Reactivation of Human Endogenous Retroviruses (HERV) in Multiple Sclerosis: epigenetic control and diagnostic potential. (Q3153997)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3153997 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Reactivation of Human Endogenous Retroviruses (HERV) in Multiple Sclerosis: epigenetic control and diagnostic potential. |
Project Q3153997 in Spain |
Statements
35,937.0 Euro
0 references
66,000.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2014
0 references
30 March 2018
0 references
INSTITUTO ARAGONES DE CIENCIAS DE LA SALUD
0 references
La Esclerosis múltiple (EM) es una enfermedad crónica inflamatoria y degenerativa del sistema nervioso central (CNS). Ya desde los años 90 se ha relacionado la expresión de de la proteína (ENV) del Retrovirus Endógeno asociado a EM (HERV-W o MSRV) con la patología. MSRV es un Retrovirus Endógeno (HERV), que persiste en multiple copias en el genóma. Aparte de MSRV, la expresión de por lo menos HERV-K y HERV-M ha sido asociado a EM. Como otros Retrovirus Endógenos Humanos (HERV), la expresión se supone controlado por mecanismos epigenéticos, especialmente al nivel de metilación del ADN. Ni el estado epigenético, ni el estado de la metilación de los HERV han sido investigado en el contexto de la enfermedad EM. Sugerimos investigar el grado de metilación de los HERVs (y de MSRV en particular) tanto en PBMC de pacientes de EM y sus controles, como en oligodendrocitos/neuronas cultivados in vitro a partir de células iPS generadas por reprogramación de células de pacientes con EM (o controles). En todos los casos determinaremos también los niveles de expresión de MSRV/HERV con el objetivo de relacionar niveles de metilación con la expresión. Utilizaremos secuenciación masiva con el fin de determinar el abanico entero de HERV expresados en pacientes con EM. Como último, intentaremos generar modelos in vitro de células neuronales a partir de pacientes con EM, para determinar el efecto de EBV, de citokinas inflamatorias y de la ausencia de Vitamina D, sobre la metilación de los HERV y los niveles de expresión. (Spanish)
0 references
Multiple Sclerosis (MS) is a chronic inflammatory and degenerative central nervous system disease (CNS). Since the 1990s, expression of the protein (ENV) of EM-associated Endogenous Retrovirus (HERV-W or MSRV) has been linked to pathology. MSRV is an Endogenous Retrovirus (HERV), which persists in multiple copies in the genome. Apart from MSRV, the expression of at least HERV-K and HERV-M has been associated with MS. Like other Human Endogenous Retroviruses (HERV), expression is supposed to be controlled by epigenetic mechanisms, especially at the level of DNA methylation. Neither the epigenetic status nor the methylation status of the HERVs have been investigated in the context of MS disease. We suggest investigating the degree of methylation of HERVs (and MSRV in particular) both in PBMC of MS patients and their controls, and in oligodendrocytes/neurons grown in vitro from iPS cells generated by reprogramming of MS patients’ (or controls) cells. In all cases we will also determine MSRV/HERV expression levels in order to relate methylation levels to expression. We will use mass sequencing to determine the whole range of HERV expressed in MS patients. Finally, we will try to generate in vitro models of neuronal cells from patients with MS, to determine the effect of EBV, inflammatory cytokines and the absence of Vitamin D, on the methylation of HERVs and expression levels. (English)
12 October 2021
0.6384745553333627
0 references
La sclérose en plaques (MS) est une maladie chronique inflammatoire et dégénératrice du système nerveux central (SNC). Depuis les années 1990, l’expression de la protéine (VEN) du rétrovirus endogène associé à l’EM (HERV-W ou MSRV) est liée à la pathologie. MSRV est un Retrovirus endogène (HERV), qui persiste en plusieurs copies dans le génome. Mis à part MSRV, l’expression d’au moins HERV-K et HERV-M a été associée à la MS. Comme d’autres Retrovirus endogènes humains (HERV), l’expression est censée être contrôlée par des mécanismes épigénétiques, en particulier au niveau de la méthylation de l’ADN. Ni le statut épigénétique ni le statut de méthylation des VRS n’ont été étudiés dans le contexte de la maladie de SEP. Nous suggérons d’étudier le degré de méthylation des VHER (et en particulier des MSRV) tant chez