Application of DNA ultrasequencing (NGS) to the study of the genetic causes of auditory neuropathies and other autosomal recessive inheritance non-syndromic hearing loss. (Q3175467)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3175467 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Application of DNA ultrasequencing (NGS) to the study of the genetic causes of auditory neuropathies and other autosomal recessive inheritance non-syndromic hearing loss. |
Project Q3175467 in Spain |
Statements
66,156.75 Euro
0 references
121,500.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2015
0 references
31 March 2018
0 references
FUNDACION INVESTIGACION BIOMEDICA HOSPITAL RAMON Y CAJAL
0 references
Objetivos: 1) Identificación de nuevos genes de hipoacusia no sindrómica autosómica recesiva. 2) Diseño, desarrollo y validación de un panel de genes para su ultrasecuenciación (NGS) en pacientes con neuropatía auditiva (incluyendo genes conocidos y genes candidatos). 3) Identificación de nuevos genes de neuropatía auditiva mediante la aplicación del panel y mediante secuenciación de exomas completos. 4) Descripción de los espectros mutacionales de los genes identificados, y determinación de la patogenicidad de las variantes de secuencia encontradas. 5) Creación de bases de datos de mutaciones, específicas de locus y de libre acceso, para los genes implicados en neuropatía auditiva aislada. 6) Investigación de las correlaciones genotipo-fenotipo en series de pacientes con neuropatía auditiva aislada y con mutaciones en el mismo gen, con especial atención a la predicción de resultados del implante coclear. 7) Investigación del patrón de expresión de cada nuevo gen y del producto que codifique, en condiciones normales y patológicas. Sujetos de estudio: individuos con hipoacusia no sindrómica de herencia autosómica recesiva e individuos con neuropatía auditiva aislada de causa no ambiental. Metodología: Cribado preliminar de los genes con mutaciones más frecuentes mediante técnicas clásicas. Ultrasecuenciación de paneles de genes de neuropatía auditiva y de hipoacusia no sindrómica. Ultrasecuenciación de exomas completos (WES). Secuenciación del DNA mitocondrial completo. Análisis bioinformáticos. Estudio de los patrones de expresión génica mediante hibridación in situ. Ensayos funcionales para determinar efectos de las mutaciones sobre el splicing y sobre la estructura y función de la proteína alterada. (Spanish)
0 references
Objectives: 1) Identification of new genes of autosomal recessive non-syndromal hearing loss. 2) Design, development and validation of a panel of genes for ultrasequencing (NGS) in patients with auditory neuropathy (including known genes and candidate genes). 3) Identification of new auditory neuropathy genes by application of the panel and by sequencing of complete exomas. 4) Description of the mutational spectra of the identified genes, and determination of the pathogenicity of the sequence variants found. 5) Creation of mutation databases, specific to locus and free access, for genes involved in isolated auditory neuropathy. 6) Investigation of genotype-phenotype correlations in series of patients with isolated auditory neuropathy and mutations in the same gene, with special attention to predicting cochlear implant results. 7) Investigation of the expression pattern of each new gene and the product it encodes, under normal and pathological conditions. Subjects of study: individuals with non-syndromal hearing loss of autosomal recessive inheritance and individuals with isolated auditory neuropathy of non-environmental cause. Methodology: Preliminary screening of genes with more frequent mutations using classical techniques. Ultrasequencing of gene panels of auditory neuropathy and non-syndromic hearing loss. Ultrasequencing of complete exomas (WES). Sequencing of complete mitochondrial DNA. Bioinformatics analysis. Study of gene expression patterns by hybridisation in situ. Functional tests to determine effects of mutations on splicing and on the structure and function of the altered protein. (English)
12 October 2021
0.0739765229872086
0 references
Objectifs: 1) Identification de nouveaux gènes de perte auditive récessive autosomique non syndromique. 2) Conception, développement et validation d’un panel de gènes pour l’ultraséquençage (NGS) chez les patients atteints de neuropathie auditive (y compris les gènes connus et les gènes candidats). 3) Identification de nouveaux gènes de neuropathie auditive par application du panel et séquençage des exomes complets. 4) Description des spectres mutationnels des gènes identifiés et détermination de la pathogénicité des variantes de séquence trouvées. 5) Création de bases de données sur les mutations, spécifiques au locus et libre accès, pour les gènes impliqués dans la neuropathie auditive isolée. 6) Étude des corrélations génotype-phénotype chez des séries de patients présentant une neuropathie auditive isolée et des mutations dans le même gène, avec une attention particulière pour prédire les résultats de l’implant cochléaire. 