OMICO AND METAOMICO STUDY OF THE EFFECT OF CONTAMINANTS THROUGH THE INTESTINAL-BRAIN MICROBIOTA AXIS. FROM ANIMAL MODEL TO CELL PHONE (MAMOMICS) (Q3190439)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3190439 in Spain
Language | Label | Description | Also known as |
---|---|---|---|
English | OMICO AND METAOMICO STUDY OF THE EFFECT OF CONTAMINANTS THROUGH THE INTESTINAL-BRAIN MICROBIOTA AXIS. FROM ANIMAL MODEL TO CELL PHONE (MAMOMICS) |
Project Q3190439 in Spain |
Statements
180,333.56 Euro
0 references
223,850.0 Euro
0 references
80.56 percent
0 references
1 January 2019
0 references
31 August 2022
0 references
UNIVERSIDAD DE HUELVA
0 references
21071
0 references
EL EQUIPO SOLICITANTE DEL SUBPROYECTO 1 TIENE UN MARCADO CARACTER MULTIDISCIPLINAR Y ESTA CONSTITUIDO POR INVESTIGADORES PERTENECIENTES A 2 UNIVERSIDADES (UHU Y UCO) Y 3 GRUPOS DE INVESTIGACION. SE INTEGRAN EN EL EQUIPO INVESTIGADOR UNA CATEDRATICA DE QUIMICA ANALITICA (IP-1, UHU, DRA. TAMARA GARCIA BARRERA, EXPERTA EN ESPECIACION QUIMICA Y METABOLOMICA) Y DOS PROFESORES TITULARES, LA DRA. NIEVES ABRIL, EXPERTA EN GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR (UCO) Y EL DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, EXPERTO EN BIOLOGIA CELULAR (UHU). EL SUBPROYECTO 1 SE CENTRA EN EL ESTUDIO DE LA RESPUESTA BIOLOGICA EN EL RATON DE LABORATORIO MUS MUSCULUS EXPUESTO A ¿COCTELES QUIMICOS¿ DE CONTAMINANTES EMERGENTES (FARMACOS) Y REGULADOS (METALES Y PLAGUICIDAS), CON ESPECIAL ENFASIS EN LA INTERACCION DE LOS MISMOS Y AL PAPEL DEL SELENIO COMO ANTAGONISTA. LA RESPUESTA BIOLOGICA SE EVALUARA A DOS NIVELES, POR UN LADO, A NIVEL MOLECULAR MEDIANTE ESTUDIOS DE ESPECIACION QUIMICA Y METALOMICA (IP-1,UHU), PARA CONOCER LAS ESPECIES QUIMICAS Y METALOBIOMOLECULAS EN TEJIDOS Y FLUIDOS BIOLOGICOS TRAS LA EXPOSICION, LA DETERMINACION Y CUANTIFICACION DE DAÑOS OXIDATIVOS EN PROTEINAS (PROTEOMICA REDOX, IP-2,UCO), FUNDAMENTAL CUANDO HAY EXPOSICION A CONTAMINANTES QUE PRODUCEN ESTRES OXIDATIVO Y METABOLOMICA (IP-1, UHU), QUE PERMITIRA RATIFICAR LAS HIPOTESIS QUE SE PLANTEAN A PARTIR DE LOS CAMBIOS EN LOS NIVELES DE EXPRESION TANTO A NIVEL DE TRANSCRITOS (TRANSCRIPTOMICA IP-2,UCO) COMO DE PROTEINAS (PROTEOMICA, IP-2, UCO). POR OTRO LADO, LA RESPUESTA BIOLOGICA SE EVALUARA A NIVEL BIOLOGICO MEDIANTE METAGENOMICA (IP-1 Y 2, UHU Y UCO), QUE PERMITIRA CONOCER LAS ALTERACIONES DE LOS MICROORGANISMOS CAUSADAS POR LA CONTAMINACION, CONCRETAMENTE POR COCTELES DE CONTAMINANTES Y EL ANTAGONISMO DEL SELENIO A TRAVES DE LA MICROBIOTA. ADEMAS, SE ESTUDIARA LA RELACION ENTRE LA MICROBIOTA Y LA BIODISPONIBILIDAD DE CONTAMINANTES IN VIVO E IN VITRO, MEDIANTE EL DISEÑO DE EXPERIENCIAS DE EXPOSICION PARALELAS EN CELULAS DE EPITELIO INTESTINAL (DR. F. NAVARRO, UHU). ASIMISMO, SE VALIDARAN LAS METODOLOGIAS EN CULTIVOS CELULARES, LO CUAL PERMITIRA PROPONER METODOS ALTERNATIVOS AL USO DE ANIMALES DE EXPERIMENTACION Y SU TRASLACION AL HOMBRE. EL PROYECTO QUE SE PRESENTA PRETENDE CONTINUAR LOS ESTUDIOS LLEVADOS A CABO DURANTE 5 PROYECTOS PREVIOS CONSECUTIVOS DEL PLAN NACIONAL DE I+D+I EN LOS QUE LAS IPS DEL PRESENTE PROYECTO HA PARTICIPADO Y EN LOS QUE SE EVOLUCIONO, DESDE LOS ESTUDIOS DE CONTAMINANTES EN EL PARQUE NACIONAL DE DOÑANA, AL ESTUDIO DE LA RESPUESTA BIOLOGICA MEDIANTE OMICAS EN MAMIFEROS E INVERTEBRADOS DE VIDA LIBRE, POSTERIORMENTE A LA INTEGRACION DE OMICAS EN ORGANISMOS MODELO DE LABORATORIO (MUS MUSCULUS) Y EXPERIENCIAS MUY INICIALES CON CELULAS, AL PRESENTE PROYECTO, EN EL QUE SE ESTUDIARA LA INFLUENCIA DE COCTELES DE CONTAMINANTES A NIVEL MOLECULAR (ESPECIES QUIMICAS, METALOBIOMOLECULAS, METABOLITOS, PROTEINAS Y GENES) Y BIOLOGICO (MICROBIOTA INTESTINAL), BUSCANDO LA CONEXION ENTRE AMBOS NIVELES A TRAVES DEL EJE MICROBIOTA INTESTINAL-CEREBRO, APLICANDO OMICAS DESDE EL INTESTINO HASTA LOS ORGANOS METABOLICAMENTE MAS ACTIVOS (HIGADO Y RIÑON), CEREBRO Y SUERO. SE ESTUDIARA LA TRASLACION AL HOMBRE Y EL DISEÑO DE METODOS ALTERNATIVOS AL USO DE ANIMALES MEDIANTE ESTUDIOS CON CELULAS. PARA ESTOS ESTUDIOS SE DESARROLLARAN NUEVOS METODOS UTILIZANDO LA INSTRUMENTACION ANALITICA DE ULTIMA GENERACION Y RECIENTE ADQUISICION QUE EL GRUPO DE INVESTIGACION DE LA UHU DISPONE EN LA ACTUALIDAD. (Spanish)
0 references
THE TEAM RESPONSIBLE FOR THE SUBPROJECT 1 (S1) HAS A MARKEDLY MULTIDISCIPLINARY NATURE, INVOLVING EXPERT RESEARCHERS FROM 2 UNIVERSITIES (UHU AND UCO) AND 3 RESEARCH GROUPS. THE TEAM INTEGRATES A FULL-PROFESSOR OF ANALYTICAL CHEMISTRY (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, EXPERT IN CHEMICAL SPECIATION AND METABOLOMICS) AND TWO ASSOCIATE PROFESSORS (DR. NIEVES ABRIL, EXPERT IN GENETICS, BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY (UCO) AND DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, EXPERT IN CELL BIOLOGY (UHU)). S1 FOCUSES ON THE STUDY OF THE BIOLOGICAL RESPONSES OF THE LABORATORY MOUSE MUS MUSCULUS TO "CHEMICAL COCKTAILS" EXPOSURE, WHERE EMERGING (PHARMACEUTICALLY ACTIVE COMPOUNDS, PACS) AND REGULATED (METALS AND PESTICIDES) POLLUTANTS ARE COMBINED, WITH SPECIAL EMPHASIS ON THEIR INTERACTION AND THE PUTATIVE ROLE OF SELENIUM AS AN ANTAGONIST. THE BIOLOGICAL RESPONSE WILL BE DOUBLY ASSESSED. ON THE ONE HAND, IT WILL BE ASSESSED AT THE MOLECULAR LEVEL, THROUGH STUDIES OF CHEMICAL SPECIATION AND METALLOMICS (IP-1, UHU), TO KNOW THE CHEMICAL AND METALO-BIOMOLECULES SPECIES DISTRIBUTION IN TISSUES AND BIOLOGICAL FLUIDS AFTER THE EXPOSURE. IN THIS LIGHT, WE WILL ALSO DETERMINE AND QUANTIFY THE CHANGES IN THE ABUNDANCE OF BIOMOLECULES (TRANSCRIPTS AND PROTEINS MEASURED, RESPECTIVELY, BY TRANSCRIPTOMICS AND PROTEOMICS -IP-2, UCO) AND THE PRESENCE OF OXIDATIVE DAMAGE IN PROTEINS (REDOX PROTEOMICS, IP-2, UCO), AN ESSENTIAL ISSUE WHEN THERE IS EXPOSURE TO POLLUTANTS THAT PRODUCE OXIDATIVE STRESS. ON THE OTHER HAND, THE BIOLOGICAL RESPONSE WILL BE ALSO EVALUATED AT THE MICROBIOME LEVEL, BY USING METAGENOMICS AND OTHER META-OMICS APPROACHES (IP-1 AND 2, UHU AND UCO) TO ELUCIDATE THE ALTERATIONS IN THE MICROORGANISM POPULATIONS AND THEIR FUNCTIONS, CAUSED BY THE EXPOSURE TO THOSE COCKTAILS OF POLLUTANTS THAT MIMICS THE REAL ENVIRONMENT AND THE PUTATIVE ANTAGONISM OF SELENIUM THROUGH MICROBIOTA STABILIZATION. WE WILL ALSO ASSESS THE RELATIONSHIP BETWEEN MICROBIOTA AND THE BIOAVAILABILITY OF CONTAMINANTS, BOTH IN VIVO AND IN VITRO, BY DESIGNING PARALLEL EXPOSURE EXPERIENCES IN HUMAN INTESTINAL EPITHELIUM CELLS (DR. F. NAVARRO, UHU). CELL CULTURES WILL BE USED IN PARALLEL TO IN VIVO MICE EXPERIMENTS IN ORDER TO TRANSLATE THE EFFECTS TO HUMANS AND TO VALIDATE NEW APPROACHES ALTERNATIVE TO THE USE OF EXPERIMENTAL ANIMALS. THIS PROJECT AIMS TO CONTINUE THE STUDIES CARRIED OUT DURING 5 CONSECUTIVE PREVIOUS PROJECTS OF THE SPANISH RESEARCH AND DEVELOPMENT PROGRAM, IN WHICH BOTH IPS HAVE PARTICIPATED. IT REPRESENTS THE EVOLUTION FROM THE STUDIES OF THE PRESENCE OF POLLUTANTS IN THE DOÑANA NATIONAL PARK, TO THE APPLICATION OF OMICS TO ELUCIDATE THE BIOLOGICAL RESPONSE IN FREE-LIFE MAMMALS AND INVERTEBRATES AND TO THE INTEGRATION OF OMICS TO STUDY THE RESPONSE OF THE MODEL ORGANISM M. MUSCULUS TO POLLUTANTS EXPOSURE UNDER CONTROLLED LAB CONDITIONS AND SOME EARLY EXPERIENCES WITH CELLS. THE PROJECT SIGNIFIES A FURTHER STEP IN THIS PROCESS, AS THE RESEARCHERS WILL STUDY THE INFLUENCE OF COCKTAILS OF POLLUTANTS, MIMICKING THE REAL WORLD, AT THE MOLECULAR LEVEL (CHEMICAL SPECIES, METALO-BIOMOLECULES, METABOLITES, PROTEINS AND GENES) AND AT THE BIOLOGICAL LEVEL (GUT MICROBIOTA), SEEKING THE CONNECTION BETWEEN BOTH LEVELS THROUGH THE MICROBIOTA-GUT-BRAIN AXIS, THROUGH THE USE OF OMIC APPROACHES FROM THE INTESTINE TO THE MOST METABOLICALLY ACTIVE ORGANS (LIVER AND KIDNEY) AND ALSO TO BRAIN AND PLASM. WE WILL USE POWERFUL ANALYTICAL INSTRUMENTATION RECENTLY ACQUIRED BY UHU RESEARCH GROUP. (English)
0.2584097780047669
0 references
L’ÉQUIPE QUI SOLLICITE LE SOUS-PROJET 1 A UN CARACTÈRE MULTIDISCIPLINAIRE FORT ET EST COMPOSÉE DE CHERCHEURS DE DEUX UNIVERSITÉS (UHU ET UCO) ET DE 3 GROUPES DE RECHERCHE. UNE CATÉDRATIQUE DE CHIMIE ANALYTIQUE (IP-1, UHU, DR. LA BARRIÈRE TAMARA GARCIA, EXPERTE EN SPÉCIATION CHIMIQUE ET MÉTABOLOMIQUE) ET DEUX PROFESSEURS TITULAIRES, DR. NIEVES APRIL, EXPERT EN GÉNÉTIQUE ET BIOLOGIE MOLÉCULAIRE (UCO) ET DR FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, EXPERT EN BIOLOGIE CELLULAIRE (UHU). LE SOUS-PROJET 1 PORTE SUR L’ÉTUDE DE LA RÉPONSE BIOLOGIQUE DANS LE LABORATOIRE RATON MUS MUSCULUS EXPOSÉ À DES COCKTAILS CHIMIQUES DE CONTAMINANTS ÉMERGENTS (PHARMACEUTIQUES) ET RÉGLEMENTÉS (MÉTAUX ET PESTICIDES), EN METTANT PARTICULIÈREMENT L’ACCENT SUR LEUR INTERACTION ET LE RÔLE DU SÉLÉNIUM EN TANT QU’ANTAGONISTE. LA RÉPONSE BIOLOGIQUE SERA ÉVALUÉE À DEUX NIVEAUX, D’UNE PART, AU NIVEAU MOLÉCULAIRE, PAR DES ÉTUDES DE SPÉCIATION CHIMIQUE ET METALOMIC (IP-1,UHU), AFIN DE CONNAÎTRE LES ESPÈCES CHIMIQUES ET METALOBIOMOLECULAS DANS LES TISSUS ET LES FLUIDES BIOLOGIQUES APRÈS EXPOSITION, LA DÉTERMINATION ET LA QUANTIFICATION DES DOMMAGES OXYDATIFS AUX PROTÉINES (REDOX PROTEOMICA, IP-2,UCO). CE QUI PERMETTRA DE RATIFIER LES HYPOTHÈSES QUI DÉCOULENT DES CHANGEMENTS DANS LES NIVEAUX D’EXPRESSION TANT AU NIVEAU DES TRANSCRIPTIONS (TRANSCRIPTOMICA IP-2,UCO) QUE DES PROTÉINES (PROTHEMIC, IP-2, UCO). D’AUTRE PART, LA RÉPONSE BIOLOGIQUE A ÉTÉ ÉVALUÉE AU NIVEAU BIOLOGIQUE PAR METAGENOMICA (IP-1 ET 2, UHU ET UCO), CE QUI PERMETTRAIT DE CONNAÎTRE LES ALTÉRATIONS DES MICROORGANISMES CAUSÉES PAR LA CONTAMINATION, EN PARTICULIER PAR LES COCKTAILS DE CONTAMINANTS ET L’ANTAGONISME DU SÉLÉNIUM À TRAVERS LE MICROBIOTE. EN OUTRE, LA RELATION ENTRE LE MICROBIOTE ET LA BIODISPONIBILITÉ DES CONTAMINANTS IN VIVO ET IN VITRO A ÉTÉ ÉTUDIÉE PAR LA CONCEPTION D’EXPÉRIENCES D’EXPOSITION PARALLÈLE DANS LES CELLULES DE L’ÉPITHÉLIUM INTESTINAL (DR. F. NAVARRO, UHU). EN OUTRE, LES MÉTHODES DANS LES CULTURES CELLULAIRES SERONT VALIDÉES, CE QUI PERMETTRA DE PROPOSER DES MÉTHODES ALTERNATIVES À L’UTILISATION D’ANIMAUX EXPÉRIMENTAUX ET LEUR TRADUCTION À L’HOMME. LE PROJET QUI EST PRÉSENTÉ VISE À POURSUIVRE LES ÉTUDES MENÉES AU COURS DE 5 PRÉCÉDENTS PROJETS CONSÉCUTIFS DU PLAN NATIONAL DE R & D & I AUQUEL LES ISP DE CE PROJET ONT PARTICIPÉ ET À LAQUELLE IL A ÉVOLUÉ, DES ÉTUDES SUR LES CONTAMINANTS DANS LE PARC NATIONAL DE DOÑANA, À L’ÉTUDE DE LA RÉPONSE BIOLOGIQUE PAR L’OMIQUE DANS LES MAMMIFÈRES ET LES INVERTÉBRÉS DE LA VIE LIBRE, APRÈS L’INTÉGRATION DES OMICAS DANS DES ORGANISMES DE LABORATOIRE MODÈLES (MUS MUSCULUS) ET DES EXPÉRIENCES TRÈS INITIALES AVEC LES CELLULES, POUR CE PROJET, DANS LEQUEL NOUS AVONS ÉTUDIÉ L’INFLUENCE DES COCKTAILS DE CONTAMINANTS AU NIVEAU MOLÉCULAIRE (ESPÈCES CHIMIQUES, METALOBIOMOLECULAS, MÉTABOLITES, PROTÉINES ET GÈNES) ET BIOLOGIQUE (MICROBIOTE INTESTINAL), EN CHERCHANT LA CONNEXION ENTRE LES DEUX NIVEAUX À TRAVERS L’AXE DU MICROBIOTE INTESTINAL-ENCÉPHALIQUE, L’APPLICATION DE L’OMIQUE DE L’INTESTIN AUX ORGANES LES PLUS ACTIFS (LIGADO ET REIN), CERVEAU ET SÉRUM. LA TRADUCTION VERS L’HOMME ET LA CONCEPTION DE MÉTHODES ALTERNATIVES À L’UTILISATION DES ANIMAUX PAR LE BIAIS D’ÉTUDES CELLULAIRES SERONT ÉTUDIÉES. POUR CES ÉTUDES, DE NOUVELLES MÉTHODES SERONT MISES AU POINT À L’AIDE DE L’INSTRUMENTATION ANALYTIQUE DE LA DERNIÈRE GÉNÉRATION ET DE L’ACQUISITION RÉCENTE DU GROUPE DE RECHERCHE DE L’UHU. (French)
