NEW BACTERIAL BIOMARKERS, FUNCTIONAL ACTIVITIES, DYNAMIC CHANGES AND BACTERIAL INTERACTIONS IN CHRONIC PERIODONTAL DISEASE (Q3142049)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3142049 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | NEW BACTERIAL BIOMARKERS, FUNCTIONAL ACTIVITIES, DYNAMIC CHANGES AND BACTERIAL INTERACTIONS IN CHRONIC PERIODONTAL DISEASE |
Project Q3142049 in Spain |
Statements
31,036.5 Euro
0 references
57,000.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2018
0 references
31 March 2021
0 references
FUNDACION INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA DE SANTIAGO DE COMPOSTELA
0 references
El presente proyecto se adecua en la Línea de la AES titulada Tecnologías moleculares y celulares de aplicación a la salud humana: Investigación biológica integrativa y de sistemas . Se plantea los siguientes objetivos: Analizar y comparar los procesos biológicos y mecanismos funcionales (clases funcionales y módulos/rutas metabólicas) y la composición de los microbiomas orales asociados a la salud y a la periodontitis crónica. Analizar y comparar las variaciones genéticas específicas y los factores de virulencia de los principales patobiontes y simbiontes en los microbiomas orales en la salud y la periodontitis crónica. Analizar y comparar los cambios dinámicos funcionales/composicionales de los microbiomas orales en la periodontitis, antes y después de la práctica de un tratamiento periodontal básico no-quirúrgico. Determinar la existencia de subcomunidades bacterianas asociadas a la salud oral y a la periodontitis crónica no tratada y tratada. Determinar consorcios bacterianos formados por taxones que interactúan y que representan unidades centrales de la comunidad bacteriana global. Explorar in silico la funcionalidad y estabilidad metabólica de especies específicas y de pequeños consorcios bacterianos en distintas condiciones clínicas. Se establecen 4 fases metodológicas:obtención de muestras subgingivales en controles y pacientes periodontales antes y después de un tratamiento básico; preparación de las muestras para la ultrasecuenciación masiva del ADN y ARN bacteriano (metagenómica directa y metatranscriptómica); análisis bioinformático/bioestadístico (incluyendo la modelización metabólica) e interpretación biológica/clínica de los datos obtenidos. (Spanish)
0 references
This project is adapted to the ESA Line entitled Molecular and Cell Technologies for Application to Human Health: Integrative and systems biological research. The objectives are as follows: Analyse and compare biological processes and functional mechanisms (functional classes and metabolic modules/routes) and the composition of oral microbiomes associated with health and chronic periodontitis. Analyse and compare the specific genetic variations and virulence factors of the main pathobionts and symbionts in oral microbiomes in health and chronic periodontitis. Analyse and compare the functional/compositional dynamic changes of oral microbiomes in periodontitis, before and after the practice of a basic non-surgical periodontal treatment. Determine the existence of bacterial subcommunities associated with oral health and untreated and treated chronic periodontitis. Determine bacterial consortia formed by interacting taxa that represent central units of the global bacterial community. Explore in silico the functionality and metabolic stability of specific species and small bacterial consortia in different clinical conditions. 4 phases are established: subgingival samples in controls and periodontal patients before and after basic treatment; preparation of samples for massive ultrasequencing of bacterial DNA and RNA (direct metagenomics and metatranscriptomics); bioinformatics/biostatistical analysis (including metabolic modelling) and biological/clinical interpretation of the data obtained. (English)
12 October 2021
0.5907551552259405
0 references
Ce projet est adapté à la ligne de l’ESA intitulée Molecular and Cell Technologies for Application to Human Health: Recherche intégrative et biologique des systèmes. Les objectifs sont les suivants: Analyser et comparer les processus biologiques et les mécanismes fonctionnels (classes fonctionnelles et modules/voies métaboliques) et la composition des microbiomes oraux associés à la santé et à la parodontite chronique. Analyser et comparer les variations génétiques spécifiques et les facteurs de virulence des principaux pathobionts et symbiontes dans les microbiomes oraux dans la santé et la parodontite chronique. Analyser et comparer les changements dynamiques fonctionnels/compositionnels des microbiomes oraux dans la parodontite, avant et après la pratique d’un traitement parodontal non chirurgical de base. Déterminer l’existence de sous-communautés bactériennes associées à la santé buccodentaire et à la parodontite chronique non traitée et traitée. Déterminer les consortiums bactériens formés par des taxons interagissant qui représentent les unités centrales de la communauté bactérienne mondiale. Explorez in silico la fonctionnalité et la stabilité métabolique d’espèces spécifiques et de petits consortiums bactériens dans différentes conditions cliniques. 4 phases sont établies: des échantillons subgingivals chez les témoins et les patients parodontaux avant et après le traitement de base; préparation d’échantillons pour l’ultraséquençage massif de l’ADN bactérien et de l’ARN (météonomie directe et métatranscriptomiques); analyse bioinformatique/biostatistique (y compris la modélisation métabolique) et interprétation biologique/clinique des données obtenues. (French)
