FORMATION OF BACTERIAL LINEAGES IN SALMONELLA ENTERICA BY EPIGENETIC MECHANISMS (Q3201570)

From EU Knowledge Graph
Jump to navigation Jump to search
Project Q3201570 in Spain
Language Label Description Also known as
English
FORMATION OF BACTERIAL LINEAGES IN SALMONELLA ENTERICA BY EPIGENETIC MECHANISMS
Project Q3201570 in Spain

    Statements

    country
    Spain
    0 references
    EU contribution
    219,324.6 Euro
    0 references
    budget
    272,250.0 Euro
    0 references
    co-financing rate
    80.56 percent
    0 references
    start time
    1 January 2014
    0 references
    end time
    30 June 2017
    0 references
    beneficiary name (string)
    UNIVERSIDAD DE SEVILLA
    0 references
    coordinate location

    37°21'5.33"N, 5°58'56.89"W
    inferred from
    postal code
    0 references
    postal code
    41012
    0 references
    summary
    LA FORMACION DE LINAJES BACTERIANOS POR MECANISMOS EPIGENETICOS ES UN FENOMENO CON INTERES ACADEMICO Y APLICADO. DESDE EL PUNTO DE VISTA DE LA BIOLOGIA FUNDAMENTAL, LA EXISTENCIA DE DIVERSIDAD FENOTIPICA DESAFIA LA VISION TRADICIONAL DE LAS BACTERIAS COMO POBLACIONES CLONALES FORMADAS POR ORGANISMOS IDENTICOS. ADEMAS, LA FORMACION DE LINAJES FENOTIPICOS TIENE UN PAPEL RELEVANTE EN INTERACCIONES PATOGENO-HOSPEDADOR Y EN LA ADAPTACION BACTERIANA A CONDICIONES AMBIENTALES CAMBIANTES Y/O HOSTILES. SALMONELLA ENTERICA ES UN ORGANISMO APROPIADO PARA EL ESTUDIO DE MECANISMOS EPIGENETICOS POR LOS MOTIVOS SIGUIENTES: (I) ES UN PATOGENO HUMANO RELEVANTE; (II) ES UN ORGANISMO MODELO EN GENETICA Y EN PATOGENESIS BACTERIANA; (III) ESTUDIOS PREVIOS, INCLUIDOS LOS DEL GRUPO SOLICITANTE, HAN MOSTRADO QUE LA FORMACION DE LINAJES ES ESENCIAL PARA LA PATOGENESIS. LA CONTINUACION DE LOS ESTUDIOS DEL GRUPO SOBRE MECANISMOS EPIGENETICOS EN SALMONELLA CONTRIBUIRA AL ESTABLECIMIENTO DE UN CONCEPTO RELATIVAMENTE NUEVO EN BIOLOGIA: QUE LA FORMACION DE LINAJES POR MECANISMOS NO MUTACIONALES ES PARTE INTRINSECA DEL MODO DE VIDA BACTERIANO. EL PROYECTO PROPONE LA INVESTIGACION DE DOS TIPOS DE MECANISMOS EPIGENETICOS QUE CONTROLAN GENES DE SALMONELLA RELACIONADOS CON LA VIRULENCIA GENERANDO LINAJES FENOTIPICOS:_x000D_ 1. SISTEMAS DE VARIACION DE FASE Y DE EXPRESION GENICA BIESTABLE CONTROLADOS POR METILACION DAM. EL PROYECTO ANALIZARA A NIVEL MOLECULAR EL SISTEMA DE VARIACION DE FASE OPVAB, QUE GENERA SUBPOBLACIONES RESISTENTES A FAGOS Y CONTROLA LA PROLIFERACION EN MACROFAGOS, Y EL OPERON FIMBRIAL STD, QUE CONTROLA LA ADHESION DE SALMONELLA AL EPITELIO INTESTINAL Y REGULA LA EXPRESION BIESTABLE DE LA ISLA DE PATOGENICIDAD 1. ADEMAS, EL PROYECTO CARACTERIZARA 20 LOCI DE VARIACION DE FASE IDENTIFICADOS POR ANALISIS BIOINFORMATICO, MUCHOS DE ELLOS CON FUNCION DESCONOCIDA. EL PROYECTO TAMBIEN PROPONE DIFERENCIAR LA VARIACION DE FASE INDEPENDIENTE DE LA VARIACION DE FASE COORDINADA. ESTE TIPO DE ANALISIS PERMITIRA ESTIMAR LA CAPACIDAD DE LA METILACION DAM PARA GENERAR HETEROGENEIDAD FENOTIPICA EN SALMONELLA. TEORICAMENTE, VEINTE LOCI CON VARIACION DE FASE INDEPENDIENTE PODRIAN GENERAR 2(ELEVADO A)20 TIPOS DE CELULAS._x000D_ 2. FORMACION DE LINAJES INDEPENDIENTE DE METILACION DAM. DIFERENCIAS ENTRE CELULAS GENERADAS POR RUIDO EN PROMOTORES O POR AMPLIFICACION GENICA PREADAPTAN SUBPOBLACIONES DE CELULAS A RESISTIR UNA SELECCION LETAL (EJ. BILIS). SI EL ESTADO QUE PERMITE LA SUPERVIVENCIA ES PROPAGADO POR UN LAZO AUTOCATALITICO SE FORMA UNA POBLACION DE CELULAS RESISTENTES. EL PROYECTO PROPONE LA DISECCION DE UNA RESPUESTA DE ESTE TIPO, DEBIDA A ACTIVACION HETEROGENEA DE LA RESPUESTA GENERAL A ESTRES DEPENDIENTE DE RPOS. DICHA RESPUESTA CONFIERE RESISTENCIA A BILIS Y PRESUNTAMENTE A OTRAS CONDICIONES ADVERSAS._x000D_ EL ESTUDIO DE LOS MECANISMOS QUE GENERAN LINAJES FENOTIPICOS PUEDE AYUDAR A ENTENDER FENOMENOS RELEVANTES PARA LA SALUD HUMANA COMO LA PERSISTENCIA BACTERIANA, LA INFECCION CRONICA, LA EVASION DE DEFENSAS DEL HUESPED Y LA RESISTENCIA NO MUTACIONAL A ANTIBACTERIANOS. ADEMAS, EL PROYECTO TIENE APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS:_x000D_ 1. DESARROLLO DE FARMACOS EPIGENETICOS PARA TERAPIA ANTIBACTERIANA (INHIBIDORES DE LA METILASA DAM, INHIBIDORES DE VARIACION DE FASE, ETC.)._x000D_ 2. DISEÑO DE INGENIOS CONTROLADOS POR METILACION DAM PARA CONSTRUIR INTERRUPTORES, SENSORES, SISTEMAS DE MEMORIA Y OTROS INGENIOS DE BIOLOGIA SINTETICA CON APLICACIONES BIOMEDICAS E INDUSTRIALES. (Spanish)
    0 references
    THE FORMATION OF BACTERIAL LINEAGES BY EPIGENETIC MECHANISMS IS A PHENOMENON WITH ACADEMIC INTEREST AND APPLIED. FROM THE POINT OF VIEW OF FUNDAMENTAL BIOLOGY, THE EXISTENCE OF PHENOTYPIC DIVERSITY CHALLENGES THE TRADITIONAL VISION OF BACTERIA AS CLONAL POPULATIONS FORMED BY IDENTITY ORGANISMS. IN ADDITION, THE FORMATION OF PHENOTYPIC LINEAGES PLAYS A RELEVANT ROLE IN PATHOGEN-HOST INTERACTIONS AND IN BACTERIAL ADAPTATION TO CHANGING AND/OR HOSTILE ENVIRONMENTAL CONDITIONS. SALMONELLA ENTERICA IS AN APPROPRIATE ORGANISM FOR THE STUDY OF EPIGENETIC MECHANISMS FOR THE FOLLOWING REASONS: (I) IS A RELEVANT HUMAN PATHOGEN; (II) IS A MODEL ORGANISM IN GENETIC AND BACTERIAL PATHOGENESIS; (III) PREVIOUS STUDIES, INCLUDING THOSE OF THE APPLICANT GROUP, HAVE SHOWN THAT LINEAGE FORMATION IS ESSENTIAL FOR PATHOGENESIS. THE CONTINUATION OF THE STUDIES OF THE GROUP ON EPIGENETIC MECHANISMS IN SALMONELLA WILL CONTRIBUTE TO THE ESTABLISHMENT OF A RELATIVELY NEW CONCEPT IN BIOLOGY: THAT THE FORMATION OF LINEAGES BY NON-MUTATIONAL MECHANISMS IS AN INTRICATE PART OF THE BACTERIAL WAY OF LIFE. The PROJECT PROPOSES the search for two types of epigenetic mechanisms that control SALMONELLA GENES RELATED TO VIRULENCE GENERANING phenotypic lineages:_x000D_ 1. PHASE VARIATION AND BISTABLE GENE EXPRESSION SYSTEMS CONTROLLED BY METILACION DAM. THE PROJECT WILL ANALYSE AT MOLECULAR LEVEL THE OPVAB PHASE VARIATION SYSTEM, WHICH GENERATES PHAGO-RESISTANT SUBPOPULATIONS AND CONTROLS THE PROLIFERATION IN MACROPHAGES, AND THE OPERON FIMBRIAL STD, WHICH CONTROLS THE ADHESION OF SALMONELLA TO THE INTESTINAL EPITHELIUM AND REGULATES THE BISTABLE EXPRESSION OF THE ISLAND OF PATHOGENICITY 1. IN ADDITION, THE PROJECT WILL CHARACTERISE 20 PHASE VARIATION LOCI IDENTIFIED BY BIOINFORMATIC ANALYSIS, MANY OF THEM WITH UNKNOWN FUNCTION. THE PROJECT ALSO PROPOSES TO DIFFERENTIATE THE INDEPENDENT PHASE VARIATION FROM THE COORDINATED PHASE VARIATION. THIS TYPE OF ANALYSIS WILL ALLOW ESTIMATING THE ABILITY OF METILACION DAM TO GENERATE PHENOTYPIC HETEROGENEITY IN SALMONELLA. Theoretically, VEINTE LOCI WITH INDEPENDENT PHASE VARIATION CAN GENERAR 2(ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. FORMATION OF LINEAGES INDEPENDENT OF METILACION DAM. DIFFERENCES BETWEEN CELLS GENERATED BY NOISE IN PROMOTERS OR BY GENIC AMPLIFICATION PREADAPTAN SUBPOPULATIONS OF CELLS TO RESIST A LETHAL SELECTION (E.G. BILE). IF THE STATE THAT ALLOWS SURVIVAL IS PROPAGATED BY AN AUTOCATALITICO LOOP, A POPULATION OF RESISTANT CELLS IS FORMED. THE PROJECT PROPOSES THE DISSECTION OF SUCH A RESPONSE, DUE TO HETEROGENEOUS ACTIVATION OF THE GENERAL RESPONSE TO STRESS DEPENDENT ON RPOS. This RESPONSE CONFERENCE RESISTANCE TO BILIS AND PRESENT TO OTHER ADVERSED CONDITIONS._x000D_ THE STUDY OF THE MECHANISMS that GENERAL phenotypic lineages can help to understand RELEVANT FENOMENS FOR HUMAN HEALTH AS BACTERIAL PERSISTENCE, chronic INFECTION, HESSPED DEFENSES EVASION AND NON-mutational ANTIBACTERIAL RESISTANCE. Besides, THE PROJECT has biotechnological applications:_x000D_ 1. Development of epigenetic pharmacies for antibacterial therapy (DAM methylase inhibitors, phase variation inhibitors, ETC.)._x000D_ 2. DESIGN OF INGENUITY CONTROLLED BY METILACION DAM TO BUILD SWITCHES, SENSORS, MEMORY SYSTEMS AND OTHER INGENUITIES OF BIOLOGIA SYNTHETICA WITH BIOMEDICAL AND INDUSTRIAL APPLICATIONS. (English)
    point in time
    13 October 2021
    readability score
    0.2688939316113875
    0 references
    LA FORMATION DE LIGNÉES BACTÉRIENNES PAR DES MÉCANISMES ÉPIGÉNÉTIQUES EST UN PHÉNOMÈNE AVEC INTÉRÊT ACADÉMIQUE ET APPLIQUÉ. DU POINT DE VUE DE LA BIOLOGIE FONDAMENTALE, L’EXISTENCE DE LA DIVERSITÉ PHÉNOTYPIQUE REMET EN QUESTION LA VISION TRADITIONNELLE DES BACTÉRIES COMME POPULATIONS CLONALES FORMÉES PAR DES ORGANISMES IDENTITAIRES. DE PLUS, LA FORMATION DE LIGNÉES PHÉNOTYPIQUES JOUE UN RÔLE IMPORTANT DANS LES INTERACTIONS PATHOGÈNES-HÔTE ET DANS L’ADAPTATION BACTÉRIENNE AUX CONDITIONS ENVIRONNEMENTALES CHANGEANTES ET/OU HOSTILES. SALMONELLA ENTERICA EST UN ORGANISME APPROPRIÉ POUR L’ÉTUDE DES MÉCANISMES ÉPIGÉNÉTIQUES POUR LES RAISONS SUIVANTES: I) EST UN AGENT PATHOGÈNE HUMAIN PERTINENT; II) EST UN ORGANISME MODÈLE DANS LE DOMAINE DE LA PATHOGENÈSE GÉNÉTIQUE ET BACTÉRIENNE; (III) DES ÉTUDES ANTÉRIEURES, Y COMPRIS CELLES DU GROUPE DEMANDEUR, ONT MONTRÉ QUE LA FORMATION DE LIGNÉES EST ESSENTIELLE À LA PATHOGENÈSE. LA POURSUITE DES ÉTUDES DU GROUPE SUR LES MÉCANISMES ÉPIGÉNÉTIQUES CHEZ SALMONELLA CONTRIBUERA À L’ÉTABLISSEMENT D’UN CONCEPT RELATIVEMENT NOUVEAU EN BIOLOGIE: QUE LA FORMATION DE LIGNÉES PAR DES MÉCANISMES NON MUTATIONNELS EST UNE PARTIE COMPLEXE DU MODE DE VIE BACTÉRIEN. Le PROJECT PROPOSE la recherche de deux types de mécanismes épigénétiques qui contrôlent SALMONELLA GENES RELATED À LA VIRULENCE GÉNÉRANisant les lignées phénotypiques:_x000D_ 1. VARIATION DE PHASE ET SYSTÈMES D’EXPRESSION DES GÈNES BISTABLES CONTRÔLÉS PAR LE BARRAGE METILACION. LE PROJET ANALYSERA AU NIVEAU MOLÉCULAIRE LE SYSTÈME DE VARIATION DE PHASE OPVAB, QUI GÉNÈRE DES SOUS-POPULATIONS RÉSISTANTES À PHAGO ET CONTRÔLE LA PROLIFÉRATION DANS LES MACROPHAGES, ET LA STD FIMBRIALE OPÉRON, QUI CONTRÔLE L’ADHÉSION DE SALMONELLA À L’ÉPITHÉLIUM INTESTINAL ET RÉGULE L’EXPRESSION BISTABLE DE L’ÎLE DE PATHOGÉNICITÉ 1. DE PLUS, LE PROJET CARACTÉRISERA 20 LOCI DE VARIATION DE PHASE IDENTIFIÉS PAR ANALYSE BIOINFORMATIQUE, DONT BEAUCOUP ONT UNE FONCTION INCONNUE. LE PROJET PROPOSE ÉGALEMENT DE DIFFÉRENCIER LA VARIATION DE PHASE INDÉPENDANTE DE LA VARIATION DE PHASE COORDONNÉE. CE TYPE D’ANALYSE PERMETTRA D’ESTIMER LA CAPACITÉ DU BARRAGE METILACION À GÉNÉRER UNE HÉTÉROGÉNÉITÉ PHÉNOTYPIQUE CHEZ SALMONELLA. En théorie, Veinte LOCI AVEC LA VARIATION DE PHASE INDÉPENDANTE CAN Genrer 2(ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. FORMATION DE LIGNAGES INDÉPENDANTS DU BARRAGE METILACION. DIFFÉRENCES ENTRE LES CELLULES GÉNÉRÉES PAR LE BRUIT CHEZ LES PROMOTEURS OU PAR AMPLIFICATION GÉNIQUE DES SOUS-POPULATIONS DE CELLULES PREADAPTAN POUR RÉSISTER À UNE SÉLECTION LÉTALE (E.G. BILE). SI L’ÉTAT QUI PERMET LA SURVIE EST PROPAGÉ PAR UNE BOUCLE AUTOCATALITICO, UNE POPULATION DE CELLULES RÉSISTANTES EST FORMÉE. LE PROJET PROPOSE LA DISSECTION D’UNE TELLE RÉPONSE, EN RAISON DE L’ACTIVATION HÉTÉROGÈNE DE LA RÉPONSE GÉNÉRALE AU STRESS DÉPENDANT DES OPR. Cette RESPONSE CONFÉRENCE RESISTANCE À Bilis ET PRÉSENT À D’autres CONDITIONS adverses._x000D_ L’ÉTUDE DES MÉCANISMES que les lignées phénotypiques GÉNÉRALEs peuvent aider à comprendre les fénomènes RELEVANTS POUR LA SANTÉ HUMAINE DE LA PERSISTENCE BACTERIE, DE L’INFECTION chronique, DEFENSES HESSPÉES ÉVASION ET LA RÉSISTANCE ANTIBACTERIELLE NON-mutationnelle. En outre, THE PROJECT a des applications biotechnologiques:_x000D_ 1. Développement de pharmacies épigénétiques pour la thérapie antibactérienne (inhibiteurs de la DAM méthylase, inhibiteurs de variation de phase, ETC.)._x000D_ 2. CONCEPTION DE L’INGÉNIOSITÉ CONTRÔLÉE PAR LE BARRAGE METILACION POUR CONSTRUIRE DES COMMUTATEURS, DES CAPTEURS, DES SYSTÈMES DE MÉMOIRE ET D’AUTRES INGÉNUITÉS DE BIOLOGIA SYNTHETICA AVEC DES APPLICATIONS BIOMÉDICALES ET INDUSTRIELLES. (French)
