CORNELIA DE LANGE SYNDROME: Development of diagnostic panels, gene expression patterns and evaluation of endocrine axes in affected patients. (Q3208658)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3208658 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | CORNELIA DE LANGE SYNDROME: Development of diagnostic panels, gene expression patterns and evaluation of endocrine axes in affected patients. |
Project Q3208658 in Spain |
Statements
54,177.75 Euro
0 references
99,500.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2016
0 references
16 December 2018
0 references
INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA ARAGON
0 references
OBJETIVOS 1. Profundizar en el conocimiento de la etiopatogenia del SCdL. 1.1. Identificando nuevos genes mediante el desarrollo de un panel diagnóstico de secuenciación masiva. 1.2. Describiendo los patrones de expresión génica en fibroblastos de pacientes NIPBL positivos. 1.3. Identificando nuevos casos de mosaicismo mediante pirosecuenciación, uso de ADN de células de mucosa oral y técnicas de secuenciación masiva. 1.4 Valorando la contribución del estrés oxidativo al daño celular en fibroblastos de pacientes. 1.5. Estudiando “in sílico” el efecto de las mutaciones de SMC1A y SMC3 en la interacción molecular de sus proteínas. 2. Identificar fenotipos característicos de genes causales del SCdL. 2.1. Mediante la recogida detallada y exhaustiva, e informatizada de datos clínicos en fichas protocolizadas por aparatos o sistemas. 2.2. Evaluando los ejes endocrinos somatotropo, suprarrenal, gonadal, tiroideo y el metabolismo fosfocálcico. 2.3. Realizando estudios antropométricos y de composición corporal (IMC, masa grasa/magra, densitometría ósea). 2.4. Valorando el grado de envejecimiento prematuro de los pacientes. 2.5. Elaborando un protocolo/guía diagnóstica optimizado/a para el estudio de pacientes con Espectro Cornelia de Lange (ECdL). METODOLOGIA 1. Diseño: Proyecto traslacional. Estudio prospectivo y retrospectivo en población seleccionada con criterios de inclusión; 2. Sujetos de estudio: Pacientes con fenotipo compatible con SCdL/ECdL, de nuestra base de datos (n=264) y nuevos; 3. Variables: Clínicas: Cualitativas y cuantitativas y de Laboratorio; 4. Recogida y análisis de datos: Consentimiento informado, recogida de datos informatizada, análisis estadístico; 5. Técnicas: Paneles de secuenciación masiva, arrays de expresión, pirosecuenciación, cultivos celulares, peroxidación lipídica, oxidación proteica, qPCR, métodos de simulación bioinformática en 3D, cuantificación de parámetros hormonales, estudios antropométricos. (Spanish)
0 references
OBJECTIVES 1. Deepening the knowledge of ethiopathogeny of SCdL. 1.1. Identifying new genes by developing a massive sequencing diagnostic panel. 1.2. Describing the patterns of gene expression in fibroblasts of positive NIPBL patients. 1.3. Identifying new cases of mosaicism through pyrossequencing, use of oral mucosal cell DNA and mass sequencing techniques. 1.4 Assessing the contribution of oxidative stress to cell damage in fibroblasts of patients. 1.5. Studying “sillic” the effect of SMC1A and SMC3 mutations on the molecular interaction of their proteins. 2. Identify characteristic phenotypes of causal genes of SCdL. 2.1. By means of detailed, comprehensive and computerised collection of clinical data in data sheets protocold by devices or systems. 2.2. Evaluating the endocrine axes somatotropus, adrenal, gonadal, thyroid and phosphocalcium metabolism. 2.3. Performing anthropometric and body composition studies (BMI, fat/male mass, bone densitometry). 2.4. Assessing the degree of premature aging of patients. 2.5. Developing an optimised diagnostic protocol/guide for the study of patients with Cornelia de Lange Spectrum (ECDL). METHOD 1. Design: Translational project. Prospective and retrospective study in selected population with inclusion criteria; 2. Subjects of study: Patients with phenotype compatible with SCdL/ECDL, from our database (n=264) and new; 3. Variables: Clinics: Qualitative and quantitative and laboratory; 4. Data collection and analysis: Informed consent, computerised data collection, statistical analysis; 5. Techniques: Massive sequencing panels, expression arrays, pyrossequencing, cell cultures, lipid peroxidation, protein oxidation, qPCR, 3D bioinformatics simulation methods, hormonal parameter quantification, anthropometric studies. (English)
14 October 2021
0.1282721640455405
0 references
OBJECTIFS 1. Approfondir la connaissance de l’éthiopathogène du SCdL. 1.1. Identifier de nouveaux gènes en développant un panel de diagnostic de séquençage massif. 1.2. Description des profils d’expression génique chez les fibroblastes des patients positifs NIPBL. 1.3. Identification de nouveaux cas de mosaïqueisme par pyrosséquençage, utilisation de l’ADN des cellules muqueuses buccales et techniques de séquençage de masse. 1.4 Évaluation de la contribution du stress oxydatif aux lésions cellulaires dans les fibroblastes des patients. 1.5. Étude «sillique» de l’effet des mutations SMC1A et SMC3 sur l’interaction moléculaire de leurs protéines. 2. Identifier les phénotypes caractéristiques des gènes causals du SCdL. 2.1. Au moyen d’une collecte détaillée, complète et informatisée de données cliniques dans des fiches de données protocoleées par des dispositifs ou des systèmes. 2.2. Évaluation des axes endocriniens somatotropus, surrénales, gonadiques, thyroïdiens et phosphocalciques. 2.3. Réalisation d’études anthropométriques et de composition corporelle (IMC, masse grasse/mâle, densitométrie osseuse). 2.4. Évaluer le degré de vieillissement prématuré des patients. 2.5. Élaboration d’un protocole/guide de diagnostic optimisé pour l’étude des patients atteints de Cornelia de Lange Spectrum (ECDL). MÉTHODE 1. Conception: Projet de traduction. Étude prospective et rétrospective dans une population sélectionnée avec des critères d’inclusion; 2. Sujets d’étude: Patients avec phénotype compatible avec SCdL/ECDL, de notre base de données (n=264) et nouveau; 3. Variables: Cliniques: Qualitatifs et quantitatifs et de laboratoire; 4. Collecte et analyse des données: Le consentement éclairé, la collecte informatisée de données, l’analyse statistique; 5. Techniques: Panneaux de séquençage massifs, tableaux d’expression, pyrosséquençage, cultures cellulaires, peroxydation lipidique, oxydation des protéines, qPCR, méthodes de simulation bioinformatique 3D, quantification des paramètres hormonaux, études anthropométriques. (French)