4 December 2021
0 references
DAS TEAM, DAS TEILPROJEKT 1 ANFORDERT, HAT EINEN STARKEN MULTIDISZIPLINÄREN CHARAKTER UND SETZT SICH AUS FORSCHERN VON 2 UNIVERSITÄTEN (UHU UND UCO) UND 3 FORSCHUNGSGRUPPEN ZUSAMMEN. EINE KATEDRATICA DER ANALYTISCHEN CHEMIE (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRIERE, EXPERTE FÜR CHEMISCHE UND METABOLOMISCHE SPEZIATION) UND ZWEI TENURED PROFESSOREN, DR. NIEVES APRIL, EXPERTE FÜR GENETICA UND MOLEKULARBIOLOGIE (UCO) UND DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, EXPERTE FÜR ZELLBIOLOGIE (UHU). DAS TEILPROJEKT 1 KONZENTRIERT SICH AUF DIE UNTERSUCHUNG DER BIOLOGISCHEN REAKTION IM LABOR RATON MUS MUSCULUS, DAS CHEMISCHEN COCKTAILS VON NEU ENTSTEHENDEN (PHARMAZEUTISCHEN) UND REGULIERTEN KONTAMINANTEN (METALLEN UND PESTIZIDEN) AUSGESETZT IST, WOBEI BESONDERES AUGENMERK AUF DEREN WECHSELWIRKUNG UND DER ROLLE VON SELEN ALS ANTAGONIST LIEGT. DIE BIOLOGISCHE REAKTION WIRD AUF ZWEI EBENEN EINERSEITS AUF MOLEKULARER EBENE DURCH STUDIEN DER CHEMISCHEN UND METALOMIC-SPEZIATION (IP-1,UHU) BEWERTET, UM DIE CHEMISCHEN ARTEN UND METALOBIOMOLECULAS IN GEWEBEN UND BIOLOGISCHEN FLÜSSIGKEITEN NACH EXPOSITION, DIE BESTIMMUNG UND QUANTIFIZIERUNG VON OXIDATIVEN SCHÄDEN AN PROTEINEN (REDOX PROTEOMICA, IP-2, UCO) ZU KENNEN. DIES ERMÖGLICHT ES, DIE HYPOTHESEN ZU RATIFIZIEREN, DIE SICH AUS DEN VERÄNDERUNGEN DER EXPRESSIONSNIVEAUS SOWOHL AUF DER EBENE DER TRANSKRIPTE (TRANSCRIPTOMICA IP-2,UCO) ALS AUCH VON PROTEINEN (PROTHEMIC, IP-2, UCO) ERGEBEN. ANDERERSEITS WURDE DIE BIOLOGISCHE REAKTION AUF BIOLOGISCHER EBENE VON METAGENOMICA (IP-1 UND 2, UHU UND UCO) BEWERTET, DIE ES ERMÖGLICHEN WÜRDE, DIE VERÄNDERUNGEN VON MIKROORGANISMEN ZU KENNEN, DIE DURCH KONTAMINATION VERURSACHT WURDEN, INSBESONDERE DURCH COCKTAILS VON KONTAMINANTEN UND SELEN-ANTAGONISMUS DURCH DIE MIKROBIOTA. DARÜBER HINAUS WURDE DIE BEZIEHUNG ZWISCHEN DER MIKROBIOTA UND DER BIOVERFÜGBARKEIT VON KONTAMINANTEN IN VIVO UND IN VITRO DURCH DIE GESTALTUNG PARALLELER EXPOSITIONSERFAHRUNGEN IN DARMEPITHELZELLEN (DR. F. NAVARRO, UHU) UNTERSUCHT. DARÜBER HINAUS WERDEN METHODEN IN ZELLKULTUREN VALIDIERT, DIE ES ERMÖGLICHEN, ALTERNATIVE METHODEN FÜR DEN EINSATZ VON VERSUCHSTIEREN UND DEREN ÜBERSETZUNG AUF DEN MENSCHEN VORZUSCHLAGEN. DAS VORGESTELLTE PROJEKT ZIELT DARAUF AB, DIE STUDIEN FORTZUSETZEN, DIE WÄHREND VON FÜNF AUFEINANDERFOLGENDEN PROJEKTEN DES NATIONALEN FUEUI-PLANS DURCHGEFÜHRT WURDEN, AN DEM DIE PSI DIESES PROJEKTS TEILGENOMMEN HABEN UND AN DENEN ES SICH VON DEN UNTERSUCHUNGEN DER KONTAMINANTEN IM NATIONALPARK DOÑANA BIS ZUR UNTERSUCHUNG DER BIOLOGISCHEN REAKTION DURCH OMICS BEI SÄUGETIEREN UND WIRBELLOSEN DES FREIEN LEBENS ENTWICKELT HAT, NACH DER INTEGRATION VON OMICAS IN MODELLLABORORGANISMEN (MUS MUSCULUS) UND SEHR ANFÄNGLICHEN ERFAHRUNGEN MIT ZELLEN, ZU DIESEM PROJEKT, IN DEM WIR DEN EINFLUSS VON COCKTAILS VON KONTAMINANTEN AUF MOLEKULARER EBENE (CHEMISCHE SPEZIES, METALOBIOMOLECULAS, METABOLITEN, PROTEINE UND GENE) UND BIOLOGISCHE (INTESTINALE MIKROBIOTA) UNTERSUCHTEN, SUCHTEN WIR DIE VERBINDUNG ZWISCHEN BEIDEN EBENEN ÜBER DIE INTESTINAL-BRAIN MICROBIOTA-ACHSE, INDEM OMICS VOM DARM ZU DEN AKTIVSTEN ORGANEN (LIGADO UND NIERE), GEHIRN UND SERUM ANGEWENDET WERDEN. DIE ÜBERSETZUNG AUF DEN MENSCHEN UND DIE GESTALTUNG ALTERNATIVER METHODEN ZUR VERWENDUNG VON TIEREN DURCH ZELLSTUDIEN WERDEN UNTERSUCHT. FÜR DIESE STUDIEN WERDEN NEUE METHODEN MIT DER ANALYTISCHEN INSTRUMENTIERUNG DER LETZTEN GENERATION UND NEUEREN AKQUISITIONEN ENTWICKELT, DIE DIE FORSCHUNGSGRUPPE DER UHU DERZEIT BESITZT. (German)
9 December 2021
0 references
HET TEAM DAT SUBPROJECT 1 AANVRAAGT, HEEFT EEN STERK MULTIDISCIPLINAIR KARAKTER EN BESTAAT UIT ONDERZOEKERS VAN 2 UNIVERSITEITEN (UHU EN UCO) EN 3 ONDERZOEKSGROEPEN. EEN CATEDRATICA VAN ANALYTISCHE CHEMIE (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRIÈRE, EXPERT IN CHEMISCHE EN METABOLOMISCHE SPECIATIE) EN TWEE VASTE PROFESSOREN, DR. NIEVES APRIL, EXPERT IN GENETICA EN MOLECULAIRE BIOLOGIE (UCO) EN DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, EXPERT IN CELLULAIRE BIOLOGIE (UHU). SUBPROJECT 1 RICHT ZICH OP DE STUDIE VAN DE BIOLOGISCHE RESPONS IN HET LABORATORIUM RATON MUS MUSCULUS BLOOTGESTELD AAN CHEMISCHE COCKTAILS VAN OPKOMENDE (FARMACEUTISCHE) EN GEREGULEERDE CONTAMINANTEN (METALEN EN PESTICIDEN), MET BIJZONDERE NADRUK OP HUN INTERACTIE EN DE ROL VAN SELENIUM ALS ANTAGONIST. DE BIOLOGISCHE RESPONS ZAL OP TWEE NIVEAUS WORDEN GEËVALUEERD, ENERZIJDS, OP MOLECULAIR NIVEAU, DOOR ONDERZOEK VAN CHEMISCHE EN METALOMISCHE SPECIATIE (IP-1,UHU), OM DE CHEMISCHE SOORT EN METALOBIOMOLECULAS IN WEEFSELS EN BIOLOGISCHE VLOEISTOFFEN NA BLOOTSTELLING TE KENNEN, DE BEPALING EN KWANTIFICERING VAN OXIDATIEVE SCHADE AAN EIWITTEN (REDOX PROTEOMICA, IP-2,UCO). FUNDAMENTEEL WANNEER ER BLOOTSTELLING IS AAN CONTAMINANTEN DIE OXIDATIEVE STRESS EN METABOLOMICA (IP-1, UHU) VEROORZAKEN; DIT ZAL HET MOGELIJK MAKEN OM DE HYPOTHESEN TE RATIFICEREN DIE VOORTVLOEIEN UIT DE VERANDERINGEN IN DE EXPRESSIENIVEAUS, ZOWEL OP HET NIVEAU VAN TRANSCRIPTEN (TRANSCRIPTOMICA IP-2, UCO) ALS EIWITTEN (PROTHEMIC, IP-2, UCO). AAN DE ANDERE KANT WERD DE BIOLOGISCHE RESPONS OP BIOLOGISCH NIVEAU GEËVALUEERD DOOR METAGENOMICA (IP-1 EN 2, UHU EN UCO), WAARDOOR DE VERANDERINGEN VAN MICRO-ORGANISMEN ALS GEVOLG VAN BESMETTING, MET NAME DOOR COCKTAILS VAN CONTAMINANTEN EN SELEENANTAGONISME VIA DE MICROBIOTA, BEKEND ZOUDEN KUNNEN WORDEN GEMAAKT. DAARNAAST WERD HET VERBAND TUSSEN DE MICROBIOTA EN DE BIOLOGISCHE BESCHIKBAARHEID VAN CONTAMINANTEN IN VIVO EN IN VITRO ONDERZOCHT DOOR MIDDEL VAN HET ONTWERP VAN PARALLELLE BLOOTSTELLINGSERVARINGEN IN INTESTINALE EPITHEELCELLEN (DR. F. NAVARRO, UHU). DAARNAAST ZULLEN METHODEN IN CELCULTUREN WORDEN GEVALIDEERD, WAARDOOR ALTERNATIEVE METHODEN KUNNEN WORDEN VOORGESTELD VOOR HET GEBRUIK VAN PROEFDIEREN EN HUN VERTALING NAAR MENSEN. HET VOORGESTELDE PROJECT IS BEDOELD OM DE STUDIES VOORT TE ZETTEN DIE ZIJN UITGEVOERD TIJDENS VIJF OPEENVOLGENDE EERDERE PROJECTEN VAN HET NATIONALE O & O & I-PLAN WAARAAN DE PSI’S VAN DIT PROJECT HEBBEN DEELGENOMEN EN WAARAAN HET IS GEËVOLUEERD, VAN DE STUDIES NAAR CONTAMINANTEN IN HET NATIONALE PARK DOÑANA, TOT DE STUDIE VAN DE BIOLOGISCHE RESPONS VIA OMICS BIJ ZOOGDIEREN EN ONGEWERVELDE DIEREN VAN VRIJ LEVEN, NA DE INTEGRATIE VAN OMICAS IN MODELLABORATORIUMORGANISMEN (MUS MUSCULUS) EN ZEER INITIËLE ERVARINGEN MET CELLEN, NAAR DIT PROJECT, WAARIN WE DE INVLOED BESTUDEERDEN VAN COCKTAILS VAN CONTAMINANTEN OP MOLECULAIR NIVEAU (CHEMISCHE SOORT, METALOBIOMOLECULAS, METABOLIETEN, EIWITTEN EN GENEN) EN BIOLOGISCH (INTESTINALE MICROBIOTA), ZOEKEND NAAR DE VERBINDING TUSSEN BEIDE NIVEAUS VIA DE INTESTINALE-HERSENMICROBIOTA-AS, WAARBIJ OMICS VAN DE DARM OP DE MEEST ACTIEVE ORGANEN (LIGADO EN NIEREN), HERSENEN EN SERUM WORDEN TOEGEPAST. DE VERTALING NAAR DE MENS EN HET ONTWERP VAN ALTERNATIEVE METHODEN VOOR HET GEBRUIK VAN DIEREN DOOR MIDDEL VAN CELONDERZOEK ZULLEN WORDEN BESTUDEERD. VOOR DEZE STUDIES ZULLEN NIEUWE METHODEN WORDEN ONTWIKKELD MET BEHULP VAN DE ANALYTISCHE INSTRUMENTATIE VAN DE LAATSTE GENERATIE EN RECENTE ACQUISITIE DIE DE ONDERZOEKSGROEP VAN DE UHU MOMENTEEL HEEFT. (Dutch)
17 December 2021
0 references
IL GRUPPO CHE RICHIEDE IL SOTTOPROGETTO 1 HA UN FORTE CARATTERE MULTIDISCIPLINARE ED È COMPOSTO DA RICERCATORI PROVENIENTI DA 2 UNIVERSITÀ (UHU E UCO) E DA 3 GRUPPI DI RICERCA. UNA CATEDRATICA DI CHIMICA ANALITICA (IP-1, UHU, DR. BARRIERA DI TAMARA GARCIA, ESPERTA IN SPECIAZIONE CHIMICA E METABOLOMICA) E DUE PROFESSORI DI RUOLO, DR. NIEVES APRIL, ESPERTO IN GENETICA E BIOLOGIA MOLECOLARE (UCO) E DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, ESPERTO IN BIOLOGIA CELLULARE (UHU). IL SOTTOPROGETTO 1 SI CONCENTRA SULLO STUDIO DELLA RISPOSTA BIOLOGICA NEL LABORATORIO RATON MUS MUSCULUS ESPOSTO A COCKTAIL CHIMICI DI CONTAMINANTI EMERGENTI (FARMACEUTICI) E REGOLAMENTATI (METALLI E PESTICIDI), CON PARTICOLARE ATTENZIONE ALLA LORO INTERAZIONE E AL RUOLO DEL SELENIO COME ANTAGONISTA. LA RISPOSTA BIOLOGICA SARÀ VALUTATA A DUE LIVELLI, DA UN LATO, A LIVELLO MOLECOLARE MEDIANTE STUDI DI SPECIAZIONE CHIMICA E METALOMOMICA (IP-1, UHU), AL FINE DI CONOSCERE LE SPECIE CHIMICHE E METALOBIOMOLECULAS NEI TESSUTI E NEI FLUIDI BIOLOGICI DOPO L'ESPOSIZIONE, LA DETERMINAZIONE E QUANTIFICAZIONE DEL DANNO OSSIDATIVO ALLE PROTEINE (REDOX PROTEOMICA, IP-2,UCO). CHE PERMETTERANNO DI RATIFICARE LE IPOTESI CHE DERIVANO DAI CAMBIAMENTI NEI LIVELLI DI ESPRESSIONE SIA A LIVELLO DI TRASCRIZIONI (TRANSCRIPTOMICA IP-2,UCO) CHE DI PROTEINE (PROTHEMIC, IP-2, UCO). D'ALTRA PARTE, LA RISPOSTA BIOLOGICA È STATA VALUTATA A LIVELLO BIOLOGICO DA METAGENOMICA (IP-1 E 2, UHU E UCO), CHE PERMETTEREBBE DI CONOSCERE LE ALTERAZIONI DEI MICRORGANISMI CAUSATE DA CONTAMINAZIONE, IN PARTICOLARE DA COCKTAIL DI CONTAMINANTI E ANTAGONISMO SELENIO ATTRAVERSO IL MICROBIOTA. INOLTRE, LA RELAZIONE TRA IL MICROBIOTA E LA BIODISPONIBILITÀ DEI CONTAMINANTI IN VIVO E IN VITRO È STATA STUDIATA ATTRAVERSO LA PROGETTAZIONE DI ESPERIENZE DI ESPOSIZIONE PARALLELA NELLE CELLULE EPITELIALI INTESTINALI (DR. F. NAVARRO, UHU). INOLTRE, I METODI NELLE COLTURE CELLULARI SARANNO CONVALIDATI, IL CHE CONSENTIRÀ DI PROPORRE METODI ALTERNATIVI ALL'USO DEGLI ANIMALI SPERIMENTALI E ALLA LORO TRADUZIONE AGLI ESSERI UMANI. IL PROGETTO CHE VIENE PRESENTATO MIRA A PROSEGUIRE GLI STUDI EFFETTUATI NEL CORSO DI 5 PROGETTI PRECEDENTI CONSECUTIVI DEL PIANO NAZIONALE DI RSI A CUI HANNO PARTECIPATO I PSI DI QUESTO PROGETTO E AI QUALI SI È EVOLUTO, DAGLI STUDI DEI CONTAMINANTI NEL PARCO NAZIONALE DI DOÑANA, ALLO STUDIO DELLA RISPOSTA BIOLOGICA ATTRAVERSO OMICI NEI MAMMIFERI E INVERTEBRATI DI VITA LIBERA, DOPO L'INTEGRAZIONE DI OMICAS IN MODELLI DI ORGANISMI DI LABORATORIO (MUS MUSCULUS) E ESPERIENZE MOLTO INIZIALI CON LE CELLULE, A QUESTO PROGETTO, IN CUI ABBIAMO STUDIATO L'INFLUENZA DEI COCKTAIL DI CONTAMINANTI A LIVELLO MOLECOLARE (SPECIE CHIMICHE, METALOBIOMOLECULAS, METABOLITI, PROTEINE E GENI) E BIOLOGICI (MICROBIOTA INTESTINALE), CERCANDO LA CONNESSIONE TRA ENTRAMBI I LIVELLI ATTRAVERSO L'ASSE DEL MICROBIOTA INTESTINALE-ENCEFALICO, APPLICANDO GLI OMICI DALL'INTESTINO AGLI ORGANI PIÙ ATTIVI (LIGADO E RENE), CERVELLO E SIERO. LA TRADUZIONE ALL'UOMO E LA PROGETTAZIONE DI METODI ALTERNATIVI ALL'USO DEGLI ANIMALI ATTRAVERSO STUDI CELLULARI SARANNO STUDIATI. PER QUESTI STUDI SARANNO SVILUPPATI NUOVI METODI UTILIZZANDO LA STRUMENTAZIONE ANALITICA DELL'ULTIMA GENERAZIONE E LA RECENTE ACQUISIZIONE CHE IL GRUPPO DI RICERCA DELL'UHU HA ATTUALMENTE. (Italian)
