INTEGRATIVE ANALYSIS OF THE FUNCTIONAL IMPACT OF INVESTMENTS IN GENOMES AND PHENOTYPIC CHARACTERS (Q3158488)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3158488 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | INTEGRATIVE ANALYSIS OF THE FUNCTIONAL IMPACT OF INVESTMENTS IN GENOMES AND PHENOTYPIC CHARACTERS |
Project Q3158488 in Spain |
Statements
118,592.1 Euro
0 references
217,800.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
30 December 2016
0 references
31 December 2020
0 references
UNIVERSIDAD AUTONOMA DE BARCELONA
0 references
8193
0 references
A PESAR DE LAS EXPECTATIVAS INICIALES DE LOS ESTUDIOS DE VARIACION A NIVEL GENOMICO, HASTA EL MOMENTO SOLO SE HA PODIDO IDENTIFICAR UNA PEQUEÑA PROPORCION DEL RIESGO GENETICO DE ENFERMEDADES COMUNES Y COMPLEJAS. LA MAYOR PARTE DE TRABAJOS SE HAN CENTRADO EN LOS POLIMORFISMOS DE UN UNICO NUCLEOTIDO (SNPS) Y, UNA VEZ DESCUBIERTA LA EXTRAORDINARIA CANTIDAD DE VARIACION ESTRUCTURAL EXISTENTE EN LOS GENOMAS, EN LAS VARIANTES EN NUMERO DE COPIAS (CNVS). LAS INVERSIONES, POR OTRO LADO, SON UN TIPO DE VARIANTES ESTRUCTURALES QUE AFECTAN UNA FRACCION IMPORTANTE DEL GENOMA HUMANO Y QUE SE HAN INVOLUCRADO EN DIFERENCIAS FENOTIPICAS EN DISTINTOS ORGANISMOS. SIN EMBARGO, DEBIDO A QUE SUS PROPIAS CARACTERISTICAS DIFICULTAN ENORMEMENTE SU DETECCION, HAN SIDO POCO ESTUDIADAS. ADEMAS, RECIENTEMENTE SE HA DEMOSTRADO QUE MUCHAS INVERSIONES SE HAN GENERADO MULTIPLES VECES EN EL LINAJE HUMANO, POR LO QUE SUS EFECTOS NO HAN PODIDO SER DETECTADOS MEDIANTE LOS TRADICIONALES ESTUDIOS DE ASOCIACION A NIVEL DE TODO EL GENOMA. ESTE PROYECTO PRETENDE APROVECHAR LA GRAN CANTIDAD DE DATOS, RECURSOS Y CONOCIMIENTO SOBRE LAS INVERSIONES GENERADO EN LOS ULTIMOS AÑOS, PARA LLEVAR A CABO UN ANALISIS INTEGRADOR DE SUS POSIBLES EFECTOS FUNCIONALES A MULTIPLES NIVELES, A TRAVES DE UNA SERIE DE OBJETIVOS INTERRELACIONADOS. LOS PRINCIPALES OBJETIVOS SON: (1) AMPLIAR EL CONJUNTO DE INVERSIONES CARACTERIZADAS EN DETALLE EN HUMANOS PARA TENER UNA VISION MAS COMPLETA DE SUS EFECTOS BIOLOGICOS; (2) REALIZAR EL PRIMER ESTUDIO DE ASOCIACION GLOBAL DE INVERSIONES HUMANAS CON CARACTERES FENOTIPICOS Y SUSCEPTIBILIDAD A ENFERMEDADES, MEDIANTE EL GENOTIPADO DE UN GRAN NUMERO DE INVERSIONES EN INDIVIDUOS BIEN CARACTERIZADOS A NIVEL FENOTIPICO Y CASOS DE AL MENOS 10 ENFERMEDADES COMPLEJAS COMUNES CON DIFERENTE ETIOLOGIA Y PREDISPOSICION GENETICA (COMO LA DIABETES TIPO 2, INFARTO DE MIOCARDIO, TRASTORNOS DEL METABOLISMO DE LOS LIPIDOS, ARTRITIS REUMATOIDE, ASMA, OBESIDAD, ALZHEIMER, PARKINSON, ESQUIZOFRENIA Y DEPRESION); (3) INVESTIGAR EL EFECTO DE LAS INVERSIONES EN LA PREDISPOSICION A SUFRIR OTRAS REORDENACIONES, UTILIZANDO COMO MODELO LA INVERSION QUE CAUSA LA MITAD DE LOS CASOS DE HEMOFILIA A SEVERA; (4) CUANTIFICAR CON EXACTITUD EL MOSAICISMO Y LAS TASAS DE MUTACION PARA INVERSIONES MEDIADAS POR REPETICIONES INVERTIDAS EN DIFERENTES TEJIDOS COMO UN PRIMER PASO PARA EVALUAR LAS POSIBLES CONSECUENCIAS DE ESTE FENOMENO; Y (5) UTILIZAR EL BIEN CONOCIDO POLIMORFISMO DE INVERSIONES 2ST/2J DE DROSOPHILA BUZZATII COMO ESTRATEGIA COMPLEMENTARIA PARA INVESTIGAR LA BASE GENETICA DE LAS DIFERENCIAS FENOTIPICAS ASOCIADAS A UNA INVERSION. POR TANTO, NUESTRO PROYECTO REPRESENTA UN PASO CLAVE EN LA DETERMINACION DEL IMPACTO FUNCIONAL DE ESTAS VARIANTES, Y PRODUCIRA RESULTADOS DE GRAN INTERES EN DISTINTOS CAMPOS, DESDE LA CIENCIA BASICA HASTA LA BIOMEDICINA, CONTRIBUYENDO DE ESTE MODO A CUMPLIR LAS PROMESAS DE LA MEDICINA PERSONALIZADA. (Spanish)
0 references
DESPITE THE INITIAL EXPECTATIONS OF VARIATION STUDIES AT THE GENOMIC LEVEL, SO FAR ONLY A SMALL PROPORTION OF THE GENETIC RISK OF COMMON AND COMPLEX DISEASES HAS BEEN IDENTIFIED. MOST WORKS HAVE FOCUSED ON THE POLYMORPHISMS OF A SINGLE NUCLEOTIDO (SNPS) AND, AFTER DISCOVERING THE EXTRAORDINARY AMOUNT OF STRUCTURAL VARIATION IN THE GENOMES, ON VARIANTS IN NUMBER OF COPIES (CNVS). INVESTMENTS, ON THE OTHER HAND, ARE A TYPE OF STRUCTURAL VARIANTS THAT AFFECT AN IMPORTANT FRACTION OF THE HUMAN GENOME AND HAVE BEEN INVOLVED IN PHENOTYPIC DIFFERENCES IN DIFFERENT ORGANISMS. HOWEVER, BECAUSE THEIR OWN CHARACTERISTICS MAKE THEIR DETECTION EXTREMELY DIFFICULT, THEY HAVE BEEN LITTLE STUDIED. IN ADDITION, IT HAS RECENTLY BEEN SHOWN THAT MANY INVESTMENTS HAVE BEEN GENERATED MULTIPLE TIMES IN THE HUMAN LINEAGE, SO ITS EFFECTS HAVE NOT BEEN DETECTED BY TRADITIONAL ASSOCIATION STUDIES AT THE LEVEL OF THE ENTIRE GENOME. THIS PROJECT AIMS TO TAKE ADVANTAGE OF THE GREAT AMOUNT OF DATA, RESOURCES AND KNOWLEDGE ABOUT INVESTMENTS GENERATED OVER THE PAST FEW YEARS, TO CARRY OUT AN INTEGRATIVE ANALYSIS OF ITS POSSIBLE FUNCTIONAL EFFECTS AT MULTIPLE LEVELS, THROUGH A SERIES OF INTERRELATED OBJECTIVES. THE MAIN OBJECTIVES ARE: (1) EXPAND THE SET OF INVESTMENTS CHARACTERISED IN DETAIL IN HUMANS TO HAVE A MORE COMPLETE VISION OF THEIR BIOLOGICAL EFFECTS; (2) TO CARRY OUT THE FIRST STUDY OF THE GLOBAL ASSOCIATION OF HUMAN INVESTMENTS WITH PHENOTYPIC CHARACTERS AND SUSCEPTIBILITY TO DISEASES, THROUGH THE GENOTYPING OF A LARGE NUMBER OF INVESTMENTS IN INDIVIDUALS WELL CHARACTERISED AT THE PENOTIPIC LEVEL AND CASES OF AT LEAST 10 COMMON COMPLEX DISEASES WITH DIFFERENT GENETIC ETIOLOGY AND PREDISPOSITION (SUCH AS TYPE 2 DIABETES, MYOCARDIAL INFARCTION, LIPID METABOLISM DISORDERS, RHEUMATOID ARTHRITIS, ASTHMA, OBESITY, ALZHEIMER’S, PARKINSON, SCHIZOPHRENIA AND DEPRESSION); (3) INVESTIGATE THE EFFECT OF INVESTMENTS ON PREDISPOSITION TO UNDERGO OTHER REORGANISATIONS, USING AS A MODEL THE INVESTMENT THAT CAUSES HALF OF THE CASES OF HAEMOPHILIA TO SEVERE; (4) ACCURATELY QUANTIFY MOSAICISM AND MUTATION RATES FOR INVESTMENTS MEDIATED BY REPEATS INVESTED IN DIFFERENT TISSUES AS A FIRST STEP IN ASSESSING THE POSSIBLE CONSEQUENCES OF THIS PHENOMENON; AND (5) USE THE WELL-KNOWN 2ST/2J INVESTMENT POLYMORPHISM OF DROSOPHILA BUZZATII AS A COMPLEMENTARY STRATEGY TO INVESTIGATE THE GENETIC BASIS OF PHENOTYPIC DIFFERENCES ASSOCIATED WITH AN INVESTMENT. THEREFORE, OUR PROJECT REPRESENTS A KEY STEP IN DETERMINING THE FUNCTIONAL IMPACT OF THESE VARIANTS, AND WILL PRODUCE RESULTS OF GREAT INTEREST IN DIFFERENT FIELDS, FROM BASIC SCIENCE TO BIOMEDICINE, THUS CONTRIBUTING TO FULFILLING THE PROMISES OF PERSONALISED MEDICINE. (English)
12 October 2021
0.3165621071921311
0 references
MALGRÉ LES ATTENTES INITIALES DES ÉTUDES DE VARIATION AU NIVEAU GÉNOMIQUE, SEULE UNE FAIBLE PROPORTION DU RISQUE GÉNÉTIQUE DE MALADIES COMMUNES ET COMPLEXES A ÉTÉ IDENTIFIÉE. LA PLUPART DES TRAVAUX ONT PORTÉ SUR LES POLYMORPHISMES D’UN SEUL NUCLEOTIDO (SNP) ET, APRÈS AVOIR DÉCOUVERT L’EXTRAORDINAIRE VARIATION STRUCTURELLE DES GÉNOMES, SUR LES VARIANTES EN NOMBRE DE COPIES (CNV). LES INVESTISSEMENTS, EN REVANCHE, SONT UN TYPE DE VARIANTES STRUCTURELLES QUI AFFECTENT UNE FRACTION IMPORTANTE DU GÉNOME HUMAIN ET QUI ONT ÉTÉ IMPLIQUÉES DANS LES DIFFÉRENCES PHÉNOTYPIQUES ENTRE LES DIFFÉRENTS ORGANISMES. CEPENDANT, PARCE QUE LEURS PROPRES CARACTÉRISTIQUES RENDENT LEUR DÉTECTION EXTRÊMEMENT DIFFICILE, ILS ONT ÉTÉ PEU ÉTUDIÉS. EN OUTRE, IL A ÉTÉ RÉCEMMENT DÉMONTRÉ QUE DE NOMBREUX INVESTISSEMENTS ONT ÉTÉ GÉNÉRÉS À PLUSIEURS REPRISES DANS LA LIGNÉE HUMAINE, DE SORTE QUE SES EFFETS N’ONT PAS ÉTÉ DÉTECTÉS PAR LES ÉTUDES TRADITIONNELLES DE L’ASSOCIATION AU NIVEAU DE L’ENSEMBLE DU GÉNOME. CE PROJET VISE À TIRER PARTI DE LA GRANDE QUANTITÉ DE DONNÉES, DE RESSOURCES ET DE CONNAISSANCES SUR LES INVESTISSEMENTS GÉNÉRÉS AU COURS DES DERNIÈRES ANNÉES, POUR RÉALISER UNE ANALYSE INTÉGRÉE DE SES ÉVENTUELS EFFETS FONCTIONNELS À PLUSIEURS NIVEAUX, À TRAVERS UNE SÉRIE D’OBJECTIFS INTERDÉPENDANTS. LES PRINCIPAUX OBJECTIFS SONT LES SUIVANTS: (1) ÉLARGIR L’ENSEMBLE DES INVESTISSEMENTS CARACTÉRISÉS EN DÉTAIL DANS LES ÊTRES HUMAINS AFIN D’AVOIR UNE VISION PLUS COMPLÈTE DE LEURS EFFETS BIOLOGIQUES; (2) DE RÉALISER LA PREMIÈRE ÉTUDE DE L’ASSOCIATION MONDIALE DES INVESTISSEMENTS HUMAINS AVEC DES CARACTÈRES PHÉNOTYPIQUES ET UNE SUSCEPTIBILITÉ AUX MALADIES, PAR LE GÉNOTYPAGE D’UN GRAND NOMBRE D’INVESTISSEMENTS CHEZ DES INDIVIDUS BIEN CARACTÉRISÉS AU NIVEAU PENOTIPIC ET DES CAS D’AU MOINS 10 MALADIES COMPLEXES COURANTES PRÉSENTANT DIFFÉRENTES ÉTIOLOGIES GÉNÉTIQUES ET PRÉDISPOSITIONS (TELLES QUE LE DIABÈTE DE TYPE 2, L’INFARCTUS DU MYOCARDE, LES TROUBLES DU MÉTABOLISME LIPIDIQUE, L’ARTHRITE RHUMATOÏDE, L’ASTHME, L’OBÉSITÉ, LA MALADIE D’ALZHEIMER, LE PARKINSON, LA SCHIZOPHRÉNIE ET LA DÉPRESSION); 3° ÉTUDIER L’EFFET DES INVESTISSEMENTS SUR LA PRÉDISPOSITION POUR SUBIR D’AUTRES RÉORGANISATIONS, EN UTILISANT COMME MODÈLE L’INVESTISSEMENT QUI CAUSE LA MOITIÉ DES CAS D’HÉMOPHILIE À LA GRAVITÉ; (4) QUANTIFIER AVEC PRÉCISION LES TAUX DE MOSAÏQUE ET DE MUTATION POUR LES INVESTISSEMENTS MÉDIÉS PAR DES RÉPÉTITIONS INVESTIES DANS DIFFÉRENTS TISSUS, COMME PREMIÈRE ÉTAPE DANS L’ÉVALUATION DES CONSÉQUENCES POSSIBLES DE CE PHÉNOMÈNE; ET (5) UTILISER LE POLYMORPHISME D’INVESTISSEMENT 2ST/2J BIEN CONNU DE DROSOPHILA BUZZATII COMME STRATÉGIE COMPLÉMENTAIRE POUR ÉTUDIER LA BASE GÉNÉTIQUE DES DIFFÉRENCES PHÉNOTYPIQUES ASSOCIÉES À UN INVESTISSEMENT. PAR CONSÉQUENT, NOTRE PROJET REPRÉSENTE UNE ÉTAPE CLÉ DANS LA DÉTERMINATION DE L’IMPACT FONCTIONNEL DE CES VARIANTES, ET PRODUIRA DES RÉSULTATS D’UN GRAND INTÉRÊT DANS DIFFÉRENTS DOMAINES, DE LA SCIENCE FONDAMENTALE À LA BIOMÉDECINE, CONTRIBUANT AINSI À LA RÉALISATION DES PROMESSES DE LA MÉDECINE PERSONNALISÉE. (French)
