Exome sequencing for the diagnosis of children with neurological developmental disorder or severe-moderate intellectual disability. (Q3161905)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3161905 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Exome sequencing for the diagnosis of children with neurological developmental disorder or severe-moderate intellectual disability. |
Project Q3161905 in Spain |
Statements
41,654.25 Euro
0 references
76,500.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2014
0 references
30 September 2018
0 references
FUNDACION INVESTIGACION BIOMEDICA HOSPITAL LA PAZ
0 references
La discapacidad intelectual (DI) es una enfermedad prevalente y global que, junto con los transtornos neuropsiquiátricos, constituye la principal fuente de costes en el ámbito de la salud en la sociedad occidental. En la infancia, el diagnóstico se basa en un retraso general del desarrollo, incluyendo retraso motor, cognitivo y del lenguaje. Las probabilidades de lograr un diagnóstico genético en los niños con discapacidad intelectual o trastorno del desarrollo neurológico moderado-severo es muy bajo una vez han sido normales los estudios “rutinarios”. En los últimos años se ha comprobado que las alteraciones genéticas son una de las principales causas de la DI o trastornos del desarrollo neurológico en la infancia. Se sabe que la tasa de mutaciones por generación en los humanos es alta. Estudios recientes han demostrado que en los individuos con DI existe una elevada tasa de mutaciones de novo. La secuenciación masiva permite la identificación rápida y sistemática de variantes a gran escala ya sea en el genoma completo o en las regiones codificantes del mismo (exoma). El objetivo de nuestro estudio es evaluar 30 niños con DI idiopática o trastorno del desarrollo sin historia familiar de DI, y estudiarlos mediante secuenciación del exoma completo empleando un abordaje de trios (estudio simultáneo del paciente y sus padres) con el fin de evaluar la presencia de mutaciones de novo. La realización de este proyecto permitirá desarrollar un “pipeline” para el análisis bioinformático de los datos generados por la secuenciación masiva, que podrá aplicarse al estudio de otras patologías con base genética. (Spanish)
0 references
Intellectual disability (IPD) is a prevalent and global disease that, together with neuropsychiatric disorders, is the main source of health costs in Western society. In childhood, diagnosis is based on a general developmental delay, including motor, cognitive and language retardation. The chances of genetic diagnosis in children with intellectual disabilities or moderate-severe neurological development disorder are very low once “routine” studies have been normal. In recent years genetic alterations have been shown to be one of the main causes of DI or neurological development disorders in childhood. The rate of mutations per generation in humans is known to be high. Recent studies have shown that there is a high rate of de novo mutations in individuals with DI. Mass sequencing allows the rapid and systematic identification of large-scale variants either in the entire genome or in the encoding regions of the genome (exome). The objective of our study is to evaluate 30 children with idiopathic DI or developmental disorder without family history of DID, and to study them by sequencing the complete exome using a trios approach (simultaneous study of the patient and his parents) in order to evaluate the presence of de novo mutations. The realisation of this project will allow the development of a “pipeline” for the bioinformatics analysis of the data generated by mass sequencing, which can be applied to the study of other genetic pathologies. (English)
12 October 2021
0.0312065364019707
0 references
Le handicap intellectuel (DPI) est une maladie répandue et mondiale qui, avec les troubles neuropsychiatriques, est la principale source de coûts de santé dans la société occidentale. Dans l’enfance, le diagnostic est basé sur un retard de développement général, y compris un retard moteur, cognitif et linguistique. Les chances de diagnostic génétique chez les enfants atteints d’une déficience intellectuelle ou d’un trouble du développement neurologique modéré à sévère sont très faibles une fois que les études «de routine» ont été normales. Ces dernières années, il a été démontré que les altérations génétiques étaient l’une des principales causes de l’IV ou des troubles neurologiques du développement au cours de l’enfance. On sait que le taux de mutations par génération chez l’homme est élevé. Des études récentes ont montré qu’il existe un taux