    point in time
    5 December 2021
    0 references
    DIE BILDUNG BAKTERIELLER LINIEN DURCH EPIGENETISCHE MECHANISMEN IST EIN PHÄNOMEN MIT AKADEMISCHEM INTERESSE UND ANGEWENDET. AUS SICHT DER FUNDAMENTALEN BIOLOGIE STELLT DIE EXISTENZ PHÄNOTYPISCHER VIELFALT DIE TRADITIONELLE VISION VON BAKTERIEN ALS KLONALE POPULATIONEN, DIE VON IDENTITÄTSORGANISMEN GEBILDET WERDEN, IN FRAGE. DARÜBER HINAUS SPIELT DIE BILDUNG PHÄNOTYPISCHER LINIEN EINE WICHTIGE ROLLE BEI DEN WECHSELWIRKUNGEN VON KRANKHEITSERREGERN UND BEI DER BAKTERIELLEN ANPASSUNG AN SICH VERÄNDERNDE UND/ODER FEINDSELIGE UMGEBUNGSBEDINGUNGEN. SALMONELLA ENTERICA IST EIN GEEIGNETER ORGANISMUS FÜR DIE UNTERSUCHUNG EPIGENETISCHER MECHANISMEN AUS FOLGENDEN GRÜNDEN: I) EIN RELEVANTER ERREGER BEIM MENSCHEN IST; II) IST EIN MODELLORGANISMUS IN DER GENETISCHEN UND BAKTERIELLEN PATHOGENESE; III) FRÜHERE STUDIEN, EINSCHLIESSLICH DERJENIGEN DER ANTRAGSTELLENDEN GRUPPE, HABEN GEZEIGT, DASS DIE BILDUNG VON LINIEN FÜR DIE PATHOGENESE VON WESENTLICHER BEDEUTUNG IST. DIE FORTSETZUNG DER STUDIEN DER GRUPPE ÜBER EPIGENETISCHE MECHANISMEN IN SALMONELLEN WIRD ZUR ENTWICKLUNG EINES RELATIV NEUEN KONZEPTS IN DER BIOLOGIE BEITRAGEN: DASS DIE BILDUNG VON LINIEN DURCH NICHT-MUTATIONALE MECHANISMEN EIN KOMPLIZIERTER TEIL DER BAKTERIELLEN LEBENSWEISE IST. Das PROJEKT PROPOSES die Suche nach zwei Arten epigenetischer Mechanismen, die SALMONELLA GENES RELATED TO VIRULENCE GENERANING phänotypische Linien steuern:_x000D_ 1. PHASENVARIATION UND BISTABILE GENEXPRESSIONSSYSTEME, DIE VON METILACION DAMM GESTEUERT WERDEN. DAS PROJEKT WIRD AUF MOLEKULARER EBENE DAS OPVAB-PHASENVARIATIONSSYSTEM ANALYSIEREN, DAS PHAGO-RESISTENTE SUBPOPULATIONEN ERZEUGT UND DIE PROLIFERATION IN MAKROPHAGEN KONTROLLIERT, SOWIE DIE OPERATIONS FIMBRIAL STD, DIE DIE ADHÄSION VON SALMONELLEN ZUM DARMEPITHEL KONTROLLIERT UND DIE BISTABILE EXPRESSION DER INSEL DER PATHOGENITÄT REGULIERT 1. DARÜBER HINAUS WIRD DAS PROJEKT 20 PHASENVARIATION LOCI CHARAKTERISIEREN, DIE DURCH BIOINFORMATISCHE ANALYSE IDENTIFIZIERT WERDEN, VIELE DAVON MIT UNBEKANNTER FUNKTION. DAS PROJEKT SCHLÄGT AUSSERDEM VOR, DIE UNABHÄNGIGE PHASENVARIATION VON DER KOORDINIERTEN PHASENVARIATION ZU UNTERSCHEIDEN. DIESE ART DER ANALYSE ERMÖGLICHT DIE SCHÄTZUNG DER FÄHIGKEIT VON METILACION DAMM, PHÄNOTYPISCHE HETEROGENITÄT IN SALMONELLEN ZU ERZEUGEN. Theoretisch, Veinte LOCI MIT INDEPENDENT PHASE VARIATION CAN generar 2 ELEVATED A20 CELL TIPS._x000D_ 2. BILDUNG VON LINIEN UNABHÄNGIG VON METILACION DAMM. UNTERSCHIEDE ZWISCHEN ZELLEN, DIE DURCH LÄRM IN PROMOTOREN ODER DURCH GENIC AMPLIFICATION PREADAPTAN SUBPOPULATIONEN VON ZELLEN ERZEUGT WERDEN, UM EINER TÖDLICHEN SELEKTION ZU WIDERSTEHEN (E.G. GALLE). WENN DER ZUSTAND, DER DAS ÜBERLEBEN ERLAUBT, DURCH EINE AUTOCATALITICO-SCHLEIFE PROPAGIERT WIRD, ENTSTEHT EINE POPULATION RESISTENTER ZELLEN. DAS PROJEKT SCHLÄGT DIE DISSEKTION EINER SOLCHEN REAKTION AUFGRUND EINER HETEROGENEN AKTIVIERUNG DER ALLGEMEINEN REAKTION AUF STRESS, DIE VON RPOS ABHÄNGIG IST, VOR. Diese RESPONSE CONFERENCE RESISTANCE TO Bilis UND PRESENT TO ANDERE negative CONDITIONS._x000D_ DIE STUDIE DER MECHANISMS, dass GENERAL phenotypische Linien dazu beitragen können, RELEVANT Fenomen für HUMAN HEALTH AS BACTERIAL PERSISTENCE, chronische INFECTION, HESSPED DEFENSES EVASION UND NON-mutational ANTIBACTERIAL RESISTANCE zu verstehen. Außerdem hat THE PROJECT biotechnologische Anwendungen:_x000D_ 1. Entwicklung epigenetischer Apotheken für antibakterielle Therapien (DAM-Methylase-Inhibitoren, Phasenvariationsinhibitoren, ETC.)._x000D_ 2. ENTWURF VON EINFALLSREICHTUM GESTEUERT DURCH METILACION DAMM ZUM BAU VON SCHALTERN, SENSOREN, SPEICHERSYSTEMEN UND ANDEREN EINFALLSREICHTUM VON BIOLOGIA SYNTHETICA MIT BIOMEDIZINISCHEN UND INDUSTRIELLEN ANWENDUNGEN. (German)
    point in time
    9 December 2021
    0 references
    DE VORMING VAN BACTERIËLE GESLACHTEN DOOR EPIGENETISCHE MECHANISMEN IS EEN FENOMEEN MET ACADEMISCH BELANG EN TOEGEPAST. VANUIT HET OOGPUNT VAN DE FUNDAMENTELE BIOLOGIE DAAGT HET BESTAAN VAN FENOTYPISCHE DIVERSITEIT DE TRADITIONELE VISIE VAN BACTERIËN UIT ALS KLONALE POPULATIES GEVORMD DOOR IDENTITEITSORGANISMEN. BOVENDIEN SPEELT DE VORMING VAN FENOTYPISCHE LINEAGES EEN RELEVANTE ROL BIJ DE INTERACTIE TUSSEN ZIEKTEVERWEKKER EN GASTHEER EN BIJ DE BACTERIËLE AANPASSING AAN VERANDERENDE EN/OF VIJANDIGE OMGEVINGSOMSTANDIGHEDEN. SALMONELLA ENTERICA IS OM DE VOLGENDE REDENEN EEN GESCHIKT ORGANISME VOOR HET ONDERZOEK VAN EPIGENETISCHE MECHANISMEN: I) EEN RELEVANT PATHOGEEN BIJ DE MENS IS; II) EEN MODELORGANISME IN GENETISCHE EN BACTERIËLE PATHOGENESE IS; (III) UIT EERDERE ONDERZOEKEN, MET INBEGRIP VAN DIE VAN DE AANVRAGENDE GROEP, IS GEBLEKEN DAT LINEAGEVORMING ESSENTIEEL IS VOOR PATHOGENESE. DE VOORTZETTING VAN DE STUDIES VAN DE GROEP OVER EPIGENETISCHE MECHANISMEN BIJ SALMONELLA ZAL BIJDRAGEN TOT DE TOTSTANDKOMING VAN EEN RELATIEF NIEUW CONCEPT IN DE BIOLOGIE: DAT DE VORMING VAN LINEAGES DOOR NIET-MUTATIEVE MECHANISMEN EEN INGEWIKKELD DEEL VAN DE BACTERIËLE MANIER VAN LEVEN IS. Het PROJECT stelt de zoektocht naar twee soorten epigenetische mechanismen die de controle van SALMONELLA GENES RELATED TO VIRULENCE GENERANING fenotypische lineages:_x000D_ 1. FASEVARIATIE EN BISTABIELE GENEXPRESSIESYSTEMEN GECONTROLEERD DOOR METILACION DAM. HET PROJECT ZAL OP MOLECULAIR NIVEAU HET OPVAB-FASEVARIATIESYSTEEM ANALYSEREN, DAT PHAGO-RESISTENTE SUBPOPULATIES GENEREERT EN DE PROLIFERATIE IN MACROFAGEN CONTROLEERT, EN DE OPERON FIMBRIAL SOA, DIE DE HECHTING VAN SALMONELLA AAN HET DARMEPTHELIUM CONTROLEERT EN DE BISTABIELE EXPRESSIE VAN HET EILAND VAN PATHOGENITEIT REGELT 1. DAARNAAST ZAL HET PROJECT KENMERKEN 20 FASE VARIATIE LOCI GEÏDENTIFICEERD DOOR BIOINFORMATISCHE ANALYSE, VEEL VAN HEN MET ONBEKENDE FUNCTIE. IN HET PROJECT WORDT OOK VOORGESTELD DE ONAFHANKELIJKE FASEVARIATIE TE ONDERSCHEIDEN VAN DE GECOÖRDINEERDE FASEVARIATIE. DIT TYPE ANALYSE ZAL HET MOGELIJK MAKEN HET VERMOGEN VAN METILACION DAM OM FENOTYPISCHE HETEROGENITEIT IN SALMONELLA TE GENEREREN. Theoretisch gezien, Veinte LOCI MET INDEPENDENT PHASE VARIATION CAN generar 2(ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. VORMING VAN LINEAGES ONAFHANKELIJK VAN METILACION DAM. VERSCHILLEN TUSSEN CELLEN DIE WORDEN GEGENEREERD DOOR LAWAAI IN PROMOTORS OF DOOR GENIC AMPLIFICATIE PREADAPTAN SUBPOPULATIES VAN CELLEN OM EEN DODELIJKE SELECTIE TE WEERSTAAN (E.G. GAL). ALS DE STAAT DIE OVERLEVING TOELAAT WORDT GEPROPAGEERD DOOR EEN AUTOCATALITICO LUS, WORDT EEN POPULATIE VAN RESISTENTE CELLEN GEVORMD. HET PROJECT STELT DE VERSNIJDING VAN EEN DERGELIJKE REACTIE VOOR, ALS GEVOLG VAN HETEROGENE ACTIVERING VAN DE ALGEMENE RESPONS OP STRESS AFHANKELIJK VAN RPO’S. Deze RESPONSE CONFERENCE RESISTANCE TO Bilis AND PRESENT TO ANDHER adversed CONDITIONS._x000D_ DE STUDIE VAN DE MECHANISMS dat Generale fenotypische lineages kunnen helpen om RELEVANT fenomenen te begrijpen voor MENSEN HALTH AS BACTERIAAL PERSISTENCE, chronische INFECTIE, HESSPED DEFENSES EVASION EN NON-mutatieve ANTIBACTERIAAL RESISTANCE. Bovendien heeft het PROJECT biotechnologische toepassingen:_x000D_ 1. Ontwikkeling van epigenetische apotheken voor antibacteriële therapie (DAM-methylaseremmers, fasevariatieremmers, ETC.)._x000D_ 2. ONTWERP VAN VINDINGRIJKHEID GECONTROLEERD DOOR METILACION DAM VOOR HET BOUWEN VAN SCHAKELAARS, SENSOREN, GEHEUGENSYSTEMEN EN ANDERE VINDINGEN VAN BIOLOGIA SYNTHETICA MET BIOMEDISCHE EN INDUSTRIËLE TOEPASSINGEN. (Dutch)
    point in time
    17 December 2021
    0 references
    LA FORMAZIONE DI LIGNAGGI BATTERICI DA MECCANISMI EPIGENETICI È UN FENOMENO CON INTERESSE ACCADEMICO E APPLICATO. DAL PUNTO DI VISTA DELLA BIOLOGIA FONDAMENTALE, L'ESISTENZA DELLA DIVERSITÀ FENOTIPICA SFIDA LA VISIONE TRADIZIONALE DEI BATTERI COME POPOLAZIONI CLONALI FORMATE DA ORGANISMI DI IDENTITÀ. INOLTRE, LA FORMAZIONE DI LIGNAGGI FENOTIPICI SVOLGE UN RUOLO RILEVANTE NELLE INTERAZIONI PATOGENO-OSPITE E NELL'ADATTAMENTO BATTERICO A CONDIZIONI AMBIENTALI MUTEVOLI E/O OSTILI. LA SALMONELLA ENTERICA È UN ORGANISMO APPROPRIATO PER LO STUDIO DEI MECCANISMI EPIGENETICI PER I SEGUENTI MOTIVI: I) È UN AGENTE PATOGENO UMANO RILEVANTE; II) È UN ORGANISMO MODELLO NELLA PATOGENESI GENETICA E BATTERICA; (III) STUDI PRECEDENTI, COMPRESI QUELLI DEL GRUPPO RICHIEDENTE, HANNO DIMOSTRATO CHE LA FORMAZIONE DI LIGNAGGIO È ESSENZIALE PER LA PATOGENESI. IL PROSEGUIMENTO DEGLI STUDI DEL GRUPPO SUI MECCANISMI EPIGENETICI NELLA SALMONELLA CONTRIBUIRÀ ALLA DEFINIZIONE DI UN CONCETTO RELATIVAMENTE NUOVO IN BIOLOGIA: CHE LA FORMAZIONE DI LIGNAGGI DA MECCANISMI NON MUTAZIONALI È UNA PARTE INTRICATA DELLO STILE DI VITA BATTERICO. Il PROGETTO PROPOSTA la ricerca di due tipi di meccanismi epigenetici che controllano SALMONELLA GENES RELATED TO VIRULENCE GENERANING fenotipici:_x000D_ 1. VARIAZIONE DI FASE E SISTEMI DI ESPRESSIONE GENICA BISTABILE CONTROLLATI DALLA DIGA METILACION. IL PROGETTO ANALIZZERÀ A LIVELLO MOLECOLARE IL SISTEMA DI VARIAZIONE DI FASE OPVAB, CHE GENERA SOTTOPOPOLAZIONI PHAGO-RESISTENTI E CONTROLLA LA PROLIFERAZIONE DEI MACROFAGI, E L'OPERONE FIMBRIALE STD, CHE CONTROLLA L'ADESIONE DELLA SALMONELLA ALL'EPITELIO INTESTINALE E REGOLA L'ESPRESSIONE BISTABILE DELL'ISOLA DI PATOGENICITÀ 1. INOLTRE, IL PROGETTO CARATTERIZZERÀ 20 VARIAZIONI DI FASE LOCI IDENTIFICATE DALL'ANALISI BIOINFORMATICA, MOLTI DEI QUALI CON FUNZIONE SCONOSCIUTA. IL PROGETTO PROPONE INOLTRE DI DIFFERENZIARE LA VARIAZIONE DI FASE INDIPENDENTE DALLA VARIAZIONE DI FASE COORDINATA. QUESTO TIPO DI ANALISI CONSENTIRÀ DI STIMARE LA CAPACITÀ DELLA DIGA DI METILACION DI GENERARE ETEROGENEITÀ FENOTIPICA NELLA SALMONELLA. Teoricamente, Veinte LOCI CON INDEPENDENT PHASE VARIATION può generarer 2 ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. FORMAZIONE DI LIGNAGGI INDIPENDENTI DALLA DIGA DI METILACION. DIFFERENZE TRA LE CELLULE GENERATE DAL RUMORE NEI PROMOTORI O DALL'AMPLIFICAZIONE GENETICA SOTTOPOPOLAZIONI PREADAPTAN DI CELLULE PER RESISTERE A UNA SELEZIONE LETALE (E.G. BILE). SE LO STATO CHE PERMETTE LA SOPRAVVIVENZA È PROPAGATO DA UN CICLO AUTOCATALITICO, SI FORMA UNA POPOLAZIONE DI CELLULE RESISTENTI. IL PROGETTO PROPONE LA DISSEZIONE DI TALE RISPOSTA, A CAUSA DELL'ATTIVAZIONE ETEROGENEA DELLA RISPOSTA GENERALE ALLO STRESS DIPENDENTE DAGLI RPO. Questa RISOLUZIONE CONFERENZA RESISTENZA A Bilis E PRESENTE ad altre CONDIZIONI avverse._x000D_ LA STUDIA DEL MECCANISMO che i lignaggi fenotipici GENERALI possono aiutare a comprendere i fenomens RELEVANT PER LA SALUTE UMANA COME PERSISTENZIA BATTERIALE, INFECZIONE CRONICA, EVASIONE DI DEFENSE EESSPED E RESISTENZA ANTIBATTERIALE NON mutata. Inoltre, IL PROGETTO ha applicazioni biotecnologiche:_x000D_ 1. Sviluppo di farmacie epigenetiche per la terapia antibatterica (inibitori della DAM metilasi, inibitori della variazione di fase, ETC.)._x000D_ 2. PROGETTAZIONE DELL'INGEGNO CONTROLLATA DALLA DIGA METILACION PER LA REALIZZAZIONE DI INTERRUTTORI, SENSORI, SISTEMI DI MEMORIA E ALTRI INGEGNOSI DELLA BIOLOGIA SYNTHETICA CON APPLICAZIONI BIOMEDICHE E INDUSTRIALI. (Italian)
