An evolutionary-based approach to design the substrate specificity of the Rossmann fold enzymes (Q84343)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q84343 in Poland
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | An evolutionary-based approach to design the substrate specificity of the Rossmann fold enzymes |
Project Q84343 in Poland |
Statements
1,995,510.0 zloty
0 references
1,995,510.0 zloty
0 references
100.0 percent
0 references
1 February 2019
0 references
31 October 2022
0 references
UNIWERSYTET WARSZAWSKI
0 references
The goal of the project is to infer a detailed evolutionary history of the Rossmann fold, which is one of the most prominent protein folds and by far the most functionally diverse one, with >300 different functions. To this end, we will perform a comprehensive bioinformatics analysis, with the aim of integrating data from different sources to obtain a reliable phylogenetic tree that encompasses all the major Rossmann enzymes classes (NAD(P)-dependent dehydrogenases; SAM-dependent methyltransferases; and NTP-utilizing enzymes). Unraveling the natural history of the Rossmann enzymes will have a significant impact on our understanding of protein fold evolution. Also, it will open the possibility (i) to reveal the principles that governed the divergence of cofactor specificity of Rossmann enzymes, (ii) use these principles to re-engineer Rossmann enzymes, and (iii) to identify the rudimentary Rossmann fold, and thereby design a functional minimal Rossman. (Polish)
0 references
The goal of the project is to infer a detailed evolutionary history of the Rossmann fold, which is one of the most prominent protein Folds and by far the most functionally diverse one, with >300 different functions. To this end, we will perform a comprehensive bioinformatics analysis, with the aim of integrating data from different sources to obtain a reliable phylogenetic tree that encompasses all the major Rossmann enzymes classes (NAD(P)-dependent dehydrogenases; Sam-dependent methyltransferases; and NTP-utilising enzymes). Unraveling the natural history of the Rossmann enzymes will have a significant impact on our understanding of protein fold evolution. Also, it will open the possibility (i) to reveal the principles that governed the divergence of cofactor specificity of Rossmann enzymes, (ii) use these principles to re-engineer Rossmann enzymes, and (iii) to identify the rudimentary Rossmann fold, and thus design a functional minimal Rossman. (English)
14 October 2020
0.3712308300439134
0 references
L’objectif du projet est de déduire une histoire évolutive détaillée du pli Rossmann, qui est l’un des plis protéiques les plus importants et de loin le plus diversifié sur le plan fonctionnel, avec > 300 fonctions différentes. À cette fin, nous réaliserons une analyse bioinformatique complète, dans le but d’intégrer des données provenant de différentes sources afin d’obtenir un arbre phylogénétique fiable qui englobe toutes les principales classes d’enzymes Rossmann (déhydrogénases dépendantes de la NAD(P); Méthyltransférases dépendantes des Sam; et des enzymes utilisant le NTP. Démêler l’histoire naturelle des enzymes Rossmann aura un impact significatif sur notre compréhension de l’évolution des plis protéiques. En outre, il ouvrira la possibilité (i) de révéler les principes qui ont régi la divergence de la spécificité des cofacteurs des enzymes Rossmann, (ii) d’utiliser ces principes pour réinventer les enzymes Rossmann, et (iii) d’identifier le pli rudimentaire Rossmann, et ainsi concevoir un Rossman minimal fonctionnel. (French)
