Multiomics, Microbiotes and Microorganisms Intetinal Colonisers Potentially Invasive: from microecology to Personalised-Predictive Genomics of Infection. (Q3144383)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3144383 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Multiomics, Microbiotes and Microorganisms Intetinal Colonisers Potentially Invasive: from microecology to Personalised-Predictive Genomics of Infection. |
Project Q3144383 in Spain |
Statements
36,209.25 Euro
0 references
66,500.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2016
0 references
31 March 2020
0 references
FUNDACION INVESTIGACION BIOMEDICA HOSPITAL RAMON Y CAJAL
0 references
La Genómica predictiva (Predictive Health Genomics) es una disciplina emergente basada en la idea de mejorar la medicina personalizada integrando información de genomas y otros tipos de datos genómicos (e.g.transcriptomas y metilomas) analizados longitudinalmente, junto con datos demográficos (estilos de vida, estado clínico). Esta disciplina ha adquirido gran relevancia en Salud humana pero las limitaciones técnicas impiden su aplicación en enfermedades bacterianas. Este proyecto aplica herramientas paraanalizar los cambios cualitativos y cuantitativos que se producen en la microbiota de individuos a lo largo del tiempo, e identificar los mecanismos de selección y desequilibrio observados. El proyecto utiliza además un abordaje multidisciplinar que combina técnicas moleculares, celulares, y omics de última generación tanto a nivel de microorganismo como de huésped y nace con la intención de ser una prueba de principio que aporte datos-clave para el futuro análisis de la ecología microbiana en medicina personalizada. Nuestro sistema experimental se basa en estudios de diversidad de las poblaciones de los principales patógenos oportunistas en el tracto GI (enterococos y E. coli) en el medio hospitalario y comunitario obtenidos en estudios previos (FIS (PI12-01581). En nuestro Proyecto se aplican marcadores metagenómicos para estudiar las causas y consecuencias de la persistencia de estos oportunistas en el la microbiota intestinal. (Spanish)
0 references
Predictive Health Genomics is an emerging discipline based on the idea of improving personalised medicine by integrating genome information and other types of genomic data (e.g. transcriptomas and methylomas) analysed longitudinally, along with demographic data (lifestyles, clinical status). This discipline has acquired great relevance in Human Health but technical limitations prevent its application in bacterial diseases. This project applies tools to analyse the qualitative and quantitative changes that occur in the microbiota of individuals over time, and to identify the mechanisms of selection and imbalance observed. The project also uses a multidisciplinary approach that combines molecular, cellular, and omic techniques of the latest generation both at the level of microorganism and host and is born with the intention of being a test of principle that provides key data for the future analysis of microbial ecology in personalised medicine. Our experimental system is based on studies of the diversity of the populations of the main opportunistic pathogens in the GI tract (enterococcus and E. coli) in the hospital and community environment obtained in previous studies (FIS (PI12-01581). In our project, metagenomic markers are applied to study the causes and consequences of the persistence of these opportunists in the intestinal microbiota. (English)
12 October 2021
0.4631142595990703
0 references
La génomique de la santé prédictive est une discipline émergente fondée sur l’idée d’améliorer la médecine personnalisée en intégrant l’information sur le génome et d’autres types de données génomiques (par exemple, les transcriptomes et les méthylomas) analysés longitudinalement, ainsi que les données démographiques (styles de vie, statut clinique). Cette discipline a acquis une grande importance dans le domaine de la santé humaine, mais les limitations techniques empêchent son application dans les maladies bactériennes. Ce projet utilise des outils pour analyser les changements qualitatifs et quantitatifs qui se produisent dans le microbiote des individus au fil du temps et pour identifier les mécanismes de sélection et de déséquilibre observés. Le projet utilise également une approche multidisciplinaire qui combine les techniques moléculaires, cellulaires et omiques de la dernière génération