APPLICATION OF ELECTROSPRAY MASS IONISATION SPECTROMETRY FOR RAPID IDENTIFICATION AND QUANTIFICATION OF FOOD PATHOGENS (Q3151710)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3151710 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | APPLICATION OF ELECTROSPRAY MASS IONISATION SPECTROMETRY FOR RAPID IDENTIFICATION AND QUANTIFICATION OF FOOD PATHOGENS |
Project Q3151710 in Spain |
Statements
72,472.95 Euro
0 references
133,100.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2014
0 references
30 June 2017
0 references
UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE COMPOSTELA
0 references
27002
0 references
EL INCREMENTO DE LAS ENFERMEDADES TRANSMITIDAS POR LOS ALIMENTOS EN LOS ULTIMOS AÑOS, CON UNA ESPECIAL EMERGENCIA DE MICROORGANISMOS PATOGENOS COMO LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI, O ESCHERICHIA COLI, HA AUMENTADO LA PREOCUPACION SOBRE LA SEGURIDAD ALIMENTARIA TANTO ENTRE LAS AUTORIDADES COMO EN EL SECTOR PRODUCTIVO Y ENTRE LOS CONSUMIDORES. LOS PATOGENOS ALIMENTARIOS NO PUEDEN SER ELIMINADOS COMPLETAMENTE DE TODOS LOS ESTADIOS DE LA CADENA ALIMENTARIA. ADEMAS, SEGUN EL TRATAMIENTO SUFRIDO POR EL ALIMENTO, LA MICROBIOTA PRESENTE PUEDE VARIAR. EXISTEN NUMEROSOS PATOGENOS QUE SE PUEDE REQUERIR A LA EMPRESA PROCESADORA QUE ANALICE PARA DETERMINAR LA RELATIVA SEGURIDAD DE SU PRODUCTO. LOS METODOS DE DETECCION E IDENTIFICACION RAPIDA IMPLEMENTADOS EN LA ACTUALIDAD PRESENTAN LA DESVENTAJA DE ESTAR LIMITADOS A UNAS CUANTAS ESPECIES (PCR EN TIEMPO REAL), NECESITAR UN PROCESADO LARGO (SECUENCIACION,¿), NO SER CUANTITATIVOS (SECUENCIACION, MALDI-TOF), NO PERMITIR LA DETECCION EN MEZCLAS COMPLEJAS COMO LOS ALIMENTOS (SECUENCIACION, MALDI-TOF), Y PRACTICAMENTE TODOS ELLOS NECESITAR PREVIAMENTE LA SIEMBRA EN PLACA. ES POR ELLO QUE SE HACE NECESARIA LA IMPLEMENTACION DE METODOLOGIAS QUE PERMITAN LA DETECCION RAPIDA Y PRECISA DE LAS ESPECIES CONTAMINANTES EN EL ALIMENTO ASI COMO LA CUANTIFICACION DIRECTAMENTE EN UNA MUESTRA DE ALIMENTO. ESTE ES EL CASO DE LA METODOLOGIA QUE SE PROPONE EN EL PRESENTE PROYECTO: LA DEFINICION DE PEPTIDOS BIOMARCADORES DE ESPECIES PATOGENAS Y PRODUCTORAS DE AMINAS BIOGENAS EN ALIMENTOS Y LA POSTERIOR IMPLEMENTACION DE LA APLICACION DE DICHOS PEPTIDOS PARA LA DETECCION EN MUESTRAS ALIMENTARIAS. PARA ELLO SE UTILIZARA LA CROMATOGRAFIA LIQUIDA CAPILAR ACOPLADA A ESPECTROMETRIA DE MASAS EN TANDEM EN UN EQUIPO ELECTROSPRAY-TRAMPA IONICA (LC-ESI-IT-MS/MS) Y POSTERIOR ANALISIS MEDIANTE DIFERENTES SOFTWARE Y COMPARACION CON LAS SECUENCIAS AMINOACIDICAS DEPOSITADAS EN BASES DE DATOS._x000D_ PARA LLEVAR A CABO LA DEFINICION DE PEPTIDOS BIOMARCADORES ES NECESARIO DISPONER DE UN AMPLIO NUMERO DE CEPAS BACTERIANAS PARA LLEVAR A CABO EL ANALISIS. LAS ESPECIES BACTERIANAS QUE SE INCLUIRAN EN EL ESTUDIO COMPRENDERAN AQUELLAS QUE SE AISLAN MAS FRECUENTEMENTE EN PRODUCTOS ALIMENTARIOS, SEGUN LO DESCRITO EN LA LITERATURA, E INCLUYEN LA FAMILIA ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, ESTAFILOCOCOS COAGULASA-POSITIVOS; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS, Y C. BOTULINUM TIPOS E Y B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS Y B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES Y YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP Y PAENIBACILLUS SPP. NUESTRO LABORATORIO DISPONE DE UNA AMPLIA COLECCION DE CEPAS BACTERIANAS AISLADAS DE DIVERSOS ALIMENTOS (CARNICOS, PESCADO, MINIMAMENTE PROCESADO Y LISTOS PARA EL CONSUMO, LACTEOS,¿). TODAS ELLAS HAN SIDO CARACTERIZADAS MEDIANTE DIFERENTES METODOLOGIAS TANTO CLASICAS COMO GENOMICAS Y PROTEOMICAS (MALDI-TOF). DICHA RELACION DE ESPECIES CON SUS CORRESPONDIENTES ESPECTROS DE MALDI-TOF Y SECUENCIA GENOMICA DEL GEN 16S RRNA ESTAN DEPOSITADAS EN LA BASE DE DATOS SPECTRABANK (WWW.SPECTRABANK.ORG) ASI COMO EN LA BASE DE DATOS DEL GENBANK (NCBI) (SOLO LA SECUENCIA DEL GEN 16S RRNA)._x000D_ LA METODOLOGIA Y RESULTADOS OBTENIDOS PERMITIRAN ASIMISMO AMPLIAR LA BASE DE DATOS SPECTRABANK (WWW.SPECTRABANK.ORG), DESARROLLADA EN NUESTRO LABORATORIO Y QUE CONSTITUIRA LA MAYOR BASE DE DATOS INTERNACIONAL DE ACCESO (Spanish)
0 references
THE INCREASE IN FOOD-BORNE DISEASES OVER THE LAST FEW YEARS, WITH A SPECIAL EMERGENCE OF PATHOGENIC MICROORGANISMS SUCH AS LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI, OR ESCHERICHIA COLI, HAS INCREASED CONCERNS ABOUT FOOD SAFETY BOTH AMONG AUTHORITIES AND IN THE PRODUCTIVE SECTOR AND AMONG CONSUMERS. FOOD PATHOGENS CANNOT BE COMPLETELY ELIMINATED FROM ALL STAGES OF THE FOOD CHAIN. IN ADDITION, ACCORDING TO THE TREATMENT SUFFERED BY THE FOOD, THE MICROBIOTA PRESENT MAY VARY. THERE ARE NUMEROUS PATHOGENS THAT THE PROCESSING COMPANY MAY BE REQUIRED TO ANALYSE TO DETERMINE THE RELATIVE SAFETY OF YOUR PRODUCT. THE DETECTION AND RAPID IDENTIFICATION METHODS CURRENTLY IMPLEMENTED PRESENTLY HAVE THE DISADVANTAGE OF BEING LIMITED TO A FEW SPECIES (REAL-TIME PCR), NEEDING LONG PROCESSING (SEQUENCE, DO), NOT BE QUANTITATIVE (SEQUENCING, MALDI-TOF), DO NOT ALLOW DETECTION IN COMPLEX MIXTURES SUCH AS FOOD (SEQUENCING, MALDI-TOF), AND PRACTICALLY ALL OF THEM NEED PREVIOUSLY PLATE SOWING. THAT IS WHY IT IS NECESSARY TO IMPLEMENT METHODS THAT ALLOW THE RAPID AND ACCURATE DETECTION OF CONTAMINATING SPECIES IN THE FOOD AS WELL AS THE QUANTIFICATION DIRECTLY IN A FOOD SAMPLE. THIS IS THE CASE WITH THE METHODOLOGY PROPOSED IN THIS PROJECT: THE DEFINITION OF BIOMARKING PEPTIDES OF PATHOGENOUS AND BIOGENOUS AMINE-PRODUCING SPECIES IN FOOD AND THE SUBSEQUENT IMPLEMENTATION OF THE APPLICATION OF THESE PEPTIDES FOR DETECTION IN FOOD SAMPLES. The LIQUID CROMATOGRAPHY ACOPLATE TO SPECTROMETRIA OF MASAS IN TANDEM IN an electrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) and POSTERIOR ANALISIS MEDIENT DIFFERENT SOFTWARE AND COMPARATION WITH AMINOACIDIC SECUTIONS deposited in DATA BASES._x000D_ in order to lead to the deposition of bio-marker PEPTIDs, it is necessary to provide for a full range of BACTERIAAN CEPAS to take over the Analyses. THE BACTERIAL SPECIES INCLUDED IN THE STUDY WILL INCLUDE THOSE THAT ARE MOST FREQUENTLY ISOLATED IN FOOD PRODUCTS, AS DESCRIBED IN THE LITERATURE, AND INCLUDE THE FAMILY ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, COAGULASE-POSITIVE STAPHYLOCOCCI; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS, AND C. BOTULINUM TYPES E AND B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS AND B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES AND YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP AND PAENIBACILLUS SPP. OUR LABORATORY HAS A WIDE COLLECTION OF BACTERIAL STRAINS ISOLATED FROM VARIOUS FOODS (MEAT, FISH, MINIMALLY PROCESSED AND READY FOR CONSUMPTION, MILK, ETC.). ALL OF THEM HAVE BEEN CHARACTERISED BY DIFFERENT METHODS, BOTH CLASSICAL AND GENOMIC AND PROTEOMIC (MALDI-TOF). Such RELATED SPECIES WITH YOUR SPECIFIC MALDI-TOF SPECTIVES AND GENOMIC SECUCE OF GEN 16 are deposited at the SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) as well as in the GENBANK DATA BASE (NCBI) (only the SECUENCE OF GEN 16S rRNA)._x000D_ METODOLOGY AND RESULTS they will allow them to expand the SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), developed in our laboratorium and constituting the highest international data base of access (English)
12 October 2021
0.6729695115795179
0 references
L’AUGMENTATION DES MALADIES D’ORIGINE ALIMENTAIRE AU COURS DES DERNIÈRES ANNÉES, AVEC L’ÉMERGENCE SPÉCIALE DE MICROORGANISMES PATHOGÈNES TELS QUE LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI OU ESCHERICHIA COLI, A ACCRU LES PRÉOCCUPATIONS AU SUJET DE LA SALUBRITÉ DES ALIMENTS TANT AU SEIN DES AUTORITÉS QUE DANS LE SECTEUR PRODUCTIF ET CHEZ LES CONSOMMATEURS. LES AGENTS PATHOGÈNES ALIMENTAIRES NE PEUVENT PAS ÊTRE COMPLÈTEMENT ÉLIMINÉS À TOUS LES STADES DE LA CHAÎNE ALIMENTAIRE. EN OUTRE, SELON LE TRAITEMENT SUBI PAR L’ALIMENT, LE MICROBIOTE PRÉSENT PEUT VARIER. IL EXISTE DE NOMBREUX AGENTS PATHOGÈNES QUE L’ENTREPRISE DE TRANSFORMATION PEUT ÊTRE TENUE D’ANALYSER POUR DÉTERMINER L’INNOCUITÉ RELATIVE DE VOTRE PRODUIT. LES MÉTHODES DE DÉTECTION ET D’IDENTIFICATION RAPIDE ACTUELLEMENT MISES EN ŒUVRE ONT L’INCONVÉNIENT D’ÊTRE LIMITÉES À QUELQUES ESPÈCES (PCR EN TEMPS RÉEL), NÉCESSITANT UN TRAITEMENT LONG (SÉQUENCE, N’EST-CE PAS), NON QUANTITATIVES (SÉQUENÇAGE, MALDI-TOF), NE PERMETTENT PAS LA DÉTECTION DANS DES MÉLANGES COMPLEXES TELS QUE LES ALIMENTS (SÉQUENÇAGE, MALDI-TOF), ET PRATIQUEMENT TOUTES ONT BESOIN D’UN SEMIS À PLAQUES. C’EST POURQUOI IL EST NÉCESSAIRE DE METTRE EN ŒUVRE DES MÉTHODES PERMETTANT DE DÉTECTER RAPIDEMENT ET AVEC PRÉCISION LES ESPÈCES CONTAMINÉES DANS LES ALIMENTS AINSI QUE LA QUANTIFICATION DIRECTEMENT DANS UN ÉCHANTILLON ALIMENTAIRE. C’EST LE CAS DE LA MÉTHODOLOGIE PROPOSÉE DANS CE PROJET: LA DÉFINITION DES PEPTIDES DE MARQUAGE BIOLOGIQUE DES ESPÈCES PATHOGÈNES ET BIOGÈNES PRODUCTRICES D’AMINES DANS LES ALIMENTS ET LA MISE EN ŒUVRE ULTÉRIEURE DE L’APPLICATION DE CES PEPTIDES POUR LA DÉTECTION DANS LES ÉCHANTILLONS D’ALIMENTS. La cromatographie LIQUIDE ACOPLATE À SPECTROMETRIA DE MASAS EN TANDEM DANS un ÉQUIPEMENT ET COMPARATION D’ÉQUIPEMENT IONIQUE D’Électro-TRAMPA (LC-ESI-IT-MS/MS) et ANALISIS Medient Medient DIFFERENT SOFTWARE AND COMPARATION AVEC les sécutions aminoacides déposées dans DATA BASES._x000D_ afin de conduire au dépôt de peptidés biomarqueurs, il est nécessaire de prévoir une gamme complète de LCPEs BACTERIAAN pour prendre en charge les analyses. LES ESPÈCES BACTÉRIENNES INCLUSES DANS L’ÉTUDE COMPRENDRONT CELLES QUI SONT LE PLUS SOUVENT ISOLÉES DANS DES PRODUITS ALIMENTAIRES, COMME DÉCRIT DANS LA LITTÉRATURE, ET COMPRENDRONT LA FAMILLE DES ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, COAGULASE-POSITIF STAPHYLOCOCCI; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS ET C. BOTULINUM TYPES E ET B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS ET B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES ET YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP ET PAENIBACILLUS SPP. NOTRE LABORATOIRE DISPOSE D’UNE VASTE COLLECTION DE SOUCHES BACTÉRIENNES ISOLÉES DE DIVERS ALIMENTS (VIANDE, POISSON, TRAITEMENT MINIMAL ET PRÊT À LA CONSOMMATION, LAIT, ETC.). TOUTES ONT ÉTÉ CARACTÉRISÉES PAR DIFFÉRENTES MÉTHODES, À LA FOIS CLASSIQUES ET GÉNOMIQUES ET PROTÉOMIQUES (MALDI-TOF). Ces SPECIES RELATIVES AVEC VOTRE SPECIFIQUE MALDI-TOF SPECIFIQUE ET LA SÉCURITÉ GÉNOMIQUE DU GEN 16 sont déposées à la SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) ainsi qu’à la BASE DES DONNÉES GEN (NCBI) (seulement la secuence OF GEN 16S rRNA)._x000D_ metodology AND RESULTS elles leur permettront d’élargir le SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), développée dans notre laboratoire et constituant la base de données internationale la plus élevée d’accès. (French)
