ELUCIDATION OF THE STRUCTURE OF THE RECOMBINANT PRPSC PRIONS (Q3165564)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3165564 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | ELUCIDATION OF THE STRUCTURE OF THE RECOMBINANT PRPSC PRIONS |
Project Q3165564 in Spain |
Statements
65,884.5 Euro
0 references
121,000.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2018
0 references
31 December 2020
0 references
UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE COMPOSTELA
0 references
15872
0 references
LOS PRIONES SON PROTEINAS INFECCIOSAS. SON VERSIONES MAL-PLEGADA DE PRTEINAS ISOSECUENCIALES CON PLEGAMIENTO NORMAL QUE SE PROPAGAN FORZANDO SU CONFORMACION EN SU PRECURSOR. LA PRPSC (PROTEINA PRIONICA, ISOFORMA SCRAPIE), EL PRIMER PRION QUE SE DESCUBRIO, ES EL AGENTE CAUSAL DE ENFERMEDADES NEURODEGENERATIVAS MORTALES QUE AFECTAN A LOS SERES HUMANOS, COMO LA ENFERMEDAD DE CREUTZFELDT-JAKOB, Y A LOS ANIMALES, COMO LA ENCEFALOPATIA ESPONGIFORME BOVINA (EEB), O ¿ENFERMEDAD DE LAS VACAS LOCAS¿. INVESTIGACIONES LLEVADAS A CABO POR NUESTRO GRUPO Y OTROS HAN DEMOSTRADO QUE LA ARQUITECTURA DE LA PRPSC CONSISTE EN UN SOLENOIDE- DE 4 PISOS, QUE SE APILA PARA FORMAR PROTOFILAMENTOS AMILOIDES. EL CONOCIMIENTO DE ESTAS CARACTERISTICAS ESTRUCTURALES, HA PERMITIDO COMPRENDER COMO SE PROPAGA LA PRPSC: LAS LAMINAS- DESAPAREADAS DE LOS PISOS SUPERIOR E INFERIOR DEL PROTOFILAMENTO ACTUAN DE MOLDE PARA CUALQUIER MOLECULA DE PRP DESPLEGADA QUE SE ACERQUE, FORZANDOLA A FORMAR LAMINAS- SIMILARES, Y POSTERIORMENTE ENROLLARSE PARA FORMAR PISOS ADICIONALES A MEDIDA QUE APARECEN NUEVAS SUPERFICIES DE LAMINAS- DESAPAREADAS. SIN EMBARGO, HAY MUCHOS ASPECTOS DE LA BIOLOGIA DE LA PRPSC QUE NO PUEDEN EXPLICARSE CON EL GRADO DE CONOCIMIENTO ESTRUCTURAL ACTUAL. EN PARTICULAR, LA EXISTENCIA DE BARRERAS DE TRANSMISION ENTRE ESPECIES, O LA EXISTENCIA DE ¿CEPAS¿ DE PRPSC QUE TENIENDO LA MISMA SECUENCIA, EXHIBEN PROPIEDADES BIOQUIMICAS Y BIOLOGICAS DIFERENTES. EN ESTE CONTEXTO, NUESTRA PROPUESTA BUSCA LA OBTENCION DE MAS INFORMACION SOBRE LA ESTRUCTURA DE LA PRPSC , PARA PODER ASI REFINAR NUESTRO MODELO ESTRUCTURAL ACTUAL. ES LA CONTINUACION DE NUESTRO PROYECTO DEL PLAN NACIONAL BFU2013-48436-C2-1-P. A TRAVES DE ESE PROYECTO, ABRIMOS EL CAMINO PARA USAR PRPSC RECOMBINANTE (RECPRPSC) COMO UN ANALOGO ADECUADO DE LA PRPSC DE CEREBRO EN ESTUDIOS ESTRUCTURALES. PARA ELLO COLABORAMOS CON JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO) EN EL DESARROLLO DE METODOS PARA PRODUCIR CANTIDADES SIGNIFICATIVAS DE RECPRPSC INFECCIOSA. POSTERIORMENTE, DETERMINAMOS QUE LA RECPRPSC Y LA PRPSC DE CEREBRO COMPARTEN UNA MISMA ARQUITECTURA BASICA Y DESARROLLAMOS METODOS DE RMN EN SOLUCION PARA ESTUDIAR LA RECPRPSC. _x000D_ PROVISTOS DE TODO ESTO, NOS PROPONEMOS: 1) DILUCIDAR SI EL APILAMIENTO DE LAS UNIDADES DE RECPRPSC A LO LARGO DEL PROTOFILAMENTO DE RECPRPSC ES ¿CABEZA-CABEZA¿ O ¿CABEZA-COLA¿; 2: EXPANDIR LA INFORMACION OBTENIDA HASTA LA FECHA MEDIANTE PROTEOLISIS LIMITADA, ACOPLANDO LA TECNICA A UN DESPLEGAMIENTO PARCIAL DE LA RECPRPSC. ESPECIFICAMENTE, BUSCAMOS CONFIRMAR LA IDENTIDAD DE LAS LAMINAS- Y LAZOS QUE HEMOS IDENTIFICADO TENTATIVAMENTE, E IDENTIFICAR MAS, PARTICULARMENTE EN LOS 2 PISOS C-TERMINALES; 3: EXPANDIR LA METODOLOGIA DE RMN EN SOLUCION DESARROLLADA EN BFU2013-48436-C2-1-P UTILIZANDO APROXIMACIONES EXPERIMENTALES DIFERENTES PARA DESPLEGAR PARCIALMENTE LA RECPRPSC, Y ASI PODER CONFIRMAR Y AMPLIAR LOS DATOS OBTENIDOS; 4: INICIAR ESTUDIOS DE RMM DE ESTADO SOLIDO DE LA RECPRPSC; NOS PROPONEMOS EMPEZAR CON EXPERIMENTOS SIMPLES 1D PARA CALCULAR CUANTOS AMINOACIDOS DE CADA TIPO ESTAN LOCALIZADOS EN LAMINAS- Y CUANTOS EN LAZOS; 5: INTEGRAR TODOS LOS DATOS OBTENIDOS EN UN MODELO ESTRUCTURAL CADA VEZ MAS REFINADO DE LA RECPRPSC, QUE INCLUIRA UN ALINEAMIENTO CON ESQUELETOS -SOLENOIDEOS CONOCIDOS. TODO ESTO DEBERIA CONDUCIR A UN MODELO ATOMISTICO DE LA PRPSC QUE ESPERAMOS SE CONVIERTA EN UNA REFERENCIA PARA EL CAMPO. (Spanish)
0 references
PRIONS ARE INFECTIOUS PROTEINS. THEY ARE MISFOLDED VERSIONS OF NORMALLY FOLDED ISOSEQUENTIAL PROTEINS. PRIONS PROPAGATE BY FORCING THEIR CONFORMATION INTO THEIR NORMALLY FOLDED PRECURSORS. PRPSC (PRION PROTEIN, SCRAPIE ISOFORM), THE FIRST PRION TO BE DISCOVERED, IS THE CAUSAL AGENT OF DEADLY NEURODEGENERATIVE DISEASES AFFECTING HUMANS, LIKE CREUTZFELDT-JAKOB DISEASE, AND ANIMALS, LIKE BOVINE SPONGIFORM ENCEPHALOPATHY (BSE), ALSO KNOWN AS ¿MAD COW DISEASE¿. RESEARCH FROM OUR AND OTHER GROUPS HAS SHOWN THAT THE ARCHITECTURE OF PRPSC CONFORMS TO A 4-RUNG -SOLENOID, THAT STACKS TO FORM AMYLOID PROTOFILAMENTS. KNOWLEDGE OF THESE STRUCTURAL CHARACTERISTICS, STILL OF A LOW RESOLUTION, ALLOW, NEVERTHELESS, AN UNDERSTANDING OF HOW PRPSC PROPAGATES: THE UNPAIRED -STRANDS IN THE UPPER- AND LOWERMOST RUNGS OF THE PROTOFILAMENT CAN TEMPLATE AN INCOMING UNFOLDED PRP MOLECULE TO FORM SIMILAR -STRANDS, AND THEN COIL TO FORM ADDITIONAL RUNGS AS FRESH UNPAIRED -STRANDS ARE FORMED. HOWEVER, THERE ARE MANY KEY ASPECTS OF PRPSC BIOLOGY THAT MUST BE OBVIOUSLY ENCIPHERED IN ITS STRUCTURE AND THEREFORE CANNOT BE EXPLAINED WITH THE CURRENT LEVEL OF STRUCTURAL RESOLUTION. IN PARTICULAR, THE EXISTENCE OF TRANSMISSION BARRIERS BETWEEN SPECIES OR PRPSC STRAINS, WHICH HAVING THE SAME SEQUENCE, EXHIBIT DIFFERENT BIOCHEMICAL AND BIOLOGICAL PROPERTIES. FURTHERMORE, A MORE DETAILED ELUCIDATION OF THE STRUCTURE OF PRPSC WILL HELP RATIONALLY DESIGN DRUGS FOR THESE CURRENTLY FATAL DISEASES._x000D_ IN THIS CONTEXT, OUR PROPOSAL AIMS AT OBTAINING FURTHER STRUCTURAL INFORMATION ON THE STRUCTURE OF PRPSC PRIONS, SO AS TO REFINE THE CURRENT STRUCTURAL MODEL. IT IS A CONTINUATION OF OUR CURRENT NATIONAL GRANT, BFU2013-48436-C2-1-P. THROUGH THIS PROJECT, WE PAVED THE WAY TO USE RECOMBINANT PRPSC (RECPRPSC) AS AN APPROPRIATE SURROGATE OF BRAIN-DERIVED PRPSC FOR STRUCTURAL STUDIES. FOR THIS, WE COLLABORATED WITH JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO) TO DEVELOP METHODS TO PRODUCE SIGNIFICANT AMOUNTS OF FULLY INFECTIOUS RECPRPSC. THEN, USING LIMITED PROTEOLYSIS AND ELECTRON MICROSCOPY STUDIES, WE OBTAINED STRONG EVIDENCE INDICATING THAT BRAIN AND RECPRPSC SHARE A COMMON BASIC ARCHITECTURE. FINALLY, WE DEVELOPED SOLUTION NMR METHODS TO STUDY RECPRPSC. _x000D_ ARMED WITH ALL THIS, WE PROPOSE NOW: 1) TO ELUCIDATE WHETHER THE STACKING OF RECPRPSC SUBUNIT ALONG THE RECPRPSC PROTOFILAMENT IS HEAD-TO-HEAD OR HEAD-TO-TAIL; 2: TO EXPAND THE LIMITED PROTEOLYSIS DATA OBTAINED THUS FAR, COUPLING IT TO PARTIAL UNFOLDING. WE SPECIFICALLY SEEK TO CONFIRM THE IDENTITY OF -STRANDS AND LOOPS THAT WE HAVE ALREADY TENTATIVELY IDENTIFIED, AND TO IDENTIFY ADDITIONAL -STRANDS AND LOOPS IN THE 2 C-TERMINAL RUNGS; 3: TO EXPAND THE SOLUTION NMR METHODOLOGY DEVELOPED THROUGH BFU2013-48436-C2-1-P USING ALTERNATIVE APPROACHES TO RECPRPSC PARTIAL UNFOLDING, SO AS TO CONFIRM AND EXTEND THE DATA THAT WE HAVE OBTAINED THUS FAR; 4: TO INITIATE SOLID STATE NMR APPROACHES TO STUDY RECPRPSC DIRECTLY. IN PARTICULAR, WE PROPOSE TO BEGIN WITH A SIMPLE 1D SOLID NMR APPROACH TO ASSESS HOW MANY AMINO ACIDS OF EACH TYPE ARE LOCATED IN -STRANDS VS. COILS; 5: TO INTEGRATE ALL STRUCTURAL RESTRAINTS OBTAINED THROUGH THE PRECEDING AIMS INTO AN EVER MORE REFINED STRUCTURAL MODEL OF RECPRPSC, INCLUDING THREADING AND MODELING USING KNOWN -SOLENOID SCAFFOLDS.ALL THIS SHOULD LEAD TO AN IMPROVED, ATOMISTIC MODEL OF PRPSC WHICH SHOULD BECOME A REFERENCE IN THE FIELD. (English)
0.0723259782246842
0 references
LES PRIONS SONT DES PROTÉINES INFECTIEUSES. CE SONT DES VERSIONS MAL DÉPLOYÉES DE PRTEINS ISOSEQUENCIAUX AVEC UN PLIAGE NORMAL QUI SE PROPAGE EN FORÇANT LEUR FORMATION DANS LEUR PRÉCURSEUR. PRPSC (PROTÉINES PRIONICA, TREMBLANTE ISOFORMA), LE PREMIER PRION À ÊTRE DÉCOUVERT, EST-IL L’AGENT CAUSAL DE MALADIES NEURODÉGÉNÉRATIVES MORTELLES AFFECTANT L’HOMME, COMME LA MALADIE DE CREUTZFELDT-JAKOB, ET LES ANIMAUX, COMME L’ENCÉPHALOPATHIE SPONGIFORME BOVINE (ESB) OU LA MALADIE DE LA VACHE FOLLE? DES RECHERCHES MENÉES PAR NOTRE GROUPE ET D’AUTRES ONT MONTRÉ QUE L’ARCHITECTURE DE LA PRPSC SE COMPOSE D’UN SOLÉNOÏDE DE 4 ÉTAGES, QUI EST EMPILÉ POUR FORMER DES PROTOFILAMENTS AMYLOÏDES. LA CONNAISSANCE DE CES CARACTÉRISTIQUES STRUCTURELLES NOUS A PERMIS DE COMPRENDRE COMMENT PRPSC SE PROPAGE: LES STRATIFIÉS NON APPARIÉS DES ÉTAGES SUPÉRIEURS ET INFÉRIEURS DE L’ACTE DE PROTOFILAMENT DE MOULE POUR TOUT PRP MOLECULATE DÉPLOYÉ QUI APPROCHE, LE FORÇANT À FORMER DES LAMINAS, PUIS ENROULÉS POUR FORMER DES PLANCHERS SUPPLÉMENTAIRES À MESURE QUE DE NOUVELLES SURFACES NON APPARIÉS DE LAMINAS- APPARAISSENT. CEPENDANT, IL EXISTE DE NOMBREUX ASPECTS DE LA BIOLOGIE DE LA PRPSC QUI NE PEUVENT ÊTRE EXPLIQUÉS AVEC LE DEGRÉ ACTUEL DE CONNAISSANCES STRUCTURELLES. EN PARTICULIER, L’EXISTENCE DE BARRIÈRES DE TRANSMISSION ENTRE LES ESPÈCES, OU L’EXISTENCE DE SOUCHES DE PRPSC AYANT LA MÊME SÉQUENCE, PRÉSENTENT DES PROPRIÉTÉS BIOCHIMIQUES ET BIOLOGIQUES DIFFÉRENTES. DANS CE CONTEXTE, NOTRE PROPOSITION VISE À OBTENIR PLUS D’INFORMATIONS SUR LA STRUCTURE DE LA PRPSC, AFIN D’AFFINER NOTRE MODÈLE STRUCTUREL ACTUEL. C’EST LA POURSUITE DE NOTRE PROJET DU PLAN NATIONAL BFU2013-48436-C2-1-P. À TRAVERS CE PROJET, NOUS OUVRONS LA VOIE À L’UTILISATION DE PRPSC RECOMBINANT (RECPRPSC) COMME UN ANALOGUE APPROPRIÉ DE LA PRPSC CÉRÉBRALE DANS LES ÉTUDES STRUCTURELLES. À CETTE FIN, NOUS AVONS COLLABORÉ AVEC JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO) À LA MISE AU POINT DE MÉTHODES POUR PRODUIRE DES QUANTITÉS SIGNIFICATIVES DE RECPRPSC INFECTIEUX. PAR LA SUITE, NOUS AVONS DÉTERMINÉ QUE RECPRPSC ET LE CERVEAU PRPSC PARTAGENT LA MÊME ARCHITECTURE DE BASE ET DÉVELOPPÉ DES MÉTHODES D’IRM EN SOLUTION POUR ÉTUDIER RECPRPSC. _x000D_ fourni de TOUS CE CE, NOUS PROPONEZ-NOUS: 1) DÉTERMINER SI L’EMPILEMENT DES UNITÉS RECPRPSC LE LONG DU PROTOFILAMENT DE RECPRPSC EST LA TÊTE-TÊTE OU LA QUEUE; 2: ÉLARGIR L’INFORMATION OBTENUE À CE JOUR GRÂCE À UNE PROTÉOLYSE LIMITÉE, COUPLÉ LA TECHNIQUE À UN DÉPLOIEMENT PARTIEL DE RECPRPSC. PLUS PRÉCISÉMENT, NOUS CHERCHONS À CONFIRMER L’IDENTITÉ DES LAMINAS- ET LES LIENS QUE NOUS AVONS PROVISOIREMENT IDENTIFIÉS, ET À IDENTIFIER DAVANTAGE, EN PARTICULIER SUR LES 2 ÉTAGES C-TERMINAL; 3: DÉVELOPPER LA MÉTHODOLOGIE DE RMN EN SOLUTION DÉVELOPPÉE DANS LE BFU2013-48436-C2-1-P EN UTILISANT DIFFÉRENTES APPROCHES EXPÉRIMENTALES POUR DÉPLOYER PARTIELLEMENT RECPRPSC, CONFIRMANT ET ÉLARGISSANT AINSI LES DONNÉES OBTENUES; 4: ENTREPRENDRE DES ÉTUDES RECPRPRPSC SUR LE RMR SOLIDE À L’ÉTAT SOLIDE; NOUS AVONS L’INTENTION DE COMMENCER PAR DES EXPÉRIENCES 1D SIMPLES POUR CALCULER COMBIEN D’ACIDES AMINÉS DE CHAQUE TYPE SONT SITUÉS DANS LAMINAS- ET COMBIEN DANS LES LIENS; 5: INTÉGRER TOUTES LES DONNÉES OBTENUES DANS UN MODÈLE STRUCTUREL DE PLUS EN PLUS RAFFINÉ DE RECPRPSC, QUI INCLURA L’ALIGNEMENT AVEC LES SQUELETTES CONNUS — SOLENOIDES. TOUT CELA DEVRAIT CONDUIRE À UN MODÈLE ATOMISTE DE LA PRPSC QUI, NOUS L’ESPÉRONS, DEVIENDRA UNE RÉFÉRENCE POUR LE DOMAINE. (French)