4 December 2021
0 references
TROTZ DER ANFÄNGLICHEN ERWARTUNGEN AN VARIATIONSSTUDIEN AUF GENOMISCHER EBENE WURDE BISHER NUR EIN KLEINER TEIL DES GENETISCHEN RISIKOS FÜR HÄUFIGE UND KOMPLEXE KRANKHEITEN ERMITTELT. DIE MEISTEN ARBEITEN KONZENTRIERTEN SICH AUF DIE POLYMORPHISMEN EINES EINZELNEN NUCLEOTIDO (SNPS) UND NACH DER ENTDECKUNG DER AUSSERORDENTLICHEN MENGE AN STRUKTURELLEN VARIATIONEN IN DEN GENOMEN, AUF VARIANTEN IN DER ANZAHL DER KOPIEN (CNVS). INVESTITIONEN HINGEGEN SIND EINE ART STRUKTURELLER VARIANTEN, DIE EINEN WICHTIGEN TEIL DES MENSCHLICHEN GENOMS BEEINFLUSSEN UND AN PHÄNOTYPISCHEN UNTERSCHIEDEN IN VERSCHIEDENEN ORGANISMEN BETEILIGT WAREN. DA IHRE EIGENEN EIGENSCHAFTEN IHRE ERKENNUNG JEDOCH EXTREM SCHWIERIG MACHEN, WURDEN SIE KAUM UNTERSUCHT. DARÜBER HINAUS WURDE KÜRZLICH GEZEIGT, DASS VIELE INVESTITIONEN IN DIE MENSCHLICHE LINIE MEHRFACH GENERIERT WURDEN, SO DASS IHRE AUSWIRKUNGEN NICHT DURCH TRADITIONELLE ASSOZIATIONSSTUDIEN AUF DER EBENE DES GESAMTEN GENOMS NACHGEWIESEN WURDEN. ZIEL DIESES PROJEKTS IST ES, DIE GROSSE MENGE AN DATEN, RESSOURCEN UND WISSEN ÜBER INVESTITIONEN IN DEN LETZTEN JAHREN ZU NUTZEN, UM DURCH EINE REIHE MITEINANDER VERKNÜPFTER ZIELE EINE INTEGRATIVE ANALYSE DER MÖGLICHEN FUNKTIONSEFFEKTE AUF MEHREREN EBENEN DURCHZUFÜHREN. DIE HAUPTZIELE SIND: (1) DIE INVESTITIONEN, DIE IM EINZELNEN BEIM MENSCHEN CHARAKTERISIERT SIND, ERWEITERN, UM EINE UMFASSENDERE SICHT IHRER BIOLOGISCHEN AUSWIRKUNGEN ZU HABEN; (2) DURCHFÜHRUNG DER ERSTEN STUDIE DER GLOBALEN VEREINIGUNG MENSCHLICHER INVESTITIONEN MIT PHÄNOTYPISCHEN CHARAKTEREN UND ANFÄLLIGKEIT FÜR KRANKHEITEN DURCH GENOTYPISIERUNG EINER VIELZAHL VON INVESTITIONEN IN PERSONEN, DIE GUT AUF PENOTIPIC-EBENE CHARAKTERISIERT SIND, UND FÄLLE VON MINDESTENS 10 HÄUFIGSTEN KOMPLEXEN KRANKHEITEN MIT UNTERSCHIEDLICHER GENETISCHER ÄTIOLOGIE UND PRÄDISPOSITION (WIE TYP-2-DIABETES, MYOKARDINFARKT, LIPIDSTOFFWECHSELSTÖRUNGEN, RHEUMATOID-ARTHRITIS, ASTHMA, FETTLEIBIGKEIT, ALZHEIMER, PARKINSON, SCHIZOPHRENIE UND DEPRESSION); (3) DIE AUSWIRKUNGEN VON INVESTITIONEN AUF DIE PRÄDISPOSITION ANDERER UMSTRUKTURIERUNGEN UNTERSUCHEN, WOBEI ALS MODELL DIE INVESTITION VERWENDET WIRD, DIE DIE HÄLFTE DER FÄLLE VON HÄMOPHILIE SCHWERWIEGEND VERURSACHT; (4) ALS ERSTEN SCHRITT ZUR BEWERTUNG DER MÖGLICHEN FOLGEN DIESES PHÄNOMENS DIE MOSAIKISMUS- UND MUTATIONSRATEN FÜR INVESTITIONEN GENAU QUANTIFIZIEREN, DIE DURCH WIEDERHOLUNGEN IN VERSCHIEDENEN GEWEBEN VERMITTELT WERDEN; UND (5) DEN BEKANNTEN 2ST/2J INVESTMENT POLYMORPHISMUS VON DROSOPHILA BUZZATII ALS ERGÄNZENDE STRATEGIE NUTZEN, UM DIE GENETISCHE GRUNDLAGE PHÄNOTYPISCHER UNTERSCHIEDE IM ZUSAMMENHANG MIT EINER INVESTITION ZU UNTERSUCHEN. DAHER STELLT UNSER PROJEKT EINEN WICHTIGEN SCHRITT ZUR BESTIMMUNG DER FUNKTIONELLEN AUSWIRKUNGEN DIESER VARIANTEN DAR UND WIRD ERGEBNISSE VON GROSSEM INTERESSE IN VERSCHIEDENEN BEREICHEN, VON DER GRUNDLAGENWISSENSCHAFT BIS ZUR BIOMEDIZIN, LIEFERN UND SO ZUR ERFÜLLUNG DER VERSPRECHEN DER PERSONALISIERTEN MEDIZIN BEITRAGEN. (German)
9 December 2021
0 references
ONDANKS DE AANVANKELIJKE VERWACHTINGEN VAN VARIATIESTUDIES OP GENOMISCH NIVEAU IS TOT DUSVER SLECHTS EEN KLEIN DEEL VAN HET GENETISCHE RISICO VAN GEMEENSCHAPPELIJKE EN COMPLEXE ZIEKTEN VASTGESTELD. DE MEESTE WERKEN HEBBEN ZICH GERICHT OP DE POLYMORFISMEN VAN ÉÉN ENKELE NUCLEOTIDO (SNP’S) EN, NA HET ONTDEKKEN VAN DE BUITENGEWONE HOEVEELHEID STRUCTURELE VARIATIE IN DE GENOMEN, OP VARIANTEN IN AANTAL KOPIEËN (CNV’S). INVESTERINGEN DAARENTEGEN ZIJN EEN SOORT STRUCTURELE VARIANTEN DIE EEN BELANGRIJKE FRACTIE VAN HET MENSELIJK GENOOM BEÏNVLOEDEN EN BETROKKEN ZIJN GEWEEST BIJ FENOTYPISCHE VERSCHILLEN IN VERSCHILLENDE ORGANISMEN. ECHTER, OMDAT HUN EIGEN KENMERKEN HUN DETECTIE UITERST MOEILIJK MAKEN, ZIJN ZE WEINIG BESTUDEERD. BOVENDIEN IS ONLANGS AANGETOOND DAT VEEL INVESTERINGEN MEERDERE MALEN IN DE MENSELIJKE LIJN ZIJN GEGENEREERD, ZODAT DE EFFECTEN ERVAN NIET ZIJN GEDETECTEERD DOOR TRADITIONELE ASSOCIATIESTUDIES OP HET NIVEAU VAN HET GEHELE GENOOM. DIT PROJECT HEEFT TOT DOEL GEBRUIK TE MAKEN VAN DE GROTE HOEVEELHEID GEGEVENS, MIDDELEN EN KENNIS OVER INVESTERINGEN DIE DE AFGELOPEN JAREN ZIJN GEGENEREERD, OM EEN INTEGRATIEVE ANALYSE VAN DE MOGELIJKE FUNCTIONELE EFFECTEN OP MEERDERE NIVEAUS UIT TE VOEREN, DOOR MIDDEL VAN EEN REEKS ONDERLING SAMENHANGENDE DOELSTELLINGEN. DE BELANGRIJKSTE DOELSTELLINGEN ZIJN: (1) DE REEKS INVESTERINGEN UIT TE BREIDEN DIE IN DETAIL IN MENSEN WORDEN GEKENMERKT OM EEN VOLLEDIGER BEELD VAN HUN BIOLOGISCHE EFFECTEN TE HEBBEN; (2) HET UITVOEREN VAN DE EERSTE STUDIE VAN DE WERELDWIJDE VERENIGING VAN MENSELIJKE INVESTERINGEN MET FENOTYPISCHE KARAKTERS EN GEVOELIGHEID VOOR ZIEKTEN, DOOR DE GENOTYPERING VAN EEN GROOT AANTAL INVESTERINGEN IN PERSONEN DIE GOED ZIJN GEKARAKTERISEERD OP PENOTIPIC-NIVEAU EN GEVALLEN VAN TEN MINSTE 10 VEEL VOORKOMENDE COMPLEXE ZIEKTEN MET VERSCHILLENDE GENETISCHE ETIOLOGIE EN PREDISPOSITIE (ZOALS TYPE 2-DIABETES, MYOCARDINFARCT, LIPIDENMETABOLISMESTOORNISSEN, REUMATOÏDE ARTRITIS, ASTMA, OBESITAS, ALZHEIMER’S, PARKINSON, SCHIZOFRENIE EN DEPRESSIE); (3) ONDERZOEK TE DOEN NAAR HET EFFECT VAN INVESTERINGEN OP DE AANLEG OM ANDERE REORGANISATIES TE ONDERGAAN, WAARBIJ ALS MODEL DE INVESTERING WORDT GEBRUIKT DIE DE HELFT VAN DE GEVALLEN VAN HEMOFILIE ERNSTIG VEROORZAAKT; (4) HET MOZAÏEK EN DE MUTATIEPERCENTAGES NAUWKEURIG KWANTIFICEREN VOOR INVESTERINGEN DIE WORDEN GEMEDIEERD DOOR HERHALINGEN DIE IN VERSCHILLENDE WEEFSELS ZIJN GEÏNVESTEERD, ALS EERSTE STAP IN DE BEOORDELING VAN DE MOGELIJKE GEVOLGEN VAN DIT VERSCHIJNSEL; EN (5) HET BEKENDE 2ST/2J-INVESTERINGSPOLYMORFISME VAN DROSOPHILA BUZZATII GEBRUIKEN ALS EEN AANVULLENDE STRATEGIE OM DE GENETISCHE BASIS VAN FENOTYPISCHE VERSCHILLEN IN VERBAND MET EEN INVESTERING TE ONDERZOEKEN. DAAROM IS ONS PROJECT EEN BELANGRIJKE STAP IN HET BEPALEN VAN DE FUNCTIONELE IMPACT VAN DEZE VARIANTEN, EN ZAL RESULTATEN VAN GROTE BELANGSTELLING OP VERSCHILLENDE GEBIEDEN, VAN DE BASISWETENSCHAP TOT BIOMEDICINE, EN ZO BIJDRAGEN AAN HET NAKOMEN VAN DE BELOFTEN VAN GEPERSONALISEERDE GENEESKUNDE. (Dutch)
17 December 2021
0 references
NONOSTANTE LE ASPETTATIVE INIZIALI DI STUDI DI VARIAZIONE A LIVELLO GENOMICO, FINORA È STATA INDIVIDUATA SOLO UNA PICCOLA PARTE DEL RISCHIO GENETICO DI MALATTIE COMUNI E COMPLESSE. LA MAGGIOR PARTE DELLE OPERE SI È CONCENTRATA SUI POLIMORFISMI DI UN SINGOLO NUCLEOTIDO (SNPS) E, DOPO AVER SCOPERTO LA STRAORDINARIA QUANTITÀ DI VARIAZIONI STRUTTURALI NEI GENOMI, SULLE VARIANTI IN NUMERO DI COPIE (CNV). GLI INVESTIMENTI, INVECE, SONO UN TIPO DI VARIANTI STRUTTURALI CHE INTERESSANO UNA PARTE IMPORTANTE DEL GENOMA UMANO E SONO STATI COINVOLTI NELLE DIFFERENZE FENOTIPICHE NEI DIVERSI ORGANISMI. TUTTAVIA, POICHÉ LE LORO CARATTERISTICHE RENDONO LA LORO RILEVAZIONE ESTREMAMENTE DIFFICILE, SONO STATE POCO STUDIATE. INOLTRE, È STATO RECENTEMENTE DIMOSTRATO CHE MOLTI INVESTIMENTI SONO STATI GENERATI PIÙ VOLTE NEL LIGNAGGIO UMANO, QUINDI I SUOI EFFETTI NON SONO STATI RILEVATI DAGLI STUDI TRADIZIONALI DELL'ASSOCIAZIONE A LIVELLO DELL'INTERO GENOMA. QUESTO PROGETTO MIRA A SFRUTTARE LA GRANDE QUANTITÀ DI DATI, RISORSE E CONOSCENZE SUGLI INVESTIMENTI GENERATI NEGLI ULTIMI ANNI, PER EFFETTUARE UN'ANALISI INTEGRATIVA DEI SUOI POSSIBILI EFFETTI FUNZIONALI A PIÙ LIVELLI, ATTRAVERSO UNA SERIE DI OBIETTIVI INTERCONNESSI. GLI OBIETTIVI PRINCIPALI SONO: (1) AMPLIARE LA SERIE DI INVESTIMENTI CARATTERIZZATI IN DETTAGLIO NELL'UOMO PER AVERE UNA VISIONE PIÙ COMPLETA DEI LORO EFFETTI BIOLOGICI; (2) EFFETTUARE IL PRIMO STUDIO DELL'ASSOCIAZIONE GLOBALE DI INVESTIMENTI UMANI CON CARATTERI FENOTIPICI E SUSCETTIBILITÀ ALLE MALATTIE, ATTRAVERSO LA GENOTIPIZZAZIONE DI UN GRAN NUMERO DI INVESTIMENTI IN INDIVIDUI BEN CARATTERIZZATI A LIVELLO PENOTIPIC E CASI DI ALMENO 10 MALATTIE COMPLESSE COMUNI CON DIVERSA EZIOLOGIA E PREDISPOSIZIONE GENETICA (COME DIABETE DI TIPO 2, INFARTO MIOCARDICO, DISTURBI DEL METABOLISMO LIPIDICO, ARTRITE REUMATOIDE, ASMA, OBESITÀ, ALZHEIMER, PARKINSON, SCHIZOFRENIA E DEPRESSIONE); (3) ESAMINARE L'EFFETTO DEGLI INVESTIMENTI SULLA PREDISPOSIZIONE A SOTTOPORSI AD ALTRE RIORGANIZZAZIONI, UTILIZZANDO COME MODELLO L'INVESTIMENTO CHE PROVOCA LA METÀ DEI CASI DI EMOFILIA A GRAVE; (4) QUANTIFICARE ACCURATAMENTE I TASSI DI MOSAICISMO E MUTAZIONE PER GLI INVESTIMENTI MEDIATI DA RIPETIZIONI INVESTITE IN DIVERSI TESSUTI COME PRIMO PASSO NELLA VALUTAZIONE DELLE POSSIBILI CONSEGUENZE DI QUESTO FENOMENO; E (5) UTILIZZARE IL NOTO POLIMORFISMO D'INVESTIMENTO 2ST/2J DELLA DROSOPHILA BUZZATII COME STRATEGIA COMPLEMENTARE PER STUDIARE LA BASE GENETICA DELLE DIFFERENZE FENOTIPICHE ASSOCIATE AD UN INVESTIMENTO. PERTANTO, IL NOSTRO PROGETTO RAPPRESENTA UN PASSO FONDAMENTALE NELLA DETERMINAZIONE DELL'IMPATTO FUNZIONALE DI QUESTE VARIANTI, E PRODURRÀ RISULTATI DI GRANDE INTERESSE IN DIVERSI CAMPI, DALLA SCIENZA DI BASE ALLA BIOMEDICINA, CONTRIBUENDO COSÌ A MANTENERE LE PROMESSE DELLA MEDICINA PERSONALIZZATA. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΠΑΡΆ ΤΙΣ ΑΡΧΙΚΈΣ ΠΡΟΣΔΟΚΊΕΣ ΓΙΑ ΜΕΛΈΤΕΣ ΜΕΤΑΒΛΗΤΌΤΗΤΑΣ ΣΕ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΌ ΕΠΊΠΕΔΟ, ΜΈΧΡΙ ΣΤΙΓΜΉΣ ΈΧΕΙ ΕΝΤΟΠΙΣΤΕΊ ΜΌΝΟ ΈΝΑ ΜΙΚΡΌ ΠΟΣΟΣΤΌ ΤΟΥ ΓΕΝΕΤΙΚΟΎ ΚΙΝΔΎΝΟΥ ΚΟΙΝΏΝ ΚΑΙ ΣΎΝΘΕΤΩΝ ΑΣΘΕΝΕΙΏΝ. ΤΑ ΠΕΡΙΣΣΌΤΕΡΑ ΈΡΓΑ ΈΧΟΥΝ ΕΠΙΚΕΝΤΡΩΘΕΊ ΣΤΟΥΣ ΠΟΛΥΜΟΡΦΙΣΜΟΎΣ ΕΝΌΣ ΜΌΝΟ NUCLEOTIDO (SNPS) ΚΑΙ, ΜΕΤΆ ΤΗΝ ΑΝΑΚΆΛΥΨΗ ΤΗΣ ΕΞΑΙΡΕΤΙΚΉΣ ΠΟΣΌΤΗΤΑΣ ΤΗΣ ΔΟΜΙΚΉΣ ΔΙΑΚΎΜΑΝΣΗΣ ΣΤΑ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΑ, ΣΕ ΠΑΡΑΛΛΑΓΈΣ ΣΕ ΑΡΙΘΜΌ ΑΝΤΙΓΡΆΦΩΝ (CNVS). ΟΙ ΕΠΕΝΔΎΣΕΙΣ, ΑΠΌ ΤΗΝ ΆΛΛΗ ΠΛΕΥΡΆ, ΕΊΝΑΙ ΈΝΑ ΕΊΔΟΣ ΔΟΜΙΚΏΝ ΠΑΡΑΛΛΑΓΏΝ ΠΟΥ ΕΠΗΡΕΆΖΟΥΝ ΈΝΑ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌ ΚΛΆΣΜΑ ΤΟΥ ΑΝΘΡΏΠΙΝΟΥ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΟΣ ΚΑΙ ΈΧΟΥΝ ΕΜΠΛΑΚΕΊ ΣΕ ΦΑΙΝΟΤΥΠΙΚΈΣ ΔΙΑΦΟΡΈΣ ΣΕ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΟΎΣ ΟΡΓΑΝΙΣΜΟΎΣ. ΩΣΤΌΣΟ, ΕΠΕΙΔΉ ΤΑ ΔΙΚΆ ΤΟΥΣ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΆ ΚΑΘΙΣΤΟΎΝ ΤΗΝ ΑΝΊΧΝΕΥΣΉ ΤΟΥΣ ΕΞΑΙΡΕΤΙΚΆ ΔΎΣΚΟΛΗ, ΈΧΟΥΝ ΜΕΛΕΤΗΘΕΊ ΕΛΆΧΙΣΤΑ. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΠΡΌΣΦΑΤΑ ΈΧΕΙ ΑΠΟΔΕΙΧΘΕΊ ΌΤΙ ΠΟΛΛΈΣ ΕΠΕΝΔΎΣΕΙΣ ΈΧΟΥΝ ΠΡΑΓΜΑΤΟΠΟΙΗΘΕΊ ΠΟΛΛΈΣ ΦΟΡΈΣ ΣΤΗΝ ΑΝΘΡΏΠΙΝΗ ΓΕΝΕΑΛΟΓΊΑ, ΟΠΌΤΕ ΤΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΆ ΤΗΣ ΔΕΝ ΈΧΟΥΝ ΕΝΤΟΠΙΣΤΕΊ ΑΠΌ ΠΑΡΑΔΟΣΙΑΚΈΣ ΜΕΛΈΤΕΣ ΣΎΝΔΕΣΗΣ ΣΕ ΕΠΊΠΕΔΟ ΟΛΌΚΛΗΡΟΥ ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΙΏΜΑΤΟΣ. ΤΟ ΈΡΓΟ ΑΥΤΌ ΈΧΕΙ ΩΣ ΣΤΌΧΟ ΝΑ ΑΞΙΟΠΟΙΉΣΕΙ ΤΟΝ ΜΕΓΆΛΟ ΌΓΚΟ ΔΕΔΟΜΈΝΩΝ, ΠΌΡΩΝ ΚΑΙ ΓΝΏΣΕΩΝ ΣΧΕΤΙΚΆ ΜΕ ΤΙΣ ΕΠΕΝΔΎΣΕΙΣ ΠΟΥ ΠΡΑΓΜΑΤΟΠΟΙΉΘΗΚΑΝ ΤΑ ΤΕΛΕΥΤΑΊΑ ΧΡΌΝΙΑ, ΠΡΟΚΕΙΜΈΝΟΥ ΝΑ ΠΡΟΒΕΊ ΣΕ ΟΛΟΚΛΗΡΩΜΈΝΗ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΩΝ ΠΙΘΑΝΏΝ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΏΝ ΕΠΙΠΤΏΣΕΏΝ ΤΟΥ ΣΕ ΠΟΛΛΑΠΛΆ ΕΠΊΠΕΔΑ, ΜΈΣΩ ΜΙΑΣ ΣΕΙΡΆΣ ΑΛΛΗΛΈΝΔΕΤΩΝ ΣΤΌΧΩΝ. ΟΙ ΚΎΡΙΟΙ ΣΤΌΧΟΙ ΕΊΝΑΙ: (1) ΝΑ ΕΠΕΚΤΕΊΝΕΙ ΤΟ ΣΎΝΟΛΟ ΤΩΝ ΕΠΕΝΔΎΣΕΩΝ ΠΟΥ ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΖΟΝΤΑΙ ΛΕΠΤΟΜΕΡΏΣ ΣΤΟΥΣ ΑΝΘΡΏΠΟΥΣ ΓΙΑ ΝΑ ΈΧΟΥΝ ΜΙΑ ΠΙΟ ΟΛΟΚΛΗΡΩΜΈΝΗ ΕΙΚΌΝΑ ΤΩΝ ΒΙΟΛΟΓΙΚΏΝ ΤΟΥΣ ΕΠΙΠΤΏΣΕΩΝ? (2) ΝΑ ΠΡΑΓΜΑΤΟΠΟΙΉΣΕΙ ΤΗΝ ΠΡΏΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΤΗΣ ΠΑΓΚΌΣΜΙΑΣ ΈΝΩΣΗΣ ΑΝΘΡΏΠΙΝΩΝ ΕΠΕΝΔΎΣΕΩΝ ΜΕ ΦΑΙΝΟΤΥΠΙΚΟΎΣ ΧΑΡΑΚΤΉΡΕΣ ΚΑΙ ΕΥΑΙΣΘΗΣΊΑ ΣΕ ΑΣΘΈΝΕΙΕΣ, ΜΈΣΩ ΤΗΣ ΓΟΝΟΤΥΠΙΚΉΣ ΑΝΆΛΥΣΗΣ ΜΕΓΆΛΟΥ ΑΡΙΘΜΟΎ ΕΠΕΝΔΎΣΕΩΝ ΣΕ ΆΤΟΜΑ ΠΟΥ ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΖΟΝΤΑΙ ΚΑΛΆ ΣΕ ΕΠΊΠΕΔΟ PENOTIPIC ΚΑΙ ΠΕΡΙΠΤΏΣΕΩΝ ΤΟΥΛΆΧΙΣΤΟΝ 10 ΚΟΙΝΏΝ ΣΎΝΘΕΤΩΝ ΑΣΘΕΝΕΙΏΝ ΜΕ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΉ ΓΕΝΕΤΙΚΉ ΑΙΤΙΟΛΟΓΊΑ ΚΑΙ ΠΡΟΔΙΆΘΕΣΗ (ΌΠΩΣ ΔΙΑΒΉΤΗΣ ΤΎΠΟΥ 2, ΈΜΦΡΑΓΜΑ ΤΟΥ ΜΥΟΚΑΡΔΊΟΥ, ΔΙΑΤΑΡΑΧΈΣ ΤΟΥ ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΎ ΤΩΝ ΛΙΠΙΔΊΩΝ, ΡΕΥΜΑΤΟΕΙΔΉ ΑΡΘΡΊΤΙΔΑ, ΆΣΘΜΑ, ΠΑΧΥΣΑΡΚΊΑ, ALZHEIMER’S, PARKINSON, ΣΧΙΖΟΦΡΈΝΕΙΑ ΚΑΙ ΚΑΤΆΘΛΙΨΗ). (3) ΝΑ ΔΙΕΡΕΥΝΗΘΕΊ Η ΕΠΊΔΡΑΣΗ ΤΩΝ ΕΠΕΝΔΎΣΕΩΝ ΣΤΗΝ ΠΡΟΔΙΆΘΕΣΗ ΝΑ ΥΠΟΒΛΗΘΟΎΝ ΣΕ ΆΛΛΕΣ ΑΝΑΔΙΟΡΓΑΝΏΣΕΙΣ, ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ ΩΣ ΠΡΌΤΥΠΟ ΤΗΝ ΕΠΈΝΔΥΣΗ ΠΟΥ ΠΡΟΚΑΛΕΊ ΣΟΒΑΡΈΣ ΤΙΣ ΜΙΣΈΣ ΑΠΌ ΤΙΣ ΠΕΡΙΠΤΏΣΕΙΣ ΑΙΜΟΡΡΟΦΙΛΊΑΣ· (4) ΝΑ ΠΟΣΟΤΙΚΟΠΟΙΉΣΕΙ ΜΕ ΑΚΡΊΒΕΙΑ ΤΑ ΠΟΣΟΣΤΆ ΜΩΣΑΪΚΙΣΜΟΎ ΚΑΙ ΜΕΤΆΛΛΑΞΗΣ ΓΙΑ ΕΠΕΝΔΎΣΕΙΣ ΜΕ ΤΗ ΔΙΑΜΕΣΟΛΆΒΗΣΗ ΕΠΑΝΑΛΉΨΕΩΝ ΠΟΥ ΕΠΕΝΔΎΟΝΤΑΙ ΣΕ ΔΙΆΦΟΡΟΥΣ ΙΣΤΟΎΣ ΩΣ ΠΡΏΤΟ ΒΉΜΑ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΞΙΟΛΌΓΗΣΗ ΤΩΝ ΠΙΘΑΝΏΝ ΣΥΝΕΠΕΙΏΝ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ ΦΑΙΝΟΜΈΝΟΥ· ΚΑΙ (5) ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΟΎΝ ΤΟΝ ΓΝΩΣΤΌ 2ST/2J ΕΠΕΝΔΥΤΙΚΌ ΠΟΛΥΜΟΡΦΙΣΜΌ ΤΗΣ DROSOPHILA BUZZATII ΩΣ ΣΥΜΠΛΗΡΩΜΑΤΙΚΉ ΣΤΡΑΤΗΓΙΚΉ ΓΙΑ ΤΗ ΔΙΕΡΕΎΝΗΣΗ ΤΗΣ ΓΕΝΕΤΙΚΉΣ ΒΆΣΗΣ ΤΩΝ ΦΑΙΝΟΤΥΠΙΚΏΝ ΔΙΑΦΟΡΏΝ ΠΟΥ ΣΥΝΔΈΟΝΤΑΙ ΜΕ ΜΙΑ ΕΠΈΝΔΥΣΗ. ΩΣ ΕΚ ΤΟΎΤΟΥ, ΤΟ ΈΡΓΟ ΜΑΣ ΑΠΟΤΕΛΕΊ ΈΝΑ ΒΑΣΙΚΌ ΒΉΜΑ ΓΙΑ ΤΟΝ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΌ ΤΟΥ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΟΎ ΑΝΤΊΚΤΥΠΟΥ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΠΑΡΑΛΛΑΓΏΝ ΚΑΙ ΘΑ ΠΑΡΆΓΕΙ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΜΕΓΆΛΟΥ ΕΝΔΙΑΦΈΡΟΝΤΟΣ ΣΕ ΔΙΆΦΟΡΟΥΣ ΤΟΜΕΊΣ, ΑΠΌ ΤΗ ΒΑΣΙΚΉ ΕΠΙΣΤΉΜΗ ΈΩΣ ΤΗ ΒΙΟΪΑΤΡΙΚΉ, ΣΥΜΒΆΛΛΟΝΤΑΣ ΈΤΣΙ ΣΤΗΝ ΕΚΠΛΉΡΩΣΗ ΤΩΝ ΥΠΟΣΧΈΣΕΩΝ ΤΗΣ ΕΞΑΤΟΜΙΚΕΥΜΈΝΗΣ ΙΑΤΡΙΚΉΣ. (Greek)
18 August 2022
0 references
PÅ TRODS AF DE OPRINDELIGE FORVENTNINGER TIL VARIATIONSUNDERSØGELSER PÅ GENOMNIVEAU ER DER INDTIL VIDERE KUN IDENTIFICERET EN LILLE DEL AF DEN GENETISKE RISIKO FOR ALMINDELIGE OG KOMPLEKSE SYGDOMME. DE FLESTE VÆRKER HAR FOKUSERET PÅ POLYMORFIERNE I EN ENKELT NUCLEOTIDO (SNP) OG, EFTER AT HAVE OPDAGET DEN EKSTRAORDINÆRE MÆNGDE STRUKTURELLE VARIATIONER I GENOMERNE, PÅ VARIANTER I ANTAL KOPIER (CNV'ER). INVESTERINGER ER DERIMOD EN TYPE STRUKTURELLE VARIANTER, DER PÅVIRKER EN VIGTIG DEL AF DET MENNESKELIGE GENOM OG HAR VÆRET INVOLVERET I FÆNOTYPISKE FORSKELLE I FORSKELLIGE ORGANISMER. MEN FORDI DERES EGNE EGENSKABER GØR DERES AFSLØRING EKSTREMT VANSKELIG, ER DE BLEVET LIDT UNDERSØGT. DESUDEN ER DET FOR NYLIG BLEVET PÅVIST, AT MANGE INVESTERINGER ER BLEVET GENERERET FLERE GANGE I DEN MENNESKELIGE SLÆGT, SÅ DENS VIRKNINGER ER IKKE BLEVET PÅVIST AF TRADITIONELLE ASSOCIATION UNDERSØGELSER PÅ NIVEAUET FOR HELE GENOMET. DETTE PROJEKT HAR TIL FORMÅL AT UDNYTTE DEN STORE MÆNGDE DATA, RESSOURCER OG VIDEN OM INVESTERINGER, DER ER GENERERET I LØBET AF DE SENESTE ÅR, TIL AT FORETAGE EN INTEGRERENDE ANALYSE AF DE MULIGE FUNKTIONELLE VIRKNINGER PÅ FLERE NIVEAUER GENNEM EN RÆKKE INDBYRDES FORBUNDNE MÅL. DE VIGTIGSTE MÅL ER: 1) UDVIDE DET SÆT INVESTERINGER, DER ER KARAKTERISERET I DETALJER HOS MENNESKER, TIL AT HAVE EN MERE FULDSTÆNDIG VISION FOR DERES BIOLOGISKE VIRKNINGER; (2) AT GENNEMFØRE DEN FØRSTE UNDERSØGELSE AF DEN GLOBALE SAMMENSLUTNING AF MENNESKELIGE INVESTERINGER MED FÆNOTYPISKE TEGN OG MODTAGELIGHED OVER FOR SYGDOMME GENNEM GENOTYPEBESTEMMELSE AF ET STORT ANTAL INVESTERINGER I ENKELTPERSONER, DER ER GODT KARAKTERISERET PÅ PENOTIPIC-NIVEAU OG TILFÆLDE AF MINDST 10 ALMINDELIGE KOMPLEKSE SYGDOMME MED FORSKELLIG GENETISK ETIOLOGI OG PRÆDISPOSITION (SÅSOM TYPE 2-DIABETES, MYOKARDIEINFARKT, LIPIDMETABOLISME, LEDDEGIGT, ASTMA, FEDME, ALZHEIMER'S, PARKINSON, SKIZOFRENI OG DEPRESSION); 3) UNDERSØGE VIRKNINGEN AF INVESTERINGER PÅ PRÆDISPONERING, DER SKAL UNDERGÅ ANDRE OMSTRUKTURERINGER, IDET MAN SOM MODEL ANVENDER DEN INVESTERING, DER FORÅRSAGER, AT HALVDELEN AF TILFÆLDENE AF HÆMOFILI BLIVER ALVORLIGE; (4) NØJAGTIGT KVANTIFICERE MOSAIKISME OG MUTATIONSRATER FOR INVESTERINGER, DER FORMIDLES AF GENTAGELSER, DER INVESTERES I FORSKELLIGE VÆV, SOM ET FØRSTE SKRIDT TIL AT VURDERE DE MULIGE KONSEKVENSER AF DETTE FÆNOMEN; OG (5) ANVENDE DROSOPHILA BUZZATII'S VELKENDTE 2ST/2J-INVESTERINGSPOLYMORFISME SOM EN SUPPLERENDE STRATEGI TIL AT UNDERSØGE DET GENETISKE GRUNDLAG FOR FÆNOTYPISKE FORSKELLE I FORBINDELSE MED EN INVESTERING. DERFOR ER VORES PROJEKT ET VIGTIGT SKRIDT TIL AT BESTEMME DEN FUNKTIONELLE VIRKNING AF DISSE VARIANTER, OG VIL GIVE RESULTATER AF STOR INTERESSE PÅ FORSKELLIGE OMRÅDER, FRA GRUNDLÆGGENDE VIDENSKAB TIL BIOMEDICIN OG DERMED BIDRAGE TIL AT OPFYLDE LØFTERNE OM PERSONLIG MEDICIN. (Danish)
18 August 2022
0 references
