INTEGRATED OMICO ANALYSIS OF THE EFFECTS OF THE MEDITERRANEAN DIET ON AGING, METILACION DYNAMICS, GENETIC MODULATION AND ITS ASSOCIATION WITH CARDIOVASCULAR PHENOTYPES (Q3147607)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3147607 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | INTEGRATED OMICO ANALYSIS OF THE EFFECTS OF THE MEDITERRANEAN DIET ON AGING, METILACION DYNAMICS, GENETIC MODULATION AND ITS ASSOCIATION WITH CARDIOVASCULAR PHENOTYPES |
Project Q3147607 in Spain |
Statements
52,707.6 Euro
0 references
96,800.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
30 December 2016
0 references
31 December 2020
0 references
UNIVERSIDAD DE VALENCIA
0 references
46100
0 references
EN EL ESTUDIO PREDIMED (ENSAYO DE INTERVENCION DIETETICA INCLUYENDO 7447 PARTICIPANTES SEGUIDOS DURANTE UNA MEDIANA DE 4,8 AÑOS) HEMOS DEMOSTRADO QUE LOS EFECTOS PROTECTORES DE LA DIETA MEDITERRANEA (MEDDIET) FRENTE A DISTINTOS FENOTIPOS INTERMEDIOS Y FINALES DE ENFERMEDAD CARDIOVASCULAR (ECV). SIN EMBARGO SON TODAVIA POCO CONOCIDOS LOS MECANISMOS PARA ESTE EFECTO PROTECTOR. LOS PRIMEROS ANALISIS NUTRIGENETICOS EN EL ESTUDIO PREDIMED NOS HAN PERMITIDO DETECTAR IMPORTANTES INTERACCIONES GEN-DIETA QUE ES NECESARIO CONOCER CON MAS PROFUNDIDAD CON LA INTEGRACION DE TECNOLOGIAS OMICAS INCLUYENDO GENOMICA, EPIGENOMICA (FUNDAMENTALMENTE A TRAVES DE ESTUDIOS DE METILACION DEL ADN). ADEMAS, EXISTE GRAN INTERES EN EL ESTUDIO DE BIOMARCADORES DE ENVEJECIMIENTO BASADOS EN EL PERFIL DE METILACION DEL ADN, TAMBIEN DENOMINADO ¿RELOJ EPIGENETICO¿. CON ELLO SE DETERMINA LA DENOMINADA EDAD BIOLOGICA (BASADA EN EL PERFIL DE METILACION) FRENTE A LA EDAD CRONOLOGICA. SU DIFERENCIA SE DENOMINA ENVEJECIMIENTO ACELERADO Y SE HA ASOCIADO CON MAS MORTALIDAD. SE SABE QUE LOS DISTINTOS COMPONENTES DE LA DIETA PUEDEN EJERCER CAMBIOS EN LA METILACION DEL ADN, PERO ESTOS CAMBIOS NO ESTAN BIEN CARACTERIZADOS EN EL TIEMPO, NI SE CONOCEN SUS ASPECTOS DINAMICOS NI SU INFLUENCIA SOBRE LOS BIOMARCADORES METILOMICOS DE ENVEJECIMIENTO NI SOBRE FENOTIPOS INTERMEDIOS Y FINALES DE ECV. POR ELLO NUESTRO OBJETIVO GENERAL ES ANALIZAR EFECTO DE LA MEDDIET EN EL PERFIL METILOMICO , TANTO DE MANERA GENERAL COMO EN LOS MARCADORES ENVEJECIMIENTO (EDAD BIOLOGICA DEL ADN) Y EN EL PERFIL METILOMICO DIFERENCIAL DE RIESGO CARDIOVASCULAR, OBSERVANDO DE MANERA DINAMICA SUS CAMBIOS EN EL TIEMPO FRENTE A LA DIETA CONTROL. TODO ELLO ADEMAS DESDE UN PUNTO DE VISTA INTEGRADO CON LA GENOMICA._x000D_ EN PRIMER LUGAR SE REALIZARA UN DISEÑO DE CASOS DE ECV Y DE CONTROLES ANIDADO EN LA COHORTE PREDIMED-VALENCIA Y EN UNA MUESTRA ALEATORIA DE OTROS NODOS (60 CASOS DE ECV Y 60 CONTROLES) PARA REALIZAR UN ESTUDIO DE METILACION DE EPIGENOMA COMPLETO INTEGRADO CON UN ESTUDIO DE GENOTIPADO DENSO EN LOS MISMOS PARTICIPANTES. EL ESTUDIO DE EPIGENOMA SE REALIZARA DE MANERA DINAMICA (BASAL Y EN DOS TIEMPOS DE SEGUIMIENTO). SE CALCULARAN VARIOS MARCADORES DE ENVEJECIMIENTO DEL ADN BASADO EN METILOMA, ENTRE ELLOS EL DE HORVATH (353 SONDAS), EL DE HANNUM (71 SONDAS) Y EL DE WEIDNER (3 LOCI). TAMBIEN SE DETERMINARAN LOS PERFILES EPIGENOMICOS ASOCIADOS A LA ECV INCIDENTE Y A SUS FENOTIPOS INTERMEDIOS. EL ANALISIS OMICO INTEGRADO PERMITIRA IDENTIFICAR LOS POLIMORFISMOS GENETICOS ASOCIADOS A ESTOS MARCADORES DE METILACION Y CREAR GENETIC RISK SCORES (GRS) QUE SE PODRAN UTILIZAR COMO PROXIS DE BIOMARCADORES DE ENVEJECIMIENTO Y METILACION PARA EL TOTAL DE LA MUESTRA. SE SELECCIONARAN 40 SNPS QUE SE DETERMINARAN EN EL TOTAL DEL ESTUDIO PREDIMED (N=7100). TAMBIEN SE DETERMINARA LA METILACION DE LOCI SELECCIONADOS EN EL TOTAL DE LOS CASOS DE ECV Y UNA MUESTRA ALEATORIA DE LA COHORTE. MEDIANTE MODELOS DE REGRESION DE COX MULTIVARIANTE CON TERMINOS DE INTERACCION DE DETERMINARA EL EFECTO GENO-EPIGENOMICO DE ESTOS MARCADORES EN LA INCIDENCIA DE ECV Y MORTALIDAD. PARALELAMENTE, SE VALIDARAN LOS MARCADORES GENOMICOS Y EPIGENOMICOS, INCLUYENDO UN ANALISIS TRANSCRIPTOMICO EN UNA SUBMUESTRA DE PARTICIPANTES EN EL ESTUDIO PREDIMED PLUS-VALENCIA. SE EMPLEARAN TECNICAS DE INTEGRACION DE OMICAS (COINERCIA, ETC) PARA LOS ANALISIS DE LOS DIFERENTES NIVELES. (Spanish)
0 references
IN THE PREDIMED STUDY (A DIETARY INTERVENTION TRIAL INCLUDING 7447 PARTICIPANTS FOLLOWED OVER A MEDIAN OF 4.8 YEARS) WE HAVE SHOWN THAT THE PROTECTIVE EFFECTS OF THE MEDITERRANEAN DIET (MEDDIET) AGAINST DIFFERENT INTERMEDIATE AND END PHENOTYPES OF CARDIOVASCULAR DISEASE (CVD). HOWEVER, THE MECHANISMS FOR THIS PROTECTIVE EFFECT ARE STILL LITTLE KNOWN. THE FIRST NUTRIGENETIC ANALYSES IN THE PREDIMED STUDY HAVE ALLOWED US TO DETECT IMPORTANT GEN-DIET INTERACTIONS THAT WE NEED TO KNOW MORE DEEPLY WITH THE INTEGRATION OF OMIC TECHNOLOGIES INCLUDING GENOMICA, EPIGENOMICA (MAINLY THROUGH STUDIES OF DNA METILACION). IN ADDITION, THERE IS GREAT INTEREST IN THE STUDY OF BIOMARKERS OF AGING BASED ON THE PROFILE OF DNA METILACION, ALSO CALLED EPIGENETIC CLOCK? THIS DETERMINES THE SO-CALLED BIOLOGICAL AGE (BASED ON THE METILACION PROFILE) VERSUS THE CHRONOLOGICAL AGE. ITS DIFFERENCE IS CALLED ACCELERATED AGING AND HAS BEEN ASSOCIATED WITH MORE MORTALITY. IT IS KNOWN THAT THE DIFFERENT COMPONENTS OF THE DIET CAN EXERT CHANGES IN DNA METILATION, BUT THESE CHANGES ARE NOT WELL CHARACTERISED OVER TIME, NOR ARE THEIR DYNAMIC ASPECTS KNOWN OR THEIR INFLUENCE ON THE METILOMIC BIOMARKERS OF AGING OR ON INTERMEDIATE AND FINAL CVD PHENOTYPES. FOR THIS REASON OUR GENERAL OBJECTIVE IS TO ANALYSE THE EFFECT OF MEDDIET ON THE METILOMICO PROFILE, BOTH IN A GENERAL WAY AND IN MARKERS AGING (BIOLOGICAL AGE OF DNA) AND ON THE DIFFERENTIAL METILOMICO PROFILE OF CARDIOVASCULAR RISK, OBSERVING DYNAMICALLY ITS CHANGES OVER TIME COMPARED TO THE CONTROL DIET. In the first place there will be a design of ECV cases and animal control cases in the Predimed-VALENCE COHORTE and in a different language of other nodes (60 cases of ECV and 60 controls) to perform a state of affairs. integrated COMPLETE epigenome METILATION WITH A GENOTIPATED STUDY OF DENSE IN PARTICIPANT MISS. THE EPIGENOMA STUDY WILL BE CONDUCTED IN A DYNAMIC MANNER (BASAL AND IN TWO FOLLOW-UP TIMES). SEVERAL METHYLOMA-BASED DNA AGING MARKERS WILL BE CALCULATED, INCLUDING HORVATH (353 PROBES), HANNUM (71 PROBES) AND WEIDNER (3 LOCI) MARKERS. THE EPIGENOMIC PROFILES ASSOCIATED WITH THE INCIDENT CVD AND ITS INTERMEDIATE PHENOTYPES WILL ALSO BE DETERMINED. THE INTEGRATED OMICO ANALYSIS WILL IDENTIFY THE GENETIC POLYMORPHISMS ASSOCIATED WITH THESE METILACION MARKERS AND CREATE GENETIC RISK SCORES (GRS) THAT CAN BE USED AS PROXIES OF AGING AND METILACION BIOMARKERS FOR THE TOTAL SAMPLE. 40 SNPS WILL BE SELECTED TO BE DETERMINED IN THE TOTAL PREDIMED STUDY (N=7100). THE METILACION OF LOCI SELECTED IN THE TOTAL CASES OF CVD AND A RANDOM SAMPLE OF THE COHORT WILL ALSO BE DETERMINED. USING MULTIVARIATE COX REGRESSION MODELS WITH TERMS OF INTERACTION TO DETERMINE THE GENO-EPIGENOMIC EFFECT OF THESE MARKERS IN THE INCIDENCE OF CVD AND MORTALITY. IN PARALLEL, GENOMIC AND EPIGENOMIC MARKERS WILL BE VALIDATED, INCLUDING A TRANSCRIPTOMIC ANALYSIS IN A SUBSAMPLE OF PARTICIPANTS IN THE PREDIMED PLUS-VALENCIA STUDY. OMIC INTEGRATION TECHNIQUES (COINERCIA, ETC) WILL BE USED FOR THE ANALYSIS OF THE DIFFERENT LEVELS. (English)
12 October 2021
0.1937901517079106
0 references
DANS L’ÉTUDE PREDIMED (UN ESSAI D’INTERVENTION ALIMENTAIRE INCLUANT 7447 PARTICIPANTS, SUIVI D’UNE MÉDIANE DE 4,8 ANS), NOUS AVONS MONTRÉ QUE LES EFFETS PROTECTEURS DU RÉGIME MÉDITERRANÉEN (MEDDIET) CONTRE DIFFÉRENTS PHÉNOTYPES INTERMÉDIAIRES ET FINAUX DES MALADIES CARDIOVASCULAIRES (CVD). CEPENDANT, LES MÉCANISMES DE CET EFFET PROTECTEUR SONT ENCORE PEU CONNUS. LES PREMIÈRES ANALYSES NUTRIGÉNÉTIQUES DE L’ÉTUDE PREDIMED NOUS ONT PERMIS DE DÉTECTER D’IMPORTANTES INTERACTIONS GEN-DIÈTES QUE NOUS DEVONS CONNAÎTRE PLUS EN PROFONDEUR AVEC L’INTÉGRATION DES TECHNOLOGIES OMIQUES, Y COMPRIS LE GÉNOMIQUE, EPIGENOMICA (PRINCIPALEMENT À TRAVERS DES ÉTUDES DE L’ADN METILACION). EN OUTRE, IL Y A UN GRAND INTÉRÊT POUR L’ÉTUDE DES BIOMARQUEURS DU VIEILLISSEMENT BASÉ SUR LE PROFIL DE L’ADN METILACION, ÉGALEMENT APPELÉ HORLOGE ÉPIGÉNÉTIQUE? CECI DÉTERMINE L’ÂGE DIT BIOLOGIQUE (BASÉ SUR LE PROFIL METILACION) PAR RAPPORT À L’ÂGE CHRONOLOGIQUE. SA DIFFÉRENCE S’APPELLE LE VIEILLISSEMENT ACCÉLÉRÉ ET A ÉTÉ ASSOCIÉE À PLUS DE MORTALITÉ. ON SAIT QUE LES DIFFÉRENTS COMPOSANTS DE L’ALIMENTATION PEUVENT MODIFIER LA MÉTILATION DE L’ADN, MAIS CES CHANGEMENTS NE SONT PAS BIEN CARACTÉRISÉS AU FIL DU TEMPS, ET LEURS ASPECTS DYNAMIQUES NE SONT PAS CONNUS OU LEUR INFLUENCE SUR LES BIOMARQUEURS METILOMIC DU VIEILLISSEMENT OU SUR LES PHÉNOTYPES INTERMÉDIAIRES ET FINAUX CVD. C’EST POURQUOI NOTRE OBJECTIF GÉNÉRAL EST D’ANALYSER L’EFFET DE MEDDIET SUR LE PROFIL METILOMICO, TANT DE MANIÈRE GÉNÉRALE QUE DANS LE VIEILLISSEMENT DES MARQUEURS (ÂGE BIOLOGIQUE DE L’ADN) ET SUR LE PROFIL DIFFÉRENTIEL METILOMICO DU RISQUE CARDIOVASCULAIRE, EN OBSERVANT DYNAMIQUEMENT SES CHANGEMENTS DANS LE TEMPS PAR RAPPORT AU RÉGIME TÉMOIN. En premier lieu, il y aura une conception des cas de VEC et des cas de contrôle animal dans la cohorte Predimed-VALENCE et dans une langue différente d’autres nœuds (60 cas de VCE et 60 témoins) pour effectuer un état de choses. L’ÉTUDE EPIGENOMA SERA MENÉE DE MANIÈRE DYNAMIQUE (DE BASE ET EN DEUX TEMPS DE SUIVI). PLUSIEURS MARQUEURS DE VIEILLISSEMENT D’ADN À BASE DE METHYLOMA SERONT CALCULÉS, Y COMPRIS LES MARQUEURS HORVATH (353 SONDES), HANNUM (71 SONDES) ET WEIDNER (3 LOCI). LES PROFILS ÉPIGÉNOMIQUES ASSOCIÉS À LA MCV INCIDENTE ET À SES PHÉNOTYPES INTERMÉDIAIRES SERONT ÉGALEMENT DÉTERMINÉS. L’ANALYSE INTÉGRÉE OMICO PERMETTRA D’IDENTIFIER LES POLYMORPHISMES GÉNÉTIQUES ASSOCIÉS À CES MARQUEURS METILACION ET DE CRÉER DES SCORES DE RISQUE GÉNÉTIQUE (GRS) QUI PEUVENT ÊTRE UTILISÉS COMME MANDATAIRES DU VIEILLISSEMENT ET DES BIOMARQUEURS METILACION POUR L’ÉCHANTILLON TOTAL. 40 PNS SERONT SÉLECTIONNÉS POUR ÊTRE DÉTERMINÉS DANS L’ÉTUDE PREDIMED TOTALE (N=7100). ON DÉTERMINERA ÉGALEMENT LA MÉTILACION DES LOCI SÉLECTIONNÉS DANS LE TOTAL DES CAS DE MCV ET UN ÉCHANTILLON ALÉATOIRE DE LA COHORTE. EN UTILISANT DES MODÈLES MULTIVARIÉS DE RÉGRESSION DE COX AVEC DES TERMES D’INTERACTION POUR DÉTERMINER L’EFFET GÉNO-ÉPIGÉNOMIQUE DE CES MARQUEURS DANS L’INCIDENCE DES MALADIES CARDIOVASCULAIRES ET DE LA MORTALITÉ. PARALLÈLEMENT, LES MARQUEURS GÉNOMIQUES ET ÉPIGÉNOMIQUES SERONT VALIDÉS, Y COMPRIS UNE ANALYSE TRANSCRIPTOMIQUE DANS UN SOUS-ÉCHANTILLON DE PARTICIPANTS À L’ÉTUDE PREDIMED PLUS-VALENCIA. LES TECHNIQUES D’INTÉGRATION ATOMIQUE (COINERCIA, ETC.) SERONT UTILISÉES POUR L’ANALYSE DES DIFFÉRENTS NIVEAUX. (French)
