Study of transcriptome (Seq RNA) and miRNoma (Small RNA Seq) in non-small cell lung cancer for the study of intratumoral heterogeneity. Finding molecular markers prognostic and extreme sensitivity to treatment (Q3164239)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3164239 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Study of transcriptome (Seq RNA) and miRNoma (Small RNA Seq) in non-small cell lung cancer for the study of intratumoral heterogeneity. Finding molecular markers prognostic and extreme sensitivity to treatment |
Project Q3164239 in Spain |
Statements
55,539.0 Euro
0 references
102,000.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2015
0 references
31 March 2018
0 references
FUNDACION CENTRO NAL DE INV. CARDIOVASCULARES CARLOS III
0 references
El cáncer de pulmón es uno de los de mayor tasa de mortalidad a nivel mundial, y el de tipo no microcítico (CPNM) el más frecuente y de difícil tratamiento. En CPNM, aunque el fracaso en la aplicación clínica de los datos moleculares está vinculado a multitud de factores, la heterogeneidad intratumoral se cree que juega un papel clave. Se piensa que la heterogeneidad de un tumor tipo CPNM es debida a la capacidad de las células iniciadoras tumorales (CIT) de autorenovarse y de diferenciar en diferentes tipos de células tumorales, y que esto viene regulado por el microambiente tumoral. En el presente subproyecto planteamos determinar el impacto de diferentes componentes del microambiente tumoral de CPNM sobre el programa transcripcional de las CIT. A partir de muestras clínicas de pacientes se purificaran las CIT y se cocultivaran con diferentes componentes celulares de su microentorno. Mediante la secuenciación del transcriptoma (RNA-Seq) y del miRNoma (Small-RNASeq) de estas CITs determinaremos la contribución específica de diferentes componentes del microambiente en la autorenovación, proliferación y diferenciación de estas células clave para la formación, progresión y resistencia del CPNM. Este tipo de caracterización molecular podría resultar en la identificación nuevos biomarcadores de progresión o en dianas antitumorales. También caracterizaremos la transcriptómica (single-cell RNA Seq) de células tumorales circulantes que se encuentran en la sangre de pacientes en estadios avanzados. Se pretende así investigar cambios transcripcionales que arrojen luz sobre el proceso de metástasis y que abran nuevos caminos para combatirlo (Spanish)
0 references
Lung cancer is one of the highest mortality rates worldwide, and non-small cell cancer (NCP) is the most frequent and difficult to treat. In NSCLC, although failure in the clinical application of molecular data is linked to a multitude of factors, intratumoral heterogeneity is believed to play a key role. The heterogeneity of a NSCLC-type tumor is thought to be due to the ability of tumor initiating cells (ITC) to self-renovate and to differentiate into different types of tumor cells, and that this is regulated by the tumor microenvironment. In this sub-project we propose to determine the impact of different components of the NSCLC tumor microenvironment on the ILC transcriptional program. From clinical samples of patients, CITs will be purified and cocultivated with different cellular components of their microenvironment. By sequencing the transcriptome (RNA-Seq) and miRNoma (Small-RNASeq) of these CITs we will determine the specific contribution of different components of the microenvironment in the self-renewal, proliferation and differentiation of these key cells for the formation, progression and resistance of NSCLC. This type of molecular characterisation could result in the identification of new progression biomarkers or antitumor targets. We will also characterise the transcriptomic (single-cell RNA Seq) of circulating tumor cells found in the blood of advanced-stage patients. It is intended to investigate transcriptional changes that shed light on the process of metastasis and open new ways to combat it. (English)
12 October 2021
0.9193342397372338
0 references
Le cancer du poumon est l’un des taux de mortalité les plus élevés au monde, et le cancer non à petites cellules (PCN) est le cancer le plus fréquent et le plus difficile à traiter. Dans le NSCLC, bien que l’échec de l’application clinique des données moléculaires soit lié à une multitude de facteurs, on croit que l’hétérogénéité intratumorale joue un rôle clé. On pense que l’hétérogénéité d’une tumeur de type NSCLC est due à la capacité des cellules initiatrices de tumeur (CTI) à s’autorénover et à se différencier en différents types de cellules tumorales, ce qui est régulé par le microenvironnement tumoral. Dans ce sous-projet, nous proposons de déterminer l’impact des différentes composantes du microenvironnement tumoral NSCLC sur le