    point in time
    16 January 2022
    0 references
    BAKTERITE LIINIDE MOODUSTUMINE EPIGENEETILISTE MEHHANISMIDE POOLT ON AKADEEMILISE HUVIGA NÄHTUS JA SEDA RAKENDATAKSE. FUNDAMENTAALBIOLOOGIA SEISUKOHAST SEAB FENOTÜÜBILISE MITMEKESISUSE OLEMASOLU KAHTLUSE ALLA TRADITSIOONILISE NÄGEMUSE BAKTERITEST KUI IDENTSUSORGANISMIDEST MOODUSTUNUD KLOONSETEST POPULATSIOONIDEST. LISAKS ON FENOTÜÜBILISTE LIINIDE MOODUSTUMISEL OLULINE ROLL PATOGEENIDE JA VÕÕRUSTAJATE VAHELISTES VASTASMÕJUDES NING BAKTERITE KOHANEMISEL MUUTUVATE JA/VÕI VAENULIKE KESKKONNATINGIMUSTEGA. SALMONELLA ENTERICA ON EPIGENEETILISTE MEHHANISMIDE UURIMISEKS SOBIV ORGANISM JÄRGMISTEL PÕHJUSTEL: I) ON ASJAKOHANE INIMPATOGEEN; II) ON GENEETILISES JA BAKTERIAALSES PATOGENEESIS ESINEV MUDELORGANISM; III) VARASEMAD UURINGUD, SEALHULGAS TAOTLEJATE RÜHMA UURINGUD, ON NÄIDANUD, ET SUGUKONNA MOODUSTUMINE ON PATOGENEESI JAOKS HÄDAVAJALIK. SALMONELLA EPIGENEETILISTE MEHHANISMIDE RÜHMA UURINGUTE JÄTKAMINE AITAB KAASA SUHTELISELT UUE KONTSEPTSIOONI LOOMISELE BIOLOOGIAS: ET LIINIDE MOODUSTUMINE MITTEMUTSIONAALSETE MEHHANISMIDE ABIL ON BAKTERIAALSE ELUVIISI KEERUKAS OSA. ETTEPANEKU otsida kahte tüüpi epigeneetilised mehhanismid, mis kontrollivad SALMONELLA GENES RELATED VIRULENCE GENERANING fenotüübiline liinid:_x000D_ 1. FAASI VARIATSIOON JA BISTABLE GEENIEKSPRESSIOONI SÜSTEEMID, MIDA KONTROLLIB METILACION TAMM. PROJEKTI KÄIGUS ANALÜÜSITAKSE MOLEKULAARTASANDIL OPVAB FAASI VARIATSIOONISÜSTEEMI, MIS LOOB PHAGO SUHTES RESISTENTSEID ALAMPOPULATSIOONE JA KONTROLLIB VOHAMIST MAKROFAAGIDES, NING OPEROONI FIMBRIAALSET STD-D, MIS KONTROLLIB SALMONELLOOSI ADHESIOONI SOOLE EPITEELIGA JA REGULEERIB PATOGEENSUSE 1 SAARE BISTABLE EKSPRESSIOONI. LISAKS ISELOOMUSTAB PROJEKT BIOINFORMAATILISE ANALÜÜSI ABIL KINDLAKS TEHTUD 20 FAASI VARIATSIOONI LOCI, MILLEST PALJUD ON TUNDMATU FUNKTSIOONIGA. PROJEKTIS TEHAKSE KA ETTEPANEK ERISTADA SÕLTUMATUT FAASI VARIATSIOONI KOORDINEERITUD FAASI VARIATSIOONIST. SEDA TÜÜPI ANALÜÜS VÕIMALDAB HINNATA METILACION’I EMASLOOMA VÕIMET TEKITADA SALMONELLA FENOTÜÜBILIST HETEROGEENSUST. Teoreetiliselt, Veinte LOCI WITH INDEPENDENT PHASE VARIATION CAN generar 2(ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. LIINIDE MOODUSTAMINE, MIS ON SÕLTUMATUD METILACION’I TAMMIST. ERINEVUSED RAKKUDE VAHEL, MIDA TEKITAVAD MÜRA PROMOOTORITES VÕI GEENNE VÕIMENDAMINE PREADAPTAN RAKKUDE ALAMPOPULATSIOONIDES, ET SEISTA VASTU SURMAVALE VALIKULE (E.G. SAPILE). KUI ELLUJÄÄMIST VÕIMALDAV RIIK LEVIB AUTOCATALITICO AHELA KAUDU, MOODUSTUB RESISTENTSETE RAKKUDE POPULATSIOON. PROJEKTIS TEHAKSE ETTEPANEK SELLISE REAGEERIMISE DISSEKTEERIMISEKS, KUNA RPODEST SÕLTUVALE STRESSILE REAGEERITAKSE EBAÜHTLASELT. See RESPONSE CONFERENCE RESISTANCE Bilis JA PRESENT MUUD KÄESOLEVAGA KONDITSIOONID._x000D_MECHANISMS, et GENERALaalsed fenotüübilised liinid võivad aidata mõista RELEVANT fenomens IMMAN HEALTH AS BACTERIAL PERSISTENCE, krooniline INFECTION, HESSPED DEFENSES EVASION JA NON-mutatsiooniline ANTIBACTERIAL RESISTANCE. Lisaks on PROJECTil biotehnoloogilised rakendused:_x000D_ 1. Epigeneetilise apteekide arendamine antibakteriaalseks raviks (DAM-metüülaasi inhibiitorid, faasimuutuste inhibiitorid, ETC.)._x000D_ 2. METILACION’I TAMMI JUHITAVA LEIDLIKKUSE PROJEKTEERIMINE, ET EHITADA BIOMEDITSIINILISTE JA TÖÖSTUSLIKE RAKENDUSTEGA BIOMEDITSIINILISTE JA TÖÖSTUSLIKE RAKENDUSTEGA LÜLITID, ANDURID, MÄLUSÜSTEEMID JA MUUD BIOMEDITSIINILISED JA TÖÖSTUSLIKUD RAKENDUSED. (Estonian)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    BAKTERIJŲ LINIJŲ SUSIDARYMAS EPIGENETINIAIS MECHANIZMAIS YRA REIŠKINYS, TURINTIS AKADEMINĮ SUSIDOMĖJIMĄ IR TAIKOMAS. PAGRINDINĖS BIOLOGIJOS POŽIŪRIU FENOTIPINĖS ĮVAIROVĖS EGZISTAVIMAS KELIA SUNKUMŲ TRADICINIAM BAKTERIJŲ, KAIP KLONŲ POPULIACIJŲ, KURIAS SUDARO TAPATYBĖS ORGANIZMAI, VIZIJAI. BE TO, FENOTIPINIŲ LINIJŲ SUSIDARYMAS VAIDINA SVARBŲ VAIDMENĮ PATOGENŲ IR ŠEIMININKO SĄVEIKAI IR BAKTERIJŲ PRISITAIKYMUI PRIE BESIKEIČIANČIŲ IR (ARBA) PRIEŠIŠKŲ APLINKOS SĄLYGŲ. SALMONELLA ENTERICA YRA TINKAMAS ORGANIZMAS EPIGENETINIŲ MECHANIZMŲ TYRIMAMS DĖL ŠIŲ PRIEŽASČIŲ: I) YRA SVARBUS ŽMOGAUS PATOGENAS; II) YRA GENETINĖS IR BAKTERINĖS PATOGENEZĖS PAVYZDINIS ORGANIZMAS; III) ANKSTESNI TYRIMAI, ĮSKAITANT PAREIŠKĖJŲ GRUPĖS TYRIMUS, PARODĖ, KAD GIMINYSTĖS LINIJOS FORMAVIMASIS YRA BŪTINAS PATOGENEZEI. TĘSIAMI SALMONELIŲ EPIGENETINIŲ MECHANIZMŲ GRUPĖS TYRIMAI PADĖS SUKURTI PALYGINTI NAUJĄ BIOLOGIJOS KONCEPCIJĄ: KAD GIMINYSTĖS SUSIDARYMAS NEMUTACINIAIS MECHANIZMAIS YRA SUDĖTINGA BAKTERINIO GYVENIMO BŪDO DALIS. PROJEKTAS ieško dviejų tipų epigenetinių mechanizmų, kurie kontroliuoja SALMONELLA GENES RELATED į VIRULENCE GENERANING fenotipines linijas:_x000D_ 1. FAZĖS VARIACIJOS IR BISTABLE GENŲ EKSPRESIJOS SISTEMOS, KONTROLIUOJAMOS METILACION UŽTVANKOS. ĮGYVENDINANT PROJEKTĄ MOLEKULINIU LYGMENIU BUS ANALIZUOJAMA OPVAB FAZIŲ VARIACIJOS SISTEMA, KURI GENERUOJA PHAGO ATSPARIAS SUBPOPULIACIJAS IR KONTROLIUOJA MAKROFAGŲ PROLIFERACIJĄ, IR OPERONO FIMBRIALUS STD, KURIS KONTROLIUOJA SALMONELLA SUKIBIMĄ SU ŽARNYNO EPITELIU IR REGULIUOJA PATOGENIŠKUMO SALOS BISTABLEINĘ EKSPRESIJĄ 1. BE TO, PROJEKTAS APIBŪDINS 20 FAZIŲ VARIACIJOS LOCI, NUSTATYTĄ BIOINFORMATIKOS ANALIZĖS, DAUGELIS IŠ JŲ SU NEŽINOMOS FUNKCIJOS. PROJEKTE TAIP PAT SIŪLOMA ATSKIRTI NEPRIKLAUSOMO ETAPO SKIRTUMUS NUO KOORDINUOTO ETAPO VARIACIJOS. TOKIO TIPO ANALIZĖ LEIS ĮVERTINTI METILACION UŽTVANKOS GEBĖJIMĄ GENERUOTI SALMONELLA FENOTIPINĮ HETEROGENIŠKUMĄ. Teoriškai, Veinte LOCI SU INDEPENDENT PHASE VARIATION CAN generar (ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. NUO METILACION UŽTVANKOS NEPRIKLAUSOMOS LINIJOS FORMAVIMAS. SKIRTUMAI TARP LĄSTELIŲ, SUSIDARANČIŲ DĖL TRIUKŠMO AKTYVATORIŲ ARBA LĄSTELIŲ GENINĖS AMPLIFIKACIJOS PREADAPTAN SUBPOPULIACIJOS, KAD ATSISPIRTŲ MIRTINAI ATRANKAI (E.G. TULŽIS). JEI VALSTYBĖ, KURI LEIDŽIA IŠGYVENTI, YRA PADAUGINTA AUTOCATALITICO KILPA, SUSIDARO ATSPARIŲ LĄSTELIŲ POPULIACIJA. PROJEKTE SIŪLOMA IŠPJAUSTYTI TOKĮ ATSAKĄ DĖL NEVIENALYČIO NUO RPO PRIKLAUSOMO BENDRO ATSAKO Į STRESĄ AKTYVAVIMO. Šis PRIEŽIŪROS KONFERENCIJA Į Bilis ir PRESENT KITĄ neigiamą SĄLYGOS._x000D_ MECHANISMS STUDIJA, kad GENERAL fenotipiniai linijos gali padėti suprasti RELEVANT fenomenus ŽMONĖ SVEIKATOS, kaip Bakterinė PERSISTENCIJA, lėtinis INFECTION, NUSTATYTI DEFENSES EVASION IR NON-mutacinė ANTIBACTERIAL RESISTANCIJA. Be to, PROJEKTAS turi biotechnologinius pritaikymus:_x000D_ 1. Epigenetinių vaistinių kūrimas antibakteriniam gydymui (DAM metilazės inhibitoriai, fazės variacijos inhibitoriai, ETC.)._x000D_ 2. METILACION UŽTVANKOS VALDOMO IŠRADINGUMO PROJEKTAVIMAS, SIEKIANT SUKURTI JUNGIKLIUS, JUTIKLIUS, ATMINTIES SISTEMAS IR KITUS BIOLOGIA SYNTHETICA IŠRADINGUMĄ BIOMEDICINOS IR PRAMONĖS REIKMĖMS. (Lithuanian)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    STVARANJE BAKTERIJSKIH LOZA EPIGENETSKIM MEHANIZMIMA FENOMEN JE S AKADEMSKIM INTERESOM I PRIMJENJUJE SE. S GLEDIŠTA TEMELJNE BIOLOGIJE, POSTOJANJE FENOTIPSKE RAZNOLIKOSTI DOVODI U PITANJE TRADICIONALNU VIZIJU BAKTERIJA KAO KLONSKIH POPULACIJA KOJE STVARAJU ORGANIZMI IDENTITETA. OSIM TOGA, STVARANJE FENOTIPSKIH LOZA IGRA VAŽNU ULOGU U INTERAKCIJAMA PATOGENA I DOMAĆINA TE U BAKTERIJSKE PRILAGODBE PROMJENJIVIM I/ILI NEPRIJATELJSKIM UVJETIMA OKOLIŠA. SALMONELLA ENTERICA JE PRIKLADAN ORGANIZAM ZA PROUČAVANJE EPIGENETSKIH MEHANIZAMA IZ SLJEDEĆIH RAZLOGA: (I) JE RELEVANTAN LJUDSKI PATOGEN; (II) JE MODEL ORGANIZMA U GENETSKOJ I BAKTERIJSKE PATOGENEZE; (III) PRETHODNA ISPITIVANJA, UKLJUČUJUĆI STUDIJE SKUPINE KOJA JE PODNIJELA ZAHTJEV, POKAZALA SU DA JE STVARANJE LOZE KLJUČNO ZA PATOGENEZU. NASTAVAK STUDIJA SKUPINE O EPIGENETSKIM MEHANIZMIMA U SALMONELI DOPRINIJET ĆE USPOSTAVI RELATIVNO NOVOG KONCEPTA U BIOLOGIJI: DA JE STVARANJE LOZA NEMUTACIJSKIM MEHANIZMIMA ZAMRŠEN DIO BAKTERIJSKOG NAČINA ŽIVOTA. PROJEKT POTVRĐUJE potragu za dvije vrste epigenetskih mehanizama koji kontroliraju SALMONELLA GENES RELATED NA VIRULENCE OPERANING fenotipske linije:_x000D_ 1. FAZNE VARIJACIJE I BISTABILNI GENSKI EKSPRESIJSKI SUSTAVI KOJE KONTROLIRA METILACION BRANA. PROJEKT ĆE NA MOLEKULARNOJ RAZINI ANALIZIRATI OPVAB SUSTAV VARIJACIJE FAZE, KOJI GENERIRA PODPOPULACIJE OTPORNE NA PHAGO I KONTROLIRA PROLIFERACIJU U MAKROFAZIMA, I OPERON FIMBRIALNI STD, KOJI KONTROLIRA PRIANJANJE SALMONELE NA CRIJEVNI EPITEL I REGULIRA BISTABILAN IZRAZ OTOKA PATOGENOSTI 1. OSIM TOGA, PROJEKT ĆE KARAKTERIZIRATI 20 FAZNIH VARIJACIJA LOKUSA IDENTIFICIRANIH BIOINFORMATSKOM ANALIZOM, OD KOJIH MNOGI IMAJU NEPOZNATU FUNKCIJU. U PROJEKTU SE PREDLAŽE I RAZLIKOVANJE NEOVISNE VARIJACIJE FAZA OD KOORDINIRANIH PROMJENA U FAZI. OVA VRSTA ANALIZE OMOGUĆIT ĆE PROCJENU SPOSOBNOSTI BRANE METILACION DA STVARA FENOTIPSKU HETEROGENOST U SALMONELI. Teoretski, Veinte LOCI S INDEPENDENT PHASE VARIATION CAN generar 2(ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. FORMIRANJE LOZA NEOVISNO O BRANI METILACION. RAZLIKE IZMEĐU STANICA KOJE NASTAJU BUKOM U PROMOTORIMA ILI GENSKIM POJAČANJEM PREADAPTAN SUBPOPULACIJE STANICA KAKO BI SE ODUPRLI SMRTONOSNOM ODABIRU (E.G. ŽUČ). AKO SE DRŽAVA KOJA DOPUŠTA PREŽIVLJAVANJE PROPAGIRA PETLJOM AUTOCATALITICO, FORMIRA SE POPULACIJA OTPORNIH STANICA. PROJEKTOM SE PREDLAŽE DISEKCIJA TAKVOG ODGOVORA ZBOG HETEROGENE AKTIVACIJE OPĆEG ODGOVORA NA STRES KOJI OVISI O RPO-OVIMA. Ovo POTVRĐUJE KONFERENCE RESISTANCE na Bilis i PRESENT za druge nepovoljne CONDITIONS._x000D_ STUDY OF MECHANISMS da OPĆI fenotipski loza može pomoći razumjeti RELEVANT fenomene za HUMAN ZDRAVLJE kao BAKTERIJALNA PERZENCIJA, kronična INFECTION, HESSPED DEFENSES EVASION I NON-mutational ANTIBACTERIAL RESISTANCE. Osim toga, PROJECT ima biotehnološke primjene:_x000D_ 1. Razvoj epigenetskih ljekarni za antibakterijsku terapiju (inhibitori DAM-metilaze, inhibitori faznih varijacija, ETC.)