ECOLOGY OF MARINE MICROORGANISMS: BIODIVERSITY, GENOMIC AND METAGENOMIC (Q3165618)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3165618 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | ECOLOGY OF MARINE MICROORGANISMS: BIODIVERSITY, GENOMIC AND METAGENOMIC |
Project Q3165618 in Spain |
Statements
87,729.84 Euro
0 references
108,900.0 Euro
0 references
80.56 percent
0 references
1 January 2014
0 references
31 December 2017
0 references
UNIVERSIDAD DE LA LAGUNA
0 references
38071
0 references
LOS OCEANOS CONSTITUYEN EL ECOSISTEMA MAS GRANDE DE LA TIERRA Y UNO DE LOS MAS DESCONOCIDOS. LAS ACTIVIDADES DE LOS MICROORGANISMOS MARINOS REGULAN LOS CICLOS BIOGEOQUIMICOS Y TIENEN UNA GRAN INFLUENCIA EN EL CONTROL DE CLIMA. ADEMAS, CASI LA MITAD DE LA POBLACION HUMANA VIVE CERCA DEL MAR Y, POR TANTO, LA HUMANIDAD EJERCE UN FUERTE IMPACTO SOBRE LOS OCEANOS Y, AL CONTRARIO, DEPENDE EN GRAN MEDIDA DE SUS SERVICIOS. POR ESTAS RAZONES LA INVESTIGACION MARINA HA SIDO CONSIDERADA UNO DE LOS RETOS SOCIALES EN EL PROGRAMA HORIZONTE 2020. EN EL PROYECTO PRESENTE PLANEAMOS ESTUDIAR ALGUNOS ASPECTOS DE LA DIVERSIDAD, LA ESTRUCTURA Y LAS CAPACIDADES FUNCIONALES DE LAS COMUNIDADES BACTERIANAS MARINAS. NUESTRO PUNTO DE PARTIDA ES QUE LA DISPONIBILIDAD DE UNA CANTIDAD ENORME DE SECUENCIAS DE LOS OCEANOS ABRE UNA VENTANA DE OPORTUNIDAD PARA RESOLVER CUESTIONES QUE NO PODRIA SER ANALIZADAS ANTES DEL ADVENIMIENTO DE LA GENOMICA Y LA METAGENOMICA._x000D_ EL PROYECTO COORDINA TRES SUBPROYECTOS CON INTERESES COMUNES PERO CON APROXIMACIONES DIFERENTES. EL PRIMER SUBPROYECTO SE DEDICARA A LA DIVERSIDAD DE LAS COMUNIDADES BACTERIANAS. PARA ESTE FIN, SE UTILIZARAN SECUENCIAS ETIQUETA (TAGS) DEL GEN 16S RDNA PARA EXPLORAR LA BIOSFERA DE LOS MICROORGANISMOS RAROS: EL CONJUNTO DE UN NUMERO MUY ELEVADO DE ESPECIES CON ABUNDANCIAS EXTRAORDINARIAMENTE BAJAS. INTENTAREMOS DETERMINAR EL NUMERO TOTAL DE TAXONES BACTERIANOS EN LOS OCEANOS Y PONDREMOS A PUNTO UN METODO PARA ANALIZAR LAS CURVAS RANGO-ABUNDANCIA QUE ESPERAMOS REVELARA PROPIEDADES ECOLOGICAS DE LAS COMUNIDADES BACTERIANAS. EL SEGUNDO SUBPROYECTO ANALIZARA LAS COMUNIDADES UTILIZANDO LA METAGENOMICA Y LA METATRANSCRIPTOMICA. UNA PARTE DE ESTE SP2 SE SOLAPARA CON EL SP1 PARA COMPARAR LA DIVERSIDAD REVELADA POR LAS SECUENCIAS ETIQUETA CON LA DERIVADA DE LOS METAGENOMAS. UN COMPONENTE IMPORTANTE DE ESTE SP2 SERA LA COMPARACION DE COMUNIDADES BASANDOSE EN LA FILOGENIA Y EN LAS FUNCIONES QUE CONTIENE. A PARTIR DE LA COEXISTENCIA EN DISTINTAS COMUNIDADES, SE ESTABLECERAN REDES DE ASOCIACION ENTRE TAXONES BACTERIANOS CON EL FIN, NUEVAMENTE, DE DERIVAR PROPIEDADES DE LAS COMUNIDADES. EL TERCER SUBPROYECTO PRESTARA ATENCION A UN GRUPO MODELO DE BACTERIAS MARINAS, POLARIBACTER, UN GENERO DENTRO DEL GRAN GRUPO DE LOS BACTEROIDETES. ESTE GENERO ES RELATIVAMENTE ABUNDANTE EN LOS OCEANOS, PARTICULARMENTE EN AGUAS POLARES. ALGUNOS DE SUS MIEMBROS CONTIENEN EL GEN DE LA PROTEORRODOPSINA, UNA PROTEINA QUE PERMITE A LAS BACTERIAS UTILIZAR ENERGIA DE LA LUZ. SP3 ANALIZARA LA REGULACION Y LA RELACION DE ESTE GRUPO DE BACTERIAS CON LA LUZ. SE AISLARAN MIEMBROS DEL GENERO EN CULTIVO PURO Y SE SECUENCIARAN SUS GENOMAS. TAMBIEN SE OBTENDRAN GENOMAS AMPLIFICADOS A PARTIR DE CELULAS INDIVIDUALES (SAGS). ESTOS GENOMAS SE UTILIZARAN PARA ESTUDIAR LAS CAPACIDADES DE POLARIBACTER Y SE COMPARARAN CON LAS SECUENCIAS DE BACTEROIDETES DERIVADAS DE METAGENOMAS EN EL SP2. FINALMENTE, SE LLEVARAN A CABO EXPERIMENTOS PARA DETERMINAR LA EXPRESION GENICA DE ESTAS BACTERIAS BAJO DIFERENTES CONDICIONES DE LUZ OSCURIDAD Y LOS RESULTADOS SE COMPARARAN CON LOS OBTENIDOS A PARTIR DE METATRANSCRIPTOMAS EN EL SP2. EL OBJETIVO DE ESTE SP3 ES COMPRENDER COMO FUNCIONA EL CONTROL DEL METABOLISMO Y LA GESTION DEL METABOLISMO EN PRESENCIA DE LA LUZ EN UNA BACTERIA HETEROTROFICA._x000D_ LOS RESULTADOS TENDRAN UN IMPACTO CIENTIFICO SIGNIFICATIVO EN EL CAMPO DE LA OCEANOGRAFIA MICROBIANA Y ESPERAMOS QUE ABRAN NUEVAS VIAS PARA COMPRENDER LA ECOLOGIA DE LOS OCEANOS. (Spanish)
0 references
THE OCEANS CONSTITUTE THE LARGEST ECOSYSTEM ON EARTH AND ONE OF THE MOST UNKNOWN. THE ACTIVITIES OF MARINE MICROORGANISMS REGULATE BIOGEOCHEMICAL CYCLES AND HAVE A MAJOR INFLUENCE ON CLIMATE CONTROL. MOREOVER, ALMOST HALF OF THE HUMAN POPULATION LIVES NEAR THE SEA AND, THEREFORE, HUMANITY HAS A STRONG IMPACT ON THE OCEANS AND, ON THE CONTRARY, DEPENDS HEAVILY ON THEIR SERVICES. FOR THESE REASONS, MARINE RESEARCH HAS BEEN CONSIDERED ONE OF THE SOCIAL CHALLENGES IN THE HORIZON 2020 PROGRAMME. IN THE PRESENT PROJECT WE PLAN TO STUDY SOME ASPECTS OF THE DIVERSITY, STRUCTURE AND FUNCTIONAL CAPABILITIES OF MARINE BACTERIAL COMMUNITIES. Our PARTY POINT is that the Availability of an Enormous Quantity of OCEAN SECUTIONS opens a VENTANA OF OPPORTUNITY to resolve questions that could not be considered before the advent of Genome and METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT THREE PROJECT WITH COMMUNITY INTERESTS WITH DIFFERENT approaches. THE FIRST SUB-PROJECT WILL FOCUS ON THE DIVERSITY OF BACTERIAL COMMUNITIES. FOR THIS PURPOSE, LABEL SEQUENCES (TAGS) OF THE 16S RDNA GENE WILL BE USED TO EXPLORE THE BIOSPHERE OF RARE MICROORGANISMS: THE SET OF A VERY HIGH NUMBER OF SPECIES WITH EXTRAORDINARILY LOW ABUNDANCES. WE WILL TRY TO DETERMINE THE TOTAL NUMBER OF BACTERIAL TAXA IN THE OCEANS AND WE WILL DEVELOP A METHOD TO ANALYSE THE RANGE-ABUNDANCE CURVES THAT WE HOPE WILL REVEAL ECOLOGICAL PROPERTIES OF BACTERIAL COMMUNITIES. THE SECOND SUB-PROJECT WILL ANALYSE COMMUNITIES USING METAGENOMICA AND METATRANSCRIPTOMICA. A PART OF THIS SP2 OVERLAPS WITH THE SP1 TO COMPARE THE DIVERSITY REVEALED BY THE LABELED SEQUENCES WITH THE DERIVATIVE OF THE METAGENOMES. AN IMPORTANT COMPONENT OF THIS SP2 WILL BE THE COMPARISON OF COMMUNITIES BASED ON THE PHYLOGENY AND THE FUNCTIONS IT CONTAINS. FROM THE COEXISTENCE IN DIFFERENT COMMUNITIES, NETWORKS OF ASSOCIATION BETWEEN BACTERIAL TAXA WILL BE ESTABLISHED IN ORDER, AGAIN, TO DERIVE PROPERTIES OF THE COMMUNITIES. THE THIRD SUBPROJECT WILL PAY ATTENTION TO A MODEL GROUP OF MARINE BACTERIA, POLARIBACTER, A GENUS WITHIN THE LARGE GROUP OF BACTEROIDS. THIS GENUS IS RELATIVELY ABUNDANT IN OCEANS, PARTICULARLY IN POLAR WATERS. SOME OF ITS MEMBERS CONTAIN THE PROTEORRODOPSIN GENE, A PROTEIN THAT ALLOWS BACTERIA TO USE LIGHT ENERGY. SP3 WILL ANALYSE THE REGULATION AND RELATIONSHIP OF THIS GROUP OF BACTERIA TO LIGHT. MEMBERS OF THE GENUS WILL BE ISOLATED IN PURE CULTURE AND THEIR GENOMES WILL BE SEQUENCED. AMPLIFIED GENOMES WILL ALSO BE OBTAINED FROM INDIVIDUAL CELLS (SAGS). THESE GENOMES WILL BE USED TO STUDY POLARIBACTER’S CAPABILITIES AND COMPARED TO BACTEROID SEQUENCES DERIVED FROM METAGENOMAS IN SP2. FINALLY, EXPERIMENTS WILL BE CARRIED OUT TO DETERMINE THE GENIC EXPRESSION OF THESE BACTERIA UNDER DIFFERENT DARK LIGHT CONDITIONS AND THE RESULTS WILL BE COMPARED WITH THOSE OBTAINED FROM METATRANSCRIPTOMS IN THE SP2. The OBJECTIVE OF THIS SP3 IS COMPRENDER AS THE CONTROL OF METABOLISM AND THE MANAGEMENT OF METABOLISM IN PRESENCE OF LIGHT IN A HETEROTROFICAL BACTERIA._x000D_ RESULTS have a SIGNIFICATIVE SCIENTIFIC IMPACT IN THE CHANGE OF MICROBIAN Oceanografia and we hope that they open new paths to understand the ecology of the oceans. (English)
12 October 2021
0.8900940050011827
0 references
LES OCÉANS CONSTITUENT LE PLUS GRAND ÉCOSYSTÈME TERRESTRE ET L’UN DES PLUS INCONNUS. LES ACTIVITÉS DES MICRO-ORGANISMES MARINS RÉGULENT LES CYCLES BIOGÉOCHIMIQUES ET ONT UNE INFLUENCE MAJEURE SUR LE CONTRÔLE CLIMATIQUE. EN OUTRE, PRÈS DE LA MOITIÉ DE LA POPULATION HUMAINE VIT PRÈS DE LA MER ET, PAR CONSÉQUENT, L’HUMANITÉ A UN FORT IMPACT SUR LES OCÉANS ET, AU CONTRAIRE, DÉPEND FORTEMENT DE SES SERVICES. POUR CES RAISONS, LA RECHERCHE MARINE A ÉTÉ CONSIDÉRÉE COMME L’UN DES DÉFIS SOCIAUX DU PROGRAMME HORIZON 2020. DANS LE CADRE DU PRÉSENT PROJET, NOUS PRÉVOYONS ÉTUDIER CERTAINS ASPECTS DE LA DIVERSITÉ, DE LA STRUCTURE ET DES CAPACITÉS FONCTIONNELLES DES COMMUNAUTÉS BACTÉRIENNES MARINES. Notre POINT PARTIE est que la disponibilité d’une quantité considérable de sécutions OCEAN ouvre une VENTANIE D’OPPORTUNITÉ pour résoudre des questions qui n’ont pas pu être examinées avant l’avènement de Génome et METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT TROIS PROJECT AVEC INTERESTS COMMUNAUTAIRES AVEC des approches DIFFÉRENTES. LE PREMIER SOUS-PROJET SERA AXÉ SUR LA DIVERSITÉ DES COMMUNAUTÉS BACTÉRIENNES. À CETTE FIN, DES SÉQUENCES D’ÉTIQUETTES (TAGS) DU GÈNE DE L’ADNR 16S SERONT UTILISÉES POUR EXPLORER LA BIOSPHÈRE DE MICRO-ORGANISMES RARES: L’ENSEMBLE D’UN TRÈS GRAND NOMBRE D’ESPÈCES AVEC DES ABONDANCES EXTRAORDINAIREMENT FAIBLES. NOUS TENTERONS DE DÉTERMINER LE NOMBRE TOTAL DE TAXONS BACTÉRIENS DANS LES OCÉANS ET NOUS ALLONS METTRE AU POINT UNE MÉTHODE POUR ANALYSER LES COURBES D’ABONDANCE DE L’AIRE DE RÉPARTITION QUI, NOUS L’ESPÉRONS, RÉVÉLERONT LES PROPRIÉTÉS ÉCOLOGIQUES DES COMMUNAUTÉS BACTÉRIENNES. LE DEUXIÈME SOUS-PROJET ANALYSERA LES COMMUNAUTÉS EN UTILISANT METAGENOMICA ET METATRANSCRIPTOMICA. UNE PARTIE DE CETTE SP2 SE CHEVAUCHE AVEC LA SP1 POUR COMPARER LA DIVERSITÉ RÉVÉLÉE PAR LES SÉQUENCES ÉTIQUETÉES AVEC LE DÉRIVÉ DES MÉTAGÉNOMES. UNE COMPOSANTE IMPORTANTE DE CE SP2 SERA LA COMPARAISON DES COMMUNAUTÉS SUR LA BASE DE LA PHYLOGÉNIE ET DES FONCTIONS QU’ELLE CONTIENT. À PARTIR DE LA COEXISTENCE DANS LES DIFFÉRENTES COMMUNAUTÉS, DES RÉSEAUX D’ASSOCIATION ENTRE TAXONS BACTÉRIENS SERONT ÉTABLIS AFIN, ENCORE UNE FOIS, D’OBTENIR DES PROPRIÉTÉS DES COMMUNAUTÉS. LE TROISIÈME SOUS-PROJET PORTERA SUR UN GROUPE MODÈLE DE BACTÉRIES MARINES, POLARIBACTER, UN GENRE AU SEIN DU GRAND GROUPE DE BACTÉRIOÏDES. CE GENRE EST RELATIVEMENT ABONDANT DANS LES OCÉANS, EN PARTICULIER DANS LES EAUX POLAIRES. CERTAINS DE SES MEMBRES CONTIENNENT LE GÈNE PROTEORRODOPSIN, UNE PROTÉINE QUI PERMET AUX BACTÉRIES D’UTILISER L’ÉNERGIE LUMINEUSE. SP3 ANALYSERA LA RÉGLEMENTATION ET LA RELATION DE CE GROUPE DE BACTÉRIES AVEC LA LUMIÈRE. LES MEMBRES DU GENRE SERONT ISOLÉS EN CULTURE PURE ET LEURS GÉNOMES SERONT SÉQUENCÉS. DES GÉNOMES AMPLIFIÉS SERONT ÉGALEMENT OBTENUS À PARTIR DE CELLULES INDIVIDUELLES (SAGS). CES GÉNOMES SERVIRONT À ÉTUDIER LES CAPACITÉS DE POLARIBACTER ET SERONT COMPARÉS AUX SÉQUENCES BACTÉRIOÏDES DÉRIVÉES DE METAGENOMAS DANS SP2. ENFIN, DES EXPÉRIENCES SERONT MENÉES POUR DÉTERMINER L’EXPRESSION GÉNIQUE DE CES BACTÉRIES SOUS DIFFÉRENTES CONDITIONS DE LUMIÈRE FONCÉE ET LES RÉSULTATS SERONT COMPARÉS À CEUX OBTENUS PAR METATRANSCRIPTOMS DANS LE SP2. L’OBJECTIVE DE CETTE SP3 est COMPRENDER comme le CONTRÔLE DU METABOLISME ET LA GESTION DU METABOLISME EN PRESENCE DE LUMIÈRE DANS UNE BACTERIE HETEROTROFICALE._x000D_ RESULTS ont une IMPACT SCIENTIFIQUE DANS LE CHANGE DE L’Océanografie microbienne et nous espérons qu’ils ouvrent de nouvelles voies pour comprendre l’écologie des océans. (French)