30 November 2021
0 references
Ziel des Projekts ist es, eine detaillierte Evolutionsgeschichte der Rossmann-Falte, die eine der prominentesten Proteinfalten und bei weitem die mit Abstand vielfältigste ist, mit > 300 verschiedenen Funktionen abzuleiten. Zu diesem Zweck werden wir eine umfassende bioinformatische Analyse durchführen, mit dem Ziel, Daten aus verschiedenen Quellen zu integrieren, um einen zuverlässigen phylogenetischen Baum zu erhalten, der alle wichtigen Rossmann-Enzymklassen (NAD(P)-abhängige Dehydrogenasen) umfasst; Sam-abhängige Methyltransferasen; und NTP-verwendende Enzyme. Die Entschlüsselung der Naturgeschichte der Rossmann-Enzyme wird einen erheblichen Einfluss auf unser Verständnis der Proteinfaltenentwicklung haben. Es wird auch die Möglichkeit eröffnen, (i) die Prinzipien aufzudecken, die die Divergenz der Cofaktor-Spezifität der Rossmann-Enzyme regierten, (ii) diese Prinzipien verwenden, um Rossmann-Enzyme neu zu entwickeln, und (iii) die rudimentäre Rossmann-Falte zu identifizieren und damit ein funktionales Minimum Rossman zu entwerfen. (German)
7 December 2021
0 references
Het doel van het project is om een gedetailleerde evolutionaire geschiedenis van de Rossmann-plooi af te leiden, een van de meest prominente eiwitplooien en verreweg de meest functioneel diverse, met > 300 verschillende functies. Hiertoe zullen we een uitgebreide bio-informaticaanalyse uitvoeren, met als doel gegevens uit verschillende bronnen te integreren om een betrouwbare fylogenetische boom te verkrijgen die alle belangrijke Rossmann-enzymenklassen (NAD(P)-afhankelijke dehydrogenases omvat; Sam-afhankelijke methyltransferasen; en NTP-gebruikende enzymen. Het ontrafelen van de natuurlijke geschiedenis van de Rossmann-enzymen zal een belangrijke invloed hebben op ons begrip van de evolutie van eiwitplooien. Ook zal het de mogelijkheid openen (i) om de principes te onthullen die de divergentie van cofactor specificiteit van Rossmann-enzymen beheersten, (ii) deze principes gebruiken om Rossmann-enzymen opnieuw te ontwikkelen en (iii) de rudimentaire Rossmann-plooi te identificeren en daarmee een functioneel minimum Rossman te ontwerpen. (Dutch)
16 December 2021
0 references
L'obiettivo del progetto è quello di dedurre una dettagliata storia evolutiva della piega Rossmann, che è una delle pieghe proteiche più importanti e di gran lunga la più diversificata dal punto di vista funzionale, con > 300 funzioni diverse. A tal fine, effettueremo un'analisi bioinformatica completa, con l'obiettivo di integrare dati provenienti da diverse fonti per ottenere un albero filogenetico affidabile che comprenda tutte le principali classi di enzimi Rossmann (deidrogenasi dipendenti da NAD(P)); Metiltransferasi Sam-dipendenti; e gli enzimi NTP-utilizzanti. Svelare la storia naturale degli enzimi Rossmann avrà un impatto significativo sulla nostra comprensione dell'evoluzione della piega proteica. Inoltre, si aprirà la possibilità (i) di rivelare i principi che hanno governato la divergenza della specificità cofattore degli enzimi Rossmann, (ii) utilizzare questi principi per ri-ingegnerizzare gli enzimi Rossmann e (iii) identificare la rudimentale piega Rossmann, e quindi progettare un minimo funzionale Rossman. (Italian)
16 January 2022
0 references