._x000D_ 2. PROJEKTIRANJE DOMIŠLJATOSTI KOJU KONTROLIRA BRANA METILACION ZA IZGRADNJU PREKIDAČA, SENZORA, MEMORIJSKIH SUSTAVA I DRUGIH GENIJALNOSTI BIOLOGIA SINTETIKE S BIOMEDICINSKIM I INDUSTRIJSKIM PRIMJENAMA. (Croatian)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    Ο ΣΧΗΜΑΤΙΣΜΌΣ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΏΝ ΓΕΝΕΏΝ ΑΠΌ ΕΠΙΓΕΝΕΤΙΚΟΎΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΎΣ ΕΊΝΑΙ ΈΝΑ ΦΑΙΝΌΜΕΝΟ ΜΕ ΑΚΑΔΗΜΑΪΚΌ ΕΝΔΙΑΦΈΡΟΝ ΚΑΙ ΕΦΑΡΜΌΖΕΤΑΙ. ΑΠΌ ΤΗΝ ΆΠΟΨΗ ΤΗΣ ΘΕΜΕΛΙΏΔΟΥΣ ΒΙΟΛΟΓΊΑΣ, Η ΎΠΑΡΞΗ ΦΑΙΝΟΤΥΠΙΚΉΣ ΠΟΙΚΙΛΟΜΟΡΦΊΑΣ ΘΈΤΕΙ ΥΠΌ ΑΜΦΙΣΒΉΤΗΣΗ ΤΟ ΠΑΡΑΔΟΣΙΑΚΌ ΌΡΑΜΑ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΊΩΝ ΩΣ ΚΛΩΝΙΚΏΝ ΠΛΗΘΥΣΜΏΝ ΠΟΥ ΣΧΗΜΑΤΊΖΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΟΡΓΑΝΙΣΜΟΎΣ ΤΑΥΤΌΤΗΤΑΣ. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, Ο ΣΧΗΜΑΤΙΣΜΌΣ ΦΑΙΝΟΤΥΠΙΚΏΝ ΓΕΝΕΏΝ ΔΙΑΔΡΑΜΑΤΊΖΕΙ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌ ΡΌΛΟ ΣΤΙΣ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ ΠΑΘΟΓΌΝΟΥ-ΞΕΝΙΣΤΉ ΚΑΙ ΣΤΗ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΉ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉ ΣΤΙΣ ΜΕΤΑΒΑΛΛΌΜΕΝΕΣ Ή/ΚΑΙ ΕΧΘΡΙΚΈΣ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ. Η SALMONELLA ENTERICA ΕΊΝΑΙ ΚΑΤΆΛΛΗΛΟΣ ΟΡΓΑΝΙΣΜΌΣ ΓΙΑ ΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΕΠΙΓΕΝΕΤΙΚΏΝ ΜΗΧΑΝΙΣΜΏΝ ΓΙΑ ΤΟΥΣ ΑΚΌΛΟΥΘΟΥΣ ΛΌΓΟΥΣ: ΠΡΌΚΕΙΤΑΙ ΓΙΑ ΣΧΕΤΙΚΌ ΠΑΘΟΓΌΝΟ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑ ΓΙΑ ΤΟΝ ΆΝΘΡΩΠΟ· II) ΕΊΝΑΙ ΠΡΌΤΥΠΟΣ ΟΡΓΑΝΙΣΜΌΣ ΣΤΗ ΓΕΝΕΤΙΚΉ ΚΑΙ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΉ ΠΑΘΟΓΈΝΕΣΗ· (III) ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΕΣ ΜΕΛΈΤΕΣ, ΣΥΜΠΕΡΙΛΑΜΒΑΝΟΜΈΝΩΝ ΕΚΕΊΝΩΝ ΤΗΣ ΑΙΤΟΎΣΑΣ ΟΜΆΔΑΣ, ΈΧΟΥΝ ΔΕΊΞΕΙ ΌΤΙ Ο ΣΧΗΜΑΤΙΣΜΌΣ ΓΕΝΕΑΛΟΓΊΑΣ ΕΊΝΑΙ ΑΠΑΡΑΊΤΗΤΟΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΑΘΟΓΈΝΕΣΗ. Η ΣΥΝΈΧΙΣΗ ΤΩΝ ΜΕΛΕΤΏΝ ΤΗΣ ΟΜΆΔΑΣ ΣΧΕΤΙΚΆ ΜΕ ΤΟΥΣ ΕΠΙΓΕΝΕΤΙΚΟΎΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΎΣ ΣΤΗ ΣΑΛΜΟΝΈΛΑ ΘΑ ΣΥΜΒΆΛΕΙ ΣΤΗ ΔΗΜΙΟΥΡΓΊΑ ΜΙΑΣ ΣΧΕΤΙΚΆ ΝΈΑΣ ΑΝΤΊΛΗΨΗΣ ΣΤΗ ΒΙΟΛΟΓΊΑ: ΌΤΙ Ο ΣΧΗΜΑΤΙΣΜΌΣ ΓΕΝΕΑΛΟΓΊΑΣ ΑΠΌ ΜΗ ΜΕΤΑΛΛΑΞΙΑΚΟΎΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΎΣ ΕΊΝΑΙ ΈΝΑ ΠΕΡΊΠΛΟΚΟ ΜΈΡΟΣ ΤΟΥ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΟΎ ΤΡΌΠΟΥ ΖΩΉΣ. Το ΕΡΓΟ ΠΡΟΤΕΙΝΕΙ την αναζήτηση δύο τύπων επιγενετικών μηχανισμών που ελέγχουν τους ΓΕΝΕΣ SALMONELLA ΣΧΕΤΙΚΑ ΜΕ ΤΗ ΒΙΟΜΗΧΑΝΙΑ ΓΕΝΙΚΗΣ ΦΕΝΟΔΟΤΗΓΙΑΣ:_x000D_ 1. ΣΥΣΤΉΜΑΤΑ ΓΟΝΙΔΙΑΚΉΣ ΈΚΦΡΑΣΗΣ ΠΟΥ ΕΛΈΓΧΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟ ΦΡΆΓΜΑ METILACION. ΤΟ ΈΡΓΟ ΘΑ ΑΝΑΛΎΣΕΙ ΣΕ ΜΟΡΙΑΚΌ ΕΠΊΠΕΔΟ ΤΟ ΣΎΣΤΗΜΑ ΔΙΑΚΥΜΆΝΣΕΩΝ ΦΆΣΗΣ OPVAB, ΤΟ ΟΠΟΊΟ ΠΑΡΆΓΕΙ ΥΠΟΠΛΗΘΥΣΜΟΎΣ ΑΝΘΕΚΤΙΚΟΎΣ ΣΤΟ PHAGO ΚΑΙ ΕΛΈΓΧΕΙ ΤΟΝ ΠΟΛΛΑΠΛΑΣΙΑΣΜΌ ΤΩΝ ΜΑΚΡΟΦΆΓΩΝ, ΚΑΙ ΤΟ OPERON FIMBRIAL STD, ΤΟ ΟΠΟΊΟ ΕΛΈΓΧΕΙ ΤΗΝ ΠΡΌΣΦΥΣΗ ΤΗΣ ΣΑΛΜΟΝΈΛΑΣ ΣΤΟ ΕΝΤΕΡΙΚΌ ΕΠΙΘΉΛΙΟ ΚΑΙ ΡΥΘΜΊΖΕΙ ΤΗΝ ΔΙΣΤΆΣΙΜΗ ΈΚΦΡΑΣΗ ΤΟΥ ΝΗΣΙΟΎ ΠΑΘΟΓΈΝΕΙΑΣ 1. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΤΟ ΈΡΓΟ ΘΑ ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΣΕΙ ΤΟΥΣ ΤΌΠΟΥΣ ΔΙΑΚΎΜΑΝΣΗΣ 20 ΦΆΣΕΩΝ ΠΟΥ ΠΡΟΣΔΙΟΡΊΖΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ, ΠΟΛΛΈΣ ΑΠΌ ΤΙΣ ΟΠΟΊΕΣ ΈΧΟΥΝ ΆΓΝΩΣΤΗ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΑ. ΤΟ ΣΧΈΔΙΟ ΠΡΟΤΕΊΝΕΙ ΕΠΊΣΗΣ ΤΗ ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΊΗΣΗ ΤΗΣ ΑΝΕΞΆΡΤΗΤΗΣ ΦΆΣΗΣ ΑΠΌ ΤΗ ΣΥΝΤΟΝΙΣΜΈΝΗ ΔΙΑΚΎΜΑΝΣΗ ΤΗΣ ΦΆΣΗΣ. ΑΥΤΌ ΤΟ ΕΊΔΟΣ ΑΝΆΛΥΣΗΣ ΘΑ ΕΠΙΤΡΈΨΕΙ ΤΗΝ ΕΚΤΊΜΗΣΗ ΤΗΣ ΙΚΑΝΌΤΗΤΑΣ ΤΟΥ ΦΡΆΓΜΑΤΟΣ METILACION ΝΑ ΠΑΡΆΓΕΙ ΦΑΙΝΟΤΥΠΙΚΉ ΕΤΕΡΟΓΈΝΕΙΑ ΣΤΗ ΣΑΛΜΟΝΈΛΑ. Θεωρητικά, Veinte LOCI ΜΕ INDEPENDENT PHASE VARIATION ΜΠΟΡΕΙ generar 2(ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. ΣΧΗΜΑΤΙΣΜΌΣ ΓΕΝΕΑΛΟΓΏΝ ΑΝΕΞΆΡΤΗΤΩΝ ΑΠΌ ΤΟ ΦΡΆΓΜΑ METILACION. ΔΙΑΦΟΡΈΣ ΜΕΤΑΞΎ ΤΩΝ ΚΥΤΤΆΡΩΝ ΠΟΥ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟ ΘΌΡΥΒΟ ΣΤΟΥΣ ΥΠΟΚΙΝΗΤΈΣ Ή ΑΠΌ ΤΗΝ ΕΝΊΣΧΥΣΗ ΤΟΥ ΓΟΝΙΚΟΎ ΥΠΟΠΛΗΘΥΣΜΟΎ ΚΥΤΤΆΡΩΝ PREADAPTAN ΓΙΑ ΝΑ ΑΝΤΙΣΤΑΘΟΎΝ ΣΕ ΜΙΑ ΘΑΝΑΤΗΦΌΡΑ ΕΠΙΛΟΓΉ (Π.Χ. ΧΟΛΉ). ΕΆΝ ΤΟ ΚΡΆΤΟΣ ΠΟΥ ΕΠΙΤΡΈΠΕΙ ΤΗΝ ΕΠΙΒΊΩΣΗ ΠΟΛΛΑΠΛΑΣΙΆΖΕΤΑΙ ΑΠΌ ΒΡΌΧΟ AUTOCATALITICO, ΣΧΗΜΑΤΊΖΕΤΑΙ ΠΛΗΘΥΣΜΌΣ ΑΝΘΕΚΤΙΚΏΝ ΚΥΤΤΆΡΩΝ. ΤΟ ΈΡΓΟ ΠΡΟΤΕΊΝΕΙ ΤΟΝ ΤΕΜΑΧΙΣΜΌ ΜΙΑΣ ΤΈΤΟΙΑΣ ΑΝΤΊΔΡΑΣΗΣ, ΛΌΓΩ ΤΗΣ ΕΤΕΡΟΓΕΝΟΎΣ ΕΝΕΡΓΟΠΟΊΗΣΗΣ ΤΗΣ ΓΕΝΙΚΉΣ ΑΝΤΊΔΡΑΣΗΣ ΣΤΟ ΆΓΧΟΣ ΠΟΥ ΕΞΑΡΤΆΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟΥΣ RPO. Η ΔΙΑΤΑΞΗ ΤΩΝ ΜΕΧΑΝΙΣΜΑΤΩΝ ότι οι γενεαλογικές φαινοτυπικές γενεές μπορούν να βοηθήσουν στην κατανόηση των ΑΝΘΡΩΠΙΝΩΝ ΦΕΝΟΤΥΠΩΝ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΘΡΩΠΙΝΗ ΥΓΕΙΑ ΩΣ ΒΑΘΜΙΚΗ ΠΡΟΣΟΧΗ, χρόνια ΕΝΗΜΕΡΩΣΗ, ΕΦΑΡΜΟΓΕΣ ΑΝΑΠΤΥΞΗΣ ΚΑΙ ΜΗ ΤΡΟΠΟΠΟΙΗΤΙΚΗ ΔΙΑΤΑΞΗ. Εξάλλου, το ΕΡΓΟ έχει βιοτεχνολογικές εφαρμογές:_x000D_ 1. Ανάπτυξη επιγενετικών φαρμακείων για αντιβακτηριακή θεραπεία (αναστολείς DAM μεθυλάσης, αναστολείς μεταβολής φάσης, ETC.)._x000D_ 2. ΣΧΕΔΙΑΣΜΌΣ ΕΦΕΥΡΕΤΙΚΌΤΗΤΑΣ ΠΟΥ ΕΛΈΓΧΕΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟ ΦΡΆΓΜΑ METILACION ΓΙΑ ΤΗΝ ΚΑΤΑΣΚΕΥΉ ΔΙΑΚΟΠΤΏΝ, ΑΙΣΘΗΤΉΡΩΝ, ΣΥΣΤΗΜΆΤΩΝ ΜΝΉΜΗΣ ΚΑΙ ΆΛΛΩΝ ΕΦΕΥΡΕΤΙΚΏΝ ΕΦΑΡΜΟΓΏΝ ΤΗΣ BIOLOGIA SYNTHETICA ΜΕ ΒΙΟΪΑΤΡΙΚΈΣ ΚΑΙ ΒΙΟΜΗΧΑΝΙΚΈΣ ΕΦΑΡΜΟΓΈΣ. (Greek)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    TVORBA BAKTERIÁLNYCH LÍNIÍ EPIGENETICKÝMI MECHANIZMAMI JE JAVOM S AKADEMICKÝM ZÁUJMOM A APLIKOVANÝM. Z HĽADISKA ZÁKLADNEJ BIOLÓGIE EXISTENCIA FENOTYPOVEJ ROZMANITOSTI SPOCHYBŇUJE TRADIČNÚ VÍZIU BAKTÉRIÍ AKO KLONOVÝCH POPULÁCIÍ TVORENÝCH IDENTICKÝMI ORGANIZMAMI. OKREM TOHO TVORBA FENOTYPOVÝCH LÍNIÍ ZOHRÁVA DÔLEŽITÚ ÚLOHU PRI INTERAKCII PATOGÉN – HOSTITEĽ A PRI ADAPTÁCII BAKTÉRIÍ NA MENIACE SA A/ALEBO NEPRIATEĽSKÉ PODMIENKY PROSTREDIA. SALMONELLA ENTERICA JE VHODNÝ ORGANIZMUS NA ŠTÚDIUM EPIGENETICKÝCH MECHANIZMOV Z TÝCHTO DÔVODOV: I) JE RELEVANTNÝM ĽUDSKÝM PATOGÉNOM; II) JE MODELOVÝ ORGANIZMUS V GENETICKEJ A BAKTERIÁLNEJ PATOGENÉZE; III) PREDCHÁDZAJÚCE ŠTÚDIE VRÁTANE ŠTÚDIÍ SKUPINY ŽIADATEĽOV UKÁZALI, ŽE TVORBA LÍNIE JE NEVYHNUTNÁ PRE PATOGENÉZU. POKRAČOVANIE ŠTÚDIÍ SKUPINY O EPIGENETICKÝCH MECHANIZMOCH U SALMONELLA PRISPEJE K VYTVORENIU RELATÍVNE NOVEJ KONCEPCIE V BIOLÓGII: ŽE TVORBA LÍNIÍ NEMUTAČNÝMI MECHANIZMAMI JE ZLOŽITOU SÚČASŤOU BAKTERIÁLNEHO SPÔSOBU ŽIVOTA. PROJEKT VYZÝVA hľadanie dvoch typov epigenetických mechanizmov, ktoré ovládajú SALMONELLA GENES RELATED NA VIRULENCE GENERANING fenotypové línie:_x000D_ 1. FÁZOVÉ VARIÁCIE A SYSTÉMY BISTABLE GÉNOVEJ EXPRESIE KONTROLOVANÉ MATKOU METILACION. PROJEKT BUDE ANALYZOVAŤ NA MOLEKULÁRNEJ ÚROVNI SYSTÉM VARIÁCIÍ FÁZY OPVAB, KTORÝ VYTVÁRA PHAGO REZISTENTNÉ SUBPOPULÁCIE A KONTROLUJE PROLIFERÁCIU V MAKROFÁGOCH, A OPERÓNOVÚ FIMBRIÁLNU STD, KTORÁ KONTROLUJE PRIĽNAVOSŤ SALMONELY K ČREVNÉMU EPITELU A REGULUJE BISTABLE EXPRESIU OSTROVA PATOGENITY 1. OKREM TOHO BUDE PROJEKT CHARAKTERIZOVAŤ 20 FÁZOVÉ VARIÁCIE LOCI IDENTIFIKOVANÉ BIOINFORMATICKOU ANALÝZOU, MNOHÉ Z NICH S NEZNÁMOU FUNKCIOU. V PROJEKTE SA TAKISTO NAVRHUJE ODLÍŠIŤ NEZÁVISLÚ FÁZU OD ODCHÝLKY KOORDINOVANEJ FÁZY. TENTO TYP ANALÝZY UMOŽNÍ ODHADNÚŤ SCHOPNOSŤ MATKY METILACION VYTVÁRAŤ FENOTYPOVÚ HETEROGENITU SALMONELY. Teoreticky, Veinte LOCI s INDEPENDENT PHASE VARIATION CAN generar 2 (ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. VYTVORENIE LÍNIÍ NEZÁVISLE OD PRIEHRADY METILACION. ROZDIELY MEDZI BUNKAMI GENEROVANÝMI HLUKOM V PROMÓTOROCH ALEBO GÉNOVOU AMPLIFIKÁCIOU PREADAPTAN SUBPOPULÁCIAMI BUNIEK, ABY ODOLALI SMRTIACEJ SELEKCII (E.G. ŽLČ). AK SA ŠTÁT, KTORÝ UMOŽŇUJE PREŽITIE, ŠÍRI SLUČKOU AUTOCATALITICO, VYTVORÍ SA POPULÁCIA REZISTENTNÝCH BUNIEK. V PROJEKTE SA NAVRHUJE ROZPUSTENIE TAKEJTO REAKCIE Z DÔVODU RÔZNORODEJ AKTIVÁCIE VŠEOBECNEJ REAKCIE NA STRES V ZÁVISLOSTI OD RPO. Tento RESPONSE CONFERENCE REZISTANCE K BILIZÁCII A PREDHODNUTIA ĎALŠIEHO PODMIENKY._x000D_ ŠTUDY MECHANZÍCIE, že GENERAL fenotypové línie môžu pomôcť pochopiť RELEVANT fenomény pre ĽUDSKÉ ZDRAVIE ako BACTERIAL PERSISTENCE, chronická INFECTION, HESSPED DEFENSES EVASION A NON-mutačný ANTIBACTERIAL RESISTANCE. Okrem toho má PROJECT biotechnologické aplikácie:_x000D_ 1. Vývoj epigenetických lekární na antibakteriálnu liečbu (inhibítory DAM metylázy, inhibítory variácie fázy, ETC.)._x000D_ 2. NÁVRH VYNALIEZAVOSTI RIADENEJ PRIEHRADOU METILACION NA ZOSTAVENIE PREPÍNAČOV, SENZOROV, PAMÄŤOVÝCH SYSTÉMOV A INÝCH VYNALIEZAVOSTI BIOLOGIA SYNTHETICA S BIOMEDICÍNSKYMI A PRIEMYSELNÝMI APLIKÁCIAMI. (Slovak)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    BAKTEERIEN MUODOSTUMINEN EPIGENEETTISTEN MEKANISMIEN AVULLA ON AKATEEMISEN MIELENKIINNON ILMIÖ JA SITÄ SOVELLETAAN. PERUSTAVANLAATUISEN BIOLOGIAN NÄKÖKULMASTA FENOTYYPPISEN MONIMUOTOISUUDEN OLEMASSAOLO HAASTAA PERINTEISEN NÄKEMYKSEN BAKTEEREISTA IDENTITEETIN ELIÖIDEN MUODOSTAMANA KLONAALIPOPULAATIONA. LISÄKSI FENOTYYPPISILLÄ LINJOILLA ON MERKITTÄVÄ ROOLI PATOGEENI-ISÄNTÄVUOROVAIKUTUKSESSA JA BAKTEERIEN SOPEUTUMISESSA MUUTTUVIIN JA/TAI VIHAMIELISIIN YMPÄRISTÖOLOSUHTEISIIN. SALMONELLA ENTERICA ON SOPIVA ORGANISMI EPIGENEETTISTEN MEKANISMIEN TUTKIMISEEN SEURAAVISTA SYISTÄ: I) ON MERKITYKSELLINEN IHMISEN TAUDINAIHEUTTAJA; II) ON GENEETTISEN JA BAKTEERIPATOGENEESIN MALLIORGANISMI; III) AIEMMAT TUTKIMUKSET, MUKAAN LUKIEN HAKIJARYHMÄN TUTKIMUKSET, OVAT OSOITTANEET, ETTÄ SUKUSOLUJEN MUODOSTUMINEN ON VÄLTTÄMÄTÖNTÄ PATOGENEESILLE. SALMONELLAN EPIGENEETTISIÄ MEKANISMEJA KÄSITTELEVÄN RYHMÄN TUTKIMUSTEN JATKAMINEN EDISTÄÄ SUHTEELLISEN UUDEN BIOLOGIAN KÄSITTEEN LUOMISTA: ETTÄ SUKUSOLUJEN MUODOSTUMINEN EI-MUTAATIOMEKANISMIEN AVULLA ON MONIMUTKAINEN OSA BAKTEERIEN ELÄMÄNTAPAA. HYVÄKSY, että etsitään kahdentyyppisiä epigeneettisiä mekanismeja, jotka ohjaavat SALMONELLA GENES RELATED TO VIRULENCE GENERANING fenotyypin linjat:_x000D_ 1. FAASIVARIAATIO JA BISTABLE GEENIN ILMENTYMISJÄRJESTELMÄT OHJATAAN METILACION PATO. HANKKEESSA ANALYSOIDAAN MOLEKYYLITASOLLA OPVAB-VAIHEEN VARIAATIOJÄRJESTELMÄÄ, JOKA TUOTTAA FAGORESISTENTTIÄ ALAPOPULAATIOITA JA VALVOO MAKROFAGIEN LEVIÄMISTÄ, SEKÄ OPERON FIMBRIAALISTA STD:TÄ, JOKA OHJAA SALMONELLAN TARTTUMISTA SUOLISTOEPITEELIIN JA SÄÄTELEE PATOGEENISUUDEN SAAREN BISTABLE ILMENTYMISTÄ 1. LISÄKSI HANKKEESSA LUONNEHDITAAN 20 VAIHEEN VAIHTELUA, JOTKA ON TUNNISTETTU BIOINFORMAATTISELLA ANALYYSILLA, JA MONET NIISTÄ, JOIDEN TOIMINTA EI OLE TIEDOSSA. HANKKEESSA EHDOTETAAN MYÖS, ETTÄ RIIPPUMATON VAIHEVAIHTELU EROTETAAN KOORDINOIDUSTA VAIHEVAIHTELUSTA. TÄMÄNTYYPPISEN ANALYYSIN AVULLA VOIDAAN ARVIOIDA METILACION-PADON KYKYÄ TUOTTAA FENOTYYPPISTÄ HETEROGEENISUUTTA SALMONELLASSA. Teoreettisesti, Veinte LOCI kanssa INDEPENDENT PHASE VARIATION CAN generar 2ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. MUODOSTUMINEN LINJAT RIIPPUMATON METILACION PADOSTA. EROT SOLUJEN VÄLILLÄ, JOTKA SYNTYVÄT PROMOOTTORIEN MELUSTA TAI SOLUJEN GEENIVAHVISTUKSESTA PREADAPTAN-ALAPOPULAATIOISTA, JOTKA VASTUSTAVAT TAPPAVAA VALINTAA (ESIM. SAPPI). JOS ELOONJÄÄMISEN MAHDOLLISTAVA VALTIO LEVIÄÄ AUTOCATALITICO-SILMUKAN AVULLA, MUODOSTUU VASTUSTUSKYKYISTEN SOLUJEN POPULAATIO. HANKKEESSA EHDOTETAAN TÄLLAISEN VASTAUKSEN LEIKKAAMISTA, KOSKA YLEINEN VASTAUS STRESSIIN ON AKTIVOITU EPÄYHTENÄISESTI RPO:ISTA RIIPPUVAN YLEISEN REAKTION VUOKSI. Tämä TUNNUSTUSTA KOSKEVAT SUOSITUKSEN TUTKIMUKSET Bilis- JA PRESENTITTEEN TUOMIOISTUIMEN TUOTTEIDEN TUOMIOISTUIMEN TUOTTEIDEN TUOTTEIDEN TUOMIOISTUIMEN KÄYTTÄMINEN KÄYTTÖMÄÄRÄT, että YLEISET fenotyyppiset linjat voivat auttaa ymmärtämään ILMAISEN TERVEYSEN TERVEYSEN PERSISTENCE, krooninen INFECTION, HESSPED DEFENSES EVASION JA NAN-mutational ANTIBACTERIAL RESISTANCE. Lisäksi, PROJECT on bioteknologisia sovelluksia:_x000D_ 1. Epigeneettisten apteekkien kehittäminen antibakteerista hoitoa varten (DAM-metyyliaasin estäjät, vaiheen vaihtelun estäjät, ETC.)