ANALYSIS OF ANTIOXIDANT RESPONSE MODULATION BY NITRATED LIPIDS DURING ABIOTICO STRESS IN PLANTS (Q3202627)

From EU Knowledge Graph
Jump to navigation Jump to search
Project Q3202627 in Spain
Language Label Description Also known as
English
ANALYSIS OF ANTIOXIDANT RESPONSE MODULATION BY NITRATED LIPIDS DURING ABIOTICO STRESS IN PLANTS
Project Q3202627 in Spain

    Statements

    0 references
    175,459.67 Euro
    0 references
    217,800.0 Euro
    0 references
    80.56 percent
    0 references
    1 January 2019
    0 references
    30 September 2022
    0 references
    UNIVERSIDAD DE JAEN
    0 references

    37°48'32.83"N, 3°45'5.40"W
    0 references
    EN LOS ULTIMOS AÑOS, EL PAPEL DEL OXIDO NITRICO (NO) Y LAS ESPECIES REACTIVAS DE NITROGENO (RNS) HA ATRAIDO LA ATENCION EN EL CAMPO DE LOS SISTEMAS DE PLANTAS. EN ESTE SENTIDO, LA CAPACIDAD DEL NO PARA MEDIAR MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES (NO-PTM) EN DIFERENTES BIOMOLECULAS, COMO LA NITRACION DE TIROSINAS O LA S-NITROSILACION, HA DEMOSTRADO LA PARTICIPACION DE ESTAS MOLECULAS EN UNA AMPLIA GAMA DE FUNCIONES EN LA FISIOLOGIA Y LA RESPUESTA ANTIOXIDANTE EN PLANTAS. EN ESTE SENTIDO, EXISTE UN INTERES CRECIENTE EN EL ESTUDIO DE LA INTERACCION DE LAS RNS CON ACIDOS GRASOS INSATURADOS, QUE ORIGINA LOS ACIDOS GRASOS NITRADOS (NO2-FA). DE HECHO, EL ESTUDIO DE ESTAS MOLECULAS CONSTITUYE UNA INTERESANTE AREA EMERGENTE EN LOS SISTEMAS VEGETALES. RECIENTEMENTE, NUESTRO EQUIPO DE INVESTIGACION EVIDENCIO EN PROYECTOS ANTERIORES LA PRESENCIA ENDOGENA DE DERIVADOS NITRADOS DE ACIDO LINOLENICO (NO2-LN) EN DIFERENTES ESPECIES DE PLANTAS. ADEMAS, A TRAVES DE LA TECNOLOGIA RNA-SEQ, SE DEMOSTRO QUE EL NO2-LN PUEDE INDUCIR UN GRAN CONJUNTO DE PROTEINAS DE CHOQUE TERMICO (HSPS) Y DIFERENTES SISTEMAS ANTIOXIDANTES, SUGIRIENDO QUE ESTA MOLECULA PUEDE DISPARAR RESPUESTAS ANTIOXIDANTES Y DE DEFENSA EN LAS PLANTAS. SIN EMBARGO, AUNQUE EL NO2-LN ACTIVA TANTO LA RESPUESTA ANTIOXIDANTE COMO MECANISMOS DE DEFENSA EN DIFERENTES CONDICIONES DE ESTRES ABIOTICO Y PRESENTA TAMBIEN LA CAPACIDAD DE LIBERAR NO, LOS MECANISMOS MEDIANTE LOS CUALES EL NO2-LN INDUCE ESTAS RESPUESTAS SIGUEN SIENDO DESCONOCIDOS. EN ESTE PUNTO, ES NECESARIO ENFATIZAR QUE LA CAPACIDAD ELECTROFILA DE LOS NO2-FA ES UNA VIA DE SEÑALIZACION FACTIBLE EN LAS PLANTAS. DE HECHO, LOS NO2-FA PUEDEN MODIFICAR LOS AMINOACIDOS NUCLEOFILOS SUSCEPTIBLES DE LAS PROTEINAS A TRAVES DE LA ADICION DE MICHAEL, LO QUE CONDUCE A UNA MODIFICACION POST-TRADUCCIONAL ESPECIFICAMENTE CONOCIDA COMO NITROALQUILACION._x000D_ TENIENDO EN CUENTA ESTOS ANTECEDENTES Y LOS RESULTADOS DE NUESTROS PROYECTOS PREVIOS EN ESTE CAMPO, EL OBJETIVO PRINCIPAL DEL PRESENTE PROYECTO SE CENTRA EN EL ESTUDIO DE LA MODULACION DE LA RESPUESTA ANTIOXIDANTE POR NO2-FA EN CONDICIONES DE ESTRES NITRO-OXIDATIVO, PARA CARACTERIZAR LOS MECANISMOS POSTRADUCCIONALES DE MODIFICACION DE PROTEINAS POR NITROALQUILACION, ASI COMO LAS INTERACCIONES CON LAS VIAS DE SEÑALIZACION INVOLUCRADAS EN LOS PROCESOS DE DEFENSA A LO LARGO DE LAS SITUACIONES DE ESTRES AMBIENTAL. PARA ESTE OBJETIVO, SE LLEVARA A CABO EL ESTUDIO DEL PAPEL DE LOS NO2FA EN LA INDUCCION DE LA RESPUESTA ANTIOXIDANTE DURANTE EL ESTRES ABIOTICO EN ARABIDOPSIS THALIANA. EN PARALELO, SE ANALIZARA LA CARACTERIZACION FUNCIONAL DE LA RESPUESTA ANTIOXIDANTE MEDIANTE NITROALQUILACION CON NO2FA, ASI COMO LA CAPACIDAD DE SEÑALIZACION MEDIANTE LA REGULACION DE HSP. SE REALIZARAN DIFERENTES DISEÑOS EXPERIMENTALES QUE RESPALDEN LOS OBJETIVOS PROPUESTOS UTILIZANDO UNA COMBINACION MULTIDISCIPLINARIA DE TECNICAS COMO ANALISIS BIOQUIMICOS Y MOLECULARES, CLSM, RMN, HPLC-MS/MS, LC-MS/MS, ENSAYO DE COMPLEMENTACION MEDIANTE FLUORESCENCIA BIMOLECULAR (BIFC), INMUNOPRECIPITACION DE CROMATINA (CHIP) Y GENETICA MOLECULAR MEDIANTE EL USO DE TRANSFORMANTES DE ARABIDOPSIS. TODOS ESTOS MECANISMOS SON DESCONOCIDOS EN LAS PLANTAS Y LOS RESULTADOS OBTENIDOS PODRIAN TENER UNA RELEVANCIA BIOTECNOLOGICA Y AGRONOMICA COMO HERRAMIENTAS BIOTECNOLOGICAS DE NO. DE HECHO, ESTA PROPUESTA ESTA EN CONCORDANCIA CON EL DESAFIO NUMERO DOS DENTRO DEL PROGRAMA "HORIZONTE 2020" Y ESTA APOYADA POR DIFERENTES ENTIDADES Y EMPRESAS. (Spanish)
    0 references
    IN THE LAST FEW YEARS, THE ROLE OF NITRIC OXIDE (NO) AND REACTIVE NITROGEN SPECIES (RNS) HAS ATTRACTED ATTENTION IN THE FIELD OF PLANT SYSTEMS. IN THIS SENSE, THE ABILITY OF NO TO MEDIATE SEVERAL POST-TRANSLATIONAL MODIFICATIONS (NO-PTM) IN DIFFERENT BIOMOLECULES, SUCH AS PROTEIN TYROSINE NITRATION OR S-NITROSYLATION HAS SHOWN THE INVOLVEMENT OF THESE MOLECULES IN A WIDE RANGE OF FUNCTIONS IN PLANT PHYSIOLOGY AND THE ANTIOXIDANT RESPONSE. IN THIS SENSE, GROWING INTEREST HAS FOCUSED ON THE INTERACTION OF THESE NO-DERIVED MOLECULES WITH UNSATURATED FATTY ACIDS, YIELDING NITRO-FATTY ACIDS (NO2-FAS). IN FACT, THE STUDY OF THESE MOLECULES IN PLANT SYSTEMS CONSTITUTES AN INTERESTING AND EMERGING AREA. RECENTLY, OUR RESEARCH TEAM EVIDENCED IN PREVIOUS PROJECTS THE ENDOGENOUS OCCURRENCE OF NITRATED-DERIVATIVES OF LINOLENIC ACID (NO2-LN) WAS ASSESSED IN PLANT SPECIES. MOREOVER AND THROUGH RNA-SEQ TECHNOLOGY, IT WAS SHOWN THAT NO2-LN CAN INDUCE A LARGE SET OF HEAT-SHOCK PROTEINS (HSPS) AND DIFFERENT ANTIOXIDANT SYSTEMS SUGGESTING THIS MOLECULE MAY LAUNCH ANTIOXIDANT AND DEFENCE RESPONSES IN PLANTS. HOWEVER, ALTHOUGH BOTH AN ANTIOXIDANT RESPONSE AND A DEFENSE MECHANISM AGAINST SEVERAL ABIOTIC-STRESS CONDITIONS IS ACTIVATED BY NO2-LN AND THE ABILITY OF THIS MOLECULE TO RELEASE NO HAS ALSO BEEN REPORTED, THE PRECISE MECHANISMS BY WHICH THIS NITRO-FATTY ACID IS ABLE TO INDUCE THESE RESPONSES REMAIN UNKNOWN. AT THIS POINT IT IS NECESSARY TO EMPHASIZE THAT THE ELECTROPHILIC CAPACITY OF NITRO-FATTY ACIDS IS ALSO A FEASIBLE SIGNALING PATHWAY IN PLANTS. IN FACT, DUE TO THEIR ELECTROPHILIC NATURE, NO2-FA ARE ABLE TO MODIFY SUSCEPTIBLE NUCLEOPHILIC AMINO ACIDS OF PROTEINS VIA THE MICHAEL ADDITION LEADING TO AN POST-TRANSLATIONAL MODIFICATION SPECIFICALLY KNOWN AS NITROALKYLATION._x000D_ CONSIDERING THIS BACKGROUND AND THE RESULTS FROM OUR PREVIOUS PROJECTS IN THIS FIELD, THE MAIN GOAL OF THE PRESENT PROJECT CONCERNS THE STUDY OF THE MODULATION OF THE ANTIOXIDANT RESPONSE BY NO2-FAS UNDER NITRO-OXIDATIVE STRESS CONDITIONS IN ORDER TO CHARACTERIZE THE POST-TRANSLATIONAL MECHANISMS OF PROTEIN MODIFICATION BY NITROALKYLATION, AS WELL AS THE INTERACTIONS WITH THE SIGNALING PATHWAYS INVOLVED IN THE DEFENSE PROCESSES ALONG THE SITUATIONS OF ENVIRONMENTAL STRESS. FOR THIS AIMS, IT WILL BE CARRY OUT THE STUDY OF THE ROLE OF NO2FA IN THE INDUCTION OF THE ANTIOXIDANT RESPONSE DURING ABIOTIC STRESS IN ARABIDOPSIS THALIANA. IN PARALLEL, IT WILL BE ANALYZE THE FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF THE ANTIOXIDANT RESPONSE BY NITROALKYLATION WITH NO2FA AS WELL AS THE SIGNALING CAPACITY BY REGULATION OF HSPS. DIFFERENT EXPERIMENTAL DESIGNS THAT SUPPORT THE PROPOSED AIMS WILL BE CONDUCTED BY USING A MULTIDISCIPLINARY COMBINATION OF TECHNIQUES SUCH AS BIOCHEMICAL AND MOLECULAR ANALYSES, CLSM, NMR, TRIPLE-QUADRUPOLE MASS SPECTROMETRY (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), BIMOLECULAR FLUORESCENCE COMPLEMENTATION ASSAY (BIFC), CHROMATIN IMMUNOPRECIPITATION (CHIP) AND MOLECULAR GENETICS BY USING ARABIDOPSIS TRANSFORMANTS. ALL THESE MECHANISMS ARE UNKNOWN IN PLANTS AND THE OBTAINED RESULTS COULD HAVE A BIOTECHNOLOGICAL AND AGRONOMICAL RELEVANCE AS BIOTECHNOLOGICAL NO TOOLS. IN FACT, THIS PROPOSAL IS IN CONCORDANCE WITH THE CHALLENGE NUMBER TWO INSIDE ¿HORIZON 2020¿ PROGRAM BEING THIS SUPPORT BY DIFFERENT ENTITIES AND COMPANIES. (English)
    0.48222651544668
    0 references
    AU COURS DES DERNIÈRES ANNÉES, LE RÔLE DES ESPÈCES D’OXYDE NITRIQUE (NON) ET D’AZOTE RÉACTIF (RNS) A ATTIRÉ L’ATTENTION DANS LE DOMAINE DES SYSTÈMES VÉGÉTAUX. EN CE SENS, LA CAPACITÉ DE NE PAS MÉDIER LES MODIFICATIONS POST-TRANSLATIONNELLES (NON PTM) DANS DIFFÉRENTES BIOMOLÉCULES, COMME LA NITRATION DE LA TYROSINE OU LA S-NITROSILACION, A DÉMONTRÉ LA PARTICIPATION DE CES MOLÉCULES À UN LARGE ÉVENTAIL DE FONCTIONS DANS LA PHYSIOLOGIE DES PLANTES ET LA RÉPONSE ANTIOXYDANTE. EN CE SENS, IL Y A UN INTÉRÊT CROISSANT POUR L’ÉTUDE DE L’INTERACTION NSR AVEC LES ACIDES GRAS INSATURÉS, QUI SONT À L’ORIGINE DES ACIDES GRAS NITRÉS (NO2-FA). EN FAIT, L’ÉTUDE DE CES MOLÉCULES CONSTITUE UNE ZONE ÉMERGENTE INTÉRESSANTE DANS LES SYSTÈMES VÉGÉTAUX. RÉCEMMENT, NOTRE ÉQUIPE DE RECHERCHE A DÉMONTRÉ DANS DES PROJETS ANTÉRIEURS LA PRÉSENCE ENDOGÈNE DE DÉRIVÉS DE L’ACIDE LINOLÉNIQUE NITRÉ (NO2-LN) CHEZ DIFFÉRENTES ESPÈCES VÉGÉTALES. EN OUTRE, GRÂCE À LA TECHNOLOGIE RNA-SEQ, IL EST DÉMONTRÉ QUE LE NO2-LN PEUT INDUIRE UN GRAND NOMBRE DE PROTÉINES DE CHOC THERMIQUE (HSPS) ET DIFFÉRENTS SYSTÈMES ANTIOXYDANTS, CE QUI SUGGÈRE QUE CE MOLECULATE PEUT DÉCLENCHER DES RÉACTIONS ANTIOXYDANTES ET DE DÉFENSE CHEZ LES PLANTES. CEPENDANT, BIEN QUE LE NO2-LN ACTIVE À LA FOIS LA RÉPONSE ANTIOXYDANTE ET LES MÉCANISMES DE DÉFENSE DANS DIFFÉRENTES CONDITIONS DE STRESS ABIOTICO ET AIT ÉGALEMENT LA CAPACITÉ DE LIBÉRER NON, LES MÉCANISMES PAR LESQUELS NO2-LN INDUIT CES RÉPONSES RESTENT INCONNUS. À CE STADE, IL EST NÉCESSAIRE DE SOULIGNER QUE LA CAPACITÉ ELECTROFILE DE NO2-FA EST UNE VOIE DE SIGNALISATION POSSIBLE DANS LES USINES. Necho, NO2-FA peut modifier les acides aminés nucléophiles suscientiles des PROTEINS PROTEINS DANS L’ADDITION DE MICHAEL, QUE la conduction à une SPÉCIFICATION DE MODIFICATION POST-TRADUCTIONNEL EN NITROALQUILATION._x000D_ eu égard à ces agents antitemporaires et aux résultats de nos projets réalisés dans cet état, L’OBJECTIF PRINCIPAL DU PROJET est CENTTÉ DANS L’ÉTUDE DE LA MODULATION DE LA RESPONSE ANTIOXIDANTE POUR NO2-FA EN CONDITIONS DU NITRO-OXIDATIVE DE LA MODIFICATION PROTEINE DE NITROALQUILATION, ainsi que les interactions avec les voyages signataires introduits dans le processus de défense de la longueur des situations environnementales. À CETTE FIN, L’ÉTUDE DU RÔLE DU NO2FA DANS L’INCITATION DE LA RÉPONSE ANTIOXYDANTE PENDANT LE STRESS ABIOTICO CHEZ ARABIDOPSIS THALIANA SERA RÉALISÉE. EN PARALLÈLE, LA CARACTÉRISATION FONCTIONNELLE DE LA RÉPONSE ANTIOXYDANTE PAR NITROALQUILATION AVEC NO2FA SERA ANALYSÉE, AINSI QUE LA CAPACITÉ DE SIGNALISATION EN RÉGULANT LE HSP. DIFFÉRENTES CONCEPTIONS EXPÉRIMENTALES SERONT RÉALISÉES POUR APPUYER LES OBJECTIFS PROPOSÉS EN UTILISANT UNE COMBINAISON MULTIDISCIPLINAIRE DE TECHNIQUES TELLES QUE L’ANALYSE BIOCHIMIQUE ET MOLÉCULAIRE, LE CLSM, LE RMN, LA CLHP-MS/MS, LE LC-MS/MS, LA COMPLÉMENTATION BIMOLÉCULAIRE PAR FLUORESCENCE (BIFC), LA CHROMATINE (PUCE) ET LA GÉNÉTIQUE MOLÉCULAIRE EN UTILISANT DES TRANSFORMATEURS ARABIDOPSIS. TOUS CES MÉCANISMES SONT INCONNUS DANS LES PLANTES ET LES RÉSULTATS OBTENUS POURRAIENT AVOIR UNE PERTINENCE BIOTECHNOLOGIQUE ET AGRONOMIQUE EN TANT QU’OUTILS BIOTECHNOLOGIQUES DU NO. EN FAIT, CETTE PROPOSITION EST CONFORME AU DÉFI NUMÉRO DEUX DU PROGRAMME «HORIZON 2020» ET EST SOUTENUE PAR DIFFÉRENTES ENTITÉS ET ENTREPRISES. (French)
