STABILITY, RESILIENCE AND FUNCTIONAL REDUNDANCY OF THE HUMAN INTESTINAL MICROBIOTA DURING DEVELOPMENT AND IN RESPONSE TO ANTIBIOTIC STRESS AND CLOSTRIDIUM DIFFICILE (Q3207520)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3207520 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | STABILITY, RESILIENCE AND FUNCTIONAL REDUNDANCY OF THE HUMAN INTESTINAL MICROBIOTA DURING DEVELOPMENT AND IN RESPONSE TO ANTIBIOTIC STRESS AND CLOSTRIDIUM DIFFICILE |
Project Q3207520 in Spain |
Statements
237,184.2 Euro
0 references
435,600.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2016
0 references
31 December 2019
0 references
FUNDACION PARA EL FOMENTO DE LA INV. SANITARIA Y BIOMEDICA DE LA COMUNIDAD VALENCIANA (FISABIO)
0 references
46010
0 references
AUNQUE DISPONEMOS DE UNA AMPLIA GAMA DE PROCEDIMIENTOS PARA CATALOGAR LOS TAXONES, LOS GENES Y LAS FUNCIONES DEL MICROBIOMA HUMANO EN CONDICIONES DE SALUD Y ENFERMEDAD, TODAVIA SEGUIMOS SIN PODER RESPONDER A QUE ES UNA MICROBIOTA ESTABLE. LA MICROBIOTA INTESTINAL, POR EJEMPLO, SE DESPLIEGA A LO LARGO DEL DESARROLLO DEL INDIVIDUO Y SU COMPOSICION Y FUNCION ES DIFERENTE SEGUN LA EDAD. EL CONCEPTO DE ESTABILIDAD COMPORTA LA IDEA DE QUE FRENTE A UNA PERTURBACION LA COMUNIDAD MICROBIANA VUELVE A SU SITUACION INICIAL EN TERMINOS DE COMPOSICION (RESILIENCIA) O FUNCION (REDUNDANCIA FUNCIONAL) CUANDO EL FACTOR PERTURBADOR DESAPARECE. ¿DEBEMOS ENTONCES CONCLUIR QUE LA MICROBIOTA INTESTINAL DE UN NIÑO SANO NO ES ESTABLE FRENTE A LA DE UN ADULTO SANO? ¿POR QUE? LA CUESTION DE LA ESTABILIDAD SE PUEDE ABORDAR TAMBIEN BAJO LA PERSPECTIVA DE UN IMPORTANTE AGENTE ALTERADOR DE LA MICROBIOTA INTESTINAL: LOS ANTIBIOTICOS. SU ACCION MODIFICA LA COMPOSICION Y FUNCION DE LA MICROBIOTA, QUE SUELE FINALIZAR EN UNA RESILIENCIA PARCIAL Y REDUNDANCIA FUNCIONAL TRAS LA DESAPARICION DEL TRATAMIENTO. NO OBSTANTE SE PUEDE ROMPER LA ESTABILIDAD HACIENDO ACTO DE PRESENCIA CLOSTRIDIUM DIFFICILE EN ALGUNAS OCASIONES. EN EL PRESENTE PROYECTO PRETENDEMOS ABORDAR LA CUESTION DE LA ESTABILIDAD TEMPORAL DE LA MICROBIOTA INTESTINAL A LO LARGO DEL DESARROLLO ASI COMO BAJO TRATAMIENTO ANTIBIOTICO O CUANDO APARECE C. DIFFICILE. VAMOS A DILUCIDAR POR MEDIO DE LA APLICACION DE UN NOVEDOSO METODO DE EVALUACION DE LA ESTABILIDAD DE LA MICROBIOTA DESARROLLADO EN EL GRUPO, ASI COMO POR LA DETERMINACION DE LA COMPOSICION (METAGENOMA) Y FUNCION (METATRANSCRIPTOMA Y METABOLOMA) DE LA MICROBIOTA INTESTINAL Y SU INTERACCION CON EL VIROMA, LOS MECANISMOS QUE PROMUEVEN LA RESILIENCIA Y LA REDUNDANCIA FUNCIONAL, IDENTIFICANDO CONCRETAMENTE EN LAS REDES BAYESIANAS Y DE CO-OCURRENCIA AQUELLOS TAXONES, FUNCIONES O RUTAS QUE CAMBIAN A LO LARGO DEL DESARROLLO O QUE NOS PROTEGEN DE LA ACUMULACION DE GENES DE RESISTENCIA EN BACTERIAS PORTADORAS DE LOS MISMOS O DE C. DIFFICILE. (Spanish)
0 references
ALTHOUGH WE HAVE A WIDE RANGE OF PROCEDURES FOR CATALOGING TAXA, GENES AND FUNCTIONS OF THE HUMAN MICROBIOME IN HEALTH AND DISEASE CONDITIONS, WE STILL CANNOT RESPOND TO THE FACT THAT IT IS A STABLE MICROBIOTA. THE INTESTINAL MICROBIOTA, FOR EXAMPLE, UNFOLDS THROUGHOUT THE INDIVIDUAL’S DEVELOPMENT AND ITS COMPOSITION AND FUNCTION IS DIFFERENT DEPENDING ON AGE. THE CONCEPT OF STABILITY IMPLIES THE IDEA THAT IN THE FACE OF A DISTURBANCE THE MICROBIAL COMMUNITY RETURNS TO ITS INITIAL SITUATION IN TERMS OF COMPOSITION (RESILIENCE) OR FUNCTION (FUNCTIONAL REDUNDANCY) WHEN THE DISTURBING FACTOR DISAPPEARS. SHOULD WE THEN CONCLUDE THAT THE INTESTINAL MICROBIOTA OF A HEALTHY CHILD IS NOT STABLE COMPARED TO THAT OF A HEALTHY ADULT? WHY? WHY? THE QUESTION OF STABILITY CAN ALSO BE ADDRESSED FROM THE PERSPECTIVE OF AN IMPORTANT DISRUPTING AGENT OF THE INTESTINAL MICROBIOTA: ANTIBIOTICS. ITS ACTION MODIFIES THE COMPOSITION AND FUNCTION OF THE MICROBIOTA, WHICH USUALLY ENDS IN A PARTIAL RESILIENCE AND FUNCTIONAL REDUNDANCY AFTER THE DISAPPEARANCE OF TREATMENT. HOWEVER, THE STABILITY CAN BE BROKEN BY HAVING THE PRESENCE OF CLOSTRIDIUM DIFFICILE ON SOME OCCASIONS. IN THIS PROJECT WE AIM TO ADDRESS THE QUESTION OF THE TEMPORAL STABILITY OF THE INTESTINAL MICROBIOTA THROUGHOUT DEVELOPMENT AS WELL AS UNDER ANTIBIOTIC TREATMENT OR WHEN C. DIFFICILE APPEARS. WE WILL ELUCIDATE BY THE APPLICATION OF A NOVEL METHOD OF EVALUATION OF THE STABILITY OF THE MICROBIOTA DEVELOPED IN THE GROUP, AS WELL AS BY THE DETERMINATION OF THE COMPOSITION (METAGENOMA) AND FUNCTION (METATRANSCRIPTOMA AND METABOLOMA) OF THE INTESTINAL MICROBIOTA AND ITS INTERACTION WITH THE VIROMA, THE MECHANISMS THAT PROMOTE RESILIENCE AND FUNCTIONAL REDUNDANCY, SPECIFICALLY IDENTIFYING IN THE BAYESIAN AND CO-OCCURRENCE NETWORKS THOSE TAXA, FUNCTIONS OR ROUTES THAT CHANGE THROUGHOUT THE DEVELOPMENT OR THAT PROTECT US FROM THE ACCUMULATION OF RESISTANCE GENES IN BACTERIA CARRIERS. (English)
13 October 2021
0.1498269501744885
0 references
BIEN QUE NOUS DISPOSIONS D’UN LARGE ÉVENTAIL DE PROCÉDURES POUR LE CATALOGAGE DES TAXONS, DES GÈNES ET DES FONCTIONS DU MICROBIOME HUMAIN DANS LES CONDITIONS DE SANTÉ ET DE MALADIE, NOUS NE POUVONS TOUJOURS PAS RÉPONDRE AU FAIT QU’IL S’AGIT D’UN MICROBIOTE STABLE. LE MICROBIOTE INTESTINAL, PAR EXEMPLE, SE DÉROULE TOUT AU LONG DU DÉVELOPPEMENT DE L’INDIVIDU ET SA COMPOSITION ET SA FONCTION SONT DIFFÉRENTES SELON L’ÂGE. LE CONCEPT DE STABILITÉ IMPLIQUE L’IDÉE QUE, FACE À UNE PERTURBATION, LA COMMUNAUTÉ MICROBIENNE REVIENT À SA SITUATION INITIALE EN TERMES DE COMPOSITION (RÉSILIENCE) OU DE FONCTION (REDONDANCE FONCTIONNELLE) LORSQUE LE FACTEUR PERTURBATEUR DISPARAÎT. DEVRIONS-NOUS ALORS CONCLURE QUE LE MICROBIOTE INTESTINAL D’UN ENFANT EN BONNE SANTÉ N’EST PAS STABLE PAR RAPPORT À CELUI D’UN ADULTE EN BONNE SANTÉ? POURQUOI? LA QUESTION DE LA STABILITÉ PEUT ÉGALEMENT ÊTRE ABORDÉE SOUS L’ANGLE D’UN AGENT PERTURBATEUR IMPORTANT DU MICROBIOTE INTESTINAL: DES ANTIBIOTIQUES. SON ACTION MODIFIE LA COMPOSITION ET LA FONCTION DU MICROBIOTE, QUI SE TERMINE GÉNÉRALEMENT PAR UNE RÉSILIENCE PARTIELLE ET UNE REDONDANCE FONCTIONNELLE APRÈS LA DISPARITION DU