4 December 2021
0 references
DIE OZEANE BILDEN DAS GRÖSSTE ÖKOSYSTEM DER ERDE UND EINES DER UNBEKANNTSTEN. DIE AKTIVITÄTEN VON MEERESMIKROORGANISMEN REGULIEREN BIOGEOCHEMISCHE ZYKLEN UND HABEN EINEN GROSSEN EINFLUSS AUF DIE KLIMAKONTROLLE. DARÜBER HINAUS LEBT FAST DIE HÄLFTE DER MENSCHLICHEN BEVÖLKERUNG IN DER NÄHE DES MEERES UND DAHER HAT DIE MENSCHHEIT EINEN STARKEN EINFLUSS AUF DIE OZEANE UND IST IM GEGENTEIL STARK VON IHREN DIENSTEN ABHÄNGIG. AUS DIESEN GRÜNDEN WURDE DIE MEERESFORSCHUNG ALS EINE DER SOZIALEN HERAUSFORDERUNGEN DES PROGRAMMS HORIZONT 2020 BETRACHTET. IM VORLIEGENDEN PROJEKT WOLLEN WIR EINIGE ASPEKTE DER VIELFALT, STRUKTUR UND FUNKTIONSFÄHIGKEIT VON MARINEN BAKTERIENGEMEINSCHAFTEN UNTERSUCHEN. Unser PARTY POINT ist, dass die Verfügbarkeit einer riesigen Menge von OCEAN-Secutions eine VENTANA OF OPPORTUNITY öffnet, um Fragen zu lösen, die vor dem Aufkommen von Genom und METAGENOMIC nicht berücksichtigt werden konnten._x000D_ COORDINA PROJECT PROJECT MIT GEMEINSCHAFT INTERESTEN MIT DIFFERENTEN Ansätzen. DAS ERSTE TEILPROJEKT KONZENTRIERT SICH AUF DIE VIELFALT BAKTERIELLER GEMEINSCHAFTEN. ZU DIESEM ZWECK WERDEN ETIKETTENSEQUENZEN (TAGS) DES 16S RDNA-GENS VERWENDET, UM DIE BIOSPHÄRE SELTENER MIKROORGANISMEN ZU ERFORSCHEN: DAS SET VON EINER SEHR HOHEN ANZAHL VON ARTEN MIT AUSSERGEWÖHNLICH NIEDRIGEN MENGEN. WIR WERDEN VERSUCHEN, DIE GESAMTZAHL DER BAKTERIELLEN TAXA IN DEN OZEANEN ZU BESTIMMEN, UND WIR WERDEN EINE METHODE ENTWICKELN, UM DIE RANGE-ABUNDANZKURVEN ZU ANALYSIEREN, DIE WIR HOFFEN, ÖKOLOGISCHE EIGENSCHAFTEN BAKTERIELLER GEMEINSCHAFTEN ZU OFFENBAREN. IM ZWEITEN TEILPROJEKT WERDEN GEMEINSCHAFTEN UNTER VERWENDUNG VON METAGENOMICA UND METATRANSCRIPTOMICA ANALYSIERT. EIN TEIL DIESES SP2 ÜBERSCHNEIDET SICH MIT DEM SP1, UM DIE VIELFALT DER MARKIERTEN SEQUENZEN MIT DEM DERIVAT DER METAGENOME ZU VERGLEICHEN. EIN WICHTIGER BESTANDTEIL DIESES SP2 IST DER VERGLEICH DER GEMEINSCHAFTEN AUF DER GRUNDLAGE DER PHYLOGENIE UND DER DARIN ENTHALTENEN FUNKTIONEN. VON DER KOEXISTENZ IN VERSCHIEDENEN GEMEINSCHAFTEN AUS WERDEN NETZWERKE DER ASSOZIATION ZWISCHEN BAKTERIELLEN TAXA GESCHAFFEN, UM WIEDER EIGENSCHAFTEN DER GEMEINSCHAFTEN ABZULEITEN. DAS DRITTE TEILPROJEKT WIRD AUF EINE MODELLGRUPPE VON MEERESBAKTERIEN, POLARIBACTER, EINE GATTUNG INNERHALB DER GROSSEN GRUPPE VON BAKTEROIDEN ACHTEN. DIESE GATTUNG IST RELATIV HÄUFIG IN OZEANEN, VOR ALLEM IN POLAREN GEWÄSSERN. EINIGE SEINER MITGLIEDER ENTHALTEN DAS PROTEORRODOPSIN-GEN, EIN PROTEIN, DAS ES BAKTERIEN ERMÖGLICHT, LICHTENERGIE ZU NUTZEN. SP3 WIRD DIE REGELUNG UND DAS VERHÄLTNIS DIESER BAKTERIENGRUPPE ZUM LICHT ANALYSIEREN. MITGLIEDER DER GATTUNG WERDEN IN DER REINEN KULTUR ISOLIERT UND IHRE GENOME WERDEN SEQUENZIERT. VERSTÄRKTE GENOME WERDEN AUCH VON EINZELNEN ZELLEN (SAGS) GEWONNEN. DIESE GENOME WERDEN VERWENDET, UM DIE FÄHIGKEITEN VON POLARIBACTER ZU UNTERSUCHEN UND MIT BAKTEROIDSEQUENZEN AUS METAGENOMAS IN SP2 ZU VERGLEICHEN. SCHLIESSLICH WERDEN EXPERIMENTE DURCHGEFÜHRT, UM DIE GENEXPRESSION DIESER BAKTERIEN UNTER UNTERSCHIEDLICHEN DUNKLEN LICHTVERHÄLTNISSEN ZU BESTIMMEN UND DIE ERGEBNISSE MIT DEN ERGEBNISSEN VON METATRANSCRIPTOMS IM SP2 ZU VERGLEICHEN. Das OBJECTIVE OF THIS SP3 ist als die KONTROLLE VON METABOLISMITÄS UND DER METABOLISMITÄT IN PRESENCE OF LIGHT in einer HETEROTROFICAL BACTERIA._x000D_ RESULTS haben einen signifikanten SCIENTIFISCHE IMPACT IN THE CHANGE OF microbian Oceanografia und wir hoffen, dass sie neue Wege öffnen, um die Ökologie der Ozeane zu verstehen. (German)
9 December 2021
0 references
DE OCEANEN VORMEN HET GROOTSTE ECOSYSTEEM OP AARDE EN EEN VAN DE MEEST ONBEKENDE. DE ACTIVITEITEN VAN MARIENE MICRO-ORGANISMEN REGELEN BIOGEOCHEMISCHE CYCLI EN HEBBEN EEN GROTE INVLOED OP DE KLIMAATBEHEERSING. BOVENDIEN WOONT BIJNA DE HELFT VAN DE MENSEN IN DE BUURT VAN DE ZEE, WAARDOOR DE MENSHEID EEN GROTE IMPACT HEEFT OP DE OCEANEN EN INTEGENDEEL STERK AFHANKELIJK IS VAN HUN DIENSTEN. OM DEZE REDENEN IS MARIEN ONDERZOEK BESCHOUWD ALS EEN VAN DE SOCIALE UITDAGINGEN IN HET HORIZON 2020-PROGRAMMA. IN DIT PROJECT ZIJN WE VAN PLAN ENKELE ASPECTEN VAN DE DIVERSITEIT, STRUCTUUR EN FUNCTIONELE MOGELIJKHEDEN VAN MARIENE BACTERIËLE GEMEENSCHAPPEN TE BESTUDEREN. Onze PARTY POINT is dat de beschikbaarheid van een Enorme hoeveelheid OCEAN secutions een VENTANA VAN OPPORTUNITEIT opent om vragen op te lossen die niet konden worden overwogen vóór de komst van Genome en METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT THREE PROJECT MET COMMUNITY INTERESTS MET DIFFERENTe benaderingen. HET EERSTE DEELPROJECT ZAL ZICH RICHTEN OP DE DIVERSITEIT VAN BACTERIËLE GEMEENSCHAPPEN. DAARTOE ZULLEN ETIKETSEQUENTIES (TAGS) VAN HET 16S RDNA-GEN WORDEN GEBRUIKT OM DE BIOSFEER VAN ZELDZAME MICRO-ORGANISMEN TE VERKENNEN: DE SET VAN EEN ZEER GROOT AANTAL SOORTEN MET BUITENGEWOON LAGE OVERVLOED. WE ZULLEN PROBEREN HET TOTALE AANTAL BACTERIËLE TAXA IN DE OCEANEN TE BEPALEN EN WE ZULLEN EEN METHODE ONTWIKKELEN OM DE BEREIKABUNDANTIECURVES TE ANALYSEREN WAARVAN WE HOPEN DAT ZE DE ECOLOGISCHE EIGENSCHAPPEN VAN BACTERIËLE GEMEENSCHAPPEN ZULLEN ONTHULLEN. HET TWEEDE SUBPROJECT ZAL GEMEENSCHAPPEN ANALYSEREN MET BEHULP VAN METAGENOMICA EN METATRANSCRIPTOMICA. EEN DEEL VAN DEZE SP2 OVERLAPT MET DE SP1 OM DE DIVERSITEIT VAN DE GELABELDE SEQUENTIES TE VERGELIJKEN MET DE AFGELEIDE VAN DE METAGENOMEN. EEN BELANGRIJK ONDERDEEL VAN DEZE SP2 IS DE VERGELIJKING VAN GEMEENSCHAPPEN OP BASIS VAN DE FYLOGENIE EN DE FUNCTIES ERVAN. UIT DE COËXISTENTIE IN VERSCHILLENDE GEMEENSCHAPPEN ZULLEN NETWERKEN VAN ASSOCIATIE TUSSEN BACTERIËLE TAXA TOT STAND WORDEN GEBRACHT OM OPNIEUW DE EIGENSCHAPPEN VAN DE GEMEENSCHAPPEN AF TE LEIDEN. HET DERDE SUBPROJECT ZAL AANDACHT BESTEDEN AAN EEN MODELGROEP VAN MARIENE BACTERIËN, POLARIBACTER, EEN GESLACHT BINNEN DE GROTE GROEP VAN BACTEROÏDEN. DIT GESLACHT IS RELATIEF OVERVLOEDIG IN OCEANEN, VOORAL IN POLAIRE WATEREN. SOMMIGE LEDEN BEVATTEN HET PROTEORRODOPSIN GEN, EEN EIWIT WAARMEE BACTERIËN LICHTENERGIE KUNNEN GEBRUIKEN. SP3 ZAL DE VERORDENING EN DE RELATIE VAN DEZE GROEP BACTERIËN MET LICHT ANALYSEREN. LEDEN VAN HET GESLACHT WORDEN GEÏSOLEERD IN PURE CULTUUR EN HUN GENOMEN ZAL WORDEN GERANGSCHIKT. GEAMPLIFICEERDE GENOOM ZAL OOK WORDEN VERKREGEN UIT INDIVIDUELE CELLEN (SAGS). DEZE GENOOM ZAL WORDEN GEBRUIKT OM DE MOGELIJKHEDEN VAN POLARIBACTER TE BESTUDEREN EN TE VERGELIJKEN MET BACTEROÏDE SEQUENTIES AFGELEID VAN METAGENOMAS IN SP2. TEN SLOTTE ZULLEN EXPERIMENTEN WORDEN UITGEVOERD OM DE GENIC EXPRESSIE VAN DEZE BACTERIËN ONDER VERSCHILLENDE DONKERE LICHTOMSTANDIGHEDEN TE BEPALEN EN DE RESULTATEN ZULLEN WORDEN VERGELEKEN MET DIE VERKREGEN UIT METATRANSCRIPTOMS IN DE SP2. De OBJECTIE VAN DEZE SP3 IS COMPRENDER ALS DE CONTROL VAN METABOLISM EN DE MANAGEMENT VAN METABOLISM IN PRESENCE VAN LICHT IN A HETEROTROFICAL BACTERIA._x000D_ RESULTS hebben een significante SCIENTIFIC IMPACT IN DE VERANDERING van microbische Oceanografia en we hopen dat ze nieuwe wegen openen om de ecologie van de oceanen te begrijpen. (Dutch)
17 December 2021
0 references
GLI OCEANI COSTITUISCONO IL PIÙ GRANDE ECOSISTEMA DELLA TERRA E UNO DEI PIÙ SCONOSCIUTI. LE ATTIVITÀ DEI MICRORGANISMI MARINI REGOLANO I CICLI BIOGEOCHIMICI E INFLUENZANO NOTEVOLMENTE IL CONTROLLO CLIMATICO. INOLTRE, QUASI LA METÀ DELLA POPOLAZIONE UMANA VIVE VICINO AL MARE E, PERTANTO, L'UMANITÀ HA UN FORTE IMPATTO SUGLI OCEANI E, AL CONTRARIO, DIPENDE FORTEMENTE DAI LORO SERVIZI. PER QUESTI MOTIVI, LA RICERCA MARINA È STATA CONSIDERATA UNA DELLE SFIDE SOCIALI DEL PROGRAMMA ORIZZONTE 2020. NEL PRESENTE PROGETTO ABBIAMO IN PROGRAMMA DI STUDIARE ALCUNI ASPETTI DELLA DIVERSITÀ, DELLA STRUTTURA E DELLE CAPACITÀ FUNZIONALI DELLE COMUNITÀ BATTERICHE MARINE. Il nostro PUNTO DI PARTI è che la disponibilità di una quantità Enormous di secuzioni OCEAN apre una VENTANA DI OPPORTUNITÀ per risolvere questioni che non potevano essere prese in considerazione prima dell'avvento del genoma e di METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT TRE PROGETTO CON INTERESSI COMUNITARI con approcci diversi. IL PRIMO SOTTOPROGETTO SI CONCENTRERÀ SULLA DIVERSITÀ DELLE COMUNITÀ BATTERICHE. A TAL FINE, LE SEQUENZE DI ETICHETTE (TAGS) DEL GENE RDNA 16S SARANNO UTILIZZATE PER ESPLORARE LA BIOSFERA DEI MICRORGANISMI RARI: L'INSIEME DI UN NUMERO MOLTO ELEVATO DI SPECIE CON ABBONDANZE STRAORDINARIAMENTE BASSE. CERCHEREMO DI DETERMINARE IL NUMERO TOTALE DI TAXA BATTERICI NEGLI OCEANI E SVILUPPEREMO UN METODO PER ANALIZZARE LE CURVE GAMMA-ABBONDANZA CHE SPERIAMO RIVELERANNO PROPRIETÀ ECOLOGICHE DELLE COMUNITÀ BATTERICHE. IL SECONDO SOTTOPROGETTO ANALIZZERÀ LE COMUNITÀ UTILIZZANDO METAGENOMICA E METATRANSCRIPTOMICA. UNA PARTE DI QUESTO SP2 SI SOVRAPPONE CON L'SP1 PER CONFRONTARE LA DIVERSITÀ RIVELATA DALLE SEQUENZE ETICHETTATE CON LA DERIVATA DEI METAGENOMI. UNA COMPONENTE IMPORTANTE DI QUESTO SP2 SARÀ IL CONFRONTO DELLE COMUNITÀ IN BASE ALLA FILOGENESI E ALLE FUNZIONI CHE ESSA CONTIENE. DALLA COESISTENZA IN DIVERSE COMUNITÀ SI CREERANNO RETI DI ASSOCIAZIONE TRA I TAXA BATTERICI AL FINE, ANCORA UNA VOLTA, DI RICAVARE LE PROPRIETÀ DELLE COMUNITÀ. IL TERZO SOTTOPROGETTO PRESTERÀ ATTENZIONE A UN GRUPPO MODELLO DI BATTERI MARINI, POLARIBACTER, UN GENERE ALL'INTERNO DEL GRANDE GRUPPO DI BATTERI. QUESTO GENERE È RELATIVAMENTE ABBONDANTE NEGLI OCEANI, IN PARTICOLARE NELLE ACQUE POLARI. ALCUNI DEI SUOI MEMBRI CONTENGONO IL GENE PROTEORRODOPSIN, UNA PROTEINA CHE PERMETTE AI BATTERI DI UTILIZZARE L'ENERGIA LEGGERA. SP3 ANALIZZERÀ IL REGOLAMENTO E LA RELAZIONE DI QUESTO GRUPPO DI BATTERI CON LA LUCE. I MEMBRI DEL GENERE SARANNO ISOLATI NELLA CULTURA PURA E I LORO GENOMI SARANNO SEQUENZIATI. I GENOMI AMPLIFICATI SARANNO OTTENUTI ANCHE DA SINGOLE CELLULE (SAGS). QUESTI GENOMI SARANNO UTILIZZATI PER STUDIARE LE CAPACITÀ DI POLARIBACTER E CONFRONTATI CON LE SEQUENZE BATTERIOIDE DERIVATE DA METAGENOMAS IN SP2. INFINE, SARANNO EFFETTUATI ESPERIMENTI PER DETERMINARE L'ESPRESSIONE GENETICA DI QUESTI BATTERI IN DIVERSE CONDIZIONI DI LUCE SCURA E I RISULTATI SARANNO CONFRONTATI CON QUELLI OTTENUTI DA METATRANSCRIPTOMS NELLA SP2. L'OBIETTIVO DI QUESTO SP3 È COMPRENDORE COME IL CONTROLLO DI METABOLISM E LA GESTIONE DEL METABOLISM IN PRESENZA DI LUCE IN UN BACTERIA ETEROTROFICA._x000D_ I RISULTATI hanno un significativo IMPATTO SCIENTIFICO NEL CAMBIA DI Oceanografia microbica e speriamo che aprano nuove vie per comprendere l'ecologia degli oceani. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΟΙ ΩΚΕΑΝΟΊ ΑΠΟΤΕΛΟΎΝ ΤΟ ΜΕΓΑΛΎΤΕΡΟ ΟΙΚΟΣΎΣΤΗΜΑ ΣΤΗ ΓΗ ΚΑΙ ΈΝΑ ΑΠΌ ΤΑ ΠΙΟ ΆΓΝΩΣΤΑ. ΟΙ ΔΡΑΣΤΗΡΙΌΤΗΤΕΣ ΤΩΝ ΘΑΛΆΣΣΙΩΝ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΏΝ ΡΥΘΜΊΖΟΥΝ ΤΟΥΣ ΒΙΟΓΕΩΧΗΜΙΚΟΎΣ ΚΎΚΛΟΥΣ ΚΑΙ ΕΠΗΡΕΆΖΟΥΝ ΣΗΜΑΝΤΙΚΆ ΤΟΝ ΈΛΕΓΧΟ ΤΟΥ ΚΛΊΜΑΤΟΣ. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΣΧΕΔΌΝ ΤΟ ΉΜΙΣΥ ΤΟΥ ΑΝΘΡΏΠΙΝΟΥ ΠΛΗΘΥΣΜΟΎ ΖΕΙ ΚΟΝΤΆ ΣΤΗ ΘΆΛΑΣΣΑ ΚΑΙ, ΩΣ ΕΚ ΤΟΎΤΟΥ, Η ΑΝΘΡΩΠΌΤΗΤΑ ΈΧΕΙ ΙΣΧΥΡΌ ΑΝΤΊΚΤΥΠΟ ΣΤΟΥΣ ΩΚΕΑΝΟΎΣ ΚΑΙ, ΑΝΤΙΘΈΤΩΣ, ΕΞΑΡΤΆΤΑΙ ΣΕ ΜΕΓΆΛΟ ΒΑΘΜΌ ΑΠΌ ΤΙΣ ΥΠΗΡΕΣΊΕΣ ΤΟΥΣ. ΓΙΑ ΤΟΥΣ ΛΌΓΟΥΣ ΑΥΤΟΎΣ, Η ΘΑΛΆΣΣΙΑ ΈΡΕΥΝΑ ΘΕΩΡΕΊΤΑΙ ΜΊΑ ΑΠΌ ΤΙΣ ΚΟΙΝΩΝΙΚΈΣ ΠΡΟΚΛΉΣΕΙΣ ΤΟΥ ΠΡΟΓΡΆΜΜΑΤΟΣ «ΟΡΊΖΩΝ 2020». ΣΤΟ ΠΑΡΌΝ ΣΧΈΔΙΟ ΣΧΕΔΙΆΖΟΥΜΕ ΝΑ ΜΕΛΕΤΉΣΟΥΜΕ ΟΡΙΣΜΈΝΕΣ ΠΤΥΧΈΣ ΤΗΣ ΠΟΙΚΙΛΟΜΟΡΦΊΑΣ, ΤΗΣ ΔΟΜΉΣ ΚΑΙ ΤΩΝ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΏΝ ΔΥΝΑΤΟΤΉΤΩΝ ΤΩΝ ΘΑΛΆΣΣΙΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΏΝ ΚΟΙΝΟΤΉΤΩΝ. Το ΣΗΜΕΙΟ ΜΕΡΟΥΣ μας είναι ότι η διαθεσιμότητα μιας σημαντικής ποσότητας OCEAN αποκομμάτων ανοίγει μια VENTANA OF OPPORTUNITY για την επίλυση ζητημάτων που δεν θα μπορούσαν να εξεταστούν πριν από την έλευση του γονιδιώματος και ΜΕΤΑΓΕΝΟΜΙΚΟ._x000D_ COORDINA PROJECT THREE PROJECT ΜΕ ΚΟΙΝΟΤΙΚΑ ΕΝΔΙΑΦΕΡΟΝΤΑΙ ΜΕ ΔΙΑΦΑΝΤΙΚΕΣ προσεγγίσεις. ΤΟ ΠΡΏΤΟ ΥΠΟΈΡΓΟ ΘΑ ΕΠΙΚΕΝΤΡΩΘΕΊ ΣΤΗΝ ΠΟΙΚΙΛΟΜΟΡΦΊΑ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΏΝ ΚΟΙΝΟΤΉΤΩΝ. ΓΙΑ ΤΟ ΣΚΟΠΌ ΑΥΤΌ, ΟΙ ΑΚΟΛΟΥΘΊΕΣ ΕΤΙΚΕΤΏΝ (TAGS) ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΊΟΥ RDNA 16S ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΞΕΡΕΎΝΗΣΗ ΤΗΣ ΒΙΌΣΦΑΙΡΑΣ ΣΠΆΝΙΩΝ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΏΝ: ΤΟ ΣΎΝΟΛΟ ΕΝΌΣ ΠΟΛΎ ΜΕΓΆΛΟΥ ΑΡΙΘΜΟΎ ΕΙΔΏΝ ΜΕ ΕΞΑΙΡΕΤΙΚΆ ΧΑΜΗΛΈΣ ΑΦΘΟΝΊΕΣ. ΘΑ ΠΡΟΣΠΑΘΉΣΟΥΜΕ ΝΑ ΚΑΘΟΡΊΣΟΥΜΕ ΤΟΝ ΣΥΝΟΛΙΚΌ ΑΡΙΘΜΌ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΏΝ ΤΑΞΙΝΟΜΙΚΏΝ ΤΆΞΕΩΝ ΣΤΟΥΣ ΩΚΕΑΝΟΎΣ ΚΑΙ ΘΑ ΑΝΑΠΤΎΞΟΥΜΕ ΜΙΑ ΜΈΘΟΔΟ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΩΝ ΚΑΜΠΥΛΏΝ ΔΙΑΣΠΟΡΆΣ ΕΎΡΟΥΣ ΠΟΥ ΕΛΠΊΖΟΥΜΕ ΌΤΙ ΘΑ ΑΠΟΚΑΛΎΨΟΥΝ ΟΙΚΟΛΟΓΙΚΈΣ ΙΔΙΌΤΗΤΕΣ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΏΝ ΚΟΙΝΟΤΉΤΩΝ. ΤΟ ΔΕΎΤΕΡΟ ΥΠΟΈΡΓΟ ΘΑ ΑΝΑΛΎΣΕΙ ΚΟΙΝΌΤΗΤΕΣ ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ METAGENOMICA ΚΑΙ METATRANSCRIPTOMICA. ΈΝΑ ΜΈΡΟΣ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ SP2 ΕΠΙΚΑΛΎΠΤΕΤΑΙ ΜΕ ΤΟ SP1 ΓΙΑ ΝΑ ΣΥΓΚΡΙΘΕΊ Η ΠΟΙΚΙΛΟΜΟΡΦΊΑ ΠΟΥ ΑΠΟΚΑΛΎΠΤΕΤΑΙ ΑΠΌ ΤΙΣ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΜΈΝΕΣ ΑΚΟΛΟΥΘΊΕΣ ΜΕ ΤΟ ΠΑΡΆΓΩΓΟ ΤΩΝ ΜΕΤΑΓΕΤΟΜΏΝ. ΈΝΑ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌ ΣΤΟΙΧΕΊΟ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ SP2 ΘΑ ΕΊΝΑΙ Η ΣΎΓΚΡΙΣΗ ΤΩΝ ΚΟΙΝΟΤΉΤΩΝ ΜΕ ΒΆΣΗ ΤΗ ΦΥΛΟΓΈΝΕΣΗ ΚΑΙ ΤΙΣ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΕΣ ΠΟΥ ΠΕΡΙΈΧΕΙ. ΑΠΌ ΤΗ ΣΥΝΎΠΑΡΞΗ ΣΕ ΔΙΆΦΟΡΕΣ ΚΟΙΝΌΤΗΤΕΣ, ΘΑ ΔΗΜΙΟΥΡΓΗΘΟΎΝ ΔΊΚΤΥΑ ΣΎΝΔΕΣΗΣ ΜΕΤΑΞΎ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΏΝ ΤΑΞΙΝΟΜΙΚΏΝ ΤΆΞΕΩΝ ΠΡΟΚΕΙΜΈΝΟΥ, ΚΑΙ ΠΆΛΙ, ΝΑ ΑΠΟΚΤΗΘΟΎΝ ΟΙ ΙΔΙΌΤΗΤΕΣ ΤΩΝ ΚΟΙΝΟΤΉΤΩΝ. ΤΟ ΤΡΊΤΟ ΥΠΟΈΡΓΟ ΘΑ ΔΏΣΕΙ ΠΡΟΣΟΧΉ ΣΕ ΜΙΑ ΟΜΆΔΑ ΜΟΝΤΈΛΩΝ ΘΑΛΆΣΣΙΩΝ ΒΑΚΤΗΡΊΩΝ, ΤΟ POLARIBACTER, ΈΝΑ ΓΈΝΟΣ ΜΈΣΑ ΣΤΗ ΜΕΓΆΛΗ ΟΜΆΔΑ ΒΑΚΤΗΡΙΔΊΩΝ. ΑΥΤΌ ΤΟ ΓΈΝΟΣ ΕΊΝΑΙ ΣΧΕΤΙΚΆ ΆΦΘΟΝΟ ΣΤΟΥΣ ΩΚΕΑΝΟΎΣ, ΙΔΙΑΊΤΕΡΑ ΣΤΑ ΠΟΛΙΚΆ ΎΔΑΤΑ. ΜΕΡΙΚΆ ΑΠΌ ΤΑ ΜΈΛΗ ΤΟΥ ΠΕΡΙΈΧΟΥΝ ΤΟ ΓΟΝΊΔΙΟ PROTEORRODOPSIN, ΜΙΑ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΗ ΠΟΥ ΕΠΙΤΡΈΠΕΙ ΣΤΑ ΒΑΚΤΉΡΙΑ ΝΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΟΎΝ ΕΛΑΦΡΙΆ ΕΝΈΡΓΕΙΑ. ΤΟ SP3 ΘΑ ΑΝΑΛΎΣΕΙ ΤΟΝ ΚΑΝΟΝΙΣΜΌ ΚΑΙ ΤΗ ΣΧΈΣΗ ΑΥΤΉΣ ΤΗΣ ΟΜΆΔΑΣ ΒΑΚΤΗΡΊΩΝ ΜΕ ΤΟ ΦΩΣ. ΤΑ ΜΈΛΗ ΤΟΥ ΓΈΝΟΥΣ ΘΑ ΑΠΟΜΟΝΩΘΟΎΝ ΣΕ ΚΑΘΑΡΉ ΚΟΥΛΤΟΎΡΑ ΚΑΙ ΤΑ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΆ ΤΟΥΣ ΘΑ ΑΚΟΛΟΥΘΟΎΝΤΑΙ. ΤΑ ΕΝΙΣΧΥΜΈΝΑ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΑ ΘΑ ΛΗΦΘΟΎΝ ΕΠΊΣΗΣ ΑΠΌ ΜΕΜΟΝΩΜΈΝΑ ΚΎΤΤΑΡΑ (SAGS). ΑΥΤΆ ΤΑ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΑ ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΓΙΑ ΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΤΩΝ ΔΥΝΑΤΟΤΉΤΩΝ ΤΗΣ POLARIBACTER ΚΑΙ ΘΑ ΣΥΓΚΡΙΘΟΎΝ ΜΕ ΤΙΣ ΒΑΚΤΗΡΙΔΙΑΚΈΣ ΑΛΛΗΛΟΥΧΊΕΣ ΠΟΥ ΠΡΟΈΡΧΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟ METAGENOMAS ΣΤΟ SP2. ΤΈΛΟΣ, ΘΑ ΔΙΕΞΑΧΘΟΎΝ ΠΕΙΡΆΜΑΤΑ ΓΙΑ ΤΟΝ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΌ ΤΗΣ ΓΟΝΙΚΉΣ ΈΚΦΡΑΣΗΣ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΊΩΝ ΥΠΌ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΣΚΟΤΕΙΝΟΎ ΦΩΤΌΣ ΚΑΙ ΤΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΘΑ ΣΥΓΚΡΙΘΟΎΝ ΜΕ ΕΚΕΊΝΑ ΠΟΥ ΛΑΜΒΆΝΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟ METATRANSCRIPTOMS ΣΤΟ SP2. Ο ΣΤΟΧΟΣ αυτού του SP3 είναι ΑΝΤΑΓΩΝΙΣΤΗΣ ΩΣ ΕΛΕΓΧΟΣ ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΥ ΚΑΙ ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗ ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΥ ΣΤΗΝ ΠΑΡΟΥΣΑ ΦΩΤΟΓΡΑΦΙΑ ΣΤΗΝ ΥΕΡΟΤΡΟΦΙΚΗ ΒΑΚΤΗΡΙΑ._x000D_ Αποτελέσματα έχουν μια σημαντική ΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΗ ΕΠΙΠΤΩΣΗ ΣΤΗ ΑΛΛΑΓΗ ΤΗΣ ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΗΣ Ωκεανογραφίας και ελπίζουμε ότι θα ανοίξουν νέους δρόμους για την κατανόηση της οικολογίας των ωκεανών. (Greek)
18 August 2022
0 references
HAVENE UDGØR DET STØRSTE ØKOSYSTEM PÅ JORDEN OG ET AF DE MEST UKENDTE. MARINE MIKROORGANISMERS AKTIVITETER REGULERER BIOGEOKEMISKE KREDSLØB OG HAR STOR INDFLYDELSE PÅ KLIMAKONTROLLEN. DESUDEN BOR NÆSTEN HALVDELEN AF BEFOLKNINGEN NÆR HAVET, OG MENNESKEHEDEN HAR DERFOR EN STÆRK INDVIRKNING PÅ HAVENE OG ER TVÆRTIMOD STÆRKT AFHÆNGIG AF DERES TJENESTER. DERFOR ER HAVFORSKNING BLEVET BETRAGTET SOM EN AF DE SOCIALE UDFORDRINGER I HORISONT 2020-PROGRAMMET. I DETTE PROJEKT PLANLÆGGER VI AT UNDERSØGE VISSE ASPEKTER AF DE MARINE BAKTERIELLE SAMFUNDS MANGFOLDIGHED, STRUKTUR OG FUNKTIONSEVNE. Vores PARTY POINT er, at tilgængeligheden af en Enorm mængde af OCEAN-beskadigelser åbner en VENTAN OF OPPORTUNITY til at løse spørgsmål, der ikke kunne overvejes før fremkomsten af Genom og METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJEKT THREE PROJEKT MED KOMMUNITY INTERESTER MED DIFFERENT tilgange. DET FØRSTE DELPROJEKT VIL FOKUSERE PÅ BAKTERIESAMFUNDENES MANGFOLDIGHED. TIL DETTE FORMÅL VIL DER BLIVE ANVENDT ETIKETSEKVENSER (TAGS) FOR 16S RDNA-GENET TIL AT UNDERSØGE SJÆLDNE MIKROORGANISMERS BIOSFÆRE: SÆTTET AF ET MEGET STORT ANTAL ARTER MED EKSTRAORDINÆRT LAVE FOREKOMSTER. VI VIL FORSØGE AT BESTEMME DET SAMLEDE ANTAL BAKTERIEL TAXA I HAVENE, OG VI VIL UDVIKLE EN METODE TIL AT ANALYSERE DE RANGE-BUNDANCE KURVER, SOM VI HÅBER VIL AFSLØRE ØKOLOGISKE EGENSKABER AF BAKTERIELLE SAMFUND. DET ANDET DELPROJEKT VIL ANALYSERE FÆLLESSKABERNE VED HJÆLP AF METAGENOMICA OG METATRANSCRIPTOMICA. EN DEL AF DENNE SP2 OVERLAPPER MED SP1 FOR AT SAMMENLIGNE DEN MANGFOLDIGHED, DER AFSLØRES AF DE MÆRKEDE SEKVENSER, MED DERIVATET AF METAGENOMERNE. EN VIGTIG DEL AF DETTE SP2 VIL VÆRE SAMMENLIGNINGEN AF FÆLLESSKABERNE BASERET PÅ PHYLOGENY OG DE FUNKTIONER, DET INDEHOLDER. PÅ BAGGRUND AF SAMEKSISTENSEN I FORSKELLIGE FÆLLESSKABER VIL DER BLIVE ETABLERET ET NETVÆRK AF SAMMENSLUTNINGER MELLEM BAKTERIEGRUPPER FOR IGEN AT KUNNE UDLEDE FÆLLESSKABERNES EGENSKABER. DET TREDJE DELPROJEKT VIL VÆRE OPMÆRKSOM PÅ EN MODELGRUPPE AF MARINE BAKTERIER, POLARIBACTER, EN SLÆGT INDEN FOR DEN STORE GRUPPE AF BAKTERIOIDER. DENNE SLÆGT ER RELATIVT RIGELIG I OCEANER, ISÆR I POLARVANDE. NOGLE AF DETS MEDLEMMER INDEHOLDER PROTEORRODOPSIN GENET, ET PROTEIN, DER TILLADER BAKTERIER AT BRUGE LYS ENERGI. SP3 VIL ANALYSERE FORORDNINGEN OG FORHOLDET MELLEM DENNE GRUPPE AF BAKTERIER OG LYS. MEDLEMMER AF SLÆGTEN VIL BLIVE ISOLERET I REN KULTUR, OG DERES SLÆGTER VIL BLIVE SEKVENSERET. AMPLIFICEREDE GENOMER VIL OGSÅ BLIVE OPNÅET FRA INDIVIDUELLE CELLER (SAGS). DISSE GENOMER VIL BLIVE BRUGT TIL AT UNDERSØGE POLARIBACTER'S KAPACITETER OG SAMMENLIGNET MED BAKTERIOIDSEKVENSER AFLEDT AF METAGENOMAS I SP2. ENDELIG VIL DER BLIVE UDFØRT FORSØG FOR AT BESTEMME DISSE BAKTERIERS GENISKE EKSPRESSION UNDER FORSKELLIGE MØRKE LYSFORHOLD, OG RESULTATERNE VIL BLIVE SAMMENLIGNET MED RESULTATERNE FRA METATRANSCRIPTOMS I SP2. OBJEKTIV AF DENNE SP3 SOM ER KONTROLEN AF METABOLISM og MANAGEMENT of METABOLISM i PRESENCE of LIGHT i en HETEROTROFICAL BACTERIA._x000D_ RESULTS har en betydelig SCIENTIFISK IMPACT I KANGE af mikrobiske Oceanografia og vi håber, at de åbner nye veje til at forstå havenes økologi. (Danish)
18 August 2022
0 references
