INTERACTION OF FLAVIVIRUS POLYMERASES WITH CELLULAR FACTORS. (Q3154270)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3154270 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | INTERACTION OF FLAVIVIRUS POLYMERASES WITH CELLULAR FACTORS. |
Project Q3154270 in Spain |
Statements
87,729.84 Euro
0 references
108,900.0 Euro
0 references
80.56 percent
0 references
30 December 2016
0 references
31 December 2020
0 references
UNIVERSIDAD DE CASTILLA-LA MANCHA
0 references
2006
0 references
LOS VIRUS SON PARASITOS INTRACELULARES OBLIGADOS QUE INTERACCIONAN CON LA MAQUINARIA CELULAR EN TODOS Y CADA UNO DE LOS PASOS DE SU CICLO REPLICATIVO. EL CONOCIMIENTO DE LA INTERACCION VIRUS-CELULA ABRE OPORTUNIDADES PARA MODULAR CADA UNO DE LOS COMPONENTES DE DICHA INTERACCION. EL VIRUS DE LA HEPATITIS C (HCV) ES UN VIRUS CON TROPISMO HEPATICO, AGENTE CAUSAL DE LA HEPATITIS C, Y PRINCIPAL CAUSANTE DE CIRROSIS Y CARCINOMA HEPATOCELULAR. LAS RELACIONES QUE EL HCV ESTABLECE CON COMPONENTES CELULARES INCLUYEN, ENTRE OTROS, RECEPTORES DE MEMBRANA, PROTEINAS IMPLICADAS EN RUTAS DE SEÑALIZACION Y CONTROL DE CICLO CELULAR, RUTAS DEL METABOLISMO DEL RNA, ETC. MI GRUPO TIENE UNA GRAN EXPERIENCIA PREVIA EN EL ESTUDIO Y ANALISIS DE LA POLIMERASA DEL HCV. DESDE HACE UNOS AÑOS, Y COMO CONSECUENCIA DE UNA ESTANCIA POSDOCTORAL PREVIA DEL INVESTIGADOR PRINCIPAL, LA LINEA DE INVESTIGACION SE HA ABIERTO A FACTORES CELULARES QUE INTERACCIONAN CON LA POLIMERASA VIRAL. FRUTO DE ESTE TRABAJO, MI GRUPO DEFINIO LA INTERACCION DE NS5B CON EL RECEPTOR ALFA DE ESTROGENOS (HILLUNG ET AL, J GEN VIROL 2012;93:780-5). MUY RECIENTEMENTE, Y LIDERANDO LA COLABORACION CON OTROS GRUPOS, HEMOS DEFINIDO LA INTERACCION DE NS5B CON LA QUINASA CELULAR AKT/PKB (VALERO ET AL, ANTIMICROB AGENTS CHEMOTHER 2016; IN PRESS). LOS RESULTADOS OBTENIDOS INCLUYEN LA FOSFORILACION IN VITRO DE NS5B POR AKT/PKB RECOMBINANTE ASI COMO LA INTERACCION PROPIAMENTE DICHA ANALIZADA MEDIANTE EXPERIMENTOS DE CO-INMUNOPRECIPITACION. ADEMAS, LA CO-LOCALIZACION INTRACELULAR DE AKT/PKB CON NS5B, BIEN EXPRESADAS ECTOPICAMENTE DE MANERA TRANSITORIA (TRANSFECCION DE PLASMIDOS) O DE MANERA ESTABLE (MANTENIENDO UN REPLICON SUBGENOMICO), BIEN EN CELULAS QUE SOPORTAN ACTIVAMENTE LA INFECCION CON HCVCC, NOS HA PERMITIDO CONCLUIR QUE LA INTERACCION NS5B-AKT/PKB INDUCE UN CAMBIO EN LA LOCALIZACION INTRACELULAR DE AKT/PKB, PASANDO DE CITOPLASMICA A PERINUCLEAR, DONDE SE SITUAN LOS COMPLEJOS REPLICATIVOS DE HCV. OTROS GRUPOS HAN DEMOSTRADO QUE LA ACTIVACION DE AKT/PKB ES CRUCIAL EN LOS PASOS INICIALES DE LA INFECCION POR HCV, PERMITIENDO LA ENTRADA DEL VIRUS EN LA CELULA (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012;287:41922-30; HUANG ET AL AUTOPHAGY. 2013;9(2):175-95). ESTA ACTIVACION, QUE TIENE LUGAR EN LA MEMBRANA PLASMATICA, DESAPARECE A LAS POCAS HORAS POSTINFECCION. ESTOS RESULTADOS PREVIOS NOS ANIMAN A SOLICITAR UN PROYECTO QUE NOS PERMITA AHONDAR EN ESTA INTERACCION, DEFINIENDO I) LOS RESIDUOS DE NS5B IMPLICADOS EN LA INTERACCION CON AKT/PKB, II) LOS RESIDUOS DE NS5B QUE SON FOSFORILADOS POR AKT/PKB, III) EL EFECTO QUE EL CAMBIO DE LOCALIZACION DE AKT/PKB TIENE SOBRE EL CICLO REPLICATIVO DE HCV, Y IV) EL EFECTO QUE NS5B TIENE SOBRE LA VIA DE SEÑALIZACION PI3K-AKT/PKB-MTOR. POR ULTIMO, LA GRAN HOMOLOGIA DE ALGUNAS DE LAS SECUENCIAS SUSCEPTIBLES DE SER FOSFORILADAS EN HCV CON OTROS MIEMBROS DE LA FAMILIA FLAVIVIRIDAE NOS ANIMA A EXTENDER ESTOS ANALISIS A VIRUS DE LOS GENEROS FLAVIVIRUS Y PESTIVIRUS. (Spanish)
0 references
VIRUSES ARE FORCED INTRACELLULAR PARASITES THAT INTERACT WITH CELL MACHINERY IN EACH AND EVERY STEP OF THEIR REPLICATIVE CYCLE. KNOWLEDGE OF VIRUS-CELL INTERACTION OPENS UP OPPORTUNITIES TO MODULATE EACH OF THE COMPONENTS OF THIS INTERACTION. HEPATITIS C VIRUS (HCV) IS A VIRUS WITH HEPATIC TROPISM, A CAUSAL AGENT OF HEPATITIS C, AND THE MAIN CAUSE OF CIRRHOSIS AND HEPATOCELLULAR CARCINOMA. THE RELATIONSHIPS THAT HCV ESTABLISHES WITH CELLULAR COMPONENTS INCLUDE, AMONG OTHERS, MEMBRANE RECEPTORS, PROTEINS INVOLVED IN CELL CYCLE SIGNALING AND CONTROL PATHWAYS, RNA METABOLISM PATHWAYS, ETC. MY GROUP HAS EXTENSIVE PREVIOUS EXPERIENCE IN THE STUDY AND ANALYSIS OF HCV POLYMERASE. FOR A FEW YEARS, AND AS A RESULT OF A PREVIOUS POSTDOCTORAL STAY OF THE PRINCIPAL INVESTIGATOR, THE RESEARCH LINE HAS BEEN OPENED TO CELLULAR FACTORS THAT INTERACT WITH VIRAL POLYMERASE. AS A RESULT OF THIS WORK, MY GROUP DEFINED NS5B INTERACTION WITH THE ESTROGEN ALPHA RECEPTOR (HILLUNG ET AL, J GENE VIROL 2012;93:780-5). VERY RECENTLY, AND LEADING THE COLLABORATION WITH OTHER GROUPS, WE HAVE DEFINED NS5B’S INTERACTION WITH AKT/PKB CELLULAR KINASE (VALERO ET AL, ANTIMICROB AGENTS CHEMOTHER 2016; IN PRESS). THE RESULTS OBTAINED INCLUDE THE IN VITRO PHOSPHORYLATION OF NS5B BY RECOMBINANT AKT/PKB AS WELL AS THE INTERACTION ITSELF ANALYSED BY CO-INMUNOPRECIPITATION EXPERIMENTS. IN ADDITION, THE INTRACELLULAR CO-LOCATION OF AKT/PKB WITH NS5B, EITHER EXPRESSED ECTOPICAMENTE EITHER TEMPORARILY (PLASMID TRANSFUSION) OR IN A STABLE MANNER (MAINTAINING A SUBGENOMIC REPLICON), OR IN CELLS THAT ACTIVELY SUPPORT HCVCC INFECTION, HAS ALLOWED US TO CONCLUDE THAT THE NS5B-AKT/PKB INTERACTION INDUCES A CHANGE IN THE INTRACELLULAR LOCATION OF AKT/PKB, MOVING FROM CYTOPLASMIC TO PERINUCLEAR, WHERE HCV REPLICATIVE COMPLEXES ARE LOCATED. OTHER GROUPS HAVE SHOWN THAT ACTIVATION OF AKT/PKB IS CRUCIAL IN THE INITIAL STEPS OF HCV INFECTION, ALLOWING THE VIRUS TO ENTER THE CELL (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012;287:41922-30; HUANG ET AL AUTOPHAGY. 2013;9(2):175-95). THIS ACTIVATION, WHICH TAKES PLACE IN THE PLASMA MEMBRANE, DISAPPEARS WITHIN A FEW HOURS POSTINFECTION. THESE PREVIOUS RESULTS ENCOURAGE US TO REQUEST A PROJECT THAT ALLOWS US TO DEEPEN THIS INTERACTION, DEFINING I) THE NS5B RESIDUES INVOLVED IN THE INTERACTION WITH AKT/PKB, II) THE NS5B RESIDUES THAT ARE PHOSPHORYLATED BY AKT/PKB, III) THE EFFECT THAT THE CHANGE OF LOCATION OF AKT/PKB HAS ON THE REPLICATIVE CYCLE OF HCV, AND IV) THE EFFECT NS5B HAS ON THE PI3K-AKT/PKB-MTOR SIGNALING ROUTE. FINALLY, THE GREAT HOMOLOGY OF SOME OF THE SEQUENCES LIKELY TO BE PHOSPHORYLATED IN HCV WITH OTHER MEMBERS OF THE FLAVIVIRIDAE FAMILY ENCOURAGES US TO EXTEND THESE ANALYSES TO VIRUSES OF THE FLAVIVIRUS AND PESTIVIRUS GENE. (English)
12 October 2021
0.9450279366456122
0 references
LES VIRUS SONT DES PARASITES INTRACELLULAIRES FORCÉS QUI INTERAGISSENT AVEC LES MACHINES CELLULAIRES À CHAQUE ÉTAPE DE LEUR CYCLE DE REPRODUCTION. LA CONNAISSANCE DE L’INTERACTION VIRUS-CELLULE OUVRE LA POSSIBILITÉ DE MODULER CHACUNE DES COMPOSANTES DE CETTE INTERACTION. LE VIRUS DE L’HÉPATITE C (VHC) EST UN VIRUS AVEC TROPISME HÉPATIQUE, UN AGENT CAUSAL DE L’HÉPATITE C ET LA PRINCIPALE CAUSE DE CIRRHOSE ET DE CARCINOME HÉPATOCELLULAIRE. LES RELATIONS QUE LE VHC ÉTABLIT AVEC LES COMPOSANTES CELLULAIRES COMPRENNENT, ENTRE AUTRES, LES RÉCEPTEURS MEMBRANAIRES, LES PROTÉINES IMPLIQUÉES DANS LA SIGNALISATION ET LES VOIES DE CONTRÔLE DU CYCLE CELLULAIRE, LES VOIES MÉTABOLIQUES DE L’ARN, ETC. MON GROUPE POSSÈDE UNE VASTE EXPÉRIENCE ANTÉRIEURE DANS L’ÉTUDE ET L’ANALYSE DE LA POLYMÉRASE DU VHC. DEPUIS QUELQUES ANNÉES, ET À LA SUITE D’UN PRÉCÉDENT SÉJOUR POSTDOCTORAL DU CHERCHEUR PRINCIPAL, LA RECHERCHE A ÉTÉ OUVERTE AUX FACTEURS CELLULAIRES QUI INTERAGISSENT AVEC LA POLYMÉRASE VIRALE. À LA SUITE DE CE TRAVAIL, MON GROUPE A DÉFINI L’INTERACTION NS5B AVEC LE RÉCEPTEUR ALPHA DE L’OESTROGÈNE (HILLUNG ET AL, GÈNE J VIROL 2012;93:780-5). TRÈS RÉCEMMENT, ET DIRIGEANT LA COLLABORATION AVEC D’AUTRES GROUPES, NOUS AVONS DÉFINI L’INTERACTION DE NS5B AVEC LA KINASE CELLULAIRE AKT/PKB (VALERO ET AL, ANTIMICROB AGENTS CHEMOTHER 2016; DANS LA PRESSE). LES RÉSULTATS OBTENUS COMPRENNENT LA PHOSPHORYLATION IN VITRO DU NS5B PAR L’AKT/PKB RECOMBINANT AINSI QUE L’INTERACTION ELLE-MÊME ANALYSÉE PAR DES EXPÉRIENCES DE CO-INMUNOPRECIPITATION. DE PLUS, LA COLOCALISATION INTRACELLULAIRE DE L’AKT/PKB AVEC LE NS5B, SOIT EXPRIMÉE ECTOPICAMENTE SOIT TEMPORAIREMENT (TRANSFUSION PLASMATIQUE) SOIT DE MANIÈRE STABLE (MAINTENANT UN REPLICON SUBGÉNOMIQUE), SOIT DANS LES CELLULES QUI SOUTIENNENT ACTIVEMENT L’INFECTION PAR LE HCVCC, NOUS A PERMIS DE CONCLURE QUE L’INTERACTION NS5B-AKT/PKB INDUIT UN CHANGEMENT DE L’EMPLACEMENT INTRACELLULAIRE DE L’AKT/PKB, PASSANT DE CYTOPLASMIQUE À PÉRINUCLÉAIRE, OÙ SE TROUVENT LES COMPLEXES RÉPLICATIFS DU VHC. D’AUTRES GROUPES ONT MONTRÉ QUE L’ACTIVATION DE L’AKT/PKB EST CRUCIALE DANS LES PREMIÈRES ÉTAPES DE L’INFECTION PAR LE VHC, CE QUI PERMET AU VIRUS D’ENTRER DANS LA CELLULE (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012;287:41922-30; HUANG ET AL AUTOPHAGY. 2013; 9(2):175-95). CETTE ACTIVATION, QUI A LIEU DANS LA MEMBRANE PLASMATIQUE, DISPARAÎT EN QUELQUES HEURES APRÈS L’INFECTION. CES RÉSULTATS PRÉCÉDENTS NOUS INCITENT À DEMANDER UN PROJET QUI NOUS PERMET D’APPROFONDIR CETTE INTERACTION, EN DÉFINISSANT I) LES RÉSIDUS NS5B IMPLIQUÉS DANS L’INTERACTION AVEC L’AKT/PKB, II) LES RÉSIDUS NS5B PHOSPHORYLÉS PAR AKT/PKB, III) L’EFFET QUE LE CHANGEMENT DE LOCALISATION DE L’AKT/PKB A SUR LE CYCLE DE REPRODUCTION DU VHC, ET IV) L’EFFET DU NS5B SUR LA ROUTE DE SIGNALISATION PI3K-AKT/PKB-MTOR. ENFIN, LA GRANDE HOMOLOGIE DE CERTAINES DES SÉQUENCES SUSCEPTIBLES D’ÊTRE PHOSPHORYLÉES DANS LE VHC AVEC D’AUTRES MEMBRES DE LA FAMILLE DES FLAVIVIRIDAE NOUS ENCOURAGE À ÉTENDRE CES ANALYSES AUX VIRUS DU GÈNE DU FLAVIVIRUS ET DU PESTIVIRUS. (French)