El objetivo del proyecto es inferir una detallada historia evolutiva del pliegue Rossmann, que es uno de los pliegues proteicos más prominentes y, con mucho, el más funcionalmente diverso, con > 300 funciones diferentes. Con este fin, realizaremos un análisis bioinformático integral, con el objetivo de integrar datos de diferentes fuentes para obtener un árbol filogenético fiable que abarque todas las principales clases de enzimas Rossmann (NAD(P) dependientes de las dehidrogenasas; Metiltransferasas dependientes de Sam; y enzimas que utilizan NTP. Desentrañar la historia natural de las enzimas Rossmann tendrá un impacto significativo en nuestra comprensión de la evolución del pliegue de proteínas. Además, abrirá la posibilidad (i) de revelar los principios que regían la divergencia de la especificidad de los cofactores de las enzimas Rossmann, (ii) usar estos principios para rediseñar las enzimas Rossmann, y (iii) identificar el pliegue rudimentario de Rossmann, y así diseñar un Rossman mínimo funcional. (Spanish)
19 January 2022
0 references
Målet med projektet er at udlede en detaljeret evolutionær historie om Rossmann folden, som er en af de mest fremtrædende proteinfolder og langt den mest funktionelt mangfoldige, med > 300 forskellige funktioner. Til dette formål vil vi udføre en omfattende bioinformatikanalyse med det formål at integrere data fra forskellige kilder for at opnå et pålideligt fylogenetisk træ, der omfatter alle de store Rossmann-enzymerklasser (NAD(P)-afhængige dehydrogenaser; Sam-afhængige methyltransferaser; og NTP-udnyttende enzymer. Optrævling af Rossmann-enzymernes naturlige historie vil have en betydelig indvirkning på vores forståelse af proteinfoldens udvikling. Det vil også åbne mulighed for (i) at afsløre de principper, der styrede forskellene i cofaktor specificitet af Rossmann enzymer, (ii) bruge disse principper til at re-engineer Rossmann enzymer, og (iii) at identificere den rudimentære Rossmann fold, og dermed designe en funktionel minimum Rossman. (Danish)
26 July 2022
0 references
Ο στόχος του έργου είναι να συναγάγει μια λεπτομερή εξελικτική ιστορία της πτυχής Rossmann, η οποία είναι μία από τις πιο σημαντικές πρωτεϊνικές πτυχές και μακράν η πιο λειτουργικά ποικιλόμορφη, με > 300 διαφορετικές λειτουργίες. Για τον σκοπό αυτό, θα διενεργήσουμε μια ολοκληρωμένη βιοπληροφορική ανάλυση, με στόχο την ενσωμάτωση δεδομένων από διαφορετικές πηγές για την απόκτηση ενός αξιόπιστου φυλογενετικού δέντρου που περιλαμβάνει όλες τις κύριες κατηγορίες ενζύμων Rossmann (NAD(P) εξαρτώμενες από αφυδρογονάση· Μεθυλτρανσφεράσες εξαρτώμενες από τον Σαμ. και τα ένζυμα που χρησιμοποιούν NTP. Η αποκάλυψη της φυσικής ιστορίας των ενζύμων Rossmann θα έχει σημαντικό αντίκτυπο στην κατανόηση της εξέλιξης των πρωτεϊνών. Επίσης, θα ανοίξει τη δυνατότητα i) να αποκαλύψει τις αρχές που διέπουν την απόκλιση της ειδικότητας συμπαράγοντος των ενζύμων Rossmann, (ii) να χρησιμοποιήσει αυτές τις αρχές για να επανασχεδιάσει τα ένζυμα Rossmann, και (iii) να προσδιορίσει την υποτυπώδη πτυχή Rossmann, και έτσι να σχεδιάσει ένα λειτουργικό ελάχιστο Rossman. (Greek)
26 July 2022
0 references
Cilj projekta je zaključiti detaljnu evolucijsku povijest Rossmannovog puta, koji je jedan od najistaknutijih proteinskih nabora i daleko najraznolikiji, s > 300 različitih funkcija. U tu svrhu provest ćemo sveobuhvatnu bioinformativnu analizu s ciljem integriranja podataka iz različitih izvora kako bismo dobili pouzdano filogenetsko stablo koje obuhvaća sve glavne klase Rossmannovih enzima (NAD(P) ovisne dehidrogenaze; Sam-ovisni metiltransferaze; i enzimi koji koriste NTP. Razotkrivanje prirodne povijesti Rossmannovih enzima imat će značajan utjecaj na naše razumijevanje evolucije proteina. Također, otvorit će se mogućnost (i) otkriti načela koja su upravljala divergencijom kofaktorske specifičnosti Rossmann enzima, (ii) koristiti ta načela za re-inženjering Rossmann enzima i (iii) identificirati rudimentarni Rossmann fold, i time dizajnirati funkcionalan minimum Rossman. (Croatian)
