OPTIMISATION OF CELLULAR REPROGRAMMING BY TOTAL RECONSTRUCTION OF WADDINGTON EPIGENETIC LANDSCAPE USING “BIG DATA” TECHNIQUES -OMICAS (Q3139463)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3139463 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | OPTIMISATION OF CELLULAR REPROGRAMMING BY TOTAL RECONSTRUCTION OF WADDINGTON EPIGENETIC LANDSCAPE USING “BIG DATA” TECHNIQUES -OMICAS |
Project Q3139463 in Spain |
Statements
72,472.95 Euro
0 references
133,100.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
30 December 2016
0 references
29 December 2019
0 references
ASOCIACION INSTITUTO BIODONOSTIA
0 references
20014
0 references
EL PAISAJE EPIGENETICO DE WADDINGTON ES UNA ¿METAFORA¿ UTILIZADA PARA ILUSTRAR EL DESARROLLO EMBRIONARIO, EN PARTICULAR LA DIFERENCIACION CELULAR. WADDINGTON HIPOTETIZO ESTE CONCEPTO EN 1957 A PARTIR DE OBSERVACIONES EXPERIMENTALES PERO SIN MEDICIONES NUMERICAS. EN LA ACTUALIDAD, GRACIAS A LOS AVANCES EN REPROGRAMACION CELULAR, ESTA IDEA ESTA SIENDO REVISITADA. HABIENDOSE DESARROLLADO MODELOS MUY PARCIALES CON FRAGMENTOS MUY PEQUEÑOS DE DICHO PAISAJE UTILIZANDO DATOS DE EXPRESION DE CONJUNTOS MUY REDUCIDOS DE DOS A MENOS DE DIEZ GENES. SIN EMBARGO, LA GRAN CANTIDAD DE DATOS OMICOS YA DISPONIBLES EN BASES DE DATOS OFRECE LA OPORTUNIDAD DE APLICAR TECNICAS "BIG DATA", PARA PASAR DE LA MERA DESCRIPCION ¿METAFORICA¿ A UNA RECONSTRUCCION NUMERICA EXHAUSTIVA DEL "PAISAJE DE WADDINGTON". EN ESTE PROYECTO SE VAN A DESARROLLAR HERRAMIENTAS DE BIOLOGIA COMPUTACIONAL PARA MODELAR DE FORMA EXHAUSTIVA MATEMATICAMENTE SU GEOMETRIA Y DINAMICA, OBTENIENDO UN PAISAJE "TOTAL" A PARTIR DE LA INTEGRACION DE MEDICIONES MOLECULARES DE EXPRESION GENETICA, DE POSICIONAMIENTO DE MARCAS DE HISTONAS Y DE METILACION DE ADN OBTENIDAS MEDIANTE TECNICAS "BIG DATA" A PARTIR DE BASES DE DATOS PUBLICAS. _x000D_ _x000D_ ESTA RECONSTRUCCION DEL "PAISAJE DE WADDINGTON", AL BASARSE EN ENTIDADES MOLECULARES QUE PUEDEN SER MEDIDAS, PERMITIRA COMPRENDER MEJOR LAS BASES MOLECULARES DEL DESARROLLO NORMAL, DE ENFERMEDADES CON GRANDES PERTURBACIONES EPIGENETICAS COMO LAS ASOCIADAS A PRACTICAMENTE TODOS LOS TIPOS DE CANCER Y DEL ENVEJECIMIENTO (PRINCIPALMENTE EN ENFERMEDADES NEURODEGENERATIVAS) COMO UNA EXTENSION DEL DESARROLLO CELULAR. ADICIONALMENTE, COMO MUCHAS DE DICHAS ENTIDADES MOLECULARES PUEDEN SER MANIPULADAS, LA RECONSTRUCCION DEL "PAISAJE DE WADDINGTON" PERMITIRA IDENTIFICAR ¿TUNELES¿ Y "PUENTES" QUE MEDIANTE INDUCCION DE FACTORES DE TRANSCRIPCION PERMITAN OPTIMIZAR LOS "COCTELES" DE REPROGRAMACION CLASICOS E IDENTIFICAR NUEVAS VIAS DE REPROGRAMACION DIRECTA PARA TRANSFORMAR UN TIPO CELULAR A OTRO SIN PASAR POR UN ESTADO INTERMEDIO PLURIPOTENTE._x000D_ _x000D_ ENTRE LAS APLICACIONES ADICIONALES DEL "PAISAJE DE WADDINGTON" NUMERICO AQUI GENERADO DESTACAN LA LOCALIZACION EN LA "GEOGRAFIA" DEL PAISAJE DE MUESTRAS BIOLOGICAS DE LAS QUE SE CONOZCAN SUS PERFILES TRANSCRIPTOMICOS Y/O EPIGENOMICOS PERO QUE NO ESTAN SUFICIENTEMENTE CARACTERIZADAS. OTRA APLICACION DUAL ES LA IDENTIFICACION EN EL PAISAJE DE REGIONES DE EXTENSION CONSIDERABLE QUE AUN COMUNICANDO TIPOS CELULARES CONOCIDOS EXISTENTES EN SUS FRONTERAS, CONTENGAN ZONAS SIN TIPOS CELULARES CONOCIDOS EN SU INTERIOR. DICHAS REGIONES SEÑALIZAN LA POSIBLE EXISTENCIA DE TIPOS CELULARES NO IDENTIFICADOS HASTA LA FECHA Y CUYA IDENTIFICACION PUEDE AYUDAR A COMPRENDER MEJOR LA DIFERENCIACION CELULAR._x000D_ _x000D_ LOS ALGORITMOS "BIG DATA" DESARROLLADOS EN ESTE PROYECTO PARA LA BUSQUEDA, PROCESAMIENTO E INTEGRACION AUTOMATICA DE DATOS OMICOS DE DISTINTA NATURALEZA MOLECULAR PROVENIENTES DE DISTINTAS PLATAFORMAS TECNOLOGICAS CONSTITUYEN EN SI MISMO UN AVANCE MUY INNOVADOR Y DE APLICACION PRACTICA INMEDIATA, NO SOLO CIRCUNSCRITO A LA OBTENCION DE LOS DATOS OMICOS NECESARIOS PARA LA GENERACION DEL "PAISAJE DE WADDINGTON", SINO A CUALQUIER OTRO PROYECTO DE BIOLOGIA COMPUTACIONAL DE GRAN ESCALA QUE REQUIERA LA BUSQUEDA, PROCESAMIENTO E INTEGRACION DE GRANDES CONJUNTOS DE DATOS OMICOS. SON ASI APLICACIONES INMEDIATAS DE LOS ALGORITMOS "BIG DATA" AQUI DESARROLLADOS PROYECTOS DE BIOMEDICINA DEL CANCER Y DEL ENVEJECIMIENTO, ENTRE OTROS. (Spanish)
0 references
WADDINGTON’S EPIGENETIC LANDSCAPE IS A METAPHRASE USED TO ILLUSTRATE EMBRYONIC DEVELOPMENT, PARTICULARLY CELL DIFFERENTIATION. WADDINGTON HYPOTHETISED THIS CONCEPT IN 1957 FROM EXPERIMENTAL OBSERVATIONS BUT WITHOUT NUMERIC MEASUREMENTS. CURRENTLY, THANKS TO ADVANCES IN CELLULAR REPROGRAMMING, THIS IDEA IS BEING REVISITED. VERY PARTIAL MODELS HAVE BEEN DEVELOPED WITH VERY SMALL FRAGMENTS OF THIS LANDSCAPE USING EXPRESSION DATA FROM VERY SMALL SETS FROM TWO TO LESS THAN TEN GENES. HOWEVER, THE VAST AMOUNT OF OMIC DATA ALREADY AVAILABLE IN DATABASES OFFERS THE OPPORTUNITY TO APPLY “BIG DATA” TECHNIQUES, TO MOVE FROM MERE METAPHORIC DESCRIPTION TO A COMPREHENSIVE NUMERICAL RECONSTRUCTION OF THE “WADDINGTON LANDSCAPE”. IN THIS PROJECT, COMPUTATIONAL BIOLOGY TOOLS WILL BE DEVELOPED TO MATHEMATICALLY MODEL THEIR GEOMETRIA AND DYNAMICS IN A COMPREHENSIVE WAY, OBTAINING A “TOTAL” LANDSCAPE FROM THE INTEGRATION OF MOLECULAR MEASUREMENTS OF GENETIC EXPRESSION, POSITIONING OF HISTONE MARKINGS AND METILACION OF DNA OBTAINED BY TECHNIQUES “BIG DATA” FROM PUBLIC DATABASES. _x000D_ _x000D_ this RECONSTRUCTION OF WADDINGTON ‘PAISAGE’, by basing itself on MOLECULAR ENTITIES that can be measured, will allow to BUY THE MOLECULAR BASES OF NORMAL DEVELOPMENT, of diseases with great epigenetic perturbations like those associated with practically all CANCER and ageing types (PRINCIPALMENT IN NEURODEGENERATIVE DISEASES) as an extension of the CELL DEVELOPMENT. In addition, as many of the molecular ENTITIES can be manipulated, the re-construction of the “WADDINGTON PAISAJE” would allow identification and “PUENTS” that would mean the identification of transcry agents that allow them to opt for the CLASSIC reprogramming “COCTELS” and identify new ones. direct reprogramming VIAS TO TRANSFORM A TYPE CELL TO OTHER WITHOUT A PLURIPOTENT INTERMEDIATE STATE._x000D_ _x000D_ BETWEEN THE ADDITIONAL APPLICATIONS OF THE NUMERICAL “WADDINGTON PAYMENT” HERE GENERATE THE LOCALISATION IN THE “GEOGRAPHY” OF THE PAISAJE of our biological characteristics of which their transcriptomic and/or epigenomic characteristics are known, but that they are not suffocatingly characterised. ANOTHER DUAL APPLICATION IS THE IDENTIFICATION IN THE LANDSCAPE OF REGIONS OF CONSIDERABLE EXTENSION THAT EVEN COMMUNICATING KNOWN CELLULAR TYPES EXISTING AT THEIR BORDERS, CONTAIN ZONES WITHOUT KNOWN CELLULAR TYPES INSIDE. These REGIONS signal the possible existence of non-identified CELULARY TIPS HAS the date and their identification can help to buy better CELULAR DIFFERENCE._x000D__x000D__x000D_ The “BIG DATA” ALGORITMS developed in this project for the search, automatic PROCESSING AND INTEGRATION OF Omic DISTINTA NATURAL DISTINTA DATA PROVENENTS OF TECHNOLOGICAL PLATAFORMS CONSTITUY IN THE SAME A VERY INNOVATIVE AVANCE AND IMMEDIATE PRACTICAL APPLICATION, not only circumscribed to the omic DATA OBTENTIONS FOR THE GENERATION OF WADDINGTON’S “PAISAJE”, but to any other project of COMPUTATIONAL BIOLOGY OF GREAT ESCAL BIOLOGY REQUIREING SEARCH, PROCESSING AND INTEGRATION OF GREAT Omic DATA. THEY ARE THUS IMMEDIATE APPLICATIONS OF THE “BIG DATA” ALGORITHMS HERE DEVELOPED BIOMEDICINE PROJECTS OF CANCER AND AGING, AMONG OTHERS. (English)
12 October 2021
0.1343786509871927
0 references
LE PAYSAGE ÉPIGÉNÉTIQUE DE WADDINGTON EST UNE MÉTAPHORE UTILISÉE POUR ILLUSTRER LE DÉVELOPPEMENT EMBRYONNAIRE, EN PARTICULIER LA DIFFÉRENCIATION CELLULAIRE. WADDINGTON A HYPOTHÉQUÉ CE CONCEPT EN 1957 À PARTIR D’OBSERVATIONS EXPÉRIMENTALES, MAIS SANS MESURES NUMÉRIQUES. ACTUELLEMENT, GRÂCE AUX PROGRÈS DE LA REPROGRAMMATION CELLULAIRE, CETTE IDÉE EST EN COURS DE RÉVISION. DES MODÈLES TRÈS PARTIELS ONT ÉTÉ DÉVELOPPÉS AVEC DE TRÈS PETITS FRAGMENTS DE CE PAYSAGE EN UTILISANT DES DONNÉES D’EXPRESSION PROVENANT DE TRÈS PETITS ENSEMBLES DE DEUX À MOINS DE DIX GÈNES. CEPENDANT, LA GRANDE QUANTITÉ DE DONNÉES ATOMIQUES DÉJÀ DISPONIBLES DANS LES BASES DE DONNÉES OFFRE L’OCCASION D’APPLIQUER DES TECHNIQUES DE «BIG DATA», POUR PASSER D’UNE SIMPLE DESCRIPTION MÉTAPHORIQUE À UNE RECONSTRUCTION NUMÉRIQUE COMPLÈTE DU «PAYSAGE DE WADDINGTON». DANS LE CADRE DE CE PROJET, DES OUTILS DE BIOLOGIE COMPUTATIONNELLE SERONT DÉVELOPPÉS POUR MODÉLISER MATHÉMATIQUEMENT LEURS GÉOMÉTRIES ET LEUR DYNAMIQUE DE MANIÈRE GLOBALE, EN OBTENANT UN PAYSAGE «TOTAL» GRÂCE À L’INTÉGRATION DES MESURES MOLÉCULAIRES DE L’EXPRESSION GÉNÉTIQUE, AU POSITIONNEMENT DES MARQUAGES HISTONES ET À LA METILACION DE L’ADN OBTENU PAR DES TECHNIQUES DE «GRANDES DONNÉES» À PARTIR DE BASES DE DONNÉES PUBLIQUES. _x000D_ _x000D_ cette RECONSTRUCTION DU «PAISAGE» de WADDINGTON, en se basant sur des ENTITÉS MOLECULAIRES qui peuvent être mesurées, permettra d’Acheter les BASES MOLECULAIRES DU DÉVELOPPEMENT NORMAL, de maladies présentant de grandes perturbations épigénétiques comme celles associées à pratiquement tous les types de CANCER et de vieillissement (PRINCIPALEMENT EN DISEASES neurodégénératives) en tant qu’extension du DEVELOPPEMENT CELL. En outre, comme beaucoup d’ENTITÉS moléculaires peuvent être manipulées, la reconstruction du «WADDINGTON Paisaje» permettrait d’identifier et de «PUENTS» ce qui signifierait l’identification des agents transcris qui leur permettent d’opter pour les «coctels» de reprogrammation CLASSIC et d’identifier de nouveaux. enTRE LES APPLICATIONS ADDITIONNELLES DU PAIEMENT NUMÉRIQUE «WADDINGTON» ICI GÉNÉRER LA LOCALISATION DANS LA GÉOGRAPHIE DE LA PAISAJE de nos caractéristiques biologiques dont leurs caractéristiques transcriptomiques et/ou épigénomiques sont connues, mais qu’elles ne sont pas caractérisées de manière suffocante. UNE AUTRE DOUBLE APPLICATION EST L’IDENTIFICATION DANS LE PAYSAGE DE RÉGIONS D’EXTENSION CONSIDÉRABLE QUI, MÊME COMMUNIQUANT DES TYPES CELLULAIRES CONNUS EXISTANT À LEURS FRONTIÈRES, CONTIENNENT DES ZONES SANS TYPES CELLULAIRES CONNUS À L’INTÉRIEUR. Ces RÉGIONS signalent l’existence possible de TIPS CELULAIRES non identifiés La date et leur identification peuvent aider à acheter une meilleure DIFFERENCE celulaire._x000D__x000D__x000D_ Les algoritmes «BIG DATA» développés dans ce projet pour la recherche, le traitement automatique et l’intégration de distinta omiques la CONSTITUATION DANS LE MÊME UNE VÉRIE INNOVATIVE AVANCE ET APPLICATION PRACTICALE IMMEDIATE, non seulement circonscrite à l’Obtentions omiques de DATA POUR LA GENÉRATION DU «Paisaje» de WADDINGTON, mais à tout autre projet de BIOLOGIE COMPUTATIONALE DE LA BIOLOGIE Économique GRAQUE nécessitant la recherche, la préparation et l’intégration de grandes DATAs Omiques. IL S’AGIT DONC D’APPLICATIONS IMMÉDIATES DES ALGORITHMES DE «BIG DATA» ICI DÉVELOPPÉS PAR DES PROJETS DE BIOMÉDECINE SUR LE CANCER ET LE VIEILLISSEMENT, ENTRE AUTRES. (French)