TRAITEMENT. CEPENDANT, LA STABILITÉ PEUT ÊTRE BRISÉE EN AYANT LA PRÉSENCE DE CLOSTRIDIUM DIFFICILE À CERTAINES OCCASIONS. DANS CE PROJET, NOUS VISONS À ABORDER LA QUESTION DE LA STABILITÉ TEMPORELLE DU MICROBIOTE INTESTINAL TOUT AU LONG DU DÉVELOPPEMENT AINSI QUE SOUS TRAITEMENT ANTIBIOTIQUE OU LORSQUE C. DIFFICILE APPARAÎT. NOUS ALLONS ÉLUCIDER PAR L’APPLICATION D’UNE NOUVELLE MÉTHODE D’ÉVALUATION DE LA STABILITÉ DU MICROBIOTE DÉVELOPPÉ DANS LE GROUPE, AINSI QUE PAR LA DÉTERMINATION DE LA COMPOSITION (METAGENOMA) ET FONCTION (METATRANSCRIPTOMA ET METABOLOMA) DU MICROBIOTE INTESTINAL ET SON INTERACTION AVEC LE VIROMA, LES MÉCANISMES QUI FAVORISENT LA RÉSILIENCE ET LA REDONDANCE FONCTIONNELLE, EN IDENTIFIANT SPÉCIFIQUEMENT DANS LES RÉSEAUX BAYÉSIENS ET CO-OCCURRENCES CES TAXONS, FONCTIONS OU VOIES QUI CHANGENT TOUT AU LONG DU DÉVELOPPEMENT OU QUI NOUS PROTÈGENT DE L’ACCUMULATION DE GÈNES DE RÉSISTANCE DANS LES VECTEURS BACTÉRIENS. (French)
5 December 2021
0 references
OBWOHL WIR EINE BREITE PALETTE VON VERFAHREN ZUR KATALOGISIERUNG VON TAXA, GENEN UND FUNKTIONEN DES MENSCHLICHEN MIKROBIOMS UNTER GESUNDHEITS- UND KRANKHEITSBEDINGUNGEN HABEN, KÖNNEN WIR NICHT AUF DIE TATSACHE REAGIEREN, DASS ES SICH UM EINE STABILE MIKROBIOTA HANDELT. DIE INTESTINALE MIKROBIOTA ENTFALTET SICH Z. B. WÄHREND DER GESAMTEN ENTWICKLUNG DES INDIVIDUUMS UND SEINE ZUSAMMENSETZUNG UND FUNKTION IST JE NACH ALTER UNTERSCHIEDLICH. DER BEGRIFF DER STABILITÄT IMPLIZIERT DIE VORSTELLUNG, DASS DIE MIKROBIELLEN GEMEINSCHAFT ANGESICHTS EINER STÖRUNG IN BEZUG AUF ZUSAMMENSETZUNG (RESILIENZ) ODER FUNKTION (FUNKTIONELLE REDUNDANZ) WIEDER ZU IHRER AUSGANGSSITUATION ZURÜCKKEHRT, WENN DER STÖRENDE FAKTOR VERSCHWINDET. SOLLTEN WIR DANN ZU DEM SCHLUSS KOMMEN, DASS DIE DARMMIKROBIOTA EINES GESUNDEN KINDES IM VERGLEICH ZU EINEM GESUNDEN ERWACHSENEN NICHT STABIL IST? WARUM? DIE FRAGE DER STABILITÄT KANN AUCH AUS DER PERSPEKTIVE EINES WICHTIGEN STÖRENDEN WIRKSTOFFS DER DARMMIKROBIOTA BEHANDELT WERDEN: ANTIBIOTIKA. SEINE WIRKUNG ÄNDERT DIE ZUSAMMENSETZUNG UND FUNKTION DER MIKROBIOTA, DIE IN DER REGEL NACH DEM VERSCHWINDEN DER BEHANDLUNG IN EINER PARTIELLEN WIDERSTANDSFÄHIGKEIT UND FUNKTIONELLEN REDUNDANZ ENDET. ALLERDINGS KANN DIE STABILITÄT DURCH DAS VORHANDENSEIN VON CLOSTRIDIUM DIFFICILE BEI EINIGEN GELEGENHEITEN GEBROCHEN WERDEN. IN DIESEM PROJEKT WOLLEN WIR DIE FRAGE DER ZEITLICHEN STABILITÄT DER DARMMIKROBIOTA SOWOHL WÄHREND DER ENTWICKLUNG ALS AUCH UNTER ANTIBIOTIKABEHANDLUNG ODER DEM AUFTRETEN VON C. DIFFICILE BEHANDELN. WIR WERDEN DURCH DIE ANWENDUNG EINER NEUARTIGEN METHODE ZUR BEWERTUNG DER STABILITÄT DER IN DER GRUPPE ENTWICKELTEN MIKROBIOTA, SOWIE DURCH DIE BESTIMMUNG DER ZUSAMMENSETZUNG (METAGENOMA) UND FUNKTION (METATRANSCRIPTOMA UND METABOLOMA) DER DARMMIKROBIOTA UND DEREN INTERAKTION MIT DEM VIROMA, DEN MECHANISMEN, DIE DIE WIDERSTANDSFÄHIGKEIT UND FUNKTIONSREDUNDANZ FÖRDERN, INSBESONDERE IN DEN BAYESISCHEN NETZWERKEN UND CO-AUFTRITTSNETZWERKEN JENE TAXA, FUNKTIONEN ODER ROUTEN, DIE SICH WÄHREND DER GESAMTEN ENTWICKLUNG ÄNDERN ODER UNS VOR DER AKKUMULATION VON RESISTENZGENEN IN BAKTERIENTRÄGERN SCHÜTZEN, VERDEUTLICHEN. (German)
9 December 2021
0 references
HOEWEL WE EEN BREED SCALA AAN PROCEDURES HEBBEN VOOR HET CATALOGISEREN VAN TAXA, GENEN EN FUNCTIES VAN HET MENSELIJKE MICROBIOME IN GEZONDHEIDS- EN ZIEKTEOMSTANDIGHEDEN, KUNNEN WE NOG STEEDS NIET REAGEREN OP HET FEIT DAT HET EEN STABIELE MICROBIOTA IS. DE DARMMICROBIOTA, BIJVOORBEELD, ONTVOUWT ZICH DOOR DE ONTWIKKELING VAN HET INDIVIDU EN ZIJN SAMENSTELLING EN FUNCTIE ZIJN VERSCHILLEND AFHANKELIJK VAN LEEFTIJD. HET BEGRIP „STABILITEIT” IMPLICEERT HET IDEE DAT DE MICROBIËLE GEMEENSCHAP IN GEVAL VAN VERSTORING TERUGKEERT NAAR HAAR OORSPRONKELIJKE SITUATIE IN TERMEN VAN SAMENSTELLING (WEERBAARHEID) OF FUNCTIE (FUNCTIONEEL ONTSLAG) WANNEER DE STORENDE FACTOR VERDWIJNT. MOETEN WE DAN CONCLUDEREN DAT DE DARMMICROBIOTA VAN EEN GEZOND KIND NIET STABIEL IS IN VERGELIJKING MET DIE VAN EEN GEZONDE VOLWASSENE? WAAROM? DE KWESTIE VAN STABILITEIT KAN OOK WORDEN AANGEPAKT VANUIT HET PERSPECTIEF VAN EEN BELANGRIJK VERSTOREND AGENS VAN DE DARMMICROBIOTA: ANTIBIOTICA. DE ACTIE WIJZIGT DE SAMENSTELLING EN FUNCTIE VAN DE MICROBIOTA, DIE MEESTAL EINDIGT IN EEN GEDEELTELIJKE VEERKRACHT EN FUNCTIONELE REDUNDANTIE NA HET VERDWIJNEN VAN DE BEHANDELING. ECHTER, DE STABILITEIT KAN WORDEN VERBROKEN DOOR DE AANWEZIGHEID VAN CLOSTRIDIUM DIFFICILE BIJ SOMMIGE GELEGENHEDEN. IN DIT PROJECT STREVEN WE NAAR DE KWESTIE VAN DE TEMPORELE STABILITEIT VAN DE DARMMICROBIOTA TIJDENS DE ONTWIKKELING EN ONDER ANTIBIOTICABEHANDELING OF WANNEER C. DIFFICILE VERSCHIJNT. WE ZULLEN OPHELDEREN DOOR DE TOEPASSING VAN EEN NIEUWE METHODE VOOR DE EVALUATIE VAN DE STABILITEIT VAN DE MICROBIOTA ONTWIKKELD IN DE GROEP, ALSMEDE DOOR DE BEPALING VAN DE SAMENSTELLING (METAGENOMA) EN FUNCTIE (METATRANSCRIPTOMA EN METABOLOMA) VAN DE DARMMICROBIOTA EN DE INTERACTIE ERVAN MET DE VIROMA, DE MECHANISMEN DIE DE VEERKRACHT EN FUNCTIONELE REDUNDANTIE BEVORDEREN, WAARBIJ SPECIFIEK IN DE BAYESIAANSE EN CO-ACTRENCENETWERKEN DIE TAXA, FUNCTIES OF ROUTES DIE VERANDEREN TIJDENS DE ONTWIKKELING OF DIE ONS BESCHERMEN TEGEN DE ACCUMULATIE VAN RESISTENTIEGENEN IN BACTERIËNDRAGERS. (Dutch)
17 December 2021
0 references
