ECO-EVOLUTIONARY FEEDBACK BETWEEN PLANT VIRUSES IN MIXED INFECTIONS (Q3149441)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3149441 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | ECO-EVOLUTIONARY FEEDBACK BETWEEN PLANT VIRUSES IN MIXED INFECTIONS |
Project Q3149441 in Spain |
Statements
97,477.6 Euro
0 references
121,000.0 Euro
0 references
80.56 percent
0 references
1 January 2015
0 references
31 December 2017
0 references
AGENCIA CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
0 references
30100
0 references
LOS VIRUS DE PLANTAS TIENEN EL POTENCIAL DE CAUSAR IMPORTANTES EPIDEMIAS Y AFECTAR NEGATIVAMENTE A LA PRODUCCION SOSTENIBLE DE ALIMENTOS REDUCIENDO LA CALIDAD DEL PRODUCTO Y EL RENDIMIENTO DEL CULTIVO. MAS ALLA DE LAS CIRCUNSTANCIAS EPIDEMIOLOGICAS QUE DEBEN ACONTECER PARA INICIAR UNA EPIDEMIA, TANTO LA GENETICA COMO LA ECOLOGIA TIENEN UN PAPEL CLAVE EN DETERMINAR CUANDO PUEDEN SURGIR ESTAS ENFERMEDADES VIRALES. HASTA EL MOMENTO, LOS ESTUDIOS DE DIVERSIDAD GENETICA EN VIRUS PRINCIPALMENTE SE HAN CENTRADO EN SISTEMAS DE INFECCIONES SIMPLES EN CONDICIONES EXPERIMENTALES, O EN EL SEGUIMIENTO DE UNA POBLACION DE VIRUS DURANTE EL BROTE DE UNA ENFERMEDAD VIRICA, Y ESTAS SIMPLIFICACIONES HAN PERMITIDO OBTENER INTERPRETACIONES CUALITATIVAS Y, MENOS FRECUENTEMENTE CUANTITATIVAS, SOBRE LA EVOLUCION Y ADAPTACION DE VIRUS. SIN EMBARGO, ES CONVENIENTE Y OPORTUNO ABORDAR ESTOS ESTUDIOS CON UN MAYOR NIVEL DE COMPLEJIDAD, PROXIMO A SITUACIONES REALES Y EPIDEMIOLOGICAMENTE RELEVANTES, CON LA IDEA DE TENER UN ENTENDIMIENTO MAS COMPLETO DE LOS MECANISMOS QUE OPERAN EN LA NATURALEZA. LOS ESTUDIOS EPIDEMIOLOGICOS REALIZADOS EN CULTIVOS HORTICOLAS REVELAN QUE LAS INFECCIONES VIRALES MULTIPLES SON MAS COMUNES EN LA NATURALEZA DE LO ESPERADO, Y ES PROBABLE QUE LAS INTERACCIONES ECOLOGICAS ENTRE LOS DISTINTOS VIRUS QUE INFECTAN LA MISMA PLANTA TENGAN UN PAPEL IMPORTANTE EN LA APARICION DE ENFERMEDADES EN ESCENARIOS DONDE ESTAS ENFERMEDADES NO EMERGERIAN POR LA ACTUACION INDIVIDUAL DE UN VIRUS. SIN EMBARGO, ESTO AUN ESTA POR INVESTIGAR, Y SE DESCONOCE SI EXISTE UNA MAYOR CAPACIDAD EVOLUTIVA PARA VIRUS EN AMBIENTES BIOTICOS QUE ABIOTICOS EN EL CONTEXTO DE INFECCIONES MIXTAS. ESTE PROYECTO TIENE COMO OBJETIVO GENERAL DETERMINAR EL IMPACTO DE LA COMPETENCIA ENTRE VIRUS EN LA DIVERSIFICACION GENETICA, INCLUYENDO LA RETROALIMENTACION ENTRE LA DIVERSIFICACION EVOLUTIVA DE UN VIRUS ESPECIFICO Y EL RESTO DE VIRUS QUE INFECTAN EL MISMO HUESPED. PARA ELLO, SE EXAMINARA CUANDO Y COMO LAS INFECCIONES MIXTAS SON IMPORTANTES PARA EL TOMATE, HACIENDO USO DE TRES PATOGENOS VIRALES MUY PROBLEMATICOS EN ESTE CULTIVO; EL VIRUS DEL MOSAICO DEL PEPINO DULCE (PEPMV), EL VIRUS DEL MOSAICO DEL TOMATE (TOMV) Y EL VIRUS DEL MOSAICO DEL PEPINO (CMV). LAS HIPOTESIS DEL PROYECTO SON: (I) LA DIVERSIDAD GENETICA DE UN VIRUS ESPECIFICO SE ACELERARA DEBIDO A LA PRESENCIA DE OTROS VIRUS EN LA MISMA PLANTA, ES DECIR, LA DIVERSIDAD DE PEPMV PUEDE INCREMENTARSE COMO RESULTADO DE UNA COMPETICION CON OTROS VIRUS POR OCUPAR NICHOS ESPECIFICOS. (II) CABE ENTONCES ESPERAR QUE LA EVOLUCION DEL VIRUS ESPECIFICO AFECTE A SU VEZ AL RESTO DE VIRUS EN LA MISMA PLANTA; ES DECIR, UNA MAYOR DIVERSIFICACION DE PEPMV INFLUIRA EN LA RECOLONIZACION DE NICHOS POR VIRUS ECOLOGICAMENTE SIMILARES. (III) COMO CONSECUENCIA, SI LA EFICACIA BIOLOGICA DE LOS VIRUS DEPENDE DE SU FRECUENCIA EN INFECCIONES MIXTAS, EL TIEMPO DE INICIO DE LAS DISTINTAS INFECCIONES PODRIA AFECTAR A DICHA RETROALIMENTACION. POR TANTO, LOS OBJETIVOS PROPUESTOS SON: 1) EXAMINAR COMO LAS DIFERENTES CONDICIONES BIOTICAS Y ABIOTICAS AFECTAN A LA DINAMICA EVOLUTIVA DE PEPMV. 2) DETERMINAR COMO LA DIVERSIFICACION PEPMV AFECTA A LA DINAMICA EVOLUTIVA DE OTROS VIRUS EN INFECCIONES MIXTAS. 3) EVALUAR SI EL TIEMPO DE INICIO DE LAS INFECCIONES DE PEPMV RESPECTO A OTROS VIRUS ES IMPORTANTE, E IDENTIFICAR EL POSIBLE MECANISMO RESPONSABLE DE LA COMPETENCIA ENTRE LOS VIRUS EN EL MISMO TEJIDO VEGETAL. (Spanish)
0 references
PLANT VIRUSES HAVE THE POTENTIAL TO CAUSE MAJOR EPIDEMICS AND NEGATIVELY AFFECT SUSTAINABLE FOOD PRODUCTION BY REDUCING PRODUCT QUALITY AND CROP YIELD. BEYOND THE EPIDEMIOLOGIC CIRCUMSTANCES THAT MUST OCCUR TO START AN EPIDEMIC, BOTH GENETICS AND ECOLOGY HAVE A KEY ROLE IN DETERMINING WHEN THESE VIRAL DISEASES MAY ARISE. SO FAR, GENETIC DIVERSITY STUDIES IN VIRUSES HAVE MAINLY FOCUSED ON SYSTEMS OF SIMPLE INFECTIONS UNDER EXPERIMENTAL CONDITIONS, OR ON THE MONITORING OF A VIRUS POPULATION DURING THE OUTBREAK OF A VIRAL DISEASE, AND THESE SIMPLIFICATIONS HAVE LED TO QUALITATIVE AND, LESS FREQUENTLY QUANTITATIVE, INTERPRETATIONS OF THE EVOLUTION AND ADAPTATION OF VIRUSES. HOWEVER, IT IS CONVENIENT AND TIMELY TO ADDRESS THESE STUDIES WITH A HIGHER LEVEL OF COMPLEXITY, CLOSE TO REAL SITUATIONS AND EPIDEMIOLOGICALLY RELEVANT, WITH THE IDEA OF HAVING A MORE COMPLETE UNDERSTANDING OF THE MECHANISMS THAT OPERATE IN NATURE. EPIDEMIOLOGIC STUDIES CARRIED OUT IN HORTICOLA CULTURES REVEAL THAT MULTIPLE VIRAL INFECTIONS ARE MORE COMMON IN NATURE THAN EXPECTED, AND IT IS LIKELY THAT ECOLOGICAL INTERACTIONS BETWEEN THE DIFFERENT VIRUSES THAT INFECT THE SAME PLANT HAVE AN IMPORTANT ROLE IN THE EMERGENCE OF DISEASES IN SCENARIOS WHERE THESE DISEASES DO NOT EMERGERIATE DUE TO THE INDIVIDUAL ACTION OF A VIRUS. HOWEVER, THIS IS YET TO BE INVESTIGATED, AND IT IS UNKNOWN WHETHER THERE IS A GREATER EVOLUTIONARY CAPACITY FOR VIRUSES IN BIOTIC RATHER THAN ABIOTIC ENVIRONMENTS IN THE CONTEXT OF MIXED INFECTIONS. THIS PROJECT AIMS TO DETERMINE THE IMPACT OF COMPETITION BETWEEN VIRUSES ON GENETIC DIVERSITY, INCLUDING FEEDBACK BETWEEN THE EVOLUTIONARY DIVERSIFICATION OF A SPECIFIC VIRUS AND THE REST OF THE VIRUSES THAT INFECT THE SAME HOST. TO THIS END, IT WILL BE EXAMINED WHEN AND HOW MIXED INFECTIONS ARE IMPORTANT FOR TOMATO, MAKING USE OF THREE VERY PROBLEMATIC VIRAL PATHOGENS IN THIS CROP; SWEET CUCUMBER MOSAIC VIRUS (PEPMV), TOMATO MOSAIC VIRUS (TOMV) AND CUCUMBER MOSAIC VIRUS (CMV). THE PROJECT’S HYPOTHESES ARE: (I) THE GENETIC DIVERSITY OF A SPECIFIC VIRUS WILL ACCELERATE DUE TO THE PRESENCE OF OTHER VIRUSES IN THE SAME PLANT, I.E. THE DIVERSITY OF PEPMV MAY BE INCREASED AS A RESULT OF A COMPETITION WITH OTHER VIRUSES TO OCCUPY SPECIFIC NICHES. (II) IT CAN THEN BE EXPECTED THAT THE EVOLUTION OF THE SPECIFIC VIRUS WILL IN TURN AFFECT THE REST OF THE VIRUSES IN THE SAME PLANT; THAT IS, A GREATER DIVERSIFICATION OF PEPMV WILL INFLUENCE THE RECOLONISATION OF NICHES BY ECOLOGICALLY SIMILAR VIRUSES. (III) AS A CONSEQUENCE, IF THE BIOLOGICAL EFFICACY OF THE VIRUSES DEPENDS ON THEIR FREQUENCY IN MIXED INFECTIONS, THE ONSET TIME OF THE VARIOUS INFECTIONS COULD AFFECT THIS FEEDBACK. THE PROPOSED OBJECTIVES ARE THEREFORE TO: 1) EXAMINE HOW THE DIFFERENT BIOTIC AND ABIOTIC CONDITIONS AFFECT THE EVOLUTIONARY DYNAMICS OF PEPMV. 2) DETERMINE HOW PEPMV DIVERSIFICATION AFFECTS THE EVOLUTIONARY DYNAMICS OF OTHER VIRUSES IN MIXED INFECTIONS. 3) TO EVALUATE WHETHER THE START TIME OF PEPMV INFECTIONS WITH RESPECT TO OTHER VIRUSES IS IMPORTANT, AND TO IDENTIFY THE POSSIBLE MECHANISM RESPONSIBLE FOR THE COMPETITION BETWEEN THE VIRUSES IN THE SAME PLANT TISSUE. (English)
12 October 2021
0.8972028537267676
0 references
LES VIRUS VÉGÉTAUX PEUVENT CAUSER DES ÉPIDÉMIES MAJEURES ET NUIRE À LA PRODUCTION ALIMENTAIRE DURABLE EN RÉDUISANT LA QUALITÉ DES PRODUITS ET LE RENDEMENT DES CULTURES. AU-DELÀ DES CIRCONSTANCES ÉPIDÉMIOLOGIQUES QUI DOIVENT SE PRODUIRE POUR DÉCLENCHER UNE ÉPIDÉMIE, TANT LA GÉNÉTIQUE QUE L’ÉCOLOGIE JOUENT UN RÔLE CLÉ DANS LA DÉTERMINATION DU MOMENT OÙ CES MALADIES VIRALES PEUVENT SURVENIR. JUSQU’À PRÉSENT, LES ÉTUDES SUR LA DIVERSITÉ GÉNÉTIQUE DES VIRUS ONT PRINCIPALEMENT PORTÉ SUR LES SYSTÈMES D’INFECTIONS SIMPLES DANS DES CONDITIONS EXPÉRIMENTALES, OU SUR LA SURVEILLANCE D’UNE POPULATION VIRALE PENDANT L’APPARITION D’UNE MALADIE VIRALE, ET CES SIMPLIFICATIONS ONT CONDUIT À DES INTERPRÉTATIONS QUALITATIVES ET, MOINS SOUVENT QUANTITATIVES, DE L’ÉVOLUTION ET DE L’ADAPTATION DES VIRUS. CEPENDANT, IL EST PRATIQUE ET OPPORTUN DE TRAITER CES ÉTUDES AVEC UN NIVEAU DE COMPLEXITÉ PLUS ÉLEVÉ, PROCHE DES SITUATIONS RÉELLES ET ÉPIDÉMIOLOGIQUEMENT PERTINENTE, AVEC L’IDÉE D’AVOIR UNE COMPRÉHENSION PLUS COMPLÈTE DES MÉCANISMES QUI FONCTIONNENT DANS LA NATURE. LES ÉTUDES ÉPIDÉMIOLOGIQUES MENÉES DANS LES CULTURES HORTICOLA RÉVÈLENT QUE LES INFECTIONS VIRALES MULTIPLES SONT PLUS FRÉQUENTES DANS LA NATURE QUE PRÉVU, ET IL EST PROBABLE QUE LES INTERACTIONS ÉCOLOGIQUES ENTRE LES DIFFÉRENTS VIRUS QUI INFECTENT LA MÊME PLANTE JOUENT UN RÔLE IMPORTANT DANS L’ÉMERGENCE DE MALADIES DANS DES SCÉNARIOS OÙ CES MALADIES NE SONT PAS EMERGERIATE EN RAISON DE L’ACTION INDIVIDUELLE D’UN VIRUS. CEPENDANT, CELA N’A PAS ENCORE ÉTÉ ÉTUDIÉ, ET L’ON NE SAIT PAS S’IL EXISTE UNE PLUS GRANDE CAPACITÉ D’ÉVOLUTION DES VIRUS DANS LES ENVIRONNEMENTS BIOTIQUES PLUTÔT QUE DANS LES ENVIRONNEMENTS ABIOTIQUES DANS LE CONTEXTE D’INFECTIONS MIXTES. CE PROJET VISE À DÉTERMINER L’IMPACT DE LA COMPÉTITION ENTRE LES VIRUS SUR LA DIVERSITÉ GÉNÉTIQUE, Y COMPRIS LA RÉTROACTION ENTRE LA DIVERSIFICATION ÉVOLUTIVE D’UN VIRUS SPÉCIFIQUE ET LE RESTE DES VIRUS QUI INFECTENT LE MÊME HÔTE. À CETTE FIN, IL SERA EXAMINÉ QUAND ET COMMENT LES INFECTIONS MIXTES SONT IMPORTANTES POUR LA TOMATE, EN UTILISANT TROIS PATHOGÈNES VIRAUX TRÈS PROBLÉMATIQUES DANS CETTE CULTURE; VIRUS DE LA MOSAÏQUE DU CONCOMBRE DOUX (PEPMV), VIRUS DE LA MOSAÏQUE DE TOMATES (TOMV) ET VIRUS DE LA MOSAÏQUE DU CONCOMBRE (CMV). LES HYPOTHÈSES DU PROJET SONT LES SUIVANTES: (I) LA DIVERSITÉ GÉNÉTIQUE D’UN VIRUS SPÉCIFIQUE S’ACCÉLÉRERA EN RAISON DE LA PRÉSENCE D’AUTRES VIRUS DANS LA MÊME PLANTE, I.E. LA DIVERSITÉ DU PEPMV PEUT ÊTRE AUGMENTÉE EN RAISON D’UNE COMPÉTITION AVEC D’AUTRES VIRUS POUR OCCUPER DES NICHES SPÉCIFIQUES. (II) ON PEUT ALORS S’ATTENDRE À CE QUE L’ÉVOLUTION DU VIRUS SPÉCIFIQUE AFFECTE À SON TOUR LE RESTE DES VIRUS DANS LA MÊME PLANTE; AUTREMENT DIT, UNE PLUS GRANDE DIVERSIFICATION DU PEPMV INFLUENCERA LA RECOLONISATION DES NICHES PAR DES VIRUS SEMBLABLES SUR LE PLAN ÉCOLOGIQUE. (III) PAR CONSÉQUENT, SI L’EFFICACITÉ BIOLOGIQUE DES VIRUS DÉPEND DE LEUR FRÉQUENCE DANS LES INFECTIONS MIXTES, L’HEURE D’APPARITION DES DIVERSES INFECTIONS POURRAIT INFLUER SUR CETTE RÉTROACTION. LES OBJECTIFS PROPOSÉS SONT DONC LES SUIVANTS: 1) EXAMINER COMMENT LES DIFFÉRENTES CONDITIONS BIOTIQUES ET ABIOTIQUES AFFECTENT LA DYNAMIQUE ÉVOLUTIVE DU PEPMV. 2) DÉTERMINER COMMENT LA DIVERSIFICATION DU PEPMV AFFECTE LA DYNAMIQUE ÉVOLUTIVE D’AUTRES VIRUS DANS LES INFECTIONS MIXTES. 3) D’ÉVALUER SI L’HEURE DE DÉBUT DES INFECTIONS À PEPMV PAR RAPPORT À D’AUTRES VIRUS EST IMPORTANTE ET D’IDENTIFIER LE MÉCANISME POSSIBLE RESPONSABLE DE LA COMPÉTITION ENTRE LES VIRUS DANS LE MÊME TISSU VÉGÉTAL. (French)
