ANALYSIS OF GENETIC SUSCEPTIBILITY FACTORS AND PHENOTYPE MODIFIERS IN FAMILY AND SPORADIC FORMS OF MYASTHENIA GRAVIS AUTOIMMUNE BY MASS SEQUENCING TECHNIQUES. (Q3139755)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3139755 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | ANALYSIS OF GENETIC SUSCEPTIBILITY FACTORS AND PHENOTYPE MODIFIERS IN FAMILY AND SPORADIC FORMS OF MYASTHENIA GRAVIS AUTOIMMUNE BY MASS SEQUENCING TECHNIQUES. |
Project Q3139755 in Spain |
Statements
41,654.25 Euro
0 references
76,500.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2017
0 references
31 March 2020
0 references
FUNDACION INSTITUTO DE INVESTIGACION DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO VALL D'HEBRON (VHIR)
0 references
Miastenia Gravis (MG) es una enfermedad autoinmune heterogénea y multifactorial. Hay evidencia de la importancia de la genética en la enfermedad. Se han propuesto ciertos haplotipos HLA-DR/DQ como principales factores genéticos de susceptibilidad y modificantes de fenotipo. Las nuevas técnicas de secuenciación masiva han permitido identificar otros genes candidatos (HLA y no-HLA) para las formas esporádicas de MG. Recientemente se ha propuesto a ENOX1 como un gen candidato para las formas familiares de MG (FAMG). Estos hallazgos refuerzan la importancia de la genética en la patogenia de la enfermedad. Objetivos. 1) Identificar variantes genéticas de susceptibilidad y modificantes de fenotipo mediante NGS en 300 pacientes, de los cuales 24 son FAMG. 2) Estudiar que variantes HLA y no-HLA son factores de riesgo para MG. 3) Analizar si las variantes se asocian a alguna de las formas de MG, 4) Analizar si alguna de las variantes genéticas identificadas en el subgrupo de FAMG cumple criterios de “major gene” para MG. Metodología. Estudio prospectivo de pacientes con formas esporádicas y familiares de MG autoinmune. Se aplicaran los criterios diagnósticos y de investigación recomendados por la MGFA. Se obtendrá consentimiento informado. Se evaluarán las características clínicas, curso de la enfermedad, anticuerpos, histología tímica y respuesta al tratamiento. El protocolo incluirá la construcción de una librería, preparación de muestras, detección, lectura e interpretación de datos. Se genotiparán las muestras mediante técnica NGS utilizando una librería de genes diseñada ad hoc incluyendo aquellos genes de interés tanto HLA como no-HLA implicados en la fisiopatogenia de la enfermedad. Se comparará la frecuencia de las variantes con las bases de datos biológicos de referencia. (Spanish)
0 references
Myasthenia Gravis (MG) is a heterogeneous and multifactorial autoimmune disease. There is evidence of the importance of genetics in the disease. Certain HLA-DR/DQ haplotypes have been proposed as the main genetic susceptibility factors and phenotype modifiers. New mass sequencing techniques have made it possible to identify other candidate genes (HLA and non-HLA) for sporadic forms of MG. ENOX1 has recently been proposed as a candidate gene for family forms of MG (FAMG). These findings reinforce the importance of genetics in disease pathogenesis. Objectives. 1) Identify genetic variants of susceptibility and phenotype modifiers using NGS in 300 patients, of whom 24 are FAMG. 2) Study HLA and non-HLA variants as risk factors for MG. 3) Analyse whether variants are associated with any of the forms of MG, 4) Analyse whether any of the genetic variants identified in the FAMG subgroup meets “major gene” criteria for MG. Methodology. Prospective study of patients with sporadic and familial forms of autoimmune MG. The diagnostic and research criteria recommended by the MGFA will be applied. Informed consent will be obtained. Clinical characteristics, disease course, antibodies, thymic histology and response to treatment will be evaluated. The protocol will include the construction of a library, sample preparation, detection, reading and interpretation of data. Samples shall be genotyped using NGS technique using an ad hoc designed gene library including those genes of interest both HLA and non-HLA involved in the pathogenesis of the disease. The frequency of variants shall be compared with reference biological databases. (English)
12 October 2021
0.3524677957382304
0 references
La myasthénie Gravis (MG) est une maladie auto-immune hétérogène et multifactorielle. Il existe des preuves de l’importance de la génétique dans la maladie. Certains haplotypes HLA-DR/DQ ont été proposés comme principaux facteurs de sensibilité génétique et modificateurs du phénotype. De nouvelles techniques de séquençage de masse ont permis d’identifier d’autres gènes candidats (HLA et non-HLA) pour des formes sporadiques de MG. ENOX1 a récemment été proposé comme gène candidat pour les formes familiales de MG (FAMG). Ces résultats renforcent l’importance de la génétique dans la pathogenèse de la maladie. Objectifs. 