    5 December 2021
    0 references
    IN DEN LETZTEN JAHREN HAT DIE ROLLE VON STICKSTOFFMONOXID (NO) UND REAKTIVEN STICKSTOFFARTEN (RNS) AUF DEM GEBIET DER PFLANZENSYSTEME AUFMERKSAMKEIT ERREGT. IN DIESEM SINNE HAT DIE FÄHIGKEIT, POST-TRANSLATIONALE (NICHT-PTM) MODIFIKATIONEN IN VERSCHIEDENEN BIOMOLEKÜLEN, WIE TYROSINNITRATION ODER S-NITROSILACION, NICHT ZU VERMITTELN, DIE BETEILIGUNG DIESER MOLEKÜLE AN EINER VIELZAHL VON FUNKTIONEN IN DER PFLANZENPHYSIOLOGIE UND ANTIOXIDATIVEN REAKTION GEZEIGT. IN DIESEM SINNE BESTEHT EIN ZUNEHMENDES INTERESSE AN DER UNTERSUCHUNG DER NSR-INTERAKTION MIT UNGESÄTTIGTEN FETTSÄUREN, DIE NITRATFETTSÄUREN (NO2-FA) ENTSTEHEN. TATSÄCHLICH STELLT DIE UNTERSUCHUNG DIESER MOLEKÜLE EIN INTERESSANTES AUFSTREBENDES GEBIET IN PFLANZENSYSTEMEN DAR. KÜRZLICH HAT UNSER FORSCHUNGSTEAM IN FRÜHEREN PROJEKTEN DAS ENDOGENE VORHANDENSEIN VON NITRATHALTIGEN LINOLSÄURE-DERIVATEN (NO2-LN) IN VERSCHIEDENEN PFLANZENARTEN DEMONSTRIERT. DARÜBER HINAUS WIRD DURCH DIE RNA-SEQ-TECHNOLOGIE GEZEIGT, DASS NO2-LN EINE GROSSE MENGE AN THERMISCHEN SCHOCKPROTEINEN (HSPS) UND VERSCHIEDENEN ANTIOXIDANTIENSYSTEMEN INDUZIEREN KANN, WAS DARAUF HINDEUTET, DASS DIESES MOLECULATE ANTIOXIDATIVE UND ABWEHRREAKTIONEN IN PFLANZEN AUSLÖSEN KANN. OBWOHL NO2-LN SOWOHL ANTIOXIDATIVE REAKTIONS- ALS AUCH ABWEHRMECHANISMEN UNTER VERSCHIEDENEN ABIOTICO STRESSBEDINGUNGEN AKTIVIERT UND AUCH DIE FÄHIGKEIT HAT, NEIN FREIZUSETZEN, BLEIBEN DIE MECHANISMEN, DURCH DIE NO2-LN DIESE REAKTIONEN INDUZIERT, UNBEKANNT. AN DIESER STELLE MUSS BETONT WERDEN, DASS DIE ELECTROFILE-KAPAZITÄT VON NO2-FA EIN REALISIERBARER SIGNALWEG IN ANLAGEN IST. Necho, NO2-FA kann die suscientile nukleophile Aminosäuren der PROTEINS PROTEINS IN DER MICHAEL ändern, DAS Leitung zu einer POST-TRADUKTIONAL MODIFICATION TECHNISCHE DATEN AS NITROALQUILATION._x000D_ unter Berücksichtigung dieser anti-temporären Wirkstoffe und der Ergebnisse unserer in diesem Zustand durchgeführten Projekte, das PRINCIPAL OBJECTIVE DES PROJEKT ist in der STUDIE DER VERORDNUNG DES ANTIOXIDANTEN RESPONSE FÜR NO2-FA IN CONDITIONEN DER NITRO-OXIDATIVE DER PROTEINEN MODIFIZIERUNG DER NITROALQUILATION sowie der Interaktionen mit den Unterzeichnerfahrten, die bei der Defensierung der Dauer der Umgebungssituationen eingeführt wurden, gebunden. ZU DIESEM ZWECK WIRD DIE ROLLE VON NO2FA BEI DER ANREGUNG VON ANTIOXIDANTIEN WÄHREND DES ABIOTICO-STRESS IN ARABIDOPSIS THALIANA UNTERSUCHT. PARALLEL DAZU WIRD DIE FUNKTIONELLE CHARAKTERISIERUNG DER ANTIOXIDATIVEN REAKTION DURCH NITROALQUILATION MIT NO2FA SOWIE DIE SIGNALFÄHIGKEIT DURCH DIE REGULIERUNG VON HSP ANALYSIERT. ZUR UNTERSTÜTZUNG DER VORGESCHLAGENEN ZIELE WERDEN UNTERSCHIEDLICHE VERSUCHSKONZEPTE MIT EINER MULTIDISZIPLINÄREN KOMBINATION VON TECHNIKEN WIE BIOCHEMISCHER UND MOLEKULARER ANALYSE, CLSM, RMN, HPLC-MS/MS, LC-MS/MS, BIMOLEKULARER FLUORESZENZKOMPLEMENTIERUNG (BIFC), CHROMATIN (CHIP) UND MOLEKULARER GENETIK UNTER VERWENDUNG VON ARABIDOPSIS-TRANSFORMATOREN DURCHGEFÜHRT. ALL DIESE MECHANISMEN SIND IN DEN PFLANZEN UNBEKANNT UND DIE ERGEBNISSE KÖNNTEN EINE BIOTECHNOLOGISCHE UND AGRONOMISCHE RELEVANZ ALS BIOTECHNOLOGISCHE INSTRUMENTE VON Nr. IN DER TAT HABEN, DIESER VORSCHLAG ENTSPRICHT DER HERAUSFORDERUNG NUMMER ZWEI INNERHALB DES PROGRAMMS „HORIZON 2020“ UND WIRD VON VERSCHIEDENEN EINRICHTUNGEN UND UNTERNEHMEN UNTERSTÜTZT. (German)
    9 December 2021
    0 references
    DE AFGELOPEN JAREN HEEFT DE ROL VAN STIKSTOFMONOXIDE (NO) EN REACTIEVE STIKSTOFSOORTEN (RNS) OP HET GEBIED VAN PLANTENSYSTEMEN DE AANDACHT GETROKKEN. IN DEZE ZIN HEEFT HET VERMOGEN OM NIET TE BEMIDDELEN POST-TRANSLATIONELE (NIET-PTM) MODIFICATIES IN VERSCHILLENDE BIOMOLECULEN, ZOALS TYROSINE NITRATIE OF S-NITROSILACION, DE DEELNAME VAN DEZE MOLECULEN AAN EEN BREED SCALA AAN FUNCTIES IN DE PLANTAARDIGE FYSIOLOGIE EN ANTIOXIDERENDE RESPONS AANGETOOND. IN DEZE ZIN IS ER STEEDS MEER BELANGSTELLING VOOR HET ONDERZOEK NAAR DE NSR-INTERACTIE MET ONVERZADIGDE VETZUREN, DIE NITRAATVETZUREN (NO2-FA) ONTSTAAN. IN FEITE VORMT DE STUDIE VAN DEZE MOLECULEN EEN INTERESSANT OPKOMENDE GEBIED IN PLANTENSYSTEMEN. ONLANGS DEMONSTREERDE ONS ONDERZOEKSTEAM IN EERDERE PROJECTEN DE ENDOGENE AANWEZIGHEID VAN NITRAAT LINOLEENZUUR (NO2-LN) DERIVATEN IN VERSCHILLENDE PLANTENSOORTEN. BOVENDIEN WORDT DOOR MIDDEL VAN RNA-SEQ-TECHNOLOGIE AANGETOOND DAT NO2-LN EEN GROTE REEKS THERMISCHE SCHOKPROTEÏNEN (HSPS) EN VERSCHILLENDE ANTIOXIDANTSYSTEMEN KAN INDUCEREN, WAT SUGGEREERT DAT DEZE MOLECULATE ANTI-OXIDANT- EN AFWEERREACTIES IN PLANTEN KAN ACTIVEREN. HOEWEL NO2-LN ZOWEL ANTIOXIDERENDE RESPONS ALS AFWEERMECHANISMEN ONDER VERSCHILLENDE ABIOTICO STRESSOMSTANDIGHEDEN ACTIVEERT EN OOK DE MOGELIJKHEID HEEFT OM NO VRIJ TE GEVEN, BLIJVEN DE MECHANISMEN WAARMEE NO2-LN DEZE REACTIES INDUCEERT, ONBEKEND. OP DIT PUNT MOET WORDEN BENADRUKT DAT DE ELECTROFILE-CAPACITEIT VAN NO2-FA EEN HAALBARE SIGNAALROUTE IN INSTALLATIES IS. Necho, NO2-FA kan de scientiele nucleofiele aminozuren van de PROTEINS PROTEINS PROTEINS in de toevoeging van MICHAEL wijzigen, DAT geleiding naar een POST-TRADUCTIONELE MODIFICATIE SPECIFICATIE AS NITROALQUILATION._x000D_ rekening houdend met deze anti-tijdelijke agenten en de resultaten van onze projecten uitgevoerd in deze staat, de PRINCIPAL OBJECTIVE van het PROJECT wordt in de STUDIE VAN DE MODULATIE VAN DE ANTIOXIDANT RESPONSE VOOR NO2-FA IN CONDITIES VAN DE NITRO-OXIDATIVE VAN DE PROTEIN MODIFICATIE van NITROALQUILATION, evenals de interacties met de ondertekenende reizen geïntroduceerd in het proces van verdediging van de lengte van de omgevingssituaties. HIERTOE ZAL DE STUDIE NAAR DE ROL VAN NO2FA BIJ DE AANSPORING VAN ANTIOXIDERENDE RESPONS TIJDENS ABIOTICO STRESS IN ARABIDOPSIS THALIANA WORDEN UITGEVOERD. PARALLEL HIERAAN ZAL DE FUNCTIONELE KARAKTERISERING VAN ANTIOXIDERENDE RESPONS DOOR NITROALQUILATION MET NO2FA WORDEN GEANALYSEERD, EVENALS DE SIGNAALCAPACITEIT DOOR HET REGULEREN VAN HSP. ER ZULLEN VERSCHILLENDE EXPERIMENTELE ONTWERPEN WORDEN GEMAAKT OM DE VOORGESTELDE DOELSTELLINGEN TE ONDERSTEUNEN MET BEHULP VAN EEN MULTIDISCIPLINAIRE COMBINATIE VAN TECHNIEKEN ZOALS BIOCHEMISCHE EN MOLECULAIRE ANALYSE, CLSM, RMN, HPLC-MS/MS, LC-MS/MS, BIMOLECULAIRE FLUORESCENTIECOMPLEMENTATIE (BIFC), CHROMATINE (CHIP) EN MOLECULAIRE GENETICA DOOR GEBRUIK TE MAKEN VAN ARABIDOPSIS TRANSFORMATOREN. AL DEZE MECHANISMEN ZIJN ONBEKEND IN DE PLANTEN EN DE VERKREGEN RESULTATEN ZOUDEN BIOTECHNOLOGISCHE EN AGRONOMISCHE RELEVANTIE KUNNEN HEBBEN ALS BIOTECHNOLOGISCHE INSTRUMENTEN VAN NO. IN FEITE IS DIT VOORSTEL IN OVEREENSTEMMING MET DE UITDAGING NUMMER TWEE BINNEN HET PROGRAMMA „HORIZON 2020” EN WORDT ONDERSTEUND DOOR VERSCHILLENDE ENTITEITEN EN BEDRIJVEN. (Dutch)
    17 December 2021
    0 references
    NEGLI ULTIMI ANNI, IL RUOLO DELL'OSSIDO NITRICO (N.) E DELLE SPECIE AZOTATE REATTIVE (RNS) HA ATTIRATO L'ATTENZIONE NEL CAMPO DEI SISTEMI VEGETALI. IN QUESTO SENSO, LA CAPACITÀ DI NON MEDIARE MODIFICHE POST-TRADUZIONALI (NON PTM) IN DIVERSE BIOMOLECOLE, COME LA NITRAZIONE DI TIROSINA O S-NITROSILACION, HA DIMOSTRATO LA PARTECIPAZIONE DI QUESTE MOLECOLE A UNA VASTA GAMMA DI FUNZIONI NELLA FISIOLOGIA VEGETALE E NELLA RISPOSTA ANTIOSSIDANTE. IN QUESTO SENSO, C'È UN CRESCENTE INTERESSE NELLO STUDIO DELL'INTERAZIONE NSR CON ACIDI GRASSI INSATURI, CHE ORIGINA GLI ACIDI GRASSI NITRATI (NO2-FA). INFATTI, LO STUDIO DI QUESTE MOLECOLE COSTITUISCE UN'INTERESSANTE AREA EMERGENTE NEI SISTEMI VEGETALI. RECENTEMENTE, IL NOSTRO TEAM DI RICERCA HA DIMOSTRATO NEI PROGETTI PRECEDENTI LA PRESENZA ENDOGENA DI DERIVATI DELL'ACIDO LINOLENICO NITRATO (NO2-LN) IN DIVERSE SPECIE VEGETALI. INOLTRE, ATTRAVERSO LA TECNOLOGIA RNA-SEQ, È DIMOSTRATO CHE NO2-LN PUÒ INDURRE UNA VASTA SERIE DI PROTEINE DA SHOCK TERMICO (HSPS) E DIVERSI SISTEMI ANTIOSSIDANTI, SUGGERENDO CHE QUESTO MOLECULATE PUÒ INNESCARE RISPOSTE ANTIOSSIDANTI E DI DIFESA NELLE PIANTE. TUTTAVIA, ANCHE SE NO2-LN ATTIVA SIA LA RISPOSTA ANTIOSSIDANTE CHE I MECCANISMI DI DIFESA IN DIVERSE CONDIZIONI DI STRESS ABIOTICO E HA ANCHE LA CAPACITÀ DI RILASCIARE NO, I MECCANISMI CON CUI NO2-LN INDUCE QUESTE RISPOSTE RIMANGONO SCONOSCIUTI. A QUESTO PUNTO, È NECESSARIO SOTTOLINEARE CHE LA CAPACITÀ ELECTROFILE DI NO2-FA È UNA VIA DI SEGNALAZIONE PRATICABILE NEGLI IMPIANTI. Necho, NO2-FA può modificare gli amminoacidi nucleofili suscientili delle PROTEINS PROTEINS NELL'ADDIZIONE DI MICHAEL, che la conduzione ad una MODIFICA POST-TRADUZIONE SPECIFICA come NITROALQUILATION._x000D_ tenendo conto di questi agenti anti-temporanei e dei risultati dei nostri progetti realizzati in questo stato, L'OBIETTIVO PRINCIPALE DEL PROGETTO è inserito nello STUDIO DELLA MODULAZIONE DELLA RESPONSA ANTIOXIDANTE PER NO2-FA IN CONDIZIONI DEL NITRO-OXIDATIVO DELLA MODIFICAZIONE PROTEINALE DEI NITROALQUILAZIONE, nonché le interazioni con i viaggi firmatari introdotti nel processo di defensificazione della durata delle situazioni ambientali. A TAL FINE, SARÀ EFFETTUATO LO STUDIO DEL RUOLO DI NO2FA NEL PERSUASIONE DELLA RISPOSTA ANTIOSSIDANTE DURANTE LO STRESS DI ABIOTICO IN ARABIDOPSIS THALIANA. PARALLELAMENTE, SARÀ ANALIZZATA LA CARATTERIZZAZIONE FUNZIONALE DELLA RISPOSTA ANTIOSSIDANTE MEDIANTE NITROALQUILATION CON NO2FA, NONCHÉ LA CAPACITÀ DI SEGNALAZIONE REGOLANDO HSP. SARANNO REALIZZATI DIVERSI PROGETTI SPERIMENTALI A SOSTEGNO DEGLI OBIETTIVI PROPOSTI UTILIZZANDO UNA COMBINAZIONE MULTIDISCIPLINARE DI TECNICHE QUALI ANALISI BIOCHIMICA E MOLECOLARE, CLSM, RMN, HPLC-MS/MS, LC-MS/MS, COMPLEMENTAZIONE DI FLUORESCENZA BIMOLECOLARE (BIFC), CROMATINA (CHIP) E GENETICA MOLECOLARE UTILIZZANDO TRASFORMATORI ARABIDOPSIS. TUTTI QUESTI MECCANISMI SONO SCONOSCIUTI NEGLI IMPIANTI E I RISULTATI OTTENUTI POTREBBERO AVERE UNA RILEVANZA BIOTECNOLOGICA E AGRONOMICA COME STRUMENTI BIOTECNOLOGICI DI NO. INFATTI, QUESTA PROPOSTA È IN LINEA CON LA SFIDA NUMERO DUE ALL'INTERNO DEL PROGRAMMA "ORIZZONTE 2020" ED È SUPPORTATA DA DIVERSE ENTITÀ E AZIENDE. (Italian)
