Role of DNA (hydroxy)methylation in the regulation of long non-coding RNAs in Multiple Myeloma (Q3180817)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3180817 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Role of DNA (hydroxy)methylation in the regulation of long non-coding RNAs in Multiple Myeloma |
Project Q3180817 in Spain |
Statements
31,308.75 Euro
0 references
57,500.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2014
0 references
31 March 2017
0 references
FUNDACION PARA LA INVESTIGACION MEDICA APLICADA
0 references
El Mieloma múltiple (MM) es una neoplasia hematológica con una muy baja tasa de curación. Junto a las alteraciones genéticas, cada vez es más evidente que tanto las alteraciones epigenéticas como los RNAs no-codificantes pueden jugar un papel importante en la patogénesis del MM. El objetivo general de este proyecto es analizar el (hidroxi)metiloma del DNA completo y conocer su papel en la regulación del transcriptoma, especialmente de los RNAs largos no-codificantes (lncRNAs), determinar si los lncRNAs están involucrados en la patogénesis y el pronóstico del MM y diseñar nuevas moléculas frente a estos lncRNAs que mejoren el tratamiento de los pacientes con MM. El (hidroxi)metiloma se analizará mediante Bis-seq, TET-seq y arrays de metilación y el transcriptoma mediante RNA-seq. La implicación de la expresión alterada o la metilación en el pronóstico del MM se estudiará mediante Q-RT-PCR y pirosecuenciación o MSP en una serie de 200 muestras de pacientes MM. De los lncRNAs que presenten una mayor alteración se analizará su funcionalidad en cuanto a su implicación en la patogénesis del MM (proliferación, ciclo celular, apoptosis) tanto in vitro como in vivo. Por último diseñaremos siAptameros o pequeñas moléculas frente a los dos lncRNAs más relevantes en el MM. Mediante este estudio en este proyecto descifraremos el (hidroxi)metiloma del MM, los lncRNAs desregulados y con una clara funcionalidad en el desarrollo y pronóstico del MM y por último diseñaremos nuevas estrategias dirigidas a los lncRNAs para mejorar el tratamiento y la calidad de vida de estos pacientes. (Spanish)
0 references
Multiple myeloma (MM) is a haematological neoplasia with a very low healing rate. Along with genetic alterations, it is increasingly evident that both epigenetic alterations and non-coding RNAs can play an important role in the pathogenesis of MM. The overall objective of this project is to analyse the (hydroxy)methyloma of the complete DNA and to know its role in the regulation of transcriptome, especially of long non-coding RNAs (lncRNAs), determine whether lncRNAs are involved in the pathogenesis and prognosis of MM, and design new molecules against these lncRNAs that improve the treatment of MM patients. The (hydroxy)methyloma shall be analysed by Bis-seq, TET-seq and methylation arrays and transcriptoma by RNA-seq. The implication of altered expression or methylation in the prognosis of MM will be studied by Q-RT-PCR and pyrossequencing or MSP in a series of 200 samples of MM patients. Of the most altered lncRNAs, their functionality will be analysed in terms of their involvement in the pathogenesis of MM (proliferation, cell cycle, apoptosis) both in vitro and in vivo. Finally we will design ifAptameros or small molecules against the two most relevant lncRNAs in the MM. Through this study in this project we will decipher the (hydroxy)methyloma of the MM, the deregulated lncRNAs and with a clear functionality in the development and prognosis of the MM and finally we will design new strategies aimed at lncRNAs to improve the treatment and quality of life of these patients. (English)
12 October 2021
0.7366630514337933
0 references
Le myélome multiple (MM) est une néoplasie hématologique avec un taux de guérison très faible. Avec les altérations génétiques, il est de plus en plus évident que les altérations épigénétiques et les ARN non codants peuvent jouer un rôle important dans la pathogenèse de MM. L’objectif général de ce projet est d’analyser le (hydroxy)méthylome de l’ADN complet et de connaître son rôle dans la régulation du transcriptome, en particulier des ARN longs non codants (ARNnc), de déterminer si les lncRNAs sont impliqués dans la pathogenèse et le pronostic de MM, et de concevoir de nouvelles molécules contre ces ARNc qui améliorent le traitement des patients atteints de MM. Le (hydroxy)méthylome doit être analysé par des réseaux Bis-seq, TET-seq et méthylation et par transcriptoma par RNA-seq. L’implication d’une altération de l’expression ou de la méthylation dans le pronostic de MM sera étudiée par