26 July 2022
0 references
Scopul proiectului este de a deduce o istorie evolutivă detaliată a pliului Rossmann, care este una dintre cele mai proeminente falduri proteice și de departe cea mai diversă din punct de vedere funcțional, cu > 300 de funcții diferite. În acest scop, vom efectua o analiză bioinformatică cuprinzătoare, cu scopul de a integra date din diferite surse pentru a obține un arbore filogenetic fiabil care să cuprindă toate clasele majore de enzime Rossmann (dehidrogenaze dependente de NAD(P); Metiltransferaze dependente de Sam; și enzimele care utilizează NTP. Dezvăluirea istoriei naturale a enzimelor Rossmann va avea un impact semnificativ asupra înțelegerii evoluției pliurilor proteice. De asemenea, va deschide posibilitatea (i) de a dezvălui principiile care au guvernat divergența specificității cofactorului enzimelor Rossmann, (ii) de a utiliza aceste principii pentru a reproiecta enzimele Rossmann și (iii) de a identifica pliul rudimentar Rossmann și, astfel, de a proiecta un minim funcțional Rossman. (Romanian)
26 July 2022
0 references
Cieľom projektu je vyvodiť podrobnú evolučnú históriu Rossmannovho záhybu, ktorý je jedným z najvýznamnejších proteínových záhybov a zďaleka najviac funkčne rôznorodý, s > 300 rôznymi funkciami. Na tento účel vykonáme komplexnú bioinformatickú analýzu s cieľom integrovať údaje z rôznych zdrojov s cieľom získať spoľahlivý fylogenetický strom, ktorý zahŕňa všetky hlavné triedy enzýmov Rossmann (NAD(P) závislé od dehydrogenáz; Metyltransferázy závislé od Samu; a NTP-užívajúce enzýmy. Rozlúštenie prirodzenej histórie enzýmov Rossmann bude mať významný vplyv na naše chápanie vývoja proteínového záhybu. Otvorí tiež možnosť i) odhaliť zásady, ktorými sa riadi divergencia kofaktorovej špecifickosti enzýmov Rossmann, ii) použiť tieto zásady na reinžinierovanie enzýmov Rossmann a iii) identifikovať rudimentárny Rossmannový záhyb, a tým navrhnúť funkčné minimum Rossman. (Slovak)
26 July 2022
0 references
L-għan tal-proġett huwa li jiddeduċi storja evoluzzjonarja dettaljata tat-tinja Rossmann, li hija waħda mill-aktar darbiet prominenti tal-proteini u bil-bosta l-aktar waħda funzjonalment diversa, b’funzjonijiet differenti > 300. Għal dan il-għan, se nwettqu analiżi bijoinformatika komprensiva, bil-għan li nintegraw id-data minn sorsi differenti biex tinkiseb siġra filoġenetika affidabbli li tinkludi l-klassijiet ewlenin kollha tal-enzimi Rossmann (dehydrogenases dipendenti fuq in-NAD(P); Methyltransferases dipendenti fuq is-SAM; u enzimi li jużaw l-NTP. Unraveling l-istorja naturali ta ‘l-enzimi Rossmann se jkollhom impatt sinifikanti fuq il-fehim tagħna ta’ l-evoluzzjoni tat-tinja tal-proteini. Barra minn hekk, se tiftaħ il-possibbiltà (i) li tiżvela l-prinċipji li jirregolaw id-diverġenza tal-ispeċifiċità tal-kofattur tal-enzimi Rossmann, (ii) tuża dawn il-prinċipji biex tirriinġini l-enzimi Rossmann, u (iii) tidentifika t-tinja Rossmann rudimentarja, u b’hekk tiddisinja Rossman minimu funzjonali. (Maltese)
26 July 2022
0 references
