Genetic Base of Porphyria (Q3142330)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3142330 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Genetic Base of Porphyria |
Project Q3142330 in Spain |
Statements
24,774.75 Euro
0 references
45,500.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2016
0 references
31 March 2020
0 references
FUNDACION INVESTIGACION BIOMEDICA HOSPITAL 12 DE OCTUBRE
0 references
Las porfirias son un grupo de enfermedades raras originadas por errores en la ruta biosintética del hemo. Dependiendo de la enzima afectada y por lo tanto del intermediario toxico acumulado, existen los distintos tipos de porfiria. Un objetivo del proyecto es la identificación y caracterización de las mutaciones responsables de los diversos tipos de porfiria en los pacientes. La tipificación de la variedad de porfiria se realizará en base a las manifestaciones clínicas y determinaciones bioquímicas (metabolitos y enzimas de la biosíntesis del hemo). Estos estudios indicaran el gen que se debe estudiar. El gen implicado se analizará mediante PCR y secuenciación a partir de ADN extraído de sangre periférica. En el caso de identificar mutaciones nuevas y cuya patogenicidad deba ser demostrada, estas serán evaluadas mediante estudios funcionales. Las mutaciones de cambio de aminoácido serán expresadas en E. coli para estimar su impacto en la actividad de la enzima. En el caso de mutaciones que pudieran afectar el procesamiento del ARN mensajero, su efecto se estudiará mediante RT-PCR y secuenciación. La mutación patológica se buscará en los familiares que expresen su consentimiento. Nuestro laboratorio ha generado un modelo murino knock-in con una deficiencia parcial en la uroporfirinógeno decarboxilasa (UROD), que desarrolla uroporfiria. En este modelo estudiaremos si en existe un déficit a nivel hematopoyético que contribuya junto con el déficit hepático al fenotipo porfírico. Con este objetivo se medirá la actividad de UROD en hígado, eritrocitos, médula ósea y bazo. También se medirán los niveles de porfirinas en orina, plasma, eritrocitos, médula ósea, hígado y bazo. (Spanish)
0 references
Porphyria are a group of rare diseases caused by errors in the biosynthetic pathway of hemo. Depending on the enzyme affected and therefore the accumulated toxic intermediate, there are different types of porphyria. One objective of the project is the identification and characterisation of mutations responsible for the different types of porphyria in patients. The porphyria variety will be typified based on clinical manifestations and biochemical determinations (metabolites and enzymes of the biosynthesis of the hemo). These studies will indicate the gene to be studied. The gene involved will be analysed by PCR and sequencing from peripheral blood DNA. In the case of identifying new mutations whose pathogenicity needs to be demonstrated, they will be evaluated by functional studies. Amino acid change mutations will be expressed in E. coli to estimate their impact on enzyme activity. In the case of mutations that could affect the processing of messenger RNA, its effect will be studied by RT-PCR and sequencing. The pathological mutation will be sought from relatives who express their consent. Our laboratory has generated a murine knock-in model with a partial deficiency in the uroporphyrinogen decarboxylase (UROD), which develops uroporphyria. In this model we will study whether there is a deficit at the hematopoietic level that contributes together with the liver deficit to the porphyric phenotype. With this objective, the activity of UROD in liver, erythrocytes, bone marrow and spleen will be measured. Porphyrin levels in urine, plasma, erythrocytes, bone marrow, liver, and spleen will also be measured. (English)
12 October 2021
0.3155440976079621
0 references
La porphyrie est un groupe de maladies rares causées par des erreurs dans la voie biosynthétique de l’hémo. En fonction de l’enzyme affectée et donc de l’intermédiaire toxique accumulé, il existe différents types de porphyrie. L’un des objectifs du projet est l’identification et la caractérisation des mutations responsables des différents types de porphyrie chez les patients. La variété porphyria sera typée en fonction des manifestations cliniques et des déterminations biochimiques (métabolites et enzymes de la biosynthèse de l’hémo). Ces études indiqueront le gène à étudier. Le gène concerné sera analysé par PCR et séquençage à partir de l’ADN sanguin périphérique. Dans le cas de l’identification de nouvelles mutations dont la pathogénicité doit être démontrée, elles seront évaluées par des études fonctionnelles. Les mutations des changements d’acides aminés seront exprimées dans E. coli afin d’estimer leur impact sur l’activité enzymatique. Dans le cas de mutations qui pourraient affecter le traitement de l’ARN messager, son effet sera étudié par RT-PCR et séquençage. La mutation pathologique sera recherchée auprès des parents qui expriment leur consentement. Notre laboratoire a produit un modèle murin avec une carence partielle de l’uroporphyrinogène décarboxylase (UROD), qui développe l’uroporphyrie. Dans ce modèle, nous étudierons s’il y a un déficit au niveau hématopoïétique qui contribue avec le déficit hépatique au phénotype porphyrique. Avec cet objectif, l’activité de l’UROD dans le foie, les érythrocytes, la moelle osseuse et la rate sera mesurée. Les taux de porphyrine dans l’urine, le plasma, les érythrocytes, la moelle osseuse, le foie et la rate seront également mesurés. (French)
