Exploration of molecular prognostic factors related to genotype and immunomodulation in localised GIST. (Q3144263)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3144263 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Exploration of molecular prognostic factors related to genotype and immunomodulation in localised GIST. |
Project Q3144263 in Spain |
Statements
41,488.4 Euro
0 references
51,500.0 Euro
0 references
80.56 percent
0 references
1 January 2016
0 references
16 December 2018
0 references
FUNDACION PUBLICA ANDALUZA PARA LA GESTION DE LA INVESTIGACION EN SALUD DE SEVILLA
0 references
Los tumores de estroma gastrointestinal (GIST) son los sarcomas más frecuentes. Nuestro grupo demostró la relevancia del genotipo en la supervivencia libre de recidiva en pacientes con GIST localizados. Concretamente, pacientes portadores de mutaciones que afecten a codones 557/558 del exón 11 del gen KIT, presentan un significativo e independiente mayor riesgo de recidiva. Sin embargo no se ha encontrado hasta el momento los factores moleculares que expliquen el mayor riesgo de recidiva en los portadores de las mutaciones críticas. En este estudio proponemos, en primer lugar, un análisis trascriptómico comparativo de portadores de mutaciones críticas respecto a otros genotipos. La hipótesis es que los portadores de mutaciones críticas presenten una expresión génica diferente de forma que planteara potenciales nuevas dianas terapéuticas. Por otra parte, planteamos un análisis de biomarcadores de inmunomodulación, mediante expresión proteínica, en la misma población de GIST localizados. La hipótesis es que la expresión de ciertos marcadores inmunológicos tendrían relevancia pronóstica en GIST localizados. Además, será de elevado interés correlacionar si los distintos genotipos no sólo tienen impacto en distintas señalizaciones génicas sino también en distinta expresión de marcadores inmunológicos. Para realizar los estudios previstos, contamos con el registro GIST del grupo GEIS con información clínico, patológica y molecular de alrededor de 400 pacientes con diagnóstico de GIST sin tratamiento adyuvante. Adicionalmente, los hospitales participantes en este proyecto multicéntrico aportarán nuevos casos de pacientes con GIST localizados tratados con Imatinib adyuvante. (Spanish)
0 references
Gastrointestinal stromal tumors (GIST) are the most common sarcomas. Our group demonstrated the relevance of the genotype in recurrence-free survival in patients with localised GIST. In particular, patients with mutations affecting codons 557/558 of exon 11 of the KIT gene have a significant and independent risk of recurrence. However, molecular factors that explain the increased risk of recurrence in carriers of critical mutations have not been found so far. In this study, we propose, first, a comparative transcryptomic analysis of carriers of critical mutations compared to other genotypes. The hypothesis is that carriers of critical mutations present a different gene expression in such a way as to pose potential new therapeutic targets. On the other hand, we propose an analysis of immunomodulation biomarkers, using protein expression, in the same population of localised GIST. The hypothesis is that the expression of certain immunological markers would have prognostic relevance in localised GIST. In addition, it will be of great interest to correlate if the different genotypes have an impact not only on different gene signs but also on different expressions of immunological markers. To carry out the planned studies, we have the GIST registry of the GEIS group with clinical, pathological and molecular information from around 400 patients diagnosed with GIST without adjuvant treatment. In addition, the hospitals participating in this multicenter project will provide new cases of patients with localised GIST treated with adjuvant Imatinib. (English)
12 October 2021
0.1851126007707507
0 references
Les tumeurs stromales gastro-intestinales (GIST) sont les sarcomes les plus courants. Notre groupe a démontré la pertinence du génotype dans la survie sans récidive chez les patients atteints de GIST localisé. En particulier, les patients présentant des mutations affectant les codons 557/558 de l’exon 11 du gène KIT présentent un risque important et indépendant de récidive. Cependant, les facteurs moléculaires qui expliquent le risque accru de récidive chez les porteurs de mutations critiques n’ont pas été trouvés jusqu’à présent. Dans cette étude, nous proposons d’abord une analyse transcryptomique comparative des porteurs de mutations critiques par rapport à d’autres génotypes. L’hypothèse est que les porteurs de mutations critiques présentent une expression génique différente de manière à poser de nouvelles cibles thérapeutiques potentielles. D’autre part, nous proposons une analyse des biomarqueurs d’immunomodulation, utilisant l’expression des protéines, dans la