2 December 2021
0 references
Dieses Projekt ist an die ESA-Linie mit dem Titel Molecular and Cell Technologies for Application to Human Health angepasst: Integrative und systembiologische Forschung. Die Ziele sind wie folgt: Analyse und Vergleich biologischer Prozesse und funktionaler Mechanismen (Funktionsklassen und Stoffwechselmodule/Route) und der Zusammensetzung oraler Mikrobiome im Zusammenhang mit Gesundheit und chronischer Parodontitis. Analysieren und vergleichen Sie die spezifischen genetischen Variationen und Virulenzfaktoren der wichtigsten Pathobionten und Symbionten in oralen Mikrobiomen in Gesundheit und chronischer Parodontitis. Analysieren und vergleichen Sie die funktionellen/kompositionalen dynamischen Veränderungen oraler Mikrobiome bei Parodontitis vor und nach der Praxis einer nicht-chirurgischen Parodontaltherapie. Bestimmen Sie das Vorhandensein bakterieller Untergemeinschaften im Zusammenhang mit der oralen Gesundheit und unbehandelter und behandelter chronischer Parodontitis. Bestimmen Sie Bakterienkonsortien, die durch die Interaktion von Taxa gebildet werden, die zentrale Einheiten der globalen Bakteriengemeinschaft darstellen. Untersuchen Sie in silico die Funktionalität und metabolische Stabilität bestimmter Arten und kleiner bakterieller Konsortien unter verschiedenen klinischen Bedingungen. 4 Phasen sind festgelegt: Subgingival-Proben bei Kontrollen und Parodontalpatienten vor und nach der Grundbehandlung; Vorbereitung von Proben zur massiven Ultrasequenzierung bakterieller DNA und RNA (direkte Metagenomics und Metatranscriptomics); Bioinformatik/biostatistische Analyse (einschließlich metabolischer Modellierung) und biologische/klinische Interpretation der gewonnenen Daten. (German)
9 December 2021
0 references
Dit project is aangepast aan de ESA Line getiteld Molecular and Cell Technologies for Application to Human Health: Integratief en systeembiologisch onderzoek. De doelstellingen zijn als volgt: Analyseer en vergelijk biologische processen en functionele mechanismen (functionele klassen en metabole modules/routes) en de samenstelling van orale microbiomen geassocieerd met gezondheid en chronische parodontitis. Analyseer en vergelijk de specifieke genetische variaties en virulentiefactoren van de belangrijkste pathobionten en symbionten in orale microbiomen in gezondheid en chronische parodontitis. Analyseer en vergelijk de functionele/compositionele dynamische veranderingen van orale microbiomen in parodontitis, voor en na de beoefening van een niet-chirurgische basisbehandeling. Bepaal het bestaan van bacteriële subcommuniteiten geassocieerd met mondgezondheid en onbehandelde en behandelde chronische periodontitis. Bepaal bacteriële consortia gevormd door interactie taxa die centrale eenheden van de wereldwijde bacteriële gemeenschap vertegenwoordigen. Ontdek in silico de functionaliteit en metabole stabiliteit van specifieke soorten en kleine bacteriële consortia in verschillende klinische omstandigheden. Er worden 4 fasen vastgesteld: subgingivalmonsters bij controlepersonen en periodontale patiënten voor en na de basisbehandeling; voorbereiding van monsters voor massale ultrasequencing van bacteriële DNA en RNA (directe metagenomica en metatranscriptomics); bio-informatica/biostatistische analyse (met inbegrip van metabolische modellering) en biologische/klinische interpretatie van de verkregen gegevens. (Dutch)
17 December 2021
0 references
Questo progetto è adattato alla linea ESA intitolata Tecnologie molecolari e cellulari per l'applicazione alla salute umana: Ricerca biologica integrativa e sistemica. Gli obiettivi sono i seguenti: Analizzare e confrontare i processi biologici e i meccanismi funzionali (classi funzionali e moduli/rote metaboliche) e la composizione dei microbiomi orali associati alla salute e alla parodontite cronica. Analizzare e confrontare le variazioni genetiche specifiche e i fattori di virulenza dei principali patobionti e simbionti nei microbiomi orali nella salute e nella parodontite cronica. Analizzare e confrontare i cambiamenti dinamici funzionali/composizionali dei microbiomi orali nella parodontite, prima e dopo la pratica di un trattamento parodontale di base non chirurgico. Determinare l'esistenza