2 December 2021
0 references
IN DER PREDIMED-STUDIE (EINE DIÄTETISCHE INTERVENTIONSSTUDIE MIT 7447 TEILNEHMERN FOLGTE ÜBER EINEN MEDIAN VON 4,8 JAHREN) HABEN WIR GEZEIGT, DASS DIE SCHÜTZENDEN WIRKUNGEN DER MEDITERRANEN ERNÄHRUNG (MEDDIET) GEGEN VERSCHIEDENE ZWISCHEN- UND ENDPHÄNOTYPEN VON HERZ-KREISLAUF-ERKRANKUNGEN (CVD) GEZEIGT HABEN. DIE MECHANISMEN FÜR DIESE SCHÜTZENDE WIRKUNG SIND JEDOCH NOCH WENIG BEKANNT. DIE ERSTEN NUTRIGENE ANALYSEN IN DER PREDIMED-STUDIE HABEN UNS ERLAUBT, WICHTIGE GEN-DIÄT-INTERAKTIONEN ZU ERKENNEN, DIE WIR MIT DER INTEGRATION VON OMISCHEN TECHNOLOGIEN, EINSCHLIESSLICH GENOMICA, EPIGENOMICA (HAUPTSÄCHLICH DURCH DNA METILACION) GENAUER WISSEN MÜSSEN. DARÜBER HINAUS BESTEHT GROSSES INTERESSE AN DER STUDIE VON BIOMARKERN DES ALTERNS BASIEREND AUF DEM PROFIL DER DNA METILACION, AUCH EPIGENETISCHE UHR GENANNT? DIES BESTIMMT DAS SOGENANNTE BIOLOGISCHE ALTER (BASIEREND AUF DEM METILACION-PROFIL) IM VERGLEICH ZUM CHRONOLOGISCHEN ALTER. SEIN UNTERSCHIED WIRD BESCHLEUNIGTES ALTERN GENANNT UND WURDE MIT MEHR STERBLICHKEIT IN VERBINDUNG GEBRACHT. ES IST BEKANNT, DASS DIE VERSCHIEDENEN KOMPONENTEN DER ERNÄHRUNG VERÄNDERUNGEN IN DER DNA METILATION BEWIRKEN KÖNNEN, ABER DIESE ÄNDERUNGEN SIND IM LAUFE DER ZEIT NICHT GUT CHARAKTERISIERT, NOCH SIND IHRE DYNAMISCHEN ASPEKTE BEKANNT ODER IHR EINFLUSS AUF DIE METILOMIC-BIOMARKER DER ALTERUNG ODER AUF ZWISCHEN- UND END-CVD-PHÄNOTYPEN. AUS DIESEM GRUND BESTEHT UNSER ALLGEMEINES ZIEL DARIN, DIE WIRKUNG VON MEDDIET AUF DAS METILOMICO-PROFIL ZU ANALYSIEREN, SOWOHL ALLGEMEIN ALS AUCH IN DER ALTERUNG VON MARKERN (BIOLOGISCHES ALTER DER DNA) UND AUF DAS DIFFERENTIAL- METILOMICO-PROFIL VON HERZ-KREISLAUF-RISIKO, WOBEI DIE VERÄNDERUNGEN IM LAUFE DER ZEIT IM VERGLEICH ZUR KONTROLLDIÄT DYNAMISCH BEOBACHTET WERDEN. In erster Linie werden ECV-Fälle und Tierkontrollfälle in der Predimed-VALENCE-Kohorte und in einer anderen Sprache anderer Knoten (60 Fälle von ECV und 60 Kontrollen) zur Durchführung eines Zustands konzipiert. DIE EPIGENOMA-STUDIE WIRD DYNAMISCH (BASAL UND IN ZWEI FOLGEZEITEN) DURCHGEFÜHRT. ES WERDEN MEHRERE AUF METHYLOMA BASIERENDE DNA-AGINGMARKER BERECHNET, DARUNTER HORVATH (353 SONDEN), HANNUM (71 SONDEN) UND WEIDNER (3 LOCI) MARKER. DIE EPIGENOMISCHEN PROFILE, DIE MIT DEM VORFALL CVD UND SEINEN ZWISCHENPHÄNOTYPEN VERBUNDEN SIND, WERDEN EBENFALLS ERMITTELT. DIE INTEGRIERTE OMICO-ANALYSE IDENTIFIZIERT DIE GENETISCHEN POLYMORPHISMEN, DIE MIT DIESEN METILACION MARKERN VERBUNDEN SIND, UND ERSTELLT GENETISCHE RISIKOSCORES (GRS), DIE ALS PROXIES VON ALTERUNGS- UND METILACION-BIOMARKERN FÜR DIE GESAMTPROBE VERWENDET WERDEN KÖNNEN. IN DER GESAMTEN PREDIMED-STUDIE (N=7100) WERDEN 40 SNPS AUSGEWÄHLT. AUCH DIE IN DEN GESAMTFÄLLEN DER CVD AUSGEWÄHLTE METILACION VON LOCI UND EINE ZUFALLSSTICHPROBE DER KOHORTE WERDEN ERMITTELT. VERWENDUNG VON MULTIVARIATEN COX-REGRESSIONSMODELLEN MIT BEGRIFFEN DER WECHSELWIRKUNG, UM DIE GENOEPIGENOMISCHE WIRKUNG DIESER MARKER IN DER INZIDENZ VON CVD UND MORTALITÄT ZU BESTIMMEN. PARALLEL DAZU WERDEN GENOMISCHE UND EPIGENOMISCHE MARKER VALIDIERT, EINSCHLIESSLICH EINER TRANSKRIPTOMANALYSE IN EINER TEILPROBE VON TEILNEHMERN DER PREDIMED PLUS-VALENCIA-STUDIE. OMIC INTEGRATIONSTECHNIKEN (COINERCIA USW.) WERDEN FÜR DIE ANALYSE DER VERSCHIEDENEN EBENEN VERWENDET. (German)
9 December 2021
0 references
IN HET PREDIMED-ONDERZOEK (EEN DIEETINTERVENTIEONDERZOEK MET 7447 DEELNEMERS VOLGDE OVER EEN MEDIAAN VAN 4,8 JAAR) HEBBEN WE AANGETOOND DAT DE BESCHERMENDE EFFECTEN VAN HET MEDITERRANE DIEET (MEDDIET) TEGEN VERSCHILLENDE TUSSEN- EN EINDFENOTYPEN VAN HART- EN VAATZIEKTEN (CVD). ECHTER, DE MECHANISMEN VOOR DIT BESCHERMENDE EFFECT ZIJN NOG STEEDS WEINIG BEKEND. DE EERSTE NUTRIGENETISCHE ANALYSES IN DE PREDIMED-STUDIE HEBBEN ONS IN STAAT GESTELD OM BELANGRIJKE GEN-DIEET-INTERACTIES TE DETECTEREN DIE WE BETER MOETEN KENNEN MET DE INTEGRATIE VAN OMISCHE TECHNOLOGIEËN, WAARONDER GENOMICA, EPIGENOMICA (VOORNAMELIJK DOOR ONDERZOEK NAAR DNA METILACION). BOVENDIEN IS ER GROTE BELANGSTELLING VOOR DE STUDIE VAN BIOMARKERS VAN VEROUDERING GEBASEERD OP HET PROFIEL VAN DNA METILACION, OOK WEL EPIGENETISCHE KLOK GENOEMD? DIT BEPAALT DE ZOGENAAMDE BIOLOGISCHE LEEFTIJD (GEBASEERD OP HET METILACION PROFIEL) VERSUS DE CHRONOLOGISCHE LEEFTIJD. HET VERSCHIL WORDT VERSNELDE VEROUDERING GENOEMD EN IS GEASSOCIEERD MET MEER STERFTE. HET IS BEKEND DAT DE VERSCHILLENDE COMPONENTEN VAN HET DIEET VERANDERINGEN IN DNA METILATIE KUNNEN UITOEFENEN, MAAR DEZE VERANDERINGEN WORDEN IN DE LOOP VAN DE TIJD NIET GOED GEKARAKTERISEERD, NOCH ZIJN HUN DYNAMISCHE ASPECTEN BEKEND OF HUN INVLOED OP DE METILOMIC-BIOMARKERS VAN VEROUDERING OF OP INTERMEDIAIRE EN DEFINITIEVE CVD-FENOTYPEN. OM DEZE REDEN IS ONZE ALGEMENE DOELSTELLING OM HET EFFECT VAN MEDDIET OP HET METILOMICO-PROFIEL TE ANALYSEREN, ZOWEL OP EEN ALGEMENE MANIER ALS IN MARKERS DIE OUDER WORDEN (BIOLOGISCHE LEEFTIJD VAN DNA) EN OP HET DIFFERENTIËLE METILOMICO-PROFIEL VAN CARDIOVASCULAIRE RISICO’S, WAARBIJ DYNAMISCH DE VERANDERINGEN IN DE TIJD WORDEN WAARGENOMEN IN VERGELIJKING MET HET CONTROLEDIEET. In de eerste plaats zal er een ontwerp zijn van ECV-gevallen en dierenbestrijdingsgevallen in de Predimed-VALENCE-cohorte en in een andere taal van andere knooppunten (60 gevallen van ECV en 60 controles) om een stand van zaken uit te voeren. DE EPIGENOMA-STUDIE ZAL DYNAMISCH WORDEN UITGEVOERD (BASIS- EN TWEE FOLLOW-UPTIJDEN). VERSCHILLENDE OP METHYLOMA GEBASEERDE DNA-VEROUDERINGSMARKERS ZULLEN WORDEN BEREKEND, WAARONDER HORVATH (353 SONDES), HANNUM (71 SONDES) EN WEIDNER (3 LOCI) MARKERS. DE EPIGENOMIC PROFIELEN IN VERBAND MET HET INCIDENT CVD EN DE TUSSENLIGGENDE FENOTYPES ZULLEN OOK WORDEN BEPAALD. DE GEÏNTEGREERDE OMICO-ANALYSE ZAL DE GENETISCHE POLYMORFISMEN IN VERBAND MET DEZE METILACION-MARKERS IDENTIFICEREN EN GENETISCHE RISICOSCORES (GRS) CREËREN DIE KUNNEN WORDEN GEBRUIKT ALS PROXIES VAN VEROUDERING EN METILACION-BIOMARKERS VOOR HET TOTALE MONSTER. 40 SNP’S ZULLEN WORDEN GESELECTEERD OM TE WORDEN BEPAALD IN HET TOTALE PREDIMED-ONDERZOEK (N=7100). DE METILACIE VAN LOCI GESELECTEERD IN DE TOTALE GEVALLEN VAN CVD EN EEN ASELECTE STEEKPROEF VAN HET COHORT ZAL OOK WORDEN BEPAALD. MET BEHULP VAN MULTIVARIATE COX REGRESSIEMODELLEN MET TERMEN VAN INTERACTIE OM HET GENO-EPIGENOMIC EFFECT VAN DEZE MARKERS IN DE INCIDENTIE VAN CVD EN MORTALITEIT TE BEPALEN. TEGELIJKERTIJD WORDEN GENOMIC EN EPIGENOMIC MARKERS GEVALIDEERD, INCLUSIEF EEN TRANSCRIPTOMISCHE ANALYSE IN EEN SUBSTEEKPROEF VAN DEELNEMERS AAN HET PREDIMED PLUS-VALENCIA ONDERZOEK. OMISCHE INTEGRATIETECHNIEKEN (COINERCIA, ENZ.) ZULLEN WORDEN GEBRUIKT VOOR DE ANALYSE VAN DE VERSCHILLENDE NIVEAUS. (Dutch)
17 December 2021
0 references
NELLO STUDIO PREDIMED (UNO STUDIO SULL'INTERVENTO ALIMENTARE CON 7447 PARTECIPANTI HA SEGUITO UNA MEDIANA DI 4,8 ANNI) ABBIAMO DIMOSTRATO CHE GLI EFFETTI PROTETTIVI DELLA DIETA MEDITERRANEA (MEDDIET) CONTRO DIVERSI FENOTIPI INTERMEDI E FINALI DI MALATTIE CARDIOVASCOLARI (CVD). TUTTAVIA, I MECCANISMI PER QUESTO EFFETTO PROTETTIVO SONO ANCORA POCO NOTI. LE PRIME ANALISI NUTRIGENETICHE DELLO STUDIO PREDIMED CI HANNO PERMESSO DI RILEVARE IMPORTANTI INTERAZIONI GEN-DIETA CHE ABBIAMO BISOGNO DI CONOSCERE PIÙ A FONDO CON L'INTEGRAZIONE DI TECNOLOGIE OMICHE TRA CUI GENOMICA, EPIGENOMICA (PRINCIPALMENTE ATTRAVERSO STUDI SU DNA METILACION). INOLTRE, C'È GRANDE INTERESSE PER LO STUDIO DEI BIOMARCATORI DELL'INVECCHIAMENTO BASATO SUL PROFILO DEL DNA METILACION, CHIAMATO ANCHE OROLOGIO EPIGENETICO? CIÒ DETERMINA LA COSIDDETTA ETÀ BIOLOGICA (BASATA SUL PROFILO METILACION) RISPETTO ALL'ETÀ CRONOLOGICA. LA SUA DIFFERENZA È CHIAMATA INVECCHIAMENTO ACCELERATO ED È STATA ASSOCIATA A UNA MAGGIORE MORTALITÀ. È NOTO CHE I DIVERSI COMPONENTI DELLA DIETA POSSONO ESERCITARE CAMBIAMENTI NELLA METILAZIONE DEL DNA, MA QUESTI CAMBIAMENTI NON SONO BEN CARATTERIZZATI NEL TEMPO, NÉ I LORO ASPETTI DINAMICI SONO NOTI O LA LORO INFLUENZA SUI BIOMARCATORI METILOMIC DELL'INVECCHIAMENTO O SUI FENOTIPI CVD INTERMEDI E FINALI. PER QUESTO MOTIVO IL NOSTRO OBIETTIVO GENERALE È QUELLO DI ANALIZZARE L'EFFETTO DI MEDDIET SUL PROFILO METILOMICO, SIA IN MODO GENERALE CHE IN MARCATORI DI INVECCHIAMENTO (ETÀ BIOLOGICA DEL DNA) E SUL PROFILO DIFFERENZIALE METILOMICO DEL RISCHIO CARDIOVASCOLARE, OSSERVANDO DINAMICAMENTE I SUOI CAMBIAMENTI NEL TEMPO RISPETTO ALLA DIETA DI CONTROLLO. In primo luogo, nella coorte Predimed-VALENCE e in un'altra lingua di altri nodi (60 casi di controlli ECV e 60 controlli) verrà elaborato un progetto di casi ECV e di casi di controllo degli animali. LO STUDIO EPIGENOMA SARÀ CONDOTTO IN MODO DINAMICO (BASAL E IN DUE TEMPI DI FOLLOW-UP). SARANNO CALCOLATI DIVERSI MARCATORI DI INVECCHIAMENTO DEL DNA BASATI SU METHYLOMA, INCLUSI I MARCATORI HORVATH (353), HANNUM (71 SONDE) E WEIDNER (3 LOCI). SARANNO INOLTRE DETERMINATI I PROFILI EPIGENOMICI ASSOCIATI ALL'INCIDENTE CVD E AI SUOI FENOTIPI INTERMEDI. L'ANALISI INTEGRATA OMICO IDENTIFICHERÀ I POLIMORFISMI GENETICI ASSOCIATI A QUESTI MARCATORI METILACION E CREERÀ PUNTEGGI DI RISCHIO GENETICO (GRS) CHE POSSONO ESSERE UTILIZZATI COME PROXY DELL'INVECCHIAMENTO E BIOMARCATORI METILACION PER IL CAMPIONE TOTALE. 