Determinants of resistance, virulence and population structure of invasive and non-invasive uropathogen E. coli and relation to the clinical-epidemiological characteristics of urinary infection (Q3161685)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3161685 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Determinants of resistance, virulence and population structure of invasive and non-invasive uropathogen E. coli and relation to the clinical-epidemiological characteristics of urinary infection |
Project Q3161685 in Spain |
Statements
27,088.88 Euro
0 references
49,750.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2014
0 references
30 September 2018
0 references
FUNDACION INVESTIGACION BIOMEDICA HOSPITAL RAMON Y CAJAL
0 references
Escherichia coli (Ec) es el agente causal más frecuente de infección del tracto urinario (ITU). Nuestras participación en un estudio multicéntrico promovido por el Grupo de Estudio de Infección Hospitalaria de la Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica, y en el proyecto europeo del 7º Programa Marco R-GNOSIS (HEALTH-F3-2011-282512) nos ha permitido conseguir una colección de más de 500 aislados de Ec uropatógeno causantes de bacteriemias de origen urinario (aislados invasivos de hemocultivos) e ITU no complicadas en la comunidad (aislados no invasivos de urocultivos) procedentes de diferentes áreas y asociados con variables epidemiológicas y clínicas bien estudiadas. El objetivo del proyecto es caracterizar microbiológicamente esta colección, describiendo las tasas de resistencia y sus bases genéticas, los determinantes de virulencia y su expresión, y la presencia de clones de alto riesgo (CAR) multirresistentes con alto potencial epidémico, empleando técnicas de microbiología molecular de última generación y herramientas bioinformáticas. El análisis de los resultados microbiológicos en relación con variables epidemiológicas y clínicas permitirá identificar los pacientes con mayor riesgo de presentar ITU por CAR y definir el pronóstico de gravedad asociado. Esta propuesta constituye un ejemplo de investigación traslacional mediante la aplicación de conocimientos de genética poblacional, resistencias a los antibióticos y virulencia a una entidad infecciosa frecuente en el ámbito sanitario como es la ITU. Los resultados ayudarán a diseñar estrategias que optimicen y mejoren el manejo clínico y la terapia empírica de la ITU en España. Finalmente, dos proyectos ya consolidados convergen de forma sinérgica en esta propuesta, permitiendo la continuidad de esta línea de investigación. (Spanish)
0 references
Escherichia coli (Ec) is the most common causal agent of urinary tract infection (UTI). Our participation in a multicenter study promoted by the Hospital Infection Study Group of the Spanish Society of Infectious Diseases and Clinical Microbiology, and in the European project of the 7th Framework Programme R-GNOSIS (HEALTH-F3-2011-282512) has enabled us to obtain a collection of more than 500 isolates of uropathogenic bacteria that cause urinary bacteremias (invasive hemoculture isolates) and ITU uncomplicated in the community (non-invasive urocultural isolations) from different areas and associated with epidemiological variables and well studied clinics. The objective of the project is to characterise this collection microbiologically, describing the resistance rates and their genetic bases, the determinants of virulence and their expression, and the presence of multi-resistant high-risk clones (CAR) with high epidemic potential, using state-of-the-art molecular microbiology techniques and bioinformatics tools. The analysis of the microbiological results in relation to epidemiological and clinical variables will allow the identification of patients with the highest risk of developing CAR UTIs and the definition of the associated severity prognosis. This proposal is an example of translational research through the application of knowledge of population genetics, antibiotic resistance and virulence to a frequent infectious entity in the health field such as UTI. The results will help to design strategies that optimise and improve clinical management and empirical therapy of UTI in Spain. Finally, two already consolidated projects converge synergistically in this proposal, allowing the continuity of this line of research. (English)
12 October 2021
0.2677963718991175
0 references
Escherichia coli (Ec) est l’agent causal le plus fréquent de l’infection des voies urinaires (ITU). Notre participation à une étude multicentrique promue par le groupe d’étude sur les infections hospitalières de la Société espagnole des maladies infectieuses et de microbiologie clinique, et au projet européen du 7e programme-cadre R-GNOSIS (HEALTH-F3-2011-282512) nous a permis d’obtenir une collection de plus de 500 isolats de bactéries uropathogènes qui causent des bactériémies urinaires (isolats d’hémoculture invasives) et de l’UIT non compliquées dans la communauté (isolements uroculturels non envahissants) de différentes régions et associées à des variables épidémiologiques et à des cliniques bien étudiées. L’objectif du projet est de caractériser cette collection sur le plan microbiologique, en décrivant les taux de résistance et leurs bases génétiques, les déterminants de la virulence et leur expression, ainsi que la présence de clones à haut risque multirésistants (CAR) à fort potentiel épidémique, à l’aide de techniques de microbiologie moléculaire et d’outils