FUNCTION OF MICRORNAS IN RESISTANCE TO PATHOGEN INFECTION IN PLANTS (Q3194714)

From EU Knowledge Graph
Jump to navigation Jump to search
Project Q3194714 in Spain
Language Label Description Also known as
English
FUNCTION OF MICRORNAS IN RESISTANCE TO PATHOGEN INFECTION IN PLANTS
Project Q3194714 in Spain

    Statements

    country
    Spain
    0 references
    EU contribution
    177,888.14 Euro
    0 references
    budget
    326,700.0 Euro
    0 references
    co-financing rate
    54.45 percent
    0 references
    start time
    1 January 2016
    0 references
    end time
    30 June 2019
    0 references
    beneficiary name (string)
    CENTRO DE INVESTIGACION EN AGRIGENOMICA
    0 references
    coordinate location

    41°28'51.02"N, 2°7'22.04"E
    inferred from
    Local Administrative Unit
    0 references
    postal code
    8193
    0 references
    summary
    EN LA NATURALEZA LAS PLANTAS ESTAN EXPUESTAS A NUMEROSAS CONDICIONES AMBIENTALES ADVERSAS QUE INCLUYEN ESTRESES DE TIPO BIOTICO Y ABIOTICOS. PARA ADAPTARSE Y SUPERAR TALES CONDICIONES, LAS PLANTAS DESARROLLAN MECANISMOS DE DEFENSA QUE LES PERMITEN RESPONDER DE LA FORMA MAS APROPIADA A CADA TIPO DE ESTRES. ELLO REQUIERE SOFISTICADOS MECANISMOS DE COMUNICACION ENTRE VIAS DE SEÑALIZACION INICIADAS POR FACTORES EXTERNOS QUE PERMITAN UNA RESPUESTA COORDINADA EN LA PLANTA. SE SABE QUE LOS MICRORNA (MIRNA) SON REGULADORES DE LA EXPRESION GENICA EN DIFERENTES PROCESOS DEL DESARROLLO, ASI COMO EN RESPUESTAS ADAPTATIVAS A ESTRESES MEDIOAMBIENTALES. LOS MIRNAS PERMITEN DAR RESPUESTAS RAPIDA Y A VECES MUY ESPECIFICAS, POR LO QUE SON ELEMENTOS CLAVE PARA EL CORRECTO AJUSTE DE LA EXPRESSION GENICA EN PROCESOS DE RESISTENCIA A PATOGENOS, ASI COMO EN PROCESOS DE COMUNICACION EN LA RESPUESTA A DIFERENTES TIPOS DE ESTRES. ESTE PROYECTO SE ABORDA ESTE TEMA PARA DAR RESPUESTA A UNA PREGUNTA NUEVA SOBRE LA INTEGRACION DE PROCESOS DURANTE LA ADAPTACION A DIFERENTES ESTRESES AMBIENTALES: EL PAPEL DE LOS MIRNA EN LA RESPUESTA DE DEFENSA Y EN SU INTERACCION CON ESTRESES NUTRICIONALES EN PLANTAS. ESTOS ESTUDIOS SE LLEVARAN A CABO EN PLANTAS DE ARROZ Y ARABIDOPSIS, LAS DOS PLANTAS MODELO PARA ESTUDIOS DE GENOMICA FUNCIONAL EN MONOCOTILEDONEAS Y DICOTILEDONEAS, Y REPRESENTA LA CONTINUACION DEL PROYECTO ACTUAL (BIO2012-32838). CONCRETAMENTE,, SE PROPONE: I) CARACTERIZAR LA RELEVANCIA DE MIR399 Y MIR827 EN LA INTERACCION ENTRE LAS RUTAS DE SEÑALIZACION DE FOSFATO (P) Y LA RESPUESTA INMUNE (ARROZ, ARABIDOPSIS), Y II) AVERIGUAR EL PAPEL QUE TIENE MIR7695, UN MIRNA ESPECIFICO DE ARROZ IDENTIFICADO EN NUESTRO GRUPO, EN EL CONTROL DE LA HOMEOSTASIS DEL HIERRO (FE) Y/O MANGANESO (MN) DURANTE LA RESPUESTA DE DEFENSA (ARROZ). ASIMISMO, SE ESTUDIARA LA INTERACCION ENTRE RUTAS DE SEÑALIZACION DE P Y FE/MN IMPLICADAS EN EL FENOTIPO DE RESISTENCIA/SUSCEPTIBILIDAD DE LAS PLANTAS EN RESPUESTA A LA INFECCION. EN NUESTRO GRUPO SE ESTUDIAN LOS PATOSISTEMAS ADECUADOS PARA ESTOS ESTUDIOS: ARROZ/MAGNAPORTHE ORYZAE Y ARABIDOPSIS /PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. POR OTRO LADO, EN LA LITERATURA SE HA DESCRITO QUE CIERTOS MIRNAS Y SIRNAS SON CAPACES DE SER TRANSPORTADOS Y ACTUAR EN ORGANISMOS DIFERENTES DEL QUE PROVIENEN (¿TRANS-KINGDOM CROSS-TALK¿). EN ESTE PROYECTO ANALIZAREMOS SI EXISTE UNA REGULACION MEDIADA POR MIRNAS ENTRE ESPECIES EN LOS PROCESOS DE RESISTENCIA A PATOGENOS EN ARROZ. ESTE PROYECTO ABARCA TECNICAS DE GENETICA DIRECTA Y REVERSA, SECUENCIACION MASIVA Y ANALISIS BIOINFORMATICO, ANALISIS CITOLOGICOS E HISTOLOGICOS, E IDENTIFICACION DE COMPLEJOS DE MIRNA-AGO DURANTE LOS PROCESOS DE INTERACCION PLANTA-PATOGENO. LA DISPONIBILIDAD DE PROTOCOLOS AND HERRAMIENTAS DE TRABAJO, NOS COLOCAN EN UN BUEN PUNTO DE PARTIDA PARA ALCANZAR DICHOS OBJETIVOS. EN CASO DE OBTENER RESULTADOS POSITIVOS, SE DEMOSTRARIA QUE LOS MIRNAS ACTUAN COMO ELEMENTOS DE CONEXION REGULADORES DE LA EXPRESION GENICA PARA EL CONTROL DE RESPUESTAS INMUNES Y HOMEOSTASIS DE NUTRIENTES DURANTE LA INFECCION POR PATOGENOS. LOS RESULTADOS OBTENIDOS Y EL CONOCIMIENTO GENERADO EN ESTE PROYECTO CONTRIBUIRAN AL ESTABLECIMIENTO DE NUEVOS CONCEPTOS EN ESTUDIOS DE INTERACCION PLANTA/PATOGENO. ELLO AYUDARA A DEFINIR NUEVAS ESTRATEGIAS DE MEJORA DE LA RESISTENCIA DE LAS PLANTAS A LA INFECCION POR PATOGENOS, QUE EN ULTIMO TERMINO BENEFICIARA A LOS PROGRAMAS DE MEJORA EN ESPECIES DE INTERES AGRONOMICO. (Spanish)
    0 references
    IN NATURE PLANTS ARE EXPOSED TO NUMEROUS ADVERSE ENVIRONMENTAL CONDITIONS INCLUDING BIOTIC AND ABIOTIC STRESS. TO ADAPT AND OVERCOME SUCH CONDITIONS, PLANTS DEVELOP DEFENSE MECHANISMS THAT ALLOW THEM TO RESPOND IN THE MOST APPROPRIATE WAY TO EACH TYPE OF STRESS. THIS REQUIRES SOPHISTICATED COMMUNICATION MECHANISMS BETWEEN SIGNALLING ROUTES INITIATED BY EXTERNAL FACTORS THAT ALLOW A COORDINATED RESPONSE IN THE PLANT. MICRORNAS (MIRNA) ARE KNOWN TO BE REGULATORS OF GENIC EXPRESSION IN DIFFERENT DEVELOPMENTAL PROCESSES, AS WELL AS IN ADAPTIVE RESPONSES TO ENVIRONMENTAL STRESS. MIRNAS ALLOW RAPID AND SOMETIMES VERY SPECIFIC RESPONSES, SO THEY ARE KEY ELEMENTS FOR THE CORRECT ADJUSTMENT OF THE GENIC EXPRESSION IN PROCESSES OF RESISTANCE TO PATHOGENS, AS WELL AS IN COMMUNICATION PROCESSES IN THE RESPONSE TO DIFFERENT TYPES OF STRESS. THIS PROJECT ADDRESSES THIS TOPIC TO ANSWER A NEW QUESTION ABOUT THE INTEGRATION OF PROCESSES DURING THE ADAPTATION TO DIFFERENT ENVIRONMENTAL STRESS: THE ROLE OF THE MIRNA IN THE DEFENSE RESPONSE AND IN THEIR INTERACTION WITH NUTRITIONAL STRESS IN PLANTS. THESE STUDIES WILL BE CARRIED OUT IN RICE PLANTS AND ARABIDOPSIS, THE TWO MODEL PLANTS FOR STUDIES OF FUNCTIONAL GENOMIC IN MONOCOTYLEDONES AND DICOTYLEDONES, AND REPRESENTS THE CONTINUATION OF THE CURRENT PROJECT (BIO2012-32838). IN PARTICULAR, IT IS PROPOSED THAT: I) CHARACTERISE THE RELEVANCE OF MIR399 AND MIR827 IN THE INTERACTION BETWEEN THE PHOSPHATE SIGNALLING ROUTES (P) AND THE IMMUNE RESPONSE (RICE, ARABIDOPSIS), AND II) TO FIND OUT THE ROLE OF MIR7695, A SPECIFIC MIRNA OF RICE IDENTIFIED IN OUR GROUP, IN THE CONTROL OF THE HOMEOSTASIS OF IRON (FE) AND/OR MANGANESE (MN) DURING THE DEFENSE RESPONSE (RICE). IN ADDITION, THE INTERACTION BETWEEN SIGNALLING ROUTES OF P AND FAITH/MN INVOLVED IN THE PHENOTYPE OF RESISTANCE/SUSCEPTIBILITY OF PLANTS IN RESPONSE TO INFECTION WILL BE STUDIED. IN OUR GROUP THE APPROPRIATE PATHOSYSTEMS FOR THESE STUDIES ARE STUDIED: RICE/MAGNAPORTHE ORYZAE AND ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. ON THE OTHER HAND, IN THE LITERATURE IT HAS BEEN DESCRIBED THAT CERTAIN MIRNAS AND SIRNAS ARE CAPABLE OF BEING TRANSPORTED AND ACTING IN ORGANISMS OTHER THAN THE ONE THEY COME FROM (TRANS-KINGDOM CROSS-TALK). IN THIS PROJECT WE WILL ANALYSE WHETHER THERE IS A REGULATION MEDIATED BY MIRNAS BETWEEN SPECIES IN THE PROCESSES OF RESISTANCE TO PATHOGENS IN RICE. THIS PROJECT COVERS TECHNIQUES OF DIRECT AND REVERSE GENETIC, MASS SEQUENCING AND BIOINFORMATIC ANALYSIS, CYTOLOGIC AND HISTOLOGIC ANALYSIS, AND IDENTIFICATION OF MIRNA-AGO COMPLEXES DURING PLANT-PATHOGEN INTERACTION PROCESSES. THE AVAILABILITY OF PROTOCOLS AND WORK TOOLS, PUTS US IN A GOOD STARTING POINT TO ACHIEVE THESE GOALS. IF POSITIVE RESULTS ARE OBTAINED, IT WOULD BE DEMONSTRATED THAT MIRNAS ACT AS CONNECTING ELEMENTS REGULATING GENIC EXPRESSION FOR THE CONTROL OF IMMUNE RESPONSES AND NUTRIENT HOMEOSTASIS DURING PATHOGEN INFECTION. THE RESULTS OBTAINED AND THE KNOWLEDGE GENERATED IN THIS PROJECT WILL CONTRIBUTE TO THE ESTABLISHMENT OF NEW CONCEPTS IN PLANT/PATHOGEN INTERACTION STUDIES. THIS WILL HELP DEFINE NEW STRATEGIES TO IMPROVE THE RESISTANCE OF PLANTS TO PATHOGEN INFECTION, WHICH WILL ULTIMATELY BENEFIT IMPROVEMENT PROGRAMS IN SPECIES OF AGRONOMIC INTEREST. (English)
    point in time
    12 October 2021
    readability score
    0.5782569717182557
    0 references
    DANS LA NATURE, LES PLANTES SONT EXPOSÉES À DE NOMBREUSES CONDITIONS ENVIRONNEMENTALES DÉFAVORABLES, Y COMPRIS LE STRESS BIOTIQUE ET ABIOTIQUE. POUR S’ADAPTER ET SURMONTER CES CONDITIONS, LES PLANTES DÉVELOPPENT DES MÉCANISMES DE DÉFENSE QUI LEUR PERMETTENT DE RÉAGIR DE LA MANIÈRE LA PLUS APPROPRIÉE À CHAQUE TYPE DE STRESS. CELA NÉCESSITE DES MÉCANISMES DE COMMUNICATION SOPHISTIQUÉS ENTRE LES VOIES DE SIGNALISATION INITIÉES PAR DES FACTEURS EXTERNES QUI PERMETTENT UNE RÉPONSE COORDONNÉE À L’INSTALLATION. LES MICROARN (MIRNA) SONT CONNUS POUR ÊTRE DES RÉGULATEURS DE L’EXPRESSION GÉNIQUE DANS DIFFÉRENTS PROCESSUS DE DÉVELOPPEMENT, AINSI QUE DANS LES RÉPONSES ADAPTATIVES AU STRESS ENVIRONNEMENTAL. LES MIRNA PERMETTENT DES RÉPONSES RAPIDES ET PARFOIS TRÈS SPÉCIFIQUES, DE SORTE QU’ILS SONT DES ÉLÉMENTS CLÉS POUR L’AJUSTEMENT CORRECT DE L’EXPRESSION GÉNIQUE DANS LES PROCESSUS DE RÉSISTANCE AUX AGENTS PATHOGÈNES, AINSI QUE DANS LES PROCESSUS DE COMMUNICATION DANS LA RÉPONSE À DIFFÉRENTS TYPES DE STRESS. CE PROJET ABORDE CE THÈME POUR RÉPONDRE À UNE NOUVELLE QUESTION SUR L’INTÉGRATION DES PROCESSUS LORS DE L’ADAPTATION AUX DIFFÉRENTS STRESS ENVIRONNEMENTAUX: LE RÔLE DE LA MIRNA DANS LA RÉPONSE DE DÉFENSE ET DANS LEUR INTERACTION AVEC LE STRESS NUTRITIONNEL CHEZ LES PLANTES. CES ÉTUDES SERONT RÉALISÉES DANS LES RIZIÈRES ET ARABIDOPSIS, LES DEUX PLANTES MODÈLES POUR L’ÉTUDE DE LA GÉNOMIQUE FONCTIONNELLE CHEZ LES MONOCOTYLEDONES ET LES DICOTYLEDONES, ET REPRÉSENTENT LA POURSUITE DU PROJET ACTUEL (BIO2012-32838). EN PARTICULIER, IL EST PROPOSÉ QUE: I) CARACTÉRISER LA PERTINENCE DES MIR399 ET MIR827 DANS L’INTERACTION ENTRE LES VOIES DE SIGNALISATION DU PHOSPHATE (P) ET LA RÉPONSE IMMUNITAIRE (RIZ, ARABIDOPSIS) ET II POUR DÉCOUVRIR LE RÔLE DU MIR7695, UNE MIRNA SPÉCIFIQUE DE RIZ IDENTIFIÉE DANS NOTRE GROUPE, DANS LE CONTRÔLE DE L’HOMÉOSTASIE DU FER (FE) ET/OU DU MANGANÈSE (MN) PENDANT LA RÉPONSE DE DÉFENSE (RIZ). EN OUTRE, L’INTERACTION ENTRE LES VOIES DE SIGNALISATION DE P ET LA FOI/MN IMPLIQUÉES DANS LE PHÉNOTYPE DE RÉSISTANCE/SUSCEPTIBILITÉ DES PLANTES EN RÉPONSE À L’INFECTION SERA ÉTUDIÉE. DANS NOTRE GROUPE, LES PATHOSYSTÈMES APPROPRIÉS POUR CES ÉTUDES SONT ÉTUDIÉS: RIZ/MAGNAPORTHE ORYZAE ET ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. D’AUTRE PART, DANS LA LITTÉRATURE, IL A ÉTÉ DÉCRIT QUE CERTAINS MIRNAS ET SIRNAS SONT CAPABLES D’ÊTRE TRANSPORTÉS ET AGISSANT DANS DES ORGANISMES AUTRES QUE CELUI D’OÙ ILS PROVIENNENT (TRANS-KINGDOM CROSS-TALK). DANS LE CADRE DE CE PROJET, NOUS ALLONS ANALYSER S’IL EXISTE UN RÈGLEMENT MÉDIÉ PAR LES MIRNA ENTRE LES ESPÈCES DANS LES PROCESSUS DE RÉSISTANCE AUX AGENTS PATHOGÈNES DANS LE RIZ. CE PROJET PORTE SUR LES TECHNIQUES DE GÉNÉTIQUE DIRECTE ET INVERSE, LE SÉQUENÇAGE DE MASSE ET L’ANALYSE BIOINFORMATIQUE, L’ANALYSE CYTOLOGIQUE ET HISTOLOGIQUE ET L’IDENTIFICATION DES COMPLEXES MIRNA-AGO AU COURS DE PROCESSUS D’INTERACTION PLANTE-PATHOGÈNE. LA DISPONIBILITÉ DE PROTOCOLES ET D’OUTILS DE TRAVAIL NOUS MET DANS UN BON POINT DE DÉPART POUR ATTEINDRE CES OBJECTIFS. SI DES RÉSULTATS POSITIFS SONT OBTENUS, IL SERAIT DÉMONTRÉ QUE LES MIRNAS AGISSENT COMME ÉLÉMENTS DE LIAISON RÉGULANT L’EXPRESSION GÉNIQUE POUR LE CONTRÔLE DES RÉPONSES IMMUNITAIRES ET DE L’HOMÉOSTASIE DES ÉLÉMENTS NUTRITIFS PENDANT L’INFECTION PAR UN AGENT PATHOGÈNE. LES RÉSULTATS OBTENUS ET LES CONNAISSANCES ACQUISES DANS LE CADRE DE CE PROJET CONTRIBUERONT À L’ÉTABLISSEMENT DE NOUVEAUX CONCEPTS DANS LES ÉTUDES D’INTERACTION PLANTE/PATHOGÈNE. CELA AIDERA À DÉFINIR DE NOUVELLES STRATÉGIES POUR AMÉLIORER LA RÉSISTANCE DES PLANTES À L’INFECTION PAR DES AGENTS PATHOGÈNES, CE QUI PROFITERA EN FIN DE COMPTE AUX PROGRAMMES D’AMÉLIORATION DES ESPÈCES D’INTÉRÊT AGRONOMIQUE. (French)