    16 January 2022
    0 references
    VIIMASTEL AASTATEL ON LÄMMASTIKOKSIIDI (EI) JA REAGEERIVATE LÄMMASTIKULIIKIDE (RNS) ROLL TAIMESÜSTEEMIDE VALDKONNAS TÄHELEPANU ÄRATANUD. SELLES MÕTTES ON NO VÕIME VAHENDADA MITMEID TRANSLATSIOONIJÄRGSEID MODIFIKATSIOONE (NO-PTM) ERINEVATES BIOMOLEKULIDES, NAGU VALGU TÜROSIINI NITREERIMINE VÕI S-NITROSÜLATSIOON, NÄIDANUD NENDE MOLEKULIDE KAASAMIST PALJUDESSE FUNKTSIOONIDESSE TAIME FÜSIOLOOGIAS JA ANTIOKSÜDANDI REAKTSIOONIS. SELLES MÕTTES ON KASVAV HUVI KESKENDUNUD NENDE SAADUD MOLEKULIDE KOOSTOIMELE KÜLLASTUMATA RASVHAPETEGA, MOODUSTADES NITRORASVHAPPEID (NO2-FAS). TEGELIKULT ON NENDE MOLEKULIDE UURIMINE TAIMESÜSTEEMIDES HUVITAV JA KUJUNEMISJÄRGUS ALA. HILJUTI TÕESTAS MEIE UURIMISRÜHM VARASEMATES PROJEKTIDES, ET TAIMELIIKIDES HINNATI LINOLEENHAPPE (NO2-LN) NITREERITUD DERIVAATIDE (NO2-LN) ENDOGEENSET ESINEMIST. LISAKS JA RNA-SEQ TEHNOLOOGIA ABIL TÕESTATI, ET NO2-LN VÕIB ESILE KUTSUDA SUURE HULGA SOOJUSŠOKIVALKE (HSPS) JA ERINEVAID ANTIOKSÜDANTE SÜSTEEME, MIS VIITAVAD SELLELE, ET SEE MOLEKUL VÕIB KÄIVITADA ANTIOKSÜDANDI JA KAITSEREAKTSIOONI TAIMEDES. KUIGI NO2-LN AKTIVEERIB NII ANTIOKSÜDANDI KUI KA KAITSEMEHHANISMI MITMETE ABIOOTILISTE STRESSITINGIMUSTE VASTU, ON TEATATUD KA SELLE MOLEKULI VABANEMISVÕIMEST NO, KUID TÄPSED MEHHANISMID, MILLE ABIL SEE NITRO-RASVHAPE SUUDAB NEID REAKTSIOONE ESILE KUTSUDA, ON TEADMATA. SIINKOHAL ON VAJA RÕHUTADA, ET NITRO-RASVHAPETE ELEKTROFIILNE VÕIMSUS ON SAMUTI TEOSTATAV SIGNAALRADA TAIMEDES. In FACT, DUE TO the THEIR electrophilic NATURE, NO2-FA ARE ABLE TO MODIFY SUSCEPTIBLE nukleofiilne AMINO ACIDS PROTEINS VIA MICHAEL ADDITION LEADING POST-TRANSLATIONAL MODIFIKATSIOON SPETSIFIKATSIOONID NITROALKYLATION AS NITROALKYLATION._x000D_ CONSIDERING THIS BACKGROUND ja saavutused meie PREVIOUS PROJEKTSIOONID THIS FIELD, PRESENT PROJEKTIIVIDE ÜHENDUSTE KOHTUASI NITROALKÜLUSE KASUTAMISE KOHUSTUSLIK KOHTUASI TÄHELEPANU NITRO-OXIDATIVE NITROALKÜLUSE KASUTAMISE KOHTUASI TÄHELEPANU arvestades, et SIGNALING PATHWAYS INVOLVERITUD DEFENSE PROCESSES LIIKMESRIIKIDE STRESSE SITUTSIOONID. SELLEKS VIIAKSE LÄBI UURING NO2FA ROLLI KOHTA ANTIOKSÜDANTIDE REAGEERIMISE INDUTSEERIMISEL ABIOOTILISE STRESSI AJAL ARABIDOPSIS THALIANAS. SAMAL AJAL ANALÜÜSITAKSE NITROALKYLATION’I JA NO2FA ANTIOKSÜDANTIDE REAKTSIOONI FUNKTSIONAALSET ISELOOMUSTUST NING HSPSI MÄÄRUSE KOHAST SIGNAALIMISVÕIMET. KAVANDATUD EESMÄRKE TOETAVAD ERINEVAD EKSPERIMENTAALSED KAVANDID VIIAKSE LÄBI SELLISTE MEETODITE MULTIDISTSIPLINAARSE KOMBINATSIOONI ABIL NAGU BIOKEEMILISED JA MOLEKULAARANALÜÜSID, CLSM, NMR, KOLMEKORDNE NELJAPOOLUSELINE MASSISPEKTROMEETRIA (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), BIMOLEKULAARSE FLUORESTSENTSI KOMPLEMENTATSIOONI TEST (BIFC), KROMATIINI IMMUNOSADESTAMINE (KIIP) JA MOLEKULAARGENEETIKA, KASUTADES ARABIDOPSIS TRANSFORMANTE. KÕIK NEED MEHHANISMID EI OLE TAIMEDES TEADA JA SAADUD TULEMUSED VÕIVAD OLLA BIOTEHNOLOOGILISED JA AGRONOOMILISED, KUNA NEED EI OLE BIOTEHNOLOOGILISED VAHENDID. TEGELIKULT ON KÄESOLEV ETTEPANEK KOOSKÕLAS PROGRAMMI „HORISONT 2020“ TEISE VÄLJAKUTSEGA, MILLEKS ON SEE TOETUS ERI ÜKSUSTELT JA ETTEVÕTETELT. (Estonian)
    4 August 2022
    0 references
    PER PASTARUOSIUS KELERIUS METUS AZOTO OKSIDO (NO) IR REAKTYVIŲJŲ AZOTO RŪŠIŲ (RNS) VAIDMUO PRITRAUKĖ DĖMESĮ AUGALŲ SISTEMŲ SRITYJE. ŠIA PRASME „NO“ GEBĖJIMAS TARPININKAUTI KELIOSE POTRANSLIACINĖSE MODIFIKACIJOSE (NO-PTM) SKIRTINGOSE BIOMOLEKULĖSE, TOKIOSE KAIP BALTYMŲ TIROZINO NITRINIMAS AR S-NITROZILINIMAS, PARODĖ, KAD ŠIOS MOLEKULĖS DALYVAUJA DAUGELYJE FUNKCIJŲ AUGALŲ FIZIOLOGIJOJE IR ANTIOKSIDANTŲ ATSAKE. ŠIA PRASME DIDĖJANTIS SUSIDOMĖJIMAS SUTELKĖ DĖMESĮ Į ŠIŲ NEIŠVESTŲ MOLEKULIŲ SĄVEIKĄ SU NESOČIOSIOMIS RIEBALŲ RŪGŠTIMIS, DĖL KURIŲ SUSIDARO NITRO-RIEBALŲ RŪGŠTYS (NO2-FAS). TIESĄ SAKANT, ŠIŲ MOLEKULIŲ TYRIMAS AUGALŲ SISTEMOSE YRA ĮDOMI IR BESIFORMUOJANTI SRITIS. NESENIAI MŪSŲ MOKSLINIŲ TYRIMŲ KOMANDA ĮRODĖ, KAD ANKSTESNIAIS PROJEKTAIS BUVO ĮVERTINTAS LINOLENO RŪGŠTIES (NO2-LN) NITRINTŲ DARINIŲ ENDOGENINIS ATSIRADIMAS AUGALŲ RŪŠYSE. BE TO, NAUDOJANT RNR-SEQ TECHNOLOGIJĄ, BUVO ĮRODYTA, KAD NO2-LN GALI SUKELTI DAUG ŠILUMOS ŠOKO BALTYMŲ (HSPS) IR ĮVAIRIŲ ANTIOKSIDANTŲ SISTEMŲ, KURIOS RODO, KAD ŠI MOLEKULĖ GALI SUKELTI ANTIOKSIDANTŲ IR GYNYBOS ATSAKĄ AUGALUOSE. TAČIAU, NORS NO2-LN AKTYVUOJA ANTIOKSIDACINĮ ATSAKĄ IR APSAUGOS NUO KELIŲ ABIOTINIŲ STRESO SĄLYGŲ MECHANIZMĄ, TAIP PAT BUVO PRANEŠTA APIE ŠIOS MOLEKULĖS GEBĖJIMĄ IŠSISKIRTI NE, TIKSLŪS MECHANIZMAI, KURIAIS ŠI NITRO-RIEBALŲ RŪGŠTIS GALI SUKELTI ŠIUOS ATSAKYMUS, LIEKA NEŽINOMI. ŠIUO METU BŪTINA PABRĖŽTI, KAD NITRO-RIEBALŲ RŪGŠČIŲ ELEKTROFILINIS PAJĖGUMAS TAIP PAT YRA ĮMANOMAS SIGNALIZAVIMO KELIAS AUGALUOSE. Be FACT, DUE į jų elektrofilinės NATURE, NO2-FA ARE ABLE MODIFY SUSCEPTIBLE nukleofilinių AMINO ACIDS iš PROTEINS VIETA MICHAEL ADDITION LEADING POST-TRANSLATION MODIFICATION SPECIFICALLY KNOWN kaip NITROALKYLATION. PRESENTO PROJEKTO VALSTYBĖS KONKRETOS VYRIAUSYBĖS DĖL ANTIOXIDANČIŲ RESPUBLIKOS NO2-FAS UNDER NITRO-OXIDATIVE SĄLYGOS SĄLYGOS, KURIUOS VALSTYBĖS VALSTYBĖS VALSTYBĖS NITROALKYBĖS, kaip INTERACTIONS su SIGNALING PATHWAYS ĮSIPAREIGOJAMOS ĮSIPAREIGOJIMŲ PROCESUOSE PRIEŽIŪROS ĮSIPAREIGOJIMO STRAIPSNIO. SIEKIANT ŠIO TIKSLO, JI BUS ATLIKTI NO2FA VAIDMENĮ INDUKUOJANT ANTIOKSIDANTŲ ATSAKĄ ABIOTINIO STRESO METU ARABIDOPSIS THALIANA. TUO PAČIU METU BUS ANALIZUOJAMAS ANTIOKSIDANTO ATSAKO FUNKCINIS APIBŪDINIMAS NITROALKYLATION SU NO2FA, TAIP PAT SIGNALIZAVIMO PAJĖGUMAS PAGAL HSPS REGULIAVIMĄ. ĮVAIRŪS EKSPERIMENTINIAI PROJEKTAI, KURIAIS BUS REMIAMI SIŪLOMI TIKSLAI, BUS VYKDOMI TAIKANT TARPDISCIPLININĮ METODŲ DERINĮ, PAVYZDŽIUI, BIOCHEMINĘ IR MOLEKULINĘ ANALIZĘ, CLSM, NMR, TRIGUBOS KVADRUPOLIO MASĖS SPEKTROMETRIJĄ (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), BIMOLEKULINĖS FLUORESCENCIJOS KOMPLEMENTACIJOS TYRIMĄ (BIFC), CHROMATINO IMUNOPRECIPITACIJĄ (LUSTĄ) IR MOLEKULINĘ GENETIKĄ NAUDOJANT ARABIDOPSIO TRANSFORMATORIUS. VISI ŠIE MECHANIZMAI AUGALUOSE NEŽINOMI, O GAUTI REZULTATAI GALI TURĖTI BIOTECHNOLOGINĘ IR AGRONOMINĘ REIKŠMĘ KAIP BIOTECHNOLOGIJA JOKIŲ PRIEMONIŲ. IŠ TIESŲ ŠIS PASIŪLYMAS ATITINKA PROGRAMOS „HORIZONTAS 2020“ PROGRAMOJE NR. 2 PATEIKTĄ ANTRĄJĮ UŽDAVINĮ – ŠIĄ PARAMĄ TEIKIA ĮVAIRŪS SUBJEKTAI IR ĮMONĖS. (Lithuanian)
    4 August 2022
    0 references
    U POSLJEDNJIH NEKOLIKO GODINA ULOGA DUŠIKOVOG OKSIDA (BR.) I REAKTIVNIH DUŠIKOVIH VRSTA (RNS) PRIVUKLA JE POZORNOST U PODRUČJU BILJNIH SUSTAVA. U TOM SMISLU, SPOSOBNOST NE DA POSREDUJE NEKOLIKO POSTTRANSLACIJSKIH MODIFIKACIJA (NO-PTM) U RAZLIČITIM BIOMOLEKULAMA, KAO ŠTO SU PROTEINSKI TIROZIN NITRATI ILI S-NITROSILACIJA, POKAZALA JE UKLJUČENOST TIH MOLEKULA U ŠIROK RASPON FUNKCIJA U BILJNOJ FIZIOLOGIJI I ANTIOKSIDATIVNOM ODGOVORU. U TOM SMISLU, SVE VEĆI INTERES JE USMJEREN NA INTERAKCIJU TIH NO-DERIVED MOLEKULA S NEZASIĆENIM MASNIM KISELINAMA, DAJUĆI NITRO-MASNE KISELINE (NO2-FAS). ZAPRAVO, PROUČAVANJE TIH MOLEKULA U BILJNIM SUSTAVIMA PREDSTAVLJA ZANIMLJIVO I NOVO PODRUČJE. NEDAVNO JE NAŠ ISTRAŽIVAČKI TIM U PRETHODNIM PROJEKTIMA DOKAZAO DA JE ENDOGENA POJAVA NITRATIRANIH DERIVATA LINOLENSKE KISELINE (NO2-LN) PROCIJENJENA KOD BILJNIH VRSTA. ŠTOVIŠE, I KROZ RNA-SEQ TEHNOLOGIJU, POKAZALO SE DA NO2-LN MOŽE IZAZVATI VELIKI SKUP PROTEINA TOPLINSKOG UDARA (HSPS) I RAZLIČITIH ANTIOKSIDACIJSKIH SUSTAVA KOJI UKAZUJU NA TO DA TA MOLEKULA MOŽE POKRENUTI ANTIOKSIDANS I OBRAMBENE ODGOVORE U BILJKAMA. MEĐUTIM, IAKO SE I ANTIOKSIDATIVNI ODGOVOR I OBRAMBENI MEHANIZAM PROTIV NEKOLIKO ABIOTIČKIH STRESNIH STANJA AKTIVIRA NO2-LN, A TAKOĐER JE PRIJAVLJENA SPOSOBNOST OVE MOLEKULE DA OTPUSTI NE, PRECIZNI MEHANIZMI KOJIMA OVA NITRO-MASNA KISELINA MOŽE IZAZVATI OVE ODGOVORE OSTAJU NEPOZNATI. U OVOM TRENUTKU POTREBNO JE NAGLASITI DA JE ELEKTROFILNI KAPACITET NITRO-MASNIH KISELINA TAKOĐER IZVEDIV SIGNALNI PUT U BILJKAMA. U FACT, DUE to THEIR electrophilic NATURE, NO2-FA ARE ABLE na MODIFY SUSCEPTIBLE nukleofilni AMINO ACIDS PROTEINA VIA MICHAEL ADDITION LEADING NA POST-TRANSLATION SPECIFIKACIJA SPECIFIKACIJA ZNANJE kao NITROALKYLATION. glavni GOAL PREDSTAVNIH PROJEKTNIH ZEMLJIŠTA STUDIJA UMJETNIČKOG RESPONCIJE PODRUČJA NO2-FAS UNDERNIH NITRO-OXIDATIVNIH KONDICICIJA U OBLIKU ZA KARAKTERISU POST-TRANSLACIJSKE MEHANISMICE PROTEIN MODIFIKACIJE BY NITROALKYLATION, kao što su INTERACTIONS sa SIGNALING PATHWAYS INVOLVED U DEFENSE PROCESSA PRIJEVOZNIK SITUACATIONs of ENVIRONMENTSTRESS. ZA TO ĆE SE PROVESTI PROUČAVANJE ULOGE NO2FA-E U INDUKCIJI ANTIOKSIDACIJSKOG ODGOVORA TIJEKOM ABIOTIČKOG STRESA U ARABIDOPSIS THALIANA. PARALELNO ĆE SE ANALIZIRATI FUNKCIONALNA KARAKTERIZACIJA ANTIOKSIDACIJSKOG ODZIVA NITROALKYLATION-A S NO2FA, KAO I SPOSOBNOST SIGNALIZACIJE PREMA PROPISIMA HSPS-A. RAZLIČITI EKSPERIMENTALNI PROJEKTI KOJI PODUPIRU PREDLOŽENE CILJEVE PROVODIT ĆE SE PRIMJENOM MULTIDISCIPLINARNE KOMBINACIJE TEHNIKA KAO ŠTO SU BIOKEMIJSKE I MOLEKULARNE ANALIZE, CLSM, NMR, TROSTRUKO ČETVEROPOLNA MASENA SPEKTROMETRIJA (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), TEST KOMPLEMENTACIJE BIMOLEKULARNE FLUORESCENCIJE (BIFC), KROMATINSKA IMUNOPRECIPITACIJA (ČIP) I MOLEKULARNA GENETIKA UPOTREBOM ARABIDOPSIS TRANSFORMATORA. SVI TI MEHANIZMI NISU POZNATI U BILJKAMA, A DOBIVENI REZULTATI MOGLI BI IMATI BIOTEHNOLOŠKI I AGRONOMSKI ZNAČAJ KAO BIOTEHNOLOŠKI BEZ ALATA. ZAPRAVO, OVAJ JE PRIJEDLOG U SKLADU S IZAZOVOM BROJ DVA U OKVIRU PROGRAMA OBZOR 2020. KAO POTPORA RAZLIČITIH SUBJEKATA I PODUZEĆA. (Croatian)
    4 August 2022
    0 references
