Contribution of mutations of X chromosome genes versus autosome mutations in couples of male siblings with unfiliated intellectual disabilities and without other family history. Study using “Next Generation Sequencing”. (Q3199758)

From EU Knowledge Graph
Jump to navigation Jump to search
Project Q3199758 in Spain
Language Label Description Also known as
English
Contribution of mutations of X chromosome genes versus autosome mutations in couples of male siblings with unfiliated intellectual disabilities and without other family history. Study using “Next Generation Sequencing”.
Project Q3199758 in Spain

    Statements

    0 references
    0 references
    50,366.25 Euro
    0 references
    92,500.0 Euro
    0 references
    54.45 percent
    0 references
    1 January 2015
    0 references
    31 March 2018
    0 references
    ASOCIACION INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA BIOCRUCES
    0 references
    0 references

    43°17'43.73"N, 2°59'24.32"W
    0 references
    Hipótesis: Clásicamente se consideran las patologías ligadas al X cuando hay varios pacientes afectados varones en diferentes fratrias, ligados vía materna. Actualmente, con el descenso de la natalidad, el tener varios afectados suele ser una excepción. Nuestra hipótesis de trabajo es que debe de existir una gran contribución de los genes ligados al X en familias en las que hay dos hermanos varones con discapacidad intelectual sin filiar y sin otros antecedentes, casos que también podrían considerarse como recesivos. Objetivo: La identificación de mutaciones patogénicas en genes conocidos y en genes candidatos, en 20 parejas de hermanos varones con discapacidad intelectual sin filiar por medio de “Next Generation Sequencing” y el estudio de la proporción de mutaciones halladas en el cromosoma X versus en autosomas. Como objetivo secundario pretendemos comparar la eficiencia, rapidez, sencillez de análisis y fiabilidad de dos tecnologías de secuenciación masiva para el cromosoma X, algo novedoso y necesario para el abordaje diagnóstico futuro en este tipo de familias, para su mejor manejo, pronóstico, asesoramiento genético y futuros tratamientos. Metodología: 1) Selección retrospectiva y prospectiva de 20 familias para estudiar “trios” (padre, madre y uno de los hijos). 2) Diseño de un panel de 100 genes del cromosoma X utilizando la plataforma Ion Torrent PGMTM y estudio de los 20 tríos. 3) Estudio de exomas en los 20 tríos en centro externo. 4) Análisis de datos y comprobación de las mutaciones/variantes halladas. 5) Redacción de conclusiones y de una Guía para el diagnóstico molecular. (Spanish)
    0 references
    Scenario: Classically, X-linked pathologies are considered when there are several male patients in different fratrias linked to the maternal pathway. Currently, with the decline in birth rate, having several affected people is usually an exception. Our working hypothesis is that there must be a great contribution of X-linked genes in families in which there are two male siblings with intellectual disabilities without filiation and without other backgrounds, cases that could also be considered recessive. Objective: The identification of pathogenic mutations in known genes and candidate genes in 20 couples of male siblings with unfiliated intellectual disabilities by means of “Next Generation Sequencing” and the study of the proportion of mutations found on the X chromosome versus autosomes. As a secondary objective we intend to compare the efficiency, speed, simplicity of analysis and reliability of two mass sequencing technologies for the X chromosome, something new and necessary for the future diagnostic approach in this type of families, for their better management, prognosis, genetic counseling and future treatments. Methodology: 1) Retrospective and prospective selection of 20 families to study “tririos” (father, mother and one of the children). 2) Design of a panel of 100 genes of the X chromosome using the Ion Torrent PGMTM platform and study of the 20 trios. 3) Study of exomas in the 20 trios in external center. 4) Data analysis and verification of the mutations/variants found. 5) Drafting conclusions and a Guide to molecular diagnosis. (English)
    13 October 2021
    0.0687872509813056
    0 references