16 January 2022
0 references
Η ΟΜΆΔΑ ΠΟΥ ΕΊΝΑΙ ΥΠΕΎΘΥΝΗ ΓΙΑ ΤΟ ΥΠΟΈΡΓΟ 1 (S1) ΈΧΕΙ ΙΔΙΑΊΤΕΡΑ ΔΙΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΌ ΧΑΡΑΚΤΉΡΑ, ΜΕ ΤΗ ΣΥΜΜΕΤΟΧΉ ΕΜΠΕΙΡΟΓΝΩΜΌΝΩΝ ΕΡΕΥΝΗΤΏΝ ΑΠΌ 2 ΠΑΝΕΠΙΣΤΉΜΙΑ (UHU ΚΑΙ UCO) ΚΑΙ 3 ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΈΣ ΟΜΆΔΕΣ. Η ΟΜΆΔΑ ΕΝΣΩΜΑΤΏΝΕΙ ΈΝΑΝ ΠΛΉΡΗ ΚΑΘΗΓΗΤΉ ΑΝΑΛΥΤΙΚΉΣ ΧΗΜΕΊΑΣ (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, ΕΜΠΕΙΡΟΓΝΏΜΟΝΑ ΣΤΗ ΧΗΜΙΚΉ ΕΞΕΙΔΊΚΕΥΣΗ ΚΑΙ ΜΕΤΑΒΟΛΟΜΙΚΉ) ΚΑΙ ΔΎΟ ΑΝΑΠΛΗΡΩΤΈΣ ΚΑΘΗΓΗΤΈΣ (DR. NIEVES ABRIL, ΕΙΔΙΚΌΣ ΣΤΗ ΓΕΝΕΤΙΚΉ, ΒΙΟΧΗΜΕΊΑ ΚΑΙ ΜΟΡΙΑΚΉ ΒΙΟΛΟΓΊΑ (UCO) ΚΑΙ DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, ΕΙΔΙΚΌΣ ΣΤΗΝ ΚΥΤΤΑΡΙΚΉ ΒΙΟΛΟΓΊΑ (UHU)). ΤΟ S1 ΕΠΙΚΕΝΤΡΏΝΕΤΑΙ ΣΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΤΩΝ ΒΙΟΛΟΓΙΚΏΝ ΑΝΤΙΔΡΆΣΕΩΝ ΤΟΥ ΜΥΪΚΟΎ ΜΥΌΣ ΤΟΥ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΟΎ ΠΟΝΤΙΚΙΟΎ MUS ΣΕ «ΧΗΜΙΚΆ ΚΟΚΤΈΙΛ» ΈΚΘΕΣΗ, ΌΠΟΥ ΑΝΑΔΥΌΜΕΝΟΙ (ΦΑΡΜΑΚΕΥΤΙΚΆ ΔΡΑΣΤΙΚΈΣ ΕΝΏΣΕΙΣ, PACS) ΚΑΙ ΡΥΘΜΙΖΌΜΕΝΟΙ (ΜΈΤΑΛΛΑ ΚΑΙ ΦΥΤΟΦΆΡΜΑΚΑ) ΡΎΠΟΙ ΣΥΝΔΥΆΖΟΝΤΑΙ, ΜΕ ΙΔΙΑΊΤΕΡΗ ΈΜΦΑΣΗ ΣΤΗΝ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΉ ΤΟΥΣ ΚΑΙ ΣΤΟΝ ΥΠΟΤΙΘΈΜΕΝΟ ΡΌΛΟ ΤΟΥ ΣΕΛΗΝΊΟΥ ΩΣ ΑΝΤΑΓΩΝΙΣΤΉ. Η ΒΙΟΛΟΓΙΚΉ ΑΠΌΚΡΙΣΗ ΘΑ ΑΞΙΟΛΟΓΗΘΕΊ ΔΙΠΛΆ. ΑΠΌ ΤΗ ΜΊΑ ΠΛΕΥΡΆ, ΘΑ ΑΞΙΟΛΟΓΗΘΕΊ ΣΕ ΜΟΡΙΑΚΌ ΕΠΊΠΕΔΟ, ΜΈΣΩ ΜΕΛΕΤΏΝ ΧΗΜΙΚΉΣ ΕΞΕΙΔΊΚΕΥΣΗΣ ΚΑΙ ΜΕΤΑΛΛΟΜΙΚΏΝ ΟΥΣΙΏΝ (IP-1, UHU), ΓΙΑ ΝΑ ΓΝΩΡΊΖΟΥΜΕ ΤΗ ΧΗΜΙΚΉ ΚΑΤΑΝΟΜΉ ΚΑΙ ΤΗΝ ΚΑΤΑΝΟΜΉ ΤΩΝ ΕΙΔΏΝ ΤΩΝ ΜΕΤΑΛΛΟ-ΒΙΟΜΗΛΊΩΝ ΣΤΟΥΣ ΙΣΤΟΎΣ ΚΑΙ ΤΑ ΒΙΟΛΟΓΙΚΆ ΥΓΡΆ ΜΕΤΆ ΤΗΝ ΈΚΘΕΣΗ. ΥΠΌ ΤΟ ΠΡΊΣΜΑ ΑΥΤΌ, ΘΑ ΚΑΘΟΡΊΣΟΥΜΕ ΚΑΙ ΘΑ ΠΟΣΟΤΙΚΟΠΟΙΉΣΟΥΜΕ ΤΙΣ ΑΛΛΑΓΈΣ ΣΤΗΝ ΑΦΘΟΝΊΑ ΤΩΝ ΒΙΟΜΟΡΊΩΝ (ΜΕΤΑΓΡΑΦΈΣ ΚΑΙ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΠΟΥ ΜΕΤΡΏΝΤΑΙ, ΑΝΤΊΣΤΟΙΧΑ, ΜΕ ΜΕΤΑΓΡΑΦΙΚΆ ΚΑΙ ΠΡΩΤΕΪΝΙΚΆ -IP-2, UCO) ΚΑΙ ΤΗΝ ΠΑΡΟΥΣΊΑ ΟΞΕΙΔΩΤΙΚΉΣ ΒΛΆΒΗΣ ΣΤΙΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ (ΠΡΩΤΕΪΝΩΜΑΤΙΚΉ ΚΟΚΚΙΝΟΞΊΝΗ, IP-2, UCO), ΈΝΑ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌ ΖΉΤΗΜΑ ΌΤΑΝ ΥΠΆΡΧΕΙ ΈΚΘΕΣΗ ΣΕ ΡΎΠΟΥΣ ΠΟΥ ΠΑΡΆΓΟΥΝ ΟΞΕΙΔΩΤΙΚΌ ΣΤΡΕΣ. ΑΠΌ ΤΗΝ ΆΛΛΗ ΠΛΕΥΡΆ, Η ΒΙΟΛΟΓΙΚΉ ΑΠΌΚΡΙΣΗ ΘΑ ΑΞΙΟΛΟΓΗΘΕΊ ΕΠΊΣΗΣ ΣΕ ΕΠΊΠΕΔΟ ΜΙΚΡΟΒΙΏΜΑΤΟΣ, ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΜΕΤΑΓΟΝΟΛΟΓΊΑΣ ΚΑΙ ΆΛΛΩΝ ΜΕΤΑ-ΟΜΙΚΏΝ ΠΡΟΣΕΓΓΊΣΕΩΝ (IP-1 ΚΑΙ 2, UHU ΚΑΙ UCO) ΓΙΑ ΝΑ ΑΠΟΣΑΦΗΝΙΣΤΟΎΝ ΟΙ ΜΕΤΑΒΟΛΈΣ ΤΩΝ ΠΛΗΘΥΣΜΏΝ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΏΝ ΚΑΙ ΤΩΝ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΏΝ ΤΟΥΣ, ΟΙ ΟΠΟΊΕΣ ΠΡΟΚΑΛΟΎΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΗΝ ΈΚΘΕΣΗ ΣΤΑ ΚΟΚΤΈΙΛ ΡΎΠΩΝ ΠΟΥ ΜΙΜΟΎΝΤΑΙ ΤΟ ΠΡΑΓΜΑΤΙΚΌ ΠΕΡΙΒΆΛΛΟΝ ΚΑΙ ΤΟΝ ΥΠΟΤΙΘΈΜΕΝΟ ΑΝΤΑΓΩΝΙΣΜΌ ΤΟΥ ΣΕΛΗΝΊΟΥ ΜΈΣΩ ΤΗΣ ΣΤΑΘΕΡΟΠΟΊΗΣΗΣ ΜΙΚΡΟΒΙΏΤΩΝ. ΘΑ ΑΞΙΟΛΟΓΉΣΟΥΜΕ ΕΠΊΣΗΣ ΤΗ ΣΧΈΣΗ ΜΕΤΑΞΎ ΜΙΚΡΟΒΊΩΝ ΚΑΙ ΒΙΟΔΙΑΘΕΣΙΜΌΤΗΤΑΣ ΜΟΛΥΣΜΑΤΙΚΏΝ ΠΡΟΣΜΕΊΞΕΩΝ, ΤΌΣΟ IN VIVO ΌΣΟ ΚΑΙ IN VITRO, ΣΧΕΔΙΆΖΟΝΤΑΣ ΕΜΠΕΙΡΊΕΣ ΠΑΡΆΛΛΗΛΗΣ ΈΚΘΕΣΗΣ ΣΕ ΑΝΘΡΏΠΙΝΑ ΕΝΤΕΡΙΚΆ ΚΎΤΤΑΡΑ ΕΠΙΘΗΛΊΟΥ (DR. F. NAVARRO, UHU). ΟΙ ΚΥΤΤΑΡΟΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΕΣ ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΟΎΝΤΑΙ ΠΑΡΆΛΛΗΛΑ ΜΕ ΠΕΙΡΆΜΑΤΑ IN VIVO ΣΕ ΠΟΝΤΊΚΙΑ, ΠΡΟΚΕΙΜΈΝΟΥ ΝΑ ΜΕΤΑΦΡΆΖΟΝΤΑΙ ΟΙ ΕΠΙΠΤΏΣΕΙΣ ΣΤΟΝ ΆΝΘΡΩΠΟ ΚΑΙ ΝΑ ΕΠΙΚΥΡΏΝΟΝΤΑΙ ΝΈΕΣ ΠΡΟΣΕΓΓΊΣΕΙΣ ΕΝΑΛΛΑΚΤΙΚΈΣ ΣΤΗ ΧΡΉΣΗ ΠΕΙΡΑΜΑΤΌΖΩΩΝ. ΣΤΌΧΟΣ ΤΟΥ ΈΡΓΟΥ ΕΊΝΑΙ Η ΣΥΝΈΧΙΣΗ ΤΩΝ ΜΕΛΕΤΏΝ ΠΟΥ ΠΡΑΓΜΑΤΟΠΟΙΉΘΗΚΑΝ ΚΑΤΆ ΤΗ ΔΙΆΡΚΕΙΑ 5 ΔΙΑΔΟΧΙΚΏΝ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΩΝ ΈΡΓΩΝ ΤΟΥ ΙΣΠΑΝΙΚΟΎ ΠΡΟΓΡΆΜΜΑΤΟΣ ΈΡΕΥΝΑΣ ΚΑΙ ΑΝΆΠΤΥΞΗΣ, ΣΤΑ ΟΠΟΊΑ ΈΧΟΥΝ ΣΥΜΜΕΤΆΣΧΕΙ ΚΑΙ ΤΑ ΔΎΟ IPS. ΑΝΤΙΠΡΟΣΩΠΕΎΕΙ ΤΗΝ ΕΞΈΛΙΞΗ ΑΠΌ ΤΙΣ ΜΕΛΈΤΕΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΑΡΟΥΣΊΑ ΡΎΠΩΝ ΣΤΟ ΕΘΝΙΚΌ ΠΆΡΚΟ DOÑANA, ΤΗΝ ΕΦΑΡΜΟΓΉ ΩΜΙΚΏΝ ΓΙΑ ΤΗ ΔΙΕΥΚΡΊΝΙΣΗ ΤΗΣ ΒΙΟΛΟΓΙΚΉΣ ΑΠΌΚΡΙΣΗΣ ΣΕ ΘΗΛΑΣΤΙΚΆ ΚΑΙ ΑΣΠΌΝΔΥΛΑ ΕΛΕΎΘΕΡΗΣ ΖΩΉΣ ΚΑΙ ΤΗΝ ΕΝΣΩΜΆΤΩΣΗ ΤΩΝ ΩΜΙΚΏΝ ΣΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΤΗΣ ΑΠΌΚΡΙΣΗΣ ΤΟΥ ΜΟΝΤΈΛΟΥ ΟΡΓΑΝΙΣΜΟΎ M. MUSCULUS ΣΕ ΡΎΠΟΥΣ ΥΠΌ ΕΛΕΓΧΌΜΕΝΕΣ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΚΑΙ ΣΕ ΟΡΙΣΜΈΝΕΣ ΠΡΏΤΕΣ ΕΜΠΕΙΡΊΕΣ ΜΕ ΚΎΤΤΑΡΑ. ΤΟ ΈΡΓΟ ΣΗΜΑΤΟΔΟΤΕΊ ΈΝΑ ΠΕΡΑΙΤΈΡΩ ΒΉΜΑ ΣΕ ΑΥΤΉ ΤΗ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑ, ΚΑΘΏΣ ΟΙ ΕΡΕΥΝΗΤΈΣ ΘΑ ΜΕΛΕΤΉΣΟΥΝ ΤΗΝ ΕΠΊΔΡΑΣΗ ΤΩΝ ΚΟΚΤΈΙΛ ΡΎΠΩΝ, ΠΟΥ ΜΙΜΟΎΝΤΑΙ ΤΟΝ ΠΡΑΓΜΑΤΙΚΌ ΚΌΣΜΟ, ΣΕ ΜΟΡΙΑΚΌ ΕΠΊΠΕΔΟ (ΧΗΜΙΚΆ ΕΊΔΗ, ΜΕΤΑΛΛΟΒΙΟΜΗΛΊΔΕΣ, ΜΕΤΑΒΟΛΊΤΕΣ, ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΚΑΙ ΓΟΝΊΔΙΑ) ΚΑΙ ΣΕ ΒΙΟΛΟΓΙΚΌ ΕΠΊΠΕΔΟ (ΜΙΚΡΟΒΙΌΤΑ ΤΟΥ ΕΝΤΈΡΟΥ), ΕΠΙΔΙΏΚΟΝΤΑΣ ΤΗ ΣΎΝΔΕΣΗ ΜΕΤΑΞΎ ΤΩΝ ΔΎΟ ΕΠΙΠΈΔΩΝ ΜΈΣΩ ΤΟΥ ΆΞΟΝΑ ΜΙΚΡΟΒΙΟ-ΕΝΤΈΡΟΥ-ΕΓΚΈΦΑΛΟΥ, ΜΈΣΩ ΤΗΣ ΧΡΉΣΗΣ ΩΜΙΚΏΝ ΠΡΟΣΕΓΓΊΣΕΩΝ ΑΠΌ ΤΟ ΈΝΤΕΡΟ ΈΩΣ ΤΑ ΠΛΈΟΝ ΜΕΤΑΒΟΛΙΚΆ ΕΝΕΡΓΆ ΌΡΓΑΝΑ (ΉΠΑΤΟΣ ΚΑΙ ΝΕΦΡΌΣ) ΚΑΙ ΕΠΊΣΗΣ ΜΕ ΤΟΝ ΕΓΚΈΦΑΛΟ ΚΑΙ ΤΟ ΠΛΆΣΜΑ. ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΉΣΟΥΜΕ ΙΣΧΥΡΆ ΑΝΑΛΥΤΙΚΆ ΌΡΓΑΝΑ ΠΟΥ ΑΠΟΚΤΉΘΗΚΑΝ ΠΡΌΣΦΑΤΑ ΑΠΌ ΤΗΝ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΉ ΟΜΆΔΑ UHU. (Greek)
18 August 2022
0 references
DET TEAM, DER ER ANSVARLIGT FOR DELPROJEKT 1 (S1), HAR EN MARKANT TVÆRFAGLIG KARAKTER, DER OMFATTER EKSPERTFORSKERE FRA TO UNIVERSITETER (UHU OG UCO) OG 3 FORSKERGRUPPER. TEAMET INTEGRERER EN FULD-PROFESSOR I ANALYTISK KEMI (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, EKSPERT I KEMISK SPECIATION OG METABOLOMIK) OG TO LEKTORER (DR. NIEVES ABRIL, EKSPERT I GENETIK, BIOKEMI OG MOLEKYLÆR BIOLOGI (UCO) OG DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, EKSPERT I CELLEBIOLOGI (UHU)). S1 FOKUSERER PÅ UNDERSØGELSEN AF LABORATORIEMUSMUSMUSKLENS BIOLOGISKE RESPONS PÅ "KEMISKE COCKTAILS", HVOR NYE (FARMACEUTISK AKTIVE FORBINDELSER, PACS) OG REGULEREDE FORURENENDE STOFFER (METALLER OG PESTICIDER) KOMBINERES MED SÆRLIG VÆGT PÅ DERES INTERAKTION OG DEN FORMODEDE ROLLE, SOM SELEN SPILLER SOM ANTAGONIST. DEN BIOLOGISKE REAKTION VIL BLIVE VURDERET DOBBELT. PÅ DEN ENE SIDE VIL DET BLIVE VURDERET PÅ MOLEKYLÆR NIVEAU VED HJÆLP AF UNDERSØGELSER AF KEMISK SPECIATION OG METALLURGI (IP-1, UHU) FOR AT KENDE DEN KEMISKE OG METALO-BIOMOLECULES ARTSFORDELING I VÆV OG BIOLOGISKE VÆSKER EFTER EKSPONERINGEN. I LYSET HERAF VIL VI OGSÅ BESTEMME OG KVANTIFICERE ÆNDRINGERNE I MÆNGDEN AF BIOMOLEKYLER (TRANSKRIPTER OG PROTEINER MÅLT HENHOLDSVIS VED TRANSKRIPTOMICS OG PROTEOMICS -IP-2, UCO) OG TILSTEDEVÆRELSEN AF OXIDATIV SKADE I PROTEINER (REDOX PROTEOMICS, IP-2, UCO), ET VIGTIGT SPØRGSMÅL, NÅR DER ER EKSPONERING FOR FORURENENDE STOFFER, DER PRODUCERER OXIDATIV STRESS. PÅ DEN ANDEN SIDE VIL DEN BIOLOGISKE RESPONS OGSÅ BLIVE EVALUERET PÅ MIKROBIOMNIVEAU VED HJÆLP AF METAGENOMFORSKNING OG ANDRE METAOMISKE TILGANGE (IP-1 OG 2, UHU OG UCO) TIL AT BELYSE FORANDRINGERNE I MIKROORGANISMEPOPULATIONERNE OG DERES FUNKTIONER SOM FØLGE AF EKSPONERINGEN FOR DISSE COCKTAILS AF FORURENENDE STOFFER, DER EFTERLIGNER DET VIRKELIGE MILJØ OG DEN FORMODEDE ANTAGONISME AF SELEN GENNEM STABILISERING AF MIKROBIOTA. VI VIL OGSÅ VURDERE FORHOLDET MELLEM MIKROBIOTA OG BIOTILGÆNGELIGHEDEN AF FORURENENDE STOFFER, BÅDE IN VIVO OG IN VITRO, VED AT UDVIKLE PARALLELLE EKSPONERINGSERFARINGER I HUMANE INTESTINALE EPITELCELLER (DR. F. NAVARRO, UHU). CELLEKULTURER VIL BLIVE ANVENDT PARALLELT MED IN VIVO-MUSFORSØG FOR AT OMSÆTTE VIRKNINGERNE TIL MENNESKER OG VALIDERE NYE TILGANGE, DER ER ALTERNATIVE TIL ANVENDELSEN AF FORSØGSDYR. DETTE PROJEKT HAR TIL FORMÅL AT FORTSÆTTE DE UNDERSØGELSER, DER ER GENNEMFØRT UNDER FEM PÅ HINANDEN FØLGENDE TIDLIGERE PROJEKTER UNDER DET SPANSKE FORSKNINGS- OG UDVIKLINGSPROGRAM, SOM BEGGE IPS HAR DELTAGET I. DEN REPRÆSENTERER UDVIKLINGEN FRA UNDERSØGELSERNE AF FOREKOMSTEN AF FORURENENDE STOFFER I DOÑANA-NATIONALPARKEN TIL ANVENDELSE AF OMICS TIL AT BELYSE DEN BIOLOGISKE REAKTION HOS FRITLEVENDE PATTEDYR OG HVIRVELLØSE DYR OG TIL INTEGRATIONEN AF OMICS TIL UNDERSØGELSE AF REAKTIONEN FRA MODELORGANISMEN M. MUSKULUS PÅ FORURENENDE STOFFER UNDER KONTROLLEREDE LABORATORIEFORHOLD OG NOGLE TIDLIGE ERFARINGER MED CELLER. PROJEKTET BETYDER ET YDERLIGERE SKRIDT I DENNE PROCES, DA FORSKERNE VIL STUDERE INDFLYDELSEN AF COCKTAILS AF FORURENENDE STOFFER, EFTERLIGNE DEN VIRKELIGE VERDEN, PÅ MOLEKYLÆR NIVEAU (KEMISKE ARTER, METALO-BIOMOLEKYLER, METABOLITTER, PROTEINER OG GENER) OG PÅ DET BIOLOGISKE NIVEAU (GUT MIKROBIOTA), SØGER FORBINDELSEN MELLEM BEGGE NIVEAUER GENNEM MIKROBIOTA-GUT-HJERNE AKSE, VED HJÆLP AF OMIC TILGANGE FRA TARMEN TIL DE MEST METABOLISK AKTIVE ORGANER (LEVER OG NYRER) OG OGSÅ TIL HJERNE OG PLASM. VI VIL BRUGE KRAFTFULDE ANALYTISKE INSTRUMENTER FOR NYLIG ERHVERVET AF UHU FORSKERGRUPPE. (Danish)
18 August 2022
0 references
ALAHANKKEESTA 1 (S1) VASTAAVA RYHMÄ ON LUONTEELTAAN SELVÄSTI MONITIETEINEN, JA SIIHEN OSALLISTUU ASIANTUNTIJOITA KAHDESTA YLIOPISTOSTA (UHU JA UCO) JA KOLMESTA TUTKIMUSRYHMÄSTÄ. TIIMI INTEGROI ANALYYTTISEN KEMIAN PROFESSORIN (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, KEMIALLISEN LAJIN JA METABOLOMIIKAN ASIANTUNTIJA) JA KAKSI APULAISPROFESSORIA (DR. NIEVES ABRIL, GENETIIKAN, BIOKEMIAN JA MOLEKYYLIBIOLOGIAN ASIANTUNTIJA (UCO) JA DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, SOLUBIOLOGIAN ASIANTUNTIJA (UHU)). S1 KESKITTYY TUTKIMAAN LABORATORIOHIIREN MUS MUSCULUS -BAKTEERIN BIOLOGISIA VASTEITA ”KEMIALLISILLE COCKTAILEILLE” ALTISTUMISELLE, JOSSA SYNTYY (FARMASEUTTISESTI AKTIIVISIA YHDISTEITÄ, PACS-YHDISTEITÄ) JA SÄÄNNELTYJÄ (METALLEJA JA TORJUNTA-AINEITA) PILAAVIA AINEITA. ERITYISESTI KOROSTETAAN NIIDEN VUOROVAIKUTUSTA JA SELEENIN OLETETTUA ROOLIA ANTAGONISTINA. BIOLOGINEN VASTE ARVIOIDAAN KAKSINKERTAISESTI. TOISAALTA SE ARVIOIDAAN MOLEKYYLITASOLLA KEMIALLISEN LAJITTELUN JA METALLOMICSIN (IP-1, UHU) TUTKIMUSTEN AVULLA, JOTTA VOIDAAN TIETÄÄ KEMIALLISTEN JA METALLI-BIOMOLEKYYLILAJIEN JAKAUTUMINEN KUDOKSISSA JA BIOLOGISISSA NESTEISSÄ ALTISTUMISEN JÄLKEEN. TÄSSÄ VALOSSA MÄÄRITÄMME JA KVANTIFIOIMME MYÖS MUUTOKSET BIOMOLEKYYLIEN (TRANSCRIPTOMICS JA PROTEOMICS -IP-2, UCO) RUNSAUDEN MUUTTUESSA SEKÄ OKSIDATIIVISTEN VAURIOIDEN ESIINTYMISEN PROTEIINEISSA (REDOX PROTEOMIIKKA, IP-2, UCO), MIKÄ ON OLENNAINEN ONGELMA, KUN ALTISTUMINEN OKSIDATIIVISTA STRESSIÄ AIHEUTTAVILLE EPÄPUHTAUKSILLE ON OLEMASSA. TOISAALTA BIOLOGINEN VASTE ARVIOIDAAN MYÖS MIKROBIOMIN TASOLLA KÄYTTÄMÄLLÄ METAGENOMIIKKAA JA MUITA METAOMISIA LÄHESTYMISTAPOJA (IP-1 JA 2, UHU JA UCO) MIKRO-ORGANISMIPOPULAATIOIDEN JA NIIDEN TOIMINTOJEN MUUTOSTEN SELVITTÄMISEKSI, JOTKA JOHTUVAT ALTISTUMISESTA KYSEISILLE PILAAVIEN AINEIDEN COCKTAILEILLE, JOTKA JÄLJITTELEVÄT TODELLISTA YMPÄRISTÖÄ JA SELEENIN OLETETTUA ANTAGONISMIA MIKROBIOTASTABILOINNIN KAUTTA. ARVIOIMME MYÖS MIKROBIOTAN SUHDETTA KONTAMINANTTIEN BIOLOGISEEN HYÖTYOSUUTEEN SEKÄ IN VIVO ETTÄ IN VITRO SUUNNITTELEMALLA RINNAKKAISIA ALTISTUSKOKEMUKSIA IHMISEN SUOLISTOEPITEELISOLUISSA (DR. F. NAVARRO, UHU). SOLUVILJELMIÄ KÄYTETÄÄN SAMANAIKAISESTI IN VIVO -HIIRTEN KANSSA, JOTTA VAIKUTUKSET VOIDAAN MUUNTAA IHMISILLE JA VALIDOIDA KOE-ELÄINTEN KÄYTÖLLE VAIHTOEHTOISIA UUSIA LÄHESTYMISTAPOJA. HANKKEEN TAVOITTEENA ON JATKAA ESPANJAN TUTKIMUS- JA KEHITYSOHJELMAN VIIDESSÄ PERÄKKÄISESSÄ HANKKEESSA TEHTYJÄ TUTKIMUKSIA, JOIHIN MOLEMMAT IPS OVAT OSALLISTUNEET. SE EDUSTAA DOÑANAN KANSALLISPUISTOSSA ESIINTYVIEN EPÄPUHTAUKSIEN ESIINTYMISTÄ KOSKEVIEN TUTKIMUSTEN EVOLUUTIOTA, OMICSIN KÄYTTÖÄ BIOLOGISEN VASTEEN SELVENTÄMISEKSI VAPAA-AIKANA ELÄVISSÄ NISÄKKÄISSÄ JA SELKÄRANGATTOMISSA SEKÄ OMIIKAN INTEGROINTIA, JOTTA VOIDAAN TUTKIA MALLIORGANISMI M. MUSCULUS -ORGANISMIN VASTE EPÄPUHTAUSALTISTUKSEEN KONTROLLOIDUISSA LABORATORIO-OLOSUHTEISSA JA JOITAIN VARHAISIA KOKEMUKSIA SOLUISTA. HANKE MERKITSEE UUTTA ASKELTA TÄSSÄ PROSESSISSA, SILLÄ TUTKIJAT TUTKIVAT PILAAVIEN AINEIDEN COCKTAILIEN VAIKUTUSTA, JÄLJITTELEMÄLLÄ TODELLISTA MAAILMAA, MOLEKYYLITASOLLA (KEMIALLISET LAJIT, METALLI-BIOMOLEKYYLET, METABOLIITIT, PROTEIINIT JA GEENIT) JA BIOLOGISELLA TASOLLA (SUOLEN MIKROBIOTA), ETSIEN MOLEMPIEN TASOJEN VÄLISTÄ YHTEYTTÄ MIKROBIOTA-SUOLEN-AIVOAKSELIN KAUTTA KÄYTTÄMÄLLÄ OMIC-LÄHESTYMISTAPOJA SUOLISTOSTA KAIKKEIN METABOLISESTI AKTIIVISIIN ELIMIIN (MAKSA JA MUNUAISET) SEKÄ AIVOIHIN JA PLASMAAN. KÄYTÄMME UHU-TUTKIMUSRYHMÄN ÄSKETTÄIN HANKKIMIA TEHOKKAITA ANALYYTTISIÄ INSTRUMENTTEJA. (Finnish)