2 December 2021
0 references
DIE ZUNAHME LEBENSMITTELBEDINGTER KRANKHEITEN IN DEN LETZTEN JAHREN MIT EINER BESONDEREN ENTSTEHUNG PATHOGENER MIKROORGANISMEN WIE LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI ODER ESCHERICHIA COLI HAT SOWOHL BEI BEHÖRDEN ALS AUCH IM PRODUKTIVEN SEKTOR UND BEI DEN VERBRAUCHERN BEDENKEN HINSICHTLICH DER LEBENSMITTELSICHERHEIT VERSTÄRKT. LEBENSMITTELERREGER KÖNNEN NICHT IN ALLEN PHASEN DER LEBENSMITTELKETTE VOLLSTÄNDIG BESEITIGT WERDEN. DARÜBER HINAUS KANN JE NACH DER BEHANDLUNG DES LEBENSMITTELS DIE MIKROBIOTA VORHANDEN VARIIEREN. ES GIBT ZAHLREICHE KRANKHEITSERREGER, DIE DAS VERARBEITUNGSUNTERNEHMEN MÖGLICHERWEISE ZUR ANALYSE DER RELATIVEN SICHERHEIT IHRES PRODUKTS BENÖTIGT. DIE DERZEIT ANGEWANDTEN NACHWEIS- UND SCHNELLERKENNUNGSMETHODEN HABEN DEN NACHTEIL, SICH AUF EINIGE WENIGE ARTEN (ECHTZEIT-PCR) ZU BESCHRÄNKEN, DIE LANGE VERARBEITUNG (SEQUENZ, TUN), NICHT QUANTITATIV (SEQUENZIERUNG, MALDI-TOF) ERFORDERN, NICHT ZULASSEN, DASS KOMPLEXE GEMISCHE WIE Z. B. LEBENSMITTEL (SEQUENZIERUNG, MALDI-TOF) DETEKTIERT WERDEN, UND PRAKTISCH ALLE BRAUCHEN VORHER PLATTENSAATEN. DESHALB IST ES NOTWENDIG, METHODEN ZU IMPLEMENTIEREN, DIE DEN SCHNELLEN UND GENAUEN NACHWEIS KONTAMINIERENDER ARTEN IM LEBENSMITTEL SOWIE DIE QUANTIFIZIERUNG DIREKT IN EINER LEBENSMITTELPROBE ERMÖGLICHEN. DIES IST BEI DER IN DIESEM PROJEKT VORGESCHLAGENEN METHODIK DER FALL: DIE DEFINITION DES BIOMARKING PEPTIDES PATHOGENER UND BIOGENER AMINE-PRODUZIERENDEN ARTEN IN LEBENSMITTELN UND DIE ANSCHLIESSENDE ANWENDUNG DIESER PEPTIDE ZUM NACHWEIS IN LEBENSMITTELPROBEN. Die LIQUID-Kromatographie ACOPLATE TO SPECTROMETRIA OF MASAS IN TANDEM IN einer elektrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) und posterior ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWARE UND COMPARATION MIT Aminoacidic Secutions in DATA BASES._x000D_um die Ablagerung von Biomarker-Peptiden zu führen, ist es notwendig, eine vollständige Palette von BACTERIAAN CEPAS über die Analysen zu führen. DIE IN DER STUDIE ENTHALTENEN BAKTERIELLEN ARTEN UMFASSEN DIEJENIGEN, DIE AM HÄUFIGSTEN IN LEBENSMITTELN ISOLIERT SIND, WIE IN DER LITERATUR BESCHRIEBEN, UND UMFASSEN DIE FAMILIE ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, KOAGULASE-POSITIVE STAPHYLOKOKKEN; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS UND C. BOTULINUM TYPES E UND B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS UND B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES UND YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP UND PAENIBACILLUS SPP. UNSER LABOR VERFÜGT ÜBER EINE BREITE SAMMLUNG VON BAKTERIENSTÄMMEN, DIE AUS VERSCHIEDENEN LEBENSMITTELN ISOLIERT SIND (FLEISCH, FISCH, MINIMAL VERARBEITET UND KONSUMFERTIG, MILCH USW.). ALLE VON IHNEN WURDEN DURCH VERSCHIEDENE METHODEN GEKENNZEICHNET, SOWOHL KLASSISCH ALS AUCH GENOMISCH UND PROTEOMISCH (MALDI-TOF). Solche RELATED SPECIES MIT IHRE SPEZIFISCHE MALDI-TOF-Spezifikationen UND GENOMISCHE SECUCE von GEN 16 werden bei der SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) sowie in der GENBANK DATA BASE (NCBI) (nur die secuence OF GEN 16S rRNA) hinterlegt._x000D_ Metodologie UND RESULTS ermöglichen es ihnen, den SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) zu erweitern, der in unserem Laboratorium entwickelt wurde und die höchste internationale Datenbank für den Zugang bildet. (German)
9 December 2021
0 references
DE TOENAME VAN DOOR VOEDSEL OVERGEDRAGEN ZIEKTEN IN DE AFGELOPEN JAREN, MET EEN SPECIALE OPKOMST VAN PATHOGENE MICRO-ORGANISMEN ZOALS LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI OF ESCHERICHIA COLI, HEEFT ZOWEL BIJ DE AUTORITEITEN ALS BIJ DE PRODUCTIEVE SECTOR EN BIJ DE CONSUMENTEN DE BEZORGDHEID OVER DE VOEDSELVEILIGHEID VERGROOT. VOEDSELPATHOGENEN KUNNEN NIET VOLLEDIG UIT ALLE STADIA VAN DE VOEDSELKETEN WORDEN GEËLIMINEERD. BOVENDIEN, AFHANKELIJK VAN DE BEHANDELING DOOR HET VOEDSEL, KAN DE AANWEZIGE MICROBIOTA VARIËREN. ER ZIJN TAL VAN ZIEKTEVERWEKKERS DIE HET VERWERKINGSBEDRIJF NODIG KAN HEBBEN OM DE RELATIEVE VEILIGHEID VAN UW PRODUCT TE BEPALEN. DE MOMENTEEL TOEGEPASTE DETECTIE- EN SNELLE IDENTIFICATIEMETHODEN HEBBEN HET NADEEL DAT ZE BEPERKT ZIJN TOT ENKELE SOORTEN (REALTIME PCR), EEN LANGE VERWERKING NODIG HEBBEN (SEQUENTIE, NIET KWANTITATIEF), NIET KWANTITATIEF ZIJN (SEQUENCING, MALDI-TOF), HET NIET MOGELIJK MAKEN OM COMPLEXE MENGSELS ZOALS LEVENSMIDDELEN (SEQUENCING, MALDI-TOF) TE DETECTEREN, EN VRIJWEL ALLEMAAL MOETEN ZE EERDER WORDEN GEZAAID. DAAROM IS HET NOODZAKELIJK METHODEN TOE TE PASSEN DIE DE SNELLE EN NAUWKEURIGE DETECTIE VAN VERONTREINIGENDE SOORTEN IN HET LEVENSMIDDEL MOGELIJK MAKEN, ALSOOK DE KWANTIFICERING RECHTSTREEKS IN EEN LEVENSMIDDELMONSTER. DIT IS HET GEVAL MET DE IN DIT PROJECT VOORGESTELDE METHODOLOGIE: DE DEFINITIE VAN BIOMARKING VAN PEPTIDEN VAN PATHOGENE EN BIOGENE AMINEPRODUCERENDE SOORTEN IN LEVENSMIDDELEN EN DE DAAROPVOLGENDE TOEPASSING VAN DE TOEPASSING VAN DEZE PEPTIDEN VOOR DETECTIE IN VOEDSELMONSTERS. De LIQUID cromatografie ACOPLATE TO SPECTROMETRIA VAN MASAS IN TANDEM IN een elektrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) en achterste ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWARE EN COMPARATION MET aminozuur secutions gedeponeerd in DATA BASES._x000D_ om te leiden tot de depositie van bio-marker peptiden, is het noodzakelijk om te voorzien in een volledig bereik van BACTERIAAN CEPAS over de Analyses. DE IN HET ONDERZOEK OPGENOMEN BACTERIËLE SOORTEN OMVATTEN DE SOORTEN DIE HET VAAKST GEÏSOLEERD ZIJN IN LEVENSMIDDELEN, ZOALS BESCHREVEN IN DE LITERATUUR, EN OMVATTEN DE FAMILIE ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, COAGULASE-POSITIEVE STAFYLOKOKKEN; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS, EN C. BOTULINUM TYPES E EN B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS EN B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES EN YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP. EN PAENIBACILLUS SPP. HEEFT EEN BREDE VERZAMELING BACTERIËLE STAMMEN GEÏSOLEERD UIT VERSCHILLENDE VOEDINGSMIDDELEN (VLEES, VIS, MINIMAAL VERWERKT EN KLAAR VOOR CONSUMPTIE, MELK, ENZ.). ZE ZIJN ALLEMAAL GEKENMERKT DOOR VERSCHILLENDE METHODEN, ZOWEL KLASSIEK ALS GENOMISCH EN PROTEOMISCH (MALDI-TOF). Dergelijke gerelateerde SPECIES MET UW SPECIFIC MALDI-TOF spectives EN GENOMISCHE SECUCE VAN GEN 16 worden gedeponeerd bij de SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) en in de GENBANK DATA BASE (NCBI) (alleen de beveiliging van GEN 16S rRNA)._x000D_ metodologie EN RESULTATEN zullen hen in staat stellen de SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), ontwikkeld in ons laboratorium uit te breiden en de hoogste internationale toegangsbasis te vormen. (Dutch)
17 December 2021
0 references
L'AUMENTO DELLE MALATTIE DI ORIGINE ALIMENTARE NEGLI ULTIMI ANNI, CON UNA PARTICOLARE COMPARSA DI MICRORGANISMI PATOGENI COME LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI O ESCHERICHIA COLI, HA ACCRESCIUTO LE PREOCCUPAZIONI PER LA SICUREZZA ALIMENTARE SIA TRA LE AUTORITÀ CHE NEL SETTORE PRODUTTIVO E TRA I CONSUMATORI. GLI AGENTI PATOGENI ALIMENTARI NON POSSONO ESSERE COMPLETAMENTE ELIMINATI DA TUTTE LE FASI DELLA CATENA ALIMENTARE. INOLTRE, SECONDO IL TRATTAMENTO SUBITO DAL CIBO, IL MICROBIOTA PRESENTE PUÒ VARIARE. CI SONO NUMEROSI AGENTI PATOGENI CHE L'AZIENDA DI TRASFORMAZIONE PUÒ ESSERE RICHIESTO DI ANALIZZARE PER DETERMINARE LA SICUREZZA RELATIVA DEL PRODOTTO. I METODI DI INDIVIDUAZIONE E DI IDENTIFICAZIONE RAPIDA ATTUALMENTE APPLICATI HANNO LO SVANTAGGIO DI ESSERE LIMITATI A POCHE SPECIE (PCR IN TEMPO REALE), CHE NECESSITANO DI UNA LUNGA LAVORAZIONE (SEQUENZA, FARE), NON SONO QUANTITATIVI (SEQUENZIAMENTO, MALDI-TOF), NON CONSENTONO IL RILEVAMENTO IN MISCELE COMPLESSE COME GLI ALIMENTI (SEQUENZIAMENTO, MALDI-TOF) E PRATICAMENTE TUTTI NECESSITANO DI SEMINA A PIASTRE. PER QUESTO MOTIVO È NECESSARIO APPLICARE METODI CHE CONSENTANO L'INDIVIDUAZIONE RAPIDA E ACCURATA DELLE SPECIE CONTAMINANTI NEGLI ALIMENTI E LA QUANTIFICAZIONE DIRETTAMENTE IN UN CAMPIONE ALIMENTARE. È IL CASO DELLA METODOLOGIA PROPOSTA NEL PRESENTE PROGETTO: LA DEFINIZIONE DI PEPTIDI BIOMARCANTI DELLE SPECIE DI AMMINE PATOGENE E BIOGENEE PRODUTTRICI DI AMMINE NEGLI ALIMENTI E LA SUCCESSIVA ATTUAZIONE DELL'APPLICAZIONE DI TALI PEPTIDI PER L'INDIVIDUAZIONE DI CAMPIONI ALIMENTARI. La cromatografia LIQUID ACOPLATO A SPECTROMETRIA DI MASAS IN TANDEM in un EQUIPMENTO elettrospruzzo-TRAMPA IONICA (LC-ESI-IT-MS/MS) e ANALISI posteriore DIFFERENT SOFTWARE E COMPARAZIONE CON secuzioni aminoacidi depositate in DATA BASES._x000D_ al fine di portare alla deposizione di peptidi biomarcatori, è necessario prevedere una gamma completa di CEPA BACTERIAAN per rilevare le analisi. LE SPECIE BATTERICHE INCLUSE NELLO STUDIO COMPRENDONO QUELLE CHE SONO PIÙ FREQUENTEMENTE ISOLATE NEI PRODOTTI ALIMENTARI, COME DESCRITTO NELLA LETTERATURA, E COMPRENDONO LA FAMIGLIA ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, STAFILOCOCCHI COAGULASI POSITIVI; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS E C. BOTULINUM TYPES E AND B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS E B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES E YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP E PAENIBACILLUS SPP. IL NOSTRO LABORATORIO DISPONE DI UN'AMPIA RACCOLTA DI CEPPI BATTERICI ISOLATI DA VARI ALIMENTI (CARNE, PESCE, MINIMAMENTE LAVORATI E PRONTI AL CONSUMO, LATTE, ECC.). TUTTI SONO STATI CARATTERIZZATI DA METODI DIVERSI, SIA CLASSICI CHE GENOMICI E PROTEOMICI (MALDI-TOF). Tali SPECIES RELATED CON IL TUO SPECIFICO MALDI-TOF spettuali e GENOMICI DI GEN 16 sono depositati presso la SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) e nella GENBANK DATA BASE (NCBI) (solo la secuenza di GEN 16S rRNA)._x000D_ Metodologia E RISULTATI permetteranno loro di espandere la SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), sviluppata nel nostro laboratorio e costituendo la più alta base di dati internazionali di accesso (Italian)