2 December 2021
0 references
Porphyrien sind eine Gruppe seltener Krankheiten, die durch Fehler im biosynthetischen Weg der Hämo verursacht werden. Je nach Enzym und damit dem angesammelten toxischen Zwischenprodukt gibt es verschiedene Arten von Porphyrien. Ein Ziel des Projekts ist die Identifizierung und Charakterisierung von Mutationen, die für die verschiedenen Arten von Porphyrie bei Patienten verantwortlich sind. Die Porphyria-Sorte wird anhand klinischer Manifestationen und biochemischer Bestimmung (Metaboliten und Enzyme der Biosynthese der Hämo) typisiert. Diese Studien zeigen das zu untersuchende Gen an. Das beteiligte Gen wird mittels PCR und Sequenzierung aus peripherer Blut-DNA analysiert. Im Falle der Identifizierung neuer Mutationen, deren Pathogenität nachgewiesen werden muss, werden sie durch funktionelle Studien bewertet. Aminosäurewechselmutationen werden in E. coli ausgedrückt, um ihre Auswirkungen auf die Enzymaktivität abzuschätzen. Im Falle von Mutationen, die die Verarbeitung von Messenger RNA beeinflussen könnten, wird seine Wirkung von RT-PCR und Sequenzierung untersucht. Die pathologische Mutation wird von Verwandten gesucht, die ihre Zustimmung zum Ausdruck bringen. Unser Labor hat ein Murine Knock-in-Modell mit einem partiellen Mangel in deruroporphyrinogen Decarboxylase (UROD) erzeugt, dieuroporphyria entwickelt. In diesem Modell werden wir untersuchen, ob es ein Defizit auf der hämatopoetischen Ebene gibt, das zusammen mit dem Leberdefizit zum porphyrischen Phänotyp beiträgt. Mit diesem Ziel wird die Aktivität von UROD in Leber, Erythrozyten, Knochenmark und Milz gemessen. Porphyrinspiegel in Urin, Plasma, Erythrozyten, Knochenmark, Leber und Milz werden ebenfalls gemessen. (German)
9 December 2021
0 references
Porfyrie is een groep zeldzame ziekten veroorzaakt door fouten in de biosynthetische route van hemo. Afhankelijk van het aangetaste enzym en dus het geaccumuleerde toxische tussenproduct, zijn er verschillende soorten porfyrie. Een van de doelstellingen van het project is de identificatie en karakterisering van mutaties die verantwoordelijk zijn voor de verschillende soorten porfyrie bij patiënten. Het ras porfyria zal worden getypeerd op basis van klinische manifestaties en biochemische bepalingen (metabolieten en enzymen van de biosynthese van de hemo). Deze studies zullen wijzen op het te onderzoeken gen. Het betrokken gen zal worden geanalyseerd door PCR en sequencing van perifeer bloed DNA. Bij het identificeren van nieuwe mutaties waarvan de pathogeniteit moet worden aangetoond, zullen deze worden geëvalueerd door middel van functionele studies. Aminozuurveranderingsmutaties worden uitgedrukt in E. coli om de impact ervan op de enzymactiviteit te schatten. In het geval van mutaties die de verwerking van messenger RNA kunnen beïnvloeden, zal het effect ervan worden onderzocht door RT-PCR en sequencing. De pathologische mutatie zal worden gezocht bij familieleden die hun toestemming geven. Ons laboratorium heeft een murine knock-in model met een gedeeltelijke deficiëntie in de uroporphyrinogen decarboxylase (UROD), die uroporfyrie ontwikkelt. In dit model zullen we onderzoeken of er een tekort is op het hematopoëtische niveau dat samen met het levertekort bijdraagt aan het porfyrische fenotype. Met dit doel wordt de activiteit van UROD in lever, erytrocyten, beenmerg en milt gemeten. De porfyrinespiegels in urine, plasma, erytrocyten, beenmerg, lever en milt zullen ook worden gemeten. (Dutch)
17 December 2021
0 references
La porfiria è un gruppo di malattie rare causate da errori nel percorso biosintetico dell'emo. A seconda dell'enzima interessato e quindi dell'intermedio tossico accumulato, ci sono diversi tipi di porfiria. Uno degli obiettivi del progetto è l'identificazione e la caratterizzazione delle mutazioni responsabili dei diversi tipi di porfiria nei pazienti. La varietà di porfiria sarà caratterizzata in base a manifestazioni cliniche e determinazioni biochimiche (metaboliti ed enzimi della biosintesi dell'emo). Questi studi indicheranno il gene da studiare. Il gene in questione sarà analizzato mediante PCR e sequenziamento dal DNA del sangue periferico. Nel caso di identificazione di nuove mutazioni la cui patogenicità deve essere dimostrata, esse saranno valutate