Analysis of the differences of IS6110 between the members of the Mycobacterium tuberculosis complex and the role of its location in the origin of replication. (Q3201886)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3201886 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Analysis of the differences of IS6110 between the members of the Mycobacterium tuberculosis complex and the role of its location in the origin of replication. |
Project Q3201886 in Spain |
Statements
33,486.75 Euro
0 references
61,500.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2016
0 references
16 December 2018
0 references
INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA ARAGON
0 references
El objeto general es aumentar el conocimiento de los polimorfismos genómicos encontrados en el complejo Mycobacterium tuberculosis que aporte datos de utilidad para la mejora del control de la tuberculosis. Para ello, nos proponemos los objetivos concretos de: 1. Analizar los aislados de M. bovis y M. africanum en nuestra población. Analizar las regiones diferenciales en sus genomas. Localizar las copias de IS6110 en sus genomas que se contrastarán con las conocidas en M. tuberculosis. Analizar la posible acción como promotor o inactivador de este elemento sobre los genes adyacentes. 2. Analizar mediante secuenciación genómica (WGS) la variabilidad de los aislados Beijing derivados de una cepa responsable de un alto número de casos en la población de Canarias. 3. Estudiar los efectos de la transposición de una copia de IS6110 en el origen de replicación en un aislado de la cepa causante del mayor brote detectado en la población aragonesa, mediante comparación de fenotipos entre dos cepas con la misma base genómica con la única diferencia de una copia de IS6110 en esta localización. 4. Mantener el genotipado sistemático de los aislados de tuberculosis en nuestra población y de los aislados multirresistentes a nivel Nacional. (Spanish)
0 references
The general objective is to increase knowledge of genomic polymorphisms found in the Mycobacterium tuberculosis complex that provides useful data for improving tuberculosis control. To this end, we set out the specific objectives of: 1. Analyse the isolated M. bovis and M. africanum in our population. Analyse differential regions in their genomes. Locate the copies of IS6110 in its genomes that will be contrasted with those known in M. tuberculosis. Analyse the possible action as promoter or inactivator of this element on adjacent genes. 2. Analyse by genomic sequencing (WGS) the variability of Beijing isolates derived from a strain responsible for a high number of cases in the population of the Canary Islands. 3. To study the effects of transposing a copy of IS6110 on the origin of replication in an isolate of the strain causing the largest outbreak detected in the Aragonese population, by comparing phenotypes between two strains with the same genomic base with the only difference from a copy of IS6110 in this location. 4. Maintain the systematic genotyping of tuberculosis isolates in our population and multidrug resistant isolates at the national level. (English)
13 October 2021
0.530950287801392
0 references
L’objectif général est d’accroître les connaissances sur les polymorphismes génomiques trouvés dans le complexe Mycobacterium tuberculosis qui fournit des données utiles pour améliorer la lutte contre la tuberculose. À cette fin, nous définissons les objectifs spécifiques suivants: 1. Analyser le M. bovis et le M. africanum isolés dans notre population. Analyser les régions différentielles dans leurs génomes. Localisez les copies de l’IS6110 dans ses génomes qui seront contrastés avec ceux connus chez M. tuberculosis. Analyser l’action possible en tant que promoteur ou inactivateur de cet élément sur les gènes adjacents. 