ERDF — URN — PATOOLBOX — EMERGENT (Q3681625)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3681625 in France
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | ERDF — URN — PATOOLBOX — EMERGENT |
Project Q3681625 in France |
Statements
75,000.0 Euro
0 references
125,947.11 Euro
0 references
59.55 percent
0 references
1 October 2019
0 references
31 March 2022
0 references
UNIVERSITE DE ROUEN-NORMANDIE
0 references
76821
0 references
Phosphatidic acids (PAs) are the simplest phospholipids naturally present in all living organisms and haveattracted considerable attention being both lipid second messengers and modulators of membrane shape. Inconsequence, PAs have been proposed to play pivotal roles for various cellular functions and accordinglyabnormalities in PA producing enzymes occur in numerous diseases including neurodegeneration, intellectualdisabilities, cancer, and hypertension. At the molecular level, PAs interact with various proteins and arepredicted to modify membrane topology, but very limited information regarding the kinetics of theseinteractions and structural effects is available due to the lack of adequate tools. For the same reason, PAdynamics, related to the specific PA species (depending on the fatty acids chains forming the PA), and theirexact biophysical properties are poorly understood. For instance, PA produced by phospholipases D (PLD),lysophosphatidyl-acyl-transferases (LPAAT), and diacylglycerol kinases (DGK) have been suspected to playvarious roles in different steps of the secretory pathway of neurosecretory cells, but the exact nature of the PAspecies involved in each step or the precise molecular mechanisms remain elusive. One of the main limitationis related to the chemical tools that have been developed to study PAs: most of them are based on PA withmodified fatty acid chains (with fluorescent or solvatochromic properties), thus cannot take into account thekey role that is played by the different fatty acid side chains. To circumvent these limitations, we propose togenerate a comprehensive toolbox to study PA's dynamics and functions in any given cellular contextand function letting their fatty acid side chains unmodified. Once these tools in hands, they will be used byour partners (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen and Dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Strasbourg) to decipher numerous aspects of secretory vesicle trafficking and fusion that remainmysterious. Most of the tools that we propose to develop will bear a small biorthogonal chemical function andphotoactivatable components that will be useful to study in a time and space dependent manner, living cells ororganisms. These tools will thus enable us and our partners to address simultaneously two topics that recentlyboosted the progresses in the study of living organisms: photopharmacology and in cellulo chemistry.This project will involve the COBRA laboratory- UMR 6014 CNRS IRIB - Université de Rouen, INSA deRouen, and more precisely the bioorganic chemistry team headed by Pr. Pierre-Yves Renard (coordinator). Dr.Alexandre Haefelé will develop the fluorescent tools associated with the project, and the core of the projectwill be led by Dr. Sébastien Balieu who joined Pr. PY Renard's team in January 2018 to work on this project.If the bioorganic chemistry team of UMR 6014 CNRS COBRA has a good experience in bioconjugatechemistry and organic fluorescent and profluorescent probes, this project will require a scientific reconversionfor Dr. Sébastien Balieu, and will enable the team to widen its know-hows to photopharmacology and incellulo chemistry. The project will give us the opportunity to hire a skilled post-doctoral fellow, Dr. MathéoBerthet, presently post-doctoral fellow in Pr. Nocolas Wissinger's laboratory in Geneva till end of December2019, and who accepted to join the lab on this project with the goal in mind to come back to France and applyfor a CNRS position. (French)
0 references
Phosphatidic acids (PAs) are the simplet phospholipids naturally present in all living organisms and haveattracted considerable attention being both lipid second messengers and modulators of membrane shape. Inconsequence, PAs have been proposed to play pivotal roles for various cellular functions and accordinglyabnormalities in PA producing enzymes occur in many diseases including neurodegeneration, intellectualdisabilities, cancer, and hypertension. At the molecular level, PAs interact with various proteins and arepredicted to modify membrane topology, but very limited information regarding the kinetics of these interactions and structural effects is available due to the lack of adequate tools. For the same reason, PAdynamics, related to the specific PA species (depending on the fatty acids chains forming the PA), and theirexact biophysical properties are poorly understood. For instance, PA produced by phospholipases D (PLD),lysophosphatidyl-acyl-transferases (LPAAT), and diacylglycerol kinases (DGK) have been suspected to playvarious roles in different steps of the secretory pathway of neurosecretory cells, but the exact nature of the PAspecies involved each in step or the precise molecular mechanisms remain elusive. One of the main limitationis related to the chemical tools that have been developed to study PAs: most of them are based on PA withmodified fatty acid chains (with fluorescent or solvatochromic properties), so cannot take into account Thekey role that is played by the different fatty acid side chains. To circumvent these limitations, we propose togenerate a comprehensive toolbox to study PA’s dynamics and functions in any given cellular contextand function letting their fatty acid side chains unmodified. Once these tools in hands, they will be used byour partners (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen and Dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Strasbourg) to decipher many aspects of secretory vesicle trafficking and fusion that remainmysterious. Most of the tools that we propose to develop will bear a small biorthogonal chemical function and photoactivatable components that will be useful to study in a time and space dependent manner, living cells ororganisms. These tools will thus enable us and our partners to address simultaneously two topics that recentlyboosted the progresses in the study of living organisms: photopharmacology and in cellulo chemistry.This project will involve the COBRA laboratory- UMR 6014 CNRS IRIB — Université de Rouen, INSA deRouen, and more precisely the bioorganic chemistry team headed by Pr. Pierre-Yves Renard (coordinator). Dr. Alexandre Haefelé will develop the fluorescent tools associated with the project, and the core of the projectwill be led by Dr. Sébastien Balieu who joined Pr. Py Renard’s team in January 2018 to work on this project.If the bioorganic chemistry team of UMR 6014 CNRS COBRA has a good experience in bioconjugatechemistry and organic fluorescent and profluorescent probes, this project will require a scientific reconversionfor Dr. Sébastien Balieu, and will enable the team to widen its know-hows to photopharmacology and incellulo chemistry. The project will give us the opportunity to hire a skilled post-doctoral fellow, Dr. MathéoBerthet, presently post-doctoral fellow in Pr. Nocolas Wissinger’s laboratory in Geneva till end of December2019, and who accepted to join the lab on this project with the goal in mind to come back to France and applyfor a CNRS position. (English)
18 November 2021
0.0670827870907726
0 references
Phosphatidic acids (PAs) are the simplet phospholipids naturally present in all living organisms and haveattracted considerable attention being both lipid second messengers and modulators of membran shape. Inconsequence, PAs have been offred to play pivotal roles for various cellular functions and accordinglyabnormalities in PA producing enzymes occur in numerous diseases including neurodegeneration, intellectualdisabilities, Krebs, and Hypertonie. At the molecular level, PAs interact with various proteins and arepredicted to modify Membran topology, but very limited information regarding the kinetics of theseinteractions and structural effects is available due to the lack of adequate tools. For the same reason, PAdynamics, related to the specific PA species (depending on the fatty acids chains forming the PA), and theirexact biophysical properties are poorly understood. For instance, PA produced by phospholipases D (PLD),lysophosphatidyl-acyl-transferases (LPAAT), and diacylglycerol kinases (DGK) have been suspected to playvarious roles in different steps of the secretory pathway of neurosecretory cells, but the exact nature of the PAspecies involved in each step or the precise molecular mechanisms remain elusive. One of the main limiteis related to the chemical tools that have been developed to study PAs: Most of them are based on PA withmodified fatty acid chains (with fluorescent or solvatochromic properties), thus cannot take into account Thekey role that is played by the different fatty acid side chains. To circumvent these limites, we bietet togenerate a comprehensive toolbox to study PA’s dynamics and functions in any given cellular contextand function letting their fatty acid side chains unmodified. Once these tools in hands, they will be used byour partners (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen and Dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Straßburg) to decipher numerous aspects of secretory vesicle trafficking and fusion that remainmysterious. Most of the tools that we offre to develop will bear a small biorthogonal chemical function andphotoactivatable components that will be useful to study in a time and space dependent manner, living cells ororganisms. These tools will thus enable us and our partners to address simultaneously two topics that recentlyboosted the progressions in the study of living organisms: Photopharmacology and in cellulo chemistry.This project will involve the COBRA laboratory- UMR 6014 CNRS IRIB – Universität Rouen, INSA deRouen, and more precisely the bioorganic chemistry team headed by Pr. Pierre-Yves Renard (Koordinator). Dr.Alexandre Haefelé will develop the fluorescent tools associated with the project, and the core of the projectwill be led by Dr. Sébastien Balieu who joined Pr. Py Renard’s team in January 2018 to work on this project.If the bioorganic chemistry team of UMR 6014 CNRS COBRA has a good experience in bioconjugatechemistry and organic fluorescent and profluorescent probes, this project will require a scientific conversionfor Dr. Sébastien Balieu, and will enable the team to widen its know-hows to photopharmacology and incellulo chemistry. The project will give us the opportunity to hire a skilled postdoctoral fellow, Dr. MathéoBerthet, presently postdoctoral fellow in Pr. Nocolas Wissinger’s laboratory in Geneva till end of December2019, and whoacceptd to join the lab on this project with the goal in mind to come back to France and applyfor a CNRS Position. (German)
