GENETIC AND PROTEOMIC STUDY OF A PROBIOTIC STRAIN OF LACTOBACILLUS PENTOSUS ISOLATED FROM FERMENTED ALOREÑA OLIVES. (Q3208753)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3208753 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | GENETIC AND PROTEOMIC STUDY OF A PROBIOTIC STRAIN OF LACTOBACILLUS PENTOSUS ISOLATED FROM FERMENTED ALOREÑA OLIVES. |
Project Q3208753 in Spain |
Statements
87,729.84 Euro
0 references
108,900.0 Euro
0 references
80.56 percent
0 references
1 January 2014
0 references
31 December 2017
0 references
UNIVERSIDAD DE JAEN
0 references
23071
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS ES UNA BACTERIA LACTICA PRESENTE EN ALIMENTOS FERMENTADOS DE ORIGEN ANIMAL Y VEGETAL COMO CULTIVO INICIADOR O FORMANDO PARTE DE LA MICROBIOTA INDIGENA, Y TAMBIEN COMO COMENSAL DEL TRACTO DIGESTIVO HUMANO Y ANIMAL. EN LOS ULTIMOS AÑOS, DEBIDO A LA CRECIENTE DEMANDA POR PARTE DE LOS CONSUMIDORES INTOLERANTES A LA LACTOSA Y LOS VEGETARIANOS, VARIAS INVESTIGACIONES SE CENTRARON EN BACTERIAS AISLADAS DE VEGETALES COMO NUEVOS CANDIDATOS A PROBIOTICOS EN HUMANOS, ROMPIENDO ASI CON EL ESQUEMA CLASICO DE LA MAYORIA DE LOS PROBIOTICOS DISPONIBLES EN EL MERCADO. LA MAYOR VENTAJA QUE POSEEN LOS PROBIOTICOS AISLADOS DE ALIMENTOS VEGETALES ES SU GRAN CAPACIDAD DE ADAPTACION A UNAS CONDICIONES FISICO-QUIMICAS SIMILARES A LAS ENCONTRADAS EN EL TRACTO DIGESTIVO HUMANO (EXTREMA ACIDEZ, ALTOS NIVELES DE NUTRIENTES NO-DIGESTIBLES Y FACTORES ANTI-NUTRICIONALES) ADEMAS DE OTRAS PROPIEDADES FUNCIONALES DESARROLLADAS EN SUS ECOSISTEMAS. DADA LA IMPORTANCIA DE LAS BACTERIAS LACTICAS DE ORIGEN VEGETAL, EN LOS ULTIMOS AÑOS HEMOS AISLADO DE LA FERMENTACION DE LA ACEITUNA MANZANILLA ALOREÑA (LA UNICA ACEITUNA QUE SE ENCUENTRA PROTEGIDA CON DENOMINACION DE ORIGEN EN ESPAÑA) VARIAS CEPAS DE LACTOBACILLUS PENTOSUS QUE DEMOSTRARON UN GRAN POTENCIAL PROBIOTICO MEDIANTE PRUEBAS PRELIMINARES. EL ANALISIS EN PROFUNDIDAD DE LAS PROPIEDADES PROBIOTICAS IN VITRO NOS PERMITIRA HACER UNA PRIMERA SELECCION DE LAS CEPAS CON EL MEJOR PERFIL PROBIOTICO Y SEGUIR PROFUNDIZANDO Y CARACTERIZANDO LA CEPA A NIVEL GENOMICO Y PROTEOMICO. EN ESTE SENTIDO, NUESTROS OBJETIVOS PLANTEADOS EN ESTE PROYECTO SE ENMARCAN EN LO SIGUIENTE: A) SELECCIONAR UNA CEPA DE LACTOBACILLUS PENTOSUS CON UN PERFIL PROBIOTICO INTERESANTE Y ATRACTIVO QUE ABARCA LAS DIFERENTES PROPIEDADES TALES COMO LA RESISTENCIA A LA ACIDEZ Y LA BILIS, CAPACIDAD DE ADHESION, AUTOAGREGACION, ASPECTOS DE SEGURIDAD, CRECIMIENTO, PRODUCCION DE SUSTANCIAS ANTIMICROBIANAS Y OTRAS PROPIEDADES BENEFICIOSAS; B) SECUENCIACION DEL GENOMA COMPLETO DE LA CEPA SELECCIONADA EN BASE A LAS PRUEBAS LLEVADAS A CABO IN VITRO; C) ANALISIS IN SILICO DE LOS GENES IMPLICADOS EN LAS PROPIEDADES PROBIOTICAS PONIENDO DE MANIFIESTO LOS GENES YA DESCRITOS EN LA LITERATURA Y AQUELLOS NUEVOS DETECTADOS EN ESTA CEPA, ADEMAS SE ANALIZARAN LOS DETERMINANTES DE VIRULENCIA PARA EVALUAR LA SEGURIDAD DE LA CEPA; D) ESTUDIAR POR PRIMERA VEZ EL PROTEOMA DE LACTOBACILLUS PENTOSUS Y ASI LAS PREDICCIONES IN SILICO INFERIDAS DE LA SECUENCIA DEL GENOMA PUEDEN SER COMPLEMENTADAS CON DATOS PROTEOMICOS; E) DETERMINAR LOS MARCADORES POTENCIALES DE LA RESISTENCIA A ACIDOS, TOLERANCIA A LAS SALES BILIARES Y LA ADHESION A LA MUCINA EN LB. PENTOSUS SIENDO ESTE OTRO ASPECTO NOVEDOSO QUE NO HA SIDO ABORDADO CON ANTERIORIDAD EN LA ESPECIE DE LACTOABACILLUS PENTOSUS Y ESTO GRACIAS A LA REALIZACION DE LA PROTEOMICA COMPARATIVA. DICHOS BIOMARCADORES SERAN DE GRAN UTILIDAD PARA LA COMUNIDAD CIENTIFICA EN GENERAL Y LAS INDUSTRIAS EN PARTICULAR YA QUE REPRESENTARAN UNAS HERRAMIENTAS UTILES PARA SELECCIONAR CEPAS CON POTENCIAL PROBIOTICO. (Spanish)
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS IS A LACTIC BACTERIA PRESENT IN FERMENTED FOODS OF ANIMAL AND PLANT ORIGIN AS AN INITIATOR CULTURE OR FORMING PART OF THE INDIGENOUS MICROBIOTA, AND ALSO AS A EATER OF THE HUMAN AND ANIMAL DIGESTIVE TRACT. IN RECENT YEARS, DUE TO THE GROWING DEMAND FROM LACTOSE INTOLERANT CONSUMERS AND VEGETARIANS, SEVERAL STUDIES FOCUSED ON BACTERIA ISOLATED FROM PLANTS AS NEW CANDIDATES FOR PROBIOTICS IN HUMANS, THUS BREAKING WITH THE CLASSIC SCHEME OF MOST PROBIOTICS AVAILABLE ON THE MARKET. THE GREATEST ADVANTAGE OF PROBIOTICS ISOLATED FROM PLANT FOODS IS THEIR GREAT ABILITY TO ADAPT TO PHYSICAL-CHEMICAL CONDITIONS SIMILAR TO THOSE FOUND IN THE HUMAN DIGESTIVE TRACT (EXTREME ACIDITY, HIGH LEVELS OF NON-DIGESTIBLE NUTRIENTS AND ANTI-NUTRITIONAL FACTORS) IN ADDITION TO OTHER FUNCTIONAL PROPERTIES DEVELOPED IN THEIR ECOSYSTEMS. GIVEN THE IMPORTANCE OF THE LACTIC BACTERIA OF PLANT ORIGIN, IN RECENT YEARS WE HAVE ISOLATED FROM THE FERMENTATION OF THE OLIVES ALOREÑA CHAMOMILE (THE ONLY OLIVE THAT IS PROTECTED WITH NAME OF ORIGIN IN SPAIN) SEVERAL STRAINS OF LACTOBACILLUS PENTOSUS THAT DEMONSTRATED A GREAT PROBIOTIC POTENTIAL THROUGH PRELIMINARY TESTS. THE IN-DEPTH ANALYSIS OF THE PROBIOTIC PROPERTIES IN VITRO WILL ALLOW US TO MAKE A FIRST SELECTION OF THE STRAINS WITH THE BEST PROBIOTIC PROFILE AND TO CONTINUE TO DEEPEN AND CHARACTERISE THE STRAIN AT THE GENOMIC AND PROTEOMIC LEVEL. IN THIS SENSE, OUR OBJECTIVES SET OUT IN THIS PROJECT ARE FRAMED AS FOLLOWS: A) SELECT A STRAIN OF LACTOBACILLUS PENTOSUS WITH AN INTERESTING AND ATTRACTIVE PROBIOTIC PROFILE COVERING THE DIFFERENT PROPERTIES SUCH AS ACIDITY AND BILE RESISTANCE, ADHESION CAPACITY, AUTOAGREGACION, SAFETY ASPECTS, GROWTH, PRODUCTION OF ANTIMICROBIAL SUBSTANCES AND OTHER BENEFICIAL PROPERTIES; SEQUENCE OF THE COMPLETE GENOME OF THE SELECTED STRAIN BASED ON IN VITRO TESTS; C) IN SILICO ANALYSIS OF THE GENES INVOLVED IN THE PROBIOTIC PROPERTIES HIGHLIGHTING THE GENES ALREADY DESCRIBED IN THE LITERATURE AND THOSE NEW ONES DETECTED IN THIS STRAIN, IN ADDITION TO ANALYSING THE DETERMINANTS OF VIRULENCE TO EVALUATE THE SAFETY OF THE STRAIN; D) TO STUDY FOR THE FIRST TIME THE PROTEOME OF LACTOBACILLUS PENTOSUS AND THUS THE IN SILICO PREDICTIONS INFERRED FROM THE GENOME SEQUENCE CAN BE SUPPLEMENTED BY PROTEOMIC DATA; E) DETERMINE POTENTIAL MARKERS OF ACID RESISTANCE, TOLERANCE TO BILE SALTS AND ADHESION TO MUCIN IN LB. PENTOSUS BEING THIS OTHER NOVEL ASPECT THAT HAS NOT BEEN ADDRESSED PREVIOUSLY IN THE SPECIES OF LACTOABACILLUS PENTOSUS AND THIS THANKS TO THE REALISATION OF COMPARATIVE PROTEOMICS. THESE BIOMARKERS WILL BE OF GREAT USE TO THE SCIENTIFIC COMMUNITY IN GENERAL AND INDUSTRIES IN PARTICULAR AS THEY REPRESENT USEFUL TOOLS FOR SELECTING STRAINS WITH PROBIOTIC POTENTIAL. (English)
14 October 2021
0.4322591879629242
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS EST UNE BACTÉRIE LACTIQUE PRÉSENTE DANS LES ALIMENTS FERMENTÉS D’ORIGINE ANIMALE ET VÉGÉTALE EN TANT QUE CULTURE INITIATRICE OU FAISANT PARTIE DU MICROBIOTE INDIGÈNE, AINSI QU’EN TANT QUE MANGEUR DU TUBE DIGESTIF HUMAIN ET ANIMAL. CES DERNIÈRES ANNÉES, EN RAISON DE LA DEMANDE CROISSANTE DES CONSOMMATEURS ET DES VÉGÉTARIENS INTOLÉRANTS AU LACTOSE, PLUSIEURS ÉTUDES ONT PORTÉ SUR LES BACTÉRIES ISOLÉES DES PLANTES EN TANT QUE NOUVEAUX CANDIDATS POUR LES PROBIOTIQUES CHEZ L’HOMME, ROMPANT AINSI AVEC LE SCHÉMA CLASSIQUE DE LA PLUPART DES PROBIOTIQUES DISPONIBLES SUR LE MARCHÉ. LE PLUS GRAND AVANTAGE DES PROBIOTIQUES ISOLÉS DES ALIMENTS VÉGÉTAUX EST LEUR GRANDE CAPACITÉ À S’ADAPTER À DES CONDITIONS PHYSICO-CHIMIQUES SEMBLABLES À CELLES QUE L’ON TROUVE DANS LE TUBE DIGESTIF HUMAIN (ACIDITÉ EXTRÊME, TENEUR ÉLEVÉE EN NUTRIMENTS NON DIGESTIBLES ET FACTEURS ANTINUTRITIONNELS) EN PLUS D’AUTRES PROPRIÉTÉS FONCTIONNELLES DÉVELOPPÉES DANS LEURS ÉCOSYSTÈMES. COMPTE TENU DE L’IMPORTANCE DES BACTÉRIES LACTIQUES D’ORIGINE VÉGÉTALE, NOUS AVONS ISOLÉ CES DERNIÈRES ANNÉES DE LA FERMENTATION DES OLIVES ALOREÑA CAMOMILLE (LA SEULE OLIVE PROTÉGÉE AVEC LE NOM D’ORIGINE EN ESPAGNE) PLUSIEURS SOUCHES DE LACTOBACILLUS PENTOSUS QUI ONT DÉMONTRÉ UN GRAND POTENTIEL PROBIOTIQUE PAR DES TESTS PRÉLIMINAIRES. L’ANALYSE APPROFONDIE DES PROPRIÉTÉS PROBIOTIQUES IN VITRO NOUS PERMETTRA DE FAIRE UNE PREMIÈRE SÉLECTION DES SOUCHES AVEC LE MEILLEUR PROFIL PROBIOTIQUE ET DE CONTINUER À APPROFONDIR ET CARACTÉRISER LA SOUCHE AU NIVEAU GÉNOMIQUE ET PROTÉOMIQUE. EN CE SENS, NOS OBJECTIFS ÉNONCÉS DANS CE PROJET SONT FORMULÉS COMME SUIT: A) SÉLECTIONNER UNE SOUCHE DE LACTOBACILLUS PENTOSUS AVEC UN PROFIL PROBIOTIQUE INTÉRESSANT ET ATTRAYANT COUVRANT LES DIFFÉRENTES PROPRIÉTÉS TELLES QUE L’ACIDITÉ ET LA RÉSISTANCE À LA BILE, LA CAPACITÉ D’ADHÉRENCE, L’AUTOAGREGACION, LES ASPECTS DE SÉCURITÉ, LA CROISSANCE, LA PRODUCTION DE SUBSTANCES ANTIMICROBIENS ET D’AUTRES PROPRIÉTÉS BÉNÉFIQUES; SÉQUENCE DU GÉNOME COMPLET DE LA SOUCHE SÉLECTIONNÉE SUR LA BASE D’ESSAIS IN VITRO; C) DANS L’ANALYSE SILICO DES GÈNES IMPLIQUÉS DANS LES PROPRIÉTÉS PROBIOTIQUES METTANT EN ÉVIDENCE LES GÈNES DÉJÀ DÉCRITS DANS LA LITTÉRATURE ET CEUX NOUVEAUX DÉTECTÉS DANS CETTE SOUCHE, EN PLUS D’ANALYSER LES DÉTERMINANTS DE VIRULENCE POUR ÉVALUER L’INNOCUITÉ DE LA SOUCHE; D) ÉTUDIER POUR LA PREMIÈRE FOIS LE PROTÉOME DE LACTOBACILLUS PENTOSUS ET AINSI LES PRÉDICTIONS IN SILICO DÉDUITES DE LA SÉQUENCE DU GÉNOME PEUVENT ÊTRE COMPLÉTÉES PAR DES DONNÉES PROTÉOMIQUES; E) DÉTERMINER LES MARQUEURS POTENTIELS DE RÉSISTANCE À L’ACIDE, LA TOLÉRANCE AUX SELS BILIAIRES ET L’ADHÉRENCE À LA MUCINE EN LB. PENTOSUS ÉTANT CET AUTRE ASPECT NOUVEAU QUI N’A PAS ÉTÉ ABORDÉ PRÉCÉDEMMENT DANS LES ESPÈCES DE LACTOABACILLUS PENTOSUS ET CECI GRÂCE À LA RÉALISATION DE PROTÉOMIQUE COMPARATIVE. CES BIOMARQUEURS SERONT D’UNE GRANDE UTILITÉ POUR LA COMMUNAUTÉ SCIENTIFIQUE EN GÉNÉRAL ET POUR LES INDUSTRIES EN PARTICULIER, CAR ILS REPRÉSENTENT DES OUTILS UTILES POUR SÉLECTIONNER LES SOUCHES À POTENTIEL PROBIOTIQUE. (French)