O objetivo do projeto é inferir uma história evolutiva detalhada da dobra de Rossmann, que é uma das dobras de proteína mais proeminentes e, de longe, a mais funcionalmente diversificada, com >300 funções diferentes. Para este fim, realizaremos uma análise bioinformática abrangente, com o objetivo de integrar dados de diferentes fontes para obter uma árvore filogenética confiável que englobe todas as principais classes de enzimas de Rossmann (desidrogenases dependentes de NAD(P); Metiltransferases dependentes de Sam; e enzimas que utilizam NTP). Desvendar a história natural das enzimas Rossmann terá um impacto significativo na nossa compreensão da evolução das pregas proteicas. Além disso, abrirá a possibilidade de (i) revelar os princípios que regeram a divergência da especificidade cofatorial das enzimas de Rossmann, (ii) usar esses princípios para reengenharia das enzimas de Rossmann e (iii) identificar a dobra rudimentar de Rossmann e, assim, projetar um Rossman funcional mínimo. (Portuguese)
26 July 2022
0 references
Projektin tavoitteena on päätellä Rossmann-taitteen yksityiskohtainen evoluutiohistoria, joka on yksi merkittävimmistä proteiinitaitteista ja ylivoimaisesti monimuotoisin, jossa on yli 300 eri toimintoa. Tätä varten teemme kattavan bioinformatiikan analyysin, jonka tavoitteena on integroida tietoja eri lähteistä luotettavan fylogeneettisen puun saamiseksi, joka kattaa kaikki tärkeimmät Rossmann-entsyymiluokat (NAD(P)-riippuvaiset dehydrogenaasit; Samoista riippuvaiset metyylitransferaasit; ja NTP-käyttäviä entsyymejä. Rossmannin entsyymien luonnonhistorian selvittäminen vaikuttaa merkittävästi käsitykseemme proteiinin taitteesta. Lisäksi se avaa mahdollisuuden i) paljastaa periaatteet, jotka sääntelivät Rossmannin entsyymien kofaktorispesifisyyden eroavaisuuksia, ii) käyttää näitä periaatteita Rossmannin entsyymien uudelleenkehittämiseen ja iii) tunnistaa Rossmannin alkeellisen taitteen ja siten suunnitella toiminnallisen minimi Rossmanin. (Finnish)
26 July 2022
0 references
Cilj projekta je izpeljati podrobno evolucijsko zgodovino Rossmannove gube, ki je ena najpomembnejših beljakovinskih gub in daleč najbolj funkcionalno raznolika, z več kot 300 različnimi funkcijami. V ta namen bomo izvedli celovito bioinformatično analizo, da bi povezali podatke iz različnih virov, da bi pridobili zanesljivo filogenetsko drevo, ki zajema vse glavne razrede Rossmannovih encimov (NAD(P)-odvisne dehidrogenaze; Metiltransferaze, odvisne od sam; in encimi, ki uporabljajo NTP. Razkrivanje naravne zgodovine Rossmannovih encimov bo pomembno vplivalo na naše razumevanje razvoja beljakovinskih gub. Prav tako bo odprla možnost (i) razkriti načela, ki so urejala razhajanje kofaktorske specifičnosti Rossmannovih encimov, (ii) uporabiti ta načela za preoblikovanje Rossmannovih encimov in (iii) identificirati osnovni Rossmannov krat in s tem oblikovati funkcionalen minimum Rossmana. (Slovenian)
26 July 2022
0 references
Cílem projektu je odvodit detailní evoluční historii Rossmannova záhybu, který je jedním z nejvýznamnějších proteinových záhybů a zdaleka nejfunkčně nejrozmanitější, s více než 300 různými funkcemi. Za tímto účelem provedeme komplexní bioinformatickou analýzu s cílem integrovat data z různých zdrojů za účelem získání spolehlivého fylogenetického stromu, který zahrnuje všechny hlavní třídy enzymů Rossmann (NAD(P) závislé dehydrogenázy; Methyltransferázy závislé na Sam; a enzymy využívající NTP. Odhalení přirozené historie Rossmannových enzymů bude mít významný vliv na naše chápání vývoje proteinového záhybu. Otevře také možnost i) odhalit principy, které řídily rozdílnost kofaktorové specifičnosti Rossmannových enzymů, ii) použít tyto zásady k přepracování Rossmannových enzymů a iii) identifikovat základní Rossmannův záhyb, a tím navrhnout funkční minimum Rossmana. (Czech)
