EpiARN: Structure, dynamics and regulation of ribonucleoproteic and epitranscriptome complexes: impact on environmental adaptation, human pathologies and host-pathogen interactions (Q3712207)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3712207 in France
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | EpiARN: Structure, dynamics and regulation of ribonucleoproteic and epitranscriptome complexes: impact on environmental adaptation, human pathologies and host-pathogen interactions |
Project Q3712207 in France |
Statements
320,000.0 Euro
0 references
800,000.0 Euro
0 references
40.0 percent
0 references
1 January 2019
0 references
30 June 2023
0 references
Centre National de la Recherche Scientifique
0 references
L'objectif du projet EpiARN est d'étudier les mécanismes moléculaires impliqués dans les modifications d'ARN en analysant la relation entre structure et fonction de complexes ribonucléoprotéiques (complexes RNP) en lien avec plusieurs ARN dont dépendent les mécanique de traduction génétique (rRNA, tRNA, snoRNA) ou les ARN régulateurs. L'analyse des dynamiques et des propriétés de reconnaissance des RNP qui impliquent notamment des interactions transitoires constituera l'un des défis à relever. Pour cette raison, le projet nécessite une approche pluridisciplinaire (biochimie, biophysique, génétique, biologie structurelle, etc.) et le développement de technique d'extraction à haut débit (analyse épitranscriptomique, purification des RNP), d'où la nécessité d'investir dans les équipements appropriés et de mettre en place une synergie forte entre les laboratoire, reconnus sur le plan international, à la pointe dans ce domaine (IBMC/IBMP à Strasbourg, CBI/IGBMC et LBP à Illkirch, IMoPA et NGERE à Nancy et LNIO à Troyes). Les équipements acquis dans le cadre du projet sont : - un microscope électronique qui sera installé dans les locaux de l'IBMC/IBMP (pour permettre d'effectuer les analyses cryo-EM dans des conditions expérimentales optimales) ; - une caméra haute-sensibilité de dernière génération GATAN K3 qui constituera une amélioration du matériel cryo-EM du CBI, qui accueille déjà les infrastructures FRISBI et Instruct. (French)
0 references
The objective of the EpiRNA project is to study the molecular mechanisms involved in RNA modifications by analysing the relationship between structure and function of ribonucleoproteic complexes (RNP complexes) in relation to several RNAs on which genetic translation mechanics (rRNA, tRNA, snoRNA) or regulatory RNA depend. An analysis of the dynamics and recognition properties of RNPs that involve, inter alia, transient interactions will be one of the challenges to be addressed. For this reason, the project requires a multidisciplinary approach (biochemistry, biophysics, genetics, structural biology, etc.) and the development of high-throughput extraction techniques (epitranscriptomic analysis, purification of RNPs), hence the need to invest in the appropriate equipment and to establish a strong synergy between internationally recognised laboratories at the forefront in this field (IBMC/IBMP in Strasbourg, CBI/IGBMC and LBP in Illkirch, IMOPA and Ngere in Nancy and LNIO in Troyes). The equipment acquired under the project is: an electron microscope to be installed in the IBMC/IBMP premises (to enable cryo-EM analyses under optimal experimental conditions); — a latest generation Gatan K3 high-sensitivity camera that will be an improvement of CBI cryo-EM equipment, which already hosts the Frisbi and Instruct infrastructures. (English)
22 November 2021
0.3825847418544051
0 references
