TOLERANCE TO OXYGEN AND NITRIC OXIDE AFTER HYPOXIA IN ARABIDOPSIS (Q3138839)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3138839 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | TOLERANCE TO OXYGEN AND NITRIC OXIDE AFTER HYPOXIA IN ARABIDOPSIS |
Project Q3138839 in Spain |
Statements
103,899.85 Euro
0 references
190,817.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2018
0 references
31 August 2021
0 references
AGENCIA CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
0 references
46022
0 references
LAS PLANTAS CRECEN NORMALMENTE EN CONDICIONES NORMOXICAS PERO PARTE DE SUS ORGANOS O TEJIDOS EXPERIMENTAN CON RELATIVA FRECUENCIA BAJA DISPONIBILIDAD DE O2 (HIPOXIA). LAS CONDICIONES HIPOXICAS SON NORMALMENTE TRANSITORIAS Y EL DESARROLLO PROGRESA MEDIANTE UNA TRANSICION A NORMOXIA. LA HIPOXIA ES INCLUSO MAS COMUN EN PLANTAS BAJO CONDICIONES AMBIENTALES ADVERSAS TALES COMO LAS EXPERIMENTADAS EN CAMPOS INUNDADOS TRAS LLUVIAS TORRENCIALES. EL PROCESO DE DES-OXIGENACION (DE-OX) QUE SUFREN LAS PLANTAS EN HIPOXIA ESTA ACOMPAÑADO POR CAMBIOS EN EL METABOLISMO, LA EXPRESION GENICA Y LA ESTABILIDAD Y MODIFICACION DE PROTEINAS. EN PARTICULAR, LAS PLANTAS BAJO HIPOXIA PRODUCEN OXIDO NITRICO (NO) COMO CONSECUENCIA DE LA UTILIZACION DE NITRITO EN LUGAR DE OXIGENO MOLECULAR COMO ACEPTOR DE ELECTRONES DE LA CADENA RESPIRATORIA MITOCONDRIAL. LAS FUNCIONES DEL O2 Y DEL NO ESTAN INTIMAMENTE LIGADAS AL CONTROL DE LA DEGRADACION DE FACTORES DE TRANSCRIPCION (TFS) DEL GRUPO VII DE LA FAMILIA ERF A TRAVES DE UN PROCESO PROTEOLITICO MEDIADO POR LA SECUENCIA N-TERMINAL (DEGRON) QUE REQUIERE DE ARGINILACION DEL EXTREMO N-TERMINAL. ESTE PROCESO ES EN SI MISMO RELEVANTE PARA EL CONTROL DE LAS RESPUESTAS A HIPOXIA. CUANDO LAS CONDICIONES HIPOXICAS DESAPARECEN, LAS PLANTAS EXPERIMENTAN UN PROCESO DE RE-OXIGENACION (RE-OX) QUE TERMINAN EN CONDICIONES NORMOXICAS DE NUEVO, Y QUE OCURREN EN PARALELO CON UNA ELEVADA PRODUCCION DE ESPECIES REACTIVAS DE OXIGENO (ROS). ESTAS ESPECIES SON DELETEREAS PARA LA PLANTA Y EN SU DETOXIFICACION PARECE JUGAR UN PAPEL IMPORTANTE EL NO PRODUCIDO DURANTE LA HIPOXIA. LOS OBJETIVOS 1 Y 2 DE ESTE PROYECTO PLANTEAN LA CARACTERIZACION MOLECULAR DE LOS EVENTOS QUE TIENEN LUGAR DURANTE DE-OX Y RE-OX MEDIANTE UNA COMBINACION DE ESTRATEGIAS NO DIRIGIDAS BASADA EN HERRAMIENTAS OMICAS, Y OTRA MAS DIRIGIDA A LA FUNCION DE TFS. PONDREMOS UN ENFASIS ESPECIAL EN COMPONENTES REGULADORES QUE ESTEN RELACIONADOS CON LA HOMEOSTASIS Y SEÑALIZACION DEL NO. ESTAS APROXIMACIONES SE BENEFICIARAN DE LA DISPONIBILIDAD EN EL LABORATORIO DE UNA AMPLIA COLECCION DE MUTANTES Y LINEAS TRANSGENICAS SOBREEXPRESORAS DE CADA UNO DE LOS COMPONENTES IMPLICADOS EN LA HOMEOSTASIS Y SEÑALIZACION DEL NO, DE LA RUTA PROTEOLITICA DIRIGIDA POR LA SECUENCIA N-TERMINAL, DE LOS FACTORES ERFVII, Y DE UNA COLECCION DE LINEAS QUE EXPRESAN CONDICIONALMENTE ALREDEDOR DE 1000 TFS DE ARABIDOPSIS. ESTE PROYECTO SE COMPLETA CON UN TERCER OBJETIVO QUE CONTEMPLA LA TAN ANSIADA GENERACION DE SENSORES IN PLANTA DE NO. ESTE OBJETIVO SE FUNDAMENTA EN EL MECANISMO SENSOR DE NO BASADO EN LA OXIDACION MEDIADA ESTRICTAMENTE POR O2 Y NO DEL RESIDUO C2 DE LOS FACTORES ERFVII Y SU DEGRADACION DEPENDIENTE DE SU SECUENCIA N-TERMINAL (DEGRON). LOS SENSORES QUE PRETENDEMOS GENERAR EXPRESARAN FUSIONES TRADUCCIONALES DE PROTEINAS REPORTADORAS (FLUORESECENTES O LUCIFERASAS) CON EL DEGRON CORRESPONDIENTE QUE, SI FUNCIONAN CORRECTAMENTE, PERMITIRAN LA CUANTIFICACION DE LOS NIVELES ENDOGENOS DE NO EN LAS PLANTAS. FINALMENTE, SI LOS DEGRONES ENSAYADOS FUNCIONAN CORRECTAMENTE HAREMOS UNA EXPLORACION PRELIMINAR DE LAS POTENCIALIDADES BIOTECNOLOGICAS DE UNA HERRAMIENTA COMO ESTA PARA CONTROLAR LA DEGRADACION DE PROTEINAS DE INTERES AGRICOLA. (Spanish)
0 references
PLANTS USUALLY GROW UNDER NORMOXIC CONDITIONS BUT IT IS RELATIVELY COMMON THAT CERTAIN ORGANS/TISSUES UNDERGO LOW O2 AVAILABILITY (HYPOXIA) THROUGHOUT DEVELOPMENT. HYPOXIC CONDITIONS ARE USUALLY TRANSIENT AND DEVELOPMENT PROGRESS WITH THE TRANSITION TO NORMOXIA. HYPOXIA IS EVEN MORE FREQUENT WHEN PLANTS FACE ADVERSE ENVIRONMENTAL CONDITIONS SUCH AS FLOODING AFTER HEAVY RAINFALLS. THE DE-OXYGENATION (DE-OX) PROCESS THAT PLANTS UNDERGO UNDER HYPOXIA IS ACCOMPANIED BY CHANGES IN THE METABOLISM, GENE EXPRESSION AND MODIFICATION AND STABILITY OF PROTEINS. IN PARTICULAR, PLANTS PRODUCE NITRIC OXIDE (NO) UNDER HYPOXIA AS A RESULT OF MITOCHONDRIAL RESPIRATION CHAIN USING NITRITE INSTEAD OF O2 AS ELECTRON ACCEPTOR. THE FUNCTIONS OF O2 AND NO ARE TIGHTLY LINKED TO THE CONTROL OF THE PROTEOLYSIS OF GROUP VII OF ERF TRANSCRIPTION FACTORS (TFS) THROUGH AN N-TERMINAL SEQUENCE (DEGRON)-MEDIATED DEGRADATION PROCESS, WHICH OCCURS THROUGH THE SO-CALLED ARG/N-END RULE PATHWAY. THIS PROCESS IS ITSELF RELEVANT TO CONTROL THE RESPONSES TO HYPOXIA. WHEN HYPOXIC CONDITIONS ARE OVER, PLANTS EXPERIENCE A RE-OXYGENATION (RE-OX) PROCESS THAT ENDS WITH NORMOXIC CONDITIONS. RE-OXYGENATION PROCESS RUNS WITH THE STRONG PRODUCTION OF REACTIVE OXYGEN SPECIES (ROS). THE HIGH LEVELS OF ROS MAY BE DELETERIOUS FOR THE PLANT AND IT HAS BEEN REPORTED THAT NO MAY PLAY AN ESSENTIAL ROLE COUNTERACTING ROS-TRIGGERED EFFECTS. IN THE OBJECTIVES 1 AND 2 OF THIS PROJECT, WE WILL ADDRESS THE MOLECULAR CHARACTERIZATION OF THE EVENTS OCCURRING DURING DE-OX AND RE-OX BY USING A COMBINATION OF NON-BIASED OMICS-BASED SEARCHING FOR REGULATORY AND SIGNALING FACTORS, AND A TARGETED APPROACH FOCUSING ON TFS. SPECIAL EMPHASIS WILL BE PUT ON THE REGULATORY COMPONENTS RELATED TO NO HOMEOSTASIS AND SIGNALING. THESE APPROACHES WILL LARGELY BENEFIT FROM THE AVAILABILITY IN THE LAB OF A COLLECTION OF MUTANTS AND OVER-EXPRESSING TRANSGENIC LINES CORRESPONDING TO MOST OF THE COMPONENTS INVOLVED IN NO HOMEOSTASIS AND SIGNALING, THE N-END RULE PROTEOLYTIC PATHWAY AND ERFVIIS, AND A COLLECTION OF TRANSGENIC LINES CONDITIONALLY EXPRESSING AROUND 1000 ARABIDOPSIS TFS. THE PROJECT IS COMPLETED BY A THIRD OBJECTIVE THAT WILL ADDRESS THE EAGERLY AWAITED GENERATION OF IN PLANTA NO SENSORS. OUR RATIONALE FOR THIS OBJECTIVE IS BASED ON THE NO SENSING MECHANISM WE PROPOSED LATELY THAT INVOLVES THE O2 AND NO-DEPENDENT OXIDATION OF C2 RESIDUE OF ERFVIIS AND THEIR SUBSEQUENT DEGRADATION THROUGH THE N-END RULE PATHWAY MACHINERY. THE NO SENSOR WE INTEND TO CONSTRUCT WILL EXPRESSED TRANSLATIONAL FUSIONS OF N-TERMINAL DEGRONS WITH REPORTER FLUORESCENT OR LUCIFERASE PROTEINS, AND, IF SUCCESSFUL, THEY WILL ALLOW THE QUANTIFICATION OF ENDOGENOUS NO LEVELS IN PLANTS. FINALLY, IF TESTED DEGRONS WORK PROPERLY, WE PLAN TO MAKE A PRELIMINARY STUDY OF THE BIOTECHNOLOGICAL POTENTIAL OF THIS TOOL TO CONTROL THE DEGRADATION OF PROTEINS WITH AGRICULTURAL INTEREST. (English)
0.1820842168723913
0 references
LES PLANTES POUSSENT NORMALEMENT DANS DES CONDITIONS NORMOXIQUES, MAIS CERTAINS DE LEURS ORGANES OU TISSUS PRÉSENTENT UNE DISPONIBILITÉ RELATIVEMENT FAIBLE EN O2 (HYPOXIE). LES CONDITIONS HYPOXIQUES SONT GÉNÉRALEMENT TRANSITOIRES ET LE DÉVELOPPEMENT PROGRESSE PAR UNE TRANSITION VERS LA NORMOXIE. L’HYPOXIE EST ENCORE PLUS FRÉQUENTE CHEZ LES PLANTES DANS DES CONDITIONS ENVIRONNEMENTALES DÉFAVORABLES, COMME DANS LES CHAMPS INONDÉS APRÈS DES PLUIES TORRENTIELLES. LE PROCESSUS DE DÉSOXYGÉNATION (DE-OX) SUBI PAR LES PLANTES DANS L’HYPOXIE S’ACCOMPAGNE DE MODIFICATIONS DU MÉTABOLISME, DE L’EXPRESSION GÉNIQUE, DE LA STABILITÉ ET DE LA MODIFICATION DES PROTÉINES. EN PARTICULIER, LES PLANTES SOUS HYPOXIE PRODUISENT DE L’OXYDE NITRIQUE (NON) EN RAISON DE L’UTILISATION DU NITRITE AU LIEU DE L’OXYGÈNE MOLÉCULAIRE COMME ACCEPTEUR ÉLECTRONIQUE DE LA CHAÎNE RESPIRATOIRE MITOCHONDRIALE. LES FONCTIONS DE L’O2 ET DE LA NE SONT PAS INTIMEMENT LIÉES AU CONTRÔLE DE LA DÉGRADATION DES FACTEURS DE TRANSCRIPTION (TFS) DU GROUPE VII DE LA FAMILLE ERF PAR UN PROCESSUS PROTÉOLITIQUE MÉDIÉ PAR LA SÉQUENCE N-TERMINALE (DEGRON) QUI NÉCESSITE L’ARGINILACION EXTRÉMITÉ N-TERMINALE. CE PROCESSUS EST EN SOI PERTINENT POUR LE CONTRÔLE DES RÉPONSES À L’HYPOXIE. LORSQUE LES CONDITIONS HIPOXICAL DISPARAISSENT, LES PLANTES SUBISSENT UN PROCESSUS DE RÉOXYGÉNATION (RÉ-OX) QUI SE RETROUVE DANS DES CONDITIONS NORMOXICALES, ET SE PRODUIT PARALLÈLEMENT À UNE PRODUCTION ÉLEVÉE D’ESPÈCES D’OXYGÈNE RÉACTIFS (ROS). CES ESPÈCES SONT DES DELETEREAS POUR LA PLANTE ET DANS SA DÉSINTOXICATION SEMBLE JOUER UN RÔLE IMPORTANT QUI N’EST PAS PRODUIT PENDANT L’HYPOXIE. LES OBJECTIFS 1 ET 2 DE CE PROJET PROPOSENT LA CARACTÉRISATION MOLÉCULAIRE DES ÉVÉNEMENTS QUI SE PRODUISENT AU COURS DE LA DÉSOX ET DE LA RÉOX AU MOYEN D’UNE COMBINAISON DE STRATÉGIES NON CIBLÉES BASÉES SUR DES OUTILS OMIQUES, ET D’UN AUTRE VISANT À LA FONCTION DE TFS. NOUS METTRONS L’ACCENT SUR LES COMPOSANTS RÉGLEMENTAIRES LIÉS À L’HOMÉOSTASIE ET À L’ABSENCE DE SIGNALISATION. CES APPROCHES BÉNÉFICIERONT DE LA DISPONIBILITÉ EN LABORATOIRE D’UNE VASTE COLLECTION DE MUTANTS ET DE LIGNES TRANSGÉNIQUES SUREXPRESSEURS DE CHACUN DES COMPOSANTS IMPLIQUÉS DANS L’HOMÉOSTASIE ET L’ABSENCE DE SIGNALISATION, LA VOIE PROTÉOLITIQUE MENÉE PAR LA SÉQUENCE N-TERMINALE, LES FACTEURS ERFVII, ET UNE COLLECTION DE LIGNES QUI EXPRIMENT CONDITIONNELLEMENT ENVIRON 1000 TFS D’ARABIDOPSIS. CE PROJET EST COMPLÉTÉ PAR UN TROISIÈME OBJECTIF QUI ENVISAGE LA GÉNÉRATION TANT ATTENDUE DE CAPTEURS DANS L’USINE NO. CET OBJECTIF EST BASÉ SUR LE MÉCANISME DU CAPTEUR QUI N’EST PAS BASÉ SUR L’OXYDATION MÉDIÉE STRICTEMENT PAR O2 ET NON SUR LE RÉSIDU C2 DES FACTEURS ERFVII ET SA DÉGRADATION DÉPEND DE SA SÉQUENCE N-TERMINALE (DEGRON). LES CAPTEURS QUE NOUS AVONS L’INTENTION DE GÉNÉRER EXPRIMERONT DES FUSIONS TRANSLATIONNELLES DES PROTÉINES DÉCLARANTES (FLUORESECENTS OU LUCIFÉRASES) AVEC LES DEGRON CORRESPONDANTS QUI, S’ILS FONCTIONNENT CORRECTEMENT, PERMETTRONT LA QUANTIFICATION DES NIVEAUX ENDOGÈNES DE NON DANS LES PLANTES. ENFIN, SI LES DEGRONES TESTÉS FONCTIONNENT CORRECTEMENT, NOUS PROCÉDERONS À UNE EXPLORATION PRÉLIMINAIRE DES POTENTIELS BIOTECHNOLOGIQUES D’UN OUTIL COMME CELUI-CI POUR CONTRÔLER LA DÉGRADATION DES PROTÉINES D’INTÉRÊT AGRICOLE. (French)