18 August 2022
0 references
IT-TIM RESPONSABBLI GĦAS-SOTTOPROĠETT 1 (S1) GĦANDU NATURA FERM MULTIDIXXIPLINARJA, LI JINVOLVI RIĊERKATURI ESPERTI MINN 2 UNIVERSITAJIET (UHU U UCO) U 3 GRUPPI TA’ RIĊERKA. IT-TIM JINTEGRA FULL-PROFESSOR TAL-KIMIKA ANALITIKA (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, ESPERT FL-ISPEĊIFIKAZZJONI KIMIKA U METABOLOMICS) U ŻEWĠ PROFESSURI ASSOĊJATI (DR. NIEVES ABRIL, ESPERT FIL-ĠENETIKA, BIJOKIMIKA U MOLEKULARI BIJOLOĠIJA (UCO) U DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, ESPERT FIL-BIJOLOĠIJA TAĊ-ĊELLOLI (UHU)). S1 JIFFOKA FUQ L-ISTUDJU TAR-REAZZJONIJIET BIJOLOĠIĊI TAL-MUSKULU TAL-ĠURDIEN TAL-LABORATORJU MUS GĦALL-ESPOŻIZZJONI “KOKTEJLS KIMIĊI”, FEJN SUSTANZI LI JNIĠĠSU EMERĠENTI (KOMPOSTI ATTIVI FARMAĊEWTIĊI, PACS) U REGOLATI (METALLI U PESTIĊIDI) HUMA KKOMBINATI, B’ENFASI SPEĊJALI FUQ L-INTERAZZJONI TAGĦHOM U R-RWOL PUTATTIV TAS-SELENJU BĦALA ANTAGONIST. IR-RISPONS BIJOLOĠIKU SE JIĠI VVALUTAT DARBTEJN. MINN NAĦA WAĦDA, SE JIĠI VVALUTAT FIL-LIVELL MOLEKULARI, PERMEZZ TA’ STUDJI TA’ SPEĊJAZZJONI KIMIKA U METALLOMIKA (IP-1, UHU), BIEX TKUN MAGĦRUFA D-DISTRIBUZZJONI KIMIKA U L-ISPEĊIJIET METALO-BIJOMOLLIKULI FIT-TESSUTI U L-FLUWIDI BIJOLOĠIĊI WARA L-ESPONIMENT. F’DAN ID-DAWL, SE NIDDETERMINAW U NIKKWANTIFIKAW UKOLL IL-BIDLIET FL-ABBUNDANZA TAL-BIJOMOLEKULI (TRASKRIZZJONIJIET U PROTEINI MKEJLA, RISPETTIVAMENT, PERMEZZ TA’ TRASKRIZZJONI U PROTEOMIKA -IP-2, UCO) U L-PREŻENZA TA’ ĦSARA OSSIDATTIVA FIL-PROTEINI (REDOX PROTEOMICS, IP-2, UCO), KWISTJONI ESSENZJALI META JKUN HEMM ESPONIMENT GĦAL SUSTANZI LI JNIĠĠSU LI JIPPRODUĊU STRESS OSSIDATTIV. MIN-NAĦA L-OĦRA, IR-RISPONS BIJOLOĠIKU SE JIĠI EVALWAT UKOLL FIL-LIVELL TAL-MIKROBIJOMA, BL-UŻU TA’ APPROĊĊI METAĠENOMIĊI U META-OMIĊI OĦRA (IP-1 U 2, UHU U UCO) BIEX JIĠU ĊĊARATI L-ALTERAZZJONIJIET FIL-POPOLAZZJONIJIET TAL-MIKROORGANIŻMU U L-FUNZJONIJIET TAGĦHOM, IKKAWŻATI MILL-ESPONIMENT GĦAL DAWK IL-KOKTEJLS TA’ SUSTANZI LI JNIĠĠSU LI JIMITAW L-AMBJENT REALI U L-ANTAGONIŻMU PUTATTIV TAS-SELENJU PERMEZZ TAL-ISTABBILIZZAZZJONI TAL-MIKROBIJOTA. SER NIVVALUTAW UKOLL IR-RELAZZJONI BEJN IL-MIKROBIJOTA U L-BIJODISPONIBBILTÀ TAL-KONTAMINANTI, KEMM IN VIVO KIF UKOLL IN VITRO, BILLI NIDDISINJAW ESPERJENZI PARALLELI TA’ ESPONIMENT FIĊ-ĊELLOLI TAL-EPITELJU INTESTINALI TAL-BNIEDEM (DR. F. NAVARRO, UHU). IL-KULTURI TAĊ-ĊELLOLI SE JINTUŻAW B’MOD PARALLEL MA’ ESPERIMENTI FUQ IL-ĠRIEDEN IN VIVO SABIEX JITTRADUĊU L-EFFETTI FUQ IL-BNEDMIN U JIVVALIDAW APPROĊĊI ALTERNATTIVI ĠODDA GĦALL-UŻU TA’ ANNIMALI SPERIMENTALI. DAN IL-PROĠETT GĦANDU L-GĦAN LI JKOMPLI L-ISTUDJI MWETTQA MATUL 5 PROĠETTI KONSEKUTTIVI PREĊEDENTI TAL-PROGRAMM SPANJOL TA’ RIĊERKA U ŻVILUPP, LI FIHOM IPPARTEĊIPAW IŻ-ŻEWĠ IPS. DAN JIRRAPPREŻENTA L-EVOLUZZJONI MILL-ISTUDJI TAL-PREŻENZA TA’ SUSTANZI LI JNIĠĠSU FIL-PARK NAZZJONALI TA’ DOÑANA, GĦALL-APPLIKAZZJONI TA’ OMICS BIEX TIĠI ĊĊARATA R-REAZZJONI BIJOLOĠIKA FIL-MAMMIFERI U L-INVERTEBRATI TAL-ĦAJJA LIBERA U GĦALL-INTEGRAZZJONI TAL-OMICS BIEX TIĠI STUDJATA R-REAZZJONI TAL-ORGANIŻMU MUDELL M. MUSCULUS GĦALL-ESPONIMENT TA’ SUSTANZI NIĠĠIESA F’KUNDIZZJONIJIET IKKONTROLLATI TAL-LABORATORJU U XI ESPERJENZI BIKRIJA MAĊ-ĊELLOLI. IL-PROĠETT IFISSER PASS ULTERJURI F’DAN IL-PROĊESS, KIF IR-RIĊERKATURI SE JISTUDJAW L-INFLUWENZA TA ‘KOKTEJLS TA’ SUSTANZI LI JNIĠĠSU, JIMITAW ID-DINJA REALI, FIL-LIVELL MOLEKULARI (SPEĊI KIMIĊI, METALO-BIJOMOLLIKULI, METABOLITI, PROTEINI U ĠENI) U FIL-LIVELL BIJOLOĠIKU (MIKROBIJOTA GUT), TFITTEX IL-KONNESSJONI BEJN IŻ-ŻEWĠ LIVELLI PERMEZZ TAL-MIKROBIJOTA-MUSRANA-MOĦĦ ASSI, PERMEZZ TAL-UŻU TA ‘APPROĊĊI OMIC MILL-IMSAREN GĦALL-ORGANI L-AKTAR METABOLIKAMENT ATTIVI (FWIED U KLIEWI) U WKOLL GĦALL-MOĦĦ U L-PLAŻMA. AĦNA SE NUŻAW STRUMENTAZZJONI ANALITIKA QAWWIJA REĊENTEMENT MIKSUBA MILL-GRUPP TA ‘RIĊERKA UHU. (Maltese)
18 August 2022
0 references
PAR 1. APAKŠPROJEKTU (S1) ATBILDĪGAJAI KOMANDAI IR IZTEIKTI DAUDZNOZARU RAKSTURS, IESAISTOT EKSPERTUS NO 2 UNIVERSITĀTĒM (UHU UN UCO) UN 3 PĒTNIECĪBAS GRUPĀM. KOMANDĀ APVIENO PILNU ANALĪTISKĀS ĶĪMIJAS PROFESORU (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, ĶĪMISKĀS SPECIĀCIJAS UN METABOLOMIKAS EKSPERTE) UN DIVUS ASOCIĒTOS PROFESORUS (DR. NIEVES ABRIL, EKSPERTS ĢENĒTIKĀ, BIOĶĪMIJĀ UN MOLEKULĀRAJĀ BIOLOĢIJĀ (UCO) UN DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, ŠŪNU BIOLOĢIJAS EKSPERTS (UHU)). S1 KONCENTRĒJAS UZ PĒTĪJUMU PAR LABORATORIJAS PELES MUS MUSCULUS BIOLOĢISKO REAKCIJU UZ “ĶĪMISKO KOKTEIĻU” IEDARBĪBU, KUR TIEK KOMBINĒTI JAUNIE (FARMACEITISKI AKTĪVIE SAVIENOJUMI, PACS) UN REGULĒTIE (METĀLI UN PESTICĪDI) PIESĀRŅOTĀJI, ĪPAŠU UZMANĪBU PIEVĒRŠOT TO MIJIEDARBĪBAI UN SELĒNA KĀ ANTAGONISTA IESPĒJAMAJAI NOZĪMEI. BIOLOĢISKO REAKCIJU NOVĒRTĒS DIVKĀRŠI. NO VIENAS PUSES, TO NOVĒRTĒS MOLEKULĀRĀ LĪMENĪ, VEICOT ĶĪMISKĀS SPECIĀCIJAS UN METALOMIKAS PĒTĪJUMUS (IP-1, UHU), LAI ZINĀTU ĶĪMISKO VIELU UN METALOBIOMOLEKULU SUGU IZPLATĪBU AUDOS UN BIOLOĢISKAJOS ŠĶIDRUMOS PĒC EKSPOZĪCIJAS. ŅEMOT TO VĒRĀ, MĒS ARĪ NOTEIKSIM UN KVANTIFICĒSIM BIOMOLEKULU DAUDZUMA IZMAIŅAS (TRANSKRIPTI UN OLBALTUMVIELAS, KO MĒRA ATTIECĪGI AR TRANSKRIPTOMIKU UN PROTEOMIKU -IP-2, UCO) UN OKSIDATĪVO BOJĀJUMU KLĀTBŪTNI OLBALTUMVIELĀS (REDOX PROTEOMIKA, IP-2, UCO), KAS IR BŪTISKS JAUTĀJUMS, JA IR IEDARBĪBA UZ PIESĀRŅOJOŠĀM VIELĀM, KAS RADA OKSIDATĪVO STRESU. NO OTRAS PUSES, BIOLOĢISKĀ REAKCIJA TIKS NOVĒRTĒTA ARĪ MIKROBIOMU LĪMENĪ, IZMANTOJOT METAGENOMIKAS UN CITAS METAOMIKAS PIEEJAS (IP-1 UN 2, UHU UN UCO), LAI IZSKAIDROTU IZMAIŅAS MIKROORGANISMU POPULĀCIJĀS UN TO FUNKCIJĀS, KO IZRAISA TO PIESĀRŅOJOŠO VIELU IEDARBĪBA UZ KOKTEIĻIEM, KAS ATDARINA REĀLO VIDI UN SELĒNA IESPĒJAMO ANTAGONISMU MIKROBIOTAS STABILIZĒŠANAS CEĻĀ. MĒS ARĪ NOVĒRTĒSIM SAISTĪBU STARP MIKROBIOTU UN PIESĀRŅOTĀJU BIOPIEEJAMĪBU GAN IN VIVO, GAN IN VITRO, IZSTRĀDĀJOT PARALĒLAS EKSPOZĪCIJAS PIEREDZI CILVĒKA ZARNU EPITĒLIJA ŠŪNĀS (DR. F. NAVARRO, UHU). ŠŪNU KULTŪRAS IZMANTO PARALĒLI IN VIVO EKSPERIMENTIEM AR PELĒM, LAI PĀRVĒRSTU IETEKMI UZ CILVĒKIEM UN APSTIPRINĀTU JAUNAS PIEEJAS, KAS IR ALTERNATĪVAS IZMĒĢINĀJUMU DZĪVNIEKU IZMANTOŠANAI. ŠĀ PROJEKTA MĒRĶIS IR TURPINĀT PĒTĪJUMUS, KAS VEIKTI PIECOS SECĪGOS IEPRIEKŠĒJOS SPĀNIJAS PĒTNIECĪBAS UN ATTĪSTĪBAS PROGRAMMAS PROJEKTOS, KUROS PIEDALĪJĀS ABI IPS. TAS ATSPOGUĻO ATTĪSTĪBU NO PĒTĪJUMIEM PAR PIESĀRŅOJOŠO VIELU KLĀTBŪTNI DOÑANA NACIONĀLAJĀ PARKĀ, UZ OMIKAS IZMANTOŠANU, LAI IZSKAIDROTU BIOLOĢISKO ATBILDES REAKCIJU BRĪVI DZĪVOJOŠIEM ZĪDĪTĀJIEM UN BEZMUGURKAULNIEKIEM, UN UZ OMIKAS INTEGRĒŠANU, LAI PĒTĪTU MODEĻA ORGANISMA M. MUSCULUS REAKCIJU UZ PIESĀRŅOJOŠĀM VIELĀM KONTROLĒTOS LABORATORIJAS APSTĀKĻOS UN ZINĀMU AGRĪNU PIEREDZI AR ŠŪNĀM. PROJEKTS IR NĀKAMAIS SOLIS ŠAJĀ PROCESĀ, JO PĒTNIEKI PĒTĪS PIESĀRŅOJOŠO VIELU KOKTEIĻU IETEKMI, ATDARINOT REĀLO PASAULI MOLEKULĀRĀ LĪMENĪ (ĶĪMISKĀS SUGAS, METALOBIOMOLEKULAS, METABOLĪTI, PROTEĪNI UN GĒNI) UN BIOLOĢISKAJĀ LĪMENĪ (ZARNU MIKROBIOTA), MEKLĒJOT SAIKNI STARP ABIEM LĪMEŅIEM CAUR MIKROBIOTAS-ZARNU SMADZEŅU ASI, IZMANTOJOT OMISKU PIEEJU NO ZARNĀM LĪDZ METABOLISMA AKTĪVAJIEM ORGĀNIEM (AKNĀM UN NIERĒM), KĀ ARĪ SMADZENĒM UN PLAZMAI. MĒS IZMANTOSIM SPĒCĪGUS ANALĪTISKOS INSTRUMENTUS, KO NESEN IEGUVA UHU PĒTNIECĪBAS GRUPA. (Latvian)
18 August 2022
0 references
TÍM ZODPOVEDNÝ ZA PODPROJEKT 1 (S1) MÁ VÝRAZNE MULTIDISCIPLINÁRNU POVAHU, DO KTOREJ SÚ ZAPOJENÍ EXPERTNÍ VÝSKUMNÍ PRACOVNÍCI Z 2 UNIVERZÍT (UHU A UCO) A 3 VÝSKUMNÝCH SKUPÍN. TÍM INTEGRUJE FULL-PROFESOR ANALYTICKEJ CHÉMIE (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, EXPERT NA CHEMICKÉ ŠPECIFIKÁCIE A METABOLOMIKA) A DVOCH DOCENTOV (DR. NIEVES ABRIL, EXPERT V GENETIKE, BIOCHÉMIE A MOLEKULÁRNEJ BIOLÓGIE (UCO) A DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, ODBORNÍK V BUNKOVEJ BIOLÓGII (UHU)). S1 SA ZAMERIAVA NA ŠTÚDIUM BIOLOGICKÝCH REAKCIÍ LABORATÓRNYCH MYŠÍ MUS MUSCULUS NA VYSTAVENIE „CHEMICKÝM KOKTAILOM“, KDE SA KOMBINUJÚ VZNIKAJÚCE (FARMACEUTICKY AKTÍVNE ZLÚČENINY, PACS) A REGULOVANÉ (KOVY A PESTICÍDY) ZNEČISŤUJÚCE LÁTKY S OSOBITNÝM DÔRAZOM NA ICH INTERAKCIU A PREDPOKLADANÚ ÚLOHU SELÉNU AKO ANTAGONISTU. BIOLOGICKÁ ODPOVEĎ SA BUDE POSUDZOVAŤ DVOJNÁSOBNE. NA JEDNEJ STRANE SA BUDE HODNOTIŤ NA MOLEKULÁRNEJ ÚROVNI PROSTREDNÍCTVOM ŠTÚDIÍ CHEMICKEJ ŠPECIFIKÁCIE A METALLOMIKY (IP-1, UHU) S CIEĽOM POZNAŤ DISTRIBÚCIU CHEMICKÝCH A METALO-BIOMOLEKÚLOVÝCH DRUHOV V TKANIVÁCH A BIOLOGICKÝCH KVAPALINÁCH PO EXPOZÍCII. V TOMTO SVETLE TIEŽ URČÍME A KVANTIFIKUJEME ZMENY V HOJNOSTI BIOMOLEKÚL (PREPISY A PROTEÍNY MERANÉ TRANSKRIPTOMIKOU A PROTEOMIKOU – IP-2, UCO) A PRÍTOMNOSŤ OXIDAČNÉHO POŠKODENIA V PROTEÍNOCH (REDOX PROTEOMICS, IP-2, UCO), ČO JE ZÁSADNÝ PROBLÉM, KEĎ DOCHÁDZA K EXPOZÍCII ZNEČISŤUJÚCIM LÁTKAM, KTORÉ SPÔSOBUJÚ OXIDAČNÝ STRES. NA DRUHEJ STRANE SA BIOLOGICKÁ ODPOVEĎ BUDE HODNOTIŤ AJ NA ÚROVNI MIKROBIÓMOV POMOCOU METAGENOMÍK A INÝCH META-OMICKÝCH PRÍSTUPOV (IP-1 A 2, UHU A UCO) NA OBJASNENIE ZMIEN V POPULÁCIÁCH MIKROORGANIZMOV A ICH FUNKCIÁCH SPÔSOBENÝCH VYSTAVENÍM TÝMTO KOKTAILOM ZNEČISŤUJÚCICH LÁTOK, KTORÉ NAPODOBŇUJÚ SKUTOČNÉ PROSTREDIE, A PREDPOKLADANÉMU ANTAGONIZMU SELÉNU PROSTREDNÍCTVOM STABILIZÁCIE MIKROBIOTY. TAKTIEŽ POSÚDIME VZŤAH MEDZI MIKROFLÓROU A BIOLOGICKOU DOSTUPNOSŤOU KONTAMINANTOV IN VIVO AJ IN VITRO NAVRHNUTÍM SKÚSENOSTÍ S PARALELNOU EXPOZÍCIOU V EPITELOVÝCH BUNKÁCH ĽUDSKÉHO ČREVA (DR. F. NAVARRO, UHU). BUNKOVÉ KULTÚRY SA BUDÚ POUŽÍVAŤ SÚBEŽNE S POKUSMI NA MYŠIACH IN VIVO S CIEĽOM PRENIESŤ ÚČINKY NA ĽUDÍ A POTVRDIŤ NOVÉ PRÍSTUPY ALTERNATÍVNE K POUŽÍVANIU POKUSNÝCH ZVIERAT. CIEĽOM TOHTO PROJEKTU JE POKRAČOVAŤ V ŠTÚDIÁCH REALIZOVANÝCH POČAS PIATICH PREDCHÁDZAJÚCICH PROJEKTOV ŠPANIELSKEHO VÝSKUMNÉHO A VÝVOJOVÉHO PROGRAMU, NA KTORÝCH SA ZÚČASTNILI OBA IPS. PREDSTAVUJE VÝVOJ OD ŠTÚDIÍ PRÍTOMNOSTI ZNEČISŤUJÚCICH LÁTOK V NÁRODNOM PARKU DOÑANA, APLIKÁCIE OMÍK NA OBJASNENIE BIOLOGICKEJ REAKCIE U VOĽNE ŽIJÚCICH CICAVCOV A BEZSTAVOVCOV A INTEGRÁCIE OMÍK NA ŠTÚDIUM REAKCIE MODELOVÉHO ORGANIZMU M. MUSCULUS NA VYSTAVENIE ZNEČISŤUJÚCICH LÁTOK V KONTROLOVANÝCH LABORATÓRNYCH PODMIENKACH A NIEKTORÉ SKORÉ SKÚSENOSTI S BUNKAMI. PROJEKT ZNAMENÁ ĎALŠÍ KROK V TOMTO PROCESE, PRETOŽE VÝSKUMNÍCI BUDÚ ŠTUDOVAŤ VPLYV KOKTAILOV ZNEČISŤUJÚCICH LÁTOK, NAPODOBŇUJÚC SKUTOČNÝ SVET, NA MOLEKULÁRNEJ ÚROVNI (CHEMICKÉ DRUHY, METALO-BIOMOLEKULY, METABOLITY, PROTEÍNY A GÉNY) A NA BIOLOGICKEJ ÚROVNI (ČREVNÁ MIKROBIOTA), HĽADANIE SPOJENIA MEDZI OBOMA ÚROVŇAMI PROSTREDNÍCTVOM OSI MIKROBIOTA-GUT-MOZOG, POMOCOU OMICKÝCH PRÍSTUPOV Z ČREVA K NAJ METABOLICKEJŠÍM ORGÁNOM (PEČEŇ A OBLIČKY) A TIEŽ K MOZGU A PLAZMU. POUŽIJEME VÝKONNÉ ANALYTICKÉ PRÍSTROJE, KTORÉ NEDÁVNO ZÍSKALA VÝSKUMNÁ SKUPINA UHU. (Slovak)