26 July 2022
0 references
Projekto tikslas – nustatyti išsamią evoliucinę Rossmanno raukšlės istoriją, kuri yra viena ryškiausių baltymų raukšlių ir funkciškiausiai įvairi, turinti daugiau kaip 300 skirtingų funkcijų. Šiuo tikslu atliksime išsamią bioinformatikos analizę, siekdami integruoti duomenis iš įvairių šaltinių, kad gautume patikimą fitogenetinį medį, apimantį visas pagrindines Rossmann fermentų klases (nuo NAD(P) priklausomas dehidrogenazes; Nuo Sam priklausomos metiltransferazės; ir NTP naudojančių fermentų. Rossmann fermentų natūralios istorijos atskleidimas turės didelę įtaką mūsų supratimui apie baltymų raukšlių evoliuciją. Be to, ji suteiks galimybę i) atskleisti principus, kuriais reglamentuojamas Rossmann fermentų kofaktoriaus specifiškumo skirtumas, ii) taikyti šiuos principus Rossmann fermentų perprojektavimui ir iii) nustatyti pradinį Rossmanno raukšlę ir taip sukurti funkcinį minimalų Rossman. (Lithuanian)
26 July 2022
0 references
Projekta mērķis ir iegūt detalizētu Rossmann krokas evolūcijas vēsturi, kas ir viena no ievērojamākajām proteīna krokām un līdz šim funkcionāli daudzveidīgākā, ar > 300 dažādām funkcijām. Šajā nolūkā mēs veiksim visaptverošu bioinformātikas analīzi ar mērķi integrēt datus no dažādiem avotiem, lai iegūtu uzticamu fitoģenētisku koku, kas aptver visas galvenās Rossmann enzīmu klases (NAD(P) atkarīgās dehidrogenāzes; No Sam atkarīgās metiltransferāzes; un NTP izmantojošos enzīmus. Rossmann enzīmu dabas vēstures atraisīšana būtiski ietekmēs mūsu izpratni par olbaltumvielu kroku evolūciju. Tas arī pavērs iespēju i) atklāt principus, kas regulē Rossmann fermentu kofaktoru specifiskuma atšķirības, ii) izmantot šos principus, lai pārveidotu Rossmann fermentus, un iii) noteikt Rossmann rudimentāro kroku un tādējādi izstrādāt funkcionālo minimumu Rossman. (Latvian)
26 July 2022
0 references
Целта на проекта е да се изведе подробна еволюционна история на гънката на Росман, която е една от най-известните протеинови гънки и най-функционално разнообразната, с > 300 различни функции. За тази цел ще извършим цялостен биоинформатичен анализ с цел интегриране на данни от различни източници, за да се получи надеждно филогенетично дърво, което обхваща всички основни класове ензими на Росман (NAD(P)-зависими дехидрогенази; Сам-зависими метилтрансферази; и NTP-използващи ензими. Разкриването на естествената история на ензимите Росман ще окаже значително влияние върху нашето разбиране за еволюцията на протеиновите гънки. Също така ще се отвори възможността i) да се разкрият принципите, ръководещи диференциацията на кофакторната специфичност на ензимите на Росман, ii) да се използват тези принципи за реинженеринг на ензимите Rossmann и iii) да се идентифицира елементарната гънка на Rossmann и по този начин да се създаде функционален минимум Rossman. (Bulgarian)
26 July 2022
0 references
A projekt célja a Rossmann-szoros részletes evolúciós története, amely az egyik legjelentősebb fehérje redő és messze a legfunkcionálisabb, több mint 300 különböző funkcióval rendelkező. Ennek érdekében átfogó bioinformatikai elemzést végzünk azzal a céllal, hogy különböző forrásokból származó adatokat integráljunk egy megbízható filogenetikai fa előállításához, amely magában foglalja az összes főbb Rossmann enzimosztályt (NAD(P)-függő dehidrogenázok); Sam-függő metiltranszferázok; és NTP-használó enzimek. A Rossmann-enzimek természettörténetének feltárása jelentős hatással lesz a fehérjék evolúciójának megértésére. Továbbá, ez megnyitja a lehetőséget (i) feltárni azokat az elveket, amelyek a Rossmann-enzimek kofaktor specificitásának eltérését szabályozzák, (ii) ezeket az elveket használják a Rossmann-enzimek újratervezésére, és (iii) azonosítják a kezdetleges Rossmann hajtást, és ezáltal egy funkcionális minimum Rossman-t terveznek. (Hungarian)