les patients atteints de SEP et leurs témoins que dans les oligodendrocytes/neurons cultivés in vitro à partir de cellules iPS générées par reprogrammation des cellules des patients atteints de SEP (ou témoins). Dans tous les cas, nous déterminerons également les niveaux d’expression MSRV/HERV afin de relier les niveaux de méthylation à l’expression. Nous allons utiliser le séquençage de masse pour déterminer toute la gamme de VHER exprimée chez les patients atteints de SEP. Enfin, nous tenterons de générer des modèles in vitro de cellules neuronales à partir de patients atteints de SEP, afin de déterminer l’effet de l’EBV, des cytokines inflammatoires et de l’absence de vitamine D, sur la méthylation des VHER et les niveaux d’expression. (French)
4 December 2021
0 references
Multiple Sklerose (MS) ist eine chronisch entzündliche und degenerative Zentralnervensystemerkrankung (CNS). Seit den 1990er Jahren ist die Expression des Proteins (ENV) des EM-assoziierten Endogenen Retrovirus (HERV-W oder MSRV) mit Pathologie verbunden. MSRV ist ein Endogenes Retrovirus (HERV), das in mehreren Kopien im Genom fortbesteht. Abgesehen von MSRV wurde der Ausdruck von mindestens HERV-K und HERV-M mit MS assoziiert. Wie andere menschliche endogene Retroviren (HERV) soll der Ausdruck durch epigenetische Mechanismen gesteuert werden, insbesondere auf der Ebene der DNA-Methylierung. Weder der epigenetische Status noch der Methylierungsstatus der HERV wurden im Zusammenhang mit der MS-Krankheit untersucht. Wir schlagen vor, den Methylierungsgrad von HERV (und insbesondere MSRV) sowohl bei PBMC von MS-Patienten und deren Kontrollen als auch bei Oligodendrozyten/Neuronen, die in vitro aus iPS-Zellen angebaut wurden, zu untersuchen, die durch Reprogrammierung von MS-Patienten (oder Kontrollzellen) erzeugt wurden. In allen Fällen werden wir auch MSRV/HERV-Ausdruckpegel bestimmen, um Methylierungsniveaus mit der Expression zu verknüpfen. Wir werden die Massensequenzierung verwenden, um den gesamten HERV-Bereich, ausgedrückt bei MS-Patienten, zu bestimmen. Schließlich werden wir versuchen, in-vitro-Modelle von neuronalen Zellen von Patienten mit MS zu erzeugen, um die Wirkung von EBV, entzündliche Zytokine und das Fehlen von Vitamin D auf die Methylierung von HERVs und Expressionsniveaus zu bestimmen. (German)
9 December 2021
0 references
Multiple sclerose (MS) is een chronische inflammatoire en degeneratieve ziekte van het centrale zenuwstelsel (CNS). Sinds de jaren negentig is de expressie van het eiwit (ENV) van EM-geassocieerd endogene retrovirus (HERV-W of MSRV) gekoppeld aan pathologie. MSRV is een endogene retrovirus (HERV), dat in meerdere kopieën in het genoom blijft bestaan. Afgezien van MSRV is de uitdrukking van ten minste HERV-K en HERV-M geassocieerd met MS. Net als andere Human Endogene Retroviruses (HERV), wordt de expressie verondersteld te worden beheerst door epigenetische mechanismen, vooral op het niveau van DNA methylation. Noch de epigenetische status, noch de methylatiestatus van de HERV’s is onderzocht in de context van MS-ziekte. We stellen voor de mate van methylatie van HERV’s (en MSRV in het bijzonder) te onderzoeken, zowel bij PBMC van MS-patiënten en hun controlegroeperingen, als in oligodendrocyten/neuronen die in vitro zijn gekweekt uit iPS-cellen die worden gegenereerd door herprogrammering van MS-patiënten (of controlecellen). In alle gevallen zullen we ook MSRV/HERV expressieniveaus bepalen om methylatieniveaus te relateren aan expressie. We zullen massa-sequencing gebruiken om het hele bereik van HERV te bepalen, uitgedrukt in MS-patiënten. Tot slot zullen we proberen in vitro modellen van neuronale cellen te genereren van patiënten met MS, om het effect van EBV, ontstekingscytokinen en de afwezigheid van vitamine D, op de methylatie van HERV’s en expressieniveaus te bepalen. (Dutch)
17 December 2021
0 references
