Induction of conjugative transfer of pheromone response plasmids (Q3140550)

From EU Knowledge Graph
Jump to navigation Jump to search
Project Q3140550 in Spain
Language Label Description Also known as
English
Induction of conjugative transfer of pheromone response plasmids
Project Q3140550 in Spain

    Statements

    0 references
    33,486.75 Euro
    0 references
    61,500.0 Euro
    0 references
    54.45 percent
    0 references
    1 January 2017
    0 references
    31 March 2020
    0 references
    FUNDACION INSTITUTO DE INVESTIGACION MARQUES DE VALDECILLA (IDIVAL)
    0 references
    0 references

    43°27'43.34"N, 3°48'35.89"W
    0 references
    Enterococcus faecalis es un notable agente productor de infecciones oportunistas en pacientes hospitalarios en nuestro entorno. Los aislamientos clínicos de E. faecalis son notorios por codificar resistencia a múltiples antibióticos. Estas resistencias se adquieren y se diseminan frecuentemente por conjugación, a través de transposones y plásmidos conjugativos. Una característica, aparentemente exclusiva de Enterococcus, es el papel jugado por feromonas peptídicas en la transferencia de plásmidos conjugativos. Dichas feromonas son sintetizadas y secretadas por todas las cepas de E. faecalis. Plásmidos respondedores a feromona son ubicuos en E. faecalis (incluidas cepas clínicas) y pueden transferirse con frecuencias cercanas al 100%. Dichos plásmidos mejoran además la transferencia de otros elementos presentes en la misma cepa. Todo ello sugiere su importancia en la diseminación de resistencias a antibióticos. Estos plásmidos codifican además determinantes de virulencia como hemolisinas y sustancias de agregación. El objetivo fundamental de este proyecto se centra en el estudio de la inducción en respuesta a feromonas del proceso de transferencia conjugativa de uno de estos plásmidos, pAD1, que se ha encontrado en el 90% de las cepas clínicas asociadas a brotes hospitalarios. Concretamente se centra en el análisis de la activación de la conjugación llevada a cabo por TraE1. Para ello se identificará el sitio de inicio de la transcripción de los operones regulados por TraE1 por RNA-seq, así como su mecanismo de acción. Se determinará su estructura tridimensional y se identificarán los residuos importantes por mutagénesis dirigida y posterior análisis funcional. De esta forma se conseguirá un avance significativo en la comprensión de la regulación de la conjugación en respuesta a feromonas permitiendo el desarrollo de inhibidores específicos que ayuden a reducir la diseminación de resistencias a antibióticos en el ambiente hospitalario. (Spanish)
    0 references
    Enterococcus faecalis is a notable agent producing opportunistic infections in hospital patients in our environment. Clinical isolations of E. faecalis are notorious for encoding resistance to multiple antibiotics. These resistances are acquired and disseminated frequently by conjugation, through transposons and conjugative plasmids. An apparently exclusive feature of Enterococcus is the role played by peptide pheromones in the transfer of conjugative plasmids. These pheromones are synthesised and secreted by all strains of E. faecalis. Pheromone-responsive plasmids are ubiquitous in E. faecalis (including clinical strains) and can be transferred at frequencies close to 100 %. These plasmids also improve the transfer of other elements present in the same strain. All this suggests its importance in the spread of antibiotic resistance. These plasmids also encode virulence determinants as hemolysins and aggregation substances. The main objective of this project is the study of induction in response to pheromones of the conjugative transfer process of one of these plasmids, pAD1, which has been found in 90 % of clinical strains associated with hospital outbreaks. Specifically, it focuses on the analysis of the activation of conjugation carried out by TraE1. This will identify the starting site of transcription of the operations regulated by TraE1 by RNA-seq, as well as its mechanism of action. Its three-dimensional structure shall be determined and significant residues identified by directed mutagenesis and subsequent functional analysis. This will lead to significant progress in understanding the regulation of conjugation in response to pheromones, allowing the development of specific inhibitors to help reduce the spread of antibiotic resistance in the hospital environment. (English)
    12 October 2021
    0.1682116629439964
    0 references
    Enterococcus faecalis est un agent remarquable produisant des infections opportunistes chez les patients hospitalisés dans notre environnement. Les isolements cliniques d’E. faecalis sont notoires pour l’encodage de la résistance à de multiples antibiotiques. Ces résistances sont acquises et diffusées fréquemment par conjugaison, par transposons et plasmides conjugatifs. Une caractéristique apparemment exclusive d’Enterococcus est le rôle joué par les phéromones peptidiques dans le transfert de plasmides conjugués. Ces phéromones sont synthétisées et sécrétées par toutes les souches d’E. faecalis. Les plasmides sensibles aux phéromones sont omniprésents chez E. faecalis (y compris les souches cliniques) et peuvent être transférés à des fréquences proches de 100 %. Ces plasmides améliorent également le transfert d’autres éléments présents dans la même souche. Tout cela suggère son importance dans la propagation de la résistance aux antibiotiques. Ces plasmides codent également les déterminants de la virulence en tant qu’hémolysines et substances d’agrégation. L’objectif principal de ce projet est l’étude de l’induction en réponse aux phéromones du processus de transfert conjugué d’un de ces plasmides, pAD1, qui a été trouvé dans 90 % des souches cliniques associées à des éclosions hospitalières. Plus précisément, il se concentre sur l’analyse de l’activation de la conjugaison réalisée par TraE1. Cela permettra d’identifier le site de départ de la transcription des opérations réglementées par TraE1 par RNA-seq, ainsi que son mécanisme d’action. Sa structure tridimensionnelle doit être déterminée et les résidus significatifs identifiés par mutagenèse dirigée et par analyse fonctionnelle ultérieure. Cela conduira à des progrès significatifs dans la compréhension de la régulation de la conjugaison en réponse aux phéromones, ce qui permettra le développement d’inhibiteurs spécifiques pour aider à réduire la propagation de la résistance aux antibiotiques dans l’environnement hospitalier. (French)
