ANALYSIS OF NITRATED LIPID SIGNALING MECHANISMS DURING DEVELOPMENT AND ABIOTICO STRESS IN PLANTS (Q3170758)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3170758 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | ANALYSIS OF NITRATED LIPID SIGNALING MECHANISMS DURING DEVELOPMENT AND ABIOTICO STRESS IN PLANTS |
Project Q3170758 in Spain |
Statements
186,279.69 Euro
0 references
231,231.0 Euro
0 references
80.56 percent
0 references
1 January 2016
0 references
31 December 2018
0 references
UNIVERSIDAD DE JAEN
0 references
LOS ESTUDIOS SOBRE EL OXIDO NITRICO (NO) EN PLANTAS A NIVEL MOLECULAR SE HAN CENTRADO FUNDAMENTALMENTE EN LA IDENTIFICACION Y CARACTERIZACION DE MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES (PTMS) DE PROTEINAS MEDIADAS POR NO, TALES COMO LA NITRACION Y LA S-NITROSILACION Y EL EFECTO QUE EJERCEN SOBRE LA ACTIVIDAD BIOLOGICA. ESTUDIOS RECIENTES EN CELULAS ANIMALES HAN DEMOSTRADO QUE EL NO PUEDE AFECTAR TAMBIEN A LOS LIPIDOS GENERANDO MOLECULAS DENOMINADAS LIPIDOS NITRADOS. ESTOS DERIVADOS LIPIDICOS NITRADOS PUEDEN EJERCER PTMS SOBRE DIANAS PROTEICAS DENOMINADAS NITROALQUILACION QUE MEDIAN EFECTOS FISIOLOGICOS Y SEÑALIZADORES MAS POTENTES QUE LOS DEL PROPIO NO. SIN EMBARGO, EXCEPTUANDO TRABAJOS RECIENTES DE NUESTRO GRUPO DERIVADOS DEL PROYECTO ANTERIOR, NO EXISTE INFORMACION ACERCA DE LA PRESENCIA Y LA FUNCION DE LOS LIPIDOS NITRADOS EN ORGANISMOS VEGETALES. DE HECHO, ESTOS RESULTADOS HAN PUESTO DE MANIFIESTO LA PRESENCIA ENDOGENA DE ACIDO NITRO-LINOLENICO (NO2-LN) EN ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA Y PISUM SATIVUM ASI COMO SU MODULACION A LO LARGO DEL DESARROLLO Y EN RESPUESTA A DIFERENTES SITUACIONES DE ESTRES ABIOTICO. ADEMAS, SE HA EVIDENCIADO QUE EL NO2-LN PARTICIPA ACTIVAMENTE EN EL METABOLISMO DEL NO MEDIANTE LA LIBERACION DE NO Y LA FORMACION IN VIVO DE S-NITROSOTIOLES (SNOS) PROTEICOS, IMPLICADOS EN PRACTICAMENTE TODOS LOS PROCESOS BIOLOGICOS QUE SOPORTAN LA ACTIVIDAD CELULAR, ADEMAS, LOS ESTUDIOS DE TRANSCRIPTOMICA FUNCIONAL MEDIANTE RNA-SEQ ESTABLECIERON EL PAPEL SEÑALIZADOR DE ESTAS MOLECULAS, EVIDENCIANDO QUE EL NO2-LN ESTA IMPLICADO FUNDAMENTALMENTE EN LA RESPUESTA DE DEFENSA FRENTE A DIFERENTES SITUACIONES DE ESTRES OXIDATIVO Y ESTRES ABIOTICO, A TRAVES DE LA MODULACION DE LOS NIVELES TRANSCRIPCIONALES DE PROTEINAS DE CHOQUE TERMICO (HSPS). TENIENDO EN CUENTA ESTOS ANTECEDENTES, LA PRESENTE PROPUESTA SE CENTRARA EN EL ESTUDIO DE LOS MECANISMOS DE SEÑALIZACION MEDIADOS POR LIPIDOS NITRADOS, CARACTERIZANDO LOS MECANISMOS POST-TRADUCCIONALES DE MODIFICACION DE PROTEINAS POR NITROALQUILACION, ASI COMO LAS INTERACCIONES DE LOS ACIDOS GRASOS NITRADOS CON LAS VIAS DE SEÑALIZACION TANTO EN CONDICIONES FISIOLOGICOS COMO DE ESTRES MEDIOAMBIENTAL. PARA ELLO, SE PROCEDERA A LA DETECCION E IDENTIFICACION IN VIVO DE DIANAS CELULARES DE NITROALQUILACION MEDIADAS POR LIPIDOS NITRADOS DURANTE EL DESARROLLO Y EN SITUACIONES DE ESTRES ABIOTICO EN ARABIDOPSIS THALIANA. PARALELAMENTE, SE ANALIZARAN LOS MECANISMOS DE SEÑALIZACION POR ACIDO NO2LN IMPLICADOS EN LA INDUCCION DE SNOS Y HSPS, ASI COMO LOS MECANISMOS DE CONTROL QUE MODULAN LOS NIVELES DE LIPIDOS NITRADOS. LOS DIFERENTES DISEÑOS EXPERIMENTALES QUE SUSTENTAN LOS OBJETIVOS PROPUESTOS SE REALIZARAN UTILIZANDO UNA COMBINACION MULTIDISCIPLINAR DE TECNICAS DE ESPECTROSCOPIA DE RESONANCIA MAGNETICA NUCLEAR (RMN), ESPECTROMETRIA DE MASAS DE TRIPLE CUADRUPOLO (HPLC-MS/MS), DE PROTEOMICA MEDIANTE MARCAJE ISOBARICO TMT Y ANALISIS POR ESPECTROMETRIA DE MASAS EN TANDEM (LC-MS/MS), MOLECULARES MEDIANTE INMUNOPRECIPITACION DE CROMATINA (CHIP) Y DE GENETICA MOLECULAR MEDIANTE LA UTILIZACION DE TRANSFORMANTES DE ARABIDOPSIS. TODOS ESTOS MECANISMOS SON DESCONOCIDOS EN PLANTAS, Y LOS RESULTADOS OBTENIDOS PODRIAN TENER RELEVANCIA BIOTECNOLOGICA Y AGRONOMICA COMO HERRAMIENTAS BIOTECNOLOGICAS DEL NO. DE HECHO, LA PROPUESTA ESTA EN CONCORDANCIA CON EL RETO NUMERO DOS DENTRO DEL PROGRAMA ¿HORIZONTE 2020¿ SIENDO APOYADA POR DIFERENTES ENTIDADES Y EMPRESAS. (Spanish)
0 references
STUDIES ON NITRIC OXIDE (NO) IN PLANTS AT MOLECULAR LEVEL HAVE MAINLY FOCUSED ON THE IDENTIFICATION AND CHARACTERISATION OF POST-TRANSLATIONAL MODIFICATIONS (PTMS) OF NON-MEDIATED PROTEINS, SUCH AS NITRATION AND S-NITROSILATION AND THEIR EFFECT ON BIOLOGICAL ACTIVITY. RECENT STUDIES IN ANIMAL CELLS HAVE SHOWN THAT IT CANNOT ALSO AFFECT LIPIDS BY GENERATING MOLECULES CALLED NITRATED LIPIDS. THESE NITRATED LIPIDIC DERIVATIVES CAN EXERT PTMS ON PROTEIN TARGETS CALLED NITROALQUILACION THAT MEDIATE PHYSIOLOGICAL AND SIGNALLING EFFECTS MORE POWERFUL THAN THOSE OF THE NO. HOWEVER, EXCEPT FOR RECENT WORK OF OUR GROUP DERIVED FROM THE PREVIOUS PROJECT, THERE IS NO INFORMATION ABOUT THE PRESENCE AND FUNCTION OF NITRATED LIPIDS IN VEGETABLE ORGANISMS. IN FACT, THESE RESULTS HAVE SHOWN THE ENDOGENOUS PRESENCE OF NITROLINOLENIC ACID (NO2-LN) IN ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA AND PISUM SATIVUM AS WELL AS ITS MODULATION THROUGHOUT DEVELOPMENT AND IN RESPONSE TO DIFFERENT SITUATIONS OF ABIOTICO STRESS. IN ADDITION, IT HAS BEEN SHOWN THAT NO2-LN PARTICIPATES ACTIVELY IN THE METABOLISM OF THE NO THROUGH THE RELEASE OF NO AND THE IN VIVO FORMATION OF PROTEIN S-NITROSOTIOLES (SNOSES) INVOLVED IN PRACTICALLY ALL THE BIOLOGICAL PROCESSES THAT SUPPORT CELLULAR ACTIVITY, IN ADDITION, THE STUDIES OF FUNCTIONAL TRANSCRIPTOMICA USING RNA-SEQ ESTABLISHED THE SIGNALING ROLE OF THESE MOLECULES, SHOWING THAT NO2-LN IS MAINLY INVOLVED IN THE DEFENSE RESPONSE AGAINST DIFFERENT SITUATIONS OF OXIDATIVE STRESS AND ABIOTICO STRESS, THROUGH THE MODULATION OF TRANSCRITIONAL LEVELS OF PROTEINS (SPSPS). TAKING INTO ACCOUNT THIS BACKGROUND, THIS PROPOSAL WILL FOCUS ON THE STUDY OF THE MECHANISMS OF SIGNALING MEDIATED BY NITRATED LIPIDS, CHARACTERISING THE POST-TRANSLATIONAL MECHANISMS OF MODIFICATION OF PROTEINS BY NITROALQUILACION, AS WELL AS THE INTERACTIONS OF NITRATED FATTY ACIDS WITH SIGNAGE PATHWAYS UNDER BOTH PHYSIOLOGICAL AND ENVIRONMENTAL STRESS CONDITIONS. FOR THIS PURPOSE, THE DETECTION AND IDENTIFICATION IN VIVO OF NITROALQUILACION CELL TARGETS MEDIATED BY NITRATED LIPIDS DURING DEVELOPMENT AND IN SITUATIONS OF ABIOTICO STRESS IN ARABIDOPSIS THALIANA. IN PARALLEL, THE NO2LN ACID SIGNALING MECHANISMS INVOLVED IN THE INDUCTION OF SNOS AND HSPS WILL BE ANALYSED, AS WELL AS THE CONTROL MECHANISMS THAT MODULATE NITRATED LIPID LEVELS. THE DIFFERENT EXPERIMENTAL DESIGNS THAT UNDERPIN THE PROPOSED OBJECTIVES WILL BE MADE USING A MULTIDISCIPLINARY COMBINATION OF NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY (RMN) TECHNIQUES, TRIPLE QUADRUPLE MASS SPECTROMETRY (HPLC-MS/MS), PROTEOMICS USING ISOBARIC TMT MARKING AND MASS SPECTROMETRY ANALYSIS IN TANDEM (LC-MS/MS), MOLECULAR USING CHROMATIN (CHIP) AND MOLECULAR GENETICA TRANSFORMERS USING ARABIDOPSIS TRANSFORMERS. ALL THESE MECHANISMS ARE UNKNOWN IN PLANTS, AND THE RESULTS OBTAINED COULD HAVE BIOTECHNOLOGICAL AND AGRONOMIC RELEVANCE AS BIOTECHNOLOGICAL TOOLS OF THE NO. IN FACT, THE PROPOSAL IS IN ACCORDANCE WITH CHALLENGE NUMBER TWO WITHIN THE PROGRAM HORIZON 2020 BEING SUPPORTED BY DIFFERENT ENTITIES AND COMPANIES. (English)
12 October 2021
0.466379780954655
0 references
LES ÉTUDES SUR L’OXYDE NITRIQUE (NON) CHEZ LES PLANTES AU NIVEAU MOLÉCULAIRE ONT PRINCIPALEMENT PORTÉ SUR L’IDENTIFICATION ET LA CARACTÉRISATION DES MODIFICATIONS POST-TRANSLATIONNELLES (TMP) DES PROTÉINES NON MÉDIÉES, TELLES QUE LA NITRATION ET LA S-NITROSILATION ET LEUR EFFET SUR L’ACTIVITÉ BIOLOGIQUE. DES ÉTUDES RÉCENTES SUR DES CELLULES ANIMALES ONT MONTRÉ QU’ELLE NE PEUT PAS AUSSI AFFECTER LES LIPIDES EN GÉNÉRANT DES MOLÉCULES APPELÉES LIPIDES NITRÉS. CES DÉRIVÉS LIPIDIQUES NITRÉS PEUVENT EXERCER DES PTM SUR DES CIBLES PROTÉIQUES APPELÉES NITROALQUILACION QUI MÉDIENT LES EFFETS PHYSIOLOGIQUES ET DE SIGNALISATION PLUS PUISSANTS QUE CEUX DU NO. CEPENDANT, À L’EXCEPTION DES TRAVAUX RÉCENTS DE NOTRE GROUPE ISSUS DU PROJET PRÉCÉDENT, IL N’EXISTE AUCUNE INFORMATION SUR LA PRÉSENCE ET LA FONCTION DES LIPIDES NITRÉS DANS LES ORGANISMES VÉGÉTAUX. EN FAIT, CES RÉSULTATS ONT MONTRÉ LA PRÉSENCE ENDOGÈNE DE L’ACIDE NITROLINOLENIC (NO2-LN) DANS ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA ET PISUM SATIVUM AINSI QUE SA MODULATION TOUT AU LONG DU DÉVELOPPEMENT ET EN RÉPONSE À DIFFÉRENTES SITUATIONS DE STRESS ABIOTICO. EN OUTRE, IL A ÉTÉ DÉMONTRÉ QUE LE NO2-LN PARTICIPE ACTIVEMENT AU MÉTABOLISME DU NO PAR LA LIBÉRATION DE NO ET LA FORMATION IN VIVO DE LA PROTÉINE S-NITROSOTIOLES (SNOSES) IMPLIQUÉE DANS PRATIQUEMENT TOUS LES PROCESSUS BIOLOGIQUES QUI SOUTIENNENT L’ACTIVITÉ CELLULAIRE, EN OUTRE, LES ÉTUDES DE TRANSCRIPTOMIQUE FONCTIONNEL UTILISANT RNA-SEQ ONT ÉTABLI LE RÔLE DE SIGNALISATION DE CES MOLÉCULES, MONTRANT QUE LE NO2-LN EST PRINCIPALEMENT IMPLIQUÉ DANS LA RÉPONSE DE DÉFENSE CONTRE DIFFÉRENTES SITUATIONS DE STRESS OXYDATIF ET DE STRESS ABIOTICO, PAR LA MODULATION DES NIVEAUX TRANSCRITIONNELS DES PROTÉINES (SPSP). COMPTE TENU DE CE CONTEXTE, LA PRÉSENTE PROPOSITION SE CONCENTRERA SUR L’ÉTUDE DES MÉCANISMES DE SIGNALISATION MÉDIÉS PAR LES LIPIDES NITRÉS, CARACTÉRISANT LES MÉCANISMES POST-TRANSLATIONNELS DE MODIFICATION DES PROTÉINES PAR NITROALQUILACION, AINSI QUE LES INTERACTIONS DES ACIDES GRAS NITRÉS AVEC LES VOIES DE SIGNALISATION DANS DES CONDITIONS DE STRESS PHYSIOLOGIQUE ET ENVIRONNEMENTAL. À CETTE FIN, LA DÉTECTION ET L’IDENTIFICATION IN VIVO DES CELLULES NITROALQUILACION CIBLES MÉDIÉES PAR DES LIPIDES NITRÉS PENDANT LE DÉVELOPPEMENT ET DANS LES SITUATIONS DE STRESS ABIOTICO CHEZ ARABIDOPSIS THALIANA. EN PARALLÈLE, LES MÉCANISMES DE SIGNALISATION ACIDE NO2LN IMPLIQUÉS DANS L’INDUCTION D’ORS ET DE HSPS SERONT ANALYSÉS, AINSI QUE LES MÉCANISMES DE CONTRÔLE QUI MODULENT LES NIVEAUX DE LIPIDES NITRÉS. LES DIFFÉRENTES CONCEPTIONS EXPÉRIMENTALES QUI SOUS-TENDENT LES OBJECTIFS PROPOSÉS SERONT RÉALISÉES À L’AIDE D’UNE COMBINAISON MULTIDISCIPLINAIRE DE TECHNIQUES DE SPECTROSCOPIE PAR RÉSONANCE MAGNÉTIQUE NUCLÉAIRE (RMN), DE SPECTROMÉTRIE DE MASSE TRIPLE QUADRUPLE (HPLC-MS/MS), DE PROTÉOMIQUE UTILISANT LE MARQUAGE TMT ISOBARIQUE ET D’ANALYSE PAR SPECTROMÉTRIE DE MASSE EN TANDEM (LC-MS/MS), MOLÉCULAIRE À L’AIDE DE TRANSFORMATEURS DE CHROMATINE (PUCE) ET MOLÉCULAIRE DE GENETICA UTILISANT DES TRANSFORMATEURS ARABIDOPSIS. TOUS CES MÉCANISMES SONT INCONNUS CHEZ LES PLANTES, ET LES RÉSULTATS OBTENUS POURRAIENT AVOIR UNE PERTINENCE BIOTECHNOLOGIQUE ET AGRONOMIQUE EN TANT QU’OUTILS BIOTECHNOLOGIQUES DU NO, EN FAIT, LA PROPOSITION EST CONFORME AU DEUXIÈME DÉFI DU PROGRAMME HORIZON 2020 SOUTENU PAR DIFFÉRENTES ENTITÉS ET ENTREPRISES. (French)
