GENOMIC AND EVOLUTION OF ANTIBIOTIC-RESISTANT BACTERIA: FROM MOLECULAR EPIDEMIOLOGY TO PHYLOGENOMICS (Q3193769)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3193769 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | GENOMIC AND EVOLUTION OF ANTIBIOTIC-RESISTANT BACTERIA: FROM MOLECULAR EPIDEMIOLOGY TO PHYLOGENOMICS |
Project Q3193769 in Spain |
Statements
105,415.2 Euro
0 references
193,600.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2018
0 references
31 December 2021
0 references
UNIVERSIDAD DE VALENCIA
0 references
46980
0 references
LA RESISTENCIA A LOS ANTIBIOTICOS REPRESENTA UNA DE LAS MAYORES AMENAZAS A LA SALUD PUBLICA MUNDIAL. NUESTRO GRUPO DE INVESTIGACION TRABAJA DESDE HACE AÑOS EN LA APLICACION DE LOS METODOS Y CONCEPTOS DE LA EVOLUCION Y GENETICA DE POBLACIONES MOLECULAR AL ESTUDIO DE MICROORGANISMOS PATOGENOS, EN LO QUE SE CONOCE COMO EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR. ADEMAS DE TRABAJAR EN CUESTIONES DE INTERES CIENTIFICO, TOMAMOS PROBLEMAS Y DEVOLVEMOS RESULTADOS RELEVANTES A LAS AUTORIDADES SANITARIAS, LOGRANDO UNA INTERESANTE APLICACION DE UNA DISCIPLINA BIOLOGICA BASICA. EN ESTE CONTEXTO, EN ESTE PROYECTO NOS PLANTEAMOS ESTUDIAR UNA AMPLIA COLECCION PROSPECTIVA DE AISLADOS DE UNA BACTERIA DE GRAN INTERES PARA LA SALUD PUBLICA, KLEBSIELLA PNEUMONIAE, PARA ANALIZAR LOS PROCESOS EVOLUTIVOS QUE AFECTAN A SU DINAMICA EN LA POBLACION DE LA COMUNIDAD VALENCIANA, CON ESPECIAL INTERES EN CEPAS RESISTENTES A ANTIBIOTICOS. POR SU RELEVANCIA CLINICA Y PARA LA SALUD PUBLICA, NOS CENTRAREMOS EN CEPAS PRODUCTORAS DE BETA-LACTAMASAS DE ESPECTRO EXTENDIDO Y/O CARBAPENEMASAS. MUCHOS DE LOS GENES RESPONSABLES DE ESTOS FENOTIPOS SE LOCALIZAN EN PLASMIDOS QUE SON FACILMENTE TRANSFERIDOS ENTRE CEPAS DE K. PNEUMONIAE Y QUE TAMBIEN PUEDEN LLEGAR A ELLA DESDE OTRAS ESPECIES. POR TANTO, UN OBJETIVO ADICIONAL PERO ESTRECHAMENTE RELACIONADO CON EL ANTERIOR SERA LA CARACTERIZACION DE ESTOS PLASMIDOS, SU DINAMICA DE MOVILIZACION Y, DE FORMA MAS NOVEDOSA, LAS CONSECUENCIAS ADAPTATIVAS DE LA MISMA REFLEJADAS EN LAS SECUENCIAS DE SUS GENOMAS. NOS INTERESAN, PARTICULARMENTE, LAS INTERACCIONES ESTABLECIDAS ENTRE GENES DE LOS PLASMIDOS Y ENTRE ELLOS Y LOS DEL CROMOSOMA BACTERIANO, LO QUE CONOCEMOS COMO ESPISTASIAS. QUEREMOS ESTUDIAR LA RELEVANCIA DE LAS EPISTASIAS EN EL ESTABLECIMIENTO Y EXPANSION DE MULTIRRESISTENCIAS A ANTIBIOTICOS. ESTE ASPECTO TAMBIEN SERA ABORDADO CON UN DISEÑO MUY DIFERENTE, DE EVOLUCION EXPERIMENTAL EN CULTIVOS DE LABORATORIO. PARA ELLO TRABAJAREMOS CON VARIOS LINAJES EVOLUTIVOS PERO DE INTERES EPIDEMIOLOGICO DE K. PNEUMONIAE, INCORPORANDO UN NIVEL ADICIONAL DE COMPLEJIDAD, EL FONDO GENOMICO, EN EL ANALISIS DE LAS EPISTASIAS. NUESTRO CUARTO Y ULTIMO OBJETIVO PARTE DE RESULTADOS OBTENIDOS CON TREPONEMA PALLIDUM EN EL ACTUAL PROYECTO BFU2014-58656-R Y EN EL NOS PLANTEAMOS ANALIZAR EL PAPEL DE LA RECOMBINACION Y LA SELECCION EN LA EXPANSION EPIDEMICA DE UN CLON DE LA SUBESPECIE T. PALLIDUM PALLIDUM, AGENTE CAUSAL DE LA SIFILIS, QUE ES RESISTENTE A LA AZITROMICINA, ANTIBIOTICO QUE NO SE USA HABITUALMENTE EN LAS INFECCIONES DE ESTA BACTERIA PERO QUE ES DE USO FRECUENTE EN EL TRATAMIENTO DE OTRAS ITS, COMO GONORREA Y CLAMIDIASIS. EN RESUMEN, EL PROYECTO COMBINARA EL ESTUDIO A GRAN ESCALA DE GENOMAS BACTERIANOS, LA EVOLUCION EXPERIMENTAL, Y LA EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR Y EVOLUTIVA PARA ESTUDIAR LA DINAMICA EPIDEMICA Y DE MOVILIZACION DE GENES DE RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS EN LA COMUNIDAD VALENCIANA. LOS RESULTADOS ESPERABLES SON RELEVANTES PARA LAS AUTORIDADES REGIONALES DE SALUD PUBLICA A LA VEZ QUE CONTRIBUIRAN A NUESTRO CONOCIMIENTO BASICO DE LA EVOLUCION DE LAS MULTIRRESISTENCIAS A ANTIBIOTICOS (Spanish)
0 references
ANTIBIOTIC RESISTANCE IS ONE OF THE MAJOR THREATS FOR PUBLIC HEALTH. OUR RESEARCH GROUP HAS BEEN WORKING FOR MANY YEARS IN THE APPLICATION OF EVOLUTION AND POPULATION GENETICS METHODS TO STUDY PATHOGENIC MICROORGANISMS, IN WHAT IS KNOWN AS MOLECULAR EPIDEMIOLOGY. APART FROM WORKING ON SCIENTIFICALLY RELEVANT QUESTIONS, WE INCORPORATE PROBLEMS FROM AND RETURN RELEVANT RESULTS TO PUBLIC HEALTH AUTHORITIES, THUS ACHIEVING AN INTERESTING AND FRUTIFUL APPLICATION OF A BASIC BIOLOGICAL DISCIPLINE. IN THIS CONTEXT, THIS PROJECT IS AIMED AT STUDYING A LARGE PROSPECTIVE COLLECTION OF ISOLATES OF A CLINICALLY AND PUBLIC HEALTH RELEVANT BACTERIUM, KLEBSIELLA PNEUMONIAE, TO ANALYZE THE EVOLUTIONARY PROCESSES THAT AFFECT ITS DYNAMICS IN THE COMUNIDAD VALENCIANA, WITH A SPECIAL INTEREST IN ANTIBIOTIC RESISTANT STRAINS. BECAUSE OF THEIR CLINICAL AND PUBLIC HEALTH RELEVANCE, WE WILL FOCUS IN EXTENDED-SPECTRUM BETA-LACTAMASE AND/OR CARBAPENEMASE PRODUCING STRAINS. MANY OF THE GENES RESPONSIBLE FOR THESE PHENOTYPES ARE LOCATED ON PLASMIDS THAT CAN BE EASILY TRANSFERRED AMONG K. PNEUMONIAE STRAINS OR FROM OTHER SPECIES INTO THEM. CONSEQUENTLY, A SEPARATE BUT CLOSELY RELATED GOAL WILL BE THE CHARACTERIZATION OF THESE PLASMIDS, THEIR MOBILIZATION DYNAMICS BUT, AS A NOVELTY, ITS ADAPTIVE CONSEQUENCES AS THEY ARE REFLECTED IN THEIR GENOME SEQUENCES. WE ARE PARTICULARLY INTERESTED IN THE INTERACTIONS BETWEEN PLASMID GENES AND BETWEEN THESE AND THOSE IN THE BACTERIAL CHROMOSOME, WHAT IS KNOWN AS EPISTASIS. WE WANT TO STUDY THE RELEVANCE OF EPISTASIS IN THE ESTABLISHMENT AND EXPANSION ON MULTIRRESISTANCE TO ANTIBIOTICS. THIS POINT WILL ALSO BE ADDRESSED WITH A VERY DIFFERENT APPROACH, USING EXPERIMENTAL EVOLUTION IN LABORATORY CULTURES. IN THIS GOAL, WE WILL WORK WITH SEVERAL EVOLUTIONARY LINEAGES, WHICH WILL ALLOW US TO INCORPORATE AN ADDITIONAL LEVEL OF COMPLEXITY TO THE ANALYSIS OF EPISTASIS, THE GENOMIC BACKGROUND. OUR FOURTH AND LAST GOAL STEMS FROM PREVIOUS RESULTS IN THE CURRENT PROJECT BFU2014-58656-R WITH TREPONEMA PALLIDUM. WE WILL ANALYZE THE ROLE OF RECOMBINATION AND NATURAL SELECTION IN THE EPIDEMIC EXPANSION OF A CLONAL LINEAGE OF THE SUBSPECIES T. PALLIDUM PALLIDUM, THE CAUSAL AGENT OF SYPHILIS, WHICH IS RESITANT TO AZYTROMICIN. THIS ANTIBIOTIC IS NOT USED REGULARLY TO FIGHT THE INFECTIONS BY THIS BACTERIUM BUT IT IS FREQUENTLY USED IN THE TREATMENT OF OTHER STIS, SUCH AS GONORRHOEAE AND CHLAMYDIASIS. TO SUMMARIZE, THIS PROJECT WILL COMBINE LARGE-SCALE ANALYSES OF BACTERIAL GENOMES, EXPERIMENTAL EVOLUTION, AND MOLECULAR AND EVOLUTIONARY EPIDEMIOLOGY TO STUDY THE EPIDEMIC DYNAMICS AND MOBILIZATION OF ANTIBIOTIC RESISTANCE GENES IN THE COMUNIDAD VALENCIANA. THE EXPECTED RESULTS ARE RELEVANT FOR PUBLIC HEALTH AUTHORITIES AND, SIMULTANEOUSLY, WILL CONTRIBUTE TO OUR BASIC KNOWLEDGE ABOUT THE EVOLUTION OF MULTIPLE RESISTANCES TO ANTIBIOTICS. (English)
0.6826559132451946
0 references
LA RÉSISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES REPRÉSENTE L’UNE DES PLUS GRANDES MENACES À LA SANTÉ PUBLIQUE DANS LE MONDE. NOTRE GROUPE DE RECHERCHE TRAVAILLE DEPUIS DES ANNÉES SUR L’APPLICATION DE MÉTHODES ET DE CONCEPTS DE L’ÉVOLUTION ET DE LA GÉNÉTIQUE DES POPULATIONS MOLÉCULAIRES À L’ÉTUDE DES MICROORGANISMES PATHOGÈNES, EN ÉPIDÉMIOLOGIE MOLÉCULAIRE. EN PLUS DE TRAVAILLER SUR DES QUESTIONS D’INTÉRÊT SCIENTIFIQUE, NOUS PRENONS DES PROBLÈMES ET RENVOYONS LES RÉSULTATS PERTINENTS AUX AUTORITÉS SANITAIRES, EN RÉALISANT UNE APPLICATION INTÉRESSANTE D’UNE DISCIPLINE BIOLOGIQUE DE BASE. DANS CE CONTEXTE, DANS CE PROJET, NOUS AVONS L’INTENTION D’ÉTUDIER UNE VASTE COLLECTION PROSPECTIVE D’ISOLATS D’UNE BACTÉRIE D’UN GRAND INTÉRÊT POUR LA SANTÉ PUBLIQUE, KLEBSIELLA PNEUMONIAE, AFIN D’ANALYSER LES PROCESSUS ÉVOLUTIFS QUI AFFECTENT SA DYNAMIQUE DANS LA POPULATION DE LA COMMUNAUTÉ VALENCIENNE, AVEC UN INTÉRÊT PARTICULIER POUR LES SOUCHES RÉSISTANTES AUX ANTIBIOTIQUES. EN RAISON DE LEUR PERTINENCE CLINIQUE ET DE SANTÉ PUBLIQUE, NOUS NOUS CONCENTRERONS SUR LES SOUCHES PRODUISANT DES BÊTA-LACTAMASSES DE SPECTRE ÉTENDU ET/OU DE CARBAPÉNÈMES. BON NOMBRE DES GÈNES RESPONSABLES DE CES PHÉNOTYPES SE TROUVENT DANS LE PLASMAIDS QUI SONT FACILEMENT TRANSFÉRÉS ENTRE LES SOUCHES DE K. PNEUMONIAE ET PEUVENT ÉGALEMENT L’ATTEINDRE À PARTIR D’AUTRES ESPÈCES. PAR CONSÉQUENT, UN OBJECTIF SUPPLÉMENTAIRE MAIS ÉTROITEMENT LIÉ AU PRÉCÉDENT SERA LA CARACTÉRISATION DE CES PLASMAIDES, LEUR DYNAMIQUE DE MOBILISATION ET, PLUS RÉCEMMENT, LEURS CONSÉQUENCES ADAPTATIVES REFLÉTÉES DANS LES SÉQUENCES DE SES GÉNOMES. NOUS SOMMES PARTICULIÈREMENT INTÉRESSÉS PAR LES INTERACTIONS ÉTABLIES ENTRE LES GÈNES PLASMAID ET ENTRE EUX ET CEUX DU CHROMOSOME BACTÉRIEN, CE QUE NOUS APPELONS SPISTASIAS. NOUS VOULONS ÉTUDIER LA PERTINENCE D’EPISTASIAS DANS L’ÉTABLISSEMENT ET L’EXPANSION DE LA MULTIRÉSISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES. CET ASPECT SERA ÉGALEMENT ABORDÉ AVEC UNE CONCEPTION TRÈS DIFFÉRENTE, DE L’ÉVOLUTION EXPÉRIMENTALE DANS LES CULTURES DE LABORATOIRE. POUR CELA, NOUS TRAVAILLERONS AVEC PLUSIEURS LIGNÉES ÉVOLUTIVES MAIS ÉPIDÉMIOLOGIQUES DE K. PNEUMONIAE, INTÉGRANT UN NIVEAU SUPPLÉMENTAIRE DE COMPLEXITÉ, LE FONDS GÉNOMIQUE, DANS L’ANALYSE DE L’EPISTASIAS. NOTRE QUATRIÈME ET DERNIER OBJECTIF EST BASÉ SUR LES RÉSULTATS OBTENUS AVEC TREPONEMA PALLIDUM DANS LE PROJET ACTUEL BFU2014-58656-R ET NOUS ENVISAGEONS D’ANALYSER LE RÔLE DE LA RECOMBINAISON ET LA SÉLECTION DANS L’EXPANSION ÉPIDÉMIQUE D’UN CLONE DE LA SOUS-ESPÈCE T. PALLIDUM PALLIDUM, AGENT CAUSAL DE SIPHILIS, QUI EST RÉSISTANT À L’AZITHROMYCINE, UN ANTIBIOTIQUE QUI N’EST PAS COURAMMENT UTILISÉ DANS LES INFECTIONS DE CETTE BACTÉRIE, MAIS QUI EST FRÉQUEMMENT UTILISÉ DANS LE TRAITEMENT D’AUTRES ITS, COMME LA GONORRHÉE ET LA CHLAMYDIA. EN BREF, LE PROJET COMBINERA L’ÉTUDE À GRANDE ÉCHELLE DES GÉNOMES BACTÉRIENS, DE L’ÉVOLUTION EXPÉRIMENTALE ET DE L’ÉPIDÉMIOLOGIE MOLÉCULAIRE ET ÉVOLUTIVE POUR ÉTUDIER LA DYNAMIQUE ÉPIDÉMIQUE ET LA MOBILISATION DES GÈNES DE RÉSISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES DANS LA COMMUNAUTÉ VALENCIENNE. LES RÉSULTATS ESCOMPTÉS SONT PERTINENTS POUR LES AUTORITÉS RÉGIONALES DE SANTÉ PUBLIQUE TOUT EN CONTRIBUANT À NOS CONNAISSANCES DE BASE SUR L’ÉVOLUTION DE LA MULTIRÉSISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES (French)