    Scénario: Classiquement, les pathologies liées aux X sont considérées lorsqu’il y a plusieurs patients masculins dans différentes fratries liées à la voie maternelle. Actuellement, avec la baisse du taux de natalité, le fait d’avoir plusieurs personnes touchées est généralement une exception. Notre hypothèse de travail est qu’il doit y avoir une grande contribution des gènes liés aux X dans les familles où il y a deux frères et sœurs mâles ayant une déficience intellectuelle sans filiation et sans autres origines, cas qui pourraient également être considérés comme récessifs. Objectif: L’identification des mutations pathogènes dans les gènes connus et les gènes candidats chez 20 couples de frères et sœurs mâles présentant une déficience intellectuelle non filiée au moyen du «séquençage de nouvelle génération» et l’étude de la proportion de mutations trouvées sur le chromosome X par rapport aux autosomes. En tant qu’objectif secondaire, nous avons l’intention de comparer l’efficacité, la rapidité, la simplicité de l’analyse et la fiabilité de deux technologies de séquençage de masse pour le chromosome X, quelque chose de nouveau et nécessaire pour l’approche diagnostique future dans ce type de familles, pour leur meilleure gestion, pronostic, conseil génétique et traitements futurs. Méthodologie: 1) sélection rétrospective et prospective de 20 familles pour étudier les «tririos» (père, mère et un des enfants). 2) Conception d’un panel de 100 gènes du chromosome X à l’aide de la plateforme PGMTM d’Ion Torrent et étude des 20 trios. 3) Étude des exomes dans les 20 trios au centre externe. 4) Analyse des données et vérification des mutations/variantes trouvées. 5) Élaboration de conclusions et d’un guide pour le diagnostic moléculaire. (French)
    5 December 2021
    0 references
    Szenario: Klassisch betrachtet werden X-verknüpfte Pathologien, wenn es mehrere männliche Patienten in verschiedenen Fratrien gibt, die mit dem mütterlichen Pfad verbunden sind. Derzeit ist mit dem Rückgang der Geburtenrate, mit mehreren betroffenen Personen in der Regel eine Ausnahme. Unsere Arbeitshypothese ist, dass es einen großen Beitrag von X-verknüpften Genen in Familien geben muss, in denen es zwei männliche Geschwister mit intellektuellen Behinderungen ohne Filiation und ohne andere Hintergründe gibt, Fälle, die auch als rezessiv betrachtet werden könnten. Ziel: Die Identifizierung pathogener Mutationen in bekannten Genen und Kandidatengen in 20 Paaren männlicher Geschwister mit unbefriedigten intellektuellen Behinderungen durch die „Next Generation Sequencing“ und die Untersuchung des Anteils der Mutationen, die auf dem X-Chromosom gegenüber Autosomen gefunden wurden. Als sekundäres Ziel wollen wir die Effizienz, Schnelligkeit, Einfachheit der Analyse und Zuverlässigkeit zweier Massensequenzierungstechnologien für das X-Chromosom vergleichen, was für den zukünftigen diagnostischen Ansatz in dieser Art von Familien, für ihre bessere Verwaltung, Prognose, genetische Beratung und zukünftige Behandlungen notwendig ist. Methodik: 1) Retrospektive und prospektive Auswahl von 20 Familien für das Studium von „Tririos“ (Vater, Mutter und eines der Kinder). 2) Entwurf eines Panels von 100 Genen des X-Chromosoms unter Verwendung der Ion Torrent PGMTM-Plattform und Untersuchung der 20 Trios. 3) Studie von Exomas in den 20 Trios in externem Zentrum. 4) Datenanalyse und Überprüfung der gefundenen Mutationen/Varianten. 5) Erarbeitung von Schlussfolgerungen und eines Leitfadens zur molekularen Diagnose. (German)
    9 December 2021
    0 references
    Scenario: Klassiek, X-gekoppelde pathologieën worden overwogen wanneer er verschillende mannelijke patiënten in verschillende fratria’s gekoppeld aan de maternale pathway. Momenteel, met de daling van het geboortecijfer, het hebben van verschillende getroffen mensen is meestal een uitzondering. Onze werkhypothese is dat er een grote bijdrage moet zijn van X-gekoppelde genen in gezinnen waarin er twee mannelijke broers en zussen met een verstandelijke handicap zijn zonder filiatie en zonder andere achtergronden, gevallen die ook als recessief kunnen worden beschouwd. Doelstelling: De identificatie van pathogene mutaties in bekende genen en kandidaat-genen in 20 paren van mannelijke broers en zussen met een niet-filiated intellectuele handicap door middel van „Next Generation Sequencing” en de studie van het aandeel mutaties gevonden op het X chromosoom versus autosomen. Als secundaire doelstelling zijn we van plan om de efficiëntie, snelheid, eenvoud van analyse en betrouwbaarheid van twee massa sequencing technologieën voor het X chromosoom te vergelijken, iets nieuws en noodzakelijk voor de toekomstige diagnostische aanpak in dit type families, voor hun betere beheer, prognose, genetische counseling en toekomstige behandelingen. Methodologie: 1) Retrospectieve en prospectieve selectie van 20 gezinnen om „tririos” te bestuderen (vader, moeder en een van de kinderen). 2) Ontwerp van een paneel van 100 genen van het X chromosoom met behulp van het Ion Torrent PGMTM platform en studie van de 20 trio’s. 3) Studie van exomas in de 20 trio’s in extern centrum. 4) Gegevensanalyse en verificatie van de gevonden mutaties/varianten. 5) Het opstellen van conclusies en een gids voor moleculaire diagnose. (Dutch)
    17 December 2021
    0 references