di sottocomunità batteriche associate alla salute orale e parodontite cronica non trattata e trattata. Determinare i consorzi batterici formati dall'interazione dei taxa che rappresentano le unità centrali della comunità batterica globale. Esplora in silico la funzionalità e la stabilità metabolica di specie specifiche e piccoli consorzi batterici in diverse condizioni cliniche. Sono stabilite 4 fasi: campioni subgingival in controlli e pazienti parodontali prima e dopo il trattamento di base; preparazione di campioni per ultrasequenziamento massiccio di DNA batterico e RNA (metagenomica diretta e metatranscriptomica); analisi bioinformatica/biostatistica (compresa la modellizzazione metabolica) e interpretazione biologica/clinica dei dati ottenuti. (Italian)
16 January 2022
0 references
Το έργο αυτό προσαρμόζεται στη γραμμή ESA με τίτλο Μοριακές και κυτταρικές τεχνολογίες για εφαρμογή στην ανθρώπινη υγεία: Ολοκληρωμένη και βιολογική έρευνα συστημάτων. Οι στόχοι είναι οι εξής: Αναλύει και συγκρίνει βιολογικές διεργασίες και λειτουργικούς μηχανισμούς (λειτουργικές κατηγορίες και μεταβολικές ενότητες/ροές) και τη σύνθεση των από του στόματος μικροβιωμάτων που σχετίζονται με την υγεία και τη χρόνια περιοδοντίτιδα. Αναλύστε και συγκρίνετε τις συγκεκριμένες γενετικές παραλλαγές και τους παράγοντες λοιμοτοξικότητας των κύριων παθοβιοντών και συμβιωμάτων στα από του στόματος μικροβιώματα στην υγεία και τη χρόνια περιοδοντίτιδα. Αναλύστε και συγκρίνετε τις λειτουργικές/σύνθετες δυναμικές αλλαγές των από του στόματος μικροβιωμάτων στην περιοδοντίτιδα, πριν και μετά την πρακτική μιας βασικής μη χειρουργικής περιοδοντικής θεραπείας. Προσδιορισμός της ύπαρξης βακτηριακών υποκοινοτήτων που σχετίζονται με στοματική υγεία και χωρίς θεραπεία και θεραπεία χρόνιας περιοδοντίτιδας. Προσδιορίστε τις βακτηριακές κοινοπραξίες που σχηματίζονται από αλληλεπιδρώντας ταξινομικές ομάδες που αντιπροσωπεύουν κεντρικές μονάδες της παγκόσμιας βακτηριακής κοινότητας. Εξερευνήστε στο πυρίτιο τη λειτουργικότητα και τη μεταβολική σταθερότητα συγκεκριμένων ειδών και μικρών βακτηριακών κοινοπραξιών σε διαφορετικές κλινικές συνθήκες. Καθορίζονται 4 φάσεις: υπογνήσια δείγματα σε μάρτυρες και περιοδοντικούς ασθενείς πριν και μετά τη βασική θεραπεία· προετοιμασία δειγμάτων για τη μαζική υπερακοντίωση του βακτηριακού DNA και του RNA (άμεση μεταγεωμική και μετατρανογραφική). βιοπληροφορική/βιοστατιστική ανάλυση (συμπεριλαμβανομένης της μεταβολικής μοντελοποίησης) και βιολογική/κλινική ερμηνεία των δεδομένων που λαμβάνονται. (Greek)
17 August 2022
0 references
Dette projekt er tilpasset ESA Line med titlen Molekylær og Cell Technologies for Application to Human Health: Integrativ og systembiologisk forskning. Målene er følgende: Analysere og sammenligne biologiske processer og funktionelle mekanismer (funktionelle klasser og metaboliske moduler/ruter) og sammensætningen af orale mikrobiomer forbundet med sundhed og kronisk parodontitis. Analysere og sammenligne de specifikke genetiske variationer og virulensfaktorer for de vigtigste patobionter og symbionter i orale mikrobiomer i sundhed og kronisk parodontitis. Analysere og sammenligne de funktionelle/sammensætningelle dynamiske ændringer af orale mikrobiomer i parodontitis, før og efter praksis med en grundlæggende ikke-kirurgisk periodontal behandling. Bestemme forekomsten af bakterielle subsamfund forbundet med oral sundhed og ubehandlet og behandlet kronisk parodontitis. Bestem bakteriekonsortier dannet ved at interagere taxaer, der repræsenterer centrale enheder i det globale bakteriesamfund. Udforsk i silico funktionaliteten og metabolisk stabilitet af specifikke arter og små bakteriekonsortier under forskellige kliniske forhold. Der er fastlagt 4 faser: subgingival prøver i kontroller og periodontale patienter før og efter grundlæggende behandling forberedelse af prøver til massiv ultrasekventering af bakteriel DNA og RNA (direkte metagenomik og metatranskriptomics) bioinformatik/biostatistisk analyse (herunder metabolisk modellering) og biologisk/klinisk fortolkning af de opnåede data. (Danish)
17 August 2022
0 references
Tämä hanke on mukautettu ESA-linjaan nimeltä Molecular and Cell Technologies for Application to Human Health: Integroiva ja systeemien biologinen tutkimus. Tavoitteet ovat seuraavat: Analysoida ja vertailla biologisia prosesseja ja toiminnallisia mekanismeja (toiminnalliset luokat ja metaboliset moduulit/reitit) sekä terveyteen ja kroontiittiin liittyvien oraalisten mikrobien koostumusta. Analysoida ja vertailla suun kautta otettavien mikrobien pääpatobionttien ja symbionttien geneettisiä variaatioita ja virulenssitekijöitä terveyden ja kroontiitin hoidossa. Analysoida ja vertailla oraalisten mikrobien toiminnallisia/koostumusdynaamisia muutoksia parodontiitin yhteydessä ennen peruskäsittelyä, joka ei-kirurginen parodontiitti, ja sen jälkeen. Määritetään suun terveyteen liittyvien bakteerien alayhteisöt sekä