La sclerosi multipla (MS) è una malattia cronica infiammatoria e degenerativa del sistema nervoso centrale (SNC). Dagli anni'90, l'espressione della proteina (ENV) del retrovirus endogeno associato all'EM (HERV-W o MSRV) è stata collegata alla patologia. MSRV è un retrovirus endogeno (HERV), che persiste in più copie nel genoma. Oltre al MSRV, l'espressione di almeno HERV-K e HERV-M è stata associata agli SM. Come altri retrovirus endogeni umani (HERV), l'espressione dovrebbe essere controllata da meccanismi epigenetici, specialmente a livello di metilazione del DNA. Né lo stato epigenetico né lo stato di metilazione degli HERV sono stati studiati nel contesto della malattia della SM. Si suggerisce di esaminare il grado di metilazione degli HERV (e in particolare MSRV) sia nella PBMC dei pazienti affetti da SM e nei loro controlli, sia negli oligodendrociti/neuroni cresciuti in vitro da cellule iPS generate dalla riprogrammazione delle cellule dei pazienti affetti da SM (o dei controlli). In tutti i casi determineremo anche i livelli di espressione MSRV/HERV al fine di collegare i livelli di metilazione all'espressione. Useremo il sequenziamento di massa per determinare l'intera gamma di HERV espressa nei pazienti con sclerosi multipla. Infine, cercheremo di generare modelli in vitro di cellule neuronali da pazienti con SM, per determinare l'effetto di EBV, citochine infiammatorie e l'assenza di vitamina D, sulla metilazione di HERV e livelli di espressione. (Italian)
16 January 2022
0 references
Hulgiskleroos (MS) on krooniline põletikuline ja degeneratiivne kesknärvisüsteemi haigus (KNS). Alates 1990. aastatest on EM-ga seotud endogeense retroviiruse (HERV-W või MSRV) ekspressioon olnud seotud patoloogiaga. MSRV on endogeenne retroviirus (HERV), mis püsib genoomis mitmes eksemplaris. Lisaks MSRV-le on hulgiskleroosiga seostatud vähemalt HERV-K ja HERV-M ekspressiooni. Nagu teisedki inimese endogeensed retroviirused (HERV), peaks ekspressiooni kontrollima epigeneetilised mehhanismid, eriti DNA metülatsiooni tasandil. Hulgiskleroosi kontekstis ei ole uuritud ei HERVde epigeneetilise seisundi ega metülatsiooni staatust. Soovitame uurida HERVde (ja eriti MSRV) metülatsiooni astet nii hulgiskleroosiga patsientide PBMC-s kui ka nende kontrollrühmas ja oligodendrotsüütides/neuroonides, mida kasvatatakse in vitro iPS-rakkudest, mis tekivad hulgiskleroosiga patsientide (või kontroll) rakkude ümberprogrammeerimisel. Kõikidel juhtudel määrame ka MSRV/HERV ekspressiooni tasemed, et seostada metülatsiooni tasemed ekspressiooniga. Me kasutame massijärjestust, et määrata hulgiskleroosiga patsientidel väljendatud HERV-sisaldus. Lõpuks püüame luua neuronaalsete rakkude in vitro mudeleid hulgiskleroosiga patsientidelt, et määrata kindlaks EBV, põletikuliste tsütokiinide ja D-vitamiini puudumise mõju HERVde metüülimisele ja ekspressioonitasemele. (Estonian)
4 August 2022
0 references
Išsėtinė sklerozė (MS) yra lėtinė uždegiminė ir degeneracinė centrinės nervų sistemos liga (CNS). Nuo dešimtojo dešimtmečio su EM susijusio endogeninio retroviruso (HERV-W arba MSRV) baltymo (ENV) ekspresija buvo susijusi su patologija. MSRV yra endogeninis retrovirusas (HERV), kuris išlieka keliose genomo kopijose. Be MSRV, bent HERV-K ir HERV-M ekspresija buvo susijusi su IS. Kaip ir kiti žmogaus endogeniniai retrovirusai (HERV), raiška turi būti kontroliuojama epigenetiniais mechanizmais, ypač DNR metilinimo lygiu. Nei epigenetinė būklė, nei HERV metilinimo būklė nebuvo tirta sergant IS liga. Siūlome ištirti HERV (ir ypač MSRV) metilinimo laipsnį tiek IS sergančių pacientų PBMC, tiek jų kontrolinėse grupėse ir oligodendrocituose/neuronuose, išaugintuose in vitro iš iPS ląstelių, gautų perprogramuojant IS sergančių pacientų (arba kontrolinių) ląsteles. Visais atvejais mes taip pat nustatysime MSRV/HERV raiškos lygius, kad būtų galima susieti metilinimo lygius su raiška. Mes naudosime masės seką, kad nustatytume visą HERV diapazoną, išreikštą IS sergantiems pacientams. Galiausiai bandysime generuoti in vitro neuroninių ląstelių modelius iš pacientų, sergančių IS, nustatyti EBV, uždegiminių citokinų ir vitamino D nebuvimo poveikį HERV ir ekspresijos lygių metilinimui. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
Multipla skleroza (MS) je kronična upalna i degenerativna bolest središnjeg živčanog sustava (CNS). Od 1990-ih, ekspresija proteina (ENV) endogenog retrovirusa povezanog s EM-om (HERV-W ili MSRV) povezana je s patologijom. MSRV je endogeni retrovirus (HERV), koji se nastavlja u više primjeraka u genomu. Osim MSRV-a, izraz barem HERV-K i HERV-M povezan je s MS-om. Kao i drugi ljudski endogeni retrovirusi (HERV), ekspresiju treba kontrolirati epigenetskim mehanizmima, posebno na razini metilacije DNK. Ni epigenetski status ni status metilacije HERV-ova nisu ispitani u kontekstu MS bolesti. Predlažemo da se istraži stupanj metilacije HERV-ova (posebno MSRV-a) u PBMC-u bolesnika s multiplom sklerozom i njihovih kontrolnih skupina te u oligodendrocita/neurona uzgojenih in vitro iz iPS stanica nastalih reprogramiranjem stanica bolesnika s MS-om (ili kontrolnih stanica). U svim slučajevima također ćemo odrediti razine ekspresije MSRV/HERV kako bi se razine metilacije povezale s ekspresijom. Upotrijebit ćemo sekvenciranje mase kako bismo odredili cijeli raspon HERV izraženih u bolesnika s MS-om. Konačno, pokušat ćemo generirati in vitro modele neuronskih stanica od bolesnika s MS-om, kako bismo odredili učinak EBV-a, upalnih citokina i odsutnosti vitamina D, na metilaciju HERV-a i razine ekspresije. (Croatian)