2 December 2021
0 references
PFLANZENVIREN HABEN DAS POTENZIAL, GROSSE EPIDEMIEN ZU VERURSACHEN UND DIE NACHHALTIGE LEBENSMITTELPRODUKTION DURCH EINE VERRINGERUNG DER PRODUKTQUALITÄT UND DES ERNTEERTRAGS NEGATIV ZU BEEINFLUSSEN. NEBEN DEN EPIDEMIOLOGISCHEN UMSTÄNDEN, DIE AUFTRETEN MÜSSEN, UM EINE EPIDEMIE ZU BEGINNEN, SPIELEN SOWOHL GENETIK ALS AUCH ÖKOLOGIE EINE SCHLÜSSELROLLE BEI DER BESTIMMUNG, WANN DIESE VIRUSKRANKHEITEN AUFTRETEN KÖNNEN. BISHER KONZENTRIERTEN SICH DIE UNTERSUCHUNGEN DER GENETISCHEN VIELFALT AN VIREN HAUPTSÄCHLICH AUF SYSTEME EINFACHER INFEKTIONEN UNTER EXPERIMENTELLEN BEDINGUNGEN ODER AUF DIE ÜBERWACHUNG EINER VIRUSPOPULATION WÄHREND DES AUSBRUCHS EINER VIRUSERKRANKUNG, UND DIESE VEREINFACHUNGEN HABEN ZU QUALITATIVEN UND WENIGER HÄUFIG QUANTITATIVEN INTERPRETATIONEN DER ENTWICKLUNG UND ANPASSUNG VON VIREN GEFÜHRT. ES IST JEDOCH ZWECKMÄSSIG UND RECHTZEITIG, DIESE STUDIEN MIT EINEM HÖHEREN MASS AN KOMPLEXITÄT, NAH AN REALEN SITUATIONEN UND EPIDEMIOLOGISCH RELEVANT ZU BEHANDELN, MIT DER IDEE, EIN VOLLSTÄNDIGERES VERSTÄNDNIS DER MECHANISMEN ZU HABEN, DIE IN DER NATUR FUNKTIONIEREN. EPIDEMIOLOGISCHE STUDIEN IN HORTICOLAKULTUREN ZEIGEN, DASS MEHRERE VIRUSINFEKTIONEN IN DER NATUR HÄUFIGER SIND ALS ERWARTET, UND ES IST WAHRSCHEINLICH, DASS ÖKOLOGISCHE WECHSELWIRKUNGEN ZWISCHEN DEN VERSCHIEDENEN VIREN, DIE DIESELBE PFLANZE INFIZIEREN, EINE WICHTIGE ROLLE BEI DER ENTSTEHUNG VON KRANKHEITEN IN SZENARIEN SPIELEN, IN DENEN DIESE KRANKHEITEN AUFGRUND DER INDIVIDUELLEN WIRKUNG EINES VIRUS NICHT EMERGERIATE. DIES IST JEDOCH NOCH NICHT ZU UNTERSUCHEN, UND ES IST NICHT BEKANNT, OB ES IM ZUSAMMENHANG MIT GEMISCHTEN INFEKTIONEN EINE GRÖSSERE EVOLUTIONÄRE KAPAZITÄT FÜR VIREN IN BIOTISCHEN UND NICHT ABIOTISCHEN UMGEBUNGEN GIBT. DIESES PROJEKT ZIELT DARAUF AB, DIE AUSWIRKUNGEN DES WETTBEWERBS ZWISCHEN VIREN AUF DIE GENETISCHE VIELFALT ZU BESTIMMEN, EINSCHLIESSLICH RÜCKMELDUNGEN ZWISCHEN DER EVOLUTIONÄREN DIVERSIFIZIERUNG EINES BESTIMMTEN VIRUS UND DEM REST DER VIREN, DIE DENSELBEN WIRT INFIZIEREN. ZU DIESEM ZWECK WIRD UNTERSUCHT WERDEN, WANN UND WIE GEMISCHTE INFEKTIONEN FÜR TOMATEN WICHTIG SIND, WOBEI DREI SEHR PROBLEMATISCHE VIRALE KRANKHEITSERREGER IN DIESER KULTUR VERWENDET WERDEN; SÜSSES GURKENMOSAIKVIRUS (PEPMV), TOMATENMOSAIKVIRUS (TOMV) UND GURKENMOSAIKVIRUS (CMV). DIE HYPOTHESEN DES PROJEKTS SIND: (I) DIE GENETISCHE VIELFALT EINES BESTIMMTEN VIRUS WIRD SICH AUFGRUND DES VORHANDENSEINS ANDERER VIREN IN DERSELBEN PFLANZE BESCHLEUNIGEN, D. H. DIE VIELFALT VON PEPMV KANN INFOLGE EINER KONKURRENZ MIT ANDEREN VIREN, UM BESTIMMTE NISCHEN ZU BESETZEN, ERHÖHT WERDEN. (II) DANN IST ZU ERWARTEN, DASS SICH DIE ENTWICKLUNG DES SPEZIFISCHEN VIRUS WIEDERUM AUF DEN REST DER VIREN IN DERSELBEN PFLANZE AUSWIRKT; DAS HEISST, EINE GRÖSSERE DIVERSIFIZIERUNG VON PEPMV WIRD DIE REKOLONISIERUNG VON NISCHEN DURCH ÖKOLOGISCH ÄHNLICHE VIREN BEEINFLUSSEN. WENN DIE BIOLOGISCHE WIRKSAMKEIT DER VIREN VON IHRER HÄUFIGKEIT BEI GEMISCHTEN INFEKTIONEN ABHÄNGT, KÖNNTE SICH DIE ANLAUFZEIT DER VERSCHIEDENEN INFEKTIONEN AUF DIESES FEEDBACK AUSWIRKEN. DIE VORGESCHLAGENEN ZIELE BESTEHEN DAHER DARIN, 1) UNTERSUCHEN, WIE DIE VERSCHIEDENEN BIOTISCHEN UND ABIOTISCHEN BEDINGUNGEN DIE EVOLUTIONÄRE DYNAMIK VON PEPMV BEEINFLUSSEN. 2) BESTIMMEN, WIE SICH DIE PEPMV-DIVERSIFIKATION AUF DIE EVOLUTIONÄRE DYNAMIK ANDERER VIREN BEI GEMISCHTEN INFEKTIONEN AUSWIRKT. 3) ZU BEWERTEN, OB DIE ANFANGSZEIT VON PEPMV-INFEKTIONEN IN BEZUG AUF ANDERE VIREN WICHTIG IST, UND UM DEN MÖGLICHEN MECHANISMUS ZU IDENTIFIZIEREN, DER FÜR DEN WETTBEWERB ZWISCHEN DEN VIREN IM SELBEN PFLANZENGEWEBE VERANTWORTLICH IST. (German)
9 December 2021
0 references
PLANTENVIRUSSEN KUNNEN GROTE EPIDEMIEËN VEROORZAKEN EN DE DUURZAME VOEDSELPRODUCTIE NEGATIEF BEÏNVLOEDEN DOOR DE PRODUCTKWALITEIT EN DE OPBRENGST VAN GEWASSEN TE VERMINDEREN. NAAST DE EPIDEMIOLOGISCHE OMSTANDIGHEDEN DIE ZICH MOETEN VOORDOEN OM EEN EPIDEMIE TE BEGINNEN, HEBBEN ZOWEL GENETICA ALS ECOLOGIE EEN SLEUTELROL BIJ HET BEPALEN WANNEER DEZE VIRALE ZIEKTEN ZICH KUNNEN VOORDOEN. TOT NU TOE WAREN ONDERZOEKEN NAAR GENETISCHE DIVERSITEIT BIJ VIRUSSEN VOORNAMELIJK GERICHT OP SYSTEMEN VAN EENVOUDIGE INFECTIES ONDER EXPERIMENTELE OMSTANDIGHEDEN, OF OP DE MONITORING VAN EEN VIRUSPOPULATIE TIJDENS HET UITBREKEN VAN EEN VIRALE ZIEKTE, EN DEZE VEREENVOUDIGINGEN HEBBEN GELEID TOT KWALITATIEVE EN, MINDER VAAK KWANTITATIEVE, INTERPRETATIES VAN DE EVOLUTIE EN AANPASSING VAN VIRUSSEN. HET IS ECHTER HANDIG EN TIJDIG OM DEZE STUDIES AAN TE PAKKEN MET EEN HOGERE COMPLEXITEIT, DICHT BIJ ECHTE SITUATIES EN EPIDEMIOLOGISCH RELEVANT, MET HET IDEE OM EEN VOLLEDIGER BEGRIP TE HEBBEN VAN DE MECHANISMEN DIE IN DE NATUUR WERKEN. EPIDEMIOLOGISCHE STUDIES UITGEVOERD IN HORTICOLACULTUREN TONEN AAN DAT MEERDERE VIRALE INFECTIES VAKER VOORKOMEN DAN VERWACHT, EN HET IS WAARSCHIJNLIJK DAT ECOLOGISCHE INTERACTIES TUSSEN DE VERSCHILLENDE VIRUSSEN DIE DEZELFDE PLANT BESMETTEN EEN BELANGRIJKE ROL SPELEN BIJ HET ONTSTAAN VAN ZIEKTEN IN SCENARIO’S WAARIN DEZE ZIEKTEN NIET EMERGERIATE ALS GEVOLG VAN DE INDIVIDUELE WERKING VAN EEN VIRUS. DIT MOET ECHTER NOG WORDEN ONDERZOCHT EN HET IS NIET BEKEND OF ER IN DE CONTEXT VAN GEMENGDE INFECTIES EEN GROTERE EVOLUTIONAIRE CAPACITEIT IS VOOR VIRUSSEN IN BIOTISCHE DAN ABIOTISCHE OMGEVINGEN. DIT PROJECT IS GERICHT OP HET BEPALEN VAN DE IMPACT VAN CONCURRENTIE TUSSEN VIRUSSEN OP DE GENETISCHE DIVERSITEIT, MET INBEGRIP VAN FEEDBACK TUSSEN DE EVOLUTIONAIRE DIVERSIFICATIE VAN EEN SPECIFIEK VIRUS EN DE REST VAN DE VIRUSSEN DIE DEZELFDE GASTHEER BESMETTEN. DAARTOE ZAL WORDEN ONDERZOCHT WANNEER EN HOE GEMENGDE INFECTIES BELANGRIJK ZIJN VOOR TOMAAT, WAARBIJ GEBRUIK WORDT GEMAAKT VAN DRIE ZEER PROBLEMATISCHE VIRALE PATHOGENEN IN DIT GEWAS; ZOETE KOMKOMMER MOZAÏEK VIRUS (PEPMV), TOMATENMOZAÏEK VIRUS (TOMV) EN KOMKOMMER MOZAÏEK VIRUS (CMV). DE HYPOTHESES VAN HET PROJECT ZIJN: (I) DE GENETISCHE DIVERSITEIT VAN EEN SPECIFIEK VIRUS ZAL VERSNELLEN ALS GEVOLG VAN DE AANWEZIGHEID VAN ANDERE VIRUSSEN IN DEZELFDE PLANT, I.E. DE DIVERSITEIT VAN PEPMV KAN WORDEN VERHOOGD ALS GEVOLG VAN EEN CONCURRENTIE MET ANDERE VIRUSSEN OM SPECIFIEKE NICHES TE BEZETTEN. (II) DAN KAN WORDEN VERWACHT DAT DE ONTWIKKELING VAN HET SPECIFIEKE VIRUS OP ZIJN BEURT DE REST VAN DE VIRUSSEN IN DEZELFDE PLANT ZAL BEÏNVLOEDEN; DAT WIL ZEGGEN, EEN GROTERE DIVERSIFICATIE VAN PEPMV ZAL DE REKOLONISATIE VAN NICHES DOOR ECOLOGISCH VERGELIJKBARE VIRUSSEN BEÏNVLOEDEN. (III) ALS GEVOLG DAARVAN, ALS DE BIOLOGISCHE WERKZAAMHEID VAN DE VIRUSSEN AFHANKELIJK IS VAN HUN FREQUENTIE BIJ GEMENGDE INFECTIES, KAN DE AANVANGSTIJD VAN DE VERSCHILLENDE INFECTIES DEZE FEEDBACK BEÏNVLOEDEN. DE VOORGESTELDE DOELSTELLINGEN ZIJN DERHALVE: 1) ONDERZOEKEN HOE DE VERSCHILLENDE BIOTISCHE EN ABIOTISCHE OMSTANDIGHEDEN DE EVOLUTIONAIRE DYNAMIEK VAN PEPMV BEÏNVLOEDEN. 2) BEPALEN HOE PEPMV-DIVERSIFICATIE DE EVOLUTIONAIRE DYNAMIEK VAN ANDERE VIRUSSEN BIJ GEMENGDE INFECTIES BEÏNVLOEDT. 3) OM TE BEOORDELEN OF DE STARTTIJD VAN PEPMV-INFECTIES MET BETREKKING TOT ANDERE VIRUSSEN BELANGRIJK IS, EN OM HET MOGELIJKE MECHANISME TE IDENTIFICEREN DAT VERANTWOORDELIJK IS VOOR DE CONCURRENTIE TUSSEN DE VIRUSSEN IN HETZELFDE PLANTENWEEFSEL. (Dutch)
17 December 2021
0 references
I VIRUS VEGETALI POSSONO CAUSARE GRAVI EPIDEMIE E INCIDERE NEGATIVAMENTE SULLA PRODUZIONE ALIMENTARE SOSTENIBILE, RIDUCENDO LA QUALITÀ DEI PRODOTTI E LA RESA DELLE COLTURE. AL DI LÀ DELLE CIRCOSTANZE EPIDEMIOLOGICHE CHE DEVONO VERIFICARSI PER INIZIARE UN'EPIDEMIA, SIA LA GENETICA CHE L'ECOLOGIA HANNO UN RUOLO CHIAVE NEL DETERMINARE QUANDO QUESTE MALATTIE VIRALI POSSONO MANIFESTARSI. FINORA, GLI STUDI DI DIVERSITÀ GENETICA SUI VIRUS SI SONO CONCENTRATI PRINCIPALMENTE SUI SISTEMI DI INFEZIONI SEMPLICI IN CONDIZIONI SPERIMENTALI, O SUL MONITORAGGIO DI UNA POPOLAZIONE VIRALE DURANTE L'INSORGENZA DI UNA MALATTIA VIRALE, E TALI SEMPLIFICAZIONI HANNO PORTATO A INTERPRETAZIONI QUALITATIVE E, MENO FREQUENTEMENTE QUANTITATIVE, DELL'EVOLUZIONE E DELL'ADATTAMENTO DEI VIRUS. TUTTAVIA, È OPPORTUNO E TEMPESTIVO AFFRONTARE QUESTI STUDI CON UN LIVELLO PIÙ ELEVATO DI COMPLESSITÀ, VICINO A SITUAZIONI REALI E EPIDEMIOLOGICAMENTE RILEVANTI, CON L'IDEA DI AVERE UNA COMPRENSIONE PIÙ COMPLETA DEI MECCANISMI CHE OPERANO IN NATURA. STUDI EPIDEMIOLOGICI CONDOTTI IN COLTURE ORTICOLA RIVELANO CHE LE INFEZIONI VIRALI MULTIPLE SONO PIÙ COMUNI DI QUANTO PREVISTO, ED È PROBABILE CHE LE INTERAZIONI ECOLOGICHE TRA I DIVERSI VIRUS CHE INFETTANO LA STESSA PIANTA ABBIANO UN RUOLO IMPORTANTE NELL'EMERGERE DI MALATTIE IN SCENARI IN CUI QUESTE MALATTIE NON EMERGONO A CAUSA DELL'AZIONE INDIVIDUALE DI UN VIRUS. TUTTAVIA, QUESTO È ANCORA DA STUDIARE, ED È SCONOSCIUTO SE VI SIA UNA MAGGIORE CAPACITÀ EVOLUTIVA PER I VIRUS IN AMBIENTI BIOTICI PIUTTOSTO CHE ABIOTICI NEL CONTESTO DI INFEZIONI MISTE. QUESTO PROGETTO MIRA A DETERMINARE L'IMPATTO DELLA CONCORRENZA TRA VIRUS SULLA DIVERSITÀ GENETICA, COMPRESO IL FEEDBACK TRA LA DIVERSIFICAZIONE EVOLUTIVA DI UN VIRUS SPECIFICO E IL RESTO DEI VIRUS CHE INFETTANO LO STESSO OSPITE. A TAL FINE, SARÀ ESAMINATO QUANDO E COME LE INFEZIONI MISTE SONO IMPORTANTI PER IL POMODORO, FACENDO USO DI TRE PATOGENI VIRALI MOLTO PROBLEMATICI IN QUESTA COLTURA; VIRUS DEL MOSAICO DEL CETRIOLO DOLCE (PEPMV), VIRUS DEL MOSAICO DEL POMODORO (TOMV) E VIRUS DEL MOSAICO DEL CETRIOLO (CMV). LE IPOTESI DEL PROGETTO SONO: (I) LA DIVERSITÀ GENETICA DI UN VIRUS SPECIFICO ACCELERERÀ A CAUSA DELLA PRESENZA DI ALTRI VIRUS NELLA STESSA PIANTA, VALE A DIRE LA DIVERSITÀ DI PEPMV PUÒ ESSERE AUMENTATA A CAUSA DI UNA CONCORRENZA CON ALTRI VIRUS PER OCCUPARE SPECIFICHE NICCHIE. II) SI PUÒ QUINDI PREVEDERE CHE L'EVOLUZIONE DEL VIRUS SPECIFICO INFLUENZI A SUA VOLTA IL RESTO DEI VIRUS NELLO STESSO IMPIANTO; CIOÈ, UNA MAGGIORE DIVERSIFICAZIONE DEL PEPMV INFLUENZERÀ LA RICOLONIZZAZIONE DELLE NICCHIE DA PARTE DI VIRUS ECOLOGICAMENTE SIMILI. (III) DI CONSEGUENZA, SE L'EFFICACIA BIOLOGICA DEI VIRUS DIPENDE DALLA LORO FREQUENZA NELLE INFEZIONI MISTE, IL TEMPO DI INSORGENZA DELLE VARIE INFEZIONI POTREBBE INFLUIRE SU QUESTO FEEDBACK. GLI OBIETTIVI PROPOSTI SONO PERTANTO I SEGUENTI: 1) ESAMINARE COME LE DIVERSE CONDIZIONI BIOTICHE E ABIOTICHE INFLUENZANO LA DINAMICA EVOLUTIVA DEL PEPMV. 