tant au niveau du micro-organisme qu’à celui de l’hôte et est née avec l’intention d’être un test de principe qui fournit des données clés pour l’analyse future de l’écologie microbienne en médecine personnalisée. Notre système expérimental est basé sur des études sur la diversité des populations des principaux pathogènes opportunistes dans le tractus gastro-intestinal (entérocoque et E. coli) dans l’environnement hospitalier et communautaire, obtenues lors d’études antérieures (FIS (PI12-01581). Dans notre projet, des marqueurs métagénomiques sont appliqués pour étudier les causes et les conséquences de la persistance de ces opportunistes dans le microbiote intestinal. (French)
2 December 2021
0 references
Predictive Health Genomics ist eine aufstrebende Disziplin, die auf der Idee beruht, die personalisierte Medizin durch die Integration von Genominformationen und anderen Arten von genomischen Daten (z. B. Transkriptomen und Methylomas) zu verbessern, die in Längsrichtung analysiert werden, zusammen mit demografischen Daten (Lebensstilen, klinischer Status). Diese Disziplin hat große Bedeutung in der menschlichen Gesundheit erworben, aber technische Einschränkungen verhindern ihre Anwendung bei bakteriellen Krankheiten. Dieses Projekt verwendet Instrumente zur Analyse der qualitativen und quantitativen Veränderungen, die im Laufe der Zeit in der Mikrobiota von Individuen auftreten, und zur Ermittlung der Mechanismen der Selektion und des Ungleichgewichts, die beobachtet werden. Das Projekt verwendet auch einen multidisziplinären Ansatz, der molekulare, zelluläre und omic Techniken der neuesten Generation sowohl auf der Ebene des Mikroorganismus als auch des Wirts kombiniert und mit der Absicht geboren wird, ein Grundsatztest zu sein, der Schlüsseldaten für die zukünftige Analyse der mikrobiellen Ökologie in der personalisierten Medizin liefert. Unser experimentelles System basiert auf Studien über die Vielfalt der Populationen der wichtigsten opportunistischen Krankheitserreger im GI-Trakt (enterococcus und E. coli) in der Krankenhaus- und Gemeindeumgebung, die in früheren Studien (FIS (PI12-01581) gewonnen wurden. In unserem Projekt werden metagenomische Marker eingesetzt, um die Ursachen und Folgen der Persistenz dieser Opportunisten im Darmmikrobiota zu untersuchen. (German)
9 December 2021
0 references
Predictive Health Genomics is een opkomende discipline gebaseerd op het idee om gepersonaliseerde geneeskunde te verbeteren door genoominformatie en andere soorten genomische gegevens (bv. transcriptomen en methylomen) te integreren die in de lengterichting worden geanalyseerd, samen met demografische gegevens (levensstijlen, klinische status). Deze discipline heeft grote relevantie verworven in de menselijke gezondheid, maar technische beperkingen voorkomen de toepassing ervan in bacteriële ziekten. Dit project gebruikt instrumenten om de kwalitatieve en kwantitatieve veranderingen te analyseren die zich voordoen in de microbiota van individuen in de loop van de tijd, en om de mechanismen van selectie en onevenwicht waargenomen te identificeren. Het project maakt ook gebruik van een multidisciplinaire aanpak die moleculaire, cellulaire en omische technieken van de nieuwste generatie combineert, zowel op het niveau van micro-organismen als gastheer en wordt geboren met de bedoeling een principetest te zijn die belangrijke gegevens levert voor de toekomstige analyse van microbiële ecologie in gepersonaliseerde geneeskunde. Ons experimentele systeem is gebaseerd op studies naar de diversiteit van de populaties van de belangrijkste opportunistische pathogenen in het GI-kanaal (enterococcus en E. coli) in het ziekenhuis en de omgeving van de gemeenschap, verkregen in eerdere studies (FIS (PI12-01581). In ons project worden metagenomic markers toegepast om de oorzaken en gevolgen van de persistentie van deze opportunisten in de darmmicrobiota te bestuderen. (Dutch)
17 December 2021
0 references