    Scenario: Classicamente, le patologie X-linked sono prese in considerazione quando ci sono diversi pazienti maschi in fratrie diverse legate alla via materna. Attualmente, con il calo del tasso di natalità, avere diverse persone colpite è di solito un'eccezione. La nostra ipotesi di lavoro è che ci debba essere un grande contributo dei geni X-linked in famiglie in cui ci sono due fratelli maschi con disabilità intellettive senza filiazione e senza altri background, casi che potrebbero anche essere considerati recessivi. Obiettivo: L'identificazione delle mutazioni patogene in geni noti e geni candidati in 20 coppie di fratelli maschi con disabilità intellettive non filiate per mezzo di "Next Generation Sequencing" e lo studio della proporzione di mutazioni trovate sul cromosoma X rispetto agli autosomi. Come obiettivo secondario intendiamo confrontare l'efficienza, la velocità, la semplicità di analisi e l'affidabilità di due tecnologie di sequenziamento di massa per il cromosoma X, qualcosa di nuovo e necessario per il futuro approccio diagnostico in questo tipo di famiglie, per la loro migliore gestione, prognosi, consulenza genetica e trattamenti futuri. Metodologia: 1) selezione retrospettiva e prospettica di 20 famiglie per studiare "tririos" (padre, madre e uno dei bambini). 2) Progettazione di un pannello di 100 geni del cromosoma X utilizzando la piattaforma Ion Torrent PGMTM e studio dei 20 trio. 3) Studio degli esomi nei 20 trio nel centro esterno. 4) Analisi dei dati e verifica delle mutazioni/varianti riscontrate. 5) Elaborazione di conclusioni e una guida alla diagnosi molecolare. (Italian)
    16 January 2022
    0 references
    Σενάριο: Κλασικά, οι παθολογίες που συνδέονται με το Χ εξετάζονται όταν υπάρχουν αρκετοί άνδρες ασθενείς σε διαφορετικές αδελφότητες που συνδέονται με τη μητρική οδό. Επί του παρόντος, με τη μείωση του ποσοστού γεννήσεων, η ύπαρξη πολλών επηρεαζόμενων ατόμων αποτελεί συνήθως εξαίρεση. Η υπόθεση εργασίας μας είναι ότι πρέπει να υπάρχει μεγάλη συμβολή των γονιδίων που συνδέονται με Χ σε οικογένειες στις οποίες υπάρχουν δύο αρσενικά αδέλφια με διανοητικές αναπηρίες χωρίς φιλία και χωρίς άλλα υπόβαθρα, περιπτώσεις που θα μπορούσαν επίσης να θεωρηθούν υποβαθμισμένες. Στόχος: Η ταυτοποίηση παθογόνων μεταλλάξεων σε γνωστά γονίδια και υποψήφια γονίδια σε 20 ζευγάρια αρσενικών αδελφών με μη φιλτραρισμένες νοητικές αναπηρίες μέσω της «Επόμενης Γενετικής αλληλουχίας» και η μελέτη του ποσοστού των μεταλλάξεων που βρέθηκαν στο Χ χρωμοσώματα έναντι των αυτοσωμάτων. Ως δευτερεύων στόχος σκοπεύουμε να συγκρίνουμε την αποτελεσματικότητα, την ταχύτητα, την απλότητα της ανάλυσης και την αξιοπιστία δύο τεχνολογιών μαζικής αλληλουχίας για το Χ χρωμοσώματα, κάτι νέο και απαραίτητο για τη μελλοντική διαγνωστική προσέγγιση σε αυτό το είδος οικογενειών, για την καλύτερη διαχείριση, πρόγνωση, γενετική συμβουλευτική και μελλοντικές θεραπείες. Μεθοδολογία: 1) Αναδρομική και μελλοντική επιλογή 20 οικογενειών για να σπουδάσουν «tririos» (πατέρας, μητέρα και ένα από τα παιδιά). 2) Σχεδιασμός ενός πάνελ 100 γονιδίων του χρωμοσώματος Χ χρησιμοποιώντας την πλατφόρμα Ion Torrent PGMTM και μελέτη των 20 τριών. 3) Μελέτη των εξωμάτων στο 20 τρίο στο εξωτερικό κέντρο. 4) Ανάλυση δεδομένων και επαλήθευση των μεταλλάξεων/παραλλαγών που βρέθηκαν. 5) Σύνταξη συμπερασμάτων και οδηγός μοριακής διάγνωσης. (Greek)
    18 August 2022
    0 references
    Scenarie: Klassisk overvejes X-forbundne patologier, når der er flere mandlige patienter i forskellige fratriaer, der er forbundet med moderens vej. I øjeblikket, med faldet i fødselsraten, at have flere berørte mennesker er normalt en undtagelse. Vores arbejdshypotese er, at der skal være et stort bidrag fra X-forbundne gener i familier, hvor der er to mandlige søskende med intellektuelle handicap uden filiation og uden andre baggrunde, tilfælde, der også kan betragtes som recessive. Formål: Identifikation af patogene mutationer i kendte gener og kandidatgener hos 20 par mandlige søskende med ufilierede intellektuelle handicap ved hjælp af "Next Generation Sequencing" og undersøgelsen af andelen af mutationer fundet på X-kromosomet versus autosomer. Som et sekundært mål har vi til hensigt at sammenligne effektiviteten, hastigheden, enkelheden i analysen og pålideligheden af to massesekvenseringsteknologier for X-kromosomet, noget nyt og nødvendigt for den fremtidige diagnostiske tilgang i denne type familier, for deres bedre forvaltning, prognose, genetisk rådgivning og fremtidige behandlinger. Metode: 1) Retrospektiv og potentiel udvælgelse af 20 familier til at studere "tririos" (far, mor og et af børnene). 2) Design af et panel af 100 gener af X-kromosomet ved hjælp af Ion Torrent PGMTM-platformen og undersøgelse af 20 trios. 3) Undersøgelse af exomer i 20 trios i eksternt center. 4) Dataanalyse og verifikation af de fundne mutationer/varianter. 5) Udarbejdelse af konklusioner og en vejledning til molekylær diagnose. (Danish)
    18 August 2022
    0 references