2 December 2021
0 references
WADDINGTONS EPIGENETISCHE LANDSCHAFT IST EINE METAPHRASE, DIE VERWENDET WIRD, UM EMBRYONALE ENTWICKLUNG, INSBESONDERE ZELLDIFFERENZIERUNG, ZU VERANSCHAULICHEN. WADDINGTON HYPOTHETISIERTE DIESES KONZEPT 1957 VON EXPERIMENTELLEN BEOBACHTUNGEN, ABER OHNE NUMERISCHE MESSUNGEN. DANK DER FORTSCHRITTE BEI DER ZELLULÄREN NEUPROGRAMMIERUNG WIRD DIESE IDEE DERZEIT ÜBERARBEITET. SEHR PARTIELLE MODELLE WURDEN MIT SEHR KLEINEN FRAGMENTEN DIESER LANDSCHAFT UNTER VERWENDUNG VON EXPRESSIONSDATEN AUS SEHR KLEINEN SETS VON ZWEI BIS WENIGER ALS ZEHN GENEN ENTWICKELT. DIE GROSSE MENGE AN OMISCHEN DATEN, DIE BEREITS IN DATENBANKEN VERFÜGBAR SIND, BIETET JEDOCH DIE MÖGLICHKEIT, „BIG DATA“-TECHNIKEN ANZUWENDEN, VON DER BLOSSEN METAPHORISCHEN BESCHREIBUNG ZU EINER UMFASSENDEN NUMERISCHEN REKONSTRUKTION DER „WADDINGTON-LANDSCHAFT“. IN DIESEM PROJEKT WERDEN BERECHNUNGSBIOLOGIE-TOOLS ENTWICKELT, UM IHRE GEOMETRIEN UND DYNAMIKEN AUF UMFASSENDE WEISE MATHEMATISCH ZU MODELLIEREN UND EINE „TOTALE“ LANDSCHAFT AUS DER INTEGRATION MOLEKULARER MESSUNGEN DER GENETISCHEN EXPRESSION, POSITIONIERUNG VON HISTONMARKIERUNGEN UND METILACION VON DNA ZU ERHALTEN, DIE DURCH TECHNIKEN „BIG DATA“ AUS ÖFFENTLICHEN DATENBANKEN GEWONNEN WERDEN. _x000D_ _x000D_ diese RECONSTRUCTION OF WADDINGTON ‚PAISAGE‘, indem sie sich auf MOLECULAR-ENTITIEN stützt, die gemessen werden können, ermöglicht es, die MOLECULAR BASES DER NORMALEN DEVELOPMENT, von Krankheiten mit großen epigenetischen Störungen wie denen, die mit praktisch allen KANCER- und Alterungstypen (PRINCIPALMENT IN neurodegenerativen DISEASES) als Erweiterung des CELL DEVELOPMENTs in Verbindung stehen, zu kaufen. Darüber hinaus, da viele der molekularen ENTITIES manipuliert werden können, würde die Rekonstruktion der „WADDINGTON Paisaje“ Identifizierung und „PUENTS“ ermöglichen, die die Identifizierung von Transcry-Agenten bedeuten würden, die es ihnen ermöglichen, sich für die CLASSIC-Neuprogrammierung von „Coctels“ zu entscheiden und neue zu identifizieren. _x000D_ BETWEEN DIE ADDITIONAL APPLICATIONEN DER NUMERIKEL „WADDINGTON PAYMENT“ HIER GENERATE THE LOCALISATION IN DER „GEOGRAPHIE“ der Paisaje unserer biologischen Eigenschaften, von denen ihre transkriptomischen und/oder epigenomischen Eigenschaften bekannt sind, aber nicht erstickend gekennzeichnet sind. EINE WEITERE DOPPELTE ANWENDUNG IST DIE IDENTIFIKATION IN DER LANDSCHAFT VON REGIONEN MIT BETRÄCHTLICHER ERWEITERUNG, DIE SOGAR BEKANNTE ZELLULÄRE TYPEN AN IHREN GRENZEN KOMMUNIZIEREN, ZONEN OHNE BEKANNTE ZELLTYPEN IM INNEREN ENTHALTEN. Diese REGIONEN signalisieren die mögliche Existenz von nicht identifizierten CELULARY TIPS HAS das Datum und ihre Identifizierung können helfen, bessere zellulare DIFFERENCE zu kaufen._x000D__x000D__x000D_ Die „BIG DATA“-Algoritmen, die in diesem Projekt für die Suche, automatische PROCESSING UND INTEGRATION OF Omic distinta NATURAL distinta DATA PROVENENTEN DER TECHNOLOGISCHEN PROVENENTE entwickelt wurden Plataforms CONSTITUY IN DER SAME VEREINIGUNG INNOVATIVE AVANCE UND IMMEDIATE PRACTICAL APPLICATION, nicht nur um die omic DATA Obtentions FÜR DIE GENERATION VON WADDINGTON’S „Paisaje“, sondern für jedes andere Projekt der COMPUTATIONAL BIOLOGIE GREAT ESCAL BIOLOGIE, die SEARCH, PROCESSING UND INTEGRATION OF GREAT Omic DATA erfordern. SIE SIND SOMIT SOFORTIGE ANWENDUNGEN DER „BIG DATA“-ALGORITHMEN HIER ENTWICKELTEN BIOMEDIZIN-PROJEKTE VON KREBS UND ALTERUNG, UNTER ANDEREM. (German)
9 December 2021
0 references
HET EPIGENETISCHE LANDSCHAP VAN WADDINGTON IS EEN METAPHRASE DIE WORDT GEBRUIKT OM EMBRYONALE ONTWIKKELING TE ILLUSTREREN, MET NAME CELDIFFERENTIATIE. WADDINGTON STELDE DIT CONCEPT IN 1957 OP BASIS VAN EXPERIMENTELE WAARNEMINGEN, MAAR ZONDER NUMERIEKE METINGEN. MOMENTEEL, DANKZIJ DE VOORUITGANG IN CELLULAIRE HERPROGRAMMERING, WORDT DIT IDEE HERZIEN. ZEER GEDEELTELIJKE MODELLEN ZIJN ONTWIKKELD MET ZEER KLEINE FRAGMENTEN VAN DIT LANDSCHAP MET BEHULP VAN EXPRESSIEGEGEVENS VAN ZEER KLEINE SETS VAN TWEE TOT MINDER DAN TIEN GENEN. DE ENORME HOEVEELHEID OMISCHE GEGEVENS DIE REEDS IN DATABASES BESCHIKBAAR ZIJN, BIEDT ECHTER DE MOGELIJKHEID OM „GROTE GEGEVENS” TECHNIEKEN TOE TE PASSEN, OM VAN LOUTER METAFORISCHE BESCHRIJVING OVER TE STAPPEN NAAR EEN UITGEBREIDE NUMERIEKE RECONSTRUCTIE VAN HET „WADDINGTON-LANDSCHAP”. IN DIT PROJECT ZULLEN COMPUTATIONELE BIOLOGIETOOLS WORDEN ONTWIKKELD OM HUN GEOMETRIA EN DYNAMIEK OP EEN ALOMVATTENDE MANIER TE MODELLEREN, WAARBIJ EEN „TOTAAL” LANDSCHAP WORDT VERKREGEN DOOR DE INTEGRATIE VAN MOLECULAIRE METINGEN VAN GENETISCHE EXPRESSIE, POSITIONERING VAN HISTONMARKERINGEN EN METILACIE VAN DNA VERKREGEN DOOR TECHNIEKEN „GROTE GEGEVENS” UIT OPENBARE DATABANKEN. _x000D_ _x000D_ deze RECONSTRUCTIE VAN WADDINGTON „PAISAGE”, door zich te baseren op MOLECULAR ENTITIES die kunnen worden gemeten, zal het mogelijk maken om de MOLECULAR BASES VAN NORMALE ONTWIKKELING, van ziekten met grote epigenetische afwijkingen zoals die geassocieerd met vrijwel alle CANCER en verouderingstypen (PRINCIPALMENT IN neurodegeneratieve DISEASES) als een uitbreiding van de CELL DEVELOPMENT. Bovendien, aangezien veel van de moleculaire ENTITIES kunnen worden gemanipuleerd, zou de reconstructie van de „WADDINGTON Paisaje” identificatie en „PUENTS” mogelijk maken, wat de identificatie zou betekenen van transcry agenten die hen in staat stellen om te kiezen voor de CLASSIC herprogrammering „coctels” en nieuwe te identificeren. _x000D_ BETWEEN THE ADDITIONAL APPLICATIONS OF THE NUMERICAL „WADDINGTON PAYMENT” HIER GENERATE DE LOCALISATIE IN DE „GEOGRAPHY” VAN HET Paisaje van onze biologische kenmerken waarvan hun transcriptomische en/of epigenomic kenmerken bekend zijn, maar die niet verstikkend worden gekarakteriseerd. EEN ANDERE DUBBELE TOEPASSING IS DE IDENTIFICATIE IN HET LANDSCHAP VAN REGIO’S MET EEN AANZIENLIJKE UITBREIDING DIE ZELFS HET COMMUNICEREN VAN BEKENDE CELLULAIRE TYPES BESTAANDE AAN HUN GRENZEN, BEVATTEN ZONES ZONDER BEKENDE CELLULAIRE TYPES BINNEN. Deze REGIONS signaleren het mogelijke bestaan van niet-geïdentificeerde CELULARY TIPS HAS de datum en hun identificatie kan helpen om betere celulaire DIFFERENCE te kopen._x000D__x000D_x000D_ De „BIG DATA” algoritmen die in dit project zijn ontwikkeld voor het zoeken, automatische PROCESSING EN INTEGRATIE VAN Omische distinta NATURAL distinta DATA PROVENENTS VAN TECHNOLOGICAL plataforms CONSTITUY IN HET SAME A ZEER INNOVATIVE AVANCE EN IMMEDIATE PRACTICAL APPLICATIE, niet alleen beperkt tot de omische DATA Obtenties voor de GENERATIE van WADDINGTON’s „Paisaje”, maar voor elk ander project van COMPUTATIONALE BIOLOGIE VAN GREAT ESCAL BIOLOGIE die SEARCH, PROCESSING EN INTEGRATIE van GREAT Omische DATA vereist. HET ZIJN DUS ONMIDDELLIJKE TOEPASSINGEN VAN DE „BIG DATA” ALGORITMES HIER ONTWIKKELD BIOMEDICINE PROJECTEN VAN KANKER EN VEROUDERING, ONDER ANDERE. (Dutch)
17 December 2021
0 references
IL PAESAGGIO EPIGENETICO DI WADDINGTON È UNA METAFRASI UTILIZZATA PER ILLUSTRARE LO SVILUPPO EMBRIONALE, IN PARTICOLARE LA DIFFERENZIAZIONE CELLULARE. WADDINGTON IPOTETÒ QUESTO CONCETTO NEL 1957 DA OSSERVAZIONI SPERIMENTALI MA SENZA MISURAZIONI NUMERICHE. ATTUALMENTE, GRAZIE AI PROGRESSI NELLA RIPROGRAMMAZIONE CELLULARE, QUESTA IDEA VIENE RIVISITATA. MODELLI MOLTO PARZIALI SONO STATI SVILUPPATI CON FRAMMENTI MOLTO PICCOLI DI QUESTO PAESAGGIO UTILIZZANDO DATI DI ESPRESSIONE DA INSIEMI MOLTO PICCOLI DA DUE A MENO DI DIECI GENI. TUTTAVIA, LA GRANDE QUANTITÀ DI DATI OMICI GIÀ DISPONIBILI NELLE BANCHE DATI OFFRE L'OPPORTUNITÀ DI APPLICARE TECNICHE "BIG DATA", PER PASSARE DALLA SEMPLICE DESCRIZIONE METAFORICA AD UNA RICOSTRUZIONE NUMERICA COMPLETA DEL "PAESAGGIO WADDINGTON". IN QUESTO PROGETTO VERRANNO SVILUPPATI STRUMENTI DI BIOLOGIA COMPUTAZIONALE PER MODELLARE MATEMATICAMENTE LA GEOMETRIA E LA DINAMICA IN MODO GLOBALE, OTTENENDO UN PAESAGGIO "TOTALE" DALL'INTEGRAZIONE DI MISURE MOLECOLARI DI ESPRESSIONE GENETICA, POSIZIONAMENTO DELLE MARCATURE ISTONICHE E METILACION DEL DNA OTTENUTO CON TECNICHE "BIG DATA" DA BANCHE DATI PUBBLICHE. _x000D_ _x000D_ questa RICONSTRUZIONE DEL PAISAGGIO DI WADDINGTON, basandosi su ENTITIE MOLECULARI che possono essere misurate, permetterà di ACQUISTARE LE BASE MOLECULARI DI SVILUPPO NORMALE, di malattie con grandi perturbazioni epigenetiche come quelle associate a praticamente tutti i tipi di CANCER e di invecchiamento (PRINCIPALMENTO IN DISEASES neurodegenerative) come estensione dello SVILUPPO CELL. Inoltre, poiché molte delle ENTITIE molecolari possono essere manipolate, la ricostruzione del "WADDINGTON Paisaje" consentirebbe l'identificazione e "PUENTS" che significherebbe l'identificazione di agenti transcridici che permetterebbero loro di optare per la riprogrammazione CLASSICA dei "cotti" e di identificarne di nuovi. _x000D_ Tra le APPLICAZIONI ADDIZIONALI DEL NUMERICA "WADDINGTON PAGAMENTO" QUI GENERARE LA LOCALISAZIONE NEL GEOGRAFIA DEL Paisaje delle nostre caratteristiche biologiche di cui sono note le loro caratteristiche trascrittomiche e/o epigenomiche, ma che non sono caratterizzate in modo soffocante. UN'ALTRA DUPLICE APPLICAZIONE È L'IDENTIFICAZIONE NEL PAESAGGIO DI REGIONI DI NOTEVOLE ESTENSIONE CHE ANCHE COMUNICANDO I TIPI CELLULARI NOTI ESISTENTI AI LORO CONFINI, CONTENGONO ZONE SENZA TIPI CELLULARI NOTI ALL'INTERNO. Queste REGIONI segnalano l'eventuale esistenza di TIPS CELULARIA non identificati hanno la data e la loro identificazione possono aiutare ad acquistare una migliore DIFFERENZA celare._x000D__x000D__x000D_ Gli algoritmi "BIG DATA" sviluppati in questo progetto per la ricerca, la PROCESSAZIONE automatica e l'INTEGRAZIONE DI Omic distinta NATURAL DATA PROVENENTS OF TECHNOLOGICAL plataforme CONSTITUY NEL SAME UN'AVANCE MOLTO INNOVATIVA E APPLICAZIONE PRATTICA IMMEDIATA, non solo circoscritto ai DATI Omici Obtenzioni per la GENERAZIONE DEL "Paisaje" di WADDINGTON, ma a qualsiasi altro progetto di BIOLOGIA COMPUTATIONALE DI GRANDE BIOLOGIA ESCALTA che richiede la RICERCA, la PROCESSAZIONE E L'INTEGRAZIONE DI GRANDI DATI Omici. SONO QUINDI APPLICAZIONI IMMEDIATE DEGLI ALGORITMI "BIG DATA" QUI SVILUPPATI PROGETTI DI BIOMEDICINA DI CANCRO E INVECCHIAMENTO, TRA GLI ALTRI. (Italian)