même population de GIST localisé. L’hypothèse est que l’expression de certains marqueurs immunologiques aurait une pertinence pronostique dans le GIST localisé. En outre, il sera très intéressant de corréler si les différents génotypes ont un impact non seulement sur les signes géniques différents, mais aussi sur les différentes expressions des marqueurs immunologiques. Pour réaliser les études prévues, nous disposons du registre GIST du groupe GEIS avec des informations cliniques, pathologiques et moléculaires d’environ 400 patients diagnostiqués avec GIST sans traitement adjuvant. En outre, les hôpitaux participant à ce projet multicentrique fourniront de nouveaux cas de patients atteints de GIST localisé traités par adjuvant Imatinib. (French)
2 December 2021
0 references
Gastrointestinale Stromaltumoren (GIST) sind die häufigsten Sarkomen. Unsere Gruppe zeigte die Relevanz des Genotyps für das rezidivfreie Überleben bei Patienten mit lokalisiertem GIST. Insbesondere Patienten mit Mutationen, die Kabeljau 557/558 von Exon 11 des KIT-Gens betreffen, haben ein signifikantes und unabhängiges Risiko eines Wiederauftretens. Molekulare Faktoren, die das erhöhte Risiko eines Wiederauftretens in Trägern kritischer Mutationen erklären, wurden jedoch bisher nicht festgestellt. In dieser Studie schlagen wir zunächst eine vergleichende transcryptomische Analyse von Trägern kritischer Mutationen im Vergleich zu anderen Genotypen vor. Die Hypothese ist, dass Träger kritischer Mutationen eine andere Genexpression in einer Weise darstellen, die potenzielle neue therapeutische Ziele darstellen. Andererseits schlagen wir eine Analyse von Immunmodulationsbiomarkern unter Verwendung von Proteinexpression in derselben Population von lokalisierten GIST vor. Die Hypothese ist, dass die Expression bestimmter immunologischer Marker prognostische Relevanz für lokalisierte GIST hätte. Darüber hinaus wird es von großem Interesse sein, zu korrelieren, wenn sich die verschiedenen Genotypen nicht nur auf verschiedene Genzeichen auswirken, sondern auch auf verschiedene Ausdrucksformen immunologischer Marker. Zur Durchführung der geplanten Studien haben wir das GIST-Register der GEIS-Gruppe mit klinischen, pathologischen und molekularen Informationen von rund 400 Patienten, die ohne adjuvante Behandlung mit GIST diagnostiziert wurden. Darüber hinaus werden die an diesem Multicenter-Projekt beteiligten Krankenhäuser neue Fälle von Patienten mit lokalisiertem GIST, die mit adjuvant Imatinib behandelt werden, versorgen. (German)
9 December 2021
0 references
Gastro-intestinale stromale tumoren (GIST) zijn de meest voorkomende sarcomen. Onze groep toonde de relevantie van het genotype aan voor recidivevrije overleving bij patiënten met gelokaliseerde GIST. Met name patiënten met mutaties die codeons 557/558 van exon 11 van het KIT-gen beïnvloeden, hebben een significant en onafhankelijk risico op herhaling. Moleculaire factoren die het verhoogde risico op herhaling bij dragers van kritieke mutaties verklaren, zijn tot dusver echter niet gevonden. In deze studie stellen we, ten eerste, een vergelijkende transcryptomische analyse van dragers van kritische mutaties ten opzichte van andere genotypes voor. De hypothese is dat dragers van kritische mutaties een andere genuitdrukking op een zodanige manier presenteren dat potentiële nieuwe therapeutische doelen worden gesteld. Anderzijds stellen we een analyse voor van biomarkers voor immunomodulatie, met behulp van eiwitexpressie, in dezelfde populatie van gelokaliseerde GIST. De hypothese is dat de expressie van bepaalde immunologische markers prognostische relevantie zou hebben in gelokaliseerd GIST. Bovendien zal het van groot belang zijn om te correleren als de verschillende genotypes niet alleen van invloed zijn op verschillende gentekens, maar ook op verschillende expressies van immunologische markers. Om de geplande studies uit te voeren, hebben we het GIST-register van de GEIS-groep met klinische, pathologische en moleculaire informatie van ongeveer 400 patiënten die gediagnosticeerd zijn met GIST zonder adjuvante behandeling. Daarnaast zullen de ziekenhuizen die deelnemen aan dit multicenter project nieuwe gevallen bieden van patiënten met gelokaliseerde GIST behandeld met adjuvant Imatinib. (Dutch)
17 December 2021
0 references
