Influence of intestinal microbiome on HIV-1 eradication mediated by a kick and kill strategy (Q3141198)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3141198 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Influence of intestinal microbiome on HIV-1 eradication mediated by a kick and kill strategy |
Project Q3141198 in Spain |
Statements
60,711.75 Euro
0 references
111,500.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2017
0 references
31 March 2020
0 references
FUNDACION IRSICAIXA
0 references
Existe una interacción bidireccional entre el microbioma intestinal humano y el sistema inmune. Por un lado los organismos comensales participan en el desarrollo, la activación y la compartimentalización del sistema inmune mediante 1) cambios epigenéticos causados por sus metabolitos (SCFAs), y 2) la modulación de cascadas moleculares a través de moléculas de la membrana externa (LPS). Por otro lado, la homeostasis de la microbiota es posible mediante el reconocimiento de ciertos elementos del sistema inmune del huésped, tanto innatos (TLR) como adaptativos (IgA). No obstante, se desconoce el papel que juega el microbioma en la activación de respuestas inmunes específicas en la erradicación del VIH-1. En este proyecto exploraremos la influencia del microbioma intestinal en las distintas etapas de un tratamiento de erradicación del VIH-1 basado en la estrategia de “kick and kill”. Nuestra hipótesis de partida es que el microbioma condiciona las respuestas del paciente tanto en la fase de erradicación del reservorio viral usando romidepsina (“kick”), como en la fase de activación de la respuesta específica contra el VIH-1 mediante la vacuna terapéutica basada en HIVconsv (“kill”). Para validarla caracterizaremos de forma longitudinal 1) la composición microbiana intestinal mediante técnicas de secuenciación masiva, 2) los metabolitos derivados de estos microorganismos y 3) el perfil inmunopatológico de los pacientes analizando biomarcadores de inflamación solubles en plasma. (Spanish)
0 references
There is a bidirectional interaction between the human intestinal microbiome and the immune system. On the one hand, commensal organisms participate in the development, activation and compartmentalisation of the immune system through 1) epigenetic changes caused by their metabolites (SCFAs), and 2) modulation of molecular cascades through external membrane molecules (LPS). On the other hand, microbiota homeostasis is possible by recognising certain elements of the host immune system, both innate (TLR) and adaptive (IgA). However, the role of the microbiome in activating specific immune responses in the eradication of HIV-1 is unknown. In this project we will explore the influence of the intestinal microbiome on the different stages of an HIV-1 eradication treatment based on the strategy of “kick and kill”. Our starting hypothesis is that the microbiome conditions the patient’s responses both in the phase of eradication of the viral reservoir using romidepsine (“kick”), and in the activation phase of the specific response to HIV-1 through the HIVconsv-based therapeutic vaccine (“kill”). To validate it we will characterise in a longitudinal way 1) the intestinal microbial composition by means of mass sequencing techniques, 2) the metabolites derived from these microorganisms and 3) the immunopathological profile of the patients analysing plasma soluble inflammation biomarkers. (English)
12 October 2021
0.3521122231513791
0 references
Il existe une interaction bidirectionnelle entre le microbiome intestinal humain et le système immunitaire. D’une part, les organismes commensaux participent au développement, à l’activation et à la compartimentation du système immunitaire par 1) les modifications épigénétiques causées par leurs métabolites (SCFA) et 2) la modulation des cascades moléculaires par des molécules membranaires externes (LPS). D’autre part, l’homéostasie microbiote est possible en reconnaissant certains éléments du système immunitaire de l’hôte, à la fois inné (TLR) et adaptatif (IgA). Cependant, le rôle du microbiome dans l’activation de réponses immunitaires spécifiques dans l’éradication du VIH-1 est inconnu. Dans ce projet, nous explorerons l’influence du microbiome intestinal sur les différentes étapes d’un traitement