2 December 2021
0 references
VIREN SIND INTRAZELLULÄRE PARASITEN, DIE MIT ZELLMASCHINEN IN JEDEM SCHRITT IHRES REPLIKATIONSZYKLUS INTERAGIEREN. DAS WISSEN ÜBER DIE VIRENZELL-INTERAKTION ERÖFFNET MÖGLICHKEITEN, JEDE KOMPONENTE DIESER INTERAKTION ZU MODULIEREN. HEPATITIS C-VIRUS (HCV) IST EIN VIRUS MIT LEBERTROPISMUS, EINEM URSÄCHLICHEN MITTEL DER HEPATITIS C UND DER HAUPTURSACHE FÜR ZIRRHOSE UND HEPATOZELLULÄRES KARZINOM. ZU DEN BEZIEHUNGEN, DIE HCV MIT ZELLULÄREN KOMPONENTEN ETABLIERT, GEHÖREN UNTER ANDEREM MEMBRANREZEPTOREN, PROTEINE, DIE AN DER SIGNALISIERUNG UND STEUERUNG VON ZELLZYKLEN BETEILIGT SIND, RNA STOFFWECHSELPFADE USW. MEINE GRUPPE VERFÜGT ÜBER UMFANGREICHE ERFAHRUNGEN IN DER STUDIE UND ANALYSE VON HCV-POLYMERASE. SEIT EINIGEN JAHREN UND INFOLGE EINES FRÜHEREN POSTDOKTORATSAUFENTHALTS DES HAUPTFORSCHERS WURDE DIE FORSCHUNGSLINIE FÜR ZELLULÄRE FAKTOREN GEÖFFNET, DIE MIT VIRALER POLYMERASE INTERAGIEREN. ALS ERGEBNIS DIESER ARBEIT DEFINIERTE MEINE GRUPPE NS5B-INTERAKTION MIT DEM ÖSTROGEN-ALPHA-REZEPTOR (HILLUNG ET AL, J-GEN VIROL 2012;93:780-5). VOR KURZEM HABEN WIR DIE INTERAKTION VON NS5B MIT AKT/PKB-ZELLKINASE DEFINIERT (VALERO ET AL, ANTIMICROB AGENTEN CHEMOTHER 2016; IN DER PRESSE). DIE GEWONNENEN ERGEBNISSE UMFASSEN DIE IN-VITRO-PHOSPHORYLIERUNG VON NS5B DURCH REKOMBINANTE AKT/PKB SOWIE DIE WECHSELWIRKUNG SELBST, DIE DURCH CO-INMUNOPRECIPITATION-EXPERIMENTE ANALYSIERT WIRD. DARÜBER HINAUS HAT DIE INTRAZELLULÄRE KO-LOKATION VON AKT/PKB MIT NS5B, ENTWEDER ECTOPICAMENTE, ENTWEDER VORÜBERGEHEND (PLASMATRANSFUSION) ODER IN STABILER WEISE (UNTER BEIBEHALTUNG EINES SUBGENOMISCHEN REPLICONS) ODER IN ZELLEN, DIE EINE HCVCC-INFEKTION AKTIV UNTERSTÜTZEN, DEN SCHLUSS GEZOGEN, DASS DIE NS5B-AKT/PKB-INTERAKTION EINE ÄNDERUNG DES INTRAZELLULÄREN STANDORTS VON AKT/PKB HERVORRUFT UND SICH VON ZYTOPLASMISCHEN ZU PERINUCLEAR BEWEGT, WO SICH HCV-REPLIKTIONSKOMPLEXE BEFINDEN. ANDERE GRUPPEN HABEN GEZEIGT, DASS DIE AKTIVIERUNG VON AKT/PKB IN DEN ERSTEN SCHRITTEN DER HCV-INFEKTION ENTSCHEIDEND IST, SODASS DAS VIRUS IN DIE ZELLE GELANGEN KANN (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012;287:41922-30; HUANG ET AL AUTOPHAGIE. 2013;9(2):175-95). DIESE AKTIVIERUNG, DIE IN DER PLASMAMEMBRAN STATTFINDET, VERSCHWINDET INNERHALB WENIGER STUNDEN NACH DER INFEKTION. DIESE FRÜHEREN ERGEBNISSE ERMUTIGEN UNS, EIN PROJEKT ANZUFORDERN, DAS ES UNS ERMÖGLICHT, DIESE INTERAKTION ZU VERTIEFEN UND I) DIE NS5B-RÜCKSTÄNDE ZU DEFINIEREN, DIE AN DER INTERAKTION MIT AKT/PKB, II) BETEILIGT SIND, DIE NS5B-RÜCKSTÄNDE, DIE DURCH AKT/PKB, III PHOSPHORYLIERT WERDEN, DEN EFFEKT HABEN, DASS DIE ÄNDERUNG DES STANDORTS VON AKT/PKB AUF DEN REPLIKATIONSZYKLUS VON HCV UND IV) DIE WIRKUNG HAT, DIE NS5B AUF DIE SIGNALROUTE PI3K-AKT/PKB-MTOR HAT. SCHLIESSLICH ERMUTIGT UNS DIE GROSSE HOMOLOGIE EINIGER SEQUENZEN, DIE IM HCV MIT ANDEREN MITGLIEDERN DER FLAVIVIRIDAE-FAMILIE PHOSPHORYLIERT WERDEN KÖNNTEN, DIESE ANALYSEN AUF VIREN DES FLAAVIVIRUS- UND PESTIVIRUS-GENS AUSZUDEHNEN. (German)
9 December 2021
0 references
VIRUSSEN ZIJN GEFORCEERDE INTRACELLULAIRE PARASIETEN DIE INTERAGEREN MET CELMACHINES IN ELKE STAP VAN HUN REPLICATIECYCLUS. KENNIS VAN VIRUS-CEL INTERACTIE OPENT MOGELIJKHEDEN OM ELK VAN DE COMPONENTEN VAN DEZE INTERACTIE TE MODULEREN. HEPATITIS C-VIRUS (HCV) IS EEN VIRUS MET LEVERTROPISME, EEN OORZAKELIJK AGENS VAN HEPATITIS C EN DE BELANGRIJKSTE OORZAAK VAN CIRROSE EN HEPATOCELLULAIR CARCINOOM. DE RELATIES DIE HCV TOT STAND BRENGT MET CELLULAIRE COMPONENTEN OMVATTEN ONDER ANDERE MEMBRAANRECEPTOREN, EIWITTEN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ DE SIGNAAL- EN CONTROLEROUTES VAN DE CELCYCLUS, RNA-METABOLISMEROUTES, ENZ. MIJN GROEP HEEFT UITGEBREIDE ERVARING MET DE STUDIE EN ANALYSE VAN HCV-POLYMERASE. VOOR EEN PAAR JAAR, EN ALS GEVOLG VAN EEN VORIG POSTDOCTORAAL VERBLIJF VAN DE HOOFDONDERZOEKER, IS DE ONDERZOEKSLIJN GEOPEND VOOR CELLULAIRE FACTOREN DIE INTERAGEREN MET VIRALE POLYMERASE. ALS GEVOLG VAN DIT WERK DEFINIEERDE MIJN GROEP NS5B INTERACTIE MET DE OESTROGEEN ALFARECEPTOR (HILLUNG ET AL, J GEN VIROL 2012;93:780-5). ZEER RECENT HEBBEN WE DE INTERACTIE VAN NS5B MET AKT/PKB CELLULAIRE KINASE (VALERO ET AL, ANTIMICROB AGENTS CHEMOTHER 2016; IN DE PERS). DE VERKREGEN RESULTATEN OMVATTEN DE IN VITRO FOSFORYLATIE VAN NS5B DOOR RECOMBINANT AKT/PKB EN DE INTERACTIE ZELF GEANALYSEERD DOOR CO-INMUNOPRECIPITATION EXPERIMENTEN. DAARNAAST HEEFT DE INTRACELLULAIRE COLOCATIE VAN AKT/PKB MET NS5B, OFWEL ECTOPICAMENTE UITGEDRUKT HETZIJ TIJDELIJK (PLASMIDETRANSFUSIE) OFWEL OP STABIELE WIJZE (MET BEHOUD VAN EEN SUBGENOMIC REPLICON), OF IN CELLEN DIE EEN HCVCC-INFECTIE ACTIEF ONDERSTEUNEN, ONS IN STAAT GESTELD TE CONCLUDEREN DAT DE INTERACTIE MET NS5B-AKT/PKB EEN VERANDERING IN DE INTRACELLULAIRE LOCATIE VAN AKT/PKB VEROORZAAKT, DIE VAN CYTOPLASMA NAAR PERINUCLEAR OVERGAAT, WAAR HCV REPLICATIEVE COMPLEXEN ZICH BEVINDEN. ANDERE GROEPEN HEBBEN AANGETOOND DAT ACTIVERING VAN AKT/PKB CRUCIAAL IS IN DE EERSTE STAPPEN VAN HCV-INFECTIE, WAARDOOR HET VIRUS DE CEL BINNEN KAN KOMEN (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012;287:41922-30; HUANG ET AL AUTOPHAGY. 2013;9(2): 175-95). DEZE ACTIVERING, DIE PLAATSVINDT IN HET PLASMAMEMBRAAN, VERDWIJNT BINNEN EEN PAAR UUR NA INFECTIE. DEZE EERDERE RESULTATEN MOEDIGEN ONS AAN OM EEN PROJECT TE VRAGEN DAT ONS IN STAAT STELT DEZE INTERACTIE TE VERDIEPEN, WAARBIJ I) DE NS5B-RESIDUEN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ DE INTERACTIE MET AKT/PKB, II) DE NS5B-RESIDUEN DIE DOOR AKT/PKB WORDEN GEFOSFORYLEERD, III) HET EFFECT VAN DE VERANDERING VAN LOCATIE VAN AKT/PKB OP DE REPLICATIEVE CYCLUS VAN HCV, EN IV) HET EFFECT VAN NS5B OP DE PI3K-AKT/PKB-MTOR-SIGNALERINGSROUTE. TEN SLOTTE MOEDIGT DE GROTE HOMOLOGIE VAN SOMMIGE SEQUENTIES DIE IN HCV MET ANDERE LEDEN VAN DE FAMILIE FLAVIVIRIDAE KUNNEN WORDEN GEFOSFORYLEERD, ONS AAN OM DEZE ANALYSES UIT TE BREIDEN TOT VIRUSSEN VAN HET FLAVIVIRUS- EN PESTIVIRUSGEN. (Dutch)
17 December 2021
0 references
I VIRUS SONO PARASSITI INTRACELLULARI FORZATI CHE INTERAGISCONO CON LE MACCHINE CELLULARI IN OGNI FASE DEL LORO CICLO REPLICATIVO. LA CONOSCENZA DELL'INTERAZIONE VIRUS-CELLULA OFFRE OPPORTUNITÀ PER MODULARE CIASCUNO DEI COMPONENTI DI QUESTA INTERAZIONE. IL VIRUS DELL'EPATITE C (HCV) È UN VIRUS CON TROPISMO EPATICO, UN AGENTE CAUSALE DELL'EPATITE C, E LA PRINCIPALE CAUSA DI CIRROSI E CARCINOMA EPATOCELLULARE. LE RELAZIONI CHE HCV STABILISCE CON I COMPONENTI CELLULARI INCLUDONO, TRA GLI ALTRI, I RECETTORI DELLA MEMBRANA, LE PROTEINE COINVOLTE NELLE VIE DI SEGNALAZIONE E CONTROLLO DEL CICLO CELLULARE, LE VIE DEL METABOLISMO DELL'RNA, ECC. IL MIO GRUPPO HA UNA VASTA ESPERIENZA PRECEDENTE NELLO STUDIO E NELL'ANALISI DELLA POLIMERASI HCV. PER ALCUNI ANNI, E COME RISULTATO DI UNA PRECEDENTE PERMANENZA POST-DOTTORATO DEL RICERCATORE PRINCIPALE, LA LINEA DI RICERCA È STATA APERTA A FATTORI CELLULARI CHE INTERAGISCONO CON LA POLIMERASI VIRALE. COME RISULTATO DI QUESTO LAVORO, IL MIO GRUPPO HA DEFINITO L'INTERAZIONE NS5B CON IL RECETTORE ALFA ESTROGENO (HILLUNG ET AL, J GENE VIROL 2012; 93:780-5). MOLTO RECENTEMENTE, E GUIDANDO LA COLLABORAZIONE CON ALTRI GRUPPI, ABBIAMO DEFINITO L'INTERAZIONE DI NS5B CON LA CHINASI CELLULARE AKT/PKB (VALERO ET AL, ANTIMICROB AGENTI CHEMOTHER 2016; NELLA STAMPA). I RISULTATI OTTENUTI INCLUDONO LA FOSFORILAZIONE IN VITRO DI NS5B MEDIANTE AKT/PKB RICOMBINANTE E L'INTERAZIONE STESSA ANALIZZATA DA ESPERIMENTI DI CO-INMUNOPRECIPITATION. INOLTRE, LA CO-LOCAZIONE INTRACELLULARE DI AKT/PKB CON NS5B, ESPRESSA O ECTOPICAMENTE TEMPORANEAMENTE (TRASFUSIONE DI PLASMIDE) O IN MODO STABILE (MANTENENDO UN REPLICON SUBGENOMICO), O IN CELLULE CHE SOSTENGONO ATTIVAMENTE L'INFEZIONE DA HCVCC, CI HA PERMESSO DI CONCLUDERE CHE L'INTERAZIONE NS5B-AKT/PKB INDUCE UN CAMBIAMENTO NELLA POSIZIONE INTRACELLULARE DI AKT/PKB, CHE SI SPOSTA DA CITOPLASMICA A PERINUCLEARE, DOVE SI TROVANO COMPLESSI REPLICATIVI HCV. ALTRI GRUPPI HANNO DIMOSTRATO CHE L'ATTIVAZIONE DI AKT/PKB È FONDAMENTALE NELLE FASI INIZIALI DELL'INFEZIONE DA HCV, PERMETTENDO AL VIRUS DI ENTRARE NELLA CELLULA (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012;287:41922-30; HUANG ET AL. AUTOFAGIA. 