hoitamaton ja hoidettu kroontiitti. Määritetään bakteeriyhteenliittymät, jotka muodostuvat vuorovaikutuksessa olevien taksojen avulla, jotka edustavat maailmanlaajuisen bakteeriyhteisön keskusyksiköitä. Tutkitaan silikossa tiettyjen lajien ja pienten bakteerikonsortioiden toiminnallisuutta ja metabolista stabiiliutta erilaisissa kliinisissä olosuhteissa. Neljä vaihetta vahvistetaan: subgingival-näytteet kontrolli- ja periodontaalipotilaista ennen perushoitoa ja sen jälkeen; näytteiden valmistelu bakteeri-DNA:n ja RNA:n massiiviseen ultrasekvensointiin (suora metagenomiikka ja metatranscriptomiikka); bioinformatiikka/biostatistiset analyysit (mukaan lukien metabolinen mallintaminen) ja saatujen tietojen biologinen/kliininen tulkinta. (Finnish)
17 August 2022
0 references
Dan il-proġett huwa adattat għal-Linja ESA intitolata Teknoloġiji Molekulari u Ċelluli għall-Applikazzjoni għas-Saħħa tal-Bniedem: Riċerka integrattiva u bijoloġika tas-sistemi. L-għanijiet huma kif ġej: Janalizza u jqabbel proċessi bijoloġiċi u mekkaniżmi funzjonali (klassijiet funzjonali u moduli/rotot metaboliċi) u l-kompożizzjoni ta’ mikrobijomi orali assoċjati mas-saħħa u l-perjodontite kronika. Janalizza u jqabbel il-varjazzjonijiet ġenetiċi speċifiċi u l-fatturi ta’ virulenza tal-patobjonanti u s-simbijonti ewlenin fil-mikrobijomi orali fis-saħħa u l-perjodontite kronika. Analizza u qabbel il-bidliet dinamiċi funzjonali/kompożizzjonali ta’ mikrobijomi orali fil- periodontitis, qabel u wara l-prattika ta’ trattament periodontali mhux kirurġiku bażiku. Iddetermina l-eżistenza ta’ sottokomunitajiet batteriċi assoċjati mas-saħħa orali u perjodontite kronika mhux ikkurata u ttrattata. Iddetermina l-konsorzji batteriċi ffurmati mill-interazzjoni tassonomiċi li jirrappreżentaw unitajiet ċentrali tal-komunità batterjali globali. Tesplora in silico l-funzjonalità u l-istabbiltà metabolika ta ‘speċi speċifiċi u konsorzji batterjali żgħar f’kundizzjonijiet kliniċi differenti. 4 fażijiet huma stabbiliti: kampjuni ta’ subgingival fil-kontrolli u pazjenti periodontali qabel u wara t-trattament bażiku; il-preparazzjoni ta’ kampjuni għall-ultrasekwenzar massiv ta’ DNA u RNA tal-batterji (metaġenomiċi u metatranscriptomics diretti); analiżi bijoinformatika/bijostatistika (inkluż l-immudellar metaboliku) u l-interpretazzjoni bijoloġika/klinika tad-dejta miksuba. (Maltese)
17 August 2022
0 references
Šis projekts ir pielāgots EKA līnijai "Molekulārās un šūnu tehnoloģijas izmantošanai cilvēku veselībā: Integrēti un sistēmu bioloģiskie pētījumi. Mērķi ir šādi: Analizēt un salīdzināt bioloģiskos procesus un funkcionālos mehānismus (funkcionālās klases un vielmaiņas moduļus/maršrutus) un ar veselību un hronisko periodontītu saistīto perorālo mikrobiomu sastāvu. Analizēt un salīdzināt specifiskās ģenētiskās variācijas un virulences faktorus galvenajiem patobiontiem un simbiontiem mutes dobuma mikrobiomos veselībā un hroniskā periodontīta gadījumā. Analizēt un salīdzināt perorālo mikrobiomu funkcionālās/kompozīcijas dinamiskās izmaiņas periodontīta gadījumā pirms un pēc periodonta pamata neķirurģiskās ārstēšanas prakses. Noteikt baktēriju apakškopienu esamību, kas saistīti ar mutes dobuma veselību un neārstētu un ārstētu hronisku periodontītu. Noteikt baktēriju konsorcijus, kas veidojas, mijiedarbojoties taksoniem, kas pārstāv globālās baktēriju kopienas centrālās vienības. Silīcijā izpētīt konkrētu sugu un mazu baktēriju konsorciju funkcionalitāti un vielmaiņas stabilitāti dažādos klīniskos apstākļos. Ir noteikti 4 posmi: subgingival paraugi kontroles un periodonta pacientiem pirms un pēc pamatterapijas; paraugu sagatavošana baktēriju DNS un RNS (tiešā metagenomika un metatranscriptomika) masveida ultrasekvencēšanai; bioinformātikas/biostatistiskās analīzes (ieskaitot metabolisko modelēšanu) un iegūto datu bioloģiskā/klīniskā interpretācija. (Latvian)
17 August 2022
0 references
Tento projekt je prispôsobený linke ESA s názvom Molekulárne a bunkové technológie pre aplikáciu na ľudské zdravie: Integračný a systémový biologický výskum. Ciele sú tieto: Analyzovať a porovnávať biologické procesy a funkčné mechanizmy (funkčné triedy a metabolické moduly/cesty) a zloženie orálnych mikrobiómov spojených so zdravím a chronickou periodontitídou. Analyzujte a porovnajte špecifické genetické variácie a virulenčné faktory hlavných patobiontov a symbiontov v perorálnych mikrobiómoch v zdravotnom stave a chronickej periodontitíde. Analyzovať a porovnávať funkčné/kompozitné dynamické zmeny perorálnych mikrobiomov pri periodontitíde, pred a po vykonaní základnej neochirurgickej periodontálnej liečby. Určiť existenciu bakteriálnych subkomunít spojených so zdravím ústnej dutiny a neliečenou a liečenou chronickou periodontitídou. Určiť bakteriálne konzorciá vytvorené interakciou taxónov, ktoré predstavujú centrálne jednotky globálnej bakteriálnej komunity. Preskúmajte v silico funkčnosť a metabolickú stabilitu špecifických druhov a malých bakteriálnych konzorcií v rôznych klinických podmienkach. Zavádzajú sa 4 fázy: subgingivalové vzorky u kontrolných a periodontálnych pacientov pred a po základnej liečbe; príprava vzoriek na masívne ultrasekvenovanie bakteriálnej DNA a RNA (priama metagenomika a metatranscriptomika); bioinformatika/biostatická analýza (vrátane metabolického modelovania) a biologická/klinická interpretácia získaných údajov. (Slovak)