2) DETERMINARE COME LA DIVERSIFICAZIONE PEPMV INFLUENZA LA DINAMICA EVOLUTIVA DI ALTRI VIRUS NELLE INFEZIONI MISTE. 3) VALUTARE SE L'ORA DI INIZIO DELLE INFEZIONI DA PEPMV RISPETTO AD ALTRI VIRUS SIA IMPORTANTE E IDENTIFICARE IL POSSIBILE MECCANISMO RESPONSABILE DELLA CONCORRENZA TRA I VIRUS NELLO STESSO TESSUTO VEGETALE. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΟΙ ΙΟΊ ΤΩΝ ΦΥΤΏΝ ΈΧΟΥΝ ΤΗ ΔΥΝΑΤΌΤΗΤΑ ΝΑ ΠΡΟΚΑΛΈΣΟΥΝ ΣΗΜΑΝΤΙΚΈΣ ΕΠΙΔΗΜΊΕΣ ΚΑΙ ΝΑ ΕΠΗΡΕΆΣΟΥΝ ΑΡΝΗΤΙΚΆ ΤΗ ΒΙΏΣΙΜΗ ΠΑΡΑΓΩΓΉ ΤΡΟΦΊΜΩΝ ΜΕΙΏΝΟΝΤΑΣ ΤΗΝ ΠΟΙΌΤΗΤΑ ΤΩΝ ΠΡΟΪΌΝΤΩΝ ΚΑΙ ΤΗΝ ΑΠΌΔΟΣΗ ΤΩΝ ΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΏΝ. ΠΈΡΑ ΑΠΌ ΤΙΣ ΕΠΙΔΗΜΙΟΛΟΓΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΠΟΥ ΠΡΈΠΕΙ ΝΑ ΣΥΜΒΟΎΝ ΓΙΑ ΝΑ ΞΕΚΙΝΉΣΕΙ ΜΙΑ ΕΠΙΔΗΜΊΑ, ΤΌΣΟ Η ΓΕΝΕΤΙΚΉ ΌΣΟ ΚΑΙ Η ΟΙΚΟΛΟΓΊΑ ΔΙΑΔΡΑΜΑΤΊΖΟΥΝ ΚΑΊΡΙΟ ΡΌΛΟ ΣΤΟΝ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΌ ΤΟΥ ΠΌΤΕ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΠΡΟΚΎΨΟΥΝ ΑΥΤΈΣ ΟΙ ΙΟΓΕΝΕΊΣ ΑΣΘΈΝΕΙΕΣ. ΜΈΧΡΙ ΣΤΙΓΜΉΣ, ΟΙ ΜΕΛΈΤΕΣ ΓΕΝΕΤΙΚΉΣ ΠΟΙΚΙΛΌΤΗΤΑΣ ΣΕ ΙΟΎΣ ΈΧΟΥΝ ΕΠΙΚΕΝΤΡΩΘΕΊ ΚΥΡΊΩΣ ΣΕ ΣΥΣΤΉΜΑΤΑ ΑΠΛΏΝ ΛΟΙΜΏΞΕΩΝ ΥΠΌ ΠΕΙΡΑΜΑΤΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ Ή ΣΤΗΝ ΠΑΡΑΚΟΛΟΎΘΗΣΗ ΕΝΌΣ ΠΛΗΘΥΣΜΟΎ ΙΏΝ ΚΑΤΆ ΤΗ ΔΙΆΡΚΕΙΑ ΤΗΣ ΕΚΔΉΛΩΣΗΣ ΙΟΓΕΝΟΎΣ ΝΌΣΟΥ, ΚΑΙ ΟΙ ΑΠΛΟΥΣΤΕΎΣΕΙΣ ΑΥΤΈΣ ΈΧΟΥΝ ΟΔΗΓΉΣΕΙ ΣΕ ΠΟΙΟΤΙΚΈΣ ΚΑΙ, ΛΙΓΌΤΕΡΟ ΣΥΧΝΆ ΠΟΣΟΤΙΚΈΣ, ΕΡΜΗΝΕΊΕΣ ΤΗΣ ΕΞΈΛΙΞΗΣ ΚΑΙ ΤΗΣ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉΣ ΤΩΝ ΙΏΝ. ΩΣΤΌΣΟ, ΕΊΝΑΙ ΒΟΛΙΚΌ ΚΑΙ ΈΓΚΑΙΡΟ ΝΑ ΑΝΤΙΜΕΤΩΠΙΣΤΟΎΝ ΟΙ ΜΕΛΈΤΕΣ ΑΥΤΈΣ ΜΕ ΥΨΗΛΌΤΕΡΟ ΕΠΊΠΕΔΟ ΠΟΛΥΠΛΟΚΌΤΗΤΑΣ, ΚΟΝΤΆ ΣΕ ΠΡΑΓΜΑΤΙΚΈΣ ΚΑΤΑΣΤΆΣΕΙΣ ΚΑΙ ΕΠΙΔΗΜΙΟΛΟΓΙΚΆ ΣΥΝΑΦΕΊΣ, ΜΕ ΤΗΝ ΙΔΈΑ ΤΗΣ ΠΛΗΡΈΣΤΕΡΗΣ ΚΑΤΑΝΌΗΣΗΣ ΤΩΝ ΜΗΧΑΝΙΣΜΏΝ ΠΟΥ ΛΕΙΤΟΥΡΓΟΎΝ ΣΤΗ ΦΎΣΗ. ΟΙ ΕΠΙΔΗΜΙΟΛΟΓΙΚΈΣ ΜΕΛΈΤΕΣ ΠΟΥ ΠΡΑΓΜΑΤΟΠΟΙΉΘΗΚΑΝ ΣΕ ΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΕΣ ΟΡΤΙΚΌΛΑΣ ΑΠΟΚΑΛΎΠΤΟΥΝ ΌΤΙ ΟΙ ΠΟΛΛΑΠΛΈΣ ΙΟΓΕΝΕΊΣ ΛΟΙΜΏΞΕΙΣ ΕΊΝΑΙ ΠΙΟ ΣΥΧΝΈΣ ΑΠΌ Ό,ΤΙ ΑΝΑΜΕΝΌΤΑΝ, ΚΑΙ ΕΊΝΑΙ ΠΙΘΑΝΌ ΟΙ ΟΙΚΟΛΟΓΙΚΈΣ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ ΜΕΤΑΞΎ ΤΩΝ ΔΙΑΦΌΡΩΝ ΙΏΝ ΠΟΥ ΜΟΛΎΝΟΥΝ ΤΟ ΊΔΙΟ ΦΥΤΌ ΝΑ ΔΙΑΔΡΑΜΑΤΊΣΟΥΝ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌ ΡΌΛΟ ΣΤΗΝ ΕΜΦΆΝΙΣΗ ΑΣΘΕΝΕΙΏΝ ΣΕ ΣΕΝΆΡΙΑ ΌΠΟΥ ΟΙ ΑΣΘΈΝΕΙΕΣ ΑΥΤΈΣ ΔΕΝ EMERGERIATE ΛΌΓΩ ΤΗΣ ΑΤΟΜΙΚΉΣ ΔΡΆΣΗΣ ΕΝΌΣ ΙΟΎ. ΩΣΤΌΣΟ, ΑΥΤΌ ΔΕΝ ΈΧΕΙ ΑΚΌΜΗ ΔΙΕΡΕΥΝΗΘΕΊ, ΚΑΙ ΕΊΝΑΙ ΆΓΝΩΣΤΟ ΚΑΤΆ ΠΌΣΟΝ ΥΠΆΡΧΕΙ ΜΕΓΑΛΎΤΕΡΗ ΕΞΕΛΙΚΤΙΚΉ ΙΚΑΝΌΤΗΤΑ ΓΙΑ ΤΟΥΣ ΙΟΎΣ ΣΕ ΒΙΟΤΙΚΆ ΚΑΙ ΌΧΙ ΑΒΙΟΤΙΚΆ ΠΕΡΙΒΆΛΛΟΝΤΑ ΣΤΟ ΠΛΑΊΣΙΟ ΤΩΝ ΜΕΙΚΤΏΝ ΛΟΙΜΏΞΕΩΝ. ΤΟ ΣΧΈΔΙΟ ΑΥΤΌ ΑΠΟΣΚΟΠΕΊ ΣΤΟΝ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΌ ΤΩΝ ΕΠΙΠΤΏΣΕΩΝ ΤΟΥ ΑΝΤΑΓΩΝΙΣΜΟΎ ΜΕΤΑΞΎ ΙΏΝ ΣΤΗ ΓΕΝΕΤΙΚΉ ΠΟΙΚΙΛΌΤΗΤΑ, ΣΥΜΠΕΡΙΛΑΜΒΑΝΟΜΈΝΗΣ ΤΗΣ ΑΝΑΤΡΟΦΟΔΌΤΗΣΗΣ ΜΕΤΑΞΎ ΤΗΣ ΕΞΕΛΙΚΤΙΚΉΣ ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΊΗΣΗΣ ΕΝΌΣ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΟΥ ΙΟΎ ΚΑΙ ΤΩΝ ΥΠΌΛΟΙΠΩΝ ΙΏΝ ΠΟΥ ΜΟΛΎΝΟΥΝ ΤΟΝ ΊΔΙΟ ΞΕΝΙΣΤΉ. ΓΙΑ ΤΟΝ ΣΚΟΠΌ ΑΥΤΌ, ΘΑ ΕΞΕΤΑΣΤΕΊ ΠΌΤΕ ΚΑΙ ΠΏΣ ΟΙ ΜΕΙΚΤΈΣ ΛΟΙΜΏΞΕΙΣ ΕΊΝΑΙ ΣΗΜΑΝΤΙΚΈΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΤΟΜΆΤΑ, ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΤΡΙΏΝ ΠΟΛΎ ΠΡΟΒΛΗΜΑΤΙΚΏΝ ΙΟΓΕΝΏΝ ΠΑΘΟΓΌΝΩΝ ΠΑΡΑΓΌΝΤΩΝ ΣΤΗ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΗ ΚΑΛΛΙΈΡΓΕΙΑ· ΙΌΣ ΤΟΥ ΜΩΣΑΪΚΟΎ ΓΛΥΚΟΎ ΑΓΓΟΥΡΙΟΎ (PEPMV), ΙΌΣ ΤΗΣ ΜΩΣΑΪ́ΚΩΣΗΣ ΤΗΣ ΤΟΜΆΤΑΣ (TOMV) ΚΑΙ ΙΌΣ ΜΩΣΑΪΚΟΎ ΑΓΓΟΥΡΙΟΎ (CMV). ΟΙ ΥΠΟΘΈΣΕΙΣ ΤΟΥ ΈΡΓΟΥ ΕΊΝΑΙ: I) Η ΓΕΝΕΤΙΚΉ ΠΟΙΚΙΛΌΤΗΤΑ ΕΝΌΣ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΟΥ ΙΟΎ ΘΑ ΕΠΙΤΑΧΥΝΘΕΊ ΛΌΓΩ ΤΗΣ ΠΑΡΟΥΣΊΑΣ ΆΛΛΩΝ ΙΏΝ ΣΤΟ ΊΔΙΟ ΦΥΤΌ, ΔΗΛΑΔΉ Η ΠΟΙΚΙΛΟΜΟΡΦΊΑ ΤΟΥ PEPMV ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΑΥΞΗΘΕΊ ΩΣ ΑΠΟΤΈΛΕΣΜΑ ΤΟΥ ΑΝΤΑΓΩΝΙΣΜΟΎ ΜΕ ΆΛΛΟΥΣ ΙΟΎΣ ΓΙΑ ΝΑ ΚΑΤΑΛΗΦΘΟΎΝ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΕΣ ΚΌΓΧΕΣ. (II) ΜΠΟΡΕΊ ΣΤΗ ΣΥΝΈΧΕΙΑ ΝΑ ΑΝΑΜΈΝΕΤΑΙ ΌΤΙ Η ΕΞΈΛΙΞΗ ΤΟΥ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΟΥ ΙΟΎ ΘΑ ΕΠΗΡΕΆΣΕΙ ΜΕ ΤΗ ΣΕΙΡΆ ΤΟΥ ΤΟΥΣ ΥΠΌΛΟΙΠΟΥΣ ΙΟΎΣ ΤΟΥ ΊΔΙΟΥ ΦΥΤΟΎ· ΔΗΛΑΔΉ, ΜΙΑ ΜΕΓΑΛΎΤΕΡΗ ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΊΗΣΗ ΤΟΥ PEPMV ΘΑ ΕΠΗΡΕΆΣΕΙ ΤΗΝ ΕΠΑΝΑΠΟΙΚΟΠΟΊΗΣΗ ΤΩΝ ΚΌΓΧΩΝ ΑΠΌ ΟΙΚΟΛΟΓΙΚΆ ΠΑΡΌΜΟΙΟΥΣ ΙΟΎΣ. (III) ΚΑΤΆ ΣΥΝΈΠΕΙΑ, ΕΆΝ Η ΒΙΟΛΟΓΙΚΉ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΙΚΌΤΗΤΑ ΤΩΝ ΙΏΝ ΕΞΑΡΤΆΤΑΙ ΑΠΌ ΤΗ ΣΥΧΝΌΤΗΤΆ ΤΟΥΣ ΣΕ ΜΕΙΚΤΈΣ ΛΟΙΜΏΞΕΙΣ, Ο ΧΡΌΝΟΣ ΈΝΑΡΞΗΣ ΤΩΝ ΔΙΑΦΌΡΩΝ ΛΟΙΜΏΞΕΩΝ ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΕΠΗΡΕΆΣΕΙ ΑΥΤΉ ΤΗΝ ΑΝΑΤΡΟΦΟΔΌΤΗΣΗ. ΩΣ ΕΚ ΤΟΎΤΟΥ, ΟΙ ΠΡΟΤΕΙΝΌΜΕΝΟΙ ΣΤΌΧΟΙ ΕΊΝΑΙ: 1) ΕΞΕΤΆΣΤΕ ΠΏΣ ΟΙ ΔΙΆΦΟΡΕΣ ΒΙΟΤΙΚΈΣ ΚΑΙ ΑΒΙΟΤΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΕΠΗΡΕΆΖΟΥΝ ΤΗΝ ΕΞΕΛΙΚΤΙΚΉ ΔΥΝΑΜΙΚΉ ΤΟΥ PEPMV. 2) ΚΑΘΟΡΊΣΤΕ ΠΏΣ Η ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΊΗΣΗ PEPMV ΕΠΗΡΕΆΖΕΙ ΤΗΝ ΕΞΕΛΙΚΤΙΚΉ ΔΥΝΑΜΙΚΉ ΆΛΛΩΝ ΙΏΝ ΣΕ ΜΕΙΚΤΈΣ ΛΟΙΜΏΞΕΙΣ. 3) ΝΑ ΑΞΙΟΛΟΓΗΘΕΊ ΚΑΤΆ ΠΌΣΟΝ ΕΊΝΑΙ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌΣ Ο ΧΡΌΝΟΣ ΈΝΑΡΞΗΣ ΤΩΝ ΛΟΙΜΏΞΕΩΝ ΑΠΌ PEPMV ΣΕ ΣΧΈΣΗ ΜΕ ΆΛΛΟΥΣ ΙΟΎΣ ΚΑΙ ΝΑ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΤΕΊ Ο ΠΙΘΑΝΌΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΌΣ ΠΟΥ ΕΊΝΑΙ ΥΠΕΎΘΥΝΟΣ ΓΙΑ ΤΟΝ ΑΝΤΑΓΩΝΙΣΜΌ ΜΕΤΑΞΎ ΤΩΝ ΙΏΝ ΣΤΟΝ ΊΔΙΟ ΙΣΤΌ ΤΩΝ ΦΥΤΏΝ. (Greek)
17 August 2022
0 references
PLANTEVIRA HAR POTENTIALE TIL AT FORÅRSAGE STØRRE EPIDEMIER OG INDVIRKE NEGATIVT PÅ BÆREDYGTIG FØDEVAREPRODUKTION VED AT REDUCERE PRODUKTKVALITETEN OG AFGRØDEUDBYTTET. UD OVER DE EPIDEMIOLOGISKE OMSTÆNDIGHEDER, DER SKAL OPSTÅ FOR AT STARTE EN EPIDEMI, SPILLER BÅDE GENETIK OG ØKOLOGI EN CENTRAL ROLLE MED HENSYN TIL AT AFGØRE, HVORNÅR DISSE VIRUSSYGDOMME KAN OPSTÅ. INDTIL VIDERE HAR UNDERSØGELSER AF GENETISK DIVERSITET I VIRUS HOVEDSAGELIG FOKUSERET PÅ SYSTEMER MED SIMPLE INFEKTIONER UNDER FORSØGSBETINGELSER ELLER PÅ OVERVÅGNING AF EN VIRUSPOPULATION UNDER UDBRUDDET AF EN VIRUSSYGDOM, OG DISSE FORENKLINGER HAR FØRT TIL KVALITATIVE OG MINDRE KVANTITATIVE FORTOLKNINGER AF UDVIKLINGEN OG TILPASNINGEN AF VIRUS. DET ER IMIDLERTID HENSIGTSMÆSSIGT OG RETTIDIGT AT BEHANDLE DISSE UNDERSØGELSER MED EN HØJERE GRAD AF KOMPLEKSITET, TÆT PÅ REELLE SITUATIONER OG EPIDEMIOLOGISK RELEVANT, MED TANKEN OM AT HAVE EN MERE FULDSTÆNDIG FORSTÅELSE AF DE MEKANISMER, DER FUNGERER I NATUREN. EPIDEMIOLOGISKE UNDERSØGELSER UDFØRT I HORTICOLAKULTURER VISER, AT FLERE VIRUSINFEKTIONER ER MERE ALMINDELIGE END FORVENTET, OG DET ER SANDSYNLIGT, AT ØKOLOGISKE INTERAKTIONER MELLEM DE FORSKELLIGE VIRA, DER INFICERER DEN SAMME PLANTE, SPILLER EN VIGTIG ROLLE I FREMKOMSTEN AF SYGDOMME I SCENARIER, HVOR DISSE SYGDOMME IKKE ER EMERGERIATE PÅ GRUND AF EN VIRUSS INDIVIDUELLE VIRKNING. DETTE ER IMIDLERTID ENDNU IKKE UNDERSØGT, OG DET VIDES IKKE, OM DER ER EN STØRRE EVOLUTIONÆR KAPACITET FOR VIRA I BIOTISKE SNARERE END ABIOTISKE MILJØER I FORBINDELSE MED BLANDEDE INFEKTIONER. DETTE PROJEKT HAR TIL FORMÅL AT BESTEMME VIRKNINGEN AF KONKURRENCEN MELLEM VIRUS PÅ DEN GENETISKE MANGFOLDIGHED, HERUNDER FEEDBACK MELLEM DEN EVOLUTIONÆRE DIVERSIFICERING AF ET SPECIFIKT VIRUS OG RESTEN AF DE VIRA, DER INFICERER DEN SAMME VÆRT. MED HENBLIK HERPÅ VIL DET BLIVE UNDERSØGT, HVORNÅR OG HVORDAN BLANDEDE INFEKTIONER ER VIGTIGE FOR TOMAT, IDET DER GØRES BRUG AF TRE MEGET PROBLEMATISKE VIRALE PATOGENER I DENNE AFGRØDE; SØD AGURKMOSAIKVIRUS (PEPMV), TOMATMOSAIKVIRUS (TOMV) OG AGURKMOSAIKVIRUS (CMV). PROJEKTETS HYPOTESER ER: I) DEN GENETISKE MANGFOLDIGHED AF ET BESTEMT VIRUS VIL ACCELERERE PÅ GRUND AF TILSTEDEVÆRELSEN AF ANDRE VIRA I SAMME PLANTE, DVS. AT PEPMV'S MANGFOLDIGHED KAN ØGES SOM FØLGE AF EN KONKURRENCE MED ANDRE VIRA OM AT BESÆTTE BESTEMTE NICHER. DET KAN SÅ FORVENTES, AT UDVIKLINGEN AF DET SPECIFIKKE VIRUS IGEN VIL PÅVIRKE RESTEN AF VIRUSSET I SAMME PLANTE; DET VIL SIGE, AT EN STØRRE DIVERSIFICERING AF PEPMV VIL PÅVIRKE GENKOLONISERINGEN AF NICHER VED ØKOLOGISK LIGNENDE VIRA. HVIS VIRUSSERNES BIOLOGISKE VIRKNING AFHÆNGER AF DERES HYPPIGHED VED BLANDEDE INFEKTIONER, KAN STARTTIDSPUNKTET FOR DE FORSKELLIGE INFEKTIONER PÅVIRKE DENNE FEEDBACK. DE FORESLÅEDE MÅL ER DERFOR AT: 1) UNDERSØGE, HVORDAN DE FORSKELLIGE BIOTISKE OG ABIOTISKE BETINGELSER PÅVIRKER DEN EVOLUTIONÆRE DYNAMIK AF PEPMV. 2) BESTEMME, HVORDAN PEPMV-DIVERSIFICERING PÅVIRKER DEN EVOLUTIONÆRE DYNAMIK AF ANDRE VIRA I BLANDEDE INFEKTIONER. 3) AT VURDERE, OM STARTTIDSPUNKTET FOR PEPMV-INFEKTIONER MED HENSYN TIL ANDRE VIRA ER VIGTIGT, OG AT IDENTIFICERE DEN MULIGE MEKANISME, DER ER ANSVARLIG FOR KONKURRENCEN MELLEM VIRUS I SAMME PLANTEVÆV. (Danish)
17 August 2022
0 references