GENOMITASON VAIHTELUTUTKIMUSTEN ALUSTAVISTA ODOTUKSISTA HUOLIMATTA TÄHÄN MENNESSÄ ON TUNNISTETTU VAIN PIENI OSA YLEISTEN JA MONIMUTKAISTEN SAIRAUKSIEN GENEETTISESTÄ RISKISTÄ. USEIMMISSA TEOKSISSA ON KESKITYTTY YHDEN NUCLEOTIDO:N POLYMORFISMIIN (SNP) JA SEN JÄLKEEN, KUN GENOMIEN POIKKEUKSELLISEN PALJON RAKENTEELLISIA VAIHTELUJA ON HAVAITTU, KOPIOIDEN MÄÄRÄN MUUNNELMIIN. TOISAALTA INVESTOINNIT OVAT ERÄÄNLAISIA RAKENTEELLISIA MUUNNELMIA, JOTKA VAIKUTTAVAT MERKITTÄVÄÄN OSAAN IHMISEN GENOMISTA JA OVAT OLLEET MUKANA FENOTYYPPISISSÄ EROISSA ERI ORGANISMEISSA. KOSKA NIIDEN OMAT OMINAISUUDET TEKEVÄT NIIDEN HAVAITSEMISEN ERITTÄIN VAIKEAKSI, NIITÄ ON KUITENKIN TUTKITTU VÄHÄN. LISÄKSI VIIME AIKOINA ON OSOITETTU, ETTÄ IHMISSUKUUN ON TEHTY USEITA INVESTOINTEJA, JOTEN SEN VAIKUTUKSIA EI OLE HAVAITTU PERINTEISISSÄ YHDISTYSTUTKIMUKSISSA KOKO GENOMIN TASOLLA. HANKKEEN TAVOITTEENA ON HYÖDYNTÄÄ VIIME VUOSINA SYNTYNEITÄ INVESTOINTEJA KOSKEVIA TIETOJA, RESURSSEJA JA TIETÄMYSTÄ SEKÄ TEHDÄ INTEGROITU ANALYYSI HANKKEEN MAHDOLLISISTA TOIMINNALLISISTA VAIKUTUKSISTA USEILLA TASOILLA TOISIINSA LIITTYVIEN TAVOITTEIDEN AVULLA. PÄÄTAVOITTEET OVAT SEURAAVAT: (1) LAAJENTAA INVESTOINTEJA, JOTKA ON MÄÄRITELTY YKSITYISKOHTAISESTI IHMISIIN, JOTTA NIILLÄ OLISI KATTAVAMPI KÄSITYS NIIDEN BIOLOGISISTA VAIKUTUKSISTA; (2) TOTEUTTAA ENSIMMÄINEN TUTKIMUS IHMISEN FENOTYYPPI- JA ALTTIUSINVESTOINTIEN MAAILMANLAAJUISESTA YHDISTYKSESTÄ SITEN, ETTÄ SUURI MÄÄRÄ INVESTOINTEJA PENOTIPIC-TASOLLA HYVIN TUNNETTUIHIN YKSILÖIHIN GENOTYYPPISESTI JA VÄHINTÄÄN 10 YLEISTÄ KOMPLEKSITAUTIA, JOILLA ON ERILAINEN GENEETTINEN ETIOLOGIA JA ALTTIUS (KUTEN TYYPIN 2 DIABETES, SYDÄNINFARKTI, RASVA-AINEENVAIHDUNNAN HÄIRIÖT, NIVELREUMA, ASTMA, LIIKALIHAVUUS, ALZHEIMERIN TAUTI, PARKINSONIN TAUTI, SKITSOFRENIA JA MASENNUS), (3) TUTKIA INVESTOINTIEN VAIKUTUSTA ALTTIUTEEN TOTEUTTAA MUITA UUDELLEENJÄRJESTELYJÄ KÄYTTÄMÄLLÄ MALLINA INVESTOINTIA, JOKA AIHEUTTAA PUOLET HEMOFILIATAPAUKSISTA VAKAVAKSI; 4) KVANTIFIOIDAAN TARKASTI MOSAIIKKI- JA MUTAATIOASTEET INVESTOINNEISSA, JOTKA VÄLITTYVÄT ERI KUDOKSIIN SIJOITETUILLA TOISTOILLA, ENSIMMÄISENÄ ASKELEENA ARVIOITAESSA TÄMÄN ILMIÖN MAHDOLLISIA SEURAUKSIA; JA 5) KÄYTTÄÄ DROSOPHILA BUZZATIIIN TUNNETTUA 2ST/2J-INVESTOINTIPOLYMORFISMIA TÄYDENTÄVÄNÄ STRATEGIANA, JOLLA TUTKITAAN SIJOITUKSEEN LIITTYVIEN FENOTYYPPISTEN EROJEN GENEETTISTÄ PERUSTAA. SIKSI HANKKEEMME ON KESKEINEN ASKEL NÄIDEN MUUNNELMIEN TOIMINNALLISTEN VAIKUTUSTEN MÄÄRITTÄMISESSÄ JA TUOTTAA ERITTÄIN KIINNOSTAVIA TULOKSIA ERI ALOILLA PERUSTIETEESTÄ BIOLÄÄKETIETEESEEN, MIKÄ AUTTAA TÄYTTÄMÄÄN YKSILÖLLISEN LÄÄKETIETEEN LUPAUKSET. (Finnish)
18 August 2022
0 references
MINKEJJA L-ASPETTATTIVI INIZJALI TA’ STUDJI TA’ VARJAZZJONI FIL-LIVELL ĠENOMIKU, S’ISSA ĠIE IDENTIFIKAT BISS PROPORZJON ŻGĦIR TAR-RISKJU ĠENETIKU TA’ MARD KOMUNI U KUMPLESS. ĦAFNA XOGĦLIJIET IFFOKAW FUQ IL-POLIMORFIŻMI TA ‘NUCLEOTIDO WIEĦED (SNPS) U, WARA LI JISKOPRU L-AMMONT STRAORDINARJU TA’ VARJAZZJONI STRUTTURALI FIL-ĠENOMI, FUQ VARJANTI FL-GĦADD TA ‘KOPJI (CNVS). L-INVESTIMENTI, MIN-NAĦA L-OĦRA, HUMA TIP TA’ VARJANTI STRUTTURALI LI JAFFETTWAW FRAZZJONI IMPORTANTI TAL-ĠENOMA UMANA U KIENU INVOLUTI F’DIFFERENZI FENOTIPIĊI F’ORGANIŻMI DIFFERENTI. MADANKOLLU, MINĦABBA L-KARATTERISTIĊI TAGĦHOM STESS JAGĦMLU L-ISKOPERTA TAGĦHOM ESTREMAMENT DIFFIĊLI, DAWN ĠEW FTIT STUDJATI. BARRA MINN HEKK, DAN L-AĦĦAR INTWERA LI ĦAFNA INVESTIMENTI ĠEW IĠĠENERATI DIVERSI DRABI FIN-NISEL UMAN, GĦALHEKK L-EFFETTI TIEGĦU MA ĠEWX IDENTIFIKATI MILL-ISTUDJI TRADIZZJONALI TAL-ASSOĊJAZZJONI FIL-LIVELL TAL-ĠENOMA KOLLHA. DAN IL-PROĠETT GĦANDU L-GĦAN LI JIEĦU VANTAĠĠ MILL-AMMONT KBIR TA’ DATA, RIŻORSI U GĦARFIEN DWAR L-INVESTIMENTI ĠĠENERATI MATUL DAWN L-AĦĦAR FTIT SNIN, BIEX IWETTAQ ANALIŻI INTEGRATTIVA TAL-EFFETTI FUNZJONALI POSSIBBLI TIEGĦU F’DIVERSI LIVELLI, PERMEZZ TA’ SERJE TA’ OBJETTIVI INTERRELATATI. L-GĦANIJIET EWLENIN HUMA: (1) JESPANDU S-SETT TA’ INVESTIMENTI KKARATTERIZZATI FID-DETTALL FIL-BNEDMIN BIEX IKOLLHOM VIŻJONI AKTAR KOMPLETA TAL-EFFETTI BIJOLOĠIĊI TAGĦHOM; (2) LI JWETTAQ L-EWWEL STUDJU TAL-ASSOĊJAZZJONI GLOBALI TAL-INVESTIMENTI UMANI B’KARATTRI FENOTIPIĊI U SUXXETTIBILITÀ GĦALL-MARD, PERMEZZ TAL-ĠENOTIPAR TA’ NUMRU KBIR TA’ INVESTIMENTI F’INDIVIDWI KKARATTERIZZATI SEW FIL-LIVELL PENOTIPIC U KAŻIJIET TA’ MILL-INQAS 10 MARD KUMPLESS KOMUNI B’ETJOLOĠIJA U PREDISPOŻIZZJONI ĠENETIKA DIFFERENTI (BĦAD-DIJABETE TAT-TIP 2, INFART MIJOKARDIJAKU, DISTURBI FIL-METABOLIŻMU TAL-LIPIDI, ARTRITE REWMATOJDE, AŻŻMA, OBESITÀ, ALZHEIMER’S, PARKINSON, SKIZOFRENJA U DIPRESSJONI); (3) TINVESTIGA L-EFFETT TA’ L-INVESTIMENTI FUQ IL-PREDISPOŻIZZJONI LI JGĦADDU MINN RIORGANIZZAZZJONIJIET OĦRA, BILLI TUŻA BĦALA MUDELL L-INVESTIMENT LI JIKKAWŻA LI NOFS IL-KAŻIJIET TA’ L-EMOFILJA JKUNU SEVERI; (4) JIKKWANTIFIKA B’MOD PREĊIŻ IL-MUŻAJĊIŻMU U R-RATI TA’ MUTAZZJONI GĦAL INVESTIMENTI MEDJATI MINN REPETIZZJONI INVESTITA F’TESSUTI DIFFERENTI BĦALA L-EWWEL PASS FIL-VALUTAZZJONI TAL-KONSEGWENZI POSSIBBLI TA’ DAN IL-FENOMENU; U (5) JUŻAW IL-POLIMORFIŻMU TA’ INVESTIMENT 2ST/2J MAGĦRUF SEW TA’ DROSOPHILA BUZZATII BĦALA STRATEĠIJA KOMPLEMENTARI BIEX TIĠI INVESTIGATA L-BAŻI ĠENETIKA TAD-DIFFERENZI FENOTIPIĊI ASSOĊJATI MA’ INVESTIMENT. GĦALHEKK, IL-PROĠETT TAGĦNA JIRRAPPREŻENTA PASS EWLIENI FID-DETERMINAZZJONI TAL-IMPATT FUNZJONALI TA’ DAWN IL-VARJANTI, U SE JIPPRODUĊI RIŻULTATI TA’ INTERESS KBIR F’OQSMA DIFFERENTI, MIX-XJENZA BAŻIKA SAL-BIJOMEDIĊINA, U B’HEKK JIKKONTRIBWIXXI GĦAT-TWETTIQ TAL-WEGĦDIET TAL-MEDIĊINA PERSONALIZZATA. (Maltese)
18 August 2022
0 references
NESKATOTIES UZ SĀKOTNĒJĀM PROGNOZĒM PAR VARIĀCIJU PĒTĪJUMIEM GENOMIKAS LĪMENĪ, LĪDZ ŠIM IR KONSTATĒTA TIKAI NELIELA DAĻA NO KOPĒJO UN KOMPLEKSO SLIMĪBU ĢENĒTISKĀ RISKA. LIELĀKĀ DAĻA DARBU IR KONCENTRĒJUŠIES UZ VIENA NUCLEOTIDO (SNP) POLIMORFISMU UN, ATKLĀJOT GENOMU STRUKTURĀLO VARIĀCIJU ĀRKĀRTĒJO DAUDZUMU, UZ KOPIJU SKAITA VARIANTIEM (CNV). NO OTRAS PUSES, IEGULDĪJUMI IR STRUKTURĀLO VARIANTU VEIDS, KAS IETEKMĒ NOZĪMĪGU CILVĒKA GENOMA DAĻU UN IR IESAISTĪTI DAŽĀDU ORGANISMU FENOTIPISKO ATŠĶIRĪBU IZRAISĪŠANĀ. TOMĒR, TĀ KĀ VIŅU PAŠU ĪPAŠĪBAS PADARA TO ATKLĀŠANU ĀRKĀRTĪGI SAREŽĢĪTU, TIE IR MAZ PĒTĪTI. TURKLĀT PĒDĒJĀ LAIKĀ IR PIERĀDĪTS, KA DAUDZI IEGULDĪJUMI IR RADĪTI VAIRĀKAS REIZES CILVĒKU CILTSGRĀMATĀ, TĀPĒC TO IETEKME NAV KONSTATĒTA TRADICIONĀLAJOS ASOCIĀCIJAS PĒTĪJUMOS VISA GENOMA LĪMENĪ. ŠĀ PROJEKTA MĒRĶIS IR IZMANTOT LIELO DATU, RESURSU UN ZINĀŠANU APJOMU PAR PĒDĒJO GADU LAIKĀ RADĪTAJIEM IEGULDĪJUMIEM, LAI, IZMANTOJOT VAIRĀKUS SAVSTARPĒJI SAISTĪTUS MĒRĶUS, VEIKTU TĀ IESPĒJAMĀS FUNKCIONĀLĀS IETEKMES INTEGRĒJOŠU ANALĪZI VAIRĀKOS LĪMEŅOS. GALVENIE MĒRĶI IR ŠĀDI: (1) PAPLAŠINĀT IEGULDĪJUMU KOPUMU, KAS SĪKI RAKSTUROTS CILVĒKOS, LAI GŪTU PILNĪGĀKU PRIEKŠSTATU PAR TO BIOLOĢISKO IETEKMI; (2) VEIKT PIRMO PĒTĪJUMU PAR PASAULES CILVĒKU IEGULDĪJUMU ASOCIĀCIJU AR FENOTIPISKĀM ĪPAŠĪBĀM UN UZŅĒMĪBU PRET SLIMĪBĀM, GENOTIPIZĒJOT LIELU SKAITU IEGULDĪJUMU INDIVĪDIEM, KAS LABI RAKSTUROTI PENOTIPIC LĪMENĪ, UN VISMAZ 10 BIEŽI SASTOPAMU KOMPLEKSU SLIMĪBU AR ATŠĶIRĪGU ĢENĒTISKO ETIOLOĢIJU UN NOSLIECI GADĪJUMIEM (PIEMĒRAM, 2. TIPA CUKURA DIABĒTS, MIOKARDA INFARKTS, LIPĪDU METABOLISMA TRAUCĒJUMI, REIMATOĪDAIS ARTRĪTS, ASTMA, APTAUKOŠANĀS, ALCHEIMERA SLIMĪBA, PARKINSONS, ŠIZOFRĒNIJA UN DEPRESIJA); (3) IZPĒTĪT IEGULDĪJUMU IETEKMI UZ NOSLIECI UZ CITU REORGANIZĀCIJU, PAR PARAUGU IZMANTOJOT IEGULDĪJUMU, KAS IZRAISA PUSI NO HEMOFILIJAS GADĪJUMIEM. (4) PRECĪZI KVANTIFICĒT MOZAĪKAS UN MUTĀCIJU RĀDĪTĀJUS IEGULDĪJUMIEM, KAS SAISTĪTI AR ATKĀRTOJUMIEM, KAS IEGULDĪTI DAŽĀDOS AUDOS, KĀ PIRMO SOLI, LAI NOVĒRTĒTU ŠĪS PARĀDĪBAS IESPĒJAMĀS SEKAS; UN (5) IZMANTOT LABI ZINĀMO DROSOPHILA BUZZATII 2ST/2J INVESTĪCIJU POLIMORFISMU KĀ PAPILDU STRATĒĢIJU, LAI IZPĒTĪTU AR IEGULDĪJUMIEM SAISTĪTO FENOTIPISKO ATŠĶIRĪBU ĢENĒTISKO PAMATU. TĀPĒC MŪSU PROJEKTS IR GALVENAIS SOLIS ŠO VARIANTU FUNKCIONĀLĀS IETEKMES NOTEIKŠANĀ UN RADĪS LIELU INTERESI DAŽĀDĀS JOMĀS, SĀKOT NO FUNDAMENTĀLAJĀM ZINĀTNĒM LĪDZ BIOMEDICĪNAI, TĀDĒJĀDI PALĪDZOT IZPILDĪT PERSONALIZĒTĀS MEDICĪNAS SOLĪJUMUS. (Latvian)
18 August 2022
0 references