SEBBENE ABBIAMO UNA VASTA GAMMA DI PROCEDURE PER LA CATALOGAZIONE DI TAXA, GENI E FUNZIONI DEL MICROBIOMA UMANO IN CONDIZIONI DI SALUTE E MALATTIE, NON POSSIAMO ANCORA RISPONDERE AL FATTO CHE SI TRATTA DI UN MICROBIOTA STABILE. IL MICROBIOTA INTESTINALE, AD ESEMPIO, SI SVILUPPA IN TUTTO LO SVILUPPO DELL'INDIVIDUO E LA SUA COMPOSIZIONE E FUNZIONE È DIVERSA A SECONDA DELL'ETÀ. IL CONCETTO DI STABILITÀ IMPLICA L'IDEA CHE, DI FRONTE A UNA PERTURBAZIONE, LA COMUNITÀ MICROBICA RITORNI ALLA SUA SITUAZIONE INIZIALE IN TERMINI DI COMPOSIZIONE (RESILIENZA) O FUNZIONE (RIDONDANZA FUNZIONALE) QUANDO IL FATTORE DISTURBANTE SCOMPARE. DOVREMMO POI CONCLUDERE CHE IL MICROBIOTA INTESTINALE DI UN BAMBINO SANO NON È STABILE RISPETTO A QUELLO DI UN ADULTO SANO? PERCHÉ? PERCHÉ? LA QUESTIONE DELLA STABILITÀ PUÒ ESSERE AFFRONTATA ANCHE DAL PUNTO DI VISTA DI UN IMPORTANTE AGENTE DISTURBANTE DEL MICROBIOTA INTESTINALE: ANTIBIOTICI. LA SUA AZIONE MODIFICA LA COMPOSIZIONE E LA FUNZIONE DEL MICROBIOTA, CHE DI SOLITO TERMINA IN UNA PARZIALE RESILIENZA E RIDONDANZA FUNZIONALE DOPO LA SCOMPARSA DEL TRATTAMENTO. TUTTAVIA, LA STABILITÀ PUÒ ESSERE ROTTA AVENDO LA PRESENZA DI CLOSTRIDIUM DIFFICILE IN ALCUNE OCCASIONI. IN QUESTO PROGETTO CI PROPONIAMO DI AFFRONTARE LA QUESTIONE DELLA STABILITÀ TEMPORALE DEL MICROBIOTA INTESTINALE DURANTE TUTTO LO SVILUPPO E IN FASE DI TRATTAMENTO ANTIBIOTICO O QUANDO APPARE C. DIFFICILE. DELUCIDAREMO CON L'APPLICAZIONE DI UN NUOVO METODO DI VALUTAZIONE DELLA STABILITÀ DEL MICROBIOTA SVILUPPATO NEL GRUPPO, NONCHÉ CON LA DETERMINAZIONE DELLA COMPOSIZIONE (METAGENOMA) E DELLA FUNZIONE (METATRANSCRIPTOMA E METABOLOMA) DEL MICROBIOTA INTESTINALE E DELLA SUA INTERAZIONE CON IL VIROMA, I MECCANISMI CHE PROMUOVONO LA RESILIENZA E LA RIDONDANZA FUNZIONALE, IDENTIFICANDO SPECIFICAMENTE NELLE RETI BAYESIANE E CO-OCCURRENCE QUEI TAXA, FUNZIONI O VIE CHE CAMBIANO DURANTE TUTTO LO SVILUPPO O CHE CI PROTEGGONO DALL'ACCUMULO DI GENI DI RESISTENZA NEI VETTORI BATTERICI. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΑΝ ΚΑΙ ΈΧΟΥΜΕ ΈΝΑ ΕΥΡΎ ΦΆΣΜΑ ΔΙΑΔΙΚΑΣΙΏΝ ΓΙΑ ΤΗΝ ΚΑΤΑΛΟΓΟΓΡΆΦΗΣΗ ΤΑΞΙΝΟΜΙΚΏΝ ΤΆΞΕΩΝ, ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΚΑΙ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΏΝ ΤΟΥ ΑΝΘΡΏΠΙΝΟΥ ΜΙΚΡΟΒΙΏΜΑΤΟΣ ΣΕ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΥΓΕΊΑΣ ΚΑΙ ΝΌΣΟΥ, ΔΕΝ ΜΠΟΡΟΎΜΕ ΑΚΌΜΑ ΝΑ ΑΝΤΑΠΟΚΡΙΘΟΎΜΕ ΣΤΟ ΓΕΓΟΝΌΣ ΌΤΙ ΠΡΌΚΕΙΤΑΙ ΓΙΑ ΜΙΑ ΣΤΑΘΕΡΉ ΜΙΚΡΟΒΙΏΤΑ. Η ΕΝΤΕΡΙΚΉ ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΉ, ΓΙΑ ΠΑΡΆΔΕΙΓΜΑ, ΕΚΤΥΛΊΣΣΕΤΑΙ ΣΕ ΌΛΗ ΤΗΝ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΤΟΥ ΑΤΌΜΟΥ ΚΑΙ ΤΗ ΣΎΝΘΕΣΗ ΚΑΙ ΤΗ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΑ ΤΟΥ ΕΊΝΑΙ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΉ ΑΝΆΛΟΓΑ ΜΕ ΤΗΝ ΗΛΙΚΊΑ. Η ΈΝΝΟΙΑ ΤΗΣ ΣΤΑΘΕΡΌΤΗΤΑΣ ΣΥΝΕΠΆΓΕΤΑΙ ΤΗΝ ΙΔΈΑ ΌΤΙ, ΣΕ ΠΕΡΊΠΤΩΣΗ ΔΙΑΤΑΡΑΧΉΣ, Η ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΉ ΚΟΙΝΌΤΗΤΑ ΕΠΑΝΈΡΧΕΤΑΙ ΣΤΗΝ ΑΡΧΙΚΉ ΤΗΣ ΚΑΤΆΣΤΑΣΗ ΌΣΟΝ ΑΦΟΡΆ ΤΗ ΣΎΝΘΕΣΗ (ΑΝΘΕΚΤΙΚΌΤΗΤΑ) Ή ΤΗ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΑ (ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΉ ΑΠΌΛΥΣΗ) ΌΤΑΝ ΕΞΑΦΑΝΊΖΕΤΑΙ Ο ΑΝΗΣΥΧΗΤΙΚΌΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑΣ. ΘΑ ΠΡΈΠΕΙ ΣΤΗ ΣΥΝΈΧΕΙΑ ΝΑ ΣΥΜΠΕΡΆΝΟΥΜΕ ΌΤΙ Η ΕΝΤΕΡΙΚΉ ΜΙΚΡΟΒΊΩΣΗ ΕΝΌΣ ΥΓΙΟΎΣ ΠΑΙΔΙΟΎ ΔΕΝ ΕΊΝΑΙ ΣΤΑΘΕΡΉ ΣΕ ΣΎΓΚΡΙΣΗ ΜΕ ΕΚΕΊΝΗ ΕΝΌΣ ΥΓΙΟΎΣ ΕΝΉΛΙΚΑ; ΓΙΑ ΠΟΙΟ ΛΌΓΟ; ΓΙΑ ΠΟΙΟ ΛΌΓΟ; ΤΟ ΖΉΤΗΜΑ ΤΗΣ ΣΤΑΘΕΡΌΤΗΤΑΣ ΜΠΟΡΕΊ ΕΠΊΣΗΣ ΝΑ ΑΝΤΙΜΕΤΩΠΙΣΤΕΊ ΑΠΌ ΤΗΝ ΆΠΟΨΗ ΕΝΌΣ ΣΗΜΑΝΤΙΚΟΎ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑ ΔΙΑΤΆΡΑΞΗΣ ΤΗΣ ΕΝΤΕΡΙΚΉΣ ΜΙΚΡΟΒΙΌΤΗΣ: ΑΝΤΙΒΙΟΤΙΚΆ. Η ΔΡΆΣΗ ΤΟΥ ΤΡΟΠΟΠΟΙΕΊ ΤΗ ΣΎΝΘΕΣΗ ΚΑΙ ΤΗ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΑ ΤΗΣ ΜΙΚΡΟΒΙΏΤΑΣ, Η ΟΠΟΊΑ ΣΥΝΉΘΩΣ ΚΑΤΑΛΉΓΕΙ ΣΕ ΜΕΡΙΚΉ ΑΝΘΕΚΤΙΚΌΤΗΤΑ ΚΑΙ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΉ ΑΠΌΛΥΣΗ ΜΕΤΆ ΤΗΝ ΕΞΑΦΆΝΙΣΗ ΤΗΣ ΘΕΡΑΠΕΊΑΣ. ΩΣΤΌΣΟ, Η ΣΤΑΘΕΡΌΤΗΤΑ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΣΠΆΣΕΙ ΜΕ ΤΗΝ ΠΑΡΟΥΣΊΑ CLOSTRIDIUM DIFFICILE ΣΕ ΟΡΙΣΜΈΝΕΣ ΠΕΡΙΠΤΏΣΕΙΣ. ΣΕ ΑΥΤΌ ΤΟ ΈΡΓΟ ΣΤΟΧΕΎΟΥΜΕ ΝΑ ΑΝΤΙΜΕΤΩΠΊΣΟΥΜΕ ΤΟ ΖΉΤΗΜΑ ΤΗΣ ΧΡΟΝΙΚΉΣ ΣΤΑΘΕΡΌΤΗΤΑΣ ΤΗΣ ΕΝΤΕΡΙΚΉΣ ΜΙΚΡΟΒΊΩΣΗΣ ΚΑΘ’ ΌΛΗ ΤΗ ΔΙΆΡΚΕΙΑ ΤΗΣ ΑΝΆΠΤΥΞΗΣ, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΥΠΌ ΑΝΤΙΒΙΟΤΙΚΉ ΑΓΩΓΉ Ή ΌΤΑΝ ΕΜΦΑΝΊΖΕΤΑΙ ΤΟ C. DIFFICILE. ΘΑ ΑΠΟΣΑΦΗΝΊΣΟΥΜΕ ΜΕ ΤΗΝ ΕΦΑΡΜΟΓΉ ΜΙΑΣ ΝΈΑΣ ΜΕΘΌΔΟΥ ΑΞΙΟΛΌΓΗΣΗΣ ΤΗΣ ΣΤΑΘΕΡΌΤΗΤΑΣ ΤΗΣ ΜΙΚΡΟΒΙΏΤΑΣ ΠΟΥ ΑΝΑΠΤΎΣΣΕΤΑΙ ΣΤΗΝ ΟΜΆΔΑ, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΜΕ ΤΟΝ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΌ ΤΗΣ ΣΎΝΘΕΣΗΣ (METAGENOMA) ΚΑΙ ΤΗΣ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΑΣ (METATRANSCRIPTOMA ΚΑΙ METABOLOMA) ΤΗΣ ΕΝΤΕΡΙΚΉΣ ΜΙΚΡΟΒΊΩΣΗΣ ΚΑΙ ΤΗΣ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΉΣ ΤΗΣ ΜΕ ΤΟ VIROMA, ΤΟΥΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΎΣ ΠΟΥ ΠΡΟΩΘΟΎΝ ΤΗΝ ΑΝΘΕΚΤΙΚΌΤΗΤΑ ΚΑΙ ΤΗ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΉ ΑΠΌΛΥΣΗ, ΠΡΟΣΔΙΟΡΊΖΟΝΤΑΣ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΑ ΣΤΑ ΔΊΚΤΥΑ BAYESIAN ΚΑΙ ΣΥΝ-ΣΥΜΒΉΣ ΤΙΣ ΤΑΞΙΝΟΜΙΚΈΣ ΤΆΞΕΙΣ, ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΕΣ Ή ΔΙΑΔΡΟΜΈΣ ΠΟΥ ΑΛΛΆΖΟΥΝ ΚΑΘ’ ΌΛΗ ΤΗ ΔΙΆΡΚΕΙΑ ΤΗΣ ΑΝΆΠΤΥΞΗΣ Ή ΠΟΥ ΜΑΣ ΠΡΟΣΤΑΤΕΎΟΥΝ ΑΠΌ ΤΗ ΣΥΣΣΏΡΕΥΣΗ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΑΝΤΟΧΉΣ ΣΕ ΦΟΡΕΊΣ ΒΑΚΤΗΡΊΩΝ. (Greek)
18 August 2022
0 references
SELV OM VI HAR EN BRED VIFTE AF PROCEDURER FOR KATALOGISERING AF TAKA, GENER OG FUNKTIONER AF DET MENNESKELIGE MIKROBIOM I SUNDHEDS- OG SYGDOMSTILSTANDE, KAN VI STADIG IKKE REAGERE PÅ DET FAKTUM, AT DET ER EN STABIL MIKROBIOTA. INTESTINAL MIKROBIOTA UDFOLDER SIG F.EKS. GENNEM HELE INDIVIDETS UDVIKLING OG DETS SAMMENSÆTNING OG FUNKTION ER FORSKELLIG AFHÆNGIGT AF ALDER. STABILITETSBEGREBET INDEBÆRER, AT DET MIKROBIELLE FÆLLESSKAB I LYSET AF EN FORSTYRRELSE VENDER TILBAGE TIL SIN OPRINDELIGE SITUATION MED HENSYN TIL SAMMENSÆTNING (MODSTANDSDYGTIGHED) ELLER FUNKTION (FUNKTIONEL REDUNDANS), NÅR DEN FORSTYRRENDE FAKTOR FORSVINDER. SKAL VI SÅ KONKLUDERE, AT ET SUNDT BARNS TARMMIKROBIOTA IKKE ER STABIL I FORHOLD TIL EN SUND VOKSENS? HVORFOR? HVORFOR? SPØRGSMÅLET OM STABILITET KAN OGSÅ BEHANDLES UD FRA ET VIGTIGT FORSTYRRENDE MIDDEL I TARMMIKROBIOTAEN: ANTIBIOTIKA. DENS VIRKNING ÆNDRER SAMMENSÆTNINGEN OG FUNKTIONEN AF MIKROBIOTA, SOM NORMALT ENDER I EN DELVIS MODSTANDSDYGTIGHED OG FUNKTIONEL REDUNDANS EFTER BEHANDLINGENS FORSVINDEN. STABILITETEN KAN DOG BRYDES VED AT HAVE TILSTEDEVÆRELSEN AF CLOSTRIDIUM DIFFICILE VED NOGLE LEJLIGHEDER. I DETTE PROJEKT SIGTER VI MOD AT BEHANDLE SPØRGSMÅLET OM DEN TIDSMÆSSIGE STABILITET AF TARMMIKROBIOTA UNDER HELE UDVIKLINGEN SAMT UNDER ANTIBIOTIKABEHANDLING, ELLER NÅR C. DIFFICILE VISES. VI VIL BELYSE VED ANVENDELSE AF EN NY METODE TIL EVALUERING AF STABILITETEN AF DEN MIKROBIOTA, DER ER UDVIKLET I GRUPPEN, SAMT VED BESTEMMELSE AF SAMMENSÆTNINGEN (METAGENOMA) OG FUNKTION (METATRANSCRIPTOMA OG METABOLOMA) AF TARMMIKROBIOTA OG DENS INTERAKTION MED VIROMA, DE MEKANISMER, DER FREMMER MODSTANDSDYGTIGHED OG FUNKTIONEL REDUNDANS, OG SOM SPECIFIKT I BAYESISKE OG CO-FOREKOMST NETVÆRK IDENTIFICERER DE SYSTEMATISKE ENHEDER, FUNKTIONER ELLER RUTER, DER ÆNDRER SIG GENNEM HELE UDVIKLINGEN, ELLER SOM BESKYTTER OS MOD AKKUMULERING AF RESISTENSGENER I BAKTERIEBÆRERE. (Danish)