7) Étude du modèle d’expression de chaque nouveau gène et du produit qu’il code, dans des conditions normales et pathologiques. Sujets d’étude: les personnes atteintes d’une perte auditive non syndromique d’hérédité autosomique récessive et les personnes atteintes d’une neuropathie auditive isolée de cause non environnementale. Méthodologie: Dépistage préliminaire de gènes présentant des mutations plus fréquentes à l’aide de techniques classiques. Ultraséquençage de panneaux génétiques de neuropathie auditive et de perte auditive non syndromique. Ultraséquençage des exomes complets (WES). Séquençage de l’ADN mitochondrial complet. Analyse bioinformatique. Étude des modèles d’expression génique par hybridation in situ. Tests fonctionnels pour déterminer les effets des mutations sur l’épissage et sur la structure et la fonction de la protéine altérée. (French)
4 December 2021
0 references
Ziele: 1) Identifizierung neuer Gene von autosomal rezessiven nicht-syndromalem Hörverlust. 2) Entwurf, Entwicklung und Validierung einer Gruppe von Genen zur Ultrasequenzierung (NGS) bei Patienten mit auditiver Neuropathie (einschließlich bekannter Gene und Kandidatengene). 3) Identifizierung neuer auditiver Neuropathie-Gene durch Anwendung des Panels und Sequenzierung kompletter Exomas. 4) Beschreibung der Mutationsspektren der identifizierten Gene und Bestimmung der Pathogenität der gefundenen Sequenzvarianten. 5) Erstellung von Mutationsdatenbanken, spezifisch für Heuschrecken und freien Zugang, für Gene, die an isolierten auditiven Neuropathien beteiligt sind. 6) Untersuchung von Genotyp-Phänotyp-Korrelationen bei Patienten mit isolierter auditiver Neuropathie und Mutationen im selben Gen, wobei besonderes Augenmerk auf die Vorhersage von Cochlea-Implantatresultaten gelegt wird. 7) Untersuchung des Expressionsmusters jedes neuen Gens und des Produkts, das es kodiert, unter normalen und pathologischen Bedingungen. Studienfächer: Personen mit nicht-syndromalem Hörverlust des autosomalen rezessiven Erbes und Einzelpersonen mit isolierter auditiver Neuropathie der nicht-ökologischen Ursache. Methodik: Vorläufiges Screening von Genen mit häufigeren Mutationen mit klassischen Techniken. Ultrasequenzierung von Genpanels von auditiver Neuropathie und nicht-syndromem Hörverlust. Ultrasequenzierung kompletter Exomas (WES). Sequenzierung kompletter mitochondrialer DNA. Analyse der Bioinformatik. Untersuchung von Genexpressionsmustern durch Hybridisierung in situ. Funktionelle Tests zur Bestimmung der Auswirkungen von Mutationen auf das Spleißen und auf die Struktur und Funktion des veränderten Proteins. (German)
9 December 2021
0 references
Doelstellingen: 1) Identificatie van nieuwe genen van autosomaal recessief niet-syndromaal gehoorverlies. 2) Ontwerp, ontwikkeling en validatie van een panel van genen voor ultrasequencing (NGS) bij patiënten met auditieve neuropathie (inclusief bekende genen en kandidaatgenen). 3) Identificatie van nieuwe auditieve neuropathiegenen door toepassing van het paneel en door het rangschikken van volledige exoma’s. 4) Beschrijving van de mutatiespectra van de geïdentificeerde genen en bepaling van de pathogeniteit van de gevonden sequentievarianten. 5) Creatie van mutatiedatabases, specifiek voor locus en vrije toegang, voor genen die betrokken zijn bij geïsoleerde auditieve neuropathie. 6) Onderzoek van genotype-fenotype correlaties in reeks patiënten met geïsoleerde auditieve neuropathie en mutaties in hetzelfde gen, met speciale aandacht voor het voorspellen van cochleair implantaat resultaten. 7) Onderzoek van het expressiepatroon van elk nieuw gen en het product dat het codeert, onder normale en pathologische omstandigheden. Studieonderwerpen: individuen met niet-syndromaal gehoorverlies van autosomaal recessieve overerving en individuen met geïsoleerde auditieve neuropathie van niet-milieuoorzaak. Methodologie: Preliminaire screening van genen met frequentere mutaties met behulp van klassieke technieken. Ultrasequencing van genpanelen van auditieve neuropathie en niet-syndromisch gehoorverlies. Ultrasequencing van complete exomas (WES). Het rangschikken van volledig mitochondriaal DNA. Analyse van bio-informatica. Studie van genexpressiepatronen door hybridisatie in situ. Functionele tests om effecten van mutaties op het verbinden en op de structuur en functie van het veranderde eiwit te bepalen. (Dutch)
17 December 2021
0 references