mediante studi funzionali. Le mutazioni della variazione degli aminoacidi saranno espresse in E. coli per stimarne l'impatto sull'attività enzimatica. Nel caso di mutazioni che potrebbero influenzare il trattamento dell'RNA messaggero, il suo effetto sarà studiato mediante RT-PCR e sequenziamento. La mutazione patologica sarà ricercata da parenti che esprimono il loro consenso. Il nostro laboratorio ha generato un modello murino knock-in con una parziale carenza di uroporfirinogen decarbossilasi (UROD), che sviluppa uroporfiria. In questo modello studieremo se c'è un deficit a livello ematopoietico che contribuisce con il deficit epatico al fenotipo porfirico. Con questo obiettivo, l'attività di UROD in fegato, eritrociti, midollo osseo e milza sarà misurata. Si misurano anche i livelli di porfirina nelle urine, nel plasma, negli eritrociti, nel midollo osseo, nel fegato e nella milza. (Italian)
16 January 2022
0 references
Porfüüria on rühm haruldasi haigusi, mida põhjustavad vead hemo biosünteetilises rajas. Sõltuvalt mõjutatud ensüümist ja seega akumuleerunud toksilisest vaheainest esineb erinevaid porfüüriat. Projekti üks eesmärk on tuvastada ja iseloomustada mutatsioone, mis põhjustavad patsientidel erinevat tüüpi porfüüriat. Porfüüria sort liigitatakse kliiniliste ilmingute ja biokeemiliste näitajate põhjal (metaboliidid ja hemo biosünteesi ensüümid). Need uuringud näitavad uuritavat geeni. Asjaomast geeni analüüsitakse PCR-meetodil ja järjestatakse perifeerse vere DNA-st. Kui tuvastatakse uusi mutatsioone, mille patogeensust tuleb tõendada, hinnatakse neid funktsionaalsete uuringutega. Aminohapete muutuste mutatsioone väljendatakse E. coli-s, et hinnata nende mõju ensüümi aktiivsusele. Messenger RNA töötlemist mõjutada võivate mutatsioonide korral uuritakse selle toimet RT-PCRi ja järjestuse abil. Patoloogilist mutatsiooni otsitakse sugulastelt, kes väljendavad oma nõusolekut. Meie labor on loonud hiire koputamise mudeli osalise puudusega uroporfürinogen dekarboksülaasis (UROD), mis arendab uroporfüüriat. Selles mudelis uurime, kas vereloome tasemel on puudujääk, mis aitab kaasa koos maksapuudulikkusega porfüürilisele fenotüübile. Sel eesmärgil mõõdetakse UROD aktiivsust maksas, erütrotsüütides, luuüdis ja põrnas. Samuti mõõdetakse porfüriini sisaldust uriinis, plasmas, erütrotsüütides, luuüdis, maksas ja põrnas. (Estonian)
4 August 2022
0 references
Porfirija yra retų ligų, kurias sukelia kraujo biosintezės kelio klaidos, grupė. Priklausomai nuo paveikto fermento ir todėl susikaupusio toksinio tarpinio, yra įvairių tipų porfirija. Vienas iš projekto tikslų – nustatyti ir apibūdinti mutacijas, atsakingas už įvairius pacientų porfirijos tipus. Porfirijos veislė bus tipizuota remiantis klinikiniais požymiais ir biocheminiais nustatymais (hemo biosintezės metabolizmais ir fermentais). Šie tyrimai parodys, kokį geną reikia tirti. Dalyvaujantis genas bus analizuojamas PGR ir seka iš periferinio kraujo DNR. Nustatant naujas mutacijas, kurių patogeniškumą reikia įrodyti, jos bus vertinamos funkciniais tyrimais. Aminorūgščių pokyčių mutacijos bus išreikštos E. coli, kad būtų galima įvertinti jų poveikį fermentų aktyvumui. Jei mutacijos gali turėti įtakos RNR pasiuntinių apdorojimui, jo poveikis bus tiriamas AT-PGR ir sekos nustatymo būdu. Patologinė mutacija bus ieškoma iš giminaičių, kurie išreiškia savo sutikimą. Mūsų laboratorija sukūrė pelių grandininį modelį su daliniu uroporphyrinogen dekarboksilazės (UROD), kuri vystosi uroporfirija, trūkumu. Šiame modelyje mes išnagrinėsime, ar yra kraujodaros lygio deficitas, kuris kartu su kepenų deficitu prisideda prie porfiro fenotipo. Šiuo tikslu bus matuojamas UROD aktyvumas kepenyse, eritrocituose, kaulų čiulpuose ir blužnyje. Taip pat bus matuojamas porfirino kiekis šlapime, plazmoje, eritrocituose, kaulų čiulpuose, kepenyse ir blužnyje. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
Porfirija je skupina rijetkih bolesti uzrokovanih pogreškama u biosintetskom putu hemo. Ovisno o enzimu koji je zahvaćen, a time i akumuliranom toksičnom intermedijeru, postoje različite vrste porfirije. Jedan od ciljeva projekta je identifikacija i karakterizacija mutacija odgovornih za različite vrste porfirije u bolesnika. Sorta porfirije tipizirat će se na temelju kliničkih manifestacija i biokemijskih određivanja (metabolita i enzima biosinteze hemo). Ova ispitivanja će ukazivati na gen koji će se proučavati. Uključeni gen će se analizirati PCR i sekvenciranje iz periferne krvi DNK. U slučaju utvrđivanja novih mutacija čiju patogenost treba dokazati, ocijenit će se funkcionalnim studijama. Mutacije promjene aminokiselina bit će izražene u E. coli kako bi se procijenio njihov utjecaj na aktivnost enzima. U slučaju mutacija koje mogu utjecati na obradu RNK glasnika, njegov će se učinak proučavati RT-PCR-om i sekvenciranjem. Patološka mutacija će se tražiti od rođaka koji izražavaju svoj pristanak. Naš laboratorij je proizveo model kucanja murina s djelomičnim nedostatkom uroporfirinogen dekarboksilaze (UROD), koji razvija uroporphyria. U ovom ćemo modelu proučiti postoji li deficit na hematopoetskoj razini koji zajedno s deficitom jetre doprinosi porfirskom fenotipu. S tim ciljem mjerit će se aktivnost UROD-a u jetri, eritrocita, koštanoj srži i slezeni. Također će se mjeriti razine porfirina u mokraći, plazmi, eritrocita, koštanoj srži, jetri i slezeni. (Croatian)