16 January 2022
0 references
TOIDU KAUDU LEVIVATE HAIGUSTE SAGENEMINE VIIMASTEL AASTATEL KOOS PATOGEENSETE MIKROORGANISMIDE, NAGU LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI VÕI ESCHERICHIA COLI, ERILISE ESILEKERKIMISEGA ON SUURENDANUD MURET TOIDUOHUTUSE PÄRAST NII AMETIASUTUSTE KUI KA TOOTMISSEKTORI JA TARBIJATE SEAS. TOIDU PATOGEENE EI SAA TÄIELIKULT KÕRVALDADA TOIDUAHELA KÕIGIST ETAPPIDEST. LISAKS SELLELE VÕIB TOIDULE OSAKS SAANUD MIKROBIOOTIKUM VARIEERUDA VASTAVALT RAVILE, MIDA TOIT KANNATAB. ON MITMEID PATOGEENE, MIDA TÖÖTLEMISETTEVÕTE VÕIB OLLA KOHUSTATUD ANALÜÜSIMA, ET TEHA KINDLAKS TEIE TOOTE SUHTELINE OHUTUS. PRAEGU RAKENDATAVAD AVASTAMIS- JA KIIRE IDENTIFITSEERIMISMEETODID ON EBASOODNE, SEST NEED ON PIIRATUD MÕNE LIIGIGA (REAALAJALINE PCR), MIS VAJAVAD PIKKA TÖÖTLEMIST (JÄRJESTUS, DO), EI OLE KVANTITATIIVSED (JÄRJESTAMINE, MALDI-TOF), EI VÕIMALDA AVASTADA KEERUKAID SEGUSID, NAGU TOIT (JÄRJESTAMINE, MALDI-TOF), JA PRAKTILISELT KÕIK NEED VAJAVAD VAREM TALDRIKULE KÜLVAMIST. SEETÕTTU ON VAJA RAKENDADA MEETODEID, MIS VÕIMALDAVAD SAASTAVATE LIIKIDE KIIRET JA TÄPSET AVASTAMIST TOIDUS NING KOGUSE MÄÄRAMIST OTSE TOIDUPROOVIS. NII ON SEE KÄESOLEVAS PROJEKTIS KAVANDATUD METOODIKA PUHUL: PATOGEENIDE JA BIOGEENSETE AMIINIDE LIIKIDE BIOMÄRGISTAMISE MÄÄRATLUS TOIDUS NING SEEJÄREL NENDE PEPTIIDIDE KASUTAMINE TOIDUPROOVIDES AVASTAMISEKS. LIQUID kromatograafia ACOPLATE TO SPECTROMETRIA MAASAS IN TANDEM In electrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) ja posterior ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWARE JA COMPARATION WITH aminoacidic secutions hoiule DATA BASES._x000D_ et viia biomarker peptiidide sadestumiseni, on vaja ette näha täielik valik BACTERIAAN CEPAS-i, et võtta üle analüüsid. UURINGUSSE KAASATUD BAKTERILIIKIDE HULKA KUULUVAD NEED, MIS ON TOIDUAINETES KÕIGE SAGEDAMINI ISOLEERITUD, NAGU ON KIRJELDATUD KIRJANDUSES, NING SUGUKONNAD ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, KOAGULAASPOSITIIVSED STAFÜLOKOKID; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS JA C. BOTULINUM TÜÜBID E JA B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS JA B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES JA YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP JA PAENIBACILLUS SPP. MEIE LABORIS ON LAI BAKTERITÜVEDE KOGU, MIS ON ERALDATUD ERINEVATEST TOIDUAINETEST (LIHA, KALA, MINIMAALSELT TÖÖDELDUD JA TARBIMISEKS VALMIS, PIIM JNE). KÕIKI NEID ON ISELOOMUSTANUD ERINEVAD MEETODID, NII KLASSIKALISED KUI KA GENOOMILISED JA PROTEOOMILISED (MALDI-TOF). Sellised TEATUD SPETSIFIKATSIOONID GEN 16 GEN 16 spetsifikaatide ja GENOMIKIDE spetsifikatsioonide hoiuleandmine toimub SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) ja GENBANK DATA BASE’i (NCBI) (ainult GEN 16S rRNA secuence of GEN 16S rRNA)._x000D_ metodoloogia JA TULEMUSED võimaldavad neil laiendada SPECTRABANK DATA BASE’i (WWW.SPECTRABANK.ORG), mis on välja töötatud meie tööjaamas ja moodustavad kõrgeima rahvusvahelise juurdepääsu andmebaasi. (Estonian)
4 August 2022
0 references
PER PASTARUOSIUS KELERIUS METUS PADAUGĖJO PER MAISTĄ PLINTANČIŲ LIGŲ, YPAČ PATOGENINIŲ MIKROORGANIZMŲ, TOKIŲ KAIP LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI ARBA ESCHERICHIA COLI, PADIDINO SUSIRŪPINIMĄ DĖL MAISTO SAUGOS TIEK VALDŽIOS INSTITUCIJOMS, TIEK GAMYBOS SEKTORIUI, TIEK VARTOTOJAMS. MAISTO PATOGENŲ NEGALIMA VISIŠKAI PAŠALINTI IŠ VISŲ MAISTO GRANDINĖS ETAPŲ. BE TO, ATSIŽVELGIANT Į MAISTO PATIRTUS GYDYMO BŪDUS, MIKROBIOTA GALI SKIRTIS. YRA DAUG PATOGENŲ, KURIUOS PERDIRBIMO ĮMONĖ GALI BŪTI PAPRAŠYTA ANALIZUOTI, KAD NUSTATYTŲ SANTYKINĮ JŪSŲ PRODUKTO SAUGUMĄ. ŠIUO METU TAIKOMI APTIKIMO IR GREITO IDENTIFIKAVIMO METODAI TURI TRŪKUMŲ, NES JIE TAIKOMI TIK KELIOMS RŪŠIMS (TIKRALAIKIS PGR), KURIUOS REIKIA ILGAI APDOROTI (SEKA, AR NE), JIE NĖRA KIEKYBINIAI (NUOSEKLUMAS, MALDI-TOF), NELEIDŽIA APTIKTI SUDĖTINGUOSE MIŠINIUOSE, PVZ., MAISTO (SEKCIJA, MALDI-TOF), IR PRAKTIŠKAI VISIEMS IŠ JŲ ANKSČIAU REIKĖJO PASĖTI. TODĖL BŪTINA ĮGYVENDINTI METODUS, KURIE LEISTŲ GREITAI IR TIKSLIAI NUSTATYTI UŽTERŠTAS RŪŠIS MAISTE, TAIP PAT ATLIKTI KIEKYBINĮ NUSTATYMĄ TIESIOGIAI MAISTO MĖGINYJE. TAIP YRA ŠIAME PROJEKTE SIŪLOMOS METODIKOS ATVEJU: PATOGENINIŲ IR BIOGENINIŲ AMINUS GAMINANČIŲ RŪŠIŲ GYVŪNŲ BIOLOGINIO ŽENKLINIMO PEPTIDŲ MAISTE APIBRĖŽTIS IR VĖLESNIS ŠIŲ PEPTIDŲ NAUDOJIMAS MAISTO MĖGINIUOSE APTIKTI. LIQUID kromatografiją ACOPLATE į SPECTROMETRIA TANDEMOS elektropurško-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) ir užpakalinės ANALISIS Medient DIFFERENT PROGRAMINĖ ĮRANGA IR COMPARATION SU aminorūgšties nuosėdų nusodinimo DATA BASES._x000D_ siekiant sukelti bio-markerinių peptidų nusėdimas, būtina numatyti visą spektrą BACTERIAAN CEPAS perimti Analyses. Į TYRIMĄ BUS ĮTRAUKTOS TOS BAKTERIJOS, KURIOS DAŽNIAUSIAI IŠSKIRIAMOS MAISTO PRODUKTUOSE, KAIP APRAŠYTA LITERATŪROJE, IR APIMA ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, KOAGULIAZĘ TURINČIŲ STAFILOKOKŲ ŠEIMĄ; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS IR C. BOTULINUM E IR B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS IR B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES IR YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP IR PAENIBACILLUS SPP. MŪSŲ LABORATORIJOJE YRA DAUG BAKTERIJŲ PADERMIŲ, IŠSKIRTŲ IŠ ĮVAIRIŲ MAISTO PRODUKTŲ (MĖSOS, ŽUVIES, MINIMALIAI APDOROTŲ IR PARUOŠTŲ VARTOTI, PIENO IR KT.). VISI JIE PASIŽYMI SKIRTINGAIS METODAIS, TIEK KLASIKINIAIS, TIEK GENOMINIAIS IR PROTEOMINIAIS (MALDI-TOF). Tokie RELATED SPECIES SU JŪSŲ SPECIFIC MALDI-TOF spekuliacijos ir GENOMIC SECUCE 16 yra deponuojami SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), taip pat GENBANK DATA BASE (NCBI) (tik GEN 16S rRNA sekuence)._x000D_ metodologija IR RESULTAI, jie leis jiems išplėsti SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), sukurtą mūsų laboratorijoje ir sudarančią aukščiausią tarptautinę prieigos duomenų bazę. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
PORAST BOLESTI KOJE SE PRENOSE HRANOM TIJEKOM POSLJEDNJIH NEKOLIKO GODINA, S POSEBNOM POJAVOM PATOGENIH MIKROORGANIZAMA KAO ŠTO SU LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI ILI ESCHERICHIA COLI, POVEĆAO JE ZABRINUTOST ZBOG SIGURNOSTI HRANE MEĐU NADLEŽNIM TIJELIMA I U PROIZVODNOM SEKTORU TE MEĐU POTROŠAČIMA. PATOGENI PREHRAMBENI PROIZVODI NE MOGU SE U POTPUNOSTI UKLONITI IZ SVIH FAZA PREHRAMBENOG LANCA. OSIM TOGA, PREMA LIJEČENJU KOJE JE HRANA PRETRPJELA, PRISUTNA MIKROBIOTA MOŽE VARIRATI. POSTOJE BROJNI PATOGENI KOJE ĆE PRERAĐIVAČKA TVRTKA MOŽDA MORATI ANALIZIRATI KAKO BI UTVRDILA RELATIVNU SIGURNOST VAŠEG PROIZVODA. METODE OTKRIVANJA I BRZE IDENTIFIKACIJE KOJE SE TRENUTAČNO PRIMJENJUJU NEPOVOLJNO SU OGRANIČENE NA NEKOLIKO VRSTA (PCR U STVARNOM VREMENU), KOJIMA JE POTREBNA DUGOTRAJNA OBRADA (SEKVENCIJA, NE), NISU KVANTITATIVNE (SEKVENCIRANJE, MALDI-TOF), NE OMOGUĆUJU OTKRIVANJE U SLOŽENIM SMJESAMA KAO ŠTO SU HRANA (SEKVENCIRANJE, MALDI-TOF) I GOTOVO SVE TE METODE TREBAJU PRETHODNO SJETVU PLOČA. ZATO JE POTREBNO PROVESTI METODE KOJE OMOGUĆUJU BRZO I TOČNO OTKRIVANJE KONTAMINIRAJUĆIH VRSTA U HRANI, KAO I IZRAVNO KVANTIFICIRANJE U UZORKU HRANE. TO JE SLUČAJ S METODOLOGIJOM PREDLOŽENOM U OVOM PROJEKTU: DEFINICIJA BIOMARKIRANJA PEPTIDA PATOGENIH I BIOGENIH VRSTA KOJE SE KORISTE ZA PROIZVODNJU AMINA U HRANI I NAKNADNA PROVEDBA PRIMJENE TIH PEPTIDA ZA OTKRIVANJE U UZORCIMA HRANE. LIQUID cromatography ACOPLATE TO SPECTROMETRIA MASAS U TANDEMU U elektrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) i posteriorni ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWARE I COMPARATION s aminoacidnim secutions taloženih u DATA BASES._x000D_ kako bi se dovelo do taloženja peptida bio-markera, potrebno je osigurati cijeli niz BACTERIAAN CEPAS da preuzme Analize. BAKTERIJSKE VRSTE UKLJUČENE U ISTRAŽIVANJE UKLJUČIVAT ĆE ONE VRSTE KOJE SU NAJČEŠĆE IZOLIRANE U PREHRAMBENIM PROIZVODIMA, KAKO JE OPISANO U LITERATURI, I UKLJUČUJU PORODICU ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, KOAGULAZA-POZITIVNE STAFILOKOKE; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS I C. BOTULINUM TIPOVI E I B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS I B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES I YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP I PAENIBACILLUS SPP. NAŠ LABORATORIJ IMA ŠIROKU ZBIRKU BAKTERIJSKIH SOJEVA IZOLIRANIH IZ RAZNIH NAMIRNICA (MESO, RIBA, MINIMALNO PRERAĐENA I SPREMNA ZA KONZUMACIJU, MLIJEKO ITD.). SVE IH KARAKTERIZIRAJU RAZLIČITE METODE, KAKO KLASIČNE, TAKO I GENOMSKE I PROTEOMSKE (MALDI-TOF). Takvi RELATEDNI SPECIES S vašim SPECIFIC MALDI-TOF spectives I GENOMIC SECUCE GEN 16 su pohranjeni na SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) kao i u GENBANK DATA BASE (NCBI) (samo sekuencija GEN 16S rRNA)._x000D_ metodologija I REZULTATI oni će im omogućiti da prošire SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), razvijen u našem labatoriju i čine najvišu međunarodnu bazu podataka pristupa (Croatian)
