Determination of the role and biomarker value of SOX1 in gastric cancer (Q3147206)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3147206 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Determination of the role and biomarker value of SOX1 in gastric cancer |
Project Q3147206 in Spain |
Statements
41,926.5 Euro
0 references
77,000.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2019
0 references
31 March 2022
0 references
ASOCIACION INSTITUTO BIODONOSTIA
0 references
El cáncer gástrico (CG) constituye la segunda causa de muerte por cáncer a nivel mundial. Avances en tecnologías de alto rendimiento han permitido recientemente la identificación del perfil molecular del CG y su clasificación en subgrupos. Además, en CG se ha revelado la existencia y relevancia de una subpoblación de células madre tumorales gástricas (gCSCs), las cuales se postulan como responsables del origen y mantenimiento de los tumores, de la resistencia a las terapias y la metástasis. Estas evidencias señalan que es necesario dilucidar los reguladores de las gCSCs por su valor como dianas moleculares para establecer tratamientos más efectivos. La familia de factores de transcripción SOX regula las células madre durante la embriogénesis y también en el estadio adulto en diversos tejidos como el tracto gastrointestinal. La función de sus miembros en cáncer es dependiente de contexto, siendo su actividad necesaria para el mantenimiento de las CSCs en diversos cánceres. Resultados preliminares del grupo muestran que distintos factores SOX están sobreexpresados en las gCSCs, destacando SOX1. Estos resultados son novedosos, ya que está establecido que SOX1 es un supresor tumoral en múltiples tipos de cáncer. En este proyecto estudiaremos el posible papel oncogénico de SOX1 en CG, tanto en la progresión como en la resistencia a la terapia, su potencial como biomarcador diagnóstico y como marcador de estratificación de pacientes en base a su valor pronóstico y predictivo, así como identificar los efectores moleculares de su acción. Para ello, contamos con muestras tumorales y biopsias líquidas de pacientes con gastritis y CG de dos cohortes, además de acceso a la información obtenida por los consorcios del TCGA (The Cancer Genome Atlas) y ACRG (Asia Cancer Research Group). Además, realizaremos estudios de ganancia y pérdida de función de SOX1, estrategias ómicas y análisis de biología computacional, tanto en cultivos de gCSCs como en modelos animales. (Spanish)
0 references
Gastric cancer (GC) is the second largest cause of cancer death worldwide. Advances in high-performance technologies have recently allowed the identification of the molecular profile of the GC and its classification into subgroups. In addition, GC has revealed the existence and relevance of a subpopulation of gastric tumor stem cells (gCSCs), which are postulated as responsible for the origin and maintenance of tumors, resistance to therapies and metastasis. This evidence indicates that it is necessary to elucidate the regulators of gCSCs by their value as molecular targets to establish more effective treatments. The SOX transcription factor family regulates stem cells during embryogenesis and also in the adult stage in various tissues such as the gastrointestinal tract. The role of its members in cancer is context dependent, being their activity necessary for the maintenance of CSCs in various cancers. Preliminary group results show that different SOX factors are overexpressed in gCSCs, highlighting SOX1. These results are novel, as SOX1 is established to be a tumor suppressor in multiple types of cancer. In this project we will study the possible oncogenic role of SOX1 in GC, both in the progression and resistance to therapy, its potential as a diagnostic biomarker and as a marker of stratification of patients based on its prognostic and predictive value, as well as identifying the molecular effectors of its action. To do this, we have tumor samples and liquid biopsies from patients with gastritis and GC from two cohorts, as well as access to information obtained by the TCGA (The Cancer Genome Atlas) and ACRG (Asia Cancer Research Group) consortia. In addition, we will conduct SOX1 function gain and loss studies, omic strategies and computational biology analysis, both in gCSC cultures and animal models. (English)
12 October 2021
0.8987262852019872
0 references
Le cancer gastrique (GC) est la deuxième cause de décès par cancer dans le monde. Les progrès réalisés dans les technologies à haute performance ont récemment permis d’identifier le profil moléculaire du GC et sa classification en sous-groupes. En outre, le GC a révélé l’existence et la pertinence d’une sous-population de cellules souches tumorales gastriques, qui sont postulées comme étant responsables de l’origine et du maintien des tumeurs, de la résistance aux thérapies et des métastases. Ces données indiquent qu’il est nécessaire d’élucider les régulateurs des gCSC en fonction de leur valeur en tant que cibles moléculaires afin d’établir des traitements plus efficaces. La famille du facteur de transcription SOX régule les cellules souches pendant l’embryogenèse et aussi au stade adulte dans divers tissus tels que le tractus gastro-intestinal. Le rôle de ses membres dans le cancer dépend du contexte, puisqu’il s’agit de leur activité nécessaire au maintien des SCC dans divers cancers. Les résultats préliminaires du groupe montrent que différents facteurs SOX sont surexprimés dans les gCSC, mettant en évidence le SOX1. Ces résultats sont nouveaux, car SOX1 est établi comme un suppresseur de tumeur dans de multiples types de cancer. Dans ce projet, nous étudierons le rôle oncogénique possible du SOX1 dans le GC, tant dans la progression que dans la résistance au traitement, son potentiel en tant que biomarqueur diagnostique et comme marqueur de stratification des patients en fonction de sa valeur pronostique et prédictive, ainsi que l’identification des effecteurs moléculaires de son action. Pour ce faire, nous avons des échantillons de tumeurs et des biopsies liquides de patients atteints de gastrite et de GC de deux cohortes, ainsi que l’accès à l’information obtenue par les consortiums TCGA (The Cancer Genome Atlas) et ACRG (Asia Cancer Cancer Research Group). De plus, nous réaliserons des études de gain et de perte de fonctions SOX1, des stratégies atomiques et des analyses de biologie computationnelle, tant dans les cultures GCSC que dans les modèles animaux. (French)
