MOLECULAR BASES OF BRASSINOSTEROIDES-MEDIATED SIGNALING IN ARABIDOPSIS MOTHER CELLS (Q3141607)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3141607 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | MOLECULAR BASES OF BRASSINOSTEROIDES-MEDIATED SIGNALING IN ARABIDOPSIS MOTHER CELLS |
Project Q3141607 in Spain |
Statements
131,769.0 Euro
0 references
242,000.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
30 December 2016
0 references
29 December 2019
0 references
CENTRO DE INVESTIGACION EN AGRIGENOMICA
0 references
8193
0 references
EL MANTENIMIENTO DE LOS NICHOS DE CELULAS MADRE EN UNA PREGUNTA CENTRAL DE LA BIOLOGIA FUNDAMENTAL. EL LABORATORIO DE LA DRA. CAÑO-DELGADO HA IDENTIFICADO RECIENTEMENTE VARIOS COMPONENTES MOLECULARES NECESARIOS PARA LA QUIESCENCIA CELULAR DEL NICHO DE CELULAS MADRE EN LA RAIZ PRIMARIA DE ARABIDOPSIS. BRAVO (BRASSINOSTEROIDS AT VASCULAR AND ORGANIZING CENTRE) ES UN FACTOR DE TRANSCRIPCION R2R3-MYB QUE FUNCIONA COMO UN REPRESOR ESPECIFICO DE LA DIVISIONES DE LAS CELULAS DEL CENTRO QUIESCENTE EN EL NICHO DE CELULAS MADRE DE LA RAIZ. EL ANALISIS MOLECULAR DE LA VIA BRAVO HA REVELADO UN MECANISMO QUE CONTROLA LAS DIVISIONES DE CELULAS ESPECIFICAS DE ESTEROIDES MEDIADA POR BRASINOESTEROIDES. ESTOS RESULTADOS ABREN UNA NUEVA LINEA PARA EL ESTUDIO DE LAS CELULAS MADRE DE LA PLANTA. ACTUALMENTE, LA IDENTIFICACION DE LAS REDES DE SEÑALIZACION QUE OPERAN DURANTE EL CRECIMIENTO Y DESARROLLO DE LA PLANTA PASA POR LA INTEGRACION DE LOS DATOS GENOMICOS CON RESOLUCION CELULAR, EN COMBINACION CON IMAGENES DE ALTA RESOLUCION ESPACIOTEMPORAL Y EL MODELADO MATEMATICO. EN LA PRESENTE PROPUESTA, EL LABORATORIO TIENE COMO OBJETIVO CARACTERIZAR LOS COMPONENTES MAS RELEVANTES Y ESPECIFICOS DE LA VIA DE LOS BRASINOESTEROIDES EN EL NICHO DE CELULAS MADRE. ACTUALMENTE, SE ESTAN GENERANDO UN GRAN NUMERO DE DATOS DE TRANSCRIPTOMICA ESPECIFICOS DE CELULAS DE LA RAIZ QUE REQUIEREN ANALISIS BIOINFORMATICO DE VANGUARDIA Y NUEVAS HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES PARA EXTRAER LA INFORMACION ESTADISTICA Y FUNCIONALMENTE SIGNIFICATIVA. EN ESTE ESCENARIO, EL ONE_CELL PROPONE ADQUIRIR LAS HABILIDADES DE CALCULO PARA EL PROCESAMIENTO, INTEGRACION Y ANALISIS FUNCIONAL DE LOS DATOS. POR ULTIMO, PROPONEMOS PONER A PUNTO ANALISIS GENOMICO EN CELULAS INDIVIDUALES DE LA RAIZ PARA DEFINIR LA NATURALEZA DE LAS CELULAS MADRE VASCULARES, UNA PREGUNTA AUN SIN RESPONDER DE LA BIOLOGIA DE LAS PLANTAS. EN GENERAL, AL FINAL DE LA PROPUESTA SE PROPORCIONARA UNA VISION INTEGRADA DE LA SEÑALIZACION DE LA BR EN EL QC Y EN LAS CELULAS MADRE VASCULARES Y SE TRATARA DE DESCIFRAR LAS CARACTERISTICAS NOVEDOSAS DE CELULAS MADRE BASADAS EN EL ANALISIS GENOMICO DE UNA SOLA CELULA. (Spanish)
0 references
THE MAINTENANCE OF MOTHER CELL NICHES IN A CENTRAL QUESTION OF FUNDAMENTAL BIOLOGY. DR.'S LAB. CAÑO-DELGADO HAS RECENTLY IDENTIFIED SEVERAL MOLECULAR COMPONENTS NECESSARY FOR CELL CYSESCENCE OF THE STEM CELL NICHE IN THE PRIMARY ROOT OF ARABIDOPSIS. BRAVO (BRASSINOSTEROIDS AT VASCULAR AND ORGANISING CENTRE) IS A TRANSCRIPTION FACTOR R2R3-MYB THAT FUNCTIONS AS A SPECIFIC REPRESSOR OF THE CELL DIVISIONS OF THE CHIESCENT CENTER IN THE ROOT STEM CELL NICHE. THE MOLECULAR ANALYSIS OF VIA BRAVO HAS REVEALED A MECHANISM THAT CONTROLS THE SPECIFIC CELL DIVISIONS OF STEROIDS MEDIATED BY BRASINOSTEROIDS. THESE RESULTS OPEN A NEW LINE FOR THE STUDY OF THE MOTHER CELLS OF THE PLANT. CURRENTLY, THE IDENTIFICATION OF SIGNALING NETWORKS THAT OPERATE DURING THE GROWTH AND DEVELOPMENT OF THE PLANT GOES THROUGH THE INTEGRATION OF GENOMIC DATA WITH CELLULAR RESOLUTION, IN COMBINATION WITH IMAGES OF HIGH SPATIAL RESOLUTION AND MATHEMATICAL MODELING. IN THIS PROPOSAL, THE LABORATORY AIMS TO CHARACTERISE THE MOST RELEVANT AND SPECIFIC COMPONENTS OF THE BRASINOSTEROID PATHWAY IN THE NICHE OF STEM CELLS. CURRENTLY, A LARGE NUMBER OF SPECIFIC TRANSCRIPTOMICA DATA ARE BEING GENERATED FROM ROOT CELLS THAT REQUIRE STATE-OF-THE-ART BIOINFORMATIC ANALYSIS AND NEW COMPUTATIONAL TOOLS TO EXTRACT STATISTICAL AND FUNCTIONALLY SIGNIFICANT INFORMATION. IN THIS SCENARIO, THE ONE_CELL PROPOSES TO ACQUIRE THE CALCULATION SKILLS FOR THE PROCESSING, INTEGRATION AND FUNCTIONAL ANALYSIS OF THE DATA. FINALLY, WE PROPOSE TO FINE-TUNE GENOMIC ANALYSIS IN INDIVIDUAL ROOT CELLS TO DEFINE THE NATURE OF VASCULAR STEM CELLS, A QUESTION WITHOUT ANSWERING THE BIOLOGY OF PLANTS. IN GENERAL, AT THE END OF THE PROPOSAL, AN INTEGRATED VISION OF THE BR SIGNALLING IN THE QC AND VASCULAR STEM CELLS WILL BE PROVIDED AND AN ATTEMPT WILL BE MADE TO DECIPHER THE NOVEL CHARACTERISTICS OF STEM CELLS BASED ON THE GENOMIC ANALYSIS OF A SINGLE CELL. (English)
12 October 2021
0.1307219658313314
0 references
LE MAINTIEN DES NICHES DE CELLULES MÈRES DANS UNE QUESTION CENTRALE DE BIOLOGIE FONDAMENTALE. LE LABO DE DR.. CAÑO-DELGADO A RÉCEMMENT IDENTIFIÉ PLUSIEURS COMPOSANTS MOLÉCULAIRES NÉCESSAIRES À LA CYSESCENCE CELLULAIRE DE LA NICHE DES CELLULES SOUCHES DANS LA RACINE PRIMAIRE D’ARABIDOPSIS. BRAVO (BRASSINSTÉROÏDES AU CENTRE VASCULAIRE ET ORGANISATEUR) EST UN FACTEUR DE TRANSCRIPTION R2R3-MYB QUI FONCTIONNE COMME UN RÉPRESSEUR SPÉCIFIQUE DES DIVISIONS CELLULAIRES DU CENTRE CHIESCENT DANS LA NICHE DES CELLULES SOUCHES DE LA RACINE. L’ANALYSE MOLÉCULAIRE DE VIA BRAVO A RÉVÉLÉ UN MÉCANISME QUI CONTRÔLE LES DIVISIONS CELLULAIRES SPÉCIFIQUES DES STÉROÏDES MÉDIÉS PAR BRASINOSTEROIDS. CES RÉSULTATS OUVRENT UNE NOUVELLE LIGNE POUR L’ÉTUDE DES CELLULES MÈRES DE LA PLANTE. ACTUELLEMENT, L’IDENTIFICATION DES RÉSEAUX DE SIGNALISATION QUI FONCTIONNENT PENDANT LA CROISSANCE ET LE DÉVELOPPEMENT DE LA PLANTE PASSE PAR L’INTÉGRATION DES DONNÉES GÉNOMIQUES À LA RÉSOLUTION CELLULAIRE, EN COMBINAISON AVEC DES IMAGES DE HAUTE RÉSOLUTION SPATIALE ET LA MODÉLISATION MATHÉMATIQUE. DANS LA PRÉSENTE PROPOSITION, LE LABORATOIRE VISE À CARACTÉRISER LES COMPOSANTES LES PLUS PERTINENTES ET SPÉCIFIQUES DE LA VOIE BRASINOSTEROID DANS LA NICHE DES CELLULES SOUCHES. ACTUELLEMENT, UN GRAND NOMBRE DE DONNÉES TRANSCRIPTOMICA SPÉCIFIQUES SONT GÉNÉRÉES À PARTIR DE CELLULES RACINAIRES QUI NÉCESSITENT UNE ANALYSE BIOINFORMATIQUE DE POINTE ET DE NOUVEAUX OUTILS DE CALCUL POUR EXTRAIRE DES INFORMATIONS STATISTIQUES ET FONCTIONNELLEMENT SIGNIFICATIVES. DANS CE SCÉNARIO, ONE_CELL PROPOSE D’ACQUÉRIR LES COMPÉTENCES DE CALCUL POUR LE TRAITEMENT, L’INTÉGRATION ET L’ANALYSE FONCTIONNELLE DES DONNÉES. ENFIN, NOUS PROPOSONS D’AFFINER L’ANALYSE GÉNOMIQUE DANS LES CELLULES RACINAIRES INDIVIDUELLES AFIN DE DÉFINIR LA NATURE DES CELLULES SOUCHES VASCULAIRES, UNE QUESTION SANS RÉPONDRE À LA BIOLOGIE DES PLANTES. EN GÉNÉRAL, À LA FIN DE LA PROPOSITION, UNE VISION INTÉGRÉE DE LA SIGNALISATION BR DANS LE QC ET LES CELLULES SOUCHES VASCULAIRES SERA FOURNIE ET UNE TENTATIVE SERA FAITE DE DÉCHIFFRER LES CARACTÉRISTIQUES NOUVELLES DES CELLULES SOUCHES SUR LA BASE DE L’ANALYSE GÉNOMIQUE D’UNE SEULE CELLULE. (French)