    Skenaario: Klassisesti X-sidotut patologiat otetaan huomioon, kun on olemassa useita miespotilaita eri fratrioissa, jotka liittyvät äidin väylään. Tällä hetkellä syntyvyyden laskun myötä useat kärsivät ihmiset ovat yleensä poikkeus. Meidän työolettamuksemme on, että on oltava suuri panos X-sidotut geenit perheissä, joissa on kaksi miespuoliset sisarukset kehitysvammaiset ilman filiation ja ilman muita taustoja, tapauksia, jotka voidaan myös pitää resessiivinen. Tavoite: Patogeenisten mutaatioiden tunnistaminen tunnetuissa geeneissä ja ehdokasgeeneissä 20 parissa miespuolisessa sisaruksessa, joilla on täyttämättömiä kehityshäiriöitä, ”Seuraavan sukupolven sekvensoinnin” avulla ja tutkimalla X-kromosomilla ja autosomeissa havaittujen mutaatioiden osuutta. Toissijaisena tavoitteena aiomme verrata kahden massasekvensointiteknologian tehokkuutta, nopeutta, analyysien yksinkertaisuutta ja luotettavuutta X-kromosomille, jotain uutta ja välttämätöntä tämäntyyppisten perheiden tulevaa diagnostista lähestymistapaa varten niiden parempaa hallintaa, ennustetta, geneettistä neuvontaa ja tulevia hoitoja varten. Menetelmät: 1) Retrospektiivinen ja prospektiivinen valinta 20 perhettä opiskelemaan ”tririos” (isä, äiti ja yksi lapsista). 2) Suunnittelu 100 geenin X kromosomi käyttäen Ion Torrent PGMTM alustan ja tutkimus 20 trios. 3) Tutkimus exomas 20 trios ulkoisessa keskustassa. 4) Havaittujen mutaatioiden/muunnelmien analysointi ja todentaminen. 5) päätelmien laatiminen ja opas molekyylidiagnoosia varten. (Finnish)
    18 August 2022
    0 references
    Xenarju: Klassikument, patoloġiji X-linked huma kkunsidrati meta jkun hemm diversi pazjenti rġiel fi fratrias differenti marbuta mal-passaġġ matern. Bħalissa, bit-tnaqqis fir-rata tat-twelid, li jkollhom diversi nies affettwati huwa normalment eċċezzjoni. Ipoteżi tax-xogħol tagħna hija li għandu jkun hemm kontribut kbir ta ‘ġeni X-marbuta fil-familji fejn hemm żewġ aħwa rġiel b’diżabilitajiet intellettwali mingħajr fili u mingħajr sfondi oħra, każijiet li jistgħu wkoll jiġu kkunsidrati reċessiv. Għan: L-identifikazzjoni ta’ mutazzjonijiet patoġeniċi f’ġeni magħrufa u ġeni kandidati f’20 koppja ta’ aħwa rġiel b’diżabilitajiet intellettwali mhux iffiljati permezz ta’ “Sekwenzjar tal-Ġenerazzjoni li Jmiss” u l-istudju tal-proporzjon ta’ mutazzjonijiet misjuba fuq il-kromożoma X kontra awtożomi. Bħala għan sekondarju għandna l-intenzjoni li tqabbel l-effiċjenza, il-veloċità, is-sempliċità tal-analiżi u l-affidabbiltà ta ‘żewġ teknoloġiji ta’ sekwenzar tal-massa għall-kromożoma X, xi ħaġa ġdida u meħtieġa għall-approċċ dijanjostiku futur f’dan it-tip ta ‘familji, għall-ġestjoni aħjar tagħhom, pronjożi, konsulenza ġenetika u trattamenti futuri. Metodoloġija: 1) għażla retrospettiva u prospettiva ta '20 familji għall-istudju “tririos” (missier, omm u wieħed mit-tfal). 2) Disinn ta ‘panel ta’ 100 ġeni tal-kromożoma X bl-użu tal-pjattaforma Ion Torrent PGMTM u studju tal-20 trios. 3) Studju ta ‘exomas fil- 20 trios fiċ-ċentru estern. 4) Analiżi tad-dejta u verifika tal-mutazzjonijiet/varjanti misjuba. 5) Abbozzar ta’ konklużjonijiet u Gwida għad-dijanjosi molekulari. (Maltese)
    18 August 2022
    0 references
    Scenārijs: Klasiski X-saistītās patoloģijas tiek ņemtas vērā, ja ir vairāki vīrieši dažādās fratriās, kas saistītas ar mātes ceļu. Pašlaik, samazinoties dzimstības līmenim, vairāki skartie cilvēki parasti ir izņēmums. Mūsu darba hipotēze ir tāda, ka ir jābūt lielam X-saistīto gēnu ieguldījumam ģimenēs, kurās ir divi vīriešu brāļi un māsas ar intelektuālās attīstības traucējumiem bez filiācijas un bez citiem foniem, gadījumi, kurus varētu uzskatīt arī par recesīviem. Mērķis: Patogēno mutāciju noteikšana zināmos gēnos un kandidātgēnos 20 pāriem vīriešu brāļiem un māsām ar nefasētiem intelektuālās attīstības traucējumiem, izmantojot “Next Generation Sequencing”, un pētījums par X hromosomā atrasto mutāciju īpatsvaru pret autosomām. Kā sekundāru mērķi mēs plānojam salīdzināt divu X hromosomu masu sekvencēšanas tehnoloģiju efektivitāti, ātrumu, vienkāršību un uzticamību, kas ir kaut kas jauns un nepieciešams turpmākai diagnostiskai pieejai šāda veida ģimenēs, to labākai pārvaldībai, prognozei, ģenētiskai konsultēšanai un turpmākai ārstēšanai. Metodika: 1) retrospektīva un perspektīva 20 ģimeņu atlase “tririos” (tēvs, māte un viens no bērniem). 2) 100 X hromosomas gēnu paneļa izstrāde, izmantojot Ion Torrent PGMTM platformu un 20 trio pētījumu. 3) Eksomas izpēte 20 trio ārējā centrā. 4) atrasto mutāciju/variantu datu analīze un pārbaude. 5) secinājumu izstrāde un molekulārās diagnozes rokasgrāmata. (Latvian)
    18 August 2022
    0 references
