Construction and validation of risk prediction models for pancreatic cancer. Application of a multi-economic approach. (Q3143278)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3143278 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Construction and validation of risk prediction models for pancreatic cancer. Application of a multi-economic approach. |
Project Q3143278 in Spain |
Statements
129,454.88 Euro
0 references
237,750.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2016
0 references
31 March 2020
0 references
FUNDACION CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES ONCOLOGICAS CARLOS III BIOLOGIA COMPUTACIONAL ESTRUCTURAL
0 references
Objetivos. (1) Diseccionar el intrincado escenario etiológico que conduce al desarrollo del adenocarcinoma ductal de páncreas (PDAC) mediante la integración de información epidemiológica (E), genómica (G), microbiomica (M), y epigenómica (Eg); (2) Construir y validar un modelo de predicción de riesgo para el PDAC con información epidemiológica (eMPR); y (3) Construir un modelo molecular/ómics de predicción de riesgo (mMPR) para el PDAC en base a los conocimientos derivados del objetivo 1. Metodología. Diseño caso-control. Los casos (N=2.330) son pacientes con PDAC diagnosticados “de novo” en 28 centros de 6 países europeos (España, Italia, Alemania, Suecia, UK, Irlanda) en el contexto del estudio PanGenEU durante 2009-2014. Los controles, (N=1.016) fueron emparejados a los casos por área de residencia, edad (± 5 años) y sexo. Se dispone de información epidemiológica obtenida por entrevistas directas con los sujetos de estudio; información genética determinada por genotipación centralizada con el kit oncoarray de 500.000 SNPs; información epigenética de un subgrupo de sujetos determinada con el kit Illumina de 450.000 CpG; e información microbiómica obtenida por sequenciación de 16sRNA. Para el análisis estadístico de los datos, proponemos una estrategia diferente del enfoque reduccionista clásico, con métodos novedosos. Vamos a aplicar estrategias cuantitativas y predictivas para analizar los datos ómics con el fin de entender cómo factores ómics y no-ómics actúan juntos en en una red de interacciones que conforman el PDAC como un sistema. (Spanish)
0 references
Objectives. (1) Dissect the intricate etiological scenario leading to the development of ductal adenocarcinoma of pancreas (PDAC) by integrating epidemiological (E), genomic (G), microbiomic (M), and epigenomic information (Eg); (2) Build and validate a risk prediction model for PDAC with epidemiological information (empr); and (3) Build a molecular/comic risk prediction model (MMPR) for PDAC based on the knowledge derived from Objective 1. Methodology. Case-control design. The cases (N=2.330) are patients with ADHD diagnosed “de novo” in 28 centers in 6 European countries (Spain, Italy, Germany, Sweden, UK, Ireland) in the context of the PanGenEU study during 2009-2014. Controls (N=1.016) were matched to cases by area of residence, age (± 5 years) and sex. Epidemiological information obtained from direct interviews with the study subjects is available; genetic information determined by centralised genotyping with the OncoArray kit of 500,000 SNPs; epigenetic information of a subgroup of subjects determined with the Illumina kit of 450,000 CpG; and microbimic information obtained by sequenciation of 16sRNA. For the statistical analysis of the data, we propose a different strategy from the classical reductionist approach, with novel methods. We will apply quantitative and predictive strategies to analyse omic data in order to understand how omic and non-omic factors act together in a network of interactions that make up PDAC as a system. (English)
12 October 2021
0.2823269830328998
0 references
Objectifs. (1) Dissecter le scénario étiologique complexe conduisant au développement d’un adénocarcinome ductal du pancréas (PDAC) en intégrant des informations épidémiologiques (E), génomiques (G), microbiomiques (M) et épigénomiques (Eg); 2) Élaborer et valider un modèle de prévision des risques pour le CADPP à l’aide d’informations épidémiologiques (REEM); et (3) Élaborer un modèle de prévision des risques moléculaires/comiques (RMMM) pour l’ACPP en se fondant sur les connaissances tirées de l’objectif 1. Méthodologie. Conception du contrôle de cas. Les cas (N=2.330) sont des patients atteints de TDAH diagnostiqués «de novo» dans 28 centres dans 6 pays européens (Espagne, Italie, Allemagne, Suède, Royaume-Uni, Irlande) dans le cadre de l’étude PanGenEU de 2009-2014. Les témoins (N=1,06) ont été jumelés aux cas selon le lieu de résidence, l’âge (± 5 ans) et le sexe. Les informations épidémiologiques obtenues lors d’entretiens directs avec les sujets de l’étude sont disponibles; l’information génétique déterminée par génotypage centralisé avec la trousse OncoArray de 500 000 SNP; l’information épigénétique d’un sous-groupe de sujets déterminé à l’aide de la trousse Illumina de 450 000 CpG; et les informations microbémiques obtenues par séquenciation de l’ARN 16s. Pour l’analyse statistique des données, nous proposons une stratégie différente de l’approche réductionniste classique, avec de nouvelles méthodes. Nous appliquerons des stratégies quantitatives et prédictives pour analyser les données omic afin de comprendre comment les facteurs omic et non-omic agissent ensemble dans un réseau d’interactions qui composent le système PDAC. (French)