Q-RT-PCR et pyrossequencing ou MSP dans une série de 200 échantillons de patients atteints de MM. Parmi les ARNc les plus altérés, leur fonctionnalité sera analysée en fonction de leur implication dans la pathogenèse de MM (prolifération, cycle cellulaire, apoptose) à la fois in vitro et in vivo. Enfin, nous allons concevoir siAptameros ou de petites molécules contre les deux lncRNAs les plus pertinents dans le MM. Grâce à cette étude dans ce projet, nous déchiffrons le (hydroxy)méthylome du MM, les ARNnc déréglementés et avec une fonctionnalité claire dans le développement et le pronostic du MM et, enfin, nous allons concevoir de nouvelles stratégies visant les ARNnc afin d’améliorer le traitement et la qualité de vie de ces patients. (French)
4 December 2021
0 references
Multiples Myelom (MM) ist eine hämatologische Neoplasie mit einer sehr niedrigen Heilungsrate. Neben genetischen Veränderungen wird immer deutlicher, dass sowohl epigenetische Veränderungen als auch nichtkodierende RNAs eine wichtige Rolle bei der Pathogenese von MM spielen können. Übergeordnetes Ziel dieses Projekts ist es, das (Hydroxy-)Methylom der vollständigen DNA zu analysieren und seine Rolle bei der Regulierung von Transkriptom zu kennen, insbesondere von langen nichtkodierenden RNAs (lncRNAs), festzustellen, ob lncRNAs an der Pathogenese und Prognose von MM beteiligt sind, und neue Moleküle gegen diese LncRNAs zu entwerfen, die die Behandlung von MM-Patienten verbessern. Das (Hydroxy-)Methylom wird mittels Bis-seq, TET-seq und Methylierungsarrays und Transkriptom durch RNA-seq analysiert. Die Implikation einer veränderten Expression oder Methylierung in der Prognose von MM wird von Q-RT-PCR und Pyrossequenzierung oder MSP in einer Reihe von 200 MM-Patienten untersucht. Von den am meisten veränderten LncRNAs wird ihre Funktionalität im Hinblick auf ihre Beteiligung an der Pathogenese von MM (Proliferation, Zellzyklus, Apoptose) sowohl in vitro als auch in vivo analysiert. Schließlich werden wir, wennAptameros oder kleine Moleküle gegen die beiden relevantesten lncRNAs im MM entwerfen. Durch diese Studie in diesem Projekt werden wir das (Hydroxy-)Methylom des MM, die deregulierten LncRNAs und mit einer klaren Funktionalität in der Entwicklung und Prognose des MM entschlüsseln und schließlich werden wir neue Strategien für lncRNAs entwickeln, um die Behandlung und Lebensqualität dieser Patienten zu verbessern. (German)
9 December 2021
0 references
Multipel myeloom (MM) is een hematologische neoplasie met een zeer lage genezingsgraad. Samen met genetische veranderingen, is het steeds duidelijker dat zowel epigenetische veranderingen als niet-coderende RNAs een belangrijke rol kunnen spelen in de pathogenese van MM. Het algemene doel van dit project is om het (hydroxy)methyloom van het volledige DNA te analyseren en zijn rol te kennen in de regulering van transcriptome, met name van lange niet-coderende RNA’s (lncRNAs), te bepalen of lncRNAs betrokken zijn bij de pathogenese en prognose van MM, en nieuwe moleculen te ontwerpen tegen deze lncRNAs die de behandeling van MM-patiënten verbeteren. Het (hydroxy)methyloom moet worden geanalyseerd met behulp van Bis-seq, TET-seq en methylation arrays en transcriptoom door middel van RNA-seq. De implicatie van veranderde expressie of methylatie in de prognose van MM zal worden onderzocht door Q-RT-PCR en pyrossequencing of MSP in een reeks van 200 MM-patiënten. Van de meest gewijzigde lncRNAs, zal hun functionaliteit worden geanalyseerd in termen van hun betrokkenheid bij de pathogenese van MM (proliferatie, celcyclus, apoptose) zowel in vitro als in vivo. Tot slot zullen we alsAptameros of kleine moleculen ontwerpen tegen de twee meest relevante lncRNAs in de MM. Door deze studie in dit project zullen we het (hydroxy)methyloom van de MM, de gedereguleerde lncRNAs en met een duidelijke functionaliteit in de ontwikkeling en prognose van de MM ontcijferen en ten slotte zullen we nieuwe strategieën ontwerpen gericht op lncRNAs om de behandeling en kwaliteit van leven van deze patiënten te verbeteren. (Dutch)
17 December 2021
0 references