    Scenár: Klasicky sa uvažuje o patológiách spojených s X, keď je niekoľko pacientov mužského pohlavia v rôznych fratriach spojených s materskou dráhou. V súčasnej dobe, s poklesom pôrodnosti, mať niekoľko postihnutých ľudí je zvyčajne výnimkou. Naša pracovná hypotéza spočíva v tom, že v rodinách, v ktorých sú dva mužské súrodenci s mentálnym postihnutím bez filiácie a bez iných prostredí, musia existovať veľký prínos génov viazaných na X, čo sú prípady, ktoré by sa tiež mohli považovať za recesívne. Cieľ: Identifikácia patogénnych mutácií v známych génoch a kandidátskych génoch v 20 pároch mužských súrodencov s nefiliovaným mentálnym postihnutím prostredníctvom „Sequencovania ďalšej generácie“ a štúdia podielu mutácií nájdených na chromozóme X oproti autozómom. Ako vedľajší cieľ chceme porovnať účinnosť, rýchlosť, jednoduchosť analýzy a spoľahlivosť dvoch masových sekvenčných technológií pre chromozóm X, niečo nové a potrebné pre budúci diagnostický prístup v tomto type rodín, pre ich lepšie riadenie, prognózu, genetické poradenstvo a budúce liečby. Metodika: 1) Retrospektívny a perspektívny výber 20 rodín na štúdium „tririos“ (otec, matka a jedno z detí). 2) Navrhnite panel 100 génov chromozómu X pomocou platformy Ion Torrent PGMTM a štúdiu 20 trios. 3) Štúdia exómov v 20 triách vo vonkajšom centre. 4) Analýza údajov a overovanie zistených mutácií/variantov. 5) Vypracovanie záverov a Príručka k molekulárnej diagnostike. (Slovak)
    18 August 2022
    0 references
    Cás: Classically, Tá paiteolaíochtaí X-nasctha san áireamh nuair a bhíonn roinnt othar fireann i fratrias éagsúla nasctha leis an cosán máthar. Faoi láthair, leis an laghdú ar an ráta breithe, is eisceacht de ghnáth é roinnt daoine a bhfuil tionchar acu orthu. Is é ár hipitéis ag obair go mór go mór de géinte X-nasctha i dteaghlaigh ina bhfuil dhá deartháireacha fireanna faoi mhíchumas intleachtúil gan filiation agus gan cúlraí eile, cásanna a d’fhéadfaí a mheas freisin cúlaitheach. Cuspóir: Sócháin phataigineacha a shainaithint i ngéinte aitheanta agus i ngéinte iarrthacha i 20 lánúin deartháireacha fireanna atá faoi mhíchumas intleachta gan uaim trí bhíthin “Seicheamhú na Chéad Ghlúine Eile” agus staidéar a dhéanamh ar chion na sóchán a fhaightear ar an X crómasóim i gcoinne uathchrómacha. Mar chuspóir tánaisteach tá sé i gceist againn comparáid a dhéanamh idir éifeachtúlacht, luas, simplíocht anailíse agus iontaofacht dhá theicneolaíochtaí seicheamhaithe maise don chrómasóim X, rud éigin nua agus riachtanach don chur chuige diagnóiseach sa todhchaí sa chineál seo teaghlaigh, as a mbainistíocht níos fearr, a prognóis, comhairleoireacht ghéiniteach agus cóireálacha sa todhchaí. Modheolaíocht: 1) Rogha cúlghabhálach agus ionchasach 20 teaghlach chun staidéar a dhéanamh ar “tririos” (athair, máthair agus duine de na leanaí). 2) Dearadh painéal de 100 géinte den X crómasóim ag baint úsáide as an ardán ian Torrent PGMTM agus staidéar a dhéanamh ar an 20 trios. 3) Staidéar ar exomas sna trios 20 i lár seachtrach. 4) Anailís sonraí agus fíorú ar na sócháin/malairtí a aimsíodh. 5) Conclúidí a dhréachtú agus Treoir maidir le diagnóis mhóilíneach. (Irish)
    18 August 2022
    0 references
    Scénář: Klasicky se berou v úvahu patologie spojené s X, pokud existuje několik mužských pacientů v různých fratriích spojených s mateřskou cestou. V současné době, s poklesem porodnosti, mít několik postižených lidí je obvykle výjimkou. Naší pracovní hypotézou je, že v rodinách, ve kterých jsou dva sourozenci s mentálním postižením bez filiace a bez jiného pozadí, musí být velký přínos genů spojených s X, případy, které by mohly být také považovány za recesivní. Cíl: Identifikace patogenních mutací ve známých genech a kandidátských genech u 20 párů samců s nefiltrovaným mentálním postižením pomocí „sekvenování příští generace“ a studie podílu mutací nalezených na chromozomech X versus autosomes. Jako sekundární cíl chceme porovnat účinnost, rychlost, jednoduchost analýzy a spolehlivost dvou sekvenačních technologií pro chromozom X, něco nového a nezbytného pro budoucí diagnostický přístup v tomto typu rodin, pro jejich lepší řízení, prognózu, genetické poradenství a budoucí léčbu. Metodika: 1) Retrospektivní a perspektivní výběr 20 rodin ke studiu „tririos“ (otec, matka a jedno z dětí). 2) Návrh panelu 100 genů chromozomu X pomocí platformy Ion Torrent PGMTM a studie 20 tria. 3) Studium exomů ve 20 triech v externím centru. 4) Analýza dat a ověření nalezených mutací/variant. 5) Návrh závěrů a Průvodce molekulární diagnózou. (Czech)
    18 August 2022
    0 references
    Cenário: Classicamente, as patologias ligadas ao X são consideradas quando há vários pacientes do sexo masculino em diferentes fratrias ligadas à via materna. Atualmente, com o declínio da taxa de natalidade, ter várias pessoas afetadas é normalmente uma exceção. Nossa hipótese de trabalho é que deve haver uma grande contribuição de genes ligados ao X em famílias em que há dois irmãos do sexo masculino com deficiência intelectual sem filiação e sem outras origens, casos que também podem ser considerados recessivos. Objectivo: A identificação de mutações patogénicas em genes conhecidos e genes candidatos em 20 casais de irmãos do sexo masculino com deficiências intelectuais não associadas através da «Sequenciação da Próxima Geração» e o estudo da proporção de mutações encontradas no cromossoma X versus autossomas. Como objetivo secundário pretendemos comparar a eficiência, a velocidade, a simplicidade de análise e a confiabilidade de duas tecnologias de sequenciamento em massa para o cromossomo X, algo novo e necessário para a futura abordagem diagnóstica neste tipo de famílias, para sua melhor gestão, prognóstico, aconselhamento genético e tratamentos futuros. Metodologia: 1) Seleção retrospetiva e prospetiva de 20 famílias para estudar «tririos» (pai, mãe e uma das crianças). 