2 December 2021
0 references
Ziele. (1) Unterscheiden Sie das komplizierte etiologische Szenario, das zur Entwicklung eines ductalen Adenokarzinoms der Bauchspeicheldrüse (PDAC) führt, indem epidemiologische (E), genomische (G), Mikrobiomische (M) und epigenomische Informationen (Eg) integriert werden; (2) Erstellung und Validierung eines Risikovorhersagemodells für PDAC mit epidemiologischen Informationen (EMPR); und (3) Aufbau eines molekularen/komischen Risikovorhersagemodells (MMPR) für PDAC auf der Grundlage des aus Ziel 1 abgeleiteten Wissens. Methodik. Gehäuse-Kontroll-Design. Bei den Fällen (N=2.330) handelt es sich um Patienten mit ADHD-Diagnostik „de novo“ in 28 Zentren in 6 europäischen Ländern (Spanien, Italien, Deutschland, Schweden, Großbritannien, Irland) im Rahmen der PanGenEU-Studie 2009-2014. Die Kontrollen (N=1.016) wurden auf Fälle nach Wohnort, Alter (± 5 Jahren) und Geschlecht abgestimmt. Epidemiologische Informationen aus direkten Befragungen mit den Studienteilnehmern sind verfügbar; genetische Informationen, die durch zentralisierte Genotypisierung mit dem OncoArray-Kit von 500.000 SNPs bestimmt werden; epigenetische Informationen einer Untergruppe von Probanden, die mit dem Illumina-Kit von 450.000 CpG bestimmt wurden; und mikrobimischen Informationen, die durch Sequenziation von 16sRNA gewonnen wurden. Für die statistische Auswertung der Daten schlagen wir eine andere Strategie als der klassische Reduktionsansatz mit neuartigen Methoden vor. Wir werden quantitative und prädiktive Strategien anwenden, um omische Daten zu analysieren, um zu verstehen, wie omic und non-omic factors in einem Netzwerk von Interaktionen, die PDAC als System bilden, zusammenwirken. (German)
9 December 2021
0 references
Doelstellingen. (1) Ontworpen het ingewikkelde etiologische scenario dat leidt tot de ontwikkeling van ductaal adenocarcinoom van alvleesklier (PDAC) door de integratie van epidemiologische (E), genomic (G), microbiomische (M) en epigenomic informatie (Eg); (2) Een risicovoorspellingsmodel voor PDAC bouwen en valideren met epidemiologische informatie (EMPR); en (3) Een moleculaire/comic risk prediction model (MMPR) voor PDAC bouwen op basis van de kennis die is ontleend aan doelstelling 1. Methodologie. Het ontwerp van de zaakcontrole. De gevallen (N=2.330) zijn patiënten met ADHD gediagnosticeerd „de novo” in 28 centra in 6 Europese landen (Spanje, Italië, Duitsland, Zweden, Verenigd Koninkrijk, Ierland) in de context van de PanGenEU-studie in 2009-2014. Controles (N=1.016) werden gekoppeld aan gevallen per woonplaats, leeftijd (± 5 jaar) en geslacht. Epidemiologische informatie die is verkregen uit rechtstreekse interviews met de proefpersonen; genetische informatie bepaald door gecentraliseerde genotypering met de OncoArray-kit van 500.000 SNP’s; epigenetische informatie van een subgroep proefpersonen bepaald met de Illumina kit van 450.000 CpG; en microbimische informatie verkregen door sequenciation van 16sRNA. Voor de statistische analyse van de gegevens stellen we een andere strategie voor dan de klassieke reductionistische aanpak, met nieuwe methoden. We zullen kwantitatieve en voorspellende strategieën toepassen om omische gegevens te analyseren om te begrijpen hoe omische en niet-omische factoren samenwerken in een netwerk van interacties die deel uitmaken van PDAC als systeem. (Dutch)
17 December 2021
0 references
Obiettivi. (1) Dissedere lo scenario eziologico complesso che porta allo sviluppo di adenocarcinoma duttale del pancreas (PDAC) integrando epidemiologici (E), genomici (G), microbiomici (M) e informazioni epigenomiche (Eg); (2) costruire e convalidare un modello di previsione del rischio per il PDAC con informazioni epidemiologiche (EMPR); e (3) costruire un modello di previsione del rischio molecolare/comico (MMPR) per il PDAC sulla base delle conoscenze derivate dall'obiettivo 1. Metodologia. Progettazione del controllo di caso. I casi (N=2.330) sono pazienti con diagnosi di ADHD "de novo" in 28 centri in 6 paesi europei (Spagna, Italia, Germania, Svezia, Regno Unito, Irlanda) nel contesto dello studio PanGenEU nel periodo 2009-2014. I controlli (N=1.016) sono stati