5 December 2021
0 references
ZIELE 1. Vertiefung des Wissens über die Ethiopathogenie von SCdL. 1.1. Identifizierung neuer Gene durch Entwicklung einer massiven Sequenzierungsdiagnostik. 1.2. Beschreibung der Muster der Genexpression in Fibroblasten positiver NIPBL-Patienten. 1.3. Identifizierung neuer Fälle von Mosaikismus durch Pyrossequenzierung, Anwendung oraler Schleimhautzell-DNA und Massensequenzierungstechniken. 1.4 Bewertung des Beitrags von oxidativem Stress zu Zellschäden in Fibroblasten von Patienten. 1.5. Studie „sillic“ die Wirkung von SMC1A und SMC3 Mutationen auf die molekulare Interaktion ihrer Proteine. 2. Identifizieren Sie charakteristische Phänotypen von kausalen Genen von SCdL. 2.1. Durch eine detaillierte, umfassende und computergestützte Erfassung klinischer Daten in Datenblättern, die von Geräten oder Systemen protokolliert werden. 2.2. Bewertung der endokrinen Achsen Somatotropus, Nebennieren, Gonaden, Schilddrüse und Phosphorcalciumstoffwechsel. 2.3. Durchführung anthropometrischer und Körperzusammensetzungsstudien (BMI, Fett/männliche Masse, Knochendichtemetrie). 2.4. Bewertung des Grads der vorzeitigen Alterung von Patienten. 2.5. Entwicklung eines optimierten Diagnoseprotokolls/Leitfadens für die Studie von Patienten mit Cornelia de Lange Spectrum (ECDL). METHODE 1. Entwurf: Übersetzungsprojekt. Prospektive und retrospektive Studie an ausgewählten Bevölkerungsgruppen mit Inklusionskriterien; 2. Studienfächer: Patienten mit Phänotyp, kompatibel mit SCdL/ECDL, aus unserer Datenbank (n=264) und neu; 3. Variablen: Kliniken: Qualitativ und quantitativ und Labor; 4. Datenerhebung und -analyse: Einwilligung nach Aufklärung, computergestützte Datenerhebung, statistische Analyse; 5. Techniken: Massive Sequencing Panels, Expression Arrays, Pyrossequenzierung, Zellkulturen, Lipidperoxidation, Proteinoxidation, qPCR, 3D-Bioinformatik-Simulationsmethoden, hormonelle Parameterquantifizierung, anthropometrische Studien. (German)
9 December 2021
0 references
DOELSTELLINGEN 1. Verdieping van de kennis van ethiopathogenie van SCdL. 1.1. Het identificeren van nieuwe genen door het ontwikkelen van een massief rangschikkend diagnostisch paneel. 1.2. Het beschrijven van de patronen van genexpressie in fibroblasten van positieve NIPBL-patiënten. 1.3. Identificeren van nieuwe gevallen van mozaïekisme door pyrossequencing, gebruik van orale mucosale cel DNA en massa sequencing technieken. 1.4 Het beoordelen van de bijdrage van oxidatieve stress aan celschade bij fibroblasten van patiënten. 1.5. Het bestuderen van „sillic” het effect van SMC1A en SMC3 mutaties op de moleculaire interactie van hun eiwitten. 2. Identificeer karakteristieke fenotypes van causale genen van SCdL. 2.1. Door middel van een gedetailleerde, uitgebreide en geautomatiseerde verzameling van klinische gegevens in door apparaten of systemen geprotocolleerde databladen. 2.2. Evaluatie van de endocriene assen somatotropus, bijnier, gonadale, schildklier en fosfocalcium metabolisme. 2.3. Uitvoeren van antropometrische en lichaamssamenstellingsstudies (BMI, vet/mannelijke massa, botdensitometrie). 2.4. Beoordeling van de mate van vroegtijdige veroudering van patiënten. 2.5. Het ontwikkelen van een geoptimaliseerd diagnostisch protocol/gids voor de studie van patiënten met Cornelia de Lange Spectrum (ECDL). METHODE 1. Ontwerp: Translationeel project. Prospectief en retrospectief onderzoek bij geselecteerde populaties met inclusiecriteria; 2. Studieonderwerpen: Patiënten met fenotype compatibel met SCdL/ECDL, uit onze database (n=264) en nieuw; 3. Variabelen: Klinieken: Kwalitatief en kwantitatief en laboratorium; 4. Verzameling en analyse van gegevens: Geïnformeerde toestemming, geautomatiseerde gegevensverzameling, statistische analyse; 5. Technieken: Massieve sequencing panelen, expressie arrays, pyrossequencing, celculturen, lipide peroxidatie, eiwitoxidatie, qPCR, 3D bio-informatica simulatiemethoden, hormonale parameter kwantificering, antropometrische studies. (Dutch)
17 December 2021
0 references
OBIETTIVI 1. Approfondire la conoscenza dell'etiopatogenesi di SCdL. 1.1. Identificare nuovi geni sviluppando un pannello diagnostico di sequenziamento massiccio. 1.2. Descrivere i modelli di espressione genica nei fibroblasti dei pazienti NIPBL positivi. 1.3. Individuazione di nuovi casi di mosaicismo attraverso il pirossequenziamento, l'uso di DNA delle cellule mucosali orali e tecniche di sequenziamento di massa. 1.4 Valutare il contributo dello stress ossidativo al danno cellulare nei fibroblasti dei pazienti. 1.5. Studio "silico" dell'effetto delle mutazioni SMC1A e SMC3 sull'interazione molecolare delle loro proteine. 2. Identificare fenotipi caratteristici dei geni causali di SCdL. 2.1. Mediante raccolta dettagliata, completa e informatizzata di dati clinici in schede di dati protocollate da dispositivi o sistemi. 2.2. Valutare il metabolismo degli assi endocrini somatotropus, surrenale, gonadale, tiroide e fosfocalcico. 2.3. Effettuare studi di composizione antropometrica e corporea (BMI, massa grassa/maschio, densitometria ossea). 2.4. Valutare il grado di invecchiamento precoce dei pazienti. 2.5. Sviluppo di un protocollo/guida diagnostico ottimizzato per lo studio di pazienti affetti da Cornelia de Lange Spectrum (ECDL). METODO 1. Progettazione: Progetto traslazionale. Studio prospettico e retrospettivo su una popolazione selezionata con criteri di inclusione; 2. Argomenti di studio: Pazienti con fenotipo compatibile con SCdL/ECDL, dal nostro database (n=264) e nuovi; 3. Variabili: Cliniche: Qualitativo e quantitativo e di laboratorio; 4. Raccolta e analisi dei dati: Consenso informato, raccolta informatizzata dei dati, analisi statistica; 5. Tecniche: Pannelli di sequenziamento massiccio, array di espressione, pirossequenziamento, colture cellulari, perossidazione lipidica, ossidazione proteica, qPCR, metodi di simulazione bioinformatica 3D, quantificazione dei parametri ormonali, studi antropometrici. (Italian)
