COLLECTION, SELECTION AND INTRODUCTION OF VARIABILITY IN GENOMES OF CULTIVATED PLANTS (Q3200862)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3200862 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | COLLECTION, SELECTION AND INTRODUCTION OF VARIABILITY IN GENOMES OF CULTIVATED PLANTS |
Project Q3200862 in Spain |
Statements
125,180.55 Euro
0 references
229,900.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2014
0 references
30 June 2017
0 references
CENTRO DE INVESTIGACION EN AGRIGENOMICA
0 references
8193
0 references
LA VARIABILIDAD GENOMICA ES LA BASE SOBRE LA QUE OPERA LA SELECCION. POR ELLO, ES IMPORTANTE CONOCER LOS MECANISMOS QUE LA GENERAN. LA VARIABILIDAD GENOMICA ES EL RESULTADO DE DIFERENTES PROCESOS QUE INTRODUCEN DIFERENTES TIPOS DE MUTACIONES. ERRORES EN LA REPLICACION DEL ADN, LA RADIACION UV Y LA EXPOSICION A ALGUNOS PRODUCTOS QUIMICOS DAN LUGAR A POLIMORFISMOS DE UN SOLO NUCLEOTIDO (SNPS) O A PEQUEÑAS INSERCIONES/DELECIONES, MIENTRAS QUE OTROS PROCESOS, COMO EL MOVIMIENTO DE TRANSPOSONES O SU RECOMBINACION, DAN LUGAR A INSERCIONES/DELECIONES GRANDES Y A REORGANIZACIONES CROMOSOMICAS. OTROS PROCESOS, TAMBIEN RELACIONADOS CON LA ACTIVIDAD DE TRANSPOSONES, PUEDEN RESULTAR EN LA VARIACION DE PRESENCIA/ AUSENCIA (PAV) DE GENES. TODAS ESTAS MUTACIONES GENERAN LA VARIABILIDAD QUE PUEDE SER SELECCIONADA DURANTE LA EVOLUCION, INCLUYENDO LA DOMESTICACION Y LA MEJORA DE PLANTAS. LA SELECCION AFECTA DIFERENCIALMENTE LA DIVERSIDAD GENOMICA, YA QUE SE DIRIGE A REGIONES ESPECIFICAS DEL GENOMA QUE CONTIENE GENES QUE REGULAN LOS RASGOS SELECCIONADOS. LA BUSQUEDA DE REGIONES DE BAJA VARIABILIDAD PUEDE AYUDAR A IDENTIFICAR LOS GENES ESPECIFICOS O MUTACIONES QUE SUBYACEN A LOS PROCESOS EVOLUTIVOS. ESTA INFORMACION ES DE GRAN VALOR PARA DEFINIR CUALES SON LOS GENES SOBRE LOS QUE CONCENTRARSE EN LA MEJORA GENETICA ._x000D_ LA SECUENCIACION COMPLETA DE GENOMAS DE ESPECIES CULTIVADAS, ASI COMO EL DESARROLLO DE METODOS DE RESECUENCIACION Y HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS PARA COMPARAR ESTOS GENOMAS, PERMITE POR PRIMERA VEZ UN ANALISIS EXHAUSTIVO DE LA VARIABILIDAD GENOMICA DE LAS ESPECIES CULTIVADAS. LOS GRUPOS QUE PRESENTAN ESTA PROPUESTA LIDERARON LA SECUENCIACION DEL GENOMA DEL MELON Y HAN COMENZADO A ANALIZAR SU VARIABILIDAD A PARTIR DE DATOS DE RESECUENCIACION DE VARIEDADES. TAMBIEN HAN DESARROLLADO HERRAMIENTAS PARA ANALIZAR LA VARIABILIDAD DEBIDO TANTO A SNPS COMO AL MOVIMIENTO DE TRANSPOSONES. EN ESTE PROYECTO SE PROPONEN PERFECCIONAR Y APLICAR ESTAS HERRAMIENTAS PARA ANALIZAR LA VARIABILIDAD DEL MELON EN COMPARACION CON LA DEL PEPINO Y LA DE ESPECIES DEL GENERO PRUNUS (PRINCIPALMENTE MELOCOTON). ESTO DEBERIA ARROJAR LUZ SOBRE ASPECTOS FUNDAMENTALES DE LA EVOLUCION DEL GENOMA DE PLANTAS Y DE LOS GENES QUE SUBYACEN A LA DOMESTICACION Y LA MEJORA DEL MELON. _x000D_ AUNQUE LA INFORMACION SOBRE LA VARIABILIDAD DEL GENOMA ES CLAVE PARA LA IDENTIFICACION DE LAS VARIANTES GENICAS RESPONSABLES DE LOS RASGOS SELECCIONADOS EN LA DOMESTICACION Y LA MEJORA, PARA TRANSFORMAR ESTE CONOCIMIENTO EN NUEVAS VARIEDADES COMERCIALES SE REQUIERE DE BUENOS METODOS PARA SU INTRODUCCION SELECTIVA. CUANDO LA NUEVA VARIANTE GENETICA NO ESTA DISPONIBLE EN EL POOL GENETICO, SOLO SE PUEDEN USAR DOS ESTRATEGIAS: MUTACIONES AL AZAR EN ESTRATEGIAS COMO EL TILLING, Y LA TRANSGENESIS. SIN EMBARGO, AMBAS TIENEN LIMITACIONES IMPORTANTES. DURANTE LOS ULTIMOS AÑOS, SE ESTAN DESARROLLANDO NUEVAS HERRAMIENTAS BASADAS EN EL USO DE NUCLEASAS ESPECIFICAS (SDNS) PARA LA INTRODUCCION DIRIGIDA DE VARIANTES GENICAS QUE DEBERIA PERMITIR UNA NUEVA GENERACION DE PLANTAS MODIFICADAS GENETICAMENTE CON FENOTIPOS MAS PREDECIBLES Y MAS SEGURAS. EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS (A ) REALIZAR UN ANALISIS DETALLADO DE LA VARIABILIDAD GENERADA Y SELECCIONADO DURANTE LA RECIENTE EVOLUCION DE ESPECIES CULTIVADAS DE PARTICULAR RELEVANCIA, Y (B ) INICIAR UNA NUEVA LINEA DE INVESTIGACION EN EL DESARROLLO DE ENFOQUES BASADOS EN SDNS PARA INTRODUCIR MUTACIONES ESPECIFICAS EN LOS GENOMAS DE PLANTAS CULTIVADAS. (Spanish)
0 references
GENOMIC VARIABILITY IS THE BASIS ON WHICH THE SELECTION OPERATES. THEREFORE, IT IS IMPORTANT TO KNOW THE MECHANISMS THAT GENERATE IT. GENOMIC VARIABILITY IS THE RESULT OF DIFFERENT PROCESSES THAT INTRODUCE DIFFERENT TYPES OF MUTATIONS. ERRORS IN DNA REPLICATION, UV RADIATION AND EXPOSURE TO SOME CHEMICALS RESULT IN SINGLE NUCLEOTITED POLYMORPHISMS (NPS) OR SMALL INSERTIONS/DELETIONS, WHILE OTHER PROCESSES, SUCH AS TRANSPOSON MOVEMENT OR THEIR RECOMBINATION, RESULT IN LARGE INSERTIONS/DELETIONS AND CHROMOSOMIC REORGANISATIONS. OTHER PROCESSES, ALSO RELATED TO TRANSPOSON ACTIVITY, MAY RESULT IN THE VARIATION OF PRESENCE/ABSENCE (PAV) OF GENES. ALL THESE MUTATIONS GENERATE VARIABILITY THAT CAN BE SELECTED DURING EVOLUTION, INCLUDING DOMESTICATION AND PLANT IMPROVEMENT. THE SELECTION DIFFERENTIALLY AFFECTS THE GENOMIC DIVERSITY, AS IT TARGETS SPECIFIC REGIONS OF THE GENOME CONTAINING GENES THAT REGULATE THE SELECTED TRAITS. SEARCHING FOR REGIONS OF LOW VARIABILITY CAN HELP IDENTIFY THE SPECIFIC GENES OR MUTATIONS THAT UNDERLIE EVOLUTIONARY PROCESSES. This INFORMATION is of great value in order to define what are the ends on which to be agreed upon in the best of GENETICA._x000D_ the complete sequencing of GENOMS OF CULTIVE SPECIES, as well as the development of bio-informative methods and tools to compare these genes, permit for the first time an EXHAUSTIVE ANALYSIS OF THE GENOMIC VARIABILITY OF CULTIVE SPECIES. THE GROUPS THAT PRESENT THIS PROPOSAL LED THE SEQUENCING OF THE MELON GENOME AND HAVE BEGUN TO ANALYSE ITS VARIABILITY BASED ON DATA ON RESECUENCIACION OF VARIETIES. THEY HAVE ALSO DEVELOPED TOOLS TO ANALYSE VARIABILITY DUE TO BOTH SNPS AND TRANSPOSON MOVEMENT. IN THIS PROJECT THEY INTEND TO REFINE AND APPLY THESE TOOLS TO ANALYSE THE VARIABILITY OF MELON COMPARED TO THAT OF CUCUMBER AND SPECIES OF THE GENUS PRUNUS (MAINLY PEACH). THIS SHOULD SHED LIGHT ON FUNDAMENTAL ASPECTS OF THE EVOLUTION OF THE PLANT GENOME AND THE GENES UNDERLYING THE DOMESTICATION AND IMPROVEMENT OF MELON. _x000D_ although the information on the variability of the GENOME is key for the identification of the responsible GENICAL VARIANTS of the categories selected in domestication and improvement, for the purpose of transforming this knowledge into new trade routes is required of good methods for their selective introduction. WHEN THE NEW GENETIC VARIANT IS NOT AVAILABLE IN THE POOL GENETICO, ONLY TWO STRATEGIES CAN BE USED: RANDOM MUTATIONS IN STRATEGIES LIKE TILLING, AND TRANSGENESIS. HOWEVER, BOTH HAVE IMPORTANT LIMITATIONS. OVER THE LAST YEARS, NEW TOOLS BASED ON THE USE OF SPECIFIC NUCLEASES (SDNS) ARE BEING DEVELOPED FOR THE TARGETED INTRODUCTION OF GENICAS VARIANTS THAT SHOULD ALLOW A NEW GENERATION OF GENETICALLY MODIFIED PLANTS WITH MORE PREDICTABLE AND SAFER PHENOTYPES. IN THIS PROJECT WE PROPOSE (A) TO CARRY OUT A DETAILED ANALYSIS OF THE VARIABILITY GENERATED AND SELECTED DURING THE RECENT EVOLUTION OF CULTIVATED SPECIES OF PARTICULAR RELEVANCE, AND (B) TO INITIATE A NEW LINE OF RESEARCH IN THE DEVELOPMENT OF APPROACHES BASED ON SDNS TO INTRODUCE SPECIFIC MUTATIONS IN THE GENOMES OF CULTIVATED PLANTS. (English)
13 October 2021
0.189568134160285
0 references
LA VARIABILITÉ GÉNOMIQUE EST LA BASE SUR LAQUELLE LA SÉLECTION FONCTIONNE. IL EST DONC IMPORTANT DE CONNAÎTRE LES MÉCANISMES QUI LA GÉNÈRENT. LA VARIABILITÉ GÉNOMIQUE EST LE RÉSULTAT DE DIFFÉRENTS PROCESSUS QUI INTRODUISENT DIFFÉRENTS TYPES DE MUTATIONS. DES ERREURS DANS LA RÉPLICATION DE L’ADN, LE RAYONNEMENT UV ET L’EXPOSITION À CERTAINS PRODUITS CHIMIQUES ENTRAÎNENT DES POLYMORPHISMES NUCLEOTITED UNIQUES (NPS) OU DE PETITES INSERTIONS/SUPPRESSIONS, TANDIS QUE D’AUTRES PROCESSUS, COMME LE MOUVEMENT DE TRANSPOSON OU LEUR RECOMBINAISON, ENTRAÎNENT DE GRANDES INSERTIONS/DÉLÉTIONS ET DES RÉORGANISATIONS CHROMOSOMIQUES. D’AUTRES PROCESSUS, ÉGALEMENT LIÉS À L’ACTIVITÉ DE TRANSPOSON, PEUVENT ENTRAÎNER LA VARIATION DE LA PRÉSENCE/ABSENCE (PAV) DES GÈNES. TOUTES CES MUTATIONS GÉNÈRENT UNE VARIABILITÉ QUI PEUT ÊTRE SÉLECTIONNÉE AU COURS DE L’ÉVOLUTION, Y COMPRIS LA DOMESTICATION ET L’AMÉLIORATION DES PLANTES. LA SÉLECTION AFFECTE DE FAÇON DIFFÉRENTIELLE LA DIVERSITÉ GÉNOMIQUE, CAR ELLE CIBLE DES RÉGIONS SPÉCIFIQUES DU GÉNOME CONTENANT DES GÈNES QUI RÉGULENT LES CARACTÈRES SÉLECTIONNÉS. LA RECHERCHE DE RÉGIONS À FAIBLE VARIABILITÉ PEUT AIDER À IDENTIFIER LES GÈNES OU MUTATIONS SPÉCIFIQUES QUI SOUS-TENDENT LES PROCESSUS ÉVOLUTIFS. Cette INFORMATION est d’une grande valeur pour définir quelles sont les fins sur lesquelles il faut convenir dans le meilleur de GENETICA._x000D_ le séquençage complet des génoms DES SPECIES Cultives, ainsi que le développement de méthodes et d’outils bio-informatifs pour comparer ces gènes, permettent pour la première fois une ANALYSE EXHAUSTIVE DE LA VARIABILITÉ GÉNOMIQUE DES SPECIES Cultives. LES GROUPES QUI PRÉSENTENT CETTE PROPOSITION ONT MENÉ LE SÉQUENÇAGE DU GÉNOME DU MELON ET ONT COMMENCÉ À ANALYSER SA VARIABILITÉ À PARTIR DES DONNÉES SUR LA RESECUENCIACION DES VARIÉTÉS. ILS ONT ÉGALEMENT DÉVELOPPÉ DES OUTILS POUR ANALYSER LA VARIABILITÉ DUE À LA FOIS AUX SNP ET AU MOUVEMENT DE TRANSPOSON. DANS CE PROJET, ILS ONT L’INTENTION D’AFFINER ET D’APPLIQUER CES OUTILS POUR ANALYSER LA VARIABILITÉ DU MELON PAR RAPPORT À CELLE DU CONCOMBRE ET DES ESPÈCES DU GENRE PRUNUS (PRINCIPALEMENT PÊCHE). CELA DEVRAIT ÉCLAIRER LES ASPECTS FONDAMENTAUX DE L’ÉVOLUTION DU GÉNOME VÉGÉTAL ET DES GÈNES SOUS-JACENTS À LA DOMESTICATION ET À L’AMÉLIORATION DU MELON. _x000D_ bien que l’information sur la variabilité du GENOME soit essentielle pour l’identification des VARIANTS GÉNIQUES responsables des catégories sélectionnées en domestication et en amélioration, afin de transformer ces connaissances en nouvelles routes commerciales, il est nécessaire de disposer de bonnes méthodes pour leur introduction sélective. LORSQUE LA NOUVELLE VARIANTE GÉNÉTIQUE N’EST PAS DISPONIBLE DANS LE POOL GENETICO, SEULES DEUX STRATÉGIES PEUVENT ÊTRE UTILISÉES: MUTATIONS ALÉATOIRES DANS DES STRATÉGIES COMME LE LABOUR ET LA TRANSGENÈSE. CEPENDANT, LES DEUX ONT DES LIMITES IMPORTANTES. AU COURS DES DERNIÈRES ANNÉES, DE NOUVEAUX OUTILS BASÉS SUR L’UTILISATION DE NUCLÉASES SPÉCIFIQUES (SDN) ONT ÉTÉ MIS AU POINT POUR L’INTRODUCTION CIBLÉE DE VARIANTES GENICAS QUI DEVRAIENT PERMETTRE À UNE NOUVELLE GÉNÉRATION DE PLANTES GÉNÉTIQUEMENT MODIFIÉES AYANT DES PHÉNOTYPES PLUS PRÉVISIBLES ET PLUS SÛRS. DANS CE PROJET, NOUS PROPOSONS (A) D’EFFECTUER UNE ANALYSE DÉTAILLÉE DE LA VARIABILITÉ GÉNÉRÉE ET SÉLECTIONNÉE AU COURS DE L’ÉVOLUTION RÉCENTE DES ESPÈCES CULTIVÉES D’UNE IMPORTANCE PARTICULIÈRE, ET (B) D’INITIER UNE NOUVELLE LIGNE DE RECHERCHE DANS LE DÉVELOPPEMENT D’APPROCHES BASÉES SUR DES SDN POUR INTRODUIRE DES MUTATIONS SPÉCIFIQUES DANS LES GÉNOMES DES PLANTES CULTIVÉES. (French)
