‘Nano-BioImaging’: development and application of high time and spatial resolution imaging studies in biomedicine (Q3923200)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3923200 in Hungary
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | ‘Nano-BioImaging’: development and application of high time and spatial resolution imaging studies in biomedicine |
Project Q3923200 in Hungary |
Statements
784,845,656.0 forint
0 references
784,845,656.0 forint
0 references
100.0 percent
0 references
1 January 2017
0 references
28 October 2020
0 references
PÉCSI TUDOMÁNYEGYETEM
0 references
46°4'35.72"N, 18°13'40.94"E
0 references
A) A projekt során megvalósítani kívánt feladatok bemutatása Napjaink egyik legdinamikusabban fejlődő tudománya, a celluláris képalkotás mára alkalmassá vált élő sejtek nagysebességű (150 µs-os expozíciós idő), szuperrezolúciós (XY/Z felbontás 20/50 nm) vizsgálatára. A molekuláris dinamikai és szuperrezolúciós morfológiai vizsgálatok eredményeinek egybevetése forradalmasíthatja a sejtekről alkotott eddigi elképzeléseket az élettudományok minden területén, a molekuláris biológiától az idegtudományig. Ezen forradalmian új, és nemzetközi szinten is egyedülálló kutatási irány megvalósításához a konzorcium egyedi eszközparkot kíván létrehozni, mellyel az élő szövetben a gyors szubcelluláris változások nyomon követhetők, valamint a szuperrezolúciós morfológia és a molekulák dinamikai vizsgálata megvalósíthatók. A meghatározott célokat szolgáló eszközök jól illeszkednek a konzorciumi tagok mikroszkópos fejlesztéseihez is. PTE SzKK-ban megvalósítani kívánt feladatok: Jelenleg az SzKK-ban található egy szuperrezolúciós vizsgálatokhoz szükséges „structured illumination” mikroszkóp (SIM), és beszerzés alatt áll egy élősejtek vizsgálatára alkalmas „stochastic optical reconstruction” mikroszkóp (STORM). A STORM-ot a pályázat erőforrásainak felhasználásával a kutatók egy, a világon egyedülálló fejlesztéssel látják el, mely lehetővé teszi a szuperrezolúció mellett egyedi molekulák időbeni nyomon követését is. Azért, hogy az interakciók tanulmányozása is megvalósuljon, egy STED-FLIM szuperrezolúciós mikroszkóp beszerzése is indokolt. Az SzKK-ban meglévő teljes belső visszaverődéses mikroszkóp (TIRFM) mellé egy olyan eszköz is kiépítésre kerül, amely a világon egyedülálló gyorsasággal 3D-ben képes egyedi molekulák nyomon követésére élő sejtben, „highly inclined laminated optical sheet” (HILO) technika felhasználásával (3D-SMD). A gyors szubcelluláris folyamatok nyomon követésére élő állatban egy in vivo 2-foton mikroszkóp is beszerzésre kerül. Az SZBK-ban megvalósítani kívánt feladatok: Anizotróp molekuláris szerkezetek feltárásának új dimenzióit nyitja meg - a korábban az SZBK-ban kifejlesztett DP-LSM technikai lehetőségeit jelentősen meghaladó módon, a laterális felbontás és az érzékenység növelésével – a differenciál-polarizációs feltéttel felszerelt új innovatív eljárás és berendezés, az újrapásztázó konfokális mikroszkóp (RCM, Re-scan Confocal Microscopy) kiegészítő egység beszerzése. Ugyancsak új berendezéssle egészítik ki a szubcelluláris felbontás növelése érdekében az in vivo 2-fotonos mikroszkópot is. A DE-n megvalósítani kívánt feladatok: A DE egy időkorrelált egyedi foton számláló (TCSPC) mikroszkóp feltétet szerez be, ami Magyarországon hiánypótló csúcsműszer, mellyel egyedi molekula érzékenységgel, egyidejűleg detektálható a molekulák 2-10 nm-es együttállása, kötöttségi állapota, ko-mobilitása, illetve az aggregáció foka. B) A megvalósítási helyszín(ek) alkalmasságának bemutatása. A meglévő képalkotó kapacitásokkal és a három intézmény szakértelmével kiegészülve egy Közép-Európában egyedülállóan széles spektrumú és színvonalú mikroszkópos és in vivo képalkotó műszeregyüttes jön létre. A fejlesztések minden partner esetében jelenleg is működő, komoly infrastruktúrával bíró laboratóriumokban valósulnak meg (PTE-SzKK, DE, SZBK). A pályázatban szereplő PTE kutatócsoportok az SzKK modern, 2012-ben épült „SMART building technology” alapú épületében dolgoznak, mely épület infrastruktúrája kiválóan alkalmas a tervezett műszerek elhelyezésére, ill. fenntartására. Az egyedileg légkondicionált, teljesen besötétíthető helyiségekben tervezik a műszerek elhelyezését, úgy, hogy további bővítés esetén is elegendő hely maradjon a műszerek zavarmentes használatára. A pályázatban résztvevő laborok nemzetközileg kiemelkedő műszerparkkal rendelkeznek (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, FLIM, in vivo kétfoton mikroszkópia). A mikroszkópia nemzetközileg elismert szakemberei (Ábrahám István, Helyes Zsuzsanna, Garab Győző, Vereb György, Varga Csaba, Krizbai István, Czéh Boldizsár, Reglődi Dóra és az Euro-BioImaging magyar koordinátora Vámosi György) biztosítják a magas fokú szakértelmet, továbbá a fejlesztés maximális hasznosulását. A PTE SzKK-ban, a DE Mikroszkópos Szolgáltató Laborban és az SZBK-ban 2 fő teljes munkaidejű szakképzett személyzet, részmunkaidőben több kutatócsoport vezető dolgozik. A Nano-BioImaging core facility létrehozásához a PTE 2 új kutatói állást hoz létre. A tartós utánpótlást 3 doktori iskola, illetve a DE-n és a PTE-n az Orvosi Képalkotó Laboratóriumi Diagnosztikai Analitikus szak hallgatói is biztosítják. Az intézetekben dolgozó munkatársak tudománymetriai adatait az alábbiakban foglaljuk össze. Ábrahám István: 49 közlemény, IF:202, CIT:1953, H-index:22; Vámosi György: 60 közlemény, IF:234, CIT:1783, H-index:22, szabadalom:1; Helyes Zsuzsanna: 135 közlemény, IF:401, CIT: 2852, H-index: 30, szabadalom:11; Czéh Boldizsár: 58 közlemény, IF:231, CIT:4198, H-index:29; Varga Csaba: 22 közlemény, IF:218, CI (Hungarian)
0 references
A) Presentation of the tasks to be implemented during the project is one of the most dynamically developing sciences of today, cellular imaging is now suitable for high-speed (150 µs exposure time), super-resolation (XY/Z resolution 20/50 nm) testing of live cells. Comparing the results of molecular dynamics and superresolative morphological studies can revolutionise the vision of cells in all areas of life sciences, from molecular biology to neuroscience. To achieve this revolutionary and internationally unique research direction, the Consortium intends to create a unique set of tools to track rapid subcellular changes in living tissue, as well as to implement the dynamic analysis of super-resolation morphology and molecules. The tools for specific purposes are also well suited to the microscopic developments of the consortium members. Tasks to be implemented in PTE CoVE: Currently, the CoVE has a “structured illumination” microscope (SIM) for superresolation tests and is being procured as a stochastic optical reconstruction microscope (STORM) for testing live cells. Using the resources of the application, STORM provides researchers with a unique development that allows not only super-resolation but also the timely tracking of individual molecules. In order to study interactions, a STED-Flim superresolation microscope is also warranted. In addition to the complete internal reflective microscope (TIRFM) in CoVE, a tool will be built that can track individual molecules in a living cell with unique speed in the world using the highly inclined laminated optical sheet (HILO) technique (3D-SMD). An in vivo 2-photon microscope is also procured for the monitoring of rapid subcellular processes in live animals. The tasks to be implemented in the SZBK are: Opens new dimensions of the exploration of anisotropic molecular structures — in a way that significantly exceeds the technical capabilities of the DP-LSM previously developed in the SZBK, by increasing lateral resolution and sensitivity — the acquisition of a new innovative process and equipment equipped with a differential polarisation condition, the re-screening concocal microscope (RCM, Re-scan Confocal Microscopy). New equipment also complements the in vivo 2-photon microscope to increase subcellular resolution. Tasks to be implemented in DE: DE acquires a time-corrected unique photon counter (TCSPC) microscope toppings, which is a top-notch instrument that fills the gap in Hungary, with which the molecules can be detected with unique molecular sensitivity at the same time as the 2-10 nm co-consistency, the bonding state, the co-mobility and the degree of aggregation. B) Presentation of the suitability of the implementation site(s). Complemented by existing imaging capacities and the expertise of the three institutions, a unique array of microscopic and in vivo imaging instruments of a wide spectrum and quality will be created in Central Europe. The developments are carried out in laboratories with significant infrastructure (PTE-SzKK, DE, SZBK) which are still operational for all partners. The PTE research groups included in the tender are working in the modern “SMART building technology” building of the CoVE, built in 2012, the infrastructure of which is excellent for the installation and maintenance of the planned instruments. In individually air-conditioned, fully-darkable rooms, it is planned to accommodate the instruments in such a way that, even in the case of further extensions, sufficient space for the use of the instruments is not disturbed. The laboratories participating in the tender have an internationally outstanding instrument park (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo two-photon microscopy). Internationally recognised experts in microscopy (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi and György Vámosi, the Hungarian coordinator of Euro-BioImaging) ensure a high level of expertise and maximum utilisation of the development. The PTE CoVE, the DE Microscopic Service Laboratory and the SZBK have 2 full-time qualified staff, and several research teams work part-time. To create the Nano-BioImaging core facility, PTE will create 2 new research jobs. The long-term replacement is provided by 3 doctoral schools and students of the Medical Imaging Laboratory Diagnostic Analytical Department at DE and PTE. The scientific metric data of the staff working in the institutes are summarised below. Ábrahám István: 49 Communications, IF:202, CIT:1953, H-index:22; György Vámosi: 60 Communications, IF:234, CIT:1783, H-index:22, patent:1; Good Zsuzsanna: 135 Communications, IF:401, CIT: 2852, H-index: 30, patent:11; Boldizsár Czéh: 58 Communications, IF:231, CIT:4198, H-index:29; Csaba Varga: 22 Communications, IF:218, CI (English)
8 February 2022
0.6493218172529064
0 references
A) La présentation des tâches à réaliser au cours du projet est l’une des sciences les plus dynamiquement développées d’aujourd’hui, l’imagerie cellulaire est désormais adaptée aux tests de haute vitesse (150 µs de temps d’exposition), de super-resolation (résolution XY/Z 20/50 nm) de cellules vivantes. La comparaison des résultats de la dynamique moléculaire et des études morphologiques superresolatives peut révolutionner la vision des cellules dans tous les domaines des sciences de la vie, de la biologie moléculaire aux neurosciences. Pour atteindre cette direction de recherche révolutionnaire et unique au niveau international, le Consortium a l’intention de créer un ensemble unique d’outils pour suivre les changements subcellulaires rapides dans les tissus vivants, ainsi que pour mettre en œuvre l’analyse dynamique de la morphologie et des molécules de super-resolation. Les outils à des fins spécifiques sont également bien adaptés aux développements microscopiques des membres du consortium. Tâches à mettre en œuvre dans PTE CoVE: À l’heure actuelle, le COVE dispose d’un microscope «d’éclairage structuré» (SIM) pour les essais de superresolation et est en cours d’acquisition en tant que microscope de reconstruction optique stochastique (STORM) pour tester des cellules vivantes. En utilisant les ressources de l’application, STORM offre aux chercheurs un développement unique qui permet non seulement la super-réssolation, mais aussi le suivi en temps opportun des molécules individuelles. Afin d’étudier les interactions, un microscope de superresolation STED-Flim est également justifié. En plus du microscope réfléchissant interne complet (TIRFM) en CoVE, un outil sera construit pour suivre les molécules individuelles dans une cellule vivante avec une vitesse unique dans le monde en utilisant la technique de feuille optique laminée très inclinée (HILO) (3D-SMD). Un microscope à 2 photons in vivo est également obtenu pour la surveillance des processus subcellulaires rapides chez les animaux vivants. Les tâches à mettre en œuvre dans le SzBK sont les suivantes: Ouvre de nouvelles dimensions de l’exploration des structures moléculaires anisotropes — d’une manière qui dépasse considérablement les capacités techniques du DP-LSM précédemment développé dans le SzBK, en augmentant la résolution latérale et la sensibilité — l’acquisition d’un nouveau procédé innovant et d’un équipement équipé d’une condition de polarisation différentielle, le microscope concocal de nouveau criblage (RCM, Microscopie Confocale Re-scan). De nouveaux équipements complètent également le microscope à 2 photons in vivo pour augmenter la résolution subcellulaire. Tâches à mettre en œuvre en Allemagne: De acquiert un compteur de photons unique corrigé dans le temps (TCSPC), qui est un instrument de pointe qui comble l’écart en Hongrie, avec lequel les molécules peuvent être détectées avec une sensibilité moléculaire unique en même temps que la cohérence 2-10 nm, l’état de liaison, la co-mobilité et le degré d’agrégation. B) Présentation de l’adéquation du ou des sites de mise en œuvre. Complété par les capacités d’imagerie existantes et l’expertise des trois institutions, un ensemble unique d’instruments d’imagerie microscopiques et in vivo d’un large spectre et de qualité sera créé en Europe centrale. Les développements sont réalisés dans des laboratoires dotés d’infrastructures importantes (PTE-SzKK, DE, SzBK) qui sont toujours opérationnelles pour tous les partenaires. Les groupes de recherche PTE inclus dans l’appel d’offres travaillent dans le bâtiment moderne «SMART Building Technology» du CoVE, construit en 2012, dont l’infrastructure est excellente pour l’installation et la maintenance des instruments prévus. Dans des salles individuellement climatisées et complètement sombres, il est prévu d’accueillir les instruments de telle sorte que, même dans le cas d’extensions supplémentaires, il n’y ait pas d’espace suffisant pour l’utilisation des instruments. Les laboratoires participant à l’appel d’offres disposent d’un parc d’instruments d’excellence internationale (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, microscopie in vivo à deux photons). Des experts internationalement reconnus en microscopie (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi et György Vámosi, coordinateur hongrois d’Euro-BioImaging) assurent un haut niveau d’expertise et une utilisation maximale du développement. Le PTE CoVE, le laboratoire de service microscopique de DE et le SzBK comptent deux employés qualifiés à temps plein, et plusieurs équipes de recherche travaillent à temps partiel. Pour créer le centre de Nano-BioImaging, PTE créera deux nouveaux emplois dans le domaine de la recherche. Le remplacement à long terme est assuré par 3 écoles doctorales et étudiants du département d’analyse diagnostique du laboratoire d’imagerie médicale de l’Allemagne et du PTE. Les données métriques sc... (French)