4 August 2022
0 references
Η πορφυρία είναι μια ομάδα σπάνιων ασθενειών που προκαλούνται από σφάλματα στη βιοσυνθετική οδό του αιμοσφαιρίου. Ανάλογα με το προσβεβλημένο ένζυμο και επομένως το συσσωρευμένο τοξικό ενδιάμεσο, υπάρχουν διάφοροι τύποι πορφυρίας. Ένας από τους στόχους του έργου είναι ο εντοπισμός και ο χαρακτηρισμός των μεταλλάξεων που ευθύνονται για τα διάφορα είδη πορφυρίας στους ασθενείς. Η ποικιλία πορφυρίας θα χαρακτηρίζεται βάσει κλινικών εκδηλώσεων και βιοχημικών προσδιορισμών (μεταβολίτες και ένζυμα της βιοσύνθεσης του αιμοσφαιρίου). Οι μελέτες αυτές υποδεικνύουν το γονίδιο που πρόκειται να μελετηθεί. Το γονίδιο που εμπλέκεται θα αναλυθεί με PCR και την αλληλουχία του DNA του περιφερικού αίματος. Στην περίπτωση εντοπισμού νέων μεταλλάξεων των οποίων η παθογένεια πρέπει να καταδειχθεί, θα αξιολογηθούν με λειτουργικές μελέτες. Οι μεταλλάξεις μεταβολών των αμινοξέων εκφράζονται σε E. coli για να εκτιμηθεί η επίδρασή τους στη δράση των ενζύμων. Στην περίπτωση μεταλλάξεων που θα μπορούσαν να επηρεάσουν την επεξεργασία του αγγελιοφόρου RNA, η επίδρασή της θα μελετηθεί με RT-PCR και τον προσδιορισμό της αλληλουχίας. Η παθολογική μετάλλαξη θα αναζητηθεί από συγγενείς που εκφράζουν τη συγκατάθεσή τους. Το εργαστήριό μας έχει δημιουργήσει ένα μυώδες μοντέλο με μερική ανεπάρκεια στην ουροπορφυρινογόνο δεκαρβοξυλάση (UROD), η οποία αναπτύσσει ουροπορφυρία. Σε αυτό το μοντέλο θα μελετήσουμε αν υπάρχει έλλειμμα στο αιματοποιητικό επίπεδο που συμβάλλει μαζί με το έλλειμμα του ήπατος στον πορφυρικό φαινότυπο. Με αυτό το στόχο, θα μετρηθεί η δραστηριότητα του UROD στο ήπαρ, τα ερυθροκύτταρα, τον μυελό των οστών και τη σπλήνα. Θα μετρηθούν επίσης τα επίπεδα πορφυρίνης στα ούρα, το πλάσμα, τα ερυθροκύτταρα, τον μυελό των οστών, το ήπαρ και τη σπλήνα. (Greek)
4 August 2022
0 references
Porfýria je skupina zriedkavých chorôb spôsobených chybami v biosyntetickej dráhe hema. V závislosti od postihnutého enzýmu, a teda akumulovaného toxického medziproduktu, existujú rôzne typy porfýrie. Jedným z cieľov projektu je identifikácia a charakterizácia mutácií zodpovedných za rôzne typy porfýrie u pacientov. Odroda porfýrie bude typizovaná na základe klinických prejavov a biochemických stanovení (metabolity a enzýmy biosyntézy hemu). Tieto štúdie indikujú gén, ktorý sa má skúmať. Zapojený gén sa bude analyzovať pomocou PCR a sekvenovaním DNA periférnej krvi. V prípade identifikácie nových mutácií, ktorých patogenitu je potrebné preukázať, budú hodnotené na základe funkčných štúdií. Mutácie zmeny aminokyselín sa vyjadria v E. coli, aby sa odhadol ich vplyv na aktivitu enzýmov. V prípade mutácií, ktoré by mohli ovplyvniť spracovanie posla RNA, sa jeho účinok bude skúmať pomocou RT-PCR a sekvenovania. Patologická mutácia bude vyhľadaná od príbuzných, ktorí vyjadrujú svoj súhlas. Naše laboratórium vytvorilo myší knock-in model s čiastočnou deficienciou uroporfyrinogen dekarboxylázy (UROD), ktorá vyvíja uroporfýriu. V tomto modeli budeme skúmať, či existuje deficit na hematopoetickej úrovni, ktorý spolu s deficitom pečene prispieva k porfyrickému fenotypu. S týmto cieľom sa meria aktivita UROD v pečeni, erytrocytoch, kostnej dreni a slezine. Tiež sa budú merať hladiny porfyrínu v moči, plazme, erytrocytoch, kostnej dreni, pečeni a slezine. (Slovak)
4 August 2022
0 references
Porfyria on ryhmä harvinaisia sairauksia, jotka johtuvat hemon biosynteettisen reitin virheistä. Riippuen entsyymi vaikuttaa ja siten kertynyt myrkyllinen välituote, on olemassa erilaisia porfyria. Hankkeen yhtenä tavoitteena on tunnistaa ja luonnehtia potilaiden eri porfyriatyypeistä vastuussa olevia mutaatioita. Porfyrialajike luokitellaan kliinisten ilmenemismuotojen ja biokemiallisten määritysten (hemon biosynteesin metaboliitit ja entsyymit) perusteella. Nämä tutkimukset osoittavat tutkittavan geenin. Geeni analysoidaan PCR:llä ja sekvensoimalla perifeerisen veren DNA: sta. Jos havaitaan uusia mutaatioita, joiden patogeenisuus on osoitettava, ne arvioidaan toiminnallisilla tutkimuksilla. Aminohappomuutosmutaatiot ilmaistaan E. coli -valmisteessa, jotta voidaan arvioida niiden vaikutus entsyymiaktiivisuuteen. Jos mutaatiot voivat vaikuttaa messenger RNA: n käsittelyyn, sen vaikutusta tutkitaan RT-PCR: llä ja sekvensoinnilla. Patologinen mutaatio etsitään sukulaisilta, jotka ilmaisevat suostumuksensa. Laboratoriomme on luonut murine knock-in-mallin, jossa on osittainen puute uroporfyrinogeenidekarboksylaasissa (UROD), joka kehittää uroporfyriaa. Tässä mallissa tutkimme, onko hematopoieettisella tasolla alijäämää, joka vaikuttaa yhdessä maksan alijäämän kanssa porfyric fenotyyppiin. Tämän tavoitteen mukaisesti mitataan UROD:n aktiivisuus maksassa, punasoluissa, luuytimessä ja pernassa. Porfyriinipitoisuudet virtsassa, plasmassa, punasoluissa, luuytimessä, maksassa ja pernassa mitataan myös. (Finnish)