programme de transcription de l’ILC. À partir d’échantillons cliniques de patients, les CIT seront purifiés et cocultivés avec différents composants cellulaires de leur microenvironnement. En séquençant le transcriptome (RNA-Seq) et le miRNoma (Small-RNASeq) de ces CIT, nous déterminerons la contribution spécifique des différentes composantes du microenvironnement dans l’auto-renouvellement, la prolifération et la différenciation de ces cellules clés pour la formation, la progression et la résistance de NSCLC. Ce type de caractérisation moléculaire pourrait conduire à l’identification de nouveaux biomarqueurs de progression ou de cibles antitumorales. Nous allons également caractériser le transcriptomique (single-cellule RNA Seq) des cellules tumorales circulantes trouvées dans le sang de patients en stade avancé. Il vise à étudier les changements transcriptionnels qui éclairent le processus de métastase et ouvrent de nouvelles façons de le combattre. (French)
4 December 2021
0 references
Lungenkrebs ist eine der höchsten Mortalitätsraten weltweit, und nicht-kleinzellige Krebsarten (NCP) sind am häufigsten und schwer zu behandeln. In NSCLC, obwohl das Versagen bei der klinischen Anwendung molekularer Daten mit einer Vielzahl von Faktoren verbunden ist, wird angenommen, dass intratumorale Heterogenität eine Schlüsselrolle spielt. Die Heterogenität eines NSCLC-Typ-Tumors wird angenommen, weil Tumorzellen (ITC) in der Lage sind, sich selbst zu renovieren und in verschiedene Arten von Tumorzellen zu differenzieren, und dass dies durch die Tumormikroumgebung reguliert wird. In diesem Teilprojekt schlagen wir vor, die Auswirkungen verschiedener Komponenten der NSCLC-Tumormikroumgebung auf das ILC-Transkriptionsprogramm zu ermitteln. Aus klinischen Proben von Patienten werden CITs gereinigt und mit verschiedenen zellulären Komponenten ihrer Mikroumgebung kokultiviert. Durch die Sequenzierung der Transkriptome (RNA-Seq) und miRNoma (Small-RNASeq) dieser CITs werden wir den spezifischen Beitrag verschiedener Komponenten der Mikroumgebung in der Selbsterneuerung, Proliferation und Differenzierung dieser Schlüsselzellen für die Bildung, Progression und Resistenz von NSCLC bestimmen. Diese Art der molekularen Charakterisierung könnte dazu führen, dass neue Progressions-Biomarker oder Antitumorziele identifiziert werden. Wir werden auch die Transkriptomik (Single-Zell RNA Seq) von zirkulierenden Tumorzellen im Blut von Patienten im fortgeschrittenen Stadium charakterisieren. Es soll transkriptionelle Veränderungen untersuchen, die den Prozess der Metastasierung beleuchten und neue Wege eröffnen, um ihn zu bekämpfen. (German)
9 December 2021
0 references
Longkanker is een van de hoogste sterftecijfers ter wereld, en niet-kleincellige kanker (NCP) is de meest voorkomende en moeilijk te behandelen. In NSCLC, hoewel falen in de klinische toepassing van moleculaire gegevens is gekoppeld aan een veelheid van factoren, wordt aangenomen dat intratumorale heterogeniteit een belangrijke rol speelt. De heterogeniteit van een NSCLC-type tumor wordt verondersteld te wijten zijn aan het vermogen van tumor initiërende cellen (ITC) om zelf te renoveren en te differentiëren in verschillende soorten tumorcellen, en dat dit wordt geregeld door de tumormicroomgeving. In dit subproject stellen we voor om de impact van verschillende componenten van de NSCLC tumor micro-omgeving op het ILC transcriptional programma te bepalen. Uit klinische monsters van patiënten worden CIT’s gezuiverd en gecocultiveerd met verschillende cellulaire componenten van hun microomgeving. Door de transcriptome (RNA-Seq) en miRNoma (Small-RNASeq) van deze CITs te rangschikken zullen we de specifieke bijdrage van verschillende componenten van het micromilieu in de zelfvernieuwing, proliferatie en differentiatie van deze sleutelcellen voor de vorming, progressie en weerstand van NSCLC bepalen. Dit type moleculaire karakterisering kan leiden tot de identificatie van nieuwe progressie biomarkers of antitumor doelen. We zullen ook de transcriptomische (enkelcellige RNA Seq) van circulerende tumorcellen in het bloed van gevorderde patiënten karakteriseren. Het is de bedoeling om transcriptionele veranderingen te onderzoeken die licht werpen op het proces van metastase en nieuwe manieren openen om het te bestrijden. (Dutch)
17 December 2021
0 references