18 August 2022
0 references
VAIKKA MEILLÄ ON LAAJA VALIKOIMA MENETELMIÄ TAKSOJEN, GEENIEN JA IHMISEN MIKROBIOMIN TOIMINTOJEN LUETTELOIMISEKSI TERVEYS- JA TAUTIOLOSUHTEISSA, EMME VOI VIELÄKÄÄN VASTATA SIIHEN, ETTÄ SE ON VAKAA MIKROBIOTA. ESIMERKIKSI SUOLISTON MIKROBIOTA KEHITTYY KOKO YKSILÖN KEHITYKSEN AJAN, JA SEN KOOSTUMUS JA TOIMINTA VAIHTELEVAT IÄSTÄ RIIPPUEN. VAKAUDEN KÄSITE MERKITSEE AJATUSTA SIITÄ, ETTÄ HÄIRIÖTILANTEESSA MIKROBIYHTEISÖ PALAA ALKUPERÄISEEN TILANTEESEENSA KOOSTUMUKSEN (RESILIENSSIN) TAI TOIMINNAN (TOIMINNALLINEN REDUNDANSSI) OSALTA, KUN HÄIRITSEVÄ TEKIJÄ KATOAA. PITÄISIKÖ SITTEN PÄÄTELLÄ, ETTÄ TERVEEN LAPSEN SUOLISTON MIKROBIOTA EI OLE VAKAA VERRATTUNA TERVEESEEN AIKUISEEN? MIKSI? MIKSI? STABIILISUUTTA KOSKEVAA KYSYMYSTÄ VOIDAAN KÄSITELLÄ MYÖS SUOLISTON MIKROBIOTAN MERKITTÄVÄN HÄIRIÖTEKIJÄN NÄKÖKULMASTA: ANTIBIOOTIT. SEN TOIMINTA MUUTTAA MIKROBIOTAN KOOSTUMUSTA JA TOIMINTAA, JOKA YLEENSÄ PÄÄTTYY OSITTAISEEN SIETOKYKYYN JA TOIMINNALLISEEN REDUNDANSSIIN HOIDON KATOAMISEN JÄLKEEN. KUITENKIN VAKAUS VOIDAAN RIKKOA OTTAA LÄSNÄOLO CLOSTRIDIUM DIFFICILE JOISSAKIN TAPAUKSISSA. TÄSSÄ HANKKEESSA PYRIMME KÄSITTELEMÄÄN KYSYMYSTÄ SUOLISTON MIKROBIOTAN AJALLISESTA STABIILISUUDESTA KOKO KEHITYKSEN AJAN SEKÄ ANTIBIOOTTIHOIDON AIKANA TAI KUN C. DIFFICILE ILMAANTUU. SELVITÄMME SOVELTAMALLA UUTTA MENETELMÄÄ RYHMÄN KEHITTÄMÄN MIKROBIOTAN VAKAUDEN ARVIOIMISEKSI SEKÄ MÄÄRITTÄMÄLLÄ SUOLISTON MIKROBIOTAN KOOSTUMUKSEN (METAGENOMA) JA TOIMINNAN (METATRANSCRIPTOMA JA METABOLOMA) JA SEN VUOROVAIKUTUKSEN VIROMAN KANSSA, MEKANISMIT, JOTKA EDISTÄVÄT HÄIRIÖNSIETOKYKYÄ JA TOIMINNALLISTA REDUNDANSSIA JA YKSILÖIVÄT BAYESIAN JA RINNAKKAISESINEIDEN VERKOSTOISSA NE TAKSONIT, TOIMINNOT TAI REITIT, JOTKA MUUTTUVAT KOKO KEHITYKSEN AJAN TAI JOTKA SUOJAAVAT MEITÄ VASTUSGEENIEN KERTYMISELTÄ BAKTEERIEN KANTAJIIN. (Finnish)
18 August 2022
0 references
GĦALKEMM GĦANDNA FIRXA WIESGĦA TA ‘PROĊEDURI GĦALL-KATALOGAR TAXA, IL-ĠENI U L-FUNZJONIJIET TAL-MIKROBIJOMA UMANA FIL-KUNDIZZJONIJIET TAS-SAĦĦA U L-MARD, XORTA MA NISTGĦUX NIRRISPONDU GĦALL-FATT LI HUWA MIKROBIJOTA STABBLI. IL-MIKROBIJOTA INTESTINALI, PEREŻEMPJU, TIŻVOLĠI FL-IŻVILUPP KOLLU TAL-INDIVIDWU U L-KOMPOŻIZZJONI U L-FUNZJONI TAGĦHA HIJA DIFFERENTI SKONT L-ETÀ. IL-KUNĊETT TA’ STABBILTÀ JIMPLIKA L-IDEA LI FIL-KONFRONT TA’ DISTURB IL-KOMUNITÀ MIKROBIKA TERĠA’ LURA GĦAS-SITWAZZJONI INIZJALI TAGĦHA F’TERMINI TA’ KOMPOŻIZZJONI (REŻILJENZA) JEW FUNZJONI (REDUNDANCY FUNZJONALI) META L-FATTUR INKWETANTI JISPARIXXI. GĦANDNA MBAGĦAD NIKKONKLUDU LI L-MIKROBIJOTA INTESTINALI TA’ TIFEL B’SAĦĦTU MHIJIEX STABBLI META MQABBLA MA’ DIK TA’ ADULT B’SAĦĦTU? GĦALIEX? GĦALIEX? IL-KWISTJONI TAL-ISTABBILTÀ TISTA’ TIĠI INDIRIZZATA WKOLL MILL-PERSPETTIVA TA’ AĠENT TA’ TFIXKIL IMPORTANTI TAL-MIKROBIJOTA INTESTINALI: ANTIBIJOTIĊI. L-AZZJONI TAGĦHA TIMMODIFIKA L-KOMPOŻIZZJONI U L-FUNZJONI TAL-MIKROBIJOTA, LI NORMALMENT TISPIĊĊA F’REŻILJENZA PARZJALI U SENSJI FUNZJONALI WARA L-GĦAJBIEN TAT-TRATTAMENT. MADANKOLLU, L-ISTABBILTÀ TISTA ‘TINKISER BILLI L-PREŻENZA TA’ CLOSTRIDIUM DIFFICILE F’XI OKKAŻJONIJIET. F’DAN IL-PROĠETT GĦANDNA L-GĦAN LI NINDIRIZZAW IL-KWISTJONI TAL-ISTABBILTÀ TEMPORALI TAL-MIKROBIJOTA INTESTINALI MATUL L-IŻVILUPP KIF UKOLL TAĦT TRATTAMENT ANTIBIJOTIKU JEW META JIDHER C. DIFFICILE. AĦNA SER NISPIĊĊAW BL-APPLIKAZZJONI TA’ METODU ĠDID TA’ EVALWAZZJONI TAL-ISTABBILTÀ TAL-MIKROBIJOTA ŻVILUPPATA FIL-GRUPP, KIF UKOLL BID-DETERMINAZZJONI TAL-KOMPOŻIZZJONI (METAGENOMA) U L-FUNZJONI (METATRANSCRIPTOMA U METABOLOMA) TAL-MIKROBIJOTA INTESTINALI U L-INTERAZZJONI TAGĦHA MAL-VIROMA, IL-MEKKANIŻMI LI JIPPROMWOVU R-REŻILJENZA U R-REDUNDANCY FUNZJONALI, LI JIDENTIFIKAW SPEĊIFIKAMENT FIN-NETWERKS BAYESIAN U L-KOOKKORRENZA DAWK IT-TASSONIJIET, IL-FUNZJONIJIET JEW IR-ROTOT LI JINBIDLU MATUL L-IŻVILUPP JEW LI JIPPROTEĠUNA MILL-AKKUMULAZZJONI TA’ ĠENI TA’ REŻISTENZA FIT-TRASPORTATURI TAL-BATTERJI. (Maltese)
18 August 2022
0 references
LAI GAN MUMS IR PLAŠS PROCEDŪRU KLĀSTS TAKSONU, GĒNU UN CILVĒKA MIKROBIOMA FUNKCIJU KATALOĢIZĒŠANAI VESELĪBAS UN SLIMĪBU APSTĀKĻOS, MĒS JOPROJĀM NEVARAM REAĢĒT UZ TO, KA TĀ IR STABILA MIKROBIOTA. PIEMĒRAM, ZARNU MIKROBIOTA ATTĪSTĀS VISĀ INDIVĪDA ATTĪSTĪBAS LAIKĀ UN TĀ SASTĀVS UN FUNKCIJA ATŠĶIRAS ATKARĪBĀ NO VECUMA. STABILITĀTES JĒDZIENS NOZĪMĒ, KA, SASKAROTIES AR TRAUCĒJUMIEM, MIKROBU KOPIENA ATGRIEŽAS SĀKOTNĒJĀ STĀVOKLĪ SASTĀVA (NOTURĪBAS) VAI FUNKCIJU (FUNKCIONĀLAS ATLAIŠANAS) ZIŅĀ, KAD TRAUCĒJOŠAIS FAKTORS IZZŪD. VAI TAD MUMS VAJADZĒTU SECINĀT, KA VESELĪGA BĒRNA ZARNU MIKROBIOTA NAV STABILA SALĪDZINĀJUMĀ AR VESELĪGU PIEAUGUŠO? KĀPĒC? KĀPĒC? STABILITĀTES JAUTĀJUMU VAR RISINĀT ARĪ NO ZARNU MIKROBIOTAS SVARĪGA TRAUCĒJOŠA LĪDZEKĻA VIEDOKĻA: ANTIBIOTIKAS. TĀ DARBĪBA MAINA MIKROBIOTAS SASTĀVU UN FUNKCIJU, KAS PARASTI BEIDZAS AR DAĻĒJU NOTURĪBU UN FUNKCIONĀLO ATLAIŠANU PĒC ĀRSTĒŠANAS IZZUŠANAS. TOMĒR STABILITĀTI VAR SALAUZT AR CLOSTRIDIUM DIFFICILE KLĀTBŪTNI DAŽOS GADĪJUMOS. ŠAJĀ PROJEKTĀ MŪSU MĒRĶIS IR RISINĀT JAUTĀJUMU PAR ZARNU MIKROBIOTAS LAIKA STABILITĀTI VISĀ ATTĪSTĪBAS LAIKĀ, KĀ ARĪ ANTIBIOTIKU ĀRSTĒŠANĀ VAI TAD, KAD PARĀDĀS C. DIFFICILE. MĒS NOSKAIDROSIM, KĀ TIEK IZMANTOTA JAUNA GRUPĀ IZSTRĀDĀTĀS MIKROBIOTAS STABILITĀTES NOVĒRTĒŠANAS METODE, KĀ ARĪ NOSAKOT ZARNU MIKROBIOTAS SASTĀVU (METAGENOMA) UN FUNKCIJU (METATRANSCRIPTOMA UN METABOLOMA) UN TĀS MIJIEDARBĪBU AR VIROMA, MEHĀNISMUS, KAS VEICINA NOTURĪBU UN FUNKCIONĀLO DUBLĒŠANOS, JO ĪPAŠI BAYESIAN UN VIENLAIKUS SASTOPAMĪBAS TĪKLOS IDENTIFICĒJOT TOS TAKSONUS, FUNKCIJAS VAI MARŠRUTUS, KAS MAINĀS VISĀ ATTĪSTĪBAS GAITĀ VAI AIZSARGĀ MŪS NO REZISTENCES GĒNU UZKRĀŠANĀS BAKTĒRIJU NESĒJOS. (Latvian)
18 August 2022
0 references
