Epigenetics and immunosuppression. Use of circulating histones and their post-translational modifications as biomarkers for diagnosis and prognosis in sepsis and septic shock. (Q3138351)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3138351 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Epigenetics and immunosuppression. Use of circulating histones and their post-translational modifications as biomarkers for diagnosis and prognosis in sepsis and septic shock. |
Project Q3138351 in Spain |
Statements
39,476.25 Euro
0 references
72,500.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2017
0 references
31 March 2020
0 references
CENTRO DE INVESTIGACION BIOMEDICA EN RED (CIBER)
0 references
La sepsis tiene una incidencia en Europa de 200-300 casos por cada 100.000 habitantes/año. Un 2% de los pacientes hospitalizados y el 75% de los pacientes de UCI desarrollan una sepsis, de los que un 30% evolucionan a shock séptico (SS). Además, muchos de los supervivientes desarrollán una inmunosupresión que los hace más sensibles a nuevas infecciones y que produce un incremento de la morbi-mortalidad a largo término. Recientemente, se ha recomendado la búsqueda de nuevos biomarcadores sensibles y específicos para la sepsis basados en modificaciones epigenéticas. y en especial las histonas se han postulado como biomarcadores en enfermedades que cursan con hiperinflamación, trauma e infecciones. Por ello el objetivo de este proyecto es Identificar biomarcadores epigenéticos y desarrollar herramientas de diagnóstico y pronóstico para la clasificación de los fenotipos particulares de la sepsis que permitan predecir los estados de inmunosupresión. En este proyecto usaremos metodología basada en la espectrometría de masas para cuantificar los niveles de histonas circulantes y usarlas como biomarcadores en sepsis. Además, con estudios de ChIP-Seq y el análisis bioinformático contribuiremos a la comprensión de los mecanismos epigenéticos relacionados con la inmunosupresión en los supervivientes de un episodio de sepsis. (Spanish)
0 references
Sepsis has an incidence in Europe of 200-300 cases per 100,000 inhabitants/year. 2 % of hospitalised patients and 75 % of ICU patients develop a sepsis, of which 30 % evolve to septic shock (SS). In addition, many of the survivors develop an immunosuppression that makes them more sensitive to new infections and leads to an increase in long-term morbidity-mortality. Recently, it has been recommended the search for new sensitive and specific biomarkers for sepsis based on epigenetic modifications, and especially histones have been postulated as biomarkers in diseases with hyperinflammation, trauma and infections. Therefore, the objective of this project is to identify epigenetic biomarkers and to develop diagnostic and prognostic tools for the classification of particular sepsis phenotypes that allow predicting the immunosuppression states. In this project we will use methodology based on mass spectrometry to quantify the levels of circulating histones and use them as biomarkers in sepsis. In addition, with ChIP-Seq studies and bioinformatics we will contribute to the understanding of epigenetic mechanisms related to immunosuppression in survivors of a sepsis episode. (English)
12 October 2021
0.8314778531045308
0 references