bioinformatiques de pointe. L’analyse des résultats microbiologiques par rapport aux variables épidémiologiques et cliniques permettra d’identifier les patients présentant le risque le plus élevé de développer des UTI CAR et de définir le pronostic de gravité associé. Cette proposition est un exemple de recherche translationnelle par l’application de connaissances sur la génétique des populations, la résistance aux antibiotiques et la virulence à une entité infectieuse fréquente dans le domaine de la santé comme l’ITU. Les résultats aideront à concevoir des stratégies qui optimisent et améliorent la prise en charge clinique et la thérapie empirique de l’IVU en Espagne. Enfin, deux projets déjà consolidés convergent de manière synergique dans cette proposition, permettant la continuité de cette ligne de recherche. (French)
4 December 2021
0 references
Escherichia coli (Ec) ist das häufigste kausale Mittel der Harnwegsinfektion (UTI). Unsere Teilnahme an einer multizentrischen Studie, die von der Hospital Infection Study Group der Spanischen Gesellschaft für Infektionskrankheiten und klinische Mikrobiologie gefördert wird, und am europäischen Projekt des 7. Rahmenprogramms R-GNOSIS (HEALTH-F3-2011-282512) ermöglichte es uns, eine Sammlung von mehr als 500 Isolate von uropathogenen Bakterien zu erhalten, die Harnbakterien verursachen (invasive Hämokulturisolate) und ITU in der Gemeinschaft (nichtinvasive urokulturelle Isolierungen) aus verschiedenen Gebieten und verbunden mit epidemiologischen Variablen und gut ausgebildeten Kliniken. Ziel des Projekts ist es, diese Sammlung mikrobiologisch zu charakterisieren und die Widerstandsraten und ihre genetischen Grundlagen, die Determinanten der Virulenz und deren Expression sowie das Vorhandensein von multiresistenten Hochrisiko-Klonen (CAR) mit hohem Epidemiepotenzial unter Verwendung modernster molekularer Mikrobiologie und bioinformatischer Werkzeuge zu beschreiben. Die Analyse der mikrobiologischen Ergebnisse in Bezug auf epidemiologische und klinische Variablen ermöglicht die Identifizierung von Patienten mit dem höchsten Risiko für die Entwicklung von CAR-UTIs und die Definition der damit verbundenen Schwereprognose. Dieser Vorschlag ist ein Beispiel für translationale Forschung durch die Anwendung von Wissen über Populationsgenetik, Antibiotikaresistenz und Virulenz auf eine häufig infektiöse Einheit im Gesundheitsbereich wie UTI. Die Ergebnisse werden dazu beitragen, Strategien zu entwickeln, die das klinische Management und die empirische Therapie von UTI in Spanien optimieren und verbessern. Schließlich konvergieren zwei bereits konsolidierte Projekte in diesem Vorschlag synergistisch und ermöglichen die Kontinuität dieser Forschungslinie. (German)
9 December 2021
0 references
Escherichia coli (Ec) is het meest voorkomende oorzakelijke agens van urineweginfectie (UTI). Onze deelname aan een multicenter studie, gepromoot door de Hospital Infection Study Group van de Spaanse Society of Infectious Diseases and Clinical Microbiology, en aan het Europese project van het 7e Kaderprogramma R-GNOSIS (HEALTH-F3-2011-282512) heeft ons in staat gesteld om een verzameling van meer dan 500 isolaten van uropathogene bacteriën te verkrijgen die urinebacteriën veroorzaken (invasieve hemocultuur isolaten) en ITU ongecompliceerd in de gemeenschap (niet-invasieve uroculturele isolaties) uit verschillende gebieden en geassocieerd met epidemiologische variabelen en goed bestudeerde klinieken. Het doel van het project is om deze collectie microbiologisch te karakteriseren, waarbij de resistentiepercentages en hun genetische basen worden beschreven, de determinanten van virulentie en hun expressie, en de aanwezigheid van multiresistente high-risk klonen (CAR) met een hoog epidemische potentieel, met behulp van state-of-the-art moleculaire microbiologietechnieken en bio-informatica-instrumenten. De analyse van de microbiologische resultaten met betrekking tot epidemiologische en klinische variabelen zal het mogelijk maken patiënten met het hoogste risico op het ontwikkelen van CAR UTI’s te identificeren en de bijbehorende ernstprognose te definiëren. Dit voorstel is een voorbeeld van translationeel onderzoek door de toepassing van kennis van populatiegenetica, antibioticaresistentie en virulentie op een frequente infectieuze entiteit op het gebied van gezondheid, zoals UTI. De resultaten zullen helpen bij het ontwerpen van strategieën die het klinisch beheer en empirische therapie van UTI in Spanje optimaliseren en verbeteren. Ten slotte convergeren twee reeds geconsolideerde projecten in dit voorstel synergetisch, waardoor de continuïteit van deze onderzoekslijn mogelijk is. (Dutch)
17 December 2021
0 references