KASVIVIRUKSET VOIVAT AIHEUTTAA MERKITTÄVIÄ EPIDEMIOITA JA VAIKUTTAA KIELTEISESTI KESTÄVÄÄN ELINTARVIKETUOTANTOON, KOSKA NE HEIKENTÄVÄT TUOTTEIDEN LAATUA JA SATOA. EPIDEMIOLOGISTEN OLOSUHTEIDEN LISÄKSI, JOITA EPIDEMIAN ALOITTAMINEN EDELLYTTÄÄ, SEKÄ GENETIIKKA ETTÄ EKOLOGIA OVAT KESKEISESSÄ ASEMASSA MÄÄRITELTÄESSÄ, MILLOIN NÄITÄ VIRUSSAIRAUKSIA VOI ESIINTYÄ. TÄHÄN MENNESSÄ VIRUSTEN GENEETTISTÄ MONIMUOTOISUUTTA KOSKEVISSA TUTKIMUKSISSA ON KESKITYTTY LÄHINNÄ YKSINKERTAISTEN INFEKTIOIDEN JÄRJESTELMIIN KOKEELLISISSA OLOSUHTEISSA TAI VIRUSKANNAN SEURANTAAN VIRUSTAUDIN PUHKEAMISEN AIKANA, JA NÄMÄ YKSINKERTAISTUKSET OVAT JOHTANEET LAADULLISIIN JA HARVEMMIN KVANTITATIIVISIIN TULKINTOIHIN VIRUSTEN KEHITTYMISESTÄ JA SOPEUTUMISESTA. ON KUITENKIN KÄTEVÄÄ JA OIKEA-AIKAISTA KÄSITELLÄ NÄITÄ TUTKIMUKSIA ENTISTÄ MONIMUTKAISEMMIN, LÄHES TODELLISISSA TILANTEISSA JA EPIDEMIOLOGISESTI MERKITYKSELLISELLÄ TAVALLA, JA AJATUKSENA ON SAADA KATTAVAMPI KÄSITYS LUONTEELTAAN TOIMIVISTA MEKANISMEISTA. HORTIKOLAVILJELMISSÄ TEHDYT EPIDEMIOLOGISET TUTKIMUKSET OSOITTAVAT, ETTÄ USEAT VIRUSINFEKTIOT OVAT LUONTEELTAAN ODOTETTUA YLEISEMPIÄ, JA ON TODENNÄKÖISTÄ, ETTÄ SAMAAN KASVIIN TARTTUVIEN ERI VIRUSTEN VÄLINEN EKOLOGINEN VUOROVAIKUTUS ON TÄRKEÄSSÄ ASEMASSA TAUTIEN SYNTYMISESSÄ TILANTEISSA, JOISSA NÄMÄ SAIRAUDET EIVÄT EMERGERIATE VIRUKSEN YKSITTÄISEN VAIKUTUKSEN VUOKSI. TÄTÄ ON KUITENKIN VIELÄ TUTKITTAVA, EIKÄ TIEDETÄ, ONKO VIRUSTEN EVOLUUTIOKYKY SUUREMPI BIOOTTISISSA YMPÄRISTÖISSÄ KUIN ABIOOTTISISSA YMPÄRISTÖISSÄ SEKAINFEKTIOIDEN YHTEYDESSÄ. HANKKEEN TAVOITTEENA ON MÄÄRITTÄÄ VIRUSTEN VÄLISEN KILPAILUN VAIKUTUS GENEETTISEEN MONIMUOTOISUUTEEN, MUKAAN LUKIEN PALAUTE TIETYN VIRUKSEN EVOLUUTION MONIPUOLISTAMISEN JA MUIDEN SAMAAN ISÄNTÄÄN TARTTUVIEN VIRUSTEN VÄLILLÄ. TÄTÄ VARTEN TUTKITAAN, MILLOIN JA MITEN SEKOITETUT INFEKTIOT OVAT TÄRKEITÄ TOMAATILLE KÄYTTÄMÄLLÄ KOLMEA ERITTÄIN ONGELMALLISTA VIRUSPATOGEENIA TÄSSÄ VILJELYKASVISSA; MAKEAN KURKUN MOSAIIKKIVIRUS (PEPMV), TOMAATIN MOSAIIKKIVIRUS (TOMV) JA KURKKUMOSAIIKKIVIRUS (CMV). HANKKEEN OLETUKSET OVAT SEURAAVAT: I) TIETYN VIRUKSEN GENEETTINEN MONIMUOTOISUUS KIIHTYY, KOSKA SAMASSA KASVISSA ESIINTYY MUITA VIRUKSIA, ELI PEPMV:N MONIMUOTOISUUS VOI KASVAA, KOSKA MUIDEN VIRUSTEN KANSSA KÄYDÄÄN KILPAILUA TIETTYJEN MARKKINARAKOJEN MIEHITTÄMISEKSI. II) TÄLLÖIN VOIDAAN OLETTAA, ETTÄ TIETYN VIRUKSEN KEHITTYMINEN PUOLESTAAN VAIKUTTAA SAMAN KASVIN MUIHIN VIRUKSIIN; TOISIN SANOEN PEPMV:N LAAJEMPI MONIPUOLISTAMINEN VAIKUTTAA MARKKINARAKOJEN UUDELLEENOLON LISÄÄMISEEN EKOLOGISESTI SAMANKALTAISILLA VIRUKSILLA. TÄMÄN SEURAUKSENA, JOS VIRUSTEN BIOLOGINEN TEHO RIIPPUU NIIDEN ESIINTYMISTIHEYDESTÄ SEKAINFEKTIOISSA, ERI INFEKTIOIDEN ALKAMISAIKA VOI VAIKUTTAA TÄHÄN PALAUTTEESEEN. EHDOTETUT TAVOITTEET OVAT NÄIN OLLEN SEURAAVAT: 1) TUTKIA, MITEN ERILAISET BIOOTTISET JA ABIOOTTISET OLOSUHTEET VAIKUTTAVAT PEPMV: N EVOLUUTIODYNAMIIKKAAN. 2) MÄÄRITÄ, MITEN PEPMV: N MONIPUOLISTAMINEN VAIKUTTAA MUIDEN VIRUSTEN EVOLUUTIODYNAMIIKKAAN SEKAINFEKTIOISSA. 3) ARVIOIDA, ONKO PEPMV-INFEKTIOIDEN ALKAMISAIKA SUHTEESSA MUIHIN VIRUKSIIN TÄRKEÄÄ, JA MÄÄRITTÄÄ MAHDOLLINEN MEKANISMI, JOKA ON VASTUUSSA SAMASSA KASVIKUDOKSESSA OLEVIEN VIRUSTEN VÄLISESTÄ KILPAILUSTA. (Finnish)
17 August 2022
0 references
IL-VIRUSES TAL-PJANTI GĦANDHOM IL-POTENZJAL LI JIKKAWŻAW EPIDEMIJI KBAR U JAFFETTWAW B’MOD NEGATTIV IL-PRODUZZJONI SOSTENIBBLI TAL-IKEL BILLI JNAQQSU L-KWALITÀ TAL-PRODOTT U R-RENDIMENT TAL-GĦELEJJEL. LIL HINN MIĊ-ĊIRKOSTANZI EPIDEMJOLOĠIĊI LI JRIDU JSEĦĦU BIEX TINBEDA EPIDEMIJA, KEMM IL-ĠENETIKA KIF UKOLL L-EKOLOĠIJA GĦANDHOM RWOL EWLIENI FID-DETERMINAZZJONI TA’ META DAN IL-MARD VIRALI JISTA’ JINQALA’. S’ISSA, L-ISTUDJI DWAR ID-DIVERSITÀ ĠENETIKA FIL-VIRUSIJIET IFFUKAW PRINĊIPALMENT FUQ SISTEMI TA’ INFEZZJONIJIET SEMPLIĊI TAĦT KUNDIZZJONIJIET SPERIMENTALI, JEW FUQ IL-MONITORAĠĠ TA’ POPOLAZZJONI TAL-VIRUS MATUL IT-TIFQIGĦA TA’ MARDA VIRALI, U DAWN IS-SIMPLIFIKAZZJONIJIET WASSLU GĦAL INTERPRETAZZJONIJIET KWALITATTIVI U, INQAS TA’ SPISS KWANTITATTIVI, TAL-EVOLUZZJONI U L-ADATTAMENT TAL-VIRUSES. MADANKOLLU, HUWA KONVENJENTI U F’WAQTU LI DAWN L-ISTUDJI JIĠU INDIRIZZATI B’LIVELL OGĦLA TA’ KUMPLESSITÀ, QRIB SITWAZZJONIJIET REALI U EPIDEMJOLOĠIKAMENT RILEVANTI, BL-IDEA LI JKUN HEMM FEHIM AKTAR KOMPLET TAL-MEKKANIŻMI LI JOPERAW FIN-NATURA. STUDJI EPIDEMJOLOĠIĊI MWETTQA F’KULTURI TA’ HORTICOLA JURU LI INFEZZJONIJIET VIRALI MULTIPLI HUMA AKTAR KOMUNI FIN-NATURA MILLI MISTENNI, U HUWA PROBABBLI LI L-INTERAZZJONIJIET EKOLOĠIĊI BEJN IL-VIRUSES DIFFERENTI LI JINFETTAW L-ISTESS PJANTA GĦANDHOM RWOL IMPORTANTI FIT-TFAĊĊAR TA’ MARD F’XENARJI FEJN DAN IL-MARD MA JKUNX EMERGERIATE MINĦABBA L-AZZJONI INDIVIDWALI TA’ VIRUS. MADANKOLLU, DAN GĦAD IRID JIĠI INVESTIGAT, U MHUX MAGĦRUF JEKK HEMMX KAPAĊITÀ EVOLUZZJONARJA AKBAR GĦALL-VIRUSES F’AMBJENTI BIJOTIĊI AKTAR MILLI ABIJOTIĊI FIL-KUNTEST TA’ INFEZZJONIJIET IMĦALLTA. DAN IL-PROĠETT GĦANDU L-GĦAN LI JIDDETERMINA L-IMPATT TAL-KOMPETIZZJONI BEJN IL-VIRUSES FUQ ID-DIVERSITÀ ĠENETIKA, INKLUŻ IR-RISPONS BEJN ID-DIVERSIFIKAZZJONI EVOLUZZJONARJA TA’ VIRUS SPEĊIFIKU U L-BQIJA TAL-VIRUSES LI JINFETTAW L-ISTESS OSPITANTI. GĦAL DAN IL-GĦAN, SE JIĠI EŻAMINAT META U KIF INFEZZJONIJIET IMĦALLTA HUMA IMPORTANTI GĦAT-TADAM, BL-UŻU TA’ TLIET PATOĠENI VIRALI PROBLEMATIĊI ĦAFNA F’DAN IL-WIĊĊ TAR-RABA’; IL-VIRUS TAL-MUŻAJK TAL-ĦJAR ĦELU (PEPMV), IL-VIRUS TAT-TADAM MUŻAJK (TOMV) U L-VIRUS TAL-MUŻAJK TAL-ĦJAR (CMV). L-IPOTEŻIJIET TAL-PROĠETT HUMA: (I) ID-DIVERSITÀ ĠENETIKA TA’ VIRUS SPEĊIFIKU SE TAĊĊELLERA MINĦABBA L-PREŻENZA TA’ VIRUSIS OĦRA FL-ISTESS IMPJANT, JIĠIFIERI D-DIVERSITÀ TA’ PEPMV TISTA’ TIŻDIED BĦALA RIŻULTAT TA’ KOMPETIZZJONI MA’ VIRUSES OĦRA BIEX JOKKUPAW NIĊEĊ SPEĊIFIĊI. (II) IMBAGĦAD JISTA’ JKUN MISTENNI LI L-EVOLUZZJONI TAL-VIRUS SPEĊIFIKU MIN-NAĦA TAGĦHA TAFFETTWA L-BQIJA TAL-VAJRUSIS FL-ISTESS IMPJANT; JIĠIFIERI, DIVERSIFIKAZZJONI AKBAR TA’ PEPMV SE TINFLUWENZA L-KOLONIZZAZZJONI MILL-ĠDID TA’ NIĊEĊ PERMEZZ TA’ VIRUSIJIET EKOLOĠIKAMENT SIMILI. (III) BĦALA KONSEGWENZA, JEKK L-EFFIKAĊJA BIJOLOĠIKA TAL-VIRUSIJIET TIDDEPENDI FUQ IL-FREKWENZA TAGĦHOM F’INFEZZJONIJIET IMĦALLTA, IL-ĦIN BIEX JIBDEW L-INFEZZJONIJIET VARJI JISTA’ JAFFETTWA DAN IR-RISPONS. L-GĦANIJIET PROPOSTI HUMA GĦALHEKK LI: 1) TEŻAMINA KIF IL-KUNDIZZJONIJIET BIJOTIĊI U ABIJOTIĊI DIFFERENTI JAFFETTWAW ID-DINAMIKA EVOLUZZJONARJA TA ‘PEPMV. 2) JIDDETERMINAW KIF ID-DIVERSIFIKAZZJONI PEPMV TAFFETTWA D-DINAMIKA EVOLUZZJONARJA TA ‘VIRUSES OĦRA F’INFEZZJONIJIET IMĦALLTA. 3) BIEX JIĠI EVALWAT JEKK IL-ĦIN TAL-BIDU TAL-INFEZZJONIJIET TAL-PEPMV FIR-RIGWARD TA’ VIRUSES OĦRA HUWIEX IMPORTANTI, U BIEX JIĠI IDENTIFIKAT IL-MEKKANIŻMU POSSIBBLI RESPONSABBLI GĦALL-KOMPETIZZJONI BEJN IL-VIRUSES FL-ISTESS TESSUT TAL-PJANTI. (Maltese)
17 August 2022
0 references
AUGU VĪRUSI VAR IZRAISĪT LIELAS EPIDĒMIJAS UN NEGATĪVI IETEKMĒT ILGTSPĒJĪGU PĀRTIKAS RAŽOŠANU, SAMAZINOT PRODUKTU KVALITĀTI UN RAŽU. PAPILDUS EPIDEMIOLOĢISKAJIEM APSTĀKĻIEM, KAS RODAS, LAI SĀKTU EPIDĒMIJU, GAN ĢENĒTIKAI, GAN EKOLOĢIJAI IR GALVENĀ LOMA, NOSAKOT, KAD ŠĪS VĪRUSU SLIMĪBAS VAR RASTIES. LĪDZ ŠIM ĢENĒTISKĀS DAUDZVEIDĪBAS PĒTĪJUMI AR VĪRUSIEM GALVENOKĀRT IR VĒRSTI UZ VIENKĀRŠU INFEKCIJU SISTĒMĀM EKSPERIMENTĀLOS APSTĀKĻOS VAI UZ VĪRUSU POPULĀCIJAS UZRAUDZĪBU VĪRUSU SLIMĪBAS UZLIESMOJUMA LAIKĀ, UN ŠIE VIENKĀRŠOJUMI IR ĻĀVUŠI KVALITATĪVI UN RETĀK KVANTITATĪVI INTERPRETĒT VĪRUSU ATTĪSTĪBU UN PIELĀGOŠANU. TOMĒR IR ĒRTI UN SAVLAICĪGI PIEVĒRSTIES ŠIEM PĒTĪJUMIEM AR AUGSTĀKU SAREŽĢĪTĪBAS PAKĀPI, TUVU REĀLĀM SITUĀCIJĀM UN EPIDEMIOLOĢISKI SVARĪGIEM, AR IDEJU PAR PILNĪGĀKU IZPRATNI PAR MEHĀNISMIEM, KAS DARBOJAS DABĀ. EPIDEMIOLOĢISKIE PĒTĪJUMI, KAS VEIKTI AR HORTICOLA KULTŪRĀM, LIECINA, KA VAIRĀKU VĪRUSU INFEKCIJAS DABĀ IR BIEŽĀK SASTOPAMAS, NEKĀ GAIDĪTS, UN IR IESPĒJAMS, KA EKOLOĢISKAJAI MIJIEDARBĪBAI STARP DAŽĀDIEM VĪRUSIEM, KAS INFICĒ VIENU UN TO PAŠU AUGU, IR NOZĪMĪGA LOMA SLIMĪBU PARĀDĪŠANĀ SCENĀRIJOS, KAD ŠĪS SLIMĪBAS NAV EMERGERIATE VĪRUSA INDIVIDUĀLĀS IEDARBĪBAS DĒĻ. TOMĒR TAS VĒL IR JĀIZPĒTA, UN NAV ZINĀMS, VAI JAUKTU INFEKCIJU KONTEKSTĀ VĪRUSIEM IR LIELĀKA EVOLŪCIJAS SPĒJA BIOTISKĀ, NEVIS ABIOTISKĀ VIDĒ. ŠĀ PROJEKTA MĒRĶIS IR NOTEIKT VĪRUSU KONKURENCES IETEKMI UZ ĢENĒTISKO DAUDZVEIDĪBU, TOSTARP ATGRIEZENISKO SAITI STARP KONKRĒTA VĪRUSA EVOLŪCIJAS DIVERSIFIKĀCIJU UN PĀRĒJIEM VĪRUSIEM, KAS INFICĒ TO PAŠU SAIMNIEKORGANISMU. ŠAJĀ NOLŪKĀ TIKS PĀRBAUDĪTS, KAD UN KĀ JAUKTAS INFEKCIJAS IR SVARĪGAS TOMĀTIEM, IZMANTOJOT TRĪS ĻOTI PROBLEMĀTISKUS VĪRUSU PATOGĒNUS ŠAJĀ KULTŪRĀ; SALDO GURĶU MOZAĪKAS VĪRUSS (PEPMV), TOMĀTU MOZAĪKAS VĪRUSS (TOMV) UN GURĶU MOZAĪKAS VĪRUSS (CMV). PROJEKTA HIPOTĒZES IR ŠĀDAS: I) KONKRĒTA VĪRUSA ĢENĒTISKĀ DAUDZVEIDĪBA PAĀTRINĀSIES CITU VĪRUSU KLĀTBŪTNES DĒĻ TAJĀ PAŠĀ AUGĀ, T.I., PEPMV DAUDZVEIDĪBU VAR PALIELINĀT, KONKURĒJOT AR CITIEM VĪRUSIEM, LAI IEŅEMTU KONKRĒTAS NIŠAS. (II) TAD VAR SAGAIDĪT, KA KONKRĒTĀ VĪRUSA ATTĪSTĪBA SAVUKĀRT IETEKMĒS PĀRĒJOS VĪRUSUS TAJĀ PAŠĀ AUGĀ; TAS NOZĪMĒ, KA LIELĀKA PEPMV DIVERSIFIKĀCIJA IETEKMĒS NIŠU REKOLONIZĀCIJU AR EKOLOĢISKI LĪDZĪGIEM VĪRUSIEM. (III) TĀ REZULTĀTĀ, JA VĪRUSU BIOLOĢISKĀ EFEKTIVITĀTE IR ATKARĪGA NO TO BIEŽUMA JAUKTU INFEKCIJU GADĪJUMĀ, DAŽĀDU INFEKCIJU RAŠANĀS LAIKS VAR IETEKMĒT ŠO ATGRIEZENISKO SAITI. TĀPĒC IEROSINĀTIE MĒRĶI IR ŠĀDI: 1) IZPĒTĪT, KĀ DAŽĀDI BIOTISKIE UN ABIOTISKI APSTĀKĻI IETEKMĒ PEPMV EVOLŪCIJAS DINAMIKU. 2) NOTEIKT, KĀ PEPMV DAŽĀDOŠANA IETEKMĒ CITU VĪRUSU EVOLŪCIJAS DINAMIKU JAUKTU INFEKCIJU GADĪJUMĀ. 3) NOVĒRTĒT, VAI PEPMV INFEKCIJU SĀKUMA LAIKS ATTIECĪBĀ PRET CITIEM VĪRUSIEM IR SVARĪGS, UN NOTEIKT IESPĒJAMO MEHĀNISMU, KAS ATBILD PAR KONKURENCI STARP VĪRUSIEM VIENĀ AUGU AUDOS. (Latvian)
17 August 2022
0 references
