Multicenter study of the metabolic and genetic interactoma in human gliomas. Diagnostic and prognostic implications. (Q3159588)

From EU Knowledge Graph
Jump to navigation Jump to search
Project Q3159588 in Spain
Language Label Description Also known as
English
Multicenter study of the metabolic and genetic interactoma in human gliomas. Diagnostic and prognostic implications.
Project Q3159588 in Spain

    Statements

    0 references
    0 references
    22,869.0 Euro
    0 references
    42,000.0 Euro
    0 references
    54.45 percent
    0 references
    1 January 2018
    0 references
    31 March 2021
    0 references
    FUNDACION INVESTIGACION BIOMEDICA HOSPITAL LA PAZ
    0 references
    0 references

    40°25'0.12"N, 3°42'12.89"W
    0 references
    Proponemos un estudio multicéntrico para mejorar el diagnóstico y pronóstico postquirúrgico de gliomas humanos explorando el interactoma entre su perfil metabólico y genético. Con este motivo proponemos crear un gran biobanco de gliomas, con biopsias procedentes de tres Hospitales; Hospital Universitario La Paz (Madrid), Hospital Universitario Reina Sofía (Córdoba) y el Hospital General Universitario (Valencia). El abordaje combinará herramientas metabolómicas y genómicas in vivo e in vitro, con técnicas estadísticas avanzadas, estableciendo un mapa interactómico con información nueva sobre la interacción entre los nodos metabólicos y genéticos. Cada biopsia contendrá toda la información prequirúrgica, obtenida in vivo mediante imagen (MRI, Perfusión, DTI). y espectroscopía de resonancia magnética multivoxel 1H MRSI (3T, Objetivo 1), y postquirúrgica; generada mediante análisis espectroscópico (1H y 31P HRMAS, Objetivo 2) y genómico (qPCR y secuenciación mutaciones IDH1/2, Objetivo 3). Seguidamente, prepararemos un mapa interactómico (Objetivo 4), con todos los nodos de expresión génica y de metabolitos y sus conexiones estadísticas, que revelarán la intensidad de su interacción. Finalmente, estudiaremos el valor predictivo de la espectroscopía de 1H y 31P RMN sobre la supervivencia postquirúrgica de pacientes de gliomas empleando el interactoma metabólico calculado para una base de datos previa con información de supervivencia a diez años (Objetivo 5), encontrando los nodos y conectividades que mejor predicen la supervivencia de los pacientes a medio y largo plazo. Los resultados podrían revelar la presencia de nuevas dianas terapéuticas derivadas de la interacción genoma-metaboloma. (Spanish)
    0 references
    We propose a multicenter study to improve the diagnosis and post-surgical prognosis of human gliomas by exploring the interaction between their metabolic and genetic profile. For this reason we propose to create a large biobank of gliomas, with biopsies from three hospitals; La Paz University Hospital (Madrid), Reina Sofía University Hospital (Córdoba) and the General University Hospital (Valencia). The approach will combine in vivo and in vitro metabolomic and genomic tools with advanced statistical techniques, establishing an interactive map with new information on the interaction between metabolic and genetic nodes. Each biopsy shall contain all pre-surgical information obtained in vivo by image (MRI, Infusion, ITD). and MRSI multivoxel 1H magnetic resonance spectroscopy (3T, Objective 1), and post-surgical; generated by spectroscopic analysis (1H and 31P HRMAS, Objective 2) and genomics (qPCR and sequencing mutations IDH1/2, Objective 3). Next, we will prepare an interactive map (Objective 4), with all the nodes of gene expression and metabolites and their statistical connections, which will reveal the intensity of their interaction. Finally, we will study the predictive value of 1H and 31P MRI spectroscopy on post-surgical survival of glioma patients using the metabolic interactoma calculated for a prior database with ten-year survival information (Objective 5), finding the nodes and connectivity that best predict patient survival in the medium and long term. The results could reveal the presence of new therapeutic targets derived from the genome-metaboloma interaction. (English)
    12 October 2021
    0.9254428380000604
    0 references
    Nous proposons une étude multicentrique pour améliorer le diagnostic et le pronostic post-chirurgical des gliomes humains en explorant l’interaction entre leur profil métabolique et génétique. Pour cette raison, nous proposons de créer une grande biobanque de gliomes, avec des biopsies provenant de trois hôpitaux; L’hôpital universitaire de La Paz (Madrid), l’hôpital universitaire Reina Sofía (Córdoba) et l’hôpital universitaire général (Valencia). L’approche combinera des outils métabolomiques et génomiques in vivo et in vitro avec des techniques statistiques avancées, établissant une carte interactive avec de nouvelles informations sur l’interaction entre les nœuds métaboliques et génétiques. Chaque biopsie doit contenir toutes les informations préchirurgicales obtenues in vivo par image (IRM, perfusion, DTI). et MRSI multivoxel 1H spectroscopie par résonance magnétique (3T, objectif 1) et post-chirurgicale; généré par analyse spectroscopique (1H et 31P HRMAS, objectif 2) et génomique (qPCR et mutations séquençage IDH1/2, Objectif 3). Ensuite, nous préparerons une carte interactive (objectif 4), avec tous les nœuds de l’expression génique et des métabolites et leurs connexions statistiques, qui révéleront l’intensité de leur interaction. Enfin, nous étudierons la valeur prédictive de la spectroscopie IRM 1H et 31P sur la survie post-chirurgicale des patients atteints de gliomes à l’aide de l’interaction métabolique calculée pour une base de données antérieure contenant des informations sur la survie sur dix ans (objectif 5), afin de trouver les nœuds et la connectivité qui prédisent le mieux la survie des patients à moyen et long terme. Les résultats pourraient révéler la présence de nouvelles cibles thérapeutiques dérivées de l’interaction génome-métabolome. (French)