2 December 2021
0 references
PFLANZEN WACHSEN NORMALERWEISE UNTER NORMOXICAL-BEDINGUNGEN, ABER EINIGE IHRER ORGANE ODER GEWEBE HABEN EINE RELATIV GERINGE VERFÜGBARKEIT VON O2 (HYPOXIE). HYPOXISCHE BEDINGUNGEN SIND IN DER REGEL VORÜBERGEHEND UND DIE ENTWICKLUNG GEHT DURCH EINEN ÜBERGANG ZUR NORMOXIE VORAN. HYPOXIE IST NOCH HÄUFIGER IN PFLANZEN UNTER WIDRIGEN UMWELTBEDINGUNGEN WIE DENEN, DIE IN FELDERN, DIE NACH TORRENTIALREGEN ÜBERSCHWEMMT WERDEN, ERFAHREN. DER PROZESS DER DEOXYGENATION (DE-OX), DER VON PFLANZEN IN HYPOXIE GELITTEN WIRD, WIRD VON VERÄNDERUNGEN DES STOFFWECHSELS, DER GENETISCHEN EXPRESSION UND DER STABILITÄT UND MODIFIKATION VON PROTEINEN BEGLEITET. INSBESONDERE PRODUZIEREN PFLANZEN UNTER HYPOXIE STICKSTOFFMONOXID (Nr.) ALS ERGEBNIS DER VERWENDUNG VON NITRIT ANSTELLE VON MOLEKULAREM SAUERSTOFF ALS ELEKTRONENAKZEPTOR DER MITOCHONDRIALEN ATEMWEGSKETTE. DIE FUNKTIONEN DES O2 UND DER O2 SIND NICHT ENG MIT DER KONTROLLE DES ABBAUS VON TRANSKRIPTIONSFAKTOREN (TFS) DER GRUPPE VII DER ERF-FAMILIE DURCH EINEN PROTEOLITISCHEN PROZESS VERBUNDEN, DER DURCH DIE N-TERMINALSEQUENZ (DEGRON) VERMITTELT WIRD, DIE N-TERMINALEND ARGINILACION ERFORDERT. DIESER PROZESS IST AN SICH FÜR DIE KONTROLLE DER REAKTIONEN AUF HYPOXIE RELEVANT. WENN HIPOXICAL-BEDINGUNGEN VERSCHWINDEN, DURCHLAUFEN PFLANZEN EINEN PROZESS DER REOXYGENATION (RE-OX), DER WIEDER IN NORMOXICAL-BEDINGUNGEN ENDET UND PARALLEL ZU EINER HOHEN PRODUKTION REAKTIVER SAUERSTOFFARTEN (ROS) STATTFINDET. DIESE ARTEN SIND DELETEREAS FÜR DIE PFLANZE UND BEI IHRER ENTGIFTUNG SCHEINT EINE WICHTIGE ROLLE ZU SPIELEN, DIE WÄHREND DER HYPOXIE NICHT PRODUZIERT WIRD. DIE ZIELE 1 UND 2 DIESES PROJEKTS SCHLAGEN DIE MOLEKULARE CHARAKTERISIERUNG DER EREIGNISSE VOR, DIE WÄHREND DER DE-OX- UND RE-OX-EREIGNISSE DURCH EINE KOMBINATION VON NICHT ZIELGERICHTETEN STRATEGIEN AUF DER GRUNDLAGE OMICRISCHER WERKZEUGE STATTFINDEN, UND EINE ANDERE AUF DIE FUNKTION VON TFS. WIR WERDEN EINEN BESONDEREN SCHWERPUNKT AUF REGULATORISCHE KOMPONENTEN LEGEN, DIE MIT HOMÖOSTASE UND KEINE BESCHILDERUNG IN ZUSAMMENHANG STEHEN. DIESE ANSÄTZE WERDEN VON DER VERFÜGBARKEIT EINER BREITEN SAMMLUNG VON MUTANTEN UND TRANSGENEN LINIEN ÜBEREXPRESSOREN JEDER DER KOMPONENTEN DER HOMÖOSTASE UND KEINE BESCHILDERUNG, DER PROTEOLITISCHEN ROUTE UNTER DER LEITUNG DER N-TERMINALSEQUENZ, ERFVII-FAKTOREN UND EINER SAMMLUNG VON LINIEN PROFITIEREN, DIE BEDINGT UM 1000 TFS ARABIDOPSIS AUSDRÜCKEN. DIESES PROJEKT WIRD MIT EINEM DRITTEN ZIEL ABGESCHLOSSEN, DAS DIE LANG ERWARTETE GENERATION VON SENSOREN IN DER ANLAGE Nr. DIESES ZIELS IN BETRACHT ZIEHT. DIESES ZIEL BASIERT AUF DEM SENSORMECHANISMUS, DER NICHT AUF OXIDATION BASIERT, DIE STRENG DURCH O2 VERMITTELT WIRD, UND NICHT AUF DEN C2-RÜCKSTAND DER ERFVII-FAKTOREN UND DESSEN ABBAU, DER VON SEINER N-TERMINALSEQUENZ (DEGRON) ABHÄNGIG IST. DIE SENSOREN, DIE WIR ERZEUGEN WOLLEN, WERDEN ÜBERSETZUNGSFUSIONEN VON MELDENDEN PROTEINEN (FLUORESECENTS ODER LUCIFERASES) MIT DEM ENTSPRECHENDEN DEGRON AUSDRÜCKEN, DER, WENN SIE ORDNUNGSGEMÄSS FUNKTIONIEREN, DIE QUANTIFIZIERUNG DER ENDOGENEN WERTE VON NEIN IN PFLANZEN ERMÖGLICHT. WENN DIE GETESTETEN DEGRONES KORREKT FUNKTIONIEREN, WERDEN WIR EINE VORLÄUFIGE UNTERSUCHUNG DER BIOTECHNOLOGISCHEN POTENZIALE EINES SOLCHEN WERKZEUGS DURCHFÜHREN, UM DEN ABBAU VON PROTEINEN VON LANDWIRTSCHAFTLICHEM INTERESSE ZU KONTROLLIEREN. (German)
9 December 2021
0 references
PLANTEN GROEIEN GEWOONLIJK ONDER NORMOXICAL-OMSTANDIGHEDEN, MAAR SOMMIGE VAN HUN ORGANEN OF WEEFSELS HEBBEN EEN RELATIEF LAGE BESCHIKBAARHEID VAN O2 (HYPOXIE). HYPOXISCHE OMSTANDIGHEDEN ZIJN MEESTAL VOORBIJGAANDE EN DE ONTWIKKELING VORDERT DOOR EEN OVERGANG NAAR NORMOXIA. HYPOXIE KOMT NOG VAKER VOOR BIJ PLANTEN ONDER ONGUNSTIGE OMGEVINGSOMSTANDIGHEDEN, ZOALS DIE ERVAREN IN VELDEN DIE OVERSTROOMD ZIJN NA STORTREGENS. HET PROCES VAN DEOXYGENATIE (DE-OX) DAT WORDT GELEDEN DOOR PLANTEN IN HYPOXIE GAAT GEPAARD MET VERANDERINGEN IN METABOLISME, GENIC EXPRESSIE EN STABILITEIT EN MODIFICATIE VAN EIWITTEN. MET NAME PLANTEN ONDER HYPOXIE PRODUCEREN STIKSTOFMONOXIDE (NEE) ALS GEVOLG VAN HET GEBRUIK VAN NITRIET IN PLAATS VAN MOLECULAIRE ZUURSTOF ALS ELEKTRONENACCEPTOR VAN DE MITOCHONDRIALE ADEMHALINGSKETEN. DE FUNCTIES VAN DE O2 EN DE FUNCTIES ZIJN NIET NAUW VERBONDEN MET DE CONTROLE VAN DE AFBRAAK VAN TRANSCRIPTIEFACTOREN (TFS) VAN GROEP VII VAN DE EVF-FAMILIE DOOR MIDDEL VAN EEN PROTEOLITISCH PROCES DAT WORDT GEMEDIEERD DOOR DE N-TERMINALSEQUENTIE (DEGRON) DIE N-TERMINAL-EIND ARGINILACION VEREIST. DIT PROCES IS OP ZICH RELEVANT VOOR DE CONTROLE VAN REACTIES OP HYPOXIE. WANNEER DE HIPOXICAL-OMSTANDIGHEDEN VERDWIJNEN, ONDERGAAN PLANTEN EEN PROCES VAN RE-OXYGENATIE (RE-OX) DAT WEER IN NORMOXICAL-OMSTANDIGHEDEN TERECHTKOMT EN TEGELIJK MET EEN HOGE PRODUCTIE VAN REACTIEVE ZUURSTOFSOORTEN (ROS) OPTREEDT. DEZE SOORTEN ZIJN DELETEREAS VOOR DE PLANT EN IN HAAR ONTGIFTING LIJKT EEN BELANGRIJKE ROL TE SPELEN DIE NIET WORDT GEPRODUCEERD TIJDENS HYPOXIE. DE DOELSTELLINGEN 1 EN 2 VAN DIT PROJECT STELLEN DE MOLECULAIRE KARAKTERISERING VOOR VAN DE GEBEURTENISSEN DIE PLAATSVINDEN TIJDENS DE-OX EN RE-OX DOOR MIDDEL VAN EEN COMBINATIE VAN NIET-GERICHTE STRATEGIEËN GEBASEERD OP OMIC TOOLS, EN EEN ANDERE GERICHT OP DE FUNCTIE VAN TFS. WE ZULLEN EEN SPECIALE NADRUK LEGGEN OP REGELGEVENDE COMPONENTEN DIE GERELATEERD ZIJN AAN HOMEOSTASE EN GEEN BEWEGWIJZERING. DEZE BENADERINGEN ZULLEN PROFITEREN VAN DE BESCHIKBAARHEID IN HET LABORATORIUM VAN EEN BREDE VERZAMELING MUTANTEN EN TRANSGENE LIJNEN OVEREXPRESSOREN VAN ELK VAN DE COMPONENTEN DIE BETROKKEN ZIJN BIJ HOMEOSTASE EN GEEN BEWEGWIJZERING, DE PROTEOLITISCHE ROUTE GELEID DOOR DE N-TERMINALSEQUENTIE, ERFVII-FACTOREN, EN EEN VERZAMELING LIJNEN DIE VOORWAARDELIJK UITDRUKKEN ROND 1000 TFS VAN ARABIDOPSIS. DIT PROJECT WORDT AFGEROND MET EEN DERDE DOELSTELLING DIE DE LANGVERWACHTE GENERATIE SENSOREN IN INSTALLATIE NR. OVERWEEGT. DEZE DOELSTELLING IS GEBASEERD OP HET SENSORMECHANISME VAN NIET GEBASEERD OP OXIDATIE DIE STRIKT WORDT GEMEDIEERD DOOR O2 EN NIET OP HET C2-RESIDU VAN DE ERFVII-FACTOREN EN DE AFBRAAK ERVAN AFHANKELIJK VAN DE N-TERMINALSEQUENTIE (DEGRON). DE SENSOREN DIE WE WILLEN GENEREREN ZULLEN TRANSLATIONELE FUSIES VAN RAPPORTERENDE EIWITTEN (FLUORESECENTS OF LUCIFERASES) UITDRUKKEN MET DE BIJBEHORENDE DEGRON DIE, ALS ZE GOED FUNCTIONEREN, DE KWANTIFICERING VAN ENDOGENE NIVEAUS VAN NO IN PLANTEN MOGELIJK MAAKT. TOT SLOT, ALS DE GETESTE DEGRONES CORRECT WERKEN, ZULLEN WE EEN EERSTE ONDERZOEK DOEN NAAR DE BIOTECHNOLOGISCHE MOGELIJKHEDEN VAN EEN INSTRUMENT ALS DIT OM DE AFBRAAK VAN EIWITTEN VAN LANDBOUWBELANG TE BEHEERSEN. (Dutch)
17 December 2021
0 references
LE PIANTE NORMALMENTE CRESCONO IN CONDIZIONI NORMOXICAL, MA ALCUNI DEI LORO ORGANI O TESSUTI HANNO UNA DISPONIBILITÀ RELATIVAMENTE BASSA DI O2 (IPOSSIA). LE CONDIZIONI IPOSSICHE SONO DI SOLITO TRANSITORIE E LO SVILUPPO PROGREDISCE ATTRAVERSO UNA TRANSIZIONE ALLA NORMOSSIA. L'IPOSSIA È ANCORA PIÙ COMUNE NELLE PIANTE IN CONDIZIONI AMBIENTALI AVVERSE COME QUELLE SPERIMENTATE NEI CAMPI INONDATI DOPO PIOGGE TORRENZIALI. IL PROCESSO DI DEOSSIGENAZIONE (DE-OX) SOFFERTO DALLE PIANTE IN IPOSSIA È ACCOMPAGNATO DA CAMBIAMENTI NEL METABOLISMO, ESPRESSIONE GENETICA E STABILITÀ E MODIFICAZIONE DELLE PROTEINE. IN PARTICOLARE, LE PIANTE SOTTO IPOSSIA PRODUCONO OSSIDO NITRICO (NO) A SEGUITO DELL'USO DI NITRITO INVECE DELL'OSSIGENO MOLECOLARE COME ACCETTORE DI ELETTRONI DELLA CATENA RESPIRATORIA MITOCONDRIALE. LE FUNZIONI DELL'O2 E DEL NON SONO INTIMAMENTE LEGATE AL CONTROLLO DELLA DEGRADAZIONE DEI FATTORI DI TRASCRIZIONE (TFS) DEL GRUPPO VII DELLA FAMIGLIA ERF ATTRAVERSO UN PROCESSO PROTEOLITICO MEDIATO DALLA SEQUENZA N-TERMINALE (DEGRON) CHE RICHIEDE L'ESTREMITÀ N-TERMINALE ARGINILACION. QUESTO PROCESSO È DI PER SÉ RILEVANTE PER IL CONTROLLO DELLE RISPOSTE ALL'IPOSSIA. QUANDO LE CONDIZIONI HIPOXICAL SCOMPAIONO, LE PIANTE SUBISCONO UN PROCESSO DI RIOSSIGENAZIONE (RE-OX) CHE FINISCONO DI NUOVO IN CONDIZIONI NORMOXICAL E SI VERIFICANO IN PARALLELO CON UN'ELEVATA PRODUZIONE DI SPECIE DI OSSIGENO REATTIVO (ROS). QUESTE SPECIE SONO DELETEREAS PER LA PIANTA E NELLA SUA DISINTOSSICAZIONE SEMBRA SVOLGERE UN RUOLO IMPORTANTE CHE NON È PRODOTTO DURANTE L'IPOSSIA. GLI OBIETTIVI 1 E 2 DI QUESTO PROGETTO PROPONGONO LA CARATTERIZZAZIONE MOLECOLARE DEGLI EVENTI CHE SI SVOLGONO DURANTE IL DE-OX E IL RE-OX ATTRAVERSO UNA COMBINAZIONE DI STRATEGIE NON MIRATE BASATE SU STRUMENTI OMICI, E UN'ALTRA VOLTA ALLA FUNZIONE DI TFS. QUESTI APPROCCI BENEFICERANNO DELLA DISPONIBILITÀ IN LABORATORIO DI UNA VASTA COLLEZIONE DI MUTANTI E LINEE TRANSGENICHE SOVRAESPRESSORI DI CIASCUNO DEI COMPONENTI COINVOLTI NELL'OMEOSTASI E NESSUNA SEGNALETICA, IL PERCORSO PROTEOLITICO GUIDATO DALLA SEQUENZA N-TERMINALE, FATTORI ERFVII, E UNA RACCOLTA DI LINEE CHE ESPRIMONO CONDIZIONATAMENTE CIRCA 1000 TFS DI ARABIDOPSIS. QUESTO PROGETTO SI COMPLETA CON UN TERZO OBIETTIVO CHE CONTEMPLA LA TANTO ATTESA GENERAZIONE DI SENSORI NELL'IMPIANTO N. TALE OBIETTIVO SI BASA SUL MECCANISMO DEI SENSORI NON BASATO SULL'OSSIDAZIONE MEDIATA RIGOROSAMENTE DA O2 E NON SUL RESIDUO C2 DEI FATTORI ERFVII E SULLA SUA DEGRADAZIONE DIPENDENTE DALLA SEQUENZA N-TERMINALE (DEGRON). I SENSORI CHE INTENDIAMO GENERARE ESPRIMERANNO FUSIONI TRASLAZIONALI DI PROTEINE SEGNALANTI (FLUORESECENTS O LUCIFERASI) CON I CORRISPONDENTI DEGRON CHE, SE FUNZIONANO CORRETTAMENTE, CONSENTIRANNO LA QUANTIFICAZIONE DEI LIVELLI ENDOGENI DI NO NELLE PIANTE. INFINE, SE I DEGRONES TESTATI FUNZIONANO CORRETTAMENTE, FAREMO UN'ESPLORAZIONE PRELIMINARE DELLE POTENZIALITÀ BIOTECNOLOGICHE DI UNO STRUMENTO COME QUESTO PER CONTROLLARE LA DEGRADAZIONE DELLE PROTEINE DI INTERESSE AGRICOLO. (Italian)