4 December 2021
0 references
PRIONEN SIND INFEKTIÖSE PROTEINE. SIE SIND SCHLECHT EINGESETZTE VERSIONEN VON ISOSEQUENCIAL PRTEINS MIT NORMALER FALTUNG, DIE SICH AUSBREITEN, INDEM SIE IHRE BILDUNG IN IHREN VORLÄUFER ZWINGEN. PRPSC (PROTEIN PRIONICA, ISOFORMA SCRAPIE), DAS ERSTE ZU ENTDECKENDE PRION, IST DER URSÄCHLICHE ERREGER TÖDLICHER NEURODEGENERATIVER ERKRANKUNGEN, DIE DEN MENSCHEN BETREFFEN, WIE DER CREUTZFELDT-JAKOB-KRANKHEIT UND VON TIEREN, WIE Z. B. BOVINE SPONGIFORME ENZEPHALOPATHIE (BSE) ODER VERRÜCKTE KUHKRANKHEIT? FORSCHUNGEN UNSERER GRUPPE UND ANDERER HABEN GEZEIGT, DASS DIE ARCHITEKTUR DES PRPSC AUS EINEM 4-STÖCKIGEN SOLENOID BESTEHT, DAS ZU AMYLOIDPROTOFILAMENTEN GESTAPELT WIRD. DIE KENNTNIS DIESER STRUKTURELLEN MERKMALE HAT UNS ERLAUBT ZU VERSTEHEN, WIE SICH PRPSC VERBREITET: DIE UNVERPAARTEN LAMINATE DER OBEREN UND UNTEREN ETAGE DES PROTOFILAMENT-SCHIMMELGESETZES FÜR JEDES EINGESETZTE PRP MOLECULATE, DAS SICH NÄHERT, ZWINGT ES, LAMINASARTIG ZU BILDEN, UND ANSCHLIESSEND ZU ZUSÄTZLICHEN BÖDEN GEWICKELT, WIE NEUE UNVERPAARTE LAMINAS- OBERFLÄCHEN ERSCHEINEN. ES GIBT JEDOCH VIELE ASPEKTE DER PRPSC-BIOLOGIE, DIE MIT DEM DERZEITIGEN GRAD AN STRUKTURELLEM WISSEN NICHT ERKLÄRT WERDEN KÖNNEN. INSBESONDERE DAS VORHANDENSEIN VON ÜBERTRAGUNGSBARRIEREN ZWISCHEN ARTEN ODER DAS VORHANDENSEIN VON PRPSC-STÄMMEN, DIE DIE GLEICHE ABFOLGE HABEN, WEISEN UNTERSCHIEDLICHE BIOCHEMISCHE UND BIOLOGISCHE EIGENSCHAFTEN AUF. IN DIESEM ZUSAMMENHANG ZIELT UNSER VORSCHLAG DARAUF AB, MEHR INFORMATIONEN ÜBER DIE STRUKTUR DES PRPSC ZU ERHALTEN, UM UNSER DERZEITIGES STRUKTURMODELL ZU VERFEINERN. ES IST DIE FORTSETZUNG UNSERES PROJEKTS DES NATIONALEN PLANS BFU2013-48436-C2-1-P. DURCH DIESES PROJEKT, ÖFFNEN WIR DEN WEG, REKOMBINANT PRPSC (RECPRPSC) ALS GEEIGNETE ANALOGIE DES GEHIRNS PRPSC IN STRUKTURSTUDIEN ZU VERWENDEN. ZU DIESEM ZWECK HABEN WIR MIT JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO) BEI DER ENTWICKLUNG VON METHODEN ZUR HERSTELLUNG SIGNIFIKANTER MENGEN AN INFEKTIÖSEM RECPRPSC ZUSAMMENGEARBEITET. ANSCHLIESSEND HABEN WIR FESTGESTELLT, DASS RECPRPSC UND GEHIRN PRPSC DIE GLEICHE GRUNDARCHITEKTUR HABEN UND MRT-METHODEN IN DER LÖSUNG ZUR STUDIE VON RECPRPSC ENTWICKELT HABEN. _x000D_ zur Verfügung gestellt von ALLES, WIR PROPONE US: 1) UM FESTZUSTELLEN, OB DAS STAPELN VON RECPRPSC-EINHEITEN ENTLANG DES PROTOFILAMENTS VON RECPRPSC KOPF ODER KOPFSCHWANZ IST; 2: ERWEITERN SIE DIE BISHER ERHALTENEN INFORMATIONEN DURCH BEGRENZTE PROTEOLYSE, GEKOPPELT DIE TECHNIK ZU EINEM TEILWEISEN EINSATZ VON RECPRPSC. INSBESONDERE VERSUCHEN WIR, DIE IDENTITÄT DER LAMINAS- UND BINDUNGEN, DIE WIR VORLÄUFIG IDENTIFIZIERT HABEN, ZU BESTÄTIGEN UND INSBESONDERE AUF DEN 2 C-TERMINALBÖDEN MEHR ZU IDENTIFIZIEREN; 3: DIE NMR-METHODIK IN DER IN BFU2013-48436-C2-1-P ENTWICKELTEN LÖSUNG UNTER VERWENDUNG VERSCHIEDENER EXPERIMENTELLER ANSÄTZE ZUR TEILWEISEN BEREITSTELLUNG VON RECPRPSC ZU ERWEITERN UND SO DIE GEWONNENEN DATEN ZU BESTÄTIGEN UND ZU ERWEITERN; 4: INITIIEREN SIE RECPRPSC-MASSIV-STATE-MMR-STUDIEN; WIR BEABSICHTIGEN, MIT EINFACHEN 1D-EXPERIMENTEN ZU BEGINNEN, UM ZU BERECHNEN, WIE VIELE AMINOSÄUREN JEDES TYPS IN LAMINAS- UND WIE VIELE VERBINDUNGEN LIEGEN; 5: INTEGRIEREN SIE ALLE GEWONNENEN DATEN IN EIN ZUNEHMEND VERFEINERTES STRUKTURELLES MODELL VON RECPRPSC, DAS DIE AUSRICHTUNG AUF BEKANNTE SKELETTS – SOLENOIDES – EINSCHLIESST. ALL DIES SOLLTE ZU EINEM ATOMISTISCHEN MODELL DES PRPSC FÜHREN, DAS WIR HOFFEN, EINE REFERENZ FÜR DAS FELD ZU WERDEN. (German)
9 December 2021
0 references
PRIONEN ZIJN INFECTIEUZE EIWITTEN. ZIJ ZIJN SLECHT INGEZETTE VERSIES VAN ISOSEQUENCIAL PRTEINS MET NORMALE VOUWEN DIE ZICH VERSPREIDEN DOOR HUN VORMING IN HUN VOORLOPER TE DWINGEN. PRPSC (EIWIT PRIONICA, ISOFORMA SCRAPIE), DE EERSTE TE ONTDEKKEN PRION, IS HET OORZAKELIJKE AGENS VAN DODELIJKE NEURODEGENERATIEVE ZIEKTEN BIJ MENSEN, ZOALS DE ZIEKTE VAN CREUTZFELDT-JAKOB, EN DIEREN, ZOALS BOVIENE SPONGIFORME ENCEFALOPATHIE (BSE), OF GEKKEKOEIENZIEKTE? ONDERZOEK UITGEVOERD DOOR ONZE GROEP EN ANDEREN HEBBEN AANGETOOND DAT DE ARCHITECTUUR VAN DE PRPSC BESTAAT UIT EEN 4-VERDIEPINGEN SOLENOIDE, DIE IS GESTAPELD OM AMYLOÏDE PROTOFILAMENTEN TE VORMEN. DE KENNIS VAN DEZE STRUCTURELE KENMERKEN HEEFT ONS IN STAAT GESTELD OM TE BEGRIJPEN HOE PRPSC ZICH VOORTPLANT: DE ONGEPAARDE LAMINATEN VAN DE BOVENSTE EN ONDERSTE VERDIEPINGEN VAN DE PROTOFILAMENT ACT OF MOLD VOOR ELKE INZET PRP MOLECULATE DIE NADERT, DWINGT HET OM LAMINA’S-ACHTIGE TE VORMEN, EN VERVOLGENS OPGEROLD OM EXTRA VLOEREN TE VORMEN ALS NIEUWE ONGEPAARDE LAMINAS-OPPERVLAKKEN VERSCHIJNEN. ER ZIJN ECHTER VEEL ASPECTEN VAN PRPSC BIOLOGIE DIE NIET KUNNEN WORDEN VERKLAARD MET DE HUIDIGE MATE VAN STRUCTURELE KENNIS. MET NAME HET BESTAAN VAN TRANSMISSIEBARRIÈRES TUSSEN SOORTEN OF HET BESTAAN VAN PRPSC-STAMMEN MET DEZELFDE SEQUENTIE VERTONEN VERSCHILLENDE BIOCHEMISCHE EN BIOLOGISCHE EIGENSCHAPPEN. IN DIT VERBAND BEOOGT ONS VOORSTEL MEER INFORMATIE TE VERKRIJGEN OVER DE STRUCTUUR VAN DE PRPSC, TENEINDE ONS HUIDIGE STRUCTUURMODEL TE VERFIJNEN. HET IS DE VOORTZETTING VAN ONS PROJECT VAN HET NATIONALE PLAN BFU2013-48436-C2-1-P. DOOR DAT PROJECT, OPENEN WE DE WEG OM RECOMBINANT PRPSC (RECPRPSC) TE GEBRUIKEN ALS EEN GESCHIKTE ANALOGE VAN HERSENEN PRPSC IN STRUCTURELE STUDIES. DAARTOE WERKTEN WE SAMEN MET JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO) AAN DE ONTWIKKELING VAN METHODEN OM AANZIENLIJKE HOEVEELHEDEN INFECTIEUZE RECPRPSC TE PRODUCEREN. VERVOLGENS STELDEN WE VAST DAT RECPRPSC EN BRAIN PRPSC DEZELFDE BASISARCHITECTUUR DELEN EN MRI-METHODEN ONTWIKKELDEN IN OPLOSSING OM RECPRPSC TE BESTUDEREN. _x000D_ verstrekt VAN ALLE DIT, wij PROPONE US: 1) OM TE BEPALEN OF HET STAPELEN VAN RECPRPSC-EENHEDEN LANGS DE PROTOFILAMENT VAN RECPRPSC HOOFD- OF KOPSTAART IS; 2: BREID DE TOT NU TOE VERKREGEN INFORMATIE UIT DOOR MIDDEL VAN BEPERKTE PROTEOLYSE, GEKOPPELD AAN EEN GEDEELTELIJKE INZET VAN RECPRPSC. MET NAME PROBEREN WE DE IDENTITEIT VAN DE LAMINAS- EN BANDEN DIE WE VOORLOPIG HEBBEN GEÏDENTIFICEERD TE BEVESTIGEN EN MEER TE IDENTIFICEREN, MET NAME OP DE 2 C-EINDVLOEREN; 3: DE IN BFU2013-48436-C2-1-P ONTWIKKELDE NMR-METHODOLOGIE IN OPLOSSING UITBREIDEN MET BEHULP VAN VERSCHILLENDE EXPERIMENTELE BENADERINGEN OM RECPRPSC GEDEELTELIJK TE IMPLEMENTEREN, WAARDOOR DE VERKREGEN GEGEVENS WORDEN BEVESTIGD EN UITGEBREID; 4: BEGINNEN MET RECPRPSC SOLID-STATE MMR-ONDERZOEKEN; WE ZIJN VAN PLAN OM TE BEGINNEN MET EENVOUDIGE 1D-EXPERIMENTEN OM TE BEREKENEN HOEVEEL AMINOZUREN VAN ELK TYPE ZICH IN LAMINAS BEVINDEN- EN HOEVEEL ER IN VERBAND STAAN; 5: INTEGREER ALLE VERKREGEN GEGEVENS IN EEN STEEDS VERFIJNDER STRUCTUREEL MODEL VAN RECPRPSC, WAARONDER UITLIJNING MET BEKENDE SKELETTEN — SOLENOIDES. DIT ALLES ZOU MOETEN LEIDEN TOT EEN ATOOMMODEL VAN DE PRPSC WAARVAN WE HOPEN DAT HET EEN REFERENTIE VOOR HET VELD ZAL WORDEN. (Dutch)
17 December 2021
0 references
I PRIONI SONO PROTEINE INFETTIVE. SONO VERSIONI SCARSAMENTE DISTRIBUITE DI PRTEINS ISOSEQUENCIAL CON NORMALE PIEGATURA CHE SI PROPAGANO FORZANDO LA LORO FORMAZIONE NEL LORO PRECURSORE. PRPSC (PROTEINA PRIONICA, ISOFORMA SCRAPIE), IL PRIMO PRIONE AD ESSERE SCOPERTO, È L'AGENTE CAUSALE DI MALATTIE NEURODEGENERATIVE MORTALI CHE COLPISCONO L'UOMO, COME LA MALATTIA DI CREUTZFELDT-JAKOB, E GLI ANIMALI, COME L'ENCEFALOPATIA SPONGIFORME BOVINA (BSE), O MALATTIA DELLA MUCCA PAZZA? RICERCHE CONDOTTE DAL NOSTRO GRUPPO E DA ALTRI HANNO DIMOSTRATO CHE L'ARCHITETTURA DEL PRPSC È COSTITUITA DA UN SOLENOIDE A 4 PIANI, CHE VIENE IMPILATO PER FORMARE PROTOFILAMENTI AMILOIDI. LA CONOSCENZA DI QUESTE CARATTERISTICHE STRUTTURALI CI HA PERMESSO DI CAPIRE COME PRPSC SI PROPAGA: I LAMINATI NON ACCOPPIATI DEI PIANI SUPERIORI E INFERIORI DEL PROTOFILAMENTO ACT DELLO STAMPO PER QUALSIASI PRP MOLECULATE SCHIERATO CHE SI AVVICINA, COSTRINGENDOLO A FORMARE LAMINAS-LIKE, E SUCCESSIVAMENTE AVVOLTO PER FORMARE PAVIMENTI AGGIUNTIVI COME NUOVE SUPERFICI LAMINAS NON ACCOPPIATE. TUTTAVIA, CI SONO MOLTI ASPETTI DELLA BIOLOGIA PRPSC CHE NON POSSONO ESSERE SPIEGATI CON L'ATTUALE GRADO DI CONOSCENZA STRUTTURALE. IN PARTICOLARE, L'ESISTENZA DI BARRIERE DI TRASMISSIONE TRA SPECIE, O L'ESISTENZA DI CEPPI PRPSC CHE HANNO LA STESSA SEQUENZA, PRESENTANO PROPRIETÀ BIOCHIMICHE E BIOLOGICHE DIVERSE. IN QUESTO CONTESTO, LA NOSTRA PROPOSTA CERCA DI OTTENERE MAGGIORI INFORMAZIONI SULLA STRUTTURA DELLA PRPSC, AL FINE DI PERFEZIONARE IL NOSTRO ATTUALE MODELLO STRUTTURALE. È LA CONTINUAZIONE DEL NOSTRO PROGETTO DEL PIANO NAZIONALE BFU2013-48436-C2-1-P. ATTRAVERSO TALE PROGETTO, APRIAMO LA STRADA PER UTILIZZARE PRPSC RICOMBINANTE (RECPRPSC) COME APPROPRIATO ANALOGO DEL CERVELLO PRPSC NEGLI STUDI STRUTTURALI. A TAL FINE, ABBIAMO COLLABORATO CON JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO) NELLO SVILUPPO DI METODI PER PRODURRE QUANTITÀ SIGNIFICATIVE DI RECPRPSC INFETTIVO. SUCCESSIVAMENTE, ABBIAMO DETERMINATO CHE RECPRPSC E IL CERVELLO PRPSC CONDIVIDONO LA STESSA ARCHITETTURA DI BASE E SVILUPPATO METODI DI RISONANZA MAGNETICA IN SOLUZIONE PER STUDIARE RECPRPSC. _x000D_ fornito di tutto questo, ci proponiamo: 1) PER DETERMINARE SE L'IMPILAMENTO DELLE UNITÀ RECPRPSC LUNGO IL PROTOFILAMENTO DI RECPRPSC È TESTA-TESTA O TESTA-CODA; 2: ESPANDERE LE INFORMAZIONI OTTENUTE FINO AD OGGI ATTRAVERSO PROTEOLISI LIMITATA, ACCOPPIATO LA TECNICA AD UNA DISTRIBUZIONE PARZIALE DI RECPRPSC. NELLO SPECIFICO, CERCHIAMO DI CONFERMARE L'IDENTITÀ DELLE LAMINAS- E LEGAMI CHE ABBIAMO PROVVISORIAMENTE IDENTIFICATO, E DI IDENTIFICARE MAGGIORMENTE, IN PARTICOLARE SUI 2 PIANI TERMINALI C; 3: AMPLIARE LA METODOLOGIA NMR IN SOLUZIONE SVILUPPATA IN BFU2013-48436-C2-1-P UTILIZZANDO DIVERSI APPROCCI SPERIMENTALI PER IMPLEMENTARE PARZIALMENTE RECPRPSC, CONFERMANDO ED ESPANDENDO IN TAL MODO I DATI OTTENUTI; 4: AVVIARE STUDI DI MMR ALLO STATO SOLIDO DI RECPRPSC; INTENDIAMO INIZIARE CON SEMPLICI ESPERIMENTI 1D PER CALCOLARE QUANTI AMINOACIDI DI OGNI TIPO SI TROVANO IN LAMINAS- E QUANTI IN LEGAMI; 5: INTEGRARE TUTTI I DATI OTTENUTI IN UN MODELLO STRUTTURALE SEMPRE PIÙ RAFFINATO DI RECPRPSC, CHE INCLUDERÀ L'ALLINEAMENTO CON GLI SCHELETRI NOTI — SOLENOIDES. TUTTO QUESTO DOVREBBE PORTARE AD UN MODELLO ATOMISTICO DEL PRPSC CHE SPERIAMO DIVENTI UN RIFERIMENTO PER IL SETTORE. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΤΑ ΠΡΙΌΝ ΕΊΝΑΙ ΜΟΛΥΣΜΑΤΙΚΈΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ. ΕΊΝΑΙ ΠΑΡΑΔΙΠΛΩΜΈΝΕΣ ΕΚΔΌΣΕΙΣ ΤΩΝ ΚΑΝΟΝΙΚΆ ΔΙΠΛΩΜΈΝΩΝ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ ISOSEQUENTIAL. ΟΙ ΠΡΙΌΝΣ ΔΙΑΔΊΔΟΝΤΑΙ ΑΝΑΓΚΆΖΟΝΤΑΣ ΤΗ ΔΙΆΠΛΑΣΉ ΤΟΥΣ ΣΤΙΣ ΚΑΝΟΝΙΚΆ ΔΙΠΛΩΜΈΝΕΣ ΠΡΌΔΡΟΜΕΣ ΟΥΣΊΕΣ ΤΟΥΣ. ΤΟ PRPSC (ΠΡΩΤΕΪ́ΝΗ ΠΡΙΌΝ, ΙΣΟΜΟΡΦΊΑ ΤΡΟΜΏΔΟΥΣ ΝΌΣΟΥ), ΤΟ ΠΡΏΤΟ ΠΡΙΌΝ ΠΟΥ ΑΝΑΚΑΛΎΦΘΗΚΕ, ΕΊΝΑΙ Ο ΑΙΤΙΏΔΗΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑΣ ΤΩΝ ΘΑΝΑΤΗΦΌΡΩΝ ΝΕΥΡΟΕΚΦΥΛΙΣΤΙΚΏΝ ΑΣΘΕΝΕΙΏΝ ΠΟΥ ΠΡΟΣΒΆΛΛΟΥΝ ΤΟΝ ΆΝΘΡΩΠΟ, ΌΠΩΣ Η ΝΌΣΟΣ CREUTZFELDT-JAKOB, ΚΑΙ ΤΑ ΖΏΑ, ΌΠΩΣ Η ΣΠΟΓΓΏΔΗΣ ΕΓΚΕΦΑΛΟΠΆΘΕΙΑ ΤΩΝ ΒΟΟΕΙΔΏΝ (ΣΕΒ), ΓΝΩΣΤΉ ΚΑΙ ΩΣ «ΝΌΣΟΣ ΤΩΝ ΤΡΕΛΏΝ ΑΓΕΛΆΔΩΝ». ΈΡΕΥΝΑ ΑΠΌ ΜΑΣ ΚΑΙ ΆΛΛΕΣ ΟΜΆΔΕΣ ΈΧΕΙ ΔΕΊΞΕΙ ΌΤΙ Η ΑΡΧΙΤΕΚΤΟΝΙΚΉ ΤΟΥ PRPSC ΣΥΜΜΟΡΦΏΝΕΤΑΙ ΜΕ ΈΝΑ 4-RUNG -SOLENOID, ΠΟΥ ΣΤΟΊΒΕΣ ΓΙΑ ΝΑ ΣΧΗΜΑΤΊΣΟΥΝ ΑΜΥΛΟΕΙΔΉ PROTOFILAMENTS. Η ΓΝΏΣΗ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΔΟΜΙΚΏΝ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΏΝ, ΑΚΌΜΗ ΧΑΜΗΛΉΣ ΑΝΆΛΥΣΗΣ, ΕΠΙΤΡΈΠΕΙ, ΩΣΤΌΣΟ, ΤΗΝ ΚΑΤΑΝΌΗΣΗ ΤΟΥ ΤΡΌΠΟΥ ΜΕ ΤΟΝ ΟΠΟΊΟ ΤΟ PRPSC ΠΟΛΛΑΠΛΑΣΙΆΖΕΙ: ΟΙ ΆΖΕΥΚΤΕΣ — ΣΤΡΑΤΗΓΕΣ ΣΤΟ UPPER- ΚΑΙ ΤΑ ΚΑΤΏΤΕΡΑ ΣΚΑΛΟΠΆΤΙΑ ΤΟΥ PROTOFILAMENT ΜΠΟΡΟΎΝ ΝΑ ΣΧΕΔΙΆΣΟΥΝ ΈΝΑ ΕΙΣΕΡΧΌΜΕΝΟ ΕΚΤΥΛΙΓΜΈΝΟ ΜΌΡΙΟ PRP ΓΙΑ ΝΑ ΣΧΗΜΑΤΊΣΟΥΝ ΠΑΡΌΜΟΙΑ — ΣΤΡΑΤΗΓΕΣ, ΚΑΙ ΣΤΗ ΣΥΝΈΧΕΙΑ ΝΑ ΣΧΗΜΑΤΊΣΟΥΝ ΕΠΙΠΛΈΟΝ ΣΚΑΛΟΠΆΤΙΑ ΩΣ ΦΡΈΣΚΑ ΜΗ ΣΥΖΕΥΓΜΈΝΑ — ΣΤΡΑΤΗΓΕΣ. ΩΣΤΌΣΟ, ΥΠΆΡΧΟΥΝ ΠΟΛΛΈΣ ΒΑΣΙΚΈΣ ΠΤΥΧΈΣ ΤΗΣ ΒΙΟΛΟΓΊΑΣ PRPSC ΠΟΥ ΠΡΈΠΕΙ ΠΡΟΦΑΝΏΣ ΝΑ ΚΡΥΠΤΟΓΡΑΦΗΘΟΎΝ ΣΤΗ ΔΟΜΉ ΤΗΣ ΚΑΙ, ΩΣ ΕΚ ΤΟΎΤΟΥ, ΔΕΝ ΜΠΟΡΟΎΝ ΝΑ ΕΞΗΓΗΘΟΎΝ ΜΕ ΤΟ ΤΡΈΧΟΝ ΕΠΊΠΕΔΟ ΔΙΑΡΘΡΩΤΙΚΉΣ ΕΞΥΓΊΑΝΣΗΣ. ΕΙΔΙΚΌΤΕΡΑ, Η ΎΠΑΡΞΗ ΦΡΑΓΜΏΝ ΜΕΤΆΔΟΣΗΣ ΜΕΤΑΞΎ ΕΙΔΏΝ Ή ΣΤΕΛΕΧΏΝ PRPSC, ΤΑ ΟΠΟΊΑ ΈΧΟΥΝ ΤΗΝ ΊΔΙΑ ΑΛΛΗΛΟΥΧΊΑ, ΠΑΡΟΥΣΙΆΖΟΥΝ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΒΙΟΧΗΜΙΚΈΣ ΚΑΙ ΒΙΟΛΟΓΙΚΈΣ ΙΔΙΌΤΗΤΕΣ. Επιπλέον, μια λεπτομερέστερη διευκρίνιση της διαρρύθμισης του PrPSc θα πρέπει να διαμορφωθεί λογικά για τις ΦΑΜΙΚΕΣ ΔΗΛΩΣΕΙΣ._x000D_ Σ’ αυτό το πλαίσιο, η προτείνησή μας σε ΣΤΑΘΕΡΗ ΔΙΑΡΘΡΩΤΙΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΕΣ ΓΙΑ ΤΗ ΔΙΑΡΘΡΩΤΙΚΗ ΔΙΑΡΘΡΩΤΙΚΗ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΕΣ ΤΩΝ ΠΡΙΟΝΙΩΝ PrPSc, ΩΣ ΝΑ ΑΝΑΦΕΡΕΙ ΤΟ CURRENT STRUCTURAL MODEL. ΑΠΟΤΕΛΕΊ ΣΥΝΈΧΕΙΑ ΤΗΣ ΤΡΈΧΟΥΣΑΣ ΕΘΝΙΚΉΣ ΕΠΙΧΟΡΉΓΗΣΗΣ, BFU2013-48436-C2-1-P. ΜΈΣΩ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ ΈΡΓΟΥ, ΠΡΟΕΤΟΊΜΑΣΑ ΤΟ ΈΔΑΦΟΣ ΓΙΑ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΈΝΟΥ PRPSC (RECPRPSC) ΩΣ ΚΑΤΆΛΛΗΛΗΣ ΥΠΟΚΑΤΆΣΤΑΣΗΣ ΤΟΥ PRPSC ΠΟΥ ΠΡΟΈΡΧΕΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟΝ ΕΓΚΈΦΑΛΟ ΓΙΑ ΔΙΑΡΘΡΩΤΙΚΈΣ ΜΕΛΈΤΕΣ. ΓΙΑ ΑΥΤΌ, ΣΥΝΕΡΓΑΣΤΉΚΑΜΕ ΜΕ ΤΟΝ JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, ΜΠΙΛΜΠΆΟ) ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΜΕΘΌΔΩΝ ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΑΡΑΓΩΓΉ ΣΗΜΑΝΤΙΚΏΝ ΠΟΣΟΤΉΤΩΝ ΠΛΉΡΩΣ ΜΟΛΥΣΜΑΤΙΚΟΎ RECPRPSC. ΣΤΗ ΣΥΝΈΧΕΙΑ, ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ ΠΕΡΙΟΡΙΣΜΈΝΕΣ ΜΕΛΈΤΕΣ ΠΡΩΤΕΌΛΥΣΗΣ ΚΑΙ ΗΛΕΚΤΡΟΝΊΩΝ ΜΙΚΡΟΣΚΟΠΊΑΣ, ΠΉΡΑΜΕ ΙΣΧΥΡΆ ΣΤΟΙΧΕΊΑ ΠΟΥ ΔΕΊΧΝΟΥΝ ΌΤΙ Ο ΕΓΚΈΦΑΛΟΣ ΚΑΙ ΤΟ RECPRPSC ΜΟΙΡΆΖΟΝΤΑΙ ΜΙΑ ΚΟΙΝΉ ΒΑΣΙΚΉ ΑΡΧΙΤΕΚΤΟΝΙΚΉ. ΤΈΛΟΣ, ΑΝΑΠΤΎΞΑΜΕ ΛΎΣΕΙΣ NMR ΜΕΘΌΔΟΥΣ ΓΙΑ ΤΗ ΜΕΛΈΤΗ RECPRPSC. _x000D_ οπλισμένοι με όλα αυτά, προτείνουμε ΤΩΡΑ: 1) ΓΙΑ ΝΑ ΔΙΕΥΚΡΙΝΊΣΕΤΕ ΑΝ Η ΣΥΣΣΏΡΕΥΣΗ ΤΗΣ ΥΠΟΜΟΝΆΔΑΣ RECPRPSC ΚΑΤΆ ΜΉΚΟΣ ΤΟΥ PROTOFILAMENT RECPRPSC ΕΊΝΑΙ ΚΕΦΆΛΙ-ΠΡΟΣ-ΚΕΦΑΛΉ Ή ΚΕΦΆΛΙ ΠΡΟΣ ΟΥΡΆ 2: ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΠΈΚΤΑΣΗ ΤΩΝ ΠΕΡΙΟΡΙΣΜΈΝΩΝ ΔΕΔΟΜΈΝΩΝ ΠΡΩΤΕΌΛΥΣΗΣ ΠΟΥ ΈΧΟΥΝ ΛΗΦΘΕΊ ΜΈΧΡΙ ΣΤΙΓΜΉΣ, ΣΎΖΕΥΞΗ ΤΩΝ ΔΕΔΟΜΈΝΩΝ ΑΥΤΏΝ ΜΕ ΜΕΡΙΚΉ ΕΞΈΛΙΞΗ. ΕΠΙΔΙΏΚΟΥΜΕ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΑ ΝΑ ΕΠΙΒΕΒΑΙΏΣΟΥΜΕ ΤΗΝ ΤΑΥΤΌΤΗΤΑ — ΣΤΡΑΤΗΓΩΝ ΚΑΙ ΒΡΌΧΩΝ ΠΟΥ ΈΧΟΥΜΕ ΉΔΗ ΕΝΤΟΠΊΣΕΙ ΠΡΟΣΩΡΙΝΆ, ΚΑΙ ΝΑ ΕΝΤΟΠΊΣΟΥΜΕ ΠΡΌΣΘΕΤΕΣ — ΣΤΡΑΤΗΓΕΣ ΚΑΙ ΒΡΌΧΟΥΣ ΣΤΑ 2 ΒΑΘΜΊΔΕΣ C-TERMINAL· 3: ΕΠΈΚΤΑΣΗ ΤΗΣ ΜΕΘΟΔΟΛΟΓΊΑΣ ΤΗΣ ΛΎΣΗΣ NMR ΠΟΥ ΑΝΑΠΤΎΧΘΗΚΕ ΜΈΣΩ ΤΟΥ BFU2013-48436-C2-1-P ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ ΕΝΑΛΛΑΚΤΙΚΈΣ ΠΡΟΣΕΓΓΊΣΕΙΣ ΓΙΑ ΤΗ ΜΕΡΙΚΉ ΑΝΆΠΤΥΞΗ ΤΟΥ RECPRPSC, ΏΣΤΕ ΝΑ ΕΠΙΒΕΒΑΙΩΘΟΎΝ ΚΑΙ ΝΑ ΕΠΕΚΤΑΘΟΎΝ ΤΑ ΔΕΔΟΜΈΝΑ ΠΟΥ ΈΧΟΥΜΕ ΣΥΓΚΕΝΤΡΏΣΕΙ ΜΈΧΡΙ ΣΤΙΓΜΉΣ· 4: ΝΑ ΔΡΟΜΟΛΟΓΉΣΕΙ ΣΤΈΡΕΕΣ ΚΡΑΤΙΚΈΣ ΠΡΟΣΕΓΓΊΣΕΙΣ NMR ΓΙΑ ΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΤΟΥ RECPRPSC ΆΜΕΣΑ. ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΑ, ΠΡΟΤΕΊΝΟΥΜΕ ΝΑ ΞΕΚΙΝΉΣΟΥΜΕ ΜΕ ΜΙΑ ΑΠΛΉ ΠΡΟΣΈΓΓΙΣΗ 1D ΣΤΕΡΕΆ NMR ΓΙΑ ΝΑ ΑΞΙΟΛΟΓΗΘΕΊ ΠΌΣΑ ΑΜΙΝΟΞΈΑ ΚΆΘΕ ΤΎΠΟΥ ΒΡΊΣΚΟΝΤΑΙ ΣΕ -STRANDS VS. COILS? 5: ΓΙΑ ΝΑ ΕΝΣΩΜΑΤΩΘΟΎΝ ΌΛΟΙ ΟΙ ΔΟΜΙΚΟΊ ΠΕΡΙΟΡΙΣΜΟΊ ΠΟΥ ΠΡΟΈΚΥΨΑΝ ΑΠΌ ΤΟΥΣ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΟΥΣ ΣΤΌΧΟΥΣ ΣΕ ΈΝΑ ΌΛΟ ΚΑΙ ΠΙΟ ΕΚΛΕΠΤΥΣΜΈΝΟ ΔΟΜΙΚΌ ΜΟΝΤΈΛΟ ΤΟΥ RECPRPSC, ΣΥΜΠΕΡΙΛΑΜΒΑΝΟΜΈΝΗΣ ΤΗΣ ΔΙΑΜΌΡΦΩΣΗΣ ΣΠΕΙΡΩΜΆΤΩΝ ΚΑΙ ΤΗΣ ΜΟΝΤΕΛΟΠΟΊΗΣΗΣ ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΓΝΩΣΤΏΝ -SOLENOID SCAFFOLDS.ΌΛΑ ΑΥΤΆ ΘΑ ΠΡΈΠΕΙ ΝΑ ΟΔΗΓΉΣΟΥΝ ΣΕ ΈΝΑ ΒΕΛΤΙΩΜΈΝΟ, ΑΤΟΜΙΚΌ ΜΟΝΤΈΛΟ PRPSC, ΤΟ ΟΠΟΊΟ ΘΑ ΠΡΈΠΕΙ ΝΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΕΙ ΣΗΜΕΊΟ ΑΝΑΦΟΡΆΣ ΣΤΟ ΠΕΔΊΟ. (Greek)
18 August 2022
0 references
PRIONER ER SMITSOMME PROTEINER. DE ER MISFOLDEDE VERSIONER AF NORMALT FOLDEDE ISOSEQUENTIAL PROTEINER. PRIONER FORMERER SIG VED AT TVINGE DERES KROPSBYGNING IND I DERES NORMALT FOLDEDE PRÆKURSORER. PRPSC (PRIONPROTEIN, SCRAPIE ISOFORM), DEN FØRSTE PRION, DER BLEV OPDAGET, ER DEN ÅRSAGSDANNENDE AGENS FOR DØDBRINGENDE NEURODEGENERATIVE SYGDOMME, DER RAMMER MENNESKER, SÅSOM CREUTZFELDT-JAKOBS SYGDOM, OG DYR SOM BOVIN SPONGIFORM ENCEPHALOPATI (BSE), OGSÅ KENDT SOM ¿KOKOSYGDOM. FORSKNING FRA VORES OG ANDRE GRUPPER HAR VIST, AT PRPSCS ARKITEKTUR ER I OVERENSSTEMMELSE MED EN 4-RUNG-SOLENOID, DER STABLER TIL AT DANNE AMYLOIDPROTOFILAMENTER. KENDSKAB TIL DISSE STRUKTURELLE KARAKTERISTIKA, SOM STADIG HAR EN LAV OPLØSNING, GØR DET IKKE DESTO MINDRE MULIGT AT FORSTÅ, HVORDAN PRPSC FORMERER: DE UNPAREREDE -STRANDS I UPPER- OG NEDERSTE TRIN AF PROTOFILAMENTET KAN SKABELON EN INDGÅENDE UDFOLDET PRP MOLEKYLE TIL AT DANNE LIGNENDE -STRANDS, OG DEREFTER SPOLE TIL AT DANNE YDERLIGERE TRIN SOM FRISK UPARERET -STRANDS DANNES. DER ER IMIDLERTID MANGE CENTRALE ASPEKTER AF PRPSC-BIOLOGIEN, SOM NATURLIGVIS SKAL INDKODES I DENS STRUKTUR OG DERFOR IKKE KAN FORKLARES MED DET NUVÆRENDE NIVEAU FOR STRUKTUREL AFVIKLING. NAVNLIG FOREKOMSTEN AF TRANSMISSIONSBARRIERER MELLEM ARTER ELLER PRPSC-STAMMER, SOM HAR SAMME SEKVENS, HAR FORSKELLIGE BIOKEMISKE OG BIOLOGISKE EGENSKABER. Endvidere vil en mere detaljeret redegørelse for, hvad der er nødvendigt for at opnå en rationel udnyttelse af de statistiske oplysninger, der er nødvendige for at sikre, at de pågældende produkter kan anvendes i praksis._x000D_ I DENNE KONTEXT, VORES PROPOSAL AIMS PÅ OBTAININGERNE STRUCTURALOPLYSNINGER om STRUCTURE af PrPSc prioner, så at få styr på det pågældende STRUCTURAL MODEL. DET ER EN FORTSÆTTELSE AF VORES NUVÆRENDE NATIONALE TILSKUD, BFU2013-48436-C2-1-P. GENNEM DETTE PROJEKT BANEDE VI VEJEN FOR AT ANVENDE REKOMBINANT PRPSC (RECPRPSC) SOM ET PASSENDE SURROGAT AF HJERNEAFLEDT PRPSC TIL STRUKTURELLE UNDERSØGELSER. TIL DETTE, VI SAMARBEJDEDE MED JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO) AT UDVIKLE METODER TIL AT PRODUCERE BETYDELIGE MÆNGDER AF FULDT INFEKTIØSE RECPRPSC. DEREFTER, VED HJÆLP AF BEGRÆNSEDE PROTEOLYSE OG ELEKTRONMIKROSKOPI UNDERSØGELSER, VI OPNÅEDE STÆRKE BEVISER FOR, AT HJERNE OG RECPRPSC DELER EN FÆLLES GRUNDLÆGGENDE ARKITEKTUR. ENDELIG UDVIKLEDE VI LØSNING NMR METODER TIL AT STUDERE RECPRPSC. _x000D_ bevæbnet med alle disse, WE PROPOSE NU: 1) AT BELYSE, OM STABLINGEN AF RECPRPSC-UNDERENHEDEN LANGS RECPRPSC-PROTOFILAMENTET ER HEAD-TO-HEAD ELLER HEAD-TO-TAIL; 2: FOR AT UDVIDE DE BEGRÆNSEDE PROTEOLYSEDATA, DER ER OPNÅET HIDTIL, KOBLES DET TIL DELVIS UDFOLDELSE. VI SØGER SPECIFIKT AT BEKRÆFTE IDENTITETEN AF -STRANDS OG SLØJFER, SOM VI ALLEREDE HAR IDENTIFICERET FORELØBIGT, OG AT IDENTIFICERE YDERLIGERE -STRANDS OG SLØJFER I DE 2 C-TERMINALER; 3: AT UDVIDE LØSNINGEN NMR-METODOLOGI, DER ER UDVIKLET GENNEM BFU2013-48436-C2-1-P, VED AT ANVENDE ALTERNATIVE METODER TIL AT RECPRPSC DELVIS UDFOLDE SIG FOR AT BEKRÆFTE OG UDVIDE DE DATA, VI HIDTIL HAR INDHENTET 4: AT INDLEDE SOLIDE STATSLIGE NMR-METODER TIL AT UNDERSØGE RECPRPSC DIREKTE. VI FORESLÅR NAVNLIG AT BEGYNDE MED EN SIMPEL 1D SOLID NMR-TILGANG TIL AT VURDERE, HVOR MANGE AMINOSYRER AF HVER TYPE DER ER PLACERET I -STRANDS VS. COILS; 5: AT INTEGRERE ALLE STRUKTURELLE BEGRÆNSNINGER OPNÅET GENNEM DE FOREGÅENDE MÅL I EN STADIG MERE RAFFINERET STRUKTUREL MODEL AF RECPRPSC, HERUNDER GEVINDSKÆRING OG MODELLERING VED HJÆLP AF KENDTE -SOLENOID SCAFFOLDS.ALL DETTE BØR FØRE TIL EN FORBEDRET, ATOMISTISK MODEL AF PRPSC, SOM BØR BLIVE EN REFERENCE I MARKEN. (Danish)
18 August 2022
0 references
PRIONIT OVAT INFEKTIOPROTEIINEJA. NE OVAT RIKKINÄISET VERSIOT NORMAALISTI TAITETTU ISOSEQUENTIAL PROTEIINEJA. PRIONIT LEVIÄVÄT PAKOTTAMALLA NIIDEN LIHAKKUUS NORMAALISTI TAITETTUIHIN ESIASTEISIINSA. PRPSC (PRIONPROTEIINI, SCRAPIE ISOFORM), ENSIMMÄINEN PRIONI, JOKA ON LÖYDETTÄVÄ, ON SYY-SEURAUSTEKIJÄ TAPPAVA NEURODEGENERATIIVISIA SAIRAUKSIA, JOTKA VAIKUTTAVAT IHMISIIN, KUTEN CREUTZFELDT-JAKOBIN TAUTI, JA ELÄIMET, KUTEN NAUDAN SPONGIFORMINEN ENKEFALOPATIA (BSE), TUNNETAAN MYÖS NIMELLÄ HULLUN LEHMÄN TAUTI. TUTKIMUS MEIDÄN JA MUIDEN RYHMIEN ON OSOITTANUT, ETTÄ ARKKITEHTUURI PRPSC VASTAA 4-RUNG -SOLENOID, JOKA PINO MUODOSTAA AMYLOIDI PROTOFILAMENTTEJA. TIEDOT NÄISTÄ RAKENTEELLISISTA OMINAISUUKSISTA, JOIDEN RESOLUUTIO ON EDELLEEN ALHAINEN, MAHDOLLISTAVAT KUITENKIN KÄSITYKSEN SIITÄ, MITEN PRPSC ETENEE: PROTOFILAMENTIN UPPER- JA ALEMPIEN PUOLIEN PARITTAMATTOMAT -STRANDS-OSAT VOIVAT MUODOSTAA SAAPUVAN TAIPUMATTOMAN PRP-MOLEKYYLIN, JOKA MUODOSTAA SAMANLAISET -STRANDS-TUOTTEET, JA SITTEN KELA MUODOSTAA UUSIA PUOLIA TUOREINA PARITTAMATTOMINA -STRANDSINA. PRPSC-BIOLOGIASSA ON KUITENKIN MONIA KESKEISIÄ NÄKÖKOHTIA, JOTKA ON SELVÄSTI YMMÄRRETTÄVÄ SEN RAKENTEESSA, EIKÄ NIITÄ SIKSI VOIDA SELITTÄÄ NYKYISELLÄ RAKENTEELLISEN RATKAISUN TASOLLA. ERITYISESTI SELLAISTEN LAJIEN TAI PRPSC-KANTOJEN VÄLILLÄ, JOILLA ON SAMA JÄRJESTYS, ON ERILAISIA BIOKEMIALLISIA JA BIOLOGISIA OMINAISUUKSIA. Lisäksi tarkempi selvitys PrPSc WILL HELP:n STRUCTURE: stä, joka on järkevästi suunnattu PrPSc-pörsseille._x000D_ TÄMÄN CONTEXT, OUREN PROPOSAL AIMS at OBTAINING FURTHER STRUCTURAL INFORMATION ON THE STRUCTURE of the PrPSc prions, SO AS to REFINE the CURRENT STRUCTURAL MODEL. SE ON JATKO NYKYISELLE KANSALLISELLE APURAHALLEMME, BFU2013–48436-C2–1-P. TÄMÄN HANKKEEN KAUTTA, POHJUSTIMME TIETÄ KÄYTTÄÄ REKOMBINANTTI PRPSC (RECPRPSC) SOPIVANA AIVOPERÄISEN PRPSC: N KORVIKKEENA RAKENTEELLISIIN TUTKIMUKSIIN. TÄTÄ VARTEN, TEIMME YHTEISTYÖTÄ JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO) KEHITTÄÄ MENETELMIÄ TUOTTAA MERKITTÄVIÄ MÄÄRIÄ TÄYSIN TARTTUVA REPRPSC. SITTEN KÄYTTÄMÄLLÄ RAJOITETTUA PROTEOLYYSIÄ JA ELEKTRONIMIKROSKOPIAA, SAIMME VAHVAA NÄYTTÖÄ SIITÄ, ETTÄ AIVOT JA RECPRPSC: LLÄ ON YHTEINEN PERUSARKKITEHTUURI. LOPUKSI KEHITIMME RATKAISU NMR MENETELMIÄ TUTKIA RECPRPSC. _x000D_ aseistettuna TÄMÄN TÄMÄN OHJELMA NYT: 1) SELVITTÄÄ, ONKO RECPRPSC-ALAYKSIKÖN PINOAMINEN REPRPSC-PROTOFILAMENTTIA PITKIN PÄÄN VAI PÄÄTÄ-HÄNTEEN; 2: TÄHÄN MENNESSÄ SAATUJEN RAJALLISTEN PROTEOLYYSITIETOJEN LAAJENTAMINEN KYTKEMÄLLÄ SE OSITTAISEEN AVAUTUMISEEN. PYRIMME ERITYISESTI VAHVISTAMAAN JO ALUSTAVASTI TUNNISTETTUJEN -STRANDS- JA SILMUKOIDEN IDENTITEETIN SEKÄ TUNNISTAMAAN 2 C-PÄÄTTEEN SARALLA MUITA -STRANDS- JA SILMUKOITA; 3: LAAJENNETAAN BFU2013–48436-C2–1-P:N AVULLA KEHITETTYÄ NMR-MENETELMÄÄ KÄYTTÄMÄLLÄ VAIHTOEHTOISIA LÄHESTYMISTAPOJA PRPSC:N OSITTAISEEN AVAUTUMISEEN, JOTTA VOIDAAN VAHVISTAA JA LAAJENTAA TÄHÄN MENNESSÄ SAAMIAMME TIETOJA; 4: KÄYNNISTETÄÄN KIINTEÄT NMR-MENETELMÄT REPRPSC:N TUTKIMISEKSI SUORAAN. EHDOTAMME ERITYISESTI, ETTÄ ALOITAMME YKSINKERTAISELLA 1D-KIINTEÄN NMR-MENETELMÄN AVULLA, JOTTA VOIDAAN ARVIOIDA, KUINKA MONTA AMINOHAPPOA KUNKIN TYYPIN SISÄLLÄ ON -STRANDS VS. KELAT; 5: INTEGROIDA KAIKKI EDELLISTEN TAVOITTEIDEN KAUTTA SAADUT RAKENTEELLISET RAJOITUKSET YHÄ HIENOSTUNEEMPAAN RECPRPSC:N RAKENTEELLISEEN MALLIIN, MUKAAN LUKIEN KIERTEITYS JA MALLINTAMINEN TUNNETTUJEN -SOLENOID SCAFFOLDS -JÄRJESTELMIEN AVULLA. KAIKKI TÄMÄN PITÄISI JOHTAA PAREMPAAN, ATOMISTISEEN PRPSC-MALLIIN, JOSTA OLISI TULTAVA VERTAILUKOHTA ALALLA. (Finnish)