abbinati ai casi per area di residenza, età (± 5 anni) e sesso. Sono disponibili informazioni epidemiologiche ottenute da colloqui diretti con i soggetti dello studio; informazioni genetiche determinate mediante genotipizzazione centralizzata con il kit OncoArray di 500.000 SNP; informazioni epigenetiche di un sottogruppo di soggetti determinati con il kit Illumina di 450.000 CpG; e informazioni microbimiche ottenute per sequenza di 16sRNA. Per l'analisi statistica dei dati, proponiamo una strategia diversa dal classico approccio riduzionista, con metodi innovativi. Applicheremo strategie quantitative e predittive per analizzare i dati omici al fine di capire come i fattori omici e non-omici agiscono insieme in una rete di interazioni che compongono il PDAC come sistema. (Italian)
16 January 2022
0 references
Στόχοι. (1) Διαχωρίστε το περίπλοκο ετιολογικό σενάριο που οδηγεί στην ανάπτυξη πόρου αδενοκαρκίνωμα του παγκρέατος (PDAC) με την ενσωμάτωση επιδημιολογικών (E), γονιδιωματικών (G), μικροβιωμικών (M) και επιγονιδιωματικών πληροφοριών (Eg)· (2) Δημιουργεί και επικυρώνει ένα μοντέλο πρόβλεψης κινδύνου για την PDAC με επιδημιολογικές πληροφορίες (EMPR)· και (3) Δημιουργήστε ένα μοντέλο πρόβλεψης μοριακού/κωμικού κινδύνου (MMPR) για την PDAC με βάση τις γνώσεις που προκύπτουν από τον στόχο 1. Μεθοδολογία. Σχεδιασμός ελέγχου υποθέσεων. Τα κρούσματα (N=2.330) είναι ασθενείς με ADHD διαγνωστεί «de novo» σε 28 κέντρα σε 6 ευρωπαϊκές χώρες (Ισπανία, Ιταλία, Γερμανία, Σουηδία, Ηνωμένο Βασίλειο, Ιρλανδία) στο πλαίσιο της μελέτης PanGenEU κατά την περίοδο 2009-2014. Οι έλεγχοι (N=1.016) αντιστοιχίστηκαν με περιπτώσεις ανά περιοχή διαμονής, ηλικία (± 5 ετών) και φύλο. Οι επιδημιολογικές πληροφορίες που λαμβάνονται από άμεσες συνεντεύξεις με τα θέματα της μελέτης είναι διαθέσιμες· γενετικές πληροφορίες που προσδιορίζονται με κεντρική γονοτυπική ανάλυση με το σετ OncoArray 500.000 SNP· επιγενετικές πληροφορίες μιας υποομάδας ατόμων που προσδιορίζονται με το κιτ Illumina των 450.000 CpG. και μικροβιολογικές πληροφορίες που λαμβάνονται με αλληλουχία του 16sRNA. Για τη στατιστική ανάλυση των δεδομένων, προτείνουμε μια διαφορετική στρατηγική από την κλασική αναγωγική προσέγγιση, με νέες μεθόδους. Θα εφαρμόσουμε ποσοτικές και προγνωστικές στρατηγικές για την ανάλυση ωμικών δεδομένων προκειμένου να κατανοήσουμε τον τρόπο με τον οποίο οι ωμικοί και οι μη ωμικοί παράγοντες δρουν από κοινού σε ένα δίκτυο αλληλεπιδράσεων που συνθέτουν την PDAC ως σύστημα. (Greek)
17 August 2022
0 references
Målsætninger. (1) Disseker det indviklede etiologiske scenario, der fører til udvikling af kanalisk adenocarcinom i bugspytkirtlen (PDAC) ved at integrere epidemiologisk (E), genomisk (G), mikrobiomisk (M) og epigenomisk information (Eg); (2) Opbygge og validere en risikoprognosemodel for PDAC med epidemiologiske oplysninger (EMPR); og 3) opbygge en model for forudsigelse af molekylær/komisk risiko (MMPR) for PDAC baseret på viden fra mål 1. Metode. Design af case-kontrol. Tilfældene (N=2.330) er patienter med ADHD diagnosticeret "de novo" i 28 centre i 6 europæiske lande (Spanien, Italien, Tyskland, Sverige, Det Forenede Kongerige, Irland) i forbindelse med PanGenEU-undersøgelsen i 2009-2014. Kontrollerne (N=1.016) blev matchet efter bopælsområde, alder (± 5 år) og køn. Der foreligger epidemiologiske oplysninger fra direkte interviews med forsøgspersonerne. genetisk information bestemt ved centraliseret genotypebestemmelse med OncoArray-sættet på 500.000 SNP'er; epigenetisk information af en undergruppe af forsøgspersoner bestemt med Illumina-sættet på 450.000 CpG; og mikrobimisk information opnået ved sekventering af 16sRNA. Til den statistiske analyse af dataene foreslår vi en anden strategi end den klassiske reduktionstilgang med nye metoder. Vi vil anvende kvantitative og prædiktive strategier til at analysere omic data for at forstå, hvordan omiske og ikke-omiske faktorer fungerer sammen i et netværk af interaktioner, der udgør PDAC som et system. (Danish)
17 August 2022
0 references
Tavoitteet. (1) Hävitetään monimutkainen etiologinen skenaario, joka johtaa haimakanavaisen adenokarsinooman (PDAC) kehittymiseen yhdistämällä epidemiologinen (E), genomi (G), mikrobiomic (M) ja epigenominen tieto (Eg); (2) Rakennetaan ja validoidaan PDAC:n riskiennustemalli epidemiologisen tiedon (EMPR) avulla; ja 3) Rakennetaan PDAC:lle molekyyli-/komiikkariskin ennustamismalli (MMPR), joka perustuu tavoitteesta 1 saatuun tietoon. Menetelmät. Tapauskohtainen suunnittelu. Tapaukset (N = 2,330) ovat potilaita, joilla oli ADHD-diagnoosi (de novo) 28 keskuksessa kuudessa Euroopan maassa (Espanjassa, Italiassa, Saksassa, Ruotsissa, Yhdistyneessä kuningaskunnassa, Irlannissa) PanGenEU-tutkimuksen yhteydessä vuosina 2009–2014. Tarkastukset (N=1.016) täsmäytyivät asuinalueen, iän (± 5 vuotta) ja sukupuolen mukaan. Tutkimushenkilöiden suorista haastatteluista saadut epidemiologiset tiedot ovat saatavilla; geneettiset tiedot, jotka määritetään keskitetyllä genotyyppisellä OncoArray-sarjalla, jossa on 500 000 SNP:tä; epigeneettiset tiedot tutkittavien alaryhmästä, jonka Illumina-pakkaus on 450 000 CpG; ja mikrobien tiedot, jotka on saatu sekvensoimalla 16sRNA. Tietojen tilastollista analysointia varten ehdotamme erilaista strategiaa kuin klassisen pelkistysmenetelmän, jossa käytetään uusia menetelmiä. Käytämme määrällisiä ja ennustavia strategioita omic datan analysointiin ymmärtääksemme, miten omiset ja muut tekijät toimivat yhdessä vuorovaikutuksen verkostossa, joka muodostaa PDAC: n järjestelmänä. (Finnish)
17 August 2022
0 references
Għanijiet. (1) Iddistingwi x-xenarju etjoloġiku kkomplikat li jwassal għall-iżvilupp ta’ adenokarċinoma kanalali tal-frixa (PDAC) billi jintegra informazzjoni epidemjoloġika (E), ġenomika (G), Mikrobijomika (M), u epiġenomika (Eg); (2) Tibni u tivvalida mudell ta’ tbassir tar-riskju għal PDAC b’informazzjoni epidemjoloġika (EMPR); u (3) Tibni mudell ta’ tbassir tar-riskju molekulari/komiku (MMPR) għal PDAC ibbażat fuq l-għarfien derivat mill-Objettiv 1. Metodoloġija. Disinn tal-kontroll tal-każ. Il-każijiet (N=2.330) huma pazjenti b’ADHD dijanjostikata “de novo” fi 28 ċentru f’6 pajjiżi Ewropej (Spanja, l-Italja, il-Ġermanja, l-Isvezja, ir-Renju Unit, l-Irlanda) fil-kuntest tal-istudju PanGenEU matul l-2009–2014. Il-kontrolli (N=1.016) tqabblu ma’ każijiet skont iż-żona ta’ residenza, l-età (± 5 snin) u s-sess. Informazzjoni epidemjoloġika miksuba minn intervisti diretti mas-suġġetti tal-istudju tkun disponibbli; informazzjoni ġenetika determinata permezz ta’ ġenotipar ċentralizzat bil-kit OncoArray ta’ 500,000 SNPs; informazzjoni epiġenetika ta’ sottogrupp ta’ individwi determinat bil-kit ta’ Illumina ta’ 450,000 CpG; u informazzjoni mikrobimika miksuba permezz ta’ sekwenza ta’ 16sRNA. Għall-analiżi statistika tad-data, aħna nipproponu strateġija differenti mill-approċċ klassiku ta’ tnaqqis, b’metodi ġodda. Aħna se napplikaw strateġiji kwantitattivi u ta’ tbassir biex nanalizzaw data omika sabiex nifhmu kif fatturi omiċi u mhux omiċi jaġixxu flimkien f’netwerk ta’ interazzjonijiet li jiffurmaw PDAC bħala sistema. (Maltese)
17 August 2022
0 references
Mērķi. (1) Atklājiet sarežģīto etioloģisko scenāriju, kura rezultātā attīstās aizkuņģa dziedzera kanalālā adenokarcinoma (PDAC), integrējot epidemioloģisko (E), genomisko (G), mikrobiomisko (M) un epigenomisko informāciju (Eg); (2) izstrādāt un validēt PDAC riska prognozēšanas modeli ar epidemioloģisko informāciju (EMPR); un 3) izveidot PDAC molekulāro/komisko risku prognozēšanas modeli (MMPR), pamatojoties uz zināšanām, kas iegūtas no 1. mērķa. Metodika. Lietu kontroles projekts. Gadījumi (N=2.330) ir pacienti ar ADHD, kas diagnosticēts “de novo” 28 centros 6 Eiropas valstīs (Spānijā, Itālijā, Vācijā, Zviedrijā, Apvienotajā Karalistē, Īrijā) PanGenEU pētījuma kontekstā 2009.–2014. gadā. Kontroles pasākumi (N=1,016) tika saskaņoti ar gadījumiem pēc dzīvesvietas apgabala, vecuma (± 5 gadi) un dzimuma. Ir pieejama epidemioloģiskā informācija, kas iegūta tiešās intervijās ar pētāmajām personām; ģenētiskā informācija, ko nosaka centralizēta genotipēšana ar OncoArray komplektu 500 000 SNP; epiģenētiska informācija par pacientu apakšgrupu, kas noteikta ar ilumina komplektu 450 000 CpG; un mikrobioloģisko informāciju, kas iegūta, secinot 16sRNS. Datu statistiskajai analīzei mēs ierosinām stratēģiju, kas atšķiras no klasiskās reducējošās pieejas, ar jaunām metodēm. Mēs piemērosim kvantitatīvas un prognozējošas stratēģijas, lai analizētu omic datus, lai saprastu, kā omiskie un ne-omiskie faktori darbojas kopā mijiedarbības tīklā, kas veido PDAC kā sistēmu. (Latvian)
17 August 2022
0 references
Ciele. (1) Rozptýliť zložitý etiologický scenár, ktorý vedie k vzniku adenokarcinómu pankreasu (PDAC) integráciou epidemiologických (E), genomických (G), mikrobiomických (M) a epigenomických informácií (Eg); (2) vytvoriť a potvrdiť model prognózy rizika pre PDAC s epidemiologickými informáciami (EMPR); a (3) Vytvoriť model predpovede molekulárneho/komického rizika (MMPR) pre PDAC na základe poznatkov odvodených z cieľa 1. Metodika. Konštrukcia ovládania prípadu. Prípady (N=2.330) sú pacienti s ADHD s diagnózou „de novo“ v 28 centrách v 6 európskych krajinách (Španielsko, Taliansko, Nemecko, Švédsko, Spojené kráľovstvo, Írsko) v kontexte štúdie PanGenEU v rokoch 2009 – 2014. Kontroly (N=1 016) boli prispôsobené prípadom podľa oblasti bydliska, veku (± 5 rokov) a pohlavia. Sú k dispozícii epidemiologické informácie získané z priamych rozhovorov s účastníkmi štúdie; genetické informácie určené centralizovaným genotypom pomocou OncoArray súpravy 500 000 SNP; epigenetické informácie o podskupine jedincov stanovenej súpravou oxidu hlinitého 450000 CpG; a mikrobimické informácie získané sekvenovaním 16sRNA. Pre štatistickú analýzu údajov navrhujeme stratégiu odlišnú od klasického redukčného prístupu s novými metódami. Použijeme kvantitatívne a prediktívne stratégie na analýzu omických údajov, aby sme pochopili, ako omické a neomické faktory pôsobia spoločne v sieti interakcií, ktoré tvoria PDAC ako systém. (Slovak)