1) Identifier les variantes génétiques de la susceptibilité et les modificateurs de phénotype à l’aide de NGS chez 300 patients, dont 24 sont FAMG. 2) Étudier les variantes HLA et non-HLA comme facteurs de risque pour le MG. 3) Analyser si les variantes sont associées à l’une ou l’autre des formes de MG, 4) Analyser si l’une des variantes génétiques identifiées dans le sous-groupe FAMG répond aux critères du «gène majeur» de MG. Méthodologie. Étude prospective de patients présentant des formes sporadiques et familiales de MG auto-immune. Les critères de diagnostic et de recherche recommandés par le MGFA seront appliqués. Le consentement éclairé sera obtenu. Les caractéristiques cliniques, l’évolution de la maladie, les anticorps, l’histologie thymique et la réponse au traitement seront évalués. Le protocole comprendra la construction d’une bibliothèque, la préparation d’échantillons, la détection, la lecture et l’interprétation des données. Les échantillons sont génotypés à l’aide de la technique NGS à l’aide d’une bibliothèque de gènes conçue ad hoc, y compris les gènes d’intérêt HLA et non-HLA impliqués dans la pathogenèse de la maladie. La fréquence des variantes est comparée aux bases de données biologiques de référence. (French)
2 December 2021
0 references
Myasthenia Gravis (MG) ist eine heterogene und multifaktorielle Autoimmunerkrankung. Es gibt Hinweise auf die Bedeutung der Genetik bei der Krankheit. Bestimmte HLA-DR/DQ-Haplotypen wurden als die wichtigsten genetischen Anfälligkeitsfaktoren und phänotypischen Modifikatoren vorgeschlagen. Neue Massensequenzierungstechniken haben es ermöglicht, andere Kandidatengene (HLA und Nicht-HLA) für sporadische Formen von MG zu identifizieren. ENOX1 wurde kürzlich als Kandidatengen für Familienformen von MG (FAMG) vorgeschlagen. Diese Erkenntnisse verstärken die Bedeutung der Genetik bei der Krankheitserregerese. Ziele. 1) Erkennen Sie genetische Varianten von Anfälligkeit und Phänotypmodifikatoren unter Verwendung von NGS bei 300 Patienten, von denen 24 FAMG sind. 2) Studie HLA und Nicht-HLA-Varianten als Risikofaktoren für MG. 3) Analyse, ob Varianten mit einer der Formen von MG verbunden sind, 4) Analyse, ob eine der in der FAMG-Untergruppe identifizierten genetischen Varianten „großes Gen“-Kriterien für MG erfüllt. Methodik. Prospektive Studie an Patienten mit sporadischen und familiären Formen von Autoimmun MG. Die vom MGFA empfohlenen Diagnose- und Forschungskriterien werden angewandt. Die Einwilligung nach Aufklärung wird eingeholt. Klinische Eigenschaften, Krankheitsverlauf, Antikörper, Thymische Histologie und Ansprechen auf die Behandlung werden bewertet. Das Protokoll umfasst den Bau einer Bibliothek, die Vorbereitung von Beispielen, die Erkennung, das Lesen und die Interpretation von Daten. Die Proben sind unter Verwendung der NGS-Technik unter Verwendung einer Ad-hoc-Genbibliothek, einschließlich der an der Pathogenese der Krankheit beteiligten Gene von Interesse, sowohl HLA als auch Nicht-HLA zu verwenden. Die Häufigkeit der Varianten ist mit Referenz-Biodatenbanken zu vergleichen. (German)
9 December 2021
0 references
Myasthenia Gravis (MG) is een heterogene en multifactoriële auto-immuunziekte. Er is bewijs van het belang van genetica in de ziekte. Bepaalde HLA-DR/DQ haplotypes zijn voorgesteld als de belangrijkste genetische gevoeligheidsfactoren en fenotypemodifiers. Nieuwe technieken voor het rangschikken van massa hebben het mogelijk gemaakt om andere kandidaatgenen (HLA en niet-HLA) voor sporadische vormen van MG te identificeren. ENOX1 is onlangs voorgesteld als kandidaat-gen voor familievormen van MG (FAMG). Deze bevindingen versterken het belang van genetica bij ziektepathogenese. Doelstellingen. 1) Identificeer genetische varianten van gevoeligheid en fenotypemodifiers die NGS gebruiken bij 300 patiënten, van wie 24 FAMG. 2) Studie HLA en niet-HLA varianten als risicofactoren voor MG. 3) Analyseer of varianten geassocieerd zijn met een van de vormen van MG, 4) Analyseer of een van de genetische varianten in de FAMG-subgroep voldoet aan de „belangrijk gen”-criteria voor MG. Methodologie. Prospectief onderzoek bij patiënten met sporadische en familiale vormen van auto-immuun MG. De door de MGFA aanbevolen diagnostische en onderzoekcriteria zullen worden toegepast. Geïnformeerde toestemming zal worden verkregen. Klinische kenmerken, ziekteverloop, antilichamen, thymische histologie en respons op de behandeling zullen worden geëvalueerd. Het protocol omvat de bouw van een bibliotheek, monstervoorbereiding, detectie, lezing en interpretatie van gegevens. De monsters worden genotypeerd met behulp van een NGS-techniek waarbij gebruik wordt gemaakt van een speciaal ontworpen genbibliotheek, met inbegrip van de genen die van belang zijn voor zowel HLA als niet-HLA die betrokken zijn bij de pathogenese van de ziekte. De frequentie van de varianten wordt vergeleken met biologische referentiedatabanken. (Dutch)
17 December 2021
0 references