Ziel des EpiARN-Projekts ist es, die molekularen Mechanismen zu untersuchen, die an RNA-Änderungen beteiligt sind, indem die Beziehung zwischen Struktur und Funktion von Ribonnukleoproteinkomplexen (RNP-Komplexen) in Verbindung mit mehreren RNA, von denen die genetische Übersetzungsmechanik (rRNA, tRNA, snoRNA) oder RegulierungsrNA abhängig ist, analysiert wird. Eine der Herausforderungen ist die Analyse der Dynamiken und Erkennungseigenschaften von RNP, die insbesondere vorübergehende Interaktionen mit sich bringen. Aus diesem Grund erfordert das Projekt einen multidisziplinären Ansatz (Biochemie, Biophysik, Genetik, Strukturbiologie usw.) und die Entwicklung von Hochgeschwindigkeitsextraktionstechniken (Epitranskriptomanalyse, Reinigung von RNP), weshalb Investitionen in die geeignete Ausrüstung und eine starke Synergie zwischen den international anerkannten Labors (IBMC/IBMP in Straßburg, CBI/IGBMC und LBP in Illkirch, IMOPA und Ngere in Nancy und LNIO in Troyes) erforderlich sind. Die im Rahmen des Projekts erworbenen Ausrüstungen sind: — ein Elektronenmikroskop, das in den Räumlichkeiten des IBMC/IBMP installiert wird (zur Durchführung von Kryo-EM-Analysen unter optimalen Versuchsbedingungen); — eine hochempfindliche Kamera der neuesten Generation Gatan K3, die eine Verbesserung der CBI-Kryo-EM-Hardware darstellt, die bereits die Infrastruktur von Frisbi und Instruct beherbergt. (German)
2 December 2021
0 references
Het doel van het EpiRNA project is het bestuderen van de moleculaire mechanismen betrokken bij RNA modificaties door het analyseren van de relatie tussen structuur en functie van ribonucleoproteic complexen (RNP complexen) in relatie tot verschillende RNA’s waarop genetische vertaling mechanica (rRNA, tRNA, snoRNA) of regulerend RNA afhankelijk zijn. Een analyse van de dynamiek en herkenningseigenschappen van RNP’s die onder meer voorbijgaande interacties omvatten, zal een van de uitdagingen zijn die moeten worden aangepakt. Om deze reden vereist het project een multidisciplinaire aanpak (biochemie, biofysica, genetica, structurele biologie, enz.) en de ontwikkeling van technieken voor de extractie van hoge-productiecapaciteit (epitranscriptomische analyse, zuivering van RNP’s), vandaar de noodzaak om te investeren in de juiste apparatuur en een sterke synergie tot stand te brengen tussen internationaal erkende laboratoria op dit gebied (IBMC/IBMP in Straatsburg, CBI/IGBMC en LBP in Illkirch, IMOPA en ngere in Nancy en LNIO in Troyes). De in het kader van het project verworven uitrusting is: een elektronenmicroscoop die in het IBMC/IBMP-gebouw moet worden geïnstalleerd (om cryo-EM-analyses onder optimale experimentele omstandigheden mogelijk te maken); — een nieuwste generatie Gatan K3 high-sensitivity camera die een verbetering zal zijn van CBI cryo-EM apparatuur, die al beschikt over de Frisbi en Instruct infrastructuren. (Dutch)
7 December 2021
0 references
L'obiettivo del progetto EpiRNA è quello di studiare i meccanismi molecolari coinvolti nelle modifiche dell'RNA analizzando la relazione tra struttura e funzione dei complessi ribonucleoproteici (complessi RRNP) in relazione a diversi RNA da cui dipendono la meccanica della traduzione genetica (rRNA, tRNA, snoRNA) o l'RNA regolamentare. Un'analisi delle dinamiche e delle proprietà di riconoscimento degli RNP che comportano, tra l'altro, interazioni transitorie sarà una delle sfide da affrontare. Per questo motivo, il progetto richiede un approccio multidisciplinare (biochimica, biofisica, genetica, biologia strutturale, ecc.) e lo sviluppo di tecniche di estrazione ad alto rendimento (analisi epitranscriptomica, purificazione dei RNP), da qui la necessità di investire nelle attrezzature appropriate e di instaurare una forte sinergia tra laboratori riconosciuti a livello internazionale in questo campo (IBMC/IBMP a Strasburgo, CBI/IGBMC e LBP a Illkirch, IMOPA e ngere a Nancy e LNIO a Troyes). Le attrezzature acquistate nell'ambito del progetto sono: un microscopio elettronico da installare nei locali dell'IBMC/IBMP (per consentire analisi crio-EM in condizioni sperimentali ottimali); — una telecamera ad alta sensibilità Gatan K3 di ultima generazione che sarà un miglioramento delle apparecchiature CBI crio-EM, che ospita già le infrastrutture Frisbi e Instruct. (Italian)
13 January 2022
0 references