La genomica della salute predittiva è una disciplina emergente basata sull'idea di migliorare la medicina personalizzata integrando le informazioni sul genoma e altri tipi di dati genomici (ad esempio trascrizionemi e metilomi) analizzati longitudinalmente, insieme ai dati demografici (stili di vita, stato clinico). Questa disciplina ha acquisito grande rilevanza nella salute umana, ma limitazioni tecniche impediscono la sua applicazione nelle malattie batteriche. Questo progetto applica strumenti per analizzare i cambiamenti qualitativi e quantitativi che si verificano nel microbiota degli individui nel tempo e per identificare i meccanismi di selezione e squilibrio osservati. Il progetto utilizza anche un approccio multidisciplinare che combina tecniche molecolari, cellulari ed omiche di ultima generazione sia a livello di microrganismo che ospite e nasce con l'intenzione di essere un test di principio che fornisce dati chiave per la futura analisi dell'ecologia microbica nella medicina personalizzata. Il nostro sistema sperimentale si basa su studi sulla diversità delle popolazioni dei principali patogeni opportunistici nel tratto GI (enterococcus ed E. coli) nell'ambiente ospedaliero e comunitario ottenuti in studi precedenti (FIS (PI12-01581). Nel nostro progetto vengono applicati marcatori metagenomici per studiare le cause e le conseguenze della persistenza di questi opportunisti nel microbiota intestinale. (Italian)
16 January 2022
0 references
Ennustav tervis genoomika on kujunemisjärgus distsipliin, mis põhineb ideel parandada personaliseeritud meditsiini, integreerides genoomiteabe ja muud liiki genoomiandmed (nt transkriptoomid ja metüüloomid), mida analüüsitakse pikisuunas koos demograafiliste andmetega (eluviis, kliiniline seisund). See distsipliin on omandanud suure tähtsuse inimeste tervisele, kuid tehnilised piirangud takistavad selle kohaldamist bakteriaalsete haiguste korral. Selle projekti raames kasutatakse vahendeid, et analüüsida aja jooksul üksikisikute mikrobiotas ilmnevaid kvalitatiivseid ja kvantitatiivseid muutusi ning teha kindlaks valikumehhanismid ja täheldatud tasakaalustamatus. Projektis kasutatakse ka multidistsiplinaarset lähenemisviisi, mis ühendab viimase põlvkonna molekulaar-, raku- ja oomitehnikaid nii mikroorganismi kui ka peremeesorganismi tasandil ning on sündinud kavatsusega olla põhimõtteline test, mis annab võtmeandmeid mikroobide ökoloogia tulevaseks analüüsimiseks personaliseeritud meditsiinis. Meie eksperimentaalne süsteem põhineb varasemate uuringute (FIS (PI12–01581)) uuringutel, mis käsitlevad seedetrakti peamiste oportunistlike patogeenide (enterokokk ja E. coli) populatsioonide mitmekesisust haiglas ja kogukonnas. Meie projektis kasutatakse metagenoomilisi markereid, et uurida nende oportunistide püsivuse põhjuseid ja tagajärgi soolestiku mikrobiotas. (Estonian)
4 August 2022
0 references
Prognozuojamoji sveikatos genomika yra besiformuojanti disciplina, pagrįsta idėja pagerinti individualizuotą mediciną integruojant genomo informaciją ir kitų tipų genominius duomenis (pvz., transkriptomas ir metilomas), analizuojamus išilgai, kartu su demografiniais duomenimis (gyvenimo būdais, klinikine būkle). Ši disciplina įgijo didelę reikšmę žmonių sveikatos srityje, tačiau techniniai apribojimai neleidžia jo taikyti bakterinėms ligoms. Įgyvendinant šį projektą taikomos priemonės, skirtos analizuoti kokybinius ir kiekybinius pokyčius, kurie laikui bėgant įvyksta individų mikrobiotoje, ir nustatyti stebimus atrankos ir disbalanso mechanizmus. Projektas taip pat naudoja daugiadisciplinį požiūrį, kuris sujungia naujausios kartos molekulinius, ląstelinius ir ominius metodus tiek mikroorganizmo, tiek šeimininko lygiu ir yra gimęs siekiant būti principiniu bandymu, kuris suteikia pagrindinius duomenis būsimai mikrobų ekologijos analizei individualizuotoje medicinoje. Mūsų eksperimentinė sistema pagrįsta ankstesnių tyrimų (FIS (PI12–01581)) pagrindinių oportunistinių patogenų (enterokokų ir E. coli) populiacijos įvairovės ligoninėse ir bendruomenės aplinkoje tyrimais. Mūsų projekte metagenominiai žymenys naudojami šių oportunistų išlikimo žarnyno mikrobiotoje priežastims ir pasekmėms tirti. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
Prediktivna zdravstvena genomika nova je disciplina koja se temelji na ideji poboljšanja personalizirane medicine integriranjem informacija o genomu i drugih vrsta genomskih podataka (npr. transkriptoma i metiloma) analiziranih uzdužno, zajedno s demografskim podacima (životni stilovi, klinički status). Ova disciplina je stekla veliku važnost u ljudskom zdravlju, ali tehnička ograničenja sprječavaju njegovu primjenu u bakterijskim bolestima. Ovaj projekt primjenjuje alate za analizu kvalitativnih i kvantitativnih promjena koje se događaju u mikrobioti pojedinaca tijekom vremena te za utvrđivanje mehanizama odabira i opažene neravnoteže. Projekt također koristi multidisciplinarni pristup koji kombinira molekularne, stanične i omičke tehnike najnovije generacije kako na razini mikroorganizma tako i domaćina i rođen je s namjerom da bude test principa koji pruža ključne podatke za buduću analizu mikrobne ekologije u personaliziranoj medicini. Naš eksperimentalni sustav temelji se na istraživanjima raznolikosti populacija glavnih oportunističkih patogena u GI traktu (enterococcus i E. coli) u bolničkom okruženju i okruženju zajednice dobivenim u prethodnim istraživanjima (FIS (PI12 – 01581). U našem projektu primjenjuju se metagenomski markeri za proučavanje uzroka i posljedica upornosti tih oportunista u crijevnoj mikrobioti. (Croatian)