4 August 2022
0 references
Η ΑΎΞΗΣΗ ΤΩΝ ΤΡΟΦΙΜΟΓΕΝΏΝ ΝΌΣΩΝ ΤΑ ΤΕΛΕΥΤΑΊΑ ΧΡΌΝΙΑ, ΜΕ ΕΙΔΙΚΉ ΕΜΦΆΝΙΣΗ ΠΑΘΟΓΌΝΩΝ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΏΝ, ΌΠΩΣ Η LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI Ή ESCHERICHIA COLI, ΈΧΕΙ ΑΥΞΉΣΕΙ ΤΙΣ ΑΝΗΣΥΧΊΕΣ ΣΧΕΤΙΚΆ ΜΕ ΤΗΝ ΑΣΦΆΛΕΙΑ ΤΩΝ ΤΡΟΦΊΜΩΝ ΤΌΣΟ ΜΕΤΑΞΎ ΤΩΝ ΑΡΧΏΝ ΌΣΟ ΚΑΙ ΣΤΟΝ ΠΑΡΑΓΩΓΙΚΌ ΤΟΜΈΑ ΚΑΙ ΜΕΤΑΞΎ ΤΩΝ ΚΑΤΑΝΑΛΩΤΏΝ. ΟΙ ΠΑΘΟΓΌΝΟΙ ΠΑΡΆΓΟΝΤΕΣ ΤΩΝ ΤΡΟΦΊΜΩΝ ΔΕΝ ΜΠΟΡΟΎΝ ΝΑ ΕΞΑΛΕΙΦΘΟΎΝ ΠΛΉΡΩΣ ΑΠΌ ΌΛΑ ΤΑ ΣΤΆΔΙΑ ΤΗΣ ΤΡΟΦΙΚΉΣ ΑΛΥΣΊΔΑΣ. ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΑΝΆΛΟΓΑ ΜΕ ΤΗ ΘΕΡΑΠΕΊΑ ΠΟΥ ΥΠΈΣΤΗ ΤΟ ΤΡΌΦΙΜΟ, Η ΠΑΡΟΥΣΊΑ ΜΙΚΡΟΒΊΩΝ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΠΟΙΚΊΛΛΕΙ. ΥΠΆΡΧΟΥΝ ΠΟΛΛΆ ΠΑΘΟΓΌΝΑ ΠΟΥ Η ΕΤΑΙΡΕΊΑ ΕΠΕΞΕΡΓΑΣΊΑΣ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΧΡΕΙΑΣΤΕΊ ΝΑ ΑΝΑΛΎΣΕΙ ΓΙΑ ΝΑ ΚΑΘΟΡΊΣΕΙ ΤΗ ΣΧΕΤΙΚΉ ΑΣΦΆΛΕΙΑ ΤΟΥ ΠΡΟΪΌΝΤΟΣ ΣΑΣ. ΟΙ ΜΈΘΟΔΟΙ ΑΝΊΧΝΕΥΣΗΣ ΚΑΙ ΤΑΧΕΊΑΣ ΤΑΥΤΟΠΟΊΗΣΗΣ ΠΟΥ ΕΦΑΡΜΌΖΟΝΤΑΙ ΕΠΊ ΤΟΥ ΠΑΡΌΝΤΟΣ ΈΧΟΥΝ ΤΟ ΜΕΙΟΝΈΚΤΗΜΑ ΌΤΙ ΠΕΡΙΟΡΊΖΟΝΤΑΙ ΣΕ ΛΊΓΑ ΕΊΔΗ (PCR ΣΕ ΠΡΑΓΜΑΤΙΚΌ ΧΡΌΝΟ), ΧΡΕΙΆΖΟΝΤΑΙ ΜΑΚΡΆ ΕΠΕΞΕΡΓΑΣΊΑ (ΑΚΟΛΟΥΘΊΑ, DO), ΔΕΝ ΕΊΝΑΙ ΠΟΣΟΤΙΚΆ (ΑΚΟΛΟΥΘΊΑ, MALDI-TOF), ΔΕΝ ΕΠΙΤΡΈΠΟΥΝ ΤΗΝ ΑΝΊΧΝΕΥΣΗ ΣΕ ΣΎΝΘΕΤΑ ΜΕΊΓΜΑΤΑ ΌΠΩΣ ΤΡΌΦΙΜΑ (ΑΚΟΛΟΥΘΊΑ, MALDI-TOF) ΚΑΙ ΣΧΕΔΌΝ ΌΛΑ ΧΡΕΙΆΖΟΝΤΑΙ ΠΡΟΗΓΟΥΜΈΝΩΣ ΣΠΟΡΆ ΤΡΥΒΛΊΩΝ. ΑΥΤΌΣ ΕΊΝΑΙ Ο ΛΌΓΟΣ ΓΙΑ ΤΟΝ ΟΠΟΊΟ ΕΊΝΑΙ ΑΝΑΓΚΑΊΟ ΝΑ ΕΦΑΡΜΟΣΤΟΎΝ ΜΈΘΟΔΟΙ ΠΟΥ ΕΠΙΤΡΈΠΟΥΝ ΤΗΝ ΤΑΧΕΊΑ ΚΑΙ ΑΚΡΙΒΉ ΑΝΊΧΝΕΥΣΗ ΤΩΝ ΜΟΛΥΣΜΑΤΙΚΏΝ ΕΙΔΏΝ ΣΤΑ ΤΡΌΦΙΜΑ, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΤΟΝ ΠΟΣΟΤΙΚΌ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΌ ΑΠΕΥΘΕΊΑΣ ΣΕ ΈΝΑ ΔΕΊΓΜΑ ΤΡΟΦΊΜΩΝ. ΑΥΤΌ ΙΣΧΎΕΙ ΣΤΗΝ ΠΕΡΊΠΤΩΣΗ ΤΗΣ ΜΕΘΟΔΟΛΟΓΊΑΣ ΠΟΥ ΠΡΟΤΕΊΝΕΤΑΙ ΣΤΟ ΠΑΡΌΝ ΣΧΈΔΙΟ: ΤΟΝ ΟΡΙΣΜΌ ΤΗΣ ΒΙΟΣΉΜΑΝΣΗΣ ΠΕΠΤΙΔΊΩΝ ΠΑΘΟΓΌΝΩΝ ΚΑΙ ΒΙΟΓΕΝΏΝ ΑΜΙΝΟΠΑΡΑΓΩΓΏΝ ΕΙΔΏΝ ΣΤΑ ΤΡΌΦΙΜΑ ΚΑΙ ΤΗΝ ΕΠΑΚΌΛΟΥΘΗ ΕΦΑΡΜΟΓΉ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΠΕΠΤΙΔΊΩΝ ΓΙΑ ΑΝΊΧΝΕΥΣΗ ΣΕ ΔΕΊΓΜΑΤΑ ΤΡΟΦΊΜΩΝ. Το LIQUID cromatography ACOPLATE TO SPECTROMETRIA OF MASAS IN TANDEM σε έναν ηλεκτροψεκτήρα-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) και οπίσθιο ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWARE AND COMPARATION ΜΕ αμινοξέα κατατίθενται σε DATA BASES._x000D_ για να οδηγήσει στην εναπόθεση των πεπτιδίων βιοδείκτη, είναι απαραίτητο να προβλεφθεί ένα πλήρες φάσμα BACTERIAAN CEPAS για να αναλάβει τις αναλυτικές. ΤΑ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΆ ΕΊΔΗ ΠΟΥ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΟΝΤΑΙ ΣΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΘΑ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΟΥΝ ΕΚΕΊΝΑ ΠΟΥ ΑΠΟΜΟΝΏΝΟΝΤΑΙ ΣΥΧΝΌΤΕΡΑ ΣΕ ΤΡΌΦΙΜΑ, ΌΠΩΣ ΠΕΡΙΓΡΆΦΕΤΑΙ ΣΤΗ ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΊΑ, ΚΑΙ ΘΑ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΟΥΝ ΤΗΝ ΟΙΚΟΓΈΝΕΙΑ ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, ΘΕΤΙΚΟΎΣ ΣΤΗΝ ΠΗΚΤΆΣΗ ΣΤΑΦΥΛΌΚΟΚΚΟΥΣ· CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS, ΚΑΙ C. BOTULINUM ΤΎΠΟΥ E ΚΑΙ B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS ΚΑΙ B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES ΚΑΙ YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP ΚΑΙ PAENIBACILLUS SPP. ΤΟ ΕΡΓΑΣΤΉΡΙΌ ΜΑΣ ΔΙΑΘΈΤΕΙ ΜΙΑ ΕΥΡΕΊΑ ΣΥΛΛΟΓΉ ΒΑΚΤΗΡΙΑΚΏΝ ΣΤΕΛΕΧΏΝ ΠΟΥ ΑΠΟΜΟΝΏΝΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΔΙΆΦΟΡΑ ΤΡΌΦΙΜΑ (ΚΡΈΑΣ, ΨΆΡΙ, ΕΛΆΧΙΣΤΑ ΕΠΕΞΕΡΓΑΣΜΈΝΑ ΚΑΙ ΈΤΟΙΜΑ ΓΙΑ ΚΑΤΑΝΆΛΩΣΗ, ΓΆΛΑ Κ.ΛΠ.). ΌΛΑ ΈΧΟΥΝ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΕΊ ΑΠΌ ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΈΣ ΜΕΘΌΔΟΥΣ, ΤΌΣΟ ΚΛΑΣΙΚΉ ΌΣΟ ΚΑΙ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΉ ΚΑΙ ΠΡΩΤΕΩΜΙΚΉ (MALDI-TOF). Τέτοιου είδους ΣΧΕΤΙΚΑ ΕΙΔΗ ΜΕ ΤΟ ΕΙΔΙΚΟ ΜΑΛΔΙΟ-ΤΟΦΕΣ ΣΑΣ ΚΑΙ ΓΕΝΙΚΗ ΤΟΜΕΑ ΤΗΣ GEN 16 κατατίθενται στη Βάση ΕΙΔΙΚΩΝ ΔΕΔΟΜΕΝΩΝ (WWW.SPECTRABANK.ORG) καθώς και στη βάση δεδομένων GENBANK (NCBI) (μόνο η απομόνωση του GEN 16S rRNA)._x000D_ Μεδολογία ΚΑΙ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΑ που θα τους επιτρέψουν να επεκτείνουν τη βάση δεδομένων SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), που αναπτύχθηκε στο workatorium μας και αποτελεί την υψηλότερη διεθνή βάση δεδομένων πρόσβασης (Greek)
4 August 2022
0 references
NÁRAST CHORÔB PRENÁŠANÝCH POTRAVINAMI V POSLEDNÝCH ROKOCH S OSOBITNÝM VÝSKYTOM PATOGÉNNYCH MIKROORGANIZMOV, AKO SÚ LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JUUNI ALEBO ESCHERICHIA COLI, ZVÝŠIL OBAVY O BEZPEČNOSŤ POTRAVÍN MEDZI ORGÁNMI, VÝROBNÝM ODVETVÍM A MEDZI SPOTREBITEĽMI. POTRAVINOVÉ PATOGÉNY NEMOŽNO ÚPLNE ODSTRÁNIŤ ZO VŠETKÝCH FÁZ POTRAVINOVÉHO REŤAZCA. OKREM TOHO, PODĽA LIEČBY, KTORÚ POTRAVINA TRPÍ, SA PRÍTOMNÁ MIKROFLÓRA MÔŽE LÍŠIŤ. EXISTUJE MNOHO PATOGÉNOV, KTORÉ SPRACOVATEĽSKÁ SPOLOČNOSŤ MÔŽE BYŤ POVINNÁ ANALYZOVAŤ NA URČENIE RELATÍVNEJ BEZPEČNOSTI VÁŠHO PRODUKTU. METÓDY DETEKCIE A RÝCHLEJ IDENTIFIKÁCIE, KTORÉ SA V SÚČASNOSTI UPLATŇUJÚ, MAJÚ TÚ NEVÝHODU, ŽE SÚ OBMEDZENÉ NA NIEKOĽKO DRUHOV (PCR V REÁLNOM ČASE), VYŽADUJÚ DLHÉ SPRACOVANIE (POSTUPNOSŤ, DO), NIE SÚ KVANTITATÍVNE (SEKVENOVANIE, MALDI-TOF), NEUMOŽŇUJÚ DETEKCIU V KOMPLEXNÝCH ZMESIACH, AKO SÚ POTRAVINY (SEKVENOVANIE, MALDI-TOF), A PRAKTICKY VŠETKY Z NICH POTREBUJÚ SKÔR SIATIE TANIEROV. PRETO JE POTREBNÉ ZAVIESŤ METÓDY, KTORÉ UMOŽNIA RÝCHLU A PRESNÚ DETEKCIU KONTAMINUJÚCICH DRUHOV V POTRAVINÁCH, AKO AJ KVANTIFIKÁCIU PRIAMO VO VZORKE POTRAVÍN. JE TO TAK V PRÍPADE METODIKY NAVRHOVANEJ V TOMTO PROJEKTE: DEFINÍCIA BIOMARKINGOVÝCH PEPTIDOV PATOGÉNNYCH A BIOGÉNNYCH DRUHOV PRODUKUJÚCICH AMÍN V POTRAVINÁCH A NÁSLEDNÁ IMPLEMENTÁCIA APLIKÁCIE TÝCHTO PEPTIDOV NA DETEKCIU VO VZORKÁCH POTRAVÍN. LIQUID cromatography ACOPLATE TO SPECTROMETRIA OF MASAS IN TANDEM V elektrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) a zadné ANALISIS Medient SOFTWARE A COMPARATION S aminoacidickými secutions uloženými v DATA BASES._x000D_ s cieľom viesť k depozícii biomarkerových peptidov, je potrebné zabezpečiť celý rad BACTERIAAN CEPAS na prevzatie analýz. BAKTERIÁLNE DRUHY ZAHRNUTÉ DO ŠTÚDIE BUDÚ ZAHŔŇAŤ TIE DRUHY, KTORÉ SÚ NAJČASTEJŠIE IZOLOVANÉ V POTRAVINOVÝCH VÝROBKOCH, AKO SA OPISUJE V LITERATÚRE, A ZAHŔŇAJÚ ČEĽAĎ ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, KOAGULÁZOVO POZITÍVNE STAFYLOKOKY; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS A C. BOTULINUM TYPY E A B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS A B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES A YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP A PAENIBACILLUS SPP. NAŠE LABORATÓRIUM DISPONUJE ŠIROKOU ZBIERKOU BAKTERIÁLNYCH KMEŇOV IZOLOVANÝCH Z RÔZNYCH POTRAVÍN (MÄSO, RYBY, MINIMÁLNE SPRACOVANÉ A PRIPRAVENÉ NA KONZUMÁCIU, MLIEKO ATĎ.). VŠETKY Z NICH BOLI CHARAKTERIZOVANÉ RÔZNYMI METÓDAMI, KLASICKÝMI AJ GENOMICKÝMI A PROTEOMICKÝMI (MALDI-TOF). Takéto OBCHODNÉ ŠPECIY S ŠPECIFICKÝM MALDI-TOF-TIFom a GENOMICKÝM SECUCE OF GEN 16 sú uložené na SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), ako aj v GENBANK DATA BASE (NCBI) (iba záchrana GEN 16S rRNA)._x000D_ metodológia a výsledky im umožnia rozšíriť SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), vyvinutý v našom laboratóriu a tvoriaci najvyššiu medzinárodnú databázu prístupu (Slovak)
4 August 2022
0 references
ELINTARVIKEPERÄISTEN TAUTIEN LISÄÄNTYMINEN VIIME VUOSINA JA PATOGEENISTEN MIKRO-ORGANISMIEN, KUTEN LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI TAI ESCHERICHIA COLI, ILMAANTUMINEN ON LISÄNNYT HUOLTA ELINTARVIKKEIDEN TURVALLISUUDESTA SEKÄ VIRANOMAISTEN ETTÄ TUOTANTOSEKTORIN JA KULUTTAJIEN KESKUUDESSA. ELINTARVIKEPATOGEENEJÄ EI VOIDA KOKONAAN POISTAA KAIKISTA ELINTARVIKEKETJUN VAIHEISTA. LISÄKSI ELINTARVIKKEEN SAAMAN HOIDON MUKAAN LÄSNÄ OLEVA MIKROBIOTA VOI VAIHDELLA. ON OLEMASSA LUKUISIA TAUDINAIHEUTTAJIA, JOITA JALOSTUSYRITYSTÄ VOIDAAN VAATIA ANALYSOIMAAN TUOTTEEN SUHTEELLISEN TURVALLISUUDEN MÄÄRITTÄMISEKSI. TÄLLÄ HETKELLÄ KÄYTÖSSÄ OLEVIEN HAVAITSEMIS- JA NOPEAN TUNNISTAMISEN MENETELMIEN HAITTANA ON SE, ETTÄ NE RAJOITTUVAT MUUTAMIIN LAJEIHIN (TOSIAIKAINEN PCR), JOTKA EDELLYTTÄVÄT PITKÄÄ KÄSITTELYÄ (SEKVENSSI, DO), EIVÄT KVANTITATIIVISIA (SEKVENSOINTI, MALDI-TOF), EIVÄT SALLI HAVAITSEMISTA MONIMUTKAISISSA SEOKSISSA, KUTEN ELINTARVIKKEISSA (SEKVENSOINTI, MALDI-TOF), JA KÄYTÄNNÖSSÄ KAIKKI NIISTÄ TARVITSEVAT AIEMMIN LEVYKYLVÖÄ. TÄMÄN VUOKSI ON TARPEEN OTTAA KÄYTTÖÖN MENETELMIÄ, JOILLA VOIDAAN NOPEASTI JA TARKASTI HAVAITA SAASTUTTAVAT LAJIT ELINTARVIKKEESTA SEKÄ KVANTIFIOIDA NE SUORAAN ELINTARVIKENÄYTTEESTÄ. TÄMÄ KOSKEE TÄSSÄ HANKKEESSA EHDOTETTUA MENETELMÄÄ: ELINTARVIKKEISSA ESIINTYVIEN PATOGEENISTEN JA BIOGEENISTEN AMIINIA TUOTTAVIEN LAJIEN PEPTIDIEN BIOLEIMAAMISEN MÄÄRITELMÄ JA SEN JÄLKEEN NÄIDEN PEPTIDIEN KÄYTTÖ ELINTARVIKENÄYTTEIDEN OSOITTAMISEEN. Elektrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) ja posterior ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWARE JA COMPARATION WITH aminoacidic secutions, jotka on talletettu DATA BASES._x000D_ -järjestelmään, jotta saadaan aikaan biomarkkeripeptidien laskeuma, on tarpeen säätää täydellisestä valikoimasta BACTERIAAN CEPASia, joka ottaa haltuunsa analyysit. TUTKIMUKSESSA MUKANA OLEVIIN BAKTEERILAJEIHIN KUULUVAT NE, JOTKA OVAT USEIMMIN ERISTYKSISSÄ ELINTARVIKKEISSA, KUTEN KIRJALLISUUDESSA ON KUVATTU, JA NIIHIN KUULUVAT ENTEROBACTERIACEAE-, SALMONELLA-, SHIGELLA-, PROTEUS- JA KOAGULAASIPOSITIIVISET STAFYLOKOKIT; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS JA C. BOTULINUM TYPE E JA B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS JA B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES JA YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP JA PAENIBACILLUS SPP. LABORATORIOSSAMME ON LAAJA KOKOELMA BAKTEERIKANTOJA ERISTETTY ERI ELINTARVIKKEISTA (LIHA, KALA, MINIMAALISESTI JALOSTETTU JA VALMIS KULUTUKSEEN, MAITO, JNE.). KAIKILLE NIILLE ON OMINAISTA ERILAISET MENETELMÄT, SEKÄ KLASSISET ETTÄ GENOMI- JA PROTEOMIMENETELMÄT (MALDI-TOF). Tällaiset RELATED TEKNISET TEKNISET TEKNISET MALDI-TOF-spektiivit ja GEN 16 GENOMINEN SECUCE talletetaan SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) sekä GENBANK DATA BASE (NCBI) (vain GEN 16S rRNA:n sekunti) (vain GEN 16S rRNA: n secuence). (Finnish)