2 December 2021
0 references
DIE ERHALTUNG VON MUTTERZELLNISCHEN IN EINER ZENTRALEN FRAGE DER FUNDAMENTALEN BIOLOGIE. DAS LABOR VON DR. CAÑO-DELGADO HAT KÜRZLICH MEHRERE MOLEKULARE KOMPONENTEN IDENTIFIZIERT, DIE FÜR DIE ZELLE CYSESCENCE DER STAMMZELLNISCHE IN DER PRIMÄREN WURZEL VON ARABIDOPSIS NOTWENDIG SIND. BRAVO (BRASSINOSTEROIDE AM GEFÄSS- UND ORGANISATIONSZENTRUM) IST EIN TRANSKRIPTIONSFAKTOR R2R3-MYB, DER ALS SPEZIFISCHER REPRESSOR DER ZELLTEILUNG DES CHIESCENT-ZENTRUMS IN DER STAMMZELLNISCHE FUNGIERT. DIE MOLEKULARE ANALYSE VON VIA BRAVO HAT EINEN MECHANISMUS AUFGEDECKT, DER DIE SPEZIFISCHEN ZELLTEILUNGEN VON STEROIDEN KONTROLLIERT, DIE VON BRASINOSTEROIDS VERMITTELT WERDEN. DIESE ERGEBNISSE ERÖFFNEN EINE NEUE LINIE FÜR DIE UNTERSUCHUNG DER MUTTERZELLEN DER PFLANZE. DERZEIT ERFOLGT DIE IDENTIFIZIERUNG VON SIGNALNETZWERKEN, DIE WÄHREND DES WACHSTUMS UND DER ENTWICKLUNG DER ANLAGE BETRIEBEN WERDEN, DURCH DIE INTEGRATION VON GENOMISCHEN DATEN MIT ZELLULÄRER AUFLÖSUNG, IN KOMBINATION MIT BILDERN MIT HOHER RÄUMLICHER AUFLÖSUNG UND MATHEMATISCHER MODELLIERUNG. IN DIESEM VORSCHLAG ZIELT DAS LABOR DARAUF AB, DIE RELEVANTESTEN UND SPEZIFISCHEN KOMPONENTEN DES BRASINOSTEROID-PFADS IN DER NISCHE DER STAMMZELLEN ZU CHARAKTERISIEREN. DERZEIT WERDEN EINE GROSSE ANZAHL SPEZIFISCHER TRANSCRIPTOMICA-DATEN AUS WURZELZELLEN GENERIERT, DIE EINE HOCHMODERNE BIOINFORMATISCHE ANALYSE UND NEUE RECHENWERKZEUGE BENÖTIGEN, UM STATISTISCHE UND FUNKTIONELL SIGNIFIKANTE INFORMATIONEN ZU EXTRAHIEREN. IN DIESEM SZENARIO SCHLÄGT DAS ONE_CELL VOR, DIE BERECHNUNGSKOMPETENZEN FÜR DIE VERARBEITUNG, INTEGRATION UND FUNKTIONALE ANALYSE DER DATEN ZU ERWERBEN. SCHLIESSLICH SCHLAGEN WIR VOR, DIE GENOMISCHE ANALYSE IN EINZELNEN WURZELZELLEN ZU VERFEINERN, UM DIE ART DER GEFÄSSSTAMMZELLEN ZU DEFINIEREN, EINE FRAGE, OHNE DIE BIOLOGIE DER PFLANZEN ZU BEANTWORTEN. IM ALLGEMEINEN WIRD AM ENDE DES VORSCHLAGS EINE INTEGRIERTE VISION DER BR-SIGNALGEBUNG IN DEN QC- UND GEFÄSSSTAMMZELLEN BEREITGESTELLT UND VERSUCHT, DIE NEUARTIGEN EIGENSCHAFTEN VON STAMMZELLEN AUF DER GRUNDLAGE DER GENOMISCHEN ANALYSE EINER EINZELNEN ZELLE ZU ENTSCHLÜSSELN. (German)
9 December 2021
0 references
HET BEHOUD VAN MOEDERCEL NICHES IN EEN CENTRALE KWESTIE VAN FUNDAMENTELE BIOLOGIE. HET LAB VAN DR. CAÑO-DELGADO HEEFT ONLANGS VERSCHILLENDE MOLECULAIRE COMPONENTEN GEÏDENTIFICEERD DIE NODIG ZIJN VOOR CEL CYSESCENCE VAN DE STAMCEL NICHE IN DE PRIMAIRE WORTEL VAN ARABIDOPSIS. BRAVO (BRASSINOSTEROÏDEN IN VASCULAIRE EN ORGANISERENDE CENTRUM) IS EEN TRANSCRIPTIEFACTOR R2R3-MYB DIE FUNCTIONEERT ALS EEN SPECIFIEKE ONDERDRUKKER VAN DE CELDELINGEN VAN HET CHIESCENT-CENTRUM IN DE NICHE VAN DE STAMCEL VAN DE WORTEL. DE MOLECULAIRE ANALYSE VAN VIA BRAVO HEEFT EEN MECHANISME ONTHULD DAT DE SPECIFIEKE CELDELINGEN VAN STEROÏDEN DOOR BRASINOSTEROIDS CONTROLEERT. DEZE RESULTATEN OPENEN EEN NIEUWE LIJN VOOR DE STUDIE VAN DE MOEDERCELLEN VAN DE PLANT. MOMENTEEL GAAT DE IDENTIFICATIE VAN SIGNAALNETWERKEN DIE WERKEN TIJDENS DE GROEI EN ONTWIKKELING VAN DE PLANT DOOR DE INTEGRATIE VAN GENOMISCHE GEGEVENS MET CELLULAIRE RESOLUTIE, IN COMBINATIE MET BEELDEN VAN HOGE RUIMTELIJKE RESOLUTIE EN WISKUNDIGE MODELLERING. IN DIT VOORSTEL WIL HET LABORATORIUM DE MEEST RELEVANTE EN SPECIFIEKE COMPONENTEN VAN DE BRASINOSTEROID-ROUTE IN DE NICHE VAN STAMCELLEN KARAKTERISEREN. MOMENTEEL WORDEN EEN GROOT AANTAL SPECIFIEKE TRANSCRIPTOMICA-GEGEVENS GEGENEREERD UIT WORTELCELLEN DIE STATE-OF-THE-ART BIO-INFORMATISCHE ANALYSE EN NIEUWE REKENINSTRUMENTEN VEREISEN OM STATISTISCHE EN FUNCTIONEEL SIGNIFICANTE INFORMATIE TE EXTRAHEREN. IN DIT SCENARIO STELT DE ONE_CELL VOOR OM DE REKENVAARDIGHEDEN TE VERWERVEN VOOR DE VERWERKING, INTEGRATIE EN FUNCTIONELE ANALYSE VAN DE GEGEVENS. TOT SLOT STELLEN WE VOOR OM GENOMISCHE ANALYSE IN INDIVIDUELE WORTELCELLEN TE VERFIJNEN OM DE AARD VAN VASCULAIRE STAMCELLEN TE DEFINIËREN, EEN VRAAG ZONDER DE BIOLOGIE VAN PLANTEN TE BEANTWOORDEN. IN HET ALGEMEEN ZAL AAN HET EINDE VAN HET VOORSTEL EEN GEÏNTEGREERDE VISIE VAN DE BR-SIGNALERING IN DE QC EN VASCULAIRE STAMCELLEN WORDEN VERSTREKT EN ZAL EEN POGING WORDEN GEDAAN OM DE NIEUWE KENMERKEN VAN STAMCELLEN TE ONTCIJFEREN OP BASIS VAN DE GENOMISCHE ANALYSE VAN EEN ENKELE CEL. (Dutch)
17 December 2021
0 references
IL MANTENIMENTO DELLE NICCHIE DELLE CELLULE MADRI IN UNA QUESTIONE CENTRALE DELLA BIOLOGIA FONDAMENTALE. IL LABORATORIO DELLA DOTTORESSA. CAÑO-DELGADO HA RECENTEMENTE IDENTIFICATO DIVERSI COMPONENTI MOLECOLARI NECESSARI PER LA CELLULA CYSESCENCE DELLA NICCHIA DELLE CELLULE STAMINALI NELLA RADICE PRIMARIA DI ARABIDOPSIS. BRAVO (BRASSINOSTEROIDI AL CENTRO VASCOLARE E ORGANIZZATIVO) È UN FATTORE DI TRASCRIZIONE R2R3-MYB CHE FUNZIONA COME UNO SPECIFICO REPRESSORE DELLE DIVISIONI CELLULARI DEL CENTRO DI CHIESCENT NELLA NICCHIA DELLE CELLULE STAMINALI RADICE. L'ANALISI MOLECOLARE DI VIA BRAVO HA RIVELATO UN MECCANISMO CHE CONTROLLA LE DIVISIONI CELLULARI SPECIFICHE DEGLI STEROIDI MEDIATI DA BRASINOSTEROIDS. QUESTI RISULTATI APRONO UNA NUOVA LINEA PER LO STUDIO DELLE CELLULE MADRI DELLA PIANTA. ATTUALMENTE, L'IDENTIFICAZIONE DELLE RETI DI SEGNALAZIONE CHE OPERANO DURANTE LA CRESCITA E LO SVILUPPO DELL'IMPIANTO PASSA ATTRAVERSO L'INTEGRAZIONE DI DATI GENOMICI CON RISOLUZIONE CELLULARE, IN COMBINAZIONE CON IMMAGINI DI ALTA RISOLUZIONE SPAZIALE E MODELLAZIONE MATEMATICA. IN