METAGENOMIC APPROXIMATION FOR THE SEARCH FOR INDICATORS OF CONTAMINATION OF ENTERIC VIRUSES IN WATERS (Q3167756)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3167756 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | METAGENOMIC APPROXIMATION FOR THE SEARCH FOR INDICATORS OF CONTAMINATION OF ENTERIC VIRUSES IN WATERS |
Project Q3167756 in Spain |
Statements
108,709.42 Euro
0 references
199,650.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2018
0 references
30 September 2021
0 references
AGENCIA CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
0 references
46980
0 references
EL AGUA SE INGIERE COMO PARTE DE LA DIETA, SE UTILIZA PARA EL RIEGO DE CULTIVOS, PARA EL LAVADO Y LIMPIEZA DE LOS ALIMENTOS DURANTE SU PREPARACION Y, ADEMAS, ES PARTE ESENCIAL EN MUCHOS PRODUCTOS ALIMENTARIOS. LA PRESENCIA DE VIRUS ENTERICOS HUMANOS (POR EJEMPLO, NOROVIRUS HUMANO, VIRUS DE LA HEPATITIS A, ETC.) EN AGUA ESTA BIEN DOCUMENTADA PUDIENDO REPRESENTAR UNA IMPORTANTE AMENAZA PARA LA SALUD DEL CONSUMIDOR. ACTUALMENTE, EL CONTROL DE VIRUS ENTERICOS HUMANOS EN AGUAS SE BASA EN EL USO DE INDICADORES BACTERIANOS LOS CUALES, CON MUCHA FRECUENCIA, NO SE CORRELACIONAN CON LA PRESENCIA DE DICHOS PATOGENOS._x000D_ RECIENTEMENTE, LAS TECNICAS DE SECUENCIACION MASIVA (NGS) HAN ABIERTO UNA GRAN OPORTUNIDAD PARA CONOCER A FONDO LA DIVERSIDAD DE LAS POBLACIONES MICROBIANAS Y SIN DUDA CONSTITUYEN UNA BUENA HERRAMIENTA PARA ABORDAR LA BUSQUEDA DE INDICADORES VIRALES MAS ADECUADOS. EL OBJETIVO PRINCIPAL DEL PROYECTO ES ANALIZAR EL VIROMA (PRESENCIA Y ABUNDANCIA RELATIVA DE SECUENCIAS DE VIRUS, INCLUYENDO FAGOS Y VIRUS ENTERICOS HUMANOS) DE AGUAS RESIDUALES Y AGUAS REGENERADAS UTILIZANDO NGS PARA DETERMINAR LOS PATOGENOS VIRALES QUE SUPONEN UN RIESGO PARA EL CONSUMIDOR Y SELECCIONAR POSIBLES INDICADORES DE CONTAMINACION VIRAL. EN PRIMER LUGAR, SE OPTIMIZARA EL PROCEDIMIENTO PARA ENRIQUECER LAS SECUENCIAS VIRALES DE MUESTRAS DE AGUA. COMO MATERIAL DE PARTIDA, EL GRUPO DE INVESTIGACION DISPONE DE UN ELEVADO NUMERO DE MUESTRAS DE AGUAS RESIDUALES, AGUAS REGENERADAS Y AGUAS SUPERFICIALES, TANTO POSITIVAS COMO NEGATIVAS PARA NOROVIRUS HUMANO, EL VIRUS DE LA HEPATITIS A Y ASTROVIRUS HUMANO. DICHAS MUESTRAS SE ANALIZARAN POR NGS Y, ADEMAS, APLICAREMOS NUESTRA EXPERIENCIA CON REACTIVOS DE VIABILIDAD (POR EJEMPLO, PROPIODIO O ETIDIO DE MONOAZIDA) INCORPORANDOLOS COMO PRETRATAMIENTO Y COMBINANDOLO CON LA SECUENCIACION MASIVA. DE ESTE MODO, SE PODRA ESTIMAR NO SOLO EL VIROMA DE LAS MUESTRAS DE AGUA, SINO TAMBIEN SU POTENCIAL INFECTIVIDAD Y PERMITIRA EVALUAR LA EFICACIA DE LAS PLANTAS DE TRATAMIENTO DE AGUAS EN CUANTO A REDUCIR LA CARGA VIRAL EN AGUAS RESIDUALES. POR SU PARTE, LA DETERMINACION DEL VIROMA DE LAS AGUAS POSIBILITARA LA IDENTIFICACION DE NUEVOS VIRUS PATOGENOS EMERGENTES ASI COMO LA SELECCION DE UNO O MAS INDICADORES SIGNIFICATIVOS PARA PREDECIR LA PRESENCIA/ABUNDANCIA DE VIRUS PATOGENOS HUMANOS EN AGUAS (SIMILAR AL USO DE ESCHERICHIA COLI ASOCIADO CON LA PRESENCIA DE PATOGENOS BACTERIANOS HUMANOS). UNA VEZ DETERMINADOS LOS INDICADORES, SE PONDRA A PUNTO UN PROCEDIMIENTO PARA LA DETECCION Y CUANTIFICACION DEL INDICADOR/(ES) VIRAL/(ES), QUE PODRIA SER SUSCEPTIBLE DE PATENTE. DISPONER DE ESTE PROCEDIMIENTO RAPIDO Y DE FACIL APLICACION E IMPLEMENTACION, PERMITIRA REALIZAR UN CONTROL RUTINARIO Y EFECTIVO DE LOS VIRUS ENTERICOS, TANTO EN LOS LABORATORIOS DE CONTROL DE CALIDAD DE AGUA Y ALIMENTOS COMO EN LOS DE SALUD PUBLICA. (Spanish)
0 references
WATER IS INGESTED JUST AS A FOOD, IS USED FOR IRRIGATION OF PLANTS, FOR WASHING AND CLEANING FOOD DURING PREPARATION AND CONSTITUTES AN ESSENTIAL INGREDIENT IN MANY FOOD PRODUCTS. THE PRESENCE OF HUMAN ENTERIC VIRUSES (E.G. HUMAN NOROVIRUS, HEPATITIS A VIRUS, ETC) IN ENVIRONMENTAL WATERS IS WELL DOCUMENTED AND DEPENDING ON ITS USE IT CAN POSE A THREAT TO THE CONSUMER. CURRENTLY, PRESENCE OF HUMAN PATHOGENIC VIRUSES IN WATER RELIES ON BACTERIAL INDICATORS, WHICH FREQUENTLY FAIL TO CORRELATE WITH THE PRESENCE OF HUMAN ENTERIC VIRUSES. _x000D_ RECENTLY NEXT GENERATION SEQUENCING (NGS) TOOLS OPEN A GREAT OPPORTUNITY TO IDENTIFY RELIABLE VIRAL INDICATORS. THE MAIN OBJECTIVE OF THIS PROPOSAL IS TO DETERMINE THE VIRIOME (PRESENCE AND RELATIVE ABUNDANCE OF SEQUENCES FROM VIRUSES, INCLUDING PHAGES AND HUMAN ENTERIC VIRUSES, IN THE ENVIROMENT) OF SEWAGE AND RECLAIMED WATERS BY USING NGS. IN THE FRAMEWORK OF THIS PROJECT, THE PROCEDURE FOR ENRICHMENT OF VIRAL SEQUENCES FROM WATER SAMPLES WILL BE OPTIMIZED. THIS PROPOSAL BENEFITS FROM HAVING A LARGE PANEL OF SEWAGE, RECLAIMED AND SURFACE WATER SAMPLES POSITIVE FOR HUMAN NOROVIRUS, HEPATITIS A VIRUS AND HUMAN ASTROVIRUS. WE WILL EXPLOIT OUR EXPERIENCE IN THE USE OF VIABILITY DYES (E.G. PROPIDIUM MONOAZIDE OR ETHIDIUM MONOAZIDE) TO COMBINE THIS PRETREATMENT WITH NGS, IN ORDER TO ESTIMATE NOT ONLY THE ENTIRE VIRIOME OF THE WATER SAMPLES BUT ALSO THEIR POTENTIAL INFECTIVITY. THIS WILL FACILITATE THE EVALUATION OF THE WATER TREATMENT PLANTS IN ORDER TO REDUCE THE VIRAL LOAD FROM SEWAGE. IN ADDITION, THE DETERMINATION OF VIRIOME FROM WATERS MAY IDENTIFY NEW EMERGING VIRUSES. IN TOP OF THAT, THE PROPOSED PROJECT AIMS AT IDENTIFYING A MORE SIGNIFICANT INDICATOR/S OF THE PRESENCE/ABUNDANCE OF HUMAN PATHOGENIC VIRUSES IN DIFFERENT TYPES OF WATERS (SIMILARLY TO THE USE OF ESCHERICHIA COLI NUMBERS ASSOCIATED WITH THE PRESENCE OF HUMAN BACTERIAL PATHOGENS). THIS INSIGHT WILL FACILITATE THE DEVELOPMENT OF A TOOL FOR A RAPID DETECTION AND QUANTIFICATION OF THE VIRAL INDICATOR/S WHICH MIGHT BE PATENTED. THE IDENTIFICATION OF MEANINGFUL VIRAL INDICATOR/S WILL ALLOW INDUSTRY AND LABORATORIES TO SIMPLIFY THE CONTROL OF ENTERIC VIRUSES BY AN EASY AND RAPID PROCEDURE TO DETECT AND QUANTIFY THE INDICATOR, WHICH IN A SHORT TERM CAN BE IMPLEMENTED IN ROUTINE LABORATORIES. (English)
0.7824893334539451
0 references
L’EAU EST INGÉRÉE DANS LE CADRE DE L’ALIMENTATION, UTILISÉE POUR L’IRRIGATION DES CULTURES, POUR LE LAVAGE ET LE NETTOYAGE DES ALIMENTS PENDANT LA PRÉPARATION ET, EN OUTRE, ELLE EST UNE PARTIE ESSENTIELLE DE NOMBREUX PRODUITS ALIMENTAIRES. LA PRÉSENCE DE VIRUS ENTÉRIQUES HUMAINS (NOROVIRUS HUMAIN E.G., VIRUS DE L’HÉPATITE A, ETC.) DANS L’EAU EST BIEN DOCUMENTÉE ET PEUT CONSTITUER UNE MENACE MAJEURE POUR LA SANTÉ DES CONSOMMATEURS. À l’heure actuelle, le contrôle du VIRUS Entric humain DANS LES WATERS est basé sur l’utilisation des INDICATEURS BACTERIAENS, avec beaucoup de FECUENCE, ne sont pas en corrélation avec la PRESENCE DES DONNÉES Patogenes._x000D_ scientifiquement, la technologie MAS (NGS) a ouvert une excellente occasion de connaître dans FUNDING LA DIVERSITÉ DES Populations Microbiennes ET SANS DUDA CONSTITUY A GOOD TOOL TOOL FOR SUR LA RECHERCHE DES INDICATEURS VIRAUX PLUS ADECTÉS. L’OBJECTIF PRINCIPAL DU PROJET EST D’ANALYSER LE VIROMA (PRÉSENCE ET ABONDANCE RELATIVE DES SÉQUENCES VIRALES, Y COMPRIS LES PHAGES ET LES VIRUS ENTÉRIQUES HUMAINS) DES EAUX USÉES ET DE L’EAU RÉGÉNÉRÉE À L’AIDE DE NGS AFIN DE DÉTERMINER LES AGENTS PATHOGÈNES VIRAUX QUI PRÉSENTENT UN RISQUE POUR LE CONSOMMATEUR ET DE SÉLECTIONNER LES INDICATEURS POSSIBLES DE CONTAMINATION VIRALE. TOUT D’ABORD, LA PROCÉDURE D’ENRICHISSEMENT DES SÉQUENCES VIRALES D’ÉCHANTILLONS D’EAU SERA OPTIMISÉE. COMME MATÉRIAU DE DÉPART, LE GROUPE DE RECHERCHE DISPOSE D’UN GRAND NOMBRE D’ÉCHANTILLONS D’EAUX USÉES, D’EAU RÉGÉNÉRÉE ET D’EAU DE SURFACE, À LA FOIS POSITIFS ET NÉGATIFS POUR LE NOROVIRUS HUMAIN, L’HÉPATITE A ET L’ASTROVIRUS HUMAIN. CES ÉCHANTILLONS SERONT ANALYSÉS PAR NGS ET, EN OUTRE, NOUS APPLIQUERONS NOTRE EXPÉRIENCE AVEC LES RÉACTIFS DE VIABILITÉ (E.G., PROPIODIO OU MONOAZIDA ETIDIO) EN LES INTÉGRANT