Il mieloma multiplo (MM) è una neoplasia ematologica con un tasso di guarigione molto basso. Insieme alle alterazioni genetiche, è sempre più evidente che sia le alterazioni epigenetiche che gli RNA non codificanti possono svolgere un ruolo importante nella patogenesi della MM. L'obiettivo generale di questo progetto è analizzare il metiloma (idrossi)metiloma del DNA completo e conoscere il suo ruolo nella regolazione del trascrittoma, in particolare dei lunghi RNA non codificanti (lncRNAs), determinare se lncRNA sono coinvolti nella patogenesi e nella prognosi di MM, e progettare nuove molecole contro questi lncRNA che migliorano il trattamento dei pazienti MM. Il (idrossi)metiloma deve essere analizzato mediante array di Bis-seq, TET-seq e metilazione e trascrittoma con RNA-seq. L'implicazione di espressione alterata o metilazione nella prognosi di MM sarà studiata da Q-RT-PCR e pirossequencing o MSP in una serie di 200 campioni di pazienti MM. Delle lncRNAs più alterate, la loro funzionalità sarà analizzata in termini di coinvolgimento nella patogenesi della MM (proliferazione, ciclo cellulare, apoptosi) sia in vitro che in vivo. Infine progetteremo se Aptameros o piccole molecole contro i due lncRNAs più rilevanti nel MM. Attraverso questo studio in questo progetto decifraremo il (idrossi)metiloma della MM, le lncRNAs deregolamentate e con una chiara funzionalità nello sviluppo e nella prognosi della MM e infine progetteremo nuove strategie mirate a lncRNAs per migliorare il trattamento e la qualità della vita di questi pazienti. (Italian)
16 January 2022
0 references
Το πολλαπλό μυέλωμα (ΜΜ) είναι αιματολογική νεοπλασία με πολύ χαμηλό ποσοστό επούλωσης. Μαζί με τις γενετικές αλλοιώσεις, καθίσταται όλο και πιο εμφανές ότι τόσο οι επιγενετικές αλλοιώσεις όσο και οι μη κωδικοποιητικές RNA μπορούν να διαδραματίσουν σημαντικό ρόλο στην παθογένεση του MM. Ο γενικός στόχος αυτού του έργου είναι η ανάλυση του (υδροξυ)μεθυλώματος του πλήρους DNA και η γνώση του ρόλου του στη ρύθμιση της μεταγραφής, ιδίως των μακροχρόνιων μη κωδικοποιητικών RNAs (lncRNAs), να προσδιοριστεί αν τα lncRNAs εμπλέκονται στην παθογένεση και την πρόγνωση των ΜΜ, και να σχεδιάσουν νέα μόρια έναντι αυτών των lncRNAs που βελτιώνουν τη θεραπεία των ασθενών ΜΜ. Το (υδροξυ)μεθυλώμα αναλύεται με Bis-seq, TET-seq και μεθυλίωση συστοιχίες και μεταγραφές με RNA-seq. Η επίπτωση της μεταβολής της έκφρασης ή της μεθυλίωσης στην πρόγνωση του MM θα μελετηθεί με Q-RT-PCR και πυρόσβεσης ή MSP σε μια σειρά 200 δειγμάτων ασθενών με MM. Από τα πιο τροποποιημένα lncRNAs, η λειτουργικότητα τους θα αναλυθεί με βάση τη συμμετοχή τους στην παθογένεση του MM (πολλαπλασιασμός, κυτταρικός κύκλος, απόπτωση) τόσο in vitro όσο και in vivo. Τέλος, θα σχεδιάσουμε αν το Aptameros ή μικρά μόρια ενάντια στα δύο πιο συναφή lncRNAs στο MM. Μέσω αυτής της μελέτης σε αυτό το έργο θα αποκρυπτογραφήσουμε το (υδροξυ)μεθυλώμα του MM, των απορρυθμισμένων lncRNAs και με σαφή λειτουργικότητα στην ανάπτυξη και την πρόγνωση του MM και τέλος θα σχεδιάσουμε νέες στρατηγικές με στόχο την lncRNAs για τη βελτίωση της θεραπείας και της ποιότητας ζωής αυτών των ασθενών. (Greek)
18 August 2022
0 references
Multipel myelomatose (MM) er en hæmatologisk neoplasi med en meget lav helbredende sats. Sammen med genetiske ændringer bliver det i stigende grad tydeligt, at både epigenetiske ændringer og ikke-kodende RNA'er kan spille en vigtig rolle i patogenesen af MM. Det overordnede mål med dette projekt er at analysere (hydroxy)methylomet af det komplette DNA og at kende dens rolle i reguleringen af transkriptom, især af lange ikke-kodende RNA'er (lncRNA'er), afgøre, om lncRNA'er er involveret i MM-patogenese og -prognose, og designe nye molekyler mod disse lncRNA'er, der forbedrer behandlingen af MM-patienter. (Hydroxy)methylomet analyseres ved hjælp af Bis-seq-, TET-seq- og methyleringsarrays og transskriptomer ved hjælp af RNA-seq. Virkningen af ændret ekspression eller methylering i prognosen for MM vil blive undersøgt af Q-RT-PCR og pyrossequencing eller MSP i en række på 200 prøver af MM patienter. Af de mest ændrede lncRNA'er vil deres funktionalitet blive analyseret med hensyn til deres involvering i patogenese af MM (spredning, cellecyklus, apoptose) både in vitro og in vivo. Endelig vil vi designe ifAptameros eller små molekyler mod de to mest relevante lncRNA'er i MM. Gennem denne undersøgelse i dette projekt vil vi dechifrere (hydroxy)methylom af MM, de deregulerede lncRNA'er og med en klar funktionalitet i udviklingen og prognosen af MM og endelig vil vi designe nye strategier rettet mod lncRNA'er for at forbedre behandlingen og livskvaliteten for disse patienter. (Danish)
18 August 2022
0 references