QUESTA PROPOSTA, IL LABORATORIO MIRA A CARATTERIZZARE I COMPONENTI PIÙ RILEVANTI E SPECIFICI DEL PERCORSO BRASINOSTEROID NELLA NICCHIA DELLE CELLULE STAMINALI. ATTUALMENTE, UN GRAN NUMERO DI DATI SPECIFICI TRANSCRIPTOMICA SONO GENERATI DA CELLULE RADICE CHE RICHIEDONO ANALISI BIOINFORMATICA ALL'AVANGUARDIA E NUOVI STRUMENTI COMPUTAZIONALI PER ESTRARRE INFORMAZIONI STATISTICHE E FUNZIONALMENTE SIGNIFICATIVE. IN QUESTO SCENARIO, ONE_CELL SI PROPONE DI ACQUISIRE LE COMPETENZE DI CALCOLO PER IL TRATTAMENTO, L'INTEGRAZIONE E L'ANALISI FUNZIONALE DEI DATI. INFINE, PROPONIAMO DI METTERE A PUNTO L'ANALISI GENOMICA NELLE SINGOLE CELLULE RADICE PER DEFINIRE LA NATURA DELLE CELLULE STAMINALI VASCOLARI, UNA DOMANDA SENZA RISPONDERE ALLA BIOLOGIA DELLE PIANTE. IN GENERALE, AL TERMINE DELLA PROPOSTA, SARÀ FORNITA UNA VISIONE INTEGRATA DELLA SEGNALAZIONE BR NEL QC E DELLE CELLULE STAMINALI VASCOLARI E SI CERCHERÀ DI DECIFRARE LE NUOVE CARATTERISTICHE DELLE CELLULE STAMINALI SULLA BASE DELL'ANALISI GENOMICA DI UNA SINGOLA CELLULA. (Italian)
16 January 2022
0 references
Η ΔΙΑΤΉΡΗΣΗ ΤΩΝ ΜΗΤΡΙΚΏΝ ΚΥΤΤΆΡΩΝ ΚΌΓΧΕΣ ΣΕ ΈΝΑ ΚΕΝΤΡΙΚΌ ΖΉΤΗΜΑ ΤΗΣ ΘΕΜΕΛΙΏΔΟΥΣ ΒΙΟΛΟΓΊΑΣ. ΤΟ ΕΡΓΑΣΤΉΡΙΟ ΤΟΥ ΔΡ. ΤΟ CAÑO-DELGADO ΕΝΤΌΠΙΣΕ ΠΡΌΣΦΑΤΑ ΑΡΚΕΤΆ ΜΟΡΙΑΚΆ ΣΥΣΤΑΤΙΚΆ ΑΠΑΡΑΊΤΗΤΑ ΓΙΑ ΤΟ ΚΎΤΤΑΡΟ CYSESCENCE ΤΗΣ ΘΈΣΗΣ ΤΩΝ ΒΛΑΣΤΟΚΥΤΤΆΡΩΝ ΣΤΗΝ ΚΎΡΙΑ ΡΊΖΑ ΤΗΣ ARABIDOPSIS. ΤΟ BRAVO (ΒΡΑΣΣΙΝΟΣΤΕΡΟΕΙΔΉ ΣΕ ΑΓΓΕΙΑΚΌ ΚΑΙ ΟΡΓΑΝΩΤΙΚΌ ΚΈΝΤΡΟ) ΕΊΝΑΙ ΈΝΑΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑΣ ΜΕΤΑΓΡΑΦΉΣ R2R3-MYB ΠΟΥ ΛΕΙΤΟΥΡΓΕΊ ΩΣ ΕΙΔΙΚΌΣ ΚΑΤΑΣΤΑΛΤΙΚΌΣ ΠΑΡΆΓΟΝΤΑΣ ΤΩΝ ΚΥΤΤΑΡΙΚΏΝ ΤΜΗΜΆΤΩΝ ΤΟΥ ΚΈΝΤΡΟΥ CHIESCENT ΣΤΗΝ ΘΈΣΗ ΤΩΝ ΒΛΑΣΤΟΚΥΤΤΆΡΩΝ ΡΊΖΑΣ. Η ΜΟΡΙΑΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΟΥ ΜΈΣΩ BRAVO ΈΧΕΙ ΑΠΟΚΑΛΎΨΕΙ ΈΝΑΝ ΜΗΧΑΝΙΣΜΌ ΠΟΥ ΕΛΈΓΧΕΙ ΤΙΣ ΣΥΓΚΕΚΡΙΜΈΝΕΣ ΚΥΤΤΑΡΙΚΈΣ ΔΙΑΙΡΈΣΕΙΣ ΤΩΝ ΣΤΕΡΟΕΙΔΏΝ ΠΟΥ ΔΙΑΜΕΣΟΛΑΒΟΎΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΟ BRASINOSTEROIDS. ΤΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΑΥΤΆ ΑΝΟΊΓΟΥΝ ΜΙΑ ΝΈΑ ΓΡΑΜΜΉ ΓΙΑ ΤΗ ΜΕΛΈΤΗ ΤΩΝ ΜΗΤΡΙΚΏΝ ΚΥΤΤΆΡΩΝ ΤΟΥ ΦΥΤΟΎ. ΕΠΊ ΤΟΥ ΠΑΡΌΝΤΟΣ, Η ΤΑΥΤΟΠΟΊΗΣΗ ΤΩΝ ΔΙΚΤΎΩΝ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΠΟΥ ΛΕΙΤΟΥΡΓΟΎΝ ΚΑΤΆ ΤΗ ΔΙΆΡΚΕΙΑ ΤΗΣ ΑΝΆΠΤΥΞΗΣ ΚΑΙ ΤΗΣ ΑΝΆΠΤΥΞΗΣ ΤΟΥ ΣΤΑΘΜΟΎ ΠΕΡΝΆ ΜΈΣΑ ΑΠΌ ΤΗΝ ΕΝΣΩΜΆΤΩΣΗ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΏΝ ΔΕΔΟΜΈΝΩΝ ΜΕ ΚΥΤΤΑΡΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ, ΣΕ ΣΥΝΔΥΑΣΜΌ ΜΕ ΕΙΚΌΝΕΣ ΥΨΗΛΉΣ ΧΩΡΙΚΉΣ ΑΝΆΛΥΣΗΣ ΚΑΙ ΜΑΘΗΜΑΤΙΚΉΣ ΜΟΝΤΕΛΟΠΟΊΗΣΗΣ. ΣΤΗΝ ΠΑΡΟΎΣΑ ΠΡΌΤΑΣΗ, ΤΟ ΕΡΓΑΣΤΉΡΙΟ ΈΧΕΙ ΩΣ ΣΤΌΧΟ ΝΑ ΧΑΡΑΚΤΗΡΊΣΕΙ ΤΑ ΠΛΈΟΝ ΣΥΝΑΦΉ ΚΑΙ ΕΙΔΙΚΆ ΣΥΣΤΑΤΙΚΆ ΤΗΣ ΟΔΟΎ BRASINOSTEROID ΣΤΗΝ ΕΞΕΙΔΙΚΕΥΜΈΝΗ ΘΈΣΗ ΤΩΝ ΒΛΑΣΤΟΚΥΤΤΆΡΩΝ. ΕΠΊ ΤΟΥ ΠΑΡΌΝΤΟΣ, ΈΝΑΣ ΜΕΓΆΛΟΣ ΑΡΙΘΜΌΣ ΕΙΔΙΚΏΝ ΔΕΔΟΜΈΝΩΝ TRANSCRIPTOMICA ΠΑΡΆΓΟΝΤΑΙ ΑΠΌ ΡΙΖΙΚΆ ΚΎΤΤΑΡΑ ΠΟΥ ΑΠΑΙΤΟΎΝ ΠΡΟΗΓΜΈΝΗ ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ ΚΑΙ ΝΈΑ ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΙΚΆ ΕΡΓΑΛΕΊΑ ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΞΑΓΩΓΉ ΣΤΑΤΙΣΤΙΚΏΝ ΚΑΙ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΆ ΣΗΜΑΝΤΙΚΏΝ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΏΝ. ΣΕ ΑΥΤΌ ΤΟ ΣΕΝΆΡΙΟ, Η ONE_CELL ΠΡΟΤΕΊΝΕΙ ΤΗΝ ΑΠΌΚΤΗΣΗ ΤΩΝ ΔΕΞΙΟΤΉΤΩΝ ΥΠΟΛΟΓΙΣΜΟΎ ΓΙΑ ΤΗΝ ΕΠΕΞΕΡΓΑΣΊΑ, ΤΗΝ ΕΝΣΩΜΆΤΩΣΗ ΚΑΙ ΤΗ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΉ ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΩΝ ΔΕΔΟΜΈΝΩΝ. ΤΈΛΟΣ, ΠΡΟΤΕΊΝΟΥΜΕ ΤΗΝ ΤΕΛΕΙΟΠΟΊΗΣΗ ΤΗΣ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΉΣ ΑΝΆΛΥΣΗΣ ΣΕ ΜΕΜΟΝΩΜΈΝΑ ΡΙΖΙΚΆ ΚΎΤΤΑΡΑ ΓΙΑ ΤΟΝ ΚΑΘΟΡΙΣΜΌ ΤΗΣ ΦΎΣΗΣ ΤΩΝ ΑΓΓΕΙΑΚΏΝ ΒΛΑΣΤΟΚΥΤΤΆΡΩΝ, ΜΙΑ ΕΡΏΤΗΣΗ ΧΩΡΊΣ ΝΑ ΑΠΑΝΤΟΎΜΕ ΣΤΗ ΒΙΟΛΟΓΊΑ ΤΩΝ ΦΥΤΏΝ. ΣΕ ΓΕΝΙΚΈΣ ΓΡΑΜΜΈΣ, ΣΤΟ ΤΈΛΟΣ ΤΗΣ ΠΡΌΤΑΣΗΣ, ΘΑ ΠΑΡΑΣΧΕΘΕΊ ΟΛΟΚΛΗΡΩΜΈΝΗ ΕΙΚΌΝΑ ΤΗΣ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ ΤΗΣ BR ΣΤΟ QC ΚΑΙ ΤΩΝ ΑΓΓΕΙΑΚΏΝ ΒΛΑΣΤΟΚΥΤΤΆΡΩΝ ΚΑΙ ΘΑ ΚΑΤΑΒΛΗΘΕΊ ΠΡΟΣΠΆΘΕΙΑ ΑΠΟΚΡΥΠΤΟΓΡΆΦΗΣΗΣ ΤΩΝ ΝΈΩΝ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΏΝ ΤΩΝ ΒΛΑΣΤΟΚΥΤΤΆΡΩΝ ΒΆΣΕΙ ΤΗΣ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΉΣ ΑΝΆΛΥΣΗΣ ΕΝΌΣ ΜΌΝΟ ΚΥΤΤΆΡΟΥ. (Greek)
17 August 2022
0 references
VEDLIGEHOLDELSE AF MODERCELLE NICHER I ET CENTRALT SPØRGSMÅL OM GRUNDLÆGGENDE BIOLOGI. DR.'S LABORATORIUM. CAÑO-DELGADO HAR FOR NYLIG IDENTIFICERET FLERE MOLEKYLÆRE KOMPONENTER, DER ER NØDVENDIGE FOR CELLE CYSESCENCE AF STAMCELLE NICHE I DEN PRIMÆRE ROD AF ARABIDOPSIS. BRAVO (BRASSINOSTEROIDER PÅ VASKULÆRT OG ORGANISERENDE CENTER) ER EN TRANSKRIPTIONSFAKTOR R2R3-MYB, DER FUNGERER SOM EN SPECIFIK REPRESSOR FOR CELLEDELINGERNE I CHIESCENT-CENTRET I RODSTAMCELLENICHEEN. DEN MOLEKYLÆRE ANALYSE AF VIA BRAVO HAR AFSLØRET EN MEKANISME, DER STYRER DE SPECIFIKKE CELLEDELINGER AF STEROIDER MEDIERET AF BRASINOSTEROIDS. DISSE RESULTATER ÅBNER EN NY LINJE FOR UNDERSØGELSEN AF PLANTENS MODERCELLER. I ØJEBLIKKET GÅR IDENTIFIKATIONEN AF SIGNALNETVÆRK, DER OPERERER UNDER ANLÆGGETS VÆKST OG UDVIKLING, GENNEM INTEGRATION AF GENOMDATA MED CELLULÆR OPLØSNING I KOMBINATION MED BILLEDER AF HØJ RUMLIG OPLØSNING OG MATEMATISK MODELLERING. I DETTE FORSLAG SIGTER LABORATORIET MOD AT KARAKTERISERE DE MEST RELEVANTE OG SPECIFIKKE KOMPONENTER I BRASINOSTEROID-VEJEN I STAMCELLERNES NICHE. I ØJEBLIKKET GENERERES DER EN LANG RÆKKE SPECIFIKKE TRANSCRIPTOMICA-DATA FRA RODCELLER, DER KRÆVER STATE-OF-THE-ART BIOINFORMATISK ANALYSE OG NYE COMPUTERVÆRKTØJER TIL AT UDTRÆKKE STATISTISKE OG FUNKTIONELT SIGNIFIKANTE OPLYSNINGER. I DETTE SCENARIO FORESLÅR ONE_CELL AT TILEGNE SIG BEREGNINGSKOMPETENCER TIL BEHANDLING, INTEGRATION OG FUNKTIONSANALYSE AF DATAENE. ENDELIG FORESLÅR VI AT FINJUSTERE GENOMANALYSE I INDIVIDUELLE RODCELLER FOR AT DEFINERE ARTEN AF VASKULÆRE STAMCELLER, ET SPØRGSMÅL UDEN AT BESVARE PLANTERNES BIOLOGI. GENERELT VIL DER I SLUTNINGEN AF FORSLAGET BLIVE FREMLAGT EN INTEGRERET VISION FOR BR-SIGNALER I QC OG VASKULÆRE STAMCELLER, OG DER VIL BLIVE GJORT ET FORSØG PÅ AT DECHIFRERE STAMCELLERS NYE KARAKTERISTIKA BASERET PÅ EN GENOMANALYSE AF EN ENKELT CELLE. (Danish)
17 August 2022
0 references