El objetivo del proyecto EpiRNA es estudiar los mecanismos moleculares involucrados en las modificaciones del ARN mediante el análisis de la relación entre estructura y función de los complejos ribonucleoproteicos (complejos RNP) en relación a varios ARNs de los que dependen la mecánica de la traducción genética (ARRN, ARNt, SnoRNA) o ARN regulatorio. Uno de los retos a abordar será el análisis de la dinámica y las propiedades de reconocimiento de los PNR que impliquen, entre otras cosas, interacciones transitorias. Por esta razón, el proyecto requiere un enfoque multidisciplinar (bioquímica, biofísica, genética, biología estructural, etc.) y el desarrollo de técnicas de extracción de alto rendimiento (análisis epitranscriptómico, purificación de RNPs), de ahí la necesidad de invertir en el equipo adecuado y de establecer una fuerte sinergia entre laboratorios reconocidos internacionalmente a la vanguardia en este campo (IBMC/IBMP en Estrasburgo, CBI/IGBMC y LBP en Illkirch, IMOPA y ngere en Nancy y LNIO en Troyes). El equipo adquirido en el marco del proyecto es: un microscopio electrónico que se instalará en los locales IBMC/IBMP (para permitir los análisis crioEM en condiciones experimentales óptimas); — una cámara de alta sensibilidad Gatan K3 de última generación que será una mejora de los equipos CBI cryo-EM, que ya alberga las infraestructuras Frisbi e Instruct. (Spanish)
14 January 2022
0 references
EpiRNA projekti eesmärk on uurida RNA modifikatsioonidega seotud molekulaarmehhanisme, analüüsides ribonukleoproteesi komplekside (RNP kompleksid) struktuuri ja funktsiooni suhet mitme RNA suhtes, millest sõltuvad geneetilised tõlkemehaanika (rRNA, tRNA, snoRNA) või regulatiivne RNA. Üks lahendamist vajav probleem on reguleeritud taimekahjustajate dünaamika ja äratundmisomaduste analüüs, mis hõlmab muu hulgas ajutist koostoimet. Sel põhjusel nõuab projekt multidistsiplinaarset lähenemisviisi (biokeemia, biofüüsika, geneetika, struktuuribioloogia jne) ja suure tootlikkusega ekstraheerimistehnikate (epitranscriptomic analysis, reguleeritud taimekaitsevahendite puhastamine) väljatöötamist, mistõttu on vaja investeerida asjakohastesse seadmetesse ja luua tugev sünergia selles valdkonnas esirinnas olevate rahvusvaheliselt tunnustatud laborite vahel (IBMC/IBMP Strasbourgis, CBI/IGBMC ja LBP Illkirchis, IMOPA ning viha Nancys ja LNIO Troyesis). Projekti raames soetatud seadmed on järgmised: IBMC/IBMP ruumidesse paigaldatav elektronmikroskoop (et võimaldada krüo-EM-analüüsi optimaalsetes katsetingimustes); – uusima põlvkonna Gatan K3 suure tundlikkusega kaamera, mis parandab CBI krüo-EM-i seadmeid, mis juba majutavad Frisbi ja Instructi infrastruktuure. (Estonian)
12 August 2022
0 references
EpiRNR projekto tikslas – ištirti molekulinius mechanizmus, susijusius su RNR modifikavimu, analizuojant ribonukleoproteinių kompleksų (RNP kompleksų) struktūros ir funkcijos santykį su keliais RNR, nuo kurių priklauso genetinis vertimas mechanika (rRNR, tRNR, snoRNR) arba reguliuojamoji RNR. Vienas iš spręstinų uždavinių bus RNP dinamikos ir atpažinimo savybių, kurios, inter alia, susijusios su trumpalaike sąveika, analizė. Dėl šios priežasties projektui reikalingas daugiadalykis požiūris (biochemija, biofizika, genetika, struktūrinė biologija ir t. t.) ir didelio našumo gavybos metodų kūrimas (epitranscriptomic analizė, RNP valymas), todėl reikia investuoti į atitinkamą įrangą ir sukurti stiprią tarptautiniu mastu pripažintų šios srities laboratorijų (IBMC/IBMP Strasbūre, CBI/IGBMC ir LBP Illkirch, IMOPA ir Nansi bei LNIO Trojee) sinergiją. Pagal projektą įsigyta įranga yra: IBMC/IBMP patalpose įrengiamas elektronų mikroskopas (kad būtų galima atlikti krio-EM analizę optimaliomis eksperimentinėmis sąlygomis); – naujausios kartos Gatan K3 didelio jautrumo kamera, kuri bus CBI Cryo-EM įrangos tobulinimas, kuriame jau yra „Frysbi“ ir „Instruct“ infrastruktūros. (Lithuanian)
12 August 2022
0 references
Cilj projekta EpiRNA je proučavanje molekularnih mehanizama uključenih u izmjene RNA analizom odnosa između strukture i funkcije ribonukleoproteskih kompleksa (RNP kompleksa) u odnosu na nekoliko RNA o kojima ovise mehanika genetskog prevođenja (rRNA, tRNA, snoRNA) ili regulatorna RNK. Jedan od izazova koje treba riješiti bit će analiza dinamike i značajki prepoznavanja RNP-ova koji, među ostalim, uključuju prolazne interakcije. Stoga je za projekt potreban multidisciplinarni pristup (biokemija, biofizika, genetika, strukturna biologija itd.) i razvoj tehnika ekstrakcije visoke propusnosti (epitranscriptomska analiza, pročišćavanje RNP-ova), zbog čega je potrebno ulagati u odgovarajuću opremu i uspostaviti snažnu sinergiju među međunarodno priznatim laboratorijima na čelu u tom području (IBMC/IBMP u Strasbourgu, CBI/IGBMC i LBP u Illkirchu, IMOPA-i ingere u Nancyju i LNIO-u u Troyesu). Oprema nabavljena u okviru projekta je: postavljanje elektronskog mikroskopa u prostorima IBMC-a/IBMP-a (kako bi se omogućile analize krio-EM-a u optimalnim eksperimentalnim uvjetima); — najnovija generacija Gatan K3 visoke osjetljivosti kamera koja će biti poboljšanje CBI cryo-EM opreme, koja je već domaćin Frisbi i Instruct infrastrukture. (Croatian)
