Study of the alteration of the respiratory microbiome in patients with severe community-acquired pneumonia and its relationship with inflammation biomarkers (Q3139297)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3139297 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Study of the alteration of the respiratory microbiome in patients with severe community-acquired pneumonia and its relationship with inflammation biomarkers |
Project Q3139297 in Spain |
Statements
41,926.5 Euro
0 references
77,000.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2018
0 references
31 March 2021
0 references
ASOCIACION INSTITUTO BIODONOSTIA
0 references
Proyecto coordinado interdisciplinar, en el que los objetivos del subproyecto Microbioma son: Principales. 1) Caracterizar y comparar la diversidad del microbioma del tracto respiratorio inferior de pacientes con neumonía comunitaria grave que requieran ventilación mecánica con la de pacientes control sin patología respiratoria infecciosa. 2) Establecer la relación de los diferentes niveles de biomarcadores séricos con el microbioma respiratorio en pacientes con neumonía grave. Secundarios. 3) Comparar el microbioma respiratorio entre pacientes con neumonía viral y bacteriana y en el transcurso de la infección. 4) Determinar la etiología y el papel diagnóstico de las nuevas técnicas de NGS en pacientes con neumonía grave. 5) Analizar el valor de las técnicas moleculares en el diagnóstico de la neumonía grave en el paciente con tratamiento antibiótico previo. Para ello se estudiará el microbioma respiratorio del mini-lavado broncoalveolar de 50 pacientes con neumonía adquirida en la comunidad con ventilación mecánica y de 20 pacientes control utilizando la plataforma de Ion Torrent y el kit ION 16S METAGENOMICS KIT (Life Technologies). A los mismos pacientes se les realizará comparativamente un diagnostico microbiológico exhaustivo con técnicas rutinarias: cultivo bacteriano y de hongos, detección de virus mediante PCR específica, detección de antígenos de neumococo y Legionella en orina. Este estudio aportará información sobre las modificaciones del microbioma respiratorio en la neumonía comunitaria grave, en función de su origen bacteriano y viral, mejorará la capacidad diagnóstica actual de la neumonía y permitirá confirmar o diseñar nuevas estrategias empíricas a incluir en las guías clínicas de tratamiento antibiótico. (Spanish)
0 references
Coordinated interdisciplinary project, in which the objectives of the Microbioma subproject are: The main ones. 1) Characterise and compare the diversity of the microbiome of the lower respiratory tract of patients with severe community pneumonia requiring mechanical ventilation with that of control patients without infectious respiratory disease. 2) To establish the relationship between the different levels of serum biomarkers and the respiratory microbiome in patients with severe pneumonia. Secondary school. 3) Compare the respiratory microbiome between patients with viral and bacterial pneumonia and in the course of infection. 4) Determine the etiology and diagnostic role of new NGS techniques in patients with severe pneumonia. 5) Analyse the value of molecular techniques in the diagnosis of severe pneumonia in the patient with previous antibiotic treatment. The respiratory microbiome of bronchoalveolar mini-washing will be studied in 50 patients with community-acquired pneumonia with mechanical ventilation and 20 control patients using the Ion Torrent platform and the ION 16S metagenomics KIT (Life Technologies) kit. The same patients will receive a comparatively comprehensive microbiological diagnosis with routine techniques: bacterial and fungal culture, virus detection by specific PCR, detection of pneumococcal antigens and Legionella in urine. This study will provide information on changes in the respiratory microbiome in severe community pneumonia, depending on its bacterial and viral origin, will improve the current diagnostic capacity of pneumonia and will confirm or design new empirical strategies to be included in antibiotic treatment clinical guidelines. (English)
12 October 2021
0.6180735326759278
0 references
Projet interdisciplinaire coordonné, dans lequel les objectifs du sous-projet microbiome sont: Les principaux. 1) Caractériser et comparer la diversité du microbiome des voies respiratoires inférieures des patients atteints de pneumonie communautaire sévère nécessitant une ventilation mécanique avec celle des patients témoins sans maladie respiratoire infectieuse. 2) Établir la relation entre les différents niveaux de biomarqueurs sériques et le microbiome respiratoire chez les patients atteints de pneumonie sévère. L’école secondaire. 3) Comparer le microbiome respiratoire entre les patients atteints de pneumonie virale et bactérienne et en cours d’infection. 4) Déterminer le rôle étiologique et diagnostique des nouvelles techniques NGS chez les patients atteints de pneumonie sévère. 5) Analyser la valeur des techniques moléculaires dans le diagnostic de pneumonie sévère chez le patient avec un traitement antibiotique antérieur. Le microbiome respiratoire du mini-lavage bronchoalvéolaire sera étudié chez 50 patients atteints de pneumonie communautaire avec ventilation mécanique et 20 patients témoins utilisant la plate-forme Ion Torrent et le kit de métagénomique ION 16S (Life Technologies). Les mêmes patients recevront un diagnostic microbiologique relativement complet avec des techniques de routine: culture bactérienne et fongique, détection de virus par PCR spécifique, détection d’antigènes pneumococciques et de Legionella dans les urines. Cette étude fournira de l’information sur les changements du microbiome respiratoire dans la pneumonie communautaire sévère, en fonction de son origine bactérienne et virale, améliorera la capacité diagnostique actuelle de la pneumonie et confirmera ou élaborera de nouvelles stratégies empiriques à inclure dans les lignes directrices cliniques de traitement antibiotique. (French)