élevé de mutations de novo chez les personnes atteintes d’IV. Le séquençage de masse permet l’identification rapide et systématique de variantes à grande échelle soit dans l’ensemble du génome, soit dans les régions codantes du génome (exome). L’objectif de notre étude est d’évaluer 30 enfants atteints d’un DI idiopathique ou d’un trouble du développement sans antécédents familiaux de DID, et de les étudier en séquençant l’exome complet en utilisant une approche trios (étude simultanée du patient et de ses parents) afin d’évaluer la présence de mutations de novo. La réalisation de ce projet permettra le développement d’une «pipeline» pour l’analyse bioinformatique des données générées par le séquençage de masse, qui peut être appliquée à l’étude d’autres pathologies génétiques. (French)
4 December 2021
0 references
Geistige Behinderung (IPD) ist eine weit verbreitete und globale Erkrankung, die zusammen mit neuropsychiatrischen Störungen die Hauptursache für die Gesundheitskosten in der westlichen Gesellschaft darstellt. In der Kindheit basiert die Diagnose auf einer allgemeinen Entwicklungsverzögerung, einschließlich motorischer, kognitiver und sprachlicher Verzögerung. Die Chancen auf genetische Diagnose bei Kindern mit geistiger Behinderung oder mittelschwerer neurologischer Entwicklungsstörung sind sehr gering, sobald die „Routine“-Studien normal waren. In den letzten Jahren hat sich gezeigt, dass genetische Veränderungen eine der Hauptursachen für DI- oder neurologische Entwicklungsstörungen in der Kindheit sind. Die Rate der Mutationen pro Generation beim Menschen ist bekanntlich hoch. Jüngste Studien haben gezeigt, dass es eine hohe Rate von De-Novo-Mutationen bei Personen mit DI gibt. Die Massensequenzierung ermöglicht die schnelle und systematische Identifizierung von großflächigen Varianten entweder im gesamten Genom oder in den Kodierungsgebieten des Genoms (Exom). Ziel unserer Studie ist es, 30 Kinder mit idiopathischer DI oder Entwicklungsstörung ohne Familiengeschichte von DID zu bewerten und sie zu untersuchen, indem sie das vollständige Exome anhand eines Trios-Ansatzes (Simultane Studie des Patienten und seiner Eltern) sequentieren, um das Vorhandensein von de novo Mutationen zu bewerten. Die Realisierung dieses Projekts ermöglicht die Entwicklung einer „Pipeline“ für die bioinformatische Analyse der durch Massensequenzierung erzeugten Daten, die auf die Erforschung anderer genetischer Pathologien angewendet werden können. (German)
9 December 2021
0 references
Intellectuele handicap (IPD) is een voorkomende en wereldwijde ziekte die samen met neuropsychiatrische aandoeningen de belangrijkste bron van gezondheidskosten in de westerse samenleving is. In de kindertijd is de diagnose gebaseerd op een algemene ontwikkelingsvertraging, met inbegrip van motorische, cognitieve en taalvertraging. De kans op genetische diagnose bij kinderen met een verstandelijke handicap of matig ernstige neurologische ontwikkelingsstoornis is zeer laag zodra „routine” studies normaal zijn geweest. In de afgelopen jaren is aangetoond dat genetische veranderingen een van de belangrijkste oorzaken zijn van DI- of neurologische ontwikkelingsstoornissen in de kindertijd. Het percentage mutaties per generatie bij mensen is bekend als hoog. Recente studies hebben aangetoond dat er een hoog percentage de novo-mutaties is bij personen met DI. Het massa rangschikken maakt de snelle en systematische identificatie van varianten op grote schaal in het gehele genoom of in de coderingsgebieden van het genoom (exoom) mogelijk. Het doel van ons onderzoek is om 30 kinderen met idiopathische DI of ontwikkelingsstoornis zonder familiegeschiedenis van DID te evalueren en ze te bestuderen door het volledige exoom te rangschikken met behulp van een triobenadering (gelijktijdige studie van de patiënt en zijn ouders) om de aanwezigheid van de novo-mutaties te evalueren. De realisatie van dit project zal de ontwikkeling mogelijk maken van een „pipeline” voor de bio-informatica analyse van de gegevens gegenereerd door massa sequencing, die kan worden toegepast op de studie van andere genetische pathologieën. (Dutch)
17 December 2021
0 references