4 December 2021
0 references
DIE GENOMISCHE VARIABILITÄT IST DIE GRUNDLAGE, AUF DER DIE AUSWAHL FUNKTIONIERT. DAHER IST ES WICHTIG, DIE MECHANISMEN ZU KENNEN, DIE SIE ERZEUGEN. GENOMISCHE VARIABILITÄT IST DAS ERGEBNIS UNTERSCHIEDLICHER PROZESSE, DIE VERSCHIEDENE ARTEN VON MUTATIONEN EINFÜHREN. FEHLER IN DER DNA-REPLIKATION, UV-STRAHLUNG UND EXPOSITION GEGENÜBER EINIGEN CHEMIKALIEN FÜHREN ZU EINZELNEN NUCLEOTITED-POLYMORPHISMEN (NPS) ODER KLEINEN EINFÜGUNGEN/LÖSCHEN, WÄHREND ANDERE PROZESSE, WIE TRANSPOSONBEWEGUNG ODER DEREN REKOMBINATION, ZU GROSSEN EINFÜGUNGEN/LÖTEN UND CHROMOSOMISCHEN REORGANISATIONEN FÜHREN. ANDERE PROZESSE, DIE AUCH MIT DER TRANSPOSON-AKTIVITÄT ZUSAMMENHÄNGEN, KÖNNEN ZUR VARIATION VON PRÄSENZ/ABWESENHEIT (PAV) VON GENEN FÜHREN. ALLE DIESE MUTATIONEN ERZEUGEN VARIABILITÄT, DIE WÄHREND DER EVOLUTION AUSGEWÄHLT WERDEN KANN, EINSCHLIESSLICH DOMESTIZATION UND VERBESSERUNG DER PFLANZEN. DIE SELEKTION WIRKT SICH UNTERSCHIEDLICH AUF DIE GENOMISCHE DIVERSITÄT AUS, DA SIE AUF BESTIMMTE REGIONEN DES GENOMS MIT GENEN ABZIELT, DIE DIE AUSGEWÄHLTEN MERKMALE REGULIEREN. DIE SUCHE NACH REGIONEN MIT GERINGER VARIABILITÄT KANN HELFEN, DIE SPEZIFISCHEN GENE ODER MUTATIONEN ZU IDENTIFIZIEREN, DIE EVOLUTIONÄREN PROZESSEN ZUGRUNDE LIEGEN. Diese Information ist von großem Wert, um zu definieren, welche Enden im besten von GENETICA zu vereinbaren sind._x000D_ die vollständige Sequenzierung von Genomen der Kultivischen SPECIES sowie die Entwicklung bioinformativer Methoden und Werkzeuge zum Vergleich dieser Gene erlauben erstmals eine EXHAUSTIVE ANALYSIS DER GENOMISCHEN VARIABILITÄT der Kultiv-SPECIES. DIE GRUPPEN, DIE DIESEN VORSCHLAG VORLEGEN, FÜHRTEN ZUR SEQUENZIERUNG DES MELONENGENOMS UND HABEN BEGONNEN, SEINE VARIABILITÄT AUF DER GRUNDLAGE VON DATEN ZUR RESECUENCIACION VON SORTEN ZU ANALYSIEREN. SIE HABEN AUCH WERKZEUGE ENTWICKELT, UM DIE VARIABILITÄT SOWOHL DURCH SNPS ALS AUCH TRANSPOSONBEWEGUNGEN ZU ANALYSIEREN. IN DIESEM PROJEKT BEABSICHTIGEN SIE, DIESE WERKZEUGE ZU VERFEINERN UND ANZUWENDEN, UM DIE VARIABILITÄT VON MELONEN IM VERGLEICH ZU GURKEN UND ARTEN DER GATTUNG PRUNUS (HAUPTSÄCHLICH PFIRSICH) ZU ANALYSIEREN. DIES SOLLTE DIE GRUNDLEGENDEN ASPEKTE DER EVOLUTION DES PFLANZENGENOMS UND DER GENE, DIE DER DOMESTIZIERUNG UND VERBESSERUNG DER MELONE ZUGRUNDE LIEGEN, BELEUCHTET WERDEN. _x000D_ obwohl die Informationen über die Variabilität des GENOME von entscheidender Bedeutung für die Identifizierung der verantwortlichen GENICAL VARIANTS der Kategorien sind, die für die Domestizierung und Verbesserung ausgewählt wurden, um dieses Wissen in neue Handelswege umzuwandeln, bedarf es guter Methoden für ihre selektive Einführung. WENN DIE NEUE GENETISCHE VARIANTE IM POOL-GENETIK NICHT VERFÜGBAR IST, KÖNNEN NUR ZWEI STRATEGIEN VERWENDET WERDEN: ZUFÄLLIGE MUTATIONEN IN STRATEGIEN WIE BODENBEARBEITUNG UND TRANSGENESE. BEIDE HABEN JEDOCH ERHEBLICHE EINSCHRÄNKUNGEN. FÜR DIE GEZIELTE EINFÜHRUNG VON GENICAS-VARIANTEN, DIE EINE NEUE GENERATION GENETISCH VERÄNDERTER PFLANZEN MIT VORHERSEHBAREREN UND SICHEREREN PHÄNOTYPEN ERMÖGLICHEN SOLLEN, WERDEN IN DEN LETZTEN JAHREN NEUE WERKZEUGE ENTWICKELT, DIE AUF DEM EINSATZ SPEZIFISCHER NUKLEASEN (SDNS) BASIEREN. IN DIESEM PROJEKT SCHLAGEN WIR A) EINE DETAILLIERTE ANALYSE DER VARIABILITÄT VOR, DIE WÄHREND DER JÜNGSTEN ENTWICKLUNG DER KULTIVIERTEN ARTEN VON BESONDERER BEDEUTUNG ERZEUGT UND AUSGEWÄHLT WURDE, UND (B) EINE NEUE FORSCHUNGSLINIE ZUR ENTWICKLUNG VON AUF SDNS BASIERENDEN ANSÄTZEN ZUR EINFÜHRUNG SPEZIFISCHER MUTATIONEN IN DIE GENOME KULTIVIERTER PFLANZEN EINZULEITEN. (German)
9 December 2021
0 references
GENOMISCHE VARIABILITEIT IS DE BASIS WAAROP DE SELECTIE WERKT. DAAROM IS HET BELANGRIJK OM DE MECHANISMEN TE KENNEN DIE HET GENEREREN. GENOMIC VARIABILITEIT IS HET RESULTAAT VAN VERSCHILLENDE PROCESSEN DIE VERSCHILLENDE SOORTEN MUTATIES INTRODUCEREN. FOUTEN IN DNA-REPLICATIE, UV-STRALING EN BLOOTSTELLING AAN BEPAALDE CHEMISCHE STOFFEN LEIDEN TOT ENKELE NUCLEOTITED POLYMORFISMEN (NPS) OF KLEINE INSERTIES/VERWIJDERINGEN, TERWIJL ANDERE PROCESSEN, ZOALS TRANSPOSONBEWEGING OF HUN RECOMBINATIE, RESULTEREN IN GROTE INSERTIES/VERWIJDERINGEN EN CHROMOSOMISCHE REORGANISATIES. ANDERE PROCESSEN, OOK GERELATEERD AAN TRANSPOSON ACTIVITEIT, KUNNEN LEIDEN TOT DE VARIATIE VAN AANWEZIGHEID/AFWEZIGHEID (PAV) VAN GENEN. AL DEZE MUTATIES GENEREREN VARIABILITEIT DIE TIJDENS DE EVOLUTIE KAN WORDEN GESELECTEERD, INCLUSIEF DOMESTICATIE EN PLANTENVERBETERING. DE SELECTIE HEEFT EEN DIFFERENTIËLE INVLOED OP DE GENOMISCHE DIVERSITEIT, OMDAT HET GERICHT IS OP SPECIFIEKE REGIO’S VAN HET GENOOM DAT GENEN BEVAT DIE DE GESELECTEERDE EIGENSCHAPPEN REGULEREN. ZOEKEN NAAR REGIO’S MET LAGE VARIABILITEIT KAN HELPEN BIJ HET IDENTIFICEREN VAN DE SPECIFIEKE GENEN OF MUTATIES DIE AAN EVOLUTIONAIRE PROCESSEN TEN GRONDSLAG LIGGEN. Deze INFORMATIE is van grote waarde om te definiëren wat de einden zijn waarop in het beste van GENETICA._x000D_ de volledige sequencing van genen VAN Cultive SPECIES moet worden overeengekomen, evenals de ontwikkeling van bio-informatieve methoden en hulpmiddelen om deze genen te vergelijken, maken voor het eerst een EXHAUSTIVE ANALYSIS VAN DE GENOMISCHE VARIABILITEIT VAN Cultive SPECIES mogelijk. DE GROEPEN DIE DIT VOORSTEL INDIENEN, HEBBEN GELEID TOT DE SEQUENTIE VAN HET MELOENGENOOM EN ZIJN BEGONNEN MET HET ANALYSEREN VAN DE VARIABILITEIT ERVAN OP BASIS VAN GEGEVENS OVER DE RESECUENCIACION VAN RASSEN. ZE HEBBEN OOK TOOLS ONTWIKKELD OM VARIABILITEIT TE ANALYSEREN ALS GEVOLG VAN ZOWEL SNPS ALS TRANSPOSON BEWEGING. IN DIT PROJECT ZIJN ZIJ VAN PLAN DEZE INSTRUMENTEN TE VERFIJNEN EN TOE TE PASSEN OM DE VARIABILITEIT VAN MELOENEN TE ANALYSEREN IN VERGELIJKING MET DIE VAN KOMKOMMER EN SOORTEN VAN HET GESLACHT PRUNUS (VOORNAMELIJK PERZIK). DIT MOET LICHT WERPEN OP FUNDAMENTELE ASPECTEN VAN DE EVOLUTIE VAN HET PLANTENGENOOM EN DE GENEN DIE AAN DE DOMESTICATIE EN VERBETERING VAN MELOEN TEN GRONDSLAG LIGGEN. _x000D_ hoewel de informatie over de variabiliteit van de GENOME essentieel is voor de identificatie van de verantwoordelijke GENICAL VARIANTS van de categorieën die zijn geselecteerd voor domesticatie en verbetering, is voor de omzetting van deze kennis in nieuwe handelsroutes goede methoden vereist voor de selectieve introductie ervan. WANNEER DE NIEUWE GENETISCHE VARIANT NIET BESCHIKBAAR IS IN DE POOL GENETICO, KUNNEN SLECHTS TWEE STRATEGIEËN WORDEN GEBRUIKT: WILLEKEURIGE MUTATIES IN STRATEGIEËN ZOALS BEWERKEN EN TRANSGENESE. BEIDE HEBBEN ECHTER BELANGRIJKE BEPERKINGEN. DE AFGELOPEN JAREN WORDEN NIEUWE INSTRUMENTEN ONTWIKKELD OP BASIS VAN HET GEBRUIK VAN SPECIFIEKE NUCLEASEN (SDN’S) VOOR DE GERICHTE INTRODUCTIE VAN GENICAS-VARIANTEN DIE EEN NIEUWE GENERATIE GENETISCH GEMODIFICEERDE PLANTEN MET MEER VOORSPELBARE EN VEILIGERE FENOTYPEN MOGELIJK MOETEN MAKEN. IN DIT PROJECT STELLEN WIJ VOOR (A) EEN GEDETAILLEERDE ANALYSE UIT TE VOEREN VAN DE VARIABILITEIT DIE TIJDENS DE RECENTE EVOLUTIE VAN GEKWEEKTE SOORTEN VAN BIJZONDER BELANG IS GEGENEREERD EN GESELECTEERD, EN (B) EEN NIEUWE ONDERZOEKSLIJN OP TE STARTEN VOOR DE ONTWIKKELING VAN BENADERINGEN OP BASIS VAN SDN’S OM SPECIFIEKE MUTATIES IN DE GENOMENIS VAN GEKWEEKTE PLANTEN IN TE VOEREN. (Dutch)
17 December 2021
0 references
LA VARIABILITÀ GENOMICA È LA BASE SU CUI OPERA LA SELEZIONE. PERTANTO, È IMPORTANTE CONOSCERE I MECCANISMI CHE LO GENERANO. LA VARIABILITÀ GENOMICA È IL RISULTATO DI DIVERSI PROCESSI CHE INTRODUCONO DIVERSI TIPI DI MUTAZIONI. ERRORI NELLA REPLICAZIONE DEL DNA, RADIAZIONI UV E L'ESPOSIZIONE AD ALCUNE SOSTANZE CHIMICHE PROVOCANO SINGOLI POLIMORFISMI NUCLEOTITED (NPS) O PICCOLE INSERZIONI/CANCELLAZIONI, MENTRE ALTRI PROCESSI, COME IL MOVIMENTO DEI TRANSPOSON O LA LORO RICOMBINAZIONE, PROVOCANO GRANDI INSERZIONI/DELEZIONI E RIORGANIZZAZIONI CROMOSOMICHE. ALTRI PROCESSI, ANCHE CORRELATI ALL'ATTIVITÀ DEI TRANSPOSON, POSSONO PORTARE ALLA VARIAZIONE DELLA PRESENZA/ASSENZA (PAV) DEI GENI. TUTTE QUESTE MUTAZIONI GENERANO VARIABILITÀ CHE POSSONO ESSERE SELEZIONATE DURANTE L'EVOLUZIONE, COMPRESA L'ADDOMESTICAZIONE E IL MIGLIORAMENTO DELLE PIANTE. LA SELEZIONE INFLUISCE IN MODO DIFFERENZIATO SULLA DIVERSITÀ GENOMICA, IN QUANTO SI RIVOLGE A SPECIFICHE REGIONI DEL GENOMA CONTENENTI GENI CHE REGOLANO I TRATTI SELEZIONATI. LA RICERCA DI REGIONI A BASSA VARIABILITÀ PUÒ AIUTARE A IDENTIFICARE I GENI SPECIFICI O LE MUTAZIONI CHE SONO ALLA BASE DEI PROCESSI EVOLUTIVI. Questa INFORMAZIONI è di grande valore per definire quali sono i fini su cui concordare nel meglio di GENETICA._x000D_ il sequenziamento completo dei genomi DI SPECIE Cultive, così come lo sviluppo di metodi e strumenti bio-informativi per confrontare questi geni, consentono per la prima volta una ANALISI SHAUSTIVA DELLA VARIABILITÀ GENOMICA DI SPECIE Cultive. I GRUPPI CHE PRESENTANO QUESTA PROPOSTA HANNO CONDOTTO IL SEQUENZIAMENTO DEL GENOMA DEL MELONE E HANNO INIZIATO AD ANALIZZARNE LA VARIABILITÀ SULLA BASE DEI DATI SULLA RESECUENCIACION DELLE VARIETÀ. HANNO ANCHE SVILUPPATO STRUMENTI PER ANALIZZARE LA VARIABILITÀ DOVUTA SIA AI SNP CHE AI MOVIMENTI TRANSPOSON. IN QUESTO PROGETTO INTENDONO AFFINARE E APPLICARE QUESTI STRUMENTI PER ANALIZZARE LA VARIABILITÀ DEL MELONE RISPETTO A QUELLA DEL CETRIOLO E DELLE SPECIE DEL GENERE PRUNUS (PRINCIPALMENTE PESCA). CIÒ DOVREBBE FAR LUCE SUGLI ASPETTI FONDAMENTALI DELL'EVOLUZIONE DEL GENOMA VEGETALE E DEI GENI SOTTOSTANTI L'ADDOMESTICAMENTO E IL MIGLIORAMENTO DEL MELONE. _x000D_ anche se le informazioni sulla variabilità del GENOME sono fondamentali per l'identificazione dei VARIANTS GENICAL responsabili delle categorie selezionate per l'addomesticamento e il miglioramento, al fine di trasformare questa conoscenza in nuove rotte commerciali è necessaria una buona metodologia per la loro introduzione selettiva. QUANDO LA NUOVA VARIANTE GENETICA NON È DISPONIBILE NEL POOL GENETICO, POSSONO ESSERE UTILIZZATE SOLO DUE STRATEGIE: MUTAZIONI CASUALI IN STRATEGIE COME LA LAVORAZIONE E LA TRANSGENESI. TUTTAVIA, ENTRAMBI HANNO IMPORTANTI LIMITAZIONI. NEGLI ULTIMI ANNI SONO IN CORSO DI SVILUPPO NUOVI STRUMENTI BASATI SULL'USO DI NUCLEASI SPECIFICHE (SDN) PER L'INTRODUZIONE MIRATA DI VARIANTI GENICAS CHE DOVREBBERO CONSENTIRE UNA NUOVA GENERAZIONE DI PIANTE GENETICAMENTE MODIFICATE CON FENOTIPI PIÙ PREVEDIBILI E PIÙ SICURI. IN QUESTO PROGETTO PROPONIAMO (A) DI EFFETTUARE UN'ANALISI DETTAGLIATA DELLA VARIABILITÀ GENERATA E SELEZIONATA DURANTE LA RECENTE EVOLUZIONE DI SPECIE COLTIVATE DI PARTICOLARE RILEVANZA, E (B) DI AVVIARE UNA NUOVA LINEA DI RICERCA NELLO SVILUPPO DI APPROCCI BASATI SULLE SDN PER INTRODURRE SPECIFICHE MUTAZIONI NEI GENOMI DELLE PIANTE COLTIVATE. (Italian)