COMME PRÉTRAITEMENT ET EN LES COMBINANT AVEC UN SÉQUENÇAGE DE MASSE. DE CETTE MANIÈRE, IL SERA POSSIBLE D’ESTIMER NON SEULEMENT LE VIROMA DES ÉCHANTILLONS D’EAU, MAIS AUSSI LEUR INFECTIVITÉ POTENTIELLE ET PERMETTRE D’ÉVALUER L’EFFICACITÉ DES STATIONS DE TRAITEMENT DE L’EAU DANS LA RÉDUCTION DE LA CHARGE VIRALE DANS LES EAUX USÉES. POUR SA PART, LA DÉTERMINATION DU VIROMA DES EAUX PERMETTRA L’IDENTIFICATION DE NOUVEAUX PATHOGÈNES ÉMERGENTS AINSI QUE LA SÉLECTION D’UN OU DE PLUSIEURS INDICATEURS SIGNIFICATIFS POUR PRÉDIRE LA PRÉSENCE ET L’ABONDANCE D’AGENTS PATHOGÈNES HUMAINS DANS LES EAUX (COMME L’UTILISATION D’ESCHERICHIA COLI ASSOCIÉE À LA PRÉSENCE D’AGENTS PATHOGÈNES BACTÉRIENS HUMAINS). UNE FOIS QUE LES INDICATEURS AURONT ÉTÉ DÉTERMINÉS, UNE PROCÉDURE SERA MISE AU POINT POUR LA DÉTECTION ET LA QUANTIFICATION D’INDICADOR/(ES) VIRAL/(S), QUI POURRAIT ÊTRE BREVETABLE. GRÂCE À CETTE PROCÉDURE RAPIDE ET À UNE APPLICATION ET À UNE MISE EN ŒUVRE FACILES, IL SERA POSSIBLE DE CONTRÔLER SYSTÉMATIQUEMENT ET EFFICACEMENT LES VIRUS ENTÉRIQUES, TANT DANS LES LABORATOIRES DE CONTRÔLE DE LA QUALITÉ DE L’EAU ET DES ALIMENTS QUE DANS LES LABORATOIRES DE SANTÉ PUBLIQUE. (French)
4 December 2021
0 references
WASSER WIRD ALS TEIL DER ERNÄHRUNG AUFGENOMMEN, FÜR DIE BEWÄSSERUNG VON PFLANZEN, FÜR DAS WASCHEN UND REINIGEN VON LEBENSMITTELN WÄHREND DER ZUBEREITUNG VERWENDET, UND DARÜBER HINAUS IST ES EIN WESENTLICHER BESTANDTEIL VIELER LEBENSMITTEL. DAS VORHANDENSEIN MENSCHLICHER ENTERISCHER VIREN (E.G. HUMAN NOROVIRUS, HEPATITIS A VIRUS, ETC.) IM WASSER IST GUT DOKUMENTIERT UND KANN EINE GROSSE GEFAHR FÜR DIE GESUNDHEIT DER VERBRAUCHER DARSTELLEN. Derzeit basiert die Kontrolle der menschlichen Entric VIRUS IN WATERS auf der Verwendung von BACTERIAAN INDICATOREN, MAS (NGS) Technologie hat eine große Gelegenheit eröffnet, in FUNDING THE DIVERSITY of Microbial Populations und OTHOUT DUDA CONSTITUY A GOOD TOOL TOOL FÜR DEN ÜBER DIE ÜBERZEUGUNG VON VIRUS IN WATERS zu wissen. HAUPTZIEL DES PROJEKTS IST ES, DIE VIROMA (PRÄSENZ UND RELATIVE FÜLLE VON VIRUSSEQUENZEN, EINSCHLIESSLICH PHAGEN UND HUMANEN ENTERISCHEN VIREN) VON ABWASSER UND REGENERIERTEM WASSER MIT HILFE VON NGS ZU ANALYSIEREN, UM DIE VIRALEN KRANKHEITSERREGER ZU BESTIMMEN, DIE EIN RISIKO FÜR DEN VERBRAUCHER DARSTELLEN, UND DIE AUSWAHL MÖGLICHER INDIKATOREN FÜR EINE VIRUSKONTAMINATION. ZUNÄCHST WIRD DAS VERFAHREN ZUR ANREICHERUNG DER VIRALEN SEQUENZEN VON WASSERPROBEN OPTIMIERT. ALS AUSGANGSMATERIAL VERFÜGT DIE FORSCHUNGSGRUPPE ÜBER EINE VIELZAHL VON PROBEN VON ABWASSER, REGENERIERTEM WASSER UND OBERFLÄCHENWASSER, SOWOHL POSITIV ALS AUCH NEGATIV FÜR MENSCHLICHES NOROVIRUS, HEPATITIS EIN VIRUS UND MENSCHLICHES ASTROVIRUS. DIESE PROBEN WERDEN VON NGS ANALYSIERT UND DARÜBER HINAUS WERDEN WIR UNSERE ERFAHRUNGEN MIT DEN MACHBARKEITSREAGENZIEN (E.G., PROPIODIO ODER MONOAZIDA ETIDIO) ALS VORBEHANDLUNG UND KOMBINATION MIT MASSENSEQUENZIERUNG ANWENDEN. AUF DIESE WEISE WIRD ES MÖGLICH SEIN, NICHT NUR DIE VIROMA DER WASSERPROBEN, SONDERN AUCH DEREN POTENZIELLE INFEKTIOSITÄT ABZUSCHÄTZEN UND DIE WIRKSAMKEIT VON WASSERAUFBEREITUNGSANLAGEN BEI DER VERRINGERUNG DER VIRUSLAST IM ABWASSER ZU BEWERTEN. DIE BESTIMMUNG DES VIROMA DER GEWÄSSER ERMÖGLICHT DIE IDENTIFIZIERUNG NEUER AUFKOMMENDER KRANKHEITSERREGER SOWIE DIE AUSWAHL EINES ODER MEHRERER SIGNIFIKANTER INDIKATOREN ZUR VORHERSAGE DES VORHANDENSEINS/ÜBERFLUSSES MENSCHLICHER KRANKHEITSERREGER IN GEWÄSSERN (ÄHNLICH DER VERWENDUNG VON ESCHERICHIA COLI, DIE MIT DEM VORHANDENSEIN MENSCHLICHER BAKTERIELLER KRANKHEITSERREGER VERBUNDEN IST). SOBALD DIE INDIKATOREN FESTGELEGT SIND, WIRD EIN VERFAHREN ZUR ERKENNUNG UND QUANTIFIZIERUNG VON INDICADOR/(ES) VIRAL/(S) ENTWICKELT, DAS PATENTIERBAR SEIN KÖNNTE. DIESES SCHNELLE VERFAHREN UND EINE EINFACHE ANWENDUNG UND UMSETZUNG ERMÖGLICHEN EINE ROUTINEMÄSSIGE UND WIRKSAME KONTROLLE VON ENTERISCHEN VIREN, SOWOHL IN LABORS ZUR KONTROLLE DER WASSER- UND LEBENSMITTELQUALITÄT ALS AUCH IN LABORS FÜR DIE ÖFFENTLICHE GESUNDHEIT. (German)
9 December 2021
0 references
WATER WORDT INGENOMEN ALS ONDERDEEL VAN HET DIEET, GEBRUIKT VOOR GEWASIRRIGATIE, VOOR HET WASSEN EN REINIGEN VAN VOEDSEL TIJDENS DE BEREIDING EN BOVENDIEN IS HET EEN ESSENTIEEL ONDERDEEL VAN VEEL VOEDINGSMIDDELEN. DE AANWEZIGHEID VAN MENSELIJKE DARMVIRUSSEN (E.G. HUMAAN NOROVIRUS, HEPATITIS EEN VIRUS, ENZ.) IN WATER IS GOED GEDOCUMENTEERD EN KAN EEN GROTE BEDREIGING VORMEN VOOR DE GEZONDHEID VAN DE CONSUMENT. Momenteel, de controle van menselijke entrische VIRUS IN WATERS is gebaseerd op het gebruik van BACTERIAAN INDICATORS, MET een heleboel FECUENCE, niet correleren met de PRESENCE VAN Patogen DAYS._x000D_ reciently, MAS (NGS) technologie heeft een geweldige kans om te weten in het ONDER DE DIVERSITEIT VAN microbiële Bevolkingen EN ZONDER DUDA CONSTITUY Een GOEDE TOOL TOOL VOOR OVER DE SEARCH VAN VIRAL INDICATOREN MEER ADECTED. HET BELANGRIJKSTE DOEL VAN HET PROJECT IS HET ANALYSEREN VAN DE VIROMA (AANWEZIGHEID EN RELATIEVE OVERVLOED VAN VIRUSSEQUENTIES, MET INBEGRIP VAN FOGEN EN MENSELIJKE ENTERISCHE VIRUSSEN) VAN AFVALWATER EN GEREGENEREERD WATER MET BEHULP VAN NGS OM DE VIRALE PATHOGENEN DIE EEN RISICO VOOR DE CONSUMENT VORMEN TE BEPALEN EN MOGELIJKE INDICATOREN VAN VIRALE BESMETTING TE SELECTEREN. TEN EERSTE WORDT DE PROCEDURE OM DE VIRALE SEQUENTIES VAN WATERMONSTERS TE VERRIJKEN GEOPTIMALISEERD. ALS UITGANGSMATERIAAL HEEFT DE ONDERZOEKSGROEP EEN GROOT AANTAL MONSTERS VAN AFVALWATER, GEREGENEREERD WATER EN OPPERVLAKTEWATER, ZOWEL POSITIEF ALS NEGATIEF VOOR HUMAAN NOROVIRUS, HEPATITIS EEN VIRUS EN MENSELIJK ASTROVIRUS. DEZE MONSTERS WORDEN GEANALYSEERD DOOR NGS EN DAARNAAST ZULLEN WE ONZE ERVARING MET LEVENSVATBAARHEIDSREAGENTIA (E.G., PROPIODIO OF MONOAZIDA ETIDIO) TOEPASSEN ALS VOORBEHANDELING EN COMBINEREN MET MASSASEQUENCING. OP DEZE MANIER ZAL HET MOGELIJK ZIJN OM NIET ALLEEN DE VIROMA VAN DE WATERMONSTERS TE SCHATTEN, MAAR OOK HUN POTENTIËLE INFECTIVITEIT EN ZAL HET MOGELIJK ZIJN OM DE DOELTREFFENDHEID VAN WATERZUIVERINGSINSTALLATIES TE EVALUEREN BIJ HET VERMINDEREN VAN DE VIRALE BELASTING IN AFVALWATER. DE BEPALING VAN HET VIROMA VAN DE WATEREN MAAKT HET MOGELIJK NIEUWE NIEUWE ZIEKTEVERWEKKERS TE IDENTIFICEREN EN EEN OF MEER SIGNIFICANTE INDICATOREN TE SELECTEREN OM DE AANWEZIGHEID/ABUNDANTIE VAN MENSELIJKE PATHOGENEN IN WATEREN TE VOORSPELLEN (VERGELIJKBAAR MET HET GEBRUIK VAN ESCHERICHIA COLI IN VERBAND MET DE AANWEZIGHEID VAN MENSELIJKE BACTERIËLE PATHOGENEN). ZODRA DE INDICATOREN ZIJN VASTGESTELD, ZAL EEN PROCEDURE WORDEN ONTWIKKELD VOOR DE DETECTIE EN KWANTIFICERING VAN INDICADOR/(ES) VIRAL/(S), DIE OCTROOIEERBAAR ZOU KUNNEN ZIJN. DANKZIJ DEZE SNELLE PROCEDURE EN EENVOUDIGE TOEPASSING EN IMPLEMENTATIE ZAL EEN ROUTINEMATIGE EN DOELTREFFENDE CONTROLE VAN ENTERISCHE VIRUSSEN MOGELIJK ZIJN, ZOWEL IN LABORATORIA VOOR WATER- EN VOEDSELKWALITEITSCONTROLE ALS IN LABORATORIA VOOR DE VOLKSGEZONDHEID. (Dutch)
17 December 2021
0 references