5 December 2021
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS IST EIN MILCHBAKTERIEN, DAS IN FERMENTIERTEN LEBENSMITTELN TIERISCHEN UND PFLANZLICHEN URSPRUNGS ALS INITIATORKULTUR ODER TEIL DER EINHEIMISCHEN MIKROBIOTA UND AUCH ALS ESSER DES MENSCHLICHEN UND TIERISCHEN VERDAUUNGSTRAKTS VORHANDEN IST. IN DEN LETZTEN JAHREN KONZENTRIERTEN SICH MEHRERE STUDIEN AUFGRUND DER WACHSENDEN NACHFRAGE VON LAKTOSEUNTOLERANTEN KONSUMENTEN UND VEGETARIERN AUF BAKTERIEN, DIE VON PFLANZEN ALS NEUE KANDIDATEN FÜR PROBIOTIKA BEIM MENSCHEN ISOLIERT WURDEN UND DAMIT MIT DEM KLASSISCHEN SCHEMA DER MEISTEN AUF DEM MARKT ERHÄLTLICHEN PROBIOTIKA BRECHEN. DER GRÖSSTE VORTEIL VON PROBIOTIKA, DIE AUS PFLANZLICHEN LEBENSMITTELN ISOLIERT WERDEN, IST IHRE GROSSE FÄHIGKEIT, SICH AN PHYSIKALISCH-CHEMISCHE BEDINGUNGEN ANZUPASSEN, DIE DENEN DES MENSCHLICHEN VERDAUUNGSTRAKTS ÄHNLICH SIND (EXTREMSÄUREGEHALT, HOHE GEHALTE AN NICHT VERDAULICHEN NÄHRSTOFFEN UND ANTI-ERNÄHRUNGSHEMMENDE FAKTOREN) ZUSÄTZLICH ZU ANDEREN IN IHREN ÖKOSYSTEMEN ENTWICKELTEN FUNKTIONELLEN EIGENSCHAFTEN. ANGESICHTS DER BEDEUTUNG DER MILCHBAKTERIEN PFLANZLICHEN URSPRUNGS HABEN WIR IN DEN LETZTEN JAHREN VON DER GÄRUNG DER OLIVEN ALOREÑA KAMILLE (DIE EINZIGE OLIVEN, DIE MIT NAMEN DES URSPRUNGS IN SPANIEN GESCHÜTZT IST) MEHRERE STÄMME VON LACTOBACILLUS PENTOSUS ISOLIERT, DIE DURCH VORVERSUCHE EIN GROSSES PROBIOTISCHES POTENZIAL DEMONSTRIERTEN. DIE GRÜNDLICHE ANALYSE DER PROBIOTISCHEN EIGENSCHAFTEN IN VITRO ERMÖGLICHT ES UNS, EINE ERSTE AUSWAHL DER STÄMME MIT DEM BESTEN PROBIOTISCHEN PROFIL ZU TREFFEN UND DIE SORTE AUF GENOMISCHER UND PROTEOMISCHER EBENE WEITER ZU VERTIEFEN UND ZU CHARAKTERISIEREN. IN DIESEM SINNE WERDEN UNSERE IN DIESEM PROJEKT DARGELEGTEN ZIELE WIE FOLGT FORMULIERT: A) WÄHLEN SIE EINEN STAMM VON LACTOBACILLUS PENTOSUS MIT EINEM INTERESSANTEN UND ATTRAKTIVEN PROBIOTISCHEN PROFIL, DER DIE VERSCHIEDENEN EIGENSCHAFTEN WIE SÄURE- UND GALLENRESISTENZ, HAFTUNGSKAPAZITÄT, AUTOAGREGACION, SICHERHEITSASPEKTE, WACHSTUM, PRODUKTION ANTIMIKROBIELLER SUBSTANZEN UND ANDERE VORTEILHAFTE EIGENSCHAFTEN ABDECKT; SEQUENZ DES VOLLSTÄNDIGEN GENOMS DES AUSGEWÄHLTEN STAMMES AUF DER GRUNDLAGE VON IN-VITRO-TESTS; C) IN DER SILICO-ANALYSE DER GENE, DIE AN DEN PROBIOTISCHEN EIGENSCHAFTEN BETEILIGT SIND UND DIE DIE BEREITS IN DER LITERATUR BESCHRIEBENEN GENE UND DIE IN DIESEM STAMM NACHGEWIESENEN NEUEN GENE HERVORHEBEN, ZUSÄTZLICH ZU DER ANALYSE DER DETERMINANTEN DER VIRULENZ ZUR BEWERTUNG DER SICHERHEIT DES STAMMES; D) ERSTMALS DAS PROTEOM VON LACTOBACILLUS PENTOSUS UND DAMIT DIE AUS DER GENOMSEQUENZ ABGELEITETEN SILICO-VORHERSAGEN DURCH PROTEOMISCHE DATEN ZU UNTERSUCHEN; E) BESTIMMUNG POTENZIELLER MARKER DER SÄURERESISTENZ, DER TOLERANZ GEGENÜBER GALLENSALZEN UND DER HAFTUNG GEGEN MUCIN IN LB. PENTOSUS IST DIESER ANDERE NEUARTIGE ASPEKT, DER BISHER IN DEN ARTEN VON LACTOABACILLUS PENTOSUS NICHT ANGESPROCHEN WURDE, UND DIES DANK DER REALISIERUNG VON VERGLEICHENDEN PROTEOMIKEN. DIESE BIOMARKER WERDEN FÜR DIE WISSENSCHAFTLICHE GEMEINSCHAFT IM ALLGEMEINEN UND FÜR DIE INDUSTRIE IM BESONDEREN VON GROSSEM NUTZEN SEIN, DA SIE NÜTZLICHE INSTRUMENTE FÜR DIE AUSWAHL VON STÄMMEN MIT PROBIOTISCHEM POTENZIAL DARSTELLEN. (German)
9 December 2021
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS IS EEN MELKZUURBACTERIËN DIE AANWEZIG ZIJN IN GEFERMENTEERDE VOEDINGSMIDDELEN VAN DIERLIJKE EN PLANTAARDIGE OORSPRONG ALS INITIATORCULTUUR OF DEEL UITMAKEN VAN DE INHEEMSE MICROBIOTA, EN OOK ALS ETER VAN HET MENSELIJKE EN DIERLIJKE SPIJSVERTERINGSKANAAL. IN DE AFGELOPEN JAREN, ALS GEVOLG VAN DE GROEIENDE VRAAG VAN LACTOSE INTOLERANTE CONSUMENTEN EN VEGETARIËRS, VERSCHILLENDE STUDIES GERICHT OP BACTERIËN GEÏSOLEERD VAN PLANTEN ALS NIEUWE KANDIDATEN VOOR PROBIOTICA BIJ DE MENS, WAARDOOR HET BREKEN MET HET KLASSIEKE SCHEMA VAN DE MEESTE PROBIOTICA OP DE MARKT. HET GROOTSTE VOORDEEL VAN PROBIOTICA DIE GEÏSOLEERD ZIJN UIT PLANTENVOEDING IS HUN GROTE VERMOGEN OM ZICH AAN TE PASSEN AAN FYSISCH-CHEMISCHE OMSTANDIGHEDEN DIE VERGELIJKBAAR ZIJN MET DIE IN HET MENSELIJKE SPIJSVERTERINGSKANAAL (EXTREME ZUURGRAAD, HOGE NIVEAUS VAN NIET-VERTEERBARE VOEDINGSSTOFFEN EN ANTI-NUTRITIONELE FACTOREN) IN AANVULLING OP ANDERE FUNCTIONELE EIGENSCHAPPEN DIE IN HUN ECOSYSTEMEN ZIJN ONTWIKKELD. GEZIEN HET BELANG VAN DE MELKZUURBACTERIËN VAN PLANTAARDIGE OORSPRONG, HEBBEN WE DE AFGELOPEN JAREN VERSCHILLENDE STAMMEN VAN LACTOBACILLUS PENTOSUS GEÏSOLEERD VAN DE FERMENTATIE VAN DE OLIJVEN ALOREÑA KAMILLE (DE ENIGE OLIJF DIE IN SPANJE WORDT BESCHERMD MET OORSPRONGSBENAMING) DIE EEN GROOT PROBIOTISCH POTENTIEEL HEBBEN AANGETOOND DOOR MIDDEL VAN VOORBEREIDENDE TESTS. DE DIEPGAANDE ANALYSE VAN DE PROBIOTISCHE EIGENSCHAPPEN IN VITRO ZAL ONS IN STAAT STELLEN OM EEN EERSTE SELECTIE VAN DE STAMMEN MET HET BESTE PROBIOTISCHE PROFIEL TE MAKEN EN DE STAM TE VERDIEPEN EN TE KARAKTERISEREN OP GENOMISCH EN PROTEOMISCH NIVEAU. IN DEZE ZIN ZIJN ONZE DOELSTELLINGEN IN DIT PROJECT ALS VOLGT GEFORMULEERD: A) SELECTEER EEN STAM VAN LACTOBACILLUS PENTOSUS MET EEN INTERESSANT EN AANTREKKELIJK PROBIOTISCH PROFIEL MET BETREKKING TOT DE VERSCHILLENDE EIGENSCHAPPEN ZOALS ZUURGRAAD EN GALRESISTENTIE, ADHESIECAPACITEIT, AUTOAGREGACION, VEILIGHEIDSASPECTEN, GROEI, PRODUCTIE VAN ANTIMICROBIËLE STOFFEN EN ANDERE GUNSTIGE EIGENSCHAPPEN; SEQUENTIE VAN HET VOLLEDIGE GENOOM VAN DE GESELECTEERDE STAM OP BASIS VAN IN-VITROTESTS; C) IN SILICOANALYSE VAN DE GENEN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ DE PROBIOTISCHE EIGENSCHAPPEN, WAARBIJ DE REEDS IN DE LITERATUUR BESCHREVEN GENEN EN DE IN DEZE STAM GEDETECTEERDE GENEN WORDEN BENADRUKT, NAAST DE ANALYSE VAN DE DETERMINANTEN VAN VIRULENTIE OM DE VEILIGHEID VAN DE STAM TE BEOORDELEN; D) OM VOOR HET EERST HET PROTEOOM VAN LACTOBACILLUS PENTOSUS TE BESTUDEREN EN DUS DE UIT DE GENOOMSEQUENTIE AFGELEIDE IN SILICO-VOORSPELLINGEN KUNNEN WORDEN AANGEVULD MET PROTEOMISCHE GEGEVENS; E) BEPAAL POTENTIËLE MARKERS VAN ZUURRESISTENTIE, TOLERANTIE VOOR GALZOUTEN EN ADHESIE AAN MUCINE IN LB. PENTOSUS IS DIT ANDERE NIEUWE ASPECT DAT NIET EERDER IS AANGEPAKT IN DE SOORT LACTOABACILLUS PENTOSUS EN DIT DANKZIJ DE REALISATIE VAN VERGELIJKENDE PROTEOMICS. DEZE BIOMARKERS ZULLEN VAN GROOT NUT ZIJN VOOR DE WETENSCHAPPELIJKE GEMEENSCHAP IN HET ALGEMEEN EN DE INDUSTRIE IN HET BIJZONDER, AANGEZIEN ZIJ NUTTIGE INSTRUMENTEN ZIJN VOOR DE SELECTIE VAN STAMMEN MET PROBIOTISCHE POTENTIE. (Dutch)
17 December 2021
0 references
IL LACTOBACILLUS PENTOSUS È UN BATTERIO LATTICO PRESENTE NEGLI ALIMENTI FERMENTATI DI ORIGINE ANIMALE E VEGETALE COME COLTURA INIZIATORE O FACENTE PARTE DEL MICROBIOTA INDIGENO, E ANCHE COME MANGIATORE DEL TRATTO DIGESTIVO UMANO E ANIMALE. NEGLI ULTIMI ANNI, A CAUSA DELLA CRESCENTE DOMANDA DA PARTE DI CONSUMATORI INTOLLERANTI AL LATTOSIO E VEGETARIANI, DIVERSI STUDI SI SONO CONCENTRATI SUI BATTERI ISOLATI DALLE PIANTE COME NUOVI CANDIDATI PER I PROBIOTICI NELL'UOMO, ROMPENDO COSÌ CON IL CLASSICO SCHEMA DELLA MAGGIOR PARTE DEI PROBIOTICI DISPONIBILI SUL MERCATO. IL PIÙ GRANDE VANTAGGIO DEI PROBIOTICI ISOLATI DAGLI ALIMENTI VEGETALI È LA LORO GRANDE CAPACITÀ DI ADATTARSI A CONDIZIONI FISICO-CHIMICHE SIMILI A QUELLE PRESENTI NEL TRATTO DIGESTIVO UMANO (ACIDITÀ ESTREMA, ALTI LIVELLI DI NUTRIENTI NON DIGERIBILI E FATTORI ANTINUTRIZIONALI) OLTRE AD ALTRE PROPRIETÀ FUNZIONALI SVILUPPATE NEI LORO ECOSISTEMI. DATA L'IMPORTANZA DEI BATTERI LATTICI DI ORIGINE VEGETALE, NEGLI ULTIMI ANNI ABBIAMO ISOLATO DALLA FERMENTAZIONE DELLE OLIVE ALOREÑA CAMOMILLA (L'UNICA OLIVA PROTETTA CON NOME DI ORIGINE IN SPAGNA) DIVERSI CEPPI DI LACTOBACILLUS PENTOSUS CHE HANNO DIMOSTRATO UN GRANDE POTENZIALE PROBIOTICO ATTRAVERSO TEST PRELIMINARI. L'ANALISI APPROFONDITA DELLE PROPRIETÀ PROBIOTICHE IN VITRO CI PERMETTERÀ DI EFFETTUARE UNA PRIMA SELEZIONE DEI CEPPI CON IL MIGLIOR PROFILO PROBIOTICO E DI CONTINUARE AD APPROFONDIRE E CARATTERIZZARE IL CEPPO A LIVELLO GENOMICO E PROTEOMICO. IN QUESTO SENSO, I NOSTRI OBIETTIVI STABILITI IN QUESTO PROGETTO SONO ARTICOLATI COME SEGUE: A) SELEZIONARE UN CEPPO DI LACTOBACILLUS PENTOSUS CON UN PROFILO PROBIOTICO INTERESSANTE E ATTRAENTE CHE COPRA LE DIVERSE PROPRIETÀ QUALI ACIDITÀ E RESISTENZA BILIARE, CAPACITÀ DI ADESIONE, AUTOAGREGACION, ASPETTI DI SICUREZZA, CRESCITA, PRODUZIONE DI SOSTANZE ANTIMICROBICHE E ALTRE PROPRIETÀ BENEFICHE; SEQUENZA DEL GENOMA COMPLETO DEL CEPPO SELEZIONATO SULLA BASE DI PROVE IN VITRO; C) NELL'ANALISI SILICO DEI GENI COINVOLTI NELLE PROPRIETÀ PROBIOTICHE EVIDENZIANDO I GENI GIÀ DESCRITTI IN LETTERATURA E QUELLI NUOVI RILEVATI IN QUESTO CEPPO, OLTRE AD ANALIZZARE I DETERMINANTI DELLA VIRULENZA PER VALUTARE LA SICUREZZA DEL CEPPO; D) STUDIARE PER LA PRIMA VOLTA IL PROTEOMA DI LACTOBACILLUS PENTOSUS E QUINDI LE PREVISIONI IN SILICO DESUNTE DALLA SEQUENZA DEL GENOMA POSSONO ESSERE INTEGRATE DA DATI PROTEOMICI; E) DETERMINARE POTENZIALI MARCATORI DI RESISTENZA AGLI ACIDI, TOLLERANZA AI SALI BILIARI E ADESIONE ALLA MUCINA IN LB. PENTOSUS ESSENDO QUESTO ALTRO ASPETTO NUOVO CHE NON È STATO AFFRONTATO IN PRECEDENZA NELLA SPECIE DI LACTOABACILLUS PENTOSUS E QUESTO GRAZIE ALLA REALIZZAZIONE DI PROTEOMICA COMPARATIVA. QUESTI BIOMARCATORI SARANNO DI GRANDE UTILITÀ PER LA COMUNITÀ SCIENTIFICA IN GENERALE E PER LE INDUSTRIE IN PARTICOLARE IN QUANTO RAPPRESENTANO STRUMENTI UTILI PER LA SELEZIONE DI CEPPI CON POTENZIALE PROBIOTICO. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΤΟ LACTOBACILLUS PENTOSUS ΕΊΝΑΙ ΈΝΑ ΓΑΛΑΚΤΙΚΌ ΒΑΚΤΉΡΙΟ ΠΟΥ ΠΕΡΙΈΧΕΤΑΙ ΣΕ ΤΡΌΦΙΜΑ ΖΩΙΚΉΣ ΚΑΙ ΦΥΤΙΚΉΣ ΠΡΟΈΛΕΥΣΗΣ ΠΟΥ ΈΧΟΥΝ ΥΠΟΣΤΕΊ ΖΎΜΩΣΗ ΩΣ ΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΑ ΕΚΚΊΝΗΣΗΣ Ή ΑΠΟΤΕΛΕΊ ΜΈΡΟΣ ΤΗΣ ΕΓΧΏΡΙΑΣ ΜΙΚΡΟΒΙΏΣΗΣ, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΩΣ ΤΡΟΦΉ ΤΟΥ ΠΕΠΤΙΚΟΎ ΣΥΣΤΉΜΑΤΟΣ ΤΟΥ ΑΝΘΡΏΠΟΥ ΚΑΙ ΤΩΝ ΖΏΩΝ. ΤΑ ΤΕΛΕΥΤΑΊΑ ΧΡΌΝΙΑ, ΛΌΓΩ ΤΗΣ ΑΥΞΑΝΌΜΕΝΗΣ ΖΉΤΗΣΗΣ ΑΠΌ ΚΑΤΑΝΑΛΩΤΈΣ ΜΕ ΔΥΣΑΝΕΞΊΑ ΣΤΗ ΛΑΚΤΌΖΗ ΚΑΙ ΧΟΡΤΟΦΆΓΟΥΣ, ΑΡΚΕΤΈΣ ΜΕΛΈΤΕΣ ΕΠΙΚΕΝΤΡΏΘΗΚΑΝ ΣΕ ΒΑΚΤΉΡΙΑ ΠΟΥ ΑΠΟΜΟΝΏΝΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΑ ΦΥΤΆ ΩΣ ΝΈΟΙ ΥΠΟΨΉΦΙΟΙ ΓΙΑ ΠΡΟΒΙΟΤΙΚΆ ΣΤΟΝ ΆΝΘΡΩΠΟ, ΠΑΡΑΒΙΆΖΟΝΤΑΣ ΈΤΣΙ ΤΟ ΚΛΑΣΙΚΌ ΣΧΉΜΑ ΤΩΝ ΠΕΡΙΣΣΌΤΕΡΩΝ ΠΡΟΒΙΟΤΙΚΏΝ ΠΟΥ ΔΙΑΤΊΘΕΝΤΑΙ ΣΤΗΝ ΑΓΟΡΆ. ΤΟ ΜΕΓΑΛΎΤΕΡΟ ΠΛΕΟΝΈΚΤΗΜΑ ΤΩΝ ΠΡΟΒΙΟΤΙΚΏΝ ΠΟΥ ΑΠΟΜΟΝΏΝΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΑ ΦΥΤΙΚΆ ΤΡΌΦΙΜΑ ΕΊΝΑΙ Η ΜΕΓΆΛΗ ΙΚΑΝΌΤΗΤΆ ΤΟΥΣ ΝΑ ΠΡΟΣΑΡΜΌΖΟΝΤΑΙ ΣΕ ΦΥΣΙΚΟΧΗΜΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΠΑΡΌΜΟΙΕΣ ΜΕ ΑΥΤΈΣ ΠΟΥ ΥΠΆΡΧΟΥΝ ΣΤΟ ΠΕΠΤΙΚΌ ΣΎΣΤΗΜΑ ΤΟΥ ΑΝΘΡΏΠΟΥ (ΑΚΡΑΊΑ ΟΞΎΤΗΤΑ, ΥΨΗΛΆ ΕΠΊΠΕΔΑ ΜΗ ΕΎΠΕΠΤΩΝ ΘΡΕΠΤΙΚΏΝ ΟΥΣΙΏΝ ΚΑΙ ΑΝΤΙΘΡΕΠΤΙΚΟΊ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ) ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΆΛΛΕΣ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΈΣ ΙΔΙΌΤΗΤΕΣ ΠΟΥ ΑΝΑΠΤΎΣΣΟΝΤΑΙ ΣΤΑ ΟΙΚΟΣΥΣΤΉΜΑΤΑ ΤΟΥΣ. ΔΕΔΟΜΈΝΗΣ ΤΗΣ ΣΗΜΑΣΊΑΣ ΤΩΝ ΓΑΛΑΚΤΙΚΏΝ ΒΑΚΤΗΡΊΩΝ ΦΥΤΙΚΉΣ ΠΡΟΈΛΕΥΣΗΣ, ΤΑ ΤΕΛΕΥΤΑΊΑ ΧΡΌΝΙΑ ΑΠΟΜΟΝΏΣΑΜΕ ΑΠΌ ΤΗ ΖΎΜΩΣΗ ΤΩΝ ΕΛΙΏΝ ALOREÑA ΧΑΜΟΜΉΛΙ (ΤΟ ΜΌΝΟ ΕΛΙΈΣ ΠΟΥ ΠΡΟΣΤΑΤΕΎΕΤΑΙ ΜΕ ΤΗΝ ΟΝΟΜΑΣΊΑ ΠΡΟΈΛΕΥΣΗΣ ΣΤΗΝ ΙΣΠΑΝΊΑ) ΠΟΛΛΆ ΣΤΕΛΈΧΗ ΤΟΥ LACTOBACILLUS PENTOSUS ΠΟΥ ΚΑΤΈΔΕΙΞΑΝ ΜΕΓΆΛΟ ΠΡΟΒΙΟΤΙΚΌ ΔΥΝΑΜΙΚΌ ΜΈΣΩ ΠΡΟΚΑΤΑΡΚΤΙΚΏΝ ΔΟΚΙΜΏΝ. Η ΕΙΣ ΒΆΘΟΣ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΩΝ ΠΡΟΒΙΟΤΙΚΏΝ ΙΔΙΟΤΉΤΩΝ IN VITRO ΘΑ ΜΑΣ ΕΠΙΤΡΈΨΕΙ ΝΑ ΚΆΝΟΥΜΕ ΜΙΑ ΠΡΏΤΗ ΕΠΙΛΟΓΉ ΤΩΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ ΜΕ ΤΟ ΚΑΛΎΤΕΡΟ ΠΡΟΒΙΟΤΙΚΌ ΠΡΟΦΊΛ ΚΑΙ ΝΑ ΣΥΝΕΧΊΣΟΥΜΕ ΝΑ ΕΜΒΑΘΎΝΟΥΜΕ ΚΑΙ ΝΑ ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΣΟΥΜΕ ΤΟ ΣΤΈΛΕΧΟΣ ΣΕ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΌ ΚΑΙ ΠΡΩΤΕΩΜΙΚΌ ΕΠΊΠΕΔΟ. ΥΠΌ ΤΗΝ ΈΝΝΟΙΑ ΑΥΤΉ, ΟΙ ΣΤΌΧΟΙ ΜΑΣ ΠΟΥ ΚΑΘΟΡΊΖΟΝΤΑΙ ΣΤΟ ΠΑΡΌΝ ΣΧΈΔΙΟ ΔΙΑΜΟΡΦΏΝΟΝΤΑΙ ΩΣ ΕΞΉΣ: Α) ΕΠΙΛΈΞΤΕ ΈΝΑ ΣΤΈΛΕΧΟΣ ΤΟΥ LACTOBACILLUS PENTOSUS ΜΕ ΕΝΔΙΑΦΈΡΟΝ ΚΑΙ ΕΛΚΥΣΤΙΚΌ ΠΡΟΒΙΟΤΙΚΌ ΠΡΟΦΊΛ ΠΟΥ ΚΑΛΎΠΤΕΙ ΤΙΣ ΔΙΆΦΟΡΕΣ ΙΔΙΌΤΗΤΕΣ ΌΠΩΣ Η ΟΞΎΤΗΤΑ ΚΑΙ Η ΑΝΤΟΧΉ ΣΤΗ ΧΟΛΉ, Η ΙΚΑΝΌΤΗΤΑ ΠΡΌΣΦΥΣΗΣ, Η AUTOAGREGACION, ΟΙ ΠΤΥΧΈΣ ΑΣΦΆΛΕΙΑΣ, Η ΑΝΆΠΤΥΞΗ, Η ΠΑΡΑΓΩΓΉ ΑΝΤΙΜΙΚΡΟΒΙΑΚΏΝ ΟΥΣΙΏΝ ΚΑΙ ΆΛΛΕΣ ΕΥΕΡΓΕΤΙΚΈΣ ΙΔΙΌΤΗΤΕΣ. ΑΛΛΗΛΟΥΧΊΑ ΤΟΥ ΠΛΉΡΟΥΣ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΟΣ ΤΟΥ ΕΠΙΛΕΓΜΈΝΟΥ ΣΤΕΛΈΧΟΥΣ ΜΕ ΒΆΣΗ ΔΟΚΙΜΈΣ IN VITRO· Γ) ΣΤΗΝ ΑΝΆΛΥΣΗ SILICO ΤΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΠΟΥ ΕΜΠΛΈΚΟΝΤΑΙ ΣΤΙΣ ΠΡΟΒΙΟΤΙΚΈΣ ΙΔΙΌΤΗΤΕΣ, ΑΝΑΔΕΙΚΝΎΟΝΤΑΣ ΤΑ ΓΟΝΊΔΙΑ ΠΟΥ ΈΧΟΥΝ ΉΔΗ ΠΕΡΙΓΡΑΦΕΊ ΣΤΗ ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΊΑ ΚΑΙ ΤΑ ΝΈΑ ΠΟΥ ΑΝΙΧΝΕΎΟΝΤΑΙ ΣΕ ΑΥΤΌ ΤΟ ΣΤΈΛΕΧΟΣ, ΕΚΤΌΣ ΑΠΌ ΤΗΝ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΩΝ ΚΑΘΟΡΙΣΤΙΚΏΝ ΠΑΡΑΓΌΝΤΩΝ ΤΗΣ ΛΟΙΜΟΓΌΝΟΥ ΔΎΝΑΜΗΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΞΙΟΛΌΓΗΣΗ ΤΗΣ ΑΣΦΆΛΕΙΑΣ ΤΟΥ ΣΤΕΛΈΧΟΥΣ. Δ) ΝΑ ΜΕΛΕΤΗΘΕΊ ΓΙΑ ΠΡΏΤΗ ΦΟΡΆ ΤΟ ΠΡΩΤΕΏΜΑ ΤΟΥ LACTOBACILLUS PENTOSUS ΚΑΙ, ΩΣ ΕΚ ΤΟΎΤΟΥ, ΟΙ ΠΡΟΒΛΈΨΕΙΣ IN SILICO ΠΟΥ ΠΡΟΚΎΠΤΟΥΝ ΑΠΌ ΤΗΝ ΑΛΛΗΛΟΥΧΊΑ ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΟΣ ΜΠΟΡΟΎΝ ΝΑ ΣΥΜΠΛΗΡΩΘΟΎΝ ΜΕ ΠΡΩΤΕΩΜΙΚΆ ΔΕΔΟΜΈΝΑ. Ε) ΚΑΘΟΡΊΖΟΥΝ ΠΙΘΑΝΟΎΣ ΔΕΊΚΤΕΣ ΌΞΙΝΗΣ ΑΝΤΟΧΉΣ, ΑΝΟΧΉΣ ΣΤΑ ΆΛΑΤΑ ΧΟΛΉΣ ΚΑΙ ΠΡΌΣΦΥΣΗΣ ΣΤΗ ΜΟΥΚΊΝΗ ΣΤΗΝ LB. PENTOSUS ΕΊΝΑΙ ΑΥΤΉ Η ΆΛΛΗ ΝΈΑ ΠΤΥΧΉ ΠΟΥ ΔΕΝ ΈΧΕΙ ΕΞΕΤΑΣΤΕΊ ΠΡΟΗΓΟΥΜΈΝΩΣ ΣΤΟ ΕΊΔΟΣ ΤΟΥ LACTOABACILLUS PENTOSUS ΚΑΙ ΑΥΤΌ ΧΆΡΗ ΣΤΗΝ ΥΛΟΠΟΊΗΣΗ ΤΗΣ ΣΥΓΚΡΙΤΙΚΉΣ ΠΡΩΤΕΩΜΙΚΉΣ. ΑΥΤΟΊ ΟΙ ΒΙΟΔΕΊΚΤΕΣ ΘΑ ΕΊΝΑΙ ΠΟΛΎ ΧΡΉΣΙΜΟΙ ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΉ ΚΟΙΝΌΤΗΤΑ ΓΕΝΙΚΆ ΚΑΙ ΓΙΑ ΤΙΣ ΒΙΟΜΗΧΑΝΊΕΣ ΕΙΔΙΚΌΤΕΡΑ, ΚΑΘΏΣ ΑΠΟΤΕΛΟΎΝ ΧΡΉΣΙΜΑ ΕΡΓΑΛΕΊΑ ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΠΙΛΟΓΉ ΣΤΕΛΕΧΏΝ ΜΕ ΠΡΟΒΙΟΤΙΚΌ ΔΥΝΑΜΙΚΌ. (Greek)
18 August 2022
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS ER EN MÆLKEBAKTERIER, DER FINDES I FERMENTEREDE FØDEVARER AF ANIMALSK OG VEGETABILSK OPRINDELSE SOM EN INITIATORKULTUR ELLER SOM EN DEL AF DEN OPRINDELIGE MIKROBIOTA, OG OGSÅ SOM SPISER AF MENNESKERS OG DYRS FORDØJELSESKANAL. PÅ GRUND AF DEN STIGENDE EFTERSPØRGSEL FRA LAKTOSEINTOLERANTE FORBRUGERE OG VEGETARER HAR FLERE UNDERSØGELSER I DE SENERE ÅR FOKUSERET PÅ BAKTERIER ISOLERET FRA PLANTER SOM NYE KANDIDATER TIL PROBIOTIKA HOS MENNESKER OG DERMED BRYDE MED DEN KLASSISKE ORDNING MED DE FLESTE PROBIOTIKA, DER FINDES PÅ MARKEDET. DEN STØRSTE FORDEL VED PROBIOTIKA ISOLERET FRA VEGETABILSKE FØDEVARER ER DERES STORE EVNE TIL AT TILPASSE SIG FYSISK-KEMISKE FORHOLD SVARENDE TIL DEM, DER FINDES I DET MENNESKELIGE FORDØJELSESKANAL (EKSTREME SYREINDHOLD, HØJE NIVEAUER AF IKKE-FORDØJELIGE NÆRINGSSTOFFER OG ANTI-ERNÆRINGSMÆSSIGE FAKTORER) UD OVER ANDRE FUNKTIONELLE EGENSKABER, DER ER UDVIKLET I DERES ØKOSYSTEMER. I BETRAGTNING AF BETYDNINGEN AF MÆLKESYREBAKTERIER AF VEGETABILSK OPRINDELSE HAR VI I DE SENESTE ÅR ISOLERET FLERE STAMMER AF LACTOBACILLUS PENTOSUS FRA GÆRINGEN AF OLIVENERNE ALOREÑA KAMILLE (DEN ENESTE OLIVEN, DER ER BESKYTTET MED OPRINDELSESBETEGNELSEN I SPANIEN) OG PÅVISTE ET STORT PROBIOTISK POTENTIALE GENNEM INDLEDENDE UNDERSØGELSER. DEN DYBDEGÅENDE ANALYSE AF DE PROBIOTISKE EGENSKABER IN VITRO VIL GIVE OS MULIGHED FOR AT FORETAGE ET FØRSTE UDVALG AF STAMMERNE MED DEN BEDSTE PROBIOTISKE PROFIL OG FORTSÆTTE MED AT UDDYBE OG KARAKTERISERE STAMMEN PÅ GENOMISK OG PROTEOMISK NIVEAU. I DENNE HENSEENDE ER DE MÅL, DER ER OPSTILLET I DETTE PROJEKT, UDFORMET SÅLEDES: A) UDVÆLGE EN STAMME AF LACTOBACILLUS PENTOSUS MED EN INTERESSANT OG ATTRAKTIV PROBIOTISK PROFIL, DER DÆKKER DE FORSKELLIGE EGENSKABER SÅSOM SURHEDSGRAD OG GALDERESISTENS, VEDHÆFTNINGSKAPACITET, AUTOAGREGACION, SIKKERHEDSASPEKTER, VÆKST, PRODUKTION AF ANTIMIKROBIELLE STOFFER OG ANDRE GAVNLIGE EGENSKABER; SEKVENS AF DEN VALGTE STAMMES FULDSTÆNDIGE GENOM BASERET PÅ IN VITRO-TEST C) I SILICOANALYSE AF DE GENER, DER INDGÅR I DE PROBIOTISKE EGENSKABER, OG SOM FREMHÆVER DE GENER, DER ALLEREDE ER BESKREVET I LITTERATUREN, OG DE NYE, DER ER PÅVIST I DENNE STAMME, UD OVER AT ANALYSERE DETERMINANTERNE FOR VIRULENS FOR AT VURDERE STAMMENS SIKKERHED; D) AT STUDERE FOR FØRSTE GANG PROTEOM AF LACTOBACILLUS PENTOSUS OG DERMED IN SILICO FORUDSIGELSER UDLEDT AF GENOMSEKVENSEN KAN SUPPLERES MED PROTEOMISKE DATA; E) BESTEMME POTENTIELLE MARKØRER FOR SYREBESTANDIGHED, TOLERANCE OVER FOR GALDESALTE OG VEDHÆFTNING TIL MUCIN I LB. PENTOSUS ER DETTE ANDET NYE ASPEKT, DER IKKE TIDLIGERE ER BLEVET BEHANDLET I ARTER AF LACTOABACILLUS PENTOSUS OG DETTE TAKKET VÆRE REALISERINGEN AF SAMMENLIGNENDE PROTEOMICS. DISSE BIOMARKØRER VIL VÆRE TIL STOR NYTTE FOR DET VIDENSKABELIGE FÆLLESSKAB I ALMINDELIGHED OG FOR INDUSTRIEN I SÆRDELESHED, DA DE UDGØR NYTTIGE REDSKABER TIL UDVÆLGELSE AF STAMMER MED PROBIOTISK POTENTIALE. (Danish)
18 August 2022