La disabilità intellettuale (IPD) è una malattia diffusa e globale che, insieme ai disturbi neuropsichiatrici, è la principale fonte di costi sanitari nella società occidentale. Nell'infanzia, la diagnosi si basa su un ritardo generale dello sviluppo, compreso il ritardo motorio, cognitivo e linguistico. Le probabilità di diagnosi genetica nei bambini con disabilità intellettive o disturbi dello sviluppo neurologico moderato-gravi sono molto basse una volta che gli studi "di routine" sono stati normali. Negli ultimi anni le alterazioni genetiche hanno dimostrato di essere una delle principali cause di disturbi dello sviluppo neurologico o di DI nell'infanzia. Il tasso di mutazioni per generazione nell'uomo è noto per essere elevato. Studi recenti hanno dimostrato che vi è un alto tasso di mutazioni de novo in individui con DI. Il sequenziamento di massa consente l'identificazione rapida e sistematica delle varianti su larga scala nell'intero genoma o nelle regioni di codifica del genoma (esome). L'obiettivo del nostro studio è quello di valutare 30 bambini con DI idiopatica o disordine dello sviluppo senza storia familiare di DID, e di studiarli sequenziando l'esome completo utilizzando un approccio trio (studio simultaneo del paziente e dei suoi genitori) al fine di valutare la presenza di mutazioni de novo. La realizzazione di questo progetto consentirà lo sviluppo di una "pipelina" per l'analisi bioinformatica dei dati generati dal sequenziamento di massa, che può essere applicata allo studio di altre patologie genetiche. (Italian)
16 January 2022
0 references
Η διανοητική αναπηρία (IPD) είναι μια διαδεδομένη και παγκόσμια ασθένεια που, μαζί με τις νευροψυχιατρικές διαταραχές, αποτελεί την κύρια πηγή κόστους υγείας στη δυτική κοινωνία. Στην παιδική ηλικία, η διάγνωση βασίζεται σε μια γενική αναπτυξιακή καθυστέρηση, συμπεριλαμβανομένης της κινητικής, της γνωστικής και της γλωσσικής καθυστέρησης. Οι πιθανότητες γενετικής διάγνωσης σε παιδιά με διανοητικές αναπηρίες ή μέτρια σοβαρή διαταραχή νευρολογικής ανάπτυξης είναι πολύ χαμηλές όταν οι «κανονικές» μελέτες είναι φυσιολογικές. Τα τελευταία χρόνια οι γενετικές αλλοιώσεις έχουν αποδειχθεί ότι είναι μία από τις κύριες αιτίες των διαταραχών της DI ή νευρολογικής ανάπτυξης στην παιδική ηλικία. Ο ρυθμός των μεταλλάξεων ανά γενιά στους ανθρώπους είναι γνωστό ότι είναι υψηλός. Πρόσφατες μελέτες έχουν δείξει ότι υπάρχει υψηλό ποσοστό μεταλλάξεων de novo σε άτομα με DI. Η μαζική αλληλουχία επιτρέπει την ταχεία και συστηματική ταυτοποίηση παραλλαγών μεγάλης κλίμακας είτε σε ολόκληρο το γονιδίωμα είτε στις περιοχές κωδικοποίησης του γονιδιώματος (εξώμη). Στόχος της μελέτης μας είναι να αξιολογήσουμε 30 παιδιά με ιδιοπαθή ή αναπτυξιακή διαταραχή χωρίς οικογενειακό ιστορικό DID, και να τα μελετήσουμε με αλληλουχία της πλήρους εξοχής χρησιμοποιώντας μια προσέγγιση τρίο (ταυτόχρονη μελέτη του ασθενούς και των γονέων του) προκειμένου να αξιολογηθεί η παρουσία de novo μεταλλάξεων. Η υλοποίηση αυτού του έργου θα επιτρέψει την ανάπτυξη μιας «σωληνικής» για τη βιοπληροφορική ανάλυση των δεδομένων που παράγονται από τη μαζική αλληλουχία, η οποία μπορεί να εφαρμοστεί στη μελέτη άλλων γενετικών παθολογιών. (Greek)
18 August 2022
0 references
Intellektuel handicap (IPD) er en udbredt og global sygdom, der sammen med neuropsykiatriske lidelser er den vigtigste kilde til sundhedsudgifter i det vestlige samfund. I barndommen er diagnosen baseret på en generel udviklingsforsinkelse, herunder motorisk, kognitiv og sproglig retardering. Chancerne for genetisk diagnose hos børn med intellektuelle handicap eller moderat alvorlig neurologisk udviklingsforstyrrelse er meget lave, når "rutinemæssige" undersøgelser har været normale. I de senere år har genetiske ændringer vist sig at være en af hovedårsagerne til DI eller neurologiske udviklingsforstyrrelser i barndommen. Frekvensen af mutationer pr. generation hos mennesker er kendt for at være høj. Nylige undersøgelser har vist, at der er en høj grad af de novo mutationer hos personer med DI. Massesekvensering muliggør hurtig og systematisk identifikation af store varianter enten i hele genomet eller i kodningsregionerne af genomet (exome). Formålet med vores undersøgelse er at evaluere 30 børn med idiopatisk DI eller udviklingsmæssig lidelse uden familiens historie af DID, og at studere dem ved at sekventere den komplette exom ved hjælp af en trios tilgang (samtidig undersøgelse af patienten og hans forældre) for at vurdere tilstedeværelsen af de novo mutationer. Realiseringen af dette projekt vil gøre det muligt at udvikle en "pipeline" til bioinformatikanalyse af de data, der genereres ved massesekvensering, som kan anvendes til undersøgelsen af andre genetiske patologier. (Danish)
18 August 2022
0 references