L’incidence de la septicémie en Europe est de 200 à 300 cas pour 100 000 habitants/an. 2 % des patients hospitalisés et 75 % des patients en soins intensifs développent une septicémie, dont 30 % évoluent vers un choc septique (SS). De plus, bon nombre des survivants développent une immunosuppression qui les rend plus sensibles aux nouvelles infections et entraîne une augmentation de la morbidité et de la mortalité à long terme. Récemment, il a été recommandé de rechercher de nouveaux biomarqueurs sensibles et spécifiques pour la septicémie basés sur des modifications épigénétiques, et en particulier les histones ont été postulés comme biomarqueurs dans les maladies présentant une hyperinflammation, des traumatismes et des infections. Par conséquent, l’objectif de ce projet est d’identifier les biomarqueurs épigénétiques et de développer des outils diagnostiques et pronostiques pour la classification de phénotypes particuliers de sepsis qui permettent de prédire les états d’immunosuppression. Dans ce projet, nous utiliserons une méthodologie basée sur la spectrométrie de masse pour quantifier les niveaux d’histones circulant et les utiliser comme biomarqueurs dans la septicémie. En outre, avec les études ChIP-Seq et la bioinformatique, nous contribuerons à la compréhension des mécanismes épigénétiques liés à l’immunosuppression chez les survivants d’un épisode de septicémie. (French)
2 December 2021
0 references
Sepsis hat eine Inzidenz von 200-300 Fällen pro 100.000 Einwohner/Jahr in Europa. 2 % der stationären Patienten und 75 % der ICU-Patienten entwickeln eine Sepsis, von denen sich 30 % zu septischen Schocks (SS) entwickeln. Darüber hinaus entwickeln viele Überlebende eine Immunsuppression, die sie empfindlicher auf neue Infektionen macht und zu einer Zunahme der Langzeitsterblichkeit führt. Vor kurzem wurde die Suche nach neuen sensiblen und spezifischen Biomarkern für Sepsis empfohlen, die auf epigenetischen Veränderungen basieren, und insbesondere Histone wurden als Biomarker bei Erkrankungen mit Hyperinflammation, Trauma und Infektionen postuliert. Ziel dieses Projekts ist es daher, epigenetische Biomarker zu identifizieren und diagnostische und prognostische Werkzeuge für die Klassifizierung bestimmter Sepsis-Phänotypen zu entwickeln, die eine Vorhersage der Immunsuppressionszustände ermöglichen. In diesem Projekt werden wir eine auf Massenspektrometrie basierende Methodik verwenden, um die Konzentrationen zirkulierender Histone zu quantifizieren und als Biomarker in Sepsis zu verwenden. Darüber hinaus werden wir mit ChIP-Seq-Studien und Bioinformatik zum Verständnis epigenetischer Mechanismen im Zusammenhang mit Immunsuppression bei Überlebenden einer Sepsis-Episode beitragen. (German)
9 December 2021
0 references
Sepsis heeft een incidentie in Europa van 200-300 gevallen per 100.000 inwoners/jaar. 2 % van de in het ziekenhuis opgenomen patiënten en 75 % van de ICU-patiënten ontwikkelen een sepsis, waarvan 30 % zich ontwikkelt tot septische shock (SS). Bovendien ontwikkelen veel van de overlevenden een immunosuppressie die hen gevoeliger maakt voor nieuwe infecties en leidt tot een toename van de morbiditeit-mortaliteit op lange termijn. Onlangs is het aanbevolen de zoektocht naar nieuwe gevoelige en specifieke biomarkers voor sepsis op basis van epigenetische modificaties, en vooral histonen zijn gepostuleerd als biomarkers bij ziekten met hyperinflammatie, trauma en infecties. Daarom is het doel van dit project om epigenetische biomarkers te identificeren en diagnostische en prognostische hulpmiddelen te ontwikkelen voor de classificatie van specifieke sepsisfenotypen die het mogelijk maken de immunosuppressietoestanden te voorspellen. In dit project zullen we methodologie op basis van massaspectrometrie gebruiken om de niveaus van circulerende histonen te kwantificeren en ze te gebruiken als biomarkers in sepsis. Daarnaast zullen we met ChIP-Seq studies en bio-informatica bijdragen aan het begrip van epigenetische mechanismen gerelateerd aan immunosuppressie bij overlevenden van een sepsis episode. (Dutch)
17 December 2021
0 references