    ΤΑ ΤΕΛΕΥΤΑΊΑ ΧΡΌΝΙΑ, Ο ΡΌΛΟΣ ΤΟΥ ΜΟΝΟΞΕΙΔΊΟΥ ΤΟΥ ΑΖΏΤΟΥ (ΑΡΙΘ.) ΚΑΙ ΤΩΝ ΑΝΤΙΔΡΑΣΤΙΚΏΝ ΕΙΔΏΝ ΑΖΏΤΟΥ (RNS) ΈΧΕΙ ΠΡΟΣΕΛΚΎΣΕΙ ΤΗΝ ΠΡΟΣΟΧΉ ΣΤΟΝ ΤΟΜΈΑ ΤΩΝ ΦΥΤΙΚΏΝ ΣΥΣΤΗΜΆΤΩΝ. ΜΕ ΑΥΤΉ ΤΗΝ ΈΝΝΟΙΑ, Η ΙΚΑΝΌΤΗΤΑ ΤΟΥ ΌΧΙ ΝΑ ΜΕΣΟΛΑΒΕΊ ΑΡΚΕΤΈΣ ΜΕΤΑ-ΜΕΤΑΦΡΑΣΤΙΚΈΣ ΤΡΟΠΟΠΟΙΉΣΕΙΣ (NO-PTM) ΣΕ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΆ ΒΙΟΜΌΡΙΑ, ΌΠΩΣ Η ΝΙΤΡΟΠΟΊΗΣΗ ΠΡΩΤΕΪΝΙΚΉΣ ΤΥΡΟΣΊΝΗΣ Ή Η S-ΝΙΤΡΟΣΥΛΊΩΣΗ, ΈΧΕΙ ΔΕΊΞΕΙ ΤΗ ΣΥΜΜΕΤΟΧΉ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΜΟΡΊΩΝ ΣΕ ΈΝΑ ΕΥΡΎ ΦΆΣΜΑ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΏΝ ΣΤΗ ΦΥΣΙΟΛΟΓΊΑ ΤΩΝ ΦΥΤΏΝ ΚΑΙ ΤΗΝ ΑΝΤΙΟΞΕΙΔΩΤΙΚΉ ΑΠΌΚΡΙΣΗ. ΥΠΌ ΤΗΝ ΈΝΝΟΙΑ ΑΥΤΉ, ΤΟ ΑΥΞΑΝΌΜΕΝΟ ΕΝΔΙΑΦΈΡΟΝ ΕΠΙΚΕΝΤΡΏΘΗΚΕ ΣΤΗΝ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΜΟΡΊΩΝ ΧΩΡΊΣ ΠΑΡΆΓΩΓΑ ΜΕ ΑΚΌΡΕΣΤΑ ΛΙΠΑΡΆ ΟΞΈΑ, ΤΑ ΟΠΟΊΑ ΠΑΡΆΓΟΥΝ ΝΙΤΡΟ-ΛΙΠΑΡΆ ΟΞΈΑ (NO2-FAS). ΣΤΗΝ ΠΡΑΓΜΑΤΙΚΌΤΗΤΑ, Η ΜΕΛΈΤΗ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΜΟΡΊΩΝ ΣΕ ΦΥΤΙΚΆ ΣΥΣΤΉΜΑΤΑ ΑΠΟΤΕΛΕΊ ΜΙΑ ΕΝΔΙΑΦΈΡΟΥΣΑ ΚΑΙ ΑΝΑΔΥΌΜΕΝΗ ΠΕΡΙΟΧΉ. ΠΡΌΣΦΑΤΑ, Η ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΉ ΜΑΣ ΟΜΆΔΑ ΑΠΈΔΕΙΞΕ ΣΕ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΑ ΈΡΓΑ ΌΤΙ Η ΕΝΔΟΓΕΝΉΣ ΕΜΦΆΝΙΣΗ ΝΙΤΡΙΚΏΝ ΠΑΡΑΓΏΓΩΝ ΤΟΥ ΛΙΝΟΛΕΝΙΚΟΎ ΟΞΈΟΣ (NO2-LN) ΑΞΙΟΛΟΓΉΘΗΚΕ ΣΕ ΦΥΤΙΚΆ ΕΊΔΗ. ΕΠΙΠΛΈΟΝ ΚΑΙ ΜΈΣΩ ΤΗΣ ΤΕΧΝΟΛΟΓΊΑΣ RNA-SEQ, ΑΠΟΔΕΊΧΘΗΚΕ ΌΤΙ ΤΟ NO2-LN ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΠΡΟΚΑΛΈΣΕΙ ΈΝΑ ΜΕΓΆΛΟ ΣΎΝΟΛΟ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ ΘΕΡΜΙΚΟΎ ΣΟΚ (HSPS) ΚΑΙ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΆ ΑΝΤΙΟΞΕΙΔΩΤΙΚΆ ΣΥΣΤΉΜΑΤΑ ΠΟΥ ΥΠΟΔΗΛΏΝΟΥΝ ΌΤΙ ΑΥΤΌ ΤΟ ΜΌΡΙΟ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΞΕΚΙΝΉΣΕΙ ΑΝΤΙΟΞΕΙΔΩΤΙΚΈΣ ΚΑΙ ΑΜΥΝΤΙΚΈΣ ΑΝΤΙΔΡΆΣΕΙΣ ΣΤΑ ΦΥΤΆ. ΩΣΤΌΣΟ, ΠΑΡΌΛΟ ΠΟΥ ΤΌΣΟ ΜΙΑ ΑΝΤΙΟΞΕΙΔΩΤΙΚΉ ΑΠΌΚΡΙΣΗ ΌΣΟ ΚΑΙ ΈΝΑΣ ΑΜΥΝΤΙΚΌΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΌΣ ΈΝΑΝΤΙ ΠΟΛΛΏΝ ΠΑΘΉΣΕΩΝ ΑΒΙΟΤΙΚΉΣ ΠΊΕΣΗΣ ΕΝΕΡΓΟΠΟΙΟΎΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟ NO2-LN ΚΑΙ ΈΧΕΙ ΕΠΊΣΗΣ ΑΝΑΦΕΡΘΕΊ Η ΙΚΑΝΌΤΗΤΑ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ ΜΟΡΊΟΥ ΝΑ ΑΠΕΛΕΥΘΕΡΏΣΕΙ ΤΟ NO, ΟΙ ΑΚΡΙΒΕΊΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΊ ΜΕ ΤΟΥΣ ΟΠΟΊΟΥΣ ΑΥΤΌ ΤΟ ΝΙΤΡΟ-ΛΙΠΑΡΌ ΟΞΎ ΕΊΝΑΙ ΣΕ ΘΈΣΗ ΝΑ ΠΡΟΚΑΛΈΣΕΙ ΑΥΤΈΣ ΤΙΣ ΑΝΤΙΔΡΆΣΕΙΣ ΠΑΡΑΜΈΝΟΥΝ ΆΓΝΩΣΤΟΙ. ΣΕ ΑΥΤΌ ΤΟ ΣΗΜΕΊΟ ΕΊΝΑΙ ΑΠΑΡΑΊΤΗΤΟ ΝΑ ΤΟΝΙΣΤΕΊ ΌΤΙ Η ΗΛΕΚΤΡΟΦΙΛΙΚΉ ΙΚΑΝΌΤΗΤΑ ΤΩΝ ΝΙΤΡΟ-ΛΙΠΑΡΏΝ ΟΞΈΩΝ ΕΊΝΑΙ ΕΠΊΣΗΣ ΜΙΑ ΕΦΙΚΤΉ ΟΔΌΣ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΣΤΑ ΦΥΤΆ. Σε ΠΡΑΞΗ, ΛΑΜΒΑΝΟΝΤΑΙ ΣΤΗΝ ΗΛΕΚΤΡΟΝΙΚΗ ΦΥΣΗ ΤΟΥΣ, NO2-FA ΕΦΑΡΜΟΖΟΝΤΑΙ ΣΤΟ ΤΡΟΠΟΠΟΙΗΤΙΚΟ νουκλεόφιλο ΑΜΙΝΟ ΟΞΥ των ΠΡΩΤΕΙΝΩΝ ΜΕ ΤΗΝ ΠΡΟΣΘΗΚΗ ΜΙΚΧΑΛΗΣ ΠΡΟΣΘΗΚΗΣ ΠΟΥ ΑΝΑΦΕΡΟΝΤΑΙ ΣΤΗ ΔΙΑΜΕΤΑΚΟΜΙΣΗ ΕΙΔΙΚΗ ΓΝΩΣΤΟΠΟΙΗΣΗ ΩΣ ΝΙΤΡΟΑΛΚΥΛΩΣΗ._x000D_ ΑΝΑΦΕΡΟΝΤΑΙ ΤΗ ΒΑΣΗ ΤΟΥΣ ΚΑΙ ΤΑ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΑ ΑΠΟ ΤΑ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ ΜΑΣ η κυρια ΚΥΡΙΑ ΚΥΡΙΑ ΤΟΥ ΠΡΟΕΔΡΟΥ ΣΧΕΤΙΚΑ ΜΕ ΤΗ ΜΕΛΕΤΗ ΤΗΣ ΤΡΟΠΟΠΟΙΗΣΗΣ ΤΗΣ ΑΝΤΙΟΞΙΔΙΔΙΚΗΣ ΑΝΑΠΤΥΞΗΣ ΑΠΟ ΤΟ NO2-FAS ΣΤΑ ΠΛΑΙΣΙΑ ΜΗΤΡΟΠΟΙΗΤΙΚΩΝ ΟΡΓΑΝΙΣΜΩΝ ΠΟΥ ΠΡΟΟΡΙΖΟΝΤΑΙ ΣΕ ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗ ΤΩΝ ΠΡΟΤΕΙΝΟΜΕΝΩΝ ΜΗΧΑΝΙΣΜΑΤΩΝ ΑΠΟ ΤΗ ΝΙΤΡΟΑΛΚΥΛΩΣΗ, όπως και οι διαδραστικές ενέργειες με τις υποκλοπές που επεξεργάστηκαν στις απομακρυσμένες διαδικασίες, οι εγκαταστάσεις των περιβαλλοντολογικών δομών. ΓΙΑ ΤΟΥΣ ΣΚΟΠΟΎΣ ΑΥΤΟΎΣ, ΘΑ ΠΡΑΓΜΑΤΟΠΟΙΉΣΕΙ ΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΤΟΥ ΡΌΛΟΥ ΤΟΥ NO2FA ΣΤΗΝ ΕΠΑΓΩΓΉ ΤΗΣ ΑΝΤΙΟΞΕΙΔΩΤΙΚΉΣ ΑΠΌΚΡΙΣΗΣ ΚΑΤΆ ΤΗ ΔΙΆΡΚΕΙΑ ΤΟΥ ΑΒΙΟΤΙΚΟΎ ΣΤΡΕΣ ΣΤΗΝ ARABIDOPSIS THALIANA. ΠΑΡΆΛΛΗΛΑ, ΘΑ ΑΝΑΛΥΘΕΊ Ο ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΌΣ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΜΌΣ ΤΗΣ ΑΝΤΙΟΞΕΙΔΩΤΙΚΉΣ ΑΠΌΚΡΙΣΗΣ ΤΗΣ NITROALKYLATION ΜΕ NO2FA ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ Η ΙΚΑΝΌΤΗΤΑ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΜΕ ΤΟΝ ΚΑΝΟΝΙΣΜΌ HSPS. ΔΙΆΦΟΡΟΙ ΠΕΙΡΑΜΑΤΙΚΟΊ ΣΧΕΔΙΑΣΜΟΊ ΠΟΥ ΥΠΟΣΤΗΡΊΖΟΥΝ ΤΟΥΣ ΠΡΟΤΕΙΝΌΜΕΝΟΥΣ ΣΤΌΧΟΥΣ ΘΑ ΔΙΕΞΑΧΘΟΎΝ ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΠΟΛΥΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΟΎ ΣΥΝΔΥΑΣΜΟΎ ΤΕΧΝΙΚΏΝ, ΌΠΩΣ ΒΙΟΧΗΜΙΚΈΣ ΚΑΙ ΜΟΡΙΑΚΈΣ ΑΝΑΛΎΣΕΙΣ, CLSM, NMR, ΦΑΣΜΑΤΟΜΕΤΡΊΑ ΜΆΖΑΣ ΤΡΙΠΛΟΎ ΤΕΤΡΑΠΌΛΟΥ (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), ΔΟΚΙΜΑΣΊΑ ΣΥΜΠΛΉΡΩΣΗΣ ΔΙΜΟΡΙΑΚΟΎ ΦΘΟΡΙΣΜΟΎ (BIFC), ΑΝΟΣΟΚΑΤΑΚΡΗΜΝΙΣΜΌΣ ΧΡΩΜΑΤΊΝΗΣ (CHIP) ΚΑΙ ΜΟΡΙΑΚΉ ΓΕΝΕΤΙΚΉ ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΜΕΤΑΣΧΗΜΑΤΙΣΤΏΝ ARABIDOPSIS. ΌΛΟΙ ΑΥΤΟΊ ΟΙ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΊ ΕΊΝΑΙ ΆΓΝΩΣΤΟΙ ΣΤΑ ΦΥΤΆ ΚΑΙ ΤΑ ΕΠΙΤΕΥΧΘΈΝΤΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΘΑ ΜΠΟΡΟΎΣΑΝ ΝΑ ΈΧΟΥΝ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΉ ΚΑΙ ΓΕΩΠΟΝΙΚΉ ΣΗΜΑΣΊΑ ΩΣ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΆ ΕΡΓΑΛΕΊΑ. ΣΤΗΝ ΠΡΑΓΜΑΤΙΚΌΤΗΤΑ, Η ΠΑΡΟΎΣΑ ΠΡΌΤΑΣΗ ΣΥΝΆΔΕΙ ΜΕ ΤΗΝ ΠΡΌΚΛΗΣΗ ΔΎΟ ΕΝΤΌΣ ΤΟΥ ΠΡΟΓΡΆΜΜΑΤΟΣ «ΟΡΊΖΩΝ 2020», Η ΟΠΟΊΑ ΕΊΝΑΙ ΑΥΤΉ Η ΣΤΉΡΙΞΗ ΑΠΌ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΟΝΤΌΤΗΤΕΣ ΚΑΙ ΕΤΑΙΡΕΊΕΣ. (Greek)
    4 August 2022
    0 references
    V POSLEDNÝCH ROKOCH PRIŤAHOVALA POZORNOSŤ V OBLASTI RASTLINNÝCH SYSTÉMOV ÚLOHA OXIDU DUSNATÉHO (Č.) A REAKTÍVNEHO DUSÍKA (RNS). V TOMTO ZMYSLE SCHOPNOSŤ NO SPROSTREDKOVAŤ NIEKOĽKO POSTTRANSLAČNÝCH MODIFIKÁCIÍ (NO-PTM) V RÔZNYCH BIOMOLEKULÁCH, AKO JE NITRÁCIA PROTEÍNOVÉHO TYROZÍNU ALEBO S-NITROZYLÁCIA, UKÁZALA ZAPOJENIE TÝCHTO MOLEKÚL DO ŠIROKEJ ŠKÁLY FUNKCIÍ V RASTLINNEJ FYZIOLÓGII A ANTIOXIDAČNEJ REAKCII. V TOMTO ZMYSLE SA RASTÚCI ZÁUJEM ZAMERAL NA INTERAKCIU TÝCHTO MOLEKÚL BEZ DERIVÁCIE S NENASÝTENÝMI MASTNÝMI KYSELINAMI, KTORÉ PRODUKUJÚ NITROMASTNÉ KYSELINY (NO2-FAS). V SKUTOČNOSTI, ŠTÚDIUM TÝCHTO MOLEKÚL V RASTLINNÝCH SYSTÉMOCH PREDSTAVUJE ZAUJÍMAVÚ A ROZVÍJAJÚCU SA OBLASŤ. V POSLEDNEJ DOBE NÁŠ VÝSKUMNÝ TÍM PREUKÁZAL V PREDCHÁDZAJÚCICH PROJEKTOCH, ŽE ENDOGÉNNY VÝSKYT NITRÁTOVÝCH DERIVÁTOV KYSELINY LINOLÉNOVEJ (NO2-LN) BOL HODNOTENÝ U RASTLINNÝCH DRUHOV. OKREM TOHO A PROSTREDNÍCTVOM TECHNOLÓGIE RNA-SEQ SA UKÁZALO, ŽE NO2-LN MÔŽE INDUKOVAŤ VEĽKÝ SÚBOR TEPELNO-ŠOKOVÝCH PROTEÍNOV (HSPS) A RÔZNE ANTIOXIDAČNÉ SYSTÉMY, KTORÉ NAZNAČUJÚ, ŽE TÁTO MOLEKULA MÔŽE SPUSTIŤ ANTIOXIDAČNÉ A OBRANNÉ REAKCIE V RASTLINÁCH. HOCI ANTIOXIDAČNÁ ODPOVEĎ A OBRANNÝ MECHANIZMUS PROTI NIEKOĽKÝM ABIOTICKÝM STRESOVÝM PODMIENKAM JE AKTIVOVANÝ NO2-LN A SCHOPNOSŤ TEJTO MOLEKULY UVOĽŇOVAŤ NO BOLA TIEŽ HLÁSENÁ, PRESNÉ MECHANIZMY, KTORÝMI JE TÁTO NITRO-MASTNÁ KYSELINA SCHOPNÁ VYVOLAŤ TIETO REAKCIE, ZOSTÁVAJÚ NEZNÁME. V TOMTO BODE JE POTREBNÉ ZDÔRAZNIŤ, ŽE ELEKTROFILNÁ KAPACITA NITRO-MASTNÝCH KYSELÍN JE TIEŽ USKUTOČNITEĽNOU SIGNALIZAČNOU CESTOU V RASTLINÁCH. In FACT, DUE TO Im elektrofilné NATURE, NO2-FA ALE TO MODIFY ZUSADNÉ nukleofilné AMINO AMINO ACIDS PROTEINS VIA MICHAEL ADDITION LEADING NA POST-TRANSLATIONAL MODIFIKÁCIA SPECIFIKÁCIA ako NITROALKYLATION._x000D_ VYHLÁSENIE PRESENTNÉHO PROJEKTU OCHRANY ZMLUVY ANTIOXIDANTNÉHO RESPONSE NO2-FAS UNDER NITRO-OXIDATIVE STRESS CONDITIONS V OBJEDNÁVKU NA VÝROBKU PREPRAVY PROTEIN MODIFIKÁCIE NITROALKYLÁCIE, ako to, že INTERACTIONS S SIGNALING PATHWAYS VYVOJENÝCH VÝROBKOV VYZÝVAJÚCE SITUÁCIE ENVIRONMENTÁLNEHO ZDRAVIE. NA DOSIAHNUTIE TÝCHTO CIEĽOV SA USKUTOČNÍ ŠTÚDIA ÚLOHY NO2FA PRI INDUKCII ANTIOXIDAČNEJ REAKCIE POČAS ABIOTICKÉHO STRESU V ARABIDOPSIS THALIANA. SÚČASNE SA BUDE ANALYZOVAŤ FUNKČNÁ CHARAKTERIZÁCIA ANTIOXIDAČNEJ REAKCIE NITROALKYLATION S NO2FA, AKO AJ SIGNALIZAČNÁ KAPACITA PODĽA NARIADENIA HSPS. RÔZNE EXPERIMENTÁLNE NÁVRHY, KTORÉ PODPORUJÚ NAVRHOVANÉ CIELE, SA BUDÚ VYKONÁVAŤ POMOCOU MULTIDISCIPLINÁRNEJ KOMBINÁCIE TECHNÍK, AKO SÚ BIOCHEMICKÉ A MOLEKULÁRNE ANALÝZY, CLSM, NMR, TROJ-KVADRUPOLOVÁ HMOTNOSTNÁ SPEKTROMETRIA (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), BIMOLEKULÁRNA FLUORESCENČNÁ KOMPLEMENTAČNÁ SKÚŠKA (BIFC), CHROMATÍNOVÁ IMUNOPRECIPITÁCIA (ČIP) A MOLEKULÁRNA GENETIKA POMOCOU ARABIDOPÁZOVÝCH TRANSFORMÁTOROV. VŠETKY TIETO MECHANIZMY NIE SÚ V RASTLINÁCH ZNÁME A ZÍSKANÉ VÝSLEDKY BY MOHLI MAŤ BIOTECHNOLOGICKÝ A AGRONOMICKÝ VÝZNAM AKO BIOTECHNOLOGICKÝ ŽIADNY NÁSTROJ. TENTO NÁVRH JE V SKUTOČNOSTI V SÚLADE S VÝZVOU Č. 2 V RÁMCI PROGRAMU HORIZONT 2020, KTOROU JE TÁTO PODPORA ZO STRANY RÔZNYCH SUBJEKTOV A SPOLOČNOSTÍ. (Slovak)
    4 August 2022
    0 references
    VIIME VUOSINA TYPPIOKSIDIN (EI) JA REAKTIIVISEN TYPEN (RNS) ROOLI ON HERÄTTÄNYT HUOMIOTA KASVIJÄRJESTELMIEN ALALLA. TÄSSÄ MIELESSÄ NO:N KYKY VÄLITTÄÄ USEITA TRANSLAATIOIDEN JÄLKEISIÄ MUUTOKSIA (EI-PTM) ERI BIOMOLEKYYLIEN, KUTEN PROTEIINITYROSIININ NITRAATION TAI S-NITROSYLAATION, OSALTA ON OSOITTANUT NÄIDEN MOLEKYYLIEN OSALLISTUMISEN MONENLAISIIN TOIMINTOIHIN KASVIFYSIOLOGIASSA JA ANTIOKSIDANTTIVASTEESSA. TÄSSÄ MIELESSÄ KASVAVA KIINNOSTUS ON KESKITTYNYT NÄIDEN EI-JOHDETTUJEN MOLEKYYLIEN VUOROVAIKUTUKSEEN TYYDYTTYMÄTTÖMIEN RASVAHAPPOJEN KANSSA, JOLLOIN SAADAAN NITRORASVAHAPPOJA (NO2-FAS). ITSE ASIASSA NÄIDEN MOLEKYYLIEN TUTKIMUS KASVIJÄRJESTELMISSÄ ON MIELENKIINTOINEN JA NOUSEVA ALUE. VIIME AIKOINA TUTKIMUSRYHMÄMME OSOITTI AIEMMISSA HANKKEISSA, ETTÄ LINOLEENIHAPON (NO2-LN) NITRAATTIJOHDANNAISTEN ENDOGEENINEN ESIINTYMINEN ARVIOITIIN KASVILAJEISSA. LISÄKSI JA RNA-SEQ-TEKNOLOGIAN AVULLA OSOITETTIIN, ETTÄ NO2-LN VOI AIHEUTTAA SUUREN JOUKON LÄMPÖSHOKKIPROTEIINEJA (HSPS) JA ERILAISIA ANTIOKSIDANTTIJÄRJESTELMIÄ, JOTKA VIITTAAVAT SIIHEN, ETTÄ TÄMÄ MOLEKYYLI SAATTAA LAUKAISTA ANTIOKSIDANTTI- JA PUOLUSTUSREAKTIOITA KASVEISSA. VAIKKA NO2-LN AKTIVOI SEKÄ ANTIOKSIDANTTIVASTEEN ETTÄ PUOLUSTUSMEKANISMIN USEITA ABIOOTTISIA STRESSIOLOSUHTEITA VASTAAN JA TÄMÄN MOLEKYYLIN KYKYÄ VAPAUTUA NO ON MYÖS RAPORTOITU, TARKKOJA MEKANISMEJA, JOILLA TÄMÄ NITRORASVAHAPPO PYSTYY INDUSOIMAAN NÄITÄ VASTEITA, EI TIEDETÄ. TÄSSÄ VAIHEESSA ON KOROSTETTAVA, ETTÄ NITRORASVAHAPPOJEN ELEKTROFIILINEN KAPASITEETTI ON MYÖS TOTEUTETTAVISSA OLEVA SIGNAALINVÄLITYSREITTI KASVEISSA. Vuonna FACT, PÄÄTTÄNYT elektrofiilinen NATURE, NO2-FA on ABLE MODIFY SUSCEPTIBLE nukleofiilinen AMINO ACIDS PROTEINS VIA MICHAEL ADDITION LEADING TRANSLATIONAL MODIFICICATION TEKNISET TIEDOT TEKNISET KÄYTTÖN NITROALKYLATION._x000D_ KATSOVAT TÄMÄN TÄMÄN BACKGROUND JA RESULTS FROM PREVIOUS PROJECTS TÄSEN FIELD, HALLITUSTEN HANKEIDEN HALLITUKSEN HALLITUSTA KOSKEVAT HALLITUKSET ANTIOXIDANT RESPONSE BY NO2-FAS UNDER NITRO-OXIDATIVE STRESS CONDITIONS ORDER THE TRANSLATIONAL MECHANISMS of PROTEIN MODIFICATION BY NITROALKYLATION, niin kuin ne, joilla on SIGNALING PATHWAYS INVOLVED in the DEFENSE PROCESSES ALONG THE SITUATIONS OF ENVIRONMENTAL STRESSS. TÄTÄ VARTEN SE TEKEE TUTKIMUKSEN NO2FA:N ROOLISTA ANTIOKSIDANTTIVASTEEN INDUKTIOSSA ABIOOTTISEN STRESSIN AIKANA ARABIDOPSIS THALIANASSA. SAMANAIKAISESTI ANALYSOIDAAN NITROALKYLATIONIN NO2FA:N ANTIOKSIDANTTIVASTEEN TOIMINNALLISTA KARAKTERISOINTIA SEKÄ HSPS:N SÄÄNTELEMÄÄ SIGNAALINANTOKAPASITEETTIA. EHDOTETTUJA TAVOITTEITA TUKEVIA KOKEELLISIA MALLEJA TOTEUTETAAN KÄYTTÄMÄLLÄ MONITIETEISTÄ YHDISTELMÄÄ BIOKEMIALLISTEN JA MOLEKYYLIANALYYSIEN, CLSM:N, NMR:N, KOLMIKVADRUPOLIMASSASPEKTROMETRIAN (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), BIMOLEKYYLISEN FLUORESENSSIKOKEEN (BIFC), KROMATIINI-IMMUNOSAOSTUMISEN (SIRU) JA MOLEKYYLIGENETIIKAN KALTAISTEN TEKNIIKOIDEN YHDISTELMÄÄ ARABIIDOPSIKSEN TRANSFORMANTTEJA KÄYTTÄMÄLLÄ. KAIKKIA NÄITÄ MEKANISMEJA EI TUNNETA KASVEISSA, JA SAAVUTETUILLA TULOKSILLA VOI OLLA BIOTEKNOLOGINEN JA AGRONOMINEN MERKITYS BIOTEKNOLOGISENA EI TYÖKALUNA. TÄMÄ EHDOTUS ON ITSE ASIASSA SOPUSOINNUSSA HORISONTTI 2020 -OHJELMAN TOISEN HAASTEEN KANSSA, KOSKA KYSEESSÄ ON ERI YKSIKÖIDEN JA YRITYSTEN TUKI. (Finnish)