17 August 2022
0 references
Tá an tionscadal seo in oiriúint do Líne ESA dar teideal Molecular and Cell Technologies for application to Human Health: Taighde comhtháiteach agus bitheolaíoch córas. Is iad seo a leanas na cuspóirí: Próisis bhitheolaíocha agus meicníochtaí feidhmiúla (aicmí feidhmiúla agus modúil/bealaí meitibileacha) agus comhdhéanamh micribhithóm ó bhéal a bhaineann le sláinte agus le tréimhseintíteas ainsealach a anailísiú agus a chur i gcomparáid. Anailís a dhéanamh ar éagsúlachtaí géiniteacha sonracha agus ar fhachtóirí nimhneachta na bpríomh-phatobionts agus na symbionts i micreabhithéam ó bhéal i sláinte agus periodontitis ainsealach agus iad a chur i gcomparáid. Anailís a dhéanamh ar athruithe dinimiciúla feidhmiúla/comhdhéanamhacha ar mhicreabhithóim béil i dtréimhseontitis agus iad a chur i gcomparáid, roimh an gcleachtas de chóireáil bhunúsach neamhmháinliachta neamh-mháinliachta agus ina dhiaidh. A chinneadh go bhfuil fophobail bhaictéaracha ann a bhaineann le sláinte béil agus periodontitis ainsealach neamhchóireáilte agus cóireáilte. Cuibhreannais baictéaracha déanta ag tacsóin idirghníomhú a léiríonn aonaid lárnacha den phobal baictéarach domhanda a chinneadh. Feidhmiúlacht agus cobhsaíocht mheitibileach speiceas ar leith agus cuibhreannais bheaga baictéaracha i ndálaí cliniciúla éagsúla a iniúchadh in silico. Bunaítear 4 chéim: samplaí subgingival i rialuithe agus othair periodontal roimh agus tar éis cóireáil bhunúsach; samplaí a ullmhú le haghaidh ultrasheicheamhú ollmhór DNA agus RNA baictéarach (meitigéanómaíocht dhíreach agus meitat-tras-scríbhinn); bithfhaisnéisíocht/anailís bhithstaidrimh (lena n-áirítear samhaltú meitibileach) agus léirmhíniú bitheolaíoch/cliniciúil ar na sonraí a fhaightear. (Irish)
17 August 2022
0 references
Tento projekt je přizpůsoben linii ESA s názvem Molekulární a buněčné technologie pro aplikaci v oblasti lidského zdraví: Integrační a systémový biologický výzkum. Cíle jsou následující: Analyzovat a porovnávat biologické procesy a funkční mechanismy (funkční třídy a metabolické moduly/trasy) a složení orálních mikrobiomů spojených se zdravím a chronickou parodontitidou. Analyzovat a porovnat specifické genetické variace a virulence faktory hlavních patobiontů a symbiontů u orálních mikrobiomů u zdraví a chronické parodontitidy. Analyzovat a porovnat funkční/kompoziční dynamické změny orálních mikrobiomů v parodontitidě před a po praxi základní nechirurgické periodontální léčby. Určete existenci bakteriálních subkomunit spojených se zdravím ústní dutiny a neléčených a léčených chronických parodontitidy. Určete bakteriální konsorcii vytvořené interakcí taxonů, které představují centrální jednotky globální bakteriální komunity. Prozkoumejte in silico funkčnost a metabolickou stabilitu specifických druhů a malých bakteriálních konsorcií v různých klinických podmínkách. Jsou stanoveny 4 fáze: subgingivální vzorky u kontrolních a periodontálních pacientů před základní léčbou a po ní; příprava vzorků pro masivní ultrasekvencování bakteriální DNA a RNA (přímá metagenomika a metatranscriptomika); bioinformatika/biostatistická analýza (včetně metabolického modelování) a biologická/klinická interpretace získaných údajů. (Czech)
17 August 2022
0 references
Este projecto está adaptado à Linha da ESA intitulada Tecnologias Moleculares e Celulares para Aplicação à Saúde Humana: Investigação biológica integrativa e de sistemas. Os objectivos são os seguintes: Analisar e comparar processos biológicos e mecanismos funcionais (classes funcionais e módulos/vias metabólicas) e a composição dos microbiomas orais associados à saúde e à periodontite crónica. Analisar e comparar as variações genéticas específicas e os fatores de virulência dos principais patobiontes e simbiontes nos microbiomas orais na saúde e na periodontite crónica. Analisar e comparar as alterações dinâmicas funcionais/composicionais dos microbiomas orais na periodontite, antes e depois da prática de um tratamento periodontal não cirúrgico básico. Determinar a existência de subcomunidades bacterianas associadas à saúde oral e periodontite crónica não tratada e tratada. Determinar consórcios bacterianos formados por táxons em interação que representam unidades centrais da comunidade bacteriana global. Explorar in silico a funcionalidade e a estabilidade metabólica de espécies específicas e pequenos consórcios bacterianos em diferentes condições clínicas. São estabelecidas quatro fases: amostras subgengivais nos controlos e nos doentes periodontais antes e depois do tratamento básico; preparação de amostras para ultrassequenciação maciça de ADN e ARN bacterianos (metagenómica direta e metatranscritómica); análise bioinformática/bioestatística (incluindo modelização metabólica) e interpretação biológica/clínica dos dados obtidos. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