18 August 2022
0 references
AN FHOIREANN ATÁ FREAGRACH AS AN BHFOTHIONSCADAL 1 (S1) TÁ NÁDÚR SUNTASACH ILDISCIPLÍNEACH, INA BHFUIL TAIGHDEOIRÍ SAINEOLAITHE Ó 2 OLLSCOILEANNA (UHU AGUS UCO) AGUS 3 GHRÚPA TAIGHDE. COMHTHÁTHAÍONN AN FHOIREANN LÁN-OLLAMH CEIMIC ANAILÍSEACH (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, SAINEOLAÍ I SPECIATION CEIMICEACH AGUS METABOLOMICS) AGUS DHÁ OLLÚNA CHOMHLACHÚ (DR. NIEVES ABRIL, SAINEOLAÍ I GÉINEOLAÍOCHT, BITHCHEIMIC AGUS BITHEOLAÍOCHT MHÓILÍNEACH (UCO) AGUS DR FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, SAINEOLAÍ I BITHEOLAÍOCHT CILLE (UHU)). DÍRÍONN S1 AR STAIDÉAR A DHÉANAMH AR FHREAGAIRTÍ BITHEOLAÍOCHA AN LUCH SAOTHARLAINNE MUS MUSCULUS DO NOCHTADH “CEIMICEÁIN CHEIMICEACHA”, I GCÁS INA GCUIRTEAR TRUAILLEÁIN ATÁ AG TEACHT CHUN CINN (COMHDHÚILE ATÁ GNÍOMHACH GO CÓGAISÍOCHTA, PACS) AGUS RIALAITHE (MIOTAIL AGUS LOTNAIDICÍDÍ) LE CHÉILE, LE BÉIM AR LEITH AR A N-IDIRGHNÍOMHAÍOCHT AGUS AR RÓL ROGHNACH SEILÉINIAM MAR ANTAGONIST. DÉANFAR MEASÚNÚ DÚBAILTE AR AN BHFREAGAIRT BHITHEOLAÍOCH. AR THAOBH AMHÁIN, DÉANFAR É A MHEASÚNÚ AR AN LEIBHÉAL MÓILÍNEACH, TRÍ STAIDÉIR AR SPECIATION CEIMICEACH AGUS METALLOMICS (IP-1, UHU), CHUN EOLAS A FHÁIL AR DHÁILEADH SPEICEAS CEIMICEACH AGUS METALO-BIOMOLECULES I BHFÍOCHÁIN AGUS I SREABHÁIN BHITHEOLAÍOCHA TAR ÉIS AN NOCHTA. I BHFIANAISE AN MÉID SIN, DÉANFAIMID CINNEADH AGUS CAINNÍOCHTÚ FREISIN AR NA HATHRUITHE AR FHLÚIRSE BITHMHÓILÍNÍ (TRAS-SCRÍBHINNÍ AGUS PRÓITÉINÍ A THOMHAISTEAR, FAOI SEACH, LE TRAS-SCRÍBHINN AGUS PRÓITÉAMAÍOCHT -IP-2, UCO) AGUS AN BHFUIL DAMÁISTE OCSAÍDIÚCHÁIN I BPRÓITÉINÍ (PRÓITÉAMAÍOCHTREDOX, IP-2, UCO), SAINCHEIST RIACHTANACH NUAIR A BHÍONN NOCHTADH DO THRUAILLEÁIN A THÁIRGEANN STRUS OCSAÍDIÚCHÁIN. AR AN LÁIMH EILE, DÉANFAR AN FHREAGAIRT BHITHEOLAÍOCH A MHEAS FREISIN AR LEIBHÉAL AN MHICRIBHITHEOLAÍOCHTA, TRÍ ÚSÁID A BHAINT AS MEITIGÉANÓM AGUS CUR CHUIGE MEITEA-ÓMAÍOCHTA EILE (IP-1 AGUS 2, UHU AGUS UCO) CHUN NA HATHRUITHE SNA DAONRAÍ MIOCRORGÁNACHA AGUS A BHFEIDHMEANNA A SHOILÉIRIÚ, MAR GHEALL AR NOCHTADH DO MHANGLAIM NA DTRUAILLEÁN SIN A DHÉANANN AITHRIS AR AN BHFÍOR-THIMPEALLACHT AGUS AR ANTAGONISM ROGHNACH SEILÉINIAM TRÍ CHOBHSÚ MICROBIOTA. DÉANFAIMID MEASÚNÚ FREISIN AR AN NGAOL IDIR MICROBIOTA AGUS BITH-INFHAIGHTEACHT ÉILLEÁN, IN VIVO AGUS IN VITRO ARAON, TRÍ EISPÉIRIS NOCHTA CHOMHTHREOMHARA A DHEARADH I GCEALLA EPITHELIUM STÉIGEACHA DAONNA (DR. F. NAVARRO, UHU). BAINFEAR ÚSÁID AS CULTÚIR CHILL I GCOMHTHREO LE TURGNAIMH LUCHA IN VIVO CHUN NA HÉIFEACHTAÍ A AISTRIÚ CHUIG DAOINE AGUS CHUN CINEÁLACHA CUR CHUIGE NUA A BHAILÍOCHTÚ MAR MHALAIRT AR AINMHITHE TURGNAMHACHA A ÚSÁID. TÁ SÉ MAR AIDHM AG AN TIONSCADAL SEO LEANÚINT AR AGHAIDH LEIS NA STAIDÉIR A RINNEADH LE LINN 5 TIONSCADAL ROIMHE SEO DE CHLÁR TAIGHDE AGUS FORBARTHA NA SPÁINNE, INA BHFUIL AN DÁ IPS RANNPHÁIRTEACH. LÉIRÍONN SÉ AN ÉABHLÓID Ó NA STAIDÉIR AR AN LÁITHREACHT TRUAILLEÁN SA PHÁIRC NÁISIÚNTA DOÑANA, LE CUR I BHFEIDHM NA OMICS CHUN ELUCIDATE AN FHREAGAIRT BITHEOLAÍOCH I MAMAIGH SAOR-SAOIL AGUS INVEIRTEABRAIGH AGUS LE COMHTHÁTHÚ OMICS CHUN STAIDÉAR A DHÉANAMH AR FHREAGAIRT AN ORGÁNAIGH SAMHAIL M. MUSCULUS NOCHTADH DO THRUAILLEÁIN FAOI CHOINNÍOLLACHA SAOTHARLAINNE RIALAITHE AGUS ROINNT TAITHÍ LUATH LE CEALLA. SIGNIFIES AN TIONSCADAL CÉIM EILE SA PHRÓISEAS SEO, MAR GO MBEIDH NA TAIGHDEOIRÍ STAIDÉAR A DHÉANAMH AR THIONCHAR MHANGLAIM NA DTRUAILLEÁN, MIMICKING AN DOMHAN FÍOR, AG AN LEIBHÉAL MÓILÍNEACH (SPEICIS CEIMICEACHA, METALO-BIOMOLECULES, MEITIBILÍTÍ, PRÓITÉINÍ AGUS GÉINTE) AGUS AG AN LEIBHÉAL BITHEOLAÍOCH (MICREBIOTAGUTGUT), AG LORG AN NASC IDIR AN DÁ LEIBHÉAL TRÍD AN AIS MICROBIOTA-GUT-INCHINN, TRÍ ÚSÁID A BHAINT AS CUR CHUIGE ADAMHACH ÓN STÉIG GO DTÍ NA HORGÁIN IS GNÍOMHAÍ MEITIBILEACH (SEACHAD AGUS DUÁIN) AGUS FREISIN INCHINN AGUS PLASM. BAINFIMID ÚSÁID AS IONSTRAIMÍOCHT ANAILÍSEACH CUMHACHTACH A FUAIR GRÚPA TAIGHDE UHU LE DÉANAÍ. (Irish)
18 August 2022
0 references
TÝM ODPOVĚDNÝ ZA DÍLČÍ PROJEKT 1 (S1) MÁ VÝRAZNĚ MULTIDISCIPLINÁRNÍ POVAHU A ZAHRNUJE ODBORNÉ VÝZKUMNÉ PRACOVNÍKY ZE 2 UNIVERZIT (UHU A UCO) A 3 VÝZKUMNÉ SKUPINY. TÝM INTEGRUJE PLNOHODNOTNÉHO PROFESORA ANALYTICKÉ CHEMIE (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, ODBORNÍK NA CHEMICKÉ SPECIACE A METABOLOMIKU) A DVA DOCENTY (DR. NIEVES ABRIL, ODBORNÍK NA GENETIKU, BIOCHEMII A MOLEKULÁRNÍ BIOLOGII (UCO) A DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, ODBORNÍK NA BUNĚČNOU BIOLOGII (UHU)). S1 SE ZAMĚŘUJE NA STUDIUM BIOLOGICKÝCH REAKCÍ LABORATORNÍ MYŠ MUS MUSCULUS NA EXPOZICI „CHEMICKÝCH KOKTEJLŮ“, KDE JSOU KOMBINOVÁNY VZNIKAJÍCÍ (FARMACEUTICKY AKTIVNÍ SLOUČENINY, PACS) A REGULOVANÉ (KOVY A PESTICIDY) ZNEČIŠŤUJÍCÍ LÁTKY, SE ZVLÁŠTNÍM DŮRAZEM NA JEJICH INTERAKCI A DOMNĚLÉ ROLI SELENU JAKO ANTAGONISTY. BIOLOGICKÁ ODEZVA BUDE POSOUZENA DVAKRÁT. NA JEDNÉ STRANĚ BUDE HODNOCENO NA MOLEKULÁRNÍ ÚROVNI, PROSTŘEDNICTVÍM STUDIÍ CHEMICKÉ SPECIACE A METALLOMIKY (IP-1, UHU), ZNÁT DISTRIBUCI CHEMICKÝCH A METALO-BIOMOLEKUL V TKÁNÍCH A BIOLOGICKÝCH TEKUTINÁCH PO EXPOZICI. V TOMTO SVĚTLE TAKÉ URČÍME A KVANTIFIKUJEME ZMĚNY V HOJNOSTI BIOMOLEKUL (TRANSKRIPTY A PROTEINY MĚŘENÉ TRANSKRIPTOMIÍ A PROTEOMIKY -IP-2, UCO) A PŘÍTOMNOST OXIDATIVNÍHO POŠKOZENÍ V PROTEINECH (REDOX PROTEOMIKA, IP-2, UCO), COŽ JE ZÁSADNÍ PROBLÉM PŘI EXPOZICI ZNEČIŠŤUJÍCÍM LÁTKÁM, KTERÉ ZPŮSOBUJÍ OXIDAČNÍ STRES. NA DRUHÉ STRANĚ BUDE BIOLOGICKÁ ODEZVA HODNOCENA TAKÉ NA ÚROVNI MIKROBIOMU POMOCÍ METAGENOMICKÝCH METOD A JINÝCH META-OMICKÝCH PŘÍSTUPŮ (IP-1 A 2, UHU A UCO) K OBJASNĚNÍ ZMĚN V POPULACÍCH MIKROORGANISMŮ A JEJICH FUNKCÍ ZPŮSOBENÝCH EXPOZICÍ TĚMTO KOKTEJLŮM ZNEČIŠŤUJÍCÍCH LÁTEK, KTERÉ NAPODOBUJÍ SKUTEČNÉ PROSTŘEDÍ A DOMNĚLÝ ANTAGONISMUS SELENU PROSTŘEDNICTVÍM STABILIZACE MIKROBIOTY. ROVNĚŽ POSOUDÍME VZTAH MEZI MIKROBIOTOU A BIOLOGICKOU DOSTUPNOSTÍ KONTAMINUJÍCÍCH LÁTEK IN VIVO I IN VITRO NAVRŽENÍM PARALELNÍCH ZKUŠENOSTÍ S EXPOZICÍ V LIDSKÝCH STŘEVNÍCH EPITELOVÝCH BUŇKÁCH (DR. F. NAVARRO, UHU). BUNĚČNÉ KULTURY BUDOU POUŽÍVÁNY SOUBĚŽNĚ S POKUSY NA MYŠÍ IN VIVO S CÍLEM PŘEVÉST ÚČINKY NA ČLOVĚKA A VALIDOVAT NOVÉ PŘÍSTUPY ALTERNATIVY K POUŽÍVÁNÍ POKUSNÝCH ZVÍŘAT. CÍLEM TOHOTO PROJEKTU JE POKRAČOVAT VE STUDIÍCH PROVÁDĚNÝCH BĚHEM PĚTI PO SOBĚ JDOUCÍCH PŘEDCHOZÍCH PROJEKTŮ ŠPANĚLSKÉHO VÝZKUMNÉHO A VÝVOJOVÉHO PROGRAMU, NA NICHŽ SE OBĚ IPS PODÍLELY. PŘEDSTAVUJE VÝVOJ OD STUDIÍ PŘÍTOMNOSTI ZNEČIŠŤUJÍCÍCH LÁTEK V NÁRODNÍM PARKU DOÑANA, PO APLIKACI OMIKŮ K OBJASNĚNÍ BIOLOGICKÉ REAKCE U SAVCŮ VE VOLNÉM ŽIVOTĚ A BEZOBRATLÝCH A NA INTEGRACI OMIKŮ KE STUDIU REAKCE MODELOVÉHO ORGANISMU M. MUSCULUS NA EXPOZICI ZNEČIŠŤUJÍCÍCH LÁTEK ZA KONTROLOVANÝCH LABORATORNÍCH PODMÍNEK A NĚKTERÝCH ČASNÝCH ZKUŠENOSTÍ S BUŇKAMI. PROJEKT ZNAMENÁ DALŠÍ KROK V TOMTO PROCESU, PROTOŽE VÝZKUMNÍCI BUDOU STUDOVAT VLIV KOKTEJLŮ ZNEČIŠŤUJÍCÍCH LÁTEK, NAPODOBUJÍCÍCH REÁLNÝ SVĚT, NA MOLEKULÁRNÍ ÚROVNI (CHEMICKÉ DRUHY, METALO-BIOMOLEKULY, METABOLITY, PROTEINY A GENY) A NA BIOLOGICKÉ ÚROVNI (GUTOVÁ MIKROBIOTA), HLEDÁNÍ SPOJENÍ MEZI OBĚMA ÚROVNĚMI PROSTŘEDNICTVÍM OSY MIKROBIOTA-GUT-MOZEK, POMOCÍ OMICKÝCH PŘÍSTUPŮ OD STŘEVA K METABOLICKY NEJAKTIVNĚJŠÍM ORGÁNŮM (JÁDRŮM A LEDVINÁM) A TAKÉ K MOZKU A PLAZMU. POUŽIJEME SILNÉ ANALYTICKÉ PŘÍSTROJE, KTERÉ NEDÁVNO ZÍSKALA VÝZKUMNÁ SKUPINA UHU. (Czech)
18 August 2022
0 references
A EQUIPA RESPONSÁVEL PELO SUBPROJETO 1 (S1) TEM CARÁTER MARCAMENTE MULTIDISCIPLINAR, ENVOLVENDO INVESTIGADORES PERITOS DE 2 UNIVERSIDADES (UHU E UCO) E 3 GRUPOS DE INVESTIGAÇÃO. A EQUIPA INTEGRA UM PROFESSOR COMPLETO DE QUÍMICA ANALÍTICA (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, PERITO EM ESPECIAÇÃO QUÍMICA E METABOLÓMICA) E DOIS PROFESSORES ASSOCIADOS (DR. NIEVES ABRIL, PERITO EM GENETIA, BIOQUÍMISTRIA E BIOLOGIA MOLECULAR (UCO) E DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, PERITO EM BIOLOGIA CELULAR (UHU)). A S1 centra-se no estudo das respostas biológicas dos músculos do tubo de laboratório à exposição a "cocktails químicos", nos casos em que os poluentes emergentes (compostos farmacêuticos activos, embalagens) e reguláveis (metálicas e pesticidas) estejam combinados, com particular incidência na sua interacção e no papel positivo do sélénio como antagónico. A resposta biológica será duplamente avaliada. Por um lado, avaliar-se-á a nível molecular, através de estudos de especiação química e metalómica (IP-1, UHU), a distribuição das espécies químicas e metalo-biomoléculas nos tecidos e fluidos biológicos após a exposição. À luz do que precede, determinaremos e quantificaremos igualmente as alterações no equilíbrio das biomoléculas (transcripções e proteínas medidas, respectivamente, pela transcriptomímica e pela proteómica - IP-2, UCO) e a presença de danos oxidativos nas proteínas (proteómicas de DERÓX, IP-2, UCO), uma questão essencial quando se está em risco de produzir esse esforço oxidativo. Por outro lado, a resposta biológica será igualmente avaliada ao nível microbiano, utilizando métodos metagenómicos e outros métodos meta-ómicos (IP-1 e 2, UHU e UCO) para elucidar as alterações nas populações microorgâmicas e nas suas funções, causadas pela exposição aos choques de poluentes que minam o ambiente real e o antagonismo eficaz da estabilização selénio através da microbiota. Iremos igualmente avaliar a relação entre a microbiota e a biodisponibilidade dos contaminantes, tanto em VIVO como em VITRO, concebendo experiências de exposição paralelas em células epiteliais intestinais humanas (DR. F. Navarro, UHU). CULTURAS CELULARES SERÃO UTILIZADAS EM PARALELO ÀS EXPERIMENTAÇÕES IN VIVO MICE PARA TRADUZIR OS EFEITOS PARA OS HUMANOS E VALIDAR NOVOS ABORDAGENS ALTERNATIVAS À UTILIZAÇÃO DE ANIMAIS EXPERIMENTAIS. Este projecto destina-se a prosseguir os estudos realizados ao longo de 5 projectos anteriores do programa espanhol de investigação e desenvolvimento, em que ambos os IPS participaram. REPRESENTA A EVOLUÇÃO DOS ESTUDOS DE PRESENÇA DOS POLUENTES NO PARQUE NACIONAL DE DOÑANA, À APLICAÇÃO DOS ÓMICOS PARA ELUCIDAR A RESPOSTA BIOLÓGICA EM MAMÍLIAS E INVERTEBRATOS EM VIDA LIVRE E À INTEGRAÇÃO DOS ÓMICOS PARA ESTUDAR A RESPOSTA DO MODELO ORGANISMO M. MUSCULUS AOS POLUENTES EM RISCOS EM CONDIÇÕES LABORAIS CONTROLADAS E A ALGUMAS EXPERIÊNCIAS ANTERAIS COM CELLS. O projecto dá um novo impulso a este processo, uma vez que os investigadores estudarão a influência dos colectores de poluentes, minando o mundo real, ao nível molecular (espécies químicas, metabolitos, metabolitos, proteínas e genes) e ao nível biológico (GUT MICROBIOTA), procurando a ligação entre ambos os níveis através do eixo microbiota-bronze, através da utilização de dispositivos ópticos do interior para os orgãos mais metabólicos (LIVER e KIDNEY) e também para o interior e o plasmo. Iremos utilizar uma poderosa ferramenta analítica adquirida recentemente pelo grupo de investigação UHU. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
