Differential genetic expression analysis in organisms exposed to different types of environmental stress. (Q3177933)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3177933 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Differential genetic expression analysis in organisms exposed to different types of environmental stress. |
Project Q3177933 in Spain |
Statements
108,009.21 Euro
0 references
134,073.0 Euro
0 references
80.56 percent
0 references
1 January 2016
0 references
30 June 2018
0 references
UNIVERSIDAD DE CADIZ
0 references
11510
0 references
Se solicita un escaner de microarrays para el análisis de expresión génica diferencial (transcriptómica). Esta técnica permite detectar la expresión diferencial de miles de genes o fragmentos de ADN simultáneamente en individuos sometidos a distintas condiciones (ambientales o experimentales). La alteración de la expresión génica es un medio temprano, rápido y sensible para la detección de la respuesta al estrés. Al analizar simultáneamente miles de genes involucrados en diferentes redes o rutas metabólicas del organismo afectado, será posible identificar modos de acción (MoAs) específicos de los diferentes contaminantes. La posterior integración de datos de niveles de concentración, bioacumulación y efectos moleculares y a mayor nivel de organización mediante métodos bioinformáticos permitirá atribuir efectos biológicos y el desarrollo de nuevas estrategias de evaluación del riesgo ambiental (ERAs) basadas en la modelización y predicción de toxicidades para otros compuestos de estructura similar no estudiados. Así, se pretende reducir en un futuro conflictos prácticos y éticos acerca de la experimentación in vivo, tal como se propone en diferentes informes europeos e internacionales (ECETOC, OECD, US EPA). Además, el equipo solicitado se puede emplear para cualquier estudio de expresión génica diferencial, como p. ej. los efectos moleculares producidos por el aumento de temperatura, variación de pH o oxígeno disuelto relacionados con el cambio global, entre otros. (Spanish)
0 references
A microarrays scan is requested for differential gene expression analysis (transcriptomics). This technique allows detecting the differential expression of thousands of genes or DNA fragments simultaneously in individuals subject to different conditions (environmental or experimental). Alteration of gene expression is an early, rapid and sensitive means of detecting the response to stress. By simultaneously analysing thousands of genes involved in different networks or metabolic pathways of the affected organism, it will be possible to identify modes of action (MOAS) specific to the different contaminants. The subsequent integration of data on concentration levels, bioaccumulation and molecular effects and at a higher level of organisation through bioinformatics will allow the attribution of biological effects and the development of new environmental risk assessment (ERAs) strategies based on the modelling and prediction of toxicities for other compounds of similar structure not studied. Thus, the aim is to reduce practical and ethical conflicts about in vivo experimentation in the future, as proposed in different European and international reports (ECETOC, OECD, US EPA). In addition, the requested equipment can be used for any differential gene expression study, such as molecular effects caused by temperature increase, pH variation or dissolved oxygen related to global change, among others. (English)
12 October 2021
0.289797540434814
0 references
Une analyse par microréseaux est demandée pour l’analyse différentielle de l’expression génique (transcriptomics). Cette technique permet de détecter l’expression différentielle de milliers de gènes ou de fragments d’ADN simultanément chez des individus soumis à des conditions différentes (environnementale ou expérimentale). L’altération de l’expression génique est un moyen précoce, rapide et sensible de détecter la réponse au stress. En analysant simultanément des milliers de gènes impliqués dans différents réseaux ou voies métaboliques de l’organisme touché, il sera possible d’identifier des modes d’action (MOAS) propres aux différents contaminants. L’intégration ultérieure des données sur les concentrations, la bioaccumulation et les effets moléculaires et à un niveau plus élevé d’organisation grâce à la bioinformatique permettra d’attribuer les effets biologiques et d’élaborer de nouvelles stratégies d’évaluation des risques environnementaux (EER) fondées sur la modélisation et la prévision des toxicités pour d’autres composés de structure similaire non étudiés. Ainsi, l’objectif est de réduire les conflits pratiques et éthiques concernant l’expérimentation in vivo à l’avenir, comme le proposent différents rapports européens et internationaux (ECETOC, OCDE, US EPA). En outre, l’équipement demandé peut être utilisé pour toute étude d’expression génique différentielle, comme les effets moléculaires causés par l’augmentation de la température, la variation du pH ou l’oxygène dissous liés, entre autres, au changement global. (French)