2013;9(2):175-95). QUESTA ATTIVAZIONE, CHE AVVIENE NELLA MEMBRANA PLASMATICA, SCOMPARE ENTRO POCHE ORE DOPO L'INFEZIONE. QUESTI RISULTATI PRECEDENTI CI INCORAGGIANO A RICHIEDERE UN PROGETTO CHE CI CONSENTA DI APPROFONDIRE QUESTA INTERAZIONE, DEFINENDO I) I RESIDUI NS5B COINVOLTI NELL'INTERAZIONE CON AKT/PKB, II) I RESIDUI NS5B CHE SONO FOSFORILATI DA AKT/PKB, III) L'EFFETTO CHE IL CAMBIAMENTO DI LOCALIZZAZIONE DI AKT/PKB HA SUL CICLO REPLICATIVO DELL'HCV, E IV) L'EFFETTO NS5B SUL PERCORSO DI SEGNALAZIONE PI3K-AKT/PKB-MTOR. INFINE, LA GRANDE OMOLOGIA DI ALCUNE DELLE SEQUENZE CHE POTREBBERO ESSERE FOSFORILATE IN HCV CON ALTRI MEMBRI DELLA FAMIGLIA FLAVIVIRIDAE CI INCORAGGIA AD ESTENDERE QUESTE ANALISI AI VIRUS DEL FLAVIVIRUS E DEL GENE DEL PESTIVIRUS. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΟΙ ΙΟΊ ΕΊΝΑΙ ΑΝΑΓΚΑΣΤΙΚΆ ΕΝΔΟΚΥΤΤΑΡΙΚΆ ΠΑΡΆΣΙΤΑ ΠΟΥ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΟΎΝ ΜΕ ΤΑ ΚΥΤΤΑΡΙΚΆ ΜΗΧΑΝΉΜΑΤΑ ΣΕ ΚΆΘΕ ΣΤΆΔΙΟ ΤΟΥ ΚΎΚΛΟΥ ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΉΣ ΤΟΥΣ. Η ΓΝΏΣΗ ΤΗΣ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗΣ ΙΏΝ-ΚΥΤΤΆΡΩΝ ΔΗΜΙΟΥΡΓΕΊ ΕΥΚΑΙΡΊΕΣ ΓΙΑ ΤΗ ΔΙΑΜΌΡΦΩΣΗ ΚΑΘΕΝΌΣ ΑΠΌ ΤΑ ΣΥΣΤΑΤΙΚΆ ΑΥΤΉΣ ΤΗΣ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗΣ. Ο ΙΌΣ ΤΗΣ ΗΠΑΤΊΤΙΔΑΣ C (HCV) ΕΊΝΑΙ ΈΝΑΣ ΙΌΣ ΜΕ ΗΠΑΤΙΚΌ ΤΡΟΠΙΣΜΌ, ΈΝΑΣ ΑΙΤΙΏΔΗΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑΣ ΤΗΣ ΗΠΑΤΊΤΙΔΑΣ C, ΚΑΙ Η ΚΎΡΙΑ ΑΙΤΊΑ ΤΗΣ ΚΊΡΡΩΣΗΣ ΚΑΙ ΤΟΥ ΗΠΑΤΟΚΥΤΤΑΡΙΚΟΎ ΚΑΡΚΙΝΏΜΑΤΟΣ. ΟΙ ΣΧΈΣΕΙΣ ΠΟΥ ΕΓΚΑΘΙΔΡΎΕΙ ΤΟ HCV ΜΕ ΤΑ ΚΥΤΤΑΡΙΚΆ ΣΥΣΤΑΤΙΚΆ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΟΥΝ, ΜΕΤΑΞΎ ΆΛΛΩΝ, ΥΠΟΔΟΧΕΊΣ ΜΕΜΒΡΑΝΏΝ, ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΠΟΥ ΕΜΠΛΈΚΟΝΤΑΙ ΣΕ ΚΥΤΤΑΡΙΚΟΎΣ ΚΎΚΛΟΥΣ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΚΑΙ ΟΔΟΎΣ ΕΛΈΓΧΟΥ, ΟΔΟΎΣ ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΎ RNA Κ.ΛΠ. Η ΟΜΆΔΑ ΜΟΥ ΈΧΕΙ ΕΚΤΕΤΑΜΈΝΗ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΗ ΕΜΠΕΙΡΊΑ ΣΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΚΑΙ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΗΣ ΠΟΛΥΜΕΡΆΣΗΣ HCV. ΓΙΑ ΜΕΡΙΚΆ ΧΡΌΝΙΑ, ΚΑΙ ΩΣ ΑΠΟΤΈΛΕΣΜΑ ΜΙΑΣ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΗΣ ΜΕΤΑΔΙΔΑΚΤΟΡΙΚΉΣ ΠΑΡΑΜΟΝΉΣ ΤΟΥ ΚΎΡΙΟΥ ΕΡΕΥΝΗΤΉ, Η ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΉ ΓΡΑΜΜΉ ΈΧΕΙ ΑΝΟΊΞΕΙ ΣΕ ΚΥΤΤΑΡΙΚΟΎΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ ΠΟΥ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΟΎΝ ΜΕ ΤΗΝ ΙΟΓΕΝΉ ΠΟΛΥΜΕΡΆΣΗ. ΩΣ ΑΠΟΤΈΛΕΣΜΑ ΑΥΤΉΣ ΤΗΣ ΕΡΓΑΣΊΑΣ, Η ΟΜΆΔΑ ΜΟΥ ΌΡΙΣΕ ΤΗΝ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ NS5B ΜΕ ΤΟΝ ΥΠΟΔΟΧΈΑ ΤΩΝ ΟΙΣΤΡΟΓΌΝΩΝ ΆΛΦΑ (HILLUNG ET AL, J ΓΟΝΊΔΙΟ VIROL 2012;93:780-5). ΠΟΛΎ ΠΡΌΣΦΑΤΑ, ΚΑΙ ΚΑΘΟΔΗΓΏΝΤΑΣ ΤΗ ΣΥΝΕΡΓΑΣΊΑ ΜΕ ΆΛΛΕΣ ΟΜΆΔΕΣ, ΟΡΊΣΑΜΕ ΤΗΝ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ ΤΗΣ NS5B ΜΕ ΤΗΝ ΚΥΤΤΑΡΙΚΉ ΚΙΝΆΣΗ AKT/PKB (VALERO ET AL, ΑΝΤΙΜΙΚΡΟΒΙΑΚΟΊ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ CHEMOTHER 2016; ΣΤΟΝ ΤΎΠΟ). ΤΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΠΟΥ ΕΛΉΦΘΗΣΑΝ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΟΥΝ ΤΗΝ IN VITRO ΦΩΣΦΟΡΥΛΊΩΣΗ ΤΟΥ NS5B ΑΠΌ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΈΝΟ AKT/PKB ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΤΗΝ ΊΔΙΑ ΤΗΝ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ ΠΟΥ ΑΝΑΛΎΘΗΚΕ ΜΕ ΠΕΙΡΆΜΑΤΑ ΣΥΝ-INMUNOPRECIPITATION. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, Η ΕΝΔΟΚΥΤΤΑΡΙΚΉ ΣΥΣΤΈΓΑΣΗ ΤΟΥ AKT/PKB ΜΕ NS5B, ΕΊΤΕ ΕΚΦΡΆΖΕΤΑΙ ΜΕ ECTOPICAMENTE ΕΊΤΕ ΠΡΟΣΩΡΙΝΆ (ΜΕΤΆΓΓΙΣΗ ΠΛΆΣΜΑΤΟΣ) ΕΊΤΕ ΜΕ ΣΤΑΘΕΡΌ ΤΡΌΠΟ (ΔΙΑΤΗΡΏΝΤΑΣ ΥΠΟΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΌ ΑΝΤΊΓΡΑΦΟ), ΕΊΤΕ ΣΕ ΚΎΤΤΑΡΑ ΠΟΥ ΥΠΟΣΤΗΡΊΖΟΥΝ ΕΝΕΡΓΆ ΤΗ ΛΟΊΜΩΞΗ HCVCC, ΜΑΣ ΕΠΈΤΡΕΨΕ ΝΑ ΣΥΜΠΕΡΆΝΟΥΜΕ ΌΤΙ Η ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ NS5B-AKT/PKB ΠΡΟΚΑΛΕΊ ΑΛΛΑΓΉ ΣΤΗΝ ΕΝΔΟΚΥΤΤΑΡΙΚΉ ΘΈΣΗ ΤΟΥ AKT/PKB, ΜΕΤΑΚΙΝΟΎΜΕΝΗ ΑΠΌ ΚΥΤΤΑΡΟΠΛΑΣΜΑΤΙΚΌ ΣΕ ΥΠΕΡΠΥΡΗΝΙΚΌ, ΌΠΟΥ ΒΡΊΣΚΟΝΤΑΙ ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΙΚΆ ΣΎΜΠΛΟΚΑ HCV. ΆΛΛΕΣ ΟΜΆΔΕΣ ΈΧΟΥΝ ΔΕΊΞΕΙ ΌΤΙ Η ΕΝΕΡΓΟΠΟΊΗΣΗ ΤΟΥ AKT/PKB ΕΊΝΑΙ ΖΩΤΙΚΉΣ ΣΗΜΑΣΊΑΣ ΣΤΑ ΑΡΧΙΚΆ ΣΤΆΔΙΑ ΤΗΣ ΛΟΊΜΩΞΗΣ ΑΠΌ HCV, ΕΠΙΤΡΈΠΟΝΤΑΣ ΣΤΟΝ ΙΌ ΝΑ ΕΙΣΈΛΘΕΙ ΣΤΟ ΚΎΤΤΑΡΟ (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012·287:41922-30· HUANG ET AL AUTOPHAGY. 2013·9(2):175-95). ΑΥΤΉ Η ΕΝΕΡΓΟΠΟΊΗΣΗ, Η ΟΠΟΊΑ ΛΑΜΒΆΝΕΙ ΧΏΡΑ ΣΤΗ ΜΕΜΒΡΆΝΗ ΠΛΆΣΜΑΤΟΣ, ΕΞΑΦΑΝΊΖΕΤΑΙ ΜΈΣΑ ΣΕ ΛΊΓΕΣ ΏΡΕΣ ΜΕΤΆ ΤΗ ΜΌΛΥΝΣΗ. ΑΥΤΆ ΤΑ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΜΑΣ ΕΝΘΑΡΡΎΝΟΥΝ ΝΑ ΖΗΤΉΣΟΥΜΕ ΈΝΑ ΈΡΓΟ ΠΟΥ ΜΑΣ ΕΠΙΤΡΈΠΕΙ ΝΑ ΕΜΒΑΘΎΝΟΥΜΕ ΑΥΤΉ ΤΗΝ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ, ΟΡΊΖΟΝΤΑΣ I) ΤΑ ΥΠΟΛΕΊΜΜΑΤΑ NS5B ΠΟΥ ΕΜΠΛΈΚΟΝΤΑΙ ΣΤΗΝ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ ΜΕ AKT/PKB, II) ΤΑ ΥΠΟΛΕΊΜΜΑΤΑ NS5B ΠΟΥ ΦΩΣΦΟΡΥΛΏΝΟΝΤΑΙ ΑΠΌ AKT/PKB, III) ΤΗΝ ΕΠΊΔΡΑΣΗ ΠΟΥ ΈΧΕΙ Η ΑΛΛΑΓΉ ΘΈΣΗΣ ΤΟΥ AKT/PKB ΣΤΟΝ ΚΎΚΛΟ ΑΝΑΠΑΡΑΓΩΓΉΣ ΤΟΥ HCV, ΚΑΙ IV) ΤΗΝ ΕΠΊΔΡΑΣΗ ΠΟΥ ΈΧΕΙ ΤΟ NS5B ΣΤΗ ΔΙΑΔΡΟΜΉ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ PI3K-AKT/PKB-MTOR. ΤΈΛΟΣ, Η ΜΕΓΆΛΗ ΟΜΟΛΟΓΊΑ ΟΡΙΣΜΈΝΩΝ ΑΠΌ ΤΙΣ ΑΛΛΗΛΟΥΧΊΕΣ ΠΟΥ ΕΝΔΈΧΕΤΑΙ ΝΑ ΦΩΣΦΟΡΥΛΙΩΘΟΎΝ ΣΤΟ HCV ΜΕ ΆΛΛΑ ΜΈΛΗ ΤΗΣ ΟΙΚΟΓΈΝΕΙΑΣ FLAVIVIRIDAE ΜΑΣ ΕΝΘΑΡΡΎΝΕΙ ΝΑ ΕΠΕΚΤΕΊΝΟΥΜΕ ΑΥΤΈΣ ΤΙΣ ΑΝΑΛΎΣΕΙΣ ΣΕ ΙΟΎΣ ΤΟΥ ΓΟΝΙΔΊΟΥ ΤΟΥ ΦΛΑΒΟΪΟΎ ΚΑΙ ΤΟΥ PESTIVIRUS. (Greek)
17 August 2022
0 references
VIRA ER TVUNGET INTRACELLULÆRE PARASITTER, DER INTERAGERER MED CELLEMASKINER I HVERT ENESTE TRIN I DERES REPLIKATIVE CYKLUS. VIDEN OM VIRUS-CELLE INTERAKTION ÅBNER MULIGHEDER FOR AT MODULERE HVER AF KOMPONENTERNE I DENNE INTERAKTION. HEPATITIS C-VIRUS (HCV) ER ET VIRUS MED HEPATISK TROPISME, EN ÅRSAGSFORBINDELSE TIL HEPATITIS C, OG HOVEDÅRSAGEN TIL CIRROSE OG HEPATOCELLULÆRT KARCINOM. DE RELATIONER, SOM HCV ETABLERER MED CELLULÆRE KOMPONENTER, OMFATTER BL.A. MEMBRANRECEPTORER, PROTEINER, DER ER INVOLVERET I CELLECYKLUSSIGNALERING OG KONTROLVEJE, RNA-METABOLISERINGSVEJE OSV. MIN GRUPPE HAR OMFATTENDE TIDLIGERE ERFARING I UNDERSØGELSEN OG ANALYSEN AF HCV-POLYMERASE. I ET PAR ÅR, OG SOM ET RESULTAT AF ET TIDLIGERE POSTDOCTORALT OPHOLD AF DEN LEDENDE INVESTIGATOR, ER FORSKNINGSLINJEN BLEVET ÅBNET FOR CELLULÆRE FAKTORER, DER INTERAGERER MED VIRAL POLYMERASE. SOM ET RESULTAT AF DETTE ARBEJDE DEFINEREDE MIN GRUPPE NS5B INTERAKTION MED ØSTROGEN ALFA RECEPTOR (HILLUNG ET AL, J GEN VIROL 2012;93:780-5). FOR GANSKE NYLIG, OG FØRENDE SAMARBEJDET MED ANDRE GRUPPER, HAR VI DEFINERET NS5B'S INTERAKTION MED AKT/PKB CELLULÆR KINASE (VALERO ET AL, ANTIMICROB MIDLER CHEMOTHER 2016; I PRESSEN). DE OPNÅEDE RESULTATER OMFATTER IN VITRO PHOSPHORYLATION AF NS5B VED REKOMBINANT AKT/PKB SAMT SELVE INTERAKTIONEN ANALYSERET VED CO-INMUNOPRECIPITATION-FORSØG. DESUDEN HAR DEN INTRACELLULÆRE SAMHUSNING AF AKT/PKB MED NS5B, ENTEN UDTRYKT ECTOPICAMENTE ENTEN MIDLERTIDIGT (PLASMIDTRANSFUSION) ELLER PÅ EN STABIL MÅDE (VEDLIGEHOLDELSE AF EN SUBGENOMISK REPLIKON) ELLER I CELLER, DER AKTIVT UNDERSTØTTER HCVCC-INFEKTION, GIVET OS MULIGHED FOR AT KONKLUDERE, AT INTERAKTIONEN MELLEM NS5B-AKT/PKB INDUCERER EN ÆNDRING I AKT/PKB'S INTRACELLULÆRE PLACERING, IDET DEN BEVÆGER SIG FRA CYTOPLASMISK TIL PERINUKLEÆR, HVOR HCV REPLIKTIVE KOMPLEKSER ER PLACERET. ANDRE GRUPPER HAR VIST, AT AKTIVERING AF AKT/PKB ER AFGØRENDE I DE INDLEDENDE TRIN AF HCV-INFEKTION, SÅ VIRUSSET KAN KOMME IND I CELLEN (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012;287:41922-30; HUANG ET AL AUTOFAGI. 2013;9(2):175-95). DENNE AKTIVERING, SOM FINDER STED I PLASMAMEMBRANEN, FORSVINDER INDEN FOR FÅ TIMER EFTER INFEKTION. DISSE TIDLIGERE RESULTATER OPFORDRER OS TIL AT ANMODE OM ET PROJEKT, DER GIVER OS MULIGHED FOR AT UDDYBE DENNE INTERAKTION, DEFINERE I) NS5B RESTKONCENTRATIONER, DER ER INVOLVERET I INTERAKTIONEN MED AKT/PKB, II) NS5B RESTKONCENTRATIONER, DER ER PHOSPHORYLERET AF AKT/PKB, III) DEN VIRKNING, AT ÆNDRINGEN AF PLACERING AF AKT/PKB HAR PÅ DEN REPLIKTIVE CYKLUS AF HCV, OG IV) EFFEKTEN NS5B HAR PÅ PI3K-AKT/PKB-MTOR SIGNALRUTE. ENDELIG, DEN STORE HOMOLOGI AF NOGLE AF DE SEKVENSER, DER SANDSYNLIGVIS VIL BLIVE PHOSPHORYLERET I HCV MED ANDRE MEDLEMMER AF FLAVIVIRIDAE FAMILIEN TILSKYNDER OS TIL AT UDVIDE DISSE ANALYSER TIL AT OMFATTE VIRUS AF FLAVIVIRUS OG PESTIVIRUS GENET. (Danish)
17 August 2022
0 references