La miastenia Gravis (MG) è una malattia autoimmune eterogenea e multifattoriale. Vi sono prove dell'importanza della genetica nella malattia. Alcuni aplotipi HLA-DR/DQ sono stati proposti come principali fattori di suscettibilità genetica e modificatori fenotipi. Nuove tecniche di sequenziamento di massa hanno permesso di identificare altri geni candidati (HLA e non HLA) per forme sporadiche di MG. ENOX1 è stato recentemente proposto come gene candidato per le forme familiari di MG (FAMG). Questi risultati rafforzano l'importanza della genetica nella patogenesi della malattia. Obiettivi. 1) Identificare le varianti genetiche della suscettibilità e dei modificatori fenotipi usando NGS in 300 pazienti, di cui 24 sono FAMG. 2) Studiare le varianti HLA e non HLA come fattori di rischio per MG. 3) Analizzare se le varianti sono associate a una qualsiasi delle forme di MG, 4) Analizzare se una delle varianti genetiche identificate nel sottogruppo FAMG soddisfa i criteri "geni maggiori" per MG. Metodologia. Studio prospettico su pazienti con forme sporadica e familiare di MG autoimmune. Saranno applicati i criteri diagnostici e di ricerca raccomandati dal MGFA. Sarà ottenuto il consenso informato. Saranno valutate le caratteristiche cliniche, il decorso della malattia, gli anticorpi, l'istologia timica e la risposta al trattamento. Il protocollo comprenderà la costruzione di una libreria, la preparazione dei campioni, il rilevamento, la lettura e l'interpretazione dei dati. I campioni devono essere genotipati utilizzando una tecnica NGS utilizzando una libreria genica ad hoc, compresi i geni di interesse sia HLA che non HLA coinvolti nella patogenesi della malattia. La frequenza delle varianti deve essere confrontata con le banche dati biologiche di riferimento. (Italian)
16 January 2022
0 references
Μυασθένεια Το Gravis (MG) είναι μια ετερογενής και πολυπαραγοντική αυτοάνοση νόσος. Υπάρχουν στοιχεία για τη σημασία της γενετικής στην ασθένεια. Ορισμένοι απλότυποι HLA-DR/DQ έχουν προταθεί ως οι κύριοι παράγοντες γενετικής ευαισθησίας και τροποποιητές φαινοτύπου. Νέες τεχνικές προσδιορισμού της αλληλουχίας μάζας επέτρεψαν τον εντοπισμό άλλων υποψήφιων γονιδίων (HLA και μη HLA) για σποραδικές μορφές MG. Το ENOX1 προτάθηκε πρόσφατα ως υποψήφιο γονίδιο για οικογενειακές μορφές MG (FAMG). Τα ευρήματα αυτά ενισχύουν τη σημασία της γενετικής στην παθογένεση της νόσου. Στόχοι. 1) Προσδιορισμός γενετικών παραλλαγών ευαισθησίας και τροποποίησης φαινοτύπου με χρήση NGS σε 300 ασθενείς, εκ των οποίων οι 24 είναι FAMG. 2) Μελέτη HLA και μη HLA παραλλαγές ως παράγοντες κινδύνου για MG. 3) Αναλύστε αν οι παραλλαγές συνδέονται με οποιαδήποτε από τις μορφές του MG, 4) Αναλύστε αν κάποια από τις γενετικές παραλλαγές που προσδιορίζονται στην υποομάδα FAMG πληροί τα «μείζονα γονίδια» κριτήρια για MG. Μεθοδολογία. Μελέτη προοπτικής σε ασθενείς με σποραδικές και οικογενείς μορφές αυτοάνοσης MG. Θα εφαρμοστούν τα κριτήρια διάγνωσης και έρευνας που συνιστά η MGFA. Θα ληφθεί η εν επιγνώσει συναίνεση. Θα αξιολογηθούν τα κλινικά χαρακτηριστικά, η πορεία της νόσου, τα αντισώματα, η θυμική ιστολογία και η ανταπόκριση στη θεραπεία. Το πρωτόκολλο θα περιλαμβάνει την κατασκευή βιβλιοθήκης, την προετοιμασία δειγμάτων, την ανίχνευση, την ανάγνωση και την ερμηνεία των δεδομένων. Τα δείγματα υποβάλλονται σε γονότυπο με τη χρήση τεχνικής NGS με τη χρήση μιας ad hoc σχεδιασμένης βιβλιοθήκης γονιδίων, συμπεριλαμβανομένων των γονιδίων που παρουσιάζουν ενδιαφέρον τόσο για την HLA όσο και για τη μη HLA που εμπλέκονται στην παθογένεση της νόσου. Η συχνότητα των παραλλαγών συγκρίνεται με τις βιολογικές βάσεις δεδομένων αναφοράς. (Greek)
17 August 2022
0 references
Myasthenia Gravis (MG) er en heterogen og multifaktoriel autoimmun sygdom. Der er tegn på betydningen af genetik i sygdommen. Visse HLA-DR/DQ haplotyper er blevet foreslået som de vigtigste genetiske følsomhedsfaktorer og fænotypemodifikatorer. Nye massesekvenseringsteknikker har gjort det muligt at identificere andre kandidatgener (HLA og ikke-HLA) for sporadiske former af MG. ENOX1 er for nylig blevet foreslået som kandidatgen for familieformer af MG (FAMG). Disse resultater forstærker betydningen af genetik i sygdomspatogenese. Målsætninger. 1) Identificer genetiske varianter af modtagelighed og fænotype modifikatorer ved hjælp af NGS hos 300 patienter, hvoraf 24 er FAMG. 2) Undersøgelse HLA og ikke-HLA varianter som risikofaktorer for MG. 3) Analyse af, om varianter er forbundet med nogen af formerne for MG, 4) Analyse af, om nogen af de genetiske varianter, der er identificeret i FAMG-undergruppen, opfylder "større gen"-kriterier for MG. Metode. Prospektiv undersøgelse af patienter med sporadiske og familiære former for autoimmun MG. De diagnostiske og forskningsmæssige kriterier, som MGFA anbefaler, vil blive anvendt. Der indhentes informeret samtykke. Kliniske karakteristika, sygdomsforløb, antistoffer, thymisk histologi og respons på behandlingen vil blive evalueret. Protokollen vil omfatte opførelse af et bibliotek, prøveforberedelse, detektion, læsning og fortolkning af data. Prøverne genotypebestemmes ved hjælp af NGS-teknik ved hjælp af et ad hoc-designet genbibliotek, der omfatter de gener af interesse både HLA og ikke-HLA, der er involveret i sygdommens patogenese. Hyppigheden af varianter sammenlignes med biologiske referencedatabaser. (Danish)
17 August 2022
0 references