4 December 2021
0 references
Für die Analyse der Differentialgenexpression (Transcriptomics) wird ein Mikroarrays-Scan beantragt. Diese Technik ermöglicht es, die Differentialexpression von Tausenden von Genen oder DNA-Fragmenten gleichzeitig bei Individuen unter unterschiedlichen Bedingungen (Umwelt oder Experimental) zu erkennen. Die Veränderung der Genexpression ist ein frühes, schnelles und empfindliches Mittel, um die Reaktion auf Stress zu erkennen. Durch die gleichzeitige Analyse von Tausenden von Genen, die an verschiedenen Netzwerken oder Stoffwechselwegen des betroffenen Organismus beteiligt sind, wird es möglich sein, spezifische Wirkungsmodi (MOAS) für die verschiedenen Schadstoffe zu identifizieren. Die anschließende Integration von Daten über Konzentrationsniveaus, Bioakkumulation und molekulare Wirkungen und auf einer höheren Organisationsebene durch Bioinformatik wird die Zuordnung biologischer Wirkungen und die Entwicklung neuer Strategien für die Umweltverträglichkeitsprüfung (ERAs) ermöglichen, die auf der Modellierung und Vorhersage von Toxizitäten für andere nicht untersuchte Verbindungen ähnlicher Struktur beruhen. Ziel ist es daher, in Zukunft praktische und ethische Konflikte über In-vivo-Experimente zu verringern, wie sie in verschiedenen europäischen und internationalen Berichten (ECETOC, OECD, US-WPA) vorgeschlagen werden. Darüber hinaus können die angeforderten Geräte für jede Differentialgenexpressionsstudie verwendet werden, wie z. B. molekulare Effekte, die durch Temperaturanstieg, pH-Variation oder gelösten Sauerstoff im Zusammenhang mit globalen Veränderungen verursacht werden. (German)
9 December 2021
0 references
Een microarraysscan wordt gevraagd voor differentiële genexpressieanalyse (transcriptomics). Deze techniek maakt het mogelijk om de differentiële expressie van duizenden genen of DNA-fragmenten tegelijkertijd te detecteren in individuen die aan verschillende (milieu- of experimentele) voorwaarden zijn onderworpen. Verandering van genuitdrukking is een vroeg, snel en gevoelig middel om de reactie op stress te detecteren. Door tegelijkertijd duizenden genen te analyseren die betrokken zijn bij verschillende netwerken of metabolische routes van het aangetaste organisme, zal het mogelijk zijn om werkingswijzen (MOAS) te identificeren die specifiek zijn voor de verschillende verontreinigende stoffen. De daaropvolgende integratie van gegevens over concentratieniveaus, bioaccumulatie en moleculaire effecten en op een hoger niveau van organisatie door middel van bio-informatica zal het mogelijk maken biologische effecten toe te wijzen en nieuwe strategieën voor milieurisicobeoordeling (EOR’s) te ontwikkelen op basis van de modellering en voorspelling van toxiciteiten voor andere verbindingen van vergelijkbare structuur die niet zijn onderzocht. Het doel is dus praktische en ethische conflicten over in vivo experimenten in de toekomst te verminderen, zoals voorgesteld in verschillende Europese en internationale verslagen (ECETOC, OESO, US EPA). Bovendien kan de gevraagde apparatuur worden gebruikt voor een differentiële genexpressiestudie, zoals moleculaire effecten veroorzaakt door temperatuurstijging, pH-variatie of opgeloste zuurstof in verband met onder andere globale veranderingen. (Dutch)
17 December 2021
0 references
Una scansione microarrays è richiesta per l'analisi dell'espressione genica differenziale (transcriptomics). Questa tecnica permette di rilevare l'espressione differenziale di migliaia di geni o frammenti di DNA simultaneamente in individui soggetti a condizioni diverse (ambientali o sperimentali). L'alterazione dell'espressione genica è un mezzo precoce, rapido e sensibile per rilevare la risposta allo stress. Analizzando contemporaneamente migliaia di geni coinvolti in diverse reti o vie metaboliche dell'organismo colpito, sarà possibile identificare modalità di azione (MOAS) specifiche per i diversi contaminanti. La successiva integrazione dei dati sui livelli di