16 January 2022
0 references
ΤΑ ΦΥΤΆ ΑΝΑΠΤΎΣΣΟΝΤΑΙ ΣΥΝΉΘΩΣ ΥΠΌ ΚΑΝΟΝΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ, ΑΛΛΆ ΕΊΝΑΙ ΣΧΕΤΙΚΆ ΣΎΝΗΘΕΣ ΟΡΙΣΜΈΝΑ ΌΡΓΑΝΑ/ΙΣΤΟΊ ΝΑ ΥΦΊΣΤΑΝΤΑΙ ΧΑΜΗΛΉ ΔΙΑΘΕΣΙΜΌΤΗΤΑ Ο2 (ΥΠΟΞΊΑ) ΚΑΘ’ ΌΛΗ ΤΗ ΔΙΆΡΚΕΙΑ ΤΗΣ ΑΝΆΠΤΥΞΗΣ. ΟΙ ΥΠΟΞΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΕΊΝΑΙ ΣΥΝΉΘΩΣ ΠΑΡΟΔΙΚΈΣ ΚΑΙ Η ΑΝΑΠΤΥΞΙΑΚΉ ΠΡΌΟΔΟΣ ΜΕ ΤΗ ΜΕΤΆΒΑΣΗ ΣΤΗ ΝΟΡΜΟΞΊΑ. Η ΥΠΟΞΊΑ ΕΊΝΑΙ ΑΚΌΜΗ ΠΙΟ ΣΥΧΝΉ ΌΤΑΝ ΤΑ ΦΥΤΆ ΑΝΤΙΜΕΤΩΠΊΖΟΥΝ ΔΥΣΜΕΝΕΊΣ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ, ΌΠΩΣ ΠΛΗΜΜΎΡΕΣ ΜΕΤΆ ΑΠΌ ΈΝΤΟΝΕΣ ΒΡΟΧΟΠΤΏΣΕΙΣ. Η ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑ ΑΠΟΟΞΥΓΌΝΩΣΗΣ (DE-OX) ΣΤΗΝ ΟΠΟΊΑ ΥΠΟΒΆΛΛΟΝΤΑΙ ΤΑ ΦΥΤΆ ΥΠΌ ΥΠΟΞΊΑ ΣΥΝΟΔΕΎΕΤΑΙ ΑΠΌ ΑΛΛΑΓΈΣ ΣΤΟ ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΌ, ΤΗΝ ΈΚΦΡΑΣΗ ΤΩΝ ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΚΑΙ ΤΗΝ ΤΡΟΠΟΠΟΊΗΣΗ ΚΑΙ ΤΗ ΣΤΑΘΕΡΌΤΗΤΑ ΤΩΝ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ. ΕΙΔΙΚΌΤΕΡΑ, ΤΑ ΦΥΤΆ ΠΑΡΆΓΟΥΝ ΜΟΝΟΞΕΊΔΙΟ ΤΟΥ ΑΖΏΤΟΥ (ΑΡΙΘ.) ΥΠΌ ΥΠΟΞΊΑ ΩΣ ΑΠΟΤΈΛΕΣΜΑ ΤΗΣ ΜΙΤΟΧΟΝΔΡΙΑΚΉΣ ΑΛΥΣΊΔΑΣ ΑΝΑΠΝΟΉΣ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ ΝΙΤΡΏΔΗ ΑΝΤΊ ΤΟΥ Ο2 ΩΣ ΔΈΚΤΗ ΗΛΕΚΤΡΟΝΊΩΝ. ΟΙ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΕΣ ΤΟΥ O2 ΚΑΙ ΤΟΥ NO ΣΥΝΔΈΟΝΤΑΙ ΣΤΕΝΆ ΜΕ ΤΟΝ ΈΛΕΓΧΟ ΤΗΣ ΠΡΩΤΕΌΛΥΣΗΣ ΤΗΣ ΟΜΆΔΑΣ VII ΤΩΝ ΠΑΡΑΓΌΝΤΩΝ ΜΕΤΑΓΡΑΦΉΣ ERF (TFS) ΜΈΣΩ ΜΙΑΣ N-ΤΕΡΜΑΤΙΚΉΣ ΑΚΟΛΟΥΘΊΑΣ (DEGRON)-MEDIATED ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑ ΥΠΟΒΆΘΜΙΣΗΣ, Η ΟΠΟΊΑ ΕΜΦΑΝΊΖΕΤΑΙ ΜΈΣΩ ΤΗΣ ΛΕΓΌΜΕΝΗΣ ΔΙΑΔΡΟΜΉΣ ΚΑΝΌΝΩΝ ARG/N-END. ΑΥΤΉ Η ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑ ΕΊΝΑΙ Η ΊΔΙΑ ΣΧΕΤΙΚΉ ΜΕ ΤΟΝ ΈΛΕΓΧΟ ΤΩΝ ΑΠΟΚΡΊΣΕΩΝ ΣΤΗΝ ΥΠΟΞΊΑ. ΌΤΑΝ ΟΙ ΥΠΟΞΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ ΞΕΠΕΡΆΣΟΥΝ, ΤΑ ΦΥΤΆ ΒΙΏΝΟΥΝ ΜΙΑ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑ ΕΠΑΝΟΞΥΓΌΝΩΣΗΣ (RE-OX) ΠΟΥ ΤΕΛΕΙΏΝΕΙ ΜΕ ΤΙΣ ΚΑΝΟΝΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ. Η ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑ ΕΠΑΝΟΞΥΓΌΝΩΣΗΣ ΕΚΤΕΛΕΊΤΑΙ ΜΕ ΤΗΝ ΙΣΧΥΡΉ ΠΑΡΑΓΩΓΉ ΑΝΤΙΔΡΑΣΤΙΚΏΝ ΕΙΔΏΝ ΟΞΥΓΌΝΟΥ (ROS). ΤΑ ΥΨΗΛΆ ΕΠΊΠΕΔΑ ROS ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΕΊΝΑΙ ΕΠΙΒΛΑΒΉ ΓΙΑ ΤΟ ΦΥΤΌ ΚΑΙ ΈΧΕΙ ΑΝΑΦΕΡΘΕΊ ΌΤΙ ΤΟ NO ΜΠΟΡΕΊ ΝΑ ΔΙΑΔΡΑΜΑΤΊΣΕΙ ΟΥΣΙΑΣΤΙΚΌ ΡΌΛΟ ΣΤΗΝ ΑΝΤΙΜΕΤΏΠΙΣΗ ΤΩΝ ΕΠΙΠΤΏΣΕΩΝ ΠΟΥ ΣΥΝΔΈΟΝΤΑΙ ΜΕ ROS. ΣΤΟΥΣ ΣΤΌΧΟΥΣ 1 ΚΑΙ 2 ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ ΈΡΓΟΥ, ΘΑ ΑΣΧΟΛΗΘΟΎΜΕ ΜΕ ΤΟΝ ΜΟΡΙΑΚΌ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΜΌ ΤΩΝ ΓΕΓΟΝΌΤΩΝ ΠΟΥ ΣΥΜΒΑΊΝΟΥΝ ΚΑΤΆ ΤΗ ΔΙΆΡΚΕΙΑ ΤΗΣ ΑΠΟΤΟΞΊΝΩΣΗΣ ΚΑΙ ΤΗΣ ΕΠΑΝΑΤΟΞΙΚΌΤΗΤΑΣ ΧΡΗΣΙΜΟΠΟΙΏΝΤΑΣ ΈΝΑΝ ΣΥΝΔΥΑΣΜΌ ΑΜΕΡΌΛΗΠΤΩΝ ΩΜΙΚΏΝ ΠΟΥ ΒΑΣΊΖΟΝΤΑΙ ΣΤΗΝ ΑΝΑΖΉΤΗΣΗ ΡΥΘΜΙΣΤΙΚΏΝ ΠΑΡΑΓΌΝΤΩΝ ΚΑΙ ΠΑΡΑΓΌΝΤΩΝ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΜΙΑ ΣΤΟΧΕΥΜΈΝΗ ΠΡΟΣΈΓΓΙΣΗ ΠΟΥ ΘΑ ΕΠΙΚΕΝΤΡΏΝΕΤΑΙ ΣΤΗΝ TFS. ΙΔΙΑΊΤΕΡΗ ΈΜΦΑΣΗ ΘΑ ΔΟΘΕΊ ΣΤΙΣ ΚΑΝΟΝΙΣΤΙΚΈΣ ΣΥΝΙΣΤΏΣΕΣ ΠΟΥ ΣΧΕΤΊΖΟΝΤΑΙ ΜΕ ΤΗΝ ΑΠΟΥΣΊΑ ΟΜΟΙΌΣΤΑΣΗΣ ΚΑΙ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗΣ. ΟΙ ΠΡΟΣΕΓΓΊΣΕΙΣ ΑΥΤΈΣ ΘΑ ΩΦΕΛΗΘΟΎΝ ΣΕ ΜΕΓΆΛΟ ΒΑΘΜΌ ΑΠΌ ΤΗ ΔΙΑΘΕΣΙΜΌΤΗΤΑ ΣΤΟ ΕΡΓΑΣΤΉΡΙΟ ΜΙΑΣ ΣΥΛΛΟΓΉΣ ΜΕΤΑΛΛΆΞΕΩΝ ΚΑΙ ΥΠΕΡΕΚΦΡΑΣΜΈΝΩΝ ΔΙΑΓΟΝΙΔΙΑΚΏΝ ΓΡΑΜΜΏΝ ΠΟΥ ΑΝΤΙΣΤΟΙΧΟΎΝ ΣΤΑ ΠΕΡΙΣΣΌΤΕΡΑ ΑΠΌ ΤΑ ΣΥΣΤΑΤΙΚΆ ΠΟΥ ΕΜΠΛΈΚΟΝΤΑΙ ΣΤΗΝ ΟΜΟΙΌΣΤΑΣΗ ΚΑΙ ΣΗΜΑΤΟΔΌΤΗΣΗ, ΣΤΗΝ ΠΡΩΤΕΟΛΥΤΙΚΉ ΟΔΌ ΚΑΝΌΝΑ N-END ΚΑΙ ΣΤΟ ERFVIIS, ΚΑΘΏΣ ΚΑΙ ΣΕ ΜΙΑ ΣΥΛΛΟΓΉ ΔΙΑΓΟΝΙΔΙΑΚΏΝ ΓΡΑΜΜΏΝ ΠΟΥ ΕΚΦΡΆΖΟΥΝ ΥΠΌ ΌΡΟΥΣ ΠΕΡΊΠΟΥ 1000 ΑΡΑΒΙΔΌΠΣΗ TFS. ΤΟ ΈΡΓΟ ΟΛΟΚΛΗΡΏΝΕΤΑΙ ΜΕ ΈΝΑΝ ΤΡΊΤΟ ΣΤΌΧΟ ΠΟΥ ΘΑ ΑΝΤΙΜΕΤΩΠΊΣΕΙ ΤΗΝ ΑΝΥΠΌΜΟΝΑ ΑΝΑΜΕΝΌΜΕΝΗ ΓΕΝΙΆ ΤΩΝ ΑΙΣΘΗΤΉΡΩΝ PLANTA NO. ΤΟ ΣΚΕΠΤΙΚΌ ΜΑΣ ΓΙΑ ΤΟΝ ΣΤΌΧΟ ΑΥΤΌ ΒΑΣΊΖΕΤΑΙ ΣΤΟΝ ΜΗΧΑΝΙΣΜΌ ΜΗ ΑΝΊΧΝΕΥΣΗΣ ΠΟΥ ΠΡΟΤΕΊΝΑΜΕ ΤΕΛΕΥΤΑΊΑ, Ο ΟΠΟΊΟΣ ΠΕΡΙΛΑΜΒΆΝΕΙ ΤΗΝ Ο2 ΚΑΙ ΤΗΝ ΜΗ ΕΞΑΡΤΏΜΕΝΗ ΟΞΕΊΔΩΣΗ ΤΟΥ ΥΠΟΛΕΊΜΜΑΤΟΣ C2 ΤΗΣ ERFVIIS ΚΑΙ ΤΗΝ ΕΠΑΚΌΛΟΥΘΗ ΑΠΟΔΌΜΗΣΗ ΤΟΥΣ ΜΈΣΩ ΤΟΥ N-END RULE PATHWAY MACHINE. Ο ΑΙΣΘΗΤΉΡΑΣ ΠΟΥ ΔΕΝ ΣΚΟΠΕΎΟΥΜΕ ΝΑ ΚΑΤΑΣΚΕΥΆΣΟΥΜΕ ΘΑ ΕΚΦΡΆΣΕΙ ΤΙΣ ΜΕΤΑΦΡΆΣΕΙΣ ΤΩΝ Ν-ΤΕΡΜΑΤΙΚΏΝ DEGRONS ΜΕ ΦΘΟΡΊΖΟΥΣΕΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ Ή ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ ΛΟΥΣΙΦΕΡΆΣΗΣ ΡΕΠΌΡΤΕΡ, ΚΑΙ, ΑΝ ΕΊΝΑΙ ΕΠΙΤΥΧΉΣ, ΘΑ ΕΠΙΤΡΈΨΟΥΝ ΤΟΝ ΠΟΣΟΤΙΚΌ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΌ ΕΝΔΟΓΕΝΏΝ ΕΠΙΠΈΔΩΝ ΚΑΝΈΝΑ ΕΠΊΠΕΔΟ ΣΤΑ ΦΥΤΆ. ΤΈΛΟΣ, ΕΆΝ ΔΟΚΙΜΑΣΤΕΊ ΤΟ DEGRONS ΛΕΙΤΟΥΡΓΟΎΝ ΣΩΣΤΆ, ΣΧΕΔΙΆΖΟΥΜΕ ΝΑ ΚΆΝΟΥΜΕ ΜΙΑ ΠΡΟΚΑΤΑΡΚΤΙΚΉ ΜΕΛΈΤΗ ΤΟΥ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΟΎ ΔΥΝΑΜΙΚΟΎ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ ΕΡΓΑΛΕΊΟΥ ΓΙΑ ΤΟΝ ΈΛΕΓΧΟ ΤΗΣ ΑΠΟΔΌΜΗΣΗΣ ΤΩΝ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ ΜΕ ΓΕΩΡΓΙΚΌ ΕΝΔΙΑΦΈΡΟΝ. (Greek)
17 August 2022
0 references
PLANTER VOKSER NORMALT UNDER NORMOXISKE FORHOLD, MEN DET ER RELATIVT ALMINDELIGT, AT VISSE ORGANER/VÆV GENNEMGÅR LAV O2-TILGÆNGELIGHED (HYPOXIA) UNDER HELE UDVIKLINGEN. HYPOXISKE TILSTANDE ER NORMALT FORBIGÅENDE OG UDVIKLINGSFREMSKRIDT MED OVERGANGEN TIL NORMOXIA. HYPOXI ER ENDNU HYPPIGERE, NÅR PLANTER STÅR OVER FOR UGUNSTIGE MILJØFORHOLD SOM F.EKS. OVERSVØMMELSER EFTER KRAFTIGE REGNSKYL. DEOXYGENATIONSPROCESSEN (DE-OX), SOM PLANTER GENNEMGÅR UNDER HYPOXI, LEDSAGES AF ÆNDRINGER I PROTEINERNES METABOLISME, GENEKSPRESSION OG MODIFIKATION OG STABILITET. PLANTER PRODUCERER NAVNLIG NITROGENOXID (NO) UNDER HYPOXI SOM FØLGE AF MITOKONDRIE RESPIRATIONSKÆDE VED HJÆLP AF NITRIT I STEDET FOR O2 SOM ELEKTRONACCEPTOR. FUNKTIONERNE I O2 OG NO ER TÆT KNYTTET TIL KONTROLLEN AF PROTEOLYSE AF GRUPPE VII AF ERF TRANSKRIPTIONSFAKTORER (TFS) GENNEM EN N-TERMINALSEKVENS (DEGRON)-MEDIATED NEDBRYDNINGSPROCES, SOM SKER GENNEM DEN SÅKALDTE ARG/N-END REGEL STI. DENNE PROCES ER I SIG SELV RELEVANT FOR AT KONTROLLERE REAKTIONERNE PÅ HYPOXI. NÅR HYPOXISKE FORHOLD ER OVERSTÅET, OPLEVER PLANTER EN GENILTNINGSPROCES (REOX), DER ENDER MED NORMOXISKE FORHOLD. GENILTNINGSPROCESSEN KØRER MED EN STÆRK PRODUKTION AF REAKTIVE OXYGENARTER (ROS). DE HØJE ROS-NIVEAUER KAN VÆRE SKADELIGE FOR ANLÆGGET, OG DET ER BLEVET RAPPORTERET, AT NO KAN SPILLE EN VÆSENTLIG ROLLE I AT MODVIRKE ROS-UDLØSEDE VIRKNINGER. I DETTE PROJEKTS MÅL 1 OG 2 VIL VI BEHANDLE DEN MOLEKYLÆRE KARAKTERISERING AF DE BEGIVENHEDER, DER OPSTÅR UNDER DEOX OG REOX, VED AT ANVENDE EN KOMBINATION AF NON-BIASED OMICS-BASERET SØGNING EFTER REGULERINGS- OG SIGNALFAKTORER OG EN MÅLRETTET TILGANG MED FOKUS PÅ TFS. DER VIL BLIVE LAGT SÆRLIG VÆGT PÅ DE LOVGIVNINGSMÆSSIGE KOMPONENTER I FORBINDELSE MED INGEN HOMEOSTASE OG SIGNALERING. DISSE TILGANGE VIL I HØJ GRAD DRAGE FORDEL AF TILGÆNGELIGHEDEN I LABORATORIET AF EN SAMLING AF MUTANTER OG OVEREKSPRIMERENDE TRANSGENE LINJER SVARENDE TIL DE FLESTE AF DE KOMPONENTER, DER ER INVOLVERET I NO HOMEOSTASIS OG SIGNALERING, N-END REGEL PROTEOLYTISK VEJ OG ERFVIIS, OG EN SAMLING AF TRANSGENE LINJER BETINGET UDTRYKKER OMKRING 1000 ARABIDOPSIS TFS. PROJEKTET ER AFSLUTTET MED ET TREDJE MÅL, DER VIL TAGE FAT PÅ DEN IVRIGT VENTEDE GENERATION AF I PLANTA NO SENSORER. VORES BEGRUNDELSE FOR DETTE MÅL ER BASERET PÅ NO-SENSING-MEKANISMEN, SOM VI HAR FORESLÅET PÅ DET SENESTE, OG SOM OMFATTER O2 OG NO-AFHÆNGIG OXIDATION AF C2-RESTER AF ERFVIIS OG DERES EFTERFØLGENDE NEDBRYDNING GENNEM N-END-REGELVEJENE. DEN NO SENSOR VI HAR TIL HENSIGT AT KONSTRUERE VIL UDTRYKKE TRANSLATIONELLE FUSIONER AF N-TERMINAL DEGRONS MED REPORTER FLUORESCERENDE ELLER LUCIFERASE PROTEINER, OG HVIS DET LYKKES, VIL DE TILLADE KVANTIFICERING AF ENDOGENE INGEN NIVEAUER I PLANTER. ENDELIG, HVIS TESTET DEGRONS FUNGERER KORREKT, PLANLÆGGER VI AT FORETAGE EN INDLEDENDE UNDERSØGELSE AF DET BIOTEKNOLOGISKE POTENTIALE I DETTE VÆRKTØJ TIL AT KONTROLLERE NEDBRYDNINGEN AF PROTEINER MED LANDBRUGSINTERESSE. (Danish)
17 August 2022
0 references