VALTAMERET OVAT SUURIN EKOSYSTEEMI MAAN PÄÄLLÄ JA YKSI TUNTEMATTOMISTA. MERTEN MIKRO-ORGANISMIEN TOIMINTA SÄÄTELEE BIOGEOKEMIALLISIA SYKLIÄ JA VAIKUTTAA MERKITTÄVÄSTI ILMASTON HALLINTAAN. LISÄKSI LÄHES PUOLET IHMISVÄESTÖSTÄ ASUU LÄHELLÄ MERTA, MINKÄ VUOKSI IHMISKUNTA VAIKUTTAA VOIMAKKAASTI VALTAMERIIN JA ON PÄINVASTOIN VAHVASTI RIIPPUVAINEN NIIDEN PALVELUISTA. NÄISTÄ SYISTÄ MERENTUTKIMUSTA ON PIDETTY YHTENÄ HORISONTTI 2020 -OHJELMAN SOSIAALISISTA HAASTEISTA. TÄSSÄ HANKKEESSA AIOMME TUTKIA JOITAKIN MERIBAKTEERIYHTEISÖJEN MONIMUOTOISUUDEN, RAKENTEEN JA TOIMINNALLISTEN VALMIUKSIEN NÄKÖKOHTIA. Meidän PARTY POINT on, että OCEAN-välikohtausten suurenmoisen määrän saatavuus avaa OPPORTUNITYA VENTANAA ratkaisemaan kysymyksiä, joita ei voitu ottaa huomioon ennen Genomin ja METAGENOMICin tuloa._x000D_ COORDINA PROJECT THREE PROJECT WITH COMMUNITY INTERESTS WITH DIFFERENT lähestymistapoja. ENSIMMÄISESSÄ ALAHANKKEESSA KESKITYTÄÄN BAKTEERIYHTEISÖJEN MONIMUOTOISUUTEEN. TÄTÄ VARTEN 16S RDNA -GEENIN ETIKETTISEKVENSSEJÄ (TAGS) KÄYTETÄÄN HARVINAISTEN MIKRO-ORGANISMIEN BIOSFÄÄRIN TUTKIMISEEN: ERITTÄIN SUURI MÄÄRÄ LAJEJA, JOIDEN RUNSAUS ON POIKKEUKSELLISEN ALHAINEN. YRITÄMME MÄÄRITTÄÄ VALTAMERTEN BAKTEERITAKSOJEN KOKONAISMÄÄRÄN JA KEHITÄMME MENETELMÄN, JOLLA ANALYSOIDAAN VAIHTELUVÄLIN RUNSAUSKÄYRÄT, JOIDEN TOIVOMME PALJASTAVAN BAKTEERIYHTEISÖJEN EKOLOGISET OMINAISUUDET. TOISESSA ALAHANKKEESSA ANALYSOIDAAN YHTEISÖJÄ KÄYTTÄEN METAGENOMICAA JA METATRANSCRIPTOMICAA. OSA TÄSTÄ SP2:STA ON PÄÄLLEKKÄINEN SP1:N KANSSA, JOTTA VOIDAAN VERRATA MERKITTYJEN SEKVENSSIEN PALJASTAMAA MONIMUOTOISUUTTA METAGENOMEJEN JOHDANNAISEEN. TÄRKEÄ OSA TÄTÄ SP2:TA ON YHTEISÖJEN VERTAILU FYLOGEENIN JA SEN SISÄLTÄMIEN TOIMINTOJEN PERUSTEELLA. RINNAKKAISELOSTA ERI YHTEISÖISSÄ MUODOSTETAAN BAKTEERITAKSOJEN VÄLISIÄ VERKOSTOJA, JOIDEN TARKOITUKSENA ON JÄLLEEN SAADA YHTEISÖJEN OMINAISUUKSIA. KOLMANNESSA ALAHANKKEESSA KIINNITETÄÄN HUOMIOTA MERIBAKTEERIEN MALLIRYHMÄÄN, POLARIBACTER-SUKUUN, JOKA KUULUU LAAJAAN BAKTEERIRYHMÄÄN. TÄMÄ SUVU ON SUHTEELLISEN RUNSAS VALTAMERISSÄ, ERITYISESTI NAPAVESISSÄ. JOTKUT SEN JÄSENISTÄ SISÄLTÄVÄT PROTEORRODOPSIN-GEENIÄ, PROTEIINIA, JONKA AVULLA BAKTEERIT VOIVAT KÄYTTÄÄ VALOENERGIAA. SP3 ANALYSOI TÄMÄN BAKTEERIRYHMÄN ASETUSTA JA SUHDETTA VALOON. SUVUN JÄSENET ERISTETÄÄN PUHTAASSA KULTTUURISSA JA HEIDÄN GENOMIT SEKVENSOIDAAN. MONISTETUT GENOMIT SAADAAN MYÖS YKSITTÄISISTÄ SOLUISTA (SAGS). NÄITÄ GENOMEJA KÄYTETÄÄN POLARIBACTERIN KYKYJEN TUTKIMISEEN, JA NIITÄ VERRATAAN METAGENOMAS-BAKTEERISTA JOHDETTUIHIN BAKTEERISEKVENSSEIHIN SP2-TUTKIMUKSESSA. LOPUKSI TEHDÄÄN KOKEITA NÄIDEN BAKTEERIEN GEENIEN ILMENTYMÄN MÄÄRITTÄMISEKSI ERILAISISSA TUMMAN VALON OLOSUHTEISSA, JA TULOKSIA VERRATAAN METATRANSCRIPTOMS-VALMISTEELLA SAATUIHIN TULOKSIIN SP2-JÄRJESTELMÄSSÄ. Tämän SP3: n OBJECTive on yhtä tärkeä kuin METABOLISMIN JA METABOLISMIN HÄNENNÖN HALLITUKSEN KÄYTTÖÖN KÄYTTÖÖN HETEROTROFICAL BACTERIA: ssa._x000D_ RESULTSilla on merkittävä SCIENTIFIC IMPACT in the CHANGE of microbian Oceanografia ja toivomme, että he avaavat uusia polkuja ymmärtääkseen valtamerten ekologiaa. (Finnish)
18 August 2022
0 references
L-OĊEANI JIKKOSTITWIXXU L-AKBAR EKOSISTEMA FID-DINJA U WAĦDA MILL-AKTAR MHUX MAGĦRUFA. L-ATTIVITAJIET TAL-MIKROORGANIŻMI TAL-BAĦAR JIRREGOLAW IĊ-ĊIKLI BIJOĠEOKIMIĊI U GĦANDHOM INFLUWENZA KBIRA FUQ IL-KONTROLL TAL-KLIMA. BARRA MINN HEKK, KWAŻI NOFS IL-POPOLAZZJONI UMANA TGĦIX QRIB IL-BAĦAR U, GĦALHEKK, L-UMANITÀ GĦANDHA IMPATT QAWWI FUQ L-OĊEANI U, GĦALL-KUNTRARJU, TIDDEPENDI ĦAFNA FUQ IS-SERVIZZI TAGĦHOM. GĦAL DAWN IR-RAĠUNIJIET, IR-RIĊERKA DWAR IL-BAĦAR ĠIET IKKUNSIDRATA BĦALA WAĦDA MILL-ISFIDI SOĊJALI FIL-PROGRAMM ORIZZONT 2020. FIL-PROĠETT PREŻENTI QED NIPPJANAW LI NISTUDJAW XI ASPETTI TAD-DIVERSITÀ, L-ISTRUTTURA U L-KAPAĊITAJIET FUNZJONALI TAL-KOMUNITAJIET TAL-BATTERJI TAL-BAĦAR. Il-POINT TA’ PARTY tagħna huwa li d-Disponibbiltà ta’ Kwantità Enormuża ta’ Sekuzzjonijiet OCEAN tiftaħ VENTANA TA’ OPPORTUNITÀ biex issolvi mistoqsijiet li ma setgħux jiġu kkunsidrati qabel il-miġja ta’ Genome u METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT THREE MA’ INTERESTI KOMUNITÀ MAL-approċċi DIFFERENT. L-EWWEL SOTTOPROĠETT SE JIFFOKA FUQ ID-DIVERSITÀ TAL-KOMUNITAJIET TAL-BATTERJI. GĦAL DAN IL-GĦAN, SEKWENZI TAT-TIKKETTA (TAGS) TAL-ĠENE 16S RDNA SE JINTUŻAW BIEX JESPLORAW IL-BIJOSFERA TA’ MIKROORGANIŻMI RARI: IS-SETT TA’ GĦADD KBIR ĦAFNA TA’ SPEĊIJIET B’ABBUNDANZA STRAORDINARJAMENT BAXXA. AĦNA SE TIPPROVA TIDDETERMINA N-NUMRU TOTALI TA ‘TAXA BATTERJALI FL-OĊEANI U AĦNA SE TIŻVILUPPA METODU BIEX TANALIZZA L-KURVI FIRXA-ABUNDANCE LI NITTAMAW SE JIŻVELAW PROPRJETAJIET EKOLOĠIĊI TA’ KOMUNITAJIET BATTERJALI. IT-TIENI SOTTOPROĠETT SE JANALIZZA L-KOMUNITAJIET BL-UŻU TA’ METAGENOMICA U METATRANSCRIPTOMICA. PARTI MINN DAN L-SP2 TIKKOINĊIDI MAL-SP1 BIEX TQABBEL ID-DIVERSITÀ ŻVELATA MIS-SEKWENZI TTIKKETTJATI MAD-DERIVATTIV TAL-METAĠENOMI. KOMPONENT IMPORTANTI TA ‘DAN L-SP2 SE JKUN IT-TQABBIL TA’ KOMUNITAJIET IBBAŻATI FUQ IL-FILOĠENIJA U L-FUNZJONIJIET LI FIH. MILL-KOEŻISTENZA F’KOMUNITAJIET DIFFERENTI, SER JIĠU STABBILITI NETWERKS TA’ ASSOĊJAZZJONI BEJN IL-GRUPPI TASSONOMIĊI BATTERIĊI SABIEX, GĦAL DARB’OĦRA, JINKISBU L-PROPRJETAJIET TAL-KOMUNITAJIET. IT-TIELET SOTTOPROĠETT SE JAGĦTI ATTENZJONI LIL GRUPP MUDELL TA’ BATTERJI TAL-BAĦAR, POLARIBACTER, ĠENERU FI ĦDAN IL-GRUPP KBIR TA’ BATTEROJDI. DAN IL-ĠENERU HUWA RELATTIVAMENT ABBUNDANTI FL-OĊEANI, B’MOD PARTIKOLARI FL-ILMIJIET POLARI. XI WĦUD MILL-MEMBRI TIEGĦU FIHOM IL-ĠENE PROTEORRODOPSIN, PROTEINA LI TIPPERMETTI LILL-BATTERJI JUŻAW L-ENERĠIJA ĦAFIFA. SP3 SE TANALIZZA R-REGOLAMENT U R-RELAZZJONI TA ‘DAN IL-GRUPP TA’ BATTERJI MAD-DAWL. IL-MEMBRI TAL-ĠENERU SE JKUNU IŻOLATI F’KULTURA PURA U L-ĠENOMI TAGĦHOM SE JIĠU SEKWENZJATI. ĠENOMI AMPLIFIKATI JINKISBU WKOLL MINN ĊELLOLI INDIVIDWALI (SAGS). DAWN IL-ĠENOMI SE JINTUŻAW GĦALL-ISTUDJU TAL-KAPAĊITAJIET TA’ POLARIBACTER’S U MQABBLA MA’ SEKWENZI BATTEROJDI DERIVATI MINN METAGENOMAS FL-SP2. FL-AĦĦAR NETT, SE JITWETTQU ESPERIMENTI BIEX TIĠI DDETERMINATA L-ESPRESSJONI ĠENIKA TA’ DAWN IL-BATTERJI TAĦT KUNDIZZJONIJIET DIFFERENTI TA’ DAWL SKUR U R-RIŻULTATI SE JITQABBLU MA’ DAWK MIKSUBA MINN METATRANSCRIPTOMS FL-SP2. L-OBJETTIVA TA’ DIN IL-KOMPONERAZZJONI TA’ METABOLIS U L-MAĠĠIMENT TA’ METABOLISM fil-PRESENZJA TA’ DAWL F’ATATTERIA HETEROTROFIĊJALI._x000D_ RESULTS għandhom IMPATT XJENTIFIKU sinifikattiv FIL-KANKJU TA’ Oċeanografija mikrobjana u nittamaw li jiftħu mogħdijiet ġodda biex jifhmu l-ekoloġija ta’ l-oċeani. (Maltese)
18 August 2022
0 references
OKEĀNI VEIDO LIELĀKO EKOSISTĒMU UZ ZEMES UN VIENU NO NEZINĀMĀKAJIEM. JŪRAS MIKROORGANISMU DARBĪBA REGULĒ BIOĢEOĶĪMISKOS CIKLUS UN BŪTISKI IETEKMĒ KLIMATA KONTROLI. TURKLĀT GANDRĪZ PUSE IEDZĪVOTĀJU DZĪVO JŪRAS TUVUMĀ, UN TĀPĒC CILVĒCEI IR LIELA IETEKME UZ OKEĀNIEM UN, GLUŽI PRETĒJI, TĀ LIELĀ MĒRĀ IR ATKARĪGA NO TO PAKALPOJUMIEM. ŠO IEMESLU DĒĻ JŪRAS PĒTNIECĪBA IR UZSKATĪTA PAR VIENU NO SOCIĀLAJĀM PROBLĒMĀM PROGRAMMĀ “APVĀRSNIS 2020”. ŠAJĀ PROJEKTĀ MĒS PLĀNOJAM IZPĒTĪT DAŽUS JŪRAS BAKTĒRIJU KOPIENU DAUDZVEIDĪBAS, STRUKTŪRAS UN FUNKCIONĀLO SPĒJU ASPEKTUS. Mūsu DAĻA POINT ir, ka Pieejamība Enormous Daudzums OCEAN sekcijām atver VENTANA OPPORTUNITY atrisināt jautājumus, kurus nevarēja apsvērt pirms parādīšanās Genome un METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT THREE PROJECT AR COMMUNITY INTERESTS AR DIFFERENT pieejas. PIRMAIS APAKŠPROJEKTS KONCENTRĒSIES UZ BAKTĒRIJU KOPIENU DAUDZVEIDĪBU. ŠIM NOLŪKAM, LAI IZPĒTĪTU RETU MIKROORGANISMU BIOSFĒRU, TIKS IZMANTOTAS 16S RDNS GĒNA ETIĶEŠU SEKVENCES (TAGS): ĻOTI LIELS SKAITS SUGU AR ĀRKĀRTĪGI ZEMU SKAITLISKUMU. MĒS CENTĪSIMIES NOTEIKT KOPĒJO BAKTĒRIJU TAKSONU SKAITU OKEĀNOS, UN MĒS IZSTRĀDĀSIM METODI, LAI ANALIZĒTU DIAPAZONA-DAUDZUMA LĪKNES, KAS, CERAMS, ATKLĀS BAKTĒRIJU KOPIENU EKOLOĢISKĀS ĪPAŠĪBAS. OTRAIS APAKŠPROJEKTS ANALIZĒS KOPIENAS, IZMANTOJOT METAGENOMICA UN METATRANSCRIPTOMICA. DAĻA NO ŠĪ SP2 PĀRKLĀJAS AR SP1, LAI SALĪDZINĀTU DAUDZVEIDĪBU, KO ATKLĀJ MARĶĒTĀS SEKVENCES AR METAGENOMU ATVASINĀJUMU. SVARĪGS ŠĀ SP2 KOMPONENTS BŪS KOPIENU SALĪDZINĀJUMS, PAMATOJOTIES UZ PHYLOGENY UN TAJĀ IETVERTAJĀM FUNKCIJĀM. NO LĪDZĀSPASTĀVĒŠANAS DAŽĀDĀS KOPIENĀS TIKS IZVEIDOTI BAKTĒRIJU TAKSONU ASOCIĀCIJAS TĪKLI, LAI ATKAL IEGŪTU KOPIENU ĪPAŠĪBAS. TREŠAIS APAKŠPROJEKTS PIEVĒRSĪS UZMANĪBU JŪRAS BAKTĒRIJU MODEĻU GRUPAI, POLARIBACTER, ĢINTS LIELĀS GRUPAS BAKTĒRIJĀM. ŠĪ ĢINTS IR SAMĒRĀ BAGĀTA OKEĀNOS, JO ĪPAŠI POLĀRAJOS ŪDEŅOS. DAŽI TĀS LOCEKĻI SATUR PROTEORRODOPSIN GĒNU, PROTEĪNU, KAS ĻAUJ BAKTĒRIJĀM IZMANTOT GAISMAS ENERĢIJU. SP3 ANALIZĒS REGULU UN ŠĪS BAKTĒRIJU GRUPAS SAISTĪBU AR GAISMU. ĢINTS LOCEKĻI TIKS IZOLĒTI TĪRĀ KULTŪRĀ, UN VIŅU GENOMI TIKS SEKVENCĒTI. PASTIPRINĀTI GENOMI TIKS IEGŪTI ARĪ NO ATSEVIŠĶĀM ŠŪNĀM (SAGS). ŠIE GENOMI TIKS IZMANTOTI, LAI PĒTĪTU POLARIBACTER SPĒJAS UN SALĪDZINĀTU AR BAKTĒRIJU SEKVENCĒM, KAS IEGŪTAS NO METAGENOMAS SP2. VISBEIDZOT, EKSPERIMENTI TIKS VEIKTI, LAI NOTEIKTU ŠO BAKTĒRIJU ĢENERISKO EKSPRESIJU DAŽĀDOS TUMŠĀS GAISMAS APSTĀKĻOS, UN REZULTĀTI TIKS SALĪDZINĀTI AR REZULTĀTIEM, KAS IEGŪTI NO METATRANSCRIPTOMS SP2. Šo SP3 MĒRĶIS KONTROLĒŠANAS METABOLISM UN METABOLISMA PĀRSKATĪŠANAS PRESENCE HETEROTROFICAL BACTERIA._x000D_ RESULTS ir nozīmīgs ZINĀTNISKĀS IMPACT mikrobiešu okeanografijas CHANGE, un mēs ceram, ka tie atver jaunus ceļus, lai izprastu okeānu ekoloģiju. (Latvian)
18 August 2022
0 references