10 February 2022
0 references
A) Projekti käigus rakendatavate ülesannete tutvustamine on tänapäeva üks dünaamilisemaid teadusi, rakukujutis sobib nüüd kiireks (150 µs kokkupuuteaeg), super-resolatsiooniks (XY/Z resolutsioon 20/50 nm) elusrakkude testimiseks. Molekulaardünaamika ja superresolatiivsete morfoloogiliste uuringute tulemuste võrdlemine võib muuta rakkude visiooni kõigis bioteaduste valdkondades alates molekulaarbioloogiast kuni neuroteaduseni. Selle revolutsioonilise ja rahvusvaheliselt ainulaadse uurimissuuna saavutamiseks kavatseb konsortsium luua ainulaadse vahendite kogumi, et jälgida kiireid rakulisi muutusi eluskoes, samuti rakendada super-resolatsiooni morfoloogia ja molekulide dünaamilist analüüsi. Spetsiaalsed vahendid sobivad hästi ka konsortsiumi liikmete mikroskoopiliste arengute jaoks. PTE kutsehariduse tipptaseme keskustes rakendatavad ülesanded: Praegu on kutsehariduse tipptaseme keskusel „struktureeritud valgustus“mikroskoop (SIM) superresolatsioonikatseteks ja seda hangitakse stohhastilise optilise rekonstrueerimise mikroskoobina (STORM) elusrakkude testimiseks. Rakenduse ressursse kasutades pakub STORM teadlastele ainulaadset arengut, mis võimaldab mitte ainult super-resolatsiooni, vaid ka üksikute molekulide õigeaegset jälgimist. Koostoimete uurimiseks on vajalik ka STED-Flim superresolatsioonimikroskoop. Lisaks täielikule sisemisele peegeldavale mikroskoobile kutsehariduse tipptaseme keskuses (TIRFM) ehitatakse tööriist, mis suudab jälgida üksikuid molekule elusrakus, millel on maailmas ainulaadne kiirus, kasutades väga kaldu lamineeritud optilise lehe (HILO) tehnikat (3D-SMD). Elusloomade kiirete subrakuliste protsesside jälgimiseks hangitakse ka in vivo 2-fotonmikroskoop. SzBK-s tuleb täita järgmised ülesanded: Avab anisotroopsete molekulaarstruktuuride uurimise uued mõõtmed – viisil, mis ületab oluliselt SzBK-s varem välja töötatud DP-LSM tehnilisi võimalusi, suurendades külgeraldust ja tundlikkust – uue uuendusliku protsessi ja seadmete omandamiseks, mis on varustatud diferentsiaalpolarisatsiooni tingimustega, konkokaalmikroskoobi uuesti sõelumisega (RCM, Re-scan Confocal Microscopy). Uued seadmed täiendavad ka in vivo 2-fotonmikroskoopi, et suurendada rakualuse eraldusvõimet. Saksamaal rakendatavad ülesanded: De omandab ajaga korrigeeritud unikaalse footoniloenduri (TCSPC) mikroskoobi, mis on tipptasemel instrument, mis täidab Ungaris tühimiku, millega saab tuvastada molekule ainulaadse molekulaartundlikkusega samal ajal kui 2–10 nm koosmõju, sidedusseisund, koosliikuvus ja agregeerimise aste. B) rakenduskoha(te) sobivuse tutvustamine. Lisaks olemasolevale kuvamisvõimele ja kolme institutsiooni oskusteabele luuakse Kesk-Euroopas ainulaadne laia spektri ja kvaliteediga mikroskoopiliste ja in vivo kuvamisvahendite valik. Arendustööd viiakse läbi märkimisväärse infrastruktuuriga laborites (PTE-SzKK, DE, SzBK), mis toimivad endiselt kõigi partnerite jaoks. Pakkumisse kaasatud PTE uurimisrühmad töötavad CoVE kaasaegses SMART-hoones, mis ehitati 2012. aastal ja mille infrastruktuur on suurepärane kavandatud vahendite paigaldamiseks ja hooldamiseks. Eraldi kliimaseadmega, täispimedates ruumides on kavandatud vahendid paigutada nii, et isegi edasiste laienduste korral ei oleks häiritud piisavalt ruumi instrumentide kasutamiseks. Hankes osalevatel laboritel on rahvusvaheliselt väljapaistev mõõteriistapark (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo kahe fotonmikroskoopia). Rahvusvaheliselt tunnustatud mikroskoopiaeksperdid (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi ja György Vámosi, Ungari koordinaator Euro-BioImaging’is) tagavad kõrgetasemelise oskusteabe ja arengu maksimaalse kasutamise. PTE CoVE, DE Microskoop Service Laboratory ja SzBK on 2 täistööajaga kvalifitseeritud töötajad, ja mitmed uurimisrühmad töötavad osalise tööajaga. Nano-BioImaging’i põhirajatise loomiseks loob PTE kaks uut teadusuuringutega seotud töökohta. Pikaajalist asendamist pakuvad 3 doktorikooli ja õpilased Medical Imaging Laboratory Diagnostic Analytical osakonna DE ja PTE. Allpool on kokkuvõtlikult esitatud instituutide töötajate teaduslikud mõõdikud. Ábrahám István: 49 Teabevahetust, IF:202, CIT:1953, H-index:22; György Vámosi: 60 Teatis, IF:234, CIT:1783, H-index:22, patent:1; Hea Zsuzsanna: 135 Teabevahetust, IF:401, sularahavedu: 2852, H-indeks: 30, patent: 11; Boldizsár Czéh: 58 Teabevahetust, IF:231, CIT:4198, H-index:29; Csaba Varga: 22 Teabevahetust, IF:218, CI (Estonian)
12 August 2022
0 references
A) Projekto metu įgyvendintinų užduočių pristatymas yra vienas iš dinamiškiausių šiandieninių mokslų, korinio vaizdo dabar tinka didelės spartos (150 µs ekspozicijos laikas), super-rezoliucijos (XY/Z skiriamoji geba 20/50 nm) gyvų ląstelių bandymai. Molekulinės dinamikos ir superrezoliucinių morfologinių tyrimų rezultatų palyginimas gali pakeisti ląstelių viziją visose gyvybės mokslų srityse – nuo molekulinės biologijos iki neuromokslo. Kad pasiektų šią revoliucinę ir tarptautiniu mastu unikalią mokslinių tyrimų kryptį, konsorciumas ketina sukurti unikalų įrankių rinkinį, skirtą stebėti greitus subląstelinius pokyčius gyvame audinyje, taip pat įgyvendinti dinamišką super-rezoliacinės morfologijos ir molekulių analizę. Konkretiems tikslams skirtos priemonės taip pat puikiai tinka konsorciumo narių mikroskopiniams pokyčiams. Užduotys, kurios turi būti įgyvendintos PTE CoVE: Šiuo metu PKC turi „struktūrinio apšvietimo“ mikroskopą (SIM), skirtą superrezoliucijos bandymams, ir yra perkamas kaip stochastinis optinės rekonstrukcijos mikroskopas (STORM) gyvų ląstelių testavimui. Naudojant programos išteklius, STORM suteikia mokslininkams unikalią plėtrą, kuri leidžia ne tik super-rezoliuciją, bet ir laiku stebėti atskiras molekules. Siekiant ištirti sąveiką, taip pat reikalingas STED-Flim superrezoliacinis mikroskopas. Be viso vidinio atspindinčio mikroskopo (TIRFM) CoVE, bus sukurtas įrankis, kuris gali sekti atskiras molekules gyvoje ląstelėje, turinčioje unikalų greitį pasaulyje, naudojant labai palenktą laminuoto optinio lakšto (HILO) techniką (3D-SMD). In vivo taip pat įsigyjamas 2-fotoninis mikroskopas, skirtas greitiems poląsteliniams procesams gyvuose gyvūnuose stebėti. SzBK įgyvendintinos šios užduotys: Atveria naujus anizotropinių molekulinių struktūrų tyrinėjimo aspektus – tokiu būdu, kuris gerokai viršija technines DP-LSM galimybes, anksčiau sukurtas SzBK, didinant šoninę skiriamąją gebą ir jautrumą – naujo naujoviško proceso ir įrangos, turinčios diferencinę poliarizaciją, įsigijimas, pakartotinis patikrinimas konkokalinis mikroskopas (RCM, Re-scan Konfokalinė mikroskopija). Nauja įranga taip pat papildo in vivo 2-fotoninį mikroskopą, siekiant padidinti subląstelinę skiriamąją gebą. Užduotys, kurios turi būti įgyvendintos Vokietijoje: De įsigyja pagal laiką pakoreguotą unikalų fotonų skaitiklį (TCSPC) mikroskopą, kuris yra aukščiausios klasės prietaisas, užpildantis spragą Vengrijoje, su kuriuo molekules galima aptikti unikaliu molekuliniu jautrumu tuo pačiu metu kaip ir 2–10 nm koherentiškumas, sujungimo būsena, bendras mobilumas ir agregacijos laipsnis. B) įgyvendinimo vietos (-ų) tinkamumo pateikimas. Be esamų vizualizavimo pajėgumų ir trijų institucijų kompetencijos, Vidurio Europoje bus sukurtas unikalus plataus spektro ir kokybės mikroskopinių ir in vivo vizualizavimo prietaisų rinkinys. Šie pokyčiai atliekami laboratorijose, turinčiose didelę infrastruktūrą (PTE-SzKK, DE, SzBK), kurios vis dar veikia visiems partneriams. Į konkursą įtrauktos PTE mokslinių tyrimų grupės dirba 2012 m. pastatytame moderniame PKC pastate „SMART pastato technologija“, kurio infrastruktūra puikiai tinka planuojamų priemonių diegimui ir priežiūrai. Atskirai oro kondicionuojamose, visiškai tamsiose patalpose instrumentus planuojama pritaikyti taip, kad net ir tolesnio išplėtimo atveju nebūtų sutrikdyta pakankamai erdvės instrumentų naudojimui. Konkurse dalyvaujančios laboratorijos turi tarptautiniu mastu neįvykdytą instrumentų parką (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo dviejų fotonų mikroskopiją). Tarptautiniu mastu pripažinti mikroskopijos ekspertai (Istvan Įbrahįm, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, Istvįn Krizbai, Boldizsįr Czéh, Dóra Reglődi ir György Vįmosi, Vengrijos „Euro-BioImaging“ koordinatorius) užtikrina aukštą kompetencijos lygį ir maksimalų plėtros panaudojimą. PTE CoVE, DE mikroskopinių paslaugų laboratorija ir SzBK turi 2 visą darbo dieną kvalifikuotus darbuotojus, o kelios mokslinių tyrimų grupės dirba ne visą darbo dieną. Norėdami sukurti „Nano-BioImaging“ pagrindinį įrenginį, PTE sukurs 2 naujas mokslinių tyrimų darbo vietas. Ilgalaikį pakeitimą teikia 3 doktorantūros mokyklos ir studentai Medicinos vaizdavimo laboratorijos diagnostinės analizės katedros DE ir PTE. Toliau apibendrinti institutuose dirbančių darbuotojų moksliniai metriniai duomenys. Įbrahįm Istvįn: 49 Komunikacijos, IF:202, CIT:1953, H-index:22; György Vįmosi: 60 Komunikacijos, IF:234, CIT:1783, H-index:22, patentas:1; Gera Zsuzsanna: 135 Komunikacijos, IF:401, CIT: 2852, H-indeksas: 30, patentas:11; Boldizsįr Czéh: 58 Komunikacijos, IF:231, CIT:4198, H-index:29; Csaba Varga: 22 Komunikacijos, IF:218, CI (Lithuanian)
12 August 2022
0 references
A) La presentazione dei compiti da attuare durante il progetto è una delle scienze più dinamiche di oggi, l'imaging cellulare è ora adatto per test ad alta velocità (150 µs tempo di esposizione), super-risolazione (risoluzione XY/Z 20/50 nm) di cellule vive. Il confronto dei risultati della dinamica molecolare e degli studi morfologici superresolativi può rivoluzionare la visione delle cellule in tutti i settori delle scienze della vita, dalla biologia molecolare alla neuroscienza. Per raggiungere questa direzione di ricerca rivoluzionaria e unica a livello internazionale, il Consorzio intende creare un insieme unico di strumenti per tracciare rapidi cambiamenti subcellulari nel tessuto vivente, nonché per implementare l'analisi dinamica della morfologia e delle molecole della super-risolazione. Gli strumenti per scopi specifici sono adatti anche agli sviluppi microscopici dei membri del consorzio. Compiti da attuare in PTE CoVE: Attualmente, il CoVE ha un microscopio a "illuminazione strutturata" (SIM) per i test di superrisolazione e viene acquistato come microscopio a ricostruzione ottica stocastica (STORM) per testare le cellule vive. Utilizzando le risorse dell'applicazione, STORM fornisce ai ricercatori uno sviluppo unico che consente non solo la super-risolazione ma anche il monitoraggio tempestivo delle singole molecole. Al fine di studiare le interazioni, è anche necessario un microscopio di superrisolazione STED-Flim. Oltre al microscopio riflettente interno completo (TIRFM) in CoVE, verrà costruito uno strumento in grado di tracciare singole molecole in una cellula vivente con velocità unica al mondo utilizzando la tecnica del foglio ottico laminato altamente inclinato (HILO) (3D-SMD). Un microscopio a 2 fotoni in vivo viene acquistato anche per il monitoraggio di processi subcellulari rapidi negli animali vivi. I compiti da attuare nella SzBK sono: Apre nuove dimensioni dell'esplorazione delle strutture molecolari anisotrope — in modo da superare significativamente le capacità tecniche del DP-LSM precedentemente sviluppato nello SzBK, aumentando la risoluzione laterale e la sensibilità — l'acquisizione di un nuovo processo innovativo e attrezzature dotate di una condizione di polarizzazione differenziale, il microscopio concocale re-screening (RCM, Re-scan Confocal Microscopy). Le nuove apparecchiature integrano anche il microscopio a 2 fotoni in vivo per aumentare la risoluzione subcellulare. Compiti da attuare in DE: De acquisisce un contatore di fotoni unici (TCSPC) corretto nel tempo, che è uno strumento di prim'ordine che riempie il vuoto in Ungheria, con il quale le molecole possono essere rilevate con sensibilità molecolare unica contemporaneamente alla co-coerenza di 2-10 nm, allo stato di legame, alla co-mobilità e al grado di aggregazione. B) Presentazione dell'idoneità del sito o dei siti di attuazione. Integrato dalle capacità di imaging esistenti e dalle competenze delle tre istituzioni, nell'Europa centrale sarà creata una gamma unica di strumenti di imaging microscopici e in vivo di ampio spettro e qualità. Gli sviluppi sono realizzati in laboratori dotati di infrastrutture significative (PTE-SzKK, DE, SzBK) che sono ancora operative per tutti i partner. I gruppi di ricerca PTE inclusi nel bando di gara stanno lavorando nel moderno edificio "SMART building technology" del CoVE, costruito nel 2012, la cui infrastruttura è eccellente per l'installazione e la manutenzione degli strumenti previsti. Nelle singole camere dotate di aria condizionata, completamente oscurabili, si prevede di accogliere gli strumenti in modo tale che, anche in caso di ulteriori ampliamenti, non venga disturbato lo spazio sufficiente per l'uso degli strumenti. I laboratori partecipanti all'appalto dispongono di un parco strumenti di eccellenza a livello internazionale (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo microscopia a due fotoni). Esperti di microscopia riconosciuti a livello internazionale (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi e György Vámosi, coordinatore ungherese di Euro-BioImaging) garantiscono un elevato livello di competenza e il massimo utilizzo dello sviluppo. Il PTE CoVE, il DE Microscopic Service Laboratory e lo SzBK dispongono di 2 collaboratori qualificati a tempo pieno e diversi gruppi di ricerca lavorano a tempo parziale. Per creare la struttura centrale Nano-BioImaging, PTE creerà 2 nuovi posti di lavoro nella ricerca. La sostituzione a lungo termine è fornita da 3 scuole di dottorato e studenti del Medical Imaging Laboratory Diagnostic Analytical Department presso DE e PTE. I dati statistici scientifici del personale che lavora negli istituti sono riassunti di seguito. Ábrahám István: 49 Comunicazioni, IF:202, CIT:1953, H-index:22; György Vámosi: 60 comunicazioni, IF:234, CIT:1783, H-index:22, brevetto:1; Buona Zsuzsanna: 135 Comunicazioni, IF:401, CIT: 2852, H-indice: 30, brevetto:11; Boldizsár Czéh... (Italian)