Multippelia myelooma (MM) on hematologinen neoplasia, jonka paranemisaste on hyvin alhainen. Geneettisten muutosten ohella on yhä ilmeisempää, että sekä epigeneettiset muutokset että koodaamattomat RNA:t voivat olla tärkeässä roolissa MM: n patogeneesissä. Tämän hankkeen yleisenä tavoitteena on analysoida täydellisen DNA: n (hydroksi)metyylioomaa ja tietää sen rooli transkriptomin sääntelyssä, erityisesti pitkien koodaamattomien RNA:iden (lncRNAs) sääntelyssä, määrittää, osallistuvatko lncRNA:t MM: n patogeneesiin ja ennusteeseen, ja suunnitella uusia molekyylejä näitä lncRNA-aineita vastaan, jotka parantavat MM-potilaiden hoitoa. (Hydroksi)metyyliooma on analysoitava Bis-seq-, TET-seq- ja metylaatioryhmillä sekä transkripoomalla RNA-seq:n avulla. Q-RT-PCR- ja pyrossekvenssin tai MSP:n vaikutusta MM:n ennusteeseen tutkitaan muuntuneen ekspressionin tai metyloitumisen vaikutuksesta 200 MM-potilaan sarjaan. Kaikkein muuttuneimmista lncRNA:ista niiden toiminnallisuutta analysoidaan sen mukaan, miten ne osallistuvat MM:n patogeneesiin (proliferaatio, solusykli, apoptoosi) sekä in vitro että in vivo. Lopuksi suunnittelemme, josAptameros tai pienet molekyylit vastaan kaksi tärkeintä lncRNAs MM: ssä. Tämän tutkimuksen avulla tässä hankkeessa tulkitsemme MM: n (hydroksi)metyyliooman, säännellyn lncRNA: n ja selkeän toiminnallisuuden MM: n kehittämisessä ja ennusteessa ja lopuksi suunnittelemme uusia strategioita, joiden tarkoituksena on parantaa näiden potilaiden hoitoa ja elämänlaatua. (Finnish)
18 August 2022
0 references
Majeloma multipla (MM) hija neoplasja ematoloġika b’rata ta’ fejqan baxxa ħafna. Flimkien ma’ alterazzjonijiet ġenetiċi, huwa dejjem aktar evidenti li kemm l-alterazzjonijiet epiġenetiċi kif ukoll l-RNAs li ma jikkodifikawx jista’ jkollhom rwol importanti fil-patoġenesi tal-MM. L-għan ġenerali ta’ dan il-proġett huwa li janalizza l-(hydroxy)methyloma tad-DNA sħiħ u li jkun jaf ir-rwol tiegħu fir-regolazzjoni tat-transcriptome, speċjalment tal-RNAs li ma jikkodifikawx (lncRNAs), jiddetermina jekk lncRNAs humiex involuti fil-patoġenisi u l-pronjożi ta’ MM, u jiddisinjaw molekuli ġodda kontra dawn il-lncRNAs li jtejbu l-kura ta’ pazjenti MM. Il-(idrossi)metiloma għandha tiġi analizzata permezz ta’ arranġamenti Bis-seq, TET-seq u metilazzjoni u traskrima bl-RNA-seq. L-implikazzjoni ta’ espressjoni mibdula jew metilazzjoni fil-pronjosi ta’ MM ser tiġi studjata permezz ta’ Q-RT-PCR u pyrossequencing jew MSP f’serje ta’ 200 kampjun ta’ pazjenti MM. Mill-aktar lncRNAs mibdula, il-funzjonalità tagħhom se tiġi analizzata f’termini tal-involviment tagħhom fil-patoġenesi tal-MM (proliferazzjoni, ċiklu taċ-ċelloli, apoptożi) kemm in vitro kif ukoll in vivo. Fl-aħħar nett se niddisinjaw jekkAptameros jew molekuli żgħar kontra ż-żewġ lncRNAs l-aktar rilevanti fl-MM. Permezz ta ‘dan l-istudju f’dan il-proġett aħna se jiddeċifraw il-(hydroxy)methyloma tal-MM, il-lncRNAs deregolati u b’funzjonalità ċara fl-iżvilupp u l-pronjosi tal-MM u fl-aħħar nett se niddisinjaw strateġiji ġodda mmirati lejn lncRNAs biex itejbu t-trattament u l-kwalità tal-ħajja ta’ dawn il-pazjenti. (Maltese)
18 August 2022
0 references
Multiplā mieloma (MM) ir hematoloģiska jaunveidojumi ar ļoti zemu dzīšanas ātrumu. Līdz ar ģenētiskajām izmaiņām arvien vairāk kļūst skaidrs, ka gan epiģenētiskajām izmaiņām, gan RNS nekodēšanai var būt svarīga loma MM patoģenēzē. Šī projekta vispārējais mērķis ir analizēt pilnīgas DNS (hidroksi)metilomu un zināt tās lomu transkriptoma regulēšanā, jo īpaši garos nekodētos RNS (lncRNS), noteikt, vai lncRNS ir iesaistītas MM patoģenēzē un prognozēšanā, un veidot jaunas molekulas pret šīm lncRNAs, kas uzlabo MM pacientu ārstēšanu. (Hidroksi)metilomu analizē ar Bis-seq, TET-seq un metilācijas blokiem un transkritomu ar RNS-seq. Izmainītas ekspresijas vai metilēšanas ietekmi MM prognozēs pētīs Q-RT-PCR un pirossekvencē vai MSP virknē 200 MM pacientu paraugu. No visvairāk izmainītajām lncRNS to funkcionalitāte tiks analizēta, ņemot vērā to iesaistīšanos MM patoģenēzē (izplatīšana, šūnu cikls, apoptoze) gan in vitro, gan in vivo. Visbeidzot, mēs izstrādāsim, jaAptameros vai mazas molekulas pret divām svarīgākajām lncRNS MM. Izmantojot šo pētījumu šajā projektā, mēs atšifrēsim MM (hidroksi)metilomu, deregulēto lncRNS un ar skaidru funkcionalitāti MM attīstībā un prognozēšanā, un visbeidzot mēs izstrādāsim jaunas stratēģijas, kuru mērķis ir lncRNAs, lai uzlabotu šo pacientu ārstēšanu un dzīves kvalitāti. (Latvian)
18 August 2022
0 references