Obiettivi: 1) Identificazione di nuovi geni di perdita dell'udito non sindromica autosomica recessiva. 2) Progettazione, sviluppo e convalida di un pannello di geni per ultrasequenziamento (NGS) in pazienti con neuropatia uditiva (compresi geni noti e geni candidati). 3) Identificazione di nuovi geni di neuropatia uditiva mediante applicazione del pannello e sequenziamento di esomi completi. 4) Descrizione degli spettri mutazionali dei geni identificati e determinazione della patogenicità delle varianti di sequenza trovate. 5) Creazione di database di mutazioni, specifici per locus e libero accesso, per i geni coinvolti in neuropatia uditiva isolata. 6) Indagine sulle correlazioni genotipo-fenotipo in serie di pazienti con neuropatia uditiva isolata e mutazioni nello stesso gene, con particolare attenzione alla previsione dei risultati dell'impianto cocleare. 7) Indagine del modello di espressione di ogni nuovo gene e del prodotto che codifica, in condizioni normali e patologiche. Argomenti di studio: individui con perdita dell'udito non sindromica di eredità autosomica recessiva e individui con neuropatia uditiva isolata di causa non ambientale. Metodologia: Screening preliminare dei geni con mutazioni più frequenti utilizzando tecniche classiche. Ultrasequenziamento di pannelli genici di neuropatia uditiva e perdita dell'udito non sindromica. Ultrasequenziamento di esomi completi (WES). Sequenziamento del DNA mitocondriale completo. Analisi bioinformatica. Studio dei modelli di espressione genica mediante ibridazione in situ. Test funzionali per determinare gli effetti delle mutazioni sulla splicing e sulla struttura e sulla funzione della proteina alterata. (Italian)
16 January 2022
0 references
Στόχοι: 1) Ταυτοποίηση των νέων γονιδίων της αυτοσωματικής υπολειμματικής απώλειας ακοής. 2) Σχεδιασμός, ανάπτυξη και επικύρωση μιας ομάδας γονιδίων για την υπερακουστική αλληλουχία (NGS) σε ασθενείς με ακουστική νευροπάθεια (συμπεριλαμβανομένων γνωστών γονιδίων και υποψήφιων γονιδίων). 3) Ταυτοποίηση νέων γονιδίων ακουστικής νευροπάθειας με την εφαρμογή του πίνακα και την αλληλουχία των πλήρων εξωμάτων. 4) Περιγραφή των μεταλλαξιογόνων φασμάτων των αναγνωρισμένων γονιδίων και προσδιορισμός της παθογένειας των παραλλαγών αλληλουχίας που βρέθηκαν. 5) Δημιουργία βάσεων δεδομένων μεταλλάξεων, ειδικά για τον τόπο και την ελεύθερη πρόσβαση, για γονίδια που εμπλέκονται σε απομονωμένη ακουστική νευροπάθεια. 6) Διερεύνηση συσχετισμών γονότυπου-φαινοτύπου σε σειρά ασθενών με απομονωμένη ακουστική νευροπάθεια και μεταλλάξεις στο ίδιο γονίδιο, με ιδιαίτερη προσοχή στην πρόβλεψη των αποτελεσμάτων κοχλιακού εμφυτεύματος. 7) Διερεύνηση του προτύπου έκφρασης κάθε νέου γονιδίου και του προϊόντος που κωδικοποιεί, υπό κανονικές και παθολογικές συνθήκες. Θέματα μελέτης: άτομα με μη-συνδρομική απώλεια ακοής αυτοσωματικής υποβαθμισμένης κληρονομιάς και άτομα με απομονωμένη ακουστική νευροπάθεια μη περιβαλλοντικής αιτίας. Μεθοδολογία: Προκαταρκτική διαλογή γονιδίων με συχνότερες μεταλλάξεις με κλασικές τεχνικές. Ultrasequencing των γονιδίων πάνελ της ακουστικής νευροπάθειας και μη-συνδρομική απώλεια ακοής. Ultrasequencing των πλήρων εξωμάτων (WES). Αλληλουχία πλήρους μιτοχονδριακού DNA. Βιοπληροφορική ανάλυση. Μελέτη των προτύπων γονιδιακής έκφρασης με υβριδισμό in situ. Λειτουργικές δοκιμές για τον προσδιορισμό των επιδράσεων των μεταλλάξεων στη σύνδεση και στη δομή και λειτουργία της τροποποιημένης πρωτεΐνης. (Greek)
18 August 2022
0 references
Målsætninger: 1) Identifikation af nye gener af autosomal recessiv ikke-syndromal høretab. 2) Design, udvikling og validering af et panel af gener til ultrasekventering (NGS) hos patienter med auditiv neuropati (herunder kendte gener og kandidatgener). 3) Identifikation af nye auditive neuropati gener ved anvendelse af panelet og ved sekventering af komplette exomer. 4) Beskrivelse af mutationsspektrene af de identificerede gener og bestemmelse af patogeniciteten af de fundne sekvensvarianter. 5) Oprettelse af mutationsdatabaser, der er specifikke for locus og fri adgang, for gener, der er involveret i isoleret auditiv neuropati. 6) Undersøgelse af genotype-phenotype korrelationer i serier af patienter med isoleret auditiv neuropati og mutationer i samme gen, med særlig vægt på at forudsige cochlear implantat resultater. 7) Undersøgelse af ekspressionsmønsteret for hvert nyt gen og det produkt, det koder, under normale og patologiske forhold. Studieemner: personer med ikke-syndromalt høretab af autosomal recessiv arv og individer med isoleret auditiv neuropati af ikke-miljømæssig årsag. Metode: Indledende screening af gener med hyppigere mutationer ved hjælp af klassiske teknikker. Ultrasekventering af genpaneler af auditiv neuropati og ikke-syndromisk høretab. Ultrasequencing af komplette exomer (WES). Sekventering af komplet mitokondrisk DNA. Bioinformatikanalyse. Undersøgelse af genekspressionsmønstre ved hybridisering in situ. Funktionelle test til bestemmelse af mutationers virkninger på splejsning og på det ændrede proteins struktur og funktion. (Danish)
18 August 2022
0 references