2. Analyser par séquençage génomique (WGS) la variabilité des isolats de Pékin provenant d’une souche responsable d’un grand nombre de cas dans la population des îles Canaries. 3. Étudier les effets de la transposition d’une copie de l’IS6110 sur l’origine de la réplication dans un isolat de la souche provoquant la plus grande éclosion détectée dans la population aragonaise, en comparant les phénotypes entre deux souches ayant la même base génomique avec la seule différence d’une copie d’IS6110 à cet endroit. 4. Maintenir le génotypage systématique des isolats de tuberculose dans notre population et des isolats multirésistants à l’échelle nationale. (French)
5 December 2021
0 references
Das allgemeine Ziel ist es, das Wissen über genomische Polymorphismen im Mycobacterium tuberculosis-Komplex zu verbessern, der nützliche Daten zur Verbesserung der Tuberkulosebekämpfung liefert. Zu diesem Zweck haben wir die spezifischen Ziele dargelegt: 1. Analysieren Sie das isolierte M. bovis und M. africanum in unserer Bevölkerung. Analysieren Sie Differentialregionen in ihren Genomen. Finden Sie die Kopien von IS6110 in seinen Genomen, die mit denen in M. Tuberkulose kontrastiert werden. Analysieren Sie die mögliche Aktion als Förderer oder Inaktivator dieses Elements auf benachbarte Gene. 2. Analyse durch genomische Sequenzierung (WGS) die Variabilität von Peking-Isolaten, die von einer Sorte abgeleitet wird, die für eine hohe Anzahl von Fällen in der Bevölkerung der Kanarischen Inseln verantwortlich ist. 3. Untersuchung der Auswirkungen der Umsetzung einer Kopie von IS6110 auf den Ursprung der Replikation in einem Isolat des Stammes, der den größten Ausbruch verursacht, der in der aragonesischen Population festgestellt wurde, indem Phänotypen zwischen zwei Stämmen mit derselben genomischen Basis mit dem einzigen Unterschied zu einer Kopie von IS6110 an diesem Ort verglichen werden. 4. Aufrechterhaltung der systematischen Genotypisierung von Tuberkuloseisolate in unserer Bevölkerung und multiresistente Isolate auf nationaler Ebene. (German)
9 December 2021
0 references
De algemene doelstelling is het vergroten van de kennis van genomische polymorfismen in het Mycobacterium tuberculosis-complex dat nuttige gegevens levert om de tuberculosebestrijding te verbeteren. Daartoe hebben wij de specifieke doelstellingen uiteengezet van: 1. Analyseer de geïsoleerde M. bovis en M. africanum in onze bevolking. Analyseer differentiële regio’s in hun genoom. Zoek de kopieën van IS6110 in zijn genomen in contrast met die welke bekend zijn in M. tuberculosis. Analyseer de mogelijke actie als promotor of inactivator van dit element op aangrenzende genen. 2. Analyseer door genomic sequencing (WGS) de variabiliteit van Beijing isolaten afgeleid van een stam die verantwoordelijk is voor een groot aantal gevallen in de bevolking van de Canarische Eilanden. 3. De effecten van de omzetting van een kopie van IS6110 op de oorsprong van de replicatie in een isolaat van de stam die de grootste uitbraak in de Aragonese populatie veroorzaakt, bestuderen door fenotypen tussen twee stammen met dezelfde genomische basis te vergelijken met het enige verschil met een kopie van IS6110 op deze locatie. 4. De systematische genotypering van tuberculoseisolaten in onze populatie en multiresistente isolaten op nationaal niveau handhaven. (Dutch)
17 December 2021
0 references