La sepsi ha un'incidenza in Europa di 200-300 casi ogni 100.000 abitanti/anno. Il 2 % dei pazienti ospedalizzati e il 75 % dei pazienti affetti da terapia intensiva sviluppano una sepsi, di cui il 30 % si evolve a shock settico (SS). Inoltre, molti dei sopravvissuti sviluppano un'immunosoppressione che li rende più sensibili alle nuove infezioni e porta ad un aumento della morbilità-mortalità a lungo termine. Recentemente, è stata raccomandata la ricerca di nuovi biomarcatori sensibili e specifici per la sepsi basata su modifiche epigenetiche, e soprattutto gli istoni sono stati postulati come biomarcatori in malattie con iperinfiammazione, traumi e infezioni. Pertanto, l'obiettivo di questo progetto è quello di identificare biomarcatori epigenetici e sviluppare strumenti diagnostici e prognostici per la classificazione di particolari fenotipi sepsi che consentono di prevedere gli stati di immunosoppressione. In questo progetto useremo una metodologia basata sulla spettrometria di massa per quantificare i livelli degli istoni circolanti e usarli come biomarcatori in sepsi. Inoltre, con studi ChIP-Seq e bioinformatica contribuiremo alla comprensione dei meccanismi epigenetici relativi all'immunosoppressione nei sopravvissuti di un episodio di sepsi. (Italian)
16 January 2022
0 references
Η σήψη έχει συχνότητα εμφάνισης 200-300 κρουσμάτων στην Ευρώπη ανά 100.000 κατοίκους/έτος. Το 2 % των νοσοκομειακών ασθενών και το 75 % των ασθενών με ΜΕΘ αναπτύσσουν σήψη, εκ των οποίων το 30 % εξελίσσεται σε σηπτικό σοκ (SS). Επιπλέον, πολλοί από τους επιζώντες αναπτύσσουν μια ανοσοκαταστολή που τους καθιστά πιο ευαίσθητους σε νέες λοιμώξεις και οδηγεί σε αύξηση της μακροχρόνιας νοσηρότητας-θανασίας. Πρόσφατα, έχει προταθεί η αναζήτηση νέων ευαίσθητων και ειδικών βιοδεικτών για σήψη με βάση επιγενετικές τροποποιήσεις, και ιδιαίτερα οι ιστόνες έχουν χαρακτηριστεί ως βιοδείκτες σε ασθένειες με υπερφλεγμονές, τραύματα και λοιμώξεις. Ως εκ τούτου, στόχος αυτού του έργου είναι ο εντοπισμός επιγενετικών βιοδεικτών και η ανάπτυξη διαγνωστικών και προγνωστικών εργαλείων για την ταξινόμηση συγκεκριμένων φαινοτύπων σήψης που επιτρέπουν την πρόβλεψη των καταστάσεων ανοσοκαταστολής. Σε αυτό το έργο θα χρησιμοποιήσουμε μεθοδολογία βασισμένη στη φασματομετρία μάζας για να ποσοτικοποιήσουμε τα επίπεδα κυκλοφορίας των ιστόνων και να τα χρησιμοποιήσουμε ως βιοδείκτες στη σήψη. Επιπλέον, με τις μελέτες του ChIP-Seq και τη βιοπληροφορική θα συμβάλουμε στην κατανόηση των επιγενετικών μηχανισμών που σχετίζονται με την ανοσοκαταστολή σε επιζώντες ενός επεισοδίου σήψης. (Greek)
17 August 2022
0 references
Sepsis har en forekomst i Europa på 200-300 tilfælde pr. 100 000 indbyggere pr. år. 2 % af de indlagte patienter og 75 % af patienterne på intensivafdelingerne udvikler sepsis, hvoraf 30 % udvikler sig til septisk chok (SS). Hertil kommer, at mange af de overlevende udvikler en immunsuppression, der gør dem mere følsomme over for nye infektioner og fører til en stigning i langvarig sygelighed-mortalitet. For nylig er det blevet anbefalet at søge efter nye følsomme og specifikke biomarkører for sepsis baseret på epigenetiske modifikationer, og især histoner er blevet postuleret som biomarkører i sygdomme med hyperinflammation, traumer og infektioner. Formålet med dette projekt er derfor at identificere epigenetiske biomarkører og udvikle diagnostiske og prognostiske værktøjer til klassificering af bestemte sepsisfænotyper, der gør det muligt at forudsige immunsuppressionstilstande. I dette projekt vil vi bruge metode baseret på massespektrometri til at kvantificere niveauet af cirkulerende histoner og bruge dem som biomarkører i sepsis. Derudover, med ChIP-Seq undersøgelser og bioinformatik vil vi bidrage til forståelsen af epigenetiske mekanismer relateret til immunsuppression hos overlevende fra en sepsis episode. (Danish)
17 August 2022
0 references