Mnohopočetný myelóm (MM) je hematologická neoplázia s veľmi nízkou rýchlosťou hojenia. Spolu s genetickými zmenami je čoraz zrejmejšie, že epigenetické zmeny aj nekódujúce RNA môžu zohrávať dôležitú úlohu v patogenéze MM. Celkovým cieľom tohto projektu je analyzovať (hydroxy)metylóm úplnej DNA a poznať jeho úlohu pri regulácii transkriptómu, najmä dlhých nekódujúcich RNA (lncRNA), určiť, či sa LncRNA podieľajú na patogenéze a prognóze MM, a navrhnúť nové molekuly proti týmto LncRNA, ktoré zlepšujú liečbu pacientov s MM. (Hydroxy)metylóm sa analyzuje pomocou polí Bis-seq, TET-seq a metylačných polí a transkriptómu pomocou RNA-seq. Vplyv zmenenej expresie alebo metylácie na prognózu MM sa bude skúmať pomocou Q-RT-PCR a pyrosekvenovania alebo NPP v sérii 200 vzoriek pacientov s MM. Z najviac zmenených lncRNA sa ich funkčnosť bude analyzovať z hľadiska ich zapojenia do patogenézy MM (šírenie, bunkový cyklus, apoptóza) tak in vitro, ako aj in vivo. Nakoniec navrhneme ifAptameros alebo malé molekuly proti dvom najvýznamnejším LncRNA v MM. Prostredníctvom tejto štúdie v tomto projekte budeme dešifrovať (hydroxy)metylóm MM, deregulované LncRNA s jasnou funkčnosťou vo vývoji a prognóze MM a nakoniec navrhneme nové stratégie zamerané na LncRNA na zlepšenie liečby a kvality života týchto pacientov. (Slovak)
18 August 2022
0 references
Is neoplasia haematological é Myeloma Il (MM) le ráta cneasaithe an-íseal. Chomh maith le hathruithe géiniteacha, tá sé ag éirí níos soiléire gur féidir le hathruithe epigenetic agus RNAs neamhchódaithe araon ról tábhachtach a bheith acu i bpataigineas MM. Is é cuspóir foriomlán an tionscadail seo anailís a dhéanamh ar mheitiloma (hiodrocsa)meitil an DNA iomlán agus a ról i rialáil transcriptome a fháil amach, go háirithe i gcás RNAs neamhchódaithe fada (lncRNAs), a chinneadh an bhfuil lncRNAs bainteach le pataigineas agus prognosis MM, agus móilíní nua a dhearadh i gcoinne na lncRNAs sin a fheabhsaíonn cóireáil othar MM. Is é Bis-seq, TET-seq agus eagair mheitile agus transcríbhinne a dhéanfaidh anailís ar an (hiodrocsa)meitioloma ag RNA-seq. Déanfaidh Q-RT-PCR agus pyrossequencing nó MSP staidéar ar an impleacht a bhaineann le sloinneadh athraithe nó meitiolú i bprógnóis MM i sraith de 200 sampla d’othair MM. As na lncRNAs is mó a athraíodh, déanfar anailís ar a bhfeidhmiúlacht i dtéarmaí a rannpháirtíochta i bpataigineas MM (iomadú, timthriall cille, apoptosis) in vitro agus in vivo araon. Ar deireadh déanfaimid dearadh ifAptameros nó móilíní beaga i gcoinne an dá lncRNAs is ábhartha sa MM. Tríd an staidéar seo sa tionscadal seo déanfaimid meitioloma (hiodrocsa)meitioloma an MM, na lncRNAs dírialáilte agus le feidhmiúlacht shoiléir i bhforbairt agus prognóis an MM agus ar deireadh déanfaimid straitéisí nua a dhearadh atá dírithe ar lncRNAs chun cóireáil agus cáilíocht saoil na n-othar sin a fheabhsú. (Irish)
18 August 2022
0 references
Mnohočetný myelom (MM) je hematologická neoplazie s velmi nízkou hojecí rychlostí. Spolu s genetickými změnami je stále patrnější, že jak epigenetické změny, tak nekódující RNA mohou hrát důležitou roli v patogenezi MM. Celkovým cílem tohoto projektu je analyzovat (hydroxy)methylom celé DNA a znát jeho roli v regulaci transkriptomu, zejména dlouhých nekódujících RNA (lncRNA), určit, zda jsou lncRNA zapojeny do patogeneze a prognózy MM, a navrhnout nové molekuly proti těmto lncRNA, které zlepšují léčbu pacientů s MM. (Hydroxy)methylom se analyzuje pomocí Bis-seq, TET-seq a methylačních polí a transkriptomu pomocí RNA-seq. Vliv změněné exprese nebo methylace na prognózu MM bude zkoumán Q-RT-PCR a pyrossequencingem nebo MSP v řadě 200 vzorků pacientů s MM. Z nejvíce změněných lncRNA bude jejich funkčnost analyzována z hlediska jejich zapojení do patogeneze MM (proliferace, buněčný cyklus, apoptóza) in vitro i in vivo. Nakonec navrhneme, zdaAptameros nebo malé molekuly proti dvěma nejvýznamnějším lncRNA v MM. Prostřednictvím této studie v tomto projektu budeme dešifrovat (hydroxy)methylom MM, deregulované lncRNA a s jasnou funkčností ve vývoji a prognóze MM a nakonec navrhneme nové strategie zaměřené na lncRNA ke zlepšení léčby a kvality života těchto pacientů. (Czech)
18 August 2022
0 references
O mieloma múltiplo (MM) é uma neoplasia hematológica com uma taxa de cicatrização muito baixa. Juntamente com as alterações genéticas, é cada vez mais evidente que tanto as alterações epigenéticas como os ARN não codificantes podem desempenhar um papel importante na patogénese da MM. O objetivo geral deste projeto é analisar o (hidroxi)metiloma do ADN completo e conhecer o seu papel na regulação do transcriptoma, especialmente dos ARN não codificantes longos (lncRNAs), determinar se os lncRNAs estão envolvidos na patogénese e no prognóstico da MM e conceber novas moléculas contra estes lncRNAs que melhoram o tratamento dos doentes com MM. O (hidroxi)metiloma deve ser analisado por matrizes Bis-seq, TET-seq e metilação e o transcriptoma por ARN-seq. A implicação da expressão alterada ou metilação no prognóstico da MM será estudada por Q-RT-PCR e pirossequencing ou MSP em uma série de 200 amostras de pacientes com MM. Dos lncRNAs mais alterados, a sua funcionalidade será analisada em termos do seu envolvimento na patogénese da MM (proliferação, ciclo celular, apoptose), tanto in vitro como in vivo. Finalmente vamos projetar ifAptameros ou pequenas moléculas contra os dois lncRNAs mais relevantes no MM. Através deste estudo neste projeto vamos decifrar o (hidroxi)metiloma do MM, os lncRNAs desregulados e com uma funcionalidade clara no desenvolvimento e prognóstico do MM e, finalmente, vamos projetar novas estratégias destinadas a lncRNAs para melhorar o tratamento e a qualidade de vida destes pacientes. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