L'ACQUA VIENE INGERITA COME PARTE DELLA DIETA, UTILIZZATA PER L'IRRIGAZIONE DELLE COLTURE, PER IL LAVAGGIO E LA PULIZIA DEGLI ALIMENTI DURANTE LA PREPARAZIONE E, INOLTRE, È UNA PARTE ESSENZIALE DI MOLTI PRODOTTI ALIMENTARI. LA PRESENZA DI VIRUS ENTERICI UMANI (NOROVIRUS UMANO, EPATITE UN VIRUS, ECC.) NELL'ACQUA È BEN DOCUMENTATA E PUÒ RAPPRESENTARE UNA GRAVE MINACCIA PER LA SALUTE DEI CONSUMATORI. Attualmente, il controllo del VIRUS IN WATERS UMANO si basa sull'uso di INDICATORI BACTERIAAN, CON un sacco di FECUENCE, non sono correlati con la PRESENZA DI GIORNI Patogen._x000D_ reciently, la tecnologia MAS (NGS) ha aperto una grande opportunità di sapere nel FONDARE LA DIVERSITÀ delle Popolazioni Microbiche E SENZA DUDA CONSTITUIA UNO STRUMENTO BUONO PER LA RICERCA DI INDICATORI VIRALI MORE ADECTED. L'OBIETTIVO PRINCIPALE DEL PROGETTO È QUELLO DI ANALIZZARE IL VIROMA (PRESENZA E RELATIVA ABBONDANZA DI SEQUENZE VIRALI, COMPRESI FAGI E VIRUS ENTERICI UMANI) DELLE ACQUE REFLUE E DELLE ACQUE RIGENERATE UTILIZZANDO NGS PER DETERMINARE GLI AGENTI PATOGENI VIRALI CHE RAPPRESENTANO UN RISCHIO PER IL CONSUMATORE E PER SELEZIONARE POSSIBILI INDICATORI DI CONTAMINAZIONE VIRALE. IN PRIMO LUOGO, LA PROCEDURA PER ARRICCHIRE LE SEQUENZE VIRALI DEI CAMPIONI D'ACQUA SARÀ OTTIMIZZATA. COME MATERIA PRIMA, IL GRUPPO DI RICERCA HA UN GRAN NUMERO DI CAMPIONI DI ACQUE REFLUE, ACQUE RIGENERATE E ACQUE SUPERFICIALI, SIA POSITIVE CHE NEGATIVE PER IL NOROVIRUS UMANO, L'EPATITE UN VIRUS E L'ASTROVIRUS UMANO. QUESTI CAMPIONI SARANNO ANALIZZATI DA NGS E, INOLTRE, APPLICHEREMO LA NOSTRA ESPERIENZA CON REAGENTI DI VITALITÀ (E.G., PROPIODIO O MONOAZIDA ETIDIO) INCORPORANDOLI COME PRETRATTAMENTO E COMBINANDOLI CON IL SEQUENZIAMENTO DI MASSA. IN QUESTO MODO SARÀ POSSIBILE STIMARE NON SOLO IL VIROMA DEI CAMPIONI D'ACQUA, MA ANCHE LA LORO POTENZIALE INFETTIVITÀ E CONSENTIRE DI VALUTARE L'EFFICACIA DEGLI IMPIANTI DI TRATTAMENTO DELLE ACQUE NELLA RIDUZIONE DELLA CARICA VIRALE NELLE ACQUE REFLUE. DA PARTE SUA, LA DETERMINAZIONE DEL VIROMA DELLE ACQUE CONSENTIRÀ L'INDIVIDUAZIONE DI NUOVI PATOGENI EMERGENTI E LA SELEZIONE DI UNO O PIÙ INDICATORI SIGNIFICATIVI PER PREVEDERE LA PRESENZA/ABBONDANZA DI AGENTI PATOGENI UMANI NELLE ACQUE (SIMILE ALL'USO DI ESCHERICHIA COLI ASSOCIATO ALLA PRESENZA DI AGENTI PATOGENI BATTERICI UMANI). UNA VOLTA DETERMINATI GLI INDICATORI, SARÀ MESSA A PUNTO UNA PROCEDURA PER L'INDIVIDUAZIONE E LA QUANTIFICAZIONE DI INDICADOR/(ES) VIRAL/(S), CHE POTREBBE ESSERE BREVETTABILE. GRAZIE A QUESTA PROCEDURA RAPIDA E AD UNA FACILE APPLICAZIONE E ATTUAZIONE, SARÀ POSSIBILE UN CONTROLLO REGOLARE ED EFFICACE DEI VIRUS ENTERICI, SIA NEI LABORATORI DI CONTROLLO DELLA QUALITÀ DELL'ACQUA E DEGLI ALIMENTI, SIA NEI LABORATORI DI SANITÀ PUBBLICA. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΤΟ ΝΕΡΌ ΚΑΤΑΝΑΛΏΝΕΤΑΙ ΑΚΡΙΒΏΣ ΌΠΩΣ ΈΝΑ ΤΡΌΦΙΜΟ, ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΕΊΤΑΙ ΓΙΑ ΤΗΝ ΆΡΔΕΥΣΗ ΤΩΝ ΦΥΤΏΝ, ΓΙΑ ΤΟ ΠΛΎΣΙΜΟ ΚΑΙ ΤΟΝ ΚΑΘΑΡΙΣΜΌ ΤΩΝ ΤΡΟΦΊΜΩΝ ΚΑΤΆ ΤΗΝ ΠΡΟΕΤΟΙΜΑΣΊΑ ΚΑΙ ΑΠΟΤΕΛΕΊ ΒΑΣΙΚΌ ΣΥΣΤΑΤΙΚΌ ΣΕ ΠΟΛΛΆ ΤΡΌΦΙΜΑ. Η ΠΑΡΟΥΣΊΑ ΑΝΘΡΏΠΙΝΩΝ ΕΝΤΕΡΙΚΏΝ ΙΏΝ (Π.Χ. ΑΝΘΡΏΠΙΝΟΣ ΝΟΡΟΪΌΣ, ΗΠΑΤΊΤΙΔΑ ΚΑΙ ΙΌΣ Κ.ΛΠ.) ΣΤΑ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΆ ΎΔΑΤΑ ΕΊΝΑΙ ΚΑΛΆ ΤΕΚΜΗΡΙΩΜΈΝΗ ΚΑΙ ΑΝΆΛΟΓΑ ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΤΟΥ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΕΙ ΑΠΕΙΛΉ ΓΙΑ ΤΟΝ ΚΑΤΑΝΑΛΩΤΉ. ΕΠΊ ΤΟΥ ΠΑΡΌΝΤΟΣ, Η ΠΑΡΟΥΣΊΑ ΑΝΘΡΏΠΙΝΩΝ ΠΑΘΟΓΌΝΩΝ ΙΏΝ ΣΤΟ ΝΕΡΌ ΒΑΣΊΖΕΤΑΙ ΣΕ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΟΎΣ ΔΕΊΚΤΕΣ, ΟΙ ΟΠΟΊΟΙ ΣΥΧΝΆ ΔΕΝ ΣΥΣΧΕΤΊΖΟΝΤΑΙ ΜΕ ΤΗΝ ΠΑΡΟΥΣΊΑ ΑΝΘΡΏΠΙΝΩΝ ΕΝΤΕΡΙΚΏΝ ΙΏΝ. _x000D_ πρόσφατα NEXT GENERATION SEQUENCING (NGS) ΕΡΓΑΛΕΙΑ ΑΝΟΙΓΜΑΤΟΣ ΜΙΑΣ ΜΕΓΑΛΗΣ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΑΣ ΣΤΗΝ ΑΝΑΓΝΩΡΙΣΗ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΩΝ VIRAL INDICATORS. ΚΎΡΙΟΣ ΣΤΌΧΟΣ ΤΗΣ ΠΑΡΟΎΣΑΣ ΠΡΌΤΑΣΗΣ ΕΊΝΑΙ Ο ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΌΣ ΤΟΥ VIRIOME (ΠΑΡΟΥΣΊΑ ΚΑΙ ΣΧΕΤΙΚΉ ΑΦΘΟΝΊΑ ΑΛΛΗΛΟΥΧΙΏΝ ΑΠΌ ΙΟΎΣ, ΣΥΜΠΕΡΙΛΑΜΒΑΝΟΜΈΝΩΝ ΤΩΝ ΦΑΓΏΝ ΚΑΙ ΤΩΝ ΑΝΘΡΏΠΙΝΩΝ ΕΝΤΕΡΙΚΏΝ ΙΏΝ, ΣΤΟ ΠΕΡΙΒΆΛΛΟΝ) ΤΩΝ ΛΥΜΆΤΩΝ ΚΑΙ ΤΩΝ ΥΔΆΤΩΝ ΑΝΆΚΤΗΣΗΣ ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ NGS. ΣΤΟ ΠΛΑΊΣΙΟ ΤΟΥ ΈΡΓΟΥ ΑΥΤΟΎ, ΘΑ ΒΕΛΤΙΣΤΟΠΟΙΗΘΕΊ Η ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑ ΕΜΠΛΟΥΤΙΣΜΟΎ ΤΩΝ ΙΟΓΕΝΏΝ ΑΛΛΗΛΟΥΧΙΏΝ ΑΠΌ ΔΕΊΓΜΑΤΑ ΝΕΡΟΎ. Η ΠΑΡΟΎΣΑ ΠΡΌΤΑΣΗ ΩΦΕΛΕΊΤΑΙ ΑΠΌ ΤΗ ΔΗΜΙΟΥΡΓΊΑ ΕΝΌΣ ΜΕΓΆΛΟΥ ΠΊΝΑΚΑ ΛΥΜΆΤΩΝ, ΔΕΙΓΜΆΤΩΝ ΑΠΌ ΑΝΆΚΤΗΣΗ ΚΑΙ ΕΠΙΦΑΝΕΙΑΚΏΝ ΥΔΆΤΩΝ ΘΕΤΙΚΆ ΓΙΑ ΤΟΝ ΑΝΘΡΏΠΙΝΟ ΝΟΡΟΪΌ, ΤΗΝ ΗΠΑΤΊΤΙΔΑ ΈΝΑΝ ΙΌ ΚΑΙ ΤΟΝ ΑΝΘΡΏΠΙΝΟ ΑΣΤΡΟΪΌ. ΘΑ ΑΞΙΟΠΟΙΉΣΟΥΜΕ ΤΗΝ ΕΜΠΕΙΡΊΑ ΜΑΣ ΣΤΗ ΧΡΉΣΗ ΤΩΝ ΧΡΩΜΆΤΩΝ ΒΙΩΣΙΜΌΤΗΤΑΣ (E.G. PROPIDIUM MONOAZIDE Ή ETHIDIUM MONOAZIDE) ΓΙΑ ΝΑ ΣΥΝΔΥΆΣΟΥΜΕ ΑΥΤΉ ΤΗΝ ΠΡΟΕΠΕΞΕΡΓΑΣΊΑ ΜΕ ΤΟ NGS, ΠΡΟΚΕΙΜΈΝΟΥ ΝΑ ΕΚΤΙΜΉΣΟΥΜΕ ΌΧΙ ΜΌΝΟ ΤΟ ΣΎΝΟΛΟ ΤΟΥ VIRIOME ΤΩΝ ΔΕΙΓΜΆΤΩΝ ΝΕΡΟΎ ΑΛΛΆ ΚΑΙ ΤΗ ΔΥΝΗΤΙΚΉ ΜΟΛΥΣΜΑΤΙΚΌΤΗΤΆ ΤΟΥΣ. ΑΥΤΌ ΘΑ ΔΙΕΥΚΟΛΎΝΕΙ ΤΗΝ ΑΞΙΟΛΌΓΗΣΗ ΤΩΝ ΣΤΑΘΜΏΝ ΕΠΕΞΕΡΓΑΣΊΑΣ ΝΕΡΟΎ ΠΡΟΚΕΙΜΈΝΟΥ ΝΑ ΜΕΙΩΘΕΊ ΤΟ ΙΙΚΌ ΦΟΡΤΊΟ ΑΠΌ ΤΑ ΛΎΜΑΤΑ. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, Ο ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΌΣ ΤΟΥ VIRIOME ΑΠΌ ΤΑ ΎΔΑΤΑ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΕΝΤΟΠΊΣΕΙ ΝΈΟΥΣ ΝΕΟΕΜΦΑΝΙΖΌΜΕΝΟΥΣ ΙΟΎΣ. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΤΟ ΠΡΟΤΕΙΝΌΜΕΝΟ ΈΡΓΟ ΑΠΟΣΚΟΠΕΊ ΣΤΟΝ ΕΝΤΟΠΙΣΜΌ ΕΝΌΣ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌΤΕΡΟΥ ΔΕΊΚΤΗ/ΤΩΝ ΔΕΙΚΤΏΝ ΠΑΡΟΥΣΊΑΣ/ΑΦΘΟΝΊΑΣ ΑΝΘΡΏΠΙΝΩΝ ΠΑΘΟΓΌΝΩΝ ΙΏΝ ΣΕ ΔΙΆΦΟΡΟΥΣ ΤΎΠΟΥΣ ΥΔΆΤΩΝ (ΠΑΡΌΜΟΙΑ ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΑΡΙΘΜΏΝ ESCHERICHIA COLI ΠΟΥ ΣΥΝΔΈΟΝΤΑΙ ΜΕ ΤΗΝ ΠΑΡΟΥΣΊΑ ΑΝΘΡΏΠΙΝΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΏΝ ΠΑΘΟΓΌΝΩΝ ΠΑΡΑΓΌΝΤΩΝ). ΑΥΤΉ Η ΔΙΟΡΑΤΙΚΌΤΗΤΑ ΘΑ ΔΙΕΥΚΟΛΎΝΕΙ ΤΗΝ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΕΝΌΣ ΕΡΓΑΛΕΊΟΥ ΓΙΑ ΤΗΝ ΤΑΧΕΊΑ ΑΝΊΧΝΕΥΣΗ ΚΑΙ ΠΟΣΟΤΙΚΟΠΟΊΗΣΗ ΤΟΥ/ΤΩΝ ΙΟΓΕΝΟΎΣ ΔΕΊΚΤΗ/-ΩΝ ΠΟΥ ΕΝΔΈΧΕΤΑΙ ΝΑ ΚΑΤΟΧΥΡΩΘΕΊ ΜΕ ΔΊΠΛΩΜΑ ΕΥΡΕΣΙΤΕΧΝΊΑΣ. Ο ΕΝΤΟΠΙΣΜΌΣ ΣΗΜΑΝΤΙΚΏΝ ΙΟΓΕΝΏΝ ΔΕΙΚΤΏΝ ΘΑ ΕΠΙΤΡΈΨΕΙ ΣΤΗ ΒΙΟΜΗΧΑΝΊΑ ΚΑΙ ΣΤΑ ΕΡΓΑΣΤΉΡΙΑ ΝΑ ΑΠΛΟΥΣΤΕΎΣΟΥΝ ΤΟΝ ΈΛΕΓΧΟ ΤΩΝ ΕΝΤΕΡΙΚΏΝ ΙΏΝ ΜΕ ΜΙΑ ΕΎΚΟΛΗ ΚΑΙ ΤΑΧΕΊΑ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑ ΓΙΑ ΤΟΝ ΕΝΤΟΠΙΣΜΌ ΚΑΙ ΤΗΝ ΠΟΣΟΤΙΚΟΠΟΊΗΣΗ ΤΟΥ ΔΕΊΚΤΗ, Ο ΟΠΟΊΟΣ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΕΦΑΡΜΟΣΤΕΊ ΒΡΑΧΥΠΡΌΘΕΣΜΑ ΣΕ ΕΡΓΑΣΤΉΡΙΑ ΡΟΥΤΊΝΑΣ. (Greek)
18 August 2022
0 references
VAND INDTAGES PÅ SAMME MÅDE SOM EN FØDEVARE, ANVENDES TIL KUNSTVANDING AF PLANTER, TIL VASK OG RENGØRING AF FØDEVARER UNDER TILBEREDNINGEN OG UDGØR EN VÆSENTLIG INGREDIENS I MANGE FØDEVARER. TILSTEDEVÆRELSEN AF HUMANE ENTERISKE VIRA (E.G. HUMAN NOROVIRUS, HEPATITIS ET VIRUS OSV.) I MILJØVAND ER VELDOKUMENTERET, OG AFHÆNGIGT AF DETS ANVENDELSE KAN DET UDGØRE EN TRUSSEL MOD FORBRUGEREN. I ØJEBLIKKET ER TILSTEDEVÆRELSEN AF HUMANPATOGENE VIRA I VAND AFHÆNGIG AF BAKTERIELLE INDIKATORER, SOM OFTE IKKE KORRELERER MED TILSTEDEVÆRELSEN AF HUMANE ENTERISKE VIRA. _x000D_ for nylig NEXT GENERATION SEQUENCING (NGS) TOOLS OPPORTUNITY TIL IDENTIFY RELIABLE VIRAL INDICATORER. HOVEDFORMÅLET MED DETTE FORSLAG ER AT FASTLÆGGE VIRIOME (TILSTEDEVÆRELSE OG RELATIV FOREKOMST AF SEKVENSER FRA VIRUS, HERUNDER FAGER OG HUMANE ENTERISKE VIRA, I MILJØET) AF SPILDEVAND OG GENVUNDET VAND VED HJÆLP AF NGS. INDEN FOR RAMMERNE AF DETTE PROJEKT VIL PROCEDUREN FOR BERIGELSE AF VIRALE SEKVENSER FRA VANDPRØVER BLIVE OPTIMERET. DETTE FORSLAG DRAGER FORDEL AF AT HAVE ET STORT PANEL AF SPILDEVAND, GENVUNDET OG OVERFLADEVAND PRØVER POSITIVE FOR HUMAN NOROVIRUS, HEPATITIS EN VIRUS OG HUMANT ASTROVIRUS. VI VIL UDNYTTE VORES ERFARING MED BRUGEN AF LEVEDYGTIGHEDSFARVESTOFFER (E.G. PROPIDIUMMONOAZID ELLER ETHIDIUMMONOAZID) TIL AT KOMBINERE DENNE FORBEHANDLING MED NGS FOR AT VURDERE IKKE BLOT HELE VIRIOME AF VANDPRØVERNE, MEN OGSÅ DERES POTENTIELLE INFEKTIVITET. DETTE VIL GØRE DET LETTERE AT EVALUERE RENSNINGSANLÆGGENE FOR AT REDUCERE VIRUSBELASTNINGEN FRA SPILDEVAND. DESUDEN KAN BESTEMMELSEN AF VIRIOME I FARVANDE IDENTIFICERE NYE VIRA. HERTIL KOMMER, AT DET FORESLÅEDE PROJEKT HAR TIL FORMÅL AT IDENTIFICERE EN ELLER FLERE MERE BETYDNINGSFULDE INDIKATORER FOR TILSTEDEVÆRELSE/FLOD AF HUMANPATOGENE VIRA I FORSKELLIGE TYPER VANDOMRÅDER (SVARENDE TIL BRUGEN AF ESCHERICHIA COLI-TAL, DER ER FORBUNDET MED TILSTEDEVÆRELSEN AF HUMANE BAKTERIELLE PATOGENER). DENNE INDSIGT VIL LETTE UDVIKLINGEN AF ET VÆRKTØJ TIL HURTIG PÅVISNING OG KVANTIFICERING AF DEN/DE VIRALE INDIKATOR(ER), DER KAN PATENTERES. IDENTIFIKATIONEN AF MENINGSFULDE VIRALE INDIKATORER VIL GØRE DET MULIGT FOR INDUSTRIEN OG LABORATORIERNE AT FORENKLE KONTROLLEN MED ENTERISKE VIRA VED HJÆLP AF EN NEM OG HURTIG PROCEDURE TIL PÅVISNING OG KVANTIFICERING AF INDIKATOREN, SOM PÅ KORT SIGT KAN GENNEMFØRES I RUTINEMÆSSIGE LABORATORIER. (Danish)