OCEÁNY PREDSTAVUJÚ NAJVÄČŠÍ EKOSYSTÉM NA ZEMI A JEDEN Z NAJVIAC NEZNÁMYCH. ČINNOSTI MORSKÝCH MIKROORGANIZMOV REGULUJÚ BIOGEOCHEMICKÉ CYKLY A MAJÚ VEĽKÝ VPLYV NA KONTROLU KLÍMY. OKREM TOHO TAKMER POLOVICA ĽUDSKEJ POPULÁCIE ŽIJE V BLÍZKOSTI MORA, A PRETO MÁ ĽUDSTVO SILNÝ VPLYV NA OCEÁNY, A NAOPAK, VO VEĽKEJ MIERE ZÁVISÍ OD ICH SLUŽIEB. Z TÝCHTO DÔVODOV SA MORSKÝ VÝSKUM POVAŽUJE ZA JEDNU ZO SOCIÁLNYCH VÝZIEV PROGRAMU HORIZONT 2020. V TOMTO PROJEKTE PLÁNUJEME ŠTUDOVAŤ NIEKTORÉ ASPEKTY ROZMANITOSTI, ŠTRUKTÚRY A FUNKČNÝCH SCHOPNOSTÍ MORSKÝCH BAKTERIÁLNYCH SPOLOČENSTIEV. Náš PARTY POINT je, že dostupnosť enormného množstva OCEANových secutions otvára VENTANA OPPORTUNITY na riešenie otázok, ktoré nebolo možné zvážiť pred príchodom genómu a METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT THREE PROJECT S COMMUNITY INTERESTS S DIFFERENTnými prístupmi. PRVÝ ČIASTKOVÝ PROJEKT SA ZAMERIA NA ROZMANITOSŤ BAKTERIÁLNYCH SPOLOČENSTIEV. NA TENTO ÚČEL SA NA PRESKÚMANIE BIOSFÉRY VZÁCNYCH MIKROORGANIZMOV POUŽIJÚ SEKVENCIE OZNAČOVANIA (TAGS) GÉNU 16S RDNA: SÚBOR VEĽMI VYSOKÉHO POČTU DRUHOV S MIMORIADNE NÍZKOU ABUNDANCIOU. POKÚSIME SA URČIŤ CELKOVÝ POČET BAKTERIÁLNYCH TAXÓNOV V OCEÁNOCH A VYVINIEME METÓDU NA ANALÝZU KRIVIEK HOJNOSTI, KTORÉ, DÚFAME, ODHALIA EKOLOGICKÉ VLASTNOSTI BAKTERIÁLNYCH SPOLOČENSTIEV. DRUHÝ ČIASTKOVÝ PROJEKT BUDE ANALYZOVAŤ SPOLOČENSTVÁ POMOCOU METAGENOMICA A METATRANSCRIPTOMICA. ČASŤ TOHTO SP2 SA PREKRÝVA SO SP1 S CIEĽOM POROVNAŤ ROZMANITOSŤ ODHALENÚ OZNAČENÝMI SEKVENCIAMI S DERIVÁTOM METAGENOMOV. DÔLEŽITOU ZLOŽKOU TOHTO SP2 BUDE POROVNANIE SPOLOČENSTIEV ZALOŽENÉ NA FYLOGÉNII A FUNKCIÁCH, KTORÉ OBSAHUJE. Z KOEXISTENCIE V RÔZNYCH SPOLOČENSTVÁCH SA VYTVORIA SIETE ZDRUŽENÍ MEDZI BAKTERIÁLNYMI TAXÓNMI, ABY SA OPÄŤ ODVODILI VLASTNOSTI SPOLOČENSTIEV. TRETÍ DIEL PROJEKT BUDE VENOVAŤ POZORNOSŤ MODELOVEJ SKUPINE MORSKÝCH BAKTÉRIÍ, POLARIBACTER, RODU V RÁMCI VEĽKEJ SKUPINY BAKTÉRIÍ. TENTO ROD JE POMERNE HOJNÝ V OCEÁNOCH, NAJMÄ V POLÁRNYCH VODÁCH. NIEKTORÍ Z JEHO ČLENOV OBSAHUJÚ GÉN PROTEORRODOPSIN, PROTEÍN, KTORÝ UMOŽŇUJE BAKTÉRIÁM VYUŽÍVAŤ SVETELNÚ ENERGIU. SP3 BUDE ANALYZOVAŤ REGULÁCIU A VZŤAH TEJTO SKUPINY BAKTÉRIÍ K SVETLU. ČLENOVIA RODU BUDÚ IZOLOVANÍ V ČISTEJ KULTÚRE A ICH GENÓMY BUDÚ SEKVENOVANÉ. ZOSILNENÉ GENÓMY SA ZÍSKAJÚ AJ Z JEDNOTLIVÝCH BUNIEK (SAGOV). TIETO GENÓMY SA POUŽIJÚ NA ŠTÚDIUM POLARIBACTER’S SCHOPNOSTÍ A POROVNÁVAJÚ SA S BAKTERIOIDNÝMI SEKVENCIAMI ODVODENÝMI Z METAGENOMASU V SP2. NAKONIEC SA VYKONAJÚ POKUSY NA URČENIE GÉNOVEJ EXPRESIE TÝCHTO BAKTÉRIÍ V RÔZNYCH PODMIENKACH TMAVÉHO SVETLA A VÝSLEDKY SA POROVNAJÚ S VÝSLEDKAMI ZÍSKANÝMI Z METATRANSCRIPTOMSU V SP2. OBJECTIVE TÝKAJÚCE SA SP3 je SPOLOČNOSŤ, ako KONTROLU METABOLISM A MANAGEMENT OF METABOLISM IN PRESENCE OF LIGHT IN A HETEROTROFICAL BACTERIA._x000D_ Výsledky majú významný SCIENTIFICKÝ VÝSTROJ V CHANGE Oceánky a dúfame, že otvoria nové cesty k pochopeniu ekológie oceánov. (Slovak)
18 August 2022
0 references
IS IAD NA HAIGÉIN AN T-ÉICEACHÓRAS IS MÓ AR DOMHAN AGUS CEANN DE NA CINN IS ANAITHNIDE. LE GNÍOMHAÍOCHTAÍ MIOCRORGÁNACH MUIRÍ, RIALAÍTEAR TIMTHRIALLTA BITHGHEOICEIMICEACHA AGUS BÍONN TIONCHAR MÓR ACU AR RIALÚ AERÁIDE. THAIRIS SIN, TÁ BEAGNACH LEATH DE DHAONRA AN DUINE INA GCÓNAÍ GAR DON FHARRAIGE AGUS, DÁ BHRÍ SIN, BÍONN TIONCHAR LÁIDIR AG AN GCINE DAONNA AR NA HAIGÉIN AGUS, AR A MHALAIRT, BRAITHEANN SÉ GO MÓR AR A GCUID SEIRBHÍSÍ. AR NA CÚISEANNA SIN, MEASADH GO RAIBH TAIGHDE MUIRÍ AR CHEANN DE NA DÚSHLÁIN SHÓISIALTA SA CHLÁR FÍS 2020. SA TIONSCADAL REATHA PLEAN AGAINN CHUN STAIDÉAR A DHÉANAMH AR ROINNT GNÉITHE DEN ÉAGSÚLACHT, STRUCHTÚR AGUS CUMAIS FHEIDHMIÚLA NA BPOBAL MARA BAICTÉARACH. Is é ár POINT PÁIRTITHE go osclaíonn an Fáil ar Chainníocht Enormous de SECUTIONS OCEAN VENTANA OF OPPORTUNITY chun ceisteanna a réiteach nach bhféadfaí a chur san áireamh roimh theacht Genome agus METAGENOMIC._x000D_ coordina PROJECT THREE PROJECT LE INTERESTS COMHPHOBAL LE cur chuige DIFFERENT. DÍREOIDH AN CHÉAD FHOTHIONSCADAL AR ÉAGSÚLACHT NA BPOBAL BAICTÉARACH. CHUN NA CRÍCHE SIN, ÚSÁIDFEAR SEICHIMH LIPÉID (TAGS) GÉINE RDNA 16S CHUN BITHSFÉAR NA MIOCRORGÁNACH NEAMHCHOITIANTA A INIÚCHADH: AN SRAITH DE LÍON AN-ARD DE SPEICIS A BHFUIL FLÚIRSE EXTRAORDINARILY ÍSEAL. DÉANFAIMID IARRACHT LÍON IOMLÁN NA DTACSAÍ BAICTÉARACHA SNA HAIGÉIN A CHINNEADH AGUS FORBRÓIMID MODH CHUN ANAILÍS A DHÉANAMH AR NA CUAIR RAIDHSE RAON A BHFUIL SÚIL AGAINN AIRÍONNA ÉICEOLAÍOCHA NA BPOBAL BAICTÉARACH A NOCHTADH. DÉANFAIDH AN DARA FOTHIONSCADAL ANAILÍS AR PHOBAIL A ÚSÁIDEANN METAGENOMICA AGUS METATRANSCRIPTOMICA. TÁ CUID DEN SP2 FORLUÍ LEIS AN SP1 CHUN COMPARÁID A DHÉANAMH AR AN ÉAGSÚLACHT A NOCHTADH AG NA SEICHIMH LIPÉADAITHE LE DÍORTHACH NA METAGENOMES. CUID THÁBHACHTACH DEN SP2 SEO IS EA COMPARÁID A DHÉANAMH IDIR POBAIL ATÁ BUNAITHE AR AN PHYLOGENY AGUS NA FEIDHMEANNA ATÁ ANN. ÓN GCÓMHAIREACHTÁIL I BPOBAIL ÉAGSÚLA, BUNÓFAR LÍONRAÍ COMHLACHAIS IDIR TACSÓIN BHAICTÉARACHA D’FHONN, ARÍS, AIRÍONNA NA BPOBAL A DHÍORTHÚ. TABHARFAIDH AN TRÍÚ FOTHIONSCADAL AIRD AR GHRÚPA MÚNLA DE BHAICTÉIR MHUIRÍ, POLARIBACTER, GÉINEAS LAISTIGH DEN GHRÚPA MÓR BACTEROIDS. TÁ AN GHÉINEAS SEO SÁCH FLÚIRSEACH SNA HAIGÉIN, GO HÁIRITHE IN UISCÍ POLACHA. TÁ GÉINE PROTEORRODOPSIN I GCUID DÁ CHOMHALTAÍ, PRÓITÉIN A LIGEANN DO BHAICTÉIR FUINNEAMH ÉADROM A ÚSÁID. DÉANFAIDH SP3 ANAILÍS AR RIALACHÁN AGUS AR GHAOL AN GHRÚPA SIN DE BHAICTÉIR CHUN SOLAIS. BEIDH BAILL DEN GHÉINEAS SCOITE AMACH I GCULTÚR ÍON AGUS DÉANFAR A GCUID GENOMES A SHEICHEAMH. BEIDH GENOMES AMPLIFIED A FHÁIL FREISIN Ó CHEALLA AONAIR (SAGS). ÚSÁIDFEAR NA GENOMES SIN CHUN STAIDÉAR A DHÉANAMH AR CHUMAIS POLARIBACTER’S AGUS I GCOMPARÁID LE SEICHIMH BHAICTÉARÓIDEACHA A DHÍORTHAÍTEAR Ó METAGENOMAS IN SP2. AR DEIREADH, DÉANFAR TURGNAIMH CHUN LÉIRIÚ GÉICE NA MBAICTÉAR SEO A CHINNEADH FAOI CHOINNÍOLLACHA ÉAGSÚLA SOLAS DORCHA AGUS CUIRFEAR NA TORTHAÍ I GCOMPARÁID LEO SIÚD A FHAIGHTEAR Ó METATRANSCRIPTOMS SA SP2. Tá an OBJECTIVE of This SP3 comprender AS CONTROL of METABOLISM agus bainistíocht na METABOLISM in imeacht na SOLAS i BACTERIA._x000D_ Tá súil againn go n-osclóidh siad bealaí nua chun éiceolaíocht na n-aigéan a thuiscint. (Irish)
18 August 2022
0 references
OCEÁNY PŘEDSTAVUJÍ NEJVĚTŠÍ EKOSYSTÉM NA ZEMI A JEDEN Z NEJVÍCE NEZNÁMÝCH. ČINNOSTI MOŘSKÝCH MIKROORGANISMŮ REGULUJÍ BIOGEOCHEMICKÉ CYKLY A MAJÍ VÝZNAMNÝ VLIV NA KONTROLU KLIMATU. KROMĚ TOHO TÉMĚŘ POLOVINA LIDSKÉ POPULACE ŽIJE V BLÍZKOSTI MOŘE, A PROTO MÁ LIDSTVO SILNÝ DOPAD NA OCEÁNY A NAOPAK SILNĚ ZÁVISÍ NA JEJICH SLUŽBÁCH. Z TĚCHTO DŮVODŮ BYL MOŘSKÝ VÝZKUM POVAŽOVÁN ZA JEDNU ZE SOCIÁLNÍCH VÝZEV PROGRAMU HORIZONT 2020. V TOMTO PROJEKTU PLÁNUJEME STUDOVAT NĚKTERÉ ASPEKTY ROZMANITOSTI, STRUKTURY A FUNKČNÍCH SCHOPNOSTÍ MOŘSKÝCH BAKTERIÁLNÍCH KOMUNIT. Naše PARTY POINT je, že dostupnost Enormous Množství OCEAN secutions otevírá VENTANA OPPORTUNITY řešit otázky, které nebylo možné zvážit před příchodem Genome a METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT THREE PROJECT SPOLEČNOST INTERESTS S DIFFERENT přístupy. PRVNÍ DÍLČÍ PROJEKT SE ZAMĚŘÍ NA ROZMANITOST BAKTERIÁLNÍCH SPOLEČENSTVÍ. ZA TÍMTO ÚČELEM BUDOU K PROZKOUMÁNÍ BIOSFÉRY VZÁCNÝCH MIKROORGANISMŮ POUŽITY SEKVENCE OZNAČENÍ (TAGY) GENU 16S RDNA: SOUBOR VELMI VYSOKÉHO POČTU DRUHŮ S MIMOŘÁDNĚ NÍZKOU HOJNOSTÍ. POKUSÍME SE URČIT CELKOVÝ POČET BAKTERIÁLNÍCH TAXONŮ V OCEÁNECH A VYTVOŘÍME METODU PRO ANALÝZU KŘIVEK ROZSAHU A HOJNOSTI, O KTERÝCH DOUFÁME, ŽE ODHALÍ EKOLOGICKÉ VLASTNOSTI BAKTERIÁLNÍCH KOMUNIT. DRUHÝ DÍLČÍ PROJEKT BUDE ANALYZOVAT KOMUNITY POMOCÍ METAGENOMICA A METATRANSCRIPTOMICA. ČÁST TOHOTO SP2 SE PŘEKRÝVÁ S SP1 PRO SROVNÁNÍ ROZMANITOSTI ODHALENÉ OZNAČENÝMI SEKVENCEMI S DERIVÁTEM METAGENOMŮ. DŮLEŽITOU SOUČÁSTÍ TOHOTO SP2 BUDE SROVNÁNÍ SPOLEČENSTVÍ ZALOŽENÉ NA FYLOGENII A FUNKCÍCH, KTERÉ OBSAHUJE. Z KOEXISTENCE V RŮZNÝCH SPOLEČENSTVÍCH BUDOU ZŘÍZENY SÍTĚ SDRUŽENÍ MEZI BAKTERIÁLNÍMI TAXONY, ABY SE ZNOVU ODVOZOVALY VLASTNOSTI SPOLEČENSTVÍ. TŘETÍ PODPROJEKT BUDE VĚNOVAT POZORNOST MODELOVÉ SKUPINĚ MOŘSKÝCH BAKTERIÍ, POLARIBACTER, RODU V RÁMCI VELKÉ SKUPINY BAKTERIOIDŮ. TENTO ROD JE POMĚRNĚ HOJNÝ V OCEÁNECH, ZEJMÉNA V POLÁRNÍCH VODÁCH. NĚKTERÉ Z JEHO ČLENŮ OBSAHUJÍ PROTEORRODOPSIN GEN, PROTEIN, KTERÝ UMOŽŇUJE BAKTERIÍM POUŽÍVAT SVĚTLOU ENERGII. SP3 BUDE ANALYZOVAT REGULACI A VZTAH TÉTO SKUPINY BAKTERIÍ KE SVĚTLU. ČLENOVÉ RODU BUDOU IZOLOVÁNI V ČISTÉ KULTUŘE A JEJICH GENOMY BUDOU SEKVENOVÁNY. ZESÍLENÉ GENOMY BUDOU TAKÉ ZÍSKÁNY Z JEDNOTLIVÝCH BUNĚK (SAGŮ). TYTO GENOMY BUDOU POUŽITY KE STUDIU SCHOPNOSTÍ POLARIBACTER A POROVNÁNY S BAKTERIOIDNÍMI SEKVENCEMI ODVOZENÝMI Z METAGENOMAS V SP2. V NEPOSLEDNÍ ŘADĚ BUDOU PROVEDENY EXPERIMENTY KE STANOVENÍ GENOVÉ EXPRESE TĚCHTO BAKTERIÍ ZA RŮZNÝCH PODMÍNEK TMAVÉHO SVĚTLA A VÝSLEDKY BUDOU POROVNÁNY S VÝSLEDKY ZÍSKANÝMI Z METATRANSCRIPTOMS V SP2. OBJEKTIVE TÉTO SP3 JE SPOLEČNOST jako KONTROL METABOLISM A MANAGEMENT METABOLISM V PRESENCE LIGHT V HETEROTROFICAL BACTERIA._x000D_ RESULTS mají signifikantní SCIENTIFICKÝ IMPACT IN THE CHANGE microbian Oceanografia a doufáme, že otevřou nové cesty k pochopení ekologie oceánů. (Czech)
18 August 2022
0 references
OS OCEANOS CONSTITUEM O MAIOR ECOSSISTEMA DA TERRA E UM DOS MAIS DESCONHECIDOS. AS ATIVIDADES DOS MICRORGANISMOS MARINHOS REGULAM OS CICLOS BIOGEOQUÍMICOS E TÊM UMA GRANDE INFLUÊNCIA NO CONTROLE CLIMÁTICO. ALÉM DISSO, QUASE METADE DA POPULAÇÃO HUMANA VIVE PERTO DO MAR E, POR CONSEGUINTE, A HUMANIDADE TEM UM FORTE IMPACTO NOS OCEANOS E, PELO CONTRÁRIO, DEPENDE FORTEMENTE DOS SEUS SERVIÇOS. POR ESTAS RAZÕES, A INVESTIGAÇÃO MARINHA FOI CONSIDERADA UM DOS DESAFIOS SOCIAIS DO PROGRAMA HORIZONTE 2020. NO PRESENTE PROJETO PRETENDEMOS ESTUDAR ALGUNS ASPETOS DA DIVERSIDADE, ESTRUTURA E CAPACIDADES FUNCIONAIS DAS COMUNIDADES BACTERIANAS MARINHAS. Nosso PARTY POINT é que a Disponibilidade de uma Quantidade Enorme de Secuções OCEANas abre uma VENTANA DE OPPORTUNIDADE para resolver questões que não poderiam ser consideradas antes do advento do Genoma e do METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJETO THREE PROJETO COM INTERESTES COM COMUNIDADE COM abordagens diferentes. O PRIMEIRO SUBPROJETO CENTRAR-SE-Á NA DIVERSIDADE DAS COMUNIDADES BACTERIANAS. PARA ESTE EFEITO, AS SEQUÊNCIAS DE ETIQUETAS (TAGS) DO GENE 16S RDNA SERÃO UTILIZADAS PARA EXPLORAR A BIOSFERA DE MICRORGANISMOS RAROS: O CONJUNTO DE UM NÚMERO MUITO ELEVADO DE ESPÉCIES COM ABUNDÂNCIAS EXTRAORDINARIAMENTE BAIXAS. TENTAREMOS DETERMINAR O NÚMERO TOTAL DE TAXA BACTERIANOS NOS OCEANOS E DESENVOLVEREMOS UM MÉTODO PARA ANALISAR AS CURVAS DE AMPLITUDE-ABUNDÂNCIA QUE ESPERAMOS REVELAR AS PROPRIEDADES ECOLÓGICAS DAS COMUNIDADES BACTERIANAS. O SEGUNDO SUBPROJETO ANALISARÁ AS COMUNIDADES UTILIZANDO A METAGENOMICA E A METATRANSCRIPTOMICA. PARTE DESTE SP2 SE SOBREPÕE AO SP1 PARA COMPARAR A DIVERSIDADE REVELADA PELAS SEQUÊNCIAS ROTULADAS COM A