Condition-dependent protease activation for targeted proteolysis in the regulation of DNA replication (Q84335)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q84335 in Poland
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Condition-dependent protease activation for targeted proteolysis in the regulation of DNA replication |
Project Q84335 in Poland |
Statements
3,470,070.0 zloty
0 references
3,470,070.0 zloty
0 references
100.0 percent
0 references
1 October 2018
0 references
30 September 2022
0 references
UNIWERSYTET GDAŃSKI
0 references
The presented project is directed at elucidation how, depending on conditions, proteases are structurally and spatially regulated to degrade essential replication proteins. The research will concentrate on bacterial Lon protease and its phosphate containing cofactors, contributing to the protease activities. We will analyze Lon from bacterial species not being investigated so far in this aspect as well as known and newly identified Lon substrates essential for replication of bacterial DNA. By applying in vitro and in vivo experiments, including real-time, single-molecule and single-cell analysis with a variety of Lon proteins, substrates and cofactors, we expect to describe species-specific, substrate-specific and general effects on Lon, and relate them to growth conditions. The cutting-edge AFM and cryo-EM will be utilize for the description of Lon complexes with cofactors and substrates. Our investigations can provide data on Lon as a new target for new antimicrobial strategies. (Polish)
0 references
The presented project is directed at elucidation how, depending on conditions, proteases are structurally and spatially regulated to DEGRADE essential replication proteins. The research will concentrate on bacterial Lon protease and its phosphate containing cofactors, contributing to the protease activities. We will analyse Lon from bacterial species not being investigated so far in this aspect as well as known and newly identified Lon substrates essential for replication of bacterial DNA. By applying in vitro and in vivo experiments, including real-time, single-molecule and single-cell analysis with a variety of Lon proteins, substrates and cofactors, we expect to describe species-specific, substrate-specific and general effects on Lon, and relate them to growth conditions. The cutting-edge AFM and cryo-EM will be utilise for the description of Lon complexes with cofactors and substrates. Our investigations can provide data on Lon as a new target for new antimicrobial strategies. (English)
14 October 2020
0.4111767188344423
0 references
Le projet présenté vise à expliquer comment, selon les conditions, les protéases sont régulées structurellement et spatialement pour dégrader les protéines de réplication essentielles. La recherche se concentrera sur la protéase bactérienne de Lon et ses cofacteurs contenant des phosphates, contribuant ainsi aux activités de protéase. Nous analyserons le Lon d’espèces bactériennes qui n’ont pas été étudiées jusqu’à présent dans cet aspect ainsi que les substrats Lon connus et nouvellement identifiés essentiels à la réplication de l’ADN bactérien. En appliquant des expériences in vitro et in vivo, y compris des analyses en temps réel, monomolécules et monocellulaires avec une variété de protéines de Lon, de substrats et de cofacteurs, nous nous attendons à décrire les effets spécifiques des espèces, spécifiques au substrat et généraux sur le Lon, et les relier aux conditions de croissance. L’AFM de pointe et le cryo-EM seront utilisés pour la description des complexes Lon avec des cofacteurs et des substrats. Nos enquêtes peuvent fournir des données sur Lon en tant que nouvelle cible pour de nouvelles stratégies antimicrobiennes. (French)
30 November 2021