YLLÄPITÄMINEN EMOSOLU MARKKINARAON KESKEINEN KYSYMYS PERUSBIOLOGIAN. TOHTORIN LABRA. CAÑO-DELGADO ON ÄSKETTÄIN TUNNISTANUT USEITA MOLEKULAARISIA KOMPONENTTEJA, JOITA TARVITAAN ARABIDOPSIKSEN PÄÄJUUREN KANTASOLUN CYSESCENCE-NIMISESSÄ SOLUSSA. BRAVO (BRASSINOSTEROIDIT VERISUONTEN JA JÄRJESTELYKESKUKSEN) ON TRANSKRIPTIOTEKIJÄ R2R3-MYB, JOKA TOIMII CHIESCENT-KESKUKSEN SOLUJAKAUTUMIEN SPESIFISENÄ TUKAHDUTTAJANA JUURI KANTASOLUN MARKKINARAKOSSA. BRAVON KAUTTA TEHTY MOLEKYYLIANALYYSI ON PALJASTANUT MEKANISMIN, JOKA OHJAA BRASINOSTEROIDSIN VÄLITTÄMIEN STEROIDIEN ERITYISIÄ SOLUJAKAUMIA. NÄMÄ TULOKSET AVAAVAT UUDEN LINJAN KASVIEN EMOSOLUJEN TUTKIMUKSEEN. TÄLLÄ HETKELLÄ LAITOKSEN KASVUN JA KEHITTÄMISEN AIKANA TOIMIVIEN SIGNAALIVERKKOJEN TUNNISTAMINEN TAPAHTUU INTEGROIMALLA GENOMIDATA SOLURESOLUUTIOON YHDISTETTYNÄ KORKEAN TILARESOLUUTION JA MATEMAATTISEN MALLINTAMISEN KUVIIN. TÄSSÄ EHDOTUKSESSA LABORATORIO PYRKII LUONNEHTIMAAN BRASINOSTEROID-REITIN TÄRKEIMPIÄ JA ERITYISIÄ KOMPONENTTEJA KANTASOLUJEN KAPEALLA ALUEELLA. TÄLLÄ HETKELLÄ SUURI MÄÄRÄ TRANSCRIPTOMICA-TIETOJA TUOTETAAN JUURISOLUISTA, JOTKA EDELLYTTÄVÄT UUSINTA KEHITYSTÄ EDUSTAVAA BIOINFORMAATTISTA ANALYYSIA JA UUSIA LASKENTAVÄLINEITÄ TILASTOLLISTEN JA TOIMINNALLISESTI MERKITTÄVIEN TIETOJEN SAAMISEKSI. TÄSSÄ SKENAARIOSSA ONE_CELL EHDOTTAA LASKENTATAITOJEN HANKKIMISTA TIETOJEN KÄSITTELYÄ, INTEGROINTIA JA TOIMINNALLISTA ANALYSOINTIA VARTEN. LOPUKSI EHDOTAMME, ETTÄ YKSITTÄISTEN JUURISOLUJEN GENOMIANALYYSIÄ HIENOSÄÄDETÄÄN VERISUONTEN KANTASOLUJEN LUONTEEN MÄÄRITTELEMISEKSI, KYSYMYS VASTAAMATTA KASVIEN BIOLOGIAAN. EHDOTUKSEN LOPUSSA ESITETÄÄN YLEISESTI OTTAEN INTEGROITU VISIO BR-MERKINANTOJÄRJESTELMÄSTÄ QC:SSÄ JA VERISUONTEN KANTASOLUISTA JA PYRITÄÄN SELVITTÄMÄÄN KANTASOLUJEN UUDET OMINAISUUDET YHDEN SOLUN GENOMIANALYYSIN PERUSTEELLA. (Finnish)
17 August 2022
0 references
IŻ-ŻAMMA TA ‘NIĊEĊ TAĊ-ĊELLOLI OMM FI KWISTJONI ĊENTRALI TA’ BIJOLOĠIJA FUNDAMENTALI. LABORATORJU TA’ DR. CAÑO-DELGADO REĊENTEMENT IDENTIFIKA DIVERSI KOMPONENTI MOLEKULARI MEĦTIEĠA GĦAL CYSESCENCE TAĊ-ĊELLOLA TAN-NICHE TAĊ-ĊELLOLI STAMINALI FL-GĦERQ PRIMARJU TAL-GĦARBIDOPSIS. BRAVO (BRASSINOSTEROIDS F’ĊENTRU VASKULARI U ORGANIZZATTIV) HUWA FATTUR TA’ TRASKRIZZJONI R2R3-MYB LI JIFFUNZJONA BĦALA RIPRESSUR SPEĊIFIKU TAD-DIVIŻJONIJIET TAĊ-ĊELLOLI TAĊ-ĊENTRU CHIESCENT FIN-NICHE TAĊ-ĊELLOLI STAMINALI TAL-GĦERUQ. L-ANALIŻI MOLEKULARI TA’ VIA BRAVO ŻVELAT MEKKANIŻMU LI JIKKONTROLLA D-DIVIŻJONIJIET SPEĊIFIĊI TAĊ-ĊELLOLI TAL-ISTEROJDI MEDJATI MINN BRASINOSTEROIDS. DAWN IR-RIŻULTATI JIFTĦU LINJA ĠDIDA GĦALL-ISTUDJU TAĊ-ĊELLOLI OMM TAL-PJANTA. BĦALISSA, L-IDENTIFIKAZZJONI TAN-NETWERKS TA’ SINJALAR LI JOPERAW MATUL IT-TKABBIR U L-IŻVILUPP TAL-IMPJANT TGĦADDI MILL-INTEGRAZZJONI TA’ DATA ĠENOMIKA MAR-RIŻOLUZZJONI ĊELLULARI, FLIMKIEN MA’ IMMAĠNIJIET TA’ RIŻOLUZZJONI SPAZJALI GĦOLJA U MMUDELLAR MATEMATIKU. F’DIN IL-PROPOSTA, IL-LABORATORJU GĦANDU L-GĦAN LI JIKKARATTERIZZA L-KOMPONENTI L-AKTAR RILEVANTI U SPEĊIFIĊI TAL-PASSAĠĠ BRASINOSTEROID FIN-NIĊĊA TAĊ-ĊELLOLI STAMINALI. BĦALISSA, QED JIĠI ĠĠENERAT GĦADD KBIR TA’ DATA SPEĊIFIKA TRANSCRIPTOMICA MINN ĊELLOLI TAL-GĦERUQ LI JEĦTIEĠU ANALIŻI BIJOINFORMATIKA TAL-OGĦLA LIVELL U GĦODOD KOMPUTAZZJONALI ĠODDA BIEX TIĠI ESTRATTA INFORMAZZJONI STATISTIKA U FUNZJONALMENT SINIFIKANTI. F’DAN IX-XENARJU, L-ONE_CELL JIPPROPONI LI JINKISBU L-ĦILIET TA’ KALKOLU GĦALL-IPPROĊESSAR, L-INTEGRAZZJONI U L-ANALIŻI FUNZJONALI TAD-DATA. FL-AĦĦAR NETT, AĦNA NIPPROPONU LI TIRFINA ANALIŻI ĠENOMIKA FIĊ-ĊELLOLI TAL-GĦERUQ INDIVIDWALI BIEX TIDDEFINIXXI N-NATURA TA ‘ĊELLOLI STAMINALI VASKULARI, U MISTOQSIJA MINGĦAJR MA TWIEĠEB IL-BIJOLOĠIJA TAL-PJANTI. B’MOD ĠENERALI, FI TMIEM IL-PROPOSTA, SE TIĠI PPROVDUTA VIŻJONI INTEGRATA TAS-SINJALAZZJONI BR FIL-QC U Ċ-ĊELLOLI STAMINALI VASKULARI U SE JSIR TENTATTIV BIEX JIĠU DDEĊIFRATI L-KARATTERISTIĊI ĠODDA TAĊ-ĊELLOLI STAMINALI BBAŻATI FUQ L-ANALIŻI ĠENOMIKA TA’ ĊELLOLA WAĦDA. (Maltese)
17 August 2022
0 references
MĀTES ŠŪNU NIŠU UZTURĒŠANA CENTRĀLAJĀ FUNDAMENTĀLĀS BIOLOĢIJAS JAUTĀJUMĀ. DR LABORATORIJA. CAÑO-DELGADO NESEN IDENTIFICĒJA VAIRĀKUS MOLEKULĀROS KOMPONENTUS, KAS NEPIECIEŠAMI CILMES ŠŪNU NIŠAS ŠŪNAI CYSESCENCE ARABIDOPSIS PRIMĀRAJĀ SAKNĒ. BRAVO (BRASINOSTEROĪDI ASINSVADU UN ORGANIZĀCIJAS CENTRĀ) IR TRANSKRIPCIJAS FAKTORS R2R3-MYB, KAS DARBOJAS KĀ SPECIFISKS CHIESCENT CENTRA ŠŪNU DALĪŠANĀS REPRESORS SAKŅU CILMES ŠŪNU NIŠĀ. MOLEKULĀRĀ ANALĪZE CAUR BRAVO IR ATKLĀJIS MEHĀNISMU, KAS KONTROLĒ SPECIFISKO ŠŪNU DALĪŠANOS STEROĪDU MEDIĒTOS BRASINOSTEROIDS. ŠIE REZULTĀTI ATVER JAUNU LĪNIJU AUGU MĀTES ŠŪNU IZPĒTEI. PAŠLAIK, IDENTIFICĒJOT SIGNALIZĀCIJAS TĪKLUS, KAS DARBOJAS AUGA AUGŠANAS UN ATTĪSTĪBAS LAIKĀ, TIEK INTEGRĒTI GENOMIKAS DATI AR ŠŪNU IZŠĶIRTSPĒJU APVIENOJUMĀ AR AUGSTAS TELPISKĀS IZŠĶIRTSPĒJAS UN MATEMĀTISKĀS MODELĒŠANAS ATTĒLIEM. ŠAJĀ PRIEKŠLIKUMĀ LABORATORIJAS MĒRĶIS IR RAKSTUROT SVARĪGĀKĀS UN SPECIFISKĀKĀS BRASINOSTEROID CEĻA SASTĀVDAĻAS CILMES ŠŪNU NIŠĀ. PAŠLAIK LIELS SKAITS KONKRĒTU TRANSCRIPTOMICA DATU TIEK ĢENERĒTI NO SAKŅU ŠŪNĀM, KURĀM NEPIECIEŠAMA VISMODERNĀKĀ BIOINFORMĀTISKĀ ANALĪZE UN JAUNI SKAITĻOŠANAS RĪKI, LAI IEGŪTU STATISTISKU UN FUNKCIONĀLI NOZĪMĪGU INFORMĀCIJU. ŠAJĀ SCENĀRIJĀ ONE_CELL IEROSINA APGŪT APRĒĶINA PRASMES DATU APSTRĀDEI, INTEGRĀCIJAI UN FUNKCIONĀLAJAI ANALĪZEI. VISBEIDZOT, MĒS IEROSINĀM PRECIZĒT GENOMISKO ANALĪZI ATSEVIŠĶĀS SAKŅU ŠŪNĀS, LAI DEFINĒTU ASINSVADU CILMES ŠŪNU RAKSTURU, KAS IR JAUTĀJUMS, NEATBILDOT UZ AUGU BIOLOĢIJU. KOPUMĀ PRIEKŠLIKUMA BEIGĀS TIKS SNIEGTS INTEGRĒTS REDZĒJUMS PAR BR SIGNALIZĒŠANU QC UN ASINSVADU CILMES ŠŪNĀS UN TIKS MĒĢINĀTS ATŠIFRĒT CILMES ŠŪNU JAUNĀS ĪPAŠĪBAS, PAMATOJOTIES UZ VIENAS ŠŪNAS GENOMISKO ANALĪZI. (Latvian)
17 August 2022
0 references
