FUNCTIONAL DIVERSITY OF CRISPR-CAS SYSTEMS: ROLE OF RT-CAS1 SYSTEMS IN DEFENCE AGAINST PHAGES. (Q3138033)
Jump to navigation
Jump to search
Project Q3138033 in Spain
| Language | Label | Description | Also known as |
|---|---|---|---|
| English | FUNCTIONAL DIVERSITY OF CRISPR-CAS SYSTEMS: ROLE OF RT-CAS1 SYSTEMS IN DEFENCE AGAINST PHAGES. |
Project Q3138033 in Spain |
Statements
107,615.27 Euro
0 references
133,584.0 Euro
0 references
80.56 percent
0 references
1 January 2018
0 references
30 September 2021
0 references
UNIVERSIDAD DE MURCIA
0 references
30100
0 references
LOS VIRUS SON LOS AGENTES BIOLOGICOS MAS ABUNDANTES EN LA BIOSFERA. EL CONOCIMIENTO DE LA INTERACCION DE ESTOS AGENTES CON LAS CELULAS QUE INFECTAN TIENE UN ENORME INTERES CIENTIFICO TANTO BASICO COMO APLICADO. PARA PROTEGERSE FRENTE A LA INFECCION POR VIRUS, Y OTROS AGENTES INFECCIOSOS EXTERNOS, LOS MICROORGANISMOS HAN DESARROLLADO DIFERENTES MECANISMOS. EN LA MAYORIA DE ARQUEAS Y CASI EL 50% DE BACTERIAS SE DETECTAN SISTEMAS CRISPR-CAS QUE CONFIEREN INMUNIDAD ADAPTATIVA. CRISPR HACE REFERENCIA A LOCI QUE CONTIENEN SECUENCIAS CORTAS REPETIDAS Y CON CARACTER PALINDROMICO QUE ESTAN SEPARADAS POR FRAGMENTOS CONOCIDOS COMO ESPACIADORES. LOS ESPACIADORES SON ADQUIRIDOS EN LA FASE DE ADAPTACION O INMUNIZACION A PARTIR DE ELEMENTOS GENETICOS MOVILES EXTRAÑOS CONSTITUYENDO UNA MEMORIA DE INFECCIONES PREVIAS. LAS PROTEINAS CAS1 Y CAS2, CODIFICADAS POR GENES ADYACENTES AL LOCUS CRISPR, PARTICIPAN EN ESA FASE DE INMUNIZACION. LAS SECUENCIAS CRISPR SON TRANSCRITAS Y PROCESADAS GENERANDO PEQUEÑOS CRRNAS (DE CRISPR-RNAS). EN UNA FASE POSTERIOR DE INTERFERENCIA, EL CRRNA COMPLEMENTARIO A UNA SECUENCIA DIANA EN EL ELEMENTO GENETICO EXTRAÑO, DIRIGIRA A UNAS PROTEINAS CAS CON ACTIVIDAD NUCLEASA QUE DEGRADARAN DICHO ELEMENTO._x000D_ _x000D_ SE ESTA DESCRIBIENDO UNA CADA VEZ MAYOR DIVERSIDAD DE SISTEMAS CRISPR. A PARTIR DE UNO DE ESTOS TIPOS SE HA CARACTERIZADO LA NUCLEASA CAS9. ESTA SE HA ADAPTADO PARA LA EDICION GENOMICA DE ORGANISMOS SUPERIORES, LO QUE HA SUPUESTO UNA ENORME REVOLUCION EN LAS CIENCIAS BIOMEDICAS. EL POTENCIAL BIOTECNOLOGICO QUE PUEDE DERIVARSE DE LA CARACTERIZACION DE TIPOS ADICIONALES DE SISTEMAS CRISPR-CAS Y DEL ESTUDIO DE SU MECANISMO DE ACTUACION ES ENORME. EN ALGUNOS MICROORGANISMOS SE HA DESCRITO LA EXISTENCIA DE PROTEINAS CAS1 QUE PRESENTAN UN DOMINIO RETROTRANSCRIPTASA (RT-CAS1). EN LA BACTERIA MARINA MARINOMONAS MEDITERRANEA SE HA DESCRITO UN SISTEMA III-B CON RT-CAS1 QUE PERMITE LA ADQUISICION DE ESPACIADORES A PARTIR DE RNA (SILAS ET AL. 2016, SCIENCE, V. 351, P. AAD4234). LA FUNCION BIOLOGICA DEL PROCESO DE RETROTRANSCRIPCION ES DESCONOCIDA. _x000D_ _x000D_ EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES PROFUNDIZAR EN LA CARACTERIZACION DE SISTEMAS CON RT-CAS1 Y SU PAPEL EN LA DEFENSA FRENTE A DIVERSOS TIPOS DE FAGOS, TANTO DE DNA COMO DE RNA. SE PRESTARA UNA ATENCION ESPECIAL A SU POSIBLE PAPEL EN LA INMUNIDAD CONTRA VIRUS DE RNA PUESTO QUE LA INTERACCION DE SISTEMAS CRISPR-CAS CON FAGOS CON ESTE TIPO DE MATERIAL GENETICO ES DESCONOCIDA EN GRAN MEDIDA. EL ESTUDIO INCLUIRA EL ANALISIS DEL PAPEL DE LAS PROTEINAS CODIFICADAS EN EL OPERON CAS EN LAS FASES DE INTERFERENCIA Y DE ADAPTACION. FINALMENTE, SE ESTUDIARA LA INTERACCION ENTRE SISTEMAS CRISPR-CAS DE DIFERENTES TIPOS QUE COEXISTEN EN UN MISMO MICROORGANISMO. ENTRE LOS ASPECTOS QUE SE CONSIDERARAN SE INCLUYE EL ESTUDIO DE LA POSIBLE REGULACION DIFERENCIAL DE LOS DISTINTOS TIPOS, LO QUE PODRIA CONFERIR RESISTENCIA COMPLEMENTARIA A FAGOS DEPENDIENDO DE LAS CONDICIONES FISIOLOGICAS. EL PROYECTO QUE SE PRESENTA PUEDE CONTRIBUIR DE FORMA SIGNIFICATIVA A LA AMPLIACION DEL CONOCIMIENTO SOBRE LA DIVERSIDAD FUNCIONAL Y ESTRUCTURAL DE LOS SISTEMAS CRISPR-CAS. ESTE ES UNO DE LOS TEMAS DE MAYOR RELEVANCIA CIENTIFICA EN LA ACTUALIDAD POR SUS ENORMES IMPLICACIONES EN DIVERSOS AMBITOS BIOMEDICOS Y BIOTECNOLOGICOS. (Spanish)
0 references
VIRUSES ARE THE MOST ABUNDANT BIOLOGICAL ENTITIES IN THE BIOSPHERE. THE KNOWLEDGE OF THEIR INTERACTION WITH THE CELLS THAT THEY INFECT HAS AN ENORMOUS SCIENTIFIC INTEREST IN BOTH, BASIC AND APPLIED ASPECTS OF BIOTECHNOLOGY. THE MICROORGANISMS HAVE DEVELOPED A WIDE RANGE OF MECHANISMS TO PROTECT THEMSELVES FROM VIRAL INFECTIONS. IN MOST OF THE ARCHEA AND ALMOST 50% OF THE BACTERIA, IT IS POSSIBLE TO DETECT CRISPR-CAS (CLUSTERED REGULARLY INTERSPACED SHORT PALINDROMIC REPEATS-CRISPR ASSOCIATED GENES) SYSTEMS THAT CONFER ADAPTATIVE IMMUNITY AGAINST PHAGE INFECTION. THE REPEATED SEQUENCES ARE SEPARATED BY SHORT FRAGMENTS NAMED SPACERS WHICH ARE ACQUIRED FROM INVADING EXTERNAL GENETIC ELEMENTS SUCH AS PHAGES OR PLASMIDS AND SO CONSTITUTE A GENETIC MEMORY OF PREVIOUS INFECTIONS. THIS ADAPTATION OR IMMUNIZATION PHASE IS MEDIATED BY THE PROTEINS CAS1 AND CAS2. IN THE EXPRESSION PHASE, THE CRISPR LOCI ARE TRANSCRIBED AND PROCESSED GENERATING CRRNA. IN THE LAST PHASE OF INTERFERENCE, THE CRRNA, WHICH IS COMPLEMENTARY TO THE INVADING GENETIC ELEMENT, WILL GUIDE CAS PROTEINS WITH NUCLEASE ACTIVITY FOR THE DEGRADATION OF THAT ELEMENT._x000D_ _x000D_ THERE IS AN INCREASING DIVERSITY OF CRISPR-CAS SYSTEMS DESCRIBED. THE NUCLEASE CAS9 OF ONE OF THOSE TYPES HAS BEEN ADAPTED FOR THE GENOMIC EDITION OF HIGHER ORGANISMS, WHAT HAS DETERMINED A REVOLUTION IN BIOMEDICAL SCIENCES. THE BIOTECHNOLOGICAL POTENTIAL OF THE DESCRIPTION AND MOLECULAR CHARACTERIZATION OF NOVEL CRISPR-CAS SYSTEMS IS ENORMOUS. SEVERAL MICROORGANISMS CONTAIN CRISPR-CAS SYSTEMS IN WHICH THE PROTEIN CAS1 IS FUSED TO A RETROTRANSCRIPTASE DOMAIN (RT-CAS1). THE MARINE BACTERIUM MARINOMONAS MEDITERRANEA CONTAINS A TYPE III-B SYSTEM WITH RT-CAS1. THIS SYSTEM HAS BEEN THE FIRST ONE DESCRIBED ABLE TO ACQUIRE SPACERS FROM RNA (SILAS ET AL. 2016, SCIENCE, V. 351, P. AAD4234). HOWEVER, THE BIOLOGICAL FUNCTION OF THE PROCESS OF RETROTRANSCRIPTION REMAINS TO BE DETERMINED. _x000D_ _x000D_ THE MAIN GOAL OF THIS PROJECT IS TO GAIN INSIGHT INTO THE ROLE OF CRISPR SYSTEMS WITH RT-CAS1 IN THE DEFENSE AGAINS DIFFERENT TYPES OF PHAGES. THE INTERACTION WITH RNA VIRUSES WILL BE A MAIN OBJECTIVE OF STUDY SINCE VERY LITTLE IS KNOWN ABOUT THE ROLE OF CRISPR-CAS SYSTEMS IN THE DEFENSE AGAINST PHAGES WITH THIS TYPE OF GENOMES. THE ROLE OF THE DIFFERENT CAS PROTEINS ENCODED IN THE OPERONS WITH RT-CAS1 IN THE PROCESSES OF ADAPTATION AND INTERFERENCE WILL BE ALSO ANALYZED. FINALLY, THE INTERACTION OF CRISPR-CAS SYSTEMS OF DIFFERENT TYPES CO-EXISTING IN THE SAME MICROORGANISM WILL BE STUDIED. AMONG OTHER ASPECTS TO BE CONSIDERED, THE ANALYSIS OF THE REGULATION OF THE EXPRESSION OF THESE SYSTEMS WILL BE INCLUDED. A DIFFERENTIAL REGULATION OF THE CRISPR-CAS SYTEMS COULD OFFER COMPLEMENTARY DEFENSES DEPENDING ON THE PHYSIOLOGICAL CONDITIONS. THE RESULTS OF THIS PROJECT COULD CONTRIBUTE SIGNIFICANTLY TO THE KNOWLEDGE OF THE FUNCTIONAL DIVERSITY OF CRISPR-CAS SYSTEMS. THIS SUBJECT IS CURRENTLY ONE OF THE MOST RELEVANT SCIENTIC FIELDS DUE TO IS HUGE IMPACT ON BIOMEDICINE AND BIOTECHNOLOGY. (English)
0.8374490678642088
0 references
LES VIRUS SONT LES AGENTS BIOLOGIQUES LES PLUS ABONDANTS DE LA BIOSPHÈRE. LA CONNAISSANCE DE L’INTERACTION DE CES AGENTS AVEC LES CELLULES QU’ILS INFECTENT A UN INTÉRÊT SCIENTIFIQUE ÉNORME À LA FOIS BASIQUE ET APPLIQUÉ. POUR SE PROTÉGER CONTRE L’INFECTION VIRALE ET D’AUTRES AGENTS INFECTIEUX EXTERNES, LES MICRO-ORGANISMES ONT DÉVELOPPÉ DIFFÉRENTS MÉCANISMES. DANS LA MAJORITÉ DES ARCHÉES ET PRÈS DE 50 % DES BACTÉRIES, DES SYSTÈMES CRISPR-CAS SONT DÉTECTÉS QUI CONFÈRENT UNE IMMUNITÉ ADAPTATIVE. CRISPR FAIT RÉFÉRENCE AUX LOCI CONTENANT DES SÉQUENCES COURTES RÉPÉTÉES AVEC UN CARACTÈRE PALINDROMICO QUI SONT SÉPARÉS PAR DES FRAGMENTS CONNUS SOUS LE NOM D’ESPACEURS. LES ENTRETOISES SONT ACQUISES AU COURS DE LA PHASE D’ADAPTATION OU D’IMMUNISATION À PARTIR D’ÉLÉMENTS GÉNÉTIQUES MOBILES ÉTRANGERS CONSTITUANT UN SOUVENIR D’INFECTIONS ANTÉRIEURES. LES PROTÉINES CAS1 ET CAS2, CODÉES PAR DES GÈNES ADJACENTS AU LOCUS CRISPR, PARTICIPENT À CE STADE DE L’IMMUNISATION. LES SÉQUENCES CRISPR SONT TRANSCRITES ET TRAITÉES GÉNÉRANT DE PETITS ARNR (À PARTIR D’ARN-CRISPR). Dans une PASS D’INTERFERENCE postérieure, le COMPLEMENTAIRE À LA SÉCURITÉ DE DIANA DANS L’ÉLÉMENT GENETIQUE EXTRANELLE, dirigera un CAS PROTÉINS AVEC L’ACTIVITÉ DE LA nucléase qui dégradera le dicho ELEMENTO._x000D_ _x000D_ CE EST DESCRIBIENING TOUTE DIVERSITÉ DES SYSTÈMES DE CRISPR. DE L’UN DE CES TYPES, LA NUCLÉASE CAS9 A ÉTÉ CARACTÉRISÉE. CECI A ÉTÉ ADAPTÉ POUR L’ÉDITION GÉNOMIQUE DES ORGANISMES SUPÉRIEURS, CE QUI A ENTRAÎNÉ UNE ÉNORME RÉVOLUTION DANS LES SCIENCES BIOMÉDICALES. LE POTENTIEL BIOTECHNOLOGIQUE QUI PEUT ÊTRE DÉRIVÉ DE LA CARACTÉRISATION D’AUTRES TYPES DE SYSTÈMES CRISPR-CAS ET L’ÉTUDE DE LEUR MÉCANISME D’ACTION EST ÉNORME. CERTAINS MICRO-ORGANISMES ONT DÉCRIT L’EXISTENCE DE PROTÉINES CAS1 AVEC UN DOMAINE RETROTRANSCRIPTASE (RT-CAS1). DANS LA BACTÉRIE MARINE MARINOMONAS MEDITERRANEA, UN SYSTÈME III-B AVEC RT-CAS1 A ÉTÉ DÉCRIT QUI PERMET L’ACQUISITION D’ESPACEURS À PARTIR DE L’ARN (SILAS ET AL. 2016, SCIENCE, V. 351, P. AAD4234). LA FONCTION BIOLOGIQUE DU PROCESSUS RETRONSCRIPCION EST INCONNUE. _x000D_ _x000D_ L’OBJECTIVE DE CE PROJET est un financement dans la CHARACTERISATION DES SYSTÈMES AVEC RT-CAS1 ET VOTRE PAPER DANS LA DÉFENSE FENT À diverses TIPS DE FAGOS, TANT D’ADN AS DE RNA. UNE ATTENTION PARTICULIÈRE SERA ACCORDÉE À SON RÔLE POSSIBLE DANS L’IMMUNITÉ CONTRE LES VIRUS DE L’ARN PUISQUE L’INTERACTION DES SYSTÈMES CRISPR-CAS AVEC LES PHAGES AVEC CE TYPE DE MATÉRIEL GÉNÉTIQUE EST LARGEMENT INCONNUE. L’ÉTUDE COMPRENDRA L’ANALYSE DU RÔLE DES PROTÉINES CODÉES DANS L’OPÉRON CAS DANS LES PHASES D’INTERFÉRENCE ET D’ADAPTATION. ENFIN, L’INTERACTION ENTRE LES SYSTÈMES CRISPR-CAS DE DIFFÉRENTS TYPES QUI COEXISTENT DANS LE MÊME MICRO-ORGANISME SERA ÉTUDIÉE. PARMI LES ASPECTS EXAMINÉS FIGURE L’ÉTUDE DE L’ÉVENTUEL RÈGLEMENT DIFFÉRENCIÉ DES DIFFÉRENTS TYPES, QUI POURRAIT CONFÉRER UNE RÉSISTANCE COMPLÉMENTAIRE AUX PHAGES EN FONCTION DES CONDITIONS PHYSIOLOGIQUES. LE PROJET PRÉSENTÉ PEUT CONTRIBUER DE MANIÈRE SIGNIFICATIVE À L’EXPANSION DES CONNAISSANCES SUR LA DIVERSITÉ FONCTIONNELLE ET STRUCTURELLE DES SYSTÈMES CRISPR-CAS. C’EST L’UN DES SUJETS LES PLUS IMPORTANTS D’ACTUALITÉ SCIENTIFIQUE EN RAISON DE SES IMPLICATIONS ÉNORMES DANS DIVERS DOMAINES BIOMÉDICAUX ET BIOTECHNOLOGIQUES. (French)