Tavoitteet: 1) Autosomaalisen resessiivisen ei-syndromaalisen kuulonaleneman uusien geenien tunnistaminen. 2) Suunnittelu, kehittäminen ja validointi geenipaneelin ultrasequencing (NGS) potilailla, joilla on kuulo neuropatia (mukaan lukien tunnetut geenit ja ehdokasgeenit). 3) uusien kuulon neuropatiageenien tunnistaminen paneelin ja täydellisen eksooman sekvensoinnin avulla. 4) Tunnistettujen geenien mutaatiospektrin kuvaus ja löydettyjen sekvenssimuunnelmien patogeenisuuden määrittäminen. 5) Mutaatiotietokantojen luominen, jotka ovat ominaisia lokukselle ja vapaalle pääsylle, eristetyssä kuulon neuropatiassa mukana oleville geeneille. 6) Tutkinta genotyypin fenotyypin korrelaatioista potilailla, joilla on erillinen kuulon neuropatia ja mutaatiot samassa geenissä, kiinnittäen erityistä huomiota sisäkorvaistutteen tulosten ennustamiseen. 7) Tutkinta kunkin uuden geenin ja sen koodaaman tuotteen ilmaisumallista normaaleissa ja patologisissa olosuhteissa. Tutkimusaiheet: henkilöt, joilla on ei-syndroaalinen kuulonmenetys autosomaalista resessiivistä perintöä, ja yksilöt, joilla on erillinen kuulon neuropatia ei-ympäristösyistä. Menetelmät: Geenien alustava seulonta, jossa esiintyy useammin mutaatioita klassisen tekniikan avulla. Kuulon neuropatian ja ei-syndromisen kuulon heikkenemisen geenipaneelien Ultrasequencing. Täydellinen eksoomien Ultrasequencing (WES). Täydellisen mitokondriaalisen DNA:n sekvensointi. Bioinformatiikan analyysi. Geenien ilmentymismallien tutkiminen hybridisaation avulla in situ. Funktionaaliset testit, joilla määritetään mutaatioiden vaikutukset liitokseen ja muutetun proteiinin rakenteeseen ja toimintaan. (Finnish)
18 August 2022
0 references
Għanijiet: 1) Identifikazzjoni ta ‘ġeni ġodda ta’ telf ta ‘smigħ mhux sindromi reċessiv awtosomali. 2) Id-disinn, l-iżvilupp u l-validazzjoni ta’ pannell ta’ ġeni għall-ultrasekwenzar (NGS) f’pazjenti b’newropatija awditorja (inklużi ġeni magħrufa u ġeni kandidati). 3) Identifikazzjoni ta ‘ġeni newropatija awditorji ġodda bl-applikazzjoni tal-bord u permezz ta’ sekwenzar ta ‘exomas komplet. 4) Deskrizzjoni tal-ispettri ta’ mutazzjoni tal-ġeni identifikati, u d-determinazzjoni tal-patoġeniċità tal-varjanti ta’ sekwenza misjuba. 5) Ħolqien ta ‘databases ta’ mutazzjoni, speċifiċi għal lokus u aċċess liberu, għall-ġeni involuti fil-newropatija awditorji iżolati. 6) Investigazzjoni ta ‘korrelazzjonijiet ta’ ġenotip- fenotip f’ serje ta ‘pazjenti b’ newropatija tas- smigħ iżolata u mutazzjonijiet fl- istess ġene, b’ attenzjoni speċjali għat- tbassir tar- riżultati ta’ l- impjant kokleari. 7) Investigazzjoni tal-mudell espressjoni ta ‘kull ġene ġdid u l-prodott li jikkodifika, taħt kondizzjonijiet normali u patoloġiċi. Suġġetti ta ' l- istudju: individwi b’telf ta ‘smigħ mhux sindromi ta’ wirt reċessiv awtosomali u individwi b’newropatija awditorja iżolata ta ‘kawża mhux ambjentali. Metodoloġija: Skrining preliminari ta’ ġeni b’mutazzjonijiet aktar frekwenti bl-użu ta’ tekniki klassiċi. Ultrasequencing ta ‘panils tal-ġeni ta’ newropatija awditorja u telf ta ‘smigħ mhux sindromi. Ultrasequencing ta’ eżoma sħiħa (WES). Sekwenzar ta’ DNA mitokondrijali komplet. Analiżi bijoinformatika. Studju ta ‘mudelli ta’ espressjoni tal-ġeni bl-ibridizzazzjoni in situ. Testijiet funzjonali biex jiġu ddeterminati l-effetti ta’ mutazzjonijiet fuq it-tferrix u fuq l-istruttura u l-funzjoni tal-proteina mibdula. (Maltese)
18 August 2022
0 references
Mērķi: 1) Jaunu autosomāli recesīvu nesindromālu dzirdes zudumu gēnu identificēšana. 2) ultrasekvencēšanas (NGS) gēnu paneļa projektēšana, izstrāde un validācija pacientiem ar dzirdes neiropātiju (tai skaitā zināmiem gēniem un kandidātgēniem). 3) Jaunu dzirdes neiropātijas gēnu identificēšana, izmantojot paneli un veicot pilnīgu eksomu sekvencēšanu. 4) identificēto gēnu mutācijas spektra apraksts un atrasto sekvences variantu patogenitātes noteikšana. 5) mutāciju datu bāzu izveide, kas raksturīga lokusam un brīvai piekļuvei, gēniem, kas saistīti ar izolētu dzirdes neiropātiju. 6) Genotipa-fenotipa korelāciju izpēte pacientu virknē pacientu ar izolētu dzirdes neiropātiju un mutācijām tajā pašā gēnā, īpašu uzmanību pievēršot kohleārā implanta rezultātu prognozēšanai. 7) katra jaunā gēna un tā kodētā produkta ekspresijas modeļa izpēte normālos un patoloģiskos apstākļos. Pētījuma priekšmeti: indivīdi ar nesindromālu dzirdes zudumu autosomāli recesīvā mantojumam un personām ar izolētu dzirdes neiropātiju, kas nav saistīta ar vidi. Metodika: Gēnu iepriekšēja skrīnings ar biežākām mutācijām, izmantojot klasiskās metodes. Dzirdes neiropātijas un nesindromiska dzirdes zuduma gēnu paneļu ultrasekvencība. Pilnīgas eksomas (WES) ultraskaņas sekvencēšana. Pilnīga mitohondriju DNS sekvencēšana. Bioinformātikas analīze. Gēnu ekspresijas modeļu izpēte, izmantojot hibridizāciju in situ. Funkcionālie testi, lai noteiktu mutāciju ietekmi uz splicēšanu un izmainītā proteīna struktūru un funkciju. (Latvian)
18 August 2022
0 references
Ciele: 1) Identifikácia nových génov autozomálnej recesívnej nesyndromálnej straty sluchu. 2) Návrh, vývoj a validácia panelu génov pre ultrasequencovanie (NGS) u pacientov s sluchovou neuropatiou (vrátane známych génov a kandidátskych génov). 3) Identifikácia nových zvukových neuropatií génov aplikáciou panelu a sekvenovaním úplných exómov. 4) Opis mutačného spektra identifikovaných génov a stanovenie patogenity nájdených variantov sekvencie. 5) Vytvorenie databáz mutácií, špecifických pre lokus a voľný prístup, pre gény zapojené do izolovanej sluchovej neuropatie. 6) Preskúmanie korelácií genotypu a fenotypu u sérií pacientov s izolovanou sluchovou neuropatiou a mutáciami v tom istom géne s osobitnou pozornosťou venovanou predpovedaniu výsledkov kochleárneho implantátu. 7) Preskúmanie expresnej štruktúry každého nového génu a produktu, ktorý kóduje, za normálnych a patologických podmienok. Študijné odbory: jedinci s nesyndromálnou stratou sluchu autozomálneho recesívneho dedičstva a jedinci s izolovanou sluchovou neuropatiou neenvironmentálnej príčiny. Metodika: Predbežný skríning génov s častejšími mutáciami pomocou klasických techník. Ultrasekvenovanie génových panelov sluchovej neuropatie a nesyndromickej straty sluchu. Ultrasekvenovanie kompletných exomas (WES). Sekvenovanie úplnej mitochondriálnej DNA. Analýza bioinformatiky. Štúdium vzorcov génovej expresie hybridizáciou in situ. Funkčné testy na určenie účinkov mutácií na spájanie a na štruktúru a funkciu zmeneného proteínu. (Slovak)