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS ON MAITOBAKTEEREJA, JOITA ESIINTYY FERMENTOIDUISSA ELÄIN- JA KASVIPERÄISISSÄ ELINTARVIKKEISSA INITIAATTORIKULTTUURINA TAI OSANA KOTOPERÄISTÄ MIKROBIOTAA SEKÄ IHMISEN JA ELÄINTEN RUOANSULATUSKANAVAN SYÖJÄNÄ. VIIME VUOSINA LAKTOOSI-INTOLERANSSIKULUTTAJIEN JA KASVISSYÖJIEN KASVAVAN KYSYNNÄN VUOKSI USEISSA TUTKIMUKSISSA KESKITYTTIIN KASVEISTA ERISTETTYIHIN BAKTEEREIHIN UUSINA PROBIOOTTIEN EHDOKKAINA IHMISILLÄ, MIKÄ RIKKOI USEIMPIEN MARKKINOILLA SAATAVILLA OLEVIEN PROBIOOTTIEN KLASSISEN JÄRJESTELMÄN. KASVINRUOISTA ERISTETYISTÄ PROBIOOTEISTA SUURIN ETU ON NIIDEN SUURI KYKY SOPEUTUA IHMISEN RUOANSULATUSKANAVASSA ESIINTYVIIN FYSIKAALIS-KEMIALLISIIN OLOSUHTEISIIN (ERITTÄIN HAPPAMUUS, RUOANSULATUSKELVOTTOMIEN RAVINTOAINEIDEN SUURI MÄÄRÄ JA RAVITSEMUKSELLISET TEKIJÄT) NIIDEN EKOSYSTEEMISSÄ KEHITETTYJEN MUIDEN TOIMINNALLISTEN OMINAISUUKSIEN LISÄKSI. KUN OTETAAN HUOMIOON KASVIPERÄISTEN MAITOHAPPOBAKTEERIEN MERKITYS, OLEMME VIIME VUOSINA ERISTÄNEET OLIIVIEN ALOREÑA KAMOMILLA (AINOA OLIIVI, JOKA ON SUOJATTU ALKUPERÄNIMITYKSELLÄ ESPANJASSA) KÄYMISEN USEISTA LACTOBACILLUS PENTOSUS -KANNOISTA, JOIDEN PROBIOOTTISET MAHDOLLISUUDET OLIVAT ALUSTAVIEN TESTIEN ANSIOSTA HYVÄT. PROBIOOTTISTEN OMINAISUUKSIEN PERUSTEELLINEN ANALYYSI IN VITRO MAHDOLLISTAA SEN, ETTÄ VOIMME TEHDÄ ENSIMMÄISEN VALIKOIMAN KANTOJA, JOILLA ON PARAS PROBIOOTTINEN PROFIILI, JA JATKAA KANNAN SYVENTÄMISTÄ JA LUONNEHTIMISTA GENOMI- JA PROTEOMITASOLLA. TÄSSÄ MIELESSÄ TÄSSÄ HANKKEESSA MÄÄRITELLYT TAVOITTEEMME OVAT SEURAAVAT: A) VALITTAVA LACTOBACILLUS PENTOSUS -KANTA, JOLLA ON MIELENKIINTOINEN JA HOUKUTTELEVA PROBIOOTTINEN PROFIILI, JOKA KATTAA ERILAISET OMINAISUUDET, KUTEN HAPPAMUUS JA SAPPIRESISTENSSI, TARTTUMISKYKY, AUTOAGREGACION, TURVALLISUUSNÄKÖKOHDAT, KASVU, MIKROBILÄÄKKEIDEN TUOTANTO JA MUUT HYÖDYLLISET OMINAISUUDET; VALITUN KANNAN TÄYDELLISEN GENOMIN SEKVENSSI IN VITRO -TESTIEN PERUSTEELLA; C) PROBIOOTTISIIN OMINAISUUKSIIN LIITTYVIEN GEENIEN SILIKOANALYYSISSÄ, JOSSA KOROSTETAAN KIRJALLISUUDESSA JO KUVATTUJA GEENEJÄ JA TÄSSÄ KANNASSA HAVAITTUJA UUSIA GEENEJÄ SEKÄ ANALYSOIDAAN VIRULENSSIN TAUSTATEKIJÖITÄ KANNAN TURVALLISUUDEN ARVIOIMISEKSI; D) TUTKIA ENSIMMÄISTÄ KERTAA LACTOBACILLUS PENTOSUS -VALMISTEEN PROTEOMIA JA SITEN GENOMIN SEKVENSSISTÄ JOHDETTUJA IN SILICO -ENNUSTEITA VOIDAAN TÄYDENTÄÄ PROTEOMISILLA TIEDOILLA; E) MÄÄRITETÄÄN MAHDOLLISET HAPPORESISTENSSIN MERKKIAINEET, SAPPISUOLOJEN SIETOKYKY JA TARTTUVUUS MUSIINIIN LB:SSÄ. PENTOSUS ON TÄMÄ TOINEN UUSI NÄKÖKOHTA, JOTA EI OLE AIEMMIN KÄSITELTY LACTOABACILLUS PENTOSUS -LAJISSA, MIKÄ JOHTUU VERTAILEVAN PROTEOMIIKAN TOTEUTUMISESTA. NÄISTÄ BIOMARKKEREISTA ON PALJON HYÖTYÄ TIEDEYHTEISÖLLE YLEENSÄ JA ERITYISESTI TEOLLISUUDELLE, KOSKA NE OVAT HYÖDYLLISIÄ VÄLINEITÄ PROBIOOTTISTEN KANTOJEN VALINNASSA. (Finnish)
18 August 2022
0 references
IL-LACTOBACILLUS PENTOSUS HUWA BATTERJI LATTIĊI PREŻENTI F’IKEL IFFERMENTAT LI JORIĠINA MILL-ANNIMALI U MILL-PJANTI BĦALA KULTURA TA’ INIZJATUR JEW LI JIFFORMA PARTI MILL-MIKROBIJOTA INDIĠENA, U WKOLL BĦALA IKEL TAL-PASSAĠĠ DIĠESTIV TAL-BNIEDEM U TAL-ANNIMALI. F’DAWN L-AĦĦAR SNIN, MINĦABBA D-DOMANDA DEJJEM TIKBER MINN KONSUMATURI U VEĠETARJANI INTOLLERANTI GĦAL-LATTOŻJU, DIVERSI STUDJI FFUKAW FUQ BATTERJI IŻOLATI MINN PJANTI BĦALA KANDIDATI ĠODDA GĦALL-PROBIJOTIĊI FIL-BNEDMIN, U B’HEKK IKISSRU MAL-ISKEMA KLASSIKA TA’ ĦAFNA PROBIJOTIĊI DISPONIBBLI FIS-SUQ. IL-VANTAĠĠ AKBAR TA ‘PROBIJOTIĊI IŻOLATI MILL-IKEL TAL-PJANTI HIJA L-ABBILTÀ KBIRA TAGĦHOM LI JADATTAW GĦALL-KONDIZZJONIJIET FIŻIĊI-KIMIĊI SIMILI GĦAL DAWK MISJUBA FIL-PASSAĠĠ DIĠESTIV TAL-BNIEDEM (AĊIDITÀ ESTREMI, LIVELLI GĦOLJA TA’ NUTRIJENTI MHUX DIĠESTIBBLI U FATTURI ANTI-NUTRIZZJONI) FIL ŻIEDA GĦAL PROPRJETAJIET FUNZJONALI OĦRA ŻVILUPPATI FL-EKOSISTEMI TAGĦHOM. MINĦABBA L-IMPORTANZA TAL-BATTERJI LATTIĊI TA’ ORIĠINI MILL-PJANTI, F’DAWN L-AĦĦAR SNIN ILNA IŻOLATI MILL-FERMENTAZZJONI TAŻ-ŻEBBUĠ ALOREÑA CHAMOMILE (L-UNIKU ŻEBBUĠ PROTETT BL-ISEM TAL-ORIĠINI FI SPANJA) DIVERSI RAZEZ TA’ LACTOBACILLUS PENTOSUS LI WREW POTENZJAL PROBIJOTIKU KBIR PERMEZZ TA’ TESTIJIET PRELIMINARI. L-ANALIŻI FIL-FOND TAL-PROPRJETAJIET PROBIJOTIĊI IN VITRO SE TIPPERMETTILNA NAGĦMLU L-EWWEL GĦAŻLA TAR-RAZEZ BL-AĦJAR PROFIL PROBIJOTIKU U NKOMPLU NAPPROFONDIXXU U NIKKARATTERIZZAW IR-RAZZA FIL-LIVELL ĠENOMIKU U PROTEOMIKU. F’DAN IS-SENS, L-GĦANIJIET TAGĦNA STABBILITI F’DAN IL-PROĠETT HUMA MFASSLA KIF ĠEJ: A) TAGĦŻEL RAZZA TA’ LACTOBACILLUS PENTOSUS BI PROFIL PROBIJOTIKU INTERESSANTI U ATTRAENTI LI JKOPRI L-PROPRJETAJIET DIFFERENTI BĦALL-AĊIDITÀ U R-REŻISTENZA TAL-BILI, IL-KAPAĊITÀ TA’ ADEŻJONI, AUTOAGREGACION, L-ASPETTI TA’ SIGURTÀ, IT-TKABBIR, IL-PRODUZZJONI TA’ SUSTANZI ANTIMIKROBIĊI U PROPRJETAJIET OĦRA TA’ BENEFIĊĊJU; SEKWENZA TAL-ĠENOMA SĦIĦA TAR-RAZZA MAGĦŻULA BBAŻATA FUQ TESTIJIET IN VITRO; C) ANALIŻI IN SILICO TAL-ĠENI INVOLUTI FIL-PROPRJETAJIET PROBIJOTIĊI LI JENFASIZZAW IL-ĠENI DIĠÀ DESKRITTI FIL-LETTERATURA U DAWK ĠODDA MISJUBA F’DIN IR-RAZZA, MINBARRA L-ANALIŻI TAD-DETERMINANTI TAL-VIRULENZA BIEX TIĠI EVALWATA S-SIKUREZZA TAR-RAZZA; D) LI JISTUDJA GĦALL-EWWEL DARBA L-PROTEOMA TAL-LACTOBACILLUS PENTOSUS U GĦALHEKK IL-PREVIŻJONIJIET IN SILICO DEDOTTI MIS-SEKWENZA TAL-ĠENOMA JISTGĦU JIĠU SSUPPLIMENTATI B’DATA PROTEOMIKA; E) IDDETERMINA L-MARKATURI POTENZJALI TAR-REŻISTENZA GĦALL-AĊIDU, IT-TOLLERANZA GĦALL-IMLUĦA TAL-BILI U L-ADEŻJONI MAL-MUĊINA F’LB. PENTOSUS HUWA DAN L-ASPETT ĠDID IEĦOR LI MA ĠIEX INDIRIZZAT QABEL FL-ISPEĊI TA’ LACTOABACILLUS PENTOSUS U DAN GRAZZI GĦAR-REALIZZAZZJONI TA’ PROTEOMIKA KOMPARATTIVA. DAWN IL-BIJOMARKATURI SE JKUNU TA’ UŻU KBIR GĦALL-KOMUNITÀ XJENTIFIKA B’MOD ĠENERALI U GĦALL-INDUSTRIJI B’MOD PARTIKOLARI PERESS LI JIRRAPPREŻENTAW GĦODOD UTLI GĦALL-GĦAŻLA TA’ RAZEZ B’POTENZJAL PROBIJOTIKU. (Maltese)
18 August 2022
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS IR PIENSKĀBES BAKTĒRIJAS, KAS ATRODAS FERMENTĒTOS DZĪVNIEKU UN AUGU IZCELSMES PĀRTIKAS PRODUKTOS KĀ INICIATORA KULTŪRA VAI DAĻA NO VIETĒJĀS MIKROBIOTAS, KĀ ARĪ KĀ CILVĒKU UN DZĪVNIEKU GREMOŠANAS TRAKTA ĒDĒJS. PĒDĒJOS GADOS, ŅEMOT VĒRĀ AUGOŠO PIEPRASĪJUMU NO LAKTOZES NEPANESĪGIEM PATĒRĒTĀJIEM UN VEĢETĀRIEŠIEM, VAIRĀKI PĒTĪJUMI KONCENTRĒJĀS UZ BAKTĒRIJĀM, KAS IZOLĒTAS NO AUGIEM KĀ JAUNI KANDIDĀTI PROBIOTIKĀM CILVĒKIEM, TĀDĒJĀDI PĀRKĀPJOT KLASISKO SHĒMU LIELĀKAJAI DAĻAI TIRGŪ PIEEJAMO PROBIOTIKU. LIELĀKĀ PRIEKŠROCĪBA PROBIOTIKĀM, KAS IZOLĒTAS NO AUGU PĀRTIKAS, IR TO LIELĀ SPĒJA PIELĀGOTIES FIZIKĀLĶĪMISKIEM APSTĀKĻIEM, KAS IR LĪDZĪGI TIEM, KAS SASTOPAMI CILVĒKA GREMOŠANAS TRAKTĀ (ĀRKĀRTĒJAIS SKĀBUMS, AUGSTS NESAGREMOJAMO BARĪBAS VIELU LĪMENIS UN ANTI-UZTURVIELU FAKTORI) PAPILDUS CITĀM TO EKOSISTĒMĀS ATTĪSTĪTAJĀM FUNKCIONĀLAJĀM ĪPAŠĪBĀM. ŅEMOT VĒRĀ AUGU IZCELSMES PIENSKĀBES BAKTĒRIJU NOZĪMI, PĒDĒJOS GADOS MĒS ESAM IZOLĒJUŠI NO ALOREÑA KUMELĪTES (VIENĪGĀS OLĪVAS, KAS SPĀNIJĀ IR AIZSARGĀTA AR CILMES VIETAS NOSAUKUMU) FERMENTĀCIJAS VAIRĀKU LACTOBACILLUS PENTOSUS CELMU DĒĻ, KAS, VEICOT SĀKOTNĒJOS TESTUS, PARĀDĪJA LIELU PROBIOTISKO POTENCIĀLU. PADZIĻINĀTA PROBIOTISKO ĪPAŠĪBU ANALĪZE IN VITRO ĻAUS MUMS VEIKT PIRMO CELMU ATLASI AR LABĀKO PROBIOTISKO PROFILU UN TURPINĀT PADZIĻINĀT UN RAKSTUROT CELMU GENOMA UN PROTEOMIKAS LĪMENĪ. ŠAJĀ ZIŅĀ MŪSU MĒRĶI, KAS IZKLĀSTĪTI ŠAJĀ PROJEKTĀ, IR FORMULĒTI ŠĀDI: A) IZVĒLAS LACTOBACILLUS PENTOSUS CELMU AR INTERESANTU UN PIEVILCĪGU PROBIOTISKO PROFILU, KAS APTVER DAŽĀDAS ĪPAŠĪBAS, PIEMĒRAM, SKĀBUMU UN ŽULTS REZISTENCI, ADHĒZIJAS SPĒJU, AUTOAGREGACION, DROŠĪBAS ASPEKTUS, AUGŠANU, ANTIMIKROBIĀLO VIELU RAŽOŠANU UN CITAS LABVĒLĪGAS ĪPAŠĪBAS; ATLASĪTĀ CELMA PILNA GENOMA SECĪBA, PAMATOJOTIES UZ IN VITRO TESTIEM; C) TO GĒNU SILIKO ANALĪZĒ, KAS IESAISTĪTI PROBIOTISKAJĀS ĪPAŠĪBĀS, IZCEĻOT LITERATŪRĀ JAU APRAKSTĪTOS GĒNUS UN JAUNOS, KAS KONSTATĒTI ŠAJĀ CELMĀ, PAPILDUS VIRULENCES NOTEICOŠO FAKTORU ANALĪZEI, LAI NOVĒRTĒTU CELMA DROŠUMU; D) PIRMO REIZI PĒTĪT LACTOBACILLUS PENTOSUS PROTEOMU UN TĀDĒJĀDI NO GENOMA SEKVENCES IEGŪTĀS IN SILIKO PROGNOZES VAR PAPILDINĀT AR PROTEOMIKAS DATIEM; E) NOSAKA IESPĒJAMOS SKĀBES REZISTENCES MARĶIERUS, TOLERANCI PRET ŽULTS SĀĻIEM UN ADHĒZIJU AR GĻOTĀDU LB. PENTOZS IR ŠIS JAUNAIS ASPEKTS, KAS IEPRIEKŠ NAV APLŪKOTS LACTOABACILLUS PENTOSUS SUGĀM, UN TAS IR PATEICOTIES SALĪDZINOŠAI PROTEOMIKAI. ŠIE BIOMARĶIERI BŪS ĻOTI NODERĪGI ZINĀTNISKAJAI KOPIENAI KOPUMĀ UN JO ĪPAŠI RŪPNIECĪBĀ, JO TIE IR NODERĪGI LĪDZEKĻI CELMU AR PROBIOTIKAS POTENCIĀLU IZVĒLEI. (Latvian)
18 August 2022