    point in time
    4 December 2021
    0 references
    IN DER NATUR SIND PFLANZEN ZAHLREICHEN WIDRIGEN UMWELTBEDINGUNGEN AUSGESETZT, EINSCHLIESSLICH BIOTISCHER UND ABIOTISCHER STRESS. UM SOLCHE BEDINGUNGEN ANZUPASSEN UND ZU ÜBERWINDEN, ENTWICKELN PFLANZEN ABWEHRMECHANISMEN, DIE ES IHNEN ERMÖGLICHEN, AUF DIE AM BESTEN GEEIGNETE WEISE AUF JEDE ART VON STRESS ZU REAGIEREN. DIES ERFORDERT AUSGEFEILTE KOMMUNIKATIONSMECHANISMEN ZWISCHEN SIGNALWEGEN, DIE DURCH EXTERNE FAKTOREN AUSGELÖST WERDEN, DIE EINE KOORDINIERTE REAKTION IN DER ANLAGE ERMÖGLICHEN. MICRORNAS (MIRNA) SIND BEKANNTERMASSEN REGULATOREN DER GENENEXPRESSION IN VERSCHIEDENEN ENTWICKLUNGSPROZESSEN SOWIE IN ADAPTIVEN REAKTIONEN AUF UMWELTBELASTUNGEN. MIRNAS ERMÖGLICHEN SCHNELLE UND MANCHMAL SEHR SPEZIFISCHE REAKTIONEN, SO DASS SIE WICHTIGE ELEMENTE FÜR DIE KORREKTE ANPASSUNG DER GENEXPRESSION IN PROZESSEN DER RESISTENZ GEGEN KRANKHEITSERREGER SOWIE IN KOMMUNIKATIONSPROZESSEN IN DER REAKTION AUF VERSCHIEDENE ARTEN VON STRESS SIND. DIESES PROJEKT BEFASST SICH MIT DIESEM THEMA, UM EINE NEUE FRAGE ZUR INTEGRATION VON PROZESSEN BEI DER ANPASSUNG AN UNTERSCHIEDLICHE UMWELTBELASTUNGEN ZU BEANTWORTEN: DIE ROLLE DER MIRNA IN DER ABWEHRREAKTION UND IN IHRER INTERAKTION MIT ERNÄHRUNGSSTRESS IN PFLANZEN. DIESE STUDIEN WERDEN IN REISPFLANZEN UND ARABIDOPSIS DURCHGEFÜHRT, DEN BEIDEN MODELLPFLANZEN FÜR STUDIEN ZUR FUNKTIONELLEN GENOMIK IN MONOCOTYLEDONE UND DICOTYLEDONE, UND STELLEN DIE FORTSETZUNG DES LAUFENDEN PROJEKTS DAR (BIO2012-32838). INSBESONDERE WIRD VORGESCHLAGEN, I) CHARAKTERISIERT DIE RELEVANZ VON MIR399 UND MIR827 IN DER WECHSELWIRKUNG ZWISCHEN DEN PHOSPHATSIGNALWEGEN (P) UND DER IMMUNANTWORT (REIS, ARABIDOPSIS) UND II, UM DIE ROLLE VON MIR7695, EINER SPEZIFISCHEN MIRNA VON REIS, DIE IN UNSERER GRUPPE IDENTIFIZIERT WURDE, BEI DER KONTROLLE DER HOMÖOSTASE VON EISEN (FE) UND/ODER MANGAN (MN) WÄHREND DER ABWEHRREAKTION (REIS) HERAUSZUFINDEN. DARÜBER HINAUS WIRD DIE WECHSELWIRKUNG ZWISCHEN SIGNALWEGEN VON P UND GLAUBEN/MN, DIE AM PHÄNOTYP DER RESISTENZ/SZEPTIBILITÄT VON PFLANZEN ALS REAKTION AUF INFEKTIONEN BETEILIGT SIND, UNTERSUCHT WERDEN. IN UNSERER GRUPPE WERDEN DIE GEEIGNETEN PATHOSYSTEME FÜR DIESE STUDIEN UNTERSUCHT: REIS/MAGNAPORTHE ORYZAE UND ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. ANDERERSEITS WURDE IN DER LITERATUR BESCHRIEBEN, DASS BESTIMMTE MIRNAS UND SIRNAS IN ANDEREN ORGANISMEN ALS DEM, AUS DEM SIE STAMMEN (TRANS-KINGDOM CROSS-TALK) TRANSPORTIERT UND HANDELN KÖNNEN. IN DIESEM PROJEKT WERDEN WIR UNTERSUCHEN, OB ES EINE VERORDNUNG GIBT, DIE VON MIRNAS ZWISCHEN DEN ARTEN IN DEN PROZESSEN DER RESISTENZ GEGEN KRANKHEITSERREGER IM REIS VERMITTELT WIRD. DIESES PROJEKT UMFASST TECHNIKEN DER DIREKTEN UND UMGEKEHRTEN GENETISCHEN, MASSENSEQUENZIERUNG UND BIOINFORMATISCHEN ANALYSE, ZYTOLOGISCHER UND HISTOLOGISCHER ANALYSE SOWIE DER IDENTIFIZIERUNG VON MIRNA-AGO-KOMPLEXEN WÄHREND DER INTERAKTIONSPROZESSE VON PFLANZENPATHOGENEN. DIE VERFÜGBARKEIT VON PROTOKOLLEN UND ARBEITSWERKZEUGEN BRINGT UNS IN EINEN GUTEN AUSGANGSPUNKT, UM DIESE ZIELE ZU ERREICHEN. WENN POSITIVE ERGEBNISSE ERZIELT WERDEN, KÖNNTE NACHGEWIESEN WERDEN, DASS MIRNAS ALS VERBINDUNGSELEMENTE FÜR DIE KONTROLLE DER IMMUNANTWORT UND DER NÄHRSTOFFHOMÖOSTASE WÄHREND DER KRANKHEITSINFEKTIONEN DIE GENGENE EXPRESSION REGULIEREN. DIE GEWONNENEN ERGEBNISSE UND DAS IM RAHMEN DIESES PROJEKTS GEWONNENE WISSEN TRAGEN ZUR ENTWICKLUNG NEUER KONZEPTE IN PFLANZEN-/PATHOGENEN INTERAKTIONSSTUDIEN BEI. DIES WIRD DAZU BEITRAGEN, NEUE STRATEGIEN ZUR VERBESSERUNG DER RESISTENZ VON PFLANZEN GEGEN KRANKHEITSERREGER ZU DEFINIEREN, DIE LETZTLICH VERBESSERUNGSPROGRAMME BEI ARTEN VON AGRONOMISCHEM INTERESSE NUTZEN WERDEN. (German)
    point in time
    9 December 2021
    0 references
    IN DE NATUUR WORDEN PLANTEN BLOOTGESTELD AAN TAL VAN ONGUNSTIGE MILIEUOMSTANDIGHEDEN, WAARONDER BIOTISCHE EN ABIOTISCHE STRESS. OM DERGELIJKE OMSTANDIGHEDEN AAN TE PASSEN EN TE OVERWINNEN, ONTWIKKELEN PLANTEN DEFENSIEMECHANISMEN DIE HEN IN STAAT STELLEN OM OP DE MEEST GESCHIKTE MANIER TE REAGEREN OP ELK TYPE STRESS. DIT VEREIST GEAVANCEERDE COMMUNICATIEMECHANISMEN TUSSEN SIGNAALROUTES DIE WORDEN GEÏNITIEERD DOOR EXTERNE FACTOREN DIE EEN GECOÖRDINEERDE REACTIE IN DE FABRIEK MOGELIJK MAKEN. MICRORNA’S (MIRNA) STAAN BEKEND ALS REGULATORS VAN GENIC EXPRESSIE IN VERSCHILLENDE ONTWIKKELINGSPROCESSEN, EVENALS IN ADAPTIEVE REACTIES OP MILIEUSTRESS. MIRNAS STAAN SNELLE EN SOMS ZEER SPECIFIEKE REACTIES TOE, DUS ZE ZIJN BELANGRIJKE ELEMENTEN VOOR DE JUISTE AANPASSING VAN DE GENIC EXPRESSIE IN PROCESSEN VAN RESISTENTIE TEGEN ZIEKTEVERWEKKERS, EVENALS IN COMMUNICATIEPROCESSEN IN DE RESPONS OP VERSCHILLENDE SOORTEN STRESS. DIT PROJECT RICHT ZICH OP DIT ONDERWERP OM EEN NIEUWE VRAAG TE BEANTWOORDEN OVER DE INTEGRATIE VAN PROCESSEN TIJDENS DE AANPASSING AAN VERSCHILLENDE MILIEUSTRESS: DE ROL VAN DE MIRNA IN DE DEFENSIERESPONS EN IN HUN INTERACTIE MET VOEDINGSSTRESS IN PLANTEN. DEZE STUDIES ZULLEN WORDEN UITGEVOERD IN RIJSTPLANTEN EN ARABIDOPSIS, DE TWEE MODELPLANTEN VOOR STUDIES NAAR FUNCTIONELE GENOMICA IN MONOCOTYLEDONEN EN DICOTYLEDONEN, EN VORMEN DE VOORTZETTING VAN HET HUIDIGE PROJECT (BIO2012-32838). IN HET BIJZONDER WORDT VOORGESTELD: I) KARAKTERISEREN DE RELEVANTIE VAN MIR399 EN MIR827 IN DE INTERACTIE TUSSEN DE FOSFAAT SIGNALERENDE ROUTES (P) EN DE IMMUUNRESPONS (RIJST, ARABIDOPSIS), EN II) OM DE ROL VAN MIR7695, EEN SPECIFIEKE MIRNA VAN RIJST GEÏDENTIFICEERD IN ONZE GROEP, IN DE CONTROLE VAN DE HOMEOSTASE VAN IJZER (FE) EN/OF MANGAAN (MN) TIJDENS DE VERDEDIGING RESPONS (RIJST). DAARNAAST ZAL DE INTERACTIE TUSSEN SIGNAALROUTES VAN P EN GELOOF/MN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ HET FENOTYPE VAN RESISTENTIE/GEVOELIGHEID VAN PLANTEN ALS REACTIE OP INFECTIE WORDEN ONDERZOCHT. IN ONZE GROEP WORDEN DE GESCHIKTE PATHOSYSTEMEN VOOR DEZE STUDIES BESTUDEERD: RIJST/MAGNAPORTHE ORYZAE EN ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. ANDERZIJDS IS IN DE LITERATUUR BESCHREVEN DAT BEPAALDE MIRNA’S EN SIRNA’S KUNNEN WORDEN VERVOERD EN KUNNEN WORDEN GETRANSPORTEERD IN ANDERE ORGANISMEN DAN DIE WAARVAN ZIJ AFKOMSTIG ZIJN (TRANS-KINGDOM KRUISVERWIJZING). IN DIT PROJECT ZULLEN WE ANALYSEREN OF ER EEN VERORDENING IS GEMEDIEERD DOOR MIRNAS TUSSEN SOORTEN IN DE PROCESSEN VAN RESISTENTIE TEGEN ZIEKTEVERWEKKERS IN RIJST. DIT PROJECT OMVAT TECHNIEKEN VAN DIRECTE EN OMGEKEERDE GENETISCHE, MASSASEQUENCING EN BIO-INFORMATISCHE ANALYSE, CYTOLOGISCHE EN HISTOLOGISCHE ANALYSE, EN IDENTIFICATIE VAN MIRNA-AGO COMPLEXEN TIJDENS PLANT-PATHOGENE INTERACTIEPROCESSEN. DE BESCHIKBAARHEID VAN PROTOCOLLEN EN WERKINSTRUMENTEN, STELT ONS IN EEN GOED UITGANGSPUNT OM DEZE DOELEN TE BEREIKEN. ALS POSITIEVE RESULTATEN WORDEN VERKREGEN, ZOU WORDEN AANGETOOND DAT MIRNAS ACT ALS VERBINDENDE ELEMENTEN DIE GENIC EXPRESSIE REGELEN VOOR DE CONTROLE VAN IMMUUNRESPONSEN EN NUTRIËNTEN HOMEOSTASE TIJDENS ZIEKTEVERWEKKER INFECTIE. DE VERKREGEN RESULTATEN EN DE IN DIT PROJECT GEGENEREERDE KENNIS ZULLEN BIJDRAGEN TOT DE ONTWIKKELING VAN NIEUWE CONCEPTEN IN PLANT/PATHOGENE INTERACTIESTUDIES. DIT ZAL HELPEN BIJ HET DEFINIËREN VAN NIEUWE STRATEGIEËN OM DE WEERSTAND VAN PLANTEN TEGEN ZIEKTEVERWEKKERS TE VERBETEREN, WAT UITEINDELIJK TEN GOEDE ZAL KOMEN AAN VERBETERINGSPROGRAMMA’S IN SOORTEN VAN AGRONOMISCH BELANG. (Dutch)
    point in time
    17 December 2021
    0 references
    IN NATURA LE PIANTE SONO ESPOSTE A NUMEROSE CONDIZIONI AMBIENTALI AVVERSE, TRA CUI LO STRESS BIOTICO E ABIOTICO. PER ADATTARE E SUPERARE TALI CONDIZIONI, LE PIANTE SVILUPPANO MECCANISMI DI DIFESA CHE CONSENTONO LORO DI RISPONDERE NEL MODO PIÙ APPROPRIATO AD OGNI TIPO DI STRESS. CIÒ RICHIEDE SOFISTICATI MECCANISMI DI COMUNICAZIONE TRA PERCORSI DI SEGNALAMENTO AVVIATI DA FATTORI ESTERNI CHE CONSENTONO UNA RISPOSTA COORDINATA ALL'INTERNO DELL'IMPIANTO. I MICRORNA (MIRNA) SONO NOTI PER ESSERE REGOLATORI DELL'ESPRESSIONE GENETICA IN DIVERSI PROCESSI DI SVILUPPO, COSÌ COME NELLE RISPOSTE ADATTATIVE ALLO STRESS AMBIENTALE. I MIRNA CONSENTONO RISPOSTE RAPIDE E TALVOLTA MOLTO SPECIFICHE, QUINDI SONO ELEMENTI CHIAVE PER IL CORRETTO ADEGUAMENTO DELL'ESPRESSIONE GENETICA NEI PROCESSI DI RESISTENZA AGLI AGENTI PATOGENI, COSÌ COME NEI PROCESSI DI COMUNICAZIONE IN RISPOSTA A DIVERSI TIPI DI STRESS. QUESTO PROGETTO AFFRONTA QUESTO ARGOMENTO PER RISPONDERE A UNA NUOVA DOMANDA SULL'INTEGRAZIONE DEI PROCESSI DURANTE L'ADATTAMENTO A DIVERSI STRESS AMBIENTALI: IL RUOLO DELLA MIRNA NELLA RISPOSTA DELLA DIFESA E NELLA LORO INTERAZIONE CON LO STRESS NUTRIZIONALE NELLE PIANTE. QUESTI STUDI SARANNO CONDOTTI SU PIANTE DI RISO E ARABIDOPSIS, LE DUE PIANTE MODELLO PER GLI STUDI DI GENOMICA FUNZIONALE IN MONOCOTYLEDONES E DICOTYLEDONES, E RAPPRESENTANO LA CONTINUAZIONE DEL PROGETTO IN CORSO (BIO2012-32838). IN PARTICOLARE, SI PROPONE DI: I) CARATTERIZZANO LA RILEVANZA DI MIR399 E MIR827 NELL'INTERAZIONE TRA LE VIE DI SEGNALAZIONE FOSFATO (P) E LA RISPOSTA IMMUNITARIA (RISO, ARABIDOPSIS), E II) PER SCOPRIRE IL RUOLO DI MIR7695, UNA SPECIFICA MIRNA DI RISO IDENTIFICATA NEL NOSTRO GRUPPO, NEL CONTROLLO DELL'OMEOSTASI DEL FERRO (FE) E/O DEL MANGANESE (MN) DURANTE LA RISPOSTA DI DIFESA (RISO). INOLTRE, SARÀ STUDIATA L'INTERAZIONE TRA LE VIE DI SEGNALAZIONE DI P E FEDE/MN COINVOLTE NEL FENOTIPO DI RESISTENZA/SENSIBILITÀ DELLE PIANTE IN RISPOSTA ALL'INFEZIONE. NEL NOSTRO GRUPPO VENGONO STUDIATI I PATHOSYSTEM APPROPRIATI PER QUESTI STUDI: RISO/MAGNAPORTHE ORYZAE E ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. D'ALTRA PARTE, IN LETTERATURA È STATO DESCRITTO CHE ALCUNI MIRNA E SIRNA SONO IN GRADO DI ESSERE TRASPORTATI E AGIRE IN ORGANISMI DIVERSI DA QUELLO DA CUI PROVENGONO (TRANS-KINGDOM CROSS-TALK). IN QUESTO PROGETTO ANALIZZEREMO SE ESISTE UN REGOLAMENTO MEDIATO DAI MIRNA TRA LE SPECIE NEI PROCESSI DI RESISTENZA AGLI AGENTI PATOGENI NEL RISO. QUESTO PROGETTO RIGUARDA LE TECNICHE DI GENETICA DIRETTA E INVERSA, IL SEQUENZIAMENTO DI MASSA E L'ANALISI BIOINFORMATICA, L'ANALISI CITOLOGICA E ISTOLOGICA E L'IDENTIFICAZIONE DEI COMPLESSI MIRNA-AGO DURANTE I PROCESSI DI INTERAZIONE TRA PIANTE E AGENTI PATOGENI. LA DISPONIBILITÀ DI PROTOCOLLI E STRUMENTI DI LAVORO CI METTE IN UN BUON PUNTO DI PARTENZA PER RAGGIUNGERE QUESTI OBIETTIVI. SE SI OTTENGONO RISULTATI POSITIVI, SAREBBE DIMOSTRATO CHE I MIRNAS AGISCONO COME ELEMENTI DI COLLEGAMENTO CHE REGOLANO L'ESPRESSIONE GENETICA PER IL CONTROLLO DELLE RISPOSTE IMMUNITARIE E DELL'OMEOSTASI DEI NUTRIENTI DURANTE L'INFEZIONE PATOGENA. I RISULTATI OTTENUTI E LE CONOSCENZE GENERATE IN QUESTO PROGETTO CONTRIBUIRANNO ALLA CREAZIONE DI NUOVI CONCETTI NEGLI STUDI DI INTERAZIONE TRA PIANTE E AGENTI PATOGENI. CIÒ CONTRIBUIRÀ A DEFINIRE NUOVE STRATEGIE PER MIGLIORARE LA RESISTENZA DELLE PIANTE ALL'INFEZIONE PATOGENA, CHE ANDRÀ A BENEFICIO DEI PROGRAMMI DI MIGLIORAMENTO NELLE SPECIE DI INTERESSE AGRONOMICO. (Italian)
