Translational study of Hepatoblastoma: from integral omic analysis to the identification, validation and therapeutic application of prognostic biomarkers for incorporation into clinical practice. (Q3155151)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3155151 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Translational study of Hepatoblastoma: from integral omic analysis to the identification, validation and therapeutic application of prognostic biomarkers for incorporation into clinical practice. |
Project Q3155151 in Spain |
Statements
36,073.12 Euro
0 references
66,250.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2014
0 references
31 March 2017
0 references
FUNDACION INSTITUTO DE INVESTIGACION EN CIENCIAS DE LA SALUD GERMANS TRIAS I PUJOL
0 references
El Hepatoblastoma (HB) es el principal tumor maligno del hígado en la infancia. El tratamiento curativo se consigue combinando quimioterapia y cirugía. No obstante, un 20% de los niños no sobreviven a la enfermedad y los que sobreviven pueden sufrir secuelas graves de por vida. El presente proyecto tiene como objetivo (i) caracterizar e identificar nuevos marcadores pronóstico de las formas más agresivas de HB a partir de un estudio molecular integral transcriptómico, genómico y proteómico, (ii) generar un conjunto altamente validado de biomarcadores y (iii) evaluar su valor teranóstico, con el objetivo global de mejorar el manejo clínico y la supervivencia de los pacientes con HB. En consecuencia, hemos creado una de las mayores colecciones mundiales de muestras de HB, que incluye formas muy agresivas y poco estudiadas. La caracterización de estos tumores se realizará a nivel transcriptómico (RNA-Seq) y genómico (Exome sequencing y arrays de SNP). Los datos generados se integrarán con datos clínicos, proteómicos y de expresión génica obtenidos previamente, utilizando distintos programas bioinformáticos. La validación de los biomarcadores se realizará mediante qPCR, secuenciación, inmunohistoquímica y FISH en >200 HBs. Finalmente, la utilidad terapéutica de determinados biomarcadores se estudiará en xenografts establecidos a partir de HB humano y líneas celulares derivadas de los mismos. Este es un estudio altamente traslacional, puesto que los resultados obtenidos se incluirán en próximos ensayos clínicos dirigidos por el grupo internacional SIOPEL (Childhood Liver Tumours Strategy Group). Además, aunque el HB sea un tumor raro, datos previos indican que los resultados podrían ser extrapolables a otros cánceres más frecuentes, como el hepatocarcinoma. (Spanish)
0 references
Hepatoblastoma (HB) is the main malignant tumor of the liver in childhood. Curative treatment is achieved by combining chemotherapy and surgery. However, 20 per cent of children do not survive the disease and those who survive may suffer severe lifetime sequelae. The objective of this project is (i) to characterise and identify new prognostic markers of the most aggressive forms of BH from an integral transcriptonomic, genomic and proteomic molecular study, (ii) to generate a highly validated set of biomarkers and (iii) to evaluate their theoretical value, with the overall objective of improving the clinical management and survival of patients with BH. As a result, we have created one of the world’s largest collections of HB samples, which includes very aggressive and poorly studied forms. The characterisation of these tumors will be performed at the transcriptomic (RNA-Seq) and genomic level (Exome sequencing and SNP arrays). The data generated will be integrated with previously obtained clinical, proteomic and gene expression data, using different bioinformatics programs. Biomarker validation shall be performed by qPCR, sequencing, immunohistochemistry and FISH at >200 HBs. Finally, the therapeutic usefulness of certain biomarkers will be studied in xenografts established from human HB and cell lines derived from them. This is a highly translational study, as the results obtained will be included in upcoming clinical trials led by the international SIOPEL group (Childhood Liver Tumours Strategy Group). In addition, although HB is a rare tumor, previous data indicate that the results may be extrapolated to other more frequent cancers, such as hepatocarcinoma. (English)
12 October 2021
0.6862781831655538
0 references
L’hépatoblastome (HB) est la principale tumeur maligne du foie dans l’enfance. Le traitement curatif est obtenu en combinant chimiothérapie et chirurgie. Toutefois, 20 % des enfants ne survivent pas à la maladie et ceux qui survivent peuvent souffrir de séquelles sévères à vie. L’objectif de ce projet est (i) de caractériser et d’identifier de nouveaux marqueurs pronostiques des formes les plus agressives de BH à partir d’une étude moléculaire intégrale transcriptonomique, génomique et protéomique, (ii) de générer un ensemble de biomarqueurs hautement validés et (iii) d’évaluer leur valeur théorique, avec l’objectif global d’améliorer la prise en charge clinique et la survie des patients atteints de BH. En conséquence, nous avons créé l’une des plus grandes collections d’échantillons HB au monde, qui comprend des formes très agressives et mal étudiées. La caractérisation de ces tumeurs sera effectuée au niveau transcriptomique (ARN-Seq) et génomique (séquençage d’Exome et tableaux SNP). Les données générées seront intégrées aux données cliniques, protéomiques et d’expression génétique obtenues antérieurement, à l’aide de différents programmes de bioinformatique. La validation du biomarqueur est effectuée par qPCR, séquençage, immunohistochimie et FISH à plus de 200 HBs. Enfin, l’utilité thérapeutique de certains biomarqueurs sera étudiée dans les xénogreffes établies à partir de lignées humaines HB et de lignées cellulaires dérivées de celles-ci. Il s’agit d’une étude hautement translationnelle, car les résultats obtenus seront inclus dans les prochains essais cliniques menés par le groupe international SIOPEL (Childhood Liver Tumours Strategy Group). De plus, bien que le HB soit une tumeur rare, des données antérieures indiquent que les résultats peuvent être extrapolés à d’autres cancers plus fréquents, comme l’hépatocarcinome. (French)