Myasthenia Gravis (MG) on heterogeeninen ja monitekijäinen autoimmuunisairaus. On näyttöä genetiikan merkityksestä taudissa. Tiettyjä HLA-DR/DQ haplotyyppejä on ehdotettu tärkeimmiksi geneettisiksi herkkyystekijöiksi ja fenotyyppisiksi muuntajiksi. Uudet massasekvensointitekniikat ovat mahdollistaneet muiden ehdokasgeenien (HLA ja non-HLA) tunnistamisen MG:n satunnaisille muodoille. ENOX1:tä on hiljattain ehdotettu MG:n (FAMG) perhemuotojen ehdokasgeeniksi. Nämä havainnot vahvistavat genetiikan merkitystä taudin patogeneesissä. Tavoitteet. 1) NGS:ää käyttävän herkkyyden ja fenotyypin muuntajien geneettisten varianttien tunnistaminen 300 potilaalla, joista 24 on FAMG-potilaita. 2) Tutki HLA- ja ei-HLA-muunnelmia MG: n riskitekijöinä. 3) Analysoi, liittyvätkö muunnokset johonkin MG: n muotoon, 4) Analysoi, täyttääkö jokin FAMG-alaryhmässä yksilöidyistä geneettisistä varianteista MG:n ”suurgeenin” kriteerit. Menetelmät. Prospektiivinen tutkimus potilailla, joilla on satunnaisia ja familiaalisia autoimmuuni MG-muotoja. Sovelletaan MGFA:n suosittelemia diagnostisia ja tutkimuskriteerejä. Tietoinen suostumus saadaan. Kliiniset ominaisuudet, taudin kulku, vasta-aineet, kateeminen histologia ja hoitovaste arvioidaan. Protokollaan sisältyy kirjaston rakentaminen, näytteiden valmistelu, tietojen havaitseminen, lukeminen ja tulkinta. Näytteet on genotyypitettävä NGS-tekniikalla käyttäen tapauskohtaista geenikirjastoa, joka sisältää taudin patogeneesiin liittyvät sekä HLA:n että ei-HLA:n kannalta merkitykselliset geenit. Varianttien esiintymistiheyttä on verrattava biologisiin viitetietokantoihin. (Finnish)
17 August 2022
0 references
Myasthenia Gravis (MG) hija marda awtoimmuni eteroġenja u multifattorjali. Hemm evidenza tal-importanza tal-ġenetika fil-marda. Ċerti aplotipi HLA-DR/DQ ġew proposti bħala l-fatturi prinċipali ta’ suxxettibilità ġenetika u l-modifikaturi fenotipiċi. Tekniki ġodda ta’ sekwenzar tal-massa għamluha possibbli li jiġu identifikati ġeni kandidati oħra (HLA u non-HLA) għal forom sporadiċi ta’ MG. L-ENOX1 dan l-aħħar ġie propost bħala ġene kandidat għal forom familjari ta’ MG (FAMG). Dawn is-sejbiet isaħħu l-importanza tal-ġenetika fil-patoġenesi tal-mard. Għanijiet. 1) Identifika varjanti ġenetiċi ta’ suxxettibilità u modifikaturi tal-fenotip bl-użu ta’ NGS fi 300 pazjent, li minnhom 24 huma FAMG. 2) Studju tal-varjanti tal-HLA u mhux tal-HLA bħala fatturi ta’ riskju għal MG. 3) Analiżi ta’ jekk il-varjanti humiex assoċjati ma’ xi waħda mill-forom ta’ MG, 4) Analiżi ta’ jekk xi wieħed mill-varjanti ġenetiċi identifikati fis-sottogrupp FAMG jissodisfax il-kriterji ta’ “ġene maġġuri” għal MG. Metodoloġija. Studju prospettiv ta’ pazjenti b’forom sporadiċi u familjali ta’ MG awtoimmuni. Il-kriterji dijanjostiċi u ta’ riċerka rakkomandati mill-MGFA se jiġu applikati. Se jinkiseb il-kunsens infurmat. Il-karatteristiċi kliniċi, il-kors ta’ mard, l-antikorpi, l-istoloġija tat-timu u r-rispons għat-trattament ser jiġu evalwati. Il-protokoll se jinkludi l-kostruzzjoni ta’ librerija, il-preparazzjoni tal-kampjuni, id-detezzjoni, il-qari u l-interpretazzjoni tad-data. Il-kampjuni għandhom jiġu ġenotipati bl-użu ta’ teknika ta’ NGS bl-użu ta’ librerija tal-ġeni mfassla ad hoc li tinkludi dawk il-ġeni ta’ interess kemm HLA kif ukoll mhux HLA involuti fil-patoġenesi tal-marda. Il-frekwenza tal-varjanti għandha titqabbel mad-databases bijoloġiċi ta’ referenza. (Maltese)
17 August 2022
0 references
Myasthenia Gravis (MG) ir neviendabīga un daudzfaktoru autoimūna slimība. Ir pierādījumi, ka ģenētika ir svarīga slimībai. Daži HLA-DR/DQ haplotipi ir ierosināti kā galvenie ģenētiskās uzņēmības faktori un fenotipa modifikatori. Jaunas masas sekvencēšanas metodes ir ļāvušas identificēt citus kandidātgēnus (HLA un ne-HLA) sporādiskām MG formām. ENOX1 nesen tika ierosināts kā kandidātgēns MG (FAMG) ģimenes formām. Šie atklājumi pastiprina ģenētikas nozīmi slimības patoģenēzē. Mērķi. 1) Noteikt uzņēmības ģenētiskos variantus un fenotipa modifikatorus, izmantojot NGS 300 pacientiem, no kuriem 24 ir FAMG. 2) Pētījums HLA un ne-HLA varianti kā riska faktori MG. 3) Analizē, vai varianti ir saistīti ar kādu no MG formām, 4) analizē, vai kāds no FAMG apakšgrupā identificētajiem ģenētiskajiem variantiem atbilst MG “galvenā gēna” kritērijiem. Metodika. Prospektīvs pētījums pacientiem ar autoimūna MG sporādiskām un ģimenes formām. Tiks piemēroti MGFA ieteiktie diagnostikas un pētniecības kritēriji. Tiks saņemta informēta piekrišana. Klīniskās īpašības, slimības kurss, antivielas, aizkrūts dziedzera histoloģija un atbildes reakcija uz ārstēšanu tiks novērtēta. Protokols ietvers bibliotēkas izveidi, paraugu sagatavošanu, atklāšanu, nolasīšanu un datu interpretēšanu. Paraugus genotipizē, izmantojot NGS tehniku, izmantojot ad hoc izstrādātu gēnu bibliotēku, tostarp tos gēnus, kas interesē gan HLA, gan ne-HLA un kas ir iesaistīti slimības patoģenēzes procesā. Variantu biežumu salīdzina ar atsauces bioloģiskajām datubāzēm. (Latvian)
17 August 2022
0 references
Myasthenia Gravis (MG) je heterogénna a multifaktorová autoimunitná choroba. Existujú dôkazy o význame genetiky v chorobe. Niektoré haplotypy HLA-DR/DQ boli navrhnuté ako hlavné faktory genetickej citlivosti a modifikátory fenotypov. Nové techniky hromadného sekvenovania umožnili identifikovať ďalšie kandidátske gény (HLA a non-HLA) pre sporadické formy MG. ENOX1 bol nedávno navrhnutý ako kandidát na gén pre rodinné formy MG (FAMG). Tieto zistenia posilňujú význam genetiky v patogenéze ochorenia. Ciele. 1) Identifikovať genetické varianty citlivosti a modifikátory fenotypov pomocou NGS u 300 pacientov, z ktorých 24 je FAMG. 2) Štúdia variantov HLA a iných ako HLA ako rizikových faktorov pre MG. 3) Analyzujte, či sú varianty spojené s niektorou z foriem MG, 4) Analyzujte, či niektorý z genetických variantov identifikovaných v podskupine FAMG spĺňa kritériá „veľkého génu“ pre MG. Metodika. Prospektívna štúdia pacientov so sporadickými a familiárnymi formami autoimunitného MG. Budú sa uplatňovať diagnostické a výskumné kritériá odporúčané MGFA. Informovaný súhlas sa získa. Vyhodnotia sa klinické charakteristiky, priebeh ochorenia, protilátky, histológia týmu a odpoveď na liečbu. Protokol bude zahŕňať výstavbu knižnice, prípravu vzoriek, detekciu, čítanie a interpretáciu údajov. Vzorky sa genotypizujú pomocou techniky NGS pomocou ad hoc určenej génovej knižnice vrátane tých génov, ktoré sú predmetom záujmu HLA aj non-HLA, ktoré sa podieľajú na patogenéze choroby. Frekvencia variantov sa porovnáva s referenčnými biologickými databázami. (Slovak)