ALLPROJEKTI NR 1 (S1) EEST VASTUTAV MEESKOND ON MÄRKIMISVÄÄRSELT MULTIDISTSIPLINAARNE, HÕLMATES EKSPERTTEADLASI KAHEST ÜLIKOOLIST (UHU JA UCO) JA 3 UURIMISRÜHMAST. MEESKOND ÜHENDAB TÄIELIKU PROFESSOR ANALÜÜTILISE KEEMIA (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, EKSPERT KEEMILISTE OMADUSTE JA METABOLOMICS) JA KAKS DOTSENT (DR. NIEVES ABRIL, EKSPERT GENEETIKA, BIOKEEMIA JA MOLEKULAARBIOLOOGIA (UCO) JA DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, EKSPERT RAKUBIOLOOGIA (UHU)). S1 KESKENDUB LABORATOORSE HIIRE MUS MUSCULUS’E BIOLOOGILISTE REAKTSIOONIDE UURIMISELE „KEEMILISTE KOKTEILIDEGA“ KOKKUPUUTELE, KUS KOMBINEERITAKSE TEKKIVAID (FARMATSEUTILISELT AKTIIVSED ÜHENDID, PACS) JA REGULEERITUD (METALLID JA PESTITSIIDID) SAASTEAINEID, PÖÖRATES ERILIST TÄHELEPANU NENDE KOOSTOIMELE JA SELEENI KUI ANTAGONISTI OLETATAVALE ROLLILE. BIOLOOGILIST RAVIVASTUST HINNATAKSE KAHEKORDSELT. ÜHEST KÜLJEST HINNATAKSE SEDA MOLEKULAARTASANDIL KEEMILISTE OMADUSTE JA METALLOOMIKA (IP-1, UHU) UURINGUTE ABIL, ET TEADA SAADA KEEMILISE JA METALO-BIOMOLEKULI LIIGI JAOTUMIST KUDEDES JA BIOLOOGILISTES VEDELIKES PÄRAST KOKKUPUUDET. SEDA SILMAS PIDADES MÄÄRAME KINDLAKS JA KVANTIFITSEERIME KA BIOMOLEKULIDE ARVUKUSE MUUTUSED (TRANSKRIPTSIOONID JA VALGUD, MIDA MÕÕDETAKSE VASTAVALT TRANSKRIPTOOMIKA JA PROTEOOMIKAGA -IP-2, UCO) NING OKSÜDATIIVSE KAHJUSTUSE OLEMASOLU VALKUDES (REDOKSPROTEOOMIKA, IP-2, UCO), MIS ON OLULINE KÜSIMUS, KUI ESINEB KOKKUPUUDE OKSÜDATIIVSE STRESSI TEKITAVATE SAASTEAINETEGA. TEISEST KÜLJEST HINNATAKSE BIOLOOGILIST REAKTSIOONI KA MIKROBIOOMI TASANDIL, KASUTADES METAGENOOMIKAT JA MUID META-OOMIKA LÄHENEMISVIISE (IP-1 JA 2, UHU JA UCO), ET SELGITADA MIKROORGANISMIDE POPULATSIOONIDE JA NENDE FUNKTSIOONIDE MUUTUSI, MIDA PÕHJUSTAB KOKKUPUUDE NENDE SAASTEAINETE KOKTEILIDEGA, MIS JÄLJENDAVAD TEGELIKKU KESKKONDA, JA SELEENI OLETATAV ANTAGONISM MIKROBIOOTIKUMI STABILISEERIMISE KAUDU. SAMUTI HINDAME MIKROBIOOTA JA SAASTEAINETE BIOSAADAVUSE SUHET NII IN VIVO KUI KA IN VITRO, KAVANDADES PARALLEELSE KOKKUPUUTE KOGEMUSI INIMESE SOOLE EPITEELI RAKKUDES (DR. F. NAVARRO, UHU). RAKUKULTUURE KASUTATAKSE PARALLEELSELT IN VIVO HIIRTEGA TEHTAVATE KATSETEGA, ET MUUTA MÕJU INIMESTELE JA VALIDEERIDA UUSI LÄHENEMISVIISE ALTERNATIIVINA KATSELOOMADE KASUTAMISELE. PROJEKTI EESMÄRK ON JÄTKATA HISPAANIA TEADUS- JA ARENDUSPROGRAMMI VIIE JÄRJESTIKUSE PROJEKTI RAAMES LÄBIVIIDUD UURINGUID, MILLES MÕLEMAD IPS ON OSALENUD. SEE KUJUTAB ENDAST ARENGUT ALATES UURINGUTEST, MIS KÄSITLEVAD SAASTEAINETE ESINEMIST DOÑANA RAHVUSPARGIS, OOMIKA RAKENDAMIST, ET SELGITADA BIOLOOGILISI REAKTSIOONE VABAS ELUS IMETAJATEL JA SELGROOTUTEL, NING OOMIKA INTEGREERIMIST, ET UURIDA MUDELORGANISMI M. MUSCULUS MÕJU SAASTEAINETEGA KOKKUPUUTELE KONTROLLITUD LABORITINGIMUSTES JA MÕNINGAID VARAJASI KOGEMUSI RAKKUDEGA. PROJEKT TÄHISTAB EDASIST SAMMU SELLES PROTSESSIS, SEST TEADLASED UURIVAD SAASTEAINETE KOKTEILIDE MÕJU, JÄLJENDADES TEGELIKKU MAAILMA, MOLEKULAARSEL TASANDIL (KEEMILISED LIIGID, METALO-BIOMOLEKULID, METABOLIIDID, VALGUD JA GEENID) JA BIOLOOGILISEL TASANDIL (SOOLE MIKROBIOOTIKUMID), OTSIDES SEOST MÕLEMA TASEME VAHEL MIKROBIOOTIKUMIDE-GUT-AJU TELJE KAUDU, KASUTADES OOMILISI LÄHENEMISVIISE SOOLESTIKUST KÕIGE METABOOLSELT AKTIIVSETE ORGANITENI (MAKS JA NEERUD) NING AJU JA PLASMAGA. KASUTAME UHU UURIMISGRUPI POOLT HILJUTI OMANDATUD VÕIMSAID ANALÜÜTILISI INSTRUMENTE. (Estonian)
18 August 2022
0 references
AZ 1. ALPROJEKTÉRT FELELŐS CSOPORT (S1) KIFEJEZETTEN MULTIDISZCIPLINÁRIS JELLEGŰ, 2 EGYETEM (UHU ÉS UCO) ÉS 3 KUTATÓCSOPORT SZAKÉRTŐI KUTATÓI RÉSZVÉTELÉVEL. A CSAPAT INTEGRÁLJA AZ ANALITIKUS KÉMIA TELJES PROFESSZORÁT (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, KÉMIAI SPEKULÁCIÓ ÉS METABOLÓMIA SZAKÉRTŐJE) ÉS KÉT DOCENST (DR. NIEVES ABRIL, GENETIKA, BIOKÉMIA ÉS MOLEKULÁRIS BIOLÓGIA (UCO) ÉS DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, SEJTBIOLÓGIAI SZAKÉRTŐ (UHU)). AZ S1 A LABORATÓRIUMI EGÉR MUS MUSCULUS ÁLTAL A „KÉMIAI KOKTÉLOKNAK” VALÓ EXPOZÍCIÓRA ADOTT BIOLÓGIAI VÁLASZOK TANULMÁNYOZÁSÁRA ÖSSZPONTOSÍT, AHOL A KIALAKULÓBAN LÉVŐ (GYÓGYSZERÉSZETILAG AKTÍV VEGYÜLETEK, PACS) ÉS SZABÁLYOZOTT (FÉMEK ÉS NÖVÉNYVÉDŐ SZEREK) SZENNYEZŐ ANYAGOKAT KOMBINÁLJÁK, KÜLÖNÖS TEKINTETTEL AZOK KÖLCSÖNHATÁSÁRA ÉS A SZELÉN MINT ANTAGONISTA FELTÉTELEZETT SZEREPÉRE. A BIOLÓGIAI REAKCIÓT KÉTSZERESEN ÉRTÉKELIK. EGYRÉSZT MOLEKULÁRIS SZINTEN FOGJÁK ÉRTÉKELNI A KÉMIAI SPEKULÁCIÓ ÉS A METALLOMIKA (IP-1, UHU) VIZSGÁLATAI RÉVÉN, HOGY MEGISMERJÉK A VEGYI ANYAGOK ÉS A METALO-BIOMOLECULES FAJOK ELOSZLÁSÁT A SZÖVETEKBEN ÉS A BIOLÓGIAI FOLYADÉKOKBAN AZ EXPOZÍCIÓT KÖVETŐEN. ENNEK FÉNYÉBEN MEGHATÁROZZUK ÉS SZÁMSZERŰSÍTJÜK A BIOMOLEKULÁK (TRANSCRIPTEK ÉS FEHÉRJÉK -IP-2, UCO) ABUNDANCIÁJÁBAN BEKÖVETKEZŐ VÁLTOZÁSOKAT, VALAMINT AZ OXIDATÍV KÁROSODÁS JELENLÉTÉT A FEHÉRJÉKBEN (REDOX PROTEOMIKA, IP-2, UCO), AMI ALAPVETŐ KÉRDÉS, HA OXIDATÍV STRESSZT OKOZÓ SZENNYEZŐ ANYAGOKNAK VANNAK KITÉVE. MÁSRÉSZT A BIOLÓGIAI VÁLASZT MIKROBIOMSZINTEN IS ÉRTÉKELIK A METAGENOMIKA ÉS MÁS METAOMIKUS MEGKÖZELÍTÉSEK (IP-1 ÉS 2, UHU ÉS UCO) ALKALMAZÁSÁVAL, HOGY TISZTÁZZÁK A MIKROORGANIZMUS-POPULÁCIÓKBAN ÉS AZOK FUNKCIÓIBAN BEKÖVETKEZŐ VÁLTOZÁSOKAT, AMELYEKET A VALÓS KÖRNYEZETET UTÁNZÓ SZENNYEZŐ ANYAGOKNAK VALÓ KITETTSÉG ÉS A SZELÉN FELTÉTELEZETT ANTAGONIZMUSA A MIKROBIÓTA STABILIZÁLÁS RÉVÉN OKOZ. A MIKROBIÓTA ÉS A SZENNYEZŐ ANYAGOK BIOHASZNOSULÁSA KÖZÖTTI ÖSSZEFÜGGÉST IN VIVO ÉS IN VITRO EGYARÁNT ÉRTÉKELJÜK AZ EMBERI BÉL HÁMSEJTEKBEN (DR. F. NAVARRO, UHU) VALÓ PÁRHUZAMOS EXPOZÍCIÓS TAPASZTALATOK MEGTERVEZÉSÉVEL. A SEJTTENYÉSZETEKET AZ IN VIVO EGÉRKÍSÉRLETEKKEL PÁRHUZAMOSAN FOGJÁK HASZNÁLNI ANNAK ÉRDEKÉBEN, HOGY A HATÁSOKAT AZ EMBERRE FORDÍTSÁK, ÉS A KÍSÉRLETI ÁLLATOK FELHASZNÁLÁSÁNAK ALTERNATÍVÁIT ÉRVÉNYESÍTSÉK. A PROJEKT CÉLJA A SPANYOL KUTATÁSI ÉS FEJLESZTÉSI PROGRAM ÖT EGYMÁST KÖVETŐ PROJEKTJE SORÁN ELVÉGZETT TANULMÁNYOK FOLYTATÁSA, AMELYEKBEN MINDKÉT IPS RÉSZT VETT. A DOÑANA NEMZETI PARKBAN A SZENNYEZŐ ANYAGOK JELENLÉTÉRE VONATKOZÓ VIZSGÁLATOK, A SZABAD ÉLETŰ EMLŐSÖK ÉS GERINCTELENEK BIOLÓGIAI VÁLASZÁNAK TISZTÁZÁSÁRA SZOLGÁLÓ OMIKUMOK ALKALMAZÁSA, VALAMINT AZ OMICS INTEGRÁCIÓJA AZ M. MUSCULUS MODELL ORGANIZMUSNAK AZ ELLENŐRZÖTT LABORATÓRIUMI KÖRÜLMÉNYEK KÖZÖTT TÖRTÉNŐ SZENNYEZŐANYAG-EXPOZÍCIÓRA ADOTT VÁLASZÁNAK TANULMÁNYOZÁSA ÉS A SEJTEKKEL KAPCSOLATOS KORAI TAPASZTALATOK TANULMÁNYOZÁSA SORÁN TÖRTÉNT FEJLŐDÉS. A PROJEKT EGY TOVÁBBI LÉPÉST JELENT EBBEN A FOLYAMATBAN, MIVEL A KUTATÓK TANULMÁNYOZZÁK A SZENNYEZŐ ANYAGOK KOKTÉLJAINAK HATÁSÁT, UTÁNOZVA A VALÓS VILÁGOT, MOLEKULÁRIS SZINTEN (VEGYI FAJOK, METALO-BIOMOLECULES, METABOLITOK, FEHÉRJÉK ÉS GÉNEK) ÉS BIOLÓGIAI SZINTEN (BÉL MIKROBIÓTA), KERESVE A KÉT SZINT KÖZÖTTI KAPCSOLATOT A MIKROBIOTA-GUT-AGY TENGELYEN KERESZTÜL A BÉLTŐL A LEGINKÁBB METABOLIKUSAN AKTÍV SZERVEKIG (MÁJ ÉS VESE), VALAMINT AZ AGYHOZ ÉS A PLAZMÁHOZ. AZ UHU KUTATÓCSOPORT ÁLTAL NEMRÉGIBEN BESZERZETT, HATÉKONY ANALITIKAI MŰSZEREKET FOGJUK HASZNÁLNI. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
ЕКИПЪТ, ОТГОВАРЯЩ ЗА ПОДПРОЕКТ 1 (S1), ИМА ПОДЧЕРТАНО МУЛТИДИСЦИПЛИНАРЕН ХАРАКТЕР, КАТО ВКЛЮЧВА ЕКСПЕРТИ ИЗСЛЕДОВАТЕЛИ ОТ 2 УНИВЕРСИТЕТА (УУ И UCO) И 3 ИЗСЛЕДОВАТЕЛСКИ ГРУПИ. ЕКИПЪТ ИНТЕГРИРА ПЪЛНОПРАВЕН ПРОФЕСОР ПО АНАЛИТИЧНА ХИМИЯ (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, ЕКСПЕРТ ПО ХИМИЧНА СПЕКУЛАЦИЯ И МЕТАБОЛОМИКА) И ДВАМА ДОЦЕНТИ (DR. NIEVES ABRIL, ЕКСПЕРТ ПО ГЕНЕТИКА, БИОХИМИЯ И МОЛЕКУЛЯРНА БИОЛОГИЯ (UCO) И Д-Р ФРАНЦИСКО НАВАРО РОЛДАН, ЕКСПЕРТ ПО КЛЕТЪЧНА БИОЛОГИЯ (UHU). S1 СЕ ФОКУСИРА ВЪРХУ ИЗУЧАВАНЕТО НА БИОЛОГИЧНИТЕ РЕАКЦИИ НА ЛАБОРАТОРНАТА МИШКА MUS МУСКУЛАТУРА КЪМ ЕКСПОЗИЦИЯТА НА „ХИМИЧЕСКИ КОКТЕЙЛИ“, КЪДЕТО СЕ КОМБИНИРАТ ВЪЗНИКВАЩИТЕ (ФАРМАЦЕВТИЧНО АКТИВНИ СЪЕДИНЕНИЯ, PACS) И РЕГУЛИРАНИТЕ (МЕТАЛИ И ПЕСТИЦИДИ) ЗАМЪРСИТЕЛИ, КАТО СЕ ОБРЪЩА СПЕЦИАЛНО ВНИМАНИЕ НА ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО ИМ И ПРЕДПОЛАГАЕМАТА РОЛЯ НА СЕЛЕН КАТО АНТАГОНИСТ. БИОЛОГИЧНИЯТ ОТГОВОР ЩЕ БЪДЕ ОЦЕНЕН ДВА ПЪТИ. ОТ ЕДНА СТРАНА, ТО ЩЕ БЪДЕ ОЦЕНЕНО НА МОЛЕКУЛЯРНО НИВО ЧРЕЗ ИЗСЛЕДВАНИЯ НА ХИМИЧЕСКАТА СПЕКУЛАЦИЯ И МЕТАЛОМИКАТА (IP-1, UHU), ЗА ДА СЕ ЗНАЕ РАЗПРЕДЕЛЕНИЕТО НА ХИМИЧНИТЕ И БИОМОЛЕКУЛИТЕ В ТЪКАНИТЕ И БИОЛОГИЧНИТЕ ТЕЧНОСТИ СЛЕД ЕКСПОЗИЦИЯТА. В ТАЗИ СВЕТЛИНА ЩЕ ОПРЕДЕЛИМ И ОПРЕДЕЛИМ КОЛИЧЕСТВЕНО ПРОМЕНИТЕ В ИЗОБИЛИЕТО НА БИОМОЛЕКУЛИТЕ (ТРАНСКРИПТОВЕ И ПРОТЕИНИ, ИЗМЕРЕНИ СЪОТВЕТНО ЧРЕЗ ТРАНСКРИПТОМИКА И ПРОТЕОМИКА -IP-2, UCO) И НАЛИЧИЕТО НА ОКСИДАТИВНО УВРЕЖДАНЕ В ПРОТЕИНИТЕ (РЕДОКСИ ПРОТЕОМИКА, IP-2, UCO), ОСНОВЕН ПРОБЛЕМ, КОГАТО ИМА ИЗЛАГАНЕ НА ЗАМЪРСИТЕЛИ, КОИТО ПРЕДИЗВИКВАТ ОКСИДАТИВЕН СТРЕС. ОТ ДРУГА СТРАНА, БИОЛОГИЧНИЯТ ОТГОВОР ЩЕ БЪДЕ ОЦЕНЕН И НА МИКРОБИОМНО НИВО, КАТО СЕ ИЗПОЛЗВАТ МЕТАГЕНОМИКИ И ДРУГИ МЕТАОМИЧНИ ПОДХОДИ (IP-1 И 2, UHU И UCO), ЗА ДА СЕ ИЗЯСНЯТ ПРОМЕНИТЕ В ПОПУЛАЦИИТЕ ОТ МИКРООРГАНИЗМИ И ТЕХНИТЕ ФУНКЦИИ, ПРИЧИНЕНИ ОТ ИЗЛАГАНЕТО НА ТЕЗИ КОКТЕЙЛИ ОТ ЗАМЪРСИТЕЛИ, КОИТО ИМИТИРАТ РЕАЛНАТА СРЕДА И ПРЕДПОЛАГАЕМИЯ АНТАГОНИЗЪМ НА СЕЛЕН ЧРЕЗ СТАБИЛИЗИРАНЕ НА МИКРОБИОТАТА. СЪЩО ТАКА ЩЕ ОЦЕНИМ ВРЪЗКАТА МЕЖДУ МИКРОБИОТАТА И БИОНАЛИЧНОСТТА НА ЗАМЪРСИТЕЛИТЕ, КАКТО IN VIVO, ТАКА И IN VITRO, КАТО ПРОЕКТИРАМЕ ПАРАЛЕЛНИ СЛУЧАИ НА ЕКСПОЗИЦИЯ В ЧОВЕШКИ ЧРЕВНИ ЕПИТЕЛОВИ КЛЕТКИ (DR. F. NAVARRO, UHU). КЛЕТЪЧНИТЕ КУЛТУРИ ЩЕ СЕ ИЗПОЛЗВАТ УСПОРЕДНО С ЕКСПЕРИМЕНТИТЕ С МИШКИ IN VIVO, ЗА ДА СЕ ПРЕВЕДАТ ЕФЕКТИТЕ ВЪРХУ ХОРАТА И ДА СЕ ВАЛИДИРАТ НОВИ ПОДХОДИ, АЛТЕРНАТИВНИ НА ИЗПОЛЗВАНЕТО НА ЕКСПЕРИМЕНТАЛНИ ЖИВОТНИ. ТОЗИ ПРОЕКТ ИМА ЗА ЦЕЛ ДА ПРОДЪЛЖИ ПРОУЧВАНИЯТА, ПРОВЕДЕНИ ПО ВРЕМЕ НА 5 ПОСЛЕДОВАТЕЛНИ ПРЕДИШНИ ПРОЕКТА ПО ИСПАНСКАТА НАУЧНОИЗСЛЕДОВАТЕЛСКА И РАЗВОЙНА ПРОГРАМА, В КОИТО СА УЧАСТВАЛИ И ДВЕТЕ IPS. ТОЙ ПРЕДСТАВЛЯВА ЕВОЛЮЦИЯТА ОТ ПРОУЧВАНИЯТА ЗА НАЛИЧИЕТО НА ЗАМЪРСИТЕЛИ В НАЦИОНАЛНИЯ ПАРК „ДОНЯНА“, ДО ПРИЛАГАНЕТО НА ОМИКАЛИ ЗА ИЗЯСНЯВАНЕ НА БИОЛОГИЧНИЯ ОТГОВОР ПРИ СВОБОДНО ЖИВЕЕЩИТЕ БОЗАЙНИЦИ И БЕЗГРЪБНАЧНИ И ДО ИНТЕГРИРАНЕТО НА ОМИКАЛИ ЗА ИЗСЛЕДВАНЕ НА РЕАКЦИЯТА НА МОДЕЛНИЯ ОРГАНИЗЪМ M. MUSCULUS КЪМ ИЗЛАГАНЕТО НА ЗАМЪРСИТЕЛИ ПРИ КОНТРОЛИРАНИ ЛАБОРАТОРНИ УСЛОВИЯ И НЯКОИ РАННИ ПРЕЖИВЯВАНИЯ С КЛЕТКИТЕ. ПРОЕКТЪТ ОЗНАЧАВА ОЩЕ ЕДНА СТЪПКА В ТОЗИ ПРОЦЕС, ТЪЙ КАТО ИЗСЛЕДОВАТЕЛИТЕ ЩЕ ИЗСЛЕДВАТ ВЛИЯНИЕТО НА КОКТЕЙЛИ ОТ ЗАМЪРСИТЕЛИ, ИМИТИРАЩИ РЕАЛНИЯ СВЯТ, НА МОЛЕКУЛЯРНО НИВО (ХИМИЧЕСКИ ВИДОВЕ, МЕТАЛО-БИОМОЛЕКУЛИ, МЕТАБОЛИТИ, ПРОТЕИНИ И ГЕНИ) И НА БИОЛОГИЧНО НИВО (ЦИКЛЕНА МИКРОБИОТА), КАТО ТЪРСЯТ ВРЪЗКА МЕЖДУ ДВЕТЕ НИВА ЧРЕЗ ОСТА НА МИКРОБИОТА-ГУТ-МОЗЪКА, ЧРЕЗ ИЗПОЛЗВАНЕТО НА ОМИЧНИ ПОДХОДИ ОТ ЧЕРВАТА КЪМ НАЙ-МЕТАБОЛИЧНО АКТИВНИТЕ ОРГАНИ (ЧЕРЕН ДРОБ И БЪБРЕЦИ), КАКТО И КЪМ МОЗЪКА И ПЛАЗМАТА. ЩЕ ИЗПОЛЗВАМЕ МОЩНА АНАЛИТИЧНА АПАРАТУРА, НАСКОРО ПРИДОБИТА ОТ ИЗСЛЕДОВАТЕЛСКАТА ГРУПА UHU. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