2 December 2021
0 references
Magenkrebs (GC) ist die zweitgrößte Ursache für den Krebstod weltweit. Fortschritte bei Hochleistungstechnologien haben kürzlich die Identifizierung des molekularen Profils des GC und dessen Klassifizierung in Untergruppen ermöglicht. Darüber hinaus hat GC die Existenz und Relevanz einer Subpopulation von Magentumorstammzellen (gCSCs) aufgedeckt, die als verantwortlich für den Ursprung und die Erhaltung von Tumoren, die Resistenz gegen Therapien und Metastasen verantwortlich sind. Dies deutet darauf hin, dass es notwendig ist, die Regulatoren von gCSCs durch ihren Wert als molekulare Ziele zu verdeutlichen, um wirksamere Behandlungen zu schaffen. Die SOX Transkriptionsfaktorfamilie reguliert Stammzellen während der Embryogenese und auch im Erwachsenenstadium in verschiedenen Geweben wie dem Magen-Darm-Trakt. Die Rolle ihrer Mitglieder bei Krebs ist abhängig von ihrer Tätigkeit, die für die Aufrechterhaltung von CSCs bei verschiedenen Krebserkrankungen erforderlich ist. Vorläufige Gruppenergebnisse zeigen, dass verschiedene SOX-Faktoren in gCSCs überexprimiert sind und SOX1 hervorheben. Diese Ergebnisse sind neu, da SOX1 ein Tumorsuppressor bei mehreren Krebsarten ist. In diesem Projekt werden wir die mögliche onkogene Rolle von SOX1 in GC untersuchen, sowohl in der Progression als auch in der Resistenz gegen die Therapie, ihr Potenzial als diagnostischer Biomarker und als Marker der Stratifikation von Patienten basierend auf seinem prognostischen und vorausschauenden Wert sowie die Bestimmung der molekularen Effektoren seiner Wirkung. Dazu haben wir Tumorproben und flüssige Biopsien von Patienten mit Gastritis und GC aus zwei Kohorten sowie Zugang zu Informationen, die von den Konsortien TCGA (The Cancer Genome Atlas) und ACRG (Asia Cancer Research Group) erhalten wurden. Darüber hinaus führen wir SOX1 Funktionsgewinn- und Verluststudien, omische Strategien und Berechnungsbiologieanalysen sowohl in GCSC-Kulturen als auch in Tiermodellen durch. (German)
9 December 2021
0 references
Maagkanker (GC) is wereldwijd de op één na grootste doodsoorzaak van kanker. Dankzij de vooruitgang op het gebied van hoogwaardige technologieën kon onlangs het moleculaire profiel van het GC en de indeling ervan in subgroepen worden geïdentificeerd. Daarnaast heeft GC het bestaan en de relevantie van een subpopulatie van maagtumor stamcellen (gCSCs) onthuld, die gepostuleerd zijn als verantwoordelijk voor de oorsprong en het onderhoud van tumoren, resistentie tegen therapieën en metastase. Dit bewijs wijst erop dat het noodzakelijk is om de regelgevers van gCSC’s te verduidelijken door hun waarde als moleculaire doelen om effectievere behandelingen vast te stellen. De familie van de SOX transcriptiefactor reguleert stamcellen tijdens embryogenese en ook in het volwassen stadium in diverse weefsels zoals het maagdarmkanaal. De rol van haar leden in kanker is contextafhankelijk, aangezien hun activiteit noodzakelijk is voor het behoud van CSC’s in verschillende vormen van kanker. Voorlopige groepsresultaten tonen aan dat verschillende SOX-factoren overexpressie zijn in gCSC’s, wat SOX1 markeert. Deze resultaten zijn nieuw, aangezien SOX1 is gevestigd als een tumor suppressor in meerdere soorten kanker. In dit project zullen we de mogelijke oncogene rol van SOX1 in GC bestuderen, zowel in de progressie en resistentie tegen therapie, het potentieel ervan als diagnostische biomarker en als marker van stratificatie van patiënten op basis van zijn prognostische en voorspellende waarde, evenals het identificeren van de moleculaire effectoren van zijn werking. Om dit te doen, hebben we tumormonsters en vloeibare biopsies van patiënten met gastritis en GC van twee cohorten, evenals toegang tot informatie verkregen door de consortia TCGA (The Cancer Genome Atlas) en ACRG (Asia Cancer Research Group). Daarnaast zullen we SOX1-functieversterkings- en verliesstudies, omische strategieën en computationele biologieanalyses uitvoeren, zowel in GCSC-culturen als in diermodellen. (Dutch)
17 December 2021
0 references
Il cancro gastrico (GC) è la seconda causa di morte per cancro in tutto il mondo. I progressi nelle tecnologie ad alte prestazioni hanno recentemente permesso di identificare il profilo molecolare del GC e la sua classificazione in sottogruppi. Inoltre, GC ha rivelato l'esistenza e la rilevanza di una sottopopolazione di cellule staminali tumorali gastriche (gCSC), che sono postulati come responsabili dell'origine e del mantenimento dei tumori, resistenza alle terapie e metastasi. Questa evidenza indica che è necessario chiarire i regolatori dei gCSC con il loro valore come obiettivi molecolari per stabilire trattamenti più efficaci. La famiglia dei fattori di trascrizione SOX regola le cellule staminali durante l'embriogenesi e anche nella fase adulta in vari tessuti come il tratto gastrointestinale. Il ruolo dei suoi membri nel cancro dipende dal contesto, essendo la loro attività necessaria per il mantenimento dei CSC in vari tumori. I risultati preliminari del gruppo mostrano che diversi fattori SOX sono