16 January 2022
0 references
WADDINGTONI EPIGENEETILINE MAASTIK ON METAFRAAS, MIDA KASUTATAKSE EMBRÜONAALSE ARENGU, ERITI RAKKUDE DIFERENTSEERIMISE ILLUSTREERIMISEKS. WADDINGTON HÜPOTEESIS SELLE MÕISTE 1957. AASTAL EKSPERIMENTAALSETE VAATLUSTE PÕHJAL, KUID ILMA ARVULISTE MÕÕTMISTETA. PRAEGU, TÄNU EDUSAMMUD RAKU ÜMBERPROGRAMMEERIMINE, SEE IDEE VAADATAKSE UUESTI. VÄGA OSALISED MUDELID ON VÄLJA TÖÖTATUD VÄGA VÄIKESTE FRAGMENTIDEGA SELLEL MAASTIKUL, KASUTADES EKSPRESSIOONIANDMEID VÄGA VÄIKESTEST KOGUMITEST KAHE KUNI VÄHEM KUI KÜMNE GEENINI. ANDMEBAASIDES JUBA OLEMASOLEVATE OOMIANDMETE SUUR HULK ANNAB SIISKI VÕIMALUSE KASUTADA „SUURANDMETE“ TEHNIKAID, ET LIIKUDA LIHTSALT METAFOORILISEST KIRJELDUSEST „WADDINGTONI MAASTIKU“ PÕHJALIKU NUMBRILISE REKONSTRUEERIMISENI. SELLES PROJEKTIS TÖÖTATAKSE VÄLJA ARVUTUSLIKUD BIOLOOGIAVAHENDID, ET MATEMAATILISELT MODELLEERIDA OMA GEOMEETRIAT JA DÜNAAMIKAT TERVIKLIKUL VIISIL, SAAVUTADES „TÄIELIKU“ MAASTIKU GENEETILISE EKSPRESSIOONI MOLEKULAARSETE MÕÕTMISTE INTEGREERIMISEST, HISTONE MARKEERINGUTE POSITSIONEERIMISEST JA DNA METILACION’IST, MIS ON SAADUD AVALIKEST ANDMEBAASIDEST SAADUD „SUURANDMETE“ MEETODITE ABIL. _x000D_ _x000D_ see WADDINGTON „PAISAGE“ RECONSTRUCTION, tuginedes MOLECULAR ENTITIES, mida saab mõõta, võimaldab MOLECULAR BASES NORMAL DEVELOPMENT, haigustest, millel on suured epigeneetilised häired, nagu need, mis on seotud praktiliselt kõigi CANCER- ja vananemistüüpidega (PRINKIPALMENT IN neurodegeneratiivsed DISEASES) kui CELL DEVELOPMENT. Lisaks, kuna paljusid molekulaarseid ENTITIES saab manipuleerida, võimaldaks „WADDINGTON Paisaje“ ümberehitamine identifitseerida ja „PUENTS“, mis tähendaks transkriotiliste ainete identifitseerimist, mis võimaldavad neil valida CLASSICi ümberprogrammeerimise „koktellid“ ja tuvastada uusi. _x000D_ BETWEEN KASUTUSED NUMERICAL „RADINGTON PAYMENT“ KASUTATAVAD KASUTAMINE Paisaje „GEOGRAPHY“, mille transkriptoomilised ja/või epigenoomsed omadused on teada, kuid neid ei ole lämbuvalt iseloomustatud. TEINE KAHEKORDNE RAKENDUS ON SELLISTE PIIRKONDADE KINDLAKSTEGEMINE MAASTIKUL, KUS ON MÄRKIMISVÄÄRNE LAIENDAMINE, ET ISEGI NENDE PIIRIDEL OLEMASOLEVATE TEADAOLEVATE RAKUTÜÜPIDE EDASTAMINE SISALDAB ALASID, KUS PUUDUVAD TEADAOLEVAD RAKUTÜÜBID SEES. Need REGIONSid annavad märku võimalikust identifitseerimata CELULARY TIPS olemasolust, kui kuupäev ja nende identifitseerimine võivad aidata osta paremat celular DIFFERENCE._x000D__x000D__x000D__x000D_ Selle projekti raames välja töötatud „BIG DATA“ algoritmid, mis on välja töötatud Omic distinta NATURAL distinta NATURAL distinta DATA PROVENENTS TECHNOLOGICAL platavormide otsinguks, automaatseks PROCESSING JA INTEGRATION CONSTITUY SAMAL AVALDATAVAD AVALDUS JA IMMEDIATE PRAKTIKATSIOONID, mis ei piirdu mitte ainult omic DATA Obtentions GENERATION of WADDINGTON’S’S „Paisaje“, vaid mis tahes muu projekti GREAT ESCAL BIOLOGY nõuab SEARCH, PROCESSING JA INTEGRATION of GREAT Omic DATA. SEEGA ON NEED KOHESED RAKENDUSED „SUURANDMED“ ALGORITMID SIIN ARENENUD BIOMEDDICINE PROJEKTE VÄHI JA VANANEMISE, MUU HULGAS. (Estonian)
4 August 2022
0 references
WADDINGTON’S EPIGENETINIS KRAŠTOVAIZDIS YRA METAFRAZĖ, NAUDOJAMA EMBRIONO VYSTYMUISI, YPAČ LĄSTELIŲ DIFERENCIJAVIMUI, ILIUSTRUOTI. WADDINGTON HIPOTEZAVO ŠIĄ KONCEPCIJĄ 1957 M. IŠ EKSPERIMENTINIŲ STEBĖJIMŲ, BET BE SKAITINIŲ MATAVIMŲ. ŠIUO METU DĖL PAŽANGOS LĄSTELIŲ PERPROGRAMAVIMO SRITYJE ŠI IDĖJA YRA PERŽIŪRIMA. LABAI DALINIAI MODELIAI BUVO SUKURTI SU LABAI MAŽAIS ŠIO KRAŠTOVAIZDŽIO FRAGMENTAIS, NAUDOJANT IŠRAIŠKOS DUOMENIS IŠ LABAI MAŽŲ RINKINIŲ NUO DVIEJŲ IKI MAŽIAU NEI DEŠIMTIES GENŲ. TAČIAU DIDELIS OMINIŲ DUOMENŲ KIEKIS DUOMENŲ BAZĖSE SUTEIKIA GALIMYBĘ TAIKYTI „DIDELIŲ DUOMENŲ“ METODUS, PEREITI NUO PAPRASTO METAFORINIO APRAŠYMO PRIE IŠSAMAUS SKAITINIO „WADDINGTON“ KRAŠTOVAIZDŽIO REKONSTRAVIMO. ŠIAME PROJEKTE BUS KURIAMOS KOMPIUTERINĖS BIOLOGIJOS PRIEMONĖS, SKIRTOS MATEMATIŠKAI MODELIUOTI JŲ GEOMETRIJĄ IR DINAMIKĄ, GAUTI „VISUMINĮ“ KRAŠTOVAIZDĮ IŠ GENETINĖS RAIŠKOS MOLEKULINIŲ MATAVIMŲ INTEGRAVIMO, HISTONINIŲ ŽYMENŲ PADĖTIES IR DNR METILACION, GAUTŲ TAIKANT METODUS „DIDELI DUOMENYS“ IŠ VIEŠŲJŲ DUOMENŲ BAZIŲ. _x000D_ _x000D_ ši WADDINGTON „PAISAGE“ RECONSTRUKCIJA, remdamasi MOLECULINIO ENTICIJA, kuri gali būti matuojama, leis BUY MOLECULAR BASES OF NORMALOPMENT, ligų su dideliu epigenetinių perturbacijų, pavyzdžiui, susijusių su praktiškai visų CANCER ir senėjimo tipų (PRINCIPALMENT į neurodegeneracinės DISEAS) kaip CELL DEVELOPMENT pratęsimo. Be to, kadangi daugelis molekulinių ENTITIES gali būti manipuliuojami, rekonstravus „WADDINGTON Paisaje“ būtų galima identifikuoti ir „PUENTS“, o tai reikštų transkripcijos agentų, leidžiančių jiems pasirinkti CLASSIC perprogramavimą „coctels“ ir identifikuoti naujus, identifikavimą. Tiesioginis perprogramavimas, skirtas TRANSFORM A TYPE CELL TO OTHOUT BE pluripotent INTERMEDIATE._x000D_ _x000D_ PRIEŽIŪROS NUMERINIŲ „WADDINGTON PAYMENTO“ PRIEŽIŪROS PRIEŽIŪROS POSĖDŽĖS „GEOGRAPHIJA“ iš mūsų biologinių savybių, kurių transkriptominės ir (arba) epigenominės savybės yra žinomos, tačiau jos nėra dūstančios. KITAS DVIGUBAS TAIKYMAS YRA DIDELIO IŠPLĖTIMO REGIONŲ KRAŠTOVAIZDŽIO NUSTATYMAS, KAD NET PRANEŠANT APIE ŽINOMUS KORINIUS TIPUS, ESANČIUS PRIE JŲ SIENŲ, YRA ZONŲ, KURIOSE NĖRA ŽINOMŲ LĄSTELIŲ TIPŲ VIDUJE. Šie REGIONAI signalizuoja apie galimą nenustatytų CELULARY TIPS egzistavimą, datą ir jų identifikavimą gali padėti įsigyti geriau celular DIFFERENCE._x000D__x000D___x000D_ The „BIG DATA“ algoritmai, sukurti šiame projekte paieškai, automatinis PROCESSING IR INTEGRACIJA Omic distinta NATURAL Distinta DATA PROVENENTS TECHNOLOGINĖS platformos KONSTITUOJE VADDINGTONO APSAUGOS IR IMMEDIATO PRAKTINĖS APSAUGOS PASIŪLYMĄ, ne tik apribotą omiškųjų duomenų įkalčiais, susijusiais su WADDINGTON’S „Paisaje“ bendrumu, bet ir į bet kurį kitą projektą, susijusį su kompleksiniu GREAT ESCAL BIOLOGIJOS BIOLOGIJOS, reikalaujančio SEARCH, PROCESSING IR INTEGRACIJOS GREAT Omic DATA, projektu. TODĖL JIE YRA NEATIDĖLIOTINAS „DIDELIŲ DUOMENŲ“ ALGORITMŲ TAIKYMAS ČIA SUKŪRĖ BIOMEDICINOS PROJEKTUS VĖŽIO IR SENĖJIMO, BE KITA KO. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
WADDINGTON’S EPIGENETSKI KRAJOLIK JE METAFRAZA KOJA SE KORISTI ZA ILUSTRACIJU EMBRIONALNOG RAZVOJA, OSOBITO STANIČNE DIFERENCIJACIJE. WADDINGTON JE 1957. HIPOTETIZIRAO OVAJ KONCEPT IZ EKSPERIMENTALNIH PROMATRANJA, ALI BEZ BROJČANIH MJERENJA. TRENUTNO, ZAHVALJUJUĆI NAPRETKU U STANIČNOM REPROGRAMIRANJU, OVA SE IDEJA PONOVNO RAZMATRA. VRLO DJELOMIČNI MODELI RAZVIJENI SU S VRLO MALIM FRAGMENTIMA OVOG KRAJOLIKA KORISTEĆI EKSPRESIVNE PODATKE IZ VRLO MALIH SETOVA OD DVA DO MANJE OD DESET GENA. MEĐUTIM, VELIKA KOLIČINA OMIČKIH PODATAKA KOJI SU VEĆ DOSTUPNI U BAZAMA PODATAKA PRUŽA MOGUĆNOST PRIMJENE TEHNIKA „VELIKIH PODATAKA” KAKO BI SE IZ PUKOG METAFORIČKOG OPISA PREŠLO NA SVEOBUHVATNU NUMERIČKU REKONSTRUKCIJU „WADDINGTON KRAJOLIKA”. U OVOM PROJEKTU RAZVIT ĆE SE RAČUNALNI BIOLOŠKI ALATI ZA MATEMATIČKI MODELIRANJE NJIHOVE GEOMETRIJE I DINAMIKE NA SVEOBUHVATAN NAČIN, DOBIVANJE „UKUPNOG” KRAJOLIKA IZ INTEGRACIJE MOLEKULARNIH MJERENJA GENETSKE EKSPRESIJE, POZICIONIRANJA HISTONSKIH OZNAKA I METILACION DNK DOBIVENIH TEHNIKAMA „VELIKIH PODATAKA” IZ JAVNIH BAZA PODATAKA. _x000D_ _x000D_ to RECONSTRUCTION WADDINGTON ‚PAISAGE’, temeljeći se na MOLECULAR ENTITIES koji se mogu mjeriti, omogućit će da se KUŽANJE MOLECULAR BASES NORMALNOG DEVELOPMENTA, od bolesti s velikim epigenetskim poremećajima poput onih povezanih s praktički svim KONČAROM i tipovima starenja (PRINCIPALMENT U neurodegenerativnom DISEASES-u) kao produžetku CELL DEVELOPMENTA. Osim toga, budući da se može manipulirati mnogim molekularnim normama, rekonstrukcija „WADDINGTON Paisaje” omogućila bi identifikaciju i „PUENTS” što bi značilo identifikaciju transkrižnih agensa koji im omogućuju da se odluče za reprogramiranje „koktela” i identificiraju nove. Izravno reprogramiranje VIAS TO TRANSFORM TYPE CELL TO OTHER WITHOUT A Pluripotentni INTERMEDIATE STATE._x000D_ _x000D_ BETWEEN DODATNIH APPLIKACIJA NUMERICALNIH „PRAJANJA” OVDJE OVDJE LOKALISACIJA u „GEOGRAPHY” Paisaje naših bioloških karakteristika od kojih su poznata njihova transkriptomska i/ili epigenomska svojstva, ali da se ne guši. JOŠ JEDNA DVOSTRUKA PRIMJENA JE IDENTIFIKACIJA U KRAJOLIKU PODRUČJA ZNAČAJNOG PROŠIRENJA KOJE ČAK I KOMUNICIRANJE POZNATIH STANIČNIH TIPOVA POSTOJE NA NJIHOVIM GRANICAMA, SADRŽI ZONE BEZ POZNATIH STANIČNIH TIPOVA UNUTAR. Ove regije signaliziraju moguće postojanje neidentificiranih CELULARY TIPS HAS datum i njihova identifikacija može pomoći u kupnji bolje celularne DIFFERENCE._x000D__x000D__x000D_The „BIG DATA” algoritmi razvijeni u ovom projektu za pretraživanje, automatsko PROCESSING I INTEGRATION of Omic distinta NATURAL Distinta DATA PROVENENTS TECHNOLOGICAL Plataforms CONSTITUY IN to je vrlo innoVATIVE AVANCE i PRODAJTE PRACTIČKE APPLIKACIJE, ne samo da je ograničeno na omske DATA Obveze za OPĆE WADDINGTON 'S „Paisaje”, ali na bilo koji drugi projekt COMPUTATIONAL BIOLOGY GREAT ESCAL BIOLOGY zahtijeva SEARCH, PROCESSING I INTEGRATION of GREAT Omic DATA. ONI SU STOGA NEPOSREDNA PRIMJENA ALGORITAMA „VELIKIH PODATAKA” OVDJE RAZVIJENI PROJEKTI BIOMEDICINE RAKA I STARENJA, MEĐU OSTALIMA. (Croatian)