I tumori stromali gastrointestinali (GIST) sono i sarcomi più comuni. Il nostro gruppo ha dimostrato la rilevanza del genotipo nella sopravvivenza libera da recidiva in pazienti con GIST localizzato. In particolare, i pazienti con mutazioni che interessano i codoni 557/558 dell'esone 11 del gene KIT presentano un rischio significativo e indipendente di recidiva. Tuttavia, finora non sono stati riscontrati fattori molecolari che spiegano l'aumento del rischio di recidiva nei portatori di mutazioni critiche. In questo studio proponiamo, in primo luogo, un'analisi transcrittomica comparativa dei portatori di mutazioni critiche rispetto ad altri genotipi. L'ipotesi è che i portatori di mutazioni critiche presentino un'espressione genica diversa in modo tale da porre potenziali nuovi obiettivi terapeutici. D'altra parte, proponiamo un'analisi dei biomarcatori di immunomodulazione, utilizzando l'espressione proteica, nella stessa popolazione di GIST localizzato. L'ipotesi è che l'espressione di alcuni marcatori immunologici avrebbe rilevanza prognostica nel GIST localizzato. Inoltre, sarà di grande interesse correlare se i diversi genotipi hanno un impatto non solo su segni genici diversi, ma anche su diverse espressioni di marcatori immunologici. Per effettuare gli studi pianificati, abbiamo il registro GIST del gruppo GEIS con informazioni cliniche, patologiche e molecolari provenienti da circa 400 pazienti con diagnosi di GIST senza trattamento adiuvante. Inoltre, gli ospedali che partecipano a questo progetto multicentrico forniranno nuovi casi di pazienti con GIST localizzato trattati con adiuvante Imatinib. (Italian)
16 January 2022
0 references
Οι γαστρεντερικοί στρωματικοί όγκοι (GIST) είναι τα πιο κοινά σαρκώματα. Η ομάδα μας απέδειξε τη σημασία του γονότυπου στην επιβίωση χωρίς υποτροπή σε ασθενείς με εντοπισμένο GIST. Ειδικότερα, οι ασθενείς με μεταλλάξεις που επηρεάζουν τους κωδικούς 557/558 από το exon 11 του γονιδίου KIT παρουσιάζουν σημαντικό και ανεξάρτητο κίνδυνο υποτροπής. Ωστόσο, μοριακοί παράγοντες που εξηγούν τον αυξημένο κίνδυνο επανεμφάνισης σε φορείς κρίσιμων μεταλλάξεων δεν έχουν βρεθεί μέχρι στιγμής. Σε αυτή τη μελέτη, προτείνουμε, πρώτον, μια συγκριτική διακρυπτονομική ανάλυση των φορέων των κρίσιμων μεταλλάξεων σε σύγκριση με άλλους γονότυπους. Η υπόθεση είναι ότι οι φορείς των κρίσιμων μεταλλάξεων παρουσιάζουν μια διαφορετική γονιδιακή έκφραση με τέτοιο τρόπο ώστε να θέτουν πιθανούς νέους θεραπευτικούς στόχους. Από την άλλη πλευρά, προτείνουμε μια ανάλυση των βιοδεικτών ανοσοτροποποίησης, χρησιμοποιώντας την έκφραση πρωτεΐνης, στον ίδιο πληθυσμό του τοπικού GIST. Η υπόθεση είναι ότι η έκφραση ορισμένων ανοσολογικών δεικτών θα είχε προγνωστική σημασία στο τοπικό GIST. Επιπλέον, θα έχει μεγάλο ενδιαφέρον να συσχετίζεται εάν οι διαφορετικοί γονότυποι έχουν αντίκτυπο όχι μόνο σε διαφορετικά γονιδιακά σημεία αλλά και σε διαφορετικές εκφράσεις ανοσολογικών δεικτών. Για τη διεξαγωγή των προγραμματισμένων μελετών, έχουμε το μητρώο GIST της ομάδας GEIS με κλινικές, παθολογικές και μοριακές πληροφορίες από περίπου 400 ασθενείς που έχουν διαγνωστεί με GIST χωρίς ανοσοενισχυτική θεραπεία. Επιπλέον, τα νοσοκομεία που συμμετέχουν σε αυτό το πολυκεντρικό έργο θα παρέχουν νέα περιστατικά ασθενών με τοπική GIST που αντιμετωπίζονται με ανοσοενισχυτικό Imatinib. (Greek)
17 August 2022
0 references
Gastrointestinal stromal tumorer (GIST) er de mest almindelige sarkomer. Vores gruppe viste relevansen af genotypen i recidivfri overlevelse hos patienter med lokaliseret GIST. Især patienter med mutationer, der påvirker kodon 557/558 af exon 11 af KIT-genet, har en signifikant og uafhængig risiko for tilbagefald. Molekylære faktorer, der forklarer den øgede risiko for gentagelse i bærere af kritiske mutationer, er imidlertid endnu ikke blevet fundet. I denne undersøgelse foreslår vi først en sammenlignende transkryptomisk analyse af bærere af kritiske mutationer sammenlignet med andre genotyper. Hypotesen er, at bærere af kritiske mutationer frembyder et andet genekspression på en sådan måde, at de udgør potentielle nye terapeutiske mål. På den anden side foreslår vi en analyse af immunmoduleringsbiomarkører ved hjælp af proteinudtryk i samme population af lokaliserede GIST. Hypotesen er, at udtryk for visse immunologiske markører ville have prognostisk relevans i lokaliseret GIST. Desuden vil det være af stor interesse at korrelere, hvis de forskellige genotyper ikke kun påvirker forskellige gentegn, men også forskellige udtryk for immunologiske markører. For at gennemføre de planlagte undersøgelser har vi GIST-registret i GEIS-gruppen med klinisk, patologisk og molekylær information fra omkring 400 patienter diagnosticeret med GIST uden adjuvansbehandling. Derudover vil de hospitaler, der deltager i dette multicenterprojekt, levere nye tilfælde af patienter med lokaliseret GIST behandlet med adjuvans Imatinib. (Danish)
17 August 2022
0 references