NAPRIEK POČIATOČNÝM OČAKÁVANIAM VARIAČNÝCH ŠTÚDIÍ NA GENOMICKEJ ÚROVNI SA DOTERAZ IDENTIFIKOVALA LEN MALÁ ČASŤ GENETICKÉHO RIZIKA BEŽNÝCH A KOMPLEXNÝCH OCHORENÍ. VÄČŠINA DIEL SA ZAMERIAVALA NA POLYMORFIZMY JEDINÉHO NUCLEOTIDO (SNP) A PO OBJAVENÍ MIMORIADNEHO MNOŽSTVA ŠTRUKTURÁLNYCH VARIÁCIÍ V GENÓMOCH AJ NA VARIANTY V POČTE KÓPIÍ (CNV). NA DRUHEJ STRANE INVESTÍCIE SÚ TYPOM ŠTRUKTURÁLNYCH VARIANTOV, KTORÉ OVPLYVŇUJÚ VÝZNAMNÚ ČASŤ ĽUDSKÉHO GENÓMU A SÚ ZAPOJENÉ DO FENOTYPOVÝCH ROZDIELOV V RÔZNYCH ORGANIZMOCH. AVŠAK, PRETOŽE ICH VLASTNÉ CHARAKTERISTIKY ROBIA ICH DETEKCIU MIMORIADNE ŤAŽKÉ, BOLI MÁLO ŠTUDOVANÉ. OKREM TOHO SA NEDÁVNO UKÁZALO, ŽE MNOHO INVESTÍCIÍ SA DO ĽUDSKÉHO RODU VYTVORILO VIACKRÁT, TAKŽE ICH ÚČINKY NEBOLI ZISTENÉ TRADIČNÝMI ŠTÚDIAMI ZDRUŽENIA NA ÚROVNI CELÉHO GENÓMU. CIEĽOM TOHTO PROJEKTU JE VYUŽIŤ VEĽKÉ MNOŽSTVO ÚDAJOV, ZDROJOV A POZNATKOV O INVESTÍCIÁCH, KTORÉ VZNIKLI V POSLEDNÝCH ROKOCH, NA VYKONANIE INTEGRAČNEJ ANALÝZY JEHO MOŽNÝCH FUNKČNÝCH ÚČINKOV NA VIACERÝCH ÚROVNIACH PROSTREDNÍCTVOM SÚBORU VZÁJOMNE PREPOJENÝCH CIEĽOV. HLAVNÝMI CIEĽMI SÚ: (1) ROZŠÍRIŤ SÚBOR INVESTÍCIÍ, KTORÉ SÚ PODROBNE CHARAKTERIZOVANÉ U ĽUDÍ, ABY MALI ÚPLNEJŠIU VÍZIU ICH BIOLOGICKÝCH ÚČINKOV; (2) VYKONAŤ PRVÚ ŠTÚDIU GLOBÁLNEJ ASOCIÁCIE ĽUDSKÝCH INVESTÍCIÍ S FENOTYPOVÝMI POSTAVAMI A NÁCHYLNOSŤOU NA CHOROBY PROSTREDNÍCTVOM GENOTYPIZÁCIE VEĽKÉHO POČTU INVESTÍCIÍ DO JEDNOTLIVCOV DOBRE CHARAKTERIZOVANÝCH NA ÚROVNI PENOTIPIC A PRÍPADOV NAJMENEJ 10 BEŽNÝCH KOMPLEXNÝCH OCHORENÍ S RÔZNOU GENETICKOU ETIOLÓGIOU A PREDISPOZÍCIOU (AKO JE CUKROVKA 2. TYPU, INFARKT MYOKARDU, PORUCHY METABOLIZMU LIPIDOV, REUMATOIDNÁ ARTRITÍDA, ASTMA, OBEZITA, ALZHEIMEROVA CHOROBA, PARKINSON, SCHIZOFRÉNIA A DEPRESIA); (3) PRESKÚMAŤ VPLYV INVESTÍCIÍ NA PREDISPOZÍCIU NA INÉ REORGANIZÁCIE, PRIČOM SA AKO MODEL POUŽIJE INVESTÍCIA, KTORÁ SPÔSOBÍ, ŽE POLOVICA PRÍPADOV HEMOFÍLIE JE ZÁVAŽNÁ; (4) PRESNÉ VYČÍSLENIE MOZAIKY A MIERY MUTÁCIÍ PRE INVESTÍCIE SPROSTREDKOVANÉ OPAKOVANÍM INVESTOVANÍM DO RÔZNYCH TKANÍV AKO PRVÝ KROK PRI POSUDZOVANÍ MOŽNÝCH DÔSLEDKOV TOHTO JAVU; A (5) POUŽIŤ ZNÁMY INVESTIČNÝ POLYMORFIZMUS DROSOPHILA BUZZATII 2ST/2J AKO DOPLNKOVÚ STRATÉGIU NA PRESKÚMANIE GENETICKÉHO ZÁKLADU FENOTYPOVÝCH ROZDIELOV SPOJENÝCH S INVESTÍCIOU. NÁŠ PROJEKT PRETO PREDSTAVUJE KĽÚČOVÝ KROK PRI URČOVANÍ FUNKČNÉHO VPLYVU TÝCHTO VARIANTOV A PRINESIE VÝSLEDKY VEĽKÉHO ZÁUJMU V RÔZNYCH OBLASTIACH, OD ZÁKLADNEJ VEDY AŽ PO BIOMEDICÍNU, ČÍM PRISPEJE K SPLNENIU SĽUBOV PERSONALIZOVANEJ MEDICÍNY. (Slovak)
18 August 2022
0 references
IN AINNEOIN IONCHAIS TOSAIGH NA STAIDÉAR ÉAGSÚLACHTA AR AN LEIBHÉAL GÉANÓMAÍOCH, GO DTÍ SEO NÍOR SAINAITHNÍODH ACH CUID BHEAG DEN RIOSCA GÉINITEACH A BHAINEANN LE GALAIR CHOITIANTA AGUS CHASTA. TÁ AN CHUID IS MÓ DE NA HOIBREACHA DÍRITHE AR PHOLAMORPHISMS DE NUCLEOTIDO AMHÁIN (SNPANNA) AGUS, TAR ÉIS TEACHT AR AN MÉID NEAMHGHNÁCH D’ÉAGSÚLACHT STRUCHTÚRACH SNA GENOMES, AR ATHRAITHEACHA I LÍON NA GCÓIPEANNA (CNVANNA). AR AN TAOBH EILE, IS CINEÁL ATHRAITHEACH STRUCHTÚRACH IAD INFHEISTÍOCHTAÍ A MBÍONN TIONCHAR ACU AR CHODÁN TÁBHACHTACH DE GHÉANÓM AN DUINE AGUS A RAIBH BAINT ACU LE DIFRÍOCHTAÍ FEINITÍOPACHA IN ORGÁNAIGH ÉAGSÚLA. MAR SIN FÉIN, TOISC GO NDÉANANN A SAINTRÉITHE FÉIN A MBRATH THAR A BHEITH DEACAIR, IS BEAG STAIDÉAR A RINNEADH ORTHU. INA THEANNTA SIN, LÉIRÍODH LE DÉANAÍ GUR GINEADH GO LEOR INFHEISTÍOCHTAÍ ARÍS AGUS ARÍS EILE I LÍNE AN DUINE, MAR SIN NÍOR BRAITHEADH A ÉIFEACHTAÍ AG STAIDÉIR CHUMANN TRAIDISIÚNTA AG LEIBHÉAL AN GHÉANÓIM AR FAD. TÁ SÉ MAR AIDHM AG AN TIONSCADAL SEO LEAS A BHAINT AS AN MÉID MÓR SONRAÍ, ACMHAINNÍ AGUS EOLAIS FAOI INFHEISTÍOCHTAÍ A GHINTEAR LE BLIANTA BEAGA ANUAS, CHUN ANAILÍS CHOMHTHÁITE A DHÉANAMH AR NA HÉIFEACHTAÍ FEIDHMIÚLA A D’FHÉADFADH A BHEITH AIGE AR LEIBHÉIL ÉAGSÚLA, TRÍ SHRAITH CUSPÓIRÍ IDIRGHAOLMHARA. IS IAD SEO A LEANAS NA PRÍOMHCHUSPÓIRÍ: (1) AN TACAR INFHEISTÍOCHTAÍ ARB IAD IS SAINAIRÍONNA I NDAOINE A LEATHNÚ CHUN GO MBEIDH FÍS NÍOS IOMLÁINE ACU MAIDIR LENA N-ÉIFEACHTAÍ BITHEOLAÍOCHA; (2) AN CHÉAD STAIDÉAR A DHÉANAMH AR CHUMANN DOMHANDA NA N-INFHEISTÍOCHTAÍ DAONNA LE CARACHTAIR FEINITÍOPACHA AGUS SO-GHABHÁLACHA DO GHALAIR, TRÍ LÍON MÓR INFHEISTÍOCHTAÍ A DHÉANAMH I NDAOINE AONAIR ARB IAD IS SAINAIRÍONNA GO MAITH AR LEIBHÉAL PENOTIPIC AGUS CÁSANNA DE 10 GALAR CASTA COITIANTA AR A LAGHAD LE HÉIEOLAÍOCHT GHÉINITEACH AGUS RÉAMHSHUÍOMH GÉINITEACH ÉAGSÚIL (AMHAIL DIAIBÉITEAS DE CHINEÁL 2, INFARCTION MIÓCAIRDIACH, NEAMHOIRD MEITIBILEACHTA LIPID, AIRTRÍTEAS RÉAMATÓIDEACH, PLÚCHADH, OTRACHT, ALZHEIMER’S, PARKINSON, SCITSIFRÉINE AGUS DÚLAGAR); (3) IMSCRÚDÚ A DHÉANAMH AR ÉIFEACHT INFHEISTÍOCHTAÍ AR THOGRACHT CHUN DUL FAOI ATHEAGRÚCHÁIN EILE, AGUS ÚSÁID Á BAINT MAR SHAMHAIL AS AN INFHEISTÍOCHT IS CÚIS LE LEATH NA GCÁSANNA HAEMAIFILIA A BHEITH DIAN; (4) RÁTAÍ MÓSÁICE AGUS SÓCHÁIN A CHAINNÍOCHTÚ GO CRUINN LE HAGHAIDH INFHEISTÍOCHTAÍ ARNA N-IDIRGHABHÁIL AG ATHRÁNNA A INFHEISTÍTEAR I BHFÍOCHÁIN ÉAGSÚLA MAR CHÉAD CHÉIM CHUN MEASÚNÚ A DHÉANAMH AR IARMHAIRTÍ FÉIDEARTHA AN FHEINIMÉIN SIN; AGUS (5) ÚSÁID A BHAINT AS POLYMORPHISM INFHEISTÍOCHTA 2ST/2J DE DROSOPHILA BUZZATII MAR STRAITÉIS CHOMHLÁNTACH CHUN BONN GÉINITEACH NA NDIFRÍOCHTAÍ FEINITÍOPACHA A BHAINEANN LE HINFHEISTÍOCHT A IMSCRÚDÚ. DÁ BHRÍ SIN, IS CÉIM THÁBHACHTACH É ÁR DTIONSCADAL CHUN TIONCHAR FEIDHMIÚIL NA N-ATHRAITHEACH SIN A CHINNEADH, AGUS CUIRFIDH SÉ TORTHAÍ A BHFUIL SPÉIS MHÓR ACU I RÉIMSÍ ÉAGSÚLA, Ó EOLAÍOCHT BHUNÚSACH GO BITHLEIGHEAS, RUD A CHUIDEOIDH LE GEALLTANAIS AN LEIGHIS PHEARSANTAITHE A CHOMHLÍONADH. (Irish)
18 August 2022
0 references
NAVZDORY PŮVODNÍM OČEKÁVÁNÍM VARIAČNÍCH STUDIÍ NA GENOMICKÉ ÚROVNI BYLA DOSUD ZJIŠTĚNA POUZE MALÁ ČÁST GENETICKÉHO RIZIKA BĚŽNÝCH A KOMPLEXNÍCH ONEMOCNĚNÍ. VĚTŠINA PRACÍ SE ZAMĚŘILA NA POLYMORFISMY JEDNOHO NUCLEOTIDO (SNP) A PO ZJIŠTĚNÍ MIMOŘÁDNÉHO MNOŽSTVÍ STRUKTURNÍCH VARIACÍ GENOMŮ NA VARIANTY V POČTU KOPIÍ (CNV). INVESTICE JSOU NA DRUHÉ STRANĚ TYPEM STRUKTURNÍCH VARIANT, KTERÉ OVLIVŇUJÍ VÝZNAMNÝ ZLOMEK LIDSKÉHO GENOMU A JSOU ZAPOJENY DO FENOTYPOVÝCH ROZDÍLŮ V RŮZNÝCH ORGANISMECH. NICMÉNĚ, PROTOŽE JEJICH VLASTNÍ VLASTNOSTI ČINÍ JEJICH DETEKCI VELMI OBTÍŽNÉ, BYLY MÁLO STUDOVÁNY. KROMĚ TOHO BYLO NEDÁVNO PROKÁZÁNO, ŽE MNOHO INVESTIC BYLO V LIDSKÉ LINII GENEROVÁNO MNOHOKRÁT, TAKŽE JEJICH ÚČINKY NEBYLY ZJIŠTĚNY TRADIČNÍMI ASOCIAČNÍMI STUDIEMI NA ÚROVNI CELÉHO GENOMU. CÍLEM TOHOTO PROJEKTU JE VYUŽÍT VELKÉHO MNOŽSTVÍ DAT, ZDROJŮ A ZNALOSTÍ O INVESTICÍCH VYTVOŘENÝCH V POSLEDNÍCH NĚKOLIKA LETECH A PROVÉST INTEGRATIVNÍ ANALÝZU JEHO MOŽNÝCH FUNKČNÍCH ÚČINKŮ NA VÍCE ÚROVNÍCH, A TO PROSTŘEDNICTVÍM ŘADY VZÁJEMNĚ PROPOJENÝCH CÍLŮ. HLAVNÍMI CÍLI JSOU: (1) ROZŠÍŘIT SOUBOR INVESTIC, KTERÉ JSOU PODROBNĚ CHARAKTERIZOVÁNY U LIDÍ, ABY MĚLY ÚPLNĚJŠÍ PŘEDSTAVU O JEJICH BIOLOGICKÝCH ÚČINCÍCH; (2) PROVÉST PRVNÍ STUDII CELOSVĚTOVÉ ASOCIACE LIDSKÝCH INVESTIC S FENOTYPOVÝMI ZNAKY A NÁCHYLNOSTÍ K CHOROBÁM PROSTŘEDNICTVÍM GENOTYPIZACE VELKÉHO POČTU INVESTIC DO JEDINCŮ DOBŘE CHARAKTERIZOVANÝCH NA ÚROVNI PENOTIPIC A PŘÍPADŮ ALESPOŇ 10 BĚŽNÝCH KOMPLEXNÍCH ONEMOCNĚNÍ S RŮZNOU GENETICKOU ETIOLOGIÍ A PREDISPOZICÍ (JAKO JE DIABETES 2. TYPU, INFARKT MYOKARDU, PORUCHY METABOLISMU LIPIDŮ, REVMATOIDNÍ ARTRITIDA, ASTMA, OBEZITA, ALZHEIMEROVA CHOROBA, PARKINSON, SCHIZOFRENIE A DEPRESE); (3) ZKOUMAT VLIV INVESTIC NA PREDISPOZICI K JINÝM REORGANIZACÍM, PŘIČEMŽ JAKO MODEL SE POUŽIJE INVESTICE, KTERÁ ZPŮSOBUJE, ŽE POLOVINA PŘÍPADŮ HEMOFILIE JE ZÁVAŽNÁ; (4) JAKO PRVNÍ KROK PŘI POSUZOVÁNÍ MOŽNÝCH DŮSLEDKŮ TOHOTO JEVU PŘESNĚ KVANTIFIKUJE MÍRU MOZAICISMU A MUTACÍ U INVESTIC ZPROSTŘEDKOVANÝCH OPAKOVANÝMI INVESTICEMI DO RŮZNÝCH TKÁNÍ; A (5) POUŽÍT ZNÁMÝ 2ST/2J INVESTIČNÍ POLYMORFISMUS DROSOPHILA BUZZATII JAKO DOPLŇKOVOU STRATEGII PRO ZKOUMÁNÍ GENETICKÉHO ZÁKLADU FENOTYPOVÝCH ROZDÍLŮ SPOJENÝCH S INVESTICÍ. PROTO NÁŠ PROJEKT PŘEDSTAVUJE KLÍČOVÝ KROK PŘI URČOVÁNÍ FUNKČNÍHO DOPADU TĚCHTO VARIANT A PŘINESE VÝSLEDKY VELKÉHO ZÁJMU V RŮZNÝCH OBLASTECH, OD ZÁKLADNÍ VĚDY AŽ PO BIOMEDICÍNU, ČÍMŽ PŘISPĚJE K NAPLNĚNÍ SLIBŮ PERSONALIZOVANÉ MEDICÍNY. (Czech)
18 August 2022
0 references
APESAR DAS EXPECTATIVAS INICIAIS DE ESTUDOS DE VARIAÇÃO EM NÍVEL GENÔMICO, ATÉ O MOMENTO APENAS UMA PEQUENA PROPORÇÃO DO RISCO GENÉTICO DE DOENÇAS COMUNS E COMPLEXAS FOI IDENTIFICADA. A MAIORIA DAS OBRAS SE CONCENTROU NOS POLIMORFISMOS DE UM ÚNICO NUCLEOTIDO (SNPS) E, DEPOIS DE DESCOBRIR A EXTRAORDINÁRIA QUANTIDADE DE VARIAÇÃO ESTRUTURAL NOS GENOMAS, EM VARIANTES EM NÚMERO DE CÓPIAS (CNVS). OS INVESTIMENTOS, POR OUTRO LADO, SÃO UM TIPO DE VARIANTES ESTRUTURAIS QUE AFETAM UMA FRAÇÃO IMPORTANTE DO GENOMA HUMANO E ESTÃO ENVOLVIDOS EM DIFERENÇAS FENOTÍPICAS EM DIFERENTES ORGANISMOS. NO ENTANTO, POR SUAS PRÓPRIAS CARACTERÍSTICAS DIFICULTAREM A SUA DETEÇÃO, TÊM SIDO POUCO ESTUDADAS. ALÉM DISSO, FOI RECENTEMENTE DEMONSTRADO QUE MUITOS INVESTIMENTOS FORAM GERADOS VÁRIAS VEZES NA LINHAGEM HUMANA, DE MODO QUE SEUS EFEITOS NÃO FORAM DETETADOS POR ESTUDOS TRADICIONAIS DA ASSOCIAÇÃO AO NÍVEL DE TODO O GENOMA. ESTE PROJETO TEM COMO OBJETIVO APROVEITAR A GRANDE QUANTIDADE DE DADOS, RECURSOS E CONHECIMENTO SOBRE INVESTIMENTOS GERADOS NOS ÚLTIMOS ANOS, PARA REALIZAR UMA ANÁLISE INTEGRATIVA DE SEUS POSSÍVEIS EFEITOS FUNCIONAIS EM VÁRIOS NÍVEIS, ATRAVÉS DE UMA SÉRIE DE OBJETIVOS INTER-RELACIONADOS. OS PRINCIPAIS OBJETIVOS SÃO OS SEGUINTES: (1) AMPLIAR O CONJUNTO DE INVESTIMENTOS CARACTERIZADOS EM PORMENORES EM HUMANOS PARA