18 August 2022
0 references
Cuspóirí: 1) Aithint géinte nua de chaillteanas éisteachta neamh-shíobhrómach cúlaitheach autosomal. 2) Dearadh, forbairt agus bailíochtú painéal géinte le haghaidh ultrasequencing (NGS) in othair a bhfuil neuropathy mallachar cloisteála (lena n-áirítear géinte aitheanta agus géinte iarrthóra). 3) géinte neuropathy nua éisteachta a shainaithint trí chur i bhfeidhm an phainéil agus trí sheicheamhú exomas iomlána. 4) Cur síos ar speictream sócháin na ngéinte aitheanta, agus pataigineacht na n-athraitheacha seicheamh a aimsíodh a chinneadh. 5) Cruthú bunachair sonraí sócháin, ar leith a locus agus rochtain saor in aisce, do géinte a bhfuil baint acu le neuropathy mallachar cloisteála iargúlta. 6) Imscrúdú ar chomhghaolta géinitíopa-pheineitíopa i sraith othar le neuropathy mallachar cloisteála agus sócháin sa ghéin chéanna, le haird ar leith ar thorthaí ionchlannáin cochlear a thuar. 7) Imscrúdú ar phatrún léirithe gach géine nua agus an táirge a ionchódaíonn sé, faoi ghnáthchoinníollacha agus paiteolaíocha. Ábhair staidéir: daoine aonair a bhfuil caillteanas éisteachta neamh-shíndromach ar oidhreacht cúlaitheach autosomal agus daoine aonair a bhfuil neuropathy mallachar cloisteála scoite de chúis neamh-chomhshaoil. Modheolaíocht: Réamhscagadh ar ghéinte le sócháin níos minice ag baint úsáide as teicnící clasaiceacha. Ultrasequencing painéil géine de neuropathy mallachar cloisteála agus neamh-syndromic caillteanas éisteachta. Ultrasequencing exomas iomlán (WES). Seicheamhú DNA mitochondrialach iomlán. Anailís bithfhaisnéisíochta. Staidéar ar phatrúin léirithe géine trí hibridiú in situ. Tástálacha feidhmiúla chun éifeachtaí sóchán ar splicing agus ar struchtúr agus feidhm an phróitéin athraithe a chinneadh. (Irish)
18 August 2022
0 references
Cíle: 1) Identifikace nových genů autosomálně recesivní non-syndromální ztráty sluchu. 2) Návrh, vývoj a validace panelu genů pro ultrasekvencování (NGS) u pacientů se sluchovou neuropatií (včetně známých genů a kandidátských genů). 3) Identifikace nových genů sluchové neuropatie aplikací panelu a sekvenováním kompletních exomů. 4) Popis mutačního spektra identifikovaných genů a určení patogenity nalezených variant sekvence. 5) Vytvoření mutačních databází specifických pro lokus a volný přístup pro geny zapojené do izolované sluchové neuropatie. 6) Vyšetřování korelace genotypu a fenotypu u řady pacientů s izolovanou sluchovou neuropatií a mutacemi ve stejném genu se zvláštní pozorností věnovanou predikci výsledků kochleárního implantátu. 7) Vyšetřování expresního vzoru každého nového genu a produktu, který kóduje, za normálních a patologických podmínek. Studijní obory: jedinci s nesyndromální ztrátou sluchu autosomálně recesivní dědičnosti a jedinci s izolovanou sluchovou neuropatií neenvironmentální příčiny. Metodika: Předběžné vyšetření genů s častějšími mutacemi klasickými technikami. Ultrazvukové sekvenování genových panelů sluchové neuropatie a non-syndromické ztráty sluchu. Ultrazvukové sekvenování kompletních exomů (WES). Sekvenování kompletní mitochondriální DNA. Bioinformatická analýza. Studium vzorců genové exprese hybridizací in situ. Funkční testy k určení účinků mutací na sesazování a na strukturu a funkci změněného proteinu. (Czech)
18 August 2022
0 references
Objetivos: 1) Identificação de novos genes de perda auditiva não sindrômica autossômica recessiva. 2) Projeto, desenvolvimento e validação de um painel de genes para ultrassequencing (NGS) em pacientes com neuropatia auditiva (incluindo genes conhecidos e genes candidatos). 3) Identificação de novos genes de neuropatia auditiva por aplicação do painel e sequenciamento de exomas completos. 4) Descrição dos espetros mutacionais dos genes identificados e determinação da patogenicidade das variantes de sequência encontradas. 5) Criação de bases de dados de mutações, específicas para locus e acesso livre, para genes envolvidos em neuropatia auditiva isolada. 6) Investigação de correlações genótipo-fenótipos em séries de pacientes com neuropatia auditiva isolada e mutações no mesmo gene, com especial atenção para predizer os resultados do implante coclear. 7) Investigação do padrão de expressão de cada novo gene e do produto que ele codifica, em condições normais e patológicas. Temas do estudo: indivíduos com perda auditiva não sindrômica de herança autossômica recessiva e indivíduos com neuropatia auditiva isolada de causa não ambiental. Metodologia: Triagem preliminar de genes com mutações mais frequentes usando técnicas clássicas. Ultrassequenciamento de painéis gênicos de neuropatia auditiva e perda auditiva não sindrômica. Ultrasequencing de exomas completos (WES). Sequenciamento de DNA mitocondrial completo. Análise de bioinformática. Estudo de padrões de expressão gênica por hibridização in situ. Testes funcionais para determinar os efeitos das mutações na emenda e na estrutura e função da proteína alterada. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