12 August 2022
0 references
A) Prezentacija zadataka koji će se provoditi tijekom projekta jedna je od najdinamičnijih znanosti današnjice, stanična slika je sada pogodna za velike brzine (vrijeme izlaganja 150 µs), super-rezolaciju (XY/Z razlučivost 20/50 nm) testiranje živih stanica. Usporedbom rezultata molekularne dinamike i superrezolativnih morfoloških istraživanja može se revolucionirati vizija stanica u svim područjima bioloških znanosti, od molekularne biologije do neuroznanosti. Kako bi se postigao ovaj revolucionarni i međunarodno jedinstven smjer istraživanja, Konzorcij namjerava stvoriti jedinstveni skup alata za praćenje brzih podstaničnih promjena u živom tkivu, kao i za provedbu dinamičke analize super-rezolacijske morfologije i molekula. Alati za posebne namjene također su dobro prilagođeni mikroskopskom razvoju članova konzorcija. Zadaće koje treba provesti u PTE CoVE-u: Trenutačno CoVE ima mikroskop „strukturiranog osvjetljenja” (SIM) za testove superrezolacije i nabavlja se kao stohastički mikroskop za optičku rekonstrukciju (STORM) za testiranje živih stanica. Koristeći resurse aplikacije, STORM pruža istraživačima jedinstven razvoj koji omogućuje ne samo super-rezolaciju, već i pravodobno praćenje pojedinačnih molekula. Za proučavanje interakcija potreban je i STED-Flim superresolacijski mikroskop. Osim potpunog internog reflektirajućeg mikroskopa (TIRFM) u CoVE-u, izgradit će se alat koji može pratiti pojedinačne molekule u živoj stanici s jedinstvenom brzinom u svijetu koristeći visoko nagnutu laminiranu optičku tehniku (HILO) (3D-SMD). In vivo 2-fotonski mikroskop također se nabavlja za praćenje brzih substaničnih procesa kod živih životinja. Zadaće koje će se provoditi u SzBK-u su: Otvara nove dimenzije istraživanja anizotropnih molekularnih struktura – na način koji značajno nadmašuje tehničke mogućnosti DP-LSM-a prethodno razvijenog u SzBK-u, povećanjem lateralne rezolucije i osjetljivosti – stjecanje novog inovativnog procesa i opreme opremljene diferencijalnim polarizacijskim stanjem, re-screening concocal microscope (RCM, Re-scan Confocal Microscopy). Nova oprema također nadopunjuje in vivo 2-fotonski mikroskop kako bi se povećala podstanična rezolucija. Zadaće koje treba provesti u Njemačkoj: De dobiva vremenski korigirani jedinstveni fotonski brojač (TCSPC) mikroskopa, koji je vrhunski instrument koji popunjava prazninu u Mađarskoj, s kojom se molekule mogu otkriti s jedinstvenom molekularnom osjetljivošću u isto vrijeme kada i sudosljednost 2 – 10 nm, stanje vezivanja, komobilnost i stupanj agregacije. B) Predstavljanje prikladnosti mjesta provedbe. Nadopunjen postojećim kapacitetima za snimanje i stručnošću triju institucija, u Srednjoj Europi stvorit će se jedinstven niz mikroskopskih i in vivo instrumenata za snimanje širokog spektra i kvalitete. Razvoj se provodi u laboratorijima sa značajnom infrastrukturom (PTE-SzKK, DE, SzBK) koji su još uvijek operativni za sve partnere. PTE istraživačke grupe uključene u natječaj rade u modernoj zgradi „SMART building technology” CoVE, izgrađenoj 2012. godine, čija je infrastruktura izvrsna za ugradnju i održavanje planiranih instrumenata. U pojedinačno klimatiziranim, potpuno tamnim prostorijama, planira se smjestiti instrumente na takav način da se, čak i u slučaju daljnjih proširenja, ne ometa dovoljno prostora za korištenje instrumenata. Laboratoriji koji sudjeluju u natječaju imaju međunarodno izvanredan instrument park (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo dvofotna mikroskopija). Međunarodno priznati stručnjaci za mikroskopiju (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi i György Vámosi, mađarski koordinator Euro-BioImaginga) osiguravaju visoku razinu stručnosti i maksimalnu iskorištenost razvoja. PTE CoVE, DE mikroskopski servisni laboratorij i SzBK imaju 2 kvalificirana osoblja s punim radnim vremenom, a nekoliko istraživačkih timova radi na nepuno radno vrijeme. Kako bi se stvorio središnji objekt Nano-BioImaging, PTE će otvoriti dva nova istraživačka radna mjesta. Dugoročnu zamjenu pružaju 3 doktorske škole i studenti Medicinskog Imaging Laboratorij Dijagnostički Analitički odjel u DE i PTE. Znanstveni metrički podaci osoblja koje radi u institutima sažeti su u nastavku. Ábrahám István: 49 Komunikacija, IF:202, CIT:1953, H-index:22; György Vámosi: 60 Komunikacija, IF:234, CIT:1783, H-index:22, patent:1; Dobra Zsuzsanna: 135 Komunikacija, IF:401, CIT: 2852, H-indeks: 30, patent:11; Boldizsár Czéh: 58 Komunikacija, IF:231, CIT:4198, H-index:29; Csaba Varga: 22 komunikacije, IF:218, CI (Croatian)
12 August 2022
0 references
Α) Η παρουσίαση των εργασιών που θα υλοποιηθούν κατά τη διάρκεια του έργου είναι μία από τις πιο δυναμικά αναπτυσσόμενες επιστήμες του σήμερα, η κυτταρική απεικόνιση είναι πλέον κατάλληλη για υψηλής ταχύτητας (150 µs χρόνος έκθεσης), υπερ-απομόνωση (XY/Z ανάλυση 20/50 nm) δοκιμή ζωντανών κυττάρων. Η σύγκριση των αποτελεσμάτων της μοριακής δυναμικής και των υπεραναλυτικών μορφολογικών μελετών μπορεί να φέρει επανάσταση στο όραμα των κυττάρων σε όλους τους τομείς των επιστημών της ζωής, από τη μοριακή βιολογία έως τη νευροεπιστήμη. Για την επίτευξη αυτής της επαναστατικής και διεθνώς μοναδικής ερευνητικής κατεύθυνσης, η Κοινοπραξία σκοπεύει να δημιουργήσει ένα μοναδικό σύνολο εργαλείων για την παρακολούθηση των ταχέων υποκυτταρικών αλλαγών στους ζωντανούς ιστούς, καθώς και για την εφαρμογή της δυναμικής ανάλυσης της μορφολογίας και των μορίων υπερ-απομόνωσης. Τα εργαλεία για συγκεκριμένους σκοπούς είναι επίσης κατάλληλα για τις μικροσκοπικές εξελίξεις των μελών της κοινοπραξίας. Καθήκοντα που πρέπει να εκτελεστούν στην επιτροπή PTE CoVE: Επί του παρόντος, το ΚΕΑ διαθέτει μικροσκόπιο «δομημένου φωτισμού» (SIM) για δοκιμές υπεραπομόνωσης και διατίθεται ως στοχαστικό μικροσκόπιο οπτικής ανακατασκευής (STORM) για τη δοκιμή ζωντανών κυττάρων. Χρησιμοποιώντας τους πόρους της εφαρμογής, το STORM παρέχει στους ερευνητές μια μοναδική εξέλιξη που επιτρέπει όχι μόνο την υπερ-απομόνωση αλλά και την έγκαιρη παρακολούθηση μεμονωμένων μορίων. Προκειμένου να μελετηθούν οι αλληλεπιδράσεις, δικαιολογείται επίσης ένα μικροσκόπιο υπεραπόλυσης STED-Flim. Εκτός από το πλήρες εσωτερικό ανακλαστικό μικροσκόπιο (TIRFM) στο ΚΕΑ, θα κατασκευαστεί ένα εργαλείο που θα μπορεί να παρακολουθεί μεμονωμένα μόρια σε ένα ζωντανό κύτταρο με μοναδική ταχύτητα στον κόσμο, χρησιμοποιώντας την τεχνική του πολυστρωματικού φύλλου υψηλής κλίσης (HILO) (3D-SMD). Παρέχεται επίσης ένα in vivo 2-φωτονικό μικροσκόπιο για την παρακολούθηση ταχειών υποκυτταρικών διεργασιών σε ζώντα ζώα. Τα καθήκοντα που πρέπει να εκτελεστούν στο SzBK είναι τα εξής: Ανοίγει νέες διαστάσεις της εξερεύνησης των ανισοτροπικών μοριακών δομών — με τρόπο που υπερβαίνει σημαντικά τις τεχνικές δυνατότητες του DP-LSM που είχε αναπτυχθεί προηγουμένως στο SzBK, αυξάνοντας την πλευρική ανάλυση και ευαισθησία — την απόκτηση μιας νέας καινοτόμου διαδικασίας και εξοπλισμού εξοπλισμένου με μια συνθήκη διαφορικής πόλωσης, το εκ νέου έλεγχο concocal μικροσκόπιο (RCM, Re-scan Confocal Microscopy). Ο νέος εξοπλισμός συμπληρώνει επίσης το in vivo 2-φωτονικό μικροσκόπιο για την αύξηση της υποκυτταρικής ανάλυσης. Καθήκοντα προς εκτέλεση στη Γερμανία: Η DE αποκτά ένα μοναδικό μετρητή φωτονίων (TCSPC) διορθωμένο στο χρόνο, το οποίο είναι ένα κορυφαίο όργανο που καλύπτει το κενό στην Ουγγαρία, με το οποίο τα μόρια μπορούν να ανιχνευθούν με μοναδική μοριακή ευαισθησία ταυτόχρονα με τη συν-συνέπεια των 2-10 nm, την κατάσταση σύνδεσης, την συμκινητικότητα και τον βαθμό συγκέντρωσης. Β) Παρουσίαση της καταλληλότητας των εγκαταστάσεων υλοποίησης. Συμπληρούμενη από τις υφιστάμενες ικανότητες απεικόνισης και την εμπειρογνωμοσύνη των τριών θεσμικών οργάνων, θα δημιουργηθεί στην Κεντρική Ευρώπη μια μοναδική σειρά μικροσκοπικών και in vivo μέσων απεικόνισης ευρέος φάσματος και ποιότητας. Οι εξελίξεις πραγματοποιούνται σε εργαστήρια με σημαντικές υποδομές (PTE-SzKK, DE, SzBK) που εξακολουθούν να λειτουργούν για όλους τους εταίρους. Οι ερευνητικές ομάδες PTE που περιλαμβάνονται στον διαγωνισμό εργάζονται στο σύγχρονο κτίριο «SMART building technology» του ΚΕΑ, το οποίο κατασκευάστηκε το 2012, του οποίου η υποδομή είναι εξαιρετική για την εγκατάσταση και συντήρηση των προγραμματισμένων μέσων. Σε κλιματιζόμενα και πλήρως σκουρόχρωμα δωμάτια, προβλέπεται η τοποθέτηση των οργάνων κατά τρόπο ώστε, ακόμη και σε περίπτωση περαιτέρω επεκτάσεων, να μην διαταράσσεται επαρκής χώρος για τη χρήση των οργάνων. Τα εργαστήρια που συμμετέχουν στον διαγωνισμό διαθέτουν ένα διεθνώς εξαιρετικό πάρκο οργάνων (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo διφωτονική μικροσκοπία). Διεθνώς αναγνωρισμένοι εμπειρογνώμονες σε μικροσκοπία (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi και György Vámosi, Ούγγρος συντονιστής της Euro-BioImaging) εξασφαλίζουν υψηλό επίπεδο εμπειρογνωμοσύνης και μέγιστη αξιοποίηση της ανάπτυξης. Το PTE CoVE, το DE Microscopic Service Laboratory και το SzBK διαθέτουν 2 εξειδικευμένο προσωπικό πλήρους απασχόλησης, ενώ αρκετές ερευνητικές ομάδες εργάζονται με μερική απασχόληση. Για τη δημιουργία της βασικής εγκατάστασης Nano-BioImaging, το PTE θα δημιουργήσει 2 νέες θέσεις εργασίας στον τομέα της έρευνας. Η μακροχρόνια αντικατάσταση παρέχεται από 3 διδακτορικές σχολές και μαθητές του Εργαστηρίου Ιατρικής Απεικόνισης Διαγνωστικού Τμήματος Δ.Ε. και ΠΤΕ. Τα επιστημονικά μετρικά δεδομένα του προσωπικού που εργάζεται στα ινστιτούτα συνοψίζονται κατωτέρω. Ábrahám István: 49 Communications, IF:202, CIT:1953, H-index:22· György Vámosi: 60 Communicati... (Greek)
12 August 2022
0 references
A) Prezentácia úloh, ktoré sa majú realizovať počas projektu, je jednou z najdynamickejšie sa rozvíjajúcich vied súčasnosti, bunkové zobrazovanie je teraz vhodné pre vysokorýchlostné (150 µs expozičný čas), superizolačné (rozlíšenie XY/Z 20/50 nm) testovanie živých buniek. Porovnaním výsledkov molekulárnej dynamiky a superrezolatívnych morfologických štúdií môže dôjsť k revolúcii videnia buniek vo všetkých oblastiach vied o živej prírode, od molekulárnej biológie po neurovedu. Na dosiahnutie tohto revolučného a medzinárodne jedinečného smerovania výskumu má konzorcium v úmysle vytvoriť jedinečný súbor nástrojov na sledovanie rýchlych subcelulárnych zmien v živom tkanive, ako aj realizovať dynamickú analýzu superizolačnej morfológie a molekúl. Nástroje na osobitné účely sú tiež dobre prispôsobené mikroskopickému vývoju členov konzorcia. Úlohy, ktoré sa majú vykonávať v OVP PTE: Centrum excelentnosti v OVP má v súčasnosti mikroskop „štruktúrovaného osvetlenia“ (SIM) na skúšky superizolácie a získava sa ako stochastický optický rekonštrukčný mikroskop (STORM) na testovanie živých buniek. Pomocou zdrojov aplikácie, STORM poskytuje výskumníkom jedinečný vývoj, ktorý umožňuje nielen super-izoláciu, ale aj včasné sledovanie jednotlivých molekúl. Na štúdium interakcií je potrebný aj STED-Flim superizolačný mikroskop. Okrem kompletného interného reflexného mikroskopu (TIRFM) v OVP sa vytvorí nástroj, ktorý dokáže sledovať jednotlivé molekuly v živej bunke s jedinečnou rýchlosťou na svete pomocou techniky vysoko naklonených laminovaných optických listov (HILO) (3D-SMD). Na monitorovanie rýchlych subcelulárnych procesov u živých zvierat sa získava aj 2-fotónový mikroskop in vivo. Úlohy, ktoré sa majú vykonávať v SzBK, sú: Otvára nové rozmery prieskumu anizotropných molekulárnych štruktúr – spôsobom, ktorý výrazne presahuje technické možnosti DP-LSM predtým vyvinutého v SzBK, zvýšením bočného rozlíšenia a citlivosti – získanie nového inovatívneho procesu a zariadenia vybaveného diferenciálnou polarizáciou, re-screening concocal mikroskop (RCM, Re-scan Confocal Microscopy). Nové zariadenie tiež dopĺňa 2-fotónový mikroskop in vivo na zvýšenie subcelulárneho rozlíšenia. Úlohy, ktoré sa majú vykonávať v DE: De získava časovo korigované jedinečné fotónové polevy (TCSPC), čo je špičkový nástroj, ktorý vypĺňa medzeru v Maďarsku, pomocou ktorého možno molekuly detekovať s jedinečnou molekulárnou citlivosťou súčasne s kokonzistenciou 2 – 10 nm, stavom väzby, komobilitou a stupňom agregácie. B) Prezentácia vhodnosti miesta(-í) implementácie. Okrem existujúcich zobrazovacích kapacít a odborných znalostí týchto troch inštitúcií sa v strednej Európe vytvorí jedinečný súbor mikroskopických a in vivo zobrazovacích nástrojov širokého spektra a kvality. Vývoj sa uskutočňuje v laboratóriách s významnou infraštruktúrou (PTE-SzKK, DE, SzBK), ktoré sú stále v prevádzke pre všetkých partnerov. Výskumné skupiny PTE zahrnuté do výberového konania pracujú v modernej budove centier excelentnosti v OVP „SMART building technology“, postavenej v roku 2012, ktorej infraštruktúra je vynikajúca pre inštaláciu a údržbu plánovaných nástrojov. V individuálne klimatizovaných, plne tmavých miestnostiach sa plánuje umiestniť prístroje tak, aby ani v prípade ďalších rozšírení nebol narušený dostatočný priestor na používanie prístrojov. Laboratóriá zúčastňujúce sa na výberovom konaní majú medzinárodne vynikajúci prístrojový park (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo dvojfotónová mikroskopia). Medzinárodne uznávaní odborníci v oblasti mikroskopie (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi a György Vámosi, maďarský koordinátor Euro-BioImaging) zabezpečujú vysokú úroveň odbornosti a maximálne využitie vývoja. PTE CoVE, DE Mikroskopické laboratórium a SzBK majú 2 kvalifikovaných pracovníkov na plný úväzok a niekoľko výskumných tímov pracuje na čiastočný úväzok. Na vytvorenie základného zariadenia Nano-BioImaging vytvorí PTE 2 nové výskumné pracovné miesta. Dlhodobú náhradu poskytujú 3 doktorandské školy a študenti diagnostického diagnostického oddelenia lekárskych zobrazovacích laboratórií v DE a PTE. Ďalej sú zhrnuté vedecké metrické údaje zamestnancov pracujúcich v ústavoch. Ábrahám István: 49 Komunikácie, IF:202, CIT:1953, H-index:22; György Vámosi: 60 Komunikácií, IF:234, CIT:1783, H-index:22, patent:1; Dobrý Zsuzsanna: 135 Komunikácií, IF:401, CIT: 2852, index H: 30, patent: 11; Boldizsár Czéh: 58 Komunikácií, IF:231, CIT:4198, H-index:29; Csaba Varga: 22 Komunikácie, IF:218, CI (Slovak)