    4 December 2021
    0 references
    Wir schlagen eine multizentrische Studie vor, um die Diagnose und postchirurgische Prognose von menschlichen Gliomen zu verbessern, indem wir die Wechselwirkungen zwischen ihrem metabolischen und genetischen Profil untersuchen. Aus diesem Grund schlagen wir vor, eine große Biobank von Gliomen mit Biopsien aus drei Krankenhäusern zu schaffen; Universitätsklinikum La Paz (Madrid), Universitätsklinikum Reina Sofía (Córdoba) und das Allgemeine Universitätsklinikum (Valencia). Der Ansatz wird in vivo und in vitro metabolomische und genomische Werkzeuge mit fortschrittlichen statistischen Techniken kombinieren und eine interaktive Karte mit neuen Informationen über die Wechselwirkung zwischen metabolischen und genetischen Knoten erstellen. Jede Biopsie muss alle vorchirurgischen Informationen enthalten, die in vivo durch Bild (MRI, Infusion, ITD) gewonnen wurden. und MRSI multivoxel 1H Magnetresonanzspektroskopie (3T, Ziel 1) und postchirurgische; erzeugt durch spektroskopische Analyse (1H und 31P HRMAS, Ziel 2) und Genomik (qPCR und Sequencing Mutationen IDH1/2, Ziel 3). Als nächstes werden wir eine interaktive Karte (Ziel 4) mit allen Knoten der Genexpression und Metaboliten und deren statistischer Verbindungen erstellen, die die Intensität ihrer Interaktion aufzeigen. Schließlich werden wir den Vorhersagewert der 1H- und 31P-MRT-Spektroskopie auf das postchirurgische Überleben von Gliompatienten unter Verwendung des metabolischen Interaktivitätsoms untersuchen, der für eine vorherige Datenbank mit zehnjähriger Überlebensinformation (Ziel 5) berechnet wurde, um die Knoten und Konnektivität zu finden, die das Überleben der Patienten mittel- und langfristig am besten vorhersagen. Die Ergebnisse könnten das Vorhandensein neuer therapeutischer Ziele zeigen, die aus der Wechselwirkung zwischen Genommetabolomen gewonnen werden. (German)
    9 December 2021
    0 references
    We stellen een multicenter studie voor om de diagnose en postchirurgische prognose van menselijke glioma’s te verbeteren door de interactie tussen hun metabolische en genetische profiel te onderzoeken. Daarom stellen wij voor om een grote biobank van glioma’s te creëren, met biopsies uit drie ziekenhuizen; Het Universitair Ziekenhuis La Paz (Madrid), het Universitair Ziekenhuis Reina Sofía (Córdoba) en het Algemeen Universitair Ziekenhuis (Valencia). De aanpak zal in vivo en in vitro metabolomic en genomic hulpmiddelen met geavanceerde statistische technieken combineren, die een interactieve kaart met nieuwe informatie over de interactie tussen metabolische en genetische knooppunten vestigen. Elke biopsie moet alle prechirurgische informatie bevatten die in vivo per beeld (MRI, Infusion, ITD) is verkregen. en MRSI multivoxel 1H magnetische resonantiespectroscopie (3T, Doelstelling 1) en postchirurgisch; gegenereerd door spectroscopische analyse (1H en 31P HRMAS, Doelstelling 2) en genomica (qPCR en sequencing mutaties IDH1/2, Doelstelling 3). Vervolgens zullen we een interactieve kaart voorbereiden (doelstelling 4), met alle knooppunten van genexpressie en metabolieten en hun statistische verbindingen, die de intensiteit van hun interactie zullen onthullen. Tot slot zullen we de voorspellende waarde van 1H en 31P MRI spectroscopie bestuderen op postchirurgische overleving van glioompatiënten met behulp van het metabolische interactoom berekend voor een eerdere database met tien jaar overlevingsinformatie (doelstelling 5), het vinden van de knooppunten en connectiviteit die de overleving van patiënten het beste voorspellen op middellange en lange termijn. De resultaten konden de aanwezigheid van nieuwe therapeutische doelen onthullen die van de genoom-metaboloominteractie worden afgeleid. (Dutch)
    17 December 2021
    0 references