2 December 2021
0 references
Hepatoblastom (HB) ist der wichtigste bösartige Tumor der Leber in der Kindheit. Kurative Behandlung wird durch die Kombination von Chemotherapie und Chirurgie erreicht. 20 Prozent der Kinder überleben die Krankheit jedoch nicht, und diejenigen, die überleben, können schwere Lebzeiten erleiden. Ziel dieses Projekts ist (i) die Charakterisierung und Identifizierung neuer prognostischer Marker der aggressivsten Formen von BH aus einer integralen transkriptonomischen, genomischen und proteomischen molekularen Studie, ii) eine hoch validierte Menge an Biomarkern zu erzeugen und iii) ihren theoretischen Wert zu bewerten, um das klinische Management und das Überleben von Patienten mit BH zu verbessern. Als Ergebnis haben wir eine der weltweit größten Sammlungen von HB-Proben erstellt, die sehr aggressiv und schlecht untersuchte Formen umfassen. Die Charakterisierung dieser Tumore erfolgt auf Transcriptomic (RNA-Seq) und genomischer Ebene (Exome Sequencing und SNP-Arrays). Die erzeugten Daten werden in zuvor erhaltene klinische, proteomische und Genexpressionsdaten unter Verwendung unterschiedlicher Bioinformatikprogramme integriert. Die Validierung des Biomarkers erfolgt durch qPCR, Sequenzierung, Immunhistochemie und FISH bei >200 HBs. Schließlich wird die therapeutische Nützlichkeit bestimmter Biomarker in Xenografts untersucht, die aus menschlichen HB- und Zelllinien hergestellt wurden. Dies ist eine hochübersetzte Studie, da die erzielten Ergebnisse in die kommenden klinischen Studien unter der Leitung der internationalen SIOPEL-Gruppe (Childhood Liver Tumours Strategy Group) einbezogen werden. Darüber hinaus, obwohl HB ein seltener Tumor ist, zeigen frühere Daten, dass die Ergebnisse auf andere häufigere Krebsarten wie Hepatokarzinom extrapoliert werden können. (German)
9 December 2021
0 references
Hepatoblastoma (HB) is de belangrijkste kwaadaardige tumor van de lever in de kindertijd. Curatieve behandeling wordt bereikt door chemotherapie en chirurgie te combineren. Echter, 20 procent van de kinderen overleven de ziekte niet en degenen die overleven kunnen ernstige levenslange gevolgen ondervinden. Het doel van dit project is (i) het karakteriseren en identificeren van nieuwe prognostische markers van de meest agressieve vormen van BH uit een integrale transcriptonomische, genomische en proteomische moleculaire studie, (ii) het genereren van een zeer gevalideerde set biomarkers en (iii) om hun theoretische waarde te evalueren, met als algemene doelstelling de klinische behandeling en overleving van patiënten met BH te verbeteren. Als gevolg hiervan hebben we een van ’s werelds grootste collecties van HB-stalen gecreëerd, waaronder zeer agressieve en slecht bestudeerde vormen. De karakterisering van deze tumoren zal worden uitgevoerd op het transcriptomische (RNA-Seq) en genomic niveau (Exome sequencing en SNP arrays). De gegenereerde gegevens zullen worden geïntegreerd met eerder verkregen klinische, proteomische en genexpressiegegevens, met behulp van verschillende bio-informaticaprogramma’s. De biomarkervalidatie wordt uitgevoerd door qPCR, sequencing, immunohistochemie en FISH bij >200 HBs. Ten slotte zal het therapeutische nut van bepaalde biomarkers worden bestudeerd in xenograften die zijn vastgesteld op basis van menselijke HB- en daaruit afgeleide cellijnen. Dit is een zeer translationeel onderzoek, aangezien de verkregen resultaten zullen worden opgenomen in komende klinische onderzoeken onder leiding van de internationale SIOPEL-groep (Childhood Liver Tumours Strategy Group). Bovendien, hoewel HB een zeldzame tumor is, geven eerdere gegevens aan dat de resultaten kunnen worden geëxtrapoleerd naar andere vaker voorkomende kankers, zoals hepatocarcinoom. (Dutch)
17 December 2021
0 references