Escherichia coli (Ec) è l'agente causale più comune dell'infezione del tratto urinario (UTI). La nostra partecipazione a uno studio multicentrico promosso dal gruppo di studio sulle infezioni ospedaliere della Società spagnola di malattie infettive e di microbiologia clinica, e al progetto europeo del 7º programma quadro R-GNOSIS (HEALTH-F3-2011-282512) ci ha permesso di ottenere una raccolta di oltre 500 isolati di batteri uropatogeni che causano batteriemia urinaria (isolati di emocoltura invasiva) e ITU non complicati nella comunità (isolamento uroculturale non invasivo) da diverse aree e associati a variabili epidemiologiche e cliniche ben studiate. L'obiettivo del progetto è quello di caratterizzare microbiologicamente questa collezione, descrivendo i tassi di resistenza e le loro basi genetiche, i determinanti della virulenza e la loro espressione, e la presenza di cloni multiresistenti ad alto rischio (CAR) ad alto potenziale epidemico, utilizzando tecniche microbiologiche molecolari all'avanguardia e strumenti di bioinformatica. L'analisi dei risultati microbiologici in relazione alle variabili epidemiologiche e cliniche consentirà l'identificazione dei pazienti con il rischio più elevato di sviluppare UTI CAR e la definizione della relativa prognosi di gravità. La presente proposta è un esempio di ricerca traslazionale attraverso l'applicazione della conoscenza della genetica della popolazione, della resistenza agli antibiotici e della virulenza a un'entità infettiva frequente in campo sanitario come l'UTI. I risultati aiuteranno a progettare strategie che ottimizzano e migliorano la gestione clinica e la terapia empirica di UTI in Spagna. Infine, due progetti già consolidati convergono sinergicamente in questa proposta, consentendo la continuità di questa linea di ricerca. (Italian)
16 January 2022
0 references
Το Escherichia coli (Ec) είναι ο συνηθέστερος αιτιώδης παράγοντας της λοίμωξης του ουροποιητικού συστήματος (UTI). Η συμμετοχή μας σε μια πολυκεντρική μελέτη που προωθήθηκε από την Ομάδα Μελέτης Νοσοκομειακών Λοιμώξεων της Ισπανικής Εταιρείας Λοιμωδών Νοσημάτων και Κλινικής Μικροβιολογίας, καθώς και στο ευρωπαϊκό πρόγραμμα του 7ου Προγράμματος Πλαισίου R-GNOSIS (HEALTH-F3-2011-282512) μας έδωσε τη δυνατότητα να αποκτήσουμε μια συλλογή από περισσότερα από 500 απομονωθέντα στελέχη ουροπαθογόνων βακτηρίων που προκαλούν βακτηριαιμία των ούρων (χωροκατακτητικές απομονώσεις αιμοκαλλιέργειας) και της ITU που δεν περιπλέκονται στην κοινότητα (μη επεμβατικές ουροπολιτισμικές απομονώσεις) από διαφορετικές περιοχές και συνδέονται με επιδημιολογικές μεταβλητές και καλά μελετημένες κλινικές. Στόχος του έργου είναι να χαρακτηρίσει αυτή τη συλλογή μικροβιολογικά, περιγράφοντας τα ποσοστά αντοχής και τις γενετικές τους βάσεις, τους καθοριστικούς παράγοντες της λοιμογόνου δύναμης και της έκφρασής τους, καθώς και την παρουσία πολυανθεκτικών κλώνων υψηλού κινδύνου (CAR) με υψηλό επιδημικό δυναμικό, χρησιμοποιώντας σύγχρονες τεχνικές μοριακής μικροβιολογίας και εργαλεία βιοπληροφορικής. Η ανάλυση των μικροβιολογικών αποτελεσμάτων σε σχέση με τις επιδημιολογικές και κλινικές μεταβλητές θα επιτρέψει την ταυτοποίηση ασθενών με τον υψηλότερο κίνδυνο ανάπτυξης UTI της CAR και τον ορισμό της σχετικής πρόγνωσης σοβαρότητας. Η παρούσα πρόταση αποτελεί παράδειγμα μεταγραφικής έρευνας μέσω της εφαρμογής της γνώσης της γενετικής του πληθυσμού, της ανθεκτικότητας στα αντιβιοτικά και της λοιμώδους αντοχής σε μια συχνή μολυσματική οντότητα στον τομέα της υγείας, όπως η UTI. Τα αποτελέσματα θα βοηθήσουν στον σχεδιασμό στρατηγικών που βελτιστοποιούν και βελτιώνουν την κλινική διαχείριση και την εμπειρική θεραπεία του UTI στην Ισπανία. Τέλος, δύο ήδη ενοποιημένα σχέδια συγκλίνουν συνεργιστικά στην παρούσα πρόταση, επιτρέποντας τη συνέχεια αυτής της γραμμής έρευνας. (Greek)
18 August 2022
0 references
Escherichia coli (Ec) er den mest almindelige årsagsforbindelse for urinvejsinfektion (UTI). Vores deltagelse i en multicenter undersøgelse fremmet af Hospital Infection Study Group of the Spanish Society of Infectious Diseases and Clinical Microbiology, og i det europæiske projekt under det syvende rammeprogram R-GNOSIS (HEALTH-F3-2011-282512) har gjort det muligt for os at opnå en samling af mere end 500 isolater af uropatogene bakterier, der forårsager urinbakterier (invasive hæmokulturisolater) og ITU ukompliceret i samfundet (ikke-invasive urokulturelle isolationer) fra forskellige områder og forbundet med epidemiologiske variabler og velundersøgte klinikker. Formålet med projektet er at karakterisere denne samling mikrobiologisk og beskrive resistensraterne og deres genetiske baser, determinanterne for virulens og deres udtryk samt tilstedeværelsen af multiresistente højrisikokloner (CAR) med et højt epidemisk potentiale ved hjælp af avancerede molekylære mikrobiologiske teknikker og bioinformatikværktøjer. Analysen af de mikrobiologiske resultater i relation til epidemiologiske og kliniske variabler vil gøre det muligt at identificere patienter med den største risiko for at udvikle CAR-UTI'er og definere den tilknyttede sværhedsprognose. Dette forslag er et eksempel på translationel forskning gennem anvendelse af viden om populationsgenetik, antibiotikaresistens og virulens på en hyppig infektiøs enhed på sundhedsområdet som f.eks. UTI. Resultaterne vil bidrage til at udforme strategier, der optimerer og forbedrer klinisk behandling og empirisk behandling af UTI i Spanien. Endelig konvergerer to allerede konsoliderede projekter synergistisk i dette forslag, hvilket gør det muligt at fortsætte denne forskningslinje. (Danish)
18 August 2022
0 references