4 December 2021
0 references
UNTERSUCHUNGEN ZU STICKSTOFFMONOXID (Nr.) IN PFLANZEN AUF MOLEKULARER EBENE KONZENTRIERTEN SICH HAUPTSÄCHLICH AUF DIE IDENTIFIZIERUNG UND CHARAKTERISIERUNG VON POSTTRANSLATIONALEN MODIFIKATIONEN (PTMS) VON NICHT-MEDIIERTEN PROTEINEN WIE NITRIERUNG UND S-NITROSILATION UND DEREN AUSWIRKUNGEN AUF DIE BIOLOGISCHE AKTIVITÄT. JÜNGSTE STUDIEN AN TIERZELLEN HABEN GEZEIGT, DASS ES NICHT AUCH LIPIDE BEEINFLUSSEN KANN, INDEM SIE MOLEKÜLE NAMENS NITRATFETTE ERZEUGEN. DIESE NITRATHALTIGEN LIPIDDERIVATE KÖNNEN PTMS AUF PROTEINZIELE, DIE NITROALQUILACION GENANNT WERDEN, AUSÜBEN, DIE PHYSIOLOGISCHE UND SIGNALWIRKUNGEN STÄRKER VERMITTELN ALS DIE DER NO., MIT AUSNAHME DER JÜNGSTEN ARBEITEN UNSERER GRUPPE, DIE AUS DEM VORHERIGEN PROJEKT ABGELEITET WURDEN, GIBT ES KEINE INFORMATIONEN ÜBER DAS VORHANDENSEIN UND DIE FUNKTION VON NITRATFETTEN IN PFLANZLICHEN ORGANISMEN. TATSÄCHLICH HABEN DIESE ERGEBNISSE DAS ENDOGENE VORHANDENSEIN VON NITROLINOLENIC SÄURE (NO2-LN) IN ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA UND PISUM SATIVUM SOWIE SEINE MODULATION WÄHREND DER GESAMTEN ENTWICKLUNG UND ALS REAKTION AUF VERSCHIEDENE SITUATIONEN VON ABIOTICO STRESS GEZEIGT. DARÜBER HINAUS HAT SICH GEZEIGT, DASS NO2-LN AKTIV AM METABOLISMUS DES NO DURCH DIE FREISETZUNG VON NEIN UND DIE IN VIVO BILDUNG VON PROTEIN S-NITROSOTIOLES (SNOSES) BETEILIGT IST, DIE AN PRAKTISCH ALLEN BIOLOGISCHEN PROZESSEN BETEILIGT SIND, DIE ZELLULÄRE AKTIVITÄT UNTERSTÜTZEN. DARÜBER HINAUS ETABLIERTEN DIE STUDIEN DER FUNKTION TRANSCRIPTOMICA UNTER VERWENDUNG VON RNA-SEQ DIE SIGNALROLLE DIESER MOLEKÜLE, WAS ZEIGT, DASS NO2-LN HAUPTSÄCHLICH AN DER ABWEHRREAKTION GEGEN VERSCHIEDENE SITUATIONEN VON OXIDATIVEM STRESS UND ABIOTICO-STRESS DURCH DIE MODULATION VON TRANSCRITIONAL-WERTEN VON PROTEINEN (SPSPS) BETEILIGT IST. UNTER BERÜCKSICHTIGUNG DIESES HINTERGRUNDS WIRD SICH DIESER VORSCHLAG AUF DIE UNTERSUCHUNG DER MECHANISMEN DER SIGNALISIERUNG DURCH NITRATFETTE KONZENTRIEREN, DIE DIE POSTTRANSLATIONALEN MECHANISMEN DER MODIFIKATION VON PROTEINEN DURCH NITROALQUILACION CHARAKTERISIEREN, SOWIE DIE WECHSELWIRKUNGEN VON NITRATFETTSÄUREN MIT SIGNAGEWEGEN SOWOHL UNTER PHYSIOLOGISCHEN ALS AUCH UNTER UMWELTBELASTUNGSBEDINGUNGEN. ZU DIESEM ZWECK ZIELT DER NACHWEIS UND DIE IDENTIFIZIERUNG IN VIVO VON NITROALQUILACION-ZELLZELLEN AB, DIE DURCH NITRATFETTE WÄHREND DER ENTWICKLUNG UND IN SITUATIONEN VON ABIOTICO STRESS IN ARABIDOPSIS THALIANA VERMITTELT WERDEN. PARALLEL DAZU WERDEN DIE AN DER INDUKTION VON SNOS UND HSPS BETEILIGTEN NO2LN-SÄURE-SIGNALMECHANISMEN SOWIE DIE KONTROLLMECHANISMEN ANALYSIERT, DIE NITRATFETTGEHALTE MODULIEREN. DIE VERSCHIEDENEN EXPERIMENTELLEN ENTWÜRFE, DIE DEN VORGESCHLAGENEN ZIELEN ZUGRUNDE LIEGEN, WERDEN UNTER VERWENDUNG EINER MULTIDISZIPLINÄREN KOMBINATION AUS KERNMAGNETRESONANZSPEKTROSKOPIE (RMN)-TECHNIKEN, DREIFACHER VIERFACHER MASSENSPEKTROMETRIE (HPLC-MS/MS), PROTEOMIK MIT ISOBARISCHEN TMT-MARKIERUNG UND MASSENSPEKTROMETRIEANALYSE IN TANDEM (LC-MS/MS), MOLEKULAREM CHROMATIN (CHIP) UND MOLEKULAREN GENETICA-TRANSFORMATOREN MIT ARABIDOPSIS-TRANSFORMATOREN ERSTELLT. ALLE DIESE MECHANISMEN SIND IN PFLANZEN UNBEKANNT, UND DIE ERZIELTEN ERGEBNISSE KÖNNTEN BIOTECHNOLOGISCHE UND AGRONOMISCHE RELEVANZ ALS BIOTECHNOLOGISCHE INSTRUMENTE DER Nr. IN DER TAT HABEN, DER VORSCHLAG ENTSPRICHT DER HERAUSFORDERUNG NUMMER ZWEI INNERHALB DES PROGRAMMS HORIZONT 2020, DAS VON VERSCHIEDENEN EINRICHTUNGEN UND UNTERNEHMEN UNTERSTÜTZT WIRD. (German)
9 December 2021
0 references
STUDIES NAAR STIKSTOFMONOXIDE (NO) IN PLANTEN OP MOLECULAIR NIVEAU HEBBEN ZICH VOORNAMELIJK GERICHT OP DE IDENTIFICATIE EN KARAKTERISERING VAN POST-TRANSLATIONELE MODIFICATIES (PTM’S) VAN NIET-GEMEDIEERDE EIWITTEN, ZOALS NITRATIE EN S-NITROSILATION EN HUN EFFECT OP DE BIOLOGISCHE ACTIVITEIT. RECENTE STUDIES IN DIERLIJKE CELLEN HEBBEN AANGETOOND DAT HET NIET OOK LIPIDEN KAN BEÏNVLOEDEN DOOR HET GENEREREN VAN MOLECULEN GENOEMD NITRAATLIPIDEN. DEZE NITRAATLIPIDE DERIVATEN KUNNEN PTM’S UITOEFENEN OP EIWITDOELEN GENAAMD NITROALQUILACION DIE FYSIOLOGISCHE EN SIGNALERENDE EFFECTEN KRACHTIGER BEMIDDELEN DAN DIE VAN DE NO. ECHTER, MET UITZONDERING VAN RECENT WERK VAN ONZE GROEP AFGELEID VAN HET VORIGE PROJECT, IS ER GEEN INFORMATIE OVER DE AANWEZIGHEID EN FUNCTIE VAN NITRAATLIPIDEN IN PLANTAARDIGE ORGANISMEN. IN FEITE HEBBEN DEZE RESULTATEN DE ENDOGENE AANWEZIGHEID VAN NITROLINOLENIC ZUUR (NO2-LN) IN ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA EN PISUM SATIVUM AANGETOOND, EVENALS ZIJN MODULATIE GEDURENDE DE ONTWIKKELING EN IN REACTIE OP VERSCHILLENDE SITUATIES VAN ABIOTICO STRESS. BOVENDIEN IS AANGETOOND DAT NO2-LN ACTIEF DEELNEEMT AAN HET METABOLISME VAN HET NO DOOR DE AFGIFTE VAN NO EN DE IN VIVO VORMING VAN EIWIT S-NITROSOTIOLES (SNOSES) BETROKKEN BIJ VRIJWEL ALLE BIOLOGISCHE PROCESSEN DIE CELLULAIRE ACTIVITEIT ONDERSTEUNEN, DAARNAAST HEBBEN DE STUDIES VAN FUNCTIONELE TRANSCRIPTOMICA MET BEHULP VAN RNA-SEQ DE SIGNALERENDE ROL VAN DEZE MOLECULEN VASTGESTELD, WAARUIT BLIJKT DAT NO2-LN VOORNAMELIJK BETROKKEN IS BIJ DE DEFENSIERESPONS TEGEN VERSCHILLENDE SITUATIES VAN OXIDATIEVE STRESS EN ABIOTICO-STRESS, DOOR DE MODULATIE VAN TRANSCRITIONAL NIVEAUS VAN EIWITTEN (SPSP’S). REKENING HOUDEND MET DEZE ACHTERGROND ZAL DIT VOORSTEL ZICH TOESPITSEN OP DE STUDIE VAN DE MECHANISMEN VOOR SIGNALERING MET BEHULP VAN NITRAATLIPIDEN, DIE DE POST-TRANSLATIONELE MECHANISMEN VAN DE MODIFICATIE VAN EIWITTEN DOOR NITROALQUILACION KARAKTERISEREN, EVENALS DE INTERACTIES VAN NITRAATVETZUREN MET BEWEGWIJZERINGSTRAJECTEN ONDER ZOWEL FYSIOLOGISCHE ALS OMGEVINGSSTRESSOMSTANDIGHEDEN. HIERTOE RICHT DE DETECTIE EN IDENTIFICATIE IN VIVO VAN NITROALQUILACION CEL ZICH TOT GEMEDIEERD DOOR NITRAATLIPIDEN TIJDENS DE ONTWIKKELING EN IN SITUATIES VAN ABIOTICO STRESS IN ARABIDOPSIS THALIANA. PARALLEL HIERAAN ZULLEN DE NO2LN-ZUURSIGNALERINGSMECHANISMEN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ DE INDUCTIE VAN SNO’S EN HSPS WORDEN GEANALYSEERD, EVENALS DE CONTROLEMECHANISMEN DIE HET NITRAATGEHALTE VAN LIPIDEN MODULEREN. DE VERSCHILLENDE EXPERIMENTELE ONTWERPEN DIE TEN GRONDSLAG LIGGEN AAN DE VOORGESTELDE DOELSTELLINGEN ZULLEN WORDEN GEMAAKT MET BEHULP VAN EEN MULTIDISCIPLINAIRE COMBINATIE VAN TECHNIEKEN VOOR NUCLEAIRE MAGNETISCHE RESONANTIESPECTROSCOPIE (RMN), DRIEVOUDIGE VIERVOUDIGE MASSASPECTROMETRIE (HPLC-MS/MS), PROTEOMICS MET ISOBARISCHE TMT-MARKERING EN MASSASPECTROMETRIEANALYSE IN TANDEM (LC-MS/MS), MOLECULAIRE GEBRUIK VAN CHROMATINE (CHIP) EN MOLECULAIRE GENETICATRANSFORMATOREN MET ARABIDOPSISTRANSFORMATOREN. AL DEZE MECHANISMEN ZIJN ONBEKEND IN PLANTEN EN DE VERKREGEN RESULTATEN ZOUDEN BIOTECHNOLOGISCHE EN AGRONOMISCHE RELEVANTIE KUNNEN HEBBEN ALS BIOTECHNOLOGISCHE INSTRUMENTEN VAN HET NO. IN FEITE IS HET VOORSTEL IN OVEREENSTEMMING MET UITDAGING NUMMER TWEE BINNEN HET PROGRAMMA HORIZON 2020 DAT WORDT ONDERSTEUND DOOR VERSCHILLENDE ENTITEITEN EN BEDRIJVEN. (Dutch)
17 December 2021
0 references
GLI STUDI SULL'OSSIDO NITRICO (NO) NELLE PIANTE A LIVELLO MOLECOLARE SI SONO CONCENTRATI PRINCIPALMENTE SULL'IDENTIFICAZIONE E LA CARATTERIZZAZIONE DELLE MODIFICHE POST-TRADUZIONALI (PTM) DI PROTEINE NON MEDIATE, COME LA NITRAZIONE E LA S-NITROSILAZIONE E IL LORO EFFETTO SULL'ATTIVITÀ BIOLOGICA. RECENTI STUDI SU CELLULE ANIMALI HANNO DIMOSTRATO CHE NON PUÒ INFLUENZARE ANCHE I LIPIDI GENERANDO MOLECOLE CHIAMATE LIPIDI NITRATI. QUESTI DERIVATI NITRATI LIPIDICI POSSONO ESERCITARE PTM SUGLI OBIETTIVI PROTEICI CHIAMATI NITROALQUILACION CHE MEDIANO EFFETTI FISIOLOGICI E SEGNALANTI PIÙ POTENTI DI QUELLI DEL NO. TUTTAVIA, AD ECCEZIONE DEL RECENTE LAVORO DEL NOSTRO GRUPPO DERIVATO DAL PROGETTO PRECEDENTE, NON CI SONO INFORMAZIONI SULLA PRESENZA E LA FUNZIONE DEI LIPIDI NITRATI NEGLI ORGANISMI VEGETALI. QUESTI RISULTATI HANNO INFATTI DIMOSTRATO LA PRESENZA ENDOGENA DELL'ACIDO NITROLINOLENIC (NO2-LN) IN ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA E PISUM SATIVUM, NONCHÉ LA SUA MODULAZIONE IN TUTTO LO SVILUPPO E IN RISPOSTA ALLE DIVERSE SITUAZIONI DI STRESS ABIOTICO. INOLTRE, È STATO DIMOSTRATO CHE NO2-LN PARTECIPA ATTIVAMENTE AL METABOLISMO DEL NO ATTRAVERSO IL RILASCIO DI NO E LA FORMAZIONE IN VIVO DI PROTEINE S-NITROSOTIOLES (SNOSES) COINVOLTI PRATICAMENTE IN TUTTI I PROCESSI BIOLOGICI CHE SUPPORTANO L'ATTIVITÀ CELLULARE, INOLTRE, GLI STUDI DI TRANSCRIPTOMICA FUNZIONALE UTILIZZANDO RNA-SEQ HANNO STABILITO IL RUOLO DI SEGNALAZIONE DI QUESTE MOLECOLE, DIMOSTRANDO CHE NO2-LN È PRINCIPALMENTE COINVOLTO NELLA RISPOSTA DI DIFESA CONTRO DIVERSE SITUAZIONI DI STRESS OSSIDATIVO E STRESS ABIOTICO, ATTRAVERSO LA MODULAZIONE DEI LIVELLI DI PROTEINE TRANSCRITIONAL (SPSP). TENENDO CONTO DI QUESTO CONTESTO, LA PRESENTE PROPOSTA SI CONCENTRERÀ SULLO STUDIO DEI MECCANISMI DI SEGNALAZIONE MEDIATI DAI LIPIDI NITRATI, CARATTERIZZANDO I MECCANISMI POST-TRADUZIONALI DELLA MODIFICA DELLE PROTEINE DA PARTE DI NITROALQUILACION, NONCHÉ SULLE INTERAZIONI DEGLI ACIDI GRASSI NITRATI CON LE VIE DI SEGNALETICA IN CONDIZIONI DI STRESS SIA FISIOLOGICHE CHE AMBIENTALI. A TAL FINE, LA RILEVAZIONE E L'IDENTIFICAZIONE IN VIVO DEGLI OBIETTIVI CELLULARI NITROALQUILACION MEDIATI DAI LIPIDI NITRATI DURANTE LO SVILUPPO E IN SITUAZIONI DI STRESS ABIOTICO IN ARABIDOPSIS THALIANA. PARALLELAMENTE, SARANNO ANALIZZATI I MECCANISMI DI SEGNALAZIONE DEGLI ACIDI NO2LN COINVOLTI NELL'INDUZIONE DI SNO E HSPS, NONCHÉ I MECCANISMI DI CONTROLLO CHE MODULANO I LIVELLI DI LIPIDI NITRATI. I DIVERSI PROGETTI SPERIMENTALI SU CUI SI FONDANO GLI OBIETTIVI PROPOSTI SARANNO REALIZZATI UTILIZZANDO UNA COMBINAZIONE MULTIDISCIPLINARE DI TECNICHE DI SPETTROSCOPIA DI RISONANZA MAGNETICA NUCLEARE (RMN), TRIPLA SPETTROMETRIA QUADRUPLA DI MASSA (HPLC-MS/MS), PROTEOMICA MEDIANTE MARCATURA ISOBARICA TMT E ANALISI SPETTROMETRIA DI MASSA IN TANDEM (LC-MS/MS), MOLECOLARI CHE UTILIZZANO CROMATINA (CHIP) E TRASFORMATORI MOLECOLARI GENETICA CHE UTILIZZANO TRASFORMATORI ARABIDOPSIS. TUTTI QUESTI MECCANISMI SONO SCONOSCIUTI NELLE PIANTE, E I RISULTATI OTTENUTI POTREBBERO AVERE RILEVANZA BIOTECNOLOGICA E AGRONOMICA COME STRUMENTI BIOTECNOLOGICI DEL NO. INFATTI, LA PROPOSTA È IN ACCORDO CON LA SFIDA NUMERO DUE ALL'INTERNO DEL PROGRAMMA HORIZON 2020 SUPPORTATO DA DIVERSE ENTITÀ E AZIENDE. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΟΙ ΜΕΛΈΤΕΣ ΣΧΕΤΙΚΆ ΜΕ ΤΟ ΜΟΝΟΞΕΊΔΙΟ ΤΟΥ ΑΖΏΤΟΥ (ΑΡΙΘ.) ΣΕ ΦΥΤΆ ΣΕ ΜΟΡΙΑΚΌ ΕΠΊΠΕΔΟ ΈΧΟΥΝ ΕΠΙΚΕΝΤΡΩΘΕΊ ΚΥΡΊΩΣ ΣΤΗΝ ΤΑΥΤΟΠΟΊΗΣΗ ΚΑΙ ΤΟΝ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΜΌ ΜΕΤΑΜΕΤΑΦΡΑΣΤΙΚΏΝ ΤΡΟΠΟΠΟΙΉΣΕΩΝ (PTM) ΤΩΝ ΜΗ ΔΙΑΜΕΣΟΛΑΒΟΎΜΕΝΩΝ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ, ΌΠΩΣ Η ΝΙΤΡΟΡΡΎΠΑΝΣΗ ΚΑΙ Η S-NITROSILATION ΚΑΙ Η ΕΠΊΔΡΑΣΉ ΤΟΥΣ ΣΤΗ ΒΙΟΛΟΓΙΚΉ ΔΡΑΣΤΗΡΙΌΤΗΤΑ. ΠΡΌΣΦΑΤΕΣ ΜΕΛΈΤΕΣ ΣΕ ΖΩΙΚΆ ΚΎΤΤΑΡΑ ΈΧΟΥΝ ΔΕΊΞΕΙ ΌΤΙ ΔΕΝ ΜΠΟΡΕΊ ΕΠΊΣΗΣ ΝΑ ΕΠΗΡΕΆΣΕΙ ΤΑ ΛΙΠΊΔΙΑ ΔΗΜΙΟΥΡΓΏΝΤΑΣ ΜΌΡΙΑ ΠΟΥ ΟΝΟΜΆΖΟΝΤΑΙ ΝΙΤΡΩΜΈΝΑ ΛΙΠΊΔΙΑ. ΑΥΤΆ ΤΑ ΝΙΤΡΩΜΈΝΑ ΛΙΠΙΔΙΚΆ ΠΑΡΆΓΩΓΑ ΜΠΟΡΟΎΝ ΝΑ ΑΣΚΉΣΟΥΝ PTM ΣΕ ΣΤΌΧΟΥΣ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ ΠΟΥ ΟΝΟΜΆΖΟΝΤΑΙ NITROALQUILACION ΠΟΥ ΜΕΣΟΛΑΒΟΎΝ ΣΤΙΣ ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΚΈΣ ΚΑΙ ΣΗΜΑΣΙΟΛΟΓΙΚΈΣ ΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ ΠΙΟ ΙΣΧΥΡΈΣ ΑΠΌ ΕΚΕΊΝΕΣ ΤΟΥ NO., ΩΣΤΌΣΟ, ΕΚΤΌΣ ΑΠΌ ΤΙΣ ΠΡΌΣΦΑΤΕΣ ΕΡΓΑΣΊΕΣ ΤΗΣ ΟΜΆΔΑΣ ΜΑΣ ΠΟΥ ΠΡΟΈΡΧΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΟ ΈΡΓΟ, ΔΕΝ ΥΠΆΡΧΟΥΝ ΠΛΗΡΟΦΟΡΊΕΣ ΣΧΕΤΙΚΆ ΜΕ ΤΗΝ ΠΑΡΟΥΣΊΑ ΚΑΙ ΤΗ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΑ ΤΩΝ ΝΙΤΡΩΜΈΝΩΝ ΛΙΠΙΔΊΩΝ ΣΤΟΥΣ ΟΡΓΑΝΙΣΜΟΎΣ ΛΑΧΑΝΙΚΏΝ. ΣΤΗΝ ΠΡΑΓΜΑΤΙΚΌΤΗΤΑ, ΤΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΑΥΤΆ ΈΧΟΥΝ ΔΕΊΞΕΙ ΤΗΝ ΕΝΔΟΓΕΝΉ ΠΑΡΟΥΣΊΑ ΤΟΥ NITROLINOLENIC ACID (NO2-LN) ΣΤΑ ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA ΚΑΙ PISUM SATIVUM ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΤΗ ΔΙΑΜΌΡΦΩΣΗ ΤΟΥ ΚΑΘ’ ΌΛΗ ΤΗ ΔΙΆΡΚΕΙΑ ΤΗΣ ΑΝΆΠΤΥΞΗΣ ΚΑΙ ΩΣ ΑΠΆΝΤΗΣΗ ΣΕ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΚΑΤΑΣΤΆΣΕΙΣ ΆΓΧΟΥΣ ABIOTICO. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΈΧΕΙ ΑΠΟΔΕΙΧΘΕΊ ΌΤΙ ΤΟ NO2-LN ΣΥΜΜΕΤΈΧΕΙ ΕΝΕΡΓΆ ΣΤΟ ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΌ ΤΟΥ ΌΧΙ ΜΈΣΩ ΤΗΣ ΑΠΕΛΕΥΘΈΡΩΣΗΣ ΤΟΥ NO ΚΑΙ ΤΟΥ IN VIVO ΣΧΗΜΑΤΙΣΜΟΎ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΗΣ S-NITROSOTIOLES (SNOSES) ΠΟΥ ΕΜΠΛΈΚΟΝΤΑΙ ΟΥΣΙΑΣΤΙΚΆ ΣΕ ΌΛΕΣ ΤΙΣ ΒΙΟΛΟΓΙΚΈΣ ΔΙΕΡΓΑΣΊΕΣ ΠΟΥ ΥΠΟΣΤΗΡΊΖΟΥΝ ΤΗΝ ΚΥΤΤΑΡΙΚΉ ΔΡΑΣΤΗΡΙΌΤΗΤΑ, ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΟΙ ΜΕΛΈΤΕΣ ΤΗΣ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΉΣ TRANSCRIPTOMICA ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ RNA-SEQ ΚΑΘΌΡΙΣΑΝ ΤΟΝ ΡΌΛΟ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΜΟΡΊΩΝ, ΑΠΟΔΕΙΚΝΎΟΝΤΑΣ ΌΤΙ ΤΟ NO2-LN ΕΜΠΛΈΚΕΤΑΙ ΚΥΡΊΩΣ ΣΤΗΝ ΑΜΥΝΤΙΚΉ ΑΠΌΚΡΙΣΗ ΈΝΑΝΤΙ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΏΝ ΚΑΤΑΣΤΆΣΕΩΝ ΟΞΕΙΔΩΤΙΚΟΎ ΣΤΡΕΣ ΚΑΙ ABIOTICO, ΜΈΣΩ ΤΗΣ ΔΙΑΜΌΡΦΩΣΗΣ ΤΩΝ TRANSCRITIONAL ΕΠΙΠΈΔΩΝ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ (SPSPS). ΛΑΜΒΆΝΟΝΤΑΣ ΥΠΌΨΗ ΑΥΤΌ ΤΟ ΠΛΑΊΣΙΟ, Η ΠΑΡΟΎΣΑ ΠΡΌΤΑΣΗ ΘΑ ΕΠΙΚΕΝΤΡΩΘΕΊ ΣΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΤΩΝ ΜΗΧΑΝΙΣΜΏΝ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΠΟΥ ΜΕΣΟΛΑΒΟΎΝ ΑΠΌ ΝΙΤΡΩΜΈΝΑ ΛΙΠΊΔΙΑ, ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΖΟΝΤΑΣ ΤΟΥΣ ΜΕΤΑΜΕΤΑΦΡΑΣΤΙΚΟΎΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΎΣ ΤΡΟΠΟΠΟΊΗΣΗΣ ΤΩΝ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ ΑΠΌ ΤΗ NITROALQUILACION, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΤΙΣ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ ΤΩΝ ΝΙΤΡΩΜΈΝΩΝ ΛΙΠΑΡΏΝ ΟΞΈΩΝ ΜΕ ΤΙΣ ΟΔΟΎΣ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΤΌΣΟ ΥΠΌ ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΚΈΣ ΌΣΟ ΚΑΙ ΥΠΌ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΚΑΤΑΠΌΝΗΣΗΣ. ΓΙΑ ΤΟ ΣΚΟΠΌ ΑΥΤΌ, Η ΑΝΊΧΝΕΥΣΗ ΚΑΙ ΤΑΥΤΟΠΟΊΗΣΗ IN VIVO ΤΩΝ ΣΤΌΧΩΝ ΚΥΤΤΆΡΩΝ NITROALQUILACION ΠΟΥ ΔΙΑΜΕΣΟΛΑΒΟΎΝΤΑΙ ΑΠΌ ΝΙΤΡΩΜΈΝΑ ΛΙΠΊΔΙΑ ΚΑΤΆ ΤΗΝ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΚΑΙ ΣΕ ΚΑΤΑΣΤΆΣΕΙΣ ΆΓΧΟΥΣ ABIOTICO ΣΤΗΝ ARABIDOPSIS THALIANA. ΠΑΡΆΛΛΗΛΑ, ΘΑ ΑΝΑΛΥΘΟΎΝ ΟΙ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΊ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΤΩΝ ΟΞΈΩΝ NO2LN ΠΟΥ ΕΜΠΛΈΚΟΝΤΑΙ ΣΤΗΝ ΕΠΑΓΩΓΉ SNO ΚΑΙ HSPS, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΟΙ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΊ ΕΛΈΓΧΟΥ ΠΟΥ ΡΥΘΜΊΖΟΥΝ ΤΑ ΕΠΊΠΕΔΑ ΝΙΤΡΩΜΈΝΩΝ ΛΙΠΙΔΊΩΝ. ΟΙ ΔΙΆΦΟΡΟΙ ΠΕΙΡΑΜΑΤΙΚΟΊ ΣΧΕΔΙΑΣΜΟΊ ΠΟΥ ΣΤΗΡΊΖΟΥΝ ΤΟΥΣ ΠΡΟΤΕΙΝΌΜΕΝΟΥΣ ΣΤΌΧΟΥΣ ΘΑ ΓΊΝΟΥΝ ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΠΟΛΥΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΟΎ ΣΥΝΔΥΑΣΜΟΎ ΤΕΧΝΙΚΏΝ ΦΑΣΜΑΤΟΣΚΟΠΊΑΣ ΠΥΡΗΝΙΚΟΎ ΜΑΓΝΗΤΙΚΟΎ ΣΥΝΤΟΝΙΣΜΟΎ (RMN), ΤΡΙΠΛΉΣ ΤΕΤΡΑΠΛΆΣΙΑΣ ΦΑΣΜΑΤΟΜΕΤΡΊΑΣ ΜΆΖΑΣ (HPLC-MS/MS), ΠΡΩΤΕΩΜΙΚΉΣ ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΙΣΟΒΑΡΙΚΉΣ ΣΉΜΑΝΣΗΣ TMT ΚΑΙ ΑΝΆΛΥΣΗΣ ΦΑΣΜΑΤΟΜΕΤΡΊΑΣ ΜΆΖΑΣ ΣΕ ΣΥΝΔΥΑΣΜΌ (LC-MS/MS), ΜΟΡΙΑΚΉΣ ΧΡΉΣΗΣ ΧΡΩΜΑΤΊΝΗΣ (CHIP) ΚΑΙ ΜΟΡΙΑΚΏΝ ΜΕΤΑΣΧΗΜΑΤΙΣΤΏΝ GENETICA ΠΟΥ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΟΎΝ ΜΕΤΑΣΧΗΜΑΤΙΣΤΈΣ ARABIDOPSIS. ΌΛΟΙ ΑΥΤΟΊ ΟΙ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΊ ΕΊΝΑΙ ΆΓΝΩΣΤΟΙ ΣΤΑ ΦΥΤΆ, ΚΑΙ ΤΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΠΟΥ ΕΠΙΤΥΓΧΆΝΟΝΤΑΙ ΘΑ ΜΠΟΡΟΎΣΑΝ ΝΑ ΈΧΟΥΝ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΉ ΚΑΙ ΓΕΩΠΟΝΙΚΉ ΣΗΜΑΣΊΑ ΩΣ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΆ ΕΡΓΑΛΕΊΑ ΤΟΥ ΑΡΙΘ. ΣΤΗΝ ΠΡΑΓΜΑΤΙΚΌΤΗΤΑ, Η ΠΡΌΤΑΣΗ ΕΊΝΑΙ ΣΎΜΦΩΝΗ ΜΕ ΤΗΝ ΠΡΌΚΛΗΣΗ ΔΎΟ ΣΤΟ ΠΛΑΊΣΙΟ ΤΟΥ ΠΡΟΓΡΆΜΜΑΤΟΣ «ΟΡΊΖΩΝ 2020» ΠΟΥ ΥΠΟΣΤΗΡΊΖΕΤΑΙ ΑΠΌ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΟΝΤΌΤΗΤΕΣ ΚΑΙ ΕΤΑΙΡΕΊΕΣ. (Greek)
18 August 2022
0 references
UNDERSØGELSER AF NITROGENOXID (NEJ) I PLANTER PÅ MOLEKYLÆR NIVEAU HAR HOVEDSAGELIG FOKUSERET PÅ IDENTIFIKATION OG KARAKTERISERING AF POSTTRANSLATIONELLE MODIFIKATIONER (PTM'ER) AF IKKE-MEDIEREDE PROTEINER, SÅSOM NITRATION OG S-NITROSILATION OG DERES VIRKNING PÅ BIOLOGISK AKTIVITET. NYLIGE UNDERSØGELSER I DYRECELLER HAR VIST, AT DET IKKE OGSÅ KAN PÅVIRKE LIPIDER VED AT GENERERE MOLEKYLER, DER KALDES NITRATHOLDIGE LIPIDER. DISSE NITTEDE LIPIDDERIVATER KAN UDØVE PTM'ER PÅ PROTEINMÅL KALDET NITROALQUILACION, DER FORMIDLER FYSIOLOGISKE OG SIGNALERENDE EFFEKTER, DER ER STÆRKERE END VIRKNINGERNE AF NO., BORTSET FRA DET SENESTE ARBEJDE I VORES GRUPPE, DER ER AFLEDT AF DET TIDLIGERE PROJEKT, ER DER INGEN OPLYSNINGER OM TILSTEDEVÆRELSEN OG FUNKTIONEN AF NITRATHOLDIGE LIPIDER I VEGETABILSKE ORGANISMER. FAKTISK HAR DISSE RESULTATER VIST ENDOGEN TILSTEDEVÆRELSE AF NITROLINOLENIC SYRE (NO2-LN) I ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA OG PISUM SATIVUM SAMT DETS GRADUERING UNDER HELE UDVIKLINGEN OG SOM REAKTION PÅ FORSKELLIGE SITUATIONER MED ABIOTICO STRESS. DESUDEN HAR DET VIST SIG, AT NO2-LN DELTAGER AKTIVT I METABOLISMEN AF NEJ GENNEM FRIGIVELSEN AF NO OG IN VIVO-DANNELSEN AF PROTEIN S-NITROSOTIOLES (SNOSES), DER ER INVOLVERET I PRAKTISK TAGET ALLE DE BIOLOGISKE PROCESSER, DER UNDERSTØTTER CELLULÆR AKTIVITET. DESUDEN FASTSLOG UNDERSØGELSERNE AF FUNKTIONEL TRANSCRIPTOMICA VED HJÆLP AF RNA-SEQ DISSE MOLEKYLERS SIGNALROLLE, HVILKET VISER, AT NO2-LN HOVEDSAGELIG ER INVOLVERET I FORSVARET MOD FORSKELLIGE SITUATIONER MED OXIDATIV STRESS OG ABIOTICO STRESS GENNEM MODULATION AF TRANSCRITIONAL NIVEAUER AF PROTEINER (SPS). UNDER HENSYNTAGEN TIL DENNE BAGGRUND VIL DETTE FORSLAG FOKUSERE PÅ UNDERSØGELSEN AF MEKANISMERNE FOR SIGNALGIVNING, DER FORMIDLES AF NITRATEDE LIPIDER, OG SOM KARAKTERISERER NITROALQUILACIONS MEKANISMER FOR MODIFIKATION AF PROTEINER EFTER OVERSÆTTELSE SAMT SAMSPILLET MELLEM NITTEDE FEDTSYRER OG TEGNVEJE UNDER BÅDE FYSIOLOGISKE OG MILJØMÆSSIGE STRESSFORHOLD. TIL DETTE FORMÅL ER PÅVISNING OG IDENTIFIKATION IN VIVO AF NITROALQUILACION CELLEMÅL MEDIERET AF NITTEDE LIPIDER UNDER UDVIKLING OG I SITUATIONER MED ABIOTICO STRESS I ARABIDOPSIS THALIANA. PARALLELT HERMED VIL NO2LN-SYRESIGNALMEKANISMERNE, DER ER INVOLVERET I INDUKTIONEN AF SNO'ER OG HSPS, BLIVE ANALYSERET, SAMT DE KONTROLMEKANISMER, DER MODULERER NITRATHOLDIGE LIPIDNIVEAUER. DE FORSKELLIGE FORSØGSMODELLER, DER LIGGER TIL GRUND FOR DE FORESLÅEDE MÅL, VIL BLIVE FREMSTILLET VED HJÆLP AF EN TVÆRFAGLIG KOMBINATION AF KERNEMAGNETISK RESONANSSPEKTROSKOPI (RMN), TREDOBBELT FIRDOBBELT MASSESPEKTROMETRI (HPLC-MS/MS), PROTEOMIK VED HJÆLP AF ISOBARISK TMT-MÆRKNING OG MASSESPEKTROMETRIANALYSE I TANDEM (LC-MS/MS), MOLEKYLÆR ANVENDELSE AF CHROMATIN (CHIP) OG MOLEKYLÆRE GENETICATRANSFORMERE VED HJÆLP AF ARABIDOPSIS TRANSFORMERE. ALLE DISSE MEKANISMER ER UKENDTE I PLANTER, OG DE OPNÅEDE RESULTATER KUNNE HAVE BIOTEKNOLOGISK OG AGRONOMISK RELEVANS SOM BIOTEKNOLOGISKE VÆRKTØJER I NO. FAKTISK, FORSLAGET ER I OVERENSSTEMMELSE MED UDFORDRING NUMMER TO INDEN FOR PROGRAMMET HORISONT 2020 STØTTES AF FORSKELLIGE ENHEDER OG VIRKSOMHEDER. (Danish)
18 August 2022
0 references