18 August 2022
0 references
IL-PRIJONI HUMA PROTEINI INFETTIVI. DAWN HUMA VERŻJONIJIET ŻBALJATI TA’ PROTEINI ISOSEQUENTIAL LI NORMALMENT JINTWEW. PRIONS PROPAGATE BILLI JĠIEGĦLU L-KONFORMAZZJONI TAGĦHOM FIL-PREKURSURI NORMALMENT MITWIJA TAGĦHOM. PRPSC (PROTEINA TAL-PRION, ISOFORM TAL-ISCRAPIE), L-EWWEL PRION LI GĦANDHA TIĠI SKOPERTA, HUWA L-AĠENT KAWŻALI TA’ MARD NEWRODEĠENERATTIV FATALI LI JAFFETTWA LILL-BNEDMIN, BĦALL-MARDA CREUTZFELDT-JAKOB, U L-ANNIMALI, BĦALL-ENĊEFALOPATIJA SPONĠIFORMI BOVINA (BSE), MAGĦRUFA WKOLL BĦALA L-MARDA TAL-BAQAR ¬MAD. RIĊERKA MINN GRUPPI TAGĦNA U OĦRAJN WERA LI L-ARKITETTURA TA ‘PRPSC TIKKONFORMA MA’ 4-RUNG -SOLENOID, LI STACKS BIEX JIFFURMAW PROTOFILAMENTI AMYLOID. L-GĦARFIEN TA’ DAWN IL-KARATTERISTIĊI STRUTTURALI, LI GĦADHOM TA’ RIŻOLUZZJONI BAXXA, JIPPERMETTU, MADANKOLLU, FEHIM TA’ KIF IL-PRPSC JIPPROPAGA: L-ISTRANŻI MHUX AKKOPPJATI FL-ISKALUNI TAL-UPPER U L-AKTAR BAXXI TAL-PROTOFILAMENT JISTGĦU JSERVU TA’ MOLEKULA PRP MHUX AKKOPPJATA LI TIDĦOL BIEX TIFFORMA -STRANDS SIMILI, U MBAGĦAD COIL BIEX TIFFORMA RUNGS ADDIZZJONALI KIF JIĠU FFURMATI -STRANDS FRISKI MHUX AKKOPPJATI. MADANKOLLU, HEMM ĦAFNA ASPETTI EWLENIN TAL-BIJOLOĠIJA TAL-PRPSC LI OVVJAMENT GĦANDHOM JIĠU INKORPORATI FL-ISTRUTTURA TAGĦHA U GĦALHEKK MA JISTGĦUX JIĠU SPJEGATI BIL-LIVELL ATTWALI TA’ RIŻOLUZZJONI STRUTTURALI. B’MOD PARTIKOLARI, L-EŻISTENZA TA’ BARRIERI TA’ TRAŻMISSJONI BEJN SPEĊI JEW RAZEZ PRPSC, LI GĦANDHOM L-ISTESS SEKWENZA, JURU PROPRJETAJIET BIJOKIMIĊI U BIJOLOĠIĊI DIFFERENTI. Barra minn hekk, MORE DETTALJONI TA ‘L-ISTRUTTURA TAL-PRPSĊILL HELP razzjonali DERGN DRUGS GĦALL-DISEASES FATALI CURRENTLY._x000D_ F’din il-KONTÀ, OUR PROPOSTA AIMS AT OBTAINING INFORMAZZJONI STRUCTURALI FUQ L-ISTRUTTURAT TA ‘Pressjonijiet, GĦANDHOM JAGĦRAF MODEL STRUCTURAL KURRENTI. HIJA KONTINWAZZJONI TAL-GĦOTJA NAZZJONALI ATTWALI TAGĦNA, BFU2013–48436-C2–1-P. PERMEZZ TA’ DAN IL-PROĠETT, WITTAJNA T-TRIQ BIEX NUŻAW PRPSC RIKOMBINANTI (RECPRPSC) BĦALA SOSTITUT XIERAQ TA’ PRPSC DERIVAT MILL-MOĦĦ GĦAL STUDJI STRUTTURALI. GĦAL DAN, AĦNA KKOLLABORAJNA MA’ JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO) BIEX NIŻVILUPPAW METODI BIEX NIPPRODUĊU AMMONTI SINIFIKANTI TA’ RECPRPSC KOMPLETAMENT INFETTIV. IMBAGĦAD, BL-UŻU TA ‘PROTEOLISI LIMITATA U STUDJI MIKROSKOPIĊI ELETTRON, AĦNA MIKSUBA EVIDENZA QAWWIJA LI TINDIKA LI L-MOĦĦ U RECPRPSC JAQSMU ARKITETTURA BAŻIKA KOMUNI. FL-AĦĦAR NETT, AĦNA ŻVILUPPATI METODI NMR SOLUZZJONI GĦALL-ISTUDJU RECPRPSC. _x000D_ armati B’DIN KOLLHA, WE PROPOŻIZZJONI ISSA: 1) BIEX JIĠI ĊĊARAT JEKK L-ISTIVAR TAS-SUBUNITÀ RECPRPSC TUL IL-PROTOFILAMENT RECPRPSC HUWIEX RAS IMB’RAS JEW RAS SA DENB; 2: BIEX TESPANDI D-DEJTA LIMITATA TAL-PROTEOLISI MIKSUBA S’ISSA, L-IGGANĊJAR TAGĦHA BIEX TIŻVOLĠI PARZJALMENT. AĦNA NFITTXU B’MOD SPEĊIFIKU LI NIKKONFERMAW L-IDENTITÀ TA’ -STRANŻI U ĊIRKWITI LI DIĠÀ IDENTIFIKAJNA B’MOD TENTATTIV, U LI NIDENTIFIKAW -STRANŻI U ĊIRKWITI ADDIZZJONALI FIŻ-2 SKALUNI C-TERMINAL; 3: LI TESPANDI L-METODOLOĠIJA TAS-SOLUZZJONI NMR ŻVILUPPATA PERMEZZ TA’ BFU2013–48436-C2–1-P BL-UŻU TA’ APPROĊĊI ALTERNATTIVI GĦALL-IŻVILUPP PARZJALI TA’ RECPRPSC, SABIEX TIĠI KKONFERMATA U ESTIŻA D-DATA LI KSIBNA S’ISSA; 4: BIEX JIBDEW APPROĊĊI NMR TAL-ISTAT SOLIDI BIEX JISTUDJAW IR-RECPRPSC DIRETTAMENT. B’MOD PARTIKOLARI, NIPPROPONU LI NIBDEW B’APPROĊĊ SEMPLIĊI TA’ 1D SOLIDU NMR BIEX NIVVALUTAW KEMM HEMM AĊIDI AMMINIĊI TA’ KULL TIP F’-STRANDS VS KOJLS; 5: BIEX IR-RESTRIZZJONIJIET STRUTTURALI KOLLHA MIKSUBA PERMEZZ TAL-GĦANIJIET PREĊEDENTI JIĠU INTEGRATI F’MUDELL STRUTTURALI DEJJEM AKTAR IRFINUT TA’ RECPRPSC, INKLUŻ IL-QTUGĦ TA’ KAMINI U L-IMMUDELLAR BL-UŻU TA’ SCAFFOLDS -SOLENOID MAGĦRUFA. (Maltese)
18 August 2022
0 references
PRIONI IR INFEKCIJAS OLBALTUMVIELAS. TĀS IR NEPAREIZI SALOCĪTAS VERSIJAS PARASTI SALOCĪTIEM ISOSEQUENTIAL PROTEĪNIEM. PRIONI PAVAIRO, PIESPIEŽOT TO UZBŪVES TO PARASTI SALOCĪTOS PREKURSOROS. PRPSC (PRIONA PROTEĪNS, SKREPI IZOFORMA), PIRMAIS PRIONS, KAS JĀATKLĀJ, IR CĒLONIS NĀVĒJOŠĀM NEIRODEĢENERATĪVĀM SLIMĪBĀM, KAS SKAR CILVĒKUS, PIEMĒRAM, KREICFELDA-JAKOBA SLIMĪBAI, UN DZĪVNIEKIEM, PIEMĒRAM, GOVJU SŪKĻVEIDA ENCEFALOPĀTIJAI (GSE), KAS PAZĪSTAMA ARĪ KĀ GOVJU SŪKĻVEIDA ENCEFALOPĀTIJA (GSE). PĒTĪJUMI NO MŪSU UN CITĀM GRUPĀM IR PARĀDĪJUŠI, KA PRPSC ARHITEKTŪRA ATBILST 4-RUNG -SOLENOID, KAS VEIDO AMILOĪDU PROTOFILĀCIJAS. ZINĀŠANAS PAR ŠĪM STRUKTURĀLAJĀM ĪPAŠĪBĀM, JOPROJĀM AR ZEMU IZŠĶIRTSPĒJU, TOMĒR ĻAUJ SAPRAST, KĀ PRPSC IZPLATĀS: NEPĀRA -STRANDS PROTOFILĀCIJAS UPPER- UN APAKŠĒJĀS KĀJIŅAS VAR VEIDOT IENĀKOŠO NEATLOCĪTO PRP MOLEKULU, LAI VEIDOTU LĪDZĪGU -STRANDS, UN PĒC TAM SPOLE, LAI VEIDOTU PAPILDU KNIEDES, JO VEIDOJAS SVAIGI NEPĀRA -STRANDS. TOMĒR IR DAUDZI BŪTISKI PRPSC BIOLOĢIJAS ASPEKTI, KURIEM IR JĀBŪT ACĪMREDZAMI NOROBEŽOTIEM TĀS STRUKTŪRĀ, UN TĀPĒC TOS NEVAR IZSKAIDROT AR PAŠREIZĒJO STRUKTURĀLĀS IZŠĶIRTSPĒJAS LĪMENI. JO ĪPAŠI TAS, KA PASTĀV TRANSMISIJAS BARJERAS STARP SUGĀM VAI PRPSC CELMIEM, KURIEM IR VIENA UN TĀ PATI SECĪBA UN KURIEM PIEMĪT ATŠĶIRĪGAS BIOĶĪMISKĀS UN BIOLOĢISKĀS ĪPAŠĪBAS. Turklāt, VAIRĀK DETAILED skaidrojums par PrPSc STRUCTURE WILL HELP racionāli DESIGN DRUGS par to CURRENTLY FATAL DISEASES._x000D_ THIS CONTEXT, mūsu PROPOSAL AIMS OBTAINING FURTHER STRUCTURAL INFORMĀCIJAS STRUCTURAL INFORMĀCIJAS PrPSc priions, SO AS REFINE CURRENT STRUCTURAL MODEL. TAS IR MŪSU PAŠREIZĒJĀS VALSTS DOTĀCIJAS BFU2013–48436-C2–1-P TURPINĀJUMS, IZMANTOJOT ŠO PROJEKTU, MĒS BRUĢĒJĀM CEĻU IZMANTOT REKOMBINANTO PRPSC (RECPRPSC) KĀ PIEMĒROTU SMADZEŅU IZCELSMES PRPSC AIZSTĀJĒJU STRUKTURĀLAJIEM PĒTĪJUMIEM. ŠIM NOLŪKAM MĒS SADARBOJĀMIES AR JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO), LAI IZSTRĀDĀTU METODES, LAI RAŽOTU IEVĒROJAMU DAUDZUMU PILNĪBĀ INFEKCIOZU RECPRPSC. PĒC TAM, IZMANTOJOT IEROBEŽOTUS PROTEOLĪZES UN ELEKTRONU MIKROSKOPIJAS PĒTĪJUMUS, MĒS IEGUVĀM SPĒCĪGUS PIERĀDĪJUMUS, KAS LIECINA, KA SMADZENES UN RECPRPSC IR KOPĪGA PAMATA ARHITEKTŪRA. VISBEIDZOT, MĒS IZSTRĀDĀJĀM RISINĀJUMU NMR METODES, LAI IZPĒTĪTU RECPRPSC. _x000D_ bruņots ar visu šo, mēs PROPOSE NOW: 1) NOSKAIDROT, VAI RECPRPSC APAKŠVIENĪBAS KRAUŠANA PA RECPRPSC PROTOFILAMENTU IR NO GALVAS UZ GALVAS VAI NO GALVAS LĪDZ ASTEI; 2: LAI PAPLAŠINĀTU LĪDZ ŠIM IEGŪTOS IEROBEŽOTOS PROTEOLĪZES DATUS, TOS SAVIENOJOT AR DAĻĒJU IZVĒRŠANU. MĒS ĪPAŠI CENŠAMIES APSTIPRINĀT -STRANDS UN CILPU IDENTITĀTI, KURAS MĒS JAU ESAM PROVIZORISKI IDENTIFICĒJUŠI, UN IDENTIFICĒT PAPILDU -STRANDS UN CILPAS 2 C-TERMINĀLAJĀS KĀJĀS; 3: PAPLAŠINĀT RISINĀJUMA NMR METODOLOĢIJU, KAS IZSTRĀDĀTA, IZMANTOJOT BFU2013–48436-C2–1-P, IZMANTOJOT ALTERNATĪVAS PIEEJAS RECPRPSC DAĻĒJAI IZVĒRŠANAI, LAI APSTIPRINĀTU UN PAPLAŠINĀTU LĪDZ ŠIM IEGŪTOS DATUS; 4: UZSĀKT CIETVIELU NMR PIEEJAS, LAI TIEŠI PĒTĪTU RECPRPSC. JO ĪPAŠI MĒS IEROSINĀM SĀKT AR VIENKĀRŠU 1D CIETU NMR PIEEJU, LAI NOVĒRTĒTU, CIK DAUDZ AMINOSKĀBJU KATRA VEIDA ATRODAS -STRANDS VS SPOLES; 5: INTEGRĒT VISUS STRUKTURĀLOS IEROBEŽOJUMUS, KAS IEGŪTI AR IEPRIEKŠĒJIEM MĒRĶIEM, ARVIEN IZSMALCINĀTĀKĀ RECPRPSC STRUKTURĀLAJĀ MODELĪ, IESKAITOT VĪTNI UN MODELĒŠANU, IZMANTOJOT ZINĀMAS -SOLENOID SCAFFOLDS.ALL TAM VAJADZĒTU NOVEST PIE UZLABOTA, ATOMISTISKA PRPSC MODEĻA, KAM JĀKĻŪST PAR ATSAUCI ŠAJĀ JOMĀ. (Latvian)
18 August 2022
0 references
PRIÓNY SÚ INFEKČNÉ BIELKOVINY. SÚ ROZLOŽENÉ VERZIE NORMÁLNE ZLOŽENÝCH ISOSEQUENTIAL PROTEÍNOV. PRIÓNY SA ŠÍRIA TÝM, ŽE NÚTIA ICH MÄSITOSŤ DO SVOJICH BEŽNE ZLOŽENÝCH PREKURZOROV. PRPSC (PRIÓNOVÝ PROTEÍN, IZOFORMA KLUSAVKY), PRVÝ OBJAVENÝ PRIÓN, JE PÔVODCOM SMRTEĽNÝCH NEURODEGENERATÍVNYCH OCHORENÍ POSTIHUJÚCICH ĽUDÍ, AKO JE CREUTZFELDT-JAKOBOVA CHOROBA, A ZVIERAT, AKO JE BOVINNÁ SPONGIFORMNÁ ENCEFALOPATIA (BSE), ZNÁMA AJ AKO CHOROBA ŠIALENÝCH KRÁV. VÝSKUM Z NAŠICH A ĎALŠÍCH SKUPÍN UKÁZAL, ŽE ARCHITEKTÚRA PRPSC ZODPOVEDÁ 4-RUNG -SOLENOID, KTORÝ SA HROMADÍ NA VYTVORENIE AMYLOIDNÝCH PROTOFILAMENTOV. ZNALOSŤ TÝCHTO ŠTRUKTURÁLNYCH CHARAKTERISTÍK, STÁLE S NÍZKYM ROZLÍŠENÍM, VŠAK UMOŽŇUJE POCHOPIŤ, AKO PRPSC ŠÍRI: NEPÁROVANÉ -STRANDS V UPPER- A SPODNÉ PRIEČKY PROTOFILAMENTU MÔŽU ŠABLÓNU PRICHÁDZAJÚCE ROZLOŽENÉ MOLEKULY PRP TVORIŤ PODOBNÉ -STRANDS, A POTOM CIEVKY NA VYTVORENIE ĎALŠÍCH PRIEČOK AKO ČERSTVÉ NEPÁROVANÉ -STRANDS SÚ VYTVORENÉ. EXISTUJE VŠAK MNOHO KĽÚČOVÝCH ASPEKTOV BIOLÓGIE PRPSC, KTORÉ MUSIA BYŤ ZJAVNE OBKLOPENÉ SVOJOU ŠTRUKTÚROU, A PRETO ICH NEMOŽNO VYSVETLIŤ SÚČASNOU ÚROVŇOU ŠTRUKTURÁLNEHO RIEŠENIA. NAJMÄ EXISTENCIA BARIÉR PRENOSU MEDZI DRUHMI ALEBO KMEŇMI PRPSC, KTORÉ MAJÚ ROVNAKÚ SEKVENCIU, VYKAZUJE ODLIŠNÉ BIOCHEMICKÉ A BIOLOGICKÉ VLASTNOSTI. Okrem toho, ZÁKLADNÉ objasnenie STRUCTURE OF PrPSc bude ZDRAVÉ ZDRAVOTNÝCH ROZPOČTOVÝCH PRACOVNÝCH ROZPOČTOVÝCH ROZPOČTOVÝCH ÚDAJOV._x000D_ v tomto CONTEXT, NAŠE PROPOSAL AIMS NA ZÁKLADNÝCH STRUCTURÁLNYCH INFORMÁCIÁCH ĎALŠIEHO STRUCTURÁLNEHO INFORMÁCIE o STRUCTURÁRNEJ PODELi PrPSC, takže ako sa má hodiť do CURRENT STRUCTURAL MODEL. JE POKRAČOVANÍM NÁŠHO SÚČASNÉHO NÁRODNÉHO GRANTU, BFU2013 – 48436-C2 – 1-P. PROSTREDNÍCTVOM TOHTO PROJEKTU SME VYDLÁŽDILI CESTU K POUŽITIU REKOMBINANTNÉHO PRPSC (RECPRPSC) AKO VHODNÉHO NÁHRADNÉHO PRPSC ODVODENÉHO OD MOZGU PRE ŠTRUKTURÁLNE ŠTÚDIE. NA TENTO ÚČEL SME SPOLUPRACOVALI S JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO) NA VÝVOJI METÓD NA VÝROBU ZNAČNÉHO MNOŽSTVA PLNE INFEKČNÉHO RECPRPSC. POTOM SME POMOCOU OBMEDZENÝCH ŠTÚDIÍ PROTEOLÝZY A ELEKTRÓNOVEJ MIKROSKOPIE ZÍSKALI PRESVEDČIVÉ DÔKAZY O TOM, ŽE MOZOG A RECPRPSC MAJÚ SPOLOČNÚ ZÁKLADNÚ ARCHITEKTÚRU. NAKONIEC SME VYVINULI RIEŠENIE NMR METÓDY NA ŠTÚDIUM RECPRPSC. _x000D_ vyzbrojený VŠETKÝM TÝKAJÚCE SA VŠETKÝCH PROPOSE TERAZ: 1) OBJASNIŤ, ČI STOHOVANIE RECPRPSC PODJEDNOTKY POZDĹŽ RECPRPSC PROTOFILAMENT JE HLAVA-HLAVA ALEBO HLAVA-K-CHVOST; 2: ROZŠÍRIŤ DOTERAZ ZÍSKANÉ OBMEDZENÉ ÚDAJE O PROTEOLÝZE, SPOJIŤ ICH S ČIASTOČNÝM ROZLOŽENÍM. KONKRÉTNE SA SNAŽÍME POTVRDIŤ IDENTITU -STRANDS A SLUČKY, KTORÉ SME UŽ PREDBEŽNE IDENTIFIKOVALI, A IDENTIFIKOVAŤ ĎALŠIE -STRANDS A SLUČKY V 2 C-TERMINÁLOVÝCH PRIEČKACH; 3: ROZŠÍRIŤ METODIKU RIEŠENIA NMR VYVINUTÚ PROSTREDNÍCTVOM BFU2013 – 48436-C2 – 1-P POMOCOU ALTERNATÍVNYCH PRÍSTUPOV K ČIASTOČNÉMU ROZLOŽENIU RECPRPSC, ABY SA POTVRDILI A ROZŠÍRILI ÚDAJE, KTORÉ SME DOTERAZ ZÍSKALI; 4: INICIOVAŤ PEVNÉ NMR PRÍSTUPY K ŠTÚDIU RECPRPSC PRIAMO. NAVRHUJEME NAJMÄ ZAČAŤ JEDNODUCHÝM PRÍSTUPOM 1D PEVNÉHO NMR, ABY SME POSÚDILI, KOĽKO AMINOKYSELÍN KAŽDÉHO TYPU SA NACHÁDZA V -STRANDS VERZUS CIEVKY; 5: INTEGROVAŤ VŠETKY ŠTRUKTURÁLNE OBMEDZENIA ZÍSKANÉ PROSTREDNÍCTVOM PREDCHÁDZAJÚCICH CIEĽOV DO ČORAZ RAFINOVANEJŠIEHO ŠTRUKTURÁLNEHO MODELU RECPRPSC VRÁTANE ZÁVITOV A MODELOVANIA POMOCOU ZNÁMYCH -SOLENOID SCAFFOLDS.ALL BY TO MALO VIESŤ K VYLEPŠENÉMU ATOMISTICKÉMU MODELU PRPSC, KTORÝ BY SA MAL STAŤ REFERENCIOU V TEJTO OBLASTI. (Slovak)