Eesmärgid: 1) Autosomaalse retsessiivse mittesündromaalse kuulmislanguse uute geenide kindlakstegemine. 2) kuulmisneuropaatiaga patsientidel (sh teadaolevad geenid ja kandidaatgeenid) ultrasequencing’i (NGS) geenide rühma kavandamine, arendamine ja valideerimine. 3) Uute kuulmise neuropaatia geenide kindlakstegemine paneeli ja täieliku eksoomi järjestuse abil. 4) Tuntud geenide mutatsioonispektrite kirjeldus ja leitud järjestuse variantide patogeensuse määramine. 5) Mutatsiooniandmebaaside loomine, mis on spetsiifilised lookusele ja vabale juurdepääsule isoleeritud kuulmisneuropaatiaga seotud geenide jaoks. 6) Genotüübi-fenotüübi korrelatsioonide uurimine isoleeritud kuulmisneuropaatia ja sama geeni mutatsioonidega patsientide seeriates, pöörates erilist tähelepanu kohleaarse implantaadi tulemuste prognoosimisele. 7) Iga uue geeni ekspressioonimustri ja sellega kodeeritava toote uurimine normaalsetes ja patoloogilistes tingimustes. Õppeained: isikud, kellel ei ole sündroomi kuulmislangus autosoomne retsessiivne pärand ja üksikisikud isoleeritud kuulmis neuropaatia mittekeskkonnalik põhjus. Metoodika: Sagedamate mutatsioonidega geenide esialgne sõelumine klassikalise tehnika abil. Kuulmise neuropaatia geenipaneelide ultraheliuuring ja mittesündiline kuulmiskadu. Täielike eksoomide ultrahelitöötlus (WES). Täieliku mitokondriaalse DNA sekveneerimine. Bioinformaatika analüüs. Geeniekspressiooni mustrite uurimine hübridisatsiooni teel in situ. Funktsionaalsed testid mutatsioonide mõju määramiseks splicingile ning muutunud valgu struktuurile ja funktsioonile. (Estonian)
18 August 2022
0 references
Célkitűzések: 1) Az autoszomális recesszív nem szindrómális halláskárosodás új génjeinek azonosítása. 2) Tervezése, fejlesztése és validálása egy panel gének ultraszekvenálás (NGS) a betegeknél halló neuropathia (beleértve az ismert gének és a jelölt gének). 3) Új hallási neuropathia gének azonosítása a panel alkalmazásával és a teljes exomák szekvenálásával. 4) Az azonosított gének mutációs spektrumának leírása és a talált szekvencia variánsok patogenitásának meghatározása. 5) mutációs adatbázisok létrehozása, amelyek kifejezetten a locusra és a szabad hozzáférésre vonatkoznak, az izolált hallási neuropátiában részt vevő gének számára. 6) A genotípus-fenotípus korrelációinak vizsgálata izolált hallási neuropathiában és ugyanazon gén mutációiban szenvedő betegek sorában, különös figyelmet fordítva a cochlearis implantátumok eredményeinek előrejelzésére. 7) Minden új gén és az általa kódolt termék expressziós mintájának vizsgálata normál és kóros körülmények között. Vizsgálati alanyok: egyének nem szindrómális halláskárosodás autoszomális recesszív öröklés és egyének elszigetelt hallás neuropathia nem környezeti okok. Módszertan: Gyakoribb mutációjú gének előzetes szűrése klasszikus technikák alkalmazásával. A halló neuropathia és a nem szindrómikus halláskárosodás génpaneleinek ultraszekvenálása. A teljes exomák (WES) ultraszekvenálása. A teljes mitokondriális DNS szekvenálása. Bioinformatikai elemzés. Génexpressziós minták tanulmányozása in situ hibridizációval. Funkcionális vizsgálatok a mutációk splicingre és a módosított fehérje szerkezetére és működésére gyakorolt hatásainak meghatározására. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
Цели: 1) Идентифициране на нови гени на автозомна рецесивна несиндромна загуба на слуха. 2) Проектиране, разработване и валидиране на група от гени за ултрасеквениране (NGS) при пациенти със слухова невропатия (включително известни гени и кандидат гени). 3) Идентифициране на нови гени на слуховата невропатия чрез прилагане на панела и чрез секвениране на пълни екзоми. 4) Описание на мутационните спектри на идентифицираните гени и определяне на патогенността на откритите варианти на последователността. 5) Създаване на бази данни за мутации, специфични за локус и свободен достъп, за гени, участващи в изолирана слухова невропатия. 6) Изследване на корелациите на генотип-фенотип в поредица от пациенти с изолирана слухова невропатия и мутации в същия ген, със специално внимание към прогнозирането на резултатите от кохлеарните импланти. 7) Изследване на модела на експресия на всеки нов ген и на продукта, който кодира, при нормални и патологични условия. Учебни предмети: лица с несиндромна загуба на слуха от автозомно рецесивно наследство и лица с изолирана слухова невропатия на неекологична причина. Методология: Предварителен скрининг на гени с по-чести мутации с използване на класически техники. Ултрасеквениране на генни панели на слухова невропатия и несиндромна загуба на слуха. Ultrasequencing на цели екзоми (WES). Секвениране на пълна митохондриална ДНК. Биоинформатичен анализ. Изследване на моделите на генна експресия чрез хибридизация in situ. Функционални тестове за определяне на ефектите на мутациите върху снаждането и върху структурата и функцията на променения протеин. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