1 December 2021
0 references
Fosfatidezuren (PA’s) zijn de eenvoudige fosfolipiden die van nature aanwezig zijn in alle levende organismen en hebben aanzienlijke aandacht getrokken als lipide tweede boodschappers en modulatoren van membraanvorm. Inconsequentie, PA’s zijn voorgesteld om cruciale rollen te spelen voor verschillende cellulaire functies en bijgevolgabnormaliteiten in PA producerende enzymen komen voor in vele ziekten, waaronder neurodegeneratie, intellectuele handicaps, kanker en hypertensie. Op moleculair niveau, PA’s interageren met verschillende eiwitten en zijnvoorspeld om membraan topologie te wijzigen, maar zeer beperkte informatie over de kinetiek van deze interacties en structurele effecten is beschikbaar vanwege het gebrek aan adequate instrumenten. Om dezelfde reden zijn PAdynamica, gerelateerd aan de specifieke PA-soorten (afhankelijk van de vetzurenketens die de PA vormen) en hunexacte biofysische eigenschappen slecht begrepen. Bijvoorbeeld, PA geproduceerd door fosfolipasen D (PLD),lysophosphatidyl-acyl-transferasen (LPAAT) en diacylglycerolkinases (DGK) spelen verschillende rollen in verschillende stappen van de secretoire route van neurosecretory cellen, maar de exacte aard van de PAspecies betrokken elk in stap of de precieze moleculaire mechanismen blijven ongrijpbaar. Een van de belangrijkste beperkingenis gerelateerd aan de chemische hulpmiddelen die zijn ontwikkeld om PA’s te bestuderen: de meeste van hen zijn gebaseerd op PA met gemodificeerde vetzuurketens (met fluorescerende of solvatochromische eigenschappen), dus kan geen rekening houden met de belangrijkste rol die wordt gespeeld door de verschillende vetzuurzijdeketens. Om deze beperkingen te omzeilen, stellen we voor om een uitgebreide toolbox te genereren om PA’s dynamiek en functies te bestuderen in een bepaalde cellulaire context en functie, zodat hun vetzuurzijdeketens ongewijzigd blijven. Zodra deze tools in handen zijn, zullen ze door onze partners worden gebruikt (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen en Dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Straatsburg) om vele aspecten van de geheimzinnige handel in blaasjes en fusies te ontcijferen die nog steeds mysterisch zijn. De meeste instrumenten die we voorstellen te ontwikkelen, zullen een kleine biorthogonale chemische functie en fotoactiveerbare componenten hebben die nuttig zijn om op een tijd- en ruimteafhankelijke manier, levende cellen of organismen te bestuderen. Deze instrumenten zullen ons en onze partners in staat stellen om gelijktijdig twee onderwerpen aan te pakken die onlangs de vooruitgang in de studie van levende organismen hebben versterkt: fotofarmacologie en cellulochemie.Dit project zal het COBRA laboratorium- UMR 6014 CNRS IRIB — Université de Rouen, INSA deRouen, en meer bepaald het bioorganische chemie team onder leiding van Pr. Pierre-Yves Renard (coördinator). Dr. Alexandre Haefelé zal de fluorescentietools ontwikkelen die bij het project horen, en de kern van het project zal worden geleid door Dr. Sébastien Balieu, die zich bij Pr heeft aangesloten. PY Renard’s team in januari 2018 om aan dit project te werken.Als het bioorganische chemieteam van UMR 6014 CNRS COBRA een goede ervaring heeft in bioconjugaatchemie en organische fluorescente en profluorescente sondes, zal dit project een wetenschappelijke reconversie voor Dr. Sébastien Balieu vereisen en het team in staat stellen zijn knowhow uit te breiden naar fotofarmacologie en incellulochemie. Het project geeft ons de mogelijkheid om een ervaren postdoctoraal fellow, Dr. MathéoBerthet, momenteel postdoctoraal fellow in Pr. Nocolas Wissinger’s laboratorium in Genève tot eind december 2019, en die aanvaardde om deel te nemen aan het lab voor dit project met als doel terug te komen naar Frankrijk en een CNRS-positie aan te vragen. (Dutch)
6 December 2021
0 references
Gli acidi fosfatidici (PAs) sono i fosfolipidi più semplici presenti naturalmente in tutti gli organismi viventi e hanno attirato notevole attenzione sia essendo i secondi messaggeri lipidici sia i modulatori di forma di membrana. Inconseguenza, gli PA sono stati proposti per svolgere ruoli cardine per varie funzioni cellulari e di conseguenza le anomalie negli enzimi di produzione di PA si verificano in molte malattie, tra cui neurodegenerazione, disabilità intellettuali, cancro e ipertensione. A livello molecolare, gli PA interagiscono con varie proteine e sono previsti per modificare la topologia della membrana, ma sono disponibili informazioni molto limitate sulla cinetica di queste interazioni e sugli effetti strutturali a causa della mancanza di strumenti adeguati. Per lo stesso motivo, la PAdinamica, relativa alle specifiche specie di PA (a seconda delle catene di acidi grassi che formano l'OP), e le loro esatte proprietà biofisiche sono poco comprese. Ad esempio, l'AP prodotto dalle fosfolipasi D (PLD), dal lisofosfatidil-acil-transferasi (LPAAT) e dalle chinasi diacilglicerolo (DGK) è stato sospettato di svolgere vari ruoli in diverse fasi della via segretaria delle cellule neurosecretorie, ma l'esatta natura delle specie PA coinvolte ciascuna in fase o i meccanismi molecolari precisi rimangono elusive. Una delle principali limitazioni è legata agli strumenti chimici che sono stati sviluppati per studiare gli PA: la maggior parte di essi si basa su PA con catene di acidi grassi modificati (con proprietà fluorescenti o solvatocromiche), quindi non può tenere conto del ruolo Thekey che è giocato dalle diverse catene laterali degli acidi grassi. Per aggirare queste limitazioni, proponiamo di generare un pacchetto completo di strumenti per studiare le dinamiche e le funzioni di PA in qualsiasi contesto cellulare e funzione lasciando le loro catene laterali di acidi grassi non modificate. Una volta che questi strumenti in mano, saranno utilizzati dai nostri partner (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen e il Dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Strasburgo) per decifrare molti aspetti del traffico di vescicole segrete e della fusione che rimangono misteriosi. La maggior parte degli strumenti che proponiamo di sviluppare porterà una piccola funzione chimica biortogonale e componenti fotoattivabili che saranno utili per studiare in modo dipendente dal tempo e dallo spazio, cellule viventi oorganismi. Questi strumenti permetteranno così a noi e ai nostri partner di affrontare contemporaneamente due temi che recentemente hanno favorito i progressi nello studio degli organismi viventi: fotofarmacologia e chimica cellulosa.Il progetto coinvolgerà il laboratorio COBRA — UMR 6014 CNRS IRIB — Université de Rouen, INSA deRouen, e più precisamente il team di chimica bioorganica guidato da Pr. Pierre-Yves Renard (coordinatore). Il Dr. Alexandre Haefelé svilupperà gli strumenti fluorescenti associati al progetto, e il nucleo del progetto sarà guidato dal Dr. Sébastien Balieu che si è unito a Pr. Il team di PY Renard nel gennaio 2018 per lavorare a questo progetto.Se il team di chimica bioorganica di UMR 6014 CNRS COBRA ha una buona esperienza in bioconjugatechemistry e sonde fluorescenti e profluorescenti organiche, questo progetto richiederà una riconversione scientifica per il Dr. Sébastien Balieu, e permetterà al team di ampliare il proprio know-how alla fotofarmacologia e chimica incellulo. Il progetto ci darà l'opportunità di assumere un esperto post-dottorato, il Dr. MathéoBerthet, attualmente borsista post-dottorato in Pr. Il laboratorio di Nocolas Wissinger a Ginevra fino alla fine di dicembre2019, e che ha accettato di aderire al laboratorio su questo progetto con l'obiettivo di tornare in Francia e richiedere una posizione CNRS. (Italian)
13 January 2022
0 references
Los ácidos fosfatídicos (PAs) son los fosfolípidos más simples presentes de forma natural en todos los organismos vivos y han atraído una atención considerable siendo tanto los mensajeros lípidos como los moduladores de la forma de la membrana. Inconsecuencia, se ha propuesto que las AP desempeñen papeles fundamentales para diversas funciones celulares y, en consecuencia, las anomalías en las enzimas de producción de PA ocurren en muchas enfermedades, incluyendo la neurodegeneración, las discapacidades intelectuales, el cáncer y la hipertensión. A nivel molecular, las PA interactúan con varias proteínas y se predicen para modificar la topología de la membrana, pero la información muy limitada sobre la cinética de estas interacciones y efectos estructurales está disponible debido a la falta de herramientas adecuadas. Por la misma razón, la PAdinámica, relacionada con las especies de PA específicas (dependiendo de las cadenas de ácidos grasos que forman la PA), y sus propiedades biofísicas exactas son mal comprendidas. Por ejemplo, se sospecha que las PA producidas por fosfolipasas D (PLD), lisofosfatidil-acil-transferasas (LPAAT) y diacilglicerol cinasas (DGK) desempeñan diversos papeles en diferentes pasos de la vía secreta de las células neurosecretarias, pero la naturaleza exacta de la especie PA involucrada cada uno en el paso o en los mecanismos moleculares precisos sigue siendo difícil de alcanzar. Una de las principales limitaciones está relacionada con las herramientas químicas que se han desarrollado para estudiar las AP: la mayoría de ellos se basan en PA con cadenas modificadas de ácidos grasos (con propiedades fluorescentes o solvatocrómicas), por lo que no pueden tener en cuenta el papel de Thekey que desempeñan las diferentes cadenas laterales de ácidos grasos. Para eludir estas limitaciones, proponemosgenerar una caja de herramientas integral para estudiar la dinámica y las funciones de PA en cualquier contexto celular dado y dejar que sus cadenas laterales de ácidos grasos no se modifiquen. Una vez que estas herramientas en las manos, serán utilizadas por nuestros socios (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen y Dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Estrasburgo) para descifrar muchos aspectos del tráfico secreto de vesículas y la fusión que siguen siendo misteriosos. La mayoría de las herramientas que proponemos desarrollar llevarán una pequeña función química biorthogonal y componentes fotoactivables que serán útiles para estudiar de una manera dependiente del tiempo y del espacio, células vivas u organismos. Estas herramientas nos permitirán así a nosotros y a nuestros socios abordar simultáneamente dos temas que recientemente impulsaron los avances en el estudio de los organismos vivos: fotofarmacología y química del celulo. Este proyecto contará con la participación del laboratorio COBRA — UMR 6014 CNRS IRIB — Université de Rouen, INSA deRouen, y más precisamente el equipo de química bioorgánica encabezado por Pr. Pierre-Yves Renard (coordinador). El Dr. Alexandre Haefelé desarrollará las herramientas fluorescentes asociadas con el proyecto, y el núcleo del proyecto será dirigido por el Dr. Sébastien Balieu, que se unió a Pr. El equipo de PY Renard en enero de 2018 para trabajar en este proyecto.Si el equipo de química bioorgánica de UMR 6014 CNRS COBRA tiene una buena experiencia en bioconjugaquímica y sondas fluorescentes y profluorescentes orgánicas, este proyecto requerirá una reconversión científica para el Dr. Sébastien Balieu, y permitirá al equipo ampliar sus conocimientos a la fotofarmacología y la química incelulo. El proyecto nos dará la oportunidad de contratar a un experto post-doctoral, Dr. MathéoBerthet, actualmente becario post-doctoral en Pr. El laboratorio de Nocolas Wissinger en Ginebra hasta finales de diciembre de 2019, y que aceptó unirse al laboratorio en este proyecto con el objetivo en mente de volver a Francia y solicitar un puesto de CNRS. (Spanish)