VIRUKSET OVAT PAKOTETTUJA SOLUNSISÄISIÄ LOISIA, JOTKA OVAT VUOROVAIKUTUKSESSA SOLUKONEIDEN KANSSA NIIDEN REPLIKAATIOSYKLIN JOKAISESSA VAIHEESSA. TIETO VIRUKSEN JA SOLUJEN VÄLISESTÄ VUOROVAIKUTUKSESTA AVAA MAHDOLLISUUKSIA TÄMÄN VUOROVAIKUTUKSEN KUNKIN OSATEKIJÄN MUOKKAAMISEEN. HEPATIITTI C -VIRUS (HCV) ON VIRUS, JOLLA ON MAKSATROPISMI, HEPATIITTI C: N SYY-SEURAAJA JA MAKSASELLULAARISEN KARSINOOMAN PÄÄASIALLINEN SYY. SUHTEITA, JOTKA HCV LUO SOLUKOMPONENTTEIHIN, OVAT MUUN MUASSA KALVORESEPTORIT, SOLUSYKLIN SIGNALOINTI- JA OHJAUSREITIT, RNA-AINEENVAIHDUNNAN REITIT JNE. RYHMÄLLÄNI ON LAAJA AIEMPI KOKEMUS HCV POLYMERAASIN TUTKIMUKSESTA JA ANALYYSISTÄ. MUUTAMAN VUODEN AJAN JA PÄÄTUTKIJAN AIEMMAN TOHTORIN JÄLKEISEN OLESKELUN SEURAUKSENA TUTKIMUSLINJA ON AVATTU SOLUTEKIJÖILLE, JOTKA OVAT VUOROVAIKUTUKSESSA VIRUSPOLYMERAASIN KANSSA. TÄMÄN TYÖN TULOKSENA RYHMÄNI MÄÄRITTELI NS5B-VUOROVAIKUTUKSEN ESTROGEENIALFA-RESEPTORIN KANSSA (HILLUNG ET AL, J-GEENI VIROL 2012;93:780–5). AIVAN ÄSKETTÄIN, JA JOHTAVA YHTEISTYÖ MUIDEN RYHMIEN KANSSA, OLEMME MÄÄRITELLEET NS5B: N VUOROVAIKUTUKSEN AKT/PKB-SOLUKINAASIN KANSSA (VALERO ET AL, ANTIMICROB AGENTS CHEMOTHER 2016; LEHDISTÖSSÄ). SAATUIHIN TULOKSIIN SISÄLTYY NS5B:N IN VITRO -FOSFORYLAATIO REKOMBINANTTI AKT/PKB:N AVULLA SEKÄ YHTEISILLÄ INMUNOPRECIPITATION-KOKEILLA ANALYSOITU VUOROVAIKUTUS. LISÄKSI AKT/PKB:N SOLUNSISÄINEN SAMANAIKAINEN SIJAINTI NS5B:N KANSSA, JOKO TILAPÄISESTI (PLASMIDISIIRTO) TAI VAKAALLA TAVALLA (SUBGENOMINEN REPLIKONI) TAI SOLUISSA, JOTKA TUKEVAT AKTIIVISESTI HCVCC-INFEKTIOTA, ON ANTANUT MEILLE MAHDOLLISUUDEN PÄÄTELLÄ, ETTÄ NS5B-AKT:N JA PKB:N VÄLINEN VUOROVAIKUTUS AIHEUTTAA MUUTOKSEN AKT/PKB:N SOLUNSISÄISEEN SIJAINTIIN JA SIIRTYY SYTOPLASMASTA PERINUCLEARIIN, JOSSA HCV-REPLIKTIIVISET KOMPLEKSIT SIJAITSEVAT. MUUT RYHMÄT OVAT OSOITTANEET, ETTÄ AKT/PKB:N AKTIVOITUMINEN ON RATKAISEVAN TÄRKEÄÄ HCV-INFEKTION ALKUVAIHEESSA, JOLLOIN VIRUS PÄÄSEE SOLUUN (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012;287:41922–30; HUANG YM. AUTOFAGIA. 2013;9(2):175–95). TÄMÄ AKTIVAATIO, JOKA TAPAHTUU PLASMAKALVOSSA, HÄVIÄÄ MUUTAMAN TUNNIN KULUESSA POSTIN INFEKTIOSTA. NÄMÄ AIEMMAT TULOKSET KANNUSTAVAT MEITÄ PYYTÄMÄÄN HANKETTA, JONKA AVULLA VOIMME SYVENTÄÄ TÄTÄ VUOROVAIKUTUSTA, MÄÄRITTELEMÄLLÄ I) NS5B-JÄÄMÄT, JOTKA LIITTYVÄT VUOROVAIKUTUKSEEN AKT/PKB:N KANSSA, II) AKT/PKB:N FOSFORYLOIMAT NS5B-JÄÄMÄT, III) AKT/PKB:N SIJAINNIN MUUTOKSEN VAIKUTUS HCV:N REPLIKOIVAAN SYKLIIN JA IV) NS5B:N VAIKUTUS PI3K-AKT/PKB-MTOR-SIGNAALINANTOREITILLE. LOPUKSI JOIDENKIN HCV: SSÄ TODENNÄKÖISESTI FOSFORYLOITUJEN SEKVENSSIEN SUURI HOMOLOGIA MUIDEN FLAVIVIRIDAE-HEIMON JÄSENTEN KANSSA KANNUSTAA MEITÄ LAAJENTAMAAN NÄMÄ ANALYYSIT FLAVIVIRUKSEN JA PESTIVIRUSGEENIN VIRUKSIIN. (Finnish)
17 August 2022
0 references
IL-VAJRUSIS HUMA PARASSITI INTRAĊELLULARI SFURZATI LI JINTERAĠIXXU MAL-MAKKINARJU TAĊ-ĊELLOLI F’KULL PASS TAĊ-ĊIKLU REPLIKATTIV TAGĦHOM. L-GĦARFIEN DWAR L-INTERAZZJONI BEJN IL-VIRUS U Ċ-ĊELLULI JIFTAĦ OPPORTUNITAJIET GĦALL-MODULAZZJONI TA’ KULL WIEĦED MILL-KOMPONENTI TA’ DIN L-INTERAZZJONI. IL-VIRUS TAL-EPATITE Ċ (HCV) HUWA VIRUS B’TROPIŻMU EPATIKU, AĠENT KAWŻALI TAL-EPATITE Ċ, U L-KAWŻA EWLENIJA TA’ ĊIRROŻI U KARĊINOMA EPATOĊELLULARI. IR-RELAZZJONIJIET LI L-HCV JISTABBILIXXI MA’ KOMPONENTI ĊELLULARI JINKLUDU, FOST L-OĦRAJN, RIĊETTURI TAL-MEMBRANA, PROTEINI INVOLUTI FIS-SINJALAR TAĊ-ĊIKLU TAĊ-ĊELLULI U ROTOT TA’ KONTROLL, ROTOT TA’ METABOLIŻMU RNA, EĊĊ. IL-GRUPP TIEGĦI GĦANDU ESPERJENZA ESTENSIVA PREĊEDENTI FL-ISTUDJU U L-ANALIŻI TAL-POLIMERAŻI TA’ HCV. GĦAL FTIT SNIN, U BĦALA RIŻULTAT TA’ WAQFA POSTDOTTORALI PREĊEDENTI TAL-INVESTIGATUR PRINĊIPALI, IL-LINJA TA’ RIĊERKA NFETĦET GĦAL FATTURI ĊELLULARI LI JINTERAĠIXXU MAL-POLIMERAŻI VIRALI. BĦALA RIŻULTAT TA ‘DAN IX-XOGĦOL, GRUPP TIEGĦI DEFINIT INTERAZZJONI NS5B MAL-ESTROĠENU ALPHA RIĊETTUR (HILLUNG ET AL, J ĠENE VIROL 2012;93:780–5). REĊENTEMENT ĦAFNA, U LI JWASSLU L-KOLLABORAZZJONI MA ‘GRUPPI OĦRA, IDDEFINIXXA L-INTERAZZJONI NS5B’S MA’ KINASE ĊELLULARI AKT/PKB (VALERO ET AL, ANTIMICROB AĠENTI CHEMOTHER 2016; FL-ISTAMPA). IR-RIŻULTATI MIKSUBA JINKLUDU L-FOSFORILAZZJONI IN VITRO TA’ NS5B PERMEZZ TA’ AKT/PKB RIKOMBINANTI KIF UKOLL L-INTERAZZJONI NNIFISHA ANALIZZATA PERMEZZ TA’ ESPERIMENTI KO-INMUNOPRECIPITATION. BARRA MINN HEKK, IL-KOLOKAZZJONI INTRAĊELLULARI TA’ AKT/PKB MA’ NS5B, JEW ESPRESSA ECTOPICAMENTE TEMPORANJAMENT (TRASFUŻJONI BIL-PLAŻMA) JEW B’MOD STABBLI (B’MOD LI ŻŻOMM REPLIKON SUBĠENOMIKU), JEW F’ĊELLOLI LI JSOSTNU B’MOD ATTIV L-INFEZZJONI TAL-HCVCC, IPPERMETTITILNA NIKKONKLUDU LI L-INTERAZZJONI NS5B-AKT/PKB TIKKAWŻA BIDLA FIL-POST INTRAĊELLULARI TA’ AKT/PKB, LI JIĊĊAQALQU MINN CYTOPLASMIC GĦAL PERINUKLEARI, FEJN JINSABU KUMPLESSI REPLIKATTIVI TA’ HCV. GRUPPI OĦRA WREW LI L-ATTIVAZZJONI TA’ AKT/PKB HIJA KRUĊJALI FL-ISTADJI INIZJALI TA’ INFEZZJONI B’HCV, U B’HEKK IL-VIRUS JISTA’ JIDĦOL FIĊ-ĊELLULA (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012;287:41922–30; HUANG ET AL AUTOPHAGY. 2013;9(2): 175–95). DIN L-ATTIVAZZJONI, LI SSEĦĦ FIL-MEMBRANA TAL-PLAŻMA, TISPARIXXI FI ŻMIEN FTIT SIGĦAT WARA L-INFEZZJONI. DAWN IR-RIŻULTATI PREĊEDENTI JĦEĠĠUNA NITOLBU PROĠETT LI JIPPERMETTILNA NAPPROFONDIXXU DIN L-INTERAZZJONI, BILLI NIDDEFINIXXU I) IR-RESIDWI TA’ NS5B INVOLUTI FL-INTERAZZJONI MA’ AKT/PKB, II) IR-RESIDWI NS5B LI HUMA FOSFORILATI MINN AKT/PKB, III) L-EFFETT LI L-BIDLA FIL-POST TA’ AKT/PKB GĦANDHA FUQ IĊ-ĊIKLU REPLIKATTIV TA’ HCV, U IV) L-EFFETT NS5B GĦANDU FUQ IR-ROTTA TA’ SINJALAR PI3K-AKT/PKB-MTOR. FL-AĦĦAR NETT, L-OMOLOĠIJA KBIRA TA’ XI WĦUD MIS-SEKWENZI LI X’AKTARX JIĠU FOSFORILATI F’HCV MA’ MEMBRI OĦRA TAL-FAMILJA FLAVIVIRIDAE TĦEĠĠIĠNA BIEX NESTENDU DAWN L-ANALIŻI GĦALL-VIRUSES TAL-ĠENE FLAVIVIRUS U PESTIVIRUS. (Maltese)
17 August 2022
0 references
VĪRUSI IR PIESPIEDU INTRACELULĀRI PARAZĪTI, KAS MIJIEDARBOJAS AR ŠŪNU MAŠĪNĀM KATRĀ TO REPLIKATĪVĀ CIKLA POSMĀ. ZINĀŠANAS PAR VĪRUSA ŠŪNU MIJIEDARBĪBU PAVER IESPĒJAS MODULĒT KATRU NO ŠĪS MIJIEDARBĪBAS KOMPONENTIEM. C HEPATĪTA VĪRUSS (HCV) IR VĪRUSS AR AKNU TROPISMU, C HEPATĪTA CĒLONIS, UN GALVENAIS CIROZES UN HEPATOCELULĀRĀS KARCINOMAS CĒLONIS. ATTIECĪBAS, KO HCV IZVEIDO AR ŠŪNU KOMPONENTIEM, CITA STARPĀ IETVER MEMBRĀNAS RECEPTORUS, OLBALTUMVIELAS, KAS IESAISTĪTAS ŠŪNU CIKLA SIGNALIZĀCIJAS UN KONTROLES CEĻOS, RNS METABOLISMA CEĻUS UTT. MANAI GRUPAI IR PLAŠA IEPRIEKŠĒJA PIEREDZE HCV POLIMERĀZES PĒTĪJUMĀ UN ANALĪZĒ. DAŽUS GADUS UN VADOŠĀ PĒTNIEKA IEPRIEKŠĒJĀS PĒCDOKTORANTŪRAS UZTURĒŠANĀS REZULTĀTĀ PĒTNIECĪBAS LĪNIJA IR ATVĒRTA ŠŪNU FAKTORIEM, KAS MIJIEDARBOJAS AR VĪRUSU POLIMERĀZI. ŠĪ DARBA REZULTĀTĀ MANA GRUPA DEFINĒJA NS5B MIJIEDARBĪBU AR ESTROGĒNA ALFA RECEPTORU (HILLUNG ET AL, J GĒNS VIROL 2012;93:780–5). PAVISAM NESEN, UN VADOT SADARBĪBU AR CITĀM GRUPĀM, MĒS ESAM NOTEIKUŠI NS5B’S MIJIEDARBĪBU AR AKT/PKB ŠŪNU KINĀZI (VALERO ET AL, ANTIMICROB AGENTS CHEMOTHER 2016; PRESĒ). IEGŪTIE REZULTĀTI IETVER NS5B FOSFORILĀCIJU IN VITRO AR REKOMBINANTO AKT/PKB, KĀ ARĪ PAŠU MIJIEDARBĪBU, KO ANALIZĒ AR KO-INMUNOPRECIPITATION EKSPERIMENTIEM. TURKLĀT AKT/PKB UN NS5B INTRACELULĀRĀ KOLOKĀCIJA, KAS VAI NU UZ LAIKU (PLAZMAS TRANSFŪZIJA), VAI STABILĀ VEIDĀ (SAGLABĀJOT SUBGENOMISKU REPLIKONU), VAI ŠŪNĀS, KAS AKTĪVI ATBALSTA HCVCC INFEKCIJU, IZSAKA ECTOPICAMENTE, IR ĻĀVUSI MUMS SECINĀT, KA NS5B-AKT/PKB MIJIEDARBĪBA IZRAISA AKT/PKB INTRACELULĀRĀS ATRAŠANĀS VIETAS IZMAIŅAS, PĀREJOT NO CITOPLAZMAS UZ PERINUCLEARU, KUR ATRODAS HCV REPLIKATĪVIE KOMPLEKSI. CITAS GRUPAS IR UZRĀDĪJUŠAS, KA AKT/PKB AKTIVĀCIJA IR BŪTISKA HCV INFEKCIJAS SĀKUMPOSMOS, ĻAUJOT VĪRUSAM IEKĻŪT ŠŪNĀ (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012; 287: 41922–30; HUANG ET AL AUTOFĀGIJA. 2013; 9(2):175–95). ŠĪ AKTIVĀCIJA, KAS NOTIEK PLAZMAS MEMBRĀNĀ, IZZŪD DAŽU STUNDU LAIKĀ PĒC INFICĒŠANĀS. ŠIE IEPRIEKŠĒJIE REZULTĀTI MUDINA MŪS PIEPRASĪT PROJEKTU, KAS ĻAUJ MUMS PADZIĻINĀT ŠO MIJIEDARBĪBU, DEFINĒJOT I) NS5B ATLIKUMUS, KAS IESAISTĪTI MIJIEDARBĪBĀ AR AKT/PKB, II) NS5B ATLIKUMUS, KO AKT/PKB FOSFORILĒ, III) AKT/PKB ATRAŠANĀS VIETAS MAIŅAS IETEKMI UZ HCV REPLIKATĪVO CIKLU, UN IV) NS5B IETEKME UZ PI3K-AKT/PKB-MTOR SIGNALIZĀCIJAS MARŠRUTU. VISBEIDZOT, DAŽU SEKVENČU LIELĀ HOMOLOĢIJA, KAS VARĒTU BŪT FOSFORILĒTAS HCV KOPĀ AR CITIEM FLAVIVIRIDAE DZIMTAS LOCEKĻIEM, MUDINA MŪS PAPLAŠINĀT ŠĪS ANALĪZES, IEKĻAUJOT FLAVIVĪRUSA UN PESTIVĪRUSA GĒNA VĪRUSUS. (Latvian)
17 August 2022
0 references