18 August 2022
0 references
VETTÄ NAUTITAAN AIVAN KUTEN RUOKAA, SITÄ KÄYTETÄÄN KASVIEN KASTELUUN, ELINTARVIKKEIDEN PESUUN JA PUHDISTUKSEEN VALMISTUKSEN AIKANA JA SE ON MONIEN ELINTARVIKKEIDEN OLENNAINEN AINESOSA. IHMISEN ENTEROVIRUSTEN (ESIM. IHMISEN NOROVIRUS, HEPATIITTI A VIRUS JNE.) ESIINTYMINEN YMPÄRISTÖVESISSÄ ON HYVIN DOKUMENTOITU, JA SEN KÄYTÖSTÄ RIIPPUEN SE VOI AIHEUTTAA UHAN KULUTTAJILLE. TÄLLÄ HETKELLÄ IHMISEN PATOGEENISTEN VIRUSTEN ESIINTYMINEN VEDESSÄ PERUSTUU BAKTEERI-INDIKAATTOREIHIN, JOTKA USEIN EIVÄT KORRELOI IHMISEN ENTEROVIRUSTEN KANSSA. _x000D_ äskettäin NEXT GENERATION SEQUENCING (NGS) TOOLS Avoin suuri OPPORTUNITY IDENTIFY RELIABLE VIRAL INDICATORS. TÄMÄN EHDOTUKSEN PÄÄTAVOITTEENA ON MÄÄRITTÄÄ JÄTEVEDEN JA REGENEROITUJEN VESIEN VIRIOME (VIRUKSISTA, FAAGEEISTA JA IHMISEN ENTEROVIRUKSISTA PERÄISIN OLEVIEN SEKVENSSIEN ESIINTYMINEN JA SUHTEELLINEN RUNSAUS YMPÄRISTÖSSÄ) KÄYTTÄMÄLLÄ NGS:ÄÄ. TÄMÄN HANKKEEN YHTEYDESSÄ OPTIMOIDAAN MENETELMÄ VIRUSSEKVENSSIEN RIKASTAMISEKSI VESINÄYTTEISTÄ. TÄMÄ EHDOTUS HYÖTYY SIITÄ, ETTÄ SUURI VIEMÄRI-, REGENEROITU- JA PINTAVESINÄYTTEET OVAT POSITIIVISET IHMISEN NOROVIRUKSEN, HEPATIITTIVIRUKSEN JA IHMISEN ASTROVIRUKSEN VARALTA. HYÖDYNNÄMME KOKEMUSTAMME ELINKYKYISTEN VÄRIAINEIDEN (E.G. PROPIDIUM MONOAZIDE TAI ETHIDIUM MONOAZIDE) KÄYTÖSTÄ TÄMÄN ESIKÄSITTELYN JA NGS:N YHDISTÄMISEKSI, JOTTA VOIDAAN ARVIOIDA PAITSI KOKO VESINÄYTTEIDEN VIRIOME MYÖS NIIDEN MAHDOLLINEN INFEKTOIVUUS. TÄMÄ HELPOTTAA VEDENPUHDISTAMOJEN ARVIOINTIA JÄTEVEDEN VIRUSKUORMAN VÄHENTÄMISEKSI. LISÄKSI VIRIOMEN MÄÄRITTÄMINEN VESILTÄ VOI TUNNISTAA UUSIA UUSIA VIRUKSIA. TÄMÄN LISÄKSI EHDOTETULLA HANKKEELLA PYRITÄÄN MÄÄRITTÄMÄÄN MERKITTÄVÄMPI INDIKAATTORI/MERKITTÄVÄT INDIKAATTORIT IHMISEN PATOGEENISTEN VIRUSTEN ESIINTYMISESTÄ JA RUNSAUDESTA ERI VESIMUODOISSA (SAMOIN KUIN ESCHERICHIA COLI -LUKUJEN KÄYTTÖ, JOKA LIITTYY IHMISEN BAKTEERIPATOGEENIEN ESIINTYMISEEN). TÄMÄ NÄKEMYS HELPOTTAA SELLAISEN VÄLINEEN KEHITTÄMISTÄ, JOLLA VOIDAAN NOPEASTI HAVAITA JA KVANTIFIOIDA VIRUSINDIKAATTORIT, JOTKA SAATTAVAT OLLA PATENTOITAVIA. MERKITYKSELLISTEN VIRUSINDIKAATTORIEN TUNNISTAMINEN ANTAA TEOLLISUUDELLE JA LABORATORIOILLE MAHDOLLISUUDEN YKSINKERTAISTAA ENTEROVIRUSTEN VALVONTAA HELPOSTI JA NOPEASTI INDIKAATTORIN HAVAITSEMISEKSI JA KVANTIFIOIMISEKSI, MIKÄ VOIDAAN LYHYELLÄ AIKAVÄLILLÄ TOTEUTTAA RUTIINILABORATORIOISSA. (Finnish)
18 August 2022
0 references
L-ILMA JINBELA’ BĦAL IKEL, JINTUŻA GĦALL-IRRIGAZZJONI TAL-PJANTI, GĦALL-ĦASIL U T-TINDIF TAL-IKEL WAQT IL-PREPARAZZJONI U JIKKOSTITWIXXI INGREDJENT ESSENZJALI F’ĦAFNA PRODOTTI TAL-IKEL. IL-PREŻENZA TA’ VIRUSES ENTERIĊI UMANI (E.G. NOROVIRUS UMAN, EPATITE A VIRUS, EĊĊ) FL-ILMIJIET AMBJENTALI HIJA DOKUMENTATA SEW U SKONT L-UŻU TAGĦHA TISTA’ TKUN TA’ THEDDIDA GĦALL-KONSUMATUR. BĦALISSA, IL-PREŻENZA TA’ VAJRUSIS PATOĠENIĊI UMANI FL-ILMA TIDDEPENDI FUQ INDIKATURI BATTERIĊI, LI SPISS JONQSU MILLI JIKKORRELATAW MAL-PREŻENZA TA’ VIRUSES ENTERIĊI TAL-BNIEDEM. _x000D_ reċentement SEQUENCING ĠENERAZZJONI ĠENERAZZJONI (NGS) TOOLS A OPPORTUNITÀ GRATTA GĦAL INDIKATORJI IDENTIFY RELIABLE VIRALI. L-GĦAN EWLIENI TA’ DIN IL-PROPOSTA HUWA LI TIDDETERMINA L-VIRIOME (PREŻENZA U ABBUNDANZA RELATTIVA TA’ SEKWENZI MINN VIRUSES, INKLUŻI L-PHAGES U VIRUSES ENTERIĊI UMANI, FL-AMBJENT) TAD-DRENAĠĠ U L-ILMIJIET REKLAMATI BL-UŻU TA’ NGS. FIL-QAFAS TA’ DAN IL-PROĠETT, IL-PROĊEDURA GĦALL-ARRIKKIMENT TA’ SEKWENZI VIRALI MINN KAMPJUNI TAL-ILMA SE TIĠI OTTIMIZZATA. DIN IL-PROPOSTA TIBBENEFIKA MINN PANNELL KBIR TA’ KAMPJUNI TAD-DRENAĠĠ, REKLAMATI U TAL-ILMA TAL-WIĊĊ POŻITTIVI GĦAN-NOROVIRUS UMAN, L-EPATITE VIRUS U L-ASTROVIRUS UMAN. SE NISFRUTTAW L-ESPERJENZA TAGĦNA FL-UŻU TA’ ŻEBGĦAT TA’ VIJABBILTÀ (E.G. PROPIDIUM MONOAZIDE JEW ETHIDIUM MONOAZIDE) BIEX NIKKOMBINAW DAN IT-TRATTAMENT MINN QABEL MA’ NGS, SABIEX NISTMAW MHUX BISS IL-VIRIOME KOLLU TAL-KAMPJUNI TAL-ILMA IŻDA WKOLL L-INFETTIVITÀ POTENZJALI TAGĦHOM. DAN SE JIFFAĊILITA L-EVALWAZZJONI TAL-IMPJANTI TAT-TRATTAMENT TAL-ILMA SABIEX TITNAQQAS IT-TAGĦBIJA VIRALI MID-DRENAĠĠ. BARRA MINN HEKK, ID-DETERMINAZZJONI TA’ VIRIOME MILL-ILMIJIET TISTA’ TIDENTIFIKA VIRUSES EMERĠENTI ĠODDA. BARRA MINN HEKK, IL-PROĠETT PROPOST GĦANDU L-GĦAN LI JIDENTIFIKA INDIKATUR/I AKTAR SINIFIKANTI TAL-PREŻENZA/AUNDANZA TA’ VIRUSES PATOĠENIĊI UMANI F’TIPI DIFFERENTI TA’ ILMIJIET (B’MOD SIMILI GĦALL-UŻU TAN-NUMRI ESCHERICHIA COLI ASSOĊJATI MAL-PREŻENZA TA’ PATOĠENI BATTERIĊI UMANI). DAN L-GĦARFIEN SE JIFFAĊILITA L-IŻVILUPP TA’ GĦODDA GĦALL-IDENTIFIKAZZJONI U L-KWANTIFIKAZZJONI RAPIDA TAL-INDIKATUR/I VIRALI LI JISTA’/JISTGĦU JIĠI/U BREVETTAT(I). L-IDENTIFIKAZZJONI TA’ INDIKATUR/I VIRALI SINIFIKANTI SE TIPPERMETTI LILL-INDUSTRIJA U LIL-LABORATORJI JISSIMPLIFIKAW IL-KONTROLL TAL-VIRUSES ENTERIĊI PERMEZZ TA’ PROĊEDURA FAĊLI U RAPIDA BIEX JINSTAB U JIĠI KKWANTIFIKAT L-INDIKATUR, LI FI ŻMIEN QASIR JISTA’ JIĠI IMPLIMENTAT F’LABORATORJI TA’ RUTINA. (Maltese)
18 August 2022
0 references
ŪDENS TIEK UZŅEMTS TĀPAT KĀ PĀRTIKA, TIEK IZMANTOTS AUGU APŪDEŅOŠANAI, PĀRTIKAS MAZGĀŠANAI UN TĪRĪŠANAI SAGATAVOŠANAS LAIKĀ UN IR BŪTISKA SASTĀVDAĻA DAUDZOS PĀRTIKAS PRODUKTOS. CILVĒKA ZARNU VĪRUSU (E.G. CILVĒKA NOROVĪRUSA, HEPATĪTA VĪRUSA UTT.) KLĀTBŪTNE VIDES ŪDEŅOS IR LABI DOKUMENTĒTA, UN ATKARĪBĀ NO LIETOŠANAS TĀ VAR RADĪT DRAUDUS PATĒRĒTĀJIEM. PAŠLAIK CILVĒKA PATOGĒNO VĪRUSU KLĀTBŪTNE ŪDENĪ BALSTĀS UZ BAKTĒRIJU RĀDĪTĀJIEM, KAS BIEŽI VIEN NESPĒJ KORELĒT AR CILVĒKA ZARNU VĪRUSU KLĀTBŪTNI. _x000D_ nesen NEXT ĢENERĀCIJAS SEQUENCING (NGS) TOOLS APSTIPRINĀJUMS ATBALSTA ATBALSTS IDENTIFY RELIABLE VIRAL INDICATORS. ŠĀ PRIEKŠLIKUMA GALVENAIS MĒRĶIS IR NOTEIKT NOTEKŪDEŅU UN REĢENERĒTO ŪDEŅU VIRIOME (VĪRUSU, TOSTARP FĀGU UN CILVĒKA ZARNU VĪRUSU, SEKVENČU KLĀTBŪTNE UN RELATĪVAIS DAUDZUMS VIDĒ), IZMANTOJOT NGS. ŠĀ PROJEKTA IETVAROS TIKS OPTIMIZĒTA PROCEDŪRA VĪRUSU SEKVENČU BAGĀTINĀŠANAI NO ŪDENS PARAUGIEM. ŠIS PRIEKŠLIKUMS SNIEDZ LABUMU NO LIELA NOTEKŪDEŅU PANEĻA, REĢENERĒTU UN VIRSZEMES ŪDEŅU PARAUGU AR POZITĪVU CILVĒKA NOROVĪRUSU, HEPATĪTA VĪRUSA UN CILVĒKA ASTROVĪRUSA. MĒS IZMANTOSIM MŪSU PIEREDZI DZĪVOTSPĒJAS KRĀSVIELU (E.G. PROPIDIJA MONOAZĪDA VAI ETIDIJA MONOAZĪDA) IZMANTOŠANĀ, LAI APVIENOTU ŠO PIRMAPSTRĀDI AR NGS, LAI NOVĒRTĒTU NE TIKAI VISU ŪDENS PARAUGU VIRIOME, BET ARĪ TO IESPĒJAMO INFICĒTSPĒJU. TAS ATVIEGLOS ŪDENS ATTĪRĪŠANAS IEKĀRTU NOVĒRTĒŠANU, LAI SAMAZINĀTU VĪRUSU SLODZI NO NOTEKŪDEŅIEM. TURKLĀT, NOSAKOT VIRIOME NO ŪDEŅIEM, VAR NOTEIKT JAUNUS VĪRUSUS. TURKLĀT IEROSINĀTĀ PROJEKTA MĒRĶIS IR NOTEIKT NOZĪMĪGĀKU(-S) RĀDĪTĀJU(-US) PAR CILVĒKU PATOGĒNO VĪRUSU KLĀTBŪTNI/DAUDZUMU DAŽĀDA VEIDA ŪDEŅOS (LĪDZĪGI ESCHERICHIA COLI SKAITAM, KAS SAISTĪTS AR CILVĒKA BAKTERIĀLO PATOGĒNU KLĀTBŪTNI). ŠIS IESKATS ATVIEGLOS TĀDA INSTRUMENTA IZSTRĀDI, AR KO ĀTRI NOTEIKT UN KVANTITATĪVI NOTEIKT VĪRUSU INDIKATORU/RĀDĪTĀJUS, KURUS VARĒTU PATENTĒT. JĒGPILNA(-U) VĪRUSA INDIKATORA(-U) IDENTIFICĒŠANA ĻAUS NOZAREI UN LABORATORIJĀM VIENKĀRŠOT ENTERISKO VĪRUSU KONTROLI, IZMANTOJOT VIEGLU UN ĀTRU PROCEDŪRU RĀDĪTĀJA NOTEIKŠANAI UN KVANTIFICĒŠANAI, KO ĪSTERMIŅĀ VAR IEVIEST KĀRTĒJĀS LABORATORIJĀS. (Latvian)
18 August 2022
0 references