2 December 2021
0 references
Koordiniertes interdisziplinäres Projekt, in dem die Ziele des Mikrobioma-Teilprojekts sind: Die wichtigsten. 1) Charakterisieren und vergleichen Sie die Vielfalt des Mikrobioms der unteren Atemwege von Patienten mit schwerer Lungenentzündung in der Gemeinschaft, die eine mechanische Belüftung mit der der Kontrollpatienten ohne infektiöse Atemwegserkrankungen erfordern. 2) Die Beziehung zwischen den verschiedenen Ebenen von Serumbiomarkern und dem Atemmikrobiom bei Patienten mit schwerer Lungenentzündung herzustellen. Sekundarschule. 3) Vergleichen Sie das Atemmikrobiom zwischen Patienten mit viraler und bakterieller Lungenentzündung und im Verlauf der Infektion. 4) Bestimmung der Ätiologie und der diagnostischen Rolle neuer NGS-Techniken bei Patienten mit schwerer Lungenentzündung. 5) Analyse des Wertes molekularer Techniken bei der Diagnose schwerer Lungenentzündung beim Patienten mit vorheriger Antibiotikabehandlung. Das Atemmikrobiom von Bronchoalveolar Mini-Waschung wird bei 50 Patienten mit an der Gemeinschaft erworbener Pneumonie mit mechanischer Belüftung und 20 Kontrollpatienten mit der Ion Torrent Plattform und dem ION 16S metagenomics KIT (Life Technologies)-Kit untersucht. Dieselben Patienten erhalten eine vergleichsweise umfassende mikrobiologische Diagnose mit Routinetechniken: Bakterien- und Pilzkultur, Virendetektion durch spezifische PCR, Nachweis von Pneumokokcal-Antigenen und Legionellen im Urin. Diese Studie wird Informationen über Veränderungen des Atemmikrobioms bei schwerer Lungenentzündung in der Gemeinschaft liefern, die je nach ihrem bakteriellen und viralen Ursprung die derzeitige diagnostische Leistungsfähigkeit der Lungenentzündung verbessern und neue empirische Strategien bestätigen oder entwickeln, die in die klinischen Leitlinien für die Antibiotikabehandlung aufgenommen werden sollen. (German)
9 December 2021
0 references
Gecoördineerd interdisciplinair project, waarin de doelstellingen van het subproject microbioma zijn: De belangrijkste. 1) Karakter en vergelijk de diversiteit van het microbioom van de onderste luchtwegen van patiënten met ernstige gemeenschapspneumonie die mechanische ventilatie vereisen met die van controlepatiënten zonder infectieuze ademhalingsziekte. 2) Het verband tussen de verschillende niveaus van serumbiomarkers en het respiratoire microbiome bij patiënten met ernstige longontsteking vast te stellen. Middelbare school. 3) Vergelijk het respiratoire microbiome tussen patiënten met virale en bacteriële pneumonie en in de loop van infectie. 4) Bepaal de etiologie en de diagnostische rol van nieuwe NGS-technieken bij patiënten met ernstige longontsteking. 5) Analyseer de waarde van moleculaire technieken in de diagnose van ernstige pneumonie bij de patiënt met eerdere antibioticabehandeling. De respiratoire microbioom van bronchoalveolar mini-wassing zal worden onderzocht bij 50 patiënten met een door de gemeenschap verworven pneumonie met mechanische ventilatie en 20 controlepatiënten met behulp van het Ion Torrent-platform en de ION 16S metagenomics KIT (Life Technologies) kit. Dezelfde patiënten krijgen een relatief uitgebreide microbiologische diagnose met routinetechnieken: bacterie- en schimmelcultuur, virusdetectie door specifieke PCR, detectie van pneumokokkenantigenen en Legionella in urine. Dit onderzoek zal informatie verschaffen over veranderingen in het respiratoire microbioom bij ernstige gemeenschapspneumonie, afhankelijk van de bacteriële en virale oorsprong ervan, zal de huidige diagnostische capaciteit van pneumonie verbeteren en zal nieuwe empirische strategieën bevestigen of ontwerpen die moeten worden opgenomen in de klinische richtlijnen voor antibioticabehandeling. (Dutch)
17 December 2021
0 references