Hulgimüeloom (MM) on hematoloogiline neoplaasia, millel on väga väike paranemiskiirus. Koos geneetilise muundumisega on üha ilmsem, et nii epigeneetilised kui ka mittekodeerivad RNA-d võivad mängida olulist rolli MM patogeneesis. Selle projekti üldine eesmärk on analüüsida täieliku DNA (hüdroksü)metüüloomi ja teada selle rolli transkriptoomi, eriti pikkade mittekodeerivate RNAde (lncRNAde) reguleerimisel, määrata kindlaks, kas lncRNA-d on kaasatud MM patogeneesi ja prognoosimisse, ning kavandada uusi molekule nende lncRNAde vastu, mis parandavad MM patsientide ravi. (Hüdroksü)metüüloomi analüüsitakse Bis-seqi, TET-seqi ja metülatsioonimassiivide abil ning transkriptoomi RNA-seq abil. Muutunud ekspressiooni või metülatsiooni mõju MM prognoosile uuritakse Q-RT-PCRi ja pürossequencing või MSP abil 200 MM patsiendi proovis. Kõige muundunumatest lncRNA-dest analüüsitakse nende toimet MM patogeneesis (proleksatsioon, rakutsükkel, apoptoos) nii in vitro kui ka in vivo. Lõpuks me kavandame, kui Aptameros või väikesed molekulid kahe kõige olulisema lncRNA vastu MM-is. Selle uuringuga selles projektis dešifreerime MM, dereguleeritud lncRNAde (hüdroksü)metüüloomi ja millel on selge funktsionaalsus MM arengus ja prognoosis, ning lõpuks töötame välja uued strateegiad, mis on suunatud lncRNA-dele, et parandada nende patsientide ravi ja elukvaliteeti. (Estonian)
18 August 2022
0 references
A mielóma multiplex (MM) hematológiai neoplasia, nagyon alacsony gyógyulási aránnyal. A genetikai változások mellett egyre nyilvánvalóbb, hogy mind az epigenetikai változások, mind a nem kódoló RNS-ek fontos szerepet játszhatnak az MM patogenezisében. Ennek a projektnek az általános célja a teljes DNS (hidroxi)metilómájának elemzése és a transzkriptómák, különösen a hosszú nem kódoló RNS-ek (lncRNS-ek) szabályozásában betöltött szerepének ismerete, annak meghatározása, hogy az lncRNS-ek részt vesznek-e az MM patogenezisében és prognózisában, és új molekulákat tervezzen ezekkel az lncRNS-ekkel szemben, amelyek javítják az MM betegek kezelését. A (hidroxi)metilómát Bis-seq, TET-seq és metilációs tömbökkel, valamint RNS-seq transzkriptomával kell elemezni. A módosított expresszió vagy metiláció hatását az MM prognózisában a Q-RT-PCR és a piroszszekvenálás, illetve az MSP 200 mintájú MM betegből álló sorozatában tanulmányozzák. A leginkább módosított lncRNS-ek közül azok funkcionalitását az MM (proliferáció, sejtciklus, apoptosis) patogenezisében való részvételük szempontjából elemzik mind in vitro, mind in vivo. Végül tervezünk, haAptameros vagy kis molekulák ellen a két legrelevánsabb lncRNS a MM. Ez a tanulmány ebben a projektben fogjuk megfejteni a (hidroxi)methyloma az MM, a deregulált lncRNS-ek és egy világos funkcionalitás a fejlesztés és a prognózis az MM és végül fogunk tervezni új stratégiák célja az lncRNS, hogy javítsa a kezelés és az életminőség ezen betegek. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
Мултиплен миелом (ММ) е хематологична неоплазия с много ниска скорост на зарастване. Заедно с генетичните промени, все по-очевидно е, че епигенетичните промени и некодиращите РНК могат да играят важна роля в патогенезата на ММ. Общата цел на този проект е да се анализира (хидрокси)метиломът на пълната ДНК и да се знае неговата роля в регулирането на трансскриптом, особено на дългите некодиращи РНК (lncRNAs), да се определи дали lncRNAs участват в патогенезата и прогнозата на MM, както и да се проектират нови молекули срещу тези инкриминиращи РНК, които подобряват лечението на пациентите с ММ. (Хидрокси)метиломът се анализира с бис-секв, TET-seq и метилиращи решетки и трансскриптом чрез РНК-seq. Влиянието на променената експресия или метилиране в прогнозата на MM ще бъде проучено чрез Q-RT-PCR и пиросеквениране или MSP в серия от 200 проби от пациенти с ММ. От най-изменените lncRNAs тяхната функционалност ще бъде анализирана от гледна точка на участието им в патогенезата на ММ (разпространение, клетъчен цикъл, апоптоза) както in vitro, така и in vivo. Накрая ще проектираме, акоАптамерос или малки молекули срещу двете най-подходящи lncRNAs в MM. Чрез това проучване в този проект ще дешифрираме (хидрокси)метилома на ММ, дерегулираните lncRNAs и с ясна функционалност в развитието и прогнозата на ММ и накрая ще разработим нови стратегии, насочени към lncRNAs за подобряване на лечението и качеството на живот на тези пациенти. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