See projekt on kohandatud ESA rida pealkirjaga "Molekulaar- ja rakutehnoloogiad kasutamiseks inimeste tervisele: Integreeritud ja süsteemide bioloogilised uuringud. Eesmärgid on järgmised: Bioloogiliste protsesside ja funktsionaalsete mehhanismide (funktsionaalsed klassid ja metaboolsed moodulid/marsruudid) ning tervise ja kroonilise periodontiidiga seotud suukaudsete mikrobioomide koostise analüüsimine ja võrdlemine. Analüüsida ja võrrelda spetsiifilisi geneetilisi variatsioone ja virulentsuse tegureid peamiste patobiontide ja sümbionntide puhul tervise mikrobioomides ja kroonilises periodontiidis. Enne ja pärast ravi mittekirurgilise parodontaalse raviga analüüsida ja võrrelda suukaudsete mikrobioomide funktsionaalseid/kompositsioonilisi dünaamilisi muutusi periodontiidi korral. Määrata kindlaks, kas esineb bakteriaalseid alakooslusi, mis on seotud suuõõne tervisega ning ravimata ja ravimata kroonilise parodontiidiga. Määrata kindlaks bakterite konsortsiumid, mis on moodustatud interaktiivsetest taksonitest, mis esindavad ülemaailmse bakterikogukonna kesküksusi. Uurige in silico funktsionaalsust ja ainevahetuse stabiilsust konkreetsete liikide ja väikeste bakterite konsortsiumide erinevates kliinilistes tingimustes. Kehtestatud on neli etappi: subgingivaliproovid kontrollrühmas ja parodontaalpatsientidel enne ja pärast põhiravi; proovide ettevalmistamine bakteriaalse DNA ja RNA (otsene metagenoomika ja metatraskriptoomika) massiivseks ultrahelitöötluseks; bioinformaatika/biostatistiline analüüs (sealhulgas metaboolne modelleerimine) ja saadud andmete bioloogiline/kliiniline tõlgendamine. (Estonian)
17 August 2022
0 references
Ez a projekt az ESA " Molekuláris és sejttechnológiák az emberi egészségre való alkalmazásért: Integratív és rendszer biológiai kutatás. A célkitűzések a következők: A biológiai folyamatok és funkcionális mechanizmusok (funkcionális osztályok és metabolikus modulok/útvonalak) és az egészségre és a krónikus periodontitiszre vonatkozó orális mikrobiomok összetételének elemzése és összehasonlítása. Elemezze és hasonlítsa össze a fő patobionták és szimbionták specifikus genetikai variációit és virulencia-tényezőit az orális mikrobiómokban az egészségben és a krónikus periodontitisben. Elemezze és hasonlítsa össze az orális mikrobiomok funkcionális/kompozíciós dinamikus változásait a periodontitiszben, az alapvető nem sebészeti periodontális kezelés előtt és után. Az orális egészséghez kapcsolódó bakteriális alközösségek, valamint a kezeletlen és kezelt krónikus periodontitisz meglétének meghatározása. Meghatározza a kölcsönhatásba lépő taxonok által létrehozott bakteriális konzorciumokat, amelyek a globális bakteriális közösség központi egységeit képviselik. Egyes fajok és kis bakteriális konzorciumok funkcionalitásának és metabolikus stabilitásának feltárása Silico-ban különböző klinikai körülmények között. 4 szakasz jön létre: szubgingivális minták a kontrollokban és a fogágyban szenvedő betegekben az alapkezelés előtt és után; minták előkészítése a bakteriális DNS és RNS (közvetlen metagenomika és metatranscriptomika) masszív ultraszekvenálására; bioinformatikai/biostatisztikai elemzés (beleértve a metabolikus modellezést is) és a kapott adatok biológiai/klinikai értelmezése. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
Този проект е адаптиран към линията ESA, озаглавена Молекулярни и клетъчни технологии за приложение в човешкото здраве: Интегративни и системни биологични изследвания. Целите са следните: Анализира и сравнява биологични процеси и функционални механизми (функционални класове и метаболитни модули/маршрути) и състава на оралните микробиоми, свързани със здравето и хроничния пародонтит. Анализират и сравняват специфичните генетични вариации и фактори на вирулентност на основните патобионти и симбионти в оралните микробиоми в здравето и хроничния пародонтит. Анализират и сравняват функционалните/съставните динамични промени на оралните микробиоми в пародонтита, преди и след практиката на основно нехирургично периодонтално лечение. Определете наличието на бактериални подобщности, свързани със здравето на устната кухина и нелекувани и лекувани хроничен пародонтит. Определете бактериални консорциуми, образувани от взаимодействащи таксони, които представляват централните единици на глобалната бактериална общност. Изследвайте in silico функционалността и метаболитната стабилност на определени видове и малки бактериални консорциуми при различни клинични състояния. Установени са 4 фази: субгингивални проби в контролите и пародонталните пациенти преди и след основното лечение; подготовка на проби за масивно ултрасеквениране на бактериална ДНК и РНК (пряка метагеномия и метатраранскриптомика); биоинформатика/биостатистически анализ (включително метаболитно моделиране) и биологично/клинично тълкуване на получените данни. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