    point in time
    16 January 2022
    0 references
    ΣΤΗ ΦΎΣΗ ΤΑ ΦΥΤΆ ΕΚΤΊΘΕΝΤΑΙ ΣΕ ΠΟΛΥΆΡΙΘΜΕΣ ΔΥΣΜΕΝΕΊΣ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ, ΣΥΜΠΕΡΙΛΑΜΒΑΝΟΜΈΝΟΥ ΤΟΥ ΒΙΟΤΙΚΟΎ ΚΑΙ ΑΒΙΟΤΙΚΟΎ ΣΤΡΕΣ. ΓΙΑ ΝΑ ΠΡΟΣΑΡΜΟΣΤΟΎΝ ΚΑΙ ΝΑ ΞΕΠΕΡΑΣΤΟΎΝ ΤΈΤΟΙΕΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ, ΤΑ ΦΥΤΆ ΑΝΑΠΤΎΣΣΟΥΝ ΑΜΥΝΤΙΚΟΎΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΎΣ ΠΟΥ ΤΟΥΣ ΕΠΙΤΡΈΠΟΥΝ ΝΑ ΑΝΤΑΠΟΚΡΊΝΟΝΤΑΙ ΜΕ ΤΟΝ ΠΙΟ ΚΑΤΆΛΛΗΛΟ ΤΡΌΠΟ ΣΕ ΚΆΘΕ ΤΎΠΟ ΣΤΡΕΣ. ΑΥΤΌ ΑΠΑΙΤΕΊ ΕΞΕΛΙΓΜΈΝΟΥΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΎΣ ΕΠΙΚΟΙΝΩΝΊΑΣ ΜΕΤΑΞΎ ΔΙΑΔΡΟΜΏΝ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΠΟΥ ΚΙΝΟΎΝΤΑΙ ΑΠΌ ΕΞΩΤΕΡΙΚΟΎΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ ΠΟΥ ΕΠΙΤΡΈΠΟΥΝ ΣΥΝΤΟΝΙΣΜΈΝΗ ΑΝΤΊΔΡΑΣΗ ΣΤΗ ΜΟΝΆΔΑ. ΟΙ MICRORNAS (MIRNA) ΕΊΝΑΙ ΓΝΩΣΤΟΊ ΩΣ ΡΥΘΜΙΣΤΈΣ ΤΗΣ ΓΟΝΙΚΉΣ ΈΚΦΡΑΣΗΣ ΣΕ ΔΙΆΦΟΡΕΣ ΑΝΑΠΤΥΞΙΑΚΈΣ ΔΙΕΡΓΑΣΊΕΣ, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΣΕ ΠΡΟΣΑΡΜΟΣΤΙΚΈΣ ΑΝΤΙΔΡΆΣΕΙΣ ΣΤΟ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΌ ΣΤΡΕΣ. ΤΑ MIRNA ΕΠΙΤΡΈΠΟΥΝ ΓΡΉΓΟΡΕΣ ΚΑΙ ΜΕΡΙΚΈΣ ΦΟΡΈΣ ΠΟΛΎ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΕΣ ΑΝΤΙΔΡΆΣΕΙΣ, ΟΠΌΤΕ ΑΠΟΤΕΛΟΎΝ ΒΑΣΙΚΆ ΣΤΟΙΧΕΊΑ ΓΙΑ ΤΗ ΣΩΣΤΉ ΡΎΘΜΙΣΗ ΤΗΣ ΓΟΝΙΚΉΣ ΈΚΦΡΑΣΗΣ ΣΕ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΕΣ ΑΝΤΟΧΉΣ ΣΕ ΠΑΘΟΓΌΝΟΥΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΣΕ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΕΣ ΕΠΙΚΟΙΝΩΝΊΑΣ ΣΤΗΝ ΑΠΌΚΡΙΣΗ ΣΕ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΟΎΣ ΤΎΠΟΥΣ ΣΤΡΕΣ. ΤΟ ΠΑΡΌΝ ΣΧΈΔΙΟ ΕΞΕΤΆΖΕΙ ΤΟ ΘΈΜΑ ΑΥΤΌ ΓΙΑ ΝΑ ΑΠΑΝΤΉΣΕΙ ΣΕ ΜΙΑ ΝΈΑ ΕΡΏΤΗΣΗ ΣΧΕΤΙΚΆ ΜΕ ΤΗΝ ΕΝΣΩΜΆΤΩΣΗ ΤΩΝ ΔΙΑΔΙΚΑΣΙΏΝ ΚΑΤΆ ΤΗΝ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉ ΣΕ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΈΣ ΠΙΈΣΕΙΣ: Ο ΡΌΛΟΣ ΤΟΥ MIRNA ΣΤΗΝ ΑΜΥΝΤΙΚΉ ΑΝΤΊΔΡΑΣΗ ΚΑΙ ΣΤΗΝ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΉ ΤΟΥΣ ΜΕ ΤΟ ΘΡΕΠΤΙΚΌ ΣΤΡΕΣ ΣΤΑ ΦΥΤΆ. ΟΙ ΜΕΛΈΤΕΣ ΑΥΤΈΣ ΘΑ ΔΙΕΞΑΧΘΟΎΝ ΣΕ ΦΥΤΆ ΡΥΖΙΟΎ ΚΑΙ ΣΤΗΝ ARABIDOPSIS, ΤΑ ΔΎΟ ΠΡΌΤΥΠΑ ΦΥΤΆ ΓΙΑ ΜΕΛΈΤΕΣ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΏΝ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΏΝ ΣΕ ΜΟΝΟΚΟΤΥΛΗΔΌΝΕΣ ΚΑΙ ΔΙΚΟΤΥΛΗΔΌΝΕΣ, ΚΑΙ ΑΝΤΙΠΡΟΣΩΠΕΎΟΥΝ ΤΗ ΣΥΝΈΧΙΣΗ ΤΟΥ ΤΡΈΧΟΝΤΟΣ ΈΡΓΟΥ (BIO2012-32838). ΕΙΔΙΚΌΤΕΡΑ, ΠΡΟΤΕΊΝΕΤΑΙ ΤΑ ΕΞΉΣ: I) ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΖΟΥΝ ΤΗ ΣΗΜΑΣΊΑ ΤΩΝ MIR399 ΚΑΙ MIR827 ΣΤΗΝ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ ΜΕΤΑΞΎ ΤΩΝ ΟΔΏΝ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΤΩΝ ΦΩΣΦΟΡΙΚΏΝ ΑΛΆΤΩΝ (P) ΚΑΙ ΤΗΣ ΑΝΟΣΟΛΟΓΙΚΉΣ ΑΠΌΚΡΙΣΗΣ (ΡΎΖΙ, ARABIDOPSIS) ΚΑΙ II) ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΑΚΆΛΥΨΗ ΤΟΥ ΡΌΛΟΥ ΤΟΥ MIR7695, ΕΝΌΣ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΟΥ ΜΊΡΝΑ ΡΥΖΙΟΎ ΠΟΥ ΑΝΑΓΝΩΡΊΖΕΤΑΙ ΣΤΗΝ ΟΜΆΔΑ ΜΑΣ, ΣΤΟΝ ΈΛΕΓΧΟ ΤΗΣ ΟΜΟΙΌΣΤΑΣΗΣ ΤΟΥ ΣΙΔΉΡΟΥ (FE) ΚΑΙ/Ή ΤΟΥ ΜΑΓΓΑΝΊΟΥ (MN) ΚΑΤΆ ΤΗ ΔΙΆΡΚΕΙΑ ΤΗΣ ΑΜΥΝΤΙΚΉΣ ΑΠΌΚΡΙΣΗΣ (ΡΎΖΙ). ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΘΑ ΜΕΛΕΤΗΘΕΊ Η ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ ΜΕΤΑΞΎ ΤΩΝ ΟΔΏΝ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΤΟΥ P ΚΑΙ ΤΗΣ ΠΊΣΤΗΣ/MN ΠΟΥ ΕΜΠΛΈΚΟΝΤΑΙ ΣΤΟΝ ΦΑΙΝΌΤΥΠΟ ΑΝΤΟΧΉΣ/ΕΥΑΊΣΘΗΤΗΣ ΕΥΑΙΣΘΗΣΊΑΣ ΤΩΝ ΦΥΤΏΝ ΩΣ ΑΠΆΝΤΗΣΗ ΣΤΗ ΛΟΊΜΩΞΗ. ΣΤΗΝ ΟΜΆΔΑ ΜΑΣ ΜΕΛΕΤΏΝΤΑΙ ΤΑ ΚΑΤΆΛΛΗΛΑ ΠΑΘΟΣΥΣΤΉΜΑΤΑ ΓΙΑ ΤΙΣ ΜΕΛΈΤΕΣ ΑΥΤΈΣ: ΡΎΖΙ/MAGNAPORTHE ORYZAE ΚΑΙ ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. ΑΠΌ ΤΗΝ ΆΛΛΗ ΠΛΕΥΡΆ, ΣΤΗ ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΊΑ ΈΧΕΙ ΠΕΡΙΓΡΑΦΕΊ ΌΤΙ ΟΡΙΣΜΈΝΕΣ MIRNA ΚΑΙ SIRNA ΜΠΟΡΟΎΝ ΝΑ ΜΕΤΑΦΕΡΘΟΎΝ ΚΑΙ ΝΑ ΔΡΆΣΟΥΝ ΣΕ ΟΡΓΑΝΙΣΜΟΎΣ ΆΛΛΟΥΣ ΑΠΌ ΑΥΤΌΝ ΑΠΌ ΤΟΝ ΟΠΟΊΟ ΠΡΟΈΡΧΟΝΤΑΙ (ΔΙΑΣΤΑΥΡΟΎΜΕΝΗ ΣΥΖΉΤΗΣΗ ΜΕΤΑΞΎ ΤΟΥ ΒΑΣΙΛΕΊΟΥ). ΣΕ ΑΥΤΌ ΤΟ ΈΡΓΟ ΘΑ ΑΝΑΛΎΣΟΥΜΕ ΚΑΤΆ ΠΌΣΟΝ ΥΠΆΡΧΕΙ ΚΑΝΟΝΙΣΜΌΣ ΜΕ ΤΗ ΔΙΑΜΕΣΟΛΆΒΗΣΗ ΤΩΝ MIRNA ΜΕΤΑΞΎ ΤΩΝ ΕΙΔΏΝ ΣΤΙΣ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΕΣ ΑΝΤΟΧΉΣ ΣΕ ΠΑΘΟΓΌΝΟΥΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ ΣΤΟ ΡΎΖΙ. ΤΟ ΈΡΓΟ ΑΥΤΌ ΚΑΛΎΠΤΕΙ ΤΕΧΝΙΚΈΣ ΆΜΕΣΗΣ ΚΑΙ ΑΝΤΊΣΤΡΟΦΗΣ ΓΕΝΕΤΙΚΉΣ, ΜΑΖΙΚΉΣ ΑΛΛΗΛΟΥΧΊΑΣ ΚΑΙ ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΉΣ ΑΝΆΛΥΣΗΣ, ΚΥΤΤΑΡΟΛΟΓΙΚΉΣ ΚΑΙ ΙΣΤΟΛΟΓΙΚΉΣ ΑΝΆΛΥΣΗΣ, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΤΑΥΤΟΠΟΊΗΣΗΣ ΤΩΝ ΣΥΜΠΛΟΚΏΝ MIRNA-AGO ΚΑΤΆ ΤΗ ΔΙΆΡΚΕΙΑ ΤΩΝ ΔΙΑΔΙΚΑΣΙΏΝ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗΣ ΦΥΤΟΠΑΘΟΓΌΝΩΝ. Η ΔΙΑΘΕΣΙΜΌΤΗΤΑ ΠΡΩΤΟΚΌΛΛΩΝ ΚΑΙ ΕΡΓΑΛΕΊΩΝ ΕΡΓΑΣΊΑΣ ΜΑΣ ΘΈΤΕΙ ΣΕ ΚΑΛΉ ΑΦΕΤΗΡΊΑ ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΠΊΤΕΥΞΗ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΣΤΌΧΩΝ. ΕΆΝ ΛΗΦΘΟΎΝ ΘΕΤΙΚΆ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ, ΘΑ ΚΑΤΑΔΕΙΚΝΎΕΤΑΙ ΌΤΙ ΤΑ MIRNAS ΔΡΟΥΝ ΩΣ ΣΥΝΔΕΤΙΚΆ ΣΤΟΙΧΕΊΑ ΠΟΥ ΡΥΘΜΊΖΟΥΝ ΤΗ ΓΟΝΙΚΉ ΈΚΦΡΑΣΗ ΓΙΑ ΤΟΝ ΈΛΕΓΧΟ ΤΩΝ ΑΝΟΣΟΛΟΓΙΚΏΝ ΑΠΟΚΡΊΣΕΩΝ ΚΑΙ ΤΗΣ ΟΜΟΙΟΣΤΆΣΗΣ ΘΡΕΠΤΙΚΏΝ ΣΥΣΤΑΤΙΚΏΝ ΚΑΤΆ ΤΗ ΔΙΆΡΚΕΙΑ ΤΗΣ ΛΟΊΜΩΞΗΣ ΑΠΌ ΠΑΘΟΓΌΝΟΥΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ. ΤΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΠΟΥ ΘΑ ΠΡΟΚΎΨΟΥΝ ΚΑΙ ΟΙ ΓΝΏΣΕΙΣ ΠΟΥ ΘΑ ΠΡΟΚΎΨΟΥΝ ΣΤΟ ΠΛΑΊΣΙΟ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ ΈΡΓΟΥ ΘΑ ΣΥΜΒΆΛΟΥΝ ΣΤΗ ΔΗΜΙΟΥΡΓΊΑ ΝΈΩΝ ΕΝΝΟΙΏΝ ΣΤΙΣ ΜΕΛΈΤΕΣ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗΣ ΦΥΤΏΝ/ΠΑΘΟΓΌΝΩΝ. ΑΥΤΌ ΘΑ ΒΟΗΘΉΣΕΙ ΣΤΟΝ ΚΑΘΟΡΙΣΜΌ ΝΈΩΝ ΣΤΡΑΤΗΓΙΚΏΝ ΓΙΑ ΤΗ ΒΕΛΤΊΩΣΗ ΤΗΣ ΑΝΘΕΚΤΙΚΌΤΗΤΑΣ ΤΩΝ ΦΥΤΏΝ ΣΤΗ ΜΌΛΥΝΣΗ ΑΠΌ ΠΑΘΟΓΌΝΑ, Η ΟΠΟΊΑ ΤΕΛΙΚΆ ΘΑ ΩΦΕΛΉΣΕΙ ΤΑ ΠΡΟΓΡΆΜΜΑΤΑ ΒΕΛΤΊΩΣΗΣ ΣΕ ΕΊΔΗ ΑΓΡΟΝΟΜΙΚΟΎ ΕΝΔΙΑΦΈΡΟΝΤΟΣ. (Greek)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    I NATUREN ER PLANTER UDSAT FOR MANGE UGUNSTIGE MILJØFORHOLD, HERUNDER BIOTISK OG ABIOTISK STRESS. FOR AT TILPASSE OG OVERVINDE SÅDANNE FORHOLD UDVIKLER PLANTER FORSVARSMEKANISMER, DER GIVER DEM MULIGHED FOR AT REAGERE PÅ DEN MEST HENSIGTSMÆSSIGE MÅDE PÅ HVER TYPE STRESS. DETTE KRÆVER SOFISTIKEREDE KOMMUNIKATIONSMEKANISMER MELLEM SIGNALVEJE, DER IVÆRKSÆTTES AF EKSTERNE FAKTORER, DER MULIGGØR EN KOORDINERET REAKTION PÅ ANLÆGGET. MIKRORNA'ER (MIRNA) ER KENDT FOR AT VÆRE REGULATORER FOR GENISK UDTRYK I FORSKELLIGE UDVIKLINGSPROCESSER SAMT I ADAPTIVE REAKTIONER PÅ MILJØMÆSSIG STRESS. MIRNA'ER GIVER MULIGHED FOR HURTIGE OG UNDERTIDEN MEGET SPECIFIKKE REAKTIONER, SÅ DE ER NØGLEELEMENTER FOR KORREKT JUSTERING AF DET GENISKE UDTRYK I PROCESSER MED RESISTENS OVER FOR PATOGENER SAMT I KOMMUNIKATIONSPROCESSER I REAKTIONEN PÅ FORSKELLIGE TYPER AF STRESS. DETTE PROJEKT BEHANDLER DETTE EMNE FOR AT BESVARE ET NYT SPØRGSMÅL OM INTEGRATION AF PROCESSER UNDER TILPASNINGEN TIL FORSKELLIGE MILJØMÆSSIGE STRESS: MIRNAS ROLLE I FORSVARET OG I DERES INTERAKTION MED ERNÆRINGSMÆSSIG STRESS I PLANTER. DISSE UNDERSØGELSER VIL BLIVE UDFØRT PÅ RISPLANTER OG ARABIDOPSIS, DE TO MODELPLANTER TIL UNDERSØGELSER AF FUNKTIONEL GENOMFORSKNING I MONOCOTYLEDONES OG DICOTYLEDONES, OG ER EN FORTSÆTTELSE AF DET NUVÆRENDE PROJEKT (BIO2012-32838). DET FORESLÅS NAVNLIG, AT: I) KARAKTERISERE RELEVANSEN AF MIR399 OG MIR827 I INTERAKTIONEN MELLEM FOSFAT SIGNALGIVNING RUTER (P) OG IMMUNRESPONS (RIS, ARABIDOPSIS), OG II) AT FINDE UD AF ROLLEN AF MIR7695, EN SPECIFIK MIRNA RIS IDENTIFICERET I VORES GRUPPE, I KONTROLLEN AF HOMEOSTASE AF JERN (FE) OG/ELLER MANGAN (MN) UNDER FORSVARET RESPONS (RIS). DESUDEN VIL SAMSPILLET MELLEM SIGNALVEJE FOR P OG TRO/MN, DER ER INVOLVERET I FÆNOTYPEN AF RESISTENS/MODTAGELSE HOS PLANTER SOM REAKTION PÅ INFEKTION, BLIVE UNDERSØGT. I VORES GRUPPE UNDERSØGES DE RELEVANTE PATOSYSTEMER TIL DISSE UNDERSØGELSER: RIS/MAGNAPORTHE ORYZAE OG ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. PÅ DEN ANDEN SIDE ER DET I LITTERATUREN BLEVET BESKREVET, AT VISSE MIRNA'ER OG SIRNA'ER KAN TRANSPORTERES OG VIRKE I ANDRE ORGANISMER END DEM, DE KOMMER FRA (TRANS-KINGDOM CROSS-TALK). I DETTE PROJEKT VIL VI ANALYSERE, OM DER ER EN FORORDNING MEDIERET AF MIRNA'ER MELLEM ARTER I PROCESSERNE FOR RESISTENS OVER FOR PATOGENER I RIS. DETTE PROJEKT OMFATTER TEKNIKKER TIL DIREKTE OG OMVENDT GENETISK, MASSESEKVENTERING OG BIOINFORMATISK ANALYSE, CYTOLOGISK OG HISTOLOGISK ANALYSE OG IDENTIFIKATION AF MIRNA-AGO-KOMPLEKSER UNDER PLANTEPATOGENE INTERAKTIONSPROCESSER. TILGÆNGELIGHEDEN AF PROTOKOLLER OG ARBEJDSREDSKABER SÆTTER OS I ET GODT UDGANGSPUNKT FOR AT NÅ DISSE MÅL. HVIS DER OPNÅS POSITIVE RESULTATER, VIL DET BLIVE PÅVIST, AT MIRNAS ACT FUNGERER SOM FORBINDELSESELEMENTER, DER REGULERER GENISK EKSPRESSION TIL KONTROL AF IMMUNRESPONS OG NÆRINGSSTOFHOMØOSTASE UNDER PATOGENINFEKTION. DE OPNÅEDE RESULTATER OG DEN VIDEN, DER GENERERES I DETTE PROJEKT, VIL BIDRAGE TIL ETABLERINGEN AF NYE KONCEPTER I UNDERSØGELSER AF PLANTE/PATOGEN INTERAKTION. DETTE VIL BIDRAGE TIL AT DEFINERE NYE STRATEGIER TIL FORBEDRING AF PLANTERS MODSTANDSDYGTIGHED OVER FOR PATOGENINFEKTION, HVILKET I SIDSTE ENDE VIL GAVNE FORBEDRINGSPROGRAMMER I ARTER AF AGRONOMISK INTERESSE. (Danish)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    LUONNOSSA KASVIT ALTISTUVAT LUKUISILLE HAITALLISILLE YMPÄRISTÖOLOSUHTEILLE, KUTEN BIOOTTISELLE JA ABIOOTTISELLE STRESSILLE. TÄLLAISTEN OLOSUHTEIDEN MUKAUTTAMISEKSI JA VOITTAMISEKSI KASVIT KEHITTÄVÄT PUOLUSTUSMEKANISMEJA, JOIDEN AVULLA NE VOIVAT VASTATA SOPIVIMMALLA TAVALLA KUHUNKIN STRESSITYYPPIIN. TÄMÄ EDELLYTTÄÄ KEHITTYNEITÄ VIESTINTÄMEKANISMEJA SELLAISTEN ULKOISTEN