4 December 2021
0 references
ANTIBIOTIKARESISTENZ STELLT EINE DER GRÖSSTEN BEDROHUNGEN FÜR DIE ÖFFENTLICHE GESUNDHEIT WELTWEIT DAR. UNSERE FORSCHUNGSGRUPPE BESCHÄFTIGT SICH SEIT JAHREN MIT DER ANWENDUNG VON METHODEN UND KONZEPTEN DER EVOLUTION UND GENETIK VON MOLEKULAREN POPULATIONEN AUF DIE ERFORSCHUNG PATHOGENER MIKROORGANISMEN, IN DER SOGENANNTEN MOLEKULAREN EPIDEMIOLOGIE. NEBEN DER ARBEIT AN FRAGEN VON WISSENSCHAFTLICHEN INTERESSE NEHMEN WIR PROBLEME UND GEBEN RELEVANTE ERGEBNISSE AN DIE GESUNDHEITSBEHÖRDEN ZURÜCK, UM EINE INTERESSANTE ANWENDUNG EINER GRUNDLEGENDEN BIOLOGISCHEN DISZIPLIN ZU ERREICHEN. IN DIESEM ZUSAMMENHANG WOLLEN WIR IN DIESEM PROJEKT EINE BREITE PROSPEKTIVE SAMMLUNG VON ISOLATEN VON BAKTERIEN VON GROSSEM INTERESSE FÜR DIE ÖFFENTLICHE GESUNDHEIT, KLEBSIELLA PNEUMONIAE, UNTERSUCHEN, UM DIE EVOLUTIONÄREN PROZESSE ZU ANALYSIEREN, DIE IHRE DYNAMIK IN DER BEVÖLKERUNG DER VALENCIANISCHEN GEMEINSCHAFT BEEINFLUSSEN, MIT BESONDEREM INTERESSE AN ANTIBIOTIKARESISTENTEN STÄMMEN. AUFGRUND IHRER KLINISCHEN UND GESUNDHEITLICHEN RELEVANZ WERDEN WIR UNS AUF STÄMME KONZENTRIEREN, DIE BETA-LACTAMASSES VON ERWEITERTEM SPEKTRUM UND/ODER CARBAPENEMASEN PRODUZIEREN. VIELE DER FÜR DIESE PHÄNOTYPEN VERANTWORTLICHEN GENE BEFINDEN SICH IN PLASMAIDS, DIE LEICHT ZWISCHEN K. PNEUMONIAE STÄMMEN ÜBERTRAGEN WERDEN UND SIE AUCH VON ANDEREN ARTEN ERREICHEN KÖNNEN. DAHER WIRD EIN ZUSÄTZLICHES ZIEL, ABER ENG MIT DEM VORHERIGEN VERBUNDEN SEIN, DIE CHARAKTERISIERUNG DIESER PLASMAIDES, IHRE DYNAMIK DER MOBILISIERUNG UND, MEHR NOVELLY, DIE ADAPTIVEN FOLGEN, DIE SICH IN DEN SEQUENZEN IHRER GENOME WIDERSPIEGELN. WIR INTERESSIEREN UNS BESONDERS FÜR DIE ETABLIERTEN WECHSELWIRKUNGEN ZWISCHEN PLASMAID-GENEN UND ZWISCHEN IHNEN UND DENEN DES BAKTERIELLEN CHROMOSOMS, WAS WIR ALS SPISTASIAS KENNEN. WIR WOLLEN DIE RELEVANZ VON EPISTASIAS FÜR DIE ETABLIERUNG UND AUSWEITUNG VON MULTIRESISTENZ GEGENÜBER ANTIBIOTIKA UNTERSUCHEN. DIESER ASPEKT WIRD AUCH MIT EINEM GANZ ANDEREN DESIGN, EXPERIMENTELLER EVOLUTION IN LABORKULTUREN BEHANDELT WERDEN. DAZU WERDEN WIR MIT MEHREREN EVOLUTIONÄREN, ABER EPIDEMIOLOGISCHEN LINIEN VON K. PNEUMONIAE ZUSAMMENARBEITEN, DIE EINE ZUSÄTZLICHE KOMPLEXITÄT, DEN GENOMISCHEN FONDS, IN DIE ANALYSE DES EPISTASIAS EINBEZIEHEN. UNSER VIERTES UND LETZTES ZIEL BASIERT AUF DEN ERGEBNISSEN, DIE MIT TREPONEMA PALLIDUM IM AKTUELLEN PROJEKT BFU2014-58656-R ERZIELT WURDEN, UND WIR BETRACHTEN DIE ANALYSE DER ROLLE DER REKOMBINATION UND DER AUSWAHL BEI DER EPIDEMIEAUSDEHNUNG EINES KLONS DER UNTERART T. PALLIDUM PALLIDUM, KAUSALES MITTEL VON SIPHILIS, DAS GEGEN AZITHROMYCIN RESISTENT IST, EIN ANTIBIOTIKUM, DAS NICHT HÄUFIG BEI INFEKTIONEN DIESER BAKTERIEN VERWENDET WIRD, ABER HÄUFIG ZUR BEHANDLUNG ANDERER STIS, WIE GONORRHOE UND CHLAMYDIA, VERWENDET WIRD. KURZ GESAGT, DAS PROJEKT WIRD DIE GROSS ANGELEGTE STUDIE BAKTERIELLER GENOME, EXPERIMENTELLER EVOLUTION UND MOLEKULARER UND EVOLUTIONÄRER EPIDEMIOLOGIE KOMBINIEREN, UM EPIDEMIENDYNAMIK UND MOBILISIERUNG VON ANTIBIOTIKARESISTENZGENEN IN DER VALENCIANER GEMEINSCHAFT ZU UNTERSUCHEN. ERWARTETE ERGEBNISSE SIND FÜR DIE REGIONALEN GESUNDHEITSBEHÖRDEN RELEVANT UND TRAGEN GLEICHZEITIG ZU UNSEREM GRUNDWISSEN ÜBER DIE ENTWICKLUNG DER MULTIRESISTENZ GEGENÜBER ANTIBIOTIKA BEI. (German)
9 December 2021
0 references
RESISTENTIE TEGEN ANTIBIOTICA IS EEN VAN DE GROOTSTE BEDREIGINGEN VOOR DE VOLKSGEZONDHEID TER WERELD. ONZE ONDERZOEKSGROEP WERKT AL JAREN AAN DE TOEPASSING VAN METHODEN EN CONCEPTEN VAN DE EVOLUTIE EN GENETISCHE VAN MOLECULAIRE POPULATIES OP DE STUDIE VAN PATHOGENE MICRO-ORGANISMEN, IN WAT BEKEND STAAT ALS MOLECULAIRE EPIDEMIOLOGIE. NAAST HET WERKEN AAN ZAKEN VAN WETENSCHAPPELIJK BELANG, NEMEN WE PROBLEMEN EN GEVEN WE RELEVANTE RESULTATEN TERUG NAAR DE GEZONDHEIDSAUTORITEITEN, WAARDOOR WE EEN INTERESSANTE TOEPASSING VAN EEN BIOLOGISCHE BASISDISCIPLINE BEREIKEN. IN DIT VERBAND ZIJN WIJ VOORNEMENS IN DIT PROJECT EEN BREDE PROSPECTIEVE VERZAMELING ISOLATEN TE BESTUDEREN VAN EEN BACTERIE DIE VAN GROOT BELANG IS VOOR DE VOLKSGEZONDHEID, KLEBSIELLA PNEUMONIAE, OM DE EVOLUTIONAIRE PROCESSEN TE ANALYSEREN DIE VAN INVLOED ZIJN OP DE DYNAMIEK ERVAN IN DE BEVOLKING VAN DE VALENCIAANSE GEMEENSCHAP, MET BIJZONDERE BELANGSTELLING VOOR STAMMEN DIE RESISTENT ZIJN TEGEN ANTIBIOTICA. VANWEGE HUN KLINISCHE EN VOLKSGEZONDHEIDSRELEVANTIE ZULLEN WE ONS RICHTEN OP STAMMEN DIE BÈTA-LACTAMASSES PRODUCEREN VAN UITGEBREID SPECTRUM EN/OF CARBAPENEMASEN. VEEL VAN DE GENEN DIE VERANTWOORDELIJK ZIJN VOOR DEZE FENOTYPES BEVINDEN ZICH IN PLASMAIDS DIE GEMAKKELIJK WORDEN OVERGEDRAGEN TUSSEN K. PNEUMONIAE STAMMEN EN KUNNEN HET OOK BEREIKEN VAN ANDERE SOORTEN. DAAROM IS EEN EXTRA DOELSTELLING, MAAR NAUW VERBONDEN MET DE VORIGE, DE KARAKTERISERING VAN DEZE PLASMAIDES, HUN MOBILISATIEDYNAMIEK EN, MEER NIEUW, DE ADAPTIEVE GEVOLGEN ERVAN WEERSPIEGELD IN DE SEQUENTIES VAN HAAR GENOOM. WE ZIJN VOORAL GEÏNTERESSEERD IN DE GEVESTIGDE INTERACTIES TUSSEN PLASMAID GENEN EN TUSSEN HEN EN DIE VAN HET BACTERIËLE CHROMOSOOM, WAT WE KENNEN ALS SPISTASIAS. WE WILLEN DE RELEVANTIE VAN EPISTASIAS BESTUDEREN BIJ HET TOT STAND BRENGEN EN UITBREIDEN VAN MULTIRESISTENTIE TEGEN ANTIBIOTICA. DIT ASPECT ZAL OOK WORDEN AANGEPAKT MET EEN HEEL ANDER ONTWERP, VAN EXPERIMENTELE EVOLUTIE IN LABORATORIUMCULTUREN. HIERVOOR ZULLEN WE WERKEN MET VERSCHILLENDE EVOLUTIONAIRE, MAAR EPIDEMIOLOGISCHE LINEAGES VAN K. PNEUMONIAE, MET EEN EXTRA COMPLEXITEIT, HET GENOMIC FUND, IN DE ANALYSE VAN HET EPISTASIAS. ONZE VIERDE EN LAATSTE DOELSTELLING IS GEBASEERD OP DE RESULTATEN VERKREGEN MET TREPONEMA PALLIDUM IN HET HUIDIGE PROJECT BFU2014-58656-R EN WE OVERWEGEN HET ANALYSEREN VAN DE ROL VAN RECOMBINATIE EN DE SELECTIE IN DE EPIDEMISCHE UITBREIDING VAN EEN KLOON VAN DE ONDERSOORT T. PALLIDUM PALLIDUM, CAUSAAL MIDDEL VAN SIPHILIS, DAT RESISTENT IS TEGEN AZITROMYCINE, EEN ANTIBIOTICUM DAT NIET VAAK WORDT GEBRUIKT BIJ INFECTIES VAN DEZE BACTERIËN, MAAR VAAK WORDT GEBRUIKT BIJ DE BEHANDELING VAN ANDERE SOA’S, ZOALS GONORROE EN CHLAMYDIA. KORTOM, HET PROJECT ZAL DE GROOTSCHALIGE STUDIE VAN BACTERIËLE GENEN, EXPERIMENTELE EVOLUTIE EN MOLECULAIRE EN EVOLUTIONAIRE EPIDEMIOLOGIE COMBINEREN OM DE EPIDEMIEDYNAMIEK EN DE MOBILISATIE VAN ANTIBIOTICARESISTENTIEGENEN IN DE VALENCIAANSE GEMEENSCHAP TE BESTUDEREN. DE VERWACHTE RESULTATEN ZIJN RELEVANT VOOR REGIONALE VOLKSGEZONDHEIDSINSTANTIES EN DRAGEN BIJ TOT ONZE BASISKENNIS VAN DE EVOLUTIE VAN MULTIRESISTENTIE TEGEN ANTIBIOTICA (Dutch)
17 December 2021
0 references
LA RESISTENZA AGLI ANTIBIOTICI RAPPRESENTA UNA DELLE MAGGIORI MINACCE PER LA SALUTE PUBBLICA A LIVELLO MONDIALE. IL NOSTRO GRUPPO DI RICERCA LAVORA DA ANNI SULL'APPLICAZIONE DI METODI E CONCETTI DELL'EVOLUZIONE E DELLA GENETICA DELLE POPOLAZIONI MOLECOLARI ALLO STUDIO DEI MICRORGANISMI PATOGENI, IN QUELLA CHE È CONOSCIUTA COME EPIDEMIOLOGIA MOLECOLARE. OLTRE A LAVORARE SU QUESTIONI DI INTERESSE SCIENTIFICO, PRENDIAMO PROBLEMI E RESTITUIAMO RISULTATI RILEVANTI ALLE AUTORITÀ SANITARIE, OTTENENDO UN'INTERESSANTE APPLICAZIONE DI UNA DISCIPLINA BIOLOGICA DI BASE. IN QUESTO CONTESTO, IN QUESTO PROGETTO INTENDIAMO STUDIARE UN'AMPIA RACCOLTA PROSPETTICA DI ISOLATI DI UN BATTERIO DI GRANDE INTERESSE PER LA SALUTE PUBBLICA, KLEBSIELLA PNEUMONIAE, PER ANALIZZARE I PROCESSI EVOLUTIVI CHE INFLUENZANO LE SUE DINAMICHE NELLA POPOLAZIONE DELLA COMUNITÀ VALENCIANA, CON PARTICOLARE INTERESSE PER CEPPI RESISTENTI AGLI ANTIBIOTICI. A CAUSA DELLA LORO RILEVANZA CLINICA E SANITARIA, CI CONCENTREREMO SU CEPPI CHE PRODUCONO BETA-LACTAMASSES DI SPETTRO ESTESO E/O CARBAPENEMASI. MOLTI DEI GENI RESPONSABILI DI QUESTI FENOTIPI SI TROVANO IN PLASMAIDS CHE SONO FACILMENTE TRASFERITI TRA I CEPPI K. PNEUMONIAE E POSSONO ANCHE RAGGIUNGERLO DA ALTRE SPECIE. PERTANTO, UN ULTERIORE OBIETTIVO MA STRETTAMENTE CORRELATO AL PRECEDENTE SARÀ LA CARATTERIZZAZIONE DI QUESTI PLASMAIDES, LA LORO DINAMICA DI MOBILITAZIONE E, PIÙ RECENTEMENTE, LE CONSEGUENZE ADATTATIVE DI ESSO RIFLESSE NELLE SEQUENZE DEI SUOI GENOMI. SIAMO PARTICOLARMENTE INTERESSATI ALLE INTERAZIONI CONSOLIDATE TRA I GENI PLASMAID E TRA LORO E QUELLE DEL CROMOSOMA BATTERICO, CIÒ CHE CONOSCIAMO COME SPISTASIAS. VOGLIAMO STUDIARE L'IMPORTANZA DI EPISTASIAS NELLA CREAZIONE E NELL'ESPANSIONE DELLA MULTIRESISTENZA AGLI ANTIBIOTICI. QUESTO ASPETTO SARÀ AFFRONTATO ANCHE CON UN DESIGN MOLTO DIVERSO, DI EVOLUZIONE SPERIMENTALE NELLE CULTURE DI LABORATORIO. PER QUESTO LAVOREREMO CON DIVERSI LIGNAGGI EVOLUTIVI MA EPIDEMIOLOGICI DI K. PNEUMONIAE, INCORPORANDO UN ULTERIORE LIVELLO DI COMPLESSITÀ, IL FONDO GENOMICO, NELL'ANALISI DELL'EPISTASIAS. IL NOSTRO QUARTO ED ULTIMO OBIETTIVO SI BASA SUI RISULTATI OTTENUTI CON TREPONEMA PALLIDUM NELL'ATTUALE PROGETTO BFU2014-58656-R E CONSIDERIAMO L'ANALISI DEL RUOLO DELLA RICOMBINAZIONE E DELLA SELEZIONE NELL'ESPANSIONE EPIDEMICA DI UN CLONE DELLA SOTTOSPECIE T. PALLIDUM PALLIDUM, AGENTE CAUSALE DI SIPHILIS, RESISTENTE ALL'AZITROMICINA, UN ANTIBIOTICO CHE NON È COMUNEMENTE USATO NELLE INFEZIONI DI QUESTO BATTERIO MA VIENE SPESSO UTILIZZATO NEL TRATTAMENTO DI ALTRE STI, COME LA GONORREA E LA CLAMIDIA. IN BREVE, IL PROGETTO UNIRÀ LO STUDIO SU LARGA SCALA DEI GENOMI BATTERICI, L'EVOLUZIONE SPERIMENTALE E L'EPIDEMIOLOGIA MOLECOLARE ED EVOLUTIVA PER STUDIARE LE DINAMICHE EPIDEMICHE E LA MOBILITAZIONE DEI GENI DELLA RESISTENZA AGLI ANTIBIOTICI NELLA COMUNITÀ DI VALENCIA. I RISULTATI ATTESI SONO RILEVANTI PER LE AUTORITÀ SANITARIE PUBBLICHE REGIONALI, CONTRIBUENDO NEL CONTEMPO ALLA NOSTRA CONOSCENZA DI BASE DELL'EVOLUZIONE DELLA RESISTENZA MULTIPLA AGLI ANTIBIOTICI (Italian)