L'obiettivo generale è quello di aumentare la conoscenza dei polimorfismi genomici presenti nel complesso Mycobacterium tuberculosis che fornisce dati utili per migliorare il controllo della tubercolosi. A tal fine, abbiamo definito gli obiettivi specifici di: 1. Analizzare l'isolato M. bovis e M. Africaum nella nostra popolazione. Analizzare le regioni differenziali nei loro genomi. Individuare le copie di IS6110 nei suoi genomi che saranno in contrasto con quelli noti in M. tubercolosi. Analizzare la possibile azione come promotore o inattivatore di questo elemento su geni adiacenti. 2. Analizzare mediante sequenziamento genomico (WGS) la variabilità degli isolati di Pechino derivati da un ceppo responsabile di un elevato numero di casi nella popolazione delle Isole Canarie. 3. Studiare gli effetti della trasposizione di una copia di IS6110 sull'origine della replicazione in un isolato del ceppo che causa il più grande focolaio rilevato nella popolazione aragonese, confrontando i fenotipi tra due ceppi con la stessa base genomica con l'unica differenza da una copia di IS6110 in questo luogo. 4. Mantenere la genotipizzazione sistematica degli isolati di tubercolosi nella nostra popolazione e degli isolati multiresistenti a livello nazionale. (Italian)
16 January 2022
0 references
Γενικός στόχος είναι η αύξηση των γνώσεων σχετικά με τους γονιδιωματικούς πολυμορφισμούς που εντοπίζονται στο σύμπλεγμα Mycobacterium tuberculosis, το οποίο παρέχει χρήσιμα δεδομένα για τη βελτίωση του ελέγχου της φυματίωσης. Για τον σκοπό αυτό, καθορίσαμε τους ειδικούς στόχους: 1. Αναλύστε το απομονωμένο M. bovis και M. africanum στον πληθυσμό μας. Αναλύστε τις διαφορικές περιοχές στα γονιδιώματα τους. Εντοπίστε τα αντίγραφα του IS6110 στα γονιδιώματα του που θα συγκρίνονται με αυτά που είναι γνωστά στη Μ. φυματίωση. Αναλύστε την πιθανή δράση ως υποστηρικτής ή αδρανοποιητής αυτού του στοιχείου σε παρακείμενα γονίδια. 2. Ανάλυση με γονιδιωματική αλληλουχία (WGS) της μεταβλητότητας των απομονωθέντων στελεχών του Πεκίνου που προέρχεται από στέλεχος υπεύθυνο για μεγάλο αριθμό κρουσμάτων στον πληθυσμό των Καναρίων Νήσων. 3. Μελέτη των επιπτώσεων της μεταφοράς αντιγράφου του IS6110 στην προέλευση της αναπαραγωγής σε απομονωμένο στέλεχος που προκαλεί τη μεγαλύτερη εστία που ανιχνεύεται στον πληθυσμό της Αραγονίας, συγκρίνοντας τους φαινότυπους μεταξύ δύο στελεχών με την ίδια γονιδιωματική βάση με τη μόνη διαφορά από ένα αντίγραφο του IS6110 σε αυτή τη θέση. 4. Διατήρηση της συστηματικής γονοτυπικής ανάλυσης των απομονωθέντων στελεχών φυματίωσης στον πληθυσμό μας και απομονωθέντων στελεχών πολυανθεκτικών φαρμάκων σε εθνικό επίπεδο. (Greek)
18 August 2022
0 references
Det overordnede mål er at øge kendskabet til genomiske polymorfier, der findes i Mycobacterium tuberculosis-komplekset, og som giver nyttige data til forbedring af tuberkulosekontrollen. Med henblik herpå opstiller vi de specifikke mål for: 1. Analysere den isolerede M. bovis og M. africanum i vores befolkning. Analysere differentierede regioner i deres genomer. Find kopierne af IS6110 i dets genomer, der vil blive sammenlignet med dem, der er kendt i M. tuberculosis. Analysere den mulige handling som promotor eller inaktivering af dette element på tilstødende gener. 2. Ved genomisk sekventering (WGS) analysere variabiliteten af Beijing-isolater, der stammer fra en stamme, der er ansvarlig for et stort antal tilfælde i populationen på De Kanariske Øer. 3. At undersøge virkningerne af at overføre en kopi af IS6110 på replikationens oprindelse i et isolate af den stamme, der forårsager det største udbrud, der blev påvist i den aragonske population, ved at sammenligne fænotyper mellem to stammer med samme genomiske base med den eneste forskel fra en kopi af IS6110 på dette sted. 4. Opretholde den systematiske genotypebestemmelse af tuberkuloseisolater i vores befolkning og multiresistente isolater på nationalt plan. (Danish)
18 August 2022
0 references