Il cancro polmonare è uno dei più alti tassi di mortalità a livello mondiale, e il cancro non a piccole cellule (NCP) è il più frequente e difficile da trattare. In NSCLC, sebbene il fallimento nell'applicazione clinica dei dati molecolari sia legato a una moltitudine di fattori, si ritiene che l'eterogeneità intratumorale svolga un ruolo chiave. Si ritiene che l'eterogeneità di un tumore di tipo NSCLC sia dovuta alla capacità delle cellule di avvio del tumore (ITC) di auto-ristrutturarsi e di differenziarsi in diversi tipi di cellule tumorali, e che questo è regolato dal microambiente tumorale. In questo sottoprogetto proponiamo di determinare l'impatto dei diversi componenti del microambiente tumorale NSCLC sul programma di trascrizione ILC. Da campioni clinici di pazienti, i CIT saranno purificati e cocoltivati con diversi componenti cellulari del loro microambiente. Sequenziando il trascrittoma (RNA-Seq) e il miRNoma (Small-RNASeq) di questi CIT determineremo il contributo specifico delle diverse componenti del microambiente nell'auto-rinnovo, proliferazione e differenziazione di queste cellule chiave per la formazione, la progressione e la resistenza di NSCLC. Questo tipo di caratterizzazione molecolare potrebbe portare all'identificazione di nuovi biomarcatori di progressione o obiettivi antitumorali. Caratterizzeremo anche la trascrizione (single-cellule RNA Seq) delle cellule tumorali circolanti trovate nel sangue di pazienti in stadio avanzato. Ha lo scopo di studiare i cambiamenti trascrizionali che fanno luce sul processo di metastasi e aprire nuovi modi per combatterla. (Italian)
16 January 2022
0 references
Kopsuvähk on üks suurimaid suremuse määrasid kogu maailmas ning mitteväikerakk-vähk (NCP) on kõige sagedasem ja raskesti ravitav. Mitteväikerakk-kopsuvähi korral, kuigi molekulaarandmete kliinilise kasutamise ebaõnnestumine on seotud paljude teguritega, arvatakse, et kasvajasisene heterogeensus mängib olulist rolli. Heterogeensus NSCLC-tüüpi kasvaja arvatakse olevat tingitud võime kasvaja algatavad rakud (ITC) iserenoveerida ja eristada eri tüüpi kasvaja rakud, ja et see on reguleeritud kasvaja mikrokeskkond. Selles allprojektis teeme ettepaneku määrata kindlaks NSCLC kasvaja mikrokeskkonna erinevate komponentide mõju ILC transkriptsiooniprogrammile. Patsientide kliinilistest proovidest puhastatakse ja kookuleeritakse CITid mikrokeskkonna erinevate rakukomponentidega. Nende CITide transkriptoomi (RNA-Seq) ja miRNoma (Small-RNASeq) järjestamisel määrame kindlaks mikrokeskkonna erinevate komponentide konkreetse panuse nende võtmerakkude eneseuuendamisse, levikusse ja diferentseerimisesse NSCLC moodustumiseks, progresseerumiseks ja resistentsuseks. Seda tüüpi molekulaarse iseloomustuse tulemuseks võib olla uute progressiooni biomarkerite või kasvajavastaste sihtmärkide kindlaksmääramine. Samuti iseloomustame kaugelearenenud patsientide veres leiduvate tsirkuleerivate kasvajarakkude transkriptoomilist (üherakulist RNA Seq) transkriptoomilist (üherakulist RNA Seq). Selle eesmärk on uurida transkriptsiooni muutusi, mis heidavad valgust metastaaside protsessile ja avavad uusi viise selle vastu võitlemiseks. (Estonian)
4 August 2022
0 references
Plaučių vėžys yra vienas iš didžiausių mirtingumo rodiklių visame pasaulyje, o nesmulkialąstelinis vėžys (NKP) yra dažniausias ir sunkiai gydomas. NSLPV sergantiems pacientams, nors molekulinių duomenų klinikinis taikymas yra susijęs su daugybe veiksnių, manoma, kad intranavikinis heterogeniškumas atlieka pagrindinį vaidmenį. Manoma, kad NSCLC tipo naviko heterogeniškumas yra dėl to, kad naviko inicijavimo ląstelių (ITC) gebėjimas savarankiškai atnaujinti ir diferencijuoti į įvairių tipų naviko ląsteles, ir kad tai reguliuoja naviko mikroaplinka. Šiame paprojektyje siūlome nustatyti įvairių NSCLC naviko mikroaplinkos komponentų poveikį ILC transkripcijos programai. Iš klinikinių pacientų mėginių grynųjų pinigų srautai bus išgryninti ir dirbti su skirtingais jų mikroaplinkos ląstelių komponentais. Sekdami šių grynųjų pinigų srautų transkriptomą (RNR-Seq) ir miRNoma (Small-RNASeq) nustatysime specifinį įvairių mikroaplinkos komponentų indėlį į šių pagrindinių ląstelių atsinaujinimą, plitimą ir diferenciaciją NSCLC formavimui, progresavimui ir atsparumui. Dėl tokio molekulinio apibūdinimo gali būti nustatyti nauji progresavimo biologiniai žymenys arba priešvėžiniai taikiniai. Taip pat apibūdinsime pažangios stadijos pacientų kraujo cirkuliuojančių naviko ląstelių transkriptografinį (vieno langelio RNR Seq) kiekį. Jis skirtas ištirti transkripcinius pokyčius, kurie išryškina metastazių procesą ir atveria naujus kovos su ja būdus. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