Sepsiksen esiintyvyys Euroopassa on 200–300 tapausta 100 000 asukasta kohti vuodessa. 2 %: lle sairaalapotilaista ja 75 prosentille ICU-potilaista kehittyy sepsis, josta 30 % kehittyy septiseksi sokiksi (SS). Lisäksi monet eloonjääneet kehittävät immunosuppression, joka tekee heistä herkempiä uusille infektioille ja johtaa pitkäaikaisen sairastuvuuden lisääntymiseen. Äskettäin on suositeltavaa etsiä uusia herkkiä ja erityisiä biomarkkereita sepsikselle, joka perustuu epigeneettisiin muutoksiin, ja erityisesti histonit on oletettu biomarkkereiksi hyperinflammation, trauman ja infektioiden aiheuttamissa sairauksissa. Siksi tämän hankkeen tavoitteena on tunnistaa epigeneettiset biomarkkerit ja kehittää diagnostisia ja prognostisia työkaluja tiettyjen sepsis fenotyyppien luokittelemiseksi, jotta immunosuppressiotiloja voidaan ennustaa. Tässä hankkeessa käytämme massaspektrometriaan perustuvia menetelmiä kvantifioimaan histonien pitoisuudet ja käyttämään niitä biomarkkereina sepsisissä. Lisäksi ChIP-Seq-tutkimusten ja bioinformatiikan avulla autamme ymmärtämään epigeneettisiä mekanismeja, jotka liittyvät immunosuppressioon selvinneiden sepsis-jaksossa. (Finnish)
17 August 2022
0 references
Is-sepsis għandha inċidenza fl-Ewropa ta’ 200–300 każ għal kull 100,000 abitant fis-sena. 2 % tal-pazjenti li ddaħħlu l-isptar u 75 % tal-pazjenti b’ICU jiżviluppaw sepsis, li minnhom 30 % jevolvu għal xokk settiku (SS). Barra minn hekk, ħafna minn dawk li baqgħu ħajjin jiżviluppaw immunosoppressjoni li tagħmilhom aktar sensittivi għal infezzjonijiet ġodda u twassal għal żieda fil-morbidità-mortalità fit-tul. Dan l-aħħar, ġie rrakkomandat it-tiftix ta’ bijomarkaturi sensittivi u speċifiċi ġodda għas-sepsis abbażi ta’ modifiki epiġenetiċi, u b’mod speċjali l-ġebel ġie postulat bħala bijomarkaturi f’mard b’iperinfjammazzjoni, trawma u infezzjonijiet. Għalhekk, l-għan ta’ dan il-proġett huwa li jidentifika bijomarkaturi epiġenetiċi u li jiżviluppa għodod dijanjostiċi u pronjostiċi għall-klassifikazzjoni ta’ fenotipi partikolari ta’ sepsis li jippermettu t-tbassir tal-istati ta’ immunosoppressjoni. F’dan il-proġett se nużaw metodoloġija bbażata fuq spettrometrija tal-massa biex nikkwantifikaw il-livelli ta’ ġebel li jiċċirkola u nużawhom bħala bijomarkaturi f’sepsis. Barra minn hekk, bi studji ChIP-Seq u bijoinformatika aħna se nikkontribwixxu għall-fehim ta’ mekkaniżmi epiġenetiċi relatati ma’ immunosoppressjoni f’superstiti ta’ episodju ta’ sepsis. (Maltese)
17 August 2022
0 references
Sepse Eiropā ir sastopama 200–300 gadījumu uz 100 000 iedzīvotāju gadā. 2 % hospitalizēto pacientu un 75 % IKV pacientu attīstās sepse, no kuras 30 % attīstās līdz septiskajam šokam (SS). Turklāt daudziem izdzīvojušajiem attīstās imūnsupresija, kas padara viņus jutīgākus pret jaunām infekcijām un izraisa ilgtermiņa saslimstības palielināšanos. Nesen tika ieteikts meklēt jaunus jutīgus un specifiskus sepses biomarķierus, pamatojoties uz epiģenētiskajām modifikācijām, un jo īpaši histoni ir postulēti kā biomarķieri slimībām ar hiperiekaisumu, traumām un infekcijām. Tāpēc šā projekta mērķis ir identificēt epiģenētiskus biomarķierus un izstrādāt diagnostikas un prognostiskus instrumentus konkrētu sepses fenotipu klasifikācijai, kas ļautu prognozēt imūnsupresijas stāvokļus. Šajā projektā mēs izmantosim uz masspektrometriju balstītu metodoloģiju, lai noteiktu cirkulējošo histonu līmeni un izmantotu tos kā biomarķierus sepsē. Turklāt ar ChIP-Seq pētījumiem un bioinformātiku mēs veicināsim izpratni par epiģenētiskajiem mehānismiem, kas saistīti ar imūnsupresiju sepses epizodes izdzīvojušajiem. (Latvian)
17 August 2022
0 references