concentrazione, bioaccumulazione e effetti molecolari e ad un livello più elevato di organizzazione attraverso la bioinformatica consentirà l'attribuzione di effetti biologici e lo sviluppo di nuove strategie di valutazione del rischio ambientale (ERA) basate sulla modellizzazione e previsione di tossicità per altri composti di struttura simile non studiati. L'obiettivo è quindi quello di ridurre i conflitti pratici ed etici sulla sperimentazione in vivo in futuro, come proposto in diverse relazioni europee e internazionali (ECETOC, OCSE, US EPA). Inoltre, l'apparecchiatura richiesta può essere utilizzata per qualsiasi studio di espressione genica differenziale, come gli effetti molecolari causati dall'aumento della temperatura, dalla variazione del pH o dall'ossigeno disciolto in relazione al cambiamento globale, tra gli altri. (Italian)
16 January 2022
0 references
Απαιτείται σάρωση μικροσυστοιχιών για ανάλυση διαφορικής γονιδιακής έκφρασης (transcriptomics). Η τεχνική αυτή επιτρέπει την ανίχνευση της διαφορικής έκφρασης χιλιάδων γονιδίων ή τμημάτων DNA ταυτόχρονα σε άτομα που υπόκεινται σε διαφορετικές συνθήκες (περιβαλλοντικές ή πειραματικές). Η αλλοίωση της γονιδιακής έκφρασης είναι ένα πρώιμο, γρήγορο και ευαίσθητο μέσο ανίχνευσης της απόκρισης στο στρες. Με την ταυτόχρονη ανάλυση χιλιάδων γονιδίων που εμπλέκονται σε διαφορετικά δίκτυα ή μεταβολικές οδούς του προσβεβλημένου οργανισμού, θα είναι δυνατός ο εντοπισμός των τρόπων δράσης (MOAS) ειδικά για τους διάφορους μολυσματικούς παράγοντες. Η επακόλουθη ενσωμάτωση δεδομένων για τα επίπεδα συγκέντρωσης, τη βιοσυσσώρευση και τις μοριακές επιδράσεις και σε υψηλότερο επίπεδο οργάνωσης μέσω της βιοπληροφορικής θα επιτρέψει τον καταλογισμό βιολογικών επιδράσεων και την ανάπτυξη νέων στρατηγικών εκτίμησης του περιβαλλοντικού κινδύνου (ERA) με βάση τη μοντελοποίηση και την πρόβλεψη τοξικοτήτων για άλλες ενώσεις παρόμοιας δομής που δεν έχουν μελετηθεί. Ως εκ τούτου, στόχος είναι η μείωση των πρακτικών και δεοντολογικών συγκρούσεων σχετικά με τον πειραματισμό in vivo στο μέλλον, όπως προτείνεται σε διάφορες ευρωπαϊκές και διεθνείς εκθέσεις (ECETOC, ΟΟΣΑ, ΣΟΕΣ των ΗΠΑ). Επιπλέον, ο απαιτούμενος εξοπλισμός μπορεί να χρησιμοποιηθεί για οποιαδήποτε μελέτη διαφορικής έκφρασης γονιδίων, όπως οι μοριακές επιδράσεις που προκαλούνται από την αύξηση της θερμοκρασίας, τη διακύμανση του pH ή το διαλυμένο οξυγόνο που σχετίζεται, μεταξύ άλλων, με την αλλαγή του πλανήτη. (Greek)
18 August 2022
0 references
Der anmodes om en mikroarray-scanning til differentialgenekspressionsanalyse (transcriptomics). Denne teknik gør det muligt at detektere differentieret ekspression af tusindvis af gener eller DNA-fragmenter samtidigt hos personer, der er underlagt forskellige betingelser (miljømæssige eller eksperimentelle). Ændring af genekspression er et tidligt, hurtigt og følsomt middel til at opdage reaktionen på stress. Ved samtidig at analysere tusindvis af gener, der er involveret i forskellige netværk eller metaboliseringsveje for den berørte organisme, vil det være muligt at identificere virkemåder (MOAS), der er specifikke for de forskellige forurenende stoffer. Den efterfølgende integration af data om koncentrationsniveauer, bioakkumulering og molekylære virkninger og på et højere organisationsniveau gennem bioinformatik vil gøre det muligt at tildele biologiske virkninger og udvikle nye strategier for miljørisikovurdering (ERA'er) baseret på modellering og forudsigelse af toksicitet for andre forbindelser af lignende struktur, som ikke er undersøgt. Målet er således at mindske praktiske og etiske konflikter om in vivo-forsøg i fremtiden, som foreslået i forskellige europæiske og internationale rapporter (ECETOC, OECD, US EPA). Desuden kan det udstyr, der anmodes om, anvendes til undersøgelser af differentialgenekspression, f.eks. molekylære virkninger forårsaget af temperaturstigning, pH-variation eller opløst ilt i forbindelse med globale ændringer. (Danish)
18 August 2022
0 references