Rak pluća jedna je od najviših stopa smrtnosti u svijetu, a rak nemalih stanica (NCP) najčešći je i teško ga je liječiti. U NSCLC-u, iako je neuspjeh u kliničkoj primjeni molekularnih podataka povezan s mnoštvom čimbenika, vjeruje se da intratumoralna heterogenost igra ključnu ulogu. Smatra se da je heterogenost tumora tipa NSCLC posljedica sposobnosti stanica koje pokreću tumor (ITC) da samostalno obnavljaju i razlikuju različite vrste tumorskih stanica, a to je regulirano mikrookolišom tumora. U ovom potprojektu predlažemo utvrđivanje utjecaja različitih komponenti mikrookoliša NSCLC tumora na transkripcijski program ILC-a. Iz kliničkih uzoraka bolesnika, CIT-ovi će se pročistiti i spojiti s različitim staničnim komponentama njihovog mikrookoliša. Sekvenciranjem transkriptoma (RNA-Seq) i miRNoma (Small-RNASeq) ovih CIT-ova odredit ćemo specifičan doprinos različitih komponenti mikrookoliša u samoobnove, proliferaciji i diferencijaciji tih ključnih stanica za formiranje, progresiju i otpornost NSCLC-a. Ova vrsta molekularne karakterizacije mogla bi dovesti do utvrđivanja novih biomarkera progresije ili antitumorskih meta. Također ćemo karakterizirati transkriptomske (jednostanične RNK Seq) cirkulirajućih tumorskih stanica pronađenih u krvi bolesnika u naprednoj fazi. Namijenjen je istraživanju transkripcijskih promjena koje rasvjetljuju proces metastaza i otvaraju nove načine borbe protiv njega. (Croatian)
4 August 2022
0 references
Ο καρκίνος του πνεύμονα είναι ένα από τα υψηλότερα ποσοστά θνησιμότητας παγκοσμίως και ο μη μικροκυτταρικός καρκίνος (NCP) είναι ο συχνότερος και πιο δύσκολος στη θεραπεία. Στο NSCLC, αν και η αποτυχία στην κλινική εφαρμογή των μοριακών δεδομένων συνδέεται με πληθώρα παραγόντων, η ενδοογκική ετερογένεια πιστεύεται ότι παίζει βασικό ρόλο. Η ετερογένεια ενός όγκου τύπου NSCLC πιστεύεται ότι οφείλεται στην ικανότητα των κυττάρων εκκίνησης όγκου (ITC) να αυτο-ανακαινιστούν και να διαφοροποιηθούν σε διαφορετικούς τύπους καρκινικών κυττάρων, και ότι αυτό ρυθμίζεται από το μικροπεριβάλλον όγκου. Σε αυτό το υπο-έργο προτείνουμε να προσδιοριστεί η επίδραση των διαφόρων συστατικών του μικροπεριβάλλοντος όγκου NSCLC στο μεταγραφικό πρόγραμμα ILC. Από κλινικά δείγματα ασθενών, οι CIT θα καθαρίζονται και θα καλλιεργούνται με διαφορετικά κυτταρικά συστατικά του μικροπεριβάλλοντός τους. Με την αλληλουχία των μεταγραφών (RNA-Seq) και miRNoma (Small-RNASeq) αυτών των CIT θα καθορίσουμε τη συγκεκριμένη συμβολή των διαφόρων συστατικών του μικροπεριβάλλοντος στην αυτοανανέωση, τον πολλαπλασιασμό και τη διαφοροποίηση αυτών των βασικών κυττάρων για το σχηματισμό, την εξέλιξη και την αντίσταση του NSCLC. Αυτός ο τύπος μοριακού χαρακτηρισμού θα μπορούσε να οδηγήσει στον εντοπισμό νέων βιοδεικτών προόδου ή στόχων κατά του όγκου. Θα χαρακτηρίσουμε επίσης τα μεταγραφικά (μονοκύτταρα RNA Seq) των κυκλοφορούντων καρκινικών κυττάρων που βρέθηκαν στο αίμα των ασθενών προχωρημένου σταδίου. Σκοπός του είναι να διερευνήσει μεταγραφικές αλλαγές που ρίχνουν φως στη διαδικασία της μετάστασης και ανοίγουν νέους τρόπους για την καταπολέμησή της. (Greek)
4 August 2022
0 references
Rakovina pľúc je jednou z najvyšších mier úmrtnosti na celom svete a nemalobunkový karcinóm (NCP) je najčastejšie a ťažko liečiteľný. Hoci v NSCLC je zlyhanie v klinickej aplikácii molekulárnych údajov spojené s množstvom faktorov, predpokladá sa, že zohráva kľúčovú úlohu intratumorálna heterogenita. Heterogenita nádoru NSCLC typu je myšlienka byť kvôli schopnosti nádoru iniciovať bunky (ITC) k seba-renovovať a rozlišovať do rôznych typov nádorových buniek, a že je to regulované nádorové mikroprostredie. V tomto čiastkovom projekte navrhujeme určiť vplyv rôznych zložiek mikroprostredia nádoru NSCLC na transkripčný program ILC. Z klinických vzoriek pacientov budú CIT purifikované a kokultivované s rôznymi bunkovými zložkami ich mikroprostredia. Sekvenovaním transkriptómu (RNA-Seq) a miRNoma (Small-RNASeq) týchto CIT určíme špecifický prínos rôznych zložiek mikroprostredia v samoobnove, proliferácii a diferenciácii týchto kľúčových buniek pre tvorbu, progresiu a rezistenciu NSCLC. Tento typ molekulárnej charakterizácie by mohol viesť k identifikácii nových progresívnych biomarkerov alebo protinádorových cieľov. Budeme tiež charakterizovať transkriptomický (jednobunkový RNA Seq) cirkulujúcich nádorových buniek nájdených v krvi pacientov s pokročilým štádiom. Jeho cieľom je preskúmať prepisné zmeny, ktoré osvetľujú proces metastáz a otvárajú nové spôsoby boja proti nemu. (Slovak)
4 August 2022
0 references
Keuhkosyöpä on yksi maailman korkeimmista kuolleisuudesta, ja ei-pienisolusyöpä on yleisin ja vaikeasti hoidettava. NSCLC: ssä, vaikka molekyylitietojen kliinisen käytön epäonnistuminen liittyy moniin tekijöihin, kasvaimensisäisen heterogeenisuuden uskotaan olevan keskeisessä asemassa. NSCLC-tyyppisen kasvaimen heterogeenisuuden uskotaan johtuvan kasvaimen käynnistävien solujen (ITC) kyvystä itseremontoida ja eriyttää erityyppisiin kasvainsoluihin, ja että tätä säännellään kasvaimen mikroympäristössä. Tässä alahankkeessa ehdotamme, että määritetään NSCLC-kasvaimen mikroympäristön eri osien vaikutus ILC-transkriptio-ohjelmaan. Kliinisistä potilasnäytteistä CIT puhdistetaan ja niitä viljellään mikroympäristön eri solukomponenteilla. Sekvensoimalla näiden arvokuljetusten transkriptiomi (RNA-Seq) ja miRNoma (Small-RNASeq) määritämme mikroympäristön eri komponenttien erityisen vaikutuksen näiden keskeisten solujen itseuudistumiseen, lisääntymiseen ja eriyttämiseen NSCLC: n muodostumista, etenemistä ja vastustusta varten. Tämäntyyppinen molekyylin karakterisointi voisi johtaa uusien etenemisen biomarkkerien tai kasvainvastaisten tavoitteiden tunnistamiseen. Aiomme myös luonnehtia transkriptominen (yksisoluinen RNA Seq) veren kiertävien kasvainsolujen löytyy veressä pitkälle edennyttä potilasta. Tarkoituksena on tutkia transkriptiomuutoksia, jotka valaisevat etäpesäkkeen prosessia ja avaavat uusia tapoja torjua sitä. (Finnish)