Sepsa sa v Európe vyskytuje 200 – 300 prípadov na 100 000 obyvateľov ročne. U 2 % hospitalizovaných pacientov a 75 % pacientov s ICU sa vyvinula sepsa, z ktorých 30 % sa vyvinulo na septický šok (SS). Okrem toho sa u mnohých ľudí, ktorí prežili, vyvinula imunosupresia, ktorá ich robí citlivejšími na nové infekcie a vedie k zvýšeniu dlhodobej morbidity-mortality. V poslednej dobe sa odporúča hľadať nové citlivé a špecifické biomarkery pre sepsu založené na epigenetických modifikáciách, a najmä históny boli postulované ako biomarkery pri ochoreniach s hyperzápalom, traumou a infekciami. Cieľom tohto projektu je preto identifikovať epigenetické biomarkery a vyvinúť diagnostické a prognostické nástroje na klasifikáciu konkrétnych fenotypov sepsy, ktoré umožňujú predpovedať stavy imunosupresie. V tomto projekte použijeme metodiku založenú na hmotnostnej spektrometrii na kvantifikáciu úrovní cirkulujúcich histónov a ich použitie ako biomarkery v sepse. Okrem toho s ChIP-Seq štúdiami a bioinformatikami prispejeme k pochopeniu epigenetických mechanizmov súvisiacich s imunosupresiou u tých, ktorí prežili epizódu sepsy. (Slovak)
17 August 2022
0 references
Sepsis Tá minicíocht san Eoraip de 200-300 cás in aghaidh 100,000 áitritheoir/bliain. Forbraíonn 2 % d’othair san ospidéal agus 75 % d’othair ICU sepsis, a n-athraíonn 30 % díobh go turraing sheipteach (SS). Ina theannta sin, forbraíonn go leor de na marthanóirí cosc imdhíonachta a fhágann go bhfuil siad níos íogaire d’ionfhabhtuithe nua agus go dtiocfaidh méadú ar ghalracht fhadtéarmach mar thoradh air. Le déanaí, tá sé molta an cuardach a dhéanamh bithmharcóirí íogair agus sonracha nua le haghaidh sepsis bunaithe ar mhodhnuithe epigenetic, agus go háirithe histones curtha postulated mar bhithmharcóirí i galair le hyperinflammation, tráma agus ionfhabhtuithe. Dá bhrí sin, is é cuspóir an tionscadail seo bithmharcóirí epigenetic a shainaithint agus uirlisí diagnóiseacha agus prognóis a fhorbairt chun feinitíopaí sepsis ar leith a aicmiú a ligeann do na stáit imdhíonachta a thuar. Sa tionscadal seo bainfimid úsáid as modheolaíocht atá bunaithe ar mhais-speictriméadracht chun na leibhéil histón a scaiptear a chainníochtú agus iad a úsáid mar bhithmharcóirí i sepsis. Ina theannta sin, le staidéir ChIP-Seq agus bioinformatics cuirfimid leis an tuiscint ar shásraí epigenetic a bhaineann le cosc imdhíonachta i marthanóirí eipeasóid sepsis. (Irish)
17 August 2022
0 references
Sepse se v Evropě vyskytuje 200–300 případů na 100 000 obyvatel ročně. U 2 % hospitalizovaných pacientů a u 75 % pacientů ICU se vyvinula sepse, z nichž 30 % se vyvinulo do septického šoku (SS). Kromě toho se u mnoha přeživších vyvíjí imunosuprese, která je činí citlivějšími na nové infekce a vede ke zvýšení dlouhodobé morbidity-smrtelnosti. V poslední době bylo doporučeno hledat nové citlivé a specifické biomarkery pro sepsi založené na epigenetických modifikacích a zejména histony byly postulovány jako biomarkery u onemocnění s hyperinflamací, traumatem a infekcemi. Cílem tohoto projektu je proto identifikovat epigenetické biomarkery a vyvinout diagnostické a prognostické nástroje pro klasifikaci konkrétních sepsí fenotypů, které umožňují předvídat stavy imunosuprese. V tomto projektu použijeme metodiku založenou na hmotnostní spektrometrii pro kvantifikaci úrovní cirkulujících histonů a použijeme je jako biomarkery v sepsi. Kromě toho pomocí studií ChIP-Seq a bioinformatiky přispějeme k pochopení epigenetických mechanismů souvisejících s imunosupresí u osob, které přežily epizodu sepse. (Czech)
17 August 2022
0 references
A sepse tem uma incidência na Europa de 200 a 300 casos por 100 000 habitantes/ano. 2 % dos doentes hospitalizados e 75 % dos doentes em UTI desenvolvem uma sepse, dos quais 30 % evoluem para choque séptico (SS). Além disso, muitos dos sobreviventes desenvolvem uma imunossupressão que os torna mais sensíveis a novas infeções e leva a um aumento da morbilidade-mortalidade a longo prazo. Recentemente, tem sido recomendada a procura de novos biomarcadores sensíveis e específicos para a sepse com base em modificações epigenéticas, e sobretudo histonas têm sido postuladas como biomarcadores em doenças com hiperinflamação, trauma e infecções. Portanto, o objetivo deste projeto é identificar biomarcadores epigenéticos e desenvolver ferramentas diagnósticas e prognósticas para a classificação de fenótipos específicos de sepse que permitam prever os estados de imunossupressão. Neste projeto, utilizaremos uma metodologia baseada na espectrometria de massa para quantificar os níveis de histonas circulantes e utilizá-los como biomarcadores na sepse. Além disso, com os estudos ChIP-Seq e a bioinformática, contribuiremos para a compreensão dos mecanismos epigenéticos relacionados à imunossupressão em sobreviventes de um episódio de sepse. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