2 December 2021
0 references
VIREN SIND DIE AM HÄUFIGSTEN VORKOMMENDEN BIOLOGISCHEN WIRKSTOFFE IN DER BIOSPHÄRE. DAS WISSEN ÜBER DIE WECHSELWIRKUNG DIESER WIRKSTOFFE MIT DEN ZELLEN, DIE SIE INFIZIEREN, HAT EIN ENORMES WISSENSCHAFTLICHES INTERESSE SOWOHL GRUNDLEGENDE ALS AUCH ANGEWANDTE. ZUM SCHUTZ VOR VIRUSINFEKTIONEN UND ANDEREN EXTERNEN INFEKTIONSERREGERN HABEN MIKROORGANISMEN UNTERSCHIEDLICHE MECHANISMEN ENTWICKELT. IN DEN MEISTEN ARCHÄEN UND FAST 50 % DER BAKTERIEN WERDEN CRISPR-CAS-SYSTEME NACHGEWIESEN, DIE EINE ADAPTIVE IMMUNITÄT VERLEIHEN. CRISPR BEZIEHT SICH AUF LOCI, DIE WIEDERHOLTE KURZE SEQUENZEN MIT PALINDROMICO-ZEICHEN ENTHÄLT, DIE DURCH FRAGMENTE, DIE ALS ABSTANDSHALTER BEZEICHNET WERDEN, GETRENNT SIND. ABSTANDSHALTER WERDEN IN DER ANPASSUNGS- ODER IMMUNISIERUNGSPHASE VON FREMDEN BEWEGLICHEN GENETISCHEN ELEMENTEN ERWORBEN, DIE EIN GEDÄCHTNIS FRÜHERER INFEKTIONEN DARSTELLEN. PROTEINE CAS1 UND CAS2, KODIERT DURCH GENE NEBEN DEM CRISPR-LOCUS, NEHMEN AN DIESEM STADIUM DER IMMUNISIERUNG TEIL. CRISPR-SEQUENZEN WERDEN TRANSKRIBIERT UND VERARBEITET, UM KLEINE CRRNAS (AUS CRISPR-RNAS) ZU ERZEUGEN. In einem posterior INTERFERENCE PASS, wird die COMPLEMENTARY crrn to a DIANA secution in the EXTRANAL GENETIC ELEMENT, wird eine CAS PROTEINS MIT Nuclease ACTIVITY leiten, die dicho ELEMENTO._x000D_ _x000D_ das wird dicho ELEMENTO degradieren. AUS EINEM DIESER TYPEN WURDE DIE CAS9 NUKLEASE CHARAKTERISIERT. DIES WURDE AN DIE GENOMISCHE AUSGABE HÖHERER ORGANISMEN ANGEPASST, WAS EINE ENORME REVOLUTION IN DEN BIOMEDIZINISCHEN WISSENSCHAFTEN BEDEUTETE. DAS BIOTECHNOLOGISCHE POTENZIAL, DAS SICH AUS DER CHARAKTERISIERUNG ZUSÄTZLICHER CRISPR-CAS-SYSTEME UND DER UNTERSUCHUNG IHRES WIRKMECHANISMUS ERGEBEN KANN, IST ENORM. EINIGE MIKROORGANISMEN HABEN DIE EXISTENZ VON CAS1-PROTEINEN MIT EINER RETROTRANSCRIPTASE-DOMÄNE (RT-CAS1) BESCHRIEBEN. IN DEN MEERESBAKTERIEN MARINOMONAS MEDITERRANEA WURDE EIN SYSTEM III-B MIT RT-CAS1 BESCHRIEBEN, DAS DEN ERWERB VON ABSTANDSHALTERN VON RNA (SILAS ET AL. 2016, WISSENSCHAFT, V. 351, P. AAD4234). DIE BIOLOGISCHE FUNKTION DES RETRONSCRIPCION-PROZESSES IST UNBEKANNT. _x000D_ _x000D_ die OBJECTIVE dieses PROJEKT ist profunding in der CHARACTERISIERUNG der Systeme mit RT-CAS1 und Ihr PAPER in der DEFENSE FENT zu verschiedenen Zeiten von FAGOS, TANT von DNA als RNA. BESONDERES AUGENMERK WIRD AUF SEINE MÖGLICHE ROLLE BEI DER IMMUNITÄT GEGEN RNA-VIREN GELEGT, DA DIE WECHSELWIRKUNG VON CRISPR-CAS-SYSTEMEN MIT PHAGEN MIT DIESER ART VON GENETISCHEM MATERIAL WEITGEHEND UNBEKANNT IST. DIE STUDIE UMFASST DIE ANALYSE DER ROLLE VON PROTEINEN, DIE IN OPERATIONS CAS IN DER INTERFERENZ- UND ANPASSUNGSPHASE KODIERT WERDEN. SCHLIESSLICH WIRD DIE WECHSELWIRKUNG ZWISCHEN CRISPR-CAS-SYSTEMEN VERSCHIEDENER TYPEN UNTERSUCHT, DIE IM SELBEN MIKROORGANISMUS NEBENEINANDER EXISTIEREN. ZU DEN UNTERSUCHTEN ASPEKTEN GEHÖRT DIE UNTERSUCHUNG DER MÖGLICHEN DIFFERENTIALREGULIERUNG DER VERSCHIEDENEN TYPEN, DIE JE NACH PHYSIOLOGISCHEN BEDINGUNGEN EINE ERGÄNZENDE RESISTENZ GEGEN PHAGEN ERMÖGLICHEN KÖNNTE. DAS VORGESTELLTE PROJEKT KANN WESENTLICH ZUR ERWEITERUNG DES WISSENS ÜBER DIE FUNKTIONALE UND STRUKTURELLE VIELFALT DER CRISPR-CAS-SYSTEME BEITRAGEN. DIES IST EINES DER THEMEN VON GRÖSSTER WISSENSCHAFTLICHER RELEVANZ HEUTE WEGEN SEINER ENORMEN AUSWIRKUNGEN AUF VERSCHIEDENE BIOMEDIZINISCHE UND BIOTECHNOLOGISCHE BEREICHE. (German)
9 December 2021
0 references
VIRUSSEN ZIJN DE MEEST VOORKOMENDE BIOLOGISCHE AGENTIA IN DE BIOSFEER. DE KENNIS VAN DE INTERACTIE VAN DEZE AGENTEN MET DE CELLEN DIE ZE INFECTEREN HEEFT EEN ENORME WETENSCHAPPELIJKE INTERESSE, ZOWEL FUNDAMENTEEL ALS TOEGEPAST. OM TE BESCHERMEN TEGEN VIRUSINFECTIES EN ANDERE UITWENDIGE INFECTIES HEBBEN MICRO-ORGANISMEN VERSCHILLENDE MECHANISMEN ONTWIKKELD. IN DE MEESTE ARCHAEA EN BIJNA 50 % VAN DE BACTERIËN WORDEN CRISPR-CAS-SYSTEMEN GEDETECTEERD DIE ADAPTIEVE IMMUNITEIT VERLENEN. CRISPR VERWIJST NAAR LOCI MET HERHAALDE KORTE SEQUENTIES MET PALINDROMICO-KARAKTER DIE GESCHEIDEN ZIJN DOOR FRAGMENTEN DIE BEKEND STAAN ALS SPACERS. SPACERS WORDEN VERKREGEN IN DE AANPASSINGS- OF IMMUNISATIEFASE VAN VREEMDE BEWEEGBARE GENETISCHE ELEMENTEN DIE EEN GEHEUGEN VAN EERDERE INFECTIES VORMEN. EIWITTEN CAS1 EN CAS2, GECODEERD DOOR GENEN GRENZEND AAN DE CRISPR LOCUS, NEMEN DEEL AAN DIT STADIUM VAN IMMUNISATIE. CRISPR-SEQUENTIES WORDEN GETRANSCRIBEERD EN VERWERKT GENERERENDE KLEINE CRRNA’S (UIT CRISPR-RNAS). In een latere INTERFERENCE PASS, zal de COMPLEMENTARY naar een DIANA secution in de EXTRANAL GENETIC ELEMENT, zal leiden een CAS PROTEINS MET Nuclease ACTIVITEIT die dicho ELEMENTO._x000D_ _x000D_ _x000D_ DIT IS DESCRIBIENING HOOGSTE LIVERSITEIT VAN CRISPR SYSTEMS. VAN EEN VAN DEZE TYPES IS DE CAS9-NUCLEASE GEKARAKTERISEERD. DIT IS AANGEPAST VOOR DE GENOMIC EDITIE VAN HOGERE ORGANISMEN, WAT EEN ENORME REVOLUTIE IN DE BIOMEDISCHE WETENSCHAPPEN HEEFT BETEKEND. HET BIOTECHNOLOGISCHE POTENTIEEL DAT KAN WORDEN AFGELEID UIT DE KARAKTERISERING VAN AANVULLENDE SOORTEN CRISPR-CAS-SYSTEMEN EN DE STUDIE VAN HUN WERKINGSMECHANISME IS ENORM. SOMMIGE MICRO-ORGANISMEN HEBBEN HET BESTAAN VAN CAS1-EIWITTEN MET EEN RETROTRANSCRIPTASE-DOMEIN (RT-CAS1) BESCHREVEN. IN DE MARIENE BACTERIËN MARINOMONAS MEDITERRANEA IS EEN SYSTEEM III-B MET RT-CAS1 BESCHREVEN DAT DE VERWERVING VAN AFSTANDHOUDERS VAN RNA (SILAS ET AL. 2016, WETENSCHAP, V. 351, P. AAD4234). DE BIOLOGISCHE FUNCTIE VAN HET RETRONSCRIPCION PROCES IS ONBEKEND. _x000D_ _x000D_ de OBJECTIVE VAN DIT PROJECT is profundering in de CHARACTERISATIE VAN SYSTEMS MET RT-CAS1 EN UW PAPER in het DEFENSE FENT VOOR diverse TIPS VAN FAGOS, TANT VAN DNA AS OF RNA. BIJZONDERE AANDACHT ZAL WORDEN BESTEED AAN DE MOGELIJKE ROL ERVAN IN IMMUNITEIT TEGEN RNA-VIRUSSEN, AANGEZIEN DE INTERACTIE VAN CRISPR-CAS-SYSTEMEN MET FOGEN MET DIT SOORT GENETISCH MATERIAAL GROTENDEELS ONBEKEND IS. DE STUDIE OMVAT DE ANALYSE VAN DE ROL VAN EIWITTEN DIE IN OPERON CAS ZIJN GECODEERD IN DE INTERFERENTIE- EN AANPASSINGSFASEN. TEN SLOTTE ZAL DE INTERACTIE TUSSEN CRISPR-CAS-SYSTEMEN VAN VERSCHILLENDE SOORTEN DIE NAAST ELKAAR BESTAAN IN HETZELFDE MICRO-ORGANISME WORDEN ONDERZOCHT. EEN VAN DE ASPECTEN DIE IN AANMERKING WORDEN GENOMEN, IS DE STUDIE VAN DE MOGELIJKE DIFFERENTIËLE REGULERING VAN DE VERSCHILLENDE SOORTEN, DIE, AFHANKELIJK VAN DE FYSIOLOGISCHE OMSTANDIGHEDEN, COMPLEMENTAIRE RESISTENTIE TEGEN FOGEN ZOU KUNNEN OPLEVEREN. HET GEPRESENTEERDE PROJECT KAN EEN AANZIENLIJKE BIJDRAGE LEVEREN AAN DE UITBREIDING VAN DE KENNIS OVER DE FUNCTIONELE EN STRUCTURELE DIVERSITEIT VAN DE CRISPR-CAS-SYSTEMEN. DIT IS EEN VAN DE ONDERWERPEN DIE VANDAAG DE DAG HET MEEST WETENSCHAPPELIJK RELEVANT ZIJN VANWEGE DE ENORME IMPLICATIES ERVAN OP VERSCHILLENDE BIOMEDISCHE EN BIOTECHNOLOGISCHE GEBIEDEN. (Dutch)
17 December 2021
0 references
I VIRUS SONO GLI AGENTI BIOLOGICI PIÙ ABBONDANTI NELLA BIOSFERA. LA CONOSCENZA DELL'INTERAZIONE DI QUESTI AGENTI CON LE CELLULE CHE INFETTANO HA UN ENORME INTERESSE SCIENTIFICO SIA DI BASE CHE APPLICATO. PER PROTEGGERE CONTRO L'INFEZIONE DA VIRUS E ALTRI AGENTI INFETTIVI ESTERNI, I MICRORGANISMI HANNO SVILUPPATO MECCANISMI DIVERSI. NELLA MAGGIOR PARTE DELL'ARCHEA E QUASI IL 50 % DEI BATTERI, VENGONO RILEVATI SISTEMI CRISPR-CAS CHE CONFERISCONO L'IMMUNITÀ ADATTATIVA. CRISPR SI RIFERISCE A LOCI CONTENENTI BREVI SEQUENZE RIPETUTE CON CARATTERE PALINDROMICO CHE SONO SEPARATE DA FRAMMENTI NOTI COME DISTANZIATORI. I DISTANZIALI SONO ACQUISITI NELLA FASE DI ADATTAMENTO O IMMUNIZZAZIONE DA ELEMENTI GENETICI MOBILI ESTRANEI CHE COSTITUISCONO UNA MEMORIA DI INFEZIONI PRECEDENTI. LE PROTEINE CAS1 E CAS2, CODIFICATE DA GENI ADIACENTI AL LOCUS CRISPR, PARTECIPANO A QUESTA FASE DI IMMUNIZZAZIONE. LE SEQUENZE CRISPR SONO TRASCRITTE ED ELABORATE GENERANDO PICCOLI CRRNA (DA CRISPR-RNA). In un PASS DI INTERFERENZA posteriormente, IL COMPLEMENTARIO Crrn ad una secuzione DIANA NELL'ELEMENTO GENETICO EXTRANAL, dirigerà un CAS PROTEINS CON ATTIVITÀ Nucleasi che degraderà l'eco ELEMENTO._x000D_ _x000D_ QUESTO È DESCRIBIENING TUTTO HA MIGLIORE DIVERSITÀ DI SYSTEMS CRISPR. DA UNO DI QUESTI TIPI È STATA CARATTERIZZATA LA NUCLEASI CAS9. QUESTO È STATO ADATTATO PER L'EDIZIONE GENOMICA DI ORGANISMI SUPERIORI, CHE HA SIGNIFICATO UN'ENORME RIVOLUZIONE NELLE SCIENZE BIOMEDICHE. IL POTENZIALE BIOTECNOLOGICO CHE PUÒ DERIVARE DALLA CARATTERIZZAZIONE DI ULTERIORI TIPI DI SISTEMI CRISPR-CAS E DALLO STUDIO DEL LORO MECCANISMO D'AZIONE È ENORME. ALCUNI MICRORGANISMI HANNO DESCRITTO L'ESISTENZA DI PROTEINE CAS1 CON UN DOMINIO RETROTRANSCRIPTASE (RT-CAS1). NEI BATTERI MARINI MARINOMONAS MEDITERRANEA È STATO DESCRITTO UN SISTEMA III-B CON RT-CAS1 CHE PERMETTE L'ACQUISIZIONE DI DISTANZIATORI DA RNA (SILAS ET AL. 2016, SCIENZA, V. 351, P. AAD4234). LA FUNZIONE BIOLOGICA DEL PROCESSO RETRONSCRIPCION È SCONOSCIUTA. _x000D_ _x000D_ l'OBIETTIVO DI QUESTO PROGETTO sta finanziando nella CHARACTERISATION OF SYSTEMS CON RT-CAS1 E IL TUO PAPER NEL DEFENSE FENT to diversiPS of FAGOS, TANT OF DNA AS OF RNA. PARTICOLARE ATTENZIONE SARÀ PRESTATA AL SUO POSSIBILE RUOLO NELL'IMMUNITÀ CONTRO I VIRUS RNA POICHÉ L'INTERAZIONE DEI SISTEMI CRISPR-CAS CON FAGI CON QUESTO TIPO DI MATERIALE GENETICO È IN GRAN PARTE SCONOSCIUTA. LO STUDIO COMPRENDERÀ L'ANALISI DEL RUOLO DELLE PROTEINE CODIFICATE NELL'OPERONE CAS NELLE FASI DI INTERFERENZA E ADATTAMENTO. INFINE, SARÀ STUDIATA L'INTERAZIONE TRA SISTEMI CRISPR-CAS DI DIVERSI TIPI CHE COESISTONO NELLO STESSO MICRORGANISMO. TRA GLI ASPETTI CONSIDERATI VI È LO STUDIO DELLA POSSIBILE REGOLAZIONE DIFFERENZIALE DEI DIVERSI TIPI, CHE POTREBBE CONFERIRE UNA RESISTENZA COMPLEMENTARE AI FAGI A SECONDA DELLE CONDIZIONI FISIOLOGICHE. IL PROGETTO PRESENTATO PUÒ CONTRIBUIRE IN MODO SIGNIFICATIVO ALL'ESPANSIONE DELLE CONOSCENZE SULLA DIVERSITÀ FUNZIONALE E STRUTTURALE DEI SISTEMI CRISPR-CAS. QUESTO È UNO DEI TEMI DI MAGGIORE RILEVANZA SCIENTIFICA OGGI A CAUSA DELLE SUE ENORMI IMPLICAZIONI IN VARI CAMPI BIOMEDICI E BIOTECNOLOGICI. (Italian)
16 January 2022
0 references
VIIRUSED ON BIOSFÄÄRI KÕIGE RIKKAMAD BIOLOOGILISED ÜHENDID. TEADMISED NENDE KOOSMÕJUST RAKKUDEGA, MIDA NAD NAKATAVAD, ON VÄGA TEADUSLIKULT HUVITATUD NII BIOTEHNOLOOGIA PÕHI- KUI KA RAKENDUSLIKEST ASPEKTIDEST. MIKROORGANISMID ON VÄLJA TÖÖTANUD MITMESUGUSEID MEHHANISME, ET KAITSTA END VIIRUSINFEKTSIOONIDE EEST. ENAMIKUS ARHEAS JA PEAAEGU 50 % BAKTERITES ON VÕIMALIK AVASTADA CRISPR-CASI (KLASTRID, MIS ON REGULAARSELT VAHETATUD LÜHIKESED PALINDROMIC REPLIKS-CRISPRIGA SEOTUD GEENID) SÜSTEEME, MIS ANNAVAD ADAPTATIIVSE IMMUUNSUSE FAAGIINFEKTSIOONI VASTU. KORDUVAID JÄRJESTUSI ERALDAVAD LÜHIKESED FRAGMENDID, MIDA NIMETATAKSE VAHEDETAILIDEKS, MIS ON OMANDATUD VÄLISTE GENEETILISTE ELEMENTIDE, NÄITEKS FAAGIDE VÕI PLASMIIDIDE SISSETUNGIMISEL, NING SEEGA KUJUTAVAD NEED ENDAST VARASEMATE INFEKTSIOONIDE GENEETILIST MÄLU. SEDA KOHANEMIS- VÕI IMMUNISEERIMISFAASI VAHENDAVAD VALGUD CAS1 JA CAS2. EKSPRESSIOONIFAASIS TRANSKRIBEERITAKSE CRISPR LOCI JA TÖÖDELDAKSE GENEREERIVAT CRRNA-D. TEENUSE LÕPLIKES, KIRJALIKE KOHTUASI TÄHELEPANU, VÕTNUD KOHTUASI TEADMISEKS TÄHELEPANU VÕTNUD KASUTAMISE TEGEVUSLIKU TEADMISEKS KRISPR-CASi SÜSTEEMID SÜSTEEMID SÜSTEEMID SÜSTEEMID SÜSTEEMID INCREASINGIMINE SÜSTEEMID SÜSTEEMID SÜSTEEMID SÜSTEEMID SÜSTEEMID SÜSTEEMID SÜSTEEMID ÜHE TÜÜBI NUKLEAASI CAS9 ON KOHANDATUD KÕRGEMATE ORGANISMIDE GENOOMILISEKS VÄLJAANDEKS, MIS ON MÄÄRANUD BIOMEDITSIINIS REVOLUTSIOONI. UUDSETE CRISPR-CAS-SÜSTEEMIDE KIRJELDUSE JA MOLEKULAARSE ISELOOMUSTUSE BIOTEHNOLOOGILINE POTENTSIAAL ON TOHUTU. MITMED MIKROORGANISMID SISALDAVAD CRISPR-CAS-SÜSTEEME, MILLES VALK CAS1 SULATATAKSE RETROTRANSCRIPTASE DOMEENIKS (RT-CAS1). MEREBAKTER MARINOMONAS MEDITERRANEA SISALDAB III-B TÜÜPI SÜSTEEMI RT-CAS1-GA. SEE SÜSTEEM ON ESIMENE KIRJELDATUD VÕIMALIK OMANDADA TUGIPOSTID RNA (SILAS ET AL. 2016, SCIENCE, V. 351, P. AAD4234). SIISKI TULEB KINDLAKS MÄÄRATA RETROTRANKRIPTSIOONI PROTSESSI BIOLOOGILINE FUNKTSIOON. _x000D_ _x000D_ THIS PROJEKTI TÄHELEPANU VÕTNUD KRISPR SÜSTEEMID KASUTATAVAD TÄHELEPANU TÄHELEPANU. KOOSTOIME RNA VIIRUSTEGA ON UURINGU PEAMINE EESMÄRK, SEST VÄGA VÄHE ON TEADA CRISPR-CAS-SÜSTEEMIDE ROLLI KAITSES FAAGIDE EEST SEDA TÜÜPI GENOOMIDEGA. ANALÜÜSITAKSE KA RT-CAS1 OPEROONIDES KODEERITUD ERINEVATE CAS-VALKUDE ROLLI KOHANEMIS- JA SEGAMISPROTSESSIDES. LÕPUKS UURITAKSE CRISPR-CASI SÜSTEEMIDE KOOSTOIMET, MIS ON SAMA MIKROORGANISMI KOOSEKSISTEERIVAD ERI TÜÜPI. MUUDE ARVESSEVÕETAVATE ASPEKTIDE HULGAS LISATAKSE KÕNEALUSTE SÜSTEEMIDE VÄLJENDAMISE MÄÄRUSE ANALÜÜS. CRISPR-CASI SÜSTEEMIDE DIFERENTSEERITUD REGULEERIMINE VÕIB PAKKUDA TÄIENDAVAT KAITSET SÕLTUVALT FÜSIOLOOGILISTEST TINGIMUSTEST. SELLE PROJEKTI TULEMUSED VÕIVAD OLULISELT KAASA AIDATA CRISPR-CAS-SÜSTEEMIDE FUNKTSIONAALSE MITMEKESISUSE TUNDMISELE. SEE TEEMA ON PRAEGU ÜKS OLULISEMAID TEADUSLIKKE VALDKONDI, KUNA SELLEL ON TOHUTU MÕJU BIOMEDITSIINILE JA BIOTEHNOLOOGIALE. (Estonian)
4 August 2022
0 references
VIRUSAI YRA GAUSIAUSI BIOSFEROS BIOLOGINIAI SUBJEKTAI. ŽINIOS APIE JŲ SĄVEIKĄ SU LĄSTELĖMIS, KURIAS JIE UŽKREČIA, TURI DIDŽIULĮ MOKSLINĮ SUSIDOMĖJIMĄ TIEK PAGRINDINIAIS, TIEK TAIKOMAIS BIOTECHNOLOGIJOS ASPEKTAIS. MIKROORGANIZMAI SUKŪRĖ ĮVAIRIUS MECHANIZMUS, SKIRTUS APSISAUGOTI NUO VIRUSINIŲ INFEKCIJŲ. DAUGUMOJE ARCHEA IR BEVEIK 50 % BAKTERIJŲ GALIMA APTIKTI CRISPR-CAS (ĮRIŠTOS REGULIARIAI TARPUSAVYJE IŠSIDĖSČIUSIOS TRUMPŲJŲ PALINDROMINIŲ PALINDROMINIŲ PALINDROMINIŲ PALINDROMINIŲ KARTŲ SU CRISPR SUSIJUSIAIS GENAIS) SISTEMAS, KURIOS SUTEIKIA ADAPTACINĮ IMUNITETĄ FAGO INFEKCIJAI. PASIKARTOJANČIOS SEKOS YRA ATSKIRTOS TRUMPOMIS FRAGMENTAIS, PAVADINTAIS TARPIKLIAIS, KURIE GAUNAMI IŠ ĮSIVERŽIMO Į IŠORINIUS GENETINIUS ELEMENTUS, TOKIUS KAIP FAGAI AR PLAZMIDĖS, TODĖL SUDARO GENETINĘ ANKSTESNIŲ INFEKCIJŲ ATMINTĮ. ŠIĄ ADAPTACIJOS AR IMUNIZACIJOS FAZĘ LEMIA BALTYMAI CAS1 IR CAS2. IŠRAIŠKOS ETAPE CRISPR LOCI YRA TRANSKRIBUOJAMA IR APDOROJAMA GENERUOJANTI CRRNR. Svarbiausiose INTERFERENCIJOS POSĖDŽĖSe, kurios yra komplikacijos, susijusios su GENETINIO ELEMENTU, su nukleazės AKTIVITYJE, skirta tam, kad būtų galima įgyvendinti ELEMENTĄ. _x000D_ _x000D_ Yra CRISPR-CAS SYSTEMS DESCRIBED INCREASING DIVERSITY. VIENO IŠ ŠIŲ TIPŲ NUKLEAZĖ CAS9 BUVO PRITAIKYTA AUKŠTESNIŲJŲ ORGANIZMŲ GENOMINIAM LEIDIMUI, KAS LĖMĖ BIOMEDICINOS MOKSLŲ REVOLIUCIJĄ. NAUJŲ CRISPR-CAS SISTEMŲ APRAŠYMO IR MOLEKULINIO APIBŪDINIMO BIOTECHNOLOGINIS POTENCIALAS YRA MILŽINIŠKAS. KELIUOSE MIKROORGANIZMUOSE YRA CRISPR-CAS SISTEMŲ, KURIOSE BALTYMAS CAS1 LYDOMAS SU RETROTRANSCRIPTASE DOMENU (RT-CAS1). JŪRŲ BAKTERIJA MARINOMONAS MEDITERRANEA TURI III-B TIPO SISTEMĄ SU RT-CAS1. ŠI SISTEMA BUVO PIRMOJI APRAŠYTA, GALINTI ĮSIGYTI TARPIKLIUS IŠ RNR (SILAS ET AL. 2016 M., MOKSLAS, V. 351, P. AAD4234). TAČIAU VIS DAR REIKIA NUSTATYTI BIOLOGINĘ RETROTRAKRIPCIJOS PROCESO FUNKCIJĄ. _x000D_ _x000D_ Šių PROJEKTŲ KONTROLĖ ĮSIPAREIGOJA TIKSLAS KRIZROS SISTEMŲ su RT-CAS1 eilėje su RT-CAS1 DEFENSE AGAINS DIFFERENT TYPES. SĄVEIKA SU RNR VIRUSAIS BUS PAGRINDINIS TYRIMO TIKSLAS, NES LABAI MAŽAI ŽINOMA APIE CRISPR-CAS SISTEMŲ VAIDMENĮ APSAUGANT NUO FAGŲ SU TOKIO TIPO GENOMAIS. TAIP PAT BUS ANALIZUOJAMAS ĮVAIRIŲ OPERONUOSE SU RT-CAS1 UŽKODUOTŲ CAS BALTYMŲ VAIDMUO PRISITAIKYMO IR TRUKDYMO PROCESUOSE. GALIAUSIAI BUS IŠTIRTA SKIRTINGŲ TIPŲ CRISPR-CAS SISTEMŲ, ESANČIŲ TAME PAČIAME MIKROORGANIZME, SĄVEIKA. BE KITŲ SVARSTYTINŲ ASPEKTŲ, BUS ĮTRAUKTA ŠIŲ SISTEMŲ IŠRAIŠKOS REGLAMENTO ANALIZĖ. DIFERENCINIS CRISPR-CAS SYTEMŲ REGULIAVIMAS GALĖTŲ SUTEIKTI PAPILDOMĄ APSAUGĄ PRIKLAUSOMAI NUO FIZIOLOGINIŲ SĄLYGŲ. ŠIO PROJEKTO REZULTATAI GALĖTŲ LABAI PRISIDĖTI PRIE ŽINIŲ APIE CRISPR-CAS SISTEMŲ FUNKCINĘ ĮVAIROVĘ. ŠI TEMA ŠIUO METU YRA VIENA SVARBIAUSIŲ MOKSLO SRIČIŲ, NES JI DARO DIDŽIULĮ POVEIKĮ BIOMEDICINAI IR BIOTECHNOLOGIJOMS. (Lithuanian)
4 August 2022
0 references
VIRUSI SU NAJOBILNIJI BIOLOŠKI ENTITETI U BIOSFERI. POZNAVANJE NJIHOVE INTERAKCIJE SA STANICAMA KOJE ZARAĐUJU IMA OGROMAN ZNANSTVENI INTERES ZA OSNOVNE I PRIMIJENJENE ASPEKTE BIOTEHNOLOGIJE. MIKROORGANIZMI SU RAZVILI ŠIROK RASPON MEHANIZAMA KAKO BI SE ZAŠTITILI OD VIRUSNIH INFEKCIJA. U VEĆINI ARHEA I GOTOVO 50 % BAKTERIJA, MOGUĆE JE DETEKTIRATI CRISPR-CAS (CLUSTERED REDOVITO INTERSPACED SHORT PALINDROMIC REPEATS-CRISPR PRIDRUŽENI GENI) KOJI DAJU ADAPTATIVNI IMUNITET PROTIV INFEKCIJE FAGOM. PONAVLJANE SEKVENCE ODVAJAJU KRATKI FRAGMENTI NAZVANI RAZMAKNICI KOJI SE DOBIVAJU OD INVAZIJE VANJSKIH GENETSKIH ELEMENATA KAO ŠTO SU PHAGES ILI PLASMIDI I TAKO ČINE GENETSKO PAMĆENJE PRETHODNIH INFEKCIJA. OVA FAZA PRILAGODBE ILI IMUNIZACIJE POSREDOVANA JE PROTEINIMA CAS1 I CAS2. U FAZI EKSPRESIJE, CRISPR LOKCI SE TRANSKRIBIRAJU I OBRAĐUJU GENERIRAJUĆI CRRNA. U LAST PHASE OF INTERFERENCE, CRONA, KOJE JE UPRAVLJANJE GENETIC ELEMENTA, ĆE GUIDE CAS PROTEINA S nukleazom AKTIVNOSTI ZA DEGRADaciju tog ELEMENT-a._x000D_ _x000D_ to je INCREASING DIVERSITY CRISPR-CAS SYSTEMS DESCRIBED. NUKLEAZA CAS9 JEDNE OD TIH VRSTA PRILAGOĐENA JE GENOMSKOM IZDANJU VIŠIH ORGANIZAMA, ŠTO JE ODREĐIVALO REVOLUCIJU U BIOMEDICINSKIM ZNANOSTIMA. BIOTEHNOLOŠKI POTENCIJAL OPISA I MOLEKULARNE KARAKTERIZACIJE NOVIH CRISPR-CAS SUSTAVA JE OGROMAN. NEKOLIKO MIKROORGANIZAMA SADRŽI CRISPR-CAS SUSTAVE U KOJIMA SE PROTEIN CAS1 SPAJA S DOMENOM RETROTRANSCRIPTASE (RT-CAS1). MORSKA BAKTERIJA MARINOMONAS MEDITERRANEA SADRŽI SUSTAV TIPA III-B S RT-CAS1. OVAJ SUSTAV JE BIO PRVI OPISAN U MOGUĆNOSTI STEĆI RAZMAKNIKE OD RNA (SILAS ET AL. 2016., ZNANOST, V. 351, P. AAD4234). MEĐUTIM, TEK TREBA UTVRDITI BIOLOŠKU FUNKCIJU PROCESA RETROTRANKRIPCIJE. _x000D_ _x000D_ glavni GOAL ovog PROJEKT-a je da se igra u korijenu CRISPR SYSTEMS sa RT-CAS1 U DEFENSE AGAINS DIFFERENT TYPES of PHAGES. INTERAKCIJA S RNK VIRUSIMA BIT ĆE GLAVNI CILJ ISTRAŽIVANJA JER SE VRLO MALO ZNA O ULOZI CRISPR-CAS SUSTAVA U OBRANI OD FAGESA S OVOM VRSTOM GENOMA. ANALIZIRAT ĆE SE I ULOGA RAZLIČITIH CAS PROTEINA KODIRANIH U OPERONIMA S RT-CAS1 U PROCESIMA PRILAGODBE I INTERFERENCIJE. NAPOSLJETKU, PROUČAVAT ĆE SE INTERAKCIJA CRISPR-CAS SUSTAVA RAZLIČITIH VRSTA KOJI POSTOJE U ISTOM MIKROORGANIZMU. MEĐU OSTALIM ASPEKTIMA KOJE TREBA RAZMOTRITI UKLJUČIT ĆE SE I ANALIZA UREDBE O IZRAŽAVANJU TIH SUSTAVA. DIFERENCIJALNA REGULACIJA CRISPR-CAS SITEMA MOGLA BI PONUDITI KOMPLEMENTARNU OBRANU OVISNO O FIZIOLOŠKIM UVJETIMA. REZULTATI OVOG PROJEKTA MOGLI BI ZNATNO DOPRINIJETI POZNAVANJU FUNKCIONALNE RAZNOLIKOSTI SUSTAVA CRISPR-CAS. TA JE TEMA TRENUTAČNO JEDNO OD NAJVAŽNIJIH PODRUČJA ZNANOSTI ZBOG VELIKOG UTJECAJA NA BIOMEDICINU I BIOTEHNOLOGIJU. (Croatian)
