Metabolomic analysis of clinical samples to identify response biomarkers and mechanisms of resistance acquired to new therapies targeting lung cancer (Q3138270)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3138270 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | Metabolomic analysis of clinical samples to identify response biomarkers and mechanisms of resistance acquired to new therapies targeting lung cancer |
Project Q3138270 in Spain |
Statements
74,596.5 Euro
0 references
137,000.0 Euro
0 references
54.45 percent
0 references
1 January 2018
0 references
31 March 2021
0 references
FUNDACION PARA LA INVESTIGACION DEL HOSPITAL UNIVERSITARIO Y POLITECNICO LA FE DE LA CV. INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA LA FE
0 references
El objetivo general de este proyecto es identificar, mediante análisis metabolómico y lipidómico, biomarcadores no invasivos de respuesta a las nuevas terapias dirigidas contra el cáncer de pulmón, y estudiar la reprogramación metabólica asociada a la adquisición de resistencias. Para ello, planteamos el análisis de biopsias de tejido tumoral y plasma/suero de pacientes diagnosticados con carcinoma pulmonar no microcítico (CPNM) procedentes de distintos centros de la Comunidad Valenciana, que reciben tratamientos con inhibidores de tirosina quinasa (ITQs) dirigidos contra el receptor del factor de crecimiento epidérmico (EGFR) o con inhibidores de puntos de control inmunitario (ICIs). El material biológico será analizado con una plataforma de metabolómica y lipidómica de última generación que proporciona una elevada cobertura metabólica (>2000 metabolitos), que incluye el uso de diferentes espectrómetros de masas (triple cuadrupolo, cuadrupolo-tiempo de vuelo con movilidad iónica) en combinación con distintas técnicas separativas como la cromatografía líquida (LC) y la cromatografía de gases (GC). En cuanto al diseño experimental, proponemos dos abordajes diferentes y complementarios: (i) estudios caso-control para la búsqueda, en biopsia líquida, de biomarcadores capaces de predecir la respuesta a los ITQs (en pacientes de CPNM EGFR mutados) y a los ICIs (en pacientes tratados con anti-PD1 y anti-PDL1); y (ii) un estudio longitudinal para monitorizar la reprogramación metabólica asociada a la resistencia adquirida a los ITQs en muestras seriadas de tejido tumoral y biopsia líquida. Paralelamente, y con el fin de comprobar el impacto funcional de las alteraciones metabólicas identificadas en los pacientes y establecer el posible mecanismo de acción, estudiaremos las alteraciones metabolómicas en modelos celulares de resistencia adquirida a los ITQs. (Spanish)
0 references
The overall objective of this project is to identify, through metabolomic and lipidomic analysis, non-invasive biomarkers in response to new therapies directed against lung cancer, and to study metabolic reprogramming associated with the acquisition of resistance. To this end, we propose the analysis of biopsies of tumor tissue and plasma/serum of patients diagnosed with non-small cell lung carcinoma (NCP) from different centers in the Valencian Community, who receive treatments with tyrosine kinase inhibitors (ITQs) directed against the epidermal growth factor receptor (EGFR) or with immune control point inhibitors (ICIs). The biological material will be analysed with a state-of-the-art metabolomic and lipidomics platform that provides high metabolic coverage (>2000 metabolites), which includes the use of different mass spectrometers (triple quadrupole, quadrupole-flight time with ion mobility) in combination with different separative techniques such as liquid chromatography (LC) and gas chromatography (GC). Regarding experimental design, we propose two different and complementary approaches: (I) case-control studies for the search, in liquid biopsy, of biomarkers capable of predicting response to ITQs (in mutated EGFR NSCLC patients) and ICIs (in patients treated with anti-PD1 and anti-PDL1); and (ii) a longitudinal study to monitor metabolic reprogramming associated with acquired resistance to ITQs in serial samples of tumor tissue and liquid biopsy. In parallel, and in order to verify the functional impact of the metabolic alterations identified in patients and establish the possible mechanism of action, we will study metabolomic alterations in cell models of resistance acquired to ITQs. (English)
12 October 2021
0.8912820968177874
0 references
L’objectif général de ce projet est d’identifier, au moyen d’analyses métabolomiques et lipidomiques, des biomarqueurs non envahissants en réponse à de nouvelles thérapies dirigées contre le cancer du poumon et d’étudier la reprogrammation métabolique associée à l’acquisition de la résistance. À cette fin, nous proposons l’analyse des biopsies du tissu tumoral et du plasma/sérum des patients diagnostiqués avec un carcinome pulmonaire non à petites cellules (NCP) provenant de différents centres de la Communauté valencienne, qui reçoivent des traitements avec des inhibiteurs de la tyrosine kinase (ITQs) dirigés contre le récepteur du facteur de croissance épidermique (EGFR) ou avec des inhibiteurs du point de contrôle immunitaire (ICI). Le matériel biologique sera analysé à l’aide d’une plate-forme métabolomique et lipidomique de pointe qui offre une couverture métabolique élevée (> 2000 métabolites), qui comprend l’utilisation de différents spectromètres de masse (triple quadrupole, temps de vol quadripolaire avec mobilité ionique) en combinaison avec différentes techniques de