Hepatoblastoma (HB) è il tumore maligno principale del fegato nell'infanzia. Il trattamento curativo si ottiene combinando chemioterapia e chirurgia. Tuttavia, il 20 % dei bambini non sopravvive alla malattia e coloro che sopravvivono possono soffrire di gravi sequele a vita. L'obiettivo di questo progetto è (i) caratterizzare e identificare nuovi marcatori prognostici delle forme più aggressive di BH da uno studio integrale trascrittonomico, genomico e proteomico molecolare, (ii) generare un insieme altamente convalidato di biomarcatori e (iii) valutare il loro valore teorico, con l'obiettivo generale di migliorare la gestione clinica e la sopravvivenza dei pazienti affetti da BH. Di conseguenza, abbiamo creato una delle più grandi collezioni al mondo di campioni HB, che comprende forme molto aggressive e scarsamente studiate. La caratterizzazione di questi tumori sarà eseguita a livello trascrittomico (RNA-Seq) e genomico (esome sequenziamento e array SNP). I dati generati saranno integrati con dati clinici, proteomici e di espressione genica precedentemente ottenuti, utilizzando diversi programmi di bioinformatica. La convalida del biomarcatore deve essere effettuata mediante qPCR, sequenziamento, immunoistochimica e FISH a >200 HB. Infine, l'utilità terapeutica di alcuni biomarcatori sarà studiata in xenografi stabiliti da HB umano e linee cellulari da essi derivate. Si tratta di uno studio altamente traslazionale, in quanto i risultati ottenuti saranno inclusi nei prossimi studi clinici condotti dal gruppo internazionale SIOPEL (Childhood Liver Tumours Strategy Group). Inoltre, sebbene l'HB sia un tumore raro, dati precedenti indicano che i risultati possono essere estrapolati ad altri tumori più frequenti, come l'epatocarcinoma. (Italian)
16 January 2022
0 references
Hepatoblastoom (HB) on peamine maksa pahaloomuline kasvaja lapsepõlves. Aktiivravi saavutatakse kemoteraapia ja kirurgia kombineerimise teel. Kuid 20 % lastest ei ela haigust üle ja need, kes ellu jäävad, võivad kannatada elu jooksul raskete tagajärgede all. Selle projekti eesmärk on i) iseloomustada ja teha kindlaks BH kõige agressiivsemate vormide uusi prognostilisi markereid terviklikust transkriptonoomsest, genoomilisest ja proteoomilisest molekulaarsest uuringust, ii) luua väga valideeritud biomarkerite kogum ja iii) hinnata nende teoreetilist väärtust üldise eesmärgiga parandada BH patsientide kliinilist juhtimist ja elulemust. Selle tulemusena oleme loonud ühe maailma suurimaid HB proovide kogusid, mis sisaldab väga agressiivseid ja halvasti uuritud vorme. Nende kasvajate iseloomustamine toimub transkriptoomilisel (RNA-Seq) ja genoomilisel tasandil (eksome sekveneerimise ja SNP massiivid). Loodud andmed integreeritakse varem saadud kliiniliste, proteoomiliste ja geeniekspressioonide andmetega, kasutades erinevaid bioinformaatikaprogramme. Biomarkeri valideerimiseks kasutatakse qPCRi, sekveneerimist, immunohistokeemiat ja FISH-i > 200 HB-l. Lõpuks uuritakse teatud biomarkerite terapeutilist kasulikkust inimese HB ja sellest tuletatud rakuliinide ksenotransplantaatides. Tegemist on väga translatiivse uuringuga, kuna saadud tulemused lisatakse tulevastesse kliinilistesse uuringutesse, mida juhib rahvusvaheline SIOPEL-rühm (lapse maksakasvaja strateegiarühm). Lisaks, kuigi HB on haruldane kasvaja, näitavad varasemad andmed, et tulemusi võib ekstrapoleerida teistele sagedasematele vähivormidele, näiteks hepatokartsinoomile. (Estonian)
4 August 2022
0 references
Hepatoblastoma (HB) yra pagrindinis piktybinis kepenų navikas vaikystėje. Gydomasis gydymas pasiekiamas derinant chemoterapiją ir chirurgiją. Tačiau 20 proc. vaikų neišgyvena ligos, o tie, kurie išgyvena, gali patirti sunkias gyvenimo pasekmes. Šio projekto tikslas: i) apibūdinti ir nustatyti naujus agresyviausių BH formų prognozinius žymenis iš integruoto transkriptonominio, genominio ir proteominio molekulinio tyrimo, ii) sukurti labai patvirtintą biologinių žymenų rinkinį ir iii) įvertinti jų teorinę vertę, siekiant bendro tikslo pagerinti pacientų, sergančių BH, klinikinį valdymą ir išgyvenimą. Dėl to sukūrėme vieną didžiausių pasaulyje HB pavyzdžių kolekcijų, kurios apima labai agresyvias ir prastai ištirtas formas. Šių navikų apibūdinimas bus atliekamas transkriptominiu (RNR-Seq) ir genominiu lygiu (Exome sekos ir SNP masyvai). Gauti duomenys bus integruoti į anksčiau gautus klinikinius, proteominius ir genų ekspresijos duomenis, naudojant skirtingas bioinformatikos programas. Biologinio žymens patvirtinimas atliekamas taikant qPGR, seką, imunohistochemiją ir FISH esant >200 HB. Galiausiai tam tikrų biologinių žymenų terapinis naudingumas bus tiriamas ksenograftuose, nustatytuose iš žmogaus HB ir iš jų gautų ląstelių linijų. Tai labai vertingas tyrimas, nes gauti rezultatai bus įtraukti į būsimus klinikinius tyrimus, kuriems vadovaus tarptautinė SIOPEL grupė (Vaikystės kepenų navikų strategijos grupė). Be to, nors HB yra retas navikas, ankstesni duomenys rodo, kad rezultatai gali būti ekstrapoliuojami kitiems dažnesniems vėžiui, pavyzdžiui, hepatokarcinomai. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
Hepatoblastom (HB) je glavni maligni tumor jetre u djetinjstvu. Kurativno liječenje postiže se kombiniranjem kemoterapije i kirurškog zahvata. Međutim, 20 posto djece ne preživi bolest, a oni koji prežive mogu trpjeti teške životne posljedice. Cilj je ovog projekta (i.) karakterizirati i identificirati nove prognostičke markere najagresivnijih oblika BH-a iz cjelovitog transkriptonomskog, genomskog i proteomskog molekularnog istraživanja, (ii) generirati visoko validirani skup biomarkera i (iii) procijeniti njihovu teoretsku vrijednost, s općim ciljem poboljšanja kliničkog liječenja i preživljavanja bolesnika s BH-om. Kao rezultat toga, stvorili smo jednu od najvećih svjetskih zbirki HB uzoraka, koja uključuje vrlo agresivne i slabo proučavane oblike. Karakterizacija tih tumora bit će izvedena na transkriptomskoj (RNA-Seq) i genomskoj razini (Exome sekvenciranje i SNP nizovi). Dobiveni podaci bit će integrirani s prethodno dobivenim kliničkim, proteomskim i ekspresijskim podacima gena, koristeći različite bioinformatičke programe. Validacija biomarkera provodi se qPCR-om, sekvenciranjem, imunohistokemijom i FISH-om na >200 HB. Konačno, terapijska korisnost određenih biomarkera proučavat će se u ksenograftsu ustanovljenim iz ljudskih HB-a i staničnih linija dobivenih iz njih. Ovo je vrlo translacijska studija jer će dobiveni rezultati biti uključeni u buduća klinička ispitivanja koja će voditi međunarodna skupina SIOPEL (Strategijska skupina za borbu protiv tumora jetre djece). Osim toga, iako je HB rijedak tumor, prethodni podaci pokazuju da se rezultati mogu ekstrapolirati na druge češće vrste raka, kao što je hepatokarcinom. (Croatian)