d’éradication du VIH-1 basé sur la stratégie de «kick and kill». Notre hypothèse de départ est que le microbiome conditionne les réponses du patient à la fois dans la phase d’éradication du réservoir viral à l’aide de romidepsine («kick»), et dans la phase d’activation de la réponse spécifique au VIH-1 par le vaccin thérapeutique à base de VIHconsv («kill»). Pour la valider, nous caractériserons de manière longitudinale 1) la composition microbienne intestinale au moyen de techniques de séquençage de masse, 2) les métabolites dérivés de ces micro-organismes et 3) le profil immunopathologique des patients analysant les biomarqueurs d’inflammation soluble dans le plasma. (French)
2 December 2021
0 references
Es gibt eine bidirektionale Wechselwirkung zwischen dem menschlichen intestinalen Mikrobiom und dem Immunsystem. Auf der einen Seite beteiligen sich Kommensalorganismen an der Entwicklung, Aktivierung und Kompartimentalisierung des Immunsystems durch 1) epigenetische Veränderungen, die durch ihre Metaboliten (SCFAs) verursacht werden, und 2) Modulation molekularer Kaskaden durch äußere Membranmoleküle (LPS). Auf der anderen Seite ist Mikrobiota-Homöostase möglich, indem bestimmte Elemente des Wirts Immunsystems erkannt werden, sowohl angeboren (TLR) als auch adaptive (IgA). Die Rolle des Mikrobioms bei der Aktivierung spezifischer Immunantworten bei der Ausrottung von HIV-1 ist jedoch unbekannt. In diesem Projekt werden wir den Einfluss des intestinalen Mikrobioms auf die verschiedenen Stadien einer HIV-1-Behandlung untersuchen, die auf der Strategie von „Kick and Kill“ basiert. Unsere Ausgangshypothese ist, dass das Mikrobiom die Reaktionen des Patienten sowohl in der Phase der Ausrottung des Virusreservoirs unter Verwendung von Romidepsin („Kick“) als auch in der Aktivierungsphase der spezifischen Reaktion auf HIV-1 durch den HIVconsv-basierten therapeutischen Impfstoff („kill“) bedingt. Zur Validierung werden wir in Längsrichtung 1) die intestinale mikrobiale Zusammensetzung durch Massensequenzierungstechniken charakterisieren, 2) die von diesen Mikroorganismen abgeleiteten Metaboliten und 3) das immunpathologische Profil der Patienten, die Plasmalösliche Entzündungsbiomarker analysieren. (German)
9 December 2021
0 references
Er is een bidirectionele interactie tussen het menselijke darmmicrobioom en het immuunsysteem. Aan de ene kant nemen commensale organismen deel aan de ontwikkeling, activering en compartimentering van het immuunsysteem door 1) epigenetische veranderingen veroorzaakt door hun metabolieten (SCFA’s), en 2) modulatie van moleculaire cascades door externe membraanmoleculen (LPS). Anderzijds is microbiota homeostase mogelijk door bepaalde elementen van het gastheerimmuunsysteem te herkennen, zowel aangeboren (TLR) als adaptief (IgA). De rol van het microbiome bij het activeren van specifieke immuunresponsen bij de uitroeiing van HIV-1 is echter onbekend. In dit project zullen we de invloed van het darmmicrobiome op de verschillende stadia van een HIV-1-uitroeiingsbehandeling onderzoeken op basis van de strategie van „kick and kill”. Onze uitgangshypothese is dat de microbiome de respons van de patiënt zowel in de fase van uitroeiing van het virale reservoir met behulp van romidepsine („kick”), als in de activeringsfase van de specifieke respons op HIV-1 via het op HIVconsv gebaseerde therapeutische vaccin („kill”) beïnvloedt. Om het te valideren zullen we op een longitudinale manier 1) de intestinale microbiële samenstelling karakteriseren door middel van massa sequencing technieken, 2) de metabolieten afgeleid van deze micro-organismen en 3) het immunopathologische profiel van de patiënten analyseren plasma oplosbare ontsteking biomarkers. (Dutch)
17 December 2021
0 references