12 August 2022
0 references
A) Projektin aikana toteutettavien tehtävien esittely on yksi nykypäivän dynaamisimmista tieteenaloista, solukuvaus soveltuu nyt nopeisiin (150 µs:n altistusaikaan), superresolaatioon (XY/Z-resoluutio 20/50 nm) elävien solujen testaukseen. Molekyylidynamiikan ja superresolatiivisten morfologisten tutkimusten tulosten vertailu voi mullistaa solujen näön kaikilla biotieteiden aloilla molekyylibiologiasta neurotieteeseen. Tämän vallankumouksellisen ja kansainvälisesti ainutlaatuisen tutkimussuunnan saavuttamiseksi konsortio aikoo luoda ainutlaatuisen joukon työkaluja, joiden avulla voidaan seurata elävien kudosten nopeita subsellulaarisia muutoksia sekä toteuttaa superresolaatiomorfologian ja molekyylien dynaaminen analyysi. Erityistarkoituksiin käytettävät välineet soveltuvat hyvin myös konsortion jäsenten mikroskooppiseen kehitykseen. PTE:n ammatillisen koulutuksen huippuyksikössä toteutettavat tehtävät: Tällä hetkellä ammatillisen koulutuksen huippuyksikössä on ”strukturoitu valaistus” mikroskooppi (SIM) superresolaatiotestejä varten, ja sitä hankitaan stokastisena optisena rekonstruktiomikroskoopina (STORM) elävien solujen testaamista varten. Sovelluksen resurssien avulla STORM tarjoaa tutkijoille ainutlaatuisen kehityksen, joka mahdollistaa paitsi superresoloinnin myös yksittäisten molekyylien oikea-aikaisen seurannan. Interaktioiden tutkimiseksi tarvitaan myös STED-Flim-superresolaatiomikroskooppi. Täydellisen sisäisen heijastavan mikroskoopin (TIRFM) lisäksi rakennetaan työkalu, joka voi seurata yksittäisiä molekyylejä elävässä solussa ainutlaatuisella nopeudella maailmassa käyttämällä erittäin kaltevaa laminoitua optista levyä (HILO) (3D-SMD). Lisäksi hankitaan in vivo 2-fotonmikroskooppi elävien eläinten nopeiden subsellulaaristen prosessien seurantaa varten. SzBK:ssa toteutettavat tehtävät ovat seuraavat: Avaa uusia ulottuvuuksia anisotrooppisten molekyylirakenteiden tutkimiseen – tavalla, joka ylittää merkittävästi SzBK:ssa aiemmin kehitetyn DP-LSM:n tekniset valmiudet lisäämällä sivuttaisresoluutiota ja herkkyyttä – uuden innovatiivisen prosessin ja laitteiden hankinta, joka on varustettu differentiaalipolarisaatiokunnossa, uudelleenseulonta concocal mikroskooppi (RCM, Re-scan Confocal Microscopy). Uudet laitteet täydentävät myös in vivo 2-photon -mikroskooppia subsellulaarisen resoluution lisäämiseksi. Saksassa toteutettavat tehtävät: De hankkii aikakorjatut ainutlaatuiset fotonilaskurin (TCSPC) mikroskoopit, joka on huippuluokkainen väline, joka täyttää unkarilaisen aukon, jonka avulla molekyylit voidaan havaita ainutlaatuisella molekyyliherkkyydellä samaan aikaan kuin 2–10 nm:n yhteisjohdonmukaisuus, sidostila, yhteisliikkuvuus ja aggregaatioaste. B) Täytäntöönpanopaikkojen soveltuvuuden esittely. Keski-Eurooppaan luodaan ainutlaatuinen laaja kirjo mikroskooppisia ja in vivo -kuvantamisvälineitä, joita täydennetään olemassa olevilla kuvantamisvalmiuksilla ja kolmen toimielimen asiantuntemuksella. Kehitystyötä tehdään laboratorioissa, joissa on merkittävä infrastruktuuri (PTE-SzKK, DE, SzBK), jotka ovat edelleen toiminnassa kaikille kumppaneille. Tarjouskilpailuun osallistuvat PTE-tutkimusryhmät työskentelevät vuonna 2012 rakennetun ammatillisen koulutuksen huippuyksikön nykyaikaisessa SMART-rakennustekniikassa, jonka infrastruktuuri on erinomainen suunniteltujen välineiden asentamiseen ja ylläpitoon. Yksittäin ilmastoiduissa, täysin vierekkäisissä huoneissa on tarkoitus sijoittaa välineet siten, että lisälaajennuksissakaan ei häiriinny välineiden käyttöä varten riittävästi tilaa. Tarjouskilpailuun osallistuvilla laboratorioilla on kansainvälisesti erinomainen välinepuisto (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo kaksivärinen mikroskopia). Mikroskopian kansainvälisesti tunnustetut asiantuntijat (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi ja György Vámosi, Euro-BioImagingin unkarilainen koordinaattori) varmistavat korkeatasoisen asiantuntemuksen ja kehityksen mahdollisimman tehokkaan hyödyntämisen. PTE-valiokunnalla, DE Microscopic Service Laboratorylla ja SzBK:lla on kaksi kokopäiväistä pätevää työntekijää, ja useat tutkimusryhmät työskentelevät osa-aikaisesti. Nano-BioImagingin ydinlaitoksen luomiseksi PTE luo kaksi uutta tutkimustyöpaikkaa. Pitkäaikaisen korvaamisen tarjoavat kolme tohtorikoulua ja lääketieteellisen kuvantamislaboratorion diagnostic Analytical Departmentin opiskelijat DE:ssä ja PTE:ssä. Seuraavassa esitetään yhteenveto laitoksissa työskentelevän henkilöstön tieteellisistä metrisistä tiedoista. Ábrahám István: 49 Viestintä, IF:202, CIT:1953, H-indeksi:22; György Vámosi: 60 Viestintä, IF:234, CIT:1783, H-indeksi:22, patentti:1; Hyvä Zsuzsanna: 135 Viestintä, IF:401, arvokuljetus: 2852, H-indeksi: 30, patentti:11; Boldizsár Czéh: 58 Viestintä, IF:231, CIT:4198, H-indeksi:29; Csaba Varga: 22 Viestintä, IF:218, CI (Finnish)
12 August 2022
0 references
A) Prezentacja zadań, które mają zostać zrealizowane podczas projektu, jest jedną z najbardziej dynamicznie rozwijających się nauk w dzisiejszych czasach, obrazowanie komórkowe jest obecnie odpowiednie do szybkiego (150 µs czasu ekspozycji), super-resolation (rozdzielczość XY/Z 20/50 nm) testowania żywych komórek. Porównanie wyników dynamiki molekularnej i nadrezolatywnych badań morfologicznych może zrewolucjonizować wizję komórek we wszystkich dziedzinach nauk o życiu, od biologii molekularnej do neuronauki. Aby osiągnąć ten rewolucyjny i unikalny na arenie międzynarodowej kierunek badań, Konsorcjum zamierza stworzyć unikalny zestaw narzędzi do śledzenia szybkich zmian subkomórkowych w żywej tkance, a także do wdrożenia dynamicznej analizy morfologii superrezolacji i cząsteczek. Narzędzia do konkretnych celów są również dobrze dostosowane do mikroskopijnego rozwoju członków konsorcjum. Zadania, które mają być realizowane w PTE CoVE: Obecnie COVE posiada mikroskop „strukturyzowanego oświetlenia” (SIM) do testów superrezolacji i jest nabywany jako stochastyczny mikroskop do rekonstrukcji optycznej (STORM) do testowania żywych komórek. Korzystając z zasobów aplikacji, STORM zapewnia badaczom unikalny rozwój, który umożliwia nie tylko super-resolation, ale także terminowe śledzenie poszczególnych cząsteczek. Aby zbadać interakcje, zaleca się również mikroskop superrezolacyjny STED-Flim. Oprócz kompletnego wewnętrznego mikroskopu odblaskowego (TIRFM) w CoVE, zostanie zbudowane narzędzie, które może śledzić pojedyncze cząsteczki w żywej komórce z unikalną prędkością na świecie przy użyciu wysoce nachylonej laminowanej blachy optycznej (HILO) (3D-SMD). Mikroskop in vivo 2-fotonowy jest również zamawiany do monitorowania szybkich procesów podkomórkowych u żywych zwierząt. Zadania do realizacji w SzBK to: Otwiera nowe wymiary eksploracji anizotropowych struktur molekularnych – w sposób, który znacznie przekracza możliwości techniczne wcześniej opracowanego w SzBK DP-LSM, zwiększając rozdzielczość boczną i czułość – nabycie nowego innowacyjnego procesu i wyposażenia wyposażonego w stan różnicowy polaryzacji, mikroskopu konkokalowego re-screeningu (RCM, Re-scan Confocal Microscopy). Nowy sprzęt uzupełnia również mikroskop 2-fotonowy in vivo w celu zwiększenia rozdzielczości podkomórkowej. Zadania, które mają być realizowane w DE: De nabywa skorygowane czasowo unikalne polewy do mikroskopu fotonów (TCSPC), które jest najwyższej klasy instrumentem wypełniającym lukę na Węgrzech, za pomocą którego cząsteczki mogą być wykrywane z unikalną czułością molekularną w tym samym czasie co współspójność 2-10 nm, stan wiązania, współmobilność i stopień agregacji. B) Prezentacja przydatności obiektu(-ów) realizacji. W Europie Środkowej, uzupełnione istniejącymi zdolnościami w zakresie obrazowania i wiedzą fachową trzech instytucji, w Europie Środkowej powstanie unikalny zestaw instrumentów do obrazowania mikroskopijnego i in vivo o szerokim spektrum i jakości. Prace prowadzone są w laboratoriach o znaczącej infrastrukturze (PTE-SzKK, DE, SzBK), które nadal funkcjonują dla wszystkich partnerów. Grupy badawcze PTE objęte przetargiem pracują w nowoczesnym budynku „SMART building technology” CoVE, wybudowanym w 2012 r., którego infrastruktura jest doskonała do montażu i konserwacji planowanych instrumentów. W indywidualnie klimatyzowanych, w pełni ciemnych pomieszczeniach planuje się umieszczenie przyrządów w taki sposób, aby nawet w przypadku kolejnych rozszerzeń nie została zakłócona wystarczająca przestrzeń na korzystanie z przyrządów. Laboratoria uczestniczące w przetargu posiadają międzynarodowy park instrumentów (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo dwufotonowa mikroskopia). Międzynarodowi eksperci w dziedzinie mikroskopii (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi i György Vámosi, węgierski koordynator Euro-BioImaging) zapewniają wysoki poziom wiedzy fachowej i maksymalne wykorzystanie rozwoju. PTE CoVE, DE Microscopic Service Laboratory i SzBK zatrudniają 2 pełnoetatowych wykwalifikowanych pracowników, a kilka zespołów badawczych pracuje w niepełnym wymiarze godzin. Aby utworzyć podstawowy obiekt Nano-BioImaging, PTE stworzy 2 nowe miejsca pracy w dziedzinie badań naukowych. Długoterminową wymianę zapewniają 3 szkoły doktoranckie i studenci Zakładu Analiz Diagnostycznych Laboratorium Diagnostycznego Medical Imaging w DE i PTE. Poniżej podsumowano dane metryczne dotyczące personelu pracującego w instytutach. Ábrahám István: 49 Komunikaty, IF:202, CIT:1953, H-index:22; György Vámosi: 60 Komunikacje, IF:234, CIT:1783, H-index:22, patent:1; Dobra Zsuzsanna: 135 Komunikacje, IF:401, CIT: 2852, indeks H: 30, patent:11; Boldizsár Czéh: 58 Komunikaty, IF:231, CIT:4198, H-index:29; Csaba Varga: 22 Komunikacja, IF:218, CI (Polish)
12 August 2022
0 references
A) Presentatie van de taken die tijdens het project moeten worden uitgevoerd is een van de meest dynamisch ontwikkelende wetenschappen van vandaag, cellulaire beeldvorming is nu geschikt voor high-speed (150 µs blootstellingstijd), super-resolatie (XY/Z resolutie 20/50 nm) testen van levende cellen. Het vergelijken van de resultaten van moleculaire dynamiek en superresolatieve morfologische studies kan de visie van cellen op alle gebieden van de biowetenschappen, van moleculaire biologie tot neurowetenschap, radicaal veranderen. Om deze revolutionaire en internationaal unieke onderzoeksrichting te bereiken, wil het Consortium een unieke set tools creëren om snelle subcellulaire veranderingen in levend weefsel te volgen en om de dynamische analyse van superresolatiemorfologie en moleculen te implementeren. De instrumenten voor specifieke doeleinden zijn ook zeer geschikt voor de microscopische ontwikkelingen van de consortiumleden. Taken die moeten worden uitgevoerd in PTE CoVE: Momenteel, de CoVE heeft een „gestructureerde verlichting” microscoop (SIM) voor superresolatie tests en wordt verkregen als een stochastische optische reconstructie microscoop (STORM) voor het testen van levende cellen. Met behulp van de middelen van de applicatie, STORM biedt onderzoekers een unieke ontwikkeling die niet alleen super-resolatie, maar ook het tijdig volgen van individuele moleculen mogelijk maakt. Om interacties te bestuderen, is ook een STED-Flim superresolatiemicroscoop gerechtvaardigd. Naast de complete interne reflecterende microscoop (TIRFM) in CoVE zal een tool worden gebouwd die individuele moleculen in een levende cel met unieke snelheid in de wereld kan volgen met behulp van de zeer hellende gelamineerde optische plaat (HILO) techniek (3D-SMD). Een in vivo 2-foton microscoop wordt ook verkregen voor de monitoring van snelle subcellulaire processen bij levende dieren. De in de SzBK uit te voeren taken zijn: Opent nieuwe dimensies van de exploratie van anisotrope moleculaire structuren — op een manier die de technische mogelijkheden van de eerder in de SzBK ontwikkelde DP-LSM aanzienlijk overschrijdt door de zijdelingse resolutie en gevoeligheid te verhogen — de aanschaf van een nieuw innovatief proces en apparatuur uitgerust met een differentiële polarisatieconditie, de herscreening concocale microscoop (RCM, Re-scan Confocal Microscopie). Nieuwe apparatuur vult ook de in vivo 2-foton microscoop aan om subcellulaire resolutie te verhogen. In DE uit te voeren taken: De verkrijgt een tijdgecorrigeerde unieke fotonenteller (TCSPC) microscoop toppings, een top-notch instrument dat de kloof in Hongarije vult, waarmee de moleculen kunnen worden gedetecteerd met unieke moleculaire gevoeligheid op hetzelfde moment als de 2-10 nm co-consistentie, de bindingstoestand, de comobiliteit en de mate van aggregatie. B) Presentatie van de geschiktheid van de uitvoeringslocatie(s). Aangevuld met bestaande beeldvormingscapaciteiten en de deskundigheid van de drie instellingen, zal in Midden-Europa een uniek scala aan microscopische en in vivo beeldvormingsinstrumenten met een breed spectrum en kwaliteit worden gecreëerd. De ontwikkelingen worden uitgevoerd in laboratoria met een aanzienlijke infrastructuur (PTE-SzKK, DE, SzBK) die nog steeds operationeel zijn voor alle partners. De PTE-onderzoeksgroepen die deel uitmaken van de aanbesteding werken in het moderne gebouw „SMART Building Technology” van de CoVE, gebouwd in 2012, waarvan de infrastructuur uitstekend is voor de installatie en het onderhoud van de geplande instrumenten. In individueel ingerichte, volledig donkere ruimten is het de bedoeling dat de instrumenten zodanig worden ondergebracht dat, zelfs in het geval van verdere uitbreidingen, voldoende ruimte voor het gebruik van de instrumenten niet wordt verstoord. De laboratoria die deelnemen aan de aanbesteding beschikken over een internationaal uitstekend instrumentpark (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo tweefotonmicroscopie). Internationaal erkende deskundigen op het gebied van microscopie (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi en György Vámosi, de Hongaarse coördinator van Euro-BioImaging) zorgen voor een hoog niveau van deskundigheid en maximale benutting van de ontwikkeling. De PTE CoVE, het DE Microscopische Service Laboratorium en de SzBK hebben 2 voltijds gekwalificeerd personeel en verschillende onderzoeksteams werken parttime. Om de kernfaciliteit Nano-BioImaging te creëren, zal PTE 2 nieuwe onderzoeksbanen creëren. De lange termijn vervanging wordt geleverd door 3 doctoraalscholen en studenten van de Medical Imaging Laboratory Diagnostic Analytical Department van DE en PTE. Hieronder worden de wetenschappelijke gegevens van het personeel van de instituten samengevat. Ábrahám István: 49 Communicatie, IF:202, CIT:1953, H-index:22; György Vámosi: 60 Communicatie, IF:234, CIT:1783, H-index:22, octrooi:1; Goede Zsuzsan... (Dutch)