4 August 2022
0 references
Η σκλήρυνση κατά πλάκας (MS) είναι μια χρόνια φλεγμονώδης και εκφυλιστική νόσος του κεντρικού νευρικού συστήματος (CNS). Από τη δεκαετία του 1990, η έκφραση της πρωτεΐνης (ENV) του ενδογενούς ρετροϊού που συνδέεται με το EM (HERV-W ή MSRV) έχει συνδεθεί με την παθολογία. Το MSRV είναι ένας ενδογενής ρετροϊός (HERV), ο οποίος επιμένει σε πολλαπλά αντίγραφα στο γονιδίωμα. Εκτός από το MSRV, η έκφραση τουλάχιστον των HERV-K και HERV-M έχει συσχετιστεί με MS. Όπως και με άλλους ενδογενείς ρετροϊούς του ανθρώπου (HERV), η έκφραση υποτίθεται ότι ελέγχεται με επιγενετικούς μηχανισμούς, ειδικά στο επίπεδο της μεθυλίωσης του DNA. Ούτε η επιγενετική κατάσταση ούτε η κατάσταση μεθυλίωσης των HERV έχουν διερευνηθεί στο πλαίσιο της νόσου MS. Προτείνουμε να διερευνηθεί ο βαθμός μεθυλίωσης των HERVs (και ειδικότερα του MSRV) τόσο στην PBMC των ασθενών με σκλήρυνση κατά πλάκας όσο και στους ελέγχους τους, καθώς και σε ολιγοδενδροκύτταρα/νεουρόνια που καλλιεργούνται in vitro από κύτταρα iPS που παράγονται από τον επαναπρογραμματισμό των κυττάρων των ασθενών με σκλήρυνση (ή των μαρτύρων). Σε όλες τις περιπτώσεις θα καθορίσουμε επίσης τα επίπεδα έκφρασης MSRV/HERV προκειμένου να συσχετίσουμε τα επίπεδα μεθυλίωσης με την έκφραση. Θα χρησιμοποιήσουμε την αλληλουχία μάζας για να καθορίσουμε ολόκληρο το εύρος του HERV που εκφράζεται σε ασθενείς με σκλήρυνση σκλήρυνσης. Τέλος, θα προσπαθήσουμε να δημιουργήσουμε in vitro μοντέλα νευρωνικών κυττάρων από ασθενείς με σκλήρυνση κατά πλάκας, για να καθορίσουμε την επίδραση του EBV, των φλεγμονωδών κυτοκινών και της απουσίας βιταμίνης D, στη μεθυλίωση των HERVs και στα επίπεδα έκφρασης. (Greek)
4 August 2022
0 references
Skleróza multiplex (MS) je chronické zápalové a degeneratívne ochorenie centrálneho nervového systému (CNS). Od 90. rokov 20. storočia sa expresia proteínu (ENV) endogénneho retrovírusu súvisiaceho s EM (HERV-W alebo MSRV) spája s patológiou. MSRV je endogénny retrovírus (HERV), ktorý pretrváva vo viacerých kópiách v genóme. Okrem MSRV, expresia aspoň HERV-K a HERV-M bola spojená s MS. Rovnako ako iné ľudské endogénne retrovírusy (HERV), expresia sa má kontrolovať epigenetickými mechanizmami, najmä na úrovni metylácie DNA. V súvislosti s ochorením SM sa neskúmal ani epigenetický stav ani stav metylácie HERV. Navrhujeme preskúmať stupeň metylácie HERV (a najmä MSRV) tak v PBMC pacientov s SM, ako aj v ich kontrolných skupinách, ako aj v oligodendrocytov/neurónoch vypestovaných in vitro z iPS buniek vytvorených preprogramovaním buniek (alebo kontrolných) buniek pacientov s MS. Vo všetkých prípadoch určíme aj úrovne expresie MSRV/HERV, aby sme prepojili hladiny metylácie s expresiou. Použijeme hromadné sekvenovanie na určenie celého rozsahu HERV vyjadreného u pacientov s SM. Nakoniec sa pokúsime vytvoriť in vitro modely neurónových buniek od pacientov so SM, aby sme určili účinok EBV, zápalových cytokínov a absenciu vitamínu D na metyláciu HERV a hladiny expresie. (Slovak)
4 August 2022
0 references
MS-tauti (MS) on krooninen tulehduksellinen ja rappeuttava keskushermoston sairaus (CNS). EM:ään liittyvän endogeenisen retroviruksen (HERV-W tai MSRV) proteiinin (ENV) ilmentyminen on 1990-luvulta lähtien liittynyt patologiaan. MSRV on endogeeninen retrovirus (HERV), joka säilyy useita kopioita genomissa. MSRV:n lisäksi ainakin HERV-K:n ja HERV-M:n ilmentymä on yhdistetty MS-tautiin. Kuten muutkin ihmisen endogeeniset retrovirukset (HERV), ilmentymistä on tarkoitus hallita epigeneettisin mekanismein, erityisesti DNA-metylaatiotasolla. HERV:n epigeneettistä tilaa tai metyloitumistilannetta ei ole tutkittu MS-taudin yhteydessä. Ehdotamme, että tutkitaan HERV:n (ja erityisesti MSRV:n) metyloitumisastetta MS-potilailla ja niiden kontrollipotilailla sekä oligodendrosyyteillä/neuroneilla, jotka on kasvatettu in vitro MS-potilaiden (tai kontrolli) solujen uudelleenohjelmointiin perustuvista iPS-soluista. Kaikissa tapauksissa määritämme myös MSRV/HERV-ilmaisutasot, jotta metylaatiotasot voidaan suhteuttaa ilmentymiseen. Käytämme massasekvensointia MS-potilailla ilmaistun HERV:n kokonaisvalikoiman määrittämiseen. Lopuksi yritämme tuottaa in vitro -malleja neuronaalisoluista MS-potilailta määrittääksemme EBV: n, tulehduksellisten sytokiinien ja D-vitamiinin puuttumisen vaikutuksen HERV: n metyloitumiseen ja ilmentymistasoihin. (Finnish)