4 August 2022
0 references
Rak płuc jest jednym z najwyższych wskaźników umieralności na świecie, a rak niedrobnokomórkowy (NCP) jest najczęstszym i najtrudniejszym w leczeniu. W NSCLC, chociaż niepowodzenie w klinicznym zastosowaniu danych molekularnych jest związane z wieloma czynnikami, uważa się, że heterogeniczność wewnątrztumoralna odgrywa kluczową rolę. Heterogeniczność nowotworu typu NSCLC jest uważana za ze względu na zdolność komórek inicjujących nowotwór (ITC) do samorenowacji i do rozróżnienia na różne rodzaje komórek nowotworowych, i że jest to regulowane przez mikrośrodowisko nowotworowe. W tym podprojektie proponujemy określenie wpływu różnych składników mikrośrodowisko nowotworu NSCLC na program transkrypcyjny ILC. Z próbek klinicznych pacjentów, CIT zostaną oczyszczone i współkultywowane różnymi składnikami komórkowymi ich mikrośrodowiska. Sekwencjonując transkrypcję (RNA-Seq) i miRNoma (Small-RNASeq) tych CIT, określimy specyficzny wkład różnych składników mikrośrodowiska w samoodnawianie, proliferację i różnicowanie tych kluczowych komórek w tworzeniu, progresji i oporności NSCLC. Ten rodzaj charakterystyki molekularnej może skutkować identyfikacją nowych biomarkerów progresji lub celów przeciwnowotworowych. Będziemy również scharakteryzować transkryptomic (jednokomórkowe RNA Seq) krążących komórek nowotworowych znajdujących się we krwi pacjentów z zaawansowanym stadium. Ma on na celu zbadanie zmian transkrypcyjnych, które rzucają światło na proces przerzutów i otwierają nowe sposoby jej zwalczania. (Polish)
4 August 2022
0 references
A tüdőrák világszerte az egyik legmagasabb halálozási arány, és a nem kissejtes rák a leggyakoribb és legnehezebb kezelni. Az NSCLC-ben, bár a molekuláris adatok klinikai alkalmazásának sikertelensége számos tényezőhöz kapcsolódik, az intratumorális heterogenitás kulcsfontosságú szerepet játszik. Az NSCLC-típusú tumor heterogenitását úgy gondolják, hogy annak köszönhető, hogy a tumor kezdeményező sejtek (ITC) képesek önfelújítani és megkülönböztetni a különböző típusú tumorsejteket, és hogy ezt a tumor mikrokörnyezete szabályozza. Ebben az alprojektben azt javasoljuk, hogy meghatározzák az NSCLC tumor mikrokörnyezet különböző összetevőinek hatását az ILC transzkripciós programra. A betegek klinikai mintáiból a CIT-ket megtisztítják és mikrokörnyezetük különböző sejtes komponenseivel kokulálják. A transzkriptom (RNA-Seq) és a miRNoma (Small-RNASeq) szekvenálásával meghatározzuk a mikrokörnyezet különböző összetevőinek egyedi hozzájárulását e kulcsfontosságú sejtek önmegújításához, proliferációjához és differenciálásához az NSCLC kialakulásához, progressziójához és ellenállásához. Az ilyen típusú molekuláris jellemzés új progresszió biomarkerek vagy tumorellenes célok azonosítását eredményezheti. Az előrehaladott stádiumú betegek vérében található keringő tumorsejtek transzkriptomikus (egysejtű RNS Seq) transzkriptomikáját (egysejtű RNS Seq) is jellemezzük. Célja, hogy megvizsgálja a transzkripciós változásokat, amelyek fényt derítenek az áttétek folyamatára, és új módszereket nyitnak meg ellene. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
Rakovina plic je jednou z nejvyšších měr úmrtnosti na celém světě a nejčastěji se léčí nemalobuněčný karcinom (NCP). U NSCLC, ačkoli selhání klinické aplikace molekulárních dat je spojeno s množstvím faktorů, má se za to, že intratumorální heterogenita hraje klíčovou roli. Má se za to, že heterogenita nádoru NSCLC je způsobena schopností nádorových iniciačních buněk (ITC) samorenovovat a rozlišit do různých typů nádorových buněk, a že je regulováno nádorovým mikroprostředím. V tomto dílčím projektu navrhujeme určit vliv různých složek nádorového mikroprostředí NSCLC na transkripční program ILC. Z klinických vzorků pacientů budou CIT čištěny a kokulovány s různými buněčnými složkami jejich mikroprostředí. Sekvenováním transkriptomu (RNA-Seq) a miRNoma (Small-RNASeq) těchto CIT určíme specifický přínos různých složek mikroprostředí pro sebeobnovení, proliferaci a diferenciaci těchto klíčových buněk pro tvorbu, progresi a odolnost NSCLC. Tento typ molekulární charakterizace by mohl vést k identifikaci nových biomarkerů progrese nebo protinádorových cílů. Budeme také charakterizovat transskriptomické (jednobuněčné RNA Seq) cirkulujících nádorových buněk nalezených v krvi pacientů v pokročilém stádiu. Jeho cílem je prozkoumat transkripční změny, které osvětlují proces metastáz a otevírají nové způsoby, jak s ním bojovat. (Czech)