Älyllinen vamma (IPD) on yleinen ja maailmanlaajuinen sairaus, joka yhdessä neuropsykiatristen häiriöiden kanssa on tärkein terveyskustannusten lähde läntisessä yhteiskunnassa. Lapsuudessa diagnoosi perustuu yleiseen kehitysviiveeseen, mukaan lukien moottori, kognitiivinen ja kielen hidastuminen. Geneettisen diagnoosin mahdollisuus kehitysvammaisilla lapsilla tai kohtalaisen vakavan neurologisen kehityksen häiriöillä on hyvin pieni, kun rutiinitutkimukset ovat olleet normaaleja. Viime vuosina geneettiset muutokset ovat osoittautuneet yhdeksi tärkeimmistä syistä DI tai neurologisia kehityshäiriöitä lapsuudessa. Mutaatioiden määrän sukupolvea kohti ihmisillä tiedetään olevan korkea. Viimeaikaiset tutkimukset ovat osoittaneet, että de novo mutaatioiden määrä on suuri potilailla, joilla on DI. Massasekvensointi mahdollistaa suurten varianttien nopean ja järjestelmällisen tunnistamisen joko koko genomissa tai genomin koodausalueilla (eksome). Tutkimuksemme tavoitteena on arvioida 30 lasta, joilla on idiopaattinen DI tai kehityshäiriö ilman DID: n suvun historiaa, ja tutkia heitä sekvensoimalla täydellinen eksome käyttäen trios-lähestymistapaa (samanaikainen tutkimus potilaasta ja hänen vanhemmistaan) de novo mutaatioiden esiintymisen arvioimiseksi. Tämän hankkeen toteuttaminen mahdollistaa ”putkiston” kehittämisen massasekvensoinnin tuottamien tietojen bioinformatiikan analysointia varten, jota voidaan soveltaa muiden geneettisten patologioiden tutkimiseen. (Finnish)
18 August 2022
0 references
Id-diżabilità intellettwali (IPD) hija marda prevalenti u globali li, flimkien mad-disturbi newropsikjatriċi, hija s-sors ewlieni tal-ispejjeż tas-saħħa fis-soċjetà tal-Punent. Fit-tfulija, id-dijanjożi hija bbażata fuq dewmien ġenerali fl-iżvilupp, inkluż ittardjar tal-moviment, konjittiv u tal-lingwa. Iċ-ċansijiet ta’ dijanjosi ġenetika fi tfal b’diżabilitajiet intellettwali jew b’disturbi ta’ żvilupp newroloġiku moderat-sever huma baxxi ħafna ladarba l-istudji ta’ “rutina” kienu normali. Fis-snin riċenti l-alterazzjonijiet ġenetiċi ġew murija li huma waħda mill-kawżi ewlenin ta ‘disturbi ta’ żvilupp DI jew newroloġiċi fit-tfulija. Ir-rata ta’ mutazzjonijiet għal kull ġenerazzjoni fil-bnedmin hija magħrufa li hija għolja. Studji riċenti wrew li hemm rata għolja ta’ mutazzjonijiet de novo f’individwi b’DI. Is-sekwenzar tal-massa jippermetti l-identifikazzjoni rapida u sistematika ta’ varjanti fuq skala kbira jew fil-ġenoma kollu jew fir-reġjuni ta’ kodifikazzjoni tal-ġenoma (eżoma). L-għan ta ‘studju tagħna huwa li tevalwa 30 tfal ma DI idjopatika jew disturb ta’ żvilupp mingħajr storja tal-familja ta ‘DID, u biex tistudjahom billi sekwenzjar l-eżomu komplet bl-użu ta’ approċċ trios (studju simultanju tal-pazjent u l-ġenituri tiegħu) sabiex tevalwa l-preżenza ta ‘mutazzjonijiet de novo. It-twettiq ta’ dan il-proġett se jippermetti l-iżvilupp ta’ “pipeline” għall-analiżi bijoinformatika tad-data ġġenerata mis-sekwenzar tal-massa, li tista’ tiġi applikata għall-istudju ta’ patoloġiji ġenetiċi oħra. (Maltese)
18 August 2022
0 references
Intelektuālā invaliditāte (IPD) ir izplatīta un globāla slimība, kas kopā ar neiropsihiskiem traucējumiem ir galvenais veselības aprūpes izmaksu avots Rietumu sabiedrībā. Bērnībā diagnoze ir balstīta uz vispārēju attīstības aizkavēšanos, ieskaitot motorisko, kognitīvo un valodas atpalicību. Ģenētiskās diagnozes iespējamība bērniem ar intelektuālās attīstības traucējumiem vai vidēji smagiem neiroloģiskās attīstības traucējumiem ir ļoti maza, ja “parastie” pētījumi ir bijuši normāli. Pēdējos gados ir pierādīts, ka ģenētiskās izmaiņas ir viens no galvenajiem DI vai neiroloģiskās attīstības traucējumu cēloņiem bērnībā. Ir zināms, ka mutāciju skaits paaudzē cilvēkiem ir augsts. Nesenie pētījumi ir parādījuši, ka indivīdiem ar DI ir augsts de novo mutāciju līmenis. Masveida sekvencēšana ļauj ātri un sistemātiski identificēt liela mēroga variantus vai nu visā genomā, vai genoma (exome) kodēšanas reģionos. Mūsu pētījuma mērķis ir novērtēt 30 bērnus ar idiopātisku DI vai attīstības traucējumiem bez DID ģimenes anamnēzē un izpētīt tos, veicot pilnīgu eksomes secību, izmantojot trio pieeju (vienlaicīgu pacienta un viņa vecāku pētījumu), lai novērtētu de novo mutāciju klātbūtni. Šā projekta realizācija ļaus izstrādāt “pipeline” bioinformātikas analīzei datiem, kas iegūti masveida sekvencēšanas rezultātā, ko var izmantot citu ģenētisko patoloģiju izpētei. (Latvian)
18 August 2022
0 references