KASVIT KASVAVAT YLEENSÄ NORMOKSISISSA OLOSUHTEISSA, MUTTA ON SUHTEELLISEN YLEISTÄ, ETTÄ TIETYISSÄ ELIMISSÄ/KUDOKSISSA ON ALHAINEN O2-SAATAVUUS (HYPOKSIA) KOKO KEHITYKSEN AJAN. HYPOKSISET OLOSUHTEET OVAT YLEENSÄ OHIMENEVIÄ JA KEHITYKSEN EDISTYMISTÄ SIIRRYTTÄESSÄ NORMOKSIAAN. HYPOKSIAA ESIINTYY VIELÄKIN USEAMMIN SILLOIN, KUN KASVIT KÄRSIVÄT EPÄSUOTUISISTA YMPÄRISTÖOLOSUHTEISTA, KUTEN TULVISTA RANKKASATEIDEN JÄLKEEN. HAPENPOISTOPROSESSIIN (DE-OX) LIITTYY MUUTOKSIA PROTEIINIEN METABOLIASSA, GEENIEN ILMENTYMISESSÄ JA MUUNTAMISESSA SEKÄ PROTEIINIEN PYSYVYYDESSÄ. ERITYISESTI LAITOKSET TUOTTAVAT TYPPIOKSIDIA (EI) HYPOKSIASSA MITOKONDRIOIDEN HENGITYSKETJUSSA, JOSSA KÄYTETÄÄN NITRIITTIÄ ELEKTRONIN HYVÄKSYJÄNÄ O2:N SIJAAN. O2:N JA NO:N TOIMINNOT LIITTYVÄT TIIVIISTI ERF:N TRANSKRIPTIOTEKIJÖIDEN RYHMÄN VII PROTEOLYYSIN HALLINTAAN N-TERMINAALISEKVENSSIN (DEGRON)-MEDIATED-HAJOAMISPROSESSIN AVULLA, JOKA TAPAHTUU NS. ARG/N-PÄÄN SÄÄNTÖREITIN KAUTTA. TÄMÄ PROSESSI ON ITSESSÄÄN MERKITYKSELLINEN HYPOKSIAN VASTEEN HALLITSEMISEKSI. KUN HYPOKSISET OLOSUHTEET OVAT OHI, KASVIT KOKEVAT UUDELLEENHAPPIA (UUDELLEENOX) PROSESSI, JOKA PÄÄTTYY NORMOXIC OLOSUHTEISSA. UUDELLEENHAPETUSPROSESSISSA TUOTETAAN VOIMAKKAASTI REAKTIIVISIA HAPPILAJEJA (ROS). KORKEAT ROS-PITOISUUDET VOIVAT OLLA TUHOISIA LAITOKSELLE, JA ON RAPORTOITU, ETTÄ EI VOI OLLA OLENNAINEN ROOLI ROS:N LAUKAISEMIEN VAIKUTUSTEN TORJUNNASSA. TÄMÄN HANKKEEN TAVOITTEISSA 1 JA 2 TARKASTELEMME OX- JA RE-OX-AIKANA TAPAHTUVIEN TAPAHTUMIEN MOLEKYYLILUOKITTELUA KÄYTTÄMÄLLÄ YHDISTELMÄÄ, JOSSA ETSITÄÄN PUOLUEETTOMIA OMIIKKA- JA SÄÄNTELY- JA MERKINANTOTEKIJÖITÄ, JA KOHDENNETTUA LÄHESTYMISTAPAA, JOSSA KESKITYTÄÄN TFS:ÄÄN. ERITYISTÄ HUOMIOTA KIINNITETÄÄN SÄÄNTELYN KOMPONENTTEIHIN, JOTKA LIITTYVÄT HOMEOSTAASIIN JA MERKINANTOON. NÄMÄ LÄHESTYMISTAVAT HYÖTYVÄT SUURESTI SIITÄ, ETTÄ LABORATORIOSSA ON SAATAVILLA KOKOELMA MUTANTTEJA JA YLIILMAISEVIA SIIRTOGEENISIÄ LINJOJA, JOTKA VASTAAVAT USEIMPIA KOMPONENTTEJA, JOTKA LIITTYVÄT HOMEOSTAASIIN JA SIGNALOINTIIN, N-END-SÄÄNTÖ PROTEOLYYTTISEEN REITTIIN JA ERFVIISIIN SEKÄ KOKOELMA SIIRTOGEENISIÄ LINJOJA, JOTKA ILMAISEVAT EHDOLLISESTI NOIN 1000 ARABIDOPSIS TFS:ÄÄ. HANKETTA TÄYDENTÄÄ KOLMAS TAVOITE, JOKA KOSKEE INNOKKAASTI ODOTETTUA PLANTA NO -TUNNISTIMIEN TUOTANTOA. PERUSTELUMME TÄLLE TAVOITTEELLE PERUSTUU VIIME AIKOINA EHDOTTAMAAMME EI-HAVAINNOINTIMEKANISMIIN, JOHON LIITTYY ERFVIISIN C2-JÄÄNNÖKSEN O2:N HAPETTUMINEN JA SEN MYÖHEMPI HAJOAMINEN N-PÄÄN SÄÄNNÖN REITTIKONEISTON KAUTTA. EI ANTURIA, JONKA AIOMME RAKENTAA, ILMAISEE N-TERMINAALIEN DEGRONS-TRANSLAATIOFUUSIOITA REPORTTERIN FLUORESOIVILLA TAI LUSIFERAASIPROTEIINEILLA, JA ONNISTUESSAAN NE MAHDOLLISTAVAT ENDOGEENISTEN PITOISUUKSIEN KVANTIFIOINNIN KASVEISSA. LOPUKSI, JOS DEGRONS-TESTIT TOIMIVAT KUNNOLLA, AIOMME TEHDÄ ALUSTAVAN TUTKIMUKSEN TÄMÄN VÄLINEEN BIOTEKNOLOGISISTA MAHDOLLISUUKSISTA HALLITA MAATALOUTEEN LIITTYVIEN PROTEIINIEN HAJOAMISTA. (Finnish)
17 August 2022
0 references
IL-PJANTI NORMALMENT JIKBRU TAĦT KUNDIZZJONIJIET NORMOXIĊI IŻDA HUWA RELATTIVAMENT KOMUNI LI ĊERTI ORGANI/TESSUTI JGĦADDU MINN DISPONIBBILTÀ BAXXA TA’ O2 (IPOKSJA) MATUL L-IŻVILUPP. IL- KUNDIZZJONIJIET IPOSSIĊI NORMALMENT JGĦADDU MALAJR U L- PROGRESS FL- IŻVILUPP BIT- TRANŻIZZJONI GĦAL NORMOXIA. IPOKSJA HIJA SAĦANSITRA AKTAR FREKWENTI META PJANTI JIFFAĊĊJAW KUNDIZZJONIJIET AMBJENTALI ĦŻIENA BĦAL GĦARGĦAR WARA XITA QAWWIJA. IL-PROĊESS TA’ DE-OSSIĠENAZZJONI (DE-OX) LI L-PJANTI JGĦADDU MINNU TAĦT IPOKSJA HUWA AKKUMPANJAT MINN BIDLIET FIL-METABOLIŻMU, L-ESPRESSJONI TAL-ĠENI U L-MODIFIKA U L-ISTABBILTÀ TAL-PROTEINI. B’MOD PARTIKOLARI, IL-PJANTI JIPPRODUĊU L-OSSIDU NITRIKU (NRU) TAĦT IPOKSJA BĦALA RIŻULTAT TAL-KATINA TAR-RESPIRAZZJONI MITOKONDRIJALI BL-UŻU TA’ NITRIT MINFLOK O2 BĦALA AĊĊETTATUR TAL-ELETTRONI. IL-FUNZJONIJIET TA’ O2 U NRU HUMA MARBUTA MILL-QRIB MAL-KONTROLL TAL-PROTEOLISI TAL-GRUPP VII TAL-FATTURI TA’ TRASKRIZZJONI TAL-ERF (TFS) PERMEZZ TA’ PROĊESS TA’ DEGRADAZZJONI TA’ SEKWENZA N-TERMINAL (DEGRON)-MEDIATED, LI JSEĦĦ PERMEZZ TAL-HEKK IMSEJJAĦ MOGĦDIJA TAR-REGOLA ARG/N-END. DAN IL-PROĊESS HUWA MINNU NNIFSU RILEVANTI GĦALL-KONTROLL TAR-REAZZJONIJIET GĦALL-IPOKSJA. META L-KUNDIZZJONIJIET HYPOXIC HUMA FUQ, PJANTI JESPERJENZAW RI-OSSIĠENAZZJONI (RE-OX) PROĊESS LI JISPIĊĊA BIL-KUNDIZZJONIJIET NORMOXIC. IL-PROĊESS TA’ RIOSSIĠENAZZJONI JAĦDEM BIL-PRODUZZJONI QAWWIJA TA’ SPEĊI TA’ OSSIĠENU REATTIV (ROS). IL-LIVELLI GĦOLJIN TA’ ROS JISTGĦU JKUNU TA’ ĦSARA GĦALL-IMPJANT U ĠIE RRAPPURTAT LI L-EBDA WIEĦED MA JISTA’ JKOLLU RWOL ESSENZJALI BIEX JIKKONTROBATTI L-EFFETTI SKATTJATI MILL-ROS. FL-OBJETTIVI 1 U 2 TA’ DAN IL-PROĠETT, AĦNA SE NINDIRIZZAW IL-KARATTERIZZAZZJONI MOLEKULARI TAL-AVVENIMENTI LI JSEĦĦU MATUL DE-OX U RE-OX BL-UŻU TA’ KOMBINAZZJONI TA’ TIFTIX MHUX PREĠUDIKAT IBBAŻAT FUQ L-OMICS GĦAL FATTURI REGOLATORJI U TA’ SINJALAR, U APPROĊĊ IMMIRAT LI JIFFOKA FUQ IT-TFS. SE SSIR ENFASI SPEĊJALI FUQ IL-KOMPONENTI REGOLATORJI RELATATI MAL-EBDA OMEOSTAŻI U S-SINJALAR. DAWN L-APPROĊĊI FIL-BIĊĊA L-KBIRA SE JIBBENEFIKAW MID-DISPONIBBILTÀ FIL-LABORATORJU TA’ ĠABRA TA’ MUTANTI U LINJI TRANSĠENIĊI LI JESPRIMU ŻŻEJJED LI JIKKORRISPONDU GĦALL-BIĊĊA L-KBIRA TAL-KOMPONENTI INVOLUTI FL-EBDA OMEOSTAŻI U SINJALAR, IR-REGOLA N-END PROTEOLITIKA U ERFVIIS, U ĠABRA TA’ LINJI TRANSĠENIĊI LI JESPRIMU B’MOD KONDIZZJONALI MADWAR 1000 GĦARBI TAT-TFS. IL-PROĠETT JITLESTA PERMEZZ TA ‘TIELET GĦAN LI SE TINDIRIZZA L-ĠENERAZZJONI EAGERLY MISTENNIJA TA’ FIS-SENSURI PLANTA NRU. IR-RAĠUNAMENT TAGĦNA GĦAL DAN L-GĦAN HUWA BBAŻAT FUQ IL-MEKKANIŻMU NO SENSING LI PPROPONEJNA DAN L-AĦĦAR LI JINVOLVI L-OSSIDAZZJONI O2 U L-EBDA DIPENDENZA TAR-RESIDWU C2 TA’ ERFVIIS U D-DEGRADAZZJONI SUSSEGWENTI TAGĦHOM PERMEZZ TAL-MAKKINARJU TAL-MOGĦDIJA TAR-REGOLA N-END. IS-SENSUR NRU GĦANDNA L-INTENZJONI LI JINBENA SE ESPRESS FUŻJONI TRASLAZZJONALI TA ‘N-TERMINAL DEGRONS MA’ PROTEINI REPORTER FLUWOREXXENTI JEW LUCIFERASE, U, JEKK JIRNEXXI, DAWN SE JIPPERMETTU L-KWANTIFIKAZZJONI TA ‘LIVELLI EBDA ENDOĠENI FIL-PJANTI. FL-AĦĦAR NETT, JEKK JIĠU TTESTJATI DEGRONS JAĦDMU KIF SUPPOST, QED NIPPJANAW LI NAGĦMLU STUDJU PRELIMINARI TAL-POTENZJAL BIJOTEKNOLOĠIKU TA ‘DIN L-GĦODDA BIEX TIKKONTROLLA D-DEGRADAZZJONI TAL-PROTEINI B’INTERESS AGRIKOLU. (Maltese)
17 August 2022
0 references
AUGI PARASTI AUG NORMĀLOS APSTĀKĻOS, BET TAS IR SALĪDZINOŠI BIEŽI, KA DAŽI ORGĀNI/AUDI IZIET ZEMU O2 PIEEJAMĪBU (HIPOKSIJA) VISĀ ATTĪSTĪBAS LAIKĀ. HIPOKSISKIE STĀVOKĻI PARASTI IR PĀREJOŠI UN ATTĪSTĪBAS GAITA LĪDZ AR PĀREJU UZ NORMOKSIJU. HIPOKSIJA IR VĒL BIEŽĀKA, KAD AUGI SASKARAS AR NELABVĒLĪGIEM VIDES APSTĀKĻIEM, PIEMĒRAM, PLŪDIEM PĒC SPĒCĪGĀM LIETUSGĀZĒM. DEOKSIGENĀCIJAS (DE-OX) PROCESS, KO AUGI VEIC HIPOKSIJAS APSTĀKĻOS, IR SAISTĪTS AR IZMAIŅĀM OLBALTUMVIELU METABOLISMĀ, GĒNU EKSPRESIJĀ UN MODIFIKĀCIJĀ UN STABILITĀTĒ. JO ĪPAŠI AUGI RAŽO SLĀPEKĻA OKSĪDU (NR.) ZEM HIPOKSIJAS MITOHONDRIJU ELPOŠANAS ĶĒDĒ, IZMANTOJOT NITRĪTU, NEVIS O2 KĀ ELEKTRONU UZTVĒRĒJU. O2 UN NĒ FUNKCIJAS IR CIEŠI SAISTĪTAS AR ERF TRANSKRIPCIJAS FAKTORU (TFS) VII GRUPAS PROTEOLĪZES KONTROLI, IZMANTOJOT N-TERMINĀLU SECĪBU (DEGRON)-MEDIATED DEGRADĀCIJAS PROCESU, KAS NOTIEK TĀ SAUKTAJĀ ARG/N-END NOTEIKUMU CEĻĀ. ŠIS PROCESS PATS PAR SEVI IR SVARĪGS, LAI KONTROLĒTU ATBILDES REAKCIJU UZ HIPOKSIJU. KAD HIPOKSISKIE APSTĀKĻI IR BEIGUSIES, AUGIEM RODAS ATKĀRTOTAS OKSIGENĀCIJAS (RE-OX) PROCESS, KAS BEIDZAS AR NORMOKSISKIEM APSTĀKĻIEM. REOKSIGENĀCIJAS PROCESS NOTIEK AR SPĒCĪGU REAKTĪVĀ SKĀBEKĻA (ROS) RAŽOŠANU. AUGSTAIS ROS LĪMENIS VAR KAITĒT IEKĀRTAI, UN IR ZIŅOTS, KA NĒ VAR BŪT BŪTISKA NOZĪME, LAI NEITRALIZĒTU ROS IZRAISĪTO IETEKMI. ŠĀ PROJEKTA 1. UN 2. MĒRĶĪ MĒS PIEVĒRSĪSIMIES DE-OX UN RE-OX LAIKĀ NOTIKUŠO NOTIKUMU MOLEKULĀRAJAI RAKSTUROŠANAI, IZMANTOJOT NEOBJEKTĪVU OMIKAS ANALĪZI, KAS BALSTĪTA UZ REGULATĪVIEM UN SIGNALIZĒJOŠIEM FAKTORIEM, UN MĒRĶTIECĪGU PIEEJU, KAS VĒRSTA UZ TFS. ĪPAŠS UZSVARS TIKS LIKTS UZ REGULATĪVAJIEM KOMPONENTIEM, KAS SAISTĪTI AR HOMEOSTĀZI UN SIGNALIZĀCIJU. ŠĪS PIEEJAS LIELĀ MĒRĀ GŪS LABUMU NO TĀ, KA LABORATORIJĀ BŪS PIEEJAMS MUTANTU UN PĀRĀK EKSPRESĒJOŠU TRANSGĒNU LĪNIJU KOPUMS, KAS ATBILST LIELĀKAJAI DAĻAI KOMPONENTU, KURI IESAISTĪTI HOMEOSTĀZI UN SIGNALIZĒŠANĀ, N-END NOTEIKUMA PROTEOLĪTISKĀ CEĻĀ UN ERFVIIS, KĀ ARĪ TRANSGĒNO LĪNIJU KRĀJUMĀ, KAS NOSACĪTI EKSPRESĒ APTUVENI 1000 ARABIDOPSIS TFS. PROJEKTS IR PABEIGTS AR TREŠO MĒRĶI, KAS RISINĀS AR NEPACIETĪBU GAIDĪTO ĢENERĒŠANU PLANTA NO SENSORIEM. MŪSU PAMATOJUMS ŠIM MĒRĶIM IR BALSTĪTS UZ PĒDĒJĀ LAIKĀ IEROSINĀTO BEZIZPĒTES MEHĀNISMU, KAS IETVER ERFVIIS C2 ATLIEKU OKSIDĒŠANU BEZ ATKARĪBAS UN TO TURPMĀKU DEGRADĀCIJU, IZMANTOJOT N-END NOTEIKUMU CEĻU MEHĀNISMU. NEVIENS SENSORS, KURU MĒS PLĀNOJAM BŪVĒT, IZTEIKS N-TERMINĀLA DEGRONS TRANSLĀCIJAS SAPLŪŠANU AR REPORTIERLUMINISCENCES VAI LUCIFERĀZES PROTEĪNIEM, UN, JA TAS BŪS VEIKSMĪGS, TIE ĻAUS KVANTITATĪVI NOTEIKT ENDOGĒNO LĪMENI AUGOS. VISBEIDZOT, JA DEGRONS TIKS PĀRBAUDĪTS PAREIZI, MĒS PLĀNOJAM VEIKT PRIEKŠIZPĒTI PAR ŠĪ INSTRUMENTA BIOTEHNOLOĢISKO POTENCIĀLU, LAI KONTROLĒTU LAUKSAIMNIECĪBAS INTERESĒS ESOŠU PROTEĪNU DEGRADĀCIJU. (Latvian)
17 August 2022
0 references
RASTLINY ZVYČAJNE RASTÚ V NORMOXNÝCH PODMIENKACH, ALE JE POMERNE BEŽNÉ, ŽE NIEKTORÉ ORGÁNY/TKANIVÁ PODSTUPUJÚ NÍZKU DOSTUPNOSŤ O2 (HYPOXIA) POČAS VÝVOJA. HYPOXICKÉ STAVY SÚ ZVYČAJNE PRECHODNÉ A VÝVOJOVÝ POKROK PRI PRECHODE NA NORMOXIU. HYPOXIA JE EŠTE ČASTEJŠIA, KEĎ RASTLINY ČELIA NEPRIAZNIVÝM ENVIRONMENTÁLNYM PODMIENKAM, AKO SÚ ZÁPLAVY PO SILNÝCH DAŽĎOCH. PROCES DEOXYGENÁCIE (DE-OX), KTORÝ RASTLINY PODSTUPUJÚ POD HYPOXIOU, JE SPREVÁDZANÝ ZMENAMI V METABOLIZME, EXPRESII A MODIFIKÁCII GÉNOV A STABILITE BIELKOVÍN. NAJMÄ RASTLINY PRODUKUJÚ OXID DUSNATÝ (Č.) POD HYPOXIOU V DÔSLEDKU MITOCHONDRIÁLNEHO RESPIRAČNÉHO REŤAZCA S POUŽITÍM DUSITANOV NAMIESTO O2 AKO ELEKTRÓNOVÉHO AKCEPTORA. FUNKCIE O2 A NO SÚ ÚZKO SPOJENÉ S KONTROLOU PROTEOLÝZY SKUPINY VII TRANSKRIPČNÝCH FAKTOROV EFU (TFS) PROSTREDNÍCTVOM N-KONCOVEJ SEKVENCIE (DEGRON)-MEDIATED DEGRADAČNÉHO PROCESU, KTORÝ SA VYSKYTUJE PROSTREDNÍCTVOM TZV. MODELU ARG/N-END PRAVIDLA. TENTO PROCES JE SÁM O SEBE RELEVANTNÝ PRE KONTROLU REAKCIÍ NA HYPOXIU. KEĎ DÔJDE K UKONČENIU HYPOXICKÝCH PODMIENOK, RASTLINY ZAŽÍVAJÚ PROCES REOXYGENÁCIE (RE-OX), KTORÝ KONČÍ NORMOXICKÝMI PODMIENKAMI. PROCES REOXYGENÁCIE PREBIEHA SO SILNOU PRODUKCIOU REAKTÍVNYCH DRUHOV KYSLÍKA (ROS). VYSOKÉ ÚROVNE ROS MÔŽU BYŤ ŠKODLIVÉ PRE RASTLINU A BOLO OZNÁMENÉ, ŽE ŽIADNY NEMÔŽE ZOHRÁVAŤ ZÁSADNÚ ÚLOHU V BOJI PROTI ÚČINKOM VYVOLANÝM ROS. V CIEĽOCH 1 A 2 TOHTO PROJEKTU SA BUDEME ZAOBERAŤ MOLEKULÁRNOU CHARAKTERIZÁCIOU