VÍRUSY SÚ NÚTENÉ INTRACELULÁRNE PARAZITY, KTORÉ INTERAGUJÚ S BUNKOVÝMI STROJMI V KAŽDOM KROKU ICH REPLIKAČNÉHO CYKLU. ZNALOSŤ INTERAKCIE MEDZI VÍRUSMI A BUNKAMI OTVÁRA MOŽNOSTI MODULÁCIE KAŽDEJ ZLOŽKY TEJTO INTERAKCIE. VÍRUS HEPATITÍDY C (HCV) JE VÍRUS S PEČEŇOVÝM TROPIZMOM, KAUZÁLNYM ČINITEĽOM HEPATITÍDY C A HLAVNOU PRÍČINOU CIRHÓZY A HEPATOCELULÁRNEHO KARCINÓMU. VZŤAHY, KTORÉ HCV VYTVÁRA S BUNKOVÝMI ZLOŽKAMI, ZAHŔŇAJÚ OKREM INÉHO MEMBRÁNOVÉ RECEPTORY, PROTEÍNY, KTORÉ SA PODIEĽAJÚ NA DRÁHACH SIGNALIZÁCIE A KONTROLY BUNKOVÉHO CYKLU, CESTY METABOLIZMU RNA ATĎ. MOJA SKUPINA MÁ ROZSIAHLE PREDCHÁDZAJÚCE SKÚSENOSTI SO ŠTÚDIOU A ANALÝZOU HCV POLYMERÁZY. NIEKOĽKO ROKOV A V DÔSLEDKU PREDCHÁDZAJÚCEHO POSTDOKTORANDSKÉHO POBYTU HLAVNÉHO VÝSKUMNÉHO PRACOVNÍKA BOLA VÝSKUMNÁ LÍNIA OTVORENÁ BUNKOVÝM FAKTOROM, KTORÉ INTERAGUJÚ S VÍRUSOVOU POLYMERÁZOU. V DÔSLEDKU TEJTO PRÁCE MOJA SKUPINA DEFINOVALA INTERAKCIU NS5B S ESTROGÉNOVÝM ALFA RECEPTOROM (HILLUNG ET AL., J GÉN VIROL 2012;93:780 – 5). VEĽMI NEDÁVNO, A VEDENIE SPOLUPRÁCE S INÝMI SKUPINAMI, SME DEFINOVALI NS5B’S INTERAKCIU S AKT/PKB BUNKOVEJ KINÁZY (VALERO ET AL, ANTIMICROB AGENTY CHEMOTHER 2016; V TLAČI). MEDZI ZÍSKANÉ VÝSLEDKY PATRÍ IN VITRO FOSFORYLÁCIA NS5B POMOCOU REKOMBINANTNÉHO AKT/PKB, AKO AJ SAMOTNÁ INTERAKCIA ANALYZOVANÁ POKUSMI SPOLUINMUNOPRECIPITATION. OKREM TOHO INTRACELULÁRNE SPOLOČNÉ UMIESTNENIE AKT/PKB S NS5B, BUĎ VYJADRENÉ ECTOPICAMENTE BUĎ DOČASNE (PLAZMIDOVÁ TRANSFÚZIA), ALEBO STABILNÝM SPÔSOBOM (ZACHOVANIE SUBGENOMICKÉHO REPLIKÓNU), ALEBO V BUNKÁCH, KTORÉ AKTÍVNE PODPORUJÚ INFEKCIU HCVCC, NÁM UMOŽNILO DOSPIEŤ K ZÁVERU, ŽE INTERAKCIA NS5B-AKT/PKB VYVOLÁVA ZMENU INTRACELULÁRNEHO UMIESTNENIA AKT/PKB, PRECHÁDZAJÚC Z CYTOPLAZMICKÝCH NA PERINUCLEÁRNE, KDE SA NACHÁDZAJÚ REPLIKAČNÉ KOMPLEXY HCV. INÉ SKUPINY UKÁZALI, ŽE AKTIVÁCIA AKT/PKB JE KĽÚČOVÁ V POČIATOČNÝCH KROKOCH INFEKCIE HCV, ČO UMOŽŇUJE, ABY VÍRUS VSTÚPIL DO BUNKY (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012;287:41922 – 30; HUANG ET AL AUTOPHAGY. 2013;9(2):175 – 95). TÁTO AKTIVÁCIA, KTORÁ SA USKUTOČŇUJE V PLAZMOVEJ MEMBRÁNE, ZMIZNE V PRIEBEHU NIEKOĽKÝCH HODÍN PO INFEKCII. TIETO PREDCHÁDZAJÚCE VÝSLEDKY NÁS NABÁDAJÚ, ABY SME POŽIADALI O PROJEKT, KTORÝ NÁM UMOŽNÍ PREHĹBIŤ TÚTO INTERAKCIU, DEFINOVAŤ I) REZÍDUÁ NS5B ZAPOJENÉ DO INTERAKCIE S AKT/PKB, II) REZÍDUÁ NS5B, KTORÉ SÚ FOSFORYLOVANÉ AKT/PKB, III) VPLYV, KTORÝ MÁ ZMENA UMIESTNENIA AKT/PKB NA REPLIKAČNÝ CYKLUS HCV, A IV) ÚČINOK NS5B NA SIGNALIZAČNÚ TRASU PI3K-AKT/PKB-MTOR. NAPOKON, VEĽKÁ HOMOLÓGIA NIEKTORÝCH SEKVENCIÍ, KTORÉ BUDÚ PRAVDEPODOBNE FOSFORYLOVANÉ V HCV S OSTATNÝMI ČLENMI RODINY FLAVIVIRIDAE, NÁS POVZBUDZUJE K ROZŠÍRENIU TÝCHTO ANALÝZ NA VÍRUSY FLAVIVÍRUSU A PESTIVÍRUSOVÉHO GÉNU. (Slovak)
17 August 2022
0 references
IS PARAISÍTÍ IONCHEALLACHA ÉIGEAN IAD VÍRIS A IDIRGHNÍOMHAÍONN LE HINNEALRA CILLE I NGACH CÉIM DÁ DTIMTHRIALL MHACASAMHLAITHE. TUGANN EOLAS AR IDIRGHNÍOMHAÍOCHT VÍREAS-CEALLA DEISEANNA CHUN GACH CEANN DE CHOMHPHÁIRTEANNA AN IDIRGHNÍOMHAÍOCHTA SEO A MHODHNÚ. HEIPITÍTEAS C VÍREAS (HCV) IS VÍREAS LE TROPISM HEPATIC, GNÍOMHAIRE CÚISEACH HEIPITÍTEAS C, AGUS AN CHÚIS IS MÓ CIRRHOSIS AGUS CARCINOMA HEPATOCELLULAR. ÁIRÍTEAR AR NA CAIDRIMH A BHUNAÍONN HCV LE COMHPHÁIRTEANNA CEALLACHA, I MEASC DAOINE EILE, GABHDÓIRÍ MEMBRANE, PRÓITÉINÍ A BHFUIL BAINT ACU LE COMHARTHAÍOCHT TIMTHRIALL CILLE AGUS BEALAÍ RIALAITHE, BEALAÍ MEITIBILEACHTA RNA, ETC TÁ TAITHÍ FHAIRSING ROIMHE SEO AG MO GHRÚPA I STAIDÉAR AGUS ANAILÍS HCV POLYASE. AR FEADH CÚPLA BLIAIN, AGUS MAR THORADH AR FHANACHT IARDHOCHTÚIREACHTA ROIMHE SEO DEN PHRÍOMH-IMSCRÚDAITHEOIR, OSCLAÍODH AN LÍNE TAIGHDE D’FHACHTÓIRÍ CEALLACHA A IDIRGHNÍOMHAÍONN LE POLAIMÉIR VÍREASACH. MAR THORADH AR AN OBAIR SEO, SHAINIGH MO GHRÚPA IDIRGHNÍOMHÚ NS5B LEIS AN RECEPTOR ESTROGEN ALPHA (HILLUNG ET AL, J GÉINE VIROL 2012;93: 780-5). LE DÉANAÍ, AGUS I GCEANNAS AR AN GCOMHAR LE GRÚPAÍ EILE, TÁ IDIRGHNÍOMHAÍOCHT NS5B’S SAINMHÍNITHE AGAINN LE AKT/PKB KINASE CHEALLACHA (VALERO ET AL, OIBREÁIN FHRITHMHIOCRÓBACHA CHEMOTHER 2016; I BPREAS). ÁIRÍTEAR AR NA TORTHAÍ A FUARTHAS PHOSPHORYLATION IN VITRO DE NS5B TRÍ AKT/PKB ATHCHUINGREACH CHOMH MAITH LEIS AN IDIRGHNÍOMHAÍOCHT FÉIN ANAILÍS AG COMH-INMUNOPRECIPITATION TURGNAIMH. INA THEANNTA SIN, TRÍD AN GCOMHSHUÍOMH IDIRCHEALLACH AKT/PKB LE NS5B, A SHLOINNTEAR ECTOPICAMENTE GO SEALADACH (PLASMIDAISTRIÚ) NÓ AR BHEALACH COBHSAÍ (A CHOINNÍONN REPLICON FOGHÉANÓMACH), NÓ I GCEALLA A THACAÍONN GO GNÍOMHACH LE HIONFHABHTÚ HCVCC, BHÍOTHAS IN ANN TEACHT AR AN GCONCLÚID GO SPREAGANN IDIRGHNÍOMHAÍOCHT NS5B-AKT/PKB ATHRÚ AR SHUÍOMH IONCHEALLACH AKT/PKB, AG BOGADH Ó CHIAPLASMIC GO SÁR-IMRÉITEACH, I GCÁS INA BHFUIL COIMPLÉISC MACASAMHLA HCV SUITE. LÉIRIGH GRÚPAÍ EILE GO BHFUIL GNÍOMHACHTÚ AKT/PKB RÍTHÁBHACHTACH I GCÉIMEANNA TOSAIGH IONFHABHTÚ HCV, RUD A LIGEANN DON VÍREAS DUL ISTEACH SA CHILL (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012;287:41922-30; VIDEO COMHRÁ AL-PHAGY. 2013;9(2):175-95). IMÍONN AN GNÍOMHACHTÚ SEO, A BHÍONN AR SIÚL SA SCANNÁN PLASMA, LAISTIGH DE CHÚPLA UAIR AN CHLOIG IAR-IONFHABHTAITHE. SPREAGANN NA TORTHAÍ ROIMHE SEO DÚINN TIONSCADAL A IARRAIDH A LIGEANN DÚINN AN IDIRGHNÍOMHAÍOCHT SEO A DHOIMHNIÚ, A SHAINMHÍNIÚ I) IARMHAIR NS5B A BHAINEANN LEIS AN IDIRGHNÍOMHAÍOCHT LE AKT/PKB, II) IARMHAIR NS5B ATÁ FOSFAIRITHE AG AKT/PKB, III) AN ÉIFEACHT ATÁ AG AN ATHRÚ AR SHUÍOMH AKT/PKB AR THIMTHRIALL MACASAMHLAITHE HCV, AGUS IV) AN ÉIFEACHT ATÁ AG NS5B AR AN MBEALACH COMHARTHAÍOCHTA PI3K-AKT/PKB-MTOR. AR DEIREADH, SPREAGANN HOMALÓG MHÓR CUID DE NA SEICHIMH AR DÓCHA GO BHFOSFARFAR IAD IN HCV LE BAILL EILE DEN TEAGHLACH FLAVIVIRIDAE DÚINN NA HANAILÍSÍ SEO A LEATHNÚ CHUIG VÍRIS DEN GHÉINE FLAVIVIRUS AGUS PESTIVIRUS. (Irish)
17 August 2022
0 references
VIRY JSOU NUCENÉ INTRACELULÁRNÍ PARAZITY, KTERÉ INTERAGUJÍ S BUNĚČNÝMI STROJI V KAŽDÉM KROKU JEJICH REPLIKAČNÍHO CYKLU. ZNALOST INTERAKCE S VIROVÝMI BUŇKAMI OTEVÍRÁ PŘÍLEŽITOSTI K MODULACI KAŽDÉ SLOŽKY TÉTO INTERAKCE. VIRUS HEPATITIDY C (HCV) JE VIRUS S JATERNÍM TROPISMEM, KAUZÁLNÍM PŮVODCEM HEPATITIDY C A HLAVNÍ PŘÍČINOU CIRHÓZY A HEPATOCELULÁRNÍHO KARCINOMU. VZTAHY, KTERÉ HCV VYTVÁŘÍ S BUNĚČNÝMI SLOŽKAMI, ZAHRNUJÍ MIMO JINÉ MEMBRÁNOVÉ RECEPTORY, PROTEINY ZAPOJENÉ DO SIGNALIZACE A KONTROLY BUNĚČNÉHO CYKLU, DRÁHY METABOLISMU RNA ATD. MOJE SKUPINA MÁ ROZSÁHLÉ PŘEDCHOZÍ ZKUŠENOSTI SE STUDIEM A ANALÝZOU HCV POLYMERÁZY. PO NĚKOLIK LET A V DŮSLEDKU PŘEDCHOZÍHO POSTDOKTORANDSKÉHO POBYTU HLAVNÍHO VYŠETŘOVATELE BYLA VÝZKUMNÁ LINIE OTEVŘENA BUNĚČNÝM FAKTORŮM, KTERÉ INTERAGUJÍ S VIROVOU POLYMERÁZOU. V DŮSLEDKU TÉTO PRÁCE MOJE SKUPINA DEFINOVALA INTERAKCI NS5B S ESTROGENOVÝM ALFA RECEPTOREM (HILLUNG ET AL, J GENE VIROL 2012;93:780–5). VELMI NEDÁVNO, A VE SPOLUPRÁCI S DALŠÍMI SKUPINAMI JSME DEFINOVALI INTERAKCI NS5B S BUNĚČNOU KINÁZOU AKT/PKB (VALERO ET AL, ANTIMICROB AGENTY CHEMOTHER 2016; V TISKU). K ZÍSKANÝM VÝSLEDKŮM PATŘÍ FOSFORYLACE NS5B IN VITRO REKOMBINANTNÍM AKT/PKB A INTERAKCE, KTERÁ BYLA ANALYZOVÁNA EXPERIMENTY KO-INMUNOPRECIPITATION. KROMĚ TOHO INTRACELULÁRNÍ KOLOKACE AKT/PKB S NS5B, BUĎ VYJÁDŘENÁ ECTOPICAMENTE BUĎ DOČASNĚ (PLASMIDOVÁ TRANSFUZE), NEBO STABILNÍM ZPŮSOBEM (ZACHOVÁVAJÍCÍ SUBGENOMICKÝ REPLIKON), NEBO V BUŇKÁCH, KTERÉ AKTIVNĚ PODPORUJÍ INFEKCI HCVCC, NÁM UMOŽNILA DOSPĚT K ZÁVĚRU, ŽE INTERAKCE NS5B-AKT/PKB VYVOLÁVÁ ZMĚNU INTRACELULÁRNÍ POLOHY AKT/PKB, KTERÁ SE PŘESUNUJE Z CYTOPLAZMATICKÉ NA PERINUCLEARÁRNÍ, KDE SE NACHÁZEJÍ REPLIKATIVNÍ KOMPLEXY HCV. JINÉ SKUPINY PROKÁZALY, ŽE AKTIVACE AKT/PKB JE KLÍČOVÁ V POČÁTEČNÍCH KROCÍCH INFEKCE HCV, COŽ VIRU UMOŽŇUJE VSTOUPIT DO BUŇKY (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012; 287:41922–30; HUANG ET AL AUTOFAGY. 2013;9(2):175–95). TATO AKTIVACE, KE KTERÉ DOCHÁZÍ V PLAZMOVÉ MEMBRÁNĚ, ZMIZÍ BĚHEM NĚKOLIKA HODIN PO INFEKCI. TYTO PŘEDCHOZÍ VÝSLEDKY NÁS VYZÝVAJÍ, ABYCHOM POŽÁDALI O PROJEKT, KTERÝ NÁM UMOŽNÍ PROHLOUBIT TUTO INTERAKCI A DEFINOVAT I) REZIDUA NS5B ZAPOJENÁ DO INTERAKCE S AKT/PKB, II) REZIDUA NS5B, KTERÁ JSOU FOSFORYLOVÁNA AKT/PKB, III) VLIV, KTERÝ MÁ ZMĚNA UMÍSTĚNÍ AKT/PKB NA REPLIKAČNÍ CYKLUS HCV, A IV) ÚČINEK NS5B NA SIGNALIZAČNÍ TRASU PI3K-AKT/PKB-MTOR. A KONEČNĚ, VELKÁ HOMOLOGIE NĚKTERÝCH SEKVENCÍ, KTERÉ BY MOHLY BÝT FOSFORYLOVÁNY V HCV S DALŠÍMI ČLENY ČELEDI FLAVIVIRIDAE, NÁS VYBÍZÍ K ROZŠÍŘENÍ TĚCHTO ANALÝZ NA VIRY GENU FLAVIVIRUS A PESTIVIRUS. (Czech)
17 August 2022
0 references
VIRUS SÃO PARASITOS INTRACELLULARES FORÇADOS QUE INTERACTAM COM AS MÁQUINAS CELULARES EM CADA PASSO DO CICLO RESPONSÁVEL. O CONHECIMENTO DA INTERACÇÃO VÍRUS-CELL PODE MODULAR CADA UM DOS COMPONENTES DA PRESENTE INTERACÇÃO. O Vírus da Hepatite C (HCV) é um Vírus com Tropismo Hepático, um agente causal da Hepatite C, e a principal causa de Circus e Carcinoma Hepatocelular. RELAÇÕES QUE O VHC ESTABELECE COM COMPONENTES CELULARES INCLUINDO, ENTRE OUTROS, RECEPTORES DE MEMBRANAS, PROTEÍNAS ENVOLVIDAS NA SINALIZAÇÃO DE CICLOS CELULARES E PATHWAYS DE CONTROLO, PATHWAYS DE METABOLISMOS DE RNA, ETC. O MEU GRUPO TEM EXPERIÊNCIA PRÉVIA EXTENSIVA NO ESTUDO E ANÁLISE DA POLIMERASE DE VHC. Durante alguns anos, e como resultado de uma anterior permanência pós-doutoral do investigador principal, a linha de investigação foi aberta a factores celulares que interagem com a polimerização viral. Como resultado deste trabalho, o meu grupo definiu a interacção da NS5B com o receptor de ESTROGEN ALPHA (HILLUNG ET AL, J GENE VIROL 2012;93:780-5). Muito recentemente, e liderando a colaboração com outros grupos, definimos a interação da NS5B com a KINASE CELULAR AKT/PKB (VALERO ET AL, AGENTES ANTIMICROB CHEMOTHER 2016; Em IMPRENSA). Os resultados obtidos incluem a fosforilação in vitro da NS5B por AKT/PKB recombinante, bem como a própria interacção analisada por experiências de co-inmunopreciação. Além disso, a COLOCAÇÃO INTRACELLULAR DE AKT/PKB COM NS5B, quer EPTOPICAÇÃO EXPRESSADA TEMPORARIAMENTE (TRANSFUSÃO DE PLÁSMIO), quer DE FORMA ESTÁVEL (MANTER UM REPLÍCIO SUBGENÓMICO), quer EM CÉLULAS QUE APOIAM ATIVAMENTE A INFEÇÃO DO VHC, permitiu-nos concluir que a INTERACÇÃO NS5B-AKT/PKB INDUZ UMA ALTERAÇÃO NA LOCAÇÃO INTRACELLULAR DE AKT/PKB, MOVENDO DE CITOPLÁMICO PARA PERINUCAR, EM QUE ESTÃO LOQUEADOS COMPLEXOS REPLICATIVOS DE HCV. Outros grupos demonstraram que a actividade da AKT/PKB é crucial nas fases iniciais da infecção pelo VHC, permitindo que o vírus entre na célula (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012;287:41922-30; HUANG ET AL AUTOPHAGY (em inglês). 2013;9(2):175-95). Esta actividade, que se instala na membrana do plasma, desaparece dentro de algumas horas após a sua instalação. Estes resultados anteriores encorajam-nos a solicitar um projecto que nos permita aprofundar esta interacção, definindo I) os resíduos NS5B envolvidos na interacção com o AKT/PKB, II) os resíduos NS5B que são fosforilados pelo AKT/PKB, III) o efeito que a mudança de localização do AKT/PKB tem no ciclo alternativo de HCV, e IV) o efeito NS5B tem na rota de sinalização PI3K-AKT/PKB-Mtor. Finalmente, a grande HOMOLOGIA de algumas das sequências susceptíveis de serem fosforiladas no HCV com outros membros da família FLAVIVIRIDAE encoraja-nos a alargar estas análises aos vírus do FLAVIVIRUS e do PESTIVIRUS GENE. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