Dauginė mieloma (MM) yra hematologinė neoplazija, kurios gijimo dažnis yra labai mažas. Kartu su genetiniais pokyčiais vis labiau akivaizdu, kad tiek epigenetiniai pakitimai, tiek nekoduojantys RNR gali atlikti svarbų vaidmenį MM patogenezės procese. Bendras šio projekto tikslas yra analizuoti (hidroksi) metilomą visos DNR ir žinoti jos vaidmenį reguliuojant transkriptomą, ypač ilgus nekoduojančius RNR (lncRNR), nustatyti, ar lncRNR dalyvauja MM patogenezės ir prognozės, ir sukurti naujas molekules prieš šias lncRNR, kurios pagerina MM pacientų gydymą. (Hidroksi)metiloma tiriama naudojant Bis-seq, TET-seq ir metilinimo matricas bei transkriptomą RNR-seq metodu. Pakitusios ekspresijos ar metilinimo poveikis MM prognozėje bus tiriamas Q-RT-PGR ir pirossekcijos arba MSP metodu 200 MM pacientų mėginių. Iš labiausiai pakeistų lncRNR jų funkcionalumas bus analizuojamas pagal jų dalyvavimą MM patogenezės (platinimo, ląstelių ciklo, apoptozės) in vitro ir in vivo atžvilgiu. Galiausiai mes sukursime, jeiAptameros ar mažos molekulės prieš dvi svarbiausias lncRNR MM. Šio projekto metu mes iššifruosime MM (hidroksi)metilomą, dereguliuojamą lncRNR ir su aiškia MM kūrimo ir prognozavimo funkcija, ir galiausiai sukursime naujas strategijas, skirtas lncRNR, siekiant pagerinti šių pacientų gydymą ir gyvenimo kokybę. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
Multipli mijelom (MM) je hematološka neoplazija s vrlo niskom stopom iscjeljivanja. Uz genetske promjene, sve je očitije da i epigenetske promjene i nekodirajuće RNK mogu igrati važnu ulogu u patogenezi MM. Opći cilj ovog projekta je analizirati (hidroksi)metilom kompletne DNK i znati njegovu ulogu u regulaciji transkriptoma, posebno dugih nekodirajućih RNK (lncRNA), utvrditi jesu li lncRNA uključeni u patogenezu i prognozu MM, te osmisliti nove molekule protiv tih lncRNAs koje poboljšavaju liječenje MM pacijenata. (Hidroksi)metilom analizira se s pomoću bis-seq, TET-seq i metilacijskim nizovima i transkriptomom RNA-seq. Implikacije promijenjene ekspresije ili metilacije u prognozu MM proučavat će Q-RT-PCR i pirossekvenciranje ili MSP u nizu od 200 uzoraka bolesnika s MM-om. Od najpromijenjenijih lncRNA-a, njihova će se funkcionalnost analizirati u smislu njihove uključenosti u patogenezu MM-a (proliferacija, stanični ciklus, apoptoza) i in vitro i in vivo. Konačno ćemo dizajnirati akoAptameros ili male molekule protiv dvije najrelevantnije lncRNA u MM. Kroz ovu studiju u ovom projektu ćemo dešifrirati (hidroksi)metilom MM, deregulirane lncRNA i s jasnom funkcionalnošću u razvoju i prognozi MM i konačno ćemo osmisliti nove strategije usmjerene na lncRNA poboljšati liječenje i kvalitetu života tih pacijenata. (Croatian)
18 August 2022
0 references
Multipelt myelom (MM) är en hematologisk neoplasi med en mycket låg läkningshastighet. Tillsammans med genetiska förändringar, är det allt tydligare att både epigenetiska förändringar och icke-kodande RNAs kan spela en viktig roll i patogenesen av MM. Det övergripande målet med detta projekt är att analysera (hydroxi)metylomen hos det kompletta DNA och att känna till dess roll i regleringen av transkriptom, särskilt av långa icke-kodande RNAs (lncRNAs), avgöra om lncRNAs är involverade i patogenesen och prognosen för MM, och utforma nya molekyler mot dessa lncRNAs som förbättrar behandlingen av MM-patienter. (Hydroxi)metylom ska analyseras med hjälp av Bis-seq, TET-seq och metyleringsmatriser samt transkriptom med RNA-seq. Konsekvenserna av förändrat uttryck eller metylering i prognosen av MM kommer att studeras av Q-RT-PCR och pyrossekvensering eller MSP i en serie av 200 prover av MM-patienter. Av de mest förändrade lncRNAs, deras funktionalitet kommer att analyseras med avseende på deras inblandning i patogenesen av MM (spridning, cellcykel, apoptos) både in vitro och in vivo. Slutligen kommer vi att designa omAptameros eller små molekyler mot de två mest relevanta lncRNAs i MM. Genom denna studie i detta projekt kommer vi att dechiffrera (hydroxi)metylom av MM, de avreglerade lncRNAs och med en tydlig funktionalitet i utvecklingen och prognosen av MM och slutligen kommer vi att utforma nya strategier som syftar till lncRNAs för att förbättra behandlingen och livskvaliteten för dessa patienter. (Swedish)