14 January 2022
0 references
Fosfatiidhapped (PA) on kõikides elusorganismides looduslikult leiduvad lihtsad fosfolipiidid, mis on äratanud märkimisväärset tähelepanu nii lipiidide teiseks sõnumitoojateks kui ka membraankujuliste modulaatoriteks. Ebatagajärjena on tehtud ettepanek, et PA-d mängiksid keskset rolli erinevate rakufunktsioonide puhul ning seetõttu esineb ebanormaalsusi PA-s ensüümide tootmisel paljudes haigustes, sealhulgas neurodegeneratsioonis, intellektuaalses puudes, vähis ja hüpertensioonis. Molekulaarsel tasandil toimivad PA-d erinevate valkudega ja on ette nähtud membraantopoloogia muutmiseks, kuid asjakohaste vahendite puudumise tõttu on nende koostoimete kineetika ja struktuuriliste mõjude kohta väga vähe teavet. Samal põhjusel on vähetuntud konkreetsete PA liikidega seotud PAdünaamikat (sõltuvalt PA moodustavatest rasvhapete ahelatest) ja nende täpseid biofüüsikalisi omadusi. Näiteks on kahtlustatud, et fosfolipaaside D (PLD), lüsofosfatidüülatsüültransferaaside (LPAAT) ja diatsüülglütseroolkinaaside (DGK) abil toodetud PA-l on neurosekretoorsete rakkude sekretoorse radade eri etappides mitmesuguseid rolle, kuid iga sammuga seotud PA-liigi täpne olemus või täpsed molekulaarsed mehhanismid jäävad raskeks. Üks peamisi piiranguid on seotud keemiliste vahenditega, mis on välja töötatud PAde uurimiseks: enamik neist põhineb modifitseeritud rasvhapete ahelatega PA-l (fluorestseeruvate või solvatokroomsete omadustega), seega ei saa arvesse võtta erinevate rasvhapete külgahelate võtmerolli. Nendest piirangutest möödahiilimiseks teeme ettepaneku luua terviklik tööriistakast, et uurida PA dünaamikat ja funktsioone mis tahes rakukontekstis ja funktsioonis, mis laseb nende rasvhapete külgahelad modifitseerimata. Kui need vahendid on käes, kasutavad neid meie partnerid (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen ja dr Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Strasbourg), et dešifreerida paljusid sekretoorsete vesiikutega kaubitsemise ja tuumasünteesi aspekte, mis jäävad müstiliseks. Enamik vahendeid, mida me välja töötada, kannavad väikest biorthogonaalset keemilist funktsiooni ja fotoaktiveeritavaid komponente, mis on kasulikud ajast ja ruumist sõltuval viisil, elusrakkude või -organismide uurimiseks. Need vahendid võimaldavad meil ja meie partneritel käsitleda samaaegselt kahte teemat, mis hiljuti edendasid edusamme elusorganismide uurimisel: fotofarmakoloogia ja Cellulo keemia.See projekt hõlmab COBRA labor- UMR 6014 CNRS IRIB – Université de Rouen, INSA deRouen, ja täpsemalt bioorgaanilise keemia meeskond eesotsas Pr. Pierre-Yves Renard (koordinaator). Dr Alexandre Haefelé töötab välja projektiga seotud fluorestseeruvad vahendid ning projekti tuumikut juhib dr Sébastien Balieu, kes liitus Pr. PY Renard meeskond jaanuaris 2018 töötada selle projekti.Kui bioorgaanilise keemia meeskond UMR 6014 CNRS COBRA on hea kogemus biokonjugatekeemia ja orgaanilise fluorestseeruva ja profluorestsentssond, see projekt nõuab teaduslikku ümberpööramist dr Sébastien Balieu ja võimaldab meeskonnal laiendada oma teadmisi fotofarmakoloogia ja incellulo keemia. Projekt annab meile võimaluse palgata kvalifitseeritud järeldoktor, dr MathéoBerthet, praegu Pr-i järeldoktor. Nocolas Wissinger’i labor Genfis kuni detsembri lõpuni 2019 ja kes nõustus selle projekti laboriga ühinema eesmärgiga tulla tagasi Prantsusmaale ja taotleda CNRSi seisukohta. (Estonian)
11 August 2022
0 references
Fosfatidinės rūgštys (PA) yra paprasti fosfolipidai, natūraliai esantys visuose gyvuose organizmuose, ir pritraukė didelį dėmesį tiek lipidų antriesiems pasiuntiniams, tiek membranos formos moduliatoriams. Dėl to PA pasiūlyta atlikti pagrindinį vaidmenį įvairioms ląstelių funkcijoms, todėl PA gaminančių fermentų nenormalumas pasireiškia daugelyje ligų, įskaitant neurodegeneraciją, intelekto sutrikimus, vėžį ir hipertenziją. Molekuliniu lygmeniu PA sąveikauja su įvairiais baltymais ir yra prognozuojama, kad gali pakeisti membranų topologiją, tačiau dėl tinkamų priemonių trūkumo turima labai mažai informacijos apie šių sąveikų kinetiką ir struktūrinį poveikį. Dėl tos pačios priežasties PAdinamika, susijusi su konkrečiomis PA rūšimis (priklausomai nuo riebalų rūgščių grandinių, sudarančių PA), ir jų tikslios biofizinės savybės yra menkai suprantamos. Pavyzdžiui, buvo įtariama, kad fosfolipas D (PLD), lizofosfatidil-aciltransferazių (LPAAT) ir diacilglicerolio kinazės (DGK) PA atlieka įvairius vaidmenis skirtingais neurosekrecinių ląstelių sekrecinio kelio etapais, tačiau tikslus PA rūšies pobūdis arba tikslūs molekuliniai mechanizmai išlieka silpni. Vienas iš pagrindinių apribojimų, susijusių su cheminėmis priemonėmis, kurios buvo sukurtos MA tyrimui: dauguma jų yra pagrįsti PA su modifikuotomis riebalų rūgščių grandinėmis (su fluorescencinėmis arba solvatochrominėmis savybėmis), todėl negalima atsižvelgti į pagrindinį vaidmenį, kurį atlieka skirtingos riebalų rūgščių šoninės grandinės. Norėdami apeiti šiuos apribojimus, siūlome sukurti išsamų priemonių rinkinį, kad būtų galima ištirti PA dinamiką ir funkcijas bet kuriuo konkrečiu koriniu kontekstu ir funkcija, leidžiančia jų riebalų rūgščių šoninėms grandinėms nemodifikuoti. Kai šie įrankiai rankose, jie bus naudojami mūsų partneriai (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen ir dr Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Strasbūras) iššifruoti daugelį slaptos pūslelių prekybos ir sintezės aspektų, kurie lieka paslaptingi. Dauguma priemonių, kurias siūlome sukurti, turės nedidelę biorthogonalinę cheminę funkciją ir fotoaktivauojamus komponentus, kurie bus naudingi tiriant laiko ir erdvės priklausomą būdą, gyvas ląsteles arorganizmus. Taigi šios priemonės leis mums ir mūsų partneriams vienu metu spręsti dvi temas, kurios neseniai paskatino pažangą tiriant gyvus organizmus: fotofarmakologija ir celiuliozės chemija. Šis projektas apims COBRA laboratoriją – UMR 6014 CNRS IRIB – Université de Rouen, INSA deRouen, tiksliau – bioorganinės chemijos komandą, kuriai vadovauja Pr. Pierre-Yves Renard (koordinatorė). Dr. Alexandre Haefelé sukurs fluorescencines priemones, susijusias su projektu, o projekto branduoliui vadovaus dr. Sébastien Balieu, prisijungęs prie Pr. PY Renard komanda sausio 2018 dirbti su šiuo projektu.Jei UMR 6014 CNRS COBRA bioorganinės chemijos komanda turi gerą patirtį biokonjugatų ir organinių fluorescencinių ir profluorescencinių zondų srityje, šiam projektui reikės mokslinės rekonversijos dr. Sébastien Balieu ir leis komandai išplėsti savo praktinę patirtį į fotofarmakologiją ir inceliulio chemiją. Projektas suteiks mums galimybę samdyti kvalifikuotą doktorantą dr. MathéoBerthet, šiuo metu Pr. Nocolas Wissinger laboratorija Ženevoje iki gruodžio 2019 pabaigos, ir kurie sutiko prisijungti prie laboratorijos dėl šio projekto, turint omenyje tikslą grįžti į Prancūziją ir kreiptis dėl CNRS pozicijos. (Lithuanian)
11 August 2022
0 references
Fosfatidne kiseline (PA) su najjednostavniji fosfolipidi prirodno prisutni u svim živim organizmima i privukli su veliku pozornost i kao lipidni drugi glasnici i modulatori membranskog oblika. Zbog toga je predloženo da PA-ovi imaju ključnu ulogu u različitim staničnim funkcijama i u skladu s timabnormalnosti u enzimima koji proizvode PA javljaju se u mnogim bolestima, uključujući neurodegeneraciju, intelektualne poremećaje, rak i hipertenziju. Na molekularnoj razini, PA-ovi djeluju u interakciji s različitim proteinima i predviđeni su za izmjenu membranske topologije, ali zbog nedostatka odgovarajućih alata dostupne su vrlo ograničene informacije o kinetici tih interakcija i strukturnih učinaka. Iz istog se razloga PAdinamika, koja se odnosi na specifičnu PA vrstu (ovisno o lancima masnih kiselina koji tvore PA), i njihova točna biofizička svojstva slabo razumiju. Na primjer, sumnja se da PA proizvodi fosfolipaze D (PLD), lizofosfatidil-acil-transferaze (LPAAT) i diacylglycerol kinaze (DGK) imajurazličite uloge u različitim fazama sekretornog puta neurosekretornih stanica, ali točna priroda vrsta koje su uključene u svaki korak ili precizni molekularni mehanizmi ostaju nedostižni. Jedno od glavnih ograničenja odnosi se na kemijske alate koji su razvijeni za proučavanje AP-ova: većina se temelji na PA smodificiranim lancima masnih kiselina (s fluorescentnim ili solvatokromnim svojstvima), stoga se ne može uzeti u obzir ključna uloga koju igraju različiti bočni lanci masnih kiselina. Kako bismo zaobišli ta ograničenja, predlažemo generiranje sveobuhvatnog alata za proučavanje dinamike i funkcija PA-a u bilo kojem staničnom kontekstu i funkciju koja omogućuje da njihovi bočni lanci masnih kiselina budu nepromijenjeni. Kada ti alati dođu u ruke, koristit će ih naši partneri (pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen i dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Strasbourg) kako bi dešifrirali mnoge aspekte trgovine sekretarnim vezikulama i fuzije koje ostaju tajanstvene. Većina alata koje predlažemo za razvoj nosit će malu biortogonalnu kemijsku funkciju i fotoaktivabilne komponente koje će biti korisne za proučavanje na način koji ovisi o vremenu i prostoru, žive stanice iliorganizmi. Ti će alati tako omogućiti nama i našim partnerima da se istodobno bave dvije teme koje su nedavno pojačale napredak u proučavanju živih organizama: fotofarmakologija i u celulo kemije.Ovaj projekt će uključivati COBRA laboratorij- UMR 6014 CNRS IRIB – Université de Rouen, INSA deRouen, a preciznije tim bioorganske kemije na čelu s Pr. Pierre-Yves Renard (koordinator). Dr. Alexandre Haefelé će razviti fluorescentne alate povezane s projektom, a jezgru projekta vodit će dr. Sébastien Balieu koji se pridružio Pr-u. PY Renardov tim u siječnju 2018. radi na ovom projektu.Ako tim bioorganske kemije UMR 6014 CNRS COBRA ima dobro iskustvo u biokonjugatnoj kemiji i organskim fluorescentnim i profluorescentnim sondama, ovaj će projekt zahtijevati znanstvenu rekonverziju za dr. Sébastien Balieu, te će omogućiti timu da proširi svoje znanje na fotofarmakologiju i incellulo kemiju. Projekt će nam dati priliku zaposliti kvalificiranog poslijedoktorskog suradnika, dr. MathéoBerthet, trenutno poslijedoktorskog suradnika u Pr. Laboratorij Nocolas Wissinger u Ženevi do kraja prosinca2019. i koji je prihvatio da se pridruži laboratoriju na ovom projektu s ciljem da se vrati u Francusku i podnese zahtjev za CNRS poziciju. (Croatian)