12 August 2022
0 references
Στόχος του έργου EpiRNA είναι να μελετηθούν οι μοριακοί μηχανισμοί που εμπλέκονται στις τροποποιήσεις του RNA, αναλύοντας τη σχέση μεταξύ της δομής και της λειτουργίας των ριβονουκλεοπρωτεϊκών συμπλοκών (σύμπλοκα RNP) σε σχέση με διάφορους RNA από τους οποίους εξαρτάται η μηχανική γενετικής μετάφρασης (rRNA, tRNA, snoRNA) ή το ρυθμιστικό RNA. Μία από τις προκλήσεις που πρέπει να αντιμετωπιστούν θα είναι η ανάλυση της δυναμικής και των ιδιοτήτων αναγνώρισης των ΠΕΣ που περιλαμβάνουν, μεταξύ άλλων, μεταβατικές αλληλεπιδράσεις. Για τον λόγο αυτό, το έργο απαιτεί μια διεπιστημονική προσέγγιση (βιοχημεία, βιοφυσική, γενετική, δομική βιολογία κ.λπ.) και την ανάπτυξη τεχνικών εξόρυξης υψηλής απόδοσης (επιτρογραφική ανάλυση, καθαρισμός των RNPs), εξ ου και η ανάγκη επένδυσης στον κατάλληλο εξοπλισμό και καθιέρωσης ισχυρής συνέργειας μεταξύ διεθνώς αναγνωρισμένων εργαστηρίων στην πρώτη γραμμή του τομέα αυτού (IBMC/IBMP στο Στρασβούργο, CBI/IGBMC και LBP στο Illkirch, IMOPA και ngere in Nancy και LNIO in Troyes). Ο εξοπλισμός που αποκτήθηκε στο πλαίσιο του έργου είναι: ηλεκτρονικό μικροσκόπιο που πρόκειται να εγκατασταθεί στις εγκαταστάσεις IBMC/IBMP (για να είναι δυνατές οι αναλύσεις κρυο-ΕΜ υπό βέλτιστες πειραματικές συνθήκες)· — μια κάμερα υψηλής ευαισθησίας Gatan K3 τελευταίας γενιάς που θα αποτελέσει βελτίωση του εξοπλισμού CBI cryo-EM, ο οποίος ήδη φιλοξενεί τις υποδομές Frisbi και Instruct. (Greek)
12 August 2022
0 references
Cieľom projektu EpiRNA je študovať molekulárne mechanizmy podieľajúce sa na modifikáciách RNA analýzou vzťahu medzi štruktúrou a funkciou ribonukleoproteických komplexov (komplexy RNP) vo vzťahu k niekoľkým RNA, od ktorých závisí genetická translačná mechanika (rRNA, tRNA, snoRNA) alebo regulačná RNA. Jednou z výziev, ktoré treba riešiť, bude analýza dynamiky a rozpoznávania vlastností RNP, ktoré zahŕňajú okrem iného prechodné interakcie. Z tohto dôvodu si projekt vyžaduje multidisciplinárny prístup (biochémia, biofyzika, genetika, štrukturálna biológia atď.) a vývoj vysokovýkonných extrakčných techník (epitranscriptomická analýza, čistenie RNP), a preto je potrebné investovať do vhodného vybavenia a vytvoriť silnú synergiu medzi medzinárodne uznávanými laboratóriami v tejto oblasti (IBMC/IBMP v Štrasburgu, CBI/IGBMC a LBP v Illkirch, IMOPA a ngere v Nancy a LNIO v Troyes). Zariadenie nadobudnuté v rámci projektu je: elektrónový mikroskop, ktorý sa má nainštalovať v priestoroch IBMC/IBMP (na umožnenie kryo-EM analýz v optimálnych experimentálnych podmienkach); najnovšia generácia vysokocitlivej kamery Gatan K3, ktorá bude zlepšením CBI kryo-EM zariadení, ktorá už hosťuje infraštruktúry Frisbi a Instruct. (Slovak)
12 August 2022
0 references
EpiRNA-hankkeen tavoitteena on tutkia RNA:n muutoksiin liittyviä molekyylimekanismeja analysoimalla ribonukleoproteiinikompleksien (RNP-kompleksien) rakenteen ja toiminnan välistä suhdetta suhteessa useisiin RNA:ihin, joista geneettiset käännösmekaniikka (rRNA, tRNA, snoRNA) tai sääntely RNA ovat riippuvaisia. Yksi haasteista, joihin on vastattava, on analyysi aluesiirtymien dynamiikasta ja tunnustamisominaisuuksista, joihin liittyy muun muassa ohimenevää vuorovaikutusta. Tästä syystä hanke edellyttää monialaista lähestymistapaa (biokemia, biofysiikka, genetiikka, rakennebiologia jne.) ja korkean tuotantotehon louhintatekniikoiden kehittämistä (epitranscriptominen analyysi, RNP:iden puhdistaminen), minkä vuoksi on investoitava asianmukaisiin laitteisiin ja luotava vahva synergia alan kansainvälisesti tunnustettujen laboratorioiden välille (IBMC/IBMP Strasbourgissa, CBI/IGBMC ja LBP Illkirchissä, IMOPA ja Nancy ja LNIO Troyesissa). Hankkeessa hankitut laitteet ovat: IBMC:n/IBMP:n tiloihin asennettava elektronimikroskooppi (kryo-EM-analyysien mahdollistamiseksi optimaalisissa koeolosuhteissa); — uusimman sukupolven Gatan K3 korkean herkkyyden kamera, joka on parannus CBI kryo-EM laitteet, joka jo isännöi Frisbi ja Instruct infrastruktuurit. (Finnish)