sovraespressi in gCSC, evidenziando SOX1. Questi risultati sono nuovi, come SOX1 è stabilito per essere un soppressore del tumore in più tipi di cancro. In questo progetto studieremo il possibile ruolo oncogenico di SOX1 in GC, sia nella progressione e resistenza alla terapia, il suo potenziale come biomarcatore diagnostico e come marcatore di stratificazione dei pazienti in base al suo valore prognostico e predittivo, oltre a identificare gli effetti molecolari della sua azione. Per fare questo, abbiamo campioni tumorali e biopsie liquide da pazienti con gastrite e GC da due coorti, così come l'accesso alle informazioni ottenute dai consorzi TCGA (The Cancer Genome Atlas) e ACRG (Asia Cancer Research Group). Inoltre, condurremo SOX1 studi di guadagno e perdita di funzionalità, strategie omiche e analisi di biologia computazionale, sia nelle colture GCSC che nei modelli animali. (Italian)
16 January 2022
0 references
Ο γαστρικός καρκίνος (GC) είναι η δεύτερη μεγαλύτερη αιτία θανάτου από καρκίνο παγκοσμίως. Οι εξελίξεις στις τεχνολογίες υψηλών επιδόσεων επέτρεψαν πρόσφατα τον προσδιορισμό του μοριακού προφίλ του GC και την ταξινόμησή του σε υποομάδες. Επιπλέον, GC έχει αποκαλύψει την ύπαρξη και τη σημασία ενός υποπληθυσμού των γαστρικών βλαστοκυττάρων όγκου (gCSCs), τα οποία θεωρούνται υπεύθυνα για την προέλευση και τη συντήρηση των όγκων, αντοχή σε θεραπείες και μετάσταση. Τα στοιχεία αυτά δείχνουν ότι είναι αναγκαίο να διευκρινιστούν οι ρυθμιστές των gCSC με την τιμή τους ως μοριακών στόχων για την καθιέρωση αποτελεσματικότερων θεραπειών. Η οικογένεια παράγοντα μεταγραφής SOX ρυθμίζει τα βλαστοκύτταρα κατά τη διάρκεια της εμβρυογένεσης και επίσης στο στάδιο των ενηλίκων σε διάφορους ιστούς, όπως η γαστρεντερική οδός. Ο ρόλος των μελών του στον καρκίνο εξαρτάται από το πλαίσιο, δεδομένου ότι η δραστηριότητά τους είναι απαραίτητη για τη διατήρηση των CSCs σε διάφορους καρκίνους. Τα προκαταρκτικά αποτελέσματα της ομάδας δείχνουν ότι διαφορετικοί παράγοντες SOX υπερεκφράζονται σε gCSCs, υπογραμμίζοντας το SOX1. Αυτά τα αποτελέσματα είναι νέα, καθώς SOX1 έχει καθιερωθεί για να είναι ένας κατασταλτικός όγκος σε πολλούς τύπους καρκίνου. Σε αυτό το έργο θα μελετήσουμε τον πιθανό ογκογόνο ρόλο του SOX1 στο GC, τόσο στην πρόοδο όσο και στην αντοχή στη θεραπεία, τη δυνατότητά του ως διαγνωστικού βιοδείκτη και ως δείκτη διαστρωμάτωσης των ασθενών με βάση την προγνωστική και προγνωστική του αξία, καθώς και τον προσδιορισμό των μοριακών παραγόντων της δράσης του. Για να γίνει αυτό, έχουμε δείγματα όγκων και υγρές βιοψίες από ασθενείς με γαστρίτιδα και GC από δύο κοόρτες, καθώς και πρόσβαση σε πληροφορίες που λαμβάνονται από τις κοινοπραξίες TCGA (The Cancer Genome Atlas) και ACRG (Asia Cancer Research Group). Επιπλέον, θα διενεργήσουμε μελέτες κέρδους και απώλειας συναρτήσεων SOX1, στρατηγικές ωμικής και υπολογιστικής βιολογίας, τόσο σε καλλιέργειες GCSC όσο και σε ζωικά μοντέλα. (Greek)
17 August 2022
0 references
Mavekræft (GC) er den næststørste årsag til kræftdød på verdensplan. Fremskridt inden for højtydende teknologier har for nylig gjort det muligt at identificere GC's molekylære profil og dens klassificering i undergrupper. Derudover har GC afsløret eksistensen og relevansen af en subpopulation af mavetumorstamceller (gCSC'er), der er postuleret som ansvarlig for oprindelse og vedligeholdelse af tumorer, resistens over for behandlinger og metastase. Denne dokumentation tyder på, at det er nødvendigt at belyse regulatorerne for gCSC'er med deres værdi som molekylære mål for at etablere mere effektive behandlinger. Den SOX transkription faktor familie regulerer stamceller under embryogenese og også i den voksne fase i forskellige væv såsom mave-tarmkanalen. Dets medlemmers rolle i forbindelse med kræft er kontekstafhængig og er deres aktivitet, der er nødvendig for at opretholde CSC'er i forskellige kræftformer. Foreløbige grupperesultater viser, at forskellige SOX-faktorer er overudtrykt i gCSC'er, hvilket fremhæver SOX1. Disse resultater er nye, da SOX1 er etableret for at være en tumor suppressor i flere typer af kræft. I dette projekt vil vi undersøge den mulige onkogene rolle af SOX1 i GC, både i progression og resistens over for behandling, dens potentiale som diagnostisk biomarkør og som markør for stratificering af patienter baseret på dens prognostiske og prædiktive værdi, samt identificere molekylære effektorer af dens virkning. For at gøre dette har vi tumorprøver og flydende biopsier fra patienter med gastritis og GC fra to kohorter samt adgang til oplysninger fra konsortierne TCGA (The Cancer Genome Atlas) og ACRG (Asia Cancer Research Group). Derudover vil vi udføre SOX1 funktion gain og tab undersøgelser, omic strategier og beregningsmæssige biologi analyse, både i GCSC kulturer og dyremodeller. (Danish)
17 August 2022
0 references
Mahasyöpä (GC) on toiseksi suurin syövän kuolinsyy maailmanlaajuisesti. Korkean suorituskyvyn teknologioiden kehitys on viime aikoina mahdollistanut GC:n molekyyliprofiilin tunnistamisen ja sen luokittelun alaryhmiin. Lisäksi GC on paljastanut alapopulaation mahalaukun kasvaimen kantasoluja (gCSC), joiden oletetaan olevan vastuussa alkuperästä ja ylläpitämisestä kasvaimia, vastus hoitoja ja etäpesäkkeitä. Tämä näyttö osoittaa, että on tarpeen selventää gCSC-yhdisteiden säätelijöitä niiden molekyylitavoitteiden perusteella, jotta voidaan luoda tehokkaampia hoitoja. SOX-transkriptiotekijäperhe säätelee kantasoluja alkiontuotannon aikana ja myös aikuisvaiheessa eri kudoksissa, kuten maha-suolikanavassa. Sen jäsenten rooli syövässä riippuu tilanteesta, sillä heidän toimintansa on välttämätöntä syöpäsairauksien ylläpitämiseksi eri syöpissä. Ryhmän alustavat tulokset osoittavat, että eri SOX-kertoimet yliilmaistuvat gCSC:issä, mikä korostaa SOX1:tä. Nämä tulokset ovat uusia, koska SOX1 on todettu olevan kasvaimen vaimentaja useissa syöpätyypeissä. Tässä hankkeessa tutkimme SOX1: n mahdollista syöpää aiheuttavaa roolia GC: ssä sekä etenemisessä että hoidon resistenssissä, sen potentiaalina diagnostisena biomerkkiaineena ja potilaiden osittumisen merkkiaineena sen ennuste- ja ennustavan arvon perusteella sekä sen toiminnan molekyylitehostimien tunnistamisessa. Tätä varten meillä on kasvainnäytteitä ja nestemäisiä biopsioita potilailta, joilla on gastriitti ja GC kahdesta kohortista, sekä pääsy TCGA: n (Syövän Genome Atlas) ja ACRG: n (Asia Cancer Research Group) yhteenliittymien saamiin tietoihin. Lisäksi teemme SOX1-toiminnon voitto- ja tappiotutkimuksia, omic-strategioita ja laskennallista biologian analysointia sekä GCSC-viljelmissä että eläinmalleissa. (Finnish)