11 August 2022
0 references
Τα φωσφατιδικά οξέα (PAs) είναι τα απλούστερα φωσφολιπίδια που είναι φυσικά παρόντα σε όλους τους ζωντανούς οργανισμούς και έχουν τραβήξει σημαντική προσοχή είναι τόσο λιπίδια δευτερογενείς αγγελιοφόροι και διαμορφωτές σχήματος μεμβράνης. Ασυνέπεια, οι ΠΑ έχουν προταθεί να διαδραματίσουν καίριο ρόλο για διάφορες κυτταρικές λειτουργίες και, κατά συνέπεια, οι ανωμαλίες στα ένζυμα που παράγουν ΠΑ εμφανίζονται σε πολλές ασθένειες, όπως η νευροεκφύλιση, οι διανοητικές αναπηρίες, ο καρκίνος και η υπέρταση. Σε μοριακό επίπεδο, οι PAs αλληλεπιδρούν με διάφορες πρωτεΐνες και είναιπροβλεπόμενοι να τροποποιήσουν την τοπολογία της μεμβράνης, αλλά πολύ περιορισμένες πληροφορίες σχετικά με την κινητική αυτών των αλληλεπιδράσεων και δομικών επιδράσεων είναι διαθέσιμες λόγω της έλλειψης επαρκών εργαλείων. Για τον ίδιο λόγο, η PAdynamics, που σχετίζεται με το συγκεκριμένο είδος PA (ανάλογα με τις αλυσίδες λιπαρών οξέων που σχηματίζουν τον οργανισμό πληρωμών), και οι ακριβείς βιοφυσικές ιδιότητές τους δεν είναι επαρκώς κατανοητές. Για παράδειγμα, PA που παράγεται από φωσφολιπάσες D (PLD), λυσοφωσφατιδυλο-ακυλοτρανσφερασές (LPAAT) και διακυλογλυκερόλη κινάσες (DGK) έχουν υποψίες ότι παίζουν διάφορους ρόλους σε διάφορα στάδια της εκκριτικής οδού των νευροεκκριτικών κυττάρων, αλλά η ακριβής φύση των PAspecies που εμπλέκονται το καθένα σε βήμα ή οι ακριβείς μοριακοί μηχανισμοί παραμένουν ασαφείς. Ένας από τους κύριους περιορισμούς σχετίζεται με τα χημικά εργαλεία που έχουν αναπτυχθεί για τη μελέτη των οργανισμών πληρωμών: τα περισσότερα από αυτά βασίζονται σε ΠΑ με αλυσίδες τροποποιημένων λιπαρών οξέων (με φθορίζουσες ή διαλυτοχρωμικές ιδιότητες), οπότε δεν μπορούν να λάβουν υπόψη τον ρόλο Thekey που διαδραματίζουν οι διάφορες πλευρικές αλυσίδες λιπαρών οξέων. Για να παρακάμψουμε αυτούς τους περιορισμούς, προτείνουμε να δημιουργηθεί μια ολοκληρωμένη εργαλειοθήκη για τη μελέτη της δυναμικής και των λειτουργιών του PA σε κάθε δεδομένο κυτταρικό πλαίσιο και λειτουργία αφήνοντας τις πλευρικές αλυσίδες λιπαρών οξέων τους αμετάβλητες. Μόλις αυτά τα εργαλεία στα χέρια, θα χρησιμοποιηθούν από τους εταίρους μας (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen και Dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Στρασβούργο) για να αποκρυπτογραφήσουν πολλές πτυχές της εκκριτικής διακίνησης κυστιδίων και της σύντηξης που παραμένουν μυστηριώδεις. Τα περισσότερα από τα εργαλεία που προτείνουμε να αναπτύξουμε θα φέρουν μια μικρή βιογονική χημική λειτουργία και φωτοενεργά συστατικά που θα είναι χρήσιμα για τη μελέτη με τρόπο εξαρτημένο από το χρόνο και το χώρο, ζωντανών κυττάρων ή οργανισμών. Έτσι, τα εργαλεία αυτά θα επιτρέψουν σε εμάς και στους εταίρους μας να ασχοληθούμε ταυτόχρονα με δύο θέματα που ενίσχυσαν πρόσφατα την πρόοδο στη μελέτη των ζωντανών οργανισμών: το έργο αυτό θα περιλαμβάνει το εργαστήριο COBRA — UMR 6014 CNRS IRIB — Université de Rouen, INSA deRouen, και πιο συγκεκριμένα την ομάδα βιοοργανικής χημείας με επικεφαλής τον Pr. Pierre-Yves Renard (συντονιστής). Ο Δρ. Alexandre Haefelé θα αναπτύξει τα φθορίζοντα εργαλεία που συνδέονται με το έργο, και ο πυρήνας του έργου θα καθοδηγείται από τον Δρ Sébastien Balieu, ο οποίος εντάχθηκε στην Pr. Η ομάδα του PY Renard τον Ιανουάριο του 2018 για να εργαστεί σε αυτό το έργο.Αν η ομάδα βιοοργανικής χημείας της UMR 6014 CNRS COBRA έχει μια καλή εμπειρία στη βιοσυζυγοχημεία και τους οργανικούς φθορίζοντες και προφθορίζοντες ανιχνευτές, το έργο αυτό θα απαιτήσει επιστημονική ανατροπή για τον Δρ Sébastien Balieu, και θα επιτρέψει στην ομάδα να διευρύνει τις γνώσεις της στη φωτοφαρμακολογία και τη χημεία incellulo. Το έργο θα μας δώσει την ευκαιρία να προσλάβουμε έναν εξειδικευμένο μεταδιδακτορικό συνεργάτη, τον Δρ. MathéoBerthet, επί του παρόντος μεταδιδακτορικό συνεργάτη στο Pr. Το εργαστήριο της Nocolas Wissinger στη Γενεύη μέχρι τα τέλη Δεκεμβρίου 2019 και ο οποίος αποδέχθηκε να ενταχθεί στο εργαστήριο αυτού του έργου με στόχο να επιστρέψει στη Γαλλία και να υποβάλει αίτηση για θέση CNRS. (Greek)
11 August 2022
0 references
Fosfatidové kyseliny (PA) sú jednoduché fosfolipidy prirodzene prítomné vo všetkých živých organizmoch a priťahujú značnú pozornosť lipidových druhých poslov a modulátorov membránového tvaru. V dôsledku toho sa navrhlo, aby PA zohrávali kľúčovú úlohu pre rôzne bunkové funkcie a v dôsledku toho sa v enzýmoch produkujúcich PA vyskytujú pri mnohých chorobách vrátane neurodegenerácie, intelektuálnej invalidity, rakoviny a hypertenzieabnormálne vlastnosti. Na molekulárnej úrovni PA interagujú s rôznymi proteínmi a predpokladajú sa, že modifikujú membránovú topológiu, ale k dispozícii sú veľmi obmedzené informácie týkajúce sa kinetiky týchto interakcií a štrukturálnych účinkov z dôvodu nedostatku primeraných nástrojov. Z rovnakého dôvodu PAdynamika súvisiaca s konkrétnymi druhmi PA (v závislosti od reťazcov mastných kyselín tvoriacich PA) a ich presné biofyzikálne vlastnosti sú nedostatočne pochopené. Napríklad PA produkované fosfolipazmi D (PLD),lyzofosfatidylacyltransferázami (LPAAT) a diacylglycerolkinázami (DGK) mali podozrenie, že hrajú rôzne úlohy v rôznych krokoch sekrečnej dráhy neurosekrečných buniek, ale presná povaha PAdruhov zapojených do kroku alebo presné molekulárne mechanizmy zostávajú nepolapiteľné. Jedno z hlavných obmedzenísa týka chemických nástrojov, ktoré boli vyvinuté na štúdium PA: väčšina z nich je založená na PA s modifikovanými reťazcami mastných kyselín (s fluorescenčnými alebo solvatochromickými vlastnosťami), takže nemôže brať do úvahy Thekey úlohu, ktorú zohrávajú rôzne bočné reťazce mastných kyselín. Aby sme obišli tieto obmedzenia, navrhujeme vytvoriť komplexný súbor nástrojov na štúdium dynamiky a funkcií PA v danom bunkovom kontexte a funkcie, čím sa ich vedľajšie reťazce mastných kyselín nemodifikované. Akonáhle sú tieto nástroje v rukách, budú ich používať naši partneri (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen a Dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Štrasburg) rozlúštiť mnohé aspekty obchodovania s sekretárnou vezikulou a fúzie, ktoré zostávajú tajomné. Väčšina nástrojov, ktoré navrhujeme vyvinúť, bude mať malú biorthogonálnu chemickú funkciu a fotoaktivovateľné zložky, ktoré budú užitočné pre štúdium v závislosti od času a priestoru, živé bunky aleboorganizmy. Tieto nástroje tak umožnia nám a našim partnerom riešiť súčasne dve témy, ktoré nedávno podporili pokrok v štúdiu živých organizmov: fotofarmakológia a v celulovej chémii.Tento projekt bude zahŕňať COBRA laboratórium- UMR 6014 CNRS IRIB – Université de Rouen, INSA deRouen, a presnejšie tím bioorganickej chémie vedený Pr. Pierre-Yves Renard (koordinátor). Dr. Alexandre Haefelé vyvinie fluorescenčné nástroje spojené s projektom a jadro projektu bude viesť Dr. Sébastien Balieu, ktorý sa pripojil k Pr. Tím PY Renard v januári 2018 pracovať na tomto projekte.Ak má tím bioorganickej chémie UMR 6014 CNRS COBRA dobré skúsenosti s biokonjugatechémiou a organickou fluorescenčnou a profluorescenčnou sondou, tento projekt bude vyžadovať vedeckú rekonverziu pre Dr. Sébastien Balieu a umožní tímu rozšíriť svoje know-how o fotofarmakológiu a incellulo chémiu. Projekt nám poskytne príležitosť najať kvalifikovaného postdoktorandského kolegu, Dr. MathéoBertheta, v súčasnosti postdoktorandského kolegu v Pr. Laboratórium Nocolas Wissinger v Ženeve do konca decembra 2019 a ktorý súhlasil, že sa pripojí k laboratóriu na tomto projekte s cieľom vrátiť sa do Francúzska a požiadať o pozíciu CNRS. (Slovak)
11 August 2022
0 references
Fosfatidihapot (PA) ovat yksinkertaisia fosfolipidejä, joita esiintyy luonnollisesti kaikissa elävissä organismeissa ja jotka ovat kiinnittäneet huomattavaa huomiota sekä lipidien sekundaarisiin lähettimiin että kalvon muotoisiin modulaattoreihin. Tästä seuraa, että PA:ta on ehdotettu toimimaan keskeisessä roolissa erilaisissa solutoiminnoissa, ja näin ollen PA: n tuottamien entsyymien epänormaaleja esiintyy monissa sairauksissa, kuten neurodegeneraatiossa, älyllisissähäiriöissä, syövässä ja verenpaineessa. Molekyylitasolla PA:t ovat vuorovaikutuksessa erilaisten proteiinien kanssa, ja niiden ennustetaan muuttavan kalvotopologiaa, mutta näiden vuorovaikutusten kinetiikasta ja rakenteellisista vaikutuksista on hyvin vähän tietoa asianmukaisten välineiden puuttumisen vuoksi. Samasta syystä PAdynamiikka, joka liittyy erityisiin PA-lajeihin (riippuen PA:n muodostavista rasvahappoketjuista), ja niiden tarkat biofyysiset ominaisuudet ymmärretään huonosti. Esimerkiksi fosfolipases D:n (PLD), lysofosfatidyyli-asyyli-transferaasien (LPAAT) ja diasyyliglyserolikinaasien (DGK) tuottamaa PA:ta on epäilty pelaavanerilaisilla rooleilla neuroscretoryn solujen eri vaiheissa, mutta PA-lajin tarkka luonne kussakin vaiheessa tai tarkat molekyylimekanismit ovat edelleen vaikeaselkoisia. Yksi tärkeimmistä rajoituksista liittyy kemiallisiin välineisiin, jotka on kehitetty kumppanuussopimusten tutkimista varten: useimmat niistä perustuvat PA muunneltu rasvahappo ketjut (fluoresoiva tai solvatochromic ominaisuudet), joten ei voida ottaa huomioon keskeinen rooli, joka on eri rasvahappo sivuketjut. Näiden rajoitusten kiertämiseksi ehdotamme kattavan työkalupakin luomista PA:n dynamiikan ja toimintojen tutkimiseksi missä tahansa solukontekstissa ja toiminnallisuudessa, jolloin rasvahappojen sivuketjut eivät muutu. Kun nämä työkalut ovat käsissä, niitä käytetään kumppanimme (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen ja tohtori Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Strasbourg) selvittämään monia salaperäisen vesikkelin salakuljetuksen ja fuusion näkökohtia, jotka ovat edelleen salaperäisiä. Useimmat työkalut, joita ehdotamme kehittää, kantavat pieni biorthogonal kemiallinen toiminto ja fotoaktiivisia komponentteja, jotka ovat hyödyllisiä tutkia ajasta ja tilasta riippuva tavalla, elävät solut tai organismit. Nämä välineet antavat meille ja kumppaneillemme mahdollisuuden käsitellä samanaikaisesti kahta aihetta, jotka viime aikoina vauhdittivat elävien organismien tutkimuksessa saavutettua edistystä: fotofarmakologia ja selluloosakemia.Tähän hankkeeseen osallistuu COBRA-laboratorio UMR 6014 CNRS IRIB – Université de Rouen, INSA deRouen ja tarkemmin sanottuna Pr:n johtama bioorgaaninen kemia. Pierre-Yves Renard (koordinaattori). Tohtori Alexandre Haefelé kehittää projektiin liittyviä fluoresoivia työkaluja, ja projektin ydintä johtaa tohtori Sébastien Balieu, joka liittyi Pr:ään. PY Renardin tiimi työskentelee tammikuussa 2018 tämän projektin parissa.Jos UMR 6014 CNRS COBRA:n bioorgaaninen kemiatiimillä on hyvä kokemus biokonjugaattikemiasta ja orgaanisesta fluoresoivasta ja profluoresoivasta luotaimesta, tämä hanke edellyttää tohtori Sébastien Balieun tieteellistä rekonversiota ja antaa tiimille mahdollisuuden laajentaa osaamistaan fotofarmakologiaan ja selluloosakemiaan. Projekti antaa meille mahdollisuuden palkata tohtori MathéoBerthet, tohtori MathéoBerthet, tällä hetkellä tohtorintutkinnon jälkeinen stipendi Pr. Nocolas Wissingerin laboratorio Genevessä joulukuun 2019 loppuun asti, ja joka suostui liittymään laboratorioon tässä projektissa tavoitteenaan palata Ranskaan ja hakea CNRS-asemaa. (Finnish)