17 August 2022
0 references
Cuspóirí. (1) Dissect the intricate etiological case as a dtiocfaidh forbairt ar adenocarcinoma duchtach de phancreas (PDAC) trí eipidéimeolaíoch (E), géanómach (G), Micribhitheolaíoch (M), agus faisnéis eipigéanómaíoch (Eg) a chomhtháthú; (2) Samhail réamh-mheasta riosca a thógáil agus a bhailíochtú do PDAC le faisnéis eipidéimeolaíoch (empr); agus (3) Samhail mhóilíneach réamh-mheasta riosca/dearg (MMPR) a thógáil do PDAC bunaithe ar an eolas a fuarthas ó Chuspóir 1. Modheolaíocht. Dearadh cás-rialú. Is iad na cásanna (N=2.330) othair a bhfuil ADHD diagnóisithe “de nóvo” i 28 ionaid i 6 thír Eorpacha (an Spáinn, an Iodáil, an Ghearmáin, an tSualainn, an Ríocht Aontaithe, Éire) i gcomhthéacs an staidéir PanGenEU i rith 2009-2014. Rinneadh rialuithe (N=1.016) a mheaitseáil le cásanna de réir limistéar cónaithe, aoise (± 5 bliana) agus inscne. Go bhfuil faisnéis eipidéimeolaíoch a fhaightear ó agallaimh dhíreacha leis na hábhair staidéir ar fáil; faisnéis ghéiniteach arna cinneadh ag gnotyping láraithe le trealamh OncoArray de 500,000 SNPanna; faisnéis eipitigéiteach d’fhoghrúpa ábhar arna chinneadh le trealamh Illumina de 450,000 CpG; agus faisnéis mhicribhitheolaíoch a fhaightear trí sheicheamhú 16sRNA. Maidir leis an anailís staitistiúil ar na sonraí, molaimid straitéis dhifriúil ón gcur chuige laghdaitheach clasaiceach, le modhanna núíosacha. Cuirfimid straitéisí cainníochtúla agus tuarthacha i bhfeidhm chun anailís a dhéanamh ar shonraí adamhach d’fhonn tuiscint a fháil ar an gcaoi a bhfeidhmíonn fachtóirí adamhach agus neamh-damhacha le chéile i líonra idirghníomhaíochtaí a dhéanann PDAC mar chóras. (Irish)
17 August 2022
0 references
Cíle. (1) Oddělte složitý etiologický scénář vedoucí k rozvoji dučného adenokarcinomu slinivky břišní (PDAC) integrací epidemiologických (E), genomických (G), mikrobiomic (M) a epigenomických informací (Eg); (2) Vytvořit a validovat model predikce rizik pro PDAC pomocí epidemiologických informací (EMPR); a 3) vytvořit model pro predikci molekulárních/komických rizik (MMPR) pro PDAC na základě znalostí odvozených z cíle 1. Metodika. Návrh kontroly případů. Případy (N = 2,330) jsou pacienti s ADHD diagnostikovanou „de novo“ v 28 centrech v 6 evropských zemích (Španělsko, Itálie, Německo, Švédsko, Spojené království, Irsko) v kontextu studie PanGenEU v letech 2009–2014. Kontroly (N=1,016) byly porovnány s případy podle oblasti bydliště, věku (±5 let) a pohlaví. Jsou k dispozici epidemiologické informace získané z přímých rozhovorů se subjekty studie; genetické informace určené centralizovaným genotypováním se sadou OncoArray 500 000 SNP; epigenetické informace podskupiny subjektů určené sadou Illumina 450 000 CpG; a mikrobimické informace získané sekvencí 16sRNA. Pro statistickou analýzu dat navrhujeme jinou strategii než klasický redukcionistický přístup s novými metodami. Budeme používat kvantitativní a prediktivní strategie pro analýzu omických dat, abychom pochopili, jak fungují omické a neomické faktory společně v síti interakcí, které tvoří PDAC jako systém. (Czech)
17 August 2022
0 references
Objetivos. (1) Dissetar o intrincado cenário etiológico que leva ao desenvolvimento de adenocarcinoma ductal do pâncreas (PDAC), integrando informações epidemiológicas (E), genômicas (G), microbiômicas (M) e epigenômicas (Eg); (2) Construir e validar um modelo de previsão de risco para o PDAC com informações epidemiológicas (EMPR); e (3) Construir um modelo de previsão de risco molecular/cômico (MMPR) para o PDAC com base nos conhecimentos derivados do objetivo 1. Metodologia. Design de caso-controle. Os casos (N=2.330) são pacientes com TDAH diagnosticado «de novo» em 28 centros em 6 países europeus (Espanha, Itália, Alemanha, Suécia, Reino Unido, Irlanda) no contexto do estudo PanGenEU durante 2009-2014. Os controles (N=1.016) foram pareados aos casos por área de residência, idade (±5 anos) e sexo. Informações epidemiológicas obtidas a partir de entrevistas diretas com os sujeitos do estudo estão disponíveis; informação genética determinada por genotipagem centralizada com o kit OncoArray de 500.000 SNPs; informação epigenética de um subgrupo de indivíduos determinado com o kit Illumina de 450.000 CpG; e informação microbiana obtida por sequenciação de 16sRNA. Para a análise estatística dos dados, propomos uma estratégia diferente da abordagem reducionista clássica, com novos métodos. Aplicaremos estratégias quantitativas e preditivas para analisar dados ômicos, a fim de entender como fatores omicos e não-ômicos atuam juntos em uma rede de interações que compõem o PDAC como um sistema. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