Šis projektas pritaikytas prie ESS linijos "Molekulinės ir ląstelių technologijos, skirtos žmonių sveikatai: Integruotieji ir sistemų biologiniai tyrimai. Tikslai yra šie: Analizuoti ir palyginti biologinius procesus ir funkcinius mechanizmus (funkcines klases ir medžiagų apykaitos modulius/maršrutus) ir geriamųjų mikrobiomų, susijusių su sveikata ir lėtiniu periodontitu, sudėtį. Analizuoti ir palyginti konkrečius genetinius variantus ir virulentiškumo veiksnius pagrindinių patobiontų ir simbionų burnos mikrobiomų sveikatos ir lėtinio periodontito. Analizuoti ir palyginti funkcinius/kompozicinius dinaminius burnos mikrobiomų pokyčius periodontite, prieš pradedant ir po pagrindinio nechirurginio periodonto gydymo. Nustatykite bakterijų pobendruomenių, susijusių su burnos sveikata ir negydomu ir gydomu lėtiniu periodontitu, buvimą. Nustatyti bakterijų konsorciumus, susiformavusius sąveikaujant taksonams, kurie atstovauja centriniams pasaulinės bakterijų bendruomenės vienetams. Ištirti konkrečių rūšių ir mažų bakterijų konsorciumų funkcionalumą ir medžiagų apykaitos stabilumą skirtingomis klinikinėmis sąlygomis. Nustatyti 4 etapai: kontrolinės grupės ir periodonto pacientų tarpiniai mėginiai prieš ir po pagrindinio gydymo; mėginių ruošimas bakterijų DNR ir RNR (tiesioginės metagenomikos ir metatranscriptomikos) masiniam ultrasektavimui; bioinformatikos ir (arba) biostatistinės analizės (įskaitant metabolinį modeliavimą) ir gautų duomenų biologinio/klinikinio aiškinimo. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
Ovaj je projekt prilagođen liniji ESA pod nazivom Molekularne i stanične tehnologije za primjenu na ljudsko zdravlje: Integracijska i sustavna biološka istraživanja. Ciljevi su sljedeći: Analizirati i usporediti biološke procese i funkcionalne mehanizme (funkcionalne klase i metaboličke module/putove) i sastav oralnih mikrobioma povezanih sa zdravljem i kroničnim parodontitisom. Analizirati i usporediti specifične genetske varijacije i faktore virulencije glavnih patobionata i simbionata u oralnim mikrobiomima u zdravlju i kroničnoj parodontitisu. Analizirati i usporediti funkcionalne/sastavne dinamičke promjene oralnih mikrobioma u parodontitisu, prije i nakon prakse osnovnog nekirurškog parodontnog liječenja. Utvrdite postojanje bakterijskih podzajednica povezanih s oralnim zdravljem i neliječenim i liječenim kroničnim parodontitisom. Odredite bakterijske konzorcije nastale interakcijom taksonima koji predstavljaju središnje jedinice globalne bakterijske zajednice. Istražite in silico funkcionalnost i metaboličku stabilnost određenih vrsta i malih bakterijskih konzorcija u različitim kliničkim uvjetima. Uspostavljene su četiri faze: subgingival uzorke u kontrolnim i parodontnim bolesnicima prije i nakon osnovnog liječenja; priprema uzoraka za masovno ultrasekvenciranje bakterijske DNK i RNK (izravna metagenomija i metatranscriptomika); bioinformatička/biostatistička analiza (uključujući modeliranje metabolizma) i biološko/kliničko tumačenje dobivenih podataka. (Croatian)
17 August 2022
0 references
Detta projekt är anpassat till ESA Line med titeln Molecular and Cell Technologies for Application to Human Health: Integrativ och systembiologisk forskning. Målen är följande: Analysera och jämföra biologiska processer och funktionsmekanismer (funktionella klasser och metaboliska moduler/vägar) och sammansättningen av orala mikrobiomer förknippade med hälsa och kronisk periodontit. Analysera och jämföra de specifika genetiska variationerna och virulensfaktorerna hos de viktigaste patobionterna och symbionterna i orala mikrobiomer i hälsa och kronisk periodontit. Analysera och jämföra de funktionella/kompositionella dynamiska förändringarna av orala mikrobiomer i periodontit, före och efter träningen av en grundläggande icke-kirurgisk periodontal behandling. Bestäm förekomsten av bakteriella subsamhällen i samband med oral hälsa och obehandlad och behandlad kronisk parodontit. Bestäm bakteriekonsortier som bildas genom att interagera taxa som representerar centrala enheter i det globala bakteriesamhället. Utforska i silico funktionaliteten och den metaboliska stabiliteten hos specifika arter och små bakteriekonsortier i olika kliniska tillstånd. Fyra faser har fastställts: subgingivalprover hos kontrollpatienter och periodontala patienter före och efter grundbehandlingen. beredning av prover för massiv ultrasekvensering av bakteriellt DNA och RNA (direkt metagenomik och metatranscriptomics). bioinformatik/biostatistisk analys (inklusive metabolisk modellering) och biologisk/klinisk tolkning av erhållna data. (Swedish)