12 August 2022
0 references
Celem projektu EpiRNA jest zbadanie mechanizmów molekularnych związanych z modyfikacjami RNA poprzez analizę zależności między strukturą a funkcją kompleksów rybonukleoproteicznych (kompleksów RNP) w odniesieniu do kilku RNA, od których zależy mechanika tłumaczenia genetycznego (rRNA, tRNA, snoRNA) lub RNA regulacji. Jednym z wyzwań, którym należy się zająć, będzie analiza dynamiki i właściwości rozpoznawczych RNP, które obejmują między innymi interakcje przejściowe. Z tego powodu projekt wymaga wielodyscyplinarnego podejścia (biochemia, biofizyka, genetyka, biologia strukturalna itp.) oraz opracowania technik ekstrakcji o wysokiej wydajności (analiza epitranscriptomiczna, oczyszczanie RNP), stąd konieczność inwestowania w odpowiedni sprzęt i ustanowienia silnej synergii między uznanymi międzynarodowymi laboratoriami na czele w tej dziedzinie (IBMC/IBMP w Strasburgu, CBI/IGBMC i LBP w Illkirch, IMOPA i ngere in Nancy i LNIO w Troyes). Wyposażenie nabyte w ramach projektu to: mikroskop elektronowy, który ma być zainstalowany w pomieszczeniach IBMC/IBMP (w celu umożliwienia analiz kriogenicznych w optymalnych warunkach doświadczalnych); — kamera o wysokiej czułości Gatan K3 najnowszej generacji, która będzie ulepszać sprzęt CBI cryo-EM, który jest już gospodarzem infrastruktury Frisbi i Instruct. (Polish)
12 August 2022
0 references
Az EpiRNA projekt célja az RNS-módosításokban részt vevő molekuláris mechanizmusok tanulmányozása a ribonukleoproteikus komplexek (RNP komplexek) szerkezete és funkciója közötti kapcsolat elemzésével, több olyan RNS-hez viszonyítva, amelyek genetikai transzmissziós mechanika (rRNS, tRNS, snoRNS) vagy szabályozási RNS-től függenek. A többek között átmeneti kölcsönhatásokat magukban foglaló RNP-k dinamikájának és felismerési tulajdonságainak elemzése lesz az egyik megoldandó kihívás. Ezért a projekt multidiszciplináris megközelítést (biokémia, biofizika, genetika, strukturális biológia stb.) és a nagy áteresztőképességű kitermelési technikák kifejlesztését (epitranscriptomikus elemzés, RNP-k tisztítása) teszi szükségessé, ezért be kell ruházni a megfelelő berendezésekbe, és erős szinergiát kell kialakítani a nemzetközileg elismert laboratóriumok között ezen a területen (IBMC/IBMP Strasbourgban, CBI/IGBMC és LBP in Illkirch, IMOPA és ngere in Nancy és LNIO Troyes). A projekt keretében beszerzett berendezések: az IBMC/IBMP helyiségeiben elektronmikroszkópot kell felszerelni (amely lehetővé teszi a krio-EM analízist optimális kísérleti körülmények között); – a legújabb generációs Gatan K3 nagy érzékenységű kamera, amely a CBI krio-EM berendezések fejlesztése lesz, amely már a Frisbi és Instruct infrastruktúrának is otthont ad. (Hungarian)
12 August 2022
0 references
Cílem projektu EpiRNA je studium molekulárních mechanismů, které se podílejí na modifikacích RNA, a to analýzou vztahu mezi strukturou a funkcí ribonukleoproteických komplexů (RNP komplexy) ve vztahu k několika RNA, na nichž závisí genetická translační mechanika (rRNA, tRNA, snoRNA) nebo regulační RNA. Jednou z výzev, kterou je třeba řešit, bude analýza dynamiky a vlastností rozpoznávání RNP, které zahrnují mimo jiné přechodné interakce. Z tohoto důvodu projekt vyžaduje multidisciplinární přístup (biochemie, biofyzika, genetika, strukturální biologie atd.) a rozvoj vysoce výkonných extrakčních technik (epitranskriptomická analýza, čištění RNP), a proto je třeba investovat do vhodného vybavení a vytvořit silnou součinnost mezi mezinárodně uznávanými laboratořemi v této oblasti (IBMC/IBMP ve Štrasburku, CBI/IGBMC a LBP v Illkirch, IMOPA a ngere v Nancy a LNIO v Troyes). Vybavením získaným v rámci projektu je: elektronový mikroskop, který má být instalován v prostorách IBMC/IBMP (pro umožnění kryo-EM analýz za optimálních experimentálních podmínek); — nejnovější generace Gatan K3 vysoce citlivý fotoaparát, který bude zlepšením CBI kryo-EM zařízení, která již hostí Frisbi a Instruct infrastruktury. (Czech)