._x000D_ 2. SUUNNITTELU KEKSELIÄISYYS OHJAA METILACION PAD RAKENTAA KYTKIMET, ANTURIT, MUISTIJÄRJESTELMÄT JA MUUT NEROUDET BIOLOGIA SYNTHETICA BIOLÄÄKETIETEELLISIÄ JA TEOLLISIA SOVELLUKSIA. (Finnish)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    TWORZENIE LINII BAKTERYJNYCH PRZEZ MECHANIZMY EPIGENETYCZNE JEST ZJAWISKIEM O ZNACZENIU AKADEMICKIM I STOSOWANYM. Z PUNKTU WIDZENIA BIOLOGII FUNDAMENTALNEJ ISTNIENIE RÓŻNORODNOŚCI FENOTYPOWEJ STANOWI WYZWANIE DLA TRADYCYJNEJ WIZJI BAKTERII JAKO POPULACJI KLONÓW UTWORZONYCH PRZEZ ORGANIZMY TOŻSAMOŚCI. PONADTO TWORZENIE LINII FENOTYPOWYCH ODGRYWA ISTOTNĄ ROLĘ W INTERAKCJACH PATOGEN-PRZYJACIÓŁ ORAZ W ADAPTACJI BAKTERII DO ZMIENIAJĄCYCH SIĘ I/LUB WROGICH WARUNKÓW ŚRODOWISKOWYCH. SALMONELLA ENTERICA JEST ODPOWIEDNIM ORGANIZMEM DO BADANIA MECHANIZMÓW EPIGENETYCZNYCH Z NASTĘPUJĄCYCH POWODÓW: I) JEST ISTOTNYM LUDZKIM PATOGENEM; (II) JEST ORGANIZMEM MODELOWYM W PATOGENEZIE GENETYCZNEJ I BAKTERYJNEJ; (III) POPRZEDNIE BADANIA, W TYM BADANIA GRUPY SKŁADAJĄCEJ WNIOSEK, WYKAZAŁY, ŻE TWORZENIE LINII MA ZASADNICZE ZNACZENIE DLA PATOGENEZY. KONTYNUACJA BADAŃ GRUPY NAD MECHANIZMAMI EPIGENETYCZNYMI W SALMONELLA PRZYCZYNI SIĘ DO USTANOWIENIA STOSUNKOWO NOWEJ KONCEPCJI W BIOLOGII: ŻE TWORZENIE LINII PRZEZ MECHANIZMY NIEMUTACYJNE JEST ZAWIŁĄ CZĘŚCIĄ BAKTERYJNEGO STYLU ŻYCIA. PROJEKT PROPOZYCJE poszukiwanie dwóch rodzajów mechanizmów epigenetycznych, które sterują genami SALMONELLA RELATED DO VIRULENCE GENERANING fenotypowymi liniami:_x000D_ 1. ZMIENNOŚĆ FAZ I DWUSTABILNE UKŁADY EKSPRESJI GENÓW KONTROLOWANE PRZEZ TAMĘ METILACION. PROJEKT BĘDZIE ANALIZOWAŁ NA POZIOMIE MOLEKULARNYM SYSTEM ZMIAN FAZOWYCH OPVAB, KTÓRY GENERUJE SUBPOPULACJE OPORNE NA PHAGO I KONTROLUJE PROLIFERACJĘ MAKROFAGÓW, A TAKŻE OPERONOWY FIMBRIAL STD, KTÓRY KONTROLUJE PRZYCZEPNOŚĆ SALMONELLI DO NABŁONKA JELITOWEGO I REGULUJE DWUSTABILNĄ EKSPRESJĘ WYSPY CHOROBOTWÓRCZOŚCI 1. PONADTO PROJEKT BĘDZIE CHARAKTERYZOWAŁ 20 FAZOWĄ ZMIENNOŚĆ LOCI ZIDENTYFIKOWANĄ W WYNIKU ANALIZY BIOINFORMATYCZNEJ, Z KTÓRYCH WIELE O NIEZNANEJ FUNKCJI. W RAMACH PROJEKTU PROPONUJE SIĘ RÓWNIEŻ ODRÓŻNIENIE NIEZALEŻNEJ ZMIANY FAZOWEJ OD SKOORDYNOWANEJ ZMIANY FAZY. TEN RODZAJ ANALIZY POZWOLI OSZACOWAĆ ZDOLNOŚĆ ZAPORY METILACION DO GENEROWANIA FENOTYPOWEJ HETEROGENICZNOŚCI W SALMONELLA. Teoretycznie, Veinte LOCI Z WYDARZENIEM PHASE VARIATION CAN generar 2(ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. TWORZENIE LINII NIEZALEŻNYCH OD TAMY METILACION. RÓŻNICE MIĘDZY KOMÓRKAMI GENEROWANYMI PRZEZ HAŁAS W PROMOTORACH LUB PRZEZ AMPLIFIKACJĘ GENÓW PREADAPTAN SUBPOPULACJI KOMÓREK, ABY OPRZEĆ SIĘ SELEKCJI ŚMIERTELNEJ (E.G. ŻÓŁCI). JEŻELI PAŃSTWO, KTÓRE POZWALA NA PRZETRWANIE, JEST PROPAGOWANE PRZEZ PĘTLĘ AUTOCATALITICO, POWSTAJE POPULACJA KOMÓREK OPORNYCH. W PROJEKCIE PROPONUJE SIĘ ROZWARSTWIENIE TAKIEJ REAKCJI ZE WZGLĘDU NA NIEJEDNORODNE AKTYWOWANIE OGÓLNEJ REAKCJI NA STRES W ZALEŻNOŚCI OD RPO. To RESPONSE CONFERENCE RESISTANCE to Bilis and PRESENT TO INNE niekorzystne CONDITIONS._x000D_ STUDY MECHANISMS, że rodowiska fenotypowe mogą pomóc w zrozumieniu RELEVANT fenomens FOR HUMAN HEALTH AS BACTERIAL PERSISTENCE, chroniczna INFECTION, HESSPED DEFENSES EVASION AND NON-mutational ANTIBACTERIAL RESISTANCE. Poza tym, PROJEKT posiada aplikacje biotechnologiczne:_x000D_ 1. Rozwój aptek epigenetycznych do terapii przeciwbakteryjnej (inhibitory metylazy DAM, inhibitory zmienności faz, ETC.)._x000D_ 2. PROJEKTOWANIE POMYSŁOWOŚCI KONTROLOWANEJ PRZEZ TAMĘ METILACION DO BUDOWY PRZEŁĄCZNIKÓW, CZUJNIKÓW, SYSTEMÓW PAMIĘCI I INNYCH POMYSŁOWOŚCI BIOLOGIA SYNTETYKA Z ZASTOSOWANIAMI BIOMEDYCZNYMI I PRZEMYSŁOWYMI. (Polish)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    A BAKTERIÁLIS VONALAK EPIGENETIKAI MECHANIZMUSOK ÚTJÁN TÖRTÉNŐ KIALAKULÁSA TUDOMÁNYOS ÉRDEKLŐDÉSSEL BÍRÓ JELENSÉG ÉS ALKALMAZOTT. AZ ALAPVETŐ BIOLÓGIA SZEMPONTJÁBÓL A FENOTÍPUSOS SOKFÉLESÉG MEGLÉTE MEGKÉRDŐJELEZI A BAKTÉRIUMOK HAGYOMÁNYOS LÁTÁSÁT, MINT AZ AZONOSSÁGI ORGANIZMUSOK ÁLTAL ALKOTOTT KLONÁLIS POPULÁCIÓKAT. EMELLETT A FENOTÍPUSOS TÖRZSEK KIALAKULÁSA FONTOS SZEREPET JÁTSZIK A KÓROKOZÓK ÉS A GAZDASZERVEZETEK KÖZÖTTI KÖLCSÖNHATÁSOKBAN, VALAMINT A VÁLTOZÓ ÉS/VAGY ELLENSÉGES KÖRNYEZETI FELTÉTELEKHEZ VALÓ BAKTERIÁLIS ALKALMAZKODÁSBAN. A SALMONELLA ENTERICA MEGFELELŐ SZERVEZET AZ EPIGENETIKAI MECHANIZMUSOK TANULMÁNYOZÁSÁRA A KÖVETKEZŐ OKOK MIATT: I. RELEVÁNS EMBERI KÓROKOZÓ; I. A GENETIKAI ÉS BAKTERIÁLIS PATOGENEZISBEN ELŐFORDULÓ MINTASZERVEZET; A KORÁBBI VIZSGÁLATOK, KÖZTÜK A KÉRELMEZŐ CSOPORT VIZSGÁLATAI AZT MUTATTÁK, HOGY A PATOGENEZIS SZEMPONTJÁBÓL ELENGEDHETETLEN A VONALKÉPZŐDÉS. A SZALMONELLA EPIGENETIKAI MECHANIZMUSAIVAL FOGLALKOZÓ CSOPORT TANULMÁNYAINAK FOLYTATÁSA HOZZÁJÁRUL EGY VISZONYLAG ÚJ BIOLÓGIÁS KONCEPCIÓ KIALAKÍTÁSÁHOZ: HOGY A NEM MUTÁCIÓS MECHANIZMUSOK ÁLTAL LÉTREHOZOTT VONALAK BONYOLULT RÉSZE A BAKTERIÁLIS ÉLETMÓDNAK. A PROJEKT ELJÁRJA két típusú epigenetikai mechanizmus keresését, amelyek ellenőrzik a SALMONELLA-GENES-t, amelyek a VIRULENCE GENERANING fenotípusos vonalakra vonatkoznak:_x000D_ 1. A METILACION GÁT ÁLTAL SZABÁLYOZOTT FÁZIS VARIÁCIÓS ÉS BISZTABLE GÉNEXPRESSZIÓS RENDSZEREK. A PROJEKT MOLEKULÁRIS SZINTEN ELEMZI AZ OPVAB FÁZIS VARIÁCIÓS RENDSZERÉT, AMELY PHAGO-REZISZTENS SZUBPOPULÁCIÓKAT GENERÁL, ÉS SZABÁLYOZZA A MAKROFÁGOK PROLIFERÁCIÓJÁT, VALAMINT AZ OPERON FIMBRIÁLIS STD-T, AMELY SZABÁLYOZZA A SALMONELLA BÉLHÁMHOZ VALÓ TAPADÁSÁT, ÉS SZABÁLYOZZA A PATOGENITÁS SZIGETÉNEK BIOLÓGIAI KIFEJEZŐDÉSÉT 1. EZENKÍVÜL A PROJEKT A BIOINFORMATIKUS ELEMZÉSSEL AZONOSÍTOTT 20 FÁZISÚ VARIÁCIÓS LOKUST FOGJA JELLEMEZNI, AMELYEK KÖZÜL SOKAN ISMERETLEN FUNKCIÓVAL RENDELKEZNEK. A PROJEKT AZT IS JAVASOLJA, HOGY A FÜGGETLEN SZAKASZBELI ELTÉRÉSEKET MEGKÜLÖNBÖZTESSÉK AZ ÖSSZEHANGOLT FÁZISVÁLTOZATTÓL. EZ A FAJTA ELEMZÉS LEHETŐVÉ TESZI ANNAK BECSLÉSÉT, HOGY A METILACION GÁT KÉPES-E A SALMONELLA-BAN FENOTÍPUSOS HETEROGENITÁST GENERÁLNI. Elméletileg Veinte LOCI WITH INDEPENDENT PHASE VARIATION CAN generar 2(ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. A METILACION GÁTTÓL FÜGGETLEN VONALAK KIALAKÍTÁSA. KÜLÖNBSÉGEK A SEJTEK KÖZÖTT, AMELYEKET A PROMÓTEREKBEN A ZAJ VAGY A SEJTEK GÉNERŐSÍTÉSE OKOZ, HOGY ELLENÁLLJANAK A HALÁLOS SZELEKCIÓNAK (E.G. EPE). HA A TÚLÉLÉST LEHETŐVÉ TEVŐ ÁLLAPOTOT AUTOCATALITICO HUROK SZAPORÍTJA, REZISZTENS SEJTEK POPULÁCIÓJA ALAKUL KI. A PROJEKT AZ RPO-KTÓL FÜGGŐ STRESSZRE ADOTT ÁLTALÁNOS VÁLASZ HETEROGÉN AKTIVÁLÁSA MIATT JAVASOLJA EGY ILYEN VÁLASZ BONCOLÁSÁT. Ez a Bilisre és más káros FOGYASZTÁSRA VONATKOZÓ CONFERENCE RESISTANCE._x000D_ A MECHANISMS azon része, amely szerint az általános fenotípusú vonalak segíthetnek megérteni a releváns fenomenseket az emberi egészség szempontjából, mint BACTERIALÁLIS PERSISTENCE, krónikus INFECTION, HESSPED DEFENSES EVASION ÉS NON mutációs ANTIBACTERIAL RESISTANCE. Emellett a PROJECT biotechnológiai alkalmazásokkal rendelkezik:_x000D_ 1. Epigenetikai gyógyszertárak fejlesztése antibakteriális terápiára (DAM metiláz inhibitorok, fázis variációs gátlók, ETC)._x000D_ 2. A METILACION GÁT ÁLTAL VEZÉRELT TALÁLÉKONYSÁG TERVEZÉSE A BIOLOGIA SZINTETIKUSA KAPCSOLÓINAK, SZENZORAINAK, MEMÓRIARENDSZEREINEK ÉS EGYÉB TALÁLÉKONYSÁGAINAK ÉPÍTÉSÉRE, ORVOSBIOLÓGIAI ÉS IPARI ALKALMAZÁSOKKAL. (Hungarian)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    TVORBA BAKTERIÁLNÍCH LINIÍ EPIGENETICKÝCH MECHANISMŮ JE FENOMÉNEM S AKADEMICKÝM ZÁJMEM A APLIKOVANÝM. Z HLEDISKA ZÁKLADNÍ BIOLOGIE ZPOCHYBŇUJE EXISTENCE FENOTYPOVÉ ROZMANITOSTI TRADIČNÍ VIZI BAKTERIÍ JAKO KLONOVÝCH POPULACÍ TVOŘENÝCH IDENTITNÍMI ORGANISMY. KROMĚ TOHO TVORBA FENOTYPOVÝCH LINIÍ HRAJE DŮLEŽITOU ROLI V INTERAKCÍCH PATOGENŮ A HOSTITELŮ A PŘI PŘIZPŮSOBOVÁNÍ BAKTERIÍ MĚNÍCÍM SE A/NEBO NEPŘÁTELSKÝM PODMÍNKÁM PROSTŘEDÍ. SALMONELLA ENTERICA JE VHODNÝ ORGANISMUS PRO STUDIUM EPIGENETICKÝCH MECHANISMŮ Z NÁSLEDUJÍCÍCH DŮVODŮ: I) JE RELEVANTNÍ LIDSKÝ PATOGEN; II) JE MODELOVÝ ORGANISMUS V GENETICKÉ A BAKTERIÁLNÍ PATOGENEZI; III) PŘEDCHOZÍ STUDIE, VČETNĚ STUDIÍ SKUPINY ŽADATELŮ, PROKÁZALY, ŽE TVORBA LINIE JE NEZBYTNÁ PRO PATOGENEZI. POKRAČOVÁNÍ STUDIÍ SKUPINY O EPIGENETICKÝCH MECHANISMECH U SALMONEL PŘISPĚJE K VYTVOŘENÍ RELATIVNĚ NOVÉHO KONCEPTU V BIOLOGII: ŽE TVORBA LINIÍ NEMUTAČNÍCH MECHANISMŮ JE SLOŽITOU SOUČÁSTÍ BAKTERIÁLNÍHO ZPŮSOBU ŽIVOTA. PROJECT PROPOSES hledání dvou typů epigenetických mechanismů, které kontrolují SALMONELLA GENES RELATED TO VIRULENCE GENERANING fenotypové linie:_x000D_ 1. FÁZOVÉ VARIACE A BISTABLE GEN EXPRESE SYSTÉMY ŘÍZENÉ METLACIOVOU MATKOU. PROJEKT BUDE ANALYZOVAT NA MOLEKULÁRNÍ ÚROVNI SYSTÉM VARIAČNÍ FÁZE OPVAB, KTERÝ GENERUJE SUBPOPULACE REZISTENTNÍ VŮČI PHAGO A KONTROLUJE PROLIFERACI MAKROFÁGŮ, A OPERON FIMBRIÁLNÍ STD, KTERÝ KONTROLUJE ADHEZI SALMONEL K STŘEVNÍMU EPITELU A REGULUJE BISTABLE EXPRESE OSTROVA PATOGENITY 1. KROMĚ TOHO BUDE PROJEKT CHARAKTERIZOVAT 20 FÁZOVÝCH VARIACÍ LOCI IDENTIFIKOVANÝCH BIOINFORMATICKOU ANALÝZOU, MNOHO Z NICH S NEZNÁMOU FUNKCÍ. PROJEKT ROVNĚŽ NAVRHUJE ODLIŠIT NEZÁVISLÉ ODCHÝLENÍ FÁZE OD KOORDINOVANÉHO FÁZOVÉHO ODCHÝLENÍ. TENTO TYP ANALÝZY UMOŽNÍ ODHADNOUT SCHOPNOST MATKY METILACION VYTVÁŘET FENOTYPOVOU HETEROGENITU U SALMONEL. Teoreticky, Veinte LOCI S INDEPENDENT PHASE VARIATION CAN generar (ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. TVORBA LINIÍ NEZÁVISLE NA PŘEHRADĚ METILACION. ROZDÍLY MEZI BUŇKAMI GENEROVANÝMI HLUKEM V PROMOTORECH NEBO GENOVÝM ZESÍLENÍM PREADAPTAN SUBPOPULACÍ BUNĚK PROTI SMRTÍCÍ SELEKCI (E.G. ŽLUČ). POKUD JE STÁT, KTERÝ UMOŽŇUJE PŘEŽITÍ, MNOŽEN AUTOCATALITICO SMYČKOU, VYTVOŘÍ SE POPULACE REZISTENTNÍCH BUNĚK. PROJEKT NAVRHUJE DISEKCI TAKOVÉ REAKCE V DŮSLEDKU RŮZNORODÉ AKTIVACE OBECNÉ REAKCE NA STRES V ZÁVISLOSTI NA RPO. Tato ZPRÁVA OVĚŘENÍ OBYVATELŮ A PŘEDSLUŠNÝCH OBCHODNÍCH PODMÍNKY._x000D_ STUDIE MECHANISŮ, že generální fenotypové linie mohou pomoci pochopit RELEVANT fenomeny pro lidské zdraví jako BACTERIAL PERSISTENCE, chronická INFEKCE, HESSPED DEFENSES EVASION a NON-mutational ANTIBACTERIAL RESISTANCE. Kromě toho, PROJECT má biotechnologické aplikace:_x000D_ 1. Vývoj epigenetických lékáren pro antibakteriální terapii (inhibitory DAM methylázy, inhibitory fázové variace, ETC.)