Yleisenä tavoitteena on lisätä tietämystä Mycobacterium tuberculosis -kompleksissa havaituista genomipolymorfismeista, joista saadaan hyödyllistä tietoa tuberkuloosin torjunnan parantamiseksi. Tätä varten tilintarkastustuomioistuin määritteli seuraavat erityistavoitteet: 1. Analysoi populaatiossamme eristetty M. bovis ja M. africanum. Analysoida differentiaaliset alueet niiden genomit. Etsi kopiot IS6110 sen genomit, jotka ovat ristiriidassa tunnettuja M. tuberculosis. Analysoida tämän elementin promoottorina tai inaktivoijana mahdollista toimintaa vierekkäisissä geeneissä. 2. Analysoidaan genomisekvenssin (WGS) avulla Pekingin isolaattien vaihtelevuutta, joka on peräisin kannasta, joka on aiheuttanut suuren määrän tapauksia Kanariansaarten populaatiossa. 3. Tutkitaan IS6110:n kopion käyttöönoton vaikutuksia Aragonian populaatiossa havaitun suurimman taudinpurkauksen aiheuttaneen kannan isolaatin replikaation alkuperään vertaamalla fenotyyppejä kahden kannan välillä, joilla on sama genomipohja, ainoana erona IS6110:n kopiosta tässä paikassa. 4. Säilytetään tuberkuloosi-isolaattien järjestelmällinen genotyyppi populaatiossamme ja monilääkeresistentit isolaatit kansallisella tasolla. (Finnish)
18 August 2022
0 references
L-objettiv ġenerali huwa li jiżdied l-għarfien tal-polimorfiżmi ġenomiċi li jinsabu fil-kumpless tal-Mycobacterium tuberculosis li jipprovdi data utli għat-titjib tal-kontroll tat-tuberkulożi. Għal dan il-għan, stabbilixxejna l-objettivi speċifiċi ta’: 1. Analizza l-iżolament M. bovis u M. africanum fil-popolazzjoni tagħna. Analiżi tar-reġjuni differenzjali fil-ġenomi tagħhom. Sib il-kopji ta’ IS6110 fil-ġenomi tiegħu li jkunu kkuntrastati ma’ dawk magħrufa f’M. tuberculosis. Analizza l-azzjoni possibbli bħala promotur jew inattivatur ta’ dan l-element fuq ġeni kontigwi. 2. Analizza permezz tas-sekwenzjar ġenomiku (WGS) il-varjabbiltà tal-iżolati ta’ Beijing miksuba minn razza responsabbli għal għadd kbir ta’ każijiet fil-popolazzjoni tal-Gżejjer Kanarji. 3. Li jiġu studjati l-effetti tat-traspożizzjoni ta’ kopja tal-IS6110 fuq l-oriġini tar-replikazzjoni f’iżolat tar-razza li tikkawża l-akbar tifqigħa osservata fil-popolazzjoni Aragoniża, billi jitqabblu l-fenotipi bejn żewġ razez mal-istess bażi ġenomika mal-unika differenza minn kopja tal-IS6110 f’dan il-post. 4. Inżommu l-ġenotipar sistematiku tal-iżolati tat-tuberkulożi fil-popolazzjoni tagħna u iżolati reżistenti għal ħafna mediċini fil-livell nazzjonali. (Maltese)
18 August 2022
0 references
Vispārīgais mērķis ir palielināt zināšanas par Mycobacterium tuberculosis kompleksa genoma polimorfismu, kas sniedz noderīgus datus tuberkulozes kontroles uzlabošanai. Šajā nolūkā esam noteikuši šādus konkrētus mērķus: 1. Analizējiet izolēto M. bovis un M. africanum mūsu populācijā. Analizējiet atšķirīgos reģionus to genomos. Atrodiet IS6110 kopijas genomos, kas būs kontrastē ar M. tuberculosis. Analizējiet iespējamo šā elementa veicinātāja vai inaktivatora darbību uz blakus esošajiem gēniem. 2. Ar genomisko sekvencēšanu (WGS) analizē Pekinas izolātu mainīgumu, kas iegūti no celma, kurš ir atbildīgs par lielu skaitu saslimšanas gadījumu Kanāriju salu iedzīvotāju vidū. 3. Pētīt IS6110 kopijas transponēšanas ietekmi uz replikācijas izcelsmi izolātā no celma, kas izraisīja lielāko uzliesmojumu Aragones populācijā, salīdzinot fenotipus starp diviem celmiem ar vienu un to pašu genomisko bāzi ar vienīgo atšķirību no IS6110 eksemplāra šajā vietā. 4. Uzturēt sistemātisku tuberkulozes izolātu genotipu mūsu populācijā un multirezistentu izolātu genotipu valsts līmenī. (Latvian)
18 August 2022
0 references