11 August 2022
0 references
Kwasy fosfatydowe (PAs) są fosfolipidami prostszymi naturalnie występującymi we wszystkich żywych organizmach i przyciągnęły znaczną uwagę zarówno lipidowymi drugimi posłańcami, jak i modulatorami kształtu błony. W konsekwencji, PAs zostały zaproponowane do odgrywania kluczowych ról dla różnych funkcji komórkowych i odpowiednio nienormalności w enzymach wytwarzających PA występują w wielu chorobach, w tym neurodegeneracji, zaburzeń intelektualnych, raka i nadciśnienia tętniczego. Na poziomie molekularnym PA wchodzą w interakcje z różnymi białkami i przewidują modyfikację topologii błony, ale ze względu na brak odpowiednich narzędzi dostępne są bardzo ograniczone informacje dotyczące kinetyki tych interakcji i efektów strukturalnych. Z tego samego powodu PAdynamika, związana z konkretnymi gatunkami PA (w zależności od łańcuchów kwasów tłuszczowych tworzących PA), oraz ich dokładne właściwości biofizyczne są słabo rozumiane. Na przykład PA wytwarzana przez fosfolipazy D (PLD), lizofosfatydyloazy acylotransferazy (LPAAT) i kinazy diacyloglicerolu (DGK) podejrzewano, że odgrywają różne role na różnych etapach wydzielczej ścieżki komórek neurosecretorycznych, ale dokładny charakter PAgat zaangażowanych w etap lub precyzyjne mechanizmy molekularne pozostają nieuchwytne. Jedno z głównych ograniczeńjest związane z narzędziami chemicznymi, które opracowano w celu badania PA: większość z nich opiera się na zmodyfikowanych łańcuchach kwasów tłuszczowych (o właściwościach fluorescencyjnych lub solvatochromowych), więc nie można wziąć pod uwagę kluczowej roli, jaką odgrywają różne łańcuchy boczne kwasów tłuszczowych. Aby obejść te ograniczenia, proponujemy stworzenie kompleksowego zestawu narzędzi do badania dynamiki i funkcji PA w dowolnym kontekście komórkowym i funkcji, dzięki czemu ich łańcuchy po stronie kwasów tłuszczowych są niezmodyfikowane. Po tych narzędziach w rękach, będą one wykorzystywane przez naszych partnerów (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen i dr Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Strasburg), aby rozszyfrować wiele aspektów handlu i fuzji wydzielonych pęcherzyków, które pozostają tajemnicze. Większość narzędzi, które proponujemy opracować, będzie miała małą biorthogonalną funkcję chemiczną i składniki fotoaktywowalne, które będą przydatne do badania w sposób zależny od czasu i przestrzeni, żywe komórki luborganizmy. Narzędzia te umożliwią nam i naszym partnerom jednoczesne zajęcie się dwoma tematami, które niedawno zwiększyły postępy w badaniach nad żywymi organizmami: fotofarmakologia i chemia celulo.Projekt ten obejmie laboratorium COBRA – UMR 6014 CNRS IRIB – Université de Rouen, INSA deRouen, a dokładniej zespół chemii bioorganicznej kierowany przez Pr. Pierre-Yves Renard (koordynator). Dr Alexandre Haefelé opracuje narzędzia fluorescencyjne związane z projektem, a podstawą projektu będzie dr Sébastien Balieu, który dołączył do projektu. Zespół PY Renard w styczniu 2018 roku do pracy nad tym projektem. Jeśli zespół chemii bioorganicznej UMR 6014 CNRS COBRA ma dobre doświadczenie w bioconjugatechemii oraz organicznych sond fluorescencyjnych i profluorescencyjnych, projekt ten będzie wymagał naukowej rekonwersji dla dr Sébastien Balieu i umożliwi zespołowi poszerzenie wiedzy o fotofarmakologię i chemię incellulo. Projekt pozwoli nam zatrudnić wykwalifikowanego podoktora dr MathéoBertheta, współpracownika podoktorskiego w Pr. Laboratorium Nocolasa Wissingera w Genewie do końca grudnia 2019 r., które zgodziło się dołączyć do laboratorium nad tym projektem z myślą o powrocie do Francji i ubieganiu się o stanowisko CNRS. (Polish)
11 August 2022
0 references
A foszfatidsavak (PA-k) a legegyszerűbb foszfolipidek, amelyek természetes módon jelen vannak minden élő szervezetben, és jelentős figyelmet fordítanak mind a lipid másodlagos hírvivőkre, mind a membrán alakú modulátorokra. Ennek következtében a PA-kat javasolták, hogy kulcsfontosságú szerepet játsszanak a különböző sejtfunkciókban, és ennek megfelelően a PA-t termelő enzimek rendellenességei számos betegségben fordulnak elő, beleértve a neurodegenerációt, az intellektuális fogyatékosságokat, a rákot és a magas vérnyomást. Molekuláris szinten a PA-k kölcsönhatásba lépnek a különböző fehérjékkel, és a membrán topológiáját módosítják, de a megfelelő eszközök hiánya miatt nagyon kevés információ áll rendelkezésre ezen interakciók és szerkezeti hatások kinetikájára vonatkozóan. Ugyanezen okból az adott PA-fajhoz kapcsolódó PAdynamics (a PA-t alkotó zsírsavláncoktól függően) és azok pontos biofizikai tulajdonságai kevéssé ismertek. Például a D foszfolipázok (PLD), a lizofoszfatidil-acil-transzferázok (LPAAT) és a diacilglicerin-kinázok (DGK) által termelt PA-t gyanították, hogy különböző szerepet játszanak a neuroszekréciós sejtek szekréciós útvonalának különböző lépéseiben, de a lépésben részt vevő PAfajok pontos jellege vagy a pontos molekuláris mechanizmusok továbbra is megfoghatatlanok. Az egyik fő korlátozás a PA-k tanulmányozására kifejlesztett kémiai eszközökhöz kapcsolódik: legtöbbjük PA-val módosított zsírsavláncokon alapul (fluoreszcens vagy solvatokróm tulajdonságokkal), így nem lehet figyelembe venni a különböző zsírsav-oldalláncok kulcsszerepét. Ezeknek a korlátozásoknak a megkerülése érdekében javasoljuk egy átfogó eszköztár létrehozását a PA dinamikájának és funkcióinak tanulmányozására bármely adott celluláris kontextusban és funkciót, amely lehetővé teszi a zsírsav oldalláncok módosítását. Amint ezek az eszközök a kezében vannak, azokat partnereink (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen és Dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Strasbourg), hogy megfejtsék a szekréciós hólyagcsempészet és -fúzió számos, továbbra is rejtélyes aspektusát. A fejlesztésre javasolt eszközök többsége egy kis biorthogon kémiai funkciót és fotoaktiválható komponenseket fog hordozni, amelyek hasznosak lesznek idő- és térfüggő módon, élő sejtek vagy mikroorganizmusok tanulmányozásához. Ezek az eszközök lehetővé teszik számunkra és partnereink számára, hogy egyszerre foglalkozzunk két olyan témával, amelyek a közelmúltban előmozdították az élő szervezetek tanulmányozásának előrehaladását: fotofarmakológia és cellulo kémia.Ez a projekt magában foglalja a COBRA laboratórium- UMR 6014 CNRS IRIB – Université de Rouen, INSA deRouen, és pontosabban a bioorganikus kémia csapat által vezetett Pr. Pierre-Yves Renard (koordinátor). Dr. Alexandre Haefelé fejleszti a projekthez kapcsolódó fluoreszkáló eszközöket, és a projekt magját Dr. Sébastien Balieu vezeti, aki csatlakozott a Pr-hez. PY Renard csapata 2018 januárjában dolgozik ezen a projekten.Ha az UMR 6014 CNRS COBRA bioszerves kémia csapata jó tapasztalattal rendelkezik a biokonjugált kémia, valamint a szerves fluoreszkáló és profluoreszcens szondák terén, ez a projekt tudományos átalakítást igényel Dr. Sébastien Balieu számára, és lehetővé teszi a csapat számára, hogy bővítse a fotofarmakológia és az incellulo kémia szakértelmét. A projekt lehetőséget ad arra, hogy felbéreljünk egy képzett posztdoktori munkatársat, Dr. MathéoBerthet-et, aki jelenleg posztdoktori munkatárs a Pr-ben. Nocolas Wissinger genfi laboratóriuma 2019. december végéig, és aki beleegyezett, hogy csatlakozzon a projekt laborjához azzal a céllal, hogy visszatérjen Franciaországba és jelentkezzen CNRS pozícióra. (Hungarian)
11 August 2022
0 references
Fosfatidové kyseliny (PA) jsou prostými fosfolipidy přirozeně přítomné ve všech živých organismech a přitahovaly značnou pozornost jak lipidovým druhým poslům, tak modulátorům tvaru membrány. V důsledku toho bylo navrženo, aby PA hrály klíčové role pro různé buněčné funkce, a proto se v mnoha onemocněních, včetně neurodegenerace, intelektuálních poruch, rakoviny a hypertenze, vyskytujíabnormality u enzymů produkujících PA. Na molekulární úrovni se PA interaguje s různými proteiny a předpokládá se, že změní membránovou topologii, ale vzhledem k nedostatku vhodných nástrojů jsou k dispozici velmi omezené informace o kinetice těchto interakcí a strukturálních účinků. Ze stejného důvodu, PAdynamics, související s konkrétními druhy PA (v závislosti na řetězcích mastných kyselin tvořících PA) a jejichpřesné biofyzikální vlastnosti jsou špatně pochopeny. Například PA produkovaná fosfolipasami D (PLD),lysofosfatidyl-acyl-acyl-transferázami (LPAAT) a diacylglycerolkinázami (DGK) byly podezřívány k tomu, že hrají různé role v různých krocích sekreční dráhy neurosekretických buněk, ale přesná povaha PA druhů, kterých se každý krok týká, nebo přesné molekulární mechanismy zůstávají nepolapitelná. Jedno z hlavních omezení se týká chemických nástrojů, které byly vyvinuty pro studium PA: většina z nich je založena na PA s modifikovanými řetězci mastných kyselin (s fluorescenčními nebo solvatochromickými vlastnostmi), takže nemůže vzít v úvahu klíčovou roli, kterou hrají různé postranní řetězce mastných kyselin. Abychom tato omezení obcházeli, navrhujeme vytvořit komplexní sadu nástrojů pro studium dynamiky a funkcí PA v jakémkoli daném buněčném kontextu a funkci, aby jejich postranní řetězce mastných kyselin zůstaly nezměněny. Jakmile tyto nástroje v rukou, budou použity našimi partnery (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen a Dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Štrasburk) rozluštily mnoho aspektů obchodování se sekreční vezikuly a fúzí, které zůstávají záhadné. Většina nástrojů, které navrhujeme vyvinout, bude nést malou biorthogonální chemickou funkci a fotoaktivovatelné složky, které budou užitečné pro studium v čase a prostoru závislém způsobem, živé buňky neboorganismy. Tyto nástroje nám a našim partnerům umožní řešit současně dvě témata, která nedávno posílila pokroky ve studiu živých organismů: fotofarmakologie a v celulární chemii.Tento projekt bude zahrnovat laboratoř COBRA – UMR 6014 CNRS IRIB – Université de Rouen, INSA deRouen a přesněji tým bioorganické chemie vedený Pr. Pierre-Yves Renard (koordinátor). Dr. Alexandre Haefelé bude vyvíjet fluorescenční nástroje spojené s projektem a jádro projektu bude vést Dr. Sébastien Balieu, který se připojil k Pr. Tým PY Renard v lednu 2018 pracuje na tomto projektu.Pokud má tým bioorganické chemie UMR 6014 CNRS COBRA dobré zkušenosti s biokonjugatechemií a organickými fluorescenčními a profluorescenčními sondami, bude tento projekt vyžadovat vědeckou přeměnu pro Dr. Sébastien Balieu a umožní týmu rozšířit své know-how o fotofarmakologii a incelulární chemii. Projekt nám umožní najmout zkušeného postdoktorandského kolegu, Dr. MathéoBertheta, v současné době postdoktorandského kolegu v Pr. Laboratoř Nocolase Wissingera v Ženevě do konce prosince 2019 a který přijal vstup do laboratoře na tento projekt s cílem vrátit se do Francie a požádat o pozici CNRS. (Czech)
11 August 2022
0 references