Mikrosarjojen skannausta pyydetään differentiaaligeenin ekspressioanalyysia varten (transcriptomics). Tämä tekniikka mahdollistaa tuhansien geenien tai DNA-fragmenttien erilaisen ilmentymän havaitsemisen samanaikaisesti yksilöissä, joilla on erilaiset olosuhteet (ympäristölliset tai kokeelliset). Geenin ilmentymän muuttaminen on varhainen, nopea ja herkkä tapa havaita stressiin reagoiminen. Analysoimalla samanaikaisesti tuhansia geenejä, jotka ovat mukana tartunnan saaneen organismin eri verkoissa tai aineenvaihduntareiteissä, on mahdollista tunnistaa eri epäpuhtauksille ominaiset toimintatavat (MOAS). Pitoisuustasoja, biokertyvyyttä ja molekulaarisia vaikutuksia koskevien tietojen yhdistäminen ja korkeammalla organisaatiotasolla bioinformatiikan avulla mahdollistaa biologisten vaikutusten osoittamisen ja uusien ympäristöriskien arviointistrategioiden kehittämisen, joka perustuu sellaisten muiden samankaltaisten yhdisteiden toksisuuden mallintamiseen ja ennustamiseen, joita ei ole tutkittu. Näin ollen tavoitteena on vähentää in vivo -kokeiluun liittyviä käytännön ja eettisiä konflikteja tulevaisuudessa, kuten eri eurooppalaisissa ja kansainvälisissä raporteissa (ECETOC, OECD, US EPA) ehdotetaan. Lisäksi pyydettyä laitetta voidaan käyttää mihin tahansa geeniekspressiotutkimukseen, kuten lämpötilan nousun, pH:n vaihtelun tai maailmanlaajuiseen muutokseen liittyvän liuenneen hapen aiheuttamiin molekyylivaikutuksiin. (Finnish)
18 August 2022
0 references
Mikroarrays scan hija mitluba għall-analiżi differenzjali espressjoni tal-ġeni (traskritomiċi). Din it-teknika tippermetti d-detezzjoni tal-espressjoni differenzjali ta’ eluf ta’ ġeni jew frammenti tad-DNA simultanjament f’individwi soġġetti għal kundizzjonijiet differenti (ambjentali jew sperimentali). Alterazzjoni ta ‘l-espressjoni tal-ġeni huwa mezz bikri, rapidu u sensittiv biex jinstab ir-rispons għall-istress. Bl-analiżi simultanja ta’ eluf ta’ ġeni involuti f’netwerks differenti jew mogħdijiet metaboliċi tal-organiżmu affettwat, se jkun possibbli li jiġu identifikati modi ta’ azzjoni (MOAS) speċifiċi għall-kontaminanti differenti. L-integrazzjoni sussegwenti tad-data dwar il-livelli ta’ konċentrazzjoni, il-bijoakkumulazzjoni u l-effetti molekulari u f’livell ogħla ta’ organizzazzjoni permezz tal-bijoinformatika se tippermetti l-attribuzzjoni ta’ effetti bijoloġiċi u l-iżvilupp ta’ strateġiji ġodda ta’ valutazzjoni tar-riskju ambjentali (ERAs) ibbażati fuq l-immudellar u t-tbassir tat-tossiċitajiet għal komposti oħra ta’ struttura simili li ma ġewx studjati. Għalhekk, l-għan huwa li jitnaqqsu l-kunflitti prattiċi u etiċi dwar l-esperimentazzjoni in vivo fil-futur, kif propost f’rapporti Ewropej u internazzjonali differenti (ECETOC, OECD, US EPA). Barra minn hekk, it-tagħmir mitlub jista’ jintuża għal kwalunkwe studju differenzjali tal-espressjoni tal-ġeni, bħall-effetti molekulari kkawżati minn żieda fit-temperatura, varjazzjoni tal-pH jew ossiġnu maħlul relatat mal-bidla globali, fost l-oħrajn. (Maltese)
18 August 2022
0 references
Lai veiktu diferenciālās gēnu ekspresijas analīzi (transkripomiku), ir nepieciešama mikrobloku skenēšana. Šī metode ļauj vienlaikus noteikt tūkstošiem gēnu vai DNS fragmentu diferenciālo ekspresiju indivīdiem, uz kuriem attiecas atšķirīgi apstākļi (vides vai eksperimentāli). Gēnu ekspresijas izmaiņas ir agrīns, ātrs un jutīgs līdzeklis, lai noteiktu reakciju uz stresu. Vienlaicīgi analizējot tūkstošiem gēnu, kas iesaistīti dažādos tīklos vai skartā organisma metabolisma ceļos, būs iespējams noteikt darbības veidus (MOAS), kas raksturīgi dažādiem piesārņotājiem. Turpmāka datu integrācija par koncentrācijas līmeņiem, bioakumulāciju un molekulāro ietekmi un augstāku organizācijas līmeni, izmantojot bioinformātiku, ļaus noteikt bioloģisko ietekmi un izstrādāt jaunas vides riska novērtēšanas (ERA) stratēģijas, kuru pamatā ir toksiskuma modelēšana un prognozēšana citiem līdzīgas struktūras savienojumiem, kas nav pētīti. Tādējādi mērķis ir samazināt praktiskus un ētiskus konfliktus par eksperimentiem in vivo nākotnē, kā ierosināts dažādos Eiropas un starptautiskajos ziņojumos (ECETOC, ESAO, ASV EPA). Turklāt pieprasīto aprīkojumu var izmantot jebkuram diferenciālās gēnu ekspresijas pētījumam, piemēram, molekulārai ietekmei, ko izraisa temperatūras paaugstināšanās, pH svārstības vai izšķīdušais skābeklis, kas saistīts ar globālām pārmaiņām. (Latvian)
18 August 2022
0 references
Na analýzu diferenciálnej génovej expresie (transcriptomics) sa vyžaduje skenovanie mikroarrays. Táto technika umožňuje detekciu diferenciálnej expresie tisícov génov alebo fragmentov DNA súčasne u jedincov vystavených rôznym podmienkam (environmentálne alebo experimentálne). Zmena génovej expresie je skorý, rýchly a citlivý prostriedok na detekciu reakcie na stres. Súbežnou analýzou tisícov génov zapojených do rôznych sietí alebo metabolických ciest postihnutého organizmu bude možné identifikovať spôsoby účinku (MOAS) špecifické pre rôzne kontaminanty. Následná integrácia údajov o úrovniach koncentrácie, bioakumulácii a molekulárnych účinkoch a na vyššej úrovni organizácie prostredníctvom bioinformatiky umožní priradenie biologických účinkov a vývoj nových stratégií hodnotenia environmentálnych rizík (ERA) založených na modelovaní a prognóze toxicity pre iné zlúčeniny podobnej štruktúry, ktoré sa neskúmali. Cieľom je teda obmedziť praktické a etické konflikty týkajúce sa experimentovania in vivo v budúcnosti, ako sa navrhuje v rôznych európskych a medzinárodných správach (ECETOC, OECD, US EPA). Okrem toho sa požadované zariadenie môže použiť na akúkoľvek štúdiu diferenciálnej génovej expresie, ako sú okrem iného molekulárne účinky spôsobené zvýšením teploty, kolísaním pH alebo rozpusteným kyslíkom v súvislosti s globálnou zmenou. (Slovak)