Progetto interdisciplinare coordinato, in cui gli obiettivi del sottoprogetto microbioma sono: Quelli principali. 1) Caratterizzare e confrontare la diversità del microbioma del tratto respiratorio inferiore dei pazienti con polmonite di comunità grave che richiedono ventilazione meccanica con quella dei pazienti di controllo senza malattie respiratorie infettive. 2) stabilire la relazione tra i diversi livelli di biomarcatori sierici e il microbioma respiratorio in pazienti con polmonite grave. Scuola secondaria. 3) Confrontare il microbioma respiratorio tra i pazienti con polmonite virale e batterica e nel corso dell'infezione. 4) Determinare l'eziologia e il ruolo diagnostico delle nuove tecniche NGS in pazienti con polmonite grave. 5) Analizzi il valore delle tecniche molecolari nella diagnosi di polmonite grave nel paziente con trattamento antibiotico precedente. Il microbioma respiratorio del minilavaggio broncoalveolare sarà studiato in 50 pazienti con polmonite acquisita in comunità con ventilazione meccanica e 20 pazienti di controllo utilizzando la piattaforma Ion Torrent e il kit ION 16S metagenomics KIT (Life Technologies). Gli stessi pazienti riceveranno una diagnosi microbiologica relativamente completa con tecniche di routine: coltura batterica e fungina, individuazione del virus mediante PCR specifica, rilevamento di antigeni pneumococcici e Legionella nelle urine. Questo studio fornirà informazioni sui cambiamenti nel microbioma respiratorio nella polmonite grave della comunità, a seconda della sua origine batterica e virale, migliorerà l'attuale capacità diagnostica della polmonite e confermerà o definirà nuove strategie empiriche da includere nelle linee guida cliniche per il trattamento degli antibiotici. (Italian)
16 January 2022
0 references
Koordineeritud interdistsiplinaarne projekt, milles mikrobioomi allprojekti eesmärgid on: Kõige tähtsamad. 1) Kirjeldage ja võrdlege mehhaanilist ventileerimist nõudva raske kogukonna kopsupõletikuga patsientide alumiste hingamisteede mikrobioomi mitmekesisust kontrollpatsientidega, kellel ei ole nakkuslikku respiratoorset haigust. 2) määrata kindlaks seos seerumi biomarkerite ja respiratoorse mikrobioomi erinevate tasemete vahel raske kopsupõletikuga patsientidel. Gümnaasium. 3) Võrrelge hingamisteede mikrobioomi viirusliku ja bakteriaalse kopsupõletikuga patsientide vahel ning infektsiooni ajal. 4) Määrata uute NGS-tehnikate etioloogia ja diagnostiline roll raske kopsupõletikuga patsientidel. 5) Analüüsige molekulaartehnikate väärtust raske kopsupõletiku diagnoosimisel varasema antibiootikumravi saanud patsiendil. Bronhoalveolaarse minipesu respiratoorset mikrobioomi uuritakse 50-l mehhaanilise ventilatsiooniga kogukonna põhjustatud pneumooniaga patsiendil ja 20-l Ion Torrenti platvormi ja ION 16S metagenomics KIT (Life Technologies) komplekti kasutades 20 kontrollpatsiendil. Samad patsiendid saavad suhteliselt põhjaliku mikrobioloogilise diagnoosi koos rutiinsete meetoditega: bakteriaalne ja seenkultuur, viiruse tuvastamine spetsiifilise PCR-meetodi abil, pneumokoki antigeenide ja Legionella tuvastamine uriinis. See uuring annab teavet hingamisteede mikrobioomi muutuste kohta raske kogukonna kopsupõletiku korral, sõltuvalt selle bakteriaalsest ja viiruslikust päritolust, parandab kopsupõletiku praegust diagnostikavõimet ning kinnitab või kujundab uusi empiirilisi strateegiaid, mis lisatakse antibiootikumravi kliinilistesse suunistesse. (Estonian)
4 August 2022
0 references
Koordinuojamas tarpdisciplininis projektas, kurio tikslai yra šie: Pagrindiniai. 1) Apibūdinkite ir palyginkite pacientų, sergančių sunkia bendruomenės pneumonija, reikalaujančia mechaninio vėdinimo, apatinių kvėpavimo takų mikrobiomą su kontrolės pacientais be infekcinės kvėpavimo ligos. 2) Nustatyti ryšį tarp skirtingų serumo biologinių žymenų ir kvėpavimo mikrobiomų pacientams, sergantiems sunkia pneumonija. Vidurinė mokykla. 3) Palyginti kvėpavimo mikrobiomą tarp pacientų, sergančių virusine ir bakterine pneumonija, ir infekcijos metu. 4) Nustatykite naujų NGS metodų etiologiją ir diagnostinį vaidmenį pacientams, sergantiems sunkia pneumonija. 5) Analizuokite molekulinių metodų vertę diagnozuojant sunkią pneumoniją pacientui su ankstesniu antibiotikų gydymu. Bronchoalveolinio mikrobiomo mikrobiomas bus tiriamas 50 pacientų, sergančių bendruomenėje įgyta pneumonija su mechanine ventiliacija, ir 20 kontrolinių pacientų, naudojančių Ion Torrent platformą ir ION 16S metagenomikos KIT (Life Technologies) rinkinį. Tiems patiems pacientams bus atliekama palyginti išsami mikrobiologinė diagnozė taikant įprastus metodus: bakterinė ir grybelinė kultūra, virusų nustatymas taikant specifinę PGR, pneumokokų antigenų ir legionelių nustatymas šlapime. Šis tyrimas suteiks informacijos apie kvėpavimo mikrobiomo pokyčius sunkios bendruomenės pneumonijoje, priklausomai nuo bakterinės ir virusinės kilmės, pagerins dabartinį pneumonijos diagnostikos pajėgumą ir patvirtins arba sukurs naujas empirines strategijas, kurios turi būti įtrauktos į gydymo antibiotikais klinikines gaires. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
Koordinirani interdisciplinarni projekt u kojem su ciljevi potprojekta mikrobioma: One glavne. 1) Karakterizirati i usporediti raznolikost mikrobioma donjeg respiratornog trakta bolesnika s teškom pneumonije zajednice koja zahtijeva mehaničku ventilaciju s onom kontrolnih bolesnika bez zarazne respiratorne bolesti. 2) utvrditi odnos između različitih razina serumskih biomarkera i respiratornog mikrobioma u bolesnika s teškom upalom pluća. Srednja škola. 3) Usporedite respiratorni mikrobiom između bolesnika s virusnom i bakterijsku upalu pluća i tijekom infekcije. 4) Odredite etiologiju i dijagnostičku ulogu novih NGS tehnika u bolesnika s teškom upalom pluća. 5) Analizirajte vrijednost molekularnih tehnika u dijagnozi teške upale pluća u bolesnika s prethodnim antibiotskim liječenjem. Respiratorni mikrobiom bronhoalveolarnog mini-pranja ispitat će se u 50 bolesnika s pneumonijama stečenima u zajednici s mehaničkom ventilacijom i 20 kontrolnih bolesnika koji koriste platformu Ion Torrent i komplet za metagenomics KIT (Life Technologies) ION 16S. Isti bolesnici će dobiti relativno sveobuhvatnu mikrobiološkoj dijagnozi s rutinskim tehnikama: bakterijska i gljivična kultura, otkrivanje virusa posebnim PCR-om, otkrivanje pneumokoknih antigena i Legionele u mokraći. Ova studija će pružiti informacije o promjenama respiratornog mikrobioma u teškoj pneumoniji u zajednici, ovisno o bakterijalnom i virusnom podrijetlu, poboljšat će trenutni dijagnostički kapacitet upale pluća te će potvrditi ili osmisliti nove empirijske strategije koje će biti uključene u kliničke smjernice za liječenje antibiotika. (Croatian)