0 references
Das vorgestellte Projekt zielt darauf ab, wie Proteasen je nach Bedingungen strukturell und räumlich reguliert werden, um wesentliche Replikationsproteine abzubauen. Die Forschung konzentriert sich auf die bakterielle Lon-Protease und ihr Phosphat, das Kofaktoren enthält, was zu den Proteaseaktivitäten beiträgt. Wir werden Lon von Bakterienarten analysieren, die in diesem Aspekt bisher nicht untersucht werden, sowie bekannte und neu identifizierte Lon-Substrate, die für die Replikation bakterieller DNA unerlässlich sind. Durch die Anwendung von In-vitro- und In-vivo-Experimenten, einschließlich Echtzeit-, Einzelmolekül- und Einzelzellanalysen mit einer Vielzahl von Lon-Proteinen, Substraten und Cofaktoren, erwarten wir, speziesspezifische, Substrat-spezifische und allgemeine Effekte auf Lon zu beschreiben und sie mit den Wachstumsbedingungen in Beziehung zu bringen. Für die Beschreibung von Lon-Komplexen mit Co-Faktoren und Substraten werden die modernsten AFM und Kryo-EM verwendet. Unsere Untersuchungen können Daten zu Lon als neues Ziel für neue antimikrobielle Strategien liefern. (German)
7 December 2021
0 references
Het gepresenteerde project richt zich op opheldering hoe, afhankelijk van omstandigheden, proteasen structureel en ruimtelijk gereguleerd zijn om essentiële replicatieproteïnen te degraderen. Het onderzoek zal zich concentreren op bacteriële Lon protease en zijn fosfaat bevattende cofactoren, wat bijdraagt aan de protease-activiteiten. We zullen Lon analyseren van bacteriële soorten die tot nu toe niet in dit aspect worden onderzocht, evenals bekende en nieuw geïdentificeerde Lon-substraten die essentieel zijn voor replicatie van bacterieel DNA. Door in vitro en in vivo experimenten toe te passen, waaronder real-time, single-molecule en eencellige analyse met een verscheidenheid aan Lon eiwitten, substraten en cofactoren, verwachten we soortenspecifieke, substraatspecifieke en algemene effecten op Lon te beschrijven en deze te relateren aan groeiomstandigheden. De geavanceerde AFM en cryo-EM zullen worden gebruikt voor de beschrijving van Lon complexen met cofactors en substraten. Onze onderzoeken kunnen gegevens verstrekken over Lon als een nieuw doelwit voor nieuwe antimicrobiële strategieën. (Dutch)
16 December 2021
0 references
Il progetto presentato è diretto a chiarire come, a seconda delle condizioni, le proteasi siano strutturalmente e spaziali regolate per degradare le proteine essenziali di replicazione. La ricerca si concentrerà sulla Lon proteasi batterica e sui suoi cofattori contenenti fosfato, contribuendo alle attività della proteasi. Analizzeremo il Lon da specie batteriche non studiate finora in questo aspetto, così come i substrati Lon noti e recentemente identificati essenziali per la replica del DNA batterico. Applicando esperimenti in vitro e in vivo, tra cui analisi in tempo reale, monomolecole e unicellulari con una varietà di proteine Lon, substrati e cofattori, ci aspettiamo di descrivere gli effetti specifici della specie, specifici del substrato e generali su Lon, e di metterli in relazione con le condizioni di crescita. Il AFM e il cryo-EM all'avanguardia saranno utilizzati per la descrizione dei complessi Lon con cofattori e substrati. Le nostre indagini possono fornire dati su Lon come nuovo obiettivo per nuove strategie antimicrobiche. (Italian)
16 January 2022
0 references