TYPPIOKSIDIA (NO) KOSKEVISSA TUTKIMUKSISSA ON KESKITYTTY PÄÄASIASSA EI-VÄLITTEISTEN PROTEIINIEN, KUTEN NITRAATION JA S-NITROSILATIONIN, TUNNISTAMISEEN JA KARAKTERISOINTIIN SEKÄ NIIDEN VAIKUTUKSEEN BIOLOGISEEN AKTIIVISUUTEEN. VIIMEAIKAISET ELÄINSOLUTUTKIMUKSET OVAT OSOITTANEET, ETTÄ SE EI VOI VAIKUTTAA MYÖS LIPIDEIHIN TUOTTAMALLA NITRAATTILIPIDEIKSI KUTSUTTUJA MOLEKYYLEJÄ. NITROALQUILACION-NITROLIDIJOHDANNAISET VOIVAT KÄYTTÄÄ PTM-AINEITA NITROALQUILACION-PROTEIINIKOHTEISIIN, JOTKA VÄLITTÄVÄT FYSIOLOGISIA JA MERKINANTOVAIKUTUKSIA VOIMAKKAAMMIN KUIN NO., LUKUUN OTTAMATTA RYHMÄMME VIIMEAIKAISTA TYÖTÄ, JOKA ON PERÄISIN AIEMMASTA PROJEKTISTA, EI OLE TIETOA NITRAATTIEN LIPIDIEN ESIINTYMISESTÄ JA TOIMINNASTA KASVIORGANISMEISSA. ITSE ASIASSA NÄMÄ TULOKSET OVAT OSOITTANEET NITROLINOLENIC-HAPON (NO2-LN) ENDOGEENISEN LÄSNÄOLON ARABIDOPSIS THALIANASSA, ORYZA SATIVASSA JA PISUM SATIVUMISSA SEKÄ SEN MUKAUTTAMISEN KOKO KEHITYKSEN AJAN JA VASTAUKSENA ABIOTICO-STRESSIN ERILAISIIN TILANTEISIIN. LISÄKSI ON OSOITETTU, ETTÄ NO2-LN OSALLISTUU AKTIIVISESTI NO:N METABOLIAAN VAPAUTTAMALLA NO JA IN VIVO PROTEIINIS-NITROSOTIOLES (SNOSES), JOTKA OSALLISTUVAT KÄYTÄNNÖLLISESTI KATSOEN KAIKKIIN BIOLOGISIIN PROSESSEIHIN, JOTKA TUKEVAT SOLUJEN AKTIIVISUUTTA, JA LISÄKSI RNA-SEQ:ÄÄ KÄYTTÄVÄT TOIMINNALLISET TRANSCRIPTOMICA-TUTKIMUKSET VAHVISTIVAT NÄIDEN MOLEKYYLIEN SIGNAALINANTOROOLIN, MIKÄ OSOITTAA, ETTÄ NO2-LN ON PÄÄASIASSA MUKANA PUOLUSTUSVASTEESSA OKSIDATIIVISEN STRESSIN JA ABIOTICO-STRESSIN ERI TILANTEISSA MODULOIMALLA TRANSCRITIONAL-PROTEIINEJA (SPSP). TÄMÄ TAUSTA HUOMIOON OTTAEN TÄSSÄ EHDOTUKSESSA KESKITYTÄÄN TUTKIMAAN NITRAATTIRASVAHAPPOJEN VÄLITTÄMIEN SIGNAALIEN MEKANISMEJA, JOTKA LUONNEHTIVAT NITROALQUILACIONIN AIHEUTTAMIA PROTEIINEJA MUUTTAVIEN TRANSLAATIOMEKANISMIEN JÄLKEISIÄ MEKANISMEJA SEKÄ NITRAATTIRASVAHAPPOJEN VUOROVAIKUTUSTA MERKKIREITTIEN KANSSA SEKÄ FYSIOLOGISISSA ETTÄ YMPÄRISTÖÖN LIITTYVISSÄ STRESSIOLOSUHTEISSA. TÄTÄ VARTEN NITROALQUILACION-SOLUN HAVAITSEMINEN JA TUNNISTAMINEN IN VIVO KOHDISTUU NITRAATTILIPIDIEN VÄLITYKSELLÄ ARABIDOPSIS THALIANASSA TAPAHTUVAN ABIOTICO-STRESSIN AIKANA. SAMANAIKAISESTI ANALYSOIDAAN SNO:IDEN JA HSPS:N INDUKTIOSSA MUKANA OLEVAT NO2LN-HAPPOSIGNAALIMEKANISMIT SEKÄ VALVONTAMEKANISMIT, JOTKA MODULOIVAT NITRAATTIRASVAPITOISUUKSIA. EHDOTETTUJEN TAVOITTEIDEN PERUSTANA OLEVAT ERILAISET KOKEELLISET MALLIT TEHDÄÄN KÄYTTÄMÄLLÄ MONITIETEISTÄ YHDISTELMÄÄ YDINMAGNEETTISEN RESONANSSISPEKTROSKOPIAN (RMN) TEKNIIKOISTA, KOLMINKERTAISESTA NELIMASSASPEKTROMETRIASTA (HPLC-MS/MS), PROTEOMISTA, JOSSA KÄYTETÄÄN ISOBARISTA TMT-MERKINTÄÄ JA MASSASPEKTROMETRIAA TANDEMISSA (LC-MS/MS), MOLEKULAARISISTA KROMATIINIA (SIRU) KÄYTTÄVISTÄ MOLEKYYLIMUUNTAJISTA JA ARABIDOPSIS-MUUNTAJIA KÄYTTÄVISTÄ MOLEKYYLIMUUNTAJISTA. KAIKKIA NÄITÄ MEKANISMEJA EI TUNNETA KASVEISSA, JA SAAVUTETUILLA TULOKSILLA VOI OLLA BIOTEKNOLOGINEN JA AGRONOMINEN MERKITYS, SILLÄ N:O. BIOTEKNOLOGISINA VÄLINEINÄ EHDOTUS VASTAA HORISONTTI 2020 -OHJELMAN HAASTETTA NUMERO KAKSI, JOTA TUKEVAT ERI TAHOT JA YRITYKSET. (Finnish)
18 August 2022
0 references
STUDJI DWAR L-OSSIDU NITRIKU (NRU) FIL-PJANTI FIL-LIVELL MOLEKULARI FFUKAW L-AKTAR FUQ L-IDENTIFIKAZZJONI U L-KARATTERIZZAZZJONI TA’ MODIFIKI POSTTRANSLAZZJONALI (PTMS) TA’ PROTEINI MHUX MEDJATI, BĦAL NITRATION U S-NITROSILATION U L-EFFETT TAGĦHOM FUQ L-ATTIVITÀ BIJOLOĠIKA. STUDJI RIĊENTI FIĊ-ĊELLOLI TAL-ANNIMALI WREW LI MA JISTGĦUX JAFFETTWAW UKOLL IL-LIPIDI BILLI JIĠĠENERAW MOLEKULI MSEJĦA LIPIDI NITRATI. DAWN ID-DERIVATTIVI LIPIDI NITRATI JISTGĦU JEŻERĊITAW PTMS FUQ IL-MIRI TAL-PROTEINI MSEJĦA NITROALKUILACION LI JIMMEDJAW EFFETTI FIŻJOLOĠIĊI U SINJALAZZJONI AKTAR QAWWIJA MINN DAWK TAN-NRU, MADANKOLLU, ĦLIEF GĦALL-ĦIDMA REĊENTI TAL-GRUPP TAGĦNA DERIVAT MILL-PROĠETT PREĊEDENTI, M’HEMM L-EBDA INFORMAZZJONI DWAR IL-PREŻENZA U L-FUNZJONI TA ‘LIPIDI NITRATI FL-ORGANIŻMI VEĠETALI. FIL-FATT, DAWN IR-RIŻULTATI WREW IL-PREŻENZA ENDOĠENA TAL-AĊIDU NITROLOLOLENIC (NO2-LN) FIL-GĦARBIIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA U PISUM SATIVUM KIF UKOLL IL-MODULAZZJONI TIEGĦU MATUL L-IŻVILUPP KOLLU U B’RISPONS GĦAL SITWAZZJONIJIET DIFFERENTI TA’ STRESS ABIOTICO. BARRA MINN HEKK, INTWERA LI L-NO2-LN JIPPARTEĊIPA B’MOD ATTIV FIL-METABOLIŻMU TAN-NRU PERMEZZ TAR-RILAXX TAN-NRU U L-FORMAZZJONI IN VIVO TAL-PROTEINA S-NITROSOTIOLES (SNOSES) INVOLUTI PRATTIKAMENT FIL-PROĊESSI BIJOLOĠIĊI KOLLHA LI JAPPOĠĠAW L-ATTIVITÀ ĊELLULARI, BARRA MINN HEKK, L-ISTUDJI TA’ TRANSCRIPTOMICA FUNZJONALI BL-UŻU TAL-RNA-SEQ STABBILIXXEW IR-RWOL TA’ SINJALAR TA’ DAWN IL-MOLEKULI, LI JURU LI NO2-LN HUWA PRINĊIPALMENT INVOLUT FIR-RISPONS TAD-DIFIŻA KONTRA SITWAZZJONIJIET DIFFERENTI TA’ STRESS OSSIDATTIV U STRESS ABIOTICO, PERMEZZ TAL-MODULAZZJONI TAL-LIVELLI TRANSCRITIONAL TAL-PROTEINI (SPSPS). B’KONT MEĦUD TA’ DAN L-ISFOND, DIN IL-PROPOSTA SE TIFFOKA FUQ L-ISTUDJU TAL-MEKKANIŻMI TA’ SINJALAR MEDJATI MINN LIPIDI NITRATI, LI JIKKARATTERIZZAW IL-MEKKANIŻMI POSTTRANSLAZZJONALI TAL-MODIFIKA TAL-PROTEINI MINN NITROALQUILACION, KIF UKOLL L-INTERAZZJONIJIET TA’ AĊIDI GRASSI NITRATI MA’ MOGĦDIJIET TA’ SINJALI TAĦT KUNDIZZJONIJIET TA’ STRESS KEMM FIŻJOLOĠIĊI KIF UKOLL AMBJENTALI. GĦAL DAN IL-GĦAN, ID-DETEZZJONI U L-IDENTIFIKAZZJONI IN VIVO TAL-MIRI TAĊ-ĊELLULI NITROALQUILACION MEDJATI MINN LIPIDI NITRATI MATUL L-IŻVILUPP U F’SITWAZZJONIJIET TA’ STRESS ABIOTICO F’ ARABIDOPSIS THALIANA. B’MOD PARALLEL, IL-MEKKANIŻMI TA’ SINJALAR TAL-AĊIDU NO2LN INVOLUTI FL-INDUZZJONI TA’ SNOS U HSPS SE JIĠU ANALIZZATI, KIF UKOLL IL-MEKKANIŻMI TA’ KONTROLL LI JIMMODULAW IL-LIVELLI NITRATI TAL-LIPIDI. ID-DISINJI SPERIMENTALI DIFFERENTI LI JIRFDU L-GĦANIJIET PROPOSTI SE JSIRU BL-UŻU TA’ KOMBINAZZJONI MULTIDIXXIPLINARJA TA’ TEKNIKI TA’ SPETTROMETRIJA TAR-REŻONANZA MANJETIKA NUKLEARI (RMN), SPETTROMETRIJA TAL-MASSA KWADRIPLI TRIPLA (HPLC-MS/MS), PROTEOMIKA BL-UŻU TA’ MMARKAR ISOBARIKU TMT U ANALIŻI TAL-ISPETTROMETRIJA TAL-MASSA F’TANDEM (LC-MS/MS), MOLEKULARI BL-UŻU TA’ TRASFORMATURI TAL-KROMATINA (ĊIPPA) U MOLEKULARI ĠENETIKA BL-UŻU TA’ TRANSFORMERS GĦARABIDOPSIS. DAWN IL-MEKKANIŻMI KOLLHA MHUMIEX MAGĦRUFA FIL-PJANTI, U R-RIŻULTATI MIKSUBA JISTA’ JKOLLHOM RILEVANZA BIJOTEKNOLOĠIKA U AGRONOMIKA PERESS LI L-GĦODOD BIJOTEKNOLOĠIĊI TAN-NRU. FIL-FATT, IL-PROPOSTA HIJA KONFORMI MAL-ISFIDA NUMRU TNEJN FI ĦDAN IL-PROGRAMM ORIZZONT 2020 BL-APPOĠĠ TA’ ENTITAJIET U KUMPANIJI DIFFERENTI. (Maltese)
18 August 2022
0 references
PĒTĪJUMI PAR SLĀPEKĻA OKSĪDU (NR) AUGIEM MOLEKULĀRĀ LĪMENĪ GALVENOKĀRT IR VĒRSTI UZ NEMEDIĒTO PROTEĪNU PĒCTRANSLĀCIJAS MODIFIKĀCIJU (PTM) NOTEIKŠANU UN RAKSTUROŠANU, PIEMĒRAM, NITRĀCIJU UN S-NITROSILĀCIJA, UN TO IETEKMI UZ BIOLOĢISKO AKTIVITĀTI. NESENIE PĒTĪJUMI AR DZĪVNIEKU ŠŪNĀM IR PARĀDĪJUŠI, KA TAS NEVAR IETEKMĒT LIPĪDUS, RADOT MOLEKULAS, KO SAUC PAR NITRĒTIEM LIPĪDIEM. ŠIE NITRĒTIE LIPĪDU ATVASINĀJUMI VAR IZRAISĪT PTM UZ OLBALTUMVIELU MĒRĶIEM, KO SAUC PAR NITROALQUILACION, KAS MEDIĒ FIZIOLOĢISKO UN SIGNALIZĒJOŠO IEDARBĪBU SPĒCĪGĀK NEKĀ NO. TOMĒR, IZŅEMOT MŪSU GRUPAS NESENO DARBU, KAS IZRIET NO IEPRIEKŠĒJĀ PROJEKTA, NAV INFORMĀCIJAS PAR NITRĒTO LIPĪDU KLĀTBŪTNI UN FUNKCIJU AUGU ORGANISMOS. FAKTISKI ŠIE REZULTĀTI LIECINA PAR NITROLINOLENIC SKĀBES (NO2-LN) ENDOGĒNO KLĀTBŪTNI ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA UN PISUM SATIVUM, KĀ ARĪ TĀS MODULĀCIJU VISĀ ATTĪSTĪBAS LAIKĀ UN REAĢĒJOT UZ DAŽĀDĀM ABIOTICO STRESA SITUĀCIJĀM. TURKLĀT IR PIERĀDĪTS, KA NO2-LN AKTĪVI PIEDALĀS NO METABOLISMĀ, ATBRĪVOJOTIES NO, UN OLBALTUMVIELU S-NITROSOTIOLES (SNOSES) VEIDOŠANĀS IN VIVO, KAS IESAISTĪTAS PRAKTISKI VISOS BIOLOĢISKAJOS PROCESOS, KAS ATBALSTA ŠŪNU AKTIVITĀTI, TURKLĀT FUNKCIONĀLĀS TRANSCRIPTOMICA, IZMANTOJOT RNS-SEQ, PĒTĪJUMOS TIKA NOTEIKTA ŠO MOLEKULU SIGNĀLS, PARĀDOT, KA NO2-LN GALVENOKĀRT IR IESAISTĪTS AIZSARDZĪBAS REAKCIJĀ PRET DAŽĀDĀM OKSIDATĪVĀ STRESA UN ABIOTICO STRESA SITUĀCIJĀM, IZMANTOJOT PROTEĪNU TRANSCRITIONAL LĪMEŅU MODULĀCIJU (SPSP). ŅEMOT VĒRĀ ŠO KONTEKSTU, ŠIS PRIEKŠLIKUMS KONCENTRĒSIES UZ PĒTĪJUMU PAR NITRĒTU LIPĪDU MEDIĒTU SIGNALIZĀCIJAS MEHĀNISMIEM, RAKSTUROJOT NITROALQUILACION PROTEĪNU MODIFIKĀCIJAS PĒCTRANSLĀCIJAS MEHĀNISMUS, KĀ ARĪ NITRĒTO TAUKSKĀBJU MIJIEDARBĪBU AR ZĪMJU CEĻIEM GAN FIZIOLOĢISKOS, GAN VIDES STRESA APSTĀKĻOS. ŠAJĀ NOLŪKĀ IN VIVO NOSAKA UN IDENTIFICĒ NITROALQUILACION ŠŪNU MĒRĶUS, KO MEDIĒ NITRĒTIE LIPĪDI ATTĪSTĪBAS LAIKĀ UN ABIOTICO STRESA SITUĀCIJĀS ARABIDOPSIS THALIANA. PARALĒLI TIKS ANALIZĒTI NO2LN SKĀBES SIGNALIZĀCIJAS MEHĀNISMI, KAS IESAISTĪTI SNO UN HSPS INDUKCIJĀ, KĀ ARĪ KONTROLES MEHĀNISMI, KAS MODULĒ NITRĒTO LIPĪDU LĪMENI. DAŽĀDIE EKSPERIMENTĀLIE MODEĻI, KAS IR IEROSINĀTO MĒRĶU PAMATĀ, TIKS VEIKTI, IZMANTOJOT KODOLMAGNĒTISKĀS REZONANSES SPEKTROSKOPIJAS (RMN) DAUDZDISCIPLĪNU KOMBINĀCIJU, TRĪSKĀRŠU ČETRKĀRŠU MASSPEKTROMETRIJU (HPLC-MS/MS), PROTEOMIKU, IZMANTOJOT IZOBARISKO TMT MARĶĒJUMU UN MASSPEKTROMETRIJAS ANALĪZI TANDĒMĀ (LC-MS/MS), MOLEKULĀRO, IZMANTOJOT HROMATĪNU (CHIP) UN MOLEKULĀROS GENETICA TRANSFORMATORUS, KUROS IZMANTO ARABIDOPSIS TRANSFORMATORUS. VISI ŠIE MEHĀNISMI AUGOS NAV ZINĀMI, UN IEGŪTIE REZULTĀTI VARĒTU BŪT BIOTEHNOLOĢISKI UN AGRONOMISKI NOZĪMĪGI KĀ NR. BIOTEHNOLOĢISKIE INSTRUMENTI, PATIESĪBĀ PRIEKŠLIKUMS ATBILST OTRAJAM IZAICINĀJUMAM PROGRAMMĀ “APVĀRSNIS 2020”, KO ATBALSTA DAŽĀDAS STRUKTŪRAS UN UZŅĒMUMI. (Latvian)
18 August 2022
0 references