16 January 2022
0 references
Η ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΉ ΜΕΤΑΒΛΗΤΌΤΗΤΑ ΕΊΝΑΙ Η ΒΆΣΗ ΣΤΗΝ ΟΠΟΊΑ ΛΕΙΤΟΥΡΓΕΊ Η ΕΠΙΛΟΓΉ. ΩΣ ΕΚ ΤΟΎΤΟΥ, ΕΊΝΑΙ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌ ΝΑ ΓΝΩΡΊΖΟΥΜΕ ΤΟΥΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΎΣ ΠΟΥ ΤΟ ΔΗΜΙΟΥΡΓΟΎΝ. Η ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΉ ΜΕΤΑΒΛΗΤΌΤΗΤΑ ΕΊΝΑΙ ΤΟ ΑΠΟΤΈΛΕΣΜΑ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΏΝ ΔΙΕΡΓΑΣΙΏΝ ΠΟΥ ΕΙΣΆΓΟΥΝ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΟΎΣ ΤΎΠΟΥΣ ΜΕΤΑΛΛΆΞΕΩΝ. ΤΑ ΣΦΆΛΜΑΤΑ ΣΤΗΝ ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΉ ΤΟΥ DNA, ΣΤΗΝ ΥΠΕΡΙΏΔΗ ΑΚΤΙΝΟΒΟΛΊΑ ΚΑΙ ΣΤΗΝ ΈΚΘΕΣΗ ΣΕ ΟΡΙΣΜΈΝΕΣ ΧΗΜΙΚΈΣ ΟΥΣΊΕΣ ΈΧΟΥΝ ΩΣ ΑΠΟΤΈΛΕΣΜΑ ΜΕΜΟΝΩΜΈΝΟΥΣ NUCLEOTITED ΠΟΛΥΜΟΡΦΙΣΜΟΎΣ (NPS) Ή ΜΙΚΡΈΣ ΠΑΡΕΜΒΟΛΈΣ/ΔΙΑΓΡΑΦΈΣ, ΕΝΏ ΆΛΛΕΣ ΔΙΕΡΓΑΣΊΕΣ, ΌΠΩΣ Η ΚΊΝΗΣΗ TRANSPOSON Ή Ο ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΌΣ ΤΟΥΣ, ΟΔΗΓΟΎΝ ΣΕ ΜΕΓΆΛΕΣ ΕΙΣΑΓΩΓΈΣ/ΔΙΑΓΡΑΦΈΣ ΚΑΙ ΧΡΩΜΟΣΩΜΙΚΈΣ ΑΝΑΔΙΟΡΓΑΝΏΣΕΙΣ. ΆΛΛΕΣ ΔΙΕΡΓΑΣΊΕΣ, ΠΟΥ ΣΧΕΤΊΖΟΝΤΑΙ ΕΠΊΣΗΣ ΜΕ ΤΗ ΔΡΑΣΤΗΡΙΌΤΗΤΑ ΜΕΤΑΦΟΡΆΣ, ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΈΧΟΥΝ ΩΣ ΑΠΟΤΈΛΕΣΜΑ ΤΗ ΔΙΑΚΎΜΑΝΣΗ ΤΗΣ ΠΑΡΟΥΣΊΑΣ/ΑΠΟΥΣΊΑΣ (PAV) ΓΟΝΙΔΊΩΝ. ΌΛΕΣ ΑΥΤΈΣ ΟΙ ΜΕΤΑΛΛΆΞΕΙΣ ΔΗΜΙΟΥΡΓΟΎΝ ΜΕΤΑΒΛΗΤΌΤΗΤΑ ΠΟΥ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΕΠΙΛΕΓΕΊ ΚΑΤΆ ΤΗ ΔΙΆΡΚΕΙΑ ΤΗΣ ΕΞΈΛΙΞΗΣ, ΣΥΜΠΕΡΙΛΑΜΒΑΝΟΜΈΝΗΣ ΤΗΣ ΕΞΗΜΕΡΏΣΕΩΣ ΚΑΙ ΤΗΣ ΒΕΛΤΊΩΣΗΣ ΤΩΝ ΦΥΤΏΝ. Η ΕΠΙΛΟΓΉ ΕΠΗΡΕΆΖΕΙ ΔΙΑΦΟΡΙΚΆ ΤΗ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΉ ΠΟΙΚΙΛΌΤΗΤΑ, ΚΑΘΏΣ ΣΤΟΧΕΎΕΙ ΣΕ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΕΣ ΠΕΡΙΟΧΈΣ ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΟΣ ΠΟΥ ΠΕΡΙΈΧΟΥΝ ΓΟΝΊΔΙΑ ΠΟΥ ΡΥΘΜΊΖΟΥΝ ΤΑ ΕΠΙΛΕΓΜΈΝΑ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΆ. Η ΑΝΑΖΉΤΗΣΗ ΠΕΡΙΟΧΏΝ ΧΑΜΗΛΉΣ ΜΕΤΑΒΛΗΤΌΤΗΤΑΣ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΒΟΗΘΉΣΕΙ ΣΤΟΝ ΕΝΤΟΠΙΣΜΌ ΤΩΝ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ Ή ΜΕΤΑΛΛΆΞΕΩΝ ΣΤΙΣ ΟΠΟΊΕΣ ΒΑΣΊΖΟΝΤΑΙ ΟΙ ΕΞΕΛΙΚΤΙΚΈΣ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΕΣ. Η παρούσα ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΚΗ ΓΕΝΙΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΕΣ είναι σημαντική για τον καθορισμό των σκοπών για τους οποίους θα συμφωνηθούν οι καλύτεροι στόχοι της GENETICA._x000D_ η πλήρης αλληλουχία των γονιδιών των πολιτιστικών ειδών, καθώς και η ανάπτυξη βιο-πληροφοριακών μεθόδων και εργαλείων για τη σύγκριση αυτών των γονιδίων, επιτρέπουν για πρώτη φορά μια ΑΝΑΛΥΣΗ ΤΗΣ ΓΕΝΙΚΗΣ VARIABILITY OF Cultive SPECIES. ΟΙ ΟΜΆΔΕΣ ΠΟΥ ΠΑΡΟΥΣΊΑΣΑΝ ΤΗΝ ΠΡΌΤΑΣΗ ΑΥΤΉ ΟΔΉΓΗΣΑΝ ΣΤΗΝ ΑΛΛΗΛΟΥΧΊΑ ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΟΣ ΤΟΥ ΠΕΠΟΝΙΟΎ ΚΑΙ ΆΡΧΙΣΑΝ ΝΑ ΑΝΑΛΎΟΥΝ ΤΗ ΜΕΤΑΒΛΗΤΌΤΗΤΑ ΤΟΥ ΜΕ ΒΆΣΗ ΣΤΟΙΧΕΊΑ ΣΧΕΤΙΚΆ ΜΕ ΤΗΝ ΑΠΑΛΟΙΦΉ ΤΩΝ ΠΟΙΚΙΛΙΏΝ. ΈΧΟΥΝ ΕΠΊΣΗΣ ΑΝΑΠΤΎΞΕΙ ΕΡΓΑΛΕΊΑ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΗΣ ΜΕΤΑΒΛΗΤΌΤΗΤΑΣ ΛΌΓΩ ΤΌΣΟ ΤΩΝ SNP ΌΣΟ ΚΑΙ ΤΗΣ ΚΊΝΗΣΗΣ TRANSPOSON. ΣΕ ΑΥΤΌ ΤΟ ΈΡΓΟ ΠΡΟΤΊΘΕΝΤΑΙ ΝΑ ΒΕΛΤΙΏΣΟΥΝ ΚΑΙ ΝΑ ΕΦΑΡΜΌΣΟΥΝ ΤΑ ΕΡΓΑΛΕΊΑ ΑΥΤΆ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΗΣ ΜΕΤΑΒΛΗΤΌΤΗΤΑΣ ΤΟΥ ΠΕΠΟΝΙΟΎ ΣΕ ΣΎΓΚΡΙΣΗ ΜΕ ΕΚΕΊΝΗ ΤΟΥ ΑΓΓΟΥΡΙΟΎ ΚΑΙ ΤΩΝ ΕΙΔΏΝ ΤΟΥ ΓΈΝΟΥΣ PRUNUS (ΚΥΡΊΩΣ ΡΟΔΆΚΙΝΟ). ΑΥΤΌ ΘΑ ΠΡΈΠΕΙ ΝΑ ΡΊΞΕΙ ΦΩΣ ΣΤΙΣ ΘΕΜΕΛΙΏΔΕΙΣ ΠΤΥΧΈΣ ΤΗΣ ΕΞΈΛΙΞΗΣ ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΟΣ ΤΩΝ ΦΥΤΏΝ ΚΑΙ ΤΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΣΤΑ ΟΠΟΊΑ ΒΑΣΊΖΕΤΑΙ Η ΕΞΟΙΚΕΊΩΣΗ ΚΑΙ Η ΒΕΛΤΊΩΣΗ ΤΟΥ ΠΕΠΟΝΙΟΎ. _x000D_ παρά το γεγονός ότι οι πληροφορίες σχετικά με τη μεταβλητότητα του ΓΕΝΟΜΕ είναι καίριας σημασίας για τον προσδιορισμό των υπεύθυνων ΓΕΝΙΚΩΝ ΒΑΡΥΝΤΩΝ των κατηγοριών που επιλέγονται για την εξοικείωση και τη βελτίωση, για τη μετατροπή των γνώσεων αυτών σε νέες εμπορικές οδούς απαιτούνται καλές μέθοδοι για την επιλεκτική εισαγωγή τους. ΌΤΑΝ Η ΝΈΑ ΓΕΝΕΤΙΚΉ ΠΑΡΑΛΛΑΓΉ ΔΕΝ ΕΊΝΑΙ ΔΙΑΘΈΣΙΜΗ ΣΤΗ ΓΕΝΕΤΙΚΉ ΟΜΆΔΑ, ΜΠΟΡΟΎΝ ΝΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΜΌΝΟ ΔΎΟ ΣΤΡΑΤΗΓΙΚΈΣ: ΤΥΧΑΊΕΣ ΜΕΤΑΛΛΆΞΕΙΣ ΣΕ ΣΤΡΑΤΗΓΙΚΈΣ ΌΠΩΣ ΤΟ ΌΡΓΩΜΑ, ΚΑΙ Η ΔΙΑΓΈΝΕΣΗ. ΩΣΤΌΣΟ, ΚΑΙ ΟΙ ΔΎΟ ΈΧΟΥΝ ΣΗΜΑΝΤΙΚΟΎΣ ΠΕΡΙΟΡΙΣΜΟΎΣ. ΤΑ ΤΕΛΕΥΤΑΊΑ ΧΡΌΝΙΑ ΑΝΑΠΤΎΣΣΟΝΤΑΙ ΝΈΑ ΕΡΓΑΛΕΊΑ ΠΟΥ ΒΑΣΊΖΟΝΤΑΙ ΣΤΗ ΧΡΉΣΗ ΕΙΔΙΚΏΝ ΝΟΥΚΛΕΑΣΏΝ (SDN) ΓΙΑ ΤΗ ΣΤΟΧΕΥΜΈΝΗ ΕΙΣΑΓΩΓΉ ΠΑΡΑΛΛΑΓΏΝ GENICAS ΠΟΥ ΑΝΑΜΈΝΕΤΑΙ ΝΑ ΕΠΙΤΡΈΨΟΥΝ ΜΙΑ ΝΈΑ ΓΕΝΙΆ ΓΕΝΕΤΙΚΏΣ ΤΡΟΠΟΠΟΙΗΜΈΝΩΝ ΦΥΤΏΝ ΜΕ ΠΙΟ ΠΡΟΒΛΈΨΙΜΟΥΣ ΚΑΙ ΑΣΦΑΛΈΣΤΕΡΟΥΣ ΦΑΙΝΌΤΥΠΟΥΣ. ΣΤΟ ΈΡΓΟ ΑΥΤΌ ΠΡΟΤΕΊΝΟΥΜΕ (Α) ΤΗ ΔΙΕΝΈΡΓΕΙΑ ΛΕΠΤΟΜΕΡΟΎΣ ΑΝΆΛΥΣΗΣ ΤΗΣ ΜΕΤΑΒΛΗΤΌΤΗΤΑΣ ΠΟΥ ΔΗΜΙΟΥΡΓΕΊΤΑΙ ΚΑΙ ΕΠΙΛΈΧΘΗΚΕ ΚΑΤΆ ΤΗΝ ΠΡΌΣΦΑΤΗ ΕΞΈΛΙΞΗ ΤΩΝ ΚΑΛΛΙΕΡΓΟΎΜΕΝΩΝ ΕΙΔΏΝ ΙΔΙΑΊΤΕΡΗΣ ΣΗΜΑΣΊΑΣ ΚΑΙ (Β) ΤΗΝ ΈΝΑΡΞΗ ΜΙΑΣ ΝΈΑΣ ΓΡΑΜΜΉΣ ΈΡΕΥΝΑΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΠΡΟΣΕΓΓΊΣΕΩΝ ΜΕ ΒΆΣΗ ΤΑ SDN ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΙΣΑΓΩΓΉ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΩΝ ΜΕΤΑΛΛΆΞΕΩΝ ΣΤΑ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΑ ΤΩΝ ΚΑΛΛΙΕΡΓΟΎΜΕΝΩΝ ΦΥΤΏΝ. (Greek)
18 August 2022
0 references
GENOMISK VARIABILITET ER GRUNDLAGET FOR UDVÆLGELSEN. DERFOR ER DET VIGTIGT AT KENDE DE MEKANISMER, DER GENERERER DET. GENOMISK VARIABILITET ER RESULTATET AF FORSKELLIGE PROCESSER, DER INTRODUCERER FORSKELLIGE TYPER MUTATIONER. FEJL I DNA REPLIKATION, UV-STRÅLING OG EKSPONERING FOR NOGLE KEMIKALIER RESULTERER I ENKELT NUCLEOTITED POLYMORFIER (NPS) ELLER SMÅ INDSÆTTELSER/SLETNINGER, MENS ANDRE PROCESSER, SÅSOM TRANSPOSON BEVÆGELSE ELLER DERES REKOMBINATION, RESULTERER I STORE INDSÆTTELSER/SLETNINGER OG KROMOMISKE REORGANISERINGER. ANDRE PROCESSER, OGSÅ RELATERET TIL TRANSPOSON AKTIVITET, KAN RESULTERE I VARIATION I TILSTEDEVÆRELSE/FRAVÆR (PAV) AF GENER. ALLE DISSE MUTATIONER GENERERER VARIABILITET, DER KAN VÆLGES UNDER EVOLUTION, HERUNDER DOMESTICATION OG PLANTEFORBEDRING. UDVÆLGELSEN PÅVIRKER FORSKELLIGT DEN GENOMISKE MANGFOLDIGHED, DA DEN ER RETTET MOD SPECIFIKKE REGIONER AF GENOMET, DER INDEHOLDER GENER, DER REGULERER DE VALGTE TRÆK. SØGNING EFTER REGIONER MED LAV VARIABILITET KAN HJÆLPE MED AT IDENTIFICERE DE SPECIFIKKE GENER ELLER MUTATIONER, DER LIGGER TIL GRUND FOR EVOLUTIONÆRE PROCESSER. Denne INFORMATION er af stor værdi for at definere, hvad der er de mål, der skal aftales i det bedste af GENETICA._x000D_ den fuldstændige sekventering af genomer AF Kultive SPECIES, samt udvikling af bio-informative metoder og værktøjer til sammenligning af disse gener, tillader for første gang en EKSHAUSTIVE ANALYSIS AF GENOMISKE VARIABILITY AF Kultive SPECIES. DE GRUPPER, DER FREMLÆGGER DETTE FORSLAG, HAR FØRT TIL RÆKKEFØLGEN AF MELONGENOMET OG ER BEGYNDT AT ANALYSERE DETS VARIABILITET PÅ GRUNDLAG AF DATA OM SORTERS RESECUENCIACION. DE HAR OGSÅ UDVIKLET VÆRKTØJER TIL AT ANALYSERE VARIABILITET PÅ GRUND AF BÅDE SNP'ER OG TRANSPOSON BEVÆGELSE. I DETTE PROJEKT AGTER DE AT FORFINE OG ANVENDE DISSE VÆRKTØJER TIL AT ANALYSERE VARIABILITETEN AF MELON I FORHOLD TIL AGURKER OG ARTER AF SLÆGTEN PRUNUS (HOVEDSAGELIG FERSKEN). DETTE BØR KASTE LYS OVER DE GRUNDLÆGGENDE ASPEKTER AF UDVIKLINGEN AF PLANTEGENOMET OG DE GENER, DER LIGGER TIL GRUND FOR TÆMMELSEN OG FORBEDRINGEN AF MELON. _x000D_ selv om oplysningerne om variabiliteten i GENOME er afgørende for identifikationen af de ansvarlige GENICAL VARIANTS for de kategorier, der er udvalgt i forbindelse med husholdning og forbedring, er det med henblik på at omdanne denne viden til nye handelsruter nødvendigt med gode metoder til selektiv indførelse heraf. NÅR DEN NYE GENETISKE VARIANT IKKE ER TILGÆNGELIG I PULJEN GENETIK, KAN DER KUN ANVENDES TO STRATEGIER: TILFÆLDIGE MUTATIONER I STRATEGIER SOM FLISEBEARBEJDNING OG TRANSGENESE. BEGGE HAR DOG BETYDELIGE BEGRÆNSNINGER. I LØBET AF DE SENESTE ÅR ER DER VED AT BLIVE UDVIKLET NYE VÆRKTØJER BASERET PÅ BRUGEN AF SPECIFIKKE NUKLEASER (SDN'ER) TIL MÅLRETTET INDFØRELSE AF GENICAS-VARIANTER, SOM SKULLE MULIGGØRE EN NY GENERATION AF GENETISK MODIFICEREDE PLANTER MED MERE FORUDSIGELIGE OG SIKRERE FÆNOTYPER. I DETTE PROJEKT FORESLÅR VI (A) AT FORETAGE EN DETALJERET ANALYSE AF DEN VARIABILITET, DER GENERERES OG UDVÆLGES UNDER DEN SENESTE UDVIKLING AF DYRKEDE ARTER AF SÆRLIG RELEVANS, OG (B) AT INDLEDE EN NY FORSKNINGSLINJE I UDVIKLINGEN AF TILGANGE BASERET PÅ SDN'ER FOR AT INDFØRE SPECIFIKKE MUTATIONER I DE DYRKEDE PLANTERS GENOMER. (Danish)
18 August 2022
0 references