HOCI MÁME ŠIROKÚ ŠKÁLU POSTUPOV NA KATALOGIZÁCIU TAXÓNOV, GÉNOV A FUNKCIÍ ĽUDSKÉHO MIKROBIÓMU V ZDRAVOTNÝCH A CHOROBNÝCH PODMIENKACH, STÁLE NEMÔŽEME REAGOVAŤ NA SKUTOČNOSŤ, ŽE IDE O STABILNÚ MIKROFLÓRU. ČREVNÁ MIKROBIOTA SA NAPRÍKLAD ROZVÍJA POČAS VÝVOJA JEDNOTLIVCA A JEJ ZLOŽENIE A FUNKCIA SA LÍŠIA V ZÁVISLOSTI OD VEKU. POJEM STABILITY ZNAMENÁ MYŠLIENKU, ŽE VZHĽADOM NA NARUŠENIE SA MIKROBIÁLNE SPOLOČENSTVO VRÁTI DO SVOJEJ PÔVODNEJ SITUÁCIE, POKIAĽ IDE O ZLOŽENIE (ODOLNOSŤ) ALEBO FUNKCIU (FUNKČNÉ PREPÚŠŤANIE), KEĎ RUŠIVÝ FAKTOR ZMIZNE. MALI BY SME POTOM DOSPIEŤ K ZÁVERU, ŽE ČREVNÁ MIKROFLÓRA ZDRAVÉHO DIEŤAŤA NIE JE STABILNÁ V POROVNANÍ SO ZDRAVÝM DOSPELÝM? PREČO? PREČO? OTÁZKU STABILITY MOŽNO RIEŠIŤ AJ Z HĽADISKA VÝZNAMNÉHO RUŠIVÉHO ČINITEĽA ČREVNEJ MIKROFLÓRY: ANTIBIOTIKÁ. JEHO PÔSOBENIE MENÍ ZLOŽENIE A FUNKCIU MIKROFLÓRY, KTORÁ ZVYČAJNE KONČÍ ČIASTOČNOU ODOLNOSŤOU A FUNKČNOU REDUNDANCIOU PO VYMIZNUTÍ LIEČBY. STABILITA VŠAK MÔŽE BYŤ PORUŠENÁ PRÍTOMNOSŤOU CLOSTRIDIUM DIFFICILE PRI NIEKTORÝCH PRÍLEŽITOSTIACH. V TOMTO PROJEKTE SA ZAMERIAVAME NA OTÁZKU ČASOVEJ STABILITY ČREVNEJ MIKROFLÓRY POČAS VÝVOJA, AKO AJ PRI LIEČBE ANTIBIOTIKAMI ALEBO PRI OBJAVENÍ SA C. DIFFICILE. BUDEME OBJASNIŤ POUŽITÍM NOVEJ METÓDY HODNOTENIA STABILITY MIKROFLÓRY VYVINUTEJ V SKUPINE, AKO AJ STANOVENÍM ZLOŽENIA (METAGENOMA) A FUNKCIE (METATRANSCRIPTOMA A METABOLOMA) ČREVNEJ MIKROFLÓRY A JEJ INTERAKCIE S VIROMA, MECHANIZMOV, KTORÉ PODPORUJÚ ODOLNOSŤ A FUNKČNÚ REDUNDANCIU, KONKRÉTNE IDENTIFIKOVANÍM TAXÓNOV, FUNKCIÍ ALEBO CIEST, KTORÉ SA MENIA POČAS VÝVOJA, ALEBO KTORÉ NÁS CHRÁNIA PRED AKUMULÁCIOU REZISTENČNÝCH GÉNOV U NOSIČOV BAKTÉRIÍ. (Slovak)
18 August 2022
0 references
CÉ GO BHFUIL RÉIMSE LEATHAN NÓSANNA IMEACHTA AGAINN CHUN TACSA, GÉINTE AGUS FEIDHMEANNA AN MHICREABHITHÓM DAONNA A CHATALÓGÚ I GCOINNÍOLLACHA SLÁINTE AGUS GALAIR, NÍ FÉIDIR LINN FREAGAIRT FÓS AR AN BHFÍRIC GUR MICROBIOTA COBHSAÍ É. LEATHNAÍONN AN MICROBIOTA INTESTINAL, MAR SHAMPLA, AR FUD FHORBAIRT AN DUINE AONAIR AGUS TÁ A CHOMHDHÉANAMH AGUS A FHEIDHM ÉAGSÚIL AG BRATH AR AOIS. TUGANN COINCHEAP NA COBHSAÍOCHTA AN SMAOINEAMH GO BHFILLEANN AN POBAL MIOCRÓBACH AR A STAID TOSAIGH Ó THAOBH COMHDHÉANAMH (ATHLÉIMNEACHT) NÓ FEIDHME (IOMARCAÍOCHT FHEIDHMIÚIL) NUAIR A IMÍONN AN FACHTÓIR SUAITE. AR CHÓIR DÚINN A THABHAIRT I GCRÍCH ANSIN NACH BHFUIL MICROBIOTA INTESTINAL LEANBH SLÁINTIÚIL COBHSAÍ I GCOMPARÁID LE DUINE FÁSTA SLÁINTIÚIL? CÉN FÁTH? CÉN FÁTH? IS FÉIDIR AGHAIDH A THABHAIRT AR CHEIST NA COBHSAÍOCHTA FREISIN Ó THAOBH OIBREÁN SUAITE TÁBHACHTACH DEN MHICREABIOTA STÉIGEACH: ANTAIBHEATHAIGH. DÉANANN A GHNÍOMHAÍOCHT MODHNÚ AR CHOMHDHÉANAMH AGUS AR FHEIDHM AN MICROBIOTA, A MBÍONN ATHLÉIMNEACHT PHÁIRTEACH AGUS IOMARCAÍOCHT FHEIDHMIÚIL MAR THORADH AIR DE GHNÁTH TAR ÉIS DON CHÓIREÁIL DUL AR CEAL. MAR SIN FÉIN, IS FÉIDIR AN CHOBHSAÍOCHT A BHRISEADH TRÍ CLOSTRIDIUM DIFFICILE A BHEITH ANN ROINNT UAIREANTA. SA TIONSCADAL SEO, TÁ SÉ MAR AIDHM AGAINN AGHAIDH A THABHAIRT AR AN GCEIST MAIDIR LE COBHSAÍOCHT AMA AN MHICRIBHITHEOLAÍOCHTA STÉIGIGH LE LINN NA FORBARTHA AGUS FAOI CHÓIREÁIL ANTAIBHEATHACH NÓ NUAIR A THAGANN C. DIFFICILE CHUN SOLAIS. LÉIREOIMID TRÍ MHODH NUA MEASTÓIREACHTA A CHUR I BHFEIDHM AR CHOBHSAÍOCHT NA MICRIBHITHÓITE A FORBRAÍODH SA GHRÚPA, AGUS TRÍ CHOMHDHÉANAMH (METAGENOMA) AGUS FEIDHM (METATRANSCRIPTOMA AGUS METABOLOMA) AN MHICRIBHITHEOLAÍOCHTA STÉIGIGH AGUS A IDIRGHNÍOMHAÍOCHT LEIS AN VIROMA A CHINNEADH, NA SÁSRAÍ A CHUIREANN ATHLÉIMNEACHT AGUS IOMARCAÍOCHT FHEIDHMIÚIL CHUN CINN, A SHAINAITHNÍONN GO SONRACH I LÍONRAÍ BAYESIAN AGUS COMHTHARLAITHE NA TACSÓIN, NA FEIDHMEANNA NÓ NA BEALAÍ SIN A ATHRAÍONN AR FUD NA FORBARTHA NÓ A CHOSNAÍONN SINN Ó CHARNADH GÉINTE FRIOTAÍOCHTA IN IOMPRÓIRÍ BAICTÉIR. (Irish)
18 August 2022
0 references
I KDYŽ MÁME ŠIROKOU ŠKÁLU POSTUPŮ PRO KATALOGIZACI TAXONŮ, GENŮ A FUNKCÍ LIDSKÉHO MIKROBIOMU VE ZDRAVOTNÍCH A NEMOCÍCH, STÁLE NEMŮŽEME REAGOVAT NA SKUTEČNOST, ŽE SE JEDNÁ O STABILNÍ MIKROBIOTU. NAPŘÍKLAD STŘEVNÍ MIKROBIOTA SE ROZVÍJÍ V PRŮBĚHU VÝVOJE JEDINCE A JEJÍ SLOŽENÍ A FUNKCE SE LIŠÍ V ZÁVISLOSTI NA VĚKU. POJEM „STABILITA“ PŘEDPOKLÁDÁ MYŠLENKU, ŽE SE MIKROBIÁLNÍ SPOLEČENSTVÍ V DŮSLEDKU NARUŠENÍ VRACÍ KE SVÉ PŮVODNÍ SITUACI, POKUD JDE O SLOŽENÍ (ODOLNOST) NEBO FUNKCI (FUNKČNÍ REDUNDANCE), KDYŽ RUŠIVÝ FAKTOR ZMIZÍ. MĚLI BYCHOM PAK DOSPĚT K ZÁVĚRU, ŽE STŘEVNÍ MIKROBIOTA ZDRAVÉHO DÍTĚTE NENÍ STABILNÍ VE SROVNÁNÍ SE ZDRAVÝM DOSPĚLÝM? PROČ? PROČ? OTÁZKU STABILITY LZE ROVNĚŽ ŘEŠIT Z HLEDISKA DŮLEŽITÉHO RUŠIVÉHO ČINITELE STŘEVNÍ MIKROBIOTY: ANTIBIOTIKA. JEHO PŮSOBENÍ MĚNÍ SLOŽENÍ A FUNKCI MIKROBIOTY, KTERÁ OBVYKLE KONČÍ V ČÁSTEČNÉ ODOLNOSTI A FUNKČNÍ REDUNDANCI PO VYMIZENÍ LÉČBY. STABILITU VŠAK MŮŽE BÝT NARUŠENA PŘÍTOMNOSTÍ CLOSTRIDIUM DIFFICILE PŘI NĚKTERÝCH PŘÍLEŽITOSTECH. V TOMTO PROJEKTU SE ZAMĚŘUJEME NA OTÁZKU ČASOVÉ STABILITY STŘEVNÍ MIKROBIOTY V PRŮBĚHU VÝVOJE I V RÁMCI LÉČBY ANTIBIOTIKY NEBO PŘI VÝSKYTU C. DIFFICILE. OSVĚTLÍME UPLATNĚNÍM NOVÉ METODY HODNOCENÍ STABILITY MIKROBIOTY VYVINUTÉ VE SKUPINĚ, JAKOŽ I STANOVENÍM SLOŽENÍ (METAGENOMA) A FUNKCE (METATRANSCRIPTOMA A METABOLOMA) STŘEVNÍ MIKROBIOTY A JEJÍ INTERAKCE S VIROMA, MECHANISMŮ, KTERÉ PODPORUJÍ ODOLNOST A FUNKČNÍ REDUNDANCI, KONKRÉTNĚ V BAYESIAN A SOUBĚŽNÝCH SÍTÍCH IDENTIFIKUJÍCÍCH TAXONY, FUNKCE NEBO CESTY, KTERÉ SE MĚNÍ V PRŮBĚHU VÝVOJE NEBO KTERÉ NÁS CHRÁNÍ PŘED HROMADĚNÍM GENŮ REZISTENCE U NOSIČŮ BAKTERIÍ. (Czech)
18 August 2022
0 references