4 August 2022
0 references
Το ηπατοβλάστωμα (HB) είναι ο κύριος κακοήθης όγκος του ήπατος στην παιδική ηλικία. Η θεραπευτική θεραπεία επιτυγχάνεται με συνδυασμό χημειοθεραπείας και χειρουργικής επέμβασης. Ωστόσο, το 20 % των παιδιών δεν επιβιώνουν από τη νόσο και όσοι επιβιώνουν μπορεί να υποφέρουν από σοβαρές επακόλουθες επακόλουθες της ζωής τους. Στόχος αυτού του έργου είναι (i) ο χαρακτηρισμός και ο εντοπισμός νέων προγνωστικών δεικτών των πιο επιθετικών μορφών BH από μια ολοκληρωμένη μεταγραφική, γονιδιωματική και πρωτεωμική μοριακή μελέτη, (ii) η παραγωγή ενός εξαιρετικά επικυρωμένου συνόλου βιοδεικτών και (iii) η αξιολόγηση της θεωρητικής τους αξίας, με γενικό στόχο τη βελτίωση της κλινικής διαχείρισης και επιβίωσης των ασθενών με BH. Ως αποτέλεσμα, δημιουργήσαμε μία από τις μεγαλύτερες συλλογές δειγμάτων HB στον κόσμο, η οποία περιλαμβάνει πολύ επιθετικές και ανεπαρκώς μελετημένες μορφές. Ο χαρακτηρισμός αυτών των όγκων θα πραγματοποιηθεί στο μεταγραφομικό (RNA-Seq) και γονιδιωματικό επίπεδο (Exome sequencing και SNP arrays). Τα παραγόμενα δεδομένα θα ενσωματωθούν σε δεδομένα κλινικής, πρωτεωμικής και γονιδιακής έκφρασης που έχουν ληφθεί προηγουμένως, με τη χρήση διαφορετικών προγραμμάτων βιοπληροφορικής. Η επικύρωση βιοδείκτη πραγματοποιείται με qPCR, αλληλουχία, ανοσοϊστοχημεία και FISH σε > 200 HBs. Τέλος, η θεραπευτική χρησιμότητα ορισμένων βιοδεικτών θα μελετηθεί σε ξενογραφήματα που έχουν διαπιστωθεί από την ανθρώπινη HB και τις κυτταρικές σειρές που προέρχονται από αυτά. Πρόκειται για μια εξαιρετικά μεταφραστική μελέτη, καθώς τα αποτελέσματα που θα προκύψουν θα συμπεριληφθούν σε επικείμενες κλινικές δοκιμές υπό την καθοδήγηση της διεθνούς ομάδας SIOPEL (Ομάδα Στρατηγικής για τα Παιδιά). Επιπλέον, αν και η HB είναι ένας σπάνιος όγκος, προηγούμενα στοιχεία δείχνουν ότι τα αποτελέσματα μπορεί να προεκτεθούν σε άλλους συχνότερους καρκίνους, όπως το ηπατοκαρκίνωμα. (Greek)
4 August 2022
0 references
Hepatoblastóm (HB) je hlavný malígny nádor pečene v detstve. Liečebná liečba sa dosahuje kombináciou chemoterapie a chirurgického zákroku. Avšak 20 percent detí neprežije chorobu a tí, ktorí prežijú, môžu trpieť ťažkými životnými následkami. Cieľom tohto projektu je i) charakterizovať a identifikovať nové prognostické markery najagresívnejších foriem BH z integrálnej transkriptonomickej, genomickej a proteomickej molekulárnej štúdie, ii) vytvoriť vysoko validovaný súbor biomarkerov a iii) vyhodnotiť ich teoretickú hodnotu s celkovým cieľom zlepšiť klinický manažment a prežitie pacientov s BH. V dôsledku toho sme vytvorili jednu z najväčších zbierok vzoriek HB na svete, ktorá zahŕňa veľmi agresívne a zle študované formy. Charakterizácia týchto nádorov bude vykonaná na transkriptomickej (RNA-Seq) a genomickej úrovni (Exome sekvencovanie a SNP polia). Získané údaje budú integrované do predtým získaných klinických, proteomických údajov a údajov o génovej expresii pomocou rôznych bioinformatických programov. Validácia biomarkerov sa vykonáva pomocou qPCR, sekvenovania, imunohistochémie a FISH pri > 200 HB. Nakoniec, terapeutická užitočnosť určitých biomarkerov sa bude skúmať v xenograftoch zistených z ľudských HB a bunkových línií odvodených z nich. Ide o veľmi translačnú štúdiu, keďže získané výsledky budú zahrnuté do nadchádzajúcich klinických skúšok vedených medzinárodnou skupinou SIOPEL (strategická skupina pre detské tumours Liver Tumours). Okrem toho, hoci HB je zriedkavý nádor, predchádzajúce údaje naznačujú, že výsledky môžu byť extrapolované na iné častejšie rakoviny, ako je hepatokarcinóm. (Slovak)
4 August 2022
0 references
Hepatoblastoma (HB) on tärkein pahanlaatuinen kasvain maksan lapsuudessa. Parantava hoito saavutetaan yhdistämällä solunsalpaajahoito ja leikkaus. Kuitenkin 20 prosenttia lapsista ei selviydy sairaudesta, ja eloonjääneet saattavat kärsiä vaikeista elinikäisistä jälkiseurauksista. Tämän hankkeen tavoitteena on i) luonnehtia ja tunnistaa uusia prognostisia merkkiaineita BH:n aggressiivisimmille muodoille integroidusta transcriptonomisesta, genomisesta ja proteomisesta molekyylitutkimuksesta, ii) tuottaa erittäin validoituja biomarkkereita ja iii) arvioida niiden teoreettinen arvo siten, että yleisenä tavoitteena on parantaa BH-potilaiden kliinistä hoitoa ja eloonjäämistä. Tämän seurauksena olemme luoneet yhden maailman suurimmista HB-näytteiden kokoelmista, jotka sisältävät erittäin aggressiivisia ja huonosti tutkittuja muotoja. Näiden kasvainten karakterisointi suoritetaan transkriptomisella (RNA-Seq) ja genomitasolla (Exome sekvensointi ja SNP-matriisit). Tuotetut tiedot integroidaan aiemmin saatuihin kliinisiin, proteomisiin ja geenien ilmentymätietoihin käyttäen erilaisia bioinformatiikkaohjelmia. Biomarkkerien validointi on suoritettava qPCR:llä, sekvensoinnilla, immunohistokemialla ja FISH:lla yli 200 HBs:llä. Tiettyjen biomarkkerien terapeuttista hyödyllisyyttä tutkitaan ihmisen HB:n ja niistä johdettujen solulinjojen ksenografteissa. Tämä on erittäin translaatiotutkimus, sillä saadut tulokset sisällytetään tuleviin kliinisiin tutkimuksiin, joita johtaa kansainvälinen SIOPEL-ryhmä (Childhood Liver Tumours Strategy Group). Lisäksi, vaikka HB on harvinainen kasvain, aiemmat tiedot osoittavat, että tulokset voidaan ekstrapoloida muihin yleisempiin syöpiin, kuten hepatokarsinoomaan. (Finnish)