El proyecto presentado se dirige a la elucidación de cómo, dependiendo de las condiciones, las proteasas se regulan estructural y espacialmente para degradar las proteínas esenciales de replicación. La investigación se centrará en la proteasa bacteriana de Lon y su fosfato que contiene cofactores, contribuyendo a las actividades de proteasa. Analizaremos Lon de especies bacterianas que no se están investigando hasta ahora en este aspecto, así como sustratos de Lon conocidos y recientemente identificados esenciales para la replicación del ADN bacteriano. Mediante la aplicación de experimentos in vitro e in vivo, incluyendo análisis en tiempo real, monomoléculas y monocélulas con una variedad de proteínas de Lon, sustratos y cofactores, esperamos describir los efectos específicos de cada especie, sustratos y generales sobre Lon, y relacionarlos con las condiciones de crecimiento. El AFM de vanguardia y el crio-EM se utilizarán para la descripción de los complejos de Lon con cofactores y sustratos. Nuestras investigaciones pueden proporcionar datos sobre Lon como un nuevo objetivo para nuevas estrategias antimicrobianas. (Spanish)
19 January 2022
0 references
Esitatud projekt on suunatud selle väljaselgitamisele, kuidas sõltuvalt tingimustest on proteaasid struktuuriliselt ja ruumiliselt reguleeritud oluliste replikatsioonivalkude degradeerumiseks. Uuringud keskenduvad bakteriaalsele Lon proteaasile ja selle fosfaati sisaldavatele kofaktoritele, aidates kaasa proteaasialasele tegevusele. Analüüsime Lon bakteriliikidest, mida selles aspektis seni ei uurita, samuti tuntud ja äsja tuvastatud Lon substraate, mis on olulised bakteriaalse DNA replikatsiooniks. Kasutades in vitro ja in vivo katseid, sealhulgas reaalajas, ühe molekuli ja üherakulise analüüsi erinevate Lon valkude, substraatide ja kofaktoritega, eeldame, et kirjeldame liigispetsiifilisi, substraadispetsiifilisi ja üldisi mõjusid Lon’ile ning seostame neid kasvutingimustega. Tipptasemel AFM ja krüo-EM kasutatakse Lon komplekside kirjeldamiseks koos kofaktorite ja substraatidega. Meie uuringud võivad anda andmeid Loni kui uute antimikroobikumistrateegiate uue eesmärgi kohta. (Estonian)
13 August 2022
0 references
Pateiktas projektas skirtas išsiaiškinti, kaip, priklausomai nuo sąlygų, proteazės yra struktūriškai ir erdviškai reguliuojamos, kad suirtų esminiai replikacijos baltymai. Atliekant mokslinius tyrimus daugiausia dėmesio bus skiriama bakterinei Lon proteazei ir jos fosfatui, kurių sudėtyje yra kofaktorių, prisidedančių prie proteazės veiklos. Mes analizuosime Lon iš bakterijų rūšių, kurios iki šiol nebuvo tiriamos šiuo aspektu, taip pat žinomus ir naujai atpažįstamus Lon substratus, būtinus bakterijų DNR replikacijai. Atlikdami in vitro ir in vivo eksperimentus, įskaitant realaus laiko, vienos molekulės ir vienos ląstelės analizę su įvairiais Lon baltymais, substratais ir kofaktorius, mes tikimės apibūdinti konkrečios rūšies, substrato ir bendrą poveikį Lon ir susieti juos su augimo sąlygomis. Pažangiausias AFM ir krio-EM bus naudojamas Lon kompleksų su kofaktoriais ir substratais aprašymui. Mūsų tyrimai gali suteikti duomenų apie Lon kaip naują naujų antimikrobinių medžiagų strategijų tikslą. (Lithuanian)
13 August 2022
0 references
Predstavljeni projekt usmjeren je na razjašnjavanje načina na koji su, ovisno o uvjetima, proteaze strukturno i prostorno regulirane za degradaciju esencijalnih replikacijskih proteina. Istraživanje će se usredotočiti na bakterijsku Lon proteazu i njezine kofaktore koji sadrže fosfat, doprinoseći aktivnostima proteaze. Analizirat ćemo Lon od bakterijskih vrsta koje nisu do sada istražene u ovom aspektu, kao i poznate i novoidentificirane Lon supstrate bitne za replikaciju bakterijske DNK. Primjenom in vitro i in vivo eksperimenata, uključujući analizu u realnom vremenu, jednomolekule i jednostanične analize s različitim Lon proteinima, supstratima i kofaktorima, očekujemo da ćemo opisati specifične vrste, specifične za supstrate i opće učinke na Lon, te ih povezati s uvjetima rasta. Najsuvremeniji AFM i krio-EM koristit će se za opis Lon kompleksa s kofaktorima i supstratima. Naša istraživanja mogu pružiti podatke o Lon-u kao novoj ciljnoj vrijednosti za nove strategije za antimikrobna sredstva. (Croatian)