4 August 2022
0 references
Plaušu vēzis ir viens no augstākajiem mirstības rādītājiem pasaulē, un nesīkšūnu vēzis (NCP) ir visbiežāk sastopamais un grūti ārstējamais. NSŠPV gadījumā, lai gan molekulāro datu klīniskās izmantošanas neveiksme ir saistīta ar daudziem faktoriem, tiek uzskatīts, ka būtiska nozīme ir intratumorālai neviendabībai. NSŠPV tipa audzēja neviendabīgums, domājams, ir saistīts ar audzēja ierosināšanas šūnu (ITC) spēju sevi atjaunot un diferencēt dažāda veida audzēja šūnās, un to regulē audzēja mikrovide. Šajā apakšprojektā mēs ierosinām noteikt dažādu NSŠPV audzēja mikrovides komponentu ietekmi uz ILC transkripcijas programmu. No pacientu klīniskajiem paraugiem skaidras naudas pārvadājumus attīra un kokultizē ar dažādiem mikrovides šūnu komponentiem. Veicot šo CIT transcriptome (RNS-Seq) un miRNomas (Small-RNASeq) sekvencēšanu, mēs noteiksim dažādu mikrovides komponentu īpašo ieguldījumu šo galveno šūnu atjaunošanā, proliferācijā un diferencēšanā NSCLC veidošanās, progresēšanas un pretestības jomā. Šāda veida molekulārā raksturojuma rezultātā varētu noteikt jaunus progresijas biomarķierus vai pretvēža mērķus. Mēs raksturosim arī cirkulējošo audzēja šūnu transkriptomiku (vienšūnu RNS Seq), kas atrodamas progresējošas stadijas pacientu asinīs. Tas ir paredzēts, lai izpētītu transkripcijas izmaiņas, kas izgaismo metastāzes procesu un paver jaunus veidus, kā to apkarot. (Latvian)
4 August 2022
0 references
Tá ailse scamhóg ar cheann de na rátaí básmhaireachta is airde ar fud an domhain, agus is í ailse neamh-bheag cille (NCP) an ailse is minice agus is deacra a chóireáil. I NSCLC, cé go bhfuil teip i gcur i bhfeidhm cliniciúil sonraí móilíneacha nasctha leis an iliomad fachtóirí, creidtear go bhfuil ról lárnach ag ilchineálacht intratumoral. Meastar go bhfuil ilchineálacht meall de chineál NSCLC mar gheall ar chumas na gceall meall a thionscnaíonn (ITC) féin-athchóiriú agus idirdhealú a dhéanamh i gcineálacha éagsúla cealla meall, agus go bhfuil sé seo á rialú ag an microenvironment meall. Sa fho-tionscadal seo molaimid tionchar na gcomhpháirteanna éagsúla den mhicrea-chomhshaoil meall NSCLC ar an gclár tras-scríofa ILC a chinneadh. Ó shamplaí cliniciúla othar, déanfar CITí a íonú agus a chomhshaothrú le comhpháirteanna ceallacha éagsúla dá micrea-chomhshaol. Trí sheicheamhú a dhéanamh ar thras-scríbhinn (RNA-Seq) agus miRNoma (Small-RNAseq) de na CITí sin, cinnfidh muid rannchuidiú sonrach chomhpháirteanna éagsúla an mhicreachomhshaoil i bhféin-athnuachan, iomadú agus difreáil na bpríomhchealla sin maidir le foirmiú, dul chun cinn agus friotaíocht NSCLC. D’fhéadfadh an cineál tréithrithe móilíneach seo bithmharcóirí dul chun cinn nua nó spriocanna antitumor a shainaithint. Déanfaimid tréithriú freisin ar an tras-scríbhinn (aoncheallach RNA Seq) de chealla meall a scaiptear le fáil i bhfuil othair ardchéime. Tá sé beartaithe chun imscrúdú a dhéanamh ar athruithe tras-scríofa a chaillfidh solas ar an bpróiseas metastasis agus bealaí nua a oscailt chun dul i ngleic leis. (Irish)
4 August 2022
0 references
Pljučni rak je ena najvišjih stopenj umrljivosti na svetu, nedrobnocelični rak pa je najpogostejši in najtežji za zdravljenje. Čeprav je neuspeh pri klinični uporabi molekularnih podatkov povezan s številnimi dejavniki, se domneva, da ima pri NSCLC ključno vlogo intratumoralna heterogenost. Heterogenost tumorja tipa NSCLC naj bi bila posledica sposobnosti tumorskih začetnih celic (ITC) za samoobnovo in razlikovanje med različnimi vrstami tumorskih celic, kar je urejeno s tumorskim mikrookoljem. V tem podprojektu predlagamo določitev vpliva različnih komponent tumorskega mikrookolja NSCLC na transkripcijski program ILC. Iz kliničnih vzorcev bolnikov se CIT očisti in kokulira z različnimi celičnimi komponentami njihovega mikrookolja. S sekvenciranjem transkriptoma (RNA-Seq) in miRNoma (majhna RNASeq) teh CIT bomo določili specifičen prispevek različnih komponent mikrookolja k samoobnovitvi, proliferaciji in diferenciaciji teh ključnih celic za nastanek, napredovanje in odpornost NSCLC. Ta vrsta molekularne karakterizacije lahko privede do opredelitve novih biomarkerjev napredovanja ali antitumorskih tarč. Opredelili bomo tudi transkriptomsko (enocelično RNA Seq) tumorskih celic v obtoku, ki jih najdemo v krvi bolnikov v napredovalem stadiju. Namen je raziskati transkripcijske spremembe, ki osvetlijo proces metastaz in odpirajo nove načine za boj proti njemu. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