ŠTÚDIE TÝKAJÚCE SA OXIDU DUSNATÉHO (Č.) V RASTLINÁCH NA MOLEKULÁRNEJ ÚROVNI SA ZAMERALI NAJMÄ NA IDENTIFIKÁCIU A CHARAKTERIZÁCIU POSTTRANSLAČNÝCH MODIFIKÁCIÍ (PTM) NESPROSTREDKOVANÝCH BIELKOVÍN, AKO JE NITRÁCIA A S-NITROSILÁCIA A ICH ÚČINOK NA BIOLOGICKÚ AKTIVITU. NEDÁVNE ŠTÚDIE NA ZVIERACÍCH BUNKÁCH UKÁZALI, ŽE NEMÔŽU OVPLYVNIŤ AJ LIPIDY VYTVÁRANÍM MOLEKÚL NAZÝVANÝCH NITRÁTOVÉ LIPIDY. TIETO NITRÁTOVÉ LIPIDOVÉ DERIVÁTY MÔŽU PÔSOBIŤ PTM NA PROTEÍNOVÉ CIELE NAZÝVANÉ NITROALQUILACION, KTORÉ SPROSTREDKUJÚ FYZIOLOGICKÉ A SIGNALIZAČNÉ ÚČINKY SILNEJŠIE AKO ÚČINKY Č., S VÝNIMKOU NEDÁVNEJ PRÁCE NAŠEJ SKUPINY ODVODENEJ Z PREDCHÁDZAJÚCEHO PROJEKTU VŠAK NIE SÚ ŽIADNE INFORMÁCIE O PRÍTOMNOSTI A FUNKCII NITRÁTOVÝCH LIPIDOV V RASTLINNÝCH ORGANIZMOCH. V SKUTOČNOSTI TIETO VÝSLEDKY UKÁZALI ENDOGÉNNE PRÍTOMNOSŤ KYSELINY NITROLINOLENIC (NO2-LN) V ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA A PISUM SATIVUM, AKO AJ JEJ MODULÁCIU POČAS VÝVOJA A V REAKCII NA RÔZNE SITUÁCIE STRESU ABIOTICO. OKREM TOHO SA PREUKÁZALO, ŽE NO2-LN SA AKTÍVNE PODIEĽA NA METABOLIZME NO PROSTREDNÍCTVOM UVOĽŇOVANIA Č. A TVORBY PROTEÍNOV S-NITROSOTIOLES (SNOSES) IN VIVO ZAPOJENÝCH DO PRAKTICKY VŠETKÝCH BIOLOGICKÝCH PROCESOV, KTORÉ PODPORUJÚ BUNKOVÚ AKTIVITU, OKREM TOHO ŠTÚDIE FUNKČNEJ TRANSCRIPTOMICA S POUŽITÍM RNA-SEQ STANOVILI SIGNALIZAČNÚ ÚLOHU TÝCHTO MOLEKÚL, ČO DOKAZUJE, ŽE NO2-LN SA PODIEĽA HLAVNE NA OBRANNEJ REAKCII PROTI RÔZNYM SITUÁCIÁM OXIDAČNÉHO STRESU A ABIOTICO STRESU PROSTREDNÍCTVOM MODULÁCIE TRANSCRITIONAL HLADÍN BIELKOVÍN (SPSP). VZHĽADOM NA UVEDENÉ SKUTOČNOSTI SA TENTO NÁVRH ZAMERIA NA ŠTÚDIU MECHANIZMOV SIGNALIZÁCIE SPROSTREDKOVANÝCH NITRÁTOVÝMI LIPIDMI, KTORÉ CHARAKTERIZUJÚ POSTTRANSLAČNÉ MECHANIZMY MODIFIKÁCIE BIELKOVÍN POMOCOU NITROALQUILACIONU, AKO AJ INTERAKCIE NITRÁTOVÝCH MASTNÝCH KYSELÍN SO SIGNÁLNYMI DRÁHAMI PRI FYZIOLOGICKÝCH A ENVIRONMENTÁLNYCH STRESOVÝCH PODMIENKACH. NA TENTO ÚČEL ZISTENIE A IDENTIFIKÁCIA IN VIVO CIEĽOV BUNIEK NITROALQUILACION SPROSTREDKOVANÝCH NITRÁTOVÝMI LIPIDMI POČAS VÝVOJA A V SITUÁCIÁCH STRESU ABIOTICO V ARABIDOPSIS THALIANA. SÚBEŽNE SA ANALYZUJÚ MECHANIZMY SIGNALIZÁCIE KYSELINY NO2LN, KTORÉ SA PODIEĽAJÚ NA INDUKCII SNO A HSPS, AKO AJ KONTROLNÉ MECHANIZMY, KTORÉ MODULUJÚ HLADINY NITRÁTOV LIPIDOV. RÔZNE EXPERIMENTÁLNE NÁVRHY, KTORÉ PODPORUJÚ NAVRHOVANÉ CIELE, SA VYKONAJÚ POMOCOU MULTIDISCIPLINÁRNEJ KOMBINÁCIE TECHNÍK NUKLEÁRNEJ MAGNETICKEJ REZONANČNEJ SPEKTROSKOPIE (RMN), TROJITEJ ŠTVORNÁSOBKOVEJ HMOTNOSTNEJ SPEKTROMETRIE (HPLC-MS/MS), PROTEOMIKY S POUŽITÍM IZOBARICKÝCH TMT ZNAČENIA A HMOTNOSTNEJ SPEKTROMETRIE V TANDEME (LC-MS/MS), MOLEKULÁRNEJ POUŽITÍM CHROMATÍNOVÝCH (ČIP) A MOLEKULÁRNYCH TRANSFORMÁTOROV GENETICA POMOCOU TRANSFORMÁTOROV ARABIDOPSIS. VŠETKY TIETO MECHANIZMY NIE SÚ V RASTLINÁCH ZNÁME A DOSIAHNUTÉ VÝSLEDKY BY MOHLI MAŤ BIOTECHNOLOGICKÝ A AGRONOMICKÝ VÝZNAM AKO BIOTECHNOLOGICKÉ NÁSTROJE NO. V SKUTOČNOSTI JE NÁVRH V SÚLADE S VÝZVOU Č. 2 V RÁMCI PROGRAMU HORIZONT 2020, KTORÚ PODPORUJÚ RÔZNE SUBJEKTY A SPOLOČNOSTI. (Slovak)
18 August 2022
0 references
TÁ STAIDÉIR AR OCSAÍD NÍTREACH (NÍL) I BPLANDAÍ AR LEIBHÉAL MÓILÍNEACH DÍRITHE GO PRÍOMHA AR MHODHNUITHE IAR-AISTRITHE (PTMS) DE PHRÓITÉINÍ NEAMH-MHEÁNAITHE A SHAINAITHINT AGUS A THRÉITHRIÚ, AMHAIL NITRATION AGUS S-NITROSILATION AGUS A N-ÉIFEACHT AR GHNÍOMHAÍOCHT BHITHEOLAÍOCH. LÉIRIGH STAIDÉIR LE DÉANAÍ I GCEALLA AINMHITHE NACH FÉIDIR LEIS DIFEAR A DHÉANAMH DO LIPIDÍ TRÍ MHÓILÍNÍ A GHINIÚINT AR A DTUGTAR LIPIDÍ NÍOTRÁITITHE. IS FÉIDIR LEIS NA DÍORTHAIGH LIPIDIC NÍOTRÁITITHE SEO PTMS A FHEIDHMIÚ AR SPRIOCANNA PRÓITÉINE AR A DTUGTAR NITROALQUILACION A DHÉANANN IDIRGHABHÁIL AR ÉIFEACHTAÍ FISEOLAÍOCHA AGUS COMHARTHAÍOCHTA NÍOS CUMHACHTAÍ NÁ IAD SIÚD DEN UIMHIR, ÁFACH, ACH AMHÁIN I GCÁS OBAIR LE DÉANAÍ AR ÁR NGRÚPA A DHÍORTHAÍTEAR ÓN TIONSCADAL ROIMHE SEO, NÍL AON FHAISNÉIS ANN FAOI LÁITHREACHT AGUS FEIDHM LIPIDÍ NÍOTRÁITITHE IN ORGÁNAIGH GLASRAÍ. GO DEIMHIN, LÉIRIGH NA TORTHAÍ SEO LÁITHREACHT INGINIÚIL AIGÉAD NITROLINOLENIC (NO2-LN) I ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA AGUS PISUM SATIVUM CHOMH MAITH LENA MHODHNÚ AR FUD NA FORBARTHA AGUS MAR FHREAGRA AR CHÁSANNA ÉAGSÚLA STRUS ABIOTICO. INA THEANNTA SIN, LÉIRÍODH GO NGLACANN NO2-LN PÁIRT GHNÍOMHACH I MEITIBILEACHT AN NO TRÍ SCAOILEADH GAN AON AGUS BHUNAIGH NA STAIDÉIR AR TRANSCRIPTOMICA FEIDHMIÚIL AG BAINT ÚSÁIDE AS RNA-SEQ RÓL COMHARTHAÍOCHTA NA MÓILÍNÍ SEO, RUD A LÉIRÍONN GO BHFUIL BAINT AG NO2-LN GO PRÍOMHA LEIS AN BHFREAGAIRT CHOSANTA I GCOINNE CÁSANNA ÉAGSÚLA STRUS OCSAÍDIÚCHÁIN AGUS STRUS ABIOTICO, TRÍ MHODHNÚ LEIBHÉIL TRANSCRITIONAL PRÓITÉINÍ (SPS). AGUS AN CÚLRA SIN Á CHUR SAN ÁIREAMH, DÍREOIDH AN TOGRA SEO AR STAIDÉAR A DHÉANAMH AR MHEICNÍOCHTAÍ COMHARTHAÍOCHTA A DHÉANANN LIPIDÍ NÍOTRÁITITHE, RUD A LÉIRÍONN MEICNÍOCHTAÍ IAR-AISTRITHEACHA AN MHODHNAITHE AR PHRÓITÉINÍ AG NITROALQUILACION, CHOMH MAITH LE HIDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ AIGÉID SHAILLEACHA NÍOTRÁITITHE LE CONAIRÍ COMHARTHAÍOCHTA FAOI CHOINNÍOLLACHA STRUIS FISEOLAÍOCHA AGUS COMHSHAOIL ARAON. CHUN NA CRÍCHE SIN, SPRIOCANNA CILLE NITROALQUILACION A BHRATH AGUS A SHAINAITHINT IN VIVO ARNA N-IDIRGHABHÁIL AG LIPIDÍ NÍOTRÁITITHE LE LINN FORBARTHA AGUS I GCÁSANNA STRUS ABIOTICO IN ARABIDOPSIS THALIANA. AG AN AM CÉANNA, DÉANFAR ANAILÍS AR NA MEICNÍOCHTAÍ COMHARTHAÍOCHTA AIGÉID NO2LN A BHAINEANN LE IONDUCHTÚ SNOS AGUS HSPANNA, CHOMH MAITH LEIS NA MEICNÍOCHTAÍ RIALAITHE A MHODHNAÍONN LEIBHÉIL LIPID NÍOTRÁITITHE. DÉANFAR NA DEARAÍ TURGNAMHACHA ÉAGSÚLA A THACAÍONN LEIS NA CUSPÓIRÍ ATÁ BEARTAITHE TRÍ ÚSÁID A BHAINT AS MEASCÁN ILDISCIPLÍNEACH DE THEICNÍCÍ SPEICTRIMÉADAIS ATHSHONDAIS MHAIGHNÉADAIGH NÚICLÉACH (RMN), MAIS-SPEICTRIMÉADRACHTA QUADRUPLE TRIPLE (HPLC-MS/MS), PRÓITÉAMAÍOCHT AG BAINT ÚSÁIDE AS MARCÁIL TMT ISOBARACH AGUS ANAILÍS MAIS-SPEICTRIMÉADRACHTA IN TANDEM (LC-MS/MS), MÓILÍNEACH AG ÚSÁID CLAOCHLADÁIN CHROMATIN (SLIS) AGUS MÓILÍNEACHA AG BAINT ÚSÁIDE AS CLAOCHLADÁIN ARABIDOPSIS. NÍL NA MEICNÍOCHTAÍ SIN AR FAD AR EOLAS I BPLANDAÍ, AGUS D’FHÉADFADH ÁBHARTHACHT BHITEICNEOLAÍOCHTA AGUS AGRANAMAÍOCH A BHEITH AG NA TORTHAÍ A FHAIGHTEAR MAR UIRLISÍ BITEICNEOLAÍOCHTA AN UIMH. GO DEIMHIN, TÁ AN TOGRA I GCOMHRÉIR LE HUIMHIR DHÚSHLÁN A DÓ LAISTIGH DEN CHLÁR FÍS 2020 Á THACÚ AG EINTITIS AGUS CUIDEACHTAÍ ÉAGSÚLA. (Irish)
18 August 2022
0 references
STUDIE O OXIDU DUSNATÉM (NO) V ROSTLINÁCH NA MOLEKULÁRNÍ ÚROVNI SE ZAMĚŘILY PŘEDEVŠÍM NA IDENTIFIKACI A CHARAKTERIZACI POSTTRANSLAČNÍCH MODIFIKACÍ (PTM) NEZPROSTŘEDKOVANÝCH PROTEINŮ, JAKO JE NITRACE A S-NITROSILATION A JEJICH VLIV NA BIOLOGICKOU AKTIVITU. NEDÁVNÉ STUDIE NA ZVÍŘECÍCH BUŇKÁCH UKÁZALY, ŽE TO NEMŮŽE OVLIVNIT ANI LIPIDY GENEROVÁNÍM MOLEKUL NAZÝVANÝCH NITROITÁLNÍ LIPIDY. TYTO NITROITÁLNÍ LIPIDOVÉ DERIVÁTY MOHOU PŮSOBIT PTM NA PROTEINOVÉ CÍLE ZVANÉ NITROALQUILACION, KTERÉ ZPROSTŘEDKOVÁVAJÍ FYZIOLOGICKÉ A SIGNALIZAČNÍ ÚČINKY SILNĚJŠÍ NEŽ ÚČINKY Č., S VÝJIMKOU NEDÁVNÉ PRÁCE NAŠÍ SKUPINY ODVOZENÉ Z PŘEDCHOZÍHO PROJEKTU, NEEXISTUJÍ ŽÁDNÉ INFORMACE O PŘÍTOMNOSTI A FUNKCI NITROITÁLNÍCH LIPIDŮ V ROSTLINNÝCH ORGANISMECH. TYTO VÝSLEDKY UKÁZALY ENDOGENNÍ PŘÍTOMNOST KYSELINY NITROLINOLENIC (NO2-LN) V ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA A PISUM SATIVUM, JAKOŽ I JEJÍ MODULACI V PRŮBĚHU VÝVOJE A V REAKCI NA RŮZNÉ SITUACE STRESU PŘÍPRAVKU ABIOTICO. KROMĚ TOHO BYLO PROKÁZÁNO, ŽE NO2-LN SE AKTIVNĚ PODÍLÍ NA METABOLISMU NO PROSTŘEDNICTVÍM UVOLŇOVÁNÍ NO A IN VIVO TVORBA PROTEINŮ S-NITROSOTIOLES (SNOSES) ZAPOJENÝCH DO PRAKTICKY VŠECH BIOLOGICKÝCH PROCESŮ, KTERÉ PODPORUJÍ BUNĚČNOU AKTIVITU, KROMĚ TOHO STUDIE FUNKČNÍ TRANSCRIPTOMICA POMOCÍ RNA-SEQ STANOVILY SIGNALIZAČNÍ ROLI TĚCHTO MOLEKUL, COŽ UKAZUJE, ŽE NO2-LN SE PODÍLÍ PŘEDEVŠÍM NA OBRANNÉ REAKCI PROTI RŮZNÝM SITUACÍM OXIDAČNÍHO STRESU A ABIOTICO STRESU, A TO PROSTŘEDNICTVÍM MODULACE TRANSCRITIONAL ÚROVNÍ PROTEINŮ (SPSP). S OHLEDEM NA TYTO SKUTEČNOSTI SE TENTO NÁVRH ZAMĚŘÍ NA STUDII MECHANISMŮ SIGNALIZACE ZPROSTŘEDKOVANÝCH DUSIČNANY LIPIDŮ, KTERÉ CHARAKTERIZUJÍ POSTTRANSLAČNÍ MECHANISMY MODIFIKACE PROTEINŮ NITROALQUILACION, JAKOŽ I INTERAKCE DUSIČNANOVÝCH MASTNÝCH KYSELIN S CESTAMI ZNAČENÍ ZA FYZIOLOGICKÝCH I ENVIRONMENTÁLNÍCH STRESOVÝCH PODMÍNEK. ZA TÍMTO ÚČELEM SE DETEKCE A IDENTIFIKACE BUNĚK NITROALQUILACION IN VIVO ZAMĚŘUJE NA ZPROSTŘEDKOVANÉ DUSIČNANOVÝMI LIPIDY BĚHEM VÝVOJE A V SITUACÍCH STRESU PŘÍPRAVKU ABIOTICO V ARABIDOPSIS THALIANA. SOUČASNĚ BUDOU ANALYZOVÁNY MECHANISMY SIGNALIZACE KYSELINY NO2LN, KTERÉ SE PODÍLEJÍ NA INDUKCI SNO A HSPS, JAKOŽ I KONTROLNÍ MECHANISMY, KTERÉ MODULUJÍ HLADINY DUSIČNANŮ LIPIDŮ. RŮZNÉ EXPERIMENTÁLNÍ NÁVRHY, O NĚŽ SE NAVRHOVANÉ CÍLE OPÍRAJÍ, BUDOU PROVEDENY POMOCÍ MULTIDISCIPLINÁRNÍ KOMBINACE TECHNIK JADERNÉ MAGNETICKÉ REZONANCE (RMN), TROJNÁSOBNÉ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE (HPLC-MS/MS), PROTEOMIKY POMOCÍ IZOBARICKÉHO TMT ZNAČENÍ A HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE V TANDEMU (LC-MS/MS), MOLEKULÁRNÍCH POMOCÍ CHROMATINOVÝCH (ČIPOVÝCH) A MOLEKULÁRNÍCH TRANSFORMÁTORŮ GENETICA VYUŽÍVAJÍCÍCH ARABIDOPSOVÉ TRANSFORMÁTORY. VŠECHNY TYTO MECHANISMY NEJSOU V ROSTLINÁCH ZNÁMY A ZÍSKANÉ VÝSLEDKY BY MOHLY MÍT BIOTECHNOLOGICKÝ A AGRONOMICKÝ VÝZNAM JAKO BIOTECHNOLOGICKÉ NÁSTROJE Č., VE SKUTEČNOSTI JE NÁVRH V SOULADU S VÝZVOU Č. 2 V RÁMCI PROGRAMU HORIZONT 2020, KTERÝ PODPORUJE RŮZNÉ SUBJEKTY A SPOLEČNOSTI. (Czech)
18 August 2022
0 references