18 August 2022
0 references
IS PRÓITÉINÍ TÓGÁLACHA IAD PRIONSAÍ. TÁ SIAD LEAGANACHA MISFOLDED DE GHNÁTH FILLTE PRÓITÉINÍ ISOSEQUENTIAL. CUIREANN PRIONSAÍ AR AGHAIDH TRÍNA GCOMHLÍONADH A BHRÚ ISTEACH INA RÉAMHTHEACHTAITHE A BHÍONN FILLTE DE GHNÁTH. IS É PRPSC (PRIONPHRÓITÉIN, ISOFORM SCRAPIE), AN CHÉAD PHRIONSA ATÁ LE FÁIL, AN T-OIBREÁN CÚISEACH DE GHALAIR NEURODEGENERATIVE DEADLY A THÉANN I BHFEIDHM AR DHAOINE, COSÚIL LE GALAR CREUTZFELDT-JAKOB, AGUS AINMHITHE, COSÚIL LE HEINCEIFILEAPAITE SPÚINSEACH BÓ (BSE), AR A DTUGTAR GALAR BÓ BUILE FREISIN. LÉIRIGH TAIGHDE ÓNÁR NGRÚPAÍ AGUS GRÚPAÍ EILE GO GCOMHLÍONANN AILTIREACHT PRPSC 4-RUNG -SOLENOID, GO GCRUACHA CHUN PROTOFILAMENTS AMYLOID A FHOIRMIÚ. MAR SIN FÉIN, A BHUÍ LEIS AN EOLAS AR NA SAINTRÉITHE STRUCHTÚRACHA SIN, IS FÉIDIR TUISCINT A FHÁIL AR AN GCAOI A IOMADAÍONN PRPSC: IS FÉIDIR LEIS AN -STRANDS UNPAIRED SA UPPER- AGUS RUNGS LOWERMOST AN PROTOFILAMENT TEIMPLÉAD AR MÓILÍN PRP AG TEACHT ISTEACH UNFOLDED CHUN FOIRM -STRANDS DEN CHINEÁL CÉANNA, AGUS ANSIN CORNA A FHOIRMIÚ RUNGS BREISE MAR ÚR UNPAIRED -STRANDS ATÁ DÉANTA. MAR SIN FÉIN, TÁ GO LEOR PRÍOMHGHNÉITHE DE BHITHEOLAÍOCHT PRPSC NACH MÓR A BHEITH AR NDÓIGH INA STRUCHTÚR AGUS, DÁ BHRÍ SIN, NÍ FÉIDIR IAD A MHÍNIÚ LEIS AN LEIBHÉAL RÉITIGH STRUCHTÚRAIGH ATÁ ANN FAOI LÁTHAIR. GO HÁIRITHE, LÉIRÍONN BACAINNÍ TARCHUIR IDIR SPEICIS NÓ TRÉITHCHINEÁLACHA PRPSC, A BHFUIL AN SEICHEAMH CÉANNA ACU, AIRÍONNA BITHCHEIMICEACHA AGUS BITHEOLAÍOCHA ÉAGSÚLA. Ina theannta sin, A elucidation MÓR STRUCTURE PrPSc WILL HELP réasúnach DRUSES FATAL CRUACH._x000D_ I CONTEXT, CEATHRÚ AIMS GHAIRMIÚIL eile FAISNÉISE maidir le STRUTHÚ PRISANTA PrPSc, mar gheall ar an gceart chun na críche sin. IS LEANÚINT É DÁR DEONTAS NÁISIÚNTA REATHA, BFU2013-48436-C2-1-P. TRÍD AN TIONSCADAL SEO, RÉITIGH MUID AN BEALACH CHUN PRPSC ATHCHUINGREACH (RECPRPSC) A ÚSÁID MAR IONADACH CUÍ PRPSC A DHÍORTHAÍTEAR ÓN INCHINN LE HAGHAIDH STAIDÉIR STRUCHTÚRACHA. CHUIGE SIN, CHOMHOIBRÍOMAR LE JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO) CHUN MODHANNA A FHORBAIRT CHUN MÉIDEANNA SUNTASACHA RECPRPSC ATÁ GO HIOMLÁN IONFHABHTAÍOCH A THÁIRGEADH. ANSIN, AG BAINT ÚSÁIDE AS STAIDÉIR PROTEOLYSIS TEORANTA AGUS MICREASCÓPACHT LEICTREON, FUAIR MUID FIANAISE LÁIDIR A LÉIRÍONN GO BHFUIL AN INCHINN AGUS RECPRPSC ROINNT AILTIREACHT BHUNÚSACH COITIANTA. AR DEIREADH, D’FHORBAIR MUID MODHANNA NMR RÉITEACH CHUN STAIDÉAR A DHÉANAMH RECPRPSC. _x000D_ armtha leis seo go léir ANOIS: 1) A LÉIRIÚ AN BHFUIL CRUACHADH FHO-AONAD RECPRPSC FEADH AN PHRÓTAIFIL RECPRPSC CEANN GO CEANN NÓ CEANN GO SONRAÍ; 2: A LEATHNÚ NA SONRAÍ PROTEOLYSIS TEORANTA A FHAIGHTEAR GO DTÍ SEO, CÚPLÁLA SÉ GO PÁIRTEACH UNFOLDING. DÉANAIMID IARRACHT GO SONRACH CÉANNACHT -STRANDS AGUS LÚBA ATÁ AITHEANTA AGAINN CHEANA FÉIN A DHEIMHNIÚ, AGUS CHUN -STRANDS AGUS LÚBA BREISE SNA RITHEANNA CRÍOCHFOIRT C 2 A SHAINAITHINT; 3: AN MHODHEOLAÍOCHT RÉITIGH NMR A FORBRAÍODH TRÍ BFU2013-48436-C2-1-P A LEATHNÚ AG BAINT ÚSÁIDE AS CUR CHUIGE MALARTACH CHUN NOCHTADH PÁIRTEACH RECPRPSC, CHUN NA SONRAÍ ATÁ FAIGHTE AGAINN GO DTÍ SEO A DHEIMHNIÚ AGUS A LEATHNÚ; 4: CHUN TÚS A CHUR LE CUR CHUIGE LÁIDIR NMR STÁIT CHUN STAIDÉAR A DHÉANAMH GO DÍREACH AR RECPRPSC. GO HÁIRITHE, MOLAIMID TÚS A CHUR LE CUR CHUIGE SIMPLÍ 1D SOLADACH NMR CHUN MEASÚNÚ A DHÉANAMH AR AN LÍON AIMÍNAIGÉID DE GACH CINEÁL ATÁ SUITE I GCORNAÍ -STRANDS VS.; 5: GACH SRIAN STRUCHTÚRACH A FHAIGHTEAR TRÍ NA HAIDHMEANNA ROIMHE SEO A CHOMHTHÁTHÚ I SAMHAIL STRUCHTÚRACH NÍOS SCAGTHA RECPRPSC, LENA N-ÁIRÍTEAR SNÁITHIÚ AGUS SAMHALTÚ AG BAINT ÚSÁIDE AS SCAFFOLDS -SOLENOID AITHEANTA. (Irish)
18 August 2022
0 references
PRIONY JSOU INFEKČNÍ PROTEINY. JEDNÁ SE O NESPRÁVNĚ SLOŽENÉ VERZE NORMÁLNĚ SKLÁDANÝCH PROTEINŮ ISOSEQUENTIAL. PRIONY SE MNOŽÍ TAK, ŽE SE ZMASAKRUJÍ DO BĚŽNĚ SLOŽENÝCH PREKURZORŮ. PRPSC (PRION PROTEIN, ISOFORMA KLUSAVKY), PRVNÍ PRION, KTERÝ MÁ BÝT OBJEVEN, JE KAUZÁLNÍ PŮVODCEM SMRTELNÝCH NEURODEGENERATIVNÍCH ONEMOCNĚNÍ POSTIHUJÍCÍCH ČLOVĚKA, JAKO JE CREUTZFELDTOVA-JAKOBOVA CHOROBA, A ZVÍŘAT, JAKO JE BOVINNÍ SPONGIFORMNÍ ENCEFALOPATIE (BSE), TAKÉ ZNÁMÁ JAKO „MAD COW DISEASE“. VÝZKUM Z NAŠICH A DALŠÍCH SKUPIN UKÁZAL, ŽE ARCHITEKTURA PRPSC ODPOVÍDÁ 4-RUNG -SOLENOID, KTERÝ STOHUJE TVOŘIT AMYLOIDNÍ PROTOFILAMENTY. ZNALOST TĚCHTO STRUKTURÁLNÍCH CHARAKTERISTIK, STÁLE NÍZKÉHO ROZLIŠENÍ, NICMÉNĚ UMOŽŇUJE POCHOPIT, JAK SE PRPSC ŠÍŘÍ: NEPÁROVÉ -STRANDS V UPPER- A NEJSPODNĚJŠÍ PŘÍČKY PROTOFILAMENTU MOHOU ŠABLONOVAT PŘÍCHOZÍ ROZLOŽENÉ PRP MOLEKULY TVOŘIT PODOBNÉ -STRANDS, A PAK CÍVKA VYTVOŘIT DALŠÍ PŘÍČKY JAKO ČERSTVÉ NEPÁROVANÉ – STRANDS JSOU TVOŘENY. EXISTUJE VŠAK MNOHO KLÍČOVÝCH ASPEKTŮ BIOLOGIE PRPSC, KTERÉ MUSÍ BÝT JASNĚ ZAKOŘENĚNY VE SVÉ STRUKTUŘE, A PROTO JE NELZE VYSVĚTLIT SOUČASNOU ÚROVNÍ STRUKTURÁLNÍHO ROZLIŠENÍ. ZEJMÉNA EXISTENCE PŘENOSOVÝCH BARIÉR MEZI DRUHY NEBO KMENY PRPSC, KTERÉ MAJÍ STEJNOU SEKVENCI, VYKAZUJÍ ODLIŠNÉ BIOCHEMICKÉ A BIOLOGICKÉ VLASTNOSTI. Kromě toho, VÍCE DETAILEDované objasnění STRUCTURE PrPSc bude HELP racionálně DESIGN DRUGS PRO CURRENTLY FATAL DISEASES._x000D_ V tomto KONTEXT, NAŠE PROPOSAL AIMS na OBTAINING FURTHER STRUCTURAL INFORMACÍ O STRUCTURE prPSc prionů, tak, aby se zabránilo CURRENT STRUCTURAL MODEL. JE POKRAČOVÁNÍM NAŠEHO SOUČASNÉHO NÁRODNÍHO GRANTU BFU2013–48436-C2–1-P. PROSTŘEDNICTVÍM TOHOTO PROJEKTU JSME PŘIPRAVILI CESTU K POUŽITÍ REKOMBINANTNÍHO PRPSC (RECPRPSC) JAKO VHODNÉ NÁHRADY MOZKŮ ODVOZENÝCH PRPSC PRO STRUKTURÁLNÍ STUDIE. ZA TÍMTO ÚČELEM JSME SPOLUPRACOVALI S JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO) NA VÝVOJI METOD PRO VÝROBU VÝZNAMNÉHO MNOŽSTVÍ PLNĚ INFEKČNÍ REPREPSC. POTÉ, POMOCÍ OMEZENÉ PROTEOLÝZY A ELEKTRONOVÉ MIKROSKOPIE, JSME ZÍSKALI SILNÉ DŮKAZY NAZNAČUJÍCÍ, ŽE MOZEK A RECPRPSC SDÍLEJÍ SPOLEČNOU ZÁKLADNÍ ARCHITEKTURU. NAKONEC JSME VYVINULI ŘEŠENÍ NMR METODY PRO STUDIUM RECPRPSC. _x000D_ vyzbrojeni se vším, co jsme nyní: 1) OBJASNIT, ZDA STOHOVÁNÍ RECPRPSC PODJEDNOTKY PODÉL RECPRPSC PROTOFILAMENT JE HLAVA-TO-HEAD NEBO HLAVA-TO-TAIL; 2: PRO ROZŠÍŘENÍ DOSUD ZÍSKANÝCH OMEZENÝCH PROTEOLÝZOVÝCH DAT JE SPOJÍME S ČÁSTEČNÝM ROZKLADEM. KONKRÉTNĚ SE SNAŽÍME POTVRDIT IDENTITU -STRANDS A CYKLŮ, KTERÉ JSME JIŽ PŘEDBĚŽNĚ IDENTIFIKOVALI, A IDENTIFIKOVAT DALŠÍ – STRANDS A SMYČKY V 2 KONCOVÝCH PŘÍČCÍCH C; 3: ROZŠÍŘIT METODIKU ŘEŠENÍ NMR VYVINUTOU PROSTŘEDNICTVÍM BFU2013–48436-C2–1-P S VYUŽITÍM ALTERNATIVNÍCH PŘÍSTUPŮ K ČÁSTEČNÉMU ROZVOJI PRPSC, ABY BYLO MOŽNÉ POTVRDIT A ROZŠÍŘIT ÚDAJE, KTERÉ JSME DOSUD ZÍSKALI; 4: INICIOVAT SOLIDNÍ STÁTNÍ NMR PŘÍSTUPY KE STUDIU RECPRPSC PŘÍMO. ZEJMÉNA NAVRHUJEME ZAČÍT JEDNODUCHÝM PŘÍSTUPEM 1D PEVNÉ NMR S CÍLEM POSOUDIT, KOLIK AMINOKYSELIN KAŽDÉHO TYPU SE NACHÁZÍ V -STRANDS VS. CÍVKY; 5: CHCETE-LI INTEGROVAT VŠECHNA STRUKTURÁLNÍ OMEZENÍ ZÍSKANÁ PROSTŘEDNICTVÍM PŘEDCHOZÍCH CÍLŮ DO STÁLE RAFINOVANĚJŠÍHO STRUKTURÁLNÍHO MODELU RECPRPSC, VČETNĚ ZÁVITOVÁNÍ A MODELOVÁNÍ POMOCÍ ZNÁMÝCH -SOLENOID SCAFFOLDS.VŠECHNY TO BY MĚLO VÉST K LEPŠÍMU, ATOMISTICKÉMU MODELU PRPSC, KTERÝ BY SE MĚL STÁT REFERENCÍ V TÉTO OBLASTI. (Czech)
18 August 2022
0 references
Os priões são proteínas infecciosas. VERSÃO DE PROTEÍNAS ISOSEQUENTIAIS NORMALMENTE ENCONTRADAS. PROPAGAÇÃO DOS PRIÕES FORÇANDO A SUA CONFORMAÇÃO NOS SEUS PRECURSORES NORMALMENTE OBSERVADOS. PRPSC (proteína de prião, ISOFORMA SCRAPIE), o primeiro a ser descoberto, é o agente causador de doenças neurodegenerativas mortais que afetam os seres humanos, como a doença de CREUTZFELDT-JAKOB, e os animais, como a encefalopatia espondiforme bovina (BSE), também conhecida como "doença de vaca louca". A investigação dos nossos e de outros grupos demonstrou que a arquitetura do PRPSC está em conformidade com um 4-RUNG-SOLENOID, que bloqueia a formação de PROTOFILAMENTOS AMILOIDOS. CONHECIMENTO DESTAS CARACTERÍSTICAS ESTRUTURAIS, AINDA DE BAIXA RESOLUÇÃO, PERMITIR, NUNCA MAIS, O COMPREENSAMENTO DE COMO O PRPSC PROPAGA: As colunas não amassadas nas extremidades superiores e inferiores do protofilamento podem formar um módulo de PPR não amassado para formar colunas semelhantes e, em seguida, formar colunas adicionais como colunas não amassadas frescas. No entanto, há muitos aspectos fundamentais da biologia PRPSC que devem ser obviamente reforçados na sua estrutura e, portanto, não podem ser explicados com o actual nível de resolução estrutural. Nomeadamente, a existência de barreiras de transmissão entre espécies ou estirpes de PRPSC, que tenham a mesma sequência, exibam diferentes propriedades bioquímicas e biológicas. Além disso, uma ELUCIDAÇÃO MAIS DETALHADA DA ESTRUTURA DO PRPSC ajudará DROGAS RACIONALMENTE CONCEBIDAS PARA ESTES DOENÇAS ATUALMENTE FATAIS._x000D_ NESTE CONTEXTO, NOSSA PROPOSTA OBTENÇÃO DE INFORMAÇÕES ESTRUTURAIS SOBRE A ESTRUTURA DOS PRIONS PRPSC, DE FORMA A REFINAR O MODELO ESTRUTURAL ATUAL. É UMA CONTINUAÇÃO DA NOSSA SUBVENÇÃO NACIONAL ATUAL, BFU2013-48436-C2-1-P. ATRAVÉS DESTE PROJECTO, PAVEMOS A FORMA DE UTILIZAR O PRPSC RECOMBINANTE (RECPRPSC) COMO ASSURROGADO ADEQUADO DE PRPSC DERIVADO DO CÉREBRO PARA ESTUDOS ESTRUTURAIS. Para isso, reunimo-nos com JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO) para desenvolver métodos para produzir quantidades significativas de RECPRPSC totalmente INFECTIVO. Então, usando proteólise limitada e estudos de microscopia de eletrões, obtivemos provas sólidas que indicam que o cérebro e o ReCPRPSC compartilham uma arquitetura básica comum. Finalmente, desenvolvemos métodos de RMN de solução para estudar o RECPRPSC. _x000D_ Armados com tudo isso, propomos agora: 1) ELUCIDAR SE O ESTABELECIMENTO DA SUBUNIDADE DO RECPRPSC DURANTE O PROTOFILAMENTO DO RECPRPSC É DA CABEÇA A CABEÇA OU DA CABEÇA A CARREGAR; 2: Expandir os dados de proteólise limitada obtidos até aqui, acoplando-os a insucesso parcial. ESPECIFICAMENTE, PROCURAMOS CONFIRMAR A IDENTIDADE DAS ESTRUTURAS E LOOPAS QUE JÁ IDENTIFICAMOS TENTATIVAMENTE, E IDENTIFICAR AS ESTRUTURAS E LOOPAS ADICIONAIS NAS 2 RUNGAS C-TERMINAIS; 3: ALARGAR A METODOLOGIA DE SOLUÇÃO DAS RMN DESENVOLVIDA ATRAVÉS DA BFU2013-48436-C2-1-P, UTILIZANDO ABORDAGENS ALTERNATIVAS PARA REPRESCENTAR O DESENVOLVIMENTO PARCIAL, DE FORMA A CONFIRMAR E ALARGAR OS DADOS QUE TEMOS OBTENIDOS NESTE PERÍODO; 4: INICIAR MÉTODOS DE RMN DE ESTADO SÓLIDO PARA ESTUDAR DIRETAMENTE O RECPRPSC. Em particular, propomo-nos começar com uma abordagem de RMN sólida de 1D para avaliar quantos aminoácidos de cada tipo estão localizados em colunas VS. 5: INTEGRAR TODOS OS RETENTOS ESTRUTURAIS OBTIDOS ATRAVÉS DOS OBJETIVOS PRECEDENTES NUM MODELO ESTRUTURAL MAIS REFINADO DE RECPRPSC, INCLUINDO A VIOLAÇÃO E O MODELO UTILIZANDO ESCAFILOS CONHECIDOS -SOLENOIDOS.Tais elementos devem conduzir a um MODELO ATOMÍSTICO DE PRPSC MELHORADO, QUE DEVE SER REFERIDO NO DOMÍNIO. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