4 August 2022
0 references
Συντονισμένο διεπιστημονικό έργο, στο οποίο οι στόχοι του υποέργου μικροβιώματος είναι: Τα κυριότερα. 1) Χαρακτηρίστε και συγκρίνετε την ποικιλομορφία του μικροβιώματος της κατώτερης αναπνευστικής οδού των ασθενών με σοβαρή πνευμονία της κοινότητας που απαιτούν μηχανικό αερισμό με εκείνη των ασθενών ελέγχου χωρίς λοιμώδη αναπνευστική νόσο. 2) Για να καθοριστεί η σχέση μεταξύ των διαφόρων επιπέδων βιοδεικτών ορού και του αναπνευστικού μικροβιώματος σε ασθενείς με σοβαρή πνευμονία. Σχολείο δευτεροβάθμιας εκπαίδευσης. 3) Σύγκριση του αναπνευστικού μικροβιώματος μεταξύ ασθενών με ιογενή και βακτηριακή πνευμονία και κατά τη διάρκεια της λοίμωξης. 4) Καθορίστε την αιτιολογία και τον διαγνωστικό ρόλο των νέων τεχνικών NGS σε ασθενείς με σοβαρή πνευμονία. 5) Αναλύστε την αξία των μοριακών τεχνικών στη διάγνωση της σοβαρής πνευμονίας στον ασθενή με προηγούμενη αντιβιοτική θεραπεία. Το αναπνευστικό μικροβιακό μικροβιακό μίνι πλύσιμο θα μελετηθεί σε 50 ασθενείς με πνευμονία από την κοινότητα με μηχανικό εξαερισμό και 20 ασθενείς ελέγχου χρησιμοποιώντας την πλατφόρμα Ion Torrent και το κιτ μεταβολικής KIT 16S (Life Technologies). Οι ίδιοι ασθενείς θα λάβουν μια συγκριτικά ολοκληρωμένη μικροβιολογική διάγνωση με τεχνικές ρουτίνας: βακτηριακή και μυκητιασική καλλιέργεια, ανίχνευση ιών με ειδική PCR, ανίχνευση πνευμονιοκοκκικών αντιγόνων και Legionella στα ούρα. Η μελέτη αυτή θα παράσχει πληροφορίες σχετικά με τις μεταβολές του αναπνευστικού μικροβιώματος στη σοβαρή κοινοτική πνευμονία, ανάλογα με τη βακτηριακή και ιογενή καταγωγή του, θα βελτιώσει την τρέχουσα διαγνωστική ικανότητα της πνευμονίας και θα επιβεβαιώσει ή θα σχεδιάσει νέες εμπειρικές στρατηγικές που θα συμπεριληφθούν στις κλινικές κατευθυντήριες γραμμές για τη θεραπεία με αντιβιοτικά. (Greek)
4 August 2022
0 references
Koordinovaný interdisciplinárny projekt, v ktorom ciele čiastkového projektu mikrobioma sú: Tie hlavné. 1) Charakterizovať a porovnať rozmanitosť mikrobiómu dolných dýchacích ciest u pacientov so závažnou pneumóniou v komunite vyžadujúcou mechanickú ventiláciu s ventiláciou kontrolných pacientov bez infekčného respiračného ochorenia. 2) Na stanovenie vzťahu medzi rôznymi hladinami sérových biomarkerov a respiračného mikrobiómu u pacientov so závažnou pneumóniou. Stredná škola. 3) Porovnajte respiračný mikrobióm medzi pacientmi s vírusovou a bakteriálnou pneumóniou a v priebehu infekcie. 4) Určte etiológiu a diagnostickú úlohu nových techník NGS u pacientov so závažnou pneumóniou. 5) Analyzujte hodnotu molekulárnych techník pri diagnostike ťažkej pneumónie u pacienta s predchádzajúcou antibiotickou liečbou. Respiračný mikrobióm bronchoalveolárneho miniumývania sa bude skúmať u 50 pacientov s pneumóniou získanou v komunite s mechanickou ventiláciou a u 20 kontrolných pacientov používajúcich platformu Ion Torrent a súpravu ION 16S metagenomics KIT (Life Technologies). Tí istí pacienti dostanú porovnateľne komplexnú mikrobiologickú diagnózu s rutinnými technikami: bakteriálna a plesňová kultúra, detekcia vírusu špecifickou PCR, detekcia pneumokokových antigénov a Legionella v moči. Táto štúdia poskytne informácie o zmenách respiračného mikrobiómu v ťažkej pneumónii v komunite v závislosti od jeho bakteriálneho a vírusového pôvodu, zlepší súčasnú diagnostickú kapacitu pneumónie a potvrdí alebo navrhne nové empirické stratégie, ktoré majú byť zahrnuté do klinických usmernení pre liečbu antibiotík. (Slovak)
4 August 2022
0 references
Koordinoitu monialainen hanke, jossa mikrobioma-alahankkeen tavoitteet ovat: Tärkeimmät. 1) Karakterisoi ja vertaa mikrobiomin monimuotoisuutta alahengitysteiden monimuotoisuutta potilailla, joilla on vaikea keuhkokuume, joka vaatii mekaanista ilmanvaihtoa, ja verrokkipotilaiden, joilla ei ole tarttuvaa hengitystiesairauksia. 2) seerumin biologisten merkkiaineiden eri pitoisuuksien ja hengitysteiden mikrobiomin välisen suhteen määrittäminen vaikeaa keuhkokuumetta sairastavilla potilailla. Lukio. 3) Vertaa hengitysteiden mikrobiomia potilailla, joilla on virus- ja bakteerikeuhkokuume ja infektion aikana. 4) Määritä uusien NGS-tekniikoiden etiologia ja diagnostinen rooli vaikeaa keuhkokuumetta sairastavilla potilailla. 5) Analysoi molekyylitekniikoiden arvoa vaikean keuhkokuumeen diagnosoinnissa potilaalla, jolla on aiempi antibioottihoito. Bronkoalveolaarisen minipesun hengitysmikrobiimiä tutkitaan 50 potilaalla, joilla on avoperäinen keuhkokuume, jolla on mekaaninen ilmanvaihto, ja 20 verrokkipotilaalla, jotka käyttävät Ion Torrent -alustaa ja ION 16S metagenomics KIT (Life Technologies) -pakkausta. Samat potilaat saavat suhteellisen kattavan mikrobiologisen diagnoosin, jossa käytetään rutiinitekniikoita: bakteeri- ja sieniviljelmä, viruksen osoittaminen spesifisen PCR:n avulla, pneumokokkiantigeenien ja legionellan osoittaminen virtsasta. Tästä tutkimuksesta saadaan tietoa hengitysteiden mikrobiomin muutoksista vaikeassa yhteisön keuhkokuumeessa sen bakteeri- ja virusperän mukaan, parannetaan keuhkokuumeen nykyistä diagnostista kapasiteettia ja vahvistetaan tai suunnitellaan uusia empiirisiä strategioita, jotka sisällytetään antibioottihoidon kliinisiin ohjeisiin. (Finnish)