GENOMIVAIHTELU ON VALINTAPERUSTEENA. SIKSI ON TÄRKEÄÄ TIETÄÄ MEKANISMIT, JOTKA TUOTTAVAT SEN. GENOMIVAIHTELU ON SEURAUSTA ERILAISISTA PROSESSEISTA, JOISSA OTETAAN KÄYTTÖÖN ERILAISIA MUTAATIOTYYPPEJÄ. DNA-REPLIKAATIOSSA, UV-SÄTEILYSSÄ JA JOILLEKIN KEMIKAALEILLE ALTISTUMISESSA ESIINTYVÄT VIRHEET JOHTAVAT YKSITTÄISEEN NUCLEOTITED-POLYMORFISMIIN (NPS) TAI PIENIIN LISÄYKSIIN/POISTOIHIN, KUN TAAS MUUT PROSESSIT, KUTEN TRANSPOSONILIIKKEET TAI NIIDEN REKOMBINAATIO, JOHTAVAT SUURIIN LISÄYKSIIN/POISTOIHIN JA KROMOSOMISIIN UUDELLEENJÄRJESTELYIHIN. MUUT PROSESSIT, JOTKA LIITTYVÄT MYÖS TRANSPOSONIAKTIIVISUUTEEN, VOIVAT JOHTAA GEENIEN ESIINTYMISEN JA PUUTTUMISEN (PAV) VAIHTELUUN. KAIKKI NÄMÄ MUTAATIOT TUOTTAVAT VAIHTELUA, JOKA VOIDAAN VALITA EVOLUUTION AIKANA, MUKAAN LUKIEN KESYTYS JA KASVIEN PARANTAMINEN. VALINTA VAIKUTTAA ERI TAVOIN GENOMISEEN MONIMUOTOISUUTEEN, SILLÄ SE KOHDISTUU TIETTYIHIN GENOMIA SISÄLTÄVIÄ GEENEJÄ SISÄLTÄVIIN ALUEISIIN, JOTKA SÄÄTELEVÄT VALITTUJA OMINAISUUKSIA. VÄHÄISEN VAIHTELUN ALUEIDEN ETSIMINEN VOI AUTTAA TUNNISTAMAAN EVOLUUTIOPROSESSIEN TAUSTALLA OLEVAT GEENIT TAI MUTAATIOT. Tämä TIEDOT on erittäin arvokas, jotta voidaan määritellä, mitkä ovat ne päämäärät, joista on sovittava parhaassa GENETICA._x000D_ Cultive SPECIES -sukujen täydellisen sekvensoinnin sekä bioinformatiivisten menetelmien ja työkalujen kehittämisen näiden geenien vertailemiseksi sallivat ensimmäistä kertaa Cultive SPECIESin GENOMICIN VARIALITYSIN TUNNUKSEN. TÄMÄN EHDOTUKSEN ESITTÄNEET RYHMÄT JOHTIVAT MELONIN GENOMIN SEKVENSOINTIA JA OVAT ALKANEET ANALYSOIDA SEN VAIHTELUA LAJIKKEIDEN RESECUENCIACION-TIETOJEN PERUSTEELLA. NE OVAT MYÖS KEHITTÄNEET VÄLINEITÄ, JOILLA ANALYSOIDAAN SEKÄ SNP- ETTÄ TÄYTÄNTÖÖNPANOLIIKKEESTÄ JOHTUVAA VAIHTELEVUUTTA. TÄSSÄ HANKKEESSA NE AIKOVAT JALOSTAA JA SOVELTAA NÄITÄ TYÖKALUJA ANALYSOIDAKSEEN MELONIN VAIHTELUA KURKKUUN JA PRUNUS-SUKUUN (PÄÄASIASSA PERSIKKA) VERRATTUNA. TÄMÄN PITÄISI VALAISTA PERUSNÄKÖKOHTIA KASVIN GENOMIN EVOLUUTIOSTA JA MELONIN KESYTYKSEN JA PARANTAMISEN TAUSTALLA OLEVISTA GEENEISTÄ. _x000D_ vaikka GENOME:n vaihtelevuutta koskevat tiedot ovat keskeisessä asemassa kesynnoinnissa ja parantamisessa valittujen luokkien vastuullisten YLEISTEN VARIANTSjen tunnistamisessa, tämän tiedon muuttamiseksi uusiksi kauppareiteiksi vaaditaan hyviä menetelmiä niiden valikoivan käyttöönoton varmistamiseksi. JOS UUTTA GENEETTISTÄ VARIANTTIA EI OLE SAATAVILLA GENEETTISESSÄ POOLISSA, VOIDAAN KÄYTTÄÄ VAIN KAHTA STRATEGIAA: SATUNNAISET MUTAATIOT STRATEGIOISSA, KUTEN MUOKKAUS JA TRANSGENEESI. MOLEMMILLA ON KUITENKIN MERKITTÄVIÄ RAJOITUKSIA. VIIME VUOSINA KEHITETÄÄN UUSIA VÄLINEITÄ, JOTKA PERUSTUVAT ERITYISTEN NUKLEAASIEN (SDN) KÄYTTÖÖN, JOTTA GENICAS-MUUNNOKSET VOIDAAN OTTAA KOHDENNETUSTI KÄYTTÖÖN JA JOIDEN PITÄISI MAHDOLLISTAA UUDEN SUKUPOLVEN GENEETTISESTI MUUNNETTUJA KASVEJA, JOIDEN FENOTYYPIT OVAT ENNUSTETTAVISSA JA TURVALLISEMPIA. TÄSSÄ HANKKEESSA EHDOTAMME A) YKSITYISKOHTAISEN ANALYYSIN TEKEMISTÄ ERITYISEN MERKITTÄVIEN VILJELTYJEN LAJIEN VIIMEAIKAISEN KEHITYKSEN AIKANA SYNTYNEESTÄ JA VALITUSTA VAIHTELUSTA JA B) UUDEN TUTKIMUSLINJAN KÄYNNISTÄMISTÄ SDN:IIN PERUSTUVIEN LÄHESTYMISTAPOJEN KEHITTÄMISEKSI ERITYISTEN MUTAATIOIDEN KÄYTTÖÖNOTTAMISEKSI VILJELTYJEN KASVIEN GENOMISSA. (Finnish)
18 August 2022
0 references
IL-VARJABBILTÀ ĠENOMIKA HIJA L-BAŻI LI FUQHA TOPERA L-GĦAŻLA. GĦALHEKK, HUWA IMPORTANTI LI WIEĦED IKUN JAF IL-MEKKANIŻMI LI JIĠĠENERAWH. IL-VARJABILITÀ ĠENOMIKA HIJA R-RIŻULTAT TA’ PROĊESSI DIFFERENTI LI JINTRODUĊU TIPI DIFFERENTI TA’ MUTAZZJONIJIET. L-IŻBALJI FIR-REPLIKAZZJONI TAD-DNA, IR-RADJAZZJONI UV U L-ESPONIMENT GĦAL XI SUSTANZI KIMIĊI JIRRIŻULTAW F’POLIMORFIŻMI NUCLEOTITED (NPS) SINGOLI JEW INSERZJONIJIET/TĦASSIR ŻGĦAR, FILWAQT LI PROĊESSI OĦRA, BĦALL-MOVIMENT TAT-TRANSPOSON JEW IR-RIKOMBINAZZJONI TAGĦHOM, JIRRIŻULTAW F’INSERZJONIJIET/TĦASSIR KBAR U RIORGANIZZAZZJONIJIET KROMOŻOMIĊI. PROĊESSI OĦRA, RELATATI WKOLL MAL-ATTIVITÀ TA’ TRANSPOSON, JISTGĦU JIRRIŻULTAW FIL-VARJAZZJONI TAL-PREŻENZA/NUQQAS TA’ PREŻENZA (PAV) TA’ ĠENI. DAWN IL-MUTAZZJONIJIET KOLLHA JIĠĠENERAW VARJABILITÀ LI TISTA’ TINTGĦAŻEL MATUL L-EVOLUZZJONI, INKLUŻI D-DOMESTIKAZZJONI U T-TITJIB TAL-PJANTI. L-GĦAŻLA B’MOD DIFFERENZJALI TAFFETTWA D-DIVERSITÀ ĠENOMIKA, PERESS LI TIMMIRA REĠJUNI SPEĊIFIĊI TAL-ĠENI LI FIHOM IL-ĠENOMA LI JIRREGOLAW IL-KARATTERISTIĊI MAGĦŻULA. IT-TIFTIX GĦAL REĠJUNI TA’ VARJABBILTÀ BAXXA JISTA’ JGĦIN BIEX JIĠU IDENTIFIKATI L-ĠENI JEW IL-MUTAZZJONIJIET SPEĊIFIĊI LI HUMA L-BAŻI TAL-PROĊESSI EVOLUZZJONARJI. Din l-INFORMAZZJONI hija ta’ valur kbir sabiex tiddefinixxi x’inhuma t-truf li fuqhom għandu jiġi miftiehem fl-aħjar ta’ GENETICA._x000D_ is-sekwenzjar sħiħ tal-ġenoms ta’ SPECIES Kultivi, kif ukoll l-iżvilupp ta’ metodi u għodod bijo-informattivi biex iqabblu dawn il-ġeni, jippermettu għall-ewwel darba l-ANALIŻI ESHAUSTIVE TAL-VARJABILITÀ ĠENOMIKA TA’ SPECJJI Kultattivi. IL-GRUPPI LI PPREŻENTAW DIN IL-PROPOSTA WASSLU GĦAS-SEKWENZAR TAL-ĠENOMA TAL-BETTIEĦ U BDEW JANALIZZAW IL-VARJABBILTÀ TIEGĦU ABBAŻI TAD-DATA DWAR IR-RESECUENCIACION TAL-VARJETAJIET. HUMA ŻVILUPPAW UKOLL GĦODOD BIEX JANALIZZAW IL-VARJABBILTÀ KEMM MINĦABBA L-SNPS KIF UKOLL MINĦABBA L-MOVIMENT TAT-TRANSPOSON. F’DAN IL-PROĠETT BIĦSIEBHOM JIRFINAW U JAPPLIKAW DAWN L-GĦODOD BIEX JANALIZZAW IL-VARJABBILTÀ TAL-BETTIEĦ META MQABBLA MA’ DIK TAL-ĦJAR U L-ISPEĊIJIET TAL-ĠENERU PRUNUS (PRINĊIPALMENT IL-ĦAWĦ). DAN GĦANDU JIXĦET DAWL FUQ L-ASPETTI FUNDAMENTALI TA ‘L-EVOLUZZJONI TAL-ĠENOMA TAL-PJANTI U L-ĠENI SOTTOSTANTI L-DOMESTIKAZZJONI U T-TITJIB TAL-BETTIEĦ. _x000D_ għalkemm l-informazzjoni dwar il-varjabbiltà tal-GENOME hija essenzjali għall-identifikazzjoni tal-VARIANTS ĠENIKALI responsabbli tal-kategoriji magħżula fid-domestikazzjoni u t-titjib, għall-fini tat-trasformazzjoni ta’ dan l-għarfien f’rotot kummerċjali ġodda hija meħtieġa metodi tajbin għall-introduzzjoni selettiva tagħhom. META L-VARJANT ĠENETIKU L-ĠDID MA JKUNX DISPONIBBLI FIL-ĠENETIKA TAL-POOL, JISTGĦU JINTUŻAW BISS ŻEWĠ STRATEĠIJI: MUTAZZJONIJIET KAŻWALI FI STRATEĠIJI BĦALL-ĦDIM, U T-TRANSĠENESI. MADANKOLLU, IT-TNEJN LI HUMA GĦANDHOM LIMITAZZJONIJIET IMPORTANTI. MATUL DAWN L-AĦĦAR SNIN, QED JIĠU ŻVILUPPATI GĦODOD ĠODDA BBAŻATI FUQ L-UŻU TA’ NUCLEASES SPEĊIFIĊI (SDNS) GĦALL-INTRODUZZJONI MMIRATA TAL-VARJANTI GENICAS LI GĦANDHOM JIPPERMETTU ĠENERAZZJONI ĠDIDA TA’ PJANTI ĠENETIKAMENT MODIFIKATI B’FENOTIPI AKTAR PREVEDIBBLI U AKTAR SIKURI. F’DAN IL-PROĠETT AĦNA NIPPROPONU (A) LI TITWETTAQ ANALIŻI DETTALJATA TAL-VARJABBILTÀ ĠĠENERATA U MAGĦŻULA MATUL L-EVOLUZZJONI REĊENTI TA’ SPEĊIJIET IKKULTIVATI TA’ RILEVANZA PARTIKOLARI, U (B) LI TINBEDA LINJA ĠDIDA TA’ RIĊERKA FL-IŻVILUPP TA’ APPROĊĊI BBAŻATI FUQ L-SDNS BIEX JIĠU INTRODOTTI MUTAZZJONIJIET SPEĊIFIĊI FIL-ĠENOMI TA’ PJANTI KKULTIVATI. (Maltese)
18 August 2022
0 references
GENOMA MAINĪGUMS IR PAMATS, UZ KURA NOTIEK ATLASE. TĀPĒC IR SVARĪGI ZINĀT MEHĀNISMUS, KAS TO RADA. GENOMA MAINĪGUMS IR DAŽĀDU PROCESU REZULTĀTS, KAS IEVIEŠ DAŽĀDA VEIDA MUTĀCIJAS. DNS REPLIKĀCIJAS, UV STAROJUMA UN DAŽU ĶĪMISKO VIELU IEDARBĪBAS KĻŪDAS IZRAISA ATSEVIŠĶUS NUCLEOTITED POLIMORFISMUS (NPS) VAI NELIELUS IEVIETOJUMUS/SVĪTROJUMUS, SAVUKĀRT CITI PROCESI, PIEMĒRAM, TRANSPOZONA KUSTĪBA VAI TO REKOMBINĀCIJA, IZRAISA LIELAS IEVIETOŠANAS/SVĪTROJUMUS UN HROMOSOMU REORGANIZĀCIJU. CITI PROCESI, KAS SAISTĪTI ARĪ AR TRANSPOZONA AKTIVITĀTI, VAR IZRAISĪT GĒNU KLĀTBŪTNES/TRŪKUMA (PAV) VARIĀCIJU. VISAS ŠĪS MUTĀCIJAS RADA MAINĪGUMU, KO VAR IZVĒLĒTIES EVOLŪCIJAS LAIKĀ, IESKAITOT DOMESTICĀCIJU UN AUGU UZLABOŠANU. SELEKCIJA ATŠĶIRĪGI IETEKMĒ GENOMISKO DAUDZVEIDĪBU, JO TĀ IR VĒRSTA UZ KONKRĒTIEM GENOMA REĢIONIEM, KAS SATUR GĒNUS, KURI REGULĒ ATLASĪTĀS ĪPAŠĪBAS. MEKLĒJOT REĢIONUS AR ZEMU MAINĪGUMU, VAR PALĪDZĒT NOTEIKT KONKRĒTUS GĒNUS VAI MUTĀCIJAS, KAS IR EVOLŪCIJAS PROCESU PAMATĀ. Šī INFORMĀCIJA ir ļoti vērtīga, lai noteiktu, kādi ir gali, par kuriem jāvienojas labākajā GENETICA._x000D_ Kultīvu SPECIES genomu pilnīga sekvencēšana, kā arī bioinformatīvu metožu un rīku izstrāde, lai salīdzinātu šos gēnus, pirmo reizi ļauj izmantot ĢENOMIKAS VARIABILITY OF Cultive SPECIES. GRUPAS, KAS IESNIEDZA ŠO PRIEKŠLIKUMU, NOTEICA MELONES GENOMA SEKVENCĒŠANU UN SĀKA ANALIZĒT TĀ MAINĪGUMU, PAMATOJOTIES UZ DATIEM PAR ŠĶIRŅU RESECUENCIACION. TĀS IR ARĪ IZSTRĀDĀJUŠAS INSTRUMENTUS, LAI ANALIZĒTU MAINĪGUMU GAN SNPS, GAN TRANSPOZONA KUSTĪBAS DĒĻ. ŠAJĀ PROJEKTĀ TĀS PLĀNO PILNVEIDOT UN IZMANTOT ŠOS INSTRUMENTUS, LAI ANALIZĒTU MELONES MAINĪGUMU SALĪDZINĀJUMĀ AR GURĶU UN PRUNUS ĢINTS SUGU (GALVENOKĀRT PERSIKU) MAINĪBU. TAM VAJADZĒTU ATKLĀT AUGU GENOMA EVOLŪCIJAS BŪTISKOS ASPEKTUS UN GĒNUS, KAS IR MELONES PIERADINĀŠANAS UN UZLABOŠANAS PAMATĀ. _x000D_ lai gan informācija par GENOME mainīgumu ir būtiska, lai noteiktu atbildīgos GENICAL VARIANTS kategorijās, kas izvēlētas iekšzemē un uzlabojumos, lai šīs zināšanas pārvērstu jaunos tirdzniecības maršrutos, ir vajadzīgas labas metodes to selektīvai ieviešanai. JA JAUNAIS ĢENĒTISKAIS VARIANTS NAV PIEEJAMS BASEINĀ GENETICO, VAR IZMANTOT TIKAI DIVAS STRATĒĢIJAS: NEJAUŠAS MUTĀCIJAS TĀDĀS STRATĒĢIJĀS KĀ APSTRĀDE UN TRANSĢENĒZE. TOMĒR ABIEM IR BŪTISKI IEROBEŽOJUMI. PĒDĒJO GADU LAIKĀ TIEK IZSTRĀDĀTI JAUNI RĪKI, KURU PAMATĀ IR SPECIFISKU KODOLU (SDN) IZMANTOŠANA, LAI MĒRĶTIECĪGI IEVIESTU GENICAS VARIANTUS, KAM BŪTU JĀNODROŠINA JAUNAS PAAUDZES ĢENĒTISKI MODIFICĒTI AUGI AR PAREDZAMĀKIEM UN DROŠĀKIEM FENOTIPIEM. ŠAJĀ PROJEKTĀ MĒS IEROSINĀM: A) VEIKT DETALIZĒTU ANALĪZI PAR ATŠĶIRĪBĀM, KAS RADUŠĀS UN IZVĒLĒTAS, NESEN ATTĪSTOTIES ĪPAŠI NOZĪMĪGĀM KULTIVĒTĀM SUGĀM, UN B) UZSĀKT JAUNU PĒTĪJUMU VIRZIENU, LAI IZSTRĀDĀTU PIEEJAS, KURU PAMATĀ IR SDN, LAI IEVIESTU ĪPAŠAS MUTĀCIJAS KULTIVĒTO AUGU GENOMOS. (Latvian)
18 August 2022
0 references