16 January 2022
0 references
EESMÄRGID 1. SCdL-i etiopatogenia alaste teadmiste süvendamine. 1.1. Uute geenide tuvastamine massiivse sekveneerimise diagnostilise paneeli abil. 1.2. Kirjeldades geeniekspressiooni mustreid fibroblastides positiivsete NIPBL-patsientide puhul. 1.3. Uute mosaiiksuse juhtude tuvastamine pürossequencing, suukaudse limaskesta raku DNA ja massi sekveneerimise meetodite abil. 1.4 Hinnata oksüdatiivse stressi panust patsientide fibroblastide rakkude kahjustusse. 1.5. Uurida SMC1A ja SMC3 mutatsioonide mõju nende valkude molekulaarsele koostoimele. 2. Määrata SCdL-i põhjuslike geenide iseloomulikud fenotüübid. 2.1. Üksikasjalike, põhjalike ja arvutipõhiste kliiniliste andmete kogumise teel andmelehtedel, mis on protokollitud seadmete või süsteemidega. 2.2. Endokriinsete telgede somatotropus, neerupealised, gonadaal, kilpnäärme ja fosforkaltsiumi metabolismi hindamine. 2.3. Antropomeetriliste ja keha koostise uuringute tegemine (KMI, rasva-isasmass, luude densitomeetria). 2.4. Patsientide enneaegse vananemise taseme hindamine. 2.5. Optimeeritud diagnostikaprotokolli/-juhendi väljatöötamine Cornelia de Lange Spectrum’i (ECDL) patsientide uurimiseks. MEETOD. Kujundus: Translatiivsed projektid. Prospektiivne ja retrospektiivne uuring valitud populatsioonis koos kaasamiskriteeriumidega; 2. Õppeained: Patsiendid, kellel on SCdL/ECDL-iga kooskõlas olev fenotüüp, meie andmebaasist (n=264) ja uued; 3. Muutujad: Kliinikud: Kvalitatiivne ja kvantitatiivne ning laboratoorne; 4. Andmete kogumine ja analüüs: Teadv nõusolek, andmete elektrooniline kogumine, statistiline analüüs; 5. Tehnikad: Massiivsed sekveneerimise paneelid, ekspressiooni massiivid, pürossequencing, rakukultuurid, lipiidide peroksüdatsioon, valgu oksüdatsioon, qPCR, 3D bioinformaatika simulatsioonimeetodid, hormonaalse parameetri kvantifitseerimine, antropomeetrilised uuringud. (Estonian)
4 August 2022
0 references
TIKSLAI 1. Gilinti žinias apie SCdL etiopatogeniją. 1.1. Naujų genų nustatymas kuriant masinę sekos nustatymo diagnostikos skydelį. 1.2. Apibūdinant geno ekspresijos modelius fibroblastuose teigiamiems NIPBL sergantiems pacientams. 1.3. Nustatyti naujus mozaikos atvejus per pirosseką, naudojant burnos gleivinės ląstelių DNR ir masės sekos nustatymo metodus. 1.4 Įvertinti oksidacinio streso poveikį pacientų fibroblastų ląstelių pažeidimui. 1.5. SMC1A ir SMC3 mutacijų „silikų“ poveikio jų baltymų molekulinei sąveikai tyrimas. 2. Nustatyti SCdL priežastinių genų būdingus fenotipus. 2.1. Išsamiu, išsamiu ir kompiuterizuotu klinikinių duomenų rinkimu duomenų lapuose, protokoluotuose prietaisuose ar sistemose. 2.2. Įvertinti endokrininių ašių somatotropus, antinksčių, gonadalinių, skydliaukės ir fosfokalcio metabolizmą. 2.3. Atlikti antropometrinius ir kūno sudėties tyrimus (KMI, riebalų/vyrų masė, kaulų densitometrija). 2.4. Priešlaikinio pacientų senėjimo laipsnio vertinimas. 2.5. Pacientų, sergančių Cornelia de Lange Spectrum (ECDL), tyrimo optimizuoto diagnostinio protokolo (vadovo) parengimas. 1 METODAS. Dizainas: Vertimo projektas. Perspektyvinis ir retrospektyvinis atrinktos populiacijos tyrimas taikant įtraukimo kriterijus; 2. Tiriamieji asmenys: Pacientai, kurių fenotipas suderinamas su SCdL/ECDL, iš mūsų duomenų bazės (n = 264) ir nauji; 3. Kintamieji: Klinikos: Kokybinis ir kiekybinis bei laboratorinis; 4. Duomenų rinkimas ir analizė: Informuoto asmens sutikimas, kompiuterinis duomenų rinkimas, statistinė analizė; 5. Metodai: Masyvios sekos nustatymo plokštės, ekspresijos matricos, pirossekcijos matricos, ląstelių kultūros, lipidų peroksidacija, baltymų oksidacija, qPGR, 3D bioinformatikos modeliavimo metodai, hormoninių parametrų kiekybinis nustatymas, antropometriniai tyrimai. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
CILJEVI 1. Produbljivanje znanja o etiopatogeniji SCdL-a. 1.1. Identificiranje novih gena razvojem masivne dijagnostičke ploče za sekvenciranje. 1.2. Opis obrazaca ekspresije gena kod fibroblasta pozitivnih bolesnika s NIPBL-om. 1.3. Identificiranje novih slučajeva mozaikizma putem pirossekvenciranjem, primjenom DNK-a usnih stanica sluznice i tehnikama sekvenciranja mase. 1.4 Procjena doprinosa oksidativnog stresa oštećenju stanica u fibroblasta bolesnika. 1.5. Proučavanje „siličkog” učinka mutacija SMC1A i SMC3 na molekularnu interakciju njihovih proteina. 2. Identificirati karakteristične fenotipove uzročnih gena SCdL-a. 2.1. Detaljnim, sveobuhvatnim i računalnim prikupljanjem kliničkih podataka u podatkovnim listovima koje protokoliraju proizvodi ili sustavi. 2.2. Procjena endokrinih osi somatotropus, nadbubrežna, gonadal, štitnjače i fosfokalcij metabolizam. 2.3. Provođenje antropometrijskih ispitivanja i ispitivanja sastava tijela (BMI, masna/muška masa, koštana densitometrija). 2.4. Procjena stupnja preranog starenja pacijenata. 2.5. Razvoj optimiziranog dijagnostičkog protokola/vodiča za ispitivanje bolesnika s Cornelia de Lange Spectrum (ECDL). METODA 1. Dizajn: Prijevodni projekt. Prospektivna i retrospektivna studija u odabranoj populaciji s kriterijima uključivanja; 2. Teme studija: Bolesnici s fenotipom kompatibilnim s SCdL/ECDL, iz naše baze podataka (n=264) i novi; 3. Varijable: Klinike: Kvalitativne, kvantitativne i laboratorijske; 4. Prikupljanje i analiza podataka: Informirani pristanak, prikupljanje računalnih podataka, statistička analiza; 5. Tehnike: Masivne sekvencirajuće ploče, ekspresijski nizovi, pirosekvenciranje, stanične kulture, peroksidacija lipida, oksidacija proteina, qPCR, metode simulacije 3D bioinformatike, kvantifikacija hormonskih parametara, antropometrijske studije. (Croatian)