4 August 2022
0 references
Skoordynowany interdyscyplinarny projekt, w którym cele podprojektu mikrobioma są następujące: Te główne. 1) Charakteryzuj i porównuj różnorodność mikrobiomu dolnych dróg oddechowych pacjentów z ciężkim zapaleniem płuc społecznościowym wymagającym wentylacji mechanicznej z wentylacją kontrolną pacjentów bez zakaźnych chorób układu oddechowego. 2) W celu ustalenia związku między różnymi poziomami biomarkerów w surowicy i mikrobiomem układu oddechowego u pacjentów z ciężkim zapaleniem płuc. W szkole średniej. 3) Porównaj mikrobiom oddechowy między pacjentami z wirusowym i bakteryjnym zapaleniem płuc oraz w trakcie infekcji. 4) Określ etiologię i rolę diagnostyczną nowych technik NGS u pacjentów z ciężkim zapaleniem płuc. 5) Analiza wartości technik molekularnych w diagnostyce ciężkiego zapalenia płuc u pacjenta z poprzednim leczeniem antybiotykiem. Mikrobiom oddechowy mini mycia oskrzelowo-pęcherzowego będzie badany u 50 pacjentów z zapaleniem płuc uzyskanym przez społeczność z wentylacją mechaniczną i 20 pacjentami kontrolnymi za pomocą platformy Ion Torrent i zestawu ION 16S metagenomics KIT (Life Technologies). Ci sami pacjenci otrzymają stosunkowo kompleksową diagnostykę mikrobiologiczną z zastosowaniem rutynowych technik: hodowla bakterii i grzybów, wykrywanie wirusów za pomocą specyficznego PCR, wykrywanie antygenów pneumokokowych i Legionella w moczu. Badanie to dostarczy informacji na temat zmian w mikrobiomie oddechowym w ciężkim wspólnotowym zapaleniu płuc, w zależności od jego pochodzenia bakteryjnego i wirusowego, poprawi obecną zdolność diagnostyczną zapalenia płuc i potwierdzi lub zaprojektuje nowe strategie empiryczne, które mają zostać uwzględnione w wytycznych klinicznych dotyczących leczenia antybiotykami. (Polish)
4 August 2022
0 references
Összehangolt interdiszciplináris projekt, amelyben a mikrobióma alprojekt célkitűzései a következők: A legfontosabbakat. 1) Jellemezze és hasonlítsa össze a mechanikus szellőzést igénylő súlyos közösségi tüdőgyulladásban szenvedő betegek alsó légúti mikrobiomjának sokféleségét a fertőző légzőszervi betegséggel nem rendelkező kontroll betegekével. 2) Súlyos tüdőgyulladásban szenvedő betegeknél a szérum biomarkerek különböző szintjei és a légző mikrobióm közötti kapcsolat megállapítása. A középiskolában. 3) Hasonlítsa össze a légzőszervi mikrobiomot a vírusos és bakteriális tüdőgyulladásban szenvedő betegek és a fertőzés során. 4) Határozza meg az új NGS technikák etiológiáját és diagnosztikai szerepét súlyos tüdőgyulladásban szenvedő betegeknél. 5) elemezze a molekuláris technikák értékét a súlyos tüdőgyulladás diagnózisában a korábbi antibiotikumos kezelésben. A bronchoalveolar mini-mosás légző mikrobiómját 50, mechanikus lélegeztetésű, közösségben szerzett tüdőgyulladásban szenvedő betegnél, valamint 20 kontroll betegnél tanulmányozzák az Ion Torrent platformot és az ION 16S metagenomics KIT (Life Technologies) készletet használva. Ugyanazok a betegek kapnak viszonylag átfogó mikrobiológiai diagnózist rutinszerű technikákkal: bakteriális és gombás tenyészet, vírus kimutatása specifikus PCR-rel, pneumococcus antigének és Legionella kimutatása a vizeletben. Ez a tanulmány információt nyújt a súlyos közösségi tüdőgyulladás légzőszervi mikrobiómájának változásairól, attól függően, hogy bakteriális és vírusos eredetű-e, javítja a tüdőgyulladás jelenlegi diagnosztikai kapacitását, és megerősíti vagy megtervezi az antibiotikum-kezelésre vonatkozó klinikai iránymutatásokba foglalandó új empirikus stratégiákat. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
Koordinovaný interdisciplinární projekt, v jehož rámci jsou cíle dílčího projektu mikrobioma: Ty hlavní. 1) charakterizovat a porovnat rozmanitost mikrobiomu dolních cest dýchacích pacientů s těžkou komunitní pneumonií vyžadující mechanické větrání s kontrolními pacienty bez infekčních respiračních onemocnění. 2) Pro stanovení vztahu mezi různými hladinami biomarkerů v séru a respiračního mikrobiomu u pacientů se závažnou pneumonií. Střední škola. 3) Porovnejte respirační mikrobiom mezi pacienty s virovou a bakteriální pneumonií a v průběhu infekce. 4) Určete etiologii a diagnostickou roli nových NGS technik u pacientů se závažnou pneumonií. 5) Analyzujte hodnotu molekulárních technik v diagnostice těžké pneumonie u pacienta s předchozí léčbou antibiotiky. Respirační mikrobiom bronchoalveolárního minimytí bude studován u 50 pacientů s komunitní pneumonií s mechanickou ventilací a 20 kontrolními pacienty pomocí platformy Ion Torrent a sady ION 16S metagenomics KIT (Life Technologies). Stejní pacienti obdrží poměrně komplexní mikrobiologickou diagnózu s rutinními technikami: bakteriální a houbová kultura, detekce viru specifickým PCR, detekce pneumokokových antigenů a Legionella v moči. Tato studie poskytne informace o změnách respiračního mikrobiomu u závažné komunitní pneumonie v závislosti na jeho bakteriálním a virovém původu, zlepší současnou diagnostickou kapacitu pneumonie a potvrdí nebo navrhne nové empirické strategie, které budou zahrnuty do klinických pokynů k léčbě antibiotik. (Czech)