GENÓMOVÁ VARIABILITA JE ZÁKLAD, NA KTOROM VÝBER FUNGUJE. PRETO JE DÔLEŽITÉ POZNAŤ MECHANIZMY, KTORÉ JU VYTVÁRAJÚ. GENÓMOVÁ VARIABILITA JE VÝSLEDKOM RÔZNYCH PROCESOV, KTORÉ ZAVÁDZAJÚ RÔZNE TYPY MUTÁCIÍ. CHYBY V REPLIKÁCII DNA, UV ŽIARENÍ A EXPOZÍCII NIEKTORÝM CHEMIKÁLIÁM MAJÚ ZA NÁSLEDOK JEDNOTLIVÉ NUCLEOTITED POLYMORFIZMY (NPS) ALEBO MALÉ VLOŽENIE/VYPÚŠŤANIE, ZATIAĽ ČO INÉ PROCESY, AKO JE POHYB TRANSPOZÓNU ALEBO ICH REKOMBINÁCIA, MAJÚ ZA NÁSLEDOK VEĽKÉ VKLADANIE/VYPÚŠŤANIE A REORGANIZÁCIU CHROMOZÓMOV. INÉ PROCESY, KTORÉ SÚVISIA AJ S TRANSPOSONICKOU AKTIVITOU, MÔŽU VIESŤ K ZMENE PRÍTOMNOSTI/ABSENCIE (PAV) GÉNOV. VŠETKY TIETO MUTÁCIE VYTVÁRAJÚ VARIABILITU, KTORÚ MOŽNO VYBRAŤ POČAS EVOLÚCIE, VRÁTANE DOMESTIKÁCIE A ZLEPŠENIA RASTLÍN. VÝBER MÁ ODLIŠNÝ VPLYV NA GENÓMOVÚ ROZMANITOSŤ, PRETOŽE SA ZAMERIAVA NA KONKRÉTNE REGIÓNY GENÓMU OBSAHUJÚCEHO GÉNY, KTORÉ REGULUJÚ VYBRANÉ ZNAKY. HĽADANIE OBLASTÍ S NÍZKOU VARIABILITOU MÔŽE POMÔCŤ IDENTIFIKOVAŤ ŠPECIFICKÉ GÉNY ALEBO MUTÁCIE, KTORÉ SÚ ZÁKLADOM EVOLUČNÝCH PROCESOV. Toto INFORMÁCIE má veľký význam pre definovanie cieľov, na ktorých sa má dohodnúť v najlepšom z GENETICA._x000D_ úplné sekvenovanie genómov Cultive SPECIES, ako aj vývoj bioinformačných metód a nástrojov na porovnanie týchto génov, umožňujú prvýkrát EXHAUSTIVE ANALYSIS GENOMICKÝCH VARIABILITY Kultívnych SPECIES. SKUPINY, KTORÉ TENTO NÁVRH PREDLOŽILI, VIEDLI SEKVENOVANIE MELÓNOVÉHO GENÓMU A ZAČALI ANALYZOVAŤ JEHO VARIABILITU NA ZÁKLADE ÚDAJOV O RESECUENCIÁCIU ODRÔD. VYVINULI TIEŽ NÁSTROJE NA ANALÝZU VARIABILITY V DÔSLEDKU POHYBU SNP A TRANSPOZÓNU. V TOMTO PROJEKTE MAJÚ V ÚMYSLE ZDOKONALIŤ A POUŽIŤ TIETO NÁSTROJE NA ANALÝZU VARIABILITY MELÓNU V POROVNANÍ S VARIABILITOU UHORKY A DRUHOV RODU PRUNUS (NAJMÄ BROSKYNE). TO BY MALO OBJASNIŤ ZÁKLADNÉ ASPEKTY VÝVOJA RASTLINNÉHO GENÓMU A GÉNOV, KTORÉ SÚ ZÁKLADOM DOMESTIKÁCIE A ZLEPŠENIA MELÓNU. _x000D_ hoci informácie o variabilite GENOME sú kľúčom k identifikácii zodpovedných GENICAL VARIANTov kategórií vybraných v oblasti domestikácie a zlepšovania, na účely premeny týchto poznatkov na nové obchodné trasy sa vyžadujú dobré metódy ich selektívneho zavedenia. AK NOVÝ GENETICKÝ VARIANT NIE JE K DISPOZÍCII V GENETICKOM BAZÉNE, MÔŽU SA POUŽIŤ LEN DVE STRATÉGIE: NÁHODNÉ MUTÁCIE V STRATÉGIÁCH AKO OBRÁBANIE A TRANSGENÉZA. OBE VŠAK MAJÚ DÔLEŽITÉ OBMEDZENIA. V POSLEDNÝCH ROKOCH SA VYVÍJAJÚ NOVÉ NÁSTROJE ZALOŽENÉ NA POUŽÍVANÍ ŠPECIFICKÝCH NUKLEÁZ (SDN) NA CIELENÉ ZAVEDENIE VARIANTOV GENICAS, KTORÉ BY MALI UMOŽNIŤ NOVÚ GENERÁCIU GENETICKY MODIFIKOVANÝCH RASTLÍN S PREDVÍDATEĽNEJŠÍMI A BEZPEČNEJŠÍMI FENOTYPMI. V TOMTO PROJEKTE NAVRHUJEME (A) VYKONAŤ PODROBNÚ ANALÝZU VARIABILITY VYTVORENEJ A VYBRANEJ POČAS NEDÁVNEHO VÝVOJA PESTOVANÝCH DRUHOV OSOBITNÉHO VÝZNAMU A (B) INICIOVAŤ NOVÚ LÍNIU VÝSKUMU VO VÝVOJI PRÍSTUPOV ZALOŽENÝCH NA SDN S CIEĽOM ZAVIESŤ ŠPECIFICKÉ MUTÁCIE V GENÓMOCH KULTIVOVANÝCH RASTLÍN. (Slovak)
18 August 2022
0 references
IS Í AN INATHRAITHEACHT GHÉANÓMAÍOCH AN BONN AR A N-OIBRÍONN AN ROGHNÚCHÁN. DÁ BHRÍ SIN, TÁ SÉ TÁBHACHTACH GO MBEADH A FHIOS AG NA MEICNÍOCHTAÍ A GHINEANN É. TÁ ÉAGSÚLACHT GHÉANÓMAÍOCH MAR THORADH AR PHRÓISIS ÉAGSÚLA A THUGANN ISTEACH CINEÁLACHA ÉAGSÚLA SÓCHÁN. IS É AN TORADH A BHÍONN AR EARRÁIDÍ I MACASAMHLÚ DNA, RADAÍOCHT UV AGUS NOCHTADH DO ROINNT CEIMICEÁN POLAMORFAIGH NUCLEOTITED AMHÁIN (NPS) NÓ IONSÁ/SCRIOSANNA BEAGA, AGUS MAR THORADH AR PHRÓISIS EILE, AMHAIL GLUAISEACHT TRANSPOSON NÓ A N-ATHCHUINGRIÚ, BÍONN IONSÁ/SCRIOSANNA MÓRA AGUS ATHEAGRÚ CRÓMASÓMACH MAR THORADH ORTHU. D’FHÉADFADH PRÓISIS EILE, A BHAINEANN LE GNÍOMHAÍOCHT TRANSPOSON FREISIN, A BHEITH INA CHÚIS LE HÉAGSÚLACHT LÁITHREACHTA/NEAMHLÁITHREACHTA (PAV) GÉINTE. GINEANN NA SÓCHÁIN SEO GO LÉIR ATHRAITHEACHT IS FÉIDIR A ROGHNÚ LE LINN ÉABHLÓID, LENA N-ÁIRÍTEAR CEANSÚ AGUS FEABHSÚ PLANDAÍ. BÍONN TIONCHAR AG AN ROGHNÚ DIFREÁLACH AR AN ÉAGSÚLACHT GHÉANÓMAÍOCH, TOISC GO NDÍRÍONN SÉ AR RÉIGIÚIN AR LEITH DEN GHÉANÓM INA BHFUIL GÉINTE A RIALAÍONN NA TRÉITHE ROGHNAITHE. IS FÉIDIR LE CUARDACH A DHÉANAMH AR RÉIGIÚIN DE ATHRAITHEACHT ÍSEAL CABHRÚ LEIS NA GÉINTE NÓ SÓCHÁIN AR LEITH A AITHINT ATÁ MAR BHONN LE PRÓISIS ÉABHLÓIDEACHA. Tá an FAISNÉISE luach mór d’fhonn a shainiú cad iad na foircinn ar a bhfuil le comhaontú sa chuid is fearr de GENETICA._x000D_ an seicheamhú iomlán Genoms OF SPECIES cultive, chomh maith le forbairt modhanna agus uirlisí bithfhaisnéiseacha a chur i gcomparáid leis na géinte, cead a thabhairt den chéad uair ANALYSIS SAOR IN AISCE NA GENOMICIÚIL NA SPECIES cultive. BHÍ NA GRÚPAÍ A CHUIREANN AN TOGRA SEO I LÁTHAIR I GCEANNAS AR SHEICHEAMHÚ NA GÉANÓM MELÓN AGUS TÁ TÚS CURTHA ACU LE HANAILÍS A DHÉANAMH AR A INATHRAITHEACHT BUNAITHE AR SHONRAÍ MAIDIR LE RESECUENCIACION CINEÁLACHA. TÁ UIRLISÍ FORBARTHA ACU FREISIN CHUN ANAILÍS A DHÉANAMH AR INATHRAITHEACHT DE BHARR SNPANNA AGUS GLUAISEACHT TRANSPOSON ARAON. SA TIONSCADAL SEO TÁ SÉ AR INTINN ACU NA HUIRLISÍ SEO A BHEACHTÚ AGUS A CHUR I BHFEIDHM CHUN ANAILÍS A DHÉANAMH AR INATHRAITHEACHT MEALBHACÁIN I GCOMPARÁID LE HATHRAITHEACHT CÚCAMAR AGUS SPEICEAS DEN GHÉINEAS PRUNUS (PEACH DEN CHUID IS MÓ). BA CHÓIR É SEO A CHAILLFIDH SOLAS AR GHNÉITHE BUNÚSACHA AN ÉABHLÓID AN GENOME PLANDAÍ AGUS NA GÉINTE IS BUNÚS LEIS AN DOMESTICATION AGUS FEABHAS A CHUR AR MELON. _x000D_ cé go bhfuil an fhaisnéis maidir le hinathraitheacht GENOME ríthábhachtach chun sainaithint a dhéanamh ar na VARIANTS GENICAL freagracha de na catagóirí a roghnaítear sa bhaile agus san fheabhsú, chun an t-eolas sin a athrú go bealaí trádála nua, tá gá le modhanna maithe chun iad a thabhairt isteach go roghnach. NUAIR NACH BHFUIL AN T-ATHRAITHEACH GÉINITEACH NUA AR FÁIL SA LINN GENETICO, NÍ FÉIDIR ACH DHÁ STRAITÉIS A ÚSÁID: SÓCHÁIN RANDAMACH I STRAITÉISÍ COSÚIL LE TILLING, AGUS TRANSGENESIS. MAR SIN FÉIN, TÁ TEORAINNEACHA TÁBHACHTACHA AG AN DÁ CHEANN. LE BLIANTA BEAGA ANUAS, TÁTHAR AG FORBAIRT UIRLISÍ NUA ATÁ BUNAITHE AR ÚSÁID A BHAINT AS NUCLEASES SONRACHA (SDNANNA) CHUN ATHRAITHIGH GENICAS A THABHAIRT ISTEACH AR BHEALACH SPRIOCDHÍRITHE, RUD A LIGFEADH DO GHLÚIN NUA PLANDAÍ GÉINMHODHNAITHE A BHFUIL FEINITÍOPAÍ NÍOS INTUARTHA AGUS NÍOS SÁBHÁILTE ACU. SA TIONSCADAL SEO MOLAIMID (A) ANAILÍS MHIONSONRAITHE A DHÉANAMH AR AN ATHRAITHEACHT A GHINTEAR AGUS A ROGHNAÍODH LE LINN ÉABHLÓID SPEICEAS SAOTHRAITHE A BHFUIL ÁBHARTHACHT AR LEITH AG BAINT LEO LE DÉANAÍ, AGUS (B) TÚS A CHUR LE LÍNE NUA TAIGHDE I BHFORBAIRT CUR CHUIGE BUNAITHE AR SDNANNA CHUN SÓCHÁIN SHONRACHA A THABHAIRT ISTEACH I NGÉANÓIM PLANDAÍ SAOTHRAITHE. (Irish)
18 August 2022
0 references
GENOMOVÁ VARIABILITA JE ZÁKLADEM PRO SELEKCI. PROTO JE DŮLEŽITÉ ZNÁT MECHANISMY, KTERÉ JI VYTVÁŘEJÍ. GENOMOVÁ VARIABILITA JE VÝSLEDKEM RŮZNÝCH PROCESŮ, KTERÉ ZAVÁDĚJÍ RŮZNÉ TYPY MUTACÍ. CHYBY V REPLIKACI DNA, UV ZÁŘENÍ A EXPOZICI NĚKTERÝM CHEMIKÁLIÍM MAJÍ ZA NÁSLEDEK JEDINÉ NUCLEOTITED POLYMORFISMY (NPS) NEBO MALÉ VLOŽENÍ/VYPUŠTĚNÍ, ZATÍMCO JINÉ PROCESY, JAKO JE TRANSPOSONOVÝ POHYB NEBO JEJICH REKOMBINACE, VEDOU K VELKÝM INKLUZÍM/DELECÍM A CHROMOZOMICKÝM REORGANIZACÍM. JINÉ PROCESY, ROVNĚŽ SOUVISEJÍCÍ S TRANSPOSONOVOU AKTIVITOU, MOHOU VÉST KE ZMĚNĚ PŘÍTOMNOSTI/NEPŘÍTOMNOSTI GENŮ. VŠECHNY TYTO MUTACE VYTVÁŘEJÍ VARIABILITU, KTEROU LZE VYBRAT BĚHEM VÝVOJE, VČETNĚ DOMESTIKACE A ZLEPŠENÍ ROSTLIN. VÝBĚR DIFERENCIÁLNĚ OVLIVŇUJE GENOMICKOU ROZMANITOST, PROTOŽE SE ZAMĚŘUJE NA SPECIFICKÉ OBLASTI GENOMU OBSAHUJÍCÍ GENY, KTERÉ REGULUJÍ VYBRANÉ ZNAKY. HLEDÁNÍ OBLASTÍ S NÍZKOU VARIABILITOU MŮŽE POMOCI IDENTIFIKOVAT SPECIFICKÉ GENY NEBO MUTACE, KTERÉ JSOU ZÁKLADEM EVOLUČNÍCH PROCESŮ. Tato INFORMACE má velkou hodnotu, aby bylo možné definovat, na jakých cílech je třeba dohodnout v nejlepším GENETICA._x000D_ kompletní sekvenování genomů kultivačních SPECIES, stejně jako vývoj bio-informativních metod a nástrojů pro porovnání těchto genů, umožňují poprvé EXHAUSTIVE ANALYSIS GENOMICKÉ VARIABILITY kultivačních SPECIES. SKUPINY, KTERÉ TENTO NÁVRH PŘEDLOŽILY, VEDLY K SEKVENOVÁNÍ GENOMU MELOUNU A ZAČALY ANALYZOVAT JEHO VARIABILITU NA ZÁKLADĚ ÚDAJŮ O ODRŮDÁCH RESECUENCIACION. VYVINULI TAKÉ NÁSTROJE PRO ANALÝZU VARIABILITY DÍKY SNP I TRANSPOSONOVÉMU POHYBU. V TOMTO PROJEKTU HODLAJÍ TYTO NÁSTROJE ZDOKONALIT A POUŽÍT K ANALÝZE VARIABILITY MELOUNU VE SROVNÁNÍ S OKURKOU A DRUHY RODU PRUNUS (HLAVNĚ BROSKVÍ). TO BY MĚLO OSVĚTLIT ZÁKLADNÍ ASPEKTY VÝVOJE GENOMU ROSTLIN A GENŮ, KTERÉ JSOU ZÁKLADEM DOMESTIKACE A ZLEPŠENÍ MELOUNU. _x000D_ i když informace o variabilitě GENOME jsou klíčem k identifikaci odpovědných GENICKÝCH VARIANTŮ vybraných kategorií domestikovaných domestikovaných a zdokonalování, za účelem transformace těchto znalostí na nové obchodní trasy je vyžadována dobrá metoda jejich selektivního zavedení. NENÍ-LI NOVÁ GENETICKÁ VARIANTA K DISPOZICI V GENETICE BAZÉNU, LZE POUŽÍT POUZE DVĚ STRATEGIE: NÁHODNÉ MUTACE VE STRATEGIÍCH, JAKO JE OBDĚLÁVÁNÍ A TRANSGENEZE. OBĚ VŠAK MAJÍ VÝZNAMNÁ OMEZENÍ. V POSLEDNÍCH LETECH SE VYVÍJEJÍ NOVÉ NÁSTROJE ZALOŽENÉ NA POUŽÍVÁNÍ SPECIFICKÝCH NUKLEÁZ (SDN) PRO CÍLENÉ ZAVÁDĚNÍ VARIANT GENICAS, KTERÉ BY MĚLY UMOŽNIT NOVOU GENERACI GENETICKY MODIFIKOVANÝCH ROSTLIN S PŘEDVÍDATELNĚJŠÍMI A BEZPEČNĚJŠÍMI FENOTYPY. V TOMTO PROJEKTU NAVRHUJEME A) PROVÉST PODROBNOU ANALÝZU VARIABILITY VYTVOŘENÉ A VYBRANÉ BĚHEM NEDÁVNÉHO VÝVOJE PĚSTOVANÝCH DRUHŮ SE ZVLÁŠTNÍM VÝZNAMEM A (B) INICIOVAT NOVOU LINII VÝZKUMU VE VÝVOJI PŘÍSTUPŮ ZALOŽENÝCH NA SDN ZA ÚČELEM ZAVEDENÍ SPECIFICKÝCH MUTACÍ DO GENOMŮ PĚSTOVANÝCH ROSTLIN. (Czech)
18 August 2022
0 references
A VARIABILIDADE GENÓMICA É A BASE SOBRE A QUAL A SELEÇÃO OPERA. PORTANTO, É IMPORTANTE CONHECER OS MECANISMOS QUE A GERAM. A VARIABILIDADE GENÔMICA É O RESULTADO DE DIFERENTES PROCESSOS QUE INTRODUZEM DIFERENTES TIPOS DE MUTAÇÕES. ERROS NA REPLICAÇÃO DE DNA, RADIAÇÃO UV E EXPOSIÇÃO A ALGUNS PRODUTOS QUÍMICOS RESULTAM EM POLIMORFISMOS NUCLEOTITED ÚNICOS (NPS) OU PEQUENAS INSERÇÕES/DELEÇÕES, ENQUANTO OUTROS PROCESSOS, COMO O MOVIMENTO TRANSPOSON OU SUA RECOMBINAÇÃO, RESULTAM EM GRANDES INSERÇÕES/DELEÇÕES E REORGANIZAÇÕES CROMOSSÔMICAS. OUTROS PROCESSOS, TAMBÉM RELACIONADOS À ATIVIDADE TRANSPOSON, PODEM RESULTAR NA VARIAÇÃO DA PRESENÇA/AUSÊNCIA (PAV) DE GENES. TODAS ESSAS MUTAÇÕES GERAM VARIABILIDADE QUE PODE SER SELECIONADA DURANTE A EVOLUÇÃO, INCLUINDO DOMESTICAÇÃO E MELHORIA DAS PLANTAS. A SELEÇÃO AFETA DIFERENCIALMENTE A DIVERSIDADE GENÔMICA, UMA VEZ QUE VISA REGIÕES ESPECÍFICAS DO GENOMA CONTENDO GENES QUE REGULAM OS TRAÇOS SELECIONADOS. A BUSCA DE REGIÕES DE BAIXA VARIABILIDADE PODE AJUDAR A IDENTIFICAR OS GENES ESPECÍFICOS OU MUTAÇÕES SUBJACENTES AOS PROCESSOS EVOLUTIVOS. Esta INFORMAÇÕES é de grande valor para definir quais são os fins sobre os quais ser acordado no melhor de GENETICA._x000D_ o sequenciamento completo de genomas DE ESPÉCIAs Cultivas, bem como o desenvolvimento de métodos e ferramentas bioinformativas para comparar esses genes, permitir pela primeira vez uma ANÁLISE EXHAUSTIVA DA VARIABILIDADE GENÓMICA DAS ESPÉCIAS Cultivas. OS GRUPOS QUE APRESENTAM ESTA PROPOSTA LEVARAM AO SEQUENCIAMENTO DO GENOMA DO MELÃO E COMEÇARAM A ANALISAR SUA VARIABILIDADE COM BASE EM DADOS DE RESECUENCIACION DE VARIEDADES. ELES TAMBÉM DESENVOLVERAM FERRAMENTAS PARA ANALISAR A VARIABILIDADE DEVIDO A AMBOS OS SNPS E O MOVIMENTO TRANSPOSON. NESTE PROJETO, PRETENDEM REFINAR E APLICAR ESTAS FERRAMENTAS PARA ANALISAR A VARIABILIDADE DO MELÃO EM COMPARAÇÃO COM A DO PEPINO E DAS ESPÉCIES DO GÉNERO PRUNUS (PRINCIPALMENTE PÊSSEGO). ISTO DEVE ESCLARECER ASPETOS FUNDAMENTAIS DA EVOLUÇÃO DO GENOMA VEGETAL E DOS GENES SUBJACENTES À DOMESTICAÇÃO E MELHORIA DO MELÃO. _x000D_ embora a informação sobre a variabilidade do GENOME seja fundamental para a identificação dos VARIANTES GENICOS responsáveis das categorias selecionadas em domesticação e melhoria, com o objetivo de transformar esse conhecimento em novas rotas comerciais é necessário de bons métodos para sua introdução seletiva. QUANDO A NOVA VARIANTE GENÉTICA NÃO ESTÁ DISPONÍVEL NO POOL GENETICO, APENAS DUAS ESTRATÉGIAS PODEM SER USADAS: MUTAÇÕES ALEATÓRIAS EM ESTRATÉGIAS COMO LAVOURA E TRANSGÉNESE. NO ENTANTO, AMBOS TÊM LIMITAÇÕES IMPORTANTES. NOS ÚLTIMOS ANOS, NOVAS FERRAMENTAS BASEADAS NO USO DE NUCLEASES ESPECÍFICAS (SDNS) ESTÃO SENDO DESENVOLVIDAS PARA A INTRODUÇÃO DIRECIONADA DE VARIANTES GENICAS QUE DEVEM PERMITIR UMA NOVA GERAÇÃO DE PLANTAS GENETICAMENTE MODIFICADAS COM FENÓTIPOS MAIS PREVISÍVEIS E MAIS SEGUROS. NESTE PROJETO PROPOMOS (A) REALIZAR UMA ANÁLISE DETALHADA DA VARIABILIDADE GERADA E SELECIONADA DURANTE A RECENTE EVOLUÇÃO DE ESPÉCIES CULTIVADAS DE PARTICULAR RELEVÂNCIA, E (B) INICIAR UMA NOVA LINHA DE PESQUISA NO DESENVOLVIMENTO DE ABORDAGENS BASEADAS EM SDNS PARA INTRODUZIR MUTAÇÕES ESPECÍFICAS NOS GENOMAS DAS PLANTAS CULTIVADAS. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