4 August 2022
0 references
ΟΙ ΙΟΊ ΕΊΝΑΙ ΟΙ ΠΙΟ ΆΦΘΟΝΕΣ ΒΙΟΛΟΓΙΚΈΣ ΟΝΤΌΤΗΤΕΣ ΣΤΗ ΒΙΌΣΦΑΙΡΑ. Η ΓΝΏΣΗ ΤΗΣ ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΉΣ ΤΟΥΣ ΜΕ ΤΑ ΚΎΤΤΑΡΑ ΠΟΥ ΜΟΛΎΝΟΥΝ ΈΧΕΙ ΤΕΡΆΣΤΙΟ ΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΌ ΕΝΔΙΑΦΈΡΟΝ ΤΌΣΟ ΓΙΑ ΤΙΣ ΒΑΣΙΚΈΣ ΌΣΟ ΚΑΙ ΓΙΑ ΤΙΣ ΕΦΑΡΜΟΣΜΈΝΕΣ ΠΤΥΧΈΣ ΤΗΣ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΊΑΣ. ΟΙ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΟΊ ΈΧΟΥΝ ΑΝΑΠΤΎΞΕΙ ΈΝΑ ΕΥΡΎ ΦΆΣΜΑ ΜΗΧΑΝΙΣΜΏΝ ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΡΟΣΤΑΣΊΑ ΤΟΥΣ ΑΠΌ ΙΟΓΕΝΕΊΣ ΛΟΙΜΏΞΕΙΣ. ΣΤΑ ΠΕΡΙΣΣΌΤΕΡΑ ΑΠΌ ΤΑ ΑΡΧΑΊΑ ΚΑΙ ΣΧΕΔΌΝ ΤΟ 50 % ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΊΩΝ, ΕΊΝΑΙ ΔΥΝΑΤΉ Η ΑΝΊΧΝΕΥΣΗ ΣΥΣΤΗΜΆΤΩΝ CRISPR-CAS (ΣΥΣΣΩΡΕΥΜΈΝΩΝ ΤΑΚΤΙΚΆ ΔΙΑΚΕΚΕΜΈΝΩΝ ΣΎΝΤΟΜΩΝ ΠΑΛΙΝΔΡΟΜΙΚΏΝ ΕΠΑΝΑΛΉΨΕΩΝ — ΓΟΝΙΔΊΩΝ ΠΟΥ ΣΧΕΤΊΖΟΝΤΑΙ ΜΕ ΤΟ CRISPR) ΠΟΥ ΠΡΟΣΔΊΔΟΥΝ ΠΡΟΣΑΡΜΟΣΤΙΚΉ ΑΝΟΣΊΑ ΈΝΑΝΤΙ ΤΗΣ ΛΟΊΜΩΞΗΣ ΑΠΌ ΤΟ ΦΑΓΚΆΖ. ΟΙ ΕΠΑΝΑΛΑΜΒΑΝΌΜΕΝΕΣ ΑΛΛΗΛΟΥΧΊΕΣ ΔΙΑΧΩΡΊΖΟΝΤΑΙ ΜΕ ΜΙΚΡΆ ΘΡΑΎΣΜΑΤΑ ΠΟΥ ΟΝΟΜΆΖΟΝΤΑΙ ΑΠΟΣΤΆΤΕΣ, ΤΑ ΟΠΟΊΑ ΑΠΟΚΤΏΝΤΑΙ ΑΠΌ ΤΗΝ ΕΙΣΒΟΛΉ ΕΞΩΤΕΡΙΚΏΝ ΓΕΝΕΤΙΚΏΝ ΣΤΟΙΧΕΊΩΝ, ΌΠΩΣ ΟΙ ΦΆΓΟΙ Ή ΤΑ ΠΛΑΣΜΊΔΙΑ, ΚΑΙ ΈΤΣΙ ΑΠΟΤΕΛΟΎΝ ΓΕΝΕΤΙΚΉ ΜΝΉΜΗ ΠΡΟΗΓΟΎΜΕΝΩΝ ΛΟΙΜΏΞΕΩΝ. ΑΥΤΉ Η ΦΆΣΗ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉΣ Ή ΑΝΟΣΟΠΟΊΗΣΗΣ ΔΙΑΜΕΣΟΛΑΒΕΊΤΑΙ ΑΠΌ ΤΙΣ ΠΡΩΤΕΪ́ΝΕΣ CAS1 ΚΑΙ CAS2. ΣΤΗ ΦΆΣΗ ΈΚΦΡΑΣΗΣ, ΟΙ ΤΌΠΟΙ CRISPR ΜΕΤΑΓΡΆΦΟΝΤΑΙ ΚΑΙ ΥΠΟΒΆΛΛΟΝΤΑΙ ΣΕ ΕΠΕΞΕΡΓΑΣΊΑ ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΑΡΑΓΩΓΉ CRRNA. Στην τελευταία φάση της διαδραστικότητας, το crRNA, όπου συμπληρώνεται με το ΕΠΕΝΔΥΤΙΚΟ ΓΕΝΕΤΙΚΟ ΣΗΜΕΙΩΜΑ, θα δώσει ΠΡΩΤΕΙΝΕΣ ΥΠΟΘΕΣΕΙΣ ΜΕ ΔΡΑΣΤΗΡΙΟΤΗΤΕΣ νουκλεάσης ΓΙΑ ΤΗΝ ΑΝΑΠΤΥΞΗ ΤΩΝ ΣΥΣΤΗΜΑΤΩΝ ΤΟΥ ELEMENT._x000D__x000D_ _x000D_ ΥΠΕΝΘΥΜΙΖΕΙ τη ΔΙΕΥΘΥΝΣΗ ΤΩΝ ΣΥΣΤΗΜΑΤΩΝ CRISPR-CAS που περιγράφονται. Η ΝΟΥΚΛΕΆΣΗ CAS9 ΕΝΌΣ ΑΠΌ ΑΥΤΟΎΣ ΤΟΥΣ ΤΎΠΟΥΣ ΈΧΕΙ ΠΡΟΣΑΡΜΟΣΤΕΊ ΓΙΑ ΤΗ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΉ ΈΚΔΟΣΗ ΤΩΝ ΑΝΏΤΕΡΩΝ ΟΡΓΑΝΙΣΜΏΝ, ΑΥΤΌ ΠΟΥ ΈΧΕΙ ΚΑΘΟΡΊΣΕΙ ΜΙΑ ΕΠΑΝΆΣΤΑΣΗ ΣΤΙΣ ΒΙΟΪΑΤΡΙΚΈΣ ΕΠΙΣΤΉΜΕΣ. ΤΟ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΌ ΔΥΝΑΜΙΚΌ ΤΗΣ ΠΕΡΙΓΡΑΦΉΣ ΚΑΙ ΤΟΥ ΜΟΡΙΑΚΟΎ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΜΟΎ ΤΩΝ ΝΈΩΝ ΣΥΣΤΗΜΆΤΩΝ CRISPR-CAS ΕΊΝΑΙ ΤΕΡΆΣΤΙΟ. ΑΡΚΕΤΟΊ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΟΊ ΠΕΡΙΈΧΟΥΝ ΣΥΣΤΉΜΑΤΑ CRISPR-CAS ΣΤΑ ΟΠΟΊΑ Η ΠΡΩΤΕΪ́ΝΗ CAS1 ΣΥΝΤΉΚΕΤΑΙ ΣΕ ΈΝΑΝ ΤΟΜΈΑ RETROTRANSCRIPTASE (RT-CAS1). ΤΟ ΘΑΛΆΣΣΙΟ ΒΑΚΤΉΡΙΟ MARINOMONAS MEDITERRANEA ΠΕΡΙΈΧΕΙ ΈΝΑ ΣΎΣΤΗΜΑ ΤΎΠΟΥ III-B ΜΕ RT-CAS1. ΑΥΤΌ ΤΟ ΣΎΣΤΗΜΑ ΉΤΑΝ ΤΟ ΠΡΏΤΟ ΠΟΥ ΠΕΡΙΓΡΆΦΕΤΑΙ ΙΚΑΝΌ ΝΑ ΑΠΟΚΤΉΣΕΙ ΑΠΟΣΤΆΤΕΣ ΑΠΌ RNA (SILAS ET AL. 2016, ΕΠΙΣΤΉΜΗ, V. 351, P. AAD4234). ΩΣΤΌΣΟ, ΑΠΟΜΈΝΕΙ ΝΑ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΤΕΊ Η ΒΙΟΛΟΓΙΚΉ ΛΕΙΤΟΥΡΓΊΑ ΤΗΣ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΑΣ ΤΗΣ ΟΠΙΣΘΟΓΡΑΦΉΣΕΩΣ. _x000D_ _x000D_ η Κύρια κυβέρνηση αυτού του έργου είναι να ΑΝΟΙΧΘΕΙ ΤΟ ΡΟΛΟ ΤΩΝ ΣΥΣΤΗΜΑΤΩΝ CRISPR ΜΕ RT-CAS1 ΣΤΙΣ ΔΙΑΦΟΡΕΣ ΤΥΠΟΥΣ ΦΑΡΜΑΚΕΥΤΙΚΩΝ ΤΥΠΩΝ ΔΙΑΦΟΡΩΝ ΤΥΠΩΝ ΦΑΡΩΝ. Η ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ ΜΕ ΤΟΥΣ ΙΟΎΣ RNA ΘΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΕΙ ΚΎΡΙΟ ΣΤΌΧΟ ΤΗΣ ΜΕΛΈΤΗΣ, ΔΕΔΟΜΈΝΟΥ ΌΤΙ ΕΛΆΧΙΣΤΑ ΕΊΝΑΙ ΓΝΩΣΤΆ ΓΙΑ ΤΟ ΡΌΛΟ ΤΩΝ ΣΥΣΤΗΜΆΤΩΝ CRISPR-CAS ΣΤΗΝ ΆΜΥΝΑ ΚΑΤΆ ΤΩΝ ΦΑΓΏΝ ΜΕ ΑΥΤΌΝ ΤΟΝ ΤΎΠΟ ΓΟΝΙΔΙΩΜΆΤΩΝ. ΘΑ ΑΝΑΛΥΘΕΊ ΕΠΊΣΗΣ Ο ΡΌΛΟΣ ΤΩΝ ΔΙΑΦΌΡΩΝ ΠΡΩΤΕΪΝΏΝ CAS ΠΟΥ ΚΩΔΙΚΟΠΟΙΟΎΝΤΑΙ ΣΤΑ ΟΠΕΡΌΝΙΑ ΜΕ RT-CAS1 ΣΤΙΣ ΔΙΑΔΙΚΑΣΊΕΣ ΠΡΟΣΑΡΜΟΓΉΣ ΚΑΙ ΠΑΡΕΜΒΟΛΉΣ. ΤΈΛΟΣ, ΘΑ ΜΕΛΕΤΗΘΕΊ Η ΑΛΛΗΛΕΠΊΔΡΑΣΗ ΤΩΝ ΣΥΣΤΗΜΆΤΩΝ CRISPR-CAS ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΏΝ ΤΎΠΩΝ ΠΟΥ ΣΥΝΥΠΆΡΧΟΥΝ ΣΤΟΝ ΊΔΙΟ ΜΙΚΡΟΟΡΓΑΝΙΣΜΌ. ΜΕΤΑΞΎ ΆΛΛΩΝ ΠΤΥΧΏΝ ΠΟΥ ΠΡΈΠΕΙ ΝΑ ΕΞΕΤΑΣΤΟΎΝ, ΘΑ ΣΥΜΠΕΡΙΛΗΦΘΕΊ Η ΑΝΆΛΥΣΗ ΤΟΥ ΚΑΝΟΝΙΣΜΟΎ ΣΧΕΤΙΚΆ ΜΕ ΤΗΝ ΈΚΦΡΑΣΗ ΤΩΝ ΕΝ ΛΌΓΩ ΣΥΣΤΗΜΆΤΩΝ. ΜΙΑ ΔΙΑΦΟΡΙΚΉ ΡΎΘΜΙΣΗ ΤΩΝ ΣΥΣΤΗΜΆΤΩΝ CRISPR-CAS ΘΑ ΜΠΟΡΟΎΣΕ ΝΑ ΠΡΟΣΦΈΡΕΙ ΣΥΜΠΛΗΡΩΜΑΤΙΚΈΣ ΆΜΥΝΕΣ ΑΝΆΛΟΓΑ ΜΕ ΤΙΣ ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΚΈΣ ΣΥΝΘΉΚΕΣ. ΤΑ ΑΠΟΤΕΛΈΣΜΑΤΑ ΑΥΤΟΎ ΤΟΥ ΈΡΓΟΥ ΘΑ ΜΠΟΡΟΎΣΑΝ ΝΑ ΣΥΜΒΆΛΟΥΝ ΣΗΜΑΝΤΙΚΆ ΣΤΗ ΓΝΏΣΗ ΤΗΣ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΚΉΣ ΠΟΙΚΙΛΟΜΟΡΦΊΑΣ ΤΩΝ ΣΥΣΤΗΜΆΤΩΝ CRISPR-CAS. ΤΟ ΘΈΜΑ ΑΥΤΌ ΑΠΟΤΕΛΕΊ ΕΠΊ ΤΟΥ ΠΑΡΌΝΤΟΣ ΈΝΑ ΑΠΌ ΤΑ ΣΗΜΑΝΤΙΚΌΤΕΡΑ ΕΠΙΣΤΗΜΟΝΙΚΆ ΠΕΔΊΑ ΛΌΓΩ ΤΟΥ ΤΕΡΆΣΤΙΟΥ ΑΝΤΊΚΤΥΠΟΥ ΣΤΗ ΒΙΟΪΑΤΡΙΚΉ ΚΑΙ ΤΗ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΊΑ. (Greek)
4 August 2022
0 references
VÍRUSY SÚ NAJROZŠÍRENEJŠÍMI BIOLOGICKÝMI ENTITAMI V BIOSFÉRE. POZNATKY O ICH INTERAKCII S BUNKAMI, KTORÉ INFIKUJÚ, MAJÚ OBROVSKÝ VEDECKÝ ZÁUJEM O ZÁKLADNÉ AJ APLIKOVANÉ ASPEKTY BIOTECHNOLÓGIE. MIKROORGANIZMY VYVINULI ŠIROKÚ ŠKÁLU MECHANIZMOV NA OCHRANU PRED VÍRUSOVÝMI INFEKCIAMI. VO VÄČŠINE ARCHEA A TAKMER 50 % BAKTÉRIÍ JE MOŽNÉ DETEKOVAŤ SYSTÉMY CRISPR-CAS (ZOSKUPENÉ PRAVIDELNE PREVIAZANÉ KRÁTKE PALINDROMIC OPAKUJE-CRISPR GÉNY), KTORÉ POSKYTUJÚ ADAPTATÍVNU IMUNITU PROTI FÁGOVEJ INFEKCII. OPAKOVANÉ SEKVENCIE SÚ ODDELENÉ KRÁTKYMI FRAGMENTMI NAZÝVANÝMI ROZPERY, KTORÉ SA ZÍSKAVAJÚ Z NAPADNUTIA VONKAJŠÍCH GENETICKÝCH PRVKOV, AKO SÚ FÁGY ALEBO PLAZMIDY, A TAK PREDSTAVUJÚ GENETICKÚ PAMÄŤ PREDCHÁDZAJÚCICH INFEKCIÍ. TÁTO ADAPTAČNÁ ALEBO IMUNIZAČNÁ FÁZA JE SPROSTREDKOVANÁ PROTEÍNMI CAS1 A CAS2. VO FÁZE EXPRESIE SA LOCI CRISPR PREPISUJÚ A SPRACÚVAJÚ GENERUJÚCI CRRNA. V LAST FHASE OF INTERFERENCE, KTORÉ JE SPOLOČNOSŤ K VYZÝVAJÚcej GENETICKEJ ÚČINNOSTI, POUŽÍVAJÚ CAS PROTEINY s aktivitou nukleázy na riešenie tohto problému._x000D_ _x000D_ NUKLEÁZA CAS9 JEDNÉHO Z TÝCHTO TYPOV BOLA UPRAVENÁ PRE GENÓMOVÉ VYDANIE VYŠŠÍCH ORGANIZMOV, ČO URČILO REVOLÚCIU V BIOMEDICÍNSKYCH VEDÁCH. BIOTECHNOLOGICKÝ POTENCIÁL OPISU A MOLEKULÁRNEJ CHARAKTERIZÁCIE NOVÝCH SYSTÉMOV CRISPR-CAS JE OBROVSKÝ. NIEKOĽKO MIKROORGANIZMOV OBSAHUJE CRISPR-CAS SYSTÉMY, V KTORÝCH SA PROTEÍN CAS1 ZLÚČI DO DOMÉNY RETROTRANSCRIPTASE (RT-CAS1). MORSKÁ BAKTÉRIA MARINOMONAS MEDITERRANEA OBSAHUJE SYSTÉM TYPU III-B S RT-CAS1. TENTO SYSTÉM BOL PRVÝM OPÍSANÝM SYSTÉMOM SCHOPNÝM ZÍSKAŤ ROZPERY OD RNA (SILAS ET AL. 2016, VEDA, V. 351, P. AAD4234). JE VŠAK POTREBNÉ URČIŤ BIOLOGICKÚ FUNKCIU PROCESU RETROTRANSKRIPCIE. _x000D_ _x000D_ MAIN GOAL OF THIS PROJEKT JE NA VYHLÁSENIE INSIGHTNÉHO SYSTÉMU s RT-CAS1 v DEFENSE AGAINS DIFFERENTOVÝCH TYPES PHAGES. INTERAKCIA S VÍRUSMI RNA BUDE HLAVNÝM CIEĽOM ŠTÚDIE, PRETOŽE VEĽMI MÁLO JE ZNÁME O ÚLOHE SYSTÉMOV CRISPR-CAS V OBRANE PROTI FÁGOM S TÝMTO TYPOM GENÓMOV. BUDE SA ANALYZOVAŤ AJ ÚLOHA RÔZNYCH PROTEÍNOV CAS KÓDOVANÝCH V OPERÓNOCH S RT-CAS1 V PROCESOCH ADAPTÁCIE A INTERFERENCIE. A NAPOKON SA BUDE SKÚMAŤ INTERAKCIA SYSTÉMOV CRISPR-CAS RÔZNYCH TYPOV KOEXISTUJÚCICH V TOM ISTOM MIKROORGANIZME. OKREM INÝCH ASPEKTOV, KTORÉ TREBA ZVÁŽIŤ, BUDE ZAHRNUTÁ AJ ANALÝZA NARIADENIA O VYJADRENÍ TÝCHTO SYSTÉMOV. DIFERENCIÁLNA REGULÁCIA SYSTÉMOV CRISPR-CAS BY MOHLA PONÚKNUŤ DOPLNKOVÚ OBRANU V ZÁVISLOSTI OD FYZIOLOGICKÝCH PODMIENOK. VÝSLEDKY TOHTO PROJEKTU BY MOHLI VÝZNAMNE PRISPIEŤ K POZNANIU FUNKČNEJ ROZMANITOSTI SYSTÉMOV CRISPR-CAS. TÁTO TÉMA JE V SÚČASNOSTI JEDNOU Z NAJDÔLEŽITEJŠÍCH VEDECKÝCH OBLASTÍ, PRETOŽE MÁ OBROVSKÝ VPLYV NA BIOMEDICÍNU A BIOTECHNOLÓGIU. (Slovak)
4 August 2022
0 references
VIRUKSET OVAT BIOSFÄÄRIN RUNSAIMPIA BIOLOGISIA ENTITEETTEJÄ. TIETO NIIDEN VUOROVAIKUTUKSESTA SOLUJEN KANSSA, ETTÄ NE SAASTUTTAVAT, ON VALTAVA TIETEELLINEN KIINNOSTUS SEKÄ PERUS- ETTÄ SOVELTAVA BIOTEKNIIKKA. MIKRO-ORGANISMIT OVAT KEHITTÄNEET MONENLAISIA MEKANISMEJA SUOJAUTUAKSEEN VIRUSINFEKTIOILTA. USEIMMISSA ARCHEASSA JA LÄHES 50 PROSENTISSA BAKTEEREISTA ON MAHDOLLISTA HAVAITA CRISPR-CAS-JÄRJESTELMÄ (KLUSTEROITU SÄÄNNÖLLISESTI INTERSEKTUOITUJA LYHYITÄ PALINDROMISIA TOISTOJA-CRISPR-JÄRJESTELMÄÄN LIITTYVIÄ GEENEJÄ), JOTKA ANTAVAT MUKAUTUVAN IMMUNITEETIN FAAGI-INFEKTIOTA VASTAAN. TOISTUVAT SEKVENSSIT EROTETAAN LYHYILLÄ VÄLILEVYILLÄ, JOTKA ON HANKITTU ULKOISISTA GENEETTISISTÄ ELEMENTEISTÄ, KUTEN FAAGEISTA TAI PLASMIDEISTA, JA MUODOSTAVAT SITEN AIEMPIEN INFEKTIOIDEN GENEETTISEN MUISTIN. TÄTÄ SOPEUTUMIS- TAI IMMUNISAATIOVAIHETTA VÄLITTÄVÄT PROTEIINIT CAS1 JA CAS2. ILMENTYMÄVAIHEESSA CRISPR LOCI TRANSKRIPTIOIDAAN JA PROSESSOIDAAN TUOTTAA CRRNA. INTERFERENCE: n LAST PHASE, KRNA, JÄLKEEN KOSKEVAT YHTEISÖN YHTEISÖN YHTEISTYÖN YHTEISTYÖN TUOTTEIDEN KÄYTTÄMINEN KÄYTTÄMINEN KÄYTTÄMINEN KÄYTTÖ._x000D_ _x000D_ SYSTEMS DESCRIBED ON TUOTTEET. NÄIDEN TYYPPIEN NUKLEAASI CAS9 ON MUKAUTETTU KORKEAMPIEN ORGANISMIEN GENOMIPAINOKSEEN, MIKÄ ON MÄÄRITTÄNYT VALLANKUMOUKSEN BIOLÄÄKETIETEELLISISSÄ TIETEISSÄ. UUSIEN CRISPR-CAS-JÄRJESTELMIEN KUVAUKSEN JA MOLEKYYLILUOKITTELUN BIOTEKNOLOGINEN POTENTIAALI ON VALTAVA. USEAT MIKRO-ORGANISMIT SISÄLTÄVÄT CRISPR-CAS-JÄRJESTELMIÄ, JOISSA PROTEIINI CAS1 SULATETAAN RETROTRANSCRIPTASE-TOIMIALAAN (RT-CAS1). MERIBAKTEERI MARINOMONAS MEDITERRANEA SISÄLTÄÄ TYYPIN III-B JÄRJESTELMÄN, JOSSA ON RT-CAS1. TÄMÄ JÄRJESTELMÄ ON OLLUT ENSIMMÄINEN KUVATTU PYSTYY HANKKIMAAN VÄLILEVYJÄ RNA (SILAS ET AL. 2016, TIEDE, V. 351, P. AAD4234). JÄLKIKÄTEISKOPIOINTIPROSESSIN BIOLOGINEN TEHTÄVÄ ON KUITENKIN VIELÄ MÄÄRITETTÄVÄ. _x000D_ _x000D_ MAIN GOAL of the this PROJECT is to GAIN INSIGHT INTO the ROLE OF CRISPR SYSTEMS WITH RT-CAS1 in the DEFENSE AGAINS DIFFERENT TYPES OF PHAGES. VUOROVAIKUTUS RNA-VIRUSTEN KANSSA ON TUTKIMUKSEN PÄÄTAVOITE, KOSKA HYVIN VÄHÄN TIEDETÄÄN CRISPR-CAS-JÄRJESTELMIEN ROOLISTA FAAGEJA VASTAAN TÄMÄN TYYPPISTEN GENOMIEN KANSSA. LISÄKSI ANALYSOIDAAN RT-CAS1:N OPERONEIHIN KOODATTUJEN ERI CAS-PROTEIINIEN ROOLIA SOPEUTUMIS- JA HÄIRIÖPROSESSEISSA. LISÄKSI TUTKITAAN ERITYYPPISTEN CRISPR-CAS-JÄRJESTELMIEN YHTEISVAIKUTUSTA SAMASSA MIKRO-ORGANISMISSA. MUIDEN HUOMIOON OTETTAVIEN NÄKÖKOHTIEN OHELLA OTETAAN HUOMIOON MYÖS ASETUKSEN ANALYYSI NÄIDEN JÄRJESTELMIEN ILMENTYMISESTÄ. CRISPR-CAS-JÄRJESTELMÄN ERIYTTÄMINEN VOISI TARJOTA TÄYDENTÄVIÄ PUOLUSTUSKEINOJA FYSIOLOGISISTA OLOSUHTEISTA RIIPPUEN. HANKKEEN TULOKSET VOISIVAT EDISTÄÄ MERKITTÄVÄSTI CRISPR-CAS-JÄRJESTELMIEN TOIMINNALLISEN MONIMUOTOISUUDEN TUNTEMUSTA. AIHE ON TÄLLÄ HETKELLÄ YKSI MERKITTÄVIMMISTÄ TIETEENALOISTA, KOSKA SILLÄ ON VALTAVA VAIKUTUS BIOLÄÄKETIETEESEEN JA BIOTEKNOLOGIAAN. (Finnish)