16 January 2022
0 references
ANTIBIOOTIKUMIRESISTENTSUS ON ÜKS PEAMISI OHTE RAHVATERVISELE. MEIE UURIMISRÜHM ON TÖÖTANUD AASTAID EVOLUTSIOONI JA POPULATSIOONI GENEETIKA MEETODITE RAKENDAMISEL PATOGEENSETE MIKROORGANISMIDE UURIMISEKS, MIDA TUNTAKSE MOLEKULAAREPIDEMIOLOOGIANA. LISAKS TEADUSLIKULT OLULISTE KÜSIMUSTEGA TÖÖTAMISELE KAASAME TERVISHOIUASUTUSTE PROBLEEMID JA TAGASTAME NEILE ASJAKOHASED TULEMUSED, SAAVUTADES SEEGA HUVITAVA JA FRUTITIIVSE KOHALDAMISE BIOLOOGILISE PÕHIDISTSIPLIINI OSAS. SELLEGA SEOSES ON PROJEKTI EESMÄRK UURIDA KLIINILISELT JA RAHVATERVISE SEISUKOHAST OLULISE BAKTERI KLEBSIELLA PNEUMONIAE ISOLAATIDE SUURT TULEVIKKU SUUNATUD KOGUMIST, ET ANALÜÜSIDA ARENGUPROTSESSE, MIS MÕJUTAVAD SELLE DÜNAAMIKAT COMUNIDAD VALENCIANAS, PÖÖRATES ERILIST TÄHELEPANU ANTIBIOOTIKUMIRESISTENTSETELE TÜVEDELE. ARVESTADES NENDE KLIINILIST JA RAHVATERVISE TÄHTSUST, KESKENDUME LAIENDATUD SPEKTRIGA BEETALAKTAMAASILE JA/VÕI KARBAPENEMAASI TOOTVATELE TÜVEDELE. PALJUD NENDE FENOTÜÜPIDE EEST VASTUTAVAD GEENID ASUVAD PLASMIIDIDEL, MIDA ON LIHTNE K. PNEUMONIAE TÜVEDE VÕI TEISTE LIIKIDE VAHEL NEILE ÜLE KANDA. SELLEST TULENEVALT ON ERALDI, KUID TIHEDALT SEOTUD EESMÄRK NENDE PLASMIIDIDE ISELOOMUSTAMINE, NENDE MOBILISATSIOONIDÜNAAMIKA, KUID UUDSUSENA NENDE KOHANDUVAD TAGAJÄRJED, MIS KAJASTUVAD NENDE GENOOMI JÄRJESTUSTES. ME OLEME ERITI HUVITATUD KOOSTOIMETEST PLASMIIDI GEENIDE JA NENDE JA BAKTERIAALSE KROMOSOOMI VAHEL, MIDA NIMETATAKSE EPISTAASIKS. ME TAHAME UURIDA EPISTAASI ASJAKOHASUST MULTIRRESISTANCE’I LOOMISEL JA LAIENDAMISEL ANTIBIOOTIKUMIDELE. SEDA PUNKTI KÄSITLETAKSE KA VÄGA ERINEVA LÄHENEMISVIISIGA, KASUTADES KATSELIST ARENGUT LABORIKULTUURIDES. SELLE EESMÄRGI NIMEL TÖÖTAME MITME EVOLUTSIOONILISE LIINIGA, MIS VÕIMALDAB MEIL LISADA EPISTAASI, GENOOMILISE TAUSTA ANALÜÜSILE TÄIENDAVA KEERUKUSE TASEME. MEIE NELJAS JA VIIMANE EESMÄRK TULENEB PRAEGUSE PROJEKTI BFU2014–58656-R VARASEMATEST TULEMUSTEST TREPONEMA PALLIDUM’IGA. ANALÜÜSIME REKOMBINATSIOONI JA LOODUSLIKU VALIKU ROLLI AZYTROMICIN’I SUHTES RESÜFILISE PÕHJUSTAJA T. PALLIDUM PALLIDUM’I KLOONILIINI EPIDEEMIA LAIENDAMISEL. SEDA ANTIBIOOTIKUMI EI KASUTATA REGULAARSELT SELLE BAKTERI PÕHJUSTATUD INFEKTSIOONIDE VASTU VÕITLEMISEKS, KUID SEDA KASUTATAKSE SAGELI TEISTE SUGULISEL TEEL LEVIVATE NAKKUSTE RAVIKS, NAGU GONORRÖA JA KLAMÜÜDIAAS. KOKKUVÕTTES ÜHENDATAKSE SELLES PROJEKTIS BAKTERIAALSETE GENOOMIDE, EKSPERIMENTAALSE EVOLUTSIOONI NING MOLEKULAARSE JA EVOLUTSIOONILISE EPIDEMIOLOOGIA ULATUSLIKUD ANALÜÜSID, ET UURIDA EPIDEEMIA DÜNAAMIKAT JA ANTIBIOOTIKUMIRESISTENTSUSE GEENIDE MOBILISEERIMIST COMUNIDAD VALENCIANAS. OODATAVAD TULEMUSED ON OLULISED TERVISHOIUASUTUSTE JAOKS JA ANNAVAD SAMAL AJAL PANUSE MEIE PÕHITEADMISTESSE MITME ANTIBIOOTIKUMIRESISTENTSUSE ARENGU KOHTA. (Estonian)
4 August 2022
0 references
ATSPARUMAS ANTIBIOTIKAMS YRA VIENA IŠ DIDŽIAUSIŲ GRĖSMIŲ VISUOMENĖS SVEIKATAI. MŪSŲ MOKSLINIŲ TYRIMŲ GRUPĖ JAU DAUGELĮ METŲ DIRBA EVOLIUCIJOS IR POPULIACIJOS GENETIKOS METODŲ TAIKYMO PATOGENINIAMS MIKROORGANIZMAMS TIRTI, KAS YRA ŽINOMA KAIP MOLEKULINĖ EPIDEMIOLOGIJA. MES NE TIK DIRBAME MOKSLIŠKAI SVARBIAIS KLAUSIMAIS, BET IR ĮTRAUKIAME PROBLEMAS IŠ VISUOMENĖS SVEIKATOS INSTITUCIJŲ IR GRĄŽINAME JOMS AKTUALIUS REZULTATUS, TOKIU BŪDU PASIEKIAME ĮDOMŲ IR ŽIAURŲ PAGRINDINĖS BIOLOGINĖS DRAUSMĖS TAIKYMĄ. ATSIŽVELGIANT Į TAI, ŠIUO PROJEKTU SIEKIAMA IŠTIRTI DIDELĘ PERSPEKTYVINĘ KLINIŠKAI IR VISUOMENĖS SVEIKATAI SVARBIOS BAKTERIJOS KLEBSIELLA PNEUMONIAE IZOLIATŲ KOLEKCIJĄ, SIEKIANT IŠANALIZUOTI EVOLIUCINIUS PROCESUS, KURIE TURI ĮTAKOS JOS DINAMIKAI VALENSIJOS REGIONE, YPATINGĄ DĖMESĮ SKIRIANT ANTIBIOTIKAMS ATSPARIOMS PADERMĖMS. DĖL JŲ KLINIKINĖS IR VISUOMENĖS SVEIKATOS SVARBOS, MES DAUGIAUSIA DĖMESIO SKIRSIME IŠPLĖSTINIO SPEKTRO BETA LAKTAMAZEI IR (ARBA) KARBAPENEMAZĘ GAMINANČIOMS PADERMĖMS. DAUGELIS GENŲ, ATSAKINGŲ UŽ ŠIUOS FENOTIPUS, YRA ANT PLAZMIDŽIŲ, KURIUOS GALIMA LENGVAI PERKELTI TARP K. PNEUMONIAE PADERMIŲ ARBA IŠ KITŲ RŪŠIŲ Į JUOS. TODĖL ATSKIRAS, BET GLAUDŽIAI SUSIJĘS TIKSLAS BUS ŠIŲ PLAZMIDŽIŲ APIBŪDINIMAS, JŲ MOBILIZACIJOS DINAMIKA, BET, KAIP NAUJOVĖ, JOS PRISITAIKANTI PASEKMĖS, NES JOS ATSISPINDI JŲ GENOMO SEKOSE. MES YPAČ DOMISI PLAZMIDŽIŲ GENŲ SĄVEIKA IR TARP JŲ IR BAKTERIJŲ CHROMOSOMŲ, VADINAMŲJŲ EPISTAZIŲ, SĄVEIKA. NORIME IŠTIRTI EPISTAZĖS SVARBĄ KURIANT IR PLEČIANT ANTIBIOTIKUS MULTIRRESISTANCE. ŠIS KLAUSIMAS TAIP PAT BUS SPRENDŽIAMAS TAIKANT LABAI SKIRTINGĄ POŽIŪRĮ, TAIKANT EKSPERIMENTINĘ EVOLIUCIJĄ LABORATORINĖSE KULTŪROSE. ŠIUO TIKSLU DIRBSIME SU KELIOMIS EVOLIUCINĖMIS LINIJOMIS, KURIOS LEIS MUMS ĮTRAUKTI PAPILDOMĄ SUDĖTINGUMO LYGĮ Į EPISTAZIŲ, GENOMINIO FONO ANALIZĘ. MŪSŲ KETVIRTASIS IR PASKUTINIS TIKSLAS KYLA IŠ ANKSTESNIŲ REZULTATŲ DABARTINIAME PROJEKTE BFU2014–58656-R SU TREPONEMA PALLIDUM. MES ANALIZUOSIME REKOMBINACIJOS IR NATŪRALIOS ATRANKOS VAIDMENĮ EPIDEMIJAI PLEČIANT PORŪŠIO T. PALLIDUM PALLIDUM, PRIEŽASTINIO VEIKSNIO SIFILIUI, KURIS YRA ATSPARUS AZYTROMICIN, KLONINĘ LINIJĄ. ŠIS ANTIBIOTIKAS NĖRA REGULIARIAI NAUDOJAMAS KOVOJANT SU ŠIOS BAKTERIJOS INFEKCIJOMIS, TAČIAU DAŽNAI NAUDOJAMAS GYDANT KITAS STI, PVZ., GONORĖJA IR CHLAMIDIOZĖ. APIBENDRINANT, ŠIS PROJEKTAS APIMS DIDELIO MASTO BAKTERIJŲ GENOMŲ, EKSPERIMENTINĖS EVOLIUCIJOS IR MOLEKULINĖS BEI EVOLIUCINĖS EPIDEMIOLOGIJOS ANALIZĘ, SIEKIANT IŠTIRTI EPIDEMIJOS DINAMIKĄ IR ATSPARUMO ANTIBIOTIKAMS GENŲ SUTELKIMĄ VALENSIJOS KOMUNIDOJE. LAUKIAMI REZULTATAI YRA SVARBŪS VISUOMENĖS SVEIKATOS INSTITUCIJOMS IR TUO PAT METU PRISIDĖS PRIE MŪSŲ PAGRINDINIŲ ŽINIŲ APIE DAUGIALYPIO ATSPARUMO ANTIBIOTIKAMS RAIDĄ. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
OTPORNOST NA ANTIBIOTIKE JEDNA JE OD GLAVNIH PRIJETNJI JAVNOM ZDRAVLJU. NAŠA ISTRAŽIVAČKA GRUPA VEĆ DUGI NIZ GODINA RADI NA PRIMJENI METODA EVOLUCIJE I POPULACIJSKE GENETIKE ZA PROUČAVANJE PATOGENIH MIKROORGANIZAMA, U ONOME ŠTO JE POZNATO KAO MOLEKULARNA EPIDEMIOLOGIJA. OSIM RADA NA ZNANSTVENO RELEVANTNIM PITANJIMA, UKLJUČUJEMO I PROBLEME I VRAĆAMO RELEVANTNE REZULTATE TIJELIMA JAVNOG ZDRAVSTVA, ČIME POSTIŽEMO ZANIMLJIVU I ŠTEDLJIVU PRIMJENU OSNOVNE BIOLOŠKE DISCIPLINE. U TOM KONTEKSTU OVAJ JE PROJEKT USMJEREN NA PROUČAVANJE VELIKE PROSPEKTIVNE ZBIRKE IZOLATA BAKTERIJE KLEBSIELLA PNEUMONIAE RELEVANTNE ZA JAVNO ZDRAVLJE KAKO BI SE ANALIZIRALI EVOLUCIJSKI PROCESI KOJI UTJEČU NA NJEZINU DINAMIKU U COMUNIDAD VALENCIANI, S POSEBNIM INTERESOM ZA SOJEVE OTPORNE NA ANTIBIOTIKE. ZBOG NJIHOVE KLINIČKE I JAVNOZDRAVSTVENE VAŽNOSTI USREDOTOČIT ĆEMO SE NA SOJEVE KOJI PROIZVODE BETA-LAKTAMAZU I/ILI KARBAPENEMZU PROŠIRENOG SPEKTRA. MNOGI GENI ODGOVORNI ZA OVE FENOTIPOVE NALAZE SE NA PLAZMIDIMA KOJI SE LAKO MOGU PRENIJETI MEĐU SOJEVE K. PNEUMONIAE ILI IZ DRUGIH VRSTA U NJIH. STOGA ĆE POSEBAN, ALI USKO SRODAN CILJ BITI KARAKTERIZACIJA TIH PLASMIDA, NJIHOVA DINAMIKA MOBILIZACIJE, ALI, KAO NOVOST, NJEGOVE ADAPTIVNE POSLJEDICE KAO ŠTO SE OGLEDAJU U NJIHOVIM GENOMSKIM SEKVENCAMA. POSEBNO NAS ZANIMAJU INTERAKCIJE IZMEĐU GENA PLAZMIDA I IZMEĐU NJIH I ONIH U BAKTERIJSKIM KROMOSOMIMA, ŠTO JE POZNATO KAO EPISTAZA. ŽELIMO PROUČITI VAŽNOST EPISTAZE U USPOSTAVLJANJU I ŠIRENJU NA MULTIRRESISTANCE NA ANTIBIOTIKE. OVA TOČKA TAKOĐER ĆE SE RJEŠAVATI VRLO RAZLIČITIM PRISTUPOM, KORISTEĆI EKSPERIMENTALNU EVOLUCIJU U LABORATORIJSKIM KULTURAMA. U TOM ĆEMO CILJU RADITI S NEKOLIKO EVOLUCIJSKIH LINIJA, KOJE ĆE NAM OMOGUĆITI DA UKLJUČIMO DODATNU RAZINU SLOŽENOSTI U ANALIZU EPISTAZE, GENOMSKE POZADINE. NAŠ ČETVRTI I POSLJEDNJI CILJ PROIZLAZI IZ PRETHODNIH REZULTATA U TRENUTNOM PROJEKTU BFU2014 – 58656-R S TREPONEMA PALLIDUM. ANALIZIRAT ĆEMO ULOGU REKOMBINACIJE I PRIRODNE SELEKCIJE U ŠIRENJU EPIDEMIJE KLONSKE LOZE PODVRSTA T. PALLIDUM PALLIDUM, UZROČNIKA SIFILISA, KOJI JE OTPORAN NA AZYTROMICIN. OVAJ ANTIBIOTIK SE NE KORISTI REDOVITO ZA BORBU PROTIV INFEKCIJA OVOM BAKTERIJOM, ALI SE ČESTO KORISTI U LIJEČENJU DRUGIH SPOLNO PRENOSIVIH BOLESTI, KAO ŠTO SU GONOREJA I KLAMIDIJAZA. UKRATKO, OVAJ ĆE PROJEKT KOMBINIRATI OPSEŽNE ANALIZE BAKTERIJSKIH GENOMA, EKSPERIMENTALNE EVOLUCIJE TE MOLEKULARNE I EVOLUCIJSKE EPIDEMIOLOGIJE KAKO BI SE PROUČILA DINAMIKA EPIDEMIJE I MOBILIZACIJA GENA OTPORNOSTI NA ANTIBIOTIKE U COMUNIDAD VALENCIANI. OČEKIVANI REZULTATI RELEVANTNI SU ZA JAVNOZDRAVSTVENA TIJELA I ISTODOBNO ĆE DOPRINIJETI NAŠEM OSNOVNOM ZNANJU O RAZVOJU VIŠESTRUKIH REZISTENCIJA NA ANTIBIOTIKE. (Croatian)