UDALOSTÍ, KU KTORÝM DOCHÁDZA POČAS DE-OX A RE-OX, POMOCOU KOMBINÁCIE NEZAUJATÝCH OMAMIKOV ZALOŽENÝCH NA HĽADANÍ REGULAČNÝCH A SIGNALIZAČNÝCH FAKTOROV A CIELENÉHO PRÍSTUPU ZAMERANÉHO NA TFS. OSOBITNÝ DÔRAZ SA BUDE KLÁSŤ NA REGULAČNÉ ZLOŽKY TÝKAJÚCE SA BEZ HOMEOSTÁZY A SIGNALIZÁCIE. TIETO PRÍSTUPY BUDÚ VO VEĽKEJ MIERE PROFITOVAŤ Z DOSTUPNOSTI SÚBORU MUTANTOV A NADMERNE EXPRESÍVNYCH TRANSGÉNNYCH LÍNIÍ V LABORATÓRIU, KTORÉ ZODPOVEDAJÚ VÄČŠINE ZLOŽIEK, KTORÉ SA PODIEĽAJÚ NA ŽIADNEJ HOMEOSTÁZE A SIGNALIZÁCII, PROTEOLYTICKEJ DRÁHE N-END A EFVIIS A KOLEKCII TRANSGÉNNYCH LÍNIÍ, KTORÉ PODMIENENE VYJADRUJÚ OKOLO 1000 ARABIDOPSIS TFS. PROJEKT JE DOKONČENÝ TRETÍM CIEĽOM, KTORÝ SA BUDE ZAOBERAŤ DYCHTIVO OČAKÁVANOU GENERÁCIOU V PLANTE ŽIADNE SENZORY. NAŠE ZDÔVODNENIE TOHTO CIEĽA JE ZALOŽENÉ NA MECHANIZME BEZ SNÍMANIA, KTORÝ SME NEDÁVNO NAVRHLI A KTORÝ ZAHŔŇA OXIDÁCIU REZÍDUA C2 ERFVIIS BEZ ZÁVISLOSTI OD O2 A ICH NÁSLEDNÚ DEGRADÁCIU PROSTREDNÍCTVOM STROJOVÝCH ZARIADENÍ NA DRÁHU PRAVIDIEL N-END. ŽIADNY SENZOR, KTORÝ PLÁNUJEME ZOSTROJIŤ, VYJADRÍ TRANSLAČNÉ FÚZIE N-TERMINÁLNEHO DEGRONSU S REPORTÉROVÝMI FLUORESCENČNÝMI ALEBO LUCIFERÁZOVÝMI PROTEÍNMI, A AK BUDE ÚSPEŠNÝ, UMOŽNÍ KVANTIFIKÁCIU ENDOGÉNNEJ HLADINY V RASTLINÁCH. NAKONIEC, AK TESTOVANÉ DEGRONS FUNGUJÚ SPRÁVNE, PLÁNUJEME VYKONAŤ PREDBEŽNÚ ŠTÚDIU BIOTECHNOLOGICKÉHO POTENCIÁLU TOHTO NÁSTROJA NA KONTROLU DEGRADÁCIE BIELKOVÍN S POĽNOHOSPODÁRSKYM ZÁUJMOM. (Slovak)
17 August 2022
0 references
PLANDAÍ AG FÁS DE GHNÁTH FAOI CHOINNÍOLLACHA NORMOXIC ACH TÁ SÉ SÁCH COITIANTA GO BHFUIL ORGÁIN/FÍOCHÁIN ÁIRITHE FAOI INFHAIGHTEACHT O2 ÍSEAL (HYPOXIA) AR FUD NA FORBARTHA. TÁ COINNÍOLLACHA HYPOXIC DE GHNÁTH DÍOMUAN AGUS DUL CHUN CINN FORBARTHA LEIS AN AISTRIÚ GO NORMOXIA. IS MINIC A BHÍONN HYPOXIA FIÚ NUAIR A BHÍONN DROCH-CHOINNÍOLLACHA COMHSHAOIL ANN DO PHLANDAÍ, MAR SHAMPLA TUILTE TAR ÉIS BÁISTEACH THROM. TÁ ATHRUITHE AR MHEITIBILEACHT, LÉIRIÚ GÉINE AGUS MODHNÚ AGUS COBHSAÍOCHT PRÓITÉINÍ AG GABHÁIL LEIS AN BPRÓISEAS DÍ-OCSAIGINITHE (DE-OX) A THÉANN PLANDAÍ FAOI HYPOXIA. GO HÁIRITHE, TÁIRGEANN PLANDAÍ OCSAÍD NÍTREACH (NÍL) FAOI HYPOXIA MAR THORADH AR SHLABHRA RIOSPRÁIDE MITEOCHONDRIAL AG BAINT ÚSÁIDE AS NÍTRÍT SEACHAS O2 MAR GHLACADÓIR LEICTREON. TÁ FEIDHMEANNA O2 AGUS NÍL AON NASC DOCHT ACU LE RIALÚ PHRÓTEALÚ GHRÚPA VII D’FHACHTÓIRÍ TRAS-SCRÍOFA ERF (TFS) TRÍ PHRÓISEAS DÍGHRÁDAITHE N-TERMINAL (DÍGHREAN)-MEDIATED, A THARLAÍONN TRÍD AN GCONAIR RIAIL ARG/N-DEIREADH MAR A THUGTAR AIR. TÁ AN PRÓISEAS SEO ÁBHARTHA CHUN NA FREAGRAÍ AR HYPOXIA A RIALÚ. NUAIR A BHÍONN COINNÍOLLACHA HYPOXIC OS A CHIONN, BÍONN PRÓISEAS ATH-OCSAIGINITHE (ATH-OCSAÍ) AG PLANDAÍ A CHRÍOCHNAÍONN LE COINNÍOLLACHA NORMOCSAINEACHA. RITHEANN AN PRÓISEAS ATH-OCSAIGINITHE LE TÁIRGEADH LÁIDIR SPEICEAS OCSAIGIN IMOIBRÍOCH (ROS). D’FHÉADFADH LEIBHÉIL ARDA ROS A BHEITH DÍOBHÁLACH DON GHLÉASRA AGUS TUAIRISCÍODH NACH BHFÉADFADH AON RÓL RIACHTANACH A BHEITH ACU IN AGHAIDH ÉIFEACHTAÍ TARRAINGTHE ROS. I GCUSPÓIRÍ 1 AGUS 2 DEN TIONSCADAL SEO, TABHARFAIMID AGHAIDH AR THRÉITHRIÚ MÓILÍNEACH NA N-IMEACHTAÍ A THARLAÍONN LE LINN DÍ-OCSA AGUS ATH-OCS TRÍ ÚSÁID A BHAINT AS TEAGLAIM DE CHUARDACH NEAMHCHLAONTA BUNAITHE AR AN DAMHSAÍOCHT LE HAGHAIDH FACHTÓIRÍ RIALÁLA AGUS COMHARTHAÍOCHTA, AGUS CUR CHUIGE SPRIOCDHÍRITHE A DHÍRÍONN AR TFS. CUIRFEAR BÉIM AR LEITH AR NA COMHPHÁIRTEANNA RIALÁLA A BHAINEANN LE HAON HOMEOSTASIS AGUS COMHARTHAÍOCHT. BAINFIDH NA CINEÁLACHA CUR CHUIGE SIN TAIRBHE DEN CHUID IS MÓ AS FÁIL A BHEITH SA TSAOTHARLANN AR BHAILIÚCHÁN SÓITEÁIN AGUS LÍNTE TRASGHINIÚNACHA RÓ-LÉIRITHE A CHOMHFHREAGRAÍONN D’FHORMHÓR NA GCOMHPHÁIRTEANNA NACH BHFUIL BAINT ACU LE HAON HOMEOSTASIS AGUS COMHARTHAÍOCHT, DE CHONAIR PHRÓITÉALAIGH RIAIL N-DEIREADH AGUS ERFVIIS, AGUS DE BHAILIÚCHÁN LÍNTE TRASGHINIÚNACHA A LÉIRÍONN GO COINNÍOLLACH THART AR 1000 TFS ARABIDOPSIS. TÁ AN TIONSCADAL CRÍOCHNAITHE AG TRÍÚ CUSPÓIR A THABHARFAIDH AGHAIDH AR GHINIÚINT GAN BRAITEOIRÍ PLANTA AG FANACHT GO FONNMHAR. IS É AN RÉASÚNAÍOCHT ATÁ AGAINN DON CHUSPÓIR SEO BUNAITHE AR AN MEICNÍOCHT GAN BHRATH A MHOLAMAR LE DÉANAÍ A BHAINEANN LE O2 AGUS OCSAÍDIÚ GAN SPLEÁCHAS AR IARMHAR C2 DE ERFVIIS AGUS A NDÍGHRÁDÚ INA DHIAIDH SIN TRÍD AN INNEALRA CONAIRE RIAIL N-DEIREADH. BEIDH AN BRAITEOIR AR BITH AR INTINN AGAINN A THÓGÁIL IN IÚL COMHLEÁ AISTRITHEACH DE N-TERMINAL DEGRONS LE TUAIRISCEOIR PRÓITÉINÍ FLUARAISEACHA NÓ LUCIFERASE, AGUS, MÁ ÉIRÍONN LEO, CEADÓIDH SIAD CAINNÍOCHTÚ AON LEIBHÉIL ENDOGENOUS I BPLANDAÍ. AR DEIREADH, MÁ OIBRÍONN DEGRONS I GCEART, TÁ SÉ BEARTAITHE AGAINN RÉAMH-STAIDÉAR A DHÉANAMH AR ACMHAINNEACHT BHITHTHEICNEOLAÍOCH NA HUIRLISE SEO CHUN DÍGHRÁDÚ PRÓITÉINÍ A BHFUIL LEAS TALMHAÍOCHTA ACU A RIALÚ. (Irish)
17 August 2022
0 references
ROSTLINY OBVYKLE ROSTOU ZA NORMÁLNÍCH PODMÍNEK, ALE JE POMĚRNĚ BĚŽNÉ, ŽE NĚKTERÉ ORGÁNY/TKÁNĚ PODLÉHAJÍ NÍZKÉ DOSTUPNOSTI O2 (HYPOXIE) PO CELOU DOBU VÝVOJE. HYPOXICKÉ STAVY JSOU OBVYKLE PŘECHODNÉ A VÝVOJOVÝ POKROK S PŘECHODEM NA NORMOXII. HYPOXIE JE JEŠTĚ ČASTĚJŠÍ, POKUD ROSTLINY ČELÍ NEPŘÍZNIVÝM PODMÍNKÁM PROSTŘEDÍ, JAKO JSOU ZÁPLAVY PO SILNÝCH SRÁŽKÁCH. PROCES DEOXYGENACE (DE-OX), KTERÝ ROSTLINY PODSTUPUJÍ POD HYPOXIÍ, JE DOPROVÁZEN ZMĚNAMI METABOLISMU, GENOVÉ EXPRESE A MODIFIKACE A STABILITY PROTEINŮ. ZEJMÉNA ROSTLINY PRODUKUJÍ OXID DUSNATÝ (NO) POD HYPOXIÍ V DŮSLEDKU MITOCHONDRIÁLNÍHO RESPIRAČNÍHO ŘETĚZCE S POUŽITÍM DUSITANŮ NAMÍSTO O2 JAKO AKCEPTORU ELEKTRONŮ. FUNKCE O2 A NE JSOU ÚZCE SPOJENY S KONTROLOU PROTEOLÝZY SKUPINY VII TRANSKRIPČNÍCH FAKTORŮ ERF (TFS) PROSTŘEDNICTVÍM PROCESU ROZKLADU N-KONCOVÉ SEKVENCE (DEGRON)-MEDIATED, K NĚMUŽ DOCHÁZÍ PROSTŘEDNICTVÍM TZV. ARG/N-END PRAVIDLA. TENTO PROCES JE SÁM O SOBĚ RELEVANTNÍ PRO KONTROLU REAKCÍ NA HYPOXII. PO SKONČENÍ HYPOXICKÝCH PODMÍNEK DOCHÁZÍ K PROCESU REOXYGENACE (RE-OX), KTERÝ KONČÍ NORMÁLNÍMI STAVY. PROCES REOXYGENACE PROBÍHÁ SE SILNOU PRODUKCÍ REAKTIVNÍCH DRUHŮ KYSLÍKU (ROS). VYSOKÉ ÚROVNĚ ROS MOHOU BÝT ŠKODLIVÉ PRO ZAŘÍZENÍ A BYLO OZNÁMENO, ŽE „NE“ MŮŽE HRÁT ZÁSADNÍ ROLI V BOJI PROTI ÚČINKŮM ROS. V CÍLECH 1 A 2 TOHOTO PROJEKTU SE BUDEME ZABÝVAT MOLEKULÁRNÍ CHARAKTERIZACÍ UDÁLOSTÍ, K NIMŽ DOCHÁZÍ BĚHEM DE-OXU A RE-OXU, POMOCÍ KOMBINACE NEZKRESLENÝCH OMIKOVÝCH VYHLEDÁVÁNÍ REGULAČNÍCH A SIGNALIZAČNÍCH FAKTORŮ A CÍLENÉHO PŘÍSTUPU ZAMĚŘENÉHO NA TFS. ZVLÁŠTNÍ DŮRAZ BUDE KLADEN NA REGULAČNÍ SLOŽKY TÝKAJÍCÍ SE BEZ HOMEOSTÁZY A SIGNALIZACE. TYTO PŘÍSTUPY BUDOU Z VELKÉ ČÁSTI TĚŽIT Z DOSTUPNOSTI V LABORATOŘI SBÍRKY MUTANTŮ A NADMĚRNĚ VYJADŘUJÍCÍCH TRANSGENNÍCH ČAR ODPOVÍDAJÍCÍCH VĚTŠINĚ SLOŽEK ZAPOJENÝCH DO BEZ HOMEOSTÁZY A SIGNALIZACE, PROTEOLYTICKÉ DRÁHY N-END PRAVIDLA A ERFVIIS A SBÍRKY TRANSGENNÍCH ČAR PODMÍNĚNĚ VYJADŘUJÍCÍCH KOLEM 1000 ARABIDOPSIS TFS. PROJEKT JE DOKONČEN TŘETÍM CÍLEM, KTERÝ BUDE ŘEŠIT DYCHTIVĚ OČEKÁVANOU GENERACI SENZORŮ PLANTA NO. NAŠE ZDŮVODNĚNÍ TOHOTO CÍLE JE ZALOŽENO NA MECHANISMU BEZ SNÍMÁNÍ, KTERÝ JSME V POSLEDNÍ DOBĚ NAVRHLI, KTERÝ ZAHRNUJE OXIDACI O2 A NEZÁVISLOU OXIDACI C2 REZIDUA ERFVIIS A JEJICH NÁSLEDNOU DEGRADACI PROSTŘEDNICTVÍM SYSTÉMU N-END PRAVIDEL. ŽÁDNÝ SENZOR, KTERÝ MÁME V ÚMYSLU VYTVOŘIT, BUDE EXPRIMOVÁN TRANSLAČNÍ FÚZÍ N-TERMINAL DEGRONS S REPORTER FLUORESCENČNÍ NEBO LUCIFERÁZOVÉ PROTEINY, A POKUD BUDE ÚSPĚŠNÁ, UMOŽNÍ KVANTIFIKACI ENDOGENNÍCH HLADIN V ROSTLINÁCH. NAKONEC, POKUD TESTOVANÉ DEGRONS FUNGUJÍ SPRÁVNĚ, PLÁNUJEME PROVÉST PŘEDBĚŽNOU STUDII BIOTECHNOLOGICKÉHO POTENCIÁLU TOHOTO NÁSTROJE PRO KONTROLU DEGRADACE PROTEINŮ SE ZEMĚDĚLSKÝM ZÁJMEM. (Czech)
17 August 2022
0 references
Habitualmente, as plantas crescem em condições NORMÓXICAS, mas é relativamente comum que certos organismos/tecidos passem por uma baixa disponibilidade de O2 (hipóxia) durante o desenvolvimento. CONDIÇÕES HIPÓXICAS SÃO UTILMENTE TRANSITÓRIAS E PROGRESSOS DE DESENVOLVIMENTO COM A TRANSIÇÃO PARA A NORMOXIA. A hipoxia é ainda mais frequente quando as plantas enfrentam condições ambientais adversas, como inundações depois de fortes chuvadas. O PROCESSO DE DE-OXIGENAÇÃO (DE-OX) QUE AS INSTALAÇÕES SOB HIPÓXIA SÃO ACOMPANHADAS POR ALTERAÇÕES NO METABOLISMO, EXPRESSÃO GENE, MODIFICAÇÃO E ESTABILIDADE DAS PROTEÍNAS. Em especial, as plantas produzem ÓXIDO NÍTRICO (NÃO) SOB HIPÓXIA, como resultado da CADEIA DE RESPIRAÇÃO MITOCHONDRIAL, utilizando NITRITE em vez de O2 como ACCEPTOR DE ELETRON. As funções do O2 e do NO estão estreitamente ligadas ao controlo da proteolise do grupo VII dos factores de transição (TFS) do FER através de um processo de desgravação mediado por uma sequência N-terminal (DEGRON), que ocorre através do chamado caminho de regra ARG/N-END. O PRESENTE PROCESSO É Próprio PERTINENTE PARA CONTROLAR AS RESPOSTAS À HIPÓXIA. Quando as condições hipóxicas terminarem, as plantas experimentam um processo de reoxigenação (RE-OX) que termina com as condições normóxicas. O PROCESSO DE REOXIGENAÇÃO REALIZA-SE COM UMA PRODUÇÃO FORTE DE ESPÉCIES OXIGENADAS REATIVAS (ROS). Os níveis elevados de ROS podem ser excessivos para a planta, tendo sido comunicado que não se pode utilizar um papel essencial para contrabalançar os efeitos provocados por ROS. Nos objetivos n.os 1 e 2 do presente projeto, abordaremos a caracterização molecular dos acontecimentos ocorridos durante a redução e a redução do óxido de etileno através da utilização de uma combinação de instrumentos de investigação não baseados no sistema omicológico para efeitos de regulação e de sinalização, bem como de uma abordagem orientada centrada nos TFS. SERÁ APRESENTADA UMA EMPRESA ESPECIAL NOS COMPONENTES REGULAMENTARES NÃO RELACIONADOS COM A NÃO HOMEOSTASE E A SINALIZAÇÃO. Estas abordagens beneficiarão largamente da disponibilidade, no laboratório, de uma recolha de materiais e de linhas transgénicas em sobre-exploração que correspondam à maioria dos componentes não envolvidos em homeostase nem em sinalização, de vias proteolíticas e ERFVIIS sem fim de regra e de uma recolha de linhas transgénicas com custos condicionais superiores a 1000 TFS ARABIDOPSIS. O PROJECTO É CONCLUÍDO POR UM TERCEIRO OBJETIVO QUE RESPEITARÁ À GERAÇÃO ATENUADA DE NO PLANTA NO SENSORES. A nossa relação com este objectivo baseia-se no mecanismo insensível que propusemos ultimamente que envolve a oxigenação sem dependência de O2 do resíduo C2 de ERFVIIS e a sua subsequente degradação através das máquinas de caminhos de ferro de fim de curso. O não-sensor que pretendemos consertar expressará as funções translacionais dos degranos N-terminais com proteínas fluorescentes ou luciferase do relator e, se for bem sucedido, permitirão a QUANTIFICAÇÃO de não-níveis endogênicos nas plantas. Finalmente, se os degraus testados funcionarem adequadamente, planeamos fazer um estudo preliminar do potencial biotecnológico desta ferramenta para controlar a degradação das proteínas com interesse agrícola. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