4 August 2022
0 references
Hepatoblastoma (HB) jest głównym nowotworem złośliwym wątroby w dzieciństwie. Leczenie lecznicze osiąga się poprzez połączenie chemioterapii i chirurgii. Jednak 20 % dzieci nie przeżyje choroby, a ci, którzy przeżyją, mogą cierpieć na poważne następstwa życiowe. Celem tego projektu jest (i) scharakteryzowanie i zidentyfikowanie nowych prognostycznych markerów najbardziej agresywnych form BH na podstawie integralnego badania molekularnego transkryptonomicznego, genomowego i proteomicznego, (ii) stworzenie wysoko zwalidowanego zestawu biomarkerów oraz (iii) ocena ich wartości teoretycznej, przy czym ogólnym celem jest poprawa zarządzania klinicznego i przeżycia pacjentów z BH. W rezultacie stworzyliśmy jedną z największych na świecie kolekcji próbek HB, która zawiera bardzo agresywne i słabo zbadane formy. Charakterystyka tych nowotworów będzie wykonywana na poziomie transkryptomicznym (RNA-Seq) i genomicznym (sekwencjonowanie zewnętrzne i tablice SNP). Generowane dane będą zintegrowane z wcześniej uzyskanymi danymi klinicznymi, proteomicznymi i ekspresji genów, przy użyciu różnych programów bioinformatycznych. Walidację biomarkera przeprowadza się za pomocą qPCR, sekwencjonowania, immunohistochemii i FISH przy > 200 HBs. Wreszcie, terapeutyczna przydatność niektórych biomarkerów zostanie zbadana w ksenograftach ustalonych z ludzkiego HB i linii komórkowych pochodzących z nich. Jest to wysoce przekładowe badanie, ponieważ uzyskane wyniki zostaną uwzględnione w nadchodzących badaniach klinicznych prowadzonych przez międzynarodową grupę SIOPEL (grupę ds. strategii wątrobowych wątrobowych dzieci). Ponadto, chociaż HB jest rzadkim nowotworem, poprzednie dane wskazują, że wyniki mogą być ekstrapolowane na inne częstsze nowotwory, takie jak raka wątroby. (Polish)
4 August 2022
0 references
Hepatoblastoma (HB) a fő rosszindulatú daganat a máj gyermekkorban. A gyógyító kezelés a kemoterápia és a műtét kombinálásával érhető el. A gyermekek 20 százaléka azonban nem éli túl a betegséget, és azok, akik túlélik, súlyos életfogytig tartó következményeket szenvedhetnek. E projekt célja i. egy integrált transzkriptonómiai, genomikus és proteomikus molekuláris vizsgálat során a BH legagresszívebb formáinak új prognosztikai markereinek jellemzése és azonosítása, ii. magas szinten validált biomarkerek létrehozása és iii. elméleti értékük értékelése azzal az átfogó céllal, hogy javítsák a BH-ban szenvedő betegek klinikai kezelését és túlélését. Ennek eredményeként létrehoztuk a világ egyik legnagyobb HB mintagyűjteményét, amely nagyon agresszív és rosszul tanulmányozott formákat tartalmaz. Ezeknek a daganatoknak a jellemzése transzkriptomikus (RNA-Seq) és genomikus szinten (Exome szekvenálás és SNP tömbök) történik. A generált adatok integrálódnak a korábban szerzett klinikai, proteomikus és génexpressziós adatokkal, különböző bioinformatikai programok segítségével. A biomarker validálását qPCR-rel, szekvenálással, immunhisztokémiával és FISH-val kell elvégezni 200 HB-nál nagyobb sebességgel. Végül, bizonyos biomarkerek terápiás hasznosságát az emberi HB-ből származó xenograftok és az ezekből származó sejtvonalak esetében tanulmányozzák. Ez egy nagyon transzlációs vizsgálat, mivel a kapott eredményeket a nemzetközi SIOPEL-csoport (Gyermekségi Liver Tumours Stratégiai Csoport) által vezetett, soron következő klinikai vizsgálatokba foglalják majd be. Ezen túlmenően, bár a HB egy ritka tumor, a korábbi adatok azt mutatják, hogy az eredmények extrapolálható más gyakoribb rákos megbetegedések, mint például a hepatocarcinoma. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
Hepatoblastom (HB) je hlavním maligním nádorem jater v dětství. Léčebné léčby je dosaženo kombinací chemoterapie a chirurgie. Nicméně 20 % dětí nepřežije nemoc a ty, které přežijí, mohou trpět závažným celoživotním následky. Cílem tohoto projektu je i) charakterizovat a identifikovat nové prognostické markery nejagresivnějších forem BH z integrální transkriponomické, genomické a proteomické molekulární studie, ii) vytvořit vysoce validovaný soubor biomarkerů a iii) vyhodnotit jejich teoretickou hodnotu s celkovým cílem zlepšit klinické řízení a přežití pacientů s BH. V důsledku toho jsme vytvořili jednu z největších světových sbírek vzorků HB, která zahrnuje velmi agresivní a špatně studované formy. Charakterizace těchto nádorů bude provedena na transscriptomické (RNA-Seq) a genomové úrovni (Exome sekvenování a SNP pole). Generovaná data budou integrována s dříve získanými klinickými, proteomickými a genovými expresními údaji za použití různých bioinformatických programů. Validace biomarkeru se provádí pomocí qPCR, sekvenování, imunohistochemie a FISH při > 200 HB. Konečně, terapeutická užitečnost některých biomarkerů bude zkoumána u xenograftů stanovených z lidských HB a z nich odvozených buněčných linií. Jedná se o vysoce translační studii, neboť získané výsledky budou zahrnuty do nadcházejících klinických studií vedených mezinárodní skupinou SIOPEL (Strategická skupina dětských nádorů jater). Kromě toho, ačkoli HB je vzácný nádor, předchozí údaje naznačují, že výsledky mohou být extrapolovány na jiné častější nádory, jako je hepatokarcinom. (Czech)