séparation telles que la chromatographie en phase liquide (LC) et la chromatographie en phase gazeuse (GC). En ce qui concerne la conception expérimentale, nous proposons deux approches différentes et complémentaires: (I) études cas-témoins pour la recherche, dans la biopsie liquide, de biomarqueurs capables de prédire la réponse aux QIT (chez les patients atteints de NSCLC EGFR mutés) et aux ICI (chez les patients traités par anti-PD1 et anti-PDL1); et ii) une étude longitudinale visant à surveiller la reprogrammation métabolique associée à la résistance acquise aux QTI dans des échantillons en série de tissus tumoraux et de biopsie liquide. En parallèle, et afin de vérifier l’impact fonctionnel des altérations métaboliques identifiées chez les patients et d’établir le mécanisme d’action possible, nous étudierons les altérations métabolomiques dans les modèles cellulaires de résistance acquis aux QTI. (French)
2 December 2021
0 references
Das übergeordnete Ziel dieses Projekts ist es, durch metabolomische und lipidomische Analyse nichtinvasive Biomarker als Reaktion auf neue Therapien gegen Lungenkrebs zu identifizieren und metabolische Reprogrammierung im Zusammenhang mit dem Erwerb von Resistenzen zu untersuchen. Zu diesem Zweck schlagen wir die Analyse von Biopsien von Tumorgewebe und Plasma/Serum von Patienten vor, die mit nicht-kleinzelligem Lungenkarzinom (NCP) aus verschiedenen Zentren der Valencianer Gemeinschaft diagnostiziert wurden, die Behandlungen mit Tyrosinkinase-Inhibitoren (ITQs) erhalten, die gegen den epidermalen Wachstumsfaktorrezeptor (EGFR) oder mit Immunkontrollpunktinhibitoren (ICIs) gerichtet sind. Das biologische Material wird mit einer hochmodernen Metabolom- und Lipidom-Plattform analysiert, die eine hohe metabolische Abdeckung (>2000 Metaboliten) bietet, die den Einsatz unterschiedlicher Massenspektrometer (Dreifachquardrupol, Vierfachflugzeit mit Ionenmobilität) in Kombination mit verschiedenen separativen Techniken wie Flüssigchromatographie (LC) und Gaschromatographie (GC) umfasst. In Bezug auf experimentelles Design schlagen wir zwei unterschiedliche und ergänzende Ansätze vor: I) Fallkontrollstudien zur Suche nach Biomarkern in flüssiger Biopsie, die das Ansprechen auf ITQs (bei mutierten EGFR-NSCLC-Patienten) und ICIs (bei Patienten, die mit Anti-PD1 und Anti-PDL1) behandelt wurden, vorhersagen können; und ii) eine Längsschnittstudie zur Überwachung der metabolischen Reprogrammierung im Zusammenhang mit der erworbenen Resistenz gegen ITQs in Serienproben von Tumorgewebe und flüssiger Biopsie. Parallel dazu und um die funktionellen Auswirkungen der bei Patienten identifizierten Stoffwechselveränderungen zu überprüfen und den möglichen Wirkmechanismus zu etablieren, werden wir metabolomische Veränderungen in Zellmodellen der Resistenz gegen ITQs untersuchen. (German)
9 December 2021
0 references
Het algemene doel van dit project is om, door middel van metabolomische en lipidomische analyse, niet-invasieve biomarkers in reactie op nieuwe therapieën gericht tegen longkanker te identificeren, en om metabolische herprogrammering geassocieerd met de verwerving van weerstand te bestuderen. Daartoe stellen we de analyse voor van biopsies van tumorweefsel en plasma/serum van patiënten die gediagnosticeerd zijn met niet-kleincellig longcarcinoom (NCP) uit verschillende centra in de Valenciaanse Gemeenschap, die behandelingen krijgen met tyrosinekinaseremmers (ITQ’s) gericht tegen de epidermale groeifactorreceptor (EGFR) of met immuuncontrolepuntremmers (ICI’s). Het biologische materiaal zal worden geanalyseerd met een state-of-the-art metabolomische en lipidomics platform dat een hoge metabole dekking (>2000 metabolieten), die het gebruik van verschillende massaspectrometers (triple quadrupole, quadrupole-vlucht tijd met ionenmobiliteit) in combinatie met verschillende scheidingstechnieken zoals vloeibare chromatografie (LC) en gaschromatografie (GC). Wat het experimentele ontwerp betreft, stellen wij twee verschillende en complementaire benaderingen voor: (I) case-control studies voor het zoeken, in vloeibare biopsie, van biomarkers die de respons op ITQ’s (bij gemuteerde EGFR NSCLC-patiënten) en ICI’s (bij patiënten behandeld met anti-PD1 en anti-PDL1) kunnen voorspellen; en ii) een longitudinale studie om metabole herprogrammering te controleren in verband met verworven weerstand tegen ITQ’s in seriële monsters van tumorweefsel en vloeibare biopsie. Parallel, en om het functionele effect van de metabolische veranderingen in patiënten te controleren en het mogelijke mechanisme van actie vast te stellen, zullen wij metabolomic veranderingen in celmodellen van weerstand aan ITQs bestuderen. (Dutch)
17 December 2021
0 references