PRIOONID ON NAKKUSLIKUD VALGUD. NEED ON TAVALISELT VOLDITUD ISOSEQUENTIAL VALKUDE VALED VERSIOONID. PRIOONID PALJUNEVAD, SUNDIDES NENDE KEHAEHITUST OMA NORMAALSELT KOKKU VOLDITUD LÄHTEAINETESSE. PRPSC (PRIOONIVALK, SKREIPI ISOFORM) ON ESIMENE AVASTATAV PRIOON, MIS PÕHJUSTAB SURMAVAID NEURODEGENERATIIVSEID HAIGUSI, MIS MÕJUTAVAD INIMESI, NAGU CREUTZFELDT-JAKOB TÕBI, JA LOOMI, NAGU VEISTE SPONGIOOSNE ENTSEFALOPAATIA (BSE), TUNTUD KA KUI „MAD COW DISEASE“. UURINGUD MEIE JA TEISTE RÜHMADE ON NÄIDANUD, ET ARHITEKTUUR PRPSC VASTAB 4-RUNG -SOLENOID, MIS KORSTNAD MOODUSTAVAD AMÜLOID PROTOFILAMENTS. TEADMISED NENDE STRUKTUURILISTE OMADUSTE KOHTA, MIS ON ENDISELT MADALA RESOLUTSIOONIGA, VÕIMALDAVAD SIISKI MÕISTA, KUIDAS PRPSC PALJUNEB: PAARITU -STRANDS UPPER- JA ALUMINE REDELI PROTOFILAMENT VÕIB MALLIDA SISSETULEV VOLTIMATA PRP MOLEKULI MOODUSTADA SARNANE -STRANDS, JA SEEJÄREL MÄHIS MOODUSTAVAD TÄIENDAVAD REDIGLID NAGU VÄRSKE PAARITU -STRANDS ON MOODUSTATUD. PRPSC BIOLOOGIAS ON SIISKI PALJU OLULISI ASPEKTE, MIDA TULEB SELLE STRUKTUURIS SELGELT PIIRITLEDA JA MIDA SEETÕTTU EI SAA SELETADA PRAEGUSE STRUKTUURSE RESOLUTSIOONI TASEMEGA. EELKÕIGE ESINEB SAMA JÄRJESTUSEGA LIIKIDE VÕI PRPSC TÜVEDE VAHEL EDASIKANDUMISTÕKKEID, MILLEL ON ERINEVAD BIOKEEMILISED JA BIOLOOGILISED OMADUSED. Lisaks, MORE DETAILED ETTEPANEKU HÄÄLETAMISEST KASUTATAVAD KASUTATAVAD TEADLIKID ratsionaalselt DESIGN DRUCTURGS THESE CURRENTLY FATAL DISEASES._x000D_ TIS CONTEXT, meie PROPOSAL AIMS on OBTAINING FURTERITURAL INFORMATION STRUCTURAL INFORMATION STRUCTURAL MODEL. SEE ON JÄTKUKS MEIE PRAEGUSELE RIIKLIKULE TOETUSELE, BFU2013–48436-C2–1-P. SELLE PROJEKTI KAUDU SILLUTASIME TEED REKOMBINANTSE PRPSC (RECPRPSC) KASUTAMISEKS AJUST TULETATUD PRPSC SOBIVA ASENDUSAINENA STRUKTUURIUURINGUTES. SELLEKS TEGIME KOOSTÖÖD JOAQUIN CASTILLAGA (CIC-BIOGUNE, BILBAO), ET TÖÖTADA VÄLJA MEETODID, ET TOOTA MÄRKIMISVÄÄRSES KOGUSES TÄIELIKULT NAKKUSOHTLIKKU RPRPSC-D. SEEJÄREL, KASUTADES PIIRATUD PROTEOLÜÜSI JA ELEKTRONMIKROSKOOPIA UURINGUID, SAIME TUGEVAID TÕENDEID, MIS NÄITAVAD, ET AJUL JA REPERTUAARIL ON ÜHINE PÕHIARHITEKTUUR. LÕPUKS TÖÖTASIME VÄLJA LAHENDUSE NMR MEETODID, ET UURIDA RECPRPSC. _x000D_ relvastatud WITH KÕIK KOKKU, MIDA TOOTMINE KOHUSTUSLIK: 1) SELGITADA, KAS REBIPSC-ALAMÜHIKU VIRNASTAMINE PIKI RISTPSC PROTOFILAMENTI ON PEA-PEA VÕI SABAVAHEL; 2: LAIENDADA SENI SAADUD PIIRATUD PROTEOLÜÜSIANDMEID, ÜHENDADES NEED OSALISE VÄLJALÜLITAMISEGA. ME PÜÜAME KONKREETSELT KINNITADA -STRANDIDE JA SILMUSTE IDENTITEETI, MILLE OLEME JUBA ESIALGSELT KINDLAKS TEINUD, NING TEHA KINDLAKS TÄIENDAVAD -STRANDS JA SILMUSED 2 C-TERMINAALSES REDELIS; 3: LAIENDADA BFU2013–48436-C2–1-P KAUDU VÄLJA TÖÖTATUD LAHENDUSE NMR METOODIKAT, KASUTADES ALTERNATIIVSEID LÄHENEMISVIISE REPREPC OSALISELE VÄLJALÜLITAMISELE, ET KINNITADA JA LAIENDADA SENI SAADUD ANDMEID; 4: ALGATADA KINDLA RIIGI NMR-LÄHENEMISVIISID, ET UURIDA OTSESELT REGLEMENTAARSET PPC-D. EELKÕIGE TEEME ETTEPANEKU ALUSTADA LIHTSA 1D TAHKE NMR-MEETODIGA, ET HINNATA, KUI PALJU IGAT TÜÜPI AMINOHAPPEID ASUB -STRANDS VS. MÄHIS; 5: INTEGREERIDA KÕIK EELNEVATE EESMÄRKIDE KAUDU SAADUD STRUKTUURILISED PIIRANGUD AINA TÄPSEMASSE REPREPC STRUKTUURIMUDELISSE, SEALHULGAS KEERMESTAMINE JA MODELLEERIMINE, KASUTADES TEADAOLEVAID SOLENOID SCAFFOLDS.KÕIK SEE PEAKS VIIMA PRPSC TÄIUSTATUD, AATOMISTLIKU MUDELINI, MILLEST PEAKS SAAMA VALDKONNA VÕRDLUSALUS. (Estonian)
18 August 2022
0 references
A PRIONOK FERTŐZŐ FEHÉRJÉK. EZEK A NORMÁLISAN ÖSSZEHAJTOGATOTT ISOSEQUENTIAL FEHÉRJÉK HIBÁS VÁLTOZATAI. A PRIONOK ÚGY TERJEDNEK, HOGY A SZOKÁSOSAN ÖSSZEHAJTOGATOTT PREKURZORAIKBA KÉNYSZERÍTIK A KONFORMÁCIÓJUKAT. A PRPSC (PRION PROTEIN, SURLÓKÓR IZOFORM), AZ ELSŐ PRION, AMELYET FEL KELL FEDEZNI, AZ EMBEREKET ÉRINTŐ HALÁLOS NEURODEGENERATÍV BETEGSÉGEK, MINT PÉLDÁUL A CREUTZFELDT-JAKOB BETEGSÉG ÉS AZ ÁLLATOK, MINT PÉLDÁUL A SZARVASMARHÁK SZIVACSOS AGYVELŐBÁNTALMA (BSE) OKOZATI OKA. A MI ÉS MÁS CSOPORTOK KUTATÁSAI AZT MUTATTÁK, HOGY A PRPSC ARCHITEKTÚRÁJA MEGFELEL EGY 4-RUNG-SOLENOID-NAK, AMELY AMYLOID PROTOFILAMENTUMOKAT KÉPEZ. EZEKNEK A SZERKEZETI JELLEMZŐKNEK A ISMERETE, AMELYEK MÉG MINDIG ALACSONY FELBONTÁSÚAK, LEHETŐVÉ TESZI ANNAK MEGÉRTÉSÉT, HOGY A PRPSC HOGYAN TERJED: A PROTOFIL UPPER- ÉS LEGALSÓ FOKAIBAN LÉVŐ PÁRATLAN -STRANDS-OK EGY BEJÖVŐ, ÖSSZEHAJTATLAN PRP-MOLEKULÁT ALKOTHATNAK HASONLÓ -STRANDS-OKKÉ, MAJD TEKERCSKÉNT TOVÁBBI FOKOKAT KÉPEZHETNEK, MIVEL FRISS PÁRATLAN -STRANDS ALAKUL KI. A PRPSC BIOLÓGIÁNAK AZONBAN SZÁMOS OLYAN KULCSFONTOSSÁGÚ ASPEKTUSA VAN, AMELYET NYILVÁNVALÓAN KÖRÜL KELL REJTENI A SZERKEZETÉBEN, ÉS EZÉRT NEM MAGYARÁZHATÓ MEG A SZERKEZETI FELBONTÁS JELENLEGI SZINTJÉVEL. KÜLÖNÖSEN AZ AZONOS SZEKVENCIÁJÚ FAJOK VAGY PRPSC TÖRZSEK KÖZÖTTI ÁTVITELI KORLÁTOK LÉTEZÉSE KÜLÖNBÖZŐ BIOKÉMIAI ÉS BIOLÓGIAI TULAJDONSÁGOKKAL RENDELKEZIK. Ezen túlmenően a PrPSc STRUCTURE-jának részletesebb tisztázása racionálisan DESIGN DRUGS-eket fog segíteni a KÖVETKEZTETENDŐ FATÁLLÍTÁSOK számára._x000D_ EZ ELLENŐRZÉSÉNEK, AJÁNLÁSA a PrPSc prionok STRUCTURÁLIS INFORMÁCIÓK ELŐZETESÍTÉSÉNEK, így a CURRENT STRUCTURAL MODEL reflektorálására. EZ A JELENLEGI NEMZETI TÁMOGATÁSUNK FOLYTATÁSA, A BFU2013–48436-C2–1-P. PROJEKTEN KERESZTÜL, ELŐKÉSZÍTETTÜK AZ UTAT A REKOMBINÁNS PRPSC (RECPRPSC) MINT AZ AGYBÓL SZÁRMAZÓ PRPSC MEGFELELŐ HELYETTESÍTŐJE STRUKTURÁLIS TANULMÁNYOKHOZ. ENNEK ÉRDEKÉBEN EGYÜTTMŰKÖDTÜNK JOAQUIN KASZTÍLIÁVAL (CIC-BIOGUNE, BILBAO), HOGY OLYAN MÓDSZEREKET DOLGOZZUNK KI, AMELYEK JELENTŐS MENNYISÉGŰ TELJESEN FERTŐZŐ RECPRPSC-T ÁLLÍTANAK ELŐ. EZUTÁN KORLÁTOZOTT PROTEOLÍZISSEL ÉS ELEKTRONMIKROSZKÓPOS VIZSGÁLATOKKAL ERŐS BIZONYÍTÉKOT SZEREZTÜNK ARRA, HOGY AZ AGY ÉS A RECPRPSC KÖZÖS ALAPVETŐ ARCHITEKTÚRÁVAL RENDELKEZNEK. VÉGÜL KIFEJLESZTETTÜNK MEGOLDÁST NMR MÓDSZEREK TANULMÁNYOZÁSÁHOZ RECPRPSC. _x000D_ felfegyverkezve mindezzel, mi most: 1) ANNAK TISZTÁZÁSA, HOGY A RECPSC ALEGYSÉG ÖSSZERAKÁSA A RECPSC PROTOFILAMENT MENTÉN FEJTŐL FEJIG VAGY FEJTŐL-FAROKIG; 2: AZ EDDIG KAPOTT KORLÁTOZOTT PROTEOLÍZIS ADATOK KIBŐVÍTÉSE ÉRDEKÉBEN AZOKAT RÉSZLEGES KIBONTAKOZÁSRA KELL KAPCSOLNI. KÜLÖNÖSEN ARRA TÖREKSZÜNK, HOGY MEGERŐSÍTSÜK AZ ÁLTALUNK MÁR ELŐZETESEN AZONOSÍTOTT -STRANDS-OK ÉS HURKOK KILÉTÉT, VALAMINT HOGY A KÉT C-TERMINÁL FOKBAN TOVÁBBI – TÁMOGATÁSOKAT ÉS HURKOKAT AZONOSÍTSUNK; 3: BŐVÍTSE KI A BFU2013–48436-C2–1-P SEGÍTSÉGÉVEL KIDOLGOZOTT NMR-MÓDSZERT A RECPRPSC RÉSZLEGES KIBONTAKOZTATÁSÁNAK ALTERNATÍV MEGKÖZELÍTÉSEIVEL, HOGY MEGERŐSÍTSE ÉS BŐVÍTSE AZ EDDIG MEGSZERZETT ADATOKAT; 4: A RECPRPSC KÖZVETLEN TANULMÁNYOZÁSÁRA IRÁNYULÓ SZILÁRD ÁLLAPOTÚ NMR-MEGKÖZELÍTÉSEK KEZDEMÉNYEZÉSE. KÜLÖNÖSEN AZT JAVASOLJUK, HOGY KEZDJÜK EGY EGYSZERŰ 1D SZILÁRD NMR MEGKÖZELÍTÉSSEL ANNAK ÉRTÉKELÉSÉRE, HOGY AZ EGYES TÍPUSOK HÁNY AMINOSAVAT TARTALMAZNAK -STRANDS VS. TEKERCSEK; 5: AZ ELŐZŐ CÉLOK RÉVÉN ELÉRT ÖSSZES SZERKEZETI KORLÁTOZÁS INTEGRÁLÁSA A RECPRPSC EGYRE KIFINOMULTABB SZERKEZETI MODELLJÉBE, BELEÉRTVE AZ ISMERT -SOLENOID SCAFFOLDS HASZNÁLATÁVAL TÖRTÉNŐ MENETELÉST ÉS MODELLEZÉST. MINDEZNEK A PRPSC TOVÁBBFEJLESZTETT, ATOMISZTIKUS MODELLJÉT KELL EREDMÉNYEZNIE, AMELYNEK REFERENCIAKÉNT KELL SZOLGÁLNIA A TERÜLETEN. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
ПРИОНИТЕ СА ИНФЕКЦИОЗНИ ПРОТЕИНИ. ТЕ СА СГЪНАТИ ВЕРСИИ НА НОРМАЛНО СГЪНАТИ ISOSEQUENTIAL ПРОТЕИНИ. ПРИОНИТЕ СЕ РАЗМНОЖАВАТ, КАТО НАСИЛВАТ КОНФОРМАЦИЯТА СИ В НОРМАЛНО СГЪНАТИТЕ СИ ПРЕКУРСОРИ. PRPSC (ПРИОН ПРОТЕИН, ИЗОФОРМНА СКРЕЙПИ), ПЪРВИЯТ ПРИОН, КОЙТО ТРЯБВА ДА БЪДЕ ОТКРИТ, Е ПРИЧИНИТЕЛ НА СМЪРТОНОСНИ НЕВРОДЕГЕНЕРАТИВНИ ЗАБОЛЯВАНИЯ, ЗАСЯГАЩИ ХОРАТА, КАТО БОЛЕСТТА НА КРОЙЦФЕЛД-ЯКОБ, И ЖИВОТНИ КАТО СПОНГИФОРМНАТА ЕНЦЕФАЛОПАТИЯ ПО ГОВЕДАТА (СЕГ), ИЗВЕСТНА СЪЩО КАТО БОЛЕСТТА „ЛУДА КРАВА“. ИЗСЛЕДВАНИЯ ОТ НАШИТЕ И ДРУГИ ГРУПИ ПОКАЗВАТ, ЧЕ АРХИТЕКТУРАТА НА PRPSC СЪОТВЕТСТВА НА 4-РУНГ -SOLENOID, ЧЕ СТЕКОВЕ, ЗА ДА ОБРАЗУВАТ АМИЛОИДИ PROTOFILAMENTS. ПОЗНАВАНЕТО НА ТЕЗИ СТРУКТУРНИ ХАРАКТЕРИСТИКИ, КОИТО ВСЕ ОЩЕ СА С НИСКА РАЗДЕЛИТЕЛНА СПОСОБНОСТ, ПОЗВОЛЯВАТ, ВЪПРЕКИ ТОВА, ДА СЕ РАЗБЕРЕ КАК PRPSC СЕ РАЗПРОСТРАНЯВА: НЕСДВОЕНИТЕ -СТРАНДС В UPPER- И НАЙ-ДОЛНИТЕ СТЪПАЛА НА ПРОТОФИЛАМЕНТА МОГАТ ДА ОФОРМЯТ ВХОДЯЩА РАЗГЪНАТА PRP МОЛЕКУЛА, ЗА ДА ОБРАЗУВАТ ПОДОБНИ -STRANDS, И СЛЕД ТОВА ДА ОБРАЗУВАТ ДОПЪЛНИТЕЛНИ СТЪПАЛА КАТО СВЕЖИ НЕСДВОЕНИ -СТРАНДС. ИМА ОБАЧЕ МНОГО КЛЮЧОВИ АСПЕКТИ НА БИОЛОГИЯТА НА PRPSC, КОИТО ОЧЕВИДНО ТРЯБВА ДА БЪДАТ КОДИРАНИ В НЕЙНАТА СТРУКТУРА И СЛЕДОВАТЕЛНО НЕ МОГАТ ДА БЪДАТ ОБЯСНЕНИ С НАСТОЯЩОТО НИВО НА СТРУКТУРНА РЕЗОЛЮЦИЯ. ПО-СПЕЦИАЛНО НАЛИЧИЕТО НА БАРИЕРИ ЗА ПРЕДАВАНЕ МЕЖДУ ВИДОВЕ ИЛИ ЩАМОВЕ PRPSC, КОИТО ИМАТ ЕДНА И СЪЩА ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТ, ПРОЯВЯВАТ РАЗЛИЧНИ БИОХИМИЧНИ И БИОЛОГИЧНИ СВОЙСТВА. Освен това ПОВЕЧЕ ОБЯВЛЕНОСТТА НА СТРУКТУРАТА НА ПРПСКАТА НА ПРАВИТЕЛНО ПРОИЗВОДСТВОТО НА ПРОИЗВОДСТВОТО НА ПРОИЗВОДСТВОТО НА ПРОИЗВОДСТВОТО НА ПРОИЗВОДСТВОТО НА ПРОИЗВОДСТВОТО НА ДЪРЖАВИТЕ СТРУКТУРИ ИНФОРМАЦИОННИ ИНФОРМАЦИОННИ ИНФОРМАЦИОННИ ИНФОРМАЦИОННИ СТРОКУРНИ ИНФОРМАЦИОННИ СТРУКУРА НА ПРОСКИТЕ Приони, така че да рефнатират CURORTURAL MODEL. ТОВА Е ПРОДЪЛЖЕНИЕ НА НАСТОЯЩАТА НИ НАЦИОНАЛНА БЕЗВЪЗМЕЗДНА ПОМОЩ, BFU2013—48436-C2—1-P. ЧРЕЗ ТОЗИ ПРОЕКТ, ПРОПРАВИХМЕ ПЪТЯ ЗА ИЗПОЛЗВАНЕ НА РЕКОМБИНАНТЕН PRPSC (RECPRPSC) КАТО ПОДХОДЯЩ ЗАМЕСТИТЕЛ НА ПОЛУЧЕНИЯ ОТ МОЗЪКА PRPSC ЗА СТРУКТУРНИ ПРОУЧВАНИЯ. ЗА ТАЗИ ЦЕЛ СИ СЪТРУДНИЧИХМЕ С ХОАКИН КАСТИЛИЯ (CIC-BIOGUNE, БИЛБАО) ЗА РАЗРАБОТВАНЕ НА МЕТОДИ ЗА ПРОИЗВОДСТВО НА ЗНАЧИТЕЛНИ КОЛИЧЕСТВА НАПЪЛНО ИНФЕКЦИОЗЕН RECPRPSC. СЛЕД ТОВА, ИЗПОЛЗВАЙКИ ОГРАНИЧЕНИ ИЗСЛЕДВАНИЯ НА ПРОТЕОЛИЗАТА И ЕЛЕКТРОННАТА МИКРОСКОПИЯ, ПОЛУЧИХМЕ СОЛИДНИ ДОКАЗАТЕЛСТВА, ПОКАЗВАЩИ, ЧЕ МОЗЪКЪТ И RECPRPSC ИМАТ ОБЩА ОСНОВНА АРХИТЕКТУРА. И НАКРАЯ, НИЕ РАЗРАБОТИХМЕ РЕШЕНИЕ NMR МЕТОДИ ЗА ПРОУЧВАНЕ RECPRPSC. _x000D_въоръжени с всичко това, ние се стремим сега: 1) ЗА ДА СЕ ИЗЯСНИ ДАЛИ ПОДРЕЖДАНЕТО НА RECPRPSC СУБЕДИНИЦАТА ПО RECPRPSC PROTOFILAMENT Е ГЛАВА ДО ГЛАВА ИЛИ ГЛАВА ДО ОПАШКА; 2: ЗА РАЗШИРЯВАНЕ НА ОГРАНИЧЕНИТЕ ДАННИ ЗА ПРОТЕОЛИЗА, ПОЛУЧЕНИ ДО МОМЕНТА, СВЪРЗВАНЕТО ИМ С ЧАСТИЧНОТО ИМ РАЗГРЪЩАНЕ. ПО-КОНКРЕТНО СЕ СТРЕМИМ ДА ПОТВЪРДИМ ИДЕНТИЧНОСТТА НА -СТРАНДС И ЛИНИИТЕ, КОИТО ВЕЧЕ СМЕ ИДЕНТИФИЦИРАЛИ УСЛОВНО, КАКТО И ДА ИДЕНТИФИЦИРАМЕ ДОПЪЛНИТЕЛНИ -СТРАНСТИ И КОНТУРИ В СТЪПАЛАТА НА 2 C-ТЕРМИНАЛ; 3: ДА СЕ РАЗШИРИ МЕТОДОЛОГИЯТА НА РЕШЕНИЕ ЯМР, РАЗРАБОТЕНА ЧРЕЗ BFU2013—48436-C2—1-P, КАТО СЕ ИЗПОЛЗВАТ АЛТЕРНАТИВНИ ПОДХОДИ ЗА ЧАСТИЧНО РАЗГРЪЩАНЕ RECPRPSC, ТАКА ЧЕ ДА СЕ ПОТВЪРДЯТ И РАЗШИРЯТ ДАННИТЕ, КОИТО СМЕ ПОЛУЧИЛИ ДО МОМЕНТА; 4: ДА СЕ ИНИЦИИРАТ ПОДХОДИ ЗА ПРЯКО ИЗУЧАВАНЕ НА RECPRPSC В ТВЪРДО СЪСТОЯНИЕ НА ЯМР. ПО-СПЕЦИАЛНО, ПРЕДЛАГАМЕ ДА СЕ ЗАПОЧНЕ С ПРОСТ 1D СОЛИДЕН ЯМР ПОДХОД, ЗА ДА СЕ ОЦЕНИ КОЛКО АМИНОКИСЕЛИНИ ОТ ВСЕКИ ТИП СА РАЗПОЛОЖЕНИ В -STRANDS СРЕЩУ БОБИНИ; 5: ЗА ДА СЕ ИНТЕГРИРАТ ВСИЧКИ СТРУКТУРНИ ОГРАНИЧЕНИЯ, ПОЛУЧЕНИ ЧРЕЗ ПРЕДХОДНИТЕ ЦЕЛИ, В ВСЕ ПО-ПРЕЦИЗЕН СТРУКТУРЕН МОДЕЛ НА RECPRPSC, ВКЛЮЧИТЕЛНО РЕЗБОВАНЕ И МОДЕЛИРАНЕ С ПОМОЩТА НА ИЗВЕСТНИ -SOLENOID SCAFFOLDS.ВСИЧКО ТОВА СЛЕДВА ДА ДОВЕДЕ ДО ПОДОБРЕН, АТОМИСТИЧЕН МОДЕЛ НА PRPSC, КОЙТО СЛЕДВА ДА СЕ ПРЕВЪРНЕ В ЕТАЛОН В ОБЛАСТТА. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