    2 December 2021
    0 references
    Enterococcus faecalis ist ein bemerkenswertes Mittel, das opportunistische Infektionen bei Krankenhauspatienten in unserer Umwelt produziert. Klinische Isolationen von E. faecalis sind berüchtigt für die Kodierung der Resistenz gegen mehrere Antibiotika. Diese Widerstände werden häufig durch Konjugation, durch Transposons und konjugative Plasmide erworben und verbreitet. Ein scheinbar exklusives Merkmal von Enterococcus ist die Rolle von Peptidpheromonen bei der Übertragung konjugativer Plasmide. Diese Pheromone werden von allen Stämmen von E. faecalis synthetisiert und abgesondert. Pheromone-responsive Plasmide sind in E. faecalis (einschließlich klinischer Stämme) allgegenwärtig und können bei Frequenzen von fast 100 % übertragen werden. Diese Plasmide verbessern auch die Übertragung anderer Elemente, die in der gleichen Sorte vorhanden sind. All dies deutet auf seine Bedeutung bei der Verbreitung der Antibiotikaresistenz hin. Diese Plasmide kodieren auch Virulenzdeterminanten als Hämolysine und Aggregationssubstanzen. Hauptziel dieses Projekts ist die Untersuchung der Induktion als Reaktion auf Pheromone des konjugativen Transferprozesses eines dieser Plasmide, pAD1, der bei 90 % der klinischen Stämme im Zusammenhang mit Krankenhausausbrüchen festgestellt wurde. Insbesondere konzentriert sie sich auf die Analyse der Aktivierung der Konjugation durch TraE1. Dies wird die Ausgangsstelle der Transkription der von TraE1 von RNA-seq geregelten Operationen sowie deren Wirkmechanismus ermitteln. Seine dreidimensionale Struktur ist zu bestimmen und signifikante Rückstände durch gezielte Mutagenese und nachfolgende Funktionsanalysen zu identifizieren. Dies wird zu erheblichen Fortschritten beim Verständnis der Regulierung der Konjugation als Reaktion auf Pheromone führen, wodurch die Entwicklung spezifischer Hemmstoffe ermöglicht wird, um die Ausbreitung von Antibiotikaresistenz in der Krankenhausumgebung zu verringern. (German)
    9 December 2021
    0 references
    Enterococcus faecalis is een opmerkelijk middel dat opportunistische infecties veroorzaakt bij ziekenhuispatiënten in onze omgeving. Klinische isolaties van E. faecalis zijn berucht voor het coderen van resistentie tegen meerdere antibiotica. Deze weerstanden worden vaak verkregen en verspreid door vervoeging, door transposons en conjugatieve plasmiden. Een schijnbaar exclusieve eigenschap van Enterococcus is de rol gespeeld door peptide feromonen in de overdracht van conjugatieve plasmiden. Deze feromonen worden gesynthetiseerd en afgescheiden door alle stammen van E. faecalis. Feromoon-responsieve plasmiden zijn alomtegenwoordig in E. faecalis (inclusief klinische stammen) en kunnen worden overgedragen bij frequenties dicht bij 100 %. Deze plasmiden verbeteren ook de overdracht van andere elementen die in dezelfde stam aanwezig zijn. Dit alles wijst op het belang ervan voor de verspreiding van antibioticaresistentie. Deze plasmiden coderen ook virulentiedeterminanten als hemolysinen en aggregatiestoffen. De belangrijkste doelstelling van dit project is de studie van de inductie in reactie op feromonen van het conjugatieve overdrachtsproces van een van deze plasmiden, pAD1, die is gevonden in 90 % van de klinische stammen geassocieerd met ziekenhuisuitbraken. Het richt zich met name op de analyse van de activering van vervoeging door TraE1. Dit zal de startplaats van transcriptie van de door TraE1 door RNA-seq geregelde operaties identificeren, evenals het werkingsmechanisme ervan. De driedimensionale structuur wordt bepaald en significante residuen worden geïdentificeerd door gerichte mutagenese en daaropvolgende functionele analyse. Dit zal leiden tot aanzienlijke vooruitgang bij het begrijpen van de regulering van vervoeging in reactie op feromonen, waardoor de ontwikkeling van specifieke remmers om de verspreiding van antibioticaresistentie in het ziekenhuis te helpen verminderen. (Dutch)
    17 December 2021
    0 references