TER UMA VISÃO MAIS COMPLETA DE SEUS EFEITOS BIOLÓGICOS; (2) REALIZAR O PRIMEIRO ESTUDO DA ASSOCIAÇÃO GLOBAL DE INVESTIMENTOS HUMANOS COM CARATERES FENOTÍPICOS E SUSCETIBILIDADE A DOENÇAS, ATRAVÉS DA GENOTIPAGEM DE UM GRANDE NÚMERO DE INVESTIMENTOS EM INDIVÍDUOS BEM CARACTERIZADOS AO NÍVEL PENOTÍPICO E CASOS DE PELO MENOS 10 DOENÇAS COMPLEXAS COMUNS COM ETIOLOGIA E PREDISPOSIÇÃO GENÉTICAS DIFERENTES (TAIS COMO DIABETES TIPO 2, INFARTO DO MIOCÁRDIO, DISTÚRBIOS DO METABOLISMO LIPÍDICO, ARTRITE REUMATOIDE, ASMA, OBESIDADE, ALZHEIMER, PARKINSON, ESQUIZOFRENIA E DEPRESSÃO); (3) INVESTIGAR O EFEITO DOS INVESTIMENTOS NA PREDISPOSIÇÃO PARA SOFRER OUTRAS REORGANIZAÇÕES, UTILIZANDO COMO MODELO O INVESTIMENTO QUE FAZ COM QUE METADE DOS CASOS DE HEMOFILIA SEJA GRAVE; (4) QUANTIFICAR COM PRECISÃO AS TAXAS DE MOSAICISMO E MUTAÇÕES PARA INVESTIMENTOS MEDIADOS POR REPETIÇÕES INVESTIDAS EM DIFERENTES TECIDOS COMO PRIMEIRO PASSO NA AVALIAÇÃO DAS POSSÍVEIS CONSEQUÊNCIAS DESTE FENÓMENO; E (5) USAR O CONHECIDO POLIMORFISMO DE INVESTIMENTO 2ST/2J DE DROSOPHILA BUZZATII COMO ESTRATÉGIA COMPLEMENTAR PARA INVESTIGAR A BASE GENÉTICA DAS DIFERENÇAS FENOTÍPICAS ASSOCIADAS A UM INVESTIMENTO. PORTANTO, NOSSO PROJETO REPRESENTA UM PASSO FUNDAMENTAL NA DETERMINAÇÃO DO IMPACTO FUNCIONAL DESSAS VARIANTES, E PRODUZIRÁ RESULTADOS DE GRANDE INTERESSE EM DIFERENTES ÁREAS, DESDE A CIÊNCIA BÁSICA ATÉ A BIOMEDICINA, CONTRIBUINDO ASSIM PARA O CUMPRIMENTO DAS PROMESSAS DA MEDICINA PERSONALIZADA. (Portuguese)
18 August 2022
0 references
VAATAMATA ESIALGSETELE OOTUSTELE VARIATSIOONIUURINGUTE KOHTA GENOOMI TASANDIL, ON SENI TUVASTATUD VAID VÄIKE OSA LEVINUD JA KOMPLEKSSETE HAIGUSTE GENEETILISEST RISKIST. ENAMIK TEOSEID ON KESKENDUNUD ÜHE NUCLEOTIDO (SNP) POLÜMORFISMIDELE JA PÄRAST GENOOMIDE ERAKORDSE STRUKTUURIMUUTUSE AVASTAMIST KOOPIATE ARVU VARIANTIDELE. INVESTEERINGUD ON AGA TEATUD TÜÜPI STRUKTUURSED VARIANDID, MIS MÕJUTAVAD OLULIST OSA INIMESE GENOOMIST JA ON SEOTUD ERINEVATE ORGANISMIDE FENOTÜÜBILISTE ERINEVUSTEGA. KUID KUNA NENDE ISEÄRASUSED MUUDAVAD NENDE AVASTAMISE ÄÄRMISELT RASKEKS, ON NEID VÄHE UURITUD. LISAKS ON HILJUTI TÕESTATUD, ET INIMLIINIS ON PALJU INVESTEERINGUID TEHTUD MITU KORDA, SEEGA EI OLE TRADITSIOONILISED ASSOTSIATSIOONIUURINGUD KOGU GENOOMI TASANDIL SELLE MÕJU AVASTANUD. SELLE PROJEKTI EESMÄRK ON KASUTADA ÄRA VIIMASTEL AASTATEL TEHTUD INVESTEERINGUTEGA SEOTUD ANDMETE, RESSURSSIDE JA TEADMISTE SUURT HULKA, ET VIIA LÄBI MITME OMAVAHEL SEOTUD EESMÄRGI KAUDU PROJEKTI VÕIMALIKE FUNKTSIONAALSETE MÕJUDE INTEGREERIV ANALÜÜS MITMEL TASANDIL. PEAMISED EESMÄRGID ON JÄRGMISED: (1) LAIENDADA INIMESTE PUHUL ÜKSIKASJALIKULT KIRJELDATUD INVESTEERINGUTE KOGUMIT, ET SAADA TÄIELIKUM ÜLEVAADE NENDE BIOLOOGILISEST MÕJUST; (2) VIIA LÄBI FENOTÜÜBILISTE TUNNUSTE JA HAIGUSTE SUHTES VASTUVÕTLIKKUSEGA INIMESTE INVESTEERINGUTE ÜLEMAAILMSE ASSOTSIATSIOONI ESIMENE UURING, TEHES SUURE HULGA INVESTEERINGUTE GENOTÜÜBI MÄÄRAMISE PENOTIPIC TASEMEL HÄSTI ISELOOMUSTATUD ISIKUTESSE NING VÄHEMALT KÜMNE ERINEVA GENEETILISE ETIOLOOGIA JA EELSOODUMUSEGA KOMPLEKSHAIGUSE (NT 2. TÜÜPI DIABEET, MÜOKARDIINFARKT, LIPIIDIDE METABOLISMI HÄIRED, REUMATOIDARTRIIT, ASTMA, RASVUMINE, ALZHEIMERI TÕBI, PARKINSON, SKISOFREENIA JA DEPRESSIOON) JUHTUDESSE; (3) UURIDA INVESTEERINGUTE MÕJU EELSOODUMUSELE, ET LÄBIDA MUUD ÜMBERKORRALDUSED, KASUTADES MUDELINA INVESTEERINGUT, MIS PÕHJUSTAB POOLI HEMOFIILIAJUHTUDEST RASKEKS; (4) TÄPSELT KVANTIFITSEERIDA MOSAIIKSUST JA MUTATSIOONIMÄÄRASID INVESTEERINGUTE PUHUL, MIDA VAHENDAVAD ERINEVATESSE KUDEDESSE INVESTEERITUD KORDUSED, ESIMESE SAMMUNA SELLE NÄHTUSE VÕIMALIKE TAGAJÄRGEDE HINDAMISEL; JA (5) KASUTADA DROSOPHILA BUZZATII TUNTUD 2ST/2J INVESTEERINGUTE POLÜMORFISMI TÄIENDAVA STRATEEGIANA, ET UURIDA INVESTEERINGUGA SEOTUD FENOTÜÜBILISTE ERINEVUSTE GENEETILIST ALUST. SEETÕTTU ON MEIE PROJEKT OLULINE SAMM NENDE VARIANTIDE FUNKTSIONAALSE MÕJU KINDLAKSMÄÄRAMISEL JA ANNAB TULEMUSI, MIS PAKUVAD SUURT HUVI ERINEVATES VALDKONDADES, ALATES PÕHITEADUSTEST KUNI BIOMEDITSIININI, AIDATES SEEGA KAASA PERSONAALSE MEDITSIINI LUBADUSTE TÄITMISELE. (Estonian)
18 August 2022
0 references
A GENOMIKUS SZINTŰ VARIÁCIÓS VIZSGÁLATOKRA VONATKOZÓ KEZDETI VÁRAKOZÁSOK ELLENÉRE MINDEDDIG A GYAKORI ÉS ÖSSZETETT BETEGSÉGEK GENETIKAI KOCKÁZATÁNAK CSAK KIS HÁNYADÁT AZONOSÍTOTTÁK. A LEGTÖBB MŰ EGYETLEN NUCLEOTIDO (SNP) POLIMORFIZMUSÁRA ÖSSZPONTOSÍTOTT, ÉS MIUTÁN FELFEDEZTE A GENOMOK RENDKÍVÜLI MÉRTÉKŰ SZERKEZETI VARIÁCIÓJÁT, A PÉLDÁNYSZÁMBAN LÉVŐ VÁLTOZATOKRA (CNV) ÖSSZPONTOSÍTOTT. MÁSRÉSZRŐL A BERUHÁZÁSOK OLYAN SZERKEZETI VARIÁNSOK, AMELYEK AZ EMBERI GENOM JELENTŐS HÁNYADÁT ÉRINTIK, ÉS KÜLÖNBÖZŐ SZERVEZETEK FENOTÍPUSOS KÜLÖNBSÉGEIBEN VETTEK RÉSZT. MIVEL AZONBAN A SAJÁT JELLEMZŐIK RENDKÍVÜL MEGNEHEZÍTIK AZ ÉSZLELÉSÜKET, KEVÉSSÉ TANULMÁNYOZTÁK ŐKET. A KÖZELMÚLTBAN BEBIZONYOSODOTT TOVÁBBÁ, HOGY SZÁMOS BERUHÁZÁST GENERÁLTAK TÖBBSZÖRÖSEN AZ EMBERI ÁGBAN, ÍGY ANNAK HATÁSAIT HAGYOMÁNYOS TÁRSULÁSI TANULMÁNYOK NEM MUTATTÁK KI A TELJES GENOM SZINTJÉN. ENNEK A PROJEKTNEK AZ A CÉLJA, HOGY KIHASZNÁLJA AZ ELMÚLT NÉHÁNY ÉVBEN A BERUHÁZÁSOKKAL KAPCSOLATOS NAGY MENNYISÉGŰ ADATOT, ERŐFORRÁST ÉS TUDÁST, HOGY EGY SOR EGYMÁSSAL ÖSSZEFÜGGŐ CÉLKITŰZÉS RÉVÉN ÁTFOGÓ ELEMZÉST VÉGEZZEN A LEHETSÉGES FUNKCIONÁLIS HATÁSOKRÓL TÖBB SZINTEN. A FŐ CÉLKITŰZÉSEK A KÖVETKEZŐK: (1) TERJESSZÉK KI AZ EMBEREKBEN RÉSZLETESEN JELLEMZETT BERUHÁZÁSOK KÖRÉT, HOGY TELJESEBB KÉPET KAPJANAK AZOK BIOLÓGIAI HATÁSAIRÓL; (2) AZ EMBERI BEFEKTETÉSEK GLOBÁLIS SZÖVETSÉGÉNEK ELSŐ TANULMÁNYA FENOTÍPUSOS KARAKTEREKKEL ÉS BETEGSÉGEKRE VALÓ FOGÉKONYSÁGGAL A PENOTIPIC-SZINTEN JÓL JELLEMZETT EGYÉNEKBE TÖRTÉNŐ NAGYSZÁMÚ BEFEKTETÉS GENOTIPIZÁLÁSA RÉVÉN, VALAMINT LEGALÁBB 10, KÜLÖNBÖZŐ GENETIKAI ETIOLÓGIÁJÚ ÉS HAJLAMÚ, ÖSSZETETT BETEGSÉG (PL. 2-ES TÍPUSÚ CUKORBETEGSÉG, MYOCARDIALIS INFARCTUS, LIPIDANYAGCSERE-RENDELLENESSÉGEK, REUMATOID ARTRITISZ, ASZTMA, ELHÍZÁS, ALZHEIMER’S, PARKINSON, SKIZOFRÉNIA ÉS DEPRESSZIÓ) GENOTIPIZÁLÁSA RÉVÉN; (3) MEGVIZSGÁLJA A BERUHÁZÁSOK HATÁSÁT AZ EGYÉB ÁTSZERVEZÉSEKRE VALÓ HAJLAMRA, MODELLKÉNT FELHASZNÁLVA AZT A BERUHÁZÁST, AMELY A HEMOFÍLIA ESETEK FELÉT SÚLYOSSÁ TESZI; (4) PONTOSAN SZÁMSZERŰSÍTSE A MOZAIKIZMUST ÉS A MUTÁCIÓS RÁTÁKAT A KÜLÖNBÖZŐ SZÖVETEKBE FEKTETETT ISMÉTLÉSEK ÁLTAL KÖZVETÍTETT BERUHÁZÁSOK ESETÉBEN, ELSŐ LÉPÉSKÉNT E JELENSÉG LEHETSÉGES KÖVETKEZMÉNYEINEK FELMÉRÉSÉBEN; ÉS (5) A DROSOPHILA BUZZATII JÓL ISMERT 2ST/2J BEFEKTETÉSI POLIMORFIZMUSÁT KIEGÉSZÍTŐ STRATÉGIAKÉNT HASZNÁLJA A BEFEKTETÉSSEL ÖSSZEFÜGGŐ FENOTÍPUSOS KÜLÖNBSÉGEK GENETIKAI ALAPJAINAK VIZSGÁLATÁRA. EZÉRT PROJEKTÜNK KULCSFONTOSSÁGÚ LÉPÉST JELENT E VÁLTOZATOK FUNKCIONÁLIS HATÁSÁNAK MEGHATÁROZÁSÁBAN, ÉS NAGY ÉRDEKLŐDÉSRE SZÁMOT TARTÓ EREDMÉNYEKET FOG EREDMÉNYEZNI A KÜLÖNBÖZŐ TERÜLETEKEN, AZ ALAPTUDOMÁNYTÓL KEZDVE A BIOMEDICINÁIG, EZÁLTAL HOZZÁJÁRULVA A SZEMÉLYRE SZABOTT ORVOSLÁS ÍGÉRETEINEK TELJESÍTÉSÉHEZ. (Hungarian)
18 August 2022
0 references
ВЪПРЕКИ ПЪРВОНАЧАЛНИТЕ ОЧАКВАНИЯ ОТ ПРОУЧВАНИЯТА НА ВАРИАЦИИТЕ НА ГЕНОМНО НИВО, ДОСЕГА Е УСТАНОВЕНА САМО МАЛКА ЧАСТ ОТ ГЕНЕТИЧНИЯ РИСК ОТ ЧЕСТО СРЕЩАНИ И СЛОЖНИ ЗАБОЛЯВАНИЯ. ПОВЕЧЕТО ПРОИЗВЕДЕНИЯ СА ФОКУСИРАНИ ВЪРХУ ПОЛИМОРФИЗМИТЕ НА ЕДИНИЧЕН NUCLEOTIDO (SNPS) И, СЛЕД ОТКРИВАНЕТО НА ИЗВЪНРЕДНОТО КОЛИЧЕСТВО СТРУКТУРНИ ВАРИАЦИИ В ГЕНОМИТЕ, ВЪРХУ ВАРИАНТИ В БРОЙ КОПИЯ (CNV). ОТ ДРУГА СТРАНА, ИНВЕСТИЦИИТЕ СА ВИД СТРУКТУРНИ ВАРИАНТИ, КОИТО ЗАСЯГАТ ВАЖНА ЧАСТ ОТ ЧОВЕШКИЯ ГЕНОМ И СА УЧАСТВАЛИ ВЪВ ФЕНОТИПНИТЕ РАЗЛИЧИЯ В РАЗЛИЧНИТЕ ОРГАНИЗМИ. ВЪПРЕКИ ТОВА, ТЪЙ КАТО ТЕХНИТЕ СОБСТВЕНИ ХАРАКТЕРИСТИКИ ПРАВЯТ ОТКРИВАНЕТО ИМ ИЗКЛЮЧИТЕЛНО ТРУДНО, ТЕ СА МАЛКО ПРОУЧЕНИ. ОСВЕН ТОВА НАСКОРО БЕШЕ ДОКАЗАНО, ЧЕ МНОГО ИНВЕСТИЦИИ СА БИЛИ ГЕНЕРИРАНИ МНОГОКРАТНО В ЧОВЕШКОТО РОДОСЛОВИЕ, ТАКА ЧЕ ЕФЕКТИТЕ ОТ ТЯХ НЕ СА БИЛИ ОТКРИТИ ОТ ТРАДИЦИОННИТЕ ПРОУЧВАНИЯ НА АСОЦИАЦИЯТА НА НИВОТО НА ЦЕЛИЯ ГЕНОМ. ТОЗИ ПРОЕКТ ИМА ЗА ЦЕЛ ДА СЕ ВЪЗПОЛЗВА ОТ ГОЛЯМОТО КОЛИЧЕСТВО ДАННИ, РЕСУРСИ И ЗНАНИЯ ЗА ИНВЕСТИЦИИТЕ, ГЕНЕРИРАНИ ПРЕЗ ПОСЛЕДНИТЕ НЯКОЛКО ГОДИНИ, ЗА ДА ИЗВЪРШИ ИНТЕГРАТИВЕН АНАЛИЗ НА ВЪЗМОЖНИТЕ МУ ФУНКЦИОНАЛНИ ЕФЕКТИ НА РАЗЛИЧНИ РАВНИЩА ЧРЕЗ ПОРЕДИЦА ОТ ВЗАИМОСВЪРЗАНИ ЦЕЛИ. ОСНОВНИТЕ ЦЕЛИ СА: (1) РАЗШИРЯВАНЕ НА НАБОРА ОТ ИНВЕСТИЦИИ, ХАРАКТЕРИЗИРАЩИ СЕ ПОДРОБНО ПРИ ХОРАТА, ЗА ДА ИМА ПО-ПЪЛНА ВИЗИЯ ЗА ТЕХНИТЕ БИОЛОГИЧНИ ЕФЕКТИ; (2) ДА ИЗВЪРШИ ПЪРВОТО ПРОУЧВАНЕ НА СВЕТОВНАТА АСОЦИАЦИЯ НА ЧОВЕШКИТЕ ИНВЕСТИЦИИ С ФЕНОТИПНИ ХАРАКТЕРИ И ПОДАТЛИВОСТ КЪМ ЗАБОЛЯВАНИЯ, ЧРЕЗ ГЕНОТИПИЗИРАНЕ НА ГОЛЯМ БРОЙ ИНВЕСТИЦИИ В ИНДИВИДИ, ДОБРЕ ХАРАКТЕРИЗИРАЩИ СЕ НА НИВО PENOTIPIC И СЛУЧАИ НА НАЙ-МАЛКО 10 ЧЕСТО СРЕЩАНИ КОМПЛЕКСНИ ЗАБОЛЯВАНИЯ С РАЗЛИЧНА ГЕНЕТИЧНА ЕТИОЛОГИЯ И ПРЕДРАЗПОЛОЖЕНОСТ (КАТО ДИАБЕТ ТИП 2, ИНФАРКТ НА МИОКАРДА, НАРУШЕНИЯ НА ЛИПИДНИЯ МЕТАБОЛИЗЪМ, РЕВМАТОИДЕН АРТРИТ, АСТМА, ЗАТЛЪСТЯВАНЕ, АЛЦХАЙМЕР, ПАРКИНСОН, ШИЗОФРЕНИЯ И ДЕПРЕСИЯ); (3) ИЗСЛЕДВА ВЪЗДЕЙСТВИЕТО НА ИНВЕСТИЦИИТЕ ВЪРХУ ПРЕДРАЗПОЛОЖЕНИЕТО КЪМ ДРУГИ РЕОРГАНИЗАЦИИ, КАТО ИЗПОЛЗВА КАТО МОДЕЛ ИНВЕСТИЦИЯТА, КОЯТО ПРИЧИНЯВА ПОЛОВИНАТА ОТ СЛУЧАИТЕ НА ХЕМОФИЛИЯ ДО ТЕЖКИ; (4) ТОЧНО КОЛИЧЕСТВЕНО ОПРЕДЕЛЯНЕ НА НИВАТА НА МОЗАЙКА И МУТАЦИЯ ЗА ИНВЕСТИЦИИ, МЕДИИРАНИ ОТ ПОВТОРЕНИЯ, ИНВЕСТИРАНИ В РАЗЛИЧНИ ТЪКАНИ, КАТО ПЪРВА СТЪПКА В ОЦЕНКАТА НА ВЪЗМОЖНИТЕ ПОСЛЕДИЦИ ОТ ТОВА ЯВЛЕНИЕ; И (5) ДА ИЗПОЛЗВАТ ДОБРЕ ПОЗНАТИЯ 2ST/2J ИНВЕСТИЦИОНЕН ПОЛИМОРФИЗЪМ НА DROSOPHILA BUZZATII КАТО ДОПЪЛВАЩА СТРАТЕГИЯ ЗА ИЗСЛЕДВАНЕ НА ГЕНЕТИЧНАТА ОСНОВА НА ФЕНОТИПНИТЕ РАЗЛИКИ, СВЪРЗАНИ С ДАДЕНА ИНВЕСТИЦИЯ. ЕТО ЗАЩО НАШИЯТ ПРОЕКТ ПРЕДСТАВЛЯВА КЛЮЧОВА СТЪПКА В ОПРЕДЕЛЯНЕТО НА ФУНКЦИОНАЛНОТО ВЪЗДЕЙСТВИЕ НА ТЕЗИ ВАРИАНТИ И ЩЕ ДОВЕДЕ ДО РЕЗУЛТАТИ ОТ ГОЛЯМ ИНТЕРЕС В РАЗЛИЧНИ ОБЛАСТИ — ОТ ОСНОВНАТА НАУКА ДО БИОМЕДИЦИНАТА, КАТО ПО ТОЗИ НАЧИН ЩЕ ДОПРИНЕСЕ ЗА ИЗПЪЛНЕНИЕТО НА ОБЕЩАНИЯТА НА ПЕРСОНАЛИЗИРАНАТА МЕДИЦИНА. (Bulgarian)