    Proponiamo uno studio multicentrico per migliorare la diagnosi e la prognosi post-chirurgica dei gliomi umani esplorando l'interazione tra il loro profilo metabolico e quello genetico. Per questo proponiamo di creare una grande biobanca di gliomi, con biopsie provenienti da tre ospedali; Ospedale universitario La Paz (Madrid), ospedale universitario Reina Sofía (Córdoba) e l'ospedale universitario generale (Valencia). L'approccio combina strumenti metabolomici e genomici in vivo e in vitro con tecniche statistiche avanzate, stabilendo una mappa interattiva con nuove informazioni sull'interazione tra nodi metabolici e genetici. Ogni biopsia deve contenere tutte le informazioni prechirurgiche ottenute in vivo per immagine (MRI, Infusion, ITD). e spettroscopia di risonanza magnetica MRSI multivoxel 1H (3T, obiettivo 1), e post-chirurgica; generato dall'analisi spettroscopica (1H e 31P HRMAS, Obiettivo 2) e dalla genomica (qPCR e mutazioni di sequenziamento IDH1/2, Obiettivo 3). Successivamente, prepareremo una mappa interattiva (Obiettivo 4), con tutti i nodi dell'espressione genica e dei metaboliti e le loro connessioni statistiche, che riveleranno l'intensità della loro interazione. Infine, studieremo il valore predittivo della spettroscopia RM 1H e 31P sulla sopravvivenza post-chirurgica dei pazienti con glioma che utilizzano l'interactoma metabolico calcolato per un database precedente con informazioni di sopravvivenza decennali (Obiettivo 5), trovando i nodi e la connettività che meglio prevedono la sopravvivenza del paziente a medio e lungo termine. I risultati potrebbero rivelare la presenza di nuovi obiettivi terapeutici derivati dall'interazione genoma-metaboloma. (Italian)
    16 January 2022
    0 references
    Προτείνουμε μια πολυκεντρική μελέτη για τη βελτίωση της διάγνωσης και της μεταχειρουργικής πρόγνωσης των ανθρώπινων γλειωμάτων εξερευνώντας την αλληλεπίδραση μεταξύ του μεταβολικού και του γενετικού προφίλ τους. Για το λόγο αυτό προτείνουμε τη δημιουργία μιας μεγάλης βιοτράπεζας γλειμών, με βιοψίες από τρία νοσοκομεία· Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο La Paz (Μαδρίτη), Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο Reina Sofía (Κόρδοβα) και Γενικό Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο (Βαλένθια). Η προσέγγιση θα συνδυάσει in vivo και in vitro μεταβολικά και γονιδιωματικά εργαλεία με προηγμένες στατιστικές τεχνικές, δημιουργώντας έναν διαδραστικό χάρτη με νέες πληροφορίες σχετικά με την αλληλεπίδραση μεταξύ μεταβολικών και γενετικών κόμβων. Κάθε βιοψία περιέχει όλες τις προχειρουργικές πληροφορίες που λαμβάνονται in vivo με εικόνα (MRI, Infusion, ITD) και τη φασματοσκοπία μαγνητικού συντονισμού MRSI multivoxel 1H (3T, στόχος 1), και μετεγχειρητική· παράγεται από φασματοσκοπική ανάλυση (1H και 31P HRMAS, Στόχος 2) και γονιδιωματική (qPCR και μεταλλάξεις αλληλουχίας IDH1/2, Στόχος 3). Στη συνέχεια, θα ετοιμάσουμε έναν διαδραστικό χάρτη (στόχος 4), με όλους τους κόμβους της γονιδιακής έκφρασης και των μεταβολιτών και τις στατιστικές συνδέσεις τους, ο οποίος θα αποκαλύψει την ένταση της αλληλεπίδρασής τους. Τέλος, θα μελετήσουμε την προγνωστική τιμή της φασματοσκοπίας 1H και 31P MRI σε μετεγχειρητική επιβίωση ασθενών με γλοίωμα χρησιμοποιώντας το μεταβολικό αλληλεπίδραση που υπολογίζεται για μια προηγούμενη βάση δεδομένων με πληροφορίες για την επιβίωση δέκα ετών (στόχος 5), βρίσκοντας τους κόμβους και τη συνδεσιμότητα που προβλέπουν καλύτερα την επιβίωση των ασθενών μεσοπρόθεσμα και μακροπρόθεσμα. Τα αποτελέσματα θα μπορούσαν να αποκαλύψουν την παρουσία νέων θεραπευτικών στόχων που προέρχονται από την αλληλεπίδραση γονιδιώματος-μεταβολώματος. (Greek)
    18 August 2022
    0 references
    Vi foreslår en multicenter undersøgelse for at forbedre diagnosen og postkirurgisk prognose for human gliomas ved at udforske samspillet mellem deres metaboliske og genetiske profil. Derfor foreslår vi, at der oprettes en stor biobank af gliomas med biopsier fra tre hospitaler; Universitetshospitalet La Paz (Madrid), Reina Sofía Universitetshospital (Córdoba) og det generelle universitetshospital (Valencia). Tilgangen vil kombinere in vivo- og in vitro-metabolomiske og genomiske værktøjer med avancerede statistiske teknikker og etablere et interaktivt kort med nye oplysninger om samspillet mellem metaboliske og genetiske knuder. Hver biopsi skal indeholde alle prækirurgiske oplysninger indhentet in vivo ved billede (MRI, Infusion, ITD) og MRSI multivoxel 1H magnetisk resonansspektroskopi (3T, Mål 1) og postkirurgisk genereret ved spektroskopisk analyse (1H og 31P HRMAS, mål 2) og genomforskning (qPCR og sekventering mutationer IDH1/2, mål 3). Dernæst vil vi udarbejde et interaktivt kort (mål 4), med alle knudepunkter af genekspression og metabolitter og deres statistiske forbindelser, som vil afsløre intensiteten af deres interaktion. Endelig vil vi undersøge den prædiktive værdi af 1H og 31P MRI-spektroskopi på postkirurgisk overlevelse hos gliomapatienter, der bruger det metaboliske interactom beregnet for en tidligere database med ti års overlevelsesinformation (mål 5), idet vi finder de knudepunkter og forbindelsesmuligheder, der bedst forudsiger patienternes overlevelse på mellemlang og lang sigt. Resultaterne kunne afsløre tilstedeværelsen af nye terapeutiske mål afledt af genom- metabolom interaktion. (Danish)
    18 August 2022
    0 references