Escherichia coli (Ec) on yleisin virtsatieinfektion (UTI) syy-seuraaja. Osallistumisemme Espanjan tartuntatautien ja kliinisten mikrobiologian yhdistyksen sairaalainfektiotutkimusryhmän ja seitsemännen puiteohjelman R-GNOSIS (HEALTH-F3–2011–282512) eurooppalaiseen hankkeeseen on mahdollistanut yli 500 isolaatin kokoelman uropatogeenisiä bakteereja, jotka aiheuttavat virtsan bakteereja (invasiivisia hemokulttuuri-isolaatteja) ja ITU:ta yhteisössä (ei-invasiiviset urokulttuuriset eristykset) eri alueilta ja jotka liittyvät epidemiologisiin muuttujiin ja hyvin tutkittuihin klinikoihin. Hankkeen tavoitteena on luonnehtia tätä mikrobiologista kokoelmaa kuvaamalla vastustuskykyä ja niiden geneettistä perustaa, virulenssin taustatekijöitä ja niiden ilmentymistä sekä moniresistenttien korkean riskin kloonien esiintymistä, joilla on suuri epidemiapotentiaali, käyttäen huipputason molekyylimikrobiologisia tekniikoita ja bioinformatiikkatyökaluja. Epidemiologisiin ja kliinisiin muuttujiin liittyvien mikrobiologisten tulosten analysoinnin avulla voidaan tunnistaa potilaat, joilla on suurin CAR- UTI-tartuntariski, ja määritellä siihen liittyvä vaikeusasteennuste. Tämä ehdotus on esimerkki translaatiotutkimuksesta, jossa populaatiogenetiikkaa, antibioottiresistenssiä ja virulenssia koskevaa tietämystä sovelletaan usein tarttuvaan yksikköön terveyden alalla, kuten UTI-tutkimukseen. Tulokset auttavat suunnittelemaan strategioita, joilla optimoidaan ja parannetaan UTI:n kliinistä hoitoa ja empiiristä hoitoa Espanjassa. Lopuksi kaksi jo konsolidoitua hanketta lähentyvät tässä ehdotuksessa synergistisesti, mikä mahdollistaa tämän tutkimuslinjan jatkuvuuden. (Finnish)
18 August 2022
0 references
Escherichia coli (Ec) hija l-aktar sustanza kawżali komuni ta’ infezzjoni fl-apparat urinarju (UTI). Il-parteċipazzjoni tagħna fi studju multiċentriku promoss mill-Grupp ta’ Studju dwar l-Infezzjoni fl-Isptar tas-Soċjetà Spanjola tal-Mard Infettiv u l-Mikrobijoloġija Klinika, u fil-proġett Ewropew tas-7 Programm Qafas R-GNOSIS (l-iżolati tal-emokultura invażivi) u l-ITU mhux ikkumplikati fil-komunità (iżolamenti urokulturali mhux invażivi) minn żoni differenti u assoċjati ma’ varjabbli epidemjoloġiċi u kliniċi studjati sew. L-għan tal-proġett huwa li jikkaratterizza dan il-ġbir mikrobijoloġiku, jiddeskrivi r-rati ta’ reżistenza u l-bażijiet ġenetiċi tagħhom, id-determinanti tal-virulenza u l-espressjoni tagħhom, u l-preżenza ta’ kloni multireżistenti ta’ riskju għoli (RĊA) b’potenzjal epidemiku għoli, bl-użu ta’ tekniki mikrobijoloġiċi molekulari avvanzati u għodod bijoinformatika. L-analiżi tar-riżultati mikrobijoloġiċi fir-rigward tal-varjabbli epidemjoloġiċi u kliniċi se tippermetti l-identifikazzjoni ta’ pazjenti bl-ogħla riskju li jiżviluppaw UTIs tar-RĊA u d-definizzjoni tal-pronjosi tas-severità assoċjata. Din il-proposta hija eżempju ta’ riċerka traslazzjonali permezz tal-applikazzjoni tal-għarfien dwar il-ġenetika tal-popolazzjoni, ir-reżistenza għall-antibijotiċi u l-virulenza għal entità infettiva frekwenti fil-qasam tas-saħħa bħall-UTI. Ir-riżultati se jgħinu fit-tfassil ta’ strateġiji li jottimizzaw u jtejbu l-ġestjoni klinika u t-terapija empirika ta’ UTI fi Spanja. Fl-aħħar nett, żewġ proġetti diġà konsolidati jikkonverġu b’mod sinerġistiku f’din il-proposta, u b’hekk jippermettu l-kontinwità ta’ din il-linja ta’ riċerka. (Maltese)
18 August 2022
0 references
Escherichia coli (Ec) ir visbiežākais urīnceļu infekcijas (UTI) cēlonis. Mūsu dalība Spānijas Infekcijas un klīniskās mikrobioloģijas biedrības Slimnīcu infekcijas pētījumu grupas veicinātajā daudzcentru pētījumā un 7. pamatprogrammas R-GNOSIS (HEALTH-F3–2011–282512) Eiropas projektā ir ļāvusi iegūt vairāk nekā 500 uropatogēnas baktēriju izolātu kolekciju, kas izraisa urīna bakterēmijas (invazīvi hemokultūras izolāti) un ITU, kas nav komplicēti sabiedrībā (neinvazīva urokultūras izolācija) no dažādām jomām un ir saistīta ar epidemioloģiskajiem mainīgajiem lielumiem un labi pētītām klīnikām. Projekta mērķis ir raksturot šo kolekciju mikrobioloģiski, aprakstot rezistences rādītājus un to ģenētisko bāzi, virulences noteicošos faktorus un to ekspresiju, kā arī vairāku rezistentu augsta riska klonu (CAR) klātbūtni ar augstu epidēmijas potenciālu, izmantojot jaunākās molekulārās mikrobioloģijas metodes un bioinformātikas rīkus. Mikrobioloģisko rezultātu analīze saistībā ar epidemioloģiskajiem un klīniskajiem mainīgajiem lielumiem ļaus identificēt pacientus ar vislielāko CAR UTI attīstības risku un noteikt ar to saistīto smaguma prognozi. Šis priekšlikums ir piemērs praktiskajiem pētījumiem, izmantojot zināšanas par populācijas ģenētiku, rezistenci pret antibiotikām un virulenci biežām infekcijas vienībām veselības jomā, piemēram, UTI. Rezultāti palīdzēs izstrādāt stratēģijas, kas optimizē un uzlabo UTI klīnisko pārvaldību un empīrisko terapiju Spānijā. Visbeidzot, divi jau konsolidēti projekti šajā priekšlikumā ir sinerģiski konverģēti, ļaujot turpināt šo pētniecības virzienu. (Latvian)
18 August 2022
0 references
Escherichia coli (Ec) je najčastejším pôvodcom infekcie močových ciest (UTI). Naša účasť na multicentrickej štúdii podporovanej študijnou skupinou nemocničných infekcií španielskej spoločnosti infekčných chorôb a klinickej mikrobiológie a v európskom projekte 7. rámcového programu R-GNOSIS (HEALTH-F3 – 2011 – 282512) nám umožnila získať zbierku viac ako 500 izolátov uropatogénnych baktérií, ktoré spôsobujú bakteriémiu moču (invazívne hemokultúrne izoláty) a ITU nekomplikované v komunite (neinvazívne urokultúrne izolácie) z rôznych oblastí a spojené s epidemiologickými premennými a dobre študovanými klinikami. Cieľom projektu je mikrobiologicky charakterizovať túto kolekciu, opisovať mieru rezistencie a ich genetické základy, determinanty virulencie a ich expresie a prítomnosť multirezistentných vysokorizikových klonov (CAR) s vysokým epidemiologickým potenciálom pomocou najmodernejších molekulárnych mikrobiologických techník a bioinformatických nástrojov. Analýza mikrobiologických výsledkov vo vzťahu k epidemiologickým a klinickým premenným umožní identifikáciu pacientov s najvyšším rizikom vzniku CAR UTI a definovanie súvisiacej prognózy závažnosti. Tento návrh je príkladom translačného výskumu prostredníctvom uplatňovania poznatkov o populačnej genetike, rezistencii voči antibiotikám a virulencii na častú infekčnú entitu v oblasti zdravia, ako je UTI. Výsledky pomôžu navrhnúť stratégie, ktoré optimalizujú a zlepšujú klinický manažment a empirickú terapiu UTI v Španielsku. Napokon, dva už konsolidované projekty sa synergicky zbližujú v tomto návrhu, čo umožňuje kontinuitu tohto výskumu. (Slovak)