VIIRUSED ON PEALESUNNITUD RAKUSISESED PARASIIDID, MIS SUHTLEVAD RAKUMASINATEGA NENDE REPLIKATSIOONITSÜKLI IGAS ETAPIS. TEADMISED VIIRUSE JA RAKKUDE KOOSTOIMEST AVAB VÕIMALUSE MODULEERIDA SELLE KOOSTOIME KÕIKI KOMPONENTE. C-HEPATIIDI VIIRUS (HCV) ON MAKSATROPISMIGA VIIRUS, MIS ON C-HEPATIIDI PÕHJUSTAJA NING TSIRROOSI JA HEPATOTSELLULAARSE KARTSINOOMI PEAMINE PÕHJUS. SEOSED, MIDA HCV LOOB RAKUKOMPONENTIDEGA, HÕLMAVAD MUU HULGAS MEMBRAANRETSEPTORIID, RAKUTSÜKLI SIGNAALIMISE JA KONTROLLI RADADEGA SEOTUD VALKE, RNA METABOLISMI RADASID JNE. MINU RÜHMAL ON ULATUSLIK EELNEV KOGEMUS HCV POLÜMERAASI UURIMISEL JA ANALÜÜSIMISEL. PAAR AASTAT, JA TÄNU EELMISE JÄRELDOKTORI VIIBIMISE JUHTIVTEADLANE, UURIMISLIINI ON AVATUD RAKULISED TEGURID, MIS MÕJUTAVAD VIIRUSE POLÜMERAASI. SELLE TÖÖ TULEMUSENA MÄÄRATLES MINU RÜHM NS5B KOOSTOIME ÖSTROGEENI ALFARETSEPTORIGA (HILLUNG ET AL, J GEEN VIROL 2012; 93:780–5). HILJUTI JA KOOSTÖÖS TEISTE RÜHMADEGA OLEME MÄÄRATLENUD NS5B KOOSTOIME AKT/PKB RAKUKINAASIGA (VALERO ET AL, ANTIMICROB AGENTS CHEMOTHER 2016; AJAKIRJANDUSES). SAADUD TULEMUSTE HULKA KUULUVAD NS5B IN VITRO FOSFORÜÜLIMINE REKOMBINANTSE AKT/PKB ABIL NING KOOSTOIME ISE, MIDA ANALÜÜSITI KOINMUNOPRECIPITATION KATSETEGA. LISAKS ON AKT/PKB INTRATSELLULAARNE KOOSPAIKNEMINE NS5B-GA, MIS VÄLJENDAB ECTOPICAMENTET KAS AJUTISELT (PLASMIIDÜLEKANNE) VÕI STABIILSEL VIISIL (SÄILITADES SUBGENOOMSET REPLIKONI) VÕI RAKKUDES, MIS AKTIIVSELT TOETAVAD HCVCC-NAKKUST, VÕIMALDANUD JÄRELDADA, ET NS5B-AKT/PKB KOOSTOIME KUTSUB ESILE AKT/PKB RAKUSISESE ASUKOHA MUUTUSE, LIIKUDES TSÜTOPLASMAST PERITUUMASSE, KUS ASUVAD HCV REPLIKATIIVSED KOMPLEKSID. TEISED RÜHMAD ON NÄIDANUD, ET AKT/PKB AKTIVEERUMINE ON HCV INFEKTSIOONI ALGETAPPIDES OTSUSTAVA TÄHTSUSEGA, VÕIMALDADES VIIRUSEL RAKKUDESSE SISENEDA (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012; 287:41922–30; HUANG ET AL AUTOFAGY. 2013;9(2):175–95). SEE PLASMAMEMBRAANIS TOIMUV AKTIVEERIMINE KAOB MÕNE TUNNI JOOKSUL PÄRAST NAKATUMIST. NEED VARASEMAD TULEMUSED JULGUSTAVAD MEID TAOTLEMA PROJEKTI, MIS VÕIMALDAB MEIL SEDA KOOSTOIMET SÜVENDADA, MÄÄRATLEDES I) NS5B JÄÄGID, MIS ON SEOTUD KOOSTOIMEGA AKT/PKBGA, II), NS5B JÄÄGID, MIS FOSFORÜLEERITAKSE AKT/PKB ABIL, III) AKT/PKB ASUKOHA MUUTMISE MÕJU HCV REPLIKATIIVSELE TSÜKLILE JA IV) NS5B MÕJU PI3K-AKT/PKB-MTORI SIGNAALIEDASTUSMARSRUUDILE. LÕPUKS, SUUR HOMOLOOGIA MÕNED JÄRJESTUSED TÕENÄOLISELT FOSFORÜÜLITUD HCV TEISTE LIIKMETEGA FLAVIVIRIDAE SUGUKONDA JULGUSTAB MEID LAIENDAMA NEID ANALÜÜSE VIIRUSTE FLAVIVIIRUSE JA PESTIVIIRUS GEENI. (Estonian)
17 August 2022
0 references
A VÍRUSOK OLYAN INTRACELLULÁRIS PARAZITÁK, AMELYEK A REPLIKÁCIÓS CIKLUS MINDEN EGYES LÉPÉSÉBEN KÖLCSÖNHATÁSBA LÉPNEK A SEJTGÉPEKKEL. A VÍRUS-SEJT KÖLCSÖNHATÁS ISMERETE LEHETŐSÉGET TEREMT A KÖLCSÖNHATÁS EGYES ÖSSZETEVŐINEK MODULÁCIÓJÁRA. A HEPATITIS C VÍRUS (HCV) EGY MÁJTROPIZMUSSAL RENDELKEZŐ VÍRUS, AMELY A HEPATITIS C OK-OKOZATI TÉNYEZŐJE, ÉS A CIRRHOSIS ÉS A HEPATOCELLULÁRIS KARCINÓMA FŐ OKA. A HCV ÉS A SEJTKOMPONENSEK KÖZÖTTI KAPCSOLATOK KÖZÉ TARTOZNAK TÖBBEK KÖZÖTT A MEMBRÁNRECEPTOROK, A SEJTCIKLUS JELZÉSÉBEN ÉS KONTROLLJÁBAN RÉSZT VEVŐ FEHÉRJÉK, AZ RNS METABOLIZMUS ÚTVONALAI STB. A CSOPORTOM KITERJEDT KORÁBBI TAPASZTALATTAL RENDELKEZIK A HCV POLIMERÁZ VIZSGÁLATÁBAN ÉS ELEMZÉSÉBEN. NÉHÁNY ÉVE, ÉS A KUTATÁSVEZETŐ KORÁBBI POSZTDOKTORI TARTÓZKODÁSÁNAK EREDMÉNYEKÉNT A KUTATÁSI VONAL MEGNYÍLT A VÍRUSPOLIMERÁZZAL KÖLCSÖNHATÁSBA LÉPŐ CELLULÁRIS TÉNYEZŐK SZÁMÁRA. ENNEK EREDMÉNYEKÉNT A CSOPORT MEGHATÁROZTA NS5B KÖLCSÖNHATÁS AZ ÖSZTROGÉN ALFA RECEPTOR (HILLUNG ET AL, J GENE VIROL 2012;93:780–5). A KÖZELMÚLTBAN, ÉS A TÖBBI CSOPORTTAL VALÓ EGYÜTTMŰKÖDÉS VEZETÉSÉVEL MEGHATÁROZTUK AZ NS5B KÖLCSÖNHATÁSÁT AZ AKT/PKB CELLULÁRIS KINÁZZAL (VALERO ET AL, ANTIMICROB AGENTS CHEMOTHER 2016; A SAJTÓBAN). A KAPOTT EREDMÉNYEK KÖZÉ TARTOZIK AZ NS5B REKOMBINÁNS AKT/PKB ÁLTAL VÉGZETT IN VITRO FOSZFORILÁCIÓJA, VALAMINT A KO-INMUNOPRECIPITATION KÍSÉRLETEKKEL ELEMZETT KÖLCSÖNHATÁS. EZEN TÚLMENŐEN AZ AKT/PKB ÉS AZ NS5B INTRACELLULÁRIS TÁRSLOKÁCIÓJA ECTOPICAMENTE-T VAGY IDEIGLENESEN (PLAZMID-TRANSZFÚZIÓ) VAGY STABILAN (A SZUBGENOMIKUS REPLIKON FENNTARTÁSA), VAGY A HCVCC-FERTŐZÉST AKTÍVAN TÁMOGATÓ SEJTEKBEN FEJEZ KI, LEHETŐVÉ TETTE SZÁMUNKRA, HOGY ARRA A KÖVETKEZTETÉSRE JUSSUNK, HOGY AZ NS5B-AKT/PKB KÖLCSÖNHATÁS AZ AKT/PKB INTRACELLULÁRIS ELHELYEZKEDÉSÉBEN VÁLTOZÁST IDÉZ ELŐ, AMELY A CITOPLAZMÁSRÓL PERINUCLEARRE MOZOG, AHOL HCV REPLIKATÍV KOMPLEXEK TALÁLHATÓK. MÁS CSOPORTOK KIMUTATTÁK, HOGY AZ AKT/PKB AKTIVÁLÁSA DÖNTŐ FONTOSSÁGÚ A HCV-FERTŐZÉS KEZDETI LÉPÉSEIBEN, LEHETŐVÉ TÉVE A VÍRUS BEJUTÁSÁT A SEJTBE (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012;287:41922–30; HUANG ET AL AUTOPHAGY. 2013;9(2):175–95). EZ AZ AKTIVÁLÁS, AMELY A PLAZMAMEMBRÁNBAN TÖRTÉNIK, A FERTŐZÉST KÖVETŐ NÉHÁNY ÓRÁN BELÜL ELTŰNIK. EZEK A KORÁBBI EREDMÉNYEK ARRA ÖSZTÖNÖZNEK BENNÜNKET, HOGY KÉRJÜNK EGY OLYAN PROJEKTET, AMELY LEHETŐVÉ TESZI, HOGY ELMÉLYÍTSÜK EZT AZ INTERAKCIÓT, MEGHATÁROZVA I.) AZ AKT/PKB-VAL VALÓ KÖLCSÖNHATÁSBAN RÉSZT VEVŐ NS5B MARADÉKANYAGOKAT, II) AZ AKT/PKB ÁLTAL FOSZFORILÁLT NS5B MARADÉKANYAGOKAT, III) AZ AKT/PKB HELYVÁLTOZTATÁSÁNAK HATÁSÁT A HCV REPLIKATÍV CIKLUSÁRA, ÉS IV) AZ NS5B HATÁSÁT A PI3K-AKT/PKB-MTOR JELÁTVITELI ÚTVONALRA. VÉGÜL A FLAVIVIRIDAE CSALÁD TÖBBI TAGJÁVAL A HCV-BEN VALÓSZÍNŰLEG FOSZFORILÁLÓDÓ SZEKVENCIÁK NAGY HOMOLÓGIÁJA ARRA ÖSZTÖNÖZ BENNÜNKET, HOGY EZEKET AZ ELEMZÉSEKET TERJESSZÜK KI A FLAVIVÍRUS ÉS A PESTIVÍRUS GÉN VÍRUSAIRA IS. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
ВИРУСИТЕ СА ПРИНУДИТЕЛНИ ВЪТРЕКЛЕТЪЧНИ ПАРАЗИТИ, КОИТО ВЗАИМОДЕЙСТВАТ С КЛЕТЪЧНИТЕ МАШИНИ ВЪВ ВСЯКА СТЪПКА ОТ ТЕХНИЯ ЦИКЪЛ НА ВЪЗПРОИЗВЕЖДАНЕ. ПОЗНАВАНЕТО НА ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО ВИРУС-КЛЕТКИ ОТВАРЯ ВЪЗМОЖНОСТИ ЗА МОДУЛИРАНЕ НА ВСЕКИ ОТ КОМПОНЕНТИТЕ НА ТОВА ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ. ВИРУСЪТ НА ХЕПАТИТ С (HCV) Е ВИРУС С ЧЕРНОДРОБЕН ТРОПИЗЪМ, ПРИЧИНИТЕЛ НА ХЕПАТИТ С И ОСНОВНАТА ПРИЧИНА ЗА ЦИРОЗА И ХЕПАТОЦЕЛУЛАРЕН КАРЦИНОМ. ВРЪЗКИТЕ, КОИТО HCV УСТАНОВЯВА С КЛЕТЪЧНИТЕ КОМПОНЕНТИ, ВКЛЮЧВАТ, НАРЕД С ДРУГОТО, МЕМБРАННИ РЕЦЕПТОРИ, ПРОТЕИНИ, УЧАСТВАЩИ В КЛЕТЪЧНИЯ ЦИКЪЛ СИГНАЛИЗИРАЩИ И КОНТРОЛНИ ПЪТИЩА, ПЪТИЩА НА МЕТАБОЛИЗМА НА РНК И ДР. МОЯТА ГРУПА ИМА БОГАТ ПРЕДИШЕН ОПИТ В ИЗСЛЕДВАНЕТО И АНАЛИЗА НА HCV ПОЛИМЕРАЗАТА. В ПРОДЪЛЖЕНИЕ НА НЯКОЛКО ГОДИНИ И В РЕЗУЛТАТ НА ПРЕДХОДЕН ПОСТДОКТОРАЛЕН ПРЕСТОЙ НА ГЛАВНИЯ ИЗСЛЕДОВАТЕЛ, НАУЧНОИЗСЛЕДОВАТЕЛСКАТА ЛИНИЯ Е ОТВОРЕНА ЗА КЛЕТЪЧНИ ФАКТОРИ, КОИТО ВЗАИМОДЕЙСТВАТ С ВИРУСНА ПОЛИМЕРАЗА. В РЕЗУЛТАТ НА ТАЗИ РАБОТА, МОЯТА ГРУПА ОПРЕДЕЛЯ NS5B ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ С ЕСТРОГЕН АЛФА РЕЦЕПТОРА (HILLUNG ET AL, J GENE VIROL 2012;93:780—5). СЪВСЕМ НАСКОРО И РЪКОВОДИХМЕ СЪТРУДНИЧЕСТВОТО С ДРУГИ ГРУПИ, ОПРЕДЕЛИХМЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО НА NS5B С AKT/PKB КЛЕТЪЧНА КИНАЗА (VALERO ET AL, АНТИМИКРОБНИ АГЕНТИ CHEMOTHER 2016; В ПРЕСАТА). ПОЛУЧЕНИТЕ РЕЗУЛТАТИ ВКЛЮЧВАТ IN VITRO ФОСФОРИЛИРАНЕ НА NS5B ЧРЕЗ РЕКОМБИНАНТЕН AKT/PKB, КАКТО И САМОТО ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ, АНАЛИЗИРАНО ЧРЕЗ СЪВМЕСТНИ ЕКСПЕРИМЕНТИ С INMUNOPRECIPITATION. ОСВЕН ТОВА ВЪТРЕКЛЕТЪЧНОТО СЪВМЕСТНО РАЗПОЛАГАНЕ НА AKT/PKB С NS5B, ИЗРАЗЕНО ИЛИ ВРЕМЕННО (ПЛАЗМЕДНО ПРЕЛИВАНЕ) ИЛИ ПО СТАБИЛЕН НАЧИН (ПОДДЪРЖАНЕ НА СУБГЕНОМИЧЕН РЕПЛИКОН), ИЛИ В КЛЕТКИ, КОИТО АКТИВНО ПОДДЪРЖАТ ИНФЕКЦИЯТА С HCVCC, НИ ПОЗВОЛИ ДА ЗАКЛЮЧИМ, ЧЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО NS5B-AKT/PKB ПРЕДИЗВИКВА ПРОМЯНА В ВЪТРЕКЛЕТЪЧНОТО МЕСТОПОЛОЖЕНИЕ НА AKT/PKB, ПРЕМИНАВАЙКИ ОТ ЦИТОПЛАЗМЕНА КЪМ ПЕРИНУЯСНА, КЪДЕТО СЕ НАМИРАТ РЕПЛИКАТИВНИТЕ КОМПЛЕКСИ НА HCV. ДРУГИ ГРУПИ СА ПОКАЗАЛИ, ЧЕ АКТИВИРАНЕТО НА AKT/PKB Е ОТ РЕШАВАЩО ЗНАЧЕНИЕ В НАЧАЛНИТЕ ЕТАПИ НА ИНФЕКЦИЯТА С HCV, КОЕТО ПОЗВОЛЯВА НА ВИРУСА ДА НАВЛЕЗЕ В КЛЕТКАТА (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012 Г.; 287:41922—30; HUANG ET AL АВТОФАГИЯ. 2013 Г.;9(2):175—95). ТОВА АКТИВИРАНЕ, КОЕТО СЕ ИЗВЪРШВА В ПЛАЗМЕНАТА МЕМБРАНА, ИЗЧЕЗВА В РАМКИТЕ НА НЯКОЛКО ЧАСА СЛЕД ИНФЕКЦИЯТА. ТЕЗИ ПРЕДИШНИ РЕЗУЛТАТИ НИ НАСЪРЧАВАТ ДА ПОИСКАМЕ ПРОЕКТ, КОЙТО НИ ПОЗВОЛЯВА ДА ЗАДЪЛБОЧИМ ТОВА ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ, ОПРЕДЕЛЯЙКИ I) ОСТАТЪЧНИТЕ ВЕЩЕСТВА ОТ NS5B, УЧАСТВАЩИ ВЪВ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО С AKT/PKB, II) ОСТАТЪЧНИТЕ ВЕЩЕСТВА ОТ NS5B, КОИТО СА ФОСФОРИЛИРАНИ ОТ AKT/PKB, III) ЕФЕКТА, КОЙТО ПРОМЯНАТА НА МЕСТОПОЛОЖЕНИЕТО НА AKT/PKB ИМА ВЪРХУ РЕПЛИКАТИВНИЯ ЦИКЪЛ НА HCV, И IV) ЕФЕКТЪТ ОТ NS5B ВЪРХУ СИГНАЛНИЯ МАРШРУТ PI3K-AKT/PKB-MTOR. И НАКРАЯ, ГОЛЯМАТА ХОМОЛОГИЯ НА НЯКОИ ОТ ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТИТЕ, КОИТО ВЕРОЯТНО ЩЕ БЪДАТ ФОСФОРИЛИРАНИ В HCV С ДРУГИ ЧЛЕНОВЕ НА СЕМЕЙСТВО FLAVIVIRIDAE, НИ НАСЪРЧАВА ДА РАЗШИРИМ ТЕЗИ АНАЛИЗИ ДО ВИРУСИ НА ФЛАВИВИРУСА И ПЕСТИВИРУСНИЯ ГЕН. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