    Ehdotamme monikeskustutkimusta ihmisen glioomien diagnoosin ja leikkauksen jälkeisen ennusteen parantamiseksi tutkimalla niiden metabolisen ja geneettisen profiilin välistä vuorovaikutusta. Tästä syystä ehdotamme, että luodaan suuri glioomien biopankki, jossa on koepaloja kolmesta sairaalasta; La Pazin yliopistollinen sairaala (Madrid), Reina Sofían yliopistollinen sairaala (Córdoba) ja General University Hospital (Valencia). Menetelmässä yhdistetään in vivo- ja in vitro -metabolomiset ja genomityökalut kehittyneisiin tilastotekniikoihin ja luodaan interaktiivinen kartta, joka sisältää uutta tietoa metabolisten ja geneettisten solmujen vuorovaikutuksesta. Jokaisessa biopsiassa on oltava kaikki kuvan (MRI, Infusion, ITD) ja MRSI multivoxel 1H magneettiresonanssispektroskopian (3T, Tavoite 1) ja leikkauksen jälkeisen leikkauksen jälkeiset in vivo -tiedot, jotka on saatu in vivo; luotu spektroskooppisen analyysin (1H ja 31P HRMAS, tavoite 2) ja genomiikan (qPCR ja sekvensointimutaatioiden IDH1/2, tavoite 3) avulla. Seuraavaksi valmistelemme interaktiivisen kartan (tavoite 4), jossa on kaikki geenien ilmentymisen ja metaboliittien solmut ja niiden tilastolliset yhteydet, jotka paljastavat niiden vuorovaikutuksen voimakkuuden. Lopuksi tutkimme 1H:n ja 31P:n MRI-spektroskopian ennustavaa arvoa glioomapotilaiden kirurgisen eloonjäämisen jälkeen käyttäen metabolista interaktioomaa, joka on laskettu aiemmasta tietokannasta, jossa on kymmenen vuoden eloonjäämistiedot (tavoite 5), löytää solmut ja yhteydet, jotka parhaiten ennustavat potilaiden eloonjäämistä keskipitkällä ja pitkällä aikavälillä. Tulokset voivat paljastaa läsnäolo uusia terapeuttisia tavoitteita johdettu genomin ja metabolooma vuorovaikutus. (Finnish)
    18 August 2022
    0 references
    Aħna nipproponu studju multiċentriku biex jittejbu d-dijanjożi u l-pronjożi postkirurġija tal-glijomi umani billi tiġi esplorata l-interazzjoni bejn il-profil metaboliku u ġenetiku tagħhom. Għal din ir-raġuni qed nipproponu li jinħoloq bijobank kbir ta’ glijomi, b’bijopsiji minn tliet sptarijiet; L-Isptar Università ta’ La Paz (Madrid), l-Isptar Universitarju ta’ Reina Sofía (Córdoba) u l-Isptar Universitarju Ġenerali (Valencia). L-approċċ se jikkombina għodod metabolomiċi u ġenomiċi in vivo u in vitro ma’ tekniki avvanzati tal-istatistika, filwaqt li jistabbilixxi mappa interattiva b’informazzjoni ġdida dwar l-interazzjoni bejn in-nodi metaboliċi u ġenetiċi. Kull bijopsija għandu jkun fiha l-informazzjoni kollha prekirurġija miksuba in vivo permezz ta’ immaġni (MRI, Infużjoni, ITD). u MRSI multivoxel 1H spettroskopija ta’ reżonanza manjetika (3T, Objettiv 1), u wara kirurġija; iġġenerat minn analiżi spettroskopika (1H u 31P HRMAS, Objettiv 2) u ġenomika (qPCR u mutazzjonijiet ta’ sekwenzjar IDH1/2, Objettiv 3). Imbagħad, aħna se tipprepara mappa interattiva (Objettiv 4), ma ‘l-għoqiedi kollha ta’ espressjoni ġenetika u l-metaboliti u l-konnessjonijiet statistiċi tagħhom, li se tiżvela l-intensità tal-interazzjoni tagħhom. Fl-aħħar nett, se nistudjaw il-valur ta’ tbassir ta’ spettroskopija MRI 1H u 31P fuq is-sopravivenza ta’ wara l-kirurġija ta’ pazjenti bi glijoma bl-użu ta’ interazzjoni metabolika kkalkulata għal database preċedenti b’informazzjoni ta’ sopravivenza ta’ għaxar snin (Objettiv 5), biex insibu n-nodi u l-konnettività li l-aħjar ibassru s-sopravivenza tal-pazjent fit-terminu medju u fit-tul. Ir-riżultati jistgħu juru l-preżenza ta’ miri terapewtiċi ġodda derivati mill-interazzjoni bejn il-ġenoma u l-metaboloma. (Maltese)
    18 August 2022
    0 references
    Mēs ierosinām daudzcentru pētījumu, lai uzlabotu cilvēka gliomas diagnozi un pēcķirurģiskās prognozes, izpētot mijiedarbību starp to metabolismu un ģenētisko profilu. Šā iemesla dēļ mēs ierosinām izveidot lielu gliomu biobanku ar biopsiju no trim slimnīcām; La Paz Universitātes slimnīca (Madride), Reinas Sofijas Universitātes slimnīca (Kordoba) un Vispārējā universitātes slimnīca (Valensija). Šī pieeja apvienos in vivo un in vitro metabolomiskos un genomiskos rīkus ar progresīvām statistikas metodēm, izveidojot interaktīvu karti ar jaunu informāciju par metabolisma un ģenētisko mezglu mijiedarbību. Katra biopsija satur visu pirmsoperācijas informāciju, kas iegūta in vivo ar attēlu (MRI, infūzija, ITD) un MRSI multivoksila 1H magnētiskās rezonanses spektroskopiju (3T, 1. mērķis) un pēc ķirurģiskas operācijas; iegūts spektroskopiskajā analīzē (1H un 31P HRMAS, 2. mērķis) un genomikā (qPCR un sekvencēšanas mutācijas IDH1/2, 3. mērķis). Tālāk mēs sagatavosim interaktīvu karti (4. mērķis) ar visiem gēnu ekspresijas un metabolītu mezgliem un to statistiskajiem savienojumiem, kas atklās to mijiedarbības intensitāti. Visbeidzot, mēs pētīsim 1H un 31P MRI spektroskopijas prognozējošo vērtību gliomas pacientu pēcķirurģijas izdzīvošanai, izmantojot metabolisko interfeisomu, kas aprēķināta iepriekšējai datubāzei ar desmit gadu dzīvildzes informāciju (5. mērķis), atrodot mezglus un savienojamību, kas vislabāk prognozē pacienta dzīvildzi vidējā termiņā un ilgtermiņā. Rezultāti var atklāt jaunus terapeitiskus mērķus, kas iegūti no genoma-metabolomas mijiedarbības. (Latvian)
    18 August 2022
    0 references