DERIVADA DOS METAGENOMES. UM COMPONENTE IMPORTANTE DESTE SP2 SERÁ A COMPARAÇÃO DE COMUNIDADES BASEADAS NA FILOGENIA E NAS FUNÇÕES QUE ELA CONTÉM. A PARTIR DA COEXISTÊNCIA EM DIFERENTES COMUNIDADES, SERÃO CRIADAS REDES DE ASSOCIAÇÃO ENTRE TAXA BACTERIANOS, A FIM DE, NOVAMENTE, DERIVAR AS PROPRIEDADES DAS COMUNIDADES. O TERCEIRO SUBPROJETO PRESTARÁ ATENÇÃO A UM GRUPO MODELO DE BACTÉRIAS MARINHAS, POLARIBACTER, UM GÊNERO DENTRO DO GRANDE GRUPO DE BACTEROIDES. ESTE GÊNERO É RELATIVAMENTE ABUNDANTE EM OCEANOS, PARTICULARMENTE EM ÁGUAS POLARES. ALGUNS DE SEUS MEMBROS CONTÊM O GENE PROTEORRODOPSINA, UMA PROTEÍNA QUE PERMITE QUE AS BACTÉRIAS USEM ENERGIA LEVE. O SP3 ANALISARÁ O REGULAMENTO E A RELAÇÃO DESTE GRUPO DE BACTÉRIAS COM A LUZ. OS MEMBROS DO GÊNERO SERÃO ISOLADOS EM CULTURA PURA E SEUS GENOMAS SERÃO SEQUENCIADOS. GENOMAS AMPLIFICADOS TAMBÉM SERÃO OBTIDOS A PARTIR DE CÉLULAS INDIVIDUAIS (SAGS). ESSES GENOMAS SERÃO USADOS PARA ESTUDAR AS CAPACIDADES DO POLARIBACTER E COMPARADOS COM SEQUÊNCIAS BACTEROIDES DERIVADAS DE METAGENOMAS EM SP2. FINALMENTE, SERÃO REALIZADOS EXPERIMENTOS PARA DETERMINAR A EXPRESSÃO GÊNICA DESSAS BACTÉRIAS EM DIFERENTES CONDIÇÕES DE LUZ ESCURA E OS RESULTADOS SERÃO COMPARADOS COM OS OBTIDOS A PARTIR DE METATRANSCRIPTOMS NO SP2. O OBJETIVO DE ESTE SP3 é COMPRENDER COMO CONTROLO DE METABOLISMO E O GESTÃO DO METABOLISMO EM PRESENÇA DA LUZ Numa BACTERIA HETEROTROFICAL._x000D_ Os RESULTADOS têm um IMPACTO CIENTÍFICO significativo NA MUDANÇA DA Oceanografia microbiana e esperamos que abram novos caminhos para compreender a ecologia dos oceanos. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
OOKEANID ON SUURIM ÖKOSÜSTEEM MAA PEAL JA ÜKS KÕIGE TUNDMATUMAID. MERE MIKROORGANISMIDE TEGEVUS REGULEERIB BIOGEOKEEMILISI TSÜKLEID JA MÕJUTAB OLULISELT KLIIMAOHJET. LISAKS ELAB PEAAEGU POOL INIMESTEST MERE LÄHEDAL JA SEETÕTTU AVALDAB INIMKOND TUGEVAT MÕJU OOKEANIDELE JA VASTUPIDI, SÕLTUB SUUREL MÄÄRAL NENDE TEENUSTEST. SEETÕTTU PEETAKSE MEREUURINGUID PROGRAMMI „HORISONT 2020“ ÜHEKS SOTSIAALSEKS VÄLJAKUTSEKS. KÄESOLEVAS PROJEKTIS PLAANIME UURIDA MÕNINGAID MEREBAKTERITE KOGUKONDADE MITMEKESISUSE, STRUKTUURI JA FUNKTSIONAALSETE VÕIMETE ASPEKTE. Meie PARTY POINT on see, et tohutu koguse OCEANi sekutsioonide kättesaadavus avab OPPORTUNITY VENTANA, et lahendada küsimusi, mida ei olnud võimalik käsitleda enne genoomi ja METAGENOMIC’i tulekut._x000D_ COORDINA PROJECT THREE PROJECT WITH COMMUNITY INTERESTS WITH DIFFERENT lähenemised. ESIMENE ALLPROJEKT KESKENDUB BAKTERIKOGUKONDADE MITMEKESISUSELE. SELLEKS KASUTATAKSE 16S RDNA GEENI MÄRGISTUSJÄRJESTUSI (MÄRGISTUSI), ET UURIDA HARULDASTE MIKROORGANISMIDE BIOSFÄÄRI: VÄGA SUURE ARVU LIIKIDE KOGUM ERAKORDSELT VÄIKESE ARVUKUSEGA. PÜÜAME KINDLAKS MÄÄRATA BAKTERIAALSETE TAKSONITE KOGUARVU OOKEANIDES JA TÖÖTAME VÄLJA MEETODI, ET ANALÜÜSIDA LEVIALA ARVUKUSE KÕVERAID, MIS LOODETAVASTI PALJASTAVAD BAKTERIKOOSLUSTE ÖKOLOOGILISED OMADUSED. TEISES ALLPROJEKTIS ANALÜÜSITAKSE KOGUKONDI METAGENOMICA JA METATRANSCRIPTOMICA ABIL. OSA SELLEST SP2-ST KATTUB SP1-GA, ET VÕRRELDA MÄRGISTATUD JÄRJESTUSTE JA METAGENOOMIDE TULETISE MITMEKESISUST. SELLE SP2 OLULISEKS KOMPONENDIKS ON ÜHENDUSTE VÕRDLEMINE FÜLOGEENSUSE JA SELLES SISALDUVATE FUNKTSIOONIDE ALUSEL. ERI ÜHENDUSTE KOOSEKSISTEERIMISEL LUUAKSE BAKTERIAALSETE TAKSONITE ASSOTSIATSIOONIVÕRGUSTIKUD, ET TULETADA TAAS ÜHENDUSTE OMADUSI. KOLMAS ALLPROJEKT PÖÖRAB TÄHELEPANU MEREBAKTERITE MUDELIRÜHMALE POLARIBACTER, MIS ON SUURE BAKTERITE RÜHMA PEREKOND. SEE PEREKOND ON OOKEANIDES, ERITI POLAARVETES, SUHTELISELT RIKKALIK. MÕNED SELLE LIIKMED SISALDAVAD PROTEORRODOPSIN GEENI, VALKU, MIS VÕIMALDAB BAKTERITEL KASUTADA KERGET ENERGIAT. SP3 ANALÜÜSIB SELLE BAKTERITE RÜHMA MÄÄRUST JA SEOST VALGUSEGA. PEREKONNA LIIKMED ISOLEERITAKSE PUHTAS KULTUURIS JA NENDE GENOOMID JÄRJESTATAKSE. VÕIMENDATUD GENOOMID SAADAKSE KA ÜKSIKUTEST RAKKUDEST (SAGS). NEID GENOOMISID KASUTATAKSE POLARIBACTERI VÕIMETE UURIMISEKS JA VÕRRELDES BAKTERITE JÄRJESTUSTEGA, MIS ON TULETATUD METAGENOMAS’IST SP2-S. LÕPUKS VIIAKSE LÄBI KATSED, ET MÄÄRATA KINDLAKS NENDE BAKTERITE GEENNE EKSPRESSIOON ERINEVATES TUMEDA VALGUSE TINGIMUSTES NING TULEMUSI VÕRRELDAKSE TULEMUSTEGA, MIS SAADI METATRANSCRIPTOMS’ILT SP2-S. THIS SP3 OBJEKTIIV TÄHELEPANU TÄHELEPANU – automaatne tõlge inglise versiooni._x000D_ RESOLUTSIOONID on oluline SCIENTIFIC IMPACTELIK mikroobide Okeanografia ja loodame, et nad avavad uusi teid, et mõista ökoloogia ookeanid. (Estonian)
18 August 2022
0 references
AZ ÓCEÁNOK ALKOTJÁK A FÖLD LEGNAGYOBB ÖKOSZISZTÉMÁJÁT ÉS AZ EGYIK LEGISMERTEBBET. A TENGERI MIKROORGANIZMUSOK TEVÉKENYSÉGE SZABÁLYOZZA A BIOGEOKÉMIAI CIKLUSOKAT, ÉS JELENTŐS HATÁSSAL VAN A KLÍMASZABÁLYOZÁSRA. RÁADÁSUL AZ EMBERI LAKOSSÁG KÖZEL FELE A TENGER KÖZELÉBEN ÉL, EZÉRT AZ EMBERISÉG JELENTŐS HATÁSSAL VAN AZ ÓCEÁNOKRA, ÉS ÉPPEN ELLENKEZŐLEG, NAGYMÉRTÉKBEN FÜGG A SZOLGÁLTATÁSAIKTÓL. EZEN OKOK MIATT A TENGERKUTATÁST A HORIZONT 2020 PROGRAM EGYIK TÁRSADALMI KIHÍVÁSÁNAK TEKINTETTÉK. A JELENLEGI PROJEKTBEN A TENGERI BAKTÉRIUMKÖZÖSSÉGEK SOKFÉLESÉGÉNEK, SZERKEZETÉNEK ÉS FUNKCIONÁLIS KÉPESSÉGEINEK NÉHÁNY ASPEKTUSÁT TANULMÁNYOZZUK. A PARTY POINT az, hogy a rendelkezésre álló Enormous Mennyiség OCEAN secutions megnyitja a VENTANA OF OPPORTUNITY olyan kérdések megoldására, amelyeket nem lehetett figyelembe venni, mielőtt a Genome és a METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJEKT THREE PROJEKT KÖZÖSSÉGI INTERESTS WITH DIFFERENTs. AZ ELSŐ ALPROJEKT A BAKTERIÁLIS KÖZÖSSÉGEK SOKFÉLESÉGÉRE ÖSSZPONTOSÍT. E CÉLBÓL A 16S RDNS GÉN CÍMKESZEKVENCIÁIT (CÍMKÉK) HASZNÁLJÁK A RITKA MIKROORGANIZMUSOK BIOSZFÉRÁJÁNAK FELTÁRÁSÁRA: A RENDKÍVÜL NAGYSZÁMÚ, RENDKÍVÜL ALACSONY ABUNDANCIÁJÚ FAJKÉSZLET. MEGPRÓBÁLJUK MEGHATÁROZNI AZ ÓCEÁNOKBAN TALÁLHATÓ BAKTERIÁLIS TAXONOK TELJES SZÁMÁT, ÉS KIDOLGOZUNK EGY MÓDSZERT A TARTOMÁNY-BŐSÉG GÖRBÉK ELEMZÉSÉRE, AMELYEK REMÉNYEINK SZERINT FELTÁRJÁK A BAKTERIÁLIS KÖZÖSSÉGEK ÖKOLÓGIAI TULAJDONSÁGAIT. A MÁSODIK ALPROJEKT A KÖZÖSSÉGEKET A METAGENOMICA ÉS METATRANSCRIPTOMICA FELHASZNÁLÁSÁVAL ELEMZI. AZ SP2 EGY RÉSZE ÁTFEDI AZ SP1-ET, HOGY ÖSSZEHASONLÍTSA A MEGJELÖLT SZEKVENCIÁK ÁLTAL KIMUTATOTT SOKFÉLESÉGET A METAGENOMOK SZÁRMAZÉKÁVAL. AZ SP2 FONTOS ELEME A KÖZÖSSÉGEKNEK A FILOGÉN ÉS A BENNE FOGLALT FUNKCIÓKON ALAPULÓ ÖSSZEHASONLÍTÁSA. A KÜLÖNBÖZŐ KÖZÖSSÉGEKBEN VALÓ EGYÜTTÉLÉSBŐL LÉTREJÖNNEK A BAKTERIÁLIS TAXONOK KÖZÖTTI TÁRSULÁSI HÁLÓZATOK, HOGY ISMÉT A KÖZÖSSÉGEK TULAJDONSÁGAIT LEHESSEN LEVEZETNI. A HARMADIK ALPROJEKT FIGYELMET FORDÍT A TENGERI BAKTÉRIUMOK EGY MODELLCSOPORTJÁRA, A POLARIBACTER-RE, AMELY A BAKTEROIDOK NAGY CSOPORTJÁBA TARTOZÓ NEMZETSÉG. EZ A NEMZETSÉG VISZONYLAG BŐSÉGES AZ ÓCEÁNOKBAN, KÜLÖNÖSEN A SARKI VIZEKBEN. NÉHÁNY TAGJA TARTALMAZZA A PROTEORRODOPSIN GÉNT, EGY FEHÉRJÉT, AMELY LEHETŐVÉ TESZI A BAKTÉRIUMOK SZÁMÁRA, HOGY KÖNNYŰ ENERGIÁT HASZNÁLJANAK. SP3 ELEMZI A RENDELET ÉS A KAPCSOLAT E CSOPORT BAKTÉRIUM FÉNY. A NEMZETSÉG TAGJAI TISZTA KULTÚRÁBAN LESZNEK ELKÜLÖNÍTVE, ÉS GENOMJAIK SZEKVENCIÁLÓDNAK. AZ AMPLIFIKÁLT GENOMOKAT EGYEDI SEJTEKBŐL (SAGOK) IS NYERIK. EZEKET A GENOMOKAT A POLARIBACTER KÉPESSÉGEINEK TANULMÁNYOZÁSÁRA HASZNÁLJÁK, ÉS ÖSSZEHASONLÍTJÁK AZ SP2-BEN A METAGENOMAS-BÓL SZÁRMAZÓ BAKTEROID SZEKVENCIÁKKAL. VÉGÜL KÍSÉRLETEKET VÉGEZNEK E BAKTÉRIUMOK KÜLÖNBÖZŐ SÖTÉT FÉNYVISZONYOK MELLETT TÖRTÉNŐ GÉN EXPRESSZIÓJÁNAK MEGHATÁROZÁSÁRA, ÉS AZ EREDMÉNYEKET ÖSSZEHASONLÍTJÁK AZ SP2 METATRANSCRIPTOMS-BÓL KAPOTT EREDMÉNYEKKEL. A CÉLKITŰZÉSI IRÁNYELV A METABOLISM ELLENŐRZÉSÉNEK ÉS A METABOLISM A HETEROTROFICICAL BACTERIA-ban a METABOLISM MANAGEJEZÉSE._x000D_ RESULTS egy jelentős SCIENTIFIC IMPACT A mikrobikus Oceanografia ékezetében, és reméljük, hogy új utakat nyitnak meg az óceánok ökológiájának megértéséhez. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
ОКЕАНИТЕ ПРЕДСТАВЛЯВАТ НАЙ-ГОЛЯМАТА ЕКОСИСТЕМА НА ЗЕМЯТА И ЕДНА ОТ НАЙ-НЕИЗВЕСТНИТЕ. ДЕЙНОСТИТЕ НА МОРСКИТЕ МИКРООРГАНИЗМИ РЕГУЛИРАТ БИОГЕОХИМИЧНИТЕ ЦИКЛИ И ОКАЗВАТ ЗНАЧИТЕЛНО ВЛИЯНИЕ ВЪРХУ КОНТРОЛА НА КЛИМАТА. ОСВЕН ТОВА ПОЧТИ ПОЛОВИНАТА ОТ ЧОВЕШКОТО НАСЕЛЕНИЕ ЖИВЕЕ БЛИЗО ДО МОРЕТО И СЛЕДОВАТЕЛНО ЧОВЕЧЕСТВОТО ОКАЗВА СИЛНО ВЪЗДЕЙСТВИЕ ВЪРХУ ОКЕАНИТЕ, А НАПРОТИВ, ЗАВИСИ В ГОЛЯМА СТЕПЕН ОТ ТЕХНИТЕ УСЛУГИ. ПОРАДИ ТЕЗИ ПРИЧИНИ МОРСКИТЕ ИЗСЛЕДВАНИЯ СЕ СЧИТАТ ЗА ЕДНО ОТ СОЦИАЛНИТЕ ПРЕДИЗВИКАТЕЛСТВА В ПРОГРАМАТА „ХОРИЗОНТ 2020“. В НАСТОЯЩИЯ ПРОЕКТ ПЛАНИРАМЕ ДА ПРОУЧИМ НЯКОИ АСПЕКТИ НА РАЗНООБРАЗИЕТО, СТРУКТУРАТА И ФУНКЦИОНАЛНИТЕ ВЪЗМОЖНОСТИ НА МОРСКИТЕ БАКТЕРИАЛНИ ОБЩНОСТИ. Нашата ЧАСТНА ПОЗИЦИЯ е, че наличността на огромно количество OCEAN secutions отваря VENTANA OF OPPORTUNITY за решаване на въпроси, които не могат да бъдат разгледани преди появата на генома и METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT THREE PROJECT С ОБЩИ ИНТЕРЕСТИ с различни подходи. ПЪРВИЯТ ПОДПРОЕКТ ЩЕ СЕ СЪСРЕДОТОЧИ ВЪРХУ РАЗНООБРАЗИЕТО НА БАКТЕРИАЛНИТЕ ОБЩНОСТИ. ЗА ТАЗИ ЦЕЛ ЩЕ СЕ ИЗПОЛЗВАТ ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТИ ОТ ЕТИКЕТИ (TAGS) НА ГЕНА 16S RDNA ЗА ИЗСЛЕДВАНЕ НА БИОСФЕРАТА НА РЕДКИ МИКРООРГАНИЗМИ: НАБОРЪТ ОТ МНОГО ГОЛЯМ БРОЙ ВИДОВЕ С ИЗКЛЮЧИТЕЛНО НИСКО ИЗОБИЛИЕ. ЩЕ СЕ ОПИТАМЕ ДА ОПРЕДЕЛИМ ОБЩИЯ БРОЙ БАКТЕРИАЛНИ ТАКСОНИ В ОКЕАНИТЕ И ЩЕ РАЗРАБОТИМ МЕТОД ЗА АНАЛИЗ НА КРИВИТЕ НА ДИАПАЗОНА, КОИТО СЕ НАДЯВАМЕ ДА РАЗКРИЯТ ЕКОЛОГИЧНИТЕ СВОЙСТВА НА БАКТЕРИАЛНИТЕ ОБЩНОСТИ. ВТОРИЯТ ПОДПРОЕКТ ЩЕ АНАЛИЗИРА ОБЩНОСТИТЕ, КАТО ИЗПОЛЗВА METAGENOMICA И METATRANSCRIPTOMICA. ЧАСТ ОТ ТОЗИ SP2 СЕ ПРИПОКРИВА С SP1, ЗА ДА СРАВНИ РАЗНООБРАЗИЕТО, РАЗКРИТО ОТ ЕТИКЕТИРАНИТЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТИ, С ПРОИЗВОДНОТО НА МЕТАГЕНОМИТЕ. ВАЖЕН КОМПОНЕНТ НА ТАЗИ SP2 ЩЕ БЪДЕ СРАВНЕНИЕТО НА ОБЩНОСТИТЕ ВЪЗ ОСНОВА НА ФИЛОГЕНИЯТА И ФУНКЦИИТЕ, КОИТО ТЯ СЪДЪРЖА. ОТ СЪВМЕСТНОТО СЪЩЕСТВУВАНЕ В РАЗЛИЧНИ ОБЩНОСТИ ЩЕ БЪДАТ СЪЗДАДЕНИ МРЕЖИ ЗА АСОЦИИРАНЕ МЕЖДУ БАКТЕРИАЛНИ ТАКСОНИ, ЗА ДА СЕ ПОЛУЧАТ ОТНОВО СВОЙСТВАТА НА ОБЩНОСТИТЕ. ТРЕТИЯТ ПОДПРОЕКТ ЩЕ ОБЪРНЕ ВНИМАНИЕ НА ГРУПА МОДЕЛИ НА МОРСКИ БАКТЕРИИ, POLARIBACTER, РОД В РАМКИТЕ НА ГОЛЯМАТА ГРУПА БАКТЕРИОИДИ. ТОЗИ РОД Е СРАВНИТЕЛНО ИЗОБИЛЕН В ОКЕАНИТЕ, ОСОБЕНО В ПОЛЯРНИТЕ ВОДИ. НЯКОИ ОТ ЧЛЕНОВЕТЕ МУ СЪДЪРЖАТ ГЕНА PROTEORRODOPSIN, ПРОТЕИН, КОЙТО ПОЗВОЛЯВА НА БАКТЕРИИТЕ ДА ИЗПОЛЗВАТ СВЕТЛИННА ЕНЕРГИЯ. SP3 ЩЕ АНАЛИЗИРА РЕГУЛИРАНЕТО И ВРЪЗКАТА НА ТАЗИ ГРУПА БАКТЕРИИ С СВЕТЛИНАТА. ЧЛЕНОВЕТЕ НА РОДА ЩЕ БЪДАТ ИЗОЛИРАНИ В ЧИСТА КУЛТУРА И ТЕХНИТЕ ГЕНОМИ ЩЕ БЪДАТ СЕКВЕНИРАНИ. АМПЛИФИЦИРАНИТЕ ГЕНОМИ СЪЩО ЩЕ БЪДАТ ПОЛУЧЕНИ ОТ ОТДЕЛНИ КЛЕТКИ (САГИ). ТЕЗИ ГЕНОМИ ЩЕ БЪДАТ ИЗПОЛЗВАНИ ЗА ПРОУЧВАНЕ НА ВЪЗМОЖНОСТИТЕ НА POLARIBACTER И СРАВНЕНИ С БАКТЕРИОИДНИТЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТИ, ПОЛУЧЕНИ ОТ METAGENOMAS В SP2. НАКРАЯ ЩЕ БЪДАТ ПРОВЕДЕНИ ЕКСПЕРИМЕНТИ ЗА ОПРЕДЕЛЯНЕ НА ГЕННАТА ЕКСПРЕСИЯ НА ТЕЗИ БАКТЕРИИ ПРИ РАЗЛИЧНИ УСЛОВИЯ НА ТЪМНА СВЕТЛИНА И РЕЗУЛТАТИТЕ ЩЕ БЪДАТ СРАВНЕНИ С ТЕЗИ, ПОЛУЧЕНИ ОТ METATRANSCRIPTOMS В SP2. OBJECTIVE OF THIS SP3 е съперник като КОНТРОЛ НА МЕТАБОЛИСМА И УПРАВЛЕНИЕТО НА МЕТАБОЛИСМА В ПРЕДСЕДАТЕЛСТВОТО НА Светлината В ХЕТЕРОФИЯ._x000D_ РЕЗУЛТАТИ имат значим НАУЧЕН ВЪЗДЕЙСТВИЕ В КАНЦИЯТА на микробната Океанография и се надяваме, че те ще отворят нови пътища, за да разберат екологията на океаните. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