UDRŽIAVANIE VÝKLENKOV MATERSKÝCH BUNIEK V ÚSTREDNEJ OTÁZKE ZÁKLADNEJ BIOLÓGIE. DR. JE LABÁK. CAÑO-DELGADO NEDÁVNO IDENTIFIKOVAL NIEKOĽKO MOLEKULÁRNYCH ZLOŽIEK POTREBNÝCH PRE BUNKU CYSESCENCE VÝKLENKU KMEŇOVÝCH BUNIEK V PRIMÁRNOM KOREŇI ARABIDOPSIS. BRAVO (BRASSINOSTEROIDY VO VASKULÁRNOM A ORGANIZAČNOM CENTRE) JE TRANSKRIPČNÝ FAKTOR R2R3-MYB, KTORÝ FUNGUJE AKO ŠPECIFICKÝ REPRESOR BUNKOVÝCH DIVÍZIÍ CENTRA CHIESCENT VO VÝKLENKU KOREŇOVÝCH KMEŇOVÝCH BUNIEK. MOLEKULÁRNA ANALÝZA CEZ BRAVO ODHALILA MECHANIZMUS, KTORÝ KONTROLUJE ŠPECIFICKÉ BUNKOVÉ DELENIA STEROIDOV SPROSTREDKOVANÉ BRASINOSTEROIDS. TIETO VÝSLEDKY OTVÁRAJÚ NOVÚ LÍNIU PRE ŠTÚDIUM MATERSKÝCH BUNIEK RASTLINY. V SÚČASNOSTI IDENTIFIKÁCIA SIGNALIZAČNÝCH SIETÍ, KTORÉ FUNGUJÚ POČAS RASTU A VÝVOJA RASTLINY, PRECHÁDZA INTEGRÁCIOU GENOMICKÝCH ÚDAJOV S BUNKOVÝM ROZLÍŠENÍM V KOMBINÁCII S OBRAZMI S VYSOKÝM PRIESTOROVÝM ROZLÍŠENÍM A MATEMATICKÝM MODELOVANÍM. V TOMTO NÁVRHU SA LABORATÓRIUM ZAMERIAVA NA CHARAKTERIZÁCIU NAJRELEVANTNEJŠÍCH A NAJŠPECIFICKEJŠÍCH ZLOŽIEK DRÁHY BRASINOSTEROID VO VÝKLENKU KMEŇOVÝCH BUNIEK. V SÚČASNOSTI SA VEĽKÉ MNOŽSTVO ŠPECIFICKÝCH ÚDAJOV TRANSCRIPTOMICA GENERUJE Z KOREŇOVÝCH BUNIEK, KTORÉ SI VYŽADUJÚ NAJMODERNEJŠIU BIOINFORMATICKÚ ANALÝZU A NOVÉ VÝPOČTOVÉ NÁSTROJE NA EXTRAKCIU ŠTATISTICKÝCH A FUNKČNE VÝZNAMNÝCH INFORMÁCIÍ. V TOMTO SCENÁRI ONE_CELL NAVRHUJE ZÍSKAŤ VÝPOČTOVÉ ZRUČNOSTI NA SPRACOVANIE, INTEGRÁCIU A FUNKČNÚ ANALÝZU ÚDAJOV. NAKONIEC NAVRHUJEME DOLADIŤ GENOMICKÚ ANALÝZU V JEDNOTLIVÝCH KOREŇOVÝCH BUNKÁCH, ABY SME DEFINOVALI POVAHU VASKULÁRNYCH KMEŇOVÝCH BUNIEK, ČO JE OTÁZKA BEZ ODPOVEDE NA BIOLÓGIU RASTLÍN. VO VŠEOBECNOSTI SA NA KONCI NÁVRHU POSKYTNE INTEGROVANÉ VIDENIE SIGNALIZÁCIE BR V QC A CIEVNYCH KMEŇOVÝCH BUNKÁCH A UROBÍ SA POKUS O DEŠIFROVANIE NOVÝCH CHARAKTERISTÍK KMEŇOVÝCH BUNIEK NA ZÁKLADE GENÓMOVEJ ANALÝZY JEDNEJ BUNKY. (Slovak)
17 August 2022
0 references
COTHABHÁIL NIDEOIGE NA MÁTHAR CILLE I GCEIST LÁRNACH DE BHITHEOLAÍOCHT BHUNÚSACH. TÁ AN TSAOTHARLANN. TÁ CAÑO-DELGADO TAR ÉIS ROINNT COMHPHÁIRTEANNA MÓILÍNEACHA A AITHINT LE DÉANAÍ ATÁ RIACHTANACH DO CYSESCENCE CILLE AN NIDEOIGE GASCHEALL I BPRÍOMHFHRÉAMH ARABIDOPSIS. IS FACHTÓIR TRAS-SCRÍOFA É BRAVO (BRASSINOSTEROIDS AG IONAD SOITHÍOCH AGUS EAGRAITHE) R2R3-MYB A FHEIDHMÍONN MAR REPRESSOR SONRACH DE RANNÁIN CILLE AN IONAID CHIESCENT SA NIDEOIGE GASCHEALL FRÉIMHE. TÁ AN ANAILÍS MHÓILÍNEACH TRÍ BRAVO LÉIRIGH MEICNÍOCHT A RIALAÍONN NA RANNÁIN CILLE SONRACHA DE STÉARÓIDIGH IDIRGHABHÁIL AG BRASINOSTEROIDS. OSCLAÍONN NA TORTHAÍ SEO LÍNE NUA CHUN STAIDÉAR A DHÉANAMH AR CHEALLA MHÁTHAIR AN GHLÉASRA. FAOI LÁTHAIR, TÉANN SAINAITHINT LÍONRAÍ COMHARTHAÍOCHTA A OIBRÍONN LE LINN FHÁS AGUS FHORBAIRT AN GHLÉASRA TRÍ CHOMHTHÁTHÚ SONRAÍ GÉANÓMAÍOCHA LE TAIFEACH CEALLACH, IN ÉINEACHT LE HÍOMHÁNNA DE ARDTAIFEACH SPÁSÚIL AGUS SAMHALTÚ MATAMAITICIÚIL. SA TOGRA SEO, TÁ SÉ MAR AIDHM AG AN TSAOTHARLANN NA COMHPHÁIRTEANNA IS ÁBHARTHA AGUS IS SONRAÍ DE CHONAIR BRASINOSTEROID I NIDEOIGE GASCHEALLA A THRÉITHRIÚ. FAOI LÁTHAIR, TÁ LÍON MÓR SONRAÍ SONRACHA TRANSCRIPTOMICA Á NGINIÚINT Ó FHRÉAMHCHEALLA A ÉILÍONN ANAILÍS BHITHFHAISNÉISEACH ÚRSCOTHACH AGUS UIRLISÍ RÍOMHAIREACHTA NUA CHUN FAISNÉIS STAIDRIMH AGUS FAISNÉIS ATÁ SUNTASACH Ó THAOBH FEIDHME DE A BHAINT AMACH. SA CHÁS SEO, MOLANN AN ONE_CELL NA SCILEANNA RÍOFA A FHÁIL MAIDIR LE PRÓISEÁIL, COMHTHÁTHÚ AGUS ANAILÍS FHEIDHMIÚIL NA SONRAÍ. AR DEIREADH, MOLAIMID ANAILÍS GHÉANÓMAÍOCHTA FÍNEÁIL-TUNE I BHFRÉAMHCHEALLA AONAIR CHUN NÁDÚR GASCHEALL SOITHÍOCH A SHAINMHÍNIÚ, CEIST GAN FREAGRA A THABHAIRT AR BHITHEOLAÍOCHT PLANDAÍ. GO GINEARÁLTA, AG DEIREADH AN TOGRA, CUIRFEAR FÍS CHOMHTHÁITE AR FÁIL DEN CHOMHARTHAÍOCHT BR SA QC AGUS SNA GASCHEALLA SOITHÍOCH AGUS DÉANFAR IARRACHT TRÉITHE NÚÍOSACHA GASCHEALLA A NOCHTADH BUNAITHE AR ANAILÍS GHÉANÓMAÍOCH AR CHILL AMHÁIN. (Irish)
17 August 2022
0 references
UDRŽOVÁNÍ MATEŘSKÝCH BUNĚČNÝCH VÝKLENEK V ÚSTŘEDNÍ OTÁZCE ZÁKLADNÍ BIOLOGIE. V LABORATOŘI DOKTORA. CAÑO-DELGADO NEDÁVNO IDENTIFIKOVAL NĚKOLIK MOLEKULÁRNÍCH SLOŽEK NEZBYTNÝCH PRO BUNĚČNOU CYSESCENCE VÝKLENKU KMENOVÝCH BUNĚK V PRIMÁRNÍ KOŘENI ARABIDOPSIS. BRAVO (BRASSINOSTEROIDY VE VASKULÁRNÍM A ORGANIZAČNÍM CENTRU) JE TRANSKRIPČNÍ FAKTOR R2R3-MYB, KTERÝ FUNGUJE JAKO SPECIFICKÝ REPRESOR BUNĚČNÝCH DĚLENÍ CENTRA CHIESCENT VE VÝKLENKU KOŘENOVÝCH KMENOVÝCH BUNĚK. MOLEKULÁRNÍ ANALÝZA PŘES BRAVO ODHALILA MECHANISMUS, KTERÝ KONTROLUJE SPECIFICKÉ BUNĚČNÉ DĚLENÍ STEROIDŮ ZPROSTŘEDKOVANÝCH BRASINOSTEROIDS. TYTO VÝSLEDKY OTEVÍRAJÍ NOVOU LINII PRO STUDIUM MATEŘSKÝCH BUNĚK ROSTLINY. V SOUČASNÉ DOBĚ SE IDENTIFIKACE SIGNÁLNÍCH SÍTÍ, KTERÉ FUNGUJÍ BĚHEM RŮSTU A VÝVOJE ZÁVODU, PROCHÁZÍ INTEGRACÍ GENOMICKÝCH DAT S BUNĚČNÝM ROZLIŠENÍM V KOMBINACI S OBRAZY S VYSOKÝM PROSTOROVÝM ROZLIŠENÍM A MATEMATICKÝM MODELOVÁNÍM. CÍLEM LABORATOŘE JE V TOMTO NÁVRHU CHARAKTERIZOVAT NEJDŮLEŽITĚJŠÍ A NEJKONKRÉTNĚJŠÍ SLOŽKY DRÁHY BRASINOSTEROID VE VÝKLENKU KMENOVÝCH BUNĚK. V SOUČASNÉ DOBĚ JE Z KOŘENOVÝCH BUNĚK GENEROVÁNO VELKÉ MNOŽSTVÍ SPECIFICKÝCH DAT TRANSCRIPTOMICA, KTERÉ VYŽADUJÍ NEJMODERNĚJŠÍ BIOINFORMATICKOU ANALÝZU A NOVÉ VÝPOČETNÍ NÁSTROJE PRO EXTRAKCI STATISTICKÝCH A FUNKČNĚ VÝZNAMNÝCH INFORMACÍ. V TOMTO SCÉNÁŘI ONE_CELL NAVRHUJE ZÍSKAT VÝPOČETNÍ DOVEDNOSTI PRO ZPRACOVÁNÍ, INTEGRACI A FUNKČNÍ ANALÝZU DAT. NAKONEC NAVRHUJEME DOLADIT GENOMOVOU ANALÝZU V JEDNOTLIVÝCH KOŘENOVÝCH BUŇKÁCH, ABYCHOM DEFINOVALI POVAHU CÉVNÍCH KMENOVÝCH BUNĚK, COŽ JE OTÁZKA BEZ ODPOVĚDI NA BIOLOGII ROSTLIN. OBECNĚ PLATÍ, ŽE NA KONCI NÁVRHU BUDE POSKYTNUTA INTEGROVANÁ VIZE SIGNALIZACE BR V QC A CÉVNÍCH KMENOVÝCH BUŇKÁCH A POKUSÍ SE DEŠIFROVAT NOVÉ VLASTNOSTI KMENOVÝCH BUNĚK NA ZÁKLADĚ GENOMICKÉ ANALÝZY JEDNÉ BUŇKY. (Czech)
17 August 2022
0 references
A MANUTENÇÃO DOS NICOS CELULARES MÃE EM QUESTÃO CENTRAL DA BIOLOGIA FUNDAMENTAL. O laboratório da DR. CAÑO-DELGADO IDENTIFICOU IGUALDADE DE COMPONENTES MOLECULARES NECESSÁRIOS PARA A CISESCÊNCIA CELULAR DO NIQUE CELULAR DO SISTEMA NA ROTA PRIMÁRIA DA ARABIDOPSE. BRAVO (BRASSINOSTERÓIDOS NO CENTRO VASCULAR E ORGANIZADOR) É UM FATOR DE TRANSCRIÇÃO R2R3-MYB QUE FUNCIONA COMO REPRESSOR ESPECÍFICO DAS DIVISÃOS DE CÉLULAS DO CENTRO DE CIESCENTES NO NICHE DE CÉLULAS DO SISTEMA ROOT. A ANÁLISE MOLECULAR DE VIA BRAVO REVELOU UM MECANISMO QUE CONTROLE AS DIVISÃOS CELULARES ESPECÍFICAS DE ESTERÓIDOS MEDIADOS POR BRASINOSTERÓIDOS. Estes resultados abrem uma nova linha para o estudo das células-mãe da planta. Atualmente, a identificação das redes de sinalização que funcionam durante o crescimento e o desenvolvimento da planta passa pela integração dos dados genéticos com a resolução celular, em combinação com imagens de alta resolução espacial e modelagem matemática. Nesta proposta, o laboratório pretende caracterizar os componentes mais relevantes e específicos do percurso de BRASINOSTEROID no nicho das células estaminais. Atualmente, está a ser gerado um grande número de dados transcritómicos específicos a partir de células-raiz que exigem uma análise bioinformática completa e novas ferramentas informáticas para extrair informações estatísticas e funcionalmente significativas. NESTE CENÁRIO, O UM_CELL PROPÕE ADQUIRIR AS COMPETÊNCIAS DE CÁLCULO PARA O TRATAMENTO, INTEGRAÇÃO E ANÁLISE FUNCIONAL DOS DADOS. Por fim, propomos uma análise genómica completa em células de raiz individuais para delinear a natureza das células estaminais vasculares, uma questão sem responder à biologia das plantas. Em geral, no final da proposta, será fornecida uma visão integrada da BR que assinale o QC e as células-tronco vasculares e será feito um atentado para determinar as características novas das células-tronco baseadas na análise genética de uma única célula. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