._x000D_ 2. NÁVRH VYNALÉZAVOSTI ŘÍZENÉ PŘEHRADOU METILACION PRO VÝSTAVBU SPÍNAČŮ, SENZORŮ, PAMĚŤOVÝCH SYSTÉMŮ A DALŠÍCH VYNALÉZAVOSTI BIOLOGIA SYNTETICKY S BIOMEDICÍNSKOU A PRŮMYSLOVOU APLIKACÍ. (Czech)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    BAKTERIĀLO LĪNIJU VEIDOŠANĀS AR EPIĢENĒTISKAJIEM MEHĀNISMIEM IR PARĀDĪBA AR AKADĒMISKU INTERESI UN PIELIETOJUMU. NO FUNDAMENTĀLĀS BIOLOĢIJAS VIEDOKĻA FENOTIPISKĀS DAUDZVEIDĪBAS ESAMĪBA APDRAUD TRADICIONĀLO REDZĒJUMU PAR BAKTĒRIJĀM KĀ KLONU POPULĀCIJĀM, KO VEIDO IDENTITĀTES ORGANISMI. TURKLĀT FENOTIPISKO LĪNIJU VEIDOŠANĀS BŪTISKI IETEKMĒ PATOGĒNU UN SAIMNIEKORGANISMA MIJIEDARBĪBU UN BAKTĒRIJU ADAPTĀCIJU MAINĪGIEM UN/VAI NAIDĪGIEM VIDES APSTĀKĻIEM. SALMONELLA ENTERICA IR PIEMĒROTS ORGANISMS EPIĢENĒTISKO MEHĀNISMU IZPĒTEI ŠĀDU IEMESLU DĒĻ: I) IR BŪTISKS CILVĒKA PATOGĒNS; II) IR ĢENĒTISKAS UN BAKTERIĀLAS PATOĢENĒZES PARAUGS; (III) IEPRIEKŠĒJIE PĒTĪJUMI, TOSTARP PIETEIKUMA IESNIEDZĒJU GRUPAS PĒTĪJUMI, IR PARĀDĪJUŠI, KA CELIŅU VEIDOŠANĀS IR BŪTISKA PATOĢENĒZEI. SALMONELLAS EPIĢENĒTISKO MEHĀNISMU GRUPAS PĒTĪJUMU TURPINĀŠANA PALĪDZĒS IZVEIDOT SALĪDZINOŠI JAUNU BIOLOĢIJAS KONCEPCIJU: KA CELIŅU VEIDOŠANĀS AR NEMUTACIONĀLU MEHĀNISMU PALĪDZĪBU IR SAREŽĢĪTA BAKTĒRIJU DZĪVESVEIDA DAĻA. PROJEKTS APSTIPRINA divu veidu epiģenētiskus mehānismus, kas kontrolē SALMONELLA GENES RELATED TO VIRULENCE GENERANING fenotipiskās līnijas:_x000D_ 1. FĀZES VARIĀCIJAS UN BISTABLE GĒNU EKSPRESIJAS SISTĒMAS, KO KONTROLĒ METILACION AIZSPROSTS. PROJEKTS MOLEKULĀRĀ LĪMENĪ ANALIZĒS OPVAB FĀZES VARIĀCIJU SISTĒMU, KAS RADA PRET PHAGO REZISTENTU APAKŠPOPULĀCIJU UN KONTROLĒ MAKROFĀGU IZPLATĪŠANOS, UN OPERONA FIMBRIĀLO STD, KAS KONTROLĒ SALMONELLAS PIELIPŠANU ZARNU EPITĒLIJAM UN REGULĒ PATOGENITĀTES SALAS BISTABLE EKSPRESIJU 1. TURKLĀT PROJEKTS RAKSTUROS 20 FĀŽU VARIĀCIJU LOKUS, KAS IDENTIFICĒTI BIOINFORMĀTISKAJĀ ANALĪZĒ, NO KURIEM DAUDZI AR NEZINĀMU FUNKCIJU. PROJEKTĀ ARĪ IEROSINĀTS NOŠĶIRT NEATKARĪGĀS FĀZES ATŠĶIRĪBAS NO KOORDINĒTĀS FĀZES VARIĀCIJĀM. ŠĀDA VEIDA ANALĪZES ĻAUS NOVĒRTĒT METILACION AIZSPROSTA SPĒJU RADĪT SALMONELLU FENOTIPISKO NEVIENDABĪGUMU. Teorētiski, Veinte LOCI AR INDEPENDENT PHASE VARIATION CAN generar 2(ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. NO METILACION AIZSPROSTA NEATKARĪGU VEIDŅU VEIDOŠANĀS. ATŠĶIRĪBAS STARP ŠŪNĀM, KO RADA TROKSNIS INICIATOROS VAI GENOGĒNA PASTIPRINĀŠANA PREADAPTAN ŠŪNU APAKŠPOPULĀCIJĀS, LAI PRETOTOS LETĀLAI SELEKCIJAI (E.G. ŽULTS). JA VALSTI, KAS ATĻAUJ IZDZĪVOŠANU, PAVAIRO AUTOCATALITICO CILPA, VEIDOJAS REZISTENTU ŠŪNU POPULĀCIJA. PROJEKTĀ IEROSINĀTS SADALĪT ŠĀDU REAKCIJU, JO VISPĀRĒJĀ REAKCIJA UZ STRESU, KAS IR ATKARĪGS NO RPO, IR NEVIENDABĪGA. Šī RESPONSE CONFERENCE RESISTANCE TO Bilis UN PRESENT UZ CUKURA NOVĒRTĒJUMI._x000D_ MECHANISMS STUDY, ka ĢENERĀLĀS fenotipiskās līnijas var palīdzēt izprast relaksējošas fenomens For HUMAN HEALTH AS BACTERIAL PERSISTENCE, hroniskas INFECTION, HESSPED DEFENSES EVASION UN NON-mutacionālo ANTIBACTERIAL RESISTANCE. Turklāt PROJEKTS ir biotehnoloģiskais pielietojums:_x000D_ 1. Epiģenētisku aptieku attīstība antibakteriālai terapijai (DAM metilāzes inhibitori, fāzes variācijas inhibitori, ETC)._x000D_ 2. ATJAUTĪBAS DIZAINS, KO KONTROLĒ METILACION AIZSPROSTS, LAI IZVEIDOTU SLĒDŽUS, SENSORUS, ATMIŅAS SISTĒMAS UN CITAS BIOLOGIA SYNTHETICA ATJAUTĪBAS AR BIOMEDICĪNISKIEM UN RŪPNIECISKIEM LIETOJUMIEM. (Latvian)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    IS FEINIMÉAN É FOIRMIÚ LÍNEÁLACHA BAICTÉARACHA AG MEICNÍOCHTAÍ EPIGENETIC LE SPÉIS ACADÚIL AGUS CURTHA I BHFEIDHM. Ó THAOBH NA BITHEOLAÍOCHTA BUNÚSAÍ DE, CUIREANN ÉAGSÚLACHT FEINITÍOPACH DÚSHLÁN ROIMH FHÍS THRAIDISIÚNTA NA MBAICTÉAR MAR DHAONRAÍ CLÓNACHA A CHRUTHAÍONN ORGÁNAIGH AITHEANTAIS. INA THEANNTA SIN, TÁ RÓL ÁBHARTHA AG FOIRMIÚ LÍNEÁLACHA FEINITÍOPACHA IN IDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ PATAIGINE-ÓSTACH AGUS IN OIRIÚNÚ BAICTÉARACH DO DHÁLAÍ ATHRAITHEACHA AGUS/NÓ DO DHÁLAÍ NAIMHDEACHA COMHSHAOIL. IS ORGÁNACH IOMCHUÍ É SALMONELLA ENTERICA CHUN STAIDÉAR A DHÉANAMH AR SHÁSRAÍ EPIGENETIC AR NA CÚISEANNA SEO A LEANAS: (I) GUR PATAIGIN DHAONNA ÁBHARTHA É; (II) IS SAMHAIL-ORGÁNACH É I BPATAIGINÉIS GHÉINITEACH AGUS BAICTÉARACH; (III) LÉIRÍODH I STAIDÉIR A RINNEADH ROIMHE SEO, LENA N-ÁIRÍTEAR STAIDÉIR DE CHUID AN GHRÚPA IARRTHAIGH, GO BHFUIL FOIRMIÚ LÍNEÁLA RIACHTANACH LE HAGHAIDH PATAIGINÍ. MÁ LEANTAR DE STAIDÉIR AN GHRÚPA AR SHÁSRAÍ EIPITIGÉITEACHA IN SALMONELLA, CUIDEOFAR LE COINCHEAP RÉASÚNTA NUA A BHUNÚ SA BHITHEOLAÍOCHT: GUR CUID INTRICATE DEN BHEALACH MAIREACHTÁLA BAICTÉARACH É FOIRMIÚ LÍNEACHTAÍ TRÍ MHEICNÍOCHTAÍ NEAMH-MUTATIONAL. Spreagann an PROJECT an cuardach a dhéanamh ar dhá chineál meicníochtaí epigenetic a rialaíonn GENES SALMONELLA a bhaineann le líneálacha feinitíopacha GENERANING GENERANING: _x000D_ 1. ATHRÚ CÉIME AGUS CÓRAIS UM LÉIRIÚ GÉINE BISTABLE ARNA RIALÚ AG DAMBA METILACION. DÉANFAIDH AN TIONSCADAL ANAILÍS AR LEIBHÉAL MÓILÍNEACH AR AN GCÓRAS ATHRÚCHÁIN CHÉIM OPVAB, A GHINEANN FODHAONRAÍ ATÁ FRITHSHEASMHACH IN AGHAIDH PHAGO AGUS A RIALAÍONN IOMADÚ I MACROPHAGES, AGUS STD FIMBRIAL OPERON, A RIALAÍONN GREAMAITHEACHT SALMONELLA LEIS AN EPITHELIUM INTESTINAL AGUS RIALAÍONN SÉ LÉIRIÚ BISTABLE AN OILEÁIN PATAIGINEACHTA 1. INA THEANNTA SIN, BEIDH AN TIONSCADAL CHARACTERIZE LOCI ATHRÚ 20 CÉIM AITHEANTA AG ANAILÍS BIOINFORMATIC, GO LEOR ACU LE FEIDHM ANAITHNID. TÁ SÉ BEARTAITHE AG AN TIONSCADAL FREISIN IDIRDHEALÚ A DHÉANAMH IDIR AN T-ATHRÚ AR CHÉIM NEAMHSPLEÁCH AGUS AN T-ATHRÚ CÉIME COMHORDAITHE. LEIS AN GCINEÁL SEO ANAILÍSE, BEIFEAR IN ANN MEASTACHÁN A DHÉANAMH AR CHUMAS DAMBA METILACION ILCHINEÁLACHT FEINITÍOPACH A GHINIÚINT I SALMONELLA. Teoiriciúil, veinte LOCI le VARIATION PHASE INDEPENDENT CAN GENERAR 2(ELEVATED A)20ELL TIPS._x000D_ 2. FOIRMIÚ LINEAGES NEAMHSPLEÁCH AR DAMBA METILACION. DIFRÍOCHTAÍ IDIR CEALLA A GHINTEAR TRÍ THORANN I DTIONSCNÓIRÍ NÓ TRÍ FHO-DHAONRAÍ GÉINEACHA PREADAPTAN DE CHEALLA CHUN SEASAMH IN ROGHA MARFACH (E.G. BILE). MÁ TÁ AN STÁT A CHEADAÍONN MARTHANAIS IOMADAITHE AG LÚB AUTOCATALITICO, CRUTHAÍTEAR DAONRA DE CHEALLA FRITHSHEASMHACHA. MOLANN AN TIONSCADAL GO NDÉANFAÍ FREAGAIRT DEN SÓRT SIN A DHIÚLTÚ, MAR GHEALL AR GHNÍOMHACHTÚ ILCHINEÁLACH AN FHREAGRA GHINEARÁLTA AR STRUS AG BRATH AR RPOS. _X000D_ STUDY NA MEABHRAÍ gur féidir le líneálacha feinitíopacha GINEARÁLTA cabhrú le tuiscint a fháil ar fhiniméiní RELEVANT DO SLÁINTE mar Pearsanra BACTERIAL, INFECTION ainsealach, FEIDHMEANNA HESSPED EOLAÍOCHTA SAOR IN AISCE. Thairis sin, tá an PROJECT iarratais biteicneolaíochta: _x000D_ 1. Forbairt cógaslanna epigenetic le haghaidh teiripe antibacterial (coscairí methylase DAM, coscairí athrú céime, ETC.)._x000D_ 2. DEARADH INGENUITY RIALAITHE AG DAMBA METILACION A THÓGÁIL LASCA, BRAITEOIRÍ, CÓRAIS CHUIMHNE AGUS INGENUITIES EILE DE BIOLOGIA SYNTHETICA LE FEIDHMEANNA BITHLEIGHIS AGUS TIONSCLAÍOCHA. (Irish)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    NASTANEK BAKTERIJSKIH LINIJ Z EPIGENETSKIMI MEHANIZMI JE FENOMEN Z AKADEMSKIM INTERESOM IN SE UPORABLJA. Z VIDIKA TEMELJNE BIOLOGIJE OBSTOJ FENOTIPSKE RAZNOLIKOSTI IZPODBIJA TRADICIONALNO VIZIJO BAKTERIJ KOT KLONALNIH POPULACIJ, KI JIH TVORIJO IDENTITETNI ORGANIZMI. POLEG TEGA IMA TVORBA FENOTIPSKIH LINIJ POMEMBNO VLOGO PRI INTERAKCIJAH PATOGENOV IN GOSTITELJEV TER PRI PRILAGAJANJU BAKTERIJ SPREMINJAJOČIM SE IN/ALI SOVRAŽNIM OKOLJSKIM RAZMERAM. SALMONELLA ENTERICA JE PRIMEREN ORGANIZEM ZA PREUČEVANJE EPIGENETSKIH MEHANIZMOV IZ NASLEDNJIH RAZLOGOV: (I) JE POMEMBEN ČLOVEŠKI PATOGEN; (II) JE VZORČNI ORGANIZEM V GENETSKI IN BAKTERIJSKI PATOGENEZI; (III) PREDHODNE ŠTUDIJE, VKLJUČNO S TISTIMI IZ SKUPINE PREDLAGATELJEV, SO POKAZALE, DA JE TVORBA LINIJE BISTVENEGA POMENA ZA PATOGENEZO. NADALJEVANJE ŠTUDIJ SKUPINE O EPIGENETIČNIH MEHANIZMIH ZA SALMONELO BO PRISPEVALO K VZPOSTAVITVI RAZMEROMA NOVEGA KONCEPTA V BIOLOGIJI: DA JE TVORBA LINIJ Z NEMUTACIJSKIMI MEHANIZMI ZAPLETEN DEL BAKTERIJSKEGA NAČINA ŽIVLJENJA. PROJEKT PROJEKT POSTAVLJA iskanje dveh vrst epigenetskih mehanizmov, ki nadzirata SALMONELLA GENES OBVEZNOSTI VIRULENCE GENERANING fenotipske linije:_x000D_ 1. FAZNI VARIACIJSKI IN BISTABILNI GENSKI EKSPRESIJSKI SISTEMI, KI JIH NADZORUJE METILACION JEZ. PROJEKT BO NA MOLEKULARNI RAVNI ANALIZIRAL SISTEM VARIACIJE FAZE OPVAB, KI USTVARJA PODPOPULACIJE, ODPORNE NA PHAGO, IN NADZIRA PROLIFERACIJO MAKROFAGOV, TER OPERON FIMBRIAL STD, KI NADZORUJE ADHEZIJO SALMONELE NA ČREVESNI EPITELIJ IN URAVNAVA BISTABILEN IZRAZ OTOKA PATOGENOSTI 1. POLEG TEGA BO PROJEKT OPREDELIL 20 FAZNIH LOKUSOV, OPREDELJENIH Z BIOINFORMATIČNO ANALIZO, OD KATERIH JE VELIKO Z NEZNANO FUNKCIJO. PROJEKT PREDLAGA TUDI RAZLIKOVANJE MED NEODVISNIMI FAZAMI IN RAZLIKAMI V USKLAJENI FAZI. TA VRSTA ANALIZE BO OMOGOČILA OCENO SPOSOBNOSTI MATERE METILACION, DA USTVARI FENOTIPSKO HETEROGENOST SALMONELE. Teoretično, Veinte LOCI z INDEPENDENT PHASE VARIATION CAN generar 2(ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. OBLIKOVANJE LINIJ NEODVISNO OD JEZU METILACION. RAZLIKE MED CELICAMI, KI JIH POVZROČA HRUP PRI PROMOTORJIH ALI PODPOPULACIJE CELIC, KI JIH POVZROČA GENIC AMPLIFICATION PREADAPTAN, DA SE UPREJO SMRTONOSNI SELEKCIJI (E.G. ŽOLČ). ČE SE DRŽAVA, KI OMOGOČA PREŽIVETJE, RAZMNOŽUJE Z ZANKO AUTOCATALITICO, NASTANE POPULACIJA ODPORNIH CELIC. PROJEKT PREDLAGA RAZKOSANJE TAKŠNEGA ODZIVA ZARADI HETEROGENEGA AKTIVACIJE SPLOŠNEGA ODZIVA NA STRES, KI JE ODVISEN OD RPO. Ta RESPONSE CONFERENCE RESISTATION TO Bilis IN PRESENT TO DRUGI neželeni učinki._x000D_ STUDY MEHANISMS, da lahko generične fenotipske linije pomagajo razumeti RELEVANTNE fenomene za zdravje ljudi, kot so BACTERIAL PERSISTENCE, kronična INFECTION, NEPSPENZNA DEJAVNOSTI IN NON-mutational ANTIBACTERIALNE RESISTANCE. Poleg tega ima PROJEKT biotehnološke aplikacije:_x000D_ 1. Razvoj epigenetskih lekarn za antibakterijsko zdravljenje (zaviralci DAM metilaze, zaviralci variacije faz, ETC.)