4 August 2022
0 references
ΣΤΌΧΟΙ 1. Εμβάθυνση της γνώσης της εθιοπαθογένειας του SCdL. 1.1. Εντοπισμός νέων γονιδίων με την ανάπτυξη μιας μαζικής αλληλουχίας διαγνωστικό πάνελ. 1.2. Περιγραφή των προτύπων γονιδιακής έκφρασης σε ινοβλάστες θετικών ασθενών με NIPBL. 1.3. Εντοπισμός νέων περιπτώσεων μωσαϊκισμού μέσω της πυρόσβεσης, της χρήσης DNA των βλεννογόνων του στόματος και τεχνικών προσδιορισμού της αλληλουχίας μάζας. Αξιολόγηση της συμβολής του οξειδωτικού στρες στην κυτταρική βλάβη στους ινοβλάστες των ασθενών. 1.5. Μελέτη της επίδρασης των μεταλλάξεων SMC1A και SMC3 στη μοριακή αλληλεπίδραση των πρωτεϊνών τους. 2. Προσδιορίστε χαρακτηριστικούς φαινότυπους αιτίων γονιδίων του SCdL. 2.1. Μέσω λεπτομερούς, περιεκτικής και μηχανογραφημένης συλλογής κλινικών δεδομένων σε δελτία δεδομένων που είναι πρωτόκολλα από συσκευές ή συστήματα. 2.2. Αξιολόγηση του μεταβολισμού των ενδοκρινικών αξόνων somatotropus, των επινεφριδίων, των γονάδων, του θυρεοειδούς και του φωσφοασβεστίου. 2.3. Διενέργεια ανθρωπομετρικών μελετών και μελετών σύνθεσης σώματος (ΔΜΣ, λίπος/αρσενική μάζα, οστική πυκνομετρία). 2.4. Αξιολόγηση του βαθμού πρόωρης γήρανσης των ασθενών. 2.5. Ανάπτυξη βελτιστοποιημένου διαγνωστικού πρωτοκόλλου/οδηγού για τη μελέτη ασθενών με Cornelia de Lange Spectrum (ECDL). ΜΈΘΟΔΟΣ 1. Σχεδιασμός: Μεταφραστικό έργο. Μελλοντική και αναδρομική μελέτη σε επιλεγμένο πληθυσμό με κριτήρια ένταξης· 2. Θέματα μελέτης: Ασθενείς με φαινότυπο συμβατό με SCdL/ECDL, από τη βάση δεδομένων μας (n=264) και νέο. 3. Μεταβλητές: Κλινικές: Ποιοτική και ποσοτική και εργαστηριακή· 4. Συλλογή και ανάλυση δεδομένων: Συναίνεση μετά από ενημέρωση, συλλογή ηλεκτρονικών δεδομένων, στατιστική ανάλυση· 5. Τεχνικές: Μαζικές επιτροπές αλληλουχίας, συστοιχίες έκφρασης, πυρόσβεσης, κυτταροκαλλιέργειες, υπεροξείδωση λιπιδίων, οξείδωση πρωτεϊνών, qPCR, τρισδιάστατες μέθοδοι προσομοίωσης βιοπληροφορικής, ποσοτικός προσδιορισμός ορμονικών παραμέτρων, ανθρωπομετρικές μελέτες. (Greek)
4 August 2022
0 references
CIEĽ Č. 1. Prehlbovanie vedomostí o etiopatogenii SCdL. 1.1. Identifikácia nových génov vytvorením masívneho sekvenčného diagnostického panelu. 1.2. Opis vzorcov génovej expresie u fibroblastov pozitívnych pacientov s NIPBL. 1.3. Identifikácia nových prípadov mozaiky prostredníctvom pyrosekvenovania, použitia ústnej DNA slizníc a masového sekvenovania. 1.4 Posúdenie prínosu oxidačného stresu k poškodeniu buniek u pacientov fibroblastov. 1.5. Štúdium „silických“ účinkov mutácií SMC1A a SMC3 na molekulárnu interakciu ich proteínov. 2. Identifikujte charakteristické fenotypy kauzálnych génov SCdL. 2.1. Prostredníctvom podrobného, komplexného a počítačového zberu klinických údajov v dátových listoch, ktoré sú prihlásené zariadeniami alebo systémami. 2.2. Hodnotenie endokrinných osí somatotropus, nadobličiek, gonád, štítnej žľazy a fosfokálcium metabolizmu. 2.3. Vykonávanie antropometrických štúdií a štúdií zloženia tela (BMI, tuková/mužská hmotnosť, denzitometria kostí). 2.4. Posúdenie stupňa predčasného starnutia pacientov. 2.5. Vypracovanie optimalizovaného diagnostického protokolu/príručky pre štúdiu pacientov s Cornelia de Lange Spectrum (ECDL). METÓDA 1. Dizajn: Prekladový projekt. Prospektívna a retrospektívna štúdia vo vybranej populácii s kritériami inklúzie; 2. Študijné odbory: Pacienti s fenotypom kompatibilným s SCdL/ECDL z našej databázy (n=264) a novými; 3. Premenné: Kliniky: Kvalitatívne a kvantitatívne a laboratórne; 4. Zber a analýza údajov: Informovaný súhlas, elektronický zber údajov, štatistická analýza; 5. Techniky: Masívne sekvenčné panely, expresné polia, pyrosekvenovanie, bunkové kultúry, peroxidácia lipidov, oxidácia proteínov, qPCR, 3D bioinformatické simulačné metódy, kvantifikácia hormonálnych parametrov, antropometrické štúdie. (Slovak)
4 August 2022
0 references
TAVOITTEET 1. SCdL:n etiopatogeenisuutta koskevien tietojen syventäminen. 1.1. Tunnistaa uusia geenejä kehittämällä massiivinen sekvensointi diagnostinen paneeli. 1.2. Positiivisten NIPBL-potilaiden fibroblasteissa esiintyvien geenien ilmentymismallien kuvaus. 1.3. Uusien mosaiikkitapausten tunnistaminen pyrossekvensoinnin, suun limakalvosolujen DNA:n ja massasekvensoinnin avulla. 1.4 Arvioidaan oksidatiivisen stressin vaikutus potilaiden fibroblastien soluvaurioihin. 1.5. Tutkitaan SMC1A- ja SMC3-mutaatioiden vaikutusta niiden proteiinien molekyylivuorovaikutukseen. 2. Tunnistaa SCdL:n syy-geenien tyypilliset fenotyypit. 2.1. Käyttämällä yksityiskohtaista, kattavaa ja tietokoneistettua kliinisten tietojen keruuta tietolomakkeissa, joissa on yhteys laitteisiin tai järjestelmiin. 2.2. Endokriinisten akseleiden somatotropus, lisämunuainen, sukurauhanen, kilpirauhasen ja fosforikalsiumaineenvaihdunnan arviointi. 2.3. Antropometristen ja kehonkoostumustutkimusten suorittaminen (BMI, rasva-/urosmassa, luun tiheys). 2.4. Potilaiden ennenaikaisen ikääntymisen asteen arviointi. 2.5. Kehitetään optimoitu diagnostinen protokolla/opas Cornelia de Lange Spectrumia (ECDL) sairastavien potilaiden tutkimukseen. MENETELMÄ 1. Suunnittelu: Käännösprojekti. Prospektiivinen ja retrospektiivinen tutkimus valitussa perusjoukossa ja sisällyttämiskriteerit; 2. Tutkimusaiheet: Potilaat, joiden fenotyyppi on yhteensopiva SCdL/ECDL: n kanssa, tietokannastamme (n=264) ja uusista; 3. Muuttujat: Klinikat: Laadulliset ja määrälliset sekä laboratoriot; 4. Tietojen keruu ja analysointi: Tietoon perustuva suostumus, tietokoneistettu tietojenkeruu, tilastoanalyysi; 5. Tekniikat: Massiiviset sekvensointipaneelit, ekspressiorakenteet, pyrossekvensointi, soluviljelmät, lipidiperoksidaatio, proteiinioksidaatio, qPCR, 3D bioinformatiikan simulointimenetelmät, hormonaalisten parametrien kvantifiointi, antropometriset tutkimukset. (Finnish)