L'obiettivo generale di questo progetto è quello di individuare, attraverso l'analisi metabolomica e lipidomica, biomarcatori non invasivi in risposta a nuove terapie dirette contro il cancro polmonare, e di studiare la riprogrammazione metabolica associata all'acquisizione della resistenza. A tal fine, proponiamo l'analisi delle biopsie del tessuto tumorale e plasma/siero di pazienti con diagnosi di carcinoma polmonare non a piccole cellule (NCP) provenienti da diversi centri della Comunità di Valencia, che ricevono trattamenti con inibitori della tirosina chinasi (ITQ) diretti contro il recettore del fattore di crescita epidermico (EGFR) o con inibitori del punto di controllo immunitario (ICI). Il materiale biologico sarà analizzato con una piattaforma metabolomica e lipidomica all'avanguardia che fornisce un'elevata copertura metabolica (>2000 metaboliti), che include l'uso di diversi spettrometri di massa (triplice quadrupolo, tempo di volo quadrupolo con mobilità ionica) in combinazione con diverse tecniche separative come la cromatografia liquida (LC) e la gascromatografia (GC). Per quanto riguarda la progettazione sperimentale, proponiamo due approcci diversi e complementari: I) studi di casi di controllo per la ricerca, nella biopsia liquida, di biomarcatori in grado di prevedere la risposta ai QTI (in pazienti mutati EGFR NSCLC) e ICI (in pazienti trattati con anti-PD1 e anti-PDL1); e ii) uno studio longitudinale per monitorare la riprogrammazione metabolica associata alla resistenza acquisita ai QTI in campioni seriali di tessuto tumorale e biopsia liquida. Parallelamente, e al fine di verificare l'impatto funzionale delle alterazioni metaboliche identificate nei pazienti e stabilire il possibile meccanismo d'azione, studieremo le alterazioni metabolomiche nei modelli cellulari di resistenza acquisita ai QTI. (Italian)
16 January 2022
0 references
Ο γενικός στόχος αυτού του έργου είναι να εντοπίσει, μέσω μεταβολικής και λιπιδομικής ανάλυσης, μη επεμβατικούς βιοδείκτες ως απάντηση σε νέες θεραπείες που στρέφονται κατά του καρκίνου του πνεύμονα, και να μελετήσει τον μεταβολικό επαναπρογραμματισμό που συνδέεται με την απόκτηση αντοχής. Για το σκοπό αυτό, προτείνουμε την ανάλυση των βιοψιών του ιστού όγκου και του πλάσματος/ορού ασθενών που έχουν διαγνωστεί με μη μικροκυτταρικό καρκίνωμα πνευμόνων (NCP) από διαφορετικά κέντρα στην Κοινότητα της Βαλένθιας, οι οποίοι λαμβάνουν θεραπείες με αναστολείς της τυροσίνης κινάσης (ITQs) που κατευθύνονται κατά του υποδοχέα επιδερμικού αυξητικού παράγοντα (EGFR) ή με αναστολείς του ανοσοποιητικού σημείου ελέγχου (ICIs). Το βιολογικό υλικό θα αναλυθεί με μια υπερσύγχρονη μεταβολική και λιπιδομική πλατφόρμα που παρέχει υψηλή μεταβολική κάλυψη (>2000 μεταβολίτες), η οποία περιλαμβάνει τη χρήση διαφορετικών φασματομέτρων μάζας (τριπλό τετράπλευρο, τετραπολικός χρόνος πτήσης με κινητικότητα ιόντων) σε συνδυασμό με διαφορετικές τεχνικές διαχωρισμού, όπως υγρή χρωματογραφία (LC) και αεριοχρωματογραφία (GC). Όσον αφορά τον πειραματικό σχεδιασμό, προτείνουμε δύο διαφορετικές και συμπληρωματικές προσεγγίσεις: I) περιπτωσιολογικές μελέτες για την αναζήτηση, σε υγρή βιοψία, βιοδεικτών ικανών να προβλέπουν την απόκριση σε ITQs (σε μεταλλαγμένους ασθενείς με EGFR NSCLC) και ICI (σε ασθενείς που λαμβάνουν αντι-PD1 και αντι-PDL1)· και ii) μια διαμήκης μελέτη για την παρακολούθηση του μεταβολικού επαναπρογραμματισμού που σχετίζεται με την επίκτητη αντοχή στα ITQs σε σειριακά δείγματα ιστού όγκου και υγρής βιοψίας. Παράλληλα, και προκειμένου να επαληθευτεί η λειτουργική επίδραση των μεταβολικών μεταβολών που εντοπίζονται στους ασθενείς και να καθιερωθεί ο πιθανός μηχανισμός δράσης, θα μελετήσουμε τις μεταβολικές αλλοιώσεις στα κυτταρικά μοντέλα αντοχής που αποκτώνται στα ITQs. (Greek)
17 August 2022
0 references
Det overordnede mål med dette projekt er gennem metabolomiske og lipidomiske analyser at identificere ikke-invasive biomarkører som reaktion på nye behandlinger rettet mod lungekræft og at undersøge metabolisk omprogrammering i forbindelse med erhvervelse af resistens. Til dette formål foreslår vi en analyse af biopsier af tumorvæv og plasma/serum hos patienter diagnosticeret med ikke-småcellet lungekarcinom (NCP) fra forskellige centre i Valencian Community, som modtager behandlinger med tyrosinkinasehæmmere (ITQ) rettet mod den epidermale vækstfaktorreceptor (EGFR) eller med immunkontrolpunkthæmmere (ICI'er). Det biologiske materiale vil blive analyseret med en state-of-the-art metabolomisk og lipidomics platform, der giver høj metabolisk dækning (>000 metabolitter), som omfatter anvendelse af forskellige massespektrometre (tredobbelt quadrupol, quadrupole-flyvetid med ionmobilitet) i kombination med forskellige separative teknikker såsom væskekromatografi (LC) og gaskromatografi (GC). Med hensyn til eksperimentel udformning foreslår vi to forskellige og komplementære tilgange: I) case-kontrolundersøgelser til søgning i flydende biopsi af biomarkører, der er i stand til at forudsige respons på ITQ'er (i muterede EGFR NSCLC-patienter) og ICI'er (hos patienter behandlet med anti-PD1 og anti-PDL1) og ii) en langsgående undersøgelse til overvågning af metabolisk omprogrammering i forbindelse med erhvervet resistens over for ITQ'er i serieprøver af tumorvæv og flydende biopsi. Parallelt hermed, og for at verificere den funktionelle virkning af de metaboliske ændringer identificeret hos patienter og etablere den mulige virkningsmekanisme, vil vi studere metabolomiske ændringer i cellemodeller af resistens erhvervet mod ITQ'er. (Danish)
17 August 2022
0 references
Hankkeen yleisenä tavoitteena on tunnistaa metabolomisten ja lipidomisten analyysien avulla ei-invasiiviset biomarkkerit vastauksena uusiin keuhkosyöpää vastaan käytettäviin hoitoihin ja tutkia resistenssin hankkimiseen liittyvää metabolista uudelleenohjelmointia. Tätä varten ehdotamme analyysiä biopsioista kasvainkudoksesta ja plasmasta/seerumista potilailla, joilla on diagnosoitu ei-pienisoluinen keuhkosyöpä Valencian yhteisön eri keskuksista, jotka saavat hoitoa tyrosiinikinaasin estäjillä (ITQ), jotka on suunnattu epidermaalisen kasvutekijän reseptoriin (EGFR) tai immuunikontrollipisteen estäjiin (ICI). Biologinen materiaali analysoidaan huipputeknisellä metabolomic- ja lipidomics-alustalla, joka tarjoaa runsaasti metabolista peittoa (>2000 metaboliittia), johon sisältyy erilaisten massaspektrometrien käyttö (kolmoisneljännes, nelilentoaika ionin liikkuvuudella) yhdistettynä erilaisiin erotustekniikoihin, kuten nestekromatografiaan (LC) ja kaasukromatografiaan (GC). Kokeellisen suunnittelun osalta ehdotamme kahta erilaista ja toisiaan täydentävää lähestymistapaa: I) tapauskontrollitutkimukset sellaisten biomarkkerien etsimiseksi nestemäistä biopsiaa varten, jotka pystyvät ennustamaan vasteen ITQ-arvoille (mutoituneilla EGRR- ei-pienisoluista keuhkosyöpää sairastavilla potilailla) ja ICI: llä (potilailla, jotka saivat anti-PD1- ja anti-PDL1); ja ii) pitkittäinen tutkimus, jossa seurataan metabolista uudelleenohjelmointia, joka liittyy hankittuun ITQ-resistenssiin kasvainkudoksen ja nestemäisen biopsian sarjanäytteissä. Samanaikaisesti ja todentaaksemme potilailla havaittujen metabolisten muutosten toiminnallisen vaikutuksen ja määrittääksemme mahdollisen vaikutusmekanismin, tutkimme ITQ:ille hankitun resistenssin solumalleissa tapahtuneita metabolomisia muutoksia. (Finnish)
17 August 2022
0 references
L-għan ġenerali ta’ dan il-proġett huwa li jidentifika, permezz ta’ analiżi metabolomika u lipidomika, bijomarkaturi mhux invażivi b’reazzjoni għal terapiji ġodda diretti kontra l-kanċer tal-pulmun, u li jistudja r-riprogrammazzjoni metabolika assoċjata mal-akkwist ta’ reżistenza. Għal dan il-għan, aħna nipproponu l-analiżi tal-bijopsiji tat-tessut tat-tumur u l-plażma/serum ta’ pazjenti dijanjostikati b’karċinoma tal-pulmun b’ċelloli mhux żgħar (NCP) minn ċentri differenti fil-Komunità ta’ Valencia, li jirċievu trattamenti b’inibituri tat-tirożina kinażi (ITQs) diretti kontra r-riċettur tal-fattur tat-tkabbir epidermiku (EGFR) jew b’inibituri tal-punti ta’ kontroll immuni (ICIs). Il-materjal bijoloġiku se jiġi analizzat bi pjattaforma metabolomika u lipidomika l-aktar avvanzata li tipprovdi kopertura metabolika għolja (>2000 metabolit), li tinkludi l-użu ta’ spettrometri tal-massa differenti (kwadrupole tripla, ħin ta’ titjir kwadripoliku b’mobbiltà jonika) flimkien ma’ tekniki differenti ta’ separazzjoni bħall-kromatografija likwida (LC) u l-kromatografija b’fażi gassuża (GC). Fir-rigward tad-disinn sperimentali, aħna nipproponu żewġ approċċi differenti u komplementari: (I) studji ta’ kontroll tal-każijiet għat-tfittxija, f’bijopsija likwida, ta’ bijomarkaturi li kapaċi jbassru r-rispons għal ITQs (f’pazjenti b’NSCLC mutat b’EGFR) u ICIs (f’pazjenti kkurati b’anti-PD1 u anti-PDL1); u (ii) studju lonġitudinali għall-monitoraġġ tar-riprogrammar metaboliku assoċjat ma’ reżistenza miksuba għall-ITQs f’kampjuni serjali ta’ tessut tat-tumur u bijopsija likwida. B’mod parallel, u sabiex jiġi vverifikat l-impatt funzjonali tal-alterazzjonijiet metaboliċi identifikati fil-pazjenti u jiġi stabbilit il-mekkaniżmu possibbli ta’ azzjoni, ser nistudjaw alterazzjonijiet metabolomiċi fil-mudelli taċ-ċelloli ta’ reżistenza miksuba għall-ITQs. (Maltese)
17 August 2022
0 references
Šā projekta vispārējais mērķis ir ar metabolomikas un lipidomiskās analīzes palīdzību noteikt neinvazīvus biomarķierus, reaģējot uz jaunām pret plaušu vēzi vērstām terapijām, un pētīt metabolisko pārprogrammēšanu, kas saistīta ar rezistences iegūšanu. Šajā nolūkā mēs ierosinām analizēt audzēja audu biopsiju un plazmu/serumu pacientiem, kam diagnosticēta nesīkšūnu plaušu karcinoma (NCP) no dažādiem Valensijas Kopienas centriem, kuri saņem ārstēšanu ar tirozīnkināzes inhibitoriem (ITQ), kas vērsti pret epidermas augšanas faktora receptoriem (EGFR) vai imūnkontroles punkta inhibitoriem (ICI). Bioloģisko materiālu analizēs ar modernu metabolomikas un lipidomijas platformu, kas nodrošina augstu metabolisko pārklājumu (>2000 metabolīti), kas ietver dažādu masspektrometru (trīskāršu četrpolu, četrpolu lidojuma laiku ar jonu mobilitāti) izmantošanu apvienojumā ar dažādām separatīvām metodēm, piemēram, šķidruma hromatogrāfija (LC) un gāzu hromatogrāfija (GC). Attiecībā uz eksperimentālo plānošanu mēs ierosinām divas dažādas un savstarpēji papildinošas pieejas: I) gadījumu kontroles pētījumi, lai šķidrā biopsijā meklētu biomarķierus, kas spēj prognozēt atbildes reakciju uz ITQ (pacientiem, kas saņēmuši mutāciju EGFR NSŠPV) un ICI (pacientiem, kas ārstēti ar anti-PD1 un anti-PDL1); un ii) garengriezuma pētījums, lai uzraudzītu metabolisko pārprogrammēšanu, kas saistīta ar iegūto rezistenci pret ITQ audzēja audu un šķidrās biopsijas sērijveida paraugos. Paralēli un lai pārbaudītu pacientiem konstatēto vielmaiņas izmaiņu funkcionālo ietekmi un noteiktu iespējamo darbības mehānismu, mēs pētīsim metabolomikas izmaiņas šūnu modeļos, kas iegūti pret ITQ. (Latvian)
17 August 2022
0 references
Celkovým cieľom tohto projektu je identifikovať prostredníctvom metabolomickej a lipidomovej analýzy neinvazívne biomarkery v reakcii na nové terapie namierené proti rakovine pľúc a študovať metabolické preprogramovanie spojené so získaním rezistencie. Na tento účel navrhujeme analýzu biopsií nádorového tkaniva a plazmy/séra pacientov s diagnózou nemalobunkového karcinómu pľúc (NCP) z rôznych centier vo Valencijskej komunite, ktorí dostávajú liečbu inhibítormi tyrozínkinázy (ITQ) namierenú proti receptoru epidermálneho rastového faktora (EGFR) alebo inhibítorom imunitnej kontroly. Biologický materiál sa bude analyzovať najmodernejšou metabolomickou a lipidomickou platformou, ktorá poskytuje vysoké metabolické pokrytie (> 2000 metabolitov), ktorá zahŕňa použitie rôznych hmotnostných spektrometrov (triple quadrupole, štvorprupolový let s iónovou mobilitou) v kombinácii s rôznymi separačnými technikami, ako je kvapalinová chromatografia (LC) a plynová chromatografia (GC). Pokiaľ ide o experimentálny návrh, navrhujeme dva rôzne a komplementárne prístupy: I) prípadovo-kontrolné štúdie na vyhľadávanie biomarkerov schopných predvídať odpoveď na ITQ (u pacientov s mutovaným EGFR NSCLC) a ICI (u pacientov liečených anti-PD1 a anti-PDL1) v tekutej biopsii; a ii) pozdĺžna štúdia na monitorovanie metabolického preprogramovania spojeného so získanou odolnosťou voči ITQ v sériových vzorkách nádorového tkaniva a tekutej biopsie. Paralelne a s cieľom overiť funkčný vplyv metabolických zmien identifikovaných u pacientov a stanoviť možný mechanizmus účinku, budeme študovať metabolomické zmeny v bunkových modeloch rezistencie získanej na ITQ. (Slovak)