    Navrhujeme multicentrickú štúdiu na zlepšenie diagnostiky a post-chirurgickej prognózy ľudských gliómov skúmaním interakcie medzi ich metabolickým a genetickým profilom. Z tohto dôvodu navrhujeme vytvoriť veľkú biobanku gliómov s biopsiou z troch nemocníc; Univerzitná nemocnica La Paz (Madrid), Univerzitná nemocnica Reina Sofía (Córdoba) a Všeobecná univerzitná nemocnica (Valencia). Tento prístup bude kombinovať metabolomické a genomické nástroje in vivo a in vitro s pokročilými štatistickými technikami a vytvorí interaktívnu mapu s novými informáciami o interakcii medzi metabolickými a genetickými uzlami. Každá biopsia musí obsahovať všetky predoperačné informácie získané in vivo pomocou obrazu (MRI, Infúzia, ITD) a MRSI multivoxel 1H magnetická rezonančná spektroskopia (3T, Cieľ 1) a po operácii; generované spektroskopickou analýzou (1H a 31P HRMAS, Cieľ 2) a genomikou (qPCR a sekvencovacie mutácie IDH1/2, Cieľ 3). Ďalej pripravíme interaktívnu mapu (cieľ 4) so všetkými uzlami génovej expresie a metabolitov a ich štatistickými spojeniami, ktoré odhalia intenzitu ich interakcie. Nakoniec budeme študovať prediktívnu hodnotu 1H a 31P MRI spektroskopiu na post-chirurgické prežívanie pacientov s gliómom pomocou metabolických interakcií vypočítaných pre predchádzajúcu databázu s desaťročnými informáciami o prežití (cieľ 5), nájdenie uzlov a konektivity, ktoré najlepšie predpovedajú prežitie pacienta v strednodobom a dlhodobom horizonte. Výsledky by mohli odhaliť prítomnosť nových terapeutických cieľov odvodených z interakcie genóm-metabolóm. (Slovak)
    18 August 2022
    0 references
    Molaimid staidéar ilionaid chun diagnóis agus prognóis iar-mháinliachta gliomas daonna a fheabhsú trí iniúchadh a dhéanamh ar an idirghníomhaíocht idir a bpróifíl mheitibileach agus ghéiniteach. Ar an gcúis sin, tá sé beartaithe againn bithbhainc mór gliomas a chruthú, le bithphíosaí ó thrí ospidéal; Ospidéal Ollscoile La Paz (Madrid), Ospidéal Ollscoile Reina Sofía (Córdoba) agus an tOspidéal Ollscoile Ginearálta (Valencia). Déanfaidh an cur chuige uirlisí meitibilímeacha agus géanómaíocha in vivo agus in vitro a chomhcheangal le hardteicnící staitistiúla, ag bunú léarscáil idirghníomhach le faisnéis nua ar an idirghníomhaíocht idir nóid mheitibileach agus ghéiniteacha. Beidh an fhaisnéis réamh-mháinliachta uile a fhaightear in vivo le híomhá (MRI, Insileadh, ITD) agus speictreascópacht athshondais mhaighnéadaigh MRSI 1H i ngach bithsíc. ginte trí anailís speictreascópach (1H agus 31P HRMAS, Cuspóir 2) agus géanómaíocht (qPCR agus sócháin sheicheamhúcháin IDH1/2, Cuspóir 3). Ina dhiaidh sin, ullmhóimid léarscáil idirghníomhach (Cuspóir 4), le nóid léiriú géine agus meitibilítí agus a naisc staitistiúla, a léireoidh déine a n-idirghníomhaíochta. Ar deireadh, déanfaimid staidéar ar an luach tuarthach de 1H agus 31P MRI speictreascópacht ar mharthanas iar-mháinliachta na n-othar faoilioma ag baint úsáide as an interactoma meitibileach ríomh do bhunachar sonraí roimhe sin le faisnéis marthanais deich mbliana (Cuspóir 5), a aimsiú na nóid agus nascacht a thuar is fearr marthanais othar sa mheántéarma agus san fhadtéarma. D’fhéadfadh na torthaí a nochtadh go bhfuil spriocanna teiripeacha nua ann a dhíorthaítear ón idirghníomhaíocht ghéanóim-meiteaboloma. (Irish)
    18 August 2022
    0 references
    Navrhujeme multicentrickou studii ke zlepšení diagnózy a postchirurgické prognózy lidských gliomů zkoumáním interakce mezi jejich metabolickým a genetickým profilem. Z tohoto důvodu navrhujeme vytvořit velkou biobanku gliomů s biopsiemi ze tří nemocnic; Fakultní nemocnice La Paz (Madrid), Fakultní nemocnice Reina Sofía (Córdoba) a Všeobecná fakultní nemocnice (Valencia). Tento přístup bude kombinovat in vivo a in vitro metabolomické a genomické nástroje s pokročilými statistickými technikami, přičemž vytvoří interaktivní mapu s novými informacemi o interakci mezi metabolickými a genetickými uzly. Každá biopsie musí obsahovat všechny předchirurgické informace získané in vivo obrazem (MRI, Infuze, ITD) a MRSI multivoxelovou 1H magnetickou rezonanční spektroskopií (3T, Cíl 1) a pooperační; spektroskopická analýza (1H a 31P HRMAS, Cíl 2) a genomika (qPCR a sekvenční mutace IDH1/2, Cíl 3). Dále připravíme interaktivní mapu (Cíl 4), se všemi uzly genové exprese a metabolitů a jejich statistickou souvislostí, která odhalí intenzitu jejich interakce. Na závěr budeme studovat prediktivní hodnotu 1H a 31P MRI spektroskopie na postchirurgické přežití pacientů s gliomem pomocí metabolického interakremu vypočteného pro předchozí databázi s desetiletými informacemi o přežití (cíl 5), nalezení uzlů a konektivity, které nejlépe předpovídají přežití pacienta ve střednědobém a dlouhodobém horizontu. Výsledky by mohly odhalit přítomnost nových terapeutických cílů odvozených z interakcí genom-metabolom. (Czech)
    18 August 2022
    0 references
    Propomos um estudo multicêntrico para melhorar o diagnóstico e o prognóstico pós-cirúrgico dos gliomas humanos ao explorar a interação entre seu perfil metabólico e genético. Por esta razão, propomos a criação de um grande biobanco de gliomas, com biópsias de três hospitais; Hospital Universitário de La Paz (Madrid), Hospital Universitário Reina Sofía (Córdoba) e Hospital Universitário Geral (Valência). A abordagem combinará ferramentas metabolómicas e genómicas in vivo e in vitro com técnicas estatísticas avançadas, estabelecendo um mapa interativo com novas informações sobre a interação entre nós metabólicos e genéticos. Cada biópsia deve conter todas as informações pré-cirúrgicas obtidas in vivo por imagem (IRM, Infusão, ITD) e espetroscopia de ressonância magnética MRSI multivoxel 1H (3T, Objetivo 1), e pós-cirúrgica; gerada por análise espectroscópica (1H e 31P HRMAS, Objetivo 2) e genómica (qPCR e mutações sequenciais IDH1/2, Objetivo 3). Em seguida, prepararemos um mapa interativo (Objetivo 4), com todos os nós de expressão genética e metabolitos e respetivas ligações estatísticas, que revelará a intensidade da sua interação. Por fim, estudaremos o valor preditivo da espectroscopia de IRM 1H e 31P na sobrevivência pós-cirúrgica de doentes com glioma utilizando o interactoma metabólico calculado para uma base de dados anterior com informações de sobrevivência a dez anos (Objetivo 5), encontrando os nós e a conectividade que melhor predizem a sobrevivência dos doentes a médio e longo prazo. Os resultados podem revelar a presença de novos alvos terapêuticos derivados da interação genoma-metaboloma. (Portuguese)