4 August 2022
0 references
Porfiria to grupa rzadkich chorób spowodowanych błędami w biosyntetycznej ścieżce hemo. W zależności od dotkniętego enzymu, a zatem nagromadzonego toksycznego półproduktu, istnieją różne rodzaje porfirii. Jednym z celów projektu jest identyfikacja i charakterystyka mutacji odpowiedzialnych za różne rodzaje porfirii u pacjentów. Odmiana porfirii będzie typowana w oparciu o objawy kliniczne i oznaczenia biochemiczne (metabolity i enzymy biosyntezy hemo). Badania te wskazują gen, który ma być badany. Ten gen będzie analizowany za pomocą PCR i sekwencjonowania z DNA krwi obwodowej. W przypadku identyfikacji nowych mutacji, których chorobotwórczość należy wykazać, zostaną one ocenione w drodze badań funkcjonalnych. Mutacje zmiany aminokwasów będą wyrażone w E. coli w celu oszacowania ich wpływu na aktywność enzymatyczną. W przypadku mutacji, które mogą mieć wpływ na przetwarzanie RNA posłańca, jego działanie będzie badane przez RT-PCR i sekwencjonowanie. Mutacja patologiczna będzie poszukiwana od krewnych, którzy wyrażają swoją zgodę. Nasze laboratorium stworzyło model pukania mory z częściowym niedoborem dekarboksylazy urporphyrinogenu (UROD), który rozwija uroporfirię. W tym modelu zbadamy, czy istnieje deficyt na poziomie hematopoetycznym, który przyczynia się wraz z deficytem wątroby do fenotypu porfirowego. W tym celu mierzy się aktywność UROD w wątrobie, erytrocytach, szpiku kostnym i śledzionie. Należy również zmierzyć stężenie porfiryny w moczu, osoczu, erytrocytach, szpiku kostnym, wątrobie i śledzionie. (Polish)
4 August 2022
0 references
A porfíria a hemo bioszintetikus útvonalának hibái által okozott ritka betegségek csoportja. Az érintett enzimtől és ezért a felhalmozódott toxikus intermediertől függően a porfiria különböző típusai vannak. A projekt egyik célja a különböző porfíriákért felelős mutációk azonosítása és jellemzése a betegekben. A porfiria fajtát klinikai megnyilvánulások és biokémiai meghatározások (a hemo bioszintézisének metabolitjai és enzimei) alapján tipizálják. Ezek a vizsgálatok jelzik a vizsgálandó gént. Az érintett gén analizálódik PCR és szekvenálás a perifériás vér DNS. Olyan új mutációk azonosítása esetén, amelyek patogenitását igazolni kell, azokat funkcionális vizsgálatokkal kell értékelni. Az aminosav-változás mutációit E. coli-ban fejezik ki, hogy megbecsüljék az enzimaktivitásra gyakorolt hatásukat. Olyan mutációk esetében, amelyek hatással lehetnek a messenger RNS feldolgozására, annak hatását RT-PCR és szekvenálás segítségével tanulmányozzák. A kóros mutációt olyan rokonoktól fogják kérni, akik kifejezik beleegyezésüket. Laboratóriumunk létrehozott egy murine knock-in modellt, amely részleges hiányt mutat az uroporphyrinogen dekarboxilázban (UROD), amely uroporphyria alakul ki. Ebben a modellben tanulmányozzuk, hogy van-e olyan hematopoetikus szintű hiány, amely a máj hiányával együtt hozzájárul a porfír fenotípushoz. Ezzel a céllal mérik az UROD aktivitását a májban, eritrocitákban, csontvelőben és lépben. A porfirin szintjét a vizeletben, a plazmában, az eritrocitákban, a csontvelőben, a májban és a lépben is meg kell mérni. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
Porfyrie jsou skupinou vzácných onemocnění způsobených chybami v biosyntetické cestě hemu. V závislosti na ovlivněném enzymu, a tedy nahromaděném toxickém meziproduktu, existují různé typy porfyrie. Jedním z cílů projektu je identifikace a charakterizace mutací zodpovědných za různé typy porfyrie u pacientů. Odrůda porfyrie bude typizována na základě klinických projevů a biochemických stanovení (metabolity a enzymy biosyntézy hemu). Tyto studie naznačí gen, který má být zkoumán. Zapojený gen bude analyzován pomocí PCR a sekvenování z periferní krve DNA. V případě identifikace nových mutací, jejichž patogenitu je třeba prokázat, budou hodnoceny funkčními studiemi. Mutace změny aminokyselin budou vyjádřeny v E. coli, aby bylo možné odhadnout jejich vliv na aktivitu enzymů. V případě mutací, které by mohly ovlivnit zpracování messenger RNA, bude jeho účinek zkoumán pomocí RT-PCR a sekvenování. Patologická mutace bude požadována od příbuzných, kteří vyjadřují svůj souhlas. Naše laboratoř vytvořila myší knock-in model s částečným nedostatkem uroporfyrinogen dekarboxylázy (UROD), která se vyvíjí uroporfyrie. V tomto modelu budeme zkoumat, zda existuje deficit na úrovni hematopoetiky, který spolu s jaterním deficitem přispívá k porfyrickému fenotypu. S tímto cílem bude měřena aktivita UROD v játrech, erytrocytech, kostní dřeni a slezině. Také budou měřeny hladiny porfyrinu v moči, plazmě, erytrocytech, kostní dřeni, játrech a slezině. (Czech)