PRIONAI YRA INFEKCINIAI BALTYMAI. JIE YRA NESULANKSTYTOS VERSIJOS PAPRASTAI SULANKSTYTI ISOSEQUENTIAL BALTYMŲ. PRIONAI DAUGINAMI VERČIANT SAVO RAUMENINGUMĄ Į JŲ PAPRASTAI SULANKSTYTI PIRMTAKAI. PRPSC (PRIONO BALTYMAS, SKREPI IZOFORMA), PIRMASIS ATRASTAS PRIONAS, YRA MIRTINŲ NEURODEGENERACINIŲ LIGŲ, KURIOMIS SERGA ŽMONĖS, PAVYZDŽIUI, CREUTZFELDT-JAKOB LIGA, IR GYVŪNŲ, PVZ., GALVIJŲ SPONGIFORMINĖS ENCEFALOPATIJOS (GSE), DAR ŽINOMOS KAIP KARVIŲ LIGA, PRIEŽASTINIS AGENTAS. MŪSŲ IR KITŲ GRUPIŲ TYRIMAI PARODĖ, KAD PRPSC ARCHITEKTŪRA ATITINKA 4-RUNG -SOLENOID, KAD KAMINAI SUDARO AMILOIDINIUS PROTOFILAMENTUS. ŽINIOS APIE ŠIAS STRUKTŪRINES CHARAKTERISTIKAS, VIS DAR MAŽOS SKIRIAMOSIOS GEBOS, VIS DĖLTO LEIDŽIA SUPRASTI, KAIP PRPSC PLINTA: NEPORUOTI – STRANDAI Į UPPER- IR APATINIŲ RUNGČIŲ PROTOFILAMENTAI GALI ŠABLONĄ GAUNAMĄ IŠSISKLEIDUSIĄ PRP MOLEKULĘ, KAD SUSIDARYTŲ PANAŠUS -STRANDS, O TADA SUVYNIOTI Į PAPILDOMŲ RUNGČIŲ KAIP ŠVIEŽIŲ NEPORUOTAS – STRANDS YRA SUFORMUOTA. TAČIAU YRA DAUG PAGRINDINIŲ PRPSC BIOLOGIJOS ASPEKTŲ, KURIE TURI BŪTI AIŠKIAI ĮTRAUKTI Į JOS STRUKTŪRĄ, TODĖL JŲ NEGALIMA PAAIŠKINTI ESAMU STRUKTŪRINĖS PERTVARKYMO LYGIU. VISŲ PIRMA TAI, KAD EGZISTUOJA PERDAVIMO BARJERAI TARP RŪŠIŲ ARBA PRPSC PADERMIŲ, KURIŲ SEKA TA PATI, PASIŽYMI SKIRTINGOMIS BIOCHEMINĖMIS IR BIOLOGINĖMIS SAVYBĖMIS. Be to, DAUGIAU DETAILUOTOJO PREKIŲ STRUKTŪROS išaiškinimas bus racionaliai paruoštas racionaliai DESIGN DUOMENYS JŪSŲ KONTROLĖJE._x000D_ THIS CONTEXT, MŪSŲ PROPOSALINIAI AIMS, KURIUOS TIKSLAS TIKSLAS TURTŪROS INFORMACIJA INFORMACIJA apie PrPSc prionų STRUKTŪRĄ, TAI, kad būtų galima atnaujinti CURRENT STRUCTURAL MODEL. TAI YRA MŪSŲ DABARTINĖS NACIONALINĖS DOTACIJOS, BFU2013–48436-C2–1-P, TĘSINYS PER ŠĮ PROJEKTĄ, MES SUKŪRĖME KELIĄ NAUDOTI REKOMBINANTINĮ PRPSC (RECPRPSC) KAIP TINKAMĄ SMEGENŲ IŠVESTINIO PRPSC PAKAITALĄ STRUKTŪRINIAMS TYRIMAMS. ŠIUO TIKSLU BENDRADARBIAVOME SU JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO), KAD SUKURTUME METODUS, SKIRTUS GAMINTI DIDELIUS KIEKIUS VISIŠKAI INFEKCINIŲ RECPRPSC. TADA, NAUDOJANT RIBOTUS PROTEOLIZĖS IR ELEKTRONŲ MIKROSKOPIJOS TYRIMUS, MES GAVOME STIPRIŲ ĮRODYMŲ, RODANČIŲ, KAD SMEGENYS IR RECPRPSC TURI BENDRĄ PAGRINDINĘ ARCHITEKTŪRĄ. GALIAUSIAI, MES SUKŪRĖME SPRENDIMĄ NMR METODUS STUDIJUOTI RECPRPSC. _x000D_ ginkluoti su visais šiais, mes PROPOSE DABAR: 1) IŠSIAIŠKINTI, AR „RECPRPSC“ SUBVIENETO KROVIMAS IŠILGAI „RECPRPSC“ PROTOFILAMENTO YRA „GALVOS Į GALVĄ“ ARBA „GALVOS Į UODEGĄ“; 2: SIEKIANT IŠPLĖSTI IKI ŠIOL GAUTUS RIBOTUS PROTEOLIZĖS DUOMENIS, JUOS SUSIEJANT SU DALINIU ATSISKLEIDIMU. KONKREČIAI SIEKIAME PATVIRTINTI -STRANDS IR KILPŲ, KURIAS JAU PRELIMINARIAI IDENTIFIKAVOME, TAPATYBĘ IR NUSTATYTI PAPILDOMAS – STRANDS IR KILPAS 2 C GALŪNĖSE; 3: IŠPLĖSTI NMR METODOLOGIJĄ, SUKURTĄ PER BFU2013–48436-C2–1-P, TAIKANT ALTERNATYVIUS METODUS, KAIP IŠ DALIES ATSISKLEISTI RECPRPSC, SIEKIANT PATVIRTINTI IR IŠPLĖSTI IKI ŠIOL GAUTUS DUOMENIS; 4: INICIJUOTI KIETOSIOS BŪSENOS NMR METODUS TIESIOGIAI STUDIJUOTI RECPRPSC. VISŲ PIRMA SIŪLOME PRADĖTI NUO PAPRASTO 1D KIETO NMR METODO, SIEKIANT ĮVERTINTI, KIEK KIEKVIENO TIPO AMINORŪGŠČIŲ YRA -STRANDS VS RITĖSE; 5: INTEGRUOTI VISUS STRUKTŪRINIUS APRIBOJIMUS, GAUTUS ĮGYVENDINANT ANKSTESNIUS TIKSLUS, Į VIS LABIAU PATOBULINTĄ „RECPRPSC“ STRUKTŪRINĮ MODELĮ, ĮSKAITANT SRIEGIMĄ IR MODELIAVIMĄ NAUDOJANT ŽINOMĄ -SOLENOID SCAFFOLDS.VISA TAI TURĖTŲ PASKATINTI TOBULESNĮ ATOMINĮ PRPSC MODELĮ, KURIS TURĖTŲ TAPTI ETALONU ŠIOJE SRITYJE. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
PRIONI SU ZARAZNI PROTEINI. TO SU KRIVO PRESAVIJENE VERZIJE OBIČNO PRESAVIJENIH PROTEINA ISOSEQUENTIAL. PRIONI SE RAZMNOŽAVAJU PRISILJAVAJUĆI SVOJU KONFORMACIJU U SVOJE UOBIČAJENO PRESAVIJENE PREKURSORE. PRPSC (PRIONSKI PROTEIN, IZOFORM GREBEŽA), PRVI PRION KOJI SE OTKRIVA, UZROČNO JE UZROČNIK SMRTONOSNIH NEURODEGENERATIVNIH BOLESTI KOJE ZAHVAĆAJU LJUDE, POPUT CREUTZFELDT-JAKOBOVE BOLESTI, I ŽIVOTINJA, POPUT GOVEĐE SPONGIFORMNE ENCEFALOPATIJE (BSE), TAKOĐER POZNATE KAO BOLEST KRAVA. ISTRAŽIVANJA IZ NAŠIH I DRUGIH GRUPA POKAZALA SU DA JE ARHITEKTURA PRPSC U SKLADU S 4-RUNG -SOLENOID, KOJI HRPE ZA FORMIRANJE AMILOIDNIH PROTOFILAMENTA. POZNAVANJE OVIH STRUKTURNIH KARAKTERISTIKA, JOŠ UVIJEK NISKE RAZLUČIVOSTI, IPAK OMOGUĆUJE RAZUMIJEVANJE KAKO PRPSC PROPAGIRA: NESPARENI – STRANDS U UPPER- I DONJI PREČKE PROTOFILAMENTA MOGU PREDLOŠKA DOLAZNE ODVIJA PRP MOLEKULE ZA FORMIRANJE SLIČNE – STRANDS, A ZATIM ZAVOJNICA ZA FORMIRANJE DODATNE PREČKE KAO SVJEŽE NESPARENE – STRANDS SU FORMIRANI. MEĐUTIM, POSTOJE MNOGI KLJUČNI ASPEKTI PRPSC BIOLOGIJE KOJI MORAJU BITI OČITO ŠIFRIRANI U SVOJOJ STRUKTURI I STOGA SE NE MOGU OBJASNITI TRENUTNOM RAZINOM STRUKTURNE REZOLUCIJE. KONKRETNO, POSTOJANJE BARIJERA ZA PRIJENOS IZMEĐU VRSTA ILI SOJEVA PRPSC-A, KOJI IMAJU ISTI SLIJED, IMAJU RAZLIČITA BIOKEMIJSKA I BIOLOŠKA SVOJSTVA. Nadalje, više DETALNO rasvjetljavanje STRUCTURE PrPSc će biti racionalno DESIGN DRUGS za te CURRENTLY FATALNI DISEASES._x000D_ U ovom KONTEXTU, Naši PROPOSALni AIMS na OBTAINING FURTHER STRUCTURAL INFORMACIJE o stanju PrPSc priona, kako bi se ispravili CURRENT STRUCTURAL MODEL. TO JE NASTAVAK NAŠE TRENUTNE NACIONALNE POTPORE, BFU2013 – 48436-C2 – 1-P. KROZ OVAJ PROJEKT, UTRLI SMO PUT ZA KORIŠTENJE REKOMBINANTNOG PRPSC (RECPRPSC) KAO ODGOVARAJUĆE SUROGAT PRPSC IZ MOZGA ZA STRUKTURNE STUDIJE. ZA TO SMO SURAĐIVALI S JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO) RAZVITI METODE ZA PROIZVODNJU ZNAČAJNE KOLIČINE POTPUNO ZARAZNE RECPRPSC. ZATIM SMO, KORISTEĆI OGRANIČENE STUDIJE PROTEOLIZE I MIKROSKOPIJE ELEKTRONA, DOBILI ČVRSTE DOKAZE KOJI UKAZUJU NA TO DA MOZAK I REKPRPSC DIJELE ZAJEDNIČKU OSNOVNU ARHITEKTURU. KONAČNO, RAZVILI SMO RJEŠENJE NMR METODE ZA PROUČAVANJE RECPRPSC. _x000D_ naoružani sa svim tim, mi PROPOSE SADA: 1) RAZJASNITI JE LI SLAGANJE PODJEDINICE RECPRPSC DUŽ PROTOFILAMENTA RECPRPSC OD GLAVE DO GLAVE ILI OD GLAVE DO REPA; 2: PROŠIRITI DO SADA DOBIVENE OGRANIČENE PODATKE O PROTEOLIZI, POVEZUJUĆI IH S DJELOMIČNIM RAZVOJEM. POSEBNO NASTOJIMO POTVRDITI IDENTITET -STRANDS-A I PETLJI KOJE SMO VEĆ PRIVREMENO IDENTIFICIRALI TE UTVRDITI DODATNE -STRANDS I PETLJE U 2 C-TERMINALA; 3: PROŠIRITI RJEŠENJE NMR METODOLOGIJU RAZVIJENU KROZ BFU2013 – 48436-C2 – 1-P KORISTEĆI ALTERNATIVNE PRISTUPE RECPRPSC DJELOMIČNOM RAZVOJU, KAKO BI SE POTVRDILI I PROŠIRILI PODACI KOJE SMO DOSAD DOBILI; 4: ZA POKRETANJE SOLIDNE DRŽAVE NMR PRISTUPI ZA PROUČAVANJE RECPRPSC IZRAVNO. KONKRETNO, PREDLAŽEMO DA SE ZAPOČNE S JEDNOSTAVNIM 1D SOLIDNIM NMR PRISTUPOM KAKO BI SE PROCIJENILO KOLIKO SE AMINOKISELINA SVAKE VRSTE NALAZI U -STRANDS VS. ZAVOJNICA; 5: INTEGRIRATI SVA STRUKTURNA OGRANIČENJA DOBIVENA KROZ PRETHODNE CILJEVE U SVE PRECIZNIJI STRUKTURNI MODEL RECPRPSC, UKLJUČUJUĆI NAVOJE I MODELIRANJE POMOĆU POZNATIH -SOLENOID SCAFFOLDS.ALL TO BI TREBALO DOVESTI DO POBOLJŠANOG, ATOMISTIČKOG MODELA PRPSC KOJI BI TREBAO POSTATI REFERENCA NA TERENU. (Croatian)
18 August 2022
0 references
PRIONS ÄR SMITTSAMMA PROTEINER. DE ÄR FELVIKTA VERSIONER AV NORMALT VIKTA ISOSEQUENTIAL PROTEINER. PRIONS FÖRÖKAS GENOM ATT TVINGA DERAS KONFORMATION TILL SINA NORMALT VIKTA PREKURSORER. PRPSC (PRIONPROTEIN, SCRAPIE ISOFORM), DEN FÖRSTA PRION SOM SKA UPPTÄCKAS, ÄR ORSAKEN TILL DÖDLIGA NEURODEGENERATIVA SJUKDOMAR SOM DRABBAR MÄNNISKOR, SÅSOM CREUTZFELDT-JAKOBS SJUKDOM, OCH DJUR, SOM BOVIN SPONGIFORM ENCEFALOPATI (BSE), ÄVEN KÄND SOM GALNA KOSJUKAN. FORSKNING FRÅN VÅRA OCH ANDRA GRUPPER HAR VISAT ATT ARKITEKTUREN I PRPSC ÖVERENSSTÄMMER MED EN 4-RUNG -SOLENOID, SOM STAPLAR FÖR ATT BILDA AMYLOID PROTOFILAMENT. KUNSKAP OM DESSA STRUKTURELLA EGENSKAPER, SOM FORTFARANDE HAR LÅG UPPLÖSNING, GÖR DET ÄNDÅ MÖJLIGT ATT FÖRSTÅ HUR PRPSC SPRIDER SIG: DE UNPARADE -STRANDS I UPPER- OCH NEDRE STEGPINNARNA I PROTOFILAMENTET KAN MALLA EN INKOMMANDE OVIKTAD PRP-MOLEKYL FÖR ATT BILDA LIKNANDE -STRANDS, OCH SEDAN SPOLA FÖR ATT BILDA YTTERLIGARE STEGPINNAR SOM FÄRSKA UNPARADE -STRANDS BILDAS. DET FINNS DOCK MÅNGA VIKTIGA ASPEKTER AV PRPSC-BIOLOGIN SOM UPPENBARLIGEN MÅSTE ANGES I DESS STRUKTUR OCH DÄRFÖR INTE KAN FÖRKLARAS MED DEN NUVARANDE NIVÅN AV STRUKTURELL UPPLÖSNING. I SYNNERHET FÖREKOMSTEN AV ÖVERFÖRINGSBARRIÄRER MELLAN ARTER ELLER PRPSC-STAMMAR, SOM HAR SAMMA SEKVENS, UPPVISAR OLIKA BIOKEMISKA OCH BIOLOGISKA EGENSKAPER. Dessutom kommer en mer avancerad utredning av PrPScs STRUCTURNING att göra en rationell bedömning av de små och medelstora FATAL DISEASES._x000D_ I DENNA CONTEXT, VÅRA PROPOSAL AIMS I OBTAINING SOM ÄR STRUCTURLIGA INFORMATION OM STRUCTURNING AV PrPSC-prions, så som att återge den stadiga STRUCTURELLA MODELn. DET ÄR EN FORTSÄTTNING PÅ VÅRT NUVARANDE NATIONELLA BIDRAG, BFU2013–48436-C2–1-P. GENOM DETTA PROJEKT, BANADE VI VÄGEN FÖR ATT ANVÄNDA REKOMBINANT PRPSC (RECPRPSC) SOM EN LÄMPLIG SURROGAT AV HJÄRNBASERAD PRPSC FÖR STRUKTURSTUDIER. FÖR DETTA SAMARBETADE VI MED JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO) FÖR ATT UTVECKLA METODER FÖR ATT PRODUCERA BETYDANDE MÄNGDER HELT SMITTSAM RECPRPSC. SEDAN, MED HJÄLP AV BEGRÄNSADE PROTEOLYS OCH ELEKTRONMIKROSKOPI STUDIER, FICK VI STARKA BEVIS SOM TYDER PÅ ATT HJÄRNA OCH RECPRPSC HAR EN GEMENSAM GRUNDARKITEKTUR. SLUTLIGEN UTVECKLADE VI LÖSNING NMR-METODER FÖR ATT STUDERA RECPRPSC. _x000D_ väpnat med alla dessa, VI PROPOSE NU: 1) ATT KLARGÖRA HURUVIDA STAPLINGEN AV REPRPSC-SUBENHETEN LÄNGS REPRPSC-PROTOFILAMENTET ÄR HUVUD-MOT-SVANS ELLER HUVUD-TILL-SVANS. 2: FÖR ATT UTÖKA DEN BEGRÄNSADE PROTEOLYSDATA SOM HITTILLS ERHÅLLITS, KOPPLA DEN TILL PARTIELL UTVECKLING. VI STRÄVAR SPECIFIKT EFTER ATT BEKRÄFTA IDENTITETEN HOS -STRANDS OCH LOOPAR SOM VI REDAN PRELIMINÄRT HAR IDENTIFIERAT, OCH ATT IDENTIFIERA YTTERLIGARE -STRANDS OCH LOOPAR I DE 2 C-TERMINALERNA. 3: ATT UTVIDGA DEN NMR-METODIK SOM UTVECKLATS GENOM BFU2013–48436-C2–1-P MED HJÄLP AV ALTERNATIVA METODER FÖR PARTIELL UTVECKLING AV RECPRPSC, FÖR ATT BEKRÄFTA OCH UTÖKA DE UPPGIFTER SOM VI HITTILLS HAR INHÄMTAT; 4: ATT INITIERA SOLIDA STATLIGA NMR-METODER FÖR ATT STUDERA RECPRPSC DIREKT. I SYNNERHET FÖRESLÅR VI ATT BÖRJA MED EN ENKEL 1D SOLID NMR-METOD FÖR ATT BEDÖMA HUR MÅNGA AMINOSYROR AV VARJE TYP SOM FINNS I -STRANDS VS. SPOLAR; 5: ATT INTEGRERA ALLA STRUKTURELLA BEGRÄNSNINGAR SOM ERHÅLLITS GENOM DE FÖREGÅENDE MÅLEN I EN ALLT MER FÖRFINAD STRUKTURMODELL AV RECPRPSC, INKLUSIVE GÄNGNING OCH MODELLERING MED HJÄLP AV KÄNDA -SOLENOID SCAFFOLDS.ALL DETTA BÖR LEDA TILL EN FÖRBÄTTRAD ATOMISTISK MODELL AV PRPSC SOM BÖR BLI EN REFERENS INOM OMRÅDET. (Swedish)
18 August 2022
0 references