2) Conceção de um painel de 100 genes do cromossoma X utilizando a plataforma PGMTM Ion Torrent e estudo dos 20 trios. 3) Estudo dos exomas nos 20 trios no centro externo. 4) Análise dos dados e verificação das mutações/variantes encontradas. 5) Redigir conclusões e um guia para o diagnóstico molecular. (Portuguese)
    18 August 2022
    0 references
    Stsenaarium: Klassikaliselt võetakse X-seotud patoloogiaid arvesse, kui ema rajaga seotud erinevates fratrias on mitu meespatsienti. Praegu on sündimuse vähenemisega seoses mitu mõjutatud inimest tavaliselt erand. Meie töö hüpotees on, et seal peab olema suur panus X-seotud geenid peredes, kus on kaks meessoost õed-vennad vaimse puudega ilma põlvnemise ja ilma muu tausta, juhtudel, mida võib samuti pidada retsessiivseks. Eesmärk: Patogeensete mutatsioonide kindlakstegemine teadaolevates geenides ja kandidaatgeenides 20 paaril mittefilieeritud intellektipuudega meessoost õdedel-vendadel „Järgmise põlvkonna järjestuse“ abil ja uuring, mis käsitleb X-kromosoomide ja autosoomide mutatsioonide osakaalu. Teise eesmärgina kavatseme võrrelda X-kromosoomi kahe massilise sekveneerimise tehnoloogia tõhusust, kiirust, analüüsi lihtsust ja usaldusväärsust, midagi uut ja vajalikku tulevaseks diagnostiliseks lähenemiseks seda tüüpi peredes, nende paremaks juhtimiseks, prognoosimiseks, geneetiliseks nõustamiseks ja tulevasteks ravimeetoditeks. Metoodika: 1) Retrospective ja tulevikku suunatud valik 20 pered õppida „tririos“ (isa, ema ja üks lastest). 2) X-kromosoomi 100 geenist koosneva paneeli kujundamine Ion Torrent PGMTM platvormi abil ja 20 triose uurimine. 3) Eksoomide uurimine väliskeskuses 20 trios. 4) Andmete analüüs ja leitud mutatsioonide/variantide kontrollimine. 5) Järelduste koostamine ja molekulaardiagnoosi juhend. (Estonian)
    18 August 2022
    0 references
    Forgatókönyv: Klasszikusan az X-kapcsolt patológiák akkor vehetők figyelembe, ha több férfi beteg van különböző fratriákban, amelyek az anyai útvonalhoz kapcsolódnak. Jelenleg a születési arány csökkenésével, mivel több érintett ember általában kivétel. Munkahipotézisünk szerint az X-kapcsolt géneknek nagy mértékben kell hozzájárulniuk az olyan családokhoz, amelyekben két, értelmi fogyatékossággal élő férfi testvér van filiáció és egyéb háttér nélkül, amelyek szintén recesszívnek tekinthetők. Célkitűzés: A patogén mutációk azonosítása ismert génekben és jelölt génekben 20 pár, nem szűrt értelmi fogyatékossággal élő férfi testvérben a „Next Generation Sequencing” segítségével, valamint az X kromoszómán talált mutációk arányának tanulmányozása az autoszómákkal szemben. Másodlagos célként az X kromoszóma két tömeges szekvenálási technológiájának hatékonyságát, sebességét, egyszerű elemzését és megbízhatóságát kívánjuk összehasonlítani, ami új és szükséges az ilyen típusú családok jövőbeli diagnosztikai megközelítéséhez, jobb kezelésükhöz, prognózisukhoz, genetikai tanácsadásukhoz és jövőbeli kezeléseikhez. Módszertan: 1) Retrospektív és jövőbeli kiválasztása 20 család tanulmányozására „tririos” (apa, anya és az egyik gyermek). 2) Az X kromoszóma 100 génjéből álló panel kialakítása az Ion Torrent PGMTM platform használatával és a 20 trió tanulmányozásával. 3) Az exómák tanulmányozása a 20 trióban a külső központban. 4) Adatelemzés és a talált mutációk/variánsok ellenőrzése. 5) Következtetések készítése és útmutató a molekuláris diagnózishoz. (Hungarian)
    18 August 2022
    0 references
    Сценарий: Класическите патологии, свързани с Х, се вземат предвид, когато има няколко пациенти от мъжки пол в различни групи, свързани с майчиния път. Понастоящем, с намаляването на раждаемостта, наличието на няколко засегнати лица обикновено е изключение. Нашата работна хипотеза е, че трябва да има голям принос на X-свързаните гени в семейства, в които има двама братя и сестри с интелектуални увреждания без родство и без друг произход, случаи, които също могат да се считат за рецесивни. Цел: Идентифициране на патогенни мутации в известни гени и кандидат гени при 20 двойки мъжки братя и сестри с непълни интелектуални увреждания чрез „следващо поколение секвениране“ и изследване на дела на мутациите, открити върху X хромозомата спрямо автозомите. Като вторична цел възнамеряваме да сравним ефективността, скоростта, простотата на анализа и надеждността на две масови секвениращи технологии за Х хромозомата, нещо ново и необходимо за бъдещия диагностичен подход в този тип семейства, за тяхното по-добро управление, прогноза, генетична консултация и бъдещи лечения. Методология: 1) Ретроспективен и перспективен избор на 20 семейства за изучаване на „тририос“ (баща, майка и едно от децата). 2) Проектиране на панел от 100 гена на X хромозомата с помощта на платформата Ion Torrent PGMTM и проучване на 20-те триоа. 3) Изследване на екзоми в 20 триоа във външен център. 4) Анализ на данни и проверка на намерените мутации/варианти. 5) Изготвяне на заключения и ръководство за молекулярна диагностика. (Bulgarian)