17 August 2022
0 references
Il-kanċer tal-istonku (GC) huwa t-tieni l-akbar kawża ta’ mewt tal-kanċer madwar id-dinja. L-avvanzi f’teknoloġiji ta’ prestazzjoni għolja dan l-aħħar ippermettew l-identifikazzjoni tal-profil molekulari tal-GC u l-klassifikazzjoni tiegħu f’sottogruppi. Barra minn hekk, GC żvela l-eżistenza u r-rilevanza ta’ sottopopolazzjoni ta’ ċelluli staminali tat-tumur gastriku (gCSCs), li huma postulati bħala responsabbli għall-oriġini u l-manteniment tat-tumuri, reżistenza għat-terapiji u metastasi. Din l-evidenza tindika li huwa meħtieġ li r-regolaturi tal-gCSCs jiġu ċċarati mill-valur tagħhom bħala miri molekulari biex jiġu stabbiliti trattamenti aktar effettivi. Il-familja tal-fattur tat-traskrizzjoni SOX tirregola ċ-ċelloli staminali matul l-embrijuġenesi kif ukoll fl-istadju adult f’diversi tessuti bħall-passaġġ gastrointestinali. Ir-rwol tal-membri tiegħu fil-kanċer jiddependi mill-kuntest, peress li l-attività tagħhom hija meħtieġa għaż-żamma tas-CSCs f’diversi tipi ta’ kanċer. Ir-riżultati tal-grupp preliminari juru li fatturi differenti ta’ SOX huma espressi żżejjed f’gCSCs, b’enfasi fuq SOX1. Dawn ir-riżultati huma ġodda, peress li SOX1 huwa stabbilit bħala soppressur tat-tumur f’tipi multipli ta’ kanċer. F’dan il-proġett se nistudjaw ir-rwol onkoġeniku possibbli ta’ SOX1 f’GC, kemm fil-progressjoni kif ukoll fir-reżistenza għat-terapija, il-potenzjal tiegħu bħala bijomarkatur dijanjostiku u bħala markatur ta’ stratifikazzjoni tal-pazjenti bbażat fuq il-valur pronjostiku u ta’ tbassir tiegħu, kif ukoll jidentifika l-effetturi molekulari tal-azzjoni tiegħu. Biex nagħmlu dan, għandna kampjuni tat-tumuri u bijopsiji likwidi minn pazjenti b’gastrite u GC minn żewġ koorti, kif ukoll aċċess għall-informazzjoni miksuba mill-konsorzji TCGA (The Cancer Genome Atlas) u ACRG (Asia Cancer Research Group). Barra minn hekk, aħna se twettaq studji dwar il-qligħ u t-telf tal-funzjoni SOX1, strateġiji omic u analiżi tal-bijoloġija komputazzjonali, kemm fil-kulturi GCSC kif ukoll fil-mudelli tal-annimali. (Maltese)
17 August 2022
0 references
Kuņģa vēzis (GC) ir otrs lielākais vēža nāves cēlonis pasaulē. Sasniegumi augstas veiktspējas tehnoloģiju jomā nesen ir ļāvuši identificēt GC molekulāro profilu un to klasificēt apakšgrupās. Turklāt GC ir atklājusi kuņģa audzēja cilmes šūnu (gCSC) apakšpopulācijas esamību un atbilstību, kas ir postulēti kā atbildīgi par audzēju izcelsmi un uzturēšanu, rezistenci pret terapiju un metastāzi. Šie pierādījumi liecina, ka gCSC regulatori ir jānoskaidro pēc to vērtības kā molekulārā mērķa, lai noteiktu efektīvāku ārstēšanu. SOX transkripcijas faktora saime regulē cilmes šūnas embrioģenēzes laikā un arī pieaugušo stadijā dažādos audos, piemēram, kuņģa-zarnu traktā. Tās locekļu loma vēža ārstēšanā ir atkarīga no konteksta, jo viņu darbība ir nepieciešama, lai uzturētu CSC dažādos vēža gadījumos. Provizoriskie grupas rezultāti liecina, ka gCSC ir pārmērīgi izteikti dažādi SOX faktori, izceļot SOX1. Šie rezultāti ir jauni, jo SOX1 ir noteikts, ka audzējs nomāc vairāku veidu vēzi. Šajā projektā mēs pētīsim SOX1 iespējamo onkogēnisko lomu GC gan progresijā un rezistentā terapijā, gan kā diagnostiska biomarķiera un pacientu stratifikācijas marķiera potenciālu, pamatojoties uz tā prognostisko un prognozējošo vērtību, kā arī identificēsim tās darbības molekulāros efektorus. Lai to izdarītu, mums ir audzēja paraugi un šķidrā biopsija no pacientiem ar gastrītu un GC no divām kohortām, kā arī piekļuve informācijai, ko iegūst TCGA (The Cancer Genome Atlas) un ACRG (Āzijas vēža pētījumu grupa) konsorcijos. Turklāt mēs veiksim SOX1 funkciju guvuma un zuduma pētījumus, omic stratēģijas un skaitļošanas bioloģijas analīzi gan GCSC kultūrās, gan dzīvnieku modeļos. (Latvian)
17 August 2022
0 references
Rakovina žalúdka je druhou najväčšou príčinou úmrtí na rakovinu na celom svete. Pokrok vo vysokovýkonných technológiách nedávno umožnil identifikáciu molekulárneho profilu GC a jeho klasifikáciu do podskupín. Okrem toho GC odhalila existenciu a význam subpopulácie kmeňových buniek žalúdočných nádorových buniek (gCSC), ktoré sú postulované ako zodpovedné za pôvod a udržiavanie nádorov, odolnosť voči terapii a metastáz. Z týchto dôkazov vyplýva, že je potrebné objasniť regulačné orgány gCSC ich hodnotou ako molekulárnych cieľov, aby sa zaviedli účinnejšie ošetrenia. Skupina SOX transkripčného faktora reguluje kmeňové bunky počas embryogenézy a tiež v dospelom štádiu v rôznych tkanivách, ako je gastrointestinálny trakt. Úloha jej členov v oblasti rakoviny je závislá od kontextu, keďže ich činnosť je potrebná na udržanie KSC pri rôznych druhoch rakoviny. Predbežné výsledky skupiny ukazujú, že rôzne SOX faktory sú nadmerne vyjadrené v gCSC, zvýraznenie SOX1. Tieto výsledky sú nové, pretože SOX1 je stanovená byť nádor supresor vo viacerých typoch rakoviny. V tomto projekte budeme skúmať možnú onkogénnu úlohu SOX1 v GC, a to tak v progresii, ako aj rezistencii voči terapii, jeho potenciál ako diagnostický biomarker a ako marker stratifikácie pacientov na základe jeho prognostickej a prediktívnej hodnoty, ako aj identifikáciu molekulárnych efektorov jeho pôsobenia. K tomu máme vzorky nádorov a tekuté biopsie od pacientov s gastritídou a GC z dvoch kohort, ako aj prístup k informáciám získaným konzorciám TCGA (The Cancer Genome Atlas) a ACRG (Asia Cancer Research Group). Okrem toho vykonáme štúdie o prírastkoch a strate funkcií SOX1, omické stratégie a výpočtovú biológiu, a to ako v kultúrach GCSC, tak aj v zvieracích modeloch. (Slovak)