TEKIJÖIDEN KÄYNNISTÄMIEN MERKINANTOREITTIEN VÄLILLÄ, JOTKA MAHDOLLISTAVAT KOORDINOIDUN REAGOINNIN LAITOKSESSA. MIKRORNA:IDEN (MIRNA) TIEDETÄÄN OLEVAN GENEETTISEN ILMENTYMÄN SÄÄTELIJÖITÄ ERILAISISSA KEHITYSPROSESSEISSA SEKÄ MUKAUTUVISSA REAKTIOISSA YMPÄRISTÖSTRESSIIN. MIRNA:T MAHDOLLISTAVAT NOPEAN JA JOSKUS HYVIN SPESIFISEN REAKTION, JOTEN NE OVAT KESKEISIÄ TEKIJÖITÄ GEENISEN ILMENTYMÄN OIKEAKSI SÄÄTÄMISEKSI PATOGEENEILLE VASTUSTUSPROSESSEISSA SEKÄ VIESTINTÄPROSESSEISSA VASTATTAESSA ERILAISIIN STRESSITYYPPEIHIN. TÄSSÄ HANKKEESSA KÄSITELLÄÄN TÄTÄ AIHETTA JA VASTATAAN UUTEEN KYSYMYKSEEN PROSESSIEN INTEGROINNISTA ERI YMPÄRISTÖSTRESSIIN SOPEUTUMISEN AIKANA: MIRNAN ROOLI PUOLUSTUSVASTEESSA JA VUOROVAIKUTUKSESSA RAVITSEMUKSELLISEN STRESSIN KANSSA KASVEISSA. NÄMÄ TUTKIMUKSET TEHDÄÄN RIISIKASVEILLA JA ARABIDOPSIKSELLA, JOTKA OVAT MONOKOTYLEDONIEN JA DIKOTYLEDONIEN FUNKTIONAALISEN GENOMITUTKIMUKSEN MALLIKASVEJA, JA NE OVAT JATKOA NYKYISELLE HANKKEELLE (BIO2012–32838). ERITYISESTI EHDOTETAAN, ETTÄ I) LUONNEHDITAAN MIR399: N JA MIR827: N MERKITYSTÄ FOSFAATTIMERKINANTOREITTIEN (P) JA IMMUUNIVASTEEN (RIISI, ARABIDOPSIS) JA II: N VUOROVAIKUTUKSESSA, JOTTA VOIDAAN SELVITTÄÄ MIR7695: N, RYHMÄN YKSILÖIDYN RIISIN MIRNAN, ROOLI RAUDAN (FE) JA/TAI MANGAANIN (MN) HOMEOSTAASIN VALVONNASSA PUOLUSTUSVASTEEN (RIISI) AIKANA. LISÄKSI TUTKITAAN P:N MERKINANTOREITTIEN JA USKON/MN:N VÄLISTÄ VUOROVAIKUTUSTA, JOKA LIITTYY KASVIEN FENOTYYPPIIN INFEKTIOON REAGOINNISSA. RYHMÄSSÄMME TUTKITAAN SOPIVIA PATOJÄRJESTELMIÄ NÄIHIN TUTKIMUKSIIN: RIISI/MAGNAPORTHE ORYZAE JA ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA KURKKU. TOISAALTA KIRJALLISUUDESSA ON KUVATTU, ETTÄ TIETTYJÄ MIRNA- JA SIRNA-AINEITA VOIDAAN KULJETTAA JA VAIKUTTAA MUIHIN ORGANISMEIHIN KUIN NIIHIN, JOISTA NE OVAT PERÄISIN (TRANSKUNINGASKUNNAN RISTIKUULUSTELU). TÄSSÄ HANKKEESSA ANALYSOIDAAN, ONKO OLEMASSA ASETUS, JOKA VÄLITTYY LAJIEN VÄLILLÄ RESISTENSSIN TAUDINAIHEUTTAJIA RIISISSÄ. TÄMÄ HANKE KATTAA SUORAN JA KÄÄNTEISEN GENEETTISEN, MASSASEKVENSOINNIN JA BIOINFORMAATTISEN ANALYYSIN, SYTOLOGISEN JA HISTOLOGISEN ANALYYSIN SEKÄ MIRNA-AGO-KOMPLEKSIEN TUNNISTAMISEN KASVI-PATOGEENIEN VUOROVAIKUTUSPROSESSIEN AIKANA. PROTOKOLLIEN JA TYÖVÄLINEIDEN SAATAVUUS ANTAA MEILLE HYVÄN LÄHTÖKOHDAN NÄIDEN TAVOITTEIDEN SAAVUTTAMISELLE. JOS SAADAAN MYÖNTEISIÄ TULOKSIA, VOIDAAN OSOITTAA, ETTÄ MIRNAS TOIMII LIITOSELEMENTTEINÄ, JOTKA SÄÄTELEVÄT GENEETTISTÄ ILMENTYMISTÄ IMMUUNIVASTEIDEN JA RAVINTEIDEN HOMEOSTAASIN HALLINNASSA PATOGEENI-INFEKTION AIKANA. TÄSSÄ HANKKEESSA SAADUT TULOKSET JA SAADUT TIEDOT EDISTÄVÄT UUSIEN KÄSITTEIDEN LUOMISTA KASVIEN JA PATOGEENIEN YHTEISVAIKUTUSTUTKIMUKSISSA. TÄMÄ AUTTAA MÄÄRITTELEMÄÄN UUSIA STRATEGIOITA, JOILLA PARANNETAAN KASVIEN VASTUSTUSKYKYÄ PATOGEENITARTUNNALLE, MIKÄ VIIME KÄDESSÄ HYÖDYTTÄÄ AGRONOMISTEN LAJIEN PARANTAMISOHJELMIA. (Finnish)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    FIN-NATURA L-PJANTI HUMA ESPOSTI GĦAL BOSTA KUNDIZZJONIJIET AMBJENTALI NEGATTIVI INKLUŻ STRESS BIJOTIKU U ABIJOTIKU. BIEX JADATTAW U JEGĦLBU DAWN IL-KUNDIZZJONIJIET, PJANTI JIŻVILUPPAW MEKKANIŻMI TA ‘DIFIŻA LI JIPPERMETTULHOM LI JIRRISPONDU BL-AKTAR MOD XIERAQ GĦAL KULL TIP TA’ STRESS. DAN JEĦTIEĠ MEKKANIŻMI SOFISTIKATI TA’ KOMUNIKAZZJONI BEJN IR-ROTOT TA’ SINJALAZZJONI MIBDIJA MINN FATTURI ESTERNI LI JIPPERMETTU RISPONS KOORDINAT FL-IMPJANT. IL-MIKRORNAS (MIRNA) HUMA MAGĦRUFA LI HUMA REGOLATURI TAL-ESPRESSJONI ĠENIKA FI PROĊESSI TA’ ŻVILUPP DIFFERENTI, KIF UKOLL F’RISPONSI ADATTIVI GĦALL-ISTRESS AMBJENTALI. IL-MIRNAS JIPPERMETTU REAZZJONIJIET RAPIDI U XI KULTANT SPEĊIFIĊI ĦAFNA, U GĦALHEKK HUMA ELEMENTI EWLENIN GĦALL-AĠĠUSTAMENT KORRETT TAL-ESPRESSJONI ĠENIKA FIL-PROĊESSI TA’ REŻISTENZA GĦALL-PATOĠENI, KIF UKOLL FIL-PROĊESSI TA’ KOMUNIKAZZJONI FIR-RISPONS GĦAL TIPI DIFFERENTI TA’ STRESS. DAN IL-PROĠETT JINDIRIZZA DAN IS-SUĠĠETT BIEX IWIEĠEB MISTOQSIJA ĠDIDA DWAR L-INTEGRAZZJONI TAL-PROĊESSI MATUL L-ADATTAMENT GĦAL STRESS AMBJENTALI DIFFERENTI: IR-RWOL TAL-MIRNA FIR-RISPONS TAD-DIFIŻA U FL-INTERAZZJONI TAGĦHOM MAL-ISTRESS NUTRITTIV FIL-PJANTI. DAWN L-ISTUDJI SE JITWETTQU FIL-PJANTI TAR-ROSS U L-GĦARBI, IŻ-ŻEWĠ MUDELLI TA’ IMPJANTI GĦALL-ISTUDJI TAL-ĠENOMIKA FUNZJONALI FIL-MONOCOTYLEDONES U D-DICOTYLEDONES, U JIRRAPPREŻENTAW IL-KONTINWAZZJONI TAL-PROĠETT ATTWALI (BIO2012–32838). B’MOD PARTIKOLARI, QED JIĠI PROPOST LI: I) JIKKARATTERIZZAW IR-RILEVANZA TA ‘MIR399 U MIR827 FL-INTERAZZJONI BEJN IR-ROTOT TA’ SINJALAZZJONI TAL-FOSFAT (P) U R-RISPONS IMMUNITARJU (ROSS, GĦARBI), U II) BIEX ISSIR TAF IR-RWOL TA ‘MIR7695, MIRNA SPEĊIFIKA TA’ ROSS IDENTIFIKAT FIL-GRUPP TAGĦNA, FIL-KONTROLL TAL-OMEOSTASI TAL-ĦADID (FE) U/JEW MANGANIŻ (MN) MATUL IR-RISPONS TAD-DIFIŻA (ROSS). BARRA MINN HEKK, SER TIĠI STUDJATA L-INTERAZZJONI BEJN IR-ROTOT TA’ SINJALAZZJONI TA’ P U L-FIDI/MN INVOLUTI FIL-FENOTIP TA’ REŻISTENZA/SUXXETTIBILITÀ TAL-PJANTI B’RISPONS GĦALL-INFEZZJONI. FIL-GRUPP TAGĦNA L-PATOSISTEMI XIERQA GĦAL DAWN L-ISTUDJI HUMA STUDJATI: ROSS/MAGNAPORTHE ORYZAE U ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. MIN-NAĦA L-OĦRA, FIL-LETTERATURA ĠIE DESKRITT LI ĊERTI MIRNAS U SIRNAS JISTGĦU JIĠU TTRASPORTATI U JAĠIXXU F’ORGANIŻMI DIFFERENTI MINN DAK LI ĠEJJIN MINNU (TRANS-KINGDOM CROSS-TALK). F’DAN IL-PROĠETT SE NANALIZZAW JEKK HEMMX REGOLAMENT MEDJAT MILL-MIRNAS BEJN L-ISPEĊIJIET FIL-PROĊESSI TA’ REŻISTENZA GĦALL-PATOĠENI FIR-ROSS. DAN IL-PROĠETT IKOPRI TEKNIKI TA’ ANALIŻI ĠENETIKA DIRETTA U INVERSA, SEKWENZAR TAL-MASSA U ANALIŻI BIJOINFORMATIKA, ANALIŻI ĊITOLOĠIKA U ISTOLOĠIKA, U L-IDENTIFIKAZZJONI TA’ KUMPLESSI MIRNA-AGO MATUL IL-PROĊESSI TA’ INTERAZZJONI BEJN IL-PJANTI U L-PATOĠENI. ID-DISPONIBBILTÀ TAL-PROTOKOLLI U L-GĦODOD TAX-XOGĦOL, TPOĠĠINA FIL-PUNT TAT-TLUQ TAJJEB BIEX NILĦQU DAWN L-GĦANIJIET. JEKK JINKISBU RIŻULTATI POŻITTIVI, JINTWERA LI L-MIRNAS ACT BĦALA ELEMENTI TA’ KONNESSJONI LI JIRREGOLAW L-ESPRESSJONI ĠENIKA GĦALL-KONTROLL TAR-RISPONSI IMMUNI U L-OMEOSTAŻI TAN-NUTRIJENTI MATUL L-INFEZZJONI TAL-PATOĠENU. IR-RIŻULTATI MIKSUBA U L-GĦARFIEN IĠĠENERAT F’DAN IL-PROĠETT SE JIKKONTRIBWIXXU GĦALL-ISTABBILIMENT TA’ KUNĊETTI ĠODDA FI STUDJI TA’ INTERAZZJONI TA’ PJANTI/PATOĠENI. DAN SE JGĦIN BIEX JIĠU DEFINITI STRATEĠIJI ĠODDA BIEX TITJIEB IR-REŻISTENZA TAL-PJANTI GĦALL-INFEZZJONI PATOĠENI, LI FL-AĦĦAR MILL-AĦĦAR SE JIBBENEFIKAW PROGRAMMI TA’ TITJIB FL-ISPEĊIJIET TA’ INTERESS AGRONOMIKU. (Maltese)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    DABAS AUGI IR PAKĻAUTI DAUDZIEM NELABVĒLĪGIEM VIDES APSTĀKĻIEM, TOSTARP BIOTISKAM UN ABIOTISKAM STRESAM. LAI PIELĀGOTU UN PĀRVARĒTU ŠĀDUS APSTĀKĻUS, AUGI IZSTRĀDĀ AIZSARDZĪBAS MEHĀNISMUS, KAS ĻAUJ VIŅIEM REAĢĒT VISPIEMĒROTĀKAJĀ VEIDĀ UZ KATRU STRESA VEIDU. LAI TO PANĀKTU, IR VAJADZĪGI SAREŽĢĪTI SAZIŅAS MEHĀNISMI STARP SIGNALIZĀCIJAS MARŠRUTIEM, KO IEROSINA ĀRĒJI FAKTORI, KAS ĻAUJ KOORDINĒTI REAĢĒT RAŽOTNĒ. IR ZINĀMS, KA MIKRORNS (MIRNA) IR GENOGĒNAS EKSPRESIJAS REGULATORI DAŽĀDOS ATTĪSTĪBAS PROCESOS, KĀ ARĪ ADAPTĪVĀ REAĢĒŠANĀ UZ VIDES STRESU. MIRNS ĻAUJ ĀTRI UN DAŽREIZ ĻOTI SPECIFISKAS ATBILDES, TĀPĒC TIE IR GALVENIE ELEMENTI, LAI PAREIZI PIELĀGOTU GENOGĒNA IZTEIKSMES PROCESOS PRETESTĪBU PATOGĒNIEM, KĀ ARĪ KOMUNIKĀCIJAS PROCESOS, REAĢĒJOT UZ DAŽĀDA VEIDA STRESU. ŠIS PROJEKTS PIEVĒRŠAS ŠIM TEMATAM, LAI ATBILDĒTU UZ JAUNU JAUTĀJUMU PAR PROCESU INTEGRĀCIJU, PIELĀGOJOTIES DAŽĀDIEM VIDES APDRAUDĒJUMIEM: MIRNAS LOMA AIZSARDZĪBAS REAKCIJĀ UN TO MIJIEDARBĪBĀ AR AUGU UZTURA STRESU. ŠIE PĒTĪJUMI TIKS VEIKTI AR RĪSU AUGIEM UN ARABIDOPSIS, KAS IR DIVI PARAUGI FUNKCIONĀLĀ GENOMIKAS PĒTĪJUMIEM MONOKOTILEDONOS UN DIKOTILLEDONOS, UN TIE IR PAŠREIZĒJĀ PROJEKTA TURPINĀJUMS (BIO2012–32838). JO ĪPAŠI TIEK IEROSINĀTS: I) RAKSTUROT MIR399 UN MIR827 NOZĪMI MIJIEDARBĪBĀ STARP FOSFĀTU SIGNALIZĀCIJAS CEĻIEM (P) UN IMŪNREAKCIJU (RĪSI, ARABIDOPSIS) UN II), LAI NOSKAIDROTU MIR7695 — MŪSU GRUPĀ IDENTIFICĒTA SPECIFISKA RĪSU MIRNA — LOMU DZELZS (FE) UN/VAI MANGĀNA (MN) HOMEOSTĀZES KONTROLĒ AIZSARDZĪBAS REAKCIJAS LAIKĀ (RĪSI). TURKLĀT TIKS PĒTĪTA MIJIEDARBĪBA STARP P UN TICĪBAS/MN SIGNALIZĒŠANAS CEĻIEM, KAS IESAISTĪTI AUGU REZISTENCES/UZŅĒMĪBAS FENOTIPĀ, REAĢĒJOT UZ INFEKCIJU. MŪSU GRUPĀ TIEK PĒTĪTAS ATBILSTOŠAS PATOSISTĒMAS ŠIEM PĒTĪJUMIEM: RĪSI/MAGNAPORTHE ORYZAE UN ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. NO OTRAS PUSES, LITERATŪRĀ IR APRAKSTĪTS, KA NOTEIKTAS MIRNS UN SIRNS VAR PĀRVADĀT UN DARBOTIES CITOS ORGANISMOS, NEVIS TAJOS, NO KURIEM TĀS NĀK (TRANS-KINGDOM CROSS-TALK). ŠAJĀ PROJEKTĀ MĒS ANALIZĒSIM, VAI RĪSOS PRET PATOGĒNIEM ESOŠO PATOGĒNU REZISTENCES PROCESOS PASTĀV REGULA, KO VEIDO MIRNS STARP SUGĀM. ŠIS PROJEKTS APTVER TIEŠĀS UN REVERSĀS ĢENĒTISKĀS, MASVEIDA SEKVENCĒŠANAS UN BIOINFORMĀTISKĀS ANALĪZES, CITOLOĢISKĀS UN HISTOLOĢISKĀS ANALĪZES METODES UN MIRNA-AGO KOMPLEKSU IDENTIFICĒŠANU AUGU-PATOGĒNU MIJIEDARBĪBAS PROCESOS. PROTOKOLU UN DARBA RĪKU PIEEJAMĪBA IR LABS SĀKUMPUNKTS ŠO MĒRĶU SASNIEGŠANAI. JA TIKTU IEGŪTI POZITĪVI REZULTĀTI, TIKTU PIERĀDĪTS, KA MIRNS ACT IR SAVIENOJOŠIE ELEMENTI, KAS REGULĒ GENĒNO EKSPRESIJU IMŪNREAKCIJAS UN BARĪBAS VIELU HOMEOSTĀZES KONTROLEI PATOGĒNU INFEKCIJAS LAIKĀ. ŠAJĀ PROJEKTĀ IEGŪTIE REZULTĀTI UN IEGŪTĀS ZINĀŠANAS PALĪDZĒS IZSTRĀDĀT JAUNAS KONCEPCIJAS AUGU/PATOGĒNU MIJIEDARBĪBAS PĒTĪJUMOS. TAS PALĪDZĒS NOTEIKT JAUNAS STRATĒĢIJAS, LAI UZLABOTU AUGU IZTURĪBU PRET PATOGĒNU INFEKCIJU, KAS GALU GALĀ VEICINĀS AGRONOMISKO INTEREŠU SUGU UZLABOŠANAS PROGRAMMAS. (Latvian)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    V PRÍRODE SÚ RASTLINY VYSTAVENÉ MNOHÝM NEPRIAZNIVÝM ENVIRONMENTÁLNYM PODMIENKAM VRÁTANE BIOTICKÉHO A ABIOTICKÉHO STRESU. NA PRISPÔSOBENIE A PREKONANIE TAKÝCHTO PODMIENOK RASTLINY VYVÍJAJÚ OBRANNÉ MECHANIZMY, KTORÉ IM UMOŽŇUJÚ REAGOVAŤ NAJVHODNEJŠÍM SPÔSOBOM NA KAŽDÝ TYP STRESU. TO SI VYŽADUJE SOFISTIKOVANÉ KOMUNIKAČNÉ MECHANIZMY MEDZI SIGNALIZAČNÝMI TRASAMI INICIOVANÉ VONKAJŠÍMI FAKTORMI, KTORÉ UMOŽŇUJÚ KOORDINOVANÚ REAKCIU V ZARIADENÍ. MIKRORNA (MIRNA) SÚ ZNÁME AKO REGULÁTORY GÉNOVEJ EXPRESIE V RÔZNYCH VÝVOJOVÝCH PROCESOCH, AKO AJ V ADAPTÍVNYCH REAKCIÁCH NA ENVIRONMENTÁLNY STRES. MIRNA UMOŽŇUJÚ RÝCHLE A NIEKEDY VEĽMI ŠPECIFICKÉ REAKCIE, TAKŽE SÚ KĽÚČOVÝMI PRVKAMI PRE SPRÁVNU ÚPRAVU GÉNOVEJ EXPRESIE V PROCESOCH REZISTENCIE VOČI PATOGÉNOM, AKO AJ V KOMUNIKAČNÝCH PROCESOCH V REAKCII NA RÔZNE TYPY STRESU. TENTO PROJEKT SA ZAOBERÁ TOUTO TÉMOU, ABY ODPOVEDAL NA NOVÚ OTÁZKU O INTEGRÁCII PROCESOV POČAS PRISPÔSOBENIA SA RÔZNYM ENVIRONMENTÁLNYM STRESOM: ÚLOHA MIRNY V OBRANNEJ REAKCII A V ICH INTERAKCII S NUTRIČNÝM STRESOM V RASTLINÁCH. TIETO ŠTÚDIE SA VYKONAJÚ V RYŽOVÝCH RASTLINÁCH A