18 August 2022
0 references
NEPAISANT PRADINIŲ LŪKESČIŲ DĖL VARIACIJOS TYRIMŲ GENOMINIU LYGIU, IKI ŠIOL NUSTATYTA TIK NEDIDELĖ BENDRŲ IR SUDĖTINGŲ LIGŲ GENETINĖS RIZIKOS DALIS. DAUGUMA KŪRINIŲ BUVO SKIRTI VIENO NUCLEOTIDO (SNP) POLIMORFIZMUI IR, ATRADUS NEPAPRASTĄ STRUKTŪRINIŲ GENOMŲ VARIACIJOS KIEKĮ, KOPIJŲ SKAIČIAUS VARIANTAMS (CNV). KITA VERTUS, INVESTICIJOS YRA TAM TIKRI STRUKTŪRINIAI VARIANTAI, TURINTYS ĮTAKOS DIDELEI ŽMOGAUS GENOMO DALIAI IR SUSIJĘ SU FENOTIPINIAIS SKIRTINGŲ ORGANIZMŲ SKIRTUMAIS. TAČIAU, NES JŲ PAČIŲ CHARAKTERISTIKOS DARO JŲ APTIKIMĄ LABAI SUNKU, JIE BUVO MAŽAI IŠTIRTAS. BE TO, NESENIAI BUVO ĮRODYTA, KAD DAUG INVESTICIJŲ ŽMOGAUS GIMINYSTĖJE BUVO DAUG KARTŲ, TODĖL JOS POVEIKIS NEBUVO APTIKTAS TRADICINIUOSE ASOCIACIJOS TYRIMUOSE VISO GENOMO LYGMENIU. ŠIUO PROJEKTU SIEKIAMA PASINAUDOTI DIDELIU DUOMENŲ KIEKIU, IŠTEKLIAIS IR ŽINIOMIS APIE INVESTICIJAS, SUKAUPTAIS PER PASTARUOSIUS KELERIUS METUS, SIEKIANT ATLIKTI INTEGRUOTĄ GALIMO FUNKCINIO POVEIKIO ANALIZĘ ĮVAIRIAIS LYGMENIMIS, ĮGYVENDINANT ĮVAIRIUS TARPUSAVYJE SUSIJUSIUS TIKSLUS. PAGRINDINIAI TIKSLAI YRA ŠIE: (1) IŠPLĖSTI INVESTICIJŲ, IŠSAMIAI APIBŪDINAMŲ ŽMONĖMS, RINKINĮ, KAD BŪTŲ GALIMA SUSIDARYTI IŠSAMESNĘ VIZIJĄ APIE JŲ BIOLOGINĮ POVEIKĮ; (2) ATLIKTI PIRMĄJĮ PASAULINĖS ASOCIACIJOS ŽMOGAUS INVESTICIJŲ SU FENOTIPINIAIS PERSONAŽAIS IR JAUTRUMU LIGOMS TYRIMĄ, GENOTIPUOJANT DAUG INVESTICIJŲ Į ASMENIS, GERAI APIBŪDINTUS PENOTIPIC LYGIU, IR MAŽIAUSIAI 10 BENDRŲ SUDĖTINGŲ LIGŲ, TURINČIŲ SKIRTINGĄ GENETINĘ ETIOLOGIJĄ IR POLINKĮ (PVZ., II TIPO DIABETAS, MIOKARDO INFARKTAS, LIPIDŲ APYKAITOS SUTRIKIMAI, REUMATOIDINIS ARTRITAS, ASTMA, NUTUKIMAS, ALZHEIMERIO S, PARKINSONAS, ŠIZOFRENIJA IR DEPRESIJA); (3) IŠTIRTI INVESTICIJŲ POVEIKĮ POLINKIUI Į KITAS REORGANIZACIJAS, KAIP MODELĮ NAUDOJANT INVESTICIJAS, DĖL KURIŲ PUSĖ HEMOFILIJOS ATVEJŲ YRA SUNKI; (4) TIKSLIAI KIEKYBIŠKAI ĮVERTINTI MOZAIKĄ IR MOZAIKOS LYGĮ INVESTICIJOMS, KURIAS SKATINA Į SKIRTINGUS AUDINIUS INVESTUOJAMI PAKARTOTINIAI VEIKSMAI, KAIP PIRMAS ŽINGSNIS VERTINANT GALIMAS ŠIO REIŠKINIO PASEKMES; IR (5) NAUDOTI GERAI ŽINOMĄ 2ST/2J INVESTICINĮ DROSOPHILA BUZZATII POLIMORFIZMĄ KAIP PAPILDOMĄ STRATEGIJĄ FENOTIPINIŲ SKIRTUMŲ, SUSIJUSIŲ SU INVESTICIJA, GENETINIAM PAGRINDUI IŠTIRTI. TODĖL MŪSŲ PROJEKTAS YRA PAGRINDINIS ŽINGSNIS NUSTATANT ŠIŲ VARIANTŲ FUNKCINĮ POVEIKĮ IR DUOS DIDELIO SUSIDOMĖJIMO ĮVAIRIOSE SRITYSE REZULTATUS, NUO PAGRINDINIO MOKSLO IKI BIOMEDICINOS, TOKIU BŪDU PRISIDEDANT PRIE INDIVIDUALIZUOTOS MEDICINOS PAŽADŲ ĮVYKDYMO. (Lithuanian)
18 August 2022
0 references
UNATOČ POČETNIM OČEKIVANJIMA STUDIJA VARIJACIJA NA GENOMSKOJ RAZINI, DOSAD JE IDENTIFICIRAN SAMO MALI UDIO GENETSKOG RIZIKA OD UOBIČAJENIH I SLOŽENIH BOLESTI. VEĆINA RADOVA USMJERENA JE NA POLIMORFIZME JEDNOG NUCLEOTIDO (SNP-OVA) I, NAKON OTKRIVANJA IZVANREDNE KOLIČINE STRUKTURNIH VARIJACIJA U GENOMIMA, NA VARIJANTE U BROJU PRIMJERAKA (CNV). S DRUGE STRANE, ULAGANJA SU VRSTA STRUKTURNIH VARIJANTI KOJE UTJEČU NA VAŽAN DIO LJUDSKOG GENOMA I UKLJUČENE SU U FENOTIPSKE RAZLIKE U RAZLIČITIM ORGANIZMIMA. MEĐUTIM, BUDUĆI DA NJIHOVA VLASTITA OBILJEŽJA ČINE NJIHOVO OTKRIVANJE IZNIMNO TEŠKIM, MALO IH JE PROUČAVALO. OSIM TOGA, NEDAVNO JE DOKAZANO DA SU MNOGA ULAGANJA GENERIRANA VIŠE PUTA U LJUDSKOM LOZU, TAKO DA NJIHOVI UČINCI NISU OTKRIVENI TRADICIONALNIM STUDIJAMA UDRUGE NA RAZINI CIJELOG GENOMA. CILJ JE OVOG PROJEKTA ISKORISTITI VELIKU KOLIČINU PODATAKA, RESURSA I ZNANJA O ULAGANJIMA OSTVARENIMA TIJEKOM PROTEKLIH NEKOLIKO GODINA, PROVESTI INTEGRATIVNU ANALIZU NJEGOVIH MOGUĆIH FUNKCIONALNIH UČINAKA NA VIŠE RAZINA, KROZ NIZ MEĐUSOBNO POVEZANIH CILJEVA. GLAVNI SU CILJEVI SLJEDEĆI: (1) PROŠIRITI SKUP ULAGANJA KOJA SU DETALJNO OPISANA KOD LJUDI KAKO BI IMALI POTPUNIJU VIZIJU NJIHOVIH BIOLOŠKIH UČINAKA; (2) PROVESTI PRVU STUDIJU GLOBALNE UDRUGE LJUDSKIH ULAGANJA S FENOTIPSKIM LIKOVIMA I OSJETLJIVOŠĆU NA BOLESTI, KROZ GENOTIPIZACIJU VELIKOG BROJA ULAGANJA U POJEDINCE KOJI SU DOBRO KARAKTERIZIRANI NA RAZINI PENOTIPIC-A I SLUČAJEVA NAJMANJE 10 UOBIČAJENIH SLOŽENIH BOLESTI S RAZLIČITOM GENETSKOM ETIOLOGIJOM I PREDISPOZICIJOM (KAO ŠTO SU DIJABETES TIPA 2, INFARKT MIOKARDA, POREMEĆAJI METABOLIZMA LIPIDA, REUMATOIDNI ARTRITIS, ASTMA, PRETILOST, ALZHEIMEROVA BOLEST, PARKINSON, SHIZOFRENIJA I DEPRESIJA); (3) ISTRAŽITI UČINAK ULAGANJA NA PREDISPOZICIJU ZA DRUGE REORGANIZACIJE, KORISTEĆI KAO MODEL ULAGANJE KOJE UZROKUJE TEŠKA POLOVINA SLUČAJEVA HEMOFILIJE; (4) TOČNO KVANTIFICIRATI MOZAIKIZAM I STOPE MUTACIJE ZA ULAGANJA POSREDOVANA PONAVLJANJIMA ULOŽENIMA U RAZLIČITA TKIVA KAO PRVI KORAK U PROCJENI MOGUĆIH POSLJEDICA OVE POJAVE; I (5) KORISTITI POZNATI 2ST/2J INVESTICIJSKI POLIMORFIZAM DROSOPHILA BUZZATII KAO KOMPLEMENTARNU STRATEGIJU ZA ISTRAŽIVANJE GENETSKE OSNOVE FENOTIPSKIH RAZLIKA POVEZANIH S ULAGANJEM. STOGA NAŠ PROJEKT PREDSTAVLJA KLJUČNI KORAK U ODREĐIVANJU FUNKCIONALNOG UTJECAJA OVIH VARIJANTI, TE ĆE PROIZVESTI REZULTATE OD VELIKOG INTERESA U RAZLIČITIM PODRUČJIMA, OD OSNOVNE ZNANOSTI DO BIOMEDICINE, DOPRINOSEĆI TIME ISPUNJAVANJU OBEĆANJA PERSONALIZIRANE MEDICINE. (Croatian)
18 August 2022
0 references
TROTS DE URSPRUNGLIGA FÖRVÄNTNINGARNA PÅ VARIATIONSSTUDIER PÅ GENOMNIVÅ HAR HITTILLS ENDAST EN LITEN DEL AV DEN GENETISKA RISKEN FÖR VANLIGA OCH KOMPLEXA SJUKDOMAR IDENTIFIERATS. DE FLESTA VERK HAR FOKUSERAT PÅ POLYMORFISMERNA HOS EN ENDA NUCLEOTIDO (SNP) OCH, EFTER ATT HA UPPTÄCKT DEN EXTRAORDINÄRA MÄNGDEN STRUKTURELLA VARIATIONER I GENOMEN, PÅ VARIANTER I ANTAL KOPIOR (CNV). INVESTERINGAR, Å ANDRA SIDAN, ÄR EN TYP AV STRUKTURELLA VARIANTER SOM PÅVERKAR EN VIKTIG DEL AV DET MÄNSKLIGA GENOMET OCH HAR VARIT INBLANDADE I FENOTYPISKA SKILLNADER I OLIKA ORGANISMER. MEN EFTERSOM DERAS EGNA EGENSKAPER GÖR DERAS UPPTÄCKT EXTREMT SVÅR, HAR DE INTE STUDERATS SÄRSKILT MYCKET. DESSUTOM HAR DET NYLIGEN VISAT SIG ATT MÅNGA INVESTERINGAR HAR GENERERATS FLERA GÅNGER I DEN MÄNSKLIGA HÄRSTAMNINGEN, SÅ DESS EFFEKTER HAR INTE UPPTÄCKTS AV TRADITIONELLA ASSOCIATION STUDIER PÅ NIVÅN FÖR HELA GENOMET. DETTA PROJEKT SYFTAR TILL ATT DRA NYTTA AV DEN STORA MÄNGD DATA, RESURSER OCH KUNSKAP OM INVESTERINGAR SOM GENERERATS UNDER DE SENASTE ÅREN, FÖR ATT GENOMFÖRA EN INTEGRERAD ANALYS AV DESS MÖJLIGA FUNKTIONELLA EFFEKTER PÅ FLERA NIVÅER, GENOM EN RAD INBÖRDES RELATERADE MÅL. HUVUDMÅLEN ÄR FÖLJANDE: (1) UTVIDGA DEN UPPSÄTTNING INVESTERINGAR SOM KARAKTERISERAS I DETALJ HOS MÄNNISKOR FÖR ATT FÅ EN MER FULLSTÄNDIG BILD AV DERAS BIOLOGISKA EFFEKTER. (2) ATT GENOMFÖRA DEN FÖRSTA STUDIEN AV DEN GLOBALA SAMMANSLUTNINGEN AV MÄNSKLIGA INVESTERINGAR MED FENOTYPISKA TECKEN OCH KÄNSLIGHET FÖR SJUKDOMAR, GENOM GENOTYPNING AV ETT STORT ANTAL INVESTERINGAR I INDIVIDER SOM ÄR VÄL KARAKTÄRISERADE PÅ PENOTIPIC-NIVÅ OCH FALL AV MINST 10 VANLIGA KOMPLEXA SJUKDOMAR MED OLIKA GENETISK ETIOLOGI OCH PREDISPOSITION (T.EX. TYP 2-DIABETES, HJÄRTINFARKT, LIPIDMETABOLISM, REUMATOID ARTRIT, ASTMA, FETMA, ALZHEIMERS, PARKINSON, SCHIZOFRENI OCH DEPRESSION). (3) UNDERSÖKA INVESTERINGARNAS INVERKAN PÅ PREDISPOSITIONEN FÖR ATT GENOMGÅ ANDRA OMORGANISATIONER, MED DEN INVESTERING SOM ORSAKAR HÄLFTEN AV FALLEN AV HEMOFILI SOM FÖREBILD, (4) KORREKT KVANTIFIERA MOSAIKISM OCH MUTATIONSGRAD FÖR INVESTERINGAR SOM FÖRMEDLAS AV UPPREPADE INVESTERINGAR I OLIKA VÄVNADER SOM ETT FÖRSTA STEG FÖR ATT BEDÖMA DE MÖJLIGA KONSEKVENSERNA AV DETTA FENOMEN, OCH (5) ANVÄNDA DEN VÄLKÄNDA 2ST/2J INVESTERINGSPOLYMORFISMEN HOS DROSOPHILA BUZZATII SOM EN KOMPLETTERANDE STRATEGI FÖR ATT UNDERSÖKA DEN GENETISKA GRUNDEN FÖR FENOTYPISKA SKILLNADER I SAMBAND MED EN INVESTERING. DÄRFÖR ÄR VÅRT PROJEKT ETT VIKTIGT STEG FÖR ATT BESTÄMMA DEN FUNKTIONELLA EFFEKTEN AV DESSA VARIANTER, OCH KOMMER ATT GE RESULTAT AV STORT INTRESSE INOM OLIKA OMRÅDEN, FRÅN GRUNDVETENSKAP TILL BIOMEDICIN, VILKET BIDRAR TILL ATT UPPFYLLA LÖFTENA OM INDIVIDANPASSAD MEDICIN. (Swedish)