4 August 2022
0 references
CELE 1. Pogłębianie wiedzy na temat etiopatogenii SCdL. 1.1. Identyfikowanie nowych genów poprzez opracowanie ogromnego panelu diagnostycznego sekwencjonowania. 1.2. Opisujące wzorce ekspresji genów u fibroblastów pacjentów z dodatnim NIPBL. 1.3. Identyfikowanie nowych przypadków mozaiki poprzez sekwencjonowanie pirosów, stosowanie doustnego DNA komórek śluzowych i technik sekwencjonowania masowego. 1.4 Ocena wpływu stresu oksydacyjnego na uszkodzenie komórek fibroblastów pacjentów. 1.5. Badanie wpływu mutacji SMC1A i SMC3 na interakcję molekularną ich białek. 2. Zidentyfikować charakterystyczne fenotypy genów przyczynowych SCdL. 2.1. Poprzez szczegółowe, kompleksowe i skomputeryzowane gromadzenie danych klinicznych w arkuszach danych protokołowanych przez wyroby lub systemy. 2.2. Ocena metabolizmu somatotropu, nadnerczy, gonadów, tarczycy i fosfowapnii. 2.3. Przeprowadzanie badań antropometrycznych i składu ciała (BMI, tłuszcz/masa męska, densytometria kości). 2.4. Ocena stopnia przedwczesnego starzenia się pacjentów. 2.5. Opracowanie zoptymalizowanego protokołu diagnostycznego/przewodnika do badania pacjentów z Cornelią de Lange Spectrum (ECDL). METODA 1. Projekt: Projekt tłumaczeniowy. Badanie prospektywne i retrospektywne w wybranej populacji z kryteriami włączenia; 2. Uczestnicy studiów: Pacjenci z fenotypem kompatybilnym z SCdL/ECDL, z naszej bazy danych (n=264) i nowi; 3. Zmienne: Kliniki: Jakościowe i ilościowe oraz laboratoryjne; 4. Gromadzenie i analiza danych: Świadoma zgoda, skomputeryzowane gromadzenie danych, analiza statystyczna; 5. Techniki: Masywne panele sekwencjonujące, tablice ekspresji, sekwencjonowanie pirosów, kultury komórkowe, peroksydacja lipidów, utlenianie białek, qPCR, metody symulacji bioinformatyki 3D, oznaczanie parametrów hormonalnych, badania antropometryczne. (Polish)
4 August 2022
0 references
CÉLKITŰZÉSEK Az SCdL etiopathogenitásával kapcsolatos ismeretek elmélyítése. 1.1. Új gének azonosítása masszív szekvenáló diagnosztikai panel kifejlesztésével. 1.2. A génexpresszió mintáinak leírása a pozitív NIPBL betegek fibroblasztjaiban. 1.3. A mozaikizmus új eseteinek azonosítása piroszszekvenálás, szájnyálkahártya sejt DNS és tömegszekvenálási technikák alkalmazása révén. 1.4 Annak felmérése, hogy az oxidatív stressz milyen mértékben járul hozzá a betegek fibroblasztjainak sejtkárosodásához. 1.5. Tanulmányozza az SMC1A és SMC3 mutációk hatását a fehérjék molekuláris kölcsönhatására. 2. Azonosítsa az SCdL ok-okozati génjeinek jellegzetes fenotípusait. 2.1. A klinikai adatoknak az eszközök vagy rendszerek által lejegyzett adatlapokon történő részletes, átfogó és számítógépes gyűjtése révén. 2.2. Az endokrin tengelyek szomatotropus, mellékvese, gonadal, pajzsmirigy és foszforkalcium metabolizmusának értékelése. 2.3. Antropometriás és testösszetételi vizsgálatok elvégzése (BMI, zsír/férfi tömeg, csont denzitometria). 2.4. A betegek korai öregedésének mértékének értékelése. 2.5. Optimalizált diagnosztikai protokoll/útmutató kidolgozása a Cornelia de Lange Spectrumban (ECDL) szenvedő betegek vizsgálatához. MÓDSZER Tervezés: Fordítási projekt. Prospektív és retrospektív vizsgálat kiválasztott populációban, befogadási kritériumokkal; 2. Vizsgálati alanyok: SCdL/ECDL-lel kompatibilis fenotípusú betegek adatbázisunkból (n=264) és újak; 3. Változók: Klinikák: Minőségi, mennyiségi és laboratóriumi; 4. Adatgyűjtés és -elemzés: Tájékoztatáson alapuló beleegyezés, számítógépes adatgyűjtés, statisztikai elemzés; 5. Technikák: Masszív szekvenáló panelek, expressziós tömbök, piroszszekvenálás, sejtkultúrák, lipid-peroxidáció, fehérjeoxidáció, qPCR, 3D bioinformatikai szimulációs módszerek, hormonparaméterek mennyiségi meghatározása, antropometriás vizsgálatok. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
CÍLE 1. Prohlubování znalostí o etiopatogenii SCdL. 1.1. Identifikace nových genů vytvořením masivního sekvenčního diagnostického panelu. 1.2. Popis vzorců genové exprese u fibroblastů pozitivních pacientů s NIPBL. 1.3. Identifikace nových případů mozaikismu prostřednictvím pyrossekvencování, použití orální DNA sliznic a technik sekvenování hmoty. 1.4 Posouzení přínosu oxidačního stresu k poškození buněk u fibroblastů pacientů. 1.5. Studium „silického“ účinku mutací SMC1A a SMC3 na molekulární interakci jejich proteinů. 2. Identifikovat charakteristické fenotypy kauzálních genů SCdL. 2.1. Prostřednictvím podrobného, komplexního a počítačového sběru klinických údajů v datových listech protokolovaných zařízeními nebo systémy. 2.2. Vyhodnocení endokrinních os somatotropus, nadledvin, gonád, štítné žlázy a metabolismu fosfokalcia. 2.3. Provádění antropometrických studií a studií složení těla (BMI, hmotnost tuku/muž, denzitometrie kostí). 2.4. Posouzení stupně předčasného stárnutí pacientů. 2.5. Vývoj optimalizovaného diagnostického protokolu/průvodce pro studium pacientů s Cornelia de Lange Spectrum (ECDL). METODA 1. Návrh: Překladový projekt. Prospektivní a retrospektivní studie u vybrané populace s kritérii pro začlenění; 2. Studijní obory: Pacienti s fenotypem kompatibilním s SCdL/ECDL, z naší databáze (n=264) a noví; 3. Proměnné: Kliniky: Kvalitativní a kvantitativní a laboratorní; 4. Sběr a analýza údajů: Informovaný souhlas, počítačový sběr údajů, statistická analýza; 5. Techniky: Masivní sekvenční panely, expresenční pole, pyrossequencing, buněčné kultury, peroxidace lipidů, oxidace proteinů, qPCR, 3D bioinformatické simulační metody, kvantifikace hormonálních parametrů, antropometrické studie. (Czech)