RASTLINNÉ VÍRUSY MÔŽU SPÔSOBIŤ VEĽKÉ EPIDÉMIE A NEGATÍVNE OVPLYVNIŤ UDRŽATEĽNÚ VÝROBU POTRAVÍN ZNÍŽENÍM KVALITY VÝROBKOV A ÚRODY PLODÍN. OKREM EPIDEMIOLOGICKÝCH OKOLNOSTÍ, KTORÉ MUSIA NASTAŤ, ABY SA ZAČALA EPIDÉMIA, GENETIKA AJ EKOLÓGIA ZOHRÁVAJÚ KĽÚČOVÚ ÚLOHU PRI URČOVANÍ TOHO, KEDY MÔŽU VZNIKNÚŤ TIETO VÍRUSOVÉ OCHORENIA. ŠTÚDIE GENETICKEJ ROZMANITOSTI VÍRUSOV SA DOTERAZ ZAMERIAVALI NAJMÄ NA SYSTÉMY JEDNODUCHÝCH INFEKCIÍ V EXPERIMENTÁLNYCH PODMIENKACH ALEBO NA MONITOROVANIE POPULÁCIE VÍRUSU POČAS VYPUKNUTIA VÍRUSOVEJ CHOROBY A TIETO ZJEDNODUŠENIA VIEDLI KU KVALITATÍVNYM A MENEJ ČASTO KVANTITATÍVNYM INTERPRETÁCIÁM VÝVOJA A ADAPTÁCIE VÍRUSOV. JE VŠAK VHODNÉ A VČAS RIEŠIŤ TIETO ŠTÚDIE S VYŠŠOU ÚROVŇOU ZLOŽITOSTI, KTORÁ JE BLÍZKA SKUTOČNÝM SITUÁCIÁM A EPIDEMIOLOGICKY RELEVANTNÁ, S MYŠLIENKOU ÚPLNEJŠIE POCHOPIŤ MECHANIZMY, KTORÉ FUNGUJÚ V PRÍRODE. EPIDEMIOLOGICKÉ ŠTÚDIE VYKONANÉ NA KULTÚRACH HORTICOLY UKAZUJÚ, ŽE MNOHONÁSOBNÉ VÍRUSOVÉ INFEKCIE SÚ V PRÍRODE BEŽNEJŠIE, AKO SA OČAKÁVALO, A JE PRAVDEPODOBNÉ, ŽE EKOLOGICKÉ INTERAKCIE MEDZI RÔZNYMI VÍRUSMI, KTORÉ INFIKUJÚ TÚ ISTÚ RASTLINU, ZOHRÁVAJÚ DÔLEŽITÚ ÚLOHU PRI VÝSKYTE CHORÔB V SCENÁROCH, KEĎ TIETO OCHORENIA NIE SÚ EMERGERIATE V DÔSLEDKU INDIVIDUÁLNEHO PÔSOBENIA VÍRUSU. TOTO SA VŠAK EŠTE MUSÍ PRESKÚMAŤ A NIE JE ZNÁME, ČI EXISTUJE VÄČŠIA EVOLUČNÁ SCHOPNOSŤ VÍRUSOV V BIOTICKOM NEŽ ABIOTICKOM PROSTREDÍ V KONTEXTE ZMIEŠANÝCH INFEKCIÍ. CIEĽOM TOHTO PROJEKTU JE URČIŤ VPLYV HOSPODÁRSKEJ SÚŤAŽE MEDZI VÍRUSMI NA GENETICKÚ ROZMANITOSŤ VRÁTANE SPÄTNEJ VÄZBY MEDZI EVOLUČNOU DIVERZIFIKÁCIOU KONKRÉTNEHO VÍRUSU A ZVYŠKOM VÍRUSOV, KTORÉ INFIKUJÚ TOHO ISTÉHO HOSTITEĽA. NA TENTO ÚČEL SA PRESKÚMA, KEDY A AKO SÚ ZMIEŠANÉ INFEKCIE DÔLEŽITÉ PRE PARADAJKY, S VYUŽITÍM TROCH VEĽMI PROBLEMATICKÝCH VÍRUSOVÝCH PATOGÉNOV V TEJTO PLODINE; VÍRUS MOZAIKY SLADKEJ UHORKY (PEPMV), VÍRUS MOZAIKY RAJČIAKOV (TOMV) A VÍRUS MOZAIKY UHORKY (CMV). PREDPOKLADMI PROJEKTU SÚ: I) GENETICKÁ ROZMANITOSŤ ŠPECIFICKÉHO VÍRUSU SA ZRÝCHĽUJE V DÔSLEDKU PRÍTOMNOSTI INÝCH VÍRUSOV V TEJ ISTEJ RASTLINE, T. J. ROZMANITOSŤ PEPMV SA MÔŽE ZVÝŠIŤ V DÔSLEDKU SÚŤAŽE S INÝMI VÍRUSMI S CIEĽOM OBSADIŤ ŠPECIFICKÉ VÝKLENKY. (II) POTOM MOŽNO OČAKÁVAŤ, ŽE VÝVOJ ŠPECIFICKÉHO VÍRUSU ZAS OVPLYVNÍ ZVYŠOK VÍRUSOV V TEJ ISTEJ RASTLINE; TO ZNAMENÁ, ŽE VÄČŠIA DIVERZIFIKÁCIA PEPMV OVPLYVNÍ REKOLONIZÁCIU VÝKLENKOV EKOLOGICKY PODOBNÝMI VÍRUSMI. (III) V DÔSLEDKU TOHO, AK BIOLOGICKÁ ÚČINNOSŤ VÍRUSOV ZÁVISÍ OD ICH FREKVENCIE PRI ZMIEŠANÝCH INFEKCIÁCH, ČAS NÁSTUPU RÔZNYCH INFEKCIÍ BY MOHOL OVPLYVNIŤ TÚTO SPÄTNÚ VÄZBU. NAVRHOVANÝMI CIEĽMI SÚ PRETO: 1) PRESKÚMAŤ, AKO RÔZNE BIOTICKÉ A ABIOTICKÉ PODMIENKY OVPLYVŇUJÚ EVOLUČNÚ DYNAMIKU PEPMV. 2) URČIŤ, AKO DIVERZIFIKÁCIA PEPMV OVPLYVŇUJE EVOLUČNÚ DYNAMIKU INÝCH VÍRUSOV PRI ZMIEŠANÝCH INFEKCIÁCH. 3) ZHODNOTIŤ, ČI JE ČAS ZAČIATKU INFEKCIE PEPMV VZHĽADOM NA INÉ VÍRUSY DÔLEŽITÝ, A IDENTIFIKOVAŤ MOŽNÝ MECHANIZMUS ZODPOVEDNÝ ZA KONKURENCIU MEDZI VÍRUSMI V TOM ISTOM RASTLINNOM TKANIVE. (Slovak)
17 August 2022
0 references
D’FHÉADFADH VÍRIS PHLANDAÍ A BHEITH INA GCÚIS LE HEIPIDÉIMÍ MÓRA AGUS TIONCHAR DIÚLTACH A BHEITH ACU AR THÁIRGEADH INBHUANAITHE BIA TRÍ CHÁILÍOCHT TÁIRGÍ AGUS TÁIRGEACHT BARR A LAGHDÚ. TAOBH AMUIGH DE NA HIMTHOSCA EIPIDÉIMEOLAÍOCHTA A CHAITHFIDH TARLÚ CHUN EIPIDÉIM A THOSÚ, TÁ RÓL LÁRNACH AG GÉINEOLAÍOCHT AGUS ÉICEOLAÍOCHT ARAON CHUN A CHINNEADH CATHAIN A D’FHÉADFADH NA GALAIR VÍREASACHA SEO TEACHT CHUN CINN. GO DTÍ SEO, TÁ STAIDÉIR AR ÉAGSÚLACHT GHÉINITEACH I VÍRIS DÍRITHE GO PRÍOMHA AR CHÓRAIS NA N-IONFHABHTUITHE SIMPLÍ FAOI CHOINNÍOLLACHA TURGNAMHACHA, NÓ AR FHAIREACHÁN A DHÉANAMH AR DHAONRA VÍREAS LE LINN RÁIG DE GHALAR VÍREASACH, AGUS TÁ NA SIMPLITHE SEO MAR THORADH AR LÉIRMHÍNITHE CÁILÍOCHTÚLA AGUS, CHOMH MINIC CÉANNA CAINNÍOCHTÚIL, LÉIRMHÍNITHE AR ÉABHLÓID AGUS OIRIÚNÚ VÍREAS. MAR SIN FÉIN, TÁ SÉ ÁISIÚIL AGUS TRÁTHÚIL AGHAIDH A THABHAIRT AR NA STAIDÉIR SIN LE LEIBHÉAL NÍOS AIRDE CASTACHTA, GAR DO FHÍORSTAIDEANNA AGUS ÁBHARTHA EIPIDÉIMEOLAÍOCHTA, AGUS TUISCINT NÍOS IOMLÁINE A BHEITH ANN AR NA SÁSRAÍ A OIBRÍONN SA NÁDÚR. LÉIRÍONN STAIDÉIR EIPIDÉIMEOLAÍOCHTA A RINNEADH I GCULTÚIR GAIRNEOLA GO BHFUIL IL-IONFHABHTUITHE VÍREASACHA NÍOS COITIANTA SA NÁDÚR NÁ MAR A BHÍOTHAS AG SÚIL LEIS, AGUS IS DÓCHA GO MBEIDH RÓL TÁBHACHTACH AG IDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ ÉICEOLAÍOCHA IDIR NA VÍRIS ÉAGSÚLA A INFHABHTAÍONN AN GLÉASRA CÉANNA I GCÁSANNA NACH BHFUIL NA GALAIR SIN EMERGERIATE MAR GHEALL AR GHNÍOMHAÍOCHT AONAIR VÍREAS. MAR SIN FÉIN, TÁ SÉ SEO FÓS LE HIMSCRÚDÚ, AGUS NÍ FIOS AN BHFUIL CUMAS ÉABHLÓIDEACH NÍOS MÓ ANN DO VÍRIS I DTIMPEALLACHTAÍ BITHEACHA SEACHAS AIBITHEACHA I GCOMHTHÉACS IONFHABHTUITHE MEASCTHA. TÁ SÉ MAR AIDHM AG AN TIONSCADAL SEO TIONCHAR NA HIOMAÍOCHTA IDIR VÍRIS AR ÉAGSÚLACHT GHÉINITEACH A CHINNEADH, LENA N-ÁIRÍTEAR AISEOLAS IDIR ÉAGSÚLÚ ÉABHLÓIDEACH VÍREAS AR LEITH AGUS AN CHUID EILE DE NA VÍRIS A INFECT AN T-ÓSTACH CÉANNA. CHUN NA CRÍCHE SIN, DÉANFAR SCRÚDÚ AR CATHAIN AGUS AR AN GCAOI A BHFUIL IONFHABHTUITHE MEASCTHA TÁBHACHTACH DO THRÁTAÍ, AG BAINT ÚSÁIDE AS TRÍ PHATAIGIN VÍREASACH AN-FHADHBACH SA BHARRA SEO; VÍREAS MÓSÁICE CÚCAMAR MILIS (PEPMV), VÍREAS MÓSÁICE TRÁTAÍ (TOMV) AGUS VÍREAS MÓSÁICE CÚCAMAR (CMV). IS IAD SEO A LEANAS HIPITÉISÍ AN TIONSCADAIL: (I) BEIDH AN ÉAGSÚLACHT GHÉINITEACH VÍREAS AR LEITH DLÚS MAR GHEALL AR AN LÁITHREACHT VÍRIS EILE SA PHLANDA CÉANNA, I.E. D’FHÉADFADH AN ÉAGSÚLACHT PEPMV A MHÉADÚ MAR THORADH AR IOMAÍOCHT LE VÍRIS EILE A ÁITIÚ NIDEOIGE AR LEITH. (II) IS FÉIDIR A BHEITH AG SÚIL LEIS ANSIN GO MBEIDH TIONCHAR AG ÉABHLÓID AN VÍRIS AR LEITH AR AN GCUID EILE DE NA VÍRIS SA PHLANDA CÉANNA; IS É SIN, BEIDH ÉAGSÚLÚ NÍOS MÓ DE PEPMV TIONCHAR A IMIRT AR AN RECOLONIZATION NA NIDEOIGE AG VÍRIS ÉICEOLAÍOCHTA DEN CHINEÁL CÉANNA. (III) MAR THORADH AIR SIN, MÁ BHRAITHEANN ÉIFEACHTÚLACHT BITHEOLAÍOCH NA VÍRIS AR A MINICÍOCHT IN IONFHABHTUITHE MEASCTHA, D’FHÉADFADH TIONCHAR A BHEITH AG AM TOSAITHE NA N-IONFHABHTUITHE ÉAGSÚLA AR AN AISEOLAS SEO. DÁ BHRÍ SIN, IS IAD SEO A LEANAS NA CUSPÓIRÍ ATÁ BEARTAITHE: 1) SCRÚDÚ A DHÉANAMH AR AN GCAOI A DTÉANN NA COINNÍOLLACHA ÉAGSÚLA BITHEACHA AGUS AIBITHEACHA I BHFEIDHM AR DHINIMIC ÉABHLÓIDEACH PEPMV. 2) A CHINNEADH CONAS A THÉANN ÉAGSÚLÚ PEPMV I BHFEIDHM AR AN DINIMIC ÉABHLÓIDEACH VÍRIS EILE IN IONFHABHTUITHE MEASCTHA. 3) A MHEAS AN BHFUIL AN T-AM TÚS NA N-IONFHABHTUITHE PEPMV MAIDIR LE VÍRIS EILE TÁBHACHTACH, AGUS CHUN AN MHEICNÍOCHT FÉIDEARTHA ATÁ FREAGRACH AS AN IOMAÍOCHT IDIR NA VÍRIS SA FÍOCHÁN PLANDAÍ CÉANNA A AITHINT. (Irish)
17 August 2022
0 references
ROSTLINNÉ VIRY MOHOU ZPŮSOBIT ZÁVAŽNÉ EPIDEMIE A NEGATIVNĚ OVLIVNIT UDRŽITELNOU PRODUKCI POTRAVIN TÍM, ŽE SNIŽUJÍ KVALITU PRODUKTŮ A VÝNOSY PLODIN. KROMĚ EPIDEMIOLOGICKÝCH OKOLNOSTÍ, KTERÉ MUSÍ NASTAT PRO ZAHÁJENÍ EPIDEMIE, HRAJÍ JAK GENETIKA, TAK EKOLOGIE KLÍČOVOU ROLI PŘI URČOVÁNÍ TOHO, KDY SE TYTO VIROVÉ CHOROBY MOHOU OBJEVIT. STUDIE GENETICKÉ ROZMANITOSTI VIRŮ SE DOSUD ZAMĚŘILY PŘEDEVŠÍM NA SYSTÉMY JEDNODUCHÝCH INFEKCÍ ZA EXPERIMENTÁLNÍCH PODMÍNEK NEBO NA SLEDOVÁNÍ POPULACE VIRU BĚHEM VYPUKNUTÍ VIROVÉ CHOROBY A TATO ZJEDNODUŠENÍ VEDLA KE KVALITATIVNÍM A MÉNĚ ČASTO KVANTITATIVNÍM INTERPRETACÍM VÝVOJE A ADAPTACE VIRŮ. JE VŠAK VHODNÉ A VČASNÉ ZABÝVAT SE TĚMITO STUDIEMI S VYŠŠÍ MÍROU SLOŽITOSTI, BLÍŽÍCÍ SE SKUTEČNÝM SITUACÍM A EPIZOOTOLOGICKY RELEVANTNÍMI, S MYŠLENKOU ÚPLNĚJŠÍHO POCHOPENÍ MECHANISMŮ, KTERÉ FUNGUJÍ V PŘÍRODĚ. EPIDEMIOLOGICKÉ STUDIE PROVEDENÉ V KULTURÁCH HORTICOLA UKAZUJÍ, ŽE VÍCE VIROVÉ INFEKCE JSOU V PŘÍRODĚ ČASTĚJŠÍ, NEŽ SE OČEKÁVALO, A JE PRAVDĚPODOBNÉ, ŽE EKOLOGICKÉ INTERAKCE MEZI RŮZNÝMI VIRY, KTERÉ INFIKUJÍ STEJNOU ROSTLINU, HRAJÍ DŮLEŽITOU ROLI VE VZNIKU ONEMOCNĚNÍ VE SCÉNÁŘÍCH, KDY TATO ONEMOCNĚNÍ NEJSOU EMERGERIÁT KVŮLI INDIVIDUÁLNÍMU PŮSOBENÍ VIRU. TO VŠAK JEŠTĚ NENÍ TŘEBA ZKOUMAT A NENÍ ZNÁMO, ZDA EXISTUJE VĚTŠÍ EVOLUČNÍ KAPACITA PRO VIRY V BIOTICKÉM PROSTŘEDÍ, A NIKOLI V ABIOTICKÉM PROSTŘEDÍ V SOUVISLOSTI SE SMÍŠENÝMI INFEKCEMI. CÍLEM TOHOTO PROJEKTU JE URČIT DOPAD KONKURENCE MEZI VIRY NA GENETICKOU ROZMANITOST, VČETNĚ ZPĚTNÉ VAZBY MEZI EVOLUČNÍ DIVERZIFIKACÍ KONKRÉTNÍHO VIRU A OSTATNÍMI VIRY, KTERÉ INFIKUJÍ STEJNÉHO HOSTITELE. ZA TÍMTO ÚČELEM BUDE ZKOUMÁNO, KDY A JAK JSOU SMÍŠENÉ INFEKCE DŮLEŽITÉ PRO RAJČATA, S VYUŽITÍM TŘÍ VELMI PROBLEMATICKÝCH VIROVÝCH PATOGENŮ V TÉTO PLODINĚ; VIRUS MOZAIKY SLADKÉ OKURKY (PEPMV), VIRUS RAJČATOVÉ MOZAIKY (TOMV) A VIRUS MOZAIKY OKURKY (CMV). HYPOTÉZY PROJEKTU JSOU: I) GENETICKÁ ROZMANITOST KONKRÉTNÍHO VIRU SE ZRYCHLÍ V DŮSLEDKU PŘÍTOMNOSTI JINÝCH VIRŮ VE STEJNÉ ROSTLINĚ, TJ. I.E. MŮŽE BÝT ZVÝŠENA ROZMANITOST PEPMV V DŮSLEDKU KONKURENCE S JINÝMI VIRY O OBSAZENÍ SPECIFICKÝCH VÝKLENEK. II) LZE POTÉ OČEKÁVAT, ŽE VÝVOJ SPECIFICKÉHO VIRU NÁSLEDNĚ OVLIVNÍ ZBYTEK VIRŮ V TÉŽE ROSTLINĚ; TO ZNAMENÁ, ŽE VĚTŠÍ DIVERZIFIKACE PEPMV OVLIVNÍ REKOLONIZACI VÝKLENEK EKOLOGICKY PODOBNÝMI VIRY. (III) V DŮSLEDKU TOHO, POKUD BIOLOGICKÁ ÚČINNOST VIRŮ ZÁVISÍ NA JEJICH ČETNOSTI U SMÍŠENÝCH INFEKCÍ, MŮŽE TATO ZPĚTNÁ VAZBA OVLIVNIT ČAS NÁSTUPU RŮZNÝCH INFEKCÍ. NAVRHOVANÝMI CÍLI JSOU PROTO: 1) ZKOUMAT, JAK RŮZNÉ BIOTICKÉ A ABIOTICKÉ PODMÍNKY OVLIVŇUJÍ EVOLUČNÍ DYNAMIKU PEPMV. 2) URČETE, JAK DIVERZIFIKACE PEPMV OVLIVŇUJE EVOLUČNÍ DYNAMIKU JINÝCH VIRŮ VE SMÍŠENÝCH INFEKCÍCH. 3) VYHODNOTIT, ZDA JE ČAS ZAHÁJENÍ INFEKCE PEPMV S OHLEDEM NA JINÉ VIRY DŮLEŽITÝ, A URČIT MOŽNÝ MECHANISMUS ZODPOVĚDNÝ ZA KONKURENCI MEZI VIRY VE STEJNÉ ROSTLINNÉ TKÁNI. (Czech)
17 August 2022
0 references
Os vírus vegetais têm o potencial de causar grandes epidemias e de afetar de forma negativa a produção alimentar sustentável através da redução da qualidade dos produtos e do rendimento das culturas. Além das circunstâncias epidemiológicas que devem ocorrer para iniciar uma epidemiologia, tanto a genética como a ecologia têm um papel fundamental na determinação quando estas doenças virais podem surgir. Assim, os estudos de diversidade genética em vírus incidiram principalmente em sistemas de infecções simples em condições experimentais, ou no controlo de uma população viral durante o aparecimento de uma doença viral, e estas simplificações conduziram a interações qualitativas e, menos frequentemente quantitativas, da evolução e da adaptação das doenças. No entanto, é conveniente e oportuno abordar estes estudos com um nível mais elevado de completude, próximo de situações reais e epidemiologicamente relevante, com a ideia de ter um entendimento mais completo dos mecanismos que funcionam na natureza. Os estudos epidemiológicos realizados nas culturas de horticóloga revelam que múltiplas infecções virais são, na sua natureza, mais comuns do que o previsto, e é provável que as interacções ecológicas entre os diferentes vírus que afectam a mesma planta tenham um papel importante na emergência de doenças nos cenários em que estas doenças não se tornam emergentes devido à acção individual de um vírus. No entanto, esta questão ainda não foi investigada e não se sabe se existe uma maior capacidade evolutiva para os vírus em ambientes biológicos do que em ambientes abióticos no contexto de infecções mistas. Este projecto destina-se a determinar o impacto da concorrência entre os vírus na diversidade genética, incluindo o efeito de retroalimentação entre a diversificação evolutiva de um vírus específico e o resto dos vírus que atingem o mesmo hospedeiro. Para o efeito, será examinado quando e como as infecções mistas são importantes para o tomate, fazendo uso de três patogéneos virais muito problemáticos nesta cultura; VÍRUS MOSAICO DE CUCUMBER DOCE (PEPMV), VÍRUS MOSAICO DE TOMATO (TOMV) E VÍRUS MOSAICO DE CUCUMBER (CMV). As hipóteses do projeto são: I) A diversidade genética de um vírus específico acender-se-á devido à presença de outros vírus na mesma planta, ou seja, a diversidade de PEPMV pode ser aumentada como resultado de uma concorrência com outros vírus para ofender nichos específicos. ii) em seguida, poder-se-á esperar que a evolução do vírus específico afecte o resto dos vírus na mesma planta; Isto é, uma maior diversificação do PEPMV irá influir na recolonização de nichos por vírus ecologicamente semelhantes. III) Como consequência, se a eficácia biológica dos vírus depende da sua frequência em infecções mistas, o momento imediato das diversas infecções pode afectar este período. Os objectivos propostos são, por conseguinte: 1) Examinar como as diferentes condições biológicas e abióticas afetam a dinâmica evolutiva do PEPMV. 