17 August 2022
0 references
Acest proiect este adaptat liniei ESA intitulată Tehnologii moleculare și celulare pentru aplicații în domeniul sănătății umane: Cercetarea biologică integrativă și a sistemelor. Obiectivele sunt următoarele: Analizarea și compararea proceselor biologice și a mecanismelor funcționale (clase funcționale și module/rute metabolice) și compoziția microbiomurilor orale asociate cu sănătatea și parodontita cronică. Analizați și comparați variațiile genetice specifice și factorii de virulență ai principalilor patobionți și simbionți din microbiomul oral în sănătate și parodontita cronică. Analizați și comparați modificările dinamice funcționale/compoziționale ale microbiomurilor orale în parodontită, înainte și după practica unui tratament parodontal non-chirurgical de bază. Determinarea existenței subcomunităților bacteriene asociate cu sănătatea orală și parodontita cronică netratată și tratată. Determinarea consorțiilor bacteriene formate din taxoni care interacționează care reprezintă unitățile centrale ale comunității bacteriene globale. Explorați în silico funcționalitatea și stabilitatea metabolică a anumitor specii și a consorțiilor bacteriene mici în diferite condiții clinice. Sunt stabilite 4 faze: probe subgingivale la pacienții de control și la pacienții parodontali înainte și după tratamentul de bază; pregătirea probelor pentru ultrasecvențierea masivă a ADN-ului bacterian și a ARN-ului (metagenomica directă și metatranscriptomica); analiza bioinformatică/biostatistică (inclusiv modelarea metabolică) și interpretarea biologică/clinică a datelor obținute. (Romanian)
17 August 2022
0 references
Ta projekt je prilagojen vrstici ESA z naslovom Molekularne in celične tehnologije za uporabo v zdravju ljudi: Integrativne in sistemske biološke raziskave. Cilji so naslednji: Analizirati in primerjati biološke procese in funkcionalne mehanizme (funkcionalni razredi in presnovni moduli/poti) ter sestavo peroralnih mikrobiomov, povezanih z zdravjem in kroničnim periodontitisom. Analizirajte in primerjajte specifične genetske variacije in faktorje virulence glavnih patoboiontov in simbiontov pri peroralnih mikrobiomih v zdravju in kroničnem periodontitisu. Analizirajte in primerjajte funkcionalne/kompozicijske dinamične spremembe peroralnih mikrobiomov v periodontitisu pred in po osnovnem nekirurškem periodontalnem zdravljenju. Ugotoviti obstoj bakterijskih podskupnosti, povezanih z zdravjem ust in nezdravljenim in zdravljenim kroničnim periodontitisom. Določite bakterijske konzorcije, ki nastanejo z interakcijo taksonov, ki predstavljajo osrednje enote globalne bakterijske skupnosti. In silico raziščite funkcionalnost in presnovno stabilnost določenih vrst in majhnih bakterijskih konzorcijev v različnih kliničnih stanjih. 4 faze so določene: vzorce subgingival v kontrolni skupini in parodontalnih bolnikih pred osnovnim zdravljenjem in po njem; priprava vzorcev za masivno ultrasekvenciranje bakterijske DNA in RNK (neposredna metagenomika in metatrankriptomika); bioinformatika/biostatistična analiza (vključno z modeliranjem presnove) in biološka/klinična razlaga pridobljenih podatkov. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
Projekt ten jest dostosowany do linii ESA zatytułowanej "Technologie molekularne i komórkowe do zastosowań w zdrowiu człowieka: Badania biologiczne integracyjne i systemowe. Cele są następujące: Analizować i porównywać procesy biologiczne i mechanizmy funkcjonalne (klasy funkcjonalne i moduły metaboliczne/trasy) oraz skład mikrobiomów jamy ustnej związanych ze zdrowiem i przewlekłym zapaleniem przyzębia. Analizować i porównywać specyficzne zmiany genetyczne i czynniki zjadliwości głównych patobiontów i symbiontów w mikrobiomach jamy ustnej w zdrowiu i przewlekłym zapaleniu przyzębia. Analizować i porównywać dynamiczne zmiany funkcjonalne/kompozycyjne mikrobiomów doustnych w zapaleniu przyzębia, przed i po praktyce podstawowego niechirurgicznego leczenia przyzębia. Określić istnienie podwspólnot bakteryjnych związanych ze zdrowiem jamy ustnej oraz nieleczone i leczone przewlekłe zapalenie przyzębia. Określić konsorcja bakteryjne utworzone przez interaktywne taksony, które reprezentują centralne jednostki globalnej społeczności bakterii. Zbadaj w silico funkcjonalność i stabilność metaboliczną określonych gatunków i małych konsorcjów bakteryjnych w różnych warunkach klinicznych. Ustanawia się cztery etapy: próbki podprzędowe w kontrolach kontrolnych i przyzębia przed i po leczeniu podstawowym; przygotowanie próbek do masowego ultrasekwencjonowania DNA bakterii i RNA (bezpośrednie metagenomika i metatranscriptomika); bioinformatyka/analiza biostatystyczna (w tym modelowanie metaboliczne) oraz biologiczna/kliniczna interpretacja uzyskanych danych. (Polish)
17 August 2022
0 references
Santiago de Compostela
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI17_01722
0 references