4 August 2022
0 references
ΤΟ ΕΠΙΓΕΝΕΤΙΚΌ ΤΟΠΊΟ ΤΟΥ WADDINGTON ΕΊΝΑΙ ΜΙΑ ΜΕΤΑΦΡΆΣΗ ΠΟΥ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΕΊΤΑΙ ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΠΕΙΚΌΝΙΣΗ ΤΗΣ ΕΜΒΡΥΪΚΉΣ ΑΝΆΠΤΥΞΗΣ, ΙΔΙΑΊΤΕΡΑ ΤΗΣ ΚΥΤΤΑΡΙΚΉΣ ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΊΗΣΗΣ. Ο WADDINGTON ΥΠΈΘΕΣΕ ΑΥΤΉ ΤΗΝ ΈΝΝΟΙΑ ΤΟ 1957 ΑΠΌ ΠΕΙΡΑΜΑΤΙΚΈΣ ΠΑΡΑΤΗΡΉΣΕΙΣ ΑΛΛΆ ΧΩΡΊΣ ΑΡΙΘΜΗΤΙΚΈΣ ΜΕΤΡΉΣΕΙΣ. ΕΠΊ ΤΟΥ ΠΑΡΌΝΤΟΣ, ΧΆΡΗ ΣΤΙΣ ΠΡΟΌΔΟΥΣ ΣΤΟΝ ΚΥΤΤΑΡΙΚΌ ΕΠΑΝΑΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΙΣΜΌ, ΑΥΤΉ Η ΙΔΈΑ ΕΠΑΝΕΞΕΤΆΖΕΤΑΙ. ΠΟΛΎ ΜΕΡΙΚΆ ΜΟΝΤΈΛΑ ΈΧΟΥΝ ΑΝΑΠΤΥΧΘΕΊ ΜΕ ΠΟΛΎ ΜΙΚΡΆ ΘΡΑΎΣΜΑΤΑ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ ΤΟΠΊΟΥ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ ΔΕΔΟΜΈΝΑ ΈΚΦΡΑΣΗΣ ΑΠΌ ΠΟΛΎ ΜΙΚΡΆ ΣΎΝΟΛΑ ΑΠΌ ΔΎΟ ΈΩΣ ΛΙΓΌΤΕΡΑ ΑΠΌ ΔΈΚΑ ΓΟΝΊΔΙΑ. ΩΣΤΌΣΟ, Ο ΤΕΡΆΣΤΙΟΣ ΌΓΚΟΣ ΤΩΝ ΩΜΙΚΏΝ ΔΕΔΟΜΈΝΩΝ ΠΟΥ ΕΊΝΑΙ ΉΔΗ ΔΙΑΘΈΣΙΜΑ ΣΤΙΣ ΒΆΣΕΙΣ ΔΕΔΟΜΈΝΩΝ ΠΡΟΣΦΈΡΕΙ ΤΗΝ ΕΥΚΑΙΡΊΑ ΝΑ ΕΦΑΡΜΟΣΤΟΎΝ ΤΕΧΝΙΚΈΣ «ΜΕΓΆΛΩΝ ΔΕΔΟΜΈΝΩΝ», ΝΑ ΜΕΤΑΚΙΝΗΘΟΎΝ ΑΠΌ ΑΠΛΉ ΜΕΤΑΦΟΡΙΚΉ ΠΕΡΙΓΡΑΦΉ ΣΕ ΜΙΑ ΟΛΟΚΛΗΡΩΜΈΝΗ ΑΡΙΘΜΗΤΙΚΉ ΑΝΑΠΑΡΆΣΤΑΣΗ ΤΟΥ ΤΟΠΊΟΥ ΤΟΥ «WADDINGTON». ΣΕ ΑΥΤΌ ΤΟ ΠΡΌΤΖΕΚΤ, ΘΑ ΑΝΑΠΤΥΧΘΟΎΝ ΕΡΓΑΛΕΊΑ ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΙΚΉΣ ΒΙΟΛΟΓΊΑΣ ΓΙΑ ΝΑ ΜΟΝΤΕΛΟΠΟΙΉΣΟΥΝ ΜΑΘΗΜΑΤΙΚΆ ΤΙΣ ΓΕΩΜΕΤΡΊΕΣ ΚΑΙ ΤΗ ΔΥΝΑΜΙΚΉ ΤΟΥΣ ΜΕ ΟΛΟΚΛΗΡΩΜΈΝΟ ΤΡΌΠΟ, ΑΠΟΚΤΏΝΤΑΣ ΈΝΑ «ΣΥΝΟΛΙΚΌ» ΤΟΠΊΟ ΑΠΌ ΤΗΝ ΟΛΟΚΛΉΡΩΣΗ ΤΩΝ ΜΟΡΙΑΚΏΝ ΜΕΤΡΉΣΕΩΝ ΤΗΣ ΓΕΝΕΤΙΚΉΣ ΈΚΦΡΑΣΗΣ, ΤΗΝ ΤΟΠΟΘΈΤΗΣΗ ΤΩΝ ΟΡΧΗΣΤΡΙΚΏΝ ΣΗΜΆΝΣΕΩΝ ΚΑΙ ΤΟ METILACION ΤΟΥ DNA ΠΟΥ ΛΑΜΒΆΝΕΤΑΙ ΑΠΌ ΤΕΧΝΙΚΈΣ «ΜΕΓΆΛΩΝ ΔΕΔΟΜΈΝΩΝ» ΑΠΌ ΔΗΜΌΣΙΕΣ ΒΆΣΕΙΣ ΔΕΔΟΜΈΝΩΝ. _x000D_ _x000D_ αυτή η ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΤΗΣ ΣΥΣΚΕΥΑΣΙΑΣ «ΠΑΡΑΓΡΑΜΜΑΤΟΣ», με βάση τις ΜΟΛΕΥΚΕΣ ΦΟΡΕΙΣ που μπορούν να μετρηθούν, θα επιτρέψει να ΑΓΟΡΑΣΟΥΝ ΤΙΣ ΜΟΛΟΚΟΥΛΕΣ ΤΗΣ ΝΟΜΙΚΗΣ ΑΝΑΠΤΥΞΗΣ, παθήσεις με μεγάλες επιγενετικές διαταράξεις όπως αυτές που σχετίζονται με σχεδόν όλους τους τύπους ΑΚΥΡΩΣΗς και γήρανσης (PRINCIPALMENT in neurodegenerative DISEASES) ως επέκταση της CELL DEVELOPMENT. Επιπλέον, καθώς πολλοί από τους μοριακούς ΦΟΡΕΙΣ μπορούν να χειραγωγηθούν, η ανακατασκευή του «WADDINGTON Paisaje» θα επέτρεπε την ταυτοποίηση και «ΕΚΔΗΛΩΣΕΙΣ» που θα σήμαινε την ταυτοποίηση των transcry παραγόντων που τους επιτρέπουν να επιλέξουν το CLASSIC αναπρογραμματίζοντας «coctels» και να εντοπίσουν νέα. _x000D_ μεταξυ των ΠΡΟΣΘΕΤΙΚΩΝ ΕΦΑΡΜΟΓΩΝ ΤΗΣ ΕΘΝΙΚΗΣ ΠΛΗΡΩΜΗΣ «WADDINGTON PAYMENT» ΕΔΩ ΓΕΝΙΚΗ ΤΟΠΟΘΕΤΗΣΗ ΣΤΗ «Γεωργία» του Paisaje των βιολογικών μας χαρακτηριστικών των οποίων είναι γνωστά τα μεταγραφικά ή/και επιγονιδιωματικά χαρακτηριστικά τους, αλλά δεν είναι ασφυκτικά χαρακτηρισμένα. ΜΙΑ ΆΛΛΗ ΔΙΠΛΉ ΕΦΑΡΜΟΓΉ ΕΊΝΑΙ Η ΑΝΑΓΝΏΡΙΣΗ ΣΤΟ ΤΟΠΊΟ ΤΩΝ ΠΕΡΙΟΧΏΝ ΣΗΜΑΝΤΙΚΉΣ ΕΠΈΚΤΑΣΗΣ ΠΟΥ ΑΚΌΜΗ ΚΑΙ Η ΕΠΙΚΟΙΝΩΝΊΑ ΓΝΩΣΤΏΝ ΚΥΤΤΑΡΙΚΏΝ ΤΎΠΩΝ ΠΟΥ ΥΠΆΡΧΟΥΝ ΣΤΑ ΣΎΝΟΡΆ ΤΟΥΣ, ΠΕΡΙΈΧΟΥΝ ΖΏΝΕΣ ΧΩΡΊΣ ΓΝΩΣΤΟΎΣ ΚΥΤΤΑΡΙΚΟΎΣ ΤΎΠΟΥΣ ΜΈΣΑ. Αυτές οι ΠΕΡΙΦΕΡΕΙΕΣ σηματοδοτούν την πιθανή ύπαρξη μη ταυτοποιημένων ΤΑΧΥΔΡΟΜΙΚΩΝ TIPS ΕΧΕΙ την ημερομηνία και τον προσδιορισμό τους μπορεί να βοηθήσει στην αγορά καλύτερης celular DIFFERENCE._x000D__x000D___x000D_ Οι αλγοριθμοί «BIG DATA» που αναπτύχθηκαν σε αυτό το έργο για την αναζήτηση, την αυτόματη ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗ και την ΕΝΙΣΧΥΣΗ ΟΜΙΚΟΥ ΔΙΠΤΙΝΤΑ ΦΥΣΙΚΟΥ ΔΙΑΤΑΞΗΣ ΔΕΔΟΜΕΝΩΝ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΩΝ ΠΛΗΤΑΜΩΝ ΚΑΤΑΝΑΛΩΣΗΣ ΣΤΟ ΣΥΓΧΡΟΝΙΣΜΕΝΗ ΠΡΑΚΤΙΚΗ ΕΦΑΡΜΟΓΗ, που δεν περιορίζεται μόνο στις ΟΜΙΚΕΣ ΥΠΟΨΗΦΙΕΣ ΓΙΑ ΤΗΝ ΓΕΝΙΚΗ ΕΠΙΧΕΙΡΗΜΑΤΙΚΟΤΗΤΑ ΤΟΥ WADDINGTON «Paisaje», αλλά και σε οποιοδήποτε άλλο έργο της COMPUTATIONAL BIOLOGY OF GREAT ESCAL BIOLOGY που απαιτεί SEARCH, ΔΙΑΔΙΚΑΣΙΑ και ΕΝΙΣΧΥΣΗ ΜΕΓΑΛΩΝ ΟΜΙΚΩΝ ΔΕΔΟΜΕΝΩΝ. ΠΡΌΚΕΙΤΑΙ, ΕΠΟΜΈΝΩΣ, ΓΙΑ ΆΜΕΣΕΣ ΕΦΑΡΜΟΓΈΣ ΤΩΝ ΑΛΓΟΡΊΘΜΩΝ «ΜΕΓΆΛΩΝ ΔΕΔΟΜΈΝΩΝ» ΠΟΥ ΑΝΑΠΤΎΧΘΗΚΑΝ ΕΔΏ, ΜΕΤΑΞΎ ΆΛΛΩΝ, ΓΙΑ ΈΡΓΑ ΒΙΟΪΑΤΡΙΚΉΣ ΓΙΑ ΤΟΝ ΚΑΡΚΊΝΟ ΚΑΙ ΤΗ ΓΉΡΑΝΣΗ. (Greek)
4 August 2022
0 references
WADDINGTON’S EPIGENETICKÁ KRAJINA JE METAFRÁZA POUŽÍVANÁ NA ILUSTRÁCIU EMBRYONÁLNEHO VÝVOJA, NAJMÄ BUNKOVEJ DIFERENCIÁCIE. WADDINGTON PREDPOKLADAL TENTO KONCEPT V ROKU 1957 Z EXPERIMENTÁLNYCH POZOROVANÍ, ALE BEZ ČÍSELNÝCH MERANÍ. V SÚČASNEJ DOBE, VĎAKA POKROKU V BUNKOVEJ PREPROGRAMOVANIE, JE TÁTO MYŠLIENKA JE ZNOVU NAVŠTEVOVANÁ. VEĽMI ČIASTOČNÉ MODELY BOLI VYVINUTÉ S VEĽMI MALÝMI FRAGMENTMI TEJTO KRAJINY POMOCOU EXPRESNÝCH ÚDAJOV Z VEĽMI MALÝCH SÁD Z DVOCH AŽ MENEJ AKO DESIATICH GÉNOV. OBROVSKÉ MNOŽSTVO OMICKÝCH ÚDAJOV, KTORÉ UŽ SÚ K DISPOZÍCII V DATABÁZACH, VŠAK PONÚKA MOŽNOSŤ UPLATNIŤ TECHNIKY „VEĽKÝCH DÁT“, ABY SA PREŠLO OD JEDNODUCHÉHO METAFORICKÉHO OPISU KU KOMPLEXNEJ NUMERICKEJ REKONŠTRUKCII „WADDINGTONSKEJ KRAJINY“. V TOMTO PROJEKTE BUDÚ VYVINUTÉ VÝPOČTOVÉ BIOLOGICKÉ NÁSTROJE NA MATEMATICKÉ MODELOVANIE ICH GEOMETRIE A DYNAMIKY KOMPLEXNÝM SPÔSOBOM, ZÍSKANIE „CELKOVEJ“ KRAJINY Z INTEGRÁCIE MOLEKULÁRNYCH MERANÍ GENETICKEJ EXPRESIE, UMIESTNENIE HISTÓNOVÝCH ZNAČENÍ A METILACION DNA ZÍSKANÁ TECHNIKAMI „VEĽKÝCH DÁT“ Z VEREJNÝCH DATABÁZ. _x000D_ _x000D_ táto RECONSTRUCTION OF WADDINGTON ‚PAISAGE‘, ktorá sa zakladá na MOLECULÁRnych ENTICIÁCH, ktoré sa dajú merať, umožní BUY MOLECULÁRNEJ BASY NORMÁLNEHO DEVELOPMENTU, chorôb s veľkými epigenetickými perturbáciami, ako sú tie, ktoré sú spojené prakticky so všetkými typmi ZRUŠENÍ a starnúcimi (PRINKIPALMENT V neurodegeneratívnych podmienkach) ako rozšírenie DEVELOPMENTU CELL. Okrem toho, keďže mnohé molekulárne ENTITIES môžu byť manipulované, rekonštrukcia „WADDINGTON Paisaje“ by umožnila identifikáciu a „PUENTS“, čo by znamenalo identifikáciu transkrytických činidiel, ktoré im umožnia zvoliť si CLASSIC preprogramovanie „koktely“ a identifikovať nové. Priame preprogramovanie VIAS TO TRANSFORM A TYPE CELL NA ĎALŠIE BEZ pluripotentného INTERMEDIATE STATE._x000D_ _x000D_ _x000D_ ĎALŠIE APLIKÁCIE NUMERICKÉHO „vzhľadu na PAYMENT“ TU VÍTAJE LOCALIZÁCIE V „GEOGRAFY“ Paisaje našich biologických vlastností, ktorých transkriptomické a/alebo epigenomické vlastnosti sú známe, ale nie sú udusené. ĎALŠOU DVOJITOU APLIKÁCIOU JE IDENTIFIKÁCIA REGIÓNOV SO ZNAČNÝM ROZŠÍRENÍM, KTORÉ DOKONCA KOMUNIKUJÚ ZNÁME BUNKOVÉ TYPY EXISTUJÚCE NA ICH HRANICIACH, OBSAHUJÚ ZÓNY BEZ ZNÁMYCH BUNKOVÝCH TYPOV VO VNÚTRI. Tieto REGIONS signalizujú možnú existenciu neidentifikovaných CELULARY TIPS má dátum a ich identifikáciu môže pomôcť kúpiť lepšie celulárnej DIFFERENCE._x000D__x000D__x000D__x000D_ algoritmy „BIG DATA“ vyvinuté v tomto projekte pre vyhľadávanie, automatické SPRACOVANIE a INTEGRÁCIE Omic ditinta NATURAL Distinta DATA PROVENENTY TECHNOLOGICKÉ platne konštanty v SAME VERY INNOVATIVE AVANCE AMMEDIATE PRAKTICKÉ ÚDAJE, nielenže sú obmedzené na omické DATA záujmy pre GENERÁCIE WADDINGTON’S „Paisaje“, ale na akýkoľvek iný projekt COMPUTATIONAL BIOLOGY GREAT ESCAL BIOLOGY vyžadujúci vyhľadávanie, SPRACOVANIE a INTEGRÁCIE VEĽKÝCH Omických ÚDAJOV. SÚ TEDA OKAMŽITÉ APLIKÁCIE ALGORITMOV „BIG DATA“ TU VYVINUTÝCH BIOMEDICÍNSKYCH PROJEKTOV RAKOVINY A STARNUTIA, OKREM INÉHO. (Slovak)
4 August 2022
0 references
WADDINGTONIN EPIGENEETTINEN MAISEMA ON METAFAASI, JOTA KÄYTETÄÄN KUVAAMAAN ALKION KEHITYSTÄ, ERITYISESTI SOLUJEN ERILAISTUMISTA. WADDINGTON HYPOTISOI TÄMÄN KÄSITTEEN VUONNA 1957 KOKEELLISISTA HAVAINNOISTA, MUTTA ILMAN NUMEERISIA MITTAUKSIA. TÄLLÄ HETKELLÄ, KIITOS EDISTYKSEN SOLUN UUDELLEENOHJELMOINTI, TÄMÄ AJATUS ON UUDELLEENKÄYNNISTYS. HYVIN OSITTAISIA MALLEJA ON KEHITETTY HYVIN PIENILLÄ FRAGMENTEILLA TÄSTÄ MAISEMASTA KÄYTTÄEN EKSPRESSIOTIETOJA HYVIN PIENISTÄ SARJOISTA KAHDESTA ALLE KYMMENEEN GEENIIN. TIETOKANNOISSA JO SAATAVILLA OLEVIEN OMIEN TIETOJEN VALTAVA MÄÄRÄ TARJOAA KUITENKIN MAHDOLLISUUDEN SOVELTAA ”ISOA DATAA” -TEKNIIKOITA SIIRTYÄKSEEN PELKÄSTÄ METAFORISESTA KUVAUKSESTA ”WADDINGTONIN MAISEMAN” KATTAVAAN NUMEERISEEN REKONSTRUOINTIIN. TÄSSÄ HANKKEESSA KEHITETÄÄN LASKENNALLISIA BIOLOGIAN TYÖKALUJA MATEMAATTISESTI MALLINTAMAAN NIIDEN GEOMETRIAA JA DYNAMIIKKAA KOKONAISVALTAISELLA TAVALLA, JOLLOIN SAADAAN ”YHTEENSÄ” MAISEMA GENEETTISEN ILMENTYMÄN MOLEKYYLIMITTAUSTEN INTEGROINNISTA, HISTONEMERKINTÖJEN SIJAINNISTA JA DNA:N METILACIONISTA, JOKA ON SAATU JULKISISTA TIETOKANNOISTA ”ISOA DATAA” KÄYTTÄEN. _x000D_ _x000D_ tämä RECONSTRUCTION OF WADDINGTON ’PAISAGE’, joka perustuu MOLECULAR ENTITIES, joka voidaan mitata, mahdollistaa sellaisten sairauksien MOLECULAR BASES OF NORMAL DEVELOPMENT, joilla on suuria epigeneettisiä häiriöitä, kuten ne, jotka liittyvät käytännöllisesti katsoen kaikkiin CANCER- ja ikääntymistyyppeihin (PRINCIPALMENT IN neurodegenerative DISEASES) CELL DEVELOPMENTIN jatkona. Koska monia molekulaarisia ENTITIESejä voidaan manipuloida, ”WADDINGTON Paisaje” -järjestelmän uudelleenrakentaminen mahdollistaisi tunnistamisen ja ”PUENTS”:n, mikä tarkoittaisi sellaisten transkry-aineiden tunnistamista, joiden avulla ne voisivat valita CLASSIC-ohjelmointiin ”koktellit” ja tunnistaa uusia. STATE._x000D_ _x000D_ BETWEEN ADDITIONAL APPLICATIONS OF the NUMERICAL ”WADDINGTON PAYMENT” HERE GENERATE the LOCALISATION in the ”GEOGRAPHY” of the Paisaje of the ”GEOGRAPHY” of the ”GEOGRAPHY” of the ”GEOGRAPHY” of the ”GEOGRAPHY” of the ”GEOGRAPHY” of the ”GEOGRAPHY” of the NUMERICAL ”WADDINGTON PAYMENTMENT” TÄSÄÄN LISÄT LISÄÄ NUMERERICAL ”WADDINGTON PAYMENT” TÄSÄÄN LISÄÄNÄ LISÄTTÄMÄÄN siitä, että Paisajen biologiset ominaisuudet, joiden transnscriptomic ja/tai epigenomiset ominaisuudet tunnetaan, mutta että ne eivät tukehduttavasti. TOINEN KAKSOISSOVELLUS ON TUNNISTAMINEN MAISEMASSA ALUEILLA, JOILLA ON HUOMATTAVAA LAAJENEMISTA, ETTÄ JOPA KOMMUNIKOIDA TUNNETTUJA SOLUTYYPPEJÄ OLEMASSA NIIDEN RAJOILLA, SISÄLTÄÄ VYÖHYKKEITÄ, JOILLA EI TUNNETA SOLUTYYPPEJÄ SISÄLLÄ. Nämä REGIONS viestivät mahdollisesta olemassaolosta tunnistamaton CELULARY TIPS Onko päivämäärä ja niiden tunnistaminen voi auttaa ostamaan parempaa celular DIFFERENCE._x000D__x000D__x000D_BIG DATA” algoritmit kehitetty tässä hankkeessa haku, automaattinen PROCESSING JA INTEGRATION Omic distinta NATURAL distinta DATA PROVENENTS OF TECHNOLOGICAL plataforms CONSTITUY TEHTÄMÄN KÄYTETTÄMÄN KÄYTETTÄMÄN VALVONTA JA MÄÄRÄN PÄÄTÖKSEN PÄÄTÖKSEKSI, ei ainoastaan rajattu Omic DATA -esteisiin, jotka koskevat WADDINGTONin ”Paisaje”:n ”Paisaje”, vaan mihin tahansa muuhun hankkeeseen, joka on TÄYTÄNTÖÖN TARKKAUKSEN TILAAMISTA BIOLOGIA, joka vaatii SARCH, PROCESSING and INTEGRATION OF GREAT Omic DATA. NE OVAT SIIS VÄLITTÖMIÄ SOVELLUKSIA ”ISO DATA” ALGORITMEJA TÄÄLLÄ KEHITETTY BIOLÄÄKETIETEEN HANKKEITA SYÖPÄ JA IKÄÄNTYMINEN, MUUN MUASSA. (Finnish)