4 August 2022
0 references
MĒRĶI NR. 1. Padziļināt zināšanas par SCdL etiopātiju. 1.1. Identificēt jaunus gēnus, izstrādājot masveida sekvencēšanas diagnostikas paneli. 1.2. Raksturojot gēnu ekspresijas modeļus pacientiem ar pozitīviem NIPBL fibroblastiem. 1.3. Jaunu mozaīkas gadījumu identificēšana, izmantojot pirossekvencēšanu, mutes dobuma gļotādas šūnu DNS izmantošanu un masu sekvencēšanas paņēmienus. 1.4 Novērtēt oksidatīvā stresa ietekmi uz šūnu bojājumiem pacientu fibroblastos. 1.5. Pētot “silīcija” SMC1A un SMC3 mutāciju ietekmi uz to proteīnu molekulāro mijiedarbību. 2. Noteikt SCdL cēloņsakarību gēnu raksturīgos fenotipus. 2.1. Izmantojot detalizētu, visaptverošu un datorizētu klīnisko datu vākšanu datu lapās, ko protokolē ierīces vai sistēmas. 2.2. Novērtējot endokrīnās asis somatotropus, virsnieru, gonadal, vairogdziedzera un fosfokalcija metabolismu. 2.3. Veicot antropometriskos un ķermeņa sastāva pētījumus (ĶMI, tauku/vīriešu masa, kaulu densitometrija). 2.4. Pacientu priekšlaicīgas novecošanas pakāpes novērtēšana. 2.5. Optimizēta diagnostikas protokola/ceļveža izstrāde pētījumu veikšanai ar Cornelia de Lange Spectrum (ECDL). METODE. Dizains: Tulkošanas projekts. Prospektīvs un retrospektīvs pētījums izvēlētajā populācijā ar iekļaušanas kritērijiem; 2. Pētījuma priekšmeti: Pacienti ar fenotipu, kas atbilst SCdL/ECDL, no mūsu datubāzes (n=264) un jauni; 3. Mainīgie lielumi: Klīnikas: Kvalitatīvas un kvantitatīvas, kā arī laboratorijas; 4. Datu vākšana un analīze: Informētu piekrišanu, datorizētu datu vākšanu, statistisko analīzi; 5. Tehniskie paņēmieni: Masveida sekvencēšanas paneļi, ekspresijas bloki, pirossekvencēšana, šūnu kultūras, lipīdu peroksidācija, olbaltumvielu oksidācija, qPCR, 3D bioinformātikas simulācijas metodes, hormonālo parametru kvantitatīvā noteikšana, antropometriskie pētījumi. (Latvian)
4 August 2022
0 references
CUSPÓIRÍ 1. An t-eolas ar ethiopathogeny SCDL a dhoimhniú. 1.1. Géinte nua a aithint trí phainéal diagnóiseach seicheamhaithe ollmhór a fhorbairt. 1.2. Cur síos ar na patrúin léiriú géine i fibroblasts na n-othar dearfach NIPBL. 1.3. Cásanna nua mósáiceachais a shainaithint trí sheicheamhú a dhéanamh, DNA cille mucosal béil agus maisteicnící seicheamhaithe a úsáid. 1.4 Measúnú a dhéanamh ar rannchuidiú strus ocsaídiúcháin le damáiste cille i bhfibroblasts na n-othar. 1.5. Ag déanamh staidéir ar “sillic” an éifeacht SMC1A agus SMC3 sócháin ar an idirghníomhaíocht mhóilíneach a gcuid próitéiní. 2. Feinitíopaí tréitheacha de ghéinte cúiseacha SCDL a shainaithint. 2.1. Trí bhíthin bailiú mionsonraithe, cuimsitheach agus ríomhairithe sonraí cliniciúla i mbileoga sonraí arna bprótacal ag feistí nó ag córais. 2.2. Meastóireacht a dhéanamh ar an somatotropus aiseanna inchríneacha, adrenal, gonadal, thyroid agus meitibileacht phosphocalcium. 2.3. Staidéir antrapaiméadracha agus comhdhéanamh coirp a dhéanamh (BMI, mais saille/fireann, dlúthmhéadracht cnámh). 2.4. Measúnú a dhéanamh ar an méid dul in aois roimh am na n-othar. 2.5. Prótacal/treoir dhiagnóiseach optamaithe a fhorbairt chun staidéar a dhéanamh ar othair le Cornelia de Lange Spectrum (ECDL). MODH 1. Dearadh: Tionscadal aistriúcháin. Staidéar ionchasach agus siarghabhálach i ndaonra roghnaithe lena mbaineann critéir maidir le cuimsiú; 2. Ábhair staidéir: Othair a bhfuil feinitíopa comhoiriúnach le SCDL/ECDL, ónár mbunachar sonraí (n = 264) agus nua; 3. Athróga: Clinicí: Cáilíochtúil agus cainníochtúil agus saotharlann; 4. Sonraí a bhailiú agus anailís a dhéanamh orthu: Toiliú feasach, bailiú sonraí ríomhairithe, anailís staidrimh; 5. Teicnící: Painéil seicheamhaithe ollmhóra, eagair léirithe, seicheamhú, saothráin chill, sárocsaídiú lipid, ocsaídiú próitéine, qPCR, modhanna ionsamhlúcháin bithfhaisnéisíochta 3D, cainníochtú paraiméadar hormónach, staidéir antrapaiméadrachta. (Irish)
4 August 2022
0 references
CILJI 1. Poglobitev znanja o etiopatogeniji SCdL. 1.1. Prepoznavanje novih genov z razvojem masivnega zaporedja diagnostičnih plošč. 1.2. Opis vzorcev genske ekspresije v fibroblastih pozitivnih bolnikov z NIPBL. 1.3. Prepoznavanje novih primerov mozaikizma s pirosekvenciranjem, uporabo DNK ustne sluznice celic in tehnikami sekvenciranja mase. 1.4 Ocenjevanje prispevka oksidativnega stresa k poškodbam celic pri bolnikih s fibroblasti. 1.5. Preučevanje učinka mutacij SMC1A in SMC3 na molekularno interakcijo njunih beljakovin. 2. Prepoznati značilne fenotipe vzročnih genov SCdL. 2.1. S podrobnim, celovitim in računalniškim zbiranjem kliničnih podatkov v podatkovnih listih, ki jih protokolirajo pripomočki ali sistemi. 2.2. Ocenjevanje endokrinih osi somatotropus, nadledvične, gonadne, ščitnice in fosfokalcijevega metabolizma. 2.3. Izvajanje antropometričnih študij in študij o sestavi telesa (ITM, maščobna/moška masa, kostna denzitometrija). 2.4. Ocenjevanje stopnje prezgodnjega staranja bolnikov. 2.5. Razvoj optimiziranega diagnostičnega protokola/vodnika za študijo bolnikov z zdravilom Cornelia de Lange Spectrum (ECDL). METODA 1. Oblikovanje: Prevajalski projekt. Prospektivna in retrospektivna študija pri izbrani populaciji z merili za vključitev; 2. Študijski predmeti: Bolniki s fenotipom, združljivim s SCdL/ECDL, iz naše baze podatkov (n = 264) in nove; 3. Spremenljivke: Klinike: Kvalitativne in kvantitativne ter laboratorijske; 4. Zbiranje in analiza podatkov: Privolitev po poučitvi, računalniško zbiranje podatkov, statistična analiza; 5. Tehnike: Masivne sekvencijske plošče, ekspresivna polja, pirosekvenciranje, celične kulture, lipidna peroksidacija, oksidacija beljakovin, qPCR, 3D bioinformatične simulacijske metode, kvantifikacija hormonskih parametrov, antropometrične študije. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