VIRUSAI YRA PRIVERSTINIAI INTRALĄSTELINIAI PARAZITAI, KURIE SĄVEIKAUJA SU LĄSTELIŲ MECHANIZMAIS KIEKVIENAME JŲ KOPIJAVIMO CIKLO ETAPE. ŽINIOS APIE VIRUSO LĄSTELIŲ SĄVEIKĄ ATVERIA GALIMYBES MODULIUOTI KIEKVIENĄ ŠIOS SĄVEIKOS SUDEDAMĄJĄ DALĮ. HEPATITO C VIRUSAS (HCV) YRA KEPENŲ TROPIZMO VIRUSAS, SUKELIANTIS HEPATITĄ C IR PAGRINDINĘ CIROZĖS IR KEPENŲ LĄSTELIŲ KARCINOMOS PRIEŽASTĮ. SANTYKIAI, KURIUOS HCV NUSTATO SU LĄSTELIŲ KOMPONENTAIS, APIMA, BE KITA KO, MEMBRANINIUS RECEPTORIUS, BALTYMUS, DALYVAUJANČIUS LĄSTELIŲ CIKLO SIGNALIZAVIMO IR KONTROLĖS KELIUOSE, RNR METABOLIZMO KELIUS IR KT. MANO GRUPĖ TURI DIDELĘ ANKSTESNĘ HCV POLIMERAZĖS TYRIMO IR ANALIZĖS PATIRTĮ. KELERIUS METUS IR DĖL ANKSTESNIO PAGRINDINIO TYRĖJO BUVIMO PO DOKTORANTŪROS, MOKSLINIŲ TYRIMŲ LINIJA BUVO ATVERTA LĄSTELIŲ VEIKSNIAMS, KURIE SĄVEIKAUJA SU VIRUSINE POLIMERAZE. DĖL ŠIO DARBO MANO GRUPĖ APIBRĖŽĖ NS5B SĄVEIKĄ SU ESTROGENO ALFA RECEPTORIUMI (HILLUNG ET AL, J GENAS VIROL 2012;93:780–5). VISAI NESENIAI IR VADOVAUDAMI BENDRADARBIAVIMUI SU KITOMIS GRUPĖMIS, NUSTATĖME NS5B SĄVEIKĄ SU AKT/PKB LĄSTELIŲ KINAZE (VALERO ET AL, ANTIMIKROB AGENTAI CHEMOTHER 2016; SPAUDOJE). GAUTI REZULTATAI APIMA NS5B FOSFORILINIMĄ IN VITRO REKOMBINANTINIU AKT/PKB BŪDU, TAIP PAT PAČIĄ SĄVEIKĄ, ANALIZUOJAMĄ EKSPERIMENTAIS KARTU SU INMUNOPRECIPITACIJA. BE TO, AKT/PKB INTRALĄSTELINĖ KOLOKACIJA SU NS5B, IŠREIKŠTA ARBA LAIKINAI (PLAZMINIS PERPYLIMAS), ARBA STABILIAI (IŠLAIKANT POGENOMINĮ REPLIKONĄ), ARBA LĄSTELĖSE, KURIOS AKTYVIAI PALAIKO HCVCC INFEKCIJĄ, LEIDO MUMS PADARYTI IŠVADĄ, KAD NS5B-AKT/PKB SĄVEIKA SUKELIA AKT/PKB INTRALĄSTELINĖS VIETOS POKYTĮ, PEREINANT NUO CITOPLAZMOS PRIE PERINUCLEAR, KUR YRA HCV REPLIKACIJOS KOMPLEKSAI. KITOS GRUPĖS PARODĖ, KAD AKT/PKB AKTYVINIMAS YRA LABAI SVARBUS PRADINIUOSE HCV INFEKCIJOS ETAPUOSE, LEIDŽIANT VIRUSUI PATEKTI Į LĄSTELĘ (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012 M.;287:41922–30; HUANG ET AL AUTOFAGY. 2013 M.; 2,2:175–95). ŠIS AKTYVAVIMAS, KURIS VYKSTA PLAZMOS MEMBRANOJE, IŠNYKSTA PER KELIAS VALANDAS PO INFEKCIJOS. ŠIE ANKSTESNI REZULTATAI SKATINA MUS PRAŠYTI PROJEKTO, KURIS LEIDŽIA MUMS GILINTI ŠIĄ SĄVEIKĄ, APIBRĖŽIANT I) NS5B LIKUČIUS, SUSIJUSIUS SU SĄVEIKA SU AKT/PKB, II), NS5B LIKUČIUS, FOSFORUOTUS AKT/PKB, III) POVEIKĮ, KURĮ AKT/PKB VIETOS PAKEITIMAS TURI HCV REPLIKACIJOS CIKLUI, IR IV) NS5B POVEIKIS PI3K-AKT/PKB-MTOR SIGNALIZAVIMO MARŠRUTUI. GALIAUSIAI, DIDŽIOJI KAI KURIŲ SEKŲ, KURIOS GALI BŪTI FOSFORILINTOS HCV SU KITAIS FLAVIVIRIDAE ŠEIMOS NARIAIS, HOMOLOGIJA SKATINA MUS IŠPLĖSTI ŠIĄ ANALIZĘ, ĮTRAUKIANT FLAVIVIRUSO IR PESTIVIRUSO GENO VIRUSUS. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
VIRUSI SU PRISILJENI UNUTARSTANIČNI PARAZITI KOJI DJELUJU S STANIČNIM STROJEVIMA U SVAKOM KORAKU NJIHOVOG REPLICIRAJUĆEG CIKLUSA. POZNAVANJE INTERAKCIJE VIRUSNIH STANICA OTVARA MOGUĆNOSTI ZA MODULACIJU SVAKE KOMPONENTE OVE INTERAKCIJE. VIRUS HEPATITISA C (HCV) JE VIRUS S TROPISMOM JETRE, UZROČNIKOM HEPATITISA C I GLAVNIM UZROKOM CIROZE I HEPATOCELULARNOG KARCINOMA. ODNOSI KOJE HCV USPOSTAVLJA S STANIČNIM KOMPONENTAMA UKLJUČUJU, MEĐU OSTALIM, MEMBRANSKE RECEPTORE, PROTEINE UKLJUČENE U SIGNALIZACIJU I KONTROLNE PUTOVE STANIČNIH CIKLUSA, PUTOVE METABOLIZMA RNK ITD. MOJA SKUPINA IMA OPSEŽNO PRETHODNO ISKUSTVO U ISTRAŽIVANJU I ANALIZI HCV POLIMERAZE. NEKOLIKO GODINA, A KAO REZULTAT PRETHODNOG POSTDOKTORSKOG BORAVKA GLAVNOG ISTRAŽIVAČA, ISTRAŽIVAČKA LINIJA OTVORENA JE STANIČNIM ČIMBENICIMA KOJI DJELUJU S VIRUSNOM POLIMERAZOM. KAO REZULTAT OVOG RADA, MOJA SKUPINA JE DEFINIRALA NS5B INTERAKCIJU S RECEPTOROM ALFA ESTROGENA (HILLUNG ET AL., J GEN VIROL 2012;93:780 – 5). NEDAVNO, I VODEĆI SURADNJU S DRUGIM SKUPINAMA, DEFINIRALI SMO INTERAKCIJU NS5B S STANIČNOM KINAZOM AKT/PKB (VALERO ET AL, ANTIMICROB AGENTI CHEMOTHER 2016; U TISKU). DOBIVENI REZULTATI UKLJUČUJU IN VITRO FOSFORILACIJU NS5B REKOMBINANTNIM AKT/PKB-OM, KAO I SAMU INTERAKCIJU ANALIZIRANU POKUSIMA KO-INMUNOPRECIPITATION. OSIM TOGA, UNUTARSTANIČNA KOLOKACIJA AKT/PKB-A S NS5B, ILI IZRAŽENA ECTOPICAMENTE ILI PRIVREMENO (TRANSFUZIJA PLAZMIDA) ILI NA STABILAN NAČIN (ODRŽAVANJE SUBGENOMSKOG REPLIKONA) ILI U STANICAMA KOJE AKTIVNO PODUPIRU INFEKCIJU HCVCC-OM, OMOGUĆILA NAM JE DA ZAKLJUČIMO DA INTERAKCIJA NS5B-AKT/PKB UZROKUJE PROMJENU UNUTARSTANIČNE LOKACIJE AKT/PKB-A, KOJA SE KREĆE OD CITOPLAZME DO PERINUKLEARNE, GDJE SE NALAZE REPLIKATIVNI KOMPLEKSI HCV-A. DRUGE SKUPINE POKAZALE SU DA JE AKTIVACIJA AKT/PKB-A KLJUČNA U POČETNIM KORACIMA INFEKCIJE HCV-OM, ČIME SE VIRUSU OMOGUĆUJE ULAZAK U STANICU (LIU ET AL., J BIOL CHEM. 2012;287:41922 – 30; HUANG ET AL AUTOPHAGY. 2013.;9(2): 175 – 95). OVA AKTIVACIJA, KOJA SE ODVIJA U MEMBRANI PLAZME, NESTAJE U ROKU OD NEKOLIKO SATI NAKON INFEKCIJE. OVI PRETHODNI REZULTATI POTIČU NAS DA ZATRAŽIMO PROJEKT KOJI NAM OMOGUĆUJE DA PRODUBIMO TU INTERAKCIJU, DEFINIRAJUĆI I) OSTATKE NS5B KOJI SU UKLJUČENI U INTERAKCIJU S AKT/PKB-OM, II. REZIDUE NS5B KOJI SU FOSFORILIRANI AKT/PKB-OM, III. UČINAK KOJI PROMJENA LOKACIJE AKT/PKB-A IMA NA REPLICIRAJUĆI CIKLUS HCV-A I IV) UČINAK NS5B NA SIGNALNI PUT PI3K-AKT/PKB-MTOR. KONAČNO, VELIKA HOMOLOGIJA NEKIH SEKVENCI KOJE ĆE VJEROJATNO BITI FOSFORILIRANE U HCV-U S DRUGIM ČLANOVIMA PORODICE FLAVIVIRIDAE POTIČE NAS DA PROŠIRIMO TE ANALIZE NA VIRUSE GENA FLAVIVIRUSA I PESTIVIRUSA. (Croatian)
17 August 2022
0 references
VIRUS ÄR PÅTVINGADE INTRACELLULÄRA PARASITER SOM INTERAGERAR MED CELLMASKINER I VARJE STEG I DERAS REPLIKATIONSCYKEL. KUNSKAP OM VIRUS-CELL INTERAKTION ÖPPNAR UPP MÖJLIGHETER ATT MODULERA VAR OCH EN AV KOMPONENTERNA I DENNA INTERAKTION. HEPATIT C-VIRUS (HCV) ÄR ETT VIRUS MED LEVERTROPISM, ETT ORSAKSSAMBAND MED HEPATIT C, OCH DEN FRÄMSTA ORSAKEN TILL CIRROS OCH HEPATOCELLULÄRT KARCINOM. DE RELATIONER SOM HCV ETABLERAR MED CELLULÄRA KOMPONENTER INKLUDERAR BLAND ANNAT MEMBRANRECEPTORER, PROTEINER SOM ÄR INVOLVERADE I CELLCYKELSIGNALERING OCH KONTROLLVÄGAR, RNA-METABOLISMVÄGAR ETC. MIN GRUPP HAR LÅNG TIDIGARE ERFARENHET AV STUDIE OCH ANALYS AV HCV-POLYMERAS. UNDER NÅGRA ÅR, OCH SOM ETT RESULTAT AV EN TIDIGARE POSTDOKTORAL VISTELSE HOS HUVUDFORSKAREN, HAR FORSKNINGSLINJEN ÖPPNATS FÖR CELLULÄRA FAKTORER SOM INTERAGERAR MED VIRUSPOLYMERAS. SOM ETT RESULTAT AV DETTA ARBETE DEFINIERADE MIN GRUPP NS5B INTERAKTION MED ÖSTROGEN ALFARECEPTORN (HILLUNG ET AL, J GEN VIROL 2012;93:780–5). HELT NYLIGEN, OCH LEDER SAMARBETET MED ANDRA GRUPPER, HAR VI DEFINIERAT NS5B’S INTERAKTION MED AKT/PKB CELLKINAS (VALERO ET AL, ANTIMICROB AGENT CHEMOTHER 2016; I PRESSEN). DE ERHÅLLNA RESULTATEN INKLUDERAR IN VITRO-FOSFORYLERING AV NS5B GENOM REKOMBINANT AKT/PKB SAMT SJÄLVA INTERAKTIONEN ANALYSERAD GENOM SAMINMUNOPRECIPITATION-FÖRSÖK. DESSUTOM HAR DEN INTRACELLULÄRA SAMLOKALISERINGEN AV AKT/PKB MED NS5B, ANTINGEN UTTRYCKT ECTOPICAMENTE ANTINGEN TILLFÄLLIGT (PLASMIDTRANSFUSION) ELLER PÅ ETT STABILT SÄTT (BEVARANDE AV EN SUBGENOMISK REPLIKON), ELLER I CELLER SOM AKTIVT STÖDER HCVCC-INFEKTION, GJORT DET MÖJLIGT FÖR OSS ATT DRA SLUTSATSEN ATT INTERAKTIONEN MELLAN NS5B-AKT/PKB INDUCERAR EN FÖRÄNDRING I DEN INTRACELLULÄRA PLACERINGEN AV AKT/PKB, SOM RÖR SIG FRÅN CYTOPLASMA TILL PERINUCLEAR, DÄR HCV-REPLIKATIVA KOMPLEX FINNS. ANDRA GRUPPER HAR VISAT ATT AKTIVERING AV AKT/PKB ÄR AVGÖRANDE I DE INLEDANDE STEGEN AV HCV-INFEKTION, SÅ ATT VIRUSET KAN KOMMA IN I CELLEN (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012;287:41922–30; HUANG ET AL AUTOFAGY. 2013;9(2):175–95). DENNA AKTIVERING, SOM SKER I PLASMAMEMBRANET, FÖRSVINNER INOM NÅGRA TIMMAR EFTER INFEKTION. DESSA TIDIGARE RESULTAT UPPMUNTRAR OSS ATT BEGÄRA ETT PROJEKT SOM GÖR DET MÖJLIGT FÖR OSS ATT FÖRDJUPA DENNA INTERAKTION, DEFINIERA I) DE NS5B-RESTER SOM INGÅR I INTERAKTIONEN MED AKT/PKB, II) DE NS5B-RESTER SOM FOSFORYLERATS AV AKT/PKB, III) DEN EFFEKT SOM ÄNDRINGEN AV AKT/PKB HAR PÅ DEN REPLIKERANDE CYKELN AV HCV, OCH IV) DEN EFFEKT NS5B HAR PÅ PI3K-AKT/PKB-MTOR SIGNALVÄG. SLUTLIGEN, DEN STORA HOMOLOGIN AV NÅGRA AV DE SEKVENSER SOM SANNOLIKT KOMMER ATT FOSFORYLERAS I HCV MED ANDRA MEDLEMMAR AV FLAVIVIRIDAE FAMILJEN UPPMUNTRAR OSS ATT UTVIDGA DESSA ANALYSER TILL VIRUS AV FLAVIVIRUS OCH PESTIVIRUS GENEN. (Swedish)