12 August 2022
0 references
A) Prezentace úkolů, které mají být realizovány v průběhu projektu, je jedním z nejdynamičtějších věd dnešního dne, buněčné zobrazování je nyní vhodné pro vysokorychlostní (150 µs expoziční čas), super-rozpuštění (XY/Z rozlišení 20/50 nm) testování živých buněk. Porovnání výsledků molekulární dynamiky a superresolativních morfologických studií může revoluci vize buněk ve všech oblastech vědy o živé přírodě, od molekulární biologie až po neurovědu. Pro dosažení tohoto revolučního a mezinárodně jedinečného výzkumného směru má Konsorcium v úmyslu vytvořit jedinečný soubor nástrojů pro sledování rychlých subcelulárních změn v živých tkáních a také implementovat dynamickou analýzu morfologie a molekul superrozpuštění. Nástroje pro specifické účely jsou rovněž vhodné pro mikroskopický vývoj členů konsorcia. Úkoly, které mají být provedeny v rámci střediska PTE pro špičkovou úroveň OV: V současné době má středisko pro špičkovou úroveň OV mikroskop „strukturovaného osvětlení“ (SIM) pro superrezolační testy a je pořizováno jako stochastický optický rekonstrukční mikroskop (STORM) pro testování živých buněk. Pomocí zdrojů aplikace, STORM poskytuje výzkumníkům jedinečný vývoj, který umožňuje nejen super-rezolaci, ale také včasné sledování jednotlivých molekul. Pro studium interakcí je také opodstatněný mikroskop STED-Flim. Kromě kompletního vnitřního reflexního mikroskopu (TIRFM) v CoVE bude vytvořen nástroj, který dokáže sledovat jednotlivé molekuly v živé buňce s jedinečnou rychlostí na světě pomocí vysoce šikmé laminované techniky optického plechu (HILO) (3D-SMD). Pro sledování rychlých subcelulárních procesů u živých zvířat je také pořízen 2-fotonový mikroskop in vivo. Úkoly, které mají být v SzBK provedeny, jsou: Otevírá nové rozměry průzkumu anizotropních molekulárních struktur – způsobem, který výrazně překračuje technické možnosti DP-LSM dříve vyvinuté v SzBK, zvýšením bočního rozlišení a citlivosti – získáním nového inovativního procesu a zařízení vybaveného diferenciální polarizací, re-screening konkokální mikroskop (RCM, Re-scan Confocal Microscopy). Nové zařízení také doplňuje 2fotonový mikroskop in vivo pro zvýšení subcelulárního rozlišení. Úkoly, které mají být provedeny v DE: De získává časově korigované unikátní fotonové mikroskopy (TCSPC), což je špičkový nástroj, který vyplňuje mezeru v Maďarsku, s níž lze molekuly detekovat s jedinečnou molekulovou citlivostí ve stejnou dobu jako kokonzistence 2–10 nm, stav vazby, komobilita a stupeň agregace. B) Prezentace vhodnosti prováděcího místa. Kromě stávajících zobrazovacích kapacit a odborných znalostí těchto tří institucí bude ve střední Evropě vytvořena unikátní řada mikroskopických a in vivo zobrazovacích nástrojů širokého spektra a kvality. Vývoj probíhá v laboratořích s významnou infrastrukturou (PTE-SzKK, DE, SzBK), které jsou stále funkční pro všechny partnery. Výzkumné skupiny PTE zahrnuté do výběrového řízení pracují v moderní budově „SMART building technology“ střediska pro špičkovou úroveň OV, která byla postavena v roce 2012, jejíž infrastruktura je vynikající pro instalaci a údržbu plánovaných přístrojů. V individuálně klimatizovaných, plně zatemnitelných místnostech je plánováno umístit nástroje tak, aby ani v případě dalších rozšíření nebyl narušen dostatečný prostor pro použití přístrojů. Laboratoře účastnící se nabídkového řízení mají mezinárodně vynikající nástrojový park (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo dvoufotonová mikroskopie). Mezinárodně uznávané odborníky na mikroskopii (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi a György Vámosi, maďarský koordinátor Euro-BioImaging) zajišťují vysokou úroveň odborných znalostí a maximální využití rozvoje. PTE CoVE, DE Microscopic Service Laboratory a SzBK mají 2 kvalifikované pracovníky na plný úvazek a několik výzkumných týmů pracuje na částečný úvazek. Chcete-li vytvořit hlavní zařízení Nano-BioImaging, PTE vytvoří 2 nová pracovní místa ve výzkumu. Dlouhodobou výměnu zajišťují 3 doktorské školy a studenti lékařského zobrazovacího laboratorního diagnostického analytického oddělení DE a PTE. Vědecké metrické údaje zaměstnanců ústavů jsou shrnuty níže. Ábrahám István: 49 Komunikace, IF:202, CIT:1953, H-index:22; György Vámosi: 60 Komunikace, IF:234, CIT:1783, H-index:22, patent:1; Dobrá Zsuzsanna: 135 sdělení, IF:401, CIT: 2852, H-index: 30, patent:11; Boldizsár Czéh: 58 Komunikace, IF:231, CIT:4198, H-index:29; Csaba Varga: 22 Komunikace, IF:218, CI (Czech)
12 August 2022
0 references
A) Projekta laikā īstenojamo uzdevumu prezentācija ir viena no dinamiskākajām mūsdienu zinātnēm, šūnu attēlveidošana tagad ir piemērota ātrdarbīgai (150 µs ekspozīcijas laiks), super-atjaunošanai (XY/Z izšķirtspēja 20/50 nm) dzīvu šūnu testēšanai. Salīdzinot molekulārās dinamikas un superrezolatīvo morfoloģisko pētījumu rezultātus, var radikāli ietekmēt šūnu redzējumu visās zinātnes par dzīvību jomās, sākot no molekulārās bioloģijas līdz neirozinātnei. Lai sasniegtu šo revolucionāro un starptautiski unikālo pētniecības virzienu, konsorcijs plāno izveidot unikālu rīku kopumu, lai izsekotu ātras subcelulārās izmaiņas dzīvo audos, kā arī lai īstenotu super-atdalīšanās morfoloģijas un molekulu dinamisko analīzi. Instrumenti konkrētiem mērķiem ir labi piemēroti arī konsorcija dalībnieku mikroskopiskajai attīstībai. Uzdevumi, kas jāīsteno PTE PIC: Pašlaik PIC ir “strukturēts apgaismojums” mikroskops (SIM) superrezolācijas testiem, un to iepērk kā stohastiskās optiskās rekonstrukcijas mikroskopu (STORM) dzīvu šūnu testēšanai. Izmantojot lietojumprogrammas resursus, STORM nodrošina pētniekus ar unikālu attīstību, kas ļauj ne tikai super-atrisinājumu, bet arī savlaicīgu atsevišķu molekulu izsekošanu. Lai pētītu mijiedarbību, ir nepieciešams arī STED-Flim superrezolācijas mikroskops. Papildus pilnīgam iekšējam atstarojošajam mikroskopam (TIRFM) PIC tiks izveidots rīks, kas var izsekot atsevišķas molekulas dzīvā šūnā ar unikālu ātrumu pasaulē, izmantojot augsti slīpi laminētas optiskās loksnes (HILO) metodi (3D-SMD). In vivo 2-fotonu mikroskopu iepērk arī, lai uzraudzītu ātrus subcelulāros procesus dzīvos dzīvniekos. SzBK veicamie uzdevumi ir šādi: Atver jaunus izmērus anizotropo molekulāro struktūru izpētei — tādā veidā, kas ievērojami pārsniedz SzBK iepriekš izstrādātā DP-LSM tehniskās iespējas, palielinot sānu izšķirtspēju un jutīgumu, jauna inovatīva procesa un aprīkojuma iegādi, kas aprīkots ar diferenciālu polarizācijas stāvokli, atkārtotu konkokālo mikroskopu (RCM, Re-scan Confocal Microscopy). Jauns aprīkojums papildina arī in vivo 2-fotonu mikroskopu, lai palielinātu subcellular izšķirtspēju. DE īstenojamie uzdevumi: De iegūst laikā koriģētu unikālu fotonu skaitītāja (TCSPC) mikroskopa virskārtu, kas ir augstākās pakāpes instruments, kas aizpilda plaisu Ungārijā, ar kuru molekulas var noteikt ar unikālu molekulāro jutību vienlaikus ar 2–10 nm līdzkonsistenci, saistīšanās stāvokli, komobilitāti un agregācijas pakāpi. B) īstenošanas vietas(-u) piemērotības izklāsts. Papildus esošajām attēlveidošanas spējām un triju iestāžu speciālajām zināšanām Centrāleiropā izveidos unikālu plaša spektra un kvalitātes mikroskopisko un in vivo attēlveidošanas instrumentu klāstu. Attīstību veic laboratorijās ar nozīmīgu infrastruktūru (PTE-SzKK, DE, SzBK), kas joprojām darbojas visu partneru labā. Konkursā iekļautās PTE pētniecības grupas strādā 2012. gadā uzbūvētajā PIC modernajā “SMART celtniecības tehnoloģiju” ēkā, kuras infrastruktūra ir lieliska plānoto instrumentu uzstādīšanai un uzturēšanai. Individuāli kondicionētos, pilnībā necaurlaidīgos numuros ir plānots izvietot instrumentus tā, lai pat turpmākas paplašināšanas gadījumā netiktu traucēta pietiekama telpa instrumentu izmantošanai. Laboratorijām, kas piedalās konkursā, ir starptautiski izcils instrumentu parks (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo divu fotonu mikroskopija). Starptautiski atzīti mikroskopijas eksperti (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi un György Vámosi, ungāru koordinators Euro-BioImaging) nodrošina augstu zināšanu līmeni un attīstības maksimālu izmantošanu. PTE CoVE, DE Mikroskopisko pakalpojumu laboratorijai un SzBK ir 2 pilna laika kvalificēti darbinieki, un vairākas pētniecības grupas strādā nepilnu slodzi. Lai izveidotu Nano-BioImaging kodoliekārtu, PTE radīs 2 jaunas pētniecības darba vietas. Ilgtermiņa nomaiņu nodrošina 3 doktorantūras skolas un studenti no Medicīnas attēlveidošanas laboratorijas diagnostikas departamenta DE un PTE. Institūtos strādājošo darbinieku zinātniskie metriskie dati ir apkopoti turpmāk. Ábrahám István: 49 Komunikācijas, IF:202, CIT:1953, H-index:22; György Vámosi: 60 Komunikācijas, IF:234, CIT:1783, H-index:22, patents:1; Laba Zsuzsanna: 135 Komunikācijas, IF:401, skaidras naudas pārvadājumi: 2852, H indekss: 30, patents:11; Boldizsár Czéh: 58 Komunikācijas, IF:231, CIT:4198, H-index:29; Csaba Varga: 22 Komunikācijas, IF:218, CI (Latvian)
12 August 2022
0 references
A) Tá cur i láthair na gcúraimí atá le cur i bhfeidhm le linn an tionscadail ar cheann de na heolaíochtaí is dinimiciúla atá ag forbairt sa lá atá inniu ann, tá íomháú ceallach oiriúnach anois do thástáil ardluais (150 µs am nochta), tástáil Super-réitithe (réiteach XY/Z 20/50 nm) ar chealla beo. Is féidir le comparáid a dhéanamh idir torthaí na dinimic mhóilíneach agus staidéir mhoirfeolaíocha superresolative réabhlóid a dhéanamh ar fhís na gceall i ngach réimse de na heolaíochtaí beatha, ó bhitheolaíocht mhóilíneach go néareolaíocht. Chun an treo taighde réabhlóideach agus go hidirnáisiúnta uathúil a bhaint amach, tá sé ar intinn ag an gCuibhreannas sraith uathúil uirlisí a chruthú chun athruithe tapa focheallacha a rianú i bhfíochán beo, chomh maith leis an anailís dhinimiciúil ar mhoirfeolaíocht agus móilíní Super-réitithe a chur i bhfeidhm. Tá na huirlisí chun críoch sonrach oiriúnach freisin d’fhorbairtí micreascópacha chomhaltaí an chuibhreannais. Cúraimí atá le cur chun feidhme in PTE CoVE: Faoi láthair, tá micreascóp “soilsiú struchtúrtha” (SIM) ag CoVE le haghaidh tástálacha forréitithe agus tá sé á sholáthar mar mhicreascóp atógála optúil stocastach (STORM) chun cealla beo a thástáil. Ag baint úsáide as acmhainní an iarratais, soláthraíonn STORM forbairt uathúil do thaighdeoirí a cheadaíonn ní hamháin Super-réiteach ach freisin rianú tráthúil móilíní aonair. D’fhonn staidéar a dhéanamh ar idirghníomhaíochtaí, tá gá le micreascóp superresolation STED-Flim freisin. Chomh maith leis an micreascóp machnamhach inmheánach iomlán (TIRFM) i CoVE, tógfar uirlis a fhéadann móilíní aonair a rianú i gcill bheo le luas uathúil ar fud an domhain ag baint úsáide as an teicníc leatháin optúla lannaithe (HILO) atá claonta (HILO) (3D-SMD). Tá micreascóp 2-fótagrafach in vivo ar fáil freisin chun faireachán a dhéanamh ar phróisis thapa fhocheallacha in ainmhithe beo. Is iad seo a leanas na cúraimí atá le cur chun feidhme sa SZBK: Osclaíonn gnéithe nua den iniúchadh ar struchtúir mhóilíneacha anisotropic — ar bhealach a sháraíonn go mór cumais theicniúla an DP-LSM a forbraíodh roimhe seo sa SZBK, trí réiteach cliathánach agus íogaireacht a mhéadú — próiseas agus trealamh nuálach nua a fháil atá feistithe le coinníoll polaraithe difreálach, an micreascóp cócúil athscagadh (RCM, Micreascópacht Chonfocal Re-scan). Comhlánaíonn trealamh nua an micreascóp 2-fótagrafach in vivo chun réiteach focheallach a mhéadú. Cúraimí atá le cur chun feidhme in DE: Faigheann DE barráin micreascóp, arna cheartú de réir ama, a líonann an bhearna san Ungáir, inar féidir na móilíní a bhrath le híogaireacht mhóilíneach uathúil ag an am céanna leis an gcomhsheasmhacht 2-10 nm, an stát nasctha, an chomhshoghluaisteacht agus an méid comhiomlánaithe. B) Cur i láthair ar oiriúnacht an láithreáin/na suíomhanna cur chun feidhme. Mar chomhlánú ar na hacmhainní íomháithe atá ann cheana agus ar shaineolas na dtrí institiúid, cruthófar sraith uathúil d’ionstraimí íomháithe micreascópacha agus in vivo de speictream agus de cháilíocht leathan i Lár na hEorpa. Déantar na forbairtí i saotharlanna a bhfuil bonneagar suntasach acu (PTE-SZKK, DE, SZBK) atá fós ag feidhmiú do na comhpháirtithe uile. Tá na grúpaí taighde PTE atá san áireamh sa tairiscint ag obair i bhfoirgneamh nua-aimseartha “teicneolaíocht tógála MTMART” den CoVE, a tógadh i 2012, a bhfuil a mbonneagar den scoth chun na hionstraimí atá beartaithe a shuiteáil agus a chothabháil. I seomraí ina n-aonar aerchóirithe, go hiomlán-darkable, tá sé beartaithe chun freastal ar na hionstraimí ar bhealach nach bhfuil, fiú i gcás síntí breise, spás leordhóthanach le haghaidh úsáid na n-ionstraimí suaite. Tá páirc uirlisí den scoth ag na saotharlanna atá rannpháirteach sa tairiscint (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, micreascópacht dhá fhótagrafaíocht in vivo). Cinntíonn saineolaithe a aithnítear go hidirnáisiúnta sa mhicreascópacht (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi agus György Vámosi, comhordaitheoir na hUngáire ar Euro-Bio Íomháú) ardleibhéal saineolais agus úsáid uasta na forbartha. Tá 2 bhall foirne lánaimseartha ag PTE CoVE, Saotharlann Seirbhíse Micreascópacha DE agus SZBK, agus oibríonn roinnt foirne taighde go páirtaimseartha. Chun croí-áis Nano-Bio Íomháithe a chruthú, cruthóidh PTE 2 phost taighde nua. Tá an athsholáthar fadtéarmach ar fáil ag 3 scoil dochtúireachta agus mic léinn na Roinne Anailíseach Diagnóiseacha Saotharlainne Íomháithe Leighis ag DE agus PTE. Tá achoimre thíos ar shonraí méadrach eolaíochta na foirne atá ag obair sna hinstitiúidí. Allah warns a seirbhísigh leis a chuid Word: 49 Cumarsáid, IF:202, CIT:1953, H-innéacs:22; Allah warns a seirbhísigh leis a chuid Word: 60 Cumarsáid, IF:234, CIT:1783, H-innéacs:22, paitinn: 1; Allah warns a seirbhísigh leis a chuid Word: 135 Cumarsáid, IF:401, CIT: 2852, H-innéacs: 30, paitinn:11; Allah warns a seirbhísigh leis a chuid Word: 58 Cumarsáid, IF... (Irish)
12 August 2022
0 references