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS JE MLIEČNA BAKTÉRIA PRÍTOMNÁ VO FERMENTOVANÝCH POTRAVINÁCH ŽIVOČÍŠNEHO A RASTLINNÉHO PÔVODU AKO INICIÁTORSKÁ KULTÚRA ALEBO TVORIACA SÚČASŤ PÔVODNEJ MIKROFLÓRY, A TIEŽ AKO JEDLÍK TRÁVIACEHO TRAKTU ČLOVEKA A ZVIERAT. V POSLEDNÝCH ROKOCH SA V DÔSLEDKU RASTÚCEHO DOPYTU ZO STRANY SPOTREBITEĽOV TRPIACICH NEZNÁŠANLIVOSŤOU LAKTÓZY A VEGETARIÁNOV NIEKOĽKO ŠTÚDIÍ ZAMERALO NA BAKTÉRIE IZOLOVANÉ Z RASTLÍN AKO NOVÝCH KANDIDÁTOV NA PROBIOTIKÁ U ĽUDÍ, ČÍM SA PRERUŠILA KLASICKÁ SCHÉMA VÄČŠINY PROBIOTÍK DOSTUPNÝCH NA TRHU. NAJVÄČŠOU VÝHODOU PROBIOTÍK IZOLOVANÝCH Z RASTLINNÝCH POTRAVÍN JE ICH VEĽKÁ SCHOPNOSŤ PRISPÔSOBIŤ SA FYZIKÁLNO-CHEMICKÝM PODMIENKAM PODOBNÝM TÝM, KTORÉ SA NACHÁDZAJÚ V ĽUDSKOM ZAŽÍVACOM TRAKTE (EXTRÉMNA KYSLOSŤ, VYSOKÁ HLADINA NESTRÁVITEĽNÝCH ŽIVÍN A PROTIVÝŽIVOVÉ FAKTORY) OKREM INÝCH FUNKČNÝCH VLASTNOSTÍ VYVINUTÝCH V ICH EKOSYSTÉMOCH. VZHĽADOM NA VÝZNAM MLIEČNYCH BAKTÉRIÍ RASTLINNÉHO PÔVODU SME V POSLEDNÝCH ROKOCH IZOLOVALI Z FERMENTÁCIE OLÍV ALOREÑA HARMANČEKA (JEDINÉ OLIVY, KTORÉ SÚ CHRÁNENÉ NÁZVOM PÔVODU V ŠPANIELSKU) NIEKOĽKO KMEŇOV LACTOBACILLUS PENTOSUS, KTORÉ PREUKÁZALI PROSTREDNÍCTVOM PREDBEŽNÝCH TESTOV VEĽKÝ PROBIOTICKÝ POTENCIÁL. HĹBKOVÁ ANALÝZA PROBIOTICKÝCH VLASTNOSTÍ IN VITRO NÁM UMOŽNÍ UROBIŤ PRVÝ VÝBER KMEŇOV S NAJLEPŠÍM PROBIOTICKÝM PROFILOM A POKRAČOVAŤ V PREHLBOVANÍ A CHARAKTERIZÁCII KMEŇA NA GENÓMOVEJ A PROTEOMICKEJ ÚROVNI. V TOMTO ZMYSLE SÚ NAŠE CIELE STANOVENÉ V TOMTO PROJEKTE VYMEDZENÉ TAKTO: A) VYBERTE KMEŇ LACTOBACILLUS PENTOSUS SO ZAUJÍMAVÝM A ATRAKTÍVNYM PROBIOTICKÝM PROFILOM POKRÝVAJÚCIM RÔZNE VLASTNOSTI, AKO JE KYSLOSŤ A REZISTENCIA ŽLČE, SCHOPNOSŤ ADHÉZIE, AUTOAGREGACION, BEZPEČNOSTNÉ ASPEKTY, RAST, PRODUKCIA ANTIMIKROBIÁLNYCH LÁTOK A INÉ PROSPEŠNÉ VLASTNOSTI; POSTUPNOSŤ ÚPLNÉHO GENÓMU VYBRANÉHO KMEŇA NA ZÁKLADE TESTOV IN VITRO; C) IN SILICO ANALÝZA GÉNOV PODIEĽAJÚCICH SA NA PROBIOTICKÝCH VLASTNOSTIACH ZDÔRAZŇUJÚCA GÉNY UŽ OPÍSANÉ V LITERATÚRE A GÉNY ZISTENÉ V TOMTO KMENI, OKREM ANALÝZY DETERMINANTOV VIRULENCIE NA VYHODNOTENIE BEZPEČNOSTI KMEŇA; D) PRVÝKRÁT ŠTUDOVAŤ PROTEÓM LACTOBACILLUS PENTOSUS, A TEDA PREDPOVEDE IN SILICO ODVODENÉ Z GENÓMOVEJ SEKVENCIE MÔŽU BYŤ DOPLNENÉ PROTEOMICKÝMI ÚDAJMI; E) STANOVTE POTENCIÁLNE MARKERY REZISTENCIE VOČI KYSELINÁM, TOLERANCIE VOČI ŽLČOVÝM SOLIAM A PRIĽNAVOSTI K MUCÍNU V LB. PENTOSUS JE TENTO ĎALŠÍ NOVÝ ASPEKT, KTORÝ NEBOL PREDTÝM RIEŠENÝ V DRUHU LACTOABACILLUS PENTOSUS A TO VĎAKA REALIZÁCII KOMPARATÍVNEJ PROTEOMIKY. TIETO BIOMARKERY BUDÚ VEĽMI UŽITOČNÉ PRE VEDECKÉ SPOLOČENSTVO VO VŠEOBECNOSTI A NAJMÄ PRE PRIEMYSELNÉ ODVETVIA, PRETOŽE PREDSTAVUJÚ UŽITOČNÉ NÁSTROJE NA VÝBER KMEŇOV S PROBIOTICKÝM POTENCIÁLOM. (Slovak)
18 August 2022
0 references
IS BAICTÉIR LACHTACHA É LACTOBACILLUS PENTOSUS ATÁ I LÁTHAIR I MBIANNA COIPTHE DE BHUNADH AINMHÍOCH AGUS PLANDAÍ MAR CHULTÚR TIONSCNAIMH NÓ MAR CHUID DEN MICROBIOTA DÚCHASACH, AGUS FREISIN MAR ITHEOIR DEN CHONAIR DÍLEÁ DAONNA AGUS AINMHITHE. LE BLIANTA BEAGA ANUAS, MAR GHEALL AR AN ÉILEAMH ATÁ AG FÁS Ó THOMHALTÓIRÍ AGUS VEIGEATÓIRÍ LACHTÓIS ÉADULANGACHA, DHÍRIGH ROINNT STAIDÉAR AR BHAICTÉIR ATÁ SCOITE AMACH Ó PHLANDAÍ MAR IARRTHÓIRÍ NUA LE HAGHAIDH PROBIOTICS I NDAOINE, RUD A BHRISEANN LEIS AN SCÉIM CLASAICEACH DE CHUID IS MÓ PROBIOTICS ATÁ AR FÁIL AR AN MARGADH. IS É AN BUNTÁISTE IS MÓ A BHAINEANN LE PROBIOTICS ATÁ SCOITE AMACH Ó BHIANNA PLANDAÍ NÁ A GCUMAS MÓR IAD FÉIN A CHUR IN OIRIÚINT DO DHÁLAÍ FISICIÚLA-CHEIMICEACHA ATÁ COSÚIL LEO SIÚD A FHAIGHTEAR SA CHONAIR DÍLEÁ DAONNA (AIGÉADACHT MHÓR, LEIBHÉIL ARDA COTHAITHEACH DO-DÍLEÁITE AGUS TOSCA FRITHCHOTHAITHEACHA) CHOMH MAITH LE HAIRÍONNA FEIDHMIÚLA EILE A FORBRAÍODH INA N-ÉICEACHÓRAIS. MAR GHEALL AR AN TÁBHACHT A BHAINEANN LEIS NA BAICTÉIR LACHTACHA DE BHUNADH PLANDAÍ, LE BLIANTA BEAGA ANUAS TÁIMID SCOITE AMACH Ó CHOIPEADH NA N-OLÓG ALOREÑA CHAMOMILE (AN T-AON OLÓIGE ATÁ FAOI CHOSAINT AINM TIONSCNAIMH SA SPÁINN) ROINNT TRÉITHCHINEÁLACHA DE LACTOBACILLUS PENTOSUS A LÉIRIGH ACMHAINNEACHT MHÓR PROBIOTIC TRÍ RÉAMHTHÁSTÁLACHA. TABHARFAIDH AN ANAILÍS DHOMHAIN AR NA HAIRÍONNA PROBIOTIC IN VITRO DEIS DÚINN AN CHÉAD ROGHA DE NA TRÉITHCHINEÁLACHA A DHÉANAMH LEIS AN BPRÓIFÍL PROBIOTIC IS FEARR AGUS LEANÚINT LEIS AN MBRÚ A DHOIMHNIÚ AGUS A THRÉITHRIÚ AR AN LEIBHÉAL GÉANÓMAÍOCH AGUS PROTEOMIC. SA CHIALL SIN, TÁ ÁR GCUSPÓIRÍ ATÁ LEAGTHA AMACH SA TIONSCADAL SEO LEAGTHA AMACH MAR SEO A LEANAS: A) ROGHNAIGH TRÉITHCHINEÁL DE LACTOBACILLUS PENTOSUS LE PRÓIFÍL PROBIOTIC SUIMIÚIL AGUS TARRAINGTEACH A CHLÚDAÍONN NA HAIRÍONNA ÉAGSÚLA AMHAIL AIGÉADACHT AGUS FRIOTAÍOCHT BILE, CUMAS GREAMAITHEACHTA, AUTOAGREGACION, GNÉITHE SÁBHÁILTEACHTA, FÁS, TÁIRGEADH SUBSTAINTÍ FRITHMHIOCRÓBACHA AGUS AIRÍONNA TAIRBHIÚLA EILE; SEICHEAMH GHÉANÓM IOMLÁN AN TRÉITHCHINEÁIL ROGHNAITHE BUNAITHE AR THÁSTÁLACHA IN VITRO; C) IN ANAILÍS SILICO AR NA GÉINTE A BHFUIL BAINT ACU LEIS NA HAIRÍONNA PROBIOTIC AG CUR BÉIME AR NA GÉINTE A THUAIRISCÍTEAR CHEANA FÉIN SA LITRÍOCHT AGUS NA CINN NUA A BHRAITEAR SA TRÉITHCHINEÁL SEO, CHOMH MAITH LE HANAILÍS A DHÉANAMH AR NA DEITÉARMANAINT A BHAINEANN LE NIMHNEACHT CHUN SÁBHÁILTEACHT AN BHRÚ A MHEAS; D) STAIDÉAR A DHÉANAMH DEN CHÉAD UAIR AR PHRÓTEÓIM LACTOBACILLUS PENTOSUS AGUS DÁ BHRÍ SIN IS FÉIDIR SONRAÍ PRÓITÉAMAÍOCHA A CHUR LEIS NA TUARTHA I SILICO ATÁ BUNAITHE AR AN SEICHEAMH GÉANÓIM; E) A CHINNEADH MARCÓIRÍ FÉIDEARTHA FRIOTAÍOCHT AIGÉAD, CAOINFHULAINGT LE SALAINN BILE AGUS GREAMAITHEACHT MUCIN I LB. PENTOSUS A BHEITH AR AN GHNÉ ÚRSCÉAL EILE NACH BHFUIL AGHAIDH TUGTHA ROIMHE SEO SA SPEICEAS DE PENTOSUS LACTOABACILLUS AGUS SEO A BHUÍOCHAS SIN DO RÉADÚ PROTEOMICS COMPARÁIDEACH. BEIDH NA BITHMHARCÓIRÍ SEO AN-ÚSÁIDEACH DON PHOBAL EOLAÍOCHTA I NGINEARÁLTA AGUS I DTIONSCAIL GO HÁIRITHE TOISC GO LÉIRÍONN SIAD UIRLISÍ ÚSÁIDEACHA CHUN TRÉITHCHINEÁLACHA A BHFUIL ACMHAINNEACHT PROBIOTIC ACU A ROGHNÚ. (Irish)
18 August 2022
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS JE MLÉČNÁ BAKTERIE PŘÍTOMNÁ V FERMENTOVANÝCH POTRAVINÁCH ŽIVOČIŠNÉHO A ROSTLINNÉHO PŮVODU JAKO INICIÁTOR KULTURY NEBO TVOŘÍCÍ SOUČÁST PŮVODNÍ MIKROBIOTY A TAKÉ JAKO POŽIVATEL TRÁVICÍHO TRAKTU ČLOVĚKA A ZVÍŘAT. V POSLEDNÍCH LETECH SE KVŮLI ROSTOUCÍ POPTÁVCE SPOTŘEBITELŮ S NESNÁŠENLIVOSTÍ LAKTÓZY A VEGETARIÁNŮ NĚKOLIK STUDIÍ ZAMĚŘILO NA BAKTERIE IZOLOVANÉ Z ROSTLIN JAKO NOVÉ KANDIDÁTY NA PROBIOTIKA U LIDÍ, ČÍMŽ SE PROLOMILO KLASICKÉ SCHÉMA VĚTŠINY PROBIOTIK DOSTUPNÝCH NA TRHU. NEJVĚTŠÍ VÝHODOU PROBIOTIK IZOLOVANÝCH Z ROSTLINNÝCH POTRAVIN JE JEJICH VELKÁ SCHOPNOST PŘIZPŮSOBIT SE FYZIKÁLNĚ-CHEMICKÝM PODMÍNKÁM PODOBNÝM TĚM, KTERÉ SE VYSKYTUJÍ V LIDSKÉM TRÁVICÍM TRAKTU (EXTRÉMNÍ KYSELOST, VYSOKÁ HLADINA NESTRAVITELNÝCH ŽIVIN A ANTINUTRIČNÍ FAKTORY), KROMĚ DALŠÍCH FUNKČNÍCH VLASTNOSTÍ VYVINUTÝCH V JEJICH EKOSYSTÉMECH. VZHLEDEM K VÝZNAMU MLÉČNÝCH BAKTERIÍ ROSTLINNÉHO PŮVODU JSME V POSLEDNÍCH LETECH IZOLOVALI OD FERMENTACE OLIV ALOREÑA HEŘMÁNEK (JEDINÁ OLIVA CHRÁNĚNÁ NÁZVEM PŮVODU VE ŠPANĚLSKU) NĚKOLIK KMENŮ LACTOBACILLUS PENTOSUS, KTERÉ PROKÁZALY VELKÝ PROBIOTICKÝ POTENCIÁL PROSTŘEDNICTVÍM PŘEDBĚŽNÝCH TESTŮ. HLOUBKOVÁ ANALÝZA PROBIOTICKÝCH VLASTNOSTÍ IN VITRO NÁM UMOŽNÍ PROVÉST PRVNÍ VÝBĚR KMENŮ S NEJLEPŠÍM PROBIOTICKÝM PROFILEM A POKRAČOVAT V PROHLUBOVÁNÍ A CHARAKTERIZACI KMENE NA GENOMICKÉ A PROTEOMICKÉ ÚROVNI. V TOMTO SMYSLU JSOU NAŠE CÍLE STANOVENÉ V TOMTO PROJEKTU FORMULOVÁNY TAKTO: A) VYBRAT KMEN LACTOBACILLUS PENTOSUS SE ZAJÍMAVÝM A ATRAKTIVNÍM PROBIOTICKÝM PROFILEM, KTERÝ POKRÝVÁ RŮZNÉ VLASTNOSTI, JAKO JE KYSELOST A REZISTENCE VŮČI ŽLUČI, SCHOPNOST ADHEZE, AUTOAGREGACION, BEZPEČNOSTNÍ ASPEKTY, RŮST, VÝROBA ANTIMIKROBIÁLNÍCH LÁTEK A DALŠÍ PROSPĚŠNÉ VLASTNOSTI; SEKVENCE ÚPLNÉHO GENOMU VYBRANÉHO KMENE NA ZÁKLADĚ ZKOUŠEK IN VITRO; C) IN SILICO ANALÝZA GENŮ ZAPOJENÝCH DO PROBIOTICKÝCH VLASTNOSTÍ ZVÝRAZŇUJÍCÍCH GENY JIŽ POPSANÉ V LITERATUŘE A GENY NOVÉ ZJIŠTĚNÉ V TOMTO KMENI, KROMĚ ANALÝZY DETERMINANT VIRULENCE PRO HODNOCENÍ BEZPEČNOSTI KMENE; D) POPRVÉ STUDOVAT PROTEOM LACTOBACILLUS PENTOSUS A TÍM I PREDIKCE IN SILICO ODVOZENÉ Z GENOMOVÉ SEKVENCE MOHOU BÝT DOPLNĚNY PROTEOMICKÝMI ÚDAJI; E) URČIT POTENCIÁLNÍ MARKERY KYSELÉ REZISTENCE, TOLERANCE VŮČI ŽLUČOVÝM SOLÍM A PŘILNAVOST K MUCINU V LB. PENTOSUS JE TENTO DALŠÍ NOVÝ ASPEKT, KTERÝ NEBYL DŘÍVE ŘEŠEN U DRUHU LACTOABACILLUS PENTOSUS, A TO DÍKY REALIZACI KOMPARATIVNÍ PROTEOMIKY. TYTO BIOMARKERY BUDOU VELMI UŽITEČNÉ PRO VĚDECKÉ SPOLEČENSTVÍ OBECNĚ A PRO PRŮMYSLOVÁ ODVĚTVÍ, NEBOŤ PŘEDSTAVUJÍ UŽITEČNÉ NÁSTROJE PRO VÝBĚR KMENŮ S PROBIOTICKÝM POTENCIÁLEM. (Czech)
18 August 2022
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS É UMA BACTÉRIA LÁCTICA PRESENTE EM ALIMENTOS LÊVEDOS DE ORIGEM ANIMAL E VEGETAL COMO UMA CULTURA INICIADORA OU FAZENDO PARTE DA MICROBIOTA INDÍGENA, E TAMBÉM COMO UM COMEDOR DO TRATO DIGESTIVO HUMANO E ANIMAL. NOS ÚLTIMOS ANOS, DEVIDO À CRESCENTE NECESSIDADE DE CONSUMIDORES E VEGETARIANOS INTOLERANTES À LACTOSE, VÁRIOS ESTUDOS FOCARAM EM BACTÉRIAS ISOLADAS DE PLANTAS COMO NOVOS CANDIDATOS A PROBIÓTICOS EM HUMANOS, ROMPENDO ASSIM COM O ESQUEMA CLÁSSICO DA MAIORIA DOS PROBIÓTICOS DISPONÍVEIS NO MERCADO. A MAIOR VANTAGEM DOS PROBIÓTICOS ISOLADOS DE ALIMENTOS VEGETAIS É SUA GRANDE CAPACIDADE DE ADAPTAÇÃO A CONDIÇÕES FÍSICO-QUÍMICAS SEMELHANTES ÀS ENCONTRADAS NO TRATO DIGESTIVO HUMANO (ACIDEZ EXTREMA, ALTOS NÍVEIS DE NUTRIENTES NÃO DIGERÍVEIS E FATORES ANTINUTRICIONAIS), ALÉM DE OUTRAS PROPRIEDADES FUNCIONAIS DESENVOLVIDAS EM SEUS ECOSSISTEMAS. DADA A IMPORTÂNCIA DAS BACTÉRIAS LÁCTICAS DE ORIGEM VEGETAL, NOS ÚLTIMOS ANOS TEMOS ISOLADO DA FERMENTAÇÃO DAS AZEITONAS CAMOMILA ALOREÑA (A ÚNICA AZEITONA PROTEGIDA COM O NOME DE ORIGEM EM ESPANHA) VÁRIAS ESTIRPES DE LACTOBACILLUS PENTOSUS QUE DEMONSTRARAM UM GRANDE POTENCIAL PROBIÓTICO ATRAVÉS DE TESTES PRELIMINARES. A ANÁLISE APROFUNDADA DAS PROPRIEDADES PROBIÓTICAS IN VITRO NOS PERMITIRÁ FAZER UMA PRIMEIRA SELEÇÃO DAS CEPAS COM O MELHOR PERFIL PROBIÓTICO E CONTINUAR A APROFUNDAR E CARACTERIZAR A CEPA A NÍVEL GENÔMICO E PROTEÔMICO. NESTE SENTIDO, OS NOSSOS OBJETIVOS ESTABELECIDOS NESTE PROJETO SÃO OS SEGUINTES: A) SELECIONAR UMA ESTIRPE DE LACTOBACILLUS PENTOSUS COM UM PERFIL PROBIÓTICO INTERESSANTE E ATRAENTE QUE CUBRA AS DIFERENTES PROPRIEDADES, TAIS COMO ACIDEZ E RESISTÊNCIA BILIAR, CAPACIDADE DE ADESÃO, AUTOAGREGACION, ASPETOS DE SEGURANÇA, CRESCIMENTO, PRODUÇÃO DE SUBSTÂNCIAS ANTIMICROBIANAS E OUTRAS PROPRIEDADES BENÉFICAS; SEQUÊNCIA DO GENOMA COMPLETO DA ESTIRPE SELECIONADA COM BASE EM ENSAIOS IN VITRO; C) NA ANÁLISE SILICO DOS GENES ENVOLVIDOS NAS PROPRIEDADES PROBIÓTICAS DESTACANDO OS GENES JÁ DESCRITOS NA LITERATURA E OS NOVOS DETETADOS NESSA CEPA, ALÉM DE ANALISAR OS DETERMINANTES DA VIRULÊNCIA PARA AVALIAR A SEGURANÇA DA CEPA; D) ESTUDAR PELA PRIMEIRA VEZ O PROTEOMA DE LACTOBACILLUS PENTOSUS E, ASSIM, AS PREDIÇÕES IN SILICO INFERIDAS A PARTIR DA SEQUÊNCIA GENOMA PODEM SER COMPLEMENTADAS POR DADOS PROTEÔMICOS; E) DETERMINAR POTENCIAIS MARCADORES DE RESISTÊNCIA ÁCIDA, TOLERÂNCIA AOS SAIS BILIARES E ADESÃO À MUCINA EM LB. PENTOSUS SENDO ESTE OUTRO ASPETO NOVO QUE NÃO FOI ABORDADO ANTERIORMENTE NAS ESPÉCIES DE LACTOABACILLUS PENTOSUS E ISSO GRAÇAS À REALIZAÇÃO DA PROTEÔMICA COMPARATIVA. ESTES BIOMARCADORES SERÃO DE GRANDE UTILIDADE PARA A COMUNIDADE CIENTÍFICA EM GERAL E PARA AS INDÚSTRIAS EM PARTICULAR, UMA VEZ QUE REPRESENTAM FERRAMENTAS ÚTEIS PARA A SELEÇÃO DE ESTIRPES COM POTENCIAL PROBIÓTICO. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS ON PIIMHAPPEBAKTERID, MIDA LEIDUB LOOMSET JA TAIMSET PÄRITOLU FERMENTEERITUD TOITUDES INITSIAATORIKULTUURINA VÕI MIS MOODUSTAVAD OSA OMAMAISEST MIKROBIOOTIKUMIST, SAMUTI INIMESE JA LOOMADE SEEDETRAKTI SÖÖJANA. VIIMASTEL AASTATEL ON LAKTOOSITALUMATUTE TARBIJATE JA TAIMETOITLASTE KASVAVA NÕUDLUSE TÕTTU MITMES UURINGUS KESKENDUTUD TAIMEDEST ISOLEERITUD BAKTERITELE UUTE PROBIOOTIKUMIDE KANDIDAATIDENA INIMESTEL, KATKESTADES SEEGA ENAMIKU TURUL SAADAOLEVATE PROBIOOTIKUMIDE KLASSIKALISE SKEEMI. TAIMSETEST TOITUDEST ERALDATUD PROBIOOTIKUMIDE SUURIM EELIS ON NENDE SUUR VÕIME KOHANEDA FÜÜSIKALIS-KEEMILISTE TINGIMUSTEGA, MIS SARNANEVAD INIMESE SEEDETRAKTIS ESINEVATELE TINGIMUSTELE (ÄÄRMINE HAPPESUS, MITTESEEDITAVATE TOITAINETE JA TOITAINETEVASTASTE TEGURITE SUUR SISALDUS) LISAKS MUUDELE FUNKTSIONAALSETELE OMADUSTELE, MIS ON VÄLJA KUJUNENUD NENDE ÖKOSÜSTEEMIDES. ARVESTADES TAIMSET PÄRITOLU PIIMHAPPEBAKTERITE TÄHTSUST, OLEME VIIMASTEL AASTATEL ERALDANUD OLIIVIDE ALOREÑA KUMMELI (AINUS HISPAANIA PÄRITOLUNIMEGA KAITSTUD OLIIVID) KÄÄRITAMISEST MITMED LACTOBACILLUS PENTOSUS’E TÜVED, MILLEL ON EELTESTIDEGA SUUR PROBIOOTILINE POTENTSIAAL. PROBIOOTILISTE OMADUSTE PÕHJALIK ANALÜÜS IN VITRO VÕIMALDAB MEIL TEHA ESIMESE VALIKU PARIMA PROBIOOTILISE PROFIILIGA TÜVEDEST NING JÄTKATA TÜVE SÜVENDAMIST JA ISELOOMUSTAMIST GENOOMILISEL JA PROTEOOMILISEL TASANDIL. SELLES MÕTTES ON MEIE PROJEKTI EESMÄRGID SÕNASTATUD JÄRGMISELT: A) VALIMA LACTOBACILLUS PENTOSUS’E TÜVE, MILLEL ON HUVITAV JA ATRAKTIIVNE PROBIOOTILINE PROFIIL, MIS HÕLMAB ERINEVAID OMADUSI, NAGU HAPPESUS JA SAPIRESISTENTSUS, HAARDUMISVÕIME, AUTOAGREGACION, OHUTUSASPEKTID, KASV, ANTIMIKROOBSETE AINETE TOOTMINE JA MUUD KASULIKUD OMADUSED; VALITUD TÜVE TÄIELIKU GENOOMI JÄRJESTUS IN VITRO KATSETE PÕHJAL; C) PROBIOOTILISTE OMADUSTEGA SEOTUD GEENIDE RÄNIANALÜÜSIS, MILLES TUUAKSE ESILE KIRJANDUSES JUBA KIRJELDATUD GEENID JA SELLES TÜVES AVASTATUD UUED GEENID, LISAKS VIRULENTSUST MÄÄRAVATE TEGURITE ANALÜÜSIMISELE TÜVE OHUTUSE HINDAMISEKS; D) UURIDA ESIMEST KORDA LACTOBACILLUS PENTOSUS’E PROTEOOMI JA SEEGA GENOOMI JÄRJESTUSEST TULETATUD IN SILICO ENNUSTUSI, MIDA SAAB TÄIENDADA PROTEOOMIANDMETEGA; E) MÄÄRATA KINDLAKS HAPPEKINDLUSE, SAPISOOLADE TALUVUSE JA LIMASKESTAGA ADHESIOONI VÕIMALIKUD MARKERID LB-S. PENTOSUS ON TEINE UUDNE ASPEKT, MIDA EI OLE VAREM LACTOABACILLUS PENTOSUS’E LIIGI PUHUL KÄSITLETUD, JA SEDA TÄNU VÕRDLEVA PROTEOOMIKA REALISEERIMISELE. NEED BIOMARKERID ON TEADUSRINGKONDADELE ÜLDISELT JA ERITI TÖÖSTUSHARUDELE VÄGA KASULIKUD, SEST NEED ON KASULIKUD VAHENDID PROBIOOTILISE POTENTSIAALIGA TÜVEDE VALIMISEKS. (Estonian)
18 August 2022
0 references
A LACTOBACILLUS PENTOSUS OLYAN TEJSAVBAKTÉRIUM, AMELY AZ ÁLLATI ÉS NÖVÉNYI EREDETŰ ERJESZTETT ÉLELMISZEREKBEN KEZDEMÉNYEZŐ KULTÚRAKÉNT VAGY AZ ŐSHONOS MIKROBIÓTA RÉSZÉT KÉPEZI, VALAMINT AZ EMBERI ÉS ÁLLATI EMÉSZTŐRENDSZER EVŐJEKÉNT IS JELEN VAN. AZ ELMÚLT ÉVEKBEN A LAKTÓZ INTOLERÁNS FOGYASZTÓK ÉS VEGETÁRIÁNUSOK NÖVEKVŐ KERESLETE MIATT SZÁMOS TANULMÁNY A NÖVÉNYEKBŐL IZOLÁLT BAKTÉRIUMOKRA ÖSSZPONTOSÍTOTT, AMELYEK AZ EMBEREK PROBIOTIKUMAINAK ÚJ JELÖLTJEI VOLTAK, EZZEL MEGSZAKÍTVA A PIACON ELÉRHETŐ LEGTÖBB PROBIOTIKUM KLASSZIKUS RENDSZERÉT. A NÖVÉNYI ÉLELMISZEREKBŐL IZOLÁLT PROBIOTIKUMOK LEGNAGYOBB ELŐNYE, HOGY KÉPESEK ALKALMAZKODNI AZ EMBERI EMÉSZTŐRENDSZERBEN TAPASZTALTAKHOZ HASONLÓ FIZIKAI-KÉMIAI KÖRÜLMÉNYEKHEZ (EXTRÉM SAVASSÁG, MAGAS SZINTŰ NEM EMÉSZTHETŐ TÁPANYAGOK ÉS TÁPLÁLKOZÁSELLENES TÉNYEZŐK) AZ ÖKOSZISZTÉMÁJUKBAN KIFEJLESZTETT EGYÉB FUNKCIONÁLIS TULAJDONSÁGOK MELLETT. TEKINTETTEL A NÖVÉNYI EREDETŰ TEJSAVBAKTÉRIUMOK JELENTŐSÉGÉRE, AZ UTÓBBI ÉVEKBEN AZ ALOREÑA KAMILLA OLAJBOGYÓ (AZ EGYETLEN OLYAN OLAJBOGYÓ, AMELY SPANYOLORSZÁGBAN OLTALOM ALATT ÁLL A SZÁRMAZÁSI NÉVVEL) ERJESZTÉSÉTŐL TÖBB LACTOBACILLUS PENTOSUS TÖRZSET KÜLÖNÍTETTÜNK EL, AMELYEK ELŐZETES VIZSGÁLATOK RÉVÉN NAGY PROBIOTIKUS POTENCIÁLT MUTATTAK. A PROBIOTIKUS TULAJDONSÁGOK RÉSZLETES ELEMZÉSE IN VITRO LEHETŐVÉ TESZI SZÁMUNKRA, HOGY A LEGJOBB PROBIOTIKUS PROFILLAL RENDELKEZŐ TÖRZSEKET ELŐSZÖR VÁLASSZUK KI, ÉS TOVÁBB MÉLYÍTSÜK ÉS JELLEMEZZÜK A TÖRZSET GENOMIKUS ÉS PROTEOMIKUS SZINTEN. EBBEN AZ ÉRTELEMBEN A PROJEKTBEN MEGHATÁROZOTT CÉLKITŰZÉSEK A KÖVETKEZŐK: A) VÁLASSZON EGY LACTOBACILLUS PENTOSUS TÖRZSET ÉRDEKES ÉS VONZÓ PROBIOTIKUS PROFILLAL, AMELY LEFEDI AZ OLYAN KÜLÖNBÖZŐ TULAJDONSÁGOKAT, MINT A SAVASSÁG ÉS AZ EPE REZISZTENCIA, A TAPADÁSI KÉPESSÉG, AZ AUTOAGREGACION, A BIZTONSÁGI SZEMPONTOK, A NÖVEKEDÉS, AZ ANTIMIKROBIÁLIS ANYAGOK ELŐÁLLÍTÁSA ÉS EGYÉB ELŐNYÖS TULAJDONSÁGOK; A KIVÁLASZTOTT TÖRZS TELJES GENOMJÁNAK SORRENDJE IN VITRO VIZSGÁLATOK ALAPJÁN; C) A PROBIOTIKUS TULAJDONSÁGOKBAN RÉSZT VEVŐ GÉNEK IN SILICO ELEMZÉSE, KIEMELVE A SZAKIRODALOMBAN MÁR LEÍRT GÉNEKET ÉS AZ EBBEN A TÖRZSBEN ÉSZLELT ÚJ GÉNEKET, A TÖRZS BIZTONSÁGOSSÁGÁNAK ÉRTÉKELÉSE CÉLJÁBÓL A VIRULENCIA MEGHATÁROZÓ TÉNYEZŐINEK ELEMZÉSE MELLETT; D) ELŐSZÖR TANULMÁNYOZZA A LACTOBACILLUS PENTOSUS PROTEOMJÁT, ÉS ÍGY A GENOMSZEKVENCIÁBÓL SZÁRMAZÓ IN SILICO ELŐREJELZÉSEKET PROTEOMIKUS ADATOKKAL EGÉSZÍTHETI KI; E) MEGHATÁROZZA A SAVÁLLÓSÁG LEHETSÉGES MARKEREIT, AZ EPESÓKKAL SZEMBENI TOLERANCIÁT ÉS A MUCINHOZ VALÓ TAPADÁST LB-BEN. A PENTOSUS EZ A MÁSIK ÚJ SZEMPONT, AMELLYEL KORÁBBAN NEM FOGLALKOZTAK A LACTOABACILLUS PENTOSUS FAJAIBAN, ÉS EZ AZ ÖSSZEHASONLÍTÓ PROTEOMIKA FELISMERÉSÉNEK KÖSZÖNHETŐ. EZEK A BIOMARKEREK ÁLTALÁBAN NAGY HASZNÁRA LESZNEK A TUDOMÁNYOS KÖZÖSSÉGNEK ÉS KÜLÖNÖSEN AZ IPARNAK, MIVEL HASZNOS ESZKÖZÖKET JELENTENEK A PROBIOTIKUS POTENCIÁLLAL RENDELKEZŐ TÖRZSEK KIVÁLASZTÁSÁHOZ. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS Е МЛЕЧНА БАКТЕРИЯ, ПРИСЪСТВАЩА В ФЕРМЕНТИРАЛИ ХРАНИ ОТ ЖИВОТИНСКИ И РАСТИТЕЛЕН ПРОИЗХОД КАТО ИНИЦИАТОР ИЛИ ЧАСТ ОТ МЕСТНАТА МИКРОБИОТА, А СЪЩО И КАТО ХРАНА НА ХРАНОСМИЛАТЕЛНИЯ ТРАКТ НА ЧОВЕКА И ЖИВОТНИТЕ. ПРЕЗ ПОСЛЕДНИТЕ ГОДИНИ, ПОРАДИ НАРАСТВАЩОТО ТЪРСЕНЕ ОТ СТРАНА НА ПОТРЕБИТЕЛИТЕ С НЕПОНОСИМОСТ КЪМ ЛАКТОЗА И ВЕГЕТАРИАНЦИТЕ, НЯКОЛКО ПРОУЧВАНИЯ СЕ ФОКУСИРАТ ВЪРХУ БАКТЕРИИТЕ, ИЗОЛИРАНИ ОТ РАСТЕНИЯТА КАТО НОВИ КАНДИДАТИ ЗА ПРОБИОТИЦИ ПРИ ХОРАТА, КАТО ПО ТОЗИ НАЧИН СЕ НАРУШАВА КЛАСИЧЕСКАТА СХЕМА НА ПОВЕЧЕТО ПРОБИОТИЦИ, ПРЕДЛАГАНИ НА ПАЗАРА. НАЙ-ГОЛЯМОТО ПРЕДИМСТВО НА ПРОБИОТИЦИ, ИЗОЛИРАНИ ОТ РАСТИТЕЛНИ ХРАНИ, Е ГОЛЯМАТА ИМ СПОСОБНОСТ ДА СЕ АДАПТИРАТ КЪМ ФИЗИКОХИМИЧНИ УСЛОВИЯ, ПОДОБНИ НА ТЕЗИ, КОИТО СЕ СРЕЩАТ В ЧОВЕШКИЯ ХРАНОСМИЛАТЕЛЕН ТРАКТ (ЕКСТРЕМНА КИСЕЛИННОСТ, ВИСОКИ НИВА НА НЕСМИЛАЕМИ ХРАНИТЕЛНИ ВЕЩЕСТВА И АНТИХРАНИТЕЛНИ ФАКТОРИ) В ДОПЪЛНЕНИЕ КЪМ ДРУГИ ФУНКЦИОНАЛНИ СВОЙСТВА, РАЗРАБОТЕНИ В ТЕХНИТЕ ЕКОСИСТЕМИ. ПРЕДВИД ЗНАЧЕНИЕТО НА МЛЕЧНИТЕ БАКТЕРИИ ОТ РАСТИТЕЛЕН ПРОИЗХОД, ПРЕЗ ПОСЛЕДНИТЕ ГОДИНИ ИЗОЛИРАХМЕ ОТ ФЕРМЕНТАЦИЯТА НА МАСЛИНИТЕ ЛАЙКА ALOREÑA (ЕДИНСТВЕНАТА МАСЛИНА, КОЯТО Е ЗАЩИТЕНА С НАИМЕНОВАНИЕ ЗА ПРОИЗХОД В ИСПАНИЯ) НЯКОЛКО ЩАМА LACTOBACILLUS PENTOSUS, КОИТО ПОКАЗАХА ГОЛЯМ ПРОБИОТИЧЕН ПОТЕНЦИАЛ ЧРЕЗ ПРЕДВАРИТЕЛНИ ТЕСТОВЕ. ЗАДЪЛБОЧЕНИЯТ АНАЛИЗ НА ПРОБИОТИЧНИТЕ СВОЙСТВА IN VITRO ЩЕ НИ ПОЗВОЛИ ДА НАПРАВИМ ПЪРВА СЕЛЕКЦИЯ НА ЩАМОВЕТЕ С НАЙ-ДОБЪР ПРОБИОТИЧЕН ПРОФИЛ И ДА ПРОДЪЛЖИМ ДА ЗАДЪЛБОЧАВАМЕ И ХАРАКТЕРИЗИРАМЕ ЩАМА НА ГЕНОМНО И ПРОТЕОМНО НИВО. В ТОЗИ СМИСЪЛ ЗАЛОЖЕНИТЕ В НАСТОЯЩИЯ ПРОЕКТ ЦЕЛИ СА ФОРМУЛИРАНИ ПО СЛЕДНИЯ НАЧИН: А) ИЗБЕРЕТЕ ЩАМ НА LACTOBACILLUS PENTOSUS С ИНТЕРЕСЕН И АТРАКТИВЕН ПРОБИОТИЧЕН ПРОФИЛ, ПОКРИВАЩ РАЗЛИЧНИТЕ СВОЙСТВА КАТО КИСЕЛИННОСТ И ЖЛЪЧНА РЕЗИСТЕНТНОСТ, АДХЕЗИЯ, AUTOAGREGACION, АСПЕКТИ НА БЕЗОПАСНОСТТА, РАСТЕЖ, ПРОИЗВОДСТВО НА АНТИМИКРОБНИ ВЕЩЕСТВА И ДРУГИ ПОЛЕЗНИ СВОЙСТВА; ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТТА НА ПЪЛНИЯ ГЕНОМ НА ИЗБРАНИЯ ЩАМ ВЪЗ ОСНОВА НА IN VITRO ИЗПИТВАНИЯ; В) В СИЛИКО АНАЛИЗ НА ГЕНИТЕ, УЧАСТВАЩИ В ПРОБИОТИЧНИТЕ СВОЙСТВА, ПОДЧЕРТАВАЩИ ГЕНИТЕ, КОИТО ВЕЧЕ СА ОПИСАНИ В ЛИТЕРАТУРАТА, И ТЕЗИ НОВИ, ОТКРИТИ В ТОЗИ ЩАМ, В ДОПЪЛНЕНИЕ КЪМ АНАЛИЗА НА ДЕТЕРМИНАНТИТЕ НА ВИРУЛЕНТНОСТТА, ЗА ДА СЕ ОЦЕНИ БЕЗОПАСНОСТТА НА ЩАМА; Г) ДА ИЗСЛЕДВА ЗА ПЪРВИ ПЪТ ПРОТЕОМ НА LACTOBACILLUS PENTOSUS И ПО ТОЗИ НАЧИН IN SILICO ПРОГНОЗИ, ИЗВЕДЕНИ ОТ ГЕНОМНАТА ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТ, МОГАТ ДА БЪДАТ ДОПЪЛНЕНИ С ПРОТЕОМНИ ДАННИ; Д) ОПРЕДЕЛЕТЕ ПОТЕНЦИАЛНИ МАРКЕРИ ЗА КИСЕЛИННА УСТОЙЧИВОСТ, ПОНОСИМОСТ КЪМ ЖЛЪЧНИТЕ СОЛИ И АДХЕЗИЯ КЪМ МУЦИН В LB. ПЕНТОСЪТ Е ТОЗИ ДРУГ НОВ АСПЕКТ, КОЙТО НЕ Е БИЛ РАЗГЛЕЖДАН ПО-РАНО ПРИ ВИДА LACTOABACILLUS PENTOSUS И ТОВА СЕ ДЪЛЖИ НА РЕАЛИЗАЦИЯТА НА СРАВНИТЕЛНАТА ПРОТЕОМИКА. ТЕЗИ БИОМАРКЕРИ ЩЕ БЪДАТ ОТ ГОЛЯМА ПОЛЗА ЗА НАУЧНАТА ОБЩНОСТ КАТО ЦЯЛО И ЗА ПРОМИШЛЕНОСТТА В ЧАСТНОСТ, ТЪЙ КАТО ПРЕДСТАВЛЯВАТ ПОЛЕЗНИ ИНСТРУМЕНТИ ЗА ПОДБОР НА ЩАМОВЕ С ПРОБИОТИЧЕН ПОТЕНЦИАЛ. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS YRA PIENO BAKTERIJOS, ESANČIOS FERMENTUOTUOSE GYVŪNINĖS IR AUGALINĖS KILMĖS MAISTO PRODUKTUOSE KAIP INICIATORIUS ARBA VIETINĖS MIKROBIOTOS DALIS, TAIP PAT KAIP ŽMOGAUS IR GYVŪNŲ VIRŠKINAMOJO TRAKTO VALGYTOJAS. PASTARAISIAIS METAIS DĖL DIDĖJANČIOS LAKTOZĖS NETOLERUOJANČIŲ VARTOTOJŲ IR VEGETARŲ PAKLAUSOS KELIUOSE TYRIMUOSE DAUGIAUSIA DĖMESIO BUVO SKIRIAMA IŠ AUGALŲ IŠSKIRTOMS BAKTERIJOMS KAIP NAUJIEMS ŽMONĖMS PROBIOTIKŲ KANDIDATAMS, TAIP PAŽEIDŽIANT KLASIKINĘ DAUGUMOS RINKOJE ESANČIŲ PROBIOTIKŲ SCHEMĄ. DIDŽIAUSIAS PROBIOTIKŲ, IŠSKIRTŲ IŠ AUGALINIŲ MAISTO PRODUKTŲ, PRIVALUMAS YRA JŲ PUIKUS GEBĖJIMAS PRISITAIKYTI PRIE FIZINIŲ-CHEMINIŲ SĄLYGŲ, PANAŠIŲ Į TAS, KURIOS RANDAMOS ŽMOGAUS VIRŠKINIMO TRAKTE (YPATINGAS RŪGŠTINGUMAS, DIDELIS NEVIRŠKINAMŲ MAISTINIŲ MEDŽIAGŲ KIEKIS IR ANTI-MITYBOS VEIKSNIAI), BE KITŲ FUNKCINIŲ SAVYBIŲ, ATSIRADUSIŲ JŲ EKOSISTEMOSE. ATSIŽVELGIANT Į AUGALINĖS KILMĖS PIENO BAKTERIJŲ SVARBĄ, PASTARAISIAIS METAIS NUO ALYVUOGIŲ ALOREÑA RAMUNĖLIŲ (VIENINTELĖS ISPANIJOJE SAUGOMOS KILMĖS VIETOS NUORODOS) FERMENTACIJOS IŠSKIRTI KELI LACTOBACILLUS PENTOSUS ŠTAMAI, KURIE, ATLIKUS IŠANKSTINIUS TYRIMUS, PARODĖ DIDELĮ PROBIOTINĮ POTENCIALĄ. IŠSAMI PROBIOTINIŲ SAVYBIŲ ANALIZĖ IN VITRO LEIS MUMS PIRMĄ KARTĄ ATRINKTI ŠTAMUS, TURINČIUS GERIAUSIĄ PROBIOTIKĄ, IR TOLIAU GILINTI IR APIBŪDINTI PADERMĘ GENOMINIU IR PROTEOMINIU LYGIU. ŠIUO POŽIŪRIU ŠIAME PROJEKTE IŠDĖSTYTI TIKSLAI SUFORMULUOTI TAIP: A) PASIRINKTI LACTOBACILLUS PENTOSUS PADERMĘ, TURINČIĄ ĮDOMŲ IR PATRAUKLŲ PROBIOTIKŲ PROFILĮ, APIMANČIĄ ĮVAIRIAS SAVYBES, TOKIAS KAIP RŪGŠTINGUMAS IR ATSPARUMAS TULŽIUI, SUKIBIMO PAJĖGUMAS, AUTOAGREGACION, SAUGOS ASPEKTAI, AUGIMAS, ANTIMIKROBINIŲ MEDŽIAGŲ GAMYBA IR KITOS NAUDINGOS SAVYBĖS; VISO PASIRINKTOS PADERMĖS GENOMO SEKA REMIANTIS IN VITRO TYRIMAIS; C) GENŲ, SUSIJUSIŲ SU PROBIOTINĖMIS SAVYBĖMIS, ANALIZĖ SILIKOZE, PABRĖŽIANT LITERATŪROJE JAU APRAŠYTUS GENUS IR NAUJUS ŠIOJE PADERMĖJE APTIKTUS GENUS, BE VIRULENTIŠKUMO LEMIANČIŲ VEIKSNIŲ ANALIZĖS, SIEKIANT ĮVERTINTI PADERMĖS SAUGUMĄ; D) PIRMĄ KARTĄ IŠTIRTI LACTOBACILLUS PENTOSUS PROTEOMĄ IR TODĖL IN SILICO PROGNOZĖS, IŠVESTOS IŠ GENOMO SEKOS, GALI BŪTI PAPILDYTOS PROTEOMINIAIS DUOMENIMIS; E) NUSTATYTI GALIMUS ATSPARUMO RŪGŠČIAI ŽYMENIS, TOLERANCIJĄ TULŽIES DRUSKOMS IR SUKIBIMĄ SU MUCINU LB. TAI YRA KITAS NAUJAS ASPEKTAS, KURIS ANKSČIAU NEBUVO SPRENDŽIAMAS LACTOABACILLUS PENTOSUS RŪŠIMS, IR TAI DĖL LYGINAMOSIOS PROTEOMIKOS REALIZAVIMO. ŠIE BIOLOGINIAI ŽYMENYS BUS LABAI NAUDINGI MOKSLO BENDRUOMENEI APSKRITAI IR YPAČ PRAMONĖS ŠAKOMS, NES JIE YRA NAUDINGOS PROBIOTINIO POTENCIALO ATMAINŲ ATRANKOS PRIEMONĖS. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS JE MLIJEČNA BAKTERIJA PRISUTNA U FERMENTIRANOJ HRANI ŽIVOTINJSKOG I BILJNOG PODRIJETLA KAO POKRETAČKA KULTURA ILI ČINI DIO AUTOHTONE MIKROBIOTE, A TAKOĐER I KAO JEDEČ LJUDSKOG I ŽIVOTINJSKOG PROBAVNOG TRAKTA. POSLJEDNJIH GODINA, ZBOG SVE VEĆE POTRAŽNJE POTROŠAČA I VEGETARIJANACA KOJI NE PODNOSE LAKTOZU, NEKOLIKO STUDIJA BILO JE USMJERENO NA BAKTERIJE IZOLIRANE IZ BILJAKA KAO NOVE KANDIDATE ZA PROBIOTICE KOD LJUDI, ČIME SE PREKIDA KLASIČNA SHEMA VEĆINE PROBIOTIKA DOSTUPNIH NA TRŽIŠTU. NAJVEĆA PREDNOST PROBIOTIKA IZOLIRANIH IZ BILJNE HRANE JE NJIHOVA VELIKA SPOSOBNOST PRILAGODBE FIZIKALNO-KEMIJSKIM UVJETIMA SLIČNIM ONIMA U LJUDSKOM PROBAVNOM TRAKTU (EKSTREMNA KISELOST, VISOKE RAZINE NEPROBAVLJIVIH HRANJIVIH TVARI I ANTI-NUTRITIVNI ČIMBENICI) UZ DRUGA FUNKCIONALNA SVOJSTVA RAZVIJENA U NJIHOVIM EKOSUSTAVIMA. S OBZIROM NA VAŽNOST MLIJEČNIH BAKTERIJA BILJNOG PODRIJETLA, POSLJEDNJIH SMO GODINA IZ FERMENTACIJE MASLINA ALOREÑA KAMILICE (JEDINE MASLINE KOJA JE ZAŠTIĆENA NAZIVOM PODRIJETLA U ŠPANJOLSKOJ) IZDVOJILI NEKOLIKO SOJEVA BAKTERIJE LACTOBACILLUS PENTOSUS KOJI SU PRELIMINARNIM ISPITIVANJIMA POKAZALI VELIK PROBIOTIČKI POTENCIJAL. DUBINSKA ANALIZA PROBIOTIČKIH SVOJSTAVA IN VITRO OMOGUĆIT ĆE NAM DA NAPRAVIMO PRVI IZBOR SOJEVA S NAJBOLJIM PROBIOTIČKIM PROFILOM I DA NASTAVIMO PRODUBLJIVATI I KARAKTERIZIRATI SOJ NA GENOMSKOJ I PROTEOMSKOJ RAZINI. U TOM SMISLU NAŠI CILJEVI UTVRĐENI U OVOM PROJEKTU OBLIKOVANI SU KAKO SLIJEDI: A) ODABRATI SOJ LACTOBACILLUS PENTOSUS SA ZANIMLJIVIM I ATRAKTIVNIM PROBIOTIČKIM PROFILOM KOJI OBUHVAĆA RAZLIČITA SVOJSTVA KAO ŠTO SU KISELOST I OTPORNOST NA ŽUČ, KAPACITET PRIANJANJA, AUTOAGREGACION, SIGURNOSNI ASPEKTI, RAST, PROIZVODNJA ANTIMIKROBNIH TVARI I DRUGA KORISNA SVOJSTVA; SLIJED CIJELOG GENOMA ODABRANOG SOJA NA TEMELJU IN VITRO ISPITIVANJA; C) IN SILICO ANALIZA GENA UKLJUČENIH U PROBIOTIČKA SVOJSTVA ISTIČUĆI GENE KOJI SU VEĆ OPISANI U LITERATURI I ONE NOVE OTKRIVENE U OVOM SOJU, UZ ANALIZU ODREDNICA VIRULENCIJE ZA PROCJENU SIGURNOSTI SOJA; D) DA SE PRVI PUT ISPITA PROTEOM LACTOBACILLUS PENTOSUS, A TIME I PREDVIĐANJA IN SILICO IZVEDENA IZ GENOMSKE SEKVENCE MOGU SE DOPUNITI PROTEOMSKIM PODACIMA; E) ODREDITI POTENCIJALNE MARKERE OTPORNOSTI NA KISELINE, TOLERANCIJU NA ŽUČNE SOLI I PRIANJANJE NA MUCIN U LB. PENTOSUS JE TAJ DRUGI NOVI ASPEKT KOJI SE PRIJE NIJE RAZMATRAO U VRSTI LACTOABACILLUS PENTOSUS I TO ZAHVALJUJUĆI REALIZACIJI KOMPARATIVNE PROTEOMIKE. TI BIOMARKERI BIT ĆE OD VELIKE KORISTI ZA ZNANSTVENU ZAJEDNICU OPĆENITO I INDUSTRIJE, POSEBNO JER PREDSTAVLJAJU KORISNE ALATE ZA ODABIR SOJEVA S PROBIOTIČKIM POTENCIJALOM. (Croatian)
18 August 2022
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS ÄR EN MJÖLKSYRABAKTERIER SOM FINNS I FERMENTERADE LIVSMEDEL AV ANIMALISKT OCH VEGETABILISKT URSPRUNG SOM EN INITIATORKULTUR ELLER SOM EN DEL AV DEN INHEMSKA MIKROBIOTAN, OCH ÄVEN SOM EN ÄTARE I MÄNNISKANS OCH DJURS MAG-TARMKANAL. UNDER DE SENASTE ÅREN, PÅ GRUND AV DEN ÖKANDE EFTERFRÅGAN FRÅN LAKTOSINTOLERANTA KONSUMENTER OCH VEGETARIANER, FOKUSERADE FLERA STUDIER PÅ BAKTERIER ISOLERADE FRÅN VÄXTER SOM NYA KANDIDATER FÖR PROBIOTIKA HOS MÄNNISKOR, VILKET BRYTER MED DET KLASSISKA SYSTEMET MED DE FLESTA PROBIOTIKA SOM FINNS PÅ MARKNADEN. DEN STÖRSTA FÖRDELEN MED PROBIOTIKA ISOLERADE FRÅN VÄXTLIVSMEDEL ÄR DERAS STORA FÖRMÅGA ATT ANPASSA SIG TILL FYSIKALISK-KEMISKA FÖRHÅLLANDEN LIKNANDE DEM SOM FINNS I MÄNNISKANS MAG-TARMKANAL (EXTREM SURHETSGRAD, HÖGA HALTER AV ICKE-SMÄLTBARA NÄRINGSÄMNEN OCH ANTI-NÄRINGSFAKTORER) UTÖVER ANDRA FUNKTIONELLA EGENSKAPER SOM UTVECKLATS I DERAS EKOSYSTEM. MED TANKE PÅ BETYDELSEN AV MJÖLKBAKTERIERNA AV VEGETABILISKT URSPRUNG HAR VI UNDER DE SENASTE ÅREN ISOLERAT OSS FRÅN JÄSNINGEN AV OLIVERNA ALOREÑA KAMOMILL (DEN ENDA OLIVOLJA SOM ÄR SKYDDAD MED NAMNET PÅ URSPRUNGET I SPANIEN) FLERA STAMMAR AV LACTOBACILLUS PENTOSUS SOM HAR VISAT EN STOR PROBIOTISK POTENTIAL GENOM PRELIMINÄRA TESTER. DEN DJUPGÅENDE ANALYSEN AV DE PROBIOTISKA EGENSKAPERNA IN VITRO GÖR DET MÖJLIGT FÖR OSS ATT GÖRA ETT FÖRSTA URVAL AV STAMMARNA MED DEN BÄSTA PROBIOTISKA PROFILEN OCH ATT FORTSÄTTA ATT FÖRDJUPA OCH KARAKTERISERA STAMMEN PÅ GENOMISK OCH PROTEOMISK NIVÅ. I DETTA AVSEENDE ÄR VÅRA MÅL SOM ANGES I DETTA PROJEKT UTFORMADE PÅ FÖLJANDE SÄTT: A) VÄLJA EN STAM AV LACTOBACILLUS PENTOSUS MED EN INTRESSANT OCH ATTRAKTIV PROBIOTISK PROFIL SOM TÄCKER DE OLIKA EGENSKAPERNA SÅSOM SURHET OCH GALLRESISTENS, VIDHÄFTNINGSFÖRMÅGA, AUTOAGREGACION, SÄKERHETSASPEKTER, TILLVÄXT, PRODUKTION AV ANTIMIKROBIELLA ÄMNEN OCH ANDRA FÖRDELAKTIGA EGENSKAPER, SEKVENSEN AV HELA GENOMET FÖR DEN VALDA STAMMEN BASERAT PÅ IN VITRO-TESTER. C) I SILICOANALYS AV DE GENER SOM ÄR INVOLVERADE I DE PROBIOTISKA EGENSKAPERNA SOM BELYSER DE GENER SOM REDAN BESKRIVITS I LITTERATUREN OCH DE NYA SOM PÅVISATS I DENNA STAM, FÖRUTOM ATT ANALYSERA BESTÄMNINGSFAKTORERNA FÖR VIRULENS FÖR ATT UTVÄRDERA STAMMENS SÄKERHET, D) ATT FÖR FÖRSTA GÅNGEN STUDERA PROTEOMEN AV LACTOBACILLUS PENTOSUS OCH DÄRMED KAN IN SILICO- FÖRUTSÄGELSERNA SOM HÄRLEDS FRÅN GENOMSEKVENSEN KOMPLETTERAS MED PROTEOMISKA DATA. E) BESTÄM POTENTIELLA MARKÖRER FÖR SYRARESISTENS, TOLERANS MOT GALLSALTER OCH VIDHÄFTNING TILL MUCIN I LB. PENTOSUS ÄR DENNA ANDRA NYA ASPEKT SOM INTE HAR BEHANDLATS TIDIGARE I ARTEN LACTOABACILLUS PENTOSUS OCH DETTA TACK VARE FÖRVERKLIGANDET AV JÄMFÖRANDE PROTEOMIK. DESSA BIOMARKÖRER KOMMER ATT VARA TILL STOR NYTTA FÖR DEN VETENSKAPLIGA GEMENSKAPEN I ALLMÄNHET OCH FÖR INDUSTRIN I SYNNERHET EFTERSOM DE UTGÖR ANVÄNDBARA VERKTYG FÖR ATT VÄLJA UT STAMMAR MED PROBIOTISK POTENTIAL. (Swedish)