18 August 2022
0 references
Is é Escherichia coli (Ec) an gníomhaire cúiseach is coitianta d’ionfhabhtú conradh urinary (UTI). Chuir ár rannpháirtíocht i staidéar illárnach arna chur chun cinn ag Grúpa Staidéir na nOspidéal um Ionfhabhtú de chuid Chumann na Spáinne um Ghalair Thógálacha agus Micribhitheolaíocht Chliniciúil, agus i dtionscadal Eorpach an 7ú Creatchlár R-GNOSIS (HEALTH-F3-2011-282512) ar ár gcumas bailiúchán de níos mó ná 500 aonraíoch de bhaictéir uropathogenic a fháil ó limistéir éagsúla agus a bhaineann le baictéaréimeanna urineacha (isoláití hemoculture ionracha) agus ITU neamhchasta sa phobal (leithlisithe urocultural neamh-ionracha) ó limistéir éagsúla agus a bhaineann le hathróga eipidéimeolaíocha agus clinicí dea-staidéar. Is é cuspóir an tionscadail an bailiúchán seo a thréithriú go micribhitheolaíoch, ag cur síos ar na rátaí friotaíochta agus a mbunúis ghéiniteacha, ar dheitéarmanaint na nimhneacht agus ar an léiriú orthu, agus ar chlóin ardriosca ilfhriotaíoch (CAR) a bheith ann a bhfuil ardacmhainneacht eipidéime iontu, agus úsáid á baint as teicnící móilíneacha móilíneacha úrscothacha micribhitheolaíochta agus as uirlisí bithfhaisnéisíochta. Leis an anailís ar na torthaí micribhitheolaíocha i ndáil le hathróga eipidéimeolaíocha agus cliniciúla, beifear in ann othair a shainaithint a bhfuil an baol is mó ann go bhforbróidh siad UTInna CAR agus go sainmhíneofar an phrognóis déine a bhaineann leis sin. Is sampla é an togra seo den taighde aistritheach trí eolas a chur i bhfeidhm ar ghéineolaíocht an phobail, ar fhrithsheasmhacht in aghaidh antaibheathach agus ar nimhneacht ar eintiteas tógálach minic i réimse na sláinte amhail UTI. Cabhróidh na torthaí le straitéisí a dhearadh a dhéanann bainistíocht chliniciúil agus teiripe eimpíreach UTI sa Spáinn a bharrfheabhsú agus a fheabhsú. Ar deireadh, tá dhá thionscadal atá comhdhlúite cheana féin ag teacht le chéile go sineirgíoch sa togra seo, rud a cheadaíonn leanúnachas na líne taighde seo. (Irish)
18 August 2022
0 references
Escherichia coli (Ec) je nejčastějším původcem infekce močových cest (UTI). Naše účast na multicentrické studii propagované Studijní skupinou Infekce nemocnice Španělské společnosti infekčních onemocnění a klinické mikrobiologie, a v evropském projektu 7. rámcového programu R-GNOSIS (HEALTH-F3–2011–282512) nám umožnila získat sbírku více než 500 izolátů uropatogenních bakterií, které způsobují močové bakteriémie (invazivní hemokulturní izoláty) a ITU nekomplikované v komunitě (neinvazivní urokulturní izolace) z různých oblastí a spojené s epidemiologickými proměnnými a dobře studovanými klinikami. Cílem projektu je charakterizovat tuto sbírku mikrobiologicky, popisovat míru rezistence a jejich genetické báze, determinant virulence a jejich exprese a přítomnost multirezistentních vysoce rizikových klonů (CAR) s vysokým epidemickým potenciálem za použití nejmodernějších molekulárních mikrobiologických technik a bioinformatických nástrojů. Analýza mikrobiologických výsledků ve vztahu k epidemiologickým a klinickým proměnným umožní identifikaci pacientů s nejvyšším rizikem vzniku UTI CAR a definici související prognózy závažnosti. Tento návrh je příkladem translačního výzkumu prostřednictvím využití znalostí populační genetiky, rezistence vůči antibiotikům a virulence na časté infekční entity v oblasti zdraví, jako je UTI. Výsledky pomohou navrhnout strategie, které optimalizují a zlepšují klinické řízení a empirickou terapii UTI ve Španělsku. A konečně, dva již konsolidované projekty se v tomto návrhu spojují synergicky, což umožňuje kontinuitu této linie výzkumu. (Czech)
18 August 2022
0 references
Escherichia coli (Ec) é o agente causal mais frequente da infeção do trato urinário (UTI). Nossa participação em um estudo multicêntrico promovido pelo Grupo de Estudo de Infeção Hospitalar da Sociedade Espanhola de Doenças Infecciosas e Microbiologia Clínica, e no projeto europeu do 7.º Programa-Quadro R-GNOSIS (HEALTH-F3-2011-282512) nos permitiu obter uma coleção de mais de 500 isolados de bactérias uropatogênicas que causam bacteremias urinárias (isolados de hemocultura invasiva) e ITU não complicadas na comunidade (isolamentos uroculturas não invasivos) de diferentes áreas e associada a variáveis epidemiológicas e clínicas bem estudadas. O objetivo do projeto é caracterizar esta coleção microbiologicamente, descrevendo as taxas de resistência e suas bases genéticas, os determinantes da virulência e sua expressão, e a presença de clones de alto risco multirresistentes (CAR) com alto potencial epidêmico, utilizando técnicas de microbiologia molecular de última geração e ferramentas bioinformáticas. A análise dos resultados microbiológicos em relação às variáveis epidemiológicas e clínicas permitirá identificar pacientes com maior risco de desenvolver ITU de RCA e definir o prognóstico de gravidade associada. Esta proposta é um exemplo de pesquisa translacional por meio da aplicação do conhecimento da genética populacional, resistência aos antibióticos e virulência a uma entidade infecciosa frequente no campo da saúde, como a ITU. Os resultados ajudarão a desenhar estratégias que otimizem e melhorem a gestão clínica e a terapia empírica da ITU na Espanha. Por fim, dois projetos já consolidados convergem sinergicamente nesta proposta, permitindo a continuidade dessa linha de pesquisa. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