4 August 2022
0 references
Koordinēts starpdisciplinārs projekts, kurā mikrobiomas apakšprojekta mērķi ir: Galvenās. 1) raksturojiet un salīdziniet apakšējo elpošanas ceļu mikrobioma daudzveidību pacientiem ar smagu kopienas pneimoniju, kam nepieciešama mehāniska ventilācija, ar kontroles pacientiem bez infekcijas elpceļu slimībām. 2) Noteikt saistību starp dažādiem seruma biomarķieru līmeņiem un elpošanas mikrobiomu pacientiem ar smagu pneimoniju. Vidusskola. 3) Salīdziniet elpošanas mikrobiomu starp pacientiem ar vīrusu un bakteriālu pneimoniju un infekcijas gaitā. 4) Noteikt jauno NGS metožu etioloģiju un diagnostikas lomu pacientiem ar smagu pneimoniju. 5) Analizē molekulāro metožu vērtību smagas pneimonijas diagnostikā pacientam ar iepriekšēju antibiotiku ārstēšanu. Bronhoalveolārās minimazgāšanas elpošanas mikrobiomu pētīs 50 pacientiem ar sabiedrībā iegūtu pneimoniju ar mehānisku ventilāciju un 20 kontroles pacientiem, izmantojot Ion Torrent platformu un ION 16S metagenomikas KIT (Life Technologies) komplektu. Tie paši pacienti saņems salīdzinoši visaptverošu mikrobioloģisko diagnozi ar ikdienas metodēm: baktēriju un sēnīšu kultūra, vīrusa noteikšana ar specifisku PĶR, pneimokoku antigēnu un Legionella noteikšana urīnā. Šis pētījums sniegs informāciju par izmaiņām elpošanas mikrobiomā smagas kopienas pneimonijas, atkarībā no tā baktēriju un vīrusu izcelsmes, uzlabos pašreizējo pneimonijas diagnostikas spēju un apstiprinās vai izstrādās jaunas empīriskās stratēģijas, kas jāiekļauj antibiotiku ārstēšanas klīniskajās vadlīnijās. (Latvian)
4 August 2022
0 references
Tionscadal idirdhisciplíneach comhordaithe, ina bhfuil cuspóirí an fhothionscadail Microbioma: Na cinn is mó. 1) Saintréith agus comparáid a dhéanamh ar éagsúlacht an microbiome an chonair riospráide níos ísle na n-othar a bhfuil niúmóine pobail dian a éilíonn aeráil mheicniúil le hothair rialaithe gan galar riospráide tógálach. 2) Chun an gaol idir na leibhéil éagsúla de biomarkers serum agus an microbiome riospráide in othair a bhfuil niúmóine dian a bhunú. Meánscoil. 3) Déan comparáid idir an microbiome riospráide idir othair a bhfuil niúmóine víreasach agus baictéarach acu agus le linn ionfhabhtaithe. 4) A chinneadh ról etiology agus diagnóiseach na dteicnící nua NGS in othair a bhfuil niúmóine dian acu. 5) Déan anailís ar luach na dteicnící móilíneacha i ndiagnóis niúmóine dian san othar le cóireáil antaibheathach roimhe seo. Déanfar staidéar ar an microbiome riospráide de mhion-níocháin bronchoalveolar i 50 othar a bhfuil niúmóine faighte ag an bpobal le haeráil mheicniúil agus 20 othar rialaithe ag baint úsáide as an ardán ian Torrent agus an trealamh ION 16S metagenomics KIT (Teicneolaíochtaí Saoil). Gheobhaidh na hothair chéanna diagnóis mhicribhitheolaíoch réasúnta cuimsitheach le gnáththeicnící: cultúr baictéarach agus fungach, brath víreas ag PCR ar leith, antaiginí niúmócacha agus Legionella a bhrath i bhfual. Cuirfidh an staidéar seo faisnéis ar fáil maidir le hathruithe ar an micribhithm riospráide in niúmóine troma pobail, ag brath ar a bhunadh baictéarach agus víreasach, feabhsóidh sé cumas diagnóiseach reatha na niúmóine agus dearbhóidh sé nó sí straitéisí eimpíreacha nua a bheidh le cur san áireamh i dtreoirlínte cliniciúla cóireála antaibheathach. (Irish)
4 August 2022
0 references
Usklajeni interdisciplinarni projekt, v katerem so cilji podprojekta mikrobioma: Glavni. 1) Značilnost in primerjava raznolikosti mikrobioma spodnjih dihal bolnikov s hudo pljučnico v skupnosti, ki zahteva mehansko prezračevanje, s kontrolnimi bolniki brez nalezljive bolezni dihal. 2) Ugotoviti razmerje med različnimi ravnmi serumskih biomarkerjev in dihalnega mikrobioma pri bolnikih s hudo pljučnico. Srednja šola. 3) Primerjajte respiratorni mikrobiom med bolniki z virusno in bakterijsko pljučnico ter med okužbo. 4) Določite etiologijo in diagnostično vlogo novih tehnik NGS pri bolnikih s hudo pljučnico. 5) Analizirajte vrednost molekularnih tehnik pri diagnozi hude pljučnice pri bolniku s predhodnim antibiotičnim zdravljenjem. Dihalni mikrobiom bronhoalveolarnega mini pranja bo raziskan pri 50 bolnikih z lokalno pljučnico z mehanskim prezračevanjem in 20 kontrolnimi bolniki, ki uporabljajo platformo Ion Torrent in komplet za metagenomiko KIT (Life Technologies) ION 16S. Isti bolniki bodo prejeli razmeroma celovito mikrobiološko diagnozo z rutinskimi tehnikami: bakterijska in glivična kultura, odkrivanje virusa s specifično PCR, odkrivanje pnevmokoknih antigenov in Legionella v urinu. Ta študija bo zagotovila informacije o spremembah dihalnega mikrobioma pri hudi pljučnici v skupnosti, odvisno od njegovega bakterijskega in virusnega izvora, bo izboljšala trenutno diagnostično zmogljivost pljučnice in potrdila ali oblikovala nove empirične strategije, ki bodo vključene v klinične smernice za zdravljenje antibiotikov. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