    Enterococcus faecalis è un importante agente che produce infezioni opportunistiche nei pazienti ospedalieri nel nostro ambiente. Gli isolamenti clinici di E. faecalis sono noti per la codifica della resistenza agli antibiotici multipli. Queste resistenze sono acquisite e diffuse frequentemente per coniugazione, attraverso trasposoni e plasmidi coniugativi. Una caratteristica apparentemente esclusiva di Enterococcus è il ruolo svolto dai feromoni peptidi nel trasferimento dei plasmidi coniugativi. Questi feromoni sono sintetizzati e secreti da tutti i ceppi di E. faecalis. I plasmidi rispondenti ai feromoni sono onnipresenti in E. faecalis (compresi i ceppi clinici) e possono essere trasferiti a frequenze prossime al 100 %. Questi plasmidi migliorano anche il trasferimento di altri elementi presenti nello stesso ceppo. Tutto questo suggerisce la sua importanza nella diffusione della resistenza agli antibiotici. Questi plasmidi codificano anche i determinanti della virulenza come emolisina e sostanze di aggregazione. L'obiettivo principale di questo progetto è lo studio dell'induzione in risposta ai feromoni del processo di trasferimento coniugativo di uno di questi plasmidi, pAD1, che è stato trovato nel 90 % dei ceppi clinici associati a focolai ospedalieri. Nello specifico, si concentra sull'analisi dell'attivazione della coniugazione effettuata da TraE1. Questo individuerà il sito di partenza della trascrizione delle operazioni regolate da TraE1 da RNA-seq, nonché il suo meccanismo d'azione. La sua struttura tridimensionale deve essere determinata e i residui significativi devono essere identificati mediante mutagenesi diretta e successiva analisi funzionale. Ciò porterà a progressi significativi nella comprensione della regolamentazione della coniugazione in risposta ai feromoni, consentendo lo sviluppo di inibitori specifici per contribuire a ridurre la diffusione della resistenza agli antibiotici nell'ambiente ospedaliero. (Italian)
    16 January 2022
    0 references
    Ο Enterococcus faecalis είναι ένας αξιοσημείωτος παράγοντας που προκαλεί ευκαιριακές λοιμώξεις σε νοσοκομειακούς ασθενείς στο περιβάλλον μας. Οι κλινικές απομονώσεις του E. faecalis είναι διαβόητες για την κωδικοποίηση της αντοχής σε πολλαπλά αντιβιοτικά. Αυτές οι αντιστάσεις αποκτώνται και διαδίδονται συχνά με σύζευξη, μέσα από transposons και συζευκτικά πλασμίδια. Ένα προφανώς αποκλειστικό χαρακτηριστικό του Enterococcus είναι ο ρόλος που διαδραματίζουν οι φερομόνες πεπτιδίων στη μεταφορά συζευγμάτων πλασμιδίων. Αυτές οι φερομόνες συντίθενται και εκκρίνονται από όλα τα στελέχη του E. faecalis. Τα πλασμίδια που ανταποκρίνονται στις φερομόνες είναι πανταχού παρόντα στο E. faecalis (συμπεριλαμβανομένων των κλινικών στελεχών) και μπορούν να μεταφερθούν σε συχνότητες κοντά στο 100 %. Αυτά τα πλασμίδια βελτιώνουν επίσης τη μεταφορά άλλων στοιχείων που υπάρχουν στο ίδιο στέλεχος. Όλα αυτά δείχνουν τη σημασία της στην εξάπλωση της αντοχής στα αντιβιοτικά. Αυτά τα πλασμίδια κωδικοποιούν επίσης τους καθοριστικούς παράγοντες λοιμοτοξικότητας ως αιμολυσίνες και ουσίες συγκέντρωσης. Ο κύριος στόχος αυτού του έργου είναι η μελέτη της επαγωγής σε απάντηση στις φερομόνες της διαδικασίας συζευκτικής μεταφοράς ενός από αυτά τα πλασμίδια, του pAD1, το οποίο έχει βρεθεί στο 90 % των κλινικών στελεχών που σχετίζονται με εστίες νοσοκομειακών λοιμώξεων. Συγκεκριμένα, επικεντρώνεται στην ανάλυση της ενεργοποίησης της σύζευξης που πραγματοποιείται από την TraE1. Αυτό θα προσδιορίσει τον τόπο έναρξης της μεταγραφής των λειτουργιών που ρυθμίζονται από το TraE1 από το RNA-seq, καθώς και τον μηχανισμό δράσης του. Προσδιορίζεται η τρισδιάστατη δομή του και εντοπίζονται σημαντικά κατάλοιπα με κατευθυνόμενη μεταλλαξιογένεση και επακόλουθη λειτουργική ανάλυση. Αυτό θα οδηγήσει σε σημαντική πρόοδο όσον αφορά την κατανόηση της ρύθμισης της σύζευξης ως απάντηση στις φερομόνες, επιτρέποντας την ανάπτυξη ειδικών αναστολέων που θα συμβάλουν στη μείωση της εξάπλωσης της ανθεκτικότητας στα αντιβιοτικά στο νοσοκομειακό περιβάλλον. (Greek)
    17 August 2022
    0 references
    Enterococcus faecalis er et bemærkelsesværdigt middel, der producerer opportunistiske infektioner hos hospitalspatienter i vores miljø. Kliniske isolationer af E. faecalis er berygtede for kodning af resistens over for flere antibiotika. Disse resistenser erhverves og udbredes ofte ved bøjning, gennem transposoner og konjugative plasmider. Et tilsyneladende eksklusivt træk ved Enterococcus er den rolle, som peptid feromoner spiller i overførslen af konjugative plasmider. Disse feromoner syntetiseres og udskilles af alle stammer af E. faecalis. Feromonresponsive plasmider er allestedsnærværende i E. faecalis (herunder kliniske stammer) og kan overføres ved frekvenser tæt på 100 %. Disse plasmider forbedrer også overførslen af andre elementer, der er til stede i samme stamme. Alt dette tyder på, at det er vigtigt for spredningen af antibiotikaresistens. Disse plasmider indkoder også virulensdeterminanter som hæmolysiner og aggregeringsstoffer. Hovedformålet med dette projekt er undersøgelsen af induktion som reaktion på feromoner i den konjugative overførselsproces af en af disse plasmider, pAD1, som er fundet hos 90 % af de kliniske stammer, der er forbundet med hospitalsudbrud. Den fokuserer specifikt på analysen af aktiveringen af bøjning foretaget af TraE1. Dette vil identificere startstedet for transskription af de operationer, der reguleres af TraE1 af RNA-seq, samt dens virkningsmekanisme. Dets tredimensionale struktur bestemmes, og signifikante restkoncentrationer identificeres ved målrettet mutagenese og efterfølgende funktionsanalyse. Dette vil føre til betydelige fremskridt med hensyn til at forstå reguleringen af konjugation som reaktion på feromoner, hvilket vil gøre det muligt at udvikle specifikke hæmmere, der kan bidrage til at reducere spredningen af antibiotikaresistens i hospitalsmiljøet. (Danish)
    17 August 2022
    0 references