17 August 2022
0 references
Is í an ailse gastric (GC) an dara cúis is mó le bás na hailse ar fud an domhain. Leis an dul chun cinn i dteicneolaíochtaí ardfheidhmíochta, bhíothas in ann próifíl mhóilíneach GC agus a aicmiú i bhfoghrúpaí a shainaithint le déanaí. Ina theannta sin, léirigh GC go bhfuil fo-dhaonra de ghaschealla meall gastric (gCSCanna) ann agus go bhfuil siad ábhartha, a chuirtear in iúl mar atá freagrach as tionscnamh agus cothabháil siadaí, friotaíocht in aghaidh teiripí agus metastasis. Tugann an fhianaise seo le fios gur gá rialtóirí na gCSCanna a shoiléiriú trína luach mar spriocanna móilíneacha chun cóireálacha níos éifeachtaí a bhunú. Rialaíonn an teaghlach fachtóir tras-scríofa SOX gaschealla le linn embryogenesis agus freisin sa chéim aosach i bhfíocháin éagsúla ar nós an chonair gastrointestinal. Tá ról na mball in ailse ag brath ar an gcomhthéacs, ós rud é go bhfuil a ngníomhaíocht riachtanach chun CSCanna a choinneáil ar bun in ailsí éagsúla. Léiríonn torthaí réamhghrúpa go bhfuil fachtóirí SOX éagsúla ró-léirithe i gCSCanna, ag cur béime ar SOX1. Tá na torthaí úrscéal, de réir mar a bunaíodh SOX1 a bheith ina suppressor meall i cineálacha éagsúla ailse. Sa tionscadal seo déanfaimid staidéar ar an ról oncogenic a d’fhéadfadh a bheith ag SOX1 i GC, sa dul chun cinn agus sa fhrithsheasmhacht le teiripe, a chumas mar bhithmharcóir diagnóiseach agus mar mharcóir srathaithe othar bunaithe ar a luach prognostic agus tuarthach, chomh maith le héifeachtaí móilíneacha a ghníomhaíochta a aithint. Chun seo a dhéanamh, tá samplaí meall agus biopsies leachtacha againn ó othair le gastritis agus GC ó dhá chohórt, chomh maith le rochtain ar fhaisnéis a fhaigheann cuibhreannais TCGA (An Ailse Genome Atlas) agus ACRG (Grúpa Taighde Ailse na hÁise). Ina theannta sin, déanfaimid staidéir a fháil agus caillteanas SOX1, straitéisí adamhach agus anailís bitheolaíochta ríomhaireachtúil, i gcultúir GCSC agus i samhlacha ainmhithe araon. (Irish)
17 August 2022
0 references
Rakovina žaludku (GC) je druhou největší příčinou úmrtí na rakovinu na světě. Pokrok v oblasti vysoce výkonných technologií nedávno umožnil identifikovat molekulární profil GC a jeho klasifikaci do podskupin. Kromě toho GC odhalila existenci a význam subpopulace nádorových kmenových buněk žaludku (gCSC), které jsou postulovány jako odpovědné za původ a udržení nádorů, rezistenci na terapie a metastázy. Z těchto důkazů vyplývá, že je nezbytné objasnit regulační orgány gCSC jejich hodnotou jako molekulárních cílů, aby byla zavedena účinnější léčba. Rodina transkripčního faktoru SOX reguluje kmenové buňky během embryogeneze a také v dospělosti v různých tkáních, jako je gastrointestinální trakt. Úloha jejích členů v oblasti rakoviny je závislá na kontextu, což je jejich činnost nezbytná pro udržení CSC u různých nádorových onemocnění. Předběžné výsledky skupiny ukazují, že různé SOX faktory jsou v gCSC převyjádněny, což zvýrazňuje SOX1. Tyto výsledky jsou nové, protože SOX1 je stanovena jako supresor nádoru u více typů rakoviny. V tomto projektu budeme zkoumat možnou onkogenní roli SOX1 v GC, a to jak v progresi, tak v rezistenci na terapii, její potenciál jako diagnostický biomarker a jako marker stratifikace pacientů na základě jeho prognostické a prediktivní hodnoty, jakož i identifikaci molekulárních efektorů jeho působení. K tomu máme vzorky nádorů a kapalné biopsie od pacientů s gastritidou a GC ze dvou kohort, stejně jako přístup k informacím získaným konsorcii TCGA (The Cancer Genome Atlas) a ACRG (Asia Cancer Research Group). Kromě toho provedeme studie zisku a ztráty funkce SOX1, omové strategie a výpočetní biologická analýza, a to jak v GCSC kulturách, tak v modelech zvířat. (Czech)
17 August 2022
0 references
O cancro gástrico (GC) é a segunda maior causa de morte por cancro em todo o mundo. Os avanços nas tecnologias de alto desempenho permitiram recentemente a identificação do perfil molecular do CG e sua classificação em subgrupos. Além disso, a CG revelou a existência e relevância de uma subpopulação de células-tronco tumorais gástricas (gCSCs), que são postuladas como responsáveis pela origem e manutenção dos tumores, resistência a terapias e metástases. Essa evidência indica que é necessário elucidar os reguladores das gCSCs pelo seu valor como alvos moleculares para estabelecer tratamentos mais eficazes. A família de fatores de transcrição SOX regula as células-tronco durante a embriogênese e também na fase adulta em vários tecidos, como o trato gastrointestinal. O papel de seus integrantes no cancro é dependente do contexto, sendo sua atividade necessária para a manutenção das CSCs em vários cânceres. Os resultados preliminares do grupo mostram que diferentes fatores SOX são superexpressos em gCSCs, destacando-se SOX1. Estes resultados são novos, uma vez que SOX1 é estabelecido como um supressor tumoral em vários tipos de cancro. Neste projeto estudaremos o possível papel oncogênico da SOX1 no GC, tanto na progressão quanto na resistência à terapia, seu potencial como biomarcador diagnóstico e como marcador de estratificação dos pacientes com base em seu valor prognóstico e preditivo, bem como identificar os efetores moleculares de sua ação. Para isso, temos amostras tumorais e biópsias líquidas de pacientes com gastrite e CG de duas coortes, bem como acesso às informações obtidas pelos consórcios TCGA (The Cancer Genome Atlas) e ACRG (Asia Cancer Research Group). Além disso, realizaremos estudos de ganho e perda de funções SOX1, estratégias omicológicas e análise de biologia computacional, tanto em culturas GCSC quanto em modelos animais. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