4 August 2022
0 references
Hepatoblastoma (HB) ir galvenais ļaundabīgais aknu audzējs bērnībā. Ārstnieciskā ārstēšana tiek panākta, apvienojot ķīmijterapiju un ķirurģiju. Tomēr 20 procenti bērnu neizdzīvo slimību, un tie, kas izdzīvo, var ciest smagas sekas mūža garumā. Šā projekta mērķis ir i) raksturot un identificēt jaunus BH agresīvāko formu prognostiskos marķierus no neatņemama transcriptonomiska, genoma un proteomiska molekulārā pētījuma, ii) izveidot augsti apstiprinātu biomarķieru kopumu un iii) novērtēt to teorētisko vērtību ar vispārējo mērķi uzlabot klīnisko pārvaldību un dzīvildzi pacientiem ar BH. Rezultātā esam izveidojuši vienu no pasaulē lielākajām HB paraugu kolekcijām, kas ietver ļoti agresīvas un vāji izpētītas formas. Šo audzēju raksturojums tiks veikts pie transkriptomikas (RNS-Seq) un genomikas līmenī (Exome sekvencēšana un SNP masīvi). Iegūtie dati tiks integrēti iepriekš iegūtajos klīniskos, proteomikas un gēnu ekspresijas datos, izmantojot dažādas bioinformātikas programmas. Biomarķieru validāciju veic ar qPCR, sekvencēšanu, imūnhistoķīmiju un FISH pie >200 HBs. Visbeidzot, dažu biomarķieru terapeitiskā lietderība tiks pētīta ksenotransplantātos, kas iegūti no cilvēka HB un no tiem iegūtām šūnu līnijām. Šis pētījums ir ļoti lietišķs, jo iegūtie rezultāti tiks iekļauti gaidāmajās klīniskajās pārbaudēs, ko vadīs starptautiskā SIOPEL grupa (Bērnu aknu audzēju stratēģijas grupa). Turklāt, lai gan HB ir reti audzējs, iepriekšējie dati liecina, ka rezultātus var ekstrapolēt uz citiem biežākiem vēža veidiem, piemēram, hepatokarcinomu. (Latvian)
4 August 2022
0 references
Is é hepatoblastoma (HB) príomh-mheall urchóideach an ae san óige. Baintear cóireáil leigheasach amach trí cheimiteiripe agus máinliacht a chomhcheangal. Mar sin féin, ní mhaireann 20 faoin gcéad de leanaí an galar agus d’fhéadfadh sé go bhfulaingeoidh daoine a mhaireann sequelae tromchúiseach ar feadh an tsaoil. Is é cuspóir an tionscadail seo (i) marcóirí prognóiseacha nua de na foirmeacha is ionsaithí de BH a thréithriú agus a shainaithint ó staidéar móilíneach transcriptonomic, géanómaíoch agus próitéamaíoch, (ii) sraith ardbhailíochtaithe bithmharcóirí a ghiniúint agus (iii) a luach teoiriciúil a mheas, agus é mar chuspóir foriomlán feabhas a chur ar bhainistíocht chliniciúil agus ar mharthanas othar a bhfuil BH acu. Mar thoradh air sin, tá ceann de na bailiúcháin is mó ar domhan de shamplaí HB cruthaithe againn, lena n-áirítear foirmeacha an-ionsaitheach agus droch-staidéar. Déanfar tréithriú na siadaí sin ag an leibhéal transcriptomic (RNA-Seq) agus ag an leibhéal géanómaíoch (seicheamhú seachtrach agus eagair SNP). Beidh na sonraí a ghintear a chomhtháthú le sonraí cliniciúla, proteomic agus léiriú géine a fuarthas roimhe seo, ag baint úsáide as cláir bioinformatics éagsúla. Is trí qPCR, seicheamhú, imdhíoncheimic agus FISH ag > 200 HBs a dhéanfar bailíochtú bithmharcóra. Ar deireadh, déanfar staidéar ar úsáid theiripeach bithmharcóirí áirithe i xenografts a bunaíodh ó HB daonna agus línte cille a dhíorthaítear uathu. Is staidéar an-aistritheach é seo, toisc go n-áireofar na torthaí a gheofar sna trialacha cliniciúla atá le teacht faoi stiúir an ghrúpa idirnáisiúnta SIOPEL (Grúpa Straitéise Tumours Liver Liver Children). Ina theannta sin, cé gur meall annamh é HB, léiríonn sonraí roimhe seo gur féidir na torthaí a eachtarshuí le hailse níos minice, mar shampla hepatocarcinoma. (Irish)
4 August 2022
0 references
Hepatoblastom (HB) je glavni maligni tumor jeter v otroštvu. Kurativno zdravljenje se doseže s kombinacijo kemoterapije in kirurškega posega. Vendar pa 20 odstotkov otrok ne preživi bolezni in tisti, ki preživijo, lahko trpijo hude posledice življenja. Cilj tega projekta je (i) opredeliti in opredeliti nove prognostične označevalce najbolj agresivnih oblik BH iz integralne transkriptonomske, genomske in proteomske molekularne študije, (ii) ustvariti visoko validiran niz biomarkerjev in (iii) oceniti njihovo teoretično vrednost s splošnim ciljem izboljšanja kliničnega upravljanja in preživetja bolnikov z BH. Zato smo ustvarili eno največjih zbirk vzorcev HB na svetu, ki vključuje zelo agresivne in slabo raziskane oblike. Karakterizacija teh tumorjev bo izvedena na transkriptomski (RNA-Seq) in genomski ravni (Exome sekvenciranje in SNP nizov). Pridobljeni podatki bodo združeni s predhodno pridobljenimi kliničnimi, proteomskimi in genskimi ekspresijskimi podatki z uporabo različnih bioinformatičnih programov. Validacija biomarkerja se izvede s qPCR, sekvenciranjem, imunohistokemijo in FISH pri > 200 HBs. Terapevtsko uporabnost nekaterih biomarkerjev bodo proučevali pri ksenograftih, ugotovljenih iz človeških HB in iz njih pridobljenih celičnih linij. To je zelo translacijska študija, saj bodo dobljeni rezultati vključeni v prihodnja klinična preskušanja, ki jih bo vodila mednarodna skupina SIOPEL (Strateška skupina za obvladovanje tumorjev na jetrih otrok). Poleg tega, čeprav je HB redek tumor, prejšnji podatki kažejo, da se lahko rezultati ekstrapolirajo na druge pogostejše vrste raka, kot je hepatokarcinom. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