    Enterococcus faecalis on merkittävä lääke, joka tuottaa opportunistisia infektioita sairaalapotilailla ympäristössämme. E. faecalis -bakteerin kliiniset eristämiset ovat tunnettuja useiden antibioottien resistenssin koodaamisessa. Nämä resistenssit hankitaan ja leviävät usein konjugoinnin, transposonien ja konjugatiivisten plasmidien kautta. Ilmeisesti yksinomainen piirre Enterococcus on rooli peptidi feromonien siirto konjugatiiviset plasmidit. Nämä feromonit syntetisoivat ja erittävät kaikki E. faecalis -bakteerit. Feromoniresponsiiviset plasmidit ovat kaikkialla E. faecalis -bakteerissa (mukaan lukien kliiniset kannat), ja niitä voidaan siirtää lähes 100 %:n taajuudella. Nämä plasmidit parantavat myös muiden samassa kannassa esiintyvien elementtien siirtoa. Kaikki tämä viittaa sen merkitykseen antibioottiresistenssin leviämisessä. Nämä plasmidit koodaavat myös virulenssin tausta-aineet hemolyysiineiksi ja aggregaatioaineiksi. Tämän hankkeen päätavoitteena on tutkimus induktiosta vastauksena feromonien konjugatiiviseen siirtoprosessiin yhden näistä plasmideista, pAD1, jota on havaittu 90 prosentissa sairaalaepidemioihin liittyvistä kliinisistä kannoista. Siinä keskitytään erityisesti TraE1:n tekemään analyysiin konjugoinnin aktivoinnista. Siinä yksilöidään TraE1:n RNA-seqin sääntelemän toiminnan aloittamispaikka sekä sen toimintamekanismi. Sen kolmiulotteinen rakenne on määritettävä ja merkittävät jäämät tunnistettava suunnatulla mutageneesilla ja sen jälkeen tehtävällä toiminnallisella analyysilla. Tämä johtaa merkittävään edistymiseen konjugoinnin sääntelyn ymmärtämisessä feromonien yhteydessä, mikä mahdollistaa erityisten estäjien kehittämisen, jotta voidaan vähentää antibioottiresistenssin leviämistä sairaalaympäristössä. (Finnish)
    17 August 2022
    0 references
    Enterococcus faecalis huwa aġent notevoli li jipproduċi infezzjonijiet opportunistiċi f’pazjenti tal-isptar fl-ambjent tagħna. L-iżolamenti kliniċi ta’ E. faecalis huma notorji għall-kodifikazzjoni tar-reżistenza għal diversi antibijotiċi. Dawn ir-reżistenzi jinkisbu u jinxterdu ta’ spiss permezz ta’ konjugazzjoni, permezz ta’ transposons u plażmidi konjugattivi. Karatteristika apparentement esklussiva ta ‘Enterococcus huwa r-rwol li għandhom peptide feromoni fit-trasferiment ta’ plasmids konjugattivi. Dawn feromoni huma sintetizzati u secreted mill-razez kollha ta ' E. faecalis. Plażmidi li jirrispondu għal feromoni jinsabu kullimkien f’E. faecalis (inkluż razez kliniċi) u jistgħu jiġu ttrasferiti fi frekwenzi qrib il-100 %. Dawn il-plasmidi jtejbu wkoll it-trasferiment ta’ elementi oħra preżenti fl-istess razza. Dan kollu jissuġġerixxi l-importanza tagħha fit-tixrid tar-reżistenza għall-antibijotiċi. Dawn il-plasmidi wkoll jikkodifikaw id-determinanti tal-virulenza bħala hemolysins u sustanzi ta’ aggregazzjoni. L-għan ewlieni ta’ dan il-proġett huwa l-istudju ta’ induzzjoni b’rispons għall-feromoni tal-proċess ta’ trasferiment konjugattiv ta’ wieħed minn dawn il-plasmidi, pAD1, li nstab f’90 % tar-razez kliniċi assoċjati ma’ tifqigħat fl-isptar. B’mod speċifiku, jiffoka fuq l-analiżi tal-attivazzjoni tal-konjugazzjoni mwettqa minn TraE1. Dan għandu jidentifika s-sit tal-bidu tat-traskrizzjoni tal-operazzjonijiet regolati minn TraE1 mill-RNA-seq, kif ukoll il-mekkaniżmu ta’ azzjoni tiegħu. L-istruttura tridimensjonali tiegħu għandha tiġi stabbilita u għandhom jiġu identifikati residwi sinifikanti permezz ta’ mutaġenesi diretta u analiżi funzjonali sussegwenti. Dan se jwassal għal progress sinifikanti fil-fehim tar-regolamentazzjoni tal-konjugazzjoni b’rispons għall-feromoni, li jippermetti l-iżvilupp ta’ inibituri speċifiċi biex jgħinu jnaqqsu t-tixrid tar-reżistenza antibijotika fl-ambjent tal-isptar. (Maltese)
    17 August 2022
    0 references
    Enterococcus faecalis ir ievērojams līdzeklis, kas izraisa oportūnistiskas infekcijas slimnīcas pacientiem mūsu vidē. E. feecalis klīniskās izolācijas ir bēdīgi slavenas, lai kodētu rezistenci pret vairākām antibiotikām. Šīs rezistences iegūst un izplata bieži konjugācijas ceļā, ar transpozoniem un konjugatīvām plazmīdām. Acīmredzot ekskluzīva iezīme Enterococcus ir loma peptīdu feromoni nodošanu konjugatīvo plazmīdu. Šie feromoni tiek sintezēti un izdalīti ar visiem celmiem E. feecalis. Feromonu reaģējošas plazmīdas ir visuresošas E. feecalis (ieskaitot klīniskos celmus) un var tikt pārnestas ar biežumu, kas ir tuvu 100 %. Šīs plazmīdas arī uzlabo citu tajā pašā celmā esošo elementu pārnesi. Tas viss liecina par tās nozīmi antibiotiku rezistences izplatīšanā. Šīs plazmīdas arī kodē virulence determinantus kā hemolizīnus un agregācijas vielas. Šā projekta galvenais mērķis ir pētījums par indukciju, reaģējot uz vienas no šīm plazmīdu konjugatīvās pārneses procesa feromoniem, pAD1, kas ir konstatēts 90 % klīnisko celmu, kas saistīti ar slimnīcu uzliesmojumiem. Konkrētāk, tā koncentrējas uz TraE1 veikto konjugācijas aktivizēšanas analīzi. Tas noteiks RNS-seq regulēto operāciju transkripcijas sākumvietu, kā arī tās darbības mehānismu. Nosaka tā trīsdimensiju struktūru un ar virzītas mutaģenēzes un pēc tam funkcionālās analīzes palīdzību identificē nozīmīgas atliekas. Tas novedīs pie ievērojama progresa, izprotot konjugācijas regulējumu, reaģējot uz feromoniem, ļaujot izstrādāt īpašus inhibitorus, lai palīdzētu samazināt antibiotiku rezistences izplatīšanos slimnīcu vidē. (Latvian)
    17 August 2022
    0 references
    Enterococcus faecalis je pozoruhodný prostriedok produkujúci oportúnne infekcie u nemocničných pacientov v našom prostredí. Klinické izolácie E. faecalisu sú notoricky známe pre kódovanie rezistencie voči viacerým antibiotikám. Tieto rezistencie sa získavajú a šíria často konjugáciou, prostredníctvom transpozónov a konjugatívnych plazmidov. Zdanlivo exkluzívnou vlastnosťou Enterococcus je úloha, ktorú hrajú peptidové feromóny pri prenose konjugatívnych plazmidov. Tieto feromóny sú syntetizované a vylučované všetkými kmeňmi E. faecalis. Feromón-reaktívne plazmidy sú u E. faecalis (vrátane klinických kmeňov) všadeprítomné a môžu sa prenášať pri frekvenciách blízkych 100 %. Tieto plazmidy tiež zlepšujú prenos iných prvkov prítomných v tom istom kmeni. To všetko naznačuje jeho význam pri šírení rezistencie voči antibiotikám. Tieto plazmidy tiež kódujú virulenčné determinanty ako hemolyzíny a agregačné látky. Hlavným cieľom tohto projektu je štúdia indukcie v reakcii na feromóny procesu konjugatívneho prenosu jednej z týchto plazmidov, pAD1, ktorá sa zistila v 90 % klinických kmeňov spojených s prepuknutím choroby v nemocniciach. Konkrétne sa zameriava na analýzu aktivácie konjugácie, ktorú vykonáva TraE1. Tým sa určí východiskové miesto prepisu operácií regulovaných systémom TraE1 RNA-seq, ako aj mechanizmus jeho účinku. Stanoví sa jeho trojrozmerná štruktúra a významné rezíduá sa identifikujú na základe cielenej mutagenézy a následnej funkčnej analýzy. To povedie k významnému pokroku v chápaní regulácie konjugácie v reakcii na feromóny, čo umožní vývoj špecifických inhibítorov, ktoré pomôžu znížiť šírenie rezistencie voči antibiotikám v nemocničnom prostredí. (Slovak)