Ракът на белия дроб е един от най-високите равнища на смъртност в световен мащаб, а недребноклетъчният рак (НПК) е най-честият и труден за лечение. В NSCLC, въпреки че неуспехът в клиничното приложение на молекулярните данни е свързан с множество фактори, се смята, че интратуморната хетерогенност играе ключова роля. Смята се, че хетерогенността на тумор от тип NSCLC се дължи на способността на туморните клетки (ITC) да се самообновяват и да се диференцират в различни видове туморни клетки и че това се регулира от туморната микросреда. В този подпроект предлагаме да се определи въздействието на различните компоненти на туморната микросреда на NSCLC върху транскрипционната програма на ILC. От клинични проби на пациенти ТПБ ще бъдат пречистени и кокултивирани с различни клетъчни компоненти на тяхната микросреда. Чрез секвениране на транскриптом (RNA-Seq) и miRNoma (Small-RNASeq) на тези ТПБ ще определи специфичния принос на различните компоненти на микросредата в самообновяване, пролиферация и диференциация на тези ключови клетки за образуването, прогресията и устойчивостта на NSCLC. Този тип молекулярно характеризиране може да доведе до идентифициране на нови прогресивни биомаркери или антитуморни цели. Също така ще характеризираме транскриптомната (едноклетъчна РНК Seq) на циркулиращите туморни клетки, открити в кръвта на пациенти в напреднал стадий. Предназначен е за изследване на транскрипционни промени, които хвърлят светлина върху процеса на метастази и откриват нови начини за борба с него. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
Il-kanċer tal-pulmun huwa waħda mill-ogħla rati ta’ mortalità madwar id-dinja, u l-kanċer taċ-ċelloli mhux żgħar (NCP) huwa l-aktar frekwenti u diffiċli biex jiġi kkurat. F’NSCLC, għalkemm falliment fl-applikazzjoni klinika ta’ dejta molekulari huwa marbut ma’ għadd kbir ta’ fatturi, hu maħsub li l-eteroġeneità intratumorali għandha rwol ewlieni. L-eteroġeneità ta’ tumur tat-tip NSCLC hija maħsuba li hija minħabba l-abbiltà tat-tumur li jibda ċ-ċelloli (ITC) li jirrinova lilu nnifsu u jiddifferenzja f’tipi differenti ta’ ċelloli tat-tumur, u li dan huwa rregolat mill-mikroambjent tat-tumur. F’dan is-sottoproġett nipproponu li niddeterminaw l-impatt tal-komponenti differenti tal-mikroambjent tat-tumur tal-NSCLC fuq il-programm traskrizzjonali tal-ILC. Minn kampjuni kliniċi ta’ pazjenti, is-CITs jiġu ppurifikati u kkokultivati b’komponenti ċellulari differenti tal-mikroambjent tagħhom. Bis-sekwenzjar tat-transcriptoma (RNA-Seq) u l-miRNoma (RNA-RNASeq) ta’ dawn is-CITs se niddeterminaw il-kontribut speċifiku tal-komponenti differenti tal-mikroambjent fit-tiġdid, il-proliferazzjoni u d-differenzjazzjoni ta’ dawn iċ-ċelloli ewlenin għall-formazzjoni, il-progressjoni u r-reżistenza tal-NSCLC. Dan it-tip ta’ karatterizzazzjoni molekulari jista’ jirriżulta fl-identifikazzjoni ta’ bijomarkaturi ġodda ta’ progressjoni jew miri antitumuri. Aħna ser nikkaratterizzaw ukoll it-traskrizzjoni (is-Seq ta’ RNA ta’ ċellula waħda) taċ-ċelloli tat-tumur li jiċċirkolaw li jinsabu fid-demm ta’ pazjenti fi stadju avvanzat. Hija maħsuba biex tinvestiga l-bidliet traskrizzjonali li jixħtu dawl fuq il-proċess ta ‘metastasi u tiftaħ modi ġodda biex jikkumbattuha. (Maltese)
4 August 2022
0 references
O cancro de pulmão é uma das maiores taxas de mortalidade em todo o mundo, e o cancro de células não pequenas (PCN) é o mais frequente e difícil de tratar. No CPNPC, embora a falha na aplicação clínica dos dados moleculares esteja ligada a uma infinidade de fatores, acredita-se que a heterogeneidade intratumoral desempenha um papel fundamental. Acredita-se que a heterogeneidade de um tumor do tipo NSCLC seja devido à capacidade de células iniciadoras do tumor (ITC) de autorrenovar e diferenciar em diferentes tipos de células tumorais, e que isso é regulado pelo microambiente tumoral. Neste subprojeto propomos determinar o impacto de diferentes componentes do microambiente tumoral do CPNPC no programa transcricional do CCI. A partir de amostras clínicas de pacientes, as CITs serão purificadas e cocultivadas com diferentes componentes telemóveis de seu microambiente. Sequenciando o transcriptoma (RNA-Seq) e o miRNoma (Small-RNASeq) destes CIT, determinaremos a contribuição específica de diferentes componentes do microambiente na autorrenovação, proliferação e diferenciação dessas células-chave para a formação, progressão e resistência do CPNPC. Este tipo de caracterização molecular poderia resultar na identificação de novos biomarcadores de progressão ou alvos antitumorais. Também vamos caracterizar o transcriptômico (RNA de célula única Seq) de células tumorais circulantes encontradas no sangue de pacientes em estágio avançado. Pretende-se investigar as mudanças transcricionais que iluminam o processo de metástase e abrir novas formas de combatê-la. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