2) DETERMINAR COMO A DIVERSIFICAÇÃO PEPMV AFETA A DINÂMICA EVOLUCIONAL DE OUTROS VÍRUS EM INFECÇÕES MISTAS. 3) Avaliar se o momento de início das infecções por PEMV em relação a outros vírus é importante e identificar o mecanismo possível responsável pela competição entre os vírus no mesmo tecido vegetal. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
TAIMEVIIRUSED VÕIVAD PÕHJUSTADA SUURI EPIDEEMIAID JA AVALDADA NEGATIIVSET MÕJU JÄTKUSUUTLIKULE TOIDUTOOTMISELE, VÄHENDADES TOODETE KVALITEETI JA SAAGIKUST. LISAKS EPIDEMIOLOOGILISTELE ASJAOLUDELE, MIS PEAVAD EPIDEEMIA ALUSTAMISEKS ILMNEMA, ON NII GENEETIKAL KUI KA ÖKOLOOGIAL OLULINE ROLL NENDE VIIRUSHAIGUSTE TEKKIMISE AJA KINDLAKSMÄÄRAMISEL. SENI ON VIIRUSTE GENEETILISE MITMEKESISUSE UURINGUD KESKENDUNUD PEAMISELT LIHTSATE NAKKUSTE SÜSTEEMIDELE KATSETINGIMUSTES VÕI VIIRUSEPOPULATSIOONI SEIRELE VIIRUSHAIGUSE PUHANGU AJAL NING NEED LIHTSUSTUSED ON VIINUD VIIRUSTE ARENGU JA KOHANDAMISE KVALITATIIVSETE JA HARVEMINI KVANTITATIIVSETE TÕLGENDUSTENI. SIISKI ON MUGAV JA ÕIGEAEGNE KÄSITLEDA NEID UURINGUID SUUREMA KEERUKUSEGA, TEGELIKELE OLUKORDADELE LÄHEDAL JA EPIDEMIOLOOGILISELT ASJAKOHASTENA, EESMÄRGIGA SAADA TÄIELIKUM ARUSAAM LOODUSES TOIMIVATEST MEHHANISMIDEST. EPIDEMIOLOOGILISED UURINGUD HORTIKALIDE KULTUURIDES NÄITAVAD, ET MITMED VIIRUSINFEKTSIOONID ON OMA OLEMUSELT OODATUST SAGEDASEMAD NING ON TÕENÄOLINE, ET SAMA TAIME NAKATAVATE ERINEVATE VIIRUSTE ÖKOLOOGILISEL KOOSTOIMEL ON OLULINE ROLL HAIGUSTE TEKKIMISEL STSENAARIUMIDES, KUS NEED HAIGUSED EI EMERGERIATE VIIRUSE INDIVIDUAALSE TOIME TÕTTU. SEDA EI OLE AGA VEEL UURITUD JA EI OLE TEADA, KAS SEGANAKKUSTE KONTEKSTIS ON VIIRUSTE EVOLUTSIOONIVÕIME SUUREM BIOOTILISTES, MITTE ABIOOTILISTES KESKKONDADES. PROJEKTI EESMÄRK ON MÄÄRATA KINDLAKS VIIRUSTE VAHELISE KONKURENTSI MÕJU GENEETILISELE MITMEKESISUSELE, SEALHULGAS TAGASISIDE KONKREETSE VIIRUSE EVOLUTSIOONILISE MITMEKESISTAMISE JA TEISTE SAMA PEREMEESORGANISMI NAKATAVATE VIIRUSTE VAHEL. SEL EESMÄRGIL UURITAKSE, MILLAL JA KUIDAS ON SEGAINFEKTSIOONID TOMATI JAOKS OLULISED, KASUTADES SELLES PÕLLUKULTUURIS KOLME VÄGA PROBLEMAATILIST VIIRUSPATOGEENI; MAGUS KURGI MOSAIIKVIIRUS (PEPMV), TOMATI MOSAIIKVIIRUS (TOMV) JA KURGI MOSAIIKVIIRUS (CMV). PROJEKTI HÜPOTEESID ON JÄRGMISED: I) KONKREETSE VIIRUSE GENEETILINE MITMEKESISUS KIIRENEB TEISTE VIIRUSTE ESINEMISE TÕTTU SAMAS TAIMES, I.E. VÕIB PEPMV MITMEKESISUS SUURENEDA KONKURENTSI TÕTTU TEISTE VIIRUSTEGA KONKREETSETE NIŠŠIDE HÕIVAMISEKS. II) SEEJÄREL VÕIB EELDADA, ET KONKREETSE VIIRUSE ARENG MÕJUTAB OMAKORDA SAMA TAIME ÜLEJÄÄNUD VIIRUSI; SEE TÄHENDAB, ET PEPMV SUUREM MITMEKESISTAMINE MÕJUTAB NIŠIDE REKOLONISEERIMIST ÖKOLOOGILISELT SARNASTE VIIRUSTE ABIL. III) KUI VIIRUSTE BIOLOOGILINE EFEKTIIVSUS SÕLTUB NENDE ESINEMISSAGEDUSEST SEGAINFEKTSIOONIDE KORRAL, VÕIB ERINEVATE INFEKTSIOONIDE ILMNEMISE AEG SEDA TAGASISIDET MÕJUTADA. KAVANDATUD EESMÄRGID ON SEEGA JÄRGMISED: 1) UURIDA, KUIDAS ERINEVAD BIOOTILISED JA ABIOOTILISED TINGIMUSED MÕJUTAVAD PEPMV EVOLUTSIOONILIST DÜNAAMIKAT. 2) TEHA KINDLAKS, KUIDAS PEPMV MITMEKESISTAMINE MÕJUTAB TEISTE VIIRUSTE EVOLUTSIOONILIST DÜNAAMIKAT SEGANAKKUSTES. 3) HINNATA, KAS PEPMV INFEKTSIOONIDE ALGUSAEG VÕRRELDES TEISTE VIIRUSTEGA ON OLULINE, NING TEHA KINDLAKS VÕIMALIK MEHHANISM, MIS VASTUTAB SAMAS TAIMEKOES OLEVATE VIIRUSTE VAHELISE KONKURENTSI EEST. (Estonian)
17 August 2022
0 references
A NÖVÉNYI VÍRUSOK SÚLYOS JÁRVÁNYOKAT OKOZHATNAK, ÉS NEGATÍVAN BEFOLYÁSOLHATJÁK A FENNTARTHATÓ ÉLELMISZER-TERMELÉST A TERMÉKMINŐSÉG ÉS A TERMÉSHOZAM CSÖKKENTÉSE RÉVÉN. A JÁRVÁNY MEGKEZDÉSÉHEZ SZÜKSÉGES EPIDEMIOLÓGIAI KÖRÜLMÉNYEKEN TÚL MIND A GENETIKA, MIND AZ ÖKOLÓGIA KULCSSZEREPET JÁTSZIK ANNAK MEGHATÁROZÁSÁBAN, HOGY MIKOR FORDULHATNAK ELŐ EZEK A VÍRUSOS BETEGSÉGEK. EDDIG A VÍRUSOKON VÉGZETT GENETIKAI SOKFÉLESÉGI VIZSGÁLATOK ELSŐSORBAN AZ EGYSZERŰ FERTŐZÉSEK KÍSÉRLETI KÖRÜLMÉNYEK KÖZÖTTI RENDSZEREIRE, VAGY A VÍRUSPOPULÁCIÓNAK A VÍRUSBETEGSÉG KITÖRÉSE SORÁN TÖRTÉNŐ MEGFIGYELÉSÉRE ÖSSZPONTOSÍTOTTAK, ÉS EZEK AZ EGYSZERŰSÍTÉSEK A VÍRUSOK FEJLŐDÉSÉNEK ÉS ALKALMAZKODÁSÁNAK MINŐSÉGI ÉS – RITKÁBBAN MENNYISÉGI – ÉRTELMEZÉSÉHEZ VEZETTEK. UGYANAKKOR KÉNYELMES ÉS IDŐSZERŰ, HOGY EZEKET A TANULMÁNYOKAT MAGASABB SZINTŰ KOMPLEXITÁSSAL, A VALÓS HELYZETEKHEZ KÖZELI ÉS JÁRVÁNYÜGYILEG RELEVÁNS MÓDON KEZELJÉK, AZZAL AZ ELKÉPZELÉSSEL, HOGY TELJESEBB MEGÉRTÉST NYERJENEK A TERMÉSZETBEN MŰKÖDŐ MECHANIZMUSOKRÓL. A HORTICOLA KULTÚRÁKBAN VÉGZETT EPIDEMIOLÓGIAI VIZSGÁLATOK AZT MUTATJÁK, HOGY A TÖBBSZÖRÖS VÍRUSFERTŐZÉSEK A VÁRTNÁL GYAKORIBBAK, ÉS VALÓSZÍNŰ, HOGY AZ UGYANAZON NÖVÉNYT MEGFERTŐZŐ KÜLÖNBÖZŐ VÍRUSOK KÖZÖTTI ÖKOLÓGIAI KÖLCSÖNHATÁSOK FONTOS SZEREPET JÁTSZANAK A BETEGSÉGEK KIALAKULÁSÁBAN OLYAN HELYZETEKBEN, AMIKOR EZEK A BETEGSÉGEK A VÍRUS EGYÉNI HATÁSA MIATT NEM EMERGERIATE. EZT AZONBAN MÉG MEG KELL VIZSGÁLNI, ÉS NEM ISMERT, HOGY A KEVERT FERTŐZÉSEK ÖSSZEFÜGGÉSÉBEN AZ ABIOTIKUS KÖRNYEZETBEN NAGYOBB EVOLÚCIÓS KÉPESSÉG ÁLL-E RENDELKEZÉSRE A VÍRUSOK TEKINTETÉBEN. A PROJEKT CÉLJA A VÍRUSOK KÖZÖTTI VERSENY GENETIKAI SOKFÉLESÉGRE GYAKOROLT HATÁSÁNAK MEGHATÁROZÁSA, BELEÉRTVE AZ ADOTT VÍRUS EVOLÚCIÓS DIVERZIFIKÁCIÓJA ÉS AZ UGYANAZON GAZDASZERVEZETET MEGFERTŐZŐ TÖBBI VÍRUS KÖZÖTTI VISSZAJELZÉST. E CÉLBÓL MEG KELL VIZSGÁLNI, HOGY MIKOR ÉS HOGYAN FONTOSAK A KEVERT FERTŐZÉSEK A PARADICSOM SZÁMÁRA, HÁROM NAGYON PROBLEMATIKUS VÍRUS KÓROKOZÓT HASZNÁLVA EBBEN A NÖVÉNYBEN; ÉDES UBORKA MOZAIK VÍRUS (PEPMV), PARADICSOMMOZAIK VÍRUS (TOMV) ÉS UBORKA MOZAIK VÍRUS (CMV). A PROJEKT HIPOTÉZISEI A KÖVETKEZŐK: I. EGY ADOTT VÍRUS GENETIKAI SOKFÉLESÉGE FELGYORSUL AZ UGYANAZON NÖVÉNYBEN TALÁLHATÓ MÁS VÍRUSOK JELENLÉTE MIATT, AZAZ A PEPMV SOKFÉLESÉGE NÖVEKEDHET A MÁS VÍRUSOKKAL BIZONYOS RÉSEK ELFOGLALÁSA ÉRDEKÉBEN FOLYTATOTT VERSENY EREDMÉNYEKÉNT. EZUTÁN VÁRHATÓ, HOGY AZ ADOTT VÍRUS FEJLŐDÉSE HATÁSSAL LESZ AZ UGYANABBAN A NÖVÉNYBEN TALÁLHATÓ TÖBBI VÍRUSRA; VAGYIS A PEPMV NAGYOBB DIVERZIFIKÁCIÓJA HATÁSSAL LESZ A RÉSEK ÖKOLÓGIAILAG HASONLÓ VÍRUSOK ÁLTALI ÚJRAKOLONIZÁCIÓJÁRA. KÖVETKEZÉSKÉPPEN, HA A VÍRUSOK BIOLÓGIAI HATÉKONYSÁGA A KEVERT FERTŐZÉSEK GYAKORISÁGÁTÓL FÜGG, A KÜLÖNBÖZŐ FERTŐZÉSEK MEGJELENÉSI IDEJE BEFOLYÁSOLHATJA EZT A VISSZAJELZÉST. A JAVASOLT CÉLKITŰZÉSEK EZÉRT A KÖVETKEZŐK: 1) VIZSGÁLJA MEG, HOGY A KÜLÖNBÖZŐ BIOTIKUS ÉS ABIOTIKUS KÖRÜLMÉNYEK HOGYAN BEFOLYÁSOLJÁK A PEPMV EVOLÚCIÓS DINAMIKÁJÁT. 2) HATÁROZZA MEG, HOGY A PEPMV DIVERZIFIKÁCIÓJA HOGYAN BEFOLYÁSOLJA MÁS VÍRUSOK EVOLÚCIÓS DINAMIKÁJÁT A VEGYES FERTŐZÉSEKBEN. 3) ANNAK ÉRTÉKELÉSE, HOGY FONTOS-E A PEPMV-FERTŐZÉSEK KEZDETE MÁS VÍRUSOKKAL SZEMBEN, ÉS AZONOSÍTSA AZ UGYANAZON NÖVÉNYI SZÖVETBEN TALÁLHATÓ VÍRUSOK KÖZÖTTI VERSENYÉRT FELELŐS LEHETSÉGES MECHANIZMUST. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
РАСТИТЕЛНИТЕ ВИРУСИ ИМАТ ПОТЕНЦИАЛА ДА ПРИЧИНЯТ ГОЛЕМИ ЕПИДЕМИИ И ДА ОКАЖАТ ОТРИЦАТЕЛНО ВЪЗДЕЙСТВИЕ ВЪРХУ УСТОЙЧИВОТО ПРОИЗВОДСТВО НА ХРАНИ ЧРЕЗ НАМАЛЯВАНЕ НА КАЧЕСТВОТО НА ПРОДУКТИТЕ И ДОБИВА НА КУЛТУРИ. ОСВЕН ЕПИДЕМИОЛОГИЧНИТЕ ОБСТОЯТЕЛСТВА, КОИТО ТРЯБВА ДА ВЪЗНИКНАТ, ЗА ДА СЕ ЗАПОЧНЕ ЕПИДЕМИЯ, КАКТО ГЕНЕТИКАТА, ТАКА И ЕКОЛОГИЯТА ИГРАЯТ КЛЮЧОВА РОЛЯ ПРИ ОПРЕДЕЛЯНЕТО НА ТОВА КОГА МОГАТ ДА ВЪЗНИКНАТ ТЕЗИ ВИРУСНИ ЗАБОЛЯВАНИЯ. ДО МОМЕНТА ИЗСЛЕДВАНИЯТА НА ГЕНЕТИЧНОТО РАЗНООБРАЗИЕ НА ВИРУСИТЕ СА СЪСРЕДОТОЧЕНИ ГЛАВНО ВЪРХУ СИСТЕМИТЕ ЗА ПРОСТИ ИНФЕКЦИИ В ЕКСПЕРИМЕНТАЛНИ УСЛОВИЯ ИЛИ ВЪРХУ НАБЛЮДЕНИЕТО НА ПОПУЛАЦИЯ ОТ ВИРУСИ ПО ВРЕМЕ НА ИЗБУХВАНЕТО НА ВИРУСНО ЗАБОЛЯВАНЕ, КАТО ТЕЗИ ОПРОСТЯВАНИЯ СА ДОВЕЛИ ДО КАЧЕСТВЕНИ И, ПО-РЯДКО КОЛИЧЕСТВЕНИ ИНТЕРПРЕТАЦИИ НА ЕВОЛЮЦИЯТА И АДАПТИРАНЕТО НА ВИРУСИТЕ. ВЪПРЕКИ ТОВА Е УДОБНО И НАВРЕМЕННО ТЕЗИ ИЗСЛЕДВАНИЯ ДА БЪДАТ РАЗГЛЕДАНИ С ПО-ВИСОКА СТЕПЕН НА СЛОЖНОСТ, БЛИЗКА ДО РЕАЛНИТЕ СИТУАЦИИ И ЕПИДЕМИОЛОГИЧНО ЗНАЧИМИ, С ИДЕЯТА ЗА ПО-ПЪЛНО РАЗБИРАНЕ НА МЕХАНИЗМИТЕ, КОИТО ФУНКЦИОНИРАТ В ПРИРОДАТА. ЕПИДЕМИОЛОГИЧНИТЕ ПРОУЧВАНИЯ, ПРОВЕДЕНИ В КУЛТУРИ ОТ HORTICOLA, ПОКАЗВАТ, ЧЕ МНОГОКРАТНИТЕ ВИРУСНИ ИНФЕКЦИИ СА ПО-ЧЕСТИ ПО ХАРАКТЕР ОТ ОЧАКВАНОТО И Е ВЕРОЯТНО ЕКОЛОГИЧНИТЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ МЕЖДУ РАЗЛИЧНИТЕ ВИРУСИ, КОИТО ЗАРАЗЯВАТ ЕДНО И СЪЩО РАСТЕНИЕ, ДА ИГРАЯТ ВАЖНА РОЛЯ ЗА ПОЯВАТА НА ЗАБОЛЯВАНИЯ ПРИ СЦЕНАРИИ, ПРИ КОИТО ТЕЗИ ЗАБОЛЯВАНИЯ НЕ СЕ ИЗЧЕРПВАТ ПОРАДИ ИНДИВИДУАЛНОТО ДЕЙСТВИЕ НА ДАДЕН ВИРУС. ТОВА ОБАЧЕ ВСЕ ОЩЕ ПРЕДСТОИ ДА БЪДЕ ПРОУЧЕНО И НЕ Е ИЗВЕСТНО ДАЛИ ИМА ПО-ГОЛЯМ ЕВОЛЮЦИОНЕН КАПАЦИТЕТ ЗА ВИРУСИ В БИОТИЧНА, А НЕ В АБИОТИЧНА СРЕДА В КОНТЕКСТА НА СМЕСЕНИ ИНФЕКЦИИ. ТОЗИ ПРОЕКТ ИМА ЗА ЦЕЛ ДА ОПРЕДЕЛИ ВЪЗДЕЙСТВИЕТО НА КОНКУРЕНЦИЯТА МЕЖДУ ВИРУСИТЕ ВЪРХУ ГЕНЕТИЧНОТО РАЗНООБРАЗИЕ, ВКЛЮЧИТЕЛНО ОБРАТНА ВРЪЗКА МЕЖДУ ЕВОЛЮЦИОННАТА ДИВЕРСИФИКАЦИЯ НА КОНКРЕТЕН ВИРУС И ОСТАНАЛИТЕ ВИРУСИ, КОИТО ЗАРАЗЯВАТ ЕДИН И СЪЩ ГОСТОПРИЕМНИК. ЗА ТАЗИ ЦЕЛ ЩЕ БЪДЕ ПРОУЧЕНО КОГА И КАК СМЕСЕНИТЕ ИНФЕКЦИИ СА ВАЖНИ ЗА ДОМАТИТЕ, КАТО СЕ ИЗПОЛЗВАТ ТРИ МНОГО ПРОБЛЕМАТИЧНИ ВИРУСНИ ПАТОГЕНА В ТАЗИ КУЛТУРА; ВИРУС НА МОЗАЙКАТА НА СЛАДКАТА КРАСТАВИЦА (PEPMV), ВИРУСА НА ДОМАТЕНАТА МОЗАЙКА (TOMV) И ВИРУСА НА МОЗАЙКАТА ОТ КРАСТАВИЦИ (CMV). ХИПОТЕЗИТЕ ПО ПРОЕКТА СА: I) ГЕНЕТИЧНОТО РАЗНООБРАЗИЕ НА КОНКРЕТЕН ВИРУС ЩЕ СЕ УСКОРИ ПОРАДИ НАЛИЧИЕТО НА ДРУГИ ВИРУСИ В СЪЩОТО РАСТЕНИЕ, Т.Е. РАЗНООБРАЗИЕТО НА PEPMV МОЖЕ ДА СЕ УВЕЛИЧИ В РЕЗУЛТАТ НА КОНКУРЕНЦИЯ С ДРУГИ ВИРУСИ, КОИТО ДА ЗАЕМАТ КОНКРЕТНИ НИШИ. II) СЛЕД ТОВА МОЖЕ ДА СЕ ОЧАКВА, ЧЕ РАЗВИТИЕТО НА КОНКРЕТНИЯ ВИРУС НА СВОЙ РЕД ЩЕ ЗАСЕГНЕ ОСТАНАЛИТЕ ВИРУСИ В СЪЩОТО РАСТЕНИЕ; ТОВА ОЗНАЧАВА, ЧЕ ПО-ГОЛЯМАТА ДИВЕРСИФИКАЦИЯ НА PEPMV ЩЕ ПОВЛИЯЕ НА РЕКОЛОНИЗАЦИЯТА НА НИШИ ОТ ПОДОБНИ В ЕКОЛОГИЧНО ОТНОШЕНИЕ ВИРУСИ. III) ВСЛЕДСТВИЕ НА ТОВА, АКО БИОЛОГИЧНАТА ЕФИКАСНОСТ НА ВИРУСИТЕ ЗАВИСИ ОТ ТЯХНАТА ЧЕСТОТА ПРИ СМЕСЕНИ ИНФЕКЦИИ, НАЧАЛОТО НА РАЗЛИЧНИТЕ ИНФЕКЦИИ МОЖЕ ДА ПОВЛИЯЕ НА ТАЗИ ОБРАТНА ВРЪЗКА. ПОРАДИ ТОВА ПРЕДЛОЖЕНИТЕ ЦЕЛИ СА: 1) ИЗСЛЕДВАЙТЕ КАК РАЗЛИЧНИТЕ БИОТИЧНИ И АБИОТИЧНИ СЪСТОЯНИЯ ВЛИЯЯТ ВЪРХУ ЕВОЛЮЦИОННАТА ДИНАМИКА НА PEPMV. 2) ОПРЕДЕЛЕТЕ КАК ДИВЕРСИФИКАЦИЯТА НА PEPMV ВЛИЯЕ ВЪРХУ ЕВОЛЮЦИОННАТА ДИНАМИКА НА ДРУГИ ВИРУСИ ПРИ СМЕСЕНИ ИНФЕКЦИИ. 3) ДА СЕ ОЦЕНИ ДАЛИ НАЧАЛНИЯТ ЧАС НА PEPMV ИНФЕКЦИИТЕ ПО ОТНОШЕНИЕ НА ДРУГИ ВИРУСИ Е ВАЖЕН И ДА СЕ ОПРЕДЕЛИ ВЪЗМОЖНИЯТ МЕХАНИЗЪМ, ОТГОВОРЕН ЗА КОНКУРЕНЦИЯТА МЕЖДУ ВИРУСИТЕ В СЪЩАТА РАСТИТЕЛНА ТЪКАН. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