UŽ 1 PAPROJEKTĮ (S1) ATSAKINGA GRUPĖ YRA LABAI DAUGIADALYKIO POBŪDŽIO, JOJE DALYVAUJA 2 UNIVERSITETŲ (UHU IR UCO) IR 3 MOKSLINIŲ TYRIMŲ GRUPIŲ TYRĖJAI EKSPERTAI. KOMANDA INTEGRUOJA VISĄ PROFESIONALĄ ANALITINĖS CHEMIJOS (IP-1, UHU, DR TAMARA GARCIA BARRERA, EKSPERTAS CHEMINĖS SPEKTRACIJOS IR METABOLOMIKOS) IR DU DOCENTAI (DR. NIEVES ABRIL, EKSPERTAS GENETIKOS, BIOCHEMIJOS IR MOLEKULINĖS BIOLOGIJOS (UCO) IR DR FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, EKSPERTAS LĄSTELIŲ BIOLOGIJOS (UHU)). S1 PAGRINDINIS DĖMESYS SKIRIAMAS LABORATORINIŲ PELIŲ MUS MUSCULUS BIOLOGINIO ATSAKO Į „CHEMINIŲ KOKTEILIŲ“ POVEIKĮ TYRIMUI, KURIAME DERINAMI ATSIRANDANTYS (FARMAKOLOGIŠKAI AKTYVŪS JUNGINIAI, PACS) IR REGULIUOJAMI (METALAI IR PESTICIDAI) TERŠALAI, YPATINGĄ DĖMESĮ SKIRIANT JŲ SĄVEIKAI IR TARIAMAM SELENO, KAIP ANTAGONISTO, VAIDMENIUI. BIOLOGINIS ATSAKAS BUS ĮVERTINTAS DVIGUBAI. VIENA VERTUS, JIS BUS VERTINAMAS MOLEKULINIU LYGMENIU, ATLIEKANT CHEMINIŲ SAVYBIŲ IR METALOMIKOS (IP-1, UHU) TYRIMUS, SIEKIANT ŽINOTI CHEMINIŲ IR METALŲ BIOMOLEKULIŲ RŪŠIŲ PASISKIRSTYMĄ AUDINIUOSE IR BIOLOGINIUOSE SKYSČIUOSE PO POVEIKIO. ATSIŽVELGIANT Į TAI, MES TAIP PAT NUSTATYSIME IR KIEKYBIŠKAI ĮVERTINSIME BIOMOLEKULIŲ GAUSOS POKYČIUS (TRANSCRIPTUS IR BALTYMUS, IŠMATUOTUS ATITINKAMAI TRANSKRIPTOMIKOJE IR PROTEOMIKOJE -IP-2, UCO) IR OKSIDACINIO PAŽEIDIMO BUVIMĄ BALTYMUOSE (REDOKSO PROTEOMIKA, IP-2, UCO), KURIS YRA ESMINIS KLAUSIMAS, KAI YRA OKSIDACINIO STRESO SUKELIANČIŲ TERŠALŲ POVEIKIS. KITA VERTUS, BIOLOGINIS ATSAKAS TAIP PAT BUS VERTINAMAS MIKROBIOMŲ LYGMENIU, NAUDOJANT METAGENOMIKĄ IR KITUS METAOMINIUS METODUS (IP-1 IR 2, UHU IR UCO), SIEKIANT IŠSIAIŠKINTI MIKROORGANIZMŲ POPULIACIJŲ IR JŲ FUNKCIJŲ POKYČIUS, KURIUOS SUKELIA TŲ TERŠALŲ KOKTEILIŲ, KURIE IMITUOJA TIKRĄJĄ APLINKĄ IR SPĖJAMAS SELENO ANTAGONIZMAS PER MIKROBIOTOS STABILIZAVIMĄ, POVEIKIS. TAIP PAT ĮVERTINSIME MIKROBIOTOS IR TERŠALŲ BIOLOGINIO PRIEINAMUMO SANTYKĮ IN VIVO IR IN VITRO, SUKURDAMI LYGIAGRETAUS POVEIKIO ŽMOGAUS ŽARNYNO EPITELIO LĄSTELĖSE (DR. F. NAVARRO, UHU) PATIRTĮ. LĄSTELIŲ KULTŪROS BUS NAUDOJAMOS LYGIAGREČIAI EKSPERIMENTAMS SU PELĖMIS IN VIVO, SIEKIANT ĮVERTINTI POVEIKĮ ŽMONĖMS IR PATVIRTINTI NAUJUS METODUS, KURIE BŪTŲ ALTERNATYVŪS EKSPERIMENTINIŲ GYVŪNŲ NAUDOJIMUI. ŠIUO PROJEKTU SIEKIAMA TĘSTI TYRIMUS, ATLIKTUS PER 5 IŠ EILĖS ANKSTESNIUS ISPANIJOS MOKSLINIŲ TYRIMŲ IR PLĖTROS PROGRAMOS PROJEKTUS, KURIUOSE DALYVAVO ABI IPS. JIS ATSPINDI TERŠALŲ BUVIMO DONJANOS NACIONALINIAME PARKE TYRIMŲ RAIDĄ, OMIKOS NAUDOJIMĄ, SIEKIANT IŠSIAIŠKINTI BIOLOGINĮ ATSAKĄ LAISVAI GYVIEMS ŽINDUOLIAMS IR BESTUBURIAMS, IR OMIKŲ INTEGRAVIMĄ, SIEKIANT IŠTIRTI PAVYZDINIO ORGANIZMO M. MUSCULUS ATSAKĄ Į TERŠALŲ POVEIKĮ KONTROLIUOJAMOMIS LABORATORINĖMIS SĄLYGOMIS IR TAM TIKRĄ ANKSTYVĄ PATIRTĮ SU LĄSTELĖMIS. PROJEKTAS REIŠKIA TOLESNĮ ŽINGSNĮ ŠIAME PROCESE, NES TYRĖJAI TIRS TERŠALŲ KOKTEILIŲ ĮTAKĄ, IMITUOJANT REALŲ PASAULĮ, MOLEKULINIU LYGIU (CHEMINĖS RŪŠYS, METALO BIOMOLEKULĖS, METABOLITAI, BALTYMAI IR GENAI) IR BIOLOGINIU LYGIU (ŽARNYNO MIKROBIOTA), SIEKIANT RYŠIO TARP ABIEJŲ LYGIŲ PER MIKROBIOTA-GUT-SMEGENŲ AŠĮ, NAUDOJANT OMINIUS METODUS NUO ŽARNYNO IKI MEDŽIAGŲ APYKAITOS POŽIŪRIU AKTYVIŲ ORGANŲ (KEPENŲ IR INKSTŲ), TAIP PAT Į SMEGENIS IR PLAZMĄ. MES NAUDOSIME GALINGAS ANALITINES PRIEMONES, KURIAS NESENIAI ĮSIGIJO UHU TYRIMŲ GRUPĖ. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
TIM ODGOVORAN ZA POTPROJEKT 1. (S1) IZRAZITO JE MULTIDISCIPLINARAN I UKLJUČUJE STRUČNJAKE S DVA SVEUČILIŠTA (UHU I UCO) I TRI ISTRAŽIVAČKE SKUPINE. TIM INTEGRIRA FULL-PROFESSOR ANALITIČKE KEMIJE (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, STRUČNJAK ZA KEMIJSKU SPECIJACIJU I METABOLOMIKU) I DVA IZVANREDNA PROFESORA (DR. NIEVES ABRIL, STRUČNJAK ZA GENETIKU, BIOKEMIJU I MOLEKULARNU BIOLOGIJU (UCO) I DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, STRUČNJAK ZA STANIČNU BIOLOGIJU (UHU)). S1 SE USREDOTOČUJE NA PROUČAVANJE BIOLOŠKIH REAKCIJA LABORATORIJSKOG MIŠA MUS MUSCULUS NA IZLOŽENOST „KEMIJSKIM KOKTELIMA”, GDJE SE KOMBINIRAJU NOVE (FARMACEUTSKI AKTIVNI SPOJEVI, PACS) I REGULIRANE (METALI I PESTICIDI) ONEČIŠĆUJUĆE TVARI, S POSEBNIM NAGLASKOM NA NJIHOVU INTERAKCIJU I PRETPOSTAVLJENU ULOGU SELENA KAO ANTAGONISTA. BIOLOŠKI ODGOVOR ĆE SE DVOSTRUKO PROCIJENITI. S JEDNE STRANE, OCIJENIT ĆE SE NA MOLEKULARNOJ RAZINI, KROZ STUDIJE KEMIJSKE SPECIJACIJE I METALOMIKE (IP-1, UHU), KAKO BI SE UPOZNALO S KEMIJSKOM I METALO-BIOMOLEKULSKOM DISTRIBUCIJOM VRSTA U TKIVIMA I BIOLOŠKIM TEKUĆINAMA NAKON IZLAGANJA. U TOM SVJETLU, TAKOĐER ĆEMO ODREDITI I KVANTIFICIRATI PROMJENE U OBILJU BIOMOLEKULA (TRANSKRIPTI I PROTEINI MJERENI TRANSKRIPTOMIMA I PROTEOMIKOMIMA -IP-2, UCO) I PRISUTNOST OKSIDATIVNOG OŠTEĆENJA U PROTEINIMA (REDOKS PROTEOMICS, IP-2, UCO), ŠTO JE BITAN PROBLEM KADA POSTOJI IZLOŽENOST ONEČIŠĆUJUĆIM TVARIMA KOJE PROIZVODE OKSIDATIVNI STRES. S DRUGE STRANE, BIOLOŠKI ODGOVOR TAKOĐER ĆE SE OCIJENITI NA RAZINI MIKROBIOMA, KORISTEĆI METAGENOMIJU I DRUGE METAOMIČKE PRISTUPE (IP-1 I 2, UHU I UCO) KAKO BI SE RAZJASNILE PROMJENE U POPULACIJAMA MIKROORGANIZAMA I NJIHOVIM FUNKCIJAMA, UZROKOVANE IZLAGANJEM ONIM KOKTELIMA ONEČIŠĆUJUĆIH TVARI KOJE OPONAŠAJU STVARNI OKOLIŠ I PRETPOSTAVLJENI ANTAGONIZAM SELENA KROZ STABILIZACIJU MIKROBIOTE. TAKOĐER ĆEMO PROCIJENITI ODNOS IZMEĐU MIKROBIOTE I BIORASPOLOŽIVOSTI KONTAMINANATA, I IN VIVO I IN VITRO, OSMIŠLJAVANJEM PARALELNIH ISKUSTAVA IZLAGANJA U STANICAMA EPITELA LJUDSKOG CRIJEVA (DR. F. NAVARRO, UHU). STANIČNE KULTURE KORISTIT ĆE SE PARALELNO S POKUSIMA NA MIŠEVIMA IN VIVO KAKO BI SE PREVELI UČINCI NA LJUDE I POTVRDILI NOVI PRISTUPI KOJI SU ALTERNATIVA KORIŠTENJU POKUSNIH ŽIVOTINJA. CILJ JE OVOG PROJEKTA NASTAVITI STUDIJE PROVEDENE TIJEKOM 5 UZASTOPNIH PRETHODNIH PROJEKATA ŠPANJOLSKOG ISTRAŽIVAČKOG I RAZVOJNOG PROGRAMA, U KOJIMA SU SUDJELOVALA OBA IPS-A. PREDSTAVLJA EVOLUCIJU IZ STUDIJA PRISUTNOSTI ONEČIŠĆUJUĆIH TVARI U NACIONALNOM PARKU DOÑANA, DO PRIMJENE OMIKA ZA RAZJAŠNJAVANJE BIOLOŠKOG ODGOVORA KOD SISAVACA I BESKRALJEŽNJAKA SLOBODNOG ŽIVOTA TE NA INTEGRACIJU OMIKA ZA PROUČAVANJE ODGOVORA MODELA ORGANIZMA M. MUSCULUS NA IZLOŽENOST ONEČIŠĆUJUĆIM TVARIMA U KONTROLIRANIM LABORATORIJSKIM UVJETIMA I NEKIM RANIM ISKUSTVIMA SA STANICAMA. PROJEKT OZNAČAVA DALJNJI KORAK U OVOM PROCESU, JER ĆE ISTRAŽIVAČI PROUČAVATI UTJECAJ KOKTELA ZAGAĐIVAČA, OPONAŠAJUĆI STVARNI SVIJET, NA MOLEKULARNOJ RAZINI (KEMIJSKE VRSTE, METALO-BIOMOLEKULE, METABOLITE, PROTEINE I GENE) I NA BIOLOŠKOJ RAZINI (GUT MICROBIOTA), TRAŽEĆI VEZU IZMEĐU OBJE RAZINE KROZ OS MIKROBIOTA-GUT-MOŽDA, KROZ KORIŠTENJE OMIČKIH PRISTUPA OD CRIJEVA DO NAJMETABOLIČKI NAJAKTIVNIJIH ORGANA (JETRA I BUBREGA), KAO I DO MOZGA I PLAZMA. UPOTRIJEBIT ĆEMO MOĆNE ANALITIČKE INSTRUMENTE KOJE JE NEDAVNO STEKLA ISTRAŽIVAČKA GRUPA UHU. (Croatian)
18 August 2022
0 references
DEN GRUPP SOM ANSVARAR FÖR DELPROJEKT 1 (S1) HAR EN TYDLIGT TVÄRVETENSKAPLIG KARAKTÄR MED EXPERTER FRÅN TVÅ UNIVERSITET (UHU OCH UCO) OCH TRE FORSKARGRUPPER. TEAMET INTEGRERAR EN FULLPROFESSOR AV ANALYTISK KEMI (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, EXPERT PÅ KEMISK SPECIATION OCH METABOLOMIK) OCH TVÅ BITRÄDANDE PROFESSORER (DR. NIEVES ABRIL, EXPERT PÅ GENETIK, BIOKEMI OCH MOLEKYLÄRBIOLOGI (UCO) OCH DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, EXPERT PÅ CELLBIOLOGI (UHU)). S1 FOKUSERAR PÅ STUDIEN AV DE BIOLOGISKA REAKTIONERNA FRÅN MUSMUSMUSMUSMUSMUSMUSMUSKULUS MOT EXPONERING FÖR ”KEMISKA COCKTAILS”, DÄR NYA (FARMACEUTISKT AKTIVA FÖRENINGAR, PACS) OCH REGLERADE FÖRORENINGAR (METALLER OCH BEKÄMPNINGSMEDEL) KOMBINERAS, MED SÄRSKILD TONVIKT PÅ DERAS INTERAKTION OCH SELENS FÖRMODADE ROLL SOM ANTAGONIST. DEN BIOLOGISKA RESPONSEN KOMMER ATT BEDÖMAS DUBBELT. Å ENA SIDAN KOMMER DET ATT BEDÖMAS PÅ MOLEKYLÄR NIVÅ, GENOM STUDIER AV KEMISK SPEKULERING OCH METALLOMIK (IP-1, UHU), ATT KÄNNA TILL DEN KEMISKA OCH METALO-BIOMOLEKYLERS ARTFÖRDELNING I VÄVNADER OCH BIOLOGISKA VÄTSKOR EFTER EXPONERINGEN. I DETTA LJUS KOMMER VI OCKSÅ ATT FASTSTÄLLA OCH KVANTIFIERA FÖRÄNDRINGARNA I FÖREKOMSTEN AV BIOMOLEKYLER (TRANSCRIPT OCH PROTEINER MÄTTA MED TRANSKRIPTOMIK RESPEKTIVE PROTEOMIK -IP-2, UCO) OCH FÖREKOMSTEN AV OXIDATIV SKADA I PROTEINER (REDOX PROTEOMICS, IP-2, UCO), EN VIKTIG FRÅGA NÄR DET FINNS EXPONERING FÖR FÖRORENINGAR SOM PRODUCERAR OXIDATIV STRESS. Å ANDRA SIDAN KOMMER DEN BIOLOGISKA RESPONSEN OCKSÅ ATT UTVÄRDERAS PÅ MIKROBIOMNIVÅ, MED HJÄLP AV METAGENOMIK OCH ANDRA METAOMISKA METODER (IP-1 OCH 2, UHU OCH UCO) FÖR ATT BELYSA DE FÖRÄNDRINGAR I MIKROORGANISMPOPULATIONERNA OCH DERAS FUNKTIONER SOM ORSAKAS AV EXPONERING FÖR DESSA COCKTAILS AV FÖRORENINGAR SOM EFTERLIKNAR DEN VERKLIGA MILJÖN OCH DEN FÖRMODADE ANTAGONISMEN HOS SELEN GENOM STABILISERING AV MIKROBIOTA. VI KOMMER OCKSÅ ATT BEDÖMA SAMBANDET MELLAN MIKROBIOTA OCH BIOTILLGÄNGLIGHETEN AV FRÄMMANDE ÄMNEN, BÅDE IN VIVO OCH IN VITRO, GENOM ATT UTFORMA PARALLELLA EXPONERINGSUPPLEVELSER I HUMANA TARM EPITELCELLER (DR. F. NAVARRO, UHU). CELLKULTURER KOMMER ATT ANVÄNDAS PARALLELLT MED FÖRSÖK MED MÖSS IN VIVO FÖR ATT ÖVERSÄTTA EFFEKTERNA TILL MÄNNISKOR OCH FÖR ATT VALIDERA NYA METODER SOM ALTERNATIV TILL ANVÄNDNING AV FÖRSÖKSDJUR. DETTA PROJEKT SYFTAR TILL ATT FORTSÄTTA DE STUDIER SOM GENOMFÖRTS UNDER FEM PÅ VARANDRA FÖLJANDE TIDIGARE PROJEKT INOM DET SPANSKA FORSKNINGS- OCH UTVECKLINGSPROGRAMMET, I VILKA BÅDA IPS HAR DELTAGIT. DEN REPRESENTERAR UTVECKLINGEN FRÅN STUDIER AV FÖREKOMSTEN AV FÖRORENINGAR I NATIONALPARKEN DOÑANA, TILL ANVÄNDNING AV OMIK FÖR ATT BELYSA DEN BIOLOGISKA RESPONSEN HOS FRILEVANDE DÄGGDJUR OCH RYGGRADSLÖSA DJUR OCH TILL INTEGRERINGEN AV OMIK FÖR ATT STUDERA HUR MODELLORGANISMEN M. MUSCULUS REAGERAR PÅ FÖRORENINGSEXPONERING UNDER KONTROLLERADE LABORATORIEFÖRHÅLLANDEN OCH VISSA TIDIGA ERFARENHETER AV CELLER. PROJEKTET INNEBÄR YTTERLIGARE ETT STEG I DENNA PROCESS, EFTERSOM FORSKARNA KOMMER ATT STUDERA PÅVERKAN AV COCKTAILS AV FÖRORENINGAR, IMITERA DEN VERKLIGA VÄRLDEN, PÅ MOLEKYLÄR NIVÅ (KEMISKA ARTER, METALO-BIOMOLEKYLER, METABOLITER, PROTEINER OCH GENER) OCH PÅ BIOLOGISK NIVÅ (GUT MICROBIOTA), SÖKA SAMBANDET MELLAN BÅDA NIVÅERNA GENOM MIKROBIOTA-GUT-HJÄRNAXELN, GENOM ANVÄNDNING AV OMISKA METODER FRÅN TARMEN TILL DE MEST METABOLISKT AKTIVA ORGANEN (LEVER OCH NJURAR) SAMT HJÄRNA OCH PLASMA. VI KOMMER ATT ANVÄNDA KRAFTFULLA ANALYTISKA INSTRUMENT SOM NYLIGEN FÖRVÄRVATS AV UHU:S FORSKARGRUPP. (Swedish)