VODA SA UŽÍVA ROVNAKO AKO JEDLO, POUŽÍVA SA NA ZAVLAŽOVANIE RASTLÍN, NA UMÝVANIE A ČISTENIE POTRAVÍN POČAS PRÍPRAVY A PREDSTAVUJE ZÁKLADNÚ ZLOŽKU MNOHÝCH POTRAVINÁRSKYCH VÝROBKOV. PRÍTOMNOSŤ ĽUDSKÝCH ENTERICKÝCH VÍRUSOV (E.G. ĽUDSKÝ NOROVÍRUS, VÍRUS HEPATITÍDY A ATĎ.) V ENVIRONMENTÁLNYCH VODÁCH JE DOBRE ZDOKUMENTOVANÁ A V ZÁVISLOSTI OD JEHO POUŽITIA MÔŽE PREDSTAVOVAŤ HROZBU PRE SPOTREBITEĽA. V SÚČASNOSTI PRÍTOMNOSŤ ĽUDSKÝCH PATOGÉNNYCH VÍRUSOV VO VODE ZÁVISÍ OD BAKTERIÁLNYCH INDIKÁTOROV, KTORÉ ČASTO NEDOKÁŽU KORELOVAŤ S PRÍTOMNOSŤOU ĽUDSKÝCH ENTERICKÝCH VÍRUSOV. _x000D_ nedávno NEXT GENERÁCIA SEQUENCING (NGS) ToOLS OTVORENÝ VŠETKÝM OPPORTUNITY NA IdentIFY RELIABNÉ VIRAL INDICATORS. HLAVNÝM CIEĽOM TOHTO NÁVRHU JE URČIŤ VIRIOME (PRÍTOMNOSŤ A RELATÍVNA ABUNDANCIA SEKVENCIÍ VÍRUSOV VRÁTANE FÁGOV A ĽUDSKÝCH ENTERICKÝCH VÍRUSOV V PROSTREDÍ) ODPADOVÝCH VÔD A REGENEROVANÝCH VÔD POMOCOU NGS. V RÁMCI TOHTO PROJEKTU SA OPTIMALIZUJE POSTUP OBOHACOVANIA VÍRUSOVÝCH SEKVENCIÍ ZO VZORIEK VODY. TENTO NÁVRH VYUŽÍVA VEĽKÝ PANEL VZORIEK ODPADOVÝCH VÔD, REGENEROVANÝCH A POVRCHOVÝCH VÔD POZITÍVNYCH NA ĽUDSKÝ NOROVÍRUS, HEPATITÍDU, VÍRUS A ĽUDSKÝ ASTROVÍRUS. VYUŽIJEME NAŠE SKÚSENOSTI S POUŽÍVANÍM ŽIVOTASCHOPNOSTI FARBÍV (E.G. PROPIDIUM MONOAZIDE ALEBO ETIDIUM MONOAZID) SKOMBINUJEME TÚTO PREDÚPRAVU S NGS, ABY SME ODHADLI NIELEN CELÝ VIRIOME VZORIEK VODY, ALE AJ ICH POTENCIÁLNU INFEKČNOSŤ. TÝM SA UĽAHČÍ HODNOTENIE ČISTIARNÍ ODPADOVÝCH VÔD S CIEĽOM ZNÍŽIŤ VÍRUSOVÚ ZÁŤAŽ SPLAŠKOV. OKREM TOHO STANOVENIE VIRIOME Z VÔD MÔŽE IDENTIFIKOVAŤ NOVÉ VZNIKAJÚCE VÍRUSY. OKREM TOHO SA NAVRHOVANÝ PROJEKT ZAMERIAVA NA IDENTIFIKÁCIU VÝZNAMNEJŠÍCH UKAZOVATEĽOV PRÍTOMNOSTI/MNOŽSTVA ĽUDSKÝCH PATOGÉNNYCH VÍRUSOV V RÔZNYCH TYPOCH VÔD (PODOBNE AKO POUŽÍVANIE ČÍSEL BAKTÉRIÍ ESCHERICHIA COLI SPOJENÝCH S PRÍTOMNOSŤOU ĽUDSKÝCH BAKTERIÁLNYCH PATOGÉNOV). TENTO POHĽAD UĽAHČÍ VÝVOJ NÁSTROJA NA RÝCHLU DETEKCIU A KVANTIFIKÁCIU VÍRUSOVÝCH INDIKÁTOROV, KTORÉ BY MOHLI BYŤ PATENTOVANÉ. IDENTIFIKÁCIA ZMYSLUPLNÝCH VÍRUSOVÝCH INDIKÁTOROV UMOŽNÍ PRIEMYSLU A LABORATÓRIÁM ZJEDNODUŠIŤ KONTROLU ENTERICKÝCH VÍRUSOV JEDNODUCHÝM A RÝCHLYM POSTUPOM NA ZISTENIE A VYČÍSLENIE INDIKÁTORA, KTORÝ SA V KRÁTKODOBOM HORIZONTE MÔŽE IMPLEMENTOVAŤ V BEŽNÝCH LABORATÓRIÁCH. (Slovak)
18 August 2022
0 references
DÉANTAR UISCE A IONGHABHÁIL DÍREACH MAR BHIA, ÚSÁIDTEAR É LE HAGHAIDH UISCIÚ PLANDAÍ, CHUN BIA A NÍ AGUS A GHLANADH LE LINN ULLMHÚCHÁIN AGUS IS COMHÁBHAR RIACHTANACH É I GO LEOR TÁIRGÍ BIA. TÁ VÍRIS IONTRÁLA DAONNA (E.G. NOROVIRUS DAONNA, HEIPITÍTEAS VÍREAS, ETC.) IN UISCÍ COMHSHAOIL DOICIMÉADAITHE GO MAITH AGUS AG BRATH AR A ÚSÁID IS FÉIDIR LEIS A BHEITH INA BHAGAIRT DON TOMHALTÓIR. FAOI LÁTHAIR, BRAITHEANN LÁITHREACHT VÍRIS PHATAIGINEACHA DAONNA IN UISCE AR THÁSCAIRÍ BAICTÉARACHA, A THEIPEANN ORTHU GO MINIC IAD A CHOMHGHAOLÚ LE VÍRIS EINTREACHA DAONNA. _x000D_ le déanaí RÉIGIÚNACH GINEARÁLTA (NGS) RÉIGIÚNACH RÉIGIÚNACH RÉIGIÚNACH RÉIGIÚNACH DO DHÉANAMH LE hAGHAIDH LEOIRÍ VIRAL A DHÉANAMH. IS É PRÍOMHCHUSPÓIR AN TOGRA SEO VIRIOME (LÁITHREACHT AGUS FLÚIRSE CHOIBHNEASTA NA SEICHEAMH Ó VÍRIS, LENA N-ÁIRÍTEAR FIAGAÍ AGUS VÍRIS EINTREACHA DAONNA, SA STRUCHTÚR) A CHINNEADH I GCÁS UISCÍ SÉARACHAIS AGUS UISCÍ ATHSHLÁNAITHE TRÍ SRTANNA A ÚSÁID. FAOI CHUIMSIÚ AN TIONSCADAIL SEO, DÉANFAR AN NÓS IMEACHTA CHUN SEICHIMH VÍREASACHA Ó SHAMPLAÍ UISCE A SHAIBHRIÚ A BHARRFHEABHSÚ. BAINEANN AN TOGRA SEO TAIRBHE AS PAINÉAL MÓR SAMPLAÍ SÉARACHAIS, SAMPLAÍ ATHSHLÁNAITHE AGUS SAMPLAÍ UISCE DROMCHLA ATÁ DEARFACH DO NOROVIRUS DAONNA, HEIPITÍTEAS VÍREAS AGUS ASTROVIRUS DAONNA. BAINFIMID LEAS AS ÁR DTAITHÍ MAIDIR LE HÚSÁID RUAIMEANNA INMHARTHANACHTA (E.G. MONOAZIDE PROPIDIUM NÓ MONOAZIDE ETHIDIUM) CHUN AN PRETREATMENT SEO A CHUR LE NGS, CHUN MEASTACHÁN A DHÉANAMH NÍ HAMHÁIN AR VIRIOME IOMLÁN NA SAMPLAÍ UISCE ACH FREISIN AR A N-IONFHABHTAÍOCHT FÉIDEARTHA. ÉASCÓIDH SÉ SEO MEASTÓIREACHT AR NA GLÉASRAÍ CÓIREÁLA UISCE CHUN AN T-UALACH VÍREASACH Ó SÉARACHAS A LAGHDÚ. INA THEANNTA SIN, FÉADFAIDH CINNEADH VIRIOME Ó UISCÍ VÍRIS NUA ATÁ AG TEACHT CHUN CINN A SHAINAITHINT. SA BHREIS AIR SIN, TÁ SÉ D’AIDHM AG AN TIONSCADAL ATÁ BEARTAITHE TÁSCAIRE/TÁSCAIRÍ NÍOS SUNTASAÍ A SHAINAITHINT MAIDIR LE VÍRIS PHATAIGINEACHA DAONNA A BHEITH I GCINEÁLACHA ÉAGSÚLA UISCÍ (COSÚIL LE HÚSÁID UIMHREACHA ESCHERICHIA COLI A BHAINEANN LE PATAIGINÍ BAICTÉARACHA DAONNA A BHEITH ANN). ÉASCÓIDH AN LÉARGAS SEO FORBAIRT UIRLISE CHUN AN TÁSCAIRE/NA TÁSCAIRÍ VÍREASACHA A D’FHÉADFAÍ A PHAITINNIÚ A BHRATH AGUS A CHAINNÍOCHTÚ GO TAPA. TRÍ THÁSCAIRE/TÁSCAIRÍ VÍREASACHA BRÍOCH A SHAINAITHINT, BEIDH AN TIONSCAL AGUS SAOTHARLANNA IN ANN RIALÚ VÍREAS ÉINTREACH A SHIMPLIÚ TRÍ NÓS IMEACHTA ÉASCA AGUS TAPA CHUN AN TÁSCAIRE A BHRATH AGUS A CHAINNÍOCHTÚ, AR FÉIDIR É A CHUR CHUN FEIDHME SA GHEARRTHÉARMA I NGNÁTH-SHAOTHARLANNA. (Irish)
18 August 2022
0 references
VODA SE POŽÍVÁ STEJNĚ JAKO JÍDLO, POUŽÍVÁ SE K ZAVLAŽOVÁNÍ ROSTLIN, K MYTÍ A ČIŠTĚNÍ POTRAVIN BĚHEM PŘÍPRAVY A PŘEDSTAVUJE ZÁKLADNÍ SLOŽKU MNOHA POTRAVINÁŘSKÝCH VÝROBKŮ. PŘÍTOMNOST LIDSKÝCH ENTERICKÝCH VIRŮ (E.G. HUMAN NOROVIRUS, HEPATITIDA A VIRUS ATD.) VE VODÁCH ŽIVOTNÍHO PROSTŘEDÍ JE DOBŘE ZDOKUMENTOVÁNA A V ZÁVISLOSTI NA JEHO POUŽITÍ MŮŽE PŘEDSTAVOVAT HROZBU PRO SPOTŘEBITELE. V SOUČASNÉ DOBĚ SE PŘÍTOMNOST LIDSKÝCH PATOGENNÍCH VIRŮ VE VODĚ SPOLÉHÁ NA BAKTERIÁLNÍ UKAZATELE, KTERÉ ČASTO NEDOKÁŽÍ KORELOVAT S PŘÍTOMNOSTÍ LIDSKÝCH ENTERICKÝCH VIRŮ. _x000D_ Nedávno NEXT GENERACE SEQUENCING (NGS) TOOLS OTEVŘENÍ VELKÝCH OPPORTUNITY pro IDENTIFY RELIABLE VIRAL INDICATORS. HLAVNÍM CÍLEM TOHOTO NÁVRHU JE STANOVIT VIRIOME (PŘÍTOMNOST A RELATIVNÍ ČETNOST SEKVENCÍ VIRŮ, VČETNĚ FÁGŮ A LIDSKÝCH ENTERICKÝCH VIRŮ, V ŽIVOTNÍM PROSTŘEDÍ) ODPADNÍCH VOD A RECYKLOVANÝCH VOD POMOCÍ NGS. V RÁMCI TOHOTO PROJEKTU BUDE OPTIMALIZOVÁN POSTUP PRO OBOHACENÍ VIROVÝCH SEKVENCÍ ZE VZORKŮ VODY. TENTO NÁVRH JE PŘÍNOSNÝ Z TOHO, ŽE MÁ VELKÝ PANEL VZORKŮ ODPADNÍCH VOD, RECYKLOVANÝCH A POVRCHOVÝCH VOD POZITIVNÍCH NA LIDSKÝ NOROVIRUS, HEPATITIDU A LIDSKÝ ASTROVIRUS. VYUŽIJEME NAŠICH ZKUŠENOSTÍ S POUŽÍVÁNÍM BARVIV ŽIVOTASCHOPNOSTI (E.G. PROPIDIUM MONOAZIDE NEBO ETHIDIUM MONOAZIDE) KE SPOJENÍ TÉTO PŘEDÚPRAVY S NGS, ABYCHOM ODHADLI NEJEN CELÝ VIRIOME VZORKŮ VODY, ALE TAKÉ JEJICH POTENCIÁLNÍ INFEKČNOST. TO USNADNÍ HODNOCENÍ ČISTÍREN ODPADNÍCH VOD S CÍLEM SNÍŽIT VIROVOU ZÁTĚŽ Z ODPADNÍCH VOD. STANOVENÍ VIRIOME Z VOD MŮŽE NAVÍC IDENTIFIKOVAT NOVĚ SE OBJEVUJÍCÍ VIRY. KROMĚ TOHO MÁ NAVRHOVANÝ PROJEKT ZA CÍL URČIT VÝZNAMNĚJŠÍ UKAZATEL/INDIKÁTORY PŘÍTOMNOSTI/MNOŽSTVÍ VIRŮ LIDSKÉ PATOGENNÍ POVAHY V RŮZNÝCH DRUZÍCH VOD (PODOBNĚ JAKO JE POUŽITÍ POČTU BAKTERIÍ ESCHERICHIA COLI SPOJENÝCH S PŘÍTOMNOSTÍ LIDSKÝCH BAKTERIÁLNÍCH PATOGENŮ). TENTO PŘEHLED USNADNÍ VÝVOJ NÁSTROJE PRO RYCHLOU DETEKCI A KVANTIFIKACI VIROVÝCH INDIKÁTORŮ, KTERÉ BY MOHLY BÝT PATENTOVÁNY. IDENTIFIKACE SMYSLUPLNÝCH VIROVÝCH INDIKÁTORŮ UMOŽNÍ PRŮMYSLU A LABORATOŘÍM ZJEDNODUŠIT KONTROLU ENTERICKÝCH VIRŮ JEDNODUCHÝM A RYCHLÝM POSTUPEM PRO DETEKCI A KVANTIFIKACI UKAZATELE, KTERÝ LZE V KRÁTKODOBÉM HORIZONTU ZAVÉST V BĚŽNÝCH LABORATOŘÍCH. (Czech)
18 August 2022
0 references