Apesar de termos uma vasta gama de procedimentos para catalogar impostos, genes e funções do microbioma humano em condições de saúde e doenças, ainda não podemos responder ao facto de que é um microbiota estável. A MICROBIOTA INTESTINAL, POR EXEMPLO, NÃO FOLHA EM TODO O DESENVOLVIMENTO DO INDIVIDUAL E A SUA COMPOSIÇÃO E FUNÇÃO É DIFERENTES EM MATÉRIA DE IDADE. O conceito de estabilidade implica que, em face de uma perturbação, a comunidade microbiana regresse à sua situação inicial em termos de composição (resiliência) ou de função (reembolso funcional) quando o factor perturbador desaparece. Devemos então concluir que a microbiota interior de uma criança saudável não é estável em comparação com a de um adulto saudável? Porquê? Porquê? A QUESTÃO DE ESTABILIDADE PODE TAMBÉM SER RESPONSÁVEL PELA PERSPECTIVA DE UM AGENTE DESRUPTOR IMPORTANTE DA MICROBIOTA INTESTINAL: Antibióticos. A sua acção modifica a composição e o funcionamento da microbiota, que habitualmente tem uma resistência parcial e uma restituição funcional após o desaparecimento do tratamento. No entanto, a estabilidade pode ser quebrada com a presença de dificilidade do clostrídio em algumas ocasiões. Neste projeto, pretendemos abordar a questão da estabilidade temporal da microbiota intestinal durante o desenvolvimento, bem como no âmbito do tratamento antibiótico ou quando C. DIFÍCIL aparece. ELUCIDAMOS PELA APLICAÇÃO DE UM NOVEL MÉTODO DE AVALIAÇÃO DA ESTABILIDADE DOS MICROBIOTAS DESENVOLVIDOS NO GRUPO, BEM COMO PELA DETERMINAÇÃO DA COMPOSIÇÃO (METAGENOMA) E DA FUNÇÃO (METATRANSCRIPTOMA E METABOLOMA) DO MICROBIOTA INTESTINAL E SUA INTERAÇÃO COM O VIROMA, OS MECANISMOS QUE PROMOVEM A RESILIÊNCIA E A REDUNDANÇA FUNCIONAL, ESPECIFICAMENTE A IDENTIFICAÇÃO NAS REDES DE BAYESIAN E COOCCURRENCE, QUE PROMOVEM A RESILIÊNCIA, FUNÇÕES OU ROTAS QUE MUDAM O DESENVOLVIMENTO OU QUE PROTE DA ACULAÇÃO DE RESISTÊNCIAS EM CARREIRAS. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
KUIGI MEIL ON PALJU ERINEVAID PROTSEDUURE TAKSONITE, GEENIDE JA INIMESE MIKROBIOOMI FUNKTSIOONIDE KATALOOGIMISEKS TERVISE JA HAIGUSTE TINGIMUSTES, EI SAA ME SIISKI VASTATA ASJAOLULE, ET SEE ON STABIILNE MIKROBIOTA. NÄITEKS SOOLESTIKU MIKROBIOTA AVALDUB INIMESE ARENGU JOOKSUL NING SELLE KOOSTIS JA FUNKTSIOON ON SÕLTUVALT VANUSEST ERINEVAD. STABIILSUSE MÕISTE VIITAB IDEELE, ET HÄIRINGU KORRAL PÖÖRDUB MIKROOBIDE KOGUKOND TAGASI OMA ALGSESSE OLUKORDA KOOSTISE (VASTUPIDAVUSVÕIME) VÕI FUNKTSIOONI (FUNKTSIONAALNE KOONDAMINE) MÕTTES, KUI HÄIRIV TEGUR KAOB. KAS ME PEAKSIME SIIS JÄRELDAMA, ET TERVE LAPSE SOOLESTIKU MIKROBIOTA EI OLE STABIILNE VÕRRELDES TERVE TÄISKASVANU OMAGA? MIKS? MIKS? STABIILSUSE KÜSIMUST SAAB KÄSITLEDA KA SOOLESTIKU MIKROBIOOTA OLULISE HÄIRIVA AINE SEISUKOHAST: ANTIBIOOTIKUMID. SELLE TEGEVUS MUUDAB MIKROBIOOTA KOOSTIST JA FUNKTSIOONI, MIS LÕPEB TAVALISELT OSALISE VASTUPANUVÕIME JA FUNKTSIONAALSE KOONDAMISEGA PÄRAST RAVI KADUMIST. SIISKI VÕIB STABIILSUST MURDA, KUI MÕNEL JUHUL ON CLOSTRIDIUM DIFFICILE. SELLE PROJEKTI EESMÄRK ON KÄSITLEDA SOOLESTIKU MIKROBIOOTA AJALIST STABIILSUST KOGU ARENGU VÄLTEL, ANTIBIOOTIKUMRAVI AJAL VÕI C. DIFFICILE ILMUMISE AJAL. SELGITAME, KASUTADES UUT RÜHMAS VÄLJA TÖÖTATUD MIKROBIOOTA STABIILSUSE HINDAMISE MEETODIT, SAMUTI SOOLESTIKU MIKROBIOOTA KOOSTISE (METAGENOMA) JA FUNKTSIOONI (METATRANSCRIPTOMA JA METABOLOMA) KINDLAKSMÄÄRAMIST NING SELLE KOOSTOIMET VIROMAGA, MEHHANISME, MIS EDENDAVAD VASTUPANUVÕIMET JA FUNKTSIONAALSET ÜLELIIGSUST, TUVASTADES KONKREETSELT BAYESI JA SAMAAEGSE ESINEMISE VÕRGUSTIKES NEED TAKSONID, FUNKTSIOONID VÕI MARSRUUDID, MIS MUUTUVAD KOGU ARENGU JOOKSUL VÕI KAITSEVAD MEID RESISTENTSUSGEENIDE KOGUNEMISE EEST BAKTERIKANDJATES. (Estonian)
18 August 2022
0 references
BÁR SZÁMOS ELJÁRÁS LÉTEZIK AZ EMBERI MIKROBIÓM TAXONJAINAK, GÉNJEINEK ÉS FUNKCIÓINAK KATALOGIZÁLÁSÁRA EGÉSZSÉGÜGYI ÉS BETEGSÉGI KÖRÜLMÉNYEK KÖZÖTT, MÉG MINDIG NEM TUDUNK REAGÁLNI ARRA A TÉNYRE, HOGY STABIL MIKROBIÓTA. A BÉL MIKROBIÓTA PÉLDÁUL KIBONTAKOZIK AZ EGYÉN FEJLŐDÉSÉBEN, ÖSSZETÉTELE ÉS FUNKCIÓJA ÉLETKORTÓL FÜGGŐEN ELTÉRŐ. A STABILITÁS FOGALMA MAGÁBAN FOGLALJA AZT AZ ELKÉPZELÉST, HOGY A ZAVAROKKAL SZEMBEN A MIKROBIÁLIS KÖZÖSSÉG AZ ÖSSZETÉTEL (ELLENÁLLÁS) VAGY A FUNKCIÓ (FUNKCIONÁLIS REDUNDANCIA) TEKINTETÉBEN VISSZATÉR EREDETI HELYZETÉHEZ, AMIKOR A ZAVARÓ TÉNYEZŐ ELTŰNIK. AZT A KÖVETKEZTETÉST KELL-E LEVONNI, HOGY EGY EGÉSZSÉGES GYERMEK BÉL MIKROBIÓTA NEM STABIL AZ EGÉSZSÉGES FELNŐTTÉHEZ KÉPEST? MIÉRT? – MIÉRT? MIÉRT? – MIÉRT? A STABILITÁS KÉRDÉSE A BÉL MIKROBIÓTA JELENTŐS ZAVARÓ ANYAGÁNAK SZEMSZÖGÉBŐL IS MEGOLDHATÓ: ANTIBIOTIKUMOK. FELLÉPÉSE MÓDOSÍTJA A MIKROBIÓTA ÖSSZETÉTELÉT ÉS FUNKCIÓJÁT, AMI A KEZELÉS ELTŰNÉSE UTÁN ÁLTALÁBAN RÉSZLEGES REZILIENCIÁVAL ÉS FUNKCIONÁLIS REDUNDANCIÁVAL VÉGZŐDIK. A STABILITÁS AZONBAN BIZONYOS ESETEKBEN A CLOSTRIDIUM DIFFICILE JELENLÉTÉVEL MEGTÖRHETŐ. EBBEN A PROJEKTBEN ARRA TÖREKSZÜNK, HOGY FOGLALKOZZUNK A BÉL MIKROBIÓTA IDŐBELI STABILITÁSÁNAK KÉRDÉSÉVEL A FEJLESZTÉS SORÁN, VALAMINT ANTIBIOTIKUM KEZELÉS ALATT VAGY A C. DIFFICILE MEGJELENÉSEKOR. A CSOPORTBAN KIFEJLESZTETT MIKROBIÓTA STABILITÁSÁNAK ÉRTÉKELÉSÉRE SZOLGÁLÓ ÚJ MÓDSZER ALKALMAZÁSÁVAL, VALAMINT A BÉL MIKROBIÓTA ÖSSZETÉTELÉNEK (METATRANSCRIPTOMA ÉS METABOLOMA) ÖSSZETÉTELÉNEK (METAGENOMA) ÉS FUNKCIÓJÁNAK (METATRANSCRIPTOMA ÉS METABOLOMA) MEGHATÁROZÁSÁVAL, VALAMINT ANNAK A VIROMA-VAL VALÓ KÖLCSÖNHATÁSÁVAL, AZ ELLENÁLLÓ KÉPESSÉGET ÉS A FUNKCIONÁLIS REDUNDANCIÁT ELŐMOZDÍTÓ MECHANIZMUSOKKAL, KIFEJEZETTEN A BAYES- ÉS TÁRSBEFOGADÁSI HÁLÓZATOKBAN AZONOSÍTJUK AZOKAT A TAXONOKAT, FUNKCIÓKAT VAGY ÚTVONALAKAT, AMELYEK A FEJLŐDÉS SORÁN VÁLTOZNAK, VAGY AMELYEK MEGVÉDENEK MINKET A REZISZTENCIA GÉNEK BAKTÉRIUMHORDOZÓKBAN VALÓ FELHALMOZÓDÁSÁTÓL. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
ВЪПРЕКИ ЧЕ ИМАМЕ ШИРОКА ГАМА ОТ ПРОЦЕДУРИ ЗА КАТАЛОГИЗИРАНЕ НА ТАКСОНИ, ГЕНИ И ФУНКЦИИ НА ЧОВЕШКИЯ МИКРОБИОМ В ЗДРАВОСЛОВНИ И БОЛЕСТНИ СЪСТОЯНИЯ, ВСЕ ОЩЕ НЕ МОЖЕМ ДА ОТГОВОРИМ НА ФАКТА, ЧЕ ТОЙ Е СТАБИЛНА МИКРОБИОТА. ЧРЕВНАТА МИКРОБИОТА, НАПРИМЕР, СЕ РАЗВИВА ПО ВРЕМЕ НА РАЗВИТИЕТО НА ИНДИВИДА И СЪСТАВЪТ И ФУНКЦИЯТА МУ СА РАЗЛИЧНИ В ЗАВИСИМОСТ ОТ ВЪЗРАСТТА. ПОНЯТИЕТО ЗА СТАБИЛНОСТ ПРЕДПОЛАГА ИДЕЯТА, ЧЕ ПРИ СМУЩЕНИЕ МИКРОБНАТА ОБЩНОСТ СЕ ВРЪЩА КЪМ ПЪРВОНАЧАЛНОТО СИ СЪСТОЯНИЕ ПО ОТНОШЕНИЕ НА СЪСТАВ (УСТОЙЧИВОСТ) ИЛИ ФУНКЦИЯ (ФУНКЦИОНАЛНО СЪКРАЩЕНИЕ), КОГАТО СМУЩАВАЩИЯТ ФАКТОР ИЗЧЕЗНЕ. ТРЯБВА ЛИ ТОГАВА ДА ЗАКЛЮЧИМ, ЧЕ ЧРЕВНАТА МИКРОБИОТА НА ЗДРАВО ДЕТЕ НЕ Е СТАБИЛНА В СРАВНЕНИЕ С ТАЗИ НА ЗДРАВ ВЪЗРАСТЕН? ЗАЩО? ЗАЩО? ЗАЩО? ЗАЩО? ВЪПРОСЪТ ЗА СТАБИЛНОСТТА МОЖЕ ДА БЪДЕ РАЗГЛЕДАН И ОТ ГЛЕДНА ТОЧКА НА ВАЖЕН НАРУШИТЕЛ НА ЧРЕВНАТА МИКРОБИОТА: АНТИБИОТИЦИ. ДЕЙСТВИЕТО МУ ПРОМЕНЯ СЪСТАВА И ФУНКЦИЯТА НА МИКРОБИОТАТА, КОЕТО ОБИКНОВЕНО ЗАВЪРШВА С