18 August 2022
0 references
ECHIPA RESPONSABILĂ DE SUBPROIECTUL 1 (S1) ARE UN CARACTER MULTIDISCIPLINAR SEMNIFICATIV, IMPLICÂND CERCETĂTORI EXPERȚI DIN 2 UNIVERSITĂȚI (UHU ȘI UCO) ȘI 3 GRUPURI DE CERCETARE. ECHIPA INTEGREAZĂ UN PROFESOR COMPLET DE CHIMIE ANALITICĂ (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, EXPERT ÎN SPECIAȚIE CHIMICĂ ȘI METABOLOMICĂ) ȘI DOI PROFESORI ASOCIAȚI (DR. NIEVES ABRIL, EXPERT ÎN GENETICĂ, BIOCHIMIE ȘI BIOLOGIE MOLECULARĂ (UCO) ȘI DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, EXPERT ÎN BIOLOGIE CELULARĂ (UHU)). S1 SE CONCENTREAZĂ PE STUDIUL RĂSPUNSURILOR BIOLOGICE ALE ȘOARECELUI MUS MUSCULUS DE LABORATOR LA EXPUNEREA LA „COCTEILURI CHIMICE”, UNDE SUNT COMBINATE POLUANȚII EMERGENȚI (COMPUȘI ACTIVI DIN PUNCT DE VEDERE FARMACEUTIC, PACS) ȘI REGLEMENTAȚI (METALE ȘI PESTICIDE), CU ACCENT SPECIAL PE INTERACȚIUNEA LOR ȘI PE ROLUL PREZUMTIV AL SELENIULUI CA ANTAGONIST. RĂSPUNSUL BIOLOGIC VA FI EVALUAT DE DOUĂ ORI. PE DE O PARTE, ACESTA VA FI EVALUAT LA NIVEL MOLECULAR, PRIN STUDII DE SPECIAȚIE CHIMICĂ ȘI METALOMICĂ (IP-1, UHU), PENTRU A CUNOAȘTE DISTRIBUȚIA SPECIILOR CHIMICE ȘI METALO-BIOMOLECULE ÎN ȚESUTURI ȘI ÎN FLUIDELE BIOLOGICE DUPĂ EXPUNERE. ÎN ACEASTĂ LUMINĂ, VOM DETERMINA ȘI CUANTIFICA, DE ASEMENEA, MODIFICĂRILE ÎN ABUNDENȚA DE BIOMOLECULE (TRANSCRIPTE ȘI PROTEINE MĂSURATE, RESPECTIV, PRIN TRANSCRIPTOMIE ȘI PROTEOMICĂ -IP-2, UCO) ȘI PREZENȚA DAUNELOR OXIDATIVE ÎN PROTEINE (PROTEOMICA REDOX, IP-2, UCO), O PROBLEMĂ ESENȚIALĂ ATUNCI CÂND EXISTĂ EXPUNERE LA POLUANȚI CARE PRODUC STRES OXIDATIV. PE DE ALTĂ PARTE, RĂSPUNSUL BIOLOGIC VA FI, DE ASEMENEA, EVALUAT LA NIVEL DE MICROBIOM, PRIN UTILIZAREA METAGENOMICII ȘI A ALTOR ABORDĂRI META-OMICE (IP-1 ȘI 2, UHU ȘI UCO) PENTRU A ELUCIDA MODIFICĂRILE POPULAȚIILOR DE MICROORGANISME ȘI ALE FUNCȚIILOR ACESTORA, CAUZATE DE EXPUNEREA LA ACELE COCKTAIL-URI DE POLUANȚI CARE IMITĂ MEDIUL REAL ȘI ANTAGONISMUL PREZUMTIV AL SELENIULUI PRIN STABILIZAREA MICROBIOTEI. VOM EVALUA, DE ASEMENEA, RELAȚIA DINTRE MICROBIOTA ȘI BIODISPONIBILITATEA CONTAMINANȚILOR, ATÂT IN VIVO, CÂT ȘI IN VITRO, PRIN PROIECTAREA EXPERIENȚELOR DE EXPUNERE PARALELĂ ÎN CELULELE EPITELIULUI INTESTINAL UMAN (DR. F. NAVARRO, UHU). CULTURILE CELULARE VOR FI UTILIZATE ÎN PARALEL CU EXPERIMENTELE IN VIVO DE ȘOARECI PENTRU A TRADUCE EFECTELE LA OM ȘI PENTRU A VALIDA NOI ABORDĂRI ALTERNATIVE LA UTILIZAREA ANIMALELOR EXPERIMENTALE. ACEST PROIECT ÎȘI PROPUNE SĂ CONTINUE STUDIILE EFECTUATE PE PARCURSUL A 5 PROIECTE CONSECUTIVE ANTERIOARE ALE PROGRAMULUI SPANIOL DE CERCETARE ȘI DEZVOLTARE, LA CARE AU PARTICIPAT AMBELE IPS. ACEASTA REPREZINTĂ EVOLUȚIA DE LA STUDIILE PRIVIND PREZENȚA POLUANȚILOR ÎN PARCUL NAȚIONAL DOÑANA, LA APLICAREA OMICII PENTRU A ELUCIDA RĂSPUNSUL BIOLOGIC LA MAMIFERELE CU VIAȚĂ LIBERĂ ȘI NEVERTEBRATE ȘI LA INTEGRAREA OMICILOR PENTRU A STUDIA RĂSPUNSUL ORGANISMULUI MODEL M. MUSCULUS LA EXPUNEREA LA POLUANȚI ÎN CONDIȚII CONTROLATE DE LABORATOR ȘI LA UNELE EXPERIENȚE TIMPURII CU CELULELE. PROIECTUL SEMNIFICĂ UN PAS SUPLIMENTAR ÎN ACEST PROCES, DEOARECE CERCETĂTORII VOR STUDIA INFLUENȚA COCTEILURILOR DE POLUANȚI, IMITÂND LUMEA REALĂ, LA NIVEL MOLECULAR (SPECII CHIMICE, METALO-BIOMOLECULE, METABOLIȚI, PROTEINE ȘI GENE) ȘI LA NIVEL BIOLOGIC (GUT MICROBIOTA), CĂUTÂND LEGĂTURA DINTRE AMBELE NIVELURI PRIN AXA MICROBIOTA-GUT-CREIER, PRIN UTILIZAREA ABORDĂRILOR OMICE DE LA INTESTIN LA CELE MAI ACTIVE ORGANE METABOLICE (FICAT ȘI RINICHI) ȘI, DE ASEMENEA, LA CREIER ȘI PLASMĂ. VOM FOLOSI INSTRUMENTE ANALITICE PUTERNICE ACHIZIȚIONATE RECENT DE GRUPUL DE CERCETARE UHU. (Romanian)
18 August 2022
0 references
SKUPINA, ODGOVORNA ZA PODPROJEKT 1 (S1), IMA IZRAZITO MULTIDISCIPLINARNO NARAVO, KI VKLJUČUJE STROKOVNJAKE IZ DVEH UNIVERZ (UHU IN UCO) IN 3 RAZISKOVALNIH SKUPIN. EKIPA ZDRUŽUJE POLNOPRAVNEGA STROKOVNJAKA ZA ANALITIČNO KEMIJO (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, STROKOVNJAKINJA ZA KEMIJSKO SPECIACIJO IN METABOLOMIKO) IN DVA IZREDNA PROFESORJA (DR. NIEVES ABRIL, STROKOVNJAK ZA GENETIKO, BIOKEMIJO IN MOLEKULARNO BIOLOGIJO (UCO) IN DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, STROKOVNJAK ZA CELIČNO BIOLOGIJO (UHU)). S1 SE OSREDOTOČA NA PREUČEVANJE BIOLOŠKIH ODZIVOV LABORATORIJSKIH MIŠI MUS MUSCULUS NA IZPOSTAVLJENOST „KEMIJSKIM KOKTAJLOM“, KJER SE POJAVLJAJO (FARMACEVTSKO AKTIVNE SPOJINE, PACS) IN REGULIRANA (KOVINE IN PESTICIDI) ONESNAŽEVALA, S POSEBNIM POUDARKOM NA NJIHOVEM MEDSEBOJNEM DELOVANJU IN DOMNEVNI VLOGI SELENA KOT ANTAGONISTA. BIOLOŠKI ODZIV BO DVAKRAT OCENJEN. PO ENI STRANI BO OCENJENO NA MOLEKULARNI RAVNI, IN SICER S ŠTUDIJAMI KEMIJSKE SPECIACIJE IN METALOMIKE (IP-1, UHU), DA SE PO IZPOSTAVLJENOSTI POZNA PORAZDELITEV KEMIJSKIH VRST IN VRST METALO-BIOMOLEKULOV V TKIVIH IN BIOLOŠKIH TEKOČINAH. V TEJ LUČI BOMO TUDI DOLOČILI IN KOLIČINSKO OPREDELILI SPREMEMBE V ŠTEVILČNOSTI BIOMOLEKUL (TRANKRIPTI IN BELJAKOVINE, IZMERJENE S TRANSKRIPTOMIJO OZIROMA PROTEOMIKO – IP-2, UCO) IN PRISOTNOST OKSIDATIVNIH POŠKODB V BELJAKOVINAH (REDOX PROTEOMIKA, IP-2, UCO), KAR JE BISTVENO PRI IZPOSTAVLJENOSTI ONESNAŽEVALOM, KI POVZROČAJO OKSIDATIVNI STRES. PO DRUGI STRANI PA SE BO BIOLOŠKI ODZIV OCENJEVAL TUDI NA RAVNI MIKROBIOMA Z UPORABO METAGENOMIKE IN DRUGIH META-OMIČNIH PRISTOPOV (IP-1 IN 2, UHU IN UCO), DA SE POJASNIJO SPREMEMBE V POPULACIJAH MIKROORGANIZMOV IN NJIHOVIH FUNKCIJAH, KI JIH POVZROČA IZPOSTAVLJENOST TEM KOKTAJLOM ONESNAŽEVAL, KI POSNEMAJO DEJANSKO OKOLJE IN DOMNEVNI ANTAGONIZEM SELENA S STABILIZACIJO MIKROBIOTA. OCENILI BOMO TUDI RAZMERJE MED MIKROBIOTI IN BIOLOŠKO UPORABNOSTJO KONTAMINANTOV, TAKO IN VIVO KOT IN VITRO, Z OBLIKOVANJEM VZPOREDNIH IZKUŠENJ Z IZPOSTAVLJENOSTJO V ČLOVEŠKIH ČREVESNIH EPITELIJSKIH CELICAH (DR. F. NAVARRO, UHU). CELIČNE KULTURE SE BODO UPORABLJALE VZPOREDNO S POSKUSI IN VIVO MIŠI, DA SE UČINKI PRENESEJO NA LJUDI IN POTRDIJO NOVI PRISTOPI, KI SO ALTERNATIVA UPORABI POSKUSNIH ŽIVALI. CILJ TEGA PROJEKTA JE NADALJEVATI ŠTUDIJE, IZVEDENE V PETIH ZAPOREDNIH PREJŠNJIH PROJEKTIH ŠPANSKEGA RAZISKOVALNEGA IN RAZVOJNEGA PROGRAMA, V KATERIH STA SODELOVALI OBE IPS. PREDSTAVLJA RAZVOJ IZ ŠTUDIJ PRISOTNOSTI ONESNAŽEVAL V NARODNEM PARKU DOÑANA, UPORABE OMIKOV ZA POJASNITEV BIOLOŠKEGA ODZIVA PRI PROSTOŽIVEČIH SESALCIH IN NEVRETENČARJIH TER VKLJUČEVANJA OMIKOV ZA PREUČEVANJE ODZIVA MODELA ORGANIZMA M. MUSCULUS NA IZPOSTAVLJENOST ONESNAŽEVALOM POD NADZOROVANIMI LABORATORIJSKIMI POGOJI IN NEKAJ ZGODNJIH IZKUŠENJ S CELICAMI. PROJEKT POMENI NADALJNJI KORAK V TEM PROCESU, SAJ BODO RAZISKOVALCI PREUČEVALI VPLIV KOKTAJLOV ONESNAŽEVAL, POSNEMALI REALNI SVET, NA MOLEKULARNI RAVNI (KEMIČNE VRSTE, METALO-BIOMOLEKULE, METABOLITI, BELJAKOVINE IN GENI) IN NA BIOLOŠKI RAVNI (MIKROBIOTA) TER ISKALI POVEZAVO MED OBEMA NIVOJEMA PREK OSI MIKROBIOTA-GUT-MOŽGANI, Z UPORABO OMIČNIH PRISTOPOV OD ČREVESJA DO NAJBOLJ METABOLIČNO AKTIVNIH ORGANOV (JETRA IN LEDVICE) TER TUDI DO MOŽGANOV IN PLAZME. UPORABILI BOMO MOČNE ANALITIČNE INSTRUMENTE, KI JIH JE NEDAVNO PRIDOBILA RAZISKOVALNA SKUPINA UHU. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
ZESPÓŁ ODPOWIEDZIALNY ZA PODPROJEKT 1 (S1) MA CHARAKTER BARDZO MULTIDYSCYPLINARNY, W KTÓREGO SKŁAD WCHODZĄ EKSPERCI Z 2 UNIWERSYTETÓW (UHU I UCO) ORAZ 3 GRUPY BADAWCZE. ZESPÓŁ INTEGRUJE PEŁNEGO PROFESJONALISTĘ CHEMII ANALITYCZNEJ (IP-1, UHU, DR. TAMARA GARCIA BARRERA, EKSPERTA W ZAKRESIE SPECYFIKACJI CHEMICZNEJ I METABOLOMIKI) I DWÓCH PROFESORÓW (DR. NIEVES ABRIL, EKSPERT W DZIEDZINIE GENETYKI, BIOCHEMII I BIOLOGII MOLEKULARNEJ (UCO) I DR. FRANCISCO NAVARRO ROLDAN, EKSPERT W BIOLOGII KOMÓRKOWEJ (UHU)). S1 KONCENTRUJE SIĘ NA BADANIU REAKCJI BIOLOGICZNYCH MYSZY LABORATORYJNEJ MUS MUSCULUS NA „CHEMICZNE KOKTAJLE”, GDZIE POJAWIAJĄCE SIĘ (ZWIĄZKI FARMACEUTYCZNE AKTYWNE, PACS) I REGULOWANE (METALE I PESTYCYDY) SĄ POŁĄCZONE, ZE SZCZEGÓLNYM NACISKIEM NA ICH INTERAKCJĘ I DOMNIEMANĄ ROLĘ SELENU JAKO ANTAGONISTY. REAKCJA BIOLOGICZNA ZOSTANIE PODDANA PODWÓJNIE OCENIE. Z JEDNEJ STRONY ZOSTANIE ON OCENIONY NA POZIOMIE MOLEKULARNYM, POPRZEZ BADANIA SPECYFIKACJI CHEMICZNEJ I METALOMIKI (IP-1, UHU), ABY POZNAĆ ROZKŁAD GATUNKÓW CHEMICZNYCH I METALO-BIOMOLEKUŁ W TKANKACH I PŁYNACH BIOLOGICZNYCH PO NARAŻENIU. W TYM ŚWIETLE BĘDZIEMY RÓWNIEŻ OKREŚLAĆ I ILOŚCIOWO OKREŚLAĆ ZMIANY W OBFITOŚCI BIOMOLEKUŁÓW (TRANKRYPTÓW I BIAŁEK MIERZONYCH ODPOWIEDNIO ZA POMOCĄ TRANSKRYPTOMIKI I PROTEOMIKI -IP-2, UCO) ORAZ OBECNOŚCI USZKODZEŃ OKSYDACYJNYCH W BIAŁKACH (REDOKS PROTEOMIKI, IP-2, UCO), CO JEST ISTOTNĄ KWESTIĄ W PRZYPADKU NARAŻENIA NA ZANIECZYSZCZENIA POWODUJĄCE STRES OKSYDACYJNY. Z DRUGIEJ STRONY, REAKCJA BIOLOGICZNA BĘDZIE RÓWNIEŻ OCENIANA NA POZIOMIE MIKROBIOMU, PRZY UŻYCIU METOD METAGENOMIKI I INNYCH METAOMIK (IP-1 I 2, UHU I UCO) W CELU WYJAŚNIENIA ZMIAN W POPULACJACH MIKROORGANIZMÓW I ICH FUNKCJI, SPOWODOWANYCH NARAŻENIEM NA TE KOKTAJLE ZANIECZYSZCZEŃ, KTÓRE NAŚLADUJĄ RZECZYWISTE ŚRODOWISKO I PRZYPUSZCZALNY ANTAGONIZM SELENU POPRZEZ STABILIZACJĘ MIKROBIOTY. OCENIMY RÓWNIEŻ ZWIĄZEK MIĘDZY MIKROBIOTĄ A BIODOSTĘPNOŚCIĄ ZANIECZYSZCZEŃ, ZARÓWNO IN VIVO, JAK I IN VITRO, POPRZEZ ZAPROJEKTOWANIE DOŚWIADCZEŃ NARAŻENIA RÓWNOLEGŁEGO W LUDZKICH KOMÓRKACH NABŁONKA JELITOWEGO (DR. F. NAVARRO, UHU). KULTURY KOMÓRKOWE BĘDĄ WYKORZYSTYWANE RÓWNOLEGLE Z EKSPERYMENTAMI NA MYSZACH IN VIVO, ABY PRZEŁOŻYĆ SKUTKI NA LUDZI I ZATWIERDZIĆ NOWE PODEJŚCIA ALTERNATYWNE WOBEC WYKORZYSTYWANIA ZWIERZĄT DOŚWIADCZALNYCH. CELEM PROJEKTU JEST KONTYNUACJA BADAŃ PRZEPROWADZONYCH PODCZAS 5 KOLEJNYCH POPRZEDNICH PROJEKTÓW HISZPAŃSKIEGO PROGRAMU BADAWCZO-ROZWOJOWEGO, W KTÓRYCH UCZESTNICZYŁY OBA IPS. STANOWI ON EWOLUCJĘ OD BADAŃ OBECNOŚCI ZANIECZYSZCZEŃ W PARKU NARODOWYM DOÑANA, DO STOSOWANIA OMIKÓW W CELU WYJAŚNIENIA REAKCJI BIOLOGICZNEJ U SSAKÓW I BEZKRĘGOWCÓW ŻYCIA WOLNEGO ORAZ DO INTEGRACJI OMIKÓW W CELU ZBADANIA REAKCJI ORGANIZMU MODELOWEGO M. MIĘŚNI NA DZIAŁANIE ZANIECZYSZCZEŃ W KONTROLOWANYCH WARUNKACH LABORATORYJNYCH ORAZ WCZESNE DOŚWIADCZENIA Z KOMÓRKAMI. PROJEKT OZNACZA KOLEJNY KROK W TYM PROCESIE, PONIEWAŻ NAUKOWCY BĘDĄ BADAĆ WPŁYW KOKTAJLI ZANIECZYSZCZEŃ, NAŚLADUJĄC REALNY ŚWIAT, NA POZIOMIE MOLEKULARNYM (GATUNKI CHEMICZNE, METALO-BIOMOLEKUŁY, METABOLITY, BIAŁKA I GENY) ORAZ NA POZIOMIE BIOLOGICZNYM (MIKROBIOTA JELIT), DĄŻĄC DO POŁĄCZENIA OBU POZIOMÓW POPRZEZ OŚ MIKROBIOTA-GUT-MÓZG, POPRZEZ ZASTOSOWANIE PODEJŚĆ OMICZNYCH OD JELITA DO NAJBARDZIEJ AKTYWNYCH METABOLICZNIE NARZĄDÓW (WĄTROBA I NERKI), A TAKŻE DO MÓZGU I PLAZMY. UŻYJEMY POTĘŻNEJ OPRZYRZĄDOWANIA ANALITYCZNEGO NABYTEJ NIEDAWNO PRZEZ GRUPĘ BADAWCZĄ UHU. (Polish)
18 August 2022
0 references
Huelva
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PGC2018-096608-B-C21
0 references