._x000D_ 2. OBLIKOVANJE IZNAJDLJIVOSTI POD NADZOROM JEZU METILACION ZA IZGRADNJO STIKAL, SENZORJEV, POMNILNIŠKIH SISTEMOV IN DRUGIH IZNAJDB BIOLOGIA SYNTHETICA Z BIOMEDICINSKO IN INDUSTRIJSKO UPORABO. (Slovenian)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    ОБРАЗУВАНЕТО НА БАКТЕРИАЛНИ ЛИНИИ ЧРЕЗ ЕПИГЕНЕТИЧНИ МЕХАНИЗМИ Е ФЕНОМЕН С АКАДЕМИЧЕН ИНТЕРЕС И ПРИЛОЖЕНИЕ. ОТ ГЛЕДНА ТОЧКА НА ФУНДАМЕНТАЛНАТА БИОЛОГИЯ СЪЩЕСТВУВАНЕТО НА ФЕНОТИПНО РАЗНООБРАЗИЕ ПОСТАВЯ ПРЕДИЗВИКАТЕЛСТВО ТРАДИЦИОННАТА ВИЗИЯ ЗА БАКТЕРИИТЕ КАТО КЛОНАЛНИ ПОПУЛАЦИИ, ОБРАЗУВАНИ ОТ ИНДИВИДУАЛНИ ОРГАНИЗМИ. ОСВЕН ТОВА ОБРАЗУВАНЕТО НА ФЕНОТИПНИ ЛИНИИ ИГРАЕ ВАЖНА РОЛЯ ЗА ВЗАИМОДЕЙСТВИЯТА ПАТОГЕН-ГОСТОПРИЕМНИК И ЗА БАКТЕРИАЛНАТА АДАПТАЦИЯ КЪМ ПРОМЕНЯЩИТЕ СЕ И/ИЛИ ВРАЖДЕБНИ УСЛОВИЯ НА ОКОЛНАТА СРЕДА. SALMONELLA ENTERICA Е ПОДХОДЯЩ ОРГАНИЗЪМ ЗА ИЗСЛЕДВАНЕ НА ЕПИГЕНЕТИЧНИ МЕХАНИЗМИ ПОРАДИ СЛЕДНИТЕ ПРИЧИНИ: I) Е ЗНАЧИМ ЧОВЕШКИ ПАТОГЕН; II) Е МОДЕЛ НА ОРГАНИЗЪМ ПРИ ГЕНЕТИЧНА И БАКТЕРИАЛНА ПАТОГЕНЕЗА; III) ПРЕДИШНИ ПРОУЧВАНИЯ, ВКЛЮЧИТЕЛНО ТЕЗИ ОТ ГРУПАТА ЗАЯВИТЕЛИ, ПОКАЗВАТ, ЧЕ ОБРАЗУВАНЕТО НА РОДОСЛОВНИ ЛИНИИ Е ОТ СЪЩЕСТВЕНО ЗНАЧЕНИЕ ЗА ПАТОГЕНЕЗАТА. ПРОДЪЛЖАВАНЕТО НА ИЗСЛЕДВАНИЯТА НА ГРУПАТА ЗА ЕПИГЕНЕТИЧНИ МЕХАНИЗМИ ПРИ САЛМОНЕЛА ЩЕ ДОПРИНЕСЕ ЗА СЪЗДАВАНЕТО НА ОТНОСИТЕЛНО НОВА КОНЦЕПЦИЯ В БИОЛОГИЯТА: ЧЕ ОБРАЗУВАНЕТО НА ЛИНИИ ЧРЕЗ НЕМУТАЦИОННИ МЕХАНИЗМИ Е СЛОЖНА ЧАСТ ОТ БАКТЕРИАЛНИЯ НАЧИН НА ЖИВОТ. ПРОЕКТ ПРОИЗВОДЯ търсенето на два типа епигенетични механизми, които контролират SALMONELLA GENES, свързани с генериращи фенотипни линии:_x000D_ 1. ФАЗОВО ВАРИАЦИЯ И БИСТАБИЛНА СИСТЕМА ЗА ГЕННА ЕКСПРЕСИЯ, КОНТРОЛИРАНА ОТ МАЙКАТА НА METILACION. ПРОЕКТЪТ ЩЕ АНАЛИЗИРА НА МОЛЕКУЛЯРНО НИВО СИСТЕМАТА ЗА ВАРИАЦИЯ НА ФАЗИТЕ НА OPVAB, КОЯТО ГЕНЕРИРА ФАГО-РЕЗИСТЕНТНИ СУБПОПУЛАЦИИ И КОНТРОЛИРА ПРОЛИФЕРАЦИЯТА В МАКРОФАГИТЕ, КАКТО И ОПЕРОННАТА ФИМБРИАЛНА STD, КОЯТО КОНТРОЛИРА АДХЕЗИЯТА НА САЛМОНЕЛА КЪМ ЧРЕВНИЯ ЕПИТЕЛ И РЕГУЛИРА РАЗНООБРАЗНАТА ЕКСПРЕСИЯ НА ОСТРОВА НА ПАТОГЕННОСТ 1. ОСВЕН ТОВА ПРОЕКТЪТ ЩЕ ХАРАКТЕРИЗИРА 20 ФАЗОВИ ВАРИАЦИИ, ИДЕНТИФИЦИРАНИ ЧРЕЗ БИОИНФОРМАТИЧЕН АНАЛИЗ, МНОГО ОТ КОИТО С НЕИЗВЕСТНА ФУНКЦИЯ. ПРОЕКТЪТ ПРЕДЛАГА СЪЩО ТАКА ДА СЕ РАЗГРАНИЧАТ НЕЗАВИСИМИТЕ ФАЗОВИ РАЗЛИЧИЯ ОТ КООРДИНИРАНИТЕ ФАЗОВИ ПРОМЕНИ. ТОЗИ ВИД АНАЛИЗ ЩЕ ПОЗВОЛИ ДА СЕ ОЦЕНИ СПОСОБНОСТТА НА ЯЗОВИРА METILACION ДА ГЕНЕРИРА ФЕНОТИПНА ХЕТЕРОГЕННОСТ В SALMONELLA. Теоретично, Veinte LOCI с INDEPENDENT PHASE VARIATION CAN generar 2(ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. ФОРМИРАНЕ НА ЛИНИИ, НЕЗАВИСИМИ ОТ ЯЗОВИРА METILACION. РАЗЛИКИ МЕЖДУ КЛЕТКИТЕ, ГЕНЕРИРАНИ ОТ ШУМА В ПРОМОТОРИТЕ ИЛИ ОТ ГЕННАТА АМПЛИФИКАЦИЯ PREADAPTAN СУБПОПУЛАЦИИ НА КЛЕТКИТЕ, ЗА ДА УСТОЯТ НА СМЪРТОНОСНА СЕЛЕКЦИЯ (E.G. ЖЛЪЧКА). АКО ДЪРЖАВАТА, КОЯТО ПОЗВОЛЯВА ОЦЕЛЯВАНЕТО, СЕ РАЗМНОЖАВА ЧРЕЗ КОНТУР AUTOCATALITICO, СЕ ОБРАЗУВА ПОПУЛАЦИЯ ОТ РЕЗИСТЕНТНИ КЛЕТКИ. ПРОЕКТЪТ ПРЕДЛАГА РАЗРЯЗВАНЕ НА ТАКЪВ ОТГОВОР ПОРАДИ РАЗНОРОДНОТО АКТИВИРАНЕ НА ОБЩАТА РЕАКЦИЯ НА СТРЕСА, ЗАВИСЕЩ ОТ RPO. Това ПРЕДСТАВЯНЕ КОНФЕРЕНЦИЯ НА Билис И ПРЕДСТАВЯНЕ НА ДРУГИ УСЛОВИЯ._x000D_СТУДИЯТА НА МЕШАНИТЕ, че ОБЩИТЕ фенотипни линии могат да помогнат да се разберат релевантните феномени за човешкото здраве, като бактериална ИНФЕКЦИЯ, ХЕСПЕЙСТВИЕ ЕВАСИЯ И Немутационно АНТИБАКТЕРИАЛНО РЕЗИСТАНИЕ. Освен това, проектът има биотехнологични приложения:_x000D_ 1. Развитие на епигенетични аптеки за антибактериална терапия (DAM метилазни инхибитори, инхибитори на вариация на фазите, ETC.)._x000D_ 2. ПРОЕКТИРАНЕ НА ИЗОБРЕТАТЕЛНОСТ, КОНТРОЛИРАНА ОТ ЯЗОВИРА METILACION ЗА ИЗГРАЖДАНЕ НА КЛЮЧОВЕ, СЕНЗОРИ, СИСТЕМИ ЗА ПАМЕТ И ДРУГИ ИЗОБРЕТАНИЯ НА BIOLOGIA SYNTHETICA С БИОМЕДИЦИНСКИ И ПРОМИШЛЕНИ ПРИЛОЖЕНИЯ. (Bulgarian)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    IL-FORMAZZJONI TA’ NISEL BATTERJALI PERMEZZ TA’ MEKKANIŻMI EPIĠENETIĊI HUWA FENOMENU B’INTERESS AKKADEMIKU U APPLIKAT. MIL-LAT TAL-BIJOLOĠIJA FUNDAMENTALI, L-EŻISTENZA TAD-DIVERSITÀ FENOTIPIKA TISFIDA L-VIŻJONI TRADIZZJONALI TAL-BATTERJI BĦALA POPOLAZZJONIJIET KLONALI FFURMATI MINN ORGANIŻMI TAL-IDENTITÀ. BARRA MINN HEKK, IL-FORMAZZJONI TA’ NISEL FENOTIPIĊI GĦANDHA RWOL RILEVANTI FL-INTERAZZJONIJIET PATOĠENIĊI-OSPITANTI U FL-ADATTAMENT TAL-BATTERJI GĦALL-KUNDIZZJONIJIET AMBJENTALI LI JINBIDLU U/JEW OSTILI. SALMONELLA ENTERICA HIJA ORGANIŻMU XIERAQ GĦALL-ISTUDJU TA’ MEKKANIŻMI EPIĠENETIĊI GĦAR-RAĠUNIJIET LI ĠEJJIN: (I) HUWA PATOĠENU UMAN RILEVANTI; (II) HUWA ORGANIŻMU MUDELL FIL-PATOĠENESI ĠENETIKA U BATTERIKA; (III) STUDJI PREĊEDENTI, INKLUŻI DAWK TAL-GRUPP APPLIKANT, UREW LI L-FORMAZZJONI TA’ NISEL HIJA ESSENZJALI GĦALL-PATOĠENESI. IL-KONTINWAZZJONI TAL-ISTUDJI TAL-GRUPP DWAR IL-MEKKANIŻMI EPIĠENETIĊI FIS-SALMONELLA SE TIKKONTRIBWIXXI GĦALL-ISTABBILIMENT TA’ KUNĊETT RELATTIVAMENT ĠDID FIL-BIJOLOĠIJA: LI L-FORMAZZJONI TA’ NISEL PERMEZZ TA’ MEKKANIŻMI MHUX MUTAZZJONALI HIJA PARTI KKOMPLIKATA TAL-MOD TA’ ĦAJJA BATTERIKA. Il-PROJECT JIPPROPONI t-tfittxija għal żewġ tipi ta’ mekkaniżmi epiġenetiċi li jikkontrollaw SALMONELLA ĠENERALI GĦALL-VERITÀ ĠENERALI ĠENERALI nisel fenotipiku:_x000D_ 1. SISTEMI TA’ VARJAZZJONI FIL-FAŻI U TA’ ESPRESSJONI TA’ ĠENI BISTABLE KKONTROLLATI MINN DAM METILACION. IL-PROĠETT SE JANALIZZA FIL-LIVELL MOLEKULARI S-SISTEMA TA’ VARJAZZJONI TAL-FAŻI OPVAB, LI TIĠĠENERA SUBPOPOLAZZJONIJIET REŻISTENTI GĦAL PHAGO U TIKKONTROLLA L-PROLIFERAZZJONI FIL-MAKROFAĠI, U L-STD TAL-OPERON FIMBRIJU, LI JIKKONTROLLA L-ADEŻJONI TAS-SALMONELLA MAL-EPITELJU INTESTINALI U JIRREGOLA L-ESPRESSJONI BISTABLE TAL-GŻIRA TA’ PATOĠENIĊITÀ 1. BARRA MINN HEKK, IL-PROĠETT SE JIKKARATTERIZZA 20 FAŻI TA ‘VARJAZZJONI LOCI IDENTIFIKATI PERMEZZ TA’ ANALIŻI BIJOINFORMATIKA, ĦAFNA MINNHOM B’FUNZJONI MHUX MAGĦRUFA. IL-PROĠETT JIPPROPONI WKOLL LI SSIR DISTINZJONI BEJN IL-VARJAZZJONI TAL-FAŻI INDIPENDENTI U L-VARJAZZJONI TAL-FAŻI KKOORDINATA. DAN IT-TIP TA’ ANALIŻI SE JIPPERMETTI L-ISTIMA TAL-KAPAĊITÀ TAD-DIGA METILACION LI TIĠĠENERA ETEROĠENEITÀ FENOTIPIKA FIS-SALMONELLA. Teoretikament, Veinte LOCI WITH INDEPENDENT PHASE VARIATION CAN generar 2(ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. FORMAZZJONI TA’ NISEL INDIPENDENTI MID-DIGA METILACION. ID-DIFFERENZI BEJN IĊ-ĊELLOLI ĠĠENERATI MILL-ISTORBJU FIL-PROMOTURI JEW MIS-SOTTOPOPOLAZZJONIJIET TA’ ĊELLOLI TA’ AMPLIFIKAZZJONI ĠENETIKA PREADAPTAN BIEX JIRREŻISTU GĦAŻLA LETALI (E.G. BILE). JEKK L-ISTAT LI JIPPERMETTI S-SOPRAVIVENZA JIĠI PROPAGAT MINN LOOP AUTOCATALITICO, TIĠI FFURMATA POPOLAZZJONI TA’ ĊELLOLI REŻISTENTI. IL-PROĠETT JIPPROPONI D-DISSEZZJONI TA’ TALI RISPONS, MINĦABBA L-ATTIVAZZJONI ETEROĠENA TAR-RISPONS ĠENERALI GĦALL-ISTRESS DIPENDENTI FUQ L-RPOS. Din ir-RESISTANZA TAL-KONFERENZA TAR-RIŻISTANZA GĦALL-Bilis U L-PRESENT LI KONDIZZJONIJIET B’mod avvers OĦRA._x000D_ L-ISTUDJU TAL-MECHANIŻI li l-lineages fenotipiċi ĠENERALI jistgħu jgħinu biex jifhmu fenomens RELEVANT GĦALL-ĦAŻA TAL-BNIEDEM bħala PERSISTENZJONI BATTERERIALI, INFECTION kronika, EVASJONI TA’ DEFENŻJONI HESSPED U RESISTANZA ANTIBACTERIAL mhux mutwazzjonali. Barra minn hekk, Il-PROJECT għandu applikazzjonijiet bijoteknoloġiċi:_x000D_ 1. Żvilupp ta’ spiżeriji epiġenetiċi għal terapija antibatterika (inibituri ta’ DAM methylase, inibituri ta’ varjazzjoni fil-fażi, ETC.)._x000D_ 2. DISINN TA’ INĠENWITÀ KKONTROLLATA MINN DIGA METILACION BIEX JINBNEW SWIĊĊIJIET, SENSURI, SISTEMI TA’ MEMORJA U INĠENWITAJIET OĦRA TA’ BIOLOGIA SYNTHETICA B’APPLIKAZZJONIJIET BIJOMEDIĊI U INDUSTRIJALI. (Maltese)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    A FORMAÇÃO DE LINHAGENS BACTERIANAS POR MECANISMOS EPIGENÉTICOS É UM FENÔMENO COM INTERESSE ACADÊMICO E APLICADO. DO PONTO DE VISTA DA BIOLOGIA FUNDAMENTAL, A EXISTÊNCIA DE DIVERSIDADE FENOTÍPICA DESAFIA A VISÃO TRADICIONAL DAS BACTÉRIAS COMO POPULAÇÕES CLONAIS FORMADAS POR ORGANISMOS IDENTITÁRIOS. ALÉM DISSO, A FORMAÇÃO DE LINHAGENS FENOTÍPICAS DESEMPENHA UM PAPEL RELEVANTE NAS INTERAÇÕES PATÓGENO-HOSPEDEIRO E NA ADAPTAÇÃO BACTERIANA A CONDIÇÕES AMBIENTAIS EM MUDANÇA E/OU HOSTIS. SALMONELLA ENTERICA É UM ORGANISMO ADEQUADO PARA O ESTUDO DE MECANISMOS EPIGENÉTICOS PELAS SEGUINTES RAZÕES: I) É UM AGENTE PATOGÉNICO HUMANO RELEVANTE; II) É UM ORGANISMO MODELO NA PATOGÊNESE GENÉTICA E BACTERIANA; (III) ESTUDOS ANTERIORES, INCLUINDO OS DO GRUPO REQUERENTE, DEMONSTRARAM QUE A FORMAÇÃO DE LINHAGENS É ESSENCIAL PARA A PATOGÊNESE. A CONTINUAÇÃO DOS ESTUDOS DO GRUPO SOBRE MECANISMOS EPIGENÉTICOS EM SALMONELLA CONTRIBUIRÁ PARA O ESTABELECIMENTO DE UM CONCEITO RELATIVAMENTE NOVO EM BIOLOGIA: QUE A FORMAÇÃO DE LINHAGENS POR MECANISMOS NÃO-MUTACIONAIS É UMA PARTE INTRINCADA DO MODO DE VIDA BACTERIANO. O PROJETO PROPOSTA a busca por dois tipos de mecanismos epigenéticos que controlam as GENES SALMONELLA RELATIVAS À VIRULÊNCIA GENERANING linhagens fenotípicas:_x000D_ 1. VARIAÇÃO DE FASE E SISTEMAS DE EXPRESSÃO DE GENES BISTABLE CONTROLADOS PELA BARRAGEM METILACION. O PROJETO ANALISARÁ EM NÍVEL MOLECULAR O SISTEMA DE VARIAÇÃO DE FASE OPVAB, QUE GERA SUBPOPULAÇÕES RESISTENTES A PHAGO E CONTROLA A PROLIFERAÇÃO EM MACRÓFAGOS, E A DST OPERON FIMBRIAL, QUE CONTROLA A ADESÃO DE SALMONELLA AO EPITÉLIO INTESTINAL E REGULA A EXPRESSÃO BISTABLE DA ILHA DE PATOGENICIDADE 1. ALÉM DISSO, O PROJETO IRÁ CARACTERIZAR 20 LOCI DE VARIAÇÃO DE FASE IDENTIFICADOS POR ANÁLISE BIOINFORMÁTICA, MUITOS DELES COM FUNÇÃO DESCONHECIDA. O PROJETO TAMBÉM PROPÕE DIFERENCIAR A VARIAÇÃO DE FASE INDEPENDENTE DA VARIAÇÃO DE FASE COORDENADA. ESTE TIPO DE ANÁLISE PERMITIRÁ ESTIMAR A CAPACIDADE DA BARRAGEM METILACION PARA GERAR HETEROGENEIDADE FENOTÍPICA EM SALMONELLA. Teoricamente, Veinte LOCI COM FASE INDEPENDENTE DE VARIAÇÃO PODE generar(A)20 TÉLULAS TELEMóVELS._x000D_ 2. FORMAÇÃO DE LINHAGENS INDEPENDENTES DA BARRAGEM METILACION. DIFERENÇAS ENTRE CÉLULAS GERADAS POR RUÍDO EM PROMOTORES OU POR AMPLIFICAÇÃO GÊNICA SUBPOPULAÇÕES PREADAPTAN DE CÉLULAS PARA RESISTIR A UMA SELEÇÃO LETAL (E.G. BILE). SE O ESTADO QUE PERMITE A SOBREVIVÊNCIA É PROPAGADO POR UM LOOP AUTOCATALITICO, UMA POPULAÇÃO DE CÉLULAS RESISTENTES É FORMADA. O PROJETO PROPÕE A DISSECÇÃO DE TAL RESPOSTA, DEVIDO À ATIVAÇÃO HETEROGÊNEA DA RESPOSTA GERAL AO ESTRESSE DEPENDENTE DE RPOS. Esta RESPONSE CONFERÊNCIA RESISTÊNCIA A BÍLIA E PRESENTE A OUTROS CONDIÇÕES adversas._x000D_ O ESTUDO DOS MECHANISMOs que as linhagens fenotípicas GERAIS podem ajudar a compreender fenomens RELEVANTES PARA SAÚDE HUMANA COM PERSISTÊNCIA BACTERIAL, INFEÇÃO Crônica, EVANSES HESSPEDOS E RESISTÊNCIA ANTIBACTERIAL NÃO-Mutacional. Além disso, o PROJETO tem aplicações biotecnológicas:_x000D_ 1. Desenvolvimento de farmácias epigenéticas para terapia antibacteriana (inibidores da DAM metilase, inibidores da variação de fase, ETC.)