Eesmärgid. (1) eristada keerulist etioloogilist stsenaariumi, mis viib pankrease kanali adenokartsinoomi (PDAC) tekkeni, integreerides epidemioloogilise (E), genoomi (G), mikrobioomilise (M) ja epigenoomteabe (Eg); (2) koostada ja valideerida PDAC riskiprognoosi mudel epidemioloogilise teabega (EMPR); ja (3) Eesmärgist 1 saadud teadmistel põhineva PDAC molekulaarse/koomilise riski prognoosi mudeli (MMPR) koostamine. Metoodika. Juhtumikontrolli ülesehitus. Juhtumid (N = 2330) on ADHD-diagnoosiga patsiendid, kellel on PanGenEU uuringu raames aastatel 2009–2014 diagnoositud „de novo“ 28 keskuses kuues Euroopa riigis (Hispaania, Itaalia, Saksamaa, Rootsi, Ühendkuningriik, Iirimaa). Kontrollid (N=1,016) vastasid juhtumitele elukoha, vanuse (± 5 aastat) ja soo järgi. On olemas epidemioloogiline teave, mis on saadud otsestel vestlustel uuringus osalejatega; geneetiline teave, mis määratakse tsentraliseeritud genotüübi määramisega OncoArray komplektiga, mis koosneb 500 000 SNP-st; epigeneetiline teave uuritavate alarühma kohta, mis on määratud Illumina komplektiga 450 000 CpG; ja mikrobioloogiline teave, mis on saadud 16sRNA sekveneerimisel. Andmete statistiliseks analüüsiks pakume välja klassikalisest redutseerimismeetodist erineva strateegia koos uudsete meetoditega. Me rakendame kvantitatiivseid ja ennustavaid strateegiaid, et analüüsida omic andmeid, et mõista, kuidas omic ja non-omic tegurid toimivad koos koostoimete võrgustikus, mis moodustavad PDACi kui süsteemi. (Estonian)
17 August 2022
0 references
Célkitűzések. (1) Az epidemiológiai (E), genomikus (G), mikrobiológiai (M) és epigenomikus információk (E) integrálásával a hasnyálmirigy-dukciós adenokarcinóma (PDAC) kialakulásához vezető bonyolult etiológiai forgatókönyvet bontsa szét; (2) PDAC-ra vonatkozó kockázatelőrejelzési modell kialakítása és validálása járványügyi információkkal (EMPR); és (3) az 1. célkitűzésből származó ismeretek alapján a PDAC-ra vonatkozó molekuláris/komikus kockázatelőrejelzési modell (MMPR) kialakítása. Módszertan. Az ügy kezelőszervének kialakítása. Az esetek (N=2.330) 6 európai ország (Spanyolország, Olaszország, Németország, Svédország, Egyesült Királyság, Írország) 28 központjában diagnosztizáltak ADHD-t a 2009–2014-es PanGenEU-vizsgálattal összefüggésben. Az ellenőrzéseket (N=1,016) a lakóhely, életkor (± 5 év) és nem szerinti esetekhez igazították. A vizsgálati alanyokkal folytatott közvetlen interjúkból származó epidemiológiai információk rendelkezésre állnak; az 500 000 SNP-ből álló OncoArray készlettel központosított genotipizálással meghatározott genetikai információ; a 450000 CpG Illumina készlettel meghatározott alanyok alcsoportjának epigenetikai információi; valamint az 16sRNS szekvenálásával nyert mikrobimikus információk. Az adatok statisztikai elemzéséhez a klasszikus redukciós megközelítéstől eltérő stratégiát javasolunk, új módszerekkel. Kvantitatív és prediktív stratégiákat alkalmazunk az omic adatok elemzésére annak érdekében, hogy megértsük, hogyan működnek együtt az omic és a nem-omikus tényezők egy olyan interakciók hálózatában, amelyek a PDAC-t alkotják rendszerként. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
Цели. (1) Разкриване на сложния етиологичен сценарий, водещ до развитието на диктален аденокарцином на панкреаса (PDAC) чрез интегриране на епидемиологична (E), геномна (G), микробиомична (M) и епигеномична информация (например); (2) Изграждане и валидиране на модел за прогнозиране на риска за PDAC с епидемиологична информация (EMPR); и 3) Изграждане на модел за прогнозиране на молекулярния/комичния риск (MMPR) за PDAC въз основа на знанията, получени по цел 1. Методология. Проект за управление на случаите. Случаите (N=2.330) са пациенти с ADHD диагностицирана „de novo“ в 28 центъра в 6 европейски страни (Испания, Италия, Германия, Швеция, Обединеното кралство, Ирландия) в контекста на проучването PanGenEU през 2009—2014 г. Контролите (N=1 016) са съпоставени със случаите по област на пребиваване, възраст (± 5 години) и пол. Има епидемиологична информация, получена от преки интервюта с участниците в изследването; генетична информация, определена чрез централизирано генотипиране с комплект OncoArray от 500 000 SNP; епигенетична информация за подгрупа субекти, определена с комплекта Illumina от 450 000 CpG; и микробимична информация, получена чрез секвениране на 16sRNA. За статистическия анализ на данните предлагаме стратегия, различна от класическия редукционистки подход, с нови методи. Ще прилагаме количествени и прогнозни стратегии за анализ на омичните данни, за да разберем как омичните и неомичните фактори действат заедно в мрежа от взаимодействия, които съставляват PDAC като система. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