VANDENYNAI YRA DIDŽIAUSIA EKOSISTEMA ŽEMĖJE IR VIENA IŠ LABIAUSIAI NEŽINOMŲ. JŪRŲ MIKROORGANIZMŲ VEIKLA REGULIUOJA BIOGEOCHEMINIUS CIKLUS IR DARO DIDELĘ ĮTAKĄ KLIMATO KONTROLEI. BE TO, BEVEIK PUSĖ ŽMONIŲ GYVENA NETOLI JŪROS, TODĖL ŽMONIJA DARO DIDELĮ POVEIKĮ VANDENYNAMS IR, PRIEŠINGAI, LABAI PRIKLAUSO NUO JŲ PASLAUGŲ. DĖL ŠIŲ PRIEŽASČIŲ JŪRŲ MOKSLINIAI TYRIMAI LAIKOMI VIENU IŠ SOCIALINIŲ IŠŠŪKIŲ PROGRAMOJE „HORIZONTAS 2020“. ŠIAME PROJEKTE PLANUOJAME IŠTIRTI KAI KURIUOS JŪRINIŲ BAKTERIJŲ BENDRUOMENIŲ ĮVAIROVĖS, STRUKTŪROS IR FUNKCINIŲ PAJĖGUMŲ ASPEKTUS. Mūsų DALIS yra ta, kad didelio OCEAN sekumentų kiekio prieinamumas atveria OPPORTUNITY VENTANA, kad išspręstų klausimus, kurie negalėjo būti svarstomi iki genomo ir METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJEKTO PROJEKTAS su COMMUNITY INTERESTS su DIFFERENT metodais. PIRMAJAME PROJEKTO PAPROGRAMYJE DAUGIAUSIA DĖMESIO BUS SKIRIAMA BAKTERIJŲ BENDRIJŲ ĮVAIROVEI. ŠIUO TIKSLU 16S RDNR GENO ETIKEČIŲ SEKA (ŽYMOS) BUS NAUDOJAMA TIRIANT RETŲ MIKROORGANIZMŲ BIOSFERĄ: LABAI DAUG RŪŠIŲ, KURIŲ GAUSA YRA LABAI MAŽA. MES STENGSIMĖS NUSTATYTI BENDRĄ BAKTERIJŲ TAKSONŲ SKAIČIŲ VANDENYNUOSE IR SUKURSIME METODĄ, SKIRTĄ ANALIZUOTI DIAPAZONO IR GAUSUMO KREIVES, KURIOS, TIKIMĖS, ATSKLEIS BAKTERIJŲ BENDRUOMENIŲ EKOLOGINES SAVYBES. ANTRAJAME PROJEKTO PAPROGRAMYJE BUS ANALIZUOJAMOS BENDRIJOS NAUDOJANT METAGENOMICA IR METATRANSCRIPTOMICA. DALIS ŠIO SP2 SUTAMPA SU SP1, KAD BŪTŲ GALIMA PALYGINTI PAŽYMĖTŲ SEKŲ ATSKLEIDIMĄ SU METAGENOMŲ DARINIU. SVARBUS ŠIO SP2 KOMPONENTAS BUS BENDRIJŲ PALYGINIMAS PAGAL FILOGOGENIJĄ IR JAME ESANČIAS FUNKCIJAS. DĖL SAMBŪVIO SKIRTINGOSE BENDRUOMENĖSE BUS SUKURTI BAKTERIJŲ TAKSONŲ ASOCIACIJOS TINKLAI, KAD VĖLGI BŪTŲ SUKURTOS BENDRIJŲ SAVYBĖS. TREČIASIS PAGALBINIS PROJEKTAS BUS ATKREIPTI DĖMESĮ Į PAVYZDINĘ GRUPĘ JŪRŲ BAKTERIJŲ, POLARIBACTER, GENTIES DIDELĖJE GRUPĖJE BAKTERIOIDŲ. ŠIOS GENTIES GANA GAUSU VANDENYNUOSE, YPAČ POLIARINIUOSE VANDENYSE. KAI KURIE JO NARIAI TURI PROTEORRODOPSIN GENĄ, BALTYMĄ, KURIS LEIDŽIA BAKTERIJOMS NAUDOTI ŠVIESOS ENERGIJĄ. SP3 ANALIZUOS ŠIOS BAKTERIJŲ GRUPĖS REGULIAVIMĄ IR RYŠĮ SU ŠVIESA. GENTIES NARIAI BUS IZOLIUOTI GRYNOJE KULTŪROJE IR JŲ GENOMAI BUS SEKAMI. SUSTIPRINTI GENOMAI TAIP PAT BUS GAUNAMI IŠ ATSKIRŲ LĄSTELIŲ (SAGŲ). ŠIE GENOMAI BUS NAUDOJAMI POLARIBACTER GEBĖJIMAMS TIRTI IR LYGINANT SU BAKTERIOIDŲ SEKOMIS, GAUTOMIS IŠ METAGENOMAS SP2 TYRIMO METU. GALIAUSIAI BUS ATLIEKAMI EKSPERIMENTAI, SIEKIANT NUSTATYTI ŠIŲ BAKTERIJŲ GENINĘ EKSPRESIJĄ SKIRTINGOMIS TAMSIOS ŠVIESOS SĄLYGOMIS, IR REZULTATAI BUS LYGINAMI SU REZULTATAIS, GAUTAIS NAUDOJANT METATRANSCRIPTOMS SP2. Šio SP3 KONKRETIJA yra KOMPLEKTAS, kaip METABOLISMO KONTROLĖ ir METABOLISMO VALSTYBĖ VALSTYBĖ ŠVIESOJE HETEROTROFICAL BACTERIA._x000D_ RESULTAI turi žymų SCIENTIFIC IMPACT į mikrobų okeanografijos CHANGE ir tikimės, kad jie atvers naujus kelius, kad suprastų vandenynų ekologiją. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
OCEANI ČINE NAJVEĆI EKOSUSTAV NA ZEMLJI I JEDAN OD NAJNEPOZNATIJIH. AKTIVNOSTI MORSKIH MIKROORGANIZAMA REGULIRAJU BIOGEOKEMIJSKE CIKLUSE I IMAJU VELIK UTJECAJ NA KONTROLU KLIME. ŠTOVIŠE, GOTOVO POLOVICA LJUDSKOG STANOVNIŠTVA ŽIVI U BLIZINI MORA I STOGA ČOVJEČANSTVO SNAŽNO UTJEČE NA OCEANE I, NAPROTIV, UVELIKE OVISI O NJIHOVIM USLUGAMA. IZ TIH SE RAZLOGA ISTRAŽIVANJE MORA SMATRA JEDNIM OD DRUŠTVENIH IZAZOVA U PROGRAMU OBZOR 2020. U OVOM PROJEKTU PLANIRAMO PROUČITI NEKE ASPEKTE RAZNOLIKOSTI, STRUKTURE I FUNKCIONALNIH SPOSOBNOSTI MORSKIH BAKTERIJSKIH ZAJEDNICA. Naš PARTY POINT je da dostupnost ogromne količine OCEAN secutions otvara VENTANA OPPORTUNITY za rješavanje pitanja koja se ne mogu razmotriti prije dolaska genoma i METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT THREE PROJECT S COMMUNITY INTERESTS sa DIFFERENT pristupima. PRVI POTPROJEKT BIT ĆE USMJEREN NA RAZNOLIKOST BAKTERIJSKIH ZAJEDNICA. U TU SVRHU ZA ISTRAŽIVANJE BIOSFERE RIJETKIH MIKROORGANIZAMA KORISTIT ĆE SE SEKVENCE (TAGS) 16S RDNK GENA (TAGS): SKUP VRLO VELIKOG BROJA VRSTA S IZNIMNO NISKIM OBILJEM. POKUŠAT ĆEMO ODREDITI UKUPAN BROJ BAKTERIJSKIH TAKSONA U OCEANIMA I RAZVITI METODU ZA ANALIZU KRIVULJA RASPONA ZA KOJE SE NADAMO DA ĆE OTKRITI EKOLOŠKA SVOJSTVA BAKTERIJSKIH ZAJEDNICA. U DRUGOM POTPROJEKTU ANALIZIRAT ĆE SE ZAJEDNICE KORISTEĆI METAGENOMICA I METATRANSCRIPTOMICA. DIO OVOG SP2 PREKLAPA SE S SP1 KAKO BI SE USPOREDILA RAZNOLIKOST OTKRIVENA U OZNAČENIM SEKVENCAMA S DERIVATOM METAGENOMA. VAŽNA SASTAVNICA OVOG SP2 BIT ĆE USPOREDBA ZAJEDNICA NA TEMELJU FILOGENIJE I FUNKCIJA KOJE ONA SADRŽI. IZ SUŽIVOTA U RAZLIČITIM ZAJEDNICAMA USPOSTAVIT ĆE SE MREŽE UDRUŽENJA IZMEĐU BAKTERIJSKIH TAKSONA KAKO BI SE PONOVNO STEKLA SVOJSTVA ZAJEDNICA. TREĆI PODPROJEKT ĆE OBRATITI POZORNOST NA MODELNU SKUPINU MORSKIH BAKTERIJA, POLARIBACTER, RODA UNUTAR VELIKE SKUPINE BAKTEROIDA. OVAJ ROD JE RELATIVNO BOGAT OCEANIMA, OSOBITO U POLARNIM VODAMA. NEKI NJEGOVI ČLANOVI SADRŽE PROTEORRODOPSIN GEN, PROTEIN KOJI BAKTERIJAMA OMOGUĆUJE KORIŠTENJE SVJETLOSNE ENERGIJE. SP3 ĆE ANALIZIRATI REGULACIJU I ODNOS OVE SKUPINE BAKTERIJA PREMA SVJETLU. ČLANOVI RODA ĆE BITI IZOLIRANI U ČISTOJ KULTURI I NJIHOVI GENOMI ĆE BITI SEKVENCIRANI. POJAČANI GENOMI TAKOĐER ĆE SE DOBITI IZ POJEDINIH STANICA (SAGS). TI ĆE SE GENOMI KORISTITI ZA ISPITIVANJE MOGUĆNOSTI POLARIBACTERA I USPOREĐIVATI S BAKTEROIDNIM SEKVENCAMA IZVEDENIMA IZ METAGENOMAS-A U SP2. KONAČNO, PROVEST ĆE SE POKUSI KAKO BI SE ODREDIO GENSKI IZRAZ TIH BAKTERIJA U RAZLIČITIM UVJETIMA TAMNE SVJETLOSTI, A REZULTATI ĆE SE USPOREDITI S REZULTATIMA DOBIVENIMA IZ METATRANSCRIPTOMS-A U SP2. OBJEKT OVO SP3 JE UTJEČAJ KONTROLA METABOLISMA I UPRAVLJANJE METABOLISMA U PREDSTAVNOSTI SVJEŽE U HETEROTROFICIJI BACTERIA._x000D_ REZULTATI imaju značajan SCIENTIFIC IMPACT U REZENCIJU mikrobske oceanografije i nadamo se da će otvoriti nove putove za razumijevanje ekologije oceana. (Croatian)
18 August 2022
0 references
HAVEN UTGÖR DET STÖRSTA EKOSYSTEMET PÅ JORDEN OCH ETT AV DE MEST OKÄNDA. MARINA MIKROORGANISMERS VERKSAMHET REGLERAR BIOGEOKEMISKA CYKLER OCH HAR STOR INVERKAN PÅ KLIMATKONTROLLEN. DESSUTOM BOR NÄSTAN HÄLFTEN AV BEFOLKNINGEN NÄRA HAVET OCH MÄNSKLIGHETEN HAR DÄRFÖR EN STARK INVERKAN PÅ HAVEN OCH ÄR TVÄRTOM STARKT BEROENDE AV DERAS TJÄNSTER. AV DESSA SKÄL HAR HAVSFORSKNING BETRAKTATS SOM EN AV DE SOCIALA UTMANINGARNA I HORISONT 2020-PROGRAMMET. I DETTA PROJEKT PLANERAR VI ATT STUDERA VISSA ASPEKTER AV MÅNGFALDEN, STRUKTUREN OCH FUNKTIONSFÖRMÅGAN HOS MARINA BAKTERIESAMHÄLLEN. Vår PARTY POINT är att tillgängligheten av en Enormous Quantity of OCEAN Secutions öppnar en VENTANA OF OPPORTUNITY för att lösa frågor som inte kunde övervägas före tillkomsten av Genom och METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJEKT TRE PROJEKT MED GEMENSAMMA INTERESTS MED DIFFERENT tillvägagångssätt. DET FÖRSTA DELPROJEKTET KOMMER ATT INRIKTAS PÅ MÅNGFALDEN AV BAKTERIESAMHÄLLEN. FÖR DETTA ÄNDAMÅL KOMMER ETIKETTSEKVENSER (TAGS) AV 16S RDNA-GENEN ATT ANVÄNDAS FÖR ATT UTFORSKA BIOSFÄREN HOS SÄLLSYNTA MIKROORGANISMER: UPPSÄTTNINGEN AV ETT MYCKET STORT ANTAL ARTER MED UTOMORDENTLIGT LÅG FÖREKOMST. VI KOMMER ATT FÖRSÖKA FASTSTÄLLA DET TOTALA ANTALET BAKTERIETAXA I HAVEN OCH VI KOMMER ATT UTVECKLA EN METOD FÖR ATT ANALYSERA DE SPÄNNVIDDKURVOR SOM VI HOPPAS KOMMER ATT AVSLÖJA EKOLOGISKA EGENSKAPER HOS BAKTERIESAMHÄLLEN. DET ANDRA DELPROJEKTET KOMMER ATT ANALYSERA GEMENSKAPERNA MED HJÄLP AV METAGENOMICA OCH METATRANSCRIPTOMICA. EN DEL AV DENNA SP2 ÖVERLAPPAR MED SP1 FÖR ATT JÄMFÖRA DEN MÅNGFALD SOM AVSLÖJAS AV DE MÄRKTA SEKVENSERNA MED DERIVATAN AV METAGENOMEN. EN VIKTIG DEL AV DETTA SP2 KOMMER ATT VARA JÄMFÖRELSEN AV SAMHÄLLEN SOM BASERAS PÅ FYLOGENIN OCH DE FUNKTIONER DEN INNEHÅLLER. FRÅN SAMEXISTENSEN I OLIKA GEMENSKAPER KOMMER NÄTVERK AV ASSOCIATIONER MELLAN BAKTERIETAXA ATT UPPRÄTTAS FÖR ATT ÅTERIGEN HÄRLEDA GEMENSKAPERNAS EGENSKAPER. DET TREDJE DELPROJEKTET KOMMER ATT UPPMÄRKSAMMA EN MODELLGRUPP AV MARINA BAKTERIER, POLARIBACTER, ETT SLÄKTE INOM DEN STORA GRUPPEN BAKTERIOIDER. DETTA SLÄKTE ÄR RELATIVT RIKLIGT I HAVEN, SÄRSKILT I POLARVATTEN. NÅGRA AV DESS MEDLEMMAR INNEHÅLLER PROTEORRODOPSIN-GENEN, ETT PROTEIN SOM GÖR DET MÖJLIGT FÖR BAKTERIER ATT ANVÄNDA LJUSENERGI. SP3 KOMMER ATT ANALYSERA FÖRORDNINGEN OCH FÖRHÅLLANDET MELLAN DENNA GRUPP AV BAKTERIER OCH LJUS. MEDLEMMAR AV SLÄKTET KOMMER ATT ISOLERAS I REN KULTUR OCH DERAS GENOM KOMMER ATT ORDNAS. FÖRSTÄRKTA GENOM KOMMER OCKSÅ ATT ERHÅLLAS FRÅN ENSKILDA CELLER (SAGS). DESSA GENOM KOMMER ATT ANVÄNDAS FÖR ATT STUDERA POLARIBACTER’S KAPACITET OCH JÄMFÖRAS MED BAKTERIOIDSEKVENSER SOM HÄRRÖR FRÅN METAGENOMAS I SP2. SLUTLIGEN KOMMER EXPERIMENT ATT UTFÖRAS FÖR ATT BESTÄMMA DESSA BAKTERIERS GENISKA UTTRYCK UNDER OLIKA MÖRKA LJUSFÖRHÅLLANDEN OCH RESULTATEN KOMMER ATT JÄMFÖRAS MED RESULTATEN FRÅN METATRANSCRIPTOMS I SP2. Det OBJEKTIV AV DENNA SP3 ÄR KONTROLL AV METABOLISM OCH MANAGEMENT AV METABOLISM I PRESENCE of LIGHT I A HETEROTROFICAL BACTERIA._x000D_ RESULTS har en betydande SCIENTIFICK IMPACT i den mikrobiska oceanografiens CHANGE och vi hoppas att de öppnar nya vägar för att förstå havens ekologi. (Swedish)