17 August 2022
0 references
Is é cuspóir foriomlán an tionscadail seo bithmharcóirí neamhionracha a shainaithint, trí anailís mheitibileach agus lipidomic, mar fhreagairt ar theiripí nua atá dírithe ar ailse scamhóg, agus staidéar a dhéanamh ar athchlárú meitibileach a bhaineann le frithsheasmhacht a fháil. Chuige sin, molaimid anailís a dhéanamh ar bhithphíosaí fíochán meall agus plasma/serum na n-othar a diagnóisíodh le carcinoma scamhóg neamh-bheag (NCP) ó ionaid éagsúla i bPobal Valencian, a fhaigheann cóireálacha le coscairí kinase tyrosine (ITQanna) atá dírithe i gcoinne an receptor fachtóir fáis epidermal (EGFR) nó le coscairí pointe rialaithe imdhíonachta (ICInna). Déanfar anailís ar an ábhar bitheolaíoch le hardán meitibilímeach agus lipidomaíoch úrscothach a sholáthraíonn cumhdach ardmheitibileach (> 2000 meitibilítí), lena n-áirítear úsáid a bhaint as mais-speictriméadair éagsúla (am trí cheathrú, cuadrupole-eitilt le soghluaisteacht ian) in éineacht le teicnící deighilteacha éagsúla amhail crómatagrafaíocht leachta (LC) agus crómatagrafaíocht gháis (GC). Maidir le dearadh turgnamhach, molaimid dhá chur chuige éagsúla agus comhlántacha: (I) staidéir chásrialaithe chun bithmharcóirí atá in ann freagairt do ITQanna (in othair mutáilte EGFR NSCLC) agus ICInna (in othair frith-PD1 agus frith-PDL1) a chuardach i mbithsící leachtacha; agus (ii) staidéar fadama chun faireachán a dhéanamh ar athchlárú meitibileach a bhaineann le frithsheasmhacht in aghaidh TFQanna i samplaí sraitheacha de fhíochán meall agus bitheas leachtach. Ag an am céanna, agus chun tionchar feidhmiúil na n-athruithe meitibileach a aithníodh in othair a fhíorú agus an mheicníocht gníomhaíochta a d’fhéadfadh a bheith ann a bhunú, déanfaimid staidéar ar athruithe meitibólacha i múnlaí cille friotaíochta a fhaightear chuig ITQanna. (Irish)
17 August 2022
0 references
Celkovým cílem tohoto projektu je identifikovat prostřednictvím metabolomické a lipidomické analýzy neinvazivní biomarkery v reakci na nové terapie zaměřené proti rakovině plic a studovat metabolické přeprogramování spojené s získáním rezistence. Za tímto účelem navrhujeme analýzu biopsií nádorové tkáně a plazmy/séra pacientů s diagnostikou nemalobuněčného karcinomu plic (NCP) z různých center ve Valencijské komunitě, kteří podstupují léčbu inhibitory tyrosinkinázy (ITQ) namířenou proti receptoru epidermálního růstového faktoru (EGFR) nebo s inhibitory imunitního kontrolního bodu (ICI). Biologický materiál bude analyzován pomocí nejmodernější metabolomické a lipidomické platformy, která poskytuje vysoké metabolické pokrytí (>2000 metabolitů), která zahrnuje použití různých hmotnostních spektrometrů (trojnásobný čtyřpól, čtyřpólový let s iontovou mobilitou) v kombinaci s různými separačními technikami, jako je kapalinová chromatografie (LC) a plynová chromatografie (GC). Pokud jde o experimentální design, navrhujeme dva různé a vzájemně se doplňující přístupy: I) případové kontrolní studie pro vyhledávání v kapalné biopsii biomarkerů schopných předvídat reakci na ITQ (u mutovaných pacientů s EGFR NSCLC) a ICI (u pacientů léčených anti-PD1 a anti-PDL1); a ii) podélná studie pro sledování metabolické reprogramace spojené se získanou rezistencí na ITQ v sériových vzorcích nádorové tkáně a kapalné biopsie. Paralelně, a za účelem ověření funkčního dopadu metabolických změn zjištěných u pacientů a stanovení možného mechanismu účinku, budeme studovat metabolomické změny v buněčných modelech rezistence získané na ITQ. (Czech)
17 August 2022
0 references
O objetivo geral deste projeto é identificar, através da análise metabolómica e lipidómica, biomarcadores não invasivos em resposta a novas terapias dirigidas contra o cancro do pulmão e estudar a reprogramação metabólica associada à aquisição de resistência. Para tal, propomos a análise de biópsias de tecido tumoral e plasma/soro de doentes diagnosticados com carcinoma pulmonar de células não pequenas (PCN) de diferentes centros da Comunidade Valenciana, que recebem tratamentos com inibidores da tirosina cinase (ITQs) dirigidos contra o recetor do fator de crescimento epidérmico (EGFR) ou com inibidores do ponto de controlo imunitário (ICI). O material biológico será analisado com uma plataforma metabolómica e lipidómica de ponta que proporcione uma elevada cobertura metabólica (>2000 metabolitos), que inclui a utilização de diferentes espectrómetros de massa (quadrupolo triplo, tempo de voo quadrupolo com mobilidade iónica) em combinação com diferentes técnicas de separação, como a cromatografia líquida (LC) e a cromatografia gasosa (GC). Em relação ao desenho experimental, propomos duas abordagens diferentes e complementares: (I) estudos de caso-controlo para a pesquisa, em biópsia líquida, de biomarcadores capazes de prever a resposta a ITQs (em doentes com CPNPC do EGFR com mutação) e ICIs (em doentes tratados com anti-PD1 e anti-PDL1); e ii) um estudo longitudinal para monitorizar a reprogramação metabólica associada à resistência adquirida a ITQ em amostras em série de tecido tumoral e biópsia líquida. Paralelamente, e a fim de verificar o impacto funcional das alterações metabólicas identificadas nos pacientes e estabelecer o possível mecanismo de ação, estudaremos as alterações metabolômicas em modelos celulares de resistência adquirida aos ITQs. (Portuguese)