18 August 2022
0 references
Iarrtar scanadh microarrays chun anailís a dhéanamh ar léiriú géine difreálach (tras-scríbhinn). Ligeann an teicníc seo léiriú difreálach na mílte géinte nó blúirí DNA a bhrath go comhuaineach i ndaoine aonair faoi réir coinníollacha éagsúla (comhshaoil nó turgnamhach). Is modh luath, tapa agus íogair é an abairt géine a athrú chun an freagra ar strus a bhrath. Trí anailís a dhéanamh ag an am céanna ar na mílte géinte a bhfuil baint acu le líonraí éagsúla nó bealaí meitibileacha an orgánaigh atá buailte, beifear in ann modhanna gníomhaíochta (MOAS) a bhaineann go sonrach leis na héilleáin éagsúla a shainaithint. Trí shonraí maidir le leibhéil tiúchana, bithbhailiú agus éifeachtaí móilíneacha a chomhtháthú ina dhiaidh sin agus ar leibhéal níos airde eagrúcháin trí bhithfhaisnéisíocht beifear in ann éifeachtaí bitheolaíocha a shannadh agus straitéisí nua measúnaithe riosca comhshaoil (ERAanna) a fhorbairt bunaithe ar shamhaltú agus ar thuar tocsaineachtaí le haghaidh comhdhúile eile de struchtúr comhchosúil nach ndéantar staidéar orthu. Dá bhrí sin, is é an aidhm atá ann coinbhleachtaí praiticiúla agus eiticiúla faoi thurgnamh in vivo amach anseo a laghdú, mar a mholtar i dtuarascálacha éagsúla Eorpacha agus idirnáisiúnta (ECETOC, OECD, US EPA). Ina theannta sin, is féidir an trealamh a iarrtar a úsáid le haghaidh aon staidéar ar léiriú géine difreálach, mar shampla éifeachtaí móilíneacha de bharr méadú teochta, éagsúlacht pH nó ocsaigin tuaslagtha a bhaineann le hathrú domhanda, i measc daoine eile. (Irish)
18 August 2022
0 references
Pro diferenciální analýzu genové exprese (transcriptomics) je vyžadováno vyšetření mikroarrays. Tato technika umožňuje detekci diferenciální exprese tisíců genů nebo fragmentů DNA současně u jedinců vystavených různým podmínkám (environmentálním nebo experimentálním). Změna genové exprese je časným, rychlým a citlivým prostředkem pro detekci reakce na stres. Souběžnou analýzou tisíců genů zapojených do různých sítí nebo metabolických cest postiženého organismu bude možné identifikovat způsoby působení (MOAS) specifické pro různé kontaminující látky. Následná integrace údajů o koncentracích, bioakumulaci a molekulárních účincích a na vyšší úrovni organizace prostřednictvím bioinformatiky umožní přiřazování biologických účinků a rozvoj nových strategií hodnocení rizik pro životní prostředí založených na modelování a predikci toxicity pro jiné sloučeniny podobné struktury, které nebyly studovány. Cílem je tedy snížit v budoucnu praktické a etické konflikty týkající se experimentování in vivo, jak je navrženo v různých evropských a mezinárodních zprávách (ECETOC, OECD, EPA USA). Kromě toho lze požadované zařízení použít pro jakoukoli studii diferenciální genové exprese, jako jsou mimo jiné molekulární účinky způsobené zvýšením teploty, kolísáním pH nebo rozpuštěným kyslíkem v souvislosti s globální změnou. (Czech)
18 August 2022
0 references
Uma varredura do microarrays é pedida para a análise diferencial da expressão genética (transcriptomics). Esta técnica permite detectar a expressão diferencial de milhares de genes ou fragmentos de ADN simultaneamente em indivíduos sujeitos a diferentes condições (ambientais ou experimentais). A alteração da expressão genética é um meio precoce, rápido e sensível de detetar a resposta ao stress. Ao analisar simultaneamente milhares de genes envolvidos em diferentes redes ou vias metabólicas do organismo afetado, será possível identificar modos de ação (MOAS) específicos para os diferentes contaminantes. A subsequente integração de dados sobre os níveis de concentração, a bioacumulação e os efeitos moleculares e a um nível mais elevado de organização através da bioinformática permitirá a atribuição de efeitos biológicos e o desenvolvimento de novas estratégias de avaliação dos riscos ambientais (ARA) baseadas na modelização e previsão de toxicidades para outros compostos de estrutura semelhante não estudados. Assim, o objetivo é reduzir os conflitos práticos e éticos sobre a experimentação in vivo no futuro, tal como proposto em diferentes relatórios europeus e internacionais (ECETOC, OCDE, EPA dos EUA). Além disso, o equipamento solicitado pode ser utilizado para qualquer estudo diferencial de expressão genética, tais como efeitos moleculares causados pelo aumento da temperatura, variação do pH ou oxigénio dissolvido relacionado com alterações globais, entre outros. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