4 August 2022
0 references
Stwardnienie rozsiane (MS) jest przewlekłą chorobą zapalną i zwyrodnieniową ośrodkowego układu nerwowego (CNS). Od lat 90. XX wieku ekspresja białka (ENV) endogennego Retrowirusa związanego z EM (HERV-W lub MSRV) jest związana z patologią. MSRV jest endogennym Retrowirusem (HERV), który utrzymuje się w wielu kopiach w genomie. Oprócz MSRV, ekspresja co najmniej HERV-K i HERV-M jest związana z SM. Podobnie jak inne ludzkie retrowirusy endogenne (HERV), ekspresja powinna być kontrolowana przez mechanizmy epigenetyczne, zwłaszcza na poziomie metylacji DNA. W kontekście choroby MS nie badano ani statusu epigenetycznego, ani statusu metylacji HERV. Sugerujemy zbadanie stopnia metylacji HERV (a w szczególności MSRV) zarówno w PBMC pacjentów z SM i ich kontroli, jak i w oligodendrocytach/neuronów wyhodowanych in vitro z komórek iPS generowanych w wyniku przeprogramowania komórek (lub kontrolnych) pacjentów z SM. WE wszystkich przypadkach określimy również poziomy ekspresji MSRV/HERV w celu powiązania poziomów metylacji z ekspresją. Użyjemy sekwencjonowania masowego do określenia całego zakresu HERV wyrażonego u pacjentów z SM. Wreszcie, będziemy starać się generować in vitro modele komórek neuronalnych od pacjentów z SM, w celu określenia wpływu EBV, cytokin zapalnych i braku witaminy D, na metylację HERVs i poziom ekspresji. (Polish)
4 August 2022
0 references
Sclerosis multiplex (MS) egy krónikus gyulladásos és degeneratív központi idegrendszeri betegség (CNS). Az 1990-es évek óta az EM-hez kapcsolódó endogén Retrovírus (HERV-W vagy MSRV) fehérje expressziója a patológiához kapcsolódik. Az MSRV egy endogén Retrovírus (HERV), amely több példányban is megmarad a genomban. Az MSRV-n kívül a legalább HERV-K és HERV-M expressziója SM-hez kapcsolódott. A többi humán endogén retrovírushoz (HERV) hasonlóan a kifejezést epigenetikus mechanizmusokkal kell szabályozni, különösen a DNS-metiláció szintjén. Sem a HERV-k epigenetikai állapotát, sem metilációs státuszát nem vizsgálták SM-betegséggel összefüggésben. Javasoljuk a HERV-k (és különösen az MSRV) metilációjának fokát mind az SM-betegek PBMC-jében és kontrollcsoportjában, mind pedig az SM-betegek (vagy kontrollok) sejtjeinek átprogramozásával létrehozott iPS-sejtekből in vitro előállított oligodendrocyták/neuronok esetében. Minden esetben meg fogjuk határozni az MSRV/HERV kifejezési szinteket is annak érdekében, hogy a metilációs szinteket a kifejezéssel kapcsoljuk össze. Tömegszekvenálást alkalmazunk a HERV SM-betegekben kifejezett teljes tartományának meghatározására. Végül megpróbálunk in vitro neuronsejteket létrehozni SM-ben szenvedő betegekből, hogy meghatározzuk az EBV, a gyulladásos citokinek és a D-vitamin hiányának hatását a HERV-k metilációjára és a expressziós szintekre. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
Roztroušená skleróza (MS) je chronické zánětlivé a degenerativní onemocnění centrálního nervového systému (CNS). Od 90. let 20. století je exprese proteinu (ENV) endogenního retroviru spojeného s EM (HERV-W nebo MSRV) spojena s patologií. MSRV je endogenní Retrovirus (HERV), který přetrvává ve více kopiích v genomu. Kromě MSRV byla exprese alespoň HERV-K a HERV-M spojena s MS. Stejně jako jiné lidské endogenní retrovirusy (HERV) má být exprese řízena epigenetickými mechanismy, zejména na úrovni methylace DNA. Epigenetický status ani methylační status HERV nebyl zkoumán v souvislosti s onemocněním roztroušené sklerózy. Navrhujeme prozkoumat stupeň methylace HERV (a zejména MSRV) jak u PBMC pacientů s roztroušenou sklerózou, tak u oligodendrocytů/neuronů pěstovaných in vitro z buněk iPS generovaných přeprogramováním buněk pacientů s roztroušenou sklerózou (nebo kontrol). Ve všech případech také určíme expresní hodnoty MSRV/HERV, abychom spojili obsah methylace s výrazem. K určení celého rozsahu HERV vyjádřeného u pacientů s roztroušenou sklerózou použijeme hmotnostní sekvenování. Nakonec se pokusíme generovat in vitro modely neuronových buněk od pacientů s roztroušenou sklerózou, určit účinek EBV, zánětlivých cytokinů a nepřítomnosti vitaminu D, na methylaci HERVs a hladiny exprese. (Czech)