EMARAKKUDE NIŠŠIDE SÄILITAMINE FUNDAMENTAALBIOLOOGIA KESKSES KÜSIMUSES. DRI LABOR. CAÑO-DELGADO ON HILJUTI KINDLAKS TEINUD MITU MOLEKULAARSET KOMPONENTI, MIS ON VAJALIKUD TÜVIRAKKUDE NIŠI RAKU CYSESCENCE’I JAOKS ARABIDOPSIS’E PÕHIJUURES. BRAVO (BRASSINOSTEROIDID VERESOONKONNAS JA ORGANISEERIMISKESKUSES) ON TRANSKRIPTSIOONIFAKTOR R2R3-MYB, MIS TOIMIB SPETSIAALSE REPRESSIOONINA CHIESCENTI KESKUSE RAKUJAOTUSTE SUHTES JUURE TÜVIRAKKUDE NIŠIS. BRAVO MOLEKULAARANALÜÜS ON NÄIDANUD MEHHANISMI, MIS KONTROLLIB BRASINOSTEROIDS’I POOLT VAHENDATUD STEROIDIDE SPETSIIFILISI RAKKUDE JAGUNEMIST. NEED TULEMUSED AVAVAD UUE REA TAIME EMARAKKUDE UURIMISEKS. PRAEGU TOIMUB TAIME KASVU JA ARENGU AJAL TOIMIVATE SIGNAALIVÕRKUDE KINDLAKSTEGEMINE LÄBI GENOOMILISTE ANDMETE INTEGREERIMISE RAKULISE RESOLUTSIOONIGA KOOS SUURE RUUMILISE LAHUTUSVÕIME JA MATEMAATILISE MODELLEERIMISEGA. KÄESOLEVAS ETTEPANEKUS ON LABORI EESMÄRK ISELOOMUSTADA TÜVIRAKKUDE NIŠI BRASINOSTEROID RADA KÕIGE ASJAKOHASEMAID JA SPETSIIFILISEMAID KOMPONENTE. PRAEGU SAADAKSE PALJU SPETSIIFILISI TRANSCRIPTOMICA ANDMEID JUURRAKKUDEST, MIS NÕUAVAD TIPPTASEMEL BIOINFORMAATIKAANALÜÜSI JA UUSI ARVUTUSVAHENDEID STATISTILISE JA FUNKTSIONAALSELT OLULISE TEABE SAAMISEKS. SELLE STSENAARIUMI PUHUL TEEB ONE_CELL ETTEPANEKU OMANDADA ARVUTUSOSKUSED ANDMETE TÖÖTLEMISEKS, INTEGREERIMISEKS JA FUNKTSIONAALSEKS ANALÜÜSIKS. LÕPUKS TEEME ETTEPANEKU PEENHÄÄLESTADA GENOOMILIST ANALÜÜSI ÜKSIKUTES JUURRAKKUDES, ET MÄÄRATLEDA VERESOONTE TÜVIRAKKUDE OLEMUS, MIS ON KÜSIMUS, VASTAMATA TAIMEDE BIOLOOGIALE. ÜLDISELT ESITATAKSE ETTEPANEKU LÕPUS TERVIKLIK VISIOON BR SIGNAALIST QC-S JA VERESOONTE TÜVIRAKKUDES NING KATSE DEŠIFREERIDA TÜVIRAKKUDE UUDSEID OMADUSI, TUGINEDES ÜHE RAKU GENOOMIANALÜÜSILE. (Estonian)
17 August 2022
0 references
AZ ANYASEJT FÜLKÉK FENNTARTÁSA AZ ALAPVETŐ BIOLÓGIA KÖZPONTI KÉRDÉSÉBEN. DR. LABORJA. CAÑO-DELGADO A KÖZELMÚLTBAN SZÁMOS MOLEKULÁRIS KOMPONENST AZONOSÍTOTT, AMELYEK AZ ARABIDOPSIS ELSŐDLEGES GYÖKERÉBEN LÉVŐ ŐSSEJT RÉS SEJT CYSESCENCE-JÉHEZ SZÜKSÉGESEK. BRAVO (BRASSINOSZTEROIDOK AZ ÉRRENDSZERI ÉS SZERVEZŐ KÖZPONTBAN) EGY R2R3-MYB TRANSZKRIPCIÓS FAKTOR, AMELY A CHIESCENT KÖZPONT SEJTOSZTÓDÁSAINAK SPECIFIKUS REPRESSZORAKÉNT MŰKÖDIK A GYÖKÉR ŐSSEJT RÉSBEN. A BRAVO-N KERESZTÜL VÉGZETT MOLEKULÁRIS ANALÍZIS EGY OLYAN MECHANIZMUST TÁRT FEL, AMELY SZABÁLYOZZA A BRASINOSTEROIDS ÁLTAL KÖZVETÍTETT SZTEROIDOK SPECIFIKUS SEJTOSZTÓDÁSAIT. EZEK AZ EREDMÉNYEK ÚJ VONALAT NYITNAK A NÖVÉNY ANYASEJTJEINEK TANULMÁNYOZÁSÁRA. JELENLEG A NÖVÉNY NÖVEKEDÉSE ÉS FEJLŐDÉSE SORÁN MŰKÖDŐ JELZŐHÁLÓZATOK AZONOSÍTÁSA A GENOMIKUS ADATOK CELLULÁRIS FELBONTÁSSAL TÖRTÉNŐ INTEGRÁLÁSÁN MEGY KERESZTÜL, A NAGY TÉRBELI FELBONTÁS ÉS A MATEMATIKAI MODELLEZÉS KÉPEIVEL KOMBINÁLVA. EBBEN A JAVASLATBAN A LABORATÓRIUM A BRASINOSTEROID ÚTVONAL LEGRELEVÁNSABB ÉS LEGSPECIFIKUSABB ÖSSZETEVŐINEK JELLEMZÉSÉRE TÖREKSZIK AZ ŐSSEJTEK RÉSÉBEN. JELENLEG SZÁMOS SPECIFIKUS TRANSCRIPTOMICA-ADAT GENERÁL OLYAN GYÖKÉRSEJTEKBŐL, AMELYEK A LEGKORSZERŰBB BIOINFORMATIKAI ELEMZÉST ÉS ÚJ SZÁMÍTÁSI ESZKÖZÖKET IGÉNYELNEK A STATISZTIKAI ÉS FUNKCIONÁLISAN JELENTŐS INFORMÁCIÓK KINYERÉSÉHEZ. EBBEN A FORGATÓKÖNYVBEN AZ ONE_CELL AZ ADATOK FELDOLGOZÁSÁHOZ, INTEGRÁLÁSÁHOZ ÉS FUNKCIONÁLIS ELEMZÉSÉHEZ SZÜKSÉGES SZÁMÍTÁSI KÉSZSÉGEK ELSAJÁTÍTÁSÁT JAVASOLJA. VÉGÜL JAVASOLJUK AZ EGYES GYÖKÉRSEJTEK GENOMIKUS ANALÍZISÉNEK FINOMHANGOLÁSÁT AZ ÉRRENDSZERI ŐSSEJTEK TERMÉSZETÉNEK MEGHATÁROZÁSA ÉRDEKÉBEN, EGY OLYAN KÉRDÉST, AMELY NEM VÁLASZOL A NÖVÉNYEK BIOLÓGIÁJÁRA. ÁLTALÁNOSSÁGBAN ELMONDHATÓ, HOGY A JAVASLAT VÉGÉN A QC-BEN ÉS AZ ÉRRENDSZERI ŐSSEJTEKBEN A BR JELZÉSRE VONATKOZÓ INTEGRÁLT ELKÉPZELÉST FOGNAK BIZTOSÍTANI, ÉS KÍSÉRLETET TESZNEK AZ ŐSSEJTEK ÚJ JELLEMZŐINEK EGY SEJT GENOMANALÍZISE ALAPJÁN TÖRTÉNŐ MEGFEJTÉSÉRE. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
ПОДДЪРЖАНЕТО НА НИШИ НА МАЙЧИНИТЕ КЛЕТКИ В ЦЕНТРАЛЕН ВЪПРОС НА ФУНДАМЕНТАЛНАТА БИОЛОГИЯ. ЛАБОРАТОРИЯТА НА Д.Р. CAÑO-DELGADO НАСКОРО ИДЕНТИФИЦИРА НЯКОЛКО МОЛЕКУЛЯРНИ КОМПОНЕНТА, НЕОБХОДИМИ ЗА КЛЕТЪЧНАТА CYSESCENCE НА НИШАТА НА СТВОЛОВИТЕ КЛЕТКИ В ПЪРВИЧНИЯ КОРЕН НА ARABIDOPSIS. БРАВО (БРАСИНОСТЕРОИДИ В СЪДОВИЯ И ОРГАНИЗИРАЩ ЦЕНТЪР) Е ТРАНСКРИПЦИОНЕН ФАКТОР R2R3-MYB, КОЙТО ФУНКЦИОНИРА КАТО СПЕЦИФИЧЕН РЕПРЕСОР НА КЛЕТЪЧНИТЕ ДЕЛЕНИЯ НА ЦЕНТЪРА CHIESCENT В НИША НА КОРЕНОВИТЕ СТВОЛОВИ КЛЕТКИ. МОЛЕКУЛЯРНИЯТ АНАЛИЗ НА VIA BRAVO Е ПОКАЗАЛ МЕХАНИЗЪМ, КОЙТО КОНТРОЛИРА СПЕЦИФИЧНИТЕ КЛЕТЪЧНИ ДЕЛЕНИЯ НА СТЕРОИДИТЕ, МЕДИИРАНИ ОТ BRASINOSTEROIDS. ТЕЗИ РЕЗУЛТАТИ ОТВАРЯТ НОВА ЛИНИЯ ЗА ИЗСЛЕДВАНЕ НА МАЙЧИНИТЕ КЛЕТКИ НА РАСТЕНИЕТО. ПОНАСТОЯЩЕМ ИДЕНТИФИЦИРАНЕТО НА СИГНАЛНИТЕ МРЕЖИ, КОИТО ФУНКЦИОНИРАТ ПО ВРЕМЕ НА РАСТЕЖА И РАЗВИТИЕТО НА РАСТЕНИЕТО, ПРЕМИНАВА ПРЕЗ ИНТЕГРИРАНЕ НА ГЕНОМНИ ДАННИ С КЛЕТЪЧНА РАЗДЕЛИТЕЛНА СПОСОБНОСТ, В КОМБИНАЦИЯ С ИЗОБРАЖЕНИЯ С ВИСОКА ПРОСТРАНСТВЕНА РАЗДЕЛИТЕЛНА СПОСОБНОСТ И МАТЕМАТИЧЕСКО МОДЕЛИРАНЕ. В НАСТОЯЩОТО ПРЕДЛОЖЕНИЕ ЛАБОРАТОРИЯТА ИМА ЗА ЦЕЛ ДА ХАРАКТЕРИЗИРА НАЙ-ВАЖНИТЕ И СПЕЦИФИЧНИ КОМПОНЕНТИ НА ПЪТЯ BRASINOSTEROID В НИШАТА НА СТВОЛОВИТЕ КЛЕТКИ. ПОНАСТОЯЩЕМ ГОЛЯМ БРОЙ СПЕЦИФИЧНИ ДАННИ ЗА TRANSCRIPTOMICA СЕ ГЕНЕРИРАТ ОТ КОРЕНОВИ КЛЕТКИ, КОИТО ИЗИСКВАТ НАЙ-СЪВРЕМЕНЕН БИОИНФОРМАТИЧЕН АНАЛИЗ И НОВИ ИЗЧИСЛИТЕЛНИ ИНСТРУМЕНТИ ЗА ИЗВЛИЧАНЕ НА СТАТИСТИЧЕСКА И ФУНКЦИОНАЛНО ЗНАЧИМА ИНФОРМАЦИЯ. ПРИ ТОЗИ СЦЕНАРИЙ ONE_CELL ПРЕДЛАГА ДА СЕ ПРИДОБИЯТ ИЗЧИСЛИТЕЛНИ УМЕНИЯ ЗА ОБРАБОТКА, ИНТЕГРИРАНЕ И ФУНКЦИОНАЛЕН АНАЛИЗ НА ДАННИТЕ. И НАКРАЯ, ПРЕДЛАГАМЕ ДА СЕ ПРЕЦИЗИРА ГЕНОМНИЯТ АНАЛИЗ В ОТДЕЛНИТЕ КОРЕНОВИ КЛЕТКИ, ЗА ДА СЕ ОПРЕДЕЛИ ЕСТЕСТВОТО НА СЪДОВИТЕ СТВОЛОВИ КЛЕТКИ, ВЪПРОС, БЕЗ ДА СЕ ОТГОВАРЯ НА БИОЛОГИЯТА НА РАСТЕНИЯТА. КАТО ЦЯЛО В КРАЯ НА ПРЕДЛОЖЕНИЕТО ЩЕ БЪДЕ ОСИГУРЕНА ИНТЕГРИРАНА ВИЗИЯ ЗА СИГНАЛИЗИРАНЕТО НА BR В QC И СЪДОВИТЕ СТВОЛОВИ КЛЕТКИ И ЩЕ БЪДЕ НАПРАВЕН ОПИТ ЗА ДЕШИФРИРАНЕ НА НОВИТЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ НА СТВОЛОВИТЕ КЛЕТКИ ВЪЗ ОСНОВА НА ГЕНОМНИЯ АНАЛИЗ НА ЕДНА-ЕДИНСТВЕНА КЛЕТКА. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