ARABIDOPSIS, DVOCH MODELOVÝCH RASTLINÁCH NA ŠTÚDIE FUNKČNEJ GENÓMOVEJ LÁTKY V MONOCOTYLEDÓNOCH A DIKOTYLÓNOCH A PREDSTAVUJÚ POKRAČOVANIE SÚČASNÉHO PROJEKTU (BIO2012 – 32838). NAVRHUJE SA NAJMÄ, ABY: I) CHARAKTERIZOVAŤ VÝZNAM MIR399 A MIR827 V INTERAKCII MEDZI FOSFÁTOVÝMI SIGNALIZAČNÝMI CESTAMI (P) A IMUNITNOU ODPOVEĎOU (RYŽA, ARABIDOPSIS) A II) ZISTIŤ ÚLOHU MIR7695, ŠPECIFICKEJ MIRNY RYŽE IDENTIFIKOVANEJ V NAŠEJ SKUPINE, PRI KONTROLE HOMEOSTÁZY ŽELEZA (FE) A/ALEBO MANGÁNU (MN) POČAS OBRANNEJ REAKCIE (RYŽA). OKREM TOHO SA BUDE SKÚMAŤ INTERAKCIA MEDZI SIGNALIZAČNÝMI CESTAMI P A VIEROU/MN, KTORÁ SA PODIEĽA NA FENOTYPE REZISTENCIE/CITLIVOSTI RASTLÍN V REAKCII NA INFEKCIU. V NAŠEJ SKUPINE SA SKÚMAJÚ VHODNÉ PATOSYSTÉMY PRE TIETO ŠTÚDIE: RYŽA/MAGNAPORTHE ORYZAE A ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. NA DRUHEJ STRANE SA V LITERATÚRE UVÁDZA, ŽE NIEKTORÉ MIRNA A SIRNA SA MÔŽU PREPRAVOVAŤ A PÔSOBIŤ V ORGANIZMOCH INÝCH AKO TIE, Z KTORÝCH POCHÁDZAJÚ (TRANS-KINGDOM CROSS-TALK). V TOMTO PROJEKTE BUDEME ANALYZOVAŤ, ČI EXISTUJE NARIADENIE SPROSTREDKOVANÉ MIRNA MEDZI DRUHMI V PROCESOCH REZISTENCIE NA PATOGÉNY V RYŽI. TENTO PROJEKT ZAHŔŇA TECHNIKY PRIAMEJ A REVERZNEJ GENETICKEJ, HROMADNEJ SEKVENOVANIA A BIOINFORMATICKEJ ANALÝZY, CYTOLOGICKEJ A HISTOLOGICKEJ ANALÝZY A IDENTIFIKÁCIE KOMPLEXOV MIRNA-AGO POČAS PROCESOV INTERAKCIE MEDZI RASTLINAMI A PATOGÉNMI. DOSTUPNOSŤ PROTOKOLOV A PRACOVNÝCH NÁSTROJOV NÁS STAVIA DO DOBRÉHO VÝCHODISKOVÉHO BODU NA DOSIAHNUTIE TÝCHTO CIEĽOV. AK SA DOSIAHNU POZITÍVNE VÝSLEDKY, PREUKÁZALO BY SA, ŽE MIRNAS PÔSOBÍ AKO SPOJOVACIE PRVKY REGULUJÚCE GÉNOVÚ EXPRESIU NA KONTROLU IMUNITNEJ ODPOVEDE A ŽIVNEJ HOMEOSTÁZY POČAS PATOGÉNNEJ INFEKCIE. ZÍSKANÉ VÝSLEDKY A POZNATKY ZÍSKANÉ V RÁMCI TOHTO PROJEKTU PRISPEJÚ K VYTVORENIU NOVÝCH KONCEPCIÍ V ŠTÚDIÁCH INTERAKCIÍ MEDZI RASTLINAMI A PATOGÉNMI. TO POMÔŽE DEFINOVAŤ NOVÉ STRATÉGIE NA ZLEPŠENIE ODOLNOSTI RASTLÍN VOČI PATOGÉNNYM INFEKCIÁM, ČO V KONEČNOM DÔSLEDKU PROSPEJE PROGRAMOM ZLEPŠENIA DRUHOV AGRONOMICKÉHO VÝZNAMU. (Slovak)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    I NÁDÚR PLANDAÍ ATÁ FAOI LÉ COINNÍOLLACHA DÍOBHÁLACHA COMHSHAOIL GO LEOR LENA N-ÁIRÍTEAR STRUS BITHEACH AGUS AIBITHEACH. CHUN COINNÍOLLACHA DEN SÓRT SIN A OIRIÚNÚ AGUS A SHÁRÚ, FORBRAÍONN PLANDAÍ MEICNÍOCHTAÍ COSANTA A LIGEANN DÓIBH FREAGAIRT AR AN MBEALACH IS OIRIÚNAÍ DO GACH CINEÁL STRUS. CHUIGE SIN, TEASTAÍONN MEICNÍOCHTAÍ CUMARSÁIDE SOFAISTICIÚLA IDIR BEALAÍ COMHARTHAÍOCHTA ARNA DTIONSCNAMH AG FACHTÓIRÍ SEACHTRACHA A CHEADAÍONN FREAGAIRT CHOMHORDAITHE SA GHLÉASRA. IS EOL GUR RIALTÓIRÍ LÉIRITHE GÉINE I BPRÓISIS FORBARTHA ÉAGSÚLA IAD MICRORNAS (MIRNA), CHOMH MAITH LE FREAGAIRTÍ OIRIÚNAITHEACHA AR STRUS COMHSHAOIL. CEADAÍONN MIRNANNA FREAGAIRTÍ TAPA AGUS AN-SONRACH UAIREANTA, MAR SIN IS PRÍOMHGHNÉITHE IAD CHUN AN SLONN GÉICE A CHOIGEARTÚ I GCEART I BPRÓISIS FHRITHSHEASMHACHTA I GCOINNE PATAIGINÍ, AGUS I BPRÓISIS CHUMARSÁIDE MAR FHREAGAIRT AR CHINEÁLACHA ÉAGSÚLA STRUIS. TUGANN AN TIONSCADAL SEO AGHAIDH AR AN ÁBHAR SEO CHUN CEIST NUA A FHREAGAIRT MAIDIR LE PRÓISIS A CHOMHTHÁTHÚ LE LINN AN OIRIÚNAITHE DO STRUS COMHSHAOIL ÉAGSÚIL: RÓL AN MIRNA SA FHREAGRA COSANTA AGUS INA N-IDIRGHNÍOMHÚ LE STRUS COTHAITHEACH I BPLANDAÍ. DÉANFAR NA STAIDÉIR SEO I BPLANDAÍ RÍSE AGUS ARABIDOPSIS, AN DÁ PHLANDAÍ SAMHAIL LE HAGHAIDH STAIDÉAR AR GHÉANÓMAÍOCHT FEIDHMIÚIL I MONOCOTYLEDONES AGUS DICOTYLEDONES, AGUS IS IONANN IAD AGUS LEANÚINT LEIS AN TIONSCADAL REATHA (BIO2012-32838). TÁ SÉ BEARTAITHE, GO HÁIRITHE, AN MÉID SEO A LEANAS A DHÉANAMH: I) TRÉITHRIÚ A DHÉANAMH AR ÁBHARTHACHT MIR399 AGUS MIR827 SAN IDIRGHNÍOMHAÍOCHT IDIR NA BEALAÍ COMHARTHAÍOCHTA FOSFÁITE (P) AGUS AN FREAGRA IMDHÍONACHTA (RÍS, ARABIDOPSIS), AGUS II) CHUN RÓL MIR7695 A FHÁIL AMACH, MIRNA AR LEITH RÍSE A AITHNÍODH INÁR NGRÚPA, I RIALÚ HOMEOSTASIS IARAINN (FE) AGUS/NÓ MANGAINÉISE (MN) LE LINN NA FREAGARTHA COSANTA (RÍS). INA THEANNTA SIN, DÉANFAR STAIDÉAR AR AN IDIRGHNÍOMHAÍOCHT IDIR BEALAÍ COMHARTHAÍOCHTA P AGUS CREIDEAMH/MN A BHFUIL BAINT ACU LE FEINITÍOPA FRIOTAÍOCHTA/FEINCHEAPACHTA PLANDAÍ MAR FHREAGAIRT AR IONFHABHTÚ. INÁR NGRÚPA DÉANTAR STAIDÉAR AR NA COSÁIN CHUÍ DO NA STAIDÉIR SEO: RÍS/MAGNAPORTHE ORYZAE AGUS ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. AR AN TAOBH EILE, TÁ CUR SÍOS DÉANTA SA LITRÍOCHT GUR FÉIDIR MIRNAS AGUS SIRNAS ÁIRITHE A IOMPAR AGUS GNÍOMHÚ IN ORGÁNAIGH SEACHAS AN CEANN AS A DTAGANN SIAD (TRANS-KINGDOM CROSS-TALK). SA TIONSCADAL SEO, DÉANFAIMID ANAILÍS FÉACHAINT AN BHFUIL RIALACHÁN Á IDIRGHABHÁIL AG MIRNANNA IDIR SPEICIS I BPRÓISEAS NA FRITHSHEASMHACHTA IN AGHAIDH PATAIGINÍ I RÍS. CLÚDAÍONN AN TIONSCADAL SEO TEICNÍCÍ D’ANAILÍS DHÍREACH AGUS DROIM AR AIS GÉINITEACH, MAISE AGUS BITHFHAISNÉISEACH, ANAILÍS CYTOLOGIC AGUS HISTOLOGIC, AGUS SAINAITHINT COIMPLÉISC MIRNA-AGO LE LINN PRÓISIS IDIRGHNÍOMHAÍOCHTA PLANDAÍ-PATAIGINÍ. CUIREANN INFHAIGHTEACHT PRÓTACAL AGUS UIRLISÍ OIBRE, TÚSPHOINTE MAITH DÚINN CHUN NA SPRIOCANNA SIN A BHAINT AMACH. DÁ BHFAIGHFÍ TORTHAÍ DEARFACHA, LÉIREOFAÍ GO BHFUIL AN GNÍOMH MIRNAS INA NASCEILIMINTÍ LENA RIALAÍTEAR LÉIRIÚ GÉICE CHUN FREAGAIRTÍ IMDHÍONACHTA AGUS HOMEOSTASIS COTHAITHEACH A RIALÚ LE LINN IONFHABHTÚ PATAIGINE. CUIRFIDH NA TORTHAÍ A GHEOFAR AGUS AN T-EOLAS A GHINTEAR SA TIONSCADAL SEO LE COINCHEAPA NUA A BHUNÚ I STAIDÉIR IDIRGHNÍOMHAÍOCHTA PLANDAÍ/PATAIGINE. CABHRÓIDH SÉ SEO LE STRAITÉISÍ NUA A SHAINIÚ CHUN FRIOTAÍOCHT PLANDAÍ A FHEABHSÚ LE HIONFHABHTÚ PATAIGIN, RUD A RACHAIDH CHUN TAIRBHE AR DEIREADH THIAR DO CHLÁIR FEABHSAITHE I SPEICIS LEASA AGRANAMAÍOCHA. (Irish)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    V PŘÍRODĚ JSOU ROSTLINY VYSTAVENY ČETNÝM NEPŘÍZNIVÝM PODMÍNKÁM PROSTŘEDÍ, VČETNĚ BIOTICKÉHO A ABIOTICKÉHO STRESU. CHCETE-LI PŘIZPŮSOBIT A PŘEKONAT TYTO PODMÍNKY, ROSTLINY VYVÍJEJÍ OBRANNÉ MECHANISMY, KTERÉ JIM UMOŽNÍ REAGOVAT NEJVHODNĚJŠÍM ZPŮSOBEM NA KAŽDÝ TYP STRESU. TO VYŽADUJE SOFISTIKOVANÉ KOMUNIKAČNÍ MECHANISMY MEZI ZABEZPEČOVACÍMI CESTAMI INICIOVANÝMI VNĚJŠÍMI FAKTORY, KTERÉ UMOŽŇUJÍ KOORDINOVANOU REAKCI V ZAŘÍZENÍ. O MIKRORNA (MIRNA) JE ZNÁMO, ŽE JSOU REGULÁTORY GENOVÉ EXPRESE V RŮZNÝCH VÝVOJOVÝCH PROCESECH, STEJNĚ JAKO V ADAPTIVNÍCH REAKCÍCH NA STRES V ŽIVOTNÍM PROSTŘEDÍ. MIRNA UMOŽŇUJÍ RYCHLÉ A NĚKDY VELMI SPECIFICKÉ REAKCE, TAKŽE JSOU KLÍČOVÝMI PRVKY PRO SPRÁVNOU ÚPRAVU GENOVÉ EXPRESE V PROCESECH REZISTENCE VŮČI PATOGENŮM, STEJNĚ JAKO V KOMUNIKAČNÍCH PROCESECH V REAKCI NA RŮZNÉ TYPY STRESU. TENTO PROJEKT SE ZABÝVÁ TÍMTO TÉMATEM A ODPOVÍDÁ NA NOVOU OTÁZKU TÝKAJÍCÍ SE INTEGRACE PROCESŮ BĚHEM ADAPTACE NA RŮZNÉ ENVIRONMENTÁLNÍ STRESY: ROLE MIRNY V OBRANNÉ REAKCI A V JEJICH INTERAKCI S NUTRIČNÍM STRESEM V ROSTLINÁCH. TYTO STUDIE BUDOU PROVÁDĚNY NA RÝŽOVÝCH ROSTLINÁCH A ARABIDOPSIS, DVOU MODELOVÝCH ROSTLINÁCH PRO STUDIE FUNKČNÍCH GENOMŮ V MONOKOTYLEDONECH A DIKOTYLEDONECH, A PŘEDSTAVUJE POKRAČOVÁNÍ SOUČASNÉHO PROJEKTU (BIO2012–32838). NAVRHUJE SE ZEJMÉNA, ABY: I) CHARAKTERIZOVAT VÝZNAM MIR399 A MIR827 V INTERAKCI MEZI FOSFÁTOVÉ SIGNALIZAČNÍ CESTY (P) A IMUNITNÍ ODPOVĚDÍ (RÝŽE, ARABIDOPSIS) A II) ZJISTIT ROLI MIR7695, KONKRÉTNÍ MIRNA RÝŽE IDENTIFIKOVANÁ V NAŠÍ SKUPINĚ, PŘI KONTROLE HOMEOSTÁZY ŽELEZA (FE) A/NEBO MANGANU (MN) BĚHEM OBRANNÉ REAKCE (RÝŽE). KROMĚ TOHO BUDE STUDOVÁNA INTERAKCE MEZI SIGNALIZAČNÍMI CESTAMI P A VÍRY/MN ZAPOJENÝMI DO FENOTYPU REZISTENCE/CITLIVOSTI ROSTLIN V REAKCI NA INFEKCI. V NAŠÍ SKUPINĚ JSOU STUDOVÁNY VHODNÉ PATOSYSTÉMY PRO TYTO STUDIE: RÝŽE/MAGNAPORTHE ORYZAE A ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. NA DRUHÉ STRANĚ BYLO V LITERATUŘE POPSÁNO, ŽE NĚKTERÉ MIRNA A SIRNA MOHOU BÝT PŘEPRAVOVÁNY A PŮSOBIT V JINÝCH ORGANISMECH, NEŽ ZE KTERÝCH POCHÁZEJÍ (TRANS-KINGDOM CROSS-TALK). V TOMTO PROJEKTU BUDEME ANALYZOVAT, ZDA EXISTUJE REGULACE ZPROSTŘEDKOVANÁ MIRNA MEZI DRUHY V PROCESECH REZISTENCE VŮČI PATOGENŮM V RÝŽI. TENTO PROJEKT ZAHRNUJE TECHNIKY PŘÍMÉ A REVERZNÍ GENETICKÉ, HMOTNOSTNÍ SEKVENCOVÁNÍ A BIOINFORMATICKÉ ANALÝZY, CYTOLOGICKÉ A HISTOLOGICKÉ ANALÝZY A IDENTIFIKACI MIRNA-AGO KOMPLEXŮ BĚHEM PROCESŮ INTERAKCE MEZI ROSTLINOU A PATOGENEM. DOSTUPNOST PROTOKOLŮ A PRACOVNÍCH NÁSTROJŮ NÁM DÁVÁ DOBRÝ VÝCHOZÍ BOD K DOSAŽENÍ TĚCHTO CÍLŮ. POKUD BUDOU ZÍSKÁNY POZITIVNÍ VÝSLEDKY, BYLO BY PROKÁZÁNO, ŽE MIRNAS ACT JAKO SPOJOVACÍ PRVKY REGULUJÍCÍ GENOVOU EXPRESI PRO KONTROLU IMUNITNÍCH REAKCÍ A ŽIVNÉ HOMEOSTÁZY BĚHEM INFEKCE PATOGENY. ZÍSKANÉ VÝSLEDKY A POZNATKY ZÍSKANÉ V RÁMCI TOHOTO PROJEKTU PŘISPĚJÍ K VYTVOŘENÍ NOVÝCH KONCEPCÍ VE STUDIÍCH INTERAKCÍ MEZI ROSTLINAMI A PATOGENY. TO POMŮŽE DEFINOVAT NOVÉ STRATEGIE KE ZLEPŠENÍ ODOLNOSTI ROSTLIN VŮČI PATOGENŮM INFEKCE, COŽ V KONEČNÉM DŮSLEDKU PROSPĚJE ZLEPŠOVÁNÍ PROGRAMŮ U DRUHŮ AGRONOMICKÉHO ZÁJMU. (Czech)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    EM PLANTAS NATURAIS ESTÃO EXPOSTAS A INÚMERAS CONDIÇÕES AMBIENTAIS ADVERSAS, INCLUINDO ESTRESSE BIÓTICO E ABIÓTICO. PARA ADAPTAR E SUPERAR TAIS CONDIÇÕES, AS PLANTAS DESENVOLVEM MECANISMOS DE DEFESA QUE LHES PERMITEM RESPONDER DA FORMA MAIS ADEQUADA A CADA TIPO DE ESTRESSE. ISTO REQUER MECANISMOS DE COMUNICAÇÃO SOFISTICADOS ENTRE AS ROTAS DE SINALIZAÇÃO INICIADAS POR FATORES EXTERNOS QUE PERMITEM UMA RESPOSTA COORDENADA NA FÁBRICA. OS MICRORNAS (MIRNA) SÃO CONHECIDOS POR SEREM REGULADORES DE EXPRESSÃO GÊNICA EM DIFERENTES PROCESSOS DE DESENVOLVIMENTO, BEM COMO EM RESPOSTAS ADAPTATIVAS AO ESTRESSE AMBIENTAL. OS MIRNAS PERMITEM RESPOSTAS RÁPIDAS E ÀS VEZES MUITO ESPECÍFICAS, POR ISSO SÃO ELEMENTOS-CHAVE PARA O CORRETO AJUSTE DA EXPRESSÃO GÊNICA EM PROCESSOS DE RESISTÊNCIA A PATÓGENOS, BEM COMO EM PROCESSOS DE COMUNICAÇÃO NA RESPOSTA A DIFERENTES TIPOS DE ESTRESSE. ESTE PROJETO ABORDA ESTE TEMA PARA RESPONDER A UMA NOVA PERGUNTA SOBRE A INTEGRAÇÃO DE PROCESSOS DURANTE A ADAPTAÇÃO A DIFERENTES STRESSES AMBIENTAIS: O PAPEL DO MIRNA NA RESPOSTA DE DEFESA E EM SUA INTERAÇÃO COM O ESTRESSE NUTRICIONAL NAS PLANTAS. ESTES ESTUDOS SERÃO REALIZADOS EM PLANTAS DE ARROZ E ARABIDOPSIS, AS DUAS PLANTAS MODELO PARA ESTUDOS DE GENÔMICA FUNCIONAL EM MONOCOTILEDONES E DICOTYLEDONES, E REPRESENTA A CONTINUAÇÃO DO PROJETO ATUAL (BIO2012-32838). EM ESPECIAL, PROPÕE-SE QUE: I) CARACTERIZAR A RELEVÂNCIA DE MIR399 E MIR827 NA INTERAÇÃO ENTRE AS VIAS DE SINALIZAÇÃO DE FOSFATO (P) E A RESPOSTA IMUNE (ARROZ, ARABIDOPSIS) E II) PARA DESCOBRIR O PAPEL DO MIR7695, UM MIRNA ESPECÍFICO DE ARROZ IDENTIFICADO EM NOSSO GRUPO, NO CONTROLE DA HOMEOSTASE DO FERRO (FE) E/OU MANGANÊS (MN) DURANTE A RESPOSTA DE DEFESA (ARROZ). ALÉM DISSO, SERÁ ESTUDADA A INTERAÇÃO ENTRE AS VIAS DE SINALIZAÇÃO DE P E FÉ/MN ENVOLVIDAS NO FENÓTIPO DE