AUGALŲ VIRUSAI GALI SUKELTI DIDELES EPIDEMIJAS IR NEIGIAMAI PAVEIKTI TVARIĄ MAISTO GAMYBĄ, NES SUMAŽĖS PRODUKTŲ KOKYBĖ IR PASĖLIŲ DERLIUS. BE EPIDEMIOLOGINIŲ APLINKYBIŲ, KURIOS TURI ATSIRASTI EPIDEMIJAI PRADĖTI, TIEK GENETIKA, TIEK EKOLOGIJA ATLIEKA PAGRINDINĮ VAIDMENĮ NUSTATANT, KADA ŠIOS VIRUSINĖS LIGOS GALI ATSIRASTI. IKI ŠIOL ATLIEKANT VIRUSŲ GENETINĖS ĮVAIROVĖS TYRIMUS DAUGIAUSIA DĖMESIO BUVO SKIRIAMA PAPRASTŲ INFEKCIJŲ SISTEMOMS EKSPERIMENTINĖMIS SĄLYGOMIS ARBA VIRUSO POPULIACIJOS STEBĖSENAI VIRUSINĖS LIGOS PROTRŪKIO METU, IR ŠIE SUPAPRASTINIMAI LĖMĖ KOKYBINIUS IR, REČIAU, KIEKYBINIUS VIRUSŲ RAIDOS IR PRISITAIKYMO AIŠKINIMUS. TAČIAU PATOGU IR LAIKU ATLIKTI ŠIUOS TYRIMUS, KURIE BŪTŲ SUDĖTINGESNI, BEVEIK REALIOS SITUACIJOS IR EPIDEMIOLOGIŠKAI SVARBŪS, SIEKIANT GERIAU SUPRASTI, KOKIE MECHANIZMAI VEIKIA. EPIDEMIOLOGINIAI TYRIMAI SU HORTICOLA KULTŪROMIS RODO, KAD DAUGELIO VIRUSINIŲ INFEKCIJŲ POBŪDIS YRA DAŽNESNIS NEI TIKĖTASI, IR TIKĖTINA, KAD EKOLOGINĖ SĄVEIKA TARP SKIRTINGŲ VIRUSŲ, KURIE UŽKREČIA TĄ PATĮ AUGALĄ, ATLIEKA SVARBŲ VAIDMENĮ ATSIRANDANT LIGOMS SCENARIJUOSE, KAI ŠIOS LIGOS NĖRA EMERGERIATE DĖL INDIVIDUALAUS VIRUSO POVEIKIO. TAČIAU TAI DAR REIKIA IŠTIRTI IR NĖRA ŽINOMA, AR ESANT MIŠRIOMS INFEKCIJOMS BIOTINĖSE, O NE ABIOTINĖSE APLINKOSE YRA DIDESNIS VIRUSŲ EVOLIUCINIS PAJĖGUMAS. ŠIUO PROJEKTU SIEKIAMA NUSTATYTI VIRUSŲ KONKURENCIJOS POVEIKĮ GENETINEI ĮVAIROVEI, ĮSKAITANT GRĮŽTAMĄJĮ RYŠĮ TARP KONKRETAUS VIRUSO EVOLIUCINĖS DIVERSIFIKACIJOS IR LIKUSIŲ VIRUSŲ, UŽKRĖSTŲ TĄ PATĮ ŠEIMININKĄ. ŠIUO TIKSLU BUS IŠTIRTA, KADA IR KAIP MIŠRIOS INFEKCIJOS YRA SVARBIOS POMIDORAMS, NAUDOJANT TRIS LABAI PROBLEMINIUS VIRUSINIUS PATOGENUS ŠIAME PASĖLYJE; SALDŽIŲJŲ AGURKŲ MOZAIKOS VIRUSAS (PEPMV), POMIDORŲ MOZAIKOS VIRUSAS (TOMV) IR AGURKŲ MOZAIKOS VIRUSAS (CMV). PROJEKTO HIPOTEZĖS YRA ŠIOS: I) KONKRETAUS VIRUSO GENETINĖ ĮVAIROVĖ PASPARTĖS DĖL KITŲ VIRUSŲ BUVIMO TAME PAČIAME AUGALE, T. Y. PEPMV ĮVAIROVĖ GALI PADIDĖTI DĖL KONKURENCIJOS SU KITAIS VIRUSAIS, KAD UŽIMTŲ SPECIFINES NIŠAS. II) GALIMA TIKĖTIS, KAD KONKRETAUS VIRUSO RAIDA SAVO RUOŽTU PAVEIKS LIKUSIUS TO PATIES AUGALO VIRUSUS; TAI REIŠKIA, KAD DIDESNĖ PEPMV ĮVAIROVĖ TURĖS ĮTAKOS NIŠŲ REKOLONIZACIJAI EKOLOGIŠKAI PANAŠIAIS VIRUSAIS. (III) DĖL TO, JEI BIOLOGINIS VIRUSŲ VEIKSMINGUMAS PRIKLAUSO NUO JŲ DAŽNUMO MIŠRIOSE INFEKCIJOSE, ĮVAIRIŲ INFEKCIJŲ ATSIRADIMO LAIKAS GALI TURĖTI ĮTAKOS ŠIAM GRĮŽTAMAJAM RYŠIUI. TODĖL SIŪLOMI ŠIE TIKSLAI: 1) IŠNAGRINĖTI, KAIP SKIRTINGOS BIOTINĖS IR ABIOTINĖS SĄLYGOS VEIKIA PEPMV EVOLIUCINĘ DINAMIKĄ. 2) NUSTATYKITE, KAIP PEPMV ĮVAIRINIMAS VEIKIA KITŲ VIRUSŲ EVOLIUCINĘ DINAMIKĄ MIŠRIOSE INFEKCIJOSE. 3) ĮVERTINTI, AR PEPMV INFEKCIJOS PRADŽIOS LAIKAS KITŲ VIRUSŲ ATŽVILGIU YRA SVARBUS, IR NUSTATYTI GALIMĄ MECHANIZMĄ, ATSAKINGĄ UŽ VIRUSŲ KONKURENCIJĄ TAME PAČIAME AUGALO AUDINYJE. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
BILJNI VIRUSI MOGU UZROKOVATI VELIKE EPIDEMIJE I NEGATIVNO UTJECATI NA ODRŽIVU PROIZVODNJU HRANE SMANJENJEM KVALITETE PROIZVODA I PRINOSA USJEVA. OSIM EPIDEMIOLOŠKIH OKOLNOSTI KOJE SE MORAJU POJAVITI KAKO BI SE ZAPOČELA EPIDEMIJA, I GENETIKA I EKOLOGIJA IMAJU KLJUČNU ULOGU U ODREĐIVANJU KADA SE TE VIRUSNE BOLESTI MOGU POJAVITI. DO SADA SU STUDIJE GENETSKE RAZNOLIKOSTI VIRUSA UGLAVNOM BILE USMJERENE NA SUSTAVE JEDNOSTAVNIH INFEKCIJA U EKSPERIMENTALNIM UVJETIMA ILI NA PRAĆENJE POPULACIJE VIRUSA TIJEKOM IZBIJANJA VIRUSNE BOLESTI, A TA SU POJEDNOSTAVLJENJA DOVELA DO KVALITATIVNIH I RJEĐE KVANTITATIVNIH TUMAČENJA RAZVOJA I PRILAGODBE VIRUSA. MEĐUTIM, PRIKLADNO JE I PRAVOVREMENO RJEŠAVATI TE STUDIJE S VIŠOM RAZINOM SLOŽENOSTI, BLIZU STVARNIM SITUACIJAMA I EPIDEMIOLOŠKI RELEVANTNIMA, S IDEJOM DA SE POSTIGNE POTPUNIJE RAZUMIJEVANJE MEHANIZAMA KOJI DJELUJU U PRIRODI. EPIDEMIOLOŠKA ISTRAŽIVANJA PROVEDENA U HORTICOLA KULTURAMA OTKRIVAJU DA SU VIŠESTRUKE VIRUSNE INFEKCIJE ČEŠĆE U PRIRODI NEGO ŠTO SE OČEKIVALO TE JE VJEROJATNO DA EKOLOŠKE INTERAKCIJE IZMEĐU RAZLIČITIH VIRUSA KOJI ZARAZIJU ISTU BILJKU IMAJU VAŽNU ULOGU U NASTANKU BOLESTI U SCENARIJIMA U KOJIMA TE BOLESTI NE DJELUJU EMERGERIATE ZBOG INDIVIDUALNOG DJELOVANJA VIRUSA. MEĐUTIM, TO SE TEK TREBA ISTRAŽITI, A NIJE POZNATO POSTOJI LI VEĆI EVOLUCIJSKI KAPACITET VIRUSA U BIOTIČKIM, A NE ABIOTIČKIM OKRUŽENJIMA U KONTEKSTU MIJEŠANIH INFEKCIJA. CILJ JE OVOG PROJEKTA UTVRDITI UTJECAJ KONKURENCIJE IZMEĐU VIRUSA NA GENETSKU RAZNOLIKOST, UKLJUČUJUĆI POVRATNE INFORMACIJE IZMEĐU EVOLUCIJSKE DIVERSIFIKACIJE ODREĐENOG VIRUSA I OSTALIH VIRUSA KOJI ZARAZIJU ISTOG DOMAĆINA. U TU ĆE SE SVRHU ISPITATI KADA I KAKO SU MJEŠOVITE INFEKCIJE VAŽNE ZA RAJČICU, KORISTEĆI TRI VRLO PROBLEMATIČNA VIRUSNA PATOGENA U OVOM USJEVU; VIRUS MOZAIKA SLATKOG KRASTAVACA (PEPMV), VIRUS MOZAIKA RAJČICE (TOMV) I VIRUS MOZAIKA KRASTAVACA (CMV). PRETPOSTAVKE PROJEKTA SU: (I) GENETSKA RAZNOLIKOST ODREĐENOG VIRUSA UBRZAT ĆE SE ZBOG PRISUTNOSTI DRUGIH VIRUSA U ISTOJ BILJCI, TJ. RAZNOLIKOST PEPMV-A MOŽE SE POVEĆATI KAO REZULTAT NATJECANJA S DRUGIM VIRUSIMA KAKO BI SE ZAUZELE ODREĐENE NIŠE. II. MOŽE SE OČEKIVATI DA ĆE RAZVOJ ODREĐENOG VIRUSA ZAUZVRAT UTJECATI NA OSTATAK VIRUSA U ISTOJ BILJCI; TO JEST, VEĆA DIVERSIFIKACIJA PEPMV-A UTJECAT ĆE NA REKOLONIZACIJU NIŠA EKOLOŠKI SLIČNIM VIRUSIMA. (III) KAO POSLJEDICA TOGA, AKO BIOLOŠKA DJELOTVORNOST VIRUSA OVISI O NJIHOVOJ UČESTALOSTI U MIJEŠANIH INFEKCIJA, VRIJEME NASTUPA RAZLIČITIH INFEKCIJA MOGLO BI UTJECATI NA OVU POVRATNU INFORMACIJU. STOGA SU PREDLOŽENI CILJEVI SLJEDEĆI: 1) ISPITATI KAKO RAZLIČITI BIOTIČKI I ABIOTIČKI UVJETI UTJEČU NA EVOLUCIJSKU DINAMIKU PEPMV-A. 2) ODREDITI KAKO PEPMV DIVERSIFIKACIJA UTJEČE NA EVOLUCIJSKU DINAMIKU DRUGIH VIRUSA U MIJEŠANIM INFEKCIJAMA. 3) PROCIJENITI JE LI VRIJEME POČETKA INFEKCIJE LIJEKOM PEPMV VAŽNO U ODNOSU NA DRUGE VIRUSE TE UTVRDITI MOGUĆI MEHANIZAM ODGOVORAN ZA NATJECANJE VIRUSA U ISTOM BILJNOM TKIVU. (Croatian)
17 August 2022
0 references
VÄXTVIRUS HAR POTENTIAL ATT ORSAKA STORA EPIDEMIER OCH NEGATIVT PÅVERKA HÅLLBAR LIVSMEDELSPRODUKTION GENOM ATT MINSKA PRODUKTKVALITETEN OCH SKÖRDEAVKASTNINGEN. UTÖVER DE EPIDEMIOLOGISKA OMSTÄNDIGHETER SOM MÅSTE INTRÄFFA FÖR ATT STARTA EN EPIDEMI, HAR BÅDE GENETIK OCH EKOLOGI EN NYCKELROLL FÖR ATT AVGÖRA NÄR DESSA VIRUSSJUKDOMAR KAN UPPSTÅ. HITTILLS HAR STUDIER AV GENETISK MÅNGFALD AV VIRUS FRÄMST INRIKTATS PÅ SYSTEM MED ENKLA INFEKTIONER UNDER EXPERIMENTELLA FÖRHÅLLANDEN, ELLER PÅ ÖVERVAKNING AV EN VIRUSPOPULATION UNDER UTBROTTET AV EN VIRUSSJUKDOM, OCH DESSA FÖRENKLINGAR HAR LETT TILL KVALITATIVA OCH, MINDRE OFTA KVANTITATIVA, TOLKNINGAR AV VIRUSENS UTVECKLING OCH ANPASSNING. DET ÄR DOCK LÄMPLIGT OCH LÄGLIGT ATT BEHANDLA DESSA STUDIER MED EN HÖGRE GRAD AV KOMPLEXITET, NÄRA VERKLIGA SITUATIONER OCH EPIDEMIOLOGISKT RELEVANTA, MED TANKEN PÅ ATT HA EN MER FULLSTÄNDIG FÖRSTÅELSE FÖR DE MEKANISMER SOM FUNGERAR I NATUREN. EPIDEMIOLOGISKA STUDIER SOM UTFÖRTS I HORTICOLAKULTURER VISAR ATT FLERA VIRUSINFEKTIONER ÄR VANLIGARE ÄN VÄNTAT, OCH DET ÄR TROLIGT ATT EKOLOGISKA INTERAKTIONER MELLAN OLIKA VIRUS SOM INFEKTERAR SAMMA VÄXT HAR EN VIKTIG ROLL I UPPKOMSTEN AV SJUKDOMAR I SCENARIER DÄR DESSA SJUKDOMAR INTE EMERGERIATE PÅ GRUND AV ETT VIRUSS INDIVIDUELLA VERKAN. DETTA ÄR DOCK ÄNNU INTE UNDERSÖKT, OCH DET ÄR OKÄNT OM DET FINNS EN STÖRRE EVOLUTIONÄR KAPACITET FÖR VIRUS I BIOTISKA SNARARE ÄN ABIOTISKA MILJÖER I SAMBAND MED BLANDADE INFEKTIONER. DETTA PROJEKT SYFTAR TILL ATT FASTSTÄLLA HUR KONKURRENSEN MELLAN VIRUS PÅVERKAR DEN GENETISKA MÅNGFALDEN, INKLUSIVE ÅTERKOPPLING MELLAN EVOLUTIONSDIVERSIFIERINGEN AV ETT VISST VIRUS OCH RESTEN AV DE VIRUS SOM INFEKTERAR SAMMA VÄRD. I DETTA SYFTE KOMMER MAN ATT UNDERSÖKA NÄR OCH HUR BLANDADE INFEKTIONER ÄR VIKTIGA FÖR TOMAT, MED ANVÄNDNING AV TRE MYCKET PROBLEMATISKA VIRUSPATOGENER I DENNA GRÖDA. SÖT GURKA MOSAIKVIRUS (PEPMV), TOMATMOSAIKVIRUS (TOMV) OCH GURKA MOSAIKVIRUS (CMV). PROJEKTETS HYPOTESER ÄR: I) DEN GENETISKA MÅNGFALDEN HOS ETT SPECIFIKT VIRUS KOMMER ATT ACCELERERA PÅ GRUND AV FÖREKOMSTEN AV ANDRA VIRUS I SAMMA VÄXT, DVS. MÅNGFALDEN AV PEPMV KAN ÖKA TILL FÖLJD AV EN KONKURRENS MED ANDRA VIRUS FÖR ATT UPPTA SPECIFIKA NISCHER. II) DET KAN DÅ FÖRVÄNTAS ATT UTVECKLINGEN AV DET SPECIFIKA VIRUSET I SIN TUR KOMMER ATT PÅVERKA RESTEN AV VIRUSEN I SAMMA VÄXT. DET VILL SÄGA EN STÖRRE DIVERSIFIERING AV PEPMV KOMMER ATT PÅVERKA ÅTERKOLONISERINGEN AV NISCHER MED EKOLOGISKT LIKNANDE VIRUS. (III) SOM EN FÖLJD AV DETTA, OM DEN BIOLOGISKA EFFEKTEN AV VIRUSEN BEROR PÅ DERAS FREKVENS VID BLANDADE INFEKTIONER, KAN STARTTIDEN FÖR DE OLIKA INFEKTIONERNA PÅVERKA DENNA ÅTERKOPPLING. DE FÖRESLAGNA MÅLEN ÄR DÄRFÖR ATT 1) UNDERSÖKA HUR DE OLIKA BIOTISKA OCH ABIOTISKA FÖRHÅLLANDENA PÅVERKAR DEN EVOLUTIONÄRA DYNAMIKEN HOS PEPMV. 2) BESTÄMMA HUR PEPMV DIVERSIFIERING PÅVERKAR EVOLUTIONSDYNAMIKEN HOS ANDRA VIRUS VID BLANDADE INFEKTIONER. 3) ATT UTVÄRDERA OM STARTTIDEN FÖR PEPMV-INFEKTIONER MED AVSEENDE PÅ ANDRA VIRUS ÄR VIKTIG, OCH ATT IDENTIFIERA DEN MÖJLIGA MEKANISMEN SOM ÄR ANSVARIG FÖR KONKURRENSEN MELLAN VIRUSEN I SAMMA VÄXTVÄVNAD. (Swedish)