A) Predstavitev nalog, ki jih je treba izvesti med projektom, je ena od najbolj dinamično razvijajočih se znanosti današnjega časa, celično slikanje je zdaj primerno za testiranje živih celic z visoko hitrostjo (150 µs časa izpostavljenosti), superresolacijo (resolucija XY/Z 20/50 nm). Primerjava rezultatov molekularne dinamike in superresolativnih morfoloških študij lahko revolucionira vizijo celic na vseh področjih znanosti o življenju, od molekularne biologije do nevroznanosti. Da bi dosegli to revolucionarno in mednarodno edinstveno raziskovalno smer, namerava konzorcij ustvariti edinstven nabor orodij za sledenje hitrim podceličnim spremembam v živem tkivu ter za izvajanje dinamične analize superresolacijske morfologije in molekul. Orodja za posebne namene so primerna tudi za mikroskopski razvoj članov konzorcija. Naloge, ki se bodo izvajale v odboru PTE CoVE: Trenutno ima CoVE „strukturiran svetlobni“ mikroskop (SIM) za superresolacijske teste in se pridobiva kot stohastični optični rekonstrukcijski mikroskop (STORM) za testiranje živih celic. Z uporabo virov aplikacije STORM raziskovalcem zagotavlja edinstven razvoj, ki omogoča ne le super-resolacijo, temveč tudi pravočasno sledenje posameznih molekul. Za preučevanje interakcij je potreben tudi STED-Flim superresolacijski mikroskop. Poleg popolnega notranjega odsevnega mikroskopa (TIRFM) v CoVE bo izdelano orodje, ki bo lahko sledilo posameznim molekulam v živi celici z edinstveno hitrostjo na svetu z uporabo tehnike visoko nagnjene laminirane optične folije (HILO) (3D-SMD). Za spremljanje hitrih podceličnih procesov pri živih živalih se pridobi tudi 2-fotonski mikroskop in vivo. Naloge, ki jih je treba izvajati v SzBK, so: Odpira nove dimenzije raziskovanja anizotropnih molekularnih struktur – na način, ki znatno presega tehnične zmogljivosti DP-LSM, ki so bile prej razvite v SzBK, s povečanjem stranske ločljivosti in občutljivosti – pridobitev novega inovativnega procesa in opreme, opremljene z diferencialno polarizacijo, ponovnim presejanjem konkonokalnega mikroskopa (RCM, Re-scan Confocal Microscopy). Nova oprema dopolnjuje tudi 2-fotonski mikroskop in vivo za povečanje podcelične ločljivosti. Naloge, ki se bodo izvajale v DE: De pridobi časovno korigirane edinstvene fotonske števce (TCSPC) mikroskope, ki so vrhunski instrument, ki zapolnjuje vrzel na Madžarskem, s katero je mogoče zaznati molekule z edinstveno molekularno občutljivostjo hkrati s sodoslednostjo 2–10 nm, stanjem vezanja, ko-mobilnostjo in stopnjo agregacije. B) Predstavitev primernosti območij izvajanja. Poleg obstoječih zmogljivosti za slikanje in strokovnega znanja treh institucij bo v Srednji Evropi ustvarjen edinstven nabor mikroskopskih in in vivo instrumentov za slikanje širokega spektra in kakovosti. Razvoj poteka v laboratorijih s pomembno infrastrukturo (PTE-SzKK, DE, SzBK), ki še vedno delujejo za vse partnerje. Raziskovalne skupine PTE, vključene v razpis, delujejo v sodobni stavbi „SMART building technology“ CoVE, zgrajeni leta 2012, katere infrastruktura je odlična za namestitev in vzdrževanje načrtovanih instrumentov. V posamično klimatiziranih, popolnoma temnih sobah se načrtuje namestitev instrumentov tako, da tudi v primeru nadaljnjih razširitev ni moteno dovolj prostora za uporabo instrumentov. Laboratoriji, ki sodelujejo v razpisu, imajo mednarodno odprt instrumentni park (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo dvofotonska mikroskopija). Mednarodno priznani strokovnjaki za mikroskopijo (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi in György Vámosi, madžarski koordinator Euro-BioImaging) zagotavljajo visoko raven strokovnega znanja in čim večjo uporabo razvoja. PTE CoVE, DE mikroskopski servis Laboratorij in SzBK imajo 2 redno usposobljeno osebje, in več raziskovalnih ekip dela s krajšim delovnim časom. Za vzpostavitev osrednjega instrumenta Nano-BioImaging bo PTE ustvaril 2 novi raziskovalni delovni mesti. Dolgoročno zamenjavo zagotavljajo 3 doktorske šole in študenti medicinskega laboratorija za slikanje diagnostični analitični oddelek na DE in PTE. Znanstveni metrični podatki osebja, ki dela v inštitutih, so povzeti spodaj. Ábrahám István: 49 Communications, IF:202, CIT:1953, H-index:22; György Vámosi: 60 Communications, IF:234, CIT:1783, H-index:22, patent:1; Dobra Zsuzsanna: 135 Komunikacij, IF:401, CIT: 2852, indeks H: 30, patent:11; Boldizsár Czéh: 58 sporočil, IF:231, CIT:4198, H-indeks:29; Csaba Varga: 22 Komunikacije, IF:218, CI (Slovenian)
12 August 2022
0 references
A) La presentación de las tareas que se llevarán a cabo durante el proyecto es una de las ciencias más dinámicas de hoy en día, la imagen celular es ahora adecuada para pruebas de alta velocidad (150 µs de tiempo de exposición), superresolación (resolución XY/Z 20/50 nm) de células vivas. La comparación de los resultados de la dinámica molecular y los estudios morfológicos superresolativos puede revolucionar la visión de las células en todas las áreas de las ciencias de la vida, desde la biología molecular hasta la neurociencia. Para lograr esta dirección de investigación revolucionaria e internacionalmente única, el Consorcio tiene la intención de crear un conjunto único de herramientas para rastrear los cambios subcelulares rápidos en los tejidos vivos, así como para implementar el análisis dinámico de la morfología de la super-resolación y las moléculas. Las herramientas para fines específicos también se adaptan bien a la evolución microscópica de los miembros del consorcio. Tareas que deben ejecutarse en PTE CoVE: Actualmente, el CoVE cuenta con un microscopio de «iluminación estructurada» (SIM) para ensayos de superresolación y se está adquiriendo como microscopio de reconstrucción óptica estocástica (STORM) para probar células vivas. Utilizando los recursos de la aplicación, STORM proporciona a los investigadores un desarrollo único que permite no solo la super-resolación sino también el seguimiento oportuno de moléculas individuales. Con el fin de estudiar interacciones, también se justifica un microscopio de superresolación STED-Flim. Además del microscopio reflectante interno completo (TIRFM) en CoVE, se construirá una herramienta que puede rastrear moléculas individuales en una célula viva con una velocidad única en el mundo utilizando la técnica de hoja óptica laminada (HILO) altamente inclinada (3D-SMD). También se adquiere un microscopio in vivo de 2 fotones para el seguimiento de procesos subcelulares rápidos en animales vivos. Las tareas que se llevarán a cabo en el SzBK son: Abre nuevas dimensiones de la exploración de estructuras moleculares anisotrópicas — de manera que supera significativamente las capacidades técnicas del DP-LSM previamente desarrollado en el SzBK, aumentando la resolución lateral y la sensibilidad — la adquisición de un nuevo proceso innovador y equipo equipado con una condición de polarización diferencial, el microscopio concocal de nuevo cribado (RCM, microscopia Confocal Re-scan). Los nuevos equipos también complementan el microscopio in vivo de 2 fotones para aumentar la resolución subcelular. Tareas que deben ejecutarse en DE: De adquiere un microscopio de contador de fotones (TCSPC), un instrumento de primer nivel que llena la brecha en Hungría, con el que las moléculas pueden ser detectadas con sensibilidad molecular única al mismo tiempo que la co-consistencia de 2-10 nm, el estado de unión, la co-movilidad y el grado de agregación. B) Presentación de la idoneidad del lugar o lugares de aplicación. Complementada por las capacidades de imagen existentes y la experiencia de las tres instituciones, en Europa Central se creará una gama única de instrumentos de imagen microscópicos e in vivo de amplio espectro y calidad. Los desarrollos se llevan a cabo en laboratorios con una infraestructura significativa (PTE-SzKK, DE, SzBK) que siguen siendo operativos para todos los socios. Los grupos de investigación PTE incluidos en la licitación trabajan en el moderno edificio «SMART Building technology» del CoVE, construido en 2012, cuya infraestructura es excelente para la instalación y mantenimiento de los instrumentos previstos. En habitaciones individualmente climatizadas y totalmente oscuras, está previsto acomodar los instrumentos de tal manera que, incluso en el caso de nuevas extensiones, no se perturbe el espacio suficiente para el uso de los instrumentos. Los laboratorios participantes en la licitación cuentan con un parque de instrumentos internacionalmente destacado (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, microscopía in vivo de dos fotones). Expertos reconocidos internacionalmente en microscopia (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi y György Vámosi, coordinador húngaro de Euro-BioImaging) garantizan un alto nivel de experiencia y la máxima utilización del desarrollo. El PTE CoVE, el Laboratorio de Servicio Microscópico DE y el SzBK cuentan con 2 empleados cualificados a tiempo completo, y varios equipos de investigación trabajan a tiempo parcial. Para crear el centro de Nano-BioImaging, PTE creará 2 nuevos trabajos de investigación. El reemplazo a largo plazo es proporcionado por 3 escuelas de doctorado y estudiantes del Departamento de Diagnóstico de Diagnóstico del Laboratorio de Imagen Médica en DE y PTE. A continuación se resumen los datos métricos científicos del personal que trabaja en los institutos. Ábrahám István: 49 Comunicaciones, IF:202, CIT:1953, índice H:22; György Vámo... (Spanish)
12 August 2022
0 references
A) Представянето на задачите, които ще бъдат изпълнени по време на проекта, е една от най-динамично развиващите се науки на днешния ден, клетъчното изобразяване вече е подходящо за високоскоростно (150 µs време на експозиция), супер-резолация (XY/Z резолюция 20/50 nm) тестване на живи клетки. Сравняването на резултатите от молекулярната динамика и свръхрезолативните морфологични изследвания може да революционизира визията на клетките във всички области на науките за живота, от молекулярната биология до неврологията. За да постигне това революционно и международно уникално изследователско направление, Консорциумът възнамерява да създаде уникален набор от инструменти за проследяване на бързите субклетъчни промени в живата тъкан, както и да приложи динамичния анализ на свръхрезолационна морфология и молекули. Инструментите за специфични цели също са добре пригодени за микроскопичните разработки на членовете на консорциума. Задачи, които трябва да бъдат изпълнени в ЦВППО: Понастоящем ЦВППО има микроскоп за „структурирана осветеност“ (SIM) за тестове за свръхрезолация и се доставя като стохастичен оптичен микроскоп за реконструкция (STORM) за тестване на живи клетки. Използвайки ресурсите на приложението, STORM осигурява на изследователите уникално развитие, което позволява не само супер-резолация, но и навременно проследяване на отделните молекули. За да се изследват взаимодействията, е необходим и суперрезолационен микроскоп STED-Flim. В допълнение към пълния вътрешен отразяващ микроскоп (TIRFM) в ЦВППО, ще бъде изграден инструмент, който може да проследява отделните молекули в жива клетка с уникална скорост в света, като се използва техниката с високо наклонен ламиниран оптичен лист (HILO) (3D-SMD). Осигурява се ин виво 2-фотонен микроскоп за наблюдение на бързи субклетъчни процеси при живи животни. Задачите, които трябва да бъдат изпълнени в SzBK, са: Открива нови измерения на изследването на анизотропни молекулярни структури — по начин, който значително надвишава техническите възможности на DP-LSM, разработен преди това в SzBK, чрез увеличаване на страничната разделителна способност и чувствителност — придобиването на нов иновативен процес и оборудване, оборудвано с диференциална поляризация, повторно пресяване на конкокалния микроскоп (RCM, Re-scan Confocal Microscopy). Ново оборудване допълва и in vivo 2-фотонния микроскоп за увеличаване на подклетъчната разделителна способност. Задачи, които трябва да бъдат изпълнени в Германия: De придобива коригиран във времето уникален фотонен брояч (TCSPC) за топинги с микроскоп, който е първокласен инструмент, който запълва празнината в Унгария, с който молекулите могат да бъдат открити с уникална молекулярна чувствителност едновременно с 2—10 nm съвместната съгласуваност, свързващото състояние, ко-мобилността и степента на агрегация. Б) Представяне на пригодността на обекта(ите) за изпълнение. Допълнен от съществуващите възможности за изображения и експертния опит на трите институции, в Централна Европа ще бъде създаден уникален набор от микроскопични и in vivo инструменти за изображения с широк спектър и качество. Разработките се извършват в лаборатории със значителна инфраструктура (PTE-SzKK, DE, SzBK), които все още функционират за всички партньори. Научноизследователските групи PTE, включени в търга, работят в модерната сграда „SMART сграда технология“ на ЦВППО, построена през 2012 г., чиято инфраструктура е отлична за инсталирането и поддръжката на планираните инструменти. В индивидуално климатизирани, напълно затъмнени помещения се планира инструментите да бъдат настанени по такъв начин, че дори в случай на допълнителни разширения да не се нарушава достатъчно пространство за използване на инструментите. Лабораториите, участващи в търга, разполагат с международен инструментален парк (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo двуфотонова микроскопия). Международно признатите експерти по микроскопия (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi и György Vámosi, унгарският координатор на Euro-BioImaging) гарантират високо ниво на експертен опит и максимално използване на разработването. PTE CoVE, DE Microscopic Service Laboratory и SzBK разполагат с 2 квалифицирани служители на пълен работен ден, а няколко изследователски екипа работят на непълно работно време. За да се създаде основното съоръжение на Nano-BioImaging, PTE ще създаде 2 нови работни места за научни изследвания. Дългосрочната замяна се осигурява от 3 докторски училища и студенти от Лабораторията по диагностика на медицинската образна диагностика в DE и PTE. Научните метрични данни за персонала, работещ в институтите, са обобщени по-долу. Ábrahám István: 49 Комуникации, IF:202, CIT:1953, H-индекс:22; Дьорд Вамоси: 60 Communications, IF:234, CIT:1783, H-индекс:22, patent:1; Добра Зузана: 135 съобщения, IF:401, CIT: 2852, H-индекс: 30, патент:11; Boldizsár Czéh: 58 Комуникации, IF:231, CIT:4198, H-индекс:29; Чаба Варга: 22 К... (Bulgarian)
12 August 2022
0 references