Sepsise esinemissagedus on Euroopas 200–300 juhtu 100 000 elaniku kohta aastas. 2 %-l hospitaliseeritud patsientidest ja 75 %-l ICU patsientidest tekib sepsis, millest 30 % areneb septiliseks šokiks (SS). Lisaks arendavad paljud ellujääjad immunosupressiooni, mis muudab nad uute nakkuste suhtes tundlikumaks ja toob kaasa pikaajalise haigestumuse-suremuse suurenemise. Hiljuti on soovitatud otsida uusi tundlikke ja spetsiifilisi biomarkereid sepsise jaoks, mis põhinevad epigeneetilistel muudatustel, ning eriti histoonid on postuleeritud biomarkeriteks hüperpõletiku, trauma ja infektsioonidega haiguste puhul. Seetõttu on projekti eesmärk teha kindlaks epigeneetilised biomarkerid ning töötada välja diagnostilised ja prognostilised vahendid konkreetsete sepsise fenotüüpide klassifitseerimiseks, mis võimaldavad prognoosida immunosupressiooni seisundit. Selles projektis kasutame me meetodit, mis põhineb massispektromeetrial, et kvantifitseerida histoonide tasemeid ja kasutada neid sepsises biomarkeritena. Lisaks aitame ChIP-Seqi uuringute ja bioinformaatika abil mõista immunosupressiooniga seotud epigeneetilisi mehhanisme sepsise episoodi ellujäänutel. (Estonian)
17 August 2022
0 references
A szepszis előfordulása Európában évente 200–300 eset 100 000 lakosra vetítve. A kórházi kezelésben részesülő betegek 2%-ánál és az ICU-ban szenvedő betegek 75%-ánál szepszis alakul ki, amelynek 30%-a szeptikus sokktá (SS) alakul ki. Ezen túlmenően sok túlélő olyan immunszuppressziót fejleszt ki, amely érzékenyebbé teszi őket az új fertőzésekre, és a hosszú távú morbiditás-mortalitás növekedéséhez vezet. A közelmúltban javasolták az epigenetikai módosításokon alapuló szepszis új érzékeny és specifikus biomarkereinek keresését, és különösen a hisztonokat biomarkerekként emlegették hipergyulladással, traumával és fertőzésekkel járó betegségekben. Ezért a projekt célja az epigenetikai biomarkerek azonosítása, valamint az egyes szepszisfenotípusok osztályozására szolgáló diagnosztikai és prognosztikai eszközök kifejlesztése, amelyek lehetővé teszik az immunszuppressziós állapotok előrejelzését. Ebben a projektben tömegspektrometrián alapuló módszertant alkalmazunk a keringő hisztonok szintjének számszerűsítésére és a szepszis biomarkerekként való felhasználására. Ezen túlmenően a ChIP-Seq vizsgálatok és bioinformatika segítségével hozzájárulunk a szepszis epizód túlélőinél az immunszuppresszióhoz kapcsolódó epigenetikai mechanizmusok megértéséhez. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
Сепсисът има честота в Европа от 200—300 случая на 100 000 жители годишно. 2 % от хоспитализираните пациенти и 75 % от пациентите с ICU развиват сепсис, от който 30 % се развиват до септичен шок (SS). Освен това много от оцелелите развиват имуносупресия, която ги прави по-чувствителни към нови инфекции и води до увеличаване на дългосрочната заболеваемост-смъртност. Наскоро беше препоръчано търсенето на нови чувствителни и специфични биомаркери за сепсис на базата на епигенетични модификации, и особено хистоните са обявени като биомаркери при заболявания с хипервъзпаление, травма и инфекции. Следователно целта на този проект е да се идентифицират епигенетичните биомаркери и да се разработят диагностични и прогностични инструменти за класификация на определени фенотипове на сепсис, които позволяват да се прогнозират състоянията на имуносупресия. В този проект ще използваме методология, базирана на масспектрометрия, за да определим количествено нивата на циркулиращите хистони и да ги използваме като биомаркери в сепсис. Освен това с ChIP-Seq проучвания и биоинформатика ще допринесем за разбирането на епигенетичните механизми, свързани с имуносупресията при оцелелите от епизод на сепсис. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