    18 August 2022
    0 references
    Pakume välja mitmekeskuselise uuringu, et parandada inimese glioomide diagnoosi ja operatsioonijärgset prognoosi, uurides nende metaboolse ja geneetilise profiili koostoimet. Seetõttu teeme ettepaneku luua suur glioomide biopank, mille biopsiad pärinevad kolmest haiglast; La Pazi Ülikooli Haigla (Madrid), Reina Sofía Ülikooli Haigla (Córdoba) ja üldülikooli haigla (Valencia). Lähenemisviisis kombineeritakse in vivo ja in vitro metaboloomilised ja genoomilised vahendid täiustatud statistiliste meetoditega, luues interaktiivse kaardi, mis sisaldab uut teavet metaboolsete ja geneetiliste sõlmede koostoime kohta. Iga biopsia peab sisaldama kogu operatsioonieelset teavet, mis on saadud in vivo kujutise (MRI, Infusion, ITD) ja MRSI multivoxel 1H magnetresonantsspektroskoopia (3T, eesmärk 1) ja operatsioonijärgselt; saadud spektroskoopilise analüüsi (1H ja 31P HRMAS, eesmärk 2) ja genoomika (qPCR ja sekveneerimise mutatsioonid IDH1/2, Eesmärk 3). Järgmiseks valmistame ette interaktiivse kaardi (eesmärk 4), millel on kõik geeniekspressiooni ja metaboliitide sõlmed ning nende statistilised ühendused, mis paljastab nende koostoime intensiivsuse. Lõpuks uurime 1H ja 31P MRI spektroskoopia ennustavat väärtust glioomipatsientide operatsioonijärgse elulemuse kohta, kasutades metaboolset interaktsiooni, mis on arvutatud eelneva andmebaasi jaoks koos kümneaastase elulemuse teabega (eesmärk 5), leides sõlmed ja ühenduvus, mis kõige paremini ennustavad patsientide elulemust keskmises ja pikas perspektiivis. Tulemused võivad paljastada uute terapeutiliste sihtmärkide olemasolu, mis tulenevad genoomi-metaboloomi koostoimest. (Estonian)
    18 August 2022
    0 references
    Javasolunk egy multicentrikus tanulmányt, amely javítja az emberi gliómák diagnózisát és műtét utáni prognózisát azáltal, hogy feltárja metabolikus és genetikai profilja közötti kölcsönhatást. Ezért javasoljuk a gliomák nagy biobankjának létrehozását, három kórház biopsziájával; La Paz Egyetemi Kórház (Madrid), Reina Sofía Egyetemi Kórház (Córdoba) és Általános Egyetemi Kórház (Valencia). A megközelítés ötvözi az in vivo és in vitro metabolomikus és genomikus eszközöket fejlett statisztikai technikákkal, interaktív térképet készítve a metabolikus és a genetikai csomópontok közötti kölcsönhatásról. Minden egyes biopszia tartalmazza a kép (MRI, Infusion, ITD) és az MRSI multivoxel 1H mágneses rezonancia spektroszkópia (3T, 1. célkitűzés) és a posztsebészeti adatok alapján in vivo kapott összes műtét előtti információt; spektroszkópiai elemzéssel (1H és 31P HRMAS, 2. célkitűzés) és genomikával (qPCR és szekvenáló mutációk IDH1/2, 3. célkitűzés) generálva. Ezután elkészítünk egy interaktív térképet (4. célkitűzés), a génexpresszió és a metabolitok összes csomópontjával és statisztikai kapcsolataikkal, amelyek felfedik interakciójuk intenzitását. Végül megvizsgáljuk az 1H és 31P MRI spektroszkópia prediktív értékét a gliomában szenvedő betegek műtét utáni túlélésére vonatkozóan, egy korábbi adatbázisban kiszámított metabolikus interactionoma alkalmazásával, amely tízéves túlélési információkat tartalmaz (5. célkitűzés), és megtaláljuk azokat a csomópontokat és kapcsolódásokat, amelyek a legjobban megjósolják a betegek túlélését közép- és hosszú távon. Az eredmények feltárhatják a genom-metabolóma kölcsönhatásból származó új terápiás célpontok jelenlétét. (Hungarian)
    18 August 2022
    0 references
    Предлагаме многоцентрово проучване за подобряване на диагностиката и постоперативната прогноза на човешките глиоми чрез изследване на взаимодействието между техния метаболитен и генетичен профил. Поради тази причина предлагаме да се създаде голяма биобанка от глиоми, с биопсии от три болници; Университетска болница Ла Пас (Мадрид), Университетска болница „Рейна София“ (Кордоба) и Обща университетска болница (Валенсия). Подходът ще съчетава in vivo и in vitro метаболомни и геномни инструменти с усъвършенствани статистически техники, създавайки интерактивна карта с нова информация за взаимодействието между метаболитните и генетичните възли. Всяка биопсия съдържа цялата предхирургична информация, получена in vivo чрез изображение (MRI, Infusion, ITD) и MRSI multivoxel 1H магнитно-резонансна спектроскопия (3T, Цел 1) и следоперативна; получени чрез спектроскопски анализ (1H и 31P HRMAS, Цел 2) и геномика (qPCR и секвениращи мутации IDH1/2, Цел 3). След това ще подготвим интерактивна карта (цел 4) с всички възли на генна експресия и метаболити и техните статистически връзки, които ще разкрият интензивността на взаимодействието им. И накрая, ще проучим прогнозната стойност на 1H и 31P ЯМР спектроскопия върху следоперативната преживяемост на пациенти с глиом, като използваме метаболитното взаимодействие, изчислено за предишна база данни с 10-годишна информация за преживяемост (цел 5), като намерим възлите и свързаността, които най-добре прогнозират преживяемостта на пациента в средносрочен и дългосрочен план. Резултатите могат да разкрият наличието на нови терапевтични цели, получени от взаимодействието геном-метаболом. (Bulgarian)