4 August 2022
0 references
WIRUSY SĄ NAJLICZNIEJSZYMI JEDNOSTKAMI BIOLOGICZNYMI W BIOSFERZE. WIEDZA NA TEMAT ICH INTERAKCJI Z KOMÓRKAMI, KTÓRE ZARAŻAJĄ, MA OGROMNE ZAINTERESOWANIE NAUKOWE ZARÓWNO PODSTAWOWYMI, JAK I STOSOWANYMI ASPEKTAMI BIOTECHNOLOGII. MIKROORGANIZMY OPRACOWAŁY SZEROKĄ GAMĘ MECHANIZMÓW CHRONIĄCYCH SIĘ PRZED INFEKCJAMI WIRUSOWYMI. W WIĘKSZOŚCI ARCHEA I PRAWIE 50 % BAKTERII MOŻLIWE JEST WYKRYCIE SYSTEMÓW CRISPR-CAS (KLASTEROWANYCH REGULARNIE MIĘDZYPRZESTRZENNYCH KRÓTKO PALINDROMICZNYCH POWTARZAJĄCYCH SIĘ GENÓW ZWIĄZANYCH Z CRISPR), KTÓRE NADAJĄ ODPORNOŚĆ ADAPTACYJNĄ NA INFEKCJE FAGAMI. POWTARZAJĄCE SIĘ SEKWENCJE SĄ ODDZIELONE KRÓTKIMI FRAGMENTAMI NAZWANYMI PRZEKŁADKAMI, KTÓRE SĄ NABYWANE Z INWAZJI ZEWNĘTRZNYCH ELEMENTÓW GENETYCZNYCH, TAKICH JAK FAGI LUB PLAZMIDY, I TYM SAMYM STANOWIĄ PAMIĘĆ GENETYCZNĄ POPRZEDNICH INFEKCJI. W TEJ FAZIE ADAPTACJI LUB UODPARNIANIA POŚREDNICZĄ BIAŁKA CAS1 I CAS2. W FAZIE EKSPRESJI LOCI CRISPR SĄ TRANSKRYPOWANE I PRZETWARZANE GENERUJĄC CRRNA. W LAST PHASE OF INTERFERENCE, THE crRNA, WHICH JEST COMPLEMENTARY DO INVADING GENETIC ELEMENT, Będą powiązać środki ochrony z nuklease ACTIVITY DLA DEGRADACJI TEGO ELEMENTU._x000D_ _x000D_ Istnieją INCREASING DIVERSITY CRISPR-CAS SYSTEMS DESCRIBED. NUKLEAZA CAS9 JEDNEGO Z TYCH TYPÓW ZOSTAŁA DOSTOSOWANA DO GENOMOWEJ EDYCJI WYŻSZYCH ORGANIZMÓW, CO OKREŚLIŁO REWOLUCJĘ W NAUKACH BIOMEDYCZNYCH. POTENCJAŁ BIOTECHNOLOGICZNY OPISU I CHARAKTERYSTYKI MOLEKULARNEJ NOWATORSKICH SYSTEMÓW CRISPR-CAS JEST OGROMNY. KILKA MIKROORGANIZMÓW ZAWIERA SYSTEMY CRISPR-CAS, W KTÓRYCH BIAŁKO CAS1 JEST ŁĄCZONE Z DOMENĄ RETROTRANSCRIPTASE (RT-CAS1). MORSKA BAKTERIA MARINOMONAS MEDITERRANEA ZAWIERA SYSTEM TYPU III-B Z RT-CAS1. SYSTEM TEN BYŁ PIERWSZYM OPISANYM W STANIE NABYĆ DYSTANSE OD RNA (SILAS ET AL. 2016, NAUKA, V. 351, P. AAD4234). NALEŻY JEDNAK OKREŚLIĆ BIOLOGICZNĄ FUNKCJĘ PROCESU RETROTRANSKRYPCJI. _x000D_ _x000D_ Główny ZŁOŚĆ TEGO PROJEKTU JEGO PROJEKTU JEST GAIN INSIGHT INTOLE OF CRISPR SYSTTEMS Z RT-CAS1 W DEFENSE AGAINS DIFFERENT TYPÓW PHAGÓW. INTERAKCJA Z WIRUSAMI RNA BĘDZIE GŁÓWNYM CELEM BADAŃ, PONIEWAŻ BARDZO NIEWIELE WIADOMO O ROLI SYSTEMÓW CRISPR-CAS W OBRONIE PRZED FAGAMI Z TEGO TYPU GENOMAMI. PRZEANALIZOWANA ZOSTANIE RÓWNIEŻ ROLA RÓŻNYCH BIAŁEK CAS ZAKODOWANYCH W OPERACH RT-CAS1 W PROCESACH ADAPTACJI I INTERFERENCJI. PONADTO ZBADANE ZOSTANĄ INTERAKCJE RÓŻNYCH TYPÓW SYSTEMÓW CRISPR-CAS WSPÓŁISTNIEJĄCYCH W TYM SAMYM MIKROORGANIZMIE. WŚRÓD INNYCH ASPEKTÓW, KTÓRE NALEŻY WZIĄĆ POD UWAGĘ, ZOSTANIE UWZGLĘDNIONA ANALIZA ROZPORZĄDZENIA DOTYCZĄCA EKSPRESJI TYCH SYSTEMÓW. REGULACJA RÓŻNICOWA SYTEMÓW CRISPR-CAS MOGŁABY OFEROWAĆ DODATKOWE ZABEZPIECZENIA W ZALEŻNOŚCI OD WARUNKÓW FIZJOLOGICZNYCH. WYNIKI TEGO PROJEKTU MOGŁYBY W ZNACZNYM STOPNIU PRZYCZYNIĆ SIĘ DO POZNANIA RÓŻNORODNOŚCI FUNKCJONALNEJ SYSTEMÓW CRISPR-CAS. TEMAT TEN JEST OBECNIE JEDNYM Z NAJISTOTNIEJSZYCH DZIEDZIN NAUKI NAUKOWEJ ZE WZGLĘDU NA OGROMNY WPŁYW NA BIOMEDYCYNĘ I BIOTECHNOLOGIĘ. (Polish)
4 August 2022
0 references
A VÍRUSOK A LEGBŐSÉGESEBB BIOLÓGIAI ENTITÁSOK A BIOSZFÉRÁBAN. AZ ÁLTALUK MEGFERTŐZÖTT SEJTEKKEL VALÓ KÖLCSÖNHATÁSUK ISMERETE ÓRIÁSI TUDOMÁNYOS ÉRDEKLŐDÉST MUTAT MIND A BIOTECHNOLÓGIA ALAPVETŐ, MIND AZ ALKALMAZOTT SZEMPONTJAI IRÁNT. A MIKROORGANIZMUSOK SOKFÉLE MECHANIZMUST FEJLESZTETTEK KI, HOGY MEGVÉDJÉK MAGUKAT A VÍRUSFERTŐZÉSEKTŐL. A LEGTÖBB ARCHEA-BAN ÉS A BAKTÉRIUMOK KÖZEL 50%-ÁBAN KIMUTATHATÓ A CRISPR-CAS (RENDSZERESEN INTERSZTERÁLT RÖVID PALINDROMIKUS ISMÉTLŐDÉSEK – CRISPR TÁRSÍTOTT GÉNEK) RENDSZEREK, AMELYEK ADAPTATÍV IMMUNITÁST BIZTOSÍTANAK A FÁGFERTŐZÉS ELLEN. AZ ISMÉTLŐDŐ SZEKVENCIÁKAT A TÁVTARTÓKNAK NEVEZETT RÖVID TÖREDÉKEK VÁLASZTJÁK EL, AMELYEK KÜLSŐ GENETIKAI ELEMEK, PÉLDÁUL FÁGOK VAGY PLAZMIDOK BEHATOLÁSÁBÓL SZÁRMAZNAK, ÉS ÍGY A KORÁBBI FERTŐZÉSEK GENETIKAI EMLÉKÉT KÉPEZIK. EZT AZ ADAPTÁCIÓS VAGY IMMUNIZÁCIÓS FÁZIST A CAS1 ÉS CAS2 FEHÉRJÉK KÖZVETÍTIK. A KIFEJEZÉS FÁZISÁBAN A CRISPR LOCI-T ÁTÍRJÁK ÉS FELDOLGOZZÁK, AMI CRRNS-T GENERÁL. Az INTERFERENCE LAST PHASE-jában, A crRNA, WHICH a GENETIC ELEMENTESÍTÉSÉNEK KÖVETKEZTETÉSÉNEK KÖVETKEZÉSÉNEK Nukleázs ACTIVITÁSA A CRISPR-CAS SYSTEMS DESCRIBITÁSA._x000D_ _x000D_ A CRISPR-CAS SYSTEMS DESCRIBITY INCREASING DIVERSITYA. AZ EGYIK ILYEN TÍPUSÚ NUKLEÁZ CAS9-ET A MAGASABB ORGANIZMUSOK GENOMIKUS KIADÁSÁHOZ IGAZÍTOTTÁK, AMI MEGHATÁROZTA AZ ORVOSBIOLÓGIAI TUDOMÁNYOK FORRADALMÁT. AZ ÚJ CRISPR-CAS RENDSZEREK LEÍRÁSÁBAN ÉS MOLEKULÁRIS JELLEMZÉSÉBEN REJLŐ BIOTECHNOLÓGIAI POTENCIÁL ÓRIÁSI. SZÁMOS MIKROORGANIZMUS TARTALMAZ OLYAN CRISPR-CAS RENDSZEREKET, AMELYEKBEN A CAS1 FEHÉRJE RETROTRANSCRIPTASE TARTOMÁNYBA (RT-CAS1) OLVAD. A MARINOMONAS MEDITERRANEA TENGERI BAKTÉRIUM III-B TÍPUSÚ, RT-CAS1-ES RENDSZERT TARTALMAZ. EZ VOLT AZ ELSŐ LEÍRT RENDSZER, AMELY KÉPES TÁVTARTÓKAT SZEREZNI AZ RNS-TŐL (SILAS ET AL. 2016, SCIENCE, V. 351, P. AAD4234). A VISSZASOROLÁS FOLYAMATÁNAK BIOLÓGIAI FUNKCIÓJÁT AZONBAN MÉG MEG KELL HATÁROZNI. _x000D_ _x000D_ A MAIN GOAL OF EZ PROJECT Az, hogy a KERESKEDELMI TÁMOGATÁSOK RÉSZÉBEN az RT-CAS1 AGAINS AGAINS DIFFERENT TYPES-ben. AZ RNS VÍRUSOKKAL VALÓ KÖLCSÖNHATÁS A VIZSGÁLAT FŐ CÉLJA LESZ, MIVEL NAGYON KEVESET TUDUNK A CRISPR-CAS RENDSZEREKNEK AZ ILYEN TÍPUSÚ GENOMOKKAL SZEMBENI VÉDEKEZÉSBEN BETÖLTÖTT SZEREPÉRŐL. AZ OPERONOKBAN RT-CAS1-GYEL KÓDOLT KÜLÖNBÖZŐ CAS-FEHÉRJÉK SZEREPÉT IS ELEMEZNI KELL AZ ADAPTÁCIÓS ÉS INTERFERENCIA FOLYAMATOKBAN. VÉGEZETÜL TANULMÁNYOZNI FOGJÁK AZ UGYANAZON MIKROORGANIZMUSBAN EGYIDEJŰLEG LÉTEZŐ KÜLÖNBÖZŐ TÍPUSÚ CRISPR-CAS RENDSZEREK KÖLCSÖNHATÁSÁT. A FIGYELEMBE VEENDŐ EGYÉB SZEMPONTOK KÖZÖTT SZEREPEL MAJD A RENDELET E RENDSZEREK KIFEJEZÉSÉRE VONATKOZÓ ELEMZÉSE IS. A CRISPR-CAS-RENDSZER DIFFERENCIÁLSZABÁLYAI KIEGÉSZÍTŐ VÉDELMET NYÚJTHATNAK A FIZIOLÓGIAI KÖRÜLMÉNYEKTŐL FÜGGŐEN. A PROJEKT EREDMÉNYEI JELENTŐSEN HOZZÁJÁRULHATNAK A CRISPR-CAS RENDSZEREK FUNKCIONÁLIS SOKFÉLESÉGÉVEL KAPCSOLATOS ISMERETEKHEZ. EZ A TÉMA JELENLEG AZ EGYIK LEGFONTOSABB TUDOMÁNYOS TERÜLET A BIOMEDICINÁRA ÉS A BIOTECHNOLÓGIÁRA GYAKOROLT JELENTŐS HATÁS MIATT. (Hungarian)
4 August 2022
0 references
VIRY JSOU NEJHOJNĚJŠÍ BIOLOGICKÉ BYTOSTI V BIOSFÉŘE. ZNALOST JEJICH INTERAKCE S BUŇKAMI, KTERÉ INFIKUJÍ, MÁ OBROVSKÝ VĚDECKÝ ZÁJEM O ZÁKLADNÍ I APLIKOVANÉ ASPEKTY BIOTECHNOLOGIE. MIKROORGANISMY VYVINULY ŠIROKOU ŠKÁLU MECHANISMŮ NA OCHRANU PŘED VIROVÝMI INFEKCEMI. VE VĚTŠINĚ ARCHEA A TÉMĚŘ 50 % BAKTERIÍ JE MOŽNÉ DETEKOVAT SYSTÉMY CRISPR-CAS (KLASTROVANÉ PRAVIDELNĚ MEZIPROSTOROVÉ KRÁTKÉ PALINDROMICKÉ OPAKOVÁNÍ – CRISPR SPOJENÉ GENY), KTERÉ POSKYTUJÍ ADAPTATIVNÍ IMUNITU PROTI FÁGOVÉ INFEKCI. OPAKOVANÉ SEKVENCE JSOU ODDĚLENY KRÁTKÝMI FRAGMENTY POJMENOVANÝMI DISTANČNÍMI DISTANČNÍMI PRVKY, KTERÉ JSOU ZÍSKÁNY Z NAPADNUTÍ VNĚJŠÍCH GENETICKÝCH PRVKŮ, JAKO JSOU FÁGY NEBO PLASMIDY, A PŘEDSTAVUJÍ TAK GENETICKOU PAMĚŤ PŘEDCHOZÍCH INFEKCÍ. TATO ADAPTAČNÍ NEBO IMUNIZAČNÍ FÁZE JE ZPROSTŘEDKOVÁVÁNA PROTEINY CAS1 A CAS2. VE FÁZI EXPRESE JSOU LOCI CRISPR PŘEPISOVÁNY A ZPRACOVÁNY GENEROVÁNÍM CRRNA. V poslední fázi INTERFERENCE, crRNA, KTERÉ JE KONLEMENTY NA VYBÍZENÍ GENETICKÉHO ELEMENTU, VYBÍZÍ CAS PROTEINS s nukleázou ACTIVITY pro DEGRADATION tohoto ELEMENT._x000D_ _x000D_ Tam je ZAŘÍZENÍ ŽIVOTNÍCH SYSTÉMŮ CRISPR-CAS DESCRIBIBED. NUKLEÁZA CAS9 JEDNOHO Z TĚCHTO TYPŮ BYLA PŘIZPŮSOBENA PRO GENOMICKOU EDICI VYŠŠÍCH ORGANISMŮ, COŽ URČUJE REVOLUCI V BIOMEDICÍNSKÝCH VĚDÁCH. BIOTECHNOLOGICKÝ POTENCIÁL POPISU A MOLEKULÁRNÍ CHARAKTERIZACE NOVÝCH SYSTÉMŮ CRISPR-CAS JE OBROVSKÝ. NĚKOLIK MIKROORGANISMŮ OBSAHUJE SYSTÉMY CRISPR-CAS, VE KTERÝCH JE PROTEIN CAS1 SPOJENÝ S DOMÉNOU RETROTRANSCRIPTASE (RT-CAS1). MOŘSKÁ BAKTERIE MARINOMONAS MEDITERRANEA OBSAHUJE SYSTÉM TYPU III-B S RT-CAS1. TENTO SYSTÉM BYL POPSÁN JAKO PRVNÍ, KTERÝ BYL SCHOPEN ZÍSKAT DISTANČNÍ ODDĚLOVAČE OD RNA (SILAS ET AL. 2016, VĚDA, V. 351, P. AAD4234). JE VŠAK TŘEBA URČIT BIOLOGICKOU FUNKCI PROCESU ZPĚTNÉHO PŘEPISU. _x000D_ _x000D_ MAIN GOAL OF THIS PROJECT je v rozporu s rohy CRISPR SYSTÉMŮ s RT-CAS1 v DEFENSE AGAINS DIFFERENT TYPES PHAGES. INTERAKCE S VIRY RNA BUDE HLAVNÍM CÍLEM STUDIE, PROTOŽE O ÚLOZE SYSTÉMŮ CRISPR-CAS V OBRANĚ PROTI FÁGŮM S TÍMTO TYPEM GENOMŮ JE ZNÁMO JEN VELMI MÁLO. ROVNĚŽ BUDE ANALYZOVÁNA ÚLOHA RŮZNÝCH PROTEINŮ CAS ZAKÓDOVANÝCH V OPERONECH S RT-CAS1 V PROCESECH ADAPTACE A INTERFERENCE. V NEPOSLEDNÍ ŘADĚ BUDE ZKOUMÁNA INTERAKCE SYSTÉMŮ CRISPR-CAS RŮZNÝCH TYPŮ SOUBĚŽNĚ EXISTUJÍCÍCH U TÉHOŽ MIKROORGANISMU. MEZI DALŠÍ ASPEKTY, KTERÉ JE TŘEBA VZÍT V ÚVAHU, BUDE ZAHRNUTA ANALÝZA NAŘÍZENÍ O VYJÁDŘENÍ TĚCHTO SYSTÉMŮ. DIFERENCIÁLNÍ REGULACE SYTEMŮ CRISPR-CAS BY MOHLA NABÍDNOUT DOPLŇKOVOU OBRANU V ZÁVISLOSTI NA FYZIOLOGICKÝCH PODMÍNKÁCH. VÝSLEDKY TOHOTO PROJEKTU BY MOHLY VÝZNAMNĚ PŘISPĚT K POZNÁNÍ FUNKČNÍ ROZMANITOSTI SYSTÉMŮ CRISPR-CAS. TOTO TÉMA JE V SOUČASNÉ DOBĚ JEDNÍM Z NEJDŮLEŽITĚJŠÍCH VĚDECKÝCH OBORŮ VZHLEDEM K OBROVSKÉMU DOPADU NA BIOMEDICÍNU A BIOTECHNOLOGII. (Czech)