Diferentsiaalgeeni ekspressiooni analüüsi (transcriptomics) jaoks on vaja mikroaare skaneerida. See meetod võimaldab avastada tuhandete geenide või DNA fragmentide diferentseeritud ekspressiooni samaaegselt indiviididel, kelle suhtes kehtivad erinevad tingimused (keskkonna- või eksperimentaaltingimused). Geeni ekspressiooni muutmine on varajane, kiire ja tundlik vahend stressile reageerimise tuvastamiseks. Analüüsides samal ajal tuhandeid geene, mis on kaasatud mõjutatud organismi erinevatesse võrkudesse või ainevahetusradadesse, on võimalik kindlaks teha erinevatele saasteainetele omased toimeviisid (MOAS). Kontsentratsioonitasemeid, bioakumulatsiooni ja molekulaarmõjusid käsitlevate andmete edasine integreerimine ning bioinformaatika abil organiseerituse kõrgem tase võimaldab omistada bioloogilisi mõjusid ja töötada välja uued keskkonnaohu hindamise strateegiad, mis põhinevad teiste sarnase struktuuriga ühendite mürgisuse modelleerimisel ja prognoosimisel, mida ei ole uuritud. Seega on eesmärk vähendada praktilisi ja eetilisi konflikte seoses in vivo katsetega tulevikus, nagu on kavandatud erinevates Euroopa ja rahvusvahelistes aruannetes (ECETOC, OECD, US EPA). Lisaks võib soovitud seadmeid kasutada mis tahes diferentseeritud geeni ekspressiooni uuringutes, näiteks temperatuuri tõusust, pH muutumisest või lahustunud hapnikust tingitud molekulaarmõjude puhul, mis on seotud muu hulgas globaalsete muutustega. (Estonian)
18 August 2022
0 references
Mikroarray-szkennelést kérünk a differenciált génexpresszió elemzéséhez (transcriptomics). Ez a technika lehetővé teszi több ezer gén vagy DNS-töredék differenciális kifejeződésének kimutatását különböző körülmények között (környezeti vagy kísérleti) érintett egyénekben. A génexpresszió megváltozása korai, gyors és érzékeny eszköz a stresszre adott válasz kimutatására. Az érintett szervezet különböző hálózataiban vagy metabolikus útvonalaiban részt vevő több ezer gén egyidejű elemzésével lehetséges a különböző szennyező anyagokra jellemző hatásmechanizmusok (MOAS) azonosítása. A koncentrációszintekre, a bioakkumulációra és a molekuláris hatásokra vonatkozó adatok ezt követő integrálása, valamint a magasabb szintű szervezettség bioinformatika révén lehetővé teszi a biológiai hatások hozzárendelését és új környezeti kockázatértékelési stratégiák kidolgozását, amelyek a hasonló szerkezetű, nem vizsgált vegyületek toxicitásának modellezésén és előrejelzésén alapulnak. Így a cél az in vivo kísérletezéssel kapcsolatos gyakorlati és etikai konfliktusok csökkentése a jövőben, ahogy azt a különböző európai és nemzetközi jelentések (ECETOC, OECD, US EPA) is javasolják. Ezenkívül a kért berendezés bármilyen differenciál génexpressziós vizsgálathoz használható, mint például a hőmérséklet-emelkedés, a pH-változás vagy a globális változáshoz kapcsolódó oldott oxigén által okozott molekuláris hatások. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
За анализ на диференциална експресия на ген (транскриптомика) се изисква сканиране на микроареси. Тази техника позволява откриването на диференциална експресия на хиляди гени или ДНК фрагменти едновременно при индивиди, подложени на различни условия (екологични или експериментални). Промяната на генната експресия е ранно, бързо и чувствително средство за откриване на реакцията към стреса. Чрез едновременно анализиране на хиляди гени, участващи в различни мрежи или метаболитни пътища на засегнатия организъм, ще бъде възможно да се идентифицират начините на действие (MOAS), специфични за различните замърсители. Последващото интегриране на данни за нивата на концентрация, биоакумулацията и молекулярните ефекти и на по-високо равнище на организация чрез биоинформатика ще позволи приписването на биологични ефекти и разработването на нови стратегии за оценка на риска за околната среда, основани на моделиране и прогнозиране на токсичността за други съединения с подобна структура, които не са проучени. По този начин целта е да се намалят практическите и етичните конфликти относно експериментирането in vivo в бъдеще, както се предлага в различни европейски и международни доклади (ECETOC, ОИСР, EPA на САЩ). Освен това исканото оборудване може да се използва за всяко изследване на диференциалната експресия на гените, като например молекулярни ефекти, причинени от повишаване на температурата, вариация на pH или разтворен кислород, свързани с глобалните промени, наред с другото. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