17 August 2022
0 references
Is Myasthenia Gravis (MG) galar autoimmune ilchineálach agus multifactorial. Go bhfuil fianaise ann maidir leis an tábhacht a bhaineann le géineolaíocht sa ghalar. Moladh haplotypes HLA-DR/DQ áirithe mar na príomhfhachtóirí so-ghabhálachta géiniteacha agus mionathraitheoirí feinitíopa. Mar thoradh ar theicnící nua seicheamhaithe maise tá sé indéanta géinte iarrthóra eile (HLA agus neamh-HLA) a aithint le haghaidh foirmeacha sporadic MG. Moladh ENOX1 le déanaí mar ghéin iarrthóra d’fhoirmeacha teaghlaigh MG (FAMG). Treisíonn na torthaí seo an tábhacht a bhaineann le géineolaíocht i bpataiginí galair. Cuspóirí. 1) Athraithigh ghéiniteacha so-ghabhálachta agus mionathraitheoirí feinitíopa a aithint ag baint úsáide as NGS i 300 othar, a bhfuil 24 acu FAMG. 2) Déan staidéar ar athraithigh HLA agus neamh-HLA mar fhachtóirí riosca do MG. 3) Déan anailís ar cé acu a bhaineann nó nach mbaineann athraithigh le haon cheann de na foirmeacha MG, 4) Déan anailís ar cibé an gcomhlíonann aon cheann de na hathraithigh ghéiniteacha a shainaithnítear i bhfoghrúpa FAMG critéir “mórghéine” le haghaidh MG. Modheolaíocht. Staidéar ionchasach ar othair a bhfuil foirmeacha sporadic agus teaghlaigh de autoimmune MG. Cuirfear na critéir dhiagnóiseacha agus taighde atá molta ag an MGFA i bhfeidhm. Gheofar toiliú feasach. Déanfar meastóireacht ar shaintréithe cliniciúla, cúrsa galair, antasubstaintí, histeolaíocht thymic agus freagairt ar chóireáil. Beidh tógáil leabharlainne, ullmhú samplach, brath, léamh agus léirmhíniú sonraí san áireamh sa phrótacal. Déanfar samplaí a ghéinitíopáil trí theicníc NGS a úsáid trí úsáid a bhaint as leabharlann géine deartha ad hoc lena n-áirítear na géinte spéise sin HLA agus neamh-HLA araon a bhfuil baint acu le pataigineas an ghalair. Cuirfear minicíocht na n-athraitheach i gcomparáid le bunachair shonraí bhitheolaíocha tagartha. (Irish)
17 August 2022
0 references
Myasthenia Gravis (MG) je heterogenní a multifaktoriální autoimunitní onemocnění. Existují důkazy o významu genetiky v nemoci. Jako hlavní faktory genetické citlivosti a fenotypové modifikátory byly navrženy určité haplotypy HLA-DR/DQ. Nové metody sekvenování hmotnosti umožnily identifikovat další kandidátské geny (HLA a jiné než HLA) pro sporadické formy MG. ENOX1 byl nedávno navržen jako kandidátský gen pro rodinné formy MG (FAMG). Tyto nálezy posilují význam genetiky v patogenezi onemocnění. Cíle. 1) Identifikovat genetické varianty citlivosti a fenotypových modifikátorů pomocí NGS u 300 pacientů, z nichž 24 je FAMG. 2) Studie HLA a varianty jiné než HLA jako rizikové faktory pro MG. 3) Analyzujte, zda jsou varianty spojeny s některou z forem MG, 4) Analyzujte, zda některá z genetických variant identifikovaných v podskupině FAMG splňuje kritéria „hlavního genu“ pro MG. Metodika. Prospektivní studie pacientů se sporadickými a familiárními formami autoimunitní MG. Použijí se diagnostická a výzkumná kritéria doporučená MGFA. Bude získán informovaný souhlas. Klinické charakteristiky, průběh onemocnění, protilátky, thymická histologie a reakce na léčbu budou hodnoceny. Protokol bude zahrnovat výstavbu knihovny, přípravu vzorků, detekci, čtení a interpretaci dat. Vzorky musí být genotypovány metodou NGS za použití ad hoc vytvořené knihovny genů, včetně relevantních genů HLA i jiných než HLA zapojených do patogeneze choroby. Četnost variant se porovnává s referenčními biologickými databázemi. (Czech)
17 August 2022
0 references
A miastenia gravis (MG) é uma doença autoimune heterogénea e multifactorial. Há evidências da importância da genética na doença. Certos haplótipos HLA-DR/DQ têm sido propostos como os principais fatores de suscetibilidade genética e modificadores do fenótipo. Novas técnicas de sequenciamento em massa tornaram possível identificar outros genes candidatos (HLA e não-HLA) para formas esporádicas de MG. ENOX1 foi proposto recentemente como um gene candidato para as formas familiares de MG (FAMG). Estes resultados reforçam a importância da genética na patogénese da doença. Objetivos. 1) Identificar variantes genéticas de suscetibilidade e modificadores fenotípicos utilizando a NGS em 300 pacientes, dos quais 24 são FAMG. 2) Estudar HLA e não-HLA variantes como factores de risco para MG. 3) Analisar se as variantes estão associadas a alguma das formas de MG; 4) Analisar se alguma das variantes genéticas identificadas no subgrupo FAMG satisfaz os critérios do «gene principal» para MG. Metodologia. Estudo prospetivo de doentes com formas esporádicas e familiares de MG autoimune. Serão aplicados os critérios diagnósticos e de pesquisa recomendados pelo MGFA. O consentimento informado será obtido. Serão avaliadas as características clínicas, o curso da doença, os anticorpos, a histologia tímica e a resposta ao tratamento. O protocolo incluirá a construção de uma biblioteca, preparação de amostras, detecção, leitura e interpretação de dados. As amostras devem ser genotipadas utilizando a técnica NGS, utilizando uma biblioteca de genes concebida ad hoc que inclua os genes de interesse HLA e não-HLA envolvidos na patogénese da doença. A frequência das variantes deve ser comparada com as bases de dados biológicas de referência. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