4 August 2022
0 references
Η ΑΝΤΟΧΉ ΣΤΑ ΑΝΤΙΒΙΟΤΙΚΆ ΕΊΝΑΙ ΜΊΑ ΑΠΌ ΤΙΣ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌΤΕΡΕΣ ΑΠΕΙΛΈΣ ΓΙΑ ΤΗ ΔΗΜΌΣΙΑ ΥΓΕΊΑ. Η ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΉ ΜΑΣ ΟΜΆΔΑ ΕΡΓΆΖΕΤΑΙ ΕΔΏ ΚΑΙ ΠΟΛΛΆ ΧΡΌΝΙΑ ΣΤΗΝ ΕΦΑΡΜΟΓΉ ΜΕΘΌΔΩΝ ΕΞΈΛΙΞΗΣ ΚΑΙ ΓΕΝΕΤΙΚΉΣ ΤΟΥ ΠΛΗΘΥΣΜΟΎ ΓΙΑ ΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΠΑΘΟΓΌΝΩΝ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΏΝ, ΣΕ ΑΥΤΌ ΠΟΥ ΕΊΝΑΙ ΓΝΩΣΤΌ ΩΣ ΜΟΡΙΑΚΉ ΕΠΙΔΗΜΙΟΛΟΓΊΑ. ΕΚΤΌΣ ΑΠΌ ΤΗΝ ΕΡΓΑΣΊΑ ΣΕ ΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΆ ΣΥΝΑΦΉ ΖΗΤΉΜΑΤΑ, ΕΝΣΩΜΑΤΏΝΟΥΜΕ ΠΡΟΒΛΉΜΑΤΑ ΚΑΙ ΕΠΙΣΤΡΈΦΟΥΜΕ ΣΧΕΤΙΚΆ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΣΤΙΣ ΑΡΧΈΣ ΔΗΜΌΣΙΑΣ ΥΓΕΊΑΣ, ΕΠΙΤΥΓΧΆΝΟΝΤΑΣ ΈΤΣΙ ΜΙΑ ΕΝΔΙΑΦΈΡΟΥΣΑ ΚΑΙ ΤΡΟΜΕΡΉ ΕΦΑΡΜΟΓΉ ΜΙΑΣ ΒΑΣΙΚΉΣ ΒΙΟΛΟΓΙΚΉΣ ΠΕΙΘΑΡΧΊΑΣ. ΣΤΟ ΠΛΑΊΣΙΟ ΑΥΤΌ, ΤΟ ΈΡΓΟ ΑΥΤΌ ΑΠΟΣΚΟΠΕΊ ΣΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΜΙΑΣ ΜΕΓΆΛΗΣ ΜΕΛΛΟΝΤΙΚΉΣ ΣΥΛΛΟΓΉΣ ΑΠΟΜΟΝΩΘΈΝΤΩΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ ΕΝΌΣ ΒΑΚΤΗΡΊΟΥ KLEBSIELLA PNEUMONIAE ΠΟΥ ΣΧΕΤΊΖΕΤΑΙ ΜΕ ΤΗΝ ΚΛΙΝΙΚΉ ΚΑΙ ΤΗ ΔΗΜΌΣΙΑ ΥΓΕΊΑ, ΜΕ ΣΚΟΠΌ ΤΗΝ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΩΝ ΕΞΕΛΙΚΤΙΚΏΝ ΔΙΕΡΓΑΣΙΏΝ ΠΟΥ ΕΠΗΡΕΆΖΟΥΝ ΤΗ ΔΥΝΑΜΙΚΉ ΤΗΣ ΣΤΗΝ COMUNIDAD VALENCIANA, ΜΕ ΙΔΙΑΊΤΕΡΟ ΕΝΔΙΑΦΈΡΟΝ ΓΙΑ ΤΑ ΑΝΘΕΚΤΙΚΆ ΣΤΑ ΑΝΤΙΒΙΟΤΙΚΆ ΣΤΕΛΈΧΗ. ΛΌΓΩ ΤΗΣ ΚΛΙΝΙΚΉΣ ΤΟΥΣ ΣΗΜΑΣΊΑΣ ΚΑΙ ΤΗΣ ΣΗΜΑΣΊΑΣ ΤΟΥΣ ΓΙΑ ΤΗ ΔΗΜΌΣΙΑ ΥΓΕΊΑ, ΘΑ ΕΠΙΚΕΝΤΡΩΘΟΎΜΕ ΣΕ ΣΤΕΛΈΧΗ ΔΙΕΥΡΥΜΈΝΟΥ ΦΆΣΜΑΤΟΣ ΒΉΤΑ-ΛΑΚΤΑΜΆΣΗΣ Ή/ΚΑΙ ΚΑΡΒΑΠΕΝΕΜΆΣΗΣ ΠΟΥ ΠΑΡΆΓΟΥΝ ΣΤΕΛΈΧΗ. ΠΟΛΛΆ ΑΠΌ ΤΑ ΓΟΝΊΔΙΑ ΠΟΥ ΕΊΝΑΙ ΥΠΕΎΘΥΝΑ ΓΙΑ ΑΥΤΟΎΣ ΤΟΥΣ ΦΑΙΝΌΤΥΠΟΥΣ ΒΡΊΣΚΟΝΤΑΙ ΣΕ ΠΛΑΣΜΊΔΙΑ ΠΟΥ ΜΠΟΡΟΎΝ ΕΎΚΟΛΑ ΝΑ ΜΕΤΑΦΕΡΘΟΎΝ ΜΕΤΑΞΎ ΤΩΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ K. PNEUMONIAE Ή ΑΠΌ ΆΛΛΑ ΕΊΔΗ ΣΕ ΑΥΤΆ. ΚΑΤΆ ΣΥΝΈΠΕΙΑ, ΈΝΑΣ ΞΕΧΩΡΙΣΤΌΣ ΑΛΛΆ ΣΤΕΝΆ ΣΥΝΔΕΔΕΜΈΝΟΣ ΣΤΌΧΟΣ ΘΑ ΕΊΝΑΙ Ο ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΜΌΣ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΠΛΑΣΜΙΔΊΩΝ, Η ΔΥΝΑΜΙΚΉ ΚΙΝΗΤΟΠΟΊΗΣΉΣ ΤΟΥΣ ΑΛΛΆ, ΩΣ ΚΑΙΝΟΤΟΜΊΑ, ΟΙ ΠΡΟΣΑΡΜΟΣΤΙΚΈΣ ΣΥΝΈΠΕΙΈΣ ΤΟΥΣ, ΌΠΩΣ ΑΝΤΙΚΑΤΟΠΤΡΊΖΟΝΤΑΙ ΣΤΙΣ ΑΛΛΗΛΟΥΧΊΕΣ ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΟΣ ΤΟΥΣ. ΕΝΔΙΑΦΕΡΌΜΑΣΤΕ ΙΔΙΑΊΤΕΡΑ ΓΙΑ ΤΙΣ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ ΜΕΤΑΞΎ ΤΩΝ ΠΛΑΣΜΙΔΊΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΚΑΙ ΜΕΤΑΞΎ ΑΥΤΏΝ ΚΑΙ ΕΚΕΊΝΩΝ ΤΟΥ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΟΎ ΧΡΩΜΟΣΏΜΑΤΟΣ, ΑΥΤΌ ΠΟΥ ΕΊΝΑΙ ΓΝΩΣΤΌ ΩΣ ΕΠΊΣΤΑΣΗ. ΘΈΛΟΥΜΕ ΝΑ ΜΕΛΕΤΉΣΟΥΜΕ ΤΗ ΣΗΜΑΣΊΑ ΤΗΣ ΕΠΊΣΤΑΣΗΣ ΣΤΗ ΔΗΜΙΟΥΡΓΊΑ ΚΑΙ ΕΠΈΚΤΑΣΗ ΤΗΣ MULTIRRESISTANCE ΣΤΑ ΑΝΤΙΒΙΟΤΙΚΆ. ΤΟ ΣΗΜΕΊΟ ΑΥΤΌ ΘΑ ΕΞΕΤΑΣΤΕΊ ΕΠΊΣΗΣ ΜΕ ΜΙΑ ΠΟΛΎ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΉ ΠΡΟΣΈΓΓΙΣΗ, ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΠΕΙΡΑΜΑΤΙΚΉΣ ΕΞΈΛΙΞΗΣ ΣΤΙΣ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΈΣ ΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΕΣ. ΣΕ ΑΥΤΌ ΤΟ ΣΤΌΧΟ, ΘΑ ΣΥΝΕΡΓΑΣΤΟΎΜΕ ΜΕ ΑΡΚΕΤΈΣ ΕΞΕΛΙΚΤΙΚΈΣ ΓΕΝΕΈΣ, ΟΙ ΟΠΟΊΕΣ ΘΑ ΜΑΣ ΕΠΙΤΡΈΨΟΥΝ ΝΑ ΕΝΣΩΜΑΤΏΣΟΥΜΕ ΈΝΑ ΕΠΙΠΛΈΟΝ ΕΠΊΠΕΔΟ ΠΟΛΥΠΛΟΚΌΤΗΤΑΣ ΣΤΗΝ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΗΣ ΕΠΙΣΤΆΣΕΩΣ, ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΟΎ ΥΠΌΒΑΘΡΟΥ. Ο ΤΈΤΑΡΤΟΣ ΚΑΙ ΤΕΛΕΥΤΑΊΟΣ ΣΤΌΧΟΣ ΜΑΣ ΠΡΟΈΡΧΕΤΑΙ ΑΠΌ ΤΑ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΤΟΥ ΤΡΈΧΟΝΤΟΣ ΈΡΓΟΥ BFU2014-58656-R ΜΕ TREPONEMA PALLIDUM. ΘΑ ΑΝΑΛΎΣΟΥΜΕ ΤΟ ΡΌΛΟ ΤΟΥ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΟΎ ΚΑΙ ΤΗΣ ΦΥΣΙΚΉΣ ΕΠΙΛΟΓΉΣ ΣΤΗΝ ΕΠΙΔΗΜΙΚΉ ΕΠΈΚΤΑΣΗ ΜΙΑΣ ΚΛΩΝΙΚΉΣ ΓΕΝΕΆΣ ΤΩΝ ΥΠΟΕΊΔΩΝ T. PALLIDUM PALLIDUM, ΤΟΥ ΑΙΤΙΏΔΟΥΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑ ΤΗΣ ΣΎΦΙΛΗΣ, Η ΟΠΟΊΑ ΕΊΝΑΙ ΡΗΞΙΚΈΛΕΥΘΗ ΜΕ ΤΟ AZYTROMICIN. ΑΥΤΌ ΤΟ ΑΝΤΙΒΙΟΤΙΚΌ ΔΕΝ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΕΊΤΑΙ ΤΑΚΤΙΚΆ ΓΙΑ ΤΗΝ ΚΑΤΑΠΟΛΈΜΗΣΗ ΤΩΝ ΛΟΙΜΏΞΕΩΝ ΑΠΌ ΑΥΤΌ ΤΟ ΒΑΚΤΉΡΙΟ, ΑΛΛΆ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΕΊΤΑΙ ΣΥΧΝΆ ΣΤΗ ΘΕΡΑΠΕΊΑ ΆΛΛΩΝ STI, ΌΠΩΣ ΓΟΝΌΡΡΟΙΑ ΚΑΙ ΧΛΑΜΎΔΙΑΣΗ. ΣΥΝΟΨΊΖΟΝΤΑΣ, ΤΟ ΈΡΓΟ ΑΥΤΌ ΘΑ ΣΥΝΔΥΆΖΕΙ ΜΕΓΆΛΗΣ ΚΛΊΜΑΚΑΣ ΑΝΑΛΎΣΕΙΣ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΏΝ ΓΟΝΙΔΙΩΜΆΤΩΝ, ΠΕΙΡΑΜΑΤΙΚΉ ΕΞΈΛΙΞΗ ΚΑΙ ΜΟΡΙΑΚΉ ΚΑΙ ΕΞΕΛΙΚΤΙΚΉ ΕΠΙΔΗΜΙΟΛΟΓΊΑ ΓΙΑ ΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΤΗΣ ΔΥΝΑΜΙΚΉΣ ΤΗΣ ΕΠΙΔΗΜΊΑΣ ΚΑΙ ΤΗΣ ΚΙΝΗΤΟΠΟΊΗΣΗΣ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΑΝΤΟΧΉΣ ΣΤΑ ΑΝΤΙΒΙΟΤΙΚΆ ΣΤΗΝ COMUNIDAD VALENCIANA. ΤΑ ΑΝΑΜΕΝΌΜΕΝΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΕΊΝΑΙ ΣΗΜΑΝΤΙΚΆ ΓΙΑ ΤΙΣ ΑΡΧΈΣ ΔΗΜΌΣΙΑΣ ΥΓΕΊΑΣ ΚΑΙ, ΤΑΥΤΌΧΡΟΝΑ, ΘΑ ΣΥΜΒΆΛΟΥΝ ΣΤΙΣ ΒΑΣΙΚΈΣ ΜΑΣ ΓΝΏΣΕΙΣ ΣΧΕΤΙΚΆ ΜΕ ΤΗΝ ΕΞΈΛΙΞΗ ΤΩΝ ΠΟΛΛΑΠΛΏΝ ΑΝΘΕΚΤΙΚΏΝ ΣΤΑ ΑΝΤΙΒΙΟΤΙΚΆ. (Greek)
4 August 2022
0 references
REZISTENCIA VOČI ANTIBIOTIKÁM JE JEDNOU Z HLAVNÝCH HROZIEB PRE VEREJNÉ ZDRAVIE. NAŠA VÝSKUMNÁ SKUPINA PRACUJE UŽ MNOHO ROKOV V APLIKÁCII EVOLÚCIE A POPULAČNEJ GENETIKY METÓD NA ŠTÚDIUM PATOGÉNNYCH MIKROORGANIZMOV, V ČO JE ZNÁME AKO MOLEKULÁRNA EPIDEMIOLÓGIA. OKREM PRÁCE NA VEDECKY RELEVANTNÝCH OTÁZKACH ZAČLEŇUJEME PROBLÉMY A VRACIAME RELEVANTNÉ VÝSLEDKY ORGÁNOM VEREJNÉHO ZDRAVOTNÍCTVA, ČÍM SA DOSAHUJE ZAUJÍMAVÉ A SKROMNÉ UPLATŇOVANIE ZÁKLADNEJ BIOLOGICKEJ DISCIPLÍNY. V TEJTO SÚVISLOSTI JE TENTO PROJEKT ZAMERANÝ NA ŠTÚDIUM ROZSIAHLEHO PROSPEKTÍVNEHO SÚBORU IZOLÁTOV KLINICKY RELEVANTNEJ BAKTÉRIE KLEBSIELLA PNEUMONIAE, KTORÁ JE RELEVANTNÁ PRE VEREJNÉ ZDRAVIE, S CIEĽOM ANALYZOVAŤ EVOLUČNÉ PROCESY, KTORÉ OVPLYVŇUJÚ JEJ DYNAMIKU V COMUNIDAD VALENCIANA, S OSOBITNÝM ZÁUJMOM O KMENE REZISTENTNÉ VOČI ANTIBIOTIKÁM. VZHĽADOM NA ICH KLINICKÝ VÝZNAM A VÝZNAM PRE VEREJNÉ ZDRAVIE SA ZAMERIAME NA KMENE PRODUKUJÚCE BETA-LAKTAMÁZU A/ALEBO KARBAPENEMÁZU S ROZŠÍRENÝM SPEKTROM. MNOHÉ Z GÉNOV ZODPOVEDNÝCH ZA TIETO FENOTYPY SA NACHÁDZAJÚ NA PLAZMIDOCH, KTORÉ SA DAJÚ ĽAHKO PRENIESŤ MEDZI KMEŇMI K. PNEUMONIAE ALEBO Z INÝCH DRUHOV DO NICH. V DÔSLEDKU TOHO BUDE SAMOSTATNÝM, ALE ÚZKO SÚVISIACIM CIEĽOM CHARAKTERIZÁCIA TÝCHTO PLAZMIDOV, ICH MOBILIZAČNÁ DYNAMIKA, ALE AKO NOVINKA, JEJ ADAPTÍVNE DÔSLEDKY, AKO SA ODRÁŽAJÚ V ICH GENÓMOVÝCH SEKVENCIÁCH. OBZVLÁŠŤ NÁS ZAUJÍMAJÚ INTERAKCIE MEDZI PLAZMIDOVÝMI GÉNMI A MEDZI NIMI A TÝMI V BAKTERIÁLNOM CHROMOZÓME, ČO JE ZNÁME AKO EPISTÁZA. CHCEME PRESKÚMAŤ RELEVANTNOSŤ EPISTÁZY V ZARIADENÍ A EXPANZIU NA MULTIRRESISTANCE NA ANTIBIOTIKÁ. TENTO BOD SA BUDE RIEŠIŤ AJ VEĽMI ODLIŠNÝM PRÍSTUPOM, PRIČOM SA POUŽIJE EXPERIMENTÁLNY VÝVOJ V LABORATÓRNYCH KULTÚRACH. V TOMTO CIELI BUDEME PRACOVAŤ S NIEKOĽKÝMI EVOLUČNÝMI LÍNIAMI, KTORÉ NÁM UMOŽNIA ZAČLENIŤ ĎALŠIU ÚROVEŇ ZLOŽITOSTI DO ANALÝZY EPISTÁZY, GENÓMOVÉHO POZADIA. NÁŠ ŠTVRTÝ A POSLEDNÝ CIEĽ VYCHÁDZA Z PREDCHÁDZAJÚCICH VÝSLEDKOV SÚČASNÉHO PROJEKTU BFU2014 – 58656-R S TREPONEMA PALLIDUM. BUDEME ANALYZOVAŤ ÚLOHU REKOMBINÁCIE A PRIRODZENÉHO VÝBERU V EPIDÉMII EXPANZIE KLONOVEJ LÍNIE PODDRUHU T. PALLIDUM PALLIDUM, KAUZÁLNEHO ČINITEĽA SYFILISU, KTORÝ JE ODOLNÝ VOČI AZYTROMICINU. TOTO ANTIBIOTIKUM SA NEPOUŽÍVA PRAVIDELNE NA BOJ PROTI INFEKCIÁM TOUTO BAKTÉRIOU, ALE ČASTO SA POUŽÍVA PRI LIEČBE INÝCH STI, AKO SÚ GONORRHOEAE A CHLAMÝDIÓZA. ABY SOM TO ZHRNUL, TENTO PROJEKT BUDE KOMBINOVAŤ ROZSIAHLE ANALÝZY BAKTERIÁLNYCH GENÓMOV, EXPERIMENTÁLNU EVOLÚCIU A MOLEKULÁRNU A EVOLUČNÚ EPIDEMIOLÓGIU NA ŠTÚDIUM EPIDEMIOLOGICKEJ DYNAMIKY A MOBILIZÁCIU GÉNOV REZISTENCIE VOČI ANTIBIOTIKÁM V COMUNIDAD VALENCIANA. OČAKÁVANÉ VÝSLEDKY SÚ RELEVANTNÉ PRE ORGÁNY VEREJNÉHO ZDRAVIA A ZÁROVEŇ PRISPEJÚ K NAŠIM ZÁKLADNÝM POZNATKOM O VÝVOJI VIACNÁSOBNEJ REZISTENCIE VOČI ANTIBIOTIKÁM. (Slovak)
4 August 2022
0 references
ANTIBIOOTTIRESISTENSSI ON YKSI SUURIMMISTA KANSANTERVEYDELLISISTÄ UHISTA. TUTKIMUSRYHMÄMME ON TYÖSKENNELLYT JO VUOSIA EVOLUUTION JA POPULAATIOGENETIIKAN MENETELMIEN SOVELTAMISESSA PATOGEENISTEN MIKRO-ORGANISMIEN TUTKIMISEEN NIIN KUTSUTUSSA MOLEKYYLIEPIDEMIOLOGIASSA. SEN LISÄKSI, ETTÄ KÄSITTELEMME TIETEELLISESTI MERKITTÄVIÄ KYSYMYKSIÄ, OTAMME HUOMIOON KANSANTERVEYSVIRANOMAISTEN ONGELMAT JA PALAAMME NIIHIN, MIKÄ TARKOITTAA, ETTÄ BIOLOGISEN PERUSALAN SOVELTAMINEN ON KIINNOSTAVAA JA VAIVATONTA. TÄSSÄ YHTEYDESSÄ TÄMÄN HANKKEEN TARKOITUKSENA ON TUTKIA KLIINISESTI JA KANSANTERVEYDELLISESTI MERKITYKSELLISEN BAKTEERIN KLEBSIELLA PNEUMONIAE -BAKTEERIN ISOLAATTIEN LAAJAA PROSPEKTIIVISTA KOKOELMAA, JOSSA ANALYSOIDAAN EVOLUUTIOPROSESSEJA, JOTKA VAIKUTTAVAT SEN DYNAMIIKKAAN VALENCIAN ITSEHALLINTOALUEELLA, JA ERITYISTÄ KIINNOSTUSTA ANTIBIOOTTIRESISTENTTEIHIN KANTOIHIN. KOSKA NIILLÄ ON KLIINISTÄ JA KANSANTERVEYDELLISTÄ MERKITYSTÄ, KESKITYMME LAAJASPEKTRISEEN BEETALAKTAMAASIA JA/TAI KARBAPENEMAAASIA TUOTTAVIIN KANTOIHIN. MONET NÄISTÄ FENOTYYPEISTÄ VASTUUSSA OLEVISTA GEENEISTÄ SIJAITSEVAT PLASMIDEILLA, JOTKA VOIDAAN HELPOSTI SIIRTÄÄ K. PNEUMONIAE -KANTOJEN VÄLILLÄ TAI MUISTA LAJEISTA NIIHIN. NÄIN OLLEN ERILLINEN MUTTA LÄHEISESTI TOISIINSA LIITTYVÄ TAVOITE ON NÄIDEN PLASMIDIEN KARAKTERISOINTI, NIIDEN MOBILISAATIODYNAMIIKKA, MUTTA UUTUUTENA SEN MUKAUTUVAT SEURAUKSET, KOSKA NE HEIJASTUVAT NIIDEN GENOMIN SEKVENSSEIHIN. OLEMME ERITYISEN KIINNOSTUNEITA PLASMIDIGEENIEN SEKÄ NÄIDEN JA BAKTEERIKROMOSOMIN, EPISTASSIN, VÄLISESTÄ VUOROVAIKUTUKSESTA. HALUAMME TUTKIA EPISTAS-TAUDIN MERKITYSTÄ MULTIRRESISTANCE-VALMISTEEN PERUSTAMISESSA JA LAAJENTAMISESSA ANTIBIOOTEILLE. TÄTÄ KOHTAA KÄSITELLÄÄN MYÖS HYVIN ERILAISELLA LÄHESTYMISTAVALLA, JOSSA KÄYTETÄÄN KOKEELLISTA KEHITYSTÄ LABORATORIOKULTTUUREISSA. TÄSSÄ TAVOITTEESSA TYÖSKENTELEMME USEIDEN EVOLUUTIOLINJAUSTEN KANSSA, JOIDEN AVULLA VOIMME SISÄLLYTTÄÄ EPISTASSIN, GENOMISEN TAUSTAN ANALYYSIIN YLIMÄÄRÄISEN MONIMUTKAISUUDEN. NELJÄS JA VIIMEINEN TAVOITTEEMME PERUSTUU TREPONEMA PALLIDUM -PROJEKTIN BFU2014–58656-R AIEMPIIN TULOKSIIN. ANALYSOIMME REKOMBINOINNIN JA LUONNOLLISEN VALINNAN ROOLIA ALALAJIN T. PALLIDUM PALLIDUM, KUPPA, JOKA ON VASTA-AINE AZYTROMICINILLE, KLONAALISEN LINJAN EPIDEMIAN LAAJENEMISESSA. TÄTÄ ANTIBIOOTTIA EI KÄYTETÄ SÄÄNNÖLLISESTI TÄMÄN BAKTEERIN INFEKTIOIDEN TORJUNTAAN, MUTTA SITÄ KÄYTETÄÄN USEIN MUIDEN SUKUPUOLIELINTEN, KUTEN TIPPURIN JA KLAMYDIAASIN, HOIDOSSA. YHTEENVETONA VOIDAAN TODETA, ETTÄ TÄSSÄ HANKKEESSA YHDISTETÄÄN LAAJAMITTAISIA ANALYYSEJA BAKTEERIEN GENOMISTA, KOKEELLISESTA EVOLUUTIOSTA SEKÄ MOLEKYYLI- JA EVOLUUTIOEPIDEMIOLOGIASTA TUTKITTAESSA EPIDEMIADYNAMIIKKAA JA ANTIBIOOTTIRESISTENSSIGEENIEN MOBILISOINTIA VALENCIAN ITSEHALLINTOALUEELLA. ODOTETUT TULOKSET OVAT MERKITYKSELLISIÄ KANSANTERVEYSVIRANOMAISILLE, JA NE LISÄÄVÄT SAMALLA PERUSTIETÄMYSTÄMME USEIDEN ANTIBIOOTTIRESISTENSSIEN KEHITTYMISESTÄ. (Finnish)