Diferencinės genų ekspresijos analizei (transcriptomics) prašoma atlikti mikromatricų skenavimą. Šis metodas leidžia nustatyti tūkstančių genų ar DNR fragmentų diferencinę ekspresiją individuose, kuriems taikomos skirtingos sąlygos (aplinkos ar eksperimentinės). Genų ekspresijos pakeitimas yra ankstyvas, greitas ir jautrus būdas nustatyti atsaką į stresą. Tuo pačiu metu analizuojant tūkstančius genų, dalyvaujančių skirtinguose tinkluose ar paveikto organizmo metaboliniuose procesuose, bus galima nustatyti veikimo būdus (MOAS), būdingus įvairiems teršalams. Vėliau sujungus duomenis apie koncentracijos lygius, biologinį kaupimąsi ir molekulinį poveikį ir aukštesniu organizacijos lygiu pasitelkiant bioinformatiką, bus galima priskirti biologinį poveikį ir parengti naujas rizikos aplinkai vertinimo strategijas, pagrįstas kitų panašios struktūros junginių toksinio poveikio modeliavimu ir prognozavimu. Taigi siekiama ateityje sumažinti praktinius ir etinius konfliktus dėl bandymų in vivo, kaip siūloma įvairiose Europos ir tarptautinėse ataskaitose (ECETOC, EBPO, JAV EPS). Be to, prašoma įranga gali būti naudojama bet kokiam diferencinės genų ekspresijos tyrimui, pavyzdžiui, molekuliniam poveikiui, kurį sukelia temperatūros padidėjimas, pH kitimas arba ištirpusio deguonies kiekis, susijęs su visuotiniu pokyčiu, be kita ko. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
Za analizu diferencijalne ekspresije gena (transcriptomika) zahtijeva se skeniranje mikroarraysa. Ova tehnika omogućuje otkrivanje diferencijalnog ekspresije tisuća gena ili fragmenta DNK istodobno kod pojedinaca podložnih različitim uvjetima (okolišni ili eksperimentalni). Promjena ekspresije gena je rano, brzo i osjetljivo sredstvo otkrivanja odgovora na stres. Istovremeno analiziranjem tisuća gena uključenih u različite mreže ili metaboličke putove zahvaćenog organizma, bit će moguće identificirati načine djelovanja (MOAS) specifične za različite zagađivače. Naknadna integracija podataka o razinama koncentracije, bioakumulaciji i molekularnim učincima te na višoj razini organizacije putem bioinformatike omogućit će utvrđivanje bioloških učinaka i razvoj novih strategija procjene rizika za okoliš (ERAs) na temelju modeliranja i predviđanja toksičnosti za druge spojeve slične strukture koji nisu ispitani. Stoga je cilj smanjiti praktične i etičke sukobe o eksperimentiranju in vivo u budućnosti, kako je predloženo u različitim europskim i međunarodnim izvješćima (ECETOC, OECD, SGP SAD-a). Osim toga, zatražena oprema može se koristiti za bilo koju studiju diferencijalne ekspresije gena, kao što su, među ostalim, molekularni učinci uzrokovani povećanjem temperature, varijacijom pH vrijednosti ili otopljenim kisikom povezanima s globalnom promjenom. (Croatian)
18 August 2022
0 references
En mikroarrays scan krävs för analys av differentialgenuttryck (transcriptomics). Denna teknik gör det möjligt att upptäcka differentialuttrycket av tusentals gener eller DNA-fragment samtidigt hos individer med olika tillstånd (miljö eller experiment). Förändring av genuttryck är ett tidigt, snabbt och känsligt sätt att upptäcka reaktionen på stress. Genom att samtidigt analysera tusentals gener som är involverade i olika nätverk eller metaboliska vägar i den drabbade organismen, kommer det att vara möjligt att identifiera verkningssätt (MOAS) som är specifika för de olika föroreningarna. Den efterföljande integreringen av data om koncentrationsnivåer, bioackumulering och molekylära effekter och på en högre organisationsnivå genom bioinformatik kommer att göra det möjligt att tillskriva biologiska effekter och utveckla nya strategier för miljöriskbedömning baserade på modellering och förutsägelse av toxicitet för andra föreningar med liknande struktur som inte studerats. Syftet är således att minska de praktiska och etiska konflikterna om in vivo-försök i framtiden, vilket föreslås i olika europeiska och internationella rapporter (ECETOC, OECD, US EPA). Dessutom kan den begärda utrustningen användas för alla olika genuttrycksstudier, t.ex. molekylära effekter orsakade av temperaturökning, pH-variation eller löst syre i samband med globala förändringar. (Swedish)