17 August 2022
0 references
VIRUSURILE PLANTELOR AU POTENȚIALUL DE A PROVOCA EPIDEMII MAJORE ȘI DE A AFECTA NEGATIV PRODUCȚIA ALIMENTARĂ DURABILĂ PRIN REDUCEREA CALITĂȚII PRODUSELOR ȘI A RANDAMENTULUI CULTURILOR. DINCOLO DE CIRCUMSTANȚELE EPIDEMIOLOGICE CARE TREBUIE SĂ APARĂ PENTRU A ÎNCEPE O EPIDEMIE, ATÂT GENETICA, CÂT ȘI ECOLOGIA AU UN ROL ESENȚIAL ÎN DETERMINAREA MOMENTULUI ÎN CARE POT APĂREA ACESTE BOLI VIRALE. PÂNĂ ÎN PREZENT, STUDIILE PRIVIND DIVERSITATEA GENETICĂ A VIRUSURILOR S-AU AXAT ÎN PRINCIPAL PE SISTEME DE INFECȚII SIMPLE ÎN CONDIȚII EXPERIMENTALE SAU PE MONITORIZAREA UNEI POPULAȚII DE VIRUSURI ÎN TIMPUL IZBUCNIRII UNEI BOLI VIRALE, IAR ACESTE SIMPLIFICĂRI AU CONDUS LA INTERPRETĂRI CALITATIVE ȘI, MAI PUȚIN FRECVENT CANTITATIVE, ALE EVOLUȚIEI ȘI ADAPTĂRII VIRUSURILOR. CU TOATE ACESTEA, ESTE CONVENABIL ȘI OPORTUN SĂ SE ABORDEZE ACESTE STUDII CU UN NIVEL MAI RIDICAT DE COMPLEXITATE, APROAPE DE SITUAȚII REALE ȘI RELEVANTE DIN PUNCT DE VEDERE EPIDEMIOLOGIC, CU IDEEA DE A AVEA O ÎNȚELEGERE MAI COMPLETĂ A MECANISMELOR CARE FUNCȚIONEAZĂ ÎN NATURĂ. STUDIILE EPIDEMIOLOGICE EFECTUATE ÎN CULTURI DE HORTICOLĂ ARATĂ CĂ INFECȚIILE VIRALE MULTIPLE SUNT MAI FRECVENTE DECÂT SE PRECONIZASE ȘI ESTE PROBABIL CA INTERACȚIUNILE ECOLOGICE DINTRE DIFERITELE VIRUSURI CARE INFECTEAZĂ ACEEAȘI PLANTĂ SĂ AIBĂ UN ROL IMPORTANT ÎN APARIȚIA BOLILOR ÎN SCENARII ÎN CARE ACESTE BOLI NU SUNT EMERGERIATE DATORITĂ ACȚIUNII INDIVIDUALE A UNUI VIRUS. CU TOATE ACESTEA, ACEST LUCRU NU A FOST ÎNCĂ INVESTIGAT ȘI NU SE CUNOAȘTE DACĂ EXISTĂ O CAPACITATE EVOLUTIVĂ MAI MARE PENTRU VIRUSURI ÎN MEDII BIOTICE, MAI DEGRABĂ DECÂT ABIOTICE, ÎN CONTEXTUL INFECȚIILOR MIXTE. ACEST PROIECT ÎȘI PROPUNE SĂ DETERMINE IMPACTUL CONCURENȚEI DINTRE VIRUSURI ASUPRA DIVERSITĂȚII GENETICE, INCLUSIV FEEDBACK-UL DINTRE DIVERSIFICAREA EVOLUTIVĂ A UNUI ANUMIT VIRUS ȘI RESTUL VIRUSURILOR CARE INFECTEAZĂ ACEEAȘI GAZDĂ. ÎN ACEST SCOP, VA FI EXAMINAT MOMENTUL ȘI MODUL ÎN CARE INFECȚIILE MIXTE SUNT IMPORTANTE PENTRU TOMATE, UTILIZÂNDU-SE TREI AGENȚI PATOGENI VIRALI FOARTE PROBLEMATICI ÎN ACEASTĂ CULTURĂ; VIRUSUL MOZAICULUI CASTRAVETE DULCE (PEPMV), VIRUSUL MOZAICULUI DE TOMATE (TOMV) ȘI VIRUSUL MOZAICULUI CASTRAVEȚI (CMV). IPOTEZELE PROIECTULUI SUNT: (I) DIVERSITATEA GENETICĂ A UNUI ANUMIT VIRUS SE VA ACCELERA DATORITĂ PREZENȚEI ALTOR VIRUSURI ÎN ACEEAȘI PLANTĂ, ADICĂ DIVERSITATEA PEPMV POATE FI CRESCUTĂ CA URMARE A UNEI COMPETIȚII CU ALȚI VIRUȘI PENTRU A OCUPA NIȘE SPECIFICE. (II) ATUNCI ESTE DE AȘTEPTAT CA EVOLUȚIA VIRUSULUI SPECIFIC SĂ AFECTEZE, LA RÂNDUL SĂU, RESTUL VIRUSURILOR DIN ACEEAȘI PLANTĂ; ADICĂ, O MAI MARE DIVERSIFICARE A PEPMV VA INFLUENȚA RECOLONIZAREA NIȘELOR PRIN VIRUSURI SIMILARE DIN PUNCT DE VEDERE ECOLOGIC. (III) ÎN CONSECINȚĂ, DACĂ EFICACITATEA BIOLOGICĂ A VIRUSURILOR DEPINDE DE FRECVENȚA ACESTORA ÎN CAZUL INFECȚIILOR MIXTE, TIMPUL DE DEBUT AL DIFERITELOR INFECȚII AR PUTEA AFECTA ACEST FEEDBACK. PRIN URMARE, OBIECTIVELE PROPUSE SUNT: 1) EXAMINAȚI MODUL ÎN CARE DIFERITELE CONDIȚII BIOTICE ȘI ABIOTICE AFECTEAZĂ DINAMICA EVOLUTIVĂ A PEPMV. 2) DETERMINAREA MODULUI ÎN CARE DIVERSIFICAREA PEPMV AFECTEAZĂ DINAMICA EVOLUTIVĂ A ALTOR VIRUSURI ÎN INFECȚII MIXTE. 3) SĂ EVALUEZE DACĂ ESTE IMPORTANT MOMENTUL DE ÎNCEPERE A INFECȚIILOR CU PEPMV FAȚĂ DE ALȚI VIRUȘI ȘI SĂ IDENTIFICE POSIBILUL MECANISM RESPONSABIL PENTRU CONCURENȚA DINTRE VIRUSURILE DIN ACELAȘI ȚESUT VEGETAL. (Romanian)
17 August 2022
0 references
RASTLINSKI VIRUSI LAHKO POVZROČIJO VEČJE EPIDEMIJE IN NEGATIVNO VPLIVAJO NA TRAJNOSTNO PROIZVODNJO HRANE Z ZMANJŠANJEM KAKOVOSTI PROIZVODOV IN PRIDELKA. POLEG EPIDEMIOLOŠKIH OKOLIŠČIN, KI SE MORAJO ZGODITI ZA ZAČETEK EPIDEMIJE, IMATA TAKO GENETIKA KOT EKOLOGIJA KLJUČNO VLOGO PRI DOLOČANJU, KDAJ SE LAHKO POJAVIJO TE VIRUSNE BOLEZNI. DOSLEJ SO SE ŠTUDIJE GENSKE RAZNOVRSTNOSTI VIRUSOV OSREDOTOČALE PREDVSEM NA SISTEME PREPROSTIH OKUŽB V POSKUSNIH POGOJIH ALI NA SPREMLJANJE VIRUSNE POPULACIJE MED IZBRUHOM VIRUSNE BOLEZNI, TE POENOSTAVITVE PA SO PRIVEDLE DO KVALITATIVNIH IN MANJ POGOSTO KVANTITATIVNIH INTERPRETACIJ RAZVOJA IN PRILAGAJANJA VIRUSOV. VENDAR JE PRIMERNO IN PRAVOČASNO OBRAVNAVATI TE ŠTUDIJE Z VIŠJO STOPNJO ZAPLETENOSTI, BLIZU RESNIČNIM RAZMERAM IN EPIDEMIOLOŠKO RELEVANTNIMI, PRI ČEMER JE ZAMISEL O CELOVITEJŠEM RAZUMEVANJU MEHANIZMOV, KI DELUJEJO V NARAVI. EPIDEMIOLOŠKE ŠTUDIJE, IZVEDENE V KULTURAH HORTIOLE, KAŽEJO, DA SO ŠTEVILNE VIRUSNE OKUŽBE PO NARAVI POGOSTEJŠE, KOT JE BILO PRIČAKOVANO, IN VERJETNO JE, DA IMAJO EKOLOŠKE INTERAKCIJE MED RAZLIČNIMI VIRUSI, KI OKUŽIJO ISTO RASTLINO, POMEMBNO VLOGO PRI POJAVU BOLEZNI V SCENARIJIH, KJER SE TE BOLEZNI NE EMERGERIATE ZARADI INDIVIDUALNEGA DELOVANJA VIRUSA. VENDAR JE TREBA TO ŠE RAZISKATI IN NI ZNANO, ALI OBSTAJA VEČJA EVOLUCIJSKA ZMOGLJIVOST VIRUSOV V BIOTIČNIH IN NE ABIOTSKIH OKOLJIH V OKVIRU MEŠANIH OKUŽB. CILJ TEGA PROJEKTA JE DOLOČITI VPLIV KONKURENCE MED VIRUSI NA GENSKO RAZNOVRSTNOST, VKLJUČNO S POVRATNIMI INFORMACIJAMI MED EVOLUCIJSKO DIVERZIFIKACIJO DOLOČENEGA VIRUSA IN PREOSTALIMI VIRUSI, KI OKUŽIJO ISTEGA GOSTITELJA. V TA NAMEN SE BO PREUČILO, KDAJ IN KAKO SO MEŠANE OKUŽBE POMEMBNE ZA PARADIŽNIK, PRI ČEMER SE BODO UPORABILI TRIJE ZELO PROBLEMATIČNI VIRUSNI PATOGENI V TEM PRIDELKU; MOZAIČNI VIRUS SLADKE KUMARE (PEPMV), MOZAIČNI VIRUS PARADIŽNIKA (TOMV) IN VIRUS MOZAIKA KUMARE (CMV). HIPOTEZE PROJEKTA SO: (I) GENETSKA RAZNOVRSTNOST DOLOČENEGA VIRUSA SE BO POSPEŠILA ZARADI PRISOTNOSTI DRUGIH VIRUSOV V ISTI RASTLINI, I.E. SE LAHKO RAZNOLIKOST PEPMV POVEČA ZARADI TEKMOVANJA Z DRUGIMI VIRUSI, DA BI ZAVZELI DOLOČENE NIŠE. (II) NATO SE LAHKO PRIČAKUJE, DA BO RAZVOJ SPECIFIČNEGA VIRUSA VPLIVAL NA PREOSTALE VIRUSE V ISTI RASTLINI; TO POMENI, DA BO VEČJA DIVERZIFIKACIJA PEPMV VPLIVALA NA REKOLONIZACIJO NIŠ Z EKOLOŠKO PODOBNIMI VIRUSI. (III) ČE JE BIOLOŠKA UČINKOVITOST VIRUSOV ODVISNA OD NJIHOVE POGOSTNOSTI PRI MEŠANIH OKUŽBAH, BI LAHKO ČAS NASTANKA RAZLIČNIH OKUŽB VPLIVAL NA TO POVRATNO INFORMACIJO. PREDLAGANI CILJI SO TOREJ: 1) PREUČITI, KAKO RAZLIČNE BIOTSKE IN ABIOTSKE RAZMERE VPLIVAJO NA EVOLUCIJSKO DINAMIKO PEPMV. 2) UGOTOVITI, KAKO PEPMV DIVERZIFIKACIJA VPLIVA NA EVOLUCIJSKO DINAMIKO DRUGIH VIRUSOV PRI MEŠANIH OKUŽBAH. 3) OCENITI, ALI JE ZAČETNI ČAS OKUŽBE S PEPMV V PRIMERJAVI Z DRUGIMI VIRUSI POMEMBEN, IN OPREDELITI MOŽNI MEHANIZEM, KI JE ODGOVOREN ZA KONKURENCO MED VIRUSI V ISTEM RASTLINSKEM TKIVU. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
WIRUSY ROŚLINNE MOGĄ POWODOWAĆ POWAŻNE EPIDEMIE I NEGATYWNIE WPŁYWAĆ NA ZRÓWNOWAŻONĄ PRODUKCJĘ ŻYWNOŚCI POPRZEZ OBNIŻENIE JAKOŚCI PRODUKTÓW I PLONÓW. POZA OKOLICZNOŚCIAMI EPIDEMIOLOGICZNYMI, KTÓRE MUSZĄ WYSTĄPIĆ, ABY ROZPOCZĄĆ EPIDEMIĘ, ZARÓWNO GENETYKA, JAK I EKOLOGIA ODGRYWAJĄ KLUCZOWĄ ROLĘ W OKREŚLANIU, KIEDY MOGĄ WYSTĄPIĆ TE CHOROBY WIRUSOWE. DO TEJ PORY BADANIA NAD RÓŻNORODNOŚCIĄ GENETYCZNĄ WIRUSÓW KONCENTROWAŁY SIĘ GŁÓWNIE NA SYSTEMACH PROSTYCH ZAKAŻEŃ W WARUNKACH DOŚWIADCZALNYCH LUB NA MONITOROWANIU POPULACJI WIRUSÓW PODCZAS WYBUCHU CHOROBY WIRUSOWEJ, A UPROSZCZENIA TE DOPROWADZIŁY DO JAKOŚCIOWYCH I, RZADZIEJ ILOŚCIOWYCH, INTERPRETACJI EWOLUCJI I ADAPTACJI WIRUSÓW. JEST JEDNAK WYGODNE I TERMINOWE, ABY ZAJĄĆ SIĘ TYMI BADANIAMI O WYŻSZYM STOPNIU ZŁOŻONOŚCI, ZBLIŻONYM DO RZECZYWISTYCH SYTUACJI I ISTOTNYM EPIDEMIOLOGICZNIE, Z MYŚLĄ O PEŁNIEJSZEGO ZROZUMIENIA MECHANIZMÓW, KTÓRE DZIAŁAJĄ W NATURZE. BADANIA EPIDEMIOLOGICZNE PRZEPROWADZONE W KULTURACH OGRODNIKÓW WYKAZUJĄ, ŻE WIELE ZAKAŻEŃ WIRUSOWYCH MA CHARAKTER BARDZIEJ POWSZECHNY NIŻ OCZEKIWANO, I PRAWDOPODOBNE JEST, ŻE INTERAKCJE EKOLOGICZNE MIĘDZY RÓŻNYMI WIRUSAMI, KTÓRE ZAKAŻAJĄ TĘ SAMĄ ROŚLINĘ, ODGRYWAJĄ WAŻNĄ ROLĘ W POJAWIANIU SIĘ CHORÓB W SCENARIUSZACH, W KTÓRYCH CHOROBY TE NIE SĄ EMERGERIATE ZE WZGLĘDU NA INDYWIDUALNE DZIAŁANIE WIRUSA. NIE WIADOMO JEDNAK, CZY ISTNIEJE WIĘKSZA ZDOLNOŚĆ EWOLUCYJNA WIRUSÓW W ŚRODOWISKACH BIOTYCZNYCH NIŻ ABIOTYCZNYCH W KONTEKŚCIE ZAKAŻEŃ MIESZANYCH. PROJEKT TEN MA NA CELU OKREŚLENIE WPŁYWU KONKURENCJI MIĘDZY WIRUSAMI NA RÓŻNORODNOŚĆ GENETYCZNĄ, W TYM INFORMACJE ZWROTNE MIĘDZY EWOLUCYJNĄ DYWERSYFIKACJĄ DANEGO WIRUSA A RESZTĄ WIRUSÓW, KTÓRE ZARAŻAJĄ TEGO SAMEGO ŻYWICIELA. W TYM CELU ZOSTANIE ZBADANE, KIEDY I W JAKI SPOSÓB ZAKAŻENIA MIESZANE SĄ WAŻNE DLA POMIDORA, WYKORZYSTUJĄC W TEJ UPRAWIE TRZY BARDZO PROBLEMATYCZNE PATOGENY WIRUSOWE; WIRUS MOZAIKI SŁODKIEGO OGÓRKA (PEPMV), WIRUS MOZAIKI POMIDOROWEJ (TOMV) I WIRUS MOZAIKI OGÓRKA (CMV). HIPOTEZY PROJEKTU SĄ NASTĘPUJĄCE: (I) RÓŻNORODNOŚĆ GENETYCZNA OKREŚLONEGO WIRUSA PRZYSPIESZY ZE WZGLĘDU NA OBECNOŚĆ INNYCH WIRUSÓW W TEJ SAMEJ ROŚLINIE, NP. RÓŻNORODNOŚĆ PEPMV MOŻE ZOSTAĆ ZWIĘKSZONA W WYNIKU KONKURENCJI Z INNYMI WIRUSAMI, ABY ZAJĄĆ OKREŚLONE NISZE. MOŻNA ZATEM OCZEKIWAĆ, ŻE EWOLUCJA KONKRETNEGO WIRUSA WPŁYNIE Z KOLEI NA RESZTĘ WIRUSÓW W TEJ SAMEJ ROŚLINIE; OZNACZA TO, ŻE WIĘKSZA DYWERSYFIKACJA PEPMV WPŁYNIE NA REKOLONIZACJĘ NISZ PRZEZ PODOBNE EKOLOGICZNIE WIRUSY. (III) W KONSEKWENCJI, JEŻELI SKUTECZNOŚĆ BIOLOGICZNA WIRUSÓW ZALEŻY OD ICH CZĘSTOŚCI WYSTĘPOWANIA W ZAKAŻENIACH MIESZANYCH, CZAS WYSTĄPIENIA RÓŻNYCH INFEKCJI MOŻE WPŁYNĄĆ NA TĘ INFORMACJĘ ZWROTNĄ. PROPONOWANE CELE SĄ ZATEM NASTĘPUJĄCE: 1) ZBADAĆ, JAK RÓŻNE WARUNKI BIOTYCZNE I ABIOTYCZNE WPŁYWAJĄ NA EWOLUCYJNĄ DYNAMIKĘ PEPMV. 2) OKREŚLIĆ, W JAKI SPOSÓB DYWERSYFIKACJA PEPMV WPŁYWA NA EWOLUCYJNĄ DYNAMIKĘ INNYCH WIRUSÓW W ZAKAŻENIACH MIESZANYCH. 3) OCENA, CZY CZAS ROZPOCZĘCIA ZAKAŻEŃ PEPMV W ODNIESIENIU DO INNYCH WIRUSÓW JEST WAŻNY, ORAZ OKREŚLENIE MOŻLIWEGO MECHANIZMU ODPOWIEDZIALNEGO ZA KONKURENCJĘ MIĘDZY WIRUSAMI W TEJ SAMEJ TKANCE ROŚLINNEJ. (Polish)
17 August 2022
0 references
Murcia
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
AGL2014-59556-R
0 references