Esiste un'interazione bidirezionale tra il microbioma intestinale umano e il sistema immunitario. Da un lato, gli organismi commensali partecipano allo sviluppo, all'attivazione e alla compartimentazione del sistema immunitario attraverso 1) cambiamenti epigenetici causati dai loro metaboliti (SCFA), e 2) modulazione delle cascate molecolari attraverso molecole di membrana esterne (LPS). D'altra parte, l'omeostasi microbiota è possibile riconoscendo alcuni elementi del sistema immunitario ospite, sia innato (TLR) che adattativo (IgA). Tuttavia, il ruolo del microbioma nell'attivazione di risposte immunitarie specifiche nell'eradicazione dell'HIV-1 non è noto. In questo progetto esploreremo l'influenza del microbioma intestinale sulle diverse fasi di un trattamento di eradicazione dell'HIV-1 basato sulla strategia di "kick and kill". La nostra ipotesi di partenza è che il microbioma condiziona le risposte del paziente sia nella fase di eradicazione del serbatoio virale con romidepina ("kick"), sia nella fase di attivazione della risposta specifica all'HIV-1 attraverso il vaccino terapeutico basato sull'HIVconsv ("uccisione"). Per convalidarla si caratterizza in modo longitudinale 1) la composizione microbica intestinale mediante tecniche di sequenziamento di massa, 2) i metaboliti derivati da questi microrganismi e 3) il profilo immunopatologico dei pazienti che analizzano biomarcatori infiammatori solubili plasmatici. (Italian)
16 January 2022
0 references
Υπάρχει αμφίδρομη αλληλεπίδραση μεταξύ του ανθρώπινου εντερικού μικροβιώματος και του ανοσοποιητικού συστήματος. Από τη μία πλευρά, οι συμβιωτικοί οργανισμοί συμμετέχουν στην ανάπτυξη, ενεργοποίηση και διαίρεση του ανοσοποιητικού συστήματος μέσω 1) επιγενετικών αλλαγών που προκαλούνται από τους μεταβολίτες τους (SCFAs) και 2) διαμόρφωσης των μοριακών καταρράξεων μέσω μορίων εξωτερικής μεμβράνης (LPS). Από την άλλη πλευρά, η μικροβιακή ομοιόσταση είναι δυνατή με την αναγνώριση ορισμένων στοιχείων του ανοσοποιητικού συστήματος του ξενιστή, τόσο έμφυτων (TLR) όσο και προσαρμοστικών (IgA). Ωστόσο, ο ρόλος του μικροβιώματος στην ενεργοποίηση συγκεκριμένων ανοσολογικών αποκρίσεων στην εξάλειψη του HIV- 1 είναι άγνωστος. Σε αυτό το έργο θα διερευνήσουμε την επίδραση του εντερικού μικροβιώματος στα διάφορα στάδια μιας θεραπείας εξάλειψης του HIV-1 με βάση τη στρατηγική του «kick and kill». Η αρχική μας υπόθεση είναι ότι το μικροβιομέτρο παθαίνει τις αντιδράσεις του ασθενούς τόσο στη φάση της εξάλειψης της ιογενούς δεξαμενής με τη χρήση ρομιδεπσίνης («kick»), όσο και στη φάση ενεργοποίησης της ειδικής απόκρισης στον HIV-1 μέσω του θεραπευτικού εμβολίου που βασίζεται στο HIVconsv («θανάτωση»). Για να το επικυρώσουμε θα χαρακτηρίσουμε με διαμήκη τρόπο 1) την εντερική μικροβιακή σύνθεση με τεχνικές μαζικής αλληλουχίας, 2) τους μεταβολίτες που προέρχονται από αυτούς τους μικροοργανισμούς και 3) το ανοσοπαθολογικό προφίλ των ασθενών που αναλύουν βιοδείκτες φλεγμονής διαλυτών στο πλάσμα. (Greek)
17 August 2022
0 references
Der er en tovejs interaktion mellem det humane intestinale mikrobiom og immunsystemet. På den ene side deltager kommens organismer i udviklingen, aktiveringen og opdelingen af immunsystemet gennem 1) epigenetiske ændringer forårsaget af deres metabolitter (SCFA'er) og 2) modulering af molekylære kaskader gennem eksterne membranmolekyler (LPS). På den anden side er mikrobiota homeostase mulig ved at genkende visse elementer i værtens immunsystem, både medfødt (TLR) og adaptiv (IgA). Mikrobiomets rolle med hensyn til at aktivere specifikke immunresponser ved udryddelsen af HIV-1 er imidlertid ukendt. I dette projekt vil vi undersøge intestinal mikrobiomes indflydelse på de forskellige stadier af en hiv-1-udryddelsesbehandling baseret på strategien om "kick and kill". Vores udgangspunkt er, at mikrobiomet tilstande patientens respons både i fasen med udryddelse af det virale reservoir ved hjælp af romidepsin ("kick") og i aktiveringsfasen af den specifikke respons på HIV-1 gennem den HIVconsv-baserede terapeutiske vaccine ("kill"). For at validere det vil vi karakterisere 1) den intestinale mikrobielle sammensætning ved hjælp af massesekvenseringsteknikker, 2) metabolitterne afledt af disse mikroorganismer og 3) den immunpatologiske profil for de patienter, der analyserer plasmaopløselige inflammationsbiomarkører. (Danish)
17 August 2022
0 references