Координиран интердисциплинарен проект, в който целите на подпроекта за микробиома са: Основните. 1) Характеризира и сравнява разнообразието на микробиом на долните дихателни пътища на пациенти с тежка обществена пневмония, изискваща механична вентилация, с тази на контролните пациенти без инфекциозно респираторно заболяване. 2) Да се установи връзката между различните нива на серумните биомаркери и респираторния микробиом при пациенти с тежка пневмония. В средното училище. 3) Сравнете респираторния микробиом между пациенти с вирусна и бактериална пневмония и по време на инфекция. 4) Определете етиологията и диагностичната роля на новите NGS техники при пациенти с тежка пневмония. 5) Анализирайте стойността на молекулярните техники при диагностицирането на тежка пневмония при пациента с предходно антибиотично лечение. Респираторният микробиом на бронхоалвеоларните минимивки ще бъде проучен при 50 пациенти с придобита в общността пневмония с механична вентилация и 20 пациенти с контрол, използвайки платформата Ion Torrent и комплекта за метагеномия на ION 16S (Life Technologies). Същите пациенти ще получат сравнително изчерпателна микробиологична диагноза с рутинни техники: бактериална и гъбична култура, откриване на вируси чрез специфична PCR, откриване на пневмококови антигени и легионела в урината. Това проучване ще предостави информация за промените в респираторния микробиом при тежката обществена пневмония, в зависимост от бактериалния и вирусния ѝ произход, ще подобри настоящия диагностичен капацитет на пневмония и ще потвърди или разработи нови емпирични стратегии, които да бъдат включени в клиничните насоки за лечение с антибиотици. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
Proġett interdixxiplinari kkoordinat, li fih l-objettivi tas-sottoproġett tal-mikrobijoma huma: Dawk ewlenin. 1) Karatterizza u qabbel id-diversità tal-mikrobijoma tal-passaġġ respiratorju t’isfel ta’ pazjenti bi pnewmonja severa fil-komunità li teħtieġ ventilazzjoni mekkanika ma’ dik tal-pazjenti ta’ kontroll mingħajr mard respiratorju infettiv. 2) Biex tiġi stabbilita r- relazzjoni bejn il- livelli differenti ta ' bijomarkaturi fis- serum u l- mikrobijoma respiratorja f’ pazjenti bi pnewmonja severa. Skola sekondarja. 3) Qabbel il-mikrobijoma respiratorja bejn pazjenti bi pnewmonja virali u batterika u fil-kors ta’ infezzjoni. 4) Iddetermina l-etjoloġija u r-rwol dijanjostiku ta’ tekniki ġodda ta’ NGS f’pazjenti bi pulmonite severa. 5) Analiżi tal-valur tat-tekniki molekulari fid-dijanjosi ta’ pnewmonja severa fil-pazjent b’kura antibijotika preċedenti. Il-mikrobijoma respiratorja tal-bronkoalveolari mini-washing se tiġi studjata f’50 pazjent b’pulmonite akkwiżita fil-komunità b’ventilazzjoni mekkanika u 20 pazjent ta’ kontroll li jużaw il-pjattaforma Ion Torrent u l-kit ION 16S metagenomics KIT (Life Technologies). L-istess pazjenti ser jirċievu dijanjosi mikrobijoloġika komparattivament komprensiva b’tekniki ta’ rutina: kultura batterjali u fungali, detezzjoni tal-virus permezz ta’ PCR speċifiku, detezzjoni ta’ antiġeni pnewmokokkali u Legionella fl-awrina. Dan l-istudju se jipprovdi informazzjoni dwar bidliet fil-mikrobijoma respiratorja f’pulmonite severa fil-komunità, skont l-oriġini batterika u virali tiegħu, se jtejjeb il-kapaċità dijanjostika attwali tal-pulmonite u se jikkonferma jew ifassal strateġiji empiriċi ġodda li għandhom jiġu inklużi fil-linji gwida kliniċi dwar it-trattament antibijotiku. (Maltese)
4 August 2022
0 references
Projeto interdisciplinar coordenado, em que os objetivos do subprojeto microbioma são: Os principais. 1) Caracterizar e comparar a diversidade do microbioma do trato respiratório inferior de pacientes com pneumonia comunitária grave que necessitam de ventilação mecânica com a dos pacientes controles sem doença respiratória infecciosa. 2) Estabelecer a relação entre os diferentes níveis de biomarcadores séricos e o microbioma respiratório em pacientes com pneumonia grave. Escola secundária. 3) Compare o microbioma respiratório entre pacientes com pneumonia viral e bacteriana e no curso da infeção. 4) Determine a etiologia e o papel diagnóstico de novas técnicas de NGS em pacientes com pneumonia grave. 5) Analisar o valor das técnicas moleculares no diagnóstico de pneumonia grave no paciente com tratamento antibiótico prévio. O microbioma respiratório da mini-lavagem broncoalveolar será estudado em 50 pacientes com pneumonia adquirida na comunidade com ventilação mecânica e 20 pacientes controle usando a plataforma Ion Torrent e o kit de metagenômica ION 16S (Life Technologies). Os mesmos pacientes receberão um diagnóstico microbiológico comparativamente abrangente com técnicas de rotina: cultura bacteriana e fúngica, deteção de vírus por PCR específica, deteção de antígenos pneumocócicos e Legionella na urina. Este estudo fornecerá informações sobre alterações no microbioma respiratório na pneumonia comunitária grave, dependendo de sua origem bacteriana e viral, melhorará a capacidade diagnóstica atual da pneumonia e confirmará ou elaborará novas estratégias empíricas a serem incluídas nas diretrizes clínicas de tratamento antibiótico. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