    4 August 2022
    0 references
    W CIĄGU OSTATNICH KILKU LAT ROLA TLENKU AZOTU (NR) I REAKTYWNEGO AZOTU (RNS) PRZYCIĄGNĘŁA UWAGĘ W DZIEDZINIE SYSTEMÓW ROŚLINNYCH. W TYM SENSIE ZDOLNOŚĆ NO DO POŚREDNICZENIA KILKU POTRANSLACYJNYCH MODYFIKACJI (NO-PTM) W RÓŻNYCH BIOMOLEKUŁACH, TAKICH JAK NITRACJA BIAŁEK TYROZYNY LUB S-NITROSYLATION, WYKAZAŁA ZAANGAŻOWANIE TYCH CZĄSTECZEK W SZEROKIM ZAKRESIE FUNKCJI FIZJOLOGII ROŚLINNEJ I ODPOWIEDZI ANTYOKSYDACYJNEJ. W TYM SENSIE ROSNĄCE ZAINTERESOWANIE KONCENTROWAŁO SIĘ NA INTERAKCJI TYCH CZĄSTECZEK NIEPOCHODZĄCYCH Z NIENASYCONYCH KWASÓW TŁUSZCZOWYCH, WYTWARZAJĄCYCH KWASY AZOTOWO-TŁUSZCZOWE (NO2-FAS). W RZECZYWISTOŚCI BADANIE TYCH CZĄSTECZEK W SYSTEMACH ROŚLINNYCH STANOWI INTERESUJĄCY I WSCHODZĄCY OBSZAR. OSTATNIO NASZ ZESPÓŁ BADAWCZY WYKAZAŁ W POPRZEDNICH PROJEKTACH, ŻE ENDOGENNE WYSTĘPOWANIE AZOTANOWYCH POCHODNYCH KWASU LINOLENOWEGO (NO2-LN) ZOSTAŁO OCENIONE U GATUNKÓW ROŚLIN. PONADTO DZIĘKI TECHNOLOGII RNA-SEQ WYKAZANO, ŻE NO2-LN MOŻE WYWOŁYWAĆ DUŻY ZESTAW BIAŁEK SZOKU CIEPLNEGO (HSPS) I RÓŻNE SYSTEMY ANTYOKSYDACYJNE SUGERUJĄCE, ŻE CZĄSTECZKA TA MOŻE WYWOŁAĆ REAKCJE ANTYOKSYDACYJNE I OBRONNE W ROŚLINACH. JEDNAK, CHOCIAŻ NO2-LN AKTYWUJE ZARÓWNO ODPOWIEDŹ PRZECIWUTLENIAJĄCĄ, JAK I MECHANIZM OBRONNY PRZECIWKO KILKU STANOM STRESU ABIOTYCZNEGO, A ZDOLNOŚĆ TEJ CZĄSTECZKI DO UWALNIANIA NO RÓWNIEŻ ZOSTAŁA ZGŁOSZONA, DOKŁADNE MECHANIZMY, ZA POMOCĄ KTÓRYCH TEN KWAS NITRO-TŁUSZCZOWY JEST W STANIE WYWOŁAĆ TE REAKCJE, POZOSTAJĄ NIEZNANE. W TYM MOMENCIE NALEŻY PODKREŚLIĆ, ŻE ELEKTROFILOWA ZDOLNOŚĆ KWASÓW NITRO-TŁUSZCZOWYCH JEST RÓWNIEŻ WYKONALNĄ ŚCIEŻKĄ SYGNALIZACYJNĄ W ROŚLINACH. In FACT, DUE TO THE I TEIR electrophilic NATURE, NO2-FA ARE ABLE TO MODIFY SUSCEPTIBLE nukleophilic AMINO ACIDS of PROTEINS VIA THE MICHAEL ADDITION LEADING to POST-TRANSLATIONAL MODIFICATIONAL MODIFICATION SPECYFIKACYJNE W NAJSZYSTKICH PROJEKCJI PREVIOUSÓW._x000D_ UZNAJĄC SIĘ TEGO BACKGROUND I WYNIKÓW OD NASZYCH PROJEKCJÓW PREVIOSOWYCH, główny ZWIĄZKU PREZYDENTEGO PROJEKTU STRONY MODULACJI ANTIOXIDANT RESPONSE BY NO2-FAS UNDER NITRO-OXIDATIVE STRESS CONDITIONS INRDER to CHARACTERISE THE POST-TRANSLATIONAL MECHANISMS OF PROTEIN MODIFICATION BY NITROALKYLACJA, tak jak INTERACTIONS Z SIGNALING PATHWAYS INVOLVED W DEFENSE PROCESES ALONG THE SITUATIONs of ENVIRONMENTAL STRESS. W TYM CELU ZOSTANIE PRZEPROWADZONA ANALIZA ROLI NO2FA W INDUKCJI ODPOWIEDZI ANTYOKSYDACYJNEJ PODCZAS STRESU ABIOTYCZNEGO W ARABIDOPSIS THALIANA. RÓWNOLEGLE ZOSTANIE PRZEPROWADZONA ANALIZA CHARAKTERYSTYKI FUNKCJONALNEJ ODPOWIEDZI ANTYOKSYDACYJNEJ NITROALKYLATION Z NO2FA ORAZ ZDOLNOŚCI SYGNALIZACYJNEJ REGULACJI HSPS. RÓŻNE PROJEKTY EKSPERYMENTALNE, KTÓRE WSPIERAJĄ PROPONOWANE CELE, BĘDĄ PROWADZONE PRZY UŻYCIU MULTIDYSCYPLINARNEJ KOMBINACJI TECHNIK, TAKICH JAK ANALIZY BIOCHEMICZNE I MOLEKULARNE, CLSM, NMR, TRÓJKWADRUPOLOWA SPEKTROMETRIA MAS (HPLC-MS/MS, LC-MS), TEST UZUPEŁNIANIA FLUORESCENCJI DWUCZĄSTECZKOWEJ (BIFC), IMMUNOPRECYTACJI CHROMATYNY (CHIP) I GENETYKI MOLEKULARNEJ ZA POMOCĄ TRANSFORMANTÓW ARABIDOPSIS. WSZYSTKIE TE MECHANIZMY SĄ NIEZNANE W ROŚLINACH, A UZYSKANE WYNIKI MOGĄ MIEĆ ZNACZENIE BIOTECHNOLOGICZNE I AGRONOMICZNE JAKO NARZĘDZIA BIOTECHNOLOGICZNE. W RZECZYWISTOŚCI NINIEJSZY WNIOSEK JEST ZGODNY Z WYZWANIEM NR 2 W RAMACH PROGRAMU „HORYZONT 2020”, JAKIM JEST WSPARCIE UDZIELANE PRZEZ RÓŻNE PODMIOTY I PRZEDSIĘBIORSTWA. (Polish)
    4 August 2022
    0 references
    AZ ELMÚLT NÉHÁNY ÉVBEN A NITROGÉN-MONOXID (NO) ÉS A REAKTÍV NITROGÉNFAJOK (RNS) SZEREPE FELKELTETTE A FIGYELMET A NÖVÉNYRENDSZEREK TERÜLETÉN. EBBEN AZ ÉRTELEMBEN A NO AZON KÉPESSÉGE, HOGY TÖBB TRANSZLÁCIÓS MÓDOSÍTÁST (NO-PTM) KÖZVETÍTSEN KÜLÖNBÖZŐ BIOMOLEKULÁKBAN, MINT PÉLDÁUL A FEHÉRJE TIROZIN-NITRÁLÁS VAGY AZ S-NITROSZILÁCIÓ, MEGMUTATTA, HOGY EZEK A MOLEKULÁK SZÁMOS FUNKCIÓBAN RÉSZT VESZNEK A NÖVÉNYI ÉLETTANBAN ÉS AZ ANTIOXIDÁNS VÁLASZBAN. EBBEN AZ ÉRTELEMBEN A NÖVEKVŐ ÉRDEKLŐDÉS EZEKNEK A NEM SZÁRMAZÓ MOLEKULÁKNAK A TELÍTETLEN ZSÍRSAVAKKAL VALÓ KÖLCSÖNHATÁSÁRA ÖSSZPONTOSÍTOTT, AMI NITRO-ZSÍRSAVAKAT (NO2-FAS) EREDMÉNYEZ. VALÓJÁBAN EZEKNEK A MOLEKULÁKNAK A TANULMÁNYOZÁSA A NÖVÉNYRENDSZEREKBEN ÉRDEKES ÉS FELTÖREKVŐ TERÜLET. A KÖZELMÚLTBAN KUTATÓCSOPORTUNK KORÁBBI PROJEKTEKBEN BIZONYÍTOTTA A LINOLÉNSAV (NO2-LN) NITRÁTSZÁRMAZÉKAINAK ENDOGÉN ELŐFORDULÁSÁT NÖVÉNYFAJOKBAN. EZENKÍVÜL AZ RNS-SEQ TECHNOLÓGIÁN KERESZTÜL KIMUTATTÁK, HOGY AZ NO2-LN NAGY MENNYISÉGŰ HŐSOKK FEHÉRJÉT (HSPS) ÉS KÜLÖNBÖZŐ ANTIOXIDÁNS RENDSZEREKET IDÉZHET ELŐ, AMELYEK ARRA UTALNAK, HOGY EZ A MOLEKULA ANTIOXIDÁNS ÉS VÉDELMI REAKCIÓKAT INDÍTHAT EL A NÖVÉNYEKBEN. BÁR AZ NO2-LN MIND AZ ANTIOXIDÁNS REAKCIÓT, MIND A TÖBB ABIOTIKUS STRESSZEL SZEMBENI VÉDEKEZŐ MECHANIZMUST AKTIVÁLJA, ÉS ENNEK A MOLEKULÁNAK A NO KIBOCSÁTÁSÁRA VALÓ KÉPESSÉGÉRŐL IS BESZÁMOLTAK, A PONTOS MECHANIZMUSOK, AMELYEKKEL EZ A NITRO-ZSÍRSAV KÉPES KIVÁLTANI EZEKET A REAKCIÓKAT, TOVÁBBRA SEM ISMERTEK. EZEN A PONTON HANGSÚLYOZNI KELL, HOGY A NITRO-ZSÍRSAVAK ELEKTROFIL KAPACITÁSA IS MEGVALÓSÍTHATÓ JELZŐÚT A NÖVÉNYEKBEN. A MICHAEL-kiegészítés a POST-transzformációs MODIKÁCIÓI MŰSZAKI TUDOMÁNY TUDOMÁNYA NITROALKYLÁCIÓK._x000D_KÖVETKEZDÉSE ÉS AZ EREDMÉNYEK A PREVIOUS PROJEKTEK KÖZÖSSÉGE, az ANTIOXIDANT RESPONZIA MODULÁCIÓJA NITRO-OXIDATÍV IRÁNYELVI FOGLALKOZÓ NITRO-OXIDATÍV IRÁNYELVI FOGLALKOZÓ KÖLTSÉGVETÉSI KÖVETELMÉNYEK A NITROALKYLÁCIÓK SZERZŐDÉSÉRE VONATKOZÓ RENDELKEZÉSEKRE VONATKOZÓ KÖVETELMÉNYEKRE VONATKOZÓ TÁMOGATÁS MÓDOSÍTÁSA, a KÖVETKEZTETÉSI SZOLGÁLTATÁSOKRA VONATKOZÓ KÖRNYEZETVÉDELEMI FOGLALKOZÓ TÁMOGATÁSOKRA VONATKOZÓ KÖVETKEZTETÉSI RENDELKEZÉSEKBEN. E CÉLOK ÉRDEKÉBEN A NO2FA SZEREPÉT AZ ARABIDOPSIS THALIANA ABIOTIKUS STRESSZ SORÁN AZ ANTIOXIDÁNS VÁLASZ INDUKCIÓJÁBAN FOGJA ELVÉGEZNI. EZZEL PÁRHUZAMOSAN ELEMEZNI KELL AZ ANTIOXIDÁNS VÁLASZ NITROALKYLATION NO2FA-VAL TÖRTÉNŐ FUNKCIONÁLIS JELLEMZÉSÉT, VALAMINT A HSPS RENDELET SZERINTI JELÁTVITELI KAPACITÁST. A JAVASOLT CÉLOKAT TÁMOGATÓ KÜLÖNBÖZŐ KÍSÉRLETI TERVEKET OLYAN TECHNIKÁK MULTIDISZCIPLINÁRIS KOMBINÁCIÓJÁVAL KELL ELVÉGEZNI, MINT A BIOKÉMIAI ÉS MOLEKULÁRIS ELEMZÉSEK, A CLSM, AZ NMR, A HÁRMAS KVADRUPOL TÖMEGSPEKTROMETRIA (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), A BIMOLEKULÁRIS FLUORESZCENCIA KOMPLEMENTÁCIÓS VIZSGÁLAT (BIFC), A KROMATIN IMMUNOPRECIPITÁCIÓ (CHIP) ÉS A MOLEKULÁRIS GENETIKA ARABIDOPSIS-TRANSZFORMÁNSOK ALKALMAZÁSÁVAL. MINDEZEK A MECHANIZMUSOK ISMERETLENEK A NÖVÉNYEKBEN, ÉS A KAPOTT EREDMÉNYEK BIOTECHNOLÓGIAI ÉS AGRONÓMIAI JELENTŐSÉGGEL BÍRHATNAK, MINT BIOTECHNOLÓGIAI ESZKÖZÖK. VALÓJÁBAN EZ A JAVASLAT ÖSSZHANGBAN VAN AZZAL, HOGY A „HORIZONT 2020” PROGRAMON BELÜL A MÁSODIK SZÁMÚ KIHÍVÁS A KÜLÖNBÖZŐ SZERVEZETEK ÉS VÁLLALATOK ÁLTAL NYÚJTOTT TÁMOGATÁS. (Hungarian)
    4 August 2022
    0 references
    V POSLEDNÍCH NĚKOLIKA LETECH UPOUTALA POZORNOST ÚLOHA OXIDŮ DUSNATÝCH (NE) A REAKTIVNÍCH DUSÍKATÝCH DRUHŮ (RNS) V OBLASTI ROSTLINNÝCH SYSTÉMŮ. V TOMTO SMYSLU SCHOPNOST NO ZPROSTŘEDKOVÁVAT NĚKOLIK POSTTRANSLAČNÍCH MODIFIKACÍ (NO-PTM) V RŮZNÝCH BIOMOLEKULÁCH, JAKO JE NITRACE PROTEINU TYROSINU NEBO S-NITROSYLACE, UKÁZALA ZAPOJENÍ TĚCHTO MOLEKUL DO ŠIROKÉ ŠKÁLY FUNKCÍ V ROSTLINNÉ FYZIOLOGII A ANTIOXIDAČNÍ REAKCI. V TOMTO SMYSLU SE ROSTOUCÍ ZÁJEM ZAMĚŘIL NA INTERAKCI TĚCHTO MOLEKUL BEZ ODVOZENÍ S NENASYCENÝMI MASTNÝMI KYSELINAMI, KTERÉ PRODUKUJÍ NITROMASTNÉ KYSELINY (NO2-FAS). VE SKUTEČNOSTI STUDIUM TĚCHTO MOLEKUL V ROSTLINNÝCH SYSTÉMECH PŘEDSTAVUJE ZAJÍMAVOU A ROZVÍJEJÍCÍ SE OBLAST. V POSLEDNÍ DOBĚ NÁŠ VÝZKUMNÝ TÝM V PŘEDCHOZÍCH PROJEKTECH PROKÁZAL, ŽE U ROSTLINNÝCH DRUHŮ BYL VYHODNOCEN ENDOGENNÍ VÝSKYT DUSIČNANOVÝCH DERIVÁTŮ KYSELINY LINOLENOVÉ (NO2-LN). NAVÍC A PROSTŘEDNICTVÍM TECHNOLOGIE RNA-SEQ BYLO PROKÁZÁNO, ŽE NO2-LN MŮŽE VYVOLAT VELKOU SADU TEPELNĚ-ŠOKOVÝCH PROTEINŮ (HSPS) A RŮZNÉ ANTIOXIDAČNÍ SYSTÉMY NAZNAČUJÍCÍ, ŽE TATO MOLEKULA MŮŽE VYVOLAT ANTIOXIDAČNÍ A OBRANNÉ REAKCE V ROSTLINÁCH. NICMÉNĚ, I KDYŽ JAK ANTIOXIDAČNÍ REAKCE, TAK OBRANNÝ MECHANISMUS PROTI NĚKOLIKA ABIOTICKÝM STRESOVÝM PODMÍNKÁM JE AKTIVOVÁN NO2-LN A SCHOPNOST TÉTO MOLEKULY UVOLNIT NO BYLA TAKÉ HLÁŠENA, PŘESNÉ MECHANISMY, KTERÝMI JE TATO NITRO-MASTNÁ KYSELINA SCHOPNA VYVOLAT TYTO REAKCE, ZŮSTÁVAJÍ NEZNÁMÉ. V TOMTO BODĚ JE TŘEBA ZDŮRAZNIT, ŽE ELEKTROFILNÍ KAPACITA NITROMASTNÝCH KYSELIN JE TAKÉ PROVEDITELNOU SIGNALIZAČNÍ CESTOU V ROSTLINÁCH. In FACT, DUE to THEIR elektrofilní NATURE, NO2-FA se nakupují do MODIFY SUSCEPTIBLE nukleofilních AMINO ACIDS PROTEINS VIA MICHAEL ADDITION LEADING K POST-TRANSLATIONU SPECIFICKÉ SPECIFICKÉ ŘÍZENÍ jako NITROALKYLATION._x000D_ KONSIDERING THIS BACKGROUND A RESULTY Z NAŠÍ PREVIOUSNÍ PROJEKTY V tomto FIELU, hlavní strana PRESENTNÍHO PROJEKTU PŘEDSLUŠTNÍHO PROJEKTU STUDY MODULACE ANTIOXIDANTNÍHO RESPONČNÍHO PŘÍSLUŠNOSTI NO2-FAS PODLE NITRO-OXIDATIVNÍHO PŘEDBĚŽENÍ V OBLASTI KARAKTIKÉHO PROSTŘEDKÉHO MECHANISŮ PROTEIN MODIFIKACE NITROALKYLATION, stejně jako INTERACTIONS SIGNALING PATHWAYS INVOLVED in the DEFENSE PROCESS ALONG THE SITUATIONs of ENVIRONMENTAL STRESS. ZA TÍMTO ÚČELEM BUDE PROVÁDĚT STUDII ÚLOHY NO2FA PŘI INDUKCI ANTIOXIDAČNÍ REAKCE BĚHEM ABIOTICKÉHO STRESU V ARABIDOPSIS THALIANA. SOUČASNĚ BUDE ANALYZOVAT FUNKČNÍ CHARAKTERIZACI ANTIOXIDAČNÍ REAKCE NITROALKYLATION S NO2FA, JAKOŽ I SIGNALIZAČNÍ KAPACITU REGULACÍ HSPS. RŮZNÉ EXPERIMENTÁLNÍ NÁVRHY, KTERÉ PODPORUJÍ NAVRHOVANÉ CÍLE, BUDOU PROVÁDĚNY POMOCÍ MULTIDISCIPLINÁRNÍ KOMBINACE TECHNIK, JAKO JSOU BIOCHEMICKÉ A MOLEKULÁRNÍ ANALÝZY, CLSM, NMR, TRIPLE-QUADRUPÓLOVÁ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), BIMOLEKULÁRNÍ FLUORESCENČNÍ KOMPLEMENTACE (BIFC), CHROMATIN IMUNOPRECIPITATION (ČIP) A MOLEKULÁRNÍ GENETIKA POMOCÍ TRANSFORMANTŮ ARABIDOPSIS. VŠECHNY TYTO MECHANISMY JSOU V ROSTLINÁCH NEZNÁMÉ A ZÍSKANÉ VÝSLEDKY BY MOHLY MÍT BIOTECHNOLOGICKÝ A AGRONOMICKÝ VÝZNAM JAKO BIOTECHNOLOGICKÉ NÁSTROJE. TENTO NÁVRH JE VE SKUTEČNOSTI V SOULADU S VÝZVOU ČÍSLO DVĚ V RÁMCI PROGRAMU „HORIZONT 2020“, KTERÁ PŘEDSTAVUJE TUTO PODPORU RŮZNÝCH SUBJEKTŮ A SPOLEČNOSTÍ. (Czech)