OS ESTUDOS SOBRE ÓXIDO NÍTRICO (NO) EM PLANTAS A NÍVEL MOLECULAR CENTRARAM-SE PRINCIPALMENTE NA IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DE MODIFICAÇÕES PÓS-TRADUCIONAIS (PTMS) DE PROTEÍNAS NÃO MEDIADAS, COMO A NITRAÇÃO E A S-NITROSILAÇÃO E O SEU EFEITO NA ATIVIDADE BIOLÓGICA. ESTUDOS RECENTES EM CÉLULAS ANIMAIS MOSTRARAM QUE TAMBÉM NÃO PODE AFETAR OS LIPÍDIOS GERANDO MOLÉCULAS CHAMADAS LIPÍDIOS NITRADOS. ESSES DERIVADOS LIPÍDICOS NITRADOS PODEM EXERCER PTMS EM ALVOS PROTEICOS CHAMADOS NITROALQUILACION QUE MEDIAM EFEITOS FISIOLÓGICOS E DE SINALIZAÇÃO MAIS PODEROSOS DO QUE OS DO N.º, NO ENTANTO, COM EXCEÇÃO DO TRABALHO RECENTE DE NOSSO GRUPO DERIVADO DO PROJETO ANTERIOR, NÃO HÁ INFORMAÇÕES SOBRE A PRESENÇA E A FUNÇÃO DE LIPÍDIOS NITRADOS EM ORGANISMOS VEGETAIS. DE FATO, ESSES RESULTADOS MOSTRARAM A PRESENÇA ENDÓGENA DE ÁCIDO NITROLINOLENIC (NO2-LN) EM ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA E PISUM SATIVUM, BEM COMO SUA MODULAÇÃO AO LONGO DO DESENVOLVIMENTO E EM RESPOSTA A DIFERENTES SITUAÇÕES DE ESTRESSE ABIOTICO. ALÉM DISSO, TEM SIDO DEMONSTRADO QUE O NO2-LN PARTICIPA ATIVAMENTE DO METABOLISMO DO NO ATRAVÉS DA LIBERAÇÃO DE NO E DA FORMAÇÃO IN VIVO DE S-NITROSOTIOLES (SNOSES) DE PROTEÍNAS ENVOLVIDAS EM PRATICAMENTE TODOS OS PROCESSOS BIOLÓGICOS QUE SUSTENTAM A ATIVIDADE TELEMÓVEL, ALÉM DISSO, OS ESTUDOS DE TRANSCRIPTOMICA FUNCIONAL UTILIZANDO RNA-SEQ ESTABELECERAM O PAPEL DE SINALIZAÇÃO DESSAS MOLÉCULAS, MOSTRANDO QUE O NO2-LN ESTÁ ENVOLVIDO PRINCIPALMENTE NA RESPOSTA DE DEFESA CONTRA DIFERENTES SITUAÇÕES DE ESTRESSE OXIDATIVO E ESTRESSE ABIOTICO, ATRAVÉS DA MODULAÇÃO DOS NÍVEIS TRANSCRIIONAIS DE PROTEÍNAS (SPSPS). TENDO EM CONTA ESTE PANO DE FUNDO, ESTA PROPOSTA CENTRAR-SE-Á NO ESTUDO DOS MECANISMOS DE SINALIZAÇÃO MEDIADOS POR LIPÍDIOS NITRADOS, CARACTERIZANDO OS MECANISMOS PÓS-TRADUCIONAIS DE MODIFICAÇÃO DE PROTEÍNAS POR NITROALQUILACION, BEM COMO AS INTERAÇÕES DE ÁCIDOS GRAXOS NITRADOS COM VIAS DE SINALIZAÇÃO EM CONDIÇÕES DE ESTRESSE FISIOLÓGICO E AMBIENTAL. PARA TANTO, A DETEÇÃO E IDENTIFICAÇÃO IN VIVO DE ALVOS TELEMÓVEIS NITROALQUILACION MEDIADOS POR LIPÍDIOS NITRADOS DURANTE O DESENVOLVIMENTO E EM SITUAÇÕES DE ESTRESSE ABIOTICO EM ARABIDOPSIS THALIANA. PARALELAMENTE, SERÃO ANALISADOS OS MECANISMOS DE SINALIZAÇÃO DO ÁCIDO NO2LN ENVOLVIDOS NA INDUÇÃO DE SNOS E HSPS, BEM COMO OS MECANISMOS DE CONTROLE QUE MODULAM OS NÍVEIS LIPÍDICOS NITRADOS. OS DIFERENTES PROJETOS EXPERIMENTAIS QUE SUSTENTAM OS OBJETIVOS PROPOSTOS SERÃO FEITOS USANDO UMA COMBINAÇÃO MULTIDISCIPLINAR DE TÉCNICAS DE ESPETROSCOPIA DE RESSONÂNCIA MAGNÉTICA NUCLEAR (RMN), ESPETROMETRIA DE MASSA TRIPLA QUÁDRUPLA (HPLC-MS/MS), PROTEÔMICA USANDO MARCAÇÃO ISOBÁRICA TMT E ANÁLISE DE ESPETROMETRIA DE MASSA EM TANDEM (LC-MS/MS), MOLECULAR USANDO TRANSFORMADORES DE CROMATINA (CHIP) E GENETICA MOLECULAR USANDO TRANSFORMADORES ARABIDOPSIS. TODOS ESSES MECANISMOS SÃO DESCONHECIDOS NAS PLANTAS, E OS RESULTADOS OBTIDOS PODEM TER RELEVÂNCIA BIOTECNOLÓGICA E AGRONÔMICA COMO FERRAMENTAS BIOTECNOLÓGICAS DO NO. DE FATO, A PROPOSTA ESTÁ DE ACORDO COM O DESAFIO NÚMERO DOIS NO ÂMBITO DO PROGRAMA HORIZONTE 2020, SENDO APOIADO POR DIFERENTES ENTIDADES E EMPRESAS. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
UURINGUD LÄMMASTIKOKSIIDI (EI) KOHTA TAIMEDES MOLEKULAARTASANDIL ON PEAMISELT KESKENDUNUD MITTEVAHENDATUD VALKUDE TRANSLATSIOONIJÄRGSETE MODIFIKATSIOONIDE KINDLAKSTEGEMISELE JA KIRJELDAMISELE, NAGU NITREERIMINE JA S-NITROSILATION, NING NENDE MÕJU BIOLOOGILISELE AKTIIVSUSELE. HILJUTISED LOOMRAKKUDE UURINGUD ON NÄIDANUD, ET SEE EI SAA MÕJUTADA KA LIPIIDIDE TEKET, TEKITADES NITRAADITUD LIPIIDIDEKS NIMETATAVAID MOLEKULE. NEED NITRAADITUD LIPIIDIDE DERIVAADID VÕIVAD AVALDADA PTM-E VALKUDELE, MIDA NIMETATAKSE NITROALQUILACIONIKS, MIS VAHENDAVAD FÜSIOLOOGILIST JA SIGNALISATSIOONIEFEKTI, MIS ON VÕIMSAM KUI NR., KUID VÄLJA ARVATUD MEIE RÜHMA HILJUTISED TÖÖD, MIS ON TULETATUD EELMISEST PROJEKTIST, PUUDUB TEAVE NITRAADITUD LIPIIDIDE ESINEMISE JA FUNKTSIOONI KOHTA TAIMSETES ORGANISMIDES. TEGELIKULT ON NEED TULEMUSED NÄIDANUD NITROLINOLENIC-HAPPE (NO2-LN) ENDOGEENSET ESINEMIST ARABIDOPSIS THALIANAS, ORYZA SATIVAS JA PISUM SATIVUMIS NING SELLE MODULATSIOONI KOGU ARENGU JOOKSUL JA VASTUSENA ABIOTICO STRESSI ERINEVATELE OLUKORDADELE. LISAKS ON TÕENDATUD, ET NO2-LN OSALEB AKTIIVSELT NO METABOLISMIS EI VABANEMISE KAUDU JA VALKUDE S-NITROSOTIOLES (SNOSES) IN VIVO MOODUSTUMISES, MIS ON SEOTUD PRAKTILISELT KÕIGIS RAKULIST AKTIIVSUST TOETAVATES BIOLOOGILISTES PROTSESSIDES, LISAKS TUVASTATI FUNKTSIONAALSE TRANSCRIPTOMICA UURINGUTES RNA-SEQI ABIL NENDE MOLEKULIDE SIGNAALROLL, MIS NÄITAB, ET NO2-LN ON PEAMISELT SEOTUD KAITSEREAKTSIOONIGA ERINEVATE OKSÜDATIIVSE STRESSI JA ABIOTICO STRESSI VASTU TRANSKRITIONALSETE VALKUDE (SPSP) TASEME MODULATSIOONI KAUDU. SEDA TAUSTA ARVESSE VÕTTES KESKENDUTAKSE KÄESOLEVAS ETTEPANEKUS NITRAADITUD LIPIIDIDE VAHENDATUD SIGNAALIMISMEHHANISMIDE UURIMISELE, ISELOOMUSTADES NITROALQUILACION’I POOLT VALKUDE MODIFITSEERIMISEL TEKKIVAID TRANSLATSIOONIJÄRGSEID MEHHANISME NING NITRAADITUD RASVHAPETE JA MÄRGISTUSRADADE VASTASTIKMÕJUSID NII FÜSIOLOOGILISTES KUI KA KESKKONNASTRESSI TINGIMUSTES. SEL EESMÄRGIL AVASTATAKSE JA TEHAKSE IN VIVO KINDLAKS NITROALQUILACION’I RAKU SIHTMÄRGID, MIDA VAHENDAVAD NITRAADITUD LIPIIDID ARENGU AJAL JA ABIOTICO STRESSIOLUKORDADES ARABIDOPSIS THALIANAS. PARALLEELSELT ANALÜÜSITAKSE SNO-DE JA HSPSI INDUTSEERIMISEGA SEOTUD NO2LN-HAPPE SIGNAALIMISMEHHANISME NING NITRAADI LIPIIDIDE TASET MODULEERIVAID KONTROLLIMEHHANISME. KAVANDATUD EESMÄRKIDE ALUSEKS OLEVAD ERINEVAD KATSEPROJEKTID TEHAKSE, KASUTADES MULTIDISTSIPLINAARSET KOMBINATSIOONI TUUMAMAGNETRESONANTSSPEKTROSKOOPIA (RMN) TEHNIKATEST, KOLMEKORDSET NELJAKORDSET MASSISPEKTROMEETRIAT (HPLC-MS/MS), PROTEOOMIKAT, MIS KASUTAB ISOBAARSET TMT MÄRGISTUST JA MASSISPEKTROMEETRILIST ANALÜÜSI TANDEM (LC-MS/MS), MOLEKULAARSEID KROMATIINI (KIIP) JA MOLEKULAARSEID GENETICA TRANSFORMAATOREID, MILLES KASUTATAKSE ARABIDOPSIS’I TRAFOSID. KÕIK NEED MEHHANISMID EI OLE TAIMEDES TEADA JA SAAVUTATUD TULEMUSED VÕIVAD OLLA BIOTEHNOLOOGILISED JA AGRONOOMILISED OLULISED KUI NR BIOTEHNOLOOGILISED VAHENDID. TEGELIKULT ON ETTEPANEK KOOSKÕLAS PROGRAMMI „HORISONT 2020“ TEISE VÄLJAKUTSEGA, MIDA TOETAVAD ERINEVAD ÜKSUSED JA ETTEVÕTTED. (Estonian)
18 August 2022
0 references
A NÖVÉNYEKBEN MOLEKULÁRIS SZINTEN A NITROGÉN-MONOXIDRA (NO) VONATKOZÓ VIZSGÁLATOK ELSŐSORBAN A NEM KÖZVETÍTETT FEHÉRJÉK TRANSZLÁCIÓS UTÁNI MÓDOSÍTÁSAINAK (PTM-EK) AZONOSÍTÁSÁRA ÉS JELLEMZÉSÉRE ÖSSZPONTOSÍTOTTAK, MINT PÉLDÁUL A NITRÁLÁS ÉS AZ S-NITROSILATION, VALAMINT EZEKNEK A BIOLÓGIAI AKTIVITÁSRA GYAKOROLT HATÁSA. AZ ÁLLATI SEJTEKEN VÉGZETT LEGÚJABB VIZSGÁLATOK AZT MUTATTÁK, HOGY NEM BEFOLYÁSOLHATJA A LIPIDEKET AZÁLTAL, HOGY MOLEKULÁKAT TERMEL, ÚGYNEVEZETT NITROD LIPIDEKET. EZEK A NITRÁTOS LIPIDSZÁRMAZÉKOK PTM-EKET FEJTHETNEK KI A NITROALQUILACION NEVŰ FEHÉRJECÉLOKRA, AMELYEK A FIZIOLÓGIAI ÉS JELZŐHATÁSOKAT ERŐSEBBEN KÖZVETÍTIK, MINT A NEM. AZONBAN, KIVÉVE A CSOPORTUNKNAK AZ ELŐZŐ PROJEKTBŐL SZÁRMAZÓ KÖZELMÚLTBELI MUNKÁJÁT, NINCS INFORMÁCIÓ A NITRÓD LIPIDEK JELENLÉTÉRŐL ÉS MŰKÖDÉSÉRŐL A NÖVÉNYI ORGANIZMUSOKBAN. VALÓJÁBAN EZEK AZ EREDMÉNYEK KIMUTATTÁK A NITROLINOLENIC SAV (NO2-LN) ENDOGÉN JELENLÉTÉT AZ ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA ÉS PISUM SATIVUM-BAN, VALAMINT A FEJLESZTÉS SORÁN ÉS AZ ABIOTICO STRESSZ KÜLÖNBÖZŐ HELYZETÉRE REAGÁLVA. EZEN TÚLMENŐEN KIMUTATTÁK, HOGY A NO2-LN AKTÍVAN RÉSZT VESZ A NO METABOLIZMUSÁBAN A NO FELSZABADULÁSA ÉS A FEHÉRJE S-NITROSOTIOLES (SNOSES) IN VIVO KÉPZŐDÉSE RÉVÉN, AMELY GYAKORLATILAG A SEJTAKTIVITÁST TÁMOGATÓ BIOLÓGIAI FOLYAMATOKBAN VESZ RÉSZT, EMELLETT A TRANSCRIPTOMICA RNS-SEQ FELHASZNÁLÁSÁVAL VÉGZETT VIZSGÁLATAI MEGÁLLAPÍTOTTÁK EZEKNEK A MOLEKULÁKNAK A JELADÓ SZEREPÉT, AMI AZT MUTATJA, HOGY A NO2-LN FŐKÉNT AZ OXIDATÍV STRESSZ ÉS AZ ABIOTICO STRESSZ KÜLÖNBÖZŐ HELYZETEIVEL SZEMBENI VÉDEKEZÉSBEN VESZ RÉSZT A FEHÉRJÉK TRANSCRITIONAL SZINTJEINEK MODULÁCIÓJA RÉVÉN. E HÁTTÉR FIGYELEMBEVÉTELÉVEL EZ A JAVASLAT A NITRÓD LIPIDEK ÁLTAL KÖZVETÍTETT JELZŐMECHANIZMUSOK TANULMÁNYOZÁSÁRA, A FEHÉRJÉK NITROALQUILACION ÁLTALI MÓDOSÍTÁSÁRA VONATKOZÓ POSZTTRANSZLÁCIÓS MECHANIZMUSOK JELLEMZÉSÉRE, VALAMINT A NITRÁTZSÍRSAVAK ÉS A JELZŐUTAK KÖLCSÖNHATÁSÁRA ÖSSZPONTOSÍT MIND FIZIOLÓGIAI, MIND KÖRNYEZETI STRESSZHELYZETBEN. E CÉLBÓL A NITROALQUILACION SEJTCÉLOK IN VIVO KIMUTATÁSA ÉS AZONOSÍTÁSA, AMELYET NITROD LIPIDEK KÖZVETÍTENEK A FEJLESZTÉS SORÁN ÉS AZ ABIOTICO STRESSZHELYZETEKBEN ARABIDOPSIS THALIANA-BAN. EZZEL PÁRHUZAMOSAN ELEMZIK AZ SNO-K ÉS A HSPS INDUKCIÓJÁBAN RÉSZT VEVŐ NO2LN SAVJELZŐ MECHANIZMUSOKAT, VALAMINT A NITRÁT LIPIDSZINTEKET MODULÁLÓ ELLENŐRZÉSI MECHANIZMUSOKAT. A JAVASOLT CÉLKITŰZÉSEKET ALÁTÁMASZTÓ KÜLÖNBÖZŐ KÍSÉRLETI TERVEK A NUKLEÁRIS MÁGNESES REZONANCIA SPEKTROSZKÓPIAI (RMN) TECHNIKÁK, A HÁRMAS NÉGYSZERES TÖMEGSPEKTROMETRIA (HPLC-MS/MS), AZ IZOBARIC TMT JELÖLÉST ALKALMAZÓ PROTEOMIKA (LC-MS/MS), A MOLEKULÁRIS KROMATIN (CHIP) ÉS A MOLEKULÁRIS GENETICA TRANSZFORMÁTOROK ARABIDOPSIS TRANSZFORMÁTOROKAT HASZNÁLÓ MULTIDISZCIPLINÁRIS KOMBINÁCIÓJÁVAL KÉSZÜLNEK. MINDEZEK A MECHANIZMUSOK NEM ISMERTEK A NÖVÉNYEKBEN, ÉS AZ ELÉRT EREDMÉNYEK BIOTECHNOLÓGIAI ÉS AGRONÓMIAI JELENTŐSÉGGEL BÍRHATNAK A NO. BIOTECHNOLÓGIAI ESZKÖZEIKÉNT, SŐT, A JAVASLAT ÖSSZHANGBAN VAN A HORIZONT 2020 PROGRAM MÁSODIK KIHÍVÁSÁVAL, AMELYET KÜLÖNBÖZŐ SZERVEZETEK ÉS VÁLLALATOK TÁMOGATNAK. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
ИЗСЛЕДВАНИЯТА НА АЗОТНИЯ ОКСИД (NO) В РАСТЕНИЯТА НА МОЛЕКУЛНО НИВО СА СЪСРЕДОТОЧЕНИ ГЛАВНО ВЪРХУ ИДЕНТИФИЦИРАНЕТО И ХАРАКТЕРИЗИРАНЕТО НА ПОСТТРАНСЛАЦИОННИТЕ МОДИФИКАЦИИ НА НЕМЕДИИРАНИ ПРОТЕИНИ, КАТО НИТРАЦИЯ И S-NITROSILATION И ТЯХНОТО ВЪЗДЕЙСТВИЕ ВЪРХУ БИОЛОГИЧНАТА АКТИВНОСТ. ПОСЛЕДНИТЕ ПРОУЧВАНИЯ ВЪРХУ ЖИВОТИНСКИ КЛЕТКИ ПОКАЗВАТ, ЧЕ ТОЙ НЕ МОЖЕ ДА ПОВЛИЯЕ И НА ЛИПИДИТЕ, КАТО ГЕНЕРИРА МОЛЕКУЛИ, НАРЕЧЕНИ НИТРИДНИ ЛИПИДИ. ТЕЗИ НИТРИДНИ ЛИПИДНИ ПРОИЗВОДНИ МОГАТ ДА УПРАЖНЯВАТ PTMS ВЪРХУ ПРОТЕИНОВИ ЦЕЛИ, НАРЕЧЕНИ NITROALQUILACION, КОИТО ПОСРЕДНИЧАТ ФИЗИОЛОГИЧНИТЕ И СИГНАЛНИТЕ ЕФЕКТИ, ПО-МОЩНИ ОТ ТЕЗИ НА NO. ОБАЧЕ, С ИЗКЛЮЧЕНИЕ НА СКОРОШНАТА РАБОТА НА НАШАТА ГРУПА, ПОЛУЧЕНА ОТ ПРЕДИШНИЯ ПРОЕКТ, НЯМА ИНФОРМАЦИЯ ЗА НАЛИЧИЕТО И ФУНКЦИЯТА НА НИТРИДНИ ЛИПИДИ В РАСТИТЕЛНИТЕ ОРГАНИЗМИ. ВСЪЩНОСТ ТЕЗИ РЕЗУЛТАТИ ПОКАЗВАТ ЕНДОГЕННОТО НАЛИЧИЕ НА NITROLINOLENIC КИСЕЛИНА (NO2-LN) В ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA И PISUM SATIVUM, КАКТО И НЕЙНАТА МОДУЛАЦИЯ ПО ВРЕМЕ НА ЦЯЛОТО РАЗВИТИЕ И В ОТГОВОР НА РАЗЛИЧНИ СИТУАЦИИ НА ABIOTICO СТРЕС. ОСВЕН ТОВА Е ДОКАЗАНО, ЧЕ NO2-LN УЧАСТВА АКТИВНО В МЕТАБОЛИЗМА НА NO ЧРЕЗ ОСВОБОЖДАВАНЕТО НА NO И IN VIVO ОБРАЗУВАНЕТО НА ПРОТЕИН S-NITROSOTIOLES (SNOSES), УЧАСТВАЩИ В ПРАКТИЧЕСКИ ВСИЧКИ БИОЛОГИЧНИ ПРОЦЕСИ, КОИТО ПОДДЪРЖАТ КЛЕТЪЧНАТА АКТИВНОСТ, ОСВЕН ТОВА ПРОУЧВАНИЯТА НА ФУНКЦИОНАЛНИТЕ TRANSCRIPTOMICA, ИЗПОЛЗВАЩИ РНК-SEQ, УСТАНОВЯВАТ СИГНАЛНАТА РОЛЯ НА ТЕЗИ МОЛЕКУЛИ, ПОКАЗВАЙКИ, ЧЕ NO2-LN УЧАСТВА ГЛАВНО В ЗАЩИТАТА СРЕЩУ РАЗЛИЧНИ СИТУАЦИИ НА ОКСИДАТИВЕН СТРЕС И ABIOTICO СТРЕС, ЧРЕЗ МОДУЛАЦИЯ НА TRANSCRITIONAL НИВА НА ПРОТЕИНИ (SPSPS). КАТО СЕ ИМА ПРЕДВИД ТОЗИ КОНТЕКСТ, НАСТОЯЩОТО ПРЕДЛОЖЕНИЕ ЩЕ СЕ СЪСРЕДОТОЧИ ВЪРХУ ПРОУЧВАНЕТО НА МЕХАНИЗМИТЕ ЗА СИГНАЛИЗИРАНЕ, МЕДИИРАНИ ОТ НИТРИДНИ ЛИПИДИ, ХАРАКТЕРИЗИРАЩИ ПОСТТРАНСЛАЦИОННИТЕ МЕХАНИЗМИ ЗА МОДИФИКАЦИЯ НА ПРОТЕИНИТЕ ОТ NITROALQUILACION, КАКТО И ВЗАИМОДЕЙСТВИЯТА НА НИТРИДНИ МАСТНИ КИСЕЛИНИ С ПЪТИЩА ЗА СИГНАЛИЗИРАНЕ КАКТО ПРИ ФИЗИОЛОГИЧНИ УСЛОВИЯ, ТАКА И ПРИ СТРЕС В ОКОЛНАТА СРЕДА. ЗА ТАЗИ ЦЕЛ, ОТКРИВАНЕ И ИДЕНТИФИЦИРАНЕ IN VIVO НА КЛЕТКИ NITROALQUILACION ЦЕЛИ МЕДИИРАНИ ОТ НИТРИДНИ ЛИПИДИ ПО ВРЕМЕ НА РАЗРАБОТВАНЕТО И В СИТУАЦИИ НА ABIOTICO СТРЕС В ARABIDOPSIS THALIANA. УСПОРЕДНО С ТОВА ЩЕ БЪДАТ АНАЛИЗИРАНИ МЕХАНИЗМИТЕ ЗА СИГНАЛИЗИРАНЕ С КИСЕЛИНА НА NO2LN, УЧАСТВАЩИ В ИНДУКЦИЯТА НА SNOS И HSPS, КАКТО И МЕХАНИЗМИТЕ ЗА КОНТРОЛ, КОИТО МОДУЛИРАТ НИВАТА НА НИТРИДНИ ЛИПИДИ. РАЗЛИЧНИТЕ ЕКСПЕРИМЕНТАЛНИ ПРОЕКТИ, КОИТО СА В ОСНОВАТА НА ПРЕДЛОЖЕНИТЕ ЦЕЛИ, ЩЕ БЪДАТ НАПРАВЕНИ, КАТО СЕ ИЗПОЛЗВА МУЛТИДИСЦИПЛИНАРНА КОМБИНАЦИЯ ОТ ТЕХНИКИ НА ЯДРЕН МАГНИТНО-РЕЗОНАНСНА СПЕКТРОСКОПИЯ (RMN), ТРОЙНА ЧЕТВОРНА МАССПЕКТРОМЕТРИЯ (HPLC-MS/MS), ПРОТЕОМИКА С ИЗПОЛЗВАНЕ НА ИЗОБАРЕН TMT МАРКИРАНЕ И МАССПЕКТРОМЕТРИЧЕН АНАЛИЗ В ТАНДЕМ (LC-MS/MS), МОЛЕКУЛЯРНО ИЗПОЛЗВАНЕ НА ХРОМАТИНОВИ ТРАНСФОРМАТОРИ (ЧИП) И МОЛЕКУЛЯРНИ ГЕНЕТИКА ТРАНСФОРМАТОРИ, ИЗПОЛЗВАЩИ АРАБИДОПСИС ТРАНСФОРМАТОРИ. ВСИЧКИ ТЕЗИ МЕХАНИЗМИ СА НЕИЗВЕСТНИ В РАСТЕНИЯТА И ПОЛУЧЕНИТЕ РЕЗУЛТАТИ БИХА МОГЛИ ДА ИМАТ БИОТЕХНОЛОГИЧНО И АГРОНОМСКО ЗНАЧЕНИЕ КАТО БИОТЕХНОЛОГИЧНИ ИНСТРУМЕНТИ НА NO. ВСЪЩНОСТ ПРЕДЛОЖЕНИЕТО Е В СЪОТВЕТСТВИЕ С ПРЕДИЗВИКАТЕЛСТВО НОМЕР ДВЕ В РАМКИТЕ НА ПРОГРАМАТА „ХОРИЗОНТ 2020“, КОЕТО СЕ ПОДКРЕПЯ ОТ РАЗЛИЧНИ СУБЕКТИ И ДРУЖЕСТВА. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