4 August 2022
0 references
Porfīrija ir retu slimību grupa, ko izraisa kļūdas hemo biosintētiskajā ceļā. Atkarībā no ietekmētā fermenta un tādējādi uzkrātā toksiskā starpprodukta ir dažādi porfīrijas veidi. Viens no projekta mērķiem ir identificēt un raksturot mutācijas, kas ir atbildīgas par dažāda veida porfīriju pacientiem. Porfīrijas šķirne tiks raksturota, pamatojoties uz klīniskajām izpausmēm un bioķīmiskajām noteikšanām (metabolīti un hemo biosintēzes fermenti). Šie pētījumi norāda gēnu, kas jāpēta. Iesaistītais gēns tiks analizēts ar PCR un sekvencēšanu no perifēro asiņu DNS. Ja tiek konstatētas jaunas mutācijas, kuru patogenitāte ir jāpierāda, tās novērtēs ar funkcionāliem pētījumiem. Aminoskābju izmaiņu mutācijas tiks izteiktas E. coli, lai novērtētu to ietekmi uz fermentu aktivitāti. Mutāciju gadījumā, kas varētu ietekmēt kurjera RNS apstrādi, tās ietekmi pētīs ar RT-PCR un sekvencēšanu. Patoloģiskā mutācija tiks meklēta no radiniekiem, kuri izteiks savu piekrišanu. Mūsu laboratorija ir izveidojusi peļu knock-in modeli ar daļēju deficītu uroporphyrinogen decarboxylase (UROD), kas attīstās uroporphyria. Šajā modelī mēs pētīsim, vai asinsrades līmenī ir deficīts, kas kopā ar aknu deficītu veicina porfīra fenotipu. Lai sasniegtu šo mērķi, tiks noteikta UROD aktivitāte aknās, eritrocītos, kaulu smadzenēs un liesā. Tiks mērīts arī porfirīna līmenis urīnā, plazmā, eritrocītos, kaulu smadzenēs, aknās un liesā. (Latvian)
4 August 2022
0 references
Is grúpa galar neamhchoitianta iad Porphyria de bharr earráidí i gcosán bithshintéiseach an hemo. Ag brath ar an einsím lena mbaineann agus dá bhrí sin an t-idirmheánach tocsaineach carntha, tá cineálacha éagsúla porphyria ann. Cuspóir amháin den tionscadal is ea sócháin a aithint agus a thréithriú atá freagrach as na cineálacha éagsúla porphyria in othair. Déanfar an éagsúlacht porphyria a chlóscríobh bunaithe ar léirithe cliniciúla agus ar chinntí bithcheimiceacha (meitibilítí agus einsímí bithshintéise an hemo). Léireoidh na staidéir seo an géine atá le staidéar. Déanfaidh PCR anailís ar an ngéin a bheidh i gceist agus déanfar seicheamhú ó DNA fola forimeallach. I gcás sócháin nua a shainaithint ar gá a bpataigineacht a léiriú, déanfar meastóireacht orthu le staidéir fheidhmiúla. Cuirfear sócháin athraithe aimínaigéad in iúl in E. coli chun a dtionchar ar ghníomhaíocht einsíme a mheas. I gcás sóchán a d’fhéadfadh difear a dhéanamh do phróiseáil teachtaire RNA, déanfaidh RT-PCR staidéar ar a éifeacht agus seicheamhú. Lorgófar an sóchán paiteolaíoch ó ghaolta a chuireann a dtoiliú in iúl. Tá ár saotharlann a ghintear múnla cnag-sa murine le easnamh páirteach sa uroporphyrinogen decarboxylase (UROD), a fhorbraíonn uroporphyria. Sa tsamhail seo déanfaimid staidéar ar cibé an bhfuil easnamh ag an leibhéal hematopoietic a chuireann le chéile leis an easnamh ae leis an bhfeinitíopa porphyric. Leis an gcuspóir seo, déanfar gníomhaíocht UROD in ae, erythrocytes, smior cnámh agus spleen a thomhas. Déanfar leibhéil porphyrin i bhfual, plasma, erythrocytes, smior cnámh, ae, agus spleen a thomhas freisin. (Irish)
4 August 2022
0 references
Porfirija je skupina redkih bolezni, ki jih povzročajo napake v biosintetični poti hema. Odvisno od prizadetega encima in s tem akumuliranega toksičnega intermediata obstajajo različne vrste porfirije. Eden od ciljev projekta je identifikacija in karakterizacija mutacij, odgovornih za različne vrste porfirije pri bolnikih. Sorta porfirije bo značilna na podlagi kliničnih manifestacij in biokemičnih določitev (presnovkov in encimov biosinteze hema). Te študije bodo pokazale gen, ki ga je treba preučiti. Zadevni gen bo analiziran s PCR in sekvenciranjem od DNK periferne krvi. V primeru identifikacije novih mutacij, katerih patogenost je treba dokazati, se ocenijo s funkcionalnimi študijami. Mutacije sprememb aminokislin bodo izražene v E. coli, da se oceni njihov vpliv na encimsko aktivnost. V primeru mutacij, ki bi lahko vplivale na obdelavo selske RNK, bo njegov učinek preučen z RT-PCR in zaporedjem. Patološka mutacija se bo iskala pri sorodnikih, ki izrazijo svoje soglasje. Naš laboratorij je ustvaril mišji knock-in model z delnim pomanjkanjem uroporphyrinogen dekarboksilaze (UROD), ki razvija uroporphyria. V tem modelu bomo preučili, ali obstaja primanjkljaj na hematopoetski ravni, ki skupaj s primanjkljajem jeter prispeva k porfirskemu fenotipu. V ta namen bomo merili aktivnost UROD v jetrih, eritrocitih, kostnem mozgu in vranici. Izmerili bodo tudi ravni porfirina v urinu, plazmi, eritrocitih, kostnem mozgu, jetrih in vranici. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