Duševné postihnutie (IPD) je rozšírená a globálna choroba, ktorá je spolu s neuropsychiatrickými poruchami hlavným zdrojom zdravotných nákladov v západnej spoločnosti. V detstve je diagnóza založená na všeobecnom vývojovom oneskorení vrátane motorickej, kognitívnej a jazykovej retardácie. Pravdepodobnosť genetickej diagnózy u detí s mentálnym postihnutím alebo stredne závažnou poruchou neurologického vývoja je veľmi nízka, ak „rutinné“ štúdie boli normálne. V posledných rokoch sa genetické zmeny ukázali ako jedna z hlavných príčin DI alebo neurologických vývojových porúch v detstve. Je známe, že miera mutácií na generáciu u ľudí je vysoká. Nedávne štúdie ukázali, že existuje vysoká miera de novo mutácií u jedincov s DI. Hromadné sekvenovanie umožňuje rýchlu a systematickú identifikáciu rozsiahlych variantov buď v celom genóme, alebo v kódovacích oblastiach genómu (exome). Cieľom našej štúdie je vyhodnotiť 30 detí s idiopatickou DI alebo vývinovou poruchou bez rodinnej anamnézy DID a študovať ich sekvenovaním kompletného exome pomocou triosového prístupu (simultánna štúdia pacienta a jeho rodičov) s cieľom vyhodnotiť prítomnosť de novo mutácií. Realizácia tohto projektu umožní vytvorenie „potrubia“ pre bioinformatické analýzy údajov získaných hromadným sekvenovaním, ktoré môžu byť aplikované na štúdium iných genetických patológií. (Slovak)
18 August 2022
0 references
Is galar forleathan agus domhanda é míchumas intleachtúil (IPD) arb é, mar aon le neamhoird neuropsychiatric, príomhfhoinse na gcostas sláinte i sochaí an Iarthair. I óige, tá diagnóis bunaithe ar mhoill forbartha ginearálta, lena n-áirítear mótair, cognaíocha agus moilliú teanga. Tá na seansanna a bhaineann le diagnóis ghéiniteach i leanaí faoi mhíchumas intleachta nó neamhord forbartha néareolaíoch measartha-dian an-íseal nuair a bhíonn staidéir “gnáth” gnáth. Le blianta beaga anuas tá sé léirithe go bhfuil athruithe géiniteacha ar cheann de na príomhchúiseanna le DI nó neamhoird forbartha néareolaíocha i óige. Is eol go bhfuil an ráta sóchán in aghaidh na giniúna i ndaoine ard. Léirigh staidéir le déanaí go bhfuil ráta ard sócháin de novo i ndaoine aonair le DI. Le seicheamhú maise is féidir athraithigh mhórscála a shainaithint go tapa agus go córasach i ngéanóm ar fad nó i réigiúin ionchódaithe an ghéanóm (exome). Is é cuspóir ár staidéir ná meastóireacht a dhéanamh ar leanaí 30 le DI idiopathic nó neamhord forbartha gan stair teaghlaigh DID, agus staidéar a dhéanamh orthu trí sheicheamhú a dhéanamh ar an exome iomlán ag baint úsáide as cur chuige trios (staidéar comhuaineach ar an othar agus a thuismitheoirí) chun meastóireacht a dhéanamh ar láithreacht sócháin de novo. Ceadóidh réadú an tionscadail seo “píblíne” a fhorbairt chun anailís bithfhaisnéisíochta a dhéanamh ar na sonraí a ghintear trí sheicheamhú maise, ar féidir iad a chur i bhfeidhm ar staidéar ar phaiteolaíochtaí géiniteacha eile. (Irish)
18 August 2022
0 references
Duševní postižení (IPD) je převládající a globální onemocnění, které je spolu s neuropsychiatrickými poruchami hlavním zdrojem zdravotních nákladů v západní společnosti. V dětství je diagnóza založena na celkovém vývojovém zpoždění, včetně motorické, kognitivní a jazykové retardace. Šance na genetickou diagnózu u dětí s mentálním postižením nebo středně těžkou neurologickou poruchou vývoje jsou velmi nízké, jakmile jsou „rutinní“ studie normální. V posledních letech bylo prokázáno, že genetické změny jsou jednou z hlavních příčin poruch DI nebo neurologického vývoje v dětství. Je známo, že rychlost mutací na generaci u lidí je vysoká. Nedávné studie ukázaly, že u jedinců s DI je vysoká míra de novo mutací. Hmotnostní sekvenování umožňuje rychlou a systematickou identifikaci velkoplošných variant buď v celém genomu, nebo v kódovacích oblastech genomu (exomu). Cílem naší studie je vyhodnotit 30 dětí s idiopatickou DI nebo vývojovou poruchou bez rodinné anamnézy DID a studovat je sekvenováním kompletního exomu pomocí triosového přístupu (simultánní studie pacienta a jeho rodičů) za účelem vyhodnocení přítomnosti de novo mutací. Realizace tohoto projektu umožní vývoj „pipeline“ pro bioinformatickou analýzu dat generovaných hmotnostním sekvenováním, kterou lze aplikovat na studium dalších genetických patologií. (Czech)
18 August 2022
0 references
A deficiência intelectual (DPI) é uma doença prevalente e global que, juntamente com distúrbios neuropsiquiátricos, é a principal fonte de custos de saúde na sociedade ocidental. Na infância, o diagnóstico é ganza em um atraso geral do desenvolvimento, incluindo retardo motor, cognitivo e de linguagem. As hipóteses de diagnóstico genético em crianças com deficiência intelectual ou transtorno do desenvolvimento neurológico moderado-severo são muito baixas, uma vez que os estudos «rotina» têm sido normais. Nos últimos anos, as alterações genéticas têm se mostrado uma das principais causas de DI ou distúrbios do desenvolvimento neurológico na infância. Sabe-se que a taxa de mutações por geração em humanos é elevada. Estudos recentes mostraram que há uma alta taxa de mutações de novo em indivíduos com DI. A sequenciação de massa permite a identificação rápida e sistemática de variantes em grande escala, quer em todo o genoma quer nas regiões de codificação do genoma (exome). O objetivo do nosso estudo é avaliar 30 crianças com DI idiopática ou transtorno do desenvolvimento sem história familiar de DID, e estudá-las sequenciando o exoma completo utilizando uma abordagem trios (estudo simultâneo do paciente e de seus pais) para avaliar a presença de mutações de novo. A realização deste projeto permitirá o desenvolvimento de uma «pipeline» para a análise bioinformática dos dados gerados pela sequenciação de massa, que pode ser aplicada ao estudo de outras patologias genéticas. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