4 August 2022
0 references
Multiplā skleroze (MS) ir hroniska iekaisuma un deģeneratīva centrālās nervu sistēmas slimība (CNS). Kopš deviņdesmitajiem gadiem ar EM saistītā endogēnā retrovīrusa (HERV-W vai MSRV) proteīna ekspresija (ENV) ir saistīta ar patoloģiju. MSRV ir endogēns retrovīruss (HERV), kas genomā saglabājas vairākos eksemplāros. Izņemot MSRV, vismaz HERV-K un HERV-M ekspresija ir saistīta ar MS. Tāpat kā citi cilvēka endogēnie retrovīrusi (HERV), ekspresiju paredzēts kontrolēt ar epiģenētiskiem mehānismiem, īpaši DNS metilācijas līmenī. MS slimības kontekstā nav pētīts ne HERV epiģenētiskais stāvoklis, ne metilēšanas statuss. Mēs iesakām izpētīt HERV (un jo īpaši MSRV) metilēšanas pakāpi gan MS pacientiem PBMC, gan viņu kontrolēm, gan oligodendrocītiem/neironiem, kas in vitro izaudzēti no iPS šūnām, kas rodas, pārprogrammējot MS pacientu (vai kontroles) šūnas. Visos gadījumos mēs noteiksim arī MSRV/HERV ekspresijas līmeņus, lai metilēšanas līmeņus sasaistītu ar ekspresiju. Mēs izmantosim masveida sekvencēšanu, lai noteiktu visu HERV diapazonu, kas izteikts MS pacientiem. Visbeidzot, mēs centīsimies in vitro radīt neironu šūnu modeļus no pacientiem ar MS, lai noteiktu EBV, iekaisuma citokīnu un D vitamīna trūkumu ietekmi uz HERV metilāciju un ekspresijas līmeni. (Latvian)
4 August 2022
0 references
Is Sclerosis Il (MS) galar ainsealach athlastach agus degenerative lárchóras na néaróg (CNS). Ó na 1990í i leith, tá léiriú na próitéine (ENV) de Retrovirus Endogenous a bhaineann le EM (HERV-W nó MSRV) nasctha le paiteolaíocht. Is Retrovirus Endogenous (HERV) é MSRV, a mhaireann i roinnt cóipeanna sa ghéanóm. Seachas MSRV, tá léiriú HERV-K agus HERV-M ar a laghad bainteach le MS. Cosúil le Retroviruses Eile Endogenous Daonna (HERV), tá sé ceaptha go mbeidh an slonn á rialú ag meicníochtaí epigenetic, go háirithe ag leibhéal meitiliúcháin DNA. Níor imscrúdaíodh stádas epigenetic ná stádas meitile na n-easpaiginí i gcomhthéacs ghalar na mBallstát. Molaimid imscrúdú a dhéanamh ar an méid meitile a dhéantar ar HERVanna (agus MSRV go háirithe) in PBMC na n-othar sna Ballstáit agus ar a rialuithe, agus in oligodendrocytes/neurons a fhástar in vitro ó chealla iPS a ghintear trí athchlárú cealla othar (nó rialuithe) de chuid na mBallstát. I ngach cás déanfaimid leibhéil léirithe MSRV/HERV a chinneadh freisin chun leibhéil mheitile a nascadh le léiriú. Bainfimid úsáid as seicheamhú maise chun an raon iomlán HERV a léirítear in othair MS a chinneadh. Ar deireadh, déanfaimid iarracht samhlacha in vitro de chealla néaróineacha a ghiniúint ó othair le Ballstáit, chun éifeacht EBV, cítokines athlastacha agus easpa Vitimín D a chinneadh, ar mheitiolú HERVanna agus ar leibhéil léirithe. (Irish)
4 August 2022
0 references
Multipla skleroza (MS) je kronična vnetna in degenerativna bolezen centralnega živčnega sistema (CNS). Od devetdesetih let prejšnjega stoletja je izražanje beljakovine (ENV) endogenega Retrovirusa, povezanega z EM (HERV-W ali MSRV), povezano s patologijo. MSRV je endogeni retrovirus (HERV), ki vztraja v več kopij v genomu. Poleg MSRV je izražanje vsaj HERV-K in HERV-M povezano z MS. Tako kot drugi humani endogeni retrovirusi (HERV) naj bi ekspresijo nadzirali epigenetični mehanizmi, zlasti na ravni metilacije DNK. Niti epigenetski status niti status metilacije HERV nista raziskana v okviru bolezni MS. Predlagamo, da se razišče stopnja metilacije HERV (in zlasti MSRV) pri bolnikih z multiplo sklerozo (PBMC) in njihovih kontrolah ter v oligodendrocitih/neuronih, vzgojenih in vitro iz iPS celic, ustvarjenih z reprogramiranjem (ali kontrolnih) celic bolnikov z MS. V vseh primerih bomo določili tudi ravni ekspresije MSRV/HERV, da bi metilacijske ravni povezali z izražanjem. Uporabili bomo množično zaporedje za določitev celotnega obsega HERV, izraženega pri bolnikih z MS. Končno bomo poskušali ustvariti in vitro modele nevronskih celic bolnikov z MS, da bi ugotovili učinek EBV, vnetnih citokinov in odsotnosti vitamina D, na metilacijo HERV in ravni izražanja. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