4 August 2022
0 references
WZROST LICZBY CHORÓB PRZENOSZONYCH PRZEZ ŻYWNOŚĆ W CIĄGU OSTATNICH KILKU LAT, ZE SZCZEGÓLNYM POJAWIENIEM SIĘ MIKROORGANIZMÓW CHOROBOTWÓRCZYCH, TAKICH JAK LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI LUB ESCHERICHIA COLI, ZWIĘKSZYŁ OBAWY DOTYCZĄCE BEZPIECZEŃSTWA ŻYWNOŚCI ZARÓWNO WŚRÓD WŁADZ, JAK I W SEKTORZE PRODUKCYJNYM, A TAKŻE WŚRÓD KONSUMENTÓW. PATOGENÓW ŻYWNOŚCIOWYCH NIE MOŻNA CAŁKOWICIE WYELIMINOWAĆ ZE WSZYSTKICH ETAPÓW ŁAŃCUCHA ŻYWNOŚCIOWEGO. PONADTO, ZGODNIE Z LECZENIEM, JAKIEGO DOŚWIADCZYŁA ŻYWNOŚĆ, OBECNOŚĆ MIKROBIOTY MOŻE SIĘ RÓŻNIĆ. ISTNIEJE WIELE CZYNNIKÓW CHOROBOTWÓRCZYCH, KTÓRE FIRMA PRZETWÓRCZY MOŻE BYĆ ZOBOWIĄZANA DO ANALIZY W CELU OKREŚLENIA WZGLĘDNEGO BEZPIECZEŃSTWA PRODUKTU. OBECNIE STOSOWANE OBECNIE METODY WYKRYWANIA I SZYBKIEJ IDENTYFIKACJI MAJĄ WADĘ OGRANICZENIA DO KILKU GATUNKÓW (W CZASIE RZECZYWISTYM PCR), WYMAGAJĄCE DŁUGIEGO PRZETWARZANIA (SEKWENCJA, NIE), NIE MAJĄ CHARAKTERU ILOŚCIOWEGO (SEKWENCJONOWANIE, MALDI-TOF), NIE POZWALAJĄ NA WYKRYWANIE W ZŁOŻONYCH MIESZANINACH, TAKICH JAK ŻYWNOŚĆ (SEKWENCJONOWANIE, MALDI-TOF), A PRAKTYCZNIE WSZYSTKIE Z NICH WYMAGAJĄ WCZEŚNIEJSZEGO SIEWU PŁYT. DLATEGO KONIECZNE JEST WDROŻENIE METOD UMOŻLIWIAJĄCYCH SZYBKIE I DOKŁADNE WYKRYWANIE GATUNKÓW ZANIECZYSZCZAJĄCYCH W ŻYWNOŚCI, A TAKŻE OZNACZANIE ILOŚCIOWE BEZPOŚREDNIO W PRÓBCE ŻYWNOŚCI. MA TO MIEJSCE W PRZYPADKU METODOLOGII ZAPROPONOWANEJ W NINIEJSZYM PROJEKCIE: DEFINICJA PEPTYDÓW BIOMARKUJĄCYCH GATUNKÓW PATOGENNYCH I BIOGENNYCH, OD KTÓRYCH LUB Z KTÓRYCH POZYSKUJE SIĘ AMINĘ W ŻYWNOŚCI, A NASTĘPNIE WDROŻENIE STOSOWANIA TYCH PEPTYDÓW DO WYKRYWANIA W PRÓBKACH ŻYWNOŚCI. LIQUID cromatography ACOPLATE TO SPECTROMETRIA OF MASAS IN TANDEM in an electrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) i tylny ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWARE AND COMPARATION WITH aminoacidic secutions zdeponowanych w DATA BASES._x000D_ w celu doprowadzenia do osadzania peptydów biomarkerowych, konieczne jest zapewnienie pełnej gamy BACTERIAAN CEPAS do przejęcia analiz. GATUNKI BAKTERYJNE OBJĘTE BADANIEM BĘDĄ OBEJMOWAĆ TE, KTÓRE SĄ NAJCZĘŚCIEJ IZOLOWANE W PRODUKTACH SPOŻYWCZYCH, JAK OPISANO W LITERATURZE, I OBEJMUJĄ RODZINĘ ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, GRONKOWCE KOAGULAZY DODATNIE; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS ORAZ C. BOTULINUM TYPE E I B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS I B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES I YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP I PAENIBACILLUS SPP. NASZE LABORATORIUM POSIADA SZEROKI ZBIÓR SZCZEPÓW BAKTERYJNYCH WYIZOLOWANYCH Z RÓŻNYCH POKARMÓW (MIĘSO, RYBY, MINIMALNIE PRZETWORZONE I GOTOWE DO SPOŻYCIA, MLEKO, ITP.). WSZYSTKIE Z NICH CHARAKTERYZUJĄ SIĘ RÓŻNYMI METODAMI, ZARÓWNO KLASYCZNYMI, JAK I GENOMOWYMI I PROTEOMICZNYMI (MALDI-TOF). Takie SPECJALNE SPECJALNE SPECJALNE SPECYFIKTYCZNE spekulacje MALDI-TOF I GENOMIC SECUCE OF GEN 16 są zdeponowane w bazie danych SPECTRABANK (WWW.SPECTRABANK.ORG), a także w GENBANK DATA BASE (NCBI) (tylko sekuencja GEN 16S rRNA)._x000D_ metodologia I WYNIKI umożliwią im rozszerzenie bazy danych SPECTRABANK (WWW.SPECTRABANK.ORG), opracowanej w naszym laboratorium i stanowiącej najwyższą międzynarodową bazę danych dostępu (Polish)
4 August 2022
0 references
AZ ÉLELMISZER-EREDETŰ BETEGSÉGEK SZÁMÁNAK NÖVEKEDÉSE AZ ELMÚLT ÉVEKBEN – AZ OLYAN PATOGÉN MIKROORGANIZMUSOK, MINT A LISTERIA MONOCYTOGENES, A SALMONELLA SPP, A CAMPYLOBACTER JEJUNI VAGY AZ ESCHERICHIA COLI KÜLÖNLEGES MEGJELENÉSÉVEL – NÖVELTE AZ ÉLELMISZER-BIZTONSÁGGAL KAPCSOLATOS AGGODALMAKAT MIND A HATÓSÁGOK, MIND A TERMELŐ ÁGAZATBAN, VALAMINT A FOGYASZTÓK KÖRÉBEN. AZ ÉLELMISZER-PATOGÉNEKET NEM LEHET TELJESEN ELTÁVOLÍTANI AZ ÉLELMISZERLÁNC MINDEN SZAKASZÁBÓL. EZENKÍVÜL AZ ÉLELMISZER ÁLTAL ELSZENVEDETT KEZELÉS SZERINT A JELEN LÉVŐ MIKROBIÓTA VÁLTOZHAT. SZÁMOS KÓROKOZÓ VAN, AMELYEKET A FELDOLGOZÓ CÉGNEK ELEMEZNIE KELL A TERMÉK RELATÍV BIZTONSÁGÁNAK MEGHATÁROZÁSÁHOZ. A JELENLEG ALKALMAZOTT KIMUTATÁSI ÉS GYORS AZONOSÍTÁSI MÓDSZEREK HÁTRÁNYA, HOGY NÉHÁNY FAJRA KORLÁTOZÓDNAK (VALÓS IDEJŰ PCR), AMELYEK HOSSZÚ FELDOLGOZÁST IGÉNYELNEK (SORREND, DO), NEM MENNYISÉGIEK (SZEKVENÁLÁS, MALDI-TOF), NEM TESZIK LEHETŐVÉ A KIMUTATÁST ÖSSZETETT KEVERÉKEKBEN, PÉLDÁUL ÉLELMISZEREKBEN (SZEKVENÁLÁS, MALDI-TOF), ÉS GYAKORLATILAG MINDEGYIKÜKNEK KORÁBBAN LEMEZVETÉSRE VAN SZÜKSÉGE. EZÉRT OLYAN MÓDSZEREKET KELL ALKALMAZNI, AMELYEK LEHETŐVÉ TESZIK A SZENNYEZŐ FAJOK GYORS ÉS PONTOS KIMUTATÁSÁT AZ ÉLELMISZERBEN, VALAMINT A MENNYISÉGI MEGHATÁROZÁST KÖZVETLENÜL AZ ÉLELMISZERMINTÁBAN. EZ A HELYZET A PROJEKTBEN JAVASOLT MÓDSZERTAN ESETÉBEN: A PATOGÉN ÉS BIOGÉN AMINTERMELŐ FAJOK BIOMARKING PEPTIDJEINEK MEGHATÁROZÁSA AZ ÉLELMISZEREKBEN, VALAMINT E PEPTIDEK ÉLELMISZERMINTÁKBAN VALÓ KIMUTATÁSÁRA VALÓ ALKALMAZÁSÁNAK EZT KÖVETŐ VÉGREHAJTÁSA. Az elektrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) és a hátsó ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWA ÉS COMPARATION aminoacidic secutions a DATA BASES._x000D_-ban elhelyezett aminoacid szecutációkkal a biomarker peptidek lerakódásához vezet, teljes körű BACTERIAAN CEPAS-t kell biztosítani, hogy a BACTERIAAN CEPAS teljes skáláját átvegye. A VIZSGÁLATBA BEVONT BAKTÉRIUMFAJOK KÖZÉ TARTOZNAK A SZAKIRODALOMBAN LEÍRT ÉLELMISZEREKBEN LEGGYAKRABBAN IZOLÁLT FAJOK, BELEÉRTVE AZ ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, KOAGULÁZ-POZITÍV STAPHYLOCOCCUSOK CSALÁDJÁT; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS ÉS C. BOTULINUM E ÉS B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS ÉS B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES ÉS YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP ÉS PAENIBACILLUS SPP. LABORATÓRIUMUNK SZÁMOS BAKTERIÁLIS TÖRZSBŐL ÁLL, MELYEKET KÜLÖNBÖZŐ ÉLELMISZEREKBŐL IZOLÁLTAK (HÚS, HAL, MINIMÁLISAN FELDOLGOZOTT ÉS FOGYASZTÁSRA KÉSZ, TEJ STB.). MINDEGYIKRE KÜLÖNBÖZŐ – KLASSZIKUS ÉS GENOMIKUS ÉS PROTEOMIKUS – MÓDSZEREK (MALDI-TOF) JELLEMZŐEK. A SPECTRABANK DATA BASE-nál (WWW.SPECTRABANK.ORG), valamint a GEN 16 szabványban (csak a GEN 16S rRNA szecuenciája)._x000D_ metodológia ÉS EREDMÉNYEK lehetővé teszik számukra, hogy bővítsék a SPECTRABANK DATA BASE-t (WWW.SPECTRABANK.ORG), amelyet a mi munkásságunkban fejlesztettek ki és alkotják a legmagasabb nemzetközi hozzáférési adatbázist. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
NÁRŮST CHOROB PŘENÁŠENÝCH POTRAVINAMI V POSLEDNÍCH NĚKOLIKA LETECH SE ZVLÁŠTNÍM VÝSKYTEM PATOGENNÍCH MIKROORGANISMŮ, JAKO JSOU LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JIUNI NEBO ESCHERICHIA COLI, ZVÝŠIL OBAVY OHLEDNĚ BEZPEČNOSTI POTRAVIN MEZI ORGÁNY I VE VÝROBNÍM ODVĚTVÍ I MEZI SPOTŘEBITELI. POTRAVINOVÉ PATOGENY NELZE ZCELA VYLOUČIT ZE VŠECH FÁZÍ POTRAVINOVÉHO ŘETĚZCE. KROMĚ TOHO SE MŮŽE PŘÍTOMNÁ MIKROBIOTA PODLE LÉČBY, KTEROU UTRPĚLA POTRAVA, LIŠIT. EXISTUJE MNOHO PATOGENŮ, KTERÉ ZPRACOVATELSKÁ SPOLEČNOST MŮŽE BÝT POVINNA ANALYZOVAT, ABY URČILA RELATIVNÍ BEZPEČNOST VAŠEHO PŘÍPRAVKU. METODY DETEKCE A RYCHLÉ IDENTIFIKACE, KTERÉ JSOU V SOUČASNÉ DOBĚ ZAVEDENY, MAJÍ NEVÝHODU V TOM, ŽE JSOU OMEZENY NA NĚKOLIK DRUHŮ (PCR V REÁLNÉM ČASE), VYŽADUJÍ DLOUHÉ ZPRACOVÁNÍ (SEKVENCE, NE), NEJSOU KVANTITATIVNÍ (SEKVENOVÁNÍ, MALDI-TOF), NEUMOŽŇUJÍ DETEKCI VE SLOŽITÝCH SMĚSÍCH, JAKO JSOU POTRAVINY (SEKVENCE, MALDI-TOF), A PRAKTICKY VŠECHNY Z NICH POTŘEBUJÍ PŘEDCHOZÍ SETÍ TALÍŘŮ. PROTO JE NEZBYTNÉ ZAVÉST METODY, KTERÉ UMOŽNÍ RYCHLOU A PŘESNOU DETEKCI KONTAMINUJÍCÍCH DRUHŮ V POTRAVINÁCH, JAKOŽ I KVANTIFIKACI PŘÍMO VE VZORKU POTRAVINY. TAK JE TOMU V PŘÍPADĚ METODIKY NAVRŽENÉ V TOMTO PROJEKTU: DEFINICE BIOMARKINGOVÝCH PEPTIDŮ PATOGENNÍCH A BIOGENNÍCH DRUHŮ PRODUKUJÍCÍCH AMIN V POTRAVINÁCH A NÁSLEDNÉ UPLATŇOVÁNÍ TĚCHTO PEPTIDŮ PRO DETEKCI VE VZORCÍCH POTRAVIN. LIQUID cromatography ACOPLATE TO SPECTROMETRIA OF MASAS IN TANDEM V elektrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) a posterior ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWARE A COMPARATION S aminoacidickými sekvencemi uloženými v DATA BASES._x000D_ s cílem vést k depozici bio-markerových peptidů, je nutné zajistit plný rozsah BACTERIAAN CEPAS pro převzetí analýz. BAKTERIÁLNÍ DRUHY ZAHRNUTÉ DO STUDIE BUDOU ZAHRNOVAT TY, KTERÉ JSOU NEJČASTĚJI IZOLOVÁNY V POTRAVINÁŘSKÝCH VÝROBCÍCH, JAK JE POPSÁNO V LITERATUŘE, A ZAHRNUJÍ ČELEDI ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, KOAGULÁZA-POZITIVNÍ STAFYLOKOKY; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS A C. BOTULINUM TYPY E A B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS A B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JIUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES A YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP A PAENIBACILLUS SPP. NAŠE LABORATOŘ MÁ ŠIROKOU SBÍRKU BAKTERIÁLNÍCH KMENŮ IZOLOVANÝCH Z RŮZNÝCH POTRAVIN (MASO, RYBY, MINIMÁLNĚ ZPRACOVANÉ A PŘIPRAVENÉ KE SPOTŘEBĚ, MLÉKO ATD.). VŠECHNY BYLY CHARAKTERIZOVÁNY RŮZNÝMI METODAMI, JAK KLASICKÝMI, TAK GENOMICKÝMI A PROTEOMICKÝMI (MALDI-TOF). Tyto RELATEDNÍ ZVĚDČENÍ S VŠECHNÝM MALDI-TOF speciálem A GEN 16 GEN 16 jsou uloženy na stránkách SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) a také v GENBANK DATA BASE (NCBI) (pouze sekuence GEN 16S rRNA)._x000D_ metodologie A RESULTS jim umožní rozšířit SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), vyvinutý v našem laboratoriu a představující nejvyšší mezinárodní databázi přístupu (Czech)