17 August 2022
0 references
Projekti üldeesmärk on teha metabonoomilise ja lipidoomilise analüüsi abil kindlaks mitteinvasiivsed biomarkerid vastuseks uutele kopsuvähi vastastele ravimeetoditele ning uurida resistentsuse tekkimisega seotud ainevahetuse ümberprogrammeerimist. Selleks teeme ettepaneku analüüsida Valencia kogukonna eri keskustest pärit mitteväikerakk-kopsuvähiga (NCP) diagnoositud patsientide kasvajakoe ja plasma/seerumi biopsiate analüüsi, kes saavad ravi türosiinkinaasi inhibiitoritega (ITQ), mis on suunatud epidermaalse kasvufaktori retseptori (EGFR) või immuunkontrollipunkti inhibiitorite (ICI) vastu. Bioloogilist materjali analüüsitakse kaasaegse metaboloomilise ja lipidoomika platvormi abil, mis tagab suure metaboolse katvuse (>2000 metaboliidi), mis hõlmab erinevate massispektromeetrite kasutamist (kolmekordset nelinurkset lennuaega koos ioonide liikuvusega) koos erinevate eraldamismeetoditega, nagu vedelikkromatograafia (LC) ja gaasikromatograafia (GC). Seoses eksperimentaalse kavandamisega pakume välja kaks erinevat ja üksteist täiendavat lähenemisviisi: I) juhtumikontrolliuuringud, et otsida vedela biopsiaga biomarkereid, mis võimaldavad ennustada ravivastust ITQ-le (muteerunud EGFR mitteväikerakk-kopsuvähiga patsientidel) ja ICI-dele (patsientidel, keda ravitakse anti-PD1 ja anti-PDL1-ga); ja ii) kestev uuring, et jälgida metaboolset ümberprogrammeerimist, mis on seotud omandatud resistentsusega kasvaja koe ja vedela biopsia seeriaproovides ITQ-de suhtes. Paralleelselt ja selleks, et kontrollida patsientide metaboolsete muutuste funktsionaalset mõju ja teha kindlaks võimalik toimemehhanism, uurime ITQ-de suhtes omandatud resistentsuse rakumudelite metaboloomseid muutusi. (Estonian)
17 August 2022
0 references
A projekt általános célja a nem invazív biomarkerek metabolómiai és lipidomikus analízissel történő azonosítása a tüdőrák elleni új terápiákra válaszul, valamint a rezisztencia megszerzéséhez kapcsolódó metabolikus újraprogramozás tanulmányozása. Ennek érdekében javasoljuk a valenciai közösség különböző központjaiból származó, nem kissejtes tüdőcarcinomával (NCP) diagnosztizált betegek tumorszövetének és plazma/szérumának biopsziáinak elemzését, akik az epidermális növekedési faktor receptor (EGFR) vagy immunkontroll pont gátlók (ICI) elleni kezelésben részesülnek. A biológiai anyagot a legkorszerűbb metabolomikus és lipidomikus platform segítségével kell elemezni, amely magas metabolikus lefedettséget biztosít (> 2000 metabolit), amely különböző tömegspektrométerek (háromnégyszeres kvadrupol, ionmobilitással járó kvadrupol-repülési idő) használatát foglalja magában különböző szeparatív technikákkal, például folyadékkromatográfiával (LC) és gázkromatográfiával (GC) kombinálva. A kísérleti tervezés tekintetében két különböző és egymást kiegészítő megközelítést javasolunk: Eset-kontroll vizsgálatok az ITQ-kra (mutált EGFR NSCLC-betegeknél) és ICI-kre adott válasz előrejelzésére képes biomarkerek folyékony biopsziában történő keresésére (anti-PD1 és anti-PDL1 kezelésben részesülő betegeknél); és ii. egy longitudinális vizsgálat, amely a tumorszövet és a folyékony biopszia sorozatos mintáiban az ITQ-kkal szembeni szerzett rezisztenciával kapcsolatos metabolikus átprogramozás nyomon követésére szolgál. Ezzel párhuzamosan, valamint annak érdekében, hogy ellenőrizzük a betegeknél azonosított metabolikus változások funkcionális hatását, és megállapítsuk a lehetséges hatásmechanizmust, tanulmányozzuk az ITQ-val szemben szerzett rezisztencia sejtmodelljei metabolómikus változásait. (Hungarian)
17 August 2022
0 references
Общата цел на този проект е да се идентифицират чрез метаболомни и липидомични анализи неинвазивните биомаркери в отговор на нови терапии, насочени срещу рак на белия дроб, и да се проучи метаболитното препрограмиране, свързано с придобиването на резистентност. За тази цел предлагаме анализ на биопсиите на туморната тъкан и плазмата/серума на пациенти, диагностицирани с недребноклетъчен белодробен карцином (NCP) от различни центрове в общността на Валенсия, които получават лечение с инхибитори на тирозин киназата (ITQ), насочени срещу рецептора на епидермалния растежен фактор (EGFR) или с инхибитори на имунна контролна точка (ICI). Биологичният материал ще бъде анализиран с най-съвременна метаболомна и липидомична платформа, която осигурява високо метаболитно покритие (> 2000 метаболита), което включва използването на различни масови спектрометри (тройна четворка, време на квадрупол-полет с йонна мобилност) в комбинация с различни сепаративни техники като течна хроматография (LC) и газова хроматография (GC). По отношение на експерименталния дизайн предлагаме два различни и допълващи се подхода: I) проучвания за контрол на случаи за търсене в течна биопсия на биомаркери, способни да предскажат отговор към ITQs (в мутирали пациенти с EGFR NSCLC) и инфекциозни инхибитори (при пациенти, лекувани с анти-PD1 и анти-PDL1); и ii) надлъжно изследване за наблюдение на метаболитното препрограмиране, свързано с придобита резистентност към ИТК в серийни проби от туморна тъкан и течна биопсия. Успоредно с това и за да проверим функционалното въздействие на метаболитните промени, идентифицирани при пациентите, и да установим възможния механизъм на действие, ще проучим метаболомните промени в клетъчните модели на резистентност, придобити към ITQs. (Bulgarian)