18 August 2022
0 references
ÎN CIUDA AȘTEPTĂRILOR INIȚIALE ALE STUDIILOR DE VARIAȚIE LA NIVEL GENOMIC, PÂNĂ ÎN PREZENT A FOST IDENTIFICATĂ DOAR O MICĂ PARTE DIN RISCUL GENETIC AL BOLILOR COMUNE ȘI COMPLEXE. CELE MAI MULTE LUCRĂRI S-AU AXAT PE POLIMORFISMELE UNUI SINGUR NUCLEOTIDO (SNP) ȘI, DUPĂ DESCOPERIREA CANTITĂȚII EXTRAORDINARE DE VARIAȚIE STRUCTURALĂ A GENOMULUI, PE VARIANTE ÎN NUMĂR DE COPII (CNV). INVESTIȚIILE, PE DE ALTĂ PARTE, SUNT UN TIP DE VARIANTE STRUCTURALE CARE AFECTEAZĂ O PARTE IMPORTANTĂ A GENOMULUI UMAN ȘI CARE AU FOST IMPLICATE ÎN DIFERENȚE FENOTIPICE ÎNTRE DIFERITE ORGANISME. CU TOATE ACESTEA, DEOARECE PROPRIILE LOR CARACTERISTICI FAC CA DETECTAREA LOR SĂ FIE EXTREM DE DIFICILĂ, ELE AU FOST PUȚIN STUDIATE. ÎN PLUS, S-A DEMONSTRAT RECENT CĂ MULTE INVESTIȚII AU FOST GENERATE DE MAI MULTE ORI ÎN DESCENDENȚA UMANĂ, ASTFEL ÎNCÂT EFECTELE SALE NU AU FOST DETECTATE DE STUDIILE TRADIȚIONALE DE ASOCIERE LA NIVELUL ÎNTREGULUI GENOM. ACEST PROIECT ÎȘI PROPUNE SĂ PROFITE DE VOLUMUL MARE DE DATE, RESURSE ȘI CUNOȘTINȚE DESPRE INVESTIȚIILE GENERATE ÎN ULTIMII ANI, PENTRU A REALIZA O ANALIZĂ INTEGRATIVĂ A POSIBILELOR SALE EFECTE FUNCȚIONALE LA MAI MULTE NIVELURI, PRINTR-O SERIE DE OBIECTIVE INTERCONECTATE. PRINCIPALELE OBIECTIVE SUNT: (1) SĂ EXTINDĂ SETUL DE INVESTIȚII CARACTERIZATE ÎN DETALIU LA OM PENTRU A AVEA O VIZIUNE MAI COMPLETĂ ASUPRA EFECTELOR LOR BIOLOGICE; (2) SĂ EFECTUEZE PRIMUL STUDIU AL ASOCIAȚIEI GLOBALE A INVESTIȚIILOR UMANE CU CARACTERE FENOTIPICE ȘI SUSCEPTIBILITATE LA BOLI, PRIN GENOTIPAREA UNUI NUMĂR MARE DE INVESTIȚII ÎN PERSOANE BINE CARACTERIZATE LA NIVELUL PENOTIPIC ȘI CAZURI DE CEL PUȚIN 10 BOLI COMPLEXE COMUNE CU DIFERITE ETIOLOGIE GENETICĂ ȘI PREDISPOZIȚIE (CUM AR FI DIABETUL DE TIP 2, INFARCTUL MIOCARDIC, TULBURĂRILE METABOLISMULUI LIPIDIC, ARTRITA REUMATOIDĂ, ASTMUL, OBEZITATEA, ALZHEIMER’S, PARKINSON, SCHIZOFRENIA ȘI DEPRESIA); (3) INVESTIGHEAZĂ EFECTUL INVESTIȚIILOR ASUPRA PREDISPOZIȚIEI DE A FI SUPUSE ALTOR REORGANIZĂRI, FOLOSIND CA MODEL INVESTIȚIA CARE PROVOACĂ JUMĂTATE DIN CAZURILE DE HEMOFILIE LA SEVERITATE; (4) CUANTIFICAREA EXACTĂ A MOSAICISMULUI ȘI A RATELOR MUTAȚIILOR PENTRU INVESTIȚIILE MEDIATE PRIN REPETĂRI INVESTITE ÎN DIFERITE ȚESUTURI CA UN PRIM PAS ÎN EVALUAREA POSIBILELOR CONSECINȚE ALE ACESTUI FENOMEN; ȘI (5) UTILIZAREA BINE-CUNOSCUTULUI POLIMORFISM INVESTIȚIONAL 2ST/2J AL DROSOPHILA BUZZATII CA O STRATEGIE COMPLEMENTARĂ PENTRU A INVESTIGA BAZA GENETICĂ A DIFERENȚELOR FENOTIPICE ASOCIATE UNEI INVESTIȚII. PRIN URMARE, PROIECTUL NOSTRU REPREZINTĂ UN PAS CHEIE ÎN DETERMINAREA IMPACTULUI FUNCȚIONAL AL ACESTOR VARIANTE ȘI VA PRODUCE REZULTATE DE MARE INTERES ÎN DIFERITE DOMENII, DE LA ȘTIINȚA DE BAZĂ LA BIOMEDICINĂ, CONTRIBUIND ASTFEL LA ÎNDEPLINIREA PROMISIUNILOR DE MEDICINĂ PERSONALIZATĂ. (Romanian)
18 August 2022
0 references
KLJUB ZAČETNIM PRIČAKOVANJEM ŠTUDIJ VARIACIJ NA GENOMSKI RAVNI JE BIL DO ZDAJ UGOTOVLJEN LE MAJHEN DELEŽ GENETSKEGA TVEGANJA ZA POGOSTE IN KOMPLEKSNE BOLEZNI. VEČINA DEL SE JE OSREDOTOČILA NA POLIMORFIZME ENEGA SAMEGA NUCLEOTIDO (SNP) IN, PO ODKRITJU IZREDNE KOLIČINE STRUKTURNIH VARIACIJ V GENOMIH, NA RAZLIČICE V ŠTEVILU KOPIJ (CNV). NALOŽBE PA SO TIP STRUKTURNIH VARIANT, KI VPLIVAJO NA POMEMBEN DEL ČLOVEŠKEGA GENOMA IN SO BILE VKLJUČENE V FENOTIPSKE RAZLIKE V RAZLIČNIH ORGANIZMIH. VENDAR, KER NJIHOVE LASTNE ZNAČILNOSTI ZELO OTEŽUJEJO NJIHOVO ODKRIVANJE, SO BILI MALO RAZISKANI. POLEG TEGA JE BILO PRED KRATKIM DOKAZANO, DA SO BILE ŠTEVILNE NALOŽBE VEČKRAT USTVARJENE V ČLOVEŠKEM RODU, ZATO TRADICIONALNE ŠTUDIJE ZDRUŽENJA NA RAVNI CELOTNEGA GENOMA NISO ODKRILE NJEGOVIH UČINKOV. NAMEN TEGA PROJEKTA JE IZKORISTITI VELIKO KOLIČINO PODATKOV, VIROV IN ZNANJA O NALOŽBAH, USTVARJENIH V ZADNJIH NEKAJ LETIH, TER IZVESTI CELOSTNO ANALIZO NJEGOVIH MOŽNIH FUNKCIONALNIH UČINKOV NA VEČ RAVNEH, IN SICER Z VRSTO MEDSEBOJNO POVEZANIH CILJEV. GLAVNI CILJI SO: (1) RAZŠIRITI SKLOP NALOŽB, KI SO PODROBNO OPREDELJENE PRI LJUDEH, DA BI IMELI CELOVITEJŠI POGLED NA NJIHOVE BIOLOŠKE UČINKE; (2) IZVESTI PRVO ŠTUDIJO GLOBALNEGA ZDRUŽENJA ČLOVEŠKIH NALOŽB S FENOTIPIČNIMI ZNAKI IN DOVZETNOSTJO ZA BOLEZNI Z GENOTIPIZACIJO VELIKEGA ŠTEVILA NALOŽB V POSAMEZNIKE, KI SO DOBRO OPREDELJENI NA RAVNI PENOTIPIC, IN PRIMEROV VSAJ 10 POGOSTIH KOMPLEKSNIH BOLEZNI Z RAZLIČNO GENETSKO ETIOLOGIJO IN PREDISPOZICIJO (KOT SO SLADKORNA BOLEZEN TIPA 2, MIOKARDNI INFARKT, MOTNJE PRESNOVE LIPIDOV, REVMATOIDNI ARTRITIS, ASTMA, DEBELOST, ALZHEIMERJEVA BOLEZEN, PARKINSON, SHIZOFRENIJA IN DEPRESIJA); (3) RAZISKATI UČINEK NALOŽB NA NAGNJENOST K DRUGIM REORGANIZACIJAM, PRI ČEMER SE KOT MODEL UPORABI NALOŽBA, KI POVZROČI HUDO POLOVICO PRIMEROV HEMOFILIJE; (4) NATANČNO KOLIČINSKO OPREDELITE MOZAIKIZEM IN STOPNJE MUTACIJ ZA NALOŽBE, KI JIH POSREDUJEJO PONAVLJAJOČE SE NALOŽBE V RAZLIČNA TKIVA, KOT PRVI KORAK PRI OCENJEVANJU MOŽNIH POSLEDIC TEGA POJAVA; IN (5) UPORABA DOBRO ZNANEGA NALOŽBENEGA POLIMORFIZMA 2ST/2J DROSOPHILA BUZZATII KOT DOPOLNILNE STRATEGIJE ZA RAZISKOVANJE GENETSKE OSNOVE FENOTIPSKIH RAZLIK, POVEZANIH Z NALOŽBO. ZATO JE NAŠ PROJEKT KLJUČNI KORAK PRI DOLOČANJU FUNKCIONALNEGA UČINKA TEH RAZLIČIC IN BO PRINESEL REZULTATE VELIKEGA ZANIMANJA NA RAZLIČNIH PODROČJIH, OD OSNOVNE ZNANOSTI DO BIOMEDICINE, S ČIMER BO PRISPEVAL K IZPOLNJEVANJU OBLJUB PERSONALIZIRANE MEDICINE. (Slovenian)
18 August 2022
0 references
POMIMO WSTĘPNYCH OCZEKIWAŃ DOTYCZĄCYCH BADAŃ NAD ZMIANAMI NA POZIOMIE GENOMU, DO TEJ PORY ZIDENTYFIKOWANO JEDYNIE NIEWIELKĄ CZĘŚĆ RYZYKA GENETYCZNEGO WYSTĘPOWANIA CHORÓB POWSZECHNYCH I ZŁOŻONYCH. WIĘKSZOŚĆ PRAC SKUPIAŁA SIĘ NA POLIMORFIZMACH POJEDYNCZEGO NUCLEOTIDO (SNP) ORAZ, PO ODKRYCIU NIEZWYKŁEJ ILOŚCI ZMIAN STRUKTURALNYCH W GENOMACH, NA WARIANTACH W LICZBIE KOPII (CNV). Z DRUGIEJ STRONY INWESTYCJE SĄ RODZAJEM WARIANTÓW STRUKTURALNYCH, KTÓRE WPŁYWAJĄ NA ISTOTNY UŁAMEK LUDZKIEGO GENOMU I SĄ ZAANGAŻOWANE W FENOTYPOWE RÓŻNICE W RÓŻNYCH ORGANIZMACH. JEDNAK, PONIEWAŻ ICH WŁASNE CECHY SPRAWIAJĄ, ŻE ICH WYKRYWANIE JEST NIEZWYKLE TRUDNE, ZOSTAŁY ONE NIEWIELE ZBADANE. PONADTO OSTATNIO WYKAZANO, ŻE WIELE INWESTYCJI W LUDZKĄ LINIĘ PRODUKOWANO WIELE RAZY, WIĘC JEGO SKUTKI NIE ZOSTAŁY WYKRYTE PRZEZ TRADYCYJNE BADANIA STOWARZYSZENIA NA POZIOMIE CAŁEGO GENOMU. PROJEKT TEN MA NA CELU WYKORZYSTANIE DUŻEJ ILOŚCI DANYCH, ZASOBÓW I WIEDZY NA TEMAT INWESTYCJI WYGENEROWANYCH W CIĄGU OSTATNICH KILKU LAT, ABY PRZEPROWADZIĆ INTEGRACYJNĄ ANALIZĘ JEGO MOŻLIWYCH EFEKTÓW FUNKCJONALNYCH NA WIELU POZIOMACH, POPRZEZ SZEREG POWIĄZANYCH ZE SOBĄ CELÓW. GŁÓWNE CELE TO: (1) ROZSZERZENIE ZESTAWU INWESTYCJI SZCZEGÓŁOWO CHARAKTERYSTYCZNYCH U LUDZI, ABY UZYSKAĆ PEŁNIEJSZĄ WIZJĘ ICH BIOLOGICZNYCH SKUTKÓW; (2) PRZEPROWADZENIE PIERWSZEGO BADANIA GLOBALNEGO STOWARZYSZENIA INWESTYCJI LUDZKICH O CHARAKTERZE FENOTYPOWYM I PODATNOŚCI NA CHOROBY POPRZEZ GENOTYPOWANIE DUŻEJ LICZBY INWESTYCJI W OSOBY DOBRZE SCHARAKTERYZOWANE NA POZIOMIE PENOTIPIC ORAZ PRZYPADKI CO NAJMNIEJ 10 POWSZECHNYCH ZŁOŻONYCH CHORÓB O RÓŻNEJ ETIOLOGII GENETYCZNEJ I PREDYSPOZYCJI (TAKICH JAK CUKRZYCA TYPU 2, ZAWAŁ MIĘŚNIA SERCOWEGO, ZABURZENIA METABOLIZMU LIPIDÓW, REUMATOIDALNE ZAPALENIE STAWÓW, ASTMA, OTYŁOŚĆ, ALZHEIMER’S, PARKINSON, SCHIZOFRENIA I DEPRESJA); (3) ZBADAĆ WPŁYW INWESTYCJI NA PREDYSPOZYCJE DO PODDANIA SIĘ INNYM REORGANIZACJOM, WYKORZYSTUJĄC JAKO MODEL INWESTYCJĘ, KTÓRA POWODUJE NASILENIE POŁOWY PRZYPADKÓW HEMOFILII; (4) DOKŁADNE OKREŚLENIE ILOŚCIOWE MOZAIKI I MUTACJI DLA INWESTYCJI, W KTÓRYCH POŚREDNICZĄ POWTARZAJĄCE SIĘ INWESTYCJE W RÓŻNE TKANKI, JAKO PIERWSZY KROK W OCENIE MOŻLIWYCH KONSEKWENCJI TEGO ZJAWISKA; ORAZ (5) WYKORZYSTAĆ ZNANY POLIMORFIZM INWESTYCYJNY 2ST/2J DROSOPHILA BUZZATII JAKO UZUPEŁNIAJĄCĄ STRATEGIĘ DO ZBADANIA GENETYCZNEJ PODSTAWY RÓŻNIC FENOTYPOWYCH ZWIĄZANYCH Z INWESTYCJĄ. DLATEGO TEŻ NASZ PROJEKT STANOWI KLUCZOWY KROK W OKREŚLENIU FUNKCJONALNEGO WPŁYWU TYCH WARIANTÓW I PRZYNIESIE REZULTATY O DUŻYM ZAINTERESOWANIU W RÓŻNYCH DZIEDZINACH, OD NAUKI PODSTAWOWEJ PO BIOMEDYCYNĘ, PRZYCZYNIAJĄC SIĘ TYM SAMYM DO SPEŁNIENIA OBIETNIC MEDYCYNY SPERSONALIZOWANEJ. (Polish)
18 August 2022
0 references
Sant Julià de Cerdanyola
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
BFU2016-77244-R
0 references