Escherichia coli (Ec) on kõige sagedasem kuseteede infektsiooni (UTI) põhjustaja. Meie osalemine mitmekeskuselises uuringus, mida edendas Hispaania nakkushaiguste ja kliinilise mikrobioloogia ühingu Haiglanakkuste uurimisrühm, ja 7. raamprogrammi R-GNOSIS Euroopa projektis (HEALTH-F3–2011–282512) on võimaldanud meil saada üle 500 isolaadi uropatogeensetest bakteritest, mis põhjustavad kuseteede bakteremiasid (invasiivsed hemokultuuri isolaadid) ja ITU-d, mis on kogukonnas komplitseerimata (mitteinvasiivsed urokultuurilised isolatsioonid), mis on seotud epidemioloogiliste muutujate ja hästi uuritud kliinikutega. Projekti eesmärk on kirjeldada seda kollektsiooni mikrobioloogiliselt, kirjeldades resistentsuse määrasid ja nende geneetilisi aluseid, virulentsust ja nende ekspressiooni määravaid tegureid ning suure epideemiapotentsiaaliga multiresistentsete kõrge riskiga kloonide olemasolu, kasutades tipptasemel molekulaarseid mikrobioloogiatehnikaid ja bioinformaatikavahendeid. Epidemioloogiliste ja kliiniliste muutujatega seotud mikrobioloogiliste tulemuste analüüs võimaldab kindlaks teha patsiendid, kellel on kõige suurem risk KAV-i UTIde tekkeks, ning määratleda sellega seotud raskusastme prognoos. Käesolev ettepanek on näide translatiivsetest uuringutest, mis põhinevad teadmistel populatsioonigeneetika, antibiootikumiresistentsuse ja virulentsuse kohta sagedaste nakkushaiguste puhul tervishoiu valdkonnas, nagu UTI. Tulemused aitavad kavandada strateegiaid, mis optimeerivad ja parandavad UTI kliinilist juhtimist ja empiirilist ravi Hispaanias. Lõpuks lähenevad kaks juba konsolideeritud projekti käesolevas ettepanekus sünergiliselt, võimaldades selle uurimisliini järjepidevust. (Estonian)
18 August 2022
0 references
Az Escherichia coli (Ec) a húgyúti fertőzés (UTI) leggyakoribb ok-okozati oka. Részvételünk egy multicentrikus tanulmányban, amelyet a fertőző betegségek és klinikai mikrobiológia spanyol egyesületének kórházi fertőzési Tanulmányi Csoportja, valamint a 7. keretprogram R-GNOSIS (HEALTH-F3–2011–282512) európai projektje támogatott, lehetővé tette számunkra, hogy különböző területekről több mint 500 izolátumot szerezzünk be olyan uropathogén baktériumokból, amelyek húgyúti baktériumokat (invazív hemokultúrás izolátumokat) és ITU-t okoznak a közösségben (nem invazív urokulturális izolációk) különböző területekről, valamint epidemiológiai változókkal és jól tanulmányozott klinikákkal kapcsolatban. A projekt célja a gyűjtemény mikrobiológiai jellemzése, leírva a rezisztencia arányát és genetikai bázisát, a virulencia meghatározóit és azok kifejeződését, valamint a magas járvány potenciállal rendelkező, multirezisztens, nagy kockázatú klónok (CAR) jelenlétét a legkorszerűbb molekuláris mikrobiológiai technikák és bioinformatikai eszközök alkalmazásával. A mikrobiológiai eredményeknek az epidemiológiai és klinikai változókkal kapcsolatos elemzése lehetővé teszi a CAR UTI-k kialakulásának legnagyobb kockázatával rendelkező betegek azonosítását és a kapcsolódó súlyossági prognózis meghatározását. Ez a javaslat példa a transzlációs kutatásra a populációgenetikára, az antibiotikum-rezisztenciára és a virulenciára vonatkozó ismereteknek az egészségügy területén gyakori fertőző entitásokra, például az UTI-ra történő alkalmazása révén. Az eredmények segítenek olyan stratégiák kialakításában, amelyek optimalizálják és javítják az UTI klinikai kezelését és empirikus terápiáját Spanyolországban. Végül két, már konszolidált projekt szinergikus módon közelít egymáshoz e javaslatban, lehetővé téve e kutatási irányvonal folytonosságát. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
Escherichia coli (Ec) е най-честият причинител на инфекция на пикочните пътища (UTI). Участието ни в многоцентрово проучване, насърчавано от Групата за изследване на инфекциите на Испанското дружество по инфекциозни болести и клинична микробиология, и в европейския проект на Седмата рамкова програма R-GNOSIS (HEALTH-F3—2011—282512) ни позволи да получим колекция от над 500 изолати на уропатогенни бактерии, които причиняват пикочни бактериомии (инвазивни хемокултурни изолати) и ITU неусложнени в общността (неинвазивни урокултурни изолати) от различни области и свързани с епидемиологични променливи и добре проучени клиники. Целта на проекта е да се характеризира тази колекция микробиологично, като се опишат нивата на резистентност и техните генетични бази, детерминантите на вирулентността и тяхната експресия, както и наличието на мултирезистентни високорискови клонинги (ЦАР) с висок епидемичен потенциал, като се използват най-съвременни молекулярни микробиологични техники и биоинформатични инструменти. Анализът на микробиологичните резултати във връзка с епидемиологичните и клиничните променливи ще позволи идентифицирането на пациенти с най-висок риск от развитие на УПИ на ЦАР и определяне на съответната прогноза за тежестта. Настоящото предложение е пример за транслационни изследвания чрез прилагане на познанията за популационната генетика, антибиотичната резистентност и вирулентността към честа инфекциозна единица в областта на здравеопазването, като например УТИ. Резултатите ще помогнат за разработването на стратегии, които оптимизират и подобряват клиничното управление и емпиричната терапия на УТИ в Испания. И накрая, два вече консолидирани проекта се обединяват в синергичен план в настоящото предложение, което позволява непрекъснатостта на тази линия на научни изследвания. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