ЦЕЛИ 1. Задълбочаване на знанията за етиопатогенията на SCdL. 1.1. Идентифициране на нови гени чрез разработване на масивен секвениращ диагностичен панел. 1.2. Описание на моделите на генна експресия при фибробласти при позитивни NIPBL пациенти. 1.3. Идентифициране на нови случаи на мозайка чрез пиросеквениране, използване на ДНК на лигавиците и техники за секвениране на масата. 1.4 Оценка на приноса на оксидативния стрес за увреждането на клетките при фибробласти при пациенти. 1.5. Изучаване на „силиций“ ефекта на SMC1A и SMC3 мутации върху молекулярното взаимодействие на техните протеини. 2. Идентифицирайте характерните фенотипове на причинните гени на SCdL. 2.1. Чрез подробно, изчерпателно и компютризирано събиране на клинични данни в информационни листове, протоколирани от изделия или системи. 2.2. Оценка на ендокринната ос соматотропус, надбъбречна, гонадна, щитовидна и фосфокалциева обмяна. 2.3. Извършване на антропометрични и телесни проучвания за състава (ИТМ, мастна/мъжка маса, костна денситометрия). 2.4. Оценка на степента на преждевременно стареене на пациентите. 2.5. Разработване на оптимизиран диагностичен протокол/ръководство за проучване на пациенти с Cornelia de Lange Spectrum (ECDL). МЕТОД 1. Проектиране: Преводачески проект. Прогнозно и ретроспективно проучване при избрана популация с критерии за включване; 2. Учебни предмети: Пациенти с фенотип, съвместим с SCdL/ECDL, от нашата база данни (n=264) и нови; 3. Променливи: Клиники: Качествени и количествени и лабораторни; 4. Събиране и анализ на данни: Информирано съгласие, компютъризирано събиране на данни, статистически анализ; 5. Техники: Масивни секвениращи панели, експресивни масиви, пиросеквениране, клетъчни култури, липидна пероксидация, окисляване на протеини, qPCR, 3D биоинформатични симулационни методи, количествено определяне на хормонални параметри, антропометрични изследвания. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
GĦANIJIET 1. L-approfondiment tal-għarfien tal-etjopatoġenija ta’ SCdL. 1.1. L-identifikazzjoni ta’ ġeni ġodda billi jiġi żviluppat panel dijanjostiku ta’ sekwenzar massiv. 1.2. Li jiddeskrivi x-xejriet tal-espressjoni tal-ġeni fibroblasts ta’ pazjenti pożittivi b’NIPBL. 1.3. L-identifikazzjoni ta’ każijiet ġodda ta’ mużajċiżmu permezz ta’ pyrossequencing, l-użu ta’ DNA orali taċ-ċelloli mukożali u tekniki ta’ sekwenzar tal-massa. 1.4 Il-valutazzjoni tal-kontribut tal-istress ossidattiv għall-ħsara fiċ-ċelloli fil-fibroblasti tal-pazjenti. 1.5. L-istudju “silliku” tal-effett tal-mutazzjonijiet SMC1A u SMC3 fuq l-interazzjoni molekulari tal-proteini tagħhom. 2. Identifika fenotipi karatteristiċi tal-ġeni kawżali ta’ SCdL. 2.1. Permezz ta’ ġbir dettaljat, komprensiv u kompjuterizzat ta’ data klinika fl-iskedi tad-data protokollati minn apparati jew sistemi. 2.2. Evalwazzjoni tal-assi endokrinali somatotropus, adrenali, gonadali, tirojde u l-metaboliżmu tal-fosfokalċju. 2.3. It-twettiq ta’ studji dwar il-kompożizzjoni antropometrika u tal-ġisem (BMI, massa ta’ xaħam/irġiel, densitometrija tal-għadam). 2.4. Evalwazzjoni tal-grad ta’ tixjiħ prematur tal-pazjenti. 2.5. L-iżvilupp ta’ protokoll/gwida dijanjostika ottimizzata għall-istudju ta’ pazjenti b’Cornelia de Lange Spectrum (ECDL). METODU 1. Disinn: Proġett translazzjonali. Studju prospettiv u retrospettiv f’popolazzjoni magħżula bi kriterji ta’ inklużjoni; 2. Suġġetti ta ' l- istudju: Pazjenti b’fenotip kompatibbli ma’ SCdL/ECDL, mid-database tagħna (n=264) u ġodda; 3. Varjabbli: Kliniċi: Il-kwalità u l-kwantità u l-laboratorju; 4. Il-ġbir u l-analiżi tad-data: Il-kunsens infurmat, il-ġbir tad-data kompjuterizzata, l-analiżi statistika; 5. Tekniki: Pannelli ta’ sekwenzar massivi, matriċijiet ta’ espressjoni, pyrossequencing, kulturi ta’ ċelloli, perossidazzjoni tal-lipidi, ossidazzjoni tal-proteini, qPCR, metodi ta’ simulazzjoni bijoinformatika 3D, kwantifikazzjoni tal-parametri ormonali, studji antropometriċi. (Maltese)
4 August 2022
0 references
OBJETIVOS 1. Aprofundamento do conhecimento da etiopatogenia da SCdL. 1.1. Identificar novos genes através do desenvolvimento de um painel de diagnóstico de sequenciamento maciço. 1.2. Descrever os padrões de expressão genética em fibroblastos de doentes NIPBL positivos. 1.3. Identificar novos casos de mosaicismo através de pirossequenciação, utilização de ADN de células da mucosa oral e técnicas de sequenciação em massa. 1.4 Avaliar a contribuição do stress oxidativo para o dano celular em fibroblastos de doentes. 1.5. Estudar «sillic» o efeito das mutações SMC1A e SMC3 na interação molecular das suas proteínas. 2. Identificar fenótipos característicos de genes causais de SCdL. 2.1. Através da recolha pormenorizada, completa e informatizada de dados clínicos em fichas de dados protocoladas por dispositivos ou sistemas. 2.2. Avaliação dos eixos endócrinos somatotrópicos, adrenais, gonadais, tiróide e fosfocálcio. 2.3. Realização de estudos antropométricos e de composição corporal (IMC, massa gorda/masculina, densitometria óssea). 2.4. Avaliar o grau de envelhecimento prematuro dos pacientes. 2.5. Desenvolver um protocolo/guia de diagnóstico otimizado para o estudo de doentes com Espectro de Cornelia de Lange (ECDL). MÉTODO 1. Conceção: Projecto translacional. Estudo prospetivo e retrospetivo na população selecionada com critérios de inclusão; 2. Temas de estudo: Doentes com fenótipo compatível com SCdL/ECDL, da nossa base de dados (n=264) e novos; 3. Variáveis: Clínicas: Qualitativo e quantitativo e laboratorial; 4. Recolha e análise de dados: Consentimento informado, recolha informatizada de dados, análise estatística; 5. Técnicas: Painéis maciços de sequenciação, matrizes de expressão, pirossequenciação, culturas celulares, peroxidação lipídica, oxidação de proteínas, qPCR, métodos de simulação bioinformática 3D, quantificação de parâmetros hormonais, estudos antropométricos. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