40 SNP SARANNO SELEZIONATI PER ESSERE DETERMINATI NELLO STUDIO TOTALE PREDIMED (N=7100). SARANNO INOLTRE DETERMINATI I METILACION DEI LOCI SELEZIONATI NEI CASI TOTALI DI CVD E UN CAMPIONE CASUALE DELLA COORTE. UTILIZZO DI MODELLI DI REGRESSIONE MULTIVARIATA COX CON TERMINI DI INTERAZIONE PER DETERMINARE L'EFFETTO GENOEPIGENOMICO DI QUESTI MARCATORI NELL'INCIDENZA DI CVD E MORTALITÀ. PARALLELAMENTE, I MARCATORI GENOMICI ED EPIGENOMICI SARANNO CONVALIDATI, COMPRESA UN'ANALISI TRASCRITTAMICA IN UN SOTTOCAMPIONE DEI PARTECIPANTI ALLO STUDIO PREDIMED PLUS-VALENCIA. LE TECNICHE DI INTEGRAZIONE OMICA (COINERCIA, ECC.) SARANNO UTILIZZATE PER L'ANALISI DEI DIVERSI LIVELLI. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΣΤΗ ΜΕΛΈΤΗ PREDIMED (ΜΙΑ ΔΟΚΙΜΉ ΔΙΑΤΡΟΦΙΚΉΣ ΠΑΡΈΜΒΑΣΗΣ ΣΤΗΝ ΟΠΟΊΑ ΣΥΜΜΕΤΕΊΧΑΝ 7447 ΣΥΜΜΕΤΈΧΟΝΤΕΣ ΣΕ ΔΙΆΣΤΗΜΑ 4,8 ΕΤΏΝ) ΚΑΤΑΔΕΊΞΑΜΕ ΌΤΙ ΤΑ ΠΡΟΣΤΑΤΕΥΤΙΚΆ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΤΗΣ ΜΕΣΟΓΕΙΑΚΉΣ ΔΙΑΤΡΟΦΉΣ (MEDDIET) ΈΝΑΝΤΙ ΤΩΝ ΔΙΑΦΌΡΩΝ ΕΝΔΙΆΜΕΣΩΝ ΚΑΙ ΤΕΛΙΚΏΝ ΦΑΙΝΟΤΎΠΩΝ ΤΗΣ ΚΑΡΔΙΑΓΓΕΙΑΚΉΣ ΝΌΣΟΥ (CVD). ΩΣΤΌΣΟ, ΟΙ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΊ ΓΙΑ ΑΥΤΌ ΤΟ ΠΡΟΣΤΑΤΕΥΤΙΚΌ ΑΠΟΤΈΛΕΣΜΑ ΕΊΝΑΙ ΑΚΌΜΗ ΕΛΆΧΙΣΤΑ ΓΝΩΣΤΟΊ. ΟΙ ΠΡΏΤΕΣ ΔΙΑΤΡΟΦΙΚΈΣ ΑΝΑΛΎΣΕΙΣ ΣΤΗ ΜΕΛΈΤΗ PREDIMED ΜΑΣ ΕΠΈΤΡΕΨΑΝ ΝΑ ΑΝΙΧΝΕΎΣΟΥΜΕ ΣΗΜΑΝΤΙΚΈΣ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΆΣΕΙΣ GEN-DIET ΠΟΥ ΠΡΈΠΕΙ ΝΑ ΓΝΩΡΊΖΟΥΜΕ ΒΑΘΎΤΕΡΑ ΜΕ ΤΗΝ ΕΝΣΩΜΆΤΩΣΗ ΤΩΝ ΩΜΙΚΏΝ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΏΝ, ΣΥΜΠΕΡΙΛΑΜΒΑΝΟΜΈΝΩΝ ΤΩΝ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΏΝ, EPIGENOMICA (ΚΥΡΊΩΣ ΜΈΣΩ ΜΕΛΕΤΏΝ DNA METILACION). ΕΠΙΠΛΈΟΝ, ΥΠΆΡΧΕΙ ΜΕΓΆΛΟ ΕΝΔΙΑΦΈΡΟΝ ΓΙΑ ΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΤΩΝ ΒΙΟΔΕΙΚΤΏΝ ΤΗΣ ΓΉΡΑΝΣΗΣ ΜΕ ΒΆΣΗ ΤΟ ΠΡΟΦΊΛ ΤΟΥ DNA METILACION, ΠΟΥ ΟΝΟΜΆΖΕΤΑΙ ΕΠΊΣΗΣ ΕΠΙΓΕΝΕΤΙΚΌ ΡΟΛΌΙ; ΑΥΤΌ ΚΑΘΟΡΊΖΕΙ ΤΗ ΛΕΓΌΜΕΝΗ ΒΙΟΛΟΓΙΚΉ ΕΠΟΧΉ (ΜΕ ΒΆΣΗ ΤΟ ΠΡΟΦΊΛ METILACION) ΣΕ ΣΧΈΣΗ ΜΕ ΤΗ ΧΡΟΝΟΛΟΓΙΚΉ ΗΛΙΚΊΑ. Η ΔΙΑΦΟΡΆ ΤΟΥ ΟΝΟΜΆΖΕΤΑΙ ΕΠΙΤΑΧΥΝΌΜΕΝΗ ΓΉΡΑΝΣΗ ΚΑΙ ΈΧΕΙ ΣΥΣΧΕΤΙΣΤΕΊ ΜΕ ΜΕΓΑΛΎΤΕΡΗ ΘΝΗΣΙΜΌΤΗΤΑ. ΕΊΝΑΙ ΓΝΩΣΤΌ ΌΤΙ ΤΑ ΔΙΆΦΟΡΑ ΣΥΣΤΑΤΙΚΆ ΤΗΣ ΔΙΑΤΡΟΦΉΣ ΜΠΟΡΟΎΝ ΝΑ ΕΠΙΦΈΡΟΥΝ ΑΛΛΑΓΈΣ ΣΤΗ METILATION DNA, ΑΛΛΆ ΑΥΤΈΣ ΟΙ ΑΛΛΑΓΈΣ ΔΕΝ ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΖΟΝΤΑΙ ΚΑΛΆ ΜΕ ΤΗΝ ΠΆΡΟΔΟ ΤΟΥ ΧΡΌΝΟΥ, ΟΎΤΕ ΕΊΝΑΙ ΓΝΩΣΤΈΣ ΟΙ ΔΥΝΑΜΙΚΈΣ ΤΟΥΣ ΠΤΥΧΈΣ Ή Η ΕΠΊΔΡΑΣΉ ΤΟΥΣ ΣΤΟΥΣ ΜΕΤΑΛΛΙΚΟΎΣ ΒΙΟΔΕΊΚΤΕΣ ΓΉΡΑΝΣΗΣ Ή ΣΤΟΥΣ ΕΝΔΙΆΜΕΣΟΥΣ ΚΑΙ ΤΕΛΙΚΟΎΣ ΦΑΙΝΌΤΥΠΟΥΣ CVD. ΓΙΑ ΤΟ ΛΌΓΟ ΑΥΤΌ, ΓΕΝΙΚΌΣ ΣΤΌΧΟΣ ΜΑΣ ΕΊΝΑΙ ΝΑ ΑΝΑΛΎΣΟΥΜΕ ΤΗΝ ΕΠΊΔΡΑΣΗ ΤΟΥ MEDDIET ΣΤΟ ΠΡΟΦΊΛ METILOMICO, ΤΌΣΟ ΜΕ ΓΕΝΙΚΌ ΤΡΌΠΟ ΌΣΟ ΚΑΙ ΣΕ ΔΕΊΚΤΕΣ ΓΉΡΑΝΣΗΣ (ΒΙΟΛΟΓΙΚΉ ΗΛΙΚΊΑ ΤΟΥ DNA) ΚΑΙ ΣΤΟ ΔΙΑΦΟΡΙΚΌ ΠΡΟΦΊΛ METILOMICO ΤΟΥ ΚΑΡΔΙΑΓΓΕΙΑΚΟΎ ΚΙΝΔΎΝΟΥ, ΠΑΡΑΤΗΡΏΝΤΑΣ ΔΥΝΑΜΙΚΆ ΤΙΣ ΑΛΛΑΓΈΣ ΤΟΥ ΜΕ ΤΗΝ ΠΆΡΟΔΟ ΤΟΥ ΧΡΌΝΟΥ ΣΕ ΣΎΓΚΡΙΣΗ ΜΕ ΤΗ ΔΙΑΤΡΟΦΉ-ΜΆΡΤΥΡΑ. Στην πρώτη θέση θα υπάρξει σχεδιασμός κρουσμάτων ECV και κρουσμάτων ελέγχου ζώων στην κοόρτη Predimed-VALENCE και σε διαφορετική γλώσσα άλλων κόμβων (60 περιπτώσεις ECV και 60 ελέγχων) για την εκτέλεση μιας κατάστασης. Η ΜΕΛΈΤΗ ΤΟΥ EPIGENOMA ΘΑ ΔΙΕΞΑΧΘΕΊ ΜΕ ΔΥΝΑΜΙΚΌ ΤΡΌΠΟ (ΒΑΣΙΚΉ ΚΑΙ ΣΕ ΔΎΟ ΕΠΑΚΌΛΟΥΘΕΣ ΠΕΡΙΌΔΟΥΣ). ΘΑ ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΟΎΝ ΑΡΚΕΤΟΊ ΔΕΊΚΤΕΣ ΓΉΡΑΝΣΗΣ DNA ΜΕ ΒΆΣΗ ΤΟ METHYLOMA, ΣΥΜΠΕΡΙΛΑΜΒΑΝΟΜΈΝΩΝ ΤΩΝ HORVATH (353 ΑΝΙΧΝΕΥΤΈΣ), HANNUM (71 ΑΝΙΧΝΕΥΤΈΣ) ΚΑΙ WEIDNER (3 LOCI) ΔΕΊΚΤΕΣ. ΘΑ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΤΟΎΝ ΕΠΊΣΗΣ ΤΑ ΕΠΙΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΆ ΠΡΟΦΊΛ ΠΟΥ ΣΥΝΔΈΟΝΤΑΙ ΜΕ ΤΟ ΠΕΡΙΣΤΑΤΙΚΌ CVD ΚΑΙ ΤΟΥΣ ΕΝΔΙΆΜΕΣΟΥΣ ΦΑΙΝΌΤΥΠΟΥΣ ΤΟΥ. Η ΟΛΟΚΛΗΡΩΜΈΝΗ ΑΝΆΛΥΣΗ OMICO ΘΑ ΠΡΟΣΔΙΟΡΊΣΕΙ ΤΟΥΣ ΓΕΝΕΤΙΚΟΎΣ ΠΟΛΥΜΟΡΦΙΣΜΟΎΣ ΠΟΥ ΣΥΝΔΈΟΝΤΑΙ ΜΕ ΑΥΤΟΎΣ ΤΟΥΣ ΔΕΊΚΤΕΣ METILACION ΚΑΙ ΘΑ ΔΗΜΙΟΥΡΓΉΣΕΙ ΒΑΘΜΟΛΟΓΊΕΣ ΓΕΝΕΤΙΚΟΎ ΚΙΝΔΎΝΟΥ (GRS) ΠΟΥ ΜΠΟΡΟΎΝ ΝΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΩΣ ΥΠΟΚΑΤΆΣΤΑΤΑ ΤΩΝ ΒΙΟΔΕΙΚΤΏΝ ΓΉΡΑΝΣΗΣ ΚΑΙ METILACION ΓΙΑ ΤΟ ΣΥΝΟΛΙΚΌ ΔΕΊΓΜΑ. ΘΑ ΕΠΙΛΕΓΟΎΝ 40 SNP ΠΟΥ ΘΑ ΚΑΘΟΡΙΣΤΟΎΝ ΣΤΗ ΣΥΝΟΛΙΚΉ ΜΕΛΈΤΗ PREDIMED (N=7100). ΘΑ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΤΕΊ ΕΠΊΣΗΣ Η METILACION ΤΩΝ ΤΌΠΩΝ ΠΟΥ ΕΠΙΛΈΧΘΗΚΑΝ ΣΤΟ ΣΎΝΟΛΟ ΤΩΝ ΠΕΡΙΠΤΏΣΕΩΝ CVD ΚΑΙ ΈΝΑ ΤΥΧΑΊΟ ΔΕΊΓΜΑ ΤΗΣ ΟΜΆΔΑΣ. ΜΕ ΤΗ ΧΡΉΣΗ ΠΟΛΥΜΕΤΑΒΛΗΤΏΝ ΜΟΝΤΈΛΩΝ ΠΑΛΙΝΔΡΌΜΗΣΗΣ COX ΜΕ ΌΡΟΥΣ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗΣ ΓΙΑ ΤΟΝ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΌ ΤΗΣ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΉΣ ΕΠΊΔΡΑΣΗΣ ΑΥΤΏΝ ΤΩΝ ΔΕΙΚΤΏΝ ΣΤΗ ΣΥΧΝΌΤΗΤΑ ΕΜΦΆΝΙΣΗΣ ΤΟΥ CVD ΚΑΙ ΤΗΣ ΘΝΗΣΙΜΌΤΗΤΑΣ. ΠΑΡΆΛΛΗΛΑ, ΟΙ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΟΊ ΚΑΙ ΕΠΙΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΟΊ ΔΕΊΚΤΕΣ ΘΑ ΕΠΙΚΥΡΩΘΟΎΝ, ΣΥΜΠΕΡΙΛΑΜΒΑΝΟΜΈΝΗΣ ΜΙΑΣ ΜΕΤΑΓΡΑΦΙΚΉΣ ΑΝΆΛΥΣΗΣ ΣΕ ΈΝΑ ΕΠΙΜΈΡΟΥΣ ΔΕΊΓΜΑ ΣΥΜΜΕΤΕΧΌΝΤΩΝ ΣΤΗ ΜΕΛΈΤΗ PREDIMED PLUS-VALENCIA. ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΩΝ ΔΙΑΦΌΡΩΝ ΕΠΙΠΈΔΩΝ ΘΑ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΗΘΟΎΝ ΤΕΧΝΙΚΈΣ ΩΜΙΚΉΣ ΟΛΟΚΛΉΡΩΣΗΣ (COINERCIA Κ.ΛΠ.). (Greek)
17 August 2022
0 references
I PREDIMED-UNDERSØGELSEN (ET KOSTINTERVENTIONSFORSØG MED 7447 DELTAGERE FULGTE MEDIANEN 4,8 ÅR) HAR VI VIST, AT DE BESKYTTENDE VIRKNINGER AF MIDDELHAVSKOSTEN (MEDDIET) MOD FORSKELLIGE MELLEM- OG ENDEFÆNOTYPER AF HJERTE-KAR-SYGDOMME (CVD). MEKANISMERNE FOR DENNE BESKYTTENDE VIRKNING ER DOG STADIG IKKE MEGET KENDTE. DE FØRSTE NÆRINGSSTOFANALYSER I PREDIMED-UNDERSØGELSEN HAR GJORT DET MULIGT FOR OS AT OPDAGE VIGTIGE GEN-DIET INTERAKTIONER, SOM VI HAR BRUG FOR AT VIDE MERE INDGÅENDE MED INTEGRATIONEN AF OMIC TEKNOLOGIER, HERUNDER GENOMICA, EPIGENOMICA (PRIMÆRT GENNEM UNDERSØGELSER AF DNA METILACION). DERUDOVER ER DER STOR INTERESSE FOR UNDERSØGELSEN AF BIOMARKØRER AF ALDRING BASERET PÅ PROFILEN AF DNA METILACION, OGSÅ KALDET EPIGENETISK UR? DETTE BESTEMMER DEN SÅKALDTE BIOLOGISKE ALDER (BASERET PÅ METILACION-PROFILEN) I FORHOLD TIL DEN KRONOLOGISKE ALDER. DENS FORSKEL KALDES ACCELERERET ALDRING OG HAR VÆRET FORBUNDET MED MERE DØDELIGHED. DET ER KENDT, AT DE FORSKELLIGE BESTANDDELE I KOSTEN KAN UDØVE ÆNDRINGER I DNA-METILATION, MEN DISSE ÆNDRINGER ER IKKE GODT KARAKTERISERET OVER TID, OG DERES DYNAMISKE ASPEKTER ER HELLER IKKE KENDT ELLER DERES INDFLYDELSE PÅ DE METILOMISKE BIOMARKØRER AF ALDRING ELLER PÅ MELLEMLIGGENDE OG ENDELIGE CVD-FÆNOTYPER. DERFOR ER VORES OVERORDNEDE MÅL AT ANALYSERE VIRKNINGEN AF MEDDIET PÅ METILOMICO-PROFILEN, BÅDE GENERELT OG I MARKØRERS ALDRING (DNA'S BIOLOGISKE ALDER) OG PÅ DEN DIFFERENTIEREDE METILOMICO-PROFIL FOR KARDIOVASKULÆR RISIKO, IDET DENS ÆNDRINGER OVER TID OBSERVERES DYNAMISK I FORHOLD TIL KONTROLKOSTEN. For det første vil der være en udformning af ECV-sager og dyrekontrolsager i Predimed-VALENCE-kohorten og på et andet sprog af andre knudepunkter (60 tilfælde af ECV og 60 kontroller) til at udføre en situation. EPIGENOMA-UNDERSØGELSEN VIL BLIVE GENNEMFØRT PÅ EN DYNAMISK MÅDE (GRUNDLÆGGENDE OG TO OPFØLGNINGSTIDER). FLERE METHYLOMA-BASEREDE DNA-ÆLDNINGSMARKØRER VIL BLIVE BEREGNET, HERUNDER HORVATH (353 SONDER), HANNUM (71 SONDER) OG WEIDNER (3 LOCI) MARKØRER. DE EPIGENOMISKE PROFILER FORBUNDET MED HÆNDELSEN CVD OG DENS MELLEMLIGGENDE FÆNOTYPER VIL OGSÅ BLIVE BESTEMT. DEN INTEGREREDE OMICO-ANALYSE VIL IDENTIFICERE DE GENETISKE POLYMORFIER, DER ER FORBUNDET MED DISSE METILACION-MARKØRER, OG SKABE GENETISKE RISIKOSCORER (GRS), DER KAN ANVENDES SOM REFERENCER FOR ALDRING OG METILACION-BIOMARKØRER FOR DEN SAMLEDE PRØVE. 40 SNP'ER UDVÆLGES TIL BESTEMMELSE I DEN SAMLEDE PREDIMED-UNDERSØGELSE (N=7100). METILACION AF LOCI UDVALGT I DE SAMLEDE TILFÆLDE AF CVD OG EN TILFÆLDIG STIKPRØVE AF KOHORTEN VIL OGSÅ BLIVE FASTLAGT. ANVENDELSE AF MULTIVARIATE COX-REGRESSIONSMODELLER MED INTERAKTIONSBETINGELSER TIL BESTEMMELSE AF DISSE MARKØRERS GENO-EPIGENOMISKE EFFEKT I INCIDENSEN AF CVD OG DØDELIGHED. SIDELØBENDE HERMED VALIDERES GENOMISKE OG EPIGENOMISKE MARKØRER, HERUNDER EN TRANSSKRIPTOMISK ANALYSE I EN DELPRØVE AF DELTAGERNE I PREDIMED PLUS-VALENCIA-UNDERSØGELSEN. OMIC INTEGRATIONSTEKNIKKER (COINERCIA OSV.) VIL BLIVE ANVENDT TIL ANALYSE AF DE FORSKELLIGE NIVEAUER. (Danish)
17 August 2022
0 references