Maha-suolikanavan stomaaliset kasvaimet (GIST) ovat yleisimpiä sarkoomia. Ryhmämme osoitti genotyypin merkityksen uusiutumisvapaan eloonjäämisen kannalta potilailla, joilla oli paikallinen GIST. Erityisesti potilailla, joilla on KIT-geenin eksoni 11:n kodoneihin 557/558 vaikuttavia mutaatioita, on merkittävä ja itsenäinen uusiutumisriski. Toistaiseksi ei kuitenkaan ole havaittu molekyylitekijöitä, jotka selittävät kriittisten mutaatioiden kantajissa lisääntyneen uusiutumisriskin. Tässä tutkimuksessa ehdotamme ensinnäkin kriittisten mutaatioiden kantajia koskevaa vertailuanalyysia muihin genotyyppeihin verrattuna. Olettamuksena on, että kriittisten mutaatioiden kantajat esittävät toisen geenin ilmentymän siten, että ne voivat aiheuttaa uusia terapeuttisia kohteita. Toisaalta ehdotamme immunomodulaatiobiologisten merkkiaineiden analysointia proteiinin ilmentymän avulla samassa paikallisessa GIST-populaatiossa. Oletuksena on, että tiettyjen immunologisten merkkiaineiden ilmentymisellä olisi prognostista merkitystä paikallisessa GIST:ssä. Lisäksi on erittäin kiinnostavaa korreloida, jos eri genotyypeillä on vaikutusta paitsi erilaisiin geenimerkkeihin myös immunologisten merkkiaineiden eri ilmaisuihin. Suunniteltujen tutkimusten suorittamiseksi meillä on GEIS-ryhmän GIST-rekisteri, jossa on kliinistä, patologista ja molekyylitietoa noin 400 potilaalta, joilla on diagnosoitu GIST ilman liitännäishoitoa. Lisäksi tähän monikeskushankkeeseen osallistuvat sairaalat tarjoavat uusia tapauksia potilaille, joilla on paikallinen GIST, jota hoidetaan Imattinibilla. (Finnish)
17 August 2022
0 references
Tumuri stromali gastrointestinali (GIST) huma l-aktar sarkomi komuni. Il-grupp tagħna wera r-rilevanza tal-ġenotip fis-sopravivenza mingħajr rikorrenza f’pazjenti b’GIST lokalizzat. B’mod partikolari, pazjenti b’mutazzjonijiet li jaffettwaw il-kodons 557/558 ta’ exon 11 tal-ġene KIT għandhom riskju sinifikanti u indipendenti ta’ rikorrenza. Madankollu, sa issa għadhom ma nstabux fatturi molekulari li jispjegaw iż-żieda fir-riskju ta’ rikorrenza fit-trasportaturi ta’ mutazzjonijiet kritiċi. F’dan l-istudju, aħna nipproponu, l-ewwel, analiżi transkriptomika komparattiva ta’ trasportaturi ta’ mutazzjonijiet kritiċi meta mqabbla ma’ ġenotipi oħra. L-ipoteżi hija li t-trasportaturi ta’ mutazzjonijiet kritiċi jippreżentaw espressjoni differenti tal-ġeni b’tali mod li joħolqu miri terapewtiċi ġodda potenzjali. Min-naħa l-oħra, aħna nipproponu analiżi tal-bijomarkaturi tal-immunomodulazzjoni, bl-użu tal-espressjoni tal-proteini, fl-istess popolazzjoni ta’ GIST lokalizzat. L-ipoteżi hija li l-espressjoni ta’ ċerti markaturi immunoloġiċi jkollha rilevanza pronjostika fil-GIST lokalizzat. Barra minn hekk, ikun ta’ interess kbir li jkun hemm korrelazzjoni jekk il-ġenotipi differenti jkollhom impatt mhux biss fuq sinjali differenti tal-ġeni iżda wkoll fuq espressjonijiet differenti ta’ markaturi immunoloġiċi. Biex inwettqu l-istudji ppjanati, għandna r-reġistru GIST tal-grupp GEIS b’informazzjoni klinika, patoloġika u molekulari minn madwar 400 pazjent dijanjostikati b’GIST mingħajr kura awżiljarja. Barra minn hekk, l-isptarijiet li jipparteċipaw f’dan il-proġett multiċentriku se jipprovdu każijiet ġodda ta’ pazjenti b’GIST lokalizzat u kkurati b’Adjuvant Imatinib. (Maltese)
17 August 2022
0 references
Kuņģa-zarnu trakta stromas audzēji (GIST) ir visbiežāk sastopamās sarkomas. Mūsu grupa pierādīja genotipa nozīmi dzīvildzei bez recidīviem pacientiem ar lokalizētu GIST. Jo īpaši pacientiem ar mutācijām, kas ietekmē KIT gēna 11. eksona kodonus 557/558, ir ievērojams un neatkarīgs recidīva risks. Tomēr molekulārie faktori, kas izskaidro kritisko mutāciju nesēju pieaugošo atkārtošanās risku, līdz šim nav konstatēti. Šajā pētījumā mēs ierosinām, pirmkārt, salīdzinošu transkriptomisku analīzi par kritisko mutāciju nesējiem salīdzinājumā ar citiem genotipiem. Hipotēze ir tāda, ka kritisko mutāciju nesēji uzrāda atšķirīgu gēnu ekspresiju tādā veidā, kas rada potenciālus jaunus terapeitiskos mērķus. No otras puses, mēs ierosinām analizēt imūnmodulācijas biomarķierus, izmantojot proteīnu ekspresiju, tajā pašā lokalizētā GIST populācijā. Hipotēze ir tāda, ka noteiktu imunoloģisko marķieru izteiksmei būtu prognostiska nozīme lokalizētā GIST. Turklāt būs ļoti interesanti korelēt, ja dažādie genotipi ietekmēs ne tikai dažādas gēnu pazīmes, bet arī dažādas imunoloģisko marķieru izpausmes. Lai veiktu plānotos pētījumus, mums ir GIST reģistrs GEIS grupā ar klīnisko, patoloģisko un molekulāro informāciju no aptuveni 400 pacientiem, kuriem diagnosticēta GIST bez adjuvantas ārstēšanas. Turklāt slimnīcas, kas piedalās šajā daudzcentru projektā, nodrošinās jaunus gadījumus pacientiem ar lokalizētu GIST, kuri tiks ārstēti ar adjuvantu Imatinibu. (Latvian)
17 August 2022
0 references