13 August 2022
0 references
Το έργο που παρουσιάζεται στοχεύει στην αποσαφήνιση του τρόπου με τον οποίο, ανάλογα με τις συνθήκες, οι πρωτεάσες ρυθμίζονται δομικά και χωρικά για να υποβαθμίσουν τις βασικές πρωτεΐνες αντιγραφής. Η έρευνα θα επικεντρωθεί στη βακτηριακή πρωτεάση Lon και στους συμπαράγοντες που περιέχουν φωσφορικά άλατα, συμβάλλοντας στις δραστηριότητες πρωτεάσης. Θα αναλύσουμε τον Lon από βακτηριακά είδη που δεν διερευνώνται μέχρι στιγμής σε αυτή την πτυχή, καθώς και γνωστά και προσφάτως αναγνωρισμένα υποστρώματα Lon που είναι απαραίτητα για την αναπαραγωγή του βακτηριακού DNA. Εφαρμόζοντας in vitro και in vivo πειράματα, συμπεριλαμβανομένης της ανάλυσης σε πραγματικό χρόνο, ενός μόριου και ενός κυττάρου με μια ποικιλία πρωτεϊνών Lon, υποστρωμάτων και συμπαράγοντες, αναμένουμε να περιγράψουμε τις ειδικές ανά είδος, ειδικές και γενικές επιδράσεις στο Lon, και να τις συνδέσουμε με τις συνθήκες ανάπτυξης. Τα αιχμής AFM και cryo-EM θα χρησιμοποιηθούν για την περιγραφή των συμπλεγμάτων Lon με συμπαράγοντες και υποστρώματα. Οι έρευνές μας μπορούν να παράσχουν δεδομένα σχετικά με το Lon ως νέο στόχο για νέες αντιμικροβιακές στρατηγικές. (Greek)
13 August 2022
0 references
Predložený projekt je zameraný na objasnenie toho, ako sú proteázy v závislosti od podmienok štrukturálne a priestorovo regulované tak, aby degradovali esenciálne replikačné proteíny. Výskum sa zameria na bakteriálnu Lon proteázu a jej kofaktory obsahujúce fosfát, čo prispeje k proteázovým aktivitám. Budeme analyzovať Lon z bakteriálnych druhov, ktoré sa doteraz v tomto ohľade neskúmali, ako aj známe a novoidentifikované Lonové substráty nevyhnutné pre replikáciu bakteriálnej DNA. Použitím experimentov in vitro a in vivo vrátane analýzy v reálnom čase, jednomolekulovej a jednobunkovej analýzy s rôznymi Lon proteínmi, substrátmi a kofaktormi očakávame, že opíšeme druho-špecifické, substrátovo špecifické a všeobecné účinky na Lon a ich spojíme s podmienkami rastu. Špičkové AFM a kryo-EM budú použité na opis Lonových komplexov s kofaktormi a substrátmi. Naše vyšetrovania môžu poskytnúť údaje o Lon ako o novom cieli pre nové antimikrobiálne stratégie. (Slovak)
13 August 2022
0 references
Esiteltävässä hankkeessa selvitetään, miten proteaaseja säädellään olosuhteista riippuen rakenteellisesti ja alueellisesti välttämättömien replikaatioproteiinien hajottamiseksi. Tutkimuksessa keskitytään bakteerilon proteaasia ja sen fosfaattia sisältäviin kofaktoreihin, mikä edistää proteaasin toimintaa. Analysoimme Lon-bakteerilajeja, joita ei ole vielä tutkittu tässä asiassa, sekä tunnettuja ja äskettäin tunnistettuja Lon-substraatteja, jotka ovat välttämättömiä bakteeri-DNA: n replikaatiolle. Soveltamalla in vitro- ja in vivo -kokeita, mukaan lukien reaaliaikaisia, yksimolekyylisiä ja yksisoluisia analyysejä, joissa on erilaisia Lon-proteiineja, substraatteja ja kofaktoreita, odotamme kuvailevamme lajispesifisiä, substraattispesifisiä ja yleisiä vaikutuksia Loniin ja liittävän ne kasvuolosuhteisiin. Huippuluokan AFM- ja kryo-EM-mallia käytetään kofaktoreiden ja substraattien Lon-kompleksien kuvauksessa. Tutkimuksemme voivat tarjota tietoa Lonista uusien mikrobilääkestrategioiden uutena tavoitteena. (Finnish)
13 August 2022
0 references