    18 August 2022
    0 references
    Scenarijus: Klasikiniu požiūriu, X susietos patologijos yra svarstomos, kai yra keletas vyrų, sergančių skirtingomis brotriomis, susijusiomis su motinos keliu. Šiuo metu, mažėjant gimstamumo lygiui, keletas nukentėjusių žmonių paprastai yra išimtis. Mūsų darbo hipotezė yra ta, kad turi būti didelis X susijusių genų indėlis į šeimas, kuriose yra du vyrai broliai ir seserys su protine negalia be filiacijos ir be kitų fonų, atvejų, kurie taip pat galėtų būti laikomi recesyviais. Tikslas: Žinomų genų ir potencialių genų patogeninių mutacijų nustatymas 20 porų brolių ir seserų su nefiliuota protine negalia naudojant „Next Generation Sequencing“ ir X chromosomoje rastų mutacijų santykio tyrimą su autosomomis. Kaip antrinis tikslas mes ketiname palyginti efektyvumą, greitį, analizės paprastumą ir patikimumą dviejų masinių sekos nustatymo technologijų X chromosomos, kažkas naujo ir būtino būsimo diagnostikos metodo šio tipo šeimoms, jų geresnio valdymo, prognozės, genetinis konsultavimas ir būsimas gydymas. Metodika: 1) Retrospektyvi ir perspektyvi 20 šeimų atranka studijuoti „tririos“ (tėvas, motina ir vienas iš vaikų). 2) 100 X chromosomos genų grupės dizainas naudojant Ion Torrent PGMTM platformą ir 20 trios tyrimą. 3) Eksomų tyrimas 20-yje išoriniame centre. 4) Duomenų analizė ir nustatytų mutacijų/variantų tikrinimas. 5) Rezultatų rengimas ir molekulinės diagnostikos vadovas. (Lithuanian)
    18 August 2022
    0 references
    Scenarij: Klasično se uzimaju u obzir patologije povezane s X-om kada postoji nekoliko muških bolesnika u različitim fratriama povezanima s majčinim putem. Trenutačno, s padom stope nataliteta, nekoliko pogođenih osoba obično je iznimka. Naša radna hipoteza je da mora postojati veliki doprinos X-povezanih gena u obiteljima u kojima postoje dvije muške braće i sestara s intelektualnim teškoćama bez filijacije i bez drugih pozadina, slučajevi koji bi se također mogli smatrati recesivnima. Cilj: Identifikacija patogenih mutacija u poznatih gena i gena kandidata u 20 parova muških braće i sestara s nefiliranim intelektualnim teškoćama pomoću „Sljedeće generacije sekvenciranja” i proučavanje udjela mutacija pronađenih na X kromosomu u odnosu na autosome. Kao sekundarni cilj namjeravamo usporediti učinkovitost, brzinu, jednostavnost analize i pouzdanost dviju tehnologija masovnog sekvenciranja za X kromosom, nešto novo i nužno za budući dijagnostički pristup u ovoj vrsti obitelji, za njihovo bolje upravljanje, prognozu, genetsko savjetovanje i buduće tretmane. Metodologija: 1) Retrospektivni i prospektivni odabir 20 obitelji za proučavanje „tririos” (otac, majka i jedna od djece). 2) Dizajn ploče od 100 gena X kromosoma pomoću Ion Torrent PGMTM platforme i proučavanja 20 triosa. 3) Studija egzoma u 20 trija u vanjskom središtu. 4) Analiza podataka i provjera mutacija/varijanata pronađenih. 5) Izrada zaključaka i vodič za molekularnu dijagnozu. (Croatian)
    18 August 2022
    0 references
    Scenario: Klassiskt, X-kopplade patologier beaktas när det finns flera manliga patienter i olika fratrias kopplade till moderns väg. För närvarande, med sjunkande födelsetal, med flera drabbade människor är vanligtvis ett undantag. Vår arbetshypotes är att det måste finnas ett stort bidrag av X-kopplade gener i familjer där det finns två manliga syskon med intellektuell funktionsnedsättning utan rasering och utan annan bakgrund, fall som också kan anses vara recessiva. Mål: Identifiering av patogena mutationer i kända gener och kandidatgener hos 20 par manliga syskon med ofilade intellektuella funktionsnedsättningar med hjälp av ”Next Generation Sequencing” och studien av andelen mutationer som finns på X-kromosomen kontra autosomer. Som ett sekundärt mål har vi för avsikt att jämföra effektiviteten, hastigheten, enkelheten i analysen och tillförlitligheten hos två masssekvenseringsteknologier för X-kromosomen, något nytt och nödvändigt för den framtida diagnostiska metoden i denna typ av familjer, för bättre hantering, prognos, genetisk rådgivning och framtida behandlingar. Metod: 1) Retrospektivt och prospektivt urval av 20 familjer för att studera ”tririos” (fader, mor och ett av barnen). 2) Design av en panel med 100 gener av X-kromosomen med hjälp av Ion Torrent PGMTM-plattformen och studie av 20 trios. 3) Studie av exomas i 20 trios i externt centrum. 4) Dataanalys och verifiering av de mutationer/varianter som finns. 5) Utarbeta slutsatser och en guide till molekylär diagnos. (Swedish)