TIRIANT AZOTO OKSIDĄ (NR.) AUGALUOSE MOLEKULINIU LYGMENIU, DAUGIAUSIA DĖMESIO BUVO SKIRIAMA NEMODIFIKUOTŲ BALTYMŲ, TOKIŲ KAIP NITRINIMAS IR S-NITROSILATION, POTRANSLIACINIŲ MODIFIKACIJŲ (PTM) IDENTIFIKAVIMUI IR APIBŪDINIMUI BEI JŲ POVEIKIUI BIOLOGINIAM AKTYVUMUI. NAUJAUSI TYRIMAI SU GYVŪNŲ LĄSTELĖMIS PARODĖ, KAD JIS TAIP PAT NEGALI PAVEIKTI LIPIDŲ GENERUOJANT MOLEKULES, VADINAMAS NITRINTAIS LIPIDAIS. ŠIE NITRINTI LIPIDINIAI DARINIAI GALI SUKELTI PTM BALTYMŲ TAIKINIAMS, VADINAMIEMS NITROALQUILACION, KURIE TARPININKAUJA FIZIOLOGINIAM IR SIGNALINIAM POVEIKIUI, KURIS YRA GALINGESNIS UŽ NR., TAČIAU, IŠSKYRUS NESENIAI ATLIKTĄ MŪSŲ GRUPĖS DARBĄ, GAUTĄ IŠ ANKSTESNIO PROJEKTO, NĖRA INFORMACIJOS APIE NITRINTŲ LIPIDŲ BUVIMĄ IR FUNKCIJĄ AUGALINIUOSE ORGANIZMUOSE. IŠ TIESŲ, ŠIE REZULTATAI PARODĖ ENDOGENINĮ NITROLINOLENIC RŪGŠTIES (NO2-LN) BUVIMĄ ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA IR PISUM SATIVUM, TAIP PAT JOS MODULIAVIMĄ KURIANT IR REAGUOJANT Į SKIRTINGAS ABIOTICO STRESO SITUACIJAS. BE TO, ĮRODYTA, KAD NO2-LN AKTYVIAI DALYVAUJA METABOLIZME NR, IŠSKIRIANT NO IR IN VIVO FORMUOJANT BALTYMUS S-NITROSOTIOLES (SNOSES), DALYVAUJANČIUS PRAKTIŠKAI VISUOSE BIOLOGINIUOSE PROCESUOSE, KURIE PALAIKO LĄSTELIŲ AKTYVUMĄ, BE TO, FUNKCINIAI TRANSCRIPTOMICA TYRIMAI, NAUDOJANT RNR-SEQ, NUSTATĖ ŠIŲ MOLEKULIŲ SIGNALIZAVIMO VAIDMENĮ, O TAI RODO, KAD NO2-LN DAUGIAUSIA DALYVAUJA GYNYBOS ATSAKE Į ĮVAIRIAS OKSIDACINIO STRESO IR ABIOTICO STRESO SITUACIJAS, MODULIUOJANT TRANSCRITIONAL BALTYMŲ KIEKĮ (SPSP). ATSIŽVELGIANT Į ŠIAS APLINKYBES, ŠIAME PASIŪLYME DAUGIAUSIA DĖMESIO BUS SKIRIAMA NITRINTŲ LIPIDŲ SIGNALŲ PERDAVIMO MECHANIZMŲ TYRIMUI, APIBŪDINANT NITROALQUILACION ATLIEKAMUS BALTYMŲ MODIFIKAVIMO PO TRANSLIACINIUS MECHANIZMUS, TAIP PAT NITRINTŲ RIEBALŲ RŪGŠČIŲ SĄVEIKĄ SU ŽYMENIMIS TIEK FIZIOLOGINĖMIS, TIEK APLINKOS STRESO SĄLYGOMIS. ŠIUO TIKSLU NITROALQUILACION LĄSTELIŲ APTIKIMAS IR IDENTIFIKAVIMAS IN VIVO, SUSIJĘS SU NITRINTAIS LIPIDAIS, VYSTYMOSI IR ABIOTICO STRESO SITUACIJOSE ARABIDOPSIS THALIANA METU. TUO PAČIU METU BUS ANALIZUOJAMI NO2LN RŪGŠTIES SIGNALIZAVIMO MECHANIZMAI, SUSIJĘ SU SNO IR HSPS INDUKCIJA, TAIP PAT KONTROLĖS MECHANIZMAI, KURIE MODULIUOJA NITRINTŲ LIPIDŲ KIEKĮ. ĮVAIRŪS EKSPERIMENTINIAI PROJEKTAI, KURIAIS GRINDŽIAMI SIŪLOMI TIKSLAI, BUS KURIAMI TAIKANT DAUGIADALYKĮ BRANDUOLINIO MAGNETINIO REZONANSO SPEKTROSKOPIJOS (RMN) METODŲ, TRIGUBOS KETURGUBOS MASĖS SPEKTROMETRIJOS (HPLC-MS/MS), PROTEOMIKOS, NAUDOJANT IZOBARINĮ TMT ŽENKLINIMĄ IR MASĖS SPEKTROMETRIJOS ANALIZĘ TANDEMO (LC-MS/MS), MOLEKULINĖS NAUDOJANT CHROMATINO (LUSTĄ) IR MOLEKULINIUS GENETICA TRANSFORMATORIUS NAUDOJANT ARABIDOPSIO TRANSFORMATORIUS, DERINĮ. VISI ŠIE MECHANIZMAI NĖRA ŽINOMI GAMYKLOSE, O GAUTI REZULTATAI GALI TURĖTI BIOTECHNOLOGINĘ IR AGRONOMINĘ REIKŠMĘ KAIP BIOTECHNOLOGINES PRIEMONES NR., PASIŪLYMAS ATITINKA ANTRĄJĮ UŽDAVINĮ PROGRAMOJE „HORIZONTAS 2020“, KURIĄ REMIA SKIRTINGI SUBJEKTAI IR ĮMONĖS. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
STUDIJE O DUŠIKOVOM OKSIDU (BR.) U BILJKAMA NA MOLEKULARNOJ RAZINI UGLAVNOM SU BILE USMJERENE NA IDENTIFIKACIJU I KARAKTERIZACIJU POSTTRANSLACIJSKIH MODIFIKACIJA (PTM) NEMEDIIRANIH BJELANČEVINA, KAO ŠTO SU NITRATI I S-NITROSILATION TE NJIHOV UČINAK NA BIOLOŠKU AKTIVNOST. NEDAVNA ISPITIVANJA NA STANICAMA ŽIVOTINJA POKAZALA SU DA NE MOŽE UTJECATI NA LIPIDE STVARANJEM MOLEKULA NAZIVA NITRATIRANI LIPIDI. TI NITRATIRANI LIPIDNI DERIVATI MOGU VRŠITI PTM-OVE NA PROTEINSKE CILJEVE NAZVANE NITROALQUILACION KOJI POSREDUJU FIZIOLOŠKIM I SIGNALIZIRAJUĆIM UČINCIMA SNAŽNIJE OD ONIH NO. MEĐUTIM, OSIM NEDAVNOG RADA NAŠE GRUPE IZVEDENOG IZ PRETHODNOG PROJEKTA, NEMA INFORMACIJA O PRISUTNOSTI I FUNKCIJI NITRATIRANIH LIPIDA U BILJNIM ORGANIZMIMA. TI SU REZULTATI ZAPRAVO POKAZALI ENDOGENU PRISUTNOST NITROLINOLENIC KISELINE (NO2-LN) U ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA I PISUM SATIVUM, KAO I NJEZINU MODULACIJU TIJEKOM RAZVOJA I KAO ODGOVOR NA RAZLIČITE SITUACIJE STRESA ABIOTICO. OSIM TOGA, POKAZALO SE DA NO2-LN AKTIVNO SUDJELUJE U METABOLIZMU NO KROZ OSLOBAĐANJE NO I IN VIVO FORMIRANJE PROTEINA S-NITROSOTIOLES (SNOSES) KOJI SU UKLJUČENI U GOTOVO SVE BIOLOŠKE PROCESE KOJI PODRŽAVAJU STANIČNU AKTIVNOST, OSIM TOGA, STUDIJAMA FUNKCIONALNE TRANSCRIPTOMICA POMOĆU RNA-SEQ UTVRĐENA JE SIGNALNA ULOGA TIH MOLEKULA, POKAZUJUĆI DA JE NO2-LN UGLAVNOM UKLJUČEN U OBRAMBENI ODGOVOR PROTIV RAZLIČITIH SITUACIJA OKSIDATIVNOG STRESA I ABIOTICO STRESA, MODULACIJOM TRANSCRITIONAL RAZINA PROTEINA (SPSP). UZIMAJUĆI U OBZIR TU POZADINU, OVAJ ĆE PRIJEDLOG BITI USMJEREN NA PROUČAVANJE MEHANIZAMA SIGNALIZACIJE POSREDOVANIH NITRATIRANIM LIPIDIMA, KARAKTERIZIRAJUĆI POSTTRANSLACIJSKE MEHANIZME MODIFIKACIJE PROTEINA NITROALQUILACIONOM, KAO I INTERAKCIJE NITRATNIH MASNIH KISELINA SA SIGNALNIM PUTEVIMA U FIZIOLOŠKIM I OKOLIŠNIM STRESNIM UVJETIMA. U TU SVRHU, OTKRIVANJE I IDENTIFIKACIJA IN VIVO META STANICA NITROALQUILACION POSREDOVANIH NITRATIRANIM LIPIDIMA TIJEKOM RAZVOJA I U SITUACIJAMA STRESA ABIOTICO U ARABIDOPSIS THALIANA. ISTODOBNO ĆE SE ANALIZIRATI MEHANIZMI SIGNALIZACIJE NO2LN KISELINE UKLJUČENI U INDUKCIJU SNO-OVA I HSPS-A, KAO I KONTROLNI MEHANIZMI KOJI MODULIRAJU RAZINE NITRATIRANIH LIPIDA. RAZLIČITI EKSPERIMENTALNI DIZAJNI NA KOJIMA SE TEMELJE PREDLOŽENI CILJEVI BIT ĆE NAPRAVLJENI POMOĆU MULTIDISCIPLINARNE KOMBINACIJE TEHNIKA NUKLEARNE MAGNETSKE REZONANCE (RMN), TROSTRUKE ČETVEROSTRUKE MASENE SPEKTROMETRIJE (HPLC-MS/MS), PROTEOMIKE POMOĆU IZOBARSKOG TMT OZNAČAVANJA I ANALIZE MASENE SPEKTROMETRIJE U TANDEMU (LC-MS/MS), MOLEKULARNE POMOĆU KROMATINA (ČIP) I MOLEKULARNE GENETICA TRANSFORMATORE POMOĆU ARABIDOPSIS TRANSFORMATORA. SVI TI MEHANIZMI NISU POZNATI U POSTROJENJIMA, A DOBIVENI REZULTATI MOGLI BI IMATI BIOTEHNOLOŠKU I AGRONOMSKU VAŽNOST KAO BIOTEHNOLOŠKI ALATI BR., ZAPRAVO, PRIJEDLOG JE U SKLADU S DRUGIM IZAZOVOM U OKVIRU PROGRAMA OBZOR 2020. KOJI PODUPIRU RAZLIČITI SUBJEKTI I PODUZEĆA. (Croatian)
18 August 2022
0 references
STUDIER AV KVÄVEOXID (NR) I VÄXTER PÅ MOLEKYLÄR NIVÅ HAR FRÄMST INRIKTATS PÅ IDENTIFIERING OCH KARAKTERISERING AV POSTTRANSLATIONELLA MODIFIERINGAR (PTM) AV ICKE-MEDIERADE PROTEINER, SÅSOM NITRAT OCH S-NITROSILATION OCH DERAS INVERKAN PÅ BIOLOGISK AKTIVITET. NYLIGEN GENOMFÖRDA STUDIER AV DJURCELLER HAR VISAT ATT DET INTE KAN PÅVERKA LIPIDER GENOM ATT GENERERA MOLEKYLER SOM KALLAS NITRITERADE LIPIDER. DESSA NITRERADE LIPIDDERIVAT KAN UTÖVA PTMS PÅ PROTEINMÅL SOM KALLAS NITROALQUILACION SOM FÖRMEDLAR FYSIOLOGISKA OCH SIGNALERANDE EFFEKTER MER KRAFTFULLA ÄN DE I NO. DOCK, MED UNDANTAG FÖR VÅR GRUPPS SENASTE ARBETE SOM HÄRLETTS FRÅN DET TIDIGARE PROJEKTET, FINNS DET INGEN INFORMATION OM FÖREKOMSTEN OCH FUNKTIONEN AV NITRERADE LIPIDER I VEGETABILISKA ORGANISMER. I SJÄLVA VERKET HAR DESSA RESULTAT VISAT DEN ENDOGENA FÖREKOMSTEN AV NITROLINOLENIC SYRA (NO2-LN) I ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA OCH PISUM SATIVUM SAMT DESS MODULERING UNDER HELA UTVECKLINGEN OCH SOM SVAR PÅ OLIKA SITUATIONER AV ABIOTICO STRESS. DESSUTOM HAR DET VISAT SIG ATT NO2-LN DELTAR AKTIVT I METABOLISMEN AV NO GENOM FRISÄTTNING AV NO OCH IN VIVO-BILDNINGEN AV PROTEIN S-NITROSOTIOLES (SNOSES) INVOLVERAD I PRAKTISKT TAGET ALLA BIOLOGISKA PROCESSER SOM STÖDER CELLULÄR AKTIVITET, DESSUTOM HAR STUDIERNA AV FUNKTIONELL TRANSCRIPTOMICA MED RNA-SEQ ETABLERAT SIGNALROLLEN FÖR DESSA MOLEKYLER, VILKET VISAR ATT NO2-LN HUVUDSAKLIGEN ÄR INVOLVERAT I FÖRSVARET MOT OLIKA SITUATIONER AV OXIDATIV STRESS OCH ABIOTICO STRESS, GENOM MODULERING AV TRANSCRITIONAL NIVÅER AV PROTEINER (SPSP). MOT BAKGRUND AV DETTA KOMMER DETTA FÖRSLAG ATT INRIKTAS PÅ STUDIER AV MEKANISMERNA FÖR SIGNALERING SOM FÖRMEDLAS AV NITRERADE LIPIDER, SOM KARAKTERISERAR DE POSTTRANSLATIONELLA MEKANISMERNA FÖR MODIFIERING AV PROTEINER GENOM NITROALQUILACION, SAMT INTERAKTIONEN MELLAN NITRIGA FETTSYROR OCH SKYLTNINGSVÄGAR UNDER BÅDE FYSIOLOGISKA OCH MILJÖMÄSSIGA STRESSFÖRHÅLLANDEN. FÖR DETTA ÄNDAMÅL, UPPTÄCKT OCH IDENTIFIERING IN VIVO AV NITROALQUILACION CELLMÅL MEDIERADE AV NITRERADE LIPIDER UNDER UTVECKLING OCH I SITUATIONER AV ABIOTICO STRESS I ARABIDOPSIS THALIANA. PARALLELLT KOMMER DE NO2LN-SYRESIGNALERINGSMEKANISMER SOM ÄR INVOLVERADE I INDUKTIONEN AV SNO OCH HSPS ATT ANALYSERAS, LIKSOM DE KONTROLLMEKANISMER SOM MODULERAR NITRATHALTER AV LIPID. DE OLIKA EXPERIMENTELLA KONSTRUKTIONER SOM LIGGER TILL GRUND FÖR DE FÖRESLAGNA MÅLEN KOMMER ATT GÖRAS MED HJÄLP AV EN TVÄRVETENSKAPLIG KOMBINATION AV KÄRNMAGNETISK RESONANSSPEKTROSKOPI (RMN), TRIPPEL FYRFALDIG MASSPEKTROMETRI (HPLC-MS/MS), PROTEOMIK MED ISOBARIC TMT-MÄRKNING OCH MASSPEKTROMETRIANALYS I TANDEM (LC-MS/MS), MOLEKYLÄR MED KROMATIN (CHIP) OCH MOLEKYLÄR GENETICATRANSFORMATORER MED HJÄLP AV ARABIDOPSISTRANSFORMATORER. ALLA DESSA MEKANISMER ÄR OKÄNDA I VÄXTER, OCH DE RESULTAT SOM UPPNÅS KAN HA BIOTEKNISK OCH AGRONOMISK RELEVANS SOM BIOTEKNISKA VERKTYG AV NR. I SJÄLVA VERKET ÄR FÖRSLAGET I LINJE MED UTMANING NUMMER TVÅ INOM PROGRAMMET HORISONT 2020 STÖDS AV OLIKA ENHETER OCH FÖRETAG. (Swedish)