Tikslai. (1) Išskirkite sudėtingą etiologinį scenarijų, dėl kurio atsiranda kasos latakų adenokarcinoma (PDAC), integruojant epidemiologinę (E), genominę (G), mikrobiominę (M) ir epigenominę informaciją (Eg); (2) sukurti ir patvirtinti PDAC rizikos prognozavimo modelį su epidemiologine informacija (EMPR); ir 3) sukurti PDAC molekulinės ir (arba) komercinės rizikos prognozavimo modelį (MMPR), pagrįstą žiniomis, gautomis iš 1 tikslo. Metodika. Atvejo kontrolės projektas. Šie atvejai (N=2.330) yra pacientai, kuriems diagnozuota ADHD 28 centruose 6 Europos šalyse (Ispanijoje, Italijoje, Vokietijoje, Švedijoje, Jungtinėje Karalystėje, Airijoje) 2009–2014 m. PanGenEU tyrimo kontekste. Kontrolė (N=1.016) atitiko atvejus pagal gyvenamąją vietą, amžių (± 5 metai) ir lytį. Turima epidemiologinės informacijos, gautos tiesiogiai apklausus tiriamuosius asmenis; genetinė informacija, nustatyta centralizuotai nustatant genotipą su OncoArray rinkiniu, kuriame yra 500 000 SNP; tiriamųjų pogrupio epigenetinė informacija, nustatyta su Illumina rinkiniu, kurio CpG yra 450 000 CpG; ir mikrobiminė informacija, gauta tęsiant 16sRNR. Statistinei duomenų analizei siūlome kitokią strategiją nei klasikinis redukcinis metodas, taikant naujus metodus. Mes taikysime kiekybines ir prognozavimo strategijas ominiams duomenims analizuoti, kad suprastume, kaip ominiai ir neominiai veiksniai veikia kartu sąveikų tinkle, kuris sudaro PDAC kaip sistemą. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
Ciljevi. (1) Razbiti zamršeni etiološki scenarij koji dovodi do razvoja duktalnog adenokarcinoma gušterače (PDAC) integriranjem epidemioloških (E), genomskih (G), mikrobiomičkih (M) i epigenomskih informacija (Eg); (2) izgraditi i potvrditi model predviđanja rizika za PDAC s epidemiološkim informacijama (EMPR); i (3) Izgraditi model predviđanja molekularnog/komičnog rizika (MMPR) za PDAC na temelju znanja dobivenih iz Cilja 1. Metodologija. Dizajn kontrole kućišta. Slučajevi (N=2.330) su pacijenti s ADHD-om s dijagnozom „de novo” u 28 centara u 6 europskih zemalja (Španjolska, Italija, Njemačka, Švedska, Ujedinjena Kraljevina, Irska) u kontekstu studije PanGenEU tijekom 2009. – 2014. Kontrole (N=0116) bile su usklađene sa slučajevima prema području prebivališta, dobi (± 5 godina) i spolu. Dostupni su epidemiološki podaci dobiveni izravnim razgovorima sa ispitanicima studije; genetske informacije određene centraliziranim genotipiziranjem s OncoArray kompletom od 500 000 SNP-ova; epigenetske informacije podskupine ispitanika određene s kompletom Illumina od 450.000 CpG; i mikrobimičke informacije dobivene redoslijedom 16sRNK. Za statističku analizu podataka predlažemo drukčiju strategiju od klasičnog redukcionističkog pristupa, s novim metodama. Primijenit ćemo kvantitativne i prediktivne strategije za analizu omičkih podataka kako bismo razumjeli kako omički i ne-omski čimbenici djeluju zajedno u mreži interakcija koje čine PDAC kao sustav. (Croatian)
17 August 2022
0 references
Mål. (1) Dissektera det invecklade etiologiska scenariot som leder till utvecklingen av duktalt adenokarcinom i bukspottkörteln (PDAC) genom att integrera epidemiologisk (E), genomisk (G), mikrobiomisk (M) och epigenomisk information (Eg). (2) Bygga och validera en modell för riskprognoser för PDAC med epidemiologisk information (EMPR). och 3) Skapa en modell för molekylär/komisk riskpredikation (MMPR) för PDAC på grundval av den kunskap som härrör från mål 1. Metodik. Utformning av fallkontroll. Fallen (N=2.330) är patienter med ADHD-diagnostiserad ”de novo” i 28 centra i 6 europeiska länder (Spanien, Italien, Tyskland, Sverige, Storbritannien, Irland) i samband med PanGenEU-studien under 2009–2014. Kontrollerna (N=1,016) matchades med fall efter bostadsområde, ålder (± 5 år) och kön. Epidemiologisk information från direkta intervjuer med försökspersonerna finns tillgänglig. genetisk information som bestäms genom centraliserad genotypning med OncoArray-satsen på 500 000 SNP. epigenetisk information för en subgrupp av försökspersoner som fastställts med Illumina-satsen på 450 000 CpG. och mikrobimisk information som erhållits genom sekvensering av 16sRNA. För den statistiska analysen av uppgifterna föreslår vi en annan strategi än den klassiska reduktionistiska metoden, med nya metoder. Vi kommer att tillämpa kvantitativa och prediktiva strategier för att analysera omiska data för att förstå hur omiska och icke-omiska faktorer agerar tillsammans i ett nätverk av interaktioner som utgör PDAC som system. (Swedish)
17 August 2022
0 references