    4 August 2022
    0 references
    DAŽOS PĒDĒJOS GADOS SLĀPEKĻA OKSĪDA (NR) UN REAKTĪVO SLĀPEKĻA SUGU (RNS) LOMA AUGU SISTĒMU JOMĀ IR PIESAISTĪJUSI UZMANĪBU. ŠAJĀ ZIŅĀ NO SPĒJA MEDIĒT VAIRĀKAS PĒCTRANSLĀCIJAS MODIFIKĀCIJAS (NO-PTM) DAŽĀDĀS BIOMOLEKULĀS, PIEMĒRAM, PROTEĪNU TIROZĪNA NITRĀCIJĀ VAI S-NITROZILĀCIJĀ, IR PARĀDĪJUSI ŠO MOLEKULU IESAISTĪŠANOS DAŽĀDĀS AUGU FIZIOLOĢIJAS UN ANTIOKSIDANTU REAKCIJAS FUNKCIJĀS. ŠAJĀ ZIŅĀ PIEAUGOŠĀ INTERESE IR VĒRSTA UZ ŠO BEZATVASINĀTO MOLEKULU MIJIEDARBĪBU AR NEPIESĀTINĀTAJĀM TAUKSKĀBĒM, KAS RADA NITROTAUKSKĀBJUS (NO2-FAS). PATIESĪBĀ ŠO MOLEKULU IZPĒTE AUGU SISTĒMĀS IR INTERESANTA UN JAUNA JOMA. NESEN MŪSU PĒTNIECĪBAS KOMANDA IEPRIEKŠĒJOS PROJEKTOS PIERĀDĪJA, KA AUGU SUGĀM TIKA NOVĒRTĒTA LINOLĒNSKĀBES (NO2-LN) NITRĀTU ATVASINĀJUMU KLĀTBŪTNE. TURKLĀT, IZMANTOJOT RNS-SEQ TEHNOLOĢIJU, TIKA PIERĀDĪTS, KA NO2-LN VAR IZRAISĪT LIELU KARSTUMA ŠOKA PROTEĪNU (HSPS) KOPUMU UN DAŽĀDAS ANTIOKSIDANTU SISTĒMAS, KAS LIECINA, KA ŠĪ MOLEKULA VAR UZSĀKT ANTIOKSIDANTU UN AIZSARDZĪBAS REAKCIJU AUGOS. TOMĒR, LAI GAN NO2-LN AKTIVIZĒ GAN ANTIOKSIDANTU ATBILDES REAKCIJU, GAN AIZSARDZĪBAS MEHĀNISMU PRET VAIRĀKIEM ABIOTISKĀ STRESA APSTĀKĻIEM, UN IR ZIŅOTS ARĪ PAR ŠĪS MOLEKULAS SPĒJU ATBRĪVOT NĒ, PRECĪZIE MEHĀNISMI, AR KURIEM ŠĪ NITRO-TAUKSKĀBE SPĒJ IZRAISĪT ŠĪS REAKCIJAS, PALIEK NEZINĀMI. ŠAJĀ BRĪDĪ IR JĀUZSVER, KA NITRO-TAUKSKĀBJU ELEKTROFILISKĀ JAUDA IR ARĪ IESPĒJAMS SIGNĀLCEĻŠ AUGOS. In FACT, DUE TO THEIR electrophilic NATURE, NO2-FA ir iespēja, lai MODIFY SUSCEPTIBLE nukleofīlo AMINO ACIDS PROTEINĀJUMU MICHAEL ADDITION LEADING TO POST-TRANSLATIONAL MODIFICATION SPECIFIKALLY KNOWN AS NITROALKYLATION._x000D_ CONSIDERING THIS BACKGROUND UN RESULTS no mūsu PREVIOUS PROJEKTI THIS FIELD, galvenā DALĪBĀ DALĪBVALSTS PALĪDZĪBAS DALĪBVALSTU ANTIOXIDIDANĀCIJAS BY NO2-FAS UNDER NITRO-OXIDATIVE STRESS CONDITIONS PASĀKUMU TIRDZNIECĪBAS POSTTRANSLĀCIJAS MEHANISMS BY NITROALKYLATION, ar SIGNALING PATHWAYS INVOLVED DEFENSE PROCESSES ALOĢIJAS SITUĀCIJAS VIENOŠANĀS. LAI SASNIEGTU ŠOS MĒRĶUS, TĀ VEIKS PĒTĪJUMU PAR NO2FA LOMU ANTIOKSIDANTA REAKCIJAS INDUKCIJĀ ABIOTISKĀ STRESA LAIKĀ ARABIDOPSIS THALIANA. VIENLAIKUS TĀ ANALIZĒS ANTIOKSIDANTA ATBILDES REAKCIJAS FUNKCIONĀLO RAKSTUROJUMU AR NITROALKYLATION AR NO2FA, KĀ ARĪ SIGNALIZĀCIJAS JAUDU SASKAŅĀ AR HSPS REGULU. IZMANTOJOT ARABIDOPSIS TRANSFORMANTUS, TIKS VEIKTI DAŽĀDI EKSPERIMENTĀLI PROJEKTI, KAS ATBALSTA IEROSINĀTOS MĒRĶUS, IZMANTOJOT DAUDZNOZARU METOŽU KOMBINĀCIJU, PIEMĒRAM, BIOĶĪMISKĀS UN MOLEKULĀRĀS ANALĪZES, CLSM, NMR, TRĪSKĀRŠĀ KVADRĀTPOLA MASSPEKTROMETRIJA (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), BIMOLEKULĀRĀS FLUORESCENCES KOMPLEMENTĀCIJAS TESTS (BIFC), HROMATĪNA IMŪNPRECIPITĀCIJA (MIKROSHĒMA) UN MOLEKULĀRĀ ĢENĒTIKA. VISI ŠIE MEHĀNISMI AUGOS NAV ZINĀMI, UN IEGŪTAJIEM REZULTĀTIEM VAR BŪT BIOTEHNOLOĢISKA UN AGRONOMISKA NOZĪME KĀ BIOTEHNOLOĢISKIEM BEZ INSTRUMENTIEM. FAKTISKI ŠIS PRIEKŠLIKUMS ATBILST OTRAJAM IZAICINĀJUMAM PROGRAMMAS “APVĀRSNIS 2020” IETVAROS, JO TAS IR ATBALSTS, KO SNIEDZ DAŽĀDAS STRUKTŪRAS UN UZŅĒMUMI. (Latvian)
    4 August 2022
    0 references
    LE BLIANTA BEAGA ANUAS, TÁ AIRD TARRAINGTHE AG RÓL NA N-OCSAÍD NÍTREACH (NÍL) AGUS SPEICEAS NÍTRIGINE IMOIBRÍOCH (RNS) I RÉIMSE NA GCÓRAS PLANDAÍ. SA CHIALL SEO, LÉIRIGH CUMAS GAN ROINNT MODHNUITHE IAR-AISTRITHE (GAN-PTM) A IDIRGHABHÁIL I MBITHMHÓILÍNÍ ÉAGSÚLA, MAR SHAMPLA NITRATION TYROSINE PRÓITÉINE NÓ S-NITROSYLATION RANNPHÁIRTÍOCHT NA MÓILÍNÍ SEO I RAON LEATHAN FEIDHMEANNA I BHFISEOLAÍOCHT PLANDAÍ AGUS SA FHREAGAIRT FRITHOCSAÍDEACH. SA CHIALL SEO, DHÍRIGH ÚS ATÁ AG FÁS AR IDIRGHNÍOMHAÍOCHT NA MÓILÍNÍ NEAMHDHÍORTHAITHE SEO LE HAIGÉID SHAILLEACHA NEAMHSHÁITHITHE, RUD A THUGANN AIGÉID NITRO-SAILLEACHA (NO2-FAS). GO DEIMHIN, IS ÉARD ATÁ SA STAIDÉAR AR NA MÓILÍNÍ SEO I GCÓRAIS PLANDAÍ LIMISTÉAR SUIMIÚIL AGUS AG TEACHT CHUN CINN. LE DÉANAÍ, RINNEADH MEASÚNÚ AR ÁR BHFOIREANN TAIGHDE I DTIONSCADAIL ROIMHE SEO AR THARLÚ INGINIÚIL NA NDÍORTHACH NÍOTRÁITITHE D’AIGÉAD LINÓLACH (NO2-LN) I SPEICIS PLANDAÍ. THAIRIS SIN AGUS TRÍ THEICNEOLAÍOCHT RNA-SEQ, LÉIRÍODH GUR FÉIDIR LE NO2-LN SRAITH MÓR PRÓITÉINÍ TURRAINGE TEASA A SPREAGADH (HSPANNA) AGUS CÓRAIS ÉAGSÚLA FRITHOCSAÍDEACHA A THUGANN LE FIOS GO BHFÉADFADH AN MÓILÍN SEO FREAGAIRTÍ FRITHOCSAÍDEACHA AGUS COSANTA A SHEOLADH I BPLANDAÍ. MAR SIN FÉIN, CÉ GO BHFUIL FREAGRA FRITHOCSAÍDEACH AGUS MEICNÍOCHT COSANTA I GCOINNE ROINNT COINNÍOLLACHA STRUS AIBITHEACH I NGNÍOMH AG NO2-LN AGUS NÍOR TUAIRISCÍODH CUMAS AN MHÓILÍN SEO GAN AON SCAOILEADH, NA MEICNÍOCHTAÍ BEACHTA TRÍNA BHFUIL AN T-AIGÉAD NITRO-SAILLEACH SEO IN ANN NA FREAGAIRTÍ SEO A SPREAGADH ANAITHNID. AG AN BPOINTE SEO IS GÁ BÉIM A LEAGAN GO BHFUIL CUMAS ELECTROPHILIC AIGÉID NITRO-SAILLEACH INA CHONAIR CHOMHARTHAÍOCHTA INDÉANTA I BPLANDAÍ FREISIN. Ar an ngníomhú, D’fhonn an t-údarás leictreaphróifileach seo a chur i bhfeidhm, is é sin le rá, NÁ DHÉANAMH NÁISIÚNTA NÁISIÚNTA NÁISIÚNTA NÁISIÚNTA LE hAGHAIDH MAIDIR LE NÁISIÚNTA LE hAGHAIDH CINNEADH MAIDIR LE NÁISIÚNTA NÁISIÚNTA AGUS NA hEARNÁLACHA NÁISIÚNTA NA hEARNÁLACHA A DHÉANAMH, [EN] (b) RIAL NA gCOMHPHOBAL AIRGEADAIS NA gCOMHPHOBAL STIÚRTHÓIREACHT ISTEACH AN BHLIANTÚIL A BHAINEANN LEIS AN NÍOMHAÍOCHTAÍ STIÚRTHÓIREACHT NA gCOMHPHOBAL-OXIDATAÍ IN ORDUITHE TIONSCAIL POST-TRANSALAL POST-NÍOMHAÍOCHTA, chomh maith leis na hidirghníomhaíochtaí a bhaineann leis na conairí SIGNALING atá in úsáid i Nósanna SEFENSEANNA NA STIÚRTHÓIREACHT GNÍOMHAÍOCHTAÍ. CHUN NA HAIDHMEANNA SEO, DÉANFAR STAIDÉAR AR RÓL NO2FA I IONDUCHTÚ AN FHREAGRA FRITHOCSAÍDEACH LE LINN STRUS AIBITHEACH IN ARABIDOPSIS THALIANA. AG AN AM CÉANNA, DÉANFAR ANAILÍS AR THRÉITHRIÚ FEIDHMIÚIL AN FHREAGRA FRITHOCSAÍDEACH AG NITROALKYLATION LE NO2FA CHOMH MAITH LEIS AN GCUMAS COMHARTHAÍOCHTA LE RIALACHÁN HSPANNA. DÉANFAR DEARAÍ TURGNAMHACHA ÉAGSÚLA A THACAÍONN LEIS NA HAIDHMEANNA ATÁ BEARTAITHE TRÍ ÚSÁID A BHAINT AS MEASCÁN ILDISCIPLÍNEACH DE THEICNÍCÍ AMHAIL ANAILÍSÍ BITHCHEIMICEACHA AGUS MÓILÍNEACHA, CLSM, NMR, MAIS-SPEICTRIMÉADRACHT TRÍ CHORADRUPOLE (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), MEASÚNACHT FHLUARAISEACHT DHÉMHÓILÍNEACH (BIFC), FRASAÍOCHT IMDHÍONACHTA CHROMATIN (SLIS) AGUS GÉINEOLAÍOCHT MHÓILÍNEACH TRÍ ÚSÁID A BHAINT AS TRASFHOIRMEOIRÍ ARABIDOPSIS. NÍL NA MEICNÍOCHTAÍ SEO GO LÉIR AR EOLAS I BPLANDAÍ AGUS D’FHÉADFADH ÁBHARTHACHT BHITEICNEOLAÍOCHTA AGUS AGRANAMAÍOCH A BHEITH AG NA TORTHAÍ A FHAIGHTEAR MAR AON UIRLISÍ BITEICNEOLAÍOCHTA. GO DEIMHIN, TÁ AN TOGRA SEO I GCOMHRÉIR LE HUIMHIR DHÚSHLÁN A DÓ LAISTIGH DE “FÍS 2020” ARB É AN TACAÍOCHT SIN Ó EINTITIS AGUS Ó CHUIDEACHTAÍ ÉAGSÚLA AN CLÁR SIN. (Irish)
    4 August 2022
    0 references
    V ZADNJIH NEKAJ LETIH JE VLOGA DUŠIKOVEGA OKSIDA (ŠT.) IN REAKTIVNIH VRST DUŠIKA (RNS) PRITEGNILA POZORNOST NA PODROČJU RASTLINSKIH SISTEMOV. V TEM SMISLU JE SPOSOBNOST NO, DA POSREDUJE VEČ POSTTRANSLACIJSKIH MODIFIKACIJ (NO-PTM) V RAZLIČNIH BIOMOLEKULAH, KOT STA BELJAKOVINSKA TIROZIN NITRACIJA ALI S-NITROZILACIJA, POKAZALA VKLJUČENOST TEH MOLEKUL V ŠIROK SPEKTER FUNKCIJ V FIZIOLOGIJI RASTLIN IN ANTIOKSIDATIVNI ODZIV. V TEM SMISLU SE JE VSE VEČJE ZANIMANJE OSREDOTOČILO NA INTERAKCIJO TEH MOLEKUL BREZ PRIDOBLJENEGA IZVORA Z NENASIČENIMI MAŠČOBNIMI KISLINAMI, KI PROIZVAJAJO NITROMAŠČOBNE KISLINE (NO2-FAS). PRAVZAPRAV JE PREUČEVANJE TEH MOLEKUL V RASTLINSKIH SISTEMIH ZANIMIVO IN NASTAJAJOČE PODROČJE. NEDAVNO JE NAŠA RAZISKOVALNA SKUPINA V PREJŠNJIH PROJEKTIH DOKAZALA, DA JE BILA PRI RASTLINSKIH VRSTAH OCENJENA ENDOGENA PRISOTNOST NITRIRANIH DERIVATOV LINOLNE KISLINE (NO2-LN). POLEG TEGA JE BILO S TEHNOLOGIJO RNA-SEQ DOKAZANO, DA NO2-LN LAHKO POVZROČI VELIK NABOR BELJAKOVIN TOPLOTNEGA ŠOKA (HSPS) IN RAZLIČNE ANTIOKSIDATIVNE SISTEME, KI KAŽEJO, DA LAHKO TA MOLEKULA SPROŽI ANTIOKSIDATIVNE IN OBRAMBNE ODZIVE V RASTLINAH. ČEPRAV NO2-LN AKTIVIRA ANTIOKSIDATIVNI ODZIV IN OBRAMBNI MEHANIZEM PRED VEČ ABIOTSKIMI STRESNIMI POGOJI, POROČAJO TUDI O SPOSOBNOSTI TE MOLEKULE, DA SPROSTI NO, VENDAR NATANČNI MEHANIZMI, S KATERIMI LAHKO TA NITROMAŠČOBNA KISLINA POVZROČI TE ODZIVE, OSTAJAJO NEZNANI. NA TEJ TOČKI JE TREBA POUDARITI, DA JE ELEKTROFILNA ZMOGLJIVOST NITROMAŠČOBNIH KISLIN TUDI IZVEDLJIVA SIGNALNA POT V RASTLINAH. V FACT, DUE TO THEIR Electrophilic NATURE, NO2-FA ARE BREZPLAČNO ZAČETNIH nukleofilnih AMINO ACIDS PROTEINSKIH DODATNIH DODATNIH MICHAEL, ki se nagibajo k POST-TRANSLACIJSKemu načinu, vlada PREDSTAVNIKA KONCERJE STUDIJE MODULCIJE ANTIOXIDANTNIH RESPONSE BY NO2-FAS NITRO-OXIDATIVE STRESS CONDITION V PODROČJU POGLAVJA NA PODROČJU POST-TRANSLACIJSKEGA MEHANICIJE PROTEIN MODIFIKACIJE Z NITROALKIRANJEM, ko so se INTERACTIONI Z VELIKIMI PATHWAYMI, INVOLVEDI V DEFENSE PROCESCIJI Z VELIKIMI SITUACIJAMI OKOLDNIH STRESSOV. ZA TE CILJE BO IZVEDLA ŠTUDIJO O VLOGI NO2FA PRI INDUKCIJI ANTIOKSIDATIVNEGA ODZIVA MED ABIOTIČNIM STRESOM V ARABIDOPSIS THALIANA. HKRATI SE BO ANALIZIRALA FUNKCIONALNA KARAKTERIZACIJA ANTIOKSIDACIJSKEGA ODZIVA Z ZDRAVILOM NITROALKYLATION Z NO2FA IN ZMOGLJIVOST SIGNALIZACIJE Z UREDBO HSPS. RAZLIČNE EKSPERIMENTALNE ZASNOVE, KI PODPIRAJO PREDLAGANE CILJE, SE BODO IZVAJALE Z UPORABO MULTIDISCIPLINARNE KOMBINACIJE TEHNIK, KOT SO BIOKEMIČNE IN MOLEKULARNE ANALIZE, CLSM, NMR, TROJNO KVADRUPOLNA MASNA SPEKTROMETRIJA (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), BIMOLEKULARNI TEST FLUORESCENČNEGA KOMPLEMENTA (BIFC), KROMATINSKA IMUNOPRECIPITACIJA (ČIP) IN MOLEKULARNA GENETIKA Z UPORABO TRANSFORMANTOV ARABIDOPSIS. VSI TI MEHANIZMI V RASTLINAH NISO ZNANI, DOBLJENI REZULTATI PA BI LAHKO IMELI BIOTEHNOLOŠKI IN AGRONOMSKI POMEN KOT BIOTEHNOLOŠKO BREZ ORODJA. DEJANSKO JE TA PREDLOG V SKLADU Z DRUGIM IZZIVOM V PROGRAMU OBZORJE 2020 KOT PODPORO RAZLIČNIH SUBJEKTOV IN PODJETIJ. (Slovenian)
    4 August 2022
    0 references