Koordineret tværfagligt projekt, hvor målene for mikrobioma-delprojektet er: De vigtigste. 1) Karakterisere og sammenligne diversiteten af mikrobiomet i de nedre luftveje hos patienter med svær lungebetændelse i samfundet, der kræver mekanisk ventilation, med kontrolpatienter uden smitsom luftvejssygdom. 2) At fastslå forholdet mellem de forskellige niveauer af serumbiomarkører og respiratorisk mikrobiom hos patienter med svær lungebetændelse. Gymnasiet. 3) Sammenlign respiratorisk mikrobiom mellem patienter med viral og bakteriel lungebetændelse og under infektion. 4) Bestem ætiologi og diagnostisk rolle af nye NGS-teknikker hos patienter med svær lungebetændelse. 5) Analyser værdien af molekylære teknikker til diagnosticering af svær lungebetændelse hos patienten med tidligere antibiotikabehandling. Den respiratoriske mikrobiom af bronchoalveolar minivaskning vil blive undersøgt hos 50 patienter med fællesskabserhvervet lungebetændelse med mekanisk ventilation og 20 kontrolpatienter, der bruger Ion Torrent-platformen og ION 16S metagenomics KIT (Life Technologies) kit. De samme patienter vil få en forholdsvis omfattende mikrobiologisk diagnose med rutineteknikker: bakterie- og svampekultur, påvisning af virus ved specifik PCR, påvisning af pneumokokantigener og Legionella i urin. Denne undersøgelse vil give oplysninger om ændringer i respiratorisk mikrobiom i svær lokal lungebetændelse, afhængigt af dets bakterielle og virale oprindelse, vil forbedre den nuværende diagnostiske kapacitet af lungebetændelse og vil bekræfte eller udforme nye empiriske strategier, der skal medtages i antibiotisk behandling kliniske retningslinjer. (Danish)
4 August 2022
0 references
Proiect interdisciplinar coordonat, în care obiectivele subproiectului microbiom sunt: Cele principale. 1) Caracterizarea și compararea diversității microbiomului tractului respirator inferior al pacienților cu pneumonie comunitară severă care necesită ventilație mecanică cu cea a pacienților de control fără boală respiratorie infecțioasă. 2) Pentru a stabili relația dintre diferitele niveluri de biomarkeri serici și microbiomul respirator la pacienții cu pneumonie severă. În gimnaziu. 3) Comparați microbiomul respirator între pacienții cu pneumonie virală și bacteriană și în cursul infecției. 4) Determinați etiologia și rolul diagnostic al noilor tehnici NGS la pacienții cu pneumonie severă. 5) Analizați valoarea tehnicilor moleculare în diagnosticarea pneumoniei severe la pacient cu tratament antibiotic anterior. Microbiomul respirator al mini-spălării bronhoalveolare va fi studiat la 50 de pacienți cu pneumonie comunitară cu ventilație mecanică și 20 de pacienți de control utilizând platforma Ion Torrent și kitul ION 16S metagenomics KIT (Life Technologies). Aceiași pacienți vor primi un diagnostic microbiologic comparativ cuprinzător cu tehnici de rutină: cultură bacteriană și fungică, detectarea virusului prin PCR specific, detectarea antigenelor pneumococice și Legionella în urină. Acest studiu va oferi informații cu privire la modificările microbiomului respirator în pneumonie comunitară severă, în funcție de originea sa bacteriană și virală, va îmbunătăți capacitatea actuală de diagnosticare a pneumoniei și va confirma sau proiecta noi strategii empirice care urmează să fie incluse în orientările clinice privind tratamentul cu antibiotice. (Romanian)
4 August 2022
0 references
Samordnat tvärvetenskapligt projekt, där målen för delprojektet för mikrobioma är följande: De viktigaste. 1) Karakterisera och jämföra mångfalden av mikrobiomet i nedre luftvägarna hos patienter med svår samhällspneumoni som kräver mekanisk ventilation med kontrollpatienter utan infektiös andningssjukdom. 2) För att fastställa förhållandet mellan de olika nivåerna av serumbiomarkörer och respiratoriskt mikrobiom hos patienter med svår lunginflammation. Gymnasiet. 3) Jämför respiratoriskt mikrobiom mellan patienter med virus- och bakteriell lunginflammation och under infektionsförloppet. 4) Bestäm etiologi och diagnostisk roll av nya NGS-tekniker hos patienter med svår lunginflammation. 5) Analysera värdet av molekylära tekniker vid diagnos av svår lunginflammation hos patienten med tidigare antibiotikabehandling. Respiratorisk mikrobiom från bronkoalveolar minitvätt kommer att studeras hos 50 patienter med samhällsförvärvad pneumoni med mekanisk ventilation och 20 kontrollpatienter som använder Ion Torrent-plattformen och ION 16S metagenomics KIT (Life Technologies) kit. Samma patienter kommer att få en jämförelsevis omfattande mikrobiologisk diagnos med rutinmässiga tekniker: bakterie- och svampodling, virusdetektion genom specifik PCR, påvisande av pneumokockantigener och legionella i urinen. Denna studie kommer att ge information om förändringar i respiratorisk mikrobiom i svår samhällspneumoni, beroende på dess bakteriella och virala ursprung, kommer att förbättra den nuvarande diagnostiska kapaciteten hos lunginflammation och kommer att bekräfta eller utforma nya empiriska strategier som ska ingå i kliniska riktlinjer för antibiotikabehandling. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Donostia/San Sebastián
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI17_01463
0 references