Maovähk on maailmas suuruselt teine vähisurma põhjustaja. Kõrgjõudlusega tehnoloogia areng on viimasel ajal võimaldanud kindlaks teha gaasikromatograafia molekulaarprofiili ja klassifitseerida selle alarühmadesse. Lisaks on GC näidanud maokasvaja tüvirakkude (gCSC) alampopulatsiooni olemasolu ja asjakohasust, mis on postuleeritud kasvajate päritolu ja säilitamise, resistentsuse ja metastaaside eest. Need tõendid näitavad, et efektiivsemate ravimeetodite loomiseks on vaja selgitada gCSCde regulaatoreid nende väärtuse järgi molekulaarsete sihtmärkidena. SOX transkriptsioonifaktori perekond reguleerib tüvirakke embrüogeneesi ajal ja ka täiskasvanute staadiumis erinevates kudedes, näiteks seedetraktis. Selle liikmete roll vähis sõltub kontekstist, mis on vajalik CSCde säilitamiseks mitmesugustes vähivormides. Esialgsed rühma tulemused näitavad, et erinevad SOX-tegurid on gCSCdes üleväljendatud, rõhutades SOX1. Need tulemused on uudsed, kuna SOX1 on loodud kasvaja supressorina mitut tüüpi vähi korral. Selles projektis uurime SOX1 võimalikku onkogeenset rolli GC-s nii progressioonis kui ka resistentsuses ravile, selle potentsiaali diagnostilise biomarkerina ja patsientide stratifitseerimismarkerina selle prognostilise ja ennustava väärtuse alusel, samuti selle toime molekulaarsete mõjurite kindlakstegemisel. Selleks on meil tuumoriproovid ja vedelad biopsiad gastriidi ja kahe kohorti GC patsientidelt, samuti juurdepääs TCGA (The Cancer Genome Atlas) ja ACRG (Asia Cancer Research Group) konsortsiumide saadud teabele. Lisaks viime läbi SOX1 funktsiooni kasvu ja kaotuse uuringud, oomistrateegiad ja arvutuslik bioloogia analüüs nii GCSC kultuurides kui ka loommudelites. (Estonian)
17 August 2022
0 references
A gyomorrák (GC) a rák halálának második legnagyobb oka világszerte. A nagy teljesítményű technológiák fejlődése a közelmúltban lehetővé tette a GC molekuláris profiljának azonosítását és alcsoportokba sorolását. Ezen túlmenően a GC feltárta a gyomordaganat őssejtek (gCSC-k) alpopulációjának létezését és relevanciáját, amelyek feltételezetten felelősek a tumorok eredetéért és fenntartásáért, a terápiákkal szembeni ellenállásért és az áttétekért. Ezek a bizonyítékok azt mutatják, hogy a hatékonyabb kezelések kialakítása érdekében a gCSC-k szabályozóit molekuláris célpontként való értékük alapján kell tisztázni. A SOX transzkripciós faktor család szabályozza az őssejteket az embriogenezis során és a felnőtt stádiumban különböző szövetekben, például a gyomor-bél traktusban. Tagjainak szerepe a rákban a kontextustól függ, mivel tevékenységük a különböző rákos megbetegedésekben a CSC-k fenntartásához szükséges. Az előzetes csoporteredmények azt mutatják, hogy a különböző SOX-tényezők túl expresszálódnak a gCSC-kben, kiemelve az SOX1-et. Ezek az eredmények újak, mivel a SOX1-et tumorszuppresszorként állapították meg több típusú rákban. Ebben a projektben tanulmányozzuk az SOX1 lehetséges onkogén szerepét a GC-ben, mind a progresszióban, mind a terápiával szembeni rezisztenciában, annak diagnosztikai biomarkerként és a betegek prognosztikai és prediktív értékén alapuló rétegződés markereként, valamint a hatás molekuláris effektorainak azonosításában. Ehhez van tumorminták és folyékony biopszia a gyomorhurutban és GC-ben szenvedő betegektől két kohorsztól, valamint hozzáférést biztosítunk a TCGA (The Cancer Genome Atlas) és az ACRG (Asia Cancer Research Group) konzorciumok által szerzett információkhoz. Ezen túlmenően SOX1 funkciógyarapodás- és veszteségvizsgálatokat, omikus stratégiákat és számítógépes biológiai elemzést végzünk, mind a GCSC kultúrákban, mind az állatmodellekben. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
Ракът на стомаха (GC) е втората по големина причина за смъртност от рак в световен мащаб. Напредъкът във високопроизводителните технологии наскоро позволи идентифицирането на молекулярния профил на GC и класифицирането му в подгрупи. В допълнение, GC разкри съществуването и значението на субпопулация на стомашни туморни стволови клетки (gCSCs), които са обявени за отговорни за произхода и поддържането на тумори, резистентност към терапии и метастази. Тези доказателства показват, че е необходимо регулаторите на gCSCs да бъдат изяснени чрез тяхната стойност като молекулярни цели, за да се установят по-ефективни лечения. Семейството транскрипционни фактори на SOX регулира стволовите клетки по време на ембриогенезата, а също и при възрастни в различни тъкани, като например стомашно-чревния тракт. Ролята на неговите членове в областта на раковите заболявания зависи от контекста, тъй като това е тяхната дейност, необходима за поддържането на ЦБК при различни видове рак. Предварителните резултати на групата показват, че различните фактори на SOX са свръхизразени в gCSCs, подчертавайки SOX1. Тези резултати са нови, тъй като SOX1 е установено, че е туморен супресор при множество видове рак. В този проект ще проучим възможната онкогенна роля на SOX1 в GC, както в прогресията и резистентността към терапията, неговия потенциал като диагностичен биомаркер и като маркер за стратификация на пациентите въз основа на неговата прогностична и прогностична стойност, както и идентифициране на молекулярния ефектори на неговото действие. За да направим това, имаме проби от тумори и течни биопсии от пациенти с гастрит и GC от две кохорти, както и достъп до информация, получена от консорциумите TCGA (The Cancer Genome Atlas) и ACRG (Asia Cancer Research Group). В допълнение, ние ще проведем SOX1 функционални проучвания за печалба и загуба, омични стратегии и изчислителен биологичен анализ, както в GCSC култури, така и в животински модели. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