Všeobecným cieľom je rozšíriť poznatky o genómových polymorfizmoch zistených v komplexe Mycobacterium tuberculosis, ktorý poskytuje užitočné údaje na zlepšenie kontroly tuberkulózy. Na tento účel sme stanovili konkrétne ciele: 1. Analyzujte izolovaný M. bovis a M. africanum v našej populácii. Analyzovať diferenciálne regióny v ich genómoch. Vyhľadajte kópie IS6110 vo svojich genómoch, ktoré budú v kontraste s tými známymi v M. tuberculosis. Analyzujte možné opatrenia ako promótor alebo inaktivátor tohto prvku na priľahlých génoch. 2. Analyzovať genómovým sekvenovaním (WGS) variabilitu izolátov v Pekingu odvodenú od kmeňa zodpovedného za vysoký počet prípadov v populácii Kanárskych ostrovov. 3. Preskúmať účinky transpozície kópie IS6110 na pôvod replikácie v izoláte kmeňa spôsobujúceho najväčšie ohnisko zistené v aragónskej populácii porovnaním fenotypov medzi dvoma kmeňmi s rovnakou genómovou bázou s jediným rozdielom od kópie IS6110 na tomto mieste. 4. Zachovať systematické genotypizácia tuberkulóznych izolátov v našej populácii a multirezistentných izolátov na vnútroštátnej úrovni. (Slovak)
18 August 2022
0 references
Is é an cuspóir ginearálta eolas a mhéadú ar pholamorphisms genomic le fáil i gcoimpléasc Mycobacterium tuberculosis a sholáthraíonn sonraí úsáideacha chun feabhas a chur ar rialú eitinne. Chuige sin, leagamar amach na cuspóirí sonracha seo a leanas: 1. Déan anailís ar an M. bovis agus M. africanum scoite inár ndaonra. Anailís a dhéanamh ar réigiúin dhifreálacha ina ngéanóim. Aimsigh na cóipeanna de IS6110 ina genomes a bheidh i gcodarsnacht leo siúd ar a dtugtar M. tuberculosis. Anailís a dhéanamh ar an ngníomh is féidir mar thionscnóir nó inactivator an eilimint seo ar géinte in aice láimhe. 2. Anailís a dhéanamh trí sheicheamh géanómaíoch (WGS) ar inathraitheacht aonraí Bhéising a dhíorthaítear ó thréithchineál atá freagrach as líon ard cásanna i ndaonra na nOileán Canárach. 3. Staidéar a dhéanamh ar na héifeachtaí a bhaineann le cóip de IS6110 a thrasuí ar thionscnamh macasamhlaithe in aonráite den tréithchineál is cúis leis an ráig is mó a braitheadh i bpobal Aragonese, trí fheinitíopaí a chur i gcomparáid idir dhá thréithchineál a bhfuil an bonn géanómaíoch céanna acu agus an t-aon difríocht ó chóip de IS6110 sa suíomh seo. 4. Coinnigh genotyping córasach na isolates eitinn inár ndaonra agus isolates in aghaidh ildrugaí ag an leibhéal náisiúnta. (Irish)
18 August 2022
0 references
Obecným cílem je zvýšit znalosti genomových polymorfismů nalezených v komplexu Mycobacterium tuberculosis, který poskytuje užitečné údaje pro zlepšení kontroly tuberkulózy. Za tímto účelem jsme stanovili konkrétní cíle: 1. Analyzujte izolované M. bovis a M. africanum v naší populaci. Analyzovat diferenciální oblasti v jejich genomech. Najděte kopie IS6110 v jeho genomech, které budou v kontrastu s těmi známými v M. tuberkulóze. Analyzovat možné působení jako promotor nebo inaktivátor tohoto prvku na sousední geny. 2. Analyzovat pomocí genomického sekvenování (WGS) variabilitu pekingských izolátů odvozených z kmene odpovědného za vysoký počet případů v populaci Kanárských ostrovů. 3. Studovat účinky transponování kopie IS6110 na původ replikace v izolátu kmene, který způsobuje největší ohnisko zjištěné v populaci Aragonie, porovnáním fenotypů mezi dvěma kmeny se stejnou genomickou bází s jediným rozdílem od kopie IS6110 v tomto místě. 4. Zachovat systematickou genotypizaci izolátů tuberkulózy v naší populaci a izolátů multirezistentních vůči drogám na národní úrovni. (Czech)
18 August 2022
0 references
O objetivo geral é aumentar o conhecimento dos polimorfismos genómicos encontrados no complexo Mycobacterium tuberculosis, que fornece dados úteis para melhorar o controlo da tuberculose. Para o efeito, definimos os objetivos específicos de: 1. Analisar os isolados M. bovis e M. africanum em nossa população. Analisar as regiões diferenciais nos seus genomas. Localize as cópias do IS6110 em seus genomas que serão contrastadas com as conhecidas no M. tuberculosis. Analisar a possível ação como promotor ou inativador deste elemento em genes adjacentes. 