4 August 2022
0 references
KRAJOBRAZ EPIGENETYCZNY WADDINGTONA TO METAFRAZA UŻYWANA DO ZILUSTROWANIA ROZWOJU EMBRIONALNEGO, W SZCZEGÓLNOŚCI RÓŻNICOWANIA KOMÓREK. WADDINGTON ZAŁOŻYŁ TĘ KONCEPCJĘ W 1957 ROKU Z OBSERWACJI EKSPERYMENTALNYCH, ALE BEZ POMIARÓW LICZBOWYCH. OBECNIE, DZIĘKI POSTĘPOM W PRZEPROGRAMOWANIU KOMÓRKOWYM, IDEA TA JEST PONOWNIE ANALIZOWANA. BARDZO CZĘŚCIOWE MODELE ZOSTAŁY OPRACOWANE Z BARDZO MAŁYMI FRAGMENTAMI TEGO KRAJOBRAZU PRZY UŻYCIU DANYCH EKSPRESJI Z BARDZO MAŁYCH ZESTAWÓW OD DWÓCH DO MNIEJ NIŻ DZIESIĘCIU GENÓW. JEDNAK OGROMNA ILOŚĆ DANYCH OMICZNYCH JUŻ DOSTĘPNYCH W BAZACH DANYCH DAJE MOŻLIWOŚĆ ZASTOSOWANIA TECHNIK „DUŻYCH DANYCH”, ABY PRZEJŚĆ OD ZWYKŁEGO OPISU METAFORYCZNEGO DO KOMPLEKSOWEJ REKONSTRUKCJI NUMERYCZNEJ „WADDINGTONSKIEGO KRAJOBRAZU”. W RAMACH TEGO PROJEKTU OPRACOWANE ZOSTANĄ NARZĘDZIA DO BIOLOGII OBLICZENIOWEJ, ABY MATEMATYCZNIE MODELOWAĆ ICH GEOMETRIĘ I DYNAMIKĘ W SPOSÓB KOMPLEKSOWY, UZYSKUJĄC „CAŁKOWITY” KRAJOBRAZ DZIĘKI INTEGRACJI POMIARÓW MOLEKULARNYCH EKSPRESJI GENETYCZNEJ, POZYCJONOWANIU OZNACZEŃ HISTONE I METILACIONOWI DNA UZYSKANEMU TECHNIKAMI „DUŻYCH DANYCH” Z PUBLICZNYCH BAZ DANYCH. _x000D_ _x000D_ to RECONSTRUKCJA WADDINGTON 'PAISAGE', opierając się na MOLECULAR ENTITIES, które mogą być zmierzone, pozwoli na KUPIENIE MOLEKULARNYCH BASÓW ROZWOJU NORMALNEGO, chorób o wielkich perturbacjach epigenetycznych, takich jak te związane z praktycznie wszystkimi typami CANCER i starzejącymi się (PRINCIPALMENT IN neurodegenerative DISEASES) jako przedłużenie DEVELOPMENTU CELL. Ponadto, ponieważ można manipulować wieloma ENTIES molekularnymi, przebudowa „WADDINGTON Paisaje” umożliwiłaby identyfikację i „PUENTS”, co oznaczałoby identyfikację czynników transkrypcyjnych, które pozwoliłyby im wybrać przeprogramowanie CLASSIC „coctels” i zidentyfikować nowe. Bezpośrednie przeprogramowanie VIAS TO TRANSFORM A TYPE CELL TO INNY BEZ pluripotent INTERMEDIATE STATE._x000D_ _x000D_ PODKREŚLAJĄCYCH APLIKACJI NUMERICALNYCH „WADDINGTON PAYMENT” TUTAJ OGRANICZENIA LOCALIZACJI W „GEOGRAPHII” Paisaje o naszych cechach biologicznych, o których znane są ich cechy transkryptomiczne i/lub epigenomiczne, ale nie są one duszące się scharakteryzowane. INNYM PODWÓJNYM ZASTOSOWANIEM JEST IDENTYFIKACJA W KRAJOBRAZIE REGIONÓW O ZNACZNYM ROZSZERZENIU, ŻE NAWET KOMUNIKOWANIE ZNANYCH TYPÓW KOMÓRKOWYCH ISTNIEJĄCYCH NA ICH GRANICACH, ZAWIERA STREFY BEZ ZNANYCH TYPÓW KOMÓRKOWYCH WEWNĄTRZ. Te REGIONS sygnalizuje ewentualny istnienie niezidentyfikowanych CELULARY TIPS HAS data i ich identyfikacja może pomóc w zakupie lepszego celular DIFFERENCE._x000D__x000D__x000D_ Algorytmy „BIG DATA” opracowane w tym projekcie do wyszukiwania, automatycznej PROCESJA I INTEGRACJI OMIC Distinta NATURAL distinta DATA PROVENENTS TECHNOLOGALnych plataform CONSTITUY w SAMIE BARDZO INNOVATIVE AVANCE I IMMEDIATE PRAKTYCZNE APLIKACJA, nie tylko ograniczone do omic Obtentacje DANYCH DO GENERACJI WADDINGTON’S „Paisaje”, ale do każdego innego projektu COMPUTATIONAL BIOLOGIA GREAT ESCAL BIOLOGIA wymagająca SEARCH, PROCESING I INTEGRACJA GREAT Omic DATA. SĄ TO WIĘC NATYCHMIASTOWE ZASTOSOWANIA ALGORYTMÓW „DUŻYCH DANYCH” OPRACOWANYCH TUTAJ M.IN. BIOMEDYCYNA PROJEKTÓW NOWOTWOROWYCH I STARZENIA. (Polish)
4 August 2022
0 references
A WADDINGTON EPIGENETIKUS TÁJKÉPE AZ EMBRIONÁLIS FEJLŐDÉST, KÜLÖNÖSEN A SEJTDIFFERENCIÁLÁST SZEMLÉLTETŐ METAFÁZIS. A WADDINGTON 1957-BEN FELTÉTELEZTE EZT A KONCEPCIÓT KÍSÉRLETI MEGFIGYELÉSEKBŐL, DE NUMERIKUS MÉRÉSEK NÉLKÜL. JELENLEG, KÖSZÖNHETŐEN A FEJLŐDÉS A CELLULÁRIS ÁTPROGRAMOZÁS, EZ AZ ÖTLET VAN FELÜLVIZSGÁLVA. NAGYON RÉSZLEGES MODELLEKET FEJLESZTETTEK KI E TÁJ NAGYON KIS TÖREDÉKEIVEL, A KÉT-TÍZ GÉNEK NAGYON KIS HALMAZAIBÓL SZÁRMAZÓ EXPRESSZIÓS ADATOK FELHASZNÁLÁSÁVAL. AZ ADATBÁZISOKBAN MÁR RENDELKEZÉSRE ÁLLÓ HATALMAS MENNYISÉGŰ OMIKUS ADAT AZONBAN LEHETŐSÉGET KÍNÁL A „NAGY ADAT” TECHNIKÁK ALKALMAZÁSÁRA, HOGY A METAFORIKUS LEÍRÁSRÓL A „WADDINGTON TÁJKÉP” ÁTFOGÓ NUMERIKUS REKONSTRUKCIÓJÁRA TÉRJÜNK ÁT. EBBEN A PROJEKTBEN SZÁMÍTÓGÉPES BIOLÓGIAI ESZKÖZÖKET FEJLESZTENEK KI A GEOMETRIA ÉS A DINAMIKA MATEMATIKAI MODELLEZÉSÉRE ÁTFOGÓ MÓDON, A GENETIKAI KIFEJEZÉS MOLEKULÁRIS MÉRÉSEINEK INTEGRÁLÁSÁBÓL, A HISTONE JELÖLÉSEK ELHELYEZÉSÉBŐL ÉS A NYILVÁNOS ADATBÁZISOKBÓL SZÁRMAZÓ „NAGY ADAT” TECHNIKÁKKAL NYERT DNS METILACION-BÓL TÖRTÉNŐ INTEGRÁLÁSÁBÓL. _x000D_ _x000D_ ez a „PAISAGE” HATÁROZAT a mérhető MOLECULAR ENTITIEK alapján lehetővé teszi, hogy a súlyos epigenetikai zavarokkal járó betegségek, mint a gyakorlatilag az összes CANCER és öregedési típus (PRINCIPALMENT in neurodegenerative DISEASES) esetében a CELL DEVELOPMENT kiterjesztéseként lehetővé váljon a NORMÁLIS FEJEZET MOLECULÁCIÓK ÁLLÁSA. Ezen túlmenően, mivel számos molekuláris ENTITIES manipulálható, a „WADDINGTON Paisaje” újraépítése lehetővé tenné az azonosítást és a „PUENTS”-t, ami a transzkriptumok azonosítását jelenti, amelyek lehetővé teszik számukra, hogy a CLASSIC átprogramozása mellett döntsenek, és újakat azonosítsanak. közvetlen átprogramozás VIAS to TRANSFORM A TÍPUSÚ TÍPUSÚ TÍPUS MEGÁLLAPODÁSA egy pluripotens INTERMEDIATE STATE-vel._x000D_ _x000D_ A NUMERICAL „WADDINGTON PAYMENT” Kiegészítő MEGJEGYZÉSE itt GENERATE THE LOCALISATION A Paisaje „GEOGRAPHY” biológiai jellemzőiről, amelyek transzkriptómiai és/vagy epigenomikus tulajdonságai ismertek, de nem fullasztóan jellemzik őket. EGY MÁSIK KETTŐS ALKALMAZÁS AZ OLYAN JELENTŐS KITERJEDÉSŰ RÉGIÓK TÁJKÉPÉN VALÓ AZONOSÍTÁSA, AMELYEK MÉG A HATÁRAIKON LÉTEZŐ ISMERT SEJTTÍPUSOKRÓL IS RENDELKEZNEK, OLYAN ZÓNÁKAT TARTALMAZNAK, AMELYEKEN BELÜL NINCSENEK ISMERT SEJTTÍPUSOK. Ezek a REGIONS jelzik a nem azonosított CELULARY TIPS lehetséges létezését, hogy a dátum és az azonosítás segíthet a jobb celular DIFFERENCE vásárlásában._x000D__x000D___x000D_ A projektben kifejlesztett „BIG DATA” algoritmák az Omic Distinta TECHNOLOGICAL plataformákra vonatkozó keresési, automatikus PROCESSING ÉS INTEGRÁCIÓK ebben az esetben nem csak a WADDINGTON „Paisaje” GENERÁCIÓRA VONATKOZÓ, hanem bármely más, a GREAT ESCAL BIOLOGIA BIOLOGÁLIS BIOLOGÁLIS BIOLOGÁLIS BIOLOGÁLIS BIOLOGÁLIS BIOLOGÁLIS BIOLOGÁLIS BIOLOGÁLIS BIOLOGIA olyan projektjére van szükség, amely a GREAT Omic DATA SEARCH, PROCESSING és INTEGRATIONÁLÁSát igényli. EZEK TEHÁT A „NAGY ADAT” ALGORITMUSOK AZONNALI ALKALMAZÁSAI, AMELYEK TÖBBEK KÖZÖTT A RÁKRA ÉS AZ ÖREGEDÉSRE VONATKOZÓ BIOGYÓGYÁSZATI PROJEKTEKET FEJLESZTETTEK KI. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
WADDINGTONOVA EPIGENETICKÁ KRAJINA JE METAFRÁZE POUŽÍVANÁ K ILUSTRACI EMBRYONÁLNÍHO VÝVOJE, ZEJMÉNA DIFERENCIACE BUNĚK. WADDINGTON HYPOTETIZOVAL TENTO KONCEPT V ROCE 1957 Z EXPERIMENTÁLNÍCH POZOROVÁNÍ, ALE BEZ NUMERICKÝCH MĚŘENÍ. V SOUČASNÉ DOBĚ, DÍKY POKROKU V BUNĚČNÉM PŘEPROGRAMOVÁNÍ, SE TATO MYŠLENKA PŘEHODNOCUJE. VELMI ČÁSTEČNÉ MODELY BYLY VYVINUTY S VELMI MALÝMI FRAGMENTY TÉTO KRAJINY POMOCÍ EXPRESE DAT Z VELMI MALÝCH SOUBORŮ OD DVOU DO MÉNĚ NEŽ DESET GENŮ. OBROVSKÉ MNOŽSTVÍ OMICKÝCH DAT, KTERÉ JSOU JIŽ V DATABÁZÍCH K DISPOZICI, VŠAK NABÍZÍ MOŽNOST UPLATNIT TECHNIKY „VELKÝCH DAT“ A PŘEJÍT OD POUHÉHO METAFORICKÉHO POPISU KE KOMPLEXNÍ NUMERICKÉ REKONSTRUKCI „WADDINGTONSKÉ KRAJINY“. V TOMTO PROJEKTU BUDOU VYVINUTY VÝPOČETNÍ BIOLOGICKÉ NÁSTROJE PRO MATEMATICKY MODELOVÁNÍ JEJICH GEOMETRIE A DYNAMIKY KOMPLEXNÍM ZPŮSOBEM, ZÍSKÁNÍ „CELKOVÉ“ KRAJINY Z INTEGRACE MOLEKULÁRNÍCH MĚŘENÍ GENETICKÉ EXPRESE, UMÍSTĚNÍ HISTONOVÝCH ZNAČENÍ A METILACION DNA ZÍSKANÉ TECHNIKAMI „VELKÁ DATA“ Z VEŘEJNÝCH DATABÁZÍ. _x000D_ _x000D_ tato RECONSTRUCTION WADDINGTON „PAISAGE“ tím, že se opírá o MOLECULÁŘNÍ ENTITIKY, které lze měřit, umožní KOUPIT MOLECULÁŘNÍ BASY NORMAL DEVELOPMENT, onemocnění s velkými epigenetickými perturbacemi, jako jsou onemocnění spojená s prakticky všemi typy CANCER a stárnutí (PRINCIPALMENT IN neurodegenerative DISEASES) jako rozšíření CELL DEVELOPMENT. Kromě toho, vzhledem k tomu, že mnohé molekulární ENTITIES lze manipulovat, rekonstrukce „WADDINGTON Paisaje“ by umožnila identifikaci a „PUENTY“, což by znamenalo identifikaci transcry činidel, které by jim umožnily zvolit si CLASSIC přeprogramování „koktelů“ a identifikovat nové. _x000D_ BETWEEN THE ADDITIONAL APPLICATIONs of the NUMERICAL „WADDINGTON PAYMENT“ ZDE GENERÁLNÍ LOCALIZACE V „GEOGRAPHY“ Paisaje o našich biologických charakteristikách, jejichž transskriptomické a/nebo epigenomické vlastnosti jsou známy, ale že nejsou dusivé. DALŠÍ DVOJÍ APLIKACÍ JE IDENTIFIKACE V KRAJINĚ OBLASTÍ ZNAČNÉHO ROZŠÍŘENÍ, KTERÉ DOKONCE KOMUNIKUJÍ ZNÁMÉ BUNĚČNÉ TYPY EXISTUJÍCÍ NA JEJICH HRANICÍCH, OBSAHUJÍ ZÓNY BEZ ZNÁMÝCH BUNĚČNÝCH TYPŮ UVNITŘ. Tyto REGIONY signalizují případnou existenci neidentifikovaných CELULARY TIPS HAS datum a jejich identifikace může pomoci koupit lepší celulární DIFFERENCE._x000D__x000D___x000D_ algoritmy „BIG DATA“ vyvinuté v tomto projektu pro vyhledávání, automatické PROCESING A INTEGRACE OMICKÉHO distintačního DATÁTU TECHNOLOGICKÉ plataformy KONSTITUJÍCÍ V JÁZE VERY INNOVATIVNÍ AVANCE A IMMEDIATE PRACTICKÁ APPLACE, nejenom omický DATA Záměry pro GENERACE WADDINGTON’S „Paisaje“, ale i jakýkoli jiný projekt COMPUTATIONAL BIOLOGY GREAT ESCAL BIOLOGY vyžadující vyhledávání, PROCESING and INTEGRATION OF GREAT Omic DATA. JEDNÁ SE TEDY O OKAMŽITÉ APLIKACE ALGORITMŮ „VELKÝCH DAT“ ZDE ROZVÍJENÝCH MIMO JINÉ BIOMEDICÍNSKÝCH PROJEKTŮ RAKOVINY A STÁRNUTÍ. (Czech)