Skrandžio vėžys (GC) yra antra pagal dydį mirties nuo vėžio priežastis visame pasaulyje. Dėl didelio našumo technologijų pažangos neseniai buvo galima nustatyti GC molekulinį profilį ir jį klasifikuoti į pogrupius. Be to, GC atskleidė skrandžio naviko kamieninių ląstelių subpopuliacijos egzistavimą ir aktualumą (gCSC), kurios yra postuluojamos kaip atsakingos už navikų kilmę ir palaikymą, atsparumą gydymo ir metastazių. Šie įrodymai rodo, kad, norint nustatyti veiksmingesnį gydymą, būtina išaiškinti gCSC reguliatorius pagal jų, kaip molekulinių taikinių, vertę. SOX transkripcijos faktoriaus šeima reguliuoja kamienines ląsteles embriono metu, taip pat suaugusiųjų stadijoje įvairiuose audiniuose, pvz., virškinimo trakte. Jos narių vaidmuo vėžio srityje yra priklausomas nuo konteksto, nes jų veikla yra būtina, kad būtų galima palaikyti įvairių vėžio susirgimų vėžiu sergančius pacientus. Preliminarūs grupės rezultatai rodo, kad skirtingi SOX faktoriai yra per daug išreikšti gCSC, pabrėžiant SOX1. Šie rezultatai yra nauji, nes SOX1 yra nustatyta, kad naviko slopintuvas kelių tipų vėžio. Šiame projekte mes tirsime galimą onkogeninį SOX1 vaidmenį GC tiek progresavimo, tiek atsparumo terapijai, jo kaip diagnostinio biologinio žymens ir kaip pacientų stratifikacijos žymens, remiantis jo prognozine ir prognozine verte, taip pat nustatant jo veikimo molekulinius efektus. Norėdami tai padaryti, turime naviko mėginius ir skystas biopsijas iš pacientų, sergančių gastritu ir GC iš dviejų kohortų, taip pat prieigą prie informacijos, gautos iš TCGA (The Cancer Genome Atlas) ir ACRG (Azijos vėžio tyrimų grupės) konsorciumai. Be to, mes atliksime SOX1 funkcijos prieaugio ir praradimo tyrimus, omikos strategijas ir skaičiavimo biologijos analizę tiek GCSC kultūrose, tiek gyvūnų modeliuose. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
Rak želuca (GC) drugi je najveći uzrok smrti od raka u svijetu. Napredak u tehnologijama visokih performansi nedavno je omogućio identifikaciju molekularnog profila GC-a i njegovu klasifikaciju u podskupine. Osim toga, GC je otkrio postojanje i relevantnost subpopulacije matičnih stanica želuca (gCSC), koje se pretpostavljaju kao odgovorne za podrijetlo i održavanje tumora, otpornost na terapije i metastaze. Ti dokazi upućuju na to da je potrebno razjasniti regulatore gCSC-ova prema njihovoj vrijednosti kao molekularnim ciljnim vrijednostima kako bi se uspostavilo učinkovitije liječenje. Obitelj faktora transkripcije SOX regulira matične stanice tijekom embriogeneze, kao i u odrasloj fazi u različitim tkivima kao što je gastrointestinalni trakt. Uloga njegovih članova u području raka ovisi o kontekstu jer je njihova aktivnost nužna za održavanje CSC-ova kod različitih vrsta raka. Preliminarni rezultati skupine pokazuju da su različiti SOX čimbenici pretjerano izraženi u gCSC-ovima, naglašavajući SOX1. Ovi rezultati su novi, kao SOX1 je utvrđeno da je tumor supresor u više vrsta raka. U ovom projektu proučavat ćemo moguću onkogenu ulogu SOX1 u GC-u, kako u progresiji tako i u rezistenciji na terapiju, njegov potencijal kao dijagnostičkog biomarkera i kao marker stratifikacije pacijenata na temelju njegove prognostičke i prediktivne vrijednosti, kao i identificiranje molekularnih efektora njegovog djelovanja. Da bismo to učinili, imamo uzorke tumora i tekuće biopsije pacijenata s gastritisom i GC iz dvije kohorte, kao i pristup informacijama dobivenim od TCGA (The Cancer Genome Atlas) i ACRG (Asia Cancer Research Group) konzorcija. Osim toga, provest ćemo SOX1 funkcijske studije dobitaka i gubitka, omičke strategije i računalnu analizu biologije, kako u kulturama GCSC tako i u životinjskim modelima. (Croatian)
17 August 2022
0 references
Magcancer (GC) är den näst största dödsorsaken i världen. Framsteg inom högpresterande teknik har nyligen gjort det möjligt att identifiera GC:s molekylprofil och dess klassificering i undergrupper. Dessutom har GC avslöjat förekomsten och relevansen av en subpopulation av magtumörstamceller (gCSC), som är postulerade som ansvariga för ursprung och underhåll av tumörer, resistens mot terapier och metastaser. Dessa uppgifter tyder på att det är nödvändigt att belysa gCSC:s tillsynsmyndigheter med hjälp av deras värde som molekylära mål för att fastställa effektivare behandlingar. SOX transkriptionsfaktorfamiljen reglerar stamceller under embryogenes och även i vuxenstadiet i olika vävnader såsom mag-tarmkanalen. Medlemmarnas roll i cancer är kontextberoende, eftersom deras verksamhet är nödvändig för att upprätthålla CSC i olika cancerformer. Preliminära gruppresultat visar att olika SOX-faktorer överuttrycks i gCSC, vilket belyser SOX1. Dessa resultat är nya, eftersom SOX1 är etablerad för att vara en tumör suppressor i flera typer av cancer. I detta projekt kommer vi att studera den möjliga onkogena rollen av SOX1 i GC, både i progression och resistens mot terapi, dess potential som diagnostisk biomarkör och som markör för stratifiering av patienter baserat på dess prognostiska och prediktiva värde, samt identifiera de molekylära effektfaktorerna för dess verkan. För att göra detta har vi tumörprover och flytande biopsier från patienter med gastrit och GC från två kohorter, samt tillgång till information som erhållits av TCGA (The Cancer Genome Atlas) och ACRG (Asia Cancer Research Group) konsortier. Dessutom kommer vi att genomföra SOX1-funktionsförstärknings- och förluststudier, omiska strategier och beräkningsbiologianalys, både i GCSC-kulturer och djurmodeller. (Swedish)