Gastrointestinálne stromálne nádory (GIST) sú najčastejšie sarkómy. Naša skupina preukázala význam genotypu v prežívaní bez recidívy u pacientov s lokalizovaným GIST. Najmä pacienti s mutáciami ovplyvňujúcimi kodóny 557/558 exonu 11 génu KIT majú významné a nezávislé riziko recidívy. Molekulárne faktory, ktoré vysvetľujú zvýšené riziko recidívy nosičov kritických mutácií, sa doteraz nezistili. V tejto štúdii navrhujeme v prvom rade porovnávaciu transkryptomickú analýzu nosičov kritických mutácií v porovnaní s inými genotypmi. Hypotéza spočíva v tom, že nosiči kritických mutácií predstavujú odlišnú expresiu génov takým spôsobom, že predstavujú potenciálne nové terapeutické ciele. Na druhej strane navrhujeme analýzu imunomodulačných biomarkerov s použitím proteínovej expresie v rovnakej populácii lokalizovaného GIST. Predpokladá sa, že expresia určitých imunologických markerov by mala prognostický význam pri lokalizovanom GIST. Okrem toho bude veľmi zaujímavé korelovať, ak rôzne genotypy majú vplyv nielen na rôzne génové znaky, ale aj na rôzne expresie imunologických markerov. Na uskutočnenie plánovaných štúdií máme register GIST skupiny GEIS s klinickými, patologickými a molekulárnymi informáciami od približne 400 pacientov s diagnózou GIST bez adjuvantnej liečby. Okrem toho nemocnice, ktoré sa zúčastňujú na tomto multicentrickom projekte, poskytnú nové prípady pacientov s lokalizovaným GIST liečených adjuvantným Imatinibom. (Slovak)
17 August 2022
0 references
Tá gastrointestinal stromal siadaí (GIST) an sarcomas is coitianta. Léirigh ár ngrúpa ábharthacht na géinitíopa i marthanais saor ó atarlú in othair le GIST logánta. Go háirithe, tá baol suntasach neamhspleách ann go dtarlóidh othair a bhfuil sócháin acu a théann i bhfeidhm ar chódáin 557/558 de exon 11 de ghéin KIT. Mar sin féin, níor aimsíodh go dtí seo fachtóirí móilíneacha a mhíníonn an baol méadaithe go dtarlóidh sócháin chriticiúla in iompróirí. Sa staidéar seo, molaimid, ar dtús, anailís chomparáideach transcryptomic ar iompróirí sócháin chriticiúla i gcomparáid le géinitíopaí eile. Is é an hipitéis ná go gcuireann iompróirí sóchán criticiúil léiriú géine difriúil ar fáil ar bhealach a d’fhéadfadh a bheith ina spriocanna teiripeacha nua. Ar an láimh eile, molaimid anailís a dhéanamh ar bhithmharcóirí imdhíonachta, ag baint úsáide as abairt próitéine, sa daonra céanna GIST logánta. Is é an hipitéis go mbeadh an abairt marcóirí imdhíoneolaíocha áirithe a bheith ábhartha prognostic i GIST logánaithe. Ina theannta sin, beidh sé an-spéis a chomhchoibhneas má tá tionchar ag na géinitíopaí éagsúla, ní hamháin ar chomharthaí géine éagsúla ach freisin ar léirithe éagsúla marcóirí imdhíoneolaíocha. Chun na staidéir atá beartaithe a dhéanamh, ní mór dúinn clárlann GIST an ghrúpa GEIS le faisnéis chliniciúil, paiteolaíoch agus mhóilíneach ó thart ar 400 othar diagnóisithe le GIST gan cóireáil aidiúvach. Ina theannta sin, cuirfidh na hospidéil a ghlacann páirt sa tionscadal ilghnéitheach seo cásanna nua d’othair a bhfuil GIST logánta cóireáilte le Imatinib aidiúvach orthu. (Irish)
17 August 2022
0 references
Gastrointestinální stromální nádory (GIST) jsou nejčastější sarkomy. Naše skupina prokázala význam genotypu pro přežití bez recidivy u pacientů s lokalizovaným GIST. Zejména pacienti s mutacemi postihujícími kodony 557/558 exonu 11 genu KIT mají významné a nezávislé riziko recidivy. Molekulární faktory, které vysvětlují zvýšené riziko recidivy u nositelů kritických mutací, však dosud nebyly nalezeny. V této studii navrhujeme nejprve srovnávací transcryptomickou analýzu nosičů kritických mutací ve srovnání s jinými genotypy. Hypotéza je taková, že nositelé kritických mutací představují jinou genovou expresi tak, aby představovaly potenciální nové terapeutické cíle. Na druhé straně navrhujeme analýzu imunomodulačních biomarkerů s využitím proteinové exprese ve stejné populaci lokalizovaného GISTu. Hypotéza je taková, že výraz některých imunologických markerů by měl prognostický význam v lokalizovaném GISTu. Kromě toho bude velký zájem korelovat, pokud různé genotypy mají vliv nejen na různé genové příznaky, ale také na různé exprese imunologických markerů. Pro provedení plánovaných studií máme registr GIST skupiny GEIS s klinickými, patologickými a molekulárními informacemi od přibližně 400 pacientů s diagnostikou GIST bez adjuvantní léčby. Kromě toho nemocnice účastnící se tohoto multicentrického projektu poskytnou nové případy pacientů s lokalizovaným GIST léčených adjuvantním Imatinibem. (Czech)
17 August 2022
0 references
Os tumores estromais gastrointestinais (GIST) são os sarcomas mais comuns. Nosso grupo demonstrou a relevância do genótipo na sobrevida livre de recidiva em pacientes com GIST localizado. Em particular, os doentes com mutações que afetam os codões 557/558 do éxon 11 do gene KIT apresentam um risco significativo e independente de recorrência. No entanto, ainda não foram encontrados fatores moleculares que explicam o aumento do risco de recorrência em portadores de mutações críticas. Neste estudo, propomos, em primeiro lugar, uma análise transcriptômica comparativa de portadores de mutações críticas em comparação com outros genótipos. A hipótese é que portadores de mutações críticas apresentam uma expressão gênica diferente de forma a representar potenciais novos alvos terapêuticos. Por outro lado, propomos uma análise dos biomarcadores de imunomodulação, utilizando a expressão proteica, na mesma população de GIST localizado. A hipótese é que a expressão de certos marcadores imunológicos teria relevância prognóstica no GIST localizado. Além disso, será de grande interesse correlacionar se os diferentes genótipos têm impacto não apenas em diferentes sinais gênicos, mas também em diferentes expressões de marcadores imunológicos. Para realizar os estudos planejados, temos o registo GIST do grupo GEIS com informações clínicas, patológicas e moleculares de cerca de 400 pacientes diagnosticados com GIST sem tratamento adjuvante. Além disso, os hospitais participantes deste projeto multicêntrico fornecerão novos casos de pacientes com GIST localizado tratados com Imatinib adjuvante. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