Intellektipuue (IPD) on levinud ja ülemaailmne haigus, mis koos neuropsühhiaatriliste häiretega on Lääne ühiskonnas peamine tervishoiukulude allikas. Lapsepõlves põhineb diagnoos üldisel arenguviivitusel, sealhulgas motoorsel, kognitiivsel ja keelepeetusel. Vaimse puudega või mõõdukate neuroloogiliste arenguhäiretega lastel on geneetilise diagnoosimise võimalused väga väikesed, kui „rutiinsed“ uuringud on normaalsed. Viimastel aastatel on geneetiline muundumine osutunud üheks peamiseks põhjuseks DI või neuroloogiliste arenguhäirete lapsepõlves. Mutatsioonide arv inimese põlvkonna kohta on teadaolevalt kõrge. Hiljutised uuringud on näidanud, et de novo mutatsioonide esinemissagedus on kõrge DI-ga inimestel. Massijärjestus võimaldab kiiresti ja süstemaatiliselt tuvastada suuremahulisi variante kas kogu genoomis või genoomi kodeerimispiirkondades (eksome). Meie uuringu eesmärk on hinnata 30 idiopaatilise DI või arenguhäirega last, kellel ei ole DID perekondlikku anamneesi, ning uurida neid, kasutades trios-meetodit (samaaegne patsiendi ja tema vanemate uuring), et hinnata de novo mutatsioonide olemasolu. Selle projekti elluviimine võimaldab töötada välja „toru“ massijärjestuse abil saadud andmete bioinformaatika analüüsimiseks, mida saab rakendada teiste geneetiliste patoloogiate uurimisel. (Estonian)
18 August 2022
0 references
Az intellektuális fogyatékosság (IPD) egy elterjedt és globális betegség, amely a neuropszichiátriai rendellenességekkel együtt az egészségügyi költségek fő forrása a nyugati társadalomban. Gyermekkorban a diagnózis általános fejlődési késleltetésen alapul, beleértve a motoros, kognitív és nyelvi késleltetést. Az intellektuális fogyatékossággal élő vagy közepesen súlyos neurológiai fejlődési zavarban szenvedő gyermekek genetikai diagnózisának esélye nagyon alacsony, ha a „rutin” vizsgálatok normálisak voltak. Az utóbbi években bebizonyosodott, hogy a genetikai változások a DI vagy a neurológiai fejlődési rendellenességek egyik fő oka a gyermekkorban. Az emberben a mutációk aránya generációnként magas. A legújabb tanulmányok kimutatták, hogy a DI-ben szenvedő egyénekben magas a de novo mutációk aránya. A tömegszekvenálás lehetővé teszi a nagyméretű variánsok gyors és szisztematikus azonosítását a teljes genomban vagy a genom kódolási régióiban (exome). Vizsgálatunk célja, hogy 30 idiopátiás DI-ben vagy fejlődési rendellenességben szenvedő gyermeket értékeljünk a DID családi kórelőzménye nélkül, és tanulmányozzuk őket a teljes exome szekvenálásával trios megközelítéssel (a beteg és szülei egyidejű vizsgálata) a de novo mutációk jelenlétének értékelése érdekében. A projekt megvalósítása lehetővé teszi a tömeges szekvenálással generált adatok bioinformatikai elemzésére szolgáló „pipelin” kifejlesztését, amelyet más genetikai patológiák tanulmányozására lehet alkalmazni. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
Интелектуалното увреждане (IPD) е широко разпространено и глобално заболяване, което заедно с невропсихиатричните разстройства е основният източник на здравни разходи в западното общество. В детството диагнозата се основава на общо забавяне на развитието, включително двигателно, когнитивно и езиково забавяне. Шансовете за генетична диагноза при деца с умствени увреждания или умерено тежко неврологично разстройство на развитието са много ниски, след като „рутинните“ проучвания са били нормални. През последните години е доказано, че генетичните промени са една от основните причини за ДИ или нарушения на неврологичното развитие в детството. Процентът на мутации на поколение при хората е известен като висок. Последните проучвания показват, че има висок процент на de novo мутации при лица с DI. Масовото секвениране позволява бързото и систематично идентифициране на широкомащабни варианти в целия геном или в кодиращите райони на генома (екзома). Целта на нашето проучване е да оценим 30 деца с идиопатичен DI или разстройство на развитието без фамилна анамнеза за DID, както и да ги проучим чрез секвениране на пълната екзома с помощта на триосен подход (едновременно проучване на пациента и неговите родители), за да се оцени наличието на de novo мутации. Осъществяването на този проект ще позволи разработването на „тръбопровод“ за биоинформатичен анализ на данните, генерирани от масовото секвениране, който може да се приложи при изучаването на други генетични патологии. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