4 August 2022
0 references
WADDINGTON’S EPIĢENĒTISKĀ AINAVA IR METAFRĀZE, KO IZMANTO, LAI ILUSTRĒTU EMBRIJU ATTĪSTĪBU, JO ĪPAŠI ŠŪNU DIFERENCIĀCIJU. WADDINGTON HIPOTĒZĒ ŠO KONCEPCIJU 1957. GADĀ NO EKSPERIMENTĀLIEM NOVĒROJUMIEM, BET BEZ SKAITLISKIEM MĒRĪJUMIEM. PAŠLAIK, PATEICOTIES PANĀKUMIEM ŠŪNU PĀRPROGRAMMĒŠANĀ, ŠĪ IDEJA TIEK PĀRSKATĪTA. IR IZSTRĀDĀTI ĻOTI DAĻĒJI MODEĻI AR ĻOTI MAZIEM ŠĪS AINAVAS FRAGMENTIEM, IZMANTOJOT IZTEIKSMES DATUS NO ĻOTI MAZĀM KOPĀM NO DIVIEM LĪDZ MAZĀK NEKĀ DESMIT GĒNIEM. TOMĒR LIELAIS OMISKO DATU APJOMS, KAS JAU IR PIEEJAMS DATUBĀZĒS, DOD IESPĒJU IZMANTOT “LIELO DATU” METODES, PĀRIET NO VIENKĀRŠA METAFORISKA APRAKSTA UZ VISAPTVEROŠU SKAITLISKU “VADINGTONAS AINAVAS” REKONSTRUKCIJU. ŠAJĀ PROJEKTĀ TIKS IZSTRĀDĀTI SKAITĻOŠANAS BIOLOĢIJAS RĪKI, LAI MATEMĀTISKI MODELĒTU SAVU ĢEOMETRIJU UN DINAMIKU VISPUSĪGĀ VEIDĀ, IEGŪSTOT “KOPĒJO” AINAVU NO ĢENĒTISKĀS EKSPRESIJAS MOLEKULĀRO MĒRĪJUMU INTEGRĒŠANAS, HISTONES ZĪMJU POZICIONĒŠANAS UN DNS METILACION, KAS IEGŪTA AR “LIELIEM DATIEM” NO PUBLISKĀM DATUBĀZĒM. _x000D_ _x000D_ šī VADĪŠANAS RECONSTRUCTION “PAISAGE”, pamatojoties uz MOLECULAR ENTITIES, ko var izmērīt, ļaus iegādāt NORMĀLĀS ATTĪSTĪBAS MOLEKULĀM, slimībām ar lielu epiģenētisku perturbāciju, piemēram, slimībām, kas saistītas ar praktiski visiem CANCER un novecošanas veidiem (PRINCIPALMENT IN Neirodeģeneratīvās DISEASES) kā CELL DEVELOPMENT. Turklāt, tā kā daudzas molekulārās ENTITIES var manipulēt, “WADDINGTON Paisaje” pārbūve ļautu identificēt un “PUENTS”, kas nozīmētu transkristālu aģentu identificēšanu, kas ļautu tiem izvēlēties CLASSIC pārprogrammēšanu “coctels” un identificēt jaunus. tieša pārprogrammēšana VIAS UZ TRANSFORMĀM A TYPE CELL TO CITHOUT BEZ pluripotent INTERMEDIATE STATE._x000D_ _x000D_ BETWEEN THE ADDITIONAL APPLICATIONS of the NUMERICAL “WADDINGTON PAYMENT” ŠEIT ĢENERĀTS Paisajes “ĢEOGRĀVIJA” par mūsu bioloģiskajām īpašībām, kuru transkriptomiskie un/vai epigenomiskie raksturlielumi ir zināmi, bet tie nav suffocatingly raksturo. VĒL VIENS DIVKĀRŠS PIELIETOJUMS IR TO REĢIONU AINAVĀ, KUROS IR IEVĒROJAMS PAPLAŠINĀJUMS UN KUROS PAT SAZIŅĀ AR ZINĀMIEM ŠŪNU TIPIEM, KAS ATRODAS PIE TO ROBEŽĀM, IR ZONAS BEZ ZINĀMIEM ŠŪNU TIPIEM IEKŠPUSĒ. Šie REĢIONI signalizē, ka, iespējams, pastāv neidentificēti CELULARY TIPS HAS datums un to identifikācija var palīdzēt iegādāties labāku celulāro DIFFERENCE._x000D__x000D__x000D_ Šajā projektā izstrādātie algoritmi meklēšanai, automātiskai PROCESSING UN INTEGRATION Omic distinta NATURAL distinta DATA PROVENENTS TECHNOLOGICAL plataformas CONSTITUY VERY INNOVATIVE AVANCE UN IMMEDIATE PRACTICAL APPLICATION, kas attiecas ne tikai uz omic DATA Obtencijas par VADĪŠANAS “Paisaje”, bet arī uz jebkuru citu projektu COMPUTATIONAL BIOLOGY OF GREAT ESCAL BIOLOGY, kas prasa SEARCH, PROCESSING un INTEGRATION GREAT Omic DATA. TĀDĒJĀDI TIE IR TŪLĪTĒJA “LIELO DATU” ALGORITMU PIELIETOŠANA ŠEIT, CITA STARPĀ, IZSTRĀDĀTI BIOMEDICĪNAS VĒŽA UN NOVECOŠANAS PROJEKTI. (Latvian)
4 August 2022
0 references
IS METAPHRASE É TÍRDHREACH EPIGENETIC WADDINGTON A ÚSÁIDTEAR CHUN FORBAIRT SUTHACH A LÉIRIÚ, GO HÁIRITHE DIFREÁIL CEALL. RINNE WADDINGTON HIPITÉIS AR AN GCOINCHEAP SEO I 1957 Ó BHREATHNUITHE TURGNAMHACHA ACH GAN TOMHAIS UIMHRIÚLA. FAOI LÁTHAIR, A BHUÍOCHAS SIN DO DHUL CHUN CINN IN ATHCHLÁRÚ CEALLACH, TÁ AN SMAOINEAMH SEO Á ATHBHEOCHAN. SAMHLACHA AN-PHÁIRTEACH A BHEITH FORBARTHA LE BLÚIRÍ AN-BHEAG DEN TÍRDHREACH AG BAINT ÚSÁIDE AS SONRAÍ A LÉIRIÚ Ó SHRAITHEANNA AN-BHEAG Ó DHÁ GO NÍOS LÚ NÁ DEICH GÉINTE. MAR SIN FÉIN, TUGANN AN MÉID MÓR SONRAÍ ADAMHACH ATÁ AR FÁIL CHEANA FÉIN I MBUNACHAIR SONRAÍ AN DEIS TEICNÍCÍ “MÓRSHONRAÍ” A CHUR I BHFEIDHM, CHUN BOGADH Ó THUAIRISC MEAFARACH AMHÁIN GO DTÍ ATÓGÁIL UIMHRIÚIL CUIMSITHEACH AR “TÍRDHREACH WADDINGTON”. SA TIONSCADAL SEO, BEIDH UIRLISÍ BITHEOLAÍOCHTA RÍOMHAIREACHTÚIL A FHORBAIRT A SAMHAIL MATAMAITICIÚIL A GEOMETRIA AGUS DINIMIC AR BHEALACH CUIMSITHEACH, A FHÁIL “IOMLÁN” TÍRDHREACH Ó CHOMHTHÁTHÚ TOMHAIS MHÓILÍNEACH AR LÉIRIÚ GÉINITEACH, SUITE MARCÁLACHA HISTONE AGUS METILACION DNA A FHAIGHTEAR TRÍ THEICNÍCÍ “SONRAÍ MÓR” Ó BHUNACHAIR SONRAÍ POIBLÍ. _x000D_ _x000D_ an reCONSTRUCTION de Waddington ‘Paisage’, trí é féin a bhunú ar ENTITIES MOLECULAR is féidir a thomhas, ligfidh sé do na BASES MOLECULAR DEVELOPMENT NORMAL, galair le perturbations mór epigenetic cosúil leo siúd a bhaineann le beagnach gach CANCER agus cineálacha aosaithe (PRINCIPALMENT IN DISEASES neurodegenerative) mar leathnú ar an DEVELOPMENT CELL. Ina theannta sin, mar is féidir go leor de na ENTITIES mhóilíneach a ionramháil, d’fhéadfadh ath-thógáil an “Waddington Paisaje” aithint agus “PUENTS” a chiallódh go n-aithneofaí gníomhairí transcry a ligeann dóibh “coctels” athchlárú CLASSIC a roghnú agus cinn nua a aithint. cé gurbh iad Avondale rogha na coitianta tháinig buachaillí GCM le plean agus chuireadar I bhfeidhm é. CUR I BHFEIDHM DÉACH EILE IS EA RÉIGIÚIN A SHAINAITHINT I DTÍRDHREACH AN TSÍNIDH SHUNTASAIGH LENA GCUIRTEAR IN IÚL FIÚ CINEÁLACHA CEALLACHA AITHEANTA ATÁ ANN AG A DTEORAINNEACHA, GO BHFUIL CRIOSANNA IONTU NACH BHFUIL CINEÁLACHA CEALLACHA AITHEANTA LAISTIGH DÍOBH. Na REGIONS comhartha a bheith ann neamh-aitheanta TIPS CELULARY TAS Is féidir leis an dáta agus a n-aitheantas cabhrú a cheannach níos fearr CELULAR DIFFERENCE._x000D__x000D__x000D_ An “BIG DATA” algoritms forbartha sa tionscadal seo le haghaidh an cuardach, PROCESSING uathoibríoch agus INTEGRATION Omic Distinta NÁDÚRTHA DATA PROVENTS CONSHNOLOGICAL plataforms sa SAME A FHÁIL AN- INNOVATIVE agus IMMEDIATE PRACTICAL APPLICATION, ní hamháin teoranta do na obtentions DATA omic DO GENERATION of Waddington’S “Paisaje”, ach le haon tionscadal eile de BIOLOGY COMPUTATIONAL GREAT ESCAL BIOLOGY ag teastáil SEARCH, PROCESSING agus INTEGRATION GREAT Omic DATA. DÁ BHRÍ SIN, TÁ SIAD I BHFEIDHM LÁITHREACH AR NA HALGARTAIM “MÓRSHONRAÍ” ANSEO A FORBRAÍODH TIONSCADAIL BITHLEIGHIS AILSE AGUS AG DUL IN AOIS, I MEASC DAOINE EILE. (Irish)
4 August 2022
0 references
WADDINGTONOVA EPIGENETIČNA POKRAJINA JE METAFRAZA, KI SE UPORABLJA ZA PONAZORITEV EMBRIONALNEGA RAZVOJA, ZLASTI CELIČNE DIFERENCIACIJE. WADDINGTON JE TA KONCEPT DOMNEVAL LETA 1957 IZ EKSPERIMENTALNIH OPAZOVANJ, VENDAR BREZ ŠTEVILSKIH MERITEV. TRENUTNO SE ZARADI NAPREDKA V CELIČNEM REPROGRAMIRANJU TA IDEJA PONOVNO PREUČUJE. ZELO DELNI MODELI SO BILI RAZVITI Z ZELO MAJHNIMI FRAGMENTI TE KRAJINE Z UPORABO EKSPRESIVNIH PODATKOV IZ ZELO MAJHNIH NIZOV OD DVEH DO MANJ KOT DESETIH GENOV. VENDAR PA VELIKA KOLIČINA OMIČNIH PODATKOV, KI SO ŽE NA VOLJO V PODATKOVNIH ZBIRKAH, PONUJA PRILOŽNOST ZA UPORABO TEHNIK „VELIKIH PODATKOV“, DA BI SE PREMAKNILI OD ZGOLJ METAFORIČNEGA OPISA DO CELOVITE NUMERIČNE REKONSTRUKCIJE „WADDINGTON KRAJINE“. V TEM PROJEKTU BODO RAZVITA RAČUNSKA BIOLOŠKA ORODJA ZA MATEMATIČNO MODELIRANJE NJIHOVE GEOMETRIJE IN DINAMIKE NA CELOVIT NAČIN, PRIDOBITEV „CELOTNE“ KRAJINE IZ INTEGRACIJE MOLEKULARNIH MERITEV GENETSKEGA IZRAŽANJA, POZICIONIRANJA HISTONSKIH OZNAK IN METILACION DNA, PRIDOBLJENE S TEHNIKAMI „VELIKIH PODATKOV“ IZ JAVNIH BAZ PODATKOV. _x000D_ _x000D_ ta RECONSTRUKCIJA WADDINGTON ‚PAISAGE‘, ki se opira na MOLEKULARNE ENTITEVE, ki jih je mogoče izmeriti, bo omogočila, da se MOLEKULARNE BASES NORMALNE DEVELOPMENT, bolezni z velikimi epigenetskimi motnjami, kot so tiste, povezane s praktično vsemi tipi CANCER in starajočimi se tipi (PRINCIPALMENT V nevrodegenerativni DISEASES) kot podaljšek CELL DEVELOPMENTA. Poleg tega, kot je mogoče manipulirati z mnogimi molekularnimi ENTITIVAMI, bi ponovna izgradnja „WADDINGTON Paisaje“ omogočila identifikacijo in „PUENTS“, kar bi pomenilo identifikacijo transkripcijskih sredstev, ki jim omogočajo, da se odločijo za CLASSIC reprogramiranje „coctels“ in identificirajo nove. neposredno reprogramiranje VIAS TO TRANSFORM A TYPE CELL TO DRUGE BREZ PODROČJA PODJETJA._x000D_ _x000D_ _x000D_ DODATNE ZADEVE NUMERICALNEGA PLAČILA PLAČILA TUKAJ V „GEOGRAPHJI“ Paisaje o naših bioloških značilnostih, o katerih so znane njihove transkriptomske in/ali epigenomske značilnosti, niso pa zadušno opredeljene. DRUGA DVOJNA UPORABA JE IDENTIFIKACIJA V POKRAJINI REGIJ PRECEJŠNJE RAZŠIRITVE, KI CELO SPOROČANJE ZNANIH CELIČNIH TIPOV, KI OBSTAJAJO NA NJIHOVIH MEJAH, VSEBUJEJO OBMOČJA BREZ ZNANIH CELIČNIH TIPOV ZNOTRAJ. Te REGIJE signalizirajo morebitni obstoj neidentificiranih KELULARNIH TIPS JE datum in njihova identifikacija lahko pomaga pri nakupu boljše celularne DIFFERENCE._x000D__x000D__x000D_ algoritmov „BIG DATA“, razvitih v tem projektu za iskanje, samodejno OČIŠČANJE IN UGOTAVLJANJE OMIC distinta NATURALNO distinta DATA PROVENENTI TEHNOLOGICALnih plataform CONSTITUY v SAME ZELA INNOVAČNEGA AVANJA IN POMEMBNO PRAKTIČNO UPORABO, ki ni omejen samo na omično DATA Obtentions ZA GENERATION OF WADDINGTON’S „Paisaje“, ampak na kateri koli drug projekt Komkutativne BIOLOGIJE ZELA ESCAL BIOLOGIJE, ki zahteva SEARCH, PROCESSING IN INTEGRATION OF GREAT Omic DATA. GRE TOREJ ZA TAKOJŠNJO UPORABO ALGORITMOV „VELIKIH PODATKOV“, KI SO BILI MED DRUGIM RAZVITI BIOMEDICINSKI PROJEKTI RAKA IN STARANJA. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