26 July 2022
0 references
Is é sprioc an tionscadail ná stair éabhlóideach mhionsonraithe a dhéanamh ar fhillte Rossmann, atá ar cheann de na fillteáin próitéine is suntasaí agus an ceann is éagsúla ó thaobh feidhme de, le > 300 feidhmeanna éagsúla. Chun na críche sin, déanfaimid anailís chuimsitheach bithfhaisnéisíochta, agus é mar aidhm sonraí ó fhoinsí éagsúla a chomhtháthú chun crann iontaofa fylogenetic a fháil a chuimsíonn gach aicme einsímí Rossmann (NAD(P)-spleách dehydrogenases; Aistrithe meitile atá spleách ar shams; agus NTP-úsáid einsímí. Beidh tionchar suntasach ag stair nádúrtha einsímí Rossmann ar ár dtuiscint ar éabhlóid huaire próitéine. Chomh maith leis sin, beidh an deis ann (i) na prionsabail a léiriú a rialaigh éagsúlacht na sainiúlachta comhfhachtóirí a bhaineann le heinsímí Rossmann, (ii) úsáid a bhaint as na prionsabail sin chun einsímí Rossmann a ath-innealtóireacht, agus (iii) chun an t-imfhilleadh rudimentary Rossmann a aithint, agus ar an gcaoi sin Rossman íosta feidhmiúil a dhearadh. (Irish)
26 July 2022
0 references
Målet med projektet är att härleda en detaljerad evolutionär historia av Rossmann-vecket, som är en av de mest framträdande proteinvecken och överlägset de mest funktionellt mångsidiga, med > 300 olika funktioner. För detta ändamål kommer vi att utföra en omfattande bioinformatikanalys, i syfte att integrera data från olika källor för att få ett tillförlitligt fylogenetiskt träd som omfattar alla de stora Rossmannenzymklasserna (NAD(P)-beroende dehydrogenaser; Sam-beroende metyltransferaser; och NTP-användande enzymer. Att reda ut Rossmannenzymernas naturliga historia kommer att ha en betydande inverkan på vår förståelse av proteinveckets evolution. Det kommer också att öppna möjligheten (i) att avslöja de principer som styrde skillnaderna mellan kofaktorspecifika egenskaper hos Rossmannenzymer, ii) använda dessa principer för att omkonstruera Rossmannenzymer och iii) identifiera den rudimentära Rossmann-veckan och därigenom utforma ett funktionellt minimum Rossman. (Swedish)
26 July 2022
0 references
Projekti eesmärk on tuletada Rossmanni voldi üksikasjalik evolutsiooniline ajalugu, mis on üks silmapaistvamaid valguvolte ja kaugelt kõige funktsionaalsemalt mitmekesisem, millel on > 300 erinevat funktsiooni. Selleks teostame põhjaliku bioinformaatika analüüsi, mille eesmärk on integreerida erinevatest allikatest pärit andmed, et saada usaldusväärne fülogeneetiline puu, mis hõlmab kõiki peamisi Rossmanni ensüümide klasse (NAD(P)-sõltuv dehüdrogenaasid; Samist sõltuvad metüültransferaasid; NTP-d kasutavad ensüümid. Rossmanni ensüümide loodusliku ajaloo lahti harutamine mõjutab oluliselt meie arusaamist valgu kordumise evolutsioonist. Samuti avab see võimaluse i) paljastada põhimõtted, mis reguleerisid Rossmanni ensüümide kofaktori spetsiifilisuse erinevust, ii) kasutada neid põhimõtteid Rossmanni ensüümide ümberkujundamiseks ja iii) tuvastada algeline Rossmanni vold ja seeläbi kujundada funktsionaalne miinimum Rossman. (Estonian)
26 July 2022
0 references
Cały Kraj
0 references
6 July 2023
0 references
Identifiers
POIR.04.04.00-00-5CF1/18
0 references