A bemutatott projekt célja annak feltárása, hogy a proteázok a körülményektől függően hogyan vannak szerkezetileg és térbelileg szabályozva az esszenciális replikációs fehérjék lebontására. A kutatás a bakteriális Lon proteázra és annak foszfáttartalmú kofaktorokra összpontosít, hozzájárulva a proteáz aktivitásához. Elemezni fogjuk az eddig nem vizsgált baktériumfajokból származó Lont, valamint azokat az ismert és újonnan azonosított Lon szubsztrátokat, amelyek nélkülözhetetlenek a bakteriális DNS replikációjához. In vitro és in vivo kísérletek alkalmazásával, beleértve a valós idejű, egy molekula és egysejtes analízist különböző Lon fehérjékkel, szubsztrátokkal és kofaktorokkal, elvárjuk, hogy leírjuk a fajspecifikus, szubsztrát-specifikus és általános Lon-hatásokat, és összekapcsoljuk őket a növekedési feltételekkel. Az élvonalbeli AFM-et és krio-EM-et kofaktorokkal és szubsztrátumokkal ellátott Lon komplexek leírására fogják használni. Vizsgálataink adatokat szolgáltathatnak Lonról, mint az új antimikrobiális stratégiák új célpontjáról. (Hungarian)
13 August 2022
0 references
Prezentovaný projekt je zaměřen na objasnění toho, jak jsou proteázy v závislosti na podmínkách strukturálně a prostorově regulovány tak, aby degradovaly základní replikační proteiny. Výzkum se zaměří na bakteriální Lon proteázu a její fosfát obsahující kofaktory, což přispívá k aktivitám proteázy. Budeme analyzovat Lon z bakteriálních druhů, které nejsou dosud zkoumány v tomto aspektu, stejně jako známé a nově identifikované Lon substráty nezbytné pro replikaci bakteriální DNA. Použitím experimentů in vitro a in vivo, včetně analýzy v reálném čase, jedné molekuly a jednobuněčné analýzy s různými Lon proteiny, substráty a kofaktory, očekáváme, že budeme popisovat druhově specifické, substrátově specifické a obecné účinky na Lon a vztahovat je na růstové podmínky. Nejmodernější AFM a kryo-EM budou použity pro popis Lon komplexů s kofaktory a substráty. Naše vyšetřování mohou poskytnout údaje o Lon jako novém cíli pro nové antimikrobiální strategie. (Czech)
13 August 2022
0 references
Iesniegtais projekts ir vērsts uz to, lai noskaidrotu, kā atkarībā no apstākļiem proteāzes tiek strukturāli un telpiski regulētas, lai degradētu būtiskus replikācijas proteīnus. Pētījumi koncentrēsies uz bakteriālo lenu proteāzi un tās fosfātu saturošiem kofaktoriem, veicinot proteāzes darbību. Mēs analizēsim Lon no baktēriju sugām, kas līdz šim netiek pētītas šajā aspektā, kā arī zināmos un tikko identificētos Lon substrātus, kas ir būtiski baktēriju DNS replikācijai. Izmantojot in vitro un in vivo eksperimentus, tostarp reāllaika, vienas molekulas un vienas šūnas analīzi ar dažādiem Lon proteīniem, substrātiem un kofaktoriem, mēs ceram aprakstīt sugai specifisku, substrātu specifisku un vispārēju ietekmi uz Lon un saistīt tos ar augšanas apstākļiem. Progresīvais AFM un krio-EM tiks izmantots, lai aprakstītu Lon kompleksus ar kofaktoriem un substrātiem. Mūsu pētījumi var sniegt datus par Lon kā jaunu mērķi jaunām antimikrobiālajām stratēģijām. (Latvian)
13 August 2022
0 references
Tá an tionscadal i láthair dírithe ar an gcaoi, ag brath ar choinníollacha, a rialaítear próitéisí go struchtúrach agus go spásúil chun próitéiní macasamhlaithe riachtanacha a dhíghrádú. Díreoidh an taighde ar phróitéáis Lon baictéarach agus ar a comhfhachtóirí ina bhfuil fosfáit, rud a chuirfidh leis na gníomhaíochtaí próitéáise. Déanfaimid anailís ar Lon ó speicis baictéaracha nach bhfuil á n-imscrúdú go dtí seo sa ghné seo chomh maith le foshraitheanna Lon aitheanta agus nua-aitheanta atá riachtanach chun DNA baictéarach a mhacasamhlú. Trí thurgnaimh in vitro agus in vivo a chur i bhfeidhm, lena n-áirítear anailís fíor-ama, aonmhóilíneach agus aoncheallach le héagsúlacht próitéiní, foshraitheanna agus cofactors Lon, táimid ag súil le cur síos a dhéanamh ar éifeachtaí speicis-sonracha, foshraith-shonracha agus ginearálta ar Lon, agus iad a nascadh le coinníollacha fáis. Úsáidfear an AFM agus cryo-EM ceannródaíoch chun cur síos a dhéanamh ar choimpléisc Lon le coachtóirí agus foshraitheanna. Is féidir lenár n-imscrúduithe sonraí ar Lon a sholáthar mar sprioc nua do straitéisí nua frithmhiocróbacha. (Irish)
13 August 2022
0 references