Ihmisen suoliston mikrobiomin ja immuunijärjestelmän välillä on kaksisuuntainen vuorovaikutus. Toisaalta kommenaaliorganismit osallistuvat immuunijärjestelmän kehittämiseen, aktivoitumiseen ja lokeroitumiseen 1) metaboliittien (SCFA) aiheuttamien epigeneettisten muutosten ja 2) molekyylikaskadien modulaatioon ulkoisten kalvomolekyylien (LPS) kautta. Toisaalta mikrobiota homeostaasi on mahdollista tunnistamalla tietyt elementit isäntä immuunijärjestelmän, sekä synnynnäinen (TLR) ja adaptiivinen (IgA). Mikrobiomin roolia spesifisten immuunivasteiden aktivoinnissa HIV-1:n hävittämisessä ei kuitenkaan tunneta. Tässä hankkeessa tutkimme suoliston mikrobiomin vaikutusta HIV-1:n hävittämishoidon eri vaiheisiin, jotka perustuvat ”pokkaa ja tappamista” -strategiaan. Lähtöolettamamme on, että mikrobiomeissa potilaan vasteet sekä romidepsiiniä käyttävän virussäiliön hävittämisvaiheessa (”kick”) että HIV-1:n erityisen vasteen aktivointivaiheessa HIVconsv-pohjaisen terapeuttisen rokotteen (”tappaminen”) kautta. Validoidaksemme sen luonnehdimme pitkittäissuunnassa 1) suoliston mikrobikoostumusta massasekvensointitekniikoiden avulla, 2) näistä mikro-organismeista johdettuja metaboliitteja ja 3) plasmaliukoisia tulehdusbiomarkkereita analysoivien potilaiden immunopatologista profiilia. (Finnish)
17 August 2022
0 references
Hemm interazzjoni bidirezzjonali bejn il-mikrobi intestinali tal-bniedem u s-sistema immunitarja. Minn naħa waħda, l-organiżmi kommensali jipparteċipaw fl-iżvilupp, l-attivazzjoni u l-kompartimentalizzazzjoni tas-sistema immunitarja permezz ta’ 1) bidliet epiġenetiċi kkawżati mill-metaboliti tagħhom (SCFAs), u 2) modulazzjoni ta’ kaskati molekulari permezz ta’ molekuli esterni tal-membrana (LPS). Min-naħa l-oħra, l-omeostażi mikrobijota hija possibbli billi jiġu rikonoxxuti ċerti elementi tas-sistema immunitarja ospitanti, kemm innata (TLR) kif ukoll adattiva (IgA). Madankollu, ir-rwol tal-mikrobijoma fl-attivazzjoni ta’ risponsi immuni speċifiċi fil-qerda tal-HIV-1 mhuwiex magħruf. F’dan il-proġett se nesploraw l-influwenza tal-mikrobijoma intestinali fuq l-istadji differenti ta’ trattament ta’ eradikazzjoni tal-HIV-1 ibbażat fuq l-istrateġija ta’ “kick u joqtol”. L-ipoteżi inizjali tagħna hija li l-mikrobijoma tikkundizzjona r-rispons tal-pazjent kemm fil-fażi ta’ eradikazzjoni tar-riżerv virali bl-użu ta’ romidepsine (“kick”), kif ukoll fil-fażi ta’ attivazzjoni tar-rispons speċifiku għall-HIV-1 permezz tal-vaċċin terapewtiku bbażat fuq l-HIVconsv (“joqtol”). Biex nivvalidawha se nikkaratterizzaw b’mod lonġitudinali 1) il-kompożizzjoni mikrobika intestinali permezz ta’ tekniki ta’ sekwenzar tal-massa, 2) il-metaboliti derivati minn dawn il-mikroorganiżmi u 3) il-profil immunopatoloġiku tal-pazjenti li janalizzaw bijomarkaturi ta’ infjammazzjoni li jinħallu fil-plażma. (Maltese)
17 August 2022
0 references
Pastāv divvirzienu mijiedarbība starp cilvēka zarnu mikrobiomu un imūnsistēmu. No vienas puses, komensālie organismi piedalās imūnsistēmas attīstībā, aktivācijā un nodalīšanā, izmantojot 1) epiģenētiskās izmaiņas, ko izraisa to metabolīti (SCFA), un 2) molekulāro kaskāžu modulāciju caur ārējām membrānu molekulām (LPS). No otras puses, mikrobiota homeostāze ir iespējama, atzīstot dažus saimniekorganisma imūnsistēmas elementus gan iedzimtā (TLR), gan adaptīvā (IgA). Tomēr mikrobioma loma specifisku imūnreakciju aktivizēšanā HIV-1 izskaušanā nav zināma. Šajā projektā mēs pētīsim zarnu mikrobioma ietekmi uz HIV-1 izskaušanas ārstēšanas dažādajiem posmiem, pamatojoties uz “slimības un nogalināšanas” stratēģiju. Mūsu sākotnējā hipotēze ir tāda, ka mikrobiomu stāvoklis ir pacienta atbildes reakcija gan vīrusu rezervuāra izskaušanas fāzē, izmantojot romidepsine (“kick”), gan specifiskās reakcijas uz HIV-1 aktivācijas fāzē, izmantojot HIVconsv terapeitisko vakcīnu (“kill”). Lai to apstiprinātu, mēs garenvirzienā raksturosim 1) zarnu mikrobu sastāvu, izmantojot masveida sekvencēšanas paņēmienus, 2) metabolītus, kas iegūti no šiem mikroorganismiem, un 3) imūnpatoloģisko profilu pacientiem, kuri analizē plazmā šķīstošā iekaisuma biomarķierus. (Latvian)
17 August 2022
0 references