A) Il-preżentazzjoni tal-kompiti li għandhom jiġu implimentati matul il-proġett hija waħda mill-aktar xjenzi li qed jiżviluppaw b’mod dinamiku tal-lum, l-immaġni ċellulari issa hija adattata għall-ittestjar ta’ ċelloli ħajjin b’veloċità għolja (150 µs ħin ta’ espożizzjoni), super-resolation (riżoluzzjoni XY/Z 20/50 nm). It-tqabbil tar-riżultati tad-dinamika molekulari u l-istudji morfoloġiċi superresolattivi jistgħu jirrivoluzzjonaw il-viżjoni taċ-ċelloli fl-oqsma kollha tax-xjenzi tal-ħajja, mill-bijoloġija molekulari sa n-newroxjenza. Biex tinkiseb din id-direzzjoni ta ‘riċerka rivoluzzjonarju u internazzjonalment unika, il-Konsorzju għandu l-ħsieb li joħloq sett uniku ta’ għodod biex jittraċċaw bidliet subċellulari mgħaġġla fit-tessut ħaj, kif ukoll biex jimplimentaw l-analiżi dinamika ta ‘morfoloġija super-resolation u molekuli. L-għodod għal skopijiet speċifiċi huma wkoll adattati sew għall-iżviluppi mikroskopiċi tal-membri tal-konsorzju. Kompiti li għandhom jiġu implimentati fil-PTE CoVE: Bħalissa, is-CoVE għandu mikroskopju ta’ “illuminazzjoni strutturata” (SIM) għal testijiet ta’ supersolazzjoni u qed jiġi akkwistat bħala mikroskopju ta’ rikostruzzjoni ottika stochastic (STORM) għall-ittestjar ta’ ċelloli ħajjin. Bl-użu tar-riżorsi ta ‘l-applikazzjoni, STORM jipprovdi lir-riċerkaturi bi żvilupp uniku li jippermetti mhux biss super-resolation iżda wkoll l-intraċċar f’waqtu ta’ molekuli individwali. Sabiex jiġu studjati l-interazzjonijiet, huwa meħtieġ ukoll mikroskopju ta’ supersolazzjoni STED-Flim. Minbarra l-mikroskopju riflettiv intern komplut (TIRFM) fis-CoVE, se tinbena għodda li tista’ ssegwi molekuli individwali f’ċellula ħajja b’veloċità unika fid-dinja bl-użu tat-teknika tal-folja ottika laminata inklinata ħafna (HILO) (3D-SMD). Mikroskopju ta’ 2-foni in vivo jinkiseb ukoll għall-monitoraġġ ta’ proċessi subċellulari rapidi f’annimali ħajjin. Il-kompiti li għandhom jiġu implimentati fl-SzBK huma: Jiftaħ dimensjonijiet ġodda tal-esplorazzjoni ta’ strutturi molekulari anisotropiċi — b’mod li jaqbeż b’mod sinifikanti l-kapaċitajiet tekniċi tad-DP-LSM żviluppati preċedentement fl-SzBK, billi jżid ir-riżoluzzjoni u s-sensittività laterali — l-akkwist ta’ proċess innovattiv ġdid u tagħmir mgħammar b’kundizzjoni ta’ polarizzazzjoni differenzjali, l-iskrinjar mill-ġdid tal-mikroskopju konkoku (RCM, Re-scan Confocal Microscopy). Tagħmir ġdid jikkomplementa wkoll il-mikroskopju ta’ 2-foni in vivo biex tiżdied ir-riżoluzzjoni subċellulari. Kompiti li għandhom jiġu implimentati f’DE: De takkwista toppings ta’ mikroskopju ta’ counter tal-foton uniku kkoreġut bil-ħin (TCSPC), li huwa strument tal-ogħla livell li jimla l-vojt fl-Ungerija, li bih il-molekuli jistgħu jiġu individwati b’sensittività molekulari unika fl-istess ħin bħall-kokonsistenza ta’ 2–10 nm, l-istat tal-irbit, il-komobbiltà u l-grad ta’ aggregazzjoni. B) Preżentazzjoni tal-adegwatezza tas-sit(i) ta’ implimentazzjoni. Flimkien mal-kapaċitajiet eżistenti ta’ immaġni u l-għarfien espert tat-tliet istituzzjonijiet, fl-Ewropa Ċentrali se tinħoloq firxa unika ta’ strumenti ta’ immaġni mikroskopiċi u in vivo ta’ spettru wiesa’ u ta’ kwalità. L-iżviluppi jitwettqu f’laboratorji b’infrastruttura sinifikanti (PTE-SzKK, DE, SzBK) li għadhom operattivi għall-imsieħba kollha. Il-gruppi ta’ riċerka PTE inklużi fl-offerta qed jaħdmu fil-bini modern tat-“teknoloġija tal-bini SMART” tas-CoVE, mibni fl-2012, li l-infrastruttura tiegħu hija eċċellenti għall-installazzjoni u l-manutenzjoni tal-istrumenti ppjanati. Fi kmamar bl-arja kundizzjonata u kompletament skurati individwalment, huwa ppjanat li l-istrumenti jiġu akkomodati b’tali mod li, anki fil-każ ta’ estensjonijiet ulterjuri, ma jkunx imfixkel biżżejjed spazju għall-użu tal-istrumenti. Il-laboratorji li jipparteċipaw fis-sejħa għall-offerti għandhom park ta’ strumenti internazzjonalment pendenti (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo b’mikroskopija b’żewġ ritratti). Esperti rikonoxxuti internazzjonalment fil-mikroskopija (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Gyġzġ Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglġdi u György Vámosi, il-koordinatur Ungeriż tal-Euro-BioImaging) jiżguraw livell għoli ta’ għarfien espert u utilizzazzjoni massima tal-iżvilupp. Il-PTE CoVE, il-Laboratorju tas-Servizz Mikroskopiku DE u l-SzBK għandhom 2 persunal ikkwalifikat full-time, u diversi timijiet ta’ riċerka jaħdmu part-time. Biex tinħoloq il-faċilità ewlenija Nano-BioImaging, PTE se toħloq 2 impjiegi ġodda ta’ riċerka. Is-sostituzzjoni fit-tul hija pprovduta minn 3 skejjel ta’ dottorat u studenti tad-Dipartiment Analitiku Dijanjostiku tal-Laboratorju Mediku tal-Immaġni f’DE u PTE. Id-data xjentifika metrika tal-persunal li jaħdmu fl-istituti huma miġbura fil-qosor hawn taħt. Ábrahám István: 49 Komunikazzjoni, IF:202, CIT:1953, H-index:22; György Vámosi: 60 Komunikazzjoni, IF:234, CIT:1783, H-index:22, privattiva:1; Zsuzsanna tajba: 135 Komunikazzjoni, IF:401, CIT: 2852, indiċi H: 30,... (Maltese)
12 August 2022
0 references
A) Apresentação das tarefas a serem implementadas durante o projeto é uma das ciências mais desenvolvidas dinamicamente de hoje, a imagem telemóvel é agora adequada para testes de alta velocidade (tempo de exposição de 150 µs), super-resolução (resolução XY/Z 20/50 nm) de células vivas. Comparar os resultados da dinâmica molecular e estudos morfológicos superresolativos pode revolucionar a visão das células em todas as áreas das ciências da vida, da biologia molecular à neurociência. Para alcançar esta revolucionária e internacionalmente única direção de pesquisa, o Consórcio pretende criar um conjunto único de ferramentas para rastrear rápidas mudanças subcelulares no tecido vivo, bem como implementar a análise dinâmica da morfologia e moléculas de superresolação. Os instrumentos para fins específicos também são adequados para os desenvolvimentos microscópicos dos membros do consórcio. Tarefas a executar no CdEP PTE: Atualmente, o CdVE possui um microscópio de «iluminação estruturada» (SIM) para testes de superresolação e está sendo adquirido como um microscópio de reconstrução ótica estocástica (STORM) para testar células vivas. Usando os recursos da aplicação, a STORM fornece aos pesquisadores um desenvolvimento único que permite não só super-resolução, mas também o rastreamento oportuno de moléculas individuais. Para estudar interações, também se justifica um microscópio de superresolação STED-Flim. Além do microscópio reflexivo interno completo (TIRFM) no CdVE, será construída uma ferramenta que pode rastrear moléculas individuais em uma célula viva com velocidade única no mundo usando a técnica de folha ótica laminada altamente inclinada (HILO) (3D-SMD). Um microscópio in vivo de 2 fotões também é adquirido para o monitoramento de processos subcelulares rápidos em animais vivos. As tarefas a executar no SzBK são as seguintes: Abre novas dimensões da exploração de estruturas moleculares anisotrópicas — de uma forma que excede significativamente as capacidades técnicas do DP-LSM previamente desenvolvido no SzBK, aumentando a resolução lateral e a sensibilidade — a aquisição de um novo processo inovador e equipamentos equipados com uma condição de polarização diferencial, o microscópio concocal de triagem (RCM, Microscopia Confocal Reescan). Novos equipamentos também complementam o microscópio in vivo de 2 fotões para aumentar a resolução subcelular. Tarefas a executar em DE: De adquire uma cobertura de microscópio de contabilista de fótons único corrigido no tempo (TCSPC), que é um instrumento de alto nível que preenche a lacuna na Hungria, com o qual as moléculas podem ser detetadas com sensibilidade molecular única ao mesmo tempo que a coconsistência de 2-10 nm, o estado de ligação, a comobilidade e o grau de agregação. B) Apresentação da adequação do(s) local(s) de implementação. Complementada pelas capacidades de imagiologia existentes e pelos conhecimentos especializados das três instituições, será criado na Europa Central um conjunto único de instrumentos de imagem microscópicos e in vivo de um amplo espetro e qualidade. Os desenvolvimentos são realizados em laboratórios com infraestruturas significativas (PTE-SzKK, DE, SzBK) que ainda estão operacionais para todos os parceiros. Os grupos de pesquisa PTE incluídos no concurso estão trabalhando no moderno edifício «SMART tecnologia de construção» do CdVE, construído em 2012, cuja infraestrutura é excelente para a instalação e manutenção dos instrumentos planejados. Em quartos climatizados e totalmente escurecidos individualmente, prevê-se que os instrumentos sejam acomodados de modo a que, mesmo no caso de outras extensões, não seja perturbado um espaço suficiente para a utilização dos instrumentos. Os laboratórios participantes do concurso contam com um parque de instrumentos de destaque internacional (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, microscopia de dois fotões in vivo). Peritos em microscopia internacionalmente reconhecidos (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi e György Vámosi, coordenador húngaro da Euro-BioImaging) asseguram um elevado nível de especialização e a máxima utilização do desenvolvimento. O PTE CdVE, o Laboratório de Serviços Microscópicos DE e o SzBK têm 2 funcionários qualificados em tempo integral, e várias equipas de pesquisa trabalham em part-time. Para criar o centro de Nano-BioImaging, o PTE criará 2 novos postos de trabalho de investigação. A substituição a longo prazo é fornecida por 3 escolas de doutoramento e estudantes do Departamento de Análise de Diagnóstico do Laboratório de Imagem Médica em DE e PTE. Os dados métricos científicos do pessoal que trabalha nos institutos são resumidos a seguir. Ábrahám István: 49 Comunicações, IF:202, CIT:1953, índice H:22; György Vámosi: 60 Comunicações, IF:234, CIT:1783, H-índice:22, patente:1; Boa Zsuzsanna: 135 Comunicações, IF:401, IRC: 2852, índice H: 30, patente:11; Boldizsár Czéh: 58 Comunica... (Portuguese)
12 August 2022
0 references
A) Præsentation af de opgaver, der skal gennemføres i løbet af projektet er en af de mest dynamisk udviklende videnskaber i dag, cellulær billeddannelse er nu egnet til høj hastighed (150 µs eksponeringstid), super-resolation (XY/Z resolution 20/50 nm) test af levende celler. Sammenligning af resultaterne af molekylær dynamik og superresolative morfologiske undersøgelser kan revolutionere visionen af celler inden for alle områder af biovidenskab, fra molekylær biologi til neurovidenskab. For at opnå denne revolutionerende og internationalt unikke forskningsretning har konsortiet til hensigt at skabe et unikt sæt værktøjer til at spore hurtige subcellulære ændringer i levende væv samt at gennemføre den dynamiske analyse af super-resolation morfologi og molekyler. Værktøjerne til specifikke formål er også velegnede til konsortiemedlemmernes mikroskopiske udvikling. Opgaver, der skal gennemføres i PTE-ekspertisecenteret: I øjeblikket har erhvervsekspertisecentret et "struktureret belysningsmikroskop" (SIM) til superresolationstest og indkøbes som et stokastisk optisk rekonstruktionsmikroskop (STORM) til test af levende celler. Ved hjælp af ressourcerne i ansøgningen, STORM giver forskere med en unik udvikling, der tillader ikke kun super-resolation, men også rettidig sporing af individuelle molekyler. For at studere interaktioner, er et STED-Flim superresolation mikroskop også berettiget. Ud over det komplette interne reflekterende mikroskop (TIRFM) i CoVE, vil der blive bygget et værktøj, der kan spore individuelle molekyler i en levende celle med unik hastighed i verden ved hjælp af høj hældning lamineret optisk ark (HILO) teknik (3D-SMD). Der indkøbes også et in vivo 2-fotonmikroskop til overvågning af hurtige subcellulære processer hos levende dyr. De opgaver, der skal gennemføres i SzBK, er: Åbner nye dimensioner af udforskningen af anisotrope molekylære strukturer — på en måde, der væsentligt overstiger den tekniske kapacitet i DP-LSM, der tidligere blev udviklet i SzBK, ved at øge lateral opløsning og følsomhed — erhvervelse af en ny innovativ proces og udstyr udstyret med en differentieret polariseringstilstand, re-screening concocal microscope (RCM, Re-scan Confocal Microscopy). Nyt udstyr supplerer også in vivo 2-fotonmikroskopet for at øge subcellulær opløsning. Opgaver, der skal gennemføres i DE: De erhverver en tidskorrigeret unik fotontæller (TCSPC) mikroskop toppings, som er et top-notch instrument, der udfylder hullet i Ungarn, hvormed molekylerne kan detekteres med unik molekylær følsomhed på samme tid som 2-10 nm co-konsistens, bindingstilstand, co-mobilitet og graden af aggregering. B) Præsentation af egnetheden af implementeringsstedet/-stederne. Suppleret med eksisterende billeddannelseskapaciteter og de tre institutioners ekspertise vil der blive skabt en unik vifte af mikroskopiske og in vivo-billeddannende instrumenter af et bredt spektrum og af høj kvalitet i Centraleuropa. Udviklingen foregår i laboratorier med betydelig infrastruktur (PTE-SzKK, DE, SzBK), som stadig er operationelle for alle partnere. De PTE-forskergrupper, der indgår i udbuddet, arbejder i den moderne "SMART Building Technology" bygning af erhvervsekspertisecenteret, der blev bygget i 2012, og hvis infrastruktur er fremragende til installation og vedligeholdelse af de planlagte instrumenter. I individuelt airconditionerede, helt mørke rum er det planlagt at rumme instrumenterne på en sådan måde, at der, selv i tilfælde af yderligere udvidelser, ikke forstyrres tilstrækkelig plads til brug af instrumenterne. De laboratorier, der deltager i udbuddet, har en internationalt udestående instrumentpark (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo 2-fotomikroskopi). Internationalt anerkendte eksperter i mikroskopi (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi og György Vámosi, den ungarske koordinator for Euro-BioImaging) sikrer en høj grad af ekspertise og maksimal udnyttelse af udviklingen. PTE-ekspertisecentret, DE Microscopic Service Laboratory og SzBK har 2 fuldtidskvalificerede medarbejdere, og flere forskerhold arbejder på deltid. For at skabe Nano-BioImaging-kernefaciliteten vil PTE skabe 2 nye forskningsjob. Den langsigtede erstatning leveres af 3 ph.d.-skoler og studerende fra Medical Imaging Laboratory Diagnostic Analytical Department i DE og PTE. De videnskabelige data for de ansatte, der arbejder i institutterne, er sammenfattet nedenfor. Ábrahám István: 49 Meddelelser, IF:202, CIT:1953, H-indeks:22; György Vámosi: 60 Meddelelser, IF:234, CIT:1783, H-index:22, patent:1; God Zsuzsanna: 135 Meddelelser, IF:401, pengetransport: 2852, H-indeks: 30, patent:11; Boldizsár Czéh: 58 Meddelelser, IF:231, CIT:4198, H-indeks:29; Csaba Varga: 22 meddelelser, IF:218, CI (Danish)
12 August 2022
0 references