Множествената склероза (МС) е хронично възпалително и дегенеративно заболяване на централната нервна система (ЦНС). От 90-те години насам експресията на протеина (ENV) на свързания с ЕМ ендогенен ретровирус (HERV-W или MSRV) е свързана с патологията. MSRV е ендогенен ретровирус (HERV), който продължава в множество копия в генома. Освен MSRV, експресията на поне HERV-K и HERV-M е свързана с МС. Подобно на други човешки ендогенни ретровируси (HERV), експресията трябва да се контролира чрез епигенетични механизми, особено на нивото на ДНК метилиране. Нито епигенетичният статус, нито статусът на метилиране на HERV са изследвани в контекста на болестта на МС. Предлагаме да се проучи степента на метилиране на HERVs (и по-специално MSRV) както в PBMC на пациенти с МС и техните контроли, така и в олигодендроцити/неврони, отглеждани in vitro от иПС клетки, генерирани от препрограмиране на клетките на пациентите с МСЧ (или контролите). Във всички случаи ще определяме и нивата на експресия на MSRV/HERV, за да свържем нивата на метилиране с експресията. Ще използваме секвениране на масата, за да определим целия диапазон на HERV, изразен при пациенти с МС. И накрая, ще се опитаме да генерираме in vitro модели на невронни клетки от пациенти с МС, за да определим ефекта на EBV, възпалителните цитокини и отсъствието на витамин D, върху метилирането на HERV и нивата на експресия. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
Sklerożi multipla (MS) hija marda kronika infjammatorja u deġenerattiva tas-sistema nervuża ċentrali (CNS). Mis-snin disgħin, l-espressjoni tal-proteina (ENV) tar-Retrovirus Endoġenu assoċjat ma’ EM (HERV-W jew MSRV) kienet marbuta mal-patoloġija. MSRV huwa Retrovirus Endoġenuż (HERV), li jippersisti f’diversi kopji fil-ġenoma. Minbarra l-MSRV, l-espressjoni ta’ mill-inqas HERV-K u HERV-M ġiet assoċjata ma’ MS. Bħal Retroviruses Enoġenużi Umani oħra (HERV), l-espressjoni suppost li tkun ikkontrollata minn mekkaniżmi epiġenetiċi, speċjalment fil-livell ta’ metilazzjoni tad-DNA. La l-istatus epiġenetiku u lanqas l-istatus tal-metilazzjoni tal-HERVs ma ġew investigati fil-kuntest tal-marda tal-MS. Nissuġġerixxu li jiġi investigat il-grad ta’ methylation ta’ HERVs (u b’mod partikolari MSRV) kemm f’PBMC ta’ pazjenti b’MS u l-kontrolli tagħhom, kif ukoll f’oligodendrocytes/newroni mkabbra in vitro minn ċelloli iPS iġġenerati mill-ipprogrammar mill-ġdid ta’ ċelloli (jew kontrolli) ta’ pazjenti b’MS. Fil-każijiet kollha se niddeterminaw ukoll il-livelli ta’ espressjoni MSRV/HERV sabiex nirrelatati l-livelli ta’ metilazzjoni mal-espressjoni. Se nużaw sekwenzar tal-massa biex niddeterminaw il-firxa sħiħa ta’ HERV espressa f’pazjenti b’MS. Fl-aħħar nett, ser nippruvaw niġġeneraw mudelli in vitro ta’ ċelloli newronali minn pazjenti b’MS, biex niddeterminaw l-effett ta’ EBV, ċitokini infjammatorji u n-nuqqas ta’ Vitamina D, fuq il-metilazzjoni ta’ HERVs u l-livelli ta’ espressjoni. (Maltese)
4 August 2022
0 references
A Esclerose Múltipla (EM) é uma doença crónica inflamatória e degenerativa do sistema nervoso central (SNC). Desde a década de 1990, a expressão da proteína (ENV) do Retrovírus Endógeno Associado à EM (HERV-W ou MSRV) tem sido associada à patologia. O MSRV é um retrovírus endógeno (HERV), que persiste em múltiplas cópias no genoma. Além do MSRV, a expressão de pelo menos HERV-K e HERV-M tem sido associada à EM. Como outros Retrovírus Endógenos Humanos (HERV), a expressão é supostamente controlada por mecanismos epigenéticos, especialmente ao nível da metilação do ADN. Nem o estado epigenético nem o estado de metilação dos HERVs foram investigados no contexto da doença da EM. Sugerimos que se investigue o grau de metilação dos HERV (e do MSRV, em particular), tanto na PBMC dos doentes com EM e nos seus controlos, como nos oligodendrócitos/neurónios cultivados in vitro a partir de células iPS geradas pela reprogramação das células (ou dos controlos) dos doentes com EM. Em todos os casos, também determinaremos os níveis de expressão de MSRV/HERV, a fim de relacionar os níveis de metilação com a expressão. Utilizaremos a sequenciação em massa para determinar toda a gama de HERV expressa em doentes com EM. Por fim, tentaremos gerar modelos in vitro de células neuronais de doentes com EM, para determinar o efeito do EBV, das citocinas inflamatórias e da ausência de vitamina D, na metilação dos HERVs e nos níveis de expressão. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