Sepsis Europoje pasitaiko 200–300 atvejų 100 000 gyventojų per metus. 2 % hospitalizuotų pacientų ir 75 % ICU sergančių pacientų išsivysto sepsis, iš kurių 30 % išsivysto į septinį šoką (SS). Be to, daugeliui išgyvenusių asmenų atsiranda imunosupresija, dėl kurios jie tampa jautresni naujoms infekcijoms ir dėl to padidėja ilgalaikis sergamumas-mirtingumas. Neseniai buvo rekomenduota ieškoti naujų jautrių ir specifinių sepsio biologinių žymenų, pagrįstų epigenetinėmis modifikacijomis, o ypač histonai buvo postuluojami kaip biologiniai žymenys sergant hiperinflamacija, trauma ir infekcijomis. Todėl šio projekto tikslas – nustatyti epigenetinius biologinius žymenis ir sukurti diagnostines bei prognostines priemones, skirtas tam tikrų sepsio fenotipų klasifikavimui, kurios leistų prognozuoti imunosupresiją. Šiame projekte mes naudosime masių spektrometrija pagrįstą metodiką, kad kiekybiškai įvertintume cirkuliuojančių histonų kiekį ir naudosime juos kaip sepsio biologinius žymenis. Be to, su ChIP-Seq tyrimais ir bioinformatika padėsime suprasti epigenetinius mechanizmus, susijusius su imunosupresija išgyvenusiems sepsio epizodą. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
Sepsa u Europi ima pojavnost od 200 – 300 slučajeva na 100 000 stanovnika godišnje. 2 % hospitaliziranih bolesnika i 75 % bolesnika s ICU-om razvija sepsa, od čega se 30 % razvija u septički šok (SS). Osim toga, mnogi preživjeli razvijaju imunosupresiju koja ih čini osjetljivijima na nove infekcije i dovodi do povećanja dugotrajnog morbiditeta-smrtnosti. Nedavno je preporučeno potragu za novim osjetljivim i specifičnim biomarkerima za sepsu na temelju epigenetskih modifikacija, a posebno histoni su pretpostavljeni kao biomarkeri u bolestima s hiperinflamacijom, traumom i infekcijama. Stoga je cilj ovog projekta identificirati epigenetske biomarkere i razviti dijagnostičke i prognostičke alate za klasifikaciju pojedinih fenotipova sepse koji omogućuju predviđanje stanja imunosupresije. U ovom ćemo projektu koristiti metodologiju temeljenu na masenoj spektrometriji kako bismo kvantificirali razine cirkulirajućih histona i koristili ih kao biomarkere u sepsi. Osim toga, s ChIP-Seq studijama i bioinformatikom doprinijet ćemo razumijevanju epigenetskih mehanizama vezanih uz imunosupresiju u osoba koje su preživjele epizodu sepse. (Croatian)
17 August 2022
0 references
Sepsis har en förekomst i Europa av 200–300 fall per 100 000 invånare/år. 2 % av patienterna på sjukhus och 75 % av ICU-patienterna utvecklar en sepsis, varav 30 % utvecklas till septisk chock (SS). Dessutom utvecklar många av de överlevande en immunsuppression som gör dem mer känsliga för nya infektioner och leder till en ökning av långvarig sjuklighet-dödlighet. Nyligen har det rekommenderats att söka efter nya känsliga och specifika biomarkörer för sepsis baserat på epigenetiska modifieringar, och särskilt histoner har postulerats som biomarkörer vid sjukdomar med hyperinflammation, trauma och infektioner. Syftet med detta projekt är därför att identifiera epigenetiska biomarkörer och att utveckla diagnostiska och prognostiska verktyg för klassificering av vissa sepsisfenotyper som gör det möjligt att förutsäga immunsuppressionstillstånd. I detta projekt kommer vi att använda metoder baserade på masspektrometri för att kvantifiera nivåerna av cirkulerande histoner och använda dem som biomarkörer i sepsis. Dessutom kommer vi med ChIP-Seq-studier och bioinformatik att bidra till förståelsen av epigenetiska mekanismer relaterade till immunsuppression hos överlevande av en sepsisepisod. (Swedish)