    18 August 2022
    0 references
    Siūlome daugiacentrį tyrimą, siekiant pagerinti žmogaus gliomų diagnozę ir po chirurginę prognozę, tiriant jų medžiagų apykaitos ir genetinio profilio sąveiką. Dėl šios priežasties siūlome sukurti didelį gliomų biologinį banką, kuriame būtų biopsijos iš trijų ligoninių; La Paz universitetinė ligoninė (Madridas), Reina Sofía universitetinė ligoninė (Kordoba) ir Generalinė universitetinė ligoninė (Valensija). Taikant šį metodą bus derinamos in vivo ir in vitro metabolominės ir genominės priemonės su pažangiais statistiniais metodais, sudarant interaktyvų žemėlapį su nauja informacija apie medžiagų apykaitos ir genetinių mazgų sąveiką. Kiekvienoje biopsijoje pateikiama visa ikichirurginė informacija, gauta in vivo atvaizdu (MRT, Infuzija, ITD) ir MRSI multivoxel 1H magnetinio rezonanso spektroskopija (3T, 1 tikslas) ir po chirurginės; gauta atliekant spektroskopinę analizę (1H ir 31P HRMAS, 2 tikslas) ir genomiką (qPGR ir sekos nustatymo mutacijas IDH1/2, 3 tikslas). Be to, mes parengsime interaktyvų žemėlapį (4 tikslas) su visais genų ekspresijos ir metabolitų mazgais bei jų statistinėmis jungtimis, kurie atskleis jų sąveikos intensyvumą. Galiausiai mes tirsime prognozuojamą 1H ir 31P MRT spektroskopiją glioma sergančių pacientų išgyvenamumui po chirurginio gydymo, naudojant metabolinę sąveikaujamą ligą, apskaičiuotą pagal ankstesnę duomenų bazę su dešimties metų išgyvenimo informacija (5 tikslas), rasti mazgus ir ryšį, kuris geriausiai prognozuoja pacientų išgyvenamumą vidutinės trukmės ir ilguoju laikotarpiu. Rezultatai gali atskleisti naujus terapinius taikinius, gautus iš genomo metabolomos sąveikos. (Lithuanian)
    18 August 2022
    0 references
    Predlažemo multicentričnu studiju za poboljšanje dijagnoze i post-kirurške prognoze ljudskih glioma istraživanjem interakcije između njihovog metaboličkog i genetskog profila. Zbog toga predlažemo stvaranje velike biobanke glioma, s biopsijama iz tri bolnice; Sveučilišna bolnica La Paz (Madrid), sveučilišna bolnica Reina Sofía (Córdoba) i Opća sveučilišna bolnica (Valencia). Pristup će kombinirati in vivo i in vitro metabolomske i genomske alate s naprednim statističkim tehnikama, uspostavljajući interaktivnu kartu s novim informacijama o interakciji metaboličkih i genetskih čvorova. Svaka biopsija mora sadržavati sve predkirurške informacije dobivene in vivo pomoću slike (MRI, Infuzija, ITD) i MRSI multivoxel 1H spektroskopije magnetske rezonance (3T, Cilj 1) i postkirurške; dobivena spektroskopskom analizom (1H i 31P HRMAS, Cilj 2.) i genomikom (qPCR i mutacije sekvenciranja IDH1/2, Cilj 3). Zatim ćemo pripremiti interaktivnu kartu (Cilj 4), sa svim čvorovima ekspresije gena i metabolita i njihovih statističkih veza, što će otkriti intenzitet njihove interakcije. Konačno, proučavat ćemo prediktivnu vrijednost MRI spektroskopije 1H i 31P za postkirurško preživljenje bolesnika s gliomom koristeći metabolički interaktom izračunat za prethodnu bazu podataka s desetogodišnjim informacijama o preživljenju (Cilj 5), pronalaženje čvorova i povezanosti koji najbolje predviđaju preživljenje bolesnika u srednjoročnom i dugoročnom razdoblju. Rezultati mogu otkriti prisutnost novih terapijskih ciljeva koji proizlaze iz interakcije genoma i metaboloma. (Croatian)
    18 August 2022
    0 references
    Vi föreslår en multicenterstudie för att förbättra diagnosen och postkirurgisk prognos av mänskliga gliomas genom att utforska samspelet mellan deras metaboliska och genetiska profil. Därför föreslår vi att man skapar en stor biobank av gliomas, med biopsier från tre sjukhus. Universitetssjukhuset La Paz (Madrid), universitetssjukhuset Reina Sofía (Córdoba) och det allmänna universitetssjukhuset (Valencia). Metoden kommer att kombinera metabolomiska och genomiska verktyg in vivo och in vitro med avancerade statistiska tekniker och upprätta en interaktiv karta med ny information om interaktionen mellan metaboliska och genetiska noder. Varje biopsi ska innehålla all prekirurgisk information som erhållits in vivo genom bild (MRI, infusion, ITD) och MRSI multivoxel 1H magnetisk resonansspektroskopi (3T, mål 1) och postkirurgisk. genereras genom spektroskopisk analys (1H och 31P HRMAS, mål 2) och genomik (qPCR och sekvenseringsmutationer IDH1/2, Mål 3). Därefter kommer vi att förbereda en interaktiv karta (mål 4), med alla noder av genuttryck och metaboliter och deras statistiska kopplingar, som kommer att avslöja intensiteten i deras interaktion. Slutligen kommer vi att studera det prediktiva värdet av 1H och 31P MRI-spektroskopi på postkirurgisk överlevnad för gliompatienter med hjälp av det metaboliska interaktionsom som beräknats för en tidigare databas med tioårig överlevnadsinformation (mål 5), hitta de noder och anslutningar som bäst förutsäger patientens överlevnad på medellång och lång sikt. Resultaten kan avslöja förekomsten av nya terapeutiska mål som härrör från interaktionen mellan genom-metabolom. (Swedish)