PREDIMED-TUTKIMUKSESSA (RUOKAVALION INTERVENTIOTUTKIMUS, JOHON OSALLISTUI 7447 OSALLISTUJAA JA JOTA SEURASI MEDIAANI 4,8 VUOTTA) OLEMME OSOITTANEET, ETTÄ VÄLIMEREN RUOKAVALION (MEDDIET) SUOJAAVAT VAIKUTUKSET SYDÄN- JA VERISUONITAUTIEN (CVD) ERI VÄLI- JA LOPPUFENOTYYPPEJÄ VASTAAN. TÄMÄN SUOJAAVAN VAIKUTUKSEN MEKANISMIT OVAT KUITENKIN VIELÄ VÄHÄN TIEDOSSA. PREDIMED-TUTKIMUKSEN ENSIMMÄISET NUTRIGENEETTISET ANALYYSIT OVAT MAHDOLLISTANEET SEN, ETTÄ VOIMME HAVAITA TÄRKEITÄ GEN-RUOKAVALIOVUOROVAIKUTUKSIA, JOTKA MEIDÄN ON TUNNETTAVA SYVÄLLISEMMIN OMIC-TEKNIIKOIDEN, KUTEN GENOMICAN, EPIGENOMICAN (LÄHINNÄ DNA METILACION -TUTKIMUSTEN AVULLA). LISÄKSI ON SUURI KIINNOSTUS TUTKIMUKSEEN BIOMARKKERIT IKÄÄNTYMISEN PERUSTUU PROFIILIN DNA METILACION, KUTSUTAAN MYÖS EPIGENEETTISTÄ KELLOA? TÄMÄ MÄÄRITTÄÄ NS. BIOLOGISEN IÄN (METILACION-PROFIILIN PERUSTEELLA) KRONOLOGISEEN IKÄÄN NÄHDEN. SEN ERO ON NIMELTÄÄN KIIHTYNYT IKÄÄNTYMINEN JA ON LIITTYNYT ENEMMÄN KUOLLEISUUTTA. TIEDETÄÄN, ETTÄ RUOKAVALION ERI OSAT VOIVAT AIHEUTTAA MUUTOKSIA DNA- METILATIONISSA, MUTTA NÄMÄ MUUTOKSET EIVÄT OLE AJAN MITTAAN HYVIN TYYPILLISIÄ, EIVÄTKÄ NIIDEN DYNAAMISET NÄKÖKOHDAT TAI NIIDEN VAIKUTUS IKÄÄNTYMISEN METILOMIC-BIOLOGISIIN MERKKIAINEISIIN TAI VÄLI- JA LOPULLISIIN CVD-FENOTYYPPEIHIN OLE TIEDOSSA. TÄSTÄ SYYSTÄ YLEISENÄ TAVOITTEENAMME ON ANALYSOIDA MEDDIETIN VAIKUTUSTA METILOMICO-PROFIILIIN SEKÄ YLEISESTI ETTÄ MERKKIAINEISSA IKÄÄNTYMISEEN (DNA:N BIOLOGINEN IKÄ) JA KARDIOVASKULAARISEN RISKIN METILOMICO-PROFIILIIN JA TARKKAILEMALLA DYNAAMISESTI SEN MUUTOKSIA AJAN MITTAAN KONTROLLIRUOKAVALIOON VERRATTUNA. Ensinnäkin suunnitellaan ECV-tapauksia ja eläinten valvontatapauksia Predimed-VALENCE-kohortissa ja eri kielellä muissa solmuissa (60 ECV-tapausta ja 60 valvontaa) asiantilan suorittamiseksi. EPIGENOMA-TUTKIMUS TOTEUTETAAN DYNAAMISESTI (PERUSVAIHEESSA JA KAHDESSA SEURANTAVAIHEESSA). LASKETAAN USEITA METHYLOMA-POHJAISIA DNA- IKÄÄNTYMISEN MARKKEREITA, MUKAAN LUKIEN HORVATH (353 ANTURIA), HANNUM (71 ANTURIA) JA WEIDNER (3 LOCI) -MARKKERIT. LISÄKSI MÄÄRITETÄÄN TAPAHTUMAAN LIITTYVÄT EPIGENOMISET PROFIILIT, JOTKA LIITTYVÄT CVD:HEN JA SEN VÄLIFENOTYYPPEIHIN. INTEGROIDUSSA OMICO-ANALYYSISSÄ TUNNISTETAAN NÄIHIN METILACION-MERKKIAINEISIIN LIITTYVÄT GENEETTISET POLYMORFISMIT JA LUODAAN GENEETTINEN RISKIPISTEMÄÄRÄ (GRS), JOTA VOIDAAN KÄYTTÄÄ IKÄÄNTYMISEN JA METILACION-BIOMARKKEREIDEN PROKSEINA KOKO NÄYTTEELLE. PREDIMED-KOKONAISTUTKIMUKSESSA (N=7100) VALITAAN 40 SNP:TÄ. LISÄKSI MÄÄRITETÄÄN CVD:N KOKONAISTAPAUKSISSA VALITUN LOCIN METILACION JA KOHORTIN SATUNNAISOTOS. NÄIDEN MERKKIAINEIDEN GENOEPIGENOMISEN VAIKUTUKSEN MÄÄRITTÄMISEKSI CVD:N JA KUOLLEISUUDEN ESIINTYVYYDESSÄ KÄYTETÄÄN MULTIVARIAATTISIA COX-REGRESSIOMALLEJA, JOISSA ON VUOROVAIKUTUSEHTOJA. SAMANAIKAISESTI VALIDOIDAAN GENOMI- JA EPIGENOMISET MERKKIAINEET, MUKAAN LUKIEN TRANSKRIMAATTIANALYYSI PREDIMED PLUS-VALENCIA -TUTKIMUKSEN OSALLISTUJISTA. ERI TASOJEN ANALYSOINNISSA KÄYTETÄÄN OMIC INTEGROINTITEKNIIKOITA (COINERCIA JNE.). (Finnish)
17 August 2022
0 references
FL-ISTUDJU PREDIMED (PROVA TA’ INTERVENT DJETETIKU LI KIENET TINKLUDI 7447 PARTEĊIPANT SEGWIT FUQ MEDJA TA’ 4.8 SNIN) AĦNA WREJNA LI L-EFFETTI PROTETTIVI TAD-DIETA MEDITERRANJA (MEDDIET) KONTRA FENOTIPI INTERMEDJI U FINALI DIFFERENTI TA’ MARD KARDJOVASKULARI (CVD). MADANKOLLU, IL-MEKKANIŻMI GĦAL DAN L-EFFETT PROTETTIV GĦADHOM FTIT MAGĦRUFA. L-EWWEL ANALIŻI NUTRIĠENETIKA FL-ISTUDJU PREDIMED IPPERMETTIELNA NISKOPRU INTERAZZJONIJIET IMPORTANTI BEJN IL-ĠENI U D-DIETA LI JEĦTIEĠ LI NKUNU NAFU AKTAR FIL-FOND BL-INTEGRAZZJONI TAT-TEKNOLOĠIJI OMIĊI INKLUŻ IL-ĠENOMIKA, EPIGENOMICA (PRINĊIPALMENT PERMEZZ TA’ STUDJI TA’ DNA METILACION). BARRA MINN HEKK, HEMM INTERESS KBIR FL-ISTUDJU TA’ BIJOMARKATURI TA’ TIXJIĦ IBBAŻAT FUQ IL-PROFIL TA’ DNA METILACION, IMSEJJAĦ UKOLL ARLOĠĠ EPIĠENETIKU? DAN JIDDETERMINA L-HEKK IMSEJĦA ETÀ BIJOLOĠIKA (ABBAŻI TAL-PROFIL METILACION) META MQABBLA MAL-ETÀ KRONOLOĠIKA. ID-DIFFERENZA TIEGĦU TISSEJJAĦ TIXJIĦ AĊĊELLERAT U ĠIET ASSOĊJATA MA ‘AKTAR MORTALITÀ. HUWA MAGĦRUF LI L-KOMPONENTI DIFFERENTI TAD-DIETA JISTGĦU JEŻERĊITAW BIDLIET FID-DNA METILATION, IŻDA DAWN IL-BIDLIET MHUMIEX IKKARATTERIZZATI SEW MAŻ-ŻMIEN, U LANQAS MA HUMA MAGĦRUFA L-ASPETTI DINAMIĊI TAGĦHOM JEW L-INFLUWENZA TAGĦHOM FUQ IL-BIJOMARKATURI METILOMIC LI QED JIXJIEĦU JEW FUQ IL-FENOTIPI CVD INTERMEDJI U FINALI. GĦAL DIN IR-RAĠUNI L-GĦAN ĠENERALI TAGĦNA HUWA LI NANALIZZAW L-EFFETT TA’ MEDDIET FUQ IL-PROFIL METILOMICO, KEMM B’MOD ĠENERALI KIF UKOLL FIL-MARKATURI LI QED JIXJIEĦU (ETÀ BIJOLOĠIKA TAD-DNA) U FUQ IL-PROFIL TA’ METILOMICO DIFFERENZJALI TA’ RISKJU KARDJOVASKULARI, FILWAQT LI JIĠU OSSERVATI DINAMIKAMENT IL-BIDLIET TIEGĦU MAŻ-ŻMIEN META MQABBEL MAD-DIETA TA’ KONTROLL. L-ewwel nett se jkun hemm disinn ta’ każijiet ECV u każijiet ta’ kontroll tal-annimali fil-koorti ta’ VALENCE Predimed u b’lingwa differenti ta’ nodi oħra (60 każ ta’ ECV u 60 kontroll) biex titwettaq sitwazzjoni attwali. L-ISTUDJU EPIGENOMA SE JITWETTAQ B’MOD DINAMIKU (BAŻIKU U F’ŻEWĠ ĦINIJIET TA’ SEGWITU). DIVERSI MARKATURI TAT-TIXJIĦ TAD-DNA BBAŻATI FUQ METHYLOMA SE JIĠU KKALKULATI, INKLUŻI HORVATH (353 PROBES), HANNUM (71 SONDI) U MARKATURI WEIDNER (3 LOCI). IL-PROFILI EPIĠENOMIĊI ASSOĊJATI MAS-CVD TAL-INĊIDENT U L-FENOTIPI INTERMEDJI TIEGĦU JIĠU DDETERMINATI WKOLL. L-ANALIŻI INTEGRATA TAL-OMICO SE TIDENTIFIKA L-POLIMORFIŻMI ĠENETIĊI ASSOĊJATI MA’ DAWN IL-MARKATURI METILACION U TOĦLOQ PUNTEĠĠI TA’ RISKJU ĠENETIKU (GRS) LI JISTGĦU JINTUŻAW BĦALA PROKURI TA’ BIJOMARKATURI LI QED JIXJIEĦU U METILACION GĦALL-KAMPJUN TOTALI. 40 SNP SE JINTGĦAŻLU BIEX JIĠU DDETERMINATI FL-ISTUDJU PREDIMED TOTALI (N=7100). SE JIĠU DDETERMINATI WKOLL IL-METILACION TA’ LOCI MAGĦŻULA FIL-KAŻIJIET TOTALI TAS-CVD U KAMPJUN ALEATORJU TAL-KOORTI. L-UŻU TA’ MUDELLI MULTIVARJATI TA’ RIGRESSJONI COX B’TERMINI TA’ INTERAZZJONI BIEX JIĠI DETERMINAT L-EFFETT ĠENO-EPIĠENOMIKU TA’ DAWN IL-MARKATURI FL-INĊIDENZA TA’ CVD U L-MORTALITÀ. B’MOD PARALLEL, IL-MARKATURI ĠENOMIĊI U EPIĠENOMIĊI SE JIĠU VVALIDATI, INKLUŻA ANALIŻI TRASKRITOMIKA F’SOTTOKAMPJUN TA’ PARTEĊIPANTI FL-ISTUDJU PREDIMED PLUS-VALENCIA. TEKNIKI TA’ INTEGRAZZJONI OMIKA (COINERCIA, EĊĊ) SER JINTUŻAW GĦALL-ANALIŻI TAL-LIVELLI DIFFERENTI. (Maltese)
17 August 2022
0 references
PREDIMED PĒTĪJUMĀ (UZTURA INTERVENCES PĒTĪJUMS, KURĀ PIEDALĪJĀS 7447 DALĪBNIEKI, KAM SEKOJA VIDĒJI 4,8 GADI) MĒS ESAM PIERĀDĪJUŠI, KA VIDUSJŪRAS REĢIONA DIĒTAS (MEDDIET) AIZSARGĀJOŠĀ IEDARBĪBA PRET DAŽĀDIEM SIRDS UN ASINSVADU SLIMĪBU (CVD) STARPPOSMA UN BEIGU FENOTIPIEM. TOMĒR ŠĪS AIZSARGĀJOŠĀS IEDARBĪBAS MEHĀNISMI JOPROJĀM IR MAZ ZINĀMI. PREDIMED PĒTĪJUMĀ VEIKTĀS PIRMĀS NUTRIĢENĒTISKĀS ANALĪZES IR ĻĀVUŠAS MUMS ATKLĀT SVARĪGU GĒNU UN DIĒTAS MIJIEDARBĪBU, KAS MUMS IR VAIRĀK JĀZINA, INTEGRĒJOT OMISKĀS TEHNOLOĢIJAS, TOSTARP GENOMICA, EPIGENOMICA (GALVENOKĀRT AR DNS METILACION PĒTĪJUMIEM). TURKLĀT PASTĀV LIELA INTERESE PAR NOVECOŠANĀS BIOMARĶIERU IZPĒTI, PAMATOJOTIES UZ DNS METILACION PROFILU, KO SAUC ARĪ PAR EPIĢENĒTISKO PULKSTENI? TAS NOSAKA TĀ SAUKTO BIOLOĢISKO VECUMU (PAMATOJOTIES UZ METILACION PROFILU) UN HRONOLOĢISKO VECUMU. TĀS ATŠĶIRĪBA TIEK SAUKTA PAR PAĀTRINĀTU NOVECOŠANOS UN IR SAISTĪTA AR LIELĀKU MIRSTĪBU. IR ZINĀMS, KA DAŽĀDIE UZTURA KOMPONENTI VAR MAINĪT DNS METILĀCIJAS, BET ŠĪS IZMAIŅAS LAIKA GAITĀ NAV LABI RAKSTUROTAS, KĀ ARĪ NAV ZINĀMI TO DINAMISKIE ASPEKTI VAI TO IETEKME UZ NOVECOŠANĀS METILOMIC BIOMARĶIERIEM VAI STARPPOSMA UN GALĪGAJIEM CVD FENOTIPIEM. ŠĪ IEMESLA DĒĻ MŪSU VISPĀRĒJAIS MĒRĶIS IR ANALIZĒT MEDDIET IETEKMI UZ METILOMICO PROFILU GAN VISPĀRĪGĀ VEIDĀ, GAN MARĶIEROS NOVECOŠANĀS (DNS BIOLOĢISKĀ VECUMA) UN UZ KARDIOVASKULĀRĀ RISKA DIFERENCIĀLO METILOMICO PROFILU, DINAMISKI NOVĒROJOT TĀ IZMAIŅAS LAIKA GAITĀ, SALĪDZINOT AR KONTROLES DIĒTU. Pirmkārt, Predimed-VALENCE kohortā un citos mezglos (60 ECV gadījumi un 60 kontroles) tiks izstrādāti ECV gadījumi un dzīvnieku kontroles gadījumi, lai veiktu stāvokli. Integrēta COMPLETE epigenome METILATION ar GENOTIPATED STUDY OF DENSE IN PARTICIPANT MISS. EPIGENOMA PĒTĪJUMS TIKS VEIKTS DINAMISKI (PAMATA UN DIVOS PĒCPĀRBAUDES LAIKOS). TIKS APRĒĶINĀTI VAIRĀKI UZ METHYLOMA BALSTĪTI DNS NOVECOŠANĀS MARĶIERI, TOSTARP HORVATH (353 ZONDES), HANNUM (71 ZONDES) UN WEIDNER (3 LOCI) MARĶIERI. TIKS NOTEIKTI ARĪ EPIGENOMISKIE PROFILI, KAS SAISTĪTI AR INCIDENTU CVD UN TĀ STARPPOSMA FENOTIPIEM. INTEGRĒTĀ OMICO ANALĪZE IDENTIFICĒS ĢENĒTISKOS POLIMORFISMUS, KAS SAISTĪTI AR ŠIEM METILACION MARĶIERIEM, UN IZVEIDOS ĢENĒTISKĀ RISKA RĀDĪTĀJUS (GRS), KO VAR IZMANTOT KĀ NOVECOŠANAS UN METILACION BIOMARĶIERU AIZSTĀJĒJUS KOPĒJAM PARAUGAM. TIKS ATLASĪTI 40 SNP, KO NOTEIKS KOPĒJĀ PREDIMED PĒTĪJUMĀ (N=7100). TIKS NOTEIKTA ARĪ LOCI METILACION, KAS ATLASĪTA KOPĒJĀ KOMPENSĀCIJAS MAKSĀJUMA GADĪJUMĀ, UN KOHORTAS IZLASES PARAUGS PĒC NEJAUŠĪBAS PRINCIPA. MULTIVARIĀTU KOKSA REGRESIJAS MODEĻU IZMANTOŠANA AR MIJIEDARBĪBAS NOSACĪJUMIEM, LAI NOTEIKTU ŠO MARĶIERU GENOTIPA IETEKMI UZ SASLIMSTĪBU AR CVD UN MIRSTĪBU. PARALĒLI TIKS VALIDĒTI GENOMA UN EPIGENOMISKIE MARĶIERI, TOSTARP TRANSKRIPTOMISKA ANALĪZE PREDIMED PLUS-VALENCIA PĒTĪJUMA DALĪBNIEKU APAKŠPARAUGĀ. DAŽĀDU LĪMEŅU ANALĪZEI TIKS IZMANTOTAS OMIC INTEGRĀCIJAS METODES (COINERCIA U.C.). (Latvian)
17 August 2022
0 references