Tikslai: 1) Naujų genų nustatymas autosominiu recesyviniu ne sindrominiu klausos praradimu. 2) Ultrasequencing (NGS) genų grupės kūrimas, kūrimas ir patvirtinimas pacientams, sergantiems klausos neuropatija (įskaitant žinomus genus ir potencialius genus). 3) Naujų klausos neuropatijos genų identifikavimas taikant skydelį ir visiškai egzomų seką. 4) Nustatytų genų mutacijų spektrų aprašymas ir nustatytų sekos variantų patogeniškumo nustatymas. 5) genų, susijusių su izoliuota klausos neuropatija, mutacijų duomenų bazių kūrimas, specifinis lokusui ir laisvai prieigai. 6) genotipo-fenotipo koreliacijos tyrimas pacientams, kuriems yra izoliuota klausos neuropatija ir to paties geno mutacijos, ypatingą dėmesį skiriant kochlearinio implanto rezultatams prognozuoti. 7) Kiekvieno naujo geno ir jo užkoduoto produkto ekspresijos modelio tyrimas normaliomis ir patologinėmis sąlygomis. Tiriamieji asmenys: asmenys, turintys ne sindrominį klausos praradimą autosominiu recesyviniu paveldėjimu, ir asmenys, turintys izoliuotą klausos neuropatiją ne aplinkos priežastis. Metodika: Išankstinė genų atranka su dažnesnėmis mutacijomis naudojant klasikinius metodus. Klausos neuropatijos ir ne sindrominio klausos praradimo genų plokščių ultrasekcija. Ultrasequencing visų egzomų (WES). Visiškos mitochondrijų DNR sekos nustatymas. Bioinformatikos analizė. Genų ekspresijos modelių tyrimas hibridizacijos in situ būdu. Funkciniai tyrimai, skirti nustatyti mutacijų poveikį sandūroms ir pakitusio baltymo struktūrai bei funkcijai. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
Ciljevi: 1) Identifikacija novih gena autosomnog recesivnog nesindromskog gubitka sluha. 2) Dizajn, razvoj i validacija panela gena za ultrasekvenciranje (NGS) u bolesnika s slušnom neuropatijom (uključujući poznate gene i gene kandidata). 3) Identifikacija novih slušnih neuropatija gena primjenom ploče i sekvenciranjem potpunih egzoma. 4) Opis mutacijskog spektra identificiranih gena i određivanje patogenosti varijanti sekvence pronađenih. 5) Stvaranje mutacija baze podataka, specifične za lokus i slobodan pristup, za gene koji su uključeni u izolirane slušne neuropatije. 6) Istraživanje korelacija genotipa-fenotipa u nizu bolesnika s izoliranom slušnom neuropatijom i mutacijama u istom genu, s posebnim naglaskom na predviđanje rezultata kohlearnih implantata. 7) Istražite obrazac ekspresije svakog novog gena i proizvoda koji kodira, u normalnim i patološkim uvjetima. Teme studija: osobe s nesindromalnim gubitkom sluha autosomno recesivno nasljeđe i pojedinci s izoliranom slušnom neuropatijom ne-okolišnog uzroka. Metodologija: Preliminarni pregled gena s češćim mutacijama pomoću klasičnih tehnika. Ultrasekvenciranje genskih panela slušne neuropatije i nesindromskog gubitka sluha. Ultrasekvenciranje potpunih egzoma (WES). Sekvenciranje potpune mitohondrijske DNK. Bioinformatička analiza. Proučavanje uzoraka ekspresije gena putem hibridizacije in situ. Funkcionalni testovi za određivanje učinaka mutacija na spajanje te na strukturu i funkciju izmijenjenog proteina. (Croatian)
18 August 2022
0 references
Mål: 1) Identifiering av nya gener för autosomal recessiv icke-syndromal hörselnedsättning. 2) Design, utveckling och validering av en panel av gener för ultrasequencing (NGS) hos patienter med hörselneuropati (inklusive kända gener och kandidatgener). 3) Identifiering av nya hörselneuropatigener genom tillämpning av panelen och genom sekvensering av fullständiga exom. 4) Beskrivning av mutationsspektrumet hos de identifierade generna, och bestämning av patogeniteten hos de sekvensvarianter som finns. 5) Skapande av mutationsdatabaser, specifika för lokus och fri tillgång, för gener som är involverade i isolerad hörselneuropati. 6) Undersökning av korrelationer mellan genotyp och fenotyp i serier av patienter med isolerad hörselneuropati och mutationer i samma gen, med särskild uppmärksamhet på att förutsäga resultat av cochleaimplantat. 7) Undersökning av uttrycksmönstret för varje ny gen och den produkt den kodar, under normala och patologiska förhållanden. Studieämnen: personer med icke-syndromal hörselnedsättning av autosomalt recessivt arv och individer med isolerad hörselneuropati av icke-miljömässig orsak. Metod: Preliminär screening av gener med mer frekventa mutationer med hjälp av klassiska tekniker. Ultrasequencing av genpaneler av hörselneuropati och icke-syndromisk hörselnedsättning. Ultrasequencing av fullständig exomas (WES). Sekvensering av fullständigt mitokondriellt DNA. Bioinformatikanalys. Studie av genuttrycksmönster genom hybridisering in situ. Funktionella tester för att bestämma effekterna av mutationer på skarvning och på det förändrade proteinets struktur och funktion. (Swedish)