Escherichia coli (Ec) yra dažniausias šlapimo takų infekcijos (UTI) sukėlėjas. Mūsų dalyvavimas daugiacentriame tyrime, kurį skatina Ispanijos infekcinių ligų ir klinikinės mikrobiologijos draugijos ligoninių infekcijos tyrimo grupė, ir 7-osios bendrosios programos R-GNOSIS (HEALTH-F3–2011–282512) Europos projekte leido mums gauti daugiau nei 500 uropatogeninių bakterijų, sukeliančių šlapimo bakteriemijas (invaziniai hemokultūros izoliatai) ir ITU nesudėtingų bendruomenėje (neinvazinių urokultūrinių izoliacijų) iš įvairių sričių ir susijusių su epidemiologiniais kintamaisiais ir gerai ištirtomis klinikomis, kolekciją. Projekto tikslas – apibūdinti šią kolekciją mikrobiologiniu būdu, apibūdinant atsparumo lygį ir jų genetinius pagrindus, virulentiškumo lemiančius veiksnius ir jų ekspresiją, taip pat daugiaatsparių didelės rizikos klonų (CAR), turinčių didelį epidemijos potencialą, buvimą, naudojant moderniausius molekulinės mikrobiologijos metodus ir bioinformatikos priemones. Mikrobiologinių rezultatų analizė, susijusi su epidemiologiniais ir klinikiniais kintamaisiais, leis nustatyti pacientus, kuriems kyla didžiausia rizika susirgti CAR UTI, ir apibrėžti su tuo susijusią sunkumo prognozę. Šis pasiūlymas yra pritaikomųjų mokslinių tyrimų pavyzdys taikant žinias apie populiacijos genetiką, atsparumą antibiotikams ir virulentiškumą dažnai infekciniam subjektui sveikatos srityje, pavyzdžiui, UTI. Rezultatai padės kurti strategijas, kurios optimizuoja ir gerina UTI klinikinį valdymą ir empirinę terapiją Ispanijoje. Galiausiai du jau konsoliduoti projektai šiame pasiūlyme sujungiami sinergiškai, o tai leidžia tęsti šią mokslinių tyrimų eilutę. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
Escherichia coli (Ec) najčešći je uzročnik infekcije mokraćnog sustava (UTI). Naše sudjelovanje u multicentričnom istraživanju koje je promovirala Skupina za bolničku infekciju španjolskog društva za zarazne bolesti i kliničku mikrobiologiju te u europskom projektu 7. okvirnog programa R-GNOSIS (HEALTH-F3 – 282512) omogućilo nam je da dobijemo zbirku od više od 500 izolata uropatogenih bakterija koje uzrokuju bakterije urina (invazivne hemokulturne izolate) i ITU nekomplicirane u zajednici (neinvazivne urokulturne izolacije) iz različitih područja i povezane s epidemiološkim varijablama i dobro proučavanim klinikama. Cilj projekta je karakterizirati ovu zbirku mikrobiološki, opisujući stope otpornosti i njihove genetske baze, odrednice virulencije i njihovu ekspresiju, te prisutnost multirezistentnih visokorizičnih klonova (CAR) s visokim potencijalom epidemije, koristeći najmodernije molekularne mikrobiološke tehnike i bioinformatičke alate. Analiza mikrobioloških rezultata u vezi s epidemiološkim i kliničkim varijablama omogućit će identifikaciju bolesnika s najvećim rizikom od razvoja CAR UTI-ja i definiranje povezane prognoze ozbiljnosti. Ovaj je prijedlog primjer translacijskog istraživanja primjenom znanja o populacijskoj genetici, otpornosti na antibiotike i virulencije na česte zarazne subjekte u području zdravlja kao što je UTI. Rezultati će pomoći u osmišljavanju strategija koje optimiziraju i poboljšavaju kliničko upravljanje i empirijsku terapiju UTI-ja u Španjolskoj. Konačno, dva već konsolidirana projekta sinergijski se konvergiraju u ovom prijedlogu, čime se omogućuje kontinuitet te linije istraživanja. (Croatian)
18 August 2022
0 references
Escherichia coli (Ec) är det vanligaste orsaksmedlet för urinvägsinfektion (UTI). Vårt deltagande i en multicenterstudie som främjas av Hospital Infection Study Group of the Spanish Society of Infectious Diseases and Clinical Microbiology, och i det europeiska projektet för sjunde ramprogrammet R-GNOSIS (HEALTH-F3–2011–282512) har gjort det möjligt för oss att få en samling av mer än 500 isolat av uropatogena bakterier som orsakar urinbakterier (invasiva hemokulturisolat) och ITU okomplicerade i samhället (icke-invasiva urokulturella isoleringar) från olika områden och i samband med epidemiologiska variabler och väl studerade kliniker. Syftet med projektet är att karakterisera denna samling mikrobiologiskt, beskriva resistensfrekvensen och deras genetiska baser, bestämningsfaktorerna för virulens och deras uttryck samt förekomsten av multiresistenta högriskkloner (CAR) med hög epidemisk potential, med hjälp av toppmoderna molekylär mikrobiologitekniker och bioinformatikverktyg. Analysen av de mikrobiologiska resultaten i förhållande till epidemiologiska och kliniska variabler kommer att göra det möjligt att identifiera patienter med störst risk att utveckla UTI i CAR och definiera den tillhörande allvarlighetsprognosen. Detta förslag är ett exempel på överbryggande forskning genom tillämpning av kunskap om populationsgenetik, antibiotikaresistens och virulens på en frekvent smittsam enhet inom hälsoområdet, t.ex. UTI. Resultaten kommer att bidra till att utforma strategier som optimerar och förbättrar klinisk hantering och empirisk behandling av UTI i Spanien. Slutligen konvergerar två redan konsoliderade projekt synergistiskt i detta förslag, vilket möjliggör kontinuitet i denna forskningslinje. (Swedish)