TAIMED KASVAVAD TAVALISELT NORMOXIC TINGIMUSTES, KUID ON SUHTELISELT TAVALINE, ET TEATUD ELUNDID/KUDED LÄBIVAD VÄHESE O2 KÄTTESAADAVUSE (HÜPOKSIA) KOGU ARENGU JOOKSUL. HÜPOKSILISED TINGIMUSED ON TAVALISELT MÖÖDUVAD JA ARENG EDENEB ÜLEMINEKUL NORMOKSIALE. HÜPOKSIA ESINEB VEELGI SAGEDAMINI, KUI TAIMED SEISAVAD SILMITSI EBASOODSATE KESKKONNATINGIMUSTEGA, NAGU ÜLEUJUTUSED PÄRAST TUGEVAID SADEMEID. HAPNIKUTUSTAMISE (DE-OX) PROTSESSIGA, MIDA TAIMED LÄBIVAD HÜPOKSIA KORRAL, KAASNEVAD MUUTUSED METABOLISMIS, GEENIEKSPRESSIOONIS NING VALKUDE MUUNDAMISES JA STABIILSUSES. EELKÕIGE TOODAVAD TAIMED HÜPOKSIA ALL LÄMMASTIKOKSIIDI (EI), MIS TULENEB MITOKONDRIAALSEST HINGAMISAHELAST, KASUTADES ELEKTRONIDE VASTUVÕTMISE ASEMEL NITRITIT O2 ASEMEL. O2 JA NR FUNKTSIOONID ON TIHEDALT SEOTUD EUROOPA PAGULASFONDI TRANSKRIPTSIOONITEGURITE VII RÜHMA PROTEOLÜÜSI KONTROLLIGA N-TERMINAALSE JÄRJESTUSE (DEGRON)-MEDIATED LAGUNEMISPROTSESSI KAUDU, MIS TOIMUB NN ARG/N-OTSA REEGLI KAUDU. SEE PROTSESS ON ISEENESEST OLULINE HÜPOKSIALE REAGEERIMISE KONTROLLIMISEKS. KUI HÜPOKSILISED TINGIMUSED ON MÖÖDAS, TOIMUB TAIMEDES REOKSÜGENISEERIMISPROTSESS, MIS LÕPEB NORMOXILISTE TINGIMUSTEGA. REOKSÜGENISEERIMISPROTSESS TOIMUB KOOS REAKTIIVSETE HAPNIKULIIKIDE (ROS) TUGEVA TOOTMISEGA. MÜÜGITULUDE KÕRGE TASE VÕIB KÄITISELE KAHJULIKULT MÕJUDA NING ON TEATATUD, ET NO-L VÕIB OLLA OLULINE ROLL TEGEVUSKASUMIST TULENEVA MÕJU VASTU VÕITLEMISEL. PROJEKTI EESMÄRKIDES 1 JA 2 KÄSITLEME DE-OX’I JA RE-OX’I AJAL TOIMUVATE SÜNDMUSTE MOLEKULAARSET ISELOOMUSTUST, KASUTADES REGULATIIVSETE JA SIGNAALIMISTEGURITE EELARVAMUSTETA OOMIKAPÕHIST OTSINGUT NING SIHTOTSTARBELIST LÄHENEMISVIISI, MIS KESKENDUB TFSILE. ERILIST TÄHELEPANU PÖÖRATAKSE MITTEHOMOSTAASI JA SIGNAALIMISEGA SEOTUD REGULATIIVSETELE KOMPONENTIDELE. NEED LÄHENEMISVIISID SAAVAD SUURES OSAS KASU LABORIS OLEVATE MUTANTIDE KOGUMIST JA TRANSGEENSETE JOONTE ÜLEEKSPRESSIOONIST, MIS VASTAVAD ENAMIKULE KOMPONENTIDEST, MIS ON SEOTUD NR HOMEOSTAASI JA SIGNAALIMISEGA, N-OTS-REEGLI PROTEOLÜÜTILISE RADA JA ERFVIISEGA NING TRANSGEENSETE LIINIDE KOGUMIGA, MIS VÄLJENDAVAD TINGIMUSLIKULT UMBES 1000 ARABIDOPSIS TFSI. PROJEKT VIIAKSE LÕPULE KOLMANDA EESMÄRGIGA, MIS KÄSITLEB INNUKALT OODATUD PÕLVKONDA PLANTA NO SENSORITES. MEIE PÕHJENDUS SELLE EESMÄRGI SAAVUTAMISEKS PÕHINEB VIIMASEL AJAL KAVANDATUD MITTESEIREMEHHANISMIL, MIS HÕLMAB ERFVIIS’E C2 JÄÄKIDE O2 JA MITTESÕLTUVAT OKSÜDEERIMIST JA NENDE EDASIST LAGUNEMIST N-OTS-REEGLI RADADE MASINA KAUDU. N-TERMINAALSE DEGRONS’I TRANSLATIIVSED LIITMISED REPORTERI FLUORESTSEERUVATE VÕI LUTSIFERAASIVALKUDEGA, KUI NEED ON EDUKAD, VÕIMALDAVAD NEED MÄÄRATA ENDOGEENSET TASET TAIMEDES. LÕPUKS, KUI TESTITUD DEGRONS TOIMIB KORRALIKULT, PLAANIME TEHA EELUURINGU SELLE VAHENDI BIOTEHNOLOOGILISE POTENTSIAALI KOHTA, ET KONTROLLIDA VALKUDE LAGUNEMIST PÕLLUMAJANDUSE HUVIDES. (Estonian)
17 August 2022
0 references
A NÖVÉNYEK ÁLTALÁBAN NORMÁLIS KÖRÜLMÉNYEK KÖZÖTT NŐNEK, DE VISZONYLAG GYAKORI, HOGY BIZONYOS SZERVEK/SZÖVETEK ALACSONY O2 RENDELKEZÉSRE ÁLLÁSON MENNEK KERESZTÜL (HIPOXIA) A FEJLŐDÉS SORÁN. A HYPOXIÁS ÁLLAPOTOK ÁLTALÁBAN ÁTMENETIEK, ÉS A FEJLŐDÉS ELŐREHALADÁSA A NORMOXIÁRA VALÓ ÁTTÉRÉS SORÁN. A HIPOXIA MÉG GYAKORIBB, HA A NÖVÉNYEK KEDVEZŐTLEN KÖRNYEZETI FELTÉTELEKKEL SZEMBESÜLNEK, MINT PÉLDÁUL A HEVES ESŐZÉSEK UTÁNI ÁRADÁSOK. A DEOXIGENIZÁCIÓS (DEOX) FOLYAMATOT, AMELYEN A NÖVÉNYEK HYPOXIA ALATT MENNEK KERESZTÜL, A FEHÉRJÉK METABOLIZMUSÁBAN, GÉNEXPRESSZIÓJÁBAN, MÓDOSÍTÁSÁBAN ÉS STABILITÁSÁBAN BEKÖVETKEZŐ VÁLTOZÁSOK KÍSÉRIK. KÜLÖNÖSEN A NÖVÉNYEK TERMELNEK NITROGÉN-MONOXID (NO) ALATT HYPOXIA EREDMÉNYEKÉNT MITOKONDRIÁLIS LÉGZÉS LÁNC SEGÍTSÉGÉVEL NITRIT HELYETT O2 ELEKTRON ELFOGADÓ. AZ O2 ÉS NO FUNKCIÓI SZOROSAN KAPCSOLÓDNAK AZ ERF TRANSZKRIPCIÓS FAKTOROK VII. CSOPORTJÁNAK PROTEOLÍZISÉNEK ELLENŐRZÉSÉHEZ EGY N-TERMINÁLIS SZEKVENCIÁN (DEGRON)-MEDIATED LEBOMLÁSI FOLYAMATON KERESZTÜL, AMELY AZ ÚGYNEVEZETT ARG/N-END SZABÁLYÚTVONALON KERESZTÜL TÖRTÉNIK. EZ A FOLYAMAT MAGA IS RELEVÁNS A HYPOXIÁRA ADOTT VÁLASZOK SZABÁLYOZÁSÁBAN. AMIKOR A HIPOXIÁS ÁLLAPOTOK VÉGET ÉRNEK, A NÖVÉNYEK REOXIGENIZÁCIÓS (RE-OX) FOLYAMATOT TAPASZTALNAK, AMELY NORMOXIK KÖRÜLMÉNYEK KÖZÖTT VÉGZŐDIK. A REOXIGENIZÁCIÓS FOLYAMAT A REAKTÍV OXIGÉNFAJOK (ROS) ERŐS TERMELÉSÉVEL ZAJLIK. A ROS MAGAS SZINTJE KÁROS LEHET AZ ÜZEMRE NÉZVE, ÉS ARRÓL SZÁMOLTAK BE, HOGY A NO NEM JÁTSZHAT LÉNYEGES SZEREPET A ROS ÁLTAL KIVÁLTOTT HATÁSOK ELLENSÚLYOZÁSÁBAN. A PROJEKT 1. ÉS 2. CÉLKITŰZÉSÉBEN A DEOX ÉS RE-OX SORÁN ELŐFORDULÓ ESEMÉNYEK MOLEKULÁRIS JELLEMZÉSÉVEL FOGLALKOZUNK, A SZABÁLYOZÁSI ÉS JELZŐTÉNYEZŐK NEM TORZÍTOTT SZEMÉSZETI ALAPÚ KERESÉSÉNEK, VALAMINT A TFS-RE ÖSSZPONTOSÍTÓ CÉLZOTT MEGKÖZELÍTÉSNEK A KOMBINÁCIÓJÁVAL. KÜLÖNÖS HANGSÚLYT FEKTETNEK A NEM HOMEOSZTÁZISSAL ÉS JELZÉSSEL KAPCSOLATOS SZABÁLYOZÁSI ELEMEKRE. EZEKNEK A MEGKÖZELÍTÉSEKNEK NAGY ELŐNYE LESZ, HOGY A LABORATÓRIUMBAN RENDELKEZÉSRE ÁLLNAK MUTÁNSOK GYŰJTEMÉNYE ÉS TÚL EXPRESSZÁLÓ TRANSZGENIKUS VONALAK, AMELYEK MEGFELELNEK A NEM HOMEOSZTÁZISBAN ÉS JELZÉSBEN, AZ N-END SZABÁLY PROTEOLITIKUS ÚTVONALÁBAN ÉS AZ ERFVIIS-BEN, VALAMINT A FELTÉTELESEN 1000 ARABIDOPSIS TFS-T KIFEJEZŐ TRANSZGENIKUS VONALAK GYŰJTEMÉNYÉNEK. A PROJEKTET EGY HARMADIK CÉLKITŰZÉS EGÉSZÍTI KI, AMELY AZ ÉRZÉKELŐK NÉLKÜLI PLANTA ALIG VÁRT GENERÁCIÓJÁT CÉLOZZA MEG. EZT A CÉLT AZ UTÓBBI IDŐBEN JAVASOLT NEM ÉRZÉKELÉSI MECHANIZMUSRA ALAPOZZUK, AMELY MAGÁBAN FOGLALJA AZ ERFVIIS C2-MARADVÁNYÁNAK O2- ÉS NEM FÜGGŐ OXIDÁCIÓJÁT, MAJD AZ N-END SZABÁLYÚTI GÉPEKEN KERESZTÜL TÖRTÉNŐ LEBOMLÁSÁT. AZ ÁLTALUNK MEGÉPÍTENI KÍVÁNT NINCS ÉRZÉKELŐ N-TERMINÁLIS DEGRONS TRANSZLÁCIÓS FÚZIÓJÁT FOGJA KIFEJEZNI RIPORTER FLUORESZKÁLÓ VAGY LUCIFERÁZ FEHÉRJÉKKEL, ÉS HA SIKERES, AKKOR LEHETŐVÉ TESZI AZ ENDOGÉN SZINT MENNYISÉGI MEGHATÁROZÁSÁT A NÖVÉNYEKBEN. VÉGÜL, HA A TESZTELT DEGRONS MEGFELELŐEN MŰKÖDIK, AZT TERVEZZÜK, HOGY ELŐZETES TANULMÁNYT KÉSZÍTÜNK AZ ESZKÖZ BIOTECHNOLÓGIAI POTENCIÁLJÁRÓL A MEZŐGAZDASÁGI ÉRDEKLŐDÉSRE SZÁMOT TARTÓ FEHÉRJÉK LEBOMLÁSÁNAK ELLENŐRZÉSÉRE. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
РАСТЕНИЯТА ОБИКНОВЕНО РАСТАТ ПРИ НОРМАЛНИ УСЛОВИЯ, НО Е ОТНОСИТЕЛНО ЧЕСТО, ЧЕ НЯКОИ ОРГАНИ/ТЪКАНИ СЕ ПОДЛАГАТ НА НИСКА НАЛИЧНОСТ НА O2 (ХИПОКСИЯ) ПО ВРЕМЕ НА ЦЯЛОТО РАЗВИТИЕ. ХИПОКСИЧНИТЕ СЪСТОЯНИЯ ОБИКНОВЕНО СА ПРЕХОДНИ И РАЗВИТИЕТО НАПРЕДВА С ПРЕХОДА КЪМ НОРМОКСИЯ. ХИПОКСИЯТА Е ОЩЕ ПО-ЧЕСТА, КОГАТО РАСТЕНИЯТА СА ИЗПРАВЕНИ ПРЕД НЕБЛАГОПРИЯТНИ УСЛОВИЯ НА ОКОЛНАТА СРЕДА, КАТО НАВОДНЕНИЯ СЛЕД ПРОЛИВНИ ВАЛЕЖИ. ПРОЦЕСЪТ НА ДЕОКСИГЕНИРАНЕ (DE-OX), КОЙТО РАСТЕНИЯТА ПРЕМИНАВАТ ПОД ХИПОКСИЯ, Е ПРИДРУЖЕН ОТ ПРОМЕНИ В МЕТАБОЛИЗМА, ГЕННАТА ЕКСПРЕСИЯ И МОДИФИКАЦИЯТА И СТАБИЛНОСТТА НА ПРОТЕИНИТЕ. ПО-СПЕЦИАЛНО РАСТЕНИЯТА ПРОИЗВЕЖДАТ АЗОТЕН ОКСИД (№) ПОД ХИПОКСИЯ В РЕЗУЛТАТ НА МИТОХОНДРИАЛНА ДИХАТЕЛНА ВЕРИГА, КАТО ИЗПОЛЗВАТ НИТРИТ ВМЕСТО O2 КАТО ЕЛЕКТРОНЕН АКЦЕПТОР. ФУНКЦИИТЕ НА O2 И NO СА ТЯСНО СВЪРЗАНИ С КОНТРОЛА НА ПРОТЕОЛИЗАТА НА ГРУПА VII НА КОЕФИЦИЕНТИТЕ НА ТРАНСКРИПЦИЯ НА ERF (TFS) ЧРЕЗ N-ТЕРМИНАЛНА ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТ (DEGRON)-MEDIATED ПРОЦЕС НА РАЗГРАЖДАНЕ, КОЙТО СЕ ОСЪЩЕСТВЯВА ЧРЕЗ Т.НАР. МАРШРУТ ARG/N-END ПРАВИЛО. ТОЗИ ПРОЦЕС САМ ПО СЕБЕ СИ Е ОТ ЗНАЧЕНИЕ ЗА КОНТРОЛИРАНЕ НА РЕАКЦИИТЕ НА ХИПОКСИЯ. КОГАТО ХИПОКСИЧНИТЕ УСЛОВИЯ ПРИКЛЮЧАТ, РАСТЕНИЯТА ИЗПИТВАТ ПРОЦЕС НА ПОВТОРНО ОКИСЛЯВАНЕ (РЕ-OX), КОЙТО ЗАВЪРШВА С НОРМАЛНИ УСЛОВИЯ. ПРОЦЕСЪТ НА ПОВТОРНО ОКИСЛЯВАНЕ ПРОТИЧА СЪС СИЛНОТО ПРОИЗВОДСТВО НА РЕАКТИВНИ КИСЛОРОДНИ ВИДОВЕ (ROS). ВИСОКИТЕ НИВА НА ВЪЗВРЪЩАЕМОСТ НА ПРОДАЖБИТЕ МОГАТ ДА БЪДАТ ВРЕДНИ ЗА ИНСТАЛАЦИЯТА И Е ДОКЛАДВАНО, ЧЕ NO МОЖЕ ДА ИГРАЕ СЪЩЕСТВЕНА РОЛЯ ЗА ПРОТИВОДЕЙСТВИЕ НА ЕФЕКТИТЕ, ПРЕДИЗВИКАНИ ОТ ROS. В ЦЕЛИ 1 И 2 НА ТОЗИ ПРОЕКТ ЩЕ РАЗГЛЕДАМЕ МОЛЕКУЛЯРНАТА ХАРАКТЕРИСТИКА НА СЪБИТИЯТА, НАСТЪПИЛИ ПО ВРЕМЕ НА ДЕТОКС И РЕ-OX, КАТО ИЗПОЛЗВАМЕ КОМБИНАЦИЯ ОТ БЕЗПРИСТРАСТНО БАЗИРАНИ НА ОМИМИКАТА ТЪРСЕНЕ НА РЕГУЛАТОРНИ И СИГНАЛНИ ФАКТОРИ, КАКТО И ЦЕЛЕНАСОЧЕН ПОДХОД, НАСОЧЕН КЪМ TFS. СПЕЦИАЛЕН АКЦЕНТ ЩЕ БЪДЕ ПОСТАВЕН ВЪРХУ РЕГУЛАТОРНИТЕ КОМПОНЕНТИ, СВЪРЗАНИ С ЛИПСАТА НА ХОМЕОСТАЗА И СИГНАЛИЗИРАНЕ. ТЕЗИ ПОДХОДИ ЩЕ СЕ ВЪЗПОЛЗВАТ ДО ГОЛЯМА СТЕПЕН ОТ НАЛИЧИЕТО В ЛАБОРАТОРИЯТА НА НАБОР ОТ МУТАНТИ И СВРЪХИЗРАЗЯВАЩИ ТРАНСГЕННИ ЛИНИИ, СЪОТВЕТСТВАЩИ НА ПОВЕЧЕТО ОТ КОМПОНЕНТИТЕ, УЧАСТВАЩИ В ЛИПСАТА НА ХОМЕОСТАЗА И СИГНАЛИЗАЦИЯ, ПРОТЕОЛИТИЧНИЯ ПЪТ НА ПРАВИЛОТО N-КРАЙ И ERFVIIS, КАКТО И КОЛЕКЦИЯ ОТ ТРАНСГЕННИ ЛИНИИ, ИЗРАЗЯВАЩИ УСЛОВНО ОКОЛО 1000 АРАБИДОПСИС TFS. ПРОЕКТЪТ Е ЗАВЪРШЕН С ТРЕТА ЦЕЛ, КОЯТО ЩЕ СЕ СПРАВИ С НЕТЪРПЕЛИВОТО ОЧАКВАНО ПОКОЛЕНИЕ В ПЛАНТА БЕЗ СЕНЗОРИ. НАШАТА ОБОСНОВКА ЗА ТАЗИ ЦЕЛ СЕ ОСНОВАВА НА МЕХАНИЗМА БЕЗ НАБЛЮДЕНИЕ, КОЙТО ПРЕДЛОЖИХМЕ НАПОСЛЕДЪК, КОЙТО ВКЛЮЧВА O2 И НЕЗАВИСИМО ОКИСЛЯВАНЕ НА ОСТАТЪЦИТЕ ОТ C2 НА ERFVIIS И ПОСЛЕДВАЩОТО ИМ РАЗГРАЖДАНЕ ЧРЕЗ МАШИНИТЕ ЗА УПРАВЛЕНИЕ N-END. НЯМА СЕНЗОР, КОЙТО ВЪЗНАМЕРЯВАМЕ ДА ИЗГРАДИМ, ЩЕ ИЗРАЗИ ТРАНСЛАЦИОННИ СЛИВАНИЯ НА N-ТЕРМИНАЛ DEGRONS С РЕПОРТЕРНИ ФЛУОРЕСЦЕНТНИ ИЛИ ЛУЦИФЕРАЗНИ ПРОТЕИНИ И, АКО СА УСПЕШНИ, ТЕ ЩЕ ПОЗВОЛЯТ КОЛИЧЕСТВЕНО ОПРЕДЕЛЯНЕ НА ЕНДОГЕННИТЕ БЕЗ НИВА В РАСТЕНИЯТА. И НАКРАЯ, АКО ТЕСТВАНИТЕ DEGRONS РАБОТЯТ ПРАВИЛНО, ПЛАНИРАМЕ ДА НАПРАВИМ ПРЕДВАРИТЕЛНО ПРОУЧВАНЕ НА БИОТЕХНОЛОГИЧНИЯ ПОТЕНЦИАЛ НА ТОЗИ ИНСТРУМЕНТ ЗА КОНТРОЛ НА РАЗГРАЖДАНЕТО НА ПРОТЕИНИ СЪС СЕЛСКОСТОПАНСКИ ИНТЕРЕС. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