Intelektinė negalia (IPD) yra paplitusi ir pasaulinė liga, kuri kartu su neuropsichiniais sutrikimais yra pagrindinis sveikatos priežiūros išlaidų šaltinis Vakarų visuomenėje. Vaikystėje diagnozė grindžiama bendru vystymosi vėlavimu, įskaitant motorinį, kognityvinį ir kalbos atsilikimą. Genetinės diagnozės tikimybė vaikams su protine negalia ar vidutinio sunkumo neurologinio vystymosi sutrikimu yra labai maža, kai „įprasti“ tyrimai buvo normalūs. Pastaraisiais metais buvo įrodyta, kad genetiniai pakitimai yra viena iš pagrindinių DI ar neurologinių vystymosi sutrikimų priežasčių vaikystėje. Žinoma, kad žmogaus mutacijų dažnis per kartą yra didelis. Naujausi tyrimai parodė, kad individams, sergantiems DI, yra daug de novo mutacijų. Masinės sekos nustatymas leidžia greitai ir sistemingai identifikuoti didelio masto variantus visame genome arba genomo kodavimo regionuose (egzome). Mūsų tyrimo tikslas – įvertinti 30 vaikų, sergančių idiopatiniu DI ar vystymosi sutrikimu be DID šeimos istorijos, ir ištirti juos sekant visą egzomą naudojant trios metodą (vienalaikis paciento ir jo tėvų tyrimas), siekiant įvertinti de novo mutacijų buvimą. Šio projekto įgyvendinimas leis sukurti „vamzdyną“ bioinformatikos duomenų, gautų masinės sekos nustatymo būdu, analizei, kuri gali būti taikoma kitų genetinių patologijų tyrimams. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
Intelektualni invaliditet (IPD) je raširena i globalna bolest koja je, zajedno s neuropsihijatrijskim poremećajima, glavni izvor zdravstvenih troškova u zapadnom društvu. U djetinjstvu se dijagnoza temelji na općem razvojnom zakašnjenju, uključujući motoričke, kognitivne i jezične retardacije. Šanse za genetsku dijagnozu u djece s intelektualnim teškoćama ili umjereno teškim poremećajem neurološkog razvoja vrlo su niske nakon što su „rutinske” studije bile normalne. Posljednjih godina pokazalo se da su genetske promjene jedan od glavnih uzroka DI-ja ili poremećaja neurološkog razvoja u djetinjstvu. Poznato je da je stopa mutacija po generaciji u ljudi visoka. Nedavna istraživanja su pokazala da postoji visoka stopa de novo mutacija u osoba s DI. Masovno sekvenciranje omogućuje brzu i sustavnu identifikaciju velikih varijanti bilo u cijelom genomu ili u područjima kodiranja genoma (eksoma). Cilj našeg istraživanja je procijeniti 30 djece s idiopatskim DI ili razvojnim poremećajem bez obiteljske anamneze DID-a, te ih proučavati sekvenciranjem kompletnog egzoma pomoću trios pristupa (istodobno proučavanje pacijenta i njegovih roditelja) kako bi se procijenila prisutnost de novo mutacija. Realizacijom ovog projekta omogućit će se razvoj „cijevi” za bioinformatičku analizu podataka dobivenih masovnim sekvenciranjem, koji se mogu primijeniti na proučavanje drugih genetskih patologija. (Croatian)
18 August 2022
0 references
Intellektuell funktionsnedsättning (IPD) är en utbredd och global sjukdom som, tillsammans med neuropsykiatriska störningar, är den främsta källan till hälsokostnader i det västerländska samhället. I barndomen baseras diagnosen på en allmän utvecklingsfördröjning, inklusive motorisk, kognitiv och språklig retardation. Risken för genetisk diagnos hos barn med intellektuell funktionsnedsättning eller måttligt svår neurologisk utvecklingsstörning är mycket låg när ”rutin” studier har varit normala. Under de senaste åren har genetiska förändringar visat sig vara en av de främsta orsakerna till DI eller neurologiska utvecklingsstörningar i barndomen. Mutationshastigheten per generation hos människor är känd för att vara hög. Nyligen genomförda studier har visat att det finns en hög frekvens av de novo-mutationer hos individer med DI. Masssekvensering möjliggör snabb och systematisk identifiering av storskaliga varianter antingen i hela genomet eller i kodningsregionerna av genomet (exome). Syftet med vår studie är att utvärdera 30 barn med idiopatisk DI eller utvecklingsstörning utan släkthistoria av DID, och att studera dem genom att sekvensera hela exomen med hjälp av en triosmetod (samtidig studie av patienten och hans föräldrar) för att utvärdera förekomsten av de novo-mutationer. Genomförandet av detta projekt kommer att göra det möjligt att utveckla en ”pipeline” för bioinformatikanalys av data som genereras genom masssekvensering, som kan tillämpas på studier av andra genetiska patologier. (Swedish)