GENOOMILINE VARIEERUVUS ON VALIKU TEGEMISE ALUS. SEETÕTTU ON OLULINE TEADA MEHHANISME, MIS SEDA TEKITAVAD. GENOOMILINE VARIEERUVUS ON TINGITUD ERINEVATEST PROTSESSIDEST, MIS TUTVUSTAVAD ERINEVAT TÜÜPI MUTATSIOONE. VEAD DNA REPLIKATSIOONIS, UV-KIIRGUSES JA KOKKUPUUTES MÕNE KEMIKAALIGA PÕHJUSTAVAD ÜKSIKUID NUCLEOTITED POLÜMORFISME (NPS) VÕI VÄIKESEID SISENDEID/KUSTUTUSI, SAMAL AJAL KUI MUUD PROTSESSID, NAGU TRANSPOSOONI LIIKUMINE VÕI NENDE REKOMBINATSIOON, PÕHJUSTAVAD SUURI SISESTAMISI/KUSTUTUSI JA KROMOSOOMILISI ÜMBERKORRALDUSI. MUUD PROTSESSID, MIS ON SAMUTI SEOTUD TRANSPOSONAALSE AKTIIVSUSEGA, VÕIVAD PÕHJUSTADA GEENIDE OLEMASOLU/PUUDUMISE (PAV) VARIEERUMIST. KÕIK NEED MUTATSIOONID TEKITAVAD VARIEERUVUST, MIDA SAAB VALIDA EVOLUTSIOONI AJAL, SEALHULGAS KODUSTAMINE JA TAIMEDE PARENDAMINE. VALIKU ERINEVUS MÕJUTAB GENOOMI MITMEKESISUST, SEST SEE ON SUUNATUD KONKREETSETELE PIIRKONDADELE GENOOMI SISALDAVAD GEENID, MIS REGULEERIVAD VALITUD OMADUSI. VÄIKESE VARIEERUVUSEGA PIIRKONDADE OTSIMINE VÕIB AIDATA KINDLAKS TEHA SPETSIIFILISI GEENE VÕI MUTATSIOONE, MIS ON EVOLUTSIOONIPROTSESSIDE ALUSEKS. See TEAVE on väga väärtuslik, et määrata kindlaks, millised on eesmärgid, mille osas tuleb kokku leppida parimal juhul GENETICA._x000D_, Cultive SPETSIOONIDE genoomide täieliku järjestuse, samuti bioinformatiivsete meetodite ja vahendite väljatöötamiseks nende geenide võrdlemiseks, võimaldab esimest korda GENOMIC VARIABILITY OF Cultive SPETSIOONI VARIABILITY EXHAUSTIVE ANALYSISE. KÄESOLEVA ETTEPANEKU ESITANUD RÜHMAD VIISID MELONI GENOOMI JÄRJESTAMISENI JA ON HAKANUD ANALÜÜSIMA SELLE VARIEERUVUST SORTIDE RESECUENCIACIONI ANDMETE PÕHJAL. SAMUTI ON NAD VÄLJA TÖÖTANUD VAHENDID, ET ANALÜÜSIDA NII SNP-DE KUI KA TRANSPOSONIDE LIIKUMISEST TINGITUD VARIEERUVUST. SELLES PROJEKTIS KAVATSEVAD NAD NEID VAHENDEID TÄIUSTADA JA KASUTADA, ET ANALÜÜSIDA MELONITE VARIEERUVUST VÕRRELDES KURGI JA PEREKONNA PRUNUS LIIKIDEGA (PEAMISELT VIRSIKUGA). SEE PEAKS VALGUSTAMA TAIMEGENOOMI EVOLUTSIOONI PÕHIASPEKTE NING MELONITE KODUSTAMISE JA PARANDAMISE ALUSEKS OLEVAID GEENE. _x000D_ kuigi teave GENOME varieeruvuse kohta on oluline selleks, et teha kindlaks päritolumaanduses ja parendamises valitud kategooriate GENICAL VARIANTS, on nende valikuliseks kasutuselevõtuks vaja häid meetodeid, et muuta need teadmised uuteks kaubateedeks. KUI UUS GENEETILINE VARIANT EI OLE BASSEINIGENEETILISES VERSIOONIS KÄTTESAADAV, VÕIB KASUTADA AINULT KAHTE STRATEEGIAT: JUHUSLIKUD MUTATSIOONID STRATEEGIATES NAGU MULLAHARIMINE JA TRANSGENEES. MÕLEMAL ON AGA OLULISED PIIRANGUD. VIIMASTEL AASTATEL TÖÖTATAKSE VÄLJA UUSI VAHENDEID, MIS PÕHINEVAD KONKREETSETE NUKLEAASIDE (SDN) KASUTAMISEL, ET VÕTTA SIHIPÄRASELT KASUTUSELE GENICASE VARIANDID, MIS PEAKSID VÕIMALDAMA UUE PÕLVKONNA GENEETILISELT MUUNDATUD TAIMI PROGNOOSITAVAMATE JA OHUTUMATE FENOTÜÜPIDEGA. SELLES PROJEKTIS TEEME ETTEPANEKU A) VIIA LÄBI ÜKSIKASJALIK ANALÜÜS ERITI OLULISTE KULTUURLIIKIDE HILJUTISE ARENGU KÄIGUS TEKKINUD JA VALITUD VARIEERUVUSE KOHTA NING B) ALGATADA UUS UURIMISLIIN, ET TÖÖTADA VÄLJA SDN-IL PÕHINEVAD LÄHENEMISVIISID, ET VÕTTA KULTUURTAIMEDE GENOOMIDES KASUTUSELE SPETSIIFILISI MUTATSIOONE. (Estonian)
18 August 2022
0 references
A KIVÁLASZTÁS ALAPJA A GENOMIKUS VARIABILITÁS. EZÉRT FONTOS MEGISMERNI AZ AZT LÉTREHOZÓ MECHANIZMUSOKAT. A GENOMIKUS VARIABILITÁS KÜLÖNBÖZŐ FOLYAMATOK EREDMÉNYE, AMELYEK KÜLÖNBÖZŐ MUTÁCIÓKAT VEZETNEK BE. A DNS-REPLIKÁCIÓ, AZ UV-SUGÁRZÁS ÉS EGYES VEGYI ANYAGOKNAK VALÓ KITETTSÉG HIBÁI EGYETLEN NUCLEOTITED POLIMORFIZMUST (NPS) VAGY KIS BEHELYEZÉSEKET/TÖRLÉSEKET EREDMÉNYEZNEK, MÍG MÁS FOLYAMATOK, MINT PÉLDÁUL A TRANSZPOZON MOZGÁS VAGY AZOK REKOMBINÁCIÓJA NAGY BEHELYEZÉSEKET/TÖRLÉSEKET ÉS KROMOSZÓMA-REORGANIZÁCIÓKAT EREDMÉNYEZ. MÁS FOLYAMATOK, AMELYEK SZINTÉN KAPCSOLÓDNAK A TRANSZPOZON AKTIVITÁSHOZ, A GÉNEK JELENLÉTÉNEK/HIÁNYÁNAK (PAV) VARIÁCIÓJÁT EREDMÉNYEZHETIK. MINDEZEK A MUTÁCIÓK OLYAN VARIABILITÁST EREDMÉNYEZNEK, AMELY AZ EVOLÚCIÓ SORÁN KIVÁLASZTHATÓ, BELEÉRTVE A HÁZIASÍTÁST ÉS A NÖVÉNYFEJLESZTÉST IS. A KIVÁLASZTÁS ELTÉRŐ MÓDON BEFOLYÁSOLJA A GENOMI SOKFÉLESÉGET, MIVEL A KIVÁLASZTOTT TULAJDONSÁGOKAT SZABÁLYOZÓ GÉNEKET TARTALMAZÓ GÉNEKET TARTALMAZÓ GENOM EGYES RÉGIÓIT CÉLOZZA MEG. AZ ALACSONY VARIABILITÁSÚ RÉGIÓK KERESÉSE SEGÍTHET AZONOSÍTANI AZ EVOLÚCIÓS FOLYAMATOK ALAPJÁT KÉPEZŐ SPECIFIKUS GÉNEKET VAGY MUTÁCIÓKAT. Ez az INFORMÁCIÓ nagy értéket képvisel annak meghatározása érdekében, hogy milyen célokról kell megállapodni a GENETICA._x000D_ a Cultive SPECIES genomjainak teljes szekvenálásában, valamint a bio-informatív módszerek és eszközök kifejlesztésében ezeknek a géneknek az összehasonlítására, első alkalommal engedélyezze a Cultive SPECIES GENOMIC VARIABILITY-jának EXHAUSTIVE ANALYSIS-ját. A JAVASLATOT BENYÚJTÓ CSOPORTOK VEZETTÉK A DINNYEGENOM SZEKVENÁLÁSÁT, ÉS A FAJTÁK RESECUENCIACION-JÁRA VONATKOZÓ ADATOK ALAPJÁN ELKEZDTÉK ELEMEZNI ANNAK VARIABILITÁSÁT. AZT IS KIFEJLESZTETTEK ESZKÖZÖKET, HOGY ELEMEZZÉK A VARIABILITÁS MIATT MIND AZ SNP-K ÉS A TRANSZPOZON MOZGÁS. EBBEN A PROJEKTBEN FINOMÍTANI ÉS ALKALMAZNI KÍVÁNJÁK EZEKET AZ ESZKÖZÖKET, HOGY ELEMEZZÉK A DINNYE VÁLTOZÉKONYSÁGÁT AZ UBORKA ÉS A PRUNUS NEMZETSÉGHEZ TARTOZÓ FAJOK (FŐKÉNT ŐSZIBARACK) VARIABILITÁSÁHOZ KÉPEST. ENNEK RÁVILÁGÍTANIA KELL A NÖVÉNYGENOM ÉS A DINNYE HÁZIASÍTÁSÁNAK ÉS JAVÍTÁSÁNAK ALAPJÁUL SZOLGÁLÓ GÉNEK ALAPVETŐ SZEMPONTJAIRA. _x000D_ bár a GENOME variabilitására vonatkozó információk kulcsfontosságúak a háziasítás és fejlesztés során kiválasztott kategóriák felelős GENICAL VARIANTS-jainak azonosításához, ezen ismeretek új kereskedelmi útvonalakká való átalakítása érdekében a szelektív bevezetésükhöz megfelelő módszerekre van szükség. HA AZ ÚJ GENETIKAI VARIÁNS NEM ÁLL RENDELKEZÉSRE A POOL GENETIKÁBAN, CSAK KÉT STRATÉGIA ALKALMAZHATÓ: VÉLETLENSZERŰ MUTÁCIÓK A STRATÉGIÁKBAN, MINT A TALAJMŰVELÉS ÉS A TRANSZGENEZIS. MINDKETTŐNEK AZONBAN JELENTŐS KORLÁTAI VANNAK. AZ ELMÚLT ÉVEKBEN BIZONYOS NUKLEÁZOK (SDN-EK) HASZNÁLATÁRA ÉPÜLŐ ÚJ ESZKÖZÖKET FEJLESZTENEK KI A GENICAS VÁLTOZATOK CÉLZOTT BEVEZETÉSÉRE, AMELYEK LEHETŐVÉ TESZIK A KISZÁMÍTHATÓBB ÉS BIZTONSÁGOSABB FENOTÍPUSOKKAL RENDELKEZŐ, GÉNTECHNOLÓGIÁVAL MÓDOSÍTOTT NÖVÉNYEK ÚJ GENERÁCIÓJÁT. EBBEN A PROJEKTBEN AZT JAVASOLJUK, HOGY A) VÉGEZZENEK RÉSZLETES ELEMZÉST A KÜLÖNÖSEN FONTOS TERMESZTETT FAJOK KÖZELMÚLTBELI FEJLŐDÉSE SORÁN KELETKEZŐ ÉS KIVÁLASZTOTT VARIABILITÁSRÓL, ÉS (B) KEZDEMÉNYEZZENEK EGY ÚJ KUTATÁSI IRÁNYT AZ SDN-EKEN ALAPULÓ MEGKÖZELÍTÉSEK KIDOLGOZÁSA TERÉN, HOGY KONKRÉT MUTÁCIÓKAT VEZESSENEK BE A TERMESZTETT NÖVÉNYEK GENOMJAIBAN. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
ГЕНОМНАТА ПРОМЕНЛИВОСТ Е ОСНОВАТА, НА КОЯТО СЕ ИЗВЪРШВА ПОДБОРЪТ. ЕТО ЗАЩО Е ВАЖНО ДА СЕ ПОЗНАВАТ МЕХАНИЗМИТЕ, КОИТО ГО ГЕНЕРИРАТ. ГЕНОМНАТА ПРОМЕНЛИВОСТ Е РЕЗУЛТАТ ОТ РАЗЛИЧНИ ПРОЦЕСИ, КОИТО ВЪВЕЖДАТ РАЗЛИЧНИ ВИДОВЕ МУТАЦИИ. ГРЕШКИТЕ В РЕПЛИКАЦИЯТА НА ДНК, УЛТРАВИОЛЕТОВОТО ЛЪЧЕНИЕ И ЕКСПОЗИЦИЯТА НА НЯКОИ ХИМИКАЛИ ВОДЯТ ДО ЕДИНИЧНИ NUCLEOTITED ПОЛИМОРФИЗМИ (NPS) ИЛИ МАЛКИ ВМЪКВАНИЯ/ИЗТРИВАНИЯ, ДОКАТО ДРУГИ ПРОЦЕСИ, КАТО НАПРИМЕР ТРАНСПОЗОННОТО ДВИЖЕНИЕ ИЛИ ТЯХНАТА РЕКОМБИНАЦИЯ, ВОДЯТ ДО ГОЛЕМИ ВМЪКВАНИЯ/ДЕЛЕЦИИ И ХРОМОЗОМНИ РЕОРГАНИЗАЦИИ. ДРУГИ ПРОЦЕСИ, СЪЩО СВЪРЗАНИ С ТРАНСПОЗОННАТА АКТИВНОСТ, МОГАТ ДА ДОВЕДАТ ДО ВАРИАЦИЯ НА ПРИСЪСТВИЕТО/ОТСЪСТВИЕТО (PAV) НА ГЕНИТЕ. ВСИЧКИ ТЕЗИ МУТАЦИИ ГЕНЕРИРАТ ПРОМЕНЛИВОСТ, КОЯТО МОЖЕ ДА БЪДЕ ИЗБРАНА ПО ВРЕМЕ НА ЕВОЛЮЦИЯТА, ВКЛЮЧИТЕЛНО ОПИТОМЯВАНЕ И ПОДОБРЯВАНЕ НА РАСТЕНИЯТА. СЕЛЕКЦИЯТА ДИФЕРЕНЦИАЛНО ВЛИЯЕ ВЪРХУ ГЕНОМНОТО РАЗНООБРАЗИЕ, ТЪЙ КАТО Е НАСОЧЕНА КЪМ СПЕЦИФИЧНИ РЕГИОНИ НА ГЕНОМА, СЪДЪРЖАЩИ ГЕНИ, КОИТО РЕГУЛИРАТ ИЗБРАНИТЕ ЧЕРТИ. ТЪРСЕНЕТО НА РЕГИОНИ С НИСКА ПРОМЕНЛИВОСТ МОЖЕ ДА ПОМОГНЕ ДА СЕ ИДЕНТИФИЦИРАТ СПЕЦИФИЧНИТЕ ГЕНИ ИЛИ МУТАЦИИ, КОИТО СА В ОСНОВАТА НА ЕВОЛЮЦИОННИТЕ ПРОЦЕСИ. Тази ИНФОРМАЦИЯ е от голяма стойност, за да се определи какви са целите, за които трябва да се постигне съгласие в най-доброто от GENETICA._x000D_ пълната последователност на геномите на култивиращите СПЕЦИИ, както и разработването на биоинформативни методи и инструменти за сравняване на тези гени, позволяват за първи път EXHAUSTIVE ANALYSIS OF GENOMIC VARIABILITYY OF Cultive SPECIES. ГРУПИТЕ, КОИТО ПРЕДСТАВЯТ ТОВА ПРЕДЛОЖЕНИЕ, ДОВЕДОХА ДО ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТТА НА ГЕНОМА НА ПЪПЕШ И ЗАПОЧНАХА ДА АНАЛИЗИРАТ НЕГОВАТА ПРОМЕНЛИВОСТ ВЪЗ ОСНОВА НА ДАННИ ЗА RESECUENCIACION НА СОРТОВЕТЕ. ТЕ СЪЩО ТАКА СА РАЗРАБОТИЛИ ИНСТРУМЕНТИ ЗА АНАЛИЗ НА ПРОМЕНЛИВОСТТА, ДЪЛЖАЩА СЕ КАКТО НА SNP, ТАКА И НА ТРАНСПОЗОННОТО ДВИЖЕНИЕ. В ТОЗИ ПРОЕКТ ТЕ ВЪЗНАМЕРЯВАТ ДА ПРЕЦИЗИРАТ И ПРИЛАГАТ ТЕЗИ ИНСТРУМЕНТИ ЗА АНАЛИЗ НА ПРОМЕНЛИВОСТТА НА ПЪПЕША В СРАВНЕНИЕ С ТАЗИ НА КРАСТАВИЦИТЕ И ВИДОВЕТЕ ОТ РОДА PRUNUS (ГЛАВНО ПРАСКОВИ). ТОВА ТРЯБВА ДА ХВЪРЛИ СВЕТЛИНА ВЪРХУ ОСНОВНИТЕ АСПЕКТИ НА ЕВОЛЮЦИЯТА НА РАСТИТЕЛНИЯ ГЕНОМ И ГЕНИТЕ, КОИТО СА В ОСНОВАТА НА ОПИТОМЯВАНЕТО И ПОДОБРЯВАНЕТО НА ПЪПЕША. _x000D_ въпреки че информацията за променливостта на GENOME е от ключово значение за идентифицирането на отговорните ГЕНИКАЛНИ ВАРИАНТИ на категориите, избрани за опитомяване и усъвършенстване, за целите на превръщането на това знание в нови търговски маршрути се изискват добри методи за тяхното избирателно въвеждане. КОГАТО НОВИЯТ ГЕНЕТИЧЕН ВАРИАНТ НЕ Е НАЛИЧЕН В ГЕНЕТИЧНИЯ ФОНД, МОГАТ ДА СЕ ИЗПОЛЗВАТ САМО ДВЕ СТРАТЕГИИ: СЛУЧАЙНИ МУТАЦИИ В СТРАТЕГИИ КАТО ОБРАБОТКА И ТРАНСГЕНЕЗА. И ДВЕТЕ ОБАЧЕ ИМАТ ВАЖНИ ОГРАНИЧЕНИЯ. ПРЕЗ ПОСЛЕДНИТЕ ГОДИНИ СЕ РАЗРАБОТВАТ НОВИ ИНСТРУМЕНТИ, ОСНОВАНИ НА ИЗПОЛЗВАНЕТО НА СПЕЦИФИЧНИ НУКЛЕАЗИ (SDNS), ЗА ЦЕЛЕНАСОЧЕНО ВЪВЕЖДАНЕ НА ВАРИАНТИ НА GENICAS, КОИТО СЛЕДВА ДА ПОЗВОЛЯТ НОВО ПОКОЛЕНИЕ ГЕНЕТИЧНО МОДИФИЦИРАНИ РАСТЕНИЯ С ПО-ПРЕДВИДИМИ И ПО-БЕЗОПАСНИ ФЕНОТИПОВЕ. В ТОЗИ ПРОЕКТ ПРЕДЛАГАМЕ А) ДА СЕ ИЗВЪРШИ ПОДРОБЕН АНАЛИЗ НА ВАРИАБИЛНОСТТА, ГЕНЕРИРАНА И ПОДБРАНА ПО ВРЕМЕ НА НЕОТДАВНАШНОТО РАЗВИТИЕ НА КУЛТИВИРАНИТЕ ВИДОВЕ ОТ ОСОБЕНО ЗНАЧЕНИЕ, И Б) ДА СЕ ИНИЦИИРА НОВА ЛИНИЯ НА НАУЧНИ ИЗСЛЕДВАНИЯ В РАЗРАБОТВАНЕТО НА ПОДХОДИ, ОСНОВАНИ НА SDN, ЗА ДА СЕ ВЪВЕДАТ СПЕЦИФИЧНИ МУТАЦИИ В ГЕНОМИТЕ НА КУЛТИВИРАНИТЕ РАСТЕНИЯ. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