4 August 2022
0 references
PĀRTIKAS IZRAISĪTO SLIMĪBU SKAITA PIEAUGUMS PĒDĒJO GADU LAIKĀ, ĪPAŠI PATOGĒNIEM MIKROORGANISMIEM, PIEMĒRAM, LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI VAI ESCHERICHIA COLI, IR PALIELINĀJIS BAŽAS PAR PĀRTIKAS NEKAITĪGUMU GAN IESTĀDĒS, GAN RAŽOŠANAS NOZARĒ, GAN PATĒRĒTĀJU VIDŪ. PĀRTIKAS PATOGĒNUS NEVAR PILNĪBĀ LIKVIDĒT VISOS PĀRTIKAS APRITES POSMOS. TURKLĀT ATKARĪBĀ NO PĀRTIKAS PRODUKTA APSTRĀDES MIKROBIOTAS KLĀTBŪTNE VAR ATŠĶIRTIES. IR DAUDZ PATOGĒNU, KAS PĀRSTRĀDES UZŅĒMUMAM VAR BŪT JĀANALIZĒ, LAI NOTEIKTU JŪSU PRODUKTA RELATĪVO DROŠĪBU. PAŠLAIK IZMANTOTO NOTEIKŠANAS UN ĀTRĀS IDENTIFICĒŠANAS METOŽU TRŪKUMS IR TĀDS, KA TĀS APROBEŽOJAS AR DAŽĀM SUGĀM (REĀLLAIKA PĶR), KURĀM VAJADZĪGA ILGA APSTRĀDE (SECĪBA, NAV), TĀS NAV KVANTITATĪVAS (SEKUNDĒŠANA, MALDI-TOF), NEĻAUJ TOS ATKLĀT KOMPLEKSOS MAISĪJUMOS, PIEMĒRAM, PĀRTIKĀ (SEKVENCĒŠANA, MALDI-TOF), UN PRAKTISKI VISĀM NO TĀM IEPRIEKŠ IR VAJADZĪGA PLĀKŠŅU SĒŠANA. TĀPĒC IR JĀIEVIEŠ METODES, KAS ĻAUJ ĀTRI UN PRECĪZI NOTEIKT PIESĀRŅOJOŠĀS SUGAS PĀRTIKĀ, KĀ ARĪ KVANTIFICĒŠANU TIEŠI PĀRTIKAS PARAUGĀ. TAS ATTIECAS UZ ŠAJĀ PROJEKTĀ IEROSINĀTO METODIKU: PATOGĒNU UN BIOGĒNU AMĪNUS RAŽOJOŠU SUGU BIOMARĶĒJOŠO PEPTĪDU DEFINĒŠANA PĀRTIKĀ UN TURPMĀKA ŠO PEPTĪDU PIELIETOŠANA NOTEIKŠANAI PĀRTIKAS PARAUGOS. LIQUID Cromatogrāfija ACOPLATE TO SPECTROMETRIA of MASAS IN TANDEM in electrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) un mugurējā ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWARE UN COMPARATION AR aminoskābju sekcijām, kas deponētas DATA BASES._x000D_, lai novestu pie bio-marķieru peptīdu nogulsnēšanās, ir nepieciešams nodrošināt pilnu BACTERIAAN CEPAS klāstu, lai pārņemtu Analy. PĒTĪJUMĀ IEKĻAUTAS BAKTĒRIJU SUGAS, KAS VISBIEŽĀK IZOLĒTAS PĀRTIKAS PRODUKTOS, KĀ APRAKSTĪTS LITERATŪRĀ, UN IETVER ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, COAGULASE-POZITĪVU STAFILOKOKU DZIMTU; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS UN C. BOTULINUM E UN B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS UN B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES UN YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP UN PAENIBACILLUS SPP. MŪSU LABORATORIJĀ IR PLAŠA BAKTĒRIJU CELMU KOLEKCIJA, KAS IZOLĒTA NO DAŽĀDIEM PĀRTIKAS PRODUKTIEM (GAĻA, ZIVIS, MINIMĀLI APSTRĀDĀTI UN GATAVI PATĒRIŅAM, PIENS UTT.). TIEM VISIEM IR RAKSTURĪGAS DAŽĀDAS METODES — GAN KLASISKĀS, GAN GENOMISKĀS UN PROTEOMIKAS (MALDI-TOF). Šādi RELATED SPECIES AR JŪSU SPECIFIKĀCIJAS MALDI-TOF spektīviem UN ĢENOMIKAS SECUCE OF GEN 16 tiek deponēti SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), kā arī GENBANK DATA BASE (NCBI) (tikai GEN 16S rRNA sekuence)._x000D_ metodoloģija UN REZULTĀTI ļaus viņiem paplašināt SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), kas izstrādāta mūsu darbaatorijā un veido augstāko starptautisko piekļuves datu bāzi. (Latvian)
4 August 2022
0 references
LEIS AN MÉADÚ AR GHALAIR BHIA-IOMPARTHA LE BLIANTA BEAGA ANUAS, LE TEACHT CHUN CINN SPEISIALTA DE MHIOCRORGÁNAIGH PHATAIGINEACHA AR NÓS LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI, NÓ ESCHERICHIA COLI, TÁ IMNÍ MHÉADAITHE ANN FAOI SHÁBHÁILTEACHT BIA I MEASC NA N-ÚDARÁS AGUS SAN EARNÁIL THÁIRGIÚIL AGUS I MEASC TOMHALTÓIRÍ. NÍ FÉIDIR PATAIGINÍ BIA A DHÍCHUR GO HIOMLÁN Ó GACH CÉIM DEN BHIASHLABHRA. INA THEANNTA SIN, DE RÉIR NA CÓIREÁLA A D’FHULAING AN BIA, D’FHÉADFADH AN MICROBIOTA ATÁ I LÁTHAIR A BHEITH ÉAGSÚIL. TÁ GO LEOR PATAIGINÍ ANN GO BHFÉADFADH SÉ GO MBEADH AR AN GCUIDEACHTA PRÓISEÁLA ANAILÍS A DHÉANAMH CHUN SÁBHÁILTEACHT CHOIBHNEASTA DO THÁIRGE A CHINNEADH. TÁ AN MÍBHUNTÁISTE AG BAINT LEIS NA MODHANNA BRAITE AGUS MEARAITHEANTAIS ATÁ Á GCUR CHUN FEIDHME FAOI LÁTHAIR GO BHFUIL SIAD TEORANTA DO ROINNT SPEICEAS (PCR FÍOR-AMA), AR GÁ PRÓISEÁIL FHADA A DHÉANAMH ORTHU (SEICHEAMH, NÁ BÍODH SIAD CAINNÍOCHTÚIL (SEICHEAMHÚ, MALDI-TOF), NÍ CHEADAÍTEAR IAD A BHRATH I MEASCÁIN CHASTA AMHAIL BIA (SEICHEAMH, MALDI-TOF), AGUS NÍ MÓR DÓIBH GO LÉIR PLÁTA A CHUR ROIMHE SIN. SIN É AN FÁTH GO BHFUIL SÉ RIACHTANACH MODHANNA A CHUR I BHFEIDHM A FHÁGANN GUR FÉIDIR SPEICIS ÉILLITHEACHA A BHRATH GO TAPA AGUS GO CRUINN SA BHIA CHOMH MAITH LEIS AN GCAINNÍOCHTÚ GO DÍREACH I SAMPLA BIA. IS AMHLAIDH ATÁ I GCÁS NA MODHEOLAÍOCHTA ATÁ BEARTAITHE SA TIONSCADAL SEO: AN SAINMHÍNIÚ AR PHEIPTÍDÍ BIOMARKING DE SPEICEAS PATAIGINEACH AGUS BITHGHINIÚNACH A THÁIRGEANN AIMÍN I MBIA AGUS CUR CHUN FEIDHME NA BPEIPTÍDÍ SIN INA DHIAIDH SIN CHUN IAD A BHRATH I SAMPLAÍ BIA. Tá an LIQUID CROMATOGRAPHY ACOPLATE to SPECTROMETRIA OF MASAS IN CINNEADH electrospray-Trampa IONICA (LC-ESI-IT-MS/MS) agus posterior ANALISIS DIFFERENT BHAILE AGUS COMHLÁNACHT LE SECUTIONS aminoacidic taiscthe i DATA BASES._x000D_ d’fhonn a bheith mar thoradh ar an sileadh peptids bithmharcóra, is gá foráil a dhéanamh maidir le raon iomlán CEPAS BACTERIAAN chun na hAnailísí a ghabháil chuici féin. ÁIREOFAR AR NA SPEICIS BHAICTÉARACHA A ÁIRÍTEAR SA STAIDÉAR IAD SIÚD IS MINICE ATÁ SCOITE AMACH I DTÁIRGÍ BIA, MAR A THUAIRISCÍTEAR SA LITRÍOCHT, AGUS ÁIREOFAR AN TEAGHLACH ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, COAGULASE-DEIMHNEACH STAPHYLOCOCCI; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS, AGUS C. BOTULINUM CINEÁLACHA E AGUS B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS AGUS B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES AGUS YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP AGUS PAENIBACILLUS SPP. TÁ BAILIÚCHÁN LEATHAN TRÉITHCHINEÁLACHA BAICTÉARACHA AG ÁR SAOTHARLANN ATÁ SCOITE AMACH Ó BHIANNA ÉAGSÚLA (FEOIL, IASC, MIONPHRÓISEÁIL AGUS RÉIDH LE CAITHEAMH, BAINNE, ETC.). GACH CEANN ACU A BHEITH TRÉITHRITHE AG MODHANNA ÉAGSÚLA, IDIR CLASAICEACH AGUS GÉANÓMACH AGUS PRÓITÉAMAÍOCH (MALDI-TOF). Sonraíochtaí RELATED den sórt sin LE DO SPEISIALTA MALDI-TOF SPECIFIC AGUS SECUCE GEN 16 i dtaisce ag an BASE SPECTRABANK DATA (WWW.SPECTRABANK.ORG) chomh maith leis an BASE GENBANK DATA (NCBI) (gan ach an secuence GEN 16s rRNA)._x000D_ metodology AGUS RESULTS ligfidh siad dóibh an BASE SPECTRABANK DATA (WWW.SPECTRABANK.ORG) a leathnú (WWW.SPECTRABANK.ORG), a forbraíodh inár laboratorium agus a chuimsíonn an bonn rochtana sonraí idirnáisiúnta is airde (Irish)
4 August 2022
0 references
POVEČANJE ŠTEVILA BOLEZNI, KI SE PRENAŠAJO S HRANO, V ZADNJIH NEKAJ LETIH S POSEBNIM POJAVOM PATOGENIH MIKROORGANIZMOV, KOT SO LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI ALI ESCHERICHIA COLI, JE POVEČALO ZASKRBLJENOST GLEDE VARNOSTI HRANE TAKO MED ORGANI KOT V PROIZVODNEM SEKTORJU IN MED POTROŠNIKI. PREHRAMBENIH PATOGENOV NI MOGOČE POPOLNOMA ODPRAVITI IZ VSEH FAZ PREHRANSKE VERIGE. POLEG TEGA SE LAHKO GLEDE NA ZDRAVLJENJE, KI GA JE UTRPELA HRANA, PRISOTNI MIKROBIOTI RAZLIKUJEJO. OBSTAJAJO ŠTEVILNI PATOGENI, KI JIH BO PREDELOVALNO PODJETJE MORDA MORALO ANALIZIRATI, DA BI DOLOČILO RELATIVNO VARNOST VAŠEGA IZDELKA. TRENUTNO UPORABLJENE METODE ODKRIVANJA IN HITREGA PREPOZNAVANJA SO OMEJENE NA NEKAJ VRST (PCR V REALNEM ČASU), POTREBUJEJO DOLGO OBDELAVO (ZAPOREDJE, NE), NISO KVANTITATIVNE (ZAPOREDJE, MALDI-TOF), NE OMOGOČAJO ODKRIVANJA V KOMPLEKSNIH MEŠANICAH, KOT SO ŽIVILA (SEKVENCIRANJE, MALDI-TOF), PRAKTIČNO VSE PA POTREBUJEJO PREDHODNO SETEV NA KROŽNIKU. ZATO JE TREBA IZVAJATI METODE, KI OMOGOČAJO HITRO IN NATANČNO ODKRIVANJE KONTAMINANTNIH VRST V ŽIVILIH TER KOLIČINSKO OPREDELITEV NEPOSREDNO V VZORCU ŽIVILA. TO VELJA ZA METODOLOGIJO, PREDLAGANO V TEM PROJEKTU: OPREDELITEV BIOOZNAČEVALNIH PEPTIDOV PATOGENIH IN BIOGENIH VRST, KI PROIZVAJAJO AMIN, V ŽIVILIH IN POZNEJŠE IZVAJANJE UPORABE TEH PEPTIDOV ZA ODKRIVANJE V VZORCIH ŽIVIL. Kromatografija LIQUID, ki se ZAVEDA SPECTROMETRIA MASAS V TANDEMU V elektrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) in posteriorni ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWARE IN COMPARATION Z aminokislinskimi sekucijami, deponiranimi v DATA BASES._x000D_, da bi privedli do odlaganja bio-markerjev peptidov, je treba zagotoviti celoten spekter BACTERIAAN CEPAS za prevzem analiz. BAKTERIJSKE VRSTE, VKLJUČENE V ŠTUDIJO, BODO VKLJUČEVALE TISTE, KI SO NAJPOGOSTEJE IZOLIRANE V ŽIVILIH, KOT JE OPISANO V LITERATURI, IN BODO VKLJUČEVALE DRUŽINO ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, KOAGULAZO POZITIVNE STAFILOKOKE; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS IN C. BOTULINUM VRSTE E IN B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS IN B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES IN YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP IN PAENIBACILLUS SPP. NAŠ LABORATORIJ IMA ŠIROKO ZBIRKO BAKTERIJSKIH SEVOV, IZOLIRANIH IZ RAZLIČNIH ŽIVIL (MESO, RIBE, MINIMALNO PREDELANE IN PRIPRAVLJENE ZA UŽIVANJE, MLEKO ITD.). ZA VSE SO ZNAČILNE RAZLIČNE METODE, TAKO KLASIČNE KOT GENOMSKE IN PROTEOMSKE (MALDI-TOF). Takšne RELATED SPECIES z vašimi SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) in v GENBANK DATA BASE (NCBI) (samo sekuenca GEN 16S rRNA)._x000D_ metodology IN RESULTS jim bodo omogočili razširitev SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), ki je bil razvit v našem delavcu in predstavlja najvišjo mednarodno podatkovno bazo dostopa. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