Myasthenia Gravis (MG) on heterogeenne ja multifaktoriline autoimmuunhaigus. On tõendeid, et geneetika on haiguses oluline. Peamiste geneetilise tundlikkuse tegurite ja fenotüübi modifikaatoritena on välja pakutud teatavad HLA-DR/DQ haplotüübid. Uued massijärjestustehnikad on võimaldanud tuvastada MG juhuslike vormide teisi kandidaatgeene (HLA ja mitte-HLA). ENOX1 on hiljuti esitatud MG (FAMG) perekonnavormide kandidaatgeenina. Need leiud tugevdavad geneetika tähtsust haiguse patogeneesis. Eesmärgid. 1) NGSi abil tuvastage tundlikkuse ja fenotüübi modifikaatorite geneetilised variandid 300 patsiendil, kellest 24 on FAMG. 2) Uuring HLA ja mitte-HLA variante riskitegurid MG. 3) Analüüsida, kas variandid on seotud mõne MG vormiga, 4) Analüüsida, kas mõni FAMG alarühmas identifitseeritud geneetilistest variantidest vastab MG „suur geeni“ kriteeriumidele. Metoodika. Prospektiivne uuring autoimmuunse MG juhuslike ja perekondlike vormidega patsientidel. Kohaldatakse MGFA soovitatud diagnostika- ja uurimiskriteeriume. Küsitakse teadvat nõusolekut. Hinnatakse kliinilisi omadusi, haiguse kulgu, antikehi, tüemilist histoloogiat ja ravivastust. Protokoll hõlmab raamatukogu ehitamist, proovide ettevalmistamist, andmete avastamist, lugemist ja tõlgendamist. Proovide genotüüp määratakse NGS-meetodil, kasutades ad hoc kavandatud geenikogu, mis hõlmab nii HLA kui ka mitte-HLA-geene, mis on seotud haiguse patogeneesiga. Variantide sagedust võrreldakse bioloogiliste võrdlusandmebaasidega. (Estonian)
17 August 2022
0 references
A myasthenia Gravis (MG) heterogén és multifaktoriális autoimmun betegség. Bizonyíték van a genetika fontosságára a betegségben. Egyes HLA-DR/DQ haplotípusokat javasoltak fő genetikai érzékenységi tényezőkként és fenotípus-módosítóként. Az új tömegszekvenálási technikák lehetővé tették más jelölt gének (HLA és nem HLA) azonosítását az MG szórványos formái esetében. Az ENOX1-et a közelmúltban javasolták az MG (FAMG) családi formáinak génjelöltjeként. Ezek az eredmények megerősítik a genetika fontosságát a betegség patogenezisében. Célkitűzések. 1) Az NGS-t használó érzékenység és fenotípus módosítók genetikai variánsainak azonosítása 300 betegnél, akik közül 24 FAMG. 2) A HLA és a nem HLA variánsok tanulmányozása az MG kockázati tényezőiként. 3) Annak elemzése, hogy a variánsok kapcsolódnak-e az MG bármely formájához, 4) Annak elemzése, hogy a FAMG alcsoportban azonosított genetikai variánsok megfelelnek-e az MG „jelentős gén” kritériumainak. Módszertan. Az autoimmun MG szórványos és familiáris formáiban szenvedő betegek prospektív vizsgálata. Az MGFA által ajánlott diagnosztikai és kutatási kritériumokat kell alkalmazni. A tájékoztatáson alapuló beleegyezést meg kell szerezni. A klinikai jellemzők, a betegség lefolyása, az antitestek, a thymikus szövettan és a kezelésre adott válasz értékelése történik. A protokoll magában foglalja a könyvtár felépítését, a mintaelőkészítést, az adatok észlelését, olvasását és értelmezését. A mintákat NGS-technika alkalmazásával genotípusossá kell tenni egy ad hoc tervezett génkönyvtár használatával, amely magában foglalja a betegség patogenezisében részt vevő HLA és nem HLA-k érdeklődésre számot tartó génjeit is. A változatok gyakoriságát össze kell hasonlítani a referencia-biológiai adatbázisokkal. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
Myasthenia Gravis (MG) е хетерогенно и многофакторно автоимунно заболяване. Има доказателства за значението на генетиката в болестта. Някои HLA-DR/DQ haplotypes са предложени като основни фактори за генетична чувствителност и фенотипни модификатори. Новите техники за секвениране на масата дадоха възможност за идентифициране на други кандидат гени (HLA и не-HLA) за спорадични форми на MG. Наскоро ENOX1 беше предложен като кандидат за ген за семейни форми на MG (FAMG). Тези констатации засилват значението на генетиката при патогенезата на заболяването. Цели. 1) Идентифициране на генетични варианти на чувствителност и фенотип модификатори, използвайки NGS при 300 пациенти, от които 24 са FAMG. 2) Проучване HLA и не-HLA варианти като рискови фактори за MG. 3) Анализ дали вариантите са свързани с някоя от формите на MG, 4) Анализ дали някой от генетичните варианти, идентифицирани в подгрупата на FAMG, отговаря на „основните гени“ критерии за MG. Методология. Проспективно проучване при пациенти със спорадични и фамилни форми на автоимунен MG. Ще се прилагат диагностичните и изследователски критерии, препоръчани от МГВД. Ще бъде получено информирано съгласие. Ще бъдат оценени клиничните характеристики, хода на заболяването, антителата, тимичната хистология и отговорът на лечението. Протоколът ще включва изграждането на библиотека, подготовка на проби, откриване, четене и интерпретиране на данни. Пробите се генотипират, като се използва техниката на NGS, като се използва специално проектирана генна библиотека, включително тези гени, които представляват интерес както за HLA, така и за не-HLA, участващи в патогенезата на болестта. Честотата на вариантите се сравнява с референтните биологични бази данни. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