V ŠTÚDII PREDIMED (MIMOMENTÁLNA INTERVENČNÁ ŠTÚDIA ZAHŔŇAJÚCA 7447 ÚČASTNÍKOV SLEDOVANÝCH POČAS MEDIÁNU 4,8 ROKA) SME PREUKÁZALI, ŽE OCHRANNÉ ÚČINKY STREDOMORSKEJ STRAVY (MEDDIET) PROTI RÔZNYM MEDZIPRODUKTOM A KONCOVÝM FENOTYPOM KARDIOVASKULÁRNEHO OCHORENIA (CVD). MECHANIZMY TOHTO OCHRANNÉHO ÚČINKU SÚ VŠAK STÁLE MÁLO ZNÁME. PRVÉ NUTRIGENETICKÉ ANALÝZY V ŠTÚDII PREDIMED NÁM UMOŽNILI ODHALIŤ DÔLEŽITÉ INTERAKCIE GEN-DIET, KTORÉ POTREBUJEME HLBŠIE POZNAŤ S INTEGRÁCIOU OMICKÝCH TECHNOLÓGIÍ VRÁTANE GENÓMIE, EPIGENOMICA (NAJMÄ PROSTREDNÍCTVOM ŠTÚDIÍ DNA METILACION). OKREM TOHO EXISTUJE VEĽKÝ ZÁUJEM O ŠTÚDIU BIOMARKEROV STARNUTIA NA ZÁKLADE PROFILU DNA METILACION, TIEŽ NAZÝVANEJ EPIGENETICKÉ HODINY? TO URČUJE TAKZVANÝ BIOLOGICKÝ VEK (NA ZÁKLADE PROFILU METILACIONU) V POROVNANÍ S CHRONOLOGICKÝM VEKOM. JEHO ROZDIEL SA NAZÝVA ZRÝCHLENÉ STARNUTIE A BOL SPOJENÝ S VÄČŠOU ÚMRTNOSŤOU. JE ZNÁME, ŽE RÔZNE ZLOŽKY STRAVY MÔŽU SPÔSOBIŤ ZMENY V DNA METILÁCII, ALE TIETO ZMENY NIE SÚ V PRIEBEHU ČASU DOBRE CHARAKTERIZOVANÉ, ANI NIE SÚ ZNÁME ICH DYNAMICKÉ ASPEKTY ALEBO ICH VPLYV NA METILOMICKÉ BIOMARKERY STARNUTIA ALEBO NA PRECHODNÉ A KONEČNÉ FENOTYPY CVD. Z TOHTO DÔVODU JE NAŠÍM VŠEOBECNÝM CIEĽOM ANALÝZA ÚČINKU MEDDIET NA PROFIL METILOMICO, A TO VŠEOBECNÝM SPÔSOBOM AJ V MARKEROCH STARNUTIA (BIOLOGICKÝ VEK DNA) A NA DIFERENCIÁLNY PROFIL METILOMICO-U KARDIOVASKULÁRNEHO RIZIKA, PRIČOM SA DYNAMICKY POZORUJÚ JEHO ZMENY V ČASE V POROVNANÍ S KONTROLNOU DIÉTOU. V prvom rade bude návrh prípadov ECV a prípadov kontroly zvierat v kohorte Predimed-VALENCE a v inom jazyku iných uzlov (60 prípadov ECV a 60 kontrol) na vykonanie stavu vecí. Integrovaná SPOLOČNOSŤ epigenómu s GENOTIPATED STUDY DENSE IN PARTICIPANT MISS. ŠTÚDIA EPIGENOMA SA BUDE VYKONÁVAŤ DYNAMICKY (BASAL A V DVOCH NÁSLEDNÝCH INTERVALOCH). VYPOČÍTA SA NIEKOĽKO MARKEROV STARNUTIA DNA NA ZÁKLADE METHYLOMA, VRÁTANE HORVATH (353 SOND), HANNUM (71 SOND) A WEIDNER (3 LOCI) MARKEROV. URČIA SA AJ EPIGENOMICKÉ PROFILY SPOJENÉ S DOPADAJÚCIM CVD A JEHO MEDZIPRODUKTMI FENOTYPOV. INTEGROVANÁ ANALÝZA OMICO IDENTIFIKUJE GENETICKÉ POLYMORFIZMY SPOJENÉ S TÝMITO MARKERMI METILACION A VYTVORÍ SKÓRE GENETICKÉHO RIZIKA (GRS), KTORÉ SA MÔŽE POUŽIŤ AKO ZÁSTUPNÉ HODNOTY STARNUTIA A BIOMARKEROV METILACION PRE CELKOVÚ VZORKU. V CELKOVEJ ŠTÚDII PREDIMED SA VYBERIE 40 SNP (N=7100). URČÍ SA AJ METILACION LOCI VYBRANÝCH V CELKOVÝCH PRÍPADOCH CVD A NÁHODNÁ VZORKA KOHORTY. POUŽITIE MULTIVARIANTNÝCH COXOVÝCH REGRESNÝCH MODELOV S PODMIENKAMI INTERAKCIE NA STANOVENIE GENO-EPIGENOMICKÉHO ÚČINKU TÝCHTO MARKEROV VO VÝSKYTE CVD A MORTALITY. PARALELNE SA VALIDUJÚ GENOMICKÉ A EPIGENOMICKÉ MARKERY VRÁTANE TRANSKRIPTOMICKEJ ANALÝZY VO VZORKE ÚČASTNÍKOV ŠTÚDIE PREDIMED PLUS-VALENCIA. NA ANALÝZU RÔZNYCH ÚROVNÍ SA POUŽIJÚ TECHNIKY OMICKEJ INTEGRÁCIE (COINERCIA ATĎ.). (Slovak)
17 August 2022
0 references
SA STAIDÉAR PREDIMED (TRIAIL IDIRGHABHÁLA COTHAITHE LENA N-ÁIRÍTEAR RANNPHÁIRTITHE 7447 LEAN AIRMHEÁN DE 4.8 BLIANA) TÁ SÉ LÉIRITHE AGAINN GO BHFUIL ÉIFEACHTAÍ COSANTA AISTE BIA NA MEÁNMHARA (MEDDIET) I GCOINNE FEINITÍOPAÍ IDIRMHEÁNACHA AGUS DEIRIDH ÉAGSÚLA DE GHALAR CARDASHOITHÍOCH (CVD). MAR SIN FÉIN, IS BEAG EOLAS ATÁ FÓS AR NA MEICNÍOCHTAÍ DON ÉIFEACHT CHOSANTA SEO. CHUIR NA CHÉAD ANAILÍSÍ COTHAITHEACHA SA STAIDÉAR PREDIMED AR ÁR GCUMAS IDIRGHNÍOMHAÍOCHTAÍ TÁBHACHTACHA GEN-AISTE BIA A BHRATH NACH MÓR DÚINN A BHEITH AR AN EOLAS NÍOS DOIMHNE MAIDIR LE COMHTHÁTHÚ TEICNEOLAÍOCHTAÍ ADAMHACH LENA N-ÁIRÍTEAR GENOMICA, EPIGENOMICA (GO PRÍOMHA TRÍ STAIDÉIR AR DNA METILACION). INA THEANNTA SIN, TÁ SUIM MHÓR ANN I STAIDÉAR A DHÉANAMH AR BHITHMHARCÓIRÍ ATÁ AG DUL IN AOIS BUNAITHE AR PHRÓIFÍL DNA METILACION, AR A DTUGTAR CLOG EPIGENETIC FREISIN? CINNEANN SÉ SIN AN AOIS BHITHEOLAÍOCH MAR A THUGTAR UIRTHI (BUNAITHE AR PHRÓIFÍL METILACION) I GCOMPARÁID LEIS AN AOIS CHRÓINEOLAÍOCH. IS É A DIFRÍOCHT AR A DTUGTAR AG DUL IN AOIS LUATHAITHE AGUS TÁ BAINT AIGE LE MORTLAÍOCHT NÍOS MÓ. TÁ SÉ AR EOLAS GUR FÉIDIR LEIS NA COMHPHÁIRTEANNA ÉAGSÚLA DEN AISTE BIA ATHRUITHE A DHÉANAMH AR METILATION DNA, ACH NÍL NA HATHRUITHE SEO TRÉITHRITHE GO MAITH LE HIMEACHT AMA, NÁ NACH BHFUIL A NGNÉITHE DINIMICIÚLA AR EOLAS NÓ A DTIONCHAR AR BHITHMHARCÓIRÍ METILOMIC AG DUL IN AOIS NÓ AR PHENOTYPES CVD IDIRMHEÁNACH AGUS DEIRIDH. AR AN GCÚIS SEO IS É ÁR GCUSPÓIR GINEARÁLTA ANAILÍS A DHÉANAMH AR ÉIFEACHT MEDDIET AR PHRÓIFÍL METILOMICO, AR BHEALACH GINEARÁLTA AGUS I MARCÓIRÍ AG DUL IN AOIS (AOIS BHITHEOLAÍOCH DNA) AGUS AR PHRÓIFÍL METILOMICO DIFREÁLACH RIOSCA CARDASHOITHÍOCH, AG BREATHNÚ GO DINIMICIÚIL A ATHRUITHE LE HIMEACHT AMA I GCOMPARÁID LEIS AN AISTE BIA RIALAITHE. Ar an gcéad dul síos, déanfar cásanna ECV agus cásanna rialaithe ainmhithe a dhearadh sa chohórt Predimed-VALENCE agus i dteanga eile de nóid eile (60 cás de ECV agus 60 cás) chun staid chúrsaí a dhéanamh. DÉANFAR AN STAIDÉAR EPIGENOMA AR BHEALACH DINIMICIÚIL (BUNÚSACH AGUS DHÁ UAIR LEANTACHA). BEIDH ROINNT MARCÓIRÍ DNA AG DUL IN AOIS METHYLOMA-BHUNAITHE A RÍOMH, LENA N-ÁIRÍTEAR HORVATH (353 TÓIREADÓIRÍ), HANNUM (71 TÓIREADÓIRÍ) AGUS WEIDNER (3 LOCI) MARCÓIRÍ. CINNFEAR FREISIN NA PRÓIFÍLÍ EIPIGÉANÓMAÍOCHA A BHAINEANN LE CVD AN TEAGMHAIS AGUS LENA FHEINITÍOPAÍ IDIRMHEÁNACHA. SAINAITHNEOIDH AN ANAILÍS CHOMHTHÁITE OMICO NA POLAMORFAIGH GHÉINITEACHA A BHAINEANN LEIS NA MARCÓIRÍ METILACION SEO AGUS CRUTHÓIDH SÍ SCÓIR RIOSCA GÉINITÍ (GRS) IS FÉIDIR A ÚSÁID MAR IONADAIGH AG DUL IN AOIS AGUS BITHMHARCÓIRÍ METILACION DON SAMPLA IOMLÁN. ROGHNÓFAR 40 SNPANNA LE CINNEADH SA STAIDÉAR IOMLÁN PREDIMED (N=7100). CINNFEAR METILACION LOCI A ROGHNAÍODH I GCÁSANNA IOMLÁNA CVD AGUS SAMPLA RANDAMACH DEN CHOHÓRT FREISIN. AG BAINT ÚSÁIDE AS SAMHLACHA AISCHÉIMNITHE ILATHRAITHEACH COX LE TÉARMAÍ IDIRGHNÍOMHAÍOCHTA CHUN ÉIFEACHT GENO-EPIGENOMIC NA MARCÓIRÍ SEO A CHINNEADH I MINICÍOCHT CVD AGUS MORTLAÍOCHTA. AG AN AM CÉANNA, DÉANFAR MARCÓIRÍ GÉANÓMAÍOCHA AGUS EIPIGÉANÓMACHA A BHAILÍOCHTÚ, LENA N-ÁIRÍTEAR ANAILÍS THRAS-SCRÍBHINNE I BHFOSHAMPLA DE RANNPHÁIRTITHE SA STAIDÉAR PREDIMED PLUS-VALENCIA. BAINFEAR ÚSÁID AS TEICNÍCÍ COMHTHÁTHAITHE ADAMHACH (COINERCIA, ETC) CHUN ANAILÍS A DHÉANAMH AR NA LEIBHÉIL ÉAGSÚLA. (Irish)
17 August 2022
0 references
VE STUDII PREDIMED (INTERVENČNÍ STUDIE V DIETĚ ZAHRNUJÍCÍ 7447 ÚČASTNÍKŮ NÁSLEDOVALA MEDIÁN 4,8 LET) JSME PROKÁZALI, ŽE OCHRANNÉ ÚČINKY STŘEDOMOŘSKÉ STRAVY (MEDDIET) PROTI RŮZNÝM MEZIPRODUKTOVÝM A KONCOVÝM FENOTYPŮM KARDIOVASKULÁRNÍCH ONEMOCNĚNÍ (CVD). MECHANISMY PRO TENTO OCHRANNÝ ÚČINEK JSOU VŠAK STÁLE MÁLO ZNÁMY. PRVNÍ NUTRIGENETICKÉ ANALÝZY VE STUDII PREDIMED NÁM UMOŽNILY ODHALIT DŮLEŽITÉ INTERAKCE S GEN-DIETOU, KTERÉ POTŘEBUJEME HLOUBĚJI POZNAT S INTEGRACÍ OMICKÝCH TECHNOLOGIÍ VČETNĚ GENOMIKY, EPIGENOMICA (ZEJMÉNA PROSTŘEDNICTVÍM STUDIÍ DNA METILACION). KROMĚ TOHO EXISTUJE VELKÝ ZÁJEM O STUDIUM BIOMARKERŮ STÁRNUTÍ NA ZÁKLADĚ PROFILU DNA METILACION, NAZÝVANÉHO TAKÉ EPIGENETICKÉ HODINY? TO URČUJE TZV. BIOLOGICKÝ VĚK (NA ZÁKLADĚ PROFILU METILACION) VERSUS CHRONOLOGICKÝ VĚK. JEHO ROZDÍL SE NAZÝVÁ ZRYCHLENÉ STÁRNUTÍ A JE SPOJEN S VĚTŠÍ ÚMRTNOSTÍ. JE ZNÁMO, ŽE RŮZNÉ SLOŽKY STRAVY MOHOU VYVOLAT ZMĚNY V DNA METILATION, ALE TYTO ZMĚNY NEJSOU V PRŮBĚHU ČASU DOBŘE CHARAKTERIZOVÁNY, ANI NEJSOU ZNÁMY JEJICH DYNAMICKÉ ASPEKTY NEBO JEJICH VLIV NA METILOMIC BIOMARKERY STÁRNUTÍ NEBO NA STŘEDNĚ POKROČILÉ A KONEČNÉ FENOTYPY CVD. Z TOHOTO DŮVODU JE NAŠÍM OBECNÝM CÍLEM ANALYZOVAT VLIV MEDDIET NA PROFIL METILOMICO, A TO JAK OBECNÝM ZPŮSOBEM, TAK I VE STÁRNUTÍ MARKERŮ (BIOLOGICKÝ VĚK DNA) A NA DIFERENCIÁLNÍ PROFIL KARDIOVASKULÁRNÍHO RIZIKA METILOMICO, PŘIČEMŽ DYNAMICKY POZORUJEME JEHO ZMĚNY V PRŮBĚHU ČASU VE SROVNÁNÍ S KONTROLNÍ DIETOU. V první řadě bude existovat návrh ECV případů a případů kontroly zvířat v Predimed-VALENCE kohorte a v jiném jazyce jiných uzlů (60 případů ECV a 60 kontrol) pro provedení aktuálního stavu. Integrovaný COMPLETE epigenome METILATION S GENOTIPATEDY OF DENSE IN PARTICIPANT MISS. STUDIE EPIGENOMA BUDE PROVÁDĚNA DYNAMICKY (ZÁKLADNÍ A VE DVOU NAVAZUJÍCÍCH ČASECH). VYPOČÍTÁ SE NĚKOLIK MARKERŮ STÁRNUTÍ DNA ZALOŽENÝCH NA METHYLOMA, VČETNĚ HORVATH (353 SOND), HANNUM (71 SOND) A WEIDNER (3 LOCI) MARKERY. ROVNĚŽ BUDOU STANOVENY EPIGENOMICKÉ PROFILY SPOJENÉ S VEDLEJŠÍM CVD A JEHO MEZIPRODUKTY FENOTYPŮ. INTEGROVANÁ ANALÝZA OMICO IDENTIFIKUJE GENETICKÉ POLYMORFISMY SPOJENÉ S TĚMITO MARKERY METILACION A VYTVOŘÍ SKÓRE GENETICKÉHO RIZIKA (GRS), KTERÉ LZE POUŽÍT JAKO ZÁSTUPCE STÁRNUTÍ A BIOMARKERŮ METILACION PRO CELKOVÝ VZOREK. BUDE VYBRÁNO 40 SNP, KTERÉ BUDOU STANOVENY V CELKOVÉ STUDII PREDIMED (N=7100). ROVNĚŽ SE URČÍ METILACION LOCI VYBRANÝCH V CELKOVÝCH PŘÍPADECH CVD A NÁHODNÝ VZOREK KOHORTY. POUŽITÍ MULTIVARIÁTNÍCH COX REGRESNÍCH MODELŮ S PODMÍNKAMI INTERAKCE KE STANOVENÍ GENO-EPIGENOMICKÉHO ÚČINKU TĚCHTO MARKERŮ NA INCIDENCI CVD A MORTALITU. SOUČASNĚ BUDOU VALIDOVÁNY GENOMICKÉ A EPIGENOMICKÉ MARKERY, VČETNĚ TRANSKRIPTOMICKÉ ANALÝZY V DÍLČÍM VZORKU ÚČASTNÍKŮ STUDIE PREDIMED PLUS-VALENCIA. PRO ANALÝZU RŮZNÝCH ÚROVNÍ SE POUŽIJÍ TECHNIKY INTEGRACE OMIKY (COINERCIA ATD.). (Czech)
17 August 2022
0 references
No estudo preliminar (um ensaio de intervenção dietética que incluiu 7447 participantes seguidos ao longo de um período de 4,8 anos), mostrámos que os efeitos protectores da dieta mediterrânea (MEDDIET) contra fenótipos diferentes intermédios e finais da doença cardiovascular (CVD). No entanto, os mecanismos para este efeito de protecção ainda são pouco conhecidos. As primeiras análises nutrigenéticas do estudo anterior permitiram-nos DETETAR INTERAÇÕES IMPORTANTES DO GEN-DIET QUE NECESSITAMOS DE SABER MAIS PROFUNDAMENTE COM A INTEGRAÇÃO DAS TECNOLOGIAS ÓMICAS, INCLUINDO A GENÓMICA, A EPIGENÓMICA (INCLUINDO, PRINCIPALMENTE, OS ESTUDOS DE METILACIÃO DO ADN). Além disso, há um grande interesse no estudo dos biomarcadores do envelhecimento com base no perfil do metillacão do ADN, também chamado de relógio epigenético? Isto determina a chamada Idade Biológica (baseada no Perfil de Metalacão) VERSUS, a Idade Cronológica. A sua diferença chama-se AGIMENTO ACELERADO E FOI ASSOCIADA A MAIS MORTALIDADE. É sabido que os diferentes componentes da dieta podem sofrer alterações na metilação do ADN, mas essas alterações não são bem caracterizadas ao longo do tempo, nem os seus aspectos dinâmicos são conhecidos, nem a sua influência sobre os biomarcadores metílicos do envelhecimento ou sobre os fenótipos intermédios e finais do leite em pó desnatado. Por esta razão, o nosso objectivo geral consiste em analisar o efeito do medicamento sobre o perfil de METILOMICO, tanto de uma forma geral como no envelhecimento dos operadores (idade biológica do ADN) e sobre o perfil de METILOMICO DIFERENCIAL do risco CARDIOVASCULAR, observando as suas alterações dinâmicas ao longo do tempo em comparação com a dieta de controlo. Em primeiro lugar, haverá uma conceção dos casos de VCE e dos casos de controlo de animais no COHORTE Predimed-VALENCE e numa língua diferente de outros nós (60 casos de VCE e 60 controlos) para realizar um estado de coisas. O estudo do EPIGENOMA será conduzido numa forma dinâmica (base e em dois tempos de seguimento). CÁLCULO DE VÁRIOS MARCADORES DE IDADE DO ADN BASEADOS EM METILOMAS, INCLUINDO MARCADORES DE HORVATH (353 PROBES), HANNUM (71 PROBES) E WEIDNER (3 LOCI). Os PERFILES EPIGENÓMICOS ASSOCIADOS À DVC INCIDENTE E AOS SEUS FENÓTIPOS INTERMÉDIOS SERÃO TAMBÉM DETERMINADOS. A ANÁLISE OMICO INTEGRADA IDENTIFICARÁ OS POLIMORFISMOS GENÉTICOS ASSOCIADOS A ESTES MARCADORES DE METILACIÓN E CRIARÁ RISCOS GENÉTICOS (GRS) QUE PODEM SER UTILIZADOS COMO PROXIMAS DE BIOMARCADORES DE ENVELHECIMENTO E DE METILACIÓN PARA A AMOSTRA TOTAL. Selecionar-se-ão 40 SNPS a determinar no estudo total premeditado (N=7100). Determinar-se-á igualmente a concentração de LOC selecionados nos casos totais de DCV e uma amostra aleatória da cortiça. UTILIZAÇÃO DE MODELOS MULTIVARIADOS DE REGRESSÃO DAS COXAS COM TERMOS DE INTERAÇÃO PARA DETERMINAR O EFEITO GENO-EPIGENÓMICO DESTES MARCADORES NA INCIDÊNCIA DA DCV E DA MORTALIDADE. Em paralelo, proceder-se-á à validação dos marcadores genéticos e epigenómicos, incluindo uma análise transcriptomímica numa amostra de participantes no estudo «plus valence». TÉCNICAS DE INTEGRAÇÃO OMICA (COINERCIA, ETC) SERÃO UTILIZADAS PARA A ANÁLISE DOS DIFERENTES NÍVEIS. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