GENOMINIS KINTAMUMAS YRA ATRANKOS PAGRINDAS. TODĖL SVARBU ŽINOTI MECHANIZMUS, KURIE JĮ SUKURIA. GENOMINIS KINTAMUMAS YRA SKIRTINGŲ PROCESŲ, KURIE ĮVEDA SKIRTINGŲ TIPŲ MUTACIJAS, REZULTATAS. DNR REPLIKACIJOS, UV SPINDULIAVIMO IR KAI KURIŲ CHEMINIŲ MEDŽIAGŲ POVEIKIO KLAIDOS LEMIA PAVIENIUS NUCLEOTITED POLIMORFIZMUS (NPS) ARBA MAŽUS ĮTERPIMUS IR (ARBA) IŠTRYNIMUS, O KITI PROCESAI, PVZ., TRANSPOZONO JUDĖJIMAS ARBA JŲ REKOMBINACIJA, SUKELIA DIDELIUS ĮTERPIMUS IR (ARBA) PAŠALINIMUS BEI CHROMOSOMŲ REORGANIZACIJAS. KITI PROCESAI, TAIP PAT SUSIJĘ SU TRANSPOZONŲ AKTYVUMU, GALI LEMTI GENŲ BUVIMO IR (ARBA) NEBUVIMO (PAV) KITIMĄ. VISOS ŠIOS MUTACIJOS SUKURIA KINTAMUMĄ, KURĮ GALIMA PASIRINKTI EVOLIUCIJOS METU, ĮSKAITANT PRIJAUKINIMĄ IR AUGALŲ TOBULINIMĄ. ATRANKA SKIRTINGAI VEIKIA GENOMINĘ ĮVAIROVĘ, NES JI NUKREIPTA Į SPECIFINIUS GENOMO REGIONUS, KURIUOSE YRA GENŲ, REGULIUOJANČIŲ PASIRINKTUS BRUOŽUS. MAŽO KINTAMUMO REGIONŲ PAIEŠKA GALI PADĖTI NUSTATYTI SPECIFINIUS GENUS AR MUTACIJAS, KURIOMIS GRINDŽIAMI EVOLIUCINIAI PROCESAI. Ši INFORMACIJA yra labai vertinga, siekiant apibrėžti, kokie yra tikslai, dėl kurių turi būti susitarta geriausioje GENETICA._x000D_ visiškai sekos Cultive SPECIES genomų sekos nustatymas, taip pat bioinformacinių metodų ir priemonių, skirtų palyginti šiuos genus, kūrimas, pirmą kartą leisti pirmą kartą atlikti GENOMINĖS VARIALIJOS Kultinių SPECIJŲ ANALIZĄ. ŠĮ PASIŪLYMĄ PATEIKUSIOS GRUPĖS VADOVAVO MELIONO GENOMO EILIŠKUMUI IR PRADĖJO ANALIZUOTI JO KINTAMUMĄ REMDAMOSI VEISLIŲ RESECUENCIACION DUOMENIMIS. JIE TAIP PAT SUKŪRĖ PRIEMONES, SKIRTAS ANALIZUOTI KINTAMUMĄ DĖL TIEK SNP, TIEK TRANSPOSON JUDĖJIMO. ŠIAME PROJEKTE JOS KETINA TOBULINTI IR TAIKYTI ŠIAS PRIEMONES, KAD IŠANALIZUOTŲ MELIONO KINTAMUMĄ, PALYGINTI SU AGURKŲ IR PRUNUS GENTIES RŪŠIŲ (DAUGIAUSIA PERSIKŲ) ĮVAIROVE. TAI TURĖTŲ PADĖTI IŠSIAIŠKINTI PAGRINDINIUS AUGALO GENOMO RAIDOS ASPEKTUS IR GENUS, KURIAIS GRINDŽIAMAS MELIONO PRIJAUKINIMAS IR TOBULINIMAS. _x000D_ nors informacija apie GENOME kintamumą yra labai svarbi identifikuojant atsakingas GENICAL VARIANTS kategorijas, pasirinktas prijaukinimui ir tobulinimui, siekiant šias žinias paversti naujais prekybos maršrutais, reikalingi geri jų atrankinio įvedimo metodai. KAI FONDO GENETINIO VARIANTO NĖRA, GALIMA NAUDOTI TIK DVI STRATEGIJAS: ATSITIKTINĖS MUTACIJOS STRATEGIJOSE, PAVYZDŽIUI, ĮDIRBIMO IR TRANSGENEZĖS. TAČIAU ABI ŠALYS TURI SVARBIŲ APRIBOJIMŲ. PASTARAISIAIS METAIS KURIAMOS NAUJOS PRIEMONĖS, GRINDŽIAMOS KONKREČIŲ NUKLEAZIŲ (SDN) NAUDOJIMU, SIEKIANT TIKSLINGAI ĮDIEGTI GENICAS VARIANTUS, KURIE TURĖTŲ SUDARYTI SĄLYGAS NAUJOS KARTOS GENETIŠKAI MODIFIKUOTIEMS AUGALAMS SU LABIAU NUSPĖJAMAIS IR SAUGESNIAIS FENOTIPAIS. ŠIAME PROJEKTE MES SIŪLOME: A) ATLIKTI IŠSAMIĄ KINTAMUMO ANALIZĘ, ATSIRADUSIĄ IR ATRINKTĄ PER NAUJAUSIĄ YPAČ SVARBIŲ KULTIVUOJAMŲ RŪŠIŲ RAIDĄ, IR (B) INICIJUOTI NAUJĄ MOKSLINIŲ TYRIMŲ LINIJĄ KURIANT METODUS, PAGRĮSTUS SDN, SIEKIANT NUSTATYTI SPECIFINES MUTACIJAS KULTIVUOJAMŲ AUGALŲ GENOMUOSE. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
GENOMSKA VARIJABILNOST JE OSNOVA NA TEMELJU KOJE ODABIR DJELUJE. STOGA JE VAŽNO ZNATI MEHANIZME KOJI GA GENERIRAJU. GENOMSKA VARIJABILNOST REZULTAT JE RAZLIČITIH PROCESA KOJI UVODE RAZLIČITE VRSTE MUTACIJA. POGREŠKE U REPLIKACIJI DNK, UV ZRAČENJU I IZLOŽENOSTI NEKIM KEMIKALIJAMA REZULTIRAJU JEDNIM NUCLEOTITED POLIMORFIZMIMA (NPS) ILI MALIM UMETANJIMA/DELECIJAMA, DOK DRUGI PROCESI, KAO ŠTO SU TRANSPOSONSKO KRETANJE ILI NJIHOVA REKOMBINACIJA, REZULTIRAJU VELIKIM UMETANJIMA/DELECIJAMA I KROMOSOMSKIM REORGANIZACIJAMA. DRUGI PROCESI, TAKOĐER POVEZANI S TRANSPOSONSKOM AKTIVNOŠĆU, MOGU REZULTIRATI VARIJACIJOM PRISUTNOSTI/ODSUTNOSTI (PAV) GENA. SVE OVE MUTACIJE STVARAJU VARIJABILNOST KOJA SE MOŽE ODABRATI TIJEKOM EVOLUCIJE, UKLJUČUJUĆI PRIPITOMLJAVANJE I POBOLJŠANJE BILJAKA. ODABIR RAZLIČITO UTJEČE NA GENOMSKU RAZNOLIKOST JER JE USMJEREN NA ODREĐENE REGIJE GENOMA KOJI SADRŽE GENE KOJI REGULIRAJU ODABRANE OSOBINE. TRAŽENJE PODRUČJA NISKE VARIJABILNOSTI MOŽE POMOĆI U PREPOZNAVANJU SPECIFIČNIH GENA ILI MUTACIJA KOJE SU TEMELJ EVOLUCIJSKIH PROCESA. Ova INFORMACIJA je od velike vrijednosti kako bi se definirali krajevi na koje se treba dogovoriti u najboljem od GENETICA._x000D_ kompletna sekvenciranje genoma kultiviranih SPECIES, kao i razvoj bio-informativnih metoda i alata za usporedbu tih gena, omogućiti po prvi put EXHAUSTIVE ANALIZA GENOMSKIH VARIABILITY Kultive SPECIES. SKUPINE KOJE PREDSTAVLJAJU OVAJ PRIJEDLOG DOVELE SU DO SEKVENCIRANJA GENOMA DINJE I POČELE SU ANALIZIRATI NJEGOVU VARIJABILNOST NA TEMELJU PODATAKA O RESECUENCIACIONU SORTI. TAKOĐER SU RAZVILI ALATE ZA ANALIZU VARIJABILNOSTI ZBOG SNP-OVA I TRANSPOSONSKOG POKRETA. U OVOM PROJEKTU NAMJERAVAJU POBOLJŠATI I PRIMIJENITI TE ALATE KAKO BI ANALIZIRALI VARIJABILNOST DINJE U ODNOSU NA VARIJACIJU KRASTAVACA I VRSTA RODA PRUNUS (UGLAVNOM BRESKVE). TO BI TREBALO RASVIJETLITI TEMELJNE ASPEKTE EVOLUCIJE BILJNOG GENOMA I GENA KOJI SU TEMELJ PRIPITOMLJAVANJA I POBOLJŠANJA DINJE. _x000D_ iako su informacije o varijabilnosti GENOME ključne za utvrđivanje odgovornih GENICAL VARIANTS kategorija odabranih u pripitovanju i poboljšanju, u svrhu pretvaranja tog znanja u nove trgovačke rute potrebne su dobre metode za njihovo selektivno uvođenje. KADA NOVA GENETSKA VARIJANTA NIJE DOSTUPNA U POOL GENETICO, MOGU SE KORISTITI SAMO DVIJE STRATEGIJE: SLUČAJNE MUTACIJE U STRATEGIJAMA POPUT OBRADE I TRANSGENEZE. MEĐUTIM, OBA IMAJU VAŽNA OGRANIČENJA. POSLJEDNJIH SE GODINA RAZVIJAJU NOVI ALATI KOJI SE TEMELJE NA UPORABI SPECIFIČNIH NUKLEAZA (SDN) ZA CILJANO UVOĐENJE VARIJANTI GENICAS KOJE BI TREBALE OMOGUĆITI NOVU GENERACIJU GENETSKI MODIFICIRANIH BILJAKA S PREDVIDLJIVIJIM I SIGURNIJIM FENOTIPOVIMA. U OVOM PROJEKTU PREDLAŽEMO (A) PROVESTI DETALJNU ANALIZU VARIJABILNOSTI KOJA JE NASTALA I ODABRANA TIJEKOM NEDAVNOG RAZVOJA KULTIVIRANIH VRSTA OD POSEBNE VAŽNOSTI TE (B) POKRENUTI NOVU LINIJU ISTRAŽIVANJA U RAZVOJU PRISTUPA TEMELJENIH NA SDN-OVIMA ZA UVOĐENJE SPECIFIČNIH MUTACIJA U GENOME KULTIVIRANIH BILJAKA. (Croatian)
18 August 2022
0 references
GENOMISK VARIABILITET ÄR GRUNDEN FÖR URVALET. DÄRFÖR ÄR DET VIKTIGT ATT KÄNNA TILL DE MEKANISMER SOM GENERERAR DEN. GENOMISK VARIABILITET ÄR RESULTATET AV OLIKA PROCESSER SOM INTRODUCERAR OLIKA TYPER AV MUTATIONER. FEL I DNA-REPLIKATION, UV-STRÅLNING OCH EXPONERING FÖR VISSA KEMIKALIER RESULTERAR I ENSTAKA NUCLEOTITED POLYMORFISMER (NPS) ELLER SMÅ INFOGNINGAR/BORTTAGNINGAR, MEDAN ANDRA PROCESSER, SÅSOM TRANSPOSONRÖRELSER ELLER REKOMBINATION AV DEM, RESULTERAR I STORA INSATSER/BORTTAGNINGAR OCH KROMOSOMOMORGANISATIONER. ANDRA PROCESSER, ÄVEN RELATERADE TILL TRANSPOSON AKTIVITET, KAN RESULTERA I VARIATION AV NÄRVARO/FRÅNVARO (PAV) AV GENER. ALLA DESSA MUTATIONER GENERERAR VARIABILITET SOM KAN VÄLJAS UNDER EVOLUTIONEN, INKLUSIVE DOMESTICERING OCH VÄXTFÖRBÄTTRING. URVALET PÅVERKAR PÅ ETT OLIKA SÄTT DEN GENOMISKA MÅNGFALDEN, EFTERSOM DET RIKTAR SIG TILL SPECIFIKA REGIONER AV GENOMET SOM INNEHÅLLER GENER SOM REGLERAR DE VALDA EGENSKAPERNA. ATT SÖKA EFTER REGIONER MED LÅG VARIABILITET KAN HJÄLPA TILL ATT IDENTIFIERA DE SPECIFIKA GENER ELLER MUTATIONER SOM LIGGER TILL GRUND FÖR EVOLUTIONÄRA PROCESSER. Denna INFORMATION är av stort värde för att definiera vilka syften som ska överenskommas i det bästa av GENETICA._x000D_ den fullständiga sekvenseringen av genoms OF Cultive SPECIES, liksom utvecklingen av bioinformativa metoder och verktyg för att jämföra dessa gener, tillåter för första gången en EXHAUSTIVE ANALYSIS AV GENOMICSKA VARIABILITET AV Cultive SPECIES. DE GRUPPER SOM LÄGGER FRAM DETTA FÖRSLAG LEDDE SEKVENSERINGEN AV MELONGENOMET OCH HAR BÖRJAT ANALYSERA DESS VARIATION PÅ GRUNDVAL AV UPPGIFTER OM SORTERNAS RESECUENCIACION. DE HAR OCKSÅ UTVECKLAT VERKTYG FÖR ATT ANALYSERA VARIABILITET PÅ GRUND AV BÅDE SNP OCH TRANSPOSON RÖRELSE. I DETTA PROJEKT AVSER DE ATT FÖRFINA OCH TILLÄMPA DESSA VERKTYG FÖR ATT ANALYSERA MELONENS VARIATION JÄMFÖRT MED GURKA OCH ARTER AV SLÄKTET PRUNUS (FRÄMST PERSIKA). DETTA BÖR BELYSA GRUNDLÄGGANDE ASPEKTER AV VÄXTGENOMETS UTVECKLING OCH DE GENER SOM LIGGER TILL GRUND FÖR DOMESTICERINGEN OCH FÖRBÄTTRINGEN AV MELON. _x000D_ även om informationen om variabiliteten hos GENOME är avgörande för identifieringen av de ansvariga GENICAL VARIANTS för de kategorier som valts för domesticering och förbättring, för att omvandla denna kunskap till nya handelsvägar krävs goda metoder för deras selektiva införande. NÄR DEN NYA GENETISKA VARIANTEN INTE FINNS TILLGÄNGLIG I POOLEN GENETIK KAN ENDAST TVÅ STRATEGIER ANVÄNDAS: SLUMPMÄSSIGA MUTATIONER I STRATEGIER SOM BEARBETNING OCH TRANSGENES. BÅDA HAR DOCK STORA BEGRÄNSNINGAR. UNDER DE SENASTE ÅREN HÅLLER NYA VERKTYG SOM BYGGER PÅ ANVÄNDNINGEN AV SPECIFIKA NUKLEASER (SDN) PÅ ATT UTVECKLAS FÖR ETT RIKTAT INFÖRANDE AV GENICAS-VARIANTER SOM BÖR MÖJLIGGÖRA EN NY GENERATION GENETISKT MODIFIERADE VÄXTER MED MER FÖRUTSÄGBARA OCH SÄKRARE FENOTYPER. I DETTA PROJEKT FÖRESLÅR VI ATT A) GENOMFÖRA EN DETALJERAD ANALYS AV VARIABILITETEN SOM GENERERATS OCH VALTS UT UNDER DEN SENASTE TIDENS UTVECKLING AV ODLADE ARTER AV SÄRSKILD RELEVANS, OCH (B) ATT INLEDA EN NY FORSKNINGSLINJE FÖR ATT UTVECKLA METODER BASERADE PÅ SDN FÖR ATT INFÖRA SPECIFIKA MUTATIONER I GENOMEN HOS ODLADE VÄXTER. (Swedish)