Myasthenia Gravis (MG) yra heterogeninė ir daugiafaktorinė autoimuninė liga. Yra įrodymų, kad genetika yra svarbi ligai. Kai kurie HLA-DR/DQ haplotipai buvo pasiūlyti kaip pagrindiniai genetiniai jautrumo faktoriai ir fenotipo modifikatoriai. Nauji masės sekos nustatymo metodai leido nustatyti kitus kandidatinius genus (HLA ir ne HLA) pavienėms MG formoms. ENOX1 neseniai pasiūlytas kaip kandidatinis genas MG šeimos formoms (FAMG). Šie duomenys sustiprina genetikos svarbą ligų patogenezei. Tikslai. 1) Nustatykite genetinius jautrumo ir fenotipo modifikatorių variantus, naudojant NGS 300 pacientų, iš kurių 24 yra FAMG. 2) HLA ir ne HLA variantų kaip MG rizikos veiksnių tyrimas. 3) Analizuokite, ar variantai yra susiję su bet kuria iš MG formų, 4) Analizuokite, ar kuris nors iš FAMG pogrupyje nustatytų genetinių variantų atitinka „pagrindinį geną“ MG. Metodika. Prospektyvinis autoimuninės MG formos pacientų, sergančių pavienėmis ir šeiminėmis formomis, tyrimas. Bus taikomi MGFA rekomenduojami diagnostiniai ir mokslinių tyrimų kriterijai. Bus gautas informuoto asmens sutikimas. Bus įvertintos klinikinės charakteristikos, ligos eiga, antikūnai, Teminė histologija ir atsakas į gydymą. Protokolas apims bibliotekos statybą, duomenų pavyzdžių rengimą, aptikimą, skaitymą ir aiškinimą. Mėginių genotipas nustatomas taikant NGS metodą, naudojant ad hoc sukurtą genų biblioteką, į kurią įtraukiami ir HLA, ir ne HLA svarbūs genai, susiję su ligos patogeneze. Variantų dažnumas lyginamas su etaloninėmis biologinėmis duomenų bazėmis. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
Miasthenia Gravis (MG) je heterogena i višefaktorska autoimuna bolest. Postoje dokazi o važnosti genetike u bolesti. Određeni HLA-DR/DQ haplotipovi predloženi su kao glavni faktori genetske osjetljivosti i modifikatori fenotipa. Nove tehnike sekvenciranja mase omogućile su identifikaciju drugih gena kandidata (HLA i ne-HLA) za sporadične oblike MG-a. ENOX1 je nedavno predložen kao gen kandidata za obiteljske oblike MG (FAMG). Ovi nalazi jačaju važnost genetike u patogenezi bolesti. Ciljevi. 1) identificirati genetske varijante osjetljivosti i fenotip modifikatora pomoću NGS u 300 bolesnika, od kojih 24 su FAMG. 2) Studija HLA i ne-HLA varijante kao faktori rizika za MG. 3) Analizirajte jesu li varijante povezane s bilo kojim od oblika MG, 4) Analizirajte ispunjava li bilo koja od genetskih varijanti identificiranih u FAMG podskupini „veliki gen” kriterije za MG. Metodologija. Prospektivna studija bolesnika s sporadičnim i obiteljskim oblicima autoimunog MG-a. Primjenjivat će se dijagnostički i istraživački kriteriji koje preporučuje MGFA. Pribavlja se informirani pristanak. Procijenit će se kliničke karakteristike, tijek bolesti, antitijela, histologija timusa i odgovor na liječenje. Protokol će uključivati izgradnju knjižnice, pripremu uzoraka, otkrivanje, čitanje i tumačenje podataka. Uzorci se genotipiziraju primjenom tehnike NGS koristeći ad hoc dizajniranu gensku biblioteku, uključujući one gene od interesa za HLA i one koji nisu HLA uključeni u patogenezu bolesti. Učestalost varijanti uspoređuje se s referentnim biološkim bazama podataka. (Croatian)
17 August 2022
0 references
Myasthenia Gravis (MG) är en heterogen och multifaktoriell autoimmun sjukdom. Det finns bevis för betydelsen av genetik i sjukdomen. Vissa HLA-DR/DQ haplotyper har föreslagits som de viktigaste genetiska känslighetsfaktorerna och fenotypmodifierarna. Nya masssekvenseringstekniker har gjort det möjligt att identifiera andra kandidatgener (HLA och icke-HLA) för sporadiska former av MG. ENOX1 har nyligen föreslagits som kandidatgen för familjeformer av MG (FAMG). Dessa fynd förstärker genetikens betydelse vid sjukdomspatogenes. Mål. 1) Identifiera genetiska varianter av känslighet och fenotypmodifierare som använder NGS hos 300 patienter, varav 24 är FAMG. 2) Studie HLA och icke-HLA varianter som riskfaktorer för MG. 3) Analysera om varianter är associerade med någon av formerna av MG, 4) Analysera om någon av de genetiska varianter som identifierats i FAMG-undergruppen uppfyller ”större gen” kriterier för MG. Metodik. Prospektiv studie av patienter med sporadiska och familjära former av autoimmun MG. De diagnostiska kriterier och forskningskriterier som rekommenderas av det makroekonomiska stödet kommer att tillämpas. Informerat samtycke kommer att erhållas. Kliniska egenskaper, sjukdomsförlopp, antikroppar, tymisk histologi och behandlingssvar kommer att utvärderas. Protokollet kommer att omfatta konstruktion av ett bibliotek, provberedning, detektering, läsning och tolkning av data. Proverna ska genotypas med hjälp av NGS-teknik med hjälp av ett ad hoc-designat genbibliotek, inklusive de gener av intresse både HLA och icke-HLA som är involverade i sjukdomens patogenes. Variationernas frekvens ska jämföras med biologiska referensdatabaser. (Swedish)