Порфирията са група редки заболявания, причинени от грешки в биосинтетичния път на хемо. В зависимост от засегнатия ензим и следователно от натрупания токсичен междинен продукт, има различни видове порфирия. Една от целите на проекта е идентифицирането и характеризирането на мутациите, отговорни за различните видове порфирия при пациентите. Сортът порфирия ще бъде типифициран въз основа на клинични прояви и биохимични определяния (метаболити и ензими на биосинтезата на хемо). Тези проучвания ще показват гена, който трябва да бъде изследван. Участващият ген ще бъде анализиран чрез PCR и секвениране на ДНК от периферна кръв. В случай на идентифициране на нови мутации, чиято патогенност трябва да бъде доказана, те ще бъдат оценени чрез функционални изследвания. Мутациите за промяна на аминокиселините се изразяват в E. coli, за да се оцени тяхното въздействие върху ензимната активност. В случай на мутации, които биха могли да повлияят на обработката на РНК, ефектът от нея ще бъде проучен чрез RT-PCR и секвениране. Патологичната мутация ще бъде търсена от роднини, които изразяват съгласието си. Нашата лаборатория е създала модел на миши чук с частичен дефицит на уропорфириноген декарбоксилаза (UROD), който развива уропорфирия. В този модел ще проучим дали има дефицит на хематопоетично ниво, който заедно с чернодробния дефицит допринася за порфиричния фенотип. С тази цел се измерва активността на UROD в черния дроб, еритроцитите, костния мозък и далака. Нивата на порфирин в урината, плазмата, еритроцитите, костния мозък, черния дроб и далака също ще бъдат измерени. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
Il-porfirja huma grupp ta’ mard rari kkawżat minn żbalji fil-passaġġ bijosintetiku tal-emimo. Skont l-enzima affettwata u għalhekk is-sustanza intermedja tossika akkumulata, hemm tipi differenti ta’ porfirja. Għan wieħed tal-proġett huwa l-identifikazzjoni u l-karatterizzazzjoni ta’ mutazzjonijiet responsabbli għat-tipi differenti ta’ porfirja fil-pazjenti. Il-varjetà tal-porfirja se tiġi ttajifikata abbażi ta’ manifestazzjonijiet kliniċi u determinazzjonijiet bijokimiċi (metaboliti u enzimi tal-bijosintesi tal-emo). Dawn l-istudji se jindikaw il-ġene li għandu jiġi studjat. Il-ġene involut se jiġi analizzat permezz tal-PCR u s-sekwenzjar mid-DNA tad-demm periferali. Fil-każ li jiġu identifikati mutazzjonijiet ġodda li l-patoġeniċità tagħhom teħtieġ li tintwera, dawn se jiġu evalwati permezz ta’ studji funzjonali. Il-mutazzjonijiet tal-bidla fl-aċidu amminiku se jiġu espressi f’E. coli biex jiġi stmat l-impatt tagħhom fuq l-attività tal-enzimi. Fil-każ ta’ mutazzjonijiet li jistgħu jaffettwaw l-ipproċessar ta’ messenger RNA, l-effett tiegħu jiġi studjat permezz ta’ RT-PCR u sekwenzar. Il-mutazzjoni patoloġika se tintalab minn qraba li jesprimu l-kunsens tagħhom. Laboratorju tagħna ġġenerat mudell knock-in murine ma ‘defiċjenza parzjali fil-decarboxylase uroporphyrinogen (UROD), li jiżviluppa uroporphyria. F’dan il-mudell se nistudjaw jekk hemmx defiċit fil-livell ematopojetiku li jikkontribwixxi flimkien mad-defiċit tal-fwied għall-fenotip porfiriku. B’dan il-għan, l-attività tal-UROD fil-fwied, l-eritroċiti, il-mudullun u l-milsa se titkejjel. Il-livelli ta’ porphyrin fl-awrina, fil-plażma, fl-eritroċiti, fil-mudullun, fil-fwied u fil-milsa se jitkejlu wkoll. (Maltese)
4 August 2022
0 references
A porfiria é um grupo de doenças raras causadas por erros na via biossintética do hemo. Dependendo da enzima afetada e, portanto, do intermediário tóxico acumulado, existem diferentes tipos de porfiria. Um dos objetivos do projeto é a identificação e caracterização de mutações responsáveis pelos diferentes tipos de porfiria em pacientes. A variedade de porfiria será tipificada com base em manifestações clínicas e determinações bioquímicas (metabolitos e enzimas da biossíntese do hemo). Esses estudos indicarão o gene a ser estudado. O gene envolvido será analisado por PCR e sequenciamento do DNA do sangue periférico. No caso de identificação de novas mutações cuja patogenicidade precisa ser demonstrada, elas serão avaliadas por estudos funcionais. As mutações da alteração do aminoácido serão expressas em E. coli para estimar o seu impacto na atividade enzimática. No caso de mutações que possam afetar o processamento do RNA estafeta, seu efeito será estudado por RT-PCR e sequenciamento. A mutação patológica será procurada por familiares que expressam seu consentimento. Nosso laboratório gerou um modelo murino knock-in com uma deficiência parcial na uroporfirinogênio descarboxilase (UROD), que desenvolve uroporfiria. Neste modelo, estudaremos se há um déficit no nível hematopoiético que contribui com o déficit hepático para o fenótipo porfírico. Com este objetivo, medir-se-á a atividade das UROD no fígado, nos eritrócitos, na medula óssea e no baço. Os níveis de porfirina na urina, plasma, eritrócitos, medula óssea, fígado e baço também serão medidos. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