Multipel sklerose (MS) er en kronisk inflammatorisk og degenerativ sygdom i centralnervesystemet (CNS). Siden 1990'erne har ekspression af proteinet (ENV) i EM-associeret Endogenous Retrovirus (HERV-W eller MSRV) været forbundet med patologi. MSRV er et Endogent Retrovirus (HERV), som fortsætter i flere kopier i genomet. Bortset fra MSRV er udtrykket for mindst HERV-K og HERV-M blevet associeret med MS. Ligesom andre humane endogene Retroviruses (HERV) formodes udtrykket at blive kontrolleret af epigenetiske mekanismer, især på DNA-methyleringsniveau. Hverken HERV'ernes epigenetiske status eller methyleringsstatus er blevet undersøgt i forbindelse med MS-sygdomme. Vi foreslår at undersøge graden af methylering af HERV'er (og især MSRV) både i PBMC hos MS-patienter og deres kontroller og i oligodendrocytter/neuroner, der dyrkes in vitro fra iPS-celler, der genereres ved omprogrammering af MS-patienters (eller kontrol) celler. I alle tilfælde vil vi også bestemme MSRV/HERV-udtryksniveauerne for at relatere methyleringsniveauerne til udtryk. Vi vil bruge massesekventering til at bestemme hele spektret af HERV udtrykt i MS-patienter. Endelig vil vi forsøge at generere in vitro-modeller af neuronale celler fra patienter med MS for at bestemme virkningen af EBV, inflammatoriske cytokiner og fraværet af D-vitamin på methylering af HERV'er og ekspressionsniveauer. (Danish)
4 August 2022
0 references
Scleroza multiplă (MS) este o boală cronică inflamatorie și degenerativă a sistemului nervos central (SNC). Începând cu anii 1990, expresia proteinei (ENV) a retrovirusului endogen asociat EM (HERV-W sau MSRV) a fost legată de patologie. MSRV este un Retrovirus Endogen (HERV), care persistă în mai multe copii în genom. În afară de MSRV, expresia a cel puțin HERV-K și HERV-M a fost asociată cu SM. Ca și alți retrovirusuri endogene umane (HERV), expresia ar trebui să fie controlată prin mecanisme epigenetice, în special la nivelul metilării ADN. Nici starea epigenetică, nici starea metilării HERV nu au fost investigate în contextul bolii SM. Sugerăm investigarea gradului de metilare a HERV (și, în special, a MSRV) atât în cazul PBMC al pacienților cu SM și al martorilor acestora, cât și în cazul oligodendrocitelor/neuronilor crescuți in vitro din celulele iPS generate de reprogramarea celulelor pacienților cu SM (sau de control). În toate cazurile, vom determina, de asemenea, nivelurile de expresie MSRV/HERV pentru a corela nivelurile de metilare cu exprimarea. Vom folosi secvențierea masei pentru a determina întreaga gamă de HERV exprimată la pacienții cu SM. În cele din urmă, vom încerca să generăm modele in vitro de celule neuronale de la pacienții cu SM, pentru a determina efectul EBV, citokine inflamatorii și absența vitaminei D, asupra metilării HERV-urilor și a nivelurilor de expresie. (Romanian)
4 August 2022
0 references
Multipel skleros (MS) är en kronisk inflammatorisk och degenerativ sjukdom i centrala nervsystemet (CNS). Sedan 1990-talet har uttrycket av proteinet (ENV) av EM-associerat endogent retrovirus (HERV-W eller MSRV) kopplats till patologi. MSRV är ett endogent retrovirus (HERV), som kvarstår i flera kopior i genomet. Bortsett från MSRV har uttrycket för åtminstone HERV-K och HERV-M associerats med MS. Liksom andra humana endogena retrovirus (HERV), förväntas uttrycket styras av epigenetiska mekanismer, särskilt vid DNA-metylering. Varken epigenetisk status eller HERV:s metyleringsstatus har undersökts i samband med MS-sjukdom. Vi föreslår att man undersöker graden av metylering av HERV (och MSRV i synnerhet) både i PBMC hos MS-patienter och deras kontroller, och i oligodendrocyter/neuroner som odlas in vitro från iPS-celler som genereras genom omprogrammering av MS-patienters (eller kontroller) celler. I samtliga fall kommer vi också att bestämma MSRV/HERV-uttrycksnivåer för att relatera metyleringsnivåer till uttryck. Vi kommer att använda masssekvensering för att bestämma hela HERV-intervallet uttryckt i MS-patienter. Slutligen kommer vi att försöka generera in vitro-modeller av neuronala celler från patienter med MS, för att bestämma effekten av EBV, inflammatoriska cytokiner och frånvaron av vitamin D, på metylering av HERV och uttrycksnivåer. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Zaragoza
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI13_02518
0 references