AUGALAI PAPRASTAI AUGA PAGAL NORMOXIC SĄLYGOMIS, TAČIAU JI YRA GANA DAŽNAI, KAD TAM TIKRI ORGANAI/AUDINIAI ATLIKTI MAŽĄ O2 PRIEINAMUMĄ (HIPOKSIJA) VISOJE VYSTYMOSI METU. HIPOKSINĖS BŪKLĖS PAPRASTAI YRA TRUMPALAIKĖS, O VYSTYMASIS PROGRESUOJA PEREINANT PRIE NORMOKSIJOS. HIPOKSIJA YRA DAR DAŽNESNĖ, KAI AUGALAI SUSIDURIA SU NEPALANKIOMIS APLINKOS SĄLYGOMIS, PAVYZDŽIUI, POTVYNIAIS PO SMARKIŲ LIŪČIŲ. DEOKSIGENACIJOS (DE-OX) PROCESĄ, KAI AUGALAI PATIRIA HIPOKSIJĄ, LYDI BALTYMŲ METABOLIZMO, GENŲ EKSPRESIJOS IR MODIFIKACIJOS BEI STABILUMO POKYČIAI. VISŲ PIRMA, AUGALAI GAMINA AZOTO OKSIDĄ (NR) HIPOKSIJA DĖL MITOCHONDRIJŲ KVĖPAVIMO GRANDINĖS, NAUDOJANT NITRITĄ VIETOJ O2 KAIP ELEKTRONŲ PRIĖMIMO ĮRENGINĮ. O2 IR NO FUNKCIJOS GLAUDŽIAI SUSIJUSIOS SU ERF TRANSKRIPCIJOS KOEFICIENTŲ (TFS) VII GRUPĖS PROTEOLIZĖS KONTROLE PER N-GALINĖS SEKOS (DEGRON)-MEDIATED SKAIDYMO PROCESĄ, KURIS VYKSTA VADINAMUOJU ARG/N-END TAISYKLĖS BŪDU. ŠIS PROCESAS YRA SVARBUS SIEKIANT KONTROLIUOTI ATSAKĄ Į HIPOKSIJĄ. KAI HIPOKSINĖS SĄLYGOS BAIGĖSI, AUGALAI PATIRIA RE-OKSIGENACIJOS (RE-OX) PROCESĄ, KURIS BAIGIASI NORMOXIC SĄLYGOMIS. RE-OKSIGENACIJOS PROCESAS VYKSTA SU STIPRIA REAKTYVIŲJŲ DEGUONIES RŪŠIŲ (ROS) GAMYBA. DIDELIS PARDAVIMO GRĄŽOS LYGIS GALI BŪTI ŽALINGAS AUGALUI IR BUVO PRANEŠTA, KAD „NE“ GALI ATLIKTI ESMINĮ VAIDMENĮ NEUTRALIZUOJANT POVEIKĮ, KURĮ SUKELIA ROS. ŠIO PROJEKTO 1 IR 2 TIKSLUOSE APTARSIME ĮVYKIŲ, ĮVYKUSIŲ DE-OX IR RE-OX METU, MOLEKULINĮ APIBŪDINIMĄ, NAUDODAMI NEŠALIŠKŲ OMIKOZĖS PAIEŠKĄ REGULIAVIMO IR SIGNALIZAVIMO VEIKSNIAMS IR TIKSLINĮ POŽIŪRĮ, ORIENTUOTĄ Į TFS. YPATINGAS DĖMESYS BUS SKIRIAMAS REGULIAVIMO KOMPONENTŲ, SUSIJUSIŲ SU NO HOMEOSTASIS IR SIGNALIZACIJA. ŠIEMS METODAMS BUS LABAI NAUDINGA TAI, KAD LABORATORIJOJE YRA MUTANTŲ IR PERNELYG EKSPRESUOJANČIŲ TRANSGENINIŲ LINIJŲ, ATITINKANČIŲ DAUGUMĄ KOMPONENTŲ, SUSIJUSIŲ SU HOMEOSTAZE IR SIGNALIZAVIMU, N-END TAISYKLĖS PROTEOLIZINIS KELIAS IR ERFVIIS, IR TRANSGENINIŲ LINIJŲ RINKINYS, SĄLYGINAI IŠREIŠKIANTIS APIE 1000 ARABIDOPSIO TFS. PROJEKTAS UŽBAIGIAMAS TREČIUOJU TIKSLU, KURIS BUS SKIRTAS NEKANTRIAI LAUKIAMAM „PLANTA NO“ JUTIKLIŲ GENERAVIMUI. MŪSŲ ŠIO TIKSLO LOGINIS PAGRINDAS GRINDŽIAMAS PASTARUOJU METU MŪSŲ PASIŪLYTU „NO SENSING“ MECHANIZMU, KURIS APIMA ERFVIIS C2 LIKUČIŲ O2 IR NUO JO NEPRIKLAUSANČIĄ OKSIDACIJĄ IR TOLESNĮ JŲ SKILIMĄ PER N-GALO TAISYKLIŲ KELIO MECHANIZMĄ. JOKIO JUTIKLIO, KURĮ KETINAME STATYTI, BUS IŠREIKŠTAS N-GALINIO DEGRONS TRANSLIACINIS SUSILIEJIMAS SU ŽURNALISTO FLUORESCENCINIAIS ARBA LIUCIFERAZĖS BALTYMAIS, IR, JEI BUS SĖKMINGAS, JIE LEIS KIEKYBIŠKAI ĮVERTINTI ENDOGENINĮ NĖRA KONCENTRACIJOS AUGALUOSE. GALIAUSIAI, JEI IŠBANDYTA DEGRONS VEIKIA TINKAMAI, MES PLANUOJAME ATLIKTI PRELIMINARŲ BIOTECHNOLOGINIO POTENCIALO ŠIOS PRIEMONĖS KONTROLIUOTI BALTYMŲ SU ŽEMĖS ŪKIO INTERESŲ. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
BILJKE OBIČNO RASTU U NORMALNIM UVJETIMA, ALI RELATIVNO JE UOBIČAJENO DA ODREĐENI ORGANI/TJELA PROLAZE KROZ NISKU DOSTUPNOST O2 (HIPOKSIJA) TIJEKOM CIJELOG RAZVOJA. HIPOKSIČNI UVJETI SU OBIČNO PROLAZNI I RAZVOJNI NAPREDAK S PRIJELAZOM NA NORMOKSIJU. HIPOKSIJA JE JOŠ ČEŠĆA KADA SE BILJKE SUOČAVAJU S NEPOVOLJNIM OKOLIŠNIM UVJETIMA KAO ŠTO SU POPLAVE NAKON OBILNIH KIŠA. PROCES DE-OKSIGENACIJE (DE-OX) KOJIM SE BILJKE PODVRGAVAJU HIPOKSIJI POPRAĆEN JE PROMJENAMA U METABOLIZMU, EKSPRESIJI GENA I MODIFIKACIJI TE STABILNOSTI PROTEINA. KONKRETNO, BILJKE PROIZVODE DUŠIKOV OKSID (BR.) POD HIPOKSIJOM KAO REZULTAT MITOHONDRIJA DISANJA LANCA KORISTEĆI NITRIT UMJESTO O2 KAO ELEKTRON APSORPTORA. FUNKCIJE O2 I NO ČVRSTO SU POVEZANE S KONTROLOM PROTEOLIZE SKUPINE VII. FAKTORA TRANSKRIPCIJE ERF-A (TFS) PUTEM NIZA N-TERMINALA (DEGRON)-MEDIATED PROCESA DEGRADACIJE, KOJI SE ODVIJA KROZ TZV. ARG/N-KRAJ PRAVILA. OVAJ JE PROCES SAM PO SEBI VAŽAN ZA KONTROLU ODGOVORA NA HIPOKSIJU. KADA SU HIPOKSIČNI UVJETI ZAVRŠENI, BILJKE DOŽIVLJAVAJU PROCES PONOVNE OKSIGENACIJE (RE-OX) KOJI ZAVRŠAVA S NORMOKSIČKIM UVJETIMA. POSTUPAK REOKSIGENACIJE ODVIJA SE UZ SNAŽNU PROIZVODNJU REAKTIVNIH VRSTA KISIKA (ROS). VISOKE RAZINE ROS-A MOGU BITI ŠTETNE ZA BILJKU I PRIJAVLJENO JE DA NE MOŽE IMATI KLJUČNU ULOGU U SUZBIJANJU UČINAKA ROS-A. U CILJEVIMA 1 I 2 OVOG PROJEKTA, BAVIT ĆEMO SE MOLEKULARNOM KARAKTERIZACIJOM DOGAĐAJA KOJI SE JAVLJAJU TIJEKOM DE-OX I RE-OX POMOĆU KOMBINACIJE NEPRISTRANE OMIČKE POTRAGE ZA REGULATORNIM I SIGNALIZACIJSKIM ČIMBENICIMA TE CILJANOG PRISTUPA USMJERENOG NA TFS. POSEBAN NAGLASAK STAVIT ĆE SE NA REGULATORNE KOMPONENTE POVEZANE S BEZ HOMEOSTAZE I SIGNALIZACIJE. TI ĆE PRISTUPI U VELIKOJ MJERI IMATI KORISTI OD DOSTUPNOSTI U LABORATORIJU ZBIRKE MUTANATA I PRETJERANO EKSPRIMIRAJUĆIH TRANSGENSKIH LINIJA KOJE ODGOVARAJU VEĆINI KOMPONENTI UKLJUČENIH U BEZ HOMEOSTAZE I SIGNALIZACIJE, PROTEOLITIČKOG PUTA N-KRAJ I ERFVIIS-A TE ZBIRKU TRANSGENSKIH LINIJA KOJE UVJETNO IZRAŽAVAJU OKO 1000 ARABIDOPSIS TFS. PROJEKT JE DOVRŠEN TREĆIM CILJEM KOJI ĆE SE BAVITI NESTRPLJIVO OČEKIVANOM GENERACIJOM SENZORA PLANTA NO. NAŠE OBRAZLOŽENJE ZA TAJ CILJ TEMELJI SE NA MEHANIZMU NEMA SENZORA KOJI JE U POSLJEDNJE VRIJEME PREDLOŽIO, A KOJI UKLJUČUJE O2 I NEOVISNU OKSIDACIJU OSTATAKA C2 ERFVIIS-A I NJIHOVU NAKNADNU RAZGRADNJU PUTEM STROJEVA ZA PRAVILA N-KRAJ. NO SENZOR KOJI NAMJERAVAMO KONSTRUIRATI ĆE IZRAZITI TRANSLACIJSKE FUZIJE N-TERMINAL DEGRONS S REPORTER FLUORESCENTNIM ILI LUCIFERASE PROTEINA, I, AKO BUDE USPJEŠAN, ONI ĆE OMOGUĆITI KVANTIFIKACIJU ENDOGENE RAZINE NEMA U BILJKAMA. KONAČNO, AKO TESTIRANI DEGRONS RADE ISPRAVNO, PLANIRAMO NAPRAVITI PRELIMINARNU STUDIJU O BIOTEHNOLOŠKOM POTENCIJALU OVOG ALATA ZA KONTROLU RAZGRADNJE PROTEINA S POLJOPRIVREDNIM INTERESOM. (Croatian)
17 August 2022
0 references
VÄXTER VÄXER VANLIGTVIS UNDER NORMOXISKA FÖRHÅLLANDEN MEN DET ÄR RELATIVT VANLIGT ATT VISSA ORGAN/VÄVNADER GENOMGÅR LÅG O2-TILLGÄNGLIGHET (HYPOXI) UNDER HELA UTVECKLINGEN. HYPOXISKA FÖRHÅLLANDEN ÄR VANLIGTVIS ÖVERGÅENDE OCH UTVECKLING FRAMSTEG MED ÖVERGÅNGEN TILL NORMOXIA. HYPOXI ÄR ÄNNU VANLIGARE NÄR VÄXTER STÅR INFÖR OGYNNSAMMA MILJÖFÖRHÅLLANDEN SOM ÖVERSVÄMNINGAR EFTER KRAFTIGA REGN. DEN AVOXYGENATIONSPROCESS (DE-OX) SOM VÄXTER GENOMGÅR UNDER HYPOXI ÅTFÖLJS AV FÖRÄNDRINGAR I PROTEINERNAS METABOLISM, GENUTTRYCK OCH MODIFIERING OCH STABILITET. I SYNNERHET PRODUCERAR VÄXTER KVÄVEOXID (N) UNDER HYPOXI SOM ETT RESULTAT AV MITOKONDRIELL ANDNINGSKEDJA MED NITRIT I STÄLLET FÖR O2 SOM ELEKTRONACCEPTOR. FUNKTIONERNA HOS O2 OCH NO ÄR TÄTT KOPPLADE TILL KONTROLLEN AV PROTEOLYSEN AV GRUPP VII AV ERF TRANSKRIPTIONSFAKTORER (TFS) GENOM EN N-TERMINAL SEKVENS (DEGRON)-MEDIATED NEDBRYTNINGSPROCESS, SOM SKER GENOM DEN S.K. ARG/N-END REGELVÄGEN. DENNA PROCESS ÄR I SIG RELEVANT FÖR ATT KONTROLLERA REAKTIONERNA PÅ HYPOXI. NÄR HYPOXISKA FÖRHÅLLANDEN ÄR ÖVER, VÄXTER UPPLEVER EN RE-OXYGENATION (RE-OX) PROCESS SOM SLUTAR MED NORMOXIC VILLKOR. REOXYGENATIONSPROCESSEN GÅR MED STARK PRODUKTION AV REAKTIVA SYREARTER (ROS). DE HÖGA NIVÅERNA AV AVKASTNING PÅ FÖRSÄLJNING KAN VARA SKADLIGA FÖR ANLÄGGNINGEN OCH DET HAR RAPPORTERATS ATT NO KAN SPELA EN VIKTIG ROLL FÖR ATT MOTVERKA ROS-UTLÖSTA EFFEKTER. I PROJEKTETS MÅL 1 OCH 2 KOMMER VI ATT TA ITU MED DEN MOLEKYLÄRA KARAKTERISERINGEN AV DE HÄNDELSER SOM INTRÄFFAR UNDER DE-OX OCH RE-OX GENOM ATT ANVÄNDA EN KOMBINATION AV OPARTISKA OMICS-BASERADE SÖKANDE EFTER REGULATORISKA OCH SIGNALERANDE FAKTORER, OCH EN MÅLINRIKTAD STRATEGI MED FOKUS PÅ TFS. SÄRSKILD TONVIKT KOMMER ATT LÄGGAS PÅ REGLERINGSKOMPONENTER SOM RÖR ”INGEN HOMEOSTAS” OCH SIGNALERING. DESSA METODER KOMMER TILL STOR DEL ATT GYNNAS AV TILLGÅNGEN I LABBET AV EN SAMLING MUTANTER OCH ÖVERUTTRYCKANDE TRANSGENA LINJER SOM MOTSVARAR DE FLESTA AV DE KOMPONENTER SOM INGÅR I INGEN HOMEOSTAS OCH SIGNALERING, N-END-REGELN PROTEOLYTISK VÄG OCH ERFVIIS, OCH EN SAMLING TRANSGENA LINJER SOM VILLKORLIGT UTTRYCKER OMKRING 1000 ARABIDOPSIS TFS. PROJEKTET AVSLUTAS MED ETT TREDJE MÅL SOM KOMMER ATT TA ITU MED DEN IVRIG EFTERLÄNGTADE GENERATIONEN AV I PLANTA INGA SENSORER. VÅR MOTIVERING FÖR DETTA MÅL ÄR BASERAD PÅ DEN NO SENSING-MEKANISM SOM VI NYLIGEN FÖRESLOG OCH SOM OMFATTAR O2 OCH NO-BEROENDE OXIDATION AV C2-RESTER AV ERFVIIS OCH DERAS EFTERFÖLJANDE NEDBRYTNING GENOM N-END REGELVÄGSMASKINERIET. INGEN SENSOR VI AVSER ATT KONSTRUERA KOMMER ATT UTTRYCKA TRANSLATIONELLA FUSIONER AV N-TERMINAL DEGRONS MED REPORTER FLUORESCERANDE ELLER LUCIFERAS PROTEINER, OCH, OM DE LYCKAS, KOMMER DE ATT MÖJLIGGÖRA KVANTIFIERING AV ENDOGENA INGA NIVÅER I VÄXTER. SLUTLIGEN, OM TESTAD DEGRONS FUNGERAR KORREKT, PLANERAR VI ATT GÖRA EN PRELIMINÄR STUDIE AV DEN BIOTEKNISKA POTENTIALEN HOS DETTA VERKTYG FÖR ATT KONTROLLERA NEDBRYTNINGEN AV PROTEINER AV JORDBRUKSINTRESSE. (Swedish)