Seedetrakti stromaalsed kasvajad (GIST) on kõige tavalisemad sarkoomid. Meie grupp näitas genotüübi asjakohasust retsidiveerumiseta elulemuses patsientidel, kellel oli lokaliseeritud GIST. Eelkõige patsientidel, kelle mutatsioonid mõjutavad KIT-geeni 11 ekson 11 koodonit 557/558, on märkimisväärne ja sõltumatu kordumise risk. Siiski ei ole seni leitud molekulaarseid tegureid, mis selgitavad kriitiliste mutatsioonide kandjate sagenemist. Selles uuringus pakume kõigepealt välja kriitilise mutatsiooni kandjate võrdleva transkrüptoloogilise analüüsi võrreldes teiste genotüüpidega. Hüpotees on see, et kriitiliste mutatsioonide kandjad kujutavad endast teistsugust geeniekspressiooni, mis võib tekitada uusi ravisihte. Teisest küljest teeme ettepaneku analüüsida immunomodulatsiooni biomarkereid, kasutades proteiini ekspressiooni, samas lokaliseeritud GIST populatsioonis. Hüpotees on, et teatud immunoloogiliste markerite ekspressioon omaks prognostilist tähtsust lokaliseeritud GISTis. Lisaks on väga huvitav korreleerida, kui erinevad genotüübid ei mõjuta mitte ainult erinevaid geenimärke, vaid ka erinevaid immunoloogiliste markerite ekspressioone. Planeeritud uuringute läbiviimiseks on meil GEIS grupi GIST register, mis sisaldab kliinilist, patoloogilist ja molekulaarset teavet ligikaudu 400 patsiendilt, kellel on diagnoositud GIST ilma adjuvantravita. Lisaks sellele pakuvad selles mitmekeskuselises projektis osalevad haiglad uusi juhtumeid patsientidel, kellel on lokaliseeritud GIST, keda ravitakse adjuvant Imatiniibiga. (Estonian)
17 August 2022
0 references
Gasztrointesztinális stromalis tumorok (GIST) a leggyakoribb szarkóma. Csoportunk igazolta a genotípus relevanciáját a kiújulásmentes túlélésben lokalizált GIST-ben szenvedő betegeknél. Különösen azok a betegek, akiknél a KIT gén 11 exonjának 557/558 kodonját érintő mutációk jelentős és független kiújulási kockázattal rendelkeznek. Mindeddig azonban nem találtak olyan molekuláris tényezőket, amelyek megmagyarázzák a kritikus mutációk hordozóinál a megismétlődés fokozott kockázatát. Ebben a vizsgálatban először a kritikus mutációk hordozóinak más genotípusokhoz viszonyított transzkriptomikus elemzését javasoljuk. A feltételezés az, hogy a kritikus mutációk hordozói más génexpressziót mutatnak oly módon, hogy új terápiás célokat jelenthetnek. Másrészt javasoljuk az immunmodulációs biomarkerek elemzését, fehérje expresszió alkalmazásával, a helyi GIST ugyanazon populációjában. A feltételezés az, hogy bizonyos immunológiai markerek kifejeződése prognosztikai jelentőséggel bírna a lokalizált GIST-ben. Ezenkívül nagy jelentőséggel bír a korreláció, ha a különböző genotípusok nemcsak a különböző génjelekre, hanem az immunológiai markerek különböző kifejeződéseire is hatással vannak. A tervezett vizsgálatok elvégzéséhez rendelkezésre áll a GEIS csoport GIST-regisztrációja, amely körülbelül 400, adjuváns kezelés nélküli GIST-vel diagnosztizált beteg klinikai, kórtani és molekuláris adatait tartalmazza. Emellett az ebben a multicentrikus projektben részt vevő kórházak új esetekkel látják el az Imatinib adjuvánssal kezelt, helyi GIST-ben szenvedő betegeket. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
Стомашно-чревните стромални тумори (GIST) са най-често срещаните саркоми. Нашата група показа значението на генотипа за преживяемостта без рецидив при пациенти с локализиран ГИСТ. По-специално, пациентите с мутации, засягащи кодони 557/558 от екзон 11 от гена на KIT, имат значителен и независим риск от рецидив. До момента обаче не са открити молекулярни фактори, които обясняват повишения риск от рецидив при носителите на критични мутации. В това проучване предлагаме, първо, сравнителен транскриптомичен анализ на носителите на критични мутации в сравнение с други генотипове. Хипотезата е, че носителите на критични мутации представляват различна генна експресия по такъв начин, че да поставят потенциални нови терапевтични мишени. От друга страна, ние предлагаме анализ на имуномодулацията биомаркери, използвайки протеин експресия, в същата популация на локализиран ГИСТ. Хипотезата е, че изразяването на някои имунологични маркери би имало прогностична значимост в локализирания ГИСТ. Освен това ще бъде от голям интерес да се направи корелация, ако различните генотипове имат въздействие не само върху различни генни признаци, но и върху различни изрази на имунологични маркери. За да извършим планираните проучвания, разполагаме с ГИСТ регистър на групата GEIS с клинична, патологична и молекулярна информация от около 400 пациенти, диагностицирани с ГИСТ без адювантно лечение. Освен това болниците, участващи в този многоцентров проект, ще предоставят нови случаи на пациенти с локализиран ГИСТ, лекувани с адювант Иматиниб. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