Хепатобластом (HB) е основният злокачествен тумор на черния дроб в детството. Лечебното лечение се постига чрез комбиниране на химиотерапия и хирургия. Въпреки това, 20 % от децата не оцеляват от болестта и тези, които оцелеят, могат да понесат тежки последствия за живота. Целта на този проект е i) да се характеризират и идентифицират нови прогностични маркери на най-агресивните форми на БХ от интегрално транскриптономно, геномно и протеомно молекулярно изследване, ii) да се генерира силно валидиран набор от биомаркери и iii) да се оцени тяхната теоретична стойност, с общата цел да се подобри клиничното управление и преживяемостта на пациентите с БХ. В резултат на това създадохме една от най-големите колекции от HB проби в света, която включва много агресивни и слабо проучени форми. Характеризирането на тези тумори ще се извършва на транскриптомно (РНК-Сек) и геномно ниво (Exome секвениране и SNP масиви). Генерираните данни ще бъдат интегрирани с предварително получени данни за клинична, протеомична и генна експресия, като се използват различни програми за биоинформатика. Валидирането на биомаркера се извършва чрез qPCR, секвениране, имунохистохимия и FISH при > 200 HBs. И накрая, терапевтичната полезност на някои биомаркери ще бъде проучена при ксеноприсади, установени от човешки HB и клетъчни линии, получени от тях. Това е силно транслационно изследване, тъй като получените резултати ще бъдат включени в предстоящите клинични изпитвания, ръководени от международната група SIOPEL (стратегическа група за детския черен дроб). Освен това, въпреки че HB е рядък тумор, предишните данни показват, че резултатите могат да бъдат екстраполирани към други по-чести ракови заболявания, като хепатокарцином. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
Hepatoblastoma (HB) hija t-tumur malinn ewlieni tal-fwied fit-tfulija. Il-kura kurattiva tinkiseb billi l-kimoterapija u l-kirurġija jiġu kkombinati. Madankollu, 20 fil-mija tat-tfal ma jissopravvivux il-marda u dawk li jgħixu jistgħu jsofru konsegwenzi severi tul ħajjithom. L-għan ta’ dan il-proġett huwa (i) li jikkaratterizza u jidentifika markaturi pronjostiċi ġodda tal-forom l-aktar aggressivi ta’ BH minn studju transskritonomiku, ġenomiku u molekulari proteomiku integrali, (ii) li jiġġenera sett ta’ bijomarkaturi vvalidati ħafna u (iii) li jevalwa l-valur teoretiku tagħhom, bl-għan ġenerali li jtejjeb il-ġestjoni klinika u s-sopravivenza tal-pazjenti b’BH. Bħala riżultat, ħloqna waħda mill-akbar kollezzjonijiet fid-dinja ta ‘kampjuni HB, li jinkludi forom aggressivi ħafna u studjati ħażin. Il-karatterizzazzjoni ta’ dawn it-tumuri se ssir fil-livell traskritomiku (RNA-Seq) u fil-livell ġenomiku (sekwenzjar Exome u arranġamenti SNP). Id-dejta ġġenerata se tiġi integrata ma’ dejta ta’ espressjoni klinika, proteomika u ġene miksuba minn qabel, bl-użu ta’ programmi bijoinformatika differenti. Il-validazzjoni tal-bijomarkatur għandha titwettaq permezz ta’ qPCR, sekwenzar, immunoistokimika u FISH f’ >200 HBs. Fl-aħħar nett, l-utilità terapewtika ta’ ċerti bijomarkaturi ser tiġi studjata f’xenografts stabbiliti minn HB uman u linji ta’ ċelloli derivati minnhom. Dan huwa studju translazzjonali ħafna, peress li r-riżultati miksuba se jiġu inklużi fil-provi kliniċi li ġejjin immexxija mill-grupp internazzjonali SIOPEL (Grupp ta’ Strateġija għat-Tumuri tal-Fwied tat-Tfal). Barra minn hekk, għalkemm HB huwa tumur rari, dejta preċedenti tindika li r-riżultati jistgħu jiġu estrapolati għal kanċers oħra aktar frekwenti, bħal epatokarċinoma. (Maltese)
4 August 2022
0 references
O hepatoblastoma (HB) é o principal tumor maligno do fígado na infância. O tratamento curativo é conseguido através da combinação de quimioterapia e cirurgia. No entanto, 20% das crianças não sobrevivem à doença e aqueles que sobrevivem podem sofrer graves sequelas ao longo da vida. O objetivo deste projeto é (i) caracterizar e identificar novos marcadores prognósticos das formas mais agressivas de HB a partir de um estudo molecular integral transcriptonómico, genómico e proteómico, (ii) gerar um conjunto altamente validado de biomarcadores e (iii) avaliar o seu valor teórico, com o objetivo geral de melhorar a gestão clínica e a sobrevivência dos doentes com HB. Como resultado, criámos uma das maiores coleções mundiais de amostras de HB, que inclui formas muito agressivas e pouco estudadas. A caracterização destes tumores será realizada no nível transcriptomic (RNA-Seq) e genomic (sequenciação de Exome e matrizes de SNP). Os dados gerados serão integrados com dados clínicos, proteómicos e de expressão genética previamente obtidos, utilizando diferentes programas de bioinformática. A validação de biomarcadores deve ser efetuada por qPCR, sequenciação, imuno-histoquímica e FISH a > 200 HB. Finalmente, a utilidade terapêutica de certos biomarcadores será estudada em xenoenxertos estabelecidos a partir de HB humana e linhas celulares derivadas deles. Este é um estudo altamente translacional, uma vez que os resultados obtidos serão incluídos nos próximos ensaios clínicos liderados pelo grupo internacional SIOPEL (Childhood Liver Tumours Strategy Group). Além disso, embora a HB seja um tumor raro, dados anteriores indicam que os resultados podem ser extrapolados para outros cancros mais frequentes, como o hepatocarcinoma. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