RESISTÊNCIA/SUSCETIBILIDADE DAS PLANTAS EM RESPOSTA À INFEÇÃO. EM NOSSO GRUPO SÃO ESTUDADOS OS PATOSSISTEMAS APROPRIADOS PARA ESSES ESTUDOS: ARROZ/MAGNAPORTHE ORYZAE E ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. POR OUTRO LADO, NA LITERATURA TEM SIDO DESCRITO QUE CERTOS MIRNAS E SIRNAS SÃO CAPAZES DE SER TRANSPORTADOS E AGIR EM ORGANISMOS DIFERENTES DAQUELES DE ONDE PROVÊM (TRANS-REINO CROSS-TALK). NESTE PROJETO, ANALISAREMOS SE EXISTE UM REGULAMENTO MEDIADO POR MIRNAS ENTRE ESPÉCIES NOS PROCESSOS DE RESISTÊNCIA A PATÓGENOS DO ARROZ. ESTE PROJETO ABRANGE TÉCNICAS DE GENÉTICA DIRETA E REVERSA, SEQUENCIAMENTO DE MASSA E ANÁLISE BIOINFORMÁTICA, ANÁLISE CITOLÓGICA E HISTOLÓGICA E IDENTIFICAÇÃO DE COMPLEXOS MIRNA-AGO DURANTE OS PROCESSOS DE INTERAÇÃO PLANTA-PATOGÊNIO. A DISPONIBILIDADE DE PROTOCOLOS E FERRAMENTAS DE TRABALHO NOS COLOCA EM UM BOM PONTO DE PARTIDA PARA ALCANÇAR ESSES OBJETIVOS. SE FOREM OBTIDOS RESULTADOS POSITIVOS, SERIA DEMONSTRADO QUE OS MIRNAS ATUAM COMO ELEMENTOS DE CONEXÃO QUE REGULAM A EXPRESSÃO GÊNICA PARA O CONTROLE DAS RESPOSTAS IMUNES E DA HOMEOSTASE NUTRITIVA DURANTE A INFEÇÃO PATÓGENA. OS RESULTADOS OBTIDOS E OS CONHECIMENTOS GERADOS NESTE PROJETO CONTRIBUIRÃO PARA O ESTABELECIMENTO DE NOVOS CONCEITOS EM ESTUDOS DE INTERAÇÃO PLANTA/PATÓGENO. ISSO AJUDARÁ A DEFINIR NOVAS ESTRATÉGIAS PARA MELHORAR A RESISTÊNCIA DAS PLANTAS À INFEÇÃO POR PATÓGENOS, O QUE ACABARÁ POR BENEFICIAR PROGRAMAS DE MELHORIA EM ESPÉCIES DE INTERESSE AGRONÔMICO. (Portuguese)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    LOODUSES PUUTUVAD TAIMED KOKKU PALJUDE EBASOODSATE KESKKONNATINGIMUSTEGA, SEALHULGAS BIOOTILISE JA ABIOOTILISE STRESSIGA. SELLISTE TINGIMUSTE KOHANDAMISEKS JA ÜLETAMISEKS ARENDAVAD TAIMED KAITSEMEHHANISME, MIS VÕIMALDAVAD NEIL REAGEERIDA KÕIGE SOBIVAMAL VIISIL IGALE STRESSITÜÜBILE. SELLEKS ON VAJA KEERUKAID SIDEMEHHANISME VÄLISTE TEGURITE ALGATATUD SIGNAALIMISTEEDE VAHEL, MIS VÕIMALDAVAD TEHAST KOORDINEERITUD REAGEERIMIST. MIKRORNAD (MIRNA) ON TEADAOLEVALT GENILISE EKSPRESSIOONI REGULAATORID ERINEVATES ARENGUPROTSESSIDES, SAMUTI KESKKONNASTRESSI KOHANEMINE. MIRNA-D VÕIMALDAVAD KIIRET JA MÕNIKORD VÄGA SPETSIIFILIST REAGEERIMIST, NII ET NEED ON PÕHIELEMENDID GEENI EKSPRESSIOONI ÕIGEKS KOHANDAMISEKS PATOGEENIDE SUHTES RESISTENTSUSE PROTSESSIDES, SAMUTI KOMMUNIKATSIOONIPROTSESSIDES REAGEERIMISEL ERINEVAT TÜÜPI STRESSILE. PROJEKTIS KÄSITLETAKSE SEDA TEEMAT, ET VASTATA UUELE KÜSIMUSELE PROTSESSIDE INTEGREERIMISE KOHTA ERINEVATE KESKKONNASTRESSIDEGA KOHANEMISEL: MIRNA ROLL KAITSEREAKTSIOONIS JA NENDE KOOSTOIMES TAIMEDE TOITUMISALASE STRESSIGA. NEED UURINGUD VIIAKSE LÄBI RIISITAIMEDE JA ARABIDOPSIS, MIS ON KAKS NÄIDISTAIMI FUNKTSIONAALSE GENOOMI UURINGUTEKS MONOCOTYLEDONES JA DICOTYLEDONES, NING KUJUTAVAD ENDAST KÄIMASOLEVA PROJEKTI JÄTKU (BIO2012–32838). EELKÕIGE TEHAKSE ETTEPANEK, ET: I) ISELOOMUSTADA MIR399 JA MIR827 TÄHTSUST FOSFAADI SIGNAALIMISTEEDE (P) JA IMMUUNVASTUSE (RIIS, ARABIDOPSIS) NING II) VAHELISES VASTASMÕJUS, ET SELGITADA VÄLJA MEIE RÜHMAS TUVASTATUD SPETSIIFILISE RIISI MIR7695 ROLL RAUA (FE) JA/VÕI MANGAANI (MN) HOMÖOSTAASI (MN) KONTROLLIMISEL KAITSEREAKTSIOONI (RIIS) AJAL. LISAKS UURITAKSE INFEKTSIOONILE REAGEERIMISEL TAIMEDE RESISTENTSUSE/TUNDLIKKUSE FENOTÜÜBIS OSALEVATE P- JA USU/MN SIGNAALITEEDE VASTASTIKUST MÕJU. MEIE GRUPIS UURITAKSE NENDE UURINGUTE JAOKS SOBIVAID PATOSÜSTEEME: RIIS/MAGNAPORTHE ORYZAE JA ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. TEISEST KÜLJEST ON KIRJANDUSES KIRJELDATUD, ET TEATUD MIRNASID JA SIRNASID ON VÕIMALIK TRANSPORTIDA JA MÕJUTADA MUUDES ORGANISMIDES KUI SEE, KUST NAD PÄRINEVAD (KINGDOMI RISTRÄÄKIMINE). SELLES PROJEKTIS ANALÜÜSIME, KAS RIISI PATOGEENIDE SUHTES RESISTENTSUSE PROTSESSIDES ON OLEMAS MÄÄRUS, MIDA VAHENDAVAD LIIKIDEVAHELISED MIRNA-D. SEE PROJEKT HÕLMAB OTSESE JA PÖÖRDGENEETILISE, MASSIJÄRJESTUSE JA BIOINFORMAATILISE ANALÜÜSI MEETODEID, TSÜTOLOOGILIST JA HISTOLOOGILIST ANALÜÜSI NING MIRNA-AGO KOMPLEKSIDE IDENTIFITSEERIMIST TAIME-PATOGEENIDE VASTASTIKMÕJU PROTSESSIDE KÄIGUS. PROTOKOLLIDE JA TÖÖVAHENDITE KÄTTESAADAVUS ANNAB MEILE HEA LÄHTEPUNKTI NENDE EESMÄRKIDE SAAVUTAMISEKS. KUI SAADAKSE POSITIIVSEID TULEMUSI, TÕESTATAKSE, ET MIRNAS ACT KUI ÜHENDAVAD ELEMENDID, MIS REGULEERIVAD GEENSET EKSPRESSIOONI IMMUUNVASTUSE JA TOITAINETE HOMÖOSTAASI KONTROLLI ALL HOIDMISEKS PATOGEENI NAKKUSE AJAL. PROJEKTI KÄIGUS SAADUD TULEMUSED JA SAADUD TEADMISED AITAVAD KAASA UUTE KONTSEPTSIOONIDE VÄLJATÖÖTAMISELE TAIMEDE/PATOGEENIDE VASTASTIKMÕJU UURINGUTES. SEE AITAB MÄÄRATLEDA UUSI STRATEEGIAID, ET PARANDADA TAIMEDE RESISTENTSUST PATOGEENIDE NAKKUSE SUHTES, MIS TOOB LÕPPKOKKUVÕTTES KASU AGRONOOMILIST HUVI PAKKUVATE LIIKIDE PARANDAMISE PROGRAMMIDELE. (Estonian)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    A TERMÉSZETBEN A NÖVÉNYEK SZÁMOS KEDVEZŐTLEN KÖRNYEZETI KÖRÜLMÉNYNEK VANNAK KITÉVE, BELEÉRTVE A BIOTIKUS ÉS ABIOTIKUS STRESSZT. AZ ILYEN KÖRÜLMÉNYEK KIIGAZÍTÁSÁHOZ ÉS LEKÜZDÉSÉHEZ A NÖVÉNYEK VÉDELMI MECHANIZMUSOKAT FEJLESZTENEK KI, AMELYEK LEHETŐVÉ TESZIK SZÁMUKRA, HOGY A LEGMEGFELELŐBB MÓDON REAGÁLJANAK AZ EGYES STRESSZTÍPUSOKRA. EHHEZ KIFINOMULT KOMMUNIKÁCIÓS MECHANIZMUSOKRA VAN SZÜKSÉG A JELZŐÚTVONALAK KÖZÖTT, AMELYEKET KÜLSŐ TÉNYEZŐK KEZDEMÉNYEZNEK, AMELYEK LEHETŐVÉ TESZIK A KOORDINÁLT REAGÁLÁST AZ ÜZEMBEN. A MIKRORNS-EK (MIRNA) A KÜLÖNBÖZŐ FEJLŐDÉSI FOLYAMATOKBAN, VALAMINT A KÖRNYEZETI STRESSZRE ADOTT ADAPTÍV VÁLASZOKBAN A GÉN EXPRESSZIÓ SZABÁLYOZÓI. A MIRNS-EK LEHETŐVÉ TESZIK A GYORS ÉS NÉHA NAGYON SPECIFIKUS VÁLASZOKAT, EZÉRT KULCSFONTOSSÁGÚAK A KÓROKOZÓKKAL SZEMBENI REZISZTENCIA FOLYAMATAIBAN, VALAMINT A KÜLÖNBÖZŐ TÍPUSÚ STRESSZRE ADOTT VÁLASZBAN A GÉN KIFEJEZÉS HELYES BEÁLLÍTÁSÁBAN. EZ A PROJEKT EZZEL A TÉMÁVAL FOGLALKOZIK, HOGY MEGVÁLASZOLJON EGY ÚJ KÉRDÉST A FOLYAMATOK INTEGRÁLÁSÁRÓL A KÜLÖNBÖZŐ KÖRNYEZETI STRESSZHEZ VALÓ ALKALMAZKODÁS SORÁN: A MIRNA SZEREPE A VÉDELMI VÁLASZBAN ÉS A NÖVÉNYEK TÁPLÁLKOZÁSI STRESSZÉVEL VALÓ KÖLCSÖNHATÁSUKBAN. EZEKET A TANULMÁNYOKAT A RIZSNÖVÉNYEKEN ÉS AZ ARABIDOPSISON, A MONOCOTYLEDONES ÉS DICOTYLEDONES FUNKCIONÁLIS GENOMIKUS VIZSGÁLATAINAK KÉT MODELLÜZEMÉN FOGJÁK ELVÉGEZNI, ÉS EZ A JELENLEGI PROJEKT FOLYTATÁSÁT JELENTI (BIO2012–32838). KÜLÖNÖSEN A KÖVETKEZŐKET JAVASOLJUK: I) JELLEMZI A MIR399 ÉS A MIR827 RELEVANCIÁJÁT A FOSZFÁTJELZŐ ÚTVONALAK (P) ÉS AZ IMMUNVÁLASZ (RIZS, ARABIDOPSIS) KÖZÖTTI KÖLCSÖNHATÁSBAN, VALAMINT II) ANNAK ÉRDEKÉBEN, HOGY MEGTUDJA A MIR7695, A CSOPORTUNKBAN AZONOSÍTOTT RIZS MIRNA SZEREPÉT A VAS (FE) ÉS/VAGY MANGÁN (MN) HOMEOSZTÁZISÁNAK KEZELÉSÉBEN A VÉDELMI VÁLASZ (RIZS) SORÁN. EZEN TÚLMENŐEN TANULMÁNYOZNI FOGJÁK A FERTŐZÉSRE ADOTT VÁLASZKÉNT A NÖVÉNYEK REZISZTENCIÁJÁNAK/ÉRZÉKENYSÉGÉNEK FENOTÍPUSÁBAN SZEREPET JÁTSZÓ P ÉS HIT/MN JELZŐÚTVONALAK KÖZÖTTI KÖLCSÖNHATÁST. CSOPORTUNKBAN AZ E VIZSGÁLATOKHOZ SZÜKSÉGES MEGFELELŐ PATORENDSZEREKET TANULMÁNYOZZUK: RIZS/MAGNAPORTHE ORYZAE ÉS ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. MÁSRÉSZT A SZAKIRODALOMBAN LEÍRTÁK, HOGY BIZONYOS MIRNS-EK ÉS SIRNS-EK MÁS SZERVEZETEKBEN IS SZÁLLÍTHATÓK ÉS HATNAK, MINT AHONNAN SZÁRMAZNAK (TRANSZ-KINGDOM KERESZTBESZÉLGETÉS). EBBEN A PROJEKTBEN ELEMEZNI FOGJUK, HOGY LÉTEZIK-E OLYAN RENDELET, AMELYET A MIRNS-EK KÖZVETÍTENEK A FAJOK KÖZÖTT A RIZS KÓROKOZÓIVAL SZEMBENI REZISZTENCIA FOLYAMATÁBAN. EZ A PROJEKT A KÖZVETLEN ÉS FORDÍTOTT GENETIKAI, TÖMEGSZEKVENÁLÁSI ÉS BIOINFORMATIKUS ELEMZÉSI TECHNIKÁKAT, A CITOLÓGIAI ÉS SZÖVETTANI ANALÍZIST, VALAMINT A MIRNA-AGO KOMPLEXEK AZONOSÍTÁSÁT FOGLALJA MAGÁBAN A NÖVÉNY-PATOGÉN KÖLCSÖNHATÁSOK SORÁN. A PROTOKOLLOK ÉS MUNKAESZKÖZÖK RENDELKEZÉSRE ÁLLÁSA JÓ KIINDULÓPONTOT JELENT E CÉLOK ELÉRÉSÉHEZ. HA POZITÍV EREDMÉNYEKET KAPUNK, BE KELL MUTATNI, HOGY A MIRNS ACT A KÓROKOZÓ FERTŐZÉS SORÁN AZ IMMUNVÁLASZOK ÉS A TÁPANYAG HOMEOSZTÁZISÁNAK SZABÁLYOZÁSÁRA SZOLGÁLÓ GÉNEXPRESSZIÓT SZABÁLYOZÓ ÖSSZEKÖTŐ ELEMKÉNT LÉP FEL. AZ EBBEN A PROJEKTBEN ELÉRT EREDMÉNYEK ÉS AZ ABBÓL SZÁRMAZÓ ISMERETEK HOZZÁJÁRULNAK A NÖVÉNYEK ÉS A KÓROKOZÓK KÖLCSÖNHATÁSÁRA IRÁNYULÓ VIZSGÁLATOK ÚJ KONCEPCIÓINAK KIALAKÍTÁSÁHOZ. EZ SEGÍT A NÖVÉNYEK KÓROKOZÓ FERTŐZÉSSEL SZEMBENI ELLENÁLLÓ KÉPESSÉGÉNEK JAVÍTÁSÁRA IRÁNYULÓ ÚJ STRATÉGIÁK MEGHATÁROZÁSÁBAN, AMELYEK VÉGSŐ SORON AZ AGRONÓMIAI JELENTŐSÉGŰ FAJOK FEJLESZTÉSI PROGRAMJAINAK JAVÁT SZOLGÁLJÁK. (Hungarian)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    В ПРИРОДАТА РАСТЕНИЯТА СА ИЗЛОЖЕНИ НА МНОЖЕСТВО НЕБЛАГОПРИЯТНИ УСЛОВИЯ НА ОКОЛНАТА СРЕДА, ВКЛЮЧИТЕЛНО БИОТИЧЕН И АБИОТИЧЕН СТРЕС. ЗА ДА СЕ АДАПТИРАТ И ПРЕОДОЛЕЯТ ТАКИВА УСЛОВИЯ, РАСТЕНИЯТА РАЗРАБОТВАТ ЗАЩИТНИ МЕХАНИЗМИ, КОИТО ИМ ПОЗВОЛЯВАТ ДА РЕАГИРАТ ПО НАЙ-ПОДХОДЯЩИЯ НАЧИН НА ВСЕКИ ВИД СТРЕС. ТОВА ИЗИСКВА СЛОЖНИ МЕХАНИЗМИ ЗА КОМУНИКАЦИЯ МЕЖДУ МАРШРУТИТЕ ЗА СИГНАЛИЗАЦИЯ, ИНИЦИИРАНИ ОТ ВЪНШНИ ФАКТОРИ, КОИТО ПОЗВОЛЯВАТ КООРДИНИРАНА РЕАКЦИЯ В ЦЕНТРАЛАТА. ИЗВЕСТНО Е, ЧЕ MICRORNAS (MIRNA) Е РЕГУЛАТОР НА ГЕННАТА ЕКСПРЕСИЯ В РАЗЛИЧНИТЕ ПРОЦЕСИ НА РАЗВИТИЕ, КАКТО И В АДАПТИВНИТЕ РЕАКЦИИ КЪМ СТРЕСА В ОКОЛНАТА СРЕДА. MIRNAS ПОЗВОЛЯВАТ БЪРЗИ И ПОНЯКОГА МНОГО СПЕЦИФИЧНИ РЕАКЦИИ, ТАКА ЧЕ ТЕ СА КЛЮЧОВИ ЕЛЕМЕНТИ ЗА ПРАВИЛНОТО КОРИГИРАНЕ НА ГЕННАТА ЕКСПРЕСИЯ В ПРОЦЕСИТЕ НА РЕЗИСТЕНТНОСТ КЪМ ПАТОГЕНИ, КАКТО И В КОМУНИКАЦИОННИТЕ ПРОЦЕСИ В ОТГОВОР НА РАЗЛИЧНИ ВИДОВЕ СТРЕС. ТОЗИ ПРОЕКТ РАЗГЛЕЖДА ТАЗИ ТЕМА, ЗА ДА ОТГОВОРИ НА НОВ ВЪПРОС ЗА ИНТЕГРИРАНЕТО НА ПРОЦЕСИТЕ ПО ВРЕМЕ НА АДАПТИРАНЕТО КЪМ РАЗЛИЧНИ ЕКОЛОГИЧНИ СТРЕСОВЕ: РОЛЯТА НА МИРНА В ЗАЩИТАТА И ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО ИМ С ХРАНИТЕЛНИЯ СТРЕС В РАСТЕНИЯТА. ТЕЗИ ПРОУЧВАНИЯ ЩЕ БЪДАТ ПРОВЕДЕНИ В ОРИЗОВИ РАСТЕНИЯ И АРАБИДОПСИС — ДВАТА МОДЕЛА РАСТЕНИЯ ЗА ИЗСЛЕДВАНИЯ НА ФУНКЦИОНАЛЕН ГЕНОМ НА МОНОКОТИЛЕДОНИ И ДИКОТИЛЕДОНИ, И ПРЕДСТАВЛЯВАТ ПРОДЪЛЖЕНИЕ НА НАСТОЯЩИЯ ПРОЕКТ (BIO2012—32838). ПО-СПЕЦИАЛНО СЕ ПРЕДЛАГА: I) ХАРАКТЕРИЗИРАТ ЗНАЧЕНИЕТО НА MIR399 И MIR827 ЗА ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО МЕЖДУ ПЪТИЩАТА ЗА ФОСФАТНА СИГНАЛИЗАЦИЯ (Р) И ИМУННИЯ ОТГОВОР (ОРИЗ, АРАБИДОПСИС) И II), ЗА ДА РАЗБЕРЕТЕ РОЛЯТА НА MIR7695, СПЕЦИФИЧЕН ОРИЗ MIRNA, ИДЕНТИФИЦИРАН В НАШАТА ГРУПА, В КОНТРОЛА НА ХОМЕОСТАЗАТА НА ЖЕЛЯЗО (FE) И/ИЛИ МАНГАН (MN) ПО ВРЕМЕ НА ЗАЩИТНАТА РЕАКЦИЯ (ОРИЗ). ОСВЕН ТОВА ЩЕ БЪДЕ ПРОУЧЕНО ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО МЕЖДУ ПЪТИЩАТА ЗА СИГНАЛИЗАЦИЯ P И ВЯРАТА/MN, УЧАСТВАЩИ ВЪВ ФЕНОТИПА НА РЕЗИСТЕНТНОСТ/ЧУВСТВИТЕЛНОСТ НА РАСТЕНИЯТА В ОТГОВОР НА ИНФЕКЦИЯ. В НАШАТА ГРУПА СА ПРОУЧЕНИ ПОДХОДЯЩИТЕ ПАТОСИСТЕМИ ЗА ТЕЗИ ПРОУЧВАНИЯ: ОРИЗ/MAGNAPORTHE ORYZAE И ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. ОТ ДРУГА СТРАНА, В ЛИТЕРАТУРАТА Е ОПИСАНО, ЧЕ НЯКОИ MIRNAS И