17 August 2022
0 references
VIRUSURILE SUNT PARAZIȚI INTRACELULARI FORȚAȚI CARE INTERACȚIONEAZĂ CU MAȘINILE CELULARE ÎN FIECARE ETAPĂ A CICLULUI LOR REPLICATIV. CUNOAȘTEREA INTERACȚIUNII VIRUS-CELULĂ DESCHIDE OPORTUNITĂȚI DE A MODULA FIECARE DINTRE COMPONENTELE ACESTEI INTERACȚIUNI. VIRUSUL HEPATITEI C (VHC) ESTE UN VIRUS CU TROPISM HEPATIC, UN AGENT CAUZAL AL HEPATITEI C ȘI CAUZA PRINCIPALĂ A CIROZEI ȘI CARCINOMULUI HEPATOCELULAR. RELAȚIILE PE CARE HCV LE STABILEȘTE CU COMPONENTELE CELULARE INCLUD, PRINTRE ALTELE, RECEPTORII MEMBRANEI, PROTEINELE IMPLICATE ÎN SEMNALIZAREA ȘI CONTROLUL CICLULUI CELULAR, CĂILE METABOLISMULUI ARN ETC. GRUPUL MEU ARE O VASTĂ EXPERIENȚĂ ANTERIOARĂ ÎN STUDIUL ȘI ANALIZA POLIMERAZEI VHC. TIMP DE CÂȚIVA ANI ȘI CA URMARE A UNEI ȘEDERI POSTDOCTORALE ANTERIOARE A CERCETĂTORULUI PRINCIPAL, LINIA DE CERCETARE A FOST DESCHISĂ FACTORILOR CELULARI CARE INTERACȚIONEAZĂ CU POLIMERAZA VIRALĂ. CA URMARE A ACESTEI LUCRĂRI, GRUPUL MEU A DEFINIT INTERACȚIUNEA NS5B CU RECEPTORUL ALFA DE ESTROGEN (HILLUNG ET AL, GENA J VIROL 2012;93:780-5). FOARTE RECENT, ȘI CONDUCÂND COLABORAREA CU ALTE GRUPURI, AM DEFINIT INTERACȚIUNEA NS5B CU KINAZA CELULARĂ AKT/PKB (VALERO ET AL, AGENȚI ANTIMICROB CHEMOTHER 2016; ÎN PRESĂ). REZULTATELE OBȚINUTE INCLUD FOSFORILAREA IN VITRO A NS5B DE CĂTRE AKT/PKB RECOMBINANTĂ, PRECUM ȘI INTERACȚIUNEA ÎN SINE ANALIZATĂ PRIN EXPERIMENTE DE CO-INMUNOPRECIPITATION. ÎN PLUS, COLOCAȚIA INTRACELULARĂ A AKT/PKB CU NS5B, FIE EXPRIMATĂ ECTOPICAMENTE FIE TEMPORAR (TRANSFUZIE PLASMATICĂ), FIE ÎNTR-UN MOD STABIL (MENȚINEREA UNUI REPLICON SUBGENOMIC), FIE ÎN CELULE CARE SUSȚIN ÎN MOD ACTIV INFECȚIA CU HCVCC, NE-A PERMIS SĂ CONCLUZIONĂM CĂ INTERACȚIUNEA NS5B-AKT/PKB INDUCE O SCHIMBARE ÎN LOCALIZAREA INTRACELULARĂ A AKT/PKB, TRECÂND DE LA CITOPLASMĂ LA PERINUCLEARĂ, UNDE SE AFLĂ COMPLEXE REPLICATIVE HCV. ALTE GRUPURI AU ARĂTAT CĂ ACTIVAREA AKT/PKB ESTE ESENȚIALĂ ÎN ETAPELE INIȚIALE ALE INFECȚIEI CU VHC, PERMIȚÂND VIRUSULUI SĂ INTRE ÎN CELULĂ (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012;287:41922-30; HUANG ET AL AUTOFAGIE. 2013;9(2):175-95). ACEASTĂ ACTIVARE, CARE ARE LOC ÎN MEMBRANA PLASMATICĂ, DISPARE ÎN CÂTEVA ORE DUPĂ INFECTARE. ACESTE REZULTATE ANTERIOARE NE ÎNCURAJEAZĂ SĂ SOLICITĂM UN PROIECT CARE SĂ NE PERMITĂ SĂ APROFUNDĂM ACEASTĂ INTERACȚIUNE, DEFININD I) REZIDUURILE DE NS5B IMPLICATE ÎN INTERACȚIUNEA CU AKT/PKB, II) REZIDUURILE NS5B CARE SUNT FOSFORILATE DE AKT/PKB, III) EFECTUL PE CARE ÎL ARE SCHIMBAREA LOCAȚIEI AKT/PKB ASUPRA CICLULUI REPLICATIV AL HCV ȘI IV) EFECTUL PE CARE NS5B ÎL ARE ASUPRA RUTEI DE SEMNALIZARE PI3K-AKT/PKB-MTOR. ÎN CELE DIN URMĂ, MAREA OMONIOLOGIE A UNOR SECVENȚE CARE AR PUTEA FI FOSFORILATE ÎN VHC CU ALȚI MEMBRI AI FAMILIEI FLAVIVIRIDAE NE ÎNCURAJEAZĂ SĂ EXTINDEM ACESTE ANALIZE LA VIRUSURILE GENEI FLAVIVIRUS ȘI PESTIVIRUS. (Romanian)
17 August 2022
0 references
VIRUSI SO PRISILJENI ZNOTRAJCELIČNI PARAZITI, KI MEDSEBOJNO DELUJEJO S CELIČNIMI STROJI V VSAKEM KORAKU NJIHOVEGA REPLIKACIJSKEGA CIKLA. POZNAVANJE INTERAKCIJE MED VIRUSI IN CELICAMI ODPIRA MOŽNOSTI ZA MODULACIJO VSAKE SESTAVINE TE INTERAKCIJE. VIRUS HEPATITISA C (HCV) JE VIRUS Z JETRNIM TROPIZMOM, VZROČNIM POVZROČITELJEM HEPATITISA C IN GLAVNIM VZROKOM CIROZE IN HEPATOCELULARNEGA KARCINOMA. RAZMERJA, KI JIH HCV VZPOSTAVLJA S CELIČNIMI KOMPONENTAMI, MED DRUGIM VKLJUČUJEJO MEMBRANSKE RECEPTORJE, BELJAKOVINE, VKLJUČENE V SIGNALIZACIJO IN KONTROLNE POTI CELIČNEGA CIKLA, POTI PRESNOVE RNK ITD. MOJA SKUPINA IMA OBSEŽNE PREDHODNE IZKUŠNJE V ŠTUDIJI IN ANALIZI POLIMERAZE HCV. ZA NEKAJ LET, IN KOT POSLEDICA PREJŠNJEGA PODOKTORSKEGA BIVANJA GLAVNEGA RAZISKOVALCA, RAZISKOVALNA LINIJA JE BILA ODPRTA ZA CELIČNE DEJAVNIKE, KI INTERAKCIJO Z VIRUSNO POLIMERAZO. ZARADI TEGA DELA JE MOJA SKUPINA OPREDELILA INTERAKCIJO NS5B Z RECEPTORJEM ESTROGENA ALFA (HILLUNG ET AL, J GEN VIROL 2012;93:780–5). V ZADNJEM ČASU, IN VODENJE SODELOVANJA Z DRUGIMI SKUPINAMI, SMO OPREDELILI NS5B’S INTERAKCIJO Z AKT/PKB CELIČNO KINAZO (VALERO ET AL, ANTIMICROB AGENTI CHEMOTHER 2016; V TISKU). DOBLJENI REZULTATI VKLJUČUJEJO FOSFORILACIJO NS5B IN VITRO Z REKOMBINANTNO AKT/PKB TER SAMO INTERAKCIJO, ANALIZIRANO S SO-INMUNOPRECIPITACIJSKIMI POSKUSI. POLEG TEGA NAM JE ZNOTRAJCELIČNA KOLOKACIJA AKT/PKB Z NS5B, IZRAŽENA BODISI ZAČASNO (PLAZEMSKA TRANSFUZIJA) BODISI STABILNO (VZDRŽEVANJE SUBGENOMSKEGA REPLIKONA) ALI V CELICAH, KI AKTIVNO PODPIRAJO OKUŽBO S HCVCC, OMOGOČILA, DA UGOTOVIMO, DA INTERAKCIJA NS5B-AKT/PKB POVZROČI SPREMEMBO ZNOTRAJCELIČNE LOKACIJE AKT/PKB, KI PREHAJA IZ CITOPLAZMIČNE V PERINUKLEARNO, KJER SE NAHAJAJO REPLIKACIJSKI KOMPLEKSI HCV. DRUGE SKUPINE SO POKAZALE, DA JE AKTIVIRANJE AKT/PKB KLJUČNEGA POMENA V ZAČETNIH FAZAH OKUŽBE S HCV, KAR VIRUSU OMOGOČA VSTOP V CELICO (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012;287:41922–30; HUANG ET AL AVTOFAGIJA. 2013;9(2):175–95). TA AKTIVACIJA, KI POTEKA V PLAZEMSKI MEMBRANI, IZGINE V NEKAJ URAH PO OKUŽBI. TI PREJŠNJI REZULTATI NAS SPODBUJAJO, DA ZAHTEVAMO PROJEKT, KI NAM OMOGOČA POGLOBITEV TE INTERAKCIJE, KI OPREDELJUJE I) OSTANKE NS5B, VKLJUČENE V INTERAKCIJO Z AKT/PKB, II) OSTANKE NS5B, KI SO FOSFORILIRANI Z AKT/PKB, III) UČINEK, KI GA IMA SPREMEMBA LOKACIJE AKT/PKB NA REPLIKATIVNI CIKEL HCV, IN IV) UČINEK NS5B NA SIGNALNO POT PI3K-AKT/PKB-MTOR. IN KONČNO, VELIKA HOMOLOGIJA NEKATERIH SEKVENC, KI SE LAHKO FOSFORILIRAJO PRI HCV Z DRUGIMI ČLANI DRUŽINE FLAVIVIRIDAE, NAS SPODBUJA, DA TE ANALIZE RAZŠIRIMO NA VIRUSE FLAVIVIRUSA IN GENA ZA PESTIVIRUS. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
WIRUSY SĄ WYMUSZONE WEWNĄTRZKOMÓRKOWE PASOŻYTY, KTÓRE WCHODZĄ W INTERAKCJE Z MASZYN KOMÓRKOWYCH NA KAŻDYM ETAPIE ICH CYKLU REPLIKACYJNEGO. ZNAJOMOŚĆ INTERAKCJI MIĘDZY WIRUSAMI A KOMÓRKAMI OTWIERA MOŻLIWOŚCI MODULOWANIA KAŻDEGO ZE SKŁADNIKÓW TEJ INTERAKCJI. WIRUS ZAPALENIA WĄTROBY TYPU C (HCV) JEST WIRUSEM Z TROPISMEM WĄTROBOWYM, CZYNNIKIEM PRZYCZYNOWYM ZAPALENIA WĄTROBY TYPU C I GŁÓWNĄ PRZYCZYNĄ MARSKOŚCI WĄTROBY I RAKA WĄTROBOWEGO. RELACJE, KTÓRE HCV NAWIĄZUJE ZE SKŁADNIKAMI KOMÓRKOWYMI, OBEJMUJĄ M.IN. RECEPTORY MEMBRANOWE, BIAŁKA UCZESTNICZĄCE W SYGNALIZOWANIU I ŚCIEŻCE KONTROLI CYKLU KOMÓRKOWEGO, ŚCIEŻKI METABOLIZMU RNA ITP. MOJA GRUPA MA BOGATE WCZEŚNIEJSZE DOŚWIADCZENIE W BADANIU I ANALIZIE POLIMERAZY HCV. PRZEZ KILKA LAT I W WYNIKU POPRZEDNIEGO POBYTU GŁÓWNEGO BADACZA, LINIA BADAWCZA ZOSTAŁA OTWARTA NA CZYNNIKI KOMÓRKOWE, KTÓRE WCHODZĄ W INTERAKCJE Z POLIMERAZĄ WIRUSOWĄ. W WYNIKU TEJ PRACY MOJA GRUPA ZDEFINIOWAŁA INTERAKCJE NS5B Z RECEPTOREM ALFA ESTROGENU (HILLUNG ET AL, GEN J VIROL 2012;93:780-5). NIEDAWNO, PROWADZĄC WSPÓŁPRACĘ Z INNYMI GRUPAMI, ZDEFINIOWALIŚMY INTERAKCJE NS5B Z KINAZĄ KOMÓRKOWĄ AKT/PKB (VALERO ET AL, ANTIMICROB AGENT CHEMOTHER 2016; W PRASIE). UZYSKANE WYNIKI OBEJMUJĄ IN VITRO FOSFORYLACJĘ NS5B REKOMBINOWANĄ AKT/PKB, A TAKŻE SAMĄ INTERAKCJĘ ANALIZOWANĄ PRZEZ EKSPERYMENTY WSPÓŁINMUNOPREKCYJNE. PONADTO WEWNĄTRZKOMÓRKOWA KOLOKACJA AKT/PKB Z NS5B, WYRAŻONA PRZEZ ECTOPICAMENTE TYMCZASOWO (TRANSFUZJA PLAZMIDOWA) LUB W STABILNY SPOSÓB (UTRZYMANIE REPLIKONU SUBGENOMICZNEGO), ALBO W KOMÓRKACH AKTYWNIE WSPIERAJĄCYCH ZAKAŻENIE HCVCC, POZWOLIŁA NAM STWIERDZIĆ, ŻE INTERAKCJA NS5B-AKT/PKB POWODUJE ZMIANĘ WEWNĄTRZKOMÓRKOWEJ LOKALIZACJI AKT/PKB, PRZECHODZĄC Z CYTOPLAZMYCZNEGO DO PERYNUKLEARNEGO, GDZIE ZNAJDUJĄ SIĘ KOMPLEKSY REPLIKACYJNE HCV. INNE GRUPY WYKAZAŁY, ŻE AKTYWACJA AKT/PKB MA KLUCZOWE ZNACZENIE W POCZĄTKOWYCH ETAPACH ZAKAŻENIA HCV, POZWALAJĄC WIRUSOWI WEJŚĆ DO KOMÓRKI (LIU ET AL, J BIOL CHEM. 2012;287:41922-30; HUANG ET AL AUTOPHAGY. 2013;9(2):175-95). AKTYWACJA TA, KTÓRA ODBYWA SIĘ W MEMBRANIE PLAZMOWEJ, ZNIKA W CIĄGU KILKU GODZIN PO ZAKAŻENIU. TE POPRZEDNIE WYNIKI ZACHĘCAJĄ NAS DO ŻĄDANIA PROJEKTU, KTÓRY POZWOLI NAM POGŁĘBIĆ TĘ INTERAKCJĘ, DEFINIUJĄC I) POZOSTAŁOŚCI NS5B BIORĄCE UDZIAŁ W INTERAKCJI Z AKT/PKB, II) POZOSTAŁOŚCI NS5B FOSFORYLOWANE PRZEZ AKT/PKB, III) WPŁYW ZMIANY LOKALIZACJI AKT/PKB NA CYKL REPLIKACYJNY HCV I IV) WPŁYW NS5B NA TRASĘ SYGNALIZACYJNĄ PI3K-AKT/PKB-MTOR. WRESZCIE, WIELKA HOMOLOGIA NIEKTÓRYCH SEKWENCJI, KTÓRE MOGĄ BYĆ FOSFORYLOWANE W HCV Z INNYMI CZŁONKAMI RODZINY FLAVIVIRIDAE, ZACHĘCA NAS DO ROZSZERZENIA TYCH ANALIZ NA WIRUSY GENU FLAWIWIRUS I PESTIWIRUSA. (Polish)
17 August 2022
0 references
Albacete
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
SAF2016-80451-P
0 references