Obiective. (1) Dezecție scenariul etiologic complicat care duce la dezvoltarea adenocarcinomului ductal al pancreasului (PDAC) prin integrarea informațiilor epidemiologice (E), genomice (G), microbiomice (M) și epigenomice (Eg); (2) Construirea și validarea unui model de predicție a riscurilor pentru PDAC cu informații epidemiologice (EMPR); și (3) Construirea unui model molecular/comic de predicție a riscului (MMPR) pentru PDAC pe baza cunoștințelor derivate din Obiectivul 1. Metodologie. Design de control al cazului. Cazurile (N=2.330) sunt pacienți cu ADHD diagnosticat „de novo” în 28 de centre din 6 țări europene (Spania, Italia, Germania, Suedia, Regatul Unit, Irlanda) în contextul studiului PanGenEU în perioada 2009-2014. Controalele (N=1.016) au fost corelate cu cazurile în funcție de zona de reședință, vârstă (± 5 ani) și sex. Sunt disponibile informații epidemiologice obținute în urma interviurilor directe cu subiecții studiului; informații genetice determinate prin genotipare centralizată cu kitul OncoArray de 500.000 SNP; informații epigenetice ale unui subgrup de subiecți determinați cu kitul Illumina de 450.000 CpG; și informații microbimice obținute prin secvențierea a 16sARN. Pentru analiza statistică a datelor, propunem o strategie diferită de abordarea reducționistă clasică, cu metode noi. Vom aplica strategii cantitative și predictive pentru a analiza datele omice pentru a înțelege modul în care factorii omici și non-omici acționează împreună într-o rețea de interacțiuni care alcătuiesc PDAC ca sistem. (Romanian)
17 August 2022
0 references
Cilji. (1) Odstranite zapleten etiološki scenarij, ki vodi do razvoja duktalnega adenokarcinoma trebušne slinavke (PDAC), z vključitvijo epidemioloških (E), genomskih (G), mikrobiomičnih (M) in epigenomskih informacij (Eg); (2) zgraditi in potrditi model napovedovanja tveganja za PDAC z epidemiološkimi informacijami (EMPR); in (3) izdelati model za napovedovanje molekularnega/komičnega tveganja (MMPR) za PDAC na podlagi znanja, pridobljenega iz cilja 1. Metodologija. Načrt kontrole primerov. Primeri (N = 2.330) so bolniki z ADHD z diagnozo „de novo“ v 28 centrih v 6 evropskih državah (Španija, Italija, Nemčija, Švedska, Združeno kraljestvo, Irska) v okviru študije PanGenEU v obdobju 2009–2014. Kontrole (n=1.016) so se ujemale s primeri glede na območje prebivališča, starost (±5 let) in spol. So na voljo epidemiološke informacije, pridobljene z neposrednimi razgovori z udeleženci študije; genetske informacije, določene s centralizirano genotipizacijo z OncoArray kompletom 500.000 SNP; epigenetski podatki podskupine oseb, določenih s kompletom Ilumina 450.000 CpG; in mikrobimske informacije, pridobljene s sekvencacijo 16sRNK. Za statistično analizo podatkov predlagamo drugačno strategijo od klasičnega redukcionističnega pristopa z novimi metodami. Uporabili bomo kvantitativne in napovedne strategije za analizo omičnih podatkov, da bi razumeli, kako omični in ne-omski dejavniki delujejo skupaj v mreži interakcij, ki sestavljajo PDAC kot sistem. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
Cele. (1) Rozróżnić zawiły scenariusz etiologiczny prowadzący do rozwoju gruczolaka przewodowego trzustki (PDAC) poprzez integrację informacji epidemiologicznych (E), genomowych (G), mikrobiomicznych (M) i epigenomicznych (Eg); (2) opracowanie i zatwierdzenie modelu prognozowania ryzyka dla PDAC za pomocą informacji epidemiologicznych (EMPR); oraz (3) stworzenie modelu prognozowania ryzyka molekularnego/komicznego (MMPR) dla PDAC w oparciu o wiedzę uzyskaną z Celu 1. Metodyka. Projekt kontroli spraw. Przypadki (N=2330) to pacjenci z ADHD zdiagnozowaną „de novo” w 28 ośrodkach w 6 krajach europejskich (Hiszpania, Włochy, Niemcy, Szwecja, Wielka Brytania, Irlandia) w kontekście badania PanGenEU w latach 2009-2014. Kontrole (N=1016) zostały dopasowane do przypadków według obszaru zamieszkania, wieku (±5 lat) i płci. Dostępne są informacje epidemiologiczne uzyskane w wyniku bezpośrednich wywiadów z uczestnikami badania; informacje genetyczne określone na podstawie scentralizowanego genotypowania za pomocą zestawu OncoArray zawierającego 500 000 SNP; informacje epigenetyczne dotyczące podgrupy pacjentów określonej za pomocą zestawu Illumina o wartości 450 000 CpG; oraz informacje mikrobimiczne uzyskane w wyniku sekwencji 16sRNA. Na potrzeby statystycznej analizy danych proponujemy inną strategię niż klasyczne podejście redukcyjne, z zastosowaniem nowatorskich metod. Będziemy stosować strategie ilościowe i predykcyjne do analizy danych ominowych, aby zrozumieć, w jaki sposób czynniki omijające i nieomiczne działają razem w sieci interakcji, które tworzą PDAC jako system. (Polish)
17 August 2022
0 references
Madrid
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI15_01573
0 references