2. Analisar por sequenciação genómica (WGS) a variabilidade dos isolados de Pequim derivados de uma estirpe responsável por um elevado número de casos na população das Ilhas Canárias. 3. Estudar os efeitos da transposição de uma cópia da IS6110 sobre a origem da replicação num isolado da estirpe causadora do maior surto detetado na população aragonesa, comparando fenótipos entre duas estirpes com a mesma base genómica com a única diferença de uma cópia da IS6110 neste local. 4. Manter a genotipagem sistemática de isolados de tuberculose em nossa população e isolados multirresistentes a nível nacional. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
Üldeesmärk on suurendada teadmisi Mycobacterium tuberculosis’e kompleksis leiduvate genoomiliste polümorfismide kohta, mis annavad kasulikke andmeid tuberkuloosi kontrolli parandamiseks. Selleks püstitasime järgmised konkreetsed eesmärgid: 1. Analüüsige isoleeritud M. bovis ja M. africanum meie populatsioonis. Analüüsida erinevaid piirkondi nende genoomides. Leidke IS6110 koopiad selle genoomides, mis vastanduvad M. tuberculosis’is tuntud koopiatele. Analüüsige selle elemendi võimalikku toimet külgnevate geenide promootor või inaktivaator. 2. Analüüsida genoomilise järjestuse (WGS) abil Pekingi isolaatide varieeruvust, mis on saadud tüvest, mis põhjustab Kanaari saarte populatsioonis suurt hulka juhtumeid. 3. Uurida IS6110 koopia ülevõtmise mõju paljunemise päritolule tüve isolaadis, mis põhjustab Aragonese populatsioonis suurimat haiguspuhangut, võrreldes kahe sama genoomibaasiga tüve fenotüüpe ainsa erinevusega IS6110 koopiast selles asukohas. 4. Säilitada meie populatsioonis tuberkuloosi isolaatide ja multiresistentsete isolaatide süstemaatiline genotüübi määramine riiklikul tasandil. (Estonian)
18 August 2022
0 references
Az általános cél a Mycobacterium tuberculosis komplexumban található genomikus polimorfizmusokkal kapcsolatos ismeretek bővítése, amely hasznos adatokkal szolgál a tuberkulózis elleni védekezés javításához. E célból meghatároztuk a következő konkrét célkitűzéseket: 1. Elemezzük az elszigetelt M. Bovis-t és M. africanumot a lakosságunkban. Elemezze a differenciált régiókat a genomjaikban. Keresse meg az IS6110 másolatait a genomjaiban, amelyek szembekerülnek az M. tuberculosis-ban ismertekkel. Elemezze a lehetséges akciót, mint promóter vagy inaktivátor ezen elem a szomszédos gének. 2. Genomikus szekvenálással (WGS) elemezze a pekingi izolátumok variabilitását egy olyan törzsből, amely a Kanári-szigetek lakosságában nagyszámú esetben felelős. 3. Az IS6110 egy példánya átültetésének az aragóni populációban észlelt legnagyobb kitörést okozó törzs izolátumában a replikáció eredetére gyakorolt hatásainak tanulmányozása, a fenotípusok két azonos genomikus bázisú törzs közötti fenotípusainak összehasonlítása az ezen a helyen található IS6110 példánytól való egyetlen különbséggel. 4. Fenntartjuk a tuberkulózis-izolátumok szisztematikus genotipizálását a lakosságunkban és a multidrogrezisztens izolátumokat nemzeti szinten. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
Общата цел е да се повишат познанията за геномните полиморфизми, открити в комплекса Mycobacterium tuberculosis, който предоставя полезни данни за подобряване на контрола на туберкулозата. За тази цел Сметната палата определи конкретните цели на: 1. Анализирайте изолираните М. Бовис и М. Африканум в нашето население. Анализират диференциалните региони в техните геноми. Намерете копията на IS6110 в геномите, които ще бъдат контрастирани с тези, известни в М. туберкулоза. Анализирайте възможното действие като промотор или инактиватор на този елемент върху съседни гени. 2. Анализира чрез геномна последователност (WGS) променливостта на изолати в Пекин, получени от щам, отговорен за голям брой случаи в популацията на Канарските острови. 3. Да се проучат ефектите от транспонирането на копие на IS6110 върху произхода на репликацията в изолат на щама, причиняващ най-голямото огнище, открито в арагонската популация, чрез сравняване на фенотиповете между два щама с една и съща геномна основа с единствената разлика от копие на IS6110 на това място. 4. Поддържане на системното генотипиране на изолати на туберкулоза в нашата популация и мултирезистентни изолати на национално ниво. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