18 August 2022
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS ESTE O BACTERIE LACTICĂ PREZENTĂ ÎN ALIMENTELE FERMENTATE DE ORIGINE ANIMALĂ ȘI VEGETALĂ CA CULTURĂ INIȚIATOARE SAU CARE FACE PARTE DIN MICROBIOTA INDIGENĂ ȘI, DE ASEMENEA, CA MÂNCĂTOR AL TRACTULUI DIGESTIV UMAN ȘI ANIMAL. ÎN ULTIMII ANI, DATORITĂ CERERII TOT MAI MARI DIN PARTEA CONSUMATORILOR INTOLERANȚI LA LACTOZĂ ȘI A VEGETARIENILOR, MAI MULTE STUDII S-AU CONCENTRAT ASUPRA BACTERIILOR IZOLATE DIN PLANTE CA NOI CANDIDAȚI PENTRU PROBIOTICE LA OM, RUPÂNDU-SE ASTFEL CU SCHEMA CLASICĂ A MAJORITĂȚII PROBIOTICELOR DISPONIBILE PE PIAȚĂ. CEL MAI MARE AVANTAJ AL PROBIOTICELOR IZOLATE DIN ALIMENTELE VEGETALE ESTE CAPACITATEA LOR MARE DE A SE ADAPTA LA CONDIȚII FIZICO-CHIMICE SIMILARE CELOR DIN TRACTUL DIGESTIV UMAN (ACIDITATE EXTREMĂ, NIVELURI RIDICATE DE NUTRIENȚI NEDIGERABILI ȘI FACTORI ANTINUTRIȚIONALI), ÎN PLUS FAȚĂ DE ALTE PROPRIETĂȚI FUNCȚIONALE DEZVOLTATE ÎN ECOSISTEMELE LOR. AVÂND ÎN VEDERE IMPORTANȚA BACTERIILOR LACTICE DE ORIGINE VEGETALĂ, ÎN ULTIMII ANI AM IZOLAT DE FERMENTAREA MĂSLINELOR ALOREÑA MUȘEȚEL (SINGURA MĂSLINE PROTEJATĂ CU DENUMIRE DE ORIGINE SPANIOLĂ) MAI MULTE TULPINI DE LACTOBACILLUS PENTOSUS CARE AU DEMONSTRAT UN POTENȚIAL PROBIOTIC RIDICAT PRIN TESTE PRELIMINARE. ANALIZA APROFUNDATĂ A PROPRIETĂȚILOR PROBIOTICE IN VITRO NE VA PERMITE SĂ FACEM O PRIMĂ SELECȚIE A TULPINILOR CU CEL MAI BUN PROFIL PROBIOTIC ȘI SĂ CONTINUĂM SĂ APROFUNDĂM ȘI SĂ CARACTERIZĂM TULPINA LA NIVEL GENOMIC ȘI PROTEOMIC. ÎN ACEST SENS, OBIECTIVELE STABILITE ÎN ACEST PROIECT SUNT FORMULATE DUPĂ CUM URMEAZĂ: A) SELECTAȚI O TULPINĂ DE LACTOBACILLUS PENTOSUS CU UN PROFIL PROBIOTIC INTERESANT ȘI ATRACTIV CARE ACOPERĂ DIFERITE PROPRIETĂȚI, CUM AR FI ACIDITATEA ȘI REZISTENȚA BILIARĂ, CAPACITATEA DE ADERENȚĂ, AUTOAGREGACION, ASPECTE DE SIGURANȚĂ, CREȘTERE, PRODUCEREA DE SUBSTANȚE ANTIMICROBIENE ȘI ALTE PROPRIETĂȚI BENEFICE; SECVENȚA GENOMULUI COMPLET AL TULPINII SELECTATE PE BAZA TESTELOR IN VITRO; C) ANALIZA ÎN SILICO A GENELOR IMPLICATE ÎN PROPRIETĂȚILE PROBIOTICE CARE EVIDENȚIAZĂ GENELE DEJA DESCRISE ÎN LITERATURA DE SPECIALITATE ȘI CELE NOI DETECTATE ÎN ACEASTĂ TULPINĂ, PE LÂNGĂ ANALIZAREA FACTORILOR DETERMINANȚI AI VIRULENȚEI PENTRU EVALUAREA SIGURANȚEI TULPINII; D) SĂ STUDIEZE PENTRU PRIMA DATĂ PROTEOMUL LACTOBACILLUS PENTOSUS ȘI ASTFEL PREDICȚIILE IN SILICO DEDUSE DIN SECVENȚA GENOMULUI POT FI COMPLETATE CU DATE PROTEOMICE; E) DETERMINĂ MARKERII POTENȚIALI AI REZISTENȚEI ACIDE, TOLERANȚEI LA SĂRURILE BILIARE ȘI ADERENȚEI LA MUCINĂ ÎN LB. PENTOSUS FIIND ACEST ALT ASPECT NOU CARE NU A FOST ABORDAT ANTERIOR ÎN SPECIA LACTOABACILLUS PENTOSUS ȘI ACEST LUCRU DATORITĂ REALIZĂRII PROTEOMICII COMPARATIVE. ACEȘTI BIOMARKERI VOR FI DE MARE FOLOS COMUNITĂȚII ȘTIINȚIFICE ÎN GENERAL ȘI INDUSTRIILOR, ÎN SPECIAL DEOARECE REPREZINTĂ INSTRUMENTE UTILE PENTRU SELECTAREA TULPINILOR CU POTENȚIAL PROBIOTIC. (Romanian)
18 August 2022
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS JE MLEČNA BAKTERIJA, KI JE PRISOTNA V FERMENTIRANIH ŽIVILIH ŽIVALSKEGA IN RASTLINSKEGA IZVORA KOT ZAČETNA KULTURA ALI DEL AVTOHTONE MIKROBIOTE, PA TUDI KOT JEDEC ČLOVEŠKEGA IN ŽIVALSKEGA PREBAVNEGA TRAKTA. V ZADNJIH LETIH SE JE ZARADI NARAŠČAJOČEGA POVPRAŠEVANJA POTROŠNIKOV IN VEGETARIJANCEV, KI NE PRENAŠAJO LAKTOZE, VEČ ŠTUDIJ OSREDOTOČILO NA BAKTERIJE, IZOLIRANE IZ RASTLIN, KOT NOVE KANDIDATE ZA PROBIOTIKE PRI LJUDEH, S ČIMER SE JE PREKINILA KLASIČNA SHEMA VEČINE PROBIOTIKOV, KI SO NA VOLJO NA TRGU. NAJVEČJA PREDNOST PROBIOTIKOV, IZOLIRANIH IZ RASTLINSKIH ŽIVIL, JE NJIHOVA VELIKA SPOSOBNOST PRILAGAJANJA FIZIKALNO-KEMIJSKIM RAZMERAM, PODOBNIM TISTIM V ČLOVEŠKEM PREBAVNEM TRAKTU (EKSTREMNA KISLOST, VISOKE RAVNI NEPREBAVLJIVIH HRANIL IN PROTINUTRITIVNI DEJAVNIKI), POLEG DRUGIH FUNKCIONALNIH LASTNOSTI, RAZVITIH V NJIHOVIH EKOSISTEMIH. GLEDE NA POMEN MLEČNIH BAKTERIJ RASTLINSKEGA IZVORA SMO V ZADNJIH LETIH IZ FERMENTACIJE OLJK ALOREÑA KAMILICE (EDINE OLJKE, KI JE ZAŠČITENA Z IMENOM POREKLA V ŠPANIJI) IZOLIRALI VEČ SEVOV LACTOBACILLUS PENTOSUS, KI SO S PREDHODNIMI TESTI POKAZALI VELIK PROBIOTSKI POTENCIAL. POGLOBLJENA ANALIZA PROBIOTIČNIH LASTNOSTI IN VITRO NAM BO OMOGOČILA PRVO IZBIRO SEVOV Z NAJBOLJŠIM PROBIOTIČNIM PROFILOM IN ŠE NAPREJ POGLABLJANJE IN KARAKTERIZACIJO SEVA NA GENOMSKI IN PROTEOMSKI RAVNI. V TEM SMISLU SO NAŠI CILJI, DOLOČENI V TEM PROJEKTU, OBLIKOVANI NA NASLEDNJI NAČIN: A) IZBRATI SEV LACTOBACILLUS PENTOSUS Z ZANIMIVIM IN PRIVLAČNIM PROBIOTIČNIM PROFILOM, KI ZAJEMA RAZLIČNE LASTNOSTI, KOT SO KISLOST IN ODPORNOST NA ŽOLČE, SPOSOBNOST ADHEZIJE, AUTOAGREGACION, VARNOSTNI VIDIKI, RAST, PROIZVODNJA PROTIMIKROBNIH SNOVI IN DRUGE KORISTNE LASTNOSTI; ZAPOREDJE CELOTNEGA GENOMA IZBRANEGA SEVA NA PODLAGI PRESKUSOV IN VITRO; C) IN SILICO ANALIZO GENOV, VKLJUČENIH V PROBIOTIČNE LASTNOSTI, S POUDARKOM NA GENIH, KI SO ŽE OPISANI V LITERATURI, IN TISTIH NOVIH, ODKRITIH V TEM SEVU, POLEG ANALIZE DETERMINANT VIRULENCE ZA OCENO VARNOSTI SEVA; D) PRVIČ PREUČITI PROTEOM LACTOBACILLUS PENTOSUS IN TAKO SE LAHKO NAPOVEDI IN SILICO, KI IZHAJAJO IZ ZAPOREDJA GENOMA, DOPOLNIJO S PROTEOMSKIMI PODATKI; E) DOLOČITE POTENCIALNE OZNAČEVALCE KISLE ODPORNOSTI, TOLERANCE NA ŽOLČNE SOLI IN ADHEZIJE NA MUCIN V LB. PENTOSUS JE TA DRUGI NOV VIDIK, KI PREJ NI BIL OBRAVNAVAN PRI VRSTI LACTOABACILLUS PENTOSUS IN TO ZAHVALJUJOČ REALIZACIJI PRIMERJALNE PROTEOMIKE. TI BIOMARKERJI BODO ZELO KORISTNI ZA ZNANSTVENO SKUPNOST NA SPLOŠNO IN ZLASTI ZA INDUSTRIJO, SAJ PREDSTAVLJAJO KORISTNO ORODJE ZA IZBIRO SEVOV S PROBIOTIČNIM POTENCIALOM. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
LACTOBACILLUS PENTOSUS JEST BAKTERIĄ MLEKOWĄ OBECNĄ W SFERMENTOWANEJ ŻYWNOŚCI POCHODZENIA ZWIERZĘCEGO I ROŚLINNEGO JAKO KULTURĘ INICJUJĄCĄ LUB STANOWIĄCĄ CZĘŚĆ RODZIMEJ MIKROBIOTY, A TAKŻE JAKO ŻYWICIEL PRZEWODU POKARMOWEGO LUDZI I ZWIERZĄT. W OSTATNICH LATACH, ZE WZGLĘDU NA ROSNĄCE ZAPOTRZEBOWANIE ZE STRONY KONSUMENTÓW NIETOLERUJĄCYCH LAKTOZY I WEGETARIAN, KILKA BADAŃ KONCENTROWAŁO SIĘ NA BAKTERIACH WYIZOLOWANYCH Z ROŚLIN JAKO NOWYCH KANDYDATÓW NA PROBIOTYKI U LUDZI, PRZERYWAJĄC TYM SAMYM KLASYCZNY SCHEMAT WIĘKSZOŚCI PROBIOTYKÓW DOSTĘPNYCH NA RYNKU. NAJWIĘKSZĄ ZALETĄ PROBIOTYKÓW WYIZOLOWANYCH Z POKARMÓW ROŚLINNYCH JEST ICH WIELKA ZDOLNOŚĆ DO PRZYSTOSOWANIA SIĘ DO WARUNKÓW FIZYKOCHEMICZNYCH PODOBNYCH DO TYCH WYSTĘPUJĄCYCH W LUDZKIM PRZEWODZIE POKARMOWYM (EKSTREMALNA KWASOWOŚĆ, WYSOKI POZIOM NIESTRAWNYCH SKŁADNIKÓW ODŻYWCZYCH I CZYNNIKÓW PRZECIWODŻYWIENIOWYCH) OPRÓCZ INNYCH WŁAŚCIWOŚCI FUNKCJONALNYCH OPRACOWANYCH W ICH EKOSYSTEMACH. BIORĄC POD UWAGĘ ZNACZENIE BAKTERII MLEKOWYCH POCHODZENIA ROŚLINNEGO, W OSTATNICH LATACH ODIZOLOWALIŚMY OD FERMENTACJI RUMIANKU ALOREÑA (JEDYNEJ OLIWKI CHRONIONEJ NAZWĄ POCHODZENIA W HISZPANII) KILKA SZCZEPÓW LACTOBACILLUS PENTOSUS, KTÓRE WYKAZAŁY DUŻY POTENCJAŁ PROBIOTYCZNY POPRZEZ WSTĘPNE TESTY. DOGŁĘBNA ANALIZA WŁAŚCIWOŚCI PROBIOTYCZNYCH IN VITRO POZWOLI NAM DOKONAĆ PIERWSZEGO WYBORU SZCZEPÓW O NAJLEPSZYM PROFILU PROBIOTYCZNYM ORAZ KONTYNUOWAĆ POGŁĘBIANIE I SCHARAKTERYZOWANIE SZCZEPU NA POZIOMIE GENOMOWYM I PROTEOMICZNYM. W ZWIĄZKU Z TYM NASZE CELE OKREŚLONE W NINIEJSZYM PROJEKCIE SĄ SFORMUŁOWANE W NASTĘPUJĄCY SPOSÓB: A) WYBRAĆ SZCZEP LACTOBACILLUS PENTOSUS O CIEKAWYM I ATRAKCYJNYM PROFILU PROBIOTYCZNYM OBEJMUJĄCYM RÓŻNE WŁAŚCIWOŚCI, TAKIE JAK KWASOWOŚĆ I ODPORNOŚĆ NA ŻÓŁĆ, ZDOLNOŚĆ PRZYCZEPNOŚCI, AUTOAGREGACION, ASPEKTY BEZPIECZEŃSTWA, WZROST, PRODUKCJA SUBSTANCJI PRZECIWDROBNOUSTROJOWYCH I INNE KORZYSTNE WŁAŚCIWOŚCI; SEKWENCJA PEŁNEGO GENOMU WYBRANEGO SZCZEPU NA PODSTAWIE BADAŃ IN VITRO; C) ANALIZA W SILICO GENÓW ZAANGAŻOWANYCH WE WŁAŚCIWOŚCI PROBIOTYCZNE PODKREŚLAJĄCA GENY OPISANE JUŻ W LITERATURZE I TE NOWE WYKRYTE W TYM SZCZEPIE, OPRÓCZ ANALIZY DETERMINANTÓW ZJADLIWOŚCI W CELU OCENY BEZPIECZEŃSTWA SZCZEPU; D) BADANIA PO RAZ PIERWSZY PROTEOMU LACTOBACILLUS PENTOSUS, A TYM SAMYM PROGNOZ IN SILICO WYWNIOSKOWANYCH Z SEKWENCJI GENOMU, MOŻNA UZUPEŁNIĆ DANYMI PROTEOMICZNYMI; E) OKREŚLIĆ POTENCJALNE MARKERY ODPORNOŚCI NA KWASY, TOLERANCJĘ NA SOLE ŻÓŁCIOWE I PRZYCZEPNOŚĆ DO MUCYNY W LB. PENTOSUS JEST TYM INNYM NOWYM ASPEKTEM, KTÓRY NIE BYŁ WCZEŚNIEJ PORUSZANY W GATUNKACH LACTOABACILLUS PENTOSUS I TO DZIĘKI REALIZACJI PROTEOMIKI PORÓWNAWCZEJ. TE BIOMARKERY BĘDĄ BARDZO PRZYDATNE DLA ŚRODOWISKA NAUKOWEGO W OGÓLE, A W SZCZEGÓLNOŚCI DLA PRZEMYSŁU, PONIEWAŻ STANOWIĄ PRZYDATNE NARZĘDZIA DO WYBORU SZCZEPÓW O POTENCJALE PROBIOTYCZNYM. (Polish)
18 August 2022
0 references
Jaén
0 references
21 December 2023
0 references
Identifiers
AGL2013-43571-P
0 references