4 August 2022
0 references
Η Προγνωστική Γονιδιωματική Υγεία είναι ένας αναδυόμενος κλάδος που βασίζεται στην ιδέα της βελτίωσης της εξατομικευμένης ιατρικής με την ενσωμάτωση πληροφοριών γονιδιώματος και άλλων τύπων γονιδιωματικών δεδομένων (π.χ. μεταγραφήματα και μεθυλώματα) που αναλύονται διαχρονικά, μαζί με δημογραφικά δεδομένα (τρόποι ζωής, κλινική κατάσταση). Ο κλάδος αυτός έχει αποκτήσει μεγάλη σημασία στην ανθρώπινη υγεία, αλλά οι τεχνικοί περιορισμοί εμποδίζουν την εφαρμογή του σε βακτηριακές ασθένειες. Το έργο αυτό εφαρμόζει εργαλεία για την ανάλυση των ποιοτικών και ποσοτικών μεταβολών που συμβαίνουν στη μικροβιότητα των ατόμων με την πάροδο του χρόνου, καθώς και για τον εντοπισμό των μηχανισμών επιλογής και ανισορροπίας που παρατηρούνται. Το έργο χρησιμοποιεί επίσης μια διεπιστημονική προσέγγιση που συνδυάζει μοριακές, κυτταρικές και ωμικές τεχνικές της τελευταίας γενιάς τόσο σε επίπεδο μικροοργανισμού όσο και σε επίπεδο ξενιστή και γεννιέται με σκοπό να αποτελέσει μια δοκιμή αρχής που παρέχει βασικά δεδομένα για τη μελλοντική ανάλυση της μικροβιακής οικολογίας στην εξατομικευμένη ιατρική. Το πειραματικό μας σύστημα βασίζεται σε μελέτες της ποικιλομορφίας των πληθυσμών των κυριότερων καιροσκοπικών παθογόνων παραγόντων του GI (εντεροκόκκος και E. coli) στο νοσοκομειακό και κοινοτικό περιβάλλον που αποκτήθηκαν σε προηγούμενες μελέτες (FIS (PI12-01581). Στο έργο μας, εφαρμόζονται μεταγεωνομικοί δείκτες για να μελετηθούν οι αιτίες και οι συνέπειες της επιμονής αυτών των καιροσκόπων στην εντερική μικροβιώτα. (Greek)
4 August 2022
0 references
Prediktívna genomika zdravia je nová disciplína založená na myšlienke zlepšenia personalizovanej medicíny integráciou informácií o genóme a iných typov genómových údajov (napr. transkriptómy a metylómy) analyzovaných pozdĺžne spolu s demografickými údajmi (životné štýly, klinický stav). Táto disciplína nadobudla veľký význam pre ľudské zdravie, ale technické obmedzenia bránia jej aplikácii pri bakteriálnych ochoreniach. Tento projekt využíva nástroje na analýzu kvalitatívnych a kvantitatívnych zmien, ktoré sa vyskytujú v mikroflóre jednotlivcov v priebehu času, a na identifikáciu mechanizmov výberu a pozorovanej nerovnováhy. Projekt využíva aj multidisciplinárny prístup, ktorý kombinuje molekulárnu, bunkovú a omickú techniku najnovšej generácie na úrovni mikroorganizmu a hostiteľa a zrodí sa s úmyslom byť principiálnym testom, ktorý poskytuje kľúčové údaje pre budúcu analýzu mikrobiálnej ekológie v personalizovanej medicíne. Náš experimentálny systém je založený na štúdiách rozmanitosti populácií hlavných oportúnnych patogénov v GI trakte (enterokok a E. coli) v nemocničnom a komunitnom prostredí získaných v predchádzajúcich štúdiách (FIS (PI12 – 01581). V našom projekte sa metagenomické markery používajú na štúdium príčin a dôsledkov pretrvávania týchto oportunistov v črevnej mikroflóre. (Slovak)
4 August 2022
0 references
Ennakoiva terveysgenomiikka on kehittymässä oleva tieteenala, joka perustuu ajatukseen yksilöllisen lääketieteen parantamisesta integroimalla genomitietoa ja muuntyyppisiä genomitietoja (esim. transcriptomat ja metyylioomat), joita analysoidaan pitkittäin, sekä demografisia tietoja (elintapa, kliininen tila). Tämä kurinalaisuus on saanut suurta merkitystä ihmisten terveydelle, mutta tekniset rajoitukset estävät sen soveltamisen bakteerisairauksiin. Tässä hankkeessa käytetään välineitä, joilla analysoidaan yksilöiden mikrobiotassa ajan mittaan tapahtuvia laadullisia ja määrällisiä muutoksia sekä tunnistetaan valintamekanismit ja havaitut epätasapainomekanismit. Hankkeessa käytetään myös monialaista lähestymistapaa, jossa yhdistyvät viimeisimmän sukupolven molekyyli-, solu- ja omic-tekniikat sekä mikro-organismien tasolla että isäntänä ja jonka tarkoituksena on olla periaatetesti, joka tarjoaa keskeisiä tietoja mikrobiekologian tulevaa analyysia varten yksilöllisessä lääketieteessä. Kokeellinen järjestelmämme perustuu tutkimuksiin GI-kanavan (enterococcus ja E. coli) tärkeimpien opportunististen patogeenien populaatioiden monimuotoisuudesta sairaala- ja yhteisöympäristössä, jotka on saatu aiemmissa tutkimuksissa (FIS (PI12–01581). Hankkeessamme metagenomisia markkereita käytetään tutkimaan näiden opportunistien pysyvyyden syitä ja seurauksia suoliston mikrobiotassa. (Finnish)