Bendras tikslas – gilinti žinias apie Mycobacterium tuberculosis komplekse aptinkamus genominius polimorfizmus, kurie suteikia naudingų duomenų tuberkuliozės kontrolei gerinti. Šiuo tikslu nustatėme konkrečius tikslus: 1. Analizuokite izoliuotą M. bovis ir M. africanum mūsų populiacijoje. Analizuokite diferencinius regionus savo genomuose. Savo genomuose raskite IS6110 kopijas, kurios bus kontrastingos M. tuberkuliozei. Analizuokite galimą šio elemento aktyvatoriaus ar inaktyvatoriaus veiksmą gretimuose genuose. 2. Analizuojant genominę seką (WGS) Pekino izoliatų, gautų iš padermės, dėl kurios Kanarų salų populiacijoje yra daug atvejų, kintamumas. 3. Ištirti IS6110 kopijos perkėlimo poveikį padermės replikacijos kilmei, sukeliančiai didžiausią protrūkį Aragono populiacijoje, lyginant dviejų padermių, turinčių tą pačią genominę bazę, fenotipus su vieninteliu skirtumu nuo IS6110 kopijos šioje vietoje. 4. Išlaikyti sisteminį tuberkuliozės izoliatų genotipo nustatymą mūsų gyventojų ir daugeliui vaistų atsparių izoliatų nacionaliniu lygmeniu. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
Opći je cilj povećati znanje o genomskim polimorfizmima pronađenima u kompleksu Mycobacterium tuberculosis koji pruža korisne podatke za poboljšanje kontrole tuberkuloze. U tu svrhu utvrdili smo posebne ciljeve: 1. Analizirajte izolirani M. Bovis i M. africanum u našoj populaciji. Analizirajte diferencijalna područja u njihovim genomima. Pronađite primjerke IS6110 u njegovim genomima koji će biti u suprotnosti s onima poznatima u M. tuberculosis. Analizirati moguće djelovanje kao promotor ili inaktivator ovog elementa na susjednim genima. 2. Analizirati genomskim sekvenciranjem (WGS) varijabilnost izolata iz Pekinga dobivenih iz soja koji je odgovoran za velik broj slučajeva u populaciji Kanarskih otoka. 3. Proučiti učinke prenošenja primjerka IS6110 na podrijetlo replikacije u izolaciji soja koji uzrokuje najveću epidemiju otkrivenu u aragonskoj populaciji usporedbom fenotipova između dvaju sojeva s istom genomskom bazom s jedinom razlikom od primjerka IS6110 na tom mjestu. 4. Održavati sustavnu genotipizaciju izolata tuberkuloze u našoj populaciji i izolata otpornih na više lijekova na nacionalnoj razini. (Croatian)
18 August 2022
0 references
Det allmänna målet är att öka kunskapen om genomiska polymorfismer som finns i Mycobacterium tuberculosis-komplexet som ger användbara data för att förbättra tuberkuloskontrollen. I detta syfte fastställde vi de särskilda målen för 1. Analysera den isolerade M. Bovis och M. africanum i vår befolkning. Analysera differentierade regioner i deras genom. Lokalisera kopiorna av IS6110 i dess genom som kommer att jämföras med dem som är kända vid M. tuberculosis. Analysera möjliga åtgärder som promotor eller inaktivator av detta element på angränsande gener. 2. Analysera genomsekvensering (WGS) variabiliteten hos Pekingisolat härledda från en stam som orsakar ett stort antal fall i populationen på Kanarieöarna. 3. Att studera effekterna av införlivandet av en kopia av IS6110 på replikeringens ursprung i ett isolat av den stam som orsakar det största utbrottet som påvisats i den aragonesiska populationen, genom att jämföra fenotyper mellan två stammar med samma genomiska bas med den enda skillnaden från en kopia av IS6110 på denna plats. 4. Upprätthålla systematisk genotypning av tuberkulosisolat i vår population och multiresistenta isolat på nationell nivå. (Swedish)