    17 August 2022
    0 references
    Is gníomhaire suntasach é Enterococcus faecalis a tháirgeann ionfhabhtuithe tráthúla in othair ospidéil inár dtimpeallacht. Tá leithlisiú cliniciúil E. faecalis notorious chun frithsheasmhacht in aghaidh antaibheathaigh iolracha a ionchódú. Tá na frithsheasmhacht a fhaightear agus a scaipeadh go minic ag comhchuingiú, trí transposons agus plasmids comhchuingeacha. Is gné eisiach de Enterococcus an ról a bhí ag pheromones peptide i aistriú plasmids comhchuingeacha. Déantar na pheromones seo a shintéisiú agus a rúnú ag gach tréithchineál E. faecalis. Tá plasmids pheromone-ponsive uileláithreach in E. faecalis (lena n-áirítear tréithchineálacha cliniciúla) agus is féidir iad a aistriú ag minicíochtaí gar do 100 %. Feabhsaíonn na plasmids seo freisin aistriú eilimintí eile atá i láthair sa bhrú céanna. Tugann sé sin le fios a thábhachtaí atá sé i leathadh na frithsheasmhachta in aghaidh antaibheathach. Tá na plasmids ionchódú freisin deitéarmanaint nimhneacht mar hemolysins agus substaintí comhiomlánaithe. Is é príomhchuspóir an tionscadail seo ná staidéar a dhéanamh ar ionduchtú mar fhreagra ar pheromones an phróisis aistrithe chomhchuingigh de cheann de na plasmids seo, pAD1, a fuarthas i 90 % de na tréithchineálacha cliniciúla a bhaineann le ráigeanna ospidéil. Go sonrach, díríonn sé ar an anailís ar ghníomhachtú comhchuingiú a dhéanann TraE1. Sainaithneofar leis sin suíomh tosaigh tras-scríofa na n-oibríochtaí arna rialú ag TraE1 ag RNA-seq, chomh maith lena mheicníocht ghníomhaíochta. Cinnfear a struchtúr tríthoiseach agus déanfar iarmhair shuntasacha arna sainaithint ag só-ghineacha dírithe agus anailís fheidhmiúil ina dhiaidh sin. Mar thoradh air sin, déanfar dul chun cinn suntasach maidir le comhchuingiú a rialáil mar fhreagairt ar fhearamóin, rud a fhágfaidh go mbeifear in ann coscairí sonracha a fhorbairt chun cuidiú le leathadh na frithsheasmhachta in aghaidh antaibheathach a laghdú i dtimpeallacht an ospidéil. (Irish)
    17 August 2022
    0 references
    Enterococcus faecalis je pozoruhodný přípravek produkující oportunní infekce u nemocničních pacientů v našem prostředí. Klinické izolace E. faecalis jsou známé pro kódování rezistence na více antibiotik. Tyto rezistence jsou získávány a šířeny často konjugací, transpozony a konjugativními plasmidy. Evidentně exkluzivním rysem Enterococcus je role, kterou hrají peptidové feromony při přenosu konjugativních plasmidů. Tyto feromony jsou syntetizovány a vylučovány všemi kmeny E. faecalis. Feromon-reagující plasmidy jsou všudypřítomné v E. faecalis (včetně klinických kmenů) a mohou být přenášeny při frekvencích blížících se 100 %. Tyto plasmidy také zlepšují přenos dalších prvků přítomných ve stejném kmeni. To vše naznačuje jeho význam při šíření rezistence vůči antibiotikům. Tyto plazmidy také kódují determinant virulence jako hemolysiny a agregační látky. Hlavním cílem tohoto projektu je studie indukce v reakci na feromony konjugativního procesu přenosu jednoho z těchto plasmidů, pAD1, který byl zjištěn u 90 % klinických kmenů spojených s ohnisky v nemocnicích. Konkrétně se zaměřuje na analýzu aktivace konjugace provedenou společností TraE1. Tím se určí výchozí místo přepisu operací regulovaných systémem TraE1 společností RNA-seq, jakož i mechanismus jeho působení. Určí se jeho trojrozměrná struktura a významná rezidua se určí na základě cílené mutageneze a následné funkční analýzy. To povede k významnému pokroku v pochopení regulace konjugace v reakci na feromony, což umožní vývoj specifických inhibitorů, které pomohou snížit šíření rezistence vůči antibiotikům v nemocničním prostředí. (Czech)
    17 August 2022
    0 references
    Enterococcus faecalis é um agente notável que produz infeções oportunistas em doentes hospitalizados no nosso ambiente. Isolamentos clínicos de E. faecalis são conhecidos por codificar a resistência a múltiplos antibióticos. Estas resistências são adquiridas e disseminadas frequentemente por conjugação, através de transposões e plasmídeos conjugativos. Uma característica aparentemente exclusiva do Enterococcus é o papel desempenhado pelas feromonas peptídicas na transferência de plasmídeos conjugativos. Estas feromonas são sintetizadas e segregadas por todas as estirpes de E. faecalis. Os plasmídeos responsivos à feromona são ubíquos em E. faecalis (incluindo estirpes clínicas) e podem ser transferidos a frequências próximas de 100 %. Estes plasmídeos também melhoram a transferência de outros elementos presentes na mesma estirpe. Tudo isto sugere a sua importância na propagação da resistência aos antibióticos. Estes plasmídeos também codificam determinantes de virulência como hemolisinas e substâncias de agregação. O principal objetivo deste projeto é o estudo da indução em resposta a feromonas do processo de transferência conjugativa de um desses plasmídeos, o pAD1, que foi encontrado em 90% das cepas clínicas associadas a surtos hospitalares. Especificamente, centra-se na análise da ativação da conjugação realizada pelo TraE1. Isto identificará o local inicial da transcrição das operações reguladas por TraE1 pelo RNA-seq, assim como seu mecanismo da ação. A sua estrutura tridimensional deve ser determinada e os resíduos significativos identificados por mutagénese dirigida e subsequente análise funcional. Isto levará a um progresso significativo na compreensão da regulação da conjugação em resposta às feromonas, permitindo o desenvolvimento de inibidores específicos para ajudar a reduzir a propagação da resistência aos antibióticos no ambiente hospitalar. (Portuguese)