Porfyri er en gruppe af sjældne sygdomme forårsaget af fejl i den biosyntetiske sti af hæmo. Afhængigt af det berørte enzym og dermed det akkumulerede toksiske mellemprodukt er der forskellige typer porfyri. Et af projektets formål er at identificere og karakterisere mutationer, der er ansvarlige for de forskellige typer porfyri hos patienter. Porfyrisorten vil blive karakteriseret ved kliniske manifestationer og biokemiske bestemmelser (metabolitter og enzymer af hemoens biosyntese). Disse undersøgelser vil angive det gen, der skal undersøges. Det involverede gen analyseres ved PCR og sekventering fra perifert blod-DNA. I tilfælde af identifikation af nye mutationer, hvis patogenicitet skal påvises, vil de blive evalueret ved hjælp af funktionelle undersøgelser. Aminosyreændringsmutationer vil blive udtrykt i E. coli for at vurdere deres indvirkning på enzymaktiviteten. I tilfælde af mutationer, der kan påvirke behandlingen af messenger RNA, vil dens virkning blive undersøgt ved RT-PCR og sekventering. Den patologiske mutation vil blive søgt fra slægtninge, der udtrykker deres samtykke. Vores laboratorium har genereret en murine knock-in model med en delvis mangel i uroporphyrinogen decarboxylase (UROD), som udvikler uroporphyria. I denne model vil vi undersøge, om der er et underskud på det hæmatopoietiske niveau, der bidrager sammen med leverunderskuddet til den porfyriske fænotype. Med dette formål måles UROD's aktivitet i lever, erythrocytter, knoglemarv og milt. Porphyrinniveauer i urin, plasma, erythrocytter, knoglemarv, lever og milt vil også blive målt. (Danish)
4 August 2022
0 references
Porfiria este un grup de boli rare cauzate de erori în calea biosintetică a hemoragiei. În funcție de enzima afectată și, prin urmare, de intermediarul toxic acumulat, există diferite tipuri de porfirie. Un obiectiv al proiectului este identificarea și caracterizarea mutațiilor responsabile pentru diferitele tipuri de porfirie la pacienți. Soiul porfiriei va fi tipizat pe baza manifestărilor clinice și a determinărilor biochimice (metaboliți și enzime ale biosintezei hemoragice). Aceste studii vor indica gena care trebuie studiată. Gena implicată va fi analizată prin PCR și secvențiere din ADN-ul sângelui periferic. În cazul identificării de noi mutații a căror patogenitate trebuie demonstrată, acestea vor fi evaluate prin studii funcționale. Mutațiile de modificare a aminoacizilor vor fi exprimate în E. coli pentru a estima impactul acestora asupra activității enzimatice. În cazul mutațiilor care ar putea afecta procesarea ARN mesager, efectul acestuia va fi studiat prin RT-PCR și secvențiere. Mutația patologică va fi căutată de la rudele care își exprimă consimțământul. Laboratorul nostru a generat un model de knock-in murine cu o deficiență parțială în uroporphyrinogen decarboxilază (UROD), care dezvoltă uroporfirie. În acest model vom studia dacă există un deficit la nivel hematopoietic care contribuie împreună cu deficitul hepatic la fenotipul porfiric. Cu acest obiectiv, se va măsura activitatea UROD în ficat, eritrocite, măduvă osoasă și splină. De asemenea, vor fi măsurate nivelurile de porfirină în urină, plasmă, eritrocite, măduvă osoasă, ficat și splină. (Romanian)
4 August 2022
0 references
Porfyri är en grupp sällsynta sjukdomar som orsakas av fel i den biosyntetiska vägen av hemo. Beroende på vilket enzym som påverkas och därmed den ackumulerade giftiga intermediären, finns det olika typer av porfyri. Ett av projektets mål är identifiering och karakterisering av mutationer som är ansvariga för de olika typerna av porfyri hos patienter. Porfyri sorten kommer att typiseras baserat på kliniska manifestationer och biokemiska bestämningar (metaboliter och enzymer av biosyntesen av hemo). Dessa studier kommer att indikera den gen som ska studeras. Genen som är involverad analyseras med PCR och sekvensering från perifert blod-DNA. Vid identifiering av nya mutationer vars patogenitet måste påvisas kommer de att utvärderas genom funktionella studier. Aminosyraförändringsmutationer kommer att uttryckas i E. coli för att uppskatta deras inverkan på enzymaktiviteten. I fallet med mutationer som kan påverka behandlingen av messenger RNA, dess effekt kommer att studeras genom RT-PCR och sekvensering. Den patologiska mutationen kommer att sökas från släktingar som uttrycker sitt samtycke. Vårt laboratorium har genererat en murin knock-in modell med en partiell brist på uroporphyrinogen dekarboxylas (UROD), som utvecklar uroporfyri. I denna modell kommer vi att undersöka om det finns ett underskott på hematopoetisk nivå som tillsammans med leverunderskottet bidrar till den porfyriska fenotypen. Med detta mål kommer aktiviteten av UROD i lever, erytrocyter, benmärg och mjälte att mätas. Porfyrinnivåer i urin, plasma, erytrocyter, benmärg, lever och mjälte kommer också att mätas. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Madrid
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI15_01404
0 references