A) Prezentarea sarcinilor care urmează să fie implementate în timpul proiectului este una dintre cele mai dinamice științe de astăzi, imagistica celulară este acum potrivită pentru testarea de mare viteză (150 µs timp de expunere), super-rezoluție (rezoluție XY/Z 20/50 nm) a celulelor vii. Compararea rezultatelor dinamicii moleculare și a studiilor morfologice superrezolative poate revoluționa viziunea celulelor în toate domeniile științelor vieții, de la biologie moleculară la neuroștiință. Pentru a realiza această direcție revoluționară și unică la nivel internațional de cercetare, Consorțiul intenționează să creeze un set unic de instrumente pentru a urmări schimbările subcelulare rapide în țesutul viu, precum și pentru a implementa analiza dinamică a morfologiei și moleculelor super-rezolvate. Instrumentele pentru scopuri specifice sunt, de asemenea, bine adaptate la evoluțiile microscopice ale membrilor consorțiului. Sarcini care urmează să fie puse în aplicare în cadrul PTE CEP: În prezent, CEP are un microscop de „iluminare structurată” (SIM) pentru testele de suprasolare și este achiziționat ca microscop stocastic de reconstrucție optică (STORM) pentru testarea celulelor vii. Folosind resursele aplicației, STORM oferă cercetătorilor o dezvoltare unică care permite nu numai super-rezolvarea, ci și urmărirea în timp util a moleculelor individuale. Pentru a studia interacțiunile, este de asemenea justificat un microscop de superrezolare STED-Flim. În plus față de microscopul reflectorizant intern complet (TIRFM) în CEP, va fi construit un instrument care poate urmări moleculele individuale într-o celulă vie cu viteză unică în lume, folosind tehnica foii optice laminate (HILO) extrem de înclinate (3D-SMD). Un microscop 2-fotonin in vivo este, de asemenea, achiziționat pentru monitorizarea proceselor subcelulare rapide la animalele vii. Sarcinile care urmează să fie puse în aplicare în cadrul SzBK sunt: Deschide noi dimensiuni ale explorării structurilor moleculare anizotropice – într-un mod care depășește semnificativ capacitățile tehnice ale DP-LSM dezvoltate anterior în SzBK, prin creșterea rezoluției laterale și a sensibilității – achiziționarea unui nou proces inovator și a echipamentelor echipate cu o condiție de polarizare diferențială, microscopul concocal re-screening (RCM, Microscopia Confocală Re-scan). Echipamente noi completează, de asemenea, microscopul 2-foton in vivo pentru a crește rezoluția subcelulară. Sarcini care urmează să fie puse în aplicare în DE: De achiziționează topping-uri microscopice unice de contor foton (TCSPC) corectate în timp, care este un instrument de vârf care umple golul din Ungaria, cu care moleculele pot fi detectate cu sensibilitate moleculară unică în același timp cu co-consecvența de 2-10 nm, starea de legătură, co-mobilitatea și gradul de agregare. B) Prezentarea caracterului adecvat al sitului (locurilor) de implementare. La care se adaugă capacitățile de imagistică existente și expertiza celor trei instituții, în Europa Centrală se va crea o gamă unică de instrumente de imagistică microscopice și in vivo de un spectru larg și de o calitate largă. Lucrările se desfășoară în laboratoare cu infrastructură semnificativă (PTE-SzKK, DE, SzBK), care sunt încă operaționale pentru toți partenerii. Grupurile de cercetare PTE incluse în licitație lucrează în clădirea modernă „Tehnologia clădirilor SMART” a CEP, construită în 2012, a cărei infrastructură este excelentă pentru instalarea și întreținerea instrumentelor planificate. În camerele individuale cu aer condiționat, complet întunecoase, se preconizează instalarea instrumentelor astfel încât, chiar și în cazul extinderilor ulterioare, să nu se perturbe suficient spațiu pentru utilizarea instrumentelor. Laboratoarele participante la licitație dispun de un parc de instrumente remarcabil la nivel internațional (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, microscopie bifotonică in vivo). Experții recunoscuți pe plan internațional în microscopie (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi și György Vámosi, coordonatorul maghiar al Euro-BioImaging) asigură un nivel ridicat de expertiză și o utilizare maximă a dezvoltării. PTE CoVE, Laboratorul de Servicii Microscopice DE și SzBK au 2 angajați calificați cu normă întreagă, iar mai multe echipe de cercetare lucrează cu fracțiune de normă. Pentru a crea instrumentul de bază Nano-BioImaging, PTE va crea două noi locuri de muncă în domeniul cercetării. Înlocuirea pe termen lung este asigurată de 3 școli doctorale și studenți de la Departamentul de Analiză de Diagnostic al Laboratorului de Imagistică Medicală de la DE și PTE. Datele metrice științifice ale personalului care lucrează în institute sunt rezumate mai jos. Ábrahám István: 49 Comunicații, IF:202, CIT:1953, H-index:22; György Vámosi: 60 Comunicații, IF:234, CIT:1783, H-index:22, brevet:1; Bunul Zsuzsanna: 135 Comunicații, IF:401, CIT: 2852, indi... (Romanian)
12 August 2022
0 references
A) Die Darstellung der während des Projektes durchzuführenden Aufgaben ist eine der dynamischsten Wissenschaften der heutigen Zeit, die zelluläre Bildgebung eignet sich nun für die Hochgeschwindigkeit (150 µs Belichtungszeit), die Superresolation (XY/Z-Auflösung 20/50 nm) von lebenden Zellen. Der Vergleich der Ergebnisse molekularer Dynamik und superresolativer morphologischer Studien kann die Vision von Zellen in allen Bereichen der Lebenswissenschaften revolutionieren, von der Molekularbiologie bis zur Neurowissenschaften. Um diese revolutionäre und international einzigartige Forschungsrichtung zu erreichen, beabsichtigt das Konsortium, eine einzigartige Reihe von Werkzeugen zu schaffen, um schnelle subzelluläre Veränderungen im lebenden Gewebe zu verfolgen und die dynamische Analyse von Super-Resolationsmorphologie und Molekülen umzusetzen. Die Instrumente für spezifische Zwecke sind auch für die mikroskopischen Entwicklungen der Konsortiumsmitglieder gut geeignet. Aufgaben, die im Rahmen von PTE CoVE durchzuführen sind: Derzeit verfügt das CoVE über ein „strukturiertes Beleuchtungsmikroskop“ (SIM) für Superresolationstests und wird als stochastisches optisches Rekonstruktionsmikroskop (STORM) zum Testen von lebenden Zellen beschafft. Mit den Ressourcen der Anwendung bietet STORM Forschern eine einzigartige Entwicklung, die nicht nur Super-Resolation, sondern auch die zeitnahe Verfolgung einzelner Moleküle ermöglicht. Um Wechselwirkungen zu untersuchen, ist auch ein STED-Flim-Superresolationsmikroskop gerechtfertigt. Neben dem kompletten internen reflektierenden Mikroskop (TIRFM) in CoVE wird ein Werkzeug gebaut, das einzelne Moleküle in einer lebenden Zelle mit einzigartiger Geschwindigkeit in der Welt mit der hoch geneigten laminierten optischen Blechtechnik (3D-SMD) verfolgen kann. Ein in vivo 2-Photon-Mikroskop wird auch für die Überwachung von schnellen subzellulären Prozessen bei lebenden Tieren beschafft. Die Aufgaben der SzBK sind: Eröffnet neue Dimensionen der Erforschung anisotroper molekularer Strukturen – in einer Weise, die die technischen Fähigkeiten des zuvor im SzBK entwickelten DP-LSM durch Erhöhung der seitlichen Auflösung und Sensitivität deutlich übertrifft – die Anschaffung eines neuen innovativen Prozesses und Gerätes mit Differentialpolarisationszustand, dem Re-Screening-Konkokalmikroskop (RCM, Re-scan Confocal Microscopy). Neue Geräte ergänzen auch das in vivo 2-Photon-Mikroskop, um die subzelluläre Auflösung zu erhöhen. In DE durchzuführende Aufgaben: De erwirbt ein zeitkorrigiertes einzigartiges Photonenzähler (TCSPC) Mikroskop, das ein erstklassiges Instrument ist, das die Lücke in Ungarn füllt, mit dem die Moleküle mit einzigartiger molekularer Empfindlichkeit gleichzeitig mit der 2-10 nm Kokonsistenz, dem Bindungszustand, der Komobilität und dem Grad der Aggregation detektiert werden können. B) Darstellung der Eignung der Durchführungsstelle(n). Ergänzt durch bestehende Bildgebungskapazitäten und die Expertise der drei Institutionen wird in Mitteleuropa ein einzigartiges Spektrum an mikroskopischen und in vivo bildgebenden Instrumenten mit breitem Spektrum und Qualität geschaffen. Die Entwicklungen werden in Laboren mit beträchtlicher Infrastruktur (PTE-SzKK, DE, SzBK) durchgeführt, die für alle Partner noch betriebsbereit sind. Die in die Ausschreibung einbezogenen PTE-Forschungsgruppen arbeiten im modernen Gebäude „SMART Building Technology“ des 2012 gebauten CoVE, dessen Infrastruktur hervorragend für die Installation und Wartung der geplanten Instrumente geeignet ist. In individuell klimatisierten, voll-Dunkel-Zimmern ist geplant, die Instrumente so zu beherbergen, dass auch bei weiteren Erweiterungen kein ausreichender Platz für den Einsatz der Instrumente gestört wird. Die an der Ausschreibung beteiligten Labors verfügen über einen international herausragenden Instrumentenpark (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo Zweiphotonenmikroskopie). International anerkannte Experten für Mikroskopie (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi und György Vámosi, die ungarische Koordinatorin von Euro-BioImaging) gewährleisten ein hohes Maß an Fachwissen und maximale Nutzung der Entwicklung. Die PTE CoVE, das DE Microscopic Service Laboratory und das SzBK verfügen über 2 hauptberuflich qualifizierte Mitarbeiter, und mehrere Forschungsteams arbeiten in Teilzeit. Um die Kernanlage Nano-BioImaging zu schaffen, wird PTE 2 neue Forschungsarbeitsplätze schaffen. Der langfristige Ersatz wird von 3 Doktoranden und Studenten der Medical Imaging Laboratory Diagnostic Analytical Department an DE und PTE zur Verfügung gestellt. Die wissenschaftlichen Daten der in den Instituten tätigen Mitarbeiter sind nachstehend zusammengefasst. Ábrahám István: 49 Mitteilungen, IF:202, CIT:1953, H-Index:22; György Vámosi: 60 Mitteilungen, IF:234, CIT:1783, H-Index:22, Patent:1; Gute Zsuzsanna: 135 Kommunikation, IF:401, CIT: ... (German)
12 August 2022
0 references
A) Presentation av de uppgifter som ska genomföras under projektet är en av de mest dynamiskt utvecklande vetenskaperna i dag, cellulär avbildning är nu lämplig för höghastighetstestning (150 µs exponeringstid), superresolation (XY/Z upplösning 20/50 nm) av levande celler. Att jämföra resultaten av molekylärdynamik och superresolativa morfologiska studier kan revolutionera cellernas vision inom alla områden av biovetenskapen, från molekylärbiologi till neurovetenskap. För att uppnå denna revolutionära och internationellt unika forskningsriktning har konsortiet för avsikt att skapa en unik uppsättning verktyg för att spåra snabba subcellulära förändringar i levande vävnad, samt att genomföra den dynamiska analysen av superresolationsmorfologi och molekyler. Verktygen för särskilda ändamål är också väl lämpade för konsortiemedlemmarnas mikroskopiska utveckling. Uppgifter som ska genomföras i yrkeskunskapscentrumet för vetenskap, telekommunikation och energi: För närvarande har CoVE ett ”strukturerat belysnings” mikroskop (SIM) för superresolationstester och upphandlas som ett stokastiskt optiskt rekonstruktionsmikroskop (STORM) för testning av levande celler. Med hjälp av resurserna i applikationen, STORM ger forskare med en unik utveckling som möjliggör inte bara super-resolation utan också snabb spårning av enskilda molekyler. För att studera interaktioner är också ett STED-Flim superresolationsmikroskop motiverat. Förutom det kompletta interna reflekterande mikroskopet (TIRFM) i CoVE kommer ett verktyg att byggas som kan spåra enskilda molekyler i en levande cell med unik hastighet i världen med hjälp av den mycket lutande laminerade optiska arktekniken (HILO) (3D-SMD). Ett in vivo 2-fotonmikroskop anskaffas också för övervakning av snabba subcellulära processer hos levande djur. De uppgifter som ska genomföras i SzBK är följande: Öppnar nya dimensioner av utforskningen av anisotropa molekylära strukturer – på ett sätt som avsevärt överstiger de tekniska egenskaperna hos DP-LSM som tidigare utvecklats i SzBK, genom att öka lateral upplösning och känslighet – förvärv av en ny innovativ process och utrustning utrustad med en differential polarisation tillstånd, re-screening concocal microscope (RCM, Re-scan Confocal Microscopy). Ny utrustning kompletterar också in vivo 2-fotonmikroskopet för att öka subcellulär upplösning. Uppgifter som ska genomföras i Tyskland: De förvärvar en tidskorrigerad unik fotonräknare (TCSPC) mikroskop toppings, som är ett top-notch instrument som fyller gapet i Ungern, med vilken molekylerna kan detekteras med unik molekylär känslighet samtidigt som 2–10 nm co-consistens, bindningsstatus, samrörlighet och graden av aggregering. B) Presentation av genomförandeplatsens lämplighet. I Centraleuropa kommer en unik uppsättning instrument för mikroskopisk och in vivo-avbildning av ett brett spektrum och kvalitet att skapas, kompletterad med befintlig bildkapacitet och expertis hos de tre institutionerna. Utvecklingen sker i laboratorier med betydande infrastruktur (PTE-SzKK, DE, SzBK) som fortfarande är i drift för alla partner. De PTE-forskningsgrupper som ingår i upphandlingen arbetar i den moderna ”SMART-byggnadsteknologin” i CoVE, byggd 2012, vars infrastruktur är utmärkt för installation och underhåll av de planerade instrumenten. I individuellt luftkonditionerade, fullt avtagbara rum är det planerat att inrymma instrumenten på ett sådant sätt att tillräckligt utrymme för användning av instrumenten inte störs, inte ens vid ytterligare utökningar. De laboratorier som deltar i anbudsförfarandet har en internationellt framstående instrumentpark (SIM, STORM, TIRF, HILO, DP-LSM, Flim, in vivo två-fotonmikroskopi). Internationellt erkända experter på mikroskopi (Istvan Ábrahám, Zsuzsanna Jóes, Győző Garab, György Vereb, Csaba Varga, István Krizbai, Boldizsár Czéh, Dóra Reglődi och György Vámosi, Ungerns samordnare för Euro-BioImaging) säkerställer en hög nivå av expertis och maximalt utnyttjande av utvecklingen. PTE CoVE, DE Microscopic Service Laboratory och SzBK har två heltidskvalificerade medarbetare och flera forskarlag arbetar deltid. För att skapa kärnanläggningen Nano-BioImaging kommer PTE att skapa två nya forskningsjobb. Den långsiktiga ersättningen tillhandahålls av 3 doktorandskolor och studenter från Medical Imaging Laboratory Diagnostic Analytical Department vid DE och PTE. Nedan sammanfattas de vetenskapliga metriska uppgifterna för den personal som arbetar vid instituten. Ábrahám István: 49 Meddelanden, IF:202, CIT:1953, H-index:22; György Vámosi: 60 Kommunikationer, IF:234, CIT:1783, H-index:22, patent:1; Bra Zsuzsanna: 135 meddelanden, IF:401, CIT: 2852, H-index: 30, patent:11; Boldizsár Czéh: 58 Meddelanden, IF:231, CIT:4198, H-index:29; Csaba Varga: 22 Meddelanden, IF:218, CI (Swedish)
12 August 2022
0 references
Pécs, Baranya
0 references
Identifiers
GINOP-2.3.3-15-2016-00030
0 references