._x000D_ 2. DESIGN DE ENGENHOSIDADE CONTROLADA PELA BARRAGEM METILACION PARA CONSTRUIR COMUTADORES, SENSORES, SISTEMAS DE MEMÓRIA E OUTRAS ENGENHOS DA BIOLOGIA SYNTHETICA COM APLICAÇÕES BIOMÉDICAS E INDUSTRIAIS. (Portuguese)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    DANNELSEN AF BAKTERIELLE SLÆGTER VED EPIGENETISKE MEKANISMER ER ET FÆNOMEN MED AKADEMISK INTERESSE OG ANVENDES. MED HENSYN TIL GRUNDLÆGGENDE BIOLOGI UDFORDRER EKSISTENSEN AF FÆNOTYPISK MANGFOLDIGHED DEN TRADITIONELLE VISION AF BAKTERIER SOM KLONBESTANDE, DER DANNES AF IDENTITETSORGANISMER. DESUDEN SPILLER DANNELSEN AF FÆNOTYPISKE SLÆGTER EN RELEVANT ROLLE I SAMSPILLET MELLEM PATOGENER OG VÆRTER OG I BAKTERIETILPASNINGEN TIL SKIFTENDE OG/ELLER FJENDTLIGE MILJØFORHOLD. SALMONELLA ENTERICA ER EN EGNET ORGANISME TIL UNDERSØGELSE AF EPIGENETISKE MEKANISMER AF FØLGENDE ÅRSAGER: I) ER ET RELEVANT HUMANT PATOGEN II) ER EN MODELORGANISME I GENETISK OG BAKTERIEL PATOGENESE TIDLIGERE UNDERSØGELSER, HERUNDER UNDERSØGELSER I DEN ANSØGENDE GRUPPE, HAR VIST, AT SLÆGTSDANNELSE ER AFGØRENDE FOR PATOGENESE. FORTSÆTTELSEN AF UNDERSØGELSERNE AF GRUPPEN VEDRØRENDE EPIGENETISKE MEKANISMER I SALMONELLA VIL BIDRAGE TIL ETABLERINGEN AF ET RELATIVT NYT KONCEPT INDEN FOR BIOLOGI: AT DANNELSEN AF SLÆGTER VED IKKE-MUTATIONELLE MEKANISMER ER EN INDVIKLET DEL AF DEN BAKTERIELLE LIVSSTIL. PROJEKTERER søgningen efter to typer epigenetiske mekanismer, der kontrollerer SALMONELLA GENES RELATED TIL VIRULENCE GENERANING fænotypiske slægter:_x000D_ 1. FASEVARIATION OG BISTABLE GENEKSPRESSIONSSYSTEMER KONTROLLERET AF METILACION-DÆMNING. PROJEKTET VIL ANALYSERE OPVAB-FASEVARIATIONSSYSTEMET PÅ MOLEKYLÆRT NIVEAU, SOM GENERERER PHAGO-RESISTENTE DELPOPULATIONER OG KONTROLLERER SPREDNINGEN I MAKROFAGER, OG OPERON FIMBRIAL STD, SOM KONTROLLERER VEDHÆFTNINGEN AF SALMONELLA TIL TARMEPITELET OG REGULERER DEN BISTABLE EKSPRESSION AF PATOGENICITETSØEN 1. DERUDOVER VIL PROJEKTET KARAKTERISERE 20 FASE VARIATION LOCI IDENTIFICERET VED BIOINFORMATISK ANALYSE, MANGE AF DEM MED UKENDT FUNKTION. PROJEKTET FORESLÅR OGSÅ AT SKELNE MELLEM DEN UAFHÆNGIGE FASEVARIATION OG DEN KOORDINEREDE FASEVARIATION. DENNE TYPE ANALYSE VIL GØRE DET MULIGT AT VURDERE METILACION-DÆMNINGENS EVNE TIL AT SKABE FÆNOTYPISK HETEROGENITET I SALMONELLA. Teoretisk set, Veinte LOCI MED INDEPENDENT PHASE VARIATION CAN slægt 2(ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. DANNELSE AF SLÆGTER UAFHÆNGIG AF METILACION DÆMNING. FORSKELLE MELLEM CELLER GENERERET AF STØJ I PROMOTORER ELLER VED GENISK AMPLIFIKATION PREADAPTAN DELPOPULATIONER AF CELLER FOR AT MODSTÅ EN DØDELIG SELEKTION (E.G. GALDE). HVIS DEN STAT, DER TILLADER OVERLEVELSE, OPFORMERES AF EN AUTOCATALITICO SLØJFE, DANNES EN POPULATION AF RESISTENTE CELLER. PROJEKTET FORESLÅR DISSEKTION AF EN SÅDAN REAKTION PÅ GRUND AF HETEROGEN AKTIVERING AF DEN GENERELLE REAKTION PÅ STRESS, DER ER AFHÆNGIG AF RPO'ER. Denne RESPONSE CONFERENCE RESISTANCE to Bilis and PresENT TO ANDRE negative CONDITIONS._x000D_ THE STUDY of the MECHANISMS at GENERAL fænotypiske afstamninger kan hjælpe med at forstå RELEVANT Fenomer TIL HUMAN HEALTH AS BACTERIAL PERSISTENCE, kronisk INFECTION, HESSPED DEFENSES EVASION OG IKKE-mutationel ANTIBACTERIAL RESISTANCE. Desuden har PROJECT bioteknologiske applikationer:_x000D_ 1. Udvikling af epigenetiske apoteker til antibakteriel behandling (DAM-methylasehæmmere, fasevariationshæmmere, ETC.)._x000D_ 2. DESIGN AF OPFINDSOMHED STYRET AF METILACION DÆMNING TIL AT BYGGE KONTAKTER, SENSORER, HUKOMMELSESSYSTEMER OG ANDRE OPFINDSOMHEDER AF BIOLOGIA SYNTHETICA MED BIOMEDICINSKE OG INDUSTRIELLE APPLIKATIONER. (Danish)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    FORMAREA LINIILOR BACTERIENE PRIN MECANISME EPIGENETICE ESTE UN FENOMEN CU INTERES ACADEMIC ȘI APLICAT. DIN PUNCTUL DE VEDERE AL BIOLOGIEI FUNDAMENTALE, EXISTENȚA DIVERSITĂȚII FENOTIPICE PROVOACĂ VIZIUNEA TRADIȚIONALĂ A BACTERIILOR CA POPULAȚII CLONALE FORMATE DE ORGANISME IDENTITARE. ÎN PLUS, FORMAREA DE DESCENDENȚI FENOTIPICI JOACĂ UN ROL RELEVANT ÎN INTERACȚIUNILE AGENT PATOGEN-GAZDĂ ȘI ÎN ADAPTAREA BACTERIANĂ LA CONDIȚIILE DE MEDIU ÎN SCHIMBARE ȘI/SAU OSTILE. SALMONELLA ENTERICA ESTE UN ORGANISM ADECVAT PENTRU STUDIUL MECANISMELOR EPIGENETICE DIN URMĂTOARELE MOTIVE: (I) ESTE UN AGENT PATOGEN UMAN RELEVANT; (II) ESTE UN ORGANISM MODEL ÎN PATOGENEZA GENETICĂ ȘI BACTERIANĂ; (III) STUDIILE ANTERIOARE, INCLUSIV CELE ALE GRUPULUI SOLICITANT, AU ARĂTAT CĂ FORMAREA DE DESCENDENȚI ESTE ESENȚIALĂ PENTRU PATOGENEZĂ. CONTINUAREA STUDIILOR GRUPULUI PRIVIND MECANISMELE EPIGENETICE DIN SALMONELLA VA CONTRIBUI LA STABILIREA UNUI CONCEPT RELATIV NOU ÎN BIOLOGIE: CĂ FORMAREA DE DESCENDENȚE PRIN MECANISME NON-MUTATIONALE ESTE O PARTE COMPLICATĂ A MODULUI DE VIAȚĂ BACTERIAN. PROIECTUL PROPUNE căutarea a două tipuri de mecanisme epigenetice care controlează SALMONELLA GENES RELATEATE LA VIRULENȚA GENERANȚEI fenotipice:_x000D_ 1. SISTEME DE VARIAȚIE A FAZELOR ȘI DE EXPRIMARE A GENELOR BISTABILE CONTROLATE DE BARAJUL METILACION. PROIECTUL VA ANALIZA LA NIVEL MOLECULAR SISTEMUL DE VARIAȚIE A FAZELOR OPVAB, CARE GENEREAZĂ SUBPOPULAȚII REZISTENTE LA PHAGO ȘI CONTROLEAZĂ PROLIFERAREA MACROFAGELOR, ȘI DTS OPERON FIMBRIAL, CARE CONTROLEAZĂ ADERENȚA SALMONELLA LA EPITELIUL INTESTINAL ȘI REGLEAZĂ EXPRESIA BISABILĂ A INSULEI PATOGENE 1. ÎN PLUS, PROIECTUL VA CARACTERIZA 20 LOCI DE VARIAȚIE DE FAZĂ IDENTIFICATE PRIN ANALIZA BIOINFORMATICĂ, MULTE DINTRE ELE CU FUNCȚIE NECUNOSCUTĂ. PROIECTUL PROPUNE, DE ASEMENEA, DIFERENȚIEREA VARIAȚIEI ETAPEI INDEPENDENTE DE VARIAȚIA COORDONATĂ A FAZEI. ACEST TIP DE ANALIZĂ VA PERMITE ESTIMAREA CAPACITĂȚII BARAJULUI METILACION DE A GENERA ETEROGENITATE FENOTIPICĂ ÎN SALMONELLA. Teoretic, Veinte LOCI WITH INDEPENDENT PHASE VARIATION CAN Genr 2(ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. FORMAREA DE LINII INDEPENDENTE DE BARAJUL METILACION. DIFERENȚELE DINTRE CELULELE GENERATE DE ZGOMOTUL DIN PROMOTORI SAU DE AMPLIFICAREA GENICĂ A SUBPOPULAȚIILOR DE CELULE PREADAPTAN PENTRU A REZISTA LA O SELECȚIE LETALĂ (E.G. BILE). DACĂ STATUL CARE PERMITE SUPRAVIEȚUIREA ESTE PROPAGAT PRINTR-O BUCLĂ AUTOCATALITICO, SE FORMEAZĂ O POPULAȚIE DE CELULE REZISTENTE. PROIECTUL PROPUNE DISECȚIA UNUI ASTFEL DE RĂSPUNS, DATORITĂ ACTIVĂRII ETEROGENE A RĂSPUNSULUI GENERAL LA STRESUL DEPENDENT DE RPO. Această REZISTANȚĂ CONFERENȚĂ PRINCIPALĂ la Bilis ȘI PRESENTĂ LA ALTE CONDIȚII adverse._x000D_ STUDIA MECHANISMELOR conform cărora descendențele fenotipice GENERALE pot ajuta la înțelegerea fenomenelor RELEVANTE PENTRU SĂNĂTATEA UMANă ca PERSISTENȚA BACTERIALĂ, INFECȚIA cronică, DEFEZIȚII HESSPED EVASION ȘI RESISTANȚA ANTIBACTERIALĂ NON-mutatională. În plus, PROJECT are aplicații biotehnologice:_x000D_ 1. Dezvoltarea farmaciilor epigenetice pentru terapia antibacteriană (inhibitori de metilază DAM, inhibitori de variație de fază, ETC.)._x000D_ 2. DESIGN DE INGENIOZITATE CONTROLATĂ DE BARAJUL METILACION PENTRU A CONSTRUI COMUTATOARE, SENZORI, SISTEME DE MEMORIE ȘI ALTE INGENIOZITĂȚI ALE BIOLOGIA SINTETICA CU APLICAȚII BIOMEDICALE ȘI INDUSTRIALE. (Romanian)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    BILDANDET AV BAKTERIELLA HÄRSTAMNINGAR GENOM EPIGENETISKA MEKANISMER ÄR ETT FENOMEN MED AKADEMISKT INTRESSE OCH TILLÄMPAT. UR GRUNDBIOLOGINS SYNVINKEL UTMANAR FÖREKOMSTEN AV FENOTYPISK MÅNGFALD DEN TRADITIONELLA VISIONEN OM BAKTERIER SOM KLONINGSPOPULATIONER SOM BILDAS AV IDENTITETSORGANISMER. DESSUTOM SPELAR BILDANDET AV FENOTYPISKA HÄRSTAMNINGAR EN RELEVANT ROLL I INTERAKTIONER MELLAN PATOGENER OCH VÄRDAR OCH FÖR BAKTERIELL ANPASSNING TILL FÖRÄNDRADE OCH/ELLER FIENTLIGA MILJÖFÖRHÅLLANDEN. SALMONELLA ENTERICA ÄR EN LÄMPLIG ORGANISM FÖR STUDIER AV EPIGENETISKA MEKANISMER AV FÖLJANDE SKÄL: I) ÄR EN RELEVANT MÄNSKLIG PATOGEN, II) ÄR EN MODELLORGANISM I GENETISK OCH BAKTERIELL PATOGENES, (III) TIDIGARE STUDIER, INKLUSIVE STUDIER I DEN ANSÖKANDE GRUPPEN, HAR VISAT ATT HÄRSTAMNING ÄR AVGÖRANDE FÖR PATOGENES. FORTSATTA STUDIER I GRUPPEN OM EPIGENETISKA MEKANISMER FÖR SALMONELLA KOMMER ATT BIDRA TILL ATT FASTSTÄLLA ETT RELATIVT NYTT BEGREPP I BIOLOGI: ATT BILDANDET AV HÄRSTAMNINGAR GENOM ICKE-MUTATIONELLA MEKANISMER ÄR EN INVECKLAD DEL AV DET BAKTERIELLA SÄTTET ATT LEVA. PROJEKT FÖRESKRAR sökandet efter två typer av epigenetiska mekanismer som styr SALMONELLA GENES RELATED TILL VIRULENCE GENERANING fenotypiska härstamningar:_x000D_ 1. FASVARIATION OCH BISTABLE GENUTTRYCKSSYSTEM SOM STYRS AV METILACION-DAMMEN. PROJEKTET KOMMER ATT PÅ MOLEKYLÄR NIVÅ ANALYSERA OPVAB FASVARIATIONSSYSTEM, SOM GENERERAR PHAGO-RESISTENTA SUBPOPULATIONER OCH KONTROLLERAR PROLIFERATIONEN I MAKROFAGER, OCH OPERONFIMBRIAL STD, SOM KONTROLLERAR VIDHÄFTNINGEN AV SALMONELLA TILL TARMEPITELET OCH REGLERAR BISTABLET UTTRYCK AV PATOGENITETSÖN 1. DESSUTOM KOMMER PROJEKTET ATT KARAKTERISERA 20 FASVARIATIONSLOCI IDENTIFIERADE GENOM BIOINFORMATISK ANALYS, VARAV MÅNGA MED OKÄND FUNKTION. I PROJEKTET FÖRESLÅS OCKSÅ ATT DEN OBEROENDE FASVARIATIONEN SKA SKILJAS FRÅN DEN SAMORDNADE FASVARIATIONEN. DENNA TYP AV ANALYS KOMMER ATT GÖRA DET MÖJLIGT ATT UPPSKATTA METILACION-DAMMENS FÖRMÅGA ATT GENERERA FENOTYPISK HETEROGENITET I SALMONELLA. Teoretiskt sett, Veinte LOCI MED INDEPENDENT PHASE VARIATION CAN generar (2ELEVATED A)20 CELL TIPS._x000D_ 2. BILDNING AV HÄRSTAMNINGAR OBEROENDE AV METILACION-DAMMEN. SKILLNADER MELLAN CELLER SOM GENERERAS AV BULLER I PROMOTORER ELLER GENOM GENISK FÖRSTÄRKNING PREADAPTAN SUBPOPULATIONER AV CELLER FÖR ATT MOTSTÅ ETT DÖDLIGT URVAL (T.EX. GALLA). OM DEN STAT SOM TILLÅTER ÖVERLEVNAD FÖRÖKAS GENOM EN AUTOCATALITICO-SLINGA BILDAS EN POPULATION AV RESISTENTA CELLER. PROJEKTET FÖRESLÅR DISSEKTION AV ETT SÅDANT SVAR, PÅ GRUND AV HETEROGEN AKTIVERING AV DEN ALLMÄNNA REAKTIONEN PÅ STRESS SOM ÄR BEROENDE AV RPO. Denna RESPONSE CONFERENCE RESISTANCE TO Bilis OCH PRESENT TILL ANDRA negativa KONDITIONER._x000D_ MECHANISMS STUDY att GENERAL fenotypiska härstamningar kan bidra till att förstå RELEVANT fenomen FÖR HUMAN HÄLJNING som BAKERIAL PERSISTENCE, kronisk INFECTION, HESSPED DEFENSES EVASION OCH NON-mutationell ANTIBACTERIAL RESISTANCE. Dessutom har PROJEKT biotekniska tillämpningar:_x000D_ 1. Utveckling av epigenetiska apotek för antibakteriell behandling (DAM-metylashämmare, fasvariationshämmare, ETC.)._x000D_ 2. DESIGN AV UPPFINNINGSRIKEDOM SOM STYRS AV METILACION-DAMMEN FÖR ATT BYGGA BRYTARE, SENSORER, MINNESSYSTEM OCH ANDRA UPPFINNINGSRIKEDOMAR AV BIOLOGIA SYNTETICA MED BIOMEDICINSKA OCH INDUSTRIELLA TILLÄMPNINGAR. (Swedish)
    point in time
    4 August 2022
    0 references
    location (string)
    Sevilla
    0 references
    date of last update
    20 December 2023
    0 references

    Identifiers

    Spanish Kohesio ID
    BIO2013-44220-R
    0 references
     
    Retrieved from "https://linkedopendata.eu/w/index.php?title=Item:Q3201570&oldid=41175168"