Fosfatidīnskābes (PA) ir vienkāršākie fosfolipīdi, kas dabiski sastopami visos dzīvos organismos, un ir pievērsuši ievērojamu uzmanību gan lipīdu sekundāriem kurjeriem, gan membrānas formas modulatoriem. Tāpēc ir ierosināts, ka PA ir galvenās lomas dažādām šūnu funkcijām, un tādējādi daudzās slimībās, tostarp neirodeģenerācijā, intelektuālās attīstības traucējumi, vēzis un hipertensija, rodas anomālijas PA ražojošos enzīmus. Molekulārā līmenī PA mijiedarbojas ar dažādiem proteīniem un irparedzēts mainīt membrānu topoloģiju, bet ir pieejama ļoti ierobežota informācija par šīs mijiedarbības kinētiku un strukturālajiem efektiem, jo trūkst piemērotu instrumentu. Tā paša iemesla dēļ PAdinamika, kas saistīta ar konkrētām PA sugām (atkarībā no taukskābju ķēdēm, kas veido PA), un to konkrētās biofizikālās īpašības ir slikti izprastas. Piemēram, ir aizdomas, ka PA, ko ražo fosfolipāzes D (PLD), lizofosfatidil-aciltransferāzes (LPAAT) un diacilglicerīna kināzes (DGK), dažādos neirosekretāro šūnu sekrēcijas ceļa posmos ir dažādas lomas, bet precīzs PA sugas veids, kas iesaistīts katrā posmā, vai precīzi molekulārie mehānismi joprojām ir nenotverami. Viens no galvenajiem ierobežojumiemir saistīts ar ķīmiskajiem instrumentiem, kas izstrādāti PA izpētei: lielākā daļa no tiem ir balstīti uz PA armodificētas taukskābju ķēdes (ar fluorescējošām vai solvatochromic īpašībām), tāpēc nevar ņemt vērā galveno lomu, ko spēlē dažādas taukskābju sānu ķēdes. Lai apietu šos ierobežojumus, mēs ierosinām izveidot visaptverošu rīkkopu, lai izpētītu PA dinamiku un funkcijas jebkurā konkrētā šūnu kontekstā un funkciju, ļaujot to taukskābju sānu ķēdēm nemodificēt. Kad šie instrumenti būs rokās, tos izmantos mūsu partneri (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen un Dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Strasbūra), lai atšifrētu daudzus sekrēcijas vezikulu tirdzniecības un saplūšanas aspektus, kas paliek noslēpumaini. Lielākajai daļai instrumentu, kurus mēs ierosinām attīstīt, būs neliela biorthogonāla ķīmiskā funkcija un fotoatbalstāmas sastāvdaļas, kas būs noderīgas, lai pētītu laiku un telpu atkarīgā veidā, dzīvās šūnas vaiorganismi. Tādējādi šie instrumenti ļaus mums un mūsu partneriem vienlaikus risināt divas tēmas, kas nesen veicināja progresu dzīvo organismu izpētē: Photopharmacology un incellulo ķīmija.Šajā projektā piedalīsies COBRA laboratorija — UMR 6014 CNRS IRIB — Université de Rouen, INSA de Rouen, un, precīzāk, bioorganiskās ķīmijas komanda, ko vada Pr. Pierre-Yves Renard (koordinators). Dr Alexandre Haefelé izstrādās fluorescējošus instrumentus, kas saistīti ar projektu, un projekta kodolu vadīs Dr. Sébastien Balieu, kurš pievienojās Pr. PY Renard komanda 2018. gada janvārī strādās pie šī projekta. Ja UMR 6014 CNRS COBRA bioorganiskās ķīmijas komandai ir laba pieredze biokonjugācijas ķīmijā un organiskajās fluorescējošās un profluorescentajās zondēs, šim projektam būs nepieciešama zinātniska pārveide Dr. Sébastien Balieu, un tā ļaus komandai paplašināt savas zināšanas līdz fotofarmakoloģijai un incellulo ķīmijai. Projekts dos mums iespēju pieņemt darbā kvalificētu pēcdoktorantūras kolēģi Dr. MathéoBerthet, šobrīd Pr doktora grādu. Nocolas Wissinger laboratorija Ženēvā līdz decembra beigām2019, un kas piekrita pievienoties laboratorijai šajā projektā ar mērķi atgriezties Francijā un pieteikties CNRS pozīcijai. (Latvian)
11 August 2022
0 references
Is iad aigéid fhosfaticídeacha (PAs) na fosfailipidí simplí atá i láthair go nádúrtha i ngach orgánach beo agus tá aird mhór tarraingthe orthu mar an dara teachtairí agus módóirí lipid de chruth membrane. Inconsequence, tá sé beartaithe PAnna róil ríthábhachtacha a imirt le haghaidh feidhmeanna ceallacha éagsúla agus dá réir sin tarlaíonn neamhghnácha in einsímí PA a tháirgeann i go leor galair lena n-áirítear neurodegeneration, intellectualdisability, ailse, agus Hipirtheannas. Ag an leibhéal móilíneach, déanann PAnna idirghníomhú le próitéiní éagsúla agus táthar ag súil go n-athróidh siad toipeolaíocht membrane, ach tá faisnéis an-teoranta maidir le cinéitic na n-idirghníomhaíochtaí agus na n-éifeachtaí struchtúracha seo ar fáil mar gheall ar easpa uirlisí leordhóthanacha. Ar an gcúis chéanna, níl tuiscint mhaith ar PAdynamics, a bhaineann leis na speicis shonracha PA (ag brath ar na slabhraí aigéid shailleacha a chruthaíonn an PA), agus a n-airíonna bithfhisiceacha exact. Mar shampla, tá amhras ann go raibh rólanna éagsúla ag PA a tháirgeann phospholipases D (PLD), aistrithe-acyl-acyl-acyl (LPAAT), agus kinases diacylglycerol (DGK) i gcéimeanna éagsúla de chonair rúnda na gceall neurosecretory, ach tá nádúr beacht na speiceas PA a bhí páirteach i ngach céim nó na meicníochtaí móilíneacha beachta fós elusive. Baineann ceann de na teorainneacha is mó leis na huirlisí ceimiceacha a forbraíodh chun staidéar a dhéanamh ar PAanna: tá an chuid is mó acu bunaithe ar PA le slabhraí aigéad sailleacha modhnaithe (le hairíonna fluaraiseacha nó solvatochromic), mar sin ní féidir leo ról Thekey a bhí ag na slabhraí taobh aigéad sailleacha éagsúla a chur san áireamh. Chun dul timpeall ar na teorainneacha sin, molaimid bosca uirlisí cuimsitheach a ghiniúint chun staidéar a dhéanamh ar dhinimic agus ar fheidhmeanna PA in aon chomhthéacs ceallach ar leith agus feidhm a ligean a slabhraí taobh aigéad sailleach gan mhodhnú. Nuair a bheidh na huirlisí seo i lámha, úsáidfidh ár gcomhpháirtithe iad (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen agus an Dr Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Strasbourg) chun go leor gnéithe de gháinneáil rúnda vesicle agus comhleá a remainmysterious. Beidh feidhm cheimiceach biorthogonal beag agus comhpháirteanna photoactivatable a bheidh úsáideach chun staidéar a dhéanamh ar am agus spás ag brath ar an chuid is mó de na huirlisí atá beartaithe againn a fhorbairt, cealla beo nó orgánaigh. Cuirfidh na huirlisí sin ar ár gcumas dúinn agus dár gcomhpháirtithe aghaidh a thabhairt ag an am céanna ar dhá thopaic a chuir dlús le déanaí leis an dul chun cinn a rinneadh maidir le staidéar a dhéanamh ar orgánaigh bheo: Photopharmacology agus sa cheimic cellulo.Beidh baint ag COBRA saotharlainne- UMR 6014 CNRS IRIB — Université de Rouen, INSA DeRouen, agus níos cruinne an fhoireann cheimic bithorgánach faoi cheannas Pr. Pierre-Yves Renard (comhordaitheoir). Forbróidh an Dr. Alexandre Haefelé na huirlisí fluaraiseacha a bhaineann leis an tionscadal, agus beidh an Dr Sébastien Balieu, a tháinig isteach in Pr. Foireann Py Renard i mí Eanáir 2018 a bheith ag obair ar an tionscadal seo.Má tá taithí mhaith ag foireann cheimic bithorgánach UMR 6014 CNRS COBRA i gceimic bhithchuingeach agus tóireadóirí fluaraiseacha agus profluorescent orgánach, beidh ath-chomhshó eolaíoch de dhíth ar an tionscadal seo don Dr Sébastien Balieu, agus cuirfidh sé ar chumas na foirne a fhios gnó a leathnú chuig fótachógaseolaíocht agus ceimic incellulo. Tabharfaidh an tionscadal deis dúinn comhalta oilte iardhochtúireachta a fhostú, an Dr MathéoBerthet, comhalta iardhochtúireachta faoi láthair in Pr. Saotharlann Nocolas Wissinger sa Ghinéiv go dtí deireadh mhí na Nollag 2019, agus a ghlac páirt sa tsaotharlann ar an tionscadal seo leis an sprioc chun filleadh ar an bhFrainc agus iarratas a dhéanamh ar phost CNRS. (Irish)
11 August 2022
0 references
Fosfatidne kisline (PA) so preprosti fosfolipidi, ki so naravno prisotni v vseh živih organizmih in so pritegnili veliko pozornosti, saj so bili lipidi drugi sli in modulatorji membranske oblike. Zaradi tega naj bi imele plačilne agencije ključno vlogo pri različnih celičnih funkcijah, zato se pri številnih boleznih, vključno z nevrodegeneracijo, intelektualnimi motnjami, rakom in hipertenzijo, pojavljajo nenormalnosti encimov, ki proizvajajo PA. Na molekularni ravni PA medsebojno delujejo z različnimi beljakovinami in so predvidene za spreminjanje membranske topologije, vendar so zaradi pomanjkanja ustreznih orodij na voljo zelo omejene informacije o kinetiki teh interakcij in strukturnih učinkov. Iz istega razloga so PAdinamike, povezane s posameznimi vrstami PA (odvisno od verig maščobnih kislin, ki tvorijo PA), in njihove točne biofizikalne lastnosti slabo razumljene. Na primer, za PA, ki jo proizvajajo fosfolipaze D (PLD), lizofosfatidil-acil-transferaze (LPAAT) in diacilglicerol kinaze (DGK), obstaja sum, da igrajo različne vloge v različnih fazah sekretorne poti nevrosekretornih celic, vendar natančna narava PAspecies, ki je vključena v korak, ali natančni molekularni mehanizmi ostajajo izmuzljivi. Ena od glavnih omejitev se nanaša na kemična orodja, ki so bila razvita za preučevanje PA: večina od njih temelji na PA z modificiranimi verigami maščobnih kislin (s fluorescenčnimi ali solvatokromnimi lastnostmi), zato ne morejo upoštevati ključne vloge, ki jo igrajo različne stranske verige maščobnih kislin. Da bi se izognili tem omejitvam, predlagamo, da se ustvari celovit nabor orodij za preučevanje dinamike in funkcij plačilne agencije v katerem koli danem celičnem kontekstu in funkciji, ki omogoča, da njihove stranske verige maščobnih kislin ostanejo nespremenjene. Ko bodo ta orodja v rokah, jih bodo uporabljali naši partnerji (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen in dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Strasbourg) za dešifriranje številnih vidikov tihotapljenja skrivnosti in fuzije, ki ostajajo skrivnostni. Večina orodij, ki jih predlagamo za razvoj, bo nosila majhno biortogonalno kemijsko funkcijo in fotoaktivabilne komponente, ki bodo koristne za preučevanje živih celic ali organizmov, odvisnih od časa in prostora. Ta orodja bodo tako nam in našim partnerjem omogočila, da hkrati obravnavajo dve temi, ki sta pred kratkim pospešili napredek pri preučevanju živih organizmov: projekt bo vključeval laboratorij COBRA – UMR 6014 CNRS IRIB – Université de Rouen, INSA deRouen, in natančneje bioorgansko kemijo, ki jo vodi Pr. Pierre-Yves Renard (koordinator). Dr. Alexandre Haefelé bo razvil fluorescenčna orodja, povezana s projektom, jedro projekta pa bo vodil dr. Sébastien Balieu, ki se je pridružil Pr. Ekipa PY Renard v januarju 2018 za delo na tem projektu.Če ima bioorganska kemijska ekipa UMR 6014 CNRS COBRA dobre izkušnje na področju biokonjugatemije in organskih fluorescenčnih in profluorescentnih sond, bo ta projekt zahteval znanstveno rekonverzijo za dr. Sébastien Balieu in bo ekipi omogočil, da razširi svoje znanje na fotofarmakologijo in kemijo incelulov. Projekt nam bo dal priložnost, da zaposlimo usposobljenega postdoktorskega sodelavca, dr. MathéoBertheta, trenutno postdoktorskega sodelavca v Pr. Nocolas Wissingerjev laboratorij v Ženevi do konca decembra 2019 in ki je sprejel, da se pridruži laboratoriju na tem projektu z namenom, da se vrne v Francijo in zaprosi za CNRS položaj. (Slovenian)
11 August 2022
0 references