    ПРЕЗ ПОСЛЕДНИТЕ НЯКОЛКО ГОДИНИ РОЛЯТА НА АЗОТНИЯ ОКСИД (NO) И РЕАКТИВНИТЕ АЗОТНИ ВИДОВЕ (RNS) ПРИВЛЕЧЕ ВНИМАНИЕТО В ОБЛАСТТА НА РАСТИТЕЛНИТЕ СИСТЕМИ. В ТОЗИ СМИСЪЛ СПОСОБНОСТТА НА NO ДА ПОСРЕДНИЧИ НЯКОЛКО ПОСТТРАНСЛАЦИОННИ МОДИФИКАЦИИ (NO-PTM) В РАЗЛИЧНИ БИОМОЛЕКУЛИ, КАТО ПРОТЕИН ТИРОЗИН НИТРАЦИЯ ИЛИ S-НИТРОЗИЛАЦИЯ, ПОКАЗВА УЧАСТИЕТО НА ТЕЗИ МОЛЕКУЛИ В ШИРОК СПЕКТЪР ОТ ФУНКЦИИ В РАСТИТЕЛНАТА ФИЗИОЛОГИЯ И АНТИОКСИДАНТНИЯ ОТГОВОР. В ТОЗИ СМИСЪЛ НАРАСТВАЩИЯТ ИНТЕРЕС СЕ СЪСРЕДОТОЧАВА ВЪРХУ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО НА ТЕЗИ НЕПРОИЗВЕДЕНИ МОЛЕКУЛИ С НЕНАСИТЕНИ МАСТНИ КИСЕЛИНИ, КОИТО ДАВАТ НИТРО-МАСТНИ КИСЕЛИНИ (NO2-FAS). ВСЪЩНОСТ ИЗСЛЕДВАНЕТО НА ТЕЗИ МОЛЕКУЛИ В РАСТИТЕЛНИТЕ СИСТЕМИ ПРЕДСТАВЛЯВА ИНТЕРЕСНА И ВЪЗНИКВАЩА ОБЛАСТ. НАСКОРО НАШИЯТ ИЗСЛЕДОВАТЕЛСКИ ЕКИП ПОКАЗА В ПРЕДИШНИ ПРОЕКТИ, ЧЕ ПРИ РАСТИТЕЛНИТЕ ВИДОВЕ Е НАПРАВЕНА ОЦЕНКА НА ЕНДОГЕННАТА ПОЯВА НА НИТРИДНИ ПРОИЗВОДНИ НА ЛИНОЛЕНОВА КИСЕЛИНА (NO2-LN). ОСВЕН ТОВА ЧРЕЗ РНК-SEQ ТЕХНОЛОГИЯ БЕШЕ ПОКАЗАНО, ЧЕ NO2-LN МОЖЕ ДА ПРЕДИЗВИКА ГОЛЯМ НАБОР ОТ ТОПЛИННО-ШОКОВИ ПРОТЕИНИ (HSPS) И РАЗЛИЧНИ АНТИОКСИДАНТНИ СИСТЕМИ, КОИТО ПРЕДПОЛАГАТ, ЧЕ ТАЗИ МОЛЕКУЛА МОЖЕ ДА ПРЕДИЗВИКА АНТИОКСИДАНТНИ И ЗАЩИТНИ РЕАКЦИИ В РАСТЕНИЯТА. ВЪПРЕКИ ТОВА, ВЪПРЕКИ ЧЕ КАКТО АНТИОКСИДАНТЕН ОТГОВОР, ТАКА И ЗАЩИТЕН МЕХАНИЗЪМ СРЕЩУ НЯКОЛКО АБИОТИЧНИ СТРЕС СЪСТОЯНИЯ СЕ АКТИВИРА ОТ NO2-LN И СПОСОБНОСТТА НА ТАЗИ МОЛЕКУЛА ДА ОСВОБОЖДАВА NO СЪЩО Е ДОКЛАДВАНА, ТОЧНИТЕ МЕХАНИЗМИ, ЧРЕЗ КОИТО ТАЗИ НИТРО-МАСТНА КИСЕЛИНА Е В СЪСТОЯНИЕ ДА ИНДУЦИРА ТЕЗИ РЕАКЦИИ, ОСТАВАТ НЕИЗВЕСТНИ. В ТОЗИ МОМЕНТ Е НЕОБХОДИМО ДА СЕ ПОДЧЕРТАЕ, ЧЕ ЕЛЕКТРОФИЛНИЯТ КАПАЦИТЕТ НА НИТРО-МАЗНИТЕ КИСЕЛИНИ СЪЩО Е ОСЪЩЕСТВИМ СИГНАЛЕН ПЪТ В РАСТЕНИЯТА. В действителност, DUE TO THEIR електрофилна Природа, NO2-FA СЪОБЩЕНИЕ НА MODIFY SUSCEPTIBLE нуклеофилни AMINO ACIDS OF PROTEINS VIA THE MICHAEL ADDITION LEADING TO AN POST-TRANSLATIONAL MODIFICATION СПЕЦИФИКАЦИИ ПО НИТРАЛКИЛАЦИЯ._x000D_ СЪОТВЕТСТВИЕТО НА ТИСКУРНОСТТА И РЕЗУЛТИТЕ ОТ НАШИТЕ ПРЕВОЗНИ ПРОЕКТИ в THIS FIELD, основното ГЛАВА НА ПРЕДСТАВИТЕЛЯ НА ПРЕДСТАВИТЕЛЯТ КОНСЕРЕНТ НА СЪТРУДНИЧЕСТВОТО НА СЪОБЩЕНИЕТО НА АНТИОКСИДАНТА НА РЕЗИОНИТЕ НА NO2-FAS UNDERERY NITRO-OXIDATIVE STRESS CONDITION, както ИНТЕРАКЦИИ С ОГРАНИЧИТЕЛНИТЕ ПЪТОВЕ В ДЕФЕНСИТЕ ПРОЦЕСИ СЪОТВЕТСТВИЕТО НА ОКОЛНИТЕ СТРЕСИ. ЗА ТАЗИ ЦЕЛ ЩЕ СЕ ПРОВЕДЕ ПРОУЧВАНЕ НА РОЛЯТА НА NO2FA В ИНДУКЦИЯТА НА АНТИОКСИДАНТНИЯ ОТГОВОР ПО ВРЕМЕ НА АБИОТИЧЕН СТРЕС ПРИ ARABIDOPSIS THALIANA. УСПОРЕДНО С ТОВА ЩЕ СЕ АНАЛИЗИРА ФУНКЦИОНАЛНОТО ХАРАКТЕРИЗИРАНЕ НА АНТИОКСИДАНТНИЯ ОТГОВОР ОТ NITROALKYLATION С NO2FA, КАКТО И КАПАЦИТЕТЪТ ЗА СИГНАЛИЗИРАНЕ ЧРЕЗ РЕГУЛИРАНЕ НА HSPS. РАЗЛИЧНИ ЕКСПЕРИМЕНТАЛНИ ПРОЕКТИ, КОИТО ПОДКРЕПЯТ ПРЕДЛОЖЕНИТЕ ЦЕЛИ, ЩЕ СЕ ИЗВЪРШВАТ ЧРЕЗ ИЗПОЛЗВАНЕ НА МУЛТИДИСЦИПЛИНАРНА КОМБИНАЦИЯ ОТ ТЕХНИКИ КАТО БИОХИМИЧНИ И МОЛЕКУЛЯРНИ АНАЛИЗИ, CLSM, ЯМР, ТРОЙНО-КВАДРУПОЛНА МАССПЕКТРОМЕТРИЯ (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), БИМОЛЕКУЛЯРЕН ФЛУОРЕСЦЕНТЕН ДОПЪЛВАЩ ТЕСТ (BIFC), ХРОМАТИНОВА ИМУНОПРЕЦИПИТАЦИЯ (ЧИП) И МОЛЕКУЛЯРНА ГЕНЕТИКА ЧРЕЗ ИЗПОЛЗВАНЕ НА ПРЕОБРАЗУВАТЕЛИ НА АРАБИДОПСИС. ВСИЧКИ ТЕЗИ МЕХАНИЗМИ СА НЕИЗВЕСТНИ В РАСТЕНИЯТА И ПОЛУЧЕНИТЕ РЕЗУЛТАТИ БИХА МОГЛИ ДА ИМАТ БИОТЕХНОЛОГИЧНО И АГРОНОМИЧНО ЗНАЧЕНИЕ КАТО БИОТЕХНОЛОГИЧНИ ИНСТРУМЕНТИ. ВСЪЩНОСТ НАСТОЯЩОТО ПРЕДЛОЖЕНИЕ Е В СЪОТВЕТСТВИЕ С ПРЕДИЗВИКАТЕЛСТВО НОМЕР ДВЕ В РАМКИТЕ НА ПРОГРАМАТА „ХОРИЗОНТ 2020“, КОЯТО ПРЕДСТАВЛЯВА ТАЗИ ПОДКРЕПА ОТ РАЗЛИЧНИ СУБЕКТИ И ДРУЖЕСТВА. (Bulgarian)
    4 August 2022
    0 references
    F’DAWN L-AĦĦAR SNIN, IR-RWOL TAL-OSSIDU NITRIKU (NRU) U L-ISPEĊIJIET TAN-NITROĠENU REATTIV (RNS) ĠIBED L-ATTENZJONI FIL-QASAM TAS-SISTEMI TAL-PJANTI. F’DAN IS-SENS, L-ABBILTÀ TA ‘LE LI TIMMEDJA DIVERSI MODIFIKI POST-TRANSLAZZJONALI (NO-PTM) F’BIJOMOLEKULI DIFFERENTI, BĦAL PROTEIN TYROSINE NITRATION JEW S-NITROSYLATION WRIET L-INVOLVIMENT TA’ DAWN IL-MOLEKULI F’FIRXA WIESGĦA TA ‘FUNZJONIJIET FIL-FIŻJOLOĠIJA TAL-PJANTI U R-RISPONS ANTIOSSIDANT. F’DAN IS-SENS, L-INTERESS DEJJEM JIKBER IFFOKA FUQ L-INTERAZZJONI TA’ DAWN IL-MOLEKULI MINGĦAJR DERIVATI MA’ AĊIDI GRASSI MHUX SATURATI, LI JAGĦTU AĊIDI NITRO-XAĦAM (NO2-FAS). FIL-FATT, L-ISTUDJU TA ‘DAWN IL-MOLEKULI FIS-SISTEMI TAL-PJANTI JIKKOSTITWIXXI QASAM INTERESSANTI U EMERĠENTI. RIĊENTEMENT, IT-TIM TAR-RIĊERKA TAGĦNA EVIDENZJA FI PROĠETTI PREĊEDENTI L-OKKORRENZA ENDOĠENA TA’ DERIVATTIVI NITRATI TA’ AĊIDU LINOLENIKU (NO2-LN) ĠIET IVVALUTATA FI SPEĊIJIET TA’ PJANTI. BARRA MINN HEKK U PERMEZZ TA ‘TEKNOLOĠIJA RNA-SEQ, INTWERA LI NO2-LN JISTA’ JINDUĊI SETT KBIR TA ‘PROTEINI TAX-XOKK TAS-SĦANA (HSPS) U SISTEMI ANTIOSSIDANTI DIFFERENTI LI JISSUĠĠERIXXU LI DIN IL-MOLEKULA TISTA’ TNIEDI RISPONSI ANTIOSSIDANTI U TA ‘DIFIŻA FIL-PJANTI. MADANKOLLU, GĦALKEMM KEMM RISPONS ANTIOSSIDANT KIF UKOLL MEKKANIŻMU TA’ DIFIŻA KONTRA DIVERSI KUNDIZZJONIJIET TA’ STRESS ABIJOTIKU HUWA ATTIVAT MINN NO2-LN U L-ABBILTÀ TA’ DIN IL-MOLEKULA LI TIRRILAXXA NRU ĠIET IRRAPPURTATA WKOLL, IL-MEKKANIŻMI PREĊIŻI LI BIHOM DAN L-AĊIDU NITROXAĦ HUWA KAPAĊI JINDUĊI DAWN IR-RISPONSI JIBQGĦU MHUX MAGĦRUFA. F’DAN IL-PUNT HUWA MEĦTIEĠ LI JIĠI ENFASIZZAT LI L-KAPAĊITÀ ELETTROFILIKA TA ‘AĊIDI NITRO-XAĦAM HUWA WKOLL MOGĦDIJA SENJALAZZJONI FATTIBBLI FIL-PJANTI. Fil FACT, GĦANDU N-NATURA elettrofilika TIEGĦU, NO2-FA ARE ABLE LI MODIFY SUSCEPTIBLE AMINO AMINO FIL PROTEINI TA ‘INDIZZJONI MICHAEL LEADING GĦALL MODIFIKAZZJONI POST-TRAŻLAZZJONI SPEĊIFIKA KNOWN AS NITROALKYLATION. il-GOAL MAIN TAL-PROJETTI PREĊENTI JIKKONĊERTI L-ISTUDJA TAL-MODULAZZJONI TAR-RESPONSE ANTIOXIDANT BY NO2-FAS UNDER STRESS NITRO-OXIDATIVA FIL-MOĊERTI TAL-POST-TRASTAZZJONALI TAL-MODIFIKAZZJONI PROTEIN BY NITROALKYLAZZJONI, kemm l-INTERACZZJONIJIET mal-PATHWAYS SIGNALING INVOLVED FIL-PROĊESSIJIET DEFENZJI ALONG L-ISTITUZZJONIJIET TAL-ISTRIZZJONIJIET AMBJENTI. GĦAL DAN IL-GĦAN, SE TWETTAQ L-ISTUDJU TAR-RWOL TAL-NO2FA FL-INDUZZJONI TAR-RISPONS ANTIOSSIDANT MATUL L-ISTRESS ABIJOTIKU FL-GĦARABIDOPSIS THALIANA. B’MOD PARALLEL, SE JIĠI ANALIZZAT IL-KARATTERIZZAZZJONI FUNZJONALI TAR-RISPONS ANTIOSSIDANT PERMEZZ TA’ NITROALKYLATION B’NO2FA KIF UKOLL IL-KAPAĊITÀ TA’ SINJALAR PERMEZZ TAR-REGOLAMENT TAL-HSPS. DISINJI SPERIMENTALI DIFFERENTI LI JAPPOĠĠJAW L-GĦANIJIET PROPOSTI SE JITWETTQU BL-UŻU TA’ KOMBINAZZJONI MULTIDIXXIPLINARJA TA’ TEKNIKI BĦALL-ANALIŻI BIJOKIMIKA U MOLEKULARI, CLSM, NMR, SPETTROMETRIJA TAL-MASSA TRIPPLA-KWADRUPOLE (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), ASSAĠĠ TA’ KOMPLEMENTAZZJONI BIMOLEKULARI TAL-FLUWOREXXENZA (BIFC), IMMUNOPREĊIPITAZZJONI TAL-KROMATINA (ĊIPITAZZJONI TAĊ-ĊIPITAZZJONI) U ĠENETIKA MOLEKULARI BL-UŻU TA’ TRASFORMANTI GĦARABIDOPSIS. DAWN IL-MEKKANIŻMI KOLLHA MHUMIEX MAGĦRUFA FIL-PJANTI U R-RIŻULTATI MIKSUBA JISTA’ JKOLLHOM RILEVANZA BIJOTEKNOLOĠIKA U AGRONOMIKA BĦALA GĦODDA BIJOTEKNOLOĠIKA NRU. FIL-FATT, DIN IL-PROPOSTA HIJA F’KONFORMITÀ MAL-ISFIDA NUMRU TNEJN FI ĦDAN IL-PROGRAMM “ORIZZONT 2020” LI HUWA DAN L-APPOĠĠ MINN ENTITAJIET U KUMPANIJI DIFFERENTI. (Maltese)
    4 August 2022
    0 references
    NOS ÚLTIMOS ANOS, O PAPEL DO ÓXIDO NÍTRICO (NÃO) E DAS ESPÉCIES REATIVAS DE NITROGÊNIO (RNS) TEM ATRAÍDO ATENÇÃO NO CAMPO DOS SISTEMAS DE PLANTAS. NESSE SENTIDO, A CAPACIDADE DE NO DE MEDIAR VÁRIAS MODIFICAÇÕES PÓS-TRADUCIONAIS (NO-PTM) EM DIFERENTES BIOMOLÉCULAS, COMO NITRAÇÃO PROTEICA TIROSINA OU S-NITROSILAÇÃO, MOSTROU O ENVOLVIMENTO DESSAS MOLÉCULAS EM UMA AMPLA GAMA DE FUNÇÕES NA FISIOLOGIA VEGETAL E NA RESPOSTA ANTIOXIDANTE. NESTE SENTIDO, O INTERESSE CRESCENTE TEM SE CONCENTRADO NA INTERAÇÃO DESTAS MOLÉCULAS NÃO DERIVADAS COM ÁCIDOS GRAXOS INSATURADOS, PRODUZINDO ÁCIDOS NITRO-GORDURAS (NO2-FAS). DE FATO, O ESTUDO DESSAS MOLÉCULAS EM SISTEMAS DE PLANTAS CONSTITUI UMA ÁREA INTERESSANTE E EMERGENTE. RECENTEMENTE, NOSSA EQUIPA DE PESQUISA EVIDENCIOU EM PROJETOS ANTERIORES A OCORRÊNCIA ENDÓGENA DE DERIVADOS NITRADOS DE ÁCIDO LINOLÊNICO (NO2-LN) FOI AVALIADA EM ESPÉCIES VEGETAIS. ALÉM DISSO, E ATRAVÉS DA TECNOLOGIA RNA-SEQ, FOI DEMONSTRADO QUE O NO2-LN PODE INDUZIR UM GRANDE CONJUNTO DE PROTEÍNAS DE CHOQUE TÉRMICO (HSPS) E DIFERENTES SISTEMAS ANTIOXIDANTES QUE SUGEREM QUE ESTA MOLÉCULA PODE LANÇAR RESPOSTAS ANTIOXIDANTES E DE DEFESA NAS PLANTAS. NO ENTANTO, EMBORA UMA RESPOSTA ANTIOXIDANTE E UM MECANISMO DE DEFESA CONTRA VÁRIAS CONDIÇÕES DE ESTRESSE ABIÓTICO SEJA ATIVADO PELO NO2-LN E A CAPACIDADE DESSA MOLÉCULA PARA DISPONIBILIZAR NO TAMBÉM TENHA SIDO RELATADA, OS MECANISMOS PRECISOS PELOS QUAIS ESSE ÁCIDO NITRO-GORDUROSO É CAPAZ DE INDUZIR ESSAS RESPOSTAS PERMANECEM DESCONHECIDOS. NESTE PONTO, É NECESSÁRIO ENFATIZAR QUE A CAPACIDADE ELETROFÍLICA DOS ÁCIDOS NITRO-GORDURAS TAMBÉM É UMA VIA DE SINALIZAÇÃO VIÁVEL EM PLANTAS. Em FACT, DUE À SUA NATUREAÇÃO Eletrofílica, NO2-FA SÃO ÁVEIS DE MODIFICAÇÃO SUSCETÍVEL AMINO ÁCIDOS DE PROTEÍNAS VIA A ADDIÇÃO MICHAEL LEADING A UMA MODIFICAÇÃO POST-TRANSLAcional ESPECIFICAMENTE COMO CONHECIMENTO como NITROALKYLATION._X000D_ CONSIDERANDO ESTE BACKGROUND E OS RESULTADOS DE NOSSOS PROJETOS PREVIOOS NESTE FIEL, a principal vantagem do processo presente controla o estado da modificação do recurso antioxidificante por NO2-FAS DE CONDIÇÕES DE ESTRESS DE ESTRESS NITRO-OXIDATIVOS EM CONDIÇÕES DE CARACTERIZAÇÃO DOS MEcanismos POST-TRANSLACIONAIS DA MODIFICAÇÃO DE PROTEÍNAS POR NITROALKYLATION, como bem como as interaçÃμes com os PATHWAYS SIGNALING INVOLVADOS NOS PROCESSOS DE DEFENSE DOS SITUAÇÕES DE ESTRESS ENVIRONMENTAIS. PARA ISSO, SERÁ REALIZADO O ESTUDO DO PAPEL DO NO2FA NA INDUÇÃO DA RESPOSTA ANTIOXIDANTE DURANTE O ESTRESSE ABIÓTICO NA ARABIDOPSIS THALIANA. EM PARALELO, SERÁ ANALISADA A CARACTERIZAÇÃO FUNCIONAL DA RESPOSTA ANTIOXIDANTE POR NITROALKYLATION COM NO2FA, BEM COMO A CAPACIDADE DE SINALIZAÇÃO POR REGULAÇÃO DE HSPS. DIFERENTES DESENHOS EXPERIMENTAIS QUE SUSTENTAM OS OBJETIVOS PROPOSTOS SERÃO REALIZADOS UTILIZANDO UMA COMBINAÇÃO MULTIDISCIPLINAR DE TÉCNICAS COMO ANÁLISES BIOQUÍMICAS E MOLECULARES, CLSM, RMN, ESPETROMETRIA DE MASSA TRIPLO-QUADRUPOLA (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), ENSAIO DE COMPLEMENTAÇÃO POR FLUORESCÊNCIA BIMOLECULAR (BIFC), IMUNOPRECIPITAÇÃO CROMATINA (CHIP) E GENÉTICA MOLECULAR USANDO TRANSFORMADORES DE ARABIDOPSIS. TODOS ESSES MECANISMOS SÃO DESCONHECIDOS NAS PLANTAS E OS RESULTADOS OBTIDOS PODEM TER RELEVÂNCIA BIOTECNOLÓGICA E AGRONÔMICA COMO FERRAMENTAS BIOTECNOLÓGICAS. COM EFEITO, ESTA PROPOSTA ESTÁ EM CONSONÂNCIA COM O DESAFIO NÚMERO DOIS NO ÂMBITO DO PROGRAMA HORIZONTE 2020 SENDO ESTE APOIO POR PARTE DE DIFERENTES ENTIDADES E EMPRESAS. (Portuguese)