18 August 2022
0 references
OCEANELE CONSTITUIE CEL MAI MARE ECOSISTEM DE PE PĂMÂNT ȘI UNUL DINTRE CELE MAI NECUNOSCUTE. ACTIVITĂȚILE MICROORGANISMELOR MARINE REGLEMENTEAZĂ CICLURILE BIOGEOCHIMICE ȘI AU O INFLUENȚĂ MAJORĂ ASUPRA CONTROLULUI CLIMEI. ÎN PLUS, APROAPE JUMĂTATE DIN POPULAȚIA UMANĂ TRĂIEȘTE ÎN APROPIEREA MĂRII ȘI, PRIN URMARE, UMANITATEA ARE UN IMPACT PUTERNIC ASUPRA OCEANELOR ȘI, DIMPOTRIVĂ, DEPINDE ÎN MARE MĂSURĂ DE SERVICIILE LOR. DIN ACESTE MOTIVE, CERCETAREA MARINĂ A FOST CONSIDERATĂ UNA DINTRE PROVOCĂRILE SOCIALE ÎN CADRUL PROGRAMULUI ORIZONT 2020. ÎN PREZENTUL PROIECT INTENȚIONĂM SĂ STUDIEM UNELE ASPECTE ALE DIVERSITĂȚII, STRUCTURII ȘI CAPACITĂȚILOR FUNCȚIONALE ALE COMUNITĂȚILOR BACTERIENE MARINE. Punctul nostru PARTY este că disponibilitatea unei Cantități Enormoase de Secutii OCEAN deschide o VENTANA DE OPPORTUNITATE pentru a rezolva întrebări care nu au putut fi luate în considerare înainte de apariția genomului și METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT PROJECT CU INTERES COMUNITATE CU abordări DIFERENTE. PRIMUL SUBPROIECT SE VA CONCENTRA ASUPRA DIVERSITĂȚII COMUNITĂȚILOR BACTERIENE. ÎN ACEST SCOP, SECVENȚELE DE ETICHETARE (TAGURI) ALE GENEI ADNR 16S VOR FI UTILIZATE PENTRU A EXPLORA BIOSFERA MICROORGANISMELOR RARE: SETUL UNUI NUMĂR FOARTE MARE DE SPECII CU ABUNDENȚE EXTREM DE SCĂZUTE. VOM ÎNCERCA SĂ DETERMINĂM NUMĂRUL TOTAL DE TAXONI BACTERIENI DIN OCEANE ȘI VOM DEZVOLTA O METODĂ DE ANALIZĂ A CURBELOR INTERVALULUI DE ABUNDENȚĂ CARE SPERĂM CĂ VOR DEZVĂLUI PROPRIETĂȚILE ECOLOGICE ALE COMUNITĂȚILOR BACTERIENE. AL DOILEA SUBPROIECT VA ANALIZA COMUNITĂȚILE FOLOSIND METAGENOMICA ȘI METATRANSCRIPTOMICA. O PARTE DIN ACEST SP2 SE SUPRAPUNE CU SP1 PENTRU A COMPARA DIVERSITATEA EVIDENȚIATĂ DE SECVENȚELE ETICHETATE CU DERIVATUL METAGENOMELOR. O COMPONENTĂ IMPORTANTĂ A ACESTUI SP2 VA FI COMPARAREA COMUNITĂȚILOR PE BAZA FILOGENIEI ȘI A FUNCȚIILOR PE CARE LE CONȚINE. DIN COEXISTENȚA ÎN DIFERITE COMUNITĂȚI, SE VOR STABILI REȚELE DE ASOCIERE ÎNTRE TAXONI BACTERIENI PENTRU A OBȚINE DIN NOU PROPRIETĂȚILE COMUNITĂȚILOR. AL TREILEA SUBPROIECT VA ACORDA ATENȚIE UNUI GRUP MODEL DE BACTERII MARINE, POLARIBACTER, UN GEN DIN GRUPUL MARE DE BACTERII MARINE. ACEST GEN ESTE RELATIV ABUNDENT ÎN OCEANE, ÎN SPECIAL ÎN APELE POLARE. UNII DINTRE MEMBRII SĂI CONȚIN GENA PROTEORRODOPSIN, O PROTEINĂ CARE PERMITE BACTERIILOR SĂ UTILIZEZE ENERGIE UȘOARĂ. SP3 VA ANALIZA REGULAMENTUL ȘI RELAȚIA DINTRE ACEST GRUP DE BACTERII ȘI LUMINĂ. MEMBRII GENULUI VOR FI IZOLAȚI ÎN CULTURA PURĂ ȘI GENOMURILE LOR VOR FI SECVENȚIATE. GENOMII AMPLIFICAȚI VOR FI, DE ASEMENEA, OBȚINUȚI DIN CELULE INDIVIDUALE (SAGURI). ACESTE GENOMURI VOR FI UTILIZATE PENTRU A STUDIA CAPACITĂȚILE POLARIBACTER ȘI VOR FI COMPARATE CU SECVENȚELE BACTERIENE DERIVATE DIN METAGENOMAS ÎN SP2. ÎN CELE DIN URMĂ, VOR FI EFECTUATE EXPERIMENTE PENTRU A DETERMINA EXPRESIA GENICĂ A ACESTOR BACTERII ÎN CONDIȚII DIFERITE DE LUMINĂ ÎNTUNECATĂ, IAR REZULTATELE VOR FI COMPARATE CU CELE OBȚINUTE DE LA METATRANSCRIPTOMS ÎN SP2. Obiectivul acestui SP3 este compresor ca CONTROL de METABOLISM ȘI MANAGEMENTUL METABOLISMULUI ÎN PRESENȚA LIGHT într-o BACTERIA HETEROTROFICALĂ._x000D_ Rezultatele au un IMPACT SCIENTIFIC semnificativ în CHANGEUL Oceanografiei microbiene și sperăm că acestea deschid noi căi pentru a înțelege ecologia oceanelor. (Romanian)
18 August 2022
0 references
OCEANI SO NAJVEČJI EKOSISTEM NA ZEMLJI IN EDEN NAJBOLJ NEZNANIH. DEJAVNOSTI MORSKIH MIKROORGANIZMOV URAVNAVAJO BIOGEOKEMIČNE CIKLE IN POMEMBNO VPLIVAJO NA NADZOR PODNEBJA. POLEG TEGA SKORAJ POLOVICA ČLOVEŠKEGA PREBIVALSTVA ŽIVI V BLIŽINI MORJA, ZATO IMA ČLOVEŠTVO MOČAN VPLIV NA OCEANE IN JE, NASPROTNO, MOČNO ODVISNO OD NJIHOVIH STORITEV. ZATO SO BILE MORSKE RAZISKAVE V PROGRAMU OBZORJE 2020 OBRAVNAVANE KOT EDEN OD SOCIALNIH IZZIVOV. V TEM PROJEKTU NAČRTUJEMO PREUČEVANJE NEKATERIH VIDIKOV RAZNOLIKOSTI, STRUKTURE IN FUNKCIONALNIH ZMOGLJIVOSTI MORSKIH BAKTERIJSKIH SKUPNOSTI. Naš PARTY POINT je, da Razpoložljivost Enormous Quantity of OCEAN Secutions odpira VENTANO OPPORTUNITY za reševanje vprašanj, ki jih ni bilo mogoče obravnavati pred prihodom genoma in METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT THREE PROJECT Z ODBOLJNIMI INTERESIJami z neposrednimi pristopi. PRVI PODPROJEKT BO OSREDOTOČEN NA RAZNOLIKOST BAKTERIJSKIH SKUPNOSTI. V TA NAMEN SE BODO ZA RAZISKOVANJE BIOSFERE REDKIH MIKROORGANIZMOV UPORABLJALE ZAPOREDJE OZNAK GENA 16S RDNA: MNOŽICA ZELO VELIKEGA ŠTEVILA VRST Z IZREDNO MAJHNIM ŠTEVILOM. POSKUŠALI BOMO DOLOČITI SKUPNO ŠTEVILO BAKTERIJSKIH TAKSONOV V OCEANIH IN RAZVITI METODO ZA ANALIZO KRIVULJ RAZPONA, ZA KATERE UPAMO, DA BODO RAZKRILE EKOLOŠKE LASTNOSTI BAKTERIJSKIH SKUPNOSTI. DRUGI PODPROJEKT BO ANALIZIRAL SKUPNOSTI Z UPORABO METAGENOMICA IN METATRANSCRIPTOMICA. DEL TEGA SP2 SE PREKRIVA S SP1, DA SE PRIMERJA RAZNOLIKOST, KI JO RAZKRIVAJO OZNAČENA ZAPOREDJA, Z DERIVATOM METAGENOMOV. POMEMBEN SESTAVNI DEL TEGA SP2 BO PRIMERJAVA SKUPNOSTI NA PODLAGI FILOGENIJE IN FUNKCIJ, KI JIH VSEBUJE. IZ SOOBSTOJA V RAZLIČNIH SKUPNOSTIH SE BODO VZPOSTAVILE MREŽE POVEZOVANJA MED BAKTERIJSKIMI TAKSONI, DA BI SE PONOVNO PRIDOBILE LASTNOSTI SKUPNOSTI. TRETJI PODPROJEKT BO POZOREN NA MODELNO SKUPINO MORSKIH BAKTERIJ, POLARIBACTER, ROD V VELIKI SKUPINI BAKTERIJ. TA ROD JE RELATIVNO BOGAT V OCEANIH, ZLASTI V POLARNIH VODAH. NEKATERI NJEGOVI ČLANI VSEBUJEJO GEN PROTEORRODOPSIN, BELJAKOVINO, KI BAKTERIJAM OMOGOČA UPORABO LAHKE ENERGIJE. SP3 BO ANALIZIRAL UREDBO IN RAZMERJE MED TO SKUPINO BAKTERIJ IN SVETLOBO. PRIPADNIKI RODU BODO IZOLIRANI V ČISTI KULTURI IN NJIHOVI GENOMI BODO RAZPOREJENI V ZAPOREDJE. OJAČANI GENOMI SE PRIDOBIVAJO TUDI IZ POSAMEZNIH CELIC (SAGS). TI GENOMI SE BODO UPORABLJALI ZA PREUČEVANJE ZMOGLJIVOSTI ZDRAVILA POLARIBACTER IN V PRIMERJAVI Z BAKTERIJSKIMI ZAPOREDJI, PRIDOBLJENIMI IZ METAGENOMAS V SP2. NAZADNJE SE BODO IZVAJALI POSKUSI ZA DOLOČITEV GENSKEGA IZRAŽANJA TEH BAKTERIJ V RAZLIČNIH POGOJIH TEMNE SVETLOBE, REZULTATI PA SE BODO PRIMERJALI S TISTIMI, PRIDOBLJENIMI IZ METATRANSCRIPTOMS V SP2. OBJEKTIVA TEGA SP3 je komplementar glede na to, da se METABOLISM IN MANAGEMENT METABOLIZEMA V PRESENCI LIGHT V HETEROTROFICALNI BACTERIJIJI._x000D_ RESULTI imajo pomemben SCIENTIFIČNI IMPAKTI V SVETU mikrobne Oceanografije in upamo, da bodo odprli nove poti za razumevanje ekologije oceanov. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
OCEANY STANOWIĄ NAJWIĘKSZY EKOSYSTEM NA ZIEMI I JEDEN Z NAJBARDZIEJ NIEZNANYCH. DZIAŁALNOŚĆ MIKROORGANIZMÓW MORSKICH REGULUJE CYKLE BIOGEOCHEMICZNE I MA ISTOTNY WPŁYW NA KONTROLĘ KLIMATU. PONADTO PRAWIE POŁOWA LUDNOŚCI MIESZKA W POBLIŻU MORZA, A ZATEM LUDZKOŚĆ MA SILNY WPŁYW NA OCEANY, A WRĘCZ PRZECIWNIE, ZALEŻY W DUŻYM STOPNIU OD ICH USŁUG. Z TYCH POWODÓW BADANIA MORSKIE UZNANO ZA JEDNO Z WYZWAŃ SPOŁECZNYCH W PROGRAMIE „HORYZONT 2020”. W OBECNYM PROJEKCIE PLANUJEMY ZBADAĆ NIEKTÓRE ASPEKTY RÓŻNORODNOŚCI, STRUKTURY I MOŻLIWOŚCI FUNKCJONALNYCH MORSKICH WSPÓLNOT BAKTERYJNYCH. Nasz PARTY POINT polega na tym, że dostępność Enormous Ilość OCEAN secutions otwiera WENTANA OF OPPORTUNITY, aby rozwiązać pytania, które nie mogły być brane pod uwagę przed pojawieniem się Genomu i METAGENOMIC._x000D_ COORDINA PROJECT THREE PROJECT Z WSPÓLNOTYCH INTERESTÓW Z podejściem DIFFERENT. PIERWSZY PODPROJEKT SKUPI SIĘ NA RÓŻNORODNOŚCI SPOŁECZNOŚCI BAKTERYJNYCH. W TYM CELU DO BADANIA BIOSFERY RZADKICH MIKROORGANIZMÓW WYKORZYSTANE ZOSTANĄ SEKWENCJE ETYKIET (TAGS) GENU RDNA 16S: ZESTAW BARDZO DUŻEJ LICZBY GATUNKÓW O WYJĄTKOWO NISKIEJ LICZEBNOŚCI. POSTARAMY SIĘ OKREŚLIĆ CAŁKOWITĄ LICZBĘ TAKSONÓW BAKTERYJNYCH W OCEANACH I OPRACUJEMY METODĘ ANALIZY KRZYWYCH LICZEBNOŚCI ZASIĘGU, KTÓRE MAMY NADZIEJĘ UJAWNIĄ EKOLOGICZNE WŁAŚCIWOŚCI WSPÓLNOT BAKTERYJNYCH. DRUGI PODPROJEKT BĘDZIE ANALIZOWAĆ WSPÓLNOTY Z WYKORZYSTANIEM METAGENOMICA I METATRANSCRIPTOMICA. CZĘŚĆ TEGO SP2 POKRYWA SIĘ Z SP1, ABY PORÓWNAĆ RÓŻNORODNOŚĆ OBJAWIONĄ PRZEZ OZNACZONE SEKWENCJE Z POCHODNĄ METAGENOMÓW. WAŻNYM SKŁADNIKIEM TEGO SP2 BĘDZIE PORÓWNANIE WSPÓLNOT NA PODSTAWIE FILOGOGENII I FUNKCJI W NIEJ ZAWARTYCH. ZE WSPÓŁISTNIENIA W RÓŻNYCH WSPÓLNOTACH UTWORZONE ZOSTANĄ SIECI STOWARZYSZENIA TAKSONÓW BAKTERYJNYCH W CELU UZYSKANIA WŁASNOŚCI WSPÓLNOT. TRZECI PODPROJEKT ZWRÓCI UWAGĘ NA MODELOWĄ GRUPĘ BAKTERII MORSKICH, POLARIBACTER, RODZAJ W DUŻEJ GRUPIE BAKTERII. RODZAJ TEN JEST STOSUNKOWO BOGATY W OCEANACH, SZCZEGÓLNIE W WODACH POLARNYCH. NIEKTÓRE Z JEGO CZŁONKÓW ZAWIERAJĄ GEN PROTEORRODOPSIN, BIAŁKO, KTÓRE POZWALA BAKTERIOM NA WYKORZYSTANIE ENERGII ŚWIETLNEJ. SP3 PRZEANALIZUJE ROZPORZĄDZENIE I ZWIĄZEK TEJ GRUPY BAKTERII ZE ŚWIATŁEM. CZŁONKOWIE RODZAJU BĘDĄ ODIZOLOWANI W CZYSTEJ KULTURZE, A ICH GENOMY BĘDĄ SEKWENCJONOWANE. AMPLIFIKOWANE GENOMY BĘDĄ RÓWNIEŻ UZYSKIWANE Z POSZCZEGÓLNYCH KOMÓREK (SAGÓW). GENOMY TE BĘDĄ WYKORZYSTYWANE DO BADANIA MOŻLIWOŚCI POLARIBACTER I PORÓWNAĆ JE Z SEKWENCJAMI BAKTERIOROIDOWYMI POCHODZĄCYMI Z METAGENOMAS W SP2. PONADTO PRZEPROWADZONE ZOSTANĄ EKSPERYMENTY W CELU OKREŚLENIA EKSPRESJI GENETYCZNEJ TYCH BAKTERII W RÓŻNYCH WARUNKACH CIEMNEGO ŚWIATŁA, A WYNIKI ZOSTANĄ PORÓWNANE Z WYNIKAMI UZYSKANYMI Z METATRANSCRIPTOMS W SP2. OBJECTIVE OF TEGO SP3 jest COMPRENDER AS THE CONTROLOLISM AND THE MANAGEMENT OF METABOLISM IN PRESENCE OF LIGHT IN A HETEROTROFICALAL BACTERIA._x000D_ Rezultaty mają znaczący IMPACT SCIENTIFIC W CHANGE microbian Oceanografia i mamy nadzieję, że otwierają nowe ścieżki do zrozumienia ekologii oceanów. (Polish)
18 August 2022
0 references
San Cristóbal de La Laguna
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
CTM2013-48292-C3-3-R
0 references