A água é ingerida apenas como alimento, é utilizada para a irritação das plantas, para a lavagem e limpeza dos alimentos durante a preparação e constitui um ingrediente essencial em muitos produtos alimentares. A presença de vírus ENTÉRICOS HUMANOS (por exemplo, NOROVÍRIO HUMANO, HEPATITIS A VIRUS, ETC) em águas ambientais é bem documentada e, dependendo da sua utilização, pode constituir uma ameaça para o consumidor. Atualmente, presença de vírus patogénicos humanos nas correntes hídricas em indicadores bacterianos, que frequentemente não coincidem com a presença de vírus entéricos humanos. _x000D_ Recentemente, as FERRAMENTAS DE SEQUÊNCIA DE GERAÇÃO (NGS) ABERTAM UMA GRANDE OPORTUNIDADE DE IDENTIFICAR INDICADORES VIRAIS FIÁVEIS. O principal objectivo da presente proposta consiste em determinar o grau de gravidade (presença e rendimento relativo das sequências de vírus, incluindo as fagos e os vírus cêntricos humanos, no ambiente) das águas residuais e das águas recicladas através da utilização de NGS. NO ÂMBITO DO PRESENTE PROJECTO, O PROCEDIMENTO DE ALIMENTAÇÃO DAS SEQUÊNCIAS VIRAIS A PARTIR DAS AMOSTRAS DE ÁGUA SERÁ OPTIMIZADO. A presente proposta beneficia de uma vasta gama de amostras de águas residuais, recicladas e superficiais, que são positivas para o NOROVÍRIO HUMANO, para a HEPATITIS, para o VÍRUS HUMANO e para o ASTROVÍRIO HUMANO. Exploraremos a nossa experiência na utilização de corantes de viabilidade (por exemplo, monoazida de propídio ou monoazida de etídio) para combinar este tratamento com a NGS, a fim de estimar não apenas a totalidade do vírus das amostras de água, mas também a sua potencial toxicidade. Isto facilitará a avaliação das instalações de tratamento de água, a fim de reduzir a carga viral dos esgotos. Além disso, a determinação de vírus a partir das águas pode identificar novos vírus emergentes. Por outro lado, o projecto proposto visa identificar um ou mais indicadores mais significativos da presença/do financiamento de vírus patogénicos humanos em diferentes tipos de águas (nomeadamente a utilização de números de ESCHERICHIA COLI associados à presença de agentes patogénicos humanos). Esta INSIGHT FACILITARÁ O DESENVOLVIMENTO DE UMA FERRAMENTA PARA UMA DETEÇÃO RÁPIDA E QUANTIFICAÇÃO DO(S) INDICADOR(ES) VIRAL(AIS) QUE PODEM SER PATENTES. A identificação do(s) indicador(es) viral(ais) permitirá à indústria e aos laboratórios simplificar o controlo dos vírus entéricos através de um procedimento fácil e rápido para detetar e quantificar o indicador que, a curto prazo, pode ser aplicado nos laboratórios rotineiros. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
VETT TARVITATAKSE NAGU TOIT, SEDA KASUTATAKSE TAIMEDE NIISUTAMISEKS, TOIDU PESEMISEKS JA PUHASTAMISEKS ETTEVALMISTAMISE AJAL NING SEE ON PALJUDE TOIDUAINETE OLULINE KOOSTISOSA. INIMESE ENTEROVIIRUSTE (E.G. INIMESE NOROVIIRUS, HEPATIIT A VIIRUS JNE) ESINEMINE KESKKONNAVETES ON HÄSTI DOKUMENTEERITUD JA SÕLTUVALT NENDE KASUTAMISEST VÕIB SEE OHUSTADA TARBIJAT. PRAEGU SÕLTUB INIMESE PATOGEENSETE VIIRUSTE ESINEMINE VEES BAKTERIAALSETEST NÄITAJATEST, MIS SAGELI EI OLE KORRELATSIOONIS INIMESE ENTEROVIIRUSTE ESINEMISEGA. _x000D_ hiljuti NEXT GENERATION SEQUENCING (NGS) TOOLID OPENAT OPPORTUNITY IDENTIFY RELIABLE VIRAL INDICATORS. KÄESOLEVA ETTEPANEKU PEAMINE EESMÄRK ON MÄÄRATA KINDLAKS REOVEE JA TAASKASUTATAVATE VEEKOGUDE VIRIOME (VIIRUSTE, SEALHULGAS FAAGIDE JA INIMESTE ENTEROVIIRUSTE JÄRJESTUSTE OLEMASOLU JA SUHTELINE ROHKUS KESKKONNAS), KASUTADES NGSI. SELLE PROJEKTI RAAMES OPTIMEERITAKSE VEEPROOVIDE VIIRUSTE JÄRJESTUSTE RIKASTAMISE KORDA. SEE ETTEPANEK ON KASULIK, KUI SUUR PANEEL REOVEE, TAASKASUTATUD JA PINNAVEE PROOVID POSITIIVNE INIMESE NOROVIIRUS, HEPATIIT VIIRUS JA INIMESE ASTROVIIRUS. KASUTAME OMA KOGEMUSI ELUVÕIMELISTE VÄRVAINETE (E.G. PROPIDIUMMONOASIID VÕI ETIDIUMMONOASIID) KASUTAMISEL, ET KOMBINEERIDA SEDA EELTÖÖTLUST NGSIGA, ET HINNATA MITTE AINULT KOGU VEEPROOVIDE VIRIOME’I, VAID KA NENDE VÕIMALIKKU NAKKAVUST. SEE HÕLBUSTAB VEEPUHASTITE HINDAMIST, ET VÄHENDADA REOVEEST TULENEVAT VIIRUSKOORMUST. LISAKS VÕIB VIRIOME MÄÄRAMINE VETEST TUVASTADA UUSI ESILEKERKIVAID VIIRUSI. LISAKS SELLELE ON KAVANDATUD PROJEKTI EESMÄRK TEHA KINDLAKS OLULISEMAD NÄITAJAD INIMESTE PATOGEENSETE VIIRUSTE ESINEMISE/ARVUKUSE KOHTA ERI LIIKI VETES (SARNASELT ESCHERICHIA COLI ARVU KASUTAMISEGA, MIS ON SEOTUD INIMESE BAKTERIAALSETE PATOGEENIDE ESINEMISEGA). SEE ÜLEVAADE HÕLBUSTAB PATENTEERITAVA(TE) VIIRUSINDIKAATORI(TE) KIIREKS AVASTAMISEKS JA KVANTIFITSEERIMISEKS MÕELDUD VAHENDI VÄLJATÖÖTAMIST. MÕTESTATUD VIIRUSINDIKAATORI(TE) KINDLAKSTEGEMINE VÕIMALDAB TÖÖSTUSEL JA LABORITEL LIHTSUSTADA SOOLEVIIRUSTE TÕRJET LIHTSA JA KIIRE MENETLUSEGA INDIKAATORI TUVASTAMISEKS JA KVANTIFITSEERIMISEKS, MIDA SAAB LÜHIAJALISELT RAKENDADA RUTIINSETES LABORITES. (Estonian)
18 August 2022
0 references
A VIZET ÉLELMISZERKÉNT FOGYASZTJÁK, NÖVÉNYEK ÖNTÖZÉSÉRE, AZ ELKÉSZÍTÉS SORÁN AZ ÉLELMISZEREK MOSÁSÁRA ÉS TISZTÍTÁSÁRA HASZNÁLJÁK, ÉS SZÁMOS ÉLELMISZER-IPARI TERMÉK ALAPVETŐ ÖSSZETEVŐJE. AZ EMBERI BÉLVÍRUSOK (E.G. HUMÁN NOROVÍRUS, HEPATITIS A VÍRUS STB.) JELENLÉTE A KÖRNYEZETI VIZEKBEN JÓL DOKUMENTÁLT, ÉS HASZNÁLATUKTÓL FÜGGŐEN VESZÉLYT JELENTHET A FOGYASZTÓKRA NÉZVE. JELENLEG AZ EMBERI PATOGENITÁSÚ VÍRUSOK VÍZBEN VALÓ JELENLÉTE BAKTERIÁLIS MUTATÓKON ALAPUL, AMELYEK GYAKRAN NEM KORRELÁLNAK AZ EMBERI BÉLVÍRUSOK JELENLÉTÉVEL. _x000D_ A közelmúltban NEXT GENERATION SEQUENCING (NGS) TOOLS OPEN A MEGÁLLAPODÁSI RELIABÁLIS VIRÁLIS INDICATORS. E JAVASLAT FŐ CÉLJA A SZENNYVÍZ ÉS A VISSZANYERT VIZEK VIRIOME-JÉNEK MEGHATÁROZÁSA (A VÍRUSOKBÓL SZÁRMAZÓ SZEKVENCIÁK JELENLÉTE ÉS RELATÍV BŐSÉGE, BELEÉRTVE A FÁGOKAT ÉS AZ EMBERI ENTERÁLIS VÍRUSOKAT IS A KÖRNYEZETBEN) NGS HASZNÁLATÁVAL. E PROJEKT KERETÉBEN OPTIMALIZÁLJÁK A VÍZMINTÁKBÓL SZÁRMAZÓ VÍRUSSZEKVENCIÁK DÚSÍTÁSÁNAK ELJÁRÁSÁT. A JAVASLAT ELŐNYE, HOGY A HUMÁN NOROVÍRUSRA, A HEPATITIS VÍRUSRA ÉS A HUMÁN ASZTROVÍRUSRA POZITÍV SZENNYVÍZ-, VISSZANYERT ÉS FELSZÍNI VÍZMINTÁKBÓL ÁLL. AZ ÉLETKÉPESSÉGI SZÍNEZÉKEK (E.G. PROPIDIUM MONOAZID VAGY ETIDIUM MONOAZID) HASZNÁLATA SORÁN SZERZETT TAPASZTALATAINKAT ARRA HASZNÁLJUK FEL, HOGY EZT AZ ELŐKEZELÉST NGS-SZEL KOMBINÁLJUK, HOGY NE CSAK A VÍZMINTÁK TELJES VIRIOME-JÁT, HANEM POTENCIÁLIS FERTŐZŐKÉPESSÉGÜKET IS MEGBECSÜLJÜK. EZ MEGKÖNNYÍTI A SZENNYVÍZTISZTÍTÓ TELEPEK ÉRTÉKELÉSÉT A SZENNYVÍZBŐL SZÁRMAZÓ VÍRUSTERHELÉS CSÖKKENTÉSE ÉRDEKÉBEN. EZENKÍVÜL A VIRIOME VIZEKBŐL TÖRTÉNŐ MEGHATÁROZÁSA ÚJ, ÚJONNAN MEGJELENŐ VÍRUSOKAT AZONOSÍTHAT. EMELLETT A JAVASOLT PROJEKT CÉLJA AZ EMBERI PATOGÉN VÍRUSOK KÜLÖNBÖZŐ TÍPUSÚ VIZEKBEN VALÓ JELENLÉTÉRE/BŐVÍTÉSÉRE VONATKOZÓ JELENTŐSEBB MUTATÓ(K) AZONOSÍTÁSA (HASONLÓAN AZ ESCHERICHIA COLI SZÁMOKNAK AZ EMBERI BAKTERIÁLIS KÓROKOZÓK JELENLÉTÉHEZ KAPCSOLÓDÓ HASZNÁLATÁHOZ). EZ A BETEKINTÉS MEGKÖNNYÍTI A SZABADALMAZTATHATÓ VÍRUSMUTATÓ(K) GYORS KIMUTATÁSÁRA ÉS MENNYISÉGI MEGHATÁROZÁSÁRA SZOLGÁLÓ ESZKÖZ KIFEJLESZTÉSÉT. AZ ÉRTELMES VÍRUSMUTATÓ(K) AZONOSÍTÁSA LEHETŐVÉ TESZI AZ IPAR ÉS A LABORATÓRIUMOK SZÁMÁRA, HOGY EGYSZERŰ ÉS GYORS ELJÁRÁSSAL EGYSZERŰSÍTSÉK AZ ENTERÁLIS VÍRUSOK ELLENI VÉDEKEZÉST A MUTATÓ KIMUTATÁSÁRA ÉS SZÁMSZERŰSÍTÉSÉRE, AMELY RÖVID TÁVON RUTINLABORATÓRIUMOKBAN IS VÉGREHAJTHATÓ. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
ВОДАТА СЕ ПОГЛЪЩА ТОЧНО КАТО ХРАНА, ИЗПОЛЗВА СЕ ЗА НАПОЯВАНЕ НА РАСТЕНИЯТА, ЗА ИЗМИВАНЕ И ПОЧИСТВАНЕ НА ХРАНИ ПО ВРЕМЕ НА ПРИГОТВЯНЕТО И ПРЕДСТАВЛЯВА ОСНОВНА СЪСТАВКА В МНОГО ХРАНИТЕЛНИ ПРОДУКТИ. НАЛИЧИЕТО НА ЧОВЕШКИ ЕНТЕРИЧНИ ВИРУСИ (НАПР. ЧОВЕШКИ НОРОВИРУС, ХЕПАТИТ И Т.Н.) ВЪВ ВОДИТЕ НА ОКОЛНАТА СРЕДА Е ДОБРЕ ДОКУМЕНТИРАНО И В ЗАВИСИМОСТ ОТ УПОТРЕБАТА МУ МОЖЕ ДА ПРЕДСТАВЛЯВА ЗАПЛАХА ЗА ПОТРЕБИТЕЛЯ. ПОНАСТОЯЩЕМ НАЛИЧИЕТО НА ЧОВЕШКИ ПАТОГЕННИ ВИРУСИ ВЪВ ВОДАТА РАЗЧИТА НА БАКТЕРИАЛНИ ПОКАЗАТЕЛИ, КОИТО ЧЕСТО НЕ УСПЯВАТ ДА СЕ СВЪРЖАТ С НАЛИЧИЕТО НА ЧОВЕШКИ ЕНТЕРИЧНИ ВИРУСИ. _x000D_ наскоро NEXT GENERATION SEQUENCING (NGS) TOOLS ОТВЪРЖДАВА великолепно ОПОРЪЧНОСТ за идентифициране на ВИАЛНИ ИНДИКАТОРИ. ОСНОВНАТА ЦЕЛ НА НАСТОЯЩОТО ПРЕДЛОЖЕНИЕ Е ДА СЕ ОПРЕДЕЛИ VIRIOME (НАЛИЧИЕ И ОТНОСИТЕЛНО ИЗОБИЛИЕ ОТ ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТИ ОТ ВИРУСИ, ВКЛЮЧИТЕЛНО ФАГИ И ЧОВЕШКИ ЕНТЕРИЧНИ ВИРУСИ, В ОКОЛНАТА СРЕДА) НА ОТПАДЪЧНИ ВОДИ И РЕЦИКЛИРАНИ ВОДИ ЧРЕЗ ИЗПОЛЗВАНЕ НА NGS. В РАМКИТЕ НА ТОЗИ ПРОЕКТ ЩЕ БЪДЕ ОПТИМИЗИРАНА ПРОЦЕДУРАТА ЗА ОБОГАТЯВАНЕ НА ВИРУСНИ СЕКВЕНЦИИ ОТ ВОДНИ ПРОБИ. ТОВА ПРЕДЛОЖЕНИЕ Е ОТ ПОЛЗА ОТ НАЛИЧИЕТО НА ГОЛЯМ ПАНЕЛ ОТ ОТПАДЪЧНИ ВОДИ, ПРОБИ ОТ РЕЦИКЛИРАНИ И ПОВЪРХНОСТНИ ВОДИ, ПОЛОЖИТЕЛНИ ЗА ЧОВЕШКИ НОРОВИРУС, ХЕПАТИТ, ВИРУС И ЧОВЕШКИ АСТРОВИРУС. ЩЕ ИЗПОЛЗВАМЕ ОПИТА СИ В ИЗПОЛЗВАНЕТО НА БАГРИЛА ЗА ЖИЗНЕСПОСОБНОСТ (E.G. ПРОПИДИЕВ МОНОАЗИД ИЛИ ЕТИДИЕВ МОНОАЗИД), ЗА ДА КОМБИНИРАМЕ ТАЗИ ПРЕДВАРИТЕЛНА ОБРАБОТКА С NGS, ЗА ДА ОЦЕНИМ НЕ САМО ЦЯЛАТА VIRIOME НА ВОДНИТЕ ПРОБИ, НО И ПОТЕНЦИАЛНАТА ИМ ИНФЕКЦИОЗНОСТ. ТОВА ЩЕ УЛЕСНИ ОЦЕНКАТА НА ПРЕЧИСТВАТЕЛНИТЕ СТАНЦИИ, ЗА ДА СЕ НАМАЛИ ВИРУСНОТО НАТОВАРВАНЕ ОТ ОТПАДЪЧНИ ВОДИ. ОСВЕН ТОВА ПРИ ОПРЕДЕЛЯНЕТО НА VIRIOME ОТ ВОДИТЕ МОЖЕ ДА СЕ ИДЕНТИФИЦИРАТ НОВОВЪЗНИКВАЩИ ВИРУСИ. ОСВЕН ТОВА ПРЕДЛОЖЕНИЯТ ПРОЕКТ ИМА ЗА ЦЕЛ ДА ИДЕНТИФИЦИРА ПО-ЗНАЧИМ(И) ПОКАЗАТЕЛ(И) ЗА НАЛИЧИЕТО/ИЗОБИЛИЕТО НА ЧОВЕШКИ ПАТОГЕННИ ВИРУСИ В РАЗЛИЧНИ ВИДОВЕ ВОДИ (ПОДОБНО НА ИЗПОЛЗВАНЕТО НА БРОЯ НА ESCHERICHIA COLI, СВЪРЗАН С НАЛИЧИЕТО НА ЧОВЕШКИ БАКТЕРИАЛНИ ПАТОГЕНИ). ТАЗИ ИНФОРМАЦИЯ ЩЕ УЛЕСНИ РАЗРАБОТВАНЕТО НА ИНСТРУМЕНТ ЗА БЪРЗО ОТКРИВАНЕ И КОЛИЧЕСТВЕНО ОПРЕДЕЛЯНЕ НА ВИРУСНИЯ(ТЕ) ИНДИКАТОР(И), КОИТО МОГАТ ДА БЪДАТ ПАТЕНТОВАНИ. ИДЕНТИФИЦИРАНЕТО НА ЗНАЧИМ(И) ВИРУСЕН(И) ПОКАЗАТЕЛ(И) ЩЕ ПОЗВОЛИ НА ПРОМИШЛЕНОСТТА И ЛАБОРАТОРИИТЕ ДА ОПРОСТЯТ КОНТРОЛА НА ЕНТЕРИЧНИТЕ ВИРУСИ ЧРЕЗ ЛЕСНА И БЪРЗА ПРОЦЕДУРА ЗА ОТКРИВАНЕ И КОЛИЧЕСТВЕНО ОПРЕДЕЛЯНЕ НА ПОКАЗАТЕЛЯ, КОЯТО В КРАТКОСРОЧЕН ПЛАН МОЖЕ ДА БЪДЕ ПРИЛОЖЕНА В РУТИННИ ЛАБОРАТОРИИ. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