4 August 2022
0 references
VĪRUSI IR VISBAGĀTĀKĀS BIOLOĢISKĀS VIENĪBAS BIOSFĒRĀ. ZINĀŠANĀM PAR TO MIJIEDARBĪBU AR INFICĒTAJĀM ŠŪNĀM IR MILZĪGA ZINĀTNISKA INTERESE GAN PAR BIOTEHNOLOĢIJAS PAMATA, GAN LIETIŠĶAJIEM ASPEKTIEM. MIKROORGANISMI IR IZSTRĀDĀJUŠI PLAŠU MEHĀNISMU KLĀSTU, LAI PASARGĀTU SEVI NO VĪRUSU INFEKCIJĀM. LIELĀKAJĀ DAĻĀ ARCHEA UN GANDRĪZ 50 % BAKTĒRIJU IR IESPĒJAMS NOTEIKT CRISPR-CAS (KAS REGULĀRI SAGRUPĒTAS ĪSOS PALINDROMISKOS AR CRISPR SAISTĪTOS GĒNUS) SISTĒMAS, KAS PIEŠĶIR ADAPTATĪVU IMUNITĀTI PRET FĀGU INFEKCIJU. ATKĀRTOTĀS SEKVENCES ATDALA AR ĪSIEM FRAGMENTIEM, KO SAUC PAR STARPLIKAS UN KAS IEGŪTI NO IEBRUKUMA ĀRĒJOS ĢENĒTISKOS ELEMENTUS, PIEMĒRAM, FĀGI VAI PLAZMĪDAS, UN TĀDĒJĀDI VEIDO ĢENĒTISKO ATMIŅU PAR IEPRIEKŠĒJĀM INFEKCIJĀM. ŠO ADAPTĀCIJAS VAI IMUNIZĀCIJAS FĀZI MEDIĒ PROTEĪNI CAS1 UN CAS2. EKSPRESIJAS POSMĀ CRISPR LOCI TIEK PĀRRAKSTĪTS UN APSTRĀDĀTS, RADOT CRRNS. INTERFERENCE, KAS PIEDĀVĀJUMS, KAS KONKURĒTSPĒJAS GENETIKAS ELEMENTS, VĒRTĪBAS KAS PROTEINĀJUMI ar kodola Aktivitātes Aktīvu._x000D_ _x000D_ _x000D_ TUR IR INCREASING DIVERSITY OF CRISPR-CAS SYSTEMS DESCRIBED. VIENA NO ŠIEM TIPIEM NUKLEĀZE CAS9 IR PIELĀGOTA AUGSTĀKU ORGANISMU GENOMISKAJAM IZDEVUMAM, KAS IR NOTEICIS REVOLŪCIJU BIOMEDICĪNAS ZINĀTNĒS. JAUNO CRISPR-CAS SISTĒMU APRAKSTA UN MOLEKULĀRĀ RAKSTUROJUMA BIOTEHNOLOĢISKAIS POTENCIĀLS IR MILZĪGS. VAIRĀKI MIKROORGANISMI SATUR CRISPR-CAS SISTĒMAS, KURĀS PROTEĪNU CAS1 PIEVIENO RETROTRANSCRIPTASE DOMĒNAM (RT-CAS1). JŪRAS BAKTĒRIJA MARINOMONAS MEDITERRANEA SATUR III-B TIPA SISTĒMU AR RT-CAS1. ŠĪ SISTĒMA IR PIRMĀ APRAKSTĪTĀ SPĒJ IEGŪT STARPLIKAS NO RNA (SILAS ET AL. 2016. GADS, ZINĀTNE, V. 351, P. AAD4234). TOMĒR VĒL JĀNOSAKA RETROTRANSKRIPCIJAS PROCESA BIOLOĢISKĀ FUNKCIJA. _x000D_ _x000D_ šo prakšu galveno DALĪVU IZMANTOŠANU KRISPRIJAS SISTĒMAS ar RT-CAS1 DEFENSE AGAINS DIFFERENT TYPES PHAGES. MIJIEDARBĪBA AR RNS VĪRUSIEM BŪS GALVENAIS PĒTĪJUMA MĒRĶIS, JO ĻOTI MAZ IR ZINĀMS PAR CRISPR-CAS SISTĒMU LOMU AIZSARDZĪBĀ PRET FĀGIEM AR ŠĀDA VEIDA GENOMIEM. TIKS ANALIZĒTA ARĪ DAŽĀDO CAS PROTEĪNU, KAS KODĒTI RT-CAS1 OPEROS, LOMA ADAPTĀCIJAS UN TRAUCĒJUMU PROCESOS. VISBEIDZOT, TIKS PĒTĪTA DAŽĀDU TIPU CRISPR-CAS SISTĒMU, KAS VIENLAIKUS PASTĀV VIENĀ MIKROORGANISMĀ, MIJIEDARBĪBA. PAPILDUS CITIEM ASPEKTIEM, KAS JĀŅEM VĒRĀ, TIKS IEKĻAUTA ŠO SISTĒMU IZTEIKSMES REGULAS ANALĪZE. CRISPR-CAS SISTĒMU DIFERENCIĀLAIS REGULĒJUMS VARĒTU PIEDĀVĀT PAPILDU AIZSARGSPĒJAS ATKARĪBĀ NO FIZIOLOĢISKAJIEM APSTĀKĻIEM. ŠĀ PROJEKTA REZULTĀTI VARĒTU IEVĒROJAMI UZLABOT ZINĀŠANAS PAR CRISPR-CAS SISTĒMU FUNKCIONĀLO DAUDZVEIDĪBU. ŠIS TEMATS PAŠLAIK IR VIENA NO SVARĪGĀKAJĀM ZINĀTNES JOMĀM, JO TĀ LIELĀ MĒRĀ IETEKMĒ BIOMEDICĪNU UN BIOTEHNOLOĢIJU. (Latvian)
4 August 2022
0 references
IS IAD VÍRIS NA HEINTITIS BHITHEOLAÍOCHA IS FLÚIRSEACH SA BHITHSFÉAR. TÁ LEAS OLLMHÓR EOLAÍOCH AG BAINT LEIS AN EOLAS AR A N-IDIRGHNÍOMHÚ LEIS NA CEALLA A IONFHABHTAÍONN SIAD I NGNÉITHE BUNÚSACHA AGUS I NGNÉITHE FEIDHMEACHA NA BITEICNEOLAÍOCHTA ARAON. TÁ RÉIMSE LEATHAN MEICNÍOCHTAÍ FORBARTHA AG NA MIOCRORGÁNAIGH CHUN IAD FÉIN A CHOSAINT Ó IONFHABHTUITHE VÍREASACHA. SA CHUID IS MÓ DE NA ARCHEA AGUS BEAGNACH 50 % DE NA BAICTÉIR, IS FÉIDIR A BHRATH CRISPR-CAS (BRAISLITHE GO RIALTA INTERSPACED GEARR PALINDROMIC REPEATS-CRISPR GAOLMHAR GÉINTE) CÓRAIS A THUGANN DÍOLÚINE OIRIÚNAITHEACH I GCOINNE IONFHABHTÚ PHAGE. TÁ NA SEICHIMH ARÍS AGUS ARÍS EILE SCARTHA LE BLÚIRÍ GEARRA AINMNITHE SPÁSÓIRÍ A FHAIGHTEAR Ó IONRADH EILIMINTÍ GÉINITEACHA SEACHTRACHA COSÚIL LE PHAGES NÓ PLASMIDS AGUS MAR SIN IS IONANN AGUS CUIMHNE GHÉINITEACH IONFHABHTUITHE ROIMHE SEO. DÉANTAR AN CHÉIM OIRIÚNAITHE NÓ IMDHÍONTA SIN A IDIRGHABHÁIL LEIS NA PRÓITÉINÍ CAS1 AGUS CAS2. I GCÉIM AN LÉIRITHE, DÉANTAR CRISPR LOCI A THRAS-SCRÍOBH AGUS A PHRÓISEÁIL AG GINIÚINT CRRNA. I LAST PHASE INTERFERCE, tá an crRNA, an crRNA, ina luí ar an ELEMENT._x000D_ _x000D_ _x000D_ _x000D_ _x000D_ _x000D_ _x000D_ _x000D. TÁ AN NUCLEASE CAS9 DE CHEANN DE NA CINEÁLACHA SIN CURTHA IN OIRIÚINT DON EAGRÁN GÉANÓMAÍOCH D’ORGÁNAIGH NÍOS AIRDE, RUD A CHINN RÉABHLÓID SNA HEOLAÍOCHTAÍ BITHLEIGHIS. TÁ ACMHAINNEACHT BHITEICNEOLAÍOCHTA AN CHUR SÍOS AGUS THRÉITHRIÚ MÓILÍNEACH NA GCÓRAS NUA CRISPR-CAS OLLMHÓR. TÁ CÓRAIS CRISPR-CAS I ROINNT MIOCRORGÁNACH INA GCOMHLEÁDHTEAR AN PHRÓITÉIN CAS1 LE FEARANN RETROTRANSCRIPTASE (RT-CAS1). TÁ CÓRAS DE CHINEÁL III-B LE RT-CAS1 SA BHAICTÉAR MARA MARINOMONAS MEDITERRANEA. TÁ AN CÓRAS SEO AN CHÉAD CHEANN CUR SÍOS IN ANN A FHÁIL SPACERS Ó RNA (SILAS ET AL. 2016, EOLAÍOCHT, V. 351, P. AAD4234). MAR SIN FÉIN, TÁ FEIDHM BHITHEOLAÍOCH PHRÓISEAS RETROTRANSCRIPTION FÓS LE CINNEADH. _x000D_ _x000D_ is é _x000D_ MAIN GO DHÉANAMH AR AN RIALACHÁN NA gCÓRASANTA CRISPR le RT-CAS1 i dTíortha Éagsúla Pháistí. BEIDH AN IDIRGHNÍOMHAÍOCHT LE VÍRIS RNA INA PHRÍOMHCHUSPÓIR STAIDÉIR ÓS RUD É GO BHFUIL AN-BEAG AR EOLAS FAOI RÓL NA GCÓRAS CRISPR-CAS SA CHOSAINT I GCOINNE PHAGES LEIS AN GCINEÁL SEO GENOMES. DÉANFAR ANAILÍS FREISIN AR RÓL NA BPRÓITÉINÍ CAS ÉAGSÚLA ATÁ IONCHÓDAITHE SNA HOIBREOIRÍ LE RT-CAS1 SNA PRÓISIS OIRIÚNAITHE AGUS TRASNAÍOCHTA. AR DEIREADH, DÉANFAR STAIDÉAR AR IDIRGHNÍOMHÚ NA GCÓRAS CRISPR-CAS DE CHINEÁLACHA ÉAGSÚLA ATÁ SA MHIOCRORGÁNACH CÉANNA. I MEASC GNÉITHE EILE A BHEIDH LE BREITHNIÚ, ÁIREOFAR AN ANAILÍS AR AN RIALACHÁN MAIDIR LE SLOINNEADH NA GCÓRAS SIN. D’FHÉADFADH RIALACHÁN DIFREÁLACH MAIDIR LE CÓRAIS CRISPR-CAS COSAINTÍ COMHLÁNTACHA A THAIRISCINT AG BRATH AR NA COINNÍOLLACHA FISEOLAÍOCHA. D’FHÉADFADH TORTHAÍ AN TIONSCADAIL SEO CUR GO MÓR LEIS AN EOLAS AR ÉAGSÚLACHT FHEIDHMIÚIL CHÓRAIS CRISPR-CAS. TÁ AN T-ÁBHAR SEO AR CHEANN DE NA RÉIMSÍ EOLAÍOCHTA IS ÁBHARTHA FAOI LÁTHAIR MAR GHEALL AR AN TIONCHAR OLLMHÓR ATÁ AIGE AR AN MBITHLEIGHEAS AGUS AR AN MBITEICNEOLAÍOCHT. (Irish)
4 August 2022
0 references
VIRUSI SO NAJOBSEŽNEJŠA BIOLOŠKA ENTITETA V BIOSFERI. POZNAVANJE NJIHOVEGA MEDSEBOJNEGA DELOVANJA S CELICAMI, KI JIH OKUŽIJO, IMA VELIK ZNANSTVENI INTERES ZA OSNOVNE IN UPORABNE VIDIKE BIOTEHNOLOGIJE. MIKROORGANIZMI SO RAZVILI ŠIROKO PALETO MEHANIZMOV ZA ZAŠČITO PRED VIRUSNIMI OKUŽBAMI. V VEČINI ARHEJE IN SKORAJ 50 % BAKTERIJ JE MOGOČE ODKRITI SISTEME CRISPR-CAS (REDNO PREPLETENE KRATKE PALINDROMSKE PONOVITVE S CRISPR POVEZANIMI GENI), KI ZAGOTAVLJAJO ADAPTATIVNO IMUNOST PROTI OKUŽBI S FAGO. PONAVLJAJOČA SE ZAPOREDJA SO LOČENA S KRATKIMI FRAGMENTI, IMENOVANIMI DISTANČNIKI, KI SO PRIDOBLJENI IZ VDORA V ZUNANJE GENETSKE ELEMENTE, KOT SO FAGI ALI PLAZMIDI, IN TAKO TVORIJO GENETSKI SPOMIN NA PREJŠNJE OKUŽBE. TO FAZO PRILAGAJANJA ALI IMUNIZACIJE POSREDUJETA BELJAKOVINI CAS1 IN CAS2. V FAZI IZRAŽANJA SO CRISPR LOCI PREPISANI IN OBDELANI, KI USTVARJAJO CRRNA. V LAST PHASE INTERFERENCE, crRNA, KI JIH Vključuje na INVADING GENETIC ELEMENT, VZDRŽAJO ZA PROTEINSTI ZA nukleazo ACTIVITY ZA POGLAVJE TEGA ELEMENTa._x000D_ _x000D_ JE NAMENJENO DIVERSITY CRISPR-CAS SYSTEMS DESCRIBED. NUKLEAZA CAS9 ENE OD TEH TIPOV JE BILA PRILAGOJENA GENOMSKI IZDAJI VIŠJIH ORGANIZMOV, KAR JE DOLOČILO REVOLUCIJO V BIOMEDICINSKIH ZNANOSTIH. BIOTEHNOLOŠKI POTENCIAL OPISA IN MOLEKULARNE KARAKTERIZACIJE NOVIH SISTEMOV CRISPR-CAS JE OGROMEN. VEČ MIKROORGANIZMOV VSEBUJE SISTEME CRISPR-CAS, V KATERIH SE BELJAKOVINA CAS1 ZLIVA V PODROČJE RETROTRANSCRIPTASE (RT-CAS1). MORSKA BAKTERIJA MARINOMONAS MEDITERRANEA VSEBUJE SISTEM TIPA III-B Z RT-CAS1. TA SISTEM JE BIL PRVI OPISAN, KI JE LAHKO PRIDOBIL DISTANČNIKE OD RNA (SILAS ET AL. 2016, ZNANOST, V. 351, P. AAD4234). VENDAR PA JE TREBA ŠE DOLOČITI BIOLOŠKO FUNKCIJO PROCESA RETROTRANKRIPCIJE. _x000D_ _x000D_ MAIN GOAL TEGA PROJEKTA NA PODROČJU KRISTNIH SYSTEMS Z RT-CAS1 V DEFENSE AGAINSKIH DRUGIH TIH PHAGES. INTERAKCIJA Z VIRUSI RNA BO GLAVNI CILJ ŠTUDIJE, SAJ JE ZELO MALO ZNANEGA O VLOGI SISTEMOV CRISPR-CAS V OBRAMBI PROTI FAGAM S TO VRSTO GENOMOV. ANALIZIRANA BO TUDI VLOGA RAZLIČNIH BELJAKOVIN CAS, KODIRANIH V OPERONAH Z RT-CAS1, V PROCESIH PRILAGAJANJA IN MOTENJ. PREUČENO BO TUDI MEDSEBOJNO DELOVANJE RAZLIČNIH VRST SISTEMOV CRISPR-CAS, KI SOOBSTAJAJO V ISTEM MIKROORGANIZMU. MED DRUGIMI VIDIKI, KI JIH JE TREBA UPOŠTEVATI, BO VKLJUČENA ANALIZA UREDBE O IZRAŽANJU TEH SISTEMOV. DIFERENCIALNA UREDITEV SISTEMA CRISPR-CAS BI LAHKO PONUDILA DOPOLNILNO OBRAMBO, ODVISNO OD FIZIOLOŠKIH RAZMER. REZULTATI TEGA PROJEKTA BI LAHKO POMEMBNO PRISPEVALI K POZNAVANJU FUNKCIONALNE RAZNOLIKOSTI SISTEMOV CRISPR-CAS. TA TEMA JE TRENUTNO ENO NAJPOMEMBNEJŠIH ZNANSTVENIH PODROČIJ ZARADI VELIKEGA VPLIVA NA BIOMEDICINO IN BIOTEHNOLOGIJO. (Slovenian)
4 August 2022
0 references