4 August 2022
0 references
OPORNOŚĆ NA ANTYBIOTYKI JEST JEDNYM Z GŁÓWNYCH ZAGROŻEŃ DLA ZDROWIA PUBLICZNEGO. NASZA GRUPA BADAWCZA OD WIELU LAT PRACUJE NAD ZASTOSOWANIEM METOD GENETYCZNYCH EWOLUCJI I POPULACJI DO BADANIA MIKROORGANIZMÓW CHOROBOTWÓRCZYCH W TZW. EPIDEMIOLOGII MOLEKULARNEJ. OPRÓCZ PRACY NAD ISTOTNYMI NAUKOWO PYTANIAMI, UWZGLĘDNIAMY PROBLEMY I ZWRACAMY ODPOWIEDNIE WYNIKI ORGANOM DS. ZDROWIA PUBLICZNEGO, OSIĄGAJĄC W TEN SPOSÓB INTERESUJĄCE I FRUTALNE STOSOWANIE PODSTAWOWEJ DYSCYPLINY BIOLOGICZNEJ. W TYM KONTEKŚCIE PROJEKT TEN MA NA CELU ZBADANIE DUŻEGO PROSPEKTYWNEGO ZBIORU IZOLATÓW BAKTERII KLEBSIELLA PNEUMONIAE O ZNACZENIU KLINICZNYM I ZDROWIA PUBLICZNEGO, W CELU PRZEANALIZOWANIA PROCESÓW EWOLUCYJNYCH, KTÓRE WPŁYWAJĄ NA JEGO DYNAMIKĘ W COMUNIDAD VALENCIANA, ZE SZCZEGÓLNYM ZAINTERESOWANIEM SZCZEPAMI OPORNYMI NA ANTYBIOTYKI. ZE WZGLĘDU NA ICH ZNACZENIE KLINICZNE I DLA ZDROWIA PUBLICZNEGO SKUPIMY SIĘ NA SZCZEPACH WYTWARZAJĄCYCH BETA-LAKTAMAZĘ O ROZSZERZONYM SPEKTRUM I/LUB KARBAPENEMAZĘ. WIELE GENÓW ODPOWIEDZIALNYCH ZA TE FENOTYPY ZNAJDUJE SIĘ NA PLAZMIDACH, KTÓRE MOŻNA ŁATWO PRZENOSIĆ MIĘDZY SZCZEPAMI K. PNEUMONIAE LUB Z INNYCH GATUNKÓW DO NICH. W ZWIĄZKU Z TYM ODRĘBNYM, ALE ŚCIŚLE POWIĄZANYM CELEM BĘDZIE CHARAKTERYSTYKA TYCH PLAZMIDÓW, ICH DYNAMIKA MOBILIZACJI, ALE JAKO NOWOŚĆ JEJ ADAPTACYJNE KONSEKWENCJE ODZWIERCIEDLONE W ICH SEKWENCJACH GENOMOWYCH. JESTEŚMY SZCZEGÓLNIE ZAINTERESOWANI INTERAKCJAMI MIĘDZY GENAMI PLAZMIDU I MIĘDZY NIMI A TYMI W CHROMOSOMIE BAKTERYJNYM, ZNANYM JAKO EPISTAZA. CHCEMY ZBADAĆ ZNACZENIE EPISTAZY W TWORZENIU I EKSPANSJI MULTIRRESISTANCE NA ANTYBIOTYKI. KWESTIA TA ZOSTANIE RÓWNIEŻ ROZWIĄZANA Z ZASTOSOWANIEM BARDZO INNEGO PODEJŚCIA, WYKORZYSTUJĄCEGO EKSPERYMENTALNĄ EWOLUCJĘ W KULTURACH LABORATORYJNYCH. W TYM CELU BĘDZIEMY PRACOWAĆ Z KILKOMA LINIAMI EWOLUCYJNYMI, KTÓRE POZWOLĄ NAM WŁĄCZYĆ DODATKOWY POZIOM ZŁOŻONOŚCI DO ANALIZY EPISTAZY, TŁA GENOMICZNEGO. NASZ CZWARTY I OSTATNI CEL WYNIKA Z POPRZEDNICH WYNIKÓW W BIEŻĄCYM PROJEKCIE BFU2014-58656-R Z TREPONEMA PALLIDUM. PRZEANALIZUJEMY ROLĘ REKOMBINACJI I DOBORU NATURALNEGO W EKSPANSJI EPIDEMICZNEJ LINII KLONALNEJ PODGATUNKÓW T. PALLIDUM PALLIDUM, CZYNNIKA PRZYCZYNOWEGO KIŁY, KTÓRY JEST ODPORNY NA AZYTROMICIN. ANTYBIOTYK TEN NIE JEST REGULARNIE STOSOWANY W CELU ZWALCZANIA ZAKAŻEŃ PRZEZ TĘ BAKTERIĘ, ALE JEST CZĘSTO STOSOWANY W LECZENIU INNYCH CHORÓB PRZENOSZONYCH DROGĄ PŁCIOWĄ, TAKICH JAK RZEŻĄCZKA I CHLAMYDIAZA. PODSUMOWUJĄC, PROJEKT TEN POŁĄCZY ANALIZY GENOMÓW BAKTERYJNYCH, EWOLUCJI EKSPERYMENTALNEJ ORAZ EPIDEMIOLOGII MOLEKULARNEJ I EWOLUCYJNEJ W CELU ZBADANIA DYNAMIKI EPIDEMII I MOBILIZACJI GENÓW OPORNOŚCI NA ANTYBIOTYKI W COMUNIDAD VALENCIANA. OCZEKIWANE WYNIKI SĄ ISTOTNE DLA ORGANÓW DS. ZDROWIA PUBLICZNEGO, A JEDNOCZEŚNIE PRZYCZYNIĄ SIĘ DO NASZEJ PODSTAWOWEJ WIEDZY NA TEMAT EWOLUCJI WIELORAKIEJ OPORNOŚCI NA ANTYBIOTYKI. (Polish)
4 August 2022
0 references
AZ ANTIBIOTIKUM-REZISZTENCIA AZ EGYIK LEGNAGYOBB KÖZEGÉSZSÉGÜGYI VESZÉLY. KUTATÓCSOPORTUNK ÉVEK ÓTA DOLGOZIK AZ EVOLÚCIÓS ÉS POPULÁCIÓGENETIKAI MÓDSZEREK ALKALMAZÁSÁN A PATOGÉN MIKROORGANIZMUSOK TANULMÁNYOZÁSÁRA, AZ ÚGYNEVEZETT MOLEKULÁRIS EPIDEMIOLÓGIÁBAN. A TUDOMÁNYOS SZEMPONTBÓL RELEVÁNS KÉRDÉSEKEN TÚL A RELEVÁNS EREDMÉNYEKET A KÖZEGÉSZSÉGÜGYI HATÓSÁGOKTÓL IS BEÉPÍTJÜK, ÉS VISSZAJUTTATJUK A RELEVÁNS EREDMÉNYEKET, ÍGY ELÉRVE AZ ALAPVETŐ BIOLÓGIAI TUDOMÁNYÁG ÉRDEKES ÉS FRUTIFUL ALKALMAZÁSÁT. EBBEN AZ ÖSSZEFÜGGÉSBEN A PROJEKT CÉLJA EGY KLINIKAILAG ÉS KÖZEGÉSZSÉGÜGYI SZEMPONTBÓL RELEVÁNS BAKTÉRIUM, A KLEBSIELLA PNEUMONIAE IZOLÁTUMAINAK NAGY, PROSPEKTÍV GYŰJTEMÉNYÉNEK TANULMÁNYOZÁSA ANNAK ÉRDEKÉBEN, HOGY ELEMEZZE AZOKAT AZ EVOLÚCIÓS FOLYAMATOKAT, AMELYEK BEFOLYÁSOLJÁK A VALENCIAI COMUNIDAD DINAMIKÁJÁT, KÜLÖNÖS TEKINTETTEL AZ ANTIBIOTIKUM-REZISZTENS TÖRZSEKRE. KLINIKAI ÉS KÖZEGÉSZSÉGÜGYI JELENTŐSÉGÜK MIATT A KITERJESZTETT SPEKTRUMÚ BÉTA-LAKTAMÁZRA ÉS/VAGY KARBAPENEMÁZT TERMELŐ TÖRZSEKRE ÖSSZPONTOSÍTUNK. AZ ILYEN FENOTÍPUSOKÉRT FELELŐS SZÁMOS GÉN OLYAN PLAZMIDOKON TALÁLHATÓ, AMELYEK KÖNNYEN ÁTVIHETŐK A K. PNEUMONIAE TÖRZSEK VAGY MÁS FAJOK KÖZÖTT. KÖVETKEZÉSKÉPPEN KÜLÖN, DE SZOROSAN KAPCSOLÓDÓ CÉL LESZ EZEKNEK A PLAZMIDOKNAK A JELLEMZÉSE, MOZGÓSÍTÁSI DINAMIKÁJA, DE ÚJDONSÁGKÉNT A GENOMSZEKVENCIÁKBAN TÜKRÖZŐDŐ ADAPTÍV KÖVETKEZMÉNYEI. KÜLÖNÖSEN ÉRDEKELNEK A PLAZMIDGÉNEK ÉS EZEK ÉS A BAKTERIÁLIS KROMOSZÓMA, AZ ÚGYNEVEZETT EPISTASIS KÖZÖTTI KÖLCSÖNHATÁSOK. SZERETNÉNK TANULMÁNYOZNI A EPISTASIS RELEVANCIÁJÁT A MULTIRRESISTANCE ANTIBIOTIKUMOKKAL KAPCSOLATOS KIALAKÍTÁSÁBAN ÉS KITERJESZTÉSÉBEN. EZZEL A PONTTAL EGY EGÉSZEN MÁS MEGKÖZELÍTÉSSEL IS FOGLALKOZUNK, A LABORATÓRIUMI KULTÚRÁK KÍSÉRLETI EVOLÚCIÓJÁT ALKALMAZVA. E CÉL ÉRDEKÉBEN TÖBB EVOLÚCIÓS VONALLAL FOGUNK EGYÜTTMŰKÖDNI, AMELYEK LEHETŐVÉ TESZIK SZÁMUNKRA, HOGY TOVÁBBI KOMPLEXITÁSI SZINTET ÉPÍTSÜNK BE AZ EPISZTASIS, A GENOMIKUS HÁTTÉR ELEMZÉSÉBE. NEGYEDIK ÉS UTOLSÓ CÉLUNK A JELENLEGI BFU2014–58656-R PROJEKT KORÁBBI EREDMÉNYEIBŐL ERED A TREPONEMA PALLIDUMMAL. ELEMEZZÜK A REKOMBINÁCIÓ ÉS A TERMÉSZETES SZELEKCIÓ SZEREPÉT A T. PALLIDUM PALLIDUM ALFAJ, A SZIFILISZ OK-OKOZATI TÉNYEZŐJE KLONÁLIS VONALÁNAK JÁRVÁNYBŐVÍTÉSÉBEN, AMELY AZ AZYTROMICIN-RA REZIDENS. EZT AZ ANTIBIOTIKUMOT NEM HASZNÁLJÁK RENDSZERESEN A BAKTÉRIUM FERTŐZÉSEINEK LEKÜZDÉSÉRE, DE GYAKRAN HASZNÁLJÁK MÁS STI-K, MINT PÉLDÁUL A GONORRHOEAE ÉS A CHLAMYDIASIS KEZELÉSÉBEN. ÖSSZEFOGLALVA, EZ A PROJEKT ÖTVÖZI A BAKTERIÁLIS GENOMOK, A KÍSÉRLETI EVOLÚCIÓ, VALAMINT A MOLEKULÁRIS ÉS EVOLÚCIÓS EPIDEMIOLÓGIÁT, HOGY TANULMÁNYOZZA A JÁRVÁNY DINAMIKÁJÁT ÉS AZ ANTIBIOTIKUM-REZISZTENCIA GÉNJEINEK MOBILIZÁLÁSÁT VALENCIABAN. A VÁRT EREDMÉNYEK RELEVÁNSAK A KÖZEGÉSZSÉGÜGYI HATÓSÁGOK SZÁMÁRA, ÉS EZZEL EGYIDEJŰLEG HOZZÁJÁRULNAK AZ ANTIBIOTIKUMOKKAL SZEMBENI TÖBBSZÖRÖS REZISZTENCIA ALAKULÁSÁVAL KAPCSOLATOS ALAPVETŐ TUDÁSUNKHOZ. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
REZISTENCE VŮČI ANTIBIOTIKŮM JE JEDNOU Z HLAVNÍCH HROZEB PRO VEŘEJNÉ ZDRAVÍ. NAŠE VÝZKUMNÁ SKUPINA PRACUJE JIŽ MNOHO LET V APLIKACI EVOLUČNÍCH A POPULAČNÍCH GENETICKÝCH METOD KE STUDIU PATOGENNÍCH MIKROORGANISMŮ, V TZV. MOLEKULÁRNÍ EPIDEMIOLOGII. KROMĚ PRÁCE NA VĚDECKY RELEVANTNÍCH OTÁZKÁCH ZAHRNUJEME PROBLÉMY A VRACÍME RELEVANTNÍ VÝSLEDKY ORGÁNŮM VEŘEJNÉHO ZDRAVÍ, ČÍMŽ DOSÁHNEME ZAJÍMAVÉHO A FRUTIÓZNÍHO UPLATNĚNÍ ZÁKLADNÍ BIOLOGICKÉ DISCIPLÍNY. V TÉTO SOUVISLOSTI JE TENTO PROJEKT ZAMĚŘEN NA STUDIUM ROZSÁHLÉ PROSPEKTIVNÍ SBÍRKY IZOLÁTŮ KLINICKY A PRO VEŘEJNÉ ZDRAVÍ RELEVANTNÍ BAKTERIE KLEBSIELLA PNEUMONIAE ZA ÚČELEM ANALÝZY EVOLUČNÍCH PROCESŮ, KTERÉ OVLIVŇUJÍ JEJÍ DYNAMIKU V COMUNIDAD VALENCIANA, SE ZVLÁŠTNÍM ZÁJMEM O KMENY REZISTENTNÍ VŮČI ANTIBIOTIKŮM. VZHLEDEM K JEJICH KLINICKÉMU VÝZNAMU A VÝZNAMU PRO VEŘEJNÉ ZDRAVÍ SE ZAMĚŘÍME NA KMENY S ROZŠÍŘENOU SPEKTREM BETA-LAKTAMÁZY A/NEBO KARBAPENEMÁZY. MNOHO GENŮ ZODPOVĚDNÝCH ZA TYTO FENOTYPY SE NACHÁZÍ NA PLAZMIDECH, KTERÉ LZE SNADNO PŘENÉST MEZI KMENY K. PNEUMONIAE NEBO Z JINÝCH DRUHŮ DO NICH. V DŮSLEDKU TOHO BUDE SAMOSTATNÝM, ALE ÚZCE SOUVISEJÍCÍM CÍLEM CHARAKTERIZACE TĚCHTO PLASMIDŮ, JEJICH MOBILIZAČNÍ DYNAMIKA, ALE JAKO NOVINKA JEJICH ADAPTIVNÍ DŮSLEDKY, KTERÉ SE ODRÁŽEJÍ V JEJICH GENOMOVÝCH SEKVENCÍCH. ZAJÍMÁ NÁS ZEJMÉNA INTERAKCE MEZI PLAZMIDOVÝMI GENY A MEZI NIMI A TĚMI V BAKTERIÁLNÍM CHROMOZOMU, COŽ JE ZNÁMÉ JAKO EPISTÁZA. CHCEME STUDOVAT VÝZNAM EPISTÁZY V ZALOŽENÍ A ROZŠÍŘENÍ MULTIRRESISTANCE NA ANTIBIOTIKA. TENTO BOD BUDE ROVNĚŽ ŘEŠEN VELMI ODLIŠNÝM PŘÍSTUPEM S VYUŽITÍM EXPERIMENTÁLNÍHO VÝVOJE V LABORATORNÍCH KULTURÁCH. V TOMTO CÍLI BUDEME PRACOVAT S NĚKOLIKA EVOLUČNÍMI LINIEMI, KTERÉ NÁM UMOŽNÍ ZAČLENIT DALŠÍ ÚROVEŇ SLOŽITOSTI DO ANALÝZY EPISTÁZY, GENOMICKÉHO POZADÍ. NÁŠ ČTVRTÝ A POSLEDNÍ CÍL VYCHÁZÍ Z PŘEDCHOZÍCH VÝSLEDKŮ SOUČASNÉHO PROJEKTU BFU2014–58656-R S TREPONEMA PALLIDUM. BUDEME ANALYZOVAT ROLI REKOMBINACE A PŘIROZENÉHO SELEKCE V EPIDEMII ROZŠÍŘENÍ KLONOVÉ LINIE PODDRUHU T. PALLIDUM PALLIDUM, KAUZÁLNÍHO ČINIDLA SYFILIS, KTERÝ JE REZISTENTNÍ NA AZYTROMICIN. TOTO ANTIBIOTIKUM SE NEPOUŽÍVÁ PRAVIDELNĚ V BOJI PROTI INFEKCÍM TOUTO BAKTERIÍ, ALE ČASTO SE POUŽÍVÁ PŘI LÉČBĚ JINÝCH POHLAVNÍCH CHOROB, JAKO JE GONORRHOEAE A CHLAMYDIASIS. STRUČNĚ ŘEČENO, TENTO PROJEKT BUDE KOMBINOVAT ROZSÁHLÉ ANALÝZY BAKTERIÁLNÍCH GENOMŮ, EXPERIMENTÁLNÍ EVOLUCE A MOLEKULÁRNÍ A EVOLUČNÍ EPIDEMIOLOGIE ZA ÚČELEM STUDIA DYNAMIKY EPIDEMIE A MOBILIZACE GENŮ REZISTENCE VŮČI ANTIBIOTIKŮM V COMUNIDAD VALENCIANA. OČEKÁVANÉ VÝSLEDKY JSOU RELEVANTNÍ PRO ORGÁNY VEŘEJNÉHO ZDRAVÍ A ZÁROVEŇ PŘISPĚJÍ K NAŠIM ZÁKLADNÍM ZNALOSTEM O VÝVOJI VÍCENÁSOBNÉ REZISTENCE VŮČI ANTIBIOTIKŮM. (Czech)