17 August 2022
0 references
Bendras šio projekto tikslas – atliekant metabolominę ir lipidominę analizę nustatyti neinvazinius biologinius žymenis, reaguojant į naujus gydymo būdus, nukreiptus prieš plaučių vėžį, ir ištirti medžiagų apykaitos perprogramavimą, susijusį su atsparumo įgijimu. Šiuo tikslu siūlome analizuoti naviko audinio biopsijas ir plazmą/serumą pacientams, kuriems diagnozuota nesmulkialąstelinė plaučių karcinoma (NCP) iš įvairių Valensijos bendruomenės centrų, kurie gydomi tirozino kinazės inhibitoriais (ITQ), nukreiptais prieš epidermio augimo faktoriaus receptorius (EGFR) arba imuninės kontrolės taško inhibitorius (ICI). Biologinė medžiaga bus analizuojama naudojant moderniausią metabolizmo ir lipidomikos platformą, kuri užtikrina didelę medžiagų apykaitos aprėptį (> 2000 metabolitų), kuri apima įvairių masės spektrometrų (trigubo kvadrupolio, keturdrupolio skrydžio su jonų judrumu) naudojimą kartu su skirtingais atskyrimo metodais, pvz., skysčių chromatografija (LC) ir dujų chromatografija (GC). Dėl eksperimentinio projektavimo siūlome du skirtingus ir vienas kitą papildančius metodus: I) atvejų kontroliniai tyrimai, skirti biologinių žymenų, galinčių numatyti atsaką į ITQ (mutavusiems EGFR NSLPV sergantiems pacientams) ir ICI (pacientams, gydytiems anti-PD1 ir anti-PDL1), paieškai skystoje biopsijoje; ir ii) išilginis tyrimas, skirtas stebėti metabolinį perprogramavimą, susijusį su įgytu atsparumu ITQ serijiniuose naviko audinio ir skystos biopsijos mėginiuose. Tuo pačiu metu ir siekdami patikrinti pacientų medžiagų apykaitos pokyčių funkcinį poveikį ir nustatyti galimą veikimo mechanizmą, mes tirsime metabolizmo pokyčius ląstelių modeliuose, įgytuose ITQ. (Lithuanian)
17 August 2022
0 references
Opći cilj ovog projekta je utvrditi, kroz metabolomsku i lipidomsku analizu, neinvazivne biomarkere kao odgovor na nove terapije usmjerene protiv raka pluća, te proučiti reprogramiranje metabolizma povezano sa stjecanjem rezistencije. U tu svrhu predlažemo analizu biopsija tumorskog tkiva i plazme/seruma bolesnika kojima je dijagnosticiran karcinom pluća nemalih stanica (NCP) iz različitih centara u Valenciji, koji se liječe inhibitorima tirozin kinaze (ITQs) usmjerenim protiv receptora epidermalnog faktora rasta (EGFR) ili inhibitorima imunološke kontrolne točke (ICI). Biološki materijal analizirat će se pomoću najsuvremenije metabolomske i lipidomske platforme koja osigurava visoku metaboličku pokrivenost (> 2000 metabolita), što uključuje upotrebu različitih masenih spektrometri (trostruki četveropol, četveropolno vrijeme leta s ionskom pokretljivošću) u kombinaciji s različitim separativnim tehnikama kao što su tekućinska kromatografija (LC) i plinska kromatografija (GC). Kad je riječ o eksperimentalnom dizajnu, predlažemo dva različita i komplementarna pristupa: (I) ispitivanja kontrole slučaja za pretraživanje, u tekućoj biopsiji, biomarkera koji mogu predvidjeti odgovor na ITQ (u bolesnika s mutiranim EGFR NSCLC-om) i ICI-ja (u bolesnika liječenih anti-PD1 i anti-PDL1); i ii. longitudinalno istraživanje za praćenje reprogramiranja metabolizma povezanog s stečenom otpornošću na ITQ-e u serijskim uzorcima tumorskog tkiva i tekuće biopsije. Paralelno, a kako bismo provjerili funkcionalan utjecaj metaboličkih promjena identificiranih u bolesnika i utvrdili mogući mehanizam djelovanja, proučavat ćemo metabolomske promjene u staničnim modelima rezistencije stečene na ITQ. (Croatian)
17 August 2022
0 references
Det övergripande målet med detta projekt är att genom metabolomisk och lipidomisk analys identifiera icke-invasiva biomarkörer som svar på nya behandlingar riktade mot lungcancer, och att studera metabolisk omprogrammering i samband med förvärv av resistens. För detta ändamål föreslår vi en analys av biopsier av tumörvävnad och plasma/serum hos patienter som diagnostiserats med icke-småcellig lungcancer (NCP) från olika centra i Valencia, som får behandlingar med tyrosinkinashämmare (ITQ) riktade mot epidermal tillväxtfaktorreceptor (EGFR) eller med immunkontrollpunktshämmare (ICI). Det biologiska materialet kommer att analyseras med en toppmodern metabolomisk plattform och lipidomisk plattform som ger hög metabolisk täckning (> 2000 metaboliter), vilket inkluderar användning av olika masspektrometrar (tripel quadrupol, quadrupole-flight-tid med jonrörlighet) i kombination med olika separativa tekniker såsom vätskekromatografi (LC) och gaskromatografi (GC). När det gäller experimentell design föreslår vi två olika och kompletterande tillvägagångssätt: I) fallkontrollstudier för sökning, i flytande biopsi, av biomarkörer som kan förutsäga svar på ITQ (i muterade EGFR-NSCLC-patienter) och ICI (för patienter behandlade med anti-PD1 och anti-PDL1). och ii) en longitudinell studie för att övervaka metabolisk omprogrammering i samband med förvärvad resistens mot ITQ i seriella prover av tumörvävnad och flytande biopsi. Parallellt, och för att verifiera den funktionella effekten av de metaboliska förändringar som identifierats hos patienter och fastställa den möjliga verkningsmekanismen, kommer vi att studera metabolomiska förändringar i cellmodeller av resistens mot ITQs. (Swedish)