SIRNAS МОГАТ ДА БЪДАТ ТРАНСПОРТИРАНИ И ДА ДЕЙСТВАТ В ОРГАНИЗМИ, РАЗЛИЧНИ ОТ ТЕЗИ, ОТ КОИТО ИДВАТ (ТРАНС КРАЛСКИ КРЪСТОСАНИ РАЗГОВОРИ). В ТОЗИ ПРОЕКТ ЩЕ АНАЛИЗИРАМЕ ДАЛИ СЪЩЕСТВУВА РЕГЛАМЕНТ, ПОСРЕДНИЧЕН ОТ MIRNAS МЕЖДУ ВИДОВЕТЕ В ПРОЦЕСИТЕ НА РЕЗИСТЕНТНОСТ КЪМ ПАТОГЕНИ В ОРИЗА. ТОЗИ ПРОЕКТ ОБХВАЩА ТЕХНИКИ ЗА ДИРЕКТЕН И ОБРАТЕН ГЕНЕТИЧЕН, МАСОВА СЕКВЕНЦИЯ И БИОИНФОРМАТИЧЕН АНАЛИЗ, ЦИТОЛОЖКИ И ХИСТОЛОГИЧНИ АНАЛИЗИ И ИДЕНТИФИЦИРАНЕ НА КОМПЛЕКСИ MIRNA-AGO ПО ВРЕМЕ НА ПРОЦЕСИТЕ НА ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ МЕЖДУ РАСТЕНИЯТА И ПАТОГЕНИТЕ. НАЛИЧИЕТО НА ПРОТОКОЛИ И РАБОТНИ ИНСТРУМЕНТИ НИ ПОСТАВЯ В ДОБРА ОТПРАВНА ТОЧКА ЗА ПОСТИГАНЕТО НА ТЕЗИ ЦЕЛИ. АКО БЪДАТ ПОЛУЧЕНИ ПОЛОЖИТЕЛНИ РЕЗУЛТАТИ, ЩЕ БЪДЕ ДОКАЗАНО, ЧЕ MIRNAS ACT КАТО СВЪРЗВАЩИ ЕЛЕМЕНТИ, РЕГУЛИРАЩИ ГЕННАТА ЕКСПРЕСИЯ ЗА КОНТРОЛ НА ИМУННИТЕ РЕАКЦИИ И ХОМЕОСТАЗАТА НА ХРАНИТЕЛНИТЕ ВЕЩЕСТВА ПО ВРЕМЕ НА ПАТОГЕННА ИНФЕКЦИЯ. ПОЛУЧЕНИТЕ РЕЗУЛТАТИ И ПОЛУЧЕНИТЕ ЗНАНИЯ ПО ТОЗИ ПРОЕКТ ЩЕ ДОПРИНЕСАТ ЗА СЪЗДАВАНЕТО НА НОВИ КОНЦЕПЦИИ В ИЗСЛЕДВАНИЯТА ЗА ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ МЕЖДУ РАСТЕНИЯТА И ПАТОГЕНИТЕ. ТОВА ЩЕ ПОМОГНЕ ЗА ОПРЕДЕЛЯНЕТО НА НОВИ СТРАТЕГИИ ЗА ПОДОБРЯВАНЕ НА УСТОЙЧИВОСТТА НА РАСТЕНИЯТА КЪМ ПАТОГЕННИ ИНФЕКЦИИ, КОЕТО В КРАЙНА СМЕТКА ЩЕ БЪДЕ ОТ ПОЛЗА ЗА ПРОГРАМИТЕ ЗА ПОДОБРЯВАНЕ НА ВИДОВЕТЕ ОТ АГРОНОМСКИ ИНТЕРЕС. (Bulgarian)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    GAMTOJE AUGALAI SUSIDURIA SU DAUGYBE NEPALANKIŲ APLINKOS SĄLYGŲ, ĮSKAITANT BIOTINĮ IR ABIOTINĮ STRESĄ. NORĖDAMI PRITAIKYTI IR ĮVEIKTI TOKIAS SĄLYGAS, AUGALAI KURIA GYNYBOS MECHANIZMUS, KURIE LEIDŽIA JIEMS TINKAMIAUSIU BŪDU REAGUOTI Į KIEKVIENĄ STRESO TIPĄ. TAM REIKIA SUDĖTINGŲ RYŠIO MECHANIZMŲ TARP SIGNALIZAVIMO MARŠRUTŲ, KURIUOS INICIJUOJA IŠORINIAI VEIKSNIAI, LEIDŽIANTYS UŽTIKRINTI KOORDINUOTĄ REAGAVIMĄ GAMYKLOJE. ŽINOMA, KAD MIKRORNR (MIRNA) YRA GENINĖS RAIŠKOS REGULIATORIAI ĮVAIRIUOSE VYSTYMOSI PROCESUOSE, TAIP PAT PRISITAIKANTI REAKCIJA Į APLINKOS STRESĄ. MIRNR LEIDŽIA GREITAI IR KARTAIS LABAI SPECIFINĮ ATSAKĄ, TODĖL JIE YRA PAGRINDINIAI ELEMENTAI, PADEDANTYS TEISINGAI KOREGUOTI GENINĘ EKSPRESIJĄ ATSPARUMO PATOGENAMS PROCESUOSE, TAIP PAT KOMUNIKACIJOS PROCESUOSE, REAGUOJANT Į ĮVAIRIUS STRESO TIPUS. ŠIS PROJEKTAS SKIRTAS ŠIAI TEMAI ATSAKYTI Į NAUJĄ KLAUSIMĄ APIE PROCESŲ INTEGRAVIMĄ PRISITAIKYMO PRIE ĮVAIRIŲ APLINKOS PROBLEMŲ METU: MIRNA VAIDMUO GYNYBOS REAGAVIMO IR JŲ SĄVEIKOS SU MITYBOS STRESO AUGALUOSE. ŠIE TYRIMAI BUS ATLIEKAMI SU RYŽIŲ AUGALAIS IR ARABIDOPSIS – DVIEM PAVYZDINIAIS AUGALAIS, SKIRTAIS MONOCOTILEDONES IR DICOTILEDONES FUNKCINĖS GENOMIKOS TYRIMAMS, IR YRA DABARTINIO PROJEKTO TĘSINYS (BIO2012–32838). VISŲ PIRMA SIŪLOMA: I) APIBŪDINA MIR399 IR MIR827 SVARBĄ FOSFATŲ SIGNALIZAVIMO MARŠRUTŲ (P) IR IMUNINIO ATSAKO (RYŽIŲ, ARABIDOPSIO) SĄVEIKAI, SIEKIANT IŠSIAIŠKINTI MIR7695, SPECIFINIO MŪSŲ GRUPĖJE IDENTIFIKUOTO RYŽIŲ MIRNA, VAIDMENĮ KONTROLIUOJANT GELEŽIES (FE) IR (ARBA) MANGANO (MN) HOMEOSTAZĘ GYNYBOS REAKCIJOS METU (RYŽIAI). BE TO, BUS IŠTIRTA P IR TIKĖJIMO/MN, SUSIJUSIŲ SU AUGALŲ ATSPARUMO/JAUTRUMO FENOTIPU, SĄVEIKA REAGUOJANT Į INFEKCIJĄ. MŪSŲ GRUPĖJE TIRIAMOS TINKAMOS ŠIŲ TYRIMŲ PATOKOS: RYŽIAI/MAGNAPORTHE ORYZAE IR ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. KITA VERTUS, LITERATŪROJE APRAŠYTA, KAD TAM TIKROS MIRNR IR SIRNR GALI BŪTI GABENAMOS IR VEIKIAMOS KITUOSE ORGANIZMUOSE NEI TIE, IŠ KURIŲ JIE KILĘ (TRANS-KINGDOM CROSS-TALK). ŠIAME PROJEKTE MES ANALIZUOSIME, AR YRA REGLAMENTAS, KURĮ REGULIUOJA MIRNR TARP RŪŠIŲ ATSPARUMO RYŽIŲ PATOGENAMS PROCESUOSE. ŠIS PROJEKTAS APIMA TIESIOGINĖS IR ATVIRKŠTINĖS GENETINĖS, MASINĖS SEKOS NUSTATYMO IR BIOINFORMATIKOS ANALIZĖS METODUS, CITOLOGINĘ IR HISTOLOGINĘ ANALIZĘ IR MIRNA-AGO KOMPLEKSŲ IDENTIFIKAVIMĄ AUGALŲ IR PATOGENŲ SĄVEIKOS PROCESUOSE. PROTOKOLŲ IR DARBO PRIEMONIŲ PRIEINAMUMAS YRA GERAS ATSPIRTIES TAŠKAS ŠIEMS TIKSLAMS PASIEKTI. JEI GAUNAMI TEIGIAMI REZULTATAI, BŪTŲ ĮRODYTA, KAD MIRNR VEIKIA KAIP JUNGIAMIEJI ELEMENTAI, REGULIUOJANTYS GENINĘ EKSPRESIJĄ IMUNINIAM ATSAKUI IR MAISTINIŲ MEDŽIAGŲ HOMEOSTAZEI KONTROLIUOTI PATOGENO INFEKCIJOS METU. ŠIO PROJEKTO METU GAUTI REZULTATAI IR SUKAUPTOS ŽINIOS PADĖS KURTI NAUJAS AUGALŲ IR PATOGENŲ SĄVEIKOS TYRIMŲ KONCEPCIJAS. TAI PADĖS NUSTATYTI NAUJAS STRATEGIJAS, KAIP PAGERINTI AUGALŲ ATSPARUMĄ PATOGENŲ INFEKCIJAI, KURI GALIAUSIAI BUS NAUDINGA AGRONOMINIŲ INTERESŲ RŪŠIŲ TOBULINIMO PROGRAMOMS. (Lithuanian)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    U PRIRODI BILJKE SU IZLOŽENE BROJNIM NEPOVOLJNIM UVJETIMA OKOLIŠA, UKLJUČUJUĆI BIOTIČKI I ABIOTIČKI STRES. ZA PRILAGODBU I PREVLADAVANJE TAKVIH UVJETA, BILJKE RAZVIJAJU OBRAMBENE MEHANIZME KOJI IM OMOGUĆUJU DA ODGOVORE NA NAJPRIKLADNIJI NAČIN NA SVAKU VRSTU STRESA. TO ZAHTIJEVA SOFISTICIRANE KOMUNIKACIJSKE MEHANIZME IZMEĐU SIGNALNO-SIGURNOSNIH PUTOVA KOJE POKREĆU VANJSKI ČIMBENICI KOJI OMOGUĆUJU KOORDINIRANI ODGOVOR U POSTROJENJU. POZNATO JE DA SU MIKRORNA (MIRNA) REGULATORI GENSKOG IZRAŽAVANJA U RAZLIČITIM RAZVOJNIM PROCESIMA, KAO I U ADAPTIVNIM ODGOVORIMA NA STRES U OKOLIŠU. MIRNA OMOGUĆUJU BRZE I PONEKAD VRLO SPECIFIČNE ODGOVORE, STOGA SU KLJUČNI ELEMENTI ZA ISPRAVNU PRILAGODBU GENSKOG IZRAŽAVANJA U PROCESIMA OTPORNOSTI NA PATOGENE, KAO I U KOMUNIKACIJSKIM PROCESIMA U ODGOVORU NA RAZLIČITE VRSTE STRESA. OVAJ SE PROJEKT BAVI OVOM TEMOM KAKO BI SE ODGOVORILO NA NOVO PITANJE O INTEGRACIJI PROCESA TIJEKOM PRILAGODBE RAZLIČITIM EKOLOŠKIM STRESOVIMA: ULOGA MIRNE U ODGOVORU OBRANE I NJIHOVOJ INTERAKCIJI S PREHRAMBENIM STRESOM U BILJKAMA. OVE STUDIJE ĆE SE PROVODITI NA RIŽINIM BILJKAMA I ARABIDOPSIS, DVA MODELA BILJAKA ZA STUDIJE FUNKCIONALNOG GENOMA U MONOKOTILEDONES I DICOTILEDONES, I PREDSTAVLJA NASTAVAK TRENUTNOG PROJEKTA (BIO2012 – 32838). KONKRETNO, PREDLAŽE SE SLJEDEĆE: I) KARAKTERIZIRAJU VAŽNOST MIR399 I MIR827 U INTERAKCIJI IZMEĐU PUTEVA SIGNALIZACIJE FOSFATA (P) I IMUNOLOŠKOG ODGOVORA (RIŽA, ARABIDOPSIS) I II) KAKO BI SAZNALI ULOGU MIR7695, SPECIFIČNE MIRNE RIŽE IDENTIFICIRANE U NAŠOJ SKUPINI, U KONTROLI HOMEOSTAZE ŽELJEZA (FE) I/ILI MANGANA (MN) TIJEKOM OBRAMBENOG ODGOVORA (RIŽA). OSIM TOGA, PROUČAVAT ĆE SE INTERAKCIJA IZMEĐU SIGNALNIH PUTOVA P I VJERE/MN-A UKLJUČENIH U FENOTIP OTPORNOSTI/OSJETLJIVOSTI BILJAKA KAO ODGOVOR NA INFEKCIJU. U NAŠOJ SKUPINI PROUČAVAJU SE ODGOVARAJUĆI PATOSUSTAVI ZA OVA ISTRAŽIVANJA: RIŽA/MAGNAPORTHE ORYZAE I ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. S DRUGE STRANE, U LITERATURI JE OPISANO DA SE ODREĐENE MIRNA-E I SIRNA-E MOGU PREVOZITI I DJELOVATI U ORGANIZMIMA IZ KOJIH POTJEČU (TRANS-KINGDOM CROSS-TALK). U OVOM ĆEMO PROJEKTU ANALIZIRATI POSTOJI LI UREDBA POSREDOVANA MIRNA-OM MEĐU VRSTAMA U PROCESIMA OTPORNOSTI NA PATOGENE U RIŽI. OVAJ PROJEKT OBUHVAĆA TEHNIKE IZRAVNE I REVERZNE GENETSKE, MASOVNE SEKVENCIRANJA I BIOINFORMATIČKE ANALIZE, CITOLOŠKE I HISTOLOŠKE ANALIZE TE IDENTIFIKACIJE MIRNA-AGO KOMPLEKSA TIJEKOM PROCESA INTERAKCIJE IZMEĐU BILJAKA I PATOGENA. DOSTUPNOST PROTOKOLA I RADNIH ALATA STAVLJA NAS U DOBRU POLAZIŠNU TOČKU ZA POSTIZANJE TIH CILJEVA. AKO SE DOBIJU POZITIVNI REZULTATI, POKAZALO BI SE DA MIRNAS DJELUJE KAO SPOJNI ELEMENTI KOJI REGULIRAJU GENSKU EKSPRESIJU ZA KONTROLU IMUNOLOŠKOG ODGOVORA I HOMEOSTAZE HRANJIVIH TVARI TIJEKOM INFEKCIJE PATOGENOM. DOBIVENI REZULTATI I ZNANJE STEČENO U OVOM PROJEKTU DOPRINIJET ĆE USPOSTAVLJANJU NOVIH KONCEPATA U STUDIJAMA INTERAKCIJE BILJAKA/PATOGENA. TO ĆE POMOĆI U DEFINIRANJU NOVIH STRATEGIJA ZA POBOLJŠANJE OTPORNOSTI BILJAKA NA PATOGENE INFEKCIJE, ŠTO ĆE U KONAČNICI KORISTITI PROGRAMIMA POBOLJŠANJA U VRSTAMA OD AGRONOMSKOG INTERESA. (Croatian)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    I NATUREN UTSÄTTS VÄXTER FÖR MÅNGA NEGATIVA MILJÖFÖRHÅLLANDEN, INKLUSIVE BIOTISK OCH ABIOTISK STRESS. FÖR ATT ANPASSA OCH ÖVERVINNA SÅDANA FÖRHÅLLANDEN UTVECKLAR VÄXTER FÖRSVARSMEKANISMER SOM GÖR DET MÖJLIGT FÖR DEM ATT REAGERA PÅ DET LÄMPLIGASTE SÄTTET PÅ VARJE TYP AV STRESS. DETTA KRÄVER SOFISTIKERADE KOMMUNIKATIONSMEKANISMER MELLAN SIGNALVÄGAR SOM INITIERAS AV EXTERNA FAKTORER SOM MÖJLIGGÖR EN SAMORDNAD REAKTION I ANLÄGGNINGEN. MIKRORNA (MIRNA) ÄR KÄNDA FÖR ATT VARA REGULATORER FÖR GENIC UTTRYCK I OLIKA UTVECKLINGSPROCESSER, LIKSOM I ADAPTIVA SVAR PÅ MILJÖPÅFRESTNINGAR. MIRNA TILLÅTER SNABBA OCH IBLAND MYCKET SPECIFIKA SVAR, SÅ DE ÄR NYCKELELEMENT FÖR KORREKT JUSTERING AV GENICUTTRYCKET I PROCESSER FÖR RESISTENS MOT PATOGENER, LIKSOM I KOMMUNIKATIONSPROCESSER I SVARET PÅ OLIKA TYPER AV STRESS. DETTA PROJEKT TAR UPP DETTA ÄMNE FÖR ATT BESVARA EN NY FRÅGA OM INTEGRATION AV PROCESSER UNDER ANPASSNINGEN TILL OLIKA MILJÖPÅFRESTNINGAR: MIRNAS ROLL I FÖRSVARET OCH I DERAS INTERAKTION MED NÄRINGSMÄSSIG STRESS I VÄXTER. DESSA STUDIER KOMMER ATT GENOMFÖRAS PÅ RISPLANTOR OCH ARABIDOPSIS, DE TVÅ MODELLVÄXTERNA FÖR STUDIER AV FUNKTIONELL GENOMIK I MONOKOTYLEDONER OCH DICOTYLEDONES, OCH UTGÖR EN FORTSÄTTNING PÅ DET PÅGÅENDE PROJEKTET (BIO2012–32838). I SYNNERHET FÖRESLÅS FÖLJANDE: I) KARAKTERISERA RELEVANSEN AV MIR399 OCH MIR827 I INTERAKTIONEN MELLAN FOSFATSIGNALVÄGARNA (P) OCH IMMUNSVARET (RIS, ARABIDOPSIS) OCH II) FÖR ATT TA REDA PÅ ROLLEN AV MIR7695, EN SPECIFIK MIRNA AV RIS SOM IDENTIFIERATS I VÅR GRUPP, I KONTROLLEN AV HOMEOSTASEN AV JÄRN (FE) OCH/ELLER MANGAN (MN) UNDER FÖRSVARSSVARET (RIS). DESSUTOM KOMMER INTERAKTIONEN MELLAN SIGNALVÄGARNA FÖR P OCH TRO/MN SOM ÄR INVOLVERADE I FENOTYPEN AV RESISTENS/KÄNSLIGHET HOS VÄXTER SOM SVAR PÅ INFEKTION ATT STUDERAS. I VÅR GRUPP STUDERAS LÄMPLIGA PATOSYSTEM FÖR DESSA STUDIER: RIS/MAGNAPORTHE ORYZAE OCH ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. Å ANDRA SIDAN HAR DET I LITTERATUREN BESKRIVITS ATT VISSA MIRNAS OCH SIRNAS KAN TRANSPORTERAS OCH AGERA I ANDRA ORGANISMER ÄN DE DE KOMMER FRÅN (TRANS-KINGDOM CROSS-TALK). I DETTA PROJEKT KOMMER VI ATT ANALYSERA OM DET FINNS EN FÖRORDNING SOM FÖRMEDLAS AV MIRNAS MELLAN ARTER I PROCESSERNA FÖR RESISTENS MOT PATOGENER I RIS. DETTA PROJEKT OMFATTAR TEKNIKER FÖR DIREKT OCH OMVÄND GENETISK, MASSSEKVENSERING OCH BIOINFORMATISK ANALYS, CYTOLOGISK OCH HISTOLOGISK ANALYS SAMT IDENTIFIERING AV MIRNA-AGO-KOMPLEX UNDER VÄXTPATOGENINTERAKTIONSPROCESSER. TILLGÅNGEN TILL PROTOKOLL OCH ARBETSVERKTYG SÄTTER OSS I EN BRA UTGÅNGSPUNKT FÖR ATT UPPNÅ DESSA MÅL. OM POSITIVA RESULTAT UPPNÅS, SKULLE DET VISAS ATT MIRNAS ACT SOM KOPPLAR ELEMENT SOM REGLERAR GENIC UTTRYCK FÖR KONTROLL AV IMMUNSVAR OCH NÄRINGSÄMNEN HOMEOSTAS UNDER PATOGENINFEKTION. DE RESULTAT SOM ERHÅLLITS OCH DEN KUNSKAP SOM GENERERAS I DETTA PROJEKT KOMMER ATT BIDRA TILL ATT ETABLERA NYA KONCEPT I INTERAKTIONSSTUDIER MELLAN