4 August 2022
0 references
REZISTENCE PRET ANTIBIOTIKĀM IR VIENS NO GALVENAJIEM DRAUDIEM SABIEDRĪBAS VESELĪBAI. MŪSU PĒTNIECĪBAS GRUPA IR STRĀDĀJUSI DAUDZUS GADUS, PIEMĒROJOT EVOLŪCIJAS UN POPULĀCIJAS ĢENĒTIKAS METODES, LAI PĒTĪTU PATOGĒNOS MIKROORGANISMUS, KAS PAZĪSTAMS KĀ MOLEKULĀRĀ EPIDEMIOLOĢIJA. PAPILDUS DARBAM AR ZINĀTNISKI SVARĪGIEM JAUTĀJUMIEM MĒS IEKĻAUJAM PROBLĒMAS NO SABIEDRĪBAS VESELĪBAS IESTĀDĒM UN ATDODAM TĀM ATTIECĪGOS REZULTĀTUS, TĀDĒJĀDI PANĀKOT INTERESANTU UN VIEGLPRĀTĪGU PAMATA BIOLOĢISKĀS DISCIPLĪNAS PIEMĒROŠANU. ŠAJĀ KONTEKSTĀ ŠĀ PROJEKTA MĒRĶIS IR IZPĒTĪT PLAŠU PERSPEKTĪVU IZOLĀTU KOLEKCIJU NO KLĪNISKI UN SABIEDRĪBAS VESELĪBAI NOZĪMĪGAS BAKTĒRIJAS KLEBSIELLA PNEUMONIAE, LAI ANALIZĒTU EVOLŪCIJAS PROCESUS, KAS IETEKMĒ TĀS DINAMIKU VALENSIJAS APGABALĀ, ĪPAŠU INTERESI PAR ANTIBIOTIKĀM REZISTENTIEM CELMIEM. ŅEMOT VĒRĀ TO IETEKMI UZ KLĪNISKO UN SABIEDRĪBAS VESELĪBU, MĒS KONCENTRĒSIMIES UZ PAPLAŠINĀTĀ SPEKTRA BETA-LAKTAMĀZI UN/VAI KARBAPENEMĀZI RAŽOJOŠIEM CELMIEM. DAUDZI NO GĒNIEM, KAS IR ATBILDĪGI PAR ŠIEM FENOTIPIEM, ATRODAS UZ PLAZMĪDĀM, KURAS VAR VIEGLI PĀRNEST STARP K. PNEUMONIAE CELMIEM VAI NO CITĀM SUGĀM UZ TĀM. LĪDZ AR TO ATSEVIŠĶS, BET CIEŠI SAISTĪTS MĒRĶIS BŪS ŠO PLAZMĪDU RAKSTUROŠANA, TO MOBILIZĀCIJAS DINAMIKA, BET KĀ JAUNUMS — TO ADAPTĪVĀS SEKAS, JO TĀS ATSPOGUĻOJAS TO GENOMA SEKVENCĒS. MŪS ĪPAŠI INTERESĒ MIJIEDARBĪBA STARP PLAZMĪDU GĒNIEM UN STARP TIEM UN BAKTĒRIJU HROMOSOMU, KAS PAZĪSTAMS KĀ EPISTĀZE. MĒS VĒLAMIES IZPĒTĪT EPISTĀZES NOZĪMI MULTIRRESISTANCE IZVEIDĒ UN PAPLAŠINĀŠANĀ LĪDZ ANTIBIOTIKĀM. ŠIS JAUTĀJUMS TIKS RISINĀTS ARĪ AR ĻOTI ATŠĶIRĪGU PIEEJU, IZMANTOJOT EKSPERIMENTĀLO ATTĪSTĪBU LABORATORIJAS KULTŪRĀS. ŠAJĀ MĒRĶĪ MĒS STRĀDĀSIM AR VAIRĀKĀM EVOLŪCIJAS LĪNIJĀM, KAS ĻAUS MUMS IEKĻAUT PAPILDU SAREŽĢĪTĪBAS LĪMENI EPISTĀZES, GENOMA FONA ANALĪZEI. MŪSU CETURTAIS UN PĒDĒJAIS MĒRĶIS IZRIET NO IEPRIEKŠĒJIEM REZULTĀTIEM PAŠREIZĒJĀ PROJEKTĀ BFU2014–58656-R AR TREPONEMA PALLIDUM. MĒS ANALIZĒSIM REKOMBINĀCIJAS UN DABISKĀS SELEKCIJAS LOMU PASUGAS T. PALLIDUM PALLIDUM, SIFILISA IZRAISĪTĀJA, KAS IR AZYTROMICIN IZRAISĪTĀJS, EPIDĒMIJAS IZPLEŠANĀS. ŠĪ ANTIBIOTIKA NETIEK LIETOTA REGULĀRI, LAI CĪNĪTOS AR INFEKCIJĀM, KO IZRAISA ŠĪ BAKTĒRIJA, BET TO BIEŽI LIETO CITU STS, PIEMĒRAM, GONOREJAS UN HLAMĪDIJAS, ĀRSTĒŠANĀ. REZUMĒJOT, ŠIS PROJEKTS APVIENOS PLAŠA MĒROGA BAKTĒRIJU GENOMU ANALĪZI, EKSPERIMENTĀLO EVOLŪCIJU UN MOLEKULĀRO UN EVOLŪCIJAS EPIDEMIOLOĢIJU, LAI PĒTĪTU EPIDĒMIJAS DINAMIKU UN ANTIBIOTIKU REZISTENCES GĒNU MOBILIZĀCIJU VALENSIJAS APGABALĀ. GAIDĀMIE REZULTĀTI IR BŪTISKI SABIEDRĪBAS VESELĪBAS IESTĀDĒM, UN VIENLAIKUS TIE VEICINĀS MŪSU PAMATZINĀŠANAS PAR MULTIPLĀS REZISTENCES PRET ANTIBIOTIKĀM ATTĪSTĪBU. (Latvian)
4 August 2022
0 references
TÁ FRITHSHEASMHACHT IN AGHAIDH ANTAIBHEATHACH AR CHEANN DE NA BAGAIRTÍ MÓRA DON TSLÁINTE PHOIBLÍ. TÁ ÁR NGRÚPA TAIGHDE AG OBAIR LE BLIANTA FADA I GCUR I BHFEIDHM MODHANNA GÉINEOLAÍOCHTA ÉABHLÓIDE AGUS DAONRA CHUN STAIDÉAR A DHÉANAMH AR MHIOCRORGÁNAIGH PHATAIGINEACHA, AR A DTUGTAR EIPIDÉIMEOLAÍOCHT MHÓILÍNEACH. SEACHAS A BHEITH AG OBAIR AR CHEISTEANNA A BHAINEANN GO HEOLAÍOCH LE HÁBHAR, NÍ MÓR DÚINN FADHBANNA A IONCHORPRÚ Ó AGUS TORTHAÍ ÁBHARTHA A THABHAIRT AR AIS D’ÚDARÁIS SLÁINTE POIBLÍ, RUD A BHAINT AMACH CUR I BHFEIDHM SUIMIÚIL AGUS FRUTIFUL DE SMACHT BITHEOLAÍOCH BUNÚSACH. SA CHOMHTHÉACS SEO, TÁ AN TIONSCADAL SEO DÍRITHE AR STAIDÉAR A DHÉANAMH AR BHAILIÚCHÁN IONCHASACH D’AONRAÍGH DE BHAICTÉAR KLEBSIELLA PNEUMONIAE A BHAINEANN LE SLÁINTE CHLINICIÚIL AGUS LE SLÁINTE PHOIBLÍ, CHUN ANAILÍS A DHÉANAMH AR NA PRÓISIS ÉABHLÓIDEACHA A THÉANN I BHFEIDHM AR A DHINIMIC SA COMUNIDAD VALENCIANA, A BHFUIL SPÉIS AR LEITH ACU I DTRÉITHCHINEÁLACHA ATÁ FRITHSHEASMHACH IN AGHAIDH ANTAIBHEATHACH. MAR GHEALL AR A N-ÁBHARTHACHT CHLINICIÚIL AGUS SLÁINTE POIBLÍ, DÍREOIMID AR THRÉITHCHINEÁLACHA A THÁIRGEANN BETA-LACTAMASE SPEICTRIM SÍNTE AGUS/NÓ CARBAIPEINEIMÉIME. TÁ GO LEOR DE NA GÉINTE ATÁ FREAGRACH AS NA FEINITÍOPAÍ SEO SUITE AR PHLASIMÍDÍ IS FÉIDIR A AISTRIÚ GO HÉASCA I MEASC TRÉITHCHINEÁLACHA NIÚMÓINE K. NÓ Ó SPEICIS EILE ISTEACH IONTU. DÁ BHRÍ SIN, BEIDH SÉ MAR SPRIOC AR LEITH ACH A BHAINEANN GO DLÚTH LE TRÉITHRIÚ NA PLASMIDS, A N-DINIMIC SLÓGADH ACH, MAR ÚRNUACHT, A IARMHAIRTÍ OIRIÚNAITHEACHA MAR A LÉIRÍTEAR IAD INA N-SEICHIMH GHÉANÓIM. TÁ SUIM AGAINN GO HÁIRITHE SNA HIDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ IDIR GÉINTE PLASMID AGUS IDIR NA AGUS IAD SIÚD SA CRÓMASÓIM BAICTÉARACH, AR A DTUGTAR EPISTASIS. BA MHAITH LINN STAIDÉAR A DHÉANAMH AR ÁBHARTHACHT EPISTASIS I MBUNÚ AGUS LEATHNÚ AR MULTIRRESISTANCE CHUN ANTAIBHEATHAIGH. TABHARFAR AGHAIDH AR AN BPOINTE SEO FREISIN LE CUR CHUIGE AN-DIFRIÚIL, AG BAINT ÚSÁIDE AS ÉABHLÓID THURGNAMHACH I GCULTÚIR SAOTHARLAINNE. SA SPRIOC SEO, OIBREOIMID LE ROINNT LINEAGES ÉABHLÓIDEACH, RUD A LIGFIDH DÚINN LEIBHÉAL BREISE CASTACHTA A IONCHORPRÚ LEIS AN ANAILÍS AR EPISTASIS, AN CÚLRA GÉANÓMAÍOCH. EASCRAÍONN ÁR GCEATHRÚ SPRIOC AGUS AN SPRIOC DHEIREANACH Ó THORTHAÍ ROIMHE SEO SA TIONSCADAL REATHA BFU2014-58656-R LE TREPONEMA PALLIDUM. DÉANFAIMID ANAILÍS AR RÓL AN ATHCHUINGRITHE AGUS AN ROGHNÚCHÁIN NÁDÚRTHA I LEATHNÚ EIPIDÉIM LÍNE CLÓLACH DEN FHOSPEICEAS T. PALLIDUM PALLIDUM, GNÍOMHAIRE CÚISEACH SIFILIS, ATÁ FRITHSHEASMHACH DO AZYTROMICIN. NÍ ÚSÁIDTEAR AN T-ANTAIBHEATHACH SEO GO RIALTA CHUN NA HIONFHABHTUITHE A CHOMHRAC LEIS AN MBAICTÉAR SEO ACH ÚSÁIDTEAR GO MINIC É I GCÓIREÁIL STINNA EILE, MAR SHAMPLA GONORRHOEAE AGUS CLAMYDIASIS. MAR ACHOIMRE, COMHCHEANGLÓIDH AN TIONSCADAL SEO ANAILÍSÍ AR SCÁLA MÓR AR GHÉANÓIM BHAICTÉARACHA, ÉABHLÓID THURGNAMHACH, AGUS EIPIDÉIMEOLAÍOCHT MHÓILÍNEACH AGUS ÉABHLÓIDEACH CHUN STAIDÉAR A DHÉANAMH AR DHINIMIC EIPIDÉIME AGUS AR SHLÓGADH GÉINTE FRITHSHEASMHACHTA IN AGHAIDH ANTAIBHEATHACH SA COMUNIDAD VALENCIANA. TÁ NA TORTHAÍ A BHFUILTEAR AG SÚIL LEO ÁBHARTHA D’ÚDARÁIS SLÁINTE POIBLÍ AGUS, AG AN AM CÉANNA, CUIDEOIDH SIAD LENÁR MBUNEOLAS MAIDIR LE HILFHRITHSHEASMHACHT IN AGHAIDH ANTAIBHEATHACH A FHORBAIRT. (Irish)
4 August 2022
0 references
ODPORNOST NA ANTIBIOTIKE JE ENA OD GLAVNIH NEVARNOSTI ZA JAVNO ZDRAVJE. NAŠA RAZISKOVALNA SKUPINA SE ŽE VRSTO LET UKVARJA Z UPORABO METOD EVOLUCIJE IN POPULACIJSKE GENETIKE ZA PREUČEVANJE PATOGENIH MIKROORGANIZMOV V TAKO IMENOVANI MOLEKULARNI EPIDEMIOLOGIJI. POLEG VPRAŠANJ, KI SO POMEMBNA ZA ZNANOST, VKLJUČUJEMO PROBLEME IZ JAVNIH ZDRAVSTVENIH ORGANOV IN JIM VRAČAMO USTREZNE REZULTATE, S ČIMER DOSEŽEMO ZANIMIVO IN NERODNO UPORABO OSNOVNE BIOLOŠKE DISCIPLINE. V TEM OKVIRU JE TA PROJEKT NAMENJEN PREUČEVANJU VELIKE PROSPEKTIVNE ZBIRKE IZOLATOV KLINIČNO IN JAVNOZDRAVSTVENE BAKTERIJE KLEBSIELLA PNEUMONIAE, DA BI ANALIZIRALI EVOLUCIJSKE PROCESE, KI VPLIVAJO NA NJENO DINAMIKO V REGIJI COMUNIDAD VALENCIANA, S POSEBNIM ZANIMANJEM ZA SEVE, ODPORNE NA ANTIBIOTIKE. ZARADI NJIHOVEGA KLINIČNEGA IN JAVNOZDRAVSTVENEGA POMENA SE BOMO OSREDOTOČILI NA RAZŠIRJENE SEVE BETA-LAKTAMAZE IN/ALI KARBAPENEMAZE. VELIKO GENOV, KI SO ODGOVORNI ZA TE FENOTIPE, SE NAHAJA NA PLAZMIDIH, KI JIH JE MOGOČE ZLAHKA PRENESTI MED SEVI K. PNEUMONIAE ALI IZ DRUGIH VRST VANJE. ZATO BO LOČEN, A TESNO POVEZAN CILJ KARAKTERIZACIJA TEH PLAZMIDOV, NJIHOVA MOBILIZACIJA DINAMIKE, VENDAR KOT NOVOST, NJIHOVE PRILAGODITVENE POSLEDICE, KOT SE ODRAŽAJO V NJIHOVIH GENOMSKIH ZAPOREDJIH. ŠE POSEBEJ NAS ZANIMAJO INTERAKCIJE MED PLAZMIDNIMI GENI IN MED NJIMI IN TISTIMI V BAKTERIJSKEM KROMOSOMU, KAR JE ZNANO KOT EPISTAZA. RADI BI PREUČILI POMEN EPISTAZ PRI USTANAVLJANJU IN ŠIRJENJU ZDRAVILA MULTIRRESISTANCE NA ANTIBIOTIKE. TA TOČKA BO OBRAVNAVANA TUDI Z ZELO DRUGAČNIM PRISTOPOM Z UPORABO EKSPERIMENTALNEGA RAZVOJA V LABORATORIJSKIH KULTURAH. V TA NAMEN BOMO DELALI Z VEČ EVOLUCIJSKIMI LINIJAMI, KI NAM BODO OMOGOČILE VKLJUČITEV DODATNE STOPNJE KOMPLEKSNOSTI ANALIZE EPISTAZ, GENOMSKEGA OZADJA. NAŠ ČETRTI IN ZADNJI CILJ IZHAJA IZ PREJŠNJIH REZULTATOV SEDANJEGA PROJEKTA BFU2014–58656-R Z TREPONEMA PALLIDUM. ANALIZIRALI BOMO VLOGO REKOMBINACIJE IN NARAVNE SELEKCIJE PRI EPIDEMIJI ŠIRJENJA KLONSKEGA RODU PODVRSTE T. PALLIDUM PALLIDUM, POVZROČITELJA SIFILISA, KI JE RESITANTEN NA AZYTROMICIN. TA ANTIBIOTIK SE NE UPORABLJA REDNO ZA BOJ PROTI OKUŽBAM S TO BAKTERIJO, VENDAR SE POGOSTO UPORABLJA PRI ZDRAVLJENJU DRUGIH SPOLNO PRENOSLJIVIH BOLEZNI, KOT SO GONOREJE IN KLAMIDIJAZA. ČE POVZAMEMO, BO TA PROJEKT ZDRUŽIL OBSEŽNE ANALIZE BAKTERIJSKIH GENOMOV, EKSPERIMENTALNE EVOLUCIJE TER MOLEKULARNE IN EVOLUCIJSKE EPIDEMIOLOGIJE ZA PREUČEVANJE DINAMIKE EPIDEMIJE IN MOBILIZACIJE GENOV ZA ODPORNOST NA ANTIBIOTIKE V COMUNIDAD VALENCIANA. PRIČAKOVANI REZULTATI SO POMEMBNI ZA JAVNOZDRAVSTVENE ORGANE IN BODO HKRATI PRISPEVALI K NAŠEMU OSNOVNEMU ZNANJU O RAZVOJU VEČKRATNE ODPORNOSTI NA ANTIBIOTIKE. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