UURINGUS PREDIMED (TOIDUSEKKUMISE UURING, MILLES OSALES 7447 OSALEJAT JA KESTIS KESKMISELT 4,8 AASTAT) TÕENDASIME, ET VAHEMERE DIEEDI (MEDDIET) KAITSETOIME SÜDAME-VERESOONKONNA HAIGUSTE ERINEVATE VAHE- JA LÕPPFENOTÜÜPIDE VASTU. SELLE KAITSEEFEKTI MEHHANISMID EI OLE SIISKI VEEL TEADA. PREDIMEDI UURINGU ESIMESED TOITAINELISED ANALÜÜSID ON VÕIMALDANUD MEIL AVASTADA OLULISI GENEETILISI KOOSTOIMEID, MIDA PEAME SÜGAVAMALT TUNDMA OOMITEHNOLOOGIATE, SEALHULGAS GENOOMIA, EPIGENOMICA INTEGREERIMISEL (PEAMISELT DNA METILACIONI UURINGUTE KAUDU). LISAKS ON SUUR HUVI UURINGU BIOMARKERITE VANANEMISE PÕHINEB PROFIILI DNA METILACION, NIMETATAKSE KA EPIGENEETILINE KELL? SEE MÄÄRAB NIINIMETATUD BIOLOOGILISE VANUSE (MIS PÕHINEB METILACION’I PROFIILIL) VÕRRELDES KRONOLOOGILISE VANUSEGA. SELLE ERINEVUST NIMETATAKSE KIIRENDATUD VANANEMISEKS JA SEDA ON SEOSTATUD SUUREMA SUREMUSEGA. ON TEADA, ET ERINEVAD TOIDUKOMPONENDID VÕIVAD MÕJUTADA DNA METILATION’I, KUID NEID MUUTUSI EI OLE AJA JOOKSUL HÄSTI ISELOOMUSTATUD, SAMUTI EI OLE TEADA NENDE DÜNAAMILISI ASPEKTE EGA NENDE MÕJU METILOMICI VANANEMISE BIOMARKERITELE VÕI VAHEPEALSETELE JA LÕPLIKELE CVD FENOTÜÜPIDELE. SEETÕTTU ON MEIE ÜLDINE EESMÄRK ANALÜÜSIDA MEDDIETI MÕJU METILOMICO PROFIILILE NII ÜLDISELT KUI KA MARKERITE VANANEMISELE (DNA BIOLOOGILINE VANUS) JA SÜDAME-VERESOONKONNA RISKI DIFERENTSIAALMETILOMICO PROFIILILE, JÄLGIDES SELLE MUUTUSI AJA JOOKSUL VÕRRELDES KONTROLLTOIDUGA. Esiteks töötatakse välja ECV juhtumid ja loomade kontrolli juhtumid Predimed-VALENCE’i kohordis ja muudes sõlmedes (60 ECV juhtumit ja 60 kontrolli), et teha olukord. Integreeritud COMPLETE epigenome METILATION WITH A GENOTIPATED STUDY OF DENSE IN PARTICIPANT MISS. EPIGENOMA UURING VIIAKSE LÄBI DÜNAAMILISELT (ALUSELISELT JA KAHEL JÄREL). ARVUTATAKSE MITU METHYLOMA-PÕHIST DNA VANANEMISMARKERIT, SEALHULGAS HORVATH (353 SONDI), HANNUM (71 SONDI) JA WEIDNER (3 LOCI) MARKERID. SAMUTI MÄÄRATAKSE KINDLAKS VAHEJUHTUMI CVDGA SEOTUD EPIGENOOMSED PROFIILID JA SELLE VAHEPEALSED FENOTÜÜBID. INTEGREERITUD OMICO ANALÜÜS TUVASTAB NENDE METILACION MARKERITEGA SEOTUD GENEETILISED POLÜMORFISMID JA LOOB GENEETILISE RISKI SKOORI (GRS), MIDA SAAB KASUTADA VANANEMISE JA METILACIONI BIOMARKERITE ASENDAJATENA KOGU PROOVI JAOKS. VALITAKSE 40 SNPD, MIS MÄÄRATAKSE KINDLAKS PREDIMEDI ÜLDUURINGUS (N=7100). SAMUTI MÄÄRATAKSE KINDLAKS KOGU CVD PUHUL VALITUD LOOKUSTE METILACION JA KOHORDI JUHUSLIK VALIM. MULTIVARIATIIVSETE COXI REGRESSIOONIMUDELITE KASUTAMINE KOOS KOOSTOIMETEGA, ET MÄÄRATA NENDE MARKERITE GENO-EPIGENOOMNE TOIME CVD JA SUREMUSE ESINEMISSAGEDUSELE. SAMAL AJAL VALIDEERITAKSE GENOOMILISED JA EPIGENOOMSED MARKERID, SEALHULGAS TRANSKRIPTOOMILINE ANALÜÜS PREDIMED PLUS-VALENCIA UURINGUS OSALEJATE ALAMVALIMIS. ERI TASANDITE ANALÜÜSIMISEKS KASUTATAKSE OOMILISE INTEGRATSIOONI TEHNIKAID (COINERCIA JNE). (Estonian)
17 August 2022
0 references
A PREDIMED VIZSGÁLATBAN (EGY 7447 RÉSZTVEVŐT MAGÁBAN FOGLALÓ ÉTRENDI BEAVATKOZÁSI VIZSGÁLATBAN, AMELYET EGY 4,8 ÉVES MEDIÁN IDŐTARTAM ALATT KÖVETTEK EL) KIMUTATTÁK, HOGY A MEDITERRÁN ÉTREND (MEDDIET) VÉDŐHATÁSAI A SZÍV- ÉS ÉRRENDSZERI BETEGSÉGEK KÜLÖNBÖZŐ KÖZBENSŐ ÉS VÉGFENOTÍPUSAIVAL SZEMBEN. ENNEK A VÉDŐHATÁSNAK A MECHANIZMUSAI AZONBAN MÉG MINDIG KEVÉSSÉ ISMERTEK. A PREDIMED VIZSGÁLAT ELSŐ NUTRIGENETIKUS ELEMZÉSE LEHETŐVÉ TETTE SZÁMUNKRA, HOGY OLYAN FONTOS GEN-DIET KÖLCSÖNHATÁSOKAT TÁRJUNK FEL, AMELYEKET MÉLYEBBEN KELL ISMERNÜNK AZ OMIC TECHNOLÓGIÁK INTEGRÁCIÓJÁVAL, BELEÉRTVE A GENOMIKÁT, AZ EPIGENOMICA-T (FŐKÉNT A DNS METILACION VIZSGÁLATÁVAL). EZENKÍVÜL NAGY ÉRDEKLŐDÉS MUTATKOZIK AZ ÖREGEDÉS BIOMARKEREKÉNEK TANULMÁNYOZÁSA IRÁNT A DNS METILACION, MÁS NÉVEN EPIGENETIKUS ÓRA PROFILJA ALAPJÁN? EZ HATÁROZZA MEG AZ ÚGYNEVEZETT BIOLÓGIAI KORT (A METILACION-PROFIL ALAPJÁN) ÉS AZ IDŐRENDI ÉLETKORT. A KÜLÖNBSÉG AZ ÚGYNEVEZETT GYORSÍTOTT ÖREGEDÉS ÉS TÁRSÍTOTT TÖBB MORTALITÁS. KÖZTUDOTT, HOGY AZ ÉTREND KÜLÖNBÖZŐ ÖSSZETEVŐI VÁLTOZÁSOKAT IDÉZHETNEK ELŐ A DNS METILATION-BAN, DE EZEK A VÁLTOZÁSOK AZ IDŐ MÚLÁSÁVAL NEM MEGFELELŐEN JELLEMEZHETŐK, NEM ISMERTEK DINAMIKUS JELLEMZŐIK, SEM AZ ÖREGEDÉS METILOMIC BIOMARKEREIRE VAGY A KÖZBENSŐ ÉS VÉGLEGES CVD-FENOTÍPUSOKRA GYAKOROLT HATÁSUK. EZÉRT ÁLTALÁNOS CÉLUNK, HOGY ELEMEZZÜK A MEDDIET HATÁSÁT A METILOMICO PROFILRA, MIND ÁLTALÁNOS MÓDON, MIND MARKEREKBEN (A DNS BIOLÓGIAI KORA), VALAMINT A KARDIOVASZKULÁRIS KOCKÁZAT DIFFERENCIÁLIS METILOMICO PROFILJÁRA, DINAMIKUSAN FIGYELVE ANNAK IDŐBELI VÁLTOZÁSAIT A KONTROLL ÉTRENDHEZ KÉPEST. Először is az ECV és az állat-ellenőrzési esetek tervezése a Predimed-VALENCE kohorszban és a többi csomópont egy másik nyelvén (60 esetben ECV és 60 ellenőrzés) a helyzet elvégzésére. AZ EPIGENOMA-TANULMÁNYT DINAMIKUSAN (ALAP- ÉS KÉT NYOMON KÖVETÉSI IDŐPONTBAN) KELL ELVÉGEZNI. TÖBB METHYLOMA ALAPÚ DNS ÖREGEDÉSI MARKERT IS KISZÁMÍTANAK, KÖZTÜK HORVATH (353 SZONDA), HANNUM (71 SZONDA) ÉS WEIDNER (3 LOCI) MARKEREK. A CVD-VEL ÉS ANNAK KÖZBENSŐ FENOTÍPUSAIVAL KAPCSOLATOS EPIGENOMIKUS PROFILOKAT IS MEG KELL HATÁROZNI. AZ INTEGRÁLT OMICO ELEMZÉS AZONOSÍTJA AZ EZEKHEZ A METILACION-MARKEREKHEZ KAPCSOLÓDÓ GENETIKAI POLIMORFIZMUSOKAT, ÉS GENETIKAI KOCKÁZATI PONTSZÁMOKAT (GRS) HOZ LÉTRE, AMELYEK FELHASZNÁLHATÓK AZ ÖREGEDÉS ÉS A METILACION BIOMARKEREK HELYETTESÍTŐJEKÉNT A TELJES MINTA ESETÉBEN. A TELJES PREDIMED VIZSGÁLATBAN 40 SNP-T VÁLASZTANAK KI (N=7100). A CVD TELJES ESETEIBEN KIVÁLASZTOTT LÓKUSZ METILACION-JÁT ÉS A KOHORSZ VÉLETLENSZERŰ MINTÁJÁT IS MEG KELL HATÁROZNI. MULTIVARIÁT COX REGRESSZIÓS MODELLEK ALKALMAZÁSA INTERAKCIÓS FELTÉTELEKKEL E MARKEREK GENO-EPIGENOMIKUS HATÁSÁNAK MEGHATÁROZÁSÁRA A CVD ÉS A MORTALITÁS ELŐFORDULÁSÁBAN. EZZEL PÁRHUZAMOSAN A GENOMIKUS ÉS EPIGENOMIKUS MARKEREKET VALIDÁLJÁK, BELEÉRTVE A PREDIMED PLUS-VALENCIA-VIZSGÁLAT RÉSZTVEVŐINEK RÉSZMINTÁJÁBAN VÉGZETT TRANSZKRIPTOMIKAI ELEMZÉST IS. A KÜLÖNBÖZŐ SZINTEK ELEMZÉSÉHEZ OMIC INTEGRÁCIÓS TECHNIKÁKAT (COINERCIA STB.) HASZNÁLNAK. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
В ПРОУЧВАНЕТО PREDIMED (ПРОУЧВАНЕ ЗА ДИЕТИЧНА ИНТЕРВЕНЦИЯ, ВКЛЮЧВАЩО 7447 УЧАСТНИЦИ, ПОСЛЕДВАНИ ОТ МЕДИАНА ОТ 4,8 ГОДИНИ) ПОКАЗАХМЕ, ЧЕ ЗАЩИТНИТЕ ЕФЕКТИ НА СРЕДИЗЕМНОМОРСКАТА ДИЕТА (MEDDIET) СРЕЩУ РАЗЛИЧНИ МЕЖДИННИ И КРАЙНИ ФЕНОТИПОВЕ НА СЪРДЕЧНО-СЪДОВИТЕ ЗАБОЛЯВАНИЯ (CVD). МЕХАНИЗМИТЕ ЗА ТОЗИ ЗАЩИТЕН ЕФЕКТ ОБАЧЕ ВСЕ ОЩЕ СА МАЛКО ИЗВЕСТНИ. ПЪРВИТЕ ХРАНИТЕЛНИ АНАЛИЗИ В ПРОУЧВАНЕТО PREDIMED НИ ПОЗВОЛИХА ДА ОТКРИЕМ ВАЖНИ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ НА ГЕН-ДИЕТА, КОИТО ТРЯБВА ДА ЗНАЕМ ПО-ЗАДЪЛБОЧЕНО С ИНТЕГРИРАНЕТО НА ОМИЧНИТЕ ТЕХНОЛОГИИ, ВКЛЮЧИТЕЛНО ГЕНОМИКА, EPIGENOMICA (ГЛАВНО ЧРЕЗ ИЗСЛЕДВАНИЯ НА ДНК METILACION). В ДОПЪЛНЕНИЕ, ИМА ГОЛЯМ ИНТЕРЕС КЪМ ИЗСЛЕДВАНЕТО НА БИОМАРКЕРИ НА СТАРЕЕНЕ ВЪЗ ОСНОВА НА ПРОФИЛА НА ДНК METILACION, НАРИЧАН СЪЩО ЕПИГЕНЕТИЧЕН ЧАСОВНИК? ТОВА ОПРЕДЕЛЯ ТАКА НАРЕЧЕНАТА БИОЛОГИЧНА ВЪЗРАСТ (ВЪЗ ОСНОВА НА ПРОФИЛА НА METILACION) СПРЯМО ХРОНОЛОГИЧНАТА ВЪЗРАСТ. НЕГОВАТА РАЗЛИКА СЕ НАРИЧА УСКОРЕНО СТАРЕЕНЕ И Е СВЪРЗАНА С ПО-ГОЛЯМА СМЪРТНОСТ. ИЗВЕСТНО Е, ЧЕ РАЗЛИЧНИТЕ КОМПОНЕНТИ НА ДИЕТАТА МОГАТ ДА УПРАЖНЯТ ПРОМЕНИ В ДНК МЕТИЛАЦИЯТА, НО ТЕЗИ ПРОМЕНИ НЕ СЕ ХАРАКТЕРИЗИРАТ ДОБРЕ С ТЕЧЕНИЕ НА ВРЕМЕТО, НИТО СА ИЗВЕСТНИ ТЕХНИТЕ ДИНАМИЧНИ АСПЕКТИ ИЛИ ВЛИЯНИЕТО ИМ ВЪРХУ БИОМАРКЕРИТЕ METILOMIC НА СТАРЕЕНЕТО ИЛИ ВЪРХУ МЕЖДИННИТЕ И ОКОНЧАТЕЛНИТЕ CVD ФЕНОТИПОВЕ. ПОРАДИ ТАЗИ ПРИЧИНА ОБЩАТА НИ ЦЕЛ Е ДА АНАЛИЗИРАМЕ ЕФЕКТА НА MEDDIET ВЪРХУ ПРОФИЛА НА METILOMICO, КАКТО ПО ОБЩ НАЧИН, ТАКА И ВЪРХУ СТАРЕЕНЕТО НА МАРКЕРИТЕ (БИОЛОГИЧНА ВЪЗРАСТ НА ДНК) И ВЪРХУ ДИФЕРЕНЦИАЛНИЯ ПРОФИЛ НА МЕТИЛОМИКО НА СЪРДЕЧНОСЪДОВИЯ РИСК, КАТО НАБЛЮДАВАМЕ ДИНАМИЧНО НЕГОВИТЕ ПРОМЕНИ ВЪВ ВРЕМЕТО В СРАВНЕНИЕ С КОНТРОЛНАТА ДИЕТА. На първо място ще има дизайн на ECV случаи и случаи за контрол на животните в Кохорта Predimed-VALENCE и на различен език на други възли (60 случая на ECV и 60 проверки), за да се извърши състояние на нещата. Интегрирана епигеномна МИТЛАЦИЯ С ГЕНТИПАТИЧНА СЪДА В ПАРТИЧНОТО МИС. ПРОУЧВАНЕТО EPIGENOMA ЩЕ СЕ ПРОВЕЖДА ПО ДИНАМИЧЕН НАЧИН (ОСНОВНО И В ДВА ПОСЛЕДВАЩИ ПЕРИОДА). ЩЕ БЪДАТ ИЗЧИСЛЕНИ НЯКОЛКО МАРКЕРА ЗА СТАРЕЕНЕ НА ДНК НА БАЗАТА НА METHYLOMA, ВКЛЮЧИТЕЛНО HORVATH (353 СОНДИ), HANNUM (71 СОНДИ) И WEIDNER (3 LOCI) МАРКЕРИ. ЩЕ БЪДАТ ОПРЕДЕЛЕНИ И ЕПИГЕНОМИЧНИТЕ ПРОФИЛИ, СВЪРЗАНИ С ИНЦИДЕНТА CVD И НЕГОВИТЕ МЕЖДИННИ ФЕНОТИПОВЕ. ИНТЕГРИРАНИЯТ АНАЛИЗ НА OMICO ЩЕ ИДЕНТИФИЦИРА ГЕНЕТИЧНИТЕ ПОЛИМОРФИЗМИ, СВЪРЗАНИ С ТЕЗИ МАРКЕРИ METILACION, И ЩЕ СЪЗДАДЕ ОЦЕНКИ НА ГЕНЕТИЧНИЯ РИСК (GRS), КОИТО МОГАТ ДА СЕ ИЗПОЛЗВАТ КАТО ЗАМЕСТИТЕЛИ НА СТАРЕЕНЕТО И БИОМАРКЕРИТЕ METILACION ЗА ОБЩАТА ПРОБА. ЩЕ БЪДАТ ИЗБРАНИ 40 SNP, КОИТО ЩЕ БЪДАТ ОПРЕДЕЛЕНИ В ОБЩОТО ПРОУЧВАНЕ PREDIMED (N=7100). ОПРЕДЕЛЯ СЕ И МЕТИЛАЦИОН ОТ ЛОКУСИ, ИЗБРАНИ В ОБЩИЯ БРОЙ СЛУЧАИ НА CVD, И ПРОИЗВОЛНА ИЗВАДКА ОТ КОХОРТАТА. ИЗПОЛЗВАНЕ НА МНОГОВАРИАНТНИ МОДЕЛИ НА COX РЕГРЕСИЯ С УСЛОВИЯ НА ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ ЗА ОПРЕДЕЛЯНЕ НА ГЕНО- ЕПИГЕНОМИЧНИЯ ЕФЕКТ НА ТЕЗИ МАРКЕРИ ВЪРХУ ЧЕСТОТАТА НА CVD И СМЪРТНОСТТА. УСПОРЕДНО С ТОВА ЩЕ БЪДАТ ВАЛИДИРАНИ ГЕНОМНИТЕ И ЕПИГЕНОМНИТЕ МАРКЕРИ, ВКЛЮЧИТЕЛНО ТРАНСКРИПТОМНИЯТ АНАЛИЗ В ПОДИЗВАДКА ОТ УЧАСТНИЦИ В ПРОУЧВАНЕТО PREDIMED PLUS-VALENCIA. ЗА АНАЛИЗА НА РАЗЛИЧНИТЕ НИВА ЩЕ СЕ ИЗПОЛЗВАТ ТЕХНИКИ ЗА ОМИЧНА ИНТЕГРАЦИЯ (COINERCIA И Т.Н.). (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