18 August 2022
0 references
Mielomul multiplu (MM) este o neoplazie hematologică cu o rată de vindecare foarte scăzută. Împreună cu modificările genetice, este din ce în ce mai evident că atât modificările epigenetice, cât și ARN-urile necodificate pot juca un rol important în patogeneza MM. Obiectivul general al acestui proiect este de a analiza (hidroxi)metilomul ADN-ului complet și de a cunoaște rolul său în reglarea transcriminului, în special a ARN-urilor lungi necodificate (lncRNA), să determine dacă lncRNA sunt implicate în patogeneza și prognosticul MM și să proiecteze noi molecule împotriva acestor lncRNA care îmbunătățesc tratamentul pacienților MM. (Hidroxi)metilomul se analizează cu ajutorul rețelelor Bis-seq, TET-seq și metilare și transcriptom cu ARN-seq. Implicațiile alterării expresiei sau metilării în prognosticul MM vor fi studiate de Q-RT-PCR și pirossequencing sau MSP într-o serie de 200 de eșantioane de pacienți MM. Dintre cele mai modificate lncRNA, funcționalitatea lor va fi analizată în ceea ce privește implicarea lor în patogeneza MM (proliferare, ciclu celular, apoptoză) atât in vitro, cât și in vivo. În cele din urmă vom proiecta dacăAptameros sau molecule mici împotriva celor mai relevante două lncRNA din MM. Prin acest studiu în acest proiect vom descifra (hidroxi)metilomul MM, lncRNA dereglementată și cu o funcționalitate clară în dezvoltarea și prognosticul MM și în cele din urmă vom proiecta noi strategii destinate lncRNA pentru a îmbunătăți tratamentul și calitatea vieții acestor pacienți. (Romanian)
18 August 2022
0 references
Multipli mielom (MM) je hematološka neoplazija z zelo nizko stopnjo celjenja. Skupaj z genetskimi spremembami je vse bolj očitno, da lahko tako epigenetične spremembe kot nekodirajoče RNK igrajo pomembno vlogo pri patogenezi MM. Splošni cilj tega projekta je analizirati (hidroksi)metilom celotne DNK in poznati njegovo vlogo pri regulaciji transkriptoma, zlasti dolgih nekodirnih RNK (lncRNA), ugotoviti, ali so lncRNA vključeni v patogenezo in prognozo MM, in oblikovati nove molekule proti tem lncRNA, ki izboljšujejo zdravljenje bolnikov z MM. (Hidroksi)metilom se analizira z bis-seq, TET-seq in metilacijskimi nizi ter transkriptomom z RNA-seq. Vpliv spremenjenega izražanja ali metilacije v prognozo MM bo preučen s Q-RT-PCR in pirosekvenciranjem ali MSP v seriji 200 vzorcev bolnikov z MM. Od najbolj spremenjenih lncRNA bo njihova funkcionalnost analizirana glede na njihovo vpletenost v patogenezo MM (širjenje, celični cikel, apoptoza) tako in vitro kot in vivo. Končno bomo zasnovali, če Aptameros ali majhne molekule proti dvema najpomembnejšima lncRNAs v MM. S pomočjo te študije v tem projektu bomo dešifrirali (hidroksi)metilom MM, deregulirane lncRNA in z jasno funkcionalnostjo v razvoju in prognozi MM in končno bomo oblikovali nove strategije, namenjene lncRNA za izboljšanje zdravljenja in kakovosti življenja teh bolnikov. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
Szpiczak mnogi (MM) jest nowotworem hematologicznym o bardzo niskim wskaźniku gojenia. Wraz ze zmianami genetycznymi coraz bardziej oczywiste jest, że zarówno zmiany epigenetyczne, jak i niekodujące RNA mogą odgrywać ważną rolę w patogenezie MM. Ogólnym celem tego projektu jest analiza (hydroksy)metyloka kompletnego DNA i poznanie jego roli w regulacji transkrypcji, zwłaszcza długich niekodujących RNA (lncRNA), ustalenie, czy lncRNA są zaangażowane w patogenezę i rokowanie MM, oraz projektowanie nowych cząsteczek przeciwko tym lncRNAs, które poprawiają leczenie pacjentów z MM. (Hydroksy)metylomama analizuje się metodą bis-seq, TET-seq i metylacji oraz transkryptoma metodą RNA-seq. Wpływ zmiany ekspresji lub metylacji w prognozowaniu MM zostanie zbadany przez Q-RT-PCR i sekwencjonowanie pyrossequencing lub MSP w serii 200 próbek pacjentów z MM. Spośród najbardziej zmienionych lncRNA ich funkcjonalność zostanie przeanalizowana pod kątem ich zaangażowania w patogenezę MM (proliferacja, cykl komórkowy, apoptoza) zarówno in vitro, jak i in vivo. Wreszcie zaprojektujemy jeśli Aptameros lub małe cząsteczki przeciwko dwóm najistotniejszym lncRNAs w MM. Przez to badanie w tym projekcie rozszyfrujemy (hydroksy)metylomocznik MM, deregulowane lncRNAs i z wyraźną funkcjonalnością w rozwoju i prognozowaniu MM i wreszcie zaprojektujemy nowe strategie ukierunkowane na lncRNAs w celu poprawy leczenia i jakości życia tych pacjentów. (Polish)
18 August 2022
0 references
Pamplona/Iruña
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI13_01469
0 references