17 August 2022
0 references
Miastenia Gravis (MG) este o boală autoimună eterogenă și multifactorială. Există dovezi ale importanței geneticii în boală. Anumite haplotipuri HLA-DR/DQ au fost propuse ca principali factori de sensibilitate genetică și modificatori de fenotip. Noile tehnici de secvențiere în masă au făcut posibilă identificarea altor gene candidate (HLA și non-HLA) pentru formele sporadice de MG. ENOX1 a fost propusă recent ca genă candidată pentru formele familiale ale MG (FAMG). Aceste constatări consolidează importanța geneticii în patogeneza bolii. Obiective. 1) Identificarea variantelor genetice ale sensibilității și modificatorilor fenotipului folosind NGS la 300 pacienți, dintre care 24 sunt FAMG. 2) Studiul HLA și variantele non-HLA ca factori de risc pentru MG. 3) Analizați dacă variantele sunt asociate cu oricare dintre formele de MG, 4) Analizați dacă oricare dintre variantele genetice identificate în subgrupul FAMG îndeplinește criteriile „genei majore” pentru MG. Metodologie. Studiu prospectiv pe pacienți cu forme sporadice și familiale de MG autoimune. Se vor aplica criteriile de diagnostic și de cercetare recomandate de AMFG. Se va obține consimțământul în cunoștință de cauză. Vor fi evaluate caracteristicile clinice, evoluția bolii, anticorpii, histologia timică și răspunsul la tratament. Protocolul va include construirea unei biblioteci, pregătirea probelor, detectarea, citirea și interpretarea datelor. Eșantioanele trebuie să fie genotipizate utilizând tehnica NGS utilizând o bibliotecă de gene concepută ad hoc care să includă genele de interes atât HLA, cât și non-HLA implicate în patogeneza bolii. Frecvența variantelor se compară cu bazele de date biologice de referință. (Romanian)
17 August 2022
0 references
Miastenija Gravis (MG) je heterogena in multifaktorska avtoimunska bolezen. Obstajajo dokazi o pomenu genetike pri bolezni. Nekateri haplotipi HLA-DR/DQ so bili predlagani kot glavni dejavniki genske občutljivosti in modifikatorji fenotipov. Nove tehnike sekvenciranja mase so omogočile identifikacijo drugih kandidatnih genov (HLA in ne-HLA) za sporadične oblike MG. ENOX1 je bil nedavno predlagan kot kandidat za gen za družinske oblike MG (FAMG). Te ugotovitve krepijo pomen genetike v patogenezi bolezni. Cilji. 1) Prepoznajte genetske variante občutljivosti in modifikatorjev fenotipov z uporabo NGS pri 300 bolnikih, od katerih jih je 24 FAMG. 2) Študija HLA in variante ne-HLA kot dejavniki tveganja za MG. 3) Analiza, ali so variante povezane s katero od oblik MG, 4) Analiza, ali katera od genetskih variant, opredeljenih v podskupini FAMG, izpolnjuje merila „glavnega gena“ za MG. Metodologija. Prospektivna študija bolnikov z občasnimi in družinskimi oblikami avtoimunskega MG. Uporabljena bodo diagnostična in raziskovalna merila, ki jih priporoča MGFA. Privolitev po poučitvi bo pridobljena. Ovrednotili bodo klinične značilnosti, potek bolezni, protitelesa, histologijo in odziv na zdravljenje. Protokol bo vključeval gradnjo knjižnice, pripravo vzorcev, odkrivanje, branje in razlago podatkov. Vzorci se genotipizirajo s tehniko NGS z uporabo ad hoc zasnovane genske knjižnice, vključno z geni, pomembnimi za HLA in ne-HLA, vključenimi v patogenezo bolezni. Pogostost različic se primerja z referenčnimi biološkimi bazami podatkov. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
Myasthenia Gravis (MG) jest niejednorodną i wielofaktyczną chorobą autoimmunologiczną. Istnieją dowody na znaczenie genetyki w chorobie. Niektóre haplotypy HLA-DR/DQ zostały zaproponowane jako główne czynniki wrażliwości genetycznej i modyfikatory fenotypu. Nowe techniki sekwencjonowania masy umożliwiły identyfikację innych genów kandydackich (HLA i non-HLA) dla sporadycznych form MG. ENOX1 został niedawno zaproponowany jako gen kandydujący dla form rodzinnych MG (FAMG). Wyniki te wzmacniają znaczenie genetyki w patogenezie choroby. Cele. 1) Identyfikuj genetyczne warianty wrażliwości i modyfikatorów fenotypu za pomocą NGS u 300 pacjentów, z których 24 to FAMG. 2) Badanie HLA i warianty inne niż HLA jako czynniki ryzyka dla MG. 3) Analiza, czy warianty są związane z którąkolwiek z form MG, 4) Analiza, czy którykolwiek z wariantów genetycznych zidentyfikowanych w podgrupie FAMG spełnia kryteria „głównego genu” dla MG. Metodyka. Prospektywne badanie pacjentów z sporadycznymi i rodzinnymi formami autoimmunologicznych MG. Stosowane będą kryteria diagnostyczne i badawcze zalecane przez MGFA. Zostanie uzyskana świadoma zgoda. Oceniona zostanie charakterystyka kliniczna, przebieg choroby, przeciwciała, histologia grasicy i odpowiedź na leczenie. Protokół będzie obejmował budowę biblioteki, przygotowanie próbek, wykrywanie, odczyt i interpretację danych. Próbki są genotypowane przy użyciu techniki NGS z wykorzystaniem doraźnej biblioteki genów, w tym genów będących przedmiotem zainteresowania zarówno HLA, jak i innych niż HLA uczestniczących w patogenezie choroby. Częstotliwość wariantów porównuje się z referencyjnymi biologicznymi bazami danych. (Polish)
17 August 2022
0 references
Barcelona
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI16_01673
0 references