VANDUO PRARYJAMAS KAIP MAISTAS, NAUDOJAMAS AUGALAMS DRĖKINTI, MAISTUI PLAUTI IR VALYTI RUOŠIMO METU IR YRA SVARBI DAUGELIO MAISTO PRODUKTŲ SUDEDAMOJI DALIS. ŽMOGAUS ENTERINIŲ VIRUSŲ (PVZ., ŽMOGAUS NOROVIRUSO, HEPATITO IR VIRUSO IR KT.) BUVIMAS APLINKOS VANDENYSE YRA GERAI DOKUMENTUOTAS IR, PRIKLAUSOMAI NUO JO NAUDOJIMO, GALI KELTI GRĖSMĘ VARTOTOJUI. ŠIUO METU ŽMONIŲ PATOGENINIŲ VIRUSŲ BUVIMAS VANDENYJE REMIASI BAKTERIJŲ RODIKLIAIS, KURIE DAŽNAI NESUTAMPA SU ŽMOGAUS ENTERINIŲ VIRUSŲ BUVIMU. _x000D_ neseniai NEXT GENERACIJOS SEQUENCING (NGS) TOOLS OPEN A GREAT OPPORTUNITY to IDENTIFY RELIABLE VIRAL INDICATORS. PAGRINDINIS ŠIO PASIŪLYMO TIKSLAS – NUSTATYTI KANALIZACIJOS IR REGENERUOTO VANDENS VIRIOME (APLINKOS VIRUSŲ, ĮSKAITANT FAGUS IR ŽMOGAUS ENTERINIUS VIRUSUS, SEKŲ BUVIMĄ IR SANTYKINĮ GAUSĄ) NAUDOJANT NGS. ĮGYVENDINANT ŠĮ PROJEKTĄ BUS OPTIMIZUOTA VIRUSO SEKŲ SODRINIMO IŠ VANDENS MĖGINIŲ PROCEDŪRA. ŠIAM PASIŪLYMUI NAUDINGA TAI, KAD DAUG NUOTEKŲ, REGENERUOTŲ IR PAVIRŠINIŲ VANDENS MĖGINIŲ YRA TEIGIAMI ŽMOGAUS NOROVIRUSUI, HEPATITUI IR ŽMOGAUS ASTROVIRUSUI. IŠNAUDOSIME SAVO PATIRTĮ NAUDOJANT GYVYBINGUMO DAŽIKLIUS (E.G. PROPIDIUM MONOAZIDE ARBA ETIDŽIO MONOAZIDĄ), KAD SUJUNGTUME ŠĮ PIRMINĮ APDOROJIMĄ SU NGS, KAD GALĖTUME ĮVERTINTI NE TIK VISĄ VANDENS MĖGINIŲ VIRIOME, BET IR JŲ GALIMĄ INFEKCIJĄ. TAI PALENGVINS VANDENS VALYMO ĮRENGINIŲ VERTINIMĄ SIEKIANT SUMAŽINTI VIRUSŲ KIEKĮ NUOTEKOSE. BE TO, VIRIOME NUSTATYMAS VANDENYSE GALI NUSTATYTI NAUJUS NAUJUS VIRUSUS. BE TO, SIŪLOMU PROJEKTU SIEKIAMA NUSTATYTI REIKŠMINGESNĮ (-US) RODIKLĮ (-IUS) APIE ŽMONIŲ PATOGENINIŲ VIRUSŲ BUVIMĄ IR (ARBA) PAPLITIMĄ ĮVAIRIŲ RŪŠIŲ VANDENYSE (PANAŠU Į ESCHERICHIA COLI SKAIČIŲ, SUSIJUSĮ SU ŽMONIŲ BAKTERIJŲ PATOGENŲ BUVIMU). ŠI ĮŽVALGA PADĖS SUKURTI PRIEMONĘ, SKIRTĄ GREITAI NUSTATYTI IR KIEKYBIŠKAI ĮVERTINTI VIRUSINĮ (-IUS) RODIKLĮ (-IUS), KURIS (-IE) GALI BŪTI PATENTUOTAS (-I). NUSTAČIUS REIKŠMINGĄ (-US) VIRUSINĮ (-IUS) RODIKLĮ (-IUS), PRAMONĖ IR LABORATORIJOS GALĖS SUPAPRASTINTI ENTERINIŲ VIRUSŲ KONTROLĘ TAIKANT PAPRASTĄ IR GREITĄ INDIKATORIAUS NUSTATYMO IR KIEKYBINIO ĮVERTINIMO PROCEDŪRĄ, KURIĄ PER TRUMPĄ LAIKĄ GALIMA ĮDIEGTI ĮPRASTOSE LABORATORIJOSE. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
VODA SE KONZUMIRA KAO HRANA, KORISTI SE ZA NAVODNJAVANJE BILJAKA, ZA PRANJE I ČIŠĆENJE HRANE TIJEKOM PRIPREME I PREDSTAVLJA BITAN SASTOJAK U MNOGIM PREHRAMBENIM PROIZVODIMA. PRISUTNOST HUMANIH ENTERIČKIH VIRUSA (E.G. HUMAN NOROVIRUS, HEPATITIS A VIRUS ITD.) U VODAMA OKOLIŠA DOBRO JE DOKUMENTIRANA I OVISNO O NJEGOVOJ UPORABI MOŽE PREDSTAVLJATI PRIJETNJU ZA POTROŠAČA. TRENUTAČNO SE PRISUTNOST LJUDSKIH PATOGENIH VIRUSA U VODI OSLANJA NA BAKTERIJSKE POKAZATELJE, KOJI ČESTO NISU POVEZANI S PRISUTNOŠĆU HUMANIH ENTERIČKIH VIRUSA. _x000D_ Nedavno NEXT OPERATION SEQUENCING (NGS) TOOLS OTVORENI OPPORTUNITY ZA IDENTIFY RELIABLE VIRAL INDICATORS. GLAVNI JE CILJ OVOG PRIJEDLOGA UTVRDITI VIRIOME (PRISUTNOST I RELATIVNA BROJNOST SEKVENCI VIRUSA, UKLJUČUJUĆI FAGOVE I HUMANE ENTERIČKE VIRUSE, U OKOLIŠU) OTPADNIH VODA I OBNOVLJENIH VODA UPOTREBOM NGS-A. U OKVIRU OVOG PROJEKTA OPTIMIZIRAT ĆE SE POSTUPAK ZA OBOGAĆIVANJE VIRUSNIH SEKVENCI IZ UZORAKA VODE. OVAJ PRIJEDLOG IMA KORISTI OD VELIKOG BROJA UZORAKA OTPADNIH VODA, OBNOVLJENIH I POVRŠINSKIH VODA POZITIVNIH NA LJUDSKI NOROVIRUS, VIRUS HEPATITISA I LJUDSKI ASTROVIRUS. ISKORISTIT ĆEMO NAŠE ISKUSTVO U KORIŠTENJU BOJILA ZA ODRŽIVOST (E.G. PROPIDIUM MONOAZID ILI ETHIDIUM MONOAZID) KAKO BISMO KOMBINIRALI OVU PRETHODNU OBRADU S NGS-OM, KAKO BISMO PROCIJENILI NE SAMO CIJELI VIRIOME UZORAKA VODE, VEĆ I NJIHOVU POTENCIJALNU INFEKCIJU. TO ĆE OLAKŠATI PROCJENU POSTROJENJA ZA PROČIŠĆAVANJE VODE KAKO BI SE SMANJILO VIRUSNO OPTEREĆENJE OTPADNIH VODA. OSIM TOGA, ODREĐIVANJEM VIRUSA VIRIOME IZ VODA MOGU SE UTVRDITI NOVI VIRUSI U NASTAJANJU. OSIM TOGA, PREDLOŽENIM PROJEKTOM NASTOJI SE UTVRDITI ZNAČAJNIJI POKAZATELJ/POKAZATELJI PRISUTNOSTI/OBILJEŽENOSTI LJUDSKIH PATOGENIH VIRUSA U RAZLIČITIM VRSTAMA VODA (SLIČNO UPORABI BROJEVA BAKTERIJE ESCHERICHIA COLI POVEZANIH S PRISUTNOŠĆU PATOGENA LJUDSKOG BAKTERIJA). TAJ ĆE UVID OLAKŠATI RAZVOJ ALATA ZA BRZO OTKRIVANJE I KVANTIFIKACIJU VIRUSNIH POKAZATELJA KOJI BI MOGLI BITI PATENTIRANI. UTVRĐIVANJE SMISLENIH VIRUSNIH POKAZATELJA OMOGUĆIT ĆE INDUSTRIJI I LABORATORIJIMA POJEDNOSTAVLJENJE KONTROLE ENTERIČKIH VIRUSA JEDNOSTAVNIM I BRZIM POSTUPKOM ZA OTKRIVANJE I KVANTIFICIRANJE POKAZATELJA, KOJI SE KRATKOROČNO MOŽE PRIMIJENITI U RUTINSKIM LABORATORIJIMA. (Croatian)
18 August 2022
0 references
VATTEN INTAS PRECIS SOM ETT LIVSMEDEL, ANVÄNDS FÖR BEVATTNING AV VÄXTER, FÖR TVÄTT OCH RENGÖRING AV LIVSMEDEL UNDER BEREDNING OCH UTGÖR EN VIKTIG INGREDIENS I MÅNGA LIVSMEDELSPRODUKTER. FÖREKOMSTEN AV HUMANA ENTERISKA VIRUS (T.EX. HUMANT NOROVIRUS, HEPATIT ETT VIRUS OSV.) I MILJÖVATTEN ÄR VÄLDOKUMENTERAD OCH BEROENDE PÅ DESS ANVÄNDNING KAN DEN UTGÖRA ETT HOT MOT KONSUMENTEN. FÖR NÄRVARANDE ÄR FÖREKOMSTEN AV HUMANPATOGENA VIRUS I VATTEN BEROENDE AV BAKTERIEINDIKATORER, SOM OFTA MISSLYCKAS MED ATT KORRELERA MED NÄRVARON AV MÄNSKLIGA ENTERISKA VIRUS. _x000D_ nyligen NEXT GENERATION SEQUENCING (NGS) TOOLS Öppna ett stort alternativ till IDENTIFY RELIABLE VIRAL INDICATORS. HUVUDSYFTET MED DETTA FÖRSLAG ÄR ATT FASTSTÄLLA VIRIOME (NÄRVARO OCH RELATIV FÖREKOMST AV SEKVENSER FRÅN VIRUS, INKLUSIVE FAG OCH MÄNSKLIGA ENTERISKA VIRUS, I MILJÖN) AV AVLOPPSVATTEN OCH ÅTERVUNNET VATTEN GENOM ANVÄNDNING AV NGS. INOM RAMEN FÖR DETTA PROJEKT KOMMER FÖRFARANDET FÖR BERIKNING AV VIRUSSEKVENSER FRÅN VATTENPROVER ATT OPTIMERAS. DETTA FÖRSLAG GYNNAS AV ATT EN STOR PANEL AV AVLOPPSVATTEN, ÅTERVUNNET AVLOPPSVATTEN OCH YTVATTENPROVER ÄR POSITIVA FÖR HUMANT NOROVIRUS, HEPATIT ETT VIRUS OCH HUMANT ASTROVIRUS. VI KOMMER ATT UTNYTTJA VÅR ERFARENHET AV ANVÄNDNING AV VIABILITETSFÄRGER (E.G. PROPIDIUM MONOAZID ELLER ETHIDIUMMONOAZID) FÖR ATT KOMBINERA DENNA FÖRBEHANDLING MED NGS, FÖR ATT UPPSKATTA INTE BARA HELA VIRIOME AV VATTENPROVERNA UTAN ÄVEN DERAS POTENTIELLA SMITTSAMHET. DETTA KOMMER ATT UNDERLÄTTA UTVÄRDERINGEN AV VATTENRENINGSVERKEN FÖR ATT MINSKA VIRUSBELASTNINGEN FRÅN AVLOPPSVATTEN. DESSUTOM KAN BESTÄMNINGEN AV VIRIOME FRÅN VATTEN IDENTIFIERA NYA NYA VIRUS. DESSUTOM SYFTAR DET FÖRESLAGNA PROJEKTET TILL ATT IDENTIFIERA EN ELLER FLERA MER SIGNIFIKANTA INDIKATORER PÅ FÖREKOMSTEN/ANTALET HUMANPATOGENA VIRUS I OLIKA TYPER AV VATTEN (PÅ SAMMA SÄTT SOM ANVÄNDNINGEN AV ESCHERICHIA COLI-TAL I SAMBAND MED FÖREKOMSTEN AV MÄNSKLIGA BAKTERIELLA PATOGENER). DENNA INSIKT KOMMER ATT UNDERLÄTTA UTVECKLINGEN AV ETT VERKTYG FÖR SNABB UPPTÄCKT OCH KVANTIFIERING AV DEN/DE VIRUSINDIKATORER SOM KAN KOMMA ATT PATENTERAS. IDENTIFIERINGEN AV MENINGSFULLA VIRUSINDIKATORER KOMMER ATT GÖRA DET MÖJLIGT FÖR INDUSTRIN OCH LABORATORIERNA ATT FÖRENKLA KONTROLLEN AV ENTEROVIRUS GENOM ETT ENKELT OCH SNABBT FÖRFARANDE FÖR ATT UPPTÄCKA OCH KVANTIFIERA INDIKATORN, SOM PÅ KORT SIKT KAN GENOMFÖRAS I RUTINMÄSSIGA LABORATORIER. (Swedish)