УВЕЛИЧАВАНЕТО НА БОЛЕСТИТЕ, ПРЕДАВАНИ ЧРЕЗ ХРАНА ПРЕЗ ПОСЛЕДНИТЕ НЯКОЛКО ГОДИНИ, СЪС СПЕЦИАЛНА ПОЯВА НА ПАТОГЕННИ МИКРООРГАНИЗМИ КАТО LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI ИЛИ ESCHERICHIA COLI, УВЕЛИЧИ ОПАСЕНИЯТА ОТНОСНО БЕЗОПАСНОСТТА НА ХРАНИТЕ КАКТО СРЕД ОРГАНИТЕ, ТАКА И В ПРОИЗВОДСТВЕНИЯ СЕКТОР И СРЕД ПОТРЕБИТЕЛИТЕ. ХРАНИТЕЛНИТЕ ПАТОГЕНИ НЕ МОГАТ ДА БЪДАТ НАПЪЛНО ЕЛИМИНИРАНИ ОТ ВСИЧКИ ЕТАПИ НА ХРАНИТЕЛНАТА ВЕРИГА. ОСВЕН ТОВА, В ЗАВИСИМОСТ ОТ ЛЕЧЕНИЕТО, ПРЕТЪРПЯНО ОТ ХРАНАТА, НАЛИЧНАТА МИКРОБИОТА МОЖЕ ДА ВАРИРА. ИМА МНОЖЕСТВО ПАТОГЕНИ, КОИТО ПРЕРАБОТВАТЕЛНАТА КОМПАНИЯ МОЖЕ ДА БЪДЕ ЗАДЪЛЖЕНА ДА АНАЛИЗИРА, ЗА ДА ОПРЕДЕЛИ ОТНОСИТЕЛНАТА БЕЗОПАСНОСТ НА ВАШИЯ ПРОДУКТ. ПРИЛАГАНИТЕ ПОНАСТОЯЩЕМ МЕТОДИ ЗА ОТКРИВАНЕ И БЪРЗА ИДЕНТИФИКАЦИЯ ИМАТ НЕДОСТАТЪКА, ЧЕ СА ОГРАНИЧЕНИ ДО НЯКОЛКО ВИДА (В РЕАЛНО ВРЕМЕ PCR), КОИТО СЕ НУЖДАЯТ ОТ ПРОДЪЛЖИТЕЛНА ОБРАБОТКА (ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТ, DO), НЕ СА КОЛИЧЕСТВЕНИ (ПОСЛЕДОВАТЕЛНО, MALDI-TOF), НЕ ПОЗВОЛЯВАТ ОТКРИВАНЕ В СЛОЖНИ СМЕСИ, КАТО НАПРИМЕР ХРАНИ (ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТТА, MALDI-TOF), И НА ПРАКТИКА ВСИЧКИ ОТ ТЯХ СЕ НУЖДАЯТ ОТ ПРЕДВАРИТЕЛНО ЗАСЯВАНЕ НА ПЛАКАТА. ЕТО ЗАЩО Е НЕОБХОДИМО ДА СЕ ПРИЛОЖАТ МЕТОДИ, КОИТО ПОЗВОЛЯВАТ БЪРЗОТО И ТОЧНО ОТКРИВАНЕ НА ЗАМЪРСЯВАЩИ ВИДОВЕ В ХРАНАТА, КАКТО И КОЛИЧЕСТВЕНОТО ОПРЕДЕЛЯНЕ ДИРЕКТНО В ПРОБА ОТ ХРАНА. ТАКЪВ Е СЛУЧАЯТ С МЕТОДОЛОГИЯТА, ПРЕДЛОЖЕНА В НАСТОЯЩИЯ ПРОЕКТ: ОПРЕДЕЛЕНИЕТО ЗА БИОМАРКИРАНЕ НА ПЕПТИДИ НА ПАТОГЕННИ И БИОГЕННИ ВИДОВЕ, ОТГЛЕЖДАНИ ЗА ПРОИЗВОДСТВО НА АМИНИ, В ХРАНИТЕ И ПОСЛЕДВАЩОТО ПРИЛАГАНЕ НА ТЕЗИ ПЕПТИДИ ЗА ОТКРИВАНЕ В ПРОБИ ОТ ХРАНИ. Кроматографията LIQUID, която се отнася до СПЕКТРОМЕТРИА НА МАСА в ТАНДЕМ В електроспрей-Трампа IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) и задна ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWARE И COMPARATION С аминоацидни секуиди, депозирани в DATA BASES._x000D_, за да доведе до отлагане на биомаркерни пептиди, необходимо е да се предвиди пълен набор от BACTERIAAN CEPAS, които да поемат анализите. БАКТЕРИАЛНИТЕ ВИДОВЕ, ВКЛЮЧЕНИ В ПРОУЧВАНЕТО, ЩЕ ВКЛЮЧВАТ ТЕЗИ, КОИТО НАЙ-ЧЕСТО СА ИЗОЛИРАНИ В ХРАНИТЕЛНИ ПРОДУКТИ, КАКТО Е ОПИСАНО В ЛИТЕРАТУРАТА, И ВКЛЮЧВАТ СЕМЕЙСТВО ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, КОАГУЛАЗА-ПОЛОЖИТЕЛНИ СТАФИЛОКОКИ; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS И C. BOTULINUM TYPES E AND B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS И B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES И YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP И PAENIBACILLUS SPP. НАШАТА ЛАБОРАТОРИЯ РАЗПОЛАГА С ШИРОКА КОЛЕКЦИЯ ОТ БАКТЕРИАЛНИ ЩАМОВЕ, ИЗОЛИРАНИ ОТ РАЗЛИЧНИ ХРАНИ (МЕСО, РИБА, МИНИМАЛНО ПРЕРАБОТЕНИ И ГОТОВИ ЗА КОНСУМАЦИЯ, МЛЯКО И ДР.). ВСИЧКИ ТЕ СЕ ХАРАКТЕРИЗИРАТ С РАЗЛИЧНИ МЕТОДИ, КАКТО КЛАСИЧЕСКИ, ТАКА И ГЕНОМНИ И ПРОТЕОМИЧНИ (MALDI-TOF). Такива СЪОБЩЕНИ СПЕЦИФИКАЦИИ С СПЕЦИФИЧНИ МАЛДИ-TOFcпективи И GEN 16 се депозират в SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), както и в GENBANK DATA BASE (NCBI) (само секретността на GEN 16S rRNA)._x000D_ методология И RESULTS те ще им позволят да разширят SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), разработен в нашия лабораторен център и представляващ най-високата международна база данни за достъп (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
IŻ-ŻIEDA FIL-MARD LI JINĠARR MILL-IKEL MATUL DAWN L-AĦĦAR FTIT SNIN, B’EMERĠENZA SPEĊJALI TA’ MIKROORGANIŻMI PATOĠENIĊI BĦAL-LISTERIA MONOCYTOGENES, IS-SALMONELLA SPP, IL-CAMPYLOBACTER JEJUNI, JEW L-ESCHERICHIA COLI, ŻIEDET IT-TĦASSIB DWAR IS-SIKUREZZA TAL-IKEL KEMM FOST L-AWTORITAJIET KIF UKOLL FIS-SETTUR PRODUTTIV U FOST IL-KONSUMATURI. IL-PATOĠENI TAL-IKEL MA JISTGĦUX JIĠU ELIMINATI KOMPLETAMENT MILL-ISTADJI KOLLHA TAL-KATINA ALIMENTARI. BARRA MINN HEKK, SKONT IT-TRATTAMENT LI JSOFRI L-IKEL, IL-MIKROBIJOTA PREŻENTI TISTA’ TVARJA. HEMM PATOĠENI NUMERUŻI LI L-KUMPANIJA TA ' L-IPPROĊESSAR JISTGĦU JKUNU MEĦTIEĠA LI JANALIZZAW BIEX JIDDETERMINAW IS-SIGURTÀ RELATTIVA TAL-PRODOTT TIEGĦEK. IL-METODI TA’ DETEZZJONI U TA’ IDENTIFIKAZZJONI RAPIDA ATTWALMENT IMPLIMENTATI BĦALISSA GĦANDHOM L-IŻVANTAĠĠ LI JKUNU LIMITATI GĦAL FTIT SPEĊIJIET (PCR F’ĦIN REALI), LI JEĦTIEĠU PPROĊESSAR TWIL (SEKWENZA, DO), MA JKUNUX KWANTITATTIVI (SEKWENZAR, MALDI-TOF), MA JIPPERMETTUX ID-DETEZZJONI F’TAĦLITIET KUMPLESSI BĦALL-IKEL (SEKWENZAR, MALDI-TOF), U PRATTIKAMENT KOLLHA JEĦTIEĠU ŻRIEGĦ QABEL. DIN HIJA R-RAĠUNI GĦALIEX HUWA MEĦTIEĠ LI JIĠU IMPLIMENTATI METODI LI JIPPERMETTU D-DETEZZJONI RAPIDA U PREĊIŻA TAL-ISPEĊIJIET KONTAMINANTI FL-IKEL KIF UKOLL IL-KWANTIFIKAZZJONI DIRETTAMENT F’KAMPJUN TAL-IKEL. DAN HUWA L-KAŻ BIL-METODOLOĠIJA PROPOSTA F’DAN IL-PROĠETT: ID-DEFINIZZJONI TAL-BIJOMARKAR TAL-PEPTIDI TA’ SPEĊIJIET PATOĠENI U BIJOĠENUŻI LI JIPPRODUĊU L-AMMINA FL-IKEL U L-IMPLIMENTAZZJONI SUSSEGWENTI TAL-APPLIKAZZJONI TA’ DAWN IL-PEPTIDI GĦAS-SEJBIEN F’KAMPJUNI TAL-IKEL. Il-kromatografija LIQUID ACOPLATE GĦAL SPECTROMETRIA TA’ MASSI F’TANDEM F’EQUIPMENT TA’ IONICA elettrosprej-TRAMPA (LC-ESI-IT-MS/MS) u posterjuri ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWARE U COMPARATION WITH secutions aminoacidic depositati f’DATA BASES._x000D_ sabiex twassal għad-depożizzjoni ta’ pids bijomarkaturi, huwa meħtieġ li tipprovdi għal firxa sħiħa ta’ BACTERIAAN CEPAS biex tieħu f’idejha l-Analy. L-ISPEĊI BATTERJALI INKLUŻI FL-ISTUDJU SE JINKLUDU DAWK LI HUMA IŻOLATI L-AKTAR TA’ SPISS FI PRODOTTI TAL-IKEL, KIF DESKRITT FIL-LETTERATURA, U JINKLUDU L-FAMILJA ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, STAFILOKOKKI KOAGULAŻI POŻITTIVI; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS, U C. BOTULINUM TIPI E U B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS U B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES U YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP U PAENIBACILLUS SPP. LABORATORJU TAGĦNA GĦANDHA ĠABRA WIESGĦA TA ‘RAZEZ BATTERJALI IŻOLATI MINN IKEL DIFFERENTI (LAĦAM, ĦUT, MINIMAMENT IPPROĊESSAT U LEST GĦALL-KONSUM, ĦALIB, EĊĊ). KOLLHA KEMM HUMA ĠEW IKKARATTERIZZATI MINN METODI DIFFERENTI, KEMM KLASSIĊI KIF UKOLL ĠENOMIĊI U PROTEOMIĊI (MALDI-TOF). Dawn l-Ispeċji RELATATI MALDI-TOF SPEĊIFIĊI MALDI-TOF SPEĊIFIĊI MALDI-TOF SPEĊIFIĊI U SIGWAZZJONI ĠENOMIKA TA’ GEN 16 huma ddepożitati fil-BASE tad-DATA SPECTRABANK (WWW.SPECTRABANK.ORG) kif ukoll fid-DATA BASE GENBANK (NCBI) (biss is-seklu TA’ GEN 16S rRNA)._x000D_ metodoloġija U RIŻULTATI li jippermettulhom jespandu l-BASE DATA SPECTRABANK (WWW.SPECTRABANK.ORG), żviluppati fil-labatorju tagħna u li jikkostitwixxu l-ogħla bażi ta’ data internazzjonali ta’ aċċess għad-data internazzjonali (Maltese)
4 August 2022
0 references
O AUMENTO DAS DOENÇAS DE ORIGEM ALIMENTAR NOS ÚLTIMOS ANOS, COM UM APARECIMENTO ESPECIAL DE MICRORGANISMOS PATOGÉNICOS COMO LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI OU ESCHERICHIA COLI, TEM AUMENTADO AS PREOCUPAÇÕES COM A SEGURANÇA ALIMENTAR, TANTO ENTRE AS AUTORIDADES COMO NO SETOR PRODUTIVO E ENTRE OS CONSUMIDORES. OS AGENTES PATOGÉNICOS ALIMENTARES NÃO PODEM SER COMPLETAMENTE ELIMINADOS DE TODAS AS FASES DA CADEIA ALIMENTAR. ALÉM DISSO, DE ACORDO COM O TRATAMENTO SOFRIDO PELO ALIMENTO, A MICROBIOTA PRESENTE PODE VARIAR. EXISTEM INÚMEROS PATÓGENOS QUE A EMPRESA DE PROCESSAMENTO PODE SER OBRIGADA A ANALISAR PARA DETERMINAR A SEGURANÇA RELATIVA DO SEU PRODUTO. OS MÉTODOS DE DETEÇÃO E IDENTIFICAÇÃO RÁPIDA ATUALMENTE IMPLEMENTADOS TÊM A DESVANTAGEM DE SE LIMITAR A ALGUMAS ESPÉCIES (PCR EM TEMPO REAL), NECESSITANDO DE PROCESSAMENTO LONGO (SEQUÊNCIA, FAZER), NÃO SER QUANTITATIVO (SEQUÊNCIA, MALDI-TOF), NÃO PERMITIR A DETEÇÃO EM MISTURAS COMPLEXAS, COMO ALIMENTOS (SEQUENCIAMENTO, MALDI-TOF), E PRATICAMENTE TODOS ELES PRECISAM DE SEMENTEIRA PREVIAMENTE EM PLACAS. É POR ISSO QUE É NECESSÁRIO APLICAR MÉTODOS QUE PERMITAM A DETEÇÃO RÁPIDA E PRECISA DE ESPÉCIES CONTAMINANTES NOS ALIMENTOS, BEM COMO A QUANTIFICAÇÃO DIRETAMENTE NUMA AMOSTRA DE ALIMENTOS. É O CASO DA METODOLOGIA PROPOSTA NESTE PROJETO: A DEFINIÇÃO DE PÉPTIDOS DE BIOMARCAÇÃO DE ESPÉCIES PATOGÉNICAS E BIOGÊNICAS PRODUTORAS DE AMINAS NOS ALIMENTOS E A SUBSEQUENTE IMPLEMENTAÇÃO DA APLICAÇÃO DESSES PEPTÍDEOS PARA DETEÇÃO EM AMOSTRAS DE ALIMENTOS. A cromatografia LÍQUIda ACOPLADO A ESPETROMETRIA DE MASAS EM TANDEM EM EQUIPAMENTO DE IONICA DE TRANMA DE TANDEM em eletrospray-TRAMPA (LC-ESI-IT-MS/MS) e ANALISE ANÁLISE Medient DIFFERENT SOFTWARE E COMPARAÇÃO COM secuções aminoácidas depositadas em DATA BASES._x000D_ a fim de levar à deposição de peptídeos biomarcadores, é necessário prever uma gama completa de CEPAS BACTERIANO para assumir as análises. AS ESPÉCIES BACTERIANAS INCLUÍDAS NO ESTUDO INCLUIRÃO AS QUE SÃO MAIS FREQUENTEMENTE ISOLADAS EM PRODUTOS ALIMENTARES, CONFORME DESCRITO NA LITERATURA, E INCLUIRÃO A FAMÍLIA ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, ESTAFILOCOCOS COAGULASE POSITIVOS; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS E C. BOTULINUM TIPOS E E B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS E B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES E YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP E PAENIBACILLUS SPP. NOSSO LABORATÓRIO POSSUI UMA AMPLA COLEÇÃO DE CEPAS BACTERIANAS ISOLADAS DE VÁRIOS ALIMENTOS (CARNE, PEIXE, MINIMAMENTE PROCESSADO E PRONTO PARA CONSUMO, LEITE, ETC.). TODOS ELES TÊM SIDO CARACTERIZADOS POR DIFERENTES MÉTODOS, TANTO CLÁSSICOS QUANTO GENÔMICOS E PROTEÔMICOS (MALDI-TOF). Tais ESPECIAS RELATIVAS COM SUAS Espetáculos ESPECÍFICOS MALDI-TOF E SECUÇA GENÉMICA DO GEN 16 são depositadas no SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), bem como no GENBANK DATA BASE (NCBI) (apenas a secuência do GEN 16S rRNA)._x000D_ metodologia e RESULTADOS que lhes permitirão expandir o SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), desenvolvido em nosso laboratório e constituindo a mais alta base de dados internacionais de acesso (Portuguese)