    18 August 2022
    0 references
    Propunem un studiu multicentric pentru a îmbunătăți diagnosticul și prognosticul post-chirurgical al glioamelor umane prin explorarea interacțiunii dintre profilul lor metabolic și genetic. Din acest motiv ne propunem să creăm o biobancă mare de glioame, cu biopsii de la trei spitale; Spitalul Universitar La Paz (Madrid), Spitalul Universitar Reina Sofía (Córdoba) și Spitalul Universitar General (Valencia). Abordarea va combina instrumentele metabolomice și genomice in vivo și in vitro cu tehnici statistice avansate, stabilind o hartă interactivă cu informații noi privind interacțiunea dintre nodurile metabolice și cele genetice. Fiecare biopsie trebuie să conțină toate informațiile prechirurgicale obținute in vivo prin imagine (RMN, perfuzie, DTI) și spectroscopia de rezonanță magnetică MRSI multivoxel 1H (3T, Obiectivul 1) și post-chirurgicală; generate de analiza spectroscopică (1H și 31P HRMAS, Obiectivul 2) și genomică (qPCR și mutații secvențiale IDH1/2, Obiectiv 3). Apoi, vom pregăti o hartă interactivă (Obiectivul 4), cu toate nodurile de expresie genetică și metaboliți și conexiunile lor statistice, care vor dezvălui intensitatea interacțiunii lor. În cele din urmă, vom studia valoarea predictivă a spectroscopiei RMN 1H și 31P pe supraviețuirea post-chirurgicală a pacienților cu gliom folosind interactomul metabolic calculat pentru o bază de date anterioară cu informații de supraviețuire pe zece ani (Obiectivul 5), găsirea nodurilor și a conectivității care prezice cel mai bine supraviețuirea pacientului pe termen mediu și lung. Rezultatele ar putea dezvălui prezența unor noi obiective terapeutice derivate din interacțiunea genom-metabolom. (Romanian)
    18 August 2022
    0 references
    Predlagamo multicentrično študijo za izboljšanje diagnoze in post-kirurške prognoze človeških gliomov z raziskovanjem interakcije med njihovim presnovnim in genetskim profilom. Zato predlagamo ustanovitev velike biobanke gliomov z biopsijo iz treh bolnišnic; Univerzitetna bolnišnica la Paz (Madrid), univerzitetna bolnišnica Reina Sofía (Córdoba) in splošna univerzitetna bolnišnica (Valencia). Pristop bo združeval in vivo ter in vitro metabolomska in genomska orodja z naprednimi statističnimi tehnikami, s čimer bo vzpostavljen interaktivni zemljevid z novimi informacijami o interakciji med metaboličnimi in genetskimi vozlišči. Vsaka biopsija vsebuje vse predkirurške informacije, pridobljene in vivo po podobi (MRI, Infusion, ITD) in MRSI multivoksel 1H magnetno resonančno spektroskopijo (3T, cilj 1), in postkirurško; pridobljeno s spektroskopsko analizo (1H in 31P HRMAS, Cilj 2) in genomiko (qPCR in mutacije sekvenciranja IDH1/2, cilj 3). Nato bomo pripravili interaktivni zemljevid (cilj 4) z vsemi vozlišči genske ekspresije in metabolitov ter njihovimi statističnimi povezavami, ki bodo razkrile intenzivnost njihovega medsebojnega delovanja. Na koncu bomo preučili napovedno vrednost 1H in 31P MRI spektroskopije o post-kirurškem preživetju bolnikov z gliomom z uporabo metaboličnega interakcijoma, izračunanega za predhodno bazo podatkov z 10-letnimi informacijami o preživetju (cilj 5), pri čemer bomo našli vozlišča in povezljivost, ki najbolje srednje- in dolgoročno napovedujejo preživetje bolnikov. Rezultati bi lahko razkrili prisotnost novih terapevtskih ciljev, ki izhajajo iz interakcije med genomom in presnovkom. (Slovenian)
    18 August 2022
    0 references
    Proponujemy wieloośrodkowe badanie w celu poprawy diagnozy i prognozowania pooperacyjnego glejaków ludzkich poprzez zbadanie interakcji między ich profilem metabolicznym i genetycznym. Z tego powodu proponujemy utworzenie dużego biobanku glejaków, z biopsją z trzech szpitali; Szpital Uniwersytecki w La Paz (Madryt), Szpital Uniwersytecki Reina Sofía (Córdoba) oraz Szpital Uniwersytecki Generalny (Walencja). Podejście to połączy narzędzia in vivo i in vitro metabolomiczne i genomowe z zaawansowanymi technikami statystycznymi, tworząc interaktywną mapę z nowymi informacjami na temat interakcji między węzłami metabolicznymi i genetycznymi. Każda biopsja musi zawierać wszystkie informacje przedoperacyjne uzyskane in vivo za pomocą obrazu (MRI, Infusion, ITD) i MRSI multiwokselowej 1H spektroskopii rezonansu magnetycznego (3T, Cel 1) i pooperacyjnej; generowane w wyniku analizy spektroskopowej (1H i 31P HRMAS, Cel 2) i genomiki (qPCR i mutacje sekwencyjne IDH1/2, Cel 3). Następnie przygotujemy interaktywną mapę (cel 4) ze wszystkimi węzłami ekspresji genowej i metabolitów oraz ich połączeniami statystycznymi, które ujawnią intensywność ich interakcji. Na koniec zbadamy wartość prognostyczną spektroskopii MRI 1H i 31P na temat przeżycia pooperacyjnego pacjentów z glejakiem przy użyciu interakcji metabolicznej obliczonej dla wcześniejszej bazy danych zawierającej dziesięcioletnie informacje o przeżyciu (cel 5), w której znajdziemy węzły i łączność, które najlepiej przewidują przeżycie pacjenta w perspektywie średnio- i długoterminowej. Wyniki mogą ujawnić obecność nowych celów terapeutycznych pochodzących z interakcji genom-metaboloma. (Polish)
    18 August 2022
    0 references
    Madrid
    0 references
    20 December 2023
    0 references

    Identifiers

    PI17_00361
    0 references