12 August 2022
0 references
EpiRNA projekta mērķis ir pētīt RNS modifikācijās iesaistītos molekulāros mehānismus, analizējot ribonukleoproteīna kompleksu (RNP kompleksu) struktūru un funkciju attiecībā uz vairākām RNS, no kurām ir atkarīga ģenētiskās tulkošanas mehānika (rRNS, tRNS, snoRNS) vai reglamentējošā RNS. Viena no risināmajām problēmām būs RNP dinamikas un atpazīšanas īpašību analīze, kas cita starpā ietver īslaicīgu mijiedarbību. Šā iemesla dēļ projektam ir vajadzīga daudzdisciplīnu pieeja (bioķīmija, biofizika, ģenētika, strukturālā bioloģija utt.) un augstas caurlaidspējas ekstrakcijas metožu izstrāde (epitranscriptomic analīze, RNP attīrīšana), tāpēc ir nepieciešams ieguldīt atbilstošā aprīkojumā un izveidot spēcīgu sinerģiju starp starptautiski atzītām laboratorijām šajā jomā (IBMC/IBMP Strasbūrā, CBI/IGBMC un LBP Illkirhā, IMOPA un Nansī ngere un LNIO Trojā). Projektā iegādātais aprīkojums ir: elektronu mikroskops, kas jāuzstāda IBMC/IBMP telpās (lai nodrošinātu krio-EM analīzes optimālos eksperimenta apstākļos); — jaunākās paaudzes Gatan K3 augstas jutības kamera, kas uzlabos CBI krio-EM aprīkojumu, kurā jau atrodas Frisbi un Instruct infrastruktūras. (Latvian)
12 August 2022
0 references
Is é is cuspóir don tionscadal EpiRNA staidéar a dhéanamh ar na sásraí móilíneacha a bhaineann le modhnuithe RNA trí anailís a dhéanamh ar an ngaol idir struchtúr agus feidhm coimpléisc ribonucleoproteic (CoimpléiscRNP) i ndáil le roinnt RNAs a mbraitheann meicnic ghéiniteach (rRNA, tRNA, snoRNA) nó RNA rialála orthu. Beidh anailís ar dhinimic agus airíonna aitheantais RNPanna lena mbaineann, inter alia, idirghníomhaíochtaí neamhbhuan ar cheann de na dúshláin nach mór aghaidh a thabhairt orthu. Ar an gcúis sin, éilíonn an tionscadal cur chuige ildisciplíneach (bithcheimic, bithfhisic, géineolaíocht, bitheolaíocht struchtúrach, etc.) agus forbairt teicnící eastósctha ard-tréchur (anailís epitran-scriptomic, íonú RNPanna), dá bhrí sin, an gá atá le hinfheistíocht a dhéanamh sa trealamh iomchuí agus sineirgíocht láidir a bhunú idir saotharlanna a aithnítear go hidirnáisiúnta ar thús cadhnaíochta sa réimse seo (IBMC/IBMP in Strasbourg, CBI/IGBMC agus LBP in Illkirch, IMOPA agus Ngere in Nancy agus LNIO i Troyes). Is é an trealamh a fuarthas faoin tionscadal: micreascóp leictreon atá le suiteáil in áitreabh IBMC/IBMP (chun anailísí cryo-EM a chumasú faoi na dálaí turgnamhacha is fearr); — ceamara ard-íogaireachta Gatan K3 den ghlúin is déanaí a bheidh ina fheabhsú ar threalamh CBI cryo-EM, ina bhfuil bonneagar Frisbi agus Instruct cheana féin. (Irish)
12 August 2022
0 references
Cilj projekta EpiRNA je preučiti molekularne mehanizme, vključene v spremembe RNA, z analizo razmerja med strukturo in funkcijo ribonukleoproteičnih kompleksov (kompleksov RNP) v zvezi z več RNK, od katerih je odvisna mehanika genetskega prevajanja (rRNA, tRNA, snoRNA) ali regulativna RNA. Eden od izzivov, ki jih je treba obravnavati, bo analiza dinamike in prepoznavnosti RNP, ki med drugim vključuje prehodne interakcije. Zato je za projekt potreben multidisciplinaren pristop (biokemija, biofizika, genetika, strukturna biologija itd.) in razvoj visokozmogljivih tehnik ekstrakcije (epitranscriptomska analiza, čiščenje RNP), zato je treba vlagati v ustrezno opremo in vzpostaviti močno sinergijo med mednarodno priznanimi laboratoriji v ospredju na tem področju (IBMC/IBMP v Strasbourgu, CBI/IGBMC in LBP v Illkirchu, IMOPA in šmi v Nancyju in LNIO v Trojah). Oprema, pridobljena v okviru projekta, je: elektronski mikroskop, ki se namesti v prostorih IBMC/IBMP (za omogočanje krio-EM analiz v optimalnih eksperimentalnih pogojih); — najnovejša generacija visokoobčutljive kamere Gatan K3, ki bo izboljšala CBI krio-EM opremo, ki že gosti infrastrukturo Frisbi in Instruct. (Slovenian)
12 August 2022
0 references