    17 August 2022
    0 references
    Enterococcus faecalis on märkimisväärne aine, mis tekitab meie keskkonnas haiglapatsientidel oportunistlikke infektsioone. E. faecalis’e kliiniline isoleerimine on kurikuulus paljude antibiootikumide suhtes resistentsuse kodeerimiseks. Neid resistentsusi omandatakse ja levitatakse sageli konjugatsiooni, transposoonide ja konjugatiivsete plasmiidide kaudu. Enterococcus’e näiliselt eksklusiivne omadus on peptiidi feromoonide roll konjugatiivsete plasmiidide ülekandmisel. Need feromoonid sünteesitakse ja erituvad kõik E. faecalis’e tüved. Feromoonile reageerivad plasmiidid on üldlevinud E. faecalis’es (sealhulgas kliinilised tüved) ja neid võib üle kanda ligikaudu 100 % sagedustel. Need plasmiidid parandavad ka teiste sama tüve elementide ülekandmist. Kõik see viitab selle tähtsusele antibiootikumiresistentsuse levikus. Need plasmiidid kodeerivad ka virulentsust määravaid tegureid hemolüsiinide ja agregatsiooniainetena. Projekti peamine eesmärk on uurida induktsioone vastusena ühe neist plasmiididest, pAD1 konjugatiivse ülekande protsessi feromoonidele, mida on leitud 90 % kliinilistest tüvedest, mis on seotud haiglapuhangutega. Täpsemalt keskendub see TraE1 poolt läbi viidud konjugatsiooni aktiveerimise analüüsile. Sellega määratakse kindlaks TraE1 poolt RNA-seqi poolt reguleeritud toimingute ümberkirjutamise lähtekoht ja selle toimemehhanism. Selle kolmemõõtmeline struktuur määratakse kindlaks ja tehakse kindlaks olulised jäägid suunatud mutageneesi ja sellele järgneva funktsionaalse analüüsi abil. See viib märkimisväärsete edusammudeni feromoonidele reageerimise konjugatsiooni reguleerimise mõistmisel, võimaldades konkreetsete inhibiitorite väljatöötamist, mis aitavad vähendada antibiootikumiresistentsuse levikut haiglakeskkonnas. (Estonian)
    17 August 2022
    0 references
    Az Enterococcus faecalis figyelemre méltó szer, amely opportunista fertőzéseket okoz a környezetünkben lévő kórházi betegekben. Az E. faecalis klinikai izolálása hírhedt a többszörös antibiotikumokkal szembeni rezisztencia kódolásáról. Ezek az ellenállások szerzett és terjesztett gyakran konjugáció, transzpozonok és konjugatív plazmidok. Az Enterococcus látszólag kizárólagos jellemzője a peptid feromonok szerepe a konjugatív plazmidok átadásában. Ezeket a feromonokat az E. faecalis összes törzse szintetizálja és kiválasztja. A feromonra reagáló plazmidok mindenütt jelen vannak az E. faecalis-ban (beleértve a klinikai törzseket is), és 100%-os gyakorisággal átvihetők. Ezek a plazmidok szintén javítják az ugyanabban a törzsben jelen lévő egyéb elemek átvitelét. Mindez arra utal, hogy fontos szerepet játszik az antibiotikum-rezisztencia terjedésében. Ezek a plazmidok a virulencia determinánsokat is hemolizinként és aggregációs anyagokként kódolják. A projekt fő célja az egyik ilyen plazmid, a pAD1 konjugatív átviteli folyamatának feromonokra adott válaszként végzett indukciós vizsgálata, amelyet a kórházi járványkitörésekkel összefüggő klinikai törzsek 90%-ában találtak. Különösen a TraE1 által végzett konjugáció aktiválásának elemzésére összpontosít. Ez azonosítja a TraE1 által az RNS-seq által szabályozott műveletek átírásának kezdő helyét, valamint annak hatásmechanizmusát. Háromdimenziós szerkezetét irányított mutagenezissel és az azt követő funkcionális elemzéssel kell meghatározni, és a jelentős maradékanyagokat azonosítani kell. Ez jelentős előrelépést fog eredményezni a feromonokra adott válaszként történő konjugáció szabályozásának megértésében, lehetővé téve olyan specifikus inhibitorok kifejlesztését, amelyek segítenek csökkenteni az antibiotikum-rezisztencia terjedését a kórházi környezetben. (Hungarian)
    17 August 2022
    0 references
    Enterococcus faecalis е забележителен агент, произвеждащ опортюнистични инфекции при болнични пациенти в нашата среда. Клиничните изолации на E. faecalis са известни с кодирането на резистентността към множество антибиотици. Тези съпротивления се придобиват и разпространяват често чрез конюгиране, чрез транспосони и конюгативни плазмиди. Ексклузивна особеност на Enterococcus е ролята на пептидни феромони в прехвърлянето на конюгативни плазмиди. Тези феромони се синтезират и секретират от всички щамове на E. faecalis. Плазмидите, реагиращи на феромони, са повсеместно разпространени при E. faecalis (включително клинични щамове) и могат да бъдат прехвърляни при честоти, близки до 100 %. Тези плазмиди също подобряват трансфера на други елементи, присъстващи в същия щам. Всичко това предполага значението му за разпространението на резистентност към антибиотици. Тези плазмиди също така кодират детерминантите на вирулентността като хемолизини и агрегационни вещества. Основната цел на този проект е проучването на индукцията в отговор на феромони на процеса на конюгативен трансфер на един от тези плазмиди, pAD1, който е открит в 90 % от клиничните щамове, свързани с огнища на болници. По-конкретно, тя е съсредоточена върху анализа на активирането на конюгацията, извършен от TraE1. Това ще определи началната точка на транскрипция на операциите, регулирани от TraE1 от РНК-seq, както и неговия механизъм на действие. Неговата триизмерна структура се определя и се идентифицират значителни остатъчни вещества чрез насочена мутагенеза и последващ функционален анализ. Това ще доведе до значителен напредък в разбирането на регулирането на конюгацията в отговор на феромони, което ще позволи разработването на специфични инхибитори, които да спомогнат за намаляване на разпространението на резистентност към антибиотици в болничната среда. (Bulgarian)