Hepatoblastoma (HB) er den vigtigste ondartede tumor i leveren i barndommen. Helbredende behandling opnås ved at kombinere kemoterapi og kirurgi. 20 % af børnene overlever imidlertid ikke sygdommen, og de, der overlever, kan lide alvorlige livstidsfølger. Formålet med dette projekt er i) at karakterisere og identificere nye prognostiske markører for de mest aggressive former for BH fra en integreret transskriptionomisk, genomisk og proteomisk molekylær undersøgelse, ii) at generere et højt valideret sæt biomarkører og iii) at evaluere deres teoretiske værdi med det overordnede mål at forbedre den kliniske behandling og overlevelsen af patienter med BH. Som følge heraf har vi skabt en af verdens største samlinger af HB-prøver, som omfatter meget aggressive og dårligt studerede former. Karakteriseringen af disse tumorer vil blive udført på transcriptomic (RNA-Seq) og genomisk niveau (Exome sekventering og SNP arrays). De genererede data vil blive integreret med tidligere opnåede kliniske data, proteomiske data og genekspressionsdata ved hjælp af forskellige bioinformatikprogrammer. Biomarkørvalidering foretages ved qPCR, sekventering, immunhistokemi og FISH ved > 200 HB'er. Endelig vil visse biomarkørers terapeutiske anvendelighed blive undersøgt i xenografter, der er etableret ud fra humane HB- og cellelinjer afledt heraf. Dette er en meget translationel undersøgelse, da de opnåede resultater vil blive inkluderet i kommende kliniske forsøg ledet af den internationale SIOPEL gruppe (Childhood Liver Tumours Strategy Group). Desuden, selv om HB er en sjælden tumor, tidligere data indikerer, at resultaterne kan ekstrapoleres til andre hyppigere kræftformer, såsom hepatocarcinom. (Danish)
4 August 2022
0 references
Hepatoblastomul (HB) este principala tumoare malignă a ficatului în copilărie. Tratamentul curativ se realizează prin combinarea chimioterapiei cu chirurgia. Cu toate acestea, 20 % dintre copii nu supraviețuiesc bolii, iar cei care supraviețuiesc pot suferi sechele severe pe viață. Obiectivul acestui proiect este (i) caracterizarea și identificarea de noi markeri de prognostic ai celor mai agresive forme de BH dintr-un studiu molecular integral transcrizomic, genomic și proteomic, (ii) generarea unui set de biomarkeri extrem de validați și (iii) evaluarea valorii lor teoretice, cu obiectivul general de îmbunătățire a managementului clinic și a supraviețuirii pacienților cu BH. Ca urmare, am creat una dintre cele mai mari colecții de mostre de HB din lume, care include forme foarte agresive și slab studiate. Caracterizarea acestor tumori vor fi efectuate la nivelul transcriminal (ARN-Seq) și genomic (secvențierea exome și matricele SNP). Datele generate vor fi integrate cu datele clinice, proteomice și gene obținute anterior, folosind diferite programe bioinformatice. Validarea markerilor biologici se efectuează prin qPCR, secvențiere, imunohistochimie și FISH la > 200 HBs. În cele din urmă, utilitatea terapeutică a anumitor biomarkeri va fi studiată în xenografte stabilite din HB uman și linii celulare derivate din acestea. Acesta este un studiu foarte translațional, deoarece rezultatele obținute vor fi incluse în viitoarele studii clinice conduse de grupul internațional SIOPEL (Childhood Liver Tumours Strategy Group). În plus, deși HB este o tumoare rară, datele anterioare indică faptul că rezultatele pot fi extrapolate la alte tipuri de cancer mai frecvente, cum ar fi hepatocarcinomul. (Romanian)
4 August 2022
0 references
Hepatoblastoma (HB) är den huvudsakliga maligna tumören i levern i barndomen. Botande behandling uppnås genom att kombinera kemoterapi och kirurgi. 20 procent av barnen överlever dock inte sjukdomen och de som överlever kan drabbas av allvarliga livslånga följdverkningar. Syftet med detta projekt är att i) karakterisera och identifiera nya prognostiska markörer för de mest aggressiva formerna av BH från en integrerad transkriptonomisk, genomisk och proteomisk molekylär studie, ii) att generera en mycket validerad uppsättning biomarkörer och iii) att utvärdera deras teoretiska värde, med det övergripande målet att förbättra den kliniska hanteringen och överlevnaden för patienter med BH. Som ett resultat har vi skapat en av världens största samlingar av HB-prover, som innehåller mycket aggressiva och dåligt studerade former. Karakteriseringen av dessa tumörer kommer att utföras på transkriptomisk (RNA-Seq) och genomisk nivå (Exome sekvensering och SNP arrays). De data som genereras kommer att integreras med tidigare erhållna kliniska, proteomiska och genuttrycksdata, med hjälp av olika bioinformatikprogram. Validering av biomarkörer ska utföras genom qPCR, sekvensering, immunohistokemi och FISH vid > 200 HBs. Slutligen kommer den terapeutiska användbarheten av vissa biomarkörer att studeras i xenografter etablerade från humant HB och cellinjer som härrör från dem. Detta är en mycket translationell studie, eftersom de erhållna resultaten kommer att ingå i kommande kliniska prövningar som leds av den internationella SIOPEL-gruppen (Childhood Liver Tumours Strategy Group). Dessutom, även om HB är en sällsynt tumör, tyder tidigare data på att resultaten kan extrapoleras till andra mer frekventa cancerformer, såsom hepatocarcinom. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Badalona
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI13_02340
0 references