VÄXTER OCH PATOGENER. DETTA KOMMER ATT BIDRA TILL ATT FASTSTÄLLA NYA STRATEGIER FÖR ATT FÖRBÄTTRA VÄXTERS MOTSTÅNDSKRAFT MOT PATOGENINFEKTION, VILKET I SLUTÄNDAN KOMMER ATT GYNNA FÖRBÄTTRINGSPROGRAM FÖR ARTER AV AGRONOMISKT INTRESSE. (Swedish)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    ÎN NATURĂ, PLANTELE SUNT EXPUSE LA NUMEROASE CONDIȚII DE MEDIU NEFAVORABILE, INCLUSIV STRES BIOTIC ȘI ABIOTIC. PENTRU A SE ADAPTA ȘI A DEPĂȘI ASTFEL DE CONDIȚII, PLANTELE DEZVOLTĂ MECANISME DE APĂRARE CARE LE PERMIT SĂ RĂSPUNDĂ ÎN MODUL CEL MAI ADECVAT LA FIECARE TIP DE STRES. ACEST LUCRU NECESITĂ MECANISME SOFISTICATE DE COMUNICARE ÎNTRE RUTELE DE SEMNALIZARE INIȚIATE DE FACTORI EXTERNI CARE PERMIT UN RĂSPUNS COORDONAT ÎN INSTALAȚIE. MICRORNA (MIRNA) SUNT CUNOSCUTE CA FIIND REGULATORI DE EXPRESIE GENICĂ ÎN DIFERITE PROCESE DE DEZVOLTARE, PRECUM ȘI ÎN RĂSPUNSURILE ADAPTIVE LA STRESUL AMBIENTAL. MIRNA PERMITE RĂSPUNSURI RAPIDE ȘI UNEORI FOARTE SPECIFICE, ASTFEL ÎNCÂT ACESTEA SUNT ELEMENTE CHEIE PENTRU AJUSTAREA CORECTĂ A EXPRESIEI GENICE ÎN PROCESELE DE REZISTENȚĂ LA AGENȚI PATOGENI, PRECUM ȘI ÎN PROCESELE DE COMUNICARE ÎN RĂSPUNSUL LA DIFERITE TIPURI DE STRES. ACEST PROIECT ABORDEAZĂ ACEST SUBIECT PENTRU A RĂSPUNDE LA O NOUĂ ÎNTREBARE PRIVIND INTEGRAREA PROCESELOR ÎN TIMPUL ADAPTĂRII LA DIFERITE STRES AMBIENTAL: ROLUL MIRNEI ÎN RĂSPUNSUL APĂRĂRII ȘI ÎN INTERACȚIUNEA LOR CU STRESUL NUTRIȚIONAL ÎN PLANTE. ACESTE STUDII VOR FI EFECTUATE PE PLANTE DE OREZ ȘI ARABIDOPSIS, CELE DOUĂ MODELE DE PLANTE PENTRU STUDII GENOMICE FUNCȚIONALE ÎN MONOCOTILEDONE ȘI DICOTILEDONE, ȘI REPREZINTĂ CONTINUAREA PROIECTULUI ACTUAL (BIO2012-32838). ÎN SPECIAL, SE PROPUNE CA: I) CARACTERIZEAZĂ RELEVANȚA MIR399 ȘI MIR827 ÎN INTERACȚIUNEA DINTRE CĂILE DE SEMNALIZARE A FOSFATULUI (P) ȘI RĂSPUNSUL IMUN (OREZ, ARABIDOPSIS) ȘI II) PENTRU A AFLA ROLUL MIR7695, O MIRNA SPECIFICĂ DE OREZ IDENTIFICATĂ ÎN GRUPUL NOSTRU, ÎN CONTROLUL HOMEOSTAZEI FIERULUI (FE) ȘI/SAU MANGANULUI (MN) ÎN TIMPUL RĂSPUNSULUI DE APĂRARE (OREZ). ÎN PLUS, VA FI STUDIATĂ INTERACȚIUNEA DINTRE CĂILE DE SEMNALIZARE ALE P ȘI CREDINȚEI/MN IMPLICATE ÎN FENOTIPUL REZISTENȚEI/SUSCEPTIBILITĂȚII PLANTELOR CA RĂSPUNS LA INFECȚIE. ÎN GRUPUL NOSTRU SE STUDIAZĂ PATOSISTEMELE ADECVATE PENTRU ACESTE STUDII: OREZ/MAGNAPORTHE ORYZAE ȘI ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. PE DE ALTĂ PARTE, ÎN LITERATURA DE SPECIALITATE S-A DESCRIS CĂ ANUMITE MIRNA ȘI SIRNA POT FI TRANSPORTATE ȘI ACȚIONEAZĂ ÎN ALTE ORGANISME DECÂT CEL DIN CARE PROVIN (TRANS-KINGDOM CROSS-TALK). ÎN ACEST PROIECT VOM ANALIZA DACĂ EXISTĂ UN REGULAMENT MEDIAT DE MIRNA ÎNTRE SPECII ÎN PROCESELE DE REZISTENȚĂ LA AGENȚII PATOGENI DIN OREZ. ACEST PROIECT ACOPERĂ TEHNICI DE ANALIZĂ GENETICĂ DIRECTĂ ȘI INVERSĂ, SECVENȚIERE ÎN MASĂ ȘI ANALIZĂ BIOINFORMATICĂ, ANALIZĂ CITOLOGICĂ ȘI HISTOLOGICĂ, PRECUM ȘI IDENTIFICAREA COMPLEXELOR MIRNA-AGO ÎN TIMPUL PROCESELOR DE INTERACȚIUNE PLANTĂ-PATOGEN. DISPONIBILITATEA PROTOCOALELOR ȘI A INSTRUMENTELOR DE LUCRU NE PUNE ÎNTR-UN BUN PUNCT DE PLECARE PENTRU ATINGEREA ACESTOR OBIECTIVE. ÎN CAZUL ÎN CARE SE OBȚIN REZULTATE POZITIVE, S-AR DEMONSTRA CĂ MIRNA ACȚIONEAZĂ CA ELEMENTE DE LEGĂTURĂ CARE REGLEMENTEAZĂ EXPRESIA GENICĂ PENTRU CONTROLUL RĂSPUNSURILOR IMUNE ȘI AL HOMEOSTAZEI NUTRIENȚILOR ÎN TIMPUL INFECȚIEI CU AGENȚI PATOGENI. REZULTATELE OBȚINUTE ȘI CUNOȘTINȚELE GENERATE ÎN CADRUL ACESTUI PROIECT VOR CONTRIBUI LA STABILIREA DE NOI CONCEPTE ÎN STUDIILE DE INTERACȚIUNE PLANTĂ/PATOGENĂ. ACEST LUCRU VA CONTRIBUI LA DEFINIREA DE NOI STRATEGII DE ÎMBUNĂTĂȚIRE A REZISTENȚEI PLANTELOR LA INFECȚIA CU AGENȚI PATOGENI, CEEA CE VA BENEFICIA ÎN CELE DIN URMĂ DE PROGRAME DE ÎMBUNĂTĂȚIRE A SPECIILOR DE INTERES AGRONOMIC. (Romanian)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    V NARAVI SO RASTLINE IZPOSTAVLJENE ŠTEVILNIM NEUGODNIM OKOLJSKIM RAZMERAM, VKLJUČNO Z BIOTIČNIM IN ABIOTSKIM STRESOM. ZA PRILAGODITEV IN PREMAGOVANJE TAKŠNIH POGOJEV RASTLINE RAZVIJEJO OBRAMBNE MEHANIZME, KI JIM OMOGOČAJO, DA SE NA NAJBOLJ PRIMEREN NAČIN ODZOVEJO NA VSAKO VRSTO STRESA. ZA TO SO POTREBNI IZPOPOLNJENI KOMUNIKACIJSKI MEHANIZMI MED SIGNALNIMI POTMI, KI JIH SPROŽIJO ZUNANJI DEJAVNIKI, KI OMOGOČAJO USKLAJEN ODZIV V OBRATU. ZNANO JE, DA SO MIKRORNA (MIRNA) REGULATORJI GENSKEGA IZRAŽANJA V RAZLIČNIH RAZVOJNIH PROCESIH, PA TUDI PRI PRILAGODLJIVIH ODZIVIH NA STRES V OKOLJU. MIRNA OMOGOČAJO HITRE IN VČASIH ZELO SPECIFIČNE ODZIVE, ZATO SO KLJUČNI ELEMENTI ZA PRAVILNO PRILAGODITEV GENSKEGA IZRAŽANJA V PROCESIH ODPORNOSTI NA PATOGENE, PA TUDI V KOMUNIKACIJSKIH PROCESIH PRI ODZIVANJU NA RAZLIČNE VRSTE STRESA. TA PROJEKT OBRAVNAVA TO TEMO IN ODGOVARJA NA NOVO VPRAŠANJE O POVEZOVANJU PROCESOV MED PRILAGAJANJEM RAZLIČNIM OKOLJSKIM STRESOM: VLOGA MIRNE V OBRAMBNEM ODZIVU IN V NJIHOVI INTERAKCIJI S PREHRANSKIM STRESOM V RASTLINAH. TE ŠTUDIJE SE BODO IZVAJALE V RIŽEVIH RASTLINAH IN ARABIDOPSISU, DVEH VZORČNIH RASTLINAH ZA ŠTUDIJE FUNKCIONALNE GENOMIKE PRI MONOKOTILEDONIH IN DIKOTILEDONIH TER PREDSTAVLJAJO NADALJEVANJE SEDANJEGA PROJEKTA (BIO2012–32838). PREDLAGA SE ZLASTI, DA SE: I) OPREDELITEV POMENA MIR399 IN MIR827 V INTERAKCIJI MED POTJO SIGNALIZACIJE FOSFATOV (P) IN IMUNSKIM ODZIVOM (RIŽ, ARABIDOPSIS) IN II) ZA UGOTAVLJANJE VLOGE MIR7695, SPECIFIČNEGA RIŽA MIRNE, OPREDELJENE V NAŠI SKUPINI, PRI NADZORU HOMEOSTAZE ŽELEZA (FE) IN/ALI MANGANA (MN) MED OBRAMBNIM ODZIVOM (RIŽ). POLEG TEGA BODO PROUČEVALI INTERAKCIJO MED SIGNALIZACIJSKIMI POTMI P IN VERA/MN, KI SODELUJEJO PRI FENOTIPU ODPORNOSTI/OBČUTLJIVOSTI RASTLIN KOT ODZIV NA OKUŽBO. V NAŠI SKUPINI SE PREUČUJEJO USTREZNI PATOSISTEMI ZA TE ŠTUDIJE: RIŽ/MAGNAPORTHE ORYZAE IN ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. PO DRUGI STRANI PA JE BILO V LITERATURI OPISANO, DA SE NEKATERE MIRNA IN SIRNA LAHKO PREVAŽAJO IN DELUJEJO V ORGANIZMIH, KI NISO TISTI, IZ KATERIH PRIHAJAJO (PREKRASNI POGOVOR). V TEM PROJEKTU BOMO ANALIZIRALI, ALI OBSTAJA UREDBA, KI JO POSREDUJE MIRNA MED VRSTAMI V PROCESIH ODPORNOSTI NA PATOGENE V RIŽU. TA PROJEKT ZAJEMA TEHNIKE NEPOSREDNE IN POVRATNE GENETSKE, SEKVENCIRANJA IN BIOINFORMATIČNE ANALIZE, CITOLOŠKE IN HISTOLOŠKE ANALIZE TER IDENTIFIKACIJO KOMPLEKSOV MIRNA-AGO MED PROCESI INTERAKCIJE MED RASTLINAMI IN PATOGENI. RAZPOLOŽLJIVOST PROTOKOLOV IN DELOVNIH ORODIJ NAS POSTAVLJA V DOBRO IZHODIŠČE ZA DOSEGANJE TEH CILJEV. ČE BI BILI REZULTATI POZITIVNI, BI DOKAZALI, DA MIRNAS DELUJE KOT POVEZOVALNI ELEMENTI, KI URAVNAVAJO GENSKI IZRAZ ZA NADZOR IMUNSKEGA ODZIVA IN HOMEOSTAZE HRANIL MED OKUŽBO S PATOGENOM. PRIDOBLJENI REZULTATI IN ZNANJE, PRIDOBLJENO V TEM PROJEKTU, BODO PRISPEVALI K VZPOSTAVITVI NOVIH KONCEPTOV V ŠTUDIJAH MEDSEBOJNEGA DELOVANJA RASTLIN/PATOGENOV. TO BO POMAGALO OPREDELITI NOVE STRATEGIJE ZA IZBOLJŠANJE ODPORNOSTI RASTLIN NA OKUŽBO S PATOGENI, KAR BO V KONČNI FAZI KORISTILO PROGRAMOM ZA IZBOLJŠANJE AGRONOMSKIH VRST. (Slovenian)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    ROŚLINY PRZYRODNICZE SĄ NARAŻONE NA LICZNE NIEKORZYSTNE WARUNKI ŚRODOWISKOWE, W TYM STRES BIOTYCZNY I ABIOTYCZNY. ABY DOSTOSOWAĆ I PRZEZWYCIĘŻYĆ TAKIE WARUNKI, ROŚLINY ROZWIJAJĄ MECHANIZMY OBRONNE, KTÓRE POZWALAJĄ IM REAGOWAĆ W NAJBARDZIEJ ODPOWIEDNI SPOSÓB NA KAŻDY RODZAJ STRESU. WYMAGA TO WYRAFINOWANYCH MECHANIZMÓW KOMUNIKACJI MIĘDZY DROGAMI SYGNALIZACYJNYMI ZAINICJOWANYMI PRZEZ CZYNNIKI ZEWNĘTRZNE, KTÓRE UMOŻLIWIAJĄ SKOORDYNOWANĄ REAKCJĘ W ZAKŁADZIE. MIKRORNA (MIRNA) SĄ ZNANE JAKO REGULATORY EKSPRESJI GENETYCZNEJ W RÓŻNYCH PROCESACH ROZWOJOWYCH, A TAKŻE W ADAPTACYJNYCH REAKCJACH NA STRES ŚRODOWISKOWY. MIRNA UMOŻLIWIAJĄ SZYBKIE, A CZASEM BARDZO SPECYFICZNE REAKCJE, DLATEGO SĄ KLUCZOWYMI ELEMENTAMI DLA PRAWIDŁOWEGO DOSTOSOWANIA EKSPRESJI GENETYCZNEJ W PROCESACH ODPORNOŚCI NA PATOGENY, A TAKŻE W PROCESACH KOMUNIKACYJNYCH W ODPOWIEDZI NA RÓŻNE RODZAJE STRESU. NINIEJSZY PROJEKT DOTYCZY TEGO TEMATU, ABY ODPOWIEDZIEĆ NA NOWE PYTANIE DOTYCZĄCE INTEGRACJI PROCESÓW PODCZAS ADAPTACJI DO RÓŻNYCH STRESÓW ŚRODOWISKOWYCH: ROLA MIRNY W ODPOWIEDZI OBRONNEJ I W ICH INTERAKCJI Z STRESEM ŻYWIENIOWYM W ROŚLINACH. BADANIA TE BĘDĄ PROWADZONE W UPRAWACH RYŻU I ARABIDOPSIS, DWÓCH MODELOWYCH ROŚLINACH DO BADAŃ GENOMU FUNKCJONALNEGO W MONOKOTYLEDONACH I DICOTYLEDONACH, I STANOWIĄ KONTYNUACJĘ OBECNEGO PROJEKTU (BIO2012-32838). W SZCZEGÓLNOŚCI PROPONUJE SIĘ, ABY: I) SCHARAKTERYZOWAĆ ZNACZENIE MIR399 I MIR827 W INTERAKCJI MIĘDZY FOSFORANOWYMI DROGAMI SYGNALIZACYJNYMI (P) A ODPOWIEDZIĄ IMMUNOLOGICZNĄ (RYŻ, ARABIDOPSIS) I II) W CELU USTALENIA ROLI MIR7695, SPECYFICZNEJ MIRNY RYŻU ZIDENTYFIKOWANEJ W NASZEJ GRUPIE, W KONTROLI HOMEOSTAZY ŻELAZA (FE) I/LUB MANGANU (MN) PODCZAS REAKCJI OBRONNEJ (RYŻ). PONADTO ZBADANA ZOSTANIE INTERAKCJA MIĘDZY DROGAMI SYGNALIZACYJNYMI P A WIARĄ/MN ZAANGAŻOWANYMI W FENOTYP OPORNOŚCI/PODATNOŚCI ROŚLIN W ODPOWIEDZI NA ZAKAŻENIE. W NASZEJ GRUPIE BADANE SĄ ODPOWIEDNIE PATOSYSTEMY DLA TYCH BADAŃ: RYŻ/MAGNAPORTHE ORYZAE I ARABIDOPSIS/PLECTOSPHAERELLA CUCUMERINA. Z DRUGIEJ STRONY W LITERATURZE OPISANO, ŻE NIEKTÓRE MIRNA I SIRNA MOGĄ BYĆ TRANSPORTOWANE I DZIAŁAĆ W ORGANIZMACH INNYCH NIŻ TE, Z KTÓRYCH POCHODZĄ (TRANS-KINGDOM CROSS-TALK). W RAMACH TEGO PROJEKTU ZBADAMY, CZY ISTNIEJE ROZPORZĄDZENIE, W KTÓRYM POŚREDNICZĄ MIRNA MIĘDZY GATUNKAMI W PROCESACH ODPORNOŚCI NA PATOGENY W RYŻU. PROJEKT TEN OBEJMUJE TECHNIKI BEZPOŚREDNIEJ I ODWROTNEJ GENETYKI, SEKWENCJONOWANIA MASOWEGO I ANALIZY BIOINFORMATYCZNEJ, ANALIZY CYTOLOGICZNEJ I HISTOLOGICZNEJ ORAZ IDENTYFIKACJI KOMPLEKSÓW MIRNA-AGO PODCZAS PROCESÓW INTERAKCJI ROŚLIN-PATOGENÓW. DOSTĘPNOŚĆ PROTOKOŁÓW I NARZĘDZI PRACY STAWIA NAS W DOBRYM PUNKCIE WYJŚCIA DO OSIĄGNIĘCIA TYCH CELÓW. W PRZYPADKU UZYSKANIA POZYTYWNYCH WYNIKÓW WYKAZANO BY, ŻE MIRNAS ACT JAKO ELEMENTY ŁĄCZĄCE REGULUJĄCE EKSPRESJĘ GENICZNĄ W CELU KONTROLI ODPOWIEDZI IMMUNOLOGICZNYCH I HOMEOSTAZY SKŁADNIKÓW ODŻYWCZYCH PODCZAS ZAKAŻENIA PATOGENEM. UZYSKANE WYNIKI I WIEDZA UZYSKANA W RAMACH TEGO PROJEKTU PRZYCZYNIĄ SIĘ DO OPRACOWANIA NOWYCH KONCEPCJI W BADANIACH INTERAKCJI ROŚLIN/PATOGENÓW. POMOŻE TO ZDEFINIOWAĆ NOWE STRATEGIE POPRAWY ODPORNOŚCI ROŚLIN NA ZAKAŻENIE PATOGENEM, CO OSTATECZNIE PRZYNIESIE KORZYŚCI PROGRAMOM POPRAWY W ODNIESIENIU DO GATUNKÓW O ZNACZENIU AGRONOMICZNYM. (Polish)
    point in time
    18 August 2022
    0 references
    location (string)
    Cerdanyola del Vallès
    0 references
    date of last update
    20 December 2023
    0 references

    Identifiers

    Spanish Kohesio ID
    BIO2015-67212-R
    0 references
     
    Retrieved from "https://linkedopendata.eu/w/index.php?title=Item:Q3194714&oldid=41121543"