    17 August 2022
    0 references
    Enterococcus faecalis yra pastebimas agentas, sukeliantis oportunistines infekcijas ligoninėms mūsų aplinkoje. E. faecalis klinikinė izoliacija yra žinoma dėl atsparumo keliems antibiotikams kodavimo. Šitie pasipriešinimai dažnai įgyjami ir skleidžiami konjugacijos būdu, per transpozonus ir konjugatyvias plazmides. Matyt išskirtinis bruožas Enterococcus yra vaidmuo peptidų feromonai į konjugacinių plazmidžių perdavimo. Šie feromonai yra sintezuojami ir išskiriami visų E. faecalis padermių. Į feromoną reaguojančios plazmidės yra visur esančios E. faecalis (įskaitant klinikines padermes) ir gali būti perduodamos maždaug 100 % dažniu. Šios plazmidės taip pat pagerina kitų toje pačioje padermėje esančių elementų perdavimą. Visa tai rodo jo svarbą atsparumo antibiotikams plitimui. Šios plazmidės taip pat koduoja virulentiškumo veiksnius kaip hemolizinus ir agregacijos medžiagas. Pagrindinis šio projekto tikslas yra indukcijos tyrimas reaguojant į vieno iš šių plazmidžių konjugacinio perdavimo proceso feromonus, pAD1, kuris buvo nustatytas 90 % klinikinių padermių, susijusių su ligoninės protrūkiais. Konkrečiai, jame daugiausia dėmesio skiriama konjugacijos aktyvavimo analizei, kurią atliko TraE1. Jame bus nustatyta pradinė operacijų, kurias TraE1 reguliuoja RNR-seq, transkripcijos vieta ir jos veikimo mechanizmas. Nustatoma jo trimatė struktūra ir nustatomi reikšmingi likučiai, atliekant kryptingą mutagenezę ir vėlesnę funkcinę analizę. Tai leis didelę pažangą suprasti konjugacijos reguliavimą reaguojant į feromonai, leidžiant konkrečių inhibitorių vystymąsi padėti sumažinti antibiotikų atsparumo plitimą ligoninės aplinkoje. (Lithuanian)
    17 August 2022
    0 references
    Enterococcus faecalis je značajan agens koji proizvodi oportunističke infekcije kod bolničkih pacijenata u našem okruženju. Klinička izolacija bakterije E. fecalis poznata je po kodiranju otpornosti na višestruke antibiotike. Ti se otpori dobivaju i šire često konjugacijom, transposonima i konjugativnim plazmidima. Naizgled ekskluzivna značajka Enterococcus je uloga koju igra peptid feromoni u prijenosu konjugativni plasmids. Ti feromoni su sintetizirani i izlučeni od strane svih sojeva E. fecalis. Feromon-odgovorni plazmidi su sveprisutni u E. fecalis (uključujući kliničke sojeve) i mogu se prenijeti na učestalosti blizu 100 %. Ovi plazmidi također poboljšavaju prijenos drugih elemenata prisutnih u istom soju. Sve to upućuje na njegovu važnost u širenju otpornosti na antibiotike. Ovi plasmidi također kodiraju virulence determinante kao hemolizini i agregacije tvari. Glavni cilj ovog projekta je studija indukcije kao odgovor na feromone konjugativnog procesa prijenosa jednog od tih plasmida, pAD1, koji je pronađen u 90 % kliničkih sojeva povezanih s bolničkim izbijanjima. Konkretno, ona se usredotočuje na analizu aktivacije konjugacije koju je provelo društvo TraE1. Time će se utvrditi početna lokacija transkripcije operacija koje regulira društvo TraE1 RNA-seq, kao i njegov mehanizam djelovanja. Određuje se njegova trodimenzionalna struktura, a značajni ostaci identificiraju se usmjerenom mutagenezom i naknadnom funkcionalnom analizom. To će dovesti do značajnog napretka u razumijevanju regulacije konjugacije kao odgovor na feromone, omogućujući razvoj specifičnih inhibitora kako bi se smanjilo širenje otpornosti na antibiotike u bolničkom okruženju. (Croatian)
    17 August 2022
    0 references
    Enterococcus faecalis är ett anmärkningsvärt medel som producerar opportunistiska infektioner hos sjukhuspatienter i vår miljö. Kliniska isoleringar av E. faecalis är ökända för att koda resistens mot flera antibiotika. Dessa motstånd förvärvas och sprids ofta genom konjugation, genom transposoner och konjugativa plasmider. En till synes exklusiv egenskap hos Enterococcus är den roll som peptidferomoner spelar i överföringen av konjugativa plasmider. Dessa feromoner syntetiseras och utsöndras av alla stammar av E. faecalis. Feromonresponsiva plasmider är allmänt förekommande i E. faecalis (inklusive kliniska stammar) och kan överföras vid frekvenser nära 100 %. Dessa plasmider förbättrar också överföringen av andra element som finns i samma stam. Allt detta tyder på dess betydelse för spridningen av antibiotikaresistens. Dessa plasmider kodar också virulensbestämningsfaktorer som hemolysiner och aggregeringsmedel. Huvudsyftet med detta projekt är att studera induktion som svar på feromoner av den konjugativa överföringsprocessen av en av dessa plasmider, pAD1, som har hittats i 90 % av de kliniska stammarna i samband med sjukhusutbrott. Den är särskilt inriktad på TraE1:s analys av aktiveringen av konjugationen. Detta kommer att identifiera startplatsen för transkription av de verksamheter som regleras av TraE1 av RNA-seq, samt dess verkningsmekanism. Dess tredimensionella struktur ska bestämmas och betydande resthalter identifieras genom riktad mutagenes och efterföljande funktionsanalys. Detta kommer att leda till betydande framsteg när det gäller att förstå regleringen av konjugation som svar på feromoner, vilket gör det möjligt att utveckla specifika hämmare för att bidra till att minska spridningen av antibiotikaresistens i sjukhusmiljön. (Swedish)