MOTININIŲ LĄSTELIŲ NIŠŲ IŠLAIKYMAS VIENU IŠ PAGRINDINIŲ BIOLOGIJOS KLAUSIMŲ. DR LABORATORIJA. CAÑO-DELGADO NESENIAI NUSTATĖ KELIS MOLEKULINIUS KOMPONENTUS, REIKALINGUS KAMIENINIŲ LĄSTELIŲ NIŠAI, ESANČIAI PIRMINĖJE ARABIDOPSIO ŠAKNYJE, LĄSTELIŲ CYSESCENCE. BRAVO (BRASSINOSTEROIDAI KRAUJAGYSLIŲ IR ORGANIZACINIAME CENTRE) YRA TRANSKRIPCIJOS FAKTORIUS R2R3-MYB, VEIKIANTIS KAIP SPECIFINIS CHIESCENT CENTRO LĄSTELIŲ DALIJIMO Į ŠAKNŲ KAMIENINIŲ LĄSTELIŲ NIŠĄ REPRESORIUS. MOLEKULINĖ ANALIZĖ PER BRAVO ATSKLEIDĖ MECHANIZMĄ, KURIS KONTROLIUOJA SPECIFINIUS LĄSTELIŲ DALIJIMĄSI STEROIDAIS, TARPININKAUJANT BRASINOSTEROIDS. ŠIE REZULTATAI ATVERIA NAUJĄ LINIJĄ AUGALŲ MOTININIŲ LĄSTELIŲ TYRIMUI. ŠIUO METU NUSTATANT SIGNALIZACIJOS TINKLUS, KURIE VEIKIA AUGALO AUGIMO IR PLĖTROS METU, INTEGRUOJAMI GENOMINIAI DUOMENYS SU KORINE RAIŠKA, KARTU SU DIDELĖS ERDVINĖS SKIRIAMOSIOS GEBOS IR MATEMATINIO MODELIAVIMO VAIZDAIS. ŠIAME PASIŪLYME LABORATORIJA SIEKIA APIBŪDINTI SVARBIAUSIUS IR KONKREČIUS BRASINOSTEROID KELIO ELEMENTUS KAMIENINIŲ LĄSTELIŲ NIŠOJE. ŠIUO METU DAUG KONKREČIŲ TRANSCRIPTOMICA DUOMENŲ GENERUOJAMI IŠ ŠAKNINIŲ LĄSTELIŲ, KURIOMS REIKALINGA NAUJAUSIA BIOINFORMATINĖ ANALIZĖ IR NAUJOS SKAIČIAVIMO PRIEMONĖS STATISTINEI IR FUNKCINE PRASME REIKŠMINGAI INFORMACIJAI GAUTI. PAGAL ŠĮ SCENARIJŲ ONE_CELL SIŪLO ĮGYTI SKAIČIAVIMO ĮGŪDŽIŲ DUOMENIMS APDOROTI, INTEGRUOTI IR ANALIZUOTI. GALIAUSIAI SIŪLOME TIKSLIAI SUDERINTI GENOMINĘ ANALIZĘ ATSKIROSE ŠAKNŲ LĄSTELĖSE, KAD BŪTŲ APIBRĖŽTAS KRAUJAGYSLIŲ KAMIENINIŲ LĄSTELIŲ POBŪDIS, KLAUSIMAS NEATSAKANT Į AUGALŲ BIOLOGIJĄ. APSKRITAI PASIŪLYMO PABAIGOJE BUS PATEIKTA INTEGRUOTA BR SIGNALIZAVIMO QC IR KRAUJAGYSLIŲ KAMIENINĖSE LĄSTELĖSE VIZIJA IR BUS BANDOMA IŠŠIFRUOTI NAUJAS KAMIENINIŲ LĄSTELIŲ SAVYBES REMIANTIS VIENOS LĄSTELĖS GENOMINE ANALIZE. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
ODRŽAVANJE NIŠA MAJKI U SREDIŠNJEM PITANJU TEMELJNE BIOLOGIJE. DR.-OV LABORATORIJ. CAÑO-DELGADO JE NEDAVNO IDENTIFICIRAO NEKOLIKO MOLEKULARNIH KOMPONENTI POTREBNIH ZA STANIČNU CYSESCENCE NIŠU MATIČNIH STANICA U PRIMARNOM KORIJENU ARABIDOPSIS. BRAVO (BRASSINOSTEROIDI U VASKULARNOM I ORGANIZACIJSKOM CENTRU) JE TRANSKRIPCIJSKI FAKTOR R2R3-MYB KOJI DJELUJE KAO SPECIFIČAN REPRESOR STANIČNIH DIJELOVA CHIESCENT CENTRA U NIŠI KORIJENSKIH MATIČNIH STANICA. MOLEKULARNA ANALIZA LIJEKA BRAVO OTKRILA JE MEHANIZAM KOJI KONTROLIRA SPECIFIČNE STANIČNE DIOBE STEROIDA POSREDOVANE BRASINOSTEROIDS-OM. OVI REZULTATI OTVARAJU NOVU LINIJU ZA PROUČAVANJE MATIČNIH STANICA BILJKE. TRENUTAČNO IDENTIFIKACIJA SIGNALNIH MREŽA KOJE DJELUJU TIJEKOM RASTA I RAZVOJA POSTROJENJA PROLAZI KROZ INTEGRACIJU GENOMSKIH PODATAKA S STANIČNOM REZOLUCIJOM, U KOMBINACIJI SA SLIKAMA VISOKE PROSTORNE RAZLUČIVOSTI I MATEMATIČKOG MODELIRANJA. U OVOM PRIJEDLOGU LABORATORIJ NASTOJI OKARAKTERIZIRATI NAJRELEVANTNIJE I NAJPOSEBNIJE KOMPONENTE PUTA BRASINOSTEROID U NIŠI MATIČNIH STANICA. TRENUTAČNO SE GENERIRA VELIK BROJ SPECIFIČNIH PODATAKA TRANSCRIPTOMICA IZ KORIJENSKIH STANICA ZA KOJE JE POTREBNA NAJSUVREMENIJA BIOINFORMATIČKA ANALIZA I NOVI RAČUNALNI ALATI ZA IZDVAJANJE STATISTIČKIH I FUNKCIONALNO ZNAČAJNIH INFORMACIJA. U TOM SCENARIJU ONE_CELL PREDLAŽE STJECANJE VJEŠTINA IZRAČUNA ZA OBRADU, INTEGRACIJU I FUNKCIONALNU ANALIZU PODATAKA. KONAČNO, PREDLAŽEMO FINO PODEŠAVANJE GENOMSKE ANALIZE U POJEDINIM KORIJENSKIM STANICAMA KAKO BI SE DEFINIRALA PRIRODA VASKULARNIH MATIČNIH STANICA, PITANJE BEZ ODGOVORA NA BIOLOGIJU BILJAKA. OPĆENITO, NA KRAJU PRIJEDLOGA OSIGURAT ĆE SE INTEGRIRANA VIZIJA SIGNALIZACIJE BR-A U QC-U I VASKULARNIM MATIČNIM STANICAMA TE ĆE SE POKUŠATI DEŠIFRIRATI NOVE KARAKTERISTIKE MATIČNIH STANICA NA TEMELJU GENOMSKE ANALIZE JEDNE STANICE. (Croatian)
17 August 2022
0 references
UPPRÄTTHÅLLANDET AV MODERCELL NISCHER I EN CENTRAL FRÅGA OM GRUNDLÄGGANDE BIOLOGI. DR:S LABB. CAÑO-DELGADO HAR NYLIGEN IDENTIFIERAT FLERA MOLEKYLÄRA KOMPONENTER SOM ÄR NÖDVÄNDIGA FÖR CELL CYSESCENCE AV STAMCELL NISCH I DEN PRIMÄRA ROTEN AV ARABIDOPSIS. BRAVO (BRASSINOSTEROIDER VID KÄRL- OCH ORGANISERINGSCENTRUM) ÄR EN TRANSKRIPTIONSFAKTOR R2R3-MYB SOM FUNGERAR SOM EN SPECIFIK UNDERTRYCKARE AV CELLDELNINGARNA I CHIESCENT-CENTRET I ROTSTAMCELLSNISCHEN. DEN MOLEKYLÄRA ANALYSEN AV VIA BRAVO HAR AVSLÖJAT EN MEKANISM SOM STYR SPECIFIKA CELLDELNINGAR AV STEROIDER MEDIERADE AV BRASINOSTEROIDS. DESSA RESULTAT ÖPPNAR EN NY LINJE FÖR STUDIEN AV MODERCELLERNA I VÄXTEN. FÖR NÄRVARANDE GÅR IDENTIFIERINGEN AV SIGNALNÄTVERK SOM FUNGERAR UNDER ANLÄGGNINGENS TILLVÄXT OCH UTVECKLING GENOM INTEGRERING AV GENOMDATA MED CELLUPPLÖSNING, I KOMBINATION MED BILDER AV HÖG RUMSLIG UPPLÖSNING OCH MATEMATISK MODELLERING. I DETTA FÖRSLAG SYFTAR LABORATORIET TILL ATT KARAKTERISERA DE MEST RELEVANTA OCH SPECIFIKA KOMPONENTERNA I BRASINOSTEROID-VÄGEN I NISCHEN AV STAMCELLER. FÖR NÄRVARANDE GENERERAS ETT STORT ANTAL SPECIFIKA TRANSCRIPTOMICA-DATA FRÅN ROTCELLER SOM KRÄVER STATE-OF-THE-ART BIOINFORMATISK ANALYS OCH NYA BERÄKNINGSVERKTYG FÖR ATT EXTRAHERA STATISTISK OCH FUNKTIONELLT SIGNIFIKANT INFORMATION. I DETTA SCENARIO FÖRESLÅR ONE_CELL ATT MAN SKAFFAR SIG BERÄKNINGSFÄRDIGHETER FÖR BEARBETNING, INTEGRATION OCH FUNKTIONELL ANALYS AV DATA. SLUTLIGEN FÖRESLÅR VI ATT FINJUSTERA GENOMISK ANALYS I ENSKILDA ROTCELLER FÖR ATT DEFINIERA KARAKTÄREN AV VASKULÄRA STAMCELLER, EN FRÅGA UTAN ATT BESVARA VÄXTERNAS BIOLOGI. I SLUTET AV FÖRSLAGET KOMMER I ALLMÄNHET EN INTEGRERAD VISION AV BR-SIGNALERING I QC OCH VASKULÄRA STAMCELLER ATT TILLHANDAHÅLLAS OCH ETT FÖRSÖK ATT DECHIFFRERA STAMCELLERNAS NYA EGENSKAPER KOMMER ATT GÖRAS PÅ GRUNDVAL AV GENOMISK ANALYS AV EN ENDA CELL. (Swedish)