ВИРУСИТЕ СА НАЙ-БОГАТИТЕ БИОЛОГИЧНИ ЕДИНИЦИ В БИОСФЕРАТА. ПОЗНАВАНЕТО НА ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО ИМ С КЛЕТКИТЕ, КОИТО ЗАРАЗЯВАТ, ИМА ОГРОМЕН НАУЧЕН ИНТЕРЕС КАКТО КЪМ ОСНОВНИТЕ, ТАКА И КЪМ ПРИЛОЖНИТЕ АСПЕКТИ НА БИОТЕХНОЛОГИИТЕ. МИКРООРГАНИЗМИТЕ СА РАЗРАБОТИЛИ ШИРОК СПЕКТЪР ОТ МЕХАНИЗМИ, ЗА ДА СЕ ПРЕДПАЗЯТ ОТ ВИРУСНИ ИНФЕКЦИИ. В ПО-ГОЛЯМАТА ЧАСТ ОТ ARCHEA И ПОЧТИ 50 % ОТ БАКТЕРИИТЕ Е ВЪЗМОЖНО ДА СЕ ОТКРИЯТ CRISPR-CAS (КЛЪСТЕРИРАНИ РЕДОВНО ИНТЕРПРОСТРАНСТВЕНИ КЪСИ ПАЛИНДРОМНИ ПОВТАРЯЩИ СЕ ГЕНИ, СВЪРЗАНИ С CRISPR), КОИТО ПРИДАВАТ АДАПТАТИВЕН ИМУНИТЕТ СРЕЩУ ФАГО ИНФЕКЦИЯ. ПОВТАРЯЩИТЕ СЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛНОСТИ СА РАЗДЕЛЕНИ ОТ КРАТКИ ФРАГМЕНТИ, НАРЕЧЕНИ СПЕЙСЪРИ, КОИТО СА ПРИДОБИТИ ОТ НАХЛУВАЩИ ВЪНШНИ ГЕНЕТИЧНИ ЕЛЕМЕНТИ КАТО ФАГИ ИЛИ ПЛАЗМИДИ И ПО ТОЗИ НАЧИН ПРЕДСТАВЛЯВАТ ГЕНЕТИЧНА ПАМЕТ ЗА ПРЕДИШНИ ИНФЕКЦИИ. ТАЗИ ФАЗА НА АДАПТАЦИЯ ИЛИ ИМУНИЗАЦИЯ СЕ МЕДИИРА ОТ ПРОТЕИНИТЕ CAS1 И CAS2. ВЪВ ФАЗАТА НА ИЗРАЗЯВАНЕ CRISPR ЛОКУСИ СЕ ТРАНСКРИБИРАТ И ОБРАБОТВАТ ГЕНЕРИРАНЕ НА CRRNA. В най-малката фаза на Интерференса, Крина, която е комплементарна към ИНВИНГЕНТИЧЕН ЕЛЕМЕНТ, ще се превърне в продукти с нуклеазна активност за DEGRADATION OF THAT ELEMENT._x000D_. НУКЛЕАЗАТА CAS9 НА ЕДИН ОТ ТЕЗИ ТИПОВЕ Е АДАПТИРАНА ЗА ГЕНОМНОТО ИЗДАНИЕ НА ВИСШИТЕ ОРГАНИЗМИ, КОЕТО Е ОПРЕДЕЛИЛО РЕВОЛЮЦИЯТА В БИОМЕДИЦИНСКИТЕ НАУКИ. БИОТЕХНОЛОГИЧНИЯТ ПОТЕНЦИАЛ НА ОПИСАНИЕТО И МОЛЕКУЛЯРНАТА ХАРАКТЕРИСТИКА НА НОВИТЕ CRISPR-CAS СИСТЕМИ Е ОГРОМЕН. НЯКОЛКО МИКРООРГАНИЗМИ СЪДЪРЖАТ CRISPR-CAS СИСТЕМИ, В КОИТО ПРОТЕИНЪТ CAS1 СЕ СЛИВА В ОБЛАСТ RETROTRANSCRIPTASE (RT-CAS1). МОРСКАТА БАКТЕРИЯ MARINOMONAS MEDITERRANEA СЪДЪРЖА СИСТЕМА ТИП III-B С RT-CAS1. ТАЗИ СИСТЕМА Е ПЪРВАТА ОПИСАНА, СПОСОБНА ДА ПРИДОБИЕ СПЕЙСЪРИ ОТ РНК (SILAS ET AL. 2016 Г., SCIENCE, V. 351, P. AAD4234). ВЪПРЕКИ ТОВА, БИОЛОГИЧНАТА ФУНКЦИЯ НА ПРОЦЕСА НА РЕТРОТРАКРИПЦИЯ ОСТАВА ДА БЪДЕ ОПРЕДЕЛЕНА. _x000D_ _x000D_ MAIN GOAL OF THIS PRECECT трябва да ОСНЯВА ДА ВЪЗЛОЖИТЕЛЯ В РОЛАТА НА СИСТЕМИ НА СИСТЕМИ С РТ-CAS1 В ДЕФЕНСКИ АГИНИ РАЗВИТИЕ НА ФАРТИВНИТЕ ВЪЗЛОЖЕНИЯ. ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО С РНК ВИРУСИ ЩЕ БЪДЕ ОСНОВНА ЦЕЛ НА ПРОУЧВАНЕТО, ТЪЙ КАТО МНОГО МАЛКО Е ИЗВЕСТНО ЗА РОЛЯТА НА CRISPR-CAS СИСТЕМИТЕ В ЗАЩИТАТА СРЕЩУ ФАГИ С ТОЗИ ТИП ГЕНОМИ. ЩЕ БЪДЕ АНАЛИЗИРАНА И РОЛЯТА НА РАЗЛИЧНИТЕ ПРОТЕИНИ ПО CAS, КОДИРАНИ В ОПЕРОНИТЕ С RT-CAS1 В ПРОЦЕСИТЕ НА АДАПТАЦИЯ И ИНТЕРФЕРЕНЦИЯ. НАКРАЯ ЩЕ БЪДЕ ПРОУЧЕНО ВЗАИМОДЕЙСТВИЕТО НА СИСТЕМИТЕ CRISPR-CAS ОТ РАЗЛИЧНИ ВИДОВЕ, КОИТО СЪЩЕСТВУВАТ СЪВМЕСТНО В ЕДИН И СЪЩ МИКРООРГАНИЗЪМ. НАРЕД С ДРУГИ АСПЕКТИ, КОИТО ТРЯБВА ДА БЪДАТ РАЗГЛЕДАНИ, ЩЕ БЪДЕ ВКЛЮЧЕН И АНАЛИЗЪТ НА РЕГЛАМЕНТА ЗА ИЗРАЗЯВАНЕТО НА ТЕЗИ СИСТЕМИ. ДИФЕРЕНЦИАЛНОТО РЕГУЛИРАНЕ НА СИСТЕМИТЕ CRISPR-CAS МОЖЕ ДА ПРЕДЛОЖИ ДОПЪЛНИТЕЛНА ЗАЩИТА В ЗАВИСИМОСТ ОТ ФИЗИОЛОГИЧНИТЕ УСЛОВИЯ. РЕЗУЛТАТИТЕ ОТ ТОЗИ ПРОЕКТ БИХА МОГЛИ ДА ДОПРИНЕСАТ ЗНАЧИТЕЛНО ЗА ПОЗНАВАНЕТО НА ФУНКЦИОНАЛНОТО РАЗНООБРАЗИЕ НА СИСТЕМИТЕ CRISPR-CAS. ТОЗИ ВЪПРОС В МОМЕНТА Е ЕДИН ОТ НАЙ-ПОДХОДЯЩИТЕ НАУЧНИ ОБЛАСТИ ПОРАДИ ОГРОМНОТО ВЪЗДЕЙСТВИЕ ВЪРХУ БИОМЕДИЦИНАТА И БИОТЕХНОЛОГИИТЕ. (Bulgarian)
4 August 2022
0 references
IL-VIRUSES HUMA L-AKTAR ENTITAJIET BIJOLOĠIĊI ABBUNDANTI FIL-BIJOSFERA. L-GĦARFIEN TAL-INTERAZZJONI TAGĦHOM MAĊ-ĊELLOLI LI JINFETTAW GĦANDU INTERESS XJENTIFIKU ENORMI KEMM FL-ASPETTI BAŻIĊI KIF UKOLL FL-ASPETTI APPLIKATI TAL-BIJOTEKNOLOĠIJA. IL-MIKROORGANIŻMI ŻVILUPPAW FIRXA WIESGĦA TA’ MEKKANIŻMI BIEX JIPPROTEĠU LILHOM INFUSHOM MINN INFEZZJONIJIET VIRALI. FIL-BIĊĊA L-KBIRA TAL-ARKEA U KWAŻI 50 % TAL-BATTERJI, HUWA POSSIBBLI LI JINSTABU SISTEMI CRISPR-CAS (CLUSTERED B’MOD REGOLARI INTERSPAZJALI QOSRA PALINDROMIC REPETUTI-CRISPR ASSOĊJATI MA’ SISTEMI) LI JAGĦTU IMMUNITÀ ADATTIVA KONTRA L-INFEZZJONI TAL-PHAGE. IS-SEKWENZI RIPETUTI HUMA SEPARATI MINN FRAMMENTI QOSRA MSEMMIJA SPACERS LI JINKISBU MINN ELEMENTI ĠENETIĊI ESTERNI BĦAL FAGI JEW PLASMIDI U B’HEKK JIKKOSTITWIXXU MEMORJA ĠENETIKA TA’ INFEZZJONIJIET PREĊEDENTI. DIN IL-FAŻI TA’ ADATTAMENT JEW IMMUNIZZAZZJONI HIJA MEDJATA MILL-PROTEINI CAS1 U CAS2. FIL-FAŻI TAL-ESPRESSJONI, IL-LOCI CRISPR HUMA TRASKRITTI U PROĊESSATI LI JIĠĠENERAW CRRNA. Fil-LAST PHASE ta ‘INTERFERENZA, Il-KRNA, LI HUMA KOMPLIMENTAZZJONI GĦALL-ELEMENT ĠENETTI INVADING, ILL GWIDE CAS PROTEINI ACTIVITÀ nuclease ACTIVITÀ għad-DEGRADAZZJONI ta ‘dan ELEMENT._x000D_ _x000D_ _x000D_ TIEGĦU DIVERSITÀ INCREASING TAL CRISPR-CAS SYSTEMI DESCRIBED. IN-NUKLEAŻI CAS9 TA’ WIEĦED MINN DAWK IT-TIPI ĠIE ADATTAT GĦALL-EDIZZJONI ĠENOMIKA TA’ ORGANIŻMI OGĦLA, DAK LI DDETERMINA RIVOLUZZJONI FIX-XJENZI BIJOMEDIĊI. IL-POTENZJAL BIJOTEKNOLOĠIKU TAD-DESKRIZZJONI U L-KARATTERIZZAZZJONI MOLEKULARI TA’ SISTEMI CRISPR-CAS ĠODDA HUWA ENORMI. DIVERSI MIKROORGANIŻMI FIHOM SISTEMI CRISPR-CAS LI FIHOM IL-PROTEINA CAS1 TINTUŻA F’DOMINJU RETROTRANSCRIPTASE (RT-CAS1). IL-BATTERJU MARITTIMU MARINOMONAS MEDITERRANEA FIH SISTEMA TAT-TIP III-B B’RT-CAS1. DIN IS-SISTEMA KIENET L-EWWEL WAĦDA DESKRITT KAPAĊI JAKKWISTAW SPACERS MINN RNA (SILAS ET AL. 2016, XJENZA, V. 351, P. AAD4234). MADANKOLLU, IL-FUNZJONI BIJOLOĠIKA TAL-PROĊESS TA’ RETROTRASKRIZZJONI GĦAD TRID TIĠI DETERMINATA. _x000D_ _x000D_ il-GOAL MAIN TA’ DIN PROJECT GĦANDHOM JAGĦMEL BIEX TIEGĦU TAS-SISTEMA tal-CRISPR mal-RT-CAS1 DIFFERENT DIFFERENT TIP TAL-PHAGES. L-INTERAZZJONI MA’ VIRUSES RNA SE TKUN GĦAN EWLIENI TAL-ISTUDJU PERESS LI FTIT LI XEJN HUWA MAGĦRUF DWAR IR-RWOL TAS-SISTEMI CRISPR-CAS FID-DIFIŻA KONTRA L-FAGI B’DAN IT-TIP TA’ ĠENOMI. IR-RWOL TAL-PROTEINI CAS DIFFERENTI KKODIFIKATI FL-OPERONS B’RT-CAS1 FIL-PROĊESSI TA’ ADATTAMENT U INTERFERENZA SE JIĠI ANALIZZAT UKOLL. FL-AĦĦAR NETT, SE TIĠI STUDJATA L-INTERAZZJONI TAS-SISTEMI CRISPR-CAS TA’ TIPI DIFFERENTI KOEŻISTENTI FL-ISTESS MIKROORGANIŻMU. FOST ASPETTI OĦRA LI GĦANDHOM JIĠU KKUNSIDRATI, SE TIĠI INKLUŻA L-ANALIŻI TAR-REGOLAMENT TAL-ESPRESSJONI TA’ DAWN IS-SISTEMI. REGOLAMENT DIFFERENZJALI TAS-SISTEMI CRISPR-CAS JISTA’ JOFFRI DIFIŻI KOMPLEMENTARI SKONT IL-KUNDIZZJONIJIET FIŻJOLOĠIĊI. IR-RIŻULTATI TA’ DAN IL-PROĠETT JISTGĦU JIKKONTRIBWIXXU B’MOD SINIFIKANTI GĦALL-GĦARFIEN TAD-DIVERSITÀ FUNZJONALI TAS-SISTEMI CRISPR-CAS. DAN IS-SUĠĠETT BĦALISSA HUWA WIEĦED MILL-OQSMA XJENTIĊI L-AKTAR RILEVANTI MINĦABBA L-IMPATT ENORMI FUQ IL-BIJOMEDIĊINA U L-BIJOTEKNOLOĠIJA. (Maltese)
4 August 2022
0 references
VÍRUS SÃO AS ENTIDADES BIOLÓGICAS MAIS ABUNDANTES DA BIOSPHERE. O CONHECIMENTO DA SUA INTERAÇÃO COM AS CÉLULAS QUE INFECTAM TEM UM ENORME INTERESSE CIENTÍFICO EM ASPECTOS BÁSICOS E APLICADOS DA BIOTECNOLOGIA. Os microorganismos desenvolveram uma vasta gama de mecanismos para os proteger das infecções virais. Na maior parte da ARCHEA e quase 50% da BACTERIA, é POSSÍVEL DETETAR SISTEMAS CRISPR-CAS (CLUSTERED REGULARMENTE INTERSPACED SHORT PALINDROMIC REPEATS-CRISPR ASSOCIATED GENES) QUE CONFEREM A IMUNIDADE ADAPTATIVA CONTRA A INFEÇÃO FÁGICA. As sequências repetidas são separadas por pequenos fragmentos denominados espaçadores que são obtidos a partir da invasão de elementos genéticos externos, tais como fagos ou plásticos e, portanto, constituem uma memória genética de infecções anteriores. ESTA FASE DE ADAPTAÇÃO OU IMMUNIZAÇÃO É MEDIADA PELAS PROTEÍNAS CAS1 E CAS2. Na FASE DE EXPRESSÃO, O LOCAL DE CRISPR É TRANSCRITADO E TRANSFORMADO GERANDO A CRRNA. Na ÚLTIMA FASE DE INTERFERÊNCIA, A CRRNA, QUE É COMPLEMENTAR AO ELEMENTO GENÉTICO INVADING, IRÁ GUIAR PROTEÍNAS CAS COM ATIVIDADE DE NUCLEASE PARA A DEGRADAÇÃO DESSE ELEMENTO._x000D_ _x000D_ Há uma DIVERSIDADE AUMENTAR DOS SISTEMAS CRISPR-CAS DESCRITADOS. A NUCLEASE CAS9 DE UM DESTES TIPOS FOI ADAPTADA PARA A EDIÇÃO GENÓMICA DE ORGANISMOS MAIS ELEVADOS, O QUE DETERMINOU UMA REVOLUÇÃO NAS CIÊNCIAS BIOMÉDICAS. O POTENCIAL BIOTECHNOLOGICO DA DESCRIÇÃO E CARACTERIZAÇÃO MOLECULAR DOS SISTEMAS NOVEL CRISPR-CAS É ENORME. MICROORGANISMOS VÁRIOS CONTÊM SISTEMAS CRISPR-CAS EM QUE A PROTEÍNA CAS1 É UTILIZADA NUM DOMÍNIO DE RETROTRANSCRIPTASE (RT-CAS1). O BACTERIO MARINOMONAS MEDITERRANEA MARINHO contém um sistema do tipo III-B com RT-CAS1. Este sistema foi o primeiro descrito capaz de adquirir espaços a partir de ARN (SILAS E AL. 2016, SCIENCE, V. 351, P. AAD4234). No entanto, continua a ser necessário determinar a função biológica do processo de retrotração. _x000D_ _x000D_ O principal objetivo deste projeto é ganhar visibilidade no papel dos sistemas de CRISPR com RT-CAS1 nos diferentes tipos de fagos de defesa. A interação com os vírus do ARN será um dos principais objetivos do estudo, uma vez que muito pouco se sabe sobre o papel dos sistemas CRISPR-CAS na defesa contra fagos com este tipo de genomas. O PAPEL DAS DIFERENTES PROTEÍNAS CAS CODIFICADAS NOS OPERONS COM RT-CAS1 NOS PROCESSOS DE ADAPTAÇÃO E INTERFERÊNCIA SERÁ TAMBÉM ANALIZADO. Finalmente, a interacção de sistemas CRISPR-CAS de diferentes tipos que co-existem no mesmo microorganismo será regulada. Entre outros aspectos a considerar, será incluída a análise da regulamentação da expressão destes sistemas. Uma regulamentação diferente dos sistemas CRISPR-CAS pode oferecer defesas complementares que dependem das condições fisiológicas. Os resultados deste projecto podem contribuir significativamente para o conhecimento da diversidade funcional dos sistemas CRISPR-CAS. ESTE OBJETO É ATUALMENTE UM DOS DOMÍNIOS CIENTÍFICOS MAIS RELEVANTES DEVIDO A UM IMPACTO GRANDE NA BIOMEDICINA E BIOTECNOLÓGICO. (Portuguese)
4 August 2022
0 references