    17 August 2022
    0 references
    Enterococcus faecalis este un agent notabil care produce infecții oportuniste la pacienții spitalizați din mediul nostru. Izolarea clinică a E. faecalis este cunoscută pentru codificarea rezistenței la antibiotice multiple. Aceste rezistențe sunt dobândite și diseminate frecvent prin conjugare, prin transposons și plasmidele conjugative. O caracteristică aparent exclusivă a Enterococcus este rolul jucat de feromonii peptide în transferul plasmidelor conjugative. Acești feromoni sunt sintetizați și secretați de toate tulpinile de E. Faecalis. Plasmidele receptive la feromoni sunt omniprezente în E. faecalis (inclusiv tulpini clinice) și pot fi transferate la frecvențe apropiate de 100 %. Aceste plasmide îmbunătățesc, de asemenea, transferul altor elemente prezente în aceeași tulpină. Toate acestea sugerează importanța sa în răspândirea rezistenței la antibiotice. Aceste plasmide codifică, de asemenea, factorii determinanți de virulență ca hemolizine și substanțe de agregare. Obiectivul principal al acestui proiect este studiul inducției ca răspuns la feromonii procesului de transfer conjugativ al uneia dintre aceste plasmide, pAD1, care a fost găsit în 90 % din tulpinile clinice asociate cu focarele spitalicești. În special, aceasta se concentrează pe analiza activării conjugării efectuată de TraE1. Aceasta va identifica locul de începere a transcrierii operațiunilor reglementate de TraE1 de către ARN-seq, precum și mecanismul său de acțiune. Se determină structura sa tridimensională și se identifică reziduuri semnificative prin mutageneză dirijată și analize funcționale ulterioare. Acest lucru va duce la progrese semnificative în înțelegerea reglementării conjugarii ca răspuns la feromoni, permițând dezvoltarea unor inhibitori specifici pentru a ajuta la reducerea răspândirii rezistenței la antibiotice în mediul spitalicesc. (Romanian)
    17 August 2022
    0 references
    Enterococcus faecalis je opazno sredstvo, ki proizvaja oportunistične okužbe pri bolnišničnih bolnikih v našem okolju. Klinična izolacija E. faecalis je znana po kodiranju odpornosti na več antibiotikov. Te rezistence se pogosto pridobivajo in razširjajo s konjugacijo, s transposoni in konjugativnimi plazmidi. Navidezno ekskluzivna značilnost Enterococcusa je vloga peptidnih feromonov pri prenosu konjugacijskih plazmidov. Ti feromoni se sintetizirajo in izločajo z vsemi sevi E. faecalis. Plazmidi, ki se odzivajo na feromon, so vseprisotni v E. faecalis (vključno s kliničnimi sevi) in se lahko prenašajo s frekvencami blizu 100 %. Ti plazmidi izboljšujejo tudi prenos drugih elementov, prisotnih v istem sevu. Vse to kaže na njegov pomen pri širjenju odpornosti na antibiotike. Ti plazmidi kodirajo tudi determinante virulence kot hemolizine in agregacijske snovi. Glavni cilj tega projekta je študija indukcije v odziv na feromone procesa konjugacijskega prenosa enega od teh plazmidov, pAD1, ki je bila ugotovljena v 90 % kliničnih sevov, povezanih z bolnišničnimi izbruhi. Natančneje, osredotoča se na analizo aktivacije konjugacije, ki jo je izvedla TraE1. To bo opredelilo začetno mesto prepisa operacij, ki jih ureja TraE1 z RNA-seq, in njegov mehanizem delovanja. Določi se njegova tridimenzionalna struktura in določijo pomembni ostanki z usmerjeno mutagenezo in naknadno funkcionalno analizo. To bo privedlo do znatnega napredka pri razumevanju regulacije konjugacije v odziv na feromone, kar bo omogočilo razvoj posebnih inhibitorjev, ki bodo pomagali zmanjšati širjenje odpornosti na antibiotike v bolnišničnem okolju. (Slovenian)
    17 August 2022
    0 references
    Enterococcus faecalis jest znaczącym czynnikiem wywołującym zakażenia oportunistyczne u pacjentów szpitalnych w naszym środowisku. Izolacje kliniczne E. faecalis są znane z kodowania oporności na wiele antybiotyków. Te oporności są nabywane i rozpowszechniane często przez koniugację, poprzez transpozony i plazmidy koniugacyjne. Pozornie wyłączną cechą Enterococcus jest rola feromonów peptydowych w transferze plazmidów koniugacyjnych. Feromony te są syntetyzowane i wydzielane przez wszystkie szczepy E. faecalis. Plazmidy reagujące na feromon są wszechobecne w E. faecalis (w tym szczepach klinicznych) i mogą być przenoszone z częstotliwością zbliżoną do 100 %. Plazmidy te poprawiają również przenoszenie innych pierwiastków obecnych w tym samym szczepie. Wszystko to sugeruje jego znaczenie w rozprzestrzenianiu się oporności na antybiotyki. Te plazmidy również kodują determinanty zjadliwości jako hemolizyny i substancje agregujące. Głównym celem tego projektu jest badanie indukcji w odpowiedzi na feromony procesu przenoszenia koniugacyjnego jednego z tych plazmidów, pAD1, który stwierdzono w 90 % szczepów klinicznych związanych z ogniskami szpitali. W szczególności koncentruje się na analizie aktywacji koniugacji przeprowadzonej przez TraE1. Pozwoli to określić miejsce rozpoczęcia transkrypcji operacji regulowanych przez TraE1 przez RNA-seq, a także mechanizm jej działania. Określa się jego trójwymiarową strukturę, a znaczące pozostałości identyfikuje się w drodze ukierunkowanej mutagenezy i późniejszej analizy funkcjonalnej. Doprowadzi to do znacznych postępów w zrozumieniu regulacji koniugacji w odpowiedzi na feromony, co pozwoli na opracowanie konkretnych inhibitorów, które pomogą zmniejszyć rozprzestrzenianie się oporności na antybiotyki w środowisku szpitalnym. (Polish)
    17 August 2022
    0 references
    Santander
    0 references
    20 December 2023
    0 references

    Identifiers

    PI16_01535
    0 references