18 August 2022
0 references
Handicapul intelectual (DPI) este o boală prevalentă și globală care, împreună cu tulburările neuropsihiatrice, reprezintă principala sursă de costuri pentru sănătate în societatea occidentală. În copilărie, diagnosticul se bazează pe o întârziere generală de dezvoltare, inclusiv întârzierea motorie, cognitivă și lingvistică. Șansele diagnosticului genetic la copiii cu dizabilități intelectuale sau tulburări de dezvoltare neurologică moderată-severă sunt foarte scăzute odată ce studiile de rutină au fost normale. În ultimii ani, modificările genetice s-au dovedit a fi una dintre principalele cauze ale DI sau tulburări de dezvoltare neurologică în copilărie. Rata mutațiilor pe generație la om este cunoscută ca fiind ridicată. Studii recente au arătat că există o rată ridicată a mutațiilor de novo la persoanele cu ID. Secvențierea în masă permite identificarea rapidă și sistematică a variantelor la scară largă, fie în întregul genom, fie în regiunile de codare ale genomului (exome). Obiectivul studiului nostru este de a evalua 30 de copii cu DI idiopatică sau tulburare de dezvoltare fără antecedente familiale de DID, și de a-i studia prin secvențierea exomului complet folosind o abordare trios (studiul simultan al pacientului și al părinților săi) pentru a evalua prezența mutațiilor de novo. Realizarea acestui proiect va permite dezvoltarea unei „conducte” pentru analiza bioinformatică a datelor generate de secvențierea în masă, care poate fi aplicată la studiul altor patologii genetice. (Romanian)
18 August 2022
0 references
Intelektualna invalidnost je razširjena in globalna bolezen, ki je skupaj z nevropsihiatričnimi motnjami glavni vir zdravstvenih stroškov v zahodni družbi. V otroštvu diagnoza temelji na splošni razvojni zamudi, vključno z motorično, kognitivno in jezikovno zaostalostjo. Možnosti genetske diagnoze pri otrocih z motnjami v duševnem razvoju ali zmerne hude nevrološke razvojne motnje so zelo majhne, ko so bile „rutinske“ študije normalne. V zadnjih letih se je izkazalo, da so genetske spremembe eden glavnih vzrokov za DI ali nevrološke razvojne motnje v otroštvu. Znano je, da je stopnja mutacij na generacijo pri ljudeh visoka. Nedavne študije so pokazale, da obstaja visoka stopnja de novo mutacij pri posameznikih z DI. Množično zaporedje omogoča hitro in sistematično prepoznavanje velikih variant bodisi v celotnem genomu bodisi v kodiranih območjih genoma (eksom). Cilj naše študije je oceniti 30 otrok z idiopatsko DI ali razvojno motnjo brez družinske anamneze DID in jih preučiti s sekvenciranjem celotnega eksoma z uporabo pristopa trios (sočasna študija bolnika in njegovih staršev), da bi ocenili prisotnost novih mutacij. Realizacija tega projekta bo omogočila razvoj „pipelina“ za bioinformatično analizo podatkov, pridobljenih z množičnim sekvenciranjem, ki se lahko uporablja za preučevanje drugih genetskih patologij. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
Niepełnosprawność intelektualna (IPD) jest powszechną i globalną chorobą, która wraz z zaburzeniami neuropsychiatrycznymi jest głównym źródłem kosztów opieki zdrowotnej w społeczeństwie zachodnim. W dzieciństwie diagnoza opiera się na ogólnym opóźnieniu rozwojowym, w tym opóźnieniu ruchowym, poznawczym i językowym. Szanse na diagnozę genetyczną u dzieci z niepełnosprawnością intelektualną lub umiarkowanymi poważnymi zaburzeniami rozwoju neurologicznego są bardzo niskie po normalnym badaniu „rutynowym”. W ostatnich latach zmiany genetyczne okazały się być jedną z głównych przyczyn zaburzeń DI lub zaburzeń rozwoju neurologicznego w dzieciństwie. Częstość mutacji na pokolenie u ludzi jest wysoka. Ostatnie badania wykazały, że istnieje wysoki odsetek mutacji de novo u osób z DI. Sekwencjonowanie masowe umożliwia szybką i systematyczną identyfikację wariantów na dużą skalę w całym genomie lub w regionach kodowania genomu (eksomu). Celem naszego badania jest ocena 30 dzieci z idiopatycznym DI lub zaburzeniem rozwojowym bez historii rodzinnej DID, oraz badanie ich poprzez sekwencjonowanie całego exomu przy użyciu podejścia triosowego (jednoczesne badanie pacjenta i jego rodziców) w celu oceny obecności mutacji de novo. Realizacja tego projektu pozwoli na opracowanie „pipeliny” do analizy bioinformatycznej danych generowanych przez sekwencjonowanie masowe, które można zastosować do badania innych patologii genetycznych. (Polish)
18 August 2022
0 references
Madrid
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI13_02010
0 references