17 August 2022
0 references
MENȚINEREA NIȘELOR CELULELOR MAMĂ ÎNTR-O CHESTIUNE CENTRALĂ A BIOLOGIEI FUNDAMENTALE. LABORATORUL DR. CAÑO-DELGADO A IDENTIFICAT RECENT MAI MULTE COMPONENTE MOLECULARE NECESARE PENTRU CELULELE CYSESCENCE DIN NIȘA CELULELOR STEM DIN RĂDĂCINA PRIMARĂ A ARABIDOPSISULUI. BRAVO (BRASSINOSTEROIZI LA CENTRUL VASCULAR ȘI ORGANIZATOR) ESTE UN FACTOR DE TRANSCRIERE R2R3-MYB CARE FUNCȚIONEAZĂ CA UN REPRESOR SPECIFIC AL DIVIZIUNILOR CELULARE ALE CENTRULUI CHIESCENT DIN NIȘA CELULELOR STEM RADICULARE. ANALIZA MOLECULARĂ VIA BRAVO A RELEVAT UN MECANISM CARE CONTROLEAZĂ DIVIZIUNILE CELULARE SPECIFICE ALE STEROIZILOR MEDIAȚI DE BRASINOSTEROIDS. ACESTE REZULTATE DESCHID O NOUĂ LINIE PENTRU STUDIUL CELULELOR MAMĂ ALE PLANTEI. ÎN PREZENT, IDENTIFICAREA REȚELELOR DE SEMNALIZARE CARE FUNCȚIONEAZĂ ÎN TIMPUL CREȘTERII ȘI DEZVOLTĂRII INSTALAȚIEI TRECE PRIN INTEGRAREA DATELOR GENOMICE CU REZOLUȚIE CELULARĂ, ÎN COMBINAȚIE CU IMAGINI DE ÎNALTĂ REZOLUȚIE SPAȚIALĂ ȘI MODELARE MATEMATICĂ. ÎN PREZENTA PROPUNERE, LABORATORUL ÎȘI PROPUNE SĂ CARACTERIZEZE CELE MAI RELEVANTE ȘI SPECIFICE COMPONENTE ALE CĂII BRASINOSTEROID DIN NIȘA CELULELOR STEM. ÎN PREZENT, UN NUMĂR MARE DE DATE TRANSCRIPTOMICA SPECIFICE SUNT GENERATE DIN CELULE RADICULARE CARE NECESITĂ ANALIZE BIOINFORMATICE DE ULTIMĂ GENERAȚIE ȘI NOI INSTRUMENTE DE CALCUL PENTRU A EXTRAGE INFORMAȚII STATISTICE ȘI SEMNIFICATIVE DIN PUNCT DE VEDERE FUNCȚIONAL. ÎN ACEST SCENARIU, ONE_CELL PROPUNE DOBÂNDIREA COMPETENȚELOR DE CALCUL PENTRU PRELUCRAREA, INTEGRAREA ȘI ANALIZA FUNCȚIONALĂ A DATELOR. ÎN CELE DIN URMĂ, PROPUNEM AJUSTAREA ANALIZEI GENOMICE ÎN CELULELE RADICULARE INDIVIDUALE PENTRU A DEFINI NATURA CELULELOR STEM VASCULARE, O ÎNTREBARE FĂRĂ A RĂSPUNDE LA BIOLOGIA PLANTELOR. ÎN GENERAL, LA SFÂRȘITUL PROPUNERII, SE VA FURNIZA O VIZIUNE INTEGRATĂ A SEMNALIZĂRII BR ÎN QC ȘI ÎN CELULELE STEM VASCULARE ȘI SE VA ÎNCERCA DESCIFRAREA CARACTERISTICILOR NOI ALE CELULELOR STEM PE BAZA ANALIZEI GENOMICE A UNEI SINGURE CELULE. (Romanian)
17 August 2022
0 references
OHRANJANJE NIŠE MATIČNIH CELIC V OSREDNJEM VPRAŠANJU TEMELJNE BIOLOGIJE. DR.-JEV LABORATORIJ. CAÑO-DELGADO JE PRED KRATKIM IDENTIFICIRAL VEČ MOLEKULSKIH KOMPONENT, POTREBNIH ZA CELIČNO CYSESCENCE NIŠE IZVORNIH CELIC V PRIMARNEM KORENU ARABIDOPSISA. BRAVO (BRASSINOSTEROIDI V ŽILNEM IN ORGANIZACIJSKEM CENTRU) JE TRANSKRIPCIJSKI FAKTOR R2R3-MYB, KI DELUJE KOT SPECIFIČNI REPRESIVNIK CELIČNE DELITVE CENTRA CHIESCENT V NIŠI KORENINSKIH MATIČNIH CELIC. MOLEKULARNA ANALIZA PREKO ZDRAVILA BRAVO JE RAZKRILA MEHANIZEM, KI NADZORUJE SPECIFIČNE CELIČNE DELITVE STEROIDOV, KI JIH POSREDUJE BRASINOSTEROIDS. TI REZULTATI ODPIRAJO NOVO LINIJO ZA ŠTUDIJO MATIČNIH CELIC RASTLINE. TRENUTNO IDENTIFIKACIJA SIGNALNIH OMREŽIJ, KI DELUJEJO MED RASTJO IN RAZVOJEM OBRATA, POTEKA SKOZI INTEGRACIJO GENOMSKIH PODATKOV S CELIČNO LOČLJIVOSTJO V KOMBINACIJI S PODOBAMI VISOKE PROSTORSKE LOČLJIVOSTI IN MATEMATIČNEGA MODELIRANJA. V TEM PREDLOGU JE CILJ LABORATORIJA OPREDELITI NAJPOMEMBNEJŠE IN POSEBNE SESTAVINE BRASINOSTEROID POTI V NIŠI IZVORNIH CELIC. TRENUTNO SE IZ KORENINSKIH CELIC PRIDOBIVA VELIKO ŠTEVILO SPECIFIČNIH PODATKOV TRANSCRIPTOMICA, KI ZAHTEVAJO NAJSODOBNEJŠO BIOINFORMATIČNO ANALIZO IN NOVA RAČUNSKA ORODJA ZA PRIDOBIVANJE STATISTIČNIH IN FUNKCIONALNO POMEMBNIH INFORMACIJ. V TEM PRIMERU ONE_CELL PREDLAGA PRIDOBITEV RAČUNSKIH SPRETNOSTI ZA OBDELAVO, INTEGRACIJO IN FUNKCIONALNO ANALIZO PODATKOV. KONČNO PREDLAGAMO, DA PRILAGODIMO GENOMSKO ANALIZO V POSAMEZNIH KORENINSKIH CELICAH, DA BI OPREDELILI NARAVO VASKULARNIH MATIČNIH CELIC, VPRAŠANJE, NE DA BI ODGOVORILI NA BIOLOGIJO RASTLIN. NA SPLOŠNO BO NA KONCU PREDLOGA ZAGOTOVLJENA CELOSTNA VIZIJA SIGNALIZACIJE BR V QC IN VASKULARNIH MATIČNIH CELICAH TER POSKUS DEŠIFRIRANJA NOVIH ZNAČILNOSTI IZVORNIH CELIC NA PODLAGI GENOMSKE ANALIZE ENE SAME CELICE. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
UTRZYMANIE NISZ MACIERZYSTYCH W CENTRALNEJ KWESTII BIOLOGII FUNDAMENTALNEJ. LABORATORIUM DOKTORA. CAÑO-DELGADO ZIDENTYFIKOWAŁ OSTATNIO KILKA SKŁADNIKÓW MOLEKULARNYCH NIEZBĘDNYCH DO CYSESCENCE KOMÓREK MACIERZYSTYCH NISZY W PIERWOTNYM KORZENIU ARABIDOPSIS. BRAVO (BRASSINOSTEROIDY W OŚRODKU NACZYNIOWYM I ORGANIZACYJNYM) JEST WSPÓŁCZYNNIKIEM TRANSKRYPCJI R2R3-MYB, KTÓRY DZIAŁA JAKO SPECYFICZNY REPRESOR PODZIAŁÓW KOMÓRKOWYCH CENTRUM CHIESCENT W NISZY MACIERZYSTEJ KORZENIA. ANALIZA MOLEKULARNA ZA POŚREDNICTWEM BRAVO UJAWNIŁA MECHANIZM, KTÓRY KONTROLUJE OKREŚLONE PODZIAŁY KOMÓRKOWE STERYDÓW POŚREDNICZĄCYCH PRZEZ BRASINOSTEROIDS. WYNIKI TE OTWIERAJĄ NOWĄ LINIĘ DO BADANIA KOMÓREK MACIERZYSTYCH ROŚLINY. OBECNIE IDENTYFIKACJA SIECI SYGNALIZACYJNYCH DZIAŁAJĄCYCH PODCZAS WZROSTU I ROZWOJU ZAKŁADU PRZECHODZI PRZEZ INTEGRACJĘ DANYCH GENOMOWYCH Z ROZDZIELCZOŚCIĄ KOMÓRKOWĄ, W POŁĄCZENIU Z OBRAZAMI O WYSOKIEJ ROZDZIELCZOŚCI PRZESTRZENNEJ I MODELOWANIU MATEMATYCZNYM. W NINIEJSZYM WNIOSKU LABORATORIUM MA NA CELU SCHARAKTERYZOWANIE NAJISTOTNIEJSZYCH I NAJBARDZIEJ SPECYFICZNYCH ELEMENTÓW ŚCIEŻKI BRASINOSTEROID W NISZY KOMÓREK MACIERZYSTYCH. OBECNIE WIELE KONKRETNYCH DANYCH TRANSCRIPTOMICA JEST GENEROWANYCH Z KOMÓREK KORZENIOWYCH, KTÓRE WYMAGAJĄ NAJNOWOCZEŚNIEJSZEJ ANALIZY BIOINFORMATYCZNEJ I NOWYCH NARZĘDZI OBLICZENIOWYCH W CELU UZYSKANIA INFORMACJI STATYSTYCZNYCH I ISTOTNYCH POD WZGLĘDEM FUNKCJONALNYM. W TYM SCENARIUSZU ONE_CELL PROPONUJE NABYCIE UMIEJĘTNOŚCI OBLICZENIOWYCH DO PRZETWARZANIA, INTEGRACJI I ANALIZY FUNKCJONALNEJ DANYCH. NA KONIEC PROPONUJEMY DOPRACOWANIE ANALIZY GENOMOWEJ W POSZCZEGÓLNYCH KOMÓRKACH KORZENIOWYCH W CELU ZDEFINIOWANIA CHARAKTERU NACZYNIOWYCH KOMÓREK MACIERZYSTYCH, PYTANIE BEZ ODPOWIEDZI NA BIOLOGIĘ ROŚLIN. OGÓLNIE RZECZ BIORĄC, NA KOŃCU WNIOSKU ZOSTANIE PRZEDSTAWIONA ZINTEGROWANA WIZJA SYGNALIZOWANIA BR W QC I KOMÓRKACH MACIERZYSTYCH NACZYNIOWYCH ORAZ PODJĘTA ZOSTANIE PRÓBA ROZSZYFROWANIA NOWATORSKICH CECH KOMÓREK MACIERZYSTYCH W OPARCIU O ANALIZĘ GENOMICZNĄ POJEDYNCZEJ KOMÓRKI. (Polish)
17 August 2022
0 references
Cerdanyola del Vallès
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
BIO2016-78150-P
0 references