Целта на проекта EpiRNA е да проучи молекулярните механизми, участващи в модификациите на РНК, като анализира връзката между структурата и функцията на рибонуклеопротеичните комплекси (RNP комплекси) във връзка с няколко РНК, от които зависят генетичните транслационни механици (РНК, tRNA, сноРНК) или регулаторната РНК. Едно от предизвикателствата, които трябва да бъдат преодолени, ще бъде анализ на динамиката и разпознавателните свойства на РНП, които включват, наред с другото, преходни взаимодействия. Поради тази причина проектът изисква мултидисциплинарен подход (биохимия, биофизика, генетика, структурна биология и др.) и разработване на техники за извличане с висока производителност (епитранскриптомичен анализ, пречистване на РНП), поради което е необходимо да се инвестира в подходящо оборудване и да се установи силна синергия между международно признати лаборатории в тази област (IBMC/IBMP в Страсбург, CBI/IGBMC и LBP в Illkirch, IMOPA и др. в Нанси и LNIO в Troyes). Придобитото по проекта оборудване е: в помещенията на IBMC/IBMP се инсталира електронен микроскоп (за да се даде възможност за крио-ЕМ анализи при оптимални експериментални условия); — последно поколение Gatan K3 високочувствителна камера, която ще бъде подобрение на CBI крио-EM оборудване, което вече е домакин на инфраструктурата на Frisbi и Instruct. (Bulgarian)
12 August 2022
0 references
L-għan tal-proġett EpiRNA huwa li jistudja l-mekkaniżmi molekulari involuti fil-modifiki tal-RNA billi janalizza r-relazzjoni bejn l-istruttura u l-funzjoni tal-kumplessi ribonukleoproteiċi (kumplessi RNP) fir-rigward ta’ diversi RNAs li fuqhom jiddependu l-mekkanika tat-traduzzjoni ġenetika (rRNA, tRNA, snoRNA) jew l-RNA regolatorju. Analiżi tad-dinamika u l-proprjetajiet ta’ rikonoxximent tal-RNPs li jinvolvu, fost l-oħrajn, interazzjonijiet tranżitorji se tkun waħda mill-isfidi li jridu jiġu indirizzati. Għal din ir-raġuni, il-proġett jeħtieġ approċċ multidixxiplinari (bijokimika, bijofiżika, ġenetika, bijoloġija strutturali, eċċ.) u l-iżvilupp ta’ tekniki ta’ estrazzjoni ta’ volum għoli (analiżi epitraskristomika, purifikazzjoni tal-RPPs), għalhekk il-ħtieġa li jsir investiment fit-tagħmir xieraq u li tiġi stabbilita sinerġija qawwija bejn laboratorji rikonoxxuti internazzjonalment fuq quddiem nett f’dan il-qasam (IBMC/IBMP fi Strasburgu, CBI/IGBMC u LBP f’Illkirch, IMOPA u ngere in Nancy u LNIO fi Troyes). It-tagħmir akkwistat taħt il-proġett huwa: mikroskopju tal-elettroni li għandu jiġi installat fil-bini tal-IBMC/IBMP (biex jippermetti l-analiżi tal-krijo-EM f’kundizzjonijiet sperimentali ottimali); — kamera Gatan K3 aħħar ġenerazzjoni ta ‘sensittività għolja li se jkun titjib tat-tagħmir CBI cryo-EM, li diġà jospita l-infrastrutturi Frisbi u Instruct. (Maltese)
12 August 2022
0 references
O objetivo do projeto EpiRNA é estudar os mecanismos moleculares envolvidos nas modificações do RNA, analisando a relação entre estrutura e função dos complexos ribonucleoproteicos (complexos RRN) em relação a vários RNAs dos quais dependem a mecânica de tradução genética (rRNA, tRNA, snoRNA) ou RNA regulamentar. Uma análise da dinâmica e das propriedades de reconhecimento dos RNPs que envolvam, nomeadamente, interações transitórias será um dos desafios a enfrentar. Por esta razão, o projeto exige uma abordagem multidisciplinar (bioquímica, biofísica, genética, biologia estrutural, etc.) e o desenvolvimento de técnicas de extração de alto rendimento (análise epitranscriptómica, purificação de RNPs), daí a necessidade de investir nos equipamentos adequados e de estabelecer uma forte sinergia entre laboratórios reconhecidos internacionalmente na vanguarda neste domínio (IBMC/IBMP em Estrasburgo, CBI/IGBMC e LBP em Illkirch, IMOPA e NGERE em Nancy e LNIO em Troyes). O equipamento adquirido no âmbito do projeto é: um microscópio eletrónico a instalar nas instalações do IBMC/IBMP (para permitir análises crio-EM em condições experimentais ótimas); — uma câmera de alta sensibilidade Gatan K3 de última geração que será uma melhoria do equipamento CBI cryo-EM, que já hospeda as infraestruturas Frisbi e Instruct. (Portuguese)
12 August 2022
0 references