Predstavljeni projekt je namenjen pojasnitvi, kako so proteaze strukturno in prostorsko urejene za razgradnjo bistvenih replikacijskih proteinov, odvisno od pogojev. Raziskave se bodo osredotočile na bakterijsko Lon proteazo in kofaktorje, ki vsebujejo fosfat, kar prispeva k dejavnostim proteaze. Analizirali bomo Lon iz bakterijskih vrst, ki še niso bile raziskane v tem pogledu, pa tudi znane in novo identificirane Lon substrate, ki so bistveni za replikacijo bakterijske DNK. Z uporabo poskusov in vitro in in vivo, vključno z analizo v realnem času, eno molekulo in enocelično analizo z različnimi Lon proteini, substrati in kofaktorji, pričakujemo, da bomo opisali specifične, substratne in splošne učinke na Lon ter jih povezali s pogoji rasti. Najsodobnejši AFM in krio-EM bosta uporabljena za opis Lonovih kompleksov s kofaktorji in substrati. Naše preiskave lahko zagotovijo podatke o Lonu kot novem cilju za nove protimikrobne strategije. (Slovenian)
13 August 2022
0 references
Представеният проект е насочен към изясняване на това как, в зависимост от условията, протеазите са структурно и пространствено регулирани, за да разграждат основните протеини за репликация. Изследването ще се съсредоточи върху бактериалната Lon протеаза и нейните фосфати, съдържащи кофактори, допринасящи за протеазните дейности. Ще анализираме Lon от бактериални видове, които не са изследвани досега в този аспект, както и известни и новооткрити Lon субстрати, които са от съществено значение за репликацията на бактериалната ДНК. Чрез прилагане на in vitro и in vivo експерименти, включително анализ в реално време, едномолекулен и едноклетъчен анализ с различни Lon протеини, субстрати и кофактори, очакваме да опишем специфични видове, специфични за субстрата и общи ефекти върху Lon и да ги свържем с условията на растеж. Авангардните AFM и крио-ЕМ ще бъдат използвани за описание на Lon комплекси с кофактори и субстрати. Нашите изследвания могат да предоставят данни за Лон като нова цел за нови антимикробни стратегии. (Bulgarian)
13 August 2022
0 references
Il-proġett ippreżentat huwa mmirat lejn l-iċċarar ta’ kif, skont il-kundizzjonijiet, il-proteażi huma rregolati strutturalment u spazjali biex jiddegradaw il-proteini essenzjali ta’ replikazzjoni. Ir-riċerka se tikkonċentra fuq il-proteażi tal-batterji Lon u l-kofatturi li fihom il-fosfat, u b’hekk tikkontribwixxi għall-attivitajiet tal-proteażi. Aħna se tanalizza Lon minn speċi batterjali li mhux qed jiġu investigati s’issa f’dan l-aspett kif ukoll sottostrati Lon magħrufa u identifikati ġodda essenzjali għar-replikazzjoni tad-DNA batterika. Bl-applikazzjoni ta’ esperimenti in vitro u in vivo, inkluż analiżi f’ħin reali, b’molekula waħda u b’ċellula waħda b’varjetà ta’ proteini, sottostrati u kofatturi Lon, nistennew li niddeskrivu effetti speċifiċi għall-ispeċi, speċifiċi għas-sottostrati u ġenerali fuq Lon, u nirrelatawhom mal-kundizzjonijiet tat-tkabbir. L-AFM u l-krijo-EM l-aktar avvanzati se jintużaw għad-deskrizzjoni tal-kumplessi Lon b’kofatturi u sottostrati. L-investigazzjonijiet tagħna jistgħu jipprovdu data dwar Lon bħala mira ġdida għal strateġiji ġodda għall-antimikrobiċi. (Maltese)
13 August 2022
0 references
O projecto apresentado é dirigido à elucidação como, segundo circunstâncias, as proteases são estrutural e espacialmente reguladas às proteínas essenciais da replicação de DEGRADE. A investigação concentrar-se-á na protease bacteriana de Lon e nos seus cofactores que contêm fosfato, contribuindo para as actividades de protease. Analisaremos o Lon de espécies bacterianas não investigadas até agora neste aspecto, bem como substratos Lon conhecidos e recentemente identificados essenciais para a replicação do ADN bacteriano. Ao aplicar experimentos in vitro e in vivo, incluindo análise em tempo real, monomolécula e monocélula com uma variedade de proteínas, substratos e cofatores de Lon, esperamos descrever os efeitos específicos da espécie, específicos do substrato e gerais sobre o Lon e relacioná-los com as condições de crescimento. O AFM de ponta e o cryo-EM serão utilizados para a descrição de complexos de Lon com cofactores e substratos. As nossas investigações podem fornecer dados sobre o Lon como um novo alvo para novas estratégias antimicrobianas. (Portuguese)