Existuje obojsmerná interakcia medzi ľudským črevným mikrobiómom a imunitným systémom. Na jednej strane sa komenzálne organizmy podieľajú na vývoji, aktivácii a kompartmentalizácii imunitného systému prostredníctvom 1) epigenetických zmien spôsobených ich metabolitmi (SCFA) a 2) modulácie molekulárnych kaskád prostredníctvom vonkajších membránových molekúl (LPS). Na druhej strane, microbiota homeostáza je možné rozpoznať určité prvky hostiteľského imunitného systému, a to ako vrodený (TLR) a adaptívne (IgA). Úloha mikrobiómu pri aktivácii špecifických imunitných odpovedí pri eradikácii HIV-1 však nie je známa. V tomto projekte preskúmame vplyv črevného mikrobiómu na rôzne štádiá eradikačnej liečby HIV-1 na základe stratégie „kopať a zabíjať“. Naša východisková hypotéza spočíva v tom, že mikrobióm podmieňuje odpoveď pacienta tak vo fáze eradikácie vírusového zásobníka romidepsínom („kop“), ako aj v aktivačnej fáze špecifickej odpovede na HIV-1 prostredníctvom terapeutickej očkovacej látky založenej na HIVconsve („zabiť“). Aby sme to potvrdili, charakterizujeme v pozdĺžnom smere 1) črevné mikrobiálne zloženie pomocou masových sekvenčných techník, 2) metabolity odvodené z týchto mikroorganizmov a 3) imunopatologický profil pacientov, ktorí analyzujú biomarkery zápalu rozpustného v plazme. (Slovak)
17 August 2022
0 references
Tá idirghníomhaíocht dhéthreoch idir an microbiome intestinal daonna agus an córas imdhíonachta. Ar thaobh amháin, glacann orgánaigh commensal páirt i bhforbairt, gníomhachtú agus urrannú an chórais imdhíonachta trí 1) athruithe epigenetic de bharr a meitibilítí (SCFAs), agus 2) modhnú cascáidí móilíneacha trí mhóilíní membrane seachtracha (LPS). Ar an láimh eile, is féidir microbiota homeostasis a aithint trí eilimintí áirithe den chóras imdhíonachta óstach a aithint, idir innate (TLR) agus oiriúnaitheach (IgA). Ní fios, áfach, an ról atá ag an micribhithóm maidir le freagairtí imdhíonachta sonracha a ghníomhachtú i ndíothú VEID-1. Sa tionscadal seo déanfaimid iniúchadh ar thionchar an mhicribhitheolaíochta intestinal ar na céimeanna éagsúla de chóireáil díothaithe VEID-1 bunaithe ar an straitéis “ciceáil agus marú”. Is é ár hipitéis tosaigh ná go gcuireann an micreabhithóm freagairtí an othair ar fáil i gcéim dhíothú an taiscumair víreasaigh ag baint úsáide as romidepsine (“kick”), agus sa chéim ghníomhachtaithe den fhreagairt shonrach ar VEID-1 tríd an vacsaín theiripeach atá bunaithe ar VEID (“scáil”). Chun é a bhailíochtú beidh muid ag tréithriú ar bhealach fadaimseartha 1) an comhdhéanamh miocróbach intestinal trí bhíthin teicnící seicheamhaithe maise, 2) na meitibilítí a dhíorthaítear ó na miocrorgánaigh seo agus 3) próifíl imdhíonachta na n-othar a dhéanann anailís ar bhithmharcóirí athlasadh intuaslagtha plasma. (Irish)
17 August 2022
0 references
Mezi lidským střevním mikrobiomem a imunitním systémem dochází k obousměrné interakci. Na jedné straně se kommenální organismy podílejí na vývoji, aktivaci a rozdělení imunitního systému prostřednictvím 1) epigenetických změn způsobených jejich metabolity (SCFA) a 2) modulace molekulárních kaskád prostřednictvím vnějších membránových molekul (LPS). Na druhé straně je mikrobiota homeostáza možná rozpoznáním určitých prvků hostitelského imunitního systému, a to jak vrozené (TLR), tak adaptivní (IgA). Úloha mikrobiomu při aktivaci specifických imunitních reakcí při eradikaci HIV-1 však není známa. V tomto projektu budeme zkoumat vliv střevního mikrobiomu na různé fáze eradikace HIV-1 na základě strategie „kopat a zabít“. Naší počáteční hypotézou je, že mikrobiomové stavy pacienta reagují jak ve fázi eradikace virové nádrže pomocí romidepsinu („kok“), tak v aktivační fázi specifické reakce na HIV-1 prostřednictvím terapeutické vakcíny na bázi HIVconsv („zabíjení“). Pro ověření budeme charakterizovat podélným způsobem 1) střevní mikrobiální složení pomocí technik hmotnostního sekvenování, 2) metabolity odvozené z těchto mikroorganismů a 3) imunopatologický profil pacientů analyzujících biomarkery rozpustných zánětů v plazmě. (Czech)
17 August 2022
0 references
Há uma interação bidirecional entre o microbioma intestinal humano e o sistema imunitário. Por um lado, os organismos comensais participam no desenvolvimento, activação e compartimentação do sistema imunitário através de 1) alterações epigenéticas causadas pelos seus metabolitos (SCFAs), e 2) modulação de cascatas moleculares através de moléculas de membrana externa (LPS). Por outro lado, a homeostase da microbiota é possível através do reconhecimento de certos elementos do sistema imunitário do hospedeiro, tanto inato (TLR) como adaptativo (IgA). No entanto, desconhece-se o papel do microbioma na ativação de respostas imunitárias específicas na erradicação do VIH-1. Neste projeto, exploraremos a influência do microbioma intestinal nas diferentes fases de um tratamento de erradicação do VIH-1 com base na estratégia de «chutar e matar». A nossa hipótese inicial é que o microbioma condiciona as respostas do doente tanto na fase de erradicação do reservatório viral utilizando romidepsina («chute») como na fase de ativação da resposta específica ao VIH-1 através da vacina terapêutica à base de VIHconsv («matar»). Para validá-lo vamos caracterizar de forma longitudinal 1) a composição microbiana intestinal através de técnicas de sequenciação de massa, 2) os metabolitos derivados destes microrganismos e 3) o perfil imunopatológico dos doentes que analisam biomarcadores de inflamação solúvel no plasma. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
Inimese soole mikrobioomi ja immuunsüsteemi vahel on kahesuunaline koostoime. Ühelt poolt osalevad kommensaalsed organismid immuunsüsteemi arendamises, aktiveerimises ja jagunemises 1) nende metaboliitide (SCFA) põhjustatud epigeneetiliste muutuste ja 2) molekulaarkaskaadi modulatsiooni kaudu väliste membraanmolekulide (LPS) kaudu. Teisest küljest on mikrobiota homeostasis võimalik, kui tunda ära peremeesorganismi immuunsüsteemi teatud elemendid, nii kaasasündinud (TLR) kui ka adaptiivne (IgA). Kuid mikrobioomi roll spetsiifiliste immuunvastuste aktiveerimisel HIV-1 likvideerimisel ei ole teada. Selles projektis uurime soole mikrobioomi mõju HIV-1 likvideerimisravi erinevatele etappidele, mis põhinevad „kick and kill“ strateegial. Meie lähtehüpotees on see, et mikrobioomid mõjutavad patsiendi vastuseid nii viiruse reservuaari likvideerimise faasis, kasutades romidepsiini („kick“), kui ka aktiveerimisfaasis konkreetse vastuse HIV-1-le HIVconsv-põhise terapeutilise vaktsiini („tapmine“) kaudu. Selle valideerimiseks iseloomustame pikisuunaliselt 1) soolestiku mikroobset koostist massijärjestustehnikate abil, 2) nendest mikroorganismidest saadud metaboliite ja 3) plasmas lahustuvaid põletiku biomarkereid analüüsivate patsientide immunopatolooge. (Estonian)
17 August 2022
0 references
Kétirányú kölcsönhatás van az emberi bél mikrobióm és az immunrendszer között. Egyrészt a kommenzális organizmusok részt vesznek az immunrendszer fejlődésében, aktivizálásában és kompaalizációjában 1) metabolitjaik (SCFA-k) által okozott epigenetikai változások és 2) a molekuláris kaszkádok külső membránmolekulákon (LPS) keresztül történő modulációja révén. Másrészt a microbiota homeosztázis a gazda immunrendszer bizonyos elemeinek felismerésével lehetséges, mind veleszületett (TLR), mind adaptív (IgA). Azonban a mikrobióm szerepe a specifikus immunválaszok aktiválásában a HIV-1 felszámolásában nem ismert. Ebben a projektben megvizsgáljuk a bél mikrobióm hatását a HIV-1 felszámolási kezelés különböző szakaszaira, a „rúgás és megölés” stratégiája alapján. A kiindulási hipotézisünk az, hogy a mikrobióm befolyásolja a beteg reakcióit mind a vírustározó romidepszin („kick”) felszámolásának fázisában, mind a HIV-1-re adott specifikus válasz aktiválási fázisában a HIVconsv-alapú terápiás vakcinán keresztül („ölés”). Ennek validálásához hosszirányban jellemezzük 1) a bél mikrobiális összetételét tömegszekvenálási technikákkal, 2) az ezekből a mikroorganizmusokból származó metabolitokat és 3) a plazmaoldható gyulladás biomarkerek elemzését végző betegek immunopátológiai profilját. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
Има двупосочно взаимодействие между човешкия чревен микробиом и имунната система. От една страна, коменсалните организми участват в развитието, активирането и разделянето на имунната система чрез 1) епигенетични промени, причинени от техните метаболити (SCFA), и 2) модулация на молекулярни каскади чрез външни мембранни молекули (LPS). От друга страна, микробиота хомеостазата е възможна чрез разпознаване на някои елементи на имунната система на гостоприемника, както вродена (TLR), така и адаптивна (IgA). Въпреки това ролята на микробиома за активиране на специфични имунни реакции при ликвидирането на ХИВ-1 не е известна. В този проект ще проучим влиянието на чревния микробиом върху различните етапи на лечение за ликвидиране на ХИВ-1 въз основа на стратегията за „ритник и убиване“. Нашата начална хипотеза е, че микробиомните състояния на отговора на пациента както във фазата на ликвидиране на вирусния резервоар с използване на ромидепсин („kick„), така и във фазата на активиране на специфичния отговор към ХИВ-1 чрез базираната на HIVconsv терапевтична ваксина („убиване“). За да го валидираме, ще характеризираме по надлъжен начин 1) чревния микробен състав чрез техники за секвениране на масата, 2) метаболитите, получени от тези микроорганизми, и 3) имунопатологичния профил на пациентите, анализиращи биомаркери за плазменоразтворимо възпаление. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