РЕЗИСТЕНТНОСТТА КЪМ АНТИБИОТИЦИ Е ЕДНА ОТ ОСНОВНИТЕ ЗАПЛАХИ ЗА ОБЩЕСТВЕНОТО ЗДРАВЕ. НАШАТА ИЗСЛЕДОВАТЕЛСКА ГРУПА РАБОТИ В ПРОДЪЛЖЕНИЕ НА МНОГО ГОДИНИ В ПРИЛАГАНЕТО НА ЕВОЛЮЦИЯТА И ПОПУЛАЦИОННИТЕ МЕТОДИ ЗА ИЗСЛЕДВАНЕ НА ПАТОГЕННИ МИКРООРГАНИЗМИ, В Т.НАР. МОЛЕКУЛЯРНА ЕПИДЕМИОЛОГИЯ. ОСВЕН ЧЕ РАБОТИМ ПО НАУЧНО ЗНАЧИМИ ВЪПРОСИ, НИЕ ВКЛЮЧВАМЕ ПРОБЛЕМИ И ВРЪЩАМЕ СЪОТВЕТНИТЕ РЕЗУЛТАТИ НА ОРГАНИТЕ ЗА ОБЩЕСТВЕНО ЗДРАВЕОПАЗВАНЕ, КАТО ПО ТОЗИ НАЧИН ПОСТИГАМЕ ИНТЕРЕСНО И НЕУДОВЛЕТВОРЕНО ПРИЛАГАНЕ НА ОСНОВНА БИОЛОГИЧНА ДИСЦИПЛИНА. В ТОЗИ КОНТЕКСТ ТОЗИ ПРОЕКТ Е НАСОЧЕН КЪМ ПРОУЧВАНЕ НА ГОЛЯМА ПОТЕНЦИАЛНА КОЛЕКЦИЯ ОТ ИЗОЛАТИ ОТ КЛИНИЧНО И ЗНАЧИМА ЗА ОБЩЕСТВЕНОТО ЗДРАВЕ БАКТЕРИЯ, KLEBSIELLA PNEUMONIAE, ЗА ДА СЕ АНАЛИЗИРАТ ЕВОЛЮЦИОННИТЕ ПРОЦЕСИ, КОИТО ВЛИЯЯТ НА НЕЙНАТА ДИНАМИКА В COMUNIDAD VALENCIANA, СЪС СПЕЦИАЛЕН ИНТЕРЕС КЪМ РЕЗИСТЕНТНИ КЪМ АНТИБИОТИЦИ ЩАМОВЕ. ПОРАДИ ТЯХНОТО КЛИНИЧНО ЗНАЧЕНИЕ И ЗНАЧЕНИЕ ЗА ОБЩЕСТВЕНОТО ЗДРАВЕ, ЩЕ СЕ СЪСРЕДОТОЧИМ ВЪРХУ ЩАМОВЕТЕ, ПРОИЗВЕЖДАЩИ БЕТА-ЛАКТАМАЗА И/ИЛИ КАРБАПЕНЕМАЗА С РАЗШИРЕН СПЕКТЪР. МНОГО ОТ ГЕНИТЕ, ОТГОВОРНИ ЗА ТЕЗИ ФЕНОТИПОВЕ, СЕ НАМИРАТ НА ПЛАЗМИДИ, КОИТО ЛЕСНО МОГАТ ДА БЪДАТ ПРЕХВЪРЛЕНИ МЕЖДУ ЩАМОВЕТЕ НА K. PNEUMONIAE ИЛИ ОТ ДРУГИ ВИДОВЕ В ТЯХ. СЛЕДОВАТЕЛНО ОТДЕЛНА, НО ТЯСНО СВЪРЗАНА ЦЕЛ ЩЕ БЪДЕ ХАРАКТЕРИЗИРАНЕТО НА ТЕЗИ ПЛАЗМИДИ, ТЯХНАТА ДИНАМИКА НА МОБИЛИЗАЦИЯ, НО КАТО НОВОСТ, НЕЙНИТЕ АДАПТИВНИ ПОСЛЕДИЦИ, ТЪЙ КАТО ТЕ СА ОТРАЗЕНИ В ТЕХНИТЕ ГЕНОМНИ ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТИ. ОСОБЕНО СЕ ИНТЕРЕСУВАМЕ ОТ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯТА МЕЖДУ ПЛАЗМИДИТЕ И МЕЖДУ ТЯХ И ТЕЗИ В БАКТЕРИАЛНАТА ХРОМОЗОМА, КОЕТО Е ИЗВЕСТНО КАТО ЕПИСТАЗА. ИСКАМЕ ДА ПРОУЧИМ ЗНАЧЕНИЕТО НА ЕПИСТАЗАТА В СЪЗДАВАНЕТО И РАЗШИРЯВАНЕТО НА MULTIRRESISTANCE ЗА АНТИБИОТИЦИ. ТОЗИ ВЪПРОС ЩЕ БЪДЕ РАЗГЛЕДАН И С МНОГО РАЗЛИЧЕН ПОДХОД, КАТО СЕ ИЗПОЛЗВА ЕКСПЕРИМЕНТАЛНА ЕВОЛЮЦИЯ В ЛАБОРАТОРНИ КУЛТУРИ. В ТАЗИ ЦЕЛ ЩЕ РАБОТИМ С НЯКОЛКО ЕВОЛЮЦИОННИ ЛИНИИ, КОИТО ЩЕ НИ ПОЗВОЛЯТ ДА ВКЛЮЧИМ ДОПЪЛНИТЕЛНО НИВО НА СЛОЖНОСТ КЪМ АНАЛИЗА НА ЕПИСТАЗАТА, ГЕНОМНИЯ ФОН. ЧЕТВЪРТАТА НИ И ПОСЛЕДНА ЦЕЛ ПРОИЗТИЧА ОТ ПРЕДИШНИ РЕЗУЛТАТИ ПО НАСТОЯЩИЯ ПРОЕКТ БФУ2014—58656-R С TREPONEMA PALLIDUM. ЩЕ АНАЛИЗИРАМЕ РОЛЯТА НА РЕКОМБИНАЦИЯТА И ЕСТЕСТВЕНИЯ ПОДБОР В ЕПИДЕМИЧНОТО РАЗШИРЕНИЕ НА КЛОНАЛНОТО ПОТЕКЛО НА ПОДВИДА T. PALLIDUM PALLIDUM, ПРИЧИНИТЕЛ НА СИФИЛИС, КОЙТО Е РЕИТАНТ НА AZYTROMICIN. ТОЗИ АНТИБИОТИК НЕ СЕ ИЗПОЛЗВА РЕДОВНО ЗА БОРБА С ИНФЕКЦИИТЕ ОТ ТАЗИ БАКТЕРИЯ, НО ЧЕСТО СЕ ИЗПОЛЗВА ЗА ЛЕЧЕНИЕ НА ДРУГИ ПОЛОВО ПРЕДАВАНИ ИНФЕКЦИИ, КАТО ГОНОРЕИ И ХЛАМИДОЗА. В ОБОБЩЕНИЕ, ТОЗИ ПРОЕКТ ЩЕ СЪЧЕТАЕ МАЩАБНИ АНАЛИЗИ НА БАКТЕРИАЛНИ ГЕНОМИ, ЕКСПЕРИМЕНТАЛНА ЕВОЛЮЦИЯ И МОЛЕКУЛЯРНА И ЕВОЛЮЦИОННА ЕПИДЕМИОЛОГИЯ ЗА ИЗСЛЕДВАНЕ НА ЕПИДЕМИЧНАТА ДИНАМИКА И МОБИЛИЗИРАНЕТО НА ГЕНИТЕ ЗА АНТИБИОТИЧНА РЕЗИСТЕНТНОСТ В COMUNIDAD VALENCIANA. ОЧАКВАНИТЕ РЕЗУЛТАТИ СА ОТ ЗНАЧЕНИЕ ЗА ОРГАНИТЕ ЗА ОБЩЕСТВЕНО ЗДРАВЕОПАЗВАНЕ И ЕДНОВРЕМЕННО С ТОВА ЩЕ ДОПРИНЕСАТ ЗА ОСНОВНИТЕ НИ ПОЗНАНИЯ ЗА РАЗВИТИЕТО НА МНОЖЕСТВЕНАТА РЕЗИСТЕНТНОСТ КЪМ АНТИБИОТИЦИ. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
IR-REŻISTENZA GĦALL-ANTIBIJOTIĊI HIJA WAĦDA MIT-THEDDIDIET EWLENIN GĦAS-SAĦĦA PUBBLIKA. GRUPP TA ‘RIĊERKA TAGĦNA ILHA TAĦDEM GĦAL ĦAFNA SNIN FL-APPLIKAZZJONI TA’ EVOLUZZJONI U L-METODI ĠENETIĊI POPOLAZZJONI BIEX JISTUDJAW MIKROORGANIŻMI PATOĠENIĊI, F’DAK LI HUWA MAGĦRUF BĦALA EPIDEMJOLOĠIJA MOLEKULARI. MINBARRA L-ĦIDMA FUQ KWISTJONIJIET XJENTIFIKAMENT RILEVANTI, AĦNA NINKORPORAW PROBLEMI MINN U NIRRITORNAW RIŻULTATI RILEVANTI LILL-AWTORITAJIET TAS-SAĦĦA PUBBLIKA, U B’HEKK NIKSBU APPLIKAZZJONI INTERESSANTI U PRODUTTIVA TA’ DIXXIPLINA BIJOLOĠIKA BAŻIKA. F’DAN IL-KUNTEST, DAN IL-PROĠETT GĦANDU L-GĦAN LI JISTUDJA ĠABRA PROSPETTIVA KBIRA TA’ IŻOLATI TA’ BATTERJU KLINIKAMENT U PUBBLIKU RILEVANTI, KLEBSIELLA PNEUMONIAE, BIEX JANALIZZA L-PROĊESSI EVOLUZZJONARJI LI JAFFETTWAW ID-DINAMIKA TIEGĦU FIL-COMUNIDAD VALENCIANA, B’INTERESS SPEĊJALI F’RAZEZ REŻISTENTI GĦALL-ANTIBIJOTIĊI. MINĦABBA R-RILEVANZA KLINIKA U TAS-SAĦĦA PUBBLIKA TAGĦHOM, AĦNA SE NIFFOKAW FUQ RAZEZ LI JIPPRODUĊU L-BETA-LACTAMASE U/JEW IL-KARBAPENEMAŻI TA’ L-ISPETTRU ESTIŻ. ĦAFNA MILL-ĠENI RESPONSABBLI GĦAL DAWN IL-FENOTIPI JINSABU FUQ PLASMIDI LI JISTGĦU FAĊILMENT JIĠU TRASFERITI FOST RAZEZ K. PNEUMONIAE JEW MINN SPEĊI OĦRA ĠO FIHOM. KONSEGWENTEMENT, GĦAN SEPARAT IŻDA RELATAT MILL-QRIB SE JKUN IL-KARATTERIZZAZZJONI TA’ DAWN IL-PLASMIDI, ID-DINAMIKA TAL-MOBILIZZAZZJONI TAGĦHOM IŻDA, BĦALA NOVITÀ, IL-KONSEGWENZI ADATTIVI TAGĦHA KIF HUMA RIFLESSI FIS-SEKWENZI TAL-ĠENOMA TAGĦHOM. AĦNA PARTIKOLARMENT INTERESSATI FL-INTERAZZJONIJIET BEJN ĠENI PLASMID U BEJN DAWN U DAWK FIL-KROMOŻOMA BATTERIKA, DAK LI HUWA MAGĦRUF BĦALA EPISTASI. IRRIDU NISTUDJAW IR-RILEVANZA TAL-EPISTASI FL-ISTABBILIMENT U L-ESPANSJONI FUQ MULTIRRESISTANCE GĦALL-ANTIBIJOTIĊI. DAN IL-PUNT SE JIĠI INDIRIZZAT UKOLL B’APPROĊĊ DIFFERENTI ĦAFNA, BL-UŻU TA’ EVOLUZZJONI SPERIMENTALI FIL-KULTURI TAL-LABORATORJU. F’DAN IL-GĦAN, AĦNA SE TAĦDEM MA ‘DIVERSI LINEAGES EVOLUZZJONARJU, LI SE JIPPERMETTILNA LI JINKORPORAW LIVELL ADDIZZJONALI TA’ KUMPLESSITÀ GĦALL-ANALIŻI TA ‘EPISTASIS, L-ISFOND ĠENOMIKU. IR-RABA’ U L-AĦĦAR GĦAN TAGĦNA JIRRIŻULTAW MINN RIŻULTATI PREĊEDENTI FIL-PROĠETT ATTWALI BFU2014–58656-R MA’ TREPONEMA PALLIDUM. AĦNA SE NANALIZZAW IR-RWOL TAR-RIKOMBINAZZJONI U L-GĦAŻLA NATURALI FL-ESPANSJONI EPIDEMIKA TA’ NISEL KLONALI TAS-SOTTOSPEĊI T. PALLIDUM PALLIDUM, L-AĠENT KAWŻALI TAS-SIFILIDE, LI HUWA RESITANTI GĦAL AZYTROMICIN. DAN L-ANTIBIJOTIKU MA JINTUŻAX REGOLARMENT BIEX JIĠĠIELED L-INFEZZJONIJIET MINN DAN IL-BATTERJU IŻDA JINTUŻA TA’ SPISS FIT-TRATTAMENT TA’ STIS OĦRA, BĦAL GONORRHOEAE U KLAMIDJASI. FIL-QOSOR, DAN IL-PROĠETT SE JIKKOMBINA ANALIŻI FUQ SKALA KBIRA TA’ ĠENOMI BATTERIĊI, EVOLUZZJONI SPERIMENTALI, U EPIDEMJOLOĠIJA MOLEKULARI U EVOLUZZJONARJA BIEX TIĠI STUDJATA D-DINAMIKA EPIDEMIKA U L-MOBILIZZAZZJONI TA’ ĠENI TA’ REŻISTENZA ANTIBIJOTIKA FIL-COMUNIDAD VALENCIANA. IR-RIŻULTATI MISTENNIJA HUMA RILEVANTI GĦALL-AWTORITAJIET TAS-SAĦĦA PUBBLIKA U, FL-ISTESS ĦIN, SE JIKKONTRIBWIXXU GĦALL-GĦARFIEN BAŻIKU TAGĦNA DWAR L-EVOLUZZJONI TA’ DIVERSI REŻISTENZI GĦALL-ANTIBIJOTIĊI. (Maltese)
4 August 2022
0 references
A resistência antibiótica é uma das maiores ameaças à saúde pública. O NOSSO GRUPO DE INVESTIGAÇÃO TEM TRABALHADO ANOS NA APLICAÇÃO DOS MÉTODOS GÉNICOS DE EVOLUÇÃO E POPULAÇÃO PARA O ESTUDO DOS MICROORGANISMOS PATHOGÉNICOS, NO QUE É CONHECIDO COMO EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR. Para além de trabalharmos em questões científicas relevantes, incorporamos problemas de resultados relevantes para as autoridades de saúde pública e devolvemos-lhes esses resultados, obtendo assim uma aplicação interessante e frutífera de uma disciplina biológica de base. Neste contexto, o presente projecto destina-se a estudar uma vasta recolha prospectiva de isolatos de um bactéria clinicamente e publicamente relevante para a saúde, KLEBSIELLA PNEUMONIAE, a fim de analisar os processos evolutivos que afectam a sua dinâmica na Valência comunitária, com especial interesse nas estirpes resistentes aos antibióticos. Devido à sua relevância clínica e pública para a saúde, vamos concentrar-nos em formas de produção de beta-lactamases e/ou carbapenemases alargadas. Muitos dos genes responsáveis por estes fenótipos estão localizados em plasmas que podem ser facilmente transferidos entre as estirpes K. PNEUMONIAE ou de outras espécies para elas. Consequentemente, um objectivo específico, mas estreitamente relacionado, será a caracterização destes plasmas, a sua dinâmica de mobilidade, mas, como é óbvio, as suas consequências adaptativas, tal como são reflectidas nas suas sequências genéticas. Estamos particularmente interessados nas interações entre os genes do plasmo e entre estes e aqueles no cromossomo bacteriano, o que é conhecido como EPISTA. QUEREMOS ESTUDAR A RELEVÂNCIA DA EPISTA NO ESTABELECIMENTO E EXPANSÃO DA MULTIRRESISTÊNCIA AOS ANTIBIÓTICOS. Este ponto será igualmente abordado com uma abordagem muito diferente, utilizando a evolução experimental nas culturas laboratoriais. Neste objetivo, trabalharemos com várias linhas evolutivas, que nos permitirão incorporar um nível adicional de completude à análise da EPISTA, o contexto genómico. NOSSO QUARTO E ÚLTIMO OBJETIVO DE RESULTADOS ANTERIORES NO ATUAL PROJETO BFU2014-58656-R COM TREPONEMA PALLIDUM. Analisaremos o papel da recombinação e da selecção natural na expansão epidémica de uma linhagem CLONAL das substâncias T. PALLIDUM PALLIDUM, agente causal da sifilis, que é resistente à azitromicina. Este antibiótico não é usado regularmente para combater as infecções por este ácido, mas é frequentemente utilizado no tratamento de outras doenças, como a gonorreia e a clamidíase. Para resumir, este projecto combinará análises de grandes dimensões de genes bacterianos, de evolução experimental e de epidemiologia molecular e evolutiva para estudar a dinâmica epidémica e a MOBILIZAÇÃO dos genes de resistência antibiótica na Valência comunitária. Os resultados esperados são relevantes para as autoridades de saúde pública e, simultaneamente, contribuirão para o nosso conhecimento básico sobre a evolução de múltiplas resistências aos antibióticos. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