17 August 2022
0 references
Obiectivul general al acestui proiect este de a identifica, prin analiza metabolomică și lipidomică, biomarkerii neinvazivi ca răspuns la noile terapii îndreptate împotriva cancerului pulmonar și de a studia reprogramarea metabolică asociată cu dobândirea rezistenței. În acest scop, propunem analiza biopsiilor țesutului tumoral și a plasmei/serului pacienților diagnosticați cu carcinom pulmonar fără celule mici (PCN) din diferite centre din Comunitatea Valenciană, care primesc tratamente cu inhibitori ai tirozin kinazei (ITQ) îndreptate împotriva receptorului factorului de creștere epidermică (EGFR) sau cu inhibitori ai punctului de control imun (ICI). Materialul biologic va fi analizat cu o platformă metabolomică și lipidomică de ultimă generație, care asigură o acoperire metabolică ridicată (>2000 de metaboliți), care include utilizarea diferitelor spectrometre de masă (cvadrupol triplu, timp de zbor cvadrupol cu mobilitate ionică) în combinație cu diferite tehnici de separare, cum ar fi cromatografia lichidă (LC) și cromatografia în fază gazoasă (GC). În ceea ce privește proiectarea experimentală, propunem două abordări diferite și complementare: (I) studii de caz pentru căutarea, în biopsia lichidă, a biomarkerilor capabili să anticipeze răspunsul la ITC (la pacienții cu NSCLC mutante EGFR) și ICI (la pacienții tratați cu anti-PD1 și anti-PDL1); și (ii) un studiu longitudinal pentru a monitoriza reprogramarea metabolică asociată cu rezistența dobândită la ITQ-uri în probe seriale de țesut tumoral și biopsie lichidă. În paralel, și pentru a verifica impactul funcțional al modificărilor metabolice identificate la pacienți și pentru a stabili mecanismul de acțiune posibil, vom studia modificări metabolomice în modelele celulare de rezistență dobândite la ITQ. (Romanian)
17 August 2022
0 references
Splošni cilj tega projekta je s pomočjo metabolomske in lipidomske analize opredeliti neinvazivne biomarkerje kot odziv na nove terapije, usmerjene proti pljučnemu raku, in preučiti presnovno reprogramiranje, povezano s pridobivanjem odpornosti. V ta namen predlagamo analizo biopsije tumorskega tkiva in plazme/seruma bolnikov z diagnozo nedrobnoceličnega pljučnega karcinoma (NCP) iz različnih centrov v Valencii, ki se zdravijo z zaviralci tirozin kinaze (ITQ), usmerjenimi proti receptorju epidermalnega rastnega faktorja (EGFR) ali z zaviralci točk imunskega nadzora (ICI). Biološki material bo analiziran z najsodobnejšo metabolomsko in lipidomsko platformo, ki zagotavlja visoko presnovno pokritost (>2000 metabolitov), ki vključuje uporabo različnih masnih spektrometrov (trikratni kvadrupol, čas kvadrupola z ionsko mobilnostjo) v kombinaciji z različnimi ločevalnimi tehnikami, kot sta tekočinska kromatografija (LC) in plinska kromatografija (GC). V zvezi z načrtovanjem poskusov predlagamo dva različna in dopolnjujoča se pristopa: (I) študije kontrole primerov za iskanje biomarkerjev, ki lahko predvidijo odziv na ITQ (pri mutiranih bolnikih z nedrobnoceličnim pljučnim rakom EGFR) in ICI (pri bolnikih, zdravljenih z anti-PD1 in anti-PDL1), v tekoči biopsiji; in (ii) longitudinalno študijo za spremljanje presnovnega reprogramiranja, povezanega s pridobljeno odpornostjo na ITQ v serijskih vzorcih tumorskega tkiva in tekoče biopsije. Vzporedno in za preverjanje funkcionalnega vpliva presnovnih sprememb, ugotovljenih pri bolnikih, in določitev možnega mehanizma delovanja bomo preučevali presnovne spremembe v celičnih modelih odpornosti, pridobljenih na ITQ. (Slovenian)
17 August 2022
0 references
Ogólnym celem tego projektu jest zidentyfikowanie, poprzez analizę metabolomiczną i lipidomiczną, nieinwazyjnych biomarkerów w odpowiedzi na nowe terapie skierowane przeciwko rakowi płuc oraz zbadanie przeprogramowania metabolicznego związanego z uzyskaniem oporności. W tym celu proponujemy analizę biopsji tkanki nowotworowej i osocza/surowicy pacjentów z rozpoznaniem niedrobnokomórkowego raka płuca (NCP) z różnych ośrodków Wspólnoty Walencji, którzy otrzymują leczenie inhibitorami kinazy tyrozynowej (ITQ) skierowanymi przeciwko receptorowi czynnika wzrostu naskórka (EGFR) lub inhibitorom punktu kontroli odporności (ICI). Materiał biologiczny będzie analizowany za pomocą najnowocześniejszej platformy metabolomicznej i lipidomicznej, która zapewnia wysoki zasięg metaboliczny (> 2000 metabolitów), która obejmuje stosowanie różnych spektrometrów masowych (triple quadrupole, poczwórny czas lotu z mobilnością jonów) w połączeniu z różnymi technikami separacji, takimi jak chromatografia cieczowa (LC) i chromatografia gazowa (GC). W odniesieniu do projektu eksperymentalnego proponujemy dwa różne i uzupełniające się podejścia: (I) badania kontrolne przypadków dotyczące poszukiwania, w biopsji ciekłej, biomarkerów zdolnych do przewidywania odpowiedzi na ITQ (w zmutowanych pacjentach z grupy EGFR NSCLC) i ICI (u pacjentów leczonych anty-PD1 i anty-PDL1); oraz (ii) badanie podłużne w celu monitorowania przeprogramowania metabolicznego związanego z nabytą opornością na ITQ w seryjnych próbkach tkanki nowotworowej i biopsji ciekłej. Równolegle, w celu zweryfikowania funkcjonalnego wpływu zmian metabolicznych zidentyfikowanych u pacjentów i ustalenia możliwego mechanizmu działania, będziemy badać zmiany metabolomiczne w modelach komórkowych oporności nabytych na ITQs. (Polish)
17 August 2022
0 references
Valencia
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
PI17_01282
0 references