18 August 2022
0 references
APA ESTE INGERATĂ LA FEL CA UN ALIMENT, ESTE UTILIZATĂ PENTRU IRIGAREA PLANTELOR, PENTRU SPĂLAREA ȘI CURĂȚAREA ALIMENTELOR ÎN TIMPUL PREPARĂRII ȘI CONSTITUIE UN INGREDIENT ESENȚIAL ÎN MULTE PRODUSE ALIMENTARE. PREZENȚA VIRUSURILOR ENTERICE UMANE (E.G. NOROVIRUS UMAN, HEPATITĂ A VIRUSULUI ETC.) ÎN APELE DE MEDIU ESTE BINE DOCUMENTATĂ ȘI, ÎN FUNCȚIE DE UTILIZAREA SA, POATE REPREZENTA O AMENINȚARE PENTRU CONSUMATOR. ÎN PREZENT, PREZENȚA VIRUSURILOR PATOGENE UMANE ÎN APĂ SE BAZEAZĂ PE INDICATORI BACTERIENI, CARE ADESEA NU REUȘESC SĂ SE CORELEZE CU PREZENȚA VIRUȘILOR ENTERICI UMANI. _x000D_ recent, NEXT GENERATION SEQUENCING (NGS) deschide o mare OPPORTUNITATE INDICATORI VIRALE RELIABLE IDENTIFII. OBIECTIVUL PRINCIPAL AL PREZENTEI PROPUNERI ESTE DE A DETERMINA VIRIOME (PREZENȚA ȘI ABUNDENȚA RELATIVĂ DE SECVENȚE PROVENITE DE LA VIRUSURI, INCLUSIV FAGI ȘI VIRUSURI ENTERICE UMANE, ÎN MEDIUL ÎNCONJURĂTOR) A APELOR UZATE ȘI A APELOR RECUPERATE PRIN UTILIZAREA NGS. ÎN CADRUL ACESTUI PROIECT, PROCEDURA DE ÎMBOGĂȚIRE A SECVENȚELOR VIRALE DIN PROBELE DE APĂ VA FI OPTIMIZATĂ. PREZENTA PROPUNERE BENEFICIAZĂ DE O GAMĂ LARGĂ DE PROBE DE APE UZATE, RECUPERATE ȘI DE SUPRAFAȚĂ POZITIVE PENTRU NOROVIRUSUL UMAN, HEPATITA A VIRUSULUI ȘI ASTROVIRUSUL UMAN. VOM EXPLOATA EXPERIENȚA NOASTRĂ ÎN UTILIZAREA COLORANȚILOR DE VIABILITATE (E.G. PROPIDIUM MONOAZIDĂ SAU ETIDIU MONOAZIDĂ) PENTRU A COMBINA ACEST TRATAMENT PREALABIL CU NGS, PENTRU A ESTIMA NU NUMAI ÎNTREAGA VIRIOME A PROBELOR DE APĂ, CI ȘI POTENȚIALA LOR INFECȚIOZITATE. ACEST LUCRU VA FACILITA EVALUAREA STAȚIILOR DE TRATARE A APEI PENTRU A REDUCE ÎNCĂRCĂTURA VIRALĂ DIN APELE UZATE. ÎN PLUS, DETERMINAREA VIRIOME DIN APE POATE IDENTIFICA NOI VIRUSURI EMERGENTE. ÎN PLUS, PROIECTUL PROPUS VIZEAZĂ IDENTIFICAREA UNUI INDICATOR/INDICATORI MAI SEMNIFICATIVI AI PREZENȚEI/ABUNDENȚEI VIRUSURILOR PATOGENE UMANE ÎN DIFERITE TIPURI DE APE (SIMILAR CU UTILIZAREA NUMERELOR ESCHERICHIA COLI ASOCIATE CU PREZENȚA AGENȚILOR PATOGENI BACTERIENI UMANI). ACEASTĂ PERSPECTIVĂ VA FACILITA DEZVOLTAREA UNUI INSTRUMENT PENTRU DETECTAREA ȘI CUANTIFICAREA RAPIDĂ A INDICATORULUI (INDICATORILOR) VIRAL(I) CARE AR PUTEA FI BREVETAT(E). IDENTIFICAREA INDICATORULUI/INDICATORILOR VIRALI SEMNIFICATIVI VA PERMITE INDUSTRIEI ȘI LABORATOARELOR SĂ SIMPLIFICE CONTROLUL VIRUSURILOR ENTERICE PRINTR-O PROCEDURĂ UȘOARĂ ȘI RAPIDĂ DE DETECTARE ȘI CUANTIFICARE A INDICATORULUI, CARE POATE FI IMPLEMENTAT PE TERMEN SCURT ÎN LABORATOARELE DE RUTINĂ. (Romanian)
18 August 2022
0 references
VODA SE ZAUŽIJE KOT HRANA, UPORABLJA SE ZA NAMAKANJE RASTLIN, PRANJE IN ČIŠČENJE HRANE MED PRIPRAVO IN PREDSTAVLJA BISTVENO SESTAVINO V ŠTEVILNIH ŽIVILSKIH PROIZVODIH. PRISOTNOST ČLOVEŠKIH ENTERIČNIH VIRUSOV (E.G. HUMAN NOROVIRUS, HEPATITIS VIRUS ITD.) V OKOLJSKIH VODAH JE DOBRO DOKUMENTIRANA IN LAHKO GLEDE NA NJEGOVO UPORABO PREDSTAVLJA NEVARNOST ZA POTROŠNIKA. TRENUTNO PRISOTNOST ČLOVEŠKIH PATOGENIH VIRUSOV V VODI TEMELJI NA BAKTERIJSKIH INDIKATORJIH, KI POGOSTO NISO POVEZANI S PRISOTNOSTJO ČLOVEŠKIH ENTERIČNIH VIRUSOV. _x000D_ pred kratkim NEXT GENERATION SEQUENCING (NGS) TOOLS ODLOČNO ODLOČNO ODLOČITEV DOSTAVNIH RELIABNIH VIRALNIH INDICATORjev. GLAVNI CILJ TEGA PREDLOGA JE DOLOČITI VIRIOME (PRISOTNOST IN RELATIVNO ŠTEVILČNOST SEKVENC IZ VIRUSOV, VKLJUČNO S FAGI IN ČLOVEŠKIMI ENTERIČNIMI VIRUSI, V OKOLJU) ODPADNE VODE IN PREDELANE VODE Z UPORABO NGS. V OKVIRU TEGA PROJEKTA BO OPTIMIZIRAN POSTOPEK OBOGATITVE VIRUSNIH SEKVENC IZ VZORCEV VODE. TA PREDLOG IMA KORISTI OD VELIKE SKUPINE ODPLAK, PREDELANIH VZORCEV IN VZORCEV POVRŠINSKE VODE, POZITIVNIH NA HUMANI NOROVIRUS, HEPATITIS ALI VIRUS IN ČLOVEŠKI ASTROVIRUS. NAŠE IZKUŠNJE PRI UPORABI RENTABILNOSTNIH BARVIL (E.G. PROPIDIUM MONOAZID ALI ETIDIJEV MONOAZID) BOMO IZKORISTILI ZA KOMBINIRANJE TE PREDOBDELAVE Z NGS, DA BI OCENILI NE LE CELOTNO VIRIOME VZORCEV VODE, AMPAK TUDI NJIHOVO POTENCIALNO INFEKTIVNOST. TO BO OLAJŠALO OCENJEVANJE ČISTILNIH NAPRAV, DA SE ZMANJŠA VIRUSNA OBREMENITEV IZ ODPLAK. POLEG TEGA LAHKO DOLOČANJE VIRIOME IZ VODA IDENTIFICIRA NOVE VIRUSE. POLEG TEGA JE PREDLAGANI PROJEKT NAMENJEN OPREDELITVI POMEMBNEJŠIH KAZALNIKOV PRISOTNOSTI/PRESEŽNOSTI ČLOVEŠKIH PATOGENIH VIRUSOV V RAZLIČNIH VRSTAH VODA (PODOBNO KOT PRI UPORABI ŠTEVIL ESCHERICHIA COLI, POVEZANIH S PRISOTNOSTJO ČLOVEŠKIH BAKTERIJSKIH PATOGENOV). TA VPOGLED BO OLAJŠAL RAZVOJ ORODJA ZA HITRO ODKRIVANJE IN KOLIČINSKO OPREDELITEV VIRUSNIH INDIKATORJEV, KI BI LAHKO BILI PATENTIRANI. IDENTIFIKACIJA POMEMBNIH VIRUSNIH INDIKATORJEV BO INDUSTRIJI IN LABORATORIJEM OMOGOČILA POENOSTAVITEV NADZORA NAD ENTERIČNIMI VIRUSI Z ENOSTAVNIM IN HITRIM POSTOPKOM ZA ODKRIVANJE IN KOLIČINSKO OPREDELITEV KAZALNIKA, KI SE LAHKO KRATKOROČNO IZVAJA V REDNIH LABORATORIJIH. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
WODA JEST SPOŻYWANA JAKO ŻYWNOŚĆ, JEST WYKORZYSTYWANA DO NAWADNIANIA ROŚLIN, DO MYCIA I CZYSZCZENIA ŻYWNOŚCI PODCZAS PRZYGOTOWYWANIA I STANOWI ZASADNICZY SKŁADNIK WIELU PRODUKTÓW SPOŻYWCZYCH. OBECNOŚĆ LUDZKICH WIRUSÓW JELITOWYCH (NP. LUDZKIEGO NOROWIRUSA, WIRUSOWEGO ZAPALENIA WĄTROBY ITP.) W WODACH ŚRODOWISKOWYCH JEST DOBRZE UDOKUMENTOWANA I W ZALEŻNOŚCI OD JEGO ZASTOSOWANIA MOŻE STANOWIĆ ZAGROŻENIE DLA KONSUMENTA. OBECNIE OBECNOŚĆ LUDZKICH WIRUSÓW CHOROBOTWÓRCZYCH W WODZIE ZALEŻY OD WSKAŹNIKÓW BAKTERYJNYCH, KTÓRE CZĘSTO NIE SĄ SKORELOWANE Z OBECNOŚCIĄ LUDZKICH WIRUSÓW JELITOWYCH. _x000D_ ostatnio NEXT GENERATION SEQUENCING (NGS) TOOLS OPEN A GREAT OPPORTUNITY to IDENTIFY RELIABLE VIRAL INDICATORS. GŁÓWNYM CELEM NINIEJSZEGO WNIOSKU JEST OKREŚLENIE VIRIOME (OBECNOŚĆ I WZGLĘDNA LICZEBNOŚĆ SEKWENCJI WIRUSÓW, W TYM FAGÓW I LUDZKICH WIRUSÓW JELITOWYCH, W ŚRODOWISKU) ŚCIEKÓW I ODZYSKANYCH WÓD ZA POMOCĄ NGS. W RAMACH TEGO PROJEKTU ZOSTANIE ZOPTYMALIZOWANA PROCEDURA WZBOGACANIA SEKWENCJI WIRUSOWYCH Z PRÓBEK WODY. NINIEJSZY WNIOSEK ODNOSI KORZYŚCI Z POSIADANIA DUŻEGO PANELU ŚCIEKÓW, PRÓBEK ODZYSKANYCH I WÓD POWIERZCHNIOWYCH Z WYNIKIEM DODATNIM W ODNIESIENIU DO LUDZKIEGO NOROWIRUSA, WIRUSOWEGO ZAPALENIA WĄTROBY I LUDZKIEGO ASTROWIRUSA. WYKORZYSTAMY NASZE DOŚWIADCZENIE W STOSOWANIU BARWNIKÓW ŻYWOTNOŚCI (MONOAZYD E.G. PROPIDIUM LUB MONOAZYD ETHIDIUM) W CELU POŁĄCZENIA TEJ OBRÓBKI WSTĘPNEJ Z NGS, ABY OSZACOWAĆ NIE TYLKO CAŁY VIRIOME PRÓBEK WODY, ALE TAKŻE ICH POTENCJALNĄ ZAKAŹNOŚĆ. UŁATWI TO OCENĘ OCZYSZCZALNI ŚCIEKÓW W CELU ZMNIEJSZENIA ILOŚCI WIRUSA ZE ŚCIEKÓW. PONADTO OZNACZANIE VIRIOME Z WÓD MOŻE WSKAZYWAĆ NOWE POJAWIAJĄCE SIĘ WIRUSY. OPRÓCZ TEGO PROPONOWANY PROJEKT MA NA CELU OKREŚLENIE BARDZIEJ ZNACZĄCEGO WSKAŹNIKA/BARDZIEJ ISTOTNYCH WSKAŹNIKÓW WYSTĘPOWANIA/WYBECNOŚCI LUDZKICH WIRUSÓW CHOROBOTWÓRCZYCH W RÓŻNYCH RODZAJACH WÓD (PODOBNIE JAK STOSOWANIE ESCHERICHIA COLI ZWIĄZANYCH Z OBECNOŚCIĄ LUDZKICH PATOGENÓW BAKTERYJNYCH). SPOSTRZEŻENIE TO UŁATWI OPRACOWANIE NARZĘDZIA SZYBKIEGO WYKRYWANIA I OZNACZANIA ILOŚCIOWEGO WSKAŹNIKA/WSKAŹNIKÓW WIRUSOWYCH, KTÓRE MOGĄ ZOSTAĆ OPATENTOWANE. IDENTYFIKACJA ZNACZĄCYCH WSKAŹNIKÓW WIRUSOWYCH UMOŻLIWI PRZEMYSŁOWI I LABORATORIOM UPROSZCZENIE KONTROLI WIRUSÓW JELITOWYCH POPRZEZ ŁATWĄ I SZYBKĄ PROCEDURĘ WYKRYWANIA I KWANTYFIKACJI WSKAŹNIKA, KTÓRY W KRÓTKIM CZASIE MOŻE ZOSTAĆ WDROŻONY W RUTYNOWYCH LABORATORIACH. (Polish)
18 August 2022
0 references
Paterna
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
AGL2017-82909-R
0 references