ЕПИГЕНЕТИЧНИЯТ ПЕЙЗАЖ НА ВАДИНГТЪН Е МЕТАФРАЗА, ИЗПОЛЗВАНА ЗА ИЛЮСТРИРАНЕ НА ЕМБРИОНАЛНОТО РАЗВИТИЕ, ОСОБЕНО КЛЕТЪЧНАТА ДИФЕРЕНЦИАЦИЯ. WADDINGTON ХИПОТЕЗА ТАЗИ КОНЦЕПЦИЯ ПРЕЗ 1957 Г. ОТ ЕКСПЕРИМЕНТАЛНИ НАБЛЮДЕНИЯ, НО БЕЗ ЦИФРОВИ ИЗМЕРВАНИЯ. В МОМЕНТА, БЛАГОДАРЕНИЕ НА НАПРЕДЪКА В КЛЕТЪЧНОТО ПРЕПРОГРАМИРАНЕ, ТАЗИ ИДЕЯ СЕ ПРЕРАЗГЛЕЖДА. МНОГО ЧАСТИЧНИ МОДЕЛИ СА РАЗРАБОТЕНИ С МНОГО МАЛКИ ФРАГМЕНТИ ОТ ТОЗИ ПЕЙЗАЖ, КАТО СЕ ИЗПОЛЗВАТ ДАННИ ЗА ЕКСПРЕСИЯТА ОТ МНОГО МАЛКИ НАБОРИ ОТ ДВА ДО ПО-МАЛКО ОТ ДЕСЕТ ГЕНА. ВЪПРЕКИ ТОВА ОГРОМНОТО КОЛИЧЕСТВО ОМИЧНИ ДАННИ, КОИТО ВЕЧЕ СА НАЛИЧНИ В БАЗИТЕ ДАННИ, ПРЕДЛАГА ВЪЗМОЖНОСТ ЗА ПРИЛАГАНЕ НА ТЕХНИКИ ЗА „ГОЛЕМИ ИНФОРМАЦИОННИ МАСИВИ„, ЗА ПРЕМИНАВАНЕ ОТ ОБИКНОВЕНО МЕТАФОРИЧНО ОПИСАНИЕ КЪМ ЦЯЛОСТНА ЦИФРОВА РЕКОНСТРУКЦИЯ НА ПЕЙЗАЖА „WADDINGTON“. В ТОЗИ ПРОЕКТ ЩЕ БЪДАТ РАЗРАБОТЕНИ ИЗЧИСЛИТЕЛНИ БИОЛОГИЧЕСКИ ИНСТРУМЕНТИ ЗА МАТЕМАТИЧЕСКИ МОДЕЛИРАНЕ НА ТЯХНАТА ГЕОМЕТРИЯ И ДИНАМИКА ПО ВСЕОБХВАТЕН НАЧИН, КАТО СЕ ПОЛУЧИ „ОБЩ„ПЕЙЗАЖ ОТ ИНТЕГРИРАНЕТО НА МОЛЕКУЛЯРНИ ИЗМЕРВАНИЯ НА ГЕНЕТИЧНАТА ЕКСПРЕСИЯ, ПОЗИЦИОНИРАНЕТО НА МАРКЕРИТЕ НА ХИСТОУН И МЕТИЛАЦИОН НА ДНК, ПОЛУЧЕНИ ЧРЕЗ ТЕХНИКИ „ГОЛЕМИ ДАННИ“ ОТ ПУБЛИЧНИ БАЗИ ДАННИ. _x000D_ _x000D_ това РЕКОНСТРУКЦИЯ НА ВОДИНГТОН „PAISAGE“, като се основава на MOLECULAR ENTIES, които могат да бъдат измервани, ще позволи да се вземат MOLECULAR BASES OF NORMAL DEVELOPMENT, на заболявания с големи епигенетични смущения, като тези, свързани с практически всички видове CANCER и стареене (ПРИНКИПЪНТ В невродегенеративни дизейси) като продължение на CELL DEVELOPMENT. Освен това, тъй като много от молекулните ЕНТИИ могат да бъдат манипулирани, реконструирането на „WADDINGTON Paisaje„ще позволи идентификацията и „PUENTS“, което би означавало идентифицирането на транскристиращи агенти, които им позволяват да изберат CLASSIC препрограмиране на „коктели„и да идентифицират нови такива. _x000D_ ПОТВЪРЖДАВАТ ДОПЪЛНИТЕЛНИТЕ АПЛИКАЦИИ НА НУМЕРИЧНАТА „ВЪЗДЪРЖАЛ СЕ“ ТУК ОБЩИ ЛОКАЛИЗАЦИЯ В „ГЕОГРАФИЯ“ на нашите биологични характеристики, чиито транскриптомни и/или епигеномични характеристики са известни, но не се характеризират със задушаване. ДРУГО ДВОЙНО ПРИЛОЖЕНИЕ Е ИДЕНТИФИЦИРАНЕТО В ЛАНДШАФТА НА РАЙОНИ СЪС ЗНАЧИТЕЛНО РАЗШИРЕНИЕ, КОИТО ДОРИ КОМУНИКИРАТ ИЗВЕСТНИ КЛЕТЪЧНИ ТИПОВЕ, СЪЩЕСТВУВАЩИ НА ТЕХНИТЕ ГРАНИЦИ, СЪДЪРЖАТ ЗОНИ БЕЗ ИЗВЕСТНИ КЛЕТЪЧНИ ТИПОВЕ ВЪТРЕ. Тези РЕГИОНИ сигнализират за възможното съществуване на неидентифицирани CELULARY TIPS е датата и тяхната идентификация могат да помогнат за закупуване на по-добра целулозна DIFFERENCE._x000D__x000D___x000D_Algoritms „BIG DATA„, разработени в този проект за търсене, автоматично ПРОЦЕСОР И ИНТЕГРАЦИЯ НА Омична дистинта НАТИНТА ПРОВЕНТИ НА ТЕХНОЛОГИЧНИ платаформи CONSTITUY INNOVATIVE AVANCE И IMMEDIATE PRACTICAL APPLICATION, не само ограничено до омичната DATA степени за генерализирането на „Пайсахе“ на WADDINGTON, но и на всеки друг проект на КОМПУТАЦИОННА БИОЛОГИЯ НА ГРАБОТНА ИССАЛНА Биология, изискваща ТЪРЦОВЕ, ПРОЦЕСИ И ИНТЕГРАЦИЯ НА ЗЕЛЕН ОМИЧНА ДАТА. ПО ТОЗИ НАЧИН ТЕ СА НЕЗАБАВНИ ПРИЛОЖЕНИЯ НА АЛГОРИТМИТЕ „ГОЛЕМИ ДАННИ“ ТУК РАЗРАБОТЕНИ БИОМЕДИЦИНСКИ ПРОЕКТИ ЗА РАК И СТАРЕЕНЕ, НАРЕД С ДРУГИ. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
IL-PAJSAĠĠ EPIĠENETIKU TA’ WADDINGTON HUWA METAFRAŻI UŻATA BIEX TURI L-IŻVILUPP EMBRIJONIKU, B’MOD PARTIKOLARI D-DIFFERENZJAZZJONI TAĊ-ĊELLOLI. WADDINGTON IPOTIZZA DAN IL-KUNĊETT FL-1957 MINN OSSERVAZZJONIJIET SPERIMENTALI IŻDA MINGĦAJR KEJL NUMERIKU. BĦALISSA, BIS-SAĦĦA TAL-AVVANZI FIR-RIPROGRAMMAZZJONI ĊELLULARI, DIN L-IDEA QED TIĠI RIVEDUTA. ĠEW ŻVILUPPATI MUDELLI PARZJALI ĦAFNA BI FRAMMENTI ŻGĦAR ĦAFNA TA ‘DAN IL-PAJSAĠĠ BL-UŻU TA’ DATA TA ‘ESPRESSJONI MINN SETTIJIET ŻGĦAR ĦAFNA MINN TNEJN SA INQAS MINN GĦAXAR ĠENI. MADANKOLLU, L-AMMONT KBIR TA’ DATA OMIKA DIĠÀ DISPONIBBLI FIL-BAŻIJIET TAD-DATA JOFFRI L-OPPORTUNITÀ LI JIĠU APPLIKATI TEKNIKI “BIG DATA”, BIEX WIEĦED JGĦADDI MINN SEMPLIĊI DESKRIZZJONI METAFORIKA GĦAL RIKOSTRUZZJONI NUMERIKA KOMPRENSIVA TAL-“PAJSAĠĠ WADDINGTON”. F’DAN IL-PROĠETT, SE JIĠU ŻVILUPPATI GĦODOD TAL-BIJOLOĠIJA KOMPUTAZZJONALI BIEX JIMMUDELLAW MATEMATIKAMENT IL-ĠEOMETRIJA U D-DINAMIKA TAGĦHOM B’MOD KOMPRENSIV, BILLI JINKISEB PAJSAĠĠ “TOTALI” MILL-INTEGRAZZJONI TAL-KEJL MOLEKULARI TAL-ESPRESSJONI ĠENETIKA, IL-POŻIZZJONAMENT TAL-MARKI HISTONE U METILACION TAD-DNA MIKSUBA MINN TEKNIKI “BIG DATA” MINN BAŻIJIET TAD-DATA PUBBLIĊI. _x000D_ _x000D_ din ir-RIKONSRUZZJONI TAL-WADDINGTON ‘PAISAGE’, billi tibbaża ruħha fuq l-ENTITAJIET MOLECULAR li jistgħu jitkejlu, se tippermetti li l-BAŻIJIET MOLEKULARJI TA’ DEVELOPMENT NORMALI, ta’ mard b’perturbazzjonijiet epiġenetiċi kbar bħal dawk assoċjati ma’ prattikament il-KANCER u t-tipi kollha ta’ tixjiħ (PRINCIPALMENT F’DISEASES newrodeġenerattivi) bħala estensjoni tad-DEVELOPMENT KELL. Barra minn hekk, peress li ħafna mill-ENTITAJIET molekulari jistgħu jiġu manipulati, il-kostruzzjoni mill-ġdid tal-“WADDINGTON Paisaje” tippermetti l-identifikazzjoni u “PUENTS” li tkun tfisser l-identifikazzjoni ta ‘aġenti transcry li jippermettulhom li jagħżlu l-programmar mill-ġdid CLASSIC “coctels” u jidentifikaw oħrajn ġodda. _x000D_ TIEGĦU L-APPLIKAZZJONIJIET ADDIZZJONALI TAL-PAYMENT NUMERICALI “WADDINGTON” HAWN ĠENERALI LOCALISATION FIL-“GEOGRAPHY” tal-paisaje tal-karatteristiċi bijoloġiċi tagħna li l-karatteristiċi traskritomiċi u/jew epiġenomiċi tagħhom huma magħrufa, iżda li mhumiex karatterizzati b’mod suffocatingly. APPLIKAZZJONI DOPPJA OĦRA HIJA L-IDENTIFIKAZZJONI FIL-PAJSAĠĠ TA’ REĠJUNI TA’ ESTENSJONI KONSIDEREVOLI LI ANKE JIKKOMUNIKAW TIPI ĊELLULARI MAGĦRUFA LI JEŻISTU FIL-FRUNTIERI TAGĦHOM, FIHOM ŻONI MINGĦAJR TIPI ĊELLULARI MAGĦRUFA ĠEWWA. Dawn ir-REĠJUNI jindikaw l-eżistenza possibbli ta’ TIPS KELULARJI mhux identifikati, id-data u l-identifikazzjoni tagħhom jistgħu jgħinu biex jixtru DIFFERENCE Ċelulari aħjar._x000D_x000D__x000D_ L-algoritms “BIG DATA” żviluppati f’dan il-proġett għat-tfittxija, PROĊESSING U INTREZZAZZJONI TA’ Omic distinta NATURALI DISPOŻIZZJONI TA’ Plataformi TECHNOLOGICAL CONSTITUY FL-ISEM A VERY INNOVATIVE U IMMEDAZZJONI mhux biss ċirkoskritti għall-Obbligi DATA omic GĦALL-ĠENERAZZJONI ta ‘WADDINGTON’S “Paisaje”, iżda għal kwalunkwe proġett ieħor ta ‘BIOLOGY KOMPUTAZZJONI TA’ BIOLOGY ESCAL GREAT jeħtieġu SEARCH, PROĊESSING U INTEGRAZZJONI TA DATA Omika GRATTA. HUMA GĦALHEKK APPLIKAZZJONIJIET IMMEDJATI TA ‘L-ALGORITMI “BIG DATA” HAWNHEKK ŻVILUPPATI BIJOMEDIĊINA PROĠETTI TAL-KANĊER U T-TIXJIĦ, FOST L-OĦRAJN. (Maltese)
4 August 2022
0 references
O PASSEIO EPIGENETIC DE WADDINGTON É UTILIZADO PARA ILUSTRAR O DESENVOLVIMENTO EMBRIONÓNICO, EM ESPECIAL DIFERENCIAÇÃO CELULAR. WADDINGTON HIPOTETIZOU ESTE CONCEITO EM 1957 A PARTIR DE OBSERVAÇÕES EXPERIMENTAIS, MAS SEM MEDIÇÕES NUMÉRICAS. Atualmente, graças aos avanços na reprogramação celular, esta ideia está a ser revista. MODELOS MUITO PARCIALIZADOS FORAM DESENVOLVIDOS COM MUITO PEQUENOS FRAGMENTOS DESTE TERRITÓRIO COM DADOS DE EXPRESSÃO DE MUITO PEQUENOS SETES DE DOIS A MENOS DE DEZ GÉNEROS. No entanto, o VERDADEIRO MONTANTE DE DADOS ÓMICOS JÁ DISPONIBILIZADO NAS BASES DE DADOS oferece A OPORTUNIDADE DE APLICAR TÉCNICAS DE «Grandes DADOS», DE MUDAR DA MESMA DESCRIÇÃO METÁFICA PARA UMA RECONSTRUÇÃO NUMÉRICA GLOBAL DO «PASSAMENTO DE TERRENO DE WADDINGTON». Neste projeto, as ferramentas de biologia informática serão desenvolvidas de modo a modelar matematicamente a sua geometria e dinâmica de forma abrangente, obtendo um patamar «total» a partir da integração de medições moleculares de expressão genética, posicionamento de marcações históricas e metilação de ADN obtido por técnicas de «BIG DADOS» a partir de bases de dados públicas. _x000D_ _x000D_ esta RECONSTRUÇÃO DA «PASSAGEM» DE WADDINGTON, baseando-se em ENTIDADES MOLECULARES que podem ser medidas, permitirá COMPRAR AS BASES MOLECULARES DO DESENVOLVIMENTO NORMAL, de doenças com grandes perturbações epigenéticas como as associadas a praticamente todos os tipos de CANCER e envelhecimento (PRINCIPALMENT IN NEURODEGENERATIVE DISEAS) como extensão do DESENVOLVIMENTO CELULAR. Além disso, uma vez que muitas das ENTIDADES moleculares podem ser manipuladas, a reconstrução do “WADDINGTON PAISAJE” permitiria a identificação e “PUENTES”, o que significaria a identificação de agentes transcry que lhes permitiriam optar pela reprogramação CLASSICA “COCTELS” e identificar novos. reprogramação direta VIAS PARA TRANSFORMAR UMA CÉLULA DE TIPO PARA OUTROS SEM UM ESTADO INTERMÉDIO PLURIPOTENTE._x000D_ _x000D_ ENTRE AS APLICAÇÕES ADICIONAIS DO NUMERICAL “PAGAMENTO DE WADDINGTON” GERAM A LOCALISAÇÃO NA “GEOGRAFIA” DO PAISAJE das nossas características biológicas de que são conhecidas as suas características transcriptómicas e/ou epigenómicas, mas que não são caracterizadas de forma sufocante. Outro pedido duplo é a identificação, no território das regiões, da extensão possível de que mesmo os tipos conhecidos de células existentes nas suas fronteiras contêm zonas sem tipos conhecidos de células no interior. Estas REGIÕES assinalam a possível existência de CELULARY TIPS não identificados TEM a data e a sua identificação pode ajudar a comprar melhor DIFFERENCE CELULAR._x000D__x000D__x000D_ Os ALGORITMOS “BIG DATA” desenvolvidos neste projeto para a busca, TRATAMENTO automático E INTEGRAÇÃO DE PROVENIENTES ÔMICOS DE DISTINTA NATURAL DE DISTINTA DE DADOS DE PLATAFORMAS TECNOLÓGICAS CONSTITUEM A MESMA AVANCE INOVATIVA E APLICAÇÃO PRÁTICA IMEDIATA, não só circunscritas às OBTENÇÕES ÔMICAS DE DADOS PARA A GENERAÇÃO DE WADDINGTONS “PAISAJE”, mas a qualquer outro projeto de BIOLOGIA COMPUTATIVA DE GREATAL BIOLOGY REQUIREING SEAR, PROCESSING AND INTEGRATION OF GREATATION DATAmic. SÃO, POR ISSO, APLICAÇÕES IMEDIATAS DOS ALGORÍTIMOS «Grandes DADOS» AQUI DESENVOLVIDOS PROJECTOS BIOMEDICÍNICOS DE CANCRO E ENVELHECIMENTO, ENTRE OUTROS. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