VIRA ER DE MEST UDBREDTE BIOLOGISKE ENHEDER I BIOSFÆREN. KENDSKABET TIL DERES INTERAKTION MED CELLERNE, SOM DE INFICERER, HAR EN ENORM VIDENSKABELIG INTERESSE I BÅDE GRUNDLÆGGENDE OG ANVENDTE ASPEKTER AF BIOTEKNOLOGI. MIKROORGANISMERNE HAR UDVIKLET EN BRED VIFTE AF MEKANISMER TIL AT BESKYTTE SIG MOD VIRUSINFEKTIONER. I DE FLESTE AF ARCHEA OG NÆSTEN 50 % AF BAKTERIERNE ER DET MULIGT AT PÅVISE CRISPR-CAS (KLYNGET REGELMÆSSIGT INTERSPACED KORTE PALINDROMIC REPEATS-CRISPR-GENER), DER GIVER ADAPTATIV IMMUNITET MOD FAGINFEKTION. DE GENTAGNE SEKVENSER ADSKILLES AF KORTE FRAGMENTER NAVNGIVET AFSTANDSSTYKKER, SOM ERHVERVES FRA INVADERE EKSTERNE GENETISKE ELEMENTER SÅSOM FAGER ELLER PLASMIDER OG DERMED UDGØR EN GENETISK HUKOMMELSE AF TIDLIGERE INFEKTIONER. DENNE TILPASNINGS- ELLER IMMUNISERINGSFASE MEDIERES AF PROTEINERNE CAS1 OG CAS2. I UDTRYKSFASEN TRANSSKRIBERES OG BEARBEJDES CRISPR LOCI, DER GENERERER CRRNA. I den sidste fase af INTERFERENCE vil crRNA'en, som er en del af den integrerede genetiske udvikling, gøre det muligt at opnå fordele med nuklease til udbedring af disse aktiviteter._x000D_ _x000D_ _x000D_ DER ER INGENDE DIVERSITY AF CRISPR-CAS SYSTEMER. NUCLEASE CAS9 AF EN AF DISSE TYPER ER BLEVET TILPASSET TIL DEN GENOMISKE UDGAVE AF HØJERE ORGANISMER, HVAD DER HAR BESTEMT EN REVOLUTION INDEN FOR BIOMEDICINSK VIDENSKAB. DET BIOTEKNOLOGISKE POTENTIALE I BESKRIVELSEN OG DEN MOLEKYLÆRE KARAKTERISERING AF NYE CRISPR-CAS-SYSTEMER ER ENORMT. FLERE MIKROORGANISMER INDEHOLDER CRISPR-CAS-SYSTEMER, HVOR PROTEINET CAS1 SMELTES TIL ET RETROTRANSCRIPTASE-DOMÆNE (RT-CAS1). MARINEBAKTERIEN MARINOMONAS MEDITERRANEA INDEHOLDER ET TYPE III-B-SYSTEM MED RT-CAS1. DETTE SYSTEM HAR VÆRET DET FØRSTE, DER BESKRIVES I STAND TIL AT ERHVERVE AFSTANDSSTYKKER FRA RNA (SILAS ET AL. 2016, VIDENSKAB, V. 351, P. AAD4234). DEN BIOLOGISKE FUNKTION AF RETROTRANSKRIPTIONSPROCESSEN ER DOG ENDNU IKKE FASTLAGT. _x000D_ _x000D_ MAIN GOAL OF DENNE PROJEKT er at GAIN INDSTILLINGEN AF CRISPR SYSTEMER MED RT-CAS1 I DEFENSE AGAINS DIFFERENT TYPES af PHAGES. INTERAKTIONEN MED RNA-VIRA VIL VÆRE ET HOVEDFORMÅL MED UNDERSØGELSEN, DA MEGET LIDT ER KENDT OM CRISPR-CAS-SYSTEMERNES ROLLE I FORSVARET MOD FAGER MED DENNE TYPE GENOMER. DEN ROLLE, SOM DE FORSKELLIGE CAS-PROTEINER, DER ER INDKODET I OPERONER MED RT-CAS1, SPILLER I TILPASNINGS- OG INTERFERENSPROCESSERNE, VIL OGSÅ BLIVE ANALYSERET. ENDELIG VIL SAMSPILLET MELLEM CRISPR-CAS-SYSTEMER AF FORSKELLIGE TYPER, DER FINDES I DEN SAMME MIKROORGANISME, BLIVE UNDERSØGT. BLANDT ANDRE ASPEKTER, DER SKAL TAGES I BETRAGTNING, VIL ANALYSEN AF FORORDNINGENS UDTRYK FOR DISSE SYSTEMER BLIVE MEDTAGET. EN DIFFERENTIERET REGULERING AF CRISPR-CAS-SYSTEMET KAN TILBYDE SUPPLERENDE FORSVAR AFHÆNGIGT AF DE FYSIOLOGISKE FORHOLD. RESULTATERNE AF DETTE PROJEKT KAN BIDRAGE VÆSENTLIGT TIL KENDSKABET TIL DEN FUNKTIONELLE MANGFOLDIGHED AF CRISPR-CAS-SYSTEMER. DETTE EMNE ER I ØJEBLIKKET ET AF DE MEST RELEVANTE VIDENSKABELIGE OMRÅDER PÅ GRUND AF DEN ENORME INDVIRKNING PÅ BIOMEDICIN OG BIOTEKNOLOGI. (Danish)
4 August 2022
0 references
VIRUSURILE SUNT CELE MAI ABUNDENTE ENTITĂȚI BIOLOGICE DIN BIOSFERĂ. CUNOAȘTEREA INTERACȚIUNII LOR CU CELULELE PE CARE LE INFECTEAZĂ ARE UN INTERES ȘTIINȚIFIC ENORM ATÂT PENTRU ASPECTELE DE BAZĂ, CÂT ȘI PENTRU CELE APLICATE ALE BIOTEHNOLOGIEI. MICROORGANISMELE AU DEZVOLTAT O GAMĂ LARGĂ DE MECANISME PENTRU A SE PROTEJA DE INFECȚIILE VIRALE. ÎN MAJORITATEA ARHEEI ȘI APROAPE 50 % DIN BACTERII, ESTE POSIBIL SĂ SE DETECTEZE SISTEME CRISPR-CAS (GRUPATE PERIODIC INTERSPAȚIATE SCURTE REPETĂRI PALINDROMIC-CRISPR ASOCIATE GENELOR) CARE CONFERĂ IMUNITATE ADAPTATIVĂ ÎMPOTRIVA INFECȚIEI CU FAGE. SECVENȚELE REPETATE SUNT SEPARATE DE FRAGMENTE SCURTE NUMITE DISTANȚIERE CARE SUNT OBȚINUTE DE LA INVADAREA ELEMENTELOR GENETICE EXTERNE, CUM AR FI FAGII SAU PLASMIDELE, CONSTITUIND ASTFEL O MEMORIE GENETICĂ A INFECȚIILOR ANTERIOARE. ACEASTĂ FAZĂ DE ADAPTARE SAU IMUNIZARE ESTE MEDIATĂ DE PROTEINELE CAS1 ȘI CAS2. ÎN FAZA DE EXPRIMARE, LOCI CRISPR SUNT TRANSCRISE ȘI PROCESATE GENERATOR DE CRARN. În ultima versiune a INTERFERENȚEI, CRNA, CARE ESTE COMPLEMENTARĂ LA INVADING GENETIC ELEMENT, VA GUIDE CAS PROTEINS CU ACTIVITATE Nucleaza PENTRU DEGRADARE A ACEST ELEMENT._x000D_ _x000D_ Este o DIVERSITATE INCREASING DE SYSTEMS CRISPR-CAS. NUCLEAZA CAS9 A UNUIA DINTRE ACESTE TIPURI A FOST ADAPTATĂ PENTRU EDIȚIA GENOMICĂ A ORGANISMELOR SUPERIOARE, CEEA CE A DETERMINAT O REVOLUȚIE ÎN ȘTIINȚELE BIOMEDICALE. POTENȚIALUL BIOTEHNOLOGIC AL DESCRIERII ȘI CARACTERIZĂRII MOLECULARE A NOILOR SISTEME CRISPR-CAS ESTE ENORM. MAI MULTE MICROORGANISME CONȚIN SISTEME CRISPR-CAS ÎN CARE PROTEINA CAS1 ESTE FUZIONATĂ CU UN DOMENIU RETROTRANSCRIPTASE (RT-CAS1). BACTERIA MARINĂ MARINOMONAS MEDITERRANEA CONȚINE UN SISTEM DE TIP III-B CU RT-CAS1. ACEST SISTEM A FOST PRIMUL DESCRIS CAPABIL SĂ ACHIZIȚIONEZE DISTANȚIERE DE LA ARN (SILAS ET AL. 2016, ȘTIINȚĂ, V. 351, P. AAD4234). CU TOATE ACESTEA, FUNCȚIA BIOLOGICĂ A PROCESULUI DE RETROTRANIFICARE RĂMÂNE DE DETERMINAT. _x000D_ _x000D_ principala valoare a acestui proiect este de a face parte din roata de sisteme CRISPR cu RT-CAS1 în tipurile de componente ale produselor alimentare. INTERACȚIUNEA CU VIRUSURILE ARN VA FI UN OBIECTIV PRINCIPAL AL STUDIULUI, DEOARECE FOARTE PUȚINE SUNT CUNOSCUTE DESPRE ROLUL SISTEMELOR CRISPR-CAS ÎN APĂRAREA ÎMPOTRIVA FAGURILOR CU ACEST TIP DE GENOM. SE VA ANALIZA, DE ASEMENEA, ROLUL DIFERITELOR PROTEINE CAS CODIFICATE ÎN OPERONI CU RT-CAS1 ÎN PROCESELE DE ADAPTARE ȘI INTERFERENȚĂ. ÎN CELE DIN URMĂ, SE VA STUDIA INTERACȚIUNEA SISTEMELOR CRISPR-CAS DE DIFERITE TIPURI CARE COEXISTĂ ÎN ACELAȘI MICROORGANISM. PRINTRE ALTE ASPECTE CARE TREBUIE LUATE ÎN CONSIDERARE, SE VA INCLUDE ANALIZA REGULAMENTULUI PRIVIND EXPRIMAREA ACESTOR SISTEME. O REGLEMENTARE DIFERENȚIALĂ A SITEMELOR CRISPR-CAS AR PUTEA OFERI O APĂRARE COMPLEMENTARĂ ÎN FUNCȚIE DE CONDIȚIILE FIZIOLOGICE. REZULTATELE ACESTUI PROIECT AR PUTEA CONTRIBUI ÎN MOD SEMNIFICATIV LA CUNOAȘTEREA DIVERSITĂȚII FUNCȚIONALE A SISTEMELOR CRISPR-CAS. ACEST SUBIECT ESTE ÎN PREZENT UNUL DINTRE CELE MAI RELEVANTE DOMENII ȘTIINȚIFICE DATORITĂ IMPACTULUI ENORM ASUPRA BIOMEDICINEI ȘI BIOTEHNOLOGIEI. (Romanian)
4 August 2022
0 references
VIRUS ÄR DE VANLIGASTE BIOLOGISKA VARELSERNA I BIOSFÄREN. KUNSKAPEN OM DERAS INTERAKTION MED DE CELLER SOM DE INFEKTERAR HAR ETT ENORMT VETENSKAPLIGT INTRESSE FÖR BÅDE GRUNDLÄGGANDE OCH TILLÄMPADE ASPEKTER AV BIOTEKNIK. MIKROORGANISMERNA HAR UTVECKLAT ETT BRETT SPEKTRUM AV MEKANISMER FÖR ATT SKYDDA SIG MOT VIRUSINFEKTIONER. I DE FLESTA AV ARCHEA OCH NÄSTAN 50 % AV BAKTERIERNA ÄR DET MÖJLIGT ATT DETEKTERA CRISPR-CAS (KLUSTRADE REGELBUNDET INTERRYMDA KORTA PALINDROMISKA REPETITIONER-CRISPR ASSOCIERADE GENER) SYSTEM SOM GER ADAPTIV IMMUNITET MOT FAGINFEKTION. DE UPPREPADE SEKVENSERNA SEPARERAS AV KORTA FRAGMENT SOM KALLAS DISTANSER SOM FÖRVÄRVAS FRÅN INVADERANDE EXTERNA GENETISKA ELEMENT SÅSOM FAG ELLER PLASMIDER OCH UTGÖR DÄRMED ETT GENETISKT MINNE AV TIDIGARE INFEKTIONER. DENNA ANPASSNINGS- ELLER IMMUNISERINGSFAS MEDIERAS AV PROTEINERNA CAS1 OCH CAS2. I UTTRYCKSFASEN TRANSKRIBERAS OCH BEARBETAS CRISPR LOCI GENERERA CRRNA. I den längsta fasen av INTERFERENCE, crRNA, som är kompatibel med den INVADING GENETIC ELEMENT, kommer att GUIDE CAS PROTEINS MED nuclease ACTIVITY FÖR DEGRADATION AV THAT ELEMENT._x000D_ _x000D_ _x000D_ DEN är en INCREASING DIVERSITY av CRISPR-CAS SYSTEMS DESCRIBED. NUKLEASEN CAS9 AV EN AV DESSA TYPER HAR ANPASSATS FÖR DEN GENOMISKA UTGÅVAN AV HÖGRE ORGANISMER, VILKET HAR LETT TILL EN REVOLUTION INOM BIOMEDICINSKA VETENSKAPER. DEN BIOTEKNISKA POTENTIALEN HOS BESKRIVNINGEN OCH DEN MOLEKYLÄRA KARAKTERISERINGEN AV NYA CRISPR-CAS-SYSTEM ÄR ENORM. FLERA MIKROORGANISMER INNEHÅLLER CRISPR-CAS-SYSTEM DÄR PROTEINET CAS1 SMÄLTS TILL EN RETROTRANSCRIPTASE-DOMÄN (RT-CAS1). DEN MARINA BAKTERIEN MARINOMONAS MEDITERRANEA INNEHÅLLER ETT TYP III-B-SYSTEM MED RT-CAS1. DETTA SYSTEM HAR VARIT DET FÖRSTA SOM BESKRIVS KUNNA FÖRVÄRVA DISTANSER FRÅN RNA (SILAS ET AL. 2016, SCIENCE, V. 351, P. AAD4234). DEN BIOLOGISKA FUNKTIONEN HOS PROCESSEN FÖR RETROTRANSERING ÅTERSTÅR DOCK ATT FASTSTÄLLA. _x000D_ _x000D_ den MAIN GOAL AV DENNA PROJEKT ÄR SOM ÄR INSIGHT INOM ROLE OF CRISPR SYSTEMS MED RT-CAS1 I DEFENSE AGAINS DIFFERENT TYPAR AV PHAGES. INTERAKTIONEN MED RNA-VIRUS KOMMER ATT VARA ETT HUVUDMÅL FÖR STUDIEN EFTERSOM MYCKET LITE ÄR KÄNT OM CRISPR-CAS-SYSTEMS ROLL I FÖRSVARET MOT FAG MED DENNA TYP AV GENOM. ROLLEN FÖR DE OLIKA CAS-PROTEINER SOM KODATS I OPERONERNA MED RT-CAS1 I ANPASSNINGS- OCH INTERFERENSPROCESSERNA KOMMER OCKSÅ ATT ANALYSERAS. SLUTLIGEN KOMMER INTERAKTIONEN MELLAN CRISPR-CAS-SYSTEM AV OLIKA TYPER SOM EXISTERAR SAMTIDIGT I SAMMA MIKROORGANISM ATT STUDERAS. BLAND ANDRA ASPEKTER SOM SKA BEAKTAS KOMMER ANALYSEN AV FÖRORDNINGEN OM HUR DESSA SYSTEM UTTRYCKS ATT INGÅ. EN DIFFERENTIERAD REGLERING AV CRISPR-CAS-SYTEMS SKULLE KUNNA ERBJUDA KOMPLETTERANDE FÖRSVAR BEROENDE PÅ DE FYSIOLOGISKA FÖRHÅLLANDENA. RESULTATEN AV DETTA PROJEKT SKULLE KUNNA BIDRA AVSEVÄRT TILL KUNSKAPEN OM DEN FUNKTIONELLA MÅNGFALDEN I CRISPR-CAS-SYSTEM. DETTA ÄMNE ÄR FÖR NÄRVARANDE ETT AV DE MEST RELEVANTA VETENSKAPLIGA OMRÅDENA PÅ GRUND AV DEN ENORMA INVERKAN PÅ BIOMEDICIN OCH BIOTEKNIK. (Swedish)
4 August 2022
0 references
Murcia
0 references
20 December 2023
0 references
Identifiers
BFU2017-85464-P
0 references