Yra dvikryptė sąveika tarp žmogaus žarnyno mikrobiomo ir imuninės sistemos. Viena vertus, simmensiniai organizmai dalyvauja kuriant, aktyvinant ir dalijant imuninę sistemą per 1) epigenetinius pokyčius, kuriuos sukelia jų metabolitai (SCFA), ir 2) molekulinių kaskadų moduliavimą per išorines membranines molekules (LPS). Kita vertus, mikrobiota homeostazė yra įmanoma atpažinus tam tikrus šeimininko imuninės sistemos elementus, tiek įgimtus (TLR), tiek adaptyvius (IgA). Tačiau mikrobiomo vaidmuo aktyvuojant specifinį imuninį atsaką į ŽIV-1 naikinimą nežinomas. Šiame projekte mes išnagrinėsime žarnyno mikrobiomo įtaką skirtingiems ŽIV-1 likvidavimo gydymo etapams, remiantis „kick ir žudyti“ strategija. Mūsų pradinė hipotezė yra ta, kad mikrobiomas sukelia paciento atsaką tiek virusinio rezervuaro likvidavimo romidepsinu („kick“), tiek specifinio atsako į ŽIV-1 aktyvinimo fazėje per ŽIVconsv pagrįstą terapinę vakciną („nužudyti“). Norėdami jį patvirtinti, išilginiu būdu apibūdinsime 1) žarnyno mikrobų sudėtį, naudodami masės sekos nustatymo metodus, 2) iš šių mikroorganizmų gautus metabolitus ir 3) pacientų, analizuojančių plazmos tirpių uždegimo biologinius žymenis, imunopatologinį profilį. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
Postoji dvosmjerna interakcija između ljudskog crijevnog mikrobioma i imunološkog sustava. S jedne strane, komenzalni organizmi sudjeluju u razvoju, aktivaciji i kompartmentalizaciji imunološkog sustava kroz 1) epigenetske promjene uzrokovane njihovim metabolitima (SCFA) i 2) modulaciju molekularnih kaskada kroz vanjske membranske molekule (LPS). S druge strane, mikrobiota homeostaza je moguća prepoznavanjem određenih elemenata imunološkog sustava domaćina, kako urođenog (TLR) tako i adaptivnog (IgA). Međutim, uloga mikrobioma u aktiviranju specifičnih imunoloških odgovora u iskorjenjivanju virusa HIV-1 nije poznata. U ovom projektu istražit ćemo utjecaj crijevnog mikrobioma na različite faze liječenja iskorjenjivanja HIV-1 na temelju strategije „kick and kill”. Naša početna hipoteza je da mikrobiom uvjetuje pacijentove odgovore kako u fazi iskorjenjivanja virusnog rezervoara pomoću romidepsina („kick”), tako iu fazi aktivacije specifičnog odgovora na HIV-1 kroz terapijsko cjepivo temeljeno na HIVconsv („ubiti”). Da bismo ga potvrdili, okarakterizirat ćemo na uzdužni način 1) crijevni mikrobni sastav tehnikama sekvenciranja mase, 2) metabolite dobivene iz tih mikroorganizama i 3) imunopatološki profil bolesnika koji analiziraju biomarkere topljive upale u plazmi. (Croatian)
17 August 2022
0 references
Det finns en dubbelriktad interaktion mellan det mänskliga tarmmikrobiomet och immunsystemet. Å ena sidan deltar kommensala organismer i utvecklingen, aktiveringen och uppdelningen av immunsystemet genom 1) epigenetiska förändringar orsakade av deras metaboliter (SCFA) och 2) modulering av molekylkaskader genom yttre membranmolekyler (LPS). Å andra sidan är mikrobiota homeostas möjlig genom att erkänna vissa delar av värdimmunsystemet, både medfödda (TLR) och adaptiva (IgA). Mikrobiomets roll för att aktivera specifika immunsvar vid utrotning av HIV-1 är dock okänd. I detta projekt kommer vi att undersöka hur tarmmikrobiomen påverkar de olika stadierna av en hiv-1-utrotningsbehandling baserad på strategin ”kick and kill”. Vår starthypotes är att mikrobiomet villkorar patientens svar både i utrotningsfasen av virusreservoaren med romidepsin (”kick”) och i aktiveringsfasen av det specifika svaret på HIV-1 genom det HIVconsv-baserade terapeutiska vaccinet (”död”). För att validera det kommer vi att karakterisera på ett longitudinellt sätt 1) tarmens mikrobiella sammansättning med hjälp av masssekvenseringstekniker, 2) de metaboliter som härleds från dessa mikroorganismer och 3) den immunpatologiska profilen för de patienter som analyserar plasmalösliga inflammationsbiomarkörer. (Swedish)