PREDIMED TYRIME (MAISTO INTERVENCIJOS TYRIMAS, KURIAME DALYVAVO 7447 DALYVIAI, KURIO MEDIANA BUVO 4,8 METŲ), PARODĖME, KAD VIDURŽEMIO JŪROS REGIONO DIETOS (MEDDIET) APSAUGINIS POVEIKIS NUO ĮVAIRIŲ TARPINIŲ IR GALUTINIŲ ŠIRDIES IR KRAUJAGYSLIŲ LIGŲ FENOTIPŲ. TAČIAU ŠIO APSAUGINIO POVEIKIO MECHANIZMAI VIS DAR MAŽAI ŽINOMI. PIRMOSIOS MAISTINĖS ANALIZĖS PREDIMED TYRIME LEIDO MUMS NUSTATYTI SVARBIĄ GENO IR DIETOS SĄVEIKĄ, KURIĄ MUMS REIKIA GILIAU PAŽINTI SU OMINIŲ TECHNOLOGIJŲ, ĮSKAITANT GENOMIKĄ, EPIGENOMICA (DAUGIAUSIA ATLIEKANT DNR METILACION TYRIMUS). BE TO, YRA DIDELIS SUSIDOMĖJIMAS SENĖJIMO BIOLOGINIŲ ŽYMENŲ TYRIMU, PAGRĮSTU DNR METILACION PROFILIU, TAIP PAT VADINAMU EPIGENETINIU LAIKRODŽIU? TAI LEMIA VADINAMĄJĮ BIOLOGINĮ AMŽIŲ (REMIANTIS METILACION PROFILIU) IR CHRONOLOGINĮ AMŽIŲ. JO SKIRTUMAS VADINAMAS PAGREITINTU SENĖJIMU IR BUVO SUSIJĘS SU DIDESNIU MIRTINGUMU. ŽINOMA, KAD SKIRTINGOS DIETOS SUDEDAMOSIOS DALYS GALI KEISTI DNR METILACIJAS, TAČIAU ŠIE POKYČIAI LAIKUI BĖGANT NĖRA GERAI APIBŪDINTI, TAIP PAT NĖRA ŽINOMI JŲ DINAMINIAI ASPEKTAI AR JŲ ĮTAKA METILOMIC SENĖJIMO BIOLOGINIAMS ŽYMENIMS ARBA TARPINIAMS IR GALUTINIAMS CVD FENOTIPAMS. DĖL ŠIOS PRIEŽASTIES MŪSŲ BENDRAS TIKSLAS YRA ANALIZUOTI MEDDIET POVEIKĮ METILOMICO PROFILIUI TIEK BENDRAI, TIEK ŽYMEKLIUOSE SENĖJANT (BIOLOGINIS DNR AMŽIUS) IR DIFERENCINIAM METILOMICO ŠIRDIES IR KRAUJAGYSLIŲ RIZIKOS PROFILIUI, STEBINT JO POKYČIUS LAIKUI BĖGANT, PALYGINTI SU KONTROLINE DIETA. Visų pirma bus sukurta ECV atvejų ir gyvūnų kontrolės atvejų konstrukcija Predimed-VALENCE kohorte ir kita kitų mazgų kalba (60 atvejų ECV ir 60 kontrolės priemonių), kad būtų galima atlikti esamą padėtį. EPIGENOMA TYRIMAS BUS ATLIEKAMAS DINAMIŠKAI (PAGRINDINIS IR DU STEBĖJIMO KARTUS). BUS APSKAIČIUOTI KELI METHYLOMA PAGRĮSTI DNR SENĖJIMO ŽYMENYS, ĮSKAITANT HORVATH (353 ZONDAI), HANNUM (71 ZONDAS) IR WEIDNER (3 LOCI) ŽYMENIS. TAIP PAT BUS NUSTATYTI EPIGENOMINIAI PROFILIAI, SUSIJĘ SU INCIDENTU IR JO TARPINIAIS FENOTIPAIS. INTEGRUOTA OMICO ANALIZĖ NUSTATYS GENETINIUS POLIMORFIZMUS, SUSIJUSIUS SU ŠIAIS METILACION ŽYMENIMIS, IR SUKURS GENETINĖS RIZIKOS BALUS (GRS), KURIE GALI BŪTI NAUDOJAMI KAIP SENĖJIMO IR METILACION BIOLOGINIŲ ŽYMENŲ PAKAITINIAI RODIKLIAI VISAM MĖGINIUI. BUS ATRINKTI 40 SNP, KURIE BUS NUSTATYTI BENDRAME PREDIMED TYRIME (N=7100). TAIP PAT BUS NUSTATYTA LOKUSŲ, ATRINKTŲ BENDRAIS CVD ATVEJAIS, METILACION IR ATSITIKTINĖ KOHORTOS IMTIS. NAUDOJANT ĮVAIRIŲ KINTAMŲJŲ COX REGRESIJOS MODELIUS SU SĄVEIKOS TERMINAIS, SIEKIANT NUSTATYTI ŠIŲ ŽYMENŲ GENOEPIGENOMINĮ POVEIKĮ CVD DAŽNIUI IR MIRTINGUMUI. TUO PAČIU METU BUS PATVIRTINTI GENOMINIAI IR EPIGENOMINIAI ŽYMENYS, ĮSKAITANT TRANSKRIPTOMINĘ ANALIZĘ PREDIMED IR VALENCIA TYRIMO DALYVIŲ POĖMYJE. ANALIZUOJANT SKIRTINGUS LYGIUS BUS NAUDOJAMI OMINIS INTEGRAVIMO METODAI (COINERCIA IR KT.). (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
U ISPITIVANJU PREDIMED (PREHRAMBENO INTERVENTNO ISPITIVANJE U KOJEM JE SUDJELOVALO 7447 SUDIONIKA TIJEKOM MEDIJANA OD 4,8 GODINA) POKAZALI SMO DA SU ZAŠTITNI UČINCI MEDITERANSKE PREHRANE (MEDDIET) PROTIV RAZLIČITIH SREDNJIH I KRAJNJIH FENOTIPOVA KARDIOVASKULARNIH BOLESTI (CVD). MEĐUTIM, MEHANIZMI ZA TAJ ZAŠTITNI UČINAK JOŠ UVIJEK SU MALO POZNATI. PRVE NUTRIGENETSKE ANALIZE U PREDIMED STUDIJI OMOGUĆILE SU NAM OTKRIVANJE VAŽNIH INTERAKCIJA GEN-DIJETE KOJE MORAMO ZNATI DUBLJE S INTEGRACIJOM OMIČKIH TEHNOLOGIJA, UKLJUČUJUĆI GENOMICU, EPIGENOMICA (UGLAVNOM KROZ STUDIJE DNA METILACION). OSIM TOGA, POSTOJI VELIKI INTERES ZA PROUČAVANJE BIOMARKERA STARENJA NA TEMELJU PROFILA DNA METILACION, KOJI SE TAKOĐER NAZIVA EPIGENETSKI SAT? TIME SE ODREĐUJE TAKOZVANA BIOLOŠKA DOB (NA TEMELJU PROFILA METILACION) U ODNOSU NA KRONOLOŠKU DOB. RAZLIKA SE NAZIVA UBRZANIM STARENJEM I POVEZANA JE S VEĆOM SMRTNOŠĆU. POZNATO JE DA RAZLIČITE KOMPONENTE PREHRANE MOGU UTJECATI NA PROMJENE U METILACIJI DNK, ALI TE PROMJENE NISU DOBRO KARAKTERIZIRANE TIJEKOM VREMENA, NITI SU POZNATI NJIHOVI DINAMIČKI ASPEKTI ILI NJIHOV UTJECAJ NA METILOMIC BIOMARKERE STARENJA ILI NA SREDNJE I KONAČNE CVD FENOTIPOVE. IZ TOG RAZLOGA NAŠ OPĆI CILJ JE ANALIZIRATI UTJECAJ MEDDIETA NA PROFIL METILOMICO, KAKO NA OPĆENIT NAČIN, TAKO I KOD MARKERA STARENJA (BIOLOŠKA DOB DNK) I NA DIFERENCIJALNI METILOMICO PROFIL KARDIOVASKULARNOG RIZIKA, PROMATRAJUĆI DINAMIČKI NJEGOVE PROMJENE TIJEKOM VREMENA U USPOREDBI S KONTROLNOM PREHRANOM. Na prvom mjestu će biti dizajn ECV slučajeva i životinja kontrole slučajeva u Predimed-VALENCE kohorte i na drugom jeziku drugih čvorova (60 slučajeva ECV i 60 kontrola) za obavljanje stanja. Integrirana COMPLETE epigenome METILATION S GENOTIPATE STUDIJA U PARTICIPANT MISS. ISPITIVANJE EPIGENOMA PROVODIT ĆE SE NA DINAMIČAN NAČIN (OSNOVNO I U DVA PUTA PRAĆENJA). IZRAČUNAT ĆE SE NEKOLIKO MARKERA STARENJA DNK BAZIRANIH NA METHYLOMA, UKLJUČUJUĆI HORVATH (353 SONDE), HANNUM (71 SONDE) I WEIDNER (3 LOCI) MARKERE. UTVRDIT ĆE SE I EPIGENOMSKI PROFILI POVEZANI S KVD-OM INCIDENTA I NJEGOVIM INTERMEDIJARNIM FENOTIPOVIMA. INTEGRIRANOM ANALIZOM OMICO-A UTVRDIT ĆE SE GENETSKI POLIMORFIZMI POVEZANI S TIM MARKERIMA METILACION-A I STVORITI OCJENE GENETSKOG RIZIKA (GRS) KOJE SE MOGU KORISTITI KAO PRIBLIŽNE VRIJEDNOSTI STARENJA I BIOMARKERA METILACION ZA UKUPNI UZORAK. ODABIRE SE 40 SNP-OVA KOJI ĆE SE ODREDITI U UKUPNOM ISPITIVANJU PREDIMED (N=7100). TAKOĐER ĆE SE ODREDITI METILACION LOKUSA ODABRANIH U UKUPNIM SLUČAJEVIMA KVD-A I NASUMIČNI UZORAK KOHORTE. KORIŠTENJE MULTIVARIJATNIH COX REGRESIJSKIH MODELA S UVJETIMA INTERAKCIJE KAKO BI SE ODREDIO GENOEPIGENOMSKI UČINAK TIH MARKERA U INCIDENCIJI KVB-A I SMRTNOSTI. ISTODOBNO ĆE SE VALIDIRATI GENOMSKI I EPIGENOMSKI MARKERI, UKLJUČUJUĆI TRANSKRIPTOMSKU ANALIZU U PODUZORKU SUDIONIKA STUDIJE PREDIMED PLUS-VALENCIA. OMIC INTEGRACIJSKE TEHNIKE (COINERCIA ITD.) KORISTIT ĆE SE ZA ANALIZU RAZLIČITIH RAZINA. (Croatian)
17 August 2022
0 references
I PREDIMED-STUDIEN (EN DIETINTERVENTIONSSTUDIE MED 7447 DELTAGARE FÖLJDE UNDER EN MEDIAN PÅ 4,8 ÅR) HAR VI VISAT ATT DE SKYDDANDE EFFEKTERNA AV MEDELHAVSDIETEN (MEDDIET) MOT OLIKA MELLANLIGGANDE OCH SLUTFENOTYPER AV HJÄRT-KÄRLSJUKDOM (CVD). MEKANISMERNA FÖR DENNA SKYDDANDE EFFEKT ÄR DOCK FORTFARANDE INTE KÄNDA. DE FÖRSTA NUTRIGENETISKA ANALYSERNA I PREDIMED-STUDIEN HAR GJORT DET MÖJLIGT FÖR OSS ATT UPPTÄCKA VIKTIGA GENDIETINTERAKTIONER SOM VI BEHÖVER VETA MER INGÅENDE MED INTEGRERINGEN AV OMISKA TEKNIKER INKLUSIVE GENOMICA, EPIGENOMICA (FRÄMST GENOM STUDIER AV DNA METILACION). DESSUTOM FINNS DET STORT INTRESSE FÖR STUDIEN AV BIOMARKÖRER FÖR ÅLDRANDE BASERAT PÅ PROFILEN FÖR DNA METILACION, ÄVEN KALLAD EPIGENETISK KLOCKA? DETTA BESTÄMMER DEN SÅ KALLADE BIOLOGISKA ÅLDERN (BASERAT PÅ METILACION-PROFILEN) JÄMFÖRT MED DEN KRONOLOGISKA ÅLDERN. DESS SKILLNAD KALLAS ACCELERERAT ÅLDRANDE OCH HAR FÖRKNIPPATS MED ÖKAD DÖDLIGHET. DET ÄR KÄNT ATT DE OLIKA KOMPONENTERNA I KOSTEN KAN MEDFÖRA FÖRÄNDRINGAR I DNA METILATION, MEN DESSA FÖRÄNDRINGAR ÄR INTE VÄL KARAKTÄRISERADE ÖVER TIDEN, INTE HELLER ÄR DERAS DYNAMISKA ASPEKTER KÄNDA ELLER DERAS INVERKAN PÅ METILOMIC-BIOMARKÖRER FÖR ÅLDRANDE ELLER PÅ INTERMEDIÄRA OCH SLUTLIGA CVD-FENOTYPER. DÄRFÖR ÄR VÅRT ALLMÄNNA MÅL ATT ANALYSERA EFFEKTEN AV MEDDIET PÅ METILOMICO-PROFILEN, BÅDE PÅ ETT GENERELLT SÄTT OCH I MARKÖRERS ÅLDRANDE (DNA:S BIOLOGISKA ÅLDER) OCH PÅ DEN DIFFERENTIERADE METILOMICO-PROFILEN FÖR KARDIOVASKULÄR RISK, OCH OBSERVERAR DYNAMISKT DESS FÖRÄNDRINGAR ÖVER TID JÄMFÖRT MED KONTROLLKOSTEN. För det första kommer det att finnas en utformning av ECV-fall och djurkontrollfall i Predimed-VALENCE-kohorten och på ett annat språk för andra noder (60 fall av ECV och 60 kontroller) för att utföra en situation. EPIGENOMA-STUDIEN KOMMER ATT GENOMFÖRAS PÅ ETT DYNAMISKT SÄTT (GRUNDLÄGGANDE OCH TVÅ UPPFÖLJNINGSTIDER). FLERA METHYLOMA-BASERADE DNA-ÅLDRINGSMARKÖRER KOMMER ATT BERÄKNAS, INKLUSIVE HORVATH (353 SONDER), HANNUM (71 SONDER) OCH WEIDNER (3 LOCI) MARKÖRER. DE EPIGENOMISKA PROFILERNA I SAMBAND MED INCIDENSEN CVD OCH DESS INTERMEDIÄRA FENOTYPER KOMMER OCKSÅ ATT BESTÄMMAS. DEN INTEGRERADE OMICO-ANALYSEN KOMMER ATT IDENTIFIERA DE GENETISKA POLYMORFISMER SOM ÄR FÖRKNIPPADE MED DESSA METILACION-MARKÖRER OCH SKAPA GENETISKA RISKPOÄNG (GRS) SOM KAN ANVÄNDAS SOM PROXYVARIANTER FÖR ÅLDRANDE OCH METILACION-BIOMARKÖRER FÖR DET TOTALA PROVET. 40 SNP KOMMER ATT VÄLJAS UT FÖR ATT FASTSTÄLLAS I DEN TOTALA PREDIMED-STUDIEN (N=7100). DEN METILACION AV LOCI SOM VALTS UT I DE TOTALA FALLEN AV CVD OCH ETT SLUMPMÄSSIGT URVAL AV KOHORTEN KOMMER OCKSÅ ATT FASTSTÄLLAS. ANVÄNDNING AV MULTIVARIAT COX REGRESSIONSMODELLER MED TERMER AV INTERAKTION FÖR ATT BESTÄMMA DEN GENO-EPIGENOMISKA EFFEKTEN AV DESSA MARKÖRER I INCIDENSEN AV CVD OCH MORTALITET. PARALLELLT KOMMER GENOMISKA OCH EPIGENOMISKA MARKÖRER ATT VALIDERAS, INKLUSIVE EN TRANSKRIPTOMISK ANALYS I ETT DELPROV AV DELTAGARE I STUDIEN PREDIMED PLUS-VALENCIA. OMISKA INTEGRATIONSTEKNIKER (COINERCIA OSV.) KOMMER ATT ANVÄNDAS FÖR ANALYS AV DE OLIKA NIVÅERNA. (Swedish)