18 August 2022
0 references
Obiectivul general este de a spori cunoștințele despre polimorfismele genomice găsite în complexul Mycobacterium tuberculosis, care oferă date utile pentru îmbunătățirea controlului tuberculozei. În acest scop, am stabilit obiectivele specifice ale: 1. Analizați izolat M. bovis și M. africanum în populația noastră. Analizați regiunile diferențiale în genomul lor. Localizați copiile IS6110 în genomurile sale care vor fi comparate cu cele cunoscute în M. tuberculosis. Analizați acțiunea posibilă ca promotor sau inactivator al acestui element pe genele adiacente. 2. Analizați prin secvențiere genomică (WGS) variabilitatea izolatelor Beijing derivate dintr-o tulpină responsabilă pentru un număr mare de cazuri în populația Insulelor Canare. 3. Pentru a studia efectele transpunerii unei copii a IS6110 asupra originii replicării într-un izolat al tulpinii care cauzează cel mai mare focar detectat în populația aragoneză, prin compararea fenotipurilor între două tulpini cu aceeași bază genomică cu singura diferență față de o copie a IS6110 în această locație. 4. Menținerea genotipării sistematice a izolatelor de tuberculoză în populația noastră și a izolatelor multirezistente la nivel național. (Romanian)
18 August 2022
0 references
Splošni cilj je izboljšati poznavanje genomskih polimorfizmov v kompleksu Mycobacterium tuberculosis, ki zagotavlja koristne podatke za izboljšanje nadzora tuberkuloze. V ta namen smo določili posebne cilje: 1. Analizirajte izolirani M. Bovis in M. Africanum v naši populaciji. Analizirajte diferencialne regije v njihovih genomih. Poiščite kopije IS6110 v njegovih genomih, ki bodo v nasprotju s tistimi, ki so znani v M. tuberculosis. Analizirajte morebitno delovanje kot promotor ali inaktivator tega elementa na sosednjih genih. 2. Z genomskim zaporedjem (WGS) analizira variabilnost pekinških izolatov, pridobljenih iz seva, odgovornega za veliko število primerov v populaciji Kanarskih otokov. 3. Preučiti učinke prenosa kopije IS6110 na izvor replikacije v izolatu seva, ki je povzročil največji izbruh v aragonski populaciji, s primerjavo fenotipov med dvema sevama z isto genomsko bazo z edino razliko od kopije IS6110 na tem mestu. 4. Ohraniti sistematično genotipizacijo izolatov tuberkuloze v naši populaciji in izolatov, odpornih na več zdravil, na nacionalni ravni. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
Ogólnym celem jest zwiększenie wiedzy na temat polimorfizmów genomowych występujących w kompleksie Mycobacterium tuberculosis, który dostarcza przydatnych danych do poprawy kontroli gruźlicy. W tym celu określiliśmy cele szczegółowe: 1. Przeanalizuj odizolowane M. Bovis i M. africanum w naszej populacji. Analiza różnicowych regionów w ich genomach. Zlokalizuj kopie IS6110 w jego genomach, które będą kontrastować z tymi znanymi w M. tuberculosis. Analizować możliwe działanie jako promotor lub inaktywator tego pierwiastka na sąsiednich genach. 2. Analiza za pomocą sekwencjonowania genomowego (WGS) zmienności izolatów pekińskich pochodzących ze szczepu odpowiedzialnego za dużą liczbę przypadków w populacji Wysp Kanaryjskich. 3. Zbadanie wpływu transpozycji kopii IS6110 na pochodzenie replikacji w izolacie szczepu powodującego największe ognisko wykryte w populacji aragońskiej, poprzez porównanie fenotypów między dwoma szczepami o tej samej bazie genomowej z jedyną różnicą w stosunku do kopii IS6110 w tym miejscu. 4. Utrzymanie systematycznego genotypowania izolatów gruźlicy w naszej populacji i izolatów opornych na wiele leków na szczeblu krajowym. (Polish)
18 August 2022
0 references
Zaragoza
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI15_00317
0 references