Фосфатидните киселини (PAs) са най-простите фосфолипиди, които присъстват естествено във всички живи организми и са привлечени от значително внимание както като липиди, така и като модулатори с мембранна форма. Незначително е, че РА са предложени да играят ключова роля за различни клетъчни функции и съответноненормалността при произвеждащите БА ензими се проявява при много заболявания, включително невродегенерация, интелектуални увреждания, рак и хипертония. На молекулярно ниво РА взаимодействат с различни протеини и се очаква да променят мембранната топология, но има много ограничена информация относно кинетиката на тези взаимодействия и структурни ефекти поради липсата на подходящи инструменти. По същата причина PAdynamics, свързана с конкретните видове PA (в зависимост от веригите на мастните киселини, формиращи РА), и техните точни биофизични свойства не са добре разбрани. Например, БА, произведени от фосфолипази D (PLD), лизофосфатидил-ацил-трансферази (LPAAT) и диацилглицерол кинази (DGK), са имали различни роли в различните етапи на секреторния път на невросекретарните клетки, но точният характер на ПАвидовете, участващи всеки в стъпка, или точните молекулярни механизми остават неуловими. Едно от основните ограничения е свързано с химическите инструменти, разработени за проучване на РА: повечето от тях се основават на PA смодифицирани вериги на мастни киселини (с флуоресцентни или солватохромни свойства), така че не могат да вземат предвид ключовата роля, която играят различните странични вериги на мастните киселини. За да се заобиколят тези ограничения, предлагаме да се създаде цялостен набор от инструменти за проучване на динамиката и функциите на РА във всеки конкретен клетъчен контекст и функция, позволяваща на техните странични вериги на мастни киселини да не се променят. След като тези инструменти в ръце, те ще бъдат използвани от нашите партньори (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen и Dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Страсбург), за да дешифрират много аспекти на трафика и сливането на секретни везикули, които остават тайнствени. Повечето от инструментите, които предлагаме да разработим, ще носят малка биортогонална химична функция и фотоактивируеми компоненти, които ще бъдат полезни за изучаване в зависим от времето и пространството начин, живи клетки или организми. По този начин тези инструменти ще дадат възможност на нас и на нашите партньори да разгледаме едновременно две теми, които наскоро засилиха напредъка в изучаването на живите организми: фотофармакология и в целулозна химия.Този проект ще включва лабораторията COBRA — UMR 6014 CNRS IRIB — Université de Rouen, INSA deRouen, и по-точно биоорганичният екип по химия, ръководен от Pr. Пиер-Ив Ренар (координатор). Д-р Александър Хефеле ще разработи флуоресцентните инструменти, свързани с проекта, а ядрото на проекта ще бъде ръководено от д-р Себастиен Балиеу, който се присъедини към Pr. Екипът на PY Renard през януари 2018 г. да работи по този проект.Ако биоорганичният екип по химия на UMR 6014 CNRS COBRA има добър опит в биоконюгатхимията и органичните флуоресцентни и профлуоресцентни сонди, този проект ще изисква научно преобразуване за д-р Себастиен Балиеу и ще даде възможност на екипа да разшири своите ноу-хау до фотофармакологията и инцелулната химия. Проектът ще ни даде възможност да наемем квалифициран пост-докторант д-р МатеоБертет, който в момента е пост-докторант в Pr. Лабораторията на Nocolas Wissinger в Женева до края на декември 2019 г., и която прие да се присъедини към лабораторията по този проект, има за цел да се върне във Франция и да кандидатства за позиция CNRS. (Bulgarian)
11 August 2022
0 references
L-aċidi fosfatidiċi (PAs) huma l-fosfolipidi sempliċi preżenti b’mod naturali fl-organiżmi ħajjin kollha u ġibdu attenzjoni konsiderevoli kemm bħala messaġġiera lipidi sekondarji kif ukoll modulaturi ta’ forma ta’ membrana. Inkonsegwenza, l-APs ġew proposti li jkollhom rwoli ċentrali għal diversi funzjonijiet ċellulari u għaldaqstant l-abnormalitajiet fl-enzimi li jipproduċu l-PA jseħħu f’ħafna mardiet li jinkludu n-newrodeġenerazzjoni, id-diżabbiltajiet intellettwali, il-kanċer, u l-ipertensjoni. Fil-livell molekulari, l-APs jinteraġixxu ma’ diversi proteini u huma previsti li jimmodifikaw it-topoloġija tal-membrana, iżda informazzjoni limitata ħafna dwar il-kinetika ta’ dawn l-interazzjonijiet u l-effetti strutturali hija disponibbli minħabba n-nuqqas ta’ għodod adegwati. Għall-istess raġuni, il-PAdinamika, relatata mal-ispeċi speċifiċi tal-PA (skont il-ktajjen tal-aċidi xaħmin li jiffurmaw l-PA), u l-proprjetajiet bijofiżiċi eżatti tagħhom mhumiex mifhuma tajjeb. Pereżempju, l-PA prodotta mill-fosfolipidi D (PLD), il-lysophosphatidyl-acyl-transferases (LPAAT), u l-kinażi tad-diaċilgliċerol (DGK) ġew issuspettati li għandhom rwoli differenti f’passi differenti tal-passaġġ ta’ sekrezzjoni taċ-ċelloli newrosekretorji, iżda n-natura eżatta tal-PAspecies involuti f’kull pass jew il-mekkaniżmi molekulari preċiżi jibqgħu elużivi. Waħda mil-limitazzjonijiet ewlenin hija relatata mal-għodod kimiċi li ġew żviluppati biex jiġu studjati l-PAs: il-biċċa l-kbira minnhom huma bbażati fuq PA bi ktajjen ta’ aċidi xaħmin modifikati (bi proprjetajiet fluworexxenti jew solvatokromatiċi), u għalhekk ma jistgħux jitqiesu r-rwol ewlieni li għandu l-ktajjen differenti tal-aċidu xaħmi. Biex jiġu evitati dawn il-limitazzjonijiet, aħna nipproponu li niġġeneraw sett ta’ għodod komprensiv biex jiġu studjati d-dinamika u l-funzjonijiet tal-PA fi kwalunkwe kuntest ċellulari u funzjoni li tħalli l-ktajjen tal-ġenb tal-aċidi xaħmin tagħhom mhux modifikati. Ladarba dawn l-għodod fl-idejn, dawn se jintużaw mill-imsieħba tagħna (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen u Dr Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Strasburgu) biex jiddeċifraw ħafna aspetti tat-traffikar u l-fużjoni tal-bużżieqa tas-sekrezzjoni li jibqgħu misterjuża. Ħafna mill-għodod li nipproponu li jiżviluppaw se jkollhom funzjoni kimika biorthogonal żgħar u komponenti photoactivatable li se jkunu utli biex jistudjaw fil-ħin u l-ispazju b’mod dipendenti, ċelluli ħajjin jew organiżmi. B’hekk, dawn l-għodod se jippermettulna u lill-imsieħba tagħna nindirizzaw fl-istess ħin żewġ suġġetti li dan l-aħħar saħħew il-progress fl-istudju tal-organiżmi ħajjin: dan il-proġett se jinvolvi l-laboratorju COBRA — UMR 6014 CNRS IRIB — Université de Rouen, INSA deRouen, u b’mod aktar preċiż it-tim tal-kimika bijoorganika mmexxi minn Pr. Pierre-Yves Renard (koordinatur). Dr Alexandre Haefelé se tiżviluppa l-għodod fluworexxenti assoċjati mal-proġett, u l-qalba tal-proġett se titmexxa minn Dr Sébastien Balieu li ssieħbu Pr. Tim PY Renard f’Jannar 2018 biex jaħdmu fuq dan il-proġett.Jekk it-tim tal-kimika bijoorganika ta ‘UMR 6014 COBRA CNRS għandu esperjenza tajba fil-bijokonjugatkimika u sondi organiċi fluworexxenti u profluworexxenti, dan il-proġett se jeħtieġu rikonverżjoni xjentifika għal Dr Sébastien Balieu, u se jippermetti lit-tim biex iwessgħu l-għarfien tiegħu għall-fotofarmakoloġija u l-kimika incellulo. Il-proġett se jagħtina l-opportunità li jimpjegaw sħabi post-dottorat sengħa, Dr. MathéoBerthet, bħalissa sħabi post-dottorat fi Pr. Il-laboratorju ta’ Nocolas Wissinger f’Ġinevra sal-aħħar ta’ Diċembru 2019, u li aċċetta li jingħaqad mal-laboratorju dwar dan il-proġett bil-għan li jerġa’ lura lejn Franza u japplika għal pożizzjoni tas-CNRS. (Maltese)
11 August 2022
0 references
Os ácidos fosfatídicos (PAs) são os fosfolípidos mais simples naturalmente presentes em todos os organismos vivos e têm atraído uma atenção considerável sendo ambos os segundo estafetas lipídicos e moduladores de forma de membrana. Em consequência, os APs têm sido propostos para desempenhar papéis fundamentais para várias funções telemóveis e, consequentemente, anormalidades em enzimas produtoras de AF ocorrem em muitas doenças, incluindo neurodegeneração, deficiências intelectuais, cancro e hipertensão. No nível molecular, os APs interagem com várias proteínas e são preditos para modificar a topologia da membrana, mas informações muito limitadas sobre a cinética dessas interações e efeitos estruturais estão disponíveis devido à falta de ferramentas adequadas. Pela mesma razão, a PAdinâmica, relacionada com as espécies de AP específicas (dependendo das cadeias de ácidos gordos que formam a AP), e as suas propriedades biofísicas exatas são mal compreendidas. Por exemplo, a PA produzida pelas fosfolipases D (PLD), lisofosfatidil-aciltransferases (LPAAT) e diacilglicerol quinases (DGK) tem sido suspeitada de desempenhar vários papéis em diferentes etapas da via secretora das células neurosecretoras, mas a natureza exata das espécies PA envolvidas em cada etapa ou os mecanismos moleculares precisos permanecem evasivas. Uma das principais limitações está relacionada com as ferramentas químicas que foram desenvolvidas para o estudo de AF: a maioria deles são ganzas em PA com cadeias de ácidos graxos modificadas (com propriedades fluorescentes ou solvatocrômicas), por isso não pode levar em conta Thekey papel que é desempenhado pelas diferentes cadeias laterais de ácidos graxos. Para contornar essas limitações, propomos gerar uma caixa de ferramentas abrangente para estudar a dinâmica e as funções da AP em qualquer contexto telemóvel e função, permitindo que suas cadeias laterais de ácidos graxos não sejam modificadas. Uma vez que essas ferramentas em mãos, elas serão usadas por nossos parceiros (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen e Dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Estrasburgo) para decifrar muitos aspetos do tráfico de vesículas secretoras e fusão que permanecem mistérios. A maioria das ferramentas que propomos desenvolver terá uma pequena função química biortogonal e componentes fotoactiváveis que serão úteis para estudar de forma dependente do tempo e do espaço, células vivas ouorganismos. Estas ferramentas permitir-nos-ão assim e aos nossos parceiros abordar simultaneamente dois temas que recentemente reforçaram os progressos no estudo dos organismos vivos: fotofarmacologia e química de celulose. Este projeto envolverá o laboratório COBRA — UMR 6014 CNRS IRIB — Université de Rouen, INSA deRouen, e, mais precisamente, a equipa de química bioorgânica liderada por Pr. Pierre-Yves Renard (coordenador). O Dr. Alexandre Haefelé desenvolverá as ferramentas fluorescentes associadas ao projeto, e o núcleo do projeto será liderado pelo Dr. Sébastien Balieu, que se juntou ao Pr. A equipa de PY Renard em janeiro de 2018 para trabalhar neste projeto.Se a equipa de química bioorgânica da UMR 6014 CNRS COBRA tem uma boa experiência em bioconjugatequímica e sondas fluorescentes e profluorescentes orgânicas, este projeto exigirá uma reconversão científica para o Dr. Sébastien Balieu, e permitirá que a equipa amplie seus conhecimentos para fotofarmacologia e química incelulo. O projeto nos dará a oportunidade de contratar um bolseiro de pós-doutoramento qualificado, Dr. MathéoBerthet, atualmente pós-doutorado em Pr. O laboratório de Nocolas Wissinger, em Genebra, até ao final de dezembro de 2019, e que aceitou juntar-se ao laboratório neste projeto com o objetivo de voltar à França e candidatar-se a uma posição do CNRS. (Portuguese)
11 August 2022
0 references