17 August 2022
0 references
PLANTELE CRESC, DE OBICEI, ÎN CONDIȚII NORMALE, DAR ESTE RELATIV FRECVENT CA ANUMITE ORGANE/ȚESUTE SĂ FIE SUPUSE UNEI DISPONIBILITĂȚI SCĂZUTE A O2 (HIPOXIA) PE TOT PARCURSUL DEZVOLTĂRII. CONDIȚIILE HIPOXICE SUNT, DE OBICEI, TRANZITORII ȘI PROGRES DE DEZVOLTARE CU TRECEREA LA NORMOXIA. HIPOXIA ESTE ȘI MAI FRECVENTĂ ATUNCI CÂND PLANTELE SE CONFRUNTĂ CU CONDIȚII DE MEDIU NEFAVORABILE, CUM AR FI INUNDAȚIILE DUPĂ PLOI ABUNDENTE. PROCESUL DE DEZOXIGENARE (DE-OXIFIERE) PRIN CARE PLANTELE SUNT SUPUSE HIPOXIEI ESTE ÎNSOȚIT DE MODIFICĂRI ALE METABOLISMULUI, ALE EXPRESIEI GENETICE ȘI ALE MODIFICĂRII ȘI STABILITĂȚII PROTEINELOR. ÎN SPECIAL, PLANTELE PRODUC OXID NITRIC (NO) SUB HIPOXIE CA URMARE A LANȚULUI DE RESPIRAȚIE MITOCONDRIAL FOLOSIND NITRIȚI ÎN LOC DE O2 CA RECEPTOR DE ELECTRONI. FUNCȚIILE O2 ȘI NO SUNT STRÂNS LEGATE DE CONTROLUL PROTEOLIZEI GRUPEI VII A FACTORILOR DE TRANSCRIERE ERF (TFS) PRINTR-O SECVENȚĂ N-TERMINALĂ (DEGRON)-MEDIATED PROCES DE DEGRADARE, CARE ARE LOC PRIN AȘA-NUMITA CALE DE REGULĂ ARG/N-END. ACEST PROCES ESTE ÎN SINE RELEVANT PENTRU A CONTROLA RĂSPUNSURILE LA HIPOXIE. CÂND CONDIȚIILE HIPOXICE SUNT DE PESTE, PLANTELE EXPERIMENTA UN PROCES DE RE-OXIGENARE (RE-OX) CARE SE TERMINĂ CU CONDIȚII NORMOXIC. PROCESUL DE REOXIGENARE SE DESFĂȘOARĂ CU PRODUCȚIA PUTERNICĂ DE SPECII REACTIVE DE OXIGEN (ROS). NIVELURILE RIDICATE DE ROS POT FI DĂUNĂTOARE PENTRU INSTALAȚIE ȘI S-A RAPORTAT CĂ NU POATE JUCA UN ROL ESENȚIAL ÎN CONTRACARAREA EFECTELOR DECLANȘATE DE ROS. ÎN CADRUL OBIECTIVELOR 1 ȘI 2 ALE ACESTUI PROIECT, VOM ABORDA CARACTERIZAREA MOLECULARĂ A EVENIMENTELOR CARE AU LOC ÎN TIMPUL DEZINTOXICĂRII ȘI RE-OXIFICĂRII, UTILIZÂND O COMBINAȚIE DE CĂUTARE NON-PĂRTINITOARE A FACTORILOR DE REGLEMENTARE ȘI DE SEMNALIZARE, PRECUM ȘI O ABORDARE ORIENTATĂ AXATĂ PE TFS. SE VA PUNE UN ACCENT DEOSEBIT PE COMPONENTELE DE REGLEMENTARE LEGATE DE LIPSA HOMEOSTAZIEI ȘI A SEMNALIZĂRII. ACESTE ABORDĂRI VOR BENEFICIA ÎN MARE MĂSURĂ DE DISPONIBILITATEA ÎN LABORATOR A UNEI COLECȚII DE MUTANȚI ȘI LINII TRANSGENICE SUPRAEXPRIMANTE CORESPUNZĂTOARE MAJORITĂȚII COMPONENTELOR IMPLICATE ÎN NO HOMEOSTASIS AND SIGNALING, CALEA PROTEOLITICĂ N-END ȘI ERFVIIS, PRECUM ȘI O COLECȚIE DE LINII TRANSGENICE CARE EXPRIMĂ CONDIȚIONAT ÎN JURUL VALORII DE 1000 ARABIDOPSIS TFS. PROIECTUL ESTE FINALIZAT DE UN AL TREILEA OBIECTIV CARE VA ABORDA GENERAȚIA AȘTEPTATĂ DE SENZORI PLANTA NO. RAȚIONAMENTUL NOSTRU PENTRU ACEST OBIECTIV SE BAZEAZĂ PE MECANISMUL FĂRĂ DETECȚIE PE CARE L-AM PROPUS ÎN ULTIMA VREME, CARE IMPLICĂ OXIDAREA O2 ȘI NEDEPENDENTĂ A REZIDUURILOR DE C2 ALE ERFVIIS ȘI DEGRADAREA ULTERIOARĂ A ACESTORA PRIN INTERMEDIUL MAȘINILOR DE CALE N-END. NICI UN SENZOR PE CARE INTENȚIONĂM SĂ-L CONSTRUIM VA EXPRIMA FUZIUNEA TRANSLAȚIONALĂ A DEGRONS-URILOR N-TERMINALE CU PROTEINELE REPORTER FLUORESCENTE SAU LUCIFERAZE ȘI, DACĂ VA AVEA SUCCES, VOR PERMITE CUANTIFICAREA NIVELURILOR ENDOGENE NO ÎN PLANTE. ÎN CELE DIN URMĂ, DACĂ DEGRONS TESTAT FUNCȚIONEAZĂ CORECT, INTENȚIONĂM SĂ FACEM UN STUDIU PRELIMINAR AL POTENȚIALULUI BIOTEHNOLOGIC AL ACESTUI INSTRUMENT PENTRU A CONTROLA DEGRADAREA PROTEINELOR CU INTERES AGRICOL. (Romanian)
17 August 2022
0 references
RASTLINE OBIČAJNO RASTEJO V NORMALNIH POGOJIH, VENDAR JE RAZMEROMA POGOSTO, DA SO NEKATERI ORGANI/TKIVA V CELOTNEM RAZVOJU IZPOSTAVLJENI NIZKI RAZPOLOŽLJIVOSTI O2 (HIPOKSIJA). HIPOKSIČNA STANJA SO OBIČAJNO PREHODNA IN RAZVOJNI NAPREDEK PRI PREHODU NA NORMOKSIJO. HIPOKSIJA JE ŠE POGOSTEJŠA, KADAR SE RASTLINE SOOČAJO Z NEUGODNIMI OKOLJSKIMI RAZMERAMI, KOT SO POPLAVE PO MOČNIH PADAVINAH. PROCES DEOKSIGENACIJE (DE-OX), KI GA RASTLINE DOŽIVLJAJO POD HIPOKSIJO, SPREMLJAJO SPREMEMBE V PRESNOVI, IZRAŽANJU GENOV TER MODIFIKACIJI IN STABILNOSTI BELJAKOVIN. ZLASTI RASTLINE PROIZVAJAJO DUŠIKOV OKSID (ŠT.) POD HIPOKSIJO KOT POSLEDICA MITOHONDRIJSKE RESPIRACIJSKE VERIGE Z UPORABO NITRITA NAMESTO O2 KOT ELEKTRONSKEGA SPREJEMNIKA. FUNKCIJE O2 IN NO SO TESNO POVEZANE Z NADZOROM PROTEOLIZE SKUPINE VII TRANSKRIPCIJSKIH FAKTORJEV ERF (TFS) PREK N-TERMINALNEGA ZAPOREDJA (DEGRON)-MEDIATED PROCESA RAZGRADNJE, KI POTEKA SKOZI T. I. POT PRAVILA ARG/N. TA PROCES JE POMEMBEN ZA NADZOR ODZIVOV NA HIPOKSIJO. KO SO HIPOKSIČNI POGOJI KONČANI, RASTLINE DOŽIVLJAJO REOKSIGENACIJSKI (RE-OX) PROCES, KI SE KONČA Z NORMOXIC POGOJI. POSTOPEK PONOVNE OKSIGENACIJE POTEKA Z MOČNO PROIZVODNJO REAKTIVNIH KISIKOVIH VRST (ROS). VISOKE STOPNJE DONOSA IZ POSLOVANJA SO LAHKO ŠKODLJIVE ZA OBRAT IN POROČA SE, DA IMA LAHKO NE BISTVENO VLOGO PRI PREPREČEVANJU UČINKOV ROS, KI JIH SPROŽIJO DONOSI. V CILJIH 1 IN 2 TEGA PROJEKTA BOMO OBRAVNAVALI MOLEKULARNO KARAKTERIZACIJO DOGODKOV, KI SE DOGAJAJO MED DE-OX IN RE-OX, Z UPORABO KOMBINACIJE NEPRISTRANSKEGA ISKANJA REGULATIVNIH IN SIGNALNIH DEJAVNIKOV NA PODLAGI OMICSA TER CILJNO USMERJENEGA PRISTOPA, KI SE OSREDOTOČA NA TFS. POSEBEN POUDAREK BO NA REGULATIVNIH KOMPONENTAH, POVEZANIH Z NO HOMEOSTASIS IN SIGNALIZACIJO. TI PRISTOPI BODO V VELIKI MERI KORISTILI OD RAZPOLOŽLJIVOSTI ZBIRKE MUTANTOV IN PREVEČ IZRAŽENIH TRANSGENSKIH LINIJ V LABORATORIJU, KI USTREZAJO VEČINI KOMPONENT, VKLJUČENIH V BREZ HOMEOSTAZE IN SIGNALIZACIJE, PROTEOLITIČNO POT PRAVILA N-KONCA IN ERFVIIS TER ZBIRKO TRANSGENSKIH LINIJ, KI POGOJNO IZRAŽAJO PRIBLIŽNO 1000 ARABIDOPSIS TFS. PROJEKT JE ZAKLJUČEN S TRETJIM CILJEM, KI BO OBRAVNAVAL NESTRPNO PRIČAKOVANO GENERACIJO V PLANTA NO SENZORJEV. NAŠA UTEMELJITEV ZA TA CILJ TEMELJI NA MEHANIZMU BREZ ZAZNAVANJA, KI SMO GA V ZADNJEM ČASU PREDLAGALI IN KI VKLJUČUJE OKSIDACIJO OSTANKOV C2 IZ ERFVIIS-A, KI NI ODVISNA OD ODVISNOSTI, IN NJIHOVO POZNEJŠO RAZGRADNJO S POMOČJO STROJEV ZA UPRAVLJANJE PRAVIL NA N-KONCU. NE SENZOR, KI GA NAMERAVAMO ZGRADITI, BO IZRAZIL TRANSLACIJSKE FUZIJE N-TERMINAL DEGRONS Z REPORTER FLUORESCENČNIMI ALI LUCIFERAZNIMI BELJAKOVINAMI IN, ČE BO USPEŠEN, BO OMOGOČIL KOLIČINSKO OPREDELITEV ENDOGENEGA BREZ RAVNI V RASTLINAH. ČE TESTIRANI DEGRONS DELUJE PRAVILNO, NAČRTUJEMO PREDHODNO ŠTUDIJO BIOTEHNOLOŠKEGA POTENCIALA TEGA ORODJA ZA NADZOR RAZGRADNJE BELJAKOVIN S KMETIJSKIM INTERESOM. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
ROŚLINY ZWYKLE ROSNĄ W WARUNKACH NORMOKSYCZNYCH, ALE STOSUNKOWO POWSZECHNE JEST, ŻE NIEKTÓRE NARZĄDY/TKANKI ULEGAJĄ NISKIEJ DOSTĘPNOŚCI O2 (HIPOKSJA) PRZEZ CAŁY OKRES ROZWOJU. STANY HIPOKSYJNE SĄ ZAZWYCZAJ PRZEJŚCIOWE I POSTĘP ROZWOJU Z PRZEJŚCIEM DO NORMOKSYI. NIEDOTLENIENIE WYSTĘPUJE JESZCZE CZĘŚCIEJ, GDY ROŚLINY BORYKAJĄ SIĘ Z NIEKORZYSTNYMI WARUNKAMI ŚRODOWISKOWYMI, TAKIMI JAK POWODZIE PO SILNYCH OPADACH DESZCZU. PROCESOWI ODTLENIANIA (DE-OX) ROŚLINOM ULEGAJĄCYM NIEDOTLENIENIU TOWARZYSZĄ ZMIANY W METABOLIZMIE, EKSPRESJI GENÓW ORAZ MODYFIKACJI I STABILNOŚCI BIAŁEK. W SZCZEGÓLNOŚCI ROŚLINY WYTWARZAJĄ TLENEK AZOTU (NR) POD NIEDOTLENIENIEM W WYNIKU MITOCHONDRIALNEGO ŁAŃCUCHA ODDECHOWEGO PRZY UŻYCIU AZOTYNÓW ZAMIAST O2 JAKO AKCEPTORA ELEKTRONÓW. FUNKCJE O2 I NO SĄ ŚCIŚLE POWIĄZANE Z KONTROLĄ PROTEOLIZY GRUPY VII WSPÓŁCZYNNIKÓW TRANSKRYPCJI ERF (TFS) POPRZEZ PROCES DEGRADACJI N-KOŃCOWEJ (DEGRON)-MEDIATED, KTÓRY ODBYWA SIĘ POPRZEZ TZW. ŚCIEŻKĘ REGUŁ ARG/N-END. PROCES TEN JEST SAM W SOBIE ISTOTNY DLA KONTROLI REAKCJI NA NIEDOTLENIENIE. PO PRZEKROCZENIU WARUNKÓW HIPOKSYJNYCH ROŚLINY DOŚWIADCZAJĄ PROCESU REOKSYGENACJI (RE-OX), KTÓRY KOŃCZY SIĘ WARUNKAMI NORMOKSYCZNYMI. PROCES REOKSYGENACJI PRZEBIEGA Z SILNĄ PRODUKCJĄ REAKTYWNYCH GATUNKÓW TLENU (ROS). WYSOKI POZIOM ROS MOŻE BYĆ SZKODLIWY DLA ZAKŁADU I ZGŁOSZONO, ŻE NO MOŻE ODGRYWAĆ ZASADNICZĄ ROLĘ W PRZECIWDZIAŁANIU SKUTKOM URUCHAMIANIA ROS. W CELACH 1 I 2 TEGO PROJEKTU ZAJMIEMY SIĘ CHARAKTERYSTYKĄ MOLEKULARNĄ ZDARZEŃ ZACHODZĄCYCH W TRAKCIE DEOX I RE-OX, WYKORZYSTUJĄC KOMBINACJĘ BEZ UPRZEDZEŃ OMIKÓW POSZUKIWANIA CZYNNIKÓW REGULACYJNYCH I SYGNALIZACYJNYCH ORAZ UKIERUNKOWANEGO PODEJŚCIA KONCENTRUJĄCEGO SIĘ NA TFS. SZCZEGÓLNY NACISK ZOSTANIE POŁOŻONY NA ELEMENTY REGULACYJNE ZWIĄZANE Z BRAKIEM HOMEOSTAZY I SYGNALIZACJI. PODEJŚCIA TE W DUŻEJ MIERZE SKORZYSTAJĄ Z DOSTĘPNOŚCI W LABORATORIUM ZBIORU MUTANTÓW I NADEKSPRESJI LINII TRANSGENICZNYCH ODPOWIADAJĄCYCH WIĘKSZOŚCI SKŁADNIKÓW ZWIĄZANYCH Z BRAKIEM HOMEOSTAZY I SYGNALIZACJI, SZLAKIEM PROTEOLITYCZNYM N-END I ERFVIIS ORAZ ZBIOREM LINII TRANSGENICZNYCH WARUNKOWO WYRAŻAJĄCYM OKOŁO 1000 TFS ARABIDOPSIS. PROJEKT JEST ZAKOŃCZONY TRZECIM CELEM, KTÓRY MA ZAJĄĆ SIĘ Z NIECIERPLIWOŚCIĄ OCZEKIWANĄ GENERACJĄ CZUJNIKÓW PLANTA NO. NASZE UZASADNIENIE DLA TEGO CELU OPIERA SIĘ NA ZAPROPONOWANYM OSTATNIO MECHANIZMIE NO SENSING, KTÓRY OBEJMUJE O2 I BEZZALEŻNE UTLENIANIE POZOSTAŁOŚCI C2 Z ERFVIIS I ICH PÓŹNIEJSZĄ DEGRADACJĘ PRZEZ MECHANIZM ŚCIEŻKI N-END. BRAK CZUJNIKA, KTÓRY ZAMIERZAMY ZBUDOWAĆ, WYRAZI TRANSLACYJNE FUZJE N-TERMINALU DEGRONS Z BIAŁKAMI FLUORESCENCYJNYMI LUB LUCYFERAZY REPORTERAZY, A JEŚLI SIĘ UDA, POZWOLĄ NA ILOŚCIOWE OZNACZANIE ENDOGENNYCH POZIOMÓW NO W ROŚLINACH. WRESZCIE, JEŚLI TESTOWANE DEGRONS DZIAŁAJĄ PRAWIDŁOWO, PLANUJEMY PRZEPROWADZIĆ WSTĘPNE BADANIE POTENCJAŁU BIOTECHNOLOGICZNEGO TEGO NARZĘDZIA DO KONTROLI DEGRADACJI BIAŁEK Z KORZYŚCIĄ DLA ROLNICTWA. (Polish)
17 August 2022
0 references
Valencia
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
BIO2017-82945-P
0 references