4 August 2022
0 references
Prognostyczna genomika zdrowia to wyłaniająca się dyscyplina oparta na idei poprawy medycyny spersonalizowanej poprzez integrację informacji genomowych i innych rodzajów danych genomowych (np. transkryptomas i methylomas) analizowanych wzdłużnie, wraz z danymi demograficznymi (styl życia, stan kliniczny). Dyscyplina ta zyskała duże znaczenie w dziedzinie zdrowia ludzkiego, ale ograniczenia techniczne uniemożliwiają jej stosowanie w chorobach bakteryjnych. W ramach tego projektu stosuje się narzędzia do analizy jakościowych i ilościowych zmian zachodzących w mikrobiocie osobników w czasie oraz do identyfikacji mechanizmów selekcji i zaobserwowanej nierównowagi. W projekcie zastosowano również podejście multidyscyplinarne, które łączy techniki molekularne, komórkowe i omijające najnowszej generacji zarówno na poziomie mikroorganizmu, jak i gospodarza i rodzi się z zamiarem bycia testem zasad, który dostarcza kluczowych danych do przyszłej analizy ekologii mikrobiologicznej w medycynie spersonalizowanej. Nasz system eksperymentalny opiera się na badaniach różnorodności populacji głównych patogenów oportunistycznych w przewodzie pokarmowym (enterococcus i E. coli) w środowisku szpitalnym i środowiskowym uzyskanym w poprzednich badaniach (FIS (PI12-01581). W naszym projekcie stosuje się markery metagenomiczne do badania przyczyn i konsekwencji utrzymywania się tych oportunistów w mikrobiocie jelitowej. (Polish)
4 August 2022
0 references
A Prediktív Health Genomics egy kialakulóban lévő tudományág, amely a személyre szabott orvoslás javításán alapul a genominformációk és más típusú genomikus adatok (pl. transzkriptomák és metilomák) integrálásával, valamint demográfiai adatokkal (életstílusokkal, klinikai állapottal). Ez a fegyelem szerzett nagy jelentőséget az emberi egészség, de a technikai korlátok megakadályozzák annak alkalmazását a bakteriális betegségek. Ez a projekt eszközöket alkalmaz az egyének mikrobiótájában idővel bekövetkező minőségi és mennyiségi változások elemzésére, valamint a megfigyelt kiválasztási és egyensúlyhiányi mechanizmusok azonosítására. A projekt egy multidiszciplináris megközelítést is alkalmaz, amely ötvözi a legújabb generáció molekuláris, sejtes és omic technikáit mind a mikroorganizmusok, mind a gazdaszervezet szintjén, és azzal a szándékkal született, hogy elvi teszt legyen, amely kulcsfontosságú adatokat szolgáltat a személyre szabott orvoslás mikrobiológiai ökológiájának jövőbeli elemzéséhez. Kísérleti rendszerünk a GI traktus fő opportunista kórokozóinak (enterococcus és E. coli) populációinak sokféleségére vonatkozó vizsgálatokon alapul a kórházban és a közösségi környezetben, amelyet korábbi vizsgálatok során nyertek (FIS (PI12–01581). Projektünkben metagenomikus markereket alkalmazunk, hogy tanulmányozzuk ezeknek az opportunistáknak a bél mikrobiótákban való fennmaradásának okait és következményeit. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
Prediktivní zdraví Genomics je nově vznikající obor založený na myšlence zlepšení personalizované medicíny integrací informací o genomu a dalších typů genomických dat (např. transkriptomů a methylomů) analyzovaných podélně spolu s demografickými údaji (životní styly, klinický stav). Tato disciplína získala velký význam v oblasti lidského zdraví, ale technická omezení brání jeho použití u bakteriálních onemocnění. Tento projekt používá nástroje k analýze kvalitativních a kvantitativních změn, k nimž dochází v mikrobiotě jednotlivců v průběhu času, a k identifikaci mechanismů výběru a zjištěné nerovnováhy. Projekt rovněž využívá multidisciplinární přístup, který kombinuje molekulární, buněčné a omické techniky nejnovější generace jak na úrovni mikroorganismu, tak hostitele, a je narozen s úmyslem být testem principu, který poskytuje klíčové údaje pro budoucí analýzu mikrobiální ekologie v personalizované medicíně. Náš experimentální systém je založen na studiích rozmanitosti populací hlavních oportunních patogenů v traktu GI (enterococcus a E. coli) v nemocničním a komunitním prostředí získaných v předchozích studiích (PI12–01581). V našem projektu jsou metagenomické markery aplikovány ke studiu příčin a důsledků přetrvávání těchto oportunistů ve střevní mikrobiotě. (Czech)