17 August 2022
0 references
Sepsisul are o incidență în Europa de 200-300 de cazuri la 100 000 de locuitori/an. 2 % dintre pacienții spitalizați și 75 % dintre pacienții cu UTI dezvoltă un sepsis, din care 30 % evoluează la șoc septic (SS). În plus, mulți dintre supraviețuitori dezvoltă o imunosupresie care îi face mai sensibili la noi infecții și duce la o creștere a morbidității-mortalității pe termen lung. Recent, s-a recomandat căutarea de noi biomarkeri sensibili și specifici pentru sepsis pe baza modificărilor epigenetice, și în special histonele au fost postulate ca markeri biologici în bolile cu hiperinflamație, traume și infecții. Prin urmare, obiectivul acestui proiect este de a identifica biomarkerii epigenetici și de a dezvolta instrumente de diagnostic și prognostic pentru clasificarea anumitor fenotipuri de sepsis care permit anticiparea stărilor imunosupresoare. În acest proiect vom folosi metodologia bazată pe spectrometria de masă pentru a cuantifica nivelurile histonelor circulante și pentru a le utiliza ca markeri biologici în sepsis. În plus, cu studiile ChIP-Seq și bioinformatica vom contribui la înțelegerea mecanismelor epigenetice legate de imunosupresie la supraviețuitorii unui episod de sepsis. (Romanian)
17 August 2022
0 references
V Evropi je pojavnost sepse 200–300 primerov na 100 000 prebivalcev/leto. Pri 2 % hospitaliziranih bolnikov in 75 % bolnikov z ICU se pojavi sepsa, od katere se 30 % razvije v septični šok (SS). Poleg tega mnogi preživeli razvijejo imunosupresijo, zaradi katere so bolj občutljivi na nove okužbe in vodijo k povečanju dolgotrajne obolevnosti-smrtnosti. V zadnjem času je bilo priporočeno iskanje novih občutljivih in specifičnih biomarkerjev za sepso, ki temeljijo na epigenetskih spremembah, zlasti histoni so bili ocenjeni kot biomarkerji pri boleznih s hipervnetjem, travmo in okužbami. Zato je cilj tega projekta opredeliti epigenetične biomarkerje in razviti diagnostična in prognostična orodja za razvrščanje določenih fenotipov sepse, ki omogočajo napovedovanje stanja imunosupresije. V tem projektu bomo uporabili metodologijo, ki temelji na masni spektrometriji, da bi količinsko opredelili ravni cirkulirajočih histonov in jih uporabili kot biomarkerje v sepsi. Poleg tega bomo s študijami ChIP-Seq in bioinformatiko prispevali k razumevanju epigenetskih mehanizmov, povezanih z imunosupresijo pri preživelih epizodi sepse. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
Posocznica ma częstość występowania w Europie 200-300 przypadków na 100 000 mieszkańców rocznie. U 2 % pacjentów hospitalizowanych i 75 % pacjentów z OIOM stwierdzono posocznicę, z czego 30 % przechodzi do wstrząsu septycznego (SS). Ponadto wielu ocalałych rozwija immunosupresję, która czyni je bardziej wrażliwymi na nowe infekcje i prowadzi do wzrostu długotrwałej zachorowalności-śmiertelności. Ostatnio zaleca się poszukiwanie nowych wrażliwych i specyficznych biomarkerów do posocznicy w oparciu o modyfikacje epigenetyczne, a zwłaszcza histony zostały postulowane jako biomarkery w chorobach z hiperzapaleniem, urazem i infekcjami. W związku z tym celem tego projektu jest identyfikacja biomarkerów epigenetycznych oraz opracowanie narzędzi diagnostycznych i prognostycznych do klasyfikacji poszczególnych fenotypów posocznicy, które pozwalają przewidzieć stany immunosupresji. W tym projekcie wykorzystamy metodologię opartą na spektrometrii mas w celu ilościowego określenia poziomów krążących histonów i wykorzystania ich jako biomarkerów w sepsie. Ponadto dzięki badaniom ChIP-Seq i bioinformatyki przyczynimy się do zrozumienia mechanizmów epigenetycznych związanych z immunosupresją u osób, które przeżyły epizod posocznicy. (Polish)
17 August 2022
0 references
Valencia
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI16_01036
0 references