17 August 2022
0 references
Există o interacțiune bidirecțională între microbiomul intestinal uman și sistemul imunitar. Pe de o parte, organismele comensale participă la dezvoltarea, activarea și compartimentarea sistemului imunitar prin 1) modificări epigenetice cauzate de metaboliții lor (SCFA) și 2) modularea cascadelor moleculare prin molecule de membrană externă (LPS). Pe de altă parte, homeostazia microbiotei este posibilă prin recunoașterea anumitor elemente ale sistemului imunitar gazdă, atât înnăscute (TLR), cât și adaptive (IgA). Cu toate acestea, nu se cunoaște rolul microbiomului în activarea răspunsurilor imune specifice în eradicarea HIV-1. În acest proiect vom explora influența microbiomului intestinal asupra diferitelor etape ale unui tratament de eradicare a HIV-1 pe baza strategiei de „lovitură și ucidere”. Ipoteza noastră inițială este că microbiomul condiționează răspunsurile pacientului atât în faza de eradicare a rezervorului viral cu romidepsină („kick”), cât și în faza de activare a răspunsului specific la HIV-1 prin vaccinul terapeutic pe bază de HIVconsv („ucidere”). Pentru a o valida, vom caracteriza în mod longitudinal 1) compoziția microbiană intestinală prin tehnici de secvențiere în masă, 2) metaboliții derivați din aceste microorganisme și 3) profilul imunopatologic al pacienților care analizează biomarkerii inflamați solubili în plasmă. (Romanian)
17 August 2022
0 references
Obstaja dvosmerna interakcija med človeškim črevesnim mikrobiomom in imunskim sistemom. Po eni strani komenzalni organizmi sodelujejo pri razvoju, aktivaciji in predelovanju imunskega sistema z 1) epigenetskimi spremembami, ki jih povzročajo njihovi metaboliti (SCFA), in 2) modulacijo molekularnih kaskad prek zunanjih membranskih molekul (LPS). Po drugi strani pa je homeostaza mikrobiota mogoča s prepoznavanjem določenih elementov imunskega sistema gostitelja, tako prirojenega (TLR) kot prilagodljivega (IgA). Vendar pa vloga mikrobioma pri aktiviranju specifičnega imunskega odziva pri izkoreninjenju virusa HIV-1 ni znana. V tem projektu bomo raziskali vpliv črevesnega mikrobioma na različne stopnje zdravljenja izkoreninjenja virusa HIV-1, ki temelji na strategiji „ubijanja in ubijanja“. Naša začetna hipoteza je, da mikrobiom vpliva na bolnikov odziv tako v fazi izkoreninjenja virusnega rezervoarja z uporabo romidepsina („kick“) kot v fazi aktivacije specifičnega odziva na HIV-1 s terapevtskim cepivom na osnovi virusa HIVconsv („ubiti“). Za potrditev bomo na vzdolžni način opredelili 1) črevesno mikrobno sestavo s tehnikami sekvenciranja mase, 2) presnovke, pridobljene iz teh mikroorganizmov, in 3) imunopatološki profil bolnikov, ki analizirajo biomarkerje topnega vnetja v plazmi. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
Istnieje dwukierunkowa interakcja między ludzkim mikrobiomem jelitowym a układem odpornościowym. Z jednej strony organizmy komensalne uczestniczą w rozwoju, aktywacji i przedzieleniu układu odpornościowego poprzez 1) zmiany epigenetyczne spowodowane przez ich metabolity (SCFA) oraz 2) modulację kaskad molekularnych poprzez zewnętrzne cząsteczki błony (LPS). Z drugiej strony homeostaza mikrobiota jest możliwa poprzez rozpoznanie pewnych elementów układu odpornościowego gospodarza, zarówno wrodzonego (TLR), jak i adaptacyjnego (IgA). Jednakże rola mikrobiomu w aktywacji specyficznych odpowiedzi immunologicznych w zwalczaniu HIV-1 nie jest znana. W ramach tego projektu zbadamy wpływ mikrobiomu jelitowego na poszczególne etapy leczenia likwidacyjnego HIV-1 w oparciu o strategię „zabijania i zabijania”. Nasza hipoteza początkowa polega na tym, że mikrobiom warunkuje reakcję pacjenta zarówno w fazie eliminacji zbiornika wirusa za pomocą romidepsyny („kick”), jak i w fazie aktywacji specyficznej odpowiedzi na HIV-1 poprzez szczepionkę terapeutyczną opartą na HIVconsv („zabicia”). Aby ją potwierdzić, scharakteryzujemy w sposób podłużny 1) skład drobnoustrojów jelitowych za pomocą technik sekwencjonowania masowego, 2) metabolity pochodzące z tych mikroorganizmów oraz 3) profil immunopatologiczny pacjentów analizujących biomarkery zapalne rozpuszczalne w osoczu. (Polish)
17 August 2022
0 references
Badalona
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI16_01421
0 references