4 August 2022
0 references
Prognozējošā veselības ģeonomika ir jauna disciplīna, kuras pamatā ir ideja uzlabot personalizēto medicīnu, integrējot genoma informāciju un cita veida genoma datus (piemēram, transkriptomas un metilomas), kas analizēti garenvirzienā kopā ar demogrāfiskajiem datiem (dzīves stili, klīniskais stāvoklis). Šī disciplīna ir ieguvusi lielu nozīmi cilvēka veselībai, bet tehniskie ierobežojumi novērš tās piemērošanu baktēriju slimībām. Šis projekts izmanto instrumentus, lai analizētu kvalitatīvās un kvantitatīvās izmaiņas, kas laika gaitā notiek indivīdu mikrobiotā, un lai noteiktu atlases un novērotās nelīdzsvarotības mehānismus. Projektā tiek izmantota arī daudznozaru pieeja, kas apvieno jaunākās paaudzes molekulārās, šūnu un omiskās metodes gan mikroorganismu, gan saimniekorganismu līmenī un ir dzimusi ar mērķi būt principa pārbaude, kas nodrošina galvenos datus mikrobu ekoloģijas turpmākai analīzei personalizētajā medicīnā. Mūsu eksperimentālā sistēma ir balstīta uz pētījumiem par galveno oportūnistisko patogēnu populāciju daudzveidību GI traktā (enterococcus un E. coli) slimnīcā un kopienas vidē, kas iegūta iepriekšējos pētījumos (FIS (PI12–01581). Mūsu projektā metagenomiskie marķieri tiek izmantoti, lai izpētītu šo oportūnistu noturības cēloņus un sekas zarnu mikrobiotā. (Latvian)
4 August 2022
0 references
Is disciplín atá ag teacht chun cinn í Géanómaíocht Sláinte Réamhfháistineach atá bunaithe ar an smaoineamh leigheas pearsantaithe a fheabhsú trí fhaisnéis ghéanómaigh agus cineálacha eile sonraí géanómaíocha (e.g. transcriptomaí agus meitilomaí) a ndearnadh anailís orthu ar feadh i bhfad, mar aon le sonraí déimeagrafacha (stíleanna beatha, stádas cliniciúil) a chomhtháthú. Tá ábharthacht mhór faighte ag an smacht seo i Sláinte an Duine ach cuireann teorainneacha teicniúla cosc ar a chur i bhfeidhm i galair bhaictéaracha. Cuireann an tionscadal seo uirlisí i bhfeidhm chun anailís a dhéanamh ar na hathruithe cáilíochtúla agus cainníochtúla a tharlaíonn i microbiota daoine le himeacht ama, agus chun na meicníochtaí roghnúcháin agus éagothroime a tugadh faoi deara a shainaithint. Baineann an tionscadal úsáid freisin as cur chuige ildisciplíneach lena gcomhcheanglaítear teicnící móilíneacha, ceallacha agus dúndaíocha na glúine is déanaí ar leibhéal an mhiocrorgánaigh agus an óstaigh araon agus a rugadh d’fhonn a bheith ina thástáil ar phrionsabal a sholáthraíonn príomhshonraí chun anailís a dhéanamh amach anseo ar éiceolaíocht mhiocróbach sa leigheas pearsantaithe. Tá ár gcóras turgnamhach bunaithe ar staidéir ar éagsúlacht dhaonraí na bpríomhphataiginí faille sa chonair GI (enteroccus agus E. coli) san ospidéal agus sa timpeallacht pobail a fuarthas i staidéir roimhe seo (FIS (PI12-01581). In ár dtionscadal, cuirtear marcóirí metagenomic i bhfeidhm chun staidéar a dhéanamh ar na cúiseanna agus na hiarmhairtí a bhaineann le marthanacht na ndeiseanna seo sa microbiota intestinal. (Irish)
4 August 2022
0 references
Geneomika napovednega zdravja je nastajajoča disciplina, ki temelji na ideji izboljšanja personalizirane medicine z vključevanjem genomskih informacij in drugih vrst genomskih podatkov (npr. transkriptomov in metilomov), analiziranih vzdolžno, skupaj z demografskimi podatki (življenjski slogi, klinično stanje). Ta disciplina je pridobila velik pomen na področju zdravja ljudi, vendar tehnične omejitve preprečujejo njegovo uporabo pri bakterijskih boleznih. Ta projekt uporablja orodja za analizo kvalitativnih in kvantitativnih sprememb, ki se sčasoma pojavijo v mikrobioti posameznikov, ter za opredelitev mehanizmov selekcije in ugotovljenega neravnovesja. Projekt uporablja tudi multidisciplinarni pristop, ki združuje molekularne, celične in omične tehnike najnovejše generacije tako na ravni mikroorganizmov kot gostitelja in je rojen z namenom, da bi bil test načel, ki zagotavlja ključne podatke za prihodnjo analizo mikrobne ekologije v personalizirani medicini. Naš eksperimentalni sistem temelji na študijah raznolikosti populacij glavnih oportunističnih patogenov v GI traktu (enterococcus in E. coli) v bolnišnicah in okolju skupnosti, pridobljenih v prejšnjih študijah (FIS (PI12–01581). V našem projektu se metagenomski označevalci uporabljajo za preučevanje vzrokov in posledic trdovratnosti teh oportunistov v črevesni mikrobioti. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