13 August 2022
0 references
Det præsenterede projekt er rettet mod at belyse, hvordan protease, afhængigt af forholdene, er strukturelt og rumligt reguleret for at nedbryde essentielle replikationsproteiner. Forskningen vil koncentrere sig om bakteriel lonprotease og dens fosfatholdige cofaktorer, hvilket bidrager til proteaseaktiviteterne. Vi vil analysere Lon fra bakteriearter, der ikke er blevet undersøgt hidtil i dette aspekt, samt kendte og nyligt identificerede Lon substrater, der er afgørende for replikation af bakteriel DNA. Ved at anvende in vitro- og in vivo-forsøg, herunder realtids-, enkeltmolekyle- og enkeltcelleanalyse med en række Lonproteiner, substrater og cofaktorer, forventer vi at beskrive artsspecifikke, substratspecifikke og generelle virkninger på Lon og relatere dem til vækstbetingelserne. Den banebrydende AFM og cryo-EM vil blive udnyttet til beskrivelse af Lon komplekser med cofaktorer og substrater. Vores undersøgelser kan give data om Lon som et nyt mål for nye antimikrobielle strategier. (Danish)
13 August 2022
0 references
Proiectul prezentat are ca scop elucidarea modului în care, în funcție de condiții, proteazele sunt reglementate structural și spațial pentru a degrada proteinele esențiale de replicare. Cercetarea se va concentra pe protează bacteriană Lon și fosfatul său care conțin cofactori, contribuind la activitățile de protează. Vom analiza Lon din speciile bacteriene care nu au fost investigate până în prezent în acest aspect, precum și substraturi Lon recent identificate, esențiale pentru replicarea ADN-ului bacterian. Prin aplicarea experimentelor in vitro și in vivo, inclusiv analiza în timp real, monomoleculă și monocelulară, cu o varietate de proteine Lon, substraturi și cofactori, ne așteptăm să descriem efectele specifice speciilor, substratului și generale asupra Lonului și să le corelăm cu condițiile de creștere. AFM de ultimă oră și crio-EM vor fi utilizate pentru descrierea complexelor Lon cu cofactori și substraturi. Investigațiile noastre pot furniza date despre Lon ca un nou obiectiv pentru noi strategii antimicrobiene. (Romanian)
13 August 2022
0 references
Det presenterade projektet är inriktat på att klargöra hur proteaser, beroende på förhållanden, är strukturellt och rumsligt reglerade för att försämra väsentliga replikeringsproteiner. Forskningen kommer att fokusera på bakteriell Lon proteas och dess fosfat som innehåller kofaktorer, vilket bidrar till proteasaktiviteterna. Vi kommer att analysera Lon från bakteriearter som hittills inte undersökts i denna aspekt samt kända och nyligen identifierade Lon-substrat som är nödvändiga för reproduktion av bakteriell DNA. Genom att tillämpa in vitro- och in vivo-experiment, inklusive realtids-, singelmolekyl- och encellsanalys med en mängd olika Lonproteiner, substrat och kofaktorer, förväntar vi oss att beskriva artspecifika, substratspecifika och allmänna effekter på Lon, och relatera dem till tillväxtförhållanden. Den banbrytande AFM och cryo-EM kommer att användas för att beskriva Lon komplex med kofaktorer och substrat. Våra undersökningar kan ge data om Lon som ett nytt mål för nya antimikrobiella strategier. (Swedish)
13 August 2022
0 references
Cały Kraj
0 references
6 July 2023
0 references
Identifiers
POIR.04.04.00-00-5C75/17
0 references