18 August 2022
0 references
Obiective: 1) Identificarea de noi gene de autozomal recesiv non-sindromale pierderea auzului. 2) Proiectarea, dezvoltarea și validarea unui panou de gene pentru ultrasecvenție (NGS) la pacienții cu neuropatie auditivă (inclusiv gene cunoscute și gene candidate). 3) Identificarea genelor noi de neuropatie auditivă prin aplicarea panoului și prin secvențierea exoamelor complete. 4) Descrierea spectrei mutației genelor identificate și determinarea patogenității variantelor secvențiale găsite. 5) Crearea bazelor de date de mutații, specifice locului și accesului liber, pentru genele implicate în neuropatia auditivă izolată. 6) Investigarea corelațiilor genotip-fenotip la o serie de pacienți cu neuropatie auditivă izolată și mutații în aceeași genă, acordând o atenție deosebită prezicerii rezultatelor implantului cohlear. 7) Investigarea modelului de expresie a fiecărei gene noi și a produsului pe care îl codifică, în condiții normale și patologice. Subiecte de studiu: persoanele cu pierderi auditive non-sindromale ale moștenirii autozomale recesive și persoanele cu neuropatie auditivă izolată de cauză non-mediu. Metodologie: Screening preliminar al genelor cu mutații mai frecvente folosind tehnici clasice. Ultrasecvențierea panourilor genetice de neuropatie auditivă și pierderea auzului non-sindromice. Ultrasecvențierea exoamelor complete (WES). Secvențierea ADN-ului mitocondrial complet. Analiza bioinformatică. Studiul modelelor de expresie genetică prin hibridizare in situ. Teste funcționale pentru a determina efectele mutațiilor asupra îmbinării și asupra structurii și funcției proteinei modificate. (Romanian)
18 August 2022
0 references
Cilji: 1) Identifikacija novih genov avtosomne recesivne nesindromalne izgube sluha. 2) Oblikovanje, razvoj in validacija skupine genov za ultrasekvenciranje (NGS) pri bolnikih z zvočno nevropatijo (vključno z znanimi geni in kandidatnimi geni). 3) Identifikacija novih genov slušne nevropatije z uporabo plošče in zaporedjem popolnih eksomov. 4) Opis mutacijskih spektrov identificiranih genov in določitev patogenosti ugotovljenih zaporednih variant. 5) Ustvarjanje podatkovnih baz mutacij, značilnih za lokus in prost dostop, za gene, vključene v izolirano slušno nevropatijo. 6) Preiskave korelacij genotipa-fenotipov pri seriji bolnikov z izolirano slušno nevropatijo in mutacijami v istem genu, s posebnim poudarkom na napovedovanju rezultatov vsadka kohlearnih vsadkov. 7) Preiskava ekspresijskega vzorca vsakega novega gena in izdelka, ki ga kodira, v normalnih in patoloških pogojih. Študijski predmeti: posamezniki z ne-sindromalno izgubo sluha avtosomne recesivne dediščine in posamezniki z izolirano slušno nevropatijo ne-okoljskega vzroka. Metodologija: Predhodno presejanje genov s pogostejšimi mutacijami z uporabo klasičnih tehnik. Ultrasekvenciranje genskih plošč slušne nevropatije in nesindromske izgube sluha. Ultrasekvenciranje popolnih eksomov (WES). Zaporedje popolne mitohondrijske DNK. Bioinformatična analiza. Preučevanje vzorcev izražanja genov s hibridizacijo in situ. Funkcionalni preskusi za ugotavljanje učinkov mutacij na spajanje ter na strukturo in delovanje spremenjene beljakovine. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
Cele: 1) Identyfikacja nowych genów autosomalnego recesywnego niesyndromowego ubytku słuchu. 2) Zaprojektowanie, opracowanie i walidacja panelu genów do ultrasekwencjonowania (NGS) u pacjentów z neuropatią słuchową (w tym znane geny i geny kandydujące). 3) Identyfikacja nowych genów neuropatii słuchowej poprzez zastosowanie panelu i sekwencjonowanie kompletnych wysięków. 4) Opis widm mutacyjnych zidentyfikowanych genów i określenie patogeniczności znalezionych wariantów sekwencji. 5) Tworzenie baz danych mutacji, specyficznych dla miejsca i swobodnego dostępu, dla genów zaangażowanych w izolowaną neuropatię słuchową. 6) Badanie korelacji genotypu-fenotypu u pacjentów z izolowaną neuropatią słuchową i mutacjami w tym samym genie, ze szczególnym uwzględnieniem przewidywania wyników implantów ślimakowych. 7) Badanie wzoru ekspresji każdego nowego genu i produktu, który koduje, w normalnych i patologicznych warunkach. Uczestnicy studiów: osoby z niesyndromowym ubytkiem słuchu z autosomalnym dziedziczeniem recesywnym oraz osoby z izolowaną neuropatią słuchową przyczyny nieśrodowiskowej. Metodyka: Wstępne badanie genów z częstszymi mutacjami przy użyciu klasycznych technik. Ultrasekwencjonowanie paneli genowych neuropatii słuchowej i niesyndromowej utraty słuchu. Ultrasekwencjonowanie kompletnych egzomatów (WES). Sekwencjonowanie pełnego mitochondrialnego DNA. Analiza bioinformatyczna. Badanie wzorców ekspresji genów poprzez hybrydyzację in situ. Testy funkcjonalne w celu określenia wpływu mutacji na łączenie oraz na strukturę i funkcję zmienionego białka. (Polish)
18 August 2022
0 references
Madrid
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI14_01162
0 references