Virškinimo trakto stromos navikai (GIST) yra labiausiai paplitusi sarkomos. Mūsų grupė parodė genotipo svarbą pacientų, sergančių lokalizuota VTSN, išgyvenamumui be pasikartojimo. Visų pirma pacientams, kuriems yra mutacijų, veikiančių kodonus 557/558 iš 11 buvusio KIT geno, kyla reikšminga ir nepriklausoma pasikartojimo rizika. Tačiau molekuliniai veiksniai, paaiškinantys padidėjusią kritinių mutacijų nešėjų pasikartojimo riziką, kol kas nebuvo nustatyti. Šiame tyrime mes siūlome, pirma, lyginamąją transkriptominę kritinių mutacijų nešėjų analizę, palyginti su kitais genotipais. Hipotezė yra ta, kad kritinių mutacijų nešėjai turi skirtingą genų ekspresiją taip, kad gali sukelti naujus terapinius taikinius. Kita vertus, siūlome imunomoduliacinių biologinių žymenų analizę, naudojant baltymų ekspresiją toje pačioje lokalizuoto GIST populiacijoje. Hipotezė yra ta, kad tam tikrų imunologinių žymenų išraiškos prognostika būtų svarbi lokalizuotam GIST. Be to, bus labai įdomu koreliuoti, jei skirtingi genotipai turės įtakos ne tik skirtingiems genų ženklams, bet ir skirtingoms imunologinių žymenų išraiškoms. Norėdami atlikti planuojamus tyrimus, turime GEIS grupės VTST registrą, kuriame pateikiama klinikinė, patologinė ir molekulinė informacija iš maždaug 400 pacientų, kuriems diagnozuota VTSN be adjuvanto gydymo. Be to, šiame daugiacentriame projekte dalyvaujančios ligoninės suteiks naujų atvejų pacientams, sergantiems lokalizuota VTSN, gydomiems adjuvantu Imatinibu. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
Gastrointestinalni stromalni tumori (GIST) su najčešći sarkomi. Naša skupina dokazala je važnost genotipa u preživljenju bez recidiva u bolesnika s lokaliziranim GIST-om. Konkretno, bolesnici s mutacijama koje zahvaćaju kodone 557/558 egzona 11 KIT gena imaju značajan i neovisan rizik od recidiva. Međutim, do sada nisu pronađeni molekularni čimbenici koji objašnjavaju povećani rizik od recidiva kod nositelja kritičnih mutacija. U ovoj studiji predlažemo, prvo, komparativnu transkriptomsku analizu nositelja kritičnih mutacija u usporedbi s drugim genotipovima. Pretpostavka je da nositelji kritičnih mutacija predstavljaju drugačiji genski izraz na takav način da predstavljaju potencijalne nove terapijske ciljeve. S druge strane, predlažemo analizu imunomodulacijskih biomarkera, koristeći ekspresiju proteina, u istoj populaciji lokaliziranog GIST-a. Pretpostavka je da bi ekspresija određenih imunoloških markera imala prognostičku važnost u lokaliziranom GIST-u. Osim toga, to će biti od velikog interesa za korelaciju ako različiti genotipovi imaju utjecaj ne samo na različite znakove gena, ali i na različite izraze imunoloških markera. Da bismo proveli planirane studije, imamo GIST registar GEIS skupine s kliničkim, patološkim i molekularnim informacijama od oko 400 bolesnika kojima je dijagnosticiran GIST bez adjuvantnog liječenja. Osim toga, bolnice koje sudjeluju u ovom multicentričnom projektu osigurat će nove slučajeve bolesnika s lokaliziranim GIST-om liječenih adjuvantnim Imatinibom. (Croatian)
17 August 2022
0 references
Gastrointestinala stromala tumörer (GIST) är de vanligaste sarkomerna. Vår grupp visade genotypens relevans för återfallsfri överlevnad hos patienter med lokaliserad GIST. Särskilt patienter med mutationer som påverkar kodon 557/558 av exon 11 av KIT-genen har en betydande och oberoende risk för återfall. Molekylära faktorer som förklarar den ökade risken för återfall hos bärare av kritiska mutationer har dock ännu inte hittats. I denna studie föreslår vi först en jämförande transkryptomisk analys av bärare av kritiska mutationer jämfört med andra genotyper. Hypotesen är att bärare av kritiska mutationer presenterar ett annat genuttryck på ett sådant sätt att det utgör potentiella nya terapeutiska mål. Å andra sidan föreslår vi en analys av immunmoduleringsbiomarkörer, med hjälp av proteinuttryck, i samma population av lokaliserade GIST. Hypotesen är att uttrycket av vissa immunologiska markörer skulle ha prognostisk relevans i lokal GIST. Dessutom kommer det att vara av stort intresse att korrelera om de olika genotyperna har en inverkan inte bara på olika gentecken utan också på olika uttryck av immunologiska markörer. För att genomföra de planerade studierna har vi GIST-registret för GEIS-gruppen med klinisk, patologisk och molekylär information från cirka 400 patienter som diagnostiserats med GIST utan adjuvant behandling. Dessutom kommer de sjukhus som deltar i detta multicenterprojekt att ge nya fall av patienter med lokaliserad GIST som behandlas med adjuvant Imatinib. (Swedish)