Fosfatidsyrer (PA'er) er de simpleste phospholipider, der naturligt findes i alle levende organismer, og har tiltrukket betydelig opmærksomhed både lipid second messengers og modulatorer af membranform. Som følge heraf er det blevet foreslået, at PA'er spiller en central rolle for forskellige cellulære funktioner, og derfor forekommer abnormaliteter i PA-producerende enzymer i mange sygdomme, herunder neurodegeneration, intellektuelle handicap, kræft og hypertension. På molekylær niveau interagerer PA'er med forskellige proteiner og forudsættes at ændre membrantopologien, men der er meget begrænsede oplysninger om kinetikken af disse interaktioner og strukturelle virkninger på grund af manglen på passende værktøjer. Af samme grund er PAdynamics relateret til de specifikke PA-arter (afhængigt af de fedtsyrer, der danner PA), og deres nøjagtige biofysiske egenskaber dårligt forstået. F.eks. har PA produceret af phospholipaser D (PLD),lysophosphatidyl-acyl-transferaser (LPAAT) og diacylglycerolkinaser (DGK) været mistænkt for at spilleforskellige roller i forskellige trin af neurosecretory cellers sekretoriske forløb, men den nøjagtige karakter af de PAarter, der hver især er involveret i trin, eller de præcise molekylære mekanismer forbliver flygtige. En af de vigtigste begrænsninger er relateret til de kemiske værktøjer, der er udviklet til undersøgelse af betalingsorganer: de fleste af dem er baseret på PA medmodificerede fedtsyrekæder (med fluorescerende eller solvatokrom egenskaber), så kan ikke tage højde for Thekey rolle, der spilles af de forskellige fedtsyre sidekæder. For at omgå disse begrænsninger foreslår vi, at der udvikles en omfattende værktøjskasse til undersøgelse af PA's dynamik og funktioner i en given cellesammenhæng og funktion, der lader deres fedtsyresidekæder umodificerede. Når disse værktøjer i hænderne, de vil blive brugt af vores partnere (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen og Dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Strasbourg) for at dechifrere mange aspekter af hemmelighedsfuld handel med vesikler og fusion, der forbliver mysterisk. De fleste af de værktøjer, som vi foreslår at udvikle, vil bære en lille biorthogonal kemisk funktion og fotoaktivatable komponenter, der vil være nyttige til at studere i en tid og rum afhængig måde, levende celler ellerorganismer. Disse værktøjer vil således sætte os og vores partnere i stand til samtidig at behandle to emner, der for nylig styrkede fremskridtene i undersøgelsen af levende organismer: fotofarmakologi og i cellulo kemi.Dette projekt vil involvere COBRA laboratorium- UMR 6014 CNRS IRIB — Université de Rouen, INSA deRouen, og mere præcist det bioorganiske kemi team ledet af Pr. Pierre-Yves Renard (koordinator). Dr. Alexandre Haefelé vil udvikle de fluorescerende værktøjer, der er forbundet med projektet, og kernen i projektet vil blive ledet af Dr. Sébastien Balieu, der tiltrådte Pr. PY Renards team i januar 2018 til at arbejde på dette projekt. Hvis det bioorganiske kemiteam af UMR 6014 CNRS COBRA har en god erfaring inden for biokonjugatkemi og organiske fluorescerende og profluorescent prober, vil dette projekt kræve en videnskabelig omstilling til Dr. Sébastien Balieu, og vil gøre det muligt for teamet at udvide sin knowhow til fotofarmakologi og incellulo kemi. Projektet vil give os mulighed for at ansætte en dygtig postdoktorale kollega, dr. MathéoBerthet, i øjeblikket postdoktorale stipendiater i Pr. Nocolas Wissingers laboratorium i Genève indtil udgangen af december 2019, og som accepterede at deltage i laboratoriet på dette projekt med det mål at komme tilbage til Frankrig og ansøge om en CNRS-stilling. (Danish)
11 August 2022
0 references
Acizii fosfatici (PA) sunt fosfolipidele simple prezente în mod natural în toate organismele vii și au atras o atenție considerabilă fiind atât mesageri lipidici secundari, cât și modulatori ai formei membranei. Inconsecvență, AP au fost propuse să joace roluri esențiale pentru diferite funcții celulare și, în consecință, anormalitățile în enzimele producătoare de PA apar în multe boli, inclusiv neurodegenerarea, dizabilitățile intelectuale, cancerul și hipertensiunea arterială. La nivel molecular, PA interacționează cu diferite proteine și sunt previzionate să modifice topologia membranei, dar sunt disponibile informații foarte limitate cu privire la cinetica acestor interacțiuni și efecte structurale din cauza lipsei de instrumente adecvate. Din același motiv, PAdinamica, legată de specia AP specifică (în funcție de lanțurile acizilor grași care formează AP) și proprietățile lor biofiziceexacte sunt slab înțelese. De exemplu, AP produse de fosfolipase D (PLD), lizofosfatidil-acil-transferaze (LPAAT) și diacilglicerol kinaze (DGK) au fost suspectate de a juca diverse roluri în diferite etape ale căii secretoare a celulelor neurosecretorii, dar natura exactă a speciilor PA implicate fiecare în etape sau mecanismele moleculare precise rămân evazive. Una dintre principalele limitări este legată de instrumentele chimice care au fost dezvoltate pentru a studia AP: cele mai multe dintre ele se bazează pe PA cu lanțuri modificate de acizi grași (cu proprietăți fluorescente sau solvatocrome), deci nu pot lua în considerare rolul cheie jucat de diferitele lanțuri laterale ale acizilor grași. Pentru a eluda aceste limitări, propunem să generăm un set cuprinzător de instrumente pentru a studia dinamica și funcțiile AP în orice context celular și funcție dată, lăsând lanțurile lor laterale de acizi grași nemodificate. Odată ce aceste instrumente vor fi folosite de partenerii noștri (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen și Dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Strasbourg) pentru a descifra multe aspecte ale traficului secret de vezicule și fuziunii care rămân misterioase. Majoritatea instrumentelor pe care le propunem să le dezvoltăm vor purta o funcție chimică biorthogonală mică și componente fotoactivabile care vor fi utile pentru a studia într-un mod dependent de timp și spațiu, celule vii sau microorganisme. Astfel, aceste instrumente ne vor permite nouă și partenerilor noștri să abordăm simultan două subiecte care au stimulat recent progresele înregistrate în studiul organismelor vii: fotofarmacologie și în chimia celulo.Acest proiect va implica laboratorul COBRA- UMR 6014 CNRS IRIB – Université de Rouen, INSA deRouen, și mai exact echipa de chimie bioorganică condusă de Pr. Pierre-Yves Renard (coordonator). Dr. Alexandre Haefelé va dezvolta instrumentele fluorescente asociate proiectului, iar nucleul proiectului va fi condus de Dr. Sébastien Balieu care s-a alăturat Pr. Echipa PY Renard în ianuarie 2018 pentru a lucra la acest proiect.În cazul în care echipa de chimie bioorganică a UMR 6014 CNRS COBRA are o experiență bună în bioconjugatechimie și sonde fluorescente și profluorescente organice, acest proiect va necesita o reconversie științifică pentru Dr. Sébastien Balieu, și va permite echipei să-și extindă know-how-ul la fotofarmacologie și chimia incelulo. Proiectul ne va oferi posibilitatea de a angaja un coleg calificat post-doctorat, Dr. MathéoBerthet, în prezent coleg post-doctorat în Pr. Laboratorul lui Nocolas Wissinger din Geneva până la sfârșitul lunii decembrie 2019 și care a acceptat să se alăture laboratorului acestui proiect cu scopul de a reveni în Franța și de a aplica pentru o poziție CNRS. (Romanian)
11 August 2022
0 references
Fosfatidsyra (PA) är de enklaste fosfolipider som finns naturligt i alla levande organismer och har dragit stor uppmärksamhet både lipid andra budbärare och modulatorer av membranform. Konsekvens, PA har föreslagits att spela avgörande roller för olika cellulära funktioner och följaktligen onormalheter i PA-producerande enzymer förekommer i många sjukdomar inklusive neurodegeneration, intellektuella funktionshinder, cancer och hypertoni. På molekylär nivå interagerar PA med olika proteiner och förutsätts ändra membrantopologi, men mycket begränsad information om kinetiken för dessa interaktioner och strukturella effekter finns tillgänglig på grund av bristen på lämpliga verktyg. Av samma anledning är PAdynamiken, relaterad till de specifika PA-arterna (beroende på de fettsyror som kedjorna bildar PA), och derasexakta biofysikaliska egenskaper dåligt förstådda. Till exempel har PA som produceras av fosfolipaser D (PLD),lysofosfatidyl-acyl-transferaser (LPAAT) och diacylglycerolkinaser (DGK) misstänkts spelaolika roller i olika steg i sekretoriska vägen för neurosekretoriska celler, men den exakta karaktären hos PAspecies involverade var och en i steg eller exakt molekylära mekanismer förblir svårfångad. En av de viktigaste begränsningarna är relaterad till de kemiska verktyg som har utvecklats för att studera PA: de flesta av dem är baserade på PA medmodifierade fettsyror kedjor (med fluorescerande eller solvatokrom) så kan inte ta hänsyn till Thekey roll som spelas av de olika fettsyra sidokedjorna. För att kringgå dessa begränsningar föreslår vi att skapa en omfattande verktygslåda för att studera PA:s dynamik och funktioner i ett givet cellulärt sammanhang och funktion som låter deras fettsyrabikedjor omodifieras. När dessa verktyg i händerna, de kommer att användas av våra partner (Pr. Maïté Montero U1239 INSERM DC2N, Rouen och Dr. Nicolas Vitale, INCI UPR 3212CNRS, Strasbourg) för att dechiffrera många aspekter av sekretära vesicle trafficking och fusion som förblir mystiska. De flesta av de verktyg som vi föreslår att utveckla kommer att ha en liten biorthogonal kemisk funktion och fotoaktiverbara komponenter som kommer att vara användbara för att studera på ett tids- och rumsberoende sätt, levande celler ellerorganismer. Dessa verktyg kommer således att göra det möjligt för oss och våra partner att samtidigt ta itu med två ämnen som nyligen stärkte framstegen i studiet av levande organismer: fotofarmakologi och cellulokemi.Detta projekt kommer att involvera COBRA-laboratoriet- UMR 6014 CNRS IRIB – Université de Rouen, INSA deRouen, och mer exakt det bioorganiska kemiteamet som leds av Pr. Pierre-Yves Renard (samordnare). Dr Alexandre Haefelé kommer att utveckla de fluorescerande verktygen i samband med projektet, och kärnan i projektet kommer att ledas av Dr. Sébastien Balieu som anslöt sig till Pr. PY Renards team i januari 2018 för att arbeta med detta projekt.Om det bioorganiska kemiteamet på UMR 6014 CNRS COBRA har en god erfarenhet av biokonjugatkemi och organiska fluorescerande och profluorescensprober, kommer detta projekt att kräva en vetenskaplig omkonversion för Dr. Sébastien Balieu, och kommer att göra det möjligt för teamet att bredda sina kunskaper till fotofarmakologi och incellulokemi. Projektet kommer att ge oss möjlighet att anställa en skicklig postdoktorand, Dr MathéoBerthet, för närvarande postdoktor i Pr. Nocolas Wissingers laboratorium i Genève till slutet av december 2019 och som accepterade att gå med i labbet på detta projekt med målet att komma tillbaka till Frankrike och ansöka om en CNRS-position. (Swedish)
11 August 2022
0 references
7 December 2023
0 references
Identifiers
19P02931
0 references