18 August 2022
0 references
Escherichia coli (Ec) este cel mai frecvent agent cauzal al infecției tractului urinar (ITU). Participarea noastră la un studiu multicentric promovat de Grupul de Studiu Infecțial Spital al Societății Spaniole de Boli Infecțioase și Microbiologie Clinică, precum și la proiectul european al celui de-al 7-lea Program Cadru R-GNOSIS (HEALTH-F3-2011-282512) ne-a permis să obținem o colecție de peste 500 de izolate de bacterii uropaogene care cauzează bacteremii urinare (izolate hemocultură invazivă) și UIT necomplicate în comunitate (izolații uroculturale neinvazive) din diferite zone și asociate cu variabile epidemiologice și clinici bine studiate. Obiectivul proiectului este de a caracteriza această colecție microbiologic, descriind ratele de rezistență și bazele lor genetice, factorii determinanți ai virulenței și expresia lor, precum și prezența clonelor multirezistente cu risc ridicat (CAR) cu potențial epidemic ridicat, folosind tehnici microbiologice moleculare de ultimă generație și instrumente bioinformatice. Analiza rezultatelor microbiologice în raport cu variabilele epidemiologice și clinice va permite identificarea pacienților cu cel mai mare risc de dezvoltare a UTI CAR și definirea prognosticului de severitate asociat. Prezenta propunere este un exemplu de cercetare translațională prin aplicarea cunoștințelor privind genetica populației, rezistența la antibiotice și virulența la o entitate infecțioasă frecventă în domeniul sănătății, cum ar fi UTI. Rezultatele vor ajuta la elaborarea de strategii care optimizează și îmbunătățesc managementul clinic și terapia empirică a UTI în Spania. În cele din urmă, două proiecte deja consolidate converg în mod sinergic în prezenta propunere, permițând continuitatea acestei linii de cercetare. (Romanian)
18 August 2022
0 references
Escherichia coli (Ec) je najpogostejši povzročitelj okužbe sečil (UTI). Naša udeležba v multicentrični študiji, ki jo spodbuja študijska skupina za bolnišnično okužbo španskega društva za nalezljive bolezni in klinično mikrobiologijo, ter v evropskem projektu 7. okvirnega programa R-GNOSIS (HEALTH-F3–2011–282512) nam je omogočila pridobitev zbirke več kot 500 izolatov uropatogenih bakterij, ki povzročajo urinske bakteremije (invazivne hemokulturne izolate) in ITU nezapletene v skupnosti (neinvazivne urokulturne izolacije) z različnih področij in povezane z epidemiološkimi spremenljivkami in dobro raziskanimi klinikami. Cilj projekta je mikrobiološko opisati to zbirko z opisom stopenj odpornosti in njihovih genetskih baz, determinant virulence in njihovega izražanja ter prisotnosti multirezistentnih klonov z visokim tveganjem (CAR) z visokim epidemičnim potencialom z uporabo najsodobnejših molekularnih mikrobioloških tehnik in bioinformatičnih orodij. Analiza mikrobioloških rezultatov v zvezi z epidemiološkimi in kliničnimi spremenljivkami bo omogočila identifikacijo bolnikov z največjim tveganjem za razvoj okužb SAR in opredelitev s tem povezane prognoze resnosti. Ta predlog je primer translacijskih raziskav z uporabo znanja o populacijski genetiki, odpornosti na antibiotike in virulenci pri pogostem infekcijskem subjektu na področju zdravja, kot je UTI. Rezultati bodo pomagali oblikovati strategije za optimizacijo in izboljšanje kliničnega upravljanja in empirične terapije z UTI v Španiji. Nazadnje, dva že konsolidirana projekta v tem predlogu sta sinergistično usklajena, kar omogoča kontinuiteto te vrste raziskav. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
Escherichia coli (Ec) jest najczęstszym czynnikiem powodującym zakażenie dróg moczowych (UTI). Udział w wieloośrodkowym badaniu promowanym przez Grupę Badającą Zakażenie Szpitala Hiszpańskiego Towarzystwa Chorób Zakaźnych i Mikrobiologii Klinicznej oraz w projekcie europejskim 7. programu ramowego R-GNOSIS (HEALTH-F3-2011-282512) pozwolił nam uzyskać zbiór ponad 500 izolatów uropatogennych bakterii, które powodują bakterie moczowe (inwazyjne izolaty hemokulturowe) i ITU nieskomplikowane w społeczności (nieinwazyjne izolacje urokulturowe) z różnych obszarów i związane ze zmiennymi epidemiologicznymi i dobrze zbadanymi klinikami. Celem projektu jest scharakteryzowanie tej kolekcji mikrobiologicznej, opisując wskaźniki oporności i ich podstawy genetyczne, determinanty zjadliwości i ich ekspresję oraz obecność wieloodpornych klonów wysokiego ryzyka (CAR) o wysokim potencjale epidemicznym, z wykorzystaniem najnowocześniejszych technik mikrobiologii molekularnej i narzędzi bioinformatycznych. Analiza wyników mikrobiologicznych w odniesieniu do zmiennych epidemiologicznych i klinicznych pozwoli na identyfikację pacjentów o najwyższym ryzyku rozwoju UTI w Republice Środkowoafrykańskiej oraz na określenie związanych z nimi prognoz nasilenia. Niniejszy wniosek jest przykładem badań translacyjnych poprzez zastosowanie wiedzy na temat genetyki populacji, oporności na antybiotyki i zjadliwości do częstej zakaźnej jednostki w dziedzinie zdrowia, takiej jak UTI. Wyniki pomogą w opracowaniu strategii, które optymalizują i poprawiają zarządzanie kliniczne i terapię empiryczną UTI w Hiszpanii. Ponadto dwa już skonsolidowane projekty są zbieżne w sposób synergistyczny w niniejszym wniosku, co pozwala na ciągłość tej linii badawczej. (Polish)
18 August 2022
0 references
Madrid
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI13_02092
0 references