WADDINGTON'S EPIGENETISKE LANDSKAB ER EN METAFRASE, DER BRUGES TIL AT ILLUSTRERE EMBRYONISK UDVIKLING, ISÆR CELLEDIFFERENTIERING. WADDINGTON HYPOTHETISEREDE DETTE BEGREB I 1957 FRA EKSPERIMENTELLE OBSERVATIONER, MEN UDEN NUMERISKE MÅLINGER. I ØJEBLIKKET, TAKKET VÆRE FREMSKRIDT I CELLULÆR OMPROGRAMMERING, DENNE IDÉ ER VED AT BLIVE REVIDERET. MEGET PARTIELLE MODELLER ER UDVIKLET MED MEGET SMÅ FRAGMENTER AF DETTE LANDSKAB VED HJÆLP AF EKSPRESSIONSDATA FRA MEGET SMÅ SÆT FRA TO TIL MINDRE END TI GENER. MEN DEN ENORME MÆNGDE AF OMIC DATA, DER ALLEREDE ER TILGÆNGELIGE I DATABASER GIVER MULIGHED FOR AT ANVENDE "STORE DATA" TEKNIKKER, AT GÅ FRA BLOT METAFORISK BESKRIVELSE TIL EN OMFATTENDE NUMERISK REKONSTRUKTION AF "WADDINGTON LANDSKAB". I DETTE PROJEKT VIL BEREGNINGSMÆSSIGE BIOLOGIVÆRKTØJER BLIVE UDVIKLET TIL MATEMATISK AT MODELLERE DERES GEOMETRI OG DYNAMIK PÅ EN OMFATTENDE MÅDE, OPNÅ ET "TOTALT" LANDSKAB FRA INTEGRATION AF MOLEKYLÆRE MÅLINGER AF GENETISK EKSPRESSION, POSITIONERING AF HISTONEMARKERINGER OG METILACION AF DNA OPNÅET VED TEKNIKKER "STORE DATA" FRA OFFENTLIGE DATABASER. _x000D_ _x000D_ denne RECONSTRUCTION AF WADDINGTON "PAISAGE', ved at basere sig på MOLECULAR ENTITIER, der kan måles, vil gøre det muligt at BUY MOLECULAR BASES AF NORMAL DEVELOPMENT, af sygdomme med store epigenetiske forstyrrelser som dem, der er forbundet med næsten alle CANCER og aldring typer (PRINCIPALMENT I neurodegenerative DISEASES) som en forlængelse af CELL DEVELOPMENT. Hertil kommer, at da mange af de molekylære ENTITITER kan manipuleres, ville genkonstruktionen af "WADDINGTON Paisaje" muliggøre identifikation og "PUENTS", der ville betyde identifikation af transcry agenter, der gør det muligt for dem at vælge den CLASSIC omprogrammering "coctels" og identificere nye. direkte omprogrammering VIAS TIL TRANSFORM A TYPE CELL TIL ANDEN med en pluripotent INTERMEDIATE STATE._x000D_ _x000D_ _x000D_ BETWEEN THE ADDITIONAL APPLICATIONER AF DEN NUMERICAL "WADDINGTON PAYMENT" HER GENERATE LOCALISATION I "GEOGRAPHY" af vores biologiske karakteristika, som deres transkriptomiske og/eller epigenomiske egenskaber er kendt, men at de ikke er kvælende karakteriseret. EN ANDEN DOBBELT ANVENDELSE ER IDENTIFIKATIONEN I LANDSKABET AF REGIONER MED BETYDELIG UDVIDELSE, DER SELV KOMMUNIKERER KENDTE CELLETYPER, DER FINDES VED DERES GRÆNSER, INDEHOLDER ZONER UDEN KENDTE CELLETYPER INDENI. Disse REGIONS signalerer den mulige eksistens af ikke-identificerede CELULARY TIPS HAR datoen og deres identifikation kan bidrage til at købe bedre celular DIFFERENCE._x000D__x000D__x000D_ De "BIG DATA" algoritmer udviklet i dette projekt til søgning, automatisk PROCESSING OG INTEGRATION AF Omic distinta NATURAL distinta DATA PROVENENTS OF TEKNOLOGICAL plataformer KONSTITUY i dette tilfælde en meget INNOVATIVE AVANCE OG IMMEDIATE PRAKTISK APPLIKATION, ikke kun begrænset til de omic DATA iagttagelser til GENERATION AF WADDINGTON "S "Paisaje", men til ethvert andet projekt af COMPUTATIONAL BIOLOGY AF GREAT ESCAL BIOLOGY kræver SEARCH, PROCESSING OG INTEGRATION AF GREAT Omic DATA. DE ER SÅLEDES ØJEBLIKKELIGE ANVENDELSER AF DE "STORE DATA" ALGORITMER HER UDVIKLET BIOMEDICINE PROJEKTER AF KRÆFT OG ALDRING, BLANDT ANDRE. (Danish)
4 August 2022
0 references
PEISAJUL EPIGENETIC AL LUI WADDINGTON ESTE O METAFRAZĂ FOLOSITĂ PENTRU A ILUSTRA DEZVOLTAREA EMBRIONARĂ, ÎN SPECIAL DIFERENȚIEREA CELULELOR. WADDINGTON A PRESUPUS ACEST CONCEPT ÎN 1957 DIN OBSERVAȚII EXPERIMENTALE, DAR FĂRĂ MĂSURĂTORI NUMERICE. ÎN PREZENT, DATORITĂ PROGRESELOR ÎNREGISTRATE ÎN REPROGRAMAREA CELULARĂ, ACEASTĂ IDEE ESTE REVIZUITĂ. AU FOST DEZVOLTATE MODELE FOARTE PARȚIALE CU FRAGMENTE FOARTE MICI DIN ACEST PEISAJ, FOLOSIND DATE DE EXPRESIE DIN SETURI FOARTE MICI, DE LA DOUĂ PÂNĂ LA MAI PUȚIN DE ZECE GENE. CU TOATE ACESTEA, CANTITATEA VASTĂ DE DATE OMICE DEJA DISPONIBILE ÎN BAZELE DE DATE OFERĂ POSIBILITATEA DE A APLICA TEHNICI DE „DATE MARI”, PENTRU A TRECE DE LA SIMPLA DESCRIERE METAFORICĂ LA O RECONSTRUCȚIE NUMERICĂ CUPRINZĂTOARE A „PEISAJULUI WADDINGTON”. ÎN ACEST PROIECT, INSTRUMENTELE DE BIOLOGIE COMPUTAȚIONALĂ VOR FI DEZVOLTATE PENTRU A MODELA MATEMATIC GEOMETRIA ȘI DINAMICA LOR ÎNTR-UN MOD CUPRINZĂTOR, OBȚINÂND UN PEISAJ „TOTAL” DIN INTEGRAREA MĂSURĂTORILOR MOLECULARE ALE EXPRESIEI GENETICE, POZIȚIONAREA MARCAJELOR HISTONE ȘI METILACION A ADN-ULUI OBȚINUTE PRIN TEHNICI DE „MARE DATE” DIN BAZELE DE DATE PUBLICE. _x000D_ _x000D_ această RECONSTRUCȚIE DE WADDINGTON „PAISAGE”, bazându-se pe ENTITILE MOLECULARe care pot fi măsurate, va permite BASES MOLECULARĂ DE DEZVOLTARE NORMALĂ, de boli cu perturbări epigenetice mari, cum ar fi cele asociate cu practic toate tipurile de CANCER și de îmbătrânire (PRINCIPALMENT IN neurodegenerative DISEASES) ca extensie a DEVELOPMENTULUI CELL. În plus, deoarece multe dintre ENTITIES moleculare pot fi manipulate, re-construcția „WADDINGTON Paisaje” ar permite identificarea și „PUENTS” care ar însemna identificarea agenților transcrieri care le permit să opteze pentru reprogramarea CLASSIC „coctels” și să identifice altele noi. reprogramarea directă VIAS LA TRANSFORM A TIPULUI LA ALTE FĂRĂ O STAT INTERMEDIAT pluripotent._x000D_ _x000D_ AICI GENEREAZĂ LOCALIZAȚIA LOCALIZAȚIEI ÎN „GEOGRAPHY” din Paisaje ale caracteristicilor noastre biologice de care sunt cunoscute caracteristicile lor transcriminale și/sau epigenomice, dar că acestea nu sunt caracterizate sufocant. O ALTĂ APLICAȚIE DUALĂ ESTE IDENTIFICAREA ÎN PEISAJUL REGIUNILOR CU O EXTINDERE CONSIDERABILĂ CARE CHIAR ȘI COMUNICAREA TIPURILOR CELULARE CUNOSCUTE EXISTENTE LA FRONTIERELE LOR, CONȚINE ZONE FĂRĂ TIPURI CELULARE CUNOSCUTE ÎN INTERIOR. Aceste REGIUNI semnaleaza posibila existenta a TIPS CELULARY neidentificate HAS data si identificarea lor poate ajuta la cumpararea mai buna celular DIFFERENCE._x000D__x000D__x000D__x000D_ Algoritmul „BIG DATA” dezvoltat in acest proiect pentru cautare, PROCESARE automata ȘI INTEGRAREA Omic distinta NATURAL distinta DATE PROVENȚIILOR DE CALITATE TEHNOLOGICĂ CONSTITUY în SAME OERY INOVATIVE AVANCE ȘI IMMEDIATE PRACTICĂ PRLICARE, nu numai circumscrise la Obținerile de DATE Omic pentru GENERAREA WADDINGTON’S „Paisaje”, ci la orice alt proiect de BIOLOGIE COMPUTATIONALĂ DE BIOLOGIE ESCALĂ MARE care necesită SEARCH, PROCESARE ȘI INTEGRAREA DE DATE Omice Mari. PRIN URMARE, ACESTEA SUNT APLICAȚII IMEDIATE ALE ALGORITMILOR „BIG DATA” AICI AU DEZVOLTAT PROIECTE BIOMEDICINA DE CANCER ȘI ÎMBĂTRÂNIRE, PRINTRE ALTELE. (Romanian)
4 August 2022
0 references
WADDINGTONS EPIGENETISKA LANDSKAP ÄR EN METAFRAS SOM ANVÄNDS FÖR ATT ILLUSTRERA EMBRYONAL UTVECKLING, SÄRSKILT CELLDIFFERENTIERING. WADDINGTON HYPOTETISERADE DETTA KONCEPT 1957 FRÅN EXPERIMENTELLA OBSERVATIONER MEN UTAN NUMERISKA MÄTNINGAR. FÖR NÄRVARANDE, TACK VARE FRAMSTEG INOM CELLULÄR OMPROGRAMMERING, DENNA IDÉ SES ÖVER IGEN. MYCKET PARTIELLA MODELLER HAR UTVECKLATS MED MYCKET SMÅ FRAGMENT AV DETTA LANDSKAP MED HJÄLP AV UTTRYCKSDATA FRÅN MYCKET SMÅ UPPSÄTTNINGAR FRÅN TVÅ TILL MINDRE ÄN TIO GENER. MEN DEN STORA MÄNGD OMISKA DATA SOM REDAN FINNS TILLGÄNGLIGA I DATABASER GER MÖJLIGHET ATT TILLÄMPA ”STORDATA”-TEKNIKER, ATT GÅ FRÅN ENBART METAFORISK BESKRIVNING TILL EN OMFATTANDE NUMERISK REKONSTRUKTION AV ”WADDINGTON-LANDSKAPET”. I DETTA PROJEKT KOMMER BERÄKNINGSBIOLOGIVERKTYG ATT UTVECKLAS FÖR ATT MATEMATISKT MODELLERA SIN GEOMETRI OCH DYNAMIK PÅ ETT HELTÄCKANDE SÄTT, FÅ ETT ”TOTALT” LANDSKAP GENOM INTEGRERING AV MOLEKYLÄRA MÄTNINGAR AV GENETISKA UTTRYCK, POSITIONERING AV HISTONMARKERINGAR OCH METILACION AV DNA SOM ERHÅLLS GENOM TEKNIKER ”STORA DATA” FRÅN OFFENTLIGA DATABASER. _x000D_ _x000D_ denna RECONSTRUCTION OF WADDINGTON ’PAISAGE’, genom att basera sig på MOLEKULAR-ENTITIES som kan mätas, kommer att göra det möjligt att BUY MOLECULAR BASES OF NORMAL DEVELOPMENT, av sjukdomar med stora epigenetiska störningar som de som förknippas med praktiskt taget alla CANCER och åldrandetyper (PRINCIPALMENT I neurodegenerativa DISEASES) som en förlängning av CELL DEVELOPMENT. Dessutom, eftersom många av de molekylära ENTITIES kan manipuleras, skulle omkonstruktionen av ”WADDINGTON Paisaje” möjliggöra identifiering och ”PUENTS” som skulle innebära identifiering av transcry medel som gör det möjligt för dem att välja den KLASSIC omprogrammering ”coctels” och identifiera nya. direkt programmering VIAS TILL TRANSFORM A TYPE CELL TILL ANDRA UTAN en pluripotent INTERMEDIATE STATE._x000D_ _x000D_ _x000D_ BETWEEN THE ADDITIONAL APPLICATIONER OF THE NUMERICAL ”WADDINGTON PAYMENT” HÄR GENERATE THE LOCALISATIONEN I Paisajes ”GEOGRAPHY” av våra biologiska egenskaper, vars transkriptomiska och/eller epigenomiska egenskaper är kända, men att de inte kvävs på ett kvävande sätt. EN ANNAN DUBBEL TILLÄMPNING ÄR IDENTIFIERINGEN I LANDSKAPET AV REGIONER MED BETYDANDE UTVIDGNING SOM TILL OCH MED KOMMUNICERAR KÄNDA CELLULÄRA TYPER SOM FINNS VID DERAS GRÄNSER, INNEHÅLLER ZONER UTAN KÄNDA CELLTYPER INUTI. Dessa REGIONER signalerar den eventuella förekomsten av icke-identifierade TIPS HAR datumet och deras identifiering kan bidra till att köpa bättre celulära DIFFERENCE._x000D__x000D__x000D_ De ”BIG DATA” algoritmer som utvecklats i detta projekt för sökning, automatisk PROCESSING OCH INTEGRATION AV Omic distinta NATURAL distinta DATA PROVENENTS OF TECHNOLOGICAL plataforms CONSTITUY I SAME AVERY INNOVATIVE AVANCE OCH IMMEDIATE PRACTICAL APPLICATION, inte bara begränsad till den omiska DATA Obtentions FOR THE GENERATION OF WADDINGTON’s ”Paisaje”, utan till något annat projekt av COMPUTATIONAL BIOLOGY OF GREAT ESCAL BIOLOGY som kräver SÖK, PROCESSING OCH INTEGRATION AV GREAT Omic DATA. DE ÄR SÅLEDES OMEDELBARA TILLÄMPNINGAR AV DE ”STORA DATA” ALGORITMER HÄR UTVECKLAT BIOMEDICIN PROJEKT AV CANCER OCH ÅLDRANDE, BLAND ANNAT. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Donostia/San Sebastián
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
BFU2016-77987-P
0 references