17 August 2022
0 references
Cancerul gastric (CG) este a doua cauză ca mărime a deceselor cauzate de cancer la nivel mondial. Progresele înregistrate în domeniul tehnologiilor de înaltă performanță au permis recent identificarea profilului molecular al CG și clasificarea acestuia în subgrupuri. În plus, GC a relevat existența și relevanța unei subpopulații a celulelor stem tumorale gastrice (gCSC), care sunt postulate ca fiind responsabile pentru originea și menținerea tumorilor, rezistența la terapii și metastaze. Aceste dovezi indică faptul că este necesar să se elucideze regulatorii GCSC prin valoarea lor ca obiective moleculare pentru a stabili tratamente mai eficiente. Familia factorului de transcriere SOX reglează celulele stem în timpul embriogenezei și, de asemenea, în stadiul adult în diferite țesuturi, cum ar fi tractul gastro-intestinal. Rolul membrilor săi în cancer este dependent de context, fiind activitatea lor necesară pentru menținerea CSC în diferite tipuri de cancer. Rezultatele preliminare ale grupului arată că diferiți factori SOX sunt supraexprimați în gCSC-uri, evidențiind SOX1. Aceste rezultate sunt noi, deoarece SOX1 este stabilit a fi un supresor tumoral în mai multe tipuri de cancer. În acest proiect vom studia posibilul rol oncogenic al SOX1 în GC, atât în progresia cât și rezistența la terapie, potențialul său ca biomarker diagnostic și ca marker al stratificării pacienților pe baza valorii sale prognostice și predictive, precum și identificarea efectorilor moleculari ai acțiunii sale. Pentru a face acest lucru, avem probe tumorale și biopsii lichide de la pacienți cu gastrită și GC din două cohorte, precum și acces la informațiile obținute de consorțiile TCGA (The Cancer Genome Atlas) și ACRG (Asia Cancer Research Group). În plus, vom efectua studii de câștig și pierdere a funcției SOX1, strategii omice și analize de biologie computațională, atât în culturile GCSC, cât și în modelele animale. (Romanian)
17 August 2022
0 references
Rak želodca je drugi največji vzrok smrti zaradi raka na svetu. Napredek na področju visoko zmogljivih tehnologij je nedavno omogočil identifikacijo molekularnega profila GC in njegovo razvrstitev v podskupine. Poleg tega je GC razkril obstoj in pomembnost podpopulacije matičnih celic želodčnega tumorja (gCSC), ki so domnevno odgovorne za izvor in vzdrževanje tumorjev, odpornost na terapije in metastaze. Ti dokazi kažejo, da je treba regulatorje gCSC pojasniti z njihovo vrednostjo kot molekularnimi cilji, da se vzpostavi učinkovitejše zdravljenje. Družina transkripcijskih faktorjev SOX uravnava izvorne celice med embriogenezo in tudi v odrasli fazi v različnih tkivih, kot so prebavni trakt. Vloga njenih članov pri raku je odvisna od konteksta, saj je njihova dejavnost potrebna za vzdrževanje CSC pri različnih vrstah raka. Rezultati predhodne skupine kažejo, da so različni faktorji SOX pretirani v gCSC, kar poudarja SOX1. Ti rezultati so novi, saj je SOX1 dokazano, da je zaviralec tumorja pri več vrstah raka. V tem projektu bomo preučili možno onkogeno vlogo SOX1 v GC, tako pri napredovanju kot odpornosti proti terapiji, njegovem potencialu kot diagnostičnem biomarkerju in kot označevalcu stratifikacije bolnikov na podlagi prognostične in napovedne vrednosti ter prepoznavanju molekularnih efektorjev njegovega delovanja. V ta namen imamo vzorce tumorjev in tekoče biopsije bolnikov z gastritisom in GC iz dveh kohort ter dostop do informacij, ki jih pridobijo konzorciji TCGA (The Cancer Genome Atlas) in ACRG (Asia Cancer Research Group). Poleg tega bomo izvedli študije pridobivanja in izgube funkcij SOX1, omične strategije in računalniško biološko analizo, tako v kulturah GCSC kot v živalskih modelih. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
Rak żołądka (GC) jest drugą pod względem wielkości przyczyną zgonów nowotworowych na świecie. Postępy w zakresie wysokowydajnych technologii pozwoliły ostatnio zidentyfikować profil molekularny GC i jego klasyfikację do podgrup. Ponadto GC ujawnił istnienie i znaczenie subpopulacji komórek macierzystych guza żołądka (gCSC), które są postulowane jako odpowiedzialne za pochodzenie i utrzymanie nowotworów, odporność na terapie i przerzuty. Dowody te wskazują, że konieczne jest wyjaśnienie regulatorów GCSC poprzez ich wartość jako cele molekularne w celu ustanowienia skuteczniejszych metod leczenia. Rodzina czynników transkrypcyjnych SOX reguluje komórki macierzyste podczas embriogenezy, a także w stadium dorosłym w różnych tkankach, takich jak przewód żołądkowo-jelitowy. Rola jej członków w dziedzinie nowotworów jest uzależniona od kontekstu, ponieważ ich działalność jest niezbędna do utrzymania CSC w różnych nowotworach. Wstępne wyniki grupy pokazują, że różne czynniki SOX są nadekspresowane w gCSC, podkreślając SOX1. Wyniki te są nowatorskie, ponieważ SOX1 jest uznany za tłumik nowotworu w wielu rodzajach nowotworów. W tym projekcie zbadamy ewentualną onkogenną rolę SOX1 w GC, zarówno w progresji, jak i oporności na terapię, jej potencjał jako biomarker diagnostyczny oraz jako marker stratyfikacji pacjentów w oparciu o jego wartość prognostyczną i predykcyjną, a także identyfikuje molekularne efekty jego działania. Aby to zrobić, mamy próbki nowotworów i ciekłe biopsje od pacjentów z zapaleniem żołądka i GC z dwóch kohort, a także dostęp do informacji uzyskanych przez konsorcja TCGA (The Cancer Genome Atlas) i ACRG (Asia Cancer Research Group). Ponadto przeprowadzimy badania nad przyrostem i stratami funkcji SOX1, strategie omiczne oraz analizę biologii obliczeniowej, zarówno w kulturach GCSC, jak i modelach zwierzęcych. (Polish)
17 August 2022
0 references
Donostia/San Sebastián
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI18_01612
0 references