17 August 2022
0 references
Tumorile stromale gastro-intestinale (GIST) sunt cele mai frecvente sarcome. Grupul nostru a demonstrat relevanța genotipului în supraviețuirea fără recurențe la pacienții cu GIST localizat. În special, pacienții cu mutații care afectează codonii 557/558 de exon 11 din gena KIT prezintă un risc semnificativ și independent de reapariție. Cu toate acestea, factorii moleculari care explică riscul crescut de reapariție la purtătorii mutațiilor critice nu au fost identificați până în prezent. În acest studiu, propunem, în primul rând, o analiză transcriptomică comparativă a purtătorilor mutațiilor critice în comparație cu alte genotipuri. Ipoteza este că purtătorii mutațiilor critice prezintă o expresie genetică diferită în așa fel încât să prezinte potențiale noi obiective terapeutice. Pe de altă parte, propunem o analiză a biomarkerilor de imunomodulare, folosind expresia proteică, în aceeași populație de GIST localizat. Ipoteza este că expresia anumitor markeri imunologici ar avea relevanță prognostică în GIST localizat. În plus, va fi de mare interes să se coreleze dacă diferitele genotipuri au un impact nu numai asupra diferitelor semne genetice, ci și asupra expresiilor diferite ale markerilor imunologici. Pentru realizarea studiilor planificate, avem registrul GIST al grupului GEIS cu informații clinice, patologice și moleculare de la aproximativ 400 de pacienți diagnosticați cu GIST fără tratament adjuvant. În plus, spitalele participante la acest proiect multicentric vor oferi noi cazuri de pacienți cu GIST localizat tratați cu Imatinib adjuvant. (Romanian)
17 August 2022
0 references
Gastrointestinalni stromalni tumorji (GIST) so najpogostejši sarkomi. Naša skupina je pokazala pomen genotipa pri preživetju brez ponovitve bolezni pri bolnikih z lokaliziranim GIST. Zlasti bolniki z mutacijami, ki vplivajo na kodone 557/558 eksona 11 gena KIT, imajo pomembno in neodvisno tveganje za ponovitev. Vendar molekularni dejavniki, ki pojasnjujejo povečano tveganje ponovitve pri nosilcih kritičnih mutacij, do zdaj niso bili ugotovljeni. V tej študiji najprej predlagamo primerjalno transkriptomsko analizo nosilcev kritičnih mutacij v primerjavi z drugimi genotipi. Hipoteza je, da nosilci kritičnih mutacij predstavljajo drugačno izražanje genov tako, da predstavljajo potencialne nove terapevtske cilje. Po drugi strani pa predlagamo analizo imunomodulatorjev biomarkerjev z ekspresijo beljakovin v isti populaciji lokaliziranega GIST. Hipoteza je, da bi imel izraz nekaterih imunoloških označevalcev prognostičen pomen v lokaliziranem GIST. Poleg tega bo zelo zanimivo, če različni genotipi vplivajo ne le na različne genske znake, ampak tudi na različne izraze imunoloških označevalcev. Za izvedbo načrtovanih študij imamo register GIST skupine GEIS s kliničnimi, patološkimi in molekularnimi informacijami približno 400 bolnikov z diagnozo GIST brez adjuvantnega zdravljenja. Poleg tega bodo bolnišnice, ki sodelujejo v tem multicentričnem projektu, zagotovile nove primere bolnikov z lokaliziranim GIST, zdravljenih z adjuvantnim Imatinibom. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
Najczęstszymi mięsakami są guzy stromalne przewodu pokarmowego (GIST). Nasza grupa wykazała znaczenie genotypu w czasie przeżycia wolnego od nawrotów u pacjentów z miejscowym GIST. W szczególności u pacjentów z mutacjami wpływającymi na kodony 557/558 exon 11 genu KIT istnieje znaczące i niezależne ryzyko nawrotu. Jednakże do tej pory nie stwierdzono czynników molekularnych, które wyjaśniają zwiększone ryzyko ponownego wystąpienia u nosicieli mutacji krytycznych. W tym badaniu proponujemy, po pierwsze, porównawczą analizę transkryptomiczną nośników mutacji krytycznych w porównaniu z innymi genotypami. Hipoteza jest taka, że nośniki mutacji krytycznych prezentują inną ekspresję genową w taki sposób, aby stwarzać potencjalne nowe cele terapeutyczne. Z drugiej strony, proponujemy analizę biomarkerów immunomodulacji, z wykorzystaniem ekspresji białek, w tej samej populacji miejscowego GIST. Hipoteza jest taka, że wyrażenie niektórych markerów immunologicznych miałoby znaczenie prognostyczne w zlokalizowanej GIST. Ponadto bardzo interesujące będzie korelowanie, jeśli różne genotypy mają wpływ nie tylko na różne znaki genowe, ale także na różne ekspresje markerów immunologicznych. Aby przeprowadzić planowane badania, mamy rejestr GIST grupy GEIS z informacjami klinicznymi, patologicznymi i molekularnymi od około 400 pacjentów, u których zdiagnozowano GIST bez leczenia adiuwantowego. Ponadto szpitale uczestniczące w tym wieloośrodkowym projekcie zapewnią nowe przypadki pacjentów z miejscowym GIST leczonych adiuwantem Imatynibem. (Polish)
17 August 2022
0 references
Sevilla
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI15_01254
0 references