18 August 2022
0 references
VARIABILITATEA GENOMICĂ ESTE BAZA PE CARE SE DESFĂȘOARĂ SELECȚIA. PRIN URMARE, ESTE IMPORTANT SĂ SE CUNOASCĂ MECANISMELE CARE O GENEREAZĂ. VARIABILITATEA GENOMICĂ ESTE REZULTATUL DIFERITELOR PROCESE CARE INTRODUC DIFERITE TIPURI DE MUTAȚII. ERORILE DE REPLICARE A ADN-ULUI, RADIAȚIILE UV ȘI EXPUNEREA LA UNELE SUBSTANȚE CHIMICE CONDUC LA POLIMORFISME NUCLEOTITED UNICE (NPS) SAU LA MICI INSERȚII/DELEȚII, ÎN TIMP CE ALTE PROCESE, CUM AR FI MIȘCAREA TRANSPOZONULUI SAU RECOMBINAREA ACESTORA, DETERMINĂ INSERȚII/DELEȚII MARI ȘI REORGANIZĂRI CROMOZOMIALE. ALTE PROCESE, LEGATE, DE ASEMENEA, DE ACTIVITATEA TRANSPOSONULUI, POT AVEA CA REZULTAT VARIAȚIA PREZENȚEI/ABSENȚEI GENELOR. TOATE ACESTE MUTAȚII GENEREAZĂ VARIABILITATE CARE POATE FI SELECTATĂ ÎN TIMPUL EVOLUȚIEI, INCLUSIV DOMESTICIREA ȘI ÎMBUNĂTĂȚIREA PLANTELOR. SELECȚIA AFECTEAZĂ DIFERENȚIAT DIVERSITATEA GENOMICĂ, DEOARECE VIZEAZĂ REGIUNI SPECIFICE ALE GENOMULUI CARE CONȚIN GENE CARE REGLEAZĂ TRĂSĂTURILE SELECTATE. CĂUTAREA REGIUNILOR CU VARIABILITATE SCĂZUTĂ POATE AJUTA LA IDENTIFICAREA GENELOR SAU MUTAȚIILOR SPECIFICE CARE STAU LA BAZA PROCESELOR EVOLUTIVE. Această INFORMAȚIE este de mare valoare pentru a defini care sunt scopurile pe care trebuie să fie convenite în cele mai bune GENETICA._x000D_ secvențierea completă a genomurilor SPECIALELOR Cultive, precum și dezvoltarea de metode și instrumente bio-informative pentru a compara aceste gene, permit pentru prima dată o analiză EXHAUSTIVă a VARIABILITATEI GENOMice a SPECIALELOR Cultive. GRUPURILE CARE PREZINTĂ ACEASTĂ PROPUNERE AU CONDUS LA SECVENȚIEREA GENOMULUI PEPENILOR GALBENI ȘI AU ÎNCEPUT SĂ ANALIZEZE VARIABILITATEA ACESTUIA PE BAZA DATELOR PRIVIND RESECUENCIACION A SOIURILOR. EI AU DEZVOLTAT, DE ASEMENEA, INSTRUMENTE PENTRU A ANALIZA VARIABILITATEA DATORATĂ ATÂT SNP-URILOR, CÂT ȘI MIȘCĂRII TRANSPOSONULUI. ÎN ACEST PROIECT, EI INTENȚIONEAZĂ SĂ PERFECȚIONEZE ȘI SĂ APLICE ACESTE INSTRUMENTE PENTRU A ANALIZA VARIABILITATEA PEPENILOR GALBENI ÎN COMPARAȚIE CU CEA A CASTRAVEȚILOR ȘI A SPECIILOR DIN GENUL PRUNUS (ÎN PRINCIPAL PIERSICI). ACEST LUCRU AR TREBUI SĂ FACĂ LUMINĂ ASUPRA ASPECTELOR FUNDAMENTALE ALE EVOLUȚIEI GENOMULUI PLANTEI ȘI A GENELOR CARE STAU LA BAZA DOMESTICIRII ȘI ÎMBUNĂTĂȚIRII PEPENILOR GALBENI. _x000D_ deși informațiile privind variabilitatea GENOME sunt esențiale pentru identificarea VARIANTS GENICALE responsabile pentru categoriile selectate în domesticire și îmbunătățire, în scopul transformării acestor cunoștințe în noi rute comerciale este necesară metode bune pentru introducerea selectivă a acestora. ATUNCI CÂND NOUA VARIANTĂ GENETICĂ NU ESTE DISPONIBILĂ ÎN POOL GENETICO, POT FI UTILIZATE DOAR DOUĂ STRATEGII: MUTAȚII ALEATORII ÎN STRATEGII CUM AR FI ARATUL, ȘI TRANSGENEZĂ. CU TOATE ACESTEA, AMBELE AU LIMITĂRI IMPORTANTE. ÎN ULTIMII ANI, SUNT ÎN CURS DE ELABORARE NOI INSTRUMENTE BAZATE PE UTILIZAREA NUCLEAZELOR SPECIFICE (SDN) PENTRU INTRODUCEREA SPECIFICĂ A VARIANTELOR GENICAS CARE AR TREBUI SĂ PERMITĂ O NOUĂ GENERAȚIE DE PLANTE MODIFICATE GENETIC CU FENOTIPURI MAI PREVIZIBILE ȘI MAI SIGURE. ÎN ACEST PROIECT PROPUNEM (A) EFECTUAREA UNEI ANALIZE DETALIATE A VARIABILITĂȚII GENERATE ȘI SELECTATE ÎN TIMPUL RECENTEI EVOLUȚII A SPECIILOR CULTIVATE CU RELEVANȚĂ DEOSEBITĂ ȘI (B) INIȚIEREA UNEI NOI LINII DE CERCETARE ÎN DEZVOLTAREA ABORDĂRILOR BAZATE PE SDN PENTRU A INTRODUCE MUTAȚII SPECIFICE ÎN GENOMUL PLANTELOR CULTIVATE. (Romanian)
18 August 2022
0 references
GENOMSKA VARIABILNOST JE OSNOVA ZA DELOVANJE IZBORA. ZATO JE POMEMBNO POZNATI MEHANIZME, KI GA USTVARJAJO. GENOMSKA VARIABILNOST JE POSLEDICA RAZLIČNIH PROCESOV, KI UVAJAJO RAZLIČNE VRSTE MUTACIJ. NAPAKE PRI REPLIKACIJI DNK, UV SEVANJU IN IZPOSTAVLJENOSTI NEKATERIM KEMIKALIJAM POVZROČAJO POSAMEZNE NUCLEOTITED POLIMORFIZME (NPS) ALI MAJHNE VSTAVKE/ODSTRANITVE, MEDTEM KO DRUGI PROCESI, KOT JE GIBANJE TRANSPOSONOV ALI NJIHOVA REKOMBINACIJA, POVZROČIJO VELIKE VSTAVITVE/ODSTRANITVE IN KROMOSOMSKE REORGANIZACIJE. DRUGI PROCESI, POVEZANI TUDI Z AKTIVNOSTJO TRANSPOSONOV, LAHKO POVZROČIJO SPREMEMBO PRISOTNOSTI/ODSOTNOSTI GENOV. VSE TE MUTACIJE USTVARJAJO VARIABILNOST, KI JO JE MOGOČE IZBRATI MED RAZVOJEM, VKLJUČNO Z UDOMAČEVANJEM IN IZBOLJŠANJEM RASTLIN. IZBIRA RAZLIČNO VPLIVA NA GENOMSKO RAZNOLIKOST, SAJ SE OSREDOTOČA NA DOLOČENE REGIJE GENOMA, KI VSEBUJEJO GENE, KI URAVNAVAJO IZBRANE LASTNOSTI. ISKANJE REGIJ Z NIZKO VARIABILNOSTJO LAHKO POMAGA PREPOZNATI SPECIFIČNE GENE ALI MUTACIJE, NA KATERIH TEMELJIJO EVOLUCIJSKI PROCESI. Ta INFORMACIJA je zelo pomembna za opredelitev, na katerih koncih se je treba dogovoriti v najboljši GENETICA._x000D_ popolno zaporedje genomov Kultivnih SPECIES, kot tudi razvoj bio-informativnih metod in orodij za primerjavo teh genov, omogoča prvič EXHAUSTIVE ANALISIS GENOMIC VARIABILITY Kultivnih SPECIES. SKUPINE, KI SO PREDLOŽILE TA PREDLOG, SO VODILE SEKVENCIRANJE GENOMA MELON IN ZAČELE ANALIZIRATI NJEGOVO SPREMENLJIVOST NA PODLAGI PODATKOV RESECUENCIACION SORT. RAZVILI SO TUDI ORODJA ZA ANALIZO VARIABILNOSTI ZARADI GIBANJA SNP IN TRANSPOSONOV. V TEM PROJEKTU NAMERAVAJO IZBOLJŠATI IN UPORABITI TA ORODJA ZA ANALIZO VARIABILNOSTI MELONE V PRIMERJAVI S KUMARAMI IN VRSTAMI RODU PRUNUS (PREDVSEM BRESKEV). TO BI MORALO OSVETLITI TEMELJNE VIDIKE RAZVOJA RASTLINSKEGA GENOMA IN GENOV, KI SO PODLAGA ZA UDOMAČEVANJE IN IZBOLJŠANJE MELONE. _x000D_ čeprav so informacije o variabilnosti GENOME ključne za opredelitev odgovornih GENICAL VARIANTS kategorij, izbranih pri udomačevanju in izboljšavah, je za namen preoblikovanja tega znanja v nove trgovske poti treba uporabiti dobre metode za njihovo selektivno uvajanje. ČE NOVA GENETSKA VARIANTA NI NA VOLJO V GENETSKEM BAZENU, SE LAHKO UPORABITA LE DVE STRATEGIJI: NAKLJUČNE MUTACIJE V STRATEGIJAH, KOT STA OBDELAVA IN TRANSGENEZA. VENDAR IMATA OBE POMEMBNI OMEJITVI. V ZADNJIH LETIH SE RAZVIJAJO NOVA ORODJA, KI TEMELJIJO NA UPORABI POSEBNIH JEDER (SDN), ZA CILJNO UVAJANJE RAZLIČIC GENICAS, KI NAJ BI OMOGOČILE NOVO GENERACIJO GENSKO SPREMENJENIH RASTLIN S PREDVIDLJIVEJŠIMI IN VARNEJŠIMI FENOTIPI. V TEM PROJEKTU PREDLAGAMO (A) IZVEDBO PODROBNE ANALIZE VARIABILNOSTI, KI JE NASTALA IN IZBRANA MED NEDAVNIM RAZVOJEM GOJENIH VRST POSEBNEGA POMENA, IN (B) ZAČETEK NOVE RAZISKOVALNE LINIJE PRI RAZVOJU PRISTOPOV, KI TEMELJIJO NA SDN, DA SE UVEDEJO SPECIFIČNE MUTACIJE V GENOMIH GOJENIH RASTLIN. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
ZMIENNOŚĆ GENOMOWA JEST PODSTAWĄ, NA KTÓREJ ODBYWA SIĘ SELEKCJA. DLATEGO WAŻNE JEST, ABY ZNAĆ MECHANIZMY, KTÓRE JĄ GENERUJĄ. ZMIENNOŚĆ GENOMU JEST WYNIKIEM RÓŻNYCH PROCESÓW, KTÓRE WPROWADZAJĄ RÓŻNE RODZAJE MUTACJI. BŁĘDY W REPLIKACJI DNA, PROMIENIOWANIU UV I NARAŻENIU NA NIEKTÓRE SUBSTANCJE CHEMICZNE SKUTKUJĄ POJEDYNCZYMI POLIMORFIZMAMI NUCLEOTITED (NPS) LUB MAŁYMI WSTAWIANIAMI/SKREŚLENIAMI, PODCZAS GDY INNE PROCESY, TAKIE JAK RUCH TRANSPOZONOWY LUB ICH REKOMBINACJA, POWODUJĄ DUŻE WSTAWIANIE/SKREŚLENIE I REORGANIZACJĘ CHROMOSOMICZNĄ. INNE PROCESY, RÓWNIEŻ ZWIĄZANE Z AKTYWNOŚCIĄ TRANSPOZONOWĄ, MOGĄ POWODOWAĆ ZRÓŻNICOWANIE OBECNOŚCI/BRAK GENÓW. WSZYSTKIE TE MUTACJE GENERUJĄ ZMIENNOŚĆ, KTÓRĄ MOŻNA WYBRAĆ PODCZAS EWOLUCJI, W TYM UDOMOWIENIE I ULEPSZENIE ROŚLIN. WYBÓR RÓŻNIE WPŁYWA NA RÓŻNORODNOŚĆ GENOMOWĄ, PONIEWAŻ DOTYCZY KONKRETNYCH REGIONÓW GENOMU ZAWIERAJĄCYCH GENY, KTÓRE REGULUJĄ WYBRANE CECHY. POSZUKIWANIE REGIONÓW O NISKIEJ ZMIENNOŚCI MOŻE POMÓC W IDENTYFIKACJI KONKRETNYCH GENÓW LUB MUTACJI, KTÓRE LEŻĄ U PODSTAW PROCESÓW EWOLUCYJNYCH. Ta INFORMACJA ma wielką wartość w celu określenia, jakie są końce, na których należy uzgodnić najlepsze z GENETICA._x000D_ kompletne sekwencjonowanie genomów kultowych SPECJI, a także rozwój bioinformacyjnych metod i narzędzi do porównywania tych genów, pozwalają po raz pierwszy na EXHAUSTIVE ANALYSIS GENOMIC VARIABILITY OF Cultive SPECIES. GRUPY, KTÓRE PRZEDSTAWIŁY NINIEJSZY WNIOSEK, DOPROWADZIŁY DO SEKWENCJONOWANIA GENOMU MELONOWEGO I ZACZĘŁY ANALIZOWAĆ JEGO ZMIENNOŚĆ W OPARCIU O DANE DOTYCZĄCE RESECUENCIACION ODMIAN. OPRACOWALI RÓWNIEŻ NARZĘDZIA DO ANALIZY ZMIENNOŚCI ZE WZGLĘDU NA ZARÓWNO SNPS I RUCHU TRANSPOSON. W RAMACH TEGO PROJEKTU ZAMIERZAJĄ UDOSKONALIĆ I ZASTOSOWAĆ TE NARZĘDZIA DO ANALIZY ZMIENNOŚCI MELONA W PORÓWNANIU Z OGÓRKIEM I GATUNKIEM RODZAJU PRUNUS (GŁÓWNIE BRZOSKWINIA). POWINNO TO RZUCIĆ ŚWIATŁO NA PODSTAWOWE ASPEKTY EWOLUCJI GENOMU ROŚLINNEGO I GENÓW LEŻĄCYCH U PODSTAW UDOMOWIENIA I POPRAWY MELONA. _x000D_ chociaż informacje na temat zmienności GENOME mają kluczowe znaczenie dla identyfikacji odpowiedzialnych WARUNKÓW OGÓLNYch z kategorii wybranych do udomowienia i poprawy, do celów przekształcenia tej wiedzy w nowe szlaki handlowe wymagane są dobre metody ich selektywnego wprowadzania. GDY NOWY WARIANT GENETYCZNY NIE JEST DOSTĘPNY W BASENIE GENETYCZNYM, MOŻNA ZASTOSOWAĆ TYLKO DWIE STRATEGIE: LOSOWE MUTACJE W STRATEGIACH TAKICH JAK ORKA I TRANSGENEZA. OBA JEDNAK MAJĄ ISTOTNE OGRANICZENIA. W OSTATNICH LATACH OPRACOWYWANE SĄ NOWE NARZĘDZIA OPARTE NA WYKORZYSTANIU KONKRETNYCH NUKLEAZ (SDN) W CELU UKIERUNKOWANEGO WPROWADZANIA WARIANTÓW GENICAS, KTÓRE POWINNY UMOŻLIWIĆ NOWĄ GENERACJĘ ROŚLIN ZMODYFIKOWANYCH GENETYCZNIE O BARDZIEJ PRZEWIDYWALNYCH I BEZPIECZNIEJSZYCH FENOTYPACH. W RAMACH TEGO PROJEKTU PROPONUJEMY A) PRZEPROWADZENIE SZCZEGÓŁOWEJ ANALIZY ZMIENNOŚCI GENEROWANEJ I WYBRANEJ PODCZAS NIEDAWNEJ EWOLUCJI GATUNKÓW UPRAWNYCH O SZCZEGÓLNYM ZNACZENIU ORAZ (B) ZAINICJOWANIE NOWEJ LINII BADAŃ NAD ROZWOJEM PODEJŚĆ OPARTYCH NA SDN W CELU WPROWADZENIA KONKRETNYCH MUTACJI W GENOMACH ROŚLIN UPRAWNYCH. (Polish)
18 August 2022
0 references
Cerdanyola del Vallès
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
AGL2013-43244-R
0 references