Formålet med EpiRNA-projektet er at undersøge de molekylære mekanismer, der indgår i RNA-ændringer, ved at analysere forholdet mellem strukturen og funktionen af ribonucleoproteic komplekser (RNP-komplekser) i forhold til flere RNA'er, som genetisk oversættelsesmekanik (rRNA, tRNA, snoRNA) eller regulatoriske RNA afhænger af. En analyse af dynamikken og anerkendelsesegenskaberne ved RNP'er, der bl.a. involverer forbigående interaktioner, vil være en af de udfordringer, der skal tages op. Derfor kræver projektet en tværfaglig tilgang (biokemi, biofysik, genetik, strukturel biologi osv.) og udvikling af højkapacitetsekstraktionsteknikker (epitranskriptomanalyse, rensning af RNP'er), hvilket gør det nødvendigt at investere i passende udstyr og etablere en stærk synergi mellem internationalt anerkendte laboratorier på forkant på dette område (IBMC/IBMP i Strasbourg, CBI/IGBMC og LBP i Illkirch, IMOPA og ngere i Nancy og LNIO i Troyes). Det udstyr, der erhverves i forbindelse med projektet, er: et elektronmikroskop, der skal installeres i IBMC/IBMP-lokalerne (for at muliggøre kryo-EM-analyser under optimale forsøgsbetingelser) — en nyeste generation Gatan K3 høj følsomhed kamera, der vil være en forbedring af CBI kryo-EM udstyr, som allerede er vært for Frisbi og Instruct infrastrukturer. (Danish)
12 August 2022
0 references
Obiectivul proiectului EpiARNA este de a studia mecanismele moleculare implicate în modificările ARN prin analizarea relației dintre structura și funcția complexelor ribonucleoproteice (complexe RRN) în raport cu mai multe ARN de care depind mecanica de traducere genetică (ARNr, tARN, snoARN) sau ARN de reglementare. O analiză a dinamicii și a proprietăților de recunoaștere ale RNP-urilor care implică, printre altele, interacțiuni tranzitorii va fi una dintre provocările care trebuie abordate. Din acest motiv, proiectul necesită o abordare multidisciplinară (biochimie, biofizică, genetică, biologie structurală etc.) și dezvoltarea unor tehnici de extracție cu un randament ridicat (analiza epitranscriptomică, purificarea RNP), de aici necesitatea de a investi în echipamentele adecvate și de a stabili o sinergie puternică între laboratoarele recunoscute la nivel internațional aflate în prima linie în acest domeniu (IBMC/IBMP la Strasbourg, CBI/IGBMC și LBP în Illkirch, IMOPA și Ngere în Nancy și LNIO în Troyes). Echipamentele achiziționate în cadrul proiectului sunt: un microscop electronic care urmează să fie instalat în incintele IBMC/IBMP (pentru a permite analize crio-EM în condiții experimentale optime); o cameră de ultimă generație Gatan K3 de înaltă sensibilitate, care va fi o îmbunătățire a echipamentului CBI crio-EM, care găzduiește deja infrastructurile Frisbi și Instruct. (Romanian)
12 August 2022
0 references
Syftet med EpiRNA-projektet är att studera de molekylära mekanismer som är involverade i RNA-modifieringar genom att analysera sambandet mellan strukturen och funktionen hos ribonucleoproteiska komplex (RNP-komplex) i förhållande till flera RNA som genetisk översättningsmekanik (rRNA, tRNA, snoRNA) eller regulatorisk RNA är beroende av. En analys av dynamiken och igenkänningsegenskaperna hos RNP, som bland annat inbegriper övergående interaktioner, kommer att vara en av de utmaningar som måste hanteras. Därför kräver projektet ett tvärvetenskapligt tillvägagångssätt (biokemi, biofysik, genetik, strukturbiologi osv.) och utveckling av tekniker med hög genomströmningsextraktion (epitranscriptomisk analys, rening av RNP), vilket innebär att det är nödvändigt att investera i lämplig utrustning och skapa en stark synergi mellan internationellt erkända laboratorier i framkant på detta område (IBMC/IBMP i Strasbourg, CBI/IGBMC och LBP i Illkirch, IMOPA och ngere i Nancy och LNIO i Troyes). Den utrustning som förvärvats inom ramen för projektet är: ett elektronmikroskop som ska installeras i IBMC/IBMP:s lokaler (för att möjliggöra kryo-EM-analyser under optimala försöksförhållanden). — en ny generation Gatan K3 högkänslighetskamera som kommer att vara en förbättring av CBI cryo-EM utrustning, som redan är värd för Frisbi och Instruct infrastrukturer. (Swedish)
12 August 2022
0 references
Alsace
0 references
7 December 2023
0 references
Identifiers
AL0024408
0 references