Прогнозното здраве геномика е нововъзникваща дисциплина, основана на идеята за подобряване на персонализираната медицина чрез интегриране на геномна информация и други видове геномни данни (напр. трансскриптоми и метиломи), анализирани надлъжно, заедно с демографски данни (начин на живот, клиничен статус). Тази дисциплина придоби голямо значение в човешкото здраве, но техническите ограничения предотвратяват прилагането ѝ при бактериални заболявания. Този проект прилага инструменти за анализ на качествените и количествените промени, които възникват в микробиотата на индивидите с течение на времето, и за идентифициране на наблюдаваните механизми за подбор и дисбаланс. Проектът използва и мултидисциплинарен подход, който съчетава молекулярни, клетъчни и омични техники от последно поколение както на ниво микроорганизъм, така и на гостоприемник, и се ражда с намерението да бъде принципен тест, който предоставя ключови данни за бъдещия анализ на микробната екология в персонализираната медицина. Нашата експериментална система се основава на проучвания на разнообразието на популациите на основните опортюнистични патогени в ГИ тракта (enterococcus и E. coli) в болничната и общностната среда, получени в предишни проучвания (FIS (PI12—01581). В нашия проект метагеномичните маркери се прилагат за изследване на причините и последиците от устойчивостта на тези опортюнисти в чревната микробиота. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
Tbassir tas-Saħħa Ġenomika hija dixxiplina emerġenti bbażata fuq l-idea li tittejjeb il-mediċina personalizzata bl-integrazzjoni ta’ informazzjoni dwar il-ġenoma u tipi oħra ta’ data ġenomika (eż. transskritomas u methylomas) analizzati b’mod lonġitudinali, flimkien ma’ data demografika (stil ta’ ħajja, stat kliniku). Din id-dixxiplina kisbet rilevanza kbira fis-Saħħa tal-Bniedem iżda l-limitazzjonijiet tekniċi jipprevjenu l-applikazzjoni tagħha fil-mard batteriku. Dan il-proġett japplika għodod biex janalizza l-bidliet kwalitattivi u kwantitattivi li jseħħu fil-mikrobijota ta’ individwi matul iż-żmien, u biex jidentifika l-mekkaniżmi ta’ għażla u żbilanċ osservati. Il-proġett juża wkoll approċċ multidixxiplinari li jikkombina tekniki molekulari, ċellulari u omiċi tal-aħħar ġenerazzjoni kemm fil-livell tal-mikroorganiżmu kif ukoll tal-ospitant u jitwieled bl-intenzjoni li jkun test ta’ prinċipju li jipprovdi dejta ewlenija għall-analiżi futura tal-ekoloġija mikrobika fil-mediċina personalizzata. Is-sistema sperimentali tagħna hija bbażata fuq studji tad-diversità tal-popolazzjonijiet tal-patoġeni opportunistiċi ewlenin fil-passaġġ GI (enterococcus u E. coli) fl-isptar u fl-ambjent tal-komunità miksuba fi studji preċedenti (FIS (PI12–01581). Fil-proġett tagħna, markaturi metaġenomiċi huma applikati biex jistudjaw il-kawżi u l-konsegwenzi tal-persistenza ta ‘dawn opportunisti fil-mikrobijota intestinali. (Maltese)
4 August 2022
0 references
A genómica preditiva da saúde é uma disciplina emergente baseada na ideia de melhorar a medicina personalizada integrando informações sobre o genoma e outros tipos de dados genómicos (por exemplo, transcriptomas e metilomas) analisados longitudinalmente, juntamente com dados demográficos (estilos de vida, estado clínico). Esta disciplina adquiriu grande relevância na Saúde Humana mas as limitações técnicas impedem a sua aplicação em doenças bacterianas. Este projeto aplica ferramentas para analisar as alterações qualitativas e quantitativas que ocorrem na microbiota dos indivíduos ao longo do tempo, e para identificar os mecanismos de seleção e desequilíbrio observados. O projeto também utiliza uma abordagem multidisciplinar que combina técnicas moleculares, celulares e ómicas de última geração, tanto ao nível do microrganismo como do hospedeiro, e nasce com a intenção de ser um teste de princípio que fornece dados fundamentais para a análise futura da ecologia microbiana na medicina personalizada. O nosso sistema experimental baseia-se em estudos da diversidade das populações dos principais agentes patogénicos oportunistas no tracto GI (enterococos e E. coli) no ambiente hospitalar e comunitário obtidos em estudos anteriores (FIS (PI12-01581). No nosso projeto, são aplicados marcadores metagenómicos para estudar as causas e consequências da persistência destes oportunistas na microbiota intestinal. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