18 August 2022
0 references
O scanare microarrays este necesară pentru analiza expresiei genelor diferențiale (transcriptomica). Această tehnică permite detectarea expresiei diferențiale a mii de gene sau fragmente de ADN simultan la indivizi supuși unor condiții diferite (de mediu sau experimentale). Modificarea expresiei genetice este un mijloc precoce, rapid și sensibil de detectare a răspunsului la stres. Analizând simultan mii de gene implicate în diferite rețele sau căi metabolice ale organismului afectat, va fi posibilă identificarea modurilor de acțiune (MOAS) specifice diferiților contaminanți. Integrarea ulterioară a datelor privind nivelurile de concentrație, bioacumularea și efectele moleculare și la un nivel mai ridicat de organizare prin bioinformatică va permite atribuirea efectelor biologice și elaborarea de noi strategii de evaluare a riscurilor pentru mediu (ERA) bazate pe modelarea și predicția toxicităților pentru alți compuși cu structură similară care nu au fost studiați. Astfel, obiectivul este de a reduce conflictele practice și etice legate de experimentele in vivo în viitor, astfel cum se propune în diferite rapoarte europene și internaționale (ECETOC, OCDE, EPA SUA). În plus, echipamentul solicitat poate fi utilizat pentru orice studiu diferențial de expresie a genelor, cum ar fi efectele moleculare cauzate de creșterea temperaturii, variația pH-ului sau oxigenul dizolvat legat de schimbarea globală, printre altele. (Romanian)
18 August 2022
0 references
Za analizo diferencialne ekspresije genov (transcriptomika) se zahteva slikanje mikroskopov. Ta tehnika omogoča istočasno odkrivanje diferencialnega izražanja tisočih genov ali fragmentov DNK pri posameznikih z različnimi pogoji (okoljski ali eksperimentalni). Sprememba genske ekspresije je zgodnje, hitro in občutljivo sredstvo za odkrivanje odziva na stres. S hkratno analizo na tisoče genov, vključenih v različne mreže ali presnovne poti prizadetega organizma, bo mogoče opredeliti načine delovanja (MOAS), specifične za različne onesnaževalce. Poznejša vključitev podatkov o koncentracijah, bioakumulaciji in molekularnih učinkih ter na višji ravni organizacije prek bioinformatike bo omogočila dodelitev bioloških učinkov in razvoj novih strategij za oceno tveganja za okolje, ki temeljijo na modeliranju in napovedovanju toksičnosti za druge spojine podobne strukture, ki niso bile preučene. Cilj je torej zmanjšati praktične in etične spore glede eksperimentiranja in vivo v prihodnosti, kot je predlagano v različnih evropskih in mednarodnih poročilih (ECETOC, OECD, EPA). Poleg tega se lahko zahtevana oprema uporabi za katero koli študijo diferencialne ekspresije genov, kot so molekularni učinki, ki jih med drugim povzroči povišanje temperature, sprememba pH ali raztopljeni kisik, povezan z globalnimi spremembami. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
Do analizy ekspresji genów różniczkowych (transcriptomics) wymagane jest skanowanie mikroarrayi. Technika ta umożliwia wykrywanie różnicowej ekspresji tysięcy genów lub fragmentów DNA jednocześnie u osób podlegających różnym warunkom (środowiskowym lub eksperymentalnym). Zmiana ekspresji genów jest wczesną, szybką i wrażliwą metodą wykrywania reakcji na stres. Analizując jednocześnie tysiące genów zaangażowanych w różne sieci lub szlaki metaboliczne dotkniętego organizmu, możliwe będzie określenie trybów działania (MOAS) specyficznych dla różnych zanieczyszczeń. Późniejsza integracja danych dotyczących poziomów stężenia, bioakumulacji i skutków molekularnych oraz na wyższym poziomie organizacji poprzez bioinformatyki pozwoli na przypisanie skutków biologicznych i opracowanie nowych strategii oceny ryzyka środowiskowego opartych na modelowaniu i prognozowaniu toksyczności dla innych związków o podobnej strukturze, które nie zostały zbadane. Celem jest zatem ograniczenie praktycznych i etycznych konfliktów dotyczących eksperymentów in vivo w przyszłości, zgodnie z propozycją zawartą w różnych sprawozdaniach europejskich i międzynarodowych (ECETOC, OECD, US EPA). Ponadto wymagany sprzęt może być stosowany do wszelkich badań ekspresji genów różnicowych, takich jak skutki molekularne spowodowane wzrostem temperatury, wahaniami pH lub rozpuszczonym tlenem związanym między innymi ze zmianami globalnymi. (Polish)
18 August 2022
0 references
Puerto Real
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
UNCA15-CE-3375
0 references