4 August 2022
0 references
STIGNINGEN I FØDEVAREBÅRNE SYGDOMME I DE SENESTE ÅR MED EN SÆRLIG FOREKOMST AF PATOGENE MIKROORGANISMER SÅSOM LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI ELLER ESCHERICHIA COLI HAR ØGET BEKYMRINGEN OVER FØDEVARESIKKERHEDEN BÅDE BLANDT MYNDIGHEDERNE OG I DEN PRODUKTIVE SEKTOR OG BLANDT FORBRUGERNE. FØDEVAREPATOGENER KAN IKKE HELT FJERNES FRA ALLE LED I FØDEKÆDEN. DESUDEN KAN DEN TILSTEDEVÆRENDE MIKROBIOTA VARIERE AFHÆNGIGT AF DEN BEHANDLING, SOM FØDEVAREN LIDER. DER ER MANGE PATOGENER, SOM FORARBEJDNINGSVIRKSOMHEDEN KAN VÆRE FORPLIGTET TIL AT ANALYSERE FOR AT BESTEMME DEN RELATIVE SIKKERHED AF DIT PRODUKT. DE DETEKTIONS- OG HURTIGE IDENTIFIKATIONSMETODER, DER I ØJEBLIKKET ANVENDES, HAR DEN ULEMPE, AT DE ER BEGRÆNSET TIL NOGLE FÅ ARTER (I REALTID PCR), KRÆVER LANG FORARBEJDNING (SEKVENS, GØR DET), IKKE ER KVANTITATIVE (SEKVENSERING, MALDI-TOF), TILLADER IKKE PÅVISNING I KOMPLEKSE BLANDINGER SOM F.EKS. FØDEVARER (SEKVENSERING, MALDI-TOF), OG PRAKTISK TAGET ALLE HAR BRUG FOR PLADESÅNING. DERFOR ER DET NØDVENDIGT AT INDFØRE METODER, DER MULIGGØR HURTIG OG NØJAGTIG PÅVISNING AF KONTAMINERENDE ARTER I FØDEVAREN SAMT KVANTIFICERING DIREKTE I EN FØDEVAREPRØVE. DETTE ER TILFÆLDET MED DEN METODE, DER FORESLÅS I DETTE PROJEKT: DEFINITIONEN AF BIOMARKERENDE PEPTIDER AF PATOGENE OG BIOGENE AMINPRODUCERENDE ARTER I FØDEVARER OG DEN EFTERFØLGENDE GENNEMFØRELSE AF ANVENDELSEN AF DISSE PEPTIDER TIL PÅVISNING I FØDEVAREPRØVER. Den flydende kromatografi ACOPLATE TIL SPECTROMETRIA AF MASAS I TANDEM I en elektrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) og posterior ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWARE OG KOMPARATION MED aminoacidic secutions deponeret i DATA BASES._x000D_ for at føre til aflejring af biomarkør peptider, er det nødvendigt at give et komplet udvalg af BACTERIAAN CEPAS til at overtage analyserne. DE BAKTERIEARTER, DER INDGÅR I UNDERSØGELSEN, VIL OMFATTE DEM, DER OFTEST ER ISOLERET I FØDEVARER, SOM BESKREVET I LITTERATUREN, OG OMFATTE FAMILIEN ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, KOAGULASEPOSITIVE STAFYLOKOKKER. CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS OG C. BOTULINUM TYPE E OG B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS OG B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES OG YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP OG PAENIBACILLUS SPP. VORES LABORATORIUM HAR EN BRED SAMLING AF BAKTERIESTAMMER ISOLERET FRA FORSKELLIGE FØDEVARER (KØD, FISK, MINIMALT FORARBEJDET OG KLAR TIL KONSUM, MÆLK, ETC.). DE HAR ALLE VÆRET KENDETEGNET VED FORSKELLIGE METODER, BÅDE KLASSISKE OG GENOMISKE OG PROTEOMISKE (MALDI-TOF). Sådanne RELATED SPECIER MED dine SPECIFIKKE MALDI-TOF-spektiver OG GENOMISKE SECUCE AF GEN 16 deponeres i SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) samt i GENBANK DATA BASE (NCBI) (kun secuence OF GEN 16S rRNA)._x000D_ metodologi OG RESULTS vil de give dem mulighed for at udvide SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), der er udviklet i vores laboratorium og udgør den højeste internationale database for adgang (Danish)
4 August 2022
0 references
CREȘTEREA NUMĂRULUI DE BOLI TRANSMISE PRIN ALIMENTE ÎN ULTIMII ANI, CU APARIȚIA SPECIALĂ A MICROORGANISMELOR PATOGENE PRECUM LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI SAU ESCHERICHIA COLI, A SPORIT PREOCUPĂRILE CU PRIVIRE LA SIGURANȚA ALIMENTARĂ ATÂT ÎN RÂNDUL AUTORITĂȚILOR, CÂT ȘI ÎN SECTORUL PRODUCTIV, PRECUM ȘI ÎN RÂNDUL CONSUMATORILOR. AGENȚII PATOGENI ALIMENTARI NU POT FI ELIMINAȚI COMPLET DIN TOATE ETAPELE LANȚULUI ALIMENTAR. ÎN PLUS, ÎN FUNCȚIE DE TRATAMENTUL SUFERIT DE ALIMENTE, MICROBIOTA PREZENTĂ POATE VARIA. EXISTĂ NUMEROȘI AGENȚI PATOGENI PE CARE COMPANIA DE PRELUCRARE POATE FI OBLIGATĂ SĂ LE ANALIZEZE PENTRU A DETERMINA SIGURANȚA RELATIVĂ A PRODUSULUI DUMNEAVOASTRĂ. METODELE DE DETECTARE ȘI IDENTIFICARE RAPIDĂ IMPLEMENTATE ÎN PREZENT AU DEZAVANTAJUL DE A FI LIMITATE LA CÂTEVA SPECII (PCR ÎN TIMP REAL), CARE NECESITĂ O PRELUCRARE ÎNDELUNGATĂ (SECVENȚĂ, NU), NU SUNT CANTITATIVE (SECVENȚIE, MALDI-TOF), NU PERMIT DETECTAREA ÎN AMESTECURI COMPLEXE, CUM AR FI ALIMENTELE (SECVENȚIERE, MALDI-TOF), ȘI PRACTIC TOATE AU NEVOIE DE ÎNSĂMÂNȚAREA PLĂCILOR ANTERIOR. ACESTA ESTE MOTIVUL PENTRU CARE ESTE NECESAR SĂ SE PUNĂ ÎN APLICARE METODE CARE SĂ PERMITĂ DETECTAREA RAPIDĂ ȘI PRECISĂ A SPECIILOR CONTAMINANTE DIN ALIMENTE, PRECUM ȘI CUANTIFICAREA DIRECTĂ ÎNTR-O PROBĂ DE ALIMENTE. ACESTA ESTE CAZUL METODOLOGIEI PROPUSE ÎN ACEST PROIECT: DEFINIȚIA PEPTIDELOR DE MARCARE BIOLOGICĂ ALE SPECIILOR PATOGENE ȘI BIOGENE PRODUCĂTOARE DE AMINE DIN ALIMENTE ȘI PUNEREA ÎN APLICARE ULTERIOARĂ A APLICĂRII ACESTOR PEPTIDE PENTRU DETECTAREA ÎN EȘANTIOANELE ALIMENTARE. Cromatografia LIQUID ACOPLAT LA SPECTROMETRIA MASAS ÎN TANDEMUL într-un electrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) și posterior ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWARE ȘI COMPARARE CU secutii aminoacide depozitate în DATA BASES._x000D_ pentru a duce la depunerea de peptide bio-marker, este necesar să se prevadă o gamă completă de CEPAS BACTERIAAN pentru a prelua analizele. SPECIILE BACTERIENE INCLUSE ÎN STUDIU VOR INCLUDE SPECIILE CARE SUNT CEL MAI FRECVENT IZOLATE ÎN PRODUSELE ALIMENTARE, ASTFEL CUM SUNT DESCRISE ÎN LITERATURA DE SPECIALITATE, ȘI INCLUD FAMILIA ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, STAFILOCOCI COAGULAZO-POZITIVI; CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS ȘI C. BOTULINUM TYPES E ȘI B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS ȘI B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES ȘI YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP ȘI PAENIBACILLUS SPP. LABORATORUL NOSTRU DISPUNE DE O COLECTIE LARGA DE TULPINI BACTERIENE IZOLATE DIN DIVERSE ALIMENTE (CARNE, PESTE, MINIM PROCESATE SI GATA PENTRU CONSUM, LAPTE, ETC.). TOATE ACESTEA AU FOST CARACTERIZATE PRIN METODE DIFERITE, ATÂT CLASICE, CÂT ȘI GENOMICE ȘI PROTEOMICE (MALDI-TOF). Astfel de SPECIALE REALATE CU SPECTRABANK MALDI-TOF spectives ȘI GENOMIC SECUCE OF GEN 16 sunt depuse la SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), precum și în GENBANK DATA BASE (NCBI) (numai secuence of GEN 16S rRNA)._x000D_ metodologie ȘI REZULTE, acestea le vor permite să extindă SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), dezvoltate în laboratorul nostru și constituind cea mai înaltă bază internațională de date de acces (Romanian)
4 August 2022
0 references
ÖKNINGEN AV LIVSMEDELSBURNA SJUKDOMAR UNDER DE SENASTE ÅREN, MED EN SÄRSKILD UTVECKLING AV PATOGENA MIKROORGANISMER SOM LISTERIA MONOCYTOGENES, SALMONELLA SPP, CAMPYLOBACTER JEJUNI ELLER ESCHERICHIA COLI, HAR ÖKAT FARHÅGORNA OM LIVSMEDELSSÄKERHET BÅDE BLAND MYNDIGHETER OCH INOM PRODUKTIONSSEKTORN OCH BLAND KONSUMENTERNA. LIVSMEDELSPATOGENER KAN INTE HELT ELIMINERAS FRÅN ALLA LED I LIVSMEDELSKEDJAN. DESSUTOM, BEROENDE PÅ BEHANDLINGEN AV MATEN, MIKROBIOTA NÄRVARANDE KAN VARIERA. DET FINNS MÅNGA PATOGENER SOM BEARBETNINGSFÖRETAGET KAN KRÄVAS FÖR ATT ANALYSERA FÖR ATT BESTÄMMA DEN RELATIVA SÄKERHETEN HOS DIN PRODUKT. DE METODER FÖR DETEKTION OCH SNABB IDENTIFIERING SOM FÖR NÄRVARANDE TILLÄMPAS HAR NACKDELEN ATT DE ÄR BEGRÄNSADE TILL ETT FÅTAL ARTER (REALTIDSPCR), KRÄVER LÅNG BEARBETNING (SEKVENS, GÖR DET), INTE ÄR KVANTITATIVA (SEKVENSERING, MALDI-TOF), TILLÅTER INTE PÅVISANDE I KOMPLEXA BLANDNINGAR SOM LIVSMEDEL (SEKVENSERING, MALDI-TOF), OCH PRAKTISKT TAGET ALLA AV DEM BEHÖVER TIDIGARE PLATTA SÅDD. DÄRFÖR ÄR DET NÖDVÄNDIGT ATT INFÖRA METODER SOM GÖR DET MÖJLIGT ATT SNABBT OCH KORREKT UPPTÄCKA FÖRORENANDE ARTER I LIVSMEDLET SAMT ATT KVANTIFIERA DIREKT I ETT LIVSMEDELSPROV. DETTA ÄR FALLET MED DEN METOD SOM FÖRESLÅS I DETTA PROJEKT: DEFINITIONEN AV BIOMÄRKTA PEPTIDER AV PATOGENA OCH BIOGENA AMINPRODUCERANDE ARTER I LIVSMEDEL OCH DEN EFTERFÖLJANDE TILLÄMPNINGEN AV DESSA PEPTIDER FÖR DETEKTION I LIVSMEDELSPROVER. Den LIQUID cromatografi ACOPLATE TO SPECTROMETRIA OF MASAS I TANDEM I en elektrospray-TRAMPA IONICA EQUIPMENT (LC-ESI-IT-MS/MS) och bakre ANALISIS Medient DIFFERENT SOFTWARE OCH COMPARATION MED aminoacid secutions deponerade i DATA BASES._x000D_ för att leda till nedfall av biomarkörpeptider, är det nödvändigt att tillhandahålla ett komplett utbud av BACTERIAAN CEPAS för att ta över Analyserna. DE BAKTERIEARTER SOM INGÅR I STUDIEN KOMMER ATT OMFATTA DE ARTER SOM OFTAST ISOLERAS I LIVSMEDEL, SÅSOM BESKRIVS I LITTERATUREN, OCH INKLUDERAR FAMILJEN ENTEROBACTERIACEAE, SALMONELLA, SHIGELLA, PROTEUS, KOAGULASPOSITIVA STAFYLOKOCKER. CLOSTRIDIUM PERFRINGENS, L. MONOCYTOGENES, BACILLUS CEREUS OCH C. BOTULINUMTYPERNA E OCH B, BACILLUS CEREUS, B. SUBTILIS OCH B. LICHENIFORMIS, VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS, CAMPYLOBACTER SPP., CAMPYLOBACTER JEJUNI, LISTERIA MONOCYTOGENES OCH YERSINIA ENTEROCOLITICA, STAPHYLOCOCCUS AUREUS, BACILLUS SPP OCH PAENIBACILLUS SPP. VÅRT LABORATORIUM HAR EN BRED SAMLING AV BAKTERIESTAMMAR ISOLERADE FRÅN OLIKA LIVSMEDEL (KÖTT, FISK, MINIMALT BEARBETADE OCH FÄRDIGA FÖR KONSUMTION, MJÖLK, ETC.). ALLA HAR KÄNNETECKNATS AV OLIKA METODER, BÅDE KLASSISKA OCH GENOMISKA OCH PROTEOMISKA (MALDI-TOF). Sådana RELATED SPECIES MED DINA SPECIFIC MALDI-TOF-spektriv och GENOMIC SECUCE OF GEN 16 deponeras på SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG) samt i GENBANK DATA BASE (NCBI) (endast sekuence AV GEN 16S rRNA)._x000D_ metodologi och RESULTS kommer de att göra det möjligt för dem att utöka SPECTRABANK DATA BASE (WWW.SPECTRABANK.ORG), som utvecklats i vårt laboratorium och utgör den högsta internationella databasen för åtkomst (Swedish)
4 August 2022
0 references
Lugo
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
AGL2013-48244-R
0 references