Prediive Health Genomics er en ny disciplin baseret på ideen om at forbedre personaliseret medicin ved at integrere genominformation og andre typer af genomdata (f.eks. transkriptomer og methylomer), der analyseres på langs, sammen med demografiske data (livsstil, klinisk status). Denne disciplin har fået stor betydning for menneskers sundhed, men tekniske begrænsninger forhindrer dens anvendelse i bakterielle sygdomme. Dette projekt anvender værktøjer til at analysere de kvalitative og kvantitative ændringer, der forekommer i individers mikrobiota over tid, og til at identificere de mekanismer for udvælgelse og ubalance, der observeres. Projektet anvender også en tværfaglig tilgang, der kombinerer molekylære, cellulære og omiske teknikker fra den seneste generation både på mikroorganisme- og værtsniveau og er født med den hensigt at være en principtest, der giver nøgledata til den fremtidige analyse af mikrobiel økologi i personaliseret medicin. Vores eksperimentelle system er baseret på undersøgelser af mangfoldigheden af populationerne af de vigtigste opportunistiske patogener i GI-kanalen (enterococcus og E. coli) i hospitals- og lokalsamfundsmiljøet, der er opnået i tidligere undersøgelser (FIS (PI12-01581). I vores projekt anvendes metagenomiske markører til at undersøge årsagerne til og konsekvenserne af disse opportunisters persistens i tarmmikrobiotaen. (Danish)
4 August 2022
0 references
Genomica predictivă a sănătății este o disciplină emergentă bazată pe ideea îmbunătățirii medicinei personalizate prin integrarea informațiilor genomice și a altor tipuri de date genomice (de exemplu, transcriptome și metiloame) analizate longitudinal, împreună cu datele demografice (moduri de viață, stare clinică). Această disciplină a dobândit o mare relevanță în domeniul sănătății umane, dar limitările tehnice împiedică aplicarea sa în bolile bacteriene. Acest proiect aplică instrumente pentru a analiza schimbările calitative și cantitative care apar în microbiota indivizilor de-a lungul timpului și pentru a identifica mecanismele de selecție și dezechilibrul observate. Proiectul utilizează, de asemenea, o abordare multidisciplinară care combină tehnicile moleculare, celulare și omice de ultimă generație atât la nivelul microorganismului, cât și la nivelul gazdei și se naște cu intenția de a fi un test de principiu care oferă date esențiale pentru analiza viitoare a ecologiei microbiene în medicina personalizată. Sistemul nostru experimental se bazează pe studii privind diversitatea populațiilor de agenți patogeni oportuniști principali din tractul GI (enterococcus și E. coli) în mediul spitalicesc și comunitar obținut în studii anterioare (FIS (PI12-01581). În proiectul nostru, markerii metagenomici sunt aplicați pentru a studia cauzele și consecințele persistenței acestor oportuniști în microbiota intestinală. (Romanian)
4 August 2022
0 references
Predictive Health Genomics är en framväxande disciplin baserad på idén att förbättra individanpassad medicin genom att integrera genominformation och andra typer av genomdata (t.ex. transkriptom och metylom) analyseras longitudinellt, tillsammans med demografiska data (livsstilar, klinisk status). Denna disciplin har fått stor betydelse för människors hälsa men tekniska begränsningar förhindrar dess tillämpning vid bakteriesjukdomar. Detta projekt tillämpar verktyg för att analysera kvalitativa och kvantitativa förändringar som sker i individers mikrobiota över tid, och för att identifiera de mekanismer för urval och obalans som observerats. Projektet använder också ett tvärvetenskapligt tillvägagångssätt som kombinerar molekylära, cellulära och omiska tekniker av den senaste generationen både på mikroorganismnivå och värdnivå och är födda med avsikten att vara ett principiellt test som ger nyckeldata för framtida analys av mikrobiell ekologi i individanpassad medicin. Vårt experimentella system bygger på studier av mångfalden av populationerna av de viktigaste opportunistiska patogenerna i GI-kanalen (enterococcus och E. coli) på sjukhus och i närmiljön som erhållits i tidigare studier (FIS (PI12–01581). I vårt projekt används metagenomiska markörer för att studera orsakerna och konsekvenserna av dessa opportunisters uthållighet i tarmmikrobiota. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Madrid
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI15_01307
0 references