Lungekræft er en af de højeste dødelighedsrater på verdensplan, og ikke-småcellet kræft (NCP) er den hyppigste og sværeste at behandle. I NSCLC menes intratumoral heterogenitet at spille en central rolle, selv om manglende klinisk anvendelse af molekylære data er forbundet med en lang række faktorer. Heterogeniteten af en NSCLC-type tumor menes at skyldes evnen af tumorinitierende celler (ITC) til selvrenovering og til at differentiere til forskellige typer af tumorceller, og at dette er reguleret af tumormikromiljøet. I dette delprojekt foreslår vi at bestemme virkningen af forskellige komponenter i NSCLC tumor mikromiljø på ILC transcriptional program. Fra kliniske prøver af patienter vil CIT'er blive renset og kokultiveret med forskellige cellekomponenter i deres mikromiljø. Ved at sekventere transkriptomet (RNA-Seq) og miRNoma (Small-RNASeq) af disse CIT'er vil vi bestemme det specifikke bidrag fra forskellige komponenter i mikromiljøet til selvfornyelse, spredning og differentiering af disse nøgleceller til NSCLC's dannelse, progression og resistens. Denne type molekylær karakterisering kan resultere i identifikation af nye progressionsbiomarkører eller antitumormål. Vi vil også karakterisere transkriptomic (enkeltcelle RNA Seq) af cirkulerende tumorceller, der findes i blodet hos avancerede patienter. Det er hensigten at undersøge transskriptionelle ændringer, der kaster lys over metastaseprocessen og åbne nye måder at bekæmpe den på. (Danish)
4 August 2022
0 references
Cancerul pulmonar este una dintre cele mai ridicate rate ale mortalității la nivel mondial, iar cancerul altul decât cel cu celule mici (PCN) este cel mai frecvent și mai dificil de tratat. În NSCLC, deși eșecul aplicării clinice a datelor moleculare este legat de o multitudine de factori, se consideră că eterogenitatea intraumorală joacă un rol cheie. Se crede că eterogenitatea unei tumori de tip NSCLC se datorează capacității celulelor care inițiază tumori (ITC) de a se auto-renova și de a se diferenția în diferite tipuri de celule tumorale și că acest lucru este reglementat de micromediul tumoral. În acest subproiect propunem determinarea impactului diferitelor componente ale micromediului tumoral NSCLC asupra programului transcripțional ILC. Din probele clinice ale pacienților, CIT vor fi purificate și cocultivate cu diferite componente celulare ale micromediului. Secvențiind transcripția (ARN-Seq) și miRNoma (Small-RNASeq) ale acestor CIT, vom determina contribuția specifică a diferitelor componente ale micromediului în auto-reînnoirea, proliferarea și diferențierea acestor celule cheie pentru formarea, progresia și rezistența NSCLC. Acest tip de caracterizare moleculară ar putea duce la identificarea unor noi biomarkeri de progresie sau a unor ținte antitumorale noi. Vom caracteriza, de asemenea, transcripția (ARN cu celule unice) celulelor tumorale circulante găsite în sângele pacienților în stadiu avansat. Este destinat să investigheze schimbările transcripționale care clarifică procesul metastazelor și să deschidă noi modalități de combatere a acesteia. (Romanian)
4 August 2022
0 references
Lungcancer är en av de högsta dödlighetstalen i världen, och icke-småcellig cancer (NCP) är den vanligaste och svårast att behandla. Vid icke-småcellig lungcancer anses den intratumorala heterogeniteten spela en nyckelroll, även om misslyckande i den kliniska tillämpningen av molekylära data är kopplat till en mängd faktorer. Heterogeniteten hos en NSCLC-typ tumör tros bero på förmågan hos tumör initierande celler (ITC) att självrenovera och differentiera i olika typer av tumörceller, och att detta regleras av tumörmikromiljö. I detta delprojekt föreslår vi att bestämma effekten av olika komponenter i NSCLC tumörmikromiljö på ILC transkriptionsprogram. Från kliniska prover från patienter renas och kokultiveras värdetransport med olika cellulära komponenter i deras mikromiljö. Genom att sekvensera transkriptomen (RNA-Seq) och miRNoma (Small-RNASeq) av dessa CIT kommer vi att bestämma det specifika bidraget från olika komponenter i mikromiljön i självförnyelse, proliferation och differentiering av dessa nyckelceller för bildandet, progressionen och resistensen av NSCLC. Denna typ av molekylär karakterisering kan resultera i identifiering av nya progressionsbiomarkörer eller antitumörmål. Vi kommer också att karakterisera den transkriptomiska (enkelcells RNA Seq) av cirkulerande tumörceller som finns i blodet hos avancerade patienter. Syftet är att undersöka transkriptionella förändringar som kastar ljus över metastassprocessen och öppnar nya sätt att bekämpa den. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Madrid
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI14_02120
0 references