PRIONII SUNT PROTEINE INFECȚIOASE. ACESTEA SUNT VERSIUNI GREȘITE ALE PROTEINELOR ISOSEQUENTIAL PLIATE ÎN MOD NORMAL. PRIONII SE PROPAGĂ FORȚÂND CONFORMAȚIA LOR ÎN PRECURSORII LOR ÎN MOD NORMAL PLIAȚI. PRPSC (PROTEINA PREPONDERENTĂ, SCRAPIE ISOFORMĂ), PRIMUL PRION DESCOPERIT, ESTE AGENTUL CAUZAL AL BOLILOR NEURODEGENERATIVE MORTALE CARE AFECTEAZĂ OAMENII, CUM AR FI BOALA CREUTZFELDT-JAKOB, ȘI ANIMALELE, CUM AR FI ENCEFALOPATIA SPONGIFORMĂ BOVINĂ (ESB), CUNOSCUTĂ ȘI SUB NUMELE DE BOALA VACII MADO. CERCETĂRILE DE LA NOI ȘI ALTE GRUPURI AU ARĂTAT CĂ ARHITECTURA PRPSC ESTE CONFORMĂ CU UN 4-RUNG -SOLENOID, CARE STIVE PENTRU A FORMA PROTOFILAMENTS AMILOID. CUNOAȘTEREA ACESTOR CARACTERISTICI STRUCTURALE, ÎNCĂ DE O REZOLUȚIE SCĂZUTĂ, PERMITE, CU TOATE ACESTEA, O ÎNȚELEGERE A MODULUI ÎN CARE PRPSC SE PROPAGĂ: NEPERECHE -STRANDS ÎN UPPER- ȘI MAI MICI TREPTE DE PROTOFILAMENT POT ȘABLON O MOLECULĂ PRP DE INTRARE NEPLIATĂ PENTRU A FORMA SIMILARE -STRANDS, ȘI APOI BOBINA PENTRU A FORMA TREPTE SUPLIMENTARE CA PROASPETE NEPERECHE -STRANDS SUNT FORMATE. CU TOATE ACESTEA, EXISTĂ MULTE ASPECTE-CHEIE ALE BIOLOGIEI PRPSC CARE TREBUIE ÎN MOD EVIDENT INTEGRATE ÎN STRUCTURA SA ȘI, PRIN URMARE, NU POT FI EXPLICATE CU NIVELUL ACTUAL AL REZOLUȚIEI STRUCTURALE. ÎN SPECIAL, EXISTENȚA UNOR BARIERE DE TRANSMITERE ÎNTRE SPECII SAU TULPINI PRPSC, CARE AU ACEEAȘI SECVENȚĂ, PREZINTĂ PROPRIETĂȚI BIOCHIMICE ȘI BIOLOGICE DIFERITE. Mai mult decât atât, o mai mare elucidare a STRUCTURII PrPSc va ajuta în mod rațional la DRUGELE DEZVOLTARE CURRENTLY FATAL._x000D_ în acest context, AI noastre PROPOSALE LA OBTAINAREA DE INFORMAȚII STRUCTURALE privind STRUCTURALUL STRUCTURAL STRUCTURAL STRUCTURAL STRUCTURAL PRPSC, astfel încât să restabilească MODELUL STRUCTURAL CURRENT. ESTE O CONTINUARE A GRANTULUI NOSTRU NAȚIONAL ACTUAL, BFU2013-48436-C2-1-P. PRIN ACEST PROIECT, AM DESCHIS CALEA PENTRU A UTILIZA PRPSC RECOMBINANT (RECPRPSC) CA UN SUROGAT ADECVAT AL PRPSC DERIVAT DIN CREIER PENTRU STUDII STRUCTURALE. PENTRU ACEASTA, AM COLABORAT CU JOAQUIN CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO) PENTRU A DEZVOLTA METODE PENTRU A PRODUCE CANTITĂȚI SEMNIFICATIVE DE RECPRPSC COMPLET INFECȚIOASE. APOI, FOLOSIND STUDII LIMITATE DE PROTEOLIZĂ ȘI MICROSCOPIE ELECTRONICĂ, AM OBȚINUT DOVEZI PUTERNICE CARE INDICĂ FAPTUL CĂ CREIERUL ȘI RECPRPSC AU O ARHITECTURĂ COMUNĂ DE BAZĂ. ÎN CELE DIN URMĂ, AM DEZVOLTAT SOLUȚII NMR METODE PENTRU A STUDIA RECPRPSC. _x000D_ înarmat cu toate acestea, noi protejăm acum: 1) PENTRU A ELUCIDA DACĂ STIVUIREA SUBUNITĂȚII RECPRPSC DE-A LUNGUL PROTOFILAMENTULUI RECPRPSC ESTE CAP LA CAP SAU CAP LA COADĂ; 2: PENTRU A EXTINDE DATELE LIMITATE DE PROTEOLIZĂ OBȚINUTE PÂNĂ ÎN PREZENT, CUPLAREA ACESTORA LA DERULAREA PARȚIALĂ. URMĂRIM ÎN MOD SPECIFIC SĂ CONFIRMĂM IDENTITATEA -STRANDS-URILOR ȘI A BUCLELOR PE CARE LE-AM IDENTIFICAT DEJA PROVIZORIU, PRECUM ȘI SĂ IDENTIFICĂM -STRANDS ȘI BUCLE SUPLIMENTARE ÎN CELE 2 TREPTE C-TERMINALE; 3: EXTINDEREA SOLUȚIEI METODOLOGIA RMN DEZVOLTATĂ PRIN BFU2013-48436-C2-1-P FOLOSIND ABORDĂRI ALTERNATIVE PENTRU DERULAREA PARȚIALĂ A RECPRPSC, ASTFEL ÎNCÂT SĂ CONFIRMĂM ȘI SĂ EXTINDEM DATELE PE CARE LE-AM OBȚINUT PÂNĂ ACUM; 4: SĂ INIȚIEZE ABORDĂRI SOLIDE ALE RMN PENTRU A STUDIA DIRECT RECPRPSC. ÎN SPECIAL, PROPUNEM SĂ ÎNCEPEM CU O ABORDARE SIMPLĂ RMN SOLIDĂ 1D PENTRU A EVALUA CÂȚI AMINOACIZI DE FIECARE TIP SUNT SITUAȚI ÎN -STRANDS VS. BOBINE; 5: PENTRU A INTEGRA TOATE RESTRICȚIILE STRUCTURALE OBȚINUTE PRIN OBIECTIVELE ANTERIOARE ÎNTR-UN MODEL STRUCTURAL DIN CE ÎN CE MAI RAFINAT DE RECPRPSC, INCLUSIV FILETAREA ȘI MODELAREA FOLOSIND SCAFFOLDS CUNOSCUTE -SOLENOID.ALL, ACEST LUCRU AR TREBUI SĂ CONDUCĂ LA UN MODEL ATOMIST ÎMBUNĂTĂȚIT AL PRPSC, CARE AR TREBUI SĂ DEVINĂ O REFERINȚĂ ÎN DOMENIU. (Romanian)
18 August 2022
0 references
PRIONI SO NALEZLJIVE BELJAKOVINE. SO NAPAČNE RAZLIČICE OBIČAJNO ZLOŽENE ISOSEQUENTIAL PROTEINOV. PRIONI SE RAZMNOŽUJEJO TAKO, DA JIH SILIJO V OBIČAJNO ZLOŽENE PREDHODNE SESTAVINE. PRPSC (PRIONSKI PROTEIN, IZOFORMA PRASKAVCA), PRVI PRION, KI GA JE TREBA ODKRITI, JE POVZROČITELJ SMRTONOSNIH NEVRODEGENERATIVNIH BOLEZNI, KI PRIZADENEJO LJUDI, KOT JE CREUTZFELDT-JAKOBOVA BOLEZEN, IN ŽIVALI, KOT JE GOVEJA SPONGIFORMNA ENCEFALOPATIJA (BSE), ZNANA TUDI KOT BOLEZEN NORIH KRAV. RAZISKAVE IZ NAŠIH IN DRUGIH SKUPIN SO POKAZALE, DA JE ARHITEKTURA PRPSC SKLADNA S 4-RUNG -SOLENOID, KI SE SKLADA ZA OBLIKOVANJE AMILOIDNIH PROTOFILAMENTOV. POZNAVANJE TEH STRUKTURNIH ZNAČILNOSTI, ŠE VEDNO NIZKE LOČLJIVOSTI, KLJUB TEMU OMOGOČA RAZUMEVANJE, KAKO SE PRPSC RAZMNOŽUJE: NEPARNI -STRANDS V UPPER- IN NAJNIŽJI KLINI PROTOFILAMENTA LAHKO ŠABLONE DOHODNE NERAZLOŽENE MOLEKULE PRP, DA TVORIJO PODOBNO -STRANDS, NATO PA TULJAVO ZA OBLIKOVANJE DODATNIH KLINOV, KOT SO OBLIKOVANI SVEŽI NEPARNI -STRANDS. VENDAR PA OBSTAJA VELIKO KLJUČNIH VIDIKOV PRPSC BIOLOGIJE, KI JIH JE TREBA JASNO VKLJUČITI V NJENO STRUKTURO IN JIH ZATO NI MOGOČE POJASNITI S SEDANJO RAVNJO STRUKTURNEGA REŠEVANJA. ZLASTI OBSTOJ PREPREK MED VRSTAMI ALI SEVI PRPSC, KI IMAJO ENAKO ZAPOREDJE, KAŽEJO RAZLIČNE BIOKEMIJSKE IN BIOLOŠKE LASTNOSTI. Poleg tega, VEČ POGLAVJE Razlaga STRUCTURE PrPSC WILL HELLP racionalno DESIGN DRUGS ZA TEČE STRUCTURALNE DIESEASES._x000D_ V THIS CONTEXT, NAŠE PROPOSALNE AIMS NA NAJBOLJŠE STRUKTURALNE INFORMACIJE O STRUCTURALNI INFORMACIJI O STRUCTURE PrPSc prionov, tako da OBRAVLJEN STRUCTURAL MODEL. TO JE NADALJEVANJE NAŠE TRENUTNE NACIONALNE DONACIJE, BFU2013–48436-C2–1-P. SKOZI TA PROJEKT, SMO UTRLI POT ZA UPORABO REKOMBINANTNEGA PRPSC (RECPRPSC) KOT USTREZNEGA NADOMESTKA MOŽGANOV PRIDOBLJENE PRPSC ZA STRUKTURNE ŠTUDIJE. ZA TO SMO SODELOVALI Z JOAQUINOM CASTILLO (CIC-BIOGUNE, BILBAO), DA BI RAZVILI METODE ZA PROIZVODNJO ZNATNIH KOLIČIN POPOLNOMA INFEKCIJSKIH REKPRPSC. NATO SMO Z OMEJENIMI ŠTUDIJAMI PROTEOLIZE IN ELEKTRONSKE MIKROSKOPIJE PRIDOBILI TRDNE DOKAZE, KI KAŽEJO, DA IMAJO MOŽGANI IN PRPSC SKUPNO OSNOVNO ARHITEKTURO. KONČNO SMO RAZVILI REŠITVE NMR METODE ZA ŠTUDIJ REKPRPSC. _x000D_ oborožen z VSE, VSE, Z ZADOVOLJSTVO ZDAJ: 1) POJASNITI, ALI JE ZLAGANJE PODENOTE REKPRPSC VZDOLŽ PROTOFILAMENTA RECPSC OD GLAVE DO GLAVE ALI OD GLAVE DO REPA; 2: DA BI RAZŠIRILI DO SEDAJ DOBLJENE OMEJENE PODATKE O PROTEOLIZI IN JIH POVEZALI Z DELNIM ODVIJANJEM. POSEBEJ SI PRIZADEVAMO ZA POTRDITEV IDENTITETE -STRANDS IN ZANK, KI SMO JIH ŽE ZAČASNO IDENTIFICIRALI, TER ZA IDENTIFIKACIJO DODATNIH -STRANDS IN ZANK V 2 C-TERMINALNIH KLINIH; 3: RAZŠIRITI METODOLOGIJO NMR REŠITVE, RAZVITE S POMOČJO BFU2013–48436-C2–1-P, Z UPORABO ALTERNATIVNIH PRISTOPOV K DELNEMU ODVIJANJU REKPRPSC, DA SE POTRDIJO IN RAZŠIRIJO DO SEDAJ PRIDOBLJENI PODATKI; 4: SPROŽITI PRISTOPE TRDNEGA STANJA NMR ZA NEPOSREDNO PREUČEVANJE REKPRPSC. ZLASTI PREDLAGAMO, DA SE ZAČNE S PREPROSTIM 1D TRDNIM NMR PRISTOPOM ZA OCENO, KOLIKO AMINOKISLIN VSAKE VRSTE SE NAHAJA V -STRANDS VS. TULJAVAH; 5: VKLJUČITI VSE STRUKTURNE OMEJITVE, PRIDOBLJENE S PREJŠNJIMI CILJI, V VEDNO BOLJ IZPOPOLNJEN STRUKTURNI MODEL RECPSC, VKLJUČNO Z NAVOJEM IN MODELIRANJEM Z UPORABO ZNANIH -SOLENOID SCAFFOLDS.VSE BI TO MORALO PRIVESTI DO IZBOLJŠANEGA, ATOMISTIČNEGA MODELA PRPSC, KI BI MORAL POSTATI REFERENCA NA TEM PODROČJU. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
PRIONY SĄ BIAŁKAMI ZAKAŹNYMI. SĄ TO BŁĘDNE WERSJE NORMALNIE SKŁADANYCH BIAŁEK ISOSEQUENTIAL. PRIONY ROZMNAŻAJĄ SIĘ POPRZEZ WYMUSZANIE ICH UFORMOWANIA W NORMALNIE ZŁOŻONE PREKURSORY. PRPSC (BIAŁKO PRIONOWE, IZOFORM TRZĘSAWKI), PIERWSZY PRION, KTÓRY ZOSTANIE ODKRYTY, JEST CZYNNIKIEM PRZYCZYNOWYM ŚMIERTELNYCH CHORÓB NEURODEGENERACYJNYCH DOTYKAJĄCYCH LUDZI, TAKICH JAK CHOROBA CREUTZFELDTA-JAKOBA, ORAZ ZWIERZĄT, TAKICH JAK GĄBCZASTA ENCEFALOPATIA BYDŁA (BSE), ZNANA RÓWNIEŻ JAKO CHOROBA KRÓW MDŁYCH¿. BADANIA Z NASZYCH I INNYCH GRUP WYKAZAŁY, ŻE ARCHITEKTURA PRPSC JEST ZGODNA Z 4-RUNG -SOLENOID, KTÓRY UKŁADA SIĘ W PROTOFILAMENTY AMYLOIDOWE. ZNAJOMOŚĆ TYCH CECH KONSTRUKCYJNYCH, WCIĄŻ O NISKIEJ ROZDZIELCZOŚCI, POZWALA JEDNAK ZROZUMIEĆ, W JAKI SPOSÓB PRPSC PROPAGUJE: NIESPAROWANE -STRANDS W UPPER- I NAJNIŻSZE SZCZEBLE PROTOFILAMENTU MOGĄ SZABLON PRZYCHODZĄCEJ ROZWIJANEJ CZĄSTECZKI PRP, ABY UTWORZYĆ PODOBNY -STRANDS, A NASTĘPNIE CEWKI, ABY UTWORZYĆ DODATKOWE SZCZEBLE JAK ŚWIEŻE NIESPAROWANE -STRANDS SĄ TWORZONE. ISTNIEJE JEDNAK WIELE KLUCZOWYCH ASPEKTÓW BIOLOGII PRPSC, KTÓRE MUSZĄ BYĆ OCZYWIŚCIE OTOCZONE JEJ STRUKTURĄ I DLATEGO NIE MOŻNA ICH WYTŁUMACZYĆ OBECNYM POZIOMEM ROZDZIELCZOŚCI STRUKTURALNEJ. W SZCZEGÓLNOŚCI ISTNIENIE BARIER TRANSMISYJNYCH MIĘDZY GATUNKAMI LUB SZCZEPAMI PRPSC, KTÓRE MAJĄ TĘ SAMĄ SEKWENCJĘ, WYKAZUJĄ RÓŻNE WŁAŚCIWOŚCI BIOCHEMICZNE I BIOLOGICZNE. Ponadto, WIĘCEJ DOSTĘPNE Wyjaśnienie STRUKTURY PrPSc będzie PRODUKCJA racjonalnie DESIGN DRUGY NA DISEASYJNYCH FATALÓW._x000D_ W TYM KONTEXT, Nasz PROPOSAL AIMS NA OBJĄCYCH INFORMACJI STRUKTURALNEJ NA STRUKTURY PrPSc prions, tak jak to zrobić, aby zwrócić uwagę na CURRENT STRUCTURAL MODEL. JEST TO KONTYNUACJA NASZEJ OBECNEJ DOTACJI KRAJOWEJ, BFU2013-48436-C2-1-P. POPRZEZ TEN PROJEKT, UTOROWALIŚMY DROGĘ DO WYKORZYSTANIA REKOMBINOWANEGO PRPSC (RECPRPSC) JAKO ODPOWIEDNIEGO ZASTĘPSTWA PRPSC POCHODZĄCEGO Z MÓZGU DO BADAŃ STRUKTURALNYCH. W TYM CELU WSPÓŁPRACOWALIŚMY Z JOAQUINEM CASTILLA (CIC-BIOGUNE, BILBAO) W CELU OPRACOWANIA METOD WYTWARZANIA ZNACZNYCH ILOŚCI W PEŁNI ZAKAŹNEGO RECPRPSC. NASTĘPNIE, KORZYSTAJĄC Z OGRANICZONYCH BADAŃ PROTEOLIZY I MIKROSKOPII ELEKTRONOWEJ, UZYSKALIŚMY SILNE DOWODY WSKAZUJĄCE, ŻE MÓZG I RECPRPSC MAJĄ WSPÓLNĄ PODSTAWOWĄ ARCHITEKTURĘ. NA KONIEC OPRACOWALIŚMY METODY NMR DO BADANIA RECPRPSC. _x000D_ uzbrojony z WSZYSTKIE, PROPOZYCJA TERAZ: 1) WYJAŚNIĆ, CZY UKŁADANIE W STOS PODJEDNOSTKI RECPRPSC WZDŁUŻ PROTOFILAMENTU RECPRPSC TO HEAD-TO-HEAD CZY HEAD-TO-TAIL; 2: ABY ROZSZERZYĆ DOTYCHCZAS OGRANICZONE DANE DOTYCZĄCE PROTEOLIZY, ŁĄCZĄC JE Z CZĘŚCIOWYM ROZKŁADEM. W SZCZEGÓLNOŚCI STARAMY SIĘ POTWIERDZIĆ TOŻSAMOŚĆ -STRANDS I PĘTLI, KTÓRE JUŻ WSTĘPNIE ZIDENTYFIKOWALIŚMY, ORAZ ZIDENTYFIKOWAĆ DODATKOWE -STRANDS I PĘTLE NA 2 SZCZYTACH C; 3: ROZSZERZENIE METODYKI NMR OPRACOWANEJ ZA POMOCĄ BFU2013-48436-C2-1-P PRZY ZASTOSOWANIU METOD ALTERNATYWNYCH DO REPRPSC CZĘŚCIOWEGO ROZKŁADANIA W CELU POTWIERDZENIA I ROZSZERZENIA DANYCH, KTÓRE DOTYCHCZAS UZYSKALIŚMY; 4: ABY ZAINICJOWAĆ PODEJŚCIE NMR PÓŁPRZEWODNIKOWE DO BEZPOŚREDNIEGO BADANIA RECPRPSC. W SZCZEGÓLNOŚCI PROPONUJEMY ZACZĄĆ OD PROSTEGO PODEJŚCIA 1D STAŁEGO NMR, ABY OCENIĆ, ILE AMINOKWASÓW KAŻDEGO TYPU ZNAJDUJE SIĘ W -STRANDS VS. CEWKI; 5: ABY ZINTEGROWAĆ WSZYSTKIE OGRANICZENIA KONSTRUKCYJNE UZYSKANE POPRZEZ POPRZEDNIE CELE W CORAZ BARDZIEJ WYRAFINOWANY MODEL KONSTRUKCYJNY RECPRPSC, W TYM GWINTOWANIE I MODELOWANIE PRZY UŻYCIU ZNANYCH -SOLENOID SCAFFOLDS. WSZYSTKIE POWINNO TO PROWADZIĆ DO ULEPSZONEGO, ATOMOWEGO MODELU PRPSC, KTÓRY POWINIEN STAĆ SIĘ PUNKTEM ODNIESIENIA W TEJ DZIEDZINIE. (Polish)
18 August 2022
0 references
Santiago de Compostela
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
BFU2017-86692-P
0 references