    4 August 2022
    0 references
    I DE SENESTE ÅR HAR ROLLEN SOM NITROGENOXID (NEJ) OG REAKTIVE NITROGENARTER (RNS) TILTRUKKET SIG OPMÆRKSOMHED INDEN FOR PLANTESYSTEMER. I DENNE FORSTAND HAR NO'S EVNE TIL AT MÆGLE FLERE POSTTRANSLATIONELLE MODIFIKATIONER (NO-PTM) I FORSKELLIGE BIOMOLEKYLER, SÅSOM PROTEINTYROSINNITRATION ELLER S-NITROSYLERING, VIST, AT DISSE MOLEKYLER ER INVOLVERET I EN LANG RÆKKE FUNKTIONER I PLANTEFYSIOLOGIEN OG ANTIOXIDANTRESPONSEN. I DENNE HENSEENDE HAR DEN VOKSENDE INTERESSE FOKUSERET PÅ SAMSPILLET MELLEM DISSE IKKE-AFLEDTE MOLEKYLER MED UMÆTTEDE FEDTSYRER, DER GIVER NITROFEDTSYRER (NO2-FAS). FAKTISK UDGØR UNDERSØGELSEN AF DISSE MOLEKYLER I PLANTESYSTEMER ET INTERESSANT OG FREMSPIRENDE OMRÅDE. FOR NYLIG VISTE VORES FORSKERHOLD I TIDLIGERE PROJEKTER, AT ENDOGEN FOREKOMST AF NITRATDERIVATER AF LINOLENSYRE (NO2-LN) BLEV VURDERET I PLANTEARTER. DESUDEN OG GENNEM RNA-SEQ-TEKNOLOGI BLEV DET VIST, AT NO2-LN KAN FREMKALDE ET STORT SÆT VARMECHOKPROTEINER (HSPS) OG FORSKELLIGE ANTIOXIDANTSYSTEMER, DER TYDER PÅ, AT DETTE MOLEKYLE KAN LANCERE ANTIOXIDANT- OG FORSVARSREAKTIONER I PLANTER. SELV OM BÅDE EN ANTIOXIDANTRESPONS OG EN FORSVARSMEKANISME MOD FLERE ABIOTISKE STRESSFORHOLD AKTIVERES AF NO2-LN, OG DETTE MOLEKYLES EVNE TIL AT FRIGIVE NO OGSÅ ER BLEVET RAPPORTERET, ER DE PRÆCISE MEKANISMER, HVORMED DENNE NITROFEDTSYRE ER I STAND TIL AT FREMKALDE DISSE REAKTIONER, IMIDLERTID UKENDT. PÅ DETTE TIDSPUNKT ER DET NØDVENDIGT AT UNDERSTREGE, AT DEN ELEKTROFILISKE KAPACITET AF NITRO-FEDTSYRER OGSÅ ER EN MULIG SIGNALVEJ I PLANTER. I FACT, VEDTAGET ved den elektrofiliske NATUR, NO2-FA, der kan overføres til et nuklefilt nuklefilt AMINO-AMINO-produktivitet, når dette sker ved hjælp af en POST-TRANSLATIONAL MODIFIKATIONSSPECIFIKATION som NITROALKYLATION._x000D_ KONSIDERING AF DENNE BACKGROUND OG RESULTATER fra vores PREVIOUS PROJEKTER i DENNE FIELD, det FORENEDE PROJEKTNINGS STYRELSER FOR MODULATIONEN AF ANTIOXIDANTENDE RESPONSE af NO2-FAS UNDER NITRO-OXIDATIVE KONDITIONER I ORDER AT KARAKERIER de POST-TRANSLATIONAL MEKHANISTER AF PROTEIN MODIFIKATIONER, så vidt jeg ved, vil jeg gerne gøre opmærksom på, at der ikke er nogen tvivl om, at det ikke er muligt at nå frem til en fælles holdning. MED HENBLIK HERPÅ VIL DET BLIVE GENNEMFØRT UNDERSØGELSEN AF NO2FA'S ROLLE I INDUKTIONEN AF ANTIOXIDANTRESPONS UNDER ABIOTISK STRESS I ARABIDOPSIS THALIANA. PARALLELT HERMED ANALYSERES DEN FUNKTIONELLE KARAKTERISERING AF NITROALKYLATIONS ANTIOXIDANTRESPONS MED NO2FA SAMT SIGNALKAPACITETEN VED HSPS-REGLEMENTET. FORSKELLIGE FORSØGSMODELLER, DER UNDERSTØTTER DE FORESLÅEDE MÅL, VIL BLIVE GENNEMFØRT VED HJÆLP AF EN TVÆRFAGLIG KOMBINATION AF TEKNIKKER SÅSOM BIOKEMISKE OG MOLEKYLÆRE ANALYSER, CLSM, NMR, TRIPLE-QUADRUPOL MASSESPEKTROMETRI (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), BIMOLEKYLÆR FLUORESCENSKOMPLEMENTATIONSASSAY (BIFC), CHROMATINIMMUNPRECIPITATION (CHIP) OG MOLEKYLÆR GENETIK VED HJÆLP AF ARABIDOPSIS TRANSFORMANTER. ALLE DISSE MEKANISMER ER UKENDTE I PLANTER, OG DE OPNÅEDE RESULTATER KAN HAVE BIOTEKNOLOGISK OG AGRONOMISK RELEVANS SOM BIOTEKNOLOGISKE REDSKABER. DETTE FORSLAG ER FAKTISK I OVERENSSTEMMELSE MED UDFORDRING NR. TO INDEN FOR PROGRAMMET "HORISONT 2020" I FORM AF STØTTE FRA FORSKELLIGE ENHEDER OG VIRKSOMHEDER. (Danish)
    4 August 2022
    0 references
    ÎN ULTIMII ANI, ROLUL OXIDULUI NITRIC (NO) ȘI AL SPECIILOR REACTIVE DE AZOT (RNS) A ATRAS ATENȚIA ÎN DOMENIUL SISTEMELOR VEGETALE. ÎN ACEST SENS, CAPACITATEA LUI NO DE A MEDIA MAI MULTE MODIFICĂRI POST-TRALAȚIONALE (NO-PTM) ÎN DIFERITE BIOMOLECULE, CUM AR FI NITRAREA PROTEINELOR TIROZINĂ SAU S-NITROZILAREA A DEMONSTRAT IMPLICAREA ACESTOR MOLECULE ÎNTR-O GAMĂ LARGĂ DE FUNCȚII ÎN FIZIOLOGIA PLANTELOR ȘI RĂSPUNSUL ANTIOXIDANT. ÎN ACEST SENS, INTERESUL TOT MAI MARE S-A CONCENTRAT ASUPRA INTERACȚIUNII ACESTOR MOLECULE NEDERIVATE CU ACIZI GRAȘI NESATURAȚI, GENERÂND ACIZI GRAȘI NITRO (NO2-FAS). DE FAPT, STUDIUL ACESTOR MOLECULE ÎN SISTEMELE VEGETALE CONSTITUIE O ZONĂ INTERESANTĂ ȘI EMERGENTĂ. RECENT, ECHIPA NOASTRĂ DE CERCETARE A EVIDENȚIAT ÎN PROIECTELE ANTERIOARE APARIȚIA ENDOGENĂ A DERIVAȚILOR NITRAȚI AI ACIDULUI LINOLENIC (NO2-LN) A FOST EVALUATĂ LA SPECIILE DE PLANTE. MAI MULT DECÂT ATÂT ȘI PRIN TEHNOLOGIA ARN-SEQ, S-A DEMONSTRAT CĂ NO2-LN POATE INDUCE UN SET MARE DE PROTEINE DE ȘOC TERMIC (HSPS) ȘI DIFERITE SISTEME ANTIOXIDANTE SUGERÂND CĂ ACEASTĂ MOLECULĂ POATE LANSA REACȚII ANTIOXIDANTE ȘI DE APĂRARE ÎN PLANTE. CU TOATE ACESTEA, DEȘI ATÂT UN RĂSPUNS ANTIOXIDANT, CÂT ȘI UN MECANISM DE APĂRARE ÎMPOTRIVA MAI MULTOR CONDIȚII DE STRES ABIOTIC ESTE ACTIVAT DE NO2-LN ȘI CAPACITATEA ACESTEI MOLECULE DE A ELIBERA NU A FOST, DE ASEMENEA, RAPORTATĂ, MECANISMELE PRECISE PRIN CARE ACEST ACID NITRO GRAS ESTE CAPABIL SĂ INDUCĂ ACESTE RĂSPUNSURI RĂMÂN NECUNOSCUTE. ÎN ACEST MOMENT, ESTE NECESAR SĂ SE SUBLINIEZE FAPTUL CĂ CAPACITATEA ELECTROFILĂ A ACIZILOR GRAȘI NITRO ESTE, DE ASEMENEA, O CALE FEZABILĂ DE SEMNALIZARE ÎN PLANTE. În FACT, DUE LA NATURA lor electrofilă, NO2-FA sunt abilitate la o MODIFY SUSCEPTIBLE AMINO AMINO ACIDS DE PROTEINS VIA LEADUL MICHAEL ADDIȚIONARE la o MODIFICARE POST-TRANSLATIONAL CAIETIFICATIV CU NITROALKYLATION._x000D_ CONSIDERARE ACKGROUND ȘI REZULTATELE DE PREVIOUS PROJECTELE noastre în acest domeniu, principala valoare a Prezentului PROJECT CONCERTĂ STUDIA MODULAȚIEI DE RESPONSE ANTIOXIDANTĂ BY NO2-FAS UNDER CONDIȚII NITRO-OXIDATIVE STRESS ÎN REGULAMENTUL DE CHARACTERIZARE POST-TRANSLATIONAL MECHANISMS DE MODIFICARE PROTEINĂ DIN NITROALKYLATION, la fel ca și INTERACȚIILE CU PATURILE SIGNALING INVOLVATE ÎN PROCESUL DEFENSE ALE SITUAȚIILOR DE STRESS ENVIRONMENTALE. ÎN ACEST SCOP, SE VA EFECTUA STUDIUL ROLULUI NO2FA ÎN INDUCEREA RĂSPUNSULUI ANTIOXIDANT ÎN TIMPUL STRESULUI ABIOTIC ÎN ARABIDOPSIS THALIANA. ÎN PARALEL, SE VA ANALIZA CARACTERIZAREA FUNCȚIONALĂ A RĂSPUNSULUI ANTIOXIDANT DE CĂTRE NITROALKYLATION CU NO2FA, PRECUM ȘI CAPACITATEA DE SEMNALIZARE PRIN REGLAREA HSPS. DIFERITE MODELE EXPERIMENTALE CARE SUSȚIN OBIECTIVELE PROPUSE VOR FI REALIZATE PRIN UTILIZAREA UNEI COMBINAȚII MULTIDISCIPLINARE DE TEHNICI CUM AR FI ANALIZELE BIOCHIMICE ȘI MOLECULARE, CLSM, RMN, SPECTROMETRIA DE MASĂ TRIPLU-CVADRUPOL (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), TESTUL DE COMPLETARE A FLUORESCENȚEI BIMOLECULARE (BIFC), IMUNOPRECIPITAREA CROMATINEI (CIP) ȘI GENETICA MOLECULARĂ PRIN UTILIZAREA TRANSFORMATORILOR ARABIDOPSIS. TOATE ACESTE MECANISME SUNT NECUNOSCUTE ÎN PLANTE, IAR REZULTATELE OBȚINUTE AR PUTEA AVEA O RELEVANȚĂ BIOTEHNOLOGICĂ ȘI AGRONOMICĂ CA INSTRUMENTE BIOTEHNOLOGICE FĂRĂ. DE FAPT, PREZENTA PROPUNERE ESTE ÎN CONCORDANȚĂ CU PROVOCAREA NUMĂRUL DOI DIN CADRUL PROGRAMULUI ORIZONT 2020 FIIND ACEST SPRIJIN DIN PARTEA DIFERITELOR ENTITĂȚI ȘI ÎNTREPRINDERI. (Romanian)
    4 August 2022
    0 references
    UNDER DE SENASTE ÅREN HAR KVÄVEOXID (NEJ) OCH REAKTIVA KVÄVEARTER (RNS) UPPMÄRKSAMMATS PÅ OMRÅDET VÄXTSYSTEM. I DETTA AVSEENDE HAR FÖRMÅGAN HOS NO ATT FÖRMEDLA FLERA POSTTRANSLATIONELLA MODIFIERINGAR (NO-PTM) I OLIKA BIOMOLEKYLER, SÅSOM PROTEINTYROSINNITRATION ELLER S-NITROSYLERING, VISAT ATT DESSA MOLEKYLER ÄR INVOLVERADE I ETT BRETT SPEKTRUM AV FUNKTIONER I VÄXTFYSIOLOGIN OCH ANTIOXIDANTSVARET. I DETTA AVSEENDE HAR DET VÄXANDE INTRESSET FOKUSERAT PÅ INTERAKTIONEN MELLAN DESSA NO-HÄRLEDDA MOLEKYLER OCH OMÄTTADE FETTSYROR, VILKET GER NITROFETTSYROR (NO2-FAS). I SJÄLVA VERKET ÄR STUDIEN AV DESSA MOLEKYLER I VÄXTSYSTEM ETT INTRESSANT OCH FRAMVÄXANDE OMRÅDE. NYLIGEN VISADE VÅR FORSKARGRUPP I TIDIGARE PROJEKT ATT ENDOGEN FÖREKOMST AV NITRATDERIVAT AV LINOLENSYRA (NO2-LN) BEDÖMDES I VÄXTARTER. DESSUTOM OCH GENOM RNA-SEQ-TEKNIKEN VISADES DET ATT NO2-LN KAN INDUCERA EN STOR UPPSÄTTNING VÄRMECHOCKPROTEINER (HSPS) OCH OLIKA ANTIOXIDANTSYSTEM SOM TYDER PÅ ATT DENNA MOLEKYL KAN LANSERA ANTIOXIDANT- OCH FÖRSVARSREAKTIONER I VÄXTER. MEN ÄVEN OM BÅDE ETT ANTIOXIDANTSVAR OCH EN FÖRSVARSMEKANISM MOT FLERA ABIOTISKA STRESSFÖRHÅLLANDEN AKTIVERAS AV NO2-LN OCH FÖRMÅGAN HOS DENNA MOLEKYL ATT FRIGÖRA NO HAR OCKSÅ RAPPORTERATS, ÄR DE EXAKTA MEKANISMERNA GENOM VILKA DENNA NITROFETTSYRA KAN INDUCERA DESSA SVAR OKÄNDA. VID DENNA TIDPUNKT ÄR DET NÖDVÄNDIGT ATT BETONA ATT DEN ELEKTROFILA KAPACITETEN HOS NITROFETTSYROR ÄR OCKSÅ EN GENOMFÖRBAR SIGNALERINGSVÄG I VÄXTER. I FACT, DUE to THEIR electrophilic NATURE, NO2-FA ARE ABLE to MODIFY SUSCEPTIBLE nucleophilic AMINO ACIDS OF PROTEINS VIA the MICHAEL ADDITION LEADING to an POST-TRANSLATIONAL MODIFIKATION SPECIFIKALLY POWN AS NITROALKYLATION._x000D_ CONSIDERING DENNA BACKROUND OCH RESULTAT FRÅN VÅRA PREVIOUS PROJEKTER I THIS FIELD, PRESENT PROJEKT CONCERNERNA STUDY OF THE MODULATION OF THE ANTIOXIDANT RESPONSE BY NO2-FAS UNDER NITRO-OXIDATIVE STONDITIONER I ORDER TO CHARACTERISE THE POST-TRANSLATIONAL MECHANISMS OF PROTEIN MODIFICATION AV NITROALKYLATION, som INTERACTIONER MED SIGNALING PATHWAYS INVOLVAR I DEFENSE PROCESSER ALONGEN THE SITUATIONER of ENVIRONMENTAL STRESS. FÖR DETTA ÄNDAMÅL KOMMER DET ATT GENOMFÖRAS EN STUDIE AV NO2FA:S ROLL I INDUKTIONEN AV ANTIOXIDANTSVARET UNDER ABIOTISK STRESS I ARABIDOPSIS THALIANA. PARALLELLT KOMMER DEN ATT ANALYSERA DEN FUNKTIONELLA KARAKTERISERINGEN AV ANTIOXIDANTSVARET GENOM NITROALKYLATION MED NO2FA SAMT SIGNALKAPACITETEN GENOM REGLERINGEN AV HSPS. OLIKA EXPERIMENTELLA KONSTRUKTIONER SOM STÖDER DE FÖRESLAGNA MÅLEN KOMMER ATT GENOMFÖRAS MED HJÄLP AV EN TVÄRVETENSKAPLIG KOMBINATION AV TEKNIKER SOM BIOKEMISKA OCH MOLEKYLÄRA ANALYSER, CLSM, NMR, TRIPPEL-QUADRUPOLMASSPEKTROMETRI (HPLC-MS/MS, LC-MS/MS), BIMOLEKYLÄR FLUORESCENSKOMPLEMENTERINGSTEST (BIFC), KROMATINIMMUNPRECIPITATION (CHIP) OCH MOLEKYLÄR GENETIK MED HJÄLP AV ARABIDOPSIS TRANSFORMANTER. ALLA DESSA MEKANISMER ÄR OKÄNDA I VÄXTER OCH DE ERHÅLLNA RESULTATEN KAN HA EN BIOTEKNISK OCH AGRONOMISK RELEVANS SOM BIOTEKNISKT NO-VERKTYG. FÖRSLAGET ÖVERENSSTÄMMER I SJÄLVA VERKET MED UTMANING NUMMER TVÅ INOM HORISONT 2020-PROGRAMMET, SOM ÄR DETTA STÖD FRÅN OLIKA ENHETER OCH FÖRETAG. (Swedish)
    4 August 2022
    0 references
    Jaén
    0 references
    20 December 2023
    0 references

    Identifiers

    PGC2018-096405-B-I00
    0 references