ANTIBIOTIKARESISTENS ER EN AF DE STØRSTE TRUSLER MOD FOLKESUNDHEDEN. VORES FORSKERGRUPPE HAR I MANGE ÅR ARBEJDET MED ANVENDELSE AF EVOLUTIONS- OG POPULATIONSGENETIKMETODER TIL UNDERSØGELSE AF PATOGENE MIKROORGANISMER I DET, DER KALDES MOLEKYLÆR EPIDEMIOLOGI. UD OVER AT ARBEJDE MED VIDENSKABELIGT RELEVANTE SPØRGSMÅL INDARBEJDER VI PROBLEMER FRA OG RETURNERER RELEVANTE RESULTATER TIL DE OFFENTLIGE SUNDHEDSMYNDIGHEDER, HVORVED VI OPNÅR EN INTERESSANT OG FRUTIFUL ANVENDELSE AF EN GRUNDLÆGGENDE BIOLOGISK DISCIPLIN. I DENNE FORBINDELSE HAR DETTE PROJEKT TIL FORMÅL AT UNDERSØGE EN STOR POTENTIEL SAMLING AF ISOLATER AF EN KLINISK OG FOLKESUNDHEDSMÆSSIG RELEVANT BAKTERIE, KLEBSIELLA PNEUMONIAE, FOR AT ANALYSERE DE EVOLUTIONÆRE PROCESSER, DER PÅVIRKER DETS DYNAMIK I COMUNIDAD VALENCIANA, MED SÆRLIG INTERESSE FOR ANTIBIOTIKARESISTENTE STAMMER. PÅ GRUND AF DERES KLINISKE OG FOLKESUNDHEDSMÆSSIGE RELEVANS VIL VI FOKUSERE PÅ UDVIDET SPEKTRUM BETA-LACTAMASE OG/ELLER CARBAPENEMASE PRODUCERER STAMMER. MANGE AF DE GENER, DER ER ANSVARLIGE FOR DISSE FÆNOTYPER, ER PLACERET PÅ PLASMIDER, DER LET KAN OVERFØRES MELLEM K. PNEUMONIAE-STAMMER ELLER FRA ANDRE ARTER TIL DEM. DERFOR VIL ET SEPARAT, MEN NÆRT BESLÆGTET MÅL VÆRE KARAKTERISERINGEN AF DISSE PLASMIDER, DERES MOBILISERINGSDYNAMIK, MEN SOM EN NYHED, DENS ADAPTIVE KONSEKVENSER, DA DE AFSPEJLES I DERES GENOMSEKVENSER. VI ER SÆRLIGT INTERESSEREDE I SAMSPILLET MELLEM PLASMIDGENER OG MELLEM DISSE OG DEM I BAKTERIEKROMOSOMET, DET SÅKALDTE EPISTASIS. VI ØNSKER AT UNDERSØGE RELEVANSEN AF EPISTASE I ETABLERING OG UDVIDELSE PÅ MULTIRRESISTANCE TIL ANTIBIOTIKA. DETTE PUNKT VIL OGSÅ BLIVE BEHANDLET MED EN MEGET ANDEN TILGANG, HVOR DER ANVENDES EKSPERIMENTEL UDVIKLING I LABORATORIEKULTURER. I DETTE MÅL VIL VI ARBEJDE MED FLERE EVOLUTIONÆRE SLÆGTER, SOM VIL GØRE DET MULIGT FOR OS AT INDARBEJDE ET YDERLIGERE NIVEAU AF KOMPLEKSITET TIL ANALYSEN AF EPISTASE, DEN GENOMISKE BAGGRUND. VORES FJERDE OG SIDSTE MÅL STAMMER FRA TIDLIGERE RESULTATER I DET NUVÆRENDE PROJEKT BFU2014-58656-R MED TREPONEMA PALLIDUM. VI VIL ANALYSERE BETYDNINGEN AF REKOMBINATION OG KVALITETSVALG I DEN EPIDEMISKE UDVIDELSE AF EN KLONAFSTAMNING AF UNDERARTEN T. PALLIDUM PALLIDUM, DEN KAUSALE AGENS FOR SYFILIS, SOM ER RESITANT FOR AZYTROMICIN. DETTE ANTIBIOTIKUM ANVENDES IKKE REGELMÆSSIGT TIL AT BEKÆMPE INFEKTIONER MED DENNE BAKTERIE, MEN DET ANVENDES OFTE TIL BEHANDLING AF ANDRE SEKSUELT OVERFØRTE SYGDOMME, SÅSOM GONORRÉ OG KLAMYDIASIS. SAMMENFATTENDE VIL DETTE PROJEKT KOMBINERE OMFATTENDE ANALYSER AF BAKTERIELLE GENOMER, EKSPERIMENTEL EVOLUTION OG MOLEKYLÆR OG EVOLUTIONÆR EPIDEMIOLOGI FOR AT UNDERSØGE EPIDEMIDYNAMIKKEN OG MOBILISERINGEN AF ANTIBIOTIKARESISTENSGENER I COMUNIDAD VALENCIANA. DE FORVENTEDE RESULTATER ER RELEVANTE FOR DE OFFENTLIGE SUNDHEDSMYNDIGHEDER OG VIL SAMTIDIG BIDRAGE TIL VORES GRUNDLÆGGENDE VIDEN OM UDVIKLINGEN AF FLERE ANTIBIOTIKARESISTENSER. (Danish)
4 August 2022
0 references
REZISTENȚA LA ANTIBIOTICE ESTE UNA DINTRE PRINCIPALELE AMENINȚĂRI LA ADRESA SĂNĂTĂȚII PUBLICE. GRUPUL NOSTRU DE CERCETARE LUCREAZĂ DE MULȚI ANI ÎN APLICAREA METODELOR DE EVOLUȚIE ȘI GENETICĂ A POPULAȚIEI PENTRU STUDIEREA MICROORGANISMELOR PATOGENE, ÎN CEEA CE ESTE CUNOSCUT SUB NUMELE DE EPIDEMIOLOGIE MOLECULARĂ. PE LÂNGĂ FAPTUL CĂ LUCRĂM LA CHESTIUNI RELEVANTE DIN PUNCT DE VEDERE ȘTIINȚIFIC, INCLUDEM PROBLEME DIN PARTEA AUTORITĂȚILOR DE SĂNĂTATE PUBLICĂ ȘI RETURNĂM REZULTATELE RELEVANTE, REALIZÂND ASTFEL O APLICARE INTERESANTĂ ȘI IMPERIOASĂ A UNEI DISCIPLINE BIOLOGICE DE BAZĂ. ÎN ACEST CONTEXT, ACEST PROIECT ARE CA SCOP STUDIEREA UNEI MARI COLECȚII PROSPECTIVE DE IZOLATE ALE UNEI BACTERII RELEVANTE DIN PUNCT DE VEDERE CLINIC ȘI DE SĂNĂTATE PUBLICĂ, KLEBSIELLA PNEUMONIAE, PENTRU A ANALIZA PROCESELE EVOLUTIVE CARE AFECTEAZĂ DINAMICA SA ÎN COMUNIDAD VALENCIANA, CU UN INTERES SPECIAL PENTRU TULPINILE REZISTENTE LA ANTIBIOTICE. DATORITĂ RELEVANȚEI LOR CLINICE ȘI PENTRU SĂNĂTATEA PUBLICĂ, NE VOM CONCENTRA ASUPRA TULPINILOR PRODUCĂTOARE DE BETA-LACTAMAZĂ ȘI/SAU CARBAPENEMAZĂ CU SPECTRU EXTINS. MULTE DINTRE GENELE RESPONSABILE PENTRU ACESTE FENOTIPURI SUNT LOCALIZATE PE PLASMIDE CARE POT FI UȘOR TRANSFERATE ÎNTRE TULPINILE K. PNEUMONIAE SAU DE LA ALTE SPECII ÎN ELE. ÎN CONSECINȚĂ, UN OBIECTIV SEPARAT, DAR STRÂNS LEGAT VA FI CARACTERIZAREA ACESTOR PLASMIDE, DINAMICA LOR DE MOBILIZARE, DAR, CA O NOUTATE, CONSECINȚELE ADAPTIVE ALE ACESTORA SUNT REFLECTATE ÎN SECVENȚELE LOR GENOMICE. SUNTEM DEOSEBIT DE INTERESAȚI DE INTERACȚIUNILE DINTRE GENELE PLASMIDICE ȘI DINTRE ACESTEA ȘI CELE DIN CROMOZOMUL BACTERIAN, CEEA CE ESTE CUNOSCUT SUB NUMELE DE EPISTAZĂ. DORIM SĂ STUDIEM RELEVANȚA EPISTAZEI ÎN STABILIREA ȘI EXTINDEREA PE MULTIRRESISTANCE LA ANTIBIOTICE. ACEST PUNCT VA FI ABORDAT, DE ASEMENEA, CU O ABORDARE FOARTE DIFERITĂ, UTILIZÂNDU-SE EVOLUȚIA EXPERIMENTALĂ ÎN CULTURILE DE LABORATOR. ÎN ACEST SCOP, VOM LUCRA CU MAI MULTE LINII EVOLUTIVE, CEEA CE NE VA PERMITE SĂ INCLUDEM UN NIVEL SUPLIMENTAR DE COMPLEXITATE LA ANALIZA EPISTAZEI, FUNDALUL GENOMIC. AL PATRULEA ȘI ULTIMUL NOSTRU OBIECTIV PROVINE DIN REZULTATELE ANTERIOARE ALE PROIECTULUI ACTUAL BFU2014-58656-R CU TREPONEMA PALLIDUM. VOM ANALIZA ROLUL RECOMBINARII SI SELECTIEI NATURALE IN EXTINDEREA EPIDEMIEI UNEI LINII CLONALE A SUBSPECIEI T. PALLIDUM PALLIDUM, AGENTUL CAUZAL AL SIFILISULUI, CARE REZINTA LA AZYTROMICIN. ACEST ANTIBIOTIC NU ESTE UTILIZAT ÎN MOD REGULAT PENTRU A COMBATE INFECȚIILE CU ACEASTĂ BACTERIE, DAR ESTE FRECVENT UTILIZAT ÎN TRATAMENTUL ALTOR STI, CUM AR FI GONORRHOEAE ȘI CHLAMYDIASIS. PE SCURT, ACEST PROIECT VA COMBINA ANALIZE PE SCARĂ LARGĂ ALE GENOMULUI BACTERIAN, EVOLUȚIA EXPERIMENTALĂ ȘI EPIDEMIOLOGIA MOLECULARĂ ȘI EVOLUTIVĂ PENTRU A STUDIA DINAMICA EPIDEMIEI ȘI MOBILIZAREA GENELOR DE REZISTENȚĂ LA ANTIBIOTICE ÎN COMUNIDAD VALENCIANA. REZULTATELE AȘTEPTATE SUNT RELEVANTE PENTRU AUTORITĂȚILE DIN DOMENIUL SĂNĂTĂȚII PUBLICE ȘI, ÎN ACELAȘI TIMP, VOR CONTRIBUI LA CUNOȘTINȚELE NOASTRE DE BAZĂ CU PRIVIRE LA EVOLUȚIA REZISTENȚEI MULTIPLE LA ANTIBIOTICE. (Romanian)
4 August 2022
0 references
ANTIBIOTIKARESISTENS ÄR ETT AV DE STÖRSTA HOTEN MOT FOLKHÄLSAN. VÅR FORSKARGRUPP HAR UNDER MÅNGA ÅR ARBETAT MED ATT TILLÄMPA EVOLUTIONS- OCH POPULATIONSGENETISKA METODER FÖR ATT STUDERA PATOGENA MIKROORGANISMER, I VAD SOM KALLAS MOLEKYLÄR EPIDEMIOLOGI. FÖRUTOM ATT ARBETA MED VETENSKAPLIGT RELEVANTA FRÅGOR INFÖRLIVAR VI PROBLEM FRÅN OCH ÅTERFÖR RELEVANTA RESULTAT TILL FOLKHÄLSOMYNDIGHETERNA, VILKET LEDER TILL EN INTRESSANT OCH SPARSAM TILLÄMPNING AV EN GRUNDLÄGGANDE BIOLOGISK DISCIPLIN. I DETTA SAMMANHANG SYFTAR DETTA PROJEKT TILL ATT STUDERA EN STOR PROSPEKTIV SAMLING ISOLAT AV EN KLINISKT OCH FOLKHÄLSORELEVANT BAKTERIE, KLEBSIELLA PNEUMONIAE, FÖR ATT ANALYSERA DE EVOLUTIONÄRA PROCESSER SOM PÅVERKAR DESS DYNAMIK I COMUNIDAD VALENCIANA, MED ETT SÄRSKILT INTRESSE FÖR ANTIBIOTIKARESISTENTA STAMMAR. PÅ GRUND AV DERAS KLINISKA OCH FOLKHÄLSORELATERADE RELEVANS KOMMER VI ATT FOKUSERA PÅ BETALAKTAMAS OCH/ELLER KARBAPENEMASPRODUCERANDE STAMMAR MED UTÖKAT SPEKTRUM. MÅNGA AV DE GENER SOM ÄR ANSVARIGA FÖR DESSA FENOTYPER FINNS PÅ PLASMIDER SOM LÄTT KAN ÖVERFÖRAS MELLAN K. PNEUMONIAE STAMMAR ELLER FRÅN ANDRA ARTER TILL DEM. FÖLJAKTLIGEN KOMMER ETT SEPARAT MEN NÄRA BESLÄKTAT MÅL ATT VARA KARAKTERISERINGEN AV DESSA PLASMIDER, DERAS MOBILISERINGSDYNAMIK, MEN SOM EN NYHET, DESS ADAPTIVA KONSEKVENSER NÄR DE ÅTERSPEGLAS I DERAS GENOMSEKVENSER. VI ÄR SÄRSKILT INTRESSERADE AV INTERAKTIONERNA MELLAN PLASMIDGENER OCH MELLAN DESSA OCH DEM I BAKTERIEKROMOSOMEN, VAD SOM KALLAS EPISTAS. VI VILL STUDERA RELEVANSEN AV EPISTAS I ETABLERINGEN OCH EXPANSIONEN AV MULTIRRESISTANCE TILL ANTIBIOTIKA. DENNA PUNKT KOMMER OCKSÅ ATT BEHANDLAS MED ETT MYCKET ANNORLUNDA TILLVÄGAGÅNGSSÄTT, MED HJÄLP AV EXPERIMENTELL UTVECKLING I LABORATORIEKULTURER. I DETTA MÅL KOMMER VI ATT ARBETA MED FLERA EVOLUTIONÄRA LINJER, VILKET KOMMER ATT GÖRA DET MÖJLIGT FÖR OSS ATT INFÖRLIVA EN YTTERLIGARE GRAD AV KOMPLEXITET TILL ANALYSEN AV EPISTAS, DEN GENOMISKA BAKGRUNDEN. VÅRT FJÄRDE OCH SISTA MÅL HÄRRÖR FRÅN TIDIGARE RESULTAT I DET NUVARANDE PROJEKTET BFU2014–58656-R MED TREPONEMA PALLIDUM. VI KOMMER ATT ANALYSERA ROLLEN AV REKOMBINATION OCH NATURLIGT URVAL I EPIDEMIEXPANSIONEN AV EN KLONSTAM AV UNDERARTEN T. PALLIDUM PALLIDUM, ORSAKSMEDLET FÖR SYFILIS, SOM ÄR RESITANT TILL AZYTROMICIN. DETTA ANTIBIOTIKUM ANVÄNDS INTE REGELBUNDET FÖR ATT BEKÄMPA INFEKTIONER AV DENNA BAKTERIE, MEN DET ANVÄNDS OFTA VID BEHANDLING AV ANDRA STI, SÅSOM GONORRÉ OCH KLAMYDIASIS. SAMMANFATTNINGSVIS KOMMER DETTA PROJEKT ATT KOMBINERA STORSKALIGA ANALYSER AV BAKTERIEGENOM, EXPERIMENTELL EVOLUTION OCH MOLEKYLÄR OCH EVOLUTIONÄR EPIDEMIOLOGI FÖR ATT STUDERA EPIDEMIDYNAMIKEN OCH MOBILISERINGEN AV ANTIBIOTIKARESISTENSGENER I COMUNIDAD VALENCIANA. DE FÖRVÄNTADE RESULTATEN ÄR RELEVANTA FÖR FOLKHÄLSOMYNDIGHETERNA OCH KOMMER SAMTIDIGT ATT BIDRA TILL VÅR GRUNDLÄGGANDE KUNSKAP OM UTVECKLINGEN AV MULTIPLA ANTIBIOTIKARESISTENSER. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Paterna
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
BFU2017-89594-R
0 references