17 August 2022
0 references
ÎN STUDIUL PREDIMED (UN STUDIU DE INTERVENȚIE ALIMENTARĂ CARE A INCLUS 7447 DE PARTICIPANȚI A URMAT O MEDIE DE 4,8 ANI) AM ARĂTAT CĂ EFECTELE DE PROTECȚIE ALE DIETEI MEDITERANEENE (MEDDIET) ÎMPOTRIVA DIFERITELOR FENOTIPURI INTERMEDIARE ȘI FINALE ALE BOLILOR CARDIOVASCULARE (CVD). CU TOATE ACESTEA, MECANISMELE PENTRU ACEST EFECT PROTECTOR SUNT ÎNCĂ PUȚIN CUNOSCUTE. PRIMELE ANALIZE NUTRIGENETICE DIN STUDIUL PREDIMED NE-AU PERMIS SĂ DETECTĂM INTERACȚIUNI IMPORTANTE DE GEN-DIETĂ PE CARE TREBUIE SĂ LE CUNOAȘTEM MAI PROFUND CU INTEGRAREA TEHNOLOGIILOR OMICE, INCLUSIV GENOMICA, EPIGENOMICA (ÎN PRINCIPAL PRIN STUDII DE ADN METILACION). ÎN PLUS, EXISTĂ UN MARE INTERES PENTRU STUDIUL BIOMARKERILOR DE ÎMBĂTRÂNIRE PE BAZA PROFILULUI METILACION ADN, NUMIT ȘI CEASUL EPIGENETIC? ACEASTA DETERMINĂ AȘA-NUMITA VÂRSTĂ BIOLOGICĂ (PE BAZA PROFILULUI METILACION) FAȚĂ DE VÂRSTA CRONOLOGICĂ. DIFERENȚA SA SE NUMEȘTE ÎMBĂTRÂNIRE ACCELERATĂ ȘI A FOST ASOCIATĂ CU O MORTALITATE MAI MARE. ESTE CUNOSCUT FAPTUL CĂ DIFERITELE COMPONENTE ALE DIETEI POT EXERCITA MODIFICĂRI ALE METILAȚIEI ADN, DAR ACESTE MODIFICĂRI NU SUNT BINE CARACTERIZATE DE-A LUNGUL TIMPULUI, NICI NU SUNT CUNOSCUTE ASPECTELE LOR DINAMICE SAU INFLUENȚA LOR ASUPRA BIOMARKERILOR METILOMICI AI ÎMBĂTRÂNIRII SAU ASUPRA FENOTIPURILOR DVC INTERMEDIARE ȘI FINALE. DIN ACEST MOTIV, OBIECTIVUL NOSTRU GENERAL ESTE DE A ANALIZA EFECTUL MEDDIET ASUPRA PROFILULUI METILOMICO, ATÂT ÎN GENERAL, CÂT ȘI ÎN CEEA CE PRIVEȘTE ÎMBĂTRÂNIREA MARKERILOR (VÂRSTA BIOLOGICĂ A ADN-ULUI) ȘI PROFILUL DIFERENȚIAL METILOMICO AL RISCULUI CARDIOVASCULAR, OBSERVÂND DINAMIC MODIFICĂRILE ACESTUIA ÎN TIMP COMPARATIV CU DIETA DE CONTROL. În primul rând, va exista un model de cazuri ECV și cazuri de control al animalelor în cohorta Predimed-VALENCE și într-un limbaj diferit al altor noduri (60 de cazuri de ECV și 60 de controale) pentru a efectua o stare de fapt. METILARE COMPLETĂ COMPLETĂ cu o STUDIE GENOTIPATE DE DENZĂ ÎN MISS PARTICIPANT. STUDIUL EPIGENOMA VA FI REALIZAT ÎNTR-O MANIERĂ DINAMICĂ (DE BAZĂ ȘI ÎN DOUĂ PERIOADE DE URMĂRIRE). VOR FI CALCULAȚI MAI MULȚI MARKERI DE ÎMBĂTRÂNIRE A ADN-ULUI PE BAZĂ DE METYLOMA, INCLUSIV MARKERI HORVATH (353 SONDE), HANNUM (71 SONDE) ȘI WEIDNER (3 LOCI). SE VOR DETERMINA, DE ASEMENEA, PROFILURILE EPIGENOMICE ASOCIATE CU DCV INCIDENT ȘI FENOTIPURILE SALE INTERMEDIARE. ANALIZA INTEGRATĂ OMICO VA IDENTIFICA POLIMORFISMELE GENETICE ASOCIATE CU ACEȘTI MARKERI METILACION ȘI VA CREA SCORURI DE RISC GENETIC (GRS) CARE POT FI UTILIZATE CA PROXIONI AI MARKERILOR BIOLOGICI DE ÎMBĂTRÂNIRE ȘI METILACION PENTRU EȘANTIONUL TOTAL. 40 SNP VOR FI SELECTATE PENTRU A FI DETERMINATE ÎN STUDIUL PREDIMED TOTAL (N=7100). SE VA DETERMINA, DE ASEMENEA, METILACION DE LOCI SELECTAȚI ÎN CAZURILE TOTALE DE CVD ȘI UN EȘANTION ALEATORIU DE COHORTĂ. UTILIZAREA MODELELOR DE REGRESIE COX MULTIVARIATE CU TERMENI DE INTERACȚIUNE PENTRU A DETERMINA EFECTUL GENO-EPIGENOMIC AL ACESTOR MARKERI ÎN INCIDENȚA DCV ȘI A MORTALITĂȚII. ÎN PARALEL, MARKERII GENOMICI ȘI EPIGENOMICI VOR FI VALIDAȚI, INCLUSIV O ANALIZĂ TRANSCRIPȚIONALĂ ÎNTR-UN SUBEȘANTION DE PARTICIPANȚI LA STUDIUL PREDIMED PLUS-VALENCIA. PENTRU ANALIZA DIFERITELOR NIVELURI SE VOR UTILIZA TEHNICI DE INTEGRARE OMICA (COINERCIA ETC.). (Romanian)
17 August 2022
0 references
V ŠTUDIJI PREDIMED (PRESKUS PREHRANSKE INTERVENCIJE, V KATEREM JE SODELOVALO 7447 UDELEŽENCEV, KI SO SODELOVALI V MEDIANI 4,8 LETA) SMO POKAZALI, DA SO ZAŠČITNI UČINKI MEDITERANSKE PREHRANE (MEDDIET) PRED RAZLIČNIMI VMESNIMI IN KONČNIMI FENOTIPI BOLEZNI SRCA IN OŽILJA (CVD). VENDAR PA SO MEHANIZMI ZA TA ZAŠČITNI UČINEK ŠE VEDNO MALO ZNANI. PRVE NUTRIGENETSKE ANALIZE V ŠTUDIJI PREDIMED SO NAM OMOGOČILE ODKRIVANJE POMEMBNIH INTERAKCIJ GEN-DIET, KI JIH MORAMO GLOBLJE POZNATI Z INTEGRACIJO OMIČNIH TEHNOLOGIJ, VKLJUČNO Z GENOMIKO, EPIGENOMICA (PREDVSEM S ŠTUDIJAMI DNA METILACION). POLEG TEGA OBSTAJA VELIKO ZANIMANJE ZA ŠTUDIJO BIOMARKERJEV STARANJA NA PODLAGI PROFILA DNA METILACION, IMENOVANE TUDI EPIGENETIČNA URA? TO DOLOČA TAKO IMENOVANO BIOLOŠKO STAROST (NA PODLAGI PROFILA METILACION) V PRIMERJAVI S KRONOLOŠKO STAROSTJO. NJEGOVA RAZLIKA SE IMENUJE POSPEŠENO STARANJE IN JE POVEZANA Z VEČJO UMRLJIVOSTJO. ZNANO JE, DA LAHKO RAZLIČNE SESTAVINE PREHRANE POVZROČIJO SPREMEMBE V DNK METILATION, VENDAR TE SPREMEMBE SČASOMA NISO DOBRO OPREDELJENE, PRAV TAKO PA NISO ZNANI NJIHOVI DINAMIČNI VIDIKI ALI NJIHOV VPLIV NA BIOMARKERJE STARANJA METILOMIC ALI NA VMESNE IN KONČNE FENOTIPE CVD. ZATO JE NAŠ SPLOŠNI CILJ ANALIZIRATI UČINEK MEDDIETA NA PROFIL METILOMICO NA SPLOŠNO IN NA STARANJE OZNAČEVALCEV (BIOLOŠKA STAROST DNK) TER NA DIFERENCIALNI METILOMICO PROFIL KARDIOVASKULARNEGA TVEGANJA, PRI ČEMER SE DINAMIČNO OPAZUJEJO NJEGOVE SPREMEMBE SKOZI ČAS V PRIMERJAVI S KONTROLNO PREHRANO. Na prvem mestu bodo oblikovani primeri ECV in primeri nadzora živali v vnaprej predvideni kohorti in v drugem jeziku drugih vozlišč (60 primerov ECV in 60 kontrol) za izvedbo stanja. ŠTUDIJA EPIGENOMA BO IZVEDENA NA DINAMIČEN NAČIN (BASAL IN V DVEH OBDOBJIH SPREMLJANJA). IZRAČUNANIH BO VEČ OZNAČEVALCEV STARANJA DNK NA OSNOVI METHYLOMA, VKLJUČNO Z OZNAKAMI HORVATH (353 SOND), HANNUM (71 SOND) IN WEIDNER (3 LOKI). DOLOČENI BODO TUDI EPIGENOMSKI PROFILI, POVEZANI Z INCIDENTOM CVD IN VMESNIMI FENOTIPI. INTEGRIRANA ANALIZA OMICO BO OPREDELILA GENETSKE POLIMORFIZME, POVEZANE S TEMI OZNAČEVALCI METILACION, IN USTVARILA OCENE GENETSKEGA TVEGANJA (GRS), KI SE LAHKO UPORABIJO KOT PRIBLIŽKI STARANJA IN BIOMARKERJEV METILACION ZA CELOTNI VZOREC. 40 SNP BO IZBRANIH ZA DOLOČITEV V CELOTNI ŠTUDIJI PREDIMED (N = 7100). DOLOČITA SE TUDI METILACIJA LOKUSOV, IZBRANIH V SKUPNIH PRIMERIH CVD, IN NAKLJUČNI VZOREC KOHORTE. UPORABA MULTIVARIANTNIH COX REGRESIJSKIH MODELOV S POGOJI INTERAKCIJE ZA DOLOČITEV GENOEPIGENOMSKEGA UČINKA TEH OZNAČEVALCEV V INCIDENCO CVD IN SMRTNOSTI. VZPOREDNO BODO POTRJENI GENOMSKI IN EPIGENOMSKI OZNAČEVALCI, VKLJUČNO S TRANSKRIPTOMSKO ANALIZO V PODVZORCU UDELEŽENCEV ŠTUDIJE PREDIMED PLUS VALENCIA. ZA ANALIZO RAZLIČNIH RAVNI SE BODO UPORABLJALE TEHNIKE OMIČNE INTEGRACIJE (COINERCIA ITD.). (Slovenian)
17 August 2022
0 references
W BADANIU PREDIMED (BADANIE INTERWENCYJNE Z UDZIAŁEM 7447 UCZESTNIKÓW W CIĄGU 4,8 ROKU) WYKAZANO, ŻE DZIAŁANIE OCHRONNE DIETY ŚRÓDZIEMNOMORSKIEJ (MEDDIET) PRZECIWKO RÓŻNYM FENOTYPOM POŚREDNIM I KOŃCOWYM CHORÓB SERCOWO-NACZYNIOWYCH (CVD). MECHANIZMY TEGO EFEKTU OCHRONNEGO SĄ JEDNAK NADAL MAŁO ZNANE. PIERWSZE ANALIZY NUTRIGENETYCZNE W BADANIU PREDIMED POZWOLIŁY NAM WYKRYĆ ISTOTNE INTERAKCJE GEN-DIETY, KTÓRE MUSIMY DOKŁADNIEJ POZNAĆ Z INTEGRACJĄ TECHNOLOGII OMIJANIA, W TYM GENOMIKI, EPIGENOMICA (GŁÓWNIE POPRZEZ BADANIA DNA METILACION). PONADTO ISTNIEJE DUŻE ZAINTERESOWANIE BADANIEM BIOMARKERÓW STARZENIA W OPARCIU O PROFIL DNA METILACION, ZWANY TAKŻE ZEGAREM EPIGENETYCZNYM? OKREŚLA TO TZW. WIEK BIOLOGICZNY (NA PODSTAWIE PROFILU METILACION) W PORÓWNANIU Z WIEKIEM CHRONOLOGICZNYM. JEGO RÓŻNICA NAZYWA SIĘ PRZYSPIESZONYM STARZENIEM SIĘ I WIĄŻE SIĘ Z WIĘKSZĄ ŚMIERTELNOŚCIĄ. WIADOMO, ŻE RÓŻNE SKŁADNIKI DIETY MOGĄ WYWIERAĆ ZMIANY W METILACJI DNA, ALE ZMIANY TE NIE SĄ DOBRZE SCHARAKTERYZOWANE Z BIEGIEM CZASU, ANI NIE SĄ ZNANE ICH DYNAMICZNE ASPEKTY ANI ICH WPŁYW NA BIOMARKERY METILOMIC STARZENIA LUB NA POŚREDNIE I KOŃCOWE FENOTYPY CVD. Z TEGO POWODU NASZYM OGÓLNYM CELEM JEST ANALIZA WPŁYWU MEDDIET NA PROFIL METILOMICO, ZARÓWNO W SPOSÓB OGÓLNY, JAK I W STARZENIU SIĘ MARKERÓW (BIOLOGICZNY WIEK DNA), A TAKŻE NA ZRÓŻNICOWANY PROFIL METILOMICO RYZYKA SERCOWO-NACZYNIOWEGO, OBSERWUJĄC DYNAMICZNIE JEGO ZMIANY W CZASIE W PORÓWNANIU Z DIETĄ KONTROLNĄ. Po pierwsze, w kohorcie Predimed-VALENCE oraz w innym języku innych węzłów (60 przypadków kontroli ECV i 60 kontroli) zostanie opracowany projekt przypadków ECV i kontroli zwierząt. Zintegrowana METILACJA KOMPLETE Epigenome METILATION Z GENOTIPATED STUDY OF DENSE IN PARTICIPANT MISS. BADANIE EPIGENOMA ZOSTANIE PRZEPROWADZONE W SPOSÓB DYNAMICZNY (PODSTAWOWY I W DWÓCH KOLEJNYCH OKRESACH). OBLICZONO KILKA MARKERÓW STARZENIA DNA OPARTYCH NA METHYLOMA, W TYM HORVATH (353 SONDY), HANNUM (71 SOND) I MARKERY WEIDNER (3 LOCI). ZOSTANĄ RÓWNIEŻ OKREŚLONE PROFILE EPIGENOMICZNE ZWIĄZANE Z INCYDENTEM CVD I JEGO FENOTYPAMI POŚREDNIMI. ZINTEGROWANA ANALIZA OMICO POZWOLI ZIDENTYFIKOWAĆ POLIMORFIZMY GENETYCZNE ZWIĄZANE Z TYMI MARKERAMI METILACION I STWORZYĆ GENETYCZNE WYNIKI RYZYKA (GRS), KTÓRE MOŻNA WYKORZYSTAĆ JAKO WSKAŹNIKI ZASTĘPCZE STARZENIA SIĘ I BIOMARKERÓW METILACION DLA CAŁEJ PRÓBKI. 40 SNP ZOSTANIE WYBRANYCH DO OKREŚLENIA W CAŁKOWITYM BADANIU PREDIMED (N=7100). ZOSTANIE RÓWNIEŻ USTALONA METILACION LOCI WYBRANYCH W ŁĄCZNYCH PRZYPADKACH CVD I LOSOWO DOBRANA PRÓBA KOHORTY. STOSOWANIE WIELOWYMIAROWYCH MODELI REGRESJI COXA Z WARUNKAMI INTERAKCJI W CELU OKREŚLENIA GENO-EPIGENOMICZNEGO WPŁYWU TYCH MARKERÓW NA CZĘSTOŚĆ WYSTĘPOWANIA CVD I ŚMIERTELNOŚĆ. JEDNOCZEŚNIE WALIDUJE SIĘ MARKERY GENOMOWE I EPIGENOMICZNE, W TYM ANALIZĘ TRANSKRYPTOMICZNĄ W PODPRÓBCE UCZESTNIKÓW BADANIA PREDIMED PLUS-VALENCIA. DO ANALIZY RÓŻNYCH POZIOMÓW ZOSTANĄ WYKORZYSTANE TECHNIKI INTEGRACJI OMIJNEJ (COINERCIA ITP.). (Polish)
17 August 2022
0 references
Burjassot
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
SAF2016-80532-R
0 references