18 August 2022
0 references
STUDIILE PRIVIND OXIDUL NITRIC (NO) ÎN PLANTE LA NIVEL MOLECULAR S-AU AXAT ÎN PRINCIPAL PE IDENTIFICAREA ȘI CARACTERIZAREA MODIFICĂRILOR POST-TRALAȚIONALE (TMP) ALE PROTEINELOR NEMEDIATE, CUM AR FI NITRAȚIA ȘI S-NITROSILATION ȘI EFECTUL ACESTORA ASUPRA ACTIVITĂȚII BIOLOGICE. STUDII RECENTE PE CELULE ANIMALE AU ARĂTAT CĂ NU POATE AFECTA ȘI LIPIDELE PRIN GENERAREA DE MOLECULE NUMITE LIPIDE NITRAȚI. ACEȘTI DERIVAȚI LIPIDICI NITRAȚI POT EXERCITA PTM-URI ASUPRA ȚINTELOR PROTEICE NUMITE NITROALQUILACION CARE MEDIAZĂ EFECTELE FIZIOLOGICE ȘI DE SEMNALIZARE MAI PUTERNICE DECÂT CELE ALE NO. CU TOATE ACESTEA, CU EXCEPȚIA LUCRĂRILOR RECENTE ALE GRUPULUI NOSTRU DERIVATE DIN PROIECTUL ANTERIOR, NU EXISTĂ INFORMAȚII DESPRE PREZENȚA ȘI FUNCȚIONAREA LIPIDELOR NITRAȚI ÎN ORGANISMELE VEGETALE. DE FAPT, ACESTE REZULTATE AU ARĂTAT PREZENȚA ENDOGENĂ A ACIDULUI NITROLINOLENIC (NO2-LN) ÎN ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA ȘI PISUM SATIVUM, PRECUM ȘI MODULAREA ACESTUIA PE PARCURSUL DEZVOLTĂRII ȘI CA RĂSPUNS LA DIFERITE SITUAȚII DE STRES ABIOTICO. ÎN PLUS, S-A DEMONSTRAT CĂ NO2-LN PARTICIPĂ ACTIV LA METABOLISMUL NO PRIN ELIBERAREA DE NO ȘI FORMAREA IN VIVO A PROTEINELOR NITROSOTIOLES (SNOSES) IMPLICATE ÎN PRACTIC TOATE PROCESELE BIOLOGICE CARE SUSȚIN ACTIVITATEA CELULARĂ, ÎN PLUS, STUDIILE DE TRANSCRIPTOMICA FUNCȚIONALĂ FOLOSIND SEQ ARN AU STABILIT ROLUL DE SEMNALIZARE AL ACESTOR MOLECULE, DEMONSTRÂND CĂ NO2-LN ESTE IMPLICAT ÎN PRINCIPAL ÎN RĂSPUNSUL DE APĂRARE ÎMPOTRIVA DIFERITELOR SITUAȚII DE STRES OXIDATIV ȘI STRES ABIOTICO, PRIN MODULAREA NIVELURILOR TRANSCRITIONALE ALE PROTEINELOR (SPSP). ȚINÂND SEAMA DE ACEST CONTEXT, PREZENTA PROPUNERE SE VA CONCENTRA PE STUDIUL MECANISMELOR DE SEMNALIZARE MEDIATE DE LIPIDE NITRAȚI, CARACTERIZÂND MECANISMELE POSTTRALAȚIONALE DE MODIFICARE A PROTEINELOR DE CĂTRE NITROALQUILACION, PRECUM ȘI INTERACȚIUNILE ACIZILOR GRAȘI NITRAȚI CU CĂILE DE SEMNALIZARE ÎN CONDIȚII DE STRES FIZIOLOGIC ȘI DE MEDIU. ÎN ACEST SCOP, DETECTAREA ȘI IDENTIFICAREA IN VIVO A CELULEI NITROALQUILACION VIZEAZĂ MEDIATE DE LIPIDE NITRAȚI ÎN TIMPUL DEZVOLTĂRII ȘI ÎN SITUAȚII DE STRES ABIOTICO ÎN ARABIDOPSIS THALIANA. ÎN PARALEL, VOR FI ANALIZATE MECANISMELE DE SEMNALIZARE A ACIDULUI NO2LN IMPLICATE ÎN INDUCEREA SNO ȘI HSPS, PRECUM ȘI MECANISMELE DE CONTROL CARE MODULEAZĂ NIVELURILE LIPIDELOR NITRAȚI. DIFERITELE MODELE EXPERIMENTALE CARE STAU LA BAZA OBIECTIVELOR PROPUSE VOR FI REALIZATE FOLOSIND O COMBINAȚIE MULTIDISCIPLINARĂ DE TEHNICI DE SPECTROSCOPIE DE REZONANȚĂ MAGNETICĂ NUCLEARĂ (RMN), SPECTROMETRIE DE MASĂ TRIPLU CVADRUPLĂ (HPLC-MS/MS), PROTEOMICĂ CARE UTILIZEAZĂ MARCAREA IZOBARĂ TMT ȘI ANALIZA SPECTROMETRIEI DE MASĂ ÎN TANDEM (LC-MS/MS), TRANSFORMATOARE MOLECULARE CU CROMATINĂ (CIP) ȘI TRANSFORMATOARE GENETICA MOLECULARĂ UTILIZÂND TRANSFORMATOARE ARABIDOPSIS. TOATE ACESTE MECANISME SUNT NECUNOSCUTE ÎN PLANTE, IAR REZULTATELE OBȚINUTE AR PUTEA AVEA RELEVANȚĂ BIOTEHNOLOGICĂ ȘI AGRONOMICĂ CA INSTRUMENTE BIOTEHNOLOGICE ALE NO. DE FAPT, PROPUNEREA ESTE ÎN CONFORMITATE CU PROVOCAREA NUMĂRUL DOI DIN CADRUL PROGRAMULUI ORIZONT 2020 FIIND SUSȚINUTĂ DE ENTITĂȚI ȘI COMPANII DIFERITE. (Romanian)
18 August 2022
0 references
ŠTUDIJE DUŠIKOVEGA OKSIDA (ŠT.) V RASTLINAH NA MOLEKULARNI RAVNI SO SE OSREDOTOČILE PREDVSEM NA IDENTIFIKACIJO IN KARAKTERIZACIJO POSTTRANSLACIJSKIH MODIFIKACIJ NEMEDIIRANIH BELJAKOVIN, KOT STA NITRACIJA IN S-NITROSILATION, TER NA NJIHOV VPLIV NA BIOLOŠKO AKTIVNOST. NEDAVNE ŠTUDIJE NA ŽIVALSKIH CELICAH SO POKAZALE, DA NE MORE VPLIVATI TUDI NA LIPIDE Z USTVARJANJEM MOLEKUL, IMENOVANIH NITRIRANI LIPIDI. TI NITRIRANI LIPIDNI DERIVATI LAHKO PTM IZVAJAJO NA PROTEINSKIH TARČAH, IMENOVANIH NITROALQUILACION, KI POSREDUJEJO FIZIOLOŠKE IN SIGNALNE UČINKE, KI SO MOČNEJŠI OD UČINKOV ŠT., VENDAR RAZEN NEDAVNEGA DELA NAŠE SKUPINE, KI IZHAJA IZ PREJŠNJEGA PROJEKTA, NI INFORMACIJ O PRISOTNOSTI IN DELOVANJU NITRIRANIH LIPIDOV V RASTLINSKIH ORGANIZMIH. DEJANSKO SO TI REZULTATI POKAZALI ENDOGENO PRISOTNOST NITROLINOLENIC KISLINE (NO2-LN) V ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA IN PISUM SATIVUM TER NJENO MODULACIJO SKOZI CELOTEN RAZVOJ IN KOT ODZIV NA RAZLIČNE SITUACIJE STRESA ABIOTICO. POLEG TEGA JE BILO DOKAZANO, DA NO2-LN AKTIVNO SODELUJE PRI PRESNOVI NO S SPROŠČANJEM NO IN IN VIVO TVORBO BELJAKOVIN S-NITROSOTIOLES (SNOSES), VKLJUČENIH V PRAKTIČNO VSE BIOLOŠKE PROCESE, KI PODPIRAJO CELIČNO AKTIVNOST, POLEG TEGA PA SO ŠTUDIJE FUNKCIONALNE TRANSCRIPTOMICA Z UPORABO RNA-SEQ DOLOČILE SIGNALNO VLOGO TEH MOLEKUL, KAR KAŽE, DA JE NO2-LN VPLETEN PREDVSEM V OBRAMBNI ODZIV PROTI RAZLIČNIM SITUACIJAM OKSIDATIVNEGA STRESA IN STRESA ABIOTICO Z MODULACIJO TRANSCRITIONAL RAVNI PROTEINOV (SPSP). OB UPOŠTEVANJU NAVEDENEGA SE BO TA PREDLOG OSREDOTOČIL NA ŠTUDIJO MEHANIZMOV SIGNALIZACIJE, POSREDOVANE Z NITRIRANIMI LIPIDI, KI OZNAČUJEJO POSTTRANSLACIJSKE MEHANIZME SPREMINJANJA BELJAKOVIN S STRANI NITROALQUILACIONA, PA TUDI INTERAKCIJE NITRIRANIH MAŠČOBNIH KISLIN Z OZNAČEVALNIMI POTMI V FIZIOLOŠKIH IN OKOLJSKIH STRESNIH RAZMERAH. V TA NAMEN DETEKCIJO IN IDENTIFIKACIJO IN VIVO CELIC NITROALQUILACION TARČE, KI JIH POSREDUJEJO NITRIRANI LIPIDI MED RAZVOJEM IN V RAZMERAH STRESA ABIOTICO V ARABIDOPSIS THALIANA. VZPOREDNO BODO ANALIZIRANI SIGNALNI MEHANIZMI NO2LN, KI SODELUJEJO PRI INDUKCIJI SNO IN HSPS, TER NADZORNI MEHANIZMI, KI MODULIRAJO RAVNI NITRIRANIH LIPIDOV. RAZLIČNE EKSPERIMENTALNE ZASNOVE, NA KATERIH TEMELJIJO PREDLAGANI CILJI, BODO IZDELANE Z UPORABO MULTIDISCIPLINARNE KOMBINACIJE TEHNIK JEDRSKE MAGNETNORESONANČNE SPEKTROSKOPIJE (RMN), TROJNE ŠTIRIKRATNE MASNE SPEKTROMETRIJE (HPLC-MS/MS), PROTEOMIKE Z UPORABO IZOBARIČNEGA OZNAČEVANJA TMT IN ANALIZE MASNE SPEKTROMETRIJE V TANDEMU (LC-MS/MS), MOLEKULARNE UPORABE KROMATINA (ČIPA) IN MOLEKULARNIH TRANSFORMATORJEV GENETICA Z UPORABO TRANSFORMATORJEV ARABIDOPSIS. VSI TI MEHANIZMI V RASTLINAH NISO ZNANI, DOBLJENI REZULTATI PA BI LAHKO IMELI BIOTEHNOLOŠKI IN AGRONOMSKI POMEN KOT BIOTEHNOLOŠKA ORODJA NO. V RESNICI JE PREDLOG V SKLADU Z DRUGIM IZZIVOM V OKVIRU PROGRAMA OBZORJE 2020, KI GA PODPIRAJO RAZLIČNI SUBJEKTI IN PODJETJA. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
BADANIA NAD TLENKU AZOTU (NR) W ROŚLINACH NA POZIOMIE MOLEKULARNYM KONCENTROWAŁY SIĘ GŁÓWNIE NA IDENTYFIKACJI I CHARAKTERYZACJI POTRANSLACYJNYCH MODYFIKACJI BIAŁEK NIEBĘDĄCYCH POŚREDNIKAMI, TAKICH JAK NITRACJA I S-NITROSILATION ORAZ ICH WPŁYW NA AKTYWNOŚĆ BIOLOGICZNĄ. OSTATNIE BADANIA NA KOMÓRKACH ZWIERZĘCYCH WYKAZAŁY, ŻE NIE MOŻE RÓWNIEŻ WPŁYWAĆ NA LIPIDY POPRZEZ GENEROWANIE CZĄSTECZEK ZWANYCH LIPIDAMI AZOTANOWYMI. TE NITROWANE POCHODNE LIPIDOWE MOGĄ WYWIERAĆ PTM NA CELE BIAŁKOWE ZWANE NITROALQUILACION, KTÓRE POŚREDNICZĄ W FIZJOLOGICZNYCH I SYGNALIZACYJNYCH EFEKTACH SILNIEJSZYCH NIŻ TE Z NO., Z WYJĄTKIEM OSTATNICH PRAC NASZEJ GRUPY WYWODZĄCYCH SIĘ Z POPRZEDNIEGO PROJEKTU, NIE MA INFORMACJI NA TEMAT OBECNOŚCI I FUNKCJI AZOTANOWANYCH LIPIDÓW W ORGANIZMACH ROŚLINNYCH. W RZECZYWISTOŚCI WYNIKI TE WYKAZAŁY ENDOGENNĄ OBECNOŚĆ KWASU NITROLINOLENIC (NO2-LN) W ARABIDOPSIS THALIANA, ORYZA SATIVA I PISUM SATIVUM, A TAKŻE JEGO MODULACJĘ W TRAKCIE ROZWOJU I W ODPOWIEDZI NA RÓŻNE SYTUACJE STRESU ABIOTICO. PONADTO WYKAZANO, ŻE NO2-LN AKTYWNIE UCZESTNICZY W METABOLIZMIE NO POPRZEZ UWALNIANIE NO I TWORZENIE IN VIVO BIAŁEK S-NITROSOTIOLES (SNOSES) ZAANGAŻOWANYCH W PRAKTYCZNIE WSZYSTKIE PROCESY BIOLOGICZNE, KTÓRE WSPIERAJĄ AKTYWNOŚĆ KOMÓRKOWĄ, PONADTO BADANIA FUNKCJONALNE TRANSCRIPTOMICA PRZY UŻYCIU RNA-SEQ USTALIŁY ROLĘ SYGNALIZACYJNĄ TYCH CZĄSTECZEK, WYKAZUJĄC, ŻE NO2-LN JEST GŁÓWNIE ZAANGAŻOWANY W ODPOWIEDŹ OBRONNĄ PRZED RÓŻNYMI SYTUACJAMI STRESU OKSYDACYJNEGO I STRESU ABIOTICO, POPRZEZ MODULACJĘ TRANSCRITIONAL POZIOMÓW BIAŁEK (SPSP). BIORĄC POD UWAGĘ POWYŻSZE OKOLICZNOŚCI, NINIEJSZY WNIOSEK SKUPI SIĘ NA BADANIU MECHANIZMÓW SYGNALIZOWANIA LIPIDÓW AZOTANOWYCH, CHARAKTERYZUJĄCYCH POTRANSLACYJNE MECHANIZMY MODYFIKACJI BIAŁEK PRZEZ NITROALQUILACION, A TAKŻE INTERAKCJE AZOTANOWANYCH KWASÓW TŁUSZCZOWYCH ZE ŚCIEŻKAMI ZNAKOWANIA W WARUNKACH ZARÓWNO STRESU FIZJOLOGICZNEGO, JAK I ŚRODOWISKOWEGO. W TYM CELU, WYKRYWANIE I IDENTYFIKACJA IN VIVO KOMÓREK NITROALQUILACION CELE POŚREDNICZĄCE PRZEZ AZOTANY LIPIDÓW PODCZAS ROZWOJU I W SYTUACJACH STRESU ABIOTICO W ARABIDOPSIS THALIANA. RÓWNOLEGLE PRZEANALIZOWANE ZOSTANĄ MECHANIZMY SYGNALIZACYJNE KWASU NO2LN ZWIĄZANE Z INDUKCJĄ SNO I HSPS, A TAKŻE MECHANIZMY KONTROLI, KTÓRE MODULUJĄ POZIOM LIPIDÓW AZOTANOWYCH. RÓŻNE PROJEKTY EKSPERYMENTALNE, KTÓRE LEŻĄ U PODSTAW PROPONOWANYCH CELÓW, ZOSTANĄ WYKONANE Z WYKORZYSTANIEM MULTIDYSCYPLINARNEJ KOMBINACJI TECHNIK SPEKTROSKOPII JĄDROWEGO REZONANSU MAGNETYCZNEGO (RMN), POTRÓJNEJ CZTEROKROTNEJ SPEKTROMETRII MAS (HPLC-MS/MS), PROTEOMIKI WYKORZYSTUJĄCEJ IZOBARYCZNE OZNACZENIE TMT I ANALIZĘ SPEKTROMETRII MASOWEJ W TANDEMIE (LC-MS/MS), MOLEKULARNEJ ZA POMOCĄ TRANSFORMATORÓW CHROMATYNY (CHIP) I MOLEKULARNEJ GENETICA PRZY UŻYCIU TRANSFORMATORÓW ARABIDOPSIS. WSZYSTKIE TE MECHANIZMY SĄ NIEZNANE W ZAKŁADACH, A UZYSKANE WYNIKI MOGĄ MIEĆ ZNACZENIE BIOTECHNOLOGICZNE I AGRONOMICZNE JAKO BIOTECHNOLOGICZNE NARZĘDZIA NR., W RZECZYWISTOŚCI WNIOSEK JEST ZGODNY Z WYZWANIEM DRUGIM W RAMACH PROGRAMU „HORYZONT 2020” WSPIERANYM PRZEZ RÓŻNE PODMIOTY I PRZEDSIĘBIORSTWA. (Polish)
18 August 2022
0 references
Jaén
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
BIO2015-66390-P
0 references