    18 August 2022
    0 references
    Scenariul: Clasic, patologiile legate de X sunt luate în considerare atunci când există mai mulți pacienți de sex masculin în diferite fratrie legate de calea maternă. În prezent, odată cu scăderea ratei natalității, faptul de a avea mai multe persoane afectate este, de obicei, o excepție. Ipoteza noastră de lucru este că trebuie să existe o mare contribuție a genelor X în familii în care există doi frați de sex masculin cu dizabilități intelectuale fără filiație și fără alte medii, cazuri care ar putea fi, de asemenea, considerate recesive. Obiectiv: Identificarea mutațiilor patogene în genele cunoscute și genele candidate în 20 de cupluri de frați de sex masculin cu dizabilități intelectuale neafiliate prin intermediul „Next Generation Sequencing” și studiul proporției de mutații găsite pe cromozomul X comparativ cu autozomii. Ca obiectiv secundar, ne propunem să comparăm eficiența, viteza, simplitatea analizei și fiabilitatea a două tehnologii de secvențiere în masă pentru cromozomul X, ceva nou și necesar pentru abordarea diagnostică viitoare în acest tip de familii, pentru o mai bună gestionare, prognostic, consiliere genetică și tratamente viitoare. Metodologie: 1) Selectarea retrospectivă și prospectivă a 20 de familii pentru a studia „tririos” (tată, mamă și unul dintre copii). 2) Proiectarea unui panou de 100 de gene ale cromozomului X folosind platforma Ion Torrent PGMTM și studiul celor 20 de triouri. 3) Studiul exoamelor în cele 20 de triouri în centrul extern. 4) Analiza datelor și verificarea mutațiilor/variantelor găsite. 5) Elaborarea concluziilor și a unui ghid pentru diagnosticul molecular. (Romanian)
    18 August 2022
    0 references
    Scenarij: Klasično se upoštevajo z X povezane patologije, kadar je več moških bolnikov v različnih fratrijah, povezanih s potjo matere. Trenutno je zaradi upada rodnosti običajno izjema več prizadetih ljudi. Naša delovna hipoteza je, da mora obstajati velik prispevek genov, povezanih z X, v družinah, v katerih sta dva moška brata in sestre z motnjami v duševnem razvoju brez sorodnikov in brez drugih okolij, primerov, ki bi se lahko šteli za recesivne. Cilj: Identifikacija patogenih mutacij v znanih genih in kandidatnih genih pri 20 paru moških bratov in sester z nefiliiranimi motnjami v duševnem razvoju s pomočjo „sekvenciranja naslednje generacije“ in študija deleža mutacij, ugotovljenih na kromosomu X v primerjavi z avtosomi. Kot sekundarni cilj nameravamo primerjati učinkovitost, hitrost, enostavnost analize in zanesljivost dveh tehnologij množičnega zaporedja za kromosom X, nekaj novega in potrebnega za prihodnji diagnostični pristop v tej vrsti družin, za njihovo boljše upravljanje, prognozo, genetsko svetovanje in prihodnje zdravljenje. Metodologija: 1) Retrospektivna in prospektivna izbira 20 družin za študij „tririos“ (oče, mati in eden od otrok). 2) Oblikovanje plošče 100 genov kromosoma X z uporabo platforme Ion Torrent PGMTM in študija 20 triosov. 3) Študija eksomov v 20 trios v zunanjem centru. 4) Analiza podatkov in preverjanje ugotovljenih mutacij/variant. 5) Priprava sklepov in priročnik za molekularno diagnozo. (Slovenian)
    18 August 2022
    0 references
    Scenariusz: Klasyczne patologie związane z X są brane pod uwagę, gdy istnieje kilku pacjentów płci męskiej w różnych fratriach związanych ze ścieżką macierzyńską. Obecnie, wraz ze spadkiem wskaźnika urodzeń, liczba osób dotkniętych chorobą jest zwykle wyjątkiem. Nasza robocza hipoteza jest taka, że musi być wielki wkład genów związanych z X w rodzinach, w których istnieją dwa rodzeństwo z niepełnosprawnością intelektualną bez dzieciństwa i bez innych środowisk, przypadki, które można również uznać za recesywne. Cel: Identyfikacja patogennych mutacji w znanych genach i genach kandydackich u 20 par rodzeństwa męskiego z niewypełnioną niepełnosprawnością intelektualną za pomocą „Next Generation Sequencing” oraz badania proporcji mutacji znalezionych na chromosomach X w stosunku do autosomów. Jako cel drugorzędny zamierzamy porównać wydajność, szybkość, prostotę analizy i niezawodność dwóch masowych technologii sekwencjonowania chromosomu X, coś nowego i niezbędnego do przyszłego podejścia diagnostycznego w tego typu rodzinach, dla ich lepszego zarządzania, prognozowania, doradztwa genetycznego i przyszłych zabiegów. Metodyka: 1) retrospektywny i prospektywny wybór 20 rodzin do nauki „tririos” (ojciec, matka i jedno z dzieci). 2) Zaprojektowanie panelu 100 genów chromosomu X za pomocą platformy Ion Torrent PGMTM i badanie 20 triów. 3) Badanie egzomatów w 20 triosach w centrum zewnętrznym. 4) Analiza danych i weryfikacja znalezionych mutacji/wariantów. 5) Wnioski redakcyjne i przewodnik po diagnostyce molekularnej. (Polish)
    18 August 2022
    0 references
    Barakaldo
    0 references
    20 December 2023
    0 references

    Identifiers

    PI14_00321
    0 references