MÅL 1. Uddybe kendskabet til SCdL's ethiopathogeny. 1.1. Identificere nye gener ved at udvikle en massiv sekventering diagnostisk panel. 1.2. Beskrivelse af genekspressionsmønstrene i fibroblaster hos positive NIPBL-patienter. 1.3. Identifikation af nye tilfælde af mosaikisme gennem pyrossekventering, brug af oralt slimcelle-DNA og massesekvenseringsteknikker. 1.4 Vurdering af oxidativ stresss bidrag til celleskader i patienters fibroblaster. 1.5. Undersøgelse af "silicisk" virkningen af SMC1A- og SMC3-mutationer på deres proteiners molekylære interaktion. 2. Identificere karakteristiske fænotyper af kausale gener af SCdL. 2.1. Ved hjælp af detaljeret, omfattende og elektronisk indsamling af kliniske data i datablade, der er protokolleret af udstyr eller systemer. 2.2. Evaluering af endokrine økser somatotropus, binyrerne, gonadal, skjoldbruskkirtlen og phosphocalcium metabolisme. 2.3. Udførelse af undersøgelser af antropometrisk og kropssammensætning (BMI, fedt-/hanmasse, knogledensitometri). 2.4. Vurdering af graden af for tidlig ældning af patienter. 2.5. Udvikling af en optimeret diagnostisk protokol/vejledning til studiet af patienter med Cornelia de Lange Spectrum (ECDL). METODE 1. Konstruktion: Oversættelsesprojekt. Prospektiv og retrospektiv undersøgelse i udvalgte populationer med inklusionskriterier 2. Studieemner: Patienter med fænotype, der er kompatible med SCdL/ECDL, fra vores database (n=264) og nye; 3. Variabler: Klinikker: Kvalitative og kvantitative og laboratoriemæssige 4. Dataindsamling og -analyse: Informeret samtykke, elektronisk dataindsamling, statistisk analyse 5. Teknikker: Massive sekventering paneler, udtryk arrays, pyrossekvensering, cellekulturer, lipidperoxidation, protein oxidation, qPCR, 3D bioinformatik simuleringsmetoder, hormonal parameter kvantificering, antropometriske undersøgelser. (Danish)
4 August 2022
0 references
OBIECTIVELE 1 Aprofundarea cunoștințelor privind etiopatogenia SCdL. 1.1. Identificarea genelor noi prin dezvoltarea unui panou de diagnostic secvențial masiv. 1.2. Descrierea tiparelor expresiei genelor în fibroblastele pacienților pozitivi cu NIPBL. 1.3. Identificarea de noi cazuri de mosaicism prin pirossequencing, utilizarea ADN-ului celulelor mucoase orale și tehnici de secvențiere în masă. 1.4 Evaluarea contribuției stresului oxidativ la deteriorarea celulară a fibroblastelor pacienților. 1.5. Studierea efectului mutațiilor SMC1A și SMC3 asupra interacțiunii moleculare a proteinelor lor. 2. Identificați fenotipurile caracteristice ale genelor cauzale ale SCdL. 2.1. Prin colectarea detaliată, cuprinzătoare și computerizată a datelor clinice în fișele de date protocolate de dispozitive sau sisteme. 2.2. Evaluarea axelor endocrine somatotropus, suprarenale, gonadale, tiroide și metabolismul fosfocalcic. 2.3. Efectuarea de studii antropometrice și de compoziție corporală (IMC, grăsime/masă masculină, densitometrie osoasă). 2.4. Evaluarea gradului de îmbătrânire prematură a pacienților. 2.5. Elaborarea unui protocol/ghid de diagnosticare optimizat pentru studiul pacienților cu Cornelia de Lange Spectrum (ECDL). METODA 1. Proiectare: Proiect translațional. Studiu prospectiv și retrospectiv pe populația selectată cu criterii de includere; 2. Subiecte de studiu: Pacienți cu fenotip compatibil cu SCdL/ECDL, din baza noastră de date (n=264) și noi; 3. Variabile: Clinici: Calitativ și cantitativ și de laborator; 4. Colectarea și analiza datelor: Consimțământul în cunoștință de cauză, colectarea computerizată a datelor, analiza statistică; 5. Tehnici: Panouri de secvențiere masivă, matrice de expresie, pirossecvenție, culturi celulare, peroxidare lipidică, oxidare proteică, qPCR, metode de simulare bioinformatică 3D, cuantificare a parametrilor hormonali, studii antropometrice. (Romanian)
4 August 2022
0 references
MÅL 1. Fördjupa kunskapen om etiopatogeni av SCdL. 1.1. Identifiera nya gener genom att utveckla en massiv sekvenseringsdiagnostikpanel. 1.2. Beskriver mönster för genuttryck i fibroblaster hos positiva NIPBL-patienter. 1.3. Identifiera nya fall av mosaikism genom pyrossekvensering, användning av oralt slemhinnecells-DNA och masssekvenseringstekniker. 1.4 Bedömning av oxidativ stresss bidrag till cellskador i fibroblaster hos patienter. 1.5. Studera ”sillic” effekten av SMC1A- och SMC3-mutationer på den molekylära interaktionen mellan deras proteiner. 2. Identifiera karakteristiska fenotyper av orsaksgener av SCdL. 2.1. Genom detaljerad, omfattande och datoriserad insamling av kliniska data i datablad som protokollförs av produkter eller system. 2.2. Utvärdera de endokrina axlarna somatotropus, binjure, gonadal, sköldkörtel och fosfokalciummetabolism. 2.3. Utföra antropometriska studier och kroppssammansättningsstudier (BMI, fett/mansmassa, bentäthet). 2.4. Bedöma graden av för tidigt åldrande hos patienter. 2.5. Utveckla ett optimerat diagnosprotokoll/guide för studien av patienter med Cornelia de Lange Spectrum (ECDL). METOD 1. Utformning: Översättningsprojekt. Prospektiv och retrospektiv undersökning av utvalda populationer med inkluderingskriterier. 2. Studieämnen: Patienter med fenotyp kompatibel med SCdL/ECDL, från vår databas (n=264) och ny; 3. Variabler: Kliniker: Kvalitativt och kvantitativt samt laboratorium. 4. Insamling och analys av data: Informerat samtycke, datoriserad uppgiftsinsamling, statistisk analys. 5. Teknik: Massiva sekvenseringspaneler, uttrycksmatriser, pyrosssekvensering, cellkulturer, lipidperoxidation, proteinoxidation, qPCR, 3D bioinformatik simuleringsmetoder, hormonparameter kvantifiering, antropometriska studier. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Zaragoza
0 references
21 December 2023
0 references
Identifiers
PI15_00707
0 references