ЧАСТИЧНА УСТОЙЧИВОСТ И ФУНКЦИОНАЛНИ СЪКРАЩЕНИЯ СЛЕД ИЗЧЕЗВАНЕТО НА ЛЕЧЕНИЕТО. ВЪПРЕКИ ТОВА, СТАБИЛНОСТТА МОЖЕ ДА БЪДЕ НАРУШЕНА ОТ НАЛИЧИЕТО НА CLOSTRIDIUM DIFFICILE В НЯКОИ СЛУЧАИ. В ТОЗИ ПРОЕКТ СЕ СТРЕМИМ ДА РАЗГЛЕДАМЕ ВЪПРОСА ЗА ТЕМПОРАЛНАТА СТАБИЛНОСТ НА ЧРЕВНАТА МИКРОБИОТА ПРЕЗ ЦЯЛОТО РАЗВИТИЕ, КАКТО И ПРИ АНТИБИОТИЧНО ЛЕЧЕНИЕ ИЛИ КОГАТО СЕ ПОЯВИ C. DIFFICILE. ЩЕ ИЗЯСНИМ ЧРЕЗ ПРИЛАГАНЕТО НА НОВ МЕТОД ЗА ОЦЕНКА НА СТАБИЛНОСТТА НА МИКРОБИОТАТА, РАЗРАБОТЕНА В ГРУПАТА, КАКТО И ЧРЕЗ ОПРЕДЕЛЯНЕ НА СЪСТАВА (METAGENOMA) И ФУНКЦИЯТА (METATRANSCRIPTOMA И METABOLOMA) НА ЧРЕВНАТА МИКРОБИОТА И ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО Ѝ С VIROMA, МЕХАНИЗМИТЕ, КОИТО НАСЪРЧАВАТ УСТОЙЧИВОСТТА И ФУНКЦИОНАЛНИТЕ СЪКРАЩЕНИЯ, КОНКРЕТНО ИДЕНТИФИЦИРАЙКИ В БЕЙЕЗИЙСКИТЕ И СЪПЪТСТВАЩИТЕ МРЕЖИ ТЕЗИ ТАКСОНИ, ФУНКЦИИ ИЛИ МАРШРУТИ, КОИТО СЕ ПРОМЕНЯТ ПО ВРЕМЕ НА РАЗВИТИЕТО ИЛИ КОИТО НИ ПРЕДПАЗВАТ ОТ НАТРУПВАНЕТО НА РЕЗИСТЕНТНИ ГЕНИ В БАКТЕРИОНОСИТЕЛИТЕ. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
NORS MES TURIME DAUGYBĘ PROCEDŪRŲ, SKIRTŲ ŽMOGAUS MIKROBIOMŲ TAKSONŲ, GENŲ IR FUNKCIJŲ KATALOGAVIMUI SVEIKATOS IR LIGŲ BŪKLEI, MES VIS DAR NEGALIME ATSAKYTI Į TAI, KAD TAI YRA STABILI MIKROBIOTA. PAVYZDŽIUI, ŽARNYNO MIKROBIOTA IŠSISKLEIDŽIA PER VISĄ INDIVIDO VYSTYMĄSI, O JO SUDĖTIS IR FUNKCIJA SKIRIASI PRIKLAUSOMAI NUO AMŽIAUS. STABILUMO SĄVOKA REIŠKIA IDĖJĄ, KAD ESANT SUTRIKIMUI, MIKROBŲ BENDRIJA GRĮŽTA Į PRADINĘ PADĖTĮ SUDĖTIES (ATSPARUMO) AR FUNKCIJOS (FUNKCINIO ATLEIDIMO) POŽIŪRIU, KAI IŠNYKS NERIMĄ KELIANTIS VEIKSNYS. AR TADA TURĖTUME DARYTI IŠVADĄ, KAD SVEIKO VAIKO ŽARNYNO MIKROBIOTA NĖRA STABILI, PALYGINTI SU SVEIKU SUAUGUSIUOJU? KODĖL? KODĖL? STABILUMO KLAUSIMAS TAIP PAT GALI BŪTI SPRENDŽIAMAS ATSIŽVELGIANT Į SVARBŲ ŽARNYNO MIKROBIOTOS TRIKDANTĮ AGENTĄ: ANTIBIOTIKAI. JO VEIKSMAS KEIČIA MIKROBIOTOS SUDĖTĮ IR FUNKCIJĄ, KURI PAPRASTAI BAIGIASI DALINIU ATSPARUMU IR FUNKCINIU ATLEIDIMU PO GYDYMO IŠNYKIMO. TAČIAU STABILUMAS GALI BŪTI PAŽEISTAS ESANT CLOSTRIDIUM DIFFICILE KAI KURIAIS ATVEJAIS. ŠIAME PROJEKTE MES SIEKIAME SPRĘSTI KLAUSIMĄ DĖL ŽARNYNO MIKROBIOTOS LAIKINO STABILUMO VYSTYMOSI METU, TAIP PAT GYDANT ANTIBIOTIKAIS ARBA KAI ATSIRANDA C. DIFFICILE. MES IŠSIAIŠKINSIME TAIKANT NAUJĄ GRUPĖJE SUKURTOS MIKROBIOTOS STABILUMO VERTINIMO METODĄ, TAIP PAT NUSTATANT ŽARNYNO MIKROBIOTOS SUDĖTĮ (METAGENOMA) IR FUNKCIJĄ (METATRANSCRIPTOMA IR METABOLOMA) IR JOS SĄVEIKĄ SU VIROMA, MECHANIZMUS, KURIE SKATINA ATSPARUMĄ IR FUNKCINĮ PERTEIKIMĄ, YPAČ BAYESIO IR BENDRO ATSIRADIMO TINKLUOSE NUSTATANT TUOS TAKSONUS, FUNKCIJAS AR MARŠRUTUS, KURIE KEIČIASI VYSTYMOSI METU ARBA KURIE APSAUGO MUS NUO ATSPARUMO GENŲ KAUPIMOSI BAKTERIJŲ NEŠIKLIUOSE. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
IAKO IMAMO ŠIROK SPEKTAR POSTUPAKA ZA KATALOGIZACIJU TAKSONA, GENA I FUNKCIJA LJUDSKOG MIKROBIOMA U ZDRAVSTVENIM I BOLESTIMA, JOŠ UVIJEK NE MOŽEMO ODGOVORITI NA ČINJENICU DA JE RIJEČ O STABILNOJ MIKROBIOTI. CRIJEVNA MIKROBIOTA, NA PRIMJER, RAZVIJA SE TIJEKOM RAZVOJA POJEDINCA I NJEZIN SASTAV I FUNKCIJA SE RAZLIKUJU OVISNO O DOBI. POJAM STABILNOSTI PODRAZUMIJEVA IDEJU DA SE U SLUČAJU POREMEĆAJA MIKROBNA ZAJEDNICA VRAĆA NA SVOJE POČETNO STANJE U SMISLU SASTAVA (OTPORNOSTI) ILI FUNKCIJE (FUNKCIONALNA REDUNDANCIJA) KADA NESTANE UZNEMIRUJUĆI FAKTOR. TREBAMO LI ONDA ZAKLJUČITI DA CRIJEVNA MIKROBIOTA ZDRAVOG DJETETA NIJE STABILNA U USPOREDBI S ONOM ZDRAVE ODRASLE OSOBE? ŠTO JE TO? ŠTO JE TO? PITANJE STABILNOSTI TAKOĐER SE MOŽE RIJEŠITI IZ PERSPEKTIVE VAŽNOG POREMEĆENOG AGENSA CRIJEVNE MIKROBIOTE: ANTIBIOTIKE. NJEGOVO DJELOVANJE MIJENJA SASTAV I FUNKCIJU MIKROBIOTE, ŠTO OBIČNO ZAVRŠAVA DJELOMIČNOM OTPORNOŠĆU I FUNKCIONALNOM REDUNDANCIJOM NAKON NESTANKA LIJEČENJA. MEĐUTIM, STABILNOST SE U NEKIM SLUČAJEVIMA MOŽE PREKINUTI PRISUTNOŠĆU CLOSTRIDIUM DIFFICILE. U OVOM PROJEKTU NASTOJIMO RIJEŠITI PITANJE VREMENSKE STABILNOSTI CRIJEVNE MIKROBIOTE TIJEKOM RAZVOJA, KAO I POD ANTIBIOTSKIM LIJEČENJEM ILI KADA SE POJAVI C. DIFFICILE. RAZJAŠNJAVAMO PRIMJENOM NOVE METODE PROCJENE STABILNOSTI MIKROBIOTE RAZVIJENE U SKUPINI, KAO I ODREĐIVANJEM SASTAVA (METAGENOMA) I FUNKCIJE (METATRANSCRIPTOMA I METABOLOMA) CRIJEVNE MIKROBIOTE I NJEZINE INTERAKCIJE S VIROMA-OM, MEHANIZMIMA KOJI PROMIČU OTPORNOST I FUNKCIONALNU REDUNDANCIJU, POSEBNO IDENTIFICIRAJUĆI U BAYESIAN I KO-NASTUPNIM MREŽAMA ONE TAKSE, FUNKCIJE ILI PUTOVE KOJI SE MIJENJAJU TIJEKOM RAZVOJA ILI NAS ŠTITE OD NAKUPLJANJA GENA OTPORA U NOSAČIMA BAKTERIJA. (Croatian)
18 August 2022
0 references
ÄVEN OM VI HAR ETT BRETT SPEKTRUM AV FÖRFARANDEN FÖR KATALOGISERING AV TAXA, GENER OCH FUNKTIONER HOS DEN MÄNSKLIGA MIKROBIOMEN I HÄLSA OCH SJUKDOMSTILLSTÅND, KAN VI FORTFARANDE INTE REAGERA PÅ DET FAKTUM ATT DET ÄR EN STABIL MIKROBIOTA. TARMENS MIKROBIOTA UTVECKLAS TILL EXEMPEL GENOM INDIVIDENS UTVECKLING OCH DESS SAMMANSÄTTNING OCH FUNKTION VARIERAR BEROENDE PÅ ÅLDER. BEGREPPET STABILITET INNEBÄR ATT DEN MIKROBIELLA GEMENSKAPEN VID EN STÖRNING ÅTERGÅR TILL SIN URSPRUNGLIGA SITUATION NÄR DET GÄLLER SAMMANSÄTTNING (RESILIENS) ELLER FUNKTION (FUNKTIONELL REDUNDANS) NÄR DEN STÖRANDE FAKTORN FÖRSVINNER. SKA VI DÅ DRA SLUTSATSEN ATT TARMMIKROBIOTAN HOS ETT FRISKT BARN INTE ÄR STABIL JÄMFÖRT MED EN FRISK VUXEN? VARFÖR DÅ? VARFÖR DÅ? FRÅGAN OM STABILITET KAN OCKSÅ TAS UPP UR PERSPEKTIVET AV ETT VIKTIGT STÖRANDE ÄMNE I TARMMIKROBIOTAN: ANTIBIOTIKA. DESS VERKAN FÖRÄNDRAR SAMMANSÄTTNINGEN OCH FUNKTIONEN AV MIKROBIOTAN, SOM VANLIGTVIS SLUTAR I EN PARTIELL MOTSTÅNDSKRAFT OCH FUNKTIONELL REDUNDANS EFTER ATT BEHANDLINGEN FÖRSVUNNIT. STABILITETEN KAN DOCK BRYTAS GENOM NÄRVARON AV CLOSTRIDIUM DIFFICILE VID VISSA TILLFÄLLEN. I DETTA PROJEKT STRÄVAR VI EFTER ATT TA ITU MED FRÅGAN OM DEN TIDSMÄSSIGA STABILITETEN I TARMMIKROBIOTAN UNDER UTVECKLING SÅVÄL SOM UNDER ANTIBIOTIKABEHANDLING ELLER NÄR C. DIFFICILE UPPTRÄDER. VI KOMMER ATT KLARGÖRA GENOM TILLÄMPNING AV EN NY METOD FÖR UTVÄRDERING AV STABILITETEN HOS DEN MIKROBIOTA SOM UTVECKLATS I GRUPPEN, LIKSOM GENOM BESTÄMNING AV SAMMANSÄTTNINGEN (METAGENOMA) OCH FUNKTIONEN (METATRANSCRIPTOMA OCH METABOLOMA) AV TARMMIKROBIOTAN OCH DESS SAMVERKAN MED VIROMA, DE MEKANISMER SOM FRÄMJAR MOTSTÅNDSKRAFT OCH FUNKTIONELL REDUNDANS, SÄRSKILT I BAYESIAN- OCH SAM-UPPKOMSTNÄTVERKEN DE TAXA, FUNKTIONER ELLER RUTTER SOM FÖRÄNDRAS UNDER HELA UTVECKLINGEN ELLER SOM SKYDDAR OSS FRÅN ANSAMLING AV RESISTENSGENER I BAKTERIEBÄRARE. (Swedish)
18 August 2022
0 references
DEȘI AVEM O GAMĂ LARGĂ DE PROCEDURI PENTRU CATALOGAREA TAXONILOR, GENELOR ȘI FUNCȚIILOR MICROBIOMULUI UMAN ÎN CONDIȚII DE SĂNĂTATE ȘI BOLI, ÎNCĂ NU PUTEM RĂSPUNDE LA FAPTUL CĂ ESTE O MICROBIOTĂ STABILĂ. MICROBIOTA INTESTINALĂ, DE EXEMPLU, SE DESFĂȘOARĂ PE TOT PARCURSUL DEZVOLTĂRII INDIVIDULUI, IAR COMPOZIȚIA ȘI FUNCȚIA SA SUNT DIFERITE ÎN FUNCȚIE DE VÂRSTĂ. CONCEPTUL DE STABILITATE IMPLICĂ IDEEA CĂ, ÎN FAȚA UNEI PERTURBĂRI, COMUNITATEA MICROBIANĂ REVINE LA SITUAȚIA SA INIȚIALĂ ÎN CEEA CE PRIVEȘTE COMPOZIȚIA (REZILIENȚA) SAU FUNCȚIA (REDUNDANȚA FUNCȚIONALĂ) ATUNCI CÂND FACTORUL PERTURBATOR DISPARE. AR TREBUI SĂ CONCLUZIONĂM CĂ MICROBIOTA INTESTINALĂ A UNUI COPIL SĂNĂTOS NU ESTE STABILĂ ÎN COMPARAȚIE CU CEA A UNUI ADULT SĂNĂTOS? DE CE? DE CE? DE CE? DE CE? PROBLEMA STABILITĂȚII POATE FI ABORDATĂ ȘI DIN PERSPECTIVA UNUI IMPORTANT AGENT PERTURBATOR AL MICROBIOTEI INTESTINALE: ANTIBIOTICE. ACȚIUNEA SA MODIFICĂ COMPOZIȚIA ȘI FUNCȚIA MICROBIOTEI, CARE SE TERMINĂ DE OBICEI PRINTR-O REZISTENȚĂ PARȚIALĂ ȘI REDUNDANȚĂ FUNCȚIONALĂ DUPĂ DISPARIȚIA TRATAMENTULUI. CU TOATE ACESTEA, STABILITATEA POATE FI RUPTĂ PRIN PREZENȚA CLOSTRIDIUM DIFFICILE ÎN UNELE OCAZII. ÎN ACEST PROIECT NE PROPUNEM SĂ ABORDĂM PROBLEMA STABILITĂȚII TEMPORALE A MICROBIOTEI INTESTINALE PE TOT PARCURSUL DEZVOLTĂRII, PRECUM ȘI ÎN CADRUL TRATAMENTULUI CU ANTIBIOTICE SAU CÂND APARE C. DIFFICILE. VOM ELUCIDA PRIN APLICAREA UNEI NOI METODE DE EVALUARE A STABILITĂȚII MICROBIOTEI DEZVOLTATE ÎN GRUP, PRECUM ȘI PRIN DETERMINAREA COMPOZIȚIEI (METAGENOMA) ȘI A FUNCȚIEI (METATRANSCRIPTOMA ȘI METABOLOMA) MICROBIOTEI INTESTINALE ȘI A INTERACȚIUNII ACESTEIA CU VIROMA, MECANISMELE CARE PROMOVEAZĂ REZILIENȚA ȘI REDUNDANȚA FUNCȚIONALĂ, IDENTIFICÂND ÎN MOD SPECIFIC ÎN REȚELELE BAYESIAN ȘI CO-OCCURRENCE ACELE TAXONI, FUNCȚII SAU RUTE CARE SE SCHIMBĂ PE TOT PARCURSUL DEZVOLTĂRII SAU CARE NE PROTEJEAZĂ DE ACUMULAREA DE GENE DE REZISTENȚĂ ÎN PURTĂTORII DE BACTERII. (Romanian)
18 August 2022
0 references
ČEPRAV IMAMO ŠIROKO PALETO POSTOPKOV ZA KATALOGIZACIJO TAKSONOV, GENOV IN FUNKCIJ ČLOVEŠKEGA MIKROBIOMA V ZDRAVSTVENIH IN BOLEZENSKIH RAZMERAH, SE ŠE VEDNO NE MOREMO ODZVATI NA DEJSTVO, DA GRE ZA STABILNO MIKROBIOTO. ČREVESNA MIKROBIOTA SE NA PRIMER ODVIJA SKOZI POSAMEZNIKOV RAZVOJ, NJEGOVA SESTAVA IN FUNKCIJA PA SE RAZLIKUJETA GLEDE NA STAROST. KONCEPT STABILNOSTI POMENI IDEJO, DA SE V PRIMERU MOTNJE MIKROBNA SKUPNOST VRNE V PRVOTNO STANJE V SMISLU SESTAVE (ODPORNOSTI) ALI FUNKCIJE (FUNKCIONALNA REDUNDANCA), KO MOTEČEGA DEJAVNIKA IZGINE. ALI NAJ POTEM ZAKLJUČIMO, DA ČREVESNA MIKROBIOTA ZDRAVEGA OTROKA NI STABILNA V PRIMERJAVI Z ZDRAVO ODRASLO OSEBO? ZAKAJ? ZAKAJ? VPRAŠANJE STABILNOSTI JE MOGOČE OBRAVNAVATI TUDI Z VIDIKA POMEMBNEGA MOTEČEGA POVZROČITELJA ČREVESNE MIKROBIOTE: ANTIBIOTIKI. NJEGOVO DELOVANJE SPREMINJA SESTAVO IN DELOVANJE MIKROBIOTE, KI SE OBIČAJNO KONČA Z DELNO ODPORNOSTJO IN FUNKCIONALNO REDUNDANCO PO IZGINOTJU ZDRAVLJENJA. VENDAR PA SE STABILNOST LAHKO PREKINE S PRISOTNOSTJO CLOSTRIDIUM DIFFICILE V NEKATERIH PRIMERIH. V TEM PROJEKTU ŽELIMO OBRAVNAVATI VPRAŠANJE ČASOVNE STABILNOSTI ČREVESNE MIKROBIOTE V CELOTNEM RAZVOJU, PA TUDI PRI ZDRAVLJENJU Z ANTIBIOTIKI ALI KO SE POJAVI C. DIFFICILE. RAZJASNILI BOMO Z UPORABO NOVE METODE OCENJEVANJA STABILNOSTI MIKROBIOTE, RAZVITE V SKUPINI, KOT TUDI Z DOLOČITVIJO SESTAVE (METAGENOMA) IN FUNKCIJE (METATRANSCRIPTOMA IN METABOLOMA) ČREVESNE MIKROBIOTE IN NJENE INTERAKCIJE Z VIROMO, MEHANIZMI, KI SPODBUJAJO ODPORNOST IN FUNKCIONALNO REDUNDANCO, ZLASTI V BAAJZEJSKIH IN SOOBSTAJAJOČIH MREŽAH, KI OPREDELJUJEJO TAKSONE, FUNKCIJE ALI POTI, KI SE SPREMINJAJO MED CELOTNIM RAZVOJEM ALI NAS ŠČITIJO PRED KOPIČENJEM ODPORNIŠKIH GENOV V NOSILCIH BAKTERIJ. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
CHOCIAŻ MAMY SZEROKI ZAKRES PROCEDUR KATALOGOWANIA TAKSONÓW, GENÓW I FUNKCJI LUDZKIEGO MIKROBIOMU W ZDROWIU I CHOROBACH, NADAL NIE MOŻEMY REAGOWAĆ NA TO, ŻE JEST TO STABILNA MIKROBIOTA. NA PRZYKŁAD MIKROBIOTA JELITOWA ROZWIJA SIĘ W TRAKCIE ROZWOJU JEDNOSTKI, A JEJ SKŁAD I FUNKCJA RÓŻNIĄ SIĘ W ZALEŻNOŚCI OD WIEKU. POJĘCIE STABILNOŚCI ZAKŁADA ZAŁOŻENIE, ŻE W OBLICZU ZAKŁÓCEŃ WSPÓLNOTA MIKROBIOLOGICZNA POWRACA DO SWOJEJ POCZĄTKOWEJ SYTUACJI POD WZGLĘDEM SKŁADU (ODPORNOŚCI) LUB FUNKCJI (ZWOLNIENIA FUNKCJONALNEGO), GDY ZNIKNIE CZYNNIK ZAKŁÓCAJĄCY. CZY POWINNIŚMY ZATEM STWIERDZIĆ, ŻE MIKROBIOTA JELITOWA ZDROWEGO DZIECKA NIE JEST STABILNA W PORÓWNANIU DO ZDROWEJ OSOBY DOROSŁEJ? DLACZEGO? DLACZEGO? KWESTIĘ STABILNOŚCI MOŻNA RÓWNIEŻ ROZWIĄZAĆ Z PERSPEKTYWY WAŻNEGO CZYNNIKA ZAKŁÓCAJĄCEGO MIKROBIOTĘ JELITOWĄ: ANTYBIOTYKI. JEGO DZIAŁANIE MODYFIKUJE SKŁAD I FUNKCJĘ MIKROBIOTY, KTÓRA ZWYKLE KOŃCZY SIĘ CZĘŚCIOWĄ ODPORNOŚCIĄ I REDUNDANCJĄ FUNKCJONALNĄ PO ZNIKNIĘCIU LECZENIA. JEDNAK STABILNOŚĆ MOŻE BYĆ ZŁAMANA PRZEZ OBECNOŚĆ CLOSTRIDIUM DIFFICILE W NIEKTÓRYCH PRZYPADKACH. W TYM PROJEKCIE DĄŻYMY DO ROZWIĄZANIA KWESTII STABILNOŚCI CZASOWEJ MIKROBIOTY JELITOWEJ W CAŁYM ROZWOJU, A TAKŻE W TRAKCIE LECZENIA ANTYBIOTYKAMI LUB W PRZYPADKU POJAWIENIA SIĘ C. DIFFICILE. WYJAŚNIMY POPRZEZ ZASTOSOWANIE NOWATORSKIEJ METODY OCENY STABILNOŚCI MIKROBIOTY OPRACOWANEJ W GRUPIE, A TAKŻE POPRZEZ OKREŚLENIE SKŁADU (METAGENOMA) I FUNKCJI (METATRANSCRIPTOMA I METABOLOMA) MIKROBIOTY JELITOWEJ I JEJ INTERAKCJI Z VIROMA, MECHANIZMÓW PROMUJĄCYCH ODPORNOŚĆ I REDUNDANCJĘ FUNKCJONALNĄ, W SZCZEGÓLNOŚCI IDENTYFIKUJĄCYCH W SIECIACH BAYESIAN I WSPÓŁWYSTĘPUJĄCYCH TE TAKSONY, FUNKCJE LUB DROGI, KTÓRE ZMIENIAJĄ SIĘ W TRAKCIE ROZWOJU LUB CHRONIĄ NAS PRZED